Evolutionäre Gesetze

@inproceedings{huxley1880on1,
    author = "Huxley, T. H",
    title = "On the application of the laws of evolution to the arrangement of the Vertebrata, und insbesondere der Mammalia",
    year = "1880",
    booktitle = "Proceedings of the Zoological Society of London, v. 43, p. 649-661",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Huxley, T. H., 1880, On the application of the laws of evolution to the arrangement of the Vertebrata, und insbesondere der Mammalia: Proceedings of the Zoological Society of London, v. 43, p. 649-661.}"
}

@misc{kellogg1907darwinism2,
    author = "Kellogg, V. L",
    title = "Darwinism heute",
    year = "1907",
    howpublished = "London, England, Bell \& Sons",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kellogg, V. L., 1907, Darwinism heute: London, England, Bell \& Sons.}"
}

@article{crossref1923evolution,
    title = "Evolution und Darwinismus",
    year = "1923",
    journal = "Science",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.58.1499.xiv.s",
    doi = "10.1126/science.58.1499.xiv.s",
    number = "1499",
    openalex = "W4236935415",
    volume = "58"
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@article{crossref1927evolution,
    title = "Evolution oder Darwinismus?",
    year = "1927",
    journal = "Blackfriars",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1741-2005.1927.tb04746.x",
    doi = "10.1111/j.1741-2005.1927.tb04746.x",
    number = "85",
    openalex = "W4233305340",
    pages = "241-246",
    volume = "8"
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Bis zum Jahr 1890 waren die Fronten in der Evolution-Debatte klar gezogen. In wissenschaftlichen Kreisen kämpften einige Hartnäckige, wie der deutsche Zoologe Virchow, verzweifelt gegen den immer populärer werdenden darwinistischen Ansatz. Amerikanische Wissenschaftler waren jedoch fast einstimmig in ihrer Annahme der Evolution, nun da die hemmende Hand von Louis Agassiz gefallen war. Auch unter den Theologen gab es Liberale, die die neue Theorie annahmen; einflussreiche protestantische Prediger wie Henry Ward Beecher und Lyman Abbott verkündeten, dass sie „begeisterte Evolutionisten“ seien. Die meisten protestantischen Führer teilten diese Begeisterung nicht. Sie blieben skeptisch gegenüber den wissenschaftlichen Verdiensten der Evolution, misstrauisch gegenüber ihren philosophischen Implikationen und fürchteten ihre theologischen Auswirkungen. Vielleicht die häufigste protestantische Technik war es, den Darwinismus als Bedrohung für das Christentum zu verurteilen. So stand die Sache: Amerika befand sich inmitten eines Kampfes zwischen einer Schule von Evolutionisten, von denen viele unchristliche oder antichristliche Philosophien vertraten, und einer anderen Gruppe von Anti-Evolutionisten, die die wissenschaftliche Gültigkeit der Evolution leugneten und sich gegen ihre theologischen Implikationen wandten. Die Evolutionisten schienen an Stärke und Anzahl zu gewinnen.

@article{doi101017s0034670500003648,
    author = "Morrison, John L.",
    title = "William Seton — Ein katholischer Darwinist",
    year = "1959",
    journal = "The Review of Politics",
    abstract = "Bis zum Jahr 1890 waren die Fronten in der Evolution-Debatte klar gezogen. In wissenschaftlichen Kreisen kämpften einige Hartnäckige, wie der deutsche Zoologe Virchow, verzweifelt gegen den immer populärer werdenden darwinistischen Ansatz. Amerikanische Wissenschaftler waren jedoch fast einstimmig in ihrer Annahme der Evolution, nun da die hemmende Hand von Louis Agassiz gefallen war. Auch unter den Theologen gab es Liberale, die die neue Theorie annahmen; einflussreiche protestantische Prediger wie Henry Ward Beecher und Lyman Abbott verkündeten, dass sie „begeisterte Evolutionisten“ seien. Die meisten protestantischen Führer teilten diese Begeisterung nicht. Sie blieben skeptisch gegenüber den wissenschaftlichen Verdiensten der Evolution, misstrauisch gegenüber ihren philosophischen Implikationen und fürchteten ihre theologischen Auswirkungen. Vielleicht die häufigste protestantische Technik war es, den Darwinismus als Bedrohung für das Christentum zu verurteilen. So stand die Sache: Amerika befand sich inmitten eines Kampfes zwischen einer Schule von Evolutionisten, von denen viele unchristliche oder antichristliche Philosophien vertraten, und einer anderen Gruppe von Anti-Evolutionisten, die die wissenschaftliche Gültigkeit der Evolution leugneten und sich gegen ihre theologischen Implikationen wandten. Die Evolutionisten schienen an Stärke und Anzahl zu gewinnen.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0034670500003648",
    doi = "10.1017/s0034670500003648",
    openalex = "W2074060047",
    references = "crossref1923evolution"
}

@book{openalexw2556090403,
    author = "Moran, P. A. P.",
    title = "The statistical processes of evolutionary theory.",
    year = "1962",
    openalex = "W2556090403"
}

@article{openalexw2145250129,
    author = "Valen, Leigh Van",
    title = "A NEW EVOLUTIONARY LAW.",
    year = "1973",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    openalex = "W2145250129"
}

@misc{vanvalen1973a3,
    author = "Van Valen, L",
    title = "Ein neues evolutionäres Gesetz",
    year = "1973",
    howpublished = "Evolutionary Theory, v. 1, p. 1-30",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Van Valen, L., 1973, Ein neues evolutionäres Gesetz: Evolutionary Theory, v. 1, p. 1-30.}"
}

Es wird vorgeschlagen, dass die Evolution bei Pflanzen mit dem Auftreten von drei primären Strategien verbunden sein kann, die jeweils anhand einer Reihe von Merkmalen identifiziert werden können, einschließlich morphologischer Merkmale, Ressourcenallokation, Phänologie und Stressreaktion. Die kompetitive Strategie dominiert in produktiven, relativ wenig gestörten Vegetationen, die stress-tolerante Strategie ist mit kontinuierlich unproduktiven Bedingungen verbunden, und die ruderalische Strategie ist charakteristisch für stark gestörte, aber potenziell produktive Lebensräume. Ein dreieckiges Modell, das auf den drei Strategien basiert, lässt sich mit der Theorie der r- und K-Auswahl in Einklang bringen, bietet Einblicke in die Prozesse der Vegetationssukzession und Dominanz und scheint in der Lage zu sein, auf Pilze und Tiere erweitert zu werden.

@article{doi101086283244,
    author = "Grime, J. P.",
    title = "Evidence for the Existence of Three Primary Strategies in Plants and Its Relevance to Ecological and Evolutionary Theory",
    year = "1977",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Es wird vorgeschlagen, dass die Evolution bei Pflanzen mit dem Auftreten von drei primären Strategien verbunden sein kann, die jeweils anhand einer Reihe von Merkmalen identifiziert werden können, einschließlich morphologischer Merkmale, Ressourcenallokation, Phänologie und Stressreaktion. Die kompetitive Strategie dominiert in produktiven, relativ wenig gestörten Vegetationen, die stress-tolerante Strategie ist mit kontinuierlich unproduktiven Bedingungen verbunden, und die ruderalische Strategie ist charakteristisch für stark gestörte, aber potenziell produktive Lebensräume. Ein dreieckiges Modell, das auf den drei Strategien basiert, lässt sich mit der Theorie der r- und K-Auswahl in Einklang bringen, bietet Einblicke in die Prozesse der Vegetationssukzession und Dominanz und scheint in der Lage zu sein, auf Pilze und Tiere erweitert zu werden.",
    url = "https://doi.org/10.1086/283244",
    doi = "10.1086/283244",
    openalex = "W2055424972",
    references = "doi101038242344a0, doi101038250026a0, doi101086282454, doi101086282455, doi1015159781400881376, doi102307213332, doi1023072258728, doi10230725528056, doi1023073241344, doi105962bhltitle59991"
}

Zusammenfassung Aktuelle Partnerpräferenzen können wichtige Hinweise auf die menschliche Reproduktionsgeschichte liefern. Wenig ist über die Merkmale bekannt, die Menschen bei potenziellen Partnern schätzen. Fünf Vorhersagen wurden über Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen auf der Grundlage evolutionärer Konzepte der elterlichen Investition, der sexuellen Selektion, der menschlichen Reproduktionsfähigkeit und sexueller Asymmetrien bezüglich der Gewissheit der Vaterschaft versus Mutterschaft getroffen. Die Vorhersagen konzentrierten sich darauf, wie jedes Geschlecht Erwerbsfähigkeit, Ambition— Fleiß, Jugend, körperliche Attraktivität und Keuschheit bewertet. Die Vorhersagen wurden an Daten aus 37 Stichproben getestet, die aus 33 Ländern auf sechs Kontinenten und fünf Inseln stammen (insgesamt N = 10.047). Für 27 Länder boten demografische Daten zum tatsächlichen Heiratsalter eine Validitätsprüfung der Fragebogendaten. Es wurde festgestellt, dass Frauen Hinweise auf die Ressourcengewinnung bei potenziellen Partnern höher bewerten als Männer. Merkmale, die die Reproduktionsfähigkeit signalisieren, wurden von Männern höher bewertet als von Frauen. Diese Geschlechtsunterschiede können auf unterschiedliche evolutionäre Selektionsdrücke auf menschliche Männer und Frauen hinweisen; sie liefern starke kulturübergreifende Beweise für aktuelle Geschlechtsunterschiede in Reproduktionsstrategien. Die Diskussion konzentriert sich auf die proximalen Mechanismen, die den Partnerpräferenzen zugrunde liegen, die Konsequenzen für den menschlichen intrasexuellen Wettbewerb und die Grenzen dieser Studie.

@article{doi101017s0140525x00023992,
    author = "Buss, David M.",
    title = "Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen: Evolutionäre Hypothesen, die in 37 Kulturen getestet wurden",
    year = "1989",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Zusammenfassung Aktuelle Partnerpräferenzen können wichtige Hinweise auf die menschliche Reproduktionsgeschichte liefern. Wenig ist über die Merkmale bekannt, die Menschen bei potenziellen Partnern schätzen. Fünf Vorhersagen wurden über Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen auf der Grundlage evolutionärer Konzepte der elterlichen Investition, der sexuellen Selektion, der menschlichen Reproduktionsfähigkeit und sexueller Asymmetrien bezüglich der Gewissheit der Vaterschaft versus Mutterschaft getroffen. Die Vorhersagen konzentrierten sich darauf, wie jedes Geschlecht Erwerbsfähigkeit, Ambition— Fleiß, Jugend, körperliche Attraktivität und Keuschheit bewertet. Die Vorhersagen wurden an Daten aus 37 Stichproben getestet, die aus 33 Ländern auf sechs Kontinenten und fünf Inseln stammen (insgesamt N = 10.047). Für 27 Länder boten demografische Daten zum tatsächlichen Heiratsalter eine Validitätsprüfung der Fragebogendaten. Es wurde festgestellt, dass Frauen Hinweise auf die Ressourcengewinnung bei potenziellen Partnern höher bewerten als Männer. Merkmale, die die Reproduktionsfähigkeit signalisieren, wurden von Männern höher bewertet als von Frauen. Diese Geschlechtsunterschiede können auf unterschiedliche evolutionäre Selektionsdrücke auf menschliche Männer und Frauen hinweisen; sie liefern starke kulturübergreifende Beweise für aktuelle Geschlechtsunterschiede in Reproduktionsstrategien. Die Diskussion konzentriert sich auf die proximalen Mechanismen, die den Partnerpräferenzen zugrunde liegen, die Konsequenzen für den menschlichen intrasexuellen Wettbewerb und die Grenzen dieser Studie.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x00023992",
    doi = "10.1017/s0140525x00023992",
    openalex = "W2157338817",
    references = "doi101007978146847862422, doi1010160022519364900384, doi1010160022519366901846, doi1010160162309582900279, doi1010160162309583900274, doi101016s0065260122x00026, doi101017cbo9780511806292, doi101017s0140525x00010128, doi10103711774000, doi10103712293000, doi101038246015a0, doi101038369716c0, doi101086284064, doi101111j155856461957tb02911x, doi101126science327542, doi1011425786, doi1011770022022190211001, doi101537ase188722495, doi1023072393017, doi1023072412191, doi1023072485224, doi1023072576242, doi1023075530, doi102307582242, doi1043249781315129266, doi10432497813151292667, doi1043249781410606266, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw1649242647, openalexw2000871817"
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@article{doi101038359826a0,
    author = "Nowak, Martin A. und May, Robert M.",
    title = "Evolutionäre Spiele und räumliches Chaos",
    year = "1992",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/359826a0",
    doi = "10.1038/359826a0",
    openalex = "W2025490132",
    references = "doi101007978146847862422, doi101007bf00450633, doi101017cbo9780511806292, doi101038280445a0, doi102307257983"
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Dieser Artikel schlägt eine kontextuell-evolutionäre Theorie menschlicher Paarungsstrategien vor. Sowohl Männern als auch Frauen wird unterstellt, dass sie unterschiedliche psychologische Mechanismen entwickelt haben, die kurzfristige und langfristige Strategien zugrunde liegen. Männer und Frauen stehen in kurzfristigen im Gegensatz zu langfristigen Paarungskontexten vor unterschiedlichen adaptiven Problemen. Folglich werden unterschiedliche Partnerpräferenzen aus ihren strategischen Repertoires aktiviert. Neun zentrale Hypothesen und 22 Vorhersagen der Sexual Strategies Theory werden skizziert und empirisch getestet. Zu den adaptiven Problemen, die kontextsensitiv sind, gehören sexuelle Zugänglichkeit, Fruchtbarkeitsabschätzung, Suche nach und Vermeidung von Bindung, unmittelbare und anhaltende Ressourcenbeschaffung, Vaterschaftssicherheit, Bewertung des Partnerwerts und elterliche Investition. Die Diskussion fasst 6 zusätzliche Quellen verhaltensbezogener Daten zusammen, skizziert adaptive Probleme, die für beide Geschlechter gemeinsam sind, und schlägt zusätzliche Kontexte vor, die wahrscheinlich zu Verschiebungen der Paarungsstrategie führen.

@article{doi1010370033295x1002204,
    author = "Buss, David M. und Schmitt, David P.",
    title = "Sexual Strategies Theory: Eine evolutionäre Perspektive auf menschliche Paarung.",
    year = "1993",
    journal = "Psychological Review",
    abstract = "Dieser Artikel schlägt eine kontextuell-evolutionäre Theorie menschlicher Paarungsstrategien vor. Sowohl Männern als auch Frauen wird unterstellt, dass sie unterschiedliche psychologische Mechanismen entwickelt haben, die kurzfristige und langfristige Strategien zugrunde liegen. Männer und Frauen stehen in kurzfristigen im Gegensatz zu langfristigen Paarungskontexten vor unterschiedlichen adaptiven Problemen. Folglich werden unterschiedliche Partnerpräferenzen aus ihren strategischen Repertoires aktiviert. Neun zentrale Hypothesen und 22 Vorhersagen der Sexual Strategies Theory werden skizziert und empirisch getestet. Zu den adaptiven Problemen, die kontextsensitiv sind, gehören sexuelle Zugänglichkeit, Fruchtbarkeitsabschätzung, Suche nach und Vermeidung von Bindung, unmittelbare und anhaltende Ressourcenbeschaffung, Vaterschaftssicherheit, Bewertung des Partnerwerts und elterliche Investition. Die Diskussion fasst 6 zusätzliche Quellen verhaltensbezogener Daten zusammen, skizziert adaptive Probleme, die für beide Geschlechter gemeinsam sind, und schlägt zusätzliche Kontexte vor, die wahrscheinlich zu Verschiebungen der Paarungsstrategie führen.",
    url = "https://doi.org/10.1037/0033-295x.100.2.204",
    doi = "10.1037/0033-295x.100.2.204",
    openalex = "W1971871412",
    references = "doi1010160162309582900279, doi1010160162309583900274, doi101017s0140525x00023992, doi101126science7123238, doi101537ase188722495, doi1043249781315129266, openalexw1659631989, openalexw2000871817"
}

Ein phylogenetisches Rahmenwerk, das aus Vergleichen von Sequenzen der kleinen Untereinheit der ribosomalen RNA abgeleitet wurde, beschreibt den evolutionären Ursprung und die frühen Verzweigungsmuster des Reiches Animalia. Maximum-Likelihood-Analysen zeigen, dass die Tierlinie monophyletisch ist und Choanoflagellaten einschließt. Innerhalb des metazoischen Assemblages folgt auf die Divergenz der Schwämme die Ctenophora, die Cnidaria plus der Placozoa Trichoplax adhaerens und schließlich eine ungelöste Polychotomie der bilateralen Tierstämme. Aus diesen Daten wurde geschlossen, dass Tiere und Pilze eine einzigartige evolutionäre Geschichte teilen und dass ihr letzter gemeinsamer Vorfahre ein flagellierter Protist war, der den heute existierenden Choanoflagellaten ähnelt.

