Coccolithen

@inproceedings{gartner1971phylogenetic1,
    author = "Gartner, S. und Jr",
    title = "Phylogenetische Linien im untertertiären Coccolithus-Gattung Chiasmolithus",
    year = "1971",
    booktitle = "North American Paleontological Convention, Proceedings, S. 930-957; Teil G",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gartner, S., Jr., 1971, Phylogenetische Linien im untertertiären Coccolithus-Gattung Chiasmolithus: North American Paleontological Convention, Proceedings, S. 930-957; Teil G.}"
}

@article{black1972british,
    author = "Black, Maurice",
    title = "British Lower Cretaceous Coccoliths. I. Gault Clay",
    year = "1972",
    journal = "Monographs of the Palaeontographical Society",
    url = "https://doi.org/10.1080/25761900.2022.12131720",
    doi = "10.1080/25761900.2022.12131720",
    number = "534",
    openalex = "W4296160015",
    pages = "1-50",
    volume = "126"
}

Kommentar: In offenen Ozeanen warmen Wassergesellschaften werden Nephrolithus frequens und Lithraphidites quadratus nicht häufig beobachtet. Der ursprüngliche zonale Intervall wurde zwischen dem ersten Vorkommen dieser Arten angegeben. Micula mura und Tetralithus trifidus sind konsistentere stratigraphische Indikatoren für denselben allgemeinen Intervall in niedrigen Breitengraden ozeanischen Gesammeln.

@incollection{doi102973dsdpproc151161973,
    author = "Bukry, David",
    title = "Low-Latitude Coccolith Biostratigraphic Zonation",
    year = "1973",
    booktitle = "U.S. Government Printing Office eBooks",
    abstract = "Comment: In open-ocean warm-water assemblages, Nephrolithus frequens and Lithraphidites quadratus are not commonly observed.The original zonal interval was indicated between the first occurrence of these species.Micula mura and Tetralithus trifidus are more consistent stratigraphic indicators for the same general interval in low-latitude oceanic assemblages.",
    url = "https://doi.org/10.2973/dsdp.proc.15.116.1973",
    doi = "10.2973/dsdp.proc.15.116.1973",
    openalex = "W2499395972",
    references = "doi101038225289a0, doi101111j216409471970tb02746x, doi102110pec74200094, doi1023071484276, doi1023071484577, doi102973dsdpproc141141972, doi102973dsdpproc431171979, doi103929ethza000086603, openalexw1505582348, openalexw2270089487, openalexw2722196962, openalexw2725455224"
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@article{doi1010160377839876900050,
    author = "Honjo, Susumu",
    title = "Coccoliths: Produktion, Transport und Sedimentation",
    year = "1976",
    journal = "Marine Micropaleontology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0377-8398(76)90005-0",
    doi = "10.1016/0377-8398(76)90005-0",
    openalex = "W2036323089",
    references = "doi1010160011747167900654, doi1010160011747173900594, doi101016001282527290102x, doi101111j216409471970tb02746x, doi101126science15437561542, doi102307201400, doi104319lo19731840534, doi104319lo19741960881, openalexw100537358, openalexw2913708518"
}

In dieser vorläufigen biometrischen Studie der kalkigen Nannofossil-Arten Chiasmolithus expansus, Chiasmolithus oamaruensis und Chiasmolithus altus aus dem oberen mittleren Eozän bis zum unteren Oligozän der Standorte 647 und 748 dokumentieren wir eine vollständige Formengradation zwischen allen drei Arten. Chiasmolithus oamaruensis weist eine signifikant höhere morphologische Varianz auf als die anderen Arten. Die Chiasmolithus-Population an jedem Standort wandelt sich von C. expansus zu C. oamaruensis und dann zu C. altus. Dies spiegelt möglicherweise keine wahre evolutionäre Sequenz wider, da dieser Sequenz eine wesentliche Umkehrung der Formänderung der zentralen Querstab-Struktur begleitet ist und da C. altus morphologisch näher an C. expansus liegt als an C. oamaruensis. Die Änderung der Breite der Querstab-Struktur ist primär das Ergebnis von Änderungen in der Ausrichtung der zentralen Verbindungsstange und nicht von Änderungen im Querstab-Winkel. Am Standort 748 führen zwei Schwankungen in der Morphologie zu Stichprobenpopulationen, die zwischen allen drei Arten liegen. Darüber hinaus zeigen die berichteten stratigraphischen und paläogeographischen Vorkommen von C. oamaruensis und C. altus unterschiedliche latitudinale Verteilungen. Diese morphologischen und verteilungsmäßigen Muster können durch einen kontinuierlichen morphologischen Gradienten zwischen C. oamaruensis und C. altus erklärt werden, wobei C. oamaruensis häufiger in kühlwasser-paläoumweltbedingungen und C. altus häufiger in kaltes-wasser-paläoumweltbedingungen vorkommt. Somit können paläoumweltbedingte Schwankungen am Standort 748 die Ursache für die morphologischen Schwankungen in Chiasmolithus sein. Diese Hypothese kann durch detailliertere Stichproben von Abschnitten entlang eines latitudinalen Transekts gegen zuvor vorgeschlagene evolutionäre Modelle getestet werden.

