Angiospermen

@misc{arnold1947introduction1,
    author = "Arnold, C. A",
    title = "Einführung in die Paläobotanik",
    year = "1947",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill, 433 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Arnold, C. A., 1947, Einführung in die Paläobotanik: New York, McGraw-Hill, 433 p.}"
}

@article{doi1023071943261,
    author = "Stebbins, G. Ledyard",
    title = "Evidence on Rates of Evolution from the Distribution of Existing and Fossil Plant Species",
    year = "1947",
    journal = "Ecological Monographs",
    url = "https://doi.org/10.2307/1943261",
    doi = "10.2307/1943261",
    openalex = "W1998160448"
}

@book{chaney1949evolutionary2,
    author = "Chaney, R. W",
    title = "Evolutionäre Trends in den Angiospermen, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., und Mayr, E., Hgg., Genetics, Paleontology and Evolution",
    year = "1949",
    publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, S. 190-201; 474 S",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Chaney, R. W., 1949, Evolutionäre Trends in den Angiospermen, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., und Mayr, E., Hgg., Genetics, Paleontology and Evolution: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, S. 190-201; 474 S.}"
}

Zeitschriftenartikel A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION Zugriff erhalten Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod University of California Los Angeles Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 6, Ausgabe 1, 1. März 1952, Seiten 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Veröffentlicht: 01. März 1952 Artikelverlauf Eingegangen: 22. Oktober 1951 Veröffentlicht: 01. März 1952

@article{doi101111j155856461952tb02810x,
    author = "Axelrod, Daniel I.",
    title = "A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION",
    year = "1952",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Zeitschriftenartikel A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION Zugriff erhalten Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod University of California Los Angeles Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 6, Ausgabe 1, 1. März 1952, Seiten 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Veröffentlicht: 01. März 1952 Artikelverlauf Eingegangen: 22. Oktober 1951 Veröffentlicht: 01. März 1952",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
    openalex = "W2320024939",
    references = "doi101144transglas211117"
}

@article{doi1023072405502,
    author = "Axelrod, Daniel I.",
    title = "A Theory of Angiosperm Evolution",
    year = "1952",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2405502",
    doi = "10.2307/2405502",
    openalex = "W4240185923"
}

@inproceedings{whittaker1969evolution4,
    author = "Whittaker, R. H",
    title = "Evolution der Vielfalt in Pflanzengemeinschaften",
    year = "1969",
    booktitle = "Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, S. 178-196",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Whittaker, R. H., 1969, Evolution der Vielfalt in Pflanzengemeinschaften: Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, S. 178-196.}"
}

@incollection{banks1970angiosperms,
    author = "Banks, Harlan P.",
    title = "Angiospermen — die Krönung der Pflanzenentwicklung",
    year = "1970",
    booktitle = "Evolution und Pflanzen der Vergangenheit",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
    doi = "10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
    openalex = "W2482891615",
    pages = "147-160",
    references = "doi101111j155856461952tb02810x, doi101144gsljgs1923079010409, doi1023071943261, doi1023072405502, doi1023072799872, doi105962bhltitle110147, openalexw1560240034"
}

@article{doi1023071218350,
    author = "Cronquist, Arthur und Stebbins, G. Ledyard",
    title = "Flowering Plants. Evolution above the Species Level",
    year = "1975",
    journal = "Taxon",
    url = "https://doi.org/10.2307/1218350",
    doi = "10.2307/1218350",
    openalex = "W1589280229"
}

@article{doi1023072418725,
    author = "Thorne, Robert F. und Beck, Charles B.",
    title = "Ursprung und frühe Evolution der Angiospermen.",
    year = "1976",
    journal = "Systematic Botany",
    url = "https://doi.org/10.2307/2418725",
    doi = "10.2307/2418725",
    openalex = "W1981841294"
}

ZUSAMMENFASSUNG Gemäß der „Gause-Hypothese", einer Folgerung aus dem Prozess der Evolution durch natürliche Selektion, muss in einer Gemeinschaft im Gleichgewicht jede Art eine andere Nische besetzen. Viele Botaniker haben diese Idee als unwahrscheinlich erachtet, weil sie die Regenerationsprozesse in Pflanzengemeinschaften ignoriert haben. Die meisten Pflanzengemeinschaften sind langlebiger als ihre einzelnen Bestandteile. Wenn ein Individuum stirbt, kann es durch ein Individuum derselben Art ersetzt werden oder auch nicht. Diese Ersatzphase ist für das vorliegende Argument von entscheidender Bedeutung. Mehrere Mechanismen, die nicht die Regeneration betreffen, tragen ebenfalls zur Aufrechterhaltung der Artenvielfalt bei: Unterschiede in der Lebensform gepaart mit der Unfähigkeit größerer Pflanzen, alle Ressourcen zu erschöpfen oder abzuschneiden, die Entwicklung von Abhängigkeitsbeziehungen, Unterschiede in der Phänologie gepaart mit Toleranz gegenüber Unterdrückung, Schwankungen in der Umwelt gepaart mit relativ geringen Unterschieden in der Wettbewerbsfähigkeit zwischen vielen Arten, die Fähigkeit bestimmter Art-Paare, stabile Mischungen zu bilden aufgrund eines Gleichgewichts zwischen intraspezifischem und interspezifischem Wettbewerb, die Produktion von Substanzen, die für die produzierende Art toxischer sind als für andere Arten, Unterschiede in den primär limitierenden Mineralnährstoffen oder Porengrößen im Boden für benachbarte Pflanzen verschiedener Arten, und Unterschiede in der Wettbewerbsfähigkeit von Arten, die von ihrem physiologischen Alter abhängen, gepaart mit der ungleichen Altersstruktur vieler Populationen. Die oben aufgeführten Mechanismen reichen nicht weit, um die unendliche Persistenz in Mischung der vielen Arten in den artenreichsten bekannten Gemeinschaften zu erklären. Im Gegensatz dazu scheinen es fast grenzenlose Möglichkeiten für Unterschiede zwischen Arten in ihren Anforderungen an die Regeneration zu geben, d.h. den Ersatz der Individuen einer Generation durch die der nächsten. Diese Idee wird für Baumarten illustriert, und es wird betont, dass Förster waren die ersten, die weitgehend ihre Bedeutung erkannten. Die Prozesse, die an der erfolgreichen Invasion einer Lücke durch eine gegebene Pflanzenart beteiligt sind, sowie einige Charakteristika der Lücke, die wichtig sein können, werden in Tabelle 2 zusammengefasst. Die Definition einer Pflanzennische erfordert die Anerkennung von vier Komponenten: die Habitat-Nische, die Lebensform-Nische, die phänologische Nische und die Regenerations-Nische. Es wird eine kurze Darstellung der Muster der Regeneration in verschiedenen Arten von Pflanzengemeinschaften gegeben, um einen Hintergrund für Studien zur Differenzierung in der Regenerations-Nische zu schaffen. Alle Stufen im Regenerationszyklus sind potenziell wichtig, und Beispiele für Differenzierungen zwischen Arten werden für jede der folgenden Stufen gegeben: Produktion lebensfähiger Samen (einschließlich der Unterstufen der Blüte, Bestäubung und Samenbildung), Ausbreitung im Raum und in der Zeit, Keimung, Etablierung und weitere Entwicklung der unreifen Pflanze. In der abschließenden Diskussion wird der Schwerpunkt auf folgenden Themen gelegt: die Art der Arbeit, die in Zukunft benötigt wird, um zu beweisen oder zu widerlegen, dass die Differenzierung in der Regenerations-Nische die Haupterklärung für die Aufrechterhaltung der Artenvielfalt in Pflanzengemeinschaften ist, die Beziehung der vorliegenden These zu veröffentlichten Ideen zum Ursprung der phänologischen Ausbreitung, die Relevanz der vorliegenden These für die Diskussion über das Vorhandensein von Kontinua in der Vegetation, die Übereinstimmung der vorliegenden These mit den aufkommenden Ideen der Evolutionisten über die Differenzierung von Angiospermen-Taxa, und die Bedeutung von Regenerationsstudien für den Naturschutz.

@article{doi101111j1469185x1977tb01347x,
    author = "Grubb, P. J.",
    title = "THE MAINTENANCE OF SPECIES‐RICHNESS IN PLANT COMMUNITIES: THE IMPORTANCE OF THE REGENERATION NICHE",
    year = "1977",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "ZUSAMMENFASSUNG Gemäß der 'Gause-Hypothese', einer Folgerung aus dem Prozess der Evolution durch natürliche Selektion, muss in einer Gemeinschaft im Gleichgewicht jede Art eine unterschiedliche Nische besetzen. Viele Botaniker haben diese Idee als unwahrscheinlich erachtet, weil sie die Regenerationsprozesse in Pflanzengemeinschaften ignoriert haben. Die meisten Pflanzengemeinschaften sind langlebiger als ihre einzelnen Bestandteile. Wenn ein Individuum stirbt, wird es möglicherweise durch ein Individuum derselben Art ersetzt oder auch nicht. Diese Ersatzphase ist für das vorgetragene Argument von entscheidender Bedeutung. Mehrere Mechanismen, die nicht die Regeneration beinhalten, tragen ebenfalls zur Aufrechterhaltung der Artenvielfalt bei: Unterschiede in der Lebensform gepaart mit der Unfähigkeit größerer Pflanzen, alle Ressourcen zu erschöpfen oder abzuschneiden, die Entwicklung von Abhängigkeitsbeziehungen, Unterschiede in der Phänologie gepaart mit Toleranz gegenüber Unterdrückung, Schwankungen in der Umwelt gepaart mit relativ geringen Unterschieden in der Wettbewerbsfähigkeit zwischen vielen Arten, die Fähigkeit bestimmter Art-Paare, stabile Mischungen zu bilden aufgrund eines Gleichgewichts zwischen intraspezifischer und interspezifischer Konkurrenz, die Produktion von Substanzen, die für die produzierende Art toxischer sind als für andere Arten, Unterschiede in den primär limitierenden mineralischen Nährstoffen oder Porengrößen im Boden für benachbarte Pflanzen verschiedener Arten, und Unterschiede in der Wettbewerbsfähigkeit von Arten, die von ihrem physiologischen Alter abhängen, gepaart mit der ungleichen Altersstruktur vieler Populationen. Die oben aufgeführten Mechanismen reichen nicht weit, um die unendliche Persistenz in Mischung der vielen Arten in den artenreichsten bekannten Gemeinschaften zu erklären. Im Gegensatz dazu scheinen es fast unendliche Möglichkeiten für Unterschiede zwischen Arten in ihren Anforderungen an die Regeneration zu geben, d.h. dem Ersatz der Individuen einer Generation durch diejenigen der nächsten. Diese Idee wird für Baumarten veranschaulicht, und es wird betont, dass Forstleute weit im Voraus die Bedeutung dieser Erkenntnis erkannten. Die Prozesse, die an der erfolgreichen Invasion einer Lücke durch eine bestimmte Pflanzenart beteiligt sind, sowie einige Charakteristika der Lücke, die wichtig sein können, werden in Tabelle 2 zusammengefasst. Die Definition einer Pflanzennische erfordert die Anerkennung von vier Komponenten: die Habitat-Nische, die Lebensform-Nische, die phänologische Nische und die Regenerations-Nische. Es wird eine kurze Darstellung der Regenerationsmuster in verschiedenen Arten von Pflanzengemeinschaften gegeben, um einen Hintergrund für Studien zur Differenzierung in der Regenerations-Nische zu schaffen. Alle Stadien im Regenerationszyklus sind potenziell wichtig, und Beispiele für Differenzierungen zwischen Arten werden für jedes der folgenden Stadien gegeben: Produktion lebensfähiger Samen (einschließlich der Unterstadien der Blüte, Bestäubung und Samenbildung), Ausbreitung im Raum und in der Zeit, Keimung, Ansiedlung und weitere Entwicklung des unreifen Pflanzen. In der abschließenden Diskussion wird der Schwerpunkt auf folgenden Themen gelegt: die Art der Arbeit, die in Zukunft benötigt wird, um zu beweisen oder zu widerlegen, dass die Differenzierung in der Regenerations-Nische die Haupterklärung für die Aufrechterhaltung der Artenvielfalt in Pflanzengemeinschaften ist, die Beziehung der vorliegenden These zu veröffentlichten Ideen zum Ursprung der phänologischen Ausbreitung, die Relevanz der vorliegenden These für die Diskussion über das Vorhandensein von Kontinua in der Vegetation, die Übereinstimmung der vorliegenden These mit den sich entwickelnden Ideen der Evolutionisten über die Differenzierung von Angiospermen-Taxa, und die Bedeutung von Regenerationsstudien für den Naturschutz.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    openalex = "W2119259345",
    references = "doi101038242344a0, doi101086282070, doi101086282687, doi101093biomet3812196, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1473655250, doi1015159780691206912, doi1023071218190, doi1023071929601, doi1023072256497, doi1023072258550, doi1023072989767, openalexw1532540194"
}

@article{doi101007bf02806171,
    title = "Evolution und Klassifizierung von Blütenpflanzen",
    year = "1979",
    journal = "Brittonia",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02806171",
    doi = "10.1007/bf02806171",
    openalex = "W1589755459"
}

@article{doi101007bf02861082,
    author = "Doyle, James A. und Donoghue, Michael J.",
    title = "Seed plant phylogeny and the origin of angiosperms: An experimental cladistic approach",
    year = "1986",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02861082",
    doi = "10.1007/bf02861082",
    openalex = "W2063845391",
    references = "doi101007bf02858880, doi101126science2314734129, doi1023072413454, doi105962bhltitle118957, openalexw3126336940"
}

The evolution and classification of flowering plants, The evolution and classification of flowering plants, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023072418914,
    author = "Keener, Carl S. and Cronquist, Arthur",
    title = "The Evolution and Classification of Flowering Plants.",
    year = "1989",
    journal = "Systematic Botany",
    abstract = "The evolution and classification of flowering plants, The evolution and classification of flowering plants, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/2418914",
    doi = "10.2307/2418914",
    openalex = "W3020856028"
}

@misc{freidman1990double3,
    author = "Freidman, W. E",
    title = "Doppelte Befruchtung bei Ephedra, einer nichtblühenden Pflanze; ihre Bedeutung für den Ursprung der Angiospermen",
    year = "1990",
    howpublished = "Science, v. 247, p. 951",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Freidman, W. E., 1990, Doppelte Befruchtung bei Ephedra, einer nichtblühenden Pflanze; ihre Bedeutung für den Ursprung der Angiospermen: Science, v. 247, p. 951.}"
}

Bei 50 Sequenzen des Gens, das für die große Untereinheit der Ribulose-1,5-bisphosphat-Carboxylase (rbcL) kodiert, die Bryophyten, Nadelbäume, Dikotyledonen und Monokotyledonen repräsentieren, wurde eine umfangreiche Variation in den Synonym- und Nichtsynonym-Austauschraten beobachtet. Relative-Raten-Tests zeigten Ratenunterschiede von bis zu 138 % für Nichtsynonym-Austausche und bis zu 85 % für Synonym-Austausche. Unter den Angiospermen entwickelten sich die einjährigen Formen im Durchschnitt schneller als die mehrjährigen Formen. Diese Ratenheterogenität war an Nichtsynonym-Stellen umfangreicher als an Synonym-Stellen und resultierte primär aus einer jüngeren Beschleunigung der Austauschrate in vielen Gruppen von Angiospermen.

@article{doi101073pnas89167844,
    author = "Bousquet, Jean und Strauss, Steven H. und Doerksen, Allan H. und Price, Robert A.",
    title = "Extensive variation in evolutionary rate of rbcL gene sequences among seed plants.",
    year = "1992",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Bei 50 Sequenzen des Gens, das für die große Untereinheit der Ribulose-1,5-bisphosphat-Carboxylase (rbcL) kodiert, die Bryophyten, Nadelbäume, Dikotyledonen und Monokotyledonen repräsentieren, wurde eine umfangreiche Variation in den Synonym- und Nichtsynonym-Austauschraten beobachtet. Relative-Raten-Tests zeigten Ratenunterschiede von bis zu 138\% für Nichtsynonym-Austausche und bis zu 85\% für Synonym-Austausche. Unter den Angiospermen entwickelten sich die einjährigen Formen im Durchschnitt schneller als die mehrjährigen Formen. Diese Ratenheterogenität war an Nichtsynonym-Stellen umfangreicher als an Synonym-Stellen und resultierte primär aus einer jüngeren Beschleunigung der Austauschrate in vielen Gruppen von Angiospermen.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.89.16.7844",
    doi = "10.1073/pnas.89.16.7844",
    openalex = "W1968683533"
}

Physiologische und ökologische Einschränkungen spielen eine Schlüsselrolle in der Evolution von Pflanzenwachstumsmustern, insbesondere im Zusammenhang mit Abwehrmechanismen gegen Herbivoren. Phänotypische und Lebenszyklus-Theorien werden im Rahmen des Wachstums-Differenzierungs-Gleichgewichts (GDB) vereinheitlicht und bilden ein integriertes System von Theorien, das Muster der pflanzlichen Abwehr und kompetitiver Interaktionen in ökologischer und evolutionärer Zeit erklärt und vorhersagt. Pflanzliche Aktivität auf zellulärer Ebene kann als Wachstum (Zellteilung und Vergrößerung) oder Differenzierung (chemische und morphologische Veränderungen, die zur Zellreifung und Spezialisierung führen) klassifiziert werden. Die GDB-Hypothese der pflanzlichen Abwehr basiert auf einem physiologischen Zielkonflikt zwischen Wachstums- und Differenzierungsprozessen. Der Zielkonflikt zwischen Wachstum und Abwehr besteht, weil sekundärer Stoffwechsel und strukturelle Verstärkung in sich teilenden und vergrößernden Zellen physiologisch eingeschränkt sind und weil sie Ressourcen von der Produktion neuer Blattfläche abziehen. Daher das Dilemma der Pflanzen: Sie müssen schnell genug wachsen, um zu vollenden, und gleichzeitig die Abwehrmechanismen aufrechterhalten, die notwendig sind, um im Vorhandensein von Krankheitserregern und Herbivoren zu überleben. Der physiologische Zielkonflikt zwischen Wachstums- und Differenzierungsprozessen interagiert mit Herbivorie und Pflanzen-Pflanzen-Wettbewerb, um sich als genetischer Zielkonflikt zwischen Wachstum und Abwehr in der Evolution von pflanzlichen Lebenszyklusstrategien zu manifestieren. Evolutionstheorien der pflanzlichen Abwehr werden überprüft. Wir erweitern auch ein Standard-Wachstumsratenmodell, indem wir seine ökologischen und evolutionären Komponenten trennen und die Rolle des Wettbewerbs in der Evolution der pflanzlichen Abwehr formalisieren. Wir schließen mit einem konzeptionellen Modell der Evolution der pflanzlichen Abwehr ab, in dem physiologische Zielkonflikte der Pflanzen mit der abiotischen Umwelt, Wettbewerb und Herbivorie interagieren.

@article{doi101086417659,
    author = "Herms, Daniel A. und Mattson, William J.",
    title = "The Dilemma of Plants: To Grow or Defend",
    year = "1992",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Physiologische und ökologische Einschränkungen spielen eine Schlüsselrolle in der Evolution von Pflanzenwachstumsmustern, insbesondere im Zusammenhang mit Abwehrmechanismen gegen Herbivoren. Phänotypische und Lebenszyklus-Theorien werden im Rahmen des Wachstums-Differenzierungs-Gleichgewichts (GDB) vereinheitlicht und bilden ein integriertes System von Theorien, das Muster der pflanzlichen Abwehr und kompetitiver Interaktionen in ökologischer und evolutionärer Zeit erklärt und vorhersagt. Pflanzliche Aktivität auf zellulärer Ebene kann als Wachstum (Zellteilung und Vergrößerung) oder Differenzierung (chemische und morphologische Veränderungen, die zur Zellreifung und Spezialisierung führen) klassifiziert werden. Die GDB-Hypothese der pflanzlichen Abwehr basiert auf einem physiologischen Zielkonflikt zwischen Wachstums- und Differenzierungsprozessen. Der Zielkonflikt zwischen Wachstum und Abwehr besteht, weil sekundärer Stoffwechsel und strukturelle Verstärkung in sich teilenden und vergrößernden Zellen physiologisch eingeschränkt sind und weil sie Ressourcen von der Produktion neuer Blattfläche abziehen. Daher das Dilemma der Pflanzen: Sie müssen schnell genug wachsen, um zu vollenden, und gleichzeitig die Abwehrmechanismen aufrechterhalten, die notwendig sind, um im Vorhandensein von Krankheitserregern und Herbivoren zu überleben. Der physiologische Zielkonflikt zwischen Wachstums- und Differenzierungsprozessen interagiert mit Herbivorie und Pflanzen-Pflanzen-Wettbewerb, um sich als genetischer Zielkonflikt zwischen Wachstum und Abwehr in der Evolution von pflanzlichen Lebenszyklusstrategien zu manifestieren. Evolutionstheorien der pflanzlichen Abwehr werden überprüft. Wir erweitern auch ein Standard-Wachstumsratenmodell, indem wir seine ökologischen und evolutionären Komponenten trennen und die Rolle des Wettbewerbs in der Evolution der pflanzlichen Abwehr formalisieren. Wir schließen mit einem konzeptionellen Modell der Evolution der pflanzlichen Abwehr ab, in dem physiologische Zielkonflikte der Pflanzen mit der abiotischen Umwelt, Wettbewerb und Herbivorie interagieren.",
    url = "https://doi.org/10.1086/417659",
    doi = "10.1086/417659",
    openalex = "W1990151103",
    references = "doi101007bf02860717, doi101086283244, doi101086284531, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461985tb00391x, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science188418319, doi101126science2304728895, doi101146annureves19110188000551, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023072389364, openalexw2169917233"
}

In Vergleichen von Schwestertaxa besteht eine signifikante, positive Korrelation zwischen der Evolutionsrate des rbc L Chloroplastengens innerhalb von Familien von Blütenpflanzen (Angiospermen) und der Anzahl der Arten in diesen Familien. Wir diskutieren kurz alternative evolutionäre Szenarien, die diese Beziehung zwischen Artbildung und molekularer Evolution in Blütenpflanzen erzeugt haben könnten.

@article{doi101098rspb19960088,
    author = "Barraclough, Timothy G. und Harvey, Paul und Nee, Sean",
    title = "Rate of rbc L gene sequence evolution and species diversification in flowering plants (angiosperms)",
    year = "1996",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "In Vergleichen von Schwestertaxa besteht eine signifikante, positive Korrelation zwischen der Evolutionsrate des rbc L Chloroplastengens innerhalb von Familien von Blütenpflanzen (Angiospermen) und der Anzahl der Arten in diesen Familien. Wir diskutieren kurz alternative evolutionäre Szenarien, die diese Beziehung zwischen Artbildung und molekularer Evolution in Blütenpflanzen erzeugt haben könnten.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.1996.0088",
    doi = "10.1098/rspb.1996.0088",
    openalex = "W2121360952",
    references = "doi101006mpev19931009, doi101038355511a0, doi101073pnas89167844, doi101098rspb19950031, doi101111j109600311989tb00482x, doi101146annureves22110191001433, doi1023071222465, doi1023072399846, doi1023074109916"
}

Neuere kladistische Analysen enthüllen die Phylogenie der Blütenpflanzen in zunehmendem Detail, und es gibt Unterstützung für die Monophylie vieler Hauptgruppen oberhalb der Familienstufe. Mit vielen Elementen der Hauptverzweigungssequenz der Phylogenie etabliert, wird eine revidierte suprafamiliale Klassifikation der Blütenpflanzen sowohl machbar als auch wünschenswert. Hier präsentieren wir eine Klassifikation von 462 Familien der Blütenpflanzen in 40 vermeintlich monophyletischen Ordnungen und einer kleinen Anzahl von monophyletischen, informellen höheren Gruppen. Letztere sind die Monokotyledonen, Commelinoiden, Eudikotyledonen, Kern-Eudikotyledonen, Rosiden einschließlich Eurosiden I und II, und Asteriden einschließlich Euasteriden I und II. Unter diesen informellen Gruppen sind auch eine Anzahl von Familien ohne Zuordnung zu einer Ordnung aufgeführt. Am Ende des Systems befindet sich eine zusätzliche Liste von Familien ungewisser Position, für die keine festen Daten bezüglich der Platzierung irgendwo innerhalb des Systems existieren. Warum Familien neu anordnen, geschweige denn Ordnungen formalisieren? Höhere Klassifikationen, die Gruppierung von Arten in Familien, Ordnungen usw., sind als Referenzwerkzeuge nicht nur in der Systematik, sondern auch in vielen anderen Bereichen der Biologie notwendig. Das Wissen über phylogenetische Beziehungen von Hauptgruppen von Organismen, das heißt, eine phylogenetische Perspektive, wird zunehmend wichtig, und folglich wird die Notwendigkeit einer phylogenetischen Klassifikation als Referenzwerkzeug ebenfalls zwingend. Unser primärer Fokus liegt auf Ordnungen mit einem sekundären Schwerpunkt auf Familien der Blütenpflanzen. Die Familie ist zentral in der Systematik der Blütenpflanzen. Zum Beispiel identifizieren wir bei der Untersuchung einer unbekannten Pflanze sie zunächst auf die Familie. Die Ordnungen hingegen waren bis vor kurzem von geringer Bedeutung, entweder weil sie morphologisch nicht erkennbar waren oder in den meisten Fällen jegliche evolutionäre Kohärenz fehlten (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). Allerdings sind Ordnungen nützlich im Unterricht, zum Studium

@article{doi1023072992015,
    title = "Eine ordinale Klassifikation für die Familien der Blütenpflanzen",
    year = "1998",
    journal = "Annals of the Missouri Botanical Garden",
    abstract = "Neuere kladistische Analysen enthüllen die Phylogenie der Blütenpflanzen in zunehmendem Detail, und es gibt Unterstützung für die Monophylie vieler Hauptgruppen oberhalb der Familienstufe. Mit vielen Elementen der Hauptverzweigungssequenz der Phylogenie etabliert, wird eine revidierte suprafamiliale Klassifikation der Blütenpflanzen sowohl machbar als auch wünschenswert. Hier präsentieren wir eine Klassifikation von 462 Familien der Blütenpflanzen in 40 vermeintlich monophyletischen Ordnungen und einer kleinen Anzahl von monophyletischen, informellen höheren Gruppen. Letztere sind die Monokotyledonen, Commelinoiden, Eudikotyledonen, Kern-Eudikotyledonen, Rosiden einschließlich Eurosiden I und II, und Asteriden einschließlich Euasteriden I und II. Unter diesen informellen Gruppen sind auch eine Anzahl von Familien ohne Zuordnung zu einer Ordnung aufgeführt. Am Ende des Systems befindet sich eine zusätzliche Liste von Familien ungewisser Position, für die keine festen Daten bezüglich der Platzierung irgendwo innerhalb des Systems existieren. Warum Familien neu anordnen, geschweige denn Ordnungen formalisieren? Höhere Klassifikationen, die Gruppierung von Arten in Familien, Ordnungen usw., sind als Referenzwerkzeuge nicht nur in der Systematik, sondern auch in vielen anderen Bereichen der Biologie notwendig. Das Wissen über phylogenetische Beziehungen von Hauptgruppen von Organismen, das heißt, eine phylogenetische Perspektive, wird zunehmend wichtig, und folglich wird die Notwendigkeit einer phylogenetischen Klassifikation als Referenzwerkzeug ebenfalls zwingend. Unser primärer Fokus liegt auf Ordnungen mit einem sekundären Schwerpunkt auf Familien der Blütenpflanzen. Die Familie ist zentral in der Systematik der Blütenpflanzen. Zum Beispiel identifizieren wir bei der Untersuchung einer unbekannten Pflanze sie zunächst auf die Familie. Die Ordnungen hingegen waren bis vor kurzem von geringer Bedeutung, entweder weil sie morphologisch nicht erkennbar waren oder in den meisten Fällen jegliche evolutionäre Kohärenz fehlten (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). Allerdings sind Ordnungen nützlich im Unterricht, zum Studium",
    url = "https://doi.org/10.2307/2992015",
    doi = "10.2307/2992015",
    openalex = "W143810700"
}

@misc{ramsay2000angiosperms,
    author = "Ramsay, Margaret M.",
    title = "Angiospermen",
    year = "2000",
    booktitle = "Encyclopedia of Cell Technology",
    url = "https://doi.org/10.1002/0471250570.spi004",
    doi = "10.1002/0471250570.spi004"
}

Die außergewöhnliche heutige Artenvielfalt und ökologische Dominanz der Blütenpflanzen (Angiospermen) sind noch bemerkenswerter, wenn man den relativ jüngeren Beginn ihrer evolutionären Diversifizierung berücksichtigt. Wir untersuchen die evolutionäre Diversifizierung der Angiospermen und die beobachtete unterschiedliche Verteilung von Arten in Angiospermen-Clans, indem wir die Diversifizierungsrate für Angiospermen insgesamt und für einen großen Satz von Angiospermen-Clans schätzen. Wir identifizieren auch Angiospermen-Clans mit einer bestehenden Vielfalt, die entweder viel höher oder niedriger als erwartet ist, gegeben die geschätzte Hintergrunddiversifizierungsrate. Die Anerkennung von Angiospermen-Clans, die phylogenetischen Beziehungen zwischen ihnen und ihre taxonomische Zusammensetzung basieren auf einer empirischen Zusammenstellung primärer phylogenetischer Studien. Durch eine integrative und kritische Nutzung des paläobotanischen Aufzeichnungsmaterials erhalten wir vernünftige und sichere Annäherungen für das Alter eines großen Satzes von Angiospermen-Clans. Diversifizierung wurde als stochastischer, zeit-homogener Geburts-und-Tod-Prozess modelliert, der von der Diversifizierungsrate (r) und der relativen Aussterberate (epsilon) abhängt. Eine statistische Analyse des Geburts-und-Tod-Prozesses wurde dann verwendet, um 95% Konfidenzintervalle für die erwartete Anzahl von Arten über die Zeit in einem Clan zu erhalten, der sich mit einer Rate diversifiziert, die gleich der von Angiospermen insgesamt ist. Konfidenzintervalle wurden für Stammgruppen- und Kronengruppen-Alter in Abwesenheit von Aussterben (e = 0.0) und unter einer hohen relativen Aussterberate (epsilon = 0.9) erhalten. Die bestehende Vielfalt von Angiospermen-Clans wurde dann mit der erwarteten Artenvielfalt gemäß dem Hintergrunddiversifizierungsrate verglichen, und je nach ihrer Platzierung im Verhältnis zu den berechneten Konfidenzintervallen wurden außergewöhnlich artenreiche oder außergewöhnlich artenarme Clans identifiziert. Die Diversifizierungsrate für Angiospermen insgesamt reicht von 0,077 (epsilon = 0.9) bis 0,089 (epsilon = 0.0) Netto-Artbildungsereignisse pro Millionen Jahre. Zehn Clans liegen über den Konfidenzintervallen der erwarteten Artenvielfalt, und 13 Clans wurden als unerwartet artenarm gefunden. Die phylogenetische Verteilung von Clans mit einer außergewöhnlich hohen Anzahl von Arten deutet darauf hin, dass Merkmale, die hohe Diversifizierungsraten verleihen, unabhängig voneinander in verschiedenen Fällen evolviert sind und die Angiospermen insgesamt nicht charakterisieren.

