1. Havel, Richard J. und Eder, Howard A. und Bragdon, Joseph H., 1955, DIE VERTEILUNG UND CHEMISCHE ZUSAMMENSETZUNG ULTRAZENTRIFUGAL GETRENNTER LIPOPROTEINE IN MENSCHLICHEM SERUM: Journal of Clinical Investigation.
Zusammenfassung
In den letzten Jahren wurden mehrere Methoden zur Analyse von Serumlipoproteinen entwickelt. Lindgren, Elliott und Gofman (1) haben die relativ niedrige Dichte der Lipoproteine genutzt, um diese von den anderen Serumproteinen durch ultrazentrifugale Aufschwimmung zu trennen. Die Quantifizierung wurde anschlie- ßend durch refraktometrische Methoden im analytischen Ultrazentrifugen durchgeführt. Trennungen von Lipoproteinen wurden auch durch Cohn-Fraktionierung in kaltem Ethanol vorgenommen, und die Mengen an Lipoprotein wurden aus dem Lipid- Gehalt der Fraktionen geschätzt (2, 3). Weit verbreitet zurzeit ist die Methode der Zonenelektrophorese mit Quantifizierung entweder durch Färbung (4) oder durch chemische Analyse von Eluaten aus dem tragenden Medium (5, 6).
BibTeX
@article{doi101172jci103182,
author = "Havel, Richard J. und Eder, Howard A. und Bragdon, Joseph H.",
title = "THE DISTRIBUTION AND CHEMICAL COMPOSITION OF ULTRACENTRIFUGALLY SEPARATED LIPOPROTEINS IN HUMAN SERUM",
year = "1955",
journal = "Journal of Clinical Investigation",
abstract = "In den letzten Jahren wurden mehrere Methoden zur Analyse von Serumlipoproteinen entwickelt. Lindgren, Elliott und Gofman (1) haben die relativ niedrige Dichte der Lipoproteine genutzt, um diese von den anderen Serumproteinen durch ultrazentrifugale Aufschwimmung zu trennen. Die Quantifizierung wurde anschlie- ßend durch refraktometrische Methoden im analytischen Ultrazentrifugen durchgeführt. Trennungen von Lipoproteinen wurden auch durch Cohn-Fraktionierung in kaltem Ethanol vorgenommen, und die Mengen an Lipoprotein wurden aus dem Lipid- Gehalt der Fraktionen geschätzt (2, 3). Weit verbreitet zurzeit ist die Methode der Zonenelektrophorese mit Quantifizierung entweder durch Färbung (4) oder durch chemische Analyse von Eluaten aus dem tragenden Medium (5, 6).",
url = "https://doi.org/10.1172/jci103182",
doi = "10.1172/jci103182",
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references = "doi101016s0021925818570216"
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2. Pickford, Grace E. und Grant, F. Blake, 1967, Serum-Osmolarität im Coelacanth, Latimeria chalumnae: Harnstoffretention und Ionenregulation: Science.
DOI: 10.1126/science.155.3762.568
Zusammenfassung
Blutproben (hämolyisiert) wurden aus der Nierenvene, dem Leberpfortader und dem Herzen eines frisch aufgetauten Exemplars von Latimeria chalumnae gewonnen. Der Coelacanth verwendet hohe Konzentrationen von Harnstoff, um seine Serum-Osmolarität auf etwa das Niveau von Meerwasser zu halten. Der Mittelwert für die Gesamt-Osmolarität betrug 1181 Milliosmole pro Liter. Die Mittelwerte (Milliäquivalente pro Liter) waren: für Natrium, 181; für Kalium, 51,3; für Calcium, 6,9; für Magnesium, 28,7; für Chlorid, 199; und für Bicarbonat, 4,7. Die mittlere Harnstoffkonzentration betrug 355 Millimole pro Liter, und der mittlere nichtproteinogene Stickstoff betrug 1343 Milligramm prozent. Das Herzk Blut zeigte signifikant niedrigere Werte für Osmolarität (921 Milliosmole pro Liter) und nichtproteinogenen Stickstoff (1030 mg prozent) und war wahrscheinlich weniger stark mit Produkten des Proteinstoffwechsels kontaminiert. Flüssigkeit aus der vorderen Augenkammer zeigte Werte von 952 Milliosmole/Liter; der Harnstoffwert für diese Flüssigkeit betrug 303 mmole/Liter, und das Magnesium betrug 7,3 meq/Liter. Der Magnesiumwert für die Kammerwasser wurde verwendet, um die abnorm hohen Konzentrationen im hämolytierten Serum zu korrigieren. Der hohe Kaliumspiegel im Serum wurde ebenfalls auf Hämolyse zurückgeführt.
BibTeX
@article{doi101126science1553762568,
author = "Pickford, Grace E. und Grant, F. Blake",
title = "Serum-Osmolarität im Coelacanth, Latimeria chalumnae: Harnstoffretention und Ionenregulation",
year = "1967",
journal = "Science",
abstract = "Blutproben (hämolyisiert) wurden aus der Nierenvene, dem Leberpfortader und dem Herzen eines frisch aufgetauten Exemplars von Latimeria chalumnae gewonnen. Der Coelacanth verwendet hohe Konzentrationen von Harnstoff, um seine Serum-Osmolarität auf etwa das Niveau von Meerwasser zu halten. Der Mittelwert für die Gesamt-Osmolarität betrug 1181 Milliosmole pro Liter. Die Mittelwerte (Milliäquivalente pro Liter) waren: für Natrium, 181; für Kalium, 51,3; für Calcium, 6,9; für Magnesium, 28,7; für Chlorid, 199; und für Bicarbonat, 4,7. Die mittlere Harnstoffkonzentration betrug 355 Millimole pro Liter, und der mittlere nichtproteinogene Stickstoff betrug 1343 Milligramm prozent. Das Herzk Blut zeigte signifikant niedrigere Werte für Osmolarität (921 Milliosmole pro Liter) und nichtproteinogenen Stickstoff (1030 mg prozent) und war wahrscheinlich weniger stark mit Produkten des Proteinstoffwechsels kontaminiert. Flüssigkeit aus der vorderen Augenkammer zeigte Werte von 952 Milliosmole/Liter; der Harnstoffwert für diese Flüssigkeit betrug 303 mmole/Liter, und das Magnesium betrug 7,3 meq/Liter. Der Magnesiumwert für die Kammerwasser wurde verwendet, um die abnorm hohen Konzentrationen im hämolytierten Serum zu korrigieren. Der hohe Kaliumspiegel im Serum wurde ebenfalls auf Hämolyse zurückgeführt.",
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3. LUTZ, PETER L. und ROBERTSON, JAMES D., 1971, OSMOTISCHE KONSTITUENTEN DES COELACANTH LATIMERIA CHALUMNAE SMITH: The Biological Bulletin: v. 141, no. 3: p. 553-560.
BibTeX
@article{lutz1971osmotic,
author = "LUTZ, PETER L. und ROBERTSON, JAMES D.",
title = "OSMOTISCHE KONSTITUENTEN DES COELACANTH LATIMERIA CHALUMNAE SMITH",
year = "1971",
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4. CHAVIN, WALTER, 1972, Schilddrüse des Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith: Nature: v. 239, no. 5371: p. 340-341.
BibTeX
@article{chavin1972thyroid,
author = "CHAVIN, WALTER",
title = "Thyroid of the Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith",
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5. Smith, Moya Meredith und Hobdell, M. H. und Miller, William A., 1972, The structure of the scales of Latimeria chalumnae: Journal of Zoology.
DOI: 10.1111/j.1469-7998.1972.tb01741.x
Zusammenfassung
Schuppen von vier Exemplaren von Latimeria chalumnae wurden in einem Präparationsmikroskop untersucht und anschließend Röntgenaufnahmen gemacht. Einige wurden entmineralisiert und für die routinemäßige Histologie vorbereitet. Andere wurden in Zedernholzöl geklärt. Gesteuerte Schnitte von in Kunststoff eingebetteten Schuppen wurden mikroradiographiert und Elektronenmikroaufnahmen von in Araldit eingebetteten gefrorenen Schuppen angefertigt. Entsprechende 1 μm dicke serielle Schnitte wurden im Lichtmikroskop untersucht. Der größere Teil der Schuppe besteht aus Schichten von unmineralisiertem Isopedin, das von dem exponierten Teil der Schuppe überragt wird, der pigmentiert ist und durch eine Reihe von Denticeln aus tubulärem Dentin mit Enamoidspitzen verziert ist. Zwischen diesen beiden Teilen befindet sich eine dünne, gerippte, knochenähnliche Schicht. In den Elektronenmikroaufnahmen zeigte sich, dass das Isopedin aus Schichten dicht gepackter Kollagenfasern besteht; die Orientierung dieser war in jeder Schicht einheitlich, variierte jedoch stark von Schicht zu Schicht. Nur wenige Zellen wurden zwischen den Faserbündeln gefunden. Die Röntgenaufnahmen zeigten zahlreiche konzentrische Jahresringe und, etwa rechtwinklig dazu liegend, eine weitere Reihe von Rippen, die vom Zentrum der Schuppen ausgehen. Es wird vorgeschlagen, dass das basale unmineralisierte Isopedin und die gerippte Schicht knochenähnlichen Gewebes, die es bedeckt, eine stark modifizierte kosmoide Schuppe darstellt, auf der die Denticel und die pigmentierte Schicht überlagert wurden.
BibTeX
@article{doi101111j146979981972tb01741x,
author = "Smith, Moya Meredith und Hobdell, M. H. und Miller, William A.",
title = "The structure of the scales of Latimeria chalumnae",
year = "1972",
journal = "Journal of Zoology",
abstract = "Schuppen von vier Exemplaren von Latimeria chalumnae wurden in einem Präparationsmikroskop untersucht und anschließend Röntgenaufnahmen gemacht. Einige wurden entmineralisiert und für die routinemäßige Histologie vorbereitet. Andere wurden in Zedernholzöl geklärt. Gesteuerte Schnitte von in Kunststoff eingebetteten Schuppen wurden mikroradiographiert und Elektronenmikroaufnahmen von in Araldit eingebetteten gefrorenen Schuppen angefertigt. Entsprechende 1 μm dicke serielle Schnitte wurden im Lichtmikroskop untersucht. Der größere Teil der Schuppe besteht aus Schichten von unmineralisiertem Isopedin, das von dem exponierten Teil der Schuppe überragt wird, der pigmentiert ist und durch eine Reihe von Denticeln aus tubulärem Dentin mit Enamoidspitzen verziert ist. Zwischen diesen beiden Teilen befindet sich eine dünne, gerippte, knochenähnliche Schicht. In den Elektronenmikroaufnahmen zeigte sich, dass das Isopedin aus Schichten dicht gepackter Kollagenfasern besteht; die Orientierung dieser war in jeder Schicht einheitlich, variierte jedoch stark von Schicht zu Schicht. Nur wenige Zellen wurden zwischen den Faserbündeln gefunden. Die Röntgenaufnahmen zeigten zahlreiche konzentrische Jahresringe und, etwa rechtwinklig dazu liegend, eine weitere Reihe von Rippen, die vom Zentrum der Schuppen ausgehen. Es wird vorgeschlagen, dass das basale unmineralisierte Isopedin und die gerippte Schicht knochenähnlichen Gewebes, die es bedeckt, eine stark modifizierte kosmoide Schuppe darstellt, auf der die Denticel und die pigmentierte Schicht überlagert wurden.",
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openalex = "W1981835508"
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6. Cole, D.F., 1973, Intraokulare Flüssigkeitszusammensetzung im Coelacanth, Latimeria chalumnae: Experimental Eye Research: v. 16, no. 5: p. 389-395.
DOI: 10.1016/0014-4835(73)90133-4
BibTeX
@article{cole1973intraocular,
author = "Cole, D.F.",
title = "Intraokulare Flüssigkeitszusammensetzung im Coelacanth, Latimeria chalumnae",
year = "1973",
journal = "Experimental Eye Research",
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volume = "16",
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7. Hamoir, G. und Piront, A. und Gerday, Ch. und Dando, P. R., 1973, Muskelproteine des Coelacanth Latimeria Chalumnae Smith: Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom: v. 53, no. 4: p. 763-784.
