Evolutionärer Fortschritt

Cope, Paläontologe, von seinem Lager am Galinas Creek im Rio-Grande-Becken, einschließlich einer Beschreibung neuer Arten von Wirbeltierfossilien und einer umfangreichen Reihe von Ablagerungen des Eozän, die auf das Bestehen hinweisen

@book{doi105962bhltitle166574,
    author = "of the 100th Meridian (U.S.), Geographical Surveys West and Cope, E. D.",
    title = "Report über in Neu-Mexiko entdeckte Wirbeltierfossilien: mit Beschreibungen neuer Arten /",
    year = "1874",
    booktitle = "Government Printing Office eBooks",
    abstract = "Cope, Paläontologe, von seinem Lager am Galinas Creek im Rio-Grande-Becken, einschließlich einer Beschreibung neuer Arten von Wirbeltierfossilien und einer umfangreichen Reihe von Ablagerungen des Eozän, die auf das Bestehen hinweisen",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.166574",
    doi = "10.5962/bhl.title.166574",
    openalex = "W3006670842"
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Zeitschriftenartikel VORSCHLÄGE ZUR QUANTITATIVEN BEWERTUNG DER EVOLUTIONSRATEN Zugriff erhalten J. B. S. Haldane J. B. S. Haldane Dept. of Biometry University College London Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 3, Ausgabe 1, 1. März 1949, Seiten 51–56, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00004.x Veröffentlicht: 01. März 1949 Artikelverlauf Eingegangen: 05. November 1948 Veröffentlicht: 01. März 1949

@article{doi101111j155856461949tb00004x,
    author = "Haldane, J. B. S.",
    title = "VORSCHLÄGE ZUR QUANTITATIVEN BEWERTUNG DER EVOLUTIONSRATEN",
    year = "1949",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Zeitschriftenartikel VORSCHLÄGE ZUR QUANTITATIVEN BEWERTUNG DER EVOLUTIONSRATEN Zugriff erhalten J. B. S. Haldane J. B. S. Haldane Dept. of Biometry University College London Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 3, Ausgabe 1, 1. März 1949, Seiten 51–56, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00004.x Veröffentlicht: 01. März 1949 Artikelverlauf Eingegangen: 05. November 1948 Veröffentlicht: 01. März 1949",
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    doi = "10.1111/j.1558-5646.1949.tb00004.x",
    openalex = "W2325035367",
    references = "doi10100703064746897, doi101007bf02982278, doi101007bf02982279, doi101007bf02982536, doi101093aesa383396, doi101093biomet1634328, doi101093genetics262177, doi101093oxfordjournalsaoba083238, doi101098rspb19480002, openalexw2428846785"
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@misc{haldane1949suggestions5,
    author = "Haldane, J. B. S",
    title = "Vorschläge zur quantitativen Messung der Evolutionstempo",
    year = "1949",
    howpublished = "Evolution, v. 3, p. 51-56",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Haldane, J. B. S., 1949, Vorschläge zur quantitativen Messung der Evolutionstempo: Evolution, v. 3, p. 51-56.}"
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@misc{dobzhansky1950evolution2,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Evolution in the Tropics",
    year = "1950",
    howpublished = "American Scientist, v. 38, p. 208-221",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dobzhansky, T., 1950, Evolution in the Tropics: American Scientist, v. 38, p. 208-221.}"
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@misc{ehrilch1963the3,
    author = "Ehrilch, P. R. und Holm, R. W",
    title = "Der Prozess der Evolution",
    year = "1963",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill, 347 S",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ehrilch, P. R., und Holm, R. W., 1963, Der Prozess der Evolution: New York, McGraw-Hill, 347 S.}"
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Von den drei südlichen Kontinenten war Südamerika während des Tertiärs stärker isoliert als Afrika, weniger isoliert als Australien. Sein Fossilbericht über das Säugetierleben im Känozoikum ist besser als der der anderen beiden. Dieser Bericht deutet darauf hin, dass zu Beginn des Känozoikums Südamerika einige wenige Wanderer – Beuteltiere, Zahnlose, Huftiere – erhielt, die den Kontinent über eine Wasserbarriere erreichten. Die Herkunftsregion war wahrscheinlich Mittelamerika, das bis nahe zum Ende des Tertiärs eine tropische nordamerikanische Halbinsel bildete. Einige spätere Wanderer erreichten den Kontinent über die Wasserbarriere – Nagetiere im späteren Eozän, Primaten damals oder im frühen Oligozän und Procyoniden vielleicht spät im Miozän. Von den Nachkommen dieser wenigen Einwanderer entwickelte sich eine ausgewogene Fauna, die in ihrer Zusammensetzung auffällig anders war als die anderer Kontinente. Die Evolution der verschiedenen Gruppen, die sie bilden, wird kurz vorgestellt und diskutiert. Am Ende des Tertiärs endete die Isolation des Kontinents mit der Entstehung des Isthmus von Panama. Der Faunaaustausch zwischen Nord- und Südamerika begann dann und läuft noch immer weiter. Die meisten nördlichen Teilnehmer des Austauschs drangen tief in Südamerika ein. Die südlichen Teilnehmer, die in einen Kontinent vorstießen, der periodischen kontinentalen Vereisungen ausgesetzt war, waren weniger erfolgreich; die Mehrheit von ihnen drang nicht jenseits des tropischen Gebiets vor. Konkurrenz und Aussterben während des Faunaaustauschs fanden hauptsächlich unter den Fleischfressern statt, wobei die südlichen Beuteltier durch die nördlichen Plazentaten ersetzt wurden. Die spektakulären Aussterbeereignisse, die hauptsächlich große Säugetiere sowohl nördlicher als auch südlicher Abstammung betrafen, ereigneten sich am Ende des Pleistozäns; die Ankunft des Menschen war wahrscheinlich ein wesentlicher Faktor.