@article{doi102973odpprocsr1201571992,
    author = "Firth, John V. und Wise, S.W. Jr.",
    title = "Eine vorläufige Studie zur Evolution von Chiasmolithus im mittleren Eozän bis Oligozän der Standorte 647 und 748",
    year = "1992",
    abstract = "In dieser vorläufigen biometrischen Studie der kalkigen Nannofossil-Arten Chiasmolithus expansus, Chiasmolithus oamaruensis und Chiasmolithus altus aus dem oberen mittleren Eozän bis zum unteren Oligozän der Standorte 647 und 748 dokumentieren wir eine vollständige Formengradation zwischen allen drei Arten. Chiasmolithus oamaruensis weist eine signifikant höhere morphologische Varianz auf als die anderen Arten. Die Chiasmolithus-Population an jedem Standort wandelt sich von C. expansus zu C. oamaruensis und dann zu C. altus. Dies spiegelt möglicherweise keine wahre evolutionäre Sequenz wider, da dieser Sequenz eine wesentliche Umkehrung der Formänderung der zentralen Querstab-Struktur begleitet ist und da C. altus morphologisch näher an C. expansus liegt als an C. oamaruensis. Die Änderung der Breite der Querstab-Struktur ist primär das Ergebnis von Änderungen in der Ausrichtung der zentralen Verbindungsstange und nicht von Änderungen im Querstab-Winkel. Am Standort 748 führen zwei Schwankungen in der Morphologie zu Stichprobenpopulationen, die zwischen allen drei Arten liegen. Darüber hinaus zeigen die berichteten stratigraphischen und paläogeographischen Vorkommen von C. oamaruensis und C. altus unterschiedliche latitudinale Verteilungen. Diese morphologischen und verteilungsmäßigen Muster können durch einen kontinuierlichen morphologischen Gradienten zwischen C. oamaruensis und C. altus erklärt werden, wobei C. oamaruensis häufiger in kühlwasser-paläoumweltbedingungen und C. altus häufiger in kaltes-wasser-paläoumweltbedingungen vorkommt. Somit können paläoumweltbedingte Schwankungen am Standort 748 die Ursache für die morphologischen Schwankungen in Chiasmolithus sein. Diese Hypothese kann durch detailliertere Stichproben von Abschnitten entlang eines latitudinalen Transekts gegen zuvor vorgeschlagene evolutionäre Modelle getestet werden.",
    url = "https://doi.org/10.2973/odp.proc.sr.120.157.1992",
    doi = "10.2973/odp.proc.sr.120.157.1992",
    openalex = "W2186724448",
    references = "doi101016003101828690009x, doi1010160377839889900340, doi101144gslmem19850100115, doi1023071484276, doi102973dsdpproc431171979, doi102973dsdpproc801171985, doi102973odpprocsr1051471989, doi102973odpprocsr1191651991, openalexw1523529762, openalexw2725455224"
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@article{bralower1996morphometrics,
    author = "Bralower, Timothy J. und Parrow, Matthew",
    title = "Morphometrie der Paläozänen Coccolith-Gattungen Cruciplacolithus, Chiasmolithus und Sullivania: eine komplexe evolutionäre Geschichte",
    year = "1996",
    journal = "The Paleontological Society Special Publications",
    url = "https://doi.org/10.1017/s2475262200000459",
    doi = "10.1017/s2475262200000459",
    openalex = "W4251350497",
    pages = "43-43",
    volume = "8"
}

@article{doi101016s037783989600028x,
    author = "Bollmann, Jörg",
    title = "Morphologie und Biogeographie von Gephyrocapsa-Kokolithen in Holozän-Sedimenten",
    year = "1997",
    journal = "Marine Micropaleontology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0377-8398(96)00028-x",
    doi = "10.1016/s0377-8398(96)00028-x",
    openalex = "W1990111902",
    references = "doi1010160011747167900654, doi1010160011747173900594, doi1010160012825272900384, doi101016001282529190035e, doi101029eo064i049p0096202, doi101111j216409471970tb02746x, doi101126science19142321131, doi1011300091761319775400gsolqc20co2, openalexw1505582348, openalexw1532540194, openalexw1593551441, openalexw653466241"
}

coccoliths, Biomineralisation, Calcit, AFM, SPM, Kristallmorphologie, Funktion

@article{doi1021130540189,
    author = "Young, J. R.",
    title = "Biomineralization Within Vesicles: The Calcite of Coccoliths",
    year = "2003",
    journal = "Reviews in Mineralogy and Geochemistry",
    abstract = "coccoliths, biomineralization, calcite, AFM, SPM, crystal morphology, function",
    url = "https://doi.org/10.2113/0540189",
    doi = "10.2113/0540189",
    openalex = "W2057382012",
    references = "doi101006jsbi19994132, doi1010079783662062784, doi1010079789401149020, doi101016092181819390061r, doi101016s0016703799002392, doi101038365499a0, doi101073pnas1132069100, doi101093oxfordjournalsmolbeva026092, doi102216i003188844065031, doi105860choice330923"
}

Botryosphaeria ist ein artenreiches Genus mit einer kosmopolitischen Verbreitung, das häufig mit Welke und Geschwüren bei Holzgewächsen in Verbindung gebracht wird. Bis zu 18 Anamorph-Genera wurden mit Botryosphaeria in Verbindung gebracht, von denen die meisten unter Diplodia (Konidien meist eiförmig, pigmentiert, dickwandig) oder Fusicoccum (Konidien meist spindelförmig, hyalin, dünnwandig) als Synonyme reduziert wurden. Es gibt jedoch zahlreiche konidiale Anamorphen mit morphologischen Merkmalen, die zwischen Diplodia und Fusicoccum liegen, und es gibt mehrere Aufzeichnungen von Arten außerhalb der Botryosphaeriaceae, die Anamorphen aufweisen, die apparently typisch für Botryosphaeria s.str. sind. Kürzlich wurden auch Verbindungen zwischen Botryosphaeria und Arten mit pigmentierten, septierten Ascosporen sowie Dothiorella-Anamorphen oder Fusicoccum-Anamorphen mit Dichomera-Synanamorphen hergestellt. Ziel dieser Studie war es, DNA-Sequenzdaten des 28S rDNA zu verwenden, um scheinbare Linien innerhalb der Botryosphaeriaceae aufzulösen. Aus diesen Daten werden 12 Klade erkannt. Zwei dieser Linien gruppierten sich außerhalb der Botryosphaeriaceae, nämlich Diplodia-ähnliche Anamorphen, die auf Mais vorkommen, die am besten in Stenocarpella (Diaporthales) untergebracht werden können, sowie eine ungelöste Klade, die Arten von Camarosporium/Microdiplodia umfasst. Wir erkennen 10 Linien innerhalb der Botryosphaeriaceae an, einschließlich einer ungelösten Klade (Diplodia/Lasiodiplodia/Tiarosporella), Botryosphaeria s.str. (Fusicoccum-Anamorphen), Macrophomina, Neoscytalidium gen. nov., Dothidotthia (Dothiorella-Anamorphen), Neofusicoccum gen. nov. (Botryosphaeria-ähnliche Teleomorphen, Dichomera-ähnliche Synanamorphen), Pseudofusicoccum gen. nov., Saccharata (Fusicoccum- und Diplodia-ähnliche Synanamorphen), "Botryosphaeria" quercuum (Diplodia-ähnliche Anamorph) und Guignardia (Phyllosticta-Anamorphen). Für neu eingeführte Genera werden getrennte Teleomorph- und Anamorph-Namen nicht angegeben, auch wenn beide Morphs bekannt sind. Die Taxonomie einiger Klade und Isolate (z. B. B. mamane) bleibt aufgrund des Fehlens von Ex-Typ-Kulturen ungelöst.