DOI: 10.1017/s0025315400022463
Zusammenfassung
Obwohl die Anatomie der Coelacanth-Muskeln sehr gründlich untersucht wurde, wurde ihre Proteinzusammensetzung bis vor kurzem nicht erforscht. Dank der britisch-französisch-amerikanischen Expedition zu den Komoren im Jahr 1972 steht jedoch gefrorenes Material zur Verfügung, und einige Ergebnisse zu Myoglobin und vier glykolytischen Enzymen wurden bereits veröffentlicht. Wir haben einen Vergleich der Sarkoplasma-Proteine von rotem und weißem Muskel durch Starch-Gel-Elektrophorese durchgeführt. Die Ninhydrin-positiven dialysierbaren Bestandteile und die Myofibrillenproteine des weißen Muskels wurden ebenfalls untersucht. Einige rätselhafte Ergebnisse, die mit den weißen Muskelextrakten erzielt wurden, wurden auf das Vorkommen von 0,1 M Ammoniak zurückgeführt, das vermutlich durch die Spaltung von Harnstoff durch eine bakterielle Urease verursacht wurde, sowie auf eine Veränderung der aktiven Thiolgruppen von GAPDH und PK. Wenn diese ungewöhnlichen postmortalen Veränderungen angemessen berücksichtigt werden, sind die Extrahierbarkeit der Proteine und ihre Eigenschaften auffallend ähnlich denen von Teleostei. Der Vergleich der Sarkoplasma-Proteine von weißem und rotem Muskel durch Starch-Gel-Elektrophorese zeigte auch, dass die im Coelacanth beobachtete Differenzierung derjenigen beim Karpfen entspricht. Eine Untersuchung der niedermolekularen Proteine oder Parvalbumine des weißen Muskels sowie der Myofibrillenproteine zeigt ebenfalls die erwarteten Unterschiede zwischen den beiden Muskeltypen. Die einzigen abnormalen Merkmale, die in dieser Studie beobachtet wurden, waren die hohe Konzentration an Parvalbuminen, 1,5–2 mal so hoch wie bei anderen untersuchten Arten, und das Vorkommen einer ungewöhnlichen Globulinfraktion, die bei einer Ionenstärke von 0,5 leicht extrahiert werden konnte und bei einer Ionenstärke von 0,35 und neutralem pH unlöslich war.
BibTeX
@article{hamoir1973muscle,
author = "Hamoir, G. und Piront, A. und Gerday, Ch. und Dando, P. R.",
title = "Muskelproteine des Coelacanth Latimeria Chalumnae Smith",
year = "1973",
journal = "Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom",
abstract = "Obwohl die Anatomie der Coelacanth-Muskeln sehr gründlich untersucht wurde, wurde ihre Proteinzusammensetzung bis vor kurzem nicht erforscht. Dank der britisch-französisch-amerikanischen Expedition zu den Komoren im Jahr 1972 steht jedoch gefrorenes Material zur Verfügung, und einige Ergebnisse zu Myoglobin und vier glykolytischen Enzymen wurden bereits veröffentlicht. Wir haben einen Vergleich der Sarkoplasma-Proteine von rotem und weißem Muskel durch Starch-Gel-Elektrophorese durchgeführt. Die Ninhydrin-positiven dialysierbaren Bestandteile und die Myofibrillenproteine des weißen Muskels wurden ebenfalls untersucht. Einige rätselhafte Ergebnisse, die mit den weißen Muskelextrakten erzielt wurden, wurden auf das Vorkommen von 0,1 M Ammoniak zurückgeführt, das vermutlich durch die Spaltung von Harnstoff durch eine bakterielle Urease verursacht wurde, sowie auf eine Veränderung der aktiven Thiolgruppen von GAPDH und PK. Wenn diese ungewöhnlichen postmortalen Veränderungen angemessen berücksichtigt werden, sind die Extrahierbarkeit der Proteine und ihre Eigenschaften auffallend ähnlich denen von Teleostei. Der Vergleich der Sarkoplasma-Proteine von weißem und rotem Muskel durch Starch-Gel-Elektrophorese zeigte auch, dass die im Coelacanth beobachtete Differenzierung derjenigen beim Karpfen entspricht. Eine Untersuchung der niedermolekularen Proteine oder Parvalbumine des weißen Muskels sowie der Myofibrillenproteine zeigt ebenfalls die erwarteten Unterschiede zwischen den beiden Muskeltypen. Die einzigen abnormalen Merkmale, die in dieser Studie beobachtet wurden, waren die hohe Konzentration an Parvalbuminen, 1,5–2 mal so hoch wie bei anderen untersuchten Arten, und das Vorkommen einer ungewöhnlichen Globulinfraktion, die bei einer Ionenstärke von 0,5 leicht extrahiert werden konnte und bei einer Ionenstärke von 0,35 und neutralem pH unlöslich war.",
url = "https://doi.org/10.1017/s0025315400022463",
doi = "10.1017/s0025315400022463",
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8. Griffith, Robert W. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K.T. und Pickford, Grace E., 1974, Serumzusammensetzung des Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith: Journal of Experimental Zoology.
Zusammenfassung
Zusammenfassung Anorganische und organische Bestandteile wurden im Blutserum untersucht, das von einem lebenden Exemplar des Coelacanth, Latimeria chalumnae, gesammelt wurde. Zu den bestimmten anorganischen Elektrolyten gehörten Natrium (196,7 mM/l), Kalium (5,78 mM/l), Magnesium (5,30 mM/l), Calcium (4,94 mM/l), Chlorid (186,7 mM/l), Bicarbonat (9,60 mM/l), Phosphat (5,08 mM/l) und Sulfat (4,80 mM/l). Das Serumharnstoff (377 mM/l) und Trimethylaminoxid (122 mM/l) waren wie zuvor berichtet erhöht und machten den Großteil des Gesamtstickstoffs ohne Protein (1199 mg%) aus; Gesamtaminosäuren trugen einen kleinen, aber nicht unbedeutenden Anteil (21,9 mg%) bei. Hohe Serumlaktat- (16,5 mM/l) und Glukosewerte (6,57 mM/l) waren wahrscheinlich ein Indikator für Stress; Glukose war die einzige Kohlenhydratart, die in nennenswerten Mengen im Serum vorhanden war, obwohl Spuren von Glucuronsäure und Rhamnose gefunden wurden. Das Gesamtcholesterin im Serum betrug 3,91 mM/l, das organisch gebundene Phosphor 1,99 mM/l und die Gesamtproteine 2,84 g%. Drei Hauptproteinfraktionen waren aus der Celluloseacetat-Elektrophorese ersichtlich, und mindestens 11 Peaks waren durch die Acrylamidgel-Elektrophorese nachweisbar. Das Latimeria-Serum fehlt eine Proteinfraktion mit einer Mobilität, die der von menschlichem Serumalbumin nahekommt. Die Serum-Osmolarität (932 mOsm/l) war etwas niedriger als die des Meerwassers, das am Fangort des Exemplars gesammelt wurde (1035 mOsm/l). Die evolutionären Implikationen der Ähnlichkeit der Latimeria-Serumchemie mit der anderer Meeresfische werden diskutiert.
BibTeX
@article{doi101002jez1401870111,
author = "Griffith, Robert W. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K.T. und Pickford, Grace E.",
title = "Serumzusammensetzung des Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith",
year = "1974",
journal = "Journal of Experimental Zoology",
abstract = "Zusammenfassung Anorganische und organische Bestandteile wurden im Blutserum untersucht, das von einem lebenden Exemplar des Coelacanth, Latimeria chalumnae, gesammelt wurde. Zu den bestimmten anorganischen Elektrolyten gehörten Natrium (196,7 mM/l), Kalium (5,78 mM/l), Magnesium (5,30 mM/l), Calcium (4,94 mM/l), Chlorid (186,7 mM/l), Bicarbonat (9,60 mM/l), Phosphat (5,08 mM/l) und Sulfat (4,80 mM/l). Das Serumharnstoff (377 mM/l) und Trimethylaminoxid (122 mM/l) waren wie zuvor berichtet erhöht und machten den Großteil des Gesamtstickstoffs ohne Protein (1199 mg%) aus; Gesamtaminosäuren trugen einen kleinen, aber nicht unbedeutenden Anteil (21,9 mg%) bei. Hohe Serumlaktat- (16,5 mM/l) und Glukosewerte (6,57 mM/l) waren wahrscheinlich ein Indikator für Stress; Glukose war die einzige Kohlenhydratart, die in nennenswerten Mengen im Serum vorhanden war, obwohl Spuren von Glucuronsäure und Rhamnose gefunden wurden. Das Gesamtcholesterin im Serum betrug 3,91 mM/l, das organisch gebundene Phosphor 1,99 mM/l und die Gesamtproteine 2,84 g%. Drei Hauptproteinfraktionen waren aus der Celluloseacetat-Elektrophorese ersichtlich, und mindestens 11 Peaks waren durch die Acrylamidgel-Elektrophorese nachweisbar. Das Latimeria-Serum fehlt eine Proteinfraktion mit einer Mobilität, die der von menschlichem Serumalbumin nahekommt. Die Serum-Osmolarität (932 mOsm/l) war etwas niedriger als die des Meerwassers, das am Fangort des Exemplars gesammelt wurde (1035 mOsm/l). Die evolutionären Implikationen der Ähnlichkeit der Latimeria-Serumchemie mit der anderer Meeresfische werden diskutiert.",
url = "https://doi.org/10.1002/jez.1401870111",
doi = "10.1002/jez.1401870111",
openalex = "W2007467582",
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9. Griffith, Robert W. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K. T. und Pickford, Grace E., 1974, Serumzusammensetzung des Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith: Journal of Experimental Zoology: v. 187, no. 1: p. 87-102.
Zusammenfassung
Unorganische und organische Bestandteile wurden im Blutserum untersucht, das von einem lebenden Exemplar des Coelacanth, Latimeria chalumnae, gesammelt wurde. Zu den bestimmten unorganischen Elektrolyten gehörten Natrium (196,7 mM/l), Kalium (5,78 mM/l), Magnesium (5,30 mM/l), Calcium (4,94 mM/l), Chlorid (186,7 mM/l), Bicarbonat (9,60 mM/l), Phosphat (5,08 mM/l) und Sulfat (4,80 mM/l). Das Serumharnstoff (377 mM/l) und Trimethylaminoxid (122 mM/l) waren wie zuvor berichtet erhöht und machten den Großteil des gesamten nicht-proteinären Stickstoffs (1199 mg%) aus; die Gesamtamino säuren fügten einen kleinen, aber nicht unbedeutenden Anteil (21,9 mg%) hinzu. Hohe Serumlaktat (16,5 mM/l) und Glukose (6,57 mM/l) Spiegel waren wahrscheinlich ein Indikator für Stress; Glukose war die einzige Kohlenhydratart, die in nennenswerten Mengen im Serum vorhanden war, obwohl Spuren von Glucuronsäure und Rhamnose gefunden wurden. Das Serumgesamtcholesterin betrug 3,91 mM/l, das organisch gebundene Phosphor 1,99 mM/l und die Gesamtproteine 2,84 g%. Drei Hauptproteinfraktionen waren aus der Celluloseacetat-Elektrophorese ersichtlich und mindestens 11 Peaks waren durch Acrylamidgel-Elektrophorese nachweisbar. Das Latimeria-Serum fehlt eine Proteinfraktion mit einer Mobilität, die der von menschlichem Serumalbumin nahekommt. Die Serumosmolarität (932 mOsm/l) war etwas niedriger als die des Meerwassers, das am Fangort des Exemplars gesammelt wurde (1035 mOsm/l). Evolutionäre Implikationen der Ähnlichkeit der Latimeria-Serumchemie mit der anderer Meeresfische werden diskutiert.
