Ökologische Genetik

@misc{connell1970readings1,
    author = "Connell, J. H. und Mertz, D. B. und Murdoch, W. W",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics",
    year = "1970",
    howpublished = "New York, Harper and Row, 397 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Connell, J. H., Mertz, D. B., und Murdoch, W. W., 1970, Readings in Ecology and Ecological Genetics: New York, Harper and Row, 397 p.}"
}

Die beiden hier vorgestellten Arbeiten wurden auf Anfrage des Sonderausschusses des Internationalen Biologischen Programms im Rahmen eines umfassenden Programms zur Ökologie und natürlichen Kontrolle von Spinnmilben (Tetranychidae) weltweit erstellt. Teil I ist eine Übersicht der einschlägigen Literatur und eine Diskussion der Biologie und Ökologie verschiedener Feinde von Spinnmilben, ihres Potenzials als biologische Kontrollmittel und der Auswirkungen von Pestiziden auf ihre Populationen. Teil II rekapituliert die Literatur zur Häufigkeit von Tetranychiden und die Belege für verschiedene Hypothesen, die sich mit ihren Populationen befassen. Es wird die Wirkung verschiedener Räuber bewertet und mögliche Wege zur Umsetzung der biologischen Kontrolle diskutiert. Eine dritte Arbeit dieser Reihe (Teil III) derselben Autoren wird die Literatur rekapitulieren und das Problem der Spinnmilben unter dem Gesichtspunkt ihrer Biologie, Ökologie, Schädlingseigenschaft und ihrer Beziehung zu Wirtspflanzen erörtern. Diese Arbeit wird voraussichtlich bald veröffentlicht.

@article{doi103733hilgv40n11p331,
    author = "McMurtry, J. A. und Huffaker, C. B. und van de Vrie, M.",
    title = "Ökologie von Tetranychiden-Milben und ihren natürlichen Feinden: Eine Übersicht: I. Tetranychid-Feinde: Ihre biologischen Merkmale und die Auswirkungen von Spritzpraktiken",
    year = "1970",
    journal = "Hilgardia",
    abstract = "Die beiden hier vorgestellten Arbeiten wurden auf Anfrage des Sonderausschusses des Internationalen Biologischen Programms im Rahmen eines umfassenden Programms zur Ökologie und natürlichen Kontrolle von Spinnmilben (Tetranychidae) weltweit erstellt. Teil I ist eine Übersicht der einschlägigen Literatur und eine Diskussion der Biologie und Ökologie verschiedener Feinde von Spinnmilben, ihres Potenzials als biologische Kontrollmittel und der Auswirkungen von Pestiziden auf ihre Populationen. Teil II rekapituliert die Literatur zur Häufigkeit von Tetranychiden und die Belege für verschiedene Hypothesen, die sich mit ihren Populationen befassen. Es wird die Wirkung verschiedener Räuber bewertet und mögliche Wege zur Umsetzung der biologischen Kontrolle diskutiert. Eine dritte Arbeit dieser Reihe (Teil III) derselben Autoren wird die Literatur rekapitulieren und das Problem der Spinnmilben unter dem Gesichtspunkt ihrer Biologie, Ökologie, Schädlingseigenschaft und ihrer Beziehung zu Wirtspflanzen erörtern. Diese Arbeit wird voraussichtlich bald veröffentlicht.",
    url = "https://doi.org/10.3733/hilg.v40n11p331",
    doi = "10.3733/hilg.v40n11p331",
    openalex = "W2324497467"
}

Die beiden hier vorgestellten Arbeiten wurden auf Anfrage des Sonderausschusses des Internationalen Biologischen Programms im Rahmen eines umfassenden Programms zur Ökologie und natürlichen Kontrolle von Spinnmilben (Tetranychidae) weltweit erstellt. Teil I ist eine Übersicht der einschlägigen Literatur und eine Diskussion der Biologie und Ökologie verschiedener Feinde von Spinnmilben, ihres Potenzials als biologische Kontrollmittel und der Auswirkungen von Pestiziden auf ihre Populationen. Teil II fasst die Literatur zur Tetranychiden-Abundanz zusammen und beleuchtet die Belege für verschiedene Hypothesen bezüglich ihrer Populationen. Er bewertet die Wirkung verschiedener Räuber und diskutiert mögliche Wege zur Umsetzung der biologischen Kontrolle. Eine dritte Arbeit dieser Reihe (Teil III) von denselben Autoren wird die Literatur zusammenfassen und das Problem der Spinnmilben unter dem Gesichtspunkt ihrer Biologie, Ökologie, ihres Schädlingsstatus und ihrer Beziehung zu Wirtspflanzen erörtern. Diese Arbeit wird voraussichtlich bald veröffentlicht.

@article{doi103733hilgv40n11p391,
    author = "Huffaker, C. B. und van de Vrie, M. und McMurtry, J. A.",
    title = "Ökologie von tetranychid mites und ihren natürlichen Feinden: Eine Übersicht: II. Tetranychid populations und ihre mögliche Kontrolle durch predators: An evaluation",
    year = "1970",
    journal = "Hilgardia",
    abstract = "The two papers presented here were prepared at the request of the Special Committee of the International Biological Program, as part of a broad program on the ecology and natural control of spider mites (Tetranychidae) on a worldwide basis. Part I is a review of the pertinent literature and a discussion of the biology and ecology of various spider mite enemies, their potential as biological control agents, and the effects of pesticides on their populations. Part II reviews the literature pertaining to tetranychid abundance, and the evidence supporting various hypotheses concerned with their populations. It evaluates the action of various predators and discusses possible ways of implementing biological control. A third paper in this series (Part III), by the same authors, will review the literature and discuss the problem of spider mites from the standpoint of their biology, ecology, pest status, and their relationship to host plants. This paper is expected to be published shortly.",
    url = "https://doi.org/10.3733/hilg.v40n11p391",
    doi = "10.3733/hilg.v40n11p391",
    openalex = "W2073176131"
}

Einführung in die Populationsgenetik-Theorie, Einführung in die Populationsgenetik-Theorie, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@book{openalexw2062594085,
    author = "Crow, James F. und Kimura, Makoto",
    title = "Einführung in die Populationsgenetik-Theorie",
    year = "1970",
    abstract = "Einführung in die Populationsgenetik-Theorie, Einführung in die Populationsgenetik-Theorie, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    openalex = "W2062594085"
}

@book{openalexw580562315,
    author = "Connell, Joseph H. und Mertz, David B. und Murdoch, William W.",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics",
    year = "1970",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    url = "https://openalex.org/W580562315",
    openalex = "W580562315"
}

@article{gilbert1971readings,
    author = "Gilbert, Edward E.",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics. Joseph H. Connell, David B. Mertz, William W. Murdoch",
    year = "1971",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/406801",
    doi = "10.1086/406801",
    number = "1",
    openalex = "W2513664272",
    pages = "92-93",
    volume = "46"
}

Zahlreiche Insekten und andere Gliederfüßer besiedeln und vermehren sich in gestörten und vom Menschen geschaffenen Umgebungen. Dies ist insbesondere in Juban-Gebieten offensichtlich. Der Grad, in dem diese Organismen urbane Umgebungen ausnutzen, wurde erst vor kurzem erkannt. Unser Unwissen in diesem Bereich ist zum großen Teil auf den allgemeinen Mangel an relevanten ökologischen Studien zurückzuführen. Ziel dieser Übersicht ist es, Informationen zu bewerten und zu synthetisieren, die für das Verständnis der ökologischen Grundlagen der Reproduktion und des Überlebens von Insekten (und in geringerem Maße anderer Gliederfüßer) in urbanen Umgebungen wichtig sind. Konkret betonen wir die Notwendigkeit, zwei Hauptkomponenten der Umwelt der Insekten zu bewerten: Ressourcen, die für das Überleben notwendig sind, und den allgegenwärtigen Einfluss des Menschen. Populations-, Gemeinschafts- und evolutionäre Fallstudien werden innerhalb dieses konzeptionellen Rahmens analysiert. Vergleichende Studien in mehr als einem Lebensraum werden besonders berücksichtigt. Schließlich werden Vorschläge für zukünftige Studien zu grundlegenden und angewandten Fragen der urbanen Entomologie angeboten. Informationen über Insekten in urbanen Umgebungen sind in der landwirtschaftlichen und biologischen Literatur verstreut. Dies ist nicht überraschend, da die meisten Informationen von Spezialisten in einer Vielzahl von Bereichen gesammelt wurden. Beispiele für diese Bereiche und repräsentative Studien umfassen: ökologische und Umweltwissenschaften (56, 64, 81, 92, 117, 118, 137, 138, 159, 165, 166), Populationsgenetik und Evolutionsbiologie (14, 17, 18,36,38-41,75,99, 151), allgemeine Schädlingsidentifikation und -kontrolle (43, 72, 150), biologische und integrierte Kontrolle (91, 107, 108, 121, 122), Forstentomologie (25, 50, 51, 71, 91, 103, 130), Pflanzenpathologie (53, 143), medizinische Entomologie (61, 85, 99, 124, 149, 157), Lagerwaresentomologie (10, 19,49, 70, 88, 102, 168, 174) und Insektizid-Toxikologie (16).

@article{doi101146annureven23010178002055,
    author = "Frankie, Gordon W. und Ehler, L. E.",
    title = "Ecology of Insects in Urban Environments",
    year = "1978",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Zahlreiche Insekten und andere Gliederfüßer besiedeln und vermehren sich in gestörten und vom Menschen geschaffenen Umgebungen. Dies ist insbesondere in Juban-Gebieten offensichtlich. Der Grad, in dem diese Organismen urbane Umgebungen ausnutzen, wurde erst vor kurzem erkannt. Unser Unwissen in diesem Bereich ist zum großen Teil auf den allgemeinen Mangel an relevanten ökologischen Studien zurückzuführen. Ziel dieser Übersicht ist es, Informationen zu bewerten und zu synthetisieren, die für das Verständnis der ökologischen Grundlagen der Reproduktion und des Überlebens von Insekten (und in geringerem Maße anderer Gliederfüßer) in urbanen Umgebungen wichtig sind. Konkret betonen wir die Notwendigkeit, zwei Hauptkomponenten der Umwelt der Insekten zu bewerten: Ressourcen, die für das Überleben notwendig sind, und den allgegenwärtigen Einfluss des Menschen. Populations-, Gemeinschafts- und evolutionäre Fallstudien werden innerhalb dieses konzeptionellen Rahmens analysiert. Vergleichende Studien in mehr als einem Lebensraum werden besonders berücksichtigt. Schließlich werden Vorschläge für zukünftige Studien zu grundlegenden und angewandten Fragen der urbanen Entomologie angeboten. Informationen über Insekten in urbanen Umgebungen sind in der landwirtschaftlichen und biologischen Literatur verstreut. Dies ist nicht überraschend, da die meisten Informationen von Spezialisten in einer Vielzahl von Bereichen gesammelt wurden. Beispiele für diese Bereiche und repräsentative Studien umfassen: ökologische und Umweltwissenschaften (56, 64, 81, 92, 117, 118, 137, 138, 159, 165, 166), Populationsgenetik und Evolutionsbiologie (14, 17, 18,36,38-41,75,99, 151), allgemeine Schädlingsidentifikation und -kontrolle (43, 72, 150), biologische und integrierte Kontrolle (91, 107, 108, 121, 122), Forstentomologie (25, 50, 51, 71, 91, 103, 130), Pflanzenpathologie (53, 143), medizinische Entomologie (61, 85, 99, 124, 149, 157), Lagerwaresentomologie (10, 19,49, 70, 88, 102, 168, 174) und Insektizid-Toxikologie (16).",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.en.23.010178.002055",
    doi = "10.1146/annurev.en.23.010178.002055",
    openalex = "W2140087242",
    references = "doi101111j155856461972tb00186x"
}

Ökologische Methoden: mit besonderer Berücksichtigung der Untersuchung von Insektenpopulationen, Ökologische Methoden: mit besonderer Berücksichtigung der Untersuchung von Insektenpopulationen, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023071936977,
    author = "Smith, Paul E. und Southwood, T. R. E.",
    title = "Ecological Methods with Particular Reference to the Study of Insect Populations",
    year = "1979",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Ökologische Methoden: mit besonderer Berücksichtigung der Untersuchung von Insektenpopulationen, Ökologische Methoden: mit besonderer Berücksichtigung der Untersuchung von Insektenpopulationen, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/1936977",
    doi = "10.2307/1936977",
    openalex = "W2111703506"
}

Teil 1 Genetische Konstitution einer Population: Hardy-Weinberg-Gleichgewicht. Teil 2 Änderungen der Genfrequenz: Migration Mutation. Teil 3 Kleine Populationen – Änderungen der Genfrequenz unter vereinfachten Bedingungen. Teil 4 Kleine Populationen – weniger vereinfachte Bedingungen. Teil 5 Kleine Populationen – verwandte Populationen und enge Inzucht. Teil 6 Kontinuierliche Variation. Teil 7 Werte und Mittelwerte. Teil 8 Varianz. Teil 9 Ähnlichkeit zwischen Verwandten. Teil 10 Vererbbarkeit. Teil 11 Selektion – die Reaktion und ihre Vorhersage. Teil 12 Selektion – die Ergebnisse von Experimenten. Teil 13 Selektion – Informationen von Verwandten. Teil 14 Inzucht und Kreuzung – Änderungen des Mittelwerts. Teil 15 Inzucht und Kreuzung – Änderungen der Varianz. Teil 16 Inzucht und Kreuzung – Anwendungen. Teil 17 Skala. Teil 18 Schwellenmerkmale. Teil 19 Korrelierte Merkmale. Teil 20 Metrische Merkmale unter natürlicher Selektion.

@article{doi1023072529912,
    author = "Edwards, A. W. F. und Falconer, D. S.",
    title = "Einführung in die quantitative Genetik.",
    year = "1982",
    journal = "Biometrics",
    abstract = "Teil 1 Genetische Konstitution einer Population: Hardy-Weinberg-Gleichgewicht. Teil 2 Änderungen der Genfrequenz: Migration Mutation. Teil 3 Kleine Populationen – Änderungen der Genfrequenz unter vereinfachten Bedingungen. Teil 4 Kleine Populationen – weniger vereinfachte Bedingungen. Teil 5 Kleine Populationen – verwandte Populationen und enge Inzucht. Teil 6 Kontinuierliche Variation. Teil 7 Werte und Mittelwerte. Teil 8 Varianz. Teil 9 Ähnlichkeit zwischen Verwandten. Teil 10 Vererbbarkeit. Teil 11 Selektion – die Reaktion und ihre Vorhersage. Teil 12 Selektion – die Ergebnisse von Experimenten. Teil 13 Selektion – Informationen von Verwandten. Teil 14 Inzucht und Kreuzung – Änderungen des Mittelwerts. Teil 15 Inzucht und Kreuzung – Änderungen der Varianz. Teil 16 Inzucht und Kreuzung – Anwendungen. Teil 17 Skala. Teil 18 Schwellenmerkmale. Teil 19 Korrelierte Merkmale. Teil 20 Metrische Merkmale unter natürlicher Selektion.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2529912",
    doi = "10.2307/2529912",
    openalex = "W2141088880"
}

L. Margolis, G. W. Esch, J. C. Holmes, A. M. Kuris, G. A. Schad, The Use of Ecological Terms in Parasitology (Report of an Ad Hoc Committee of the American Society of Parasitologists), The Journal of Parasitology, Vol. 68, No. 1 (Feb., 1982), pp. 131-133

@article{doi1023073281335,
    author = "Margolis, Leo and Esch, G. W. and Holmes, John C. and Kuris, Armand M. and Schad, G. A.",
    title = "The Use of Ecological Terms in Parasitology (Report of an Ad Hoc Committee of the American Society of Parasitologists)",
    year = "1982",
    journal = "Journal of Parasitology",
    abstract = "L. Margolis, G. W. Esch, J. C. Holmes, A. M. Kuris, G. A. Schad, The Use of Ecological Terms in Parasitology (Report of an Ad Hoc Committee of the American Society of Parasitologists), The Journal of Parasitology, Vol. 68, No. 1 (Feb., 1982), pp. 131-133",
    url = "https://doi.org/10.2307/3281335",
    doi = "10.2307/3281335",
    openalex = "W2059029412"
}

Die vierte Auflage von Populationsgenetik ist die aktuellste, umfassendste und zugänglichste Einführung in das Fach für fortgeschrittene Studierende im Bachelor- und Masterstudium sowie für Forschende in den Bereichen Genetik, Evolution, Naturschutz und verwandte Gebiete. In den letzten Jahren ist das Interesse an der Anwendung von Prinzipien der Populationsgenetik auf neue molekulare Daten stark gestiegen, und die neue Ausgabe von Dr. Hedrick spiegelt sein Engagement wider, Schritt mit diesem dynamischen Forschungsbereich zu halten. Um es Studierenden zu ermöglichen, sich stärker auf das Kernmaterial zu konzentrieren, integriert die vierte Auflage die Behandlung theoretischer Fragen mit einer klaren Darstellung der experimentellen Populationsgenetik und empirischer Daten. Unter Verwendung von Beispielen aus sowohl aktuellen als auch klassischen Studien und unter Einbeziehung einer Vielzahl von Organismen, um die weitreichenden Entwicklungen der Populationsgenetik zu veranschaulichen, bietet dieses Werk Studierenden und Forschenden die umfassendste Ressource in diesem Bereich.

@book{openalexw1495050269,
    author = "Hedrick, Philip W.",
    title = "Genetics of populations",
    year = "1983",
    abstract = "The Fourth Edition of Genetics of Populations is the most current, comprehensive, and accessible introduction to the field for advanced undergraduate and graduate students, and researchers in genetics, evolution, conservation, and related fields. In the past several years, interest in the application of population genetics principles to new molecular data has increased greatly, and Dr. Hedrick's new edition exemplifies his commitment to keeping pace with this dynamic area of study. Reorganized to allow students to focus more sharply on key material, the Fourth Edition integrates coverage of theoretical issues with a clear presentation of experimental population genetics and empirical data. Drawing examples from both recent and classic studies, and using a variety of organisms to illustrate the vast developments of population genetics, this text provides students and researchers with the most comprehensive resource in the field.",
    openalex = "W1495050269"
}

Viele empirische Analysen von Lebenszyklus-Strategien basieren auf der Annahme, dass demografische Variation am größten sein sollte zwischen Populationen oder Arten, die in unterschiedlichen Umgebungen leben. Allerdings gibt es in einer einzigen Population der sessilen kolonialen Seesquille Botryllus schlosseri zwei diskrete Lebenszyklus-Morphen. Semelpare Kolonien zeichnen sich durch a) Tod unmittelbar nach der Produktion eines einzigen Wurfes, b) frühes Alter bei der ersten Fortpflanzung, c) schnelles Wachstum bis zur ersten Fortpflanzung und d) hohe reproduktive Anstrengung aus. Im Gegensatz dazu produzieren iteropare Kolonien a) mindestens drei Würfe, bevor sie sterben, b) verschieben die sexuelle Fortpflanzung bis sie fast doppelt so alt sind wie semelpare Kolonien, c) wachsen mit etwa der Hälfte der Rate von semelparen Kolonien und d) investieren etwa 75% weniger in die reproduktive Anstrengung als semelpare Kolonien. Semelpare Kolonien dominieren die Population bis zum Hochsommer; später im Sommer sind iteropare Kolonien am zahlreichsten. Feld- und Labor-Gemeinschaftsgarten-Experimente sowie Zuchtstudien deuten darauf hin, dass die demografischen Unterschiede zwischen den Morphen genetisch bestimmt sind. Folglich kann der saisonale Wechsel von der Dominanz durch semelpare Kolonien zur Dominanz durch iteropare Kolonien eine evolvierte Reaktion auf eine sich saisonal ändernde Umwelt sein. Aus theoretischen Gründen wird angenommen, dass zeitliche Variation in der Selektion eine relativ unbedeutende Rolle bei der Aufrechterhaltung genetischer Polymorphismen spielt; dennoch zeigt der in dieser Studie nachgewiesene saisonal wiederkehrende Lebenszyklus-Polymorphismus, dass zeitliche Variation in der Selektion zur Aufrechterhaltung genetischer Polymorphismen für Merkmale führen kann, die die Fitness stark beeinflussen.