@article{doi101111j001438202001tb00826x,
    author = "Magallón, Susana und Sanderson, Michael J.",
    title = "ABSOLUTE DIVERSIFICATION RATES IN ANGIOSPERM CLADES",
    year = "2001",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Die außergewöhnliche heutige Artenvielfalt und ökologische Dominanz der Blütenpflanzen (Angiospermen) sind noch bemerkenswerter, wenn man den relativ jüngeren Beginn ihrer evolutionären Diversifizierung berücksichtigt. Wir untersuchen die evolutionäre Diversifizierung der Angiospermen und die beobachtete unterschiedliche Verteilung von Arten in Angiospermen-Clans, indem wir die Diversifizierungsrate für Angiospermen insgesamt und für einen großen Satz von Angiospermen-Clans schätzen. Wir identifizieren auch Angiospermen-Clans mit einer bestehenden Vielfalt, die entweder viel höher oder niedriger als erwartet ist, gegeben die geschätzte Hintergrunddiversifizierungsrate. Die Anerkennung von Angiospermen-Clans, die phylogenetischen Beziehungen zwischen ihnen und ihre taxonomische Zusammensetzung basieren auf einer empirischen Zusammenstellung primärer phylogenetischer Studien. Durch eine integrative und kritische Nutzung des paläobotanischen Aufzeichnungsmaterials erhalten wir vernünftige und sichere Annäherungen für das Alter eines großen Satzes von Angiospermen-Clans. Diversifizierung wurde als stochastischer, zeit-homogener Geburts-und-Tod-Prozess modelliert, der von der Diversifizierungsrate (r) und der relativen Aussterberate (epsilon) abhängt. Eine statistische Analyse des Geburts-und-Tod-Prozesses wurde dann verwendet, um 95% Konfidenzintervalle für die erwartete Anzahl von Arten über die Zeit in einem Clan zu erhalten, der sich mit einer Rate diversifiziert, die gleich der von Angiospermen insgesamt ist. Konfidenzintervalle wurden für Stammgruppen- und Kronengruppen-Alter in Abwesenheit von Aussterben (e = 0.0) und unter einer hohen relativen Aussterberate (epsilon = 0.9) erhalten. Die bestehende Vielfalt von Angiospermen-Clans wurde dann mit der erwarteten Artenvielfalt gemäß dem Hintergrunddiversifizierungsrate verglichen, und je nach ihrer Platzierung im Verhältnis zu den berechneten Konfidenzintervallen wurden außergewöhnlich artenreiche oder außergewöhnlich artenarme Clans identifiziert. Die Diversifizierungsrate für Angiospermen insgesamt reicht von 0,077 (epsilon = 0.9) bis 0,089 (epsilon = 0.0) Netto-Artbildungsereignisse pro Millionen Jahre. Zehn Clans liegen über den Konfidenzintervallen der erwarteten Artenvielfalt, und 13 Clans wurden als unerwartet artenarm gefunden. Die phylogenetische Verteilung von Clans mit einer außergewöhnlich hohen Anzahl von Arten deutet darauf hin, dass Merkmale, die hohe Diversifizierungsraten verleihen, unabhängig voneinander in verschiedenen Fällen evolviert sind und die Angiospermen insgesamt nicht charakterisieren.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
    openalex = "W2031187632",
    references = "doi1010029781444313918, doi101006bojl20000380, doi1010079783642616631, doi101007bf02860537, doi101007bf02860540, doi101017s0094837300006539, doi10103846536, doi101086285258, doi101098rspb19960088, doi101098rstb19940068, doi101126science13334591105, doi101214aoms1177730285, doi1023071266137, doi1023072399030, doi1023072992015, openalexw1978269554, openalexw409616968"
}

@article{doi101038nature01019,
    author = "Diamond, Jared M.",
    title = "Evolution, consequences and future of plant and animal domestication",
    year = "2002",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature01019",
    doi = "10.1038/nature01019",
    openalex = "W2128616554",
    references = "crossref2022quaternary, doi101002sici10969136199712145s7aiddia52233co2i, doi101038414782a, doi101086300102, doi101093acprofosobl97801995490610010001, doi101111j155856461991tb04425x, doi1023071185219, doi1023072137390, doi1023072403680, doi1023072485224, doi1023072803166, doi102307jctv301gjp"
}

Zusammenfassung Das Konzept des funktionellen Pflanzentyps schlägt vor, dass Arten nach gemeinsamen Reaktionen auf die Umwelt und/oder gemeinsamen Auswirkungen auf Ökosystemprozesse gruppiert werden können. Allerdings bleibt das Wissen über die Beziehungen zwischen Merkmalen, die mit der Reaktion von Pflanzen auf Umweltfaktoren wie Ressourcen und Störungen (Reaktionsmerkmale) verbunden sind, und Merkmalen, die die Auswirkungen von Pflanzen auf Ökosystemfunktionen (Effektmerkmale) bestimmen, wie biogeochemische Kreisläufe oder Anfälligkeit für Störungen, rudimentär. Wir präsentieren einen Rahmen, der Konzepte und Ergebnisse aus der Gemeinschaftsökologie, der Ökosystemökologie und der Evolutionsbiologie verwendet, um diese Verbindung herzustellen. Das Ökosystemfunktionieren ist das Endergebnis des Betriebs mehrerer Umweltfilter in einer Hierarchie von Skalen, die durch die Auswahl von Individuen mit angemessenen Reaktionen Assemblagen mit variierender Merkmalszusammensetzung ergeben. Funktionelle Verknüpfungen und Kompromisse zwischen Merkmalen, von denen jedes sich auf einen oder mehrere Prozesse bezieht, bestimmen, ob das Filtern durch verschiedene Faktoren zu einer Übereinstimmung führt und ob Ökosystemauswirkungen leicht aus dem Wissen über die Filter abgeleitet werden können. Um diesen Rahmen zu veranschaulichen, analysieren wir eine Reihe von Schlüsselfaktoren der Umwelt und Ökosystemprozessen. Während Merkmale, die mit der Reaktion auf Nährstoffgradienten verbunden sind, stark mit denen überlappen, die die Netto-Primärproduktion bestimmen, wurde nur wenig direkte Überlappung zwischen der Reaktion auf Feuer und Brennbarkeit gefunden. Wir vermuten, dass diese Muster allgemeine Trends widerspiegeln. Reaktionen auf die Verfügbarkeit von Ressourcen würden durch Merkmale bestimmt, die auch an biogeochemischen Kreisläufen beteiligt sind, da sowohl diese Reaktionen als auch Auswirkungen durch den Kompromiss zwischen Akquisition und Konservierung angetrieben werden. Auf der anderen Seite wären Regenerations- und demografische Merkmale, die mit der Reaktion auf Störungen verbunden sind und bekanntermaßen wenig Verbindung zu adulten Merkmalen haben, die an der Pflanzenökophysiologie beteiligt sind, für Ökosystemprozesse von geringer Relevanz. Dieser Rahmen ist wahrscheinlich weit anwendbar, obwohl Vorsicht geboten ist, um Merkmalsverknüpfungen und Kompromisse zu verwenden, die für die Skala, die Umweltbedingungen und den evolutionären Kontext angemessen sind. Er kann die Auswahl von funktionellen Pflanzentypen für Vegetationsmodelle über eine Reihe von Skalen hinweg leiten und bei der Gestaltung experimenteller Studien zu den Beziehungen zwischen Pflanzenvielfalt und Ökosystemeigenschaften helfen.

@article{doi101046j13652435200200664x,
    author = "Lavorel, Sandra und Garnier, Éric",
    title = "Vorhersage von Veränderungen in der Gemeinschaftszusammensetzung und im Ökosystemfunktionieren aus Pflanzenmerkmalen: eine Neubewertung des Heiligen Grals",
    year = "2002",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Zusammenfassung Das Konzept des funktionellen Pflanzentyps schlägt vor, dass Arten nach gemeinsamen Reaktionen auf die Umwelt und/oder gemeinsamen Auswirkungen auf Ökosystemprozesse gruppiert werden können. Allerdings bleibt das Wissen über die Beziehungen zwischen Merkmalen, die mit der Reaktion von Pflanzen auf Umweltfaktoren wie Ressourcen und Störungen (Reaktionsmerkmale) verbunden sind, und Merkmalen, die die Auswirkungen von Pflanzen auf Ökosystemfunktionen (Effektmerkmale) bestimmen, wie biogeochemische Kreisläufe oder Anfälligkeit für Störungen, rudimentär. Wir präsentieren einen Rahmen, der Konzepte und Ergebnisse aus der Gemeinschaftsökologie, der Ökosystemökologie und der Evolutionsbiologie verwendet, um diese Verbindung herzustellen. Das Ökosystemfunktionieren ist das Endergebnis des Betriebs mehrerer Umweltfilter in einer Hierarchie von Skalen, die durch die Auswahl von Individuen mit angemessenen Reaktionen Assemblagen mit variierender Merkmalszusammensetzung ergeben. Funktionelle Verknüpfungen und Kompromisse zwischen Merkmalen, von denen jedes sich auf einen oder mehrere Prozesse bezieht, bestimmen, ob das Filtern durch verschiedene Faktoren zu einer Übereinstimmung führt und ob Ökosystemauswirkungen leicht aus dem Wissen über die Filter abgeleitet werden können. Um diesen Rahmen zu veranschaulichen, analysieren wir eine Reihe von Schlüsselfaktoren der Umwelt und Ökosystemprozessen. Während Merkmale, die mit der Reaktion auf Nährstoffgradienten verbunden sind, stark mit denen überlappen, die die Netto-Primärproduktion bestimmen, wurde nur wenig direkte Überlappung zwischen der Reaktion auf Feuer und Brennbarkeit gefunden. Wir vermuten, dass diese Muster allgemeine Trends widerspiegeln. Reaktionen auf die Verfügbarkeit von Ressourcen würden durch Merkmale bestimmt, die auch an biogeochemischen Kreisläufen beteiligt sind, da sowohl diese Reaktionen als auch Auswirkungen durch den Kompromiss zwischen Akquisition und Konservierung angetrieben werden. Auf der anderen Seite wären Regenerations- und demografische Merkmale, die mit der Reaktion auf Störungen verbunden sind und bekanntermaßen wenig Verbindung zu adulten Merkmalen haben, die an der Pflanzenökophysiologie beteiligt sind, für Ökosystemprozesse von geringer Relevanz. Dieser Rahmen ist wahrscheinlich weit anwendbar, obwohl Vorsicht geboten ist, um Merkmalsverknüpfungen und Kompromisse zu verwenden, die für die Skala, die Umweltbedingungen und den evolutionären Kontext angemessen sind. Er kann die Auswahl von funktionellen Pflanzentypen für Vegetationsmodelle über eine Reihe von Skalen hinweg leiten und bei der Gestaltung experimenteller Studien zu den Beziehungen zwischen Pflanzenvielfalt und Ökosystemeigenschaften helfen.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    openalex = "W2168173042",
    references = "doi1010079783642809132, doi101007bf00002772, doi101023a1004327224729, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}

Hier wird die Koevolution von Mykorrhiza-Pilzen und Wurzeln im Lichte der jetzt verfügbaren Beweise bewertet, aus paläobotanischen und morphologischen Studien sowie der Analyse von DNA-basierter Phylogenie. Die ersten moosartigen Landpflanzen im frühen Devon (vor 400 Millionen Jahren) hatten endophytische Assoziationen, die Vesikel-Arbuskel-Mykorrhizen (VAM) ähnelten, noch bevor Wurzeln entstanden. Die Mykorrhiza-Evolution wäre von endophytischen Hyphen zu ausgewogenen Assoziationen fortgeschritten, bei denen die Partner aufgrund des Austauschs begrenzter Energie- und Nährstoffressourcen voneinander abhängig waren. Die meisten Mykorrhizen sind mutualistisch, aber in einigen Fällen führt der Trend zur zunehmenden Kontrolle der Pflanzen über Pilze zu den ausbeuterischen Mykorrhizen von achlorophyllen, mykoheterotrophen Pflanzen. Ektomykorrhizen, ericoid und Orchideen-Mykorrhizen sowie nichtmykorrhizale Wurzeln entwickelten sich während der Periode der schnellen Angiospermien-Strahlung im Kreidezeit. Es wird angenommen, dass Wurzeln allmählich von Rhizomen abstammen, um geeignetere Lebensräume für Mykorrhiza-Pilze zu bieten und Pflanzen mit komplexen Verzweigungen und Blättern mit Wasser und Nährstoffen zu versorgen. Selektionsdrücke haben die morphologische Divergenz von Wurzeln mit verschiedenen Arten von Mykorrhizen verursacht. Die Dicke der Wurzelrinde und die Exodermis-Suberisation sind bei obligat mykorrhizalen Pflanzen am größten, während nichtmykorrhizale Pflanzen tendenziell feine Wurzeln haben, mit mehr Wurzelhaaren und relativ fortgeschrittenen chemischen Abwehrmechanismen. Hauptkoevolutionstrends und der relative Erfolg von Pflanzen mit verschiedenen Wurzeltypen werden diskutiert. Inhaltsverzeichnis Zusammenfassung 275 I. Einleitung 276 II. Mykorrhiza-Pilze 276 III. Der Beginn der Mykorrhizen 279 IV. Mykorrhiza-Assoziationen lebender und ausgestorbener Pflanzen 282 V. Evolution der Wurzeln 288 VI. Die Wurzel als Lebensraum für Pilze 290 VII. Mykorrhiza-Evolutionstrends 295 Danksagungen 298 Referenzen 298.

@article{doi101046j14698137200200397x,
    author = "Brundrett, Mark",
    title = "Coevolution of roots and mycorrhizas of land plants",
    year = "2002",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Hier wird die Koevolution von Mykorrhiza-Pilzen und Wurzeln im Lichte der jetzt verfügbaren Beweise bewertet, aus paläobotanischen und morphologischen Studien sowie der Analyse von DNA-basierter Phylogenie. Die ersten moosartigen Landpflanzen im frühen Devon (vor 400 Millionen Jahren) hatten endophytische Assoziationen, die Vesikel-Arbuskel-Mykorrhizen (VAM) ähnelten, noch bevor Wurzeln entstanden. Die Mykorrhiza-Evolution wäre von endophytischen Hyphen zu ausgewogenen Assoziationen fortgeschritten, bei denen die Partner aufgrund des Austauschs begrenzter Energie- und Nährstoffressourcen voneinander abhängig waren. Die meisten Mykorrhizen sind mutualistisch, aber in einigen Fällen führt der Trend zur zunehmenden Kontrolle der Pflanzen über Pilze zu den ausbeuterischen Mykorrhizen von achlorophyllen, mykoheterotrophen Pflanzen. Ektomykorrhizen, ericoid und Orchideen-Mykorrhizen sowie nichtmykorrhizale Wurzeln entwickelten sich während der Periode der schnellen Angiospermien-Strahlung im Kreidezeit. Es wird angenommen, dass Wurzeln allmählich von Rhizomen abstammen, um geeignetere Lebensräume für Mykorrhiza-Pilze zu bieten und Pflanzen mit komplexen Verzweigungen und Blättern mit Wasser und Nährstoffen zu versorgen. Selektionsdrücke haben die morphologische Divergenz von Wurzeln mit verschiedenen Arten von Mykorrhizen verursacht. Die Dicke der Wurzelrinde und die Exodermis-Suberisation sind bei obligat mykorrhizalen Pflanzen am größten, während nichtmykorrhizale Pflanzen tendenziell feine Wurzeln haben, mit mehr Wurzelhaaren und relativ fortgeschrittenen chemischen Abwehrmechanismen. Hauptkoevolutionstrends und der relative Erfolg von Pflanzen mit verschiedenen Wurzeltypen werden diskutiert. Inhaltsverzeichnis Zusammenfassung 275 I. Einleitung 276 II. Mykorrhiza-Pilze 276 III. Der Beginn der Mykorrhizen 279 IV. Mykorrhiza-Assoziationen lebender und ausgestorbener Pflanzen 282 V. Evolution der Wurzeln 288 VI. Die Wurzel als Lebensraum für Pilze 290 VII. Mykorrhiza-Evolutionstrends 295 Danksagungen 298 Referenzen 298.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
    doi = "10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
    openalex = "W2142191074",
    references = "doi101017s1464793101005735, doi10103837918, doi101146annurevearth261379"
}

Samenruhe spielt eine wichtige Rolle in der Keimungsökologie und der Evolution der Samenpflanzen. Morphologische Samenruhe wird durch einen unreifen Embryo verursacht, der vor der Keimung ausreifen muss. Es wurde vorgeschlagen, dass das Vorhandensein eines unreifen Embryos unter den Samenpflanzen plesiomorph ist und dass parallele gerichtete Veränderungen der Embryonalmorphologie getrennt in Gymnospermen und Angiospermen aufgetreten sind. Wir testen diese Hypothesen unter Verwendung ursprünglicher Daten zur Embryonalmorphologie wichtiger basaler Taxa, eines veröffentlichten Datensatzes und der Methode der Rekonstruktion von Vorfahrenzuständen mittels generalisierter kleinster Quadrate (GLS). Rekonstruktionen des Verhältnisses von Embryo zu Samen (E:S) unter Verwendung von Familienmitteln für 179 Familien zeigten, dass sich das E:S zwischen dem ursprünglichen Angiospermen und fast allen extanten Angiospermen-Taxa erhöht hat. Arten im rosid-Clade haben besonders große Embryonen im Vergleich zum Angiospermen-Vorfahren. Die Ergebnisse für die Gymnospermen zeigen eine ähnliche, aber kleinere Zunahme. Es gab keine statistisch signifikanten Unterschiede im E:S zwischen basal Taxa und jeder abgeleiteten Gruppe aufgrund extrem großer Standardfehler, die durch GLS-Modelle erzeugt wurden. Allerdings sind die Unterschiede zwischen den rekonstruierten Werten für den Angiospermen-Vorfahren und höher verschachtelten Knoten groß, und diese Ergebnisse sind robust gegenüber topologischen und Astlängen-Manipulationen. Unsere Analyse unterstützt die Idee, dass der unreife Embryo unter den Samenpflanzen primitiv ist und dass es eine gerichtete Veränderung des E:S sowohl innerhalb der Angiospermen als auch der Gymnospermen gegeben hat. Unsere Analyse deutet darauf hin, dass durch einen unreifen Embryo erzwungene Ruhe unter den Angiospermen plesiomorph ist und dass Nichtruhe und andere Ruhetypen wahrscheinlich innerhalb der Angiospermen evolviert sind. Der Verschiebung im E:S war wahrscheinlich eine heterochronische Veränderung und hat wichtige Implikationen für die Lebensgeschichte der Samenpflanzen.

@article{doi101111j001438202002tb00137x,
    author = "Forbis, Tara A. und Floyd, Sandra K. und de Queiroz, Alan",
    title = "DIE EVOLUTION DER EMBRYONALGRÖSSE IN BEDERFRUCHTPLANZEN UND ANDEREN SAMENPFLANZEN: IMPLIKATIONEN FÜR DIE EVOLUTION DER SAMENRUHE",
    year = "2002",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Samenruhe spielt eine wichtige Rolle in der Keimungsökologie und der Evolution der Samenpflanzen. Morphologische Samenruhe wird durch einen unreifen Embryo verursacht, der vor der Keimung ausreifen muss. Es wurde vorgeschlagen, dass das Vorhandensein eines unreifen Embryos unter den Samenpflanzen plesiomorph ist und dass parallele gerichtete Veränderungen der Embryonalmorphologie getrennt in Gymnospermen und Angiospermen aufgetreten sind. Wir testen diese Hypothesen unter Verwendung ursprünglicher Daten zur Embryonalmorphologie wichtiger basal Taxa, eines veröffentlichten Datensatzes und der Methode der Rekonstruktion von Vorfahrenzuständen mittels generalisierter kleinster Quadrate (GLS). Rekonstruktionen des Verhältnisses von Embryo zu Samen (E:S) unter Verwendung von Familienmitteln für 179 Familien zeigten, dass sich das E:S zwischen dem ursprünglichen Angiospermen und fast allen extanten Angiospermen-Taxa erhöht hat. Arten im rosid-Clade haben besonders große Embryonen im Vergleich zum Angiospermen-Vorfahren. Die Ergebnisse für die Gymnospermen zeigen eine ähnliche, aber kleinere Zunahme. Es gab keine statistisch signifikanten Unterschiede im E:S zwischen basal Taxa und jeder abgeleiteten Gruppe aufgrund extrem großer Standardfehler, die durch GLS-Modelle erzeugt wurden. Allerdings sind die Unterschiede zwischen den rekonstruierten Werten für den Angiospermen-Vorfahren und höher verschachtelten Knoten groß, und diese Ergebnisse sind robust gegenüber topologischen und Astlängen-Manipulationen. Unsere Analyse unterstützt die Idee, dass der unreife Embryo unter den Samenpflanzen primitiv ist und dass es eine gerichtete Veränderung des E:S sowohl innerhalb der Angiospermen als auch der Gymnospermen gegeben hat. Unsere Analyse deutet darauf hin, dass durch einen unreifen Embryo erzwungene Ruhe unter den Angiospermen plesiomorph ist und dass Nichtruhe und andere Ruhetypen wahrscheinlich innerhalb der Angiospermen evolviert sind. Der Verschiebung im E:S war wahrscheinlich eine heterochronische Veränderung und hat wichtige Implikationen für die Lebensgeschichte der Samenpflanzen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
    openalex = "W2179841627",
    references = "doi101007bf02101694, doi10103844766, doi101093oso97801985464120010001, doi1023072529087, doi105860choice185809, doi105860choice295104, doi105860choice362164, openalexw1546962148, openalexw2506868775, openalexw3217097258"
}

@article{doi101046j109583392003t01100158x,
    author = "GROUP*, THE ANGIOSPERM PHYLOGENY",
    title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG II",
    year = "2003",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    doi = "10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    openalex = "W2980373194",
    references = "doi1023072399846"
}

Der latitudinale Gradient der Artenvielfalt ist ein weit verbreitetes Merkmal der lebenden Welt, doch seine zugrunde liegenden Ursachen bleiben unklar. Wir bewerteten die Hypothese, dass Umweltenergie evolutionäre Raten und damit die Diversifizierung bei Blütenpflanzen antreibt. Wir schätzten Energieniveaus über die Verteilungen von Angiospermen-Familien in Bezug auf Verdunstungstranspiration, Temperatur und UV-Strahlung, die aus Satelliten- und Klimadatenbanken entnommen wurden. Unter Verwendung des umfassendsten bis dato auf DNA basierenden phylogenetischen Baums für Angiospermen zeigt die Analyse von 86 Vergleichen von Schwesterfamilien, dass molekulare evolutionäre Raten in Hochenergie-Regionen tatsächlich schneller waren, dass dies jedoch kein Zwischenschritt zwischen Energie und Vielfalt ist. Energie hat starke, aber unabhängige Effekte sowohl auf die Artenvielfalt als auch auf molekulare evolutionäre Raten.

@article{doi101098rspb20042849,
    author = "Davies, T. Jonathan und Savolainen, Vincent und Chase, Mark W. und Moat, Justin und Barraclough, Timothy G.",
    title = "Umweltenergie und evolutionäre Raten bei Blütenpflanzen",
    year = "2004",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Der latitudinale Gradient der Artenvielfalt ist ein weit verbreitetes Merkmal der lebenden Welt, doch seine zugrunde liegenden Ursachen bleiben unklar. Wir bewerteten die Hypothese, dass Umweltenergie evolutionäre Raten und damit die Diversifizierung bei Blütenpflanzen antreibt. Wir schätzten Energieniveaus über die Verteilungen von Angiospermen-Familien in Bezug auf Verdunstungstranspiration, Temperatur und UV-Strahlung, die aus Satelliten- und Klimadatenbanken entnommen wurden. Unter Verwendung des umfassendsten bis dato auf DNA basierenden phylogenetischen Baums für Angiospermen zeigt die Analyse von 86 Vergleichen von Schwesterfamilien, dass molekulare evolutionäre Raten in Hochenergie-Regionen tatsächlich schneller waren, dass dies jedoch kein Zwischenschritt zwischen Energie und Vielfalt ist. Energie hat starke, aber unabhängige Effekte sowohl auf die Artenvielfalt als auch auf molekulare evolutionäre Raten.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2004.2849",
    doi = "10.1098/rspb.2004.2849",
    openalex = "W2145421207",
    references = "doi101098rspb19960088"
}

@misc{crossref2005angiosperms,
    title = "Angiospermen",
    year = "2005",
    booktitle = "Van Nostrand's Scientific Encyclopedia",
    url = "https://doi.org/10.1002/0471743984.vse0445",
    doi = "10.1002/0471743984.vse0445"
}

@article{doi101016jpalaeo200507006,
    author = "Friis, Else Marie und Pedersen, Kaj Raunsgaard und Crane, Peter R.",
    title = "Kreidezeitliche Angiospermenblüten: Innovation und Evolution in der Pflanzenvermehrung",
    year = "2005",
    journal = "Paläogeographie Paläoklimatologie Paläoökologie",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    doi = "10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    openalex = "W2001715812",
    references = "doi101007bf02860067, doi101007bf02860540, doi101007bf02861082, doi101016s0012821x0000159x, doi101038363342a0, doi10103846536, doi101038nature01420, doi1010719780643090149, doi1023071485834, doi1023072399030, doi1023072418725, doi1023072807789, doi105860choice323883, doi105860choice323884"
}

@incollection{kenrick2005angiosperms,
    author = "Kenrick, P.",
    title = "Angiospermen",
    year = "2005",
    booktitle = "Encyclopedia of Geology",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
    doi = "10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
    pages = "501-510"
}

Obwohl große Fortschritte bei der Klärung tiefer liegender Beziehungen unter den Angiospermen erzielt wurden, haben sich einige frühe Knoten im Ast der Angiospermen im Baum des Lebens als schwierig zu lösen erwiesen. Vielleicht ist die letzte große offene Frage in der Phylogenie der basalsten Angiospermen die Verzweigungsreihenfolge zwischen den fünf Hauptkladen der Mesangiospermen (Ceratophyllum, Chloranthaceae, Eudikotyledonen, Magnoliiden und Monokotyledonen). Vorherige Analysen haben keine konsistente Unterstützung für Beziehungen zwischen diesen Kladen gefunden. Um diese Beziehungen zu klären, führten wir phylogenetische Analysen von 61 Plastidgenomen (ungefähr 42.000 bp) für 45 Taxa durch, einschließlich Mitgliedern aller wichtigen basalsten Angiospermen-Linien. Wir berichten auch über die vollständige Plastidom-Genomsequenz von Ceratophyllum demersum. Die Parsimonie-Analysen der kombinierten und partitionierten Datensätze variierten in der Platzierung mehrerer Taxa, insbesondere Ceratophyllum, wohingegen Maximum-Likelihood (ML)-Bäume topologisch stabiler waren. Total-Evidence-ML-Analysen ergaben eine Klade aus Chloranthaceae + Magnoliiden als Schwestergruppe einer gut unterstützten Klade aus Monokotyledonen + (Ceratophyllum + Eudikotyledonen). Die ML-Bootstrap- und Bayesian-Support-Werte für diese Beziehungen waren im Allgemeinen hoch, obwohl annähernd unvoreingenommene Topologietests mehrere alternative Topologien nicht ablehnen konnten. Die extrem kurzen Äste, die diese fünf Linien trennen, implizieren eine schnelle Diversifizierung, die zwischen 143,8 +/- 4,8 und 140,3 +/- 4,8 Mya geschätzt erfolgt zu sein.