BibTeX
@article{griffith1974serum,
author = "Griffith, Robert W. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K. T. und Pickford, Grace E.",
title = "Serumzusammensetzung des Coelacanth, Latimeria chalumnae Smith",
year = "1974",
journal = "Journal of Experimental Zoology",
abstract = "Unorganische und organische Bestandteile wurden im Blutserum untersucht, das von einem lebenden Exemplar des Coelacanth, Latimeria chalumnae, gesammelt wurde. Zu den bestimmten unorganischen Elektrolyten gehörten Natrium (196,7 mM/l), Kalium (5,78 mM/l), Magnesium (5,30 mM/l), Calcium (4,94 mM/l), Chlorid (186,7 mM/l), Bicarbonat (9,60 mM/l), Phosphat (5,08 mM/l) und Sulfat (4,80 mM/l). Das Serumharnstoff (377 mM/l) und Trimethylaminoxid (122 mM/l) waren wie zuvor berichtet erhöht und machten den Großteil des gesamten nicht-proteinären Stickstoffs (1199 mg%) aus; die Gesamtamino säuren fügten einen kleinen, aber nicht unbedeutenden Anteil (21,9 mg%) hinzu. Hohe Serumlaktat (16,5 mM/l) und Glukose (6,57 mM/l) Spiegel waren wahrscheinlich ein Indikator für Stress; Glukose war die einzige Kohlenhydratart, die in nennenswerten Mengen im Serum vorhanden war, obwohl Spuren von Glucuronsäure und Rhamnose gefunden wurden. Das Serumgesamtcholesterin betrug 3,91 mM/l, das organisch gebundene Phosphor 1,99 mM/l und die Gesamtproteine 2,84 g%. Drei Hauptproteinfraktionen waren aus der Celluloseacetat-Elektrophorese ersichtlich und mindestens 11 Peaks waren durch Acrylamidgel-Elektrophorese nachweisbar. Das Latimeria-Serum fehlt eine Proteinfraktion mit einer Mobilität, die der von menschlichem Serumalbumin nahekommt. Die Serumosmolarität (932 mOsm/l) war etwas niedriger als die des Meerwassers, das am Fangort des Exemplars gesammelt wurde (1035 mOsm/l). Evolutionäre Implikationen der Ähnlichkeit der Latimeria-Serumchemie mit der anderer Meeresfische werden diskutiert.",
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doi = "10.1002/jez.1401870111",
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10. Griffith, R. W. und Umminger, B. L. und Grant, B. F. und Pang, P. K. T. und Pickford, G. E, 1974, Serumzusammensetzung des Coelacanth Latimeria chalumnae Smith: Journal of Experimental Zoology, v. 187, S. 87-102.
BibTeX
@article{griffith1974serum1,
author = "Griffith, R. W. und Umminger, B. L. und Grant, B. F. und Pang, P. K. T. und Pickford, G. E",
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}
11. Griffith, Robert W. und Mathews, Martin B. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K.T. und Thomson, Keith Stewart und Pickford, Grace E., 1975, Zusammensetzung der Flüssigkeit aus dem Notochordalkanal des Coelacanth, Latimeria chalumnae: Journal of Experimental Zoology.
Zusammenfassung
Flüssigkeit aus dem Notochordalkanal des Coelacanth, Latimeria chalumnae, wurde auf Hauptanorganische und organische Bestandteile analysiert und mit Blutserum desselben Fisches verglichen. Signifikant oder deutend niedrigere Gehalte an Natrium, Magnesium, Calcium, Bicarbonat, Sulfat, Gesamtkohlenhydraten, Glukose, Laktat, Cholesterin, gebundenem Phosphat und Gesamtproteinen wurden in der Notochordalflüssigkeit im Vergleich zum Serum gefunden, wohingegen Kalium, Chlorid, Harnstoff, Trimethylaminoxid und Gesamtfreie Aminosäuren höher waren und anorganisches Phosphor im Wesentlichen identisch. Die Osmolarität der Notochordalflüssigkeit (1058 mOsm) übersteigt die des Serums (942 mOsm). Ein weißlicher Niederschlag in der Flüssigkeit bestand aus einer Matrix von Fasern mit einem Durchmesser von 100 Å und unbestimmter Länge. Er ähnelte in der Zusammensetzung einem Sialoglykoprotein und wurde durch Disulfidbrücken stabilisiert. Die Flüssigkeit enthielt Zelltrümmer.
BibTeX
@article{doi101002jez1401920206,
author = "Griffith, Robert W. und Mathews, Martin B. und Umminger, Bruce L. und Grant, Blake F. und Pang, Peter K.T. und Thomson, Keith Stewart und Pickford, Grace E.",
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journal = "Journal of Experimental Zoology",
abstract = "Flüssigkeit aus dem Notochordalkanal des Coelacanth, Latimeria chalumnae, wurde auf Hauptanorganische und organische Bestandteile analysiert und mit Blutserum desselben Fisches verglichen. Signifikant oder deutend niedrigere Gehalte an Natrium, Magnesium, Calcium, Bicarbonat, Sulfat, Gesamtkohlenhydraten, Glukose, Laktat, Cholesterin, gebundenem Phosphat und Gesamtproteinen wurden in der Notochordalflüssigkeit im Vergleich zum Serum gefunden, wohingegen Kalium, Chlorid, Harnstoff, Trimethylaminoxid und Gesamtfreie Aminosäuren höher waren und anorganisches Phosphor im Wesentlichen identisch. Die Osmolarität der Notochordalflüssigkeit (1058 mOsm) übersteigt die des Serums (942 mOsm). Ein weißlicher Niederschlag in der Flüssigkeit bestand aus einer Matrix von Fasern mit einem Durchmesser von 100 Å und unbestimmter Länge. Er ähnelte in der Zusammensetzung einem Sialoglykoprotein und wurde durch Disulfidbrücken stabilisiert. Die Flüssigkeit enthielt Zelltrümmer.",
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12. Lagios, Michael D., 1975, Die Hypophyse des Coelacanth Latimeria chalumnae Smith: General and Comparative Endocrinology: v. 25, no. 2: p. 126-146.
DOI: 10.1016/0016-6480(75)90184-7
BibTeX
@article{lagios1975the,
author = "Lagios, Michael D.",
title = "The pituitary gland of the coelacanth Latimeria chalumnae Smith",
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13. Griffith, Robert W., 1980, Chemie der Körperflüssigkeiten des Coelacanth, Latimeria chalumnae: Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences.
Zusammenfassung
Zusammenfassung Der Coelacanth, Latimeria chalumnae, besitzt eine Blutchemie, die nahezu identisch mit der der Knorpelfisch ist und sich von der der Knochenfische und Tetrapoden unterscheidet. Besonders bemerkenswert ist die Aufrechterhaltung hoher Konzentrationen von Harnstoff (377 mM) und Trimethylaminoxid (122 mM), die dazu beitragen, die Blut-Osmolarität (942 mosm/l) an die des Meerwasserumfelds anzunähern. Diese Merkmale kennzeichnen auch andere Coelacanth-Körperflüssigkeiten, wie das Notochordalfluid, wässrige und glasartige Humor, Ventrikelflüssigkeit, Coelomflüssigkeit und Galle. Die Gewebe von Latimeria, wie z. B. Muskeln, zeichnen sich ebenfalls durch hohe Harnstoffkonzentrationen aus. Das osmotische Gleichgewicht zwischen extrazellulären Flüssigkeiten und Geweben scheint durch das Vorhandensein sehr hoher Gewebespiegel von Trimethylaminoxid (ca. 300 mmol/(kg H2O)) erreicht zu werden, die die niedrigen Ionenkonzentrationen im Gewebe ausgleichen. Die Nierenfunktion bei Latimeria scheint die selektive Elimination bestimmter divalenter Ionen (Magnesium, Phosphat und Sulfat) und organischer Substanzen (Glucuronat, Kreatin und einige Aminosäuren) einzuschließen. Im Gegensatz zu anderen ureosmotischen Fischen besitzt der Coelacanth nicht die Nierenkapazität, Harnstoff zurückzuabsorbieren. Hinweise deuten darauf hin, dass die Rektaldrüse, strukturell sehr ähnlich zu denen der Chondrichthier, dazu dient, überschüssiges Natriumchlorid auszuschleusen. Da die Blut-Osmolarität von Latimeria etwas niedriger ist als die des Meerwassers (942 cf. 1026 mosm/l), befindet sie sich in einem negativen Wasserhaushalt. Einige Hinweise deuten darauf hin, dass dies durch das Trinken von Meerwasser auf eine Weise überwunden wird, die der der Teleostei ähnelt. Die Frage, ob die ureosmotische Regulation bei Latimeria und den Chondrichthier homolog ist, ist zweifelhaft, obwohl wir die Möglichkeit bevorzugen, dass sie unabhängig erworben wurde, aus folgenden Gründen. (1) Die renale Harnstoff-Resorption fehlt bei Latimeria, obwohl sie für die ureosmotische Regulation bei den Chondrichthier entscheidend ist. (2) Die interne Befruchtung und Entwicklung sind notwendige Begleiterscheinungen der ureosmotischen Regulation bei Fischen, und die interne Befruchtung in den beiden Gruppen wird durch nicht-homologe Mechanismen erreicht. (3) Die ureosmotische Regulation wurde unabhängig in einer dritten Wirbeltiergruppe, dem euryhalinen Amphibien Rana cancrivora, entwickelt.
BibTeX
@article{doi101098rspb19800054,
author = "Griffith, Robert W.",
title = "Chemie der Körperflüssigkeiten des Coelacanth, Latimeria chalumnae",
year = "1980",
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abstract = "Zusammenfassung Der Coelacanth, Latimeria chalumnae, besitzt eine Blutchemie, die nahezu identisch mit der der Knorpelfisch ist und sich von der der Knochenfische und Tetrapoden unterscheidet. Besonders bemerkenswert ist die Aufrechterhaltung hoher Konzentrationen von Harnstoff (377 mM) und Trimethylaminoxid (122 mM), die dazu beitragen, die Blut-Osmolarität (942 mosm/l) an die des Meerwasserumfelds anzunähern. Diese Merkmale kennzeichnen auch andere Coelacanth-Körperflüssigkeiten, wie das Notochordalfluid, wässrige und glasartige Humor, Ventrikelflüssigkeit, Coelomflüssigkeit und Galle. Die Gewebe von Latimeria, wie z. B. Muskeln, zeichnen sich ebenfalls durch hohe Harnstoffkonzentrationen aus. Das osmotische Gleichgewicht zwischen extrazellulären Flüssigkeiten und Geweben scheint durch das Vorhandensein sehr hoher Gewebespiegel von Trimethylaminoxid (ca. 300 mmol/(kg H2O)) erreicht zu werden, die die niedrigen Ionenkonzentrationen im Gewebe ausgleichen. Die Nierenfunktion bei Latimeria scheint die selektive Elimination bestimmter divalenter Ionen (Magnesium, Phosphat und Sulfat) und organischer Substanzen (Glucuronat, Kreatin und einige Aminosäuren) einzuschließen. Im Gegensatz zu anderen ureosmotischen Fischen besitzt der Coelacanth nicht die Nierenkapazität, Harnstoff zurückzuabsorbieren. Hinweise deuten darauf hin, dass die Rektaldrüse, strukturell sehr ähnlich zu denen der Chondrichthier, dazu dient, überschüssiges Natriumchlorid auszuschleusen. Da die Blut-Osmolarität von Latimeria etwas niedriger ist als die des Meerwassers (942 cf. 1026 mosm/l), befindet sie sich in einem negativen Wasserhaushalt. Einige Hinweise deuten darauf hin, dass dies durch das Trinken von Meerwasser auf eine Weise überwunden wird, die der der Teleostei ähnelt. Die Frage, ob die ureosmotische Regulation bei Latimeria und den Chondrichthier homolog ist, ist zweifelhaft, obwohl wir die Möglichkeit bevorzugen, dass sie unabhängig erworben wurde, aus folgenden Gründen. (1) Die renale Harnstoff-Resorption fehlt bei Latimeria, obwohl sie für die ureosmotische Regulation bei den Chondrichthier entscheidend ist. (2) Die interne Befruchtung und Entwicklung sind notwendige Begleiterscheinungen der ureosmotischen Regulation bei Fischen, und die interne Befruchtung in den beiden Gruppen wird durch nicht-homologe Mechanismen erreicht. (3) Die ureosmotische Regulation wurde unabhängig in einer dritten Wirbeltiergruppe, dem euryhalinen Amphibien Rana cancrivora, entwickelt.",
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14. Bruton, Michael N. und Coutouvidis, Sheila E. und Pote, Jean, 1991, Bibliographie des lebenden Coelacanthen Latimeria chalumnae, mit Kommentaren zu Publikationstrends: Developments in environmental biology of fishes.