@article{doi101111j155856461988tb02510x,
    author = "Grosberg, Richard K.",
    title = "LEbenszyklus-VARIATION INNERHALB EINER POPULATION DER KOLONIALEN ASCIDIE BOTRYLLUS SCHLOSSERI. I. DIE GENETISCHE UND UMWELTBESTIMMTE KONTROLLE DER JAHRESZEITLICHEN VARIATION",
    year = "1988",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Viele empirische Analysen von Lebenszyklus-Strategien basieren auf der Annahme, dass demografische Variation am größten sein sollte zwischen Populationen oder Arten, die in unterschiedlichen Umgebungen leben. Allerdings gibt es in einer einzigen Population der sessilen kolonialen Seesquille Botryllus schlosseri zwei diskrete Lebenszyklus-Morphen. Semelpare Kolonien zeichnen sich durch a) Tod unmittelbar nach der Produktion eines einzigen Wurfes, b) frühes Alter bei der ersten Fortpflanzung, c) schnelles Wachstum bis zur ersten Fortpflanzung und d) hohe reproduktive Anstrengung aus. Im Gegensatz dazu produzieren iteropare Kolonien a) mindestens drei Würfe, bevor sie sterben, b) verschieben die sexuelle Fortpflanzung bis sie fast doppelt so alt sind wie semelpare Kolonien, c) wachsen mit etwa der Hälfte der Rate von semelparen Kolonien und d) investieren etwa 75% weniger in die reproduktive Anstrengung als semelpare Kolonien. Semelpare Kolonien dominieren die Population bis zum Hochsommer; später im Sommer sind iteropare Kolonien am zahlreichsten. Feld- und Labor-Gemeinschaftsgarten-Experimente sowie Zuchtstudien deuten darauf hin, dass die demografischen Unterschiede zwischen den Morphen genetisch bestimmt sind. Folglich kann der saisonale Wechsel von der Dominanz durch semelpare Kolonien zur Dominanz durch iteropare Kolonien eine evolvierte Reaktion auf eine sich saisonal ändernde Umwelt sein. Aus theoretischen Gründen wird angenommen, dass zeitliche Variation in der Selektion eine relativ unbedeutende Rolle bei der Aufrechterhaltung genetischer Polymorphismen spielt; dennoch zeigt der in dieser Studie nachgewiesene saisonal wiederkehrende Lebenszyklus-Polymorphismus, dass zeitliche Variation in der Selektion zur Aufrechterhaltung genetischer Polymorphismen für Merkmale führen kann, die die Fitness stark beeinflussen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1988.tb02510.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1988.tb02510.x",
    openalex = "W2312721243",
    references = "doi10103711774000, doi101086409052, doi101146annureves08110177001045, doi1023071419292, doi1023071605, doi1023071936778, doi1023072402622, doi1023072529912, openalexw1495050269, openalexw2077454220, openalexw580562315"
}

Es besteht nun ein gutes theoretisches Verständnis der Evolution der Lebensgeschichte, und detaillierte explizite Optimalitätsmodelle wurden erstellt. Diese stellen eine Herausforderung für empirische Arbeiten dar, die einige der Annahmen untersuchen, wie zum Beispiel das Ausmaß und die Mechanismen der Kosten von Wachstum und Fortpflanzung. Darüber hinaus besteht ein offensichtlicher Bedarf an vergleichenden Tests der Modelle. Diese Tests, wenn sie richtig angewendet werden, können besonders aufschlussreich sein, da sie sich mit mehreren unabhängigen Variablen, einschließlich ökologischer Variablen, befassen können und breite Trends vor dem Hintergrund von Einschränkungen der Optima und der Rate des evolutionären Annäherungsprozesses an diese aufzeigen können. Lebensgeschichten sind die Überlebenswahrscheinlichkeiten und die Fortpflanzungsraten in jedem Alter der Lebensspanne. Fortpflanzung ist kostspielig, sodass die Fruchtbarkeit in allen Altersstufen nicht gleichzeitig durch natürliche Selektion maximiert werden kann. Die Zuteilung von Fortpflanzungsaufwand hat sich als Reaktion auf den demografischen Einfluss verschiedener Umgebungen entwickelt, ist jedoch durch genetische Varianz und evolutionäre Geschichte eingeschränkt.

@article{doi101126science24148721449,
    author = "Partridge, Linda und Harvey, Paul",
    title = "The Ecological Context of Life History Evolution",
    year = "1988",
    journal = "Science",
    abstract = "Es besteht nun ein gutes theoretisches Verständnis der Evolution der Lebensgeschichte, und detaillierte explizite Optimalitätsmodelle wurden erstellt. Diese stellen eine Herausforderung für empirische Arbeiten dar, die einige der Annahmen untersuchen, wie zum Beispiel das Ausmaß und die Mechanismen der Kosten von Wachstum und Fortpflanzung. Darüber hinaus besteht ein offensichtlicher Bedarf an vergleichenden Tests der Modelle. Diese Tests, wenn sie richtig angewendet werden, können besonders aufschlussreich sein, da sie sich mit mehreren unabhängigen Variablen, einschließlich ökologischer Variablen, befassen können und breite Trends vor dem Hintergrund von Einschränkungen der Optima und der Rate des evolutionären Annäherungsprozesses an diese aufzeigen können. Lebensgeschichten sind die Überlebenswahrscheinlichkeiten und die Fortpflanzungsraten in jedem Alter der Lebensspanne. Fortpflanzung ist kostspielig, sodass die Fruchtbarkeit in allen Altersstufen nicht gleichzeitig durch natürliche Selektion maximiert werden kann. Die Zuteilung von Fortpflanzungsaufwand hat sich als Reaktion auf den demografischen Einfluss verschiedener Umgebungen entwickelt, ist jedoch durch genetische Varianz und evolutionäre Geschichte eingeschränkt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.241.4872.1449",
    doi = "10.1126/science.241.4872.1449",
    openalex = "W1974377563",
    references = "doi101007bf00378945, doi1010160040580974900537, doi101146annureves15110184002235"
}

Es wird eine neue Methode beschrieben, um genetische Verwandtschaft aus genetischen Markern wie Proteinpolymorphismen zu schätzen. Sie basiert auf dem Verwandtschaftskoeffizienten von Grafen (1985) und lässt sich am einfachsten in Bezug auf Identität durch Abstammung interpretieren, nicht als genetische Regression. Sie bietet mehrere Vorteile gegenüber derzeit verwendeten Methoden: Sie eliminiert eine nach unten gerichtete Verzerrung bei kleinen Stichprobengrößen; sie verbessert die Schätzung der Verwandtschaft für Teilmengen von Populationsstichproben; und sie ermöglicht die Schätzung der Verwandtschaft für eine einzelne Gruppe oder für ein einzelnes Individuenpaar. Einzelne Schätzungen der Verwandtschaft neigen dazu, hoch variabel zu sein, können aber in der Summe immer noch sehr nützlich als Daten für nichtparametrische Tests sein. Solche Tests ermöglichen das Testen von Unterschieden in der Verwandtschaft zwischen zwei Stichproben oder das Korrelieren einzelner Verwandtschaftswerte mit einer anderen Variable.

@article{doi101111j155856461989tb04226x,
    author = "Queller, David C. und Goodnight, Keith F.",
    title = "ESTIMATING RELATEDNESS USING GENETIC MARKERS",
    year = "1989",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Es wird eine neue Methode beschrieben, um genetische Verwandtschaft aus genetischen Markern wie Proteinpolymorphismen zu schätzen. Sie basiert auf dem Verwandtschaftskoeffizienten von Grafen (1985) und lässt sich am einfachsten in Bezug auf Identität durch Abstammung interpretieren, nicht als genetische Regression. Sie bietet mehrere Vorteile gegenüber derzeit verwendeten Methoden: Sie eliminiert eine nach unten gerichtete Verzerrung bei kleinen Stichprobengrößen; sie verbessert die Schätzung der Verwandtschaft für Teilmengen von Populationsstichproben; und sie ermöglicht die Schätzung der Verwandtschaft für eine einzelne Gruppe oder für ein einzelnes Individuenpaar. Einzelne Schätzungen der Verwandtschaft neigen dazu, hoch variabel zu sein, können aber in der Summe immer noch sehr nützlich als Daten für nichtparametrische Tests sein. Solche Tests ermöglichen das Testen von Unterschieden in der Verwandtschaft zwischen zwei Stichproben oder das Korrelieren einzelner Verwandtschaftswerte mit einer anderen Variable.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1989.tb04226.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1989.tb04226.x",
    openalex = "W1973214225",
    references = "doi1010160022519364900396, doi101073pnas721143"
}

@article{doi101007bf00328407,
    author = "Rice, Kevin J. und Mack, Richard N.",
    title = "Ökologische Genetik von Bromus tectorum",
    year = "1991",
    journal = "Oecologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00328407",
    doi = "10.1007/bf00328407",
    openalex = "W2086094837"
}

Teil 1 Natürliche Selektion und Lebensgeschichten: evolutionäre Modelle in der Verhaltensökologie Evolution von Lebensgeschichten menschliche Verhaltensökologie. Teil 2 Ausbeutung von Ressourcen: Entscheidungsfindung Wettbewerb um Ressourcen Interaktionen zwischen Räubern und Beute. Teil 3 Sexuelle Selektion und Fortpflanzungsstrategien: sexuelle Selektion elterliche Investition Paarungssysteme. Teil 4 Kooperation und Konflikt: kooperative Brut bei Vögeln und Säugetieren Konflikt und Kooperation bei Insekten Kommunikation.

@article{doi1023075530,
    author = "Adams, Jonathan und Krebs, J. R. und Davies, N. B.",
    title = "Behavioural Ecology: An Evolutionary Approach",
    year = "1992",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Teil 1 Natürliche Selektion und Lebensgeschichten: evolutionäre Modelle in der Verhaltensökologie Evolution von Lebensgeschichten menschliche Verhaltensökologie. Teil 2 Ausbeutung von Ressourcen: Entscheidungsfindung Wettbewerb um Ressourcen Interaktionen zwischen Räubern und Beute. Teil 3 Sexuelle Selektion und Fortpflanzungsstrategien: sexuelle Selektion elterliche Investition Paarungssysteme. Teil 4 Kooperation und Konflikt: kooperative Brut bei Vögeln und Säugetieren Konflikt und Kooperation bei Insekten Kommunikation.",
    url = "https://doi.org/10.2307/5530",
    doi = "10.2307/5530",
    openalex = "W2136284908"
}

Um eine kohärente evolutionäre Theorie zu erreichen, ist es notwendig, die Auswirkungen der Umwelt auf den Entwicklungsprozess zu berücksichtigen. Phänotypische Plastizität ist die Änderung des ausgedrückten Phänotyps eines Genotyps als Funktion der Umwelt. Es gibt verschiedene Maße für Plastizität, die viele innerhalb des Rahmens einer Polynomfunktion vereinigt werden können. Diese Funktion ist die Reaktionsnorm. Für den Spezialfall einer linearen Reaktionsnorm kann genetische Variation in Anteile unterteilt werden, die unabhängig von der Umwelt sind und solche, die von der Umwelt abhängen. Aus dieser Aufteilung werden zwei Heritabilitätsmaße abgeleitet, die alternativ verwendet werden können, um Populationen zu vergleichen oder Vorhersagen über die Reaktion auf Selektion zu treffen. Genetisch ist Plastizität wahrscheinlich sowohl auf Unterschiede in der Allelexpression über verschiedene Umgebungen hinweg als auch auf Änderungen in den Interaktionen zwischen Loci zurückzuführen; Plastizität ist keine Funktion der Heterozygotie. Plastizität reagiert sowohl auf künstliche als auch auf natürliche Selektion. Die Evolution der Plastizität wird auf drei Arten modelliert: Optimalitätsmodelle, quantitative genetische Modelle und gametische Modelle. Alle Modelle machen ähnliche Vorhersagen über die Bedingungen, die Plastizität begünstigen. Weiterentwicklungen bedürfen die Erweiterung quantitativer genetischer Modelle und strukturierter Populationsmodelle; zudem sind Daten über die wahren Formen von Reaktionsnormen sowie genetische Variation und Kovariation für nichtlineare Reaktionsnormparameter und multiple Umgebungen erforderlich.

@article{doi101146annureves24110193000343,
    author = "Scheiner, Samuel M.",
    title = "Genetics and Evolution of Phenotypic Plasticity",
    year = "1993",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Um eine kohärente evolutionäre Theorie zu erreichen, ist es notwendig, die Auswirkungen der Umwelt auf den Entwicklungsprozess zu berücksichtigen. Phänotypische Plastizität ist die Änderung des ausgedrückten Phänotyps eines Genotyps als Funktion der Umwelt. Es gibt verschiedene Maße für Plastizität, die viele innerhalb des Rahmens einer Polynomfunktion vereinigt werden können. Diese Funktion ist die Reaktionsnorm. Für den Spezialfall einer linearen Reaktionsnorm kann genetische Variation in Anteile unterteilt werden, die unabhängig von der Umwelt sind und solche, die von der Umwelt abhängen. Aus dieser Aufteilung werden zwei Heritabilitätsmaße abgeleitet, die alternativ verwendet werden können, um Populationen zu vergleichen oder Vorhersagen über die Reaktion auf Selektion zu treffen. Genetisch ist Plastizität wahrscheinlich sowohl auf Unterschiede in der Allelexpression über verschiedene Umgebungen hinweg als auch auf Änderungen in den Interaktionen zwischen Loci zurückzuführen; Plastizität ist keine Funktion der Heterozygotie. Plastizität reagiert sowohl auf künstliche als auch auf natürliche Selektion. Die Evolution der Plastizität wird auf drei Arten modelliert: Optimalitätsmodelle, quantitative genetische Modelle und gametische Modelle. Alle Modelle machen ähnliche Vorhersagen über die Bedingungen, die Plastizität begünstigen. Weiterentwicklungen bedürfen die Erweiterung quantitativer genetischer Modelle und strukturierter Populationsmodelle; zudem sind Daten über die wahren Formen von Reaktionsnormen sowie genetische Variation und Kovariation für nichtlineare Reaktionsnormparameter und multiple Umgebungen erforderlich.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.24.110193.000343",
    doi = "10.1146/annurev.es.24.110193.000343",
    openalex = "W2134835006",
    references = "doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101111j155856461985tb00391x, doi1023072389364, doi1023075403"
}

Zeitschriftenartikel GENEPOP (Version 1.2): Populationsgenetik-Software für exakte Tests und Ökumenizismus Zugriff erhalten M. Raymond, M. Raymond Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic PubMed Google Scholar F. Rousset F. Rousset Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic PubMed Google Scholar Journal of Heredity, Band 86, Ausgabe 3, Mai 1995, Seiten 248–249, https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573 Veröffentlicht: 01. Mai 1995 Artikelverlauf Eingegangen: 28. März 1994 Angenommen: 04. Oktober 1994 Veröffentlicht: 01. Mai 1995

@article{doi101093oxfordjournalsjhereda111573,
    author = "Raymond, Michel und Rousset, François",
    title = "GENEPOP (Version 1.2): Populationsgenetik-Software für exakte Tests und Ökumenizismus",
    year = "1995",
    journal = "Journal of Heredity",
    abstract = "Zeitschriftenartikel GENEPOP (Version 1.2): Populationsgenetik-Software für exakte Tests und Ökumenizismus Zugriff erhalten M. Raymond, M. Raymond Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic PubMed Google Scholar F. Rousset F. Rousset Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic PubMed Google Scholar Journal of Heredity, Band 86, Ausgabe 3, Mai 1995, Seiten 248–249, https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573 Veröffentlicht: 01. Mai 1995 Artikelverlauf Eingegangen: 28. März 1994 Angenommen: 04. Oktober 1994 Veröffentlicht: 01. Mai 1995",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573",
    openalex = "W2253414912"
}

Zusammenfassung Knochenfische (Teleostei) stellen die artenreichste taxonomische Gruppe der Wirbeltiere dar. Sie kommen in allen denkbaren Arten von aquatischen Lebensräumen vor und sind verhaltensmäßig extrem divers. Ihr evolutionärer Erfolg als taxonomische Gruppe ist teilweise auf ihre auffällige verhaltensmäßige Plastizität zurückzuführen. In dieser Hinsicht sind sie auch extrem nützliche Organismen, um mechanistische und funktionelle Verhaltensmodelle zu testen. In den letzten zehn Jahren wurde beträchtlicher Fortschritt bei der Erforschung der Wechselwirkungen zwischen Verhalten, Ökologie und Genetik erzielt, die das individuelle Überleben und den Fortpflanzungserfolg von Fischen bestimmen und somit die Evolution ihres Verhaltens. Behavioural Ecology of Teleost Fishes rekapituliert die neuesten Fortschritte in verhaltensmäßigen Anpassungen für das Überleben und die Fortpflanzung bei Fischen und schlägt neue Richtungen und Ansätze für zukünftige Forschung vor. Das Buch konzentriert sich auf verhaltensmäßige Strategien und Taktiken der Habitatwahl und Raumnutzung, der Nahrungssuche, der Vermeidung und Ausweichung von Räubern sowie der Fortpflanzung. Es betrachtet auch, wie das Verhalten von Individuen ökologische Prozesse auf Populations- und Gemeinschaftsebene beeinflusst. Der Text wird allen mit einem allgemeinen Interesse an der Verhaltensökologie zugutekommen und für Studierende, Lehrer und Forscher, die sich für das Verhalten und die Ökologie von Fischen interessieren, Pflichtlektüre sein. Er wird auch eine wertvolle Referenzquelle für Biologen, Aquakulturgeologen und Naturschützer sein.

@book{doi101093oso97801985478460010001,
    author = "Godin, Jean‐Guy J.",
    title = "Behavioural Ecology of Teleost Fishes",
    year = "1997",
    abstract = "Abstract Teleost (bony) fishes represent the most abundant taxonomic group of vertebrates. They are found in all conceivable types of aquatic environment and are extremely diverse behaviourally. Their evolutionary success as a taxonomic group is partly due to their striking behavioural plasticity. As such they are also extremely useful organisms on which to test mechanistic and functional models of behaviour. Considerable progress has been made over the past decade in understanding how behaviour, ecology, and genetics interact to determine individual survival and reproductive success in fishes, and thus the evolution of their behaviour. Behavioural Ecology of Teleost Fishes reviews the latest advances in behavioural adaptations for survival and reproduction in fishes, and proposes new directions and approaches for future research. The book focuses on behavioural strategies and tactics of habitat selection and space use, foraging, predator avoidance and evasion, and reproduction. It also considers how the behaviour of individuals affects ecological processes at population and community levels. The text will benefit all those with a general interest in behavioural ecology, and will be required reading for students, teachers, and researchers interested in the behaviour and ecology of fishes. It will also be a valuable reference source for biologists, aquaculturists, and conservationists.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198547846.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198547846.001.0001",
    openalex = "W1925505063"
}

Aphis gossypii Glover ist ein zerstörerischer Schädling von über zwei Dutzend Kulturpflanzen weltweit. Schäden an einigen dieser Kulturpflanzen sind auf direkte Fütterung zurückzuführen, aber für die meisten dieser Kulturpflanzen liegt sein Einfluss in seiner Rolle als Virusvektor. Wie erwartet, hat dies zu vielen Artikeln geführt, die sich mit Methoden zur Kontrolle dieses Insekts befassen. Die Blattlaus hat die Fähigkeit, Resistenzen gegen viele Pestizide zu entwickeln, und es besteht wachsende Besorgnis über die Umweltauswirkungen des Pestizideinsatzes. Infolgedessen wird die Manipulation des Agroökosystems eine immer größere Rolle bei der Bewirtschaftung dieses Insekts spielen. Die meisten Aspekte der Biologie dieser Blattlaus werden in diesem Überblick behandelt. Das wiederkehrende Thema konzentriert sich auf die Bedeutung von Wirtspflanzeneinflüssen auf die Biologie der Blattlaus. Neben der Prüfung der Literatur zur Biologie der Blattlaus widmet sich ein großer Abschnitt dem, was die Mortalität der Blattlaus beeinflusst, sowie zu von dieser Blattlaus übertragenen, von der Blattlaus übertragenen Viren. Dieser Überblick deckt die Literatur von 1912 bis 1995 ab, aber Artikel zur Blattlausbewirtschaftung (z. B. Pestizidwirksamkeit, Pflanztermin) wurden ausgelassen, es sei denn, sie befassen sich mit der Biologie oder Ökologie der Blattlaus. Die Forschung zur Biologie dieser Blattlaus wurde stark in mehrere disparate Kategorien verschoben. Erstens konzentrierte sich die Forschung auf den Einfluss von Wirtspflanze und Temperatur auf die Reproduktionsrate dieser Blattlaus. Zweitens konzentrierte sich die Forschung auf die Ursache für die Produktion von Alaten wie Ernährungsstress, andere Ernährungsfaktoren, Überbevölkerung und Temperatur. Drittens konzentrierte sich die Forschung auf die von dieser Blattlaus übertragenen viralen Krankheitserreger. Drei spezifische Fälle werden hervorgehoben: Zitrus-Tristeza, Gurkenmosaikvirus und die Potyviren. Zuletzt konzentrierte sich die Forschung auf die Rolle von Organismen, die sich von dieser Blattlaus ernähren. Aufgrund der Komplexität der in diesem Bereich möglichen Forschung hat sehr wenig Forschung den Einfluss dieser nützlichen Organismen auf die Lebensgeschichtseigenschaften dieser Blattlaus untersucht.