@article{doi101086405916,
    author = "Patterson, Bryan und Pascual, Rosendo",
    title = "The Fossil Mammal Fauna of South America",
    year = "1968",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Von den drei südlichen Kontinenten war Südamerika während des Tertiärs stärker isoliert als Afrika, weniger isoliert als Australien. Sein Fossilbericht über das Säugetierleben im Känozoikum ist besser als der der anderen beiden. Dieser Bericht deutet darauf hin, dass zu Beginn des Känozoikums Südamerika einige wenige Wanderer – Beuteltiere, Zahnlose, Huftiere – erhielt, die den Kontinent über eine Wasserbarriere erreichten. Die Herkunftsregion war wahrscheinlich Mittelamerika, das bis nahe zum Ende des Tertiärs eine tropische nordamerikanische Halbinsel bildete. Einige spätere Wanderer erreichten den Kontinent über die Wasserbarriere – Nagetiere im späteren Eozän, Primaten damals oder im frühen Oligozän und Procyoniden vielleicht spät im Miozän. Von den Nachkommen dieser wenigen Einwanderer entwickelte sich eine ausgewogene Fauna, die in ihrer Zusammensetzung auffällig anders war als die anderer Kontinente. Die Evolution der verschiedenen Gruppen, die sie bilden, wird kurz vorgestellt und diskutiert. Am Ende des Tertiärs endete die Isolation des Kontinents mit der Entstehung des Isthmus von Panama. Der Faunaaustausch zwischen Nord- und Südamerika begann dann und läuft noch immer weiter. Die meisten nördlichen Teilnehmer des Austauschs drangen tief in Südamerika ein. Die südlichen Teilnehmer, die in einen Kontinent vorstießen, der periodischen kontinentalen Vereisungen ausgesetzt war, waren weniger erfolgreich; die Mehrheit von ihnen drang nicht jenseits des tropischen Gebiets vor. Konkurrenz und Aussterben während des Faunaaustauschs fanden hauptsächlich unter den Fleischfressern statt, wobei die südlichen Beuteltiere durch die nördlichen Plazentaten ersetzt wurden. Die spektakulären Aussterbeereignisse, die hauptsächlich große Säugetiere sowohl nördlicher als auch südlicher Abstammung betrafen, ereigneten sich am Ende des Pleistozäns; die Ankunft des Menschen war wahrscheinlich ein wesentlicher Faktor.",
    url = "https://doi.org/10.1086/405916",
    doi = "10.1086/405916",
    openalex = "W2059320655"
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Bestimmte wurmförmige Strukturen auf Gesteinen werden als Schrumpfungsrisse erkannt. Einige echte präkambrische Übergangsfossilien werden kurz beschrieben. Das frühe Cambrium enthält eine reichere Assemblage, einschließlich einiger charakteristischer und weit verbreiteter Formgattungen. Die Untersuchung früher Übergangsfossilien führt zu Schlussfolgerungen nicht nur über Fazies, sondern auch über die Evolution von Verhalten und funktioneller Morphologie bei weichkörperigen Organismen.

@article{doi101111j150239311969tb01258x,
    author = "Glaessner, Martin F.",
    title = "ÜBERGANGSFOSSEILE AUS DEM PRECAMBRIUM UND DEM BASAL CAMBRIUM",
    year = "1969",
    journal = "Lethaia",
    abstract = "Bestimmte wurmförmige Strukturen auf Gesteinen werden als Schrumpfungsrisse erkannt. Einige echte präkambrische Übergangsfossilien werden kurz beschrieben. Das frühe Cambrium enthält eine reichere Assemblage, einschließlich einiger charakteristischer und weit verbreiteter Formgattungen. Die Untersuchung früher Übergangsfossilien führt zu Schlussfolgerungen nicht nur über Fazies, sondern auch über die Evolution von Verhalten und funktioneller Morphologie bei weichkörperigen Organismen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1502-3931.1969.tb01258.x",
    doi = "10.1111/j.1502-3931.1969.tb01258.x",
    openalex = "W1975727583",
    references = "doi1010160031018266900113, doi101038scientificamerican036172, doi10108011035896509448903, doi101086626811, doi101111j1469185x1962tb01331x, doi101111j150239311968tb01740x, doi101126science1543750766, doi101130gsab481873, doi101144gsljgs1890046010439, openalexw2170541304, openalexw2586923183"
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Misonne, X. African and Indo-Australian Muridae: Evolutionary Trends. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Belgique. Annales, Serie In-8°, Sciences Zoologiques, 172:1–219 Zugriff Misonne X.African and Indo-Australian Muridae: Evolutionary Trends. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Belgique. Annales, Serie In-8°, Sciences Zoologiques, 172: 1–219, 27 pls., 10 figs, in text, 1969. Kein Preis angegeben. Duane A. Schlitter Duane A. Schlitter Department of Zoology, University of Maryland, College Park, 20742 Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Journal of Mammalogy, Volume 54, Issue 3, 31 August 1973, Pages 795–796, https://doi.org/10.2307/1378990 Veröffentlicht: 31 August 1973