DOI: 10.1007/978-94-011-3194-0_27
BibTeX
@incollection{doi101007978940113194027,
author = "Bruton, Michael N. und Coutouvidis, Sheila E. und Pote, Jean",
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15. Bruton, Michael N. und Coutouvidis, Sheila E. und Pote, Jean, 1991, Bibliographie des lebenden Coelacanthen Latimeria chalumnae, mit Kommentaren zu Publikationstrends: Environmental Biology of Fishes.
BibTeX
@article{doi101007bf00007469,
author = "Bruton, Michael N. und Coutouvidis, Sheila E. und Pote, Jean",
title = "Bibliographie des lebenden Coelacanthen Latimeria chalumnae, mit Kommentaren zu Publikationstrends",
year = "1991",
journal = "Environmental Biology of Fishes",
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16. Inoue, Jun und Miya, Masaki und Venkatesh, Byrappa und Nishida, Mutsumi, 2005, Das mitochondriale Genom des indonesischen Coelakanten Latimeria menadoensis (Sarcopterygii: Coelacanthiformes) und die Schätzung der Divergenzzeit zwischen den beiden Coelakanten: Gene.
DOI: 10.1016/j.gene.2005.01.008
BibTeX
@article{doi101016jgene200501008,
author = "Inoue, Jun und Miya, Masaki und Venkatesh, Byrappa und Nishida, Mutsumi",
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17. Gwee, Pai-Chung und Amemiya, Chris T. und Brenner, Sydney und Venkatesh, Byrappa, 2008, Sequenz und Organisation von Coelacanth-Neurohypophysen-Hormongenen: Evolutionäre Geschichte des Genlocus für Neurohypophysen-Hormone bei Wirbeltieren: BMC Evolutionary Biology.
Zusammenfassung
HINTERGRUND: Die neurohypophysären Hormone der Säugetiere, Vasopressin und Oxytocin, sind an der Osmoregulation bzw. an der Kontraktion der glatten Muskulatur der Gebärmutter beteiligt. Alle Kiefermäuler enthalten jeweils mindestens ein Homolog von Vasopressin und Oxytocin, während Kieferlose nur ein einziges neurohypophysäres Hormon namens Vasotocin enthalten. Das Vasopressin-Homolog bei nicht-säugetierischen Wirbeltieren ist Vasotocin; das Oxytocin-Homolog ist bei nicht-eutherischen Tetrapoden Mesotocin, bei Lungenfischen Mesotocin und [Phe2]mesotocin sowie bei Strahlenflossern Isotocin. Die Gene, die Vasopressin- und Oxytocin-Gene kodieren, sind in den menschlichen und Nagetiergenomen in einer kopf-zu-kopf-Orientierung eng verknüpft. Im Gegensatz dazu befinden sich ihre Haifisch-Homologe (Vasotocin und Isotocin) auf demselben DNA-Strang, wobei das Isotocin-Gen upstream vom Vasotocin-Gen liegt und durch fünf Gene getrennt ist, was darauf hindeutet, dass dieser Locus in der Säugetier- oder Strahlenfisch-Linie oder in beiden Linien Rearrangements erfahren hat. Die Coelacanthen nehmen eine einzigartige phylogenetische Position ein, die nahe der Divergenz der Säugetier- und Strahlenfisch-Linien liegt. ERGEBNISSE: Wir haben ein Coelacanth (Latimeria menadoensis) BAC-Klon, der die neurohypophysären Hormongene umfasst, sequenziert und die evolutionäre Geschichte des Wirbeltier-neurohypophysären Hormongens-Locus innerhalb eines vergleichenden Genomik-Rahmens untersucht. Der Coelacanth enthält Vasotocin- und Mesotocin-Gene wie nicht-säugetierische Tetrapoden. Die Coelacanth-Gene befinden sich auf demselben DNA-Strang ohne dazwischenliegende Gene, wobei das Vasotocin-Gen upstream vom Mesotocin-Gen liegt. Nukleotidsequenzen der zweiten Exons der beiden Gene unterliegen purifizierender Selektion, was auf eine regulatorische Funktion hindeutet. Wir haben zudem den neurohypophysären Hormongens-Locus in den Genomen von Beuteltier, Huhn und Xenopus tropicalis analysiert. Das Beuteltier enthält zwei tandemartige Kopien von Vasopressin- und Mesotocin-Genen. Die Vasotocin- und Mesotocin-Gene bei Huhn und Xenopus sowie die Vasopressin- und Mesotocin-Gene beim Beuteltier sind kopf-zu-schwanz verknüpft, ähnlich wie ihre Orthologe beim Coelacanth, im Gegensatz zu ihren Homologen beim Menschen und Nagetieren. SCHLUSSFOLGERUNG: Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass der neurohypophysäre Hormongens-Locus in beiden Plazentalsäugetieren und Teleostfischen unabhängige Rearrangements erfahren hat. Das Coelacanth-Genom scheint stabiler zu sein als das von Säugetieren und Teleostfischen. Daher dient es als wertvoller Outgroup für die Untersuchung der Evolution von Säugetier- und Teleostfischgenomen.
BibTeX
@article{doi10118614712148893,
author = "Gwee, Pai-Chung and Amemiya, Chris T. and Brenner, Sydney and Venkatesh, Byrappa",
title = "Sequence and organization of coelacanth neurohypophysial hormone genes: Evolutionary history of the vertebrate neurohypophysial hormone gene locus",
year = "2008",
journal = "BMC Evolutionary Biology",
abstract = "HINTERGRUND: Die neurohypophysären Hormone der Säugetiere, Vasopressin und Oxytocin, sind an der Osmoregulation bzw. an der Kontraktion der glatten Muskulatur der Gebärmutter beteiligt. Alle Kiefermäuler enthalten jeweils mindestens ein Homolog von Vasopressin und Oxytocin, während Kieferlose nur ein einziges neurohypophysäres Hormon namens Vasotocin enthalten. Das Vasopressin-Homolog bei nicht-säugetierischen Wirbeltieren ist Vasotocin; das Oxytocin-Homolog ist bei nicht-eutherischen Tetrapoden Mesotocin, bei Lungenfischen Mesotocin und [Phe2]mesotocin sowie bei Strahlenflossern Isotocin. Die Gene, die Vasopressin- und Oxytocin-Gene kodieren, sind in den menschlichen und Nagetiergenomen in einer kopf-zu-kopf-Orientierung eng verknüpft. Im Gegensatz dazu befinden sich ihre Haifisch-Homologe (Vasotocin und Isotocin) auf demselben DNA-Strang, wobei das Isotocin-Gen upstream vom Vasotocin-Gen liegt und durch fünf Gene getrennt ist, was darauf hindeutet, dass dieser Locus in der Säugetier- oder Strahlenfisch-Linie oder in beiden Linien Rearrangements erfahren hat. Die Coelacanthen nehmen eine einzigartige phylogenetische Position ein, die nahe der Divergenz der Säugetier- und Strahlenfisch-Linien liegt. ERGEBNISSE: Wir haben ein Coelacanth (Latimeria menadoensis) BAC-Klon, der die neurohypophysären Hormongene umfasst, sequenziert und die evolutionäre Geschichte des Wirbeltier-neurohypophysären Hormongens-Locus innerhalb eines vergleichenden Genomik-Rahmens untersucht. Der Coelacanth enthält Vasotocin- und Mesotocin-Gene wie nicht-säugetierische Tetrapoden. Die Coelacanth-Gene befinden sich auf demselben DNA-Strang ohne dazwischenliegende Gene, wobei das Vasotocin-Gen upstream vom Mesotocin-Gen liegt. Nukleotidsequenzen der zweiten Exons der beiden Gene unterliegen purifizierender Selektion, was auf eine regulatorische Funktion hindeutet. Wir haben zudem den neurohypophysären Hormongens-Locus in den Genomen von Beuteltier, Huhn und Xenopus tropicalis analysiert. Das Beuteltier enthält zwei tandemartige Kopien von Vasopressin- und Mesotocin-Genen. Die Vasotocin- und Mesotocin-Gene bei Huhn und Xenopus sowie die Vasopressin- und Mesotocin-Gene beim Beuteltier sind kopf-zu-schwanz verknüpft, ähnlich wie ihre Orthologe beim Coelacanth, im Gegensatz zu ihren Homologen beim Menschen und Nagetieren. SCHLUSSFOLGERUNG: Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass der neurohypophysäre Hormongens-Locus in beiden Plazentalsäugetieren und Teleostfischen unabhängige Rearrangements erfahren hat. Das Coelacanth-Genom scheint stabiler zu sein als das von Säugetieren und Teleostfischen. Daher dient es als wertvoller Outgroup für die Untersuchung der Evolution von Säugetier- und Teleostfischgenomen.",
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doi = "10.1186/1471-2148-8-93",
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18. 2009, Coelacanths: Encyclopedia of Time: Wissenschaft, Philosophie, Theologie, & Kultur.
DOI: 10.4135/9781412963961.n99
BibTeX
@misc{crossref2009coelacanths,
title = "Coelacanths",
year = "2009",
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19. Casañe, Didier und Laurenti, Patrick, 2013, Warum Koiacanten keine „lebenden Fossilien" sind: BioEssays.
Zusammenfassung
Eine Reihe neuerer Studien über lebende Koiacanten hat die langsame Rate der molekularen und morphologischen Evolution in diesen Arten betont. Diese Studien basierten auf der Annahme, dass ein Koiacant ein „lebendes Fossil" ist, das seit dem Devon kaum morphologische Veränderungen gezeigt hat, und sie schlugen einen kausalen Zusammenhang zwischen niedriger molekularer Evolutionsrate und morphologischer Stase vor. Hier haben wir die verfügbaren molekularen und morphologischen Daten untersucht und gezeigt, dass: (i) geringe intraspezifische molekulare Vielfalt nicht eine niedrige Mutationsrate impliziert, (ii) Studien, die keine niedrigen Substitutionsraten bei Koiacanten zeigen, oft vernachlässigt werden, (iii) die morphologische Stabilität von Koiacanten durch paläontologische Belege nicht gestützt wird. Wir erinnern daran, dass Intraspezies-Niveaus der molekularen Vielfalt, interspezifische Genomdivergenzraten und morphologische Divergenzraten unter unterschiedlichen Einschränkungen stehen und nicht unbedingt korreliert sind. Schließlich betonen wir, dass Konzepte wie „lebendes Fossil", „basale Linie" oder „primitive lebende Art" aus einer Baumdenk-Perspektive keinen Sinn ergeben.