@article{doi103114sim551235,
    author = "Crous, P.W. und Slippers, Bernard und Wingfield, Michael J. und Rheeder, John P. und Marasas, Walter F. O. und Philips, Alan J L und Alves, Artur und Burgess, Treena I. und Barber, P.A. und Groenewald, J.Z.",
    title = "Phylogenetische Linien in der Botryosphaeriaceae",
    year = "2006",
    journal = "Studien in Mycology",
    abstract = {Botryosphaeria ist ein artenreiches Genus mit einer kosmopolitischen Verbreitung, das häufig mit Welke und Geschwüren bei Holzgewächsen in Verbindung gebracht wird. Bis zu 18 Anamorph-Genera wurden mit Botryosphaeria in Verbindung gebracht, von denen die meisten unter Diplodia (Konidien meist eiförmig, pigmentiert, dickwandig) oder Fusicoccum (Konidien meist spindelförmig, hyalin, dünnwandig) als Synonyme reduziert wurden. Es gibt jedoch zahlreiche konidiale Anamorphen mit morphologischen Merkmalen, die zwischen Diplodia und Fusicoccum liegen, und es gibt mehrere Aufzeichnungen von Arten außerhalb der Botryosphaeriaceae, die Anamorphen aufweisen, die apparently typisch für Botryosphaeria s.str. sind. Kürzlich wurden auch Verbindungen zwischen Botryosphaeria und Arten mit pigmentierten, septierten Ascosporen sowie Dothiorella-Anamorphen oder Fusicoccum-Anamorphen mit Dichomera-Synanamorphen hergestellt. Ziel dieser Studie war es, DNA-Sequenzdaten des 28S rDNA zu verwenden, um scheinbare Linien innerhalb der Botryosphaeriaceae aufzulösen. Aus diesen Daten werden 12 Klade erkannt. Zwei dieser Linien gruppierten sich außerhalb der Botryosphaeriaceae, nämlich Diplodia-ähnliche Anamorphen, die auf Mais vorkommen, die am besten in Stenocarpella (Diaporthales) untergebracht werden können, sowie eine ungelöste Klade, die Arten von Camarosporium/Microdiplodia umfasst. Wir erkennen 10 Linien innerhalb der Botryosphaeriaceae an, einschließlich einer ungelösten Klade (Diplodia/Lasiodiplodia/Tiarosporella), Botryosphaeria s.str. (Fusicoccum-Anamorphen), Macrophomina, Neoscytalidium gen. nov., Dothidotthia (Dothiorella-Anamorphen), Neofusicoccum gen. nov. (Botryosphaeria-ähnliche Teleomorphen, Dichomera-ähnliche Synanamorphen), Pseudofusicoccum gen. nov., Saccharata (Fusicoccum- und Diplodia-ähnliche Synanamorphen), "Botryosphaeria" quercuum (Diplodia-ähnliche Anamorph) und Guignardia (Phyllosticta-Anamorphen). Für neu eingeführte Genera werden getrennte Teleomorph- und Anamorph-Namen nicht angegeben, auch wenn beide Morphs bekannt sind. Die Taxonomie einiger Klade und Isolate (z. B. B. mamane) bleibt aufgrund des Fehlens von Ex-Typ-Kulturen ungelöst.},
    url = "https://doi.org/10.3114/sim.55.1.235",
    doi = "10.3114/sim.55.1.235",
    openalex = "W2156957853",
    references = "doi101128jb1728423842461990, openalexw2733548038"
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@article{crous2013phylogenetic,
    author = "Crous, P.W. und Braun, U. und Hunter, G.C. und Wingfield, M.J. und Verkley, G.J.M. und Shin, H.-D. und Nakashima, C. und Groenewald, J.Z.",
    title = "Phylogenetische Linien in Pseudocercospora",
    year = "2013",
    journal = "Studies in Mycology",
    url = "https://doi.org/10.3114/sim0005",
    doi = "10.3114/sim0005",
    openalex = "W2093219539",
    pages = "37-114",
    volume = "75",
    references = "doi1010160968000490902527, doi101016b9780123721808500421, doi101073pnas1117018109, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsm092, doi101093nargki198, doi101093sysbio422182, doi101128jb1728423842461990, doi1023072992540, doi105860choice392183"
}