@article{doi101126science8469985,
    author = "Wainright, Patricia O. und Hinkle, Gregory und Sogin, Mitchell L. und Stickel, Shawn K.",
    title = "Monophyletic Origins of the Metazoa: an Evolutionary Link with Fungi",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "Ein phylogenetisches Rahmenwerk, das aus Vergleichen von Sequenzen der kleinen Untereinheit der ribosomalen RNA abgeleitet wurde, beschreibt den evolutionären Ursprung und die frühen Verzweigungsmuster des Reiches Animalia. Maximum-Likelihood-Analysen zeigen, dass die Tierlinie monophyletisch ist und Choanoflagellaten einschließt. Innerhalb des metazoischen Assemblages folgt auf die Divergenz der Schwämme die Ctenophora, die Cnidaria plus der Placozoa Trichoplax adhaerens und schließlich eine ungelöste Polychotomie der bilateralen Tierstämme. Aus diesen Daten wurde geschlossen, dass Tiere und Pilze eine einzigartige evolutionäre Geschichte teilen und dass ihr letzter gemeinsamer Vorfahre ein flagellierter Protist war, der den heute existierenden Choanoflagellaten ähnelt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.8469985",
    doi = "10.1126/science.8469985",
    openalex = "W2034733986",
    references = "doi101126science3277277, openalexw2076004673"
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Natürliche Evolution ist ein populationsbasiertes Optimierungsverfahren. Die Simulation dieses Prozesses auf einem Computer führt zu stochastischen Optimierungstechniken, die bei der Anwendung auf schwierige reale Probleme häufig klassische Optimierungsverfahren übertreffen. Es gibt derzeit drei Hauptforschungsrichtungen in der simulierten Evolution: genetische Algorithmen, Evolutionsstrategien und evolutionäre Programmierung. Jede Methode betont einen anderen Aspekt der natürlichen Evolution. Genetische Algorithmen betonen chromosomale Operatoren. Evolutionsstrategien betonen Verhaltensänderungen auf der Ebene des Individuums. Evolutionäre Programmierung betont Verhaltensänderungen auf der Ebene der Art. Die Entwicklung dieser Verfahren über die letzten 35 Jahre wird beschrieben. Einige jüngere Bemühungen in diesen Bereichen werden besprochen.

@article{doi10110972265956,
    author = "Fogel, David B.",
    title = "An introduction to simulated evolutionary optimization",
    year = "1994",
    journal = "IEEE Transactions on Neural Networks",
    abstract = "Natural evolution is a population-based optimization process. Simulating this process on a computer results in stochastic optimization techniques that can often outperform classical methods of optimization when applied to difficult real-world problems. There are currently three main avenues of research in simulated evolution: genetic algorithms, evolution strategies, and evolutionary programming. Each method emphasizes a different facet of natural evolution. Genetic algorithms stress chromosomal operators. Evolution strategies emphasize behavioral changes at the level of the individual. Evolutionary programming stresses behavioral change at the level of the species. The development of each of these procedures over the past 35 years is described. Some recent efforts in these areas are reviewed.",
    url = "https://doi.org/10.1109/72.265956",
    doi = "10.1109/72.265956",
    openalex = "W2154808242",
    references = "doi1010079783662028308, doi101073pnas722646, doi101093auk1002507, doi101093genetics16297, doi104159harvard9780674865327, doi104324978100333479834, doi105860choice270936, doi107551mitpress10900010001, doi107551mitpress52360010001, openalexw1550375751, openalexw1965324089, openalexw2166843422"
}

@article{doi101006dbio19960032,
    author = "Gilbert, Scott F. und Opitz, John M. und Raff, Rudolf A.",
    title = "Resynthesizing Evolutionary and Developmental Biology",
    year = "1996",
    journal = "Developmental Biology",
    url = "https://doi.org/10.1006/dbio.1996.0032",
    doi = "10.1006/dbio.1996.0032",
    openalex = "W2054702070",
    references = "doi105694j132653771943tb44800x, doi105962bhltitle21641"
}

TreeView ist eine einfache, benutzerfreundliche Utility zur Anzeige phylogenetischer Bäume, die sowohl unter MacOS (auf Apple Macintosh-Computern) als auch unter Microsoft Windows auf Intel-basierten Computern läuft, den beiden gängigsten Personalcomputern, die von Biologen verwendet werden. Einige Phylogenie-Programme, wie PAUP (Swofford, 1993) und MacClade (Maddison und Maddison, 1992), bieten bereits hervorragende Funktionen zum Zeichnen und Drucken von Bäumen, sind jedoch derzeit auf Apple Macintosh-Computer beschränkt. Darüber hinaus müssen Benutzer bei diesen Programmen einen Datensatz laden, bevor Bäume angezeigt werden können, was unbequem ist, wenn der Benutzer die Bäume lediglich betrachten möchte. Weitere portable Programme wie DRAWGRAM und DRAWTREE im PHYLIP-Paket (Felsenstein, 1993) können sowohl unter MacOS als auch Windows-Computern ausgeführt werden, nutzen aber kaum, wenn überhaupt, die grafischen Schnittstellenfunktionen, die unter diesen Betriebssystemen verfügbar sind. TreeView läuft als natives Programm entweder unter MacOS oder Windows-Computern, ermöglicht es dem Benutzer, die auf seinem Gerät installierten Standard-Schriftarten sowie seinen Drucker zu verwenden und unterstützt das relevante native Grafikformat (PICT und Windows-Metafile) zum Erstellen von Grafikdateien oder zum Einfügen von Bildern in andere Anwendungen über die Zwischenablage. Das Programm unterstützt zudem Standarddateibehandlungen wie „Drag and Drop", wobei das Ziehen des Symbols einer Datei auf das Programm diese Datei öffnet. TreeView kann eine Reihe von Baumdateiformaten lesen (siehe unten) und Bäume in verschiedenen Stilen anzeigen (Abb. 1). Zusätzliche Informationen wie Kantentlängen und interne Knotenbeschriftungen können ebenfalls angezeigt werden. Die Reihenfolge der terminalen Taxa im Baum kann geändert werden, und der Baum kann neu verwurzelt werden. Wenn die Baumdatei mehr als einen Baum enthält, kann der Benutzer jeden Baum nacheinander betrachten. Das Programm kann Bäume auch in verschiedenen Dateiformaten speichern, sodass es zum Verschieben von Bäumen zwischen Programmen verwendet werden kann, die unterschiedliche Dateiformate nutzen.

@article{doi101093bioinformatics124357,
    author = "Page, Roderic",
    title = "Tree View: Eine Anwendung zur Darstellung phylogenetischer Bäume auf Personalcomputern",
    year = "1996",
    journal = "Computeranwendungen in den Biosciences",
    abstract = "TreeView ist eine einfache, benutzerfreundliche Utility zur Anzeige phylogenetischer Bäume, die sowohl unter MacOS (auf Apple Macintosh-Computern) als auch unter Microsoft Windows auf Intel-basierten Computern läuft, den beiden gängigsten Personalcomputern, die von Biologen verwendet werden. Einige Phylogenie-Programme, wie PAUP (Swofford, 1993) und MacClade (Maddison und Maddison, 1992), bieten bereits hervorragende Funktionen zum Zeichnen und Drucken von Bäumen, sind jedoch derzeit auf Apple Macintosh-Computer beschränkt. Darüber hinaus müssen Benutzer bei diesen Programmen einen Datensatz laden, bevor Bäume angezeigt werden können, was unbequem ist, wenn der Benutzer die Bäume lediglich betrachten möchte. Weitere portable Programme wie DRAWGRAM und DRAWTREE im PHYLIP-Paket (Felsenstein, 1993) können sowohl unter MacOS als auch Windows-Computern ausgeführt werden, nutzen aber kaum, wenn überhaupt, die grafischen Schnittstellenfunktionen, die unter diesen Betriebssystemen verfügbar sind. TreeView läuft als natives Programm entweder unter MacOS oder Windows-Computern, ermöglicht es dem Benutzer, die auf seinem Gerät installierten Standard-Schriftarten sowie seinen Drucker zu verwenden und unterstützt das relevante native Grafikformat (PICT und Windows-Metafile) zum Erstellen von Grafikdateien oder zum Einfügen von Bildern in andere Anwendungen über die Zwischenablage. Das Programm unterstützt zudem Standarddateibehandlungen wie „Drag and Drop", wobei das Ziehen des Symbols einer Datei auf das Programm diese Datei öffnet. TreeView kann eine Reihe von Baumdateiformaten lesen (siehe unten) und Bäume in verschiedenen Stilen anzeigen (Abb. 1). Zusätzliche Informationen wie Kantentlängen und interne Knotenbeschriftungen können ebenfalls angezeigt werden. Die Reihenfolge der terminalen Taxa im Baum kann geändert werden, und der Baum kann neu verwurzelt werden. Wenn die Baumdatei mehr als einen Baum enthält, kann der Benutzer jeden Baum nacheinander betrachten. Das Programm kann Bäume auch in verschiedenen Dateiformaten speichern, sodass es zum Verschieben von Bäumen zwischen Programmen verwendet werden kann, die unterschiedliche Dateiformate nutzen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bioinformatics/12.4.357",
    doi = "10.1093/bioinformatics/12.4.357",
    openalex = "W2150297520",
    references = "doi101093bioinformatics10141, doi101093nar21133021, doi101093nar22224673, doi105860choice392183"
}

Jedes Verhaltensmuster wird durch Versuch und Irrtum geformt. Solche schrittweise Anpassung kann durch individuelles Lernen oder durch natürliche Selektion, die Grundlage der Evolution, erfolgen. Seit den Arbeiten von Maynard Smith und anderen wurde erkannt, wie die Spieltheorie diesen Prozess modellieren kann. Die evolutionäre Spieltheorie ersetzt die statischen Lösungen der klassischen Spieltheorie durch einen dynamischen Ansatz, der sich nicht auf das Konzept rationaler Spieler, sondern auf die Populationsdynamik von Verhaltensprogrammen konzentriert. In diesem Buch untersuchen die Autoren die nichtlineare Dynamik der Selbstregulierung von sozialem und ökonomischem Verhalten sowie der eng damit verbundenen Interaktionen zwischen Arten in ökologischen Gemeinschaften. Replikatorgleichungen beschreiben, wie erfolgreiche Strategien sich ausbreiten und dadurch neue Bedingungen schaffen, die die Grundlage ihres Erfolgs verändern können, d. h., um uns zu ermöglichen, die strategischen und genetischen Grundlagen der endlosen Chronik von Invasionen und Aussterben zu verstehen, die die Evolution durchsetzen. Kurz gesagt, beschreibt die evolutionäre Spieltheorie, wann ein Konflikt eskaliert werden sollte, wie Kooperation hervorgerufen werden kann, warum ein Geschlechtergleichgewicht erwartet werden sollte und wie natürliche Selektion in mathematischen Begriffen verstanden werden kann.

@book{doi101017cbo9781139173179,
    author = "Hofbauer, Josef und Sigmund, Karl",
    title = "Evolutionary Games and Population Dynamics",
    year = "1998",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Jedes Verhaltensmuster wird durch Versuch und Irrtum geformt. Solche schrittweise Anpassung kann durch individuelles Lernen oder durch natürliche Selektion, die Grundlage der Evolution, erfolgen. Seit den Arbeiten von Maynard Smith und anderen wurde erkannt, wie die Spieltheorie diesen Prozess modellieren kann. Die evolutionäre Spieltheorie ersetzt die statischen Lösungen der klassischen Spieltheorie durch einen dynamischen Ansatz, der sich nicht auf das Konzept rationaler Spieler, sondern auf die Populationsdynamik von Verhaltensprogrammen konzentriert. In diesem Buch untersuchen die Autoren die nichtlineare Dynamik der Selbstregulierung von sozialem und ökonomischem Verhalten sowie der eng damit verbundenen Interaktionen zwischen Arten in ökologischen Gemeinschaften. Replikatorgleichungen beschreiben, wie erfolgreiche Strategien sich ausbreiten und dadurch neue Bedingungen schaffen, die die Grundlage ihres Erfolgs verändern können, d. h., um uns zu ermöglichen, die strategischen und genetischen Grundlagen der endlosen Chronik von Invasionen und Aussterben zu verstehen, die die Evolution durchsetzen. Kurz gesagt, beschreibt die evolutionäre Spieltheorie, wann ein Konflikt eskaliert werden sollte, wie Kooperation hervorgerufen werden kann, warum ein Geschlechtergleichgewicht erwartet werden sollte und wie natürliche Selektion in mathematischen Begriffen verstanden werden kann.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9781139173179",
    doi = "10.1017/cbo9781139173179",
    openalex = "W2085728653",
    references = "doi101007978146847862422, doi1010160040580977900429, doi101038119012b0, doi101086282272, doi1023071578, doi1023072965538, doi1023074549, doi1023075530, doi105962bhltitle4489"
}

Wirtschaftswissenschaftler haben lange evolutionäre Sprache und Metaphern verwendet, um wirtschaftlichen Wandel zu charakterisieren, haben sich jedoch bis vor kurzem weitgehend der Formulierung expliziter evolutionärer Theorien enthalten. In den letzten zehn Jahren haben jedoch Wirtschaftswissenschaftler und andere Sozialwissenschaftler eine Reihe expliziter evolutionärer Theorien entwickelt. Dieser Aufsatz diskutiert die allgemeine analytische Kunstform und fasst und bespricht eine Reihe der besonderen Modelle zusammen. Unter Berücksichtigung dieser Beispiele bewertet er die Stärken und Schwächen expliziter evolutionärer Theorien als Ansatz zum Verständnis wirtschaftlichen Wandels.

@incollection{doi10100797833228084005,
    author = "Nelson, Richard Alan",
    title = "Recent Evolutionary Theorizing About Economic Change",
    year = "2000",
    booktitle = "VS Verlag für Sozialwissenschaften eBooks",
    abstract = "Wirtschaftswissenschaftler haben lange evolutionäre Sprache und Metaphern verwendet, um wirtschaftlichen Wandel zu charakterisieren, haben sich jedoch bis vor kurzem weitgehend der Formulierung expliziter evolutionärer Theorien enthalten. In den letzten zehn Jahren haben jedoch Wirtschaftswissenschaftler und andere Sozialwissenschaftler eine Reihe expliziter evolutionärer Theorien entwickelt. Dieser Aufsatz diskutiert die allgemeine analytische Kunstform und fasst und bespricht eine Reihe der besonderen Modelle zusammen. Unter Berücksichtigung dieser Beispiele bewertet er die Stärken und Schwächen expliziter evolutionärer Theorien als Ansatz zum Verständnis wirtschaftlichen Wandels.",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-322-80840-0\_5",
    doi = "10.1007/978-3-322-80840-0\_5",
    openalex = "W1521985566",
    references = "doi101007978146847862422, doi10106313050879, doi10108000213624198711504638, doi101093oxfordjournalscjea013725, doi1011425786, doi1023071058511, doi1023071060065, doi1023071884513, doi1023072218271, doi1023072232409, doi1023072233763, doi1023072234208, doi1023072393344, doi1023072393549, doi1023072551371, doi1023072938222, doi107208chicago97802263604920010001"
}

Phylogenien, die aus Gen-Sequenzen rekonstruiert wurden, können verwendet werden, um das Tempo und die Art der Artbildung zu untersuchen. Hier entwickeln und verwenden wir neue statistische Methoden, um vergangene Muster der Artbildung und des Aussterbens aus molekularen Phylogenien abzuleiten. Insbesondere testen wir die Nullhypothese, dass die pro Abstammungslinie auftretenden Artbildungs- und Aussterberaten im Laufe der Zeit konstant geblieben sind. Die Ablehnung dieser Hypothese könnte Beweise für evolutionäre Ereignisse wie adaptive Radiationen oder Schlüsselanpassungen liefern. Im Gegensatz zu früheren Ansätzen sind unsere Methoden robust gegenüber unvollständiger Taxon-Abtastung und konservativ hinsichtlich des Aussterbens. Mittels Simulation untersuchen wir zunächst die nachteiligen Auswirkungen, wenn unvollständige Abtastung nicht berücksichtigt wird, und zweitens die Leistungsfähigkeit und Zuverlässigkeit unserer Tests. Wenn auf veröffentlichte Phylogenien angewendet, deuten unsere Tests darauf hin, dass in einigen Fällen die Artbildungsrate im Laufe der Zeit abgenommen hat.