BibTeX
@article{doi101002bies201200145,
author = "Casañe, Didier und Laurenti, Patrick",
title = "Warum Koiacanten keine „lebenden Fossilien" sind",
year = "2013",
journal = "BioEssays",
abstract = "Eine Reihe neuerer Studien über lebende Koiacanten hat die langsame Rate der molekularen und morphologischen Evolution in diesen Arten betont. Diese Studien basierten auf der Annahme, dass ein Koiacant ein „lebendes Fossil" ist, das seit dem Devon kaum morphologische Veränderungen gezeigt hat, und sie schlugen einen kausalen Zusammenhang zwischen niedriger molekularer Evolutionsrate und morphologischer Stase vor. Hier haben wir die verfügbaren molekularen und morphologischen Daten untersucht und gezeigt, dass: (i) geringe intraspezifische molekulare Vielfalt nicht eine niedrige Mutationsrate impliziert, (ii) Studien, die keine niedrigen Substitutionsraten bei Koiacanten zeigen, oft vernachlässigt werden, (iii) die morphologische Stabilität von Koiacanten durch paläontologische Belege nicht gestützt wird. Wir erinnern daran, dass Intraspezies-Niveaus der molekularen Vielfalt, interspezifische Genomdivergenzraten und morphologische Divergenzraten unter unterschiedlichen Einschränkungen stehen und nicht unbedingt korreliert sind. Schließlich betonen wir, dass Konzepte wie „lebendes Fossil", „basale Linie" oder „primitive lebende Art" aus einer Baumdenk-Perspektive keinen Sinn ergeben.",
url = "https://doi.org/10.1002/bies.201200145",
doi = "10.1002/bies.201200145",
openalex = "W1560120724",
references = "doi101016jtig201005003, doi101038nrg2146, doi101038scientificamerican117998, doi101046j1365294x200301731x, doi101146annureven10010165000525, doi101146annureves23110192001403, doi105860choice375647, doi105860choice396411, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303"
}
20. Amemiya, Chris T. und Alföldi, Jessica und Lee, Alison und Fan, Shaohua und Philippe, Hervé und MacCallum, Iain und Braasch, Ingo und Manousaki, Tereza und Schneider, Igor und Rohner, Nicolas und Organ, Chris L. und Chalopin, Domitille und Smith, Jeramiah J. und Robinson, Mark und Dorrington, Rosemary A. und Gerdol, Marco und Aken, Bronwen und Biscotti, Maria Assunta und Barucca, Marco und Baurain, Denis und Berlin, Aaron M. und Blatch, Gregory L. und Buonocore, Francesco und Burmester, Thorsten und Campbell, Michael S. und Canapa, Adriana und Cannon, John P. und Christoffels, Alan und Moro, Gianluca De und Edkins, Adrienne L. und Fan, Lin und Fausto, Anna Maria und Feiner, Nathalie und Forconi, Marikò und Gamieldien, Junaid und Gnerre, Sante und Gnirke, Andreas und Goldstone, Jared V. und Haerty, Wilfried und Hahn, Mark E. und Hesse, Uljana und Hoffmann, Steve und Johnson, Jeremy und Karchner, Sibel I. und Kuraku, Shigehiro und Lara, Marcia und Levin, Joshua Z. und Litman, Gary W. und Mauceli, Evan und Miyake, Tsutomu und Mueller, M. Gail und Nelson, David R. und Nitsche, Anne und Olmo, Ettore und Ota, Tatsuya und Pallavicini, Alberto und Panji, Sumir und Picone, Barbara und Ponting, Chris P. und Prohaska, Sonja J. und Przybylski, Dariusz und Saha, Nil Ratan und Ravi, Vydianathan und Ribeiro, Filipe J. und Sauka‐Spengler, Tatjana und Scapigliati, Giuseppe und Searle, Stephen M. J. und Sharpe, Ted und Simakov, Oleg und Stadler, Peter F. und Stegeman, John J. und Sumiyama, Kenta und Tabbaa, Diana und Tafer, Hakim und Turner-Maier, Jason und Heusden, Peter Van und White, Simon und Williams, Louise und Yandell, Mark und Brinkmann, Henner und Volff, Jean-Nicolas und Tabin, Clifford J. und Shubin, Neil H. und Schartl, Manfred und Jaffe, David B. und Postlethwait, John H. und Venkatesh, Byrappa und Palma, Federica Di und Lander, Eric S. und Meyer, Axel und Lindblad‐Toh, Kerstin, 2013, Das Genom des afrikanischen Coelacanth liefert Einblicke in die Evolution der Tetrapoden: Nature.
Zusammenfassung
Die Entdeckung eines lebenden Coelacanth-Exemplars im Jahr 1938 war bemerkenswert, da diese Linie der Kiemendeckelfische für ausgestorben gehalten wurde, seit 70 Millionen Jahren. Der moderne Coelacanth sieht bemerkenswert ähnlich aus wie viele seiner alten Verwandten, und seine evolutionäre Nähe zu unseren eigenen Fischvorfahren gibt einen Einblick in die Fische, die zuerst an Land gingen. Hier berichten wir über die Genomsequenz des afrikanischen Coelacanth, Latimeria chalumnae. Durch eine phylogenomische Analyse schließen wir, dass der Lungenfisch und nicht der Coelacanth der nächste lebende Verwandter der Tetrapoden ist. Coelacanth-Proteincodierende Gene entwickeln sich signifikant langsamer als die der Tetrapoden, im Gegensatz zu anderen genomischen Merkmalen. Analysen von Veränderungen in Genen und regulatorischen Elementen während der Wirbeltieranpassung an Land heben Gene hervor, die an Immunität, Stickstoffausscheidung und der Entwicklung von Flossen, Schwanz, Ohr, Auge, Gehirn und Geruchssinn beteiligt sind. Funktionelle Assays von Enhancern, die an der Flosse-zu-Gliedmaße-Übergang und am Auftreten von extraembryonalen Geweben beteiligt sind, zeigen die Bedeutung des Coelacanth-Genoms als Blaupause für das Verständnis der Tetrapoden-Evolution.
BibTeX
@article{doi101038nature12027,
author = "Amemiya, Chris T. and Alföldi, Jessica and Lee, Alison and Fan, Shaohua and Philippe, Hervé and MacCallum, Iain and Braasch, Ingo and Manousaki, Tereza and Schneider, Igor and Rohner, Nicolas and Organ, Chris L. and Chalopin, Domitille and Smith, Jeramiah J. and Robinson, Mark and Dorrington, Rosemary A. and Gerdol, Marco and Aken, Bronwen and Biscotti, Maria Assunta and Barucca, Marco and Baurain, Denis and Berlin, Aaron M. and Blatch, Gregory L. and Buonocore, Francesco and Burmester, Thorsten and Campbell, Michael S. and Canapa, Adriana and Cannon, John P. and Christoffels, Alan and Moro, Gianluca De and Edkins, Adrienne L. and Fan, Lin and Fausto, Anna Maria and Feiner, Nathalie and Forconi, Marikò and Gamieldien, Junaid and Gnerre, Sante and Gnirke, Andreas and Goldstone, Jared V. and Haerty, Wilfried and Hahn, Mark E. and Hesse, Uljana and Hoffmann, Steve and Johnson, Jeremy and Karchner, Sibel I. and Kuraku, Shigehiro and Lara, Marcia and Levin, Joshua Z. and Litman, Gary W. and Mauceli, Evan and Miyake, Tsutomu and Mueller, M. Gail and Nelson, David R. and Nitsche, Anne and Olmo, Ettore and Ota, Tatsuya and Pallavicini, Alberto and Panji, Sumir and Picone, Barbara and Ponting, Chris P. and Prohaska, Sonja J. and Przybylski, Dariusz and Saha, Nil Ratan and Ravi, Vydianathan and Ribeiro, Filipe J. and Sauka‐Spengler, Tatjana and Scapigliati, Giuseppe and Searle, Stephen M. J. and Sharpe, Ted and Simakov, Oleg and Stadler, Peter F. and Stegeman, John J. and Sumiyama, Kenta and Tabbaa, Diana and Tafer, Hakim and Turner-Maier, Jason and Heusden, Peter Van und White, Simon und Williams, Louise und Yandell, Mark und Brinkmann, Henner und Volff, Jean-Nicolas und Tabin, Clifford J. und Shubin, Neil H. und Schartl, Manfred und Jaffe, David B. und Postlethwait, John H. und Venkatesh, Byrappa und Palma, Federica Di und Lander, Eric S. und Meyer, Axel und Lindblad‐Toh, Kerstin",
title = "The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution",
year = "2013",
journal = "Nature",
abstract = "Die Entdeckung eines lebenden Coelacanth-Exemplars im Jahr 1938 war bemerkenswert, da diese Linie der Kiemendeckelfische für ausgestorben gehalten wurde, seit 70 Millionen Jahren. Der moderne Coelacanth sieht bemerkenswert ähnlich aus wie viele seiner alten Verwandten, und seine evolutionäre Nähe zu unseren eigenen Fischvorfahren gibt einen Einblick in die Fische, die zuerst an Land gingen. Hier berichten wir über die Genomsequenz des afrikanischen Coelacanth, Latimeria chalumnae. Durch eine phylogenomische Analyse schließen wir, dass der Lungenfisch und nicht der Coelacanth der nächste lebende Verwandter der Tetrapoden ist. Coelacanth-Proteincodierende Gene entwickeln sich signifikant langsamer als die der Tetrapoden, im Gegensatz zu anderen genomischen Merkmalen. Analysen von Veränderungen in Genen und regulatorischen Elementen während der Wirbeltieranpassung an Land heben Gene hervor, die an Immunität, Stickstoffausscheidung und der Entwicklung von Flossen, Schwanz, Ohr, Auge, Gehirn und Geruchssinn beteiligt sind. Funktionelle Assays von Enhancern, die an der Flosse-zu-Gliedmaße-Übergang und am Auftreten von extraembryonalen Geweben beteiligt sind, zeigen die Bedeutung des Coelacanth-Genoms als Blaupause für das Verständnis der Tetrapoden-Evolution.",
url = "https://doi.org/10.1038/nature12027",
doi = "10.1038/nature12027",
openalex = "W1963630241",
references = "doi101016jgene200501008, doi101038nature04072, doi101038nature07891, doi101038nature10944, doi101038nbt1883, doi101073pnas1017351108, doi101093bioinformaticsbti191, doi101093genetics1352599, doi101093molbevmsh112, doi101126science1098119, doi1011861471216414538, doi101242jeb1982273, doi1023073514548, doi105860choice300927, nieuwenhuys1998the"
}
21. Pallavicini, Alberto und Canapa, Adriana und Barucca, Marco und Alföldi, Jessica und Biscotti, Maria Assunta und Buonocore, Francesco und Moro, Gianluca De und Palma, Federica Di und Fausto, Anna Maria und Forconi, Marikò und Gerdol, Marco und Makapedua, Daisy Monica und Turner-Meier, Jason und Olmo, Ettore und Scapigliati, Giuseppe, 2013, Analyse des Transkriptoms des indonesischen Coelacanthen Latimeria menadoensis: BMC Genomics.
Zusammenfassung
HINTERGRUND: Latimeria menadoensis ist eine Coelacanth-Art, die erstmals 1997 in Indonesien identifiziert wurde, 10.000 km entfernt von ihrem afrikanischen Verwandten. Bislang wurden nur sechs Exemplare gefangen und es stehen nur sehr begrenzte molekulare Daten zur Verfügung. In der vorliegenden Arbeit beschreiben wir die de novo Transkriptom-Montage, die aus Leber- und Hodenproben des fünften jemals gefangenen Exemplars dieser Art gewonnen wurde. ERGEBNISSE: Die tiefe RNA-Sequenzierung, die mit Illumina-Technologien durchgeführt wurde, erzeugte 145.435.156 paired-end Reads, die ~14 GB Sequenzdaten ausmachen, die mit einer kombinierten Trinity/CLC-Strategie de novo montiert wurden. Das Montageergebnis wurde verarbeitet und gefiltert, wodurch ein Satz von 66.308 Contigs entstand, deren Qualität sorgfältig bewertet wurde. Der Vergleich mit dem kürzlich sequenzierten Genom des afrikanischen Verwandten Latimeria chalumnae und den verfügbaren genomischen Ressourcen anderer Wirbeltiere ergab eine gute Rekonstruktion von Volltranskripten und eine hohe Abdeckung des vorhergesagten vollständigen Coelacanth-Transkriptoms. SCHLUSSFOLGERUNG: Angesichts der hohen genomischen Affinität zwischen den beiden Coelacanth-Arten kann die hier beschriebene de novo Transkriptom-Montage als wertvolles Unterstützungswerkzeug für die Verbesserung der Genvorhersage innerhalb des Genoms von L. chalumnae und als wertvolle Ressource für die Untersuchung vieler Aspekte der Tetrapoden-Evolution betrachtet werden.