Das Genus Diaporthe umfasst pathogene, endophytische und saprobische Arten mit sowohl gemäßigten als auch tropischen Verbreitungen. Kryptische Diversifizierung, phänotypische Plastizität und umfangreiche Wirtsassoziationen haben die genaue Identifizierung von Arten in diesem Genus lange erschwert. Die Abgrenzung der typischen Art des Genus Diaporthe eres war aufgrund des Mangels an Ex-Typ-Kulturen unsicher. Die Artgrenzen von D. eres und eng verwandten Arten wurden mittels molekularer phylogenetischer Analyse von acht Genen bewertet, darunter nuklearer ribosomaler intern transkribierter Spacer (ITS), partielle Sequenzen von Aktin (ACT), DNA-Lyase (Apn2), Translationselongationsfaktor 1-α (EF1-α), Beta-Tubulin (TUB), Calmodulin (CAL), 60s ribosomales Protein L37 (FG1093) und Histone-3 (HIS). Das Auftreten von Sequenzheterogenität von ITS innerhalb von D. eres wird beobachtet, was die Analyse erschwert und zu einer Überschätzung der Artenvielfalt führen kann. Die strengen Kriterien der Genealogical Concordance Phylogenetic Species Recognition (GCPSR) wurden angewendet, um Artgrenzen basierend auf individuellen und kombinierten Analysen der anderen sieben Gene außer dem ITS zu klären. Wir akzeptieren neun distincte phylogenetische Arten, darunter Diaporthe alleghaniensis, D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis, D. neilliae, D. pulla und D. vaccinii. Epitypen werden für D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis und D. pulla festgelegt. Für diese Arten werden moderne Beschreibungen und Illustrationen bereitgestellt. Neu entwickelte Primer werden eingeführt, um das Apn2 (DNA-Lyase)-Gen in Diaporthe zu amplifizieren und zu sequenzieren. Basierend auf phylogenetischen Informationsprofilen werden EF1-α, Apn2 und HIS-Gene als die besten Marker zur Definition von Arten im D. eres-Komplex erkannt.

@article{doi101007s1322501402972,
    author = "Udayanga, Dhanushka und Castlebury, Lisa A. und Rossman, Amy Y. und Chukeatirote, Ekachai und Hyde, Kevin D.",
    title = "Einblicke in das Genus Diaporthe: phylogenetische Artabgrenzung im D. eres-Artkomplex",
    year = "2014",
    journal = "Fungal Diversity",
    abstract = "Das Genus Diaporthe umfasst pathogene, endophytische und saprobische Arten mit sowohl gemäßigten als auch tropischen Verbreitungen. Kryptische Diversifizierung, phänotypische Plastizität und umfangreiche Wirtsassoziationen haben die genaue Identifizierung von Arten in diesem Genus lange erschwert. Die Abgrenzung der typischen Art des Genus Diaporthe eres war aufgrund des Mangels an Ex-Typ-Kulturen unsicher. Die Artgrenzen von D. eres und eng verwandten Arten wurden mittels molekularer phylogenetischer Analyse von acht Genen bewertet, darunter nuklearer ribosomaler intern transkribierter Spacer (ITS), partielle Sequenzen von Aktin (ACT), DNA-Lyase (Apn2), Translationselongationsfaktor 1-α (EF1-α), Beta-Tubulin (TUB), Calmodulin (CAL), 60s ribosomales Protein L37 (FG1093) und Histone-3 (HIS). Das Auftreten von Sequenzheterogenität von ITS innerhalb von D. eres wird beobachtet, was die Analyse erschwert und zu einer Überschätzung der Artenvielfalt führen kann. Die strengen Kriterien der Genealogical Concordance Phylogenetic Species Recognition (GCPSR) wurden angewendet, um Artgrenzen basierend auf individuellen und kombinierten Analysen der anderen sieben Gene außer dem ITS zu klären. Wir akzeptieren neun distincte phylogenetische Arten, darunter Diaporthe alleghaniensis, D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis, D. neilliae, D. pulla und D. vaccinii. Epitypen werden für D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis und D. pulla festgelegt. Für diese Arten werden moderne Beschreibungen und Illustrationen bereitgestellt. Neu entwickelte Primer werden eingeführt, um das Apn2 (DNA-Lyase)-Gen in Diaporthe zu amplifizieren und zu sequenzieren. Basierend auf phylogenetischen Informationsprofilen werden EF1-α, Apn2 und HIS-Gene als die besten Marker zur Definition von Arten im D. eres-Komplex erkannt.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s13225-014-0297-2",
    doi = "10.1007/s13225-014-0297-2",
    openalex = "W2001517763",
    references = "doi103114sim0012"
}

@misc{crossref2018review,
    title = {Review of: A refinement of coccolith separation methods: Measuring the sinking characters of coccoliths},
    year = "2018",
    url = "https://doi.org/10.5194/bg-2018-82-rc2",
    doi = "10.5194/bg-2018-82-rc2",
    openalex = "W4234196604"
}