@article{openalexw1513341262,
    author = "Ebert, Timothy A. und Cartwright, B.",
    title = "Biology and ecology of Aphis gossypii glover (Homoptera: Aphididae)",
    year = "1997",
    journal = "Southwestern Entomologist",
    abstract = "Aphis gossypii Glover ist ein zerstörerischer Schädling von über zwei Dutzend Kulturpflanzen weltweit. Schäden an einigen dieser Kulturpflanzen sind auf direkte Fütterung zurückzuführen, aber für die meisten dieser Kulturpflanzen liegt sein Einfluss in seiner Rolle als Virusvektor. Wie erwartet, hat dies zu vielen Artikeln geführt, die sich mit Methoden zur Kontrolle dieses Insekts befassen. Die Blattlaus hat die Fähigkeit, Resistenzen gegen viele Pestizide zu entwickeln, und es besteht wachsende Besorgnis über die Umweltauswirkungen des Pestizideinsatzes. Infolgedessen wird die Manipulation des Agroökosystems eine immer größere Rolle bei der Bewirtschaftung dieses Insekts spielen. Die meisten Aspekte der Biologie dieser Blattlaus werden in diesem Überblick behandelt. Das wiederkehrende Thema konzentriert sich auf die Bedeutung von Wirtspflanzeneinflüssen auf die Biologie der Blattlaus. Neben der Prüfung der Literatur zur Biologie der Blattlaus widmet sich ein großer Abschnitt dem, was die Mortalität der Blattlaus beeinflusst, sowie zu von dieser Blattlaus übertragenen, von der Blattlaus übertragenen Viren. Dieser Überblick deckt die Literatur von 1912 bis 1995 ab, aber Artikel zur Blattlausbewirtschaftung (z. B. Pestizidwirksamkeit, Pflanztermin) wurden ausgelassen, es sei denn, sie befassen sich mit der Biologie oder Ökologie der Blattlaus. Die Forschung zur Biologie dieser Blattlaus wurde stark in mehrere disparate Kategorien verschoben. Erstens konzentrierte sich die Forschung auf den Einfluss von Wirtspflanze und Temperatur auf die Reproduktionsrate dieser Blattlaus. Zweitens konzentrierte sich die Forschung auf die Ursache für die Produktion von Alaten wie Ernährungsstress, andere Ernährungsfaktoren, Überbevölkerung und Temperatur. Drittens konzentrierte sich die Forschung auf die von dieser Blattlaus übertragenen viralen Krankheitserreger. Drei spezifische Fälle werden hervorgehoben: Zitrus-Tristeza, Gurkenmosaikvirus und die Potyviren. Zuletzt konzentrierte sich die Forschung auf die Rolle von Organismen, die sich von dieser Blattlaus ernähren. Aufgrund der Komplexität der in diesem Bereich möglichen Forschung hat sehr wenig Forschung den Einfluss dieser nützlichen Organismen auf die Lebensgeschichtseigenschaften dieser Blattlaus untersucht.",
    openalex = "W1513341262",
    references = "doi101111j157074581994tb01769x"
}

Die individuelle Identifizierung über nicht-invasive Probenahme ist von höchster Bedeutung in der Erhaltungsbiologie und in der Verhaltensökologie. Dieser Ansatz ermöglicht genetische Studien an Wildtieren, ohne diese einfangen oder gar beobachten zu müssen. Das als Quelle für DNA verwendete Material sind in der Regel Kot, abgestoßene Haare oder abgestoßene Federn. Es wurde kürzlich gezeigt, dass dieses Material zu Genotypisierungsfehlern führen kann, hauptsächlich aufgrund von allelischem Dropout. Neben diesen technischen Fehlern bestehen Probleme bei der genauen Schätzung der Identifizierungswahrscheinlichkeit (PI, oder die Wahrscheinlichkeit, dass zwei Individuen identische Genotypen haben) aufgrund des Vorhandenseins von nahen Verwandten in natürlichen Populationen. Als Konsequenz empfehlen wir dringend, vor dem Beginn einer umfassenden Studie, die nicht-invasive Probenahme beinhaltet, eine Pilotstudie durchzuführen, um sowohl die technischen Schwierigkeiten als auch die PI für die zu verwendenden genetischen Marker zu bewerten. Diese Pilotstudie könnte in drei Schritten durchgeführt werden: (i) Schätzung der PI unter Verwendung vorläufiger genetischer Daten; (ii) Simulationen unter Berücksichtigung der PI und Auswahl der technischen Fehlerrate, die niedrig genug ist, um die wissenschaftliche Frage zu bewerten; (iii) Polymerase-Kettenreaktion (PCR)-Experimente, um zu überprüfen, ob es technisch möglich ist, diese Fehlerrate zu erreichen.

@article{doi101111j109583121999tb01157x,
    author = "Taberlet, Pierre und Luikart, Gordon",
    title = "Nicht-invasive genetische Probenahme und individuelle Identifizierung",
    year = "1999",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Die individuelle Identifizierung über nicht-invasive Probenahme ist von höchster Bedeutung in der Erhaltungsbiologie und in der Verhaltensökologie. Dieser Ansatz ermöglicht genetische Studien an Wildtieren, ohne diese einfangen oder gar beobachten zu müssen. Das als Quelle für DNA verwendete Material sind in der Regel Kot, abgestoßene Haare oder abgestoßene Federn. Es wurde kürzlich gezeigt, dass dieses Material zu Genotypisierungsfehlern führen kann, hauptsächlich aufgrund von allelischem Dropout. Neben diesen technischen Fehlern bestehen Probleme bei der genauen Schätzung der Identifizierungswahrscheinlichkeit (PI, oder die Wahrscheinlichkeit, dass zwei Individuen identische Genotypen haben) aufgrund des Vorhandenseins von nahen Verwandten in natürlichen Populationen. Als Konsequenz empfehlen wir dringend, vor dem Beginn einer umfassenden Studie, die nicht-invasive Probenahme beinhaltet, eine Pilotstudie durchzuführen, um sowohl die technischen Schwierigkeiten als auch die PI für die zu verwendenden genetischen Marker zu bewerten. Diese Pilotstudie könnte in drei Schritten durchgeführt werden: (i) Schätzung der PI unter Verwendung vorläufiger genetischer Daten; (ii) Simulationen unter Berücksichtigung der PI und Auswahl der technischen Fehlerrate, die niedrig genug ist, um die wissenschaftliche Frage zu bewerten; (iii) Polymerase-Kettenreaktion (PCR)-Experimente, um zu überprüfen, ob es technisch möglich ist, diese Fehlerrate zu erreichen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1999.tb01157.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1999.tb01157.x",
    openalex = "W2010722055"
}

@article{allen2002ecology,
    author = "Allen, Phil S. und Meyer, Susan E.",
    title = "Ökologie und ökologische Genetik der Samenruhe bei Downy Brome",
    year = "2002",
    journal = "Weed Science",
    url = "https://doi.org/10.1614/0043-1745(2002)050[0241:eaegos]2.0.co;2",
    doi = "10.1614/0043-1745(2002)050[0241:eaegos]2.0.co;2",
    number = "2",
    openalex = "W2172657677",
    pages = "241-247",
    volume = "50",
    references = "doi10100797813490462709, doi101007bf00328407, doi101016000632079290659b, doi1010160304374681900275, doi101016s0065266008600486, doi10108007060660109506904, doi101093jxb376729, doi101104pp942840, doi101146annureves23110192000431, doi1016140043174520020500248aohttq20co2"
}

1. Die Landschaftsökologie befasst sich mit dem Einfluss räumlicher Muster auf ökologische Prozesse. Sie betrachtet die ökologischen Konsequenzen der räumlichen Lage von Objekten, ihrer relativen Position zueinander und davon, wie diese Beziehungen und ihre Konsequenzen von den Eigenschaften des umgebenden Landschaftsmosaiks in mehreren zeitlichen und räumlichen Skalen abhängen. Traditionell haben sich Landschaftsökologen auf terrestrische Ökosysteme konzentriert, und Flüsse und Bäche wurden entweder als Elemente von Landschaftsmosaiken oder als Einheiten betrachtet, die durch Fließprozesse über Grenzen oder Ökotone mit der terrestrischen Landschaft verbunden sind. Weniger häufig wurde die Heterogenität, die innerhalb eines Flusses oder Bachs besteht, als ein `Flussscape' an sich betrachtet. 2. Die Landschaftsökologie kann sich um sechs zentrale Themen vereinigen: (1) Patches unterscheiden sich in ihrer Qualität, (2) Patches-Grenzen beeinflussen Fließprozesse, (3) der Kontext von Patches ist wichtig, (4) Konnektivität ist entscheidend, (5) Organismen sind wichtig, und (6) die Bedeutung der Skala. Obwohl sich fluviatile Systeme von terrestrischen Systemen durch die starke physikalische Kraft der Hydrologie und die inhärente Konnektivität, die durch den Wasserfluss bereitgestellt wird, unterscheiden, gelten all diese Themen gleichermaßen für aquatische und terrestrische Ökosysteme sowie für die Verbindungen zwischen beiden. 3. Die Landschaftsökologie bietet daher wichtige Erkenntnisse für die Untersuchung fluviärer Ökosysteme, aber diese Systeme können auch hervorragende Möglichkeiten bieten, um die Landschaftsökologische Theorie zu entwickeln und zu testen. Die Prinzipien und Ansätze der Landschaftsökologie sollten erweitert werden, um Süßwassersysteme einzubeziehen; es ist Zeit, das `Land' aus der Landschaftsökologie zu nehmen.

@article{doi101046j13652427200200887x,
    author = "Wiens, John A.",
    title = "Riverine landscapes: taking landscape ecology into the water",
    year = "2002",
    journal = "Freshwater Biology",
    abstract = "1. Die Landschaftsökologie befasst sich mit dem Einfluss räumlicher Muster auf ökologische Prozesse. Sie betrachtet die ökologischen Konsequenzen der räumlichen Lage von Objekten, ihrer relativen Position zueinander und davon, wie diese Beziehungen und ihre Konsequenzen von den Eigenschaften des umgebenden Landschaftsmosaiks in mehreren zeitlichen und räumlichen Skalen abhängen. Traditionell haben sich Landschaftsökologen auf terrestrische Ökosysteme konzentriert, und Flüsse und Bäche wurden entweder als Elemente von Landschaftsmosaiken oder als Einheiten betrachtet, die durch Fließprozesse über Grenzen oder Ökotone mit der terrestrischen Landschaft verbunden sind. Weniger häufig wurde die Heterogenität, die innerhalb eines Flusses oder Bachs besteht, als ein `Flussscape' an sich betrachtet. 2. Die Landschaftsökologie kann sich um sechs zentrale Themen vereinigen: (1) Patches unterscheiden sich in ihrer Qualität, (2) Patches-Grenzen beeinflussen Fließprozesse, (3) der Kontext von Patches ist wichtig, (4) Konnektivität ist entscheidend, (5) Organismen sind wichtig, und (6) die Bedeutung der Skala. Obwohl sich fluviatile Systeme von terrestrischen Systemen durch die starke physikalische Kraft der Hydrologie und die inhärente Konnektivität, die durch den Wasserfluss bereitgestellt wird, unterscheiden, gelten all diese Themen gleichermaßen für aquatische und terrestrische Ökosysteme sowie für die Verbindungen zwischen beiden. 3. Die Landschaftsökologie bietet daher wichtige Erkenntnisse für die Untersuchung fluviärer Ökosysteme, aber diese Systeme können auch hervorragende Möglichkeiten bieten, um die Landschaftsökologische Theorie zu entwickeln und zu testen. Die Prinzipien und Ansätze der Landschaftsökologie sollten erweitert werden, um Süßwassersysteme einzubeziehen; es ist Zeit, das `Land' aus der Landschaftsökologie zu nehmen.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2427.2002.00887.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2427.2002.00887.x",
    openalex = "W2159194951"
}

Die spag e d i Version 1.0 ist eine Software, die primär dazu entwickelt wurde, die räumliche genetische Struktur kartierter Individuen oder Populationen unter Verwendung von Genotypdaten kodominanter Marker zu charakterisieren. Sie berechnet verschiedene Statistiken, die genetische Verwandtschaft oder Differenzierung zwischen Individuen oder Populationen durch paarweise Vergleiche beschreiben, und testet deren Signifikanz durch angemessene numerische Resampling-Verfahren. spag e d i ist nützlich für: (i) die Erkennung von Isolation durch Distanz innerhalb oder zwischen Populationen und die Schätzung von Genflussparametern; (ii) die Bewertung der genetischen Verwandtschaft zwischen Individuen und ihrer tatsächlichen Varianz, ein Parameter von Interesse für auf Markern basierende Schlussfolgerungen zur quantitativen Vererbung; (iii) die Bewertung der genetischen Differenzierung zwischen Populationen, einschließlich des Falls von Haploiden oder Autopolyploiden.

@article{doi101046j14718286200200305x,
    author = "Hardy, Olivier J. und Vekemans, Xavier",
    title = "spag e d i: ein vielseitiges Computerprogramm zur Analyse der räumlichen genetischen Struktur auf individueller oder populationsbezogener Ebene",
    year = "2002",
    journal = "Molecular Ecology Notes",
    abstract = "Die spag e d i Version 1.0 ist eine Software, die primär dazu entwickelt wurde, die räumliche genetische Struktur kartierter Individuen oder Populationen unter Verwendung von Genotypdaten kodominanter Marker zu charakterisieren. Sie berechnet verschiedene Statistiken, die genetische Verwandtschaft oder Differenzierung zwischen Individuen oder Populationen durch paarweise Vergleiche beschreiben, und testet deren Signifikanz durch angemessene numerische Resampling-Verfahren. spag e d i ist nützlich für: (i) die Erkennung von Isolation durch Distanz innerhalb oder zwischen Populationen und die Schätzung von Genflussparametern; (ii) die Bewertung der genetischen Verwandtschaft zwischen Individuen und ihrer tatsächlichen Varianz, ein Parameter von Interesse für auf Markern basierende Schlussfolgerungen zur quantitativen Vererbung; (iii) die Bewertung der genetischen Differenzierung zwischen Populationen, einschließlich des Falls von Haploiden oder Autopolyploiden.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2002.00305.x",
    doi = "10.1046/j.1471-8286.2002.00305.x",
    openalex = "W2107356656",
    references = "doi101093genetics1391457, doi101093genetics893583, doi101093oxfordjournalsjhereda111573"
}

Wir untersuchten die menschliche Populationsstruktur anhand von Genotypen an 377 autosomalen Mikrosatelliten-Loci bei 1056 Individuen aus 52 Populationen. Innerhalb-populationsbedingte Unterschiede zwischen Individuen machen 93 bis 95% der genetischen Variation aus; Unterschiede zwischen großen Gruppen stellen nur 3 bis 5% dar. Dennoch, ohne Nutzung von Vorabinformationen über die Herkunft der Individuen, identifizierten wir sechs Hauptgenetische Cluster, von denen fünf den großen geografischen Regionen entsprechen, sowie Subcluster, die oft einzelnen Populationen entsprechen. Die allgemeine Übereinstimmung genetischer und vordefinierter Populationen deutet darauf hin, dass selbstberichtete Abstammung die Bewertung epidemiologischer Risiken erleichtern kann, aber die Notwendigkeit, genetische Informationen in genetischen Assoziationsstudien zu verwenden, nicht aufhebt.

@article{doi101126science1078311,
    author = "Rosenberg, Noah A. und Pritchard, Jonathan K. und Weber, James L. und Cann, Howard M. und Kídd, Kenneth K. und Zhivotovsky, Lev A. und Feldman, Marcus W.",
    title = "Genetic Structure of Human Populations",
    year = "2002",
    journal = "Science",
    abstract = "Wir untersuchten die menschliche Populationsstruktur anhand von Genotypen an 377 autosomalen Mikrosatelliten-Loci bei 1056 Individuen aus 52 Populationen. Innerhalb-populationsbedingte Unterschiede zwischen Individuen machen 93 bis 95% der genetischen Variation aus; Unterschiede zwischen großen Gruppen stellen nur 3 bis 5% dar. Dennoch, ohne Nutzung von Vorabinformationen über die Herkunft der Individuen, identifizierten wir sechs Hauptgenetische Cluster, von denen fünf den großen geografischen Regionen entsprechen, sowie Subcluster, die oft einzelnen Populationen entsprechen. Die allgemeine Übereinstimmung genetischer und vordefinierter Populationen deutet darauf hin, dass selbstberichtete Abstammung die Bewertung epidemiologischer Risiken erleichtern kann, aber die Notwendigkeit, genetische Informationen in genetischen Assoziationsstudien zu verwenden, nicht aufhebt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1078311",
    doi = "10.1126/science.1078311",
    openalex = "W2141042406",
    references = "doi101006tpbi20011543, doi101038368455a0, doi101038ng761, doi101073pnas9494516, doi101086302825, doi101086339929, doi101093genetics1552945, doi101093genetics1592699, doi101126science2965566261b, doi101186gb200237comment2007"
}

Genetic assignment methods use genotype likelihoods to draw inference about where individuals were or were not born, potentially allowing direct, real-time estimates of dispersal. We used simulated data sets to test the power and accuracy of Monte Carlo resampling methods in generating statistical thresholds for identifying F0 immigrants in populations with ongoing gene flow, and hence for providing direct, real-time estimates of migration rates. The identification of accurate critical values required that resampling methods preserved the linkage disequilibrium deriving from recent generations of immigrants and reflected the sampling variance present in the data set being analysed. A novel Monte Carlo resampling method taking into account these aspects was proposed and its efficiency was evaluated. Power and error were relatively insensitive to the frequency assumed for missing alleles. Power to identify F0 immigrants was improved by using large sample size (up to about 50 individuals) and by sampling all populations from which migrants may have originated. A combination of plotting genotype likelihoods and calculating mean genotype likelihood ratios (DLR) appeared to be an effective way to predict whether F0 immigrants could be identified for a particular pair of populations using a given set of markers.

@article{doi101046j1365294x200402008x,
    author = "Paetkau, David and Slade, Robert and Burden, Michael and Estoup, Arnaud",
    title = "Genetic assignment methods for the direct, real‐time estimation of migration rate: a simulation‐based exploration of accuracy and power",
    year = "2003",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Genetic assignment methods use genotype likelihoods to draw inference about where individuals were or were not born, potentially allowing direct, real-time estimates of dispersal. We used simulated data sets to test the power and accuracy of Monte Carlo resampling methods in generating statistical thresholds for identifying F0 immigrants in populations with ongoing gene flow, and hence for providing direct, real-time estimates of migration rates. The identification of accurate critical values required that resampling methods preserved the linkage disequilibrium deriving from recent generations of immigrants and reflected the sampling variance present in the data set being analysed. A novel Monte Carlo resampling method taking into account these aspects was proposed and its efficiency was evaluated. Power and error were relatively insensitive to the frequency assumed for missing alleles. Power to identify F0 immigrants was improved by using large sample size (up to about 50 individuals) and by sampling all populations from which migrants may have originated. A combination of plotting genotype likelihoods and calculating mean genotype likelihood ratios (DLR) appeared to be an effective way to predict whether F0 immigrants could be identified for a particular pair of populations using a given set of markers.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.2004.02008.x",
    doi = "10.1046/j.1365-294x.2004.02008.x",
    openalex = "W2152021152",
    references = "doi101017s0016672300012994, doi101073pnas94179197, doi10108001621459198310477973, doi101086282771, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16297, doi101093genetics16331177, doi101093genetics762379, doi101111j1365294x1995tb00227x, doi101111j1365294x200402396x, doi101111j155856461984tb05657x, doi101111j251761611995tb02031x"
}

Wir präsentieren Beweise dafür, dass die vererbliche genetische Variation innerhalb einzelner Arten, insbesondere dominanter und Schlüsselarten, Auswirkungen auf Gemeinschaften und Ökosysteme hat. Diese Auswirkungen stellen erweiterte Phänotypen dar, d. h. die Effekte von Genen auf Ebenen höher als die Population. Unter Verwendung vielfältiger Beispiele von Mikroben bis zu Wirbeltieren zeigen wir, dass der erweiterte Phänotyp von den Individuen, die das Merkmal besitzen, über die Gemeinschaft bis hin zu Ökosystemprozessen wie Laubzersetzung und N-Mineralisierung verfolgt werden kann. In unserer Entwicklung einer Gemeinschafts-Genetik-Perspektive konzentrieren wir uns auf die intraspezifische genetische Variation, da die erweiterten Phänotypen dieser Gene von einer Generation zur nächsten weitergegeben werden können, was einen Mechanismus für Vererbung bereitstellt. Zur Unterstützung dieser Sichtweise zeigen gemeinsame-Garten-Experimente mit synthetischen Kreuzungen einer dominanten Baumart, dass ihre Nachkommen tendenziell Arthropoden-Gemeinschaften unterstützen, die denen ihrer Eltern ähneln. Wir argumentieren auch, dass die kombinierten Wechselwirkungen von erweiterten Phänotypen zur Varianz der Merkmale von Individuen innerhalb von Gemeinschaften zwischen den Gemeinschaften beitragen. Die genetischen Faktoren, die dieser Varianz der Merkmalsausdrucks zwischen den Gemeinschaften zugrunde liegen, insbesondere diejenigen, die genetische Wechselwirkungen zwischen Arten beinhalten, stellen die Gemeinschaftsvererblichkeit dar. Diese Erkenntnisse haben vielfältige Implikationen. (1) Sie bieten einen genetischen Rahmen zum Verständnis von Gemeinschaftsstruktur und Ökosystemprozessen. Die Effekte von erweiterten Phänotypen auf diesen höheren Ebenen müssen nicht diffus sein; sie können direkt sein oder in relativ wenigen Schritten wirken, was unsere Fähigkeit zur Erkennung und Vorhersage ihrer Effekte verbessert. (2) Aus einer Erhaltungs-Perspektive führen wir das Konzept der minimalen lebensfähigen interagierenden Population (MVIP) ein, die die Größe einer Population darstellt, die erforderlich ist, um die genetische Vielfalt auf den von anderen interagierenden Arten in der Gemeinschaft geforderten Ebenen aufrechtzuerhalten. (3) Genotyp × Umwelt-Wechselwirkungen in dominanten und Schlüsselarten können erweiterte Phänotypen verschieben, um unerwartete Auswirkungen auf Gemeinschafts- und Ökosystem-Ebenen zu haben, eine Frage, die besonders wichtig ist, da sie sich auf den globalen Wandel bezieht. (4) Die Dokumentation der Gemeinschaftsvererblichkeit rechtfertigt eine Gemeinschafts-Genetik-Perspektive und ist ein wesentlicher erster Schritt zur Demonstration der Gemeinschaftsevolution. (5) Gemeinschafts-Genetik erfordert und fördert einen integrativen Ansatz, von Genen bis zu Ökosystemen, der für die Verbindung von Ökologie und Genetik notwendig ist. Wenige Studien erstrecken sich von Genen bis zu Ökosystemen, aber eine solche Integration ist wahrscheinlich unerlässlich für das Verständnis der natürlichen Welt. Korrespondierender Herausgeber: A. A. Agrawal