BibTeX
@article{doi1011861471216414538,
author = "Pallavicini, Alberto und Canapa, Adriana und Barucca, Marco und Alföldi, Jessica und Biscotti, Maria Assunta und Buonocore, Francesco und Moro, Gianluca De und Palma, Federica Di und Fausto, Anna Maria und Forconi, Marikò und Gerdol, Marco und Makapedua, Daisy Monica und Turner-Meier, Jason und Olmo, Ettore und Scapigliati, Giuseppe",
title = "Analysis of the transcriptome of the Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis",
year = "2013",
journal = "BMC Genomics",
abstract = "HINTERGRUND: Latimeria menadoensis ist eine Coelacanth-Art, die erstmals 1997 in Indonesien identifiziert wurde, 10.000 km entfernt von ihrem afrikanischen Verwandten. Bislang wurden nur sechs Exemplare gefangen und es stehen nur sehr begrenzte molekulare Daten zur Verfügung. In der vorliegenden Arbeit beschreiben wir die de novo Transkriptom-Montage, die aus Leber- und Hodenproben des fünften jemals gefangenen Exemplars dieser Art gewonnen wurde. ERGEBNISSE: Die tiefe RNA-Sequenzierung, die mit Illumina-Technologien durchgeführt wurde, erzeugte 145.435.156 paired-end Reads, die ~14 GB Sequenzdaten ausmachen, die mit einer kombinierten Trinity/CLC-Strategie de novo montiert wurden. Das Montageergebnis wurde verarbeitet und gefiltert, wodurch ein Satz von 66.308 Contigs entstand, deren Qualität sorgfältig bewertet wurde. Der Vergleich mit dem kürzlich sequenzierten Genom des afrikanischen Verwandten Latimeria chalumnae und den verfügbaren genomischen Ressourcen anderer Wirbeltiere ergab eine gute Rekonstruktion von Volltranskripten und eine hohe Abdeckung des vorhergesagten vollständigen Coelacanth-Transkriptoms. SCHLUSSFOLGERUNG: Angesichts der hohen genomischen Affinität zwischen den beiden Coelacanth-Arten kann die hier beschriebene de novo Transkriptom-Montage als wertvolles Unterstützungswerkzeug für die Verbesserung der Genvorhersage innerhalb des Genoms von L. chalumnae und als wertvolle Ressource für die Untersuchung vieler Aspekte der Tetrapoden-Evolution betrachtet werden.",
url = "https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-538",
doi = "10.1186/1471-2164-14-538",
openalex = "W2131848830",
references = "doi101016jtig200712007, doi101016jygeno200807001, doi101016jygeno201003001, doi101016s0022283605803602, doi101017s0094837300004310, doi101038nbt1883, doi101038nrg2484, doi101038nrg3068, doi101093bioinformatics179847, doi101093bioinformaticsbti610"
}
22. Forconi, Marikò und Canapa, Adriana und Barucca, Marco und Biscotti, Maria Assunta und Capriglione, Teresa und Buonocore, Francesco und Fausto, Anna Maria und Makapedua, Daisy Monica und Pallavicini, Alberto und Gerdol, Marco und Moro, Gianluca De und Scapigliati, Giuseppe und Olmo, Ettore und Schartl, Manfred, 2013, Charakterisierung der Gene für Geschlechtsbestimmung und Geschlechtsdifferenzierung bei Latimeria: PLoS ONE.
DOI: 10.1371/journal.pone.0056006
Zusammenfassung
Gene, die an der Geschlechtsbestimmung und -differenzierung beteiligt sind, wurden bei Mäusen, Menschen, Hühnern, Reptilien, Amphibien und Knochenfischen identifiziert. Allerdings ist wenig über ihre funktionelle Erhaltung bekannt, und es ist unklar, ob es einen gemeinsamen Satz von Genen gibt, der von allen Wirbeltieren geteilt wird. Coelacanthen, basale Sarcopterygier und einzigartige „lebende Fossilien" könnten dabei helfen, ein Inventar der ursprünglichen Gene zu erstellen, die an diesen wichtigen Entwicklungsprozessen beteiligt sind, und Einblicke in ihre Komponenten zu geben. In dieser Studie wurden 33 Gene aus dem Genom von Latimeria chalumnae und aus den Leber- und Hoden-Transkriptomen von Latimeria menadoensis identifiziert und charakterisiert, die an der Geschlechtsbestimmung und -differenzierung beteiligt sind, und ihre Expressionsniveaus gemessen. Interessante Ergebnisse wurden für GSDF erzielt, das zuvor nur bei Knochenfischen identifiziert wurde und nun erstmals in der sarcopterygischen Linie charakterisiert wurde; FGF9, das bei Knochenfischen nicht vorkommt; und DMRT1, dessen Expression in adulten Gonaden kürzlich mit der Aufrechterhaltung der sexuellen Identität in Verbindung gebracht wurde. Das Genrepertoire und die hoden-spezifische Genexpression, die bei Coelacanthen dokumentiert wurden, zeigen eine größere Ähnlichkeit zu modernen Fischen und deuten auf unerwartete Veränderungen im Genregulationsnetzwerk hin, das die sexuelle Entwicklung steuert.
BibTeX
@article{doi101371journalpone0056006,
author = "Forconi, Marikò und Canapa, Adriana und Barucca, Marco und Biscotti, Maria Assunta und Capriglione, Teresa und Buonocore, Francesco und Fausto, Anna Maria und Makapedua, Daisy Monica und Pallavicini, Alberto und Gerdol, Marco und Moro, Gianluca De und Scapigliati, Giuseppe und Olmo, Ettore und Schartl, Manfred",
title = "Charakterisierung der Gene für Geschlechtsbestimmung und Geschlechtsdifferenzierung bei Latimeria",
year = "2013",
journal = "PLoS ONE",
abstract = {Gene, die an der Geschlechtsbestimmung und -differenzierung beteiligt sind, wurden bei Mäusen, Menschen, Hühnern, Reptilien, Amphibien und Knochenfischen identifiziert. Allerdings ist wenig über ihre funktionelle Erhaltung bekannt, und es ist unklar, ob es einen gemeinsamen Satz von Genen gibt, der von allen Wirbeltieren geteilt wird. Coelacanthen, basale Sarcopterygier und einzigartige „lebende Fossilien" könnten dabei helfen, ein Inventar der ursprünglichen Gene zu erstellen, die an diesen wichtigen Entwicklungsprozessen beteiligt sind, und Einblicke in ihre Komponenten zu geben. In dieser Studie wurden 33 Gene aus dem Genom von Latimeria chalumnae und aus den Leber- und Hoden-Transkriptomen von Latimeria menadoensis identifiziert und charakterisiert, die an der Geschlechtsbestimmung und -differenzierung beteiligt sind, und ihre Expressionsniveaus gemessen. Interessante Ergebnisse wurden für GSDF erzielt, das zuvor nur bei Knochenfischen identifiziert wurde und nun erstmals in der sarcopterygischen Linie charakterisiert wurde; FGF9, das bei Knochenfischen nicht vorkommt; und DMRT1, dessen Expression in adulten Gonaden kürzlich mit der Aufrechterhaltung der sexuellen Identität in Verbindung gebracht wurde. Das Genrepertoire und die hoden-spezifische Genexpression, die bei Coelacanthen dokumentiert wurden, zeigen eine größere Ähnlichkeit zu modernen Fischen und deuten auf unerwartete Veränderungen im Genregulationsnetzwerk hin, das die sexuelle Entwicklung steuert.},
url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056006",
doi = "10.1371/journal.pone.0056006",
openalex = "W2109356079",
references = "doi1011861471216414538"
}
23. Boudinot, Pierre und Zou, Jun und Ota, Tatsuya und Buonocore, Francesco und Scapigliati, Giuseppe und Canapa, Adriana und Cannon, John P. und Litman, Gary W. und Hansen, John D., 2014, Ein tetrapodenähnliches Repertoire an angeborenen Immunrezeptoren und Effektoren für Coelacanthen: Journal of Experimental Zoology Part B Molecular and Developmental Evolution.
Zusammenfassung
Die jüngste Verfügbarkeit sowohl robuster Transkriptom- als auch Genomressourcen für Coelacanten (Latimeria chalumnae) hat zu einzigartigen Entdeckungen in Bezug auf die Coelacanten-Immunität geführt, wie z. B. das Fehlen von IgM, einem zentralen Bestandteil der adaptiven Immunität. Diese Studie wurde entwickelt, um die Ursprünge und die Evolution von Genfamilien genauer zu untersuchen, die an der ersten Erkennung und Reaktion auf mikrobielle Pathogene beteiligt sind, welche die angeborene Immunität vermitteln. Verschiedene Multigenfamilien, die an der angeborenen Immunität beteiligt sind, werden behandelt, darunter: Toll-like Rezeptoren (TLRs), retinsäureinduzierbare Gen 1 (RIG1)-ähnliche Rezeptoren (RLRs), Proteine mit Nukleotid-bindendem Domäne und Leucin-reicher Wiederholung (NLRs), diverse Immunoglobulin-domänenhaltige Proteine (DICP) und modulare Domänen-Immun-Typ-Rezeptoren (MDIRs). Unsere Analysen umfassen auch die Tripartite-Motiv-haltigen Proteine (TRIM), die an der Pathogen-Erkennung sowie an der positiven Regulation der antiviralen Immunität beteiligt sind. Schließlich wurde in dieser Studie einige der nachgeschalteten Effektoren der antimikrobiellen Antwort behandelt, einschließlich IL-1-Familienmitglieder, Typ I und II Interferone (IFN) und IFN-stimulierte Effektoren (ISGs). Insgesamt teilen die Gene und Genfamilien in Coelacanten, die angeborene Immunfunktionen vermitteln, Merkmale sowohl im Inhalt, der Struktur und der Anordnung mit denen, die bei Tetrapoden, aber nicht bei Teleostern gefunden werden. Die Ergebnisse unterstützen die Schwestergruppen-Beziehung der Coelacantenfische mit Tetrapoden.
BibTeX
@article{doi101002jezb22559,
author = "Boudinot, Pierre und Zou, Jun und Ota, Tatsuya und Buonocore, Francesco und Scapigliati, Giuseppe und Canapa, Adriana und Cannon, John P. und Litman, Gary W. und Hansen, John D.",
title = "Ein tetrapodenähnliches Repertoire an angeborenen Immunrezeptoren und Effektoren für Coelacanthen",
year = "2014",
journal = "Journal of Experimental Zoology Part B Molecular and Developmental Evolution",
abstract = "Die jüngste Verfügbarkeit sowohl robuster Transkriptom- als auch Genomressourcen für Coelacanten (Latimeria chalumnae) hat zu einzigartigen Entdeckungen in Bezug auf die Coelacanten-Immunität geführt, wie z. B. das Fehlen von IgM, einem zentralen Bestandteil der adaptiven Immunität. Diese Studie wurde entwickelt, um die Ursprünge und die Evolution von Genfamilien genauer zu untersuchen, die an der ersten Erkennung und Reaktion auf mikrobielle Pathogene beteiligt sind, welche die angeborene Immunität vermitteln. Verschiedene Multigenfamilien, die an der angeborenen Immunität beteiligt sind, werden behandelt, darunter: Toll-like Rezeptoren (TLRs), retinsäureinduzierbare Gen 1 (RIG1)-ähnliche Rezeptoren (RLRs), Proteine mit Nukleotid-bindendem Domäne und Leucin-reicher Wiederholung (NLRs), diverse Immunoglobulin-domänenhaltige Proteine (DICP) und modulare Domänen-Immun-Typ-Rezeptoren (MDIRs). Unsere Analysen umfassen auch die Tripartite-Motiv-haltigen Proteine (TRIM), die an der Pathogen-Erkennung sowie an der positiven Regulation der antiviralen Immunität beteiligt sind. Schließlich wurde in dieser Studie einige der nachgeschalteten Effektoren der antimikrobiellen Antwort behandelt, einschließlich IL-1-Familienmitglieder, Typ I und II Interferone (IFN) und IFN-stimulierte Effektoren (ISGs). Insgesamt teilen die Gene und Genfamilien in Coelacanten, die angeborene Immunfunktionen vermitteln, Merkmale sowohl im Inhalt, der Struktur und der Anordnung mit denen, die bei Tetrapoden, aber nicht bei Teleostern gefunden werden. Die Ergebnisse unterstützen die Schwestergruppen-Beziehung der Coelacantenfische mit Tetrapoden.",
url = "https://doi.org/10.1002/jez.b.22559",
doi = "10.1002/jez.b.22559",
openalex = "W1894895855",
references = "doi101002bies201200145, doi101016jimmuni201105006, doi101016s0092867400801725, doi10103841131, doi101038nature05732, doi101038nature09907, doi101038nri2314, doi101093molbevmsr121, doi101111j01052896200400204x, doi101126science1183021, doi101128cmr1447788092001"
}
24. Mondéjar‐Fernández, Jorge und Meunier, François und Cloutier, Richard und Clément, Gaël und Laurin, Michel und Mondéjar‐Fernández, Jorge und Andrews, M und Long, J und Ahlberg, P und Barwick, R und Campbell, K und Amat, F und Meiri, S und Amprino, R und Brito, P und Meunier, F und Clment, G und Geffard-Kuriyama, D und Castanet, J und Castanet, J und Meunier, F und Bergot, C und Franois, Y und Castanet, J und Meunier, F-J und Ricqles, A De und Castanet, J und Francillon-Vieillot, H und Meunier, F-J und Ricqls, A De und Castanet, Francillon und Vieillot, H und Ricqls, A De und Chevrinais, M und Sire, J und A, Cloutier R; und Chevrinais, M und Jacquet, C und Cloutier, R und Cloutier, R und Cloutier, R und Cloutier, R und Proust, J und Tessier, B und Cupello, C und Meunier, F-J und Herbin, M und Clment, G und Brito, P und Cupello, C und Meunier, F-J und Herbin, M und Janvier, P und Clment, G und Brito, P und Downs, J und Donoghue, P und Daget, J und Bauchot, M und Arnoult, J und Dutel, H und Galland, M und Tafforeau, P und Long, J und Fagan, M und Janvier, P und Herrel, A und Santini, M und Clment, G und Herbin, M und Flower, S und Forey, P und Ahlberg, P und Lukevis, E und Zupin, I und Francillon, H und Meunier, F-J und Ngo, Tuan und Phong und Ricqles, A De und Francillon-Vieillot, H und Buffrenil, V De und Castanet, J und Graudie, J und Meunier, F-J und Sire, J-Y und Zylberberg, L und Ricqls, A De und Friedman, M und Coates, M und Anderson, P und Geffen, A und Pontual, H De und Wright, P und Mosegaard, H und Giraud, M und Castanet, J und Meunier, F und Bouligand, Y und Haines, R, 2022, Peer Review #2 von "Lebensgeschichte und Ossifikationsmuster in Miguashaia bureaui offenbaren die frühe Evolution der Osteogenese bei Coelacanthen (v0.1)".