@article{doi1023071378990,
    author = "Schlitter, Duane A. und Misonne, Xavier",
    title = "African and Indo-Australian Muridae: Evolutionary Trends",
    year = "1973",
    journal = "Journal of Mammalogy",
    abstract = "Misonne, X. African and Indo-Australian Muridae: Evolutionary Trends. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Belgique. Annales, Serie In-8°, Sciences Zoologiques, 172:1–219 Zugriff Misonne X.African and Indo-Australian Muridae: Evolutionary Trends. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Belgique. Annales, Serie In-8°, Sciences Zoologiques, 172: 1–219, 27 pls., 10 figs, in text, 1969. Kein Preis angegeben. Duane A. Schlitter Duane A. Schlitter Department of Zoology, University of Maryland, College Park, 20742 Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Journal of Mammalogy, Volume 54, Issue 3, 31 August 1973, Pages 795–796, https://doi.org/10.2307/1378990 Veröffentlicht: 31 August 1973",
    url = "https://doi.org/10.2307/1378990",
    doi = "10.2307/1378990",
    openalex = "W2235767591"
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@article{openalexw2145250129,
    author = "Valen, Leigh Van",
    title = "A NEW EVOLUTIONARY LAW.",
    year = "1973",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    openalex = "W2145250129"
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Die Gebisse sympatrischer fossiler (oder lebender) Säugetierarten, die einen relativ jüngsten gemeinsamen Vorfahren teilen, lassen sich oft nicht allein anhand ihrer Form unterscheiden. In solchen Fällen sind Größenunterschiede wichtig für die Diagnose der Arten. Messungen der Länge und Breite der unteren Molaren und Prämolaren großer Stichproben von 19 Arten lebender Säugetiere zeigen, dass M1 in der Regel die geringste Größenvariabilität aufweist, während P3, P4 und M3 die höchste Variabilität aufweisen. Die geringe Variabilität von M1 ist vermutlich darauf zurückzuführen, dass es der erste bleibende Zahn ist, der sich bildet und durchbricht, sowie auf seine zentrale Position im Zahnreihen. Aufgrund seiner geringen Variabilität ist M1 der beste Zahn, auf dem man die Diagnose der Größe für sehr eng verwandte sympatrische fossile Arten basieren lassen kann. Beispiele für die Diagnose von zwei Arten der fossilen Primaten Plesiadapis (bei Cernay), Pelycodus (bei Avenay) und Protoadapis (bei Grauves) werden gegeben. Die Fähigkeit, eng verwandte sympatrische Arten zu unterscheiden, ist grundlegend für die Rekonstruktion der phylogenetischen Geschichte einer Gruppe aus dem Fossilbericht.