@article{doi1018900012965820030840559caegac20co2,
    author = "Whitham, Thomas G. und Young, William P. und Martinsen, Gregory D. und Gehring, Catherine A. und Schweitzer, Jennifer A. und Shuster, Stephen M. und Wimp, Gina M. und Fischer, Dylan G. und Bailey, Joseph K. und Lindroth, Richard L. und Woolbright, Scott A. und Kuske, Cheryl R.",
    title = "COMMUNITY AND ECOSYSTEM GENETICS: A CONSEQUENCE OF THE EXTENDED PHENOTYPE",
    year = "2003",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Wir präsentieren Beweise dafür, dass die vererbbare genetische Variation innerhalb einzelner Arten, insbesondere dominanter und Schlüsselarten, Gemeinschafts- und Ökosystemfolgen hat. Diese Folgen stellen erweiterte Phänotypen dar, d. h. die Wirkung von Genen auf Ebenen höher als die Population. Unter Verwendung vielfältiger Beispiele von Mikroben bis zu Wirbeltieren zeigen wir, dass der erweiterte Phänotyp von den Individuen, die das Merkmal besitzen, über die Gemeinschaft bis hin zu Ökosystemprozessen wie Laubzersetzung und N-Mineralisierung verfolgt werden kann. In unserer Entwicklung einer Gemeinschafts-Genetik-Perspektive konzentrieren wir uns auf die intraspezifische genetische Variation, da die erweiterten Phänotypen dieser Gene von einer Generation zur nächsten weitergegeben werden können, was einen Mechanismus für Vererbung bereitstellt. Zur Unterstützung dieser Sichtweise zeigen gemeinsame-Garten-Experimente mit synthetischen Kreuzungen einer dominanten Baumart, dass ihre Nachkommen tendenziell Arthropoden-Gemeinschaften unterstützen, die denen ihrer Eltern ähneln. Wir argumentieren auch, dass die kombinierten Wechselwirkungen von erweiterten Phänotypen zur Varianz der Merkmale von Individuen innerhalb von Gemeinschaften zwischen den Gemeinschaften beitragen. Die genetischen Faktoren, die dieser Varianz der Merkmalsausdrucks zwischen den Gemeinschaften zugrunde liegen, insbesondere diejenigen, die genetische Wechselwirkungen zwischen Arten beinhalten, stellen die Gemeinschaftsvererblichkeit dar. Diese Erkenntnisse haben vielfältige Implikationen. (1) Sie bieten einen genetischen Rahmen zum Verständnis von Gemeinschaftsstruktur und Ökosystemprozessen. Die Wirkungen von erweiterten Phänotypen auf diesen höheren Ebenen müssen nicht diffus sein; sie können direkt sein oder in relativ wenigen Schritten wirken, was unsere Fähigkeit zur Erkennung und Vorhersage ihrer Wirkungen verbessert. (2) Aus einer Erhaltungs-Perspektive führen wir das Konzept der minimalen lebensfähigen interagierenden Population (MVIP) ein, die die Größe einer Population darstellt, die erforderlich ist, um die genetische Vielfalt auf den von anderen interagierenden Arten in der Gemeinschaft geforderten Ebenen aufrechtzuerhalten. (3) Genotyp × Umwelt-Wechselwirkungen in dominanten und Schlüsselarten können erweiterte Phänotypen verschieben, um unerwartete Folgen auf Gemeinschafts- und Ökosystem-Ebenen zu haben, ein Thema, das besonders wichtig ist, wenn es sich auf den globalen Wandel bezieht. (4) Die Dokumentation der Gemeinschaftsvererblichkeit rechtfertigt eine Gemeinschafts-Genetik-Perspektive und ist ein wesentlicher erster Schritt, um die Gemeinschaftsentwicklung zu demonstrieren. (5) Gemeinschafts-Genetik erfordert und fördert einen integrativen Ansatz, von Genen bis zu Ökosystemen, der für die Verschmelzung von Ökologie und Genetik notwendig ist. Wenige Studien erstrecken sich von Genen bis zu Ökosystemen, aber eine solche Integration ist wahrscheinlich unerlässlich, um die natürliche Welt zu verstehen. Korrespondierender Herausgeber: A. A. Agrawal",
    url = "https://doi.org/10.1890/0012-9658(2003)084[0559:caegac]2.0.co;2",
    doi = "10.1890/0012-9658(2003)084[0559:caegac]2.0.co;2",
    openalex = "W2108013961",
    references = "doi101016s0169534701022832, doi101046j14390388200200356x, doi101086410450, doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi1015159780691185507, doi1023072408842, doi1023072529912, doi1023072531471, doi107208chicago97802264249720010001, doi107208chicago97802267976700010001, goodnight1992contextual, openalexw2798374369"
}

Mit seiner theoretischen Grundlage, die fest in der molekularen evolutionären und Populationsgenetik verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution und der Inferenz der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, bedingt durch die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken sowie neuartigen statistischen und computergestützten Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für automatisches und manuelles Sequenzalignment, webbasierte Datenbanksuche, Inferenz phylogenetischer Bäume, Schätzung evolutionärer Distanzen und Testung evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.

@article{doi101093bib52150,
    author = "Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA3: Integrierte Software für die Analyse der molekularen Evolutionären Genetik und Sequenzierung sowie Sequenzalignment",
    year = "2004",
    journal = "Briefings in Bioinformatics",
    abstract = "Mit seiner theoretischen Grundlage, die fest in der molekularen evolutionären und Populationsgenetik verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution und der Inferenz der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, bedingt durch die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken sowie neuartigen statistischen und computergestützten Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für automatisches und manuelles Sequenzalignment, webbasierte Datenbanksuche, Inferenz phylogenetischer Bäume, Schätzung evolutionärer Distanzen und Testung evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150",
    doi = "10.1093/bib/5.2.150",
    openalex = "W2146396346",
    references = "doi101007bf01731581, doi101007bf02407308, doi101016b9781483232119500097, doi101093bioinformatics17121244, doi101093genetics1233585, doi101093nar22224673, doi101093nar25173389, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093oxfordjournalsmolbeva040343, doi101093oxfordjournalsmolbeva040410, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023072408678, doi1023072412074, doi105860choice392183, openalexw2032279931, openalexw3217097258"
}

Zusammenfassung Einzelne Menschen und Mitglieder verschiedener anderer Arten zeigen konsistente Unterschiede in Aggressivität, Schüchternheit, Geselligkeit und Aktivität. Solche intraspezifischen Verhaltensunterschiede wurden weitgehend als nicht-adaptive Variation angenommen, die sich um (möglicherweise) adaptive populationsdurchschnittliche Verhaltensweisen herum erstreckt. Dennoch, im Einklang mit jüngsten Forderungen, darwinistische Argumentation auf immer feinere Skalen biologischer Variation anzuwenden, skizzieren wir die Grundlagen einer adaptiven Theorie konsistenter individueller Verhaltensunterschiede. Unsere These basiert auf der Vorstellung, dass solche „Persönlichkeitsunterschiede" selektiert werden können, wenn Fitnessauszahlungen von sowohl den Häufigkeiten abhängen, mit denen konkurrierende Strategien gespielt werden, als auch der Verhaltensgeschichte eines Individuums. Zu diesem Zweck überblicken wir bestehende Modelle, die dies veranschaulichen, und schlagen einen spieltheoretischen Ansatz zur Analyse von Persönlichkeitsunterschieden vor, der sowohl dynamisch als auch zustandsabhängig ist. Unsere Motivation besteht darin, Einblicke in die Evolution und Aufrechterhaltung eines scheinbar gemeinsamen tierischen Merkmals zu liefern: Persönlichkeit, die weitreichende ökologische und evolutionäre Implikationen hat.

@article{doi101111j14610248200400618x,
    author = "Dall, Sasha R. X. und Houston, Alasdair I. und McNamara, John M.",
    title = "The behavioural ecology of personality: consistent individual differences from an adaptive perspective",
    year = "2004",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Zusammenfassung Einzelne Menschen und Mitglieder verschiedener anderer Arten zeigen konsistente Unterschiede in Aggressivität, Schüchternheit, Geselligkeit und Aktivität. Solche intraspezifischen Verhaltensunterschiede wurden weitgehend als nicht-adaptive Variation angenommen, die sich um (möglicherweise) adaptive populationsdurchschnittliche Verhaltensweisen herum erstreckt. Dennoch, im Einklang mit jüngsten Forderungen, darwinistische Argumentation auf immer feinere Skalen biologischer Variation anzuwenden, skizzieren wir die Grundlagen einer adaptiven Theorie konsistenter individueller Verhaltensunterschiede. Unsere These basiert auf der Vorstellung, dass solche „Persönlichkeitsunterschiede" selektiert werden können, wenn Fitnessauszahlungen von sowohl den Häufigkeiten abhängen, mit denen konkurrierende Strategien gespielt werden, als auch der Verhaltensgeschichte eines Individuums. Zu diesem Zweck überblicken wir bestehende Modelle, die dies veranschaulichen, und schlagen einen spieltheoretischen Ansatz zur Analyse von Persönlichkeitsunterschieden vor, der sowohl dynamisch als auch zustandsabhängig ist. Unsere Motivation besteht darin, Einblicke in die Evolution und Aufrechterhaltung eines scheinbar gemeinsamen tierischen Merkmals zu liefern: Persönlichkeit, die weitreichende ökologische und evolutionäre Implikationen hat.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2004.00618.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2004.00618.x",
    openalex = "W1980446206",
    references = "doi101023a1012294324713, openalexw1973833797"
}

Zusammenfassung genalex ist ein benutzerfreundliches, plattformübergreifendes Paket, das innerhalb von Microsoft Excel läuft und populationsgenetische Analysen von kodominanten, haploiden und binären Daten ermöglicht. Analysen auf Basis der Allelfrequenz umfassen Heterozygotie, F-Statistiken, genetische Distanz nach Nei, Zuordnung von Populationen, Identitätswahrscheinlichkeiten und paarweise Verwandtschaft. Distanzbasierte Berechnungen umfassen amova, Hauptkoordinatenanalyse (PCA), Mantel-Tests, multivariate und 2D-Räumliche Autokorrelation sowie twogener. Mehr als 20 verschiedene Diagramme fassen Daten zusammen und unterstützen die Exploration. Sequenz- und Genotypdaten können von automatisierten Sequenzierern importiert und in andere Software exportiert werden. Ursprünglich als Lehrwerkzeug konzipiert, bietet genalex 6 nun auch Funktionen für Forscher. Dokumentation und das Programm sind unter http://www.anu.edu.au/BoZo/GenAlEx/ verfügbar.

@article{doi101111j14718286200501155x,
    author = "Peakall, Rod und Smouse, Peter E.",
    title = "genalex 6: genetische Analyse in Excel. Populationsgenetische Software für Lehre und Forschung",
    year = "2005",
    journal = "Molecular Ecology Notes",
    abstract = "Zusammenfassung genalex ist ein benutzerfreundliches, plattformübergreifendes Paket, das innerhalb von Microsoft Excel läuft und populationsgenetische Analysen von kodominanten, haploiden und binären Daten ermöglicht. Analysen auf Basis der Allelfrequenz umfassen Heterozygotie, F-Statistiken, genetische Distanz nach Nei, Zuordnung von Populationen, Identitätswahrscheinlichkeiten und paarweise Verwandtschaft. Distanzbasierte Berechnungen umfassen amova, Hauptkoordinatenanalyse (PCA), Mantel-Tests, multivariate und 2D-Räumliche Autokorrelation sowie twogener. Mehr als 20 verschiedene Diagramme fassen Daten zusammen und unterstützen die Exploration. Sequenz- und Genotypdaten können von automatisierten Sequenzierern importiert und in andere Software exportiert werden. Ursprünglich als Lehrwerkzeug konzipiert, bietet genalex 6 nun auch Funktionen für Forscher. Dokumentation und das Programm sind unter http://www.anu.edu.au/BoZo/GenAlEx/ verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x",
    doi = "10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x",
    openalex = "W2004444667",
    references = "doi101017s0016672300033620, doi101046j1365294x200301702x, doi101046j1365294x200402008x, doi101093genetics1312479, doi101093genetics15241753, doi101111j109583121999tb01157x, doi101111j1365294x1995tb00227x, doi101111j155856461989tb04226x, doi1023071942552, doi1023072413122"
}

Arlequin ver 3.0 ist ein Softwarepaket, das mehrere grundlegende und fortgeschrittene Methoden zur Datenanalyse in der Populationsgenetik integriert, wie die Berechnung von Standardindizes für genetische Vielfalt, die Schätzung von Allel- und Haplotyp-Frequenzen, Tests auf Abweichung vom Linkage-Gleichgewicht, Abweichung von selektiver Neutralität und demografischem Gleichgewicht, Schätzung von Parametern aus vergangenen Populationsexpansionen sowie gründliche Analysen der Populationsaufteilung im Rahmen des AMOVA-Konzepts. Arlequin 3 führt eine völlig neue grafische Oberfläche ein, die in C++ geschrieben wurde, eine robustere semantische Analyse von Eingabedateien und zwei neue Methoden: eine bayesianische Schätzung des gametischen Phasens aus Multi-Locus-Genotypen sowie eine Schätzung der Parameter einer instantanen räumlichen Expansion aus DNA-Sequenz-Polymorphismus. Arlequin kann verschiedene Datentypen verarbeiten wie DNA-Sequenzen, Mikrosatelliten-Daten oder Standard-Multi-Locus-Genotypen. Eine Windows-Version der Software ist kostenlos unter http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3 verfügbar.

@article{doi101177117693430500100003,
    author = "Excoffier, Laurent und Laval, Guillaume und Schneider, Stefan",
    title = "Arlequin (Version 3.0): Ein integriertes Softwarepaket zur Datenanalyse in der Populationsgenetik",
    year = "2005",
    journal = "Evolutionary Bioinformatics",
    abstract = "Arlequin ver 3.0 ist ein Softwarepaket, das mehrere grundlegende und fortgeschrittene Methoden zur Datenanalyse in der Populationsgenetik integriert, wie die Berechnung von Standardindizes für genetische Vielfalt, die Schätzung von Allel- und Haplotyp-Frequenzen, Tests auf Abweichung vom Linkage-Gleichgewicht, Abweichung von selektiver Neutralität und demografischem Gleichgewicht, Schätzung von Parametern aus vergangenen Populationsexpansionen sowie gründliche Analysen der Populationsaufteilung im Rahmen des AMOVA-Konzepts. Arlequin 3 führt eine völlig neue grafische Oberfläche ein, die in C++ geschrieben wurde, eine robustere semantische Analyse von Eingabedateien und zwei neue Methoden: eine bayesianische Schätzung des gametischen Phasens aus Multi-Locus-Genotypen sowie eine Schätzung der Parameter einer instantanen räumlichen Expansion aus DNA-Sequenz-Polymorphismus. Arlequin kann verschiedene Datentypen verarbeiten wie DNA-Sequenzen, Mikrosatelliten-Daten oder Standard-Multi-Locus-Genotypen. Eine Windows-Version der Software ist kostenlos unter http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3 verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1177/117693430500100003",
    doi = "10.1177/117693430500100003",
    openalex = "W4239149238",
    references = "doi101093bioinformaticsbtg359, doi101093genetics1053767, doi101093genetics1233585, doi101093genetics1312479, doi101093genetics1391457, doi101093genetics1472915, doi101093oxfordjournalsjhereda111573"
}

Die Interaktion zwischen Individuen ist universell, sowohl bei Tieren als auch bei Pflanzen, und beeinflusst die Evolution natürlicher Populationen sowie die Reaktion auf künstliche Selektion in der Landwirtschaft erheblich. Obwohl die quantitative Genetik erfolgreich auf viele Merkmale angewendet wurde, bietet sie keine allgemeine Theorie, die die Interaktion zwischen Individuen und die Selektion auf mehreren Ebenen erklärt. Folglich versagt die aktuelle quantitative genetische Theorie darin zu erklären, warum einige Merkmale nicht auf die Selektion zwischen Individuen reagieren, aber stark auf die Selektion zwischen Gruppen reagieren. Das Verständnis der vollen Auswirkungen vererbbarer Interaktionen auf die Ergebnisse der Selektion erfordert einen quantitativen genetischen Rahmen, der alle Ebenen der Selektion und Verwandtschaft einschließt. Hier präsentieren wir einen solchen Rahmen und liefern Ausdrücke für die Reaktion auf die Selektion. Die Ergebnisse zeigen, dass die Interaktion zwischen Individuen erhebliche vererbliche Variationen erzeugen kann, die für klassische Analysen unsichtbar bleiben. Die Selektion auf höheren Organisationsstufen erfasst diese versteckte Variation und liefert daher immer eine positive Reaktion, während die individuelle Selektion eine Reaktion in die entgegengesetzte Richtung liefern kann. Unsere Arbeit liefert überprüfbare Vorhersagen zur Reaktion auf die multilevel Selektion und reduziert sich in Abwesenheit von Interaktion auf die klassische Theorie. Die bereitgestellte statistische Methodik ermöglicht die empirische Anwendung unserer Arbeit sowohl auf natürliche als auch auf domestizierte Populationen.

@article{doi101534genetics106062711,
    author = "Bijma, Piter and Muir, William M. and van Arendonk, J.A.M.",
    title = "Multilevel Selection 1: Quantitative Genetics of Inheritance and Response to Selection",
    year = "2006",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Interaction among individuals is universal, both in animals and in plants, and substantially affects evolution of natural populations and responses to artificial selection in agriculture. Although quantitative genetics has successfully been applied to many traits, it does not provide a general theory accounting for interaction among individuals and selection acting on multiple levels. Consequently, current quantitative genetic theory fails to explain why some traits do not respond to selection among individuals, but respond greatly to selection among groups. Understanding the full impacts of heritable interactions on the outcomes of selection requires a quantitative genetic framework including all levels of selection and relatedness. Here we present such a framework and provide expressions for the response to selection. Results show that interaction among individuals may create substantial heritable variation, which is hidden to classical analyses. Selection acting on higher levels of organization captures this hidden variation and therefore always yields positive response, whereas individual selection may yield response in the opposite direction. Our work provides testable predictions of response to multilevel selection and reduces to classical theory in the absence of interaction. Statistical methodology provided elsewhere enables empirical application of our work to both natural and domestic populations.",
    url = "https://doi.org/10.1534/genetics.106.062711",
    doi = "10.1534/genetics.106.062711",
    openalex = "W2132362070",
    references = "cooper2004group, doi1010160022519364900384, doi101016s0065345408603526, doi101038238413a0, doi10103835012234, doi101046j14390388200200356x, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461965tb01731x, doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi1023072408842, doi1023072529912, doi105962bhltitle27468, goodnight1992contextual"
}

Stimmung beschreibt die Idee, dass individuelle Verhaltensunterschiede über die Zeit und in verschiedenen Situationen wiederholbar sind. Dieses gemeinsame Phänomen umfasst zahlreiche Merkmale, wie Aggressivität, Vermeidung von Neuem, Bereitschaft, Risiken einzugehen, Erkundung und Sozialität. Die Erforschung der Stimmung ist zentral für die Tierpsychologie, das verhaltensgenetische Forschung, die Pharmakologie und die Tierhaltung, aber relativ wenige Studien haben die Ökologie und Evolution von Stimmungsmerkmalen untersucht. Diese Situation ist überraschend, da die Stimmung wahrscheinlich einen wichtigen Einfluss auf viele Aspekte der Tierökologie und -evolution ausübt und die individuelle Variation in der Stimmung bei Tierarten weit verbreitet zu sein scheint. Mögliche Erklärungen für dieses Missachten der Stimmung umfassen eine wahrgenommene Irrelevanz, ein unzureichendes Verständnis des Zusammenhangs zwischen Stimmungsmerkmalen und Fitness sowie ein Mangel an Kohärenz in der Terminologie, bei dem ähnliche Merkmale oft unterschiedliche Namen erhalten oder unterschiedliche Merkmale denselben Namen. Wir schlagen vor, dass Stimmung innerhalb eines evolutionären ökologischen Rahmens untersucht werden kann und sollte und stellen eine Terminologie bereit, die als Arbeitsinstrument für ökologische Studien der Stimmung verwendet werden könnte. Unsere Terminologie umfasst fünf Hauptkategorien von Stimmungsmerkmalen: Scheu-Wagemut, Erkundung-Vermeidung, Aktivität, Sozialität und Aggressivität. Diese Terminologie macht keine Rückschlüsse auf zugrunde liegende Dispositionen oder psychologische Prozesse, die Ökologen und Evolutionsbiologen möglicherweise daran gehindert haben, an diesen Merkmalen zu arbeiten. Wir präsentieren umfangreiche Literaturübersichten, die zeigen, dass Stimmungsmerkmale vererbbar sind und mit Fitness sowie mit mehreren anderen Merkmalen verbunden sind, die für Ökologie und Evolution von Bedeutung sind. Darüber hinaus beschreiben wir ökologisch relevante Messmethoden und weisen auf mehrere ökologische und evolutionäre Themen hin, die davon profitieren würden, die Stimmung zu berücksichtigen, wie phänotypische Plastizität, Naturschutzbiologie, Populationsstichproben und Invasionsbiologie.