@article{doi101098rspb20001278,
    author = "Pybus, Oliver G. und Harvey, Paul",
    title = "Testing macro–evolutionary models using incomplete molecular phylogenies",
    year = "2000",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Phylogenies reconstructed from gene sequences can be used to investigate the tempo and mode of species diversification. Here we develop and use new statistical methods to infer past patterns of speciation and extinction from molecular phylogenies. Specifically, we test the null hypothesis that per-lineage speciation and extinction rates have remained constant through time. Rejection of this hypothesis may provide evidence for evolutionary events such as adaptive radiations or key adaptations. In contrast to previous approaches, our methods are robust to incomplete taxon sampling and are conservative with respect to extinction. Using simulation we investigate, first, the adverse effects of failing to take incomplete sampling into account and, second, the power and reliability of our tests. When applied to published phylogenies our tests suggest that, in some cases, speciation rates have decreased through time.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2000.1278",
    doi = "10.1098/rspb.2000.1278",
    openalex = "W2118610143",
    references = "doi101086627905"
}

@misc{crossref2001darwinism,
    title = "Darwinismus und evolutionäre Ökonomie",
    year = "2001",
    url = "https://doi.org/10.4337/9781843762942",
    doi = "10.4337/9781843762942"
}

s.kumar@asu.edu

@article{doi101093bioinformatics17121244,
    author = "Kumar, Sudhir und Tamura, Koichiro und Jakobsen, Ingrid B. und Nei, Masatoshi",
    title = "MEGA2: Software zur Analyse molekularer evolutionärer Genetik",
    year = "2001",
    journal = "Bioinformatics",
    abstract = "s.kumar@asu.edu",
    url = "https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.12.1244",
    doi = "10.1093/bioinformatics/17.12.1244",
    openalex = "W2156434383",
    references = "doi101007bf00173196, doi101093bioinformatics102189, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi102307jctvcm4gbm10, openalexw2002446259"
}

@article{doi101016s0045782501003231,
    author = "Coello, Carlos A. Coello",
    title = "Theoretische und numerische Techniken zur Handhabung von Nebenbedingungen bei evolutionären Algorithmen: Eine Übersicht über den Stand der Technik",
    year = "2002",
    journal = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0045-7825(01)00323-1",
    doi = "10.1016/s0045-7825(01)00323-1",
    openalex = "W2167580870",
    references = "doi1010079783662028308, doi1010160378475482901173, doi105962bhltitle59991, doi107551mitpress39270010001, openalexw1511493290"
}

@book{doi102307jctvjsf433,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory",
    year = "2002",
    booktitle = "Harvard University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctvjsf433",
    doi = "10.2307/j.ctvjsf433",
    openalex = "W4300925890"
}

* *1. Definition und Überarbeitung der Struktur der Evolutionstheorie * Teil I: Die Geschichte der darwinistischen Logik und Debatte *2. Das Wesen des Darwinismus und die Grundlage der modernen Orthodoxie: Eine Exegese des Ursprungs der Arten *3. Samen der Hierarchie *4. Internalismus und Gesetze der Form: Prädarwinistische Alternativen zum Funktionalismus *5. Die fruchtbaren Facetten von Galtons Polyeder: Kanäle und Saltationen im postdarwinistischen Formalismus *6. Muster und Fortschritt auf der geologischen Bühne *7. Die moderne Synthese als begrenzter Konsens * Teil II: Hin zu einer überarbeiteten und erweiterten Evolutionstheorie *8. Arten als Individuen in der hierarchischen Theorie der Selektion *9. Punctuated Equilibrium und die Validierung der makroevolutionären Theorie *10. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Historische Constraints und die Evolution der Entwicklung *11. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Strukturbeschränkungen, Spandrels und die Zentralität der Exaptation in der Makroevolution *12. Ebenen der Zeit und Versuche der Extrapolation, mit einem Epilog über die Interaktion von Allgemeiner Theorie und kontingenter Geschichte * Bibliographie * Index

@article{doi105860choice396411,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The structure of evolutionary theory",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "* *1. Definition und Überarbeitung der Struktur der Evolutionstheorie * Teil I: Die Geschichte der darwinistischen Logik und Debatte *2. Das Wesen des Darwinismus und die Grundlage der modernen Orthodoxie: Eine Exegese des Ursprungs der Arten *3. Samen der Hierarchie *4. Internalismus und Gesetze der Form: Prädarwinistische Alternativen zum Funktionalismus *5. Die fruchtbaren Facetten von Galtons Polyeder: Kanäle und Saltationen im postdarwinistischen Formalismus *6. Muster und Fortschritt auf der geologischen Bühne *7. Die moderne Synthese als begrenzter Konsens * Teil II: Hin zu einer überarbeiteten und erweiterten Evolutionstheorie *8. Arten als Individuen in der hierarchischen Theorie der Selektion *9. Punctuated Equilibrium und die Validierung der makroevolutionären Theorie *10. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Historische Constraints und die Evolution der Entwicklung *11. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Strukturbeschränkungen, Spandrels und die Zentralität der Exaptation in der Makroevolution *12. Ebenen der Zeit und Versuche der Extrapolation, mit einem Epilog über die Interaktion von Allgemeiner Theorie und kontingenter Geschichte * Bibliographie * Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-6411",
    doi = "10.5860/choice.39-6411",
    openalex = "W1539968307"
}

@article{doi101016jtree200404009,
    author = "Sih, Andrew und Bell, Alison M. und Johnson, J. Chadwick",
    title = "Behavioral syndromes: an ecological and evolutionary overview",
    year = "2004",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2004.04.009",
    doi = "10.1016/j.tree.2004.04.009",
    openalex = "W2109104251",
    references = "doi101007978146847862422, doi101017cbo9780511806292, doi101073pnas931910262"
}

Mit seiner theoretischen Basis, die fest in der molekularen evolutionären und populationsgenetischen Forschung verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution sowie der Inferenz der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, bedingt durch die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken sowie neuartigen statistischen und computergestützten Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für das automatische und manuelle Sequenzalignment, das webbasierte Ausgraben von Datenbanken, die Inferenz phylogenetischer Bäume, die Schätzung evolutionärer Distanzen und das Testen evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.

@article{doi101093bib52150,
    author = "Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment",
    year = "2004",
    journal = "Briefings in Bioinformatics",
    abstract = "Mit seiner theoretischen Basis, die fest in der molekularen evolutionären und populationsgenetischen Forschung verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution sowie der Inferenz der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, bedingt durch die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken sowie neuartigen statistischen und computergestützten Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für das automatische und manuelle Sequenzalignment, das webbasierte Ausgraben von Datenbanken, die Inferenz phylogenetischer Bäume, die Schätzung evolutionärer Distanzen und das Testen evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150",
    doi = "10.1093/bib/5.2.150",
    openalex = "W2146396346",
    references = "doi101007bf01731581, doi101007bf02407308, doi101016b9781483232119500097, doi101093bioinformatics17121244, doi101093genetics1233585, doi101093nar22224673, doi101093nar25173389, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093oxfordjournalsmolbeva040343, doi101093oxfordjournalsmolbeva040410, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023072408678, doi1023072412074, doi105860choice392183, openalexw2032279931, openalexw3217097258"
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Die evolutionäre Theorie erlebt eine Renaissance; in vielen Disziplinen, einschließlich der Ökonomie, hat sich eine beträchtliche Blüte von Ideen entfaltet, die weit mehr ist als gelehrte Hommage an eines der wichtigsten wissenschaftlichen Entwicklungen aller Zeiten. Für Ökonomen, die sich für Innovation, Wettbewerb, Wachstum und Entwicklung interessieren, ist es nicht schwierig, ein Interesse an der evolutionären Idee zu begründen; denn das zentrale empirische Faktum der letzten zwei Jahrhunderte, wenn nicht länger, ist die anhaltende Veränderung und Transformation der Muster von Aktivitäten, die moderne Ökonomien definieren. Die Beweise sind allgegenwärtig und überzeugend. Die Schaffung neuer Aktivitäten, das Scheitern etablierter Aktivitäten und die ständigen Verschiebungen in der wirtschaftlichen Bedeutung überlebender Aktivitäten sind ständige Symbole der Veränderungen, die in vielen verschiedenen Orten mit unterschiedlichen Geschwindigkeiten stattfinden. Die strukturellen und qualitativen Transformationen, die sie in unserer wirtschaftlichen Welt in vergleichsweise kurzen Zeiträumen hervorrufen, sind wirklich bemerkenswert – nichts weniger als eine kontinuierliche Umgestaltung und Verschiebung des wirtschaftlichen Mobiliars.

@incollection{doi101017cbo9780511492297012,
    author = "Metcalfe, J. Stanley",
    title = "Evolutionäre Konzepte im Verhältnis zur evolutionären Ökonomie",
    year = "2005",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Die evolutionäre Theorie erlebt eine Renaissance; in vielen Disziplinen, einschließlich der Ökonomie, hat sich eine beträchtliche Blüte von Ideen entfaltet, die weit mehr ist als gelehrte Hommage an eines der wichtigsten wissenschaftlichen Entwicklungen aller Zeiten. Für Ökonomen, die sich für Innovation, Wettbewerb, Wachstum und Entwicklung interessieren, ist es nicht schwierig, ein Interesse an der evolutionären Idee zu begründen; denn das zentrale empirische Faktum der letzten zwei Jahrhunderte, wenn nicht länger, ist die anhaltende Veränderung und Transformation der Muster von Aktivitäten, die moderne Ökonomien definieren. Die Beweise sind allgegenwärtig und überzeugend. Die Schaffung neuer Aktivitäten, das Scheitern etablierter Aktivitäten und die ständigen Verschiebungen in der wirtschaftlichen Bedeutung überlebender Aktivitäten sind ständige Symbole der Veränderungen, die in vielen verschiedenen Orten mit unterschiedlichen Geschwindigkeiten stattfinden. Die strukturellen und qualitativen Transformationen, die sie in unserer wirtschaftlichen Welt in vergleichsweise kurzen Zeiträumen hervorrufen, sind wirklich bemerkenswert – nichts weniger als eine kontinuierliche Umgestaltung und Verschiebung des wirtschaftlichen Mobiliars.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511492297.012",
    doi = "10.1017/cbo9780511492297.012",
    openalex = "W2491636393",
    references = "crossref2001darwinism"
}

Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110215,
    author = "Petit, Rémy J. und Hampe, Arndt",
    title = "Some Evolutionary Consequences of Being a Tree",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    openalex = "W2102352162",
    references = "doi101111j001438202001tb00826x, doi101111j14610248200500739x, doi101126science1061967, doi101146annurevecolsys271237, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi107208chicago97802261186970010001, openalexw2065039187, openalexw2145250129, openalexw2146778590"
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Traditionelle Problemlösungsmethodologien wie Brainstorming, Synectics, Versuch und Irrtum usw. stoßen an ihre Grenzen, wenn sie sich mit erfinderischen Problemen oder Problemen konfrontiert sehen, die als Widersprüche beschrieben werden können. Ein Widerspruch besteht, wenn zwei verschiedene und sich gegenseitig ausschließende Anforderungen, Zustände oder Bedingungen in einem System gleichzeitig vorhanden sein und zusammenwirken müssen, um dieselben Ziele zu erreichen. Der Kompromiss ist in der Regel die am häufigsten verwendete Methode, um diese Art von Problem zu lösen, die auch durch eine zufällige Suche nach Lösungen gekennzeichnet ist. Diese Situationen haben einen negativen Einfluss auf die Leistung, der durch die Anwendung anderer Methodologien und Werkzeuge verbessert werden könnte. Die Theorie des erfinderischen Problemlösens oder die TRIZ-Theorie hat die Fähigkeit, die oben beschriebenen negativen Aspekte zu eliminieren und innovative Lösungen für Widersprüche zu produzieren. Dieser Ansatz, der sich von den traditionellen, auf der Psychologie basierenden Ansätzen unterscheidet, ist wissensbasiert. Die besondere Vision der TRIZ basiert auf der Geschichte der technologischen Evolution. TRIZ betrachtet Innovation als einen Prozess, der kontrolliert und systematisch eingesetzt werden kann. Paradoxerweise hat dieser wissensbasierte Ansatz mit transversaler Domänenanwendung nicht die Fähigkeit, sich zu merken, was für das Lernen fundamental ist. Folglich kann Wissen, das beim Lösen erfinderischer Probleme eingesetzt und geschaffen wurde, nicht wiederverwendet werden. Dieser Nachteil hat einen negativen Effekt auf die Problemlösungsleistung beim Einsatz von TRIZ. Das Wissensmanagement hat die Fähigkeit entwickelt, Wissen zu identifizieren, zu speichern und wiederverwenden zu können. Dies ist die Kernfähigkeit mehrerer Wissensmanagement-Methodologien, darunter ist die Fallbasierte Schlussfolgerung (CBR). Die Leistung dieses Problemlösungswerkzeugs liegt im Wesentlichen in seiner Fähigkeit, eine pragmatische Antwort für spezifische Domänenprobleme zu bieten. CBR-Systeme lösen ein neues Problem, indem sie seine Ähnlichkeit zu einem oder mehreren zuvor gelösten Problemen identifizieren, die in einem Speicher gespeichert sind, und deren bekannte Lösungen anpassen. Da die CBR-Anwendung domänenspezifisch ist, kann CBR die Lösungen nicht berücksichtigen, die bereits in anderen Domänen identifiziert wurden, während neue Probleme gelöst werden. Diese Eigenschaft begrenzt die Fähigkeit des CBR, innovative Lösungen für ein Problem vorzuschlagen. Darüber hinaus zeigt sich ein Mangel, wenn ein CBR-System einem Problem gegenübersteht, das in der Vergangenheit nicht gelöst wurde. Wenn diese Situation eintritt, kann der Speicher kein ähnliches Problem finden und folglich wird keine Lösung vorgeschlagen. Die Grenzen und die Komplementarität, die zwischen TRIZ und CBR beobachtet wurden, werden genutzt, um ein neues Modell vorzuschlagen. Dieses Modell präsentiert einen Ansatz, der die technologische Vision der TRIZ und die Fähigkeit, die von CBR entwickelt wurde, Wissen zu speichern und wiederverwenden zu kombinieren. Diese Synergie ermöglicht erstens, den kreativen Aufwand zu steuern, wenn man sich mit erfinderischen Problemen konfrontiert sieht, und zweitens, Wissen wiederverwenden, das in vergangenen Problemen erworben wurde. Die Fähigkeit dieses neuen Ansatzes wird durch seine Anwendung im Prozessingenieurwesen und im Industriefachwesen illustriert.

@phdthesis{openalexw134840284,
    author = "Cortés-Robles, Guillermo",
    title = "Management de l'innovation technologique et des connaissances: synergie entre la théorie TRIZ et le raisonnement à partir de cas: application en génie des procédés et systèmes industriels",
    year = "2006",
    booktitle = "SPIRE - Sciences Po Institutional REpository",
    abstract = "Traditionelle Problemlösungsmethoden wie Brainstorming, Synectics, Trial and Error usw. stoßen an ihre Grenzen, wenn sie sich mit erfinderischen Problemen oder Problemen konfrontiert sehen, die als Widersprüche beschrieben werden können. Ein Widerspruch liegt vor, wenn zwei verschiedene und sich gegenseitig ausschließende Anforderungen, Zustände oder Bedingungen in einem System gleichzeitig vorhanden sein und zusammenwirken müssen, um dieselben Ziele zu erreichen. Der Kompromiss ist in der Regel die am häufigsten verwendete Methode zur Lösung dieser Art von Problemen, die auch durch eine zufällige Suche nach Lösungen gekennzeichnet ist. Diese Situationen haben einen negativen Einfluss auf die Leistung, der durch die Anwendung anderer Methoden und Werkzeuge verbessert werden könnte. Die Theorie des erfinderischen Problemlösens oder die TRIZ-Theorie hat die Fähigkeit, die oben beschriebenen negativen Aspekte zu eliminieren und innovative Lösungen für Widersprüche zu produzieren. Dieser Ansatz, der sich von den traditionellen auf der Psychologie basierenden Ansätzen unterscheidet, ist wissensbasiert. Die besondere Sichtweise der TRIZ basiert auf der Geschichte der technologischen Evolution. TRIZ betrachtet Innovation als einen Prozess, der kontrolliert und systematisch eingesetzt werden kann. Paradoxerweise hat dieser wissensbasierte Ansatz mit transversaler Domänenanwendung nicht die Fähigkeit, sich zu merken, was für das Lernen fundamental ist. Folglich kann Wissen, das beim Lösen erfinderischer Probleme eingesetzt und geschaffen wurde, nicht wiederverwendet werden. Dieser Nachteil hat einen negativen Effekt auf die Problemlösungsleistung beim Einsatz der TRIZ. Das Wissensmanagement hat die Fähigkeit entwickelt, Wissen zu identifizieren, zu speichern und wiederverwenden zu können. Dies ist die Kernfähigkeit mehrerer Wissensmanagement-Methodologien, darunter ist die Case-Based Reasoning (CBR). Die Leistungsfähigkeit dieses Problemlösungswerkzeugs liegt im Wesentlichen in seiner Fähigkeit, eine pragmatische Antwort für spezifische Domänenprobleme zu bieten. CBR-Systeme lösen ein neues Problem, indem sie seine Ähnlichkeit zu einem oder mehreren zuvor gelösten Problemen identifizieren, die in einem Speicher gespeichert sind, und ihre bekannten Lösungen anpassen. Da die CBR-Anwendung domänenspezifisch ist, kann CBR beim Lösen neuer Probleme nicht die Lösungen berücksichtigen, die bereits in anderen Domänen identifiziert wurden. Diese Eigenschaft begrenzt die Fähigkeit des CBR, innovative Lösungen für ein Problem vorzuschlagen. Darüber hinaus zeigt sich ein Mangel, wenn ein CBR-System einem Problem gegenübersteht, das in der Vergangenheit nicht gelöst wurde. Wenn diese Situation eintritt, kann der Speicher kein ähnliches Problem finden und folglich wird keine Lösung vorgeschlagen. Die Grenzen und die Komplementarität, die zwischen TRIZ und CBR beobachtet wurden, werden genutzt, um ein neues Modell vorzuschlagen. Dieses Modell präsentiert einen Ansatz, der die technologische Sichtweise der TRIZ und die Fähigkeit, die von CBR entwickelt wurde, Wissen zu speichern und wiederverwenden zu kombinieren. Diese Synergie ermöglicht zunächst, den kreativen Aufwand bei der Bewältigung erfinderischer Probleme zu steuern und zweitens, Wissen zu wiederverwenden, das bei früheren Problemen erworben wurde. Die Fähigkeit dieses neuen Ansatzes wird durch seine Anwendung im Prozessingenieurwesen und im Anlagenbau veranschaulicht.",
    openalex = "W134840284"
}