@article{openalexw2322266803,
    author = "Gingerich, Philip D.",
    title = "SIZE VARIABILITY OF THE TEETH IN LIVING MAMMALS AND THE DIAGNOSIS OF CLOSELY RELATED SYMPATRIC FOSSIL SPECIES",
    year = "1974",
    journal = "Journal of Paleontology",
    abstract = "The dentitions of sympatric fossil (or living) mammalian species which share a relatively recent common ancestor often cannot be distinguished by form alone. In such cases, size differences are important in diagnosing the species. Measurements of the length and width of the lower molars and premolars of large samples of 19 species of living mammals demonstrate that M1 is usually the least variable in size, and that P3, P4, and M3 are the most variable. The low variability of M1 is presumably related to the fact that it is the first permanent tooth to form and erupt, and to its central position in the tooth row. Because of its low variability, M1 is the best tooth on which to base size diagnoses of very closely related sympatric fossil species. Examples are given of the diagnosis of two species of the fossil primates Plesiadapis (at Cernay), Pelycodus (at Avenay), and Protoadapis (at Grauves). The ability to distinguish closely related sympatric species is fundamental to reconstructing the phylogenetic history of any group from the fossil record.",
    openalex = "W2322266803"
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@book{crossref1977patterns,
    title = "Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record",
    year = "1977",
    booktitle = "Developments in Palaeontology and Stratigraphy",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    doi = "10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    openalex = "W563635432"
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@book{gingerich1977patterns4,
    author = "Gingerich, P. D",
    title = "Patterns of Evolution in the Mammalian Fossil Record, in Hallam, A., ed., Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record",
    year = "1977",
    publisher = "Amsterdam, Elsevier, p. 469-500",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gingerich, P. D., 1977, Patterns of Evolution in the Mammalian Fossil Record, in Hallam, A., ed., Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record: Amsterdam, Elsevier, p. 469-500.}"
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@book{hallam1977patterns6,
    author = "Hallam, A",
    title = "Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record, 5 of Developments in Palaeontology and Stratigraphy",
    year = "1977",
    publisher = "Amsterdam, Elsevier",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hallam, A., 1977, Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record, 5 of Developments in Palaeontology and Stratigraphy: Amsterdam, Elsevier.}"
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@article{bretsky1978patterns,
    author = "Bretsky, Sara S.",
    title = "Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record. A. Hallam",
    year = "1978",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/410816",
    doi = "10.1086/410816",
    number = "4",
    openalex = "W2514820112",
    pages = "431-432",
    volume = "53"
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@article{simpson1978patterns,
    author = "SIMPSON, G",
    title = "Patterns of evolution, wie sie durch den Fossilbericht illustriert werden",
    year = "1978",
    journal = "Earth-Science Reviews",
    url = "https://doi.org/10.1016/0012-8252(78)90014-4",
    doi = "10.1016/0012-8252(78)90014-4",
    number = "2",
    openalex = "W3036197351",
    pages = "177-178",
    volume = "14"
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@article{cowen1979patterns,
    author = "Cowen, R.",
    title = "Patterns of evolution as illustrated by the fossil record",
    year = "1979",
    journal = "Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0031-0182(79)90127-5",
    doi = "10.1016/0031-0182(79)90127-5",
    openalex = "W2323803959",
    pages = "323-324",
    volume = "28"
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@article{haugh1979patterns,
    author = "Haugh, Bruce N.",
    title = "Patterns of evolution as illustrated by the fossil record",
    year = "1979",
    journal = "Precambrian Research",
    url = "https://doi.org/10.1016/0301-9268(79)90046-9",
    doi = "10.1016/0301-9268(79)90046-9",
    number = "1-2",
    openalex = "W2612078796",
    pages = "147-148",
    volume = "8"
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Angaben zur Anzahl mariner Familien innerhalb von 91 Metazoenklassen, die aus dem Fossilbericht des Phanerozoik bekannt sind, werden analysiert. Die Verteilung der 2800 fossilen Familien auf die Klassen ist sehr ungleichmäßig, wobei die meisten zu einer kleinen Minderheit der Klassen gehören. Ebenso ist die stratigraphische Verteilung der Klassen sehr ungleichmäßig, wobei die meisten erstmals früh im Paläozoikum erscheinen und viele der kleineren Klassen vor dem Ende dieser Ära aussterben. Dennoch zeigt eine Q-Modus-Faktoranalyse trotz dieser Ungleichmäßigkeit, dass die Struktur dieser Daten eher einfach ist. Nur drei Faktoren sind erforderlich, um mehr als 90 % der Daten zu erklären. Diese Faktoren werden als Ausdruck der drei großen „evolutionären Faunen" des marinen Fossilberichts des Phanerozoik interpretiert: eine trilobiten-dominierte kambriische Fauna, eine brachiopoden-dominierte spätpaläozoische Fauna und eine muschel-dominierte mesozoisch-känozoische oder „moderne" Fauna. Kleinere Faktoren beziehen sich auf den langsamen taxonomischen Wandel innerhalb der großen Faunen über die Zeit und auf einzigartige Aspekte bestimmter Taxa und Zeiträume. Jede der drei großen Faunen scheint eine eigene charakteristische Diversität aufzuweisen, so dass ihre Expansion oder Kontraktion eng mit einer bestimmten Phase in der Geschichte der gesamten marinen Diversität verbunden erscheint. Die kambriische Fauna expandiert während der frühen kambrischen Radiationen rasch und behält ihre Dominanz während des mittleren bis späten kambrischen „Gleichgewichts". Die paläozoische Fauna steigt dann während der ordovizischen Radiationen zur Dominanz auf, die die Diversität dramatisch erhöhen; diese neue Fauna behält dann die Dominanz während des langen Intervalls scheinbaren Gleichgewichts, das bis zum Ende des Paläozoikums anhält. Die moderne Fauna, die während des Paläozoikums langsam an Bedeutung gewinnt, steigt mit den späten permischen Aussterbeereignissen schnell zur Dominanz auf und behält diesen Status während des allgemeinen Anstiegs der Diversität bis zum scheinbaren Maximum im Neogen bei. Der mit der Expansion jeder neuen Fauna verbundene Anstieg der Diversität scheint mit einem etwa exponentiellen Rückgang der zuvor dominierenden Fauna übereinzustimmen, was eine mögliche Verdrängung jeder evolutionären Fauna durch ihre Nachfolger nahelegt.