@article{doi101111j1469185x200700010x,
    author = "Réale, D. und Reader, S. und Sol, D. und McDougall, P. T. und Dingemanse, N.",
    title = "Integration von Tierstimmung in Ökologie und Evolution",
    year = "2007",
    journal = "Biological Reviews",
    abstract = "Stimmung beschreibt die Idee, dass individuelle Verhaltensunterschiede über die Zeit und in verschiedenen Situationen wiederholbar sind. Dieses gemeinsame Phänomen umfasst zahlreiche Merkmale, wie Aggressivität, Vermeidung von Neuem, Bereitschaft, Risiken einzugehen, Erkundung und Sozialität. Die Erforschung der Stimmung ist zentral für die Tierpsychologie, das verhaltensgenetische Forschung, die Pharmakologie und die Tierhaltung, aber relativ wenige Studien haben die Ökologie und Evolution von Stimmungsmerkmalen untersucht. Diese Situation ist überraschend, da die Stimmung wahrscheinlich einen wichtigen Einfluss auf viele Aspekte der Tierökologie und -evolution ausübt und die individuelle Variation in der Stimmung bei Tierarten weit verbreitet zu sein scheint. Mögliche Erklärungen für dieses Missachten der Stimmung umfassen eine wahrgenommene Irrelevanz, ein unzureichendes Verständnis des Zusammenhangs zwischen Stimmungsmerkmalen und Fitness sowie ein Mangel an Kohärenz in der Terminologie, bei dem ähnliche Merkmale oft unterschiedliche Namen erhalten oder unterschiedliche Merkmale denselben Namen. Wir schlagen vor, dass Stimmung innerhalb eines evolutionären ökologischen Rahmens untersucht werden kann und sollte und stellen eine Terminologie bereit, die als Arbeitsinstrument für ökologische Studien der Stimmung verwendet werden könnte. Unsere Terminologie umfasst fünf Hauptkategorien von Stimmungsmerkmalen: Scheu-Wagemut, Erkundung-Vermeidung, Aktivität, Sozialität und Aggressivität. Diese Terminologie macht keine Rückschlüsse auf zugrunde liegende Dispositionen oder psychologische Prozesse, die Ökologen und Evolutionsbiologen möglicherweise daran gehindert haben, an diesen Merkmalen zu arbeiten. Wir präsentieren umfangreiche Literaturübersichten, die zeigen, dass Stimmungsmerkmale vererbbar sind und mit Fitness sowie mit mehreren anderen Merkmalen verbunden sind, die für Ökologie und Evolution von Bedeutung sind. Darüber hinaus beschreiben wir ökologisch relevante Messmethoden und weisen auf mehrere ökologische und evolutionäre Themen hin, die davon profitieren würden, die Stimmung zu berücksichtigen, wie phänotypische Plastizität, Naturschutzbiologie, Populationsstichproben und Invasionsbiologie.",
    url = "https://dspace.library.uu.nl/bitstream/handle/1874/25732/reader\_07\_integratinganimaltemperament.pdf?sequence=1\&isAllowed=y",
    doi = "10.1111/j.1469-185X.2007.00010.x",
    is_oa = "true",
    number = "2",
    pages = "291-318",
    semanticscholar_citation_count = "3268",
    semanticscholar_id = "6c8a3a23a9dda76402597d002ba0ca649befabe0",
    volume = "82"
}

Arlequin ver 3.0 ist ein Softwarepaket, das mehrere grundlegende und fortgeschrittene Methoden zur Populationsgenetik-Datenanalyse integriert, wie die Berechnung standardisierter genetischer Diversitätsindizes, die Schätzung von Allel- und Haplotyp-Frequenzen, Tests auf Abweichung vom Linkage-Gleichgewicht, Abweichung von selektiver Neutralität und demografischem Gleichgewicht, Schätzung von Parametern aus vergangenen Populationsexpansionen sowie gründliche Analysen der Populationsaufteilung im Rahmen des AMOVA-Konzepts. Arlequin 3 führt eine völlig neue grafische Oberfläche ein, die in C++ geschrieben wurde, eine robustere semantische Analyse von Eingabedateien und zwei neue Methoden: eine bayesianische Schätzung des gametischen Phasens aus Multi-Locus-Genotypen sowie eine Schätzung der Parameter einer instantanen räumlichen Expansion aus DNA-Sequenz-Polymorphismus. Arlequin kann verschiedene Datentypen verarbeiten wie DNA-Sequenzen, Mikrosatelliten-Daten oder standardisierte Multi-Locus-Genotypen. Eine Windows-Version der Software ist kostenlos verfügbar unter http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.

@article{openalexw2119799171,
    author = "Excoffier, Laurent und Laval, Guillaume und Schneider, Stefan",
    title = "Arlequin (Version 3.0): ein integriertes Softwarepaket zur Populationsgenetik-Datenanalyse.",
    year = "2007",
    journal = "PubMed",
    abstract = "Arlequin ver 3.0 ist ein Softwarepaket, das mehrere grundlegende und fortgeschrittene Methoden zur Populationsgenetik-Datenanalyse integriert, wie die Berechnung standardisierter genetischer Diversitätsindizes, die Schätzung von Allel- und Haplotyp-Frequenzen, Tests auf Abweichung vom Linkage-Gleichgewicht, Abweichung von selektiver Neutralität und demografischem Gleichgewicht, Schätzung von Parametern aus vergangenen Populationsexpansionen sowie gründliche Analysen der Populationsaufteilung im Rahmen des AMOVA-Konzepts. Arlequin 3 führt eine völlig neue grafische Oberfläche ein, die in C++ geschrieben wurde, eine robustere semantische Analyse von Eingabedateien und zwei neue Methoden: eine bayesianische Schätzung des gametischen Phasens aus Multi-Locus-Genotypen sowie eine Schätzung der Parameter einer instantanen räumlichen Expansion aus DNA-Sequenz-Polymorphismus. Arlequin kann verschiedene Datentypen verarbeiten wie DNA-Sequenzen, Mikrosatelliten-Daten oder standardisierte Multi-Locus-Genotypen. Eine Windows-Version der Software ist kostenlos verfügbar unter http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.",
    openalex = "W2119799171",
    references = "doi101093bioinformaticsbtg359, doi101093genetics1053767, doi101093genetics1233585, doi101093genetics1312479, doi101093genetics1391457, doi101093genetics1472915, doi101093oxfordjournalsjhereda111573, doi101093oxfordjournalsjhereda111627, doi101093oxfordjournalsmolbeva040727, doi101111j155856461995tb04456x, doi1023072409372, doi1023072532296"
}

Diese Einleitung zum Themenheft über evolutionäre und ökologische Ansätze zur Erforschung der Persönlichkeit bietet einen Überblick über konzeptionellen, theoretischen und methodischen Fortschritt in der Forschung zu tierischen Persönlichkeiten über das letzte Jahrzehnt und setzt die Beiträge zu diesem Band in den Kontext. Das Heft hat drei Hauptziele. Erstens wollten wir Theoretiker zusammenbringen, um zur Entwicklung von Modellen beizutragen, die adaptive Erklärungen für tierische Persönlichkeit bieten, die Empiriker leiten und den Austausch von Ideen zwischen den beiden Forschergruppen anregen können. Zweitens wollten wir die gegenseitige Befruchtung zwischen verschiedenen wissenschaftlichen Feldern, die Persönlichkeit untersuchen, nämlich Verhaltensökologie, Psychologie, Genomik, quantitative Genetik, Neuroendokrinologie und Entwicklungsbiologie, anregen. Drittens wollten wir die Anwendung eines evolutionären Rahmens auf die Erforschung der Persönlichkeit fördern.

@article{doi101098rstb20100222,
    author = "Réale, Denis und Dingemanse, Niels J. und Kazem, Anahita J.N. und Wright, Jonathan",
    title = "Evolutionäre und ökologische Ansätze zur Erforschung der Persönlichkeit",
    year = "2010",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Diese Einleitung zum Themenheft über evolutionäre und ökologische Ansätze zur Erforschung der Persönlichkeit bietet einen Überblick über konzeptionellen, theoretischen und methodischen Fortschritt in der Forschung zu tierischen Persönlichkeiten über das letzte Jahrzehnt und setzt die Beiträge zu diesem Band in den Kontext. Das Heft hat drei Hauptziele. Erstens wollten wir Theoretiker zusammenbringen, um zur Entwicklung von Modellen beizutragen, die adaptive Erklärungen für tierische Persönlichkeit bieten, die Empiriker leiten und den Austausch von Ideen zwischen den beiden Forschergruppen anregen können. Zweitens wollten wir die gegenseitige Befruchtung zwischen verschiedenen wissenschaftlichen Feldern, die Persönlichkeit untersuchen, nämlich Verhaltensökologie, Psychologie, Genomik, quantitative Genetik, Neuroendokrinologie und Entwicklungsbiologie, anregen. Drittens wollten wir die Anwendung eines evolutionären Rahmens auf die Erforschung der Persönlichkeit fördern.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2010.0222",
    doi = "10.1098/rstb.2010.0222",
    openalex = "W2170542651",
    references = "doi101073pnas931910262"
}

Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen auf die Natur und das Ausmaß der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von essentieller Bedeutung. Hiermit verkünden wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5), einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, der Biomedizin und der Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen die ML-Baumschließungsalgorithmen in MEGA5 in Bezug auf die Recheneffizienz und die Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen den Sites günstig mit anderen Softwarepaketen. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun so erweitert, dass sie aktivitätsgetrieben ist, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X- und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net erhältlich.

@article{doi101093molbevmsr121,
    author = "Tamura, Koichiro und Peterson, Daniel G. und Peterson, Nora und Stecher, Glen und Nei, M und Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen auf die Natur und das Ausmaß der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von essentieller Bedeutung. Hiermit verkünden wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5), einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, der Biomedizin und der Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen die ML-Baumschließungsalgorithmen in MEGA5 in Bezug auf die Recheneffizienz und die Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen den Sites günstig mit anderen Softwarepaketen. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun so erweitert, dass sie aktivitätsgetrieben ist, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X- und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net erhältlich.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msr121",
    doi = "10.1093/molbev/msr121",
    openalex = "W2132632499",
    references = "doi101007bf01734359, doi101007bf02101694, doi10108010635150390235520, doi10108010635150490522304, doi101093bioinformatics149817, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet762297, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093sysbiosyq010, doi101111j155856461985tb00420x, doi101186147121055113, openalexw3217097258"
}

Diese Übersicht untersucht den Beitrag der Forschung an Fischen zum wachsenden Feld der Verhaltenssyndrome. Der aktuelle Wissensstand über Verhaltenssyndrome bei Fischen wird im Hinblick auf fünf Hauptachsen der Tierpersönlichkeit überprüft: (1) Scheu-Wagemut, (2) Erkundung-Vermeidung, (3) Aktivität, (4) Aggressivität und (5) Sozialität. Im Vergleich zu anderen Taxa hat die Forschung an Fischen eine führende Rolle bei der Beschreibung der scheu-wagemutigen Persönlichkeitsachse gespielt und innovative Beiträge zur Untersuchung der Sozialitätsdimension geleistet, indem sie die Sozialnetzwerktheorie einbezog. Fische sind praktisch das einzige große Taxon, bei dem Verhaltenskorrelationen zwischen Populationen verglichen wurden. Diese Forschung hat das Feld bei der Untersuchung, wie Variationen im Selektionsregime die Persönlichkeit formen können, geleitet. Die jüngste Forschung an Fischen hat zudem wichtige Fortschritte beim Verständnis der genetischen und neuroendokrinen Grundlagen von Verhaltenssyndromen gemacht, indem Ansätze verwendet wurden, die künstliche Selektion, genetische Kartierung, Kandidatengene und funktionelle Genomik umfassen. Diese Arbeit hat eine konsistente individuelle Variation in hochkomplexen neuroendokrinen und Genexpressionswegen veranschaulicht. Im Gegensatz dazu wurde die ontogenetische Stabilität von Verhaltenssyndromen oder deren Fitnessfolgen bei Fischen relativ wenig untersucht. Schließlich kann die Anwendung eines Verhaltenssyndrom-Rahmens bei Fragen des Fischereimanagements, einschließlich künstlicher Vermehrung, Habitatrestaurierung und invasiver Arten, den Wiederherstellungserfolg fördern. Wenige Studien haben jedoch die ökologische Relevanz von Verhaltenssyndromen im Feld untersucht. Kenntnisse darüber, wie Verhaltenssyndrome in der Wildnis ablaufen, werden entscheidend sein, um einen solchen Rahmen in Managementpraktiken einzubeziehen.

@article{doi101111j10958649201002874x,
    author = "Conrad, J. Louise und Weinersmith, Kelly L. und Brodin, Tomas und Saltz, Julia B. und Sih, Andrew",
    title = "Behavioural syndromes in fishes: a review with implications for ecology and fisheries management",
    year = "2011",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Diese Übersicht untersucht den Beitrag der Forschung an Fischen zum wachsenden Feld der Verhaltenssyndrome. Der aktuelle Wissensstand über Verhaltenssyndrome bei Fischen wird im Hinblick auf fünf Hauptachsen der Tierpersönlichkeit überprüft: (1) Scheu-Wagemut, (2) Erkundung-Vermeidung, (3) Aktivität, (4) Aggressivität und (5) Sozialität. Im Vergleich zu anderen Taxa hat die Forschung an Fischen eine führende Rolle bei der Beschreibung der scheu-wagemutigen Persönlichkeitsachse gespielt und innovative Beiträge zur Untersuchung der Sozialitätsdimension geleistet, indem sie die Sozialnetzwerktheorie einbezog. Fische sind praktisch das einzige große Taxon, bei dem Verhaltenskorrelationen zwischen Populationen verglichen wurden. Diese Forschung hat das Feld bei der Untersuchung, wie Variationen im Selektionsregime die Persönlichkeit formen können, geleitet. Die jüngste Forschung an Fischen hat zudem wichtige Fortschritte beim Verständnis der genetischen und neuroendokrinen Grundlagen von Verhaltenssyndromen gemacht, indem Ansätze verwendet wurden, die künstliche Selektion, genetische Kartierung, Kandidatengene und funktionelle Genomik umfassen. Diese Arbeit hat eine konsistente individuelle Variation in hochkomplexen neuroendokrinen und Genexpressionswegen veranschaulicht. Im Gegensatz dazu wurde die ontogenetische Stabilität von Verhaltenssyndromen oder deren Fitnessfolgen bei Fischen relativ wenig untersucht. Schließlich kann die Anwendung eines Verhaltenssyndrom-Rahmens bei Fragen des Fischereimanagements, einschließlich künstlicher Vermehrung, Habitatrestaurierung und invasiver Arten, den Wiederherstellungserfolg fördern. Wenige Studien haben jedoch die ökologische Relevanz von Verhaltenssyndromen im Feld untersucht. Kenntnisse darüber, wie Verhaltenssyndrome in der Wildnis ablaufen, werden entscheidend sein, um einen solchen Rahmen in Managementpraktiken einzubeziehen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2010.02874.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8649.2010.02874.x",
    openalex = "W2144863680",
    references = "doi101016jtree200806001, doi101093behecoarp018"
}

Neueste Verbesserungen der Geschwindigkeit, Kosten und Genauigkeit der Sequenzierung der nächsten Generation revolutionieren die Entdeckung von Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs). SNPs werden zunehmend als Ergänzung zum Werkzeugkasten der Molekulärekologie bei nichtmodellorganismen eingesetzt, doch ihre effiziente Nutzung bleibt herausfordernd. Hier diskutieren wir gemeinsame Probleme bei der Anwendung von SNP-Markern, einschließlich der hohen Anzahl von Markern, die typischerweise eingesetzt werden, der Auswirkungen der Ascerting-Bias und der Einbeziehung nichtneutraler Loci in ein Marker-Panel. Wir bieten eine Kritik von Überlegungen, die speziell mit der Anwendung und der Populationsgenetischen Analyse von SNPs in nichtmodelltaxa verbunden sind, wobei wir uns speziell auf einige der am häufigsten angewandten Methoden konzentrieren.

@article{doi101111j17550998201002943x,
    author = "Helyar, Sarah und Hemmer‐Hansen, Jakob und Bekkevold, Dorte und Taylor, MI und Ogden, Rob und Limborg, Morten T. und Cariani, Alessia und Maes, Gregory E. und Diopere, Eveline und Carvalho, G. R. und Nielsen, Einar Eg",
    title = "Anwendung von SNPs für die Populationsgenetik nichtmodellorganismen: neue Möglichkeiten und Herausforderungen",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "Neueste Verbesserungen der Geschwindigkeit, Kosten und Genauigkeit der Sequenzierung der nächsten Generation revolutionieren die Entdeckung von Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs). SNPs werden zunehmend als Ergänzung zum Werkzeugkasten der Molekulärekologie bei nichtmodellorganismen eingesetzt, doch ihre effiziente Nutzung bleibt herausfordernd. Hier diskutieren wir gemeinsame Probleme bei der Anwendung von SNP-Markern, einschließlich der hohen Anzahl von Markern, die typischerweise eingesetzt werden, der Auswirkungen der Ascerting-Bias und der Einbeziehung nichtneutraler Loci in ein Marker-Panel. Wir bieten eine Kritik von Überlegungen, die speziell mit der Anwendung und der Populationsgenetischen Analyse von SNPs in nichtmodelltaxa verbunden sind, wobei wir uns speziell auf einige der am häufigsten angewandten Methoden konzentrieren.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02943.x",
    doi = "10.1111/j.1755-0998.2010.02943.x",
    openalex = "W2155309921",
    references = "doi101093jheredesh074, doi101111j14718286200701931x"
}

HINTERGRUND UND ZIELE: Samen-Dormanz variiert innerhalb von Arten als Reaktion auf das Klima, sowohl langfristig (durch Ökotypen oder Kline) als auch kurzfristig (durch den Einfluss der Samenreifungsumgebung). Das Trennen beider Prozesse ist entscheidend, um die Anpassung von Pflanzen an Umweltveränderungen zu verstehen. In dieser Studie wurden die lokalen Muster der Samen-Dormanz bei einer schmal endemischen Art, Centaurium somedanum, untersucht, um den Einfluss der Samenreifungsumgebung, der populationsgenetischen Zusammensetzung und des Klimas zu bestimmen. METHODEN: Laborkeimungsexperimente wurden durchgeführt, um die Dormanz bei (1) Samen, die aus verschiedenen wilden Populationen entlang eines lokalen Höhengradienten gesammelt wurden, und (2) Samen einer nachfolgenden Generation, die in einem Gemeinschaftsgarten produziert wurden, zu messen. Die genetische Zusammensetzung der ursprünglichen Populationen wurde mittels Intersimple-Sequenz-Wiederholungs-PCR (ISSR-PCR) und Hauptkoordinatenanalyse (PCoA) charakterisiert, und ihre Korrelation mit den Dormanzmustern beider Generationen wurde analysiert. Der Einfluss des lokalen Klimas auf die Dormanz wurde ebenfalls modelliert. HAUPTERGEBNISSE: Bei den wilden Populationen wurde ein Höhen-Dormanz-Klin gefunden, der durch die im Gemeinschaftsgarten gewachsenen Pflanzen aufrechterhalten wurde. Allerdings reagierten Samen aus dem Gemeinschaftsgarten besser auf Stratifikation, und ihre Freisetzung aus der Dormanz war intensiver. Die Muster der Dormanzvariation korrelierten mit der genetischen Zusammensetzung, während niedrigere Temperaturen und Sommerniederschläge an den Populationsstandorten eine höhere Dormanz bei den Samen beider Generationen vorhersagten. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Der Dormanz-Klin bei C. somedanum ist mit einem lokalen Klimagradienten verbunden und entspricht auch der genetischen Differenzierung zwischen Populationen. Dieser Klin wird weiter durch die Wetterbedingungen während der Samenreifung beeinflusst, die die Empfänglichkeit für Dormanz-aufhebende Faktoren beeinflussen. Diese Ergebnisse zeigen, dass die Dormanz sowohl durch langfristige als auch kurzfristige klimatische Variationen beeinflusst wird. Solche Prozesse auf einer so reduzierten räumlichen Skala heben das Potenzial von Pflanzen hervor, sich an schnelle Umweltveränderungen anzupassen.