@article{doi101073pnas0708072104,
    author = "Moore, Michael J. und Bell, Charles D. und Soltis, Pamela S. und Soltis, Pamela S.",
    title = "Using plastid genome-scale data to resolve enigmatic relationships among basal angiosperms",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Obwohl große Fortschritte bei der Klärung tiefer liegender Beziehungen unter den Angiospermen erzielt wurden, haben sich einige frühe Knoten im Ast der Angiospermen im Baum des Lebens als schwierig zu lösen erwiesen. Vielleicht ist die letzte große offene Frage in der Phylogenie der basalsten Angiospermen die Verzweigungsreihenfolge zwischen den fünf Hauptkladen der Mesangiospermen (Ceratophyllum, Chloranthaceae, Eudikotyledonen, Magnoliiden und Monokotyledonen). Vorherige Analysen haben keine konsistente Unterstützung für Beziehungen zwischen diesen Kladen gefunden. Um diese Beziehungen zu klären, führten wir phylogenetische Analysen von 61 Plastidgenomen (ungefähr 42.000 bp) für 45 Taxa durch, einschließlich Mitgliedern aller wichtigen basalsten Angiospermen-Linien. Wir berichten auch über die vollständige Plastidom-Genomsequenz von Ceratophyllum demersum. Die Parsimonie-Analysen der kombinierten und partitionierten Datensätze variierten in der Platzierung mehrerer Taxa, insbesondere Ceratophyllum, wohingegen Maximum-Likelihood (ML)-Bäume topologisch stabiler waren. Total-Evidence-ML-Analysen ergaben eine Klade aus Chloranthaceae + Magnoliiden als Schwestergruppe einer gut unterstützten Klade aus Monokotyledonen + (Ceratophyllum + Eudikotyledonen). Die ML-Bootstrap- und Bayesian-Support-Werte für diese Beziehungen waren im Allgemeinen hoch, obwohl annähernd unvoreingenommene Topologietests mehrere alternative Topologien nicht ablehnen konnten. Die extrem kurzen Äste, die diese fünf Linien trennen, implizieren eine schnelle Diversifizierung, die zwischen 143,8 +/- 4,8 und 140,3 +/- 4,8 Mya geschätzt erfolgt zu sein.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0708072104",
    doi = "10.1073/pnas.0708072104",
    openalex = "W2114217421",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi1023072399030, openalexw2163836228"
}

Angiospermen sind die größte und erfolgreichste Gruppe von Landpflanzen mit über 250.000 Arten, die in fast jedem terrestrischen Lebensraum verbreitet sind. Viele phylogenetische Studien basieren auf DNA-Sequenzen von einem bis mehreren Genen, doch trotz jahrzehntelanger intensiver Bemühungen bleiben die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen frühen divergierenden Linien und einigen der Hauptgruppen entweder unvollständig geklärt oder schwach unterstützt. Wir haben phylogenetische Analysen von 81 Plastidgenen in 64 sequenzierten Genomen durchgeführt, einschließlich 13 neuer Genome, um die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den Hauptgruppen der Angiospermen zu schätzen, und die resultierenden Bäume werden verwendet, um die Evolution des Gen- und Introninhalts zu untersuchen. Phylogenetische Bäume aus mehreren Methoden, einschließlich modellbasierter Ansätze, liefern starke Unterstützung für die Position von Amborella als der frühest divergierenden Linie der Blütenpflanzen, gefolgt von Nymphaeales und Austrobaileyales. Die Plastidgenombäume liefern ebenfalls starke Unterstützung für eine Schwesterbeziehung zwischen Eudikotyledonen und Monokotyledonen, und diese Gruppe ist Schwestergruppe einer Gruppe, die Chloranthales und Magnoliiden einschließt. Die Klärung der Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den Hauptgruppen der Angiospermen bietet das notwendige Rahmenwerk, um zahlreiche evolutionäre Fragen bezüglich der schnellen Diversifizierung der Angiospermen zu adressieren. Gen- und Introninhalt sind bei den frühen divergierenden Angiospermen und basalsten Eudikotyledonen hochkonserviert, aber 62 unabhängige Gen- und Intronverluste sind auf die abgeleiteteren Monokotyledonen- und Eudikotyledonen-Gruppen beschränkt. Darüber hinaus wurde eine linien-spezifische Korrelation zwischen den Raten von Nukleotidsubstitutionen, Insertionen/Deletionen und genomischen Umlagerungen festgestellt.

@article{doi101073pnas0709121104,
    author = "Jansen, Robert K. und Cai, Zhengqiu und Raubeson, Linda A. und Daniell, Henry und dePamphilis, Claude W. und Leebens-Mack, James und Müller, Kai und Guisinger-Bellian, Mary und Haberle, Rosemarie C. und Hansen, Anne und Chumley, Timothy W. und Lee, Seung Bum und Peery, Rhiannon M. und McNeal, Joel R. und Kuehl, Jennifer V. und Boore, Jeffrey L.",
    title = "Analyse von 81 Genen aus 64 Plastidgenomen klärt Verwandtschaftsverhältnisse in den Angiospermen und identifiziert evolutionäre Muster im Genom-Skala",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Angiospermen sind die größte und erfolgreichste Gruppe von Landpflanzen mit über 250.000 Arten, die in fast jedem terrestrischen Lebensraum verbreitet sind. Viele phylogenetische Studien basieren auf DNA-Sequenzen von einem bis mehreren Genen, doch trotz jahrzehntelanger intensiver Bemühungen bleiben die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen frühen divergierenden Linien und einigen der Hauptgruppen entweder unvollständig geklärt oder schwach unterstützt. Wir haben phylogenetische Analysen von 81 Plastidgenen in 64 sequenzierten Genomen durchgeführt, einschließlich 13 neuer Genome, um die Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den Hauptgruppen der Angiospermen zu schätzen, und die resultierenden Bäume werden verwendet, um die Evolution des Gen- und Introninhalts zu untersuchen. Phylogenetische Bäume aus mehreren Methoden, einschließlich modellbasierter Ansätze, liefern starke Unterstützung für die Position von Amborella als der frühest divergierenden Linie der Blütenpflanzen, gefolgt von Nymphaeales und Austrobaileyales. Die Plastidgenombäume liefern ebenfalls starke Unterstützung für eine Schwesterbeziehung zwischen Eudikotyledonen und Monokotyledonen, und diese Gruppe ist Schwestergruppe einer Gruppe, die Chloranthales und Magnoliiden einschließt. Die Klärung der Verwandtschaftsverhältnisse zwischen den Hauptgruppen der Angiospermen bietet das notwendige Rahmenwerk, um zahlreiche evolutionäre Fragen bezüglich der schnellen Diversifizierung der Angiospermen zu adressieren. Gen- und Introninhalt sind bei den frühen divergierenden Angiospermen und basalsten Eudikotyledonen hochkonserviert, aber 62 unabhängige Gen- und Intronverluste sind auf die abgeleiteteren Monokotyledonen- und Eudikotyledonen-Gruppen beschränkt. Darüber hinaus wurde eine linien-spezifische Korrelation zwischen den Raten von Nukleotidsubstitutionen, Insertionen/Deletionen und genomischen Umlagerungen festgestellt.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0709121104",
    doi = "10.1073/pnas.0709121104",
    openalex = "W2127735379",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi10108010635150290069913, doi101093bioinformatics17121246, doi101111boj12385"
}

Phylogenetische Studien zeigen, dass große ökologische Nischen im Laufe der evolutionären Geschichte stärker konserviert sind als erwartet, was impliziert, dass Anpassungen an große Klimaveränderungen nicht in allen Linien leicht erreicht wurden. Der phylogenetische Nischenkonservatismus hat wichtige Konsequenzen für die Zusammensetzung sowohl lokaler Gemeinschaften als auch der regionalen Artensammlungen, aus denen diese stammen. Wenn Korridore für die Bewegung verfügbar sind, werden neu entstehende Umgebungen tendenziell von Arten besiedelt, die aus Gebieten filtern, in denen die relevanten Anpassungen bereits entwickelt wurden, anstatt durch die in situ-Entwicklung dieser Anpassungen besiedelt zu werden. Beispiele hierfür sind interkontinentale Disjunktionen tropischer Pflanzen, die Ausbreitung von Pflanzenlinien um die nördliche Hemisphäre nach der Entwicklung von Kältetoleranz und die Radiation nördlicher alpiner Pflanzen in die Anden. Diese Beobachtungen unterstreichen die Rolle phylogenetischen Wissens und der historischen Biogeographie bei der Erklärung globaler Biodiversitätsmuster. Sie haben auch Implikationen für die Zukunft der Biodiversität.

@article{doi101073pnas0801962105,
    author = "Donoghue, Michael J.",
    title = "A phylogenetic perspective on the distribution of plant diversity",
    year = "2008",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Phylogenetic studies are revealing that major ecological niches are more conserved through evolutionary history than expected, implying that adaptations to major climate changes have not readily been accomplished in all lineages. Phylogenetic niche conservatism has important consequences for the assembly of both local communities and the regional species pools from which these are drawn. If corridors for movement are available, newly emerging environments will tend to be filled by species that filter in from areas in which the relevant adaptations have already evolved, as opposed to being filled by in situ evolution of these adaptations. Examples include intercontinental disjunctions of tropical plants, the spread of plant lineages around the Northern Hemisphere after the evolution of cold tolerance, and the radiation of northern alpine plants into the Andes. These observations highlight the role of phylogenetic knowledge and historical biogeography in explanations of global biodiversity patterns. They also have implications for the future of biodiversity.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0801962105",
    doi = "10.1073/pnas.0801962105",
    openalex = "W2064987933",
    references = "doi101007bf02806171, doi101126science1130880, doi1023072395199, doi1023073224530"
}

@incollection{leng2008angiosperms,
    author = "Leng, Qin und Wu, Shun-qing und Friis, Else Marie",
    title = "ANGIOSPERMS",
    year = "2008",
    booktitle = "The Jehol Fossils",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
    doi = "10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
    pages = "178-179-185"
}

Neuere phylogenetische Studien haben die entscheidende Rolle der Hebung der Anden bei der außerordentlichen Diversifizierung der neotropischen Flora aufgedeckt. Diese Studien haben jedoch typischerweise die Hebung der Anden als ein einzelnes, zeitlich begrenztes Ereignis betrachtet, das die Evolution von Hochlandelementen förderte. Dies steht im Gegensatz zu geologischen Rekonstruktionen, die zeigen, dass die Hebung in diskreten Perioden von West nach Ost stattfand und verschiedene Regionen zu unterschiedlichen Zeiten betraf. Wir stellen einen Ansatz vor, um die andine Tektonik mit biogeografischen Rekonstruktionen neotropischer Pflanzen zu integrieren, wobei die Kaffeefamilie (Rubiaceae) als Modellgruppe dient. Die Verbreitung dieser Familie umfasst Hochland- und Berglandschaften sowie tropische Tiefländer Mittel- und Südamerikas und bietet somit eine einzigartige Gelegenheit, den Einfluss der andinen Hebung auf die gesamte neotropische Flora zu untersuchen. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Rubiaceae in den Paläotropen entstanden und die boreotropische Verbindung nutzten, um nach Südamerika zu gelangen. Die gefundenen biogeografischen Muster bestätigen die Existenz einer lang anhaltenden Dispersionsbarriere zwischen den nördlichen und zentralen Anden, dem „Westlichen Andenportal". Die Hebung der Ostkordillere beendete diese Barriere und ermöglichte die Ausbreitung boreotropischer Linien nach Süden, führte jedoch zu einem riesigen Feuchtgebietssystem („Lake Pebas") im westlichen Amazonasgebiet, das die in situ Artbildung und die floristische Ausbreitung zwischen den Anden und dem Amazonasgebiet für mindestens 6 Millionen Jahre verhinderte. Hier liefern wir Beweise für diese Ereignisse in Pflanzen.

@article{doi101073pnas0811421106,
    author = "Antonelli, Alexandre und Nylander, Johan A. A. und Persson, Claes und Sanmartín, Isabel",
    title = "Tracing the impact of the Andean uplift on Neotropical plant evolution",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Neuere phylogenetische Studien haben die entscheidende Rolle der Hebung der Anden bei der außerordentlichen Diversifizierung der neotropischen Flora aufgedeckt. Diese Studien haben jedoch typischerweise die Hebung der Anden als ein einzelnes, zeitlich begrenztes Ereignis betrachtet, das die Evolution von Hochlandelementen förderte. Dies steht im Gegensatz zu geologischen Rekonstruktionen, die zeigen, dass die Hebung in diskreten Perioden von West nach Ost stattfand und verschiedene Regionen zu unterschiedlichen Zeiten betraf. Wir stellen einen Ansatz vor, um die andine Tektonik mit biogeografischen Rekonstruktionen neotropischer Pflanzen zu integrieren, wobei die Kaffeefamilie (Rubiaceae) als Modellgruppe dient. Die Verbreitung dieser Familie umfasst Hochland- und Berglandschaften sowie tropische Tiefländer Mittel- und Südamerikas und bietet somit eine einzigartige Gelegenheit, den Einfluss der andinen Hebung auf die gesamte neotropische Flora zu untersuchen. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Rubiaceae in den Paläotropen entstanden und die boreotropische Verbindung nutzten, um nach Südamerika zu gelangen. Die gefundenen biogeografischen Muster bestätigen die Existenz einer lang anhaltenden Dispersionsbarriere zwischen den nördlichen und zentralen Anden, dem „Westlichen Andenportal". Die Hebung der Ostkordillere beendete diese Barriere und ermöglichte die Ausbreitung boreotropischer Linien nach Süden, führte jedoch zu einem riesigen Feuchtgebietssystem („Lake Pebas") im westlichen Amazonasgebiet, das die in situ Artbildung und die floristische Ausbreitung zwischen den Anden und dem Amazonasgebiet für mindestens 6 Millionen Jahre verhinderte. Hier liefern wir Beweise für diese Ereignisse in Pflanzen.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0811421106",
    doi = "10.1073/pnas.0811421106",
    openalex = "W2026781465",
    references = "doi101007978146133485919, doi101111j109583122001tb01368x, doi1011300016760620001121091uhotca23co2, doi1023073515620, doi105962bhlpart13183, openalexw3001739384"
}

Die Rosiden-Clade (70.000 Arten) enthält mehr als ein Viertel aller Angiosperm-Arten und umfasst die meisten Linien von existierenden Laub- und tropischen Waldbäumen. Trotz Fortschritten bei der Aufklärung der Beziehungen innerhalb der Angiospermen bleiben die Rosiden der größte schlecht aufgelöste Hauptclade; die tiefen Beziehungen innerhalb der Rosiden sind besonders rätselhaft. Basierend auf Parsimonie- und Maximum-Likelihood (ML)-Analysen von separaten und kombinierten 12-Gen-Datensätzen (10 plastidiale Gene, 2 nukleäre; >18.000 bp) und plastidialen invertierten Wiederholungen (IR; 24 Gene und dazwischenliegende Spacers; >25.000 bp) für >100 Rosiden-Arten stellen wir ein deutlich verbessertes Verständnis der Rosiden-Phylogenie bereit. Vitaceae sind Schwestergruppe aller anderen Rosiden, die ihrerseits zwei große Clades bilden, jeder mit einem ML-Bootstrap-Wert von 100%: (i) Eurosiden I (Fabidae) umfassen die stickstofffixierenden Clade, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales und Oxalidales; und (ii) Eurosiden II (Malvidae) umfassen Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales und Picramniaceae. Der Rosiden-Clade diversifizierte sich schnell in diese Hauptlinien, möglicherweise über einen Zeitraum von <15 Millionen Jahren und vielleicht sogar in nur 4 bis 5 Millionen Jahren. Der Zeitpunkt der inferred schnellen Strahlung der Rosiden [108 bis 91 Millionen Jahre vor heute (Mya) und 107-83 Mya für Fabidae und Malvidae, jeweils] entspricht dem schnellen Aufstieg von Angiosperm-dominierten Wäldern und der gleichzeitigen Diversifizierung anderer Clades, die diese Wälder bewohnen, einschließlich Amphibien, Ameisen, Plazentatieren und Farne.

@article{doi101073pnas0813376106,
    author = "Wang, Hengchang und Moore, Michael J. und Soltis, Pamela S. und Bell, Charles D. und Brockington, Samuel F. und Alexandre, Roolse und Davis, Charles C. und Latvis, Maribeth und Manchester, Steven R. und Soltis, Pamela S.",
    title = "Rosid radiation and the rapid rise of angiosperm-dominated forests",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Die Rosiden-Clade (70.000 Arten) enthält mehr als ein Viertel aller Angiosperm-Arten und umfasst die meisten Linien von existierenden Laub- und tropischen Waldbäumen. Trotz Fortschritten bei der Aufklärung der Beziehungen innerhalb der Angiospermen bleiben die Rosiden der größte schlecht aufgelöste Hauptclade; die tiefen Beziehungen innerhalb der Rosiden sind besonders rätselhaft. Basierend auf Parsimonie- und Maximum-Likelihood (ML)-Analysen von separaten und kombinierten 12-Gen-Datensätzen (10 plastidiale Gene, 2 nukleäre; >18.000 bp) und plastidialen invertierten Wiederholungen (IR; 24 Gene und dazwischenliegende Spacers; >25.000 bp) für >100 Rosiden-Arten stellen wir ein deutlich verbessertes Verständnis der Rosiden-Phylogenie bereit. Vitaceae sind Schwestergruppe aller anderen Rosiden, die ihrerseits zwei große Clades bilden, jeder mit einem ML-Bootstrap-Wert von 100\%: (i) Eurosiden I (Fabidae) umfassen die stickstofffixierenden Clade, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales und Oxalidales; und (ii) Eurosiden II (Malvidae) umfassen Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales und Picramniaceae. Der Rosiden-Clade diversifizierte sich schnell in diese Hauptlinien, möglicherweise über einen Zeitraum von <15 Millionen Jahren und vielleicht sogar in nur 4 bis 5 Millionen Jahren. Der Zeitpunkt der inferred schnellen Strahlung der Rosiden [108 bis 91 Millionen Jahre vor heute (Mya) und 107-83 Mya für Fabidae und Malvidae, jeweils] entspricht dem schnellen Aufstieg von Angiosperm-dominierten Wäldern und der gleichzeitigen Diversifizierung anderer Clades, die diese Wälder bewohnen, einschließlich Amphibien, Ameisen, Plazentatieren und Farne.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0813376106",
    doi = "10.1073/pnas.0813376106",
    openalex = "W2158722151",
    references = "doi101146annurevento53103106093304"
}

Die relative Bedeutung lokaler ökologischer und großräumiger historischer Prozesse bei der Entstehung von Unterschieden in der Artenvielfalt weltweit bleibt heftig umstritten. Um Einblicke in diese Fragen zu gewinnen, untersuchten wir die Entstehung der Pflanzenvielfalt im Cerrado in Südamerika, der artenreichsten tropischen Savanne der Welt. Zeitkalibrierte Phylogenien deuten darauf hin, dass Cerrado-Linien vor weniger als 10 Millionen Jahren begannen sich zu diversifizieren, wobei die meisten Linien vor 4 Millionen Jahren oder weniger diversifiziert wurden, was mit dem Aufstieg der brennbaren C4-Gräser zur Dominanz und der Ausdehnung des Savannenbioms weltweit zusammenfällt. Diese Pflanzenphylogenien zeigen, dass Cerrado-Linien stark mit Anpassungen an Feuer verbunden sind und Schwestergruppen in weitgehend feuerfreien benachbarten Feuchtwald, saisonal trockenem Wald, subtropischen Grasland oder Feuchtlandvegetation haben. Diese Ergebnisse implizieren, dass das Cerrado in situ durch jüngere und häufigere adaptive Verschiebungen zur Feuerresistenz entstand, anstatt durch die Ausbreitung von Linien, die bereits an Feuer angepasst waren. Die Lage des Cerrado, umgeben von einer vielfältigen Auswahl artenreicher Biome, und die scheinbar bescheidene adaptive Barriere, die Feuer darstellt, haben wahrscheinlich zu seiner auffälligen Artenvielfalt beigetragen. Diese Ergebnisse fügen sich zu wachsenden Beweisen hinzu, dass die Ursprünge und die historische Zusammenstellung artenreicher Biome idiosynkratisch waren und in großem Maße durch einzigartige Merkmale der regionalen und kontinentalen Geohistorie getrieben wurden und dass unterschiedliche historische Prozesse zu ähnlichen Niveaus der modernen Artenvielfalt führen können.

@article{doi101073pnas0903410106,
    author = "Simon, Marcelo Fragomeni und Grether, Rosaura und de Queiroz, Luciano Paganucci und Skema, Cynthia und Pennington, R. Toby und Hughes, Colin E.",
    title = "Recent assembly of the Cerrado, a neotropical plant diversity hotspot, by in situ evolution of adaptations to fire",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Die relative Bedeutung lokaler ökologischer und großräumiger historischer Prozesse bei der Entstehung von Unterschieden in der Artenvielfalt weltweit bleibt heftig umstritten. Um Einblicke in diese Fragen zu gewinnen, untersuchten wir die Entstehung der Pflanzenvielfalt im Cerrado in Südamerika, der artenreichsten tropischen Savanne der Welt. Zeitkalibrierte Phylogenien deuten darauf hin, dass Cerrado-Linien vor weniger als 10 Millionen Jahren begannen sich zu diversifizieren, wobei die meisten Linien vor 4 Millionen Jahren oder weniger diversifiziert wurden, was mit dem Aufstieg der brennbaren C4-Gräser zur Dominanz und der Ausdehnung des Savannenbioms weltweit zusammenfällt. Diese Pflanzenphylogenien zeigen, dass Cerrado-Linien stark mit Anpassungen an Feuer verbunden sind und Schwestergruppen in weitgehend feuerfreien benachbarten Feuchtwald, saisonal trockenem Wald, subtropischen Grasland oder Feuchtlandvegetation haben. Diese Ergebnisse implizieren, dass das Cerrado in situ durch jüngere und häufigere adaptive Verschiebungen zur Feuerresistenz entstand, anstatt durch die Ausbreitung von Linien, die bereits an Feuer angepasst waren. Die Lage des Cerrado, umgeben von einer vielfältigen Auswahl artenreicher Biome, und die scheinbar bescheidene adaptive Barriere, die Feuer darstellt, haben wahrscheinlich zu seiner auffälligen Artenvielfalt beigetragen. Diese Ergebnisse fügen sich zu wachsenden Beweisen hinzu, dass die Ursprünge und die historische Zusammenstellung artenreicher Biome idiosynkratisch waren und in großem Maße durch einzigartige Merkmale der regionalen und kontinentalen Geohistorie getrieben wurden und dass unterschiedliche historische Prozesse zu ähnlichen Niveaus der modernen Artenvielfalt führen können.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0903410106",
    doi = "10.1073/pnas.0903410106",
    openalex = "W2151396518",
    references = "doi101073pnas0608361104, doi101146annurevecolsys110308120327, openalexw2611511275"
}

Die Adern, die die Blätter während der Photosynthese mit Wasser versorgen, sind bei Blütenpflanzen im Vergleich zu jeder anderen Gefäßpflanzenlinie deutlich häufiger. Die Aderdichten bei Angiospermen betragen im Durchschnitt 8 mm Ader pro mm(2) Blattfläche und können 25 mm mm(-2) erreichen, während solche hohen Dichten bei allen anderen Pflanzen, lebenden oder ausgestorbenen, fehlen. Blätter von Nicht-Angiospermen haben sich über 380 Millionen Jahre Evolution hinweg durchschnittlich konstant bei knapp 2 mm mm(-2) gehalten, trotz einer komplexen Geschichte, die vier oder mehr unabhängige Ursprünge von lamellären Blättern mit vielen Adern sowie dramatische Veränderungen des Klimas und der atmosphärischen Zusammensetzung umfasst. Wir zeigen ferner, dass die hohen Aderdichten, die einzigartig für Angiospermen sind, beispiellose Transpirationsraten ermöglichen und damit frühere Arbeiten erweitern, die eine starke Korrelation zwischen Aderdichte und Assimilationsraten nachweisen. Da die Aderdichte in Fossilien direkt messbar ist, bieten diese Korrelationen neuen Zugang zur Physiologie ausgestorbener Pflanzen und zu deren Einfluss auf ihre Umwelt. Erstens waren die hohen Assimilationsraten, die derzeit nur bei Angiospermen unter lebenden Pflanzen vorkommen, wahrscheinlich während der gesamten Evolutionsgeschichte einzigartig. Zweitens könnte die für die Stärkung der Niederschläge in modernen tropischen Regenwäldern wichtige durch Transpiration angetriebene Wasserrecycling in einer Welt vor den Angiospermen deutlich geringer gewesen sein.

@article{doi101098rspb20081919,
    author = "Boyce, C. Kevin und Brodribb, Timothy J. und Feild, Taylor S. und Zwieniecki, Maciej A.",
    title = "Angiosperm leaf vein evolution was physiologically and environmentally transformative",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "The veins that irrigate leaves during photosynthesis are demonstrated to be strikingly more abundant in flowering plants than in any other vascular plant lineage. Angiosperm vein densities average 8 mm of vein per mm(2) of leaf area and can reach 25 mm mm(-2), whereas such high densities are absent from all other plants, living or extinct. Leaves of non-angiosperms have consistently averaged close to 2 mm mm(-2) throughout 380 million years of evolution despite a complex history that has involved four or more independent origins of laminate leaves with many veins and dramatic changes in climate and atmospheric composition. We further demonstrate that the high leaf vein densities unique to the angiosperms enable unparalleled transpiration rates, extending previous work indicating a strong correlation between vein density and assimilation rates. Because vein density is directly measurable in fossils, these correlations provide new access to the physiology of extinct plants and how they may have impacted their environments. First, the high assimilation rates currently confined to the angiosperms among living plants are likely to have been unique throughout evolutionary history. Second, the transpiration-driven recycling of water that is important for bolstering precipitation in modern tropical rainforests might have been significantly less in a world before the angiosperms.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2008.1919",
    doi = "10.1098/rspb.2008.1919",
    openalex = "W2119610202",
    references = "doi101016s0065250408601191, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0608361104, doi10108000241160310004657, doi101104pp107101352, doi101111boj12385, doi101126science24749481322, doi101146annurevarplant56032604144141, doi10230725065646, doi1023073515620, openalexw1584176508"
}

Es wird eine revidierte und aktualisierte Klassifikation für die Familien der Blütenpflanzen bereitgestellt. Viele kürzlich durchgeführte Studien haben zunehmend detaillierte Beweise für die Positionen von zuvor nicht zugeordneten Familien erbracht, was zur Einführung einer Reihe neuer Ordnungen führte, darunter Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales und Zygophyllales. Eine Reihe zuvor nicht zugeordneter Gattungen und Familien werden hier in Ordnungen aufgenommen, wodurch die Anzahl der nicht zugeordneten Taxa erheblich reduziert wird; dazu gehören Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae und Rafflesiaceae (beide Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae und Strasburgeriaceae (alle Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae und Gerrardinaceae (beide Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) und Boraginaceae (nun zumindest als Mitglied des lamiid Clades bekannt). Neu getrennte Familien für Gattungen, die zuvor als zu anderen von der APG anerkannten Familien gehörig verstanden wurden, umfassen Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae und Cleomaceae (beide Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae und Talinaceae (alle Caryophyllales) sowie Linderniaceae und Thomandersiaceae (beide Lamiales). Die Verwendung von in Klammern gesetzten Familien wird aufgrund ihrer Unbeliebtheit aufgegeben, und in den meisten Fällen werden die breiteren Umfassungen beibehalten; dazu gehören Amaryllidaceae, Asparagaceace und Xanthorrheaceae (alle Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) und mehrere andere kleinere Familien. Separate Artikel in diesem Band befassen sich mit einer neuen linearen Ordnung für die APG, mit Subfamilien-Namen, die für eine genauere Kommunikation in Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. und Xanthorrheaceae s.l. (alle Asparagales) verwendet werden können, und mit einer formellen supraordinalen Klassifikation für die Blütenpflanzen.

@article{doi101111j10958339200900996x,
    author = "GROUP, THE ANGIOSPERM PHYLOGENY",
    title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III",
    year = "2009",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    abstract = "A revised and updated classification for the families of flowering plants is provided. Many recent studies have yielded increasingly detailed evidence for the positions of formerly unplaced families, resulting in a number of newly adopted orders, including Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales and Zygophyllales. A number of previously unplaced genera and families are included here in orders, greatly reducing the number of unplaced taxa; these include Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae and Rafflesiaceae (both Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae and Strasburgeriaceae (all Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae and Gerrardinaceae (both Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) and Boraginaceae (now at least known to be a member of lamiid clade). Newly segregated families for genera previously understood to be in other APG-recognized families include Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae and Cleomaceae (both Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae and Talinaceae (all Caryophyllales) and Linderniaceae and Thomandersiaceae (both Lamiales). Use of bracketed families is abandoned because of its unpopularity, and in most cases the broader circumscriptions are retained; these include Amaryllidaceae, Asparagaceace and Xanthorrheaceae (all Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) and several other smaller families. Separate papers in this same volume deal with a new linear order for APG, subfamilial names that can be used for more accurate communication in Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. and Xanthorrheaceae s.l. (all Asparagales) and a formal supraordinal classification for the flowering plants.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
    openalex = "W4245471709",
    references = "doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0708072104, doi101073pnas0709121104, doi101073pnas0813376106, doi101111j175348871981tb06752x, doi1023072484473, doi1023072992015, doi103732ajb0800047, doi103732ajb891132, doi105860choice453190, openalexw2961549061"
}

Die Evolution der Angiospermen veränderte die globale Ökologie, und ein Großteil dieses Einflusses geht auf die unübertroffene vegetative Produktivität dominanter Angiospermen-Clades zurück. Dennoch bleiben die Ursprünge der hohen photosynthetischen Kapazität bei Angiospermen unbekannt. In dieser Studie beschreiben wir die steile Entwicklungskurve der Blattadendichte (D(v)) bei Angiospermen und prognostizieren, dass diese Innovation der Blattverrohrung eine wesentliche Verschiebung der Fähigkeit der Blätter ermöglichte, CO(2) zu assimilieren. Durch die Rekonstruktion der Blattadenevolution anhand einer Untersuchung von 504 Angiospermen-Arten stellten wir fest, dass während der frühen Evolution der Angiospermen ein rascher dreis- bis vierfacher Anstieg der D(v) stattfand. Wir zeigen, wie diese wesentliche Verschiebung in der Blattadenen-Architektur es potenziell ermöglichte, dass die maximale photosynthetische Kapazität bei Angiospermen vor 140–100 Millionen Jahren über konkurrierende Gruppen hinaus anstieg. Unsere Daten deuten darauf hin, dass frühe terrestrische Angiospermen Blätter mit niedrigen photosynthetischen Raten produzierten, dass jedoch der spätere Erfolg der Angiospermen mit einem Anstieg der photosynthetischen Kapazität während ihrer frühen Diversifizierung verbunden ist.