@article{doi101017s0094837300003778,
    author = "Sepkoski, J. John",
    title = "Eine faktoranalytische Beschreibung des Fossilberichts mariner Organismen des Phanerozoik",
    year = "1981",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Angaben zur Anzahl mariner Familien innerhalb von 91 Metazoenklassen, die aus dem Fossilbericht des Phanerozoik bekannt sind, werden analysiert. Die Verteilung der 2800 fossilen Familien auf die Klassen ist sehr ungleichmäßig, wobei die meisten zu einer kleinen Minderheit der Klassen gehören. Ebenso ist die stratigraphische Verteilung der Klassen sehr ungleichmäßig, wobei die meisten erstmals früh im Paläozoikum erscheinen und viele der kleineren Klassen vor dem Ende dieser Ära aussterben. Dennoch zeigt eine Q-Modus-Faktoranalyse trotz dieser Ungleichmäßigkeit, dass die Struktur dieser Daten eher einfach ist. Nur drei Faktoren sind erforderlich, um mehr als 90\% der Daten zu erklären. Diese Faktoren werden als Ausdruck der drei großen „evolutionären Faunen" des marinen Fossilberichts des Phanerozoik interpretiert: eine trilobiten-dominierte kambriische Fauna, eine brachiopoden-dominierte spätpaläozoische Fauna und eine muschel-dominierte mesozoisch-känozoische oder „moderne" Fauna. Kleinere Faktoren beziehen sich auf den langsamen taxonomischen Wandel innerhalb der großen Faunen über die Zeit und auf einzigartige Aspekte bestimmter Taxa und Zeiträume. Jede der drei großen Faunen scheint eine eigene charakteristische Diversität aufzuweisen, so dass ihre Expansion oder Kontraktion eng mit einer bestimmten Phase in der Geschichte der gesamten marinen Diversität verbunden erscheint. Die kambriische Fauna expandiert während der frühen kambrischen Radiationen rasch und behält ihre Dominanz während des mittleren bis späten kambrischen „Gleichgewichts". Die paläozoische Fauna steigt dann während der ordovizischen Radiationen zur Dominanz auf, die die Diversität dramatisch erhöhen; diese neue Fauna behält dann die Dominanz während des langen Intervalls scheinbaren Gleichgewichts, das bis zum Ende des Paläozoikums anhält. Die moderne Fauna, die während des Paläozoikums langsam an Bedeutung gewinnt, steigt mit den späten permischen Aussterbeereignissen schnell zur Dominanz auf und behält diesen Status während des allgemeinen Anstiegs der Diversität bis zum scheinbaren Maximum im Neogen bei. Der mit der Expansion jeder neuen Fauna verbundene Anstieg der Diversität scheint mit einem etwa exponentiellen Rückgang der zuvor dominierenden Fauna übereinzustimmen, was eine mögliche Verdrängung jeder evolutionären Fauna durch ihre Nachfolger nahelegt.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300003778",
    doi = "10.1017/s0094837300003778",
    openalex = "W2505144080",
    references = "doi10100797814613088367, doi1010160012825272900724, doi101017s0094837300004917, doi101017s009483730000508x, doi101017s0094837300005236, doi101017s0094837300005352, doi101017s0094837300005649, doi101017s0094837300005972, doi101017s0094837300012549, doi101126science17740541065, doi101126science2064415217, doi101130spe89p63, doi1023071483846, doi1023071796560, doi1023072405671, doi1023072412725, doi1023072412728, doi1023072806339, doi107312simp93764, openalexw1504049102, openalexw645218623"
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@article{doi1023072402394,
    author = "Cloudsley‐Thompson, J. L. und Soulé, Michael E. und Wilcox, Bruce A.",
    title = "Conservation Biology. An Evolutionary-Ecological Perspective.",
    year = "1981",
    journal = "Journal of Applied Ecology",
    url = "https://doi.org/10.2307/2402394",
    doi = "10.2307/2402394",
    openalex = "W1587420391"
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@article{doi1023072806339,
    author = "Funk, Vicki A. und Eldredge, Niles und Cracraft, Joël",
    title = "Phylogenetische Muster und der evolutionäre Prozess.",
    year = "1981",
    journal = "Brittonia",
    url = "https://doi.org/10.2307/2806339",
    doi = "10.2307/2806339",
    openalex = "W2330719889"
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@misc{jaanusson1981functional7,
    author = "Jaanusson, V",
    title = "Funktionsschwellen im evolutionären Fortschritt",
    year = "1981",
    howpublished = "Lethaia, v. 14, p. 251-260",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Jaanusson, V., 1981, Funktionsschwellen im evolutionären Fortschritt: Lethaia, v. 14, p. 251-260.}"
}

Zahngröße variiert exponentiell mit dem Körpergewicht bei Primaten. Die logarithmische Transformation der Zahnkronenfläche und des Körpergewichts ergibt ein lineares Modell mit einer Steigung von 0,67 als isometrische (geometrische) Basislinie für die Untersuchung der dentalen Allometrie. Dieses Modell wird mit demjenigen verglichen, das durch metabolische Skalierung vorhergesagt wird (Steigung = 0,75). Tarsius und andere Insektenfresser haben im Verhältnis zu ihrer Körpergröße größere Zähne als generalisierte Primaten und sind in dieser Analyse nicht enthalten. Bei generalisierten Primaten korreliert die Zahngröße stark mit der Körpergröße. Die Korrelationen zwischen Ober- und Unterkieferbackenzähnen und der Körpergröße liegen zwischen 0,90 und 0,97, abhängig von der Zahnposition. Zentrale Backenzähne (P44 und M11) weisen allometrische Koeffizienten zwischen 0,57 und 0,65 auf, die deutlich unterhalb der geometrischen Skalierung liegen. Vorder- und hintere Backenzähne skalieren bei oder über der metabolischen Skalierung. Werden sie einzeln oder als Gruppe betrachtet, skalieren die oberen Backenzähne allometrisch mit niedrigeren Koeffizienten als die entsprechenden unteren Backenzähne; das Gegenteil gilt für Schneidezähne. Die Summe der Kronenflächen aller oberen Backenzähne skaliert signifikant unterhalb der geometrischen Skalierung, während die Summe der Kronenflächen aller unteren Backenzähne der geometrischen Skalierung entspricht. Die Zahngröße kann verwendet werden, um das Körpergewicht generalisierter fossiler Primaten vorherzusagen. Dies wird für Aegyptopithecus und andere primaten aus dem Eozän, Oligozän und Miozän illustriert. Regressionen, die auf der Zahngröße bei generalisierten Primaten basieren, liefern vernünftige Schätzungen des Körpergewichts, aber es bleibt noch viel zu lernen über die Skalierung von Zahn- und Körpergröße in engeren systematischen Gruppen und Ernährungsgruppen.