DOI: 10.7287/peerj.13175v0.1/reviews/2
Zusammenfassung
Die Erforschung der Entwicklung ist entscheidend, um die Evolution wichtiger Wirbeltierlinien aufzudecken. Coelacanthen gehören zu den Wirbeltierlinien mit der längsten evolutionären Geschichte, doch trotz des Zugangs zu lebenden Vertretern ist der Beginn ihrer schwach verknöcherten Endoskelettentwicklung noch schlecht verstanden. Hier präsentieren wir die erste paläohistologische und skeletochronologische Studie von Miguashaia bureaui aus dem Oberen Devon Kanadas, die für die Erforschung der Paläobiologie und der frühen Evolution der Osteogenese bei Coelacanthen von zentraler Bedeutung ist. Querschnitte der Schwanzflossenknochen zeigen, dass die Kortikalis aus Schichten von Primärknochen besteht, die durch Wachstumsarrestlinien getrennt sind, was auf ein zyklisches Wachstum hinweist. Die Markhöhle zeigt Überreste von verkalktem Knorpel, der mit knöchernen Trabekeln assoziiert ist, was charakteristisch für die enchondrale Verknöcherung ist. Eine skeletochronologische Analyse zeigt, dass ein schnelles Wachstum während einer kurzen juvenilen Phase von einem langsameren Wachstum im Erwachsenenalter gefolgt war. Unsere neue Analyse hebt die Lebensgeschichte und die Paläoökologie von Miguashaia bureaui hervor und zeigt, dass die schlechte Endoskelettverknöcherung, die bei dem lebenden Latimeria chalumnae bekannt ist, mindestens vor 375 Millionen Jahren zurückverfolgt werden kann.
BibTeX
@misc{doi107287peerj13175v01reviews2,
author = "Mondéjar‐Fernández, Jorge and Meunier, François and Cloutier, Richard and Clément, Gaël and Laurin, Michel and Mondéjar‐Fernández, Jorge and Andrews, M and Long, J and Ahlberg, P and Barwick, R and Campbell, K and Amat, F and Meiri, S and Amprino, R and Brito, P and Meunier, F and Clment, G and Geffard-Kuriyama, D and Castanet, J and Castanet, J and Meunier, F and Bergot, C and Franois, Y and Castanet, J and Meunier, F-J and Ricqles, A De and Castanet, J and Francillon-Vieillot, H and Meunier, F-J and Ricqls, A De and Castanet, Francillon and Vieillot, H and Ricqls, A De and Chevrinais, M and Sire, J and A, Cloutier R; and Chevrinais, M and Jacquet, C and Cloutier, R and Cloutier, R and Cloutier, R and Cloutier, R and Proust, J and Tessier, B and Cupello, C and Meunier, F-J and Herbin, M and Clment, G and Brito, P and Cupello, C and Meunier, F-J and Herbin, M and Janvier, P and Clment, G and Brito, P and Downs, J and Donoghue, P and Daget, J and Bauchot, M and Arnoult, J and Dutel, H and Galland, M and Tafforeau, P and Long, J and Fagan, M and Janvier, P and Herrel, A and Santini, M and Clment, G and Herbin, M and Flower, S and Forey, P and Ahlberg, P and Lukevis, E and Zupin, I and Francillon, H and Meunier, F-J and Ngo, Tuan and Phong and Ricqles, A De and Francillon-Vieillot, H and Buffrenil, V De and Castanet, J and Graudie, J and Meunier, F-J and Sire, J-Y and Zylberberg, L and Ricqls, A De and Friedman, M and Coates, M and Anderson, P and Geffen, A and Pontual, H De and Wright, P and Mosegaard, H and Giraud, M and Castanet, J and Meunier, F and Bouligand, Y and Haines, R",
title = {Peer Review \#2 von "Life history and ossification patterns in Miguashaia bureaui reveal the early evolution of osteogenesis in coelacanths (v0.1)"},
year = "2022",
abstract = "Die Erforschung der Entwicklung ist entscheidend, um die Evolution wichtiger Wirbeltierlinien aufzudecken. Coelacanthen gehören zu den Wirbeltierlinien mit der längsten evolutionären Geschichte, doch trotz des Zugangs zu lebenden Vertretern ist der Beginn ihrer schwach verknöcherten Endoskelettentwicklung noch schlecht verstanden. Hier präsentieren wir die erste paläohistologische und skeletochronologische Studie von Miguashaia bureaui aus dem Oberen Devon Kanadas, die für die Erforschung der Paläobiologie und der frühen Evolution der Osteogenese bei Coelacanthen von zentraler Bedeutung ist. Querschnitte der Schwanzflossenknochen zeigen, dass die Kortikalis aus Schichten von Primärknochen besteht, die durch Wachstumsarrestlinien getrennt sind, was auf ein zyklisches Wachstum hinweist. Die Markhöhle zeigt Überreste von verkalktem Knorpel, der mit knöchernen Trabekeln assoziiert ist, was charakteristisch für die enchondrale Verknöcherung ist. Eine skeletochronologische Analyse zeigt, dass ein schnelles Wachstum während einer kurzen juvenilen Phase von einem langsameren Wachstum im Erwachsenenalter gefolgt war. Unsere neue Analyse hebt die Lebensgeschichte und die Paläoökologie von Miguashaia bureaui hervor und zeigt, dass die schlechte Endoskelettverknöcherung, die bei dem lebenden Latimeria chalumnae bekannt ist, mindestens vor 375 Millionen Jahren zurückverfolgt werden kann.",
url = "https://doi.org/10.7287/peerj.13175v0.1/reviews/2",
doi = "10.7287/peerj.13175v0.1/reviews/2",
openalex = "W4223452416",
references = "doi101111joa13428"
}
25. Mondéjar‐Fernández, Jorge und Meunier, François und Cloutier, Richard und Clément, Gaël und Laurin, Michel, 2022, Life history and ossification patterns in Miguashaia bureaui reveal the early evolution of osteogenesis in coelacanths: PeerJ.
Zusammenfassung
Die Erforschung der Entwicklung ist entscheidend, um die Evolution wichtiger Wirbeltierlinien aufzudecken. Coelacanthen gehören zu den längsten evolutionären Geschichten unter den Knochenfischen, doch trotz des Zugangs zu lebenden Vertretern ist der Beginn ihres schwach verknöcherten Endoskeletts immer noch schlecht verstanden. Hier präsentieren wir die erste paläohistologische und skeletochronologische Studie von Miguashaia bureaui aus dem Oberen Devon Kanadas, die für die Erforschung der Paläobiologie und der frühen Evolution der Osteogenese bei Coelacanthen von zentraler Bedeutung ist. Querschnitte der Schwanzflossenknochen zeigen, dass die Kortikalis aus Schichten von Primärknochen besteht, die durch Wachstumsarrestlinien getrennt sind, was auf ein zyklisches Wachstum hinweist. Die Markhöhle zeigt Überreste von verkalktem Knorpel, der mit knöchernen Trabekeln assoziiert ist, was charakteristisch für die enchondrale Verknöcherung ist. Eine skeletochronologische Analyse zeigt, dass schnelles Wachstum während einer kurzen juvenilen Phase von einem langsameren Wachstum im Erwachsenenalter gefolgt war. Unsere neue Analyse hebt die Lebensgeschichte und Paläoökologie von Miguashaia bureaui hervor und zeigt, dass die schlechte endoskelettale Verknöcherung, die bei dem lebenden Latimeria chalumnae bekannt ist, mindestens vor 375 Millionen Jahren zurückverfolgt werden kann.
BibTeX
@article{doi107717peerj13175,
author = "Mondéjar‐Fernández, Jorge und Meunier, François und Cloutier, Richard und Clément, Gaël und Laurin, Michel",
title = "Life history and ossification patterns in Miguashaia bureaui reveal the early evolution of osteogenesis in coelacanths",
year = "2022",
journal = "PeerJ",
abstract = "Die Erforschung der Entwicklung ist entscheidend, um die Evolution wichtiger Wirbeltierlinien aufzudecken. Coelacanthen gehören zu den längsten evolutionären Geschichten unter den Knochenfischen, doch trotz des Zugangs zu lebenden Vertretern ist der Beginn ihres schwach verknöcherten Endoskeletts immer noch schlecht verstanden. Hier präsentieren wir die erste paläohistologische und skeletochronologische Studie von Miguashaia bureaui aus dem Oberen Devon Kanadas, die für die Erforschung der Paläobiologie und der frühen Evolution der Osteogenese bei Coelacanthen von zentraler Bedeutung ist. Querschnitte der Schwanzflossenknochen zeigen, dass die Kortikalis aus Schichten von Primärknochen besteht, die durch Wachstumsarrestlinien getrennt sind, was auf ein zyklisches Wachstum hinweist. Die Markhöhle zeigt Überreste von verkalktem Knorpel, der mit knöchernen Trabekeln assoziiert ist, was charakteristisch für die enchondrale Verknöcherung ist. Eine skeletochronologische Analyse zeigt, dass schnelles Wachstum während einer kurzen juvenilen Phase von einem langsameren Wachstum im Erwachsenenalter gefolgt war. Unsere neue Analyse hebt die Lebensgeschichte und Paläoökologie von Miguashaia bureaui hervor und zeigt, dass die schlechte endoskelettale Verknöcherung, die bei dem lebenden Latimeria chalumnae bekannt ist, mindestens vor 375 Millionen Jahren zurückverfolgt werden kann.",
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doi = "10.7717/peerj.13175",
openalex = "W4225838116",
references = "doi101111joa13428"
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26. Johnston, Peter, 2022, Die fehlende Anatomie des lebenden Coelacanth, Latimeria chalumnae (Smith, 1939): Vertebrate Zoology: v. 72: p. 513-531.
Zusammenfassung
In histologischen Schnittreihen, Gewebefärbungen von microCT-Scans, MRT-Scans und Synchrotron-Scanreihen wurden anatomische Merkmale gesucht, die in Latimeria bisher nicht beschrieben wurden. Das Spirakelorgan, die ultimobranchiale endokrine Drüse und der m. cucullaris wurden an den erwarteten Stellen identifiziert. Zusätzlich wurde ein Muskel identifiziert, der an der medialen Seite des Schultergürtels entspringt, und mit einem Muskel an einer ähnlichen Stelle verglichen, der sich am Schädelfortsatz bei Lungenfischen ansetzt; diese werden als Homologe des tetrapoden m. omohyoideus vorgeschlagen. Diese Befunde werden durch den Vergleich mit ausgewählten anderen Fischgruppen, Lungenfischen und Tetrapoden in einen evolutionären Kontext gesetzt. Die Position von Latimeria als Schlüsseltaxon im Übergang von Fischen zu Tetrapoden wird durch diese Befunde betont, und die Befunde haben das Potenzial, die Forschung zur Schädelstruktur in ausgestorbenen Taxa zu informieren.