@article{ryan2006the,
    author = "Ryan, Frank X.",
    title = "The evolution of Darwinism: Selection, adaptation, and progress in evolutionary biology",
    year = "2006",
    journal = "Journal of the History of the Behavioral Sciences",
    url = "https://doi.org/10.1002/jhbs.20149",
    doi = "10.1002/jhbs.20149",
    number = "2",
    openalex = "W1991686317",
    pages = "193-194",
    volume = "42"
}

In diesem Artikel wird die Verwendung des Nischenkonzepts zur Erklärung radikaler technischer Veränderungen untersucht. Beiträge verschiedener literarischer Strömungen werden in einer Taxonomie ausgearbeitet und systematisiert. Radikaler Wandel oder technologische Diskontinuität wird als die Etablierung eines neuen soziotechnischen Regimes definiert. Soziotechnische Regimes tragen und speichern Regeln für die Produktion, Nutzung und Regulierung spezifischer Technologien. Sie übernehmen die Funktion von Genen und definieren die Grenze zwischen technologischen Arten. Es wird vorgeschlagen, dass radikaler Wandel durch vier verschiedene evolutionäre Mechanismen und Muster erzeugt wird: natürliche Selektion, punctuated equilibrium, Markt-Nischen-Selektion und technologische Nischen-Selektion. In jedem Muster ist eine unterschiedliche Art von Nische am Veränderungsprozess beteiligt. Der Unterschied zwischen Nischen ergibt sich aus der Unterscheidung zweier Dimensionen: (1) ob Nischen intern oder extern zum herrschenden soziotechnischen Regime sind; (2) ob Regeln für Design und Nutzung einer spezifischen Technologie innerhalb der Nische stabil oder instabil sind.

@article{doi101007s0019100700575,
    author = "Schot, Johan und Geels, Frank W.",
    title = "Niches in evolutionary theories of technical change",
    year = "2007",
    journal = "Journal of Evolutionary Economics",
    abstract = "In diesem Artikel wird die Verwendung des Nischenkonzepts zur Erklärung radikaler technischer Veränderungen untersucht. Beiträge verschiedener literarischer Strömungen werden in einer Taxonomie ausgearbeitet und systematisiert. Radikaler Wandel oder technologische Diskontinuität wird als die Etablierung eines neuen soziotechnischen Regimes definiert. Soziotechnische Regime tragen und speichern Regeln für die Produktion, Nutzung und Regulierung spezifischer Technologien. Sie übernehmen die Funktion von Genen und definieren die Grenze zwischen technologischen Arten. Es wird vorgeschlagen, dass radikaler Wandel durch vier verschiedene evolutionäre Mechanismen und Muster erzeugt wird: natürliche Selektion, punctuated equilibrium, Markt-Nischen-Selektion und technologische Nischen-Selektion. In jedem Muster ist eine unterschiedliche Art von Nische am Veränderungsprozess beteiligt. Der Unterschied zwischen Nischen ergibt sich aus der Unterscheidung zweier Dimensionen: (1) ob Nischen intern oder extern zum herrschenden soziotechnischen Regime sind; (2) ob Regeln für Design und Nutzung einer spezifischen Technologie innerhalb der Nische stabil oder instabil sind.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00191-007-0057-5",
    doi = "10.1007/s00191-007-0057-5",
    openalex = "W1569479704",
    references = "crossref2001darwinism"
}

@article{doi101016jphysrep200704004,
    author = "Szabó, György und Fáth, Gábor",
    title = "Evolutionary games on graphs",
    year = "2007",
    journal = "Physics Reports",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.physrep.2007.04.004",
    doi = "10.1016/j.physrep.2007.04.004",
    openalex = "W1992195122",
    references = "doi1010160022519364900384, doi1010160022519364900396, doi101017cbo9780511806292, doi101038246015a0, doi10103830918, doi101038366223a0, doi101038nature00823, doi101038nature03607, doi101090mbk12132, doi101098rspa19270118, doi101103revmodphys65851, doi101103revmodphys7447, doi10111911934457, doi10111911986710, doi101126science16238591243, doi101126science2865439509, doi101126science7466396, doi1011370129022, doi101137s003614450342480, doi1015159780691213255, doi1015159780691213255004, doi1023072256497, doi1023072341823, doi102307257983, doi102307jctvjghw98, doi105962bhltitle27468, openalexw2040525210, openalexw2624262714"
}

@article{doi101038nature05587,
    author = "Forest, Félix und Grenyer, Richard und Rouget, Mathieu und Davies, T. Jonathan und Cowling, Richard M. und Faith, Daniel P. und Balmford, Andrew und Manning, John C. und Procheş, Şerban und van der Bank, Michelle und Reeves, Gail und Hedderson, Terry A. und Savolainen, Vincent",
    title = "Preserving the evolutionary potential of floras in biodiversity hotspots",
    year = "2007",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature05587",
    doi = "10.1038/nature05587",
    openalex = "W2140483939",
    references = "doi101017s1464793103006171, doi101111j109600311999tb00277x"
}

Seit es eine „evolutionäre" Perspektive auf die Wirtschaft vorgeschlagen wurde, gibt es unterschiedliche und teilweise inkompatible Auffassungen darüber, was dies spezifisch bedeutet. Indem dieser Artikel untersucht, wo die Unterschiede liegen und was sie motiviert, identifiziert er vier Hauptansätze zur evolutionären Ökonomie. Die Unterschiede zwischen ihnen lassen sich auf entgegengesetzte Positionen bezüglich der Grundannahmen über die Realität und die angemessene Konzeptualisierung der Evolution zurückführen. Die gleichen Unterschiede finden sich auch in der evolutionären Spieltheorie. Die Leistungen der Hauptansätze zur evolutionären Ökonomie und ihre Aussichten für die zukünftige Forschung werden mittels einer Peer-Befragung bewertet.

@article{doi101007s0019100801077,
    author = "Witt, Ulrich",
    title = "Was ist spezifisch an der evolutionären Ökonomie?",
    year = "2008",
    journal = "Journal of Evolutionary Economics",
    abstract = "Seit es eine „evolutionäre" Perspektive auf die Wirtschaft vorgeschlagen wurde, gibt es unterschiedliche und teilweise inkompatible Auffassungen darüber, was dies spezifisch bedeutet. Indem dieser Artikel untersucht, wo die Unterschiede liegen und was sie motiviert, identifiziert er vier Hauptansätze zur evolutionären Ökonomie. Die Unterschiede zwischen ihnen lassen sich auf entgegengesetzte Positionen bezüglich der Grundannahmen über die Realität und die angemessene Konzeptualisierung der Evolution zurückführen. Die gleichen Unterschiede finden sich auch in der evolutionären Spieltheorie. Die Leistungen der Hauptansätze zur evolutionären Ökonomie und ihre Aussichten für die zukünftige Forschung werden mittels einer Peer-Befragung bewertet.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00191-008-0107-7",
    doi = "10.1007/s00191-008-0107-7",
    openalex = "W2063903232",
    references = "crossref2001darwinism, doi101007s001910050058, doi104337978184542350600007"
}

Charles Darwin skizzierte seinen ersten evolutionären Stammbaum im Jahr 1837, und Bäume sind bis heute ein zentrales Metapher in der Evolutionsbiologie. Heute hat die Phylogenetik – die Wissenschaft, die Hypothesen über historische Abstammungsmuster in Form evolutionärer Bäume konstruiert und bewertet – sowohl innerhalb als auch zunehmend außerhalb der Evolutionsbiologie an Bedeutung gewonnen. Die Förderung von Fähigkeiten im „Baumdenken" ist daher ein kritischer Bestandteil der biologischen Bildung. Umgekehrt können Missverständnisse über evolutionäre Bäume das Verständnis der Muster und Prozesse, die in der Geschichte des Lebens stattgefunden haben, sehr nachteilig beeinflussen. Dieser Artikel bietet eine grundlegende Einführung in evolutionäre Bäume, einschließlich einiger Richtlinien dafür, wie man sie lesen und wie man sie nicht lesen sollte. Zehn der häufigsten Missverständnisse über evolutionäre Bäume und ihre Implikationen für das Verständnis der Evolution werden behandelt.

@article{doi101007s120520080035x,
    author = "Gregory, T. Ryan",
    title = "Understanding Evolutionary Trees",
    year = "2008",
    journal = "Evolution Education and Outreach",
    abstract = "Charles Darwin skizzierte seinen ersten evolutionären Stammbaum im Jahr 1837, und Bäume sind bis heute ein zentrales Metapher in der Evolutionsbiologie. Heute hat die Phylogenetik – die Wissenschaft, die Hypothesen über historische Abstammungsmuster in Form evolutionärer Bäume konstruiert und bewertet – sowohl innerhalb als auch zunehmend außerhalb der Evolutionsbiologie an Bedeutung gewonnen. Die Förderung von Fähigkeiten im „Baumdenken" ist daher ein kritischer Bestandteil der biologischen Bildung. Umgekehrt können Missverständnisse über evolutionäre Bäume das Verständnis der Muster und Prozesse, die in der Geschichte des Lebens stattgefunden haben, sehr nachteilig beeinflussen. Dieser Artikel bietet eine grundlegende Einführung in evolutionäre Bäume, einschließlich einiger Richtlinien dafür, wie man sie lesen und wie man sie nicht lesen sollte. Zehn der häufigsten Missverständnisse über evolutionäre Bäume und ihre Implikationen für das Verständnis der Evolution werden behandelt.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s12052-008-0035-x",
    doi = "10.1007/s12052-008-0035-x",
    openalex = "W2158798844",
    references = "doi101038nature05634, doi101086383584, doi101093oso97801951358480010001, doi101126science1126746, doi1023073037993, doi102307jctvjsf433, doi105860choice396411, doi105962bhltitle59991, openalexw2002446259, openalexw3135630760"
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@article{doi101016jcell200806030,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evo-Devo und eine sich erweiternde evolutionäre Synthese: Eine genetische Theorie der morphologischen Evolution",
    year = "2008",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.030",
    doi = "10.1016/j.cell.2008.06.030",
    openalex = "W2171193618",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016b9781483227344500176, doi101038276565a0, doi101038376479a0, doi10103841710, doi101038nature02415, doi101038nature03158, doi101038nrg2063, doi101086406830, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200700105x, doi101126science1090005, doi101126science1107239, doi101126science147365368, doi101126science7892602, doi101242dev1212333, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, openalexw591049712, openalexw614012683"
}

Ein neuer Fortschritt in der phylogenetischen vergleichenden Analyse kontinuierlicher Merkmale besteht in der expliziten, modellbasierten Messung des "phylogenetischen Signals" in Datensätzen, die aus Beobachtungen bestehen, die von Arten gesammelt wurden, die durch einen phylogenetischen Baum miteinander verwandt sind. Das phylogenetische Signal ist ein Maß für die statistische Abhängigkeit zwischen den Merkmalswerten von Arten aufgrund ihrer phylogenetischen Beziehungen. Obwohl das phylogenetische Signal ein Maß für Muster (statistische Abhängigkeit) ist, besteht in der Literatur dennoch eine weit verbreitete Tendenz, dieses Muster auf Aspekte des evolutionären Prozesses oder der Rate zurückzuführen. Dies kann teilweise auf die Wahrnehmung zurückzuführen sein, dass eine hohe evolutionäre Rate notwendigerweise zu einem niedrigen phylogenetischen Signal führt; und umgekehrt, dass eine niedrige evolutionäre Rate oder stabilisierende Selektion zu einem hohen phylogenetischen Signal führt (aufgrund der daraus resultierenden hohen Ähnlichkeit zwischen verwandten Arten). In dieser Studie verwenden wir individualbasierte numerische Simulationen auf stochastischen phylogenetischen Bäumen, um die Beziehung zwischen phylogenetischem Signal, Rate und evolutionärem Prozess zu klären. Unter dem einfachsten Modell für die quantitative Merkmalsentwicklung, der homogenen Raten-genetischen Drift, besteht keine Beziehung zwischen evolutionärer Rate und phylogenetischem Signal. Für andere Umstände, wie funktionelle Einschränkung, schwankende Selektion, Nischenkonservatismus und evolutionäre Heterogenität, ist die Beziehung zwischen Prozess, Rate und phylogenetischem Signal komplex. Aus diesen Gründen empfehlen wir gegen Interpretationen des evolutionären Prozesses oder der Rate basierend auf Schätzungen des phylogenetischen Signals.

@article{doi10108010635150802302427,
    author = "Revell, Liam J. und Harmon, Luke J. und Collar, David C.",
    title = "Phylogenetisches Signal, evolutionärer Prozess und Rate",
    year = "2008",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = {Ein neuer Fortschritt in der phylogenetischen vergleichenden Analyse kontinuierlicher Merkmale besteht in der expliziten, modellbasierten Messung des "phylogenetischen Signals" in Datensätzen, die aus Beobachtungen bestehen, die von Arten gesammelt wurden, die durch einen phylogenetischen Baum miteinander verwandt sind. Das phylogenetische Signal ist ein Maß für die statistische Abhängigkeit zwischen den Merkmalswerten von Arten aufgrund ihrer phylogenetischen Beziehungen. Obwohl das phylogenetische Signal ein Maß für Muster (statistische Abhängigkeit) ist, besteht in der Literatur dennoch eine weit verbreitete Tendenz, dieses Muster auf Aspekte des evolutionären Prozesses oder der Rate zurückzuführen. Dies kann teilweise auf die Wahrnehmung zurückzuführen sein, dass eine hohe evolutionäre Rate notwendigerweise zu einem niedrigen phylogenetischen Signal führt; und umgekehrt, dass eine niedrige evolutionäre Rate oder stabilisierende Selektion zu einem hohen phylogenetischen Signal führt (aufgrund der daraus resultierenden hohen Ähnlichkeit zwischen verwandten Arten). In dieser Studie verwenden wir individualbasierte numerische Simulationen auf stochastischen phylogenetischen Bäumen, um die Beziehung zwischen phylogenetischem Signal, Rate und evolutionärem Prozess zu klären. Unter dem einfachsten Modell für die quantitative Merkmalsentwicklung, der homogenen Raten-genetischen Drift, besteht keine Beziehung zwischen evolutionärer Rate und phylogenetischem Signal. Für andere Umstände, wie funktionelle Einschränkung, schwankende Selektion, Nischenkonservatismus und evolutionäre Heterogenität, ist die Beziehung zwischen Prozess, Rate und phylogenetischem Signal komplex. Aus diesen Gründen empfehlen wir gegen Interpretationen des evolutionären Prozesses oder der Rate basierend auf Schätzungen des phylogenetischen Signals.},
    url = "https://doi.org/10.1080/10635150802302427",
    doi = "10.1080/10635150802302427",
    openalex = "W2162399971",
    references = "doi101038217624a0, doi10103844766, doi101073pnas0507648103, doi101086284325, doi101086383584, doi101086510633, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oso97801985464120010001, doi101111j001438202001tb00731x, doi101111j001438202003tb00285x, doi1023072529912, doi102307jctvjsf433, doi105860choice295104, doi105860choice396411"
}

Die Software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) ist eine Desktop-Anwendung, die für die vergleichende Analyse homologer Gensequenzen entweder aus Multigenfamilien oder aus verschiedenen Spezies entwickelt wurde, mit einem besonderen Schwerpunkt auf der Inferenz evolutionärer Beziehungen und Muster der DNA- und Proteinevolution. Neben den Werkzeugen für die statistische Analyse von Daten bietet MEGA viele praktische Einrichtungen zur Zusammenstellung von Sequenzdatensätzen aus Dateien oder webbasierten Repositories und enthält Werkzeuge für die visuelle Darstellung der Ergebnisse in Form von interaktiven phylogenetischen Bäumen und evolutionären Distanzmatrizen. Hier diskutieren wir die Motivation, Designprinzipien und Prioritäten, die die Entwicklung von MEGA geprägt haben. Wir diskutieren auch, wie sich MEGA in Zukunft entwickeln könnte, um Forschern bei ihrem wachsenden Bedarf an der Analyse großer Datensätze mit neuen computergestützten Methoden zu helfen.