@article{doi101002ajpa1330580110,
    author = "Gingerich, Philip D. und Smith, B. Holly und Rosenberg, Karen",
    title = "Allometrische Skalierung in der Zahnform von Primaten und Vorhersage des Körpergewichts aus der Zahngröße in Fossilien",
    year = "1982",
    journal = "American Journal of Physical Anthropology",
    abstract = "Zahngröße variiert exponentiell mit dem Körpergewicht bei Primaten. Die logarithmische Transformation der Zahnkronenfläche und des Körpergewichts ergibt ein lineares Modell mit einer Steigung von 0,67 als isometrische (geometrische) Basislinie für die Untersuchung der dentalen Allometrie. Dieses Modell wird mit demjenigen verglichen, das durch metabolische Skalierung vorhergesagt wird (Steigung = 0,75). Tarsius und andere Insektenfresser haben im Verhältnis zu ihrer Körpergröße größere Zähne als generalisierte Primaten und sind in dieser Analyse nicht enthalten. Bei generalisierten Primaten korreliert die Zahngröße stark mit der Körpergröße. Die Korrelationen zwischen Ober- und Unterkieferbackenzähnen und der Körpergröße liegen zwischen 0,90 und 0,97, abhängig von der Zahnposition. Zentrale Backenzähne (P44 und M11) weisen allometrische Koeffizienten zwischen 0,57 und 0,65 auf, die deutlich unterhalb der geometrischen Skalierung liegen. Vorder- und hintere Backenzähne skalieren bei oder über der metabolischen Skalierung. Werden sie einzeln oder als Gruppe betrachtet, skalieren die oberen Backenzähne allometrisch mit niedrigeren Koeffizienten als die entsprechenden unteren Backenzähne; das Gegenteil gilt für Schneidezähne. Die Summe der Kronenflächen aller oberen Backenzähne skaliert signifikant unterhalb der geometrischen Skalierung, während die Summe der Kronenflächen aller unteren Backenzähne der geometrischen Skalierung entspricht. Die Zahngröße kann verwendet werden, um das Körpergewicht generalisierter fossiler Primaten vorherzusagen. Dies wird für Aegyptopithecus und andere primaten aus dem Eozän, Oligozän und Miozän illustriert. Regressionen, die auf der Zahngröße bei generalisierten Primaten basieren, liefern vernünftige Schätzungen des Körpergewichts, aber es bleibt noch viel zu lernen über die Skalierung von Zahn- und Körpergröße in engeren systematischen Gruppen und Ernährungsgruppen.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ajpa.1330580110",
    doi = "10.1002/ajpa.1330580110",
    openalex = "W2165987887",
    references = "doi101159000155026, doi1023072412851, openalexw201159638, wolpoff1975allometry"
}

Eine neue Zusammenstellung von Fossilien-Daten zu Wirbellosen und Wirbeltier-Familien zeigt, dass vier Massenaussterben im marinen Bereich statistisch von den Hintergrund-Aussterberaten unterschiedlich sind. Diese vier ereigneten sich spät in den Ordovizium-, Permium-, Trias- und Kreide-Perioden. Ein fünftes Aussterbeereignis im Devon fällt aus dem Hintergrund heraus, ist aber in diesen Daten nicht statistisch signifikant. Die Hintergrund-Aussterberaten scheinen seit der Zeit des Kambriums zurückgegangen zu sein, was mit der Vorhersage übereinstimmt, dass die Optimierung der Fitness sich im Laufe der evolutionären Zeit erhöhen sollte.

@article{doi101126science21545391501,
    author = "Raup, David M. und Sepkoski, J. John",
    title = "Mass Extinctions in the Marine Fossil Record",
    year = "1982",
    journal = "Science",
    abstract = "Eine neue Zusammenstellung von Fossilien-Daten zu Wirbellosen und Wirbeltier-Familien zeigt, dass vier Massenaussterben im marinen Bereich statistisch von den Hintergrund-Aussterberaten unterschiedlich sind. Diese vier ereigneten sich spät in den Ordovizium-, Permium-, Trias- und Kreide-Perioden. Ein fünftes Aussterbeereignis im Devon fällt aus dem Hintergrund heraus, ist aber in diesen Daten nicht statistisch signifikant. Die Hintergrund-Aussterberaten scheinen seit der Zeit des Kambriums zurückgegangen zu sein, was mit der Vorhersage übereinstimmt, dass die Optimierung der Fitness sich im Laufe der evolutionären Zeit erhöhen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.215.4539.1501",
    doi = "10.1126/science.215.4539.1501",
    openalex = "W1976721572",
    references = "doi101017s009483730000511x, doi101017s0094837300006539, doi101130spe89p63, doi105281zenodo16226412, openalexw2335729143, openalexw2591197405, openalexw2596207362"
}

Clusteranalysen von kambro-ordovizischen marinen benthischen Gemeinschaften und Gemeinschafts-Trophie-Analysen von spät-kreidezeitischen Shelf-Faunen deuten darauf hin, dass wesentliche ökologische Innovationen in Küstennähe entstanden und sich dann nach außen über das Shelf ausbreiteten, auf Kosten älterer Gemeinschaftstypen. Dieses Muster der Küsteninnovation, der offshore-archaischen evolutionären Entwicklung, ist angesichts der allgemein höheren Artenumsatzraten von offshore-Kladen überraschend. Dieses Muster resultiert wahrscheinlich aus unterschiedlichen Aussterberaten von Küsten- im Vergleich zu offshore-Kladen oder aus unterschiedlichen Entstehungsraten neuer ökologischer Assoziationen oder evolutionärer Neuheiten in Küstennähe.