@article{doi101111j14610248200901410x,
    author = "Brodribb, Timothy J. und Feild, Taylor S.",
    title = "Leaf hydraulic evolution led a surge in leaf photosynthetic capacity during early angiosperm diversification",
    year = "2009",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Angiosperm evolution transformed global ecology, and much of this impact derives from the unrivalled vegetative productivity of dominant angiosperm clades. However, the origins of high photosynthetic capacity in angiosperms remain unknown. In this study, we describe the steep trajectory of leaf vein density (D(v)) evolution in angiosperms, and predict that this leaf plumbing innovation enabled a major shift in the capacity of leaves to assimilate CO(2). Reconstructing leaf vein evolution from an examination of 504 angiosperm species we found a rapid three- to fourfold increase in D(v) occurred during the early evolution of angiosperms. We demonstrate how this major shift in leaf vein architecture potentially allowed the maximum photosynthetic capacity in angiosperms to rise above competing groups 140-100 Ma. Our data suggest that early terrestrial angiosperms produced leaves with low photosynthetic rates, but that subsequent angiosperm success is linked to a surge in photosynthetic capacity during their early diversification.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
    openalex = "W2153946082",
    references = "doi101038282424a0, doi101046j14698137200200397x, doi101073pnas0709121104, doi101098rspb20081919, doi101111j14698137200400974x, doi101126science1155121, doi101126science2815374237, doi1023071218350, doi102475ajs294156, doi102475ajs3012182, doi103732ajb0800047, doi104159harvard9780674864856"
}

Polyploidie wurde lange als eine Hauptkraft in der Evolution der Bedecktsamer anerkannt. Kürzlich durchgeführte genomische Untersuchungen zeigen nicht nur, dass Polyploidie unter den Bedecktsamern allgegenwärtig ist, sondern deuten auch auf mehrere alte Verdopplungsereignisse des Genoms hin. Dazu gehören alte Ereignisse der gesamten Genomverdopplung (WGD) in basalsten Linien der Bedecktsamer sowie ein vorgeschlagenes paläohexaploides Ereignis, das möglicherweise nahe der Divergenz der Eudikoten stattgefunden hat. Allerdings gibt es derzeit keine Beweise für WGD in Amborella, der vermuteten Schwesterart zu anderen existierenden Bedecktsamern. Die Frage lautet nicht mehr „Welcher Anteil der Bedecktsamer ist polyploid?“, sondern „Wie viele Episoden von Polyploidie kennzeichnen eine gegebene Linie?\" Neue Algorithmen bieten die Aussicht, dass ancestrale Genome für tiefe Divergenzen rekonstruiert werden können (z. B. es könnte möglich sein, das ancestrale Genom der Eudikoten oder sogar das ancestrale Genom der Bedecktsamer zu rekonstruieren). Vergleiche der Diversifizierungsraten deuten darauf hin, dass die Genomverdopplung zu einem dramatischen Anstieg der Artenvielfalt in mehreren Linien der Bedecktsamer geführt haben könnte, darunter Poaceae, Solanaceae, Fabaceae und Brassicaceae. Allerdings sind weitere genomische Studien erforderlich, um den genauen phylogenetischen Platz der alten Polyploidie-Ereignisse innerhalb dieser Linien zu bestimmen und festzustellen, wann neu entstandene Gene, die aus der Polyploidie resultieren, adaptive Strahlungen ermöglicht haben.

@article{doi103732ajb0800079,
    author = "Soltis, Pamela S. und Albert, Victor A. und Leebens‐Mack, Jim und Bell, Charles D. und Paterson, Andrew H. und Zheng, Chunfang und Sankoff, David und de Pamphilis, Claude W. und Wall, P. Kerr und Soltis, Pamela S.",
    title = "Polyploidie und die Diversifizierung der Bedecktsamer",
    year = "2009",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = {Polyploidie wurde lange als eine Hauptkraft in der Evolution der Bedecktsamer anerkannt. Kürzlich durchgeführte genomische Untersuchungen zeigen nicht nur, dass Polyploidie unter den Bedecktsamern allgegenwärtig ist, sondern deuten auch auf mehrere alte Verdopplungsereignisse des Genoms hin. Dazu gehören alte Ereignisse der gesamten Genomverdopplung (WGD) in basalsten Linien der Bedecktsamer sowie ein vorgeschlagenes paläohexaploides Ereignis, das möglicherweise nahe der Divergenz der Eudikoten stattgefunden hat. Allerdings gibt es derzeit keine Beweise für WGD in Amborella, der vermuteten Schwesterart zu anderen existierenden Bedecktsamern. Die Frage lautet nicht mehr „Welcher Anteil der Bedecktsamer ist polyploid?\", sondern „Wie viele Episoden von Polyploidie kennzeichnen eine gegebene Linie?\" Neue Algorithmen bieten die Aussicht, dass ancestrale Genome für tiefe Divergenzen rekonstruiert werden können (z. B. es könnte möglich sein, das ancestrale Genom der Eudikoten oder sogar das ancestrale Genom der Bedecktsamer zu rekonstruieren). Vergleiche der Diversifizierungsraten deuten darauf hin, dass die Genomverdopplung zu einem dramatischen Anstieg der Artenvielfalt in mehreren Linien der Bedecktsamer geführt haben könnte, darunter Poaceae, Solanaceae, Fabaceae und Brassicaceae. Allerdings sind weitere genomische Studien erforderlich, um den genauen phylogenetischen Platz der alten Polyploidie-Ereignisse innerhalb dieser Linien zu bestimmen und festzustellen, wann neu entstandene Gene, die aus der Polyploidie resultieren, adaptive Strahlungen ermöglicht haben.},
    url = "https://doi.org/10.3732/ajb.0800079",
    doi = "10.3732/ajb.0800079",
    openalex = "W2064911343",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101111j001438202001tb00826x, doi101146annurevgenet341401, doi101196annals1438005"
}

Die Wiederverwertung von verdunstetem Wasser ist als wichtige Quelle für Niederschläge, insbesondere in den Tropen, gut bekannt, und Angiospermen haben Verdunstungskapazitäten, die höher sind als bei allen anderen Pflanzen in der gesamten evolutionären Geschichte. Daher wird vorgeschlagen, dass die Evolution und der Aufstieg der Blütenpflanzen zur ökologischen Dominanz das Klima stark verändert haben. Die Verdunstungskapazität korreliert eng mit der Blattadendichte, und die durchschnittliche Adendichte von Angiospermen-Blättern ist viermal höher als die aller anderen Pflanzen, lebend oder ausgestorben. Ein schneller Übergang zu hohen Adendichten ereignete sich unabhängig in drei oder mehr Blütenpflanzen-Stämmen vor etwa 100 Millionen Jahren. Klimamodellierungen der Auswirkungen dieser physiologischen Revolution deuten darauf hin, dass die Tropen ohne Angiospermen heißer, trockener und saisonaler gewesen wären und die Gesamtfläche der tropischen Regenwälder erheblich zurückgegangen wäre. Da die Angiospermenvielfalt von Regenwaldfläche und Niederschlagsmenge und -gleichmäßigkeit beeinflusst wird, ist die hohe Vielfalt der Angiospermen teilweise ein Produkt eines positiven Rückkopplungsschleifens mit den vom Angiospermen selbst initiierten Klimamodifikationen. Stämmevervielfältigungen unter Wirbeltieren und Wirbellosen sowie nicht-angiospermischen Pflanzen im Gefolge der Angiospermendiversifikation könnten mit dem beispiellosen Einfluss der Angiospermen auf das Klima zusammenhängen.

@article{doi1034172009143,
    author = "Boyce, C. Kevin und Lee, Jung‐Eun und Feild, Taylor S. und Brodribb, Timothy J. und Zwieniecki, Maciej A.",
    title = "Angiospermen halfen, den Regen in die Regenwälder zu bringen: Der Einfluss der evolutionären physiologischen Entwicklung von Pflanzen auf die tropische Biodiversität 1",
    year = "2010",
    journal = "Annals of the Missouri Botanical Garden",
    abstract = "Die Wiederverwertung von verdunstetem Wasser ist als wichtige Quelle für Niederschläge, insbesondere in den Tropen, gut bekannt, und Angiospermen haben Verdunstungskapazitäten, die höher sind als bei allen anderen Pflanzen in der gesamten evolutionären Geschichte. Daher wird vorgeschlagen, dass die Evolution und der Aufstieg der Blütenpflanzen zur ökologischen Dominanz das Klima stark verändert haben. Die Verdunstungskapazität korreliert eng mit der Blattadendichte, und die durchschnittliche Adendichte von Angiospermen-Blättern ist viermal höher als die aller anderen Pflanzen, lebend oder ausgestorben. Ein schneller Übergang zu hohen Adendichten ereignete sich unabhängig in drei oder mehr Blütenpflanzen-Stämmen vor etwa 100 Millionen Jahren. Klimamodellierungen der Auswirkungen dieser physiologischen Revolution deuten darauf hin, dass die Tropen ohne Angiospermen heißer, trockener und saisonaler gewesen wären und die Gesamtfläche der tropischen Regenwälder erheblich zurückgegangen wäre. Da die Angiospermenvielfalt von Regenwaldfläche und Niederschlagsmenge und -gleichmäßigkeit beeinflusst wird, ist die hohe Vielfalt der Angiospermen teilweise ein Produkt eines positiven Rückkopplungsschleifens mit den vom Angiospermen selbst initiierten Klimamodifikationen. Stämmevervielfältigungen unter Wirbeltieren und Wirbellosen sowie nicht-angiospermischen Pflanzen im Gefolge der Angiospermendiversifikation könnten mit dem beispiellosen Einfluss der Angiospermen auf das Klima zusammenhängen.",
    url = "https://doi.org/10.3417/2009143",
    doi = "10.3417/2009143",
    openalex = "W2100361465",
    references = "doi101038nature05634, doi101073pnas0608361104, doi101086282687, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science1066854, doi101126science1100217, doi101126science1164033, doi101126science1177265, doi1023073071998, doi102475ajs294156"
}

@incollection{crossref2011angiosperms,
    title = "Angiospermen",
    year = "2011",
    booktitle = "Ein Lehrbuch der Botanik",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9781139105231.012",
    doi = "10.1017/cbo9781139105231.012",
    pages = "466-586"
}

Blätter von Angiospermen zeigen eine bemerkenswerte Vielfalt an Formen, die sich von Entwicklungssequenzen innerhalb eines Sprosses und innerhalb der Kronenreaktion auf das Mikroklima bis hin zu Variationen zwischen Arten innerhalb und zwischen Gemeinschaften sowie zwischen Ordnungen oder Familien erstrecken. Es wird allgemein angenommen, dass aufgrund der kritischen Bedeutung photosynthetischer Blätter für das Pflanzenwachstum und das Überleben die Variation in ihrer Form die natürliche Selektion widerspiegelt, die auf die Funktion wirkt. Es wurden mehrere nicht sich gegenseitig ausschließende Theorien vorgeschlagen, um die Vielfalt der Blattformen zu erklären. Dazu gehören: Thermoregulation der Blätter, insbesondere in trockenen und heißen Umgebungen, hydraulische Einschränkungen, Muster der Blattausbildung bei Laubbaumarten, biomechanische Einschränkungen, Anpassungen zur Vermeidung von Herbivorie, Anpassungen zur Optimierung der Lichtabsorption und sogar die Annahme, dass die Variation der Blattform eine Reaktion auf die Selektion der Blütenform ist. Allerdings ist die relative Bedeutung oder Wahrscheinlichkeit jedes dieser Faktoren unklar. Hier überblicken wir den evolutionären Kontext der Diversifizierung der Blattform, diskutieren die proximalen Mechanismen, die die Vielfalt in bestehenden Systemen erzeugen, und betrachten die Evidenz für jede der oben genannten Hypothesen im Kontext der funktionalen Bedeutung der Blattform. Die Synthese dieser weitreichenden Bereiche hilft, Punkte der konzeptuellen Konvergenz für laufende Diskussionen und integrierte Richtungen für zukünftige Forschung zu identifizieren.

@article{doi101071fp11057,
    author = "Nicotra, Adrienne B. und Leigh, Andrea und Boyce, C. Kevin und Jones, Cynthia S. und Niklas, Karl J. und Royer, Dana L. und Tsukaya, Hirokazu",
    title = "The evolution and functional significance of leaf shape in the angiosperms",
    year = "2011",
    journal = "Functional Plant Biology",
    abstract = "Blätter von Angiospermen zeigen eine bemerkenswerte Vielfalt an Formen, die sich von Entwicklungssequenzen innerhalb eines Sprosses und innerhalb der Kronenreaktion auf das Mikroklima bis hin zu Variationen zwischen Arten innerhalb und zwischen Gemeinschaften sowie zwischen Ordnungen oder Familien erstrecken. Es wird allgemein angenommen, dass aufgrund der kritischen Bedeutung photosynthetischer Blätter für das Pflanzenwachstum und das Überleben die Variation in ihrer Form die natürliche Selektion widerspiegelt, die auf die Funktion wirkt. Es wurden mehrere nicht sich gegenseitig ausschließende Theorien vorgeschlagen, um die Vielfalt der Blattformen zu erklären. Dazu gehören: Thermoregulation der Blätter, insbesondere in trockenen und heißen Umgebungen, hydraulische Einschränkungen, Muster der Blattausbildung bei Laubbaumarten, biomechanische Einschränkungen, Anpassungen zur Vermeidung von Herbivorie, Anpassungen zur Optimierung der Lichtabsorption und sogar die Annahme, dass die Variation der Blattform eine Reaktion auf die Selektion der Blütenform ist. Allerdings ist die relative Bedeutung oder Wahrscheinlichkeit jedes dieser Faktoren unklar. Hier überblicken wir den evolutionären Kontext der Diversifizierung der Blattform, diskutieren die proximalen Mechanismen, die die Vielfalt in bestehenden Systemen erzeugen, und betrachten die Evidenz für jede der oben genannten Hypothesen im Kontext der funktionalen Bedeutung der Blattform. Die Synthese dieser weitreichenden Bereiche hilft, Punkte der konzeptuellen Konvergenz für laufende Diskussionen und integrierte Richtungen für zukünftige Forschung zu identifizieren.",
    url = "https://doi.org/10.1071/fp11057",
    doi = "10.1071/fp11057",
    openalex = "W2144704825",
    references = "doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}

Polyploidie kann ein wichtiger Faktor für den Erfolg von Arteninvasionen sein, durch eine Kombination aus (1) 'Vor-Anpassung', wobei polyploide Linien prädisponiert sind für Bedingungen im neuen Verbreitungsgebiet und daher höhere Überlebensraten und Fitness in der frühesten Etablierungsphase aufweisen; und (2) der Möglichkeit für anschließende Anpassung aufgrund einer größeren genetischen Vielfalt, die die 'Evolution der Invasivität' unterstützen kann. Alternativ kann die Polyploidisierung eine wichtige Rolle spielen durch (3) die Wiederherstellung der sexuellen Fortpflanzung nach Hybridisierung oder, umgekehrt, (4) die asexuelle Fortpflanzung bei fehlenden geeigneten Partnern. Wir ermutigen Invasionbiologen daher, Bewertungen der Ploidie in ihre Studien zu invasiven alien Arten aufzunehmen.

@article{doi101093aobmcr277,
    author = "te Beest, Mariska und Roux, Johannes J. Le und Richardson, David M. und Brysting, Anne K. und Suda, Jan und Kubešová, Magdalena und Pyšek, Petr",
    title = "Je mehr, desto besser? Die Rolle der Polyploidie bei der Förderung von Pflanzeninvasionen",
    year = "2011",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "Polyploidie kann ein wichtiger Faktor für den Erfolg von Arteninvasionen sein, durch eine Kombination aus (1) 'Vor-Anpassung', wobei polyploide Linien prädisponiert sind für Bedingungen im neuen Verbreitungsgebiet und daher höhere Überlebensraten und Fitness in der frühesten Etablierungsphase aufweisen; und (2) der Möglichkeit für anschließende Anpassung aufgrund einer größeren genetischen Vielfalt, die die 'Evolution der Invasivität' unterstützen kann. Alternativ kann die Polyploidisierung eine wichtige Rolle spielen durch (3) die Wiederherstellung der sexuellen Fortpflanzung nach Hybridisierung oder, umgekehrt, (4) die asexuelle Fortpflanzung bei fehlenden geeigneten Partnern. Wir ermutigen Invasionbiologen daher, Bewertungen der Ploidie in ihre Studien zu invasiven alien Arten aufzunehmen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcr277",
    doi = "10.1093/aob/mcr277",
    openalex = "W2061325948",
    references = "doi101016jtplants200912003, doi101038nrg1711, doi101038nrg2600, doi101073pnas0900906106, doi101111j10958339200900996x, doi101111j13669516200600302x, doi1011910309133306pp490pr"
}

Zusammenfassung Pflanzeneigenschaften – die morphologischen, anatomischen, physiologischen, biochemischen und phänologischen Merkmale von Pflanzen und ihren Organen – bestimmen, wie Primärproduzenten auf Umweltfaktoren reagieren, beeinflussen andere trophische Ebenen, wirken auf Ökosystemprozesse und -leistungen ein und stellen eine Verbindung von Artenvielfalt zur funktionellen Vielfalt von Ökosystemen her. Eigenschaftsdaten stellen somit das Rohmaterial für eine breite Palette von Forschungsbereichen dar, von der Evolutionsbiologie über die Gemeinschafts- und funktionelle Ökologie bis zur Biogeographie. Hier stellen wir die globale Datenbankinitiative namens TRY vor, die eine breite Gemeinschaft der Pflanzenforschung weltweit vereint hat und einen beispiellosen Einsatz von Eigenschaftsdaten erzielt hat: bisher wurden 93 Datenbanken mit Pflanzeneigenschaften beigetragen. Das Datenarchiv enthält derzeit fast drei Millionen Eigenschaftseinträge für 69 000 von weltweit 300 000 Pflanzenarten, mit einem Schwerpunkt auf 52 Gruppen von Eigenschaften, die die vegetativen und Regenerationsphasen des Pflanzenlebenszyklus charakterisieren, einschließlich Wachstum, Ausbreitung, Etablierung und Persistenz. Eine erste Datenanalyse zeigt, dass die meisten Pflanzeneigenschaften ungefähr log-normalverteilt sind, mit weit unterschiedlichen Bereichen der Variation zwischen den Eigenschaften. Die meisten Eigenschaftsvariationen liegen zwischen Arten (interspezifisch), jedoch wird auch eine signifikante intraspezifische Variation dokumentiert, bis zu 40 % der gesamten Variation. Pflanzentypen (PFTs), wie sie häufig in Vegetationsmodellen verwendet werden, erfassen einen beträchtlichen Anteil der beobachteten Variation – aber für mehrere Eigenschaften tritt die meisten Variation innerhalb der PFTs auf, bis zu 75 % der gesamten Variation. Im Kontext von Vegetationsmodellen sollten diese Eigenschaften besser durch Zustandsvariablen als durch feste Parameterwerte dargestellt werden. Die verbesserte Verfügbarkeit von Pflanzeneigenschaftsdaten in der einheitlichen globalen Datenbank wird voraussichtlich einen Paradigmenwechsel von der artbasierten zur eigenschaftsbasierten Ökologie unterstützen, neue Möglichkeiten für synthetische Pflanzenforschung bieten und eine realistischere und empirisch fundierte Darstellung terrestrischer Vegetation in Erdsystemmodellen ermöglichen.

@article{doi101111j13652486201102451x,
    author = "Kattge, Jens und Dı́az, Soledad und Lavorel, Sandra und Prentice, I. Colin und Leadley, Paul und Bönisch, Gerhard und Garnier, Éric und Westoby, Mark und Reich, Peter B. und Wright, Ian J. und Cornelissen, J. H. C. und Violle, Cyrille und Harrison, Sandy P. und van Bodegom, Peter M. und Reichstein, Markus und Enquist, Brian J. und Soudzilovskaia, Nadejda A. und Ackerly, David D. und Anand, M. und Atkin, Owen K. und Bahn, Michael und Baker, Timothy R. und Baldocchi, Dennis und Bekker, R.M. und Blanco, C. und Blonder, Benjamin und Bond, William J. und Bradstock, Ross A. und Bunker, Dan und Casanoves, Fernando und Cavender‐Bares, Jeannine und Chambers, Jeffrey Q. und Chapin, F. Stuart und Chave, Jérôme und Coomes, David A. und Cornwell, William K. und Craine, Joseph M. und Dobrin, Barbara und Duarte, Leandro und Durka, Walter und Elser, James J. und Esser, G. und Estiarte, Marc und Fagan, William F. und Fang, Jinwei und Fernández‐Méndez, Fernando und Fidélis, Alessandra und Finegan, Bryan und Flores, Olivier und FORD, HENRY und Frank, Dorothea und Freschet, Grégoire T. und Fyllas, Nikolaos M. und Gallagher, Rachael V. und GREEN, W. A. und Gutiérrez, Álvaro G. und Hickler, Thomas und Higgins, Steven I. und Hodgson, J. G. und Jalili, Amir und Jansen, Steven und Joly, Carlos Alfredo und Kerkhoff, Andrew J. und Kirkup, Donald W. und Kitajima, Kaoru und Kleyer, Michael und Klotz, Stefan und Knops, Johannes M. H. und Krämer, K. und Kühn, Ingolf und Kurokawa, H. und Laughlin, Daniel C. und Lee, Tali D. und Leishman, Michelle R. und Lens, Frederic und Lenz, Tanja I. und Lewis, Simon L. und Lloyd, Jon und Llusià, Joan und Louault, Frédérique und Ma, Sai und Mahecha, Miguel D. und Manning, Peter und Massad, Tara Joy und Medlyn, Belinda E. und Messier, J. und Moles, Angela T. und Müller, Sandra Cristina und Nadrowski, Karin und NAEEM, S. und Niinemets, Ülo und Nöllert, Stephanie und Nuske, Alison und Ogaya, Romà und Oleksyn, Jacek und Onipchenko, V. G. und Onoda, Yusuke und Ordóñez, Jenny und Overbeck, Gerhard E. und Ozinga, W.A.",
    title = "TRY – eine globale Datenbank von Pflanzenmerkmalen",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Abstract Pflanzenmerkmale – die morphologischen, anatomischen, physiologischen, biochemischen und phänologischen Eigenschaften von Pflanzen und ihren Organen – bestimmen, wie Primärproduzenten auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen, Ökosystemprozesse und -dienstleistungen beeinflussen und eine Verbindung von Artenvielfalt zu funktionaler Ökosystemvielfalt herstellen. Merkmalsdaten stellen somit das Rohmaterial für eine breite Palette von Forschungsbereichen dar, von der Evolutionsbiologie über die Gemeinschafts- und Funktionsökologie bis zur Biogeographie. Hier stellen wir die globale Datenbankinitiative namens TRY vor, die eine breite Palette der weltweit tätigen Pflanzenmerkmal-Forschergemeinschaft vereint hat und einen beispiellosen Datenbeitrag erzielt hat: bisher wurden 93 Merkmalsdatenbanken beigetragen. Das Datenarchiv enthält derzeit fast drei Millionen Merkmalseinträge für 69.000 von weltweit 300.000 Pflanzenarten, mit einem Schwerpunkt auf 52 Gruppen von Merkmalen, die die vegetativen und Regenerationsphasen des Pflanzenlebenszyklus charakterisieren, einschließlich Wachstum, Ausbreitung, Etablierung und Persistenz. Eine erste Datenanalyse zeigt, dass die meisten Pflanzenmerkmale annähernd log-normalverteilt sind, mit weit unterschiedlichen Variationsspannen über die Merkmale hinweg. Die meisten Merkmalsvariationen liegen zwischen Arten (interspezifisch), aber auch signifikante intraspezifische Variationen werden dokumentiert, bis zu 40 % der gesamten Variation. Pflanzenfunktionaltypen (PFTs), wie sie häufig in Vegetationsmodellen verwendet werden, erfassen einen beträchtlichen Anteil der beobachteten Variation – aber für mehrere Merkmale tritt die meisten Variation innerhalb der PFTs auf, bis zu 75 % der gesamten Variation. Im Kontext von Vegetationsmodellen sollten diese Merkmale besser durch Zustandsvariablen als durch feste Parameterwerte dargestellt werden. Die verbesserte Verfügbarkeit von Pflanzenmerkmalen in der einheitlichen globalen Datenbank wird voraussichtlich einen Paradigmenwechsel von der Art- zur Merkmalsökologie unterstützen, neue Möglichkeiten für synthetische Pflanzenmerkmal-Forschung bieten und eine realistischere und empirisch fundierte Darstellung terrestrischer Vegetation in Erdsystemmodellen ermöglichen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    openalex = "W2162584119",
    references = "doi101007bf00386231, doi1010160165176580900245, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652486200300569x, doi101071bt02124, doi101086283244, doi101111j00301299200715559x, doi101111j14610248200600924x, doi101111j14610248200801219x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi1011552009421425"
}

Unsere Analysen bestätigen, dass mit großen Mengen an Sequenzdaten die meisten tiefen Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb der Angiospermen geklärt werden können. Wir erwarten, dass dieser gut aufgelöste Angiospermenbaum für viele Bereiche der Biologie, einschließlich Physiologie, Ökologie, Paläobiologie und Genomik, breite Anwendung finden wird.

@article{doi103732ajb1000404,
    author = "Soltis, Pamela S. und Smith, Stephen A. und Cellinese, Nico und Wurdack, Kenneth J. und Tank, David C. und Brockington, Samuel F. und Refulio, Nancy und Walker, Jay B. und Moore, Michael J. und Carlsward, Barbara S. und Bell, Charles D. und Latvis, Maribeth und Crawley, Sunny und Black, Chelsea M. und Diouf, Diaga und Xi, Zhenxiang und Rushworth, Catherine A. und Gitzendanner, Matthew A. und Sytsma, Kenneth J. und Qiu, Yin‐Long und Hilu, Khidir W. und Davis, Charles C. und Sanderson, Michael J. und Beaman, Reed S. und Olmstead, Richard G. und Judd, Walter S. und Donoghue, Michael J. und Soltis, Pamela S.",
    title = "Angiosperm phylogeny: 17 genes, 640 taxa",
    year = "2011",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Unsere Analysen bestätigen, dass mit großen Mengen an Sequenzdaten die meisten tiefen Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb der Angiospermen geklärt werden können. Wir erwarten, dass dieser gut aufgelöste Angiospermenbaum für viele Bereiche der Biologie, einschließlich Physiologie, Ökologie, Paläobiologie und Genomik, breite Anwendung finden wird.",
    url = "https://doi.org/10.3732/ajb.1000404",
    doi = "10.3732/ajb.1000404",
    openalex = "W2123023543",
    references = "doi101016jympev200802011"
}

Pflanzenfunktionelle Merkmale sind die Eigenschaften (morphologisch, physiologisch, phänologisch), die ökologische Strategien repräsentieren und bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften prägen. Variationen in pflanzenfunktionellen Merkmalen und Merkmals-Syndromen haben sich als nützlich erwiesen, um viele wichtige ökologische Fragen auf verschiedenen Skalen zu bearbeiten, was zu einer Nachfrage nach standardisierten Methoden zur Messung ökologisch bedeutsamer Pflanzenmerkmale geführt hat. Diese Forschungsrichtung gehört zu den fruchtbarsten Wegen, um ökologische und evolutionäre Muster und Prozesse zu verstehen. Sie hat zudem das Potenzial, sowohl ein prädiktives Set lokaler, regionaler und globaler Beziehungen zwischen Pflanzen und Umwelt aufzubauen als auch eine breite Palette natürlicher und menschlich getriebener Prozesse zu quantifizieren, einschließlich Veränderungen der Biodiversität, Auswirkungen von Arteninvasionen, Änderungen in biogeochemischen Prozessen und Vegetation–Atmosphären-Interaktionen. Die Bedeutung dieser Themen diktiert den dringenden Bedarf an mehr und besseren Daten und erhöht den Wert standardisierter Protokolle zur Quantifizierung der Merkmalsvariation verschiedener Arten, insbesondere für Merkmale mit der Kraft, Pflanzen- und Ökosystem-Ebene-Prozesse vorherzusagen, und für Merkmale, die relativ leicht gemessen werden können. Aktualisiert und erweitert gegenüber der weit verbreiteten vorherigen Version behält dieses Handbuch den Fokus auf klar präsentierte, weit anwendbare, schrittweise Rezepte bei, mit einem Minimum an Text zur Theorie, und enthält nicht nur aktualisierte Methoden für die zuvor behandelten Merkmale, sondern führt auch viele neue Protokolle für weitere Merkmale ein. Dieses neue Handbuch hat ein besseres Gleichgewicht zwischen ganzen Pflanzenmerkmalen, Blattmerkmalen, Wurzel- und Stängelmerkmalen sowie regenerativen Merkmalen und legt besonderen Wert auf Merkmale, die wichtig sind für die Vorhersage von Artenwirkungen auf Schlüssel-Ökosystem-Eigenschaften. Wir hoffen, dass dieses neue Handbuch zu einem Standardbegleiter in lokalen und globalen Bemühungen wird, um über die Reaktionen und Auswirkungen verschiedener Pflanzenarten hinsichtlich Umweltveränderungen in Gegenwart, Vergangenheit und Zukunft zu lernen.