Dieser Artikel ist der 13. Beitrag in der Reihe Fungal Diversity Notes, in der 125 Taxa aus vier Phyla, zehn Klassen, 31 Ordnungen, 69 Familien, 92 Gattungen und drei Gattungen incertae sedis behandelt werden, was eine weltweite und geografische Verbreitung demonstriert. In der vorliegenden Studie beschriebene und illustrierte Pilztaxa umfassen drei neue Gattungen, 69 neue Arten, eine neue Kombination, ein Referenzexemplar und 51 neue Funde an neuen Wirten und neuen geografischen Verbreitungen. Drei neue Gattungen, Cylindrotorula (Torulaceae), Scolecoleotia (Leotiales genus incertae sedis) und Xenovaginatispora (Lindomycetaceae), werden auf Basis distincter phylogenetischer Linien und einzigartiger Morphologien eingeführt. Neu beschriebene Arten sind Aspergillus lannaensis, Cercophora dulciaquae, Cladophialophora aquatica, Coprinellus punjabensis, Cortinarius alutarius, C. mammillatus, C. quercoflocculosus, Coryneum fagi, Cruentomycena uttarakhandina, Cryptocoryneum rosae, Cyathus uniperidiolus, Cylindrotorula indica, Diaporthe chamaeropicola, Didymella azollae, Diplodia alanphillipsii, Dothiora coronicola, Efibula rodriguezarmasiae, Erysiphe salicicola, Fusarium queenslandicum, Geastrum gorgonicum, G. hansagiense, Helicosporium sexualis, Helminthosporium chiangraiensis, Hongkongmyces kokensis, Hydrophilomyces hydraenae, Hygrocybe boertmannii, Hyphoderma australosetigerum, Hyphodontia yunnanensis, Khaleijomyces umikazeana, Laboulbenia divisa, Laboulbenia triarthronis, Laccaria populina, Lactarius pallidozonarius, Lepidosphaeria strobelii, Longipedicellata megafusiformis, Lophiotrema lincangensis, Marasmius benghalensis, M. jinfoshanensis, M. subtropicus, Mariannaea camelliae, Melanographium smilaxii, Microbotryum polycnemoides, Mimeomyces digitatus, Minutisphaera thailandensis, Mortierella solitaria, Mucor harpali, Nigrograna jinghongensis, Odontia huanrenensis, O. parvispina, Paraconiothyrium ajrekarii, Parafuscosporella niloticus, Phaeocytostroma yomensis, Phaeoisaria synnematicus, Phanerochaete hainanensis, Pleopunctum thailandicum, Pleurotheciella dimorphospora, Pseudochaetosphaeronema chiangraiense, Pseudodactylaria albicolonia, Rhexoacrodictys nigrospora, Russula paravioleipes, Scolecoleotia eriocamporesi, Seriascoma honghense, Synandromyces makranczyi, Thyridaria aureobrunnea, Torula lancangjiangensis, Tubeufia longihelicospora, Wicklowia fusiformispora, Xenovaginatispora phichaiensis und Xylaria apiospora. Eine neue Kombination, Pseudobactrodesmium stilboideus, wird vorgeschlagen. Ein Referenzexemplar von Comoclathris permunda wird benannt. Neue Wirte- oder Verbreitungsnachweise werden für Acrocalymma fici, Aliquandostipite khaoyaiensis, Camarosporidiella laburni, Canalisporium caribense, Chaetoscutula juniperi, Chlorophyllum demangei, C. globosum, C. hortense, Cladophialophora abundans, Dendryphion hydei, Diaporthe foeniculina, D. pseudophoenicicola, D. pyracanthae, Dictyosporium pandanicola, Dyfrolomyces distoseptatus, Ernakulamia tanakae, Eutypa flavovirens, E. lata, Favolus septatus, Fusarium atrovinosum, F. clavum, Helicosporium luteosporum, Hermatomyces nabanheensis, Hermatomyces sphaericoides, Longipedicellata aquatica, Lophiostoma caudata, L. clematidis-vitalbae, Lophiotrema hydei, L. neoarundinaria, Marasmiellus palmivorus, Megacapitula villosa, Micropsalliota globocystis, M. gracilis, Montagnula thailandica, Neohelicosporium irregulare, N. parisporum, Paradictyoarthrinium diffractum, Phaeoisaria aquatica, Poaceascoma taiwanense, Saproamanita manicata, Spegazzinia camelliae, Submersispora variabilis, Thyronectria caudata, T. mackenziei, Tubeufia chiangmaiensis, T. roseohelicospora, Vaginatispora nypae, Wicklowia submersa, Xanthagaricus necopinatus und Xylaria haemorrhoidalis bereitgestellt. Die hier vorgestellten Daten basieren auf morphologischen Untersuchungen frischer Exemplare, gekoppelt mit der Analyse phylogenetischer Sequenzdaten, um Taxa besser in angemessene taxonomische Ränge zu integrieren und ihre evolutionären Beziehungen abzuleiten.