@article{doi101126science22246281123,
    author = "Jablonski, David und Sepkoski, J. John und Bottjer, David J. und Sheehan, Peter M.",
    title = "Onshore-Offshore Patterns in the Evolution of Phanerozoic Shelf Communities",
    year = "1983",
    journal = "Science",
    abstract = "Clusteranalysen von kambro-ordovizischen marinen benthischen Gemeinschaften und Gemeinschafts-Trophie-Analysen von spät-kreidezeitischen Shelf-Faunen deuten darauf hin, dass wesentliche ökologische Innovationen in Küstennähe entstanden und sich dann nach außen über das Shelf ausbreiteten, auf Kosten älterer Gemeinschaftstypen. Dieses Muster der Küsteninnovation, der offshore-archaischen evolutionären Entwicklung, ist angesichts der allgemein höheren Artenumsatzraten von offshore-Kladen überraschend. Dieses Muster resultiert wahrscheinlich aus unterschiedlichen Aussterberaten von Küsten- im Vergleich zu offshore-Kladen oder aus unterschiedlichen Entstehungsraten neuer ökologischer Assoziationen oder evolutionärer Neuheiten in Küstennähe.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.222.4628.1123",
    doi = "10.1126/science.222.4628.1123",
    openalex = "W1973535425",
    references = "bretsky1968evolution, doi1010079781475707403, doi101017s0094837300003778, doi101017s0094837300005224, doi101017s0094837300005236, doi101017s0094837300005352, doi101017s009483730001246x, doi101038293435a0, doi101111j1469185x1983tb00380x, doi101126science21545391501, doi101126science2164542173, doi101130spe89p63"
}

@book{ali1984photoreception1,
    author = "Ali, M. A",
    title = "Photoreception and Vision in Invertebrates",
    year = "1984",
    publisher = "New York, Plenum Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ali, M. A., 1984, Photoreception and Vision in Invertebrates: New York, Plenum Press.}"
}

Unser Verständnis der Primaten-Evolution basiert letztlich auf Mustern phylogenetischer Beziehungen und morphologischer Veränderungen, die im Fossilbericht dokumentiert sind. Die stratophenetische Interpretation lebender und fossiler Primaten liefert eine objektive Alternative zur willkürlichen Scala Naturae, die implizit in der traditionellen vergleichenden Biologie angenommen wird. Fossilien liefern einen Überblick über die Primaten-Geschichte, der vergleichende Analysen einschränkt, die Taxa und morphologische Merkmale umfassen, die nicht im Fossilbericht vertreten sind. Existierende Taxa ohne bekannte prähistorische Verwandte können in diesen Überblick interpoliert werden, indem deduktive cladistische Analysen morphologischer Merkmale und der allgemeinen molekularen Ähnlichkeit durchgeführt werden. Cladistische Analyse bietet eine Methode zur Bewertung der relativen Stärke stratophenetischer Verbindungen zwischen Taxa. Der phylogenetische Knoten, der Anthropoidea-Adapoidea-Lemuroidea verbindet, wird hier als Beispiel analysiert: die Verbindung zwischen eozänen Adapoidea und primitiven Anthropoidea scheint stärker zu sein als die zwischen Adapoidea und Lemuroidea, da sie auf geteilten abgeleiteten statt auf geteilten primitiven Merkmalen basiert. Die vollständige Integration molekularer Ergebnisse mit morphologischen Informationen erfordert ein besseres Verständnis der Raten molekularer Veränderungen über geologische Zeit. Raten molekularer Evolution können untersucht werden, indem paläontologisch dokumentierte Divergenzzeiten für Prosimii-Anthropoidea (ca. 55 m.y.B.P.), Platyrrhini-Catarrhini (ca. 40 m.y.B.P.) und Hominoidea-Cercopithecoidea (ca. 25 m.y.B.P.) verwendet werden. Immunologische Distanzen in Kombination mit diesen Divergenzzeiten deuten darauf hin, dass Primaten-Albumin, das weit verbreitet als molekularer Takt in Primatologie verwendet wird, über geologische Zeit nichtlinear evolviert hat. Ein nichtlinearer Albumin-Takt liefert Divergenzzeiten von etwa 9 Millionen Jahren vor heute für Menschen und Schimpansen sowie etwa 13 Millionen Jahre vor heute für Menschen und Orang-Utans (verglichen mit 4 m.y.B.P. und 7 m.y.B.P. bzw., basierend auf einem linearen Albumin-Takt). Das scheinbare Verlangsamen der Albumin-Evolution über die Zeit bleibt vollständig zu erklären. Andere Proteine und Nukleinsäuren könnten bessere Takte bieten. Cladistische Analyse morphologischer Merkmale und vergleichende Studien der molekularen Struktur, interpretiert im Kontext des Fossilberichts, versprechen einen vollständigeren Verständnis der Primaten-Evolution beizutragen.