@article{doi101071bt12225,
    author = "Harguindeguy, Natalia Pérez und Dı́az, Sandra und Garnier, Éric und Lavorel, Sandra und Poorter, Hendrik und Jaureguiberry, Pedro und Bret‐Harte, M. Syndonia und Cornwell, William K. und Craine, Joseph M. und Gurvich, Diego E. und Urcelay, Carlos und Veneklaas, Erik J. und Reich, Peter B. und Poorter, Lourens und Wright, Ian J. und Ray, Peter M. und Enrico, Lucas und Pausas, Juli G. und de Vos, Arjen C. und Buchmann, Nina und Funes, Guillermo und Quétier, Fabien und Hodgson, John und Thompson, K. und Morgan, Huw D. und ter Steege, Hans und van der Heijden, Marcel G. A. und Sack, Lawren und Blonder, B. und Poschlod, Peter und Vaieretti, María V. und Conti, Georgina und Staver, A. Carla und Aquino, Sâmia und Cornelissen, J. H. C.",
    title = "Neues Handbuch für standardisierte Messung von Pflanzenfunktionseigenschaften weltweit",
    year = "2013",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Pflanzenfunktionseigenschaften sind Merkmale (morphologisch, physiologisch, phänologisch), die ökologische Strategien repräsentieren und bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften prägen. Variationen in Pflanzenfunktionseigenschaften und Eigenschaftssyndromen haben sich als nützlich erwiesen, um viele wichtige ökologische Fragen auf verschiedenen Skalen zu bearbeiten, was zu einer Nachfrage nach standardisierten Methoden zur Messung ökologisch bedeutsamer Pflanzenmerkmale geführt hat. Diese Forschungsrichtung gehört zu den fruchtbarsten Wegen, um ökologische und evolutionäre Muster und Prozesse zu verstehen. Sie hat zudem das Potenzial, sowohl ein prädiktives Set lokaler, regionaler und globaler Beziehungen zwischen Pflanzen und Umwelt aufzubauen als auch eine breite Palette natürlicher und menschlich getriebener Prozesse zu quantifizieren, einschließlich Veränderungen der Biodiversität, Auswirkungen von Arteninvasionen, Änderungen biogeochemischer Prozesse und Vegetation–Atmosphären-Interaktionen. Die Bedeutung dieser Themen diktiert den dringenden Bedarf an mehr und besseren Daten und erhöht den Wert standardisierter Protokolle zur Quantifizierung der Eigenschaftsvariation verschiedener Arten, insbesondere für Eigenschaften, die in der Lage sind, pflanzen- und ökoseystemweite Prozesse vorherzusagen, sowie für Eigenschaften, die relativ leicht gemessen werden können. Aktualisiert und erweitert gegenüber der weit verbreiteten vorherigen Version behält dieses Handbuch den Fokus auf klar präsentierte, weit anwendbare, schrittweise Rezepte bei, mit einem Minimum an Text zur Theorie, und enthält nicht nur aktualisierte Methoden für die zuvor behandelten Eigenschaften, sondern führt auch viele neue Protokolle für weitere Eigenschaften ein. Dieses neue Handbuch bietet ein besseres Gleichgewicht zwischen gesamten Pflanzenmerkmalen, Blattmerkmalen, Wurzel- und Stängelmerkmalen sowie regenerativen Merkmalen und legt besonderen Wert auf Eigenschaften, die wichtig sind, um die Auswirkungen von Arten auf Schlüssel-Ökosystemeigenschaften vorherzusagen. Wir hoffen, dass dieses neue Handbuch zu einem Standardbegleiter in lokalen und globalen Bemühungen wird, um über die Reaktionen und Auswirkungen verschiedener Pflanzenarten im Hinblick auf Umweltveränderungen in Gegenwart, Vergangenheit und Zukunft zu lernen.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt12225",
    doi = "10.1071/bt12225",
    openalex = "W2101020813",
    references = "doi101006anbo20001261, doi101007s004420050100x, doi1010160031942281851345, doi101016b9780124735422x50007, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi10103835012241, doi101038nature02403, doi101038nature11148, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi101146annurevpp40060189002443, doi1023073241344, doi105860choice324498, openalexw1573494572, openalexw2058502945, openalexw2764433274, openalexw569951484"
}

Die Ausweitung phylogenetischer Bäume in Umfang und Größe ist vielversprechend für das Verständnis einer Vielzahl evolutionärer Muster und Prozesse. Bei Bäumen, die größere, ältere und global verteilte Klade umfassen, ist es wahrscheinlich, dass die Labilität eines binären Merkmals zwischen den Abstammungslinien erheblich unterschiedlich ist, was zu Fehlern bei der Schätzung von Übergangsrate und der damit verbundenen Inferenz von Vorfahrenzuständen führen könnte. Hier entwickeln und implementieren wir eine neue Methode zur Identifizierung unterschiedlicher Evolutionsraten eines binären Merkmals entlang verschiedener Äste einer Phylogenie. Wir illustrieren diesen Ansatz, indem wir die Evolution des Wachstumshabitus bei Campanuliden untersuchen, einer Blütenpflanzenklade, die etwa 35.000 Arten umfasst. Die Verteilung von holzigen gegenüber krautigen Arten wirft Fragen bezüglich der Verwendung traditioneller Modelle der binären Merkmalsentwicklung auf. Die Anerkennung und Berücksichtigung von Änderungen der Rate der Wachstumshabitus-Evolution in verschiedenen Linien demonstriert erstmals ein robustes Bild der Wachstumshabitus-Evolution über eine sehr große, sehr alte und sehr weit verbreitete Blütenpflanzenklade hinweg.

@article{doi101093sysbiosyt034,
    author = "Beaulieu, Jeremy M. and O’Meara, Brian C. and Donoghue, Michael J.",
    title = "Identifying Hidden Rate Changes in the Evolution of a Binary Morphological Character: The Evolution of Plant Habit in Campanulid Angiosperms",
    year = "2013",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "The growth of phylogenetic trees in scope and in size is promising from the standpoint of understanding a wide variety of evolutionary patterns and processes. With trees comprised of larger, older, and globally distributed clades, it is likely that the lability of a binary character will differ significantly among lineages, which could lead to errors in estimating transition rates and the associated inference of ancestral states. Here we develop and implement a new method for identifying different rates of evolution in a binary character along different branches of a phylogeny. We illustrate this approach by exploring the evolution of growth habit in Campanulidae, a flowering plant clade containing some 35,000 species. The distribution of woody versus herbaceous species calls into question the use of traditional models of binary character evolution. The recognition and accommodation of changes in the rate of growth form evolution in different lineages demonstrates, for the first time, a robust picture of growth form evolution across a very large, very old, and very widespread flowering plant clade.",
    url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syt034",
    doi = "10.1093/sysbio/syt034",
    openalex = "W2112282403",
    references = "doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093nargkh340, doi101109tac19741100705, doi101111j10958339200900996x, doi1023071266136, doi1023072004114, doi1023073802723, openalexw2611511275, openalexw3149745985"
}

Amborella trichopoda wird stark als die einzige lebende Art der Schwesterlinie zu allen anderen noch existierenden Blütenpflanzen unterstützt und bietet einen einzigartigen Referenzpunkt, um den Genominhalt und die Struktur des jüngsten gemeinsamen Vorfahren (MRCA) der lebenden Angiospermen zu erschließen. Durch die Sequenzierung des Amborella-Genoms identifizierten wir eine alte Genomduplikation, die der Angiospermen-Diversifikation voranging, ohne Hinweise auf nachfolgende, linien-spezifische Genomduplikationen. Vergleiche zwischen Amborella und anderen Angiospermen ermöglichten die Rekonstruktion des ancestralen Angiospermen-Geninhalts und der Genordnung im MRCA der Kern-Eudikoten. Wir identifizieren neue Genfamilien, Gen-Duplikationen und florale Protein-Protein-Interaktionen, die erstmals im ancestralen Angiospermen auftraten. Transposable Elemente in Amborella sind alt und stark divergent, ohne jüngere Transposon-Strahlungen. Eine populationsgenomische Analyse über den natürlichen Verbreitungsraum von Amborella in Neukaledonien zeigt einen jüngsten genetischen Flaschenhals und eine geografische Struktur mit Implikationen für den Artenschutz.

@article{doi101126science1241089,
    author = "Project, Amborella Genome and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Leebens-Mack, James and Mā, Hong and Palmer, Jeffrey D. and Rounsley, Steve and Sankoff, David and Schuster, Stephan C. and Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S. and Wessler, Susan R. and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Ammiraju, Jetty S. S. and Barbazuk, W. Bradley and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Determann, Ronald and Leebens-Mack, James and Ma, Hong and Ralph, Paula E. and Rounsley, Steve and Schuster, Stephan C. and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Talag, Jason and Tomsho, Lynn and Walts, Brandon and Wanke, Stefan and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chang, Tien-Hao and Determann, Ronald and Lan, Tianying and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Ayyampalayam, Saravanaraj and Barbazuk, W. Brad and Burnette, James M. and Chamala, Srikar and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Farrell, Nina and Harkess, Alex and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Meyers, Blake C. and Shahid, Saima and Wafula, Eric and Walts, Brandon and Wessler, Susan R. and Zhai, Jixian and Zhang, Xiaoyu and Albert, Victor A. and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Lyons, Eric and Sankoff, David and Tang, Haibao and Wafula, Eric and Zheng, Chunfang and Albert, Victor A. and Altman, Naomi S. and Barbazuk, W. Bradley and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Wafula, Eric and Altman, Naomi S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chen, Feng and Chen, Jian‐Qun and Chiang, Vincent L. and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W.",
    title = "The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants",
    year = "2013",
    journal = "Science",
    abstract = "Amborella trichopoda is strongly supported as the single living species of the sister lineage to all other extant flowering plants, providing a unique reference for inferring the genome content and structure of the most recent common ancestor (MRCA) of living angiosperms. Sequencing the Amborella genome, we identified an ancient genome duplication predating angiosperm diversification, without evidence of subsequent, lineage-specific genome duplications. Comparisons between Amborella and other angiosperms facilitated reconstruction of the ancestral angiosperm gene content and gene order in the MRCA of core eudicots. We identify new gene families, gene duplications, and floral protein-protein interactions that first appeared in the ancestral angiosperm. Transposable elements in Amborella are ancient and highly divergent, with no recent transposon radiations. Population genomic analysis across Amborella's native range in New Caledonia reveals a recent genetic bottleneck and geographic structure with conservation implications.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1241089",
    doi = "10.1126/science.1241089",
    openalex = "W2058378183",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101146annurevearth042711105313, doi101196annals1438005"
}

@misc{crossref2014angiosperms,
    title = "ANGIOSPERMS",
    year = "2014",
    booktitle = "Enzyklopädie der Umweltveränderung",
    url = "https://doi.org/10.4135/9781446247501.n178",
    doi = "10.4135/9781446247501.n178"
}

Symbiotische Assoziationen kommen in jedem Lebensraum auf der Erde vor, doch wir wissen sehr wenig über ihre evolutionären Geschichten. Aktuelle Modelle der Merkmalsentwicklung können die tiefe Geschichte der symbiotischen Innovation nicht angemessen rekonstruieren, da sie homogene evolutionäre Prozesse über Millionen von Jahren hinweg annehmen. Hier verwenden wir ein kürzlich entwickeltes, heterogenes und quantitatives phylogenetisches Rahmenwerk, um den Ursprung der Symbiose zwischen Angiospermen und stickstofffixierenden (N2) bakteriellen Symbionten in Knöllchen zu untersuchen. Wir erstellen die größte Datenbank globaler knöllchenbildender Pflanzenarten und rekonstruieren die Evolution der Symbiose. Wir identifizieren eine einzelne, kryptische evolutionäre Innovation, die die Evolution der symbiotischen N2-Fixierung antreibt, gefolgt von mehreren Gewinnen und Verlusten der Symbiose sowie dem anschließenden Auftreten von 'stabilen Fixierern' (Kladen, die die Symbiose extrem unwahrscheinlich verlieren). Ursprünglich vor über 100 MYA entstanden, deutet diese Innovation auf eine tiefe Homologie in der symbiotischen N2-Fixierung hin. Die Identifizierung kryptischer Innovationen im Baum des Lebens ist entscheidend für das Verständnis der Evolution komplexer Merkmale, einschließlich symbiotischer Partnerschaften.

@article{doi101038ncomms5087,
    author = "Werner, Gijsbert D. A. und Cornwell, William K. und Sprent, Janet I. und Kattge, Jens und Kiers, E. Toby",
    title = "Eine einzelne evolutionäre Innovation treibt die tiefe Evolution der symbiotischen N2-Fixierung in Angiospermen voran",
    year = "2014",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Symbiotische Assoziationen kommen in jedem Lebensraum auf der Erde vor, doch wir wissen sehr wenig über ihre evolutionären Geschichten. Aktuelle Modelle der Merkmalsentwicklung können die tiefe Geschichte der symbiotischen Innovation nicht angemessen rekonstruieren, da sie homogene evolutionäre Prozesse über Millionen von Jahren hinweg annehmen. Hier verwenden wir ein kürzlich entwickeltes, heterogenes und quantitatives phylogenetisches Rahmenwerk, um den Ursprung der Symbiose zwischen Angiospermen und stickstofffixierenden (N2) bakteriellen Symbionten in Knöllchen zu untersuchen. Wir erstellen die größte Datenbank globaler knöllchenbildender Pflanzenarten und rekonstruieren die Evolution der Symbiose. Wir identifizieren eine einzelne, kryptische evolutionäre Innovation, die die Evolution der symbiotischen N2-Fixierung antreibt, gefolgt von mehreren Gewinnen und Verlusten der Symbiose sowie dem anschließenden Auftreten von 'stabilen Fixierern' (Kladen, die die Symbiose extrem unwahrscheinlich verlieren). Ursprünglich vor über 100 MYA entstanden, deutet diese Innovation auf eine tiefe Homologie in der symbiotischen N2-Fixierung hin. Die Identifizierung kryptischer Innovationen im Baum des Lebens ist entscheidend für das Verständnis der Evolution komplexer Merkmale, einschließlich symbiotischer Partnerschaften.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms5087",
    doi = "10.1038/ncomms5087",
    openalex = "W2031705623",
    references = "doi101038nature10625, doi101038nature12872, doi101038nrmicro1987, doi101038nrmicro2990, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi101111j13652486201102451x, doi101111j155856461985tb00420x, doi103758bf03206482"
}

Die Rekonstruktion des Ursprungs und der Evolution von Landpflanzen und ihren algalen Verwandten ist ein grundlegendes Problem der Pflanzenphylogenetik und unerlässlich für das Verständnis, wie kritische Anpassungen entstanden sind, einschließlich des Embryos, des Gefäßgewebes, der Samen und der Blüten. Trotz Fortschritte in der molekularen Systematik bleiben einige Hypothesen über Verwandtschaftsbeziehungen schwach aufgelöst. Das Inferieren tiefer Phylogenien mit Phasen schneller Diversifizierung kann problematisch sein; jedoch sollten genomweite Daten die Anzahl informativer Merkmale für Analysen erheblich erhöhen. Kürzlich durchgeführte phylogenomische Rekonstruktionen, die sich auf die Hauptdivergenzen von Pflanzen konzentrierten, führten zu vielversprechenden, aber inkonsistenten Ergebnissen. Eine Einschränkung ist die spärliche Taxon-Sampling, wahrscheinlich bedingt durch die Schwierigkeit und Kosten der Datengenerierung. Um diese Einschränkung zu adressieren, wurden Transkriptomdaten für 92 Streptophyta-Taxa erzeugt und analysiert, zusammen mit 11 veröffentlichten Pflanzen-Genomsequenzen. Phylogenetische Rekonstruktionen wurden durchgeführt, basierend auf bis zu 852 nuklearen Genen und 1.701.170 ausgerichteten Stellen. Es wurden 69 Analysen durchgeführt, um die Robustheit phylogenetischer Inferenzen gegenüber Permutationen der Datenmatrix oder phylogenetischen Methoden zu testen, einschließlich Supermatrix-, Supertree- und koaleszenzbasierter Ansätze, Maximum-Likelihood- und Bayes'scher Methoden, partitionierter und unpartitionierter Analysen sowie Aminosäure- versus DNA-Ausrichtungen. Unter anderem finden wir robuste Unterstützung für eine Schwestergruppen-Beziehung zwischen Landpflanzen und einer Gruppe von Streptophyta-Grünalgen, den Zygnematophyceae. Starke und robuste Unterstützung für einen Kladus, der Lebermoose und Moose umfasst, steht im Widerspruch zu einer weit verbreiteten Sichtweise der frühen Evolution von Landpflanzen und deutet darauf hin, dass phylogenetische Hypothesen, die verwendet werden, um die Evolution grundlegender Pflanzenmerkmale zu verstehen, neu bewertet werden sollten.

@article{doi101073pnas1323926111,
    author = "Wickett, Norman J. und Mirarab, Siavash und Nguyen, Nam und Warnow, Tandy und Carpenter, Eric und Matasci, Naim und Ayyampalayam, Saravanaraj und Barker, Michael S. und Burleigh, J. Gordon und Gitzendanner, Matthew A. und Ruhfel, Brad R. und Wafula, Eric und Der, Joshua P. und Graham, Sean W. und Mathews, Sarah und Melkonian, Michael und Soltis, Pamela S. und Soltis, Pamela S. und Miles, Nicholas W. und Rothfels, Carl J. und Pokorny, Lisa und Shaw, A. Jonathan und DeGironimo, Lisa und Stevenson, Dennis und Surek, Barbara und Villarreal, Juan Carlos und Roure, Béatrice und Philippe, Hervé und dePamphilis, Claude W. und Chen, Tao und Deyholos, Michael K. und Baucom, Regina S. und Kutchan, Toni M. und Augustin, Megan M. und Wang, Jun und Zhang, Yong und Tian, Zhijian und Yan, Zhixiang und Wu, Xiaolei und Sun, Xiao und Wong, Gane Ka‐Shu und Leebens-Mack, James",
    title = "Phylotranskriptomische Analyse des Ursprungs und der frühen Diversifizierung von Landpflanzen",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Die Rekonstruktion des Ursprungs und der Evolution von Landpflanzen und ihren algalen Verwandten ist ein grundlegendes Problem der Pflanzenphylogenetik und unerlässlich für das Verständnis, wie kritische Anpassungen entstanden sind, einschließlich des Embryos, des Gefäßgewebes, der Samen und der Blüten. Trotz Fortschritte in der molekularen Systematik bleiben einige Hypothesen über Verwandtschaftsbeziehungen schwach aufgelöst. Das Inferieren tiefer Phylogenien mit Phasen schneller Diversifizierung kann problematisch sein; jedoch sollten genomweite Daten die Anzahl informativer Merkmale für Analysen erheblich erhöhen. Kürzlich durchgeführte phylogenomische Rekonstruktionen, die sich auf die Hauptdivergenzen von Pflanzen konzentrierten, führten zu vielversprechenden, aber inkonsistenten Ergebnissen. Eine Einschränkung ist die spärliche Taxon-Sampling, wahrscheinlich bedingt durch die Schwierigkeit und Kosten der Datengenerierung. Um diese Einschränkung zu adressieren, wurden Transkriptomdaten für 92 Streptophyta-Taxa erzeugt und analysiert, zusammen mit 11 veröffentlichten Pflanzen-Genomsequenzen. Phylogenetische Rekonstruktionen wurden durchgeführt, basierend auf bis zu 852 nuklearen Genen und 1.701.170 ausgerichteten Stellen. Es wurden 69 Analysen durchgeführt, um die Robustheit phylogenetischer Inferenzen gegenüber Permutationen der Datenmatrix oder phylogenetischen Methoden zu testen, einschließlich Supermatrix-, Supertree- und koaleszenzbasierter Ansätze, Maximum-Likelihood- und Bayes'scher Methoden, partitionierter und unpartitionierter Analysen sowie Aminosäure- versus DNA-Ausrichtungen. Unter anderem finden wir robuste Unterstützung für eine Schwestergruppen-Beziehung zwischen Landpflanzen und einer Gruppe von Streptophyta-Grünalgen, den Zygnematophyceae. Starke und robuste Unterstützung für einen Kladus, der Lebermoose und Moose umfasst, steht im Widerspruch zu einer weit verbreiteten Sichtweise der frühen Evolution von Landpflanzen und deutet darauf hin, dass phylogenetische Hypothesen, die verwendet werden, um die Evolution grundlegender Pflanzenmerkmale zu verstehen, neu bewertet werden sollten.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1323926111",
    doi = "10.1073/pnas.1323926111",
    openalex = "W2013277649",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101016s0022283605803602, doi10103837918, doi101046j109583392003t01100158x, doi101093bioinformatics83275, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbio463523, doi101093sysbiosyt022, doi101111boj12385, doi101111j10958339200900996x, doi101111j10960031200800217x, doi1011861471214811104, doi101371journalpcbi1002195, doi1023072346830, openalexw3148514506"
}

Die Hauptfunktion der Blattadern besteht darin, Wasser über die photosynthetische Oberfläche zu transportieren, um die Stomata offen zu halten und den Zugang zu atmosphärischem CO2 trotz des Verdunstungsbedarfs zu ermöglichen. Die optimale gleichmäßige Wasserversorgung tritt auf, wenn der Abstand zwischen den Adern der Tiefe der Adenplatzierung innerhalb des Blattes von der verdunstenden Oberfläche entspricht. Wie hier dargestellt, halten nur Angiospermen dieses anatomische Optimum über alle Blattdicken und verschiedene Lebensräume hinweg aufrecht, einschließlich geschützter Umgebungen, in denen diese Optimierung nicht erforderlich ist. Faszinierenderweise neigen basale Angiospermengruppen dazu, hydraulisch unterinvestiert zu sein; eine einheitlich hohe Optimierung wird unabhängig in den Magnoliiden, Monokotyledonen und Kern-Eudikotyledonen entwickelt. Gymnospermen und Farne, einschließlich verfügbarer Fossilien, sind durch ihre Unfähigkeit, hohe Adendichten zu produzieren, begrenzt. Die häufige Assoziation von Farne mit schattigen, feuchten Umgebungen mag teilweise eine direkte evolutionäre Konsequenz ihrer Unfähigkeit sein, hydraulisch optimierte Blätter zu produzieren. Einige Gymnospermen nähern sich zwar der optimalen Adenplatzierung, dies jedoch nur aufgrund ihrer Fähigkeit, dicke Blätter zu produzieren, die in Umgebungen, die Wasserkonservierung erfordern, am besten geeignet sind. Somit bietet dieses einfache anatomische Maß eine wichtige Perspektive auf die Evolution und die phylogenetische Verteilung von Pflanzenökologien und liefert weitere Beweise dafür, dass die vegetative Biologie von Blütenpflanzen – nicht nur ihre reproduktive Biologie – einzigartig ist.

@article{doi101098rspb20132829,
    author = "Zwieniecki, Maciej A. und Boyce, C. Kevin",
    title = "Evolution einer einzigartigen anatomischen Präzision in der Blattadernbildung von Angiospermen hebt Einschränkungen für die Ökologie von Gefäßpflanzen auf",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Die Hauptfunktion der Blattadern besteht darin, Wasser über die photosynthetische Oberfläche zu transportieren, um die Stomata offen zu halten und den Zugang zu atmosphärischem CO2 trotz des Verdunstungsbedarfs zu ermöglichen. Die optimale gleichmäßige Wasserversorgung tritt auf, wenn der Abstand zwischen den Adern der Tiefe der Adenplatzierung innerhalb des Blattes von der verdunstenden Oberfläche entspricht. Wie hier dargestellt, halten nur Angiospermen dieses anatomische Optimum über alle Blattdicken und verschiedene Lebensräume hinweg aufrecht, einschließlich geschützter Umgebungen, in denen diese Optimierung nicht erforderlich ist. Faszinierenderweise neigen basale Angiospermengruppen dazu, hydraulisch unterinvestiert zu sein; eine einheitlich hohe Optimierung wird unabhängig in den Magnoliiden, Monokotyledonen und Kern-Eudikotyledonen entwickelt. Gymnospermen und Farne, einschließlich verfügbarer Fossilien, sind durch ihre Unfähigkeit, hohe Adendichten zu produzieren, begrenzt. Die häufige Assoziation von Farne mit schattigen, feuchten Umgebungen mag teilweise eine direkte evolutionäre Konsequenz ihrer Unfähigkeit sein, hydraulisch optimierte Blätter zu produzieren. Einige Gymnospermen nähern sich zwar der optimalen Adenplatzierung, dies jedoch nur aufgrund ihrer Fähigkeit, dicke Blätter zu produzieren, die in Umgebungen, die Wasserkonservierung erfordern, am besten geeignet sind. Somit bietet dieses einfache anatomische Maß eine wichtige Perspektive auf die Evolution und die phylogenetische Verteilung von Pflanzenökologien und liefert weitere Beweise dafür, dass die vegetative Biologie von Blütenpflanzen – nicht nur ihre reproduktive Biologie – einzigartig ist.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2013.2829",
    doi = "10.1098/rspb.2013.2829",
    openalex = "W2118988740",
    references = "doi101007b138533, doi101086300102, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j14610248200901410x, doi1016660094837320040300082dadani20co2, doi1023073515620, openalexw2097450069"
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Zusammenfassung Das Blattökonomie-Spektrum (LES) bietet einen nützlichen Rahmen zur Untersuchung von Artenstrategien, die durch ihre evolutionäre Geschichte geformt wurden. Allerdings umfasste dieses Spektrum in seiner ursprünglichen Beschreibung nur zwei Schlüsselernährungsfaktoren (Kohlenstoff und Nährstoffe) und eines der drei wirtschaftlich wichtigen Pflanzenteile. Hiermit bewerte ich, ob die Idee des Ökonomie-Spektrums auf Wasser – den dritten Schlüsselernährungsfaktor – Stängel, Wurzeln und ganze Pflanzen sowie auf Individuum-, Gemeinschafts- und Ökosystemebene allgemein erweitert werden kann. Meine übergeordnete Hypothese ist, dass eine starke Selektion entlang der Achsen von Merkmalstausch, in Verbindung mit biophysikalischen Einschränkungen, zu einer Konvergenz für jede Taxa auf eine einheitlich schnelle, mittlere oder langsame Strategie (d. h. Raten der Ressourcenerfassung und -verarbeitung) für alle Organe und alle Ressourcen führt. Es gibt Belege für ökonomische Merkmalspektren bei Stängeln und Wurzeln ebenso wie bei Blättern und für Merkmale, die mit Wasser ebenso wie mit Kohlenstoff und Nährstoffen zusammenhängen. Diese gelten allgemein innerhalb und über Skalen hinweg (innerhalb und über Gemeinschaften, Klimazonen, Biome und Abstammungslinien). Es bestehen Verbindungen zwischen Organen und Kopplungen zwischen Ressourcen, was zu einem integrierten ganzen-Pflanzen-Ökonomie-Spektrum führt. Arten, die Wasser schnell bewegen können, weisen eine geringe Gewebedichte, eine kurze Gewebelbensdauer und hohe Raten der Ressourcenerfassung und des Flusses auf Organ- und Individualebene auf. Das Gegenteil gilt für Arten mit der langsamen Strategie. Verschiedene Merkmale können unter verschiedenen Bedingungen wichtig sein, aber da Schnelligkeit in einem Aspekt im Allgemeinen Schnelligkeit in anderen erfordert, ist das Sein schnell oder langsam ein allgemeines Merkmal von Arten. Ökonomische Merkmale beeinflussen Leistung und Fitness im Einklang mit der merkmalsbasierten Theorie über zugrunde liegende adaptive Mechanismen. Merkmale helfen, Unterschiede im Wachstum und Überleben über Ressourcengradienten hinweg zu erklären und tragen somit dazu bei, die Verteilung von Arten und die Zusammenstellung von Gemeinschaften über Licht-, Wasser- und Nährstoffgradienten hinweg zu erklären. Merkmale skalieren auf – schnelle Merkmale sind mit schnelleren Raten von Ökosystemprozessen wie Zersetzung oder Primärproduktion verbunden, und langsame Merkmale mit langsamen Prozessraten. Synthese. Merkmale zählen. Ein einzelnes „schnell-langsam“-Pflanzenökonomie-Spektrum, das Blätter, Stängel und Wurzeln integriert, ist ein Schlüsselelement des Pflanzenuniversums und hilft, individuelle ökologische Strategien, Gemeinschaftsbildungsprozesse und das Funktionieren von Ökosystemen zu erklären.

@article{doi1011111365274512211,
    author = "Reich, Peter B.",
    title = "The world‐wide 'fast–slow' plant economics spectrum: a traits manifesto",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Zusammenfassung Das Blattökonomie-Spektrum (LES) bietet einen nützlichen Rahmen zur Untersuchung von Artenstrategien, die durch ihre evolutionäre Geschichte geformt wurden. Allerdings umfasste dieses Spektrum in seiner ursprünglichen Beschreibung nur zwei Schlüsselernährungsfaktoren (Kohlenstoff und Nährstoffe) und eines der drei wirtschaftlich wichtigen Pflanzenteile. Hiermit bewerte ich, ob die Idee des Ökonomie-Spektrums auf Wasser – den dritten Schlüsselernährungsfaktor – Stängel, Wurzeln und ganze Pflanzen sowie auf Individuum-, Gemeinschafts- und Ökosystemebene allgemein erweitert werden kann. Meine übergeordnete Hypothese ist, dass eine starke Selektion entlang der Achsen von Merkmalstausch, in Verbindung mit biophysikalischen Einschränkungen, zu einer Konvergenz für jede Taxa auf eine einheitlich schnelle, mittlere oder langsame Strategie (d. h. Raten der Ressourcenerfassung und -verarbeitung) für alle Organe und alle Ressourcen führt. Es gibt Belege für ökonomische Merkmalspektren bei Stängeln und Wurzeln ebenso wie bei Blättern und für Merkmale, die mit Wasser ebenso wie mit Kohlenstoff und Nährstoffen zusammenhängen. Diese gelten allgemein innerhalb und über Skalen hinweg (innerhalb und über Gemeinschaften, Klimazonen, Biome und Abstammungslinien). Es bestehen Verbindungen zwischen Organen und Kopplungen zwischen Ressourcen, was zu einem integrierten ganzen-Pflanzen-Ökonomie-Spektrum führt. Arten, die Wasser schnell bewegen können, weisen eine geringe Gewebedichte, eine kurze Gewebelbensdauer und hohe Raten der Ressourcenerfassung und des Flusses auf Organ- und Individualebene auf. Das Gegenteil gilt für Arten mit der langsamen Strategie. Verschiedene Merkmale können unter verschiedenen Bedingungen wichtig sein, aber da Schnelligkeit in einem Aspekt im Allgemeinen Schnelligkeit in anderen erfordert, ist das Sein schnell oder langsam ein allgemeines Merkmal von Arten. Ökonomische Merkmale beeinflussen Leistung und Fitness im Einklang mit der merkmalsbasierten Theorie über zugrunde liegende adaptive Mechanismen. Merkmale helfen, Unterschiede im Wachstum und Überleben über Ressourcengradienten hinweg zu erklären und tragen somit dazu bei, die Verteilung von Arten und die Zusammenstellung von Gemeinschaften über Licht-, Wasser- und Nährstoffgradienten hinweg zu erklären. Merkmale skalieren auf – schnelle Merkmale sind mit schnelleren Raten von Ökosystemprozessen wie Zersetzung oder Primärproduktion verbunden, und langsame Merkmale mit langsamen Prozessraten. Synthese. Merkmale zählen. Ein einzelnes „schnell-langsam“-Pflanzenökonomie-Spektrum, das Blätter, Stängel und Wurzeln integriert, ist ein Schlüsselelement des Pflanzenuniversums und hilft, individuelle ökologische Strategien, Gemeinschaftsbildungsprozesse und das Funktionieren von Ökosystemen zu erklären.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12211",
    doi = "10.1111/1365-2745.12211",
    openalex = "W2127928904",
    references = "doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652745199800306x, doi101086283244, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annureves11110180001313, doi1018900012965819970781958cafasa20co2, doi1023072259756, doi1023074549, doi1034172009143, openalexw1564371012, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
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Samenruhe kann durch die Kontrolle des Keimungszeitpunkts die Überlebensfähigkeit von Pflanzen stark beeinflussen. Die Art der Samenruhe kann daher sowohl populations- als auch artenbezogene Prozesse wie Kolonisation, Anpassung, Artbildung und Aussterben beeinflussen. Wir verwendeten einen Datensatz mit über 14.000 Taxa in 318 Familien über die Samenpflanzen hinweg, um Hypothesen über die Evolution verschiedener Arten der Samenruhe und deren Zusammenhang mit der Diversifizierung von Abstammungslinien zu testen. Wir stellten fest, dass die morphophysiologische Ruhe der wahrscheinlichste ursprüngliche Zustand der Samenpflanzen ist, was darauf hindeutet, dass eine physiologisch regulierte Ruhe als Reaktion auf Umweltreize bereits bei der Entstehung der Samenpflanzen vorhanden war. Darüber hinaus stellten wir fest, dass die physiologische Ruhe (PD), sobald sie von der morphologischen Ruhe getrennt wurde, als ein „evolutionärer Knotenpunkt" wirkte, von dem aus andere Ruheklassen sich entwickelten, und dass sie mit höheren Raten der Diversifizierung von Abstammungslinien durch höhere Artbildungsrate verbunden war. Die durch die Ruhe im Allgemeinen und insbesondere durch PD bereitgestellte Umweltsensibilität scheint ein Schlüsselmerkmal für die Diversifizierung der Samenpflanzen zu sein.