@article{doi101007s13225019004292,
    author = "Hyde, Kevin D. and Tennakoon, Danushka S. and Jeewon, Rajesh and Bhat, D. Jayarama and Maharachchikumbura, Sajeewa S. N. and Rossi, Walter and Leonardi, Marco and Lee, Hyang Burm and Mun, Hye Yeon and Houbraken, Jos and Nguyen, Thuong T. T. and Jeon, Sun Jeong and Frisvad, Jens C. and Wanasinghe, Dhanushka N. and Lücking, Robert and Aptroot, André and Cáceres, Marcela E. S. and Karunarathna, Samantha C. and Hongsanan, Sinang and Phookamsak, Rungtiwa and de Silva, Nimali I. and Thambugala, Kasun M. and Jayawardena, Ruvishika S. and Senanayake, Indunil C. and Boonmee, Saranyaphat and Chen, Jie and Luo, Zong-Long and Phukhamsakda, Chayanard and Pereira, Olinto Liparini and de Abreu, Vanessa Pereira and Rosado, André Wilson Campos and Bart, Buyck and Randrianjohany, Émile and Hofstetter, Valérie and Gibertoni, Tatiana Baptista and Soares, A.M. and Plautz, Helio Longoni and Sotão, Helen Maria Pontes and Xavier, William Kalhy Silva and Bezerra, Jadson Diogo Pereira and de Oliveira, Thays Gabrielle Lins and de Souza‐Motta, Cristina Maria and Magalhães, Oliane Maria Correia and Bundhun, Digvijayini and Harishchandra, Dulanjalee and Manawasinghe, Ishara S. and Dong, Wei and Zhang, Shengnan and Bao, Dan-Feng and Samarakoon, Milan C. and Pem, Dhandevi and Karunarathna, Anuruddha and Lin, Chuan-Gen and Yang, Jing and Perera, Rekhani H. and Kumar, Vinit and Huang, Shi-Ke and Dayarathne, Monika C. and Ekanayaka, Anusha H. and Jayasiri, Subashini C. and Xiao, Yuan-Pin and Konta, Sirinapa and Niskanen, Tuula and Liimatainen, Kare and Dai, Yu-Cheng and Ji, Xiao-Hong and Tian, Xue-Mei and Mešić, Armin and Singh, Sanjay K. and Phutthacharoen, Kunthida and Cai, Lei and Sorvongxay, Touny and Thiyagaraja, Vinodhini and Norphanphoun, Chada and Chaiwan, Napalai and Lu, Yong‐Zhong and Jiang, Hong-Bo and Zhang, Jin-Feng and Abeywickrama, Pranami D. and Aluthmuhandiram, Janith V. S. and Brahmanage, Rashika S. and Zeng, Ming and Chethana, K. W. Thilini and Wei, De-Ping and Réblová, Martina and Fournier, Jacques and Nekvindová, Jana and do Nascimento Barbosa, Renan and dos Santos, José Ewerton Felinto and de Oliveira, Neiva Tinti and Li, Guojie and Ertz, Damien and Shang, Qiu-Ju and Phillips, Alan J. L. and KUO, CHANG-HSIN and Camporesi, Erio and Bulgakov, Timur S. and Lumyong, Saisamorn and Jones, E. B. Gareth and Chomnunti, Putarak",
    title = "Fungal diversity notes 1036–1150: taxonomic and phylogenetic contributions on genera and species of fungal taxa",
    year = "2019",
    journal = "Fungal Diversity",
    abstract = "This article is the 13th contribution in the Fungal Diversity Notes series, wherein 125 taxa from four phyla, ten classes, 31 orders, 69 families, 92 genera and three genera incertae sedis are treated, demonstrating worldwide and geographic distribution. Fungal taxa described and illustrated in the present study include three new genera, 69 new species, one new combination, one reference specimen and 51 new records on new hosts and new geographical distributions. Three new genera, Cylindrotorula (Torulaceae), Scolecoleotia (Leotiales genus incertae sedis) and Xenovaginatispora (Lindomycetaceae) are introduced based on distinct phylogenetic lineages and unique morphologies. Newly described species are Aspergillus lannaensis, Cercophora dulciaquae, Cladophialophora aquatica, Coprinellus punjabensis, Cortinarius alutarius, C. mammillatus, C. quercoflocculosus, Coryneum fagi, Cruentomycena uttarakhandina, Cryptocoryneum rosae, Cyathus uniperidiolus, Cylindrotorula indica, Diaporthe chamaeropicola, Didymella azollae, Diplodia alanphillipsii, Dothiora coronicola, Efibula rodriguezarmasiae, Erysiphe salicicola, Fusarium queenslandicum, Geastrum gorgonicum, G. hansagiense, Helicosporium sexualis, Helminthosporium chiangraiensis, Hongkongmyces kokensis, Hydrophilomyces hydraenae, Hygrocybe boertmannii, Hyphoderma australosetigerum, Hyphodontia yunnanensis, Khaleijomyces umikazeana, Laboulbenia divisa, Laboulbenia triarthronis, Laccaria populina, Lactarius pallidozonarius, Lepidosphaeria strobelii, Longipedicellata megafusiformis, Lophiotrema lincangensis, Marasmius benghalensis, M. jinfoshanensis, M. subtropicus, Mariannaea camelliae, Melanographium smilaxii, Microbotryum polycnemoides, Mimeomyces digitatus, Minutisphaera thailandensis, Mortierella solitaria, Mucor harpali, Nigrograna jinghongensis, Odontia huanrenensis, O. parvispina, Paraconiothyrium ajrekarii, Parafuscosporella niloticus, Phaeocytostroma yomensis, Phaeoisaria synnematicus, Phanerochaete hainanensis, Pleopunctum thailandicum, Pleurotheciella dimorphospora, Pseudochaetosphaeronema chiangraiense, Pseudodactylaria albicolonia, Rhexoacrodictys nigrospora, Russula paravioleipes, Scolecoleotia eriocamporesi, Seriascoma honghense, Synandromyces makranczyi, Thyridaria aureobrunnea, Torula lancangjiangensis, Tubeufia longihelicospora, Wicklowia fusiformispora, Xenovaginatispora phichaiensis and Xylaria apiospora. One new combination, Pseudobactrodesmium stilboideus is proposed. A reference specimen of Comoclathris permunda is designated. New host or distribution records are provided for Acrocalymma fici, Aliquandostipite khaoyaiensis, Camarosporidiella laburni, Canalisporium caribense, Chaetoscutula juniperi, Chlorophyllum demangei, C. globosum, C. hortense, Cladophialophora abundans, Dendryphion hydei, Diaporthe foeniculina, D. pseudophoenicicola, D. pyracanthae, Dictyosporium pandanicola, Dyfrolomyces distoseptatus, Ernakulamia tanakae, Eutypa flavovirens, E. lata, Favolus septatus, Fusarium atrovinosum, F. clavum, Helicosporium luteosporum, Hermatomyces nabanheensis, Hermatomyces sphaericoides, Longipedicellata aquatica, Lophiostoma caudata, L. clematidis-vitalbae, Lophiotrema hydei, L. neoarundinaria, Marasmiellus palmivorus, Megacapitula villosa, Micropsalliota globocystis, M. gracilis, Montagnula thailandica, Neohelicosporium irregulare, N. parisporum, Paradictyoarthrinium diffractum, Phaeoisaria aquatica, Poaceascoma taiwanense, Saproamanita manicata, Spegazzinia camelliae, Submersispora variabilis, Thyronectria caudata, T. mackenziei, Tubeufia chiangmaiensis, T. roseohelicospora, Vaginatispora nypae, Wicklowia submersa, Xanthagaricus necopinatus and Xylaria haemorrhoidalis. The data presented herein are based on morphological examination of fresh specimens, coupled with analysis of phylogenetic sequence data to better integrate taxa into appropriate taxonomic ranks and infer their evolutionary relationships.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s13225-019-00429-2",
    doi = "10.1007/s13225-019-00429-2",
    openalex = "W2953029298",
    references = "doi101007s1322501703860"
}

Marine Phytoplankton bilden funktionelle Biominerale mit komplexen Morphologien und Architekturen. Coccolithophoren nehmen unter diesen Organismen eine besondere Stellung ein, da sie komplexe Calcit-Schuppen, sogenannte Coccolithen, produzieren. Obwohl sich die Morphologien der Coccolithen zwischen verschiedenen Arten unterscheiden, werden die Kristalle systematisch um eine organische Matrix herum angeordnet, um eine Anordnung von erstaunlicher Symmetrie zu bilden. Wir zeigen die Möglichkeiten, die sich aus der vierdimensionalen Rastertiefenmikroskopie (4D-STEM) ergeben, um die Kristallographie solcher Biominerale räumlich zu lösen. Durch die Entwicklung einer computergestützten Pipeline, die automatisch die Orientierung an Bildpixeln löst, die Kristallen entsprechen, können wir die Orientierung der verflochtenen und überlappenden kristallinen Bausteine kartieren, aus denen der Coccolith besteht. Die vorliegende Arbeit veranschaulicht, wie parallele Aufnahmen im Realraum und im Beugungsraum die Durchsatzrate beim Entschlüsseln des komplexen Netzwerks von Biomineral-Superstrukturen erleichtern und verbessern können.