@article{doi101093bibbbn017,
    author = "Kumar, Sudhir und Nei, M und Dudley, Joel T. und Tamura, Koichiro",
    title = "MEGA: Eine biologizentrierte Software für die evolutionäre Analyse von DNA- und Proteinsequenzen",
    year = "2008",
    journal = "Briefings in Bioinformatics",
    abstract = "Die Software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) ist eine Desktop-Anwendung, die für die vergleichende Analyse homologer Gensequenzen entweder aus Multigenfamilien oder aus verschiedenen Spezies entwickelt wurde, mit einem besonderen Schwerpunkt auf der Inferenz evolutionärer Beziehungen und Muster der DNA- und Proteinevolution. Neben den Werkzeugen für die statistische Analyse von Daten bietet MEGA viele praktische Einrichtungen zur Zusammenstellung von Sequenzdatensätzen aus Dateien oder webbasierten Repositories und enthält Werkzeuge für die visuelle Darstellung der Ergebnisse in Form von interaktiven phylogenetischen Bäumen und evolutionären Distanzmatrizen. Hier diskutieren wir die Motivation, Designprinzipien und Prioritäten, die die Entwicklung von MEGA geprägt haben. Wir diskutieren auch, wie sich MEGA in Zukunft entwickeln könnte, um Forschern bei ihrem wachsenden Bedarf an der Analyse großer Datensätze mit neuen computergestützten Methoden zu helfen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bib/bbn017",
    doi = "10.1093/bib/bbn017",
    openalex = "W2110899053",
    references = "doi101086383584, doi101093acprofoso97801985670280010001, doi101093bib52150, doi101093bioinformatics17121244, doi101093molbevmsm092, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi107312nei92038"
}

@article{doi101016jmar200812001,
    author = "Johansson, Tobias und Siverbo, Sven",
    title = "Warum ist Forschung zum Wandel des Management-Controllings nicht explizit evolutionär? Den nächsten Schritt in der Konzeptualisierung des Wandels des Management-Controllings",
    year = "2009",
    journal = "Management Accounting Research",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.mar.2008.12.001",
    doi = "10.1016/j.mar.2008.12.001",
    openalex = "W1992063498",
    references = "crossref2001darwinism"
}

@article{doi101038nature07891,
    author = "Shubin, Neil H. und Tabin, Cliff und Carroll, Sean B.",
    title = "Deep Homologie und die Ursprünge evolutionärer Neuheiten",
    year = "2009",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature07891",
    doi = "10.1038/nature07891",
    openalex = "W2012399832",
    references = "doi101016jcell200702040, doi10103841710, doi101038nature04637, doi101126science7892602, doi102307jctvjsf433"
}

In der Ära von Qualität und Optimierung entwickelte Werkzeuge und Methoden haben ihre Grenzen gezeigt und sind im Kontext der Anforderungen an Innovation unangemessen geworden. Heute wird der Bedarf, Designpraktiken in Unternehmen neu zu gestalten, sowohl hinsichtlich menschlicher Fähigkeiten als auch methodischer Expertise dringend empfunden. Zum Teil wurde ein Weg, um die Schwierigkeiten der Innovationsära zu bewältigen, durch die Theorie des erfinderischen Problemlösens bereitgestellt. Diese Theorie stellt einen bedeutenden Durchbruch dar, der die Problemstellung und -lösung in eine Richtung lenkt, die durch die Idee ausgedrückt wird, dass technische Systeme von objektiven Gesetzen angetrieben werden. Ein zweites Postulat betrifft den Begriff des Widerspruchs, doch bisher haben nur wenige Beiträge die Beziehungen zwischen Gesetzen und Widersprüchen behandelt. Dieser Artikel präsentiert durch einen qualitativen Ansatz eine Lösung für diese Einschränkung und schlägt eine mögliche Verwendung von Gesetzen bei der Auswahl des passenden widersprüchlichen Paares vor, bevor TRIZ-Lösungstechniken eingesetzt werden. Tests, um die Auswirkungen des vorgeschlagenen Ansatzes zu beobachten, wurden an einer französischen Ingenieurs-Hochschule „grande école" über drei Semester mit 180 Ingenieuren durchgeführt. Die Beiträge dieses Artikels sind zweifach. Einerseits gibt es einen theoretischen Beitrag zur Theorie des erfinderischen Problemlösens. Darüber hinaus bietet die vorgeschlagene Methode insbesondere TRIZ-Praktizierenden neue Wege für das Problemverständnis und die Problemformulierung.

@article{doi101111j14678691200900515x,
    author = "Cavallucci, Denis und Rousselot, François und Zanni, Cécilia",
    title = "Verknüpfung von Widersprüchen und Gesetzen der Evolution von Ingenieursystemen innerhalb des TRIZ-Rahmens",
    year = "2009",
    journal = "Kreativität und Innovationsmanagement",
    abstract = "In der Ära von Qualität und Optimierung entwickelte Werkzeuge und Methoden haben ihre Grenzen gezeigt und sind im Kontext der Anforderungen an Innovation unangemessen geworden. Heute wird der Bedarf, Designpraktiken in Unternehmen neu zu gestalten, sowohl hinsichtlich menschlicher Fähigkeiten als auch methodischer Expertise dringend empfunden. Zum Teil wurde ein Weg, um die Schwierigkeiten der Innovationsära zu bewältigen, durch die Theorie des erfinderischen Problemlösens bereitgestellt. Diese Theorie stellt einen bedeutenden Durchbruch dar, der die Problemstellung und -lösung in eine Richtung lenkt, die durch die Idee ausgedrückt wird, dass technische Systeme von objektiven Gesetzen angetrieben werden. Ein zweites Postulat betrifft den Begriff des Widerspruchs, doch bisher haben nur wenige Beiträge die Beziehungen zwischen Gesetzen und Widersprüchen behandelt. Dieser Artikel präsentiert durch einen qualitativen Ansatz eine Lösung für diese Einschränkung und schlägt eine mögliche Verwendung von Gesetzen bei der Auswahl des passenden widersprüchlichen Paares vor, bevor TRIZ-Lösungstechniken eingesetzt werden. Tests, um die Auswirkungen des vorgeschlagenen Ansatzes zu beobachten, wurden an einer französischen Ingenieurs-Hochschule „grande école" über drei Semester mit 180 Ingenieuren durchgeführt. Die Beiträge dieses Artikels sind zweifach. Einerseits gibt es einen theoretischen Beitrag zur Theorie des erfinderischen Problemlösens. Darüber hinaus bietet die vorgeschlagene Methode insbesondere TRIZ-Praktizierenden neue Wege für das Problemverständnis und die Problemformulierung.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1467-8691.2009.00515.x",
    doi = "10.1111/j.1467-8691.2009.00515.x",
    openalex = "W2001301510"
}

@article{openalexw2611511275,
    author = "Maddison, Wayne P. und Maddison, David R.",
    title = "Mesquite: ein modulares System zur evolutionären Analyse. Version 2.6",
    year = "2009",
    openalex = "W2611511275"
}

Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von wesentlicher Bedeutung. Hier kündigen wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5) an, einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, der Biomedizin und der Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen ML-Baum-Schließungsalgorithmen in MEGA5 in Bezug auf Recheneffizienz und die Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen Sites günstig mit anderen Softwarepaketen. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun so verbessert, dass sie aktivitätsgetrieben ist, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X- und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net erhältlich.

@article{doi101093molbevmsr121,
    author = "Tamura, Koichiro und Peterson, Daniel G. und Peterson, Nora und Stecher, Glen und Nei, M und Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA5: Molekulare evolutionäre Genetik-Analyse unter Verwendung von Maximum-Likelihood-, evolutionärer Distanz- und Maximum-Parsimony-Methoden",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen der Natur und des Ausmaßes der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von wesentlicher Bedeutung. Hier kündigen wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5) an, einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, der Biomedizin und der Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen ML-Baum-Schließungsalgorithmen in MEGA5 in Bezug auf Recheneffizienz und die Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen Sites günstig mit anderen Softwarepaketen. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun so verbessert, dass sie aktivitätsgetrieben ist, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X- und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net erhältlich.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msr121",
    doi = "10.1093/molbev/msr121",
    openalex = "W2132632499",
    references = "doi101007bf01734359, doi101007bf02101694, doi10108010635150390235520, doi10108010635150490522304, doi101093bioinformatics149817, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet762297, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093sysbiosyq010, doi101111j155856461985tb00420x, doi101186147121055113, openalexw3217097258"
}

Wir neigen dazu, Geschichte und Evolution als aus getrennten Wurzeln hervorgehend zu sehen, wobei die eine in der menschlichen Welt und die andere in der natürlichen Welt verwurzelt ist. Menschen haben sich jedoch wahrscheinlich zur mächtigsten Spezies entwickelt, die heute die Evolution gestaltet, und die durch den Menschen verursachte Evolution bei anderen Arten war wahrscheinlich die wichtigste Kraft, die die menschliche Geschichte geformt hat. Dieses Buch führt Leser in die Evolutionäre Geschichte ein, ein neues Feld, das Geschichte und Biologie vereint, um ein umfassenderes Verständnis der Vergangenheit zu schaffen, als es beide allein erreichen könnten. Die Evolutionäre Geschichte kann überraschende neue Hypothesen für jedes Feld der Geschichte und der Evolutionsbiologie anregen. Wie viele Kunsthistoriker hätten erraten, dass Skulpturen die Evolution von zahlosen Elefanten förderten? Wie viele Biologen hätten vorhergesagt, dass menschliche Armut die Tierentwicklung beschleunigen würde? Wie viele Militärgeschichtswissenschaftler hätten vermutet, dass die Pflanzenentwicklung eine Strategie zur Bekämpfung von Aufständen in eine Rebellen-Subvention umwandeln würde? Mit Beispielen aus der ganzen Welt wird dieses Buch den Lesern helfen, die breitesten Muster der Geschichte und die Details ihres eigenen Lebens in neuem Licht zu sehen.

@article{doi105860choice490841,
    title = "Evolutionary history: uniting history and biology to understand life on Earth",
    year = "2011",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Wir neigen dazu, Geschichte und Evolution als aus getrennten Wurzeln hervorgehend zu sehen, wobei die eine in der menschlichen Welt und die andere in der natürlichen Welt verwurzelt ist. Menschen haben sich jedoch wahrscheinlich zur mächtigsten Spezies entwickelt, die heute die Evolution gestaltet, und die durch den Menschen verursachte Evolution bei anderen Arten war wahrscheinlich die wichtigste Kraft, die die menschliche Geschichte geformt hat. Dieses Buch führt Leser in die Evolutionäre Geschichte ein, ein neues Feld, das Geschichte und Biologie vereint, um ein umfassenderes Verständnis der Vergangenheit zu schaffen, als es beide allein erreichen könnten. Die Evolutionäre Geschichte kann überraschende neue Hypothesen für jedes Feld der Geschichte und der Evolutionsbiologie anregen. Wie viele Kunsthistoriker hätten erraten, dass Skulpturen die Evolution von zahlosen Elefanten förderten? Wie viele Biologen hätten vorhergesagt, dass menschliche Armut die Tierentwicklung beschleunigen würde? Wie viele Militärgeschichtswissenschaftler hätten vermutet, dass die Pflanzenentwicklung eine Strategie zur Bekämpfung von Aufständen in eine Rebellen-Subvention umwandeln würde? Mit Beispielen aus der ganzen Welt wird dieses Buch den Lesern helfen, die breitesten Muster der Geschichte und die Details ihres eigenen Lebens in neuem Licht zu sehen.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.49-0841",
    doi = "10.5860/choice.49-0841",
    openalex = "W632483353",
    references = "crossref2001darwinism"
}

Die Software für die Analyse der molekularen Evolution (MEGA) hat sich weiterentwickelt und enthält nun eine umfangreiche Sammlung von Methoden und Werkzeugen der computergestützten molekularen Evolution. Hier beschreiben wir neue Ergänzungen, die MEGA zu einem umfassenderen Werkzeug für die Erstellung von Zeitbäumen von Arten, Krankheitserregern und Genfamilien mittels schneller Relaxed-Clock-Methoden machen. Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten und Konfidenzintervallen wurden implementiert, um Wahrscheinlichkeitsdichten für Kalibrierungsbeschränkungen bei Knoten-Datierungen und Sequenz-Sampling-Daten bei Spitzen-Datierungsanalysen zu verwenden. Sie werden durch neue Optionen zur Kennzeichnung von Sequenzen mit räumlich-zeitlichen Sampling-Informationen, einen erweiterten interaktiven Editor für Knotenkalibrierungen und einen erweiterten Tree Explorer zur Anzeige von Zeitbäumen unterstützt. Zudem wurde eine Bayes'sche Methode zur Schätzung neutraler evolutionärer Wahrscheinlichkeiten von Allelen in einer Art unter Verwendung von Mehrarten-Sequenzalignments und eine maschinelles Lernverfahren zum Testen auf Autokorrelation evolutionärer Raten in Phylogenien hinzugefügt. Die Anforderungen an den Arbeitsspeicher für die Maximum-Likelihood-Analyse wurden durch Neuprogrammierung erheblich reduziert, und die grafische Benutzeroberfläche wurde für sehr große Datensätze reaktionsschneller und interaktiver gestaltet. Diese Verbesserungen werden die Benutzererfahrung, die Qualität der Ergebnisse und das Tempo biologischer Entdeckungen verbessern. Native kompilierte grafische Benutzeroberflächen- und Kommandozeilen-Versionen von MEGA11 sind für Microsoft Windows, Linux und macOS unter www.megasoftware.net verfügbar.

@article{doi101093molbevmst197,
    author = "Tamura, Koichiro und Stecher, Glen und Peterson, Daniel S. und Filipski, Alan und Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0",
    year = "2013",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Die Software für die Analyse der molekularen Evolution (MEGA) hat sich weiterentwickelt und enthält nun eine umfangreiche Sammlung von Methoden und Werkzeugen der computergestützten molekularen Evolution. Hier beschreiben wir neue Ergänzungen, die MEGA zu einem umfassenderen Werkzeug für die Erstellung von Zeitbäumen von Arten, Krankheitserregern und Genfamilien mittels schneller Relaxed-Clock-Methoden machen. Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten und Konfidenzintervallen wurden implementiert, um Wahrscheinlichkeitsdichten für Kalibrierungsbeschränkungen bei Knoten-Datierungen und Sequenz-Sampling-Daten bei Spitzen-Datierungsanalysen zu verwenden. Sie werden durch neue Optionen zur Kennzeichnung von Sequenzen mit räumlich-zeitlichen Sampling-Informationen, einen erweiterten interaktiven Editor für Knotenkalibrierungen und einen erweiterten Tree Explorer zur Anzeige von Zeitbäumen unterstützt. Zudem wurde eine Bayes'sche Methode zur Schätzung neutraler evolutionärer Wahrscheinlichkeiten von Allelen in einer Art unter Verwendung von Mehrarten-Sequenzalignments und eine maschinelles Lernverfahren zum Testen auf Autokorrelation evolutionärer Raten in Phylogenien hinzugefügt. Die Anforderungen an den Arbeitsspeicher für die Maximum-Likelihood-Analyse wurden durch Neuprogrammierung erheblich reduziert, und die grafische Benutzeroberfläche wurde für sehr große Datensätze reaktionsschneller und interaktiver gestaltet. Diese Verbesserungen werden die Benutzererfahrung, die Qualität der Ergebnisse und das Tempo biologischer Entdeckungen verbessern. Native kompilierte grafische Benutzeroberflächen- und Kommandozeilen-Versionen von MEGA11 sind für Microsoft Windows, Linux und macOS unter www.megasoftware.net verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/mst197",
    doi = "10.1093/molbev/mst197",
    openalex = "W2152207030",
    references = "doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas1213199109, doi101093bib52150, doi101093bioinformatics102189, doi101093bioinformatics17121244, doi101093bioinformaticsbts507, doi101093molbevmsr121, doi101093oso97801951358480010001, doi101126science1211028, openalexw3217097258"
}

Die Begriffe „Evolution" und „Koevolution" werden in der Organisationsforschung weit verbreitet verwendet, aber selten definiert. Oft ist unklar, ob sie sich auf einzelne Einheiten oder Populationen beziehen. Wenn spezifische evolutionäre Prozesse vorgeschlagen werden, ist die Bezeichnung oft irreführend. Zum Beispiel wird in der Debatte über die Rollen der individuellen Anpassung und der kompetitiven Selektion die „Selektionistische" Position von Michael Hannan und John Freeman, die die Rolle der Selektion betont und die Grenzen der individuellen Anpassungsfähigkeit von Unternehmen hervorhebt, oft als „darwinistisch" beschrieben, während gegenteilige Ansichten, die die Anpassungsfähigkeit betonen, als „lamarckistisch" beschrieben werden. Doch diese Labels sind nicht streng dichotom. Wissenschaftler haben gezeigt, dass Kernprinzipien der Darwinismus, die aus einer abstrakten ontologischen Gemeinsamkeit und nicht aus Analogie resultieren, auf die soziale Evolution anwendbar sind. Dies eröffnet eine Forschungsagenda unter Verwendung der Prinzipien des verallgemeinerten Darwinismus und des Replikator–Interaktor-Rahmens, um die Evolution von Organisationen zu verstehen. Einige Beispiele für den konzeptionellen Wert dieses Ansatzes werden gegeben, einschließlich des Verständnisses der Verflechtung von Selektion und Anpassung, der Natur und Rolle von Organisationsroutinen, der Stelle der strategischen Wahl und des Wachstums der Organisationskomplexität. Der Rahmen des verallgemeinerten Darwinismus hilft auch, scheinbar divergente Perspektiven in der Literatur zur Unternehmensstrategie und zur Organisationsökologie zu überbrücken.