BibTeX
@article{johnston2022the,
author = "Johnston, Peter",
title = "The missing anatomy of the living coelacanth, Latimeria chalumnae (Smith, 1939)",
year = "2022",
journal = "Vertebrate Zoology",
abstract = "Anatomical features that have not been previously described in Latimeria were sought in histological section series, tissue-stained microCT scans, MRI scans, and synchrotron scan series. The spiracular organ, ultimobranchial endocrine gland, and m. cucullaris were identified in the expected locations. In addition, a muscle arising on the medial side of the pectoral girdle is identified and compared with a muscle in a similar location that attaches to the cranial rib in lungfish; these are proposed as homologues of the tetrapod m. omohyoideus. These findings are placed in evolutionary context by comparison with selected other groups of fish, lungfish and tetrapods. The position of Latimeria as a key taxon in the fish-to-tetrapod transition is emphasised by these findings, and the findings have potential to inform research on cranial structure in extinct taxa.",
url = "https://doi.org/10.3897/vz.72.e84274",
doi = "10.3897/vz.72.e84274",
openalex = "W4285490446",
pages = "513-531",
volume = "72",
references = "doi101038ncomms2036, doi101038s4158601911173, doi10118614726793911, doi101186s1286201709583, doi1023071441701, doi1023072413058, doi105962bhltitle82144, doi107554elife40179, openalexw563680134, openalexw628087051"
}
27. Ferrante, Christophe und Cavin, Lionel, 2025, Ein tiefer Einblick in die Phylogenie des Coelacanth: PLoS ONE.
DOI: 10.1371/journal.pone.0320214
Zusammenfassung
Die Entdeckung eines lebenden Coelacanth, Latimeria chalumnae, im Jahr 1938 löste viel Forschung und Diskussion über die evolutionäre Geschichte und Phylogenie dieser peculiar sarcopterygian Fische aus. Tatsächlich galten Coelacanthen als das 'fehlende Glied' zwischen Fischen und Tetrapoden, eine phylogenetische Position, die jetzt verworfen wird. Da die ersten Analysen mit einem phylogenetischen Ansatz vor drei Jahrzehnten durchgeführt wurden, wurde von Forschern relativ konsistent eine relativ ähnliche Datenmatrix für die Durchführung von Analysen verwendet, ohne signifikante Änderungen außer der Hinzufügung neuer Taxa und Charaktere sowie kleiner Korrekturen zur Definition und Bewertung der Zustände. Hier untersuchen wir die Phylogenie der Actinistia mit einer aktualisierten Datenmatrix basierend auf einer Liste teilweise neuer oder modifizierter Charaktere. Von der anfänglichen Liste der in den neuesten Studien verfügbaren Charaktere haben wir 16 Charaktere entfernt, die Definition von 16 anderen Charakteren geändert und 18 neue Charaktere hinzugefügt, was zu einer Liste von 112 Charakteren führte. Wir haben die Datenmatrix auch revidiert, indem wir 171 Fehlkodierungen für 37 Taxa korrigiert haben. Basierend auf der neuen Phylogenie schlagen wir eine neue Klassifizierung der Coelacanthen vor, die 46 Coelacanth-Gattungen umfasst, von denen einige in neun Familien und vier Unterfamilien zugeordnet sind. Die meisten dieser Gruppen waren bereits benannt, wurden aber nicht als Klade anerkannt oder waren in früheren phylogenetischen Analysen schlecht oder gar nicht diagnostiziert. Wir stellen mehrere neue oder emendierte Diagnosen für jede Klade bereit. Zum ersten Mal wurde eine Reihe paläozoischer Coelacanth-Gattungen in einer Klade gefunden, nämlich die Diplocercidae. Alle mesozoischen Coelacanthen, einschließlich der extanten Latimeria, werden als Mitglieder der Ordnung Coelacanthiformes gelöst, einer Klade, die im Perm entstand, wobei Coelacanthus zuerst divergierte. Wir haben auch festgestellt, dass die meisten mesozoischen Coelacanthen in einer Klade, den Latimerioidei, gesammelt sind, die selbst in die Latimeriidae und die Mawsoniidae unterteilt ist, wobei jede in zwei Unterfamilien unterteilt ist. Obwohl diese wichtigen Änderungen, zeigt die neue Phylogenie der Actinistia keine signifikante Veränderung und bleibt im Vergleich zu früheren Studien relativ ähnlich. Dies zeigt, dass die Coelacanth-Phylogenie jetzt ziemlich stabil ist, trotz der schwachen Unterstützung für die meisten Knoten in der Phylogenie und trotz der Schwierigkeit, relevante morphologische Charaktere zu definieren, die in diesem relativ langsam entwickelnden Linien bewertet werden können.
BibTeX
@article{doi101371journalpone0320214,
author = "Ferrante, Christophe und Cavin, Lionel",
title = "Ein tiefer Einblick in die Coelacanth-Phylogenie",
year = "2025",
journal = "PLoS ONE",
abstract = "Die Entdeckung eines lebenden Coelacanth, Latimeria chalumnae, im Jahr 1938 löste viel Forschung und Diskussion über die evolutionäre Geschichte und Phylogenie dieser peculiar sarcopterygian Fische aus. Tatsächlich galten Coelacanthen als das 'fehlende Glied' zwischen Fischen und Tetrapoden, eine phylogenetische Position, die jetzt verworfen wird. Da die ersten Analysen mit einem phylogenetischen Ansatz vor drei Jahrzehnten durchgeführt wurden, wurde von Forschern relativ konsistent eine relativ ähnliche Datenmatrix für die Durchführung von Analysen verwendet, ohne signifikante Änderungen außer der Hinzufügung neuer Taxa und Charaktere sowie kleiner Korrekturen zur Definition und Bewertung der Zustände. Hier untersuchen wir die Phylogenie der Actinistia mit einer aktualisierten Datenmatrix basierend auf einer Liste teilweise neuer oder modifizierter Charaktere. Von der anfänglichen Liste der in den neuesten Studien verfügbaren Charaktere haben wir 16 Charaktere entfernt, die Definition von 16 anderen Charakteren geändert und 18 neue Charaktere hinzugefügt, was zu einer Liste von 112 Charakteren führte. Wir haben die Datenmatrix auch revidiert, indem wir 171 Fehlkodierungen für 37 Taxa korrigiert haben. Basierend auf der neuen Phylogenie schlagen wir eine neue Klassifizierung der Coelacanthen vor, die 46 Coelacanth-Gattungen umfasst, von denen einige in neun Familien und vier Unterfamilien zugeordnet sind. Die meisten dieser Gruppen waren bereits benannt, wurden aber nicht als Klade anerkannt oder waren in früheren phylogenetischen Analysen schlecht oder gar nicht diagnostiziert. Wir stellen mehrere neue oder emendierte Diagnosen für jede Klade bereit. Zum ersten Mal wurde eine Reihe paläozoischer Coelacanth-Gattungen in einer Klade gefunden, nämlich die Diplocercidae. Alle mesozoischen Coelacanthen, einschließlich der extanten Latimeria, werden als Mitglieder der Ordnung Coelacanthiformes gelöst, einer Klade, die im Perm entstand, wobei Coelacanthus zuerst divergierte. Wir haben auch festgestellt, dass die meisten mesozoischen Coelacanthen in einer Klade, den Latimerioidei, gesammelt sind, die selbst in die Latimeriidae und die Mawsoniidae unterteilt ist, wobei jede in zwei Unterfamilien unterteilt ist. Obwohl diese wichtigen Änderungen, zeigt die neue Phylogenie der Actinistia keine signifikante Veränderung und bleibt im Vergleich zu früheren Studien relativ ähnlich. Dies zeigt, dass die Coelacanth-Phylogenie jetzt ziemlich stabil ist, trotz der schwachen Unterstützung für die meisten Knoten in der Phylogenie und trotz der Schwierigkeit, relevante morphologische Charaktere zu definieren, die in diesem relativ langsam entwickelnden Linien bewertet werden können.",
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openalex = "W4411086515",
references = "doi101038s41467024512384, doi101111joa13428"
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28. Sheahan, Emmaline R. und Owens, Hannah L. und Guralnick, Robert und Naylor, Gavin J. P., 2025, 3D ökologische Nischenmodelle übertreffen 2D bei der Vorhersage des Lebensraums von Coelacanthen (Latimeria spp.): Frontiers in Marine Science.
DOI: 10.3389/fmars.2025.1521474
Zusammenfassung
Einführung Entdeckungen von Coelacanth-Populationen vor der Ostafrikanischen Küste und im Indopazifik rechtfertigen eine Analyse ihrer potenziellen Verbreitungen, doch die notwendigen Werkzeuge, um ihre Verbreitungen in drei Dimensionen zu modellieren und zu projizieren, fehlen. Methoden Unter Verwendung von Vorkommensaufzeichnungen für den westindischen Ozean-Coelacanth, Latimeria chalumnae, erstellten wir 3D- und 2D-Maximum-Entropy-ökologische Nischenmodelle und projizierten sie in den Lebensraum des indonesischen Coelacanth, Latimeria menadoensis. Wir bewerteten den Erfolg jedes Modells daran, wie gut es das Vorkommen von L. menadoensis vorhersagen konnte, das von Tauchbeobachtungen aufgezeichnet wurde. Ergebnisse Während das 2D-Modell 33 % der Vorkommen bei der nachsichtigsten Schwelle ausließ, sagte das 3D-Modell alle Vorkommen erfolgreich voraus, unabhängig vom Schwellenwert. Diskussion Die Einbeziehung der Tiefe führt zu einer verbesserten Modellgenauigkeit bei der Vorhersage des Coelacanth-Lebensraums, und die Projektion in drei Dimensionen kann uns Einblicke geben, wo wir zukünftige Probenahmen konzentrieren sollten. Dieses 3D-Modellierungsrahmenwerk kann uns dabei helfen, besser zu verstehen, wie marine Arten nach Tiefe verteilt sind, und ermöglicht eine gezieltere Erhaltungsmanagement.
BibTeX
@article{doi103389fmars20251521474,
author = "Sheahan, Emmaline R. und Owens, Hannah L. und Guralnick, Robert und Naylor, Gavin J. P.",
title = "3D ökologische Nischenmodelle übertreffen 2D bei der Vorhersage des Lebensraums von Coelacanthen (Latimeria spp.)",
year = "2025",
journal = "Frontiers in Marine Science",
abstract = "Einführung Entdeckungen von Coelacanth-Populationen vor der Ostafrikanischen Küste und im Indopazifik rechtfertigen eine Analyse ihrer potenziellen Verbreitungen, doch die notwendigen Werkzeuge, um ihre Verbreitungen in drei Dimensionen zu modellieren und zu projizieren, fehlen. Methoden Unter Verwendung von Vorkommensaufzeichnungen für den westindischen Ozean-Coelacanth, Latimeria chalumnae, erstellten wir 3D- und 2D-Maximum-Entropy-ökologische Nischenmodelle und projizierten sie in den Lebensraum des indonesischen Coelacanth, Latimeria menadoensis. Wir bewerteten den Erfolg jedes Modells daran, wie gut es das Vorkommen von L. menadoensis vorhersagen konnte, das von Tauchbeobachtungen aufgezeichnet wurde. Ergebnisse Während das 2D-Modell 33\% der Vorkommen bei der nachsichtigsten Schwelle ausließ, sagte das 3D-Modell alle Vorkommen erfolgreich voraus, unabhängig vom Schwellenwert. Diskussion Die Einbeziehung der Tiefe führt zu einer verbesserten Modellgenauigkeit bei der Vorhersage des Coelacanth-Lebensraums, und die Projektion in drei Dimensionen kann uns Einblicke geben, wo wir zukünftige Probenahmen konzentrieren sollten. Dieses 3D-Modellierungsrahmenwerk kann uns dabei helfen, besser zu verstehen, wie marine Arten nach Tiefe verteilt sind, und ermöglicht eine gezieltere Erhaltungsmanagement.",
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doi = "10.3389/fmars.2025.1521474",
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references = "doi101038s41467024512384"
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