@article{doi101093aobmct154,
    author = "Fernández‐Pascual, Eduardo und Jiménez‐Alfaro, Borja und Caujapé‐Castells, Juli und Jaén‐Molina, Ruth und Díaz, Tomás E.",
    title = "Ein lokaler Dormanz-Klin ist mit der Samenreifungsumgebung, der populationsgenetischen Zusammensetzung und dem Klima verbunden",
    year = "2013",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "HINTERGRUND UND ZIELE: Samen-Dormanz variiert innerhalb von Arten als Reaktion auf das Klima, sowohl langfristig (durch Ökotypen oder Kline) als auch kurzfristig (durch den Einfluss der Samenreifungsumgebung). Das Trennen beider Prozesse ist entscheidend, um die Anpassung von Pflanzen an Umweltveränderungen zu verstehen. In dieser Studie wurden die lokalen Muster der Samen-Dormanz bei einer schmal endemischen Art, Centaurium somedanum, untersucht, um den Einfluss der Samenreifungsumgebung, der populationsgenetischen Zusammensetzung und des Klimas zu bestimmen. METHODEN: Laborkeimungsexperimente wurden durchgeführt, um die Dormanz bei (1) Samen, die aus verschiedenen wilden Populationen entlang eines lokalen Höhengradienten gesammelt wurden, und (2) Samen einer nachfolgenden Generation, die in einem Gemeinschaftsgarten produziert wurden, zu messen. Die genetische Zusammensetzung der ursprünglichen Populationen wurde mittels Intersimple-Sequenz-Wiederholungs-PCR (ISSR-PCR) und Hauptkoordinatenanalyse (PCoA) charakterisiert, und ihre Korrelation mit den Dormanzmustern beider Generationen wurde analysiert. Der Einfluss des lokalen Klimas auf die Dormanz wurde ebenfalls modelliert. HAUPTERGEBNISSE: Bei den wilden Populationen wurde ein Höhen-Dormanz-Klin gefunden, der durch die im Gemeinschaftsgarten gewachsenen Pflanzen aufrechterhalten wurde. Allerdings reagierten Samen aus dem Gemeinschaftsgarten besser auf Stratifikation, und ihre Freisetzung aus der Dormanz war intensiver. Die Muster der Dormanzvariation korrelierten mit der genetischen Zusammensetzung, während niedrigere Temperaturen und Sommerniederschläge an den Populationsstandorten eine höhere Dormanz bei den Samen beider Generationen vorhersagten. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Der Dormanz-Klin bei C. somedanum ist mit einem lokalen Klimagradienten verbunden und entspricht auch der genetischen Differenzierung zwischen Populationen. Dieser Klin wird weiter durch die Wetterbedingungen während der Samenreifung beeinflusst, die die Empfänglichkeit für Dormanz-aufhebende Faktoren beeinflussen. Diese Ergebnisse zeigen, dass die Dormanz sowohl durch langfristige als auch kurzfristige klimatische Variationen beeinflusst wird. Solche Prozesse auf einer so reduzierten räumlichen Skala heben das Potenzial von Pflanzen hervor, sich an schnelle Umweltveränderungen anzupassen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mct154",
    doi = "10.1093/aob/mct154",
    openalex = "W2171829639",
    references = "allen2002ecology"
}

Die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) hat sich weiterentwickelt und enthält nun eine umfangreiche Sammlung von Methoden und Werkzeugen der computergestützten molekularen Evolution. Hier beschreiben wir neue Ergänzungen, die MEGA zu einem umfassenderen Werkzeug für die Erstellung von Zeitbäumen von Arten, Krankheitserregern und Genfamilien mittels schneller Relaxed-Clock-Methoden machen. Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten und Konfidenzintervallen wurden implementiert, um Wahrscheinlichkeitsdichten für Kalibrierungsbedingungen bei Knoten-Datierungen und Sequenz-Samplings-Daten bei Spitzen-Datierungen-Analysen zu verwenden. Sie werden durch neue Optionen für das Taggen von Sequenzen mit räumlich-zeitlichen Samplings-Informationen, einen erweiterten interaktiven Knoten-Kalibrierungs-Editor und einen erweiterten Baum-Explorer zur Anzeige von Zeitbäumen unterstützt. Zudem wurde eine bayesianische Methode zur Schätzung neutraler evolutionärer Wahrscheinlichkeiten von Allelen in einer Art unter Verwendung von Mehrarten-Sequenzalignments und eine maschinelle Lernmethode zum Testen auf Autokorrelation evolutionärer Raten in Phylogenien hinzugefügt. Die Anforderungen an den Computer-Speicher für die Maximum-Likelihood-Analyse wurden durch Neuimplementierung erheblich reduziert, und die grafische Benutzeroberfläche wurde für sehr große Datensätze reaktionsschneller und interaktiver gestaltet. Diese Verbesserungen werden das Benutzererlebnis, die Qualität der Ergebnisse und das Tempo der biologischen Entdeckung verbessern. Native kompilierte grafische Benutzeroberflächen- und Kommandozeilen-Versionen von MEGA11 sind für Microsoft Windows, Linux und macOS unter www.megasoftware.net verfügbar.

@article{doi101093molbevmst197,
    author = "Tamura, Koichiro und Stecher, Glen und Peterson, Daniel S. und Filipski, Alan und Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0",
    year = "2013",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) hat sich weiterentwickelt und enthält nun eine umfangreiche Sammlung von Methoden und Werkzeugen der computergestützten molekularen Evolution. Hier beschreiben wir neue Ergänzungen, die MEGA zu einem umfassenderen Werkzeug für die Erstellung von Zeitbäumen von Arten, Krankheitserregern und Genfamilien mittels schneller Relaxed-Clock-Methoden machen. Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten und Konfidenzintervallen wurden implementiert, um Wahrscheinlichkeitsdichten für Kalibrierungsbedingungen bei Knoten-Datierungen und Sequenz-Samplings-Daten bei Spitzen-Datierungen-Analysen zu verwenden. Sie werden durch neue Optionen für das Taggen von Sequenzen mit räumlich-zeitlichen Samplings-Informationen, einen erweiterten interaktiven Knoten-Kalibrierungs-Editor und einen erweiterten Baum-Explorer zur Anzeige von Zeitbäumen unterstützt. Zudem wurde eine bayesianische Methode zur Schätzung neutraler evolutionärer Wahrscheinlichkeiten von Allelen in einer Art unter Verwendung von Mehrarten-Sequenzalignments und eine maschinelle Lernmethode zum Testen auf Autokorrelation evolutionärer Raten in Phylogenien hinzugefügt. Die Anforderungen an den Computer-Speicher für die Maximum-Likelihood-Analyse wurden durch Neuimplementierung erheblich reduziert, und die grafische Benutzeroberfläche wurde für sehr große Datensätze reaktionsschneller und interaktiver gestaltet. Diese Verbesserungen werden das Benutzererlebnis, die Qualität der Ergebnisse und das Tempo der biologischen Entdeckung verbessern. Native kompilierte grafische Benutzeroberflächen- und Kommandozeilen-Versionen von MEGA11 sind für Microsoft Windows, Linux und macOS unter www.megasoftware.net verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/mst197",
    doi = "10.1093/molbev/mst197",
    openalex = "W2152207030",
    references = "doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas1213199109, doi101093bib52150, doi101093bioinformatics102189, doi101093bioinformatics17121244, doi101093bioinformaticsbts507, doi101093molbevmsr121, doi101093oso97801951358480010001, doi101126science1211028, openalexw3217097258"
}

Ziel der Zusammenfassung: Unter Verwendung hochauflösender genetischer Marker an Proben, die über ihren weiten Verbreitungsbereich gesammelt wurden, unternahmen wir den Versuch, die Artenvielfalt bei riffbildenden Pocillopora-Korallen abzugrenzen. Sie sind häufig, ökologisch bedeutsam und im gesamten Indopazifik weit verbreitet, doch ihre phänotypische Plastizität als Reaktion auf Umweltbedingungen und ihre nahezu strukturlosen Mikroskelettstrukturen erschweren taxonomische Zuordnungen und begrenzen das Verständnis ihrer Ökologie und Evolution. Standort: Indopazifik, Rotes Meer, Arabisches/Persisches Golf. Methoden: Sequenzanalyse von nukleären ribosomalen (internes transkribiertes Spacer 2, ITS 2) und mitochondrialen (offener Leserahmen) Loci wurden mit populationsgenetischen Daten (sieben Mikrosatelliten-Loci) für Pocillopora-Proben kombiniert, die im gesamten Indopazifik, Roten Meer und Arabischen Golf gesammelt wurden, um die evolutionäre Divergenz, reproduktive Isolation, Häufigkeit von Hybridisierung und geografische Verteilungen der Gattung zu bewerten. Ergebnisse: Zwischen fünf und acht genetisch distinkte Linien, die Arten vergleichbar sind, wurden identifiziert, mit minimaler oder keiner Hybridisierung zwischen ihnen. Die Kolonienmorphologie war im gesamten Umfang der Stichproben im Allgemeinen inkongruent mit der Genetik, und die Gesamtzahl der Arten scheint mit niedrigeren Schätzungen aus konkurrierenden, morphologisch basierten Hypothesen (etwa sieben oder acht Taxa) übereinzustimmen. Die am häufigsten vorkommenden genetischen Linien waren weit verbreitet und zeigten hohe Ausbreitung und Genfluss, Faktoren, die wahrscheinlich allopatrische Artbildung minimiert haben. Einzigartig unter den Scleractinia-Gattungen enthält diese Gattung eine monophyletische Gruppe von Broadcast-Spawner, die kürzlich von einem ancestralen Brooder abstammen. Hauptfolgerungen: Die Abgrenzung der Artenvielfalt, geleitet durch Genetik, fördert grundlegend unser Verständnis der geografischen Verteilungen, Ökologie und Evolution von Pocillopora. Da traditionelle diagnostische Merkmale der Kolonien- und Astmorphologie sich als von begrenzter Nützlichkeit erweisen, sollte die Identifizierung von Pocillopora-Arten für zukünftige ökologische und experimentelle Arbeiten auf genetische Merkmale basieren, die die Forschung verbessern und bei Erhaltungsstrategien für diese und andere riffbildende Korallen helfen, einschließlich der Erkennung von echten und falschen endemischen Populationen.

@article{doi101111jbi12110,
    author = "Pinzón, Jorge H. and Sampayo, Eugenia M. and Cox, Evelyn F. and Chauka, Leonard J. and Chen, Chaolun Allen and Voolstra, Christian R. and LaJeunesse, Todd C.",
    title = "Blind to morphology: genetics identifies several widespread ecologically common species and few endemics among Indo‐Pacific cauliflower corals (Pocillopora, Scleractinia)",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Biogeography",
    abstract = "Ziel der Zusammenfassung: Unter Verwendung hochauflösender genetischer Marker an Proben, die über ihren weiten Verbreitungsbereich gesammelt wurden, unternahmen wir den Versuch, die Artenvielfalt bei riffbildenden Pocillopora-Korallen abzugrenzen. Sie sind häufig, ökologisch bedeutsam und im gesamten Indopazifik weit verbreitet, doch ihre phänotypische Plastizität als Reaktion auf Umweltbedingungen und ihre nahezu strukturlosen Mikroskelettstrukturen erschweren taxonomische Zuordnungen und begrenzen das Verständnis ihrer Ökologie und Evolution. Standort: Indopazifik, Rotes Meer, Arabisches/Persisches Golf. Methoden: Sequenzanalyse von nukleären ribosomalen (internes transkribiertes Spacer 2, ITS 2) und mitochondrialen (offener Leserahmen) Loci wurden mit populationsgenetischen Daten (sieben Mikrosatelliten-Loci) für Pocillopora-Proben kombiniert, die im gesamten Indopazifik, Roten Meer und Arabischen Golf gesammelt wurden, um die evolutionäre Divergenz, reproduktive Isolation, Häufigkeit von Hybridisierung und geografische Verteilungen der Gattung zu bewerten. Ergebnisse: Zwischen fünf und acht genetisch distinkte Linien, die Arten vergleichbar sind, wurden identifiziert, mit minimaler oder keiner Hybridisierung zwischen ihnen. Die Kolonienmorphologie war im gesamten Umfang der Stichproben im Allgemeinen inkongruent mit der Genetik, und die Gesamtzahl der Arten scheint mit niedrigeren Schätzungen aus konkurrierenden, morphologisch basierten Hypothesen (etwa sieben oder acht Taxa) übereinzustimmen. Die am häufigsten vorkommenden genetischen Linien waren weit verbreitet und zeigten hohe Ausbreitung und Genfluss, Faktoren, die wahrscheinlich allopatrische Artbildung minimiert haben. Einzigartig unter den Scleractinia-Gattungen enthält diese Gattung eine monophyletische Gruppe von Broadcast-Spawner, die kürzlich von einem ancestralen Brooder abstammen. Hauptfolgerungen: Die Abgrenzung der Artenvielfalt, geleitet durch Genetik, fördert grundlegend unser Verständnis der geografischen Verteilungen, Ökologie und Evolution von Pocillopora. Da traditionelle diagnostische Merkmale der Kolonien- und Astmorphologie sich als von begrenzter Nützlichkeit erweisen, sollte die Identifizierung von Pocillopora-Arten für zukünftige ökologische und experimentelle Arbeiten auf genetische Merkmale basieren, die die Forschung verbessern und bei Erhaltungsstrategien für diese und andere riffbildende Korallen helfen, einschließlich der Erkennung von echten und falschen endemischen Populationen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jbi.12110",
    doi = "10.1111/jbi.12110",
    openalex = "W2149681625",
    references = "doi101093bioinformatics178754, doi101093bioinformaticsbtm233, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16441567, doi101093nar22224673, doi101093oxfordjournalsjhereda111573, doi101111j1365294x200502553x, doi101111j14718286200501155x, doi101111j14718286200701931x, openalexw3217097258"
}

@incollection{falk2013population,
    author = "Falk, Donald A. und Richards, Christopher M. und Montalvo, Arlee M. und Knapp, Eric E.",
    title = "Population and Ecological Genetics in Restoration Ecology",
    year = "2013",
    booktitle = "Foundations of Restoration Ecology",
    url = "https://doi.org/10.2307/jj.41003482.7",
    doi = "10.2307/jj.41003482.7",
    openalex = "W7151974137",
    pages = "14-41"
}

Molekulare Studien waren entscheidend für die Verfeinerung der Artgrenzen in der Korallengattung Pocillopora und die Aufdeckung verborgener Artenvielfalt innerhalb der umfassend untersuchten globalen Art Pocillopora damicornis. Hier revidieren wir formell den taxonomischen Status von Arten, die eng mit dem P. damicornis-Artkomplex verwandt sind und innerhalb desselben liegen, unter Berücksichtigung sowohl genetischer Beweise als auch neuer Daten zur Morphometrie, einschließlich der Feinstruktur von Koralliten und Coenosteum. Wir stellten fest, dass mitochondriale molekulare Phylogenien mit Gruppen basierend auf der Grobmorphologie übereinstimmen und somit eine Art-Ebene-Differenzierung widerspiegeln. Allerdings verdecken hohe Grade der grobmorphologischen Plastizität und gemeinsame morphologische Merkmale eine klare Trennung für einige Gruppen. Feinstrukturelle morphologische Variationen, insbesondere die Form und der Typ der Columella, waren nützlich zur Unterscheidung zwischen Kladi und bieten ein hervorragendes Merkmal für die evolutionären Beziehungen zwischen genetischen Linien. Da introgressive Hybridisierung und unvollständige Linien-Sortierung die Abgrenzung von Arten innerhalb der Gattung auf Basis eines einzigen Artkonzepts erschweren, könnte das Unified Species Concept einen geeigneten Ansatz zur Revision der Pocillopora-Taxonomie darstellen. Acht Arten werden hier beschrieben (P. damicornis, P. acuta, P. aliciae, P. verrucosa, P. meandrina, P. eydouxi, P. cf. brevicornis), einschließlich eines neuen Taxons – Pocillopora bairdi sp. nov. (Schmidt-Roach, diese Studie). Zitationssynonyme und Typmaterialien werden vorgestellt. © 2014 The Linnean Society of London

@article{doi101111zoj12092,
    author = "Schmidt‐Roach, Sebastian und Miller, Karen J. und Lundgren, Petra und Andreakis, Nikos",
    title = "With eyes wide open: eine Revision der Arten innerhalb und eng verwandt mit dem Pocillopora damicornis-Artkomplex (Scleractinia; Pocilloporidae) unter Verwendung von Morphologie und Genetik",
    year = "2014",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Molekulare Studien waren entscheidend für die Verfeinerung der Artgrenzen in der Korallengattung Pocillopora und die Aufdeckung verborgener Artenvielfalt innerhalb der umfassend untersuchten globalen Art Pocillopora damicornis. Hier revidieren wir formell den taxonomischen Status von Arten, die eng mit dem P. damicornis-Artkomplex verwandt sind und innerhalb desselben liegen, unter Berücksichtigung sowohl genetischer Beweise als auch neuer Daten zur Morphometrie, einschließlich der Feinstruktur von Koralliten und Coenosteum. Wir stellten fest, dass mitochondriale molekulare Phylogenien mit Gruppen basierend auf der Grobmorphologie übereinstimmen und somit eine Art-Ebene-Differenzierung widerspiegeln. Allerdings verdecken hohe Grade der grobmorphologischen Plastizität und gemeinsame morphologische Merkmale eine klare Trennung für einige Gruppen. Feinstrukturelle morphologische Variationen, insbesondere die Form und der Typ der Columella, waren nützlich zur Unterscheidung zwischen Kladi und bieten ein hervorragendes Merkmal für die evolutionären Beziehungen zwischen genetischen Linien. Da introgressive Hybridisierung und unvollständige Linien-Sortierung die Abgrenzung von Arten innerhalb der Gattung auf Basis eines einzigen Artkonzepts erschweren, könnte das Unified Species Concept einen geeigneten Ansatz zur Revision der Pocillopora-Taxonomie darstellen. Acht Arten werden hier beschrieben (P. damicornis, P. acuta, P. aliciae, P. verrucosa, P. meandrina, P. eydouxi, P. cf. brevicornis), einschließlich eines neuen Taxons – Pocillopora bairdi sp. nov. (Schmidt-Roach, diese Studie). Zitationssynonyme und Typmaterialien werden vorgestellt. © 2014 The Linnean Society of London",
    url = "https://doi.org/10.1111/zoj.12092",
    doi = "10.1111/zoj.12092",
    openalex = "W2171806591",
    references = "doi101016jtree200401003, doi101017cbo9781139567411, doi10108010635150701701083, doi101093bioinformaticsbtn129, doi101093molbevmsm092, doi101093oxfordjournalsmolbeva026036, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101111j155856461985tb00420x, doi101111jbi12110, doi1023072408678, doi105860choice332723"
}

Moderne genetische Daten in Kombination mit geeigneten statistischen Methoden haben das Potenzial, erheblich zu unserem Verständnis der menschlichen Geschichte beizutragen. Wir haben einen Ansatz entwickelt, der die genomische Struktur von admixten Populationen nutzt, um historische Mischungsereignisse auf feiner Ebene zu datieren und zu charakterisieren. Wir haben dies genutzt, um einen Atlas der weltweiten menschlichen Admixture-Geschichte zu erstellen, der ausschließlich auf genetischen Daten basiert und über 100 Ereignisse umfasst, die in den letzten 4000 Jahren stattfanden. Wir identifizierten Ereignisse, deren Daten und Teilnehmer darauf hindeuten, dass sie genetische Auswirkungen des mongolischen Reiches, des arabischen Sklavenhandels, der bantu-Expansion, der Migrationsbewegungen im ersten Jahrtausend n. Chr. in Osteuropa und des europäischen Kolonialismus beschreiben, sowie nicht dokumentierte Ereignisse, die zeigen, dass Admixture eine fast universelle Kraft ist, die menschliche Populationen prägt.