@article{doi101111nph12782,
    author = "Willis, Charles G. and Baskin, Carol C. and Baskin, Jerry M. and Auld, Josh R. and Venable, D. Lawrence and Cavender‐Bares, Jeannine and Donohue, Kathleen and de Casas, Rafael Rubio and Group, The NESCent Germination Working",
    title = "The evolution of seed dormancy: environmental cues, evolutionary hubs, and diversification of the seed plants",
    year = "2014",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Seed dormancy, by controlling the timing of germination, can strongly affect plant survival. The kind of seed dormancy, therefore, can influence both population and species-level processes such as colonization, adaptation, speciation, and extinction. We used a dataset comprising over 14,000 taxa in 318 families across the seed plants to test hypotheses on the evolution of different kinds of seed dormancy and their association with lineage diversification. We found morphophysiological dormancy to be the most likely ancestral state of seed plants, suggesting that physiologically regulated dormancy in response to environmental cues was present at the origin of seed plants. Additionally, we found that physiological dormancy (PD), once disassociated from morphological dormancy, acted as an 'evolutionary hub' from which other dormancy classes evolved, and that it was associated with higher rates of lineage diversification via higher speciation rates. The environmental sensitivity provided by dormancy in general, and by PD in particular, appears to be a key trait in the diversification of seed plants.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.12782",
    doi = "10.1111/nph.12782",
    openalex = "W2110336319",
    references = "doi101111j001438202002tb00137x, doi10118614712105788"
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Welche Faktoren beeinflussen, ob eine Abstammungsreihe erfolgreich in ein neues Biom übergehen kann, und warum waren einige Biom-Shifts häufiger als andere? Um diese Forschungsrichtung zu orientieren, entwickeln wir ein konzeptionelles Rahmenwerk, in dem die Wahrscheinlichkeit eines Biom-Shifts eine Funktion von (a) der Exposition gegenüber kontrastierenden Umgebungen über die Zeit, (b) der evolutionären Zugänglichkeit relevanter Anpassungen und (c) sich ändernden biotischen Interaktionen ist. Wir bewerten die Literatur zu Biom-Shifts bei Pflanzen im Hinblick auf eine Reihe von Hypothesen über die Größe, Vernetzung und das absolute Alter von Biotopen sowie über die Anpassungsfähigkeit bestimmter Abstammungsreihen und ökologischer Interaktionen über die Zeit. Wir kritisieren auch die phylogenetische Inferenz vergangener Biotopmodelle und einen „globalen" modellbasierten Ansatz zur Biom-Evolution. Robustere Verallgemeinerungen über Biom-Shifts werden detaillierte Studien gut abgesteckter und gut aufgelöster Klade erfordern, die Veränderungen der relevanten abiotischen und biotischen Faktoren über die Zeit berücksichtigen.

@article{doi101146annurevecolsys120213091905,
    author = "Donoghue, Michael J. und Edwards, Erika J.",
    title = "Biome-Shifts und Nischen-Evolution bei Pflanzen",
    year = "2014",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Welche Faktoren beeinflussen, ob eine Abstammungsreihe erfolgreich in ein neues Biom übergehen kann, und warum waren einige Biom-Shifts häufiger als andere? Um diese Forschungsrichtung zu orientieren, entwickeln wir ein konzeptionelles Rahmenwerk, in dem die Wahrscheinlichkeit eines Biom-Shifts eine Funktion von (a) der Exposition gegenüber kontrastierenden Umgebungen über die Zeit, (b) der evolutionären Zugänglichkeit relevanter Anpassungen und (c) sich ändernden biotischen Interaktionen ist. Wir bewerten die Literatur zu Biom-Shifts bei Pflanzen im Hinblick auf eine Reihe von Hypothesen über die Größe, Vernetzung und das absolute Alter von Biotopen sowie über die Anpassungsfähigkeit bestimmter Abstammungsreihen und ökologischer Interaktionen über die Zeit. Wir kritisieren auch die phylogenetische Inferenz vergangener Biotopmodelle und einen „globalen" modellbasierten Ansatz zur Biom-Evolution. Robustere Verallgemeinerungen über Biom-Shifts werden detaillierte Studien gut abgesteckter und gut aufgelöster Klade erfordern, die Veränderungen der relevanten abiotischen und biotischen Faktoren über die Zeit berücksichtigen.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
    doi = "10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
    openalex = "W2141294262",
    references = "doi101002joc1276, doi101016jtplants201009008, doi101016jtree200409011, doi101038nature12872, doi101093oso97801951223430010001, doi101093sysbiosyt034, doi101111j14610248200801229x, doi101111j14610248201001515x, doi101146annurevecolsys36102803095431, doi1016410006356820010510933teotwa20co2, openalexw2273605253"
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Die Gewinnung aussagekräftiger Schlussfolgerungen aus phylogenetischen Vergleichsdaten erfordert ein aussagekräftiges Modell der Merkmalsentwicklung. Daher ist es wichtig zu bestimmen, ob das Modell für die Daten und die zu beantwortende Frage geeignet ist. Eine Möglichkeit, dies zu bewerten, besteht darin zu prüfen, ob das Modell eine gute statistische Erklärung für die Variation in den Daten liefert. Bisher haben sich Forscher primär auf die Erklärungskraft eines Modells im Vergleich zu alternativen Modellen konzentriert. Es wurden Methoden entwickelt, um die Angemessenheit oder die absolute Erklärungskraft phylogenetischer Merkmalsmodelle zu bewerten, doch diese waren auf spezifische Modelle oder Fragen beschränkt. Hier stellen wir einen allgemeinen statistischen Rahmen zur Bewertung der Angemessenheit phylogenetischer Merkmalsmodelle vor. Wir verwenden unseren Ansatz, um die statistische Leistung gängiger Merkmalsmodelle an 337 Vergleichsdatensätzen zu bewerten, die drei wesentliche funktionale Merkmale von Angiospermen abdecken. Im Allgemeinen lieferten die von uns getesteten Modelle oft eine schlechte statistische Erklärung für die Entwicklung dieser Merkmale. Dies galt für viele verschiedene Gruppen und auf vielen verschiedenen Ebenen. Ob eine solche statistische Unzulänglichkeit die aus Vergleichsdatensätzen gezogenen Schlussfolgerungen qualitativ verändern wird, hängt vom Kontext ab. Unabhängig davon kann die Bewertung der Modellangemessenheit interessante biologische Erkenntnisse liefern – wie und warum ein Modell die Variation in einem Datensatz nicht beschreibt, gibt uns Hinweise darauf, welche evolutionären Prozesse die Merkmalsentwicklung über die Zeit hinweg angetrieben haben könnten.

@article{doi101086682022,
    author = "Pennell, Matthew W. and FitzJohn, Richard G. and Cornwell, William K. and Harmon, Luke J.",
    title = "Model Adequacy and the Macroevolution of Angiosperm Functional Traits",
    year = "2015",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Making meaningful inferences from phylogenetic comparative data requires a meaningful model of trait evolution. It is thus important to determine whether the model is appropriate for the data and the question being addressed. One way to assess this is to ask whether the model provides a good statistical explanation for the variation in the data. To date, researchers have focused primarily on the explanatory power of a model relative to alternative models. Methods have been developed to assess the adequacy, or absolute explanatory power, of phylogenetic trait models, but these have been restricted to specific models or questions. Here we present a general statistical framework for assessing the adequacy of phylogenetic trait models. We use our approach to evaluate the statistical performance of commonly used trait models on 337 comparative data sets covering three key angiosperm functional traits. In general, the models we tested often provided poor statistical explanations for the evolution of these traits. This was true for many different groups and at many different scales. Whether such statistical inadequacy will qualitatively alter inferences drawn from comparative data sets will depend on the context. Regardless, assessing model adequacy can provide interesting biological insights-how and why a model fails to describe variation in a data set give us clues about what evolutionary processes may have driven trait evolution across time.",
    url = "https://doi.org/10.1086/682022",
    doi = "10.1086/682022",
    openalex = "W2952286239",
    references = "doi101146annurevecolsys120213091905"
}

Unser wachsendes Verständnis des Pflanzenbaums des Lebens bietet eine neue Möglichkeit, die Haupttreiber der Angiospermendiversität aufzudecken. Unter Verwendung einer zeitkalibrierten Phylogenie charakterisierten wir heiße und kalte Flecken der Linienvermehrung über den gesamten Baum des Angiosperm-Lebens, indem wir die evolutionäre Diversifizierung mit schrittweisem AIC (MEDUSA) modellierten. Wir testeten auch das Modell der Verzögerungszeit der Ganzgenomduplikation (WGD)-Strahlung, das postuliert, dass Anstiege in der Diversifizierung hinter etablierten WGD-Ereignissen zurückbleiben. Die Diversifizierungsraten waren im Laufe der evolutionären Geschichte der Angiospermen unglaublich heterogen und offenbaren ein Muster von 'eingeschachtelten Strahlungen' – Anstiege in der Netto-Diversifizierung, die innerhalb anderer Strahlungen eingebettet sind. Dieses Muster erzeugt wiederum eine negative Beziehung zwischen dem Alter der Klade und der Vielfalt über sowohl Familien als auch Ordnungen hinweg. Wir schlagen vor, dass stochastisch veränderliche Diversifizierungsraten über die Phylogenie hinweg diese Muster erklären. Schließlich zeigen wir signifikante statistische Unterstützung für das WGD-Strahlungsverzögerungszeitmodell. Bei Angiospermen führten eingeschachtelte Verschiebungen in der Diversifizierung zu einer insgesamt steigenden Netto-Diversifizierungsrate und sinkenden relativen Aussterberaten im Laufe der Zeit. Diese Diversifizierungsverschiebungen sind nur selten perfekt mit WGD-Ereignissen assoziiert, folgen ihnen aber häufig nach einer Verzögerungsperiode.

@article{doi101111nph13491,
    author = "Tank, David C. und Eastman, Jonathan M. und Pennell, Matthew W. und Soltis, Pamela S. und Soltis, Pamela S. und Hinchliff, Cody E. und Brown, Joseph W. und Sessa, Emily B. und Harmon, Luke J.",
    title = "Nested radiations and the pulse of angiosperm diversification: increased diversification rates often follow whole genome duplications",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Unser wachsendes Verständnis des Pflanzenbaums des Lebens bietet eine neue Möglichkeit, die Haupttreiber der Angiospermendiversität aufzudecken. Unter Verwendung einer zeitkalibrierten Phylogenie charakterisierten wir heiße und kalte Flecken der Linienvermehrung über den gesamten Baum des Angiosperm-Lebens, indem wir die evolutionäre Diversifizierung mit schrittweisem AIC (MEDUSA) modellierten. Wir testeten auch das Modell der Verzögerungszeit der Ganzgenomduplikation (WGD)-Strahlung, das postuliert, dass Anstiege in der Diversifizierung hinter etablierten WGD-Ereignissen zurückbleiben. Die Diversifizierungsraten waren im Laufe der evolutionären Geschichte der Angiospermen unglaublich heterogen und offenbaren ein Muster von 'eingeschachtelten Strahlungen' – Anstiege in der Netto-Diversifizierung, die innerhalb anderer Strahlungen eingebettet sind. Dieses Muster erzeugt wiederum eine negative Beziehung zwischen dem Alter der Klade und der Vielfalt über sowohl Familien als auch Ordnungen hinweg. Wir schlagen vor, dass stochastisch veränderliche Diversifizierungsraten über die Phylogenie hinweg diese Muster erklären. Schließlich zeigen wir signifikante statistische Unterstützung für das WGD-Strahlungsverzögerungszeitmodell. Bei Angiospermen führten eingeschachtelte Verschiebungen in der Diversifizierung zu einer insgesamt steigenden Netto-Diversifizierungsrate und sinkenden relativen Aussterberaten im Laufe der Zeit. Diese Diversifizierungsverschiebungen sind nur selten perfekt mit WGD-Ereignissen assoziiert, folgen ihnen aber häufig nach einer Verzögerungsperiode.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13491",
    doi = "10.1111/nph.13491",
    openalex = "W2159372152",
    references = "doi101111j14610248200901410x, doi101111j14754983201001011x"
}

Pflanzliche funktionelle Merkmale sind die Eigenschaften (morphologisch, physiologisch, phänologisch), die ökologische Strategien repräsentieren und bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften prägen. Variationen in pflanzlichen funktionellen Merkmalen und Merkmals-Syndromen haben sich als nützlich erwiesen, um viele wichtige ökologische Fragen auf verschiedenen Skalen zu beantworten, was zu einer Nachfrage nach standardisierten Methoden zur Messung ökologisch bedeutsamer pflanzlicher Merkmale geführt hat. Diese Forschungsrichtung gehört zu den fruchtbarsten Wegen, um ökologische und evolutionäre Muster und Prozesse zu verstehen. Sie hat zudem das Potenzial, sowohl ein prädiktives Set lokaler, regionaler und globaler Beziehungen zwischen Pflanzen und Umwelt aufzubauen als auch eine breite Palette natürlicher und menschlich getriebener Prozesse zu quantifizieren, einschließlich Veränderungen der Biodiversität, Auswirkungen von Arteninvasionen, Änderungen in biogeochemischen Prozessen und Vegetation–Atmosphäre-Interaktionen. Die Bedeutung dieser Themen diktiert den dringenden Bedarf an mehr und besseren Daten und erhöht den Wert standardisierter Protokolle zur Quantifizierung der Merkmalsvariation verschiedener Arten, insbesondere für Merkmale, die in der Lage sind, Prozesse auf Pflanzen- und Ökosystemebene vorherzusagen, sowie für Merkmale, die relativ leicht gemessen werden können. Aktualisiert und erweitert gegenüber der weit verbreiteten vorherigen Version behält dieses Handbuch den Fokus auf klar präsentierte, weit anwendbare, schrittweise Rezepte bei, mit einem Minimum an theoretischem Text, und enthält nicht nur aktualisierte Methoden für die zuvor behandelten Merkmale, sondern führt auch viele neue Protokolle für weitere Merkmale ein. Dieses neue Handbuch bietet eine bessere Balance zwischen ganzen Pflanzenmerkmalen, Blattmerkmalen, Wurzel- und Stängelmerkmalen sowie regenerativen Merkmalen und legt besonderen Wert auf Merkmale, die wichtig sind, um die Auswirkungen von Arten auf Schlüssel-Ökosystemeigenschaften vorherzusagen. Wir hoffen, dass dieses neue Handbuch zu einem Standardbegleiter in lokalen und globalen Bemühungen wird, um über die Reaktionen und Auswirkungen verschiedener Pflanzenarten im Hinblick auf Umweltveränderungen in Gegenwart, Vergangenheit und Zukunft zu lernen.

@article{doi101071bt12225co,
    author = "Harguindeguy, Natalia Pérez and Díaz, Silvia and Garnier, Éric and Lavorel, Sandra and Poorter, Hendrik and Jaureguiberry, Pedro and Bret‐Harte, M. Syndonia and Cornwell, William K. and Craine, Joseph M. and Gurvich, Diego E. and Urcelay, Carlos and Veneklaas, Erik J. and Reich, Peter B. and Poorter, Lourens and Wright, Ian J. and Ray, Prasun and Enrico, Lucas and Pausas, Juli G. and Vos, Ad and Buchmann, Nina and Funes, Guillermo and Quétier, Fabien and Hodgson, John and Thompson, Ken and Morgan, Huw D. and ter Steege, Hans and Sack, Lawren and Blonder, B. and Poschlod, Peter and Vaieretti, María V. and Conti, Georgina and Staver, A. Carla and Aquino, Sâmia and Cornelissen, J. H. C.",
    title = "Corrigendum to: New handbook for standardised measurement of plant functional traits worldwide",
    year = "2016",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Pflanzliche funktionelle Merkmale sind die Eigenschaften (morphologisch, physiologisch, phänologisch), die ökologische Strategien repräsentieren und bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften prägen. Variationen in pflanzlichen funktionellen Merkmalen und Merkmals-Syndromen haben sich als nützlich erwiesen, um viele wichtige ökologische Fragen auf verschiedenen Skalen zu beantworten, was zu einer Nachfrage nach standardisierten Methoden zur Messung ökologisch bedeutsamer pflanzlicher Merkmale geführt hat. Diese Forschungsrichtung gehört zu den fruchtbarsten Wegen, um ökologische und evolutionäre Muster und Prozesse zu verstehen. Sie hat zudem das Potenzial, sowohl ein prädiktives Set lokaler, regionaler und globaler Beziehungen zwischen Pflanzen und Umwelt aufzubauen als auch eine breite Palette natürlicher und menschlich getriebener Prozesse zu quantifizieren, einschließlich Veränderungen der Biodiversität, Auswirkungen von Arteninvasionen, Änderungen in biogeochemischen Prozessen und Vegetation–Atmosphäre-Interaktionen. Die Bedeutung dieser Themen diktiert den dringenden Bedarf an mehr und besseren Daten und erhöht den Wert standardisierter Protokolle zur Quantifizierung der Merkmalsvariation verschiedener Arten, insbesondere für Merkmale, die in der Lage sind, Prozesse auf Pflanzen- und Ökosystemebene vorherzusagen, sowie für Merkmale, die relativ leicht gemessen werden können. Aktualisiert und erweitert gegenüber der weit verbreiteten vorherigen Version behält dieses Handbuch den Fokus auf klar präsentierte, weit anwendbare, schrittweise Rezepte bei, mit einem Minimum an theoretischem Text, und enthält nicht nur aktualisierte Methoden für die zuvor behandelten Merkmale, sondern führt auch viele neue Protokolle für weitere Merkmale ein. Dieses neue Handbuch bietet eine bessere Balance zwischen ganzen Pflanzenmerkmalen, Blattmerkmalen, Wurzel- und Stängelmerkmalen sowie regenerativen Merkmalen und legt besonderen Wert auf Merkmale, die wichtig sind, um die Auswirkungen von Arten auf Schlüssel-Ökosystemeigenschaften vorherzusagen. Wir hoffen, dass dieses neue Handbuch zu einem Standardbegleiter in lokalen und globalen Bemühungen wird, um über die Reaktionen und Auswirkungen verschiedener Pflanzenarten im Hinblick auf Umweltveränderungen in Gegenwart, Vergangenheit und Zukunft zu lernen.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt12225\_co",
    doi = "10.1071/bt12225\_co",
    openalex = "W2561479186",
    references = "doi101006anbo20001261, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}

© 2016 The Linnean Society of London. Eine Aktualisierung der Klassifikation der Ordnungen und Familien der Angiospermen durch die Angiosperm Phylogeny Group (APG) wird vorgestellt. Mehrere neue Ordnungen werden anerkannt: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales und Vahliales. Dies bringt die Gesamtzahl der im APG-System anerkannten Ordnungen und Familien auf 64 bzw. 416. Wir schlagen zwei zusätzliche informelle Hauptklades vor, Superrosids und Superasterids, die jeweils die zusätzlichen Ordnungen umfassen, die in den größeren Klades dominiert von den Rosiden und Asteriden enthalten sind. Familien, die potenziell monofamiliale Ordnungen bildeten, Dasypogonaceae und Sabiaceae, werden stattdessen den Arecales bzw. Proteales zugeordnet. Zwei parasitäre Familien, deren Position früher unsicher war, werden nun platziert: Cynomoriaceae in Saxifragales und Apodanthaceae in Cucurbitales. Obwohl es Hinweise darauf gibt, dass einige Familien, die in APG III anerkannt sind, nicht monophyletisch sind, treffen wir keine Änderungen bei Dioscoreales und Santalales im Vergleich zu APG III und lassen einige Gattungen in Lamiales unplatziert (z. B. Peltanthera). Diese Änderungen der familiären Umgrenzung und Anerkennung sind alle auf neue Ergebnisse zurückzuführen, die seit APG III veröffentlicht wurden, mit Ausnahme einiger Änderungen, die einfach aufgrund nomenklatorischer Fragen vorliegen, zu denen die Substitution von Asphodelaceae für Xanthorrhoeaceae (Asparagales) und Francoaceae für Melianthaceae (Geraniales) gehören; jedoch schließen wir in Francoaceae auch Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae und Vivianiaceae ein. Andere Änderungen der Familienbegrenzung sind nicht drastisch oder zahlreich und konzentrieren sich hauptsächlich auf einige Mitglieder der Lamiiden, insbesondere die ehemalige Icacinaceae, die lange Zeit problematisch war, wobei mehrere Gattungen zur ehemals monogenerischen Metteniusaceae verlegt wurden, aber geringfügige Änderungen der Umgrenzung umfassen Aristolochiaceae (jetzt einschließlich Lactoridaceae und Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (aus Juncaginaceae entfernt; Alismatales), Restionaceae (jetzt wieder einschließlich Anarthriaceae und Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (jetzt einschließlich Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (aus Euphorbiaceae getrennt; Malpighiales), Anerkennung von Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae und Microteaceae (alle Caryophyllales), Aufspaltung von Petiveriaceae aus Phytolaccaceae (Caryophyllales), Änderungen der Gattungs-Zusammensetzung von Ixonanthaceae und Irvingiaceae (mit Übertragung von Allantospermum von der einen zur anderen; Malpighiales), Übertragung von Pakaraimaea (ehemals Dipterocarpaceae) zu Cistaceae (Malvales), Übertragung von Borthwickia, Forchhammeria, Stixis und Tirania (ehemals alle Capparaceae) zu Resedaceae (Brassicales), Aufspaltung von Nyssaceae aus Cornaceae (Cornales), Versetzung von Pteleocarpa zu Gelsemiaceae (Gentianales), Änderungen der Gattungs-Zusammensetzung von Gesneriaceae (Sanango aus Loganiaceae entfernt) und Orobanchaceae (jetzt einschließlich Lindenbergiaceae und Rehmanniaceae) und Anerkennung von Mazaceae als von Phrymaceae getrennt (alle Lamiales).

@article{doi101111boj12385,
    author = "Group, The Angiosperm Phylogeny",
    title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV",
    year = "2016",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    abstract = "© 2016 The Linnean Society of London. Eine Aktualisierung der Klassifikation der Angiosperm Phylogeny Group (APG) für die Ordnungen und Familien der Angiospermen wird vorgestellt. Mehrere neue Ordnungen werden anerkannt: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales und Vahliales. Dadurch steigt die Gesamtzahl der im APG-System anerkannten Ordnungen und Familien auf 64 bzw. 416. Wir schlagen zwei zusätzliche informelle Hauptklades vor, Superrosids und Superasterids, die jeweils die zusätzlichen Ordnungen umfassen, die in den größeren Klades dominiert von den Rosiden und Asteriden enthalten sind. Familien, die potenziell monofamiliale Ordnungen bildeten, Dasypogonaceae und Sabiaceae, werden stattdessen den Arecales und Proteales zugeordnet. Zwei parasitäre Familien, deren Position früher unsicher war, werden nun platziert: Cynomoriaceae in Saxifragales und Apodanthaceae in Cucurbitales. Obwohl es Hinweise darauf gibt, dass einige Familien, die in APG III anerkannt wurden, nicht monophyletisch sind, machen wir keine Änderungen bei Dioscoreales und Santalales im Vergleich zu APG III und lassen einige Gattungen in Lamiales unplatziert (z. B. Peltanthera). Diese Änderungen der familiären Umgrenzung und Anerkennung sind alle auf neue Ergebnisse zurückzuführen, die seit APG III veröffentlicht wurden, mit Ausnahme einiger Änderungen, die einfach aufgrund nomenklatorischer Fragen entstanden sind, die den Ersatz von Asphodelaceae durch Xanthorrhoeaceae (Asparagales) und Francoaceae durch Melianthaceae (Geraniales) umfassen; jedoch schließen wir in Francoaceae auch Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae und Vivianiaceae ein. Andere Änderungen der familiären Grenzen sind nicht drastisch oder zahlreich und konzentrieren sich hauptsächlich auf einige Mitglieder der Lamiids, insbesondere die ehemaligen Icacinaceae, die lange Zeit problematisch waren, wobei mehrere Gattungen in die ehemals monogenerische Metteniusaceae verlegt wurden, aber geringfügige Änderungen der Umgrenzung umfassen Aristolochiaceae (jetzt einschließlich Lactoridaceae und Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (aus Juncaginaceae entfernt; Alismatales), Restionaceae (jetzt wieder einschließlich Anarthriaceae und Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (jetzt einschließlich Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (aus Euphorbiaceae getrennt; Malpighiales), Anerkennung von Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae und Microteaceae (alle Caryophyllales), Aufspaltung von Petiveriaceae aus Phytolaccaceae (Caryophyllales), Änderungen der Gattungs-Zusammensetzung von Ixonanthaceae und Irvingiaceae (mit Übertragung von Allantospermum von der einen zur anderen; Malpighiales), Übertragung von Pakaraimaea (ehemals Dipterocarpaceae) zu Cistaceae (Malvales), Übertragung von Borthwickia, Forchhammeria, Stixis und Tirania (ehemals alle Capparaceae) zu Resedaceae (Brassicales), Aufspaltung von Nyssaceae aus Cornaceae (Cornales), Verschiebung von Pteleocarpa zu Gelsemiaceae (Gentianales), Änderungen der Gattungs-Zusammensetzung von Gesneriaceae (Sanango von Loganiaceae entfernt) und Orobanchaceae (jetzt einschließlich Lindenbergiaceae und Rehmanniaceae) und Anerkennung von Mazaceae als von Phrymaceae getrennt (alle Lamiales).",
    url = "https://doi.org/10.1111/boj.12385",
    doi = "10.1111/boj.12385",
    openalex = "W2166152751",
    references = "doi1010079783642143977, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas1323926111, doi101111j10958339200900996x, doi101111j109600311996tb00196x, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023071222465, doi1023072399846, doi10230725065646, doi103732ajb0800047, openalexw3148514506, openalexw70084438"
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Neueste Fortschritte in der molekularen Phylogenie und eine Reihe wichtiger paläobotanischer Entdeckungen haben unser Verständnis der Angiospermendiversifizierung revolutioniert. Dennoch bleibt der Ursprung und die frühe Evolution ihrer charakteristischsten Eigenschaft, der Blüte, schlecht verstanden. Insbesondere ist die Struktur der ursprünglichen Blüte aller lebenden Angiospermen noch unklar. Hier berichten wir modellbasierte Rekonstruktionen für ursprüngliche Blüten an den tiefsten Knoten in der Phylogenie der Angiospermen unter Verwendung des bisher größten Datensatzes von Blütenmerkmalen. Wir rekonstruieren die ursprüngliche Angiospermenblüte als zweigeschlechtlich und radial symmetrisch, mit mehr als zwei Kreisen von jeweils drei getrennten Blütenhüllorganen (undifferenzierte Tepalen), mehr als zwei Kreisen von jeweils drei getrennten Staubblättern und mehr als fünf spiralförmig angeordneten getrennten Fruchtblättern. Obwohl für einige Merkmale Unsicherheit bleibt, ermöglicht unsere Rekonstruktion es uns, ein neues plausibles Szenario für die frühe Diversifizierung der Blüten vorzuschlagen, was zu neuen überprüfbaren Hypothesen für zukünftige Forschung an Angiospermen führt.