@article{doi101093mamozaf087,
    author = "Leghziel, Rebecca C und Addadi, Lia und Gal, Assaf und Houben, Lothar",
    title = "Solving the Crystal Architecture of Coccoliths Using 4D-STEM.",
    year = "2025",
    journal = "Microscopy and microanalysis: das offizielle Journal der Microscopy Society of America, Microbeam Analysis Society, Microscopical Society of Canada",
    abstract = "Marine Phytoplankton bilden funktionelle Biominerale mit komplexen Morphologien und Architekturen. Coccolithophoren nehmen unter diesen Organismen eine besondere Stellung ein, da sie komplexe Calcit-Schuppen, sogenannte Coccolithen, produzieren. Obwohl sich die Morphologien der Coccolithen zwischen verschiedenen Arten unterscheiden, werden die Kristalle systematisch um eine organische Matrix herum angeordnet, um eine Anordnung von erstaunlicher Symmetrie zu bilden. Wir zeigen die Möglichkeiten, die sich aus der vierdimensionalen Rastertiefenmikroskopie (4D-STEM) ergeben, um die Kristallographie solcher Biominerale räumlich zu lösen. Durch die Entwicklung einer computergestützten Pipeline, die automatisch die Orientierung an Bildpixeln löst, die Kristallen entsprechen, können wir die Orientierung der verflochtenen und überlappenden kristallinen Bausteine kartieren, aus denen der Coccolith besteht. Die vorliegende Arbeit veranschaulicht, wie parallele Aufnahmen im Realraum und im Beugungsraum die Durchsatzrate beim Entschlüsseln des komplexen Netzwerks von Biomineral-Superstrukturen erleichtern und verbessern können.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41056096/",
    doi = "10.1093/mam/ozaf087",
    openalex = "W4414912265",
    pmid = "41056096",
    references = "doi101006jcis19960217, doi101006jsbi19994132, doi101016jactbio201405024, doi101017s1431927619000497, doi101017s1431927621000477, doi101038356516a0, doi101093icb244893, doi101093oso97801950497700010001, doi1021130540189, openalexw92296177"
}

Coccoliths sind mehrkristalline Calcitstrukturen, die von Mikroalgen innerhalb einer intrazellulären Vesikel gebildet werden. Die Morphologie jedes Kristalls ist komplex, und aktuelle Studien postulieren, dass die Coccolith-Morphogenese durch die Begrenzungsmembran seiner Vesikel reguliert wird. Allerdings macht die begrenzte Information über die Organisation im nativen Zustand innerhalb der Zelle es schwierig zu verstehen, welche strukturellen Aspekte der Membran für die Morphogenese verantwortlich sind. Hier untersuchten wir das vesikuläre Umfeld während der Bildung von Calcidiscus leptoporus Coccoliths unter Verwendung fortschrittlicher Kryo-Elektronenmikroskopie und Röntgenfluoreszenztomographie. Unsere Ergebnisse zeigen zwei verschiedene Arten von Kristalloberflächen, die während der Coccolith-Entwicklung bestehen bleiben: flach und gekrümmt, die sich auch in der Rauheit unterscheiden. Interessanterweise sind beide Arten von Oberflächen, obwohl sie variable Grade der Membraneinschränkung aufweisen, durch deutlich unterscheidbare „Bänder" des engen Kontakts zwischen den Kristallen und der Membran getrennt. Wir schlagen vor, dass diese „Bänder" als Grenzen dienen und Subkompartimente innerhalb der Coccolith-Vesikel schaffen, die das Kristallwachstum und dessen Beendigung regulieren. Diese Ergebnisse deuten darauf hin, dass die Coccolith-Vesikelmembran auf der Nanometerskala unterschiedliche und funktionelle chemische Umgebungen aufrechterhält.

@article{doi101021jacs6c02151,
    author = "Avrahami, Emanuel M und Karpov, Dmitry und Aram, Lior und Elad, Nadav und Safadi, Razi und Rosenhek-Goldian, Irit und Sui, Xiao-Meng und de Haan, Diede und Varsano, Neta und Cohen, Sidney R und Zlotnikov, Igor und Gal, Assaf",
    title = "Spatial Relations between Coccoliths and Their Confining Membrane During Crystal Morphogenesis.",
    year = "2026",
    journal = "Journal of the American Chemical Society",
    abstract = {Coccoliths are multicrystalline calcite structures formed by microalgae within an intracellular vesicle. The morphology of each crystal is complex, and recent studies postulate that coccolith morphogenesis is regulated by the bounding membrane of its vesicle. However, the limited information about the native-state organization within the cell makes it difficult to understand which structural aspects of the membrane are responsible for morphogenesis. Here, we examined the vesicular environment during the formation of Calcidiscus leptoporus coccoliths, using advanced cryo-electron microscopy and X-ray fluorescence tomography. Our findings show two distinct types of crystal surfaces that persist during coccolith development: flat and curved, which differ also in roughness. Interestingly, even though both types of surfaces have variable degrees of membrane confinement, they are separated by distinct "bands" of intimate contact between the crystals and the membrane. We propose that these "bands" serve as boundaries, creating subcompartments within the coccolith vesicle that regulate crystal growth and its cessation. These results suggest that the coccolith vesicle membrane maintains distinct and functional chemical environments on the nanometer scale.},
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC13067266/",
    doi = "10.1021/jacs.6c02151",
    openalex = "W7140159870",
    pmcid = "PMC13067266",
    pmid = "41875313",
    references = "doi101006jsbi19994132, doi101021ie800900f, doi101038356516a0, doi101038nature04382, doi101038nature14365, doi101073pnas1118120109, doi10108800344885684r03, doi101146annurevmarine122414034032, doi1021130540189, doi102216i003188844065031"
}