@article{doi101126science1243518,
    author = "Hellenthal, Garrett und Busby, George und Band, Gavin und Wilson, James F. und Capelli, Cristian und Falush, Daniel und Myers, Simon",
    title = "A Genetic Atlas of Human Admixture History",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "Moderne genetische Daten in Kombination mit geeigneten statistischen Methoden haben das Potenzial, erheblich zu unserem Verständnis der menschlichen Geschichte beizutragen. Wir haben einen Ansatz entwickelt, der die genomische Struktur von admixten Populationen nutzt, um historische Mischungsereignisse auf feiner Ebene zu datieren und zu charakterisieren. Wir haben dies genutzt, um einen Atlas der weltweiten menschlichen Admixture-Geschichte zu erstellen, der ausschließlich auf genetischen Daten basiert und über 100 Ereignisse umfasst, die in den letzten 4000 Jahren stattfanden. Wir identifizierten Ereignisse, deren Daten und Teilnehmer darauf hindeuten, dass sie genetische Auswirkungen des mongolischen Reiches, des arabischen Sklavenhandels, der bantu-Expansion, der Migrationsbewegungen im ersten Jahrtausend n. Chr. in Osteuropa und des europäischen Kolonialismus beschreiben, sowie nicht dokumentierte Ereignisse, die zeigen, dass Admixture eine fast universelle Kraft ist, die menschliche Populationen prägt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1243518",
    doi = "10.1126/science.1243518",
    openalex = "W1979677919",
    references = "doi101038nature02168, doi101038nature06258, doi101038ng1847, doi101086519795, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16441567, doi101109518626, doi101111j14718286200501155x, doi101126science1172257, doi101371journalpgen0020190, doi101371journalpgen1000529, doi101371journalpgen1002453"
}

Fische haben sich als Modellorganismen für die Erforschung von Tierpersönlichkeiten erwiesen, und eine reiche Literatur dokumentiert konsistente interindividuelle Verhaltensunterschiede bei einer Vielzahl von Arten. Allerdings haben relativ wenige Studien die ökologischen Konsequenzen solcher konsistenten interindividuellen Verhaltensunterschiede bei Fischen oder anderen Organismen untersucht, insbesondere unter Feldbedingungen. In diesem Review und dieser Perspektive diskutieren wir die Faktoren, die zur Entstehung und Aufrechterhaltung von Verhaltensmustern in Fischpopulationen führen können. Anschließend untersuchen wir, was über die Auswirkungen von Persönlichkeitsvariationen auf individuelles Wachstum und Überleben, Fortpflanzungsverhalten und Reproduktionserfolg, Habitatnutzung, Ernährung und ontogenetische Nischenshifts, Migration und Ausbreitung sowie potenzielle Konsequenzen für Arteninteraktionen und Ökosystemfunktionen bekannt ist. Wir konzentrieren uns so weit wie möglich auf Studien, die unter natürlichen oder seminaturalen Bedingungen durchgeführt wurden, da solche Feldstudien am relevantesten sind, um die ökologischen Konsequenzen von Verhaltensvariationen aufzuklären. Schließlich diskutieren wir die potenzielle Bedeutung konsistenter individueller Verhaltensunterschiede für das Fischereimanagement und den Naturschutz, wobei wir insbesondere die Konsequenzen für Freizeit- und kommerzielle Fischerei, Aufzucht in Zuchtbetrieben und Bestandsverbesserung untersuchen.

@article{doi101139cjfas20130558,
    author = "Mittelbach, Gary G. and Ballew, Nick and Kjelvik, Melissa K.",
    title = "Fish behavioral types and their ecological consequences",
    year = "2014",
    journal = "Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences",
    abstract = "Fische haben sich als Modellorganismen für die Erforschung von Tierpersönlichkeiten erwiesen, und eine reiche Literatur dokumentiert konsistente interindividuelle Verhaltensunterschiede bei einer Vielzahl von Arten. Allerdings haben relativ wenige Studien die ökologischen Konsequenzen solcher konsistenten interindividuellen Verhaltensunterschiede bei Fischen oder anderen Organismen untersucht, insbesondere unter Feldbedingungen. In diesem Review und dieser Perspektive diskutieren wir die Faktoren, die zur Entstehung und Aufrechterhaltung von Verhaltensmustern in Fischpopulationen führen können. Anschließend untersuchen wir, was über die Auswirkungen von Persönlichkeitsvariationen auf individuelles Wachstum und Überleben, Fortpflanzungsverhalten und Reproduktionserfolg, Habitatnutzung, Ernährung und ontogenetische Nischenshifts, Migration und Ausbreitung sowie potenzielle Konsequenzen für Arteninteraktionen und Ökosystemfunktionen bekannt ist. Wir konzentrieren uns so weit wie möglich auf Studien, die unter natürlichen oder seminaturalen Bedingungen durchgeführt wurden, da solche Feldstudien am relevantesten sind, um die ökologischen Konsequenzen von Verhaltensvariationen aufzuklären. Schließlich diskutieren wir die potenzielle Bedeutung konsistenter individueller Verhaltensunterschiede für das Fischereimanagement und den Naturschutz, wobei wir insbesondere die Konsequenzen für Freizeit- und kommerzielle Fischerei, Aufzucht in Zuchtbetrieben und Bestandsverbesserung untersuchen.",
    url = "https://doi.org/10.1139/cjfas-2013-0558",
    doi = "10.1139/cjfas-2013-0558",
    openalex = "W1725059466",
    references = "doi101093behecoarp018"
}

Viele mikrobielle, pilzliche oder oomycetische Populationen verletzen die Annahmen für die Analyse der Populationsgenetik, da diese Populationen klonal, admixt, teilweise klonal und/oder sexuell sind. Darüber hinaus gibt es nur wenige Werkzeuge, die speziell für die Analyse von Daten aus klonalen Populationen entwickelt wurden, was die Analyse schwierig und willkürlich macht. Wir haben das R-Paket poppr entwickelt, das einzigartige Werkzeuge zur Analyse von Daten aus admixten, klonalen, gemischten und/oder sexuellen Populationen bietet. Derzeit kann poppr für dominante/kodominante und haploide/diploide genetische Daten verwendet werden. Daten können aus verschiedenen Formaten importiert werden, einschließlich GenAlEx-formatierter Textdateien, und können auf einer vom Benutzer definierten Hierarchie analysiert werden, die unbegrenzte Ebenen der Subpopulationsstruktur und des Klonzensurings umfasst. Neue Funktionen umfassen die Berechnung der Bruvo-Distanz für Mikrosatelliten, die Batch-Analyse des Assoziationsindexes mit mehreren Indizes der Genotypdiversität und das Erstellen von Graphen, einschließlich Dendrogrammen mit Bootstrap-Unterstützung und minimalen Spannnetzwerken. Während Funktionen für Genotypdiversität und Klonzensurung spezifisch für klonale Populationen sind, sind mehrere in poppr gefundene Funktionen auch für die Analyse beliebiger Populationen wertvoll. Ein Handbuch mit Dokumentation und Beispielen wird bereitgestellt. Poppr ist Open Source und Hauptversionen sind auf CRAN verfügbar: http://cran.r-project.org/package=poppr. Weitere unterstützende Dokumentation und Tutorials finden Sie unter 'resources' bei: http://grunwaldlab.cgrb.oregonstate.edu/.

@article{doi107717peerj281,
    author = "Kamvar, Zhian N. und Tabima, Javier F. und Grünwald, Niklaus J.",
    title = "Poppr: ein R-Paket zur genetischen Analyse von Populationen mit klonaler, teilweise klonaler und/oder sexueller Fortpflanzung",
    year = "2014",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "Viele mikrobielle, pilzliche oder oomycetische Populationen verletzen die Annahmen für die Analyse der Populationsgenetik, da diese Populationen klonal, admixt, teilweise klonal und/oder sexuell sind. Darüber hinaus gibt es nur wenige Werkzeuge, die speziell für die Analyse von Daten aus klonalen Populationen entwickelt wurden, was die Analyse schwierig und willkürlich macht. Wir haben das R-Paket poppr entwickelt, das einzigartige Werkzeuge zur Analyse von Daten aus admixten, klonalen, gemischten und/oder sexuellen Populationen bietet. Derzeit kann poppr für dominante/kodominante und haploide/diploide genetische Daten verwendet werden. Daten können aus verschiedenen Formaten importiert werden, einschließlich GenAlEx-formatierter Textdateien, und können auf einer vom Benutzer definierten Hierarchie analysiert werden, die unbegrenzte Ebenen der Subpopulationsstruktur und des Klonzensurings umfasst. Neue Funktionen umfassen die Berechnung der Bruvo-Distanz für Mikrosatelliten, die Batch-Analyse des Assoziationsindexes mit mehreren Indizes der Genotypdiversität und das Erstellen von Graphen, einschließlich Dendrogrammen mit Bootstrap-Unterstützung und minimalen Spannnetzwerken. Während Funktionen für Genotypdiversität und Klonzensurung spezifisch für klonale Populationen sind, sind mehrere in poppr gefundene Funktionen auch für die Analyse beliebiger Populationen wertvoll. Ein Handbuch mit Dokumentation und Beispielen wird bereitgestellt. Poppr ist Open Source und Hauptversionen sind auf CRAN verfügbar: http://cran.r-project.org/package=poppr. Weitere unterstützende Dokumentation und Tutorials finden Sie unter 'resources' bei: http://grunwaldlab.cgrb.oregonstate.edu/.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.281",
    doi = "10.7717/peerj.281",
    openalex = "W2016603972",
    references = "doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093genetics893583, doi101111j14718286200501155x, doi1023071934145"
}

Das Verständnis der Prozesse, die räumliche Muster der genetischen Struktur prägen, ist ein zentrales Ziel der Landschaftsgenetik. Es bleibt jedoch unklar, wie geografische Merkmale und Umweltvariablen den Genfluss formen, insbesondere für marine Arten in großen, komplexen Seascapes. Hier bewerten wir die genomische Zusammensetzung des Zweiband-Anemonfisches Amphiprion bicinctus über seinen gesamten geografischen Verbreitungsraum im Roten Meer und im Golf von Aden sowie seine nahe verwandte Art Amphiprion omanensis, die endemisch an der südlichen Küste Omans vorkommt. Sowohl das Rote Meer als auch das Arabische Meer sind komplexe und umweltmäßig heterogene marine Systeme, die eine ideale Situation bieten, um diese Fragen zu untersuchen. Unsere Ergebnisse bestätigen das Vorhandensein von zwei genetischen Clustern, die zuvor für A. bicinctus im Roten Meer berichtet wurden. Analysen der genetischen Struktur deuten auf eine komplexe Seascape-Konfiguration hin, mit Belegen sowohl für Isolation durch Distanz (IBD) als auch für Isolation durch Umwelt (IBE). Neben IBD und IBE wurde die genetische Struktur zwischen den Standorten am besten erklärt, wenn auch zwei Barrieren für den Genfluss berücksichtigt wurden. Eine dieser Barrieren stimmt mit einem starken oligotroph-eutrophen Gradienten bei etwa 16-20˚N im Roten Meer überein. Die andere stimmt mit einem historischen bathymetrischen Barrieren am Meerenge von Bab al Mandab überein. Schließlich stützen diese Daten das Vorhandensein von interspezifischen Hybriden in einer intermediären Suture-Zone auf Socotra und zeigen komplexe Muster genomischer Admixture im Golf von Aden mit Belegen für Introgression zwischen den Arten. Unsere Ergebnisse unterstreichen die Kraft neuer genomischer Ansätze, um subtile Muster des Genflusses in marinen Seascapes aufzulösen.

@article{doi101111mec13471,
    author = "Saenz‐Agudelo, Pablo und DiBattista, Joseph D. und Piatek, Marek J. und Gaither, Michelle R. und Harrison, Hugo B. und Nanninga, Gerrit B. und Berumen, Michael L.",
    title = "Seascape genetics along environmental gradients in the Arabian Peninsula: insights from ddRAD sequencing of anemonefishes",
    year = "2015",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Das Verständnis der Prozesse, die räumliche Muster der genetischen Struktur prägen, ist ein zentrales Ziel der Landschaftsgenetik. Es bleibt jedoch unklar, wie geografische Merkmale und Umweltvariablen den Genfluss formen, insbesondere für marine Arten in großen, komplexen Seascapes. Hier bewerten wir die genomische Zusammensetzung des Zweiband-Anemonfisches Amphiprion bicinctus über seinen gesamten geografischen Verbreitungsraum im Roten Meer und im Golf von Aden sowie seine nahe verwandte Art Amphiprion omanensis, die endemisch an der südlichen Küste Omans vorkommt. Sowohl das Rote Meer als auch das Arabische Meer sind komplexe und umweltmäßig heterogene marine Systeme, die eine ideale Situation bieten, um diese Fragen zu untersuchen. Unsere Ergebnisse bestätigen das Vorhandensein von zwei genetischen Clustern, die zuvor für A. bicinctus im Roten Meer berichtet wurden. Analysen der genetischen Struktur deuten auf eine komplexe Seascape-Konfiguration hin, mit Belegen sowohl für Isolation durch Distanz (IBD) als auch für Isolation durch Umwelt (IBE). Neben IBD und IBE wurde die genetische Struktur zwischen den Standorten am besten erklärt, wenn auch zwei Barrieren für den Genfluss berücksichtigt wurden. Eine dieser Barrieren stimmt mit einem starken oligotroph-eutrophen Gradienten bei etwa 16-20˚N im Roten Meer überein. Die andere stimmt mit einem historischen bathymetrischen Barrieren am Meerenge von Bab al Mandab überein. Schließlich stützen diese Daten das Vorhandensein von interspezifischen Hybriden in einer intermediären Suture-Zone auf Socotra und zeigen komplexe Muster genomischer Admixture im Golf von Aden mit Belegen für Introgression zwischen den Arten. Unsere Ergebnisse unterstreichen die Kraft neuer genomischer Ansätze, um subtile Muster des Genflusses in marinen Seascapes aufzulösen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13471",
    doi = "10.1111/mec.13471",
    openalex = "W2197145080",
    references = "doi101111jbi12649"
}

Die Bedeutung der pflanzlichen genetischen Vielfalt (PGD) wird nun als spezifischer Bereich anerkannt, da die explosionsartige Bevölkerungswachstum durch Urbanisierung und die abnehmenden kultivierbaren Flächen kritische Faktoren sind, die zur Nahrungsmittelunsicherheit in der Entwicklungsländer beitragen. Agrarwissenschaftler erkannten, dass PGD in Form von pflanzlichen genetischen Ressourcen (PGR) wie Genbanken, DNA-Bibliotheken und ähnlichem in Biorepositorien erfasst und gespeichert werden kann, die genetisches Material für lange Zeiträume bewahren. Konservierte PGR müssen jedoch zur Verbesserung von Kulturpflanzen genutzt werden, um zukünftige globale Herausforderungen im Zusammenhang mit Nahrungsmittel- und Ernährungssicherheit zu bewältigen. Dieser Artikel überprüft umfassend vier wichtige Bereiche: (i) die Bedeutung der pflanzlichen genetischen Vielfalt (PGD) und PGR, insbesondere bei landwirtschaftlich wichtigen Kulturpflanzen (meist Ackerkulturen); (ii) Risiken im Zusammenhang mit der Verengung der genetischen Basis aktueller kommerzieller Sorten und dem Klimawandel; (iii) Analyse bestehender PGD-Analysemethoden in der prägenomischen und genomischen Ära; und (iv) moderne Werkzeuge, die für die PGD-Analyse in der postgenomischen Ära verfügbar sind. Diese Diskussion kommt der pflanzenwissenschaftlichen Gemeinschaft zugute, um neue Methoden und Technologien für eine bessere und schnellere Bewertung sowie zur Nutzung von Germplasm aus Genbanken in ihren angewandten Zuchtprogrammen einzusetzen. Mit dem Aufkommen neuer biotechnologischer Techniken wird dieser Prozess der genetischen Manipulation nun beschleunigt und mit größerer Präzision (unter Vernachlässigung von Umwelteinflüssen) und in einem beschleunigten Tempo durchgeführt als bei klassischen Zuchttechniken. Es ist auch zu beachten, dass Genbanken mehrere Aspekte untersuchen, um die Verteilungsebenen von Germplasm und dessen Nutzung, die Duplizierung der Pflanzenidentität und den Zugang zu Datenbanken für Vorkreuzungsaktivitäten zu verbessern. Da Pflanzenzüchtungsforschung und Sortenentwicklung integrale Bestandteile der Verbesserung der Nahrungsmittelproduktion sind, wird die Verfügbarkeit und der Zugang zu vielfältigen genetischen Quellen sicherstellen, dass das globale Nahrungsmittelproduktionsnetzwerk nachhaltiger wird. Die Vor- und Nachteile der grundlegenden und fortgeschrittenen statistischen Werkzeuge zur Messung der genetischen Vielfalt werden kurz diskutiert, und ihre Quellenverlinkungen (meistens) wurden bereitgestellt, um einen einfachen Zugang zu ermöglichen; dies verbessert das Verständnis der Werkzeuge und ihrer praktischen Anwendbarkeit für Forscher.

@article{doi1011552015431487,
    author = "Govindaraj, Mahalingam und Vetriventhan, Mani und Srinivasan, Mahalingam",
    title = "Bedeutung der Bewertung der genetischen Vielfalt bei Kulturpflanzen und ihre jüngsten Fortschritte: Ein Überblick über ihre analytischen Perspektiven",
    year = "2015",
    journal = "Genetics Research International",
    abstract = "Die Bedeutung der pflanzlichen genetischen Vielfalt (PGD) wird nun als spezifischer Bereich anerkannt, da die explosionsartige Bevölkerungswachstum durch Urbanisierung und die abnehmenden kultivierbaren Flächen kritische Faktoren sind, die zur Nahrungsmittelunsicherheit in der Entwicklungsländer beitragen. Agrarwissenschaftler erkannten, dass PGD in Form von pflanzlichen genetischen Ressourcen (PGR) wie Genbanken, DNA-Bibliotheken und ähnlichem in Biorepositorien erfasst und gespeichert werden kann, die genetisches Material für lange Zeiträume bewahren. Konservierte PGR müssen jedoch zur Verbesserung von Kulturpflanzen genutzt werden, um zukünftige globale Herausforderungen im Zusammenhang mit Nahrungsmittel- und Ernährungssicherheit zu bewältigen. Dieser Artikel überprüft umfassend vier wichtige Bereiche: (i) die Bedeutung der pflanzlichen genetischen Vielfalt (PGD) und PGR, insbesondere bei landwirtschaftlich wichtigen Kulturpflanzen (meist Ackerkulturen); (ii) Risiken im Zusammenhang mit der Verengung der genetischen Basis aktueller kommerzieller Sorten und dem Klimawandel; (iii) Analyse bestehender PGD-Analysemethoden in der prägenomischen und genomischen Ära; und (iv) moderne Werkzeuge, die für die PGD-Analyse in der postgenomischen Ära verfügbar sind. Diese Diskussion kommt der pflanzenwissenschaftlichen Gemeinschaft zugute, um neue Methoden und Technologien für eine bessere und schnellere Bewertung sowie zur Nutzung von Germplasm aus Genbanken in ihren angewandten Zuchtprogrammen einzusetzen. Mit dem Aufkommen neuer biotechnologischer Techniken wird dieser Prozess der genetischen Manipulation nun beschleunigt und mit größerer Präzision (unter Vernachlässigung von Umwelteinflüssen) und in einem beschleunigten Tempo durchgeführt als bei klassischen Zuchttechniken. Es ist auch zu beachten, dass Genbanken mehrere Aspekte untersuchen, um die Verteilungsebenen von Germplasm und dessen Nutzung, die Duplizierung der Pflanzenidentität und den Zugang zu Datenbanken für Vorkreuzungsaktivitäten zu verbessern. Da Pflanzenzüchtungsforschung und Sortenentwicklung integrale Bestandteile der Verbesserung der Nahrungsmittelproduktion sind, wird die Verfügbarkeit und der Zugang zu vielfältigen genetischen Quellen sicherstellen, dass das globale Nahrungsmittelproduktionsnetzwerk nachhaltiger wird. Die Vor- und Nachteile der grundlegenden und fortgeschrittenen statistischen Werkzeuge zur Messung der genetischen Vielfalt werden kurz diskutiert, und ihre Quellenverlinkungen (meistens) wurden bereitgestellt, um einen einfachen Zugang zu ermöglichen; dies verbessert das Verständnis der Werkzeuge und ihrer praktischen Anwendbarkeit für Forscher.",
    url = "https://doi.org/10.1155/2015/431487",
    doi = "10.1155/2015/431487",
    openalex = "W1969660305",
    references = "doi101093bioinformaticsbtp187, doi101093bioinformaticsbts460, doi101093oxfordjournalsjhereda109497, doi101111j14718286200501155x, doi101371journalpgen1002453, doi102135cropsci20031235, openalexw2119799171"
}

Die Raten des aeroben Stoffwechsels variieren erheblich über evolutionäre Linien hinweg, doch ist wenig über die proximalen und ultimativen Faktoren bekannt, die diese Variabilität erzeugen und aufrechterhalten. Unter Verwendung von Daten für 131 Teleostenfischarten führten wir eine groß angelegte phylogenetische vergleichende Analyse durch, um zu untersuchen, wie interspezifische Variationen in den Ruhe-Stoffwechselraten (RMRs) und maximalen Stoffwechselraten (MMRs) mit mehreren ökologischen und morphologischen Variablen zusammenhängen. Masse- und temperaturadjustierte RMR und MMR sind entlang eines Kontinuums, das einen Bereich von 30- bis 40-fach umfasst, stark korreliert. Phylogenetische generalisierte kleinste-Quadrate-Modelle deuten darauf hin, dass RMR und MMR bei pelagischen Arten höher sind und dass Arten mit höheren trophischen Ebenen erhöhte MMR aufweisen. Diese Variation spiegelt sich auf verschiedenen Ebenen der strukturellen Organisation wider: Kiemenoberfläche, Muskelproteingehalt und Seitenflossen-Aspektverhältnis (ein Proxy für Aktivität) stehen positiv mit der aeroben Kapazität in Verbindung. Auch Muskelproteingehalt und Seitenflossen-Aspektverhältnis korrelieren positiv mit RMR. Hypoxietolerante Linien liegen am unteren Ende des metabolischen Kontinuums. Verschiedene ökologische Lebensstile sind mit kontrastierenden Niveaus aerober Kapazität verbunden, was möglicherweise das Zusammenspiel zwischen der Selektion für erhöhte locomotorische Leistung einerseits und der Toleranz gegenüber niedriger Ressourcenverfügbarkeit, insbesondere Sauerstoff, andererseits widerspiegelt. Diese Ergebnisse stützen das aerobe Kapazitätsmodell der Evolution der Endothermie und deuten darauf hin, dass erhöhte Körpertemperaturen als korrelierte Antworten auf die Selektion für hohe Aktivitätsniveaus evolviert sind.