@article{doi1011770170840613485855,
    author = "Hodgson, Geoffrey M.",
    title = "Understanding Organizational Evolution: Toward a Research Agenda using Generalized Darwinism",
    year = "2013",
    journal = "Organization Studies",
    abstract = "The terms ‘evolution’ and ‘coevolution’ are widely used in organization studies but rarely defined. Often it is unclear whether they refer to single entities or populations. When specific evolutionary processes are suggested, the labelling is often misleading. For example, in the debate over the roles of individual adaptation and competitive selection, the ‘selectionist’ position of Michael Hannan and John Freeman, which emphasizes the role of selection and stress the limits of individual firm adaptability, is often described as ‘Darwinian’ whereas opposing views that emphasize adaptability are described as ‘Lamarckian’. But these labels are not strictly dichotomous. Scholars have shown that core Darwinian principles, resulting from abstract ontological communality rather than analogy, apply to social evolution. This opens up a research agenda using the principles of generalized Darwinism and the replicator–interactor framework to help understand the evolution of organizations. Some illustrations of the conceptual value of this approach are provided, including understanding the entwinement of selection and adaptation, the nature and role of organizational routines, the place of strategic choice and the growth of organizational complexity. The framework of generalized Darwinism also helps to bridge apparently divergent perspectives in the business strategy and organizational ecology literatures.",
    url = "https://doi.org/10.1177/0170840613485855",
    doi = "10.1177/0170840613485855",
    openalex = "W2056159659",
    references = "crossref2001darwinism, doi1010160002822393921965, doi101016s004873339780234x, doi10106313067010, doi101093oso97801950926910010001, doi1023071367778, doi1023072232409, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle6432, doi105962bhltitle82303, openalexw3124140110"
}

@article{doi101038nature13400,
    author = "Moroz, Leonid L. und Kocot, Kevin M. und Citarella, Mathew R. und Sohn, Dosung und Norekian, Tigran P. und Povolotskaya, Inna und Grigorenko, Anastasia P. und Dailey, Christopher A. und Berezikov, Eugène und Buckley, Katherine M. und Ptitsyn, Andrey und Reshetov, Denis A. und Mukherjee, Krishanu und Moroz, Tatiana P. und Bobkova, Yelena und Yu, Fahong und Kapitonov, Vladimir V. und Jurka, Jerzy und Bobkov, Yuri V. und Swore, Joshua J. und Girardo, David O. und Fodor, Alexander und Gusev, Fedor und Sanford, Rachel und Bruders, Rebecca und Kittler, Ellen L. W. und Mills, Claudia E. und Rast, Jonathan P. und Derelle, Romain und Solovyev, Victor und Kondrashov, Fyodor A. und Swalla, Billie J. und Sweedler, Jonathan V. und Рогаев, Е. И. und Halanych, Kenneth M. und Kohn, Andrea B.",
    title = "Das Ctenophor-Genom und die evolutionären Ursprünge neuronaler Systeme",
    year = "2014",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature13400",
    doi = "10.1038/nature13400",
    openalex = "W2070443686",
    references = "doi101038nrg2303, doi101098rspb20090896, doi105860choice501469, openalexw659399033"
}

@incollection{clavien2015evolution,
    author = "Clavien, Christine",
    title = "Evolution, Gesellschaft und Ethik: Sozialdarwinismus versus evolutionäre Ethik",
    year = "2015",
    booktitle = "Handbook of Evolutionary Thinking in the Sciences",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-017-9014-7\_34",
    doi = "10.1007/978-94-017-9014-7\_34",
    pages = "725-745"
}

Next generation sequencing transformed the field of evolutionary biology and high throughput sequencing platforms are routinely used in phylogenomic, population genomic or metagenomic studies. Here I review the recent technical advancements of third generation sequencing instruments, thereby covering nanopore sequencing and single molecule real-time (SMRT) sequencing. The output and error rates are compared with sequencing platforms of the second generation (454 pyrosequencing, Illumina and Ion Torrent). Third generation sequencers produce sequence reads in hitherto unprecedented lengths and will help to strongly increase the quality of genome assemblies. Moreover, the speed of sequencing and ease of sample preparation enables sequencing in the field. Even though the output and error rate of the new generation of sequencer remains to be improved, new possibilities for evolutionary research will open up in the near future by these new techniques.

@article{doi1010801477200020151099575,
    author = "Bleidorn, Christoph",
    title = "Third generation sequencing: technology and its potential impact on evolutionary biodiversity research",
    year = "2015",
    journal = "Systematics and Biodiversity",
    abstract = "Next generation sequencing transformed the field of evolutionary biology and high throughput sequencing platforms are routinely used in phylogenomic, population genomic or metagenomic studies. Here I review the recent technical advancements of third generation sequencing instruments, thereby covering nanopore sequencing and single molecule real-time (SMRT) sequencing. The output and error rates are compared with sequencing platforms of the second generation (454 pyrosequencing, Illumina and Ion Torrent). Third generation sequencers produce sequence reads in hitherto unprecedented lengths and will help to strongly increase the quality of genome assemblies. Moreover, the speed of sequencing and ease of sample preparation enables sequencing in the field. Even though the output and error rate of the new generation of sequencer remains to be improved, new possibilities for evolutionary research will open up in the near future by these new techniques.",
    url = "https://doi.org/10.1080/14772000.2015.1099575",
    doi = "10.1080/14772000.2015.1099575",
    openalex = "W2222342855",
    references = "doi101016jtree201503003"
}

Wissenschaftliche Aktivitäten finden innerhalb strukturierter Mengen von Ideen und Annahmen statt, die ein Fachgebiet und seine Praktiken definieren. Das konzeptionelle Rahmenwerk der Evolutionsbiologie entstand mit der modernen Synthese im frühen 20. Jahrhundert und hat sich seitdem zu einem höchst erfolgreichen Forschungsprogramm entwickelt, um die Prozesse der Diversifizierung und Anpassung zu erforschen. Dennoch wurde die Fähigkeit dieses Rahmens, die raschen Fortschritte in der Entwicklungsbiologie, Genomik und Ökologie zufriedenstellend zu berücksichtigen, in Frage gestellt. Wir rekapitulieren einige dieser Argumente, wobei wir uns auf Literaturbereiche konzentrieren (Evo-Devo, entwicklungsbedingte Plastizität, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion), deren Implikationen für die Evolution auf zwei Arten interpretiert werden können – einerseits so, dass die interne Struktur der gegenwärtigen evolutionären Theorie erhalten bleibt, und andererseits so, dass sie auf ein alternatives konzeptionelles Rahmenwerk hinweist. Letzteres, das wir als 'extended evolutionary synthesis' (EES) bezeichnen, behält die Fundamente der evolutionären Theorie bei, unterscheidet sich jedoch in seiner Betonung der Rolle konstruktiver Prozesse in Entwicklung und Evolution sowie in der wechselseitigen Darstellung von Kausalität. Im EES teilen Entwicklungsprozesse, die über entwicklungsbedingte Verzerrung, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion wirken, die Verantwortung für Richtung und Tempo der Evolution, den Ursprung von Charaktervariationen und die Komplementarität zwischen Organismus und Umwelt. Wir erläutern die Struktur, die Kernannahmen und die neuen Vorhersagen des EES und zeigen, wie es eingesetzt werden kann, um Forschung in denjenigen Feldern zu stimulieren und voranzutreiben, die Evolutionsbiologie untersuchen oder anwenden.

@article{doi101098rspb20151019,
    author = "Laland, Kevin N. und Uller, Tobias und Feldman, Marcus W. und Sterelny, Kim und Müller, Gerd B. und Moczek, Armin P. und Jablonka, Eva und Odling‐Smee, John",
    title = "The extended evolutionary synthesis: its structure, assumptions and predictions",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Wissenschaftliche Aktivitäten finden innerhalb strukturierter Mengen von Ideen und Annahmen statt, die ein Fachgebiet und seine Praktiken definieren. Das konzeptionelle Rahmenwerk der Evolutionsbiologie entstand mit der modernen Synthese im frühen 20. Jahrhundert und hat sich seitdem zu einem höchst erfolgreichen Forschungsprogramm entwickelt, um die Prozesse der Diversifizierung und Anpassung zu erforschen. Dennoch wurde die Fähigkeit dieses Rahmens, die raschen Fortschritte in der Entwicklungsbiologie, Genomik und Ökologie zufriedenstellend zu berücksichtigen, in Frage gestellt. Wir rekapitulieren einige dieser Argumente, wobei wir uns auf Literaturbereiche konzentrieren (Evo-Devo, entwicklungsbedingte Plastizität, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion), deren Implikationen für die Evolution auf zwei Arten interpretiert werden können – einerseits so, dass die interne Struktur der gegenwärtigen evolutionären Theorie erhalten bleibt, und andererseits so, dass sie auf ein alternatives konzeptionelles Rahmenwerk hinweist. Letzteres, das wir als 'extended evolutionary synthesis' (EES) bezeichnen, behält die Fundamente der evolutionären Theorie bei, unterscheidet sich jedoch in seiner Betonung der Rolle konstruktiver Prozesse in Entwicklung und Evolution sowie in der wechselseitigen Darstellung von Kausalität. Im EES teilen Entwicklungsprozesse, die über entwicklungsbedingte Verzerrung, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion wirken, die Verantwortung für Richtung und Tempo der Evolution, den Ursprung von Charaktervariationen und die Komplementarität zwischen Organismus und Umwelt. Wir erläutern die Struktur, die Kernannahmen und die neuen Vorhersagen des EES und zeigen, wie es eingesetzt werden kann, um Forschung in denjenigen Feldern zu stimulieren und voranzutreiben, die Evolutionsbiologie untersuchen oder anwenden.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2015.1019",
    doi = "10.1098/rspb.2015.1019",
    openalex = "W2103794982",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511621123, doi101038218525a0, doi10106313050879, doi101086346135, doi101093auk1002507, doi101093oso97801951223430010001, doi101111j155856461982tb05068x, doi101126science1113832, doi101146annureves01110170000245, doi1015159780691209418, doi1015159781400847266, doi1023071367778, doi1023072260026, doi102307jctvjsf433, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice364478, doi105860choice396411, doi105962bhltitle27468, doi107208chicago97802263088830010001, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw2080618944, openalexw227636185"
}

@article{zouaoua2015application,
    author = "Zouaoua, Dalia und Crubleau, Pascal und Choulier, Denis und Richir, Simon",
    title = "Anwendung evolutionärer Gesetze",
    year = "2015",
    journal = "Procedia Engineering",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.proeng.2015.12.404",
    doi = "10.1016/j.proeng.2015.12.404",
    openalex = "W2287403478",
    pages = "922-932",
    volume = "131",
    references = "doi101016s0007850607620848, doi101111j14678691200900515x, doi101111j154058852007002764x, doi101111j15405885201100848x, doi105310220052401436, openalexw134840284, openalexw637970702"
}

Die Fähigkeit, Diagramme des Lebensbaums (ToL) zu interpretieren und daraus zu schlussfolgern, ist im 21. Jahrhundert zu einem wesentlichen Bestandteil der wissenschaftlichen Bildung geworden. Dieser Artikel berichtet über die Wirksamkeit eines auf der Forschung basierenden Lehrplans, der ein Lehrbuch, Laborpraktika und Vorlesungen umfasst, um die Grundlagen dieses Baumdenkens in einer einführenden Biologiekunde für Studierende der Naturwissenschaften zu vermitteln. Wir präsentieren die Ergebnisse einer Studie mit 117 Studierenden, die entweder unserem neuen, auf der Forschung basierenden Baumdenk-Lehrplan oder einer Routine-Unterrichtsmethode ausgesetzt waren. Wir stellten fest, dass die Gruppe mit dem experimentellen Unterricht im Baumdenken größere Fortschritte machte als die Gruppe mit der Routine-Unterrichtsmethode, gemessen an der Leistung in unserem neu entwickelten Bewertungsinstrument. Dies war ein Effekt mittlerer Größe. Diese Fortschritte wurden bei einem nicht angekündigten Test beobachtet, der ∼5-6 Wochen nach der primären Unterrichtseinheit zum Baumdenken durchgeführt wurde. Die Art der Schwierigkeiten der Studierenden im Nachunterricht beim Baumdenken deutet darauf hin, dass das kritische zugrundeliegende Konzept für die Erwerb von Kompetenz auf Expertenniveau in diesem Bereich das Verständnis ist, dass jeder spezifische phylogenetische Baum ein Teilmenge des vollständigen, unvorstellbar großen ToL ist.

@article{doi101187cbe15060127,
    author = "Novick, Laura R. und Catley, Kefyn M.",
    title = "Fostering 21st-Century Evolutionary Reasoning: Teaching Tree Thinking to Introductory Biology Students",
    year = "2016",
    journal = "CBE—Life Sciences Education",
    abstract = "Die Fähigkeit, Diagramme des Lebensbaums (ToL) zu interpretieren und daraus zu schlussfolgern, ist im 21. Jahrhundert zu einem wesentlichen Bestandteil der wissenschaftlichen Bildung geworden. Dieser Artikel berichtet über die Wirksamkeit eines auf der Forschung basierenden Lehrplans, der ein Lehrbuch, Laborpraktika und Vorlesungen umfasst, um die Grundlagen dieses Baumdenkens in einer einführenden Biologiekunde für Studierende der Naturwissenschaften zu vermitteln. Wir präsentieren die Ergebnisse einer Studie mit 117 Studierenden, die entweder unserem neuen, auf der Forschung basierenden Baumdenk-Lehrplan oder einer Routine-Unterrichtsmethode ausgesetzt waren. Wir stellten fest, dass die Gruppe mit dem experimentellen Unterricht im Baumdenken größere Fortschritte machte als die Gruppe mit der Routine-Unterrichtsmethode, gemessen an der Leistung in unserem neu entwickelten Bewertungsinstrument. Dies war ein Effekt mittlerer Größe. Diese Fortschritte wurden bei einem nicht angekündigten Test beobachtet, der ∼5-6 Wochen nach der primären Unterrichtseinheit zum Baumdenken durchgeführt wurde. Die Art der Schwierigkeiten der Studierenden im Nachunterricht beim Baumdenken deutet darauf hin, dass das kritische zugrundeliegende Konzept für die Erwerb von Kompetenz auf Expertenniveau in diesem Bereich das Verständnis ist, dass jeder spezifische phylogenetische Baum ein Teilmenge des vollständigen, unvorstellbar großen ToL ist.",
    url = "https://doi.org/10.1187/cbe.15-06-0127",
    doi = "10.1187/cbe.15-06-0127",
    openalex = "W2556407280",
    references = "doi101002sce20436, doi101007s1205200901227, doi101007s1205201002549, doi10118619366434613"
}

@article{doi101016jbiocon201805007,
    author = "Potter, Kevin M.",
    title = "Do United States protected areas effectively conserve forest tree rarity and evolutionary distinctiveness?",
    year = "2018",
    journal = "Biological Conservation",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biocon.2018.05.007",
    doi = "10.1016/j.biocon.2018.05.007",
    openalex = "W2803967095",
    references = "doi101016jtree201410002"
}

In den letzten zwei Jahrzehnten haben wir eine Wiederbelebung des Interesses an den Werken von Joseph Schumpeter und „evolutionären" Ideen in der Ökonomie im Allgemeinen gesehen. Eine Fachgesellschaft, die Schumpeters Namen ehrt, wurde gegründet, und damit verbunden haben wir seit mehr als fünfzehn Jahren nun eine Fachzeitschrift, die sich diesem Gedankengang widmet. Es wurde jedoch argumentiert, dass der Zusammenhang zwischen Schumpeters eigenem Werk und den jüngeren Beiträgen zur evolutionären Ökonomie trotz dieser jüngsten Entwicklungen tatsächlich eher schwach ist. Dieser Artikel betrachtet diese Behauptung.