UNLABELLED: Coccolithen sind einzelne Platten aus Calciumcarbonat, die die Schalen von marinen kalkbildenden Haptophyten-Algen bilden. Ihre Überreste bieten ein hervorragendes sedimentäres Archiv für die Rekonstruktion vergangener Umweltparameter. Mittels nano-skalierte Sekundärionen-Massenspektrometrie (NanoSIMS) haben wir den Mg-, Sr-, Na- und K-Gehalt in einzelnen Coccolithen von Emiliania huxleyi, jetzt Gephyrocapsa huxleyi genannt, gemessen, um ihr Potenzial als Paläoproxy zu untersuchen. Für jüngste Umweltproben aus dem Mittelmeer und dem Schwarzen Meer sowie kultivierten Exemplaren scheinen alle Elemente innerhalb der einzelnen Coccolithen homogen verteilt, aber zwischen ihnen hochgradig variabel zu sein. Mg/Ca- und Sr/Ca-Verhältnisse umfassen einen Bereich von 0,06–83 mmol mol−1 bzw. 1,9–3,8 mmol mol−1 und stimmen mit zuvor bestimmten Werten überein. Na/Ca lag zwischen 1,6–186 mmol mol−1. K/Ca konnte nicht kalibriert werden, aber die gemessenen 39K+/44Ca+-Ionenzählverhältnisse variierten zwischen 0,03–2,7. Obwohl die Na/Ca-Verhältnisse in den Mittelmeerproben mit zunehmender Gesamtalkalität und Salinität signifikant abnahmen, wurden diese Trends in Proben, die aus Kulturen gesammelt wurden, bei denen die Alkalität und Salinität separat variierten, nicht beobachtet. Ebenso zeigten K/Ca-Verhältnisse keine klaren Trends mit der Gesamtalkalität oder Salinität des Kulturmediums. Die Verkalkung in Coccolithophoren ist biologisch kontrolliert und dies kann die Auswirkung von Umweltfaktoren auf die beobachtete Variation im Na- und K-Gehalt einzelner Coccolithen von E. huxleyi maskieren. SUPPLEMENTARY INFORMATION: Die Online-Version enthält ergänzendes Material unter 10.1038/s41598-026-40623-2 verfügbar.

@article{doi101038s41598026406232,
    author = "Roepert, Anne und Middelburg, Jack J und Weiss, Gabriella M und van der Meer, Marcel T J und Polerecky, Lubos",
    title = "Natrium- und Kaliumanalyse einzelner Coccolithen mittels Sekundärionen-Massenspektrometrie.",
    year = "2026",
    journal = "Scientific reports",
    abstract = "UNLABELLED: Coccolithen sind einzelne Platten aus Calciumcarbonat, die die Schalen von marinen kalkbildenden Haptophyten-Algen bilden. Ihre Überreste bieten ein hervorragendes sedimentäres Archiv für die Rekonstruktion vergangener Umweltparameter. Mittels nano-skalierte Sekundärionen-Massenspektrometrie (NanoSIMS) haben wir den Mg-, Sr-, Na- und K-Gehalt in einzelnen Coccolithen von Emiliania huxleyi, jetzt Gephyrocapsa huxleyi genannt, gemessen, um ihr Potenzial als Paläoproxy zu untersuchen. Für jüngste Umweltproben aus dem Mittelmeer und dem Schwarzen Meer sowie kultivierten Exemplaren scheinen alle Elemente innerhalb der einzelnen Coccolithen homogen verteilt, aber zwischen ihnen hochgradig variabel zu sein. Mg/Ca- und Sr/Ca-Verhältnisse umfassen einen Bereich von 0,06–83 mmol mol−1 bzw. 1,9–3,8 mmol mol−1 und stimmen mit zuvor bestimmten Werten überein. Na/Ca lag zwischen 1,6–186 mmol mol−1. K/Ca konnte nicht kalibriert werden, aber die gemessenen 39K+/44Ca+-Ionenzählverhältnisse variierten zwischen 0,03–2,7. Obwohl die Na/Ca-Verhältnisse in den Mittelmeerproben mit zunehmender Gesamtalkalität und Salinität signifikant abnahmen, wurden diese Trends in Proben, die aus Kulturen gesammelt wurden, bei denen die Alkalität und Salinität separat variierten, nicht beobachtet. Ebenso zeigten K/Ca-Verhältnisse keine klaren Trends mit der Gesamtalkalität oder Salinität des Kulturmediums. Die Verkalkung in Coccolithophoren ist biologisch kontrolliert und dies kann die Auswirkung von Umweltfaktoren auf die beobachtete Variation im Na- und K-Gehalt einzelner Coccolithen von E. huxleyi maskieren. SUPPLEMENTARY INFORMATION: Die Online-Version enthält ergänzendes Material unter 10.1038/s41598-026-40623-2 verfügbar.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC13048990/",
    doi = "10.1038/s41598-026-40623-2",
    openalex = "W7132837306",
    pmcid = "PMC13048990",
    pmid = "41764317",
    references = "doi10100797836620627845, doi101016007919467990106x, doi101016s0016703798000970, doi101038320129a0, doi101038330367a0, doi101038347462a0, doi101038nature10295, doi101111j152988171987tb04217x, doi101126sciadv1501822, doi101126science1110063"
}

@misc{crossrefNonetable,
    title = "Tabelle 6: In der Literatur dokumentierte Dichten von Fleckenhyänen.",
    year = "Keine",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.12307/table-6",
    doi = "10.7717/peerj.12307/table-6"
}