@article{doi101038ncomms16047,
    author = "Sauquet, Hervé und von Balthazar, Maria und Magallón, Susana und Doyle, James A. und Endress, Peter K. und Bailes, Emily J. und de Morais, Érica Barroso und Bull–Hereñu, Kester und Carrive, Laetitia und Chartier, Marion und Chomicki, Guillaume und Coiro, Mario und Cornette, Raphaël und Ottra, Juliana Hanna Leite El und Epicoco, Cyril und Foster, Charles S. P. und Jabbour, Florian und Haevermans, Agathe und Haevermans, Thomas und Hernández, Rebeca und Little, Stefan A. und Löfstrand, Stefan und Luna, Javier A. und Massoni, Julien und Nadot, Sophie und Pamperl, Susanne und Prieu, Charlotte und Reyes, Elisabeth und dos Santos, Patrícia und Schoonderwoerd, Kristel M. und Sontag, Susanne und Soulebeau, Anaëlle und Staedler, Yannick M. und Tschan, Georg F. und Leung, Amy Wing-Sze und Schönenberger, Jürg",
    title = "The ancestral flower of angiosperms and its early diversification",
    year = "2017",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Neueste Fortschritte in der molekularen Phylogenie und eine Reihe wichtiger paläobotanischer Entdeckungen haben unser Verständnis der Angiospermendiversifizierung revolutioniert. Dennoch bleibt der Ursprung und die frühe Evolution ihrer charakteristischsten Eigenschaft, der Blüte, schlecht verstanden. Insbesondere ist die Struktur der ursprünglichen Blüte aller lebenden Angiospermen noch unklar. Hier berichten wir modellbasierte Rekonstruktionen für ursprüngliche Blüten an den tiefsten Knoten in der Phylogenie der Angiospermen unter Verwendung des bisher größten Datensatzes von Blütenmerkmalen. Wir rekonstruieren die ursprüngliche Angiospermenblüte als zweigeschlechtlich und radial symmetrisch, mit mehr als zwei Kreisen von jeweils drei getrennten Blütenhüllorganen (undifferenzierte Tepalen), mehr als zwei Kreisen von jeweils drei getrennten Staubblättern und mehr als fünf spiralförmig angeordneten getrennten Fruchtblättern. Obwohl für einige Merkmale Unsicherheit bleibt, ermöglicht unsere Rekonstruktion es uns, ein neues plausibles Szenario für die frühe Diversifizierung der Blüten vorzuschlagen, was zu neuen überprüfbaren Hypothesen für zukünftige Forschung an Angiospermen führt.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms16047",
    doi = "10.1038/ncomms16047",
    openalex = "W2741748285",
    references = "doi101073pnas0709121104, doi101073pnas1323926111, doi101080106351501753462876, doi10108010635150490522232, doi10108010635150490522304, doi10108010635150701607033, doi101086675935, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093molbevmss075, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi1011112041210x12420, doi101111boj12385, doi101146annurevearth042711105313, doi103732ajb0800047"
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Der Erfolg der Polyploidie, der diploiden Vorfahren fast aller Pflanzen verdrängt, wird gut durch die enorme Angiospermen-Diversität veranschaulicht, die von wiederkehrenden Polyploidisierungsereignissen ausgehen soll. Auffällig ist, dass die Polyploidisierung oft vor oder gleichzeitig mit großen evolutionären Übergängen und der adaptiven Strahlung von Arten stattfand, was das Konzept unterstützt, dass die Polyploidie eine vorherrschende Rolle in Ausbrüchen adaptiver Artbildung spielt. Polyploidie führt zu sofortiger genetischer Redundanz und stellt, zusammen mit der Entstehung neuer Genfunktionen, eine wichtige Quelle für Neuheiten dar. Zusammen mit Rekombination, Genmutation, Transposon-Aktivität und chromosomaler Umordnung wirken Polyploidie und Ganzgenomduplikation als Treiber der Evolution und Divergenz im Pflanzenverhalten und der Genfunktion, wodurch Diversifizierung, Artbildung und damit die Pflanzenentwicklung ermöglicht werden.

@article{doi101093aobmcx079,
    author = "Alix, Karine und Gérard, P. und Schwarzacher, Trude und Heslop‐Harrison, J. S.",
    title = "Polyploidie und interspezifische Hybridisierung: Partner für Anpassung, Artbildung und Evolution bei Pflanzen",
    year = "2017",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "Der Erfolg der Polyploidie, der diploiden Vorfahren fast aller Pflanzen verdrängt, wird gut durch die enorme Angiospermen-Diversität veranschaulicht, die von wiederkehrenden Polyploidisierungsereignissen ausgehen soll. Auffällig ist, dass die Polyploidisierung oft vor oder gleichzeitig mit großen evolutionären Übergängen und der adaptiven Strahlung von Arten stattfand, was das Konzept unterstützt, dass die Polyploidie eine vorherrschende Rolle in Ausbrüchen adaptiver Artbildung spielt. Polyploidie führt zu sofortiger genetischer Redundanz und stellt, zusammen mit der Entstehung neuer Genfunktionen, eine wichtige Quelle für Neuheiten dar. Zusammen mit Rekombination, Genmutation, Transposon-Aktivität und chromosomaler Umordnung wirken Polyploidie und Ganzgenomduplikation als Treiber der Evolution und Divergenz im Pflanzenverhalten und der Genfunktion, wodurch Diversifizierung, Artbildung und damit die Pflanzenentwicklung ermöglicht werden.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcx079",
    doi = "10.1093/aob/mcx079",
    openalex = "W2734942911",
    references = "doi101002bies201100035, doi101016jpalaeo200507006, doi101111j14697998201100829x"
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In der Pflanzenmikrobiota stellen mutualistische Pilz- und bakterielle Symbionten auffällige Beispiele für Mikroorganismen dar, die eine entscheidende Rolle bei der Nährstoffaufnahme spielen. Sie haben sich seit der anfänglichen Anpassung der Pflanzen an Land mit ihren Wirten koevolviert. Trotz der evolutionären Distanzen, die Mykorrhiza- und Stickstofffixierungs-Symbiosen trennen, teilen diese Assoziationen eine Reihe hochkonservierter Merkmale, darunter spezifische pflanzliche symbiotische Signalwege, Strategien zur Wurzelbesiedelung, die pflanzliche Immunantworten umgehen, die Bildung einer funktionalen Schnittstelle zwischen Wirt und Mikroorganismus sowie die zentrale Rolle von Phytohormonen in symbioseassoziierten Wurzelentwicklungswegen. Wir heben jüngste und aufkommende Untersuchungsbereiche im Zusammenhang mit diesen evolutionär konservierten Mechanismen hervor, mit einem Schwerpunkt auf den ursprünglicheren Mykorrhiza-Assoziationen, und betrachten, inwieweit dieses Wissen zu einem Verständnis von Pflanzen-Mikrobiota-Assoziationen insgesamt beitragen kann.

@article{doi101126scienceaad4501,
    author = "Martin, Francis und Uroz, Stéphane und Barker, David G.",
    title = "Ancestral alliances: Plant mutualistic symbioses with fungi and bacteria",
    year = "2017",
    journal = "Science",
    abstract = "In der Pflanzenmikrobiota stellen mutualistische Pilz- und bakterielle Symbionten auffällige Beispiele für Mikroorganismen dar, die eine entscheidende Rolle bei der Nährstoffaufnahme spielen. Sie haben sich seit der anfänglichen Anpassung der Pflanzen an Land mit ihren Wirten koevolviert. Trotz der evolutionären Distanzen, die Mykorrhiza- und Stickstofffixierungs-Symbiosen trennen, teilen diese Assoziationen eine Reihe hochkonservierter Merkmale, darunter spezifische pflanzliche symbiotische Signalwege, Strategien zur Wurzelbesiedelung, die pflanzliche Immunantworten umgehen, die Bildung einer funktionalen Schnittstelle zwischen Wirt und Mikroorganismus sowie die zentrale Rolle von Phytohormonen in symbioseassoziierten Wurzelentwicklungswegen. Wir heben jüngste und aufkommende Untersuchungsbereiche im Zusammenhang mit diesen evolutionär konservierten Mechanismen hervor, mit einem Schwerpunkt auf den ursprünglicheren Mykorrhiza-Assoziationen, und betrachten, inwieweit dieses Wissen zu einem Verständnis von Pflanzen-Mikrobiota-Assoziationen insgesamt beitragen kann.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aad4501",
    doi = "10.1126/science.aad4501",
    openalex = "W2618012128",
    references = "doi101038ncomms5087, doi101098rstb20110271"
}

Die terrestrische Vegetation ist zweifellos ein wichtiger Faktor im Klimasystem, der den Austausch von Energie, Impuls, Wasserdampf und anderen Spurengasen zwischen Land und Atmosphäre moduliert. Hier überprüfen wir die Evolution der terrestrischen Flora vom Proterozoikum bis zum Neogen auf drei unterschiedlichen Ebenen – die allgemeine Evolution der floristischen Zusammensetzung, die Evolution der Pflanzenphysiologie und die Evolution der Landschaftsbesiedelung sowohl räumlich als auch saisonal – alles im Kontext dessen, wie die Vegetation den Klimawandel im Laufe der Zeit beeinflusst haben könnte und welche evolutionären Übergänge in der tiefen Zeit den größten Effekt hatten. Unser Fokus liegt auf den direkten Auswirkungen der Vegetation auf Temperatur und Niederschlag, aber wir betrachten auch die indirekten Auswirkungen der Pflanzen auf das Klima über die atmosphärische Zusammensetzung. Wir argumentieren, dass die Zeiten der größten Veränderungen in den pflanzlichen Klimarückkopplungen wahrscheinlich das Karbon und das frühe Paläogen waren.

@article{doi101146annurevearth063016015629,
    author = "Boyce, C. Kevin und Lee, Jung‐Eun",
    title = "Plant Evolution and Climate Over Geological Timescales",
    year = "2017",
    journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
    abstract = "Die terrestrische Vegetation ist zweifellos ein wichtiger Faktor im Klimasystem, der den Austausch von Energie, Impuls, Wasserdampf und anderen Spurengasen zwischen Land und Atmosphäre moduliert. Hier überprüfen wir die Evolution der terrestrischen Flora vom Proterozoikum bis zum Neogen auf drei unterschiedlichen Ebenen – die allgemeine Evolution der floristischen Zusammensetzung, die Evolution der Pflanzenphysiologie und die Evolution der Landschaftsbesiedelung sowohl räumlich als auch saisonal – alles im Kontext dessen, wie die Vegetation den Klimawandel im Laufe der Zeit beeinflusst haben könnte und welche evolutionären Übergänge in der tiefen Zeit den größten Effekt hatten. Unser Fokus liegt auf den direkten Auswirkungen der Vegetation auf Temperatur und Niederschlag, aber wir betrachten auch die indirekten Auswirkungen der Pflanzen auf das Klima über die atmosphärische Zusammensetzung. Wir argumentieren, dass die Zeiten der größten Veränderungen in den pflanzlichen Klimarückkopplungen wahrscheinlich das Karbon und das frühe Paläogen waren.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-earth-063016-015629",
    doi = "10.1146/annurev-earth-063016-015629",
    openalex = "W2523635891",
    references = "doi101098rspb20132829, doi101126science1260947"
}

Diese Studie zeigt einen Weg, verfügbare Ressourcen zu kombinieren, um eine datierte Phylogenie für Pflanzen zu erstellen. Dieser Ansatz ist jedoch ein erster Schritt, und weitere Entwicklungen sind erforderlich, um Daten hinzuzufügen, die zugrundeliegende Unsicherheiten besser zu berücksichtigen, und die Auflösung zu verbessern. Die hier diskutierten Methoden können auch auf andere große Klades im Baum des Lebens angewendet werden.

@article{doi101002ajb21019,
    author = "Smith, Stephen A. und Brown, Joseph W.",
    title = "Aufbau einer weit gefassten Phylogenie von Samenpflanzen",
    year = "2018",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Diese Studie zeigt einen Weg, verfügbare Ressourcen zu kombinieren, um eine datierte Phylogenie für Pflanzen zu erstellen. Dieser Ansatz ist jedoch ein erster Schritt, und weitere Entwicklungen sind erforderlich, um Daten hinzuzufügen, die zugrundeliegende Unsicherheiten besser zu berücksichtigen, und die Auflösung zu verbessern. Die hier diskutierten Methoden können auch auf andere große Klades im Baum des Lebens angewendet werden.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ajb2.1019",
    doi = "10.1002/ajb2.1019",
    openalex = "W2792688220",
    references = "doi101038nature11631, doi101038nature12872, doi101038ncomms16047, doi101038ncomms2958, doi101073pnas1323926111, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101111nph13264, doi101111syen12037"
}

Nach Jahrzehnten molekularer phylogenetischer Studien ist die tiefe Phylogenie der Gymnospermen nicht geklärt, und die phylogenetische Einordnung der Gnetales bleibt eines der umstrittensten Themen in der Evolution der Samenpflanzen. Um die tiefe Phylogenie der Samenpflanzen zu klären und die Ursachen phylogenetischer Konflikte zu untersuchen, führten wir eine phylotranskriptomische Studie mit einer Stichprobe aller 13 Familien der Gymnospermen und der Hauptlinien der Angiospermen durch. Mehrere Datensätze, die bis zu 1 296 042 Positionen über 1308 Loci umfassen, wurden unter Verwendung von Concatenation- und Koaleszenz-Ansätzen analysiert. Unsere Studie erzeugte eine konsistente und gut aufgelöste Phylogenie der Samenpflanzen, die die Gnetales als Schwestergruppe der Pinaceae einordnet und damit die Gnepine-Hypothese unterstützt. Zykaden plus Ginkgo sind Schwestergruppe der übrigen Gymnospermen. Wir stellten auch fest, dass Gnetales und Angiospermen ähnliche molekulare Evolutionsraten aufweisen, die viel höher sind als die anderer Gymnospermen. Dies impliziert, dass Gnetales und Angiospermen in ihren evolutionären Geschichtverläufen ähnlichen Selektionsdruck erfahren haben könnten. Konvergente molekulare Evolution oder Homoplasie tragen teilweise zu den phylogenetischen Konflikten bei Samenpflanzen bei. Unsere Studie liefert eine robust rekonstruierte Grundgerüst-Phylogenie, die für zukünftige molekulare und morphologische Studien von Samenpflanzen, insbesondere Gymnospermen, im Lichte der Evolution wichtig ist.

@article{doi101098rspb20181012,
    author = "Ran, Jin‐Hua und Shen, Tingting und Wang, Mingming und Wang, Xiaoquan",
    title = "Phylogenomics resolves the deep phylogeny of seed plants and indicates partial convergent or homoplastic evolution between Gnetales and angiosperms",
    year = "2018",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Nach Jahrzehnten molekularer phylogenetischer Studien ist die tiefe Phylogenie der Gymnospermen nicht geklärt, und die phylogenetische Einordnung der Gnetales bleibt eines der umstrittensten Themen in der Evolution der Samenpflanzen. Um die tiefe Phylogenie der Samenpflanzen zu klären und die Ursachen phylogenetischer Konflikte zu untersuchen, führten wir eine phylotranskriptomische Studie mit einer Stichprobe aller 13 Familien der Gymnospermen und der Hauptlinien der Angiospermen durch. Mehrere Datensätze, die bis zu 1 296 042 Positionen über 1308 Loci umfassen, wurden unter Verwendung von Concatenation- und Koaleszenz-Ansätzen analysiert. Unsere Studie erzeugte eine konsistente und gut aufgelöste Phylogenie der Samenpflanzen, die die Gnetales als Schwestergruppe der Pinaceae einordnet und damit die Gnepine-Hypothese unterstützt. Zykaden plus Ginkgo sind Schwestergruppe der übrigen Gymnospermen. Wir stellten auch fest, dass Gnetales und Angiospermen ähnliche molekulare Evolutionsraten aufweisen, die viel höher sind als die anderer Gymnospermen. Dies impliziert, dass Gnetales und Angiospermen in ihren evolutionären Geschichtverläufen ähnlichen Selektionsdruck erfahren haben könnten. Konvergente molekulare Evolution oder Homoplasie tragen teilweise zu den phylogenetischen Konflikten bei Samenpflanzen bei. Unsere Studie liefert eine robust rekonstruierte Grundgerüst-Phylogenie, die für zukünftige molekulare und morphologische Studien von Samenpflanzen, insbesondere Gymnospermen, im Lichte der Evolution wichtig ist.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2018.1012",
    doi = "10.1098/rspb.2018.1012",
    openalex = "W2808886394",
    references = "doi101038nbt1883, doi101038nprot2013084, doi101093bioinformaticsbtl158, doi101093bioinformaticsbtu033, doi101093bioinformaticsbtu170, doi101093molbevmsm088, doi101093molbevmst010, doi101093molbevmsw260, doi101093sysbiosys029, doi101186s1305901507212"
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Inhaltsübersicht 1108 I. Einleitung 1108 II. Mykorrhiza-Pflanzenvielfalt auf globaler und lokaler Ebene 1108 III. Mykorrhiza-Evolution in Pflanzen: eine kurze Aktualisierung 1111 IV. Schlussfolgerungen und Perspektiven 1114 Referenzen 1114 ZUSAMMENFASSUNG: Die Mehrheit der Gefäßpflanzen ist mykorrhizal: 72 % sind arbuskuläre Mykorrhiza (AM), 2,0 % sind Ektomykorrhiza (EcM), 1,5 % sind erikoid Mykorrhiza und 10 % sind Orchideen-Mykorrhiza. Nur 8 % sind vollständig nicht-mykorrhizal (NM), während 7 % inkonsistente NM-AM-Assoziationen aufweisen. Die meisten NM- und NM-AM-Pflanzen sind Ernährungsspezialisten (z. B. Fleischfresser und Parasiten) oder Habitatspezialisten (z. B. Hydrophyten und Epiphyten). Mykorrhiza-Assoziationen sind in den meisten Familien konsistent, es gibt jedoch Ausnahmen bei komplexen Wurzeln (z. B. sowohl EcM als auch AM). Wir erkennen drei Wellen der mykorrhizalen Evolution, beginnend mit AM in frühen Landpflanzen, fortgesetzt im Kreidezeitraum mit mehreren neuen NM- oder EcM-Linien, erikoider und Orchideen-Mykorrhiza. Die dritte Welle, die jüngst und andauernd ist, hat zu Wurzelkomplexität geführt, die mit einer schnellen Pflanzendiversifizierung in Biodiversitäts-Hotspots verbunden ist.

@article{doi101111nph14976,
    author = "Brundrett, Mark und Tedersoo, Leho",
    title = "Evolutionäre Geschichte der mykorrhizalen Symbiosen und globale Wirtspflanzenvielfalt",
    year = "2018",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Inhaltsübersicht 1108 I. Einleitung 1108 II. Mykorrhiza-Pflanzenvielfalt auf globaler und lokaler Ebene 1108 III. Mykorrhiza-Evolution in Pflanzen: eine kurze Aktualisierung 1111 IV. Schlussfolgerungen und Perspektiven 1114 Referenzen 1114 ZUSAMMENFASSUNG: Die Mehrheit der Gefäßpflanzen ist mykorrhizal: 72 % sind arbuskuläre Mykorrhiza (AM), 2,0 % sind Ektomykorrhiza (EcM), 1,5 % sind erikoid Mykorrhiza und 10 % sind Orchideen-Mykorrhiza. Nur 8 % sind vollständig nicht-mykorrhizal (NM), während 7 % inkonsistente NM-AM-Assoziationen aufweisen. Die meisten NM- und NM-AM-Pflanzen sind Ernährungsspezialisten (z. B. Fleischfresser und Parasiten) oder Habitatspezialisten (z. B. Hydrophyten und Epiphyten). Mykorrhiza-Assoziationen sind in den meisten Familien konsistent, es gibt jedoch Ausnahmen bei komplexen Wurzeln (z. B. sowohl EcM als auch AM). Wir erkennen drei Wellen der mykorrhizalen Evolution, beginnend mit AM in frühen Landpflanzen, fortgesetzt im Kreidezeitraum mit mehreren neuen NM- oder EcM-Linien, erikoider und Orchideen-Mykorrhiza. Die dritte Welle, die jüngst und andauernd ist, hat zu Wurzelkomplexität geführt, die mit einer schnellen Pflanzendiversifizierung in Biodiversitäts-Hotspots verbunden ist.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.14976",
    doi = "10.1111/nph.14976",
    openalex = "W2792482912",
    references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038nrg201726, doi101146annurevearth261379"
}

Effizientere Gasaustauschstrategien in dynamischen Lichtumgebungen wurden als Beitrag zur Dominanz der Angiospermen in der Gefäßpflanzenflora vermutet. Dennoch fehlt uns ein klares Verständnis davon, wie Stomata-Dynamiken die photosynthetische Dynamik beeinflussen und ob Unterschiede zwischen Abstammungslinien bestehen. Stomata- und photosynthetische Dynamiken nach Änderungen der Bestrahlungsstärke wurden bei 15 Arten untersucht, darunter Farnen, Gymnospermen und Angiospermen. Wir bestimmten den Einfluss der Stomata-Geschwindigkeit auf die dynamische Photosynthese und den Wasserverlust. Darüber hinaus bewerteten wir, ob sich das dynamische Verhalten an evolutionäre Abstammungslinien anpasst oder ob die ökologische Anpassung zur Maximierung der Nutzung von Lichtflecken das dynamische Verhalten beschreiben kann. Wir fanden heraus, dass Arten mit schneller Stomata-Öffnung, wie Farnen, weniger Photosynthese während der photosynthetischen Induktion aufgeben. Im Gegensatz dazu bestand kein Zusammenhang zwischen der Geschwindigkeit der Stomata-Schließung und dem durch vorübergehend stärker geöffnete Stomata verschwendeten Wasser, da Arten mit höheren Gasaustauschraten auch eine schnellere Stomata-Schließung zeigten. Schattenangepasste Arten besaßen schnell öffnende, aber langsam schließende Stomata, was mit der ökologischen Anpassung zur Maximierung der Nutzung von Lichtflecken übereinstimmt. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass sich das dynamische Verhalten stärker an adaptive ökologische Trends als an evolutionäre anpasst, aber Angiospermen könnten von einer relativ schnelleren photosynthetischen Induktion profitieren, indem sie eine weniger konservative Wasserstrategie annehmen.

@article{doi101111nph15572,
    author = "Deans, Ross M. and Brodribb, Timothy J. and Busch, Florian A. and Farquhar, Graham D.",
    title = "Plant water‐use strategy mediates stomatal effects on the light induction of photosynthesis",
    year = "2018",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Effizientere Gasaustauschstrategien in dynamischen Lichtumgebungen wurden als Beitrag zur Dominanz der Angiospermen in der Gefäßpflanzenflora vermutet. Dennoch fehlt uns ein klares Verständnis davon, wie Stomata-Dynamiken die photosynthetische Dynamik beeinflussen und ob Unterschiede zwischen Abstammungslinien bestehen. Stomata- und photosynthetische Dynamiken nach Änderungen der Bestrahlungsstärke wurden bei 15 Arten untersucht, darunter Farnen, Gymnospermen und Angiospermen. Wir bestimmten den Einfluss der Stomata-Geschwindigkeit auf die dynamische Photosynthese und den Wasserverlust. Darüber hinaus bewerteten wir, ob sich das dynamische Verhalten an evolutionäre Abstammungslinien anpasst oder ob die ökologische Anpassung zur Maximierung der Nutzung von Lichtflecken das dynamische Verhalten beschreiben kann. Wir fanden heraus, dass Arten mit schneller Stomata-Öffnung, wie Farnen, weniger Photosynthese während der photosynthetischen Induktion aufgeben. Im Gegensatz dazu bestand kein Zusammenhang zwischen der Geschwindigkeit der Stomata-Schließung und dem durch vorübergehend stärker geöffnete Stomata verschwendeten Wasser, da Arten mit höheren Gasaustauschraten auch eine schnellere Stomata-Schließung zeigten. Schattenangepasste Arten besaßen schnell öffnende, aber langsam schließende Stomata, was mit der ökologischen Anpassung zur Maximierung der Nutzung von Lichtflecken übereinstimmt. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass sich das dynamische Verhalten stärker an adaptive ökologische Trends als an evolutionäre anpasst, aber Angiospermen könnten von einer relativ schnelleren photosynthetischen Induktion profitieren, indem sie eine weniger konservative Wasserstrategie annehmen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.15572",
    doi = "10.1111/nph.15572",
    openalex = "W2899292980",
    references = "doi101098rspb20132829"
}

@incollection{crossref2019angiosperms,
    title = "Angiospermen",
    year = "2019",
    booktitle = "Einführung in Pflanzenfossilien",
    url = "https://doi.org/10.1017/9781108650021.010",
    doi = "10.1017/9781108650021.010",
    pages = "188-212"
}

Wasserlilien gehören zur Ordnung der Bedecktsamer Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales und Austrobaileyales bilden gemeinsam die sogenannte ANA-Stufe der Bedecktsamer, die lebenden Vertreter von Abstammungslinien sind, die sich am frühesten von der Linie abspalteten, die zu den heutigen Mesangiospermen führt 1-3. Hier berichten wir über die 409-Megabase-Genomsequenz der Wasserlilie mit blauen Blütenblättern (Nymphaea colorata). Unsere phylogenomischen Analysen stützen Amborellales und Nymphaeales als aufeinanderfolgende Schwesterlinien zu allen anderen lebenden Bedecktsamern. Das N. colorata-Genom und 19 weitere Wasserlilien-Transkriptomdaten zeigen ein Nymphaealean-Genomverdopplungsereignis, das von Nymphaeaceae und möglicherweise Cabombaceae geteilt wird. Zu den Genen, die aus dieser Genomverdopplung erhalten wurden, gehören Homologe von Genen, die den Übergang zur Blüte und die Blütenentwicklung regulieren. Die breite Expression von Homologen von floralen ABCE-Genen in N. colorata könnte ein ähnlich breit aktives ancestrales ABCE-Modell der Bestimmung von Blütenorganen bei frühen Bedecktsamern unterstützen. Wasserlilien haben attraktive duftende Blüten und Farben entwickelt, Merkmale, die mit Mesangiospermen geteilt werden, und wir haben ihre vermuteten biosynthetischen Gene in N. colorata identifiziert. Die chemischen Verbindungen und biosynthetischen Gene hinter den Blütendüften deuten darauf hin, dass sie parallel zu denen in Mesangiospermen evolviert sind. Aufgrund seiner einzigartigen phylogenetischen Position wirft das N. colorata-Genom Licht auf die frühe Evolution der Bedecktsamer.

@article{doi101038s4158601918525,
    author = "Zhang, Liangsheng und Chen, Fei und Zhang, Xingtan und Li, Zhen und Zhao, Yiyong und Lohaus, Rolf und Chang, Xiaojun und Dong, Wei und Ho, Simon Y. W. und Liu, Xing und Song, Aixia und Chen, Junhao und Guo, Wenlei und Wang, Zhengjia und Zhuang, Yingyu und Wang, Haifeng und Chen, Xuequn und Hu, Juan und Liu, Yanhui und Qin, Yuan und Wang, Kai und Dong, Shanshan und Liu, Yang und Zhang, Shouzhou und Yu, Xianxian und Wu, Qian und Wang, Liangsheng und Yan, Xueqing und Jiao, Yuannian und Kong, Hongzhi und Zhou, Xiaofan und Yu, Cuiwei und Chen, Yuchu und Li, Fan und Wang, Jihua und Chen, Wei und Chen, Xinlu und Jia, Qidong und Zhang, Chi und Jiang, Yifan und Zhang, Wanbo und Liu, Guanhua und Fu, Jianyu und Chen, Feng und Mā, Hong und de Peer, Yves Van und Tang, Haibao",
    title = "Das Wasserlilien-Genom und die frühe Evolution der Blütenpflanzen",
    year = "2019",
    journal = "Nature",
    abstract = "Wasserlilien gehören zur Ordnung der Bedecktsamer Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales und Austrobaileyales bilden gemeinsam die sogenannte ANA-Stufe der Bedecktsamer, die lebenden Vertreter von Abstammungslinien sind, die sich am frühesten von der Linie abspalteten, die zu den heutigen Mesangiospermen führt 1-3. Hier berichten wir über die 409-Megabase-Genomsequenz der Wasserlilie mit blauen Blütenblättern (Nymphaea colorata). Unsere phylogenomischen Analysen stützen Amborellales und Nymphaeales als aufeinanderfolgende Schwesterlinien zu allen anderen lebenden Bedecktsamern. Das N. colorata-Genom und 19 weitere Wasserlilien-Transkriptomdaten zeigen ein Nymphaealean-Genomverdopplungsereignis, das von Nymphaeaceae und möglicherweise Cabombaceae geteilt wird. Zu den Genen, die aus dieser Genomverdopplung erhalten wurden, gehören Homologe von Genen, die den Übergang zur Blüte und die Blütenentwicklung regulieren. Die breite Expression von Homologen von floralen ABCE-Genen in N. colorata könnte ein ähnlich breit aktives ancestrales ABCE-Modell der Bestimmung von Blütenorganen bei frühen Bedecktsamern unterstützen. Wasserlilien haben attraktive duftende Blüten und Farben entwickelt, Merkmale, die mit Mesangiospermen geteilt werden, und wir haben ihre vermuteten biosynthetischen Gene in N. colorata identifiziert. Die chemischen Verbindungen und biosynthetischen Gene hinter den Blütendüften deuten darauf hin, dass sie parallel zu denen in Mesangiospermen evolviert sind. Aufgrund seiner einzigartigen phylogenetischen Position wirft das N. colorata-Genom Licht auf die frühe Evolution der Bedecktsamer.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-019-1852-5",
    doi = "10.1038/s41586-019-1852-5",
    openalex = "W2995259736",
    references = "doi101038ncomms16047, doi101111j14698137201103794x"
}

Pilze erfüllen viele essentielle Funktionen in Ökosystemen. Sie ermöglichen Pflanzen den Zugang zu Nährstoffen und Wasser, wirken als Zersetzer, die Kohlenstoff und Nährstoffe durch Boden, Wasser und Atmosphäre zirkulieren lassen, und sind wichtige Regulatoren von Makroorganismen-Populationen. Obwohl technologische Fortschritte die Detektion und Identifizierung von Pilzen verbessern, bestehen weiterhin wesentliche Lücken in unserem ökologischen Wissen über dieses Reich, insbesondere im Hinblick auf die Funktion. Ansatzmethoden, die auf Merkmalen basieren, haben dazu beigetragen, unser Verständnis der Pflanzenfunktionalekologie zu stärken und bieten daher hervorragende Modelle, um unser Verständnis der Pilzfunktionalekologie auf neue Weise zu vertiefen, die Erkenntnisse aus traditionellen und -omics-basierten Techniken ergänzen. In diesem Review fassen wir den aktuellen Stand des Wissens über die Pilzfunktionalekologie, Taxonomie und Systematik zusammen und stellen eine neue Datenbank für Pilzmerkmale (Fun Fun) vor. Fun Fun wurde entwickelt, um mit anderen Datenbanken zu interagieren, um zu erforschen und vorherzusagen, wie die funktionale Vielfalt von Pilzen je nach Taxonomie, Gilde und anderen evolutionären oder ökologischen Gruppierungsvariablen variiert. Um zu verdeutlichen, wie ein quantitativer, auf Merkmalen basierender Ansatz neue Erkenntnisse liefern kann, beschreiben wir mehrere gezielte Beispiele und schließen mit Vorschlägen für nächste Schritte im schnell wachsenden Feld der Pilzfunktionalekologie.