@incollection{doi104337978178811026600008,
    author = "Fagerberg, Jan",
    title = "Schumpeter und die Wiederbelebung der evolutionären Ökonomie: eine Bewertung der Literatur",
    year = "2018",
    booktitle = "Edward Elgar Publishing eBooks",
    abstract = {In den letzten zwei Jahrzehnten haben wir eine Wiederbelebung des Interesses an den Werken von Joseph Schumpeter und „evolutionären" Ideen in der Ökonomie im Allgemeinen gesehen. Eine Fachgesellschaft, die Schumpeters Namen ehrt, wurde gegründet, und damit verbunden haben wir seit mehr als fünfzehn Jahren nun eine Fachzeitschrift, die sich diesem Gedankengang widmet. Es wurde jedoch argumentiert, dass der Zusammenhang zwischen Schumpeters eigenem Werk und den jüngeren Beiträgen zur evolutionären Ökonomie trotz dieser jüngsten Entwicklungen tatsächlich eher schwach ist. Dieser Artikel betrachtet diese Behauptung.},
    url = "https://doi.org/10.4337/9781788110266.00008",
    doi = "10.4337/9781788110266.00008",
    openalex = "W2070153097",
    references = "crossref2001darwinism"
}

Die Entwicklung der Theorie Darwins von 1859 bis 1926 wird betrachtet. Die «kohäsive ephemerale» Theorie der Vererbung, die in dieser Phase dominant war, zerstörte den Kern des darwinistischen Konzepts — die Vorstellung der natürlichen Selektion als führender Faktor in der Evolution. Die Ergebnisse von Studien von Genetikern der ersten Jahrzehnte des 20. Jahrhunderts wiesen ebenfalls auf die Nutzlosigkeit der Theorie der natürlichen Selektion als Faktor hin, der den Prozess der biologischen Evolution steuert. Schlüsselwörter: «Origin of Species»; «indefinite» hereditäre Variabilität; «certain» hereditäre Variabilität; natürliche Selektion; «conjointly ephemeral» Theorie der Vererbung; «constant-corpuscular» Theorie der Vererbung.

@article{doi107124visnykutgis161904,
    author = "Vagyn, Yu. V.",
    title = "Evolution of Darwinism. The classical stage: 1859 — 1926 Jahre",
    year = "2018",
    journal = "Visnik ukrains kogo tovaristva genetikiv i selekcioneriv",
    abstract = "Die Entwicklung der Theorie Darwins von 1859 bis 1926 wird betrachtet. Die «kohäsive ephemerale» Theorie der Vererbung, die in dieser Phase dominant war, zerstörte den Kern des darwinistischen Konzepts — die Vorstellung der natürlichen Selektion als führender Faktor in der Evolution. Die Ergebnisse von Studien von Genetikern der ersten Jahrzehnte des 20. Jahrhunderts wiesen ebenfalls auf die Nutzlosigkeit der Theorie der natürlichen Selektion als Faktor hin, der den Prozess der biologischen Evolution steuert. Schlüsselwörter: «Origin of Species»; «indefinite» hereditäre Variabilität; «certain» hereditäre Variabilität; natürliche Selektion; «conjointly ephemeral» Theorie der Vererbung; «constant-corpuscular» Theorie der Vererbung.",
    url = "https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.16.1.904",
    doi = "10.7124/visnyk.utgis.16.1.904",
    openalex = "W2967450105",
    references = "doi10108000033793600200111, doi1023072840896, doi105962bhltitle68064, doi107124bc0007ed"
}

Zusammenfassung Obwohl Evolution die zentrale Idee in der modernen Biologie ist, gibt es beträchtliche Unterschiede in ihrer Akzeptanz weltweit, und Berichte über anti-evolutionistische und kreationistische Bewegungen sind weit verbreitet. Pädagogen müssen die Ansätze zur Vermittlung von Evolution an Schüler neu bewerten, um ihr Verständnis und ihre Akzeptanz zu erleichtern. Ein wesentlicher Hindernis beim Verständnis der Konzepte der Evolution ist, dass Menschen die Welt tendenziell teleologisch betrachten. Lernende erschweren das Verständnis der Konzepte der Evolution, indem sie Tieren, Prozessen oder leblosen Objekten Zweck oder absichtsbewusste Handlungen zuschreiben. Ein unverzichtbares Lernwerkzeug im Bereich der Evolution ist der evolutionäre Baum, da er eine direkte Darstellung evolutionärer Hypothesen ist. Die Fähigkeit, diese Darstellungsform zu lesen und zu verstehen, ist eine Voraussetzung, um die Konzepte der Evolution vollständig zu verstehen. In dieser Arbeit stellen wir Probleme dar, die auftreten, wenn versucht wird, Schülern beizubringen, evolutionäre Bäume zu lesen, sowie problematische diagrammatische Eigenschaften, die teleologisches Denken fördern können. Darüber hinaus stellen wir Lehrpraktiken und Methoden vor, die verwendet werden können, um die oben genannten Herausforderungen zu vermeiden (aus diagrammatischer und instruktionaler Perspektive). Mit dieser Arbeit wollen wir das Bewusstsein von Pädagogen für die verschiedenen potenziellen teleologischen Fallstricke im Bereich der Lehre, wie man evolutionäre Bäume liest, schärfen und verschiedene Ansätze zur Minimierung teleologischer Argumentation und Denkens in der Evolutionserziehung vorstellen.

@article{doi101186s1205201901123,
    author = "Schramm, Thilo und Schmiemann, Philipp",
    title = "Teleologische Fallstricke beim Lesen evolutionärer Bäume und Wege, um sie zu vermeiden",
    year = "2019",
    journal = "Evolution Education and Outreach",
    abstract = "Zusammenfassung Obwohl Evolution die zentrale Idee in der modernen Biologie ist, gibt es beträchtliche Unterschiede in ihrer Akzeptanz weltweit, und Berichte über anti-evolutionistische und kreationistische Bewegungen sind weit verbreitet. Pädagogen müssen die Ansätze zur Vermittlung von Evolution an Schüler neu bewerten, um ihr Verständnis und ihre Akzeptanz zu erleichtern. Ein wesentlicher Hindernis beim Verständnis der Konzepte der Evolution ist, dass Menschen die Welt tendenziell teleologisch betrachten. Lernende erschweren das Verständnis der Konzepte der Evolution, indem sie Tieren, Prozessen oder leblosen Objekten Zweck oder absichtsbewusste Handlungen zuschreiben. Ein unverzichtbares Lernwerkzeug im Bereich der Evolution ist der evolutionäre Baum, da er eine direkte Darstellung evolutionärer Hypothesen ist. Die Fähigkeit, diese Darstellungsform zu lesen und zu verstehen, ist eine Voraussetzung, um die Konzepte der Evolution vollständig zu verstehen. In dieser Arbeit stellen wir Probleme dar, die auftreten, wenn versucht wird, Schülern beizubringen, evolutionäre Bäume zu lesen, sowie problematische diagrammatische Eigenschaften, die teleologisches Denken fördern können. Darüber hinaus stellen wir Lehrpraktiken und Methoden vor, die verwendet werden können, um die oben genannten Herausforderungen zu vermeiden (aus diagrammatischer und instruktionaler Perspektive). Mit dieser Arbeit wollen wir das Bewusstsein von Pädagogen für die verschiedenen potenziellen teleologischen Fallstricke im Bereich der Lehre, wie man evolutionäre Bäume liest, schärfen und verschiedene Ansätze zur Minimierung teleologischer Argumentation und Denkens in der Evolutionserziehung vorstellen.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12052-019-0112-3",
    doi = "10.1186/s12052-019-0112-3",
    openalex = "W2990019910",
    references = "doi101007s1205201002549"
}

Der Prozess der Kombination von Darwinismus und Genetik, der als synthetische Theorie der Evolution in die Geschichte der Biologie eingegangen ist, wird betrachtet. Schlüsselwörter: synthetische Theorie der Evolution, Neodarwinismus, das Konzept einer biologischen Art, Populationsgenetik, genetische Polymorphismus, die Theorie der Dominanz, genetische Drift.

@article{doi107124visnykutgis1711201,
    author = "Vagyn, Yu. V.",
    title = "Evolution of darwinism. Synthetic theory of evolutions: 1926 – 1975 Jahre",
    year = "2019",
    journal = "Visnik ukrains kogo tovaristva genetikiv i selekcioneriv",
    abstract = "Der Prozess der Kombination von Darwinismus und Genetik, der als synthetische Theorie der Evolution in die Geschichte der Biologie eingegangen ist, wird betrachtet. Schlüsselwörter: synthetische Theorie der Evolution, Neodarwinismus, das Konzept einer biologischen Art, Populationsgenetik, genetische Polymorphismus, die Theorie der Dominanz, genetische Drift.",
    url = "https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.17.1.1201",
    doi = "10.7124/visnyk.utgis.17.1.1201",
    openalex = "W2971981968",
    references = "doi101038149637a0, doi101093genetics16297, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle61216, doi107124visnykutgis161904"
}

Die evolutionäre Entwicklungsbiologie (Evo-Devo) untersucht die Evolution von Entwicklungsmechanismen. Hier überprüfe ich einige der Theorien, Modelle und Gesetze in der Evo-Devo, sowohl aus der Vergangenheit als auch der Gegenwart. Die Evo-Devo des 19. Jahrhunderts wurde von der Rekapitulationstheorie und Archetypen dominiert. Sie brachte uns auch die Keimschichttheorie, die Wirbelsäulentheorie des Schädels, Blütenorgane als modifizierte Blätter und die „invertierte Wirbellose"-Theorie unter anderem. Neuere Theorien und Modelle umfassen die Frameshift-Theorie, das genetische Werkzeugkasten für die Entwicklung, das ABC-Modell der Blütenentwicklung, das entwicklungsbiologische Sanduhr-Modell, das Zootyp, Urbilateria und den Hox-Code. Einige dieser neuen Theorien zeigen den Einfluss von Archetypen und Rekapitulation. Interessanterweise unterstützen jüngste Studien die alten „primordiale Blätter", „invertierte Wirbellose" und „segmentierter Kopf"-Theorien. Darüber hinaus müssen möglicherweise von Baers erste drei Gesetze rehabilitiert und das Sanduhr-Modell modifiziert werden, angesichts dessen, was Abzhanov über den maternal-zygotischen Übergang festgestellt hat. Es gibt viele vermeintliche „Gesetze" der Evo-Devo, aber ich argumentiere, dass dies lediglich Verallgemeinerungen über Trends in bestimmten Linien sind. Ich argumentiere, dass der „Körplan" ein Archetyp ist und oft so verwendet wird, dass er keine wissenschaftliche Bedeutung hat. Blickend in die Zukunft wird eine Herausforderung für die Evo-Devo darin bestehen, neue Theorien und Modelle zu entwickeln, um die Fülle neuer Daten aus Hochdurchsatz-Sequenzierung, einschließlich Einzelzell-Sequenzierung, zu berücksichtigen. Ein Schritt in diese Richtung ist die Verwendung von ausgefeilten in silico-Analysen, wie in den „transkriptomischen Sanduhr"-Modellen.

@article{doi101002jezb23096,
    author = "Richardson, Michael K.",
    title = "Theorien, Gesetze und Modelle in der Evo-Devo",
    year = "2021",
    journal = "Journal of Experimental Zoology Part B Molecular and Developmental Evolution",
    abstract = {Die evolutionäre Entwicklungsbiologie (Evo-Devo) untersucht die Evolution von Entwicklungsmechanismen. Hier überprüfe ich einige der Theorien, Modelle und Gesetze in der Evo-Devo, sowohl aus der Vergangenheit als auch der Gegenwart. Die Evo-Devo des 19. Jahrhunderts wurde von der Rekapitulationstheorie und Archetypen dominiert. Sie brachte uns auch die Keimschichttheorie, die Wirbelsäulentheorie des Schädels, Blütenorgane als modifizierte Blätter und die „invertierte Wirbellose"-Theorie unter anderem. Neuere Theorien und Modelle umfassen die Frameshift-Theorie, das genetische Werkzeugkasten für die Entwicklung, das ABC-Modell der Blütenentwicklung, das entwicklungsbiologische Sanduhr-Modell, das Zootyp, Urbilateria und den Hox-Code. Einige dieser neuen Theorien zeigen den Einfluss von Archetypen und Rekapitulation. Interessanterweise unterstützen jüngste Studien die alten „primordiale Blätter", „invertierte Wirbellose" und „segmentierter Kopf"-Theorien. Darüber hinaus müssen möglicherweise von Baers erste drei Gesetze rehabilitiert und das Sanduhr-Modell modifiziert werden, angesichts dessen, was Abzhanov über den maternal-zygotischen Übergang festgestellt hat. Es gibt viele vermeintliche „Gesetze" der Evo-Devo, aber ich argumentiere, dass dies lediglich Verallgemeinerungen über Trends in bestimmten Linien sind. Ich argumentiere, dass der „Körplan" ein Archetyp ist und oft so verwendet wird, dass er keine wissenschaftliche Bedeutung hat. Blickend in die Zukunft wird eine Herausforderung für die Evo-Devo darin bestehen, neue Theorien und Modelle zu entwickeln, um die Fülle neuer Daten aus Hochdurchsatz-Sequenzierung, einschließlich Einzelzell-Sequenzierung, zu berücksichtigen. Ein Schritt in diese Richtung ist die Verwendung von ausgefeilten in silico-Analysen, wie in den „transkriptomischen Sanduhr"-Modellen.},
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.b.23096",
    doi = "10.1002/jez.b.23096",
    openalex = "W3204462195",
    references = "doi101002aja1002030302, doi101002jezb23096, doi101016s0022519369800160, doi101038276565a0, doi101038353031a0, doi10109301982470440010001, doi101093auk1002507, doi1023072412825, doi1023072551371, doi105962bhltitle82303, openalexw2145250129"
}

Die Ergebnisse der Synthese der evolutionären Genetik und der Entwicklungsbiologie werden vorgestellt, die Ursachen der Krise der evolutionären Genetik und Wege, um sie zu überwinden, werden erklärt, und der Mechanismus der Artbildung höherer Organismen wird erläutert. Schlüsselwörter: neue evolutionäre Synthese, evolutionäre Genetik, Genetik der Ontogenese, morphogenetisches Programm, Entwicklungsgene.

@article{vagyn2021evolution,
    author = "Vagyn, Yu. V.",
    title = "Evolution of darwinism. A new evolutionary synthesis: combining evolutionary genetics and development genetics",
    year = "2021",
    journal = "Visnik ukrains'kogo tovaristva genetikiv i selekcioneriv",
    abstract = "Die Ergebnisse der Synthese der evolutionären Genetik und der Entwicklungsbiologie werden vorgestellt, die Ursachen der Krise der evolutionären Genetik und Wege, um sie zu überwinden, werden erklärt, und der Mechanismus der Artbildung höherer Organismen wird erläutert. Schlüsselwörter: neue evolutionäre Synthese, evolutionäre Genetik, Genetik der Ontogenese, morphogenetisches Programm, Entwicklungsgene.",
    url = "https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    doi = "10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    number = "1-2",
    openalex = "W3134902110",
    pages = "70-75",
    volume = "18",
    references = "doi105860choice474406, doi105962bhltitle61216, doi107124visnykutgis161904, doi107124visnykutgis1711201"
}

Gene) werden bei Tieren genutzt, um genetische Neuheiten zu erzeugen, die eine Anpassung an eine neue Umwelt ermöglichen. Wie die Entwicklung wird das Immunsystem durch Wechselwirkungen mit der Umwelt, nämlich der mikrobiellen Welt, geformt. Doch wenn es um die Erforschung von Immunabwehrmechanismen bei Wirbellosen geht, konzentriert sich das Interesse primär auf evolutionär konservierte Moleküle, die auch beim Menschen vorkommen. Hier, mit Fokus auf antivirale Immunität, argumentieren wir, dass Immungene, die beim Menschen nicht konserviert sind, eine unerforschte Ressource für die Entdeckung neuer antiviraler Strategien darstellen. Wir rekapitulieren jüngste Erkenntnisse zum cGAS-STING-Signalweg und erläutern, wie zyklische Dinukleotide, die von cGAS-ähnlichen Rezeptoren produziert werden, genutzt werden können, um das Portfolio antiviraler Gene in einem breiten Spektrum von Arten zu untersuchen. Dies wird den Boden für evo-immuno-Ansätze bereiten, die die in antivirale Abwehrmechanismen investierte Leistung von Metazoen über Hunderte von Millionen Jahren Evolution ausnutzen. Dieser Artikel ist Teil des Themenhefts 'Sculpting the microbiome: how host factors determine and respond to microbial colonization'.