@article{doi101086685893,
    author = "Killen, Shaun S. und Glazier, Douglas S. und Rezende, Enrico L. und Clark, Thomas D. und Atkinson, David und Willener, Astrid S. T. und Halsey, Lewis G.",
    title = "Ökologische Einflüsse und morphologische Korrelate der Ruhe- und maximalen Stoffwechselraten bei Teleostenfischen",
    year = "2016",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Die Raten des aeroben Stoffwechsels variieren erheblich über evolutionäre Linien hinweg, doch ist wenig über die proximalen und ultimativen Faktoren bekannt, die diese Variabilität erzeugen und aufrechterhalten. Unter Verwendung von Daten für 131 Teleostenfischarten führten wir eine groß angelegte phylogenetische vergleichende Analyse durch, um zu untersuchen, wie interspezifische Variationen in den Ruhe-Stoffwechselraten (RMRs) und maximalen Stoffwechselraten (MMRs) mit mehreren ökologischen und morphologischen Variablen zusammenhängen. Masse- und temperaturadjustierte RMR und MMR sind entlang eines Kontinuums, das einen Bereich von 30- bis 40-fach umfasst, stark korreliert. Phylogenetische generalisierte kleinste-Quadrate-Modelle deuten darauf hin, dass RMR und MMR bei pelagischen Arten höher sind und dass Arten mit höheren trophischen Ebenen erhöhte MMR aufweisen. Diese Variation spiegelt sich auf verschiedenen Ebenen der strukturellen Organisation wider: Kiemenoberfläche, Muskelproteingehalt und Seitenflossen-Aspektverhältnis (ein Proxy für Aktivität) stehen positiv mit der aeroben Kapazität in Verbindung. Auch Muskelproteingehalt und Seitenflossen-Aspektverhältnis korrelieren positiv mit RMR. Hypoxietolerante Linien liegen am unteren Ende des metabolischen Kontinuums. Verschiedene ökologische Lebensstile sind mit kontrastierenden Niveaus aerober Kapazität verbunden, was möglicherweise das Zusammenspiel zwischen der Selektion für erhöhte locomotorische Leistung einerseits und der Toleranz gegenüber niedriger Ressourcenverfügbarkeit, insbesondere Sauerstoff, andererseits widerspiegelt. Diese Ergebnisse stützen das aerobe Kapazitätsmodell der Evolution der Endothermie und deuten darauf hin, dass erhöhte Körpertemperaturen als korrelierte Antworten auf die Selektion für hohe Aktivitätsniveaus evolviert sind.",
    url = "https://doi.org/10.1086/685893",
    doi = "10.1086/685893",
    openalex = "W2290005196",
    references = "doi101098rstb20072099, doi101111j1469185x201000122x"
}

HINTERGRUND: In den letzten Jahren haben verschiedene Arten molekularer Marker und neue mikroskopische Skelettmerkmale das Potenzial als leistungsstarke Werkzeuge für phylogenetische Rekonstruktionen und die höhere Taxonomie von Scleractinia-Korallen gezeigt. Dennoch ist die Unterscheidung eng verwandter Taxa in der Forschung an Scleractinia-Korallen nach wie vor höchst umstritten. Hier verwendeten wir neu sequenzierte vollständige mitochondriale Genome und 30 Mikrosatelliten, um die genetische Divergenz zwischen zwei eng verwandten azooxanthellaten Taxa der Familie Caryophylliidae zu definieren: dem solitären Desmophyllum dianthus und der kolonialen Lophelia pertusa. ERGEBNISSE: In der mitochondrialen Kontrollregion waren erstaunlich 99,8 % der Nukleotide zwischen L. pertusa und D. dianthus identisch. Die Variabilität der mitochondrialen Genome der beiden Arten wird durch nur 12 nicht-synonyme von insgesamt 19 Nukleotidsubstitutionen dargestellt. Die Mikrosatelliten-Sequenzanalyse (37 Loci) von L. pertusa und D. dianthus zeigte, dass die genetische Ähnlichkeit etwa 97 % beträgt. Unsere Ergebnisse deuten auch darauf hin, dass L. pertusa und D. dianthus eine hohe Skelettplastizität in der Korallumform und Ähnlichkeit in der Skelettontogenese sowie mikromorphologische (septale und Wandgranulierungen) und mikrostrukturelle Merkmale (Anordnung von schnellen Akkretionsablagerungen, Verdickungsablagerungen) aufweisen. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Molekular und morphologisch scheinen das solitäre Desmophyllum und die dendroide Lophelia deutlich ähnlicher zueinander zu sein als andere bis heute analysierte unmissverständliche Korallengattungen. Dies führt folglich dazu, beide Taxa unter dem Gattungsnamen Desmophyllum zu subsumieren (Priorität nach Veröffentlichungsdatum). Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass Kolonialität möglicherweise kein robustes taxonomisches Merkmal bei Scleractinia-Korallen ist.

@article{doi101186s1286201606548,
    author = "Addamo, Anna Maria und Vertino, Agostina und Stolarski, Jarosław und García-Jiménez, Ricardo und Taviani, Marco und Machordom, Annie",
    title = "Merging scleractinian genera: the overwhelming genetic similarity between solitary Desmophyllum und colonial Lophelia",
    year = "2016",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    abstract = "HINTERGRUND: In den letzten Jahren haben verschiedene Arten molekularer Marker und neue mikroskopische Skelettmerkmale das Potenzial als leistungsstarke Werkzeuge für phylogenetische Rekonstruktionen und die höhere Taxonomie von Scleractinia-Korallen gezeigt. Dennoch ist die Unterscheidung eng verwandter Taxa in der Forschung an Scleractinia-Korallen nach wie vor höchst umstritten. Hier verwendeten wir neu sequenzierte vollständige mitochondriale Genome und 30 Mikrosatelliten, um die genetische Divergenz zwischen zwei eng verwandten azooxanthellaten Taxa der Familie Caryophylliidae zu definieren: dem solitären Desmophyllum dianthus und der kolonialen Lophelia pertusa. ERGEBNISSE: In der mitochondrialen Kontrollregion waren erstaunlich 99,8 % der Nukleotide zwischen L. pertusa und D. dianthus identisch. Die Variabilität der mitochondrialen Genome der beiden Arten wird durch nur 12 nicht-synonyme von insgesamt 19 Nukleotidsubstitutionen dargestellt. Die Mikrosatelliten-Sequenzanalyse (37 Loci) von L. pertusa und D. dianthus zeigte, dass die genetische Ähnlichkeit etwa 97 % beträgt. Unsere Ergebnisse deuten auch darauf hin, dass L. pertusa und D. dianthus eine hohe Skelettplastizität in der Korallumform und Ähnlichkeit in der Skelettontogenese sowie mikromorphologische (septale und Wandgranulierungen) und mikrostrukturelle Merkmale (Anordnung von schnellen Akkretionsablagerungen, Verdickungsablagerungen) aufweisen. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Molekular und morphologisch scheinen das solitäre Desmophyllum und die dendroide Lophelia deutlich ähnlicher zueinander zu sein als andere bis heute analysierte unmissverständliche Korallengattungen. Dies führt folglich dazu, beide Taxa unter dem Gattungsnamen Desmophyllum zu subsumieren (Priorität nach Veröffentlichungsdatum). Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass Kolonialität möglicherweise kein robustes taxonomisches Merkmal bei Scleractinia-Korallen ist.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12862-016-0654-8",
    doi = "10.1186/s12862-016-0654-8",
    openalex = "W2402769049",
    references = "doi101111zoj12092"
}

) hat sich zu einer komplexen, mehrmilliardenschweren Industrie entwickelt. Die Fischerei ist besorgniserregend aufgrund hoher Erntemengen und potenzieller indirekter Auswirkungen der Entfernung von Seelachs auf die Struktur und Funktion von Kelpwäldern. Kalifornische Seelachs sind protogynische Hermaphroditen, die als Räuber von Seeigel und anderen Wirbellosen kritische Bestandteile der Kelpwald-Ökosysteme im nordöstlichen Pazifik sind. Überfischung kann trophische Kaskaden und weitreichende ökologische Dysfunktion auslösen, wenn auch andere Seeigel-Räuber aus dem System verschwinden. Über die Ökologie und den Bestand von Seelachs vor der kommerziellen Ausbeutung ist wenig bekannt. Das Fehlen einer historischen Perspektive schafft eine Lücke für die Bewertung von Fischereimanagementmaßnahmen und Meeresreservaten, die darauf abzielen, Seelachs-Populationen auf historische Baseline-Bedingungen zurückzubauen. Wir verwenden Daten zur Populationsdichte und Größenstruktur aus dem zooarchäologischen Archiv, in Verbindung mit isotopischen Daten, um die langfristige Gesundheit und Tragfähigkeit der Seelachs-Fischerei in Südkalifornien zu bewerten. Unsere Ergebnisse zeigen, dass die Bedeutung von Seelachs für die Ernährung der einheimischen Chumash-Völker räumlich über die Channel Islands variierte und moderne biogeografische Muster widerspiegelt. Beim Vergleich alter (~10.000 kalibrierte Jahre vor heute bis 1825 n. Chr.) und moderner Proben beobachteten wir Variabilität und signifikante Rückgänge in der relativen Häufigkeit von Seelachs, Reduktionen in den Größenfrequenzverteilungen und Verschiebungen der Ernährungsnische zwischen alten und modernen Sammlungen. Diese Ergebnisse verdeutlichen, wie selektive Fischerei die ökologische Rolle von Schlüsselräubern verändern kann und wie zooarchäologische Daten das Fischereimanagement informieren können, indem sie historische Baselines etablieren, die zukünftige Naturschutzmaßnahmen unterstützen.

@article{doi101126sciadv1601759,
    author = "Braje, Todd J. und Rick, Torben C. und Szpak, Paul und Newsome, Seth D. und McCain, Joseph M. und Smith, Emma A. Elliott und Glassow, Michael A. und Hamilton, Scott L.",
    title = "Historical ecology and the conservation of large, hermaphroditic fishes in Pacific Coast kelp forest ecosystems",
    year = "2017",
    journal = "Science Advances",
    abstract = ") hat sich zu einer komplexen, mehrmilliardenschweren Industrie entwickelt. Die Fischerei ist besorgniserregend aufgrund hoher Erntemengen und potenzieller indirekter Auswirkungen der Entfernung von Seelachs auf die Struktur und Funktion von Kelpwäldern. Kalifornische Seelachs sind protogynische Hermaphroditen, die als Räuber von Seeigel und anderen Wirbellosen kritische Bestandteile der Kelpwald-Ökosysteme im nordöstlichen Pazifik sind. Überfischung kann trophische Kaskaden und weitreichende ökologische Dysfunktion auslösen, wenn auch andere Seeigel-Räuber aus dem System verschwinden. Über die Ökologie und den Bestand von Seelachs vor der kommerziellen Ausbeutung ist wenig bekannt. Das Fehlen einer historischen Perspektive schafft eine Lücke für die Bewertung von Fischereimanagementmaßnahmen und Meeresreservaten, die darauf abzielen, Seelachs-Populationen auf historische Baseline-Bedingungen zurückzubauen. Wir verwenden Daten zur Populationsdichte und Größenstruktur aus dem zooarchäologischen Archiv, in Verbindung mit isotopischen Daten, um die langfristige Gesundheit und Tragfähigkeit der Seelachs-Fischerei in Südkalifornien zu bewerten. Unsere Ergebnisse zeigen, dass die Bedeutung von Seelachs für die Ernährung der einheimischen Chumash-Völker räumlich über die Channel Islands variierte und moderne biogeografische Muster widerspiegelt. Beim Vergleich alter (\textasciitilde 10.000 kalibrierte Jahre vor heute bis 1825 n. Chr.) und moderner Proben beobachteten wir Variabilität und signifikante Rückgänge in der relativen Häufigkeit von Seelachs, Reduktionen in den Größenfrequenzverteilungen und Verschiebungen der Ernährungsnische zwischen alten und modernen Sammlungen. Diese Ergebnisse verdeutlichen, wie selektive Fischerei die ökologische Rolle von Schlüsselräubern verändern kann und wie zooarchäologische Daten das Fischereimanagement informieren können, indem sie historische Baselines etablieren, die zukünftige Naturschutzmaßnahmen unterstützen.",
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.1601759",
    doi = "10.1126/sciadv.1601759",
    openalex = "W2584763220",
    references = "doi101111j14672979201200464x"
}

wurden unter Bleichbedingungen in einem Langzeit-Mesocosmen-Experiment ausgesetzt und mit einem ausgewählten BMC-Konsortium oder einer Salzlösungs-Plazebo-Inokulation versehen. Alle Korallen waren von Hitzestress betroffen, aber das beobachtete „post-Hitzestress-Syndrom" wurde durch BMCs gemildert, was sich in Mustern der Dimethylsulfoniopropionat-Zersetzung, der Lipid-Erhaltung und der transkriptionellen Neuprogrammierung des Korallenwirts für zelluläre Umstrukturierung, Reparatur, Stressschutz und Immungene zeigte, begleitet von einer 40%igen Steigerung der Überlebensrate und einer stabilen photosynthetischen Leistung der Endosymbiontenalgen. Diese Studie liefert Einblicke in die Reaktionen, die der probiotischen Wirtsmannipulation zugrunde liegen. Wir zeigen, dass BMCs einen dynamischen Prozess der Mikrobiom-Umstrukturierung auslösen, der genetische und metabolische Veränderungen im Korallenwirt bewirkt, die schließlich das Korallenbleichen und die Sterblichkeit mildern.

@article{doi101126sciadvabg3088,
    author = "Santoro, Érika P. und Borges, Ricardo M. und Espinoza, Josh L. und Freire, Marcelo und Messias, Camila S. M. A. und Villela, Helena und de Mattos Pereira, Leandro und Vilela, Caren L. S. und Rosado, João G. und Cardoso, Pedro und Rosado, Phillipe M. und Assis, Juliana M. und Duarte, Gustavo und Perna, Gabriela und Rosado, Alexandre Soares und Macrae, Andrew und Dupont, Christopher L. und Nelson, Karen E. und Sweet, Michael und Voolstra, Christian R. und Peixoto, Raquel S.",
    title = "Manipulation des Korallenmikrobioms löst metabolische und genetische Umstrukturierungen aus, um Hitzestress zu mildern und Sterblichkeit zu vermeiden",
    year = "2021",
    journal = "Science Advances",
    abstract = {wurden unter Bleichbedingungen in einem Langzeit-Mesocosmen-Experiment ausgesetzt und mit einem ausgewählten BMC-Konsortium oder einer Salzlösungs-Plazebo-Inokulation versehen. Alle Korallen waren von Hitzestress betroffen, aber das beobachtete „post-Hitzestress-Syndrom" wurde durch BMCs gemildert, was sich in Mustern der Dimethylsulfoniopropionat-Zersetzung, der Lipid-Erhaltung und der transkriptionellen Neuprogrammierung des Korallenwirts für zelluläre Umstrukturierung, Reparatur, Stressschutz und Immungene zeigte, begleitet von einer 40\%igen Steigerung der Überlebensrate und einer stabilen photosynthetischen Leistung der Endosymbiontenalgen. Diese Studie liefert Einblicke in die Reaktionen, die der probiotischen Wirtsmannipulation zugrunde liegen. Wir zeigen, dass BMCs einen dynamischen Prozess der Mikrobiom-Umstrukturierung auslösen, der genetische und metabolische Veränderungen im Korallenwirt bewirkt, die schließlich das Korallenbleichen und die Sterblichkeit mildern.},
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.abg3088",
    doi = "10.1126/sciadv.abg3088",
    openalex = "W3191241810",
    references = "doi101016jzool201802004, doi101038s41467019109695"
}

Die ökologische Risikobewertung (ERA) wurde weit verbreitet eingesetzt, um die Anfälligkeit von Arten für die Auswirkungen der Fischerei zu bewerten und dann zusätzliche Managementmaßnahmen zur Verringerung der Auswirkungen zu priorisieren. Das Rahmenwerk für die ökologische Risikobewertung der Auswirkungen der Fischerei basiert auf einer Hierarchie qualitativer und semi-quantitativer Werkzeuge, die in datenarmen Situationen gut funktionieren. In dieser Studie wurden zunächst die Werkzeuge Scale Intensity and Consequence (SICA) und Productive and Susceptibility Analyses (PSA) verwendet, um die Auswirkungen der industriellen Grundschleppnetzfischerei auf braune Südgarnelen auf dem Amazonas-Kontinentalsockel im nördlichen Brasilien zu bewerten. Insgesamt wurden 540 Arten identifiziert, die direkte oder indirekte Wechselwirkungen mit den Schleppnetzen aufweisen. Die SICA identifizierte, dass das Hauptrisiko mit den Fangaktivitäten der Fischerei zusammenhängt und potenziell die Populationsgröße der Arten beeinträchtigen könnte. Von den 47 in der PSA bewerteten Arten zeigten 12 eine geringe Anfälligkeit, 23 eine moderate Anfälligkeit und 12 eine hohe Anfälligkeit für die Auswirkungen der Fischerei. Die zukünftige Fischereimanagement sollte sich darauf konzentrieren, die Anfälligkeit von Arten zu verringern, indem die Datenerhebung für die am stärksten gefährdeten Arten priorisiert wird. Auch Fischereigeräte-Modifikationen, wie Beifang-Ausschlussgeräte (BRDs), sollten eingesetzt werden, um die Anfälligkeit der Arten zu verringern.

@article{doi103389fmars20251490894,
    author = "Peixoto, Ualerson Iran und Hijaz, Miriana und Hobday, Alistair J. und Bentes, Bianca und Passarone, Rafaela und Lucena‐Frédou, Flávia und Isaac, Victoria",
    title = "Ökologische Risikobewertung von Meeresressourcen, die als Beifang in der industriellen Grundschleppnetzfischerei auf Garnelen im Amazonas-Kontinentalsockel gefangen werden",
    year = "2025",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Die ökologische Risikobewertung (ERA) wurde weit verbreitet eingesetzt, um die Anfälligkeit von Arten für die Auswirkungen der Fischerei zu bewerten und dann zusätzliche Managementmaßnahmen zur Verringerung der Auswirkungen zu priorisieren. Das Rahmenwerk für die ökologische Risikobewertung der Auswirkungen der Fischerei basiert auf einer Hierarchie qualitativer und semi-quantitativer Werkzeuge, die in datenarmen Situationen gut funktionieren. In dieser Studie wurden zunächst die Werkzeuge Scale Intensity and Consequence (SICA) und Productive and Susceptibility Analyses (PSA) verwendet, um die Auswirkungen der industriellen Grundschleppnetzfischerei auf braune Südgarnelen auf dem Amazonas-Kontinentalsockel im nördlichen Brasilien zu bewerten. Insgesamt wurden 540 Arten identifiziert, die direkte oder indirekte Wechselwirkungen mit den Schleppnetzen aufweisen. Die SICA identifizierte, dass das Hauptrisiko mit den Fangaktivitäten der Fischerei zusammenhängt und potenziell die Populationsgröße der Arten beeinträchtigen könnte. Von den 47 in der PSA bewerteten Arten zeigten 12 eine geringe Anfälligkeit, 23 eine moderate Anfälligkeit und 12 eine hohe Anfälligkeit für die Auswirkungen der Fischerei. Die zukünftige Fischereimanagement sollte sich darauf konzentrieren, die Anfälligkeit von Arten zu verringern, indem die Datenerhebung für die am stärksten gefährdeten Arten priorisiert wird. Auch Fischereigeräte-Modifikationen, wie Beifang-Ausschlussgeräte (BRDs), sollten eingesetzt werden, um die Anfälligkeit der Arten zu verringern.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2025.1490894",
    doi = "10.3389/fmars.2025.1490894",
    openalex = "W4407112428",
    references = "doi101016jtree200409004, doi101038s41586020031739, doi101086401873, doi101126science1059199, doi101126science1098222, doi101126science1255641, doi101126science2795352860, doi101146annurevecolsys33010802150515, doi1023071440619, doi1023071930126, openalexw580562315"
}