@article{doi101111brv12570,
    author = "Zanne, Amy E. und Abarenkov, Kessy und Afkhami, Michelle E. und Aguilar‐Trigueros, Carlos A. und Bates, Scott T. und Bhatnagar, Jennifer und Busby, Posy E. und Christian, Natalie und Cornwell, William K. und Crowther, Thomas W. und Flores‐Moreno, Habacuc und Floudas, Dimitrios und Gazis, Romina und Hibbett, David S. und Kennedy, Peter G. und Lindner, Daniel L. und Maynard, Daniel S. und Milo, Amy M. und Nilsson, Rolf Henrik und Powell, Jeff R. und Schildhauer, Mark und Schilling, Jonathan S. und Treseder, Kathleen K.",
    title = "Fungal functional ecology: bringing a trait‐based approach to plant‐associated fungi",
    year = "2019",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Pilze erfüllen viele essentielle Funktionen in Ökosystemen. Sie ermöglichen Pflanzen den Zugang zu Nährstoffen und Wasser, wirken als Zersetzer, die Kohlenstoff und Nährstoffe durch Boden, Wasser und Atmosphäre zirkulieren lassen, und sind wichtige Regulatoren von Makroorganismen-Populationen. Obwohl technologische Fortschritte die Detektion und Identifizierung von Pilzen verbessern, bestehen weiterhin wesentliche Lücken in unserem ökologischen Wissen über dieses Reich, insbesondere im Hinblick auf die Funktion. Ansatzmethoden, die auf Merkmalen basieren, haben dazu beigetragen, unser Verständnis der Pflanzenfunktionalekologie zu stärken und bieten daher hervorragende Modelle, um unser Verständnis der Pilzfunktionalekologie auf neue Weise zu vertiefen, die Erkenntnisse aus traditionellen und -omics-basierten Techniken ergänzen. In diesem Review fassen wir den aktuellen Stand des Wissens über die Pilzfunktionalekologie, Taxonomie und Systematik zusammen und stellen eine neue Datenbank für Pilzmerkmale (Fun Fun) vor. Fun Fun wurde entwickelt, um mit anderen Datenbanken zu interagieren, um zu erforschen und vorherzusagen, wie die funktionale Vielfalt von Pilzen je nach Taxonomie, Gilde und anderen evolutionären oder ökologischen Gruppierungsvariablen variiert. Um zu verdeutlichen, wie ein quantitativer, auf Merkmalen basierender Ansatz neue Erkenntnisse liefern kann, beschreiben wir mehrere gezielte Beispiele und schließen mit Vorschlägen für nächste Schritte im schnell wachsenden Feld der Pilzfunktionalekologie.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12570",
    doi = "10.1111/brv.12570",
    openalex = "W2991566198",
    references = "doi101093sysbiosyy031"
}

Wir stellen V.PhyloMaker vor, ein kostenloses Paket für R, das zur Generierung von Phylogenien für Gefäßpflanzen entwickelt wurde. Der in V.PhyloMaker implementierte Mega-Baum (d. h. GBOTB.extended.tre), der aus zwei kürzlich veröffentlichten Mega-Bäumen abgeleitet wurde und 74 533 Arten sowie alle Familien bestehender Gefäßpflanzen umfasst, ist die größte datierte Phylogenie für Gefäßpflanzen. V.PhyloMaker kann Phylogenien für sehr große Artenlisten generieren (die größte von uns getestete Artenliste umfasste 314 686 Arten). V.PhyloMaker generiert Phylogenien mit hoher Geschwindigkeit, deutlich schneller als andere Phylogenie-generierende Pakete. Unsere Tests von V.PhyloMaker zeigen, dass die Generierung einer Phylogenie für 60 000 Arten weniger als sechs Stunden erfordert. V.PhyloMaker enthält einen Ansatz, um Gattungen oder Arten ihren nahen Verwandten in einer Phylogenie zuzuordnen. Wir geben in diesem Artikel ein einfaches Beispiel, um zu zeigen, wie man V.PhyloMaker verwendet, um Phylogenien zu generieren.

@article{doi101111ecog04434,
    author = "Jin, Yi und Qian, Hong",
    title = "V.PhyloMaker: ein R-Paket zur Generierung sehr großer Phylogenien für Gefäßpflanzen",
    year = "2019",
    journal = "Ecography",
    abstract = "Wir stellen V.PhyloMaker vor, ein kostenloses Paket für R, das zur Generierung von Phylogenien für Gefäßpflanzen entwickelt wurde. Der in V.PhyloMaker implementierte Mega-Baum (d. h. GBOTB.extended.tre), der aus zwei kürzlich veröffentlichten Mega-Bäumen abgeleitet wurde und 74 533 Arten sowie alle Familien bestehender Gefäßpflanzen umfasst, ist die größte datierte Phylogenie für Gefäßpflanzen. V.PhyloMaker kann Phylogenien für sehr große Artenlisten generieren (die größte von uns getestete Artenliste umfasste 314 686 Arten). V.PhyloMaker generiert Phylogenien mit hoher Geschwindigkeit, deutlich schneller als andere Phylogenie-generierende Pakete. Unsere Tests von V.PhyloMaker zeigen, dass die Generierung einer Phylogenie für 60 000 Arten weniger als sechs Stunden erfordert. V.PhyloMaker enthält einen Ansatz, um Gattungen oder Arten ihren nahen Verwandten in einer Phylogenie zuzuordnen. Wir geben in diesem Artikel ein einfaches Beispiel, um zu zeigen, wie man V.PhyloMaker verwendet, um Phylogenien zu generieren.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ecog.04434",
    doi = "10.1111/ecog.04434",
    openalex = "W2922439782",
    references = "doi101038nature12872"
}

Pflanzeneigenschaften – die morphologischen, anatomischen, physiologischen, biochemischen und phänologischen Merkmale von Pflanzen – bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften sowie deren Nutzen und Nachteile für den Menschen prägen. Pflanzeneigenschaftsdaten bilden daher die Grundlage für ein weites Forschungsfeld, das sich von der Evolutionsbiologie über die Gemeinschafts- und funktionelle Ökologie bis hin zur Biodiversitätserhaltung, dem Ökosystem- und Landschaftsmanagement, der Renaturierung, der Biogeographie und der Erdsystemmodellierung erstreckt. Seit ihrer Gründung im Jahr 2007 ist die TRY-Datenbank für Pflanzeneigenschaften kontinuierlich gewachsen. Sie bietet nun eine beispiellose Datenabdeckung unter einer Open-Access-Datenpolitik und ist die weltweit am häufigsten genutzte Pflanzeneigenschaftsdatenbank der Forschungsgemeinschaft. Immer mehr unterstützt die TRY-Datenbank auch neue Frontieren der eigenschaftsbasierten Pflanzenforschung, einschließlich der Identifizierung von Datenlücken und der anschließenden Mobilisierung oder Erfassung neuer Daten. Um diese Entwicklung zu unterstützen, bewerten wir in diesem Artikel den Umfang der in TRY zusammengestellten Eigenschaftsdaten und analysieren entstehende Muster der Datenabdeckung und Repräsentativität. Die beste Artenabdeckung wird für kategorische Eigenschaften erreicht – nahezu vollständige Abdeckung für „Pflanzenwachstumsform". Allerdings sind die meisten für Ökologie und Vegetationsmodellierung relevanten Eigenschaften durch kontinuierliche intraspezifische Variation und Eigenschaft-Umwelt-Beziehungen gekennzeichnet. Diese Eigenschaften müssen an einzelnen Pflanzen in ihrer jeweiligen Umgebung gemessen werden. Trotz der beispiellosen Datenabdeckung beobachten wir eine bescheidene Unvollständigkeit und mangelnde Repräsentativität dieser kontinuierlichen Eigenschaften in vielen Aspekten. Wir schließen daher, dass die Verringerung von Datenlücken und Verzerrungen in der TRY-Datenbank weiterhin eine zentrale Herausforderung darstellt und einen koordinierten Ansatz zur Datenmobilisierung und Eigenschaftsmessung erfordert. Dies kann nur in Zusammenarbeit mit anderen Initiativen erreicht werden.

@article{doi101111gcb14904,
    author = "Kattge, Jens und Bönisch, Gerhard und Dı́az, Sandra und Lavorel, Sandra und Prentice, I. Colin und Leadley, Paul und Tautenhahn, Susanne und Werner, Gijsbert D. A. und Aakala, Tuomas und Abedi, Mehdi und Acosta, Alicia Teresa Rosario und Adamidis, George C. und Adamson, Kairi und Aiba, Masahiro und Albert, Cécile H. und Alcántara, Julio M. und C, Carolina Alcázar und Aleixo, Izabela und Ali, Hamada E. und Amiaud, Bernard und Ammer, Christian und Amoroso, Mariano M. und Anand, Madhur und Anderson, C. und Anten, Niels P. R. und Antos, Joseph A. und Apgaua, Deborah M. G. und Ashman, Tia‐Lynn und Asmara, Degi Harja und Asner, Gregory P. und Aspinwall, Michael J. und Atkin, Owen K. und Aubin, Isabelle und Baastrup‐Spohr, Lars und Bahalkeh, Khadijeh und Bahn, Michael und Baker, Timothy R. und Baker, William J. und Bakker, Jan P. und Baldocchi, Dennis und Baltzer, Jennifer L. und Banerjee, Arindam und Baranger, Anne und Barlow, Jos und Barneche, Diego R. und Baruch, Zdravko und Bastianelli, Denis und Battles, John J. und Bauerle, William L. und Bauters, Marijn und Bazzato, Erika und Beckmann, Michael und Beeckman, Hans und Beierkuhnlein, Carl und Bekker, Renée M. und Belfry, Gavin und Belluau, Michaël und Beloiu, Mirela und Benavides, Raquel und Benomar, Lahcen und Berdugo‐Lattke, Mary Lee und Berenguer, Erika und Bergamin, Rodrigo Scarton und Bergmann, Joana und Carlucci, Marcos Bergmann und Berner, Logan T. und Bernhardt‐Römermann, Markus und Bigler, Christof und Bjorkman, Anne D. und Blackman, Chris J. und Blanco, C. und Blonder, Benjamin und Blumenthal, Dana M. und Bocanegra‐González, Kelly T. und Boeckx, Pascal und Bohlman, Stephanie und Böhning‐Gaese, Katrin und Boisvert‐Marsh, Laura und Bond, William J. und Bond‐Lamberty, Ben und Boom, Arnoud und Boonman, Coline C. F. und Bordin, Kauane Maiara und Boughton, Elizabeth H. und Boukili, Vanessa und Bowman, David M. J. S. und Bravo, Sandra und Brendel, Marco R. und Broadley, Martin R. und Brown, Kerry A. und Bruelheide, Helge und Brumnich, Federico und Bruun, Hans Henrik und Bruy, David und Buchanan, Serra-Willow und Bucher, Solveig Franziska und Buchmann, Nina und Buitenwerf, Robert und Bunker, Daniel E. und Bürger, Jana",
    title = "TRY plant trait database – enhanced coverage and open access",
    year = "2019",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Pflanzliche Merkmale – die morphologischen, anatomischen, physiologischen, biochemischen und phänologischen Eigenschaften von Pflanzen – bestimmen, wie Pflanzen auf Umweltfaktoren reagieren, andere trophische Ebenen beeinflussen und Ökosystemeigenschaften sowie deren Nutzen und Nachteile für den Menschen prägen. Pflanzliche Merkmalsdaten bilden daher die Grundlage für ein breites Forschungsfeld, das von der Evolutionsbiologie, der Gemeinschafts- und Funktionsökologie bis zur Biodiversitätserhaltung, dem Ökosystem- und Landschaftsmanagement, der Renaturierung, der Biogeographie und der Erdsystemmodellierung reicht. Seit ihrer Gründung im Jahr 2007 ist die TRY-Datenbank für pflanzliche Merkmale kontinuierlich gewachsen. Sie bietet nun eine beispiellose Datenabdeckung unter einer Open-Access-Datenpolitik und ist die wichtigste Datenbank für pflanzliche Merkmale, die von der Forschungsgemeinschaft weltweit genutzt wird. Immer mehr unterstützt die TRY-Datenbank auch neue Forschungsfronten der merkmalsbasierten Pflanzenforschung, einschließlich der Identifizierung von Datenlücken und der anschließenden Mobilisierung oder Erfassung neuer Daten. Um diese Entwicklung zu unterstützen, bewerten wir in diesem Artikel den Umfang der in TRY zusammengestellten Merkmalsdaten und analysieren entstehende Muster der Datenabdeckung und Repräsentativität. Die beste Artenabdeckung wird für kategorische Merkmale erreicht – fast vollständige Abdeckung für 'Pflanzenwachstumsform'. Die meisten für Ökologie und Vegetationsmodellierung relevanten Merkmale zeichnen sich jedoch durch kontinuierliche intraspezifische Variation und Merkmals-Umwelt-Beziehungen aus. Diese Merkmale müssen an einzelnen Pflanzen in ihrer jeweiligen Umgebung gemessen werden. Trotz der beispiellosen Datenabdeckung beobachten wir eine bescheidene Unvollständigkeit und mangelnde Repräsentativität dieser kontinuierlichen Merkmale in vielen Aspekten. Wir schließen daher, dass die Verringerung von Datenlücken und Verzerrungen in der TRY-Datenbank weiterhin eine zentrale Herausforderung darstellt und einen koordinierten Ansatz zur Datenmobilisierung und Merkmalsmessung erfordert. Dies kann nur in Zusammenarbeit mit anderen Initiativen erreicht werden.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.14904",
    doi = "10.1111/gcb.14904",
    openalex = "W2983606184",
    references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038s4158601805637, doi101071bt12225, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x"
}

Hydraulische Eigenschaften steuern die Reaktionen von Pflanzen auf das Klima und stehen wahrscheinlich unter starkem Selektionsdruck, doch ihre makro-evolutionäre Geschichte ist noch schlecht charakterisiert. Um diese Lücke zu schließen, haben wir einen globalen Datensatz von hydraulischen Merkmalen zusammengestellt, die die Xylem-Leitfähigkeit (K s), den Xylem-Widerstand gegen Embolie (P50), die Zuweisung von Splintholz relativ zur Blattfläche (Hv) und die Dürreexposition (ψ min) beschreiben, und diesen mit globalen Phylogenien von Samenpflanzen abgeglichen. Individuell weisen diese Merkmale mittlere bis hohe phylogenetische Signale auf, die teilweise mit den Umweltselektionsdrücken zusammenhängen, die die Evolution von Abstammungslinien formen. Die meisten dieser Merkmale entwickelten sich unabhängig voneinander und wurden durch dieselben Umweltselektionsdrücke gemeinsam selektiert. Allerdings zeigen die evolutionären Korrelationen zwischen P50 und ψ min sowie zwischen K s und Hv Anzeichen einer tieferen evolutionären Integration aufgrund funktionaler, entwicklungsbiologischer oder genetischer Einschränkungen, was evolutionären Modulen entspricht. Wir detektieren keine evolutionäre Integration zwischen Leitfähigkeit und Widerstand gegen Embolie und lehnen einen fest verdrahteten Kompromiss für dieses Merkmalpaar ab.

@article{doi101111ele13584,
    author = "Sanchez‐Martinez, Pablo und Martínez‐Vilalta, Jordi und Dexter, Kyle G. und Segovia, Ricardo A. und Mencuccini, Maurizio",
    title = "Anpassung und koordinierte Evolution von hydraulischen Merkmalen bei Pflanzen",
    year = "2020",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Hydraulische Eigenschaften steuern die Reaktionen von Pflanzen auf das Klima und stehen wahrscheinlich unter starkem Selektionsdruck, doch ihre makro-evolutionäre Geschichte ist noch schlecht charakterisiert. Um diese Lücke zu schließen, haben wir einen globalen Datensatz von hydraulischen Merkmalen zusammengestellt, die die Xylem-Leitfähigkeit (K s), den Xylem-Widerstand gegen Embolie (P50), die Zuweisung von Splintholz relativ zur Blattfläche (Hv) und die Dürreexposition (ψ min) beschreiben, und diesen mit globalen Phylogenien von Samenpflanzen abgeglichen. Individuell weisen diese Merkmale mittlere bis hohe phylogenetische Signale auf, die teilweise mit den Umweltselektionsdrücken zusammenhängen, die die Evolution von Abstammungslinien formen. Die meisten dieser Merkmale entwickelten sich unabhängig voneinander und wurden durch dieselben Umweltselektionsdrücke gemeinsam selektiert. Allerdings zeigen die evolutionären Korrelationen zwischen P50 und ψ min sowie zwischen K s und Hv Anzeichen einer tieferen evolutionären Integration aufgrund funktionaler, entwicklungsbiologischer oder genetischer Einschränkungen, was evolutionären Modulen entspricht. Wir detektieren keine evolutionäre Integration zwischen Leitfähigkeit und Widerstand gegen Embolie und lehnen einen fest verdrahteten Kompromiss für dieses Merkmalpaar ab.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.13584",
    doi = "10.1111/ele.13584",
    openalex = "W3073875730",
    references = "doi101098rspb20181012"
}

@incollection{crossref2021angiosperms,
    title = "ANGIOSPERMS:",
    year = "2021",
    booktitle = "The Ecology of the Trees, Shrubs, and Woody Vines of Northern Florida",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
    doi = "10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
    pages = "57-360"
}

Die Biodiversität heute hat die ungewöhnliche Eigenschaft, dass 85 % der Pflanzen- und Tierarten an Land statt im Meer leben, und die Hälfte davon in tropischen Regenwäldern. Eine explosive Steigerung der terrestrischen Vielfalt ereignete sich vor ca. 100–50 Millionen Jahren, im späten Kreidezeit und frühen Paläogen. Während dieses Intervalls wurde das Erden-Lebens-System an Land zurückgesetzt, und die Biosphäre erweiterte sich auf ein neues Niveau der Produktivität, wodurch die Kapazität und Artenvielfalt terrestrischer Umgebungen verbessert wurden. Diese Steigerung der terrestrischen Biodiversität fiel mit Innovationen in der Biologie der Blütenpflanzen und der evolutionären Ökologie zusammen, einschließlich ihrer Blüten und Reproduktionseffizienz; Koevolution mit Tieren, insbesondere Bestäubern und Pflanzenfressern; photosynthetische Fähigkeiten; Anpassungsfähigkeit; und die Fähigkeit, Lebensräume zu verändern. Der Aufstieg der Angiospermen löste eine makroökologische Revolution an Land aus und trieb die moderne Biodiversität in einem säkularen, langfristigen Wandel zu neuen, hohen Niveaus voran, eine Reihe von Prozessen, die wir hier die Angiosperm Terrestrial Revolution nennen.

@article{doi101111nph17822,
    author = "Benton, Michael J. und Wilf, Peter und Sauquet, Hervé",
    title = "The Angiosperm Terrestrial Revolution and the origins of modern biodiversity",
    year = "2021",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Die Biodiversität heute hat die ungewöhnliche Eigenschaft, dass 85 % der Pflanzen- und Tierarten an Land statt im Meer leben, und die Hälfte davon in tropischen Regenwäldern. Eine explosive Steigerung der terrestrischen Vielfalt ereignete sich vor ca. 100–50 Millionen Jahren, im späten Kreidezeit und frühen Paläogen. Während dieses Intervalls wurde das Erden-Lebens-System an Land zurückgesetzt, und die Biosphäre erweiterte sich auf ein neues Niveau der Produktivität, wodurch die Kapazität und Artenvielfalt terrestrischer Umgebungen verbessert wurden. Diese Steigerung der terrestrischen Biodiversität fiel mit Innovationen in der Biologie der Blütenpflanzen und der evolutionären Ökologie zusammen, einschließlich ihrer Blüten und Reproduktionseffizienz; Koevolution mit Tieren, insbesondere Bestäubern und Pflanzenfressern; photosynthetische Fähigkeiten; Anpassungsfähigkeit; und die Fähigkeit, Lebensräume zu verändern. Der Aufstieg der Angiospermen löste eine makroökologische Revolution an Land aus und trieb die moderne Biodiversität in einem säkularen, langfristigen Wandel zu neuen, hohen Niveaus voran, eine Reihe von Prozessen, die wir hier die Angiosperm Terrestrial Revolution nennen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.17822",
    doi = "10.1111/nph.17822",
    openalex = "W3209026994",
    references = "doi101016jcub201508003, doi101016jcub201804062, doi101016jgloplacha201804004, doi101016jtree201905008, doi101038nature06277, doi101038ncomms16047, doi101038s4158601916932, doi101073pnas1112694108, doi101073pnas1813206116, doi101073pnas1907847116, doi101093icbicq078, doi101093molbevmsx324, doi101093sysbiosyaa034, doi101098rspb20080715, doi101111syen12132, doi1023072399030, doi103390ijms140510242, doi1034172009143, doi107717peerj1719"
}

Eine frühere Version von V.PhyloMaker wurde weit verbreitet zur Generierung phylogenetischer Bäume von Gefäßpflanzen für botanische, biogeographische und ökologische Studien verwendet. Hier aktualisieren und erweitern wir dieses Paket, das nun als 'V.PhyloMaker2' bezeichnet wird. Mit V.PhyloMaker2 kann man einen phylogenetischen Baum für Gefäßpflanzen basierend auf einem von drei verschiedenen botanischen Nomenklaturesystemen generieren. V.PhyloMaker2 kann Phylogenien für sehr große Artenlisten erstellen (die größte Artenliste, die wir testeten, enthielt 365.198 Arten). V.PhyloMaker2 generiert Phylogenien mit hoher Geschwindigkeit. Wir stellen in diesem Artikel ein Beispiel (einschließlich einer Musterartenliste und eines R-Skripts zum Ausführen) bereit, um zu zeigen, wie man V.PhyloMaker2 verwendet, um phylogenetische Bäume zu generieren.

@article{doi101016jpld202205005,
    author = "Jin, Yi und Qian, Hong",
    title = "V.PhyloMaker2: Ein aktualisiertes und erweitertes R-Paket zur Generierung sehr großer Phylogenien für Gefäßpflanzen",
    year = "2022",
    journal = "Plant Diversity",
    abstract = "Eine frühere Version von V.PhyloMaker wurde weit verbreitet zur Generierung phylogenetischer Bäume von Gefäßpflanzen für botanische, biogeographische und ökologische Studien verwendet. Hier aktualisieren und erweitern wir dieses Paket, das nun als 'V.PhyloMaker2' bezeichnet wird. Mit V.PhyloMaker2 kann man einen phylogenetischen Baum für Gefäßpflanzen basierend auf einem von drei verschiedenen botanischen Nomenklaturesystemen generieren. V.PhyloMaker2 kann Phylogenien für sehr große Artenlisten erstellen (die größte Artenliste, die wir testeten, enthielt 365.198 Arten). V.PhyloMaker2 generiert Phylogenien mit hoher Geschwindigkeit. Wir stellen in diesem Artikel ein Beispiel (einschließlich einer Musterartenliste und eines R-Skripts zum Ausführen) bereit, um zu zeigen, wie man V.PhyloMaker2 verwendet, um phylogenetische Bäume zu generieren.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.pld.2022.05.005",
    doi = "10.1016/j.pld.2022.05.005",
    openalex = "W4281979425",
    references = "doi101038nature12872"
}

Zykaden stellen eine der ältesten Linien lebender Samenpflanzen dar. Die Identifizierung genomischer Merkmale, die einzigartig von Zykaden und anderen existierenden Samenpflanzen geteilt werden, aber nicht von nicht-samenbildenden Pflanzen, könnte Aufschluss über den Ursprung von Schlüsselinnovationen sowie über die frühe Diversifizierung der Samenpflanzen geben. Hier berichten wir über das 10,5-Gb-Referenzgenom von Cycas panzhihuaensis, ergänzt durch die Transkriptome von 339 Zykadenarten. Kern- und Plastid-phylogenomische Analysen deuten stark darauf hin, dass Zykaden und Ginkgo einen Kladus bilden, der allen anderen lebenden Gymnospermen Schwestergruppe ist, im Gegensatz zu mitochondrialen Daten, die Zykaden allein an dieser Position platzieren. Wir fanden Hinweise auf eine alte Ganzgenom-Duplikation im gemeinsamen Vorfahren der existierenden Gymnospermen. Das Cycas-Genom enthält vier Homologe der fitD-Genfamilie, die wahrscheinlich durch horizontalen Gentransfer von Pilzen erworben wurden, und diese Gene verleihen Zykaden Resistenz gegen Herbivoren. Der Y-chromosom-spezifische Bereich von C. panzhihuaensis enthält einen MADS-Box-Transkriptionsfaktor, der ausschließlich in männlichen Zapfen exprimiert wird und einem in Ginkgo berichteten System ähnelt, was darauf hindeutet, dass ein Geschlechtsbestimmungsmechanismus, der durch MADS-Box-Gene gesteuert wird, im gemeinsamen Vorfahren von Zykaden und Ginkgo entstanden sein könnte. Das C. panzhihuaensis-Genom stellt eine wichtige neue Ressource von breiter Nützlichkeit für Biologen dar.

@article{doi101038s41477022011297,
    author = "Liu, Yang und Wang, Sibo und Li, Linzhou und Yang, Ting und Dong, Shanshan und Wei, Tong und Wu, Shengdan und Liu, Yongbo und Gong, Yiqing und Feng, Xiuyan und Ma, Jianchao und Chang, Guanxiao und Huang, Jinling und Yang, Yong und Wang, Hongli und Liu, Min und Xu, Yan und Liang, Hongping und Jin, Yu und Cai, Yuqing und Zhang, Zhaowu und Fan, Yannan und Mu, Weixue und Sahu, Sunil Kumar und Liu, Shuchun und Lang, Xiaoan und Yang, Leilei und Li, Na und Habib, Sadaf und Yang, Yongqiong und Lindström, Anders J. und Liang, Pei und Goffinet, Bernard und Zaman, Sumaira und Wegrzyn, Jill und Li, Dexiang und Liu, Jian und Cui, Jie und Sonnenschein, Eva C. und Wang, Xiaobo und Ruan, Jue und Xue, Jia‐Yu und Shao, Zhu‐Qing und Song, Chi und Fan, Guangyi und Li, Zhen und Zhang, Liangsheng und Liu, Jianquan und Liu, Zhong‐Jian und Jiao, Yuannian und Wang, Xiaoquan und Wu, Hong und Wang, Ertao und Lisby, Michael und Yang, Huanming und Wang, Jian und Liu, Xin und Xu, Xun und Li, Nan und Soltis, Pamela S. und de Peer, Yves Van und Soltis, Douglas E. und Gong, Xun und Liu, Huan und Zhang, Shouzhou",
    title = "Das Cycas-Genom und die frühe Evolution der Samenpflanzen",
    year = "2022",
    journal = "Nature Plants",
    abstract = "Zykaden stellen eine der ältesten Linien lebender Samenpflanzen dar. Die Identifizierung genomischer Merkmale, die einzigartig von Zykaden und anderen existierenden Samenpflanzen geteilt werden, aber nicht von nicht-samenbildenden Pflanzen, könnte Aufschluss über den Ursprung von Schlüsselinnovationen sowie über die frühe Diversifizierung der Samenpflanzen geben. Hier berichten wir über das 10,5-Gb-Referenzgenom von Cycas panzhihuaensis, ergänzt durch die Transkriptome von 339 Zykadenarten. Kern- und Plastid-phylogenomische Analysen deuten stark darauf hin, dass Zykaden und Ginkgo einen Kladus bilden, der allen anderen lebenden Gymnospermen Schwestergruppe ist, im Gegensatz zu mitochondrialen Daten, die Zykaden allein an dieser Position platzieren. Wir fanden Hinweise auf eine alte Ganzgenom-Duplikation im gemeinsamen Vorfahren der existierenden Gymnospermen. Das Cycas-Genom enthält vier Homologe der fitD-Genfamilie, die wahrscheinlich durch horizontalen Gentransfer von Pilzen erworben wurden, und diese Gene verleihen Zykaden Resistenz gegen Herbivoren. Der Y-chromosom-spezifische Bereich von C. panzhihuaensis enthält einen MADS-Box-Transkriptionsfaktor, der ausschließlich in männlichen Zapfen exprimiert wird und einem in Ginkgo berichteten System ähnelt, was darauf hindeutet, dass ein Geschlechtsbestimmungsmechanismus, der durch MADS-Box-Gene gesteuert wird, im gemeinsamen Vorfahren von Zykaden und Ginkgo entstanden sein könnte. Das C. panzhihuaensis-Genom stellt eine wichtige neue Ressource von breiter Nützlichkeit für Biologen dar.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41477-022-01129-7",
    doi = "10.1038/s41477-022-01129-7",
    openalex = "W4223990635",
    references = "doi101098rspb20181012"
}

@misc{crossrefNoneangiosperms,
    title = "Angiosperms",
    year = "None",
    booktitle = "AccessScience",
    url = "https://doi.org/10.1036/1097-8542.yb010070",
    doi = "10.1036/1097-8542.yb010070"
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