@article{doi101098rstb20230068,
    author = "Imler, Jean‐Luc und Cai, Hua und Meignin, Carine und Martins, Nelson",
    title = "Evolutionary immunology to explore original antiviral strategies",
    year = "2024",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Gene) werden bei Tieren genutzt, um genetische Neuheiten zu erzeugen, die eine Anpassung an eine neue Umwelt ermöglichen. Wie die Entwicklung wird das Immunsystem durch Wechselwirkungen mit der Umwelt, nämlich der mikrobiellen Welt, geformt. Doch wenn es um die Erforschung von Immunabwehrmechanismen bei Wirbellosen geht, konzentriert sich das Interesse primär auf evolutionär konservierte Moleküle, die auch beim Menschen vorkommen. Hier, mit Fokus auf antivirale Immunität, argumentieren wir, dass Immungene, die beim Menschen nicht konserviert sind, eine unerforschte Ressource für die Entdeckung neuer antiviraler Strategien darstellen. Wir rekapitulieren jüngste Erkenntnisse zum cGAS-STING-Signalweg und erläutern, wie zyklische Dinukleotide, die von cGAS-ähnlichen Rezeptoren produziert werden, genutzt werden können, um das Portfolio antiviraler Gene in einem breiten Spektrum von Arten zu untersuchen. Dies wird den Boden für evo-immuno-Ansätze bereiten, die die in antivirale Abwehrmechanismen investierte Leistung von Metazoen über Hunderte von Millionen Jahren Evolution ausnutzen. Dieser Artikel ist Teil des Themenhefts 'Sculpting the microbiome: how host factors determine and respond to microbial colonization'.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2023.0068",
    doi = "10.1098/rstb.2023.0068",
    openalex = "W4392915981",
    references = "doi101016jydbio202202007"
}

Eine kürzlich veröffentlichte wissenschaftliche Stellungnahme und ein präsidentielles Beratungsdokument der American Heart Association erkannten ein neues Syndrom, das kardiovaskulär-nieren-metabolische Syndrom. Dies erweitert unser Verständnis dessen, was als kardioresnales Syndrom bezeichnet wurde, indem es die pathophysiologische Verknüpfung metabolischer Risikofaktoren in das vorherige Konzept des kardioresnalen Syndroms einbezieht. Wichtig ist, dass Störungen der kardialen oder renalen Physiologie zusammenwirken und signifikante nachteilige Ergebnisse hervorrufen. Das kardioresnale Syndrom ist ein wesentlicher Bestandteil des kardiovaskulär-nieren-metabolischen Syndroms und trägt zu den Kosten der Gesundheitsversorgung, Behinderungen und Sterblichkeit bei. Es ist eine quälende Krankheit, die erhebliches Interesse geweckt hat. Um das Syndrom zu verstehen, ist die Bewertung seiner teleologischen Ursprünge wichtig. Zu Beginn des Lebens erwarben Eukaryoten Exozytose zur Ausscheidung, bildeten tubuläre sekretorische Systeme zur Clearance und ein mesenchymales nukleinsäurebasiertes Vasoform zur Nährstoffverteilung. Diese Strukturen entwickelten sich zu kardiovaskulären und renalen Systemen sich entwickelnder Organismen, deren Wanderung zu Flüssen und Land komplexe, koordinierte, homöostatische Rollen auferlegte, um die intravasale Stabilität aufrechtzuerhalten. Die Gewebemineralisierung des Wirbeltierendoskeletts fügte die Regulation des renalen Kalziumhaushalts hinzu, die bei Nierenversagen zu kardiovaskulärer Verkalkung führt. Erkenntnisse über kardioresnale Erkrankungen lassen sich bis zur alten ägyptischen und chinesischen Medizin zurückverfolgen, durch die wissenschaftliche Revolution und bis zu aktuellen Einsichten in die menschliche Physiologie und Pathophysiologie. Die post-Weltkrieg-II-Epidemie der kardiovaskulären Sterblichkeit erzeugte erhebliche Informationen über kardiovaskuläre Erkrankungen, die bei Patienten mit Nierenerkrankungen höher sind und zunehmende Gesundheitsbedenken hervorriefen. Das kardioresnale Syndrom wurde in diesem Setting formell eingeführt mit einem Fokus auf Ultrafiltration zur Behandlung von Volumenüberlastung. Eine evolutionäre Überprüfung der Erkenntnisse über das kardioresnale Syndrom wird uns helfen, das neue kardiovaskulär-nieren-metabolische Syndrom besser zu verstehen.

@article{doi101161circheartfailure123011510,
    author = "Young, James B. und Eknoyan, Garabed",
    title = "Cardiorenal Syndrome: An Evolutionary Appraisal",
    year = "2024",
    journal = "Circulation Heart Failure",
    abstract = "Eine kürzlich veröffentlichte wissenschaftliche Stellungnahme und ein präsidentielles Beratungsdokument der American Heart Association erkannten ein neues Syndrom, das kardiovaskulär-nieren-metabolische Syndrom. Dies erweitert unser Verständnis dessen, was als kardioresnales Syndrom bezeichnet wurde, indem es die pathophysiologische Verknüpfung metabolischer Risikofaktoren in das vorherige Konzept des kardioresnalen Syndroms einbezieht. Wichtig ist, dass Störungen der kardialen oder renalen Physiologie zusammenwirken und signifikante nachteilige Ergebnisse hervorrufen. Das kardioresnale Syndrom ist ein wesentlicher Bestandteil des kardiovaskulär-nieren-metabolischen Syndroms und trägt zu den Kosten der Gesundheitsversorgung, Behinderungen und Sterblichkeit bei. Es ist eine quälende Krankheit, die erhebliches Interesse geweckt hat. Um das Syndrom zu verstehen, ist die Bewertung seiner teleologischen Ursprünge wichtig. Zu Beginn des Lebens erwarben Eukaryoten Exozytose zur Ausscheidung, bildeten tubuläre sekretorische Systeme zur Clearance und ein mesenchymales nukleinsäurebasiertes Vasoform zur Nährstoffverteilung. Diese Strukturen entwickelten sich zu kardiovaskulären und renalen Systemen sich entwickelnder Organismen, deren Wanderung zu Flüssen und Land komplexe, koordinierte, homöostatische Rollen auferlegte, um die intravasale Stabilität aufrechtzuerhalten. Die Gewebemineralisierung des Wirbeltierendoskeletts fügte die Regulation des renalen Kalziumhaushalts hinzu, die bei Nierenversagen zu kardiovaskulärer Verkalkung führt. Erkenntnisse über kardioresnale Erkrankungen lassen sich bis zur alten ägyptischen und chinesischen Medizin zurückverfolgen, durch die wissenschaftliche Revolution und bis zu aktuellen Einsichten in die menschliche Physiologie und Pathophysiologie. Die post-Weltkrieg-II-Epidemie der kardiovaskulären Sterblichkeit erzeugte erhebliche Informationen über kardiovaskuläre Erkrankungen, die bei Patienten mit Nierenerkrankungen höher sind und zunehmende Gesundheitsbedenken hervorriefen. Das kardioresnale Syndrom wurde in diesem Setting formell eingeführt mit einem Fokus auf Ultrafiltration zur Behandlung von Volumenüberlastung. Eine evolutionäre Überprüfung der Erkenntnisse über das kardioresnale Syndrom wird uns helfen, das neue kardiovaskulär-nieren-metabolische Syndrom besser zu verstehen.",
    url = "https://doi.org/10.1161/circheartfailure.123.011510",
    doi = "10.1161/circheartfailure.123.011510",
    openalex = "W4397022134",
    references = "doi101007s1205200800761"
}

@incollection{doi1010079789401787062622,
    author = "Ananth, Mahesh",
    title = "Menschliche Organismen aus evolutionärer Perspektive: Ihre Bedeutung für die Medizin",
    year = "2025",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-017-8706-2\_62-2",
    doi = "10.1007/978-94-017-8706-2\_62-2",
    openalex = "W4412102788",
    references = "doi101113jp284426"
}

@incollection{doi101007978940242252862,
    author = "Ananth, Mahesh",
    title = "Human Organisms from an Evolutionary Perspective: Its Significance for Medicine",
    year = "2025",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-024-2252-8\_62",
    doi = "10.1007/978-94-024-2252-8\_62",
    openalex = "W4414726152",
    references = "doi101113jp284426"
}

Die Forschung zur Biologie und Evolution von Geschlechtschromosomen hat sich hauptsächlich auf diploide XX/XY- und ZW/ZZ-Systeme konzentriert. Im Gegensatz dazu ist die Entstehung, Evolution und das Verschwinden von U/V-Systemen ein Rätsel geblieben. Hier analysieren wir Genome von neun Arten brauner Algen mit unterschiedlichen Geschlechtssystemen, um die Geschichte ihrer Geschlechtsbestimmung zu ermitteln. U/V-Geschlechtschromosomen entstanden zwischen 450 und 224 Millionen Jahren, als ein Bereich, der den entscheidenden männlich bestimmenden Faktor MIN enthält, die Rekombination einstellte. Sieben urtümliche Gene innerhalb des geschlechtsbestimmenden Bereichs zeigen eine bemerkenswerte Erhaltung über diese enorme evolutionäre Zeitspanne, obwohl verschachtelte Inversionen zu Erweiterungen des Geschlechtsloci führten, unabhängig in jeder Linie. Wir bewerten, ob diese Erweiterungen mit erhöhter morphologischer Komplexität und sexueller Differenzierung zusammenhängen, und zeigen, dass taxonomisch eingeschränkte Gene in U- und V-Chromosomen unerwartet häufig evolvieren. Wir untersuchen auch zwei Situationen, in denen U/V-verknüpfte Bereiche sich verändert haben. Erstens zeigen wir, dass die konvergente Evolution zweier monoicischer Arten durch die Akquisition U-spezifischer Gene durch urtümliche Männchen erfolgte. Zweitens beinhaltet das Fucus-dioecische System neue geschlechtsbestimmende Gene, die während der Entwicklung upstream von ehemals V-spezifischen Genen wirken. Beide Situationen haben zum Verschwinden der U- und V-Chromosomen und zur Erosion ihrer spezifischen genomischen Merkmale geführt.

@article{doi101038s4155902502838w,
    author = "Barrera‐Redondo, Josué und Lipinska, Agnieszka P. und Liu, Pengfei und Dinatale, Erica und Cossard, Guillaume und Bogaert, Kenny A. und Hoshino, Masakazu und Craig, Rory J. und Avia, Komlan und Leiria, Gonçalo und Avdievich, Elena und Liesner, Daniel und Luthringer, R. und Godfroy, Olivier und Heesch, Svenja und Nehr, Zofia und Brillet-Guéguen, Loraine und Peters, Akira F. und Hoarau, Galice und Pearson, Gareth A. und Aury, Jean‐Marc und Wincker, Patrick und Denœud, France und Cock, J. Mark und Haas, Fabian B. und Coelho, Susana M.",
    title = "Ursprung und evolutionäre Trajektorien der Geschlechtschromosomen brauner Algen",
    year = "2025",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    abstract = "Die Forschung zur Biologie und Evolution von Geschlechtschromosomen hat sich hauptsächlich auf diploide XX/XY- und ZW/ZZ-Systeme konzentriert. Im Gegensatz dazu ist die Entstehung, Evolution und das Verschwinden von U/V-Systemen ein Rätsel geblieben. Hier analysieren wir Genome von neun Arten brauner Algen mit unterschiedlichen Geschlechtssystemen, um die Geschichte ihrer Geschlechtsbestimmung zu ermitteln. U/V-Geschlechtschromosomen entstanden zwischen 450 und 224 Millionen Jahren, als ein Bereich, der den entscheidenden männlich bestimmenden Faktor MIN enthält, die Rekombination einstellte. Sieben urtümliche Gene innerhalb des geschlechtsbestimmenden Bereichs zeigen eine bemerkenswerte Erhaltung über diese enorme evolutionäre Zeitspanne, obwohl verschachtelte Inversionen zu Erweiterungen des Geschlechtsloci führten, unabhängig in jeder Linie. Wir bewerten, ob diese Erweiterungen mit erhöhter morphologischer Komplexität und sexueller Differenzierung zusammenhängen, und zeigen, dass taxonomisch eingeschränkte Gene in U- und V-Chromosomen unerwartet häufig evolvieren. Wir untersuchen auch zwei Situationen, in denen U/V-verknüpfte Bereiche sich verändert haben. Erstens zeigen wir, dass die konvergente Evolution zweier monoicischer Arten durch die Akquisition U-spezifischer Gene durch urtümliche Männchen erfolgte. Zweitens beinhaltet das Fucus-dioecische System neue geschlechtsbestimmende Gene, die während der Entwicklung upstream von ehemals V-spezifischen Genen wirken. Beide Situationen haben zum Verschwinden der U- und V-Chromosomen und zur Erosion ihrer spezifischen genomischen Merkmale geführt.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41559-025-02838-w",
    doi = "10.1038/s41559-025-02838-w",
    openalex = "W4413494774",
    references = "doi101038s41586024080598"
}

Dieser Aufsatz untersucht Agency, also Verhalten, das einem Organismus eigen ist und von ihm initiiert wird, in Bezug auf die Entwicklung mehrzelliger Organismen und deren Evolution. Wir fragen, wie agentives Verhalten zur Evolution beiträgt und sich gemeinsam mit evolutionären Übergängen von der Einzelligkeit zur Multizellularität verändert, einschließlich der Evolution von Tieren von ihren nächsten einzelligen Vorfahren. Wir betrachten die Beziehung zwischen organisatorischen Eigenschaften und der Agency mehrzelliger Organismen und kommen überraschenderweise zu dem Schluss, dass sie nicht so streng ist wie bei einzelnen Zellen. Die Hauptgründe sind zuvor nicht anerkannte morphogenetische Eigenheiten mehrzelliger Materie und die Fähigkeit der Entwicklung, Funktionalitäten der konstituierenden Zellen zu verstärken und zu partitionieren. Diese Modalitäten erzeugen neue phänotypische Ermöglichungen, die den Umfang des agentiven Verhaltens erweitern. Wir diskutieren experimentelle Ansätze, um zwischen Agency und evolvierten, stereotypen Verhaltensweisen von Organismen, einschließlich absichtlicher Handlungen, zu unterscheiden. Wir argumentieren, dass die evolvierten Komplexitäten der Tierentwicklung sie ungeeignet machen, um Einzellig-zu-Multizellular-Transformationen in der Agency experimentell zu erforschen. Wir lenken unsere Aufmerksamkeit stattdessen auf die Agency in den Lebenszyklen von sozialen Bakterien und Amöben sowie auf die Übergänge zwischen mehrzellulären und einzelligen Zuständen bei Krebs. Schließlich diskutieren wir mathematische Darstellungen von unvollständig spezifizierten dynamischen Systemen und wie sie verwendet werden können, um biologische Autonomie und Agency zu charakterisieren.

@article{doi101086735964,
    author = "Newman, Stuart A. und Benítez, Mariana und Bhat, Ramray und Glimm, Tilmann und Kumar, K. Vijay und Nanjundiah, Vidyanand und Nicholson, Daniel J. und Sarkar, Sahotra",
    title = "Agency in the Evolutionary Transition to Multicellularity",
    year = "2025",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Dieser Aufsatz untersucht Agency, also Verhalten, das einem Organismus eigen ist und von ihm initiiert wird, in Bezug auf die Entwicklung mehrzelliger Organismen und deren Evolution. Wir fragen, wie agentives Verhalten zur Evolution beiträgt und sich gemeinsam mit evolutionären Übergängen von der Einzelligkeit zur Multizellularität verändert, einschließlich der Evolution von Tieren von ihren nächsten einzelligen Vorfahren. Wir betrachten die Beziehung zwischen organisatorischen Eigenschaften und der Agency mehrzelliger Organismen und kommen überraschenderweise zu dem Schluss, dass sie nicht so streng ist wie bei einzelnen Zellen. Die Hauptgründe sind zuvor nicht anerkannte morphogenetische Eigenheiten mehrzelliger Materie und die Fähigkeit der Entwicklung, Funktionalitäten der konstituierenden Zellen zu verstärken und zu partitionieren. Diese Modalitäten erzeugen neue phänotypische Ermöglichungen, die den Umfang des agentiven Verhaltens erweitern. Wir diskutieren experimentelle Ansätze, um zwischen Agency und evolvierten, stereotypen Verhaltensweisen von Organismen, einschließlich absichtlicher Handlungen, zu unterscheiden. Wir argumentieren, dass die evolvierten Komplexitäten der Tierentwicklung sie ungeeignet machen, um Einzellig-zu-Multizellular-Transformationen in der Agency experimentell zu erforschen. Wir lenken unsere Aufmerksamkeit stattdessen auf die Agency in den Lebenszyklen von sozialen Bakterien und Amöben sowie auf die Übergänge zwischen mehrzellulären und einzelligen Zuständen bei Krebs. Schließlich diskutieren wir mathematische Darstellungen von unvollständig spezifizierten dynamischen Systemen und wie sie verwendet werden können, um biologische Autonomie und Agency zu charakterisieren.",
    url = "https://doi.org/10.1086/735964",
    doi = "10.1086/735964",
    openalex = "W4410763737",
    references = "doi101007s13752024004717, doi1010179781108616751"
}