@article{doi101002ajpa1330270504,
    author = "Gingerich, Philip D.",
    title = "Primaten-Evolution: Belege aus dem Fossilbericht, vergleichender Morphologie und Molekularbiologie",
    year = "1984",
    journal = "American Journal of Physical Anthropology",
    abstract = "Unser Verständnis der Primaten-Evolution basiert letztlich auf Mustern phylogenetischer Beziehungen und morphologischer Veränderungen, die im Fossilbericht dokumentiert sind. Die stratophenetische Interpretation lebender und fossiler Primaten liefert eine objektive Alternative zur willkürlichen Scala Naturae, die implizit in der traditionellen vergleichenden Biologie angenommen wird. Fossilien liefern einen Überblick über die Primaten-Geschichte, der vergleichende Analysen einschränkt, die Taxa und morphologische Merkmale umfassen, die nicht im Fossilbericht vertreten sind. Existierende Taxa ohne bekannte prähistorische Verwandte können in diesen Überblick interpoliert werden, indem deduktive cladistische Analysen morphologischer Merkmale und der allgemeinen molekularen Ähnlichkeit durchgeführt werden. Cladistische Analyse bietet eine Methode zur Bewertung der relativen Stärke stratophenetischer Verbindungen zwischen Taxa. Der phylogenetische Knoten, der Anthropoidea-Adapoidea-Lemuroidea verbindet, wird hier als Beispiel analysiert: die Verbindung zwischen eozänen Adapoidea und primitiven Anthropoidea scheint stärker zu sein als die zwischen Adapoidea und Lemuroidea, da sie auf geteilten abgeleiteten statt auf geteilten primitiven Merkmalen basiert. Die vollständige Integration molekularer Ergebnisse mit morphologischen Informationen erfordert ein besseres Verständnis der Raten molekularer Veränderungen über geologische Zeit. Raten molekularer Evolution können untersucht werden, indem paläontologisch dokumentierte Divergenzzeiten für Prosimii-Anthropoidea (ca. 55 m.y.B.P.), Platyrrhini-Catarrhini (ca. 40 m.y.B.P.) und Hominoidea-Cercopithecoidea (ca. 25 m.y.B.P.) verwendet werden. Immunologische Distanzen in Kombination mit diesen Divergenzzeiten deuten darauf hin, dass Primaten-Albumin, das weit verbreitet als molekularer Takt in Primatologie verwendet wird, über geologische Zeit nichtlinear evolviert hat. Ein nichtlinearer Albumin-Takt liefert Divergenzzeiten von etwa 9 Millionen Jahren vor heute für Menschen und Schimpansen sowie etwa 13 Millionen Jahre vor heute für Menschen und Orang-Utans (verglichen mit 4 m.y.B.P. und 7 m.y.B.P. bzw., basierend auf einem linearen Albumin-Takt). Das scheinbare Verlangsamen der Albumin-Evolution über die Zeit bleibt vollständig zu erklären. Andere Proteine und Nukleinsäuren könnten bessere Takte bieten. Cladistische Analyse morphologischer Merkmale und vergleichende Studien der molekularen Struktur, interpretiert im Kontext des Fossilberichts, versprechen einen vollständigeren Verständnis der Primaten-Evolution beizutragen.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ajpa.1330270504",
    doi = "10.1002/ajpa.1330270504",
    openalex = "W2048307773",
    references = "doi101093sysbio242209, doi101126science1683931578, doi1023072412851"
}

Es werden einige statistische Methoden zur Erfassung und Schätzung der Variabilität der Evolutionsrate beschrieben, basierend auf biometrischen Daten zu einzelnen Merkmalen in fossilen Linien. Die Methoden wurden auf einige veröffentlichte Beispiele von Protisten- und Säugetierlinien angewendet, die eine Dauer von 0,8 bis 6,4 Myr umfassen. Von den untersuchten sechs Fällen zeigte nur einer keine Hinweise auf eine signifikante Variation der Evolutionsrate, und nur vier weichten signifikant von einem Random-Walk-Muster ab, trotz signifikanter netter evolutionärer Veränderung in allen Fällen außer einem.

@article{doi101017s0094837300008289,
    author = "Charlesworth, Brian",
    title = "Some quantitative methods for studying evolutionary patterns in single characters",
    year = "1984",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Some statistical methods are described for the detection and estimation of variability in the rate of evolution, from biometrical data on single characters in fossil lineages. The methods were applied to some published examples of protistan and mammalian lineages, extending between 0.8 and 6.4 Myr in duration. Of six cases examined, only one failed to show evidence for significant variation in the rate of evolution, and only four deviated significantly from a random walk pattern, despite significant net evolutionary change in all cases but one.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300008289",
    doi = "10.1017/s0094837300008289",
    openalex = "W1906467586"
}

@incollection{doi101007978148990539010,
    author = "Vianey‐Liaud, Monique",
    title = "Mögliche evolutionäre Beziehungen zwischen Eozänen und unteren Oligozänen Nagetieren Asiens, Europas und Nordamerikas",
    year = "1985",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4899-0539-0\_10",
    doi = "10.1007/978-1-4899-0539-0\_10",
    openalex = "W170267095",
    references = "openalexw201159638"
}

Zeitschriftenartikel Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die evolutionäre Genetik Zugang erhalten ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA2Howard Hughes Medical Institute, U426, University of California, San Francisco, Kalifornien 94143, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA3Wildlife Genetics Laboriatory, Department of Wildlife and Fisheries Sciences, Texas A & M University, College Station, Texas 77843, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA4Institut für Biochemie, Howard University, Washington, DC 20059, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA5Institut für Klinische Genetik, Karolinska Hospital, Box 60500, S-104 01 Stockholm, Schweden Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA6Institut für Zoologie, University of Hawaii, Honolulu, Hawaii 96822, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA7Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar... Mehr anzeigen MARK STONEKING MARK STONEKING 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Band 26, Ausgabe 4, Dezember 1985, Seiten 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Veröffentlicht: 28. Juni 2008 Artikelverlauf Angenommen: 01. Juli 1985 Veröffentlicht: 28. Juni 2008

@article{doi101111j109583121985tb02048x,
    author = "Wilson, Allan C. und Cann, Rebecca L. und Carr, Steven M. und George, Matthew und GYLLENSTEN, ULF B. und Helm‐Bychowski, Kathleen und Higuchi, Russell und Palumbi, Stephen R. und Prager, Ellen M. und Sage, Richard D. und Stoneking, Mark",
    title = "Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die Evolutionärgenetik",
    year = "1985",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Journal Article Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die Evolutionärgenetik Zugang erlangen ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA2Howard Hughes Medical Institute, U426, Universität von Kalifornien, San Francisco, Kalifornien 94143, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA3Wildlife Genetics Laboraiory, Institut für Wildtiere und Fischereiwissenschaften, Texas A \& M University, College Station, Texas 77843, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA4Institut für Biochemie, Howard University, Washington, DC 20059, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA5Institut für Klinische Genetik, Karolinska Hospital, Box 60500, S-104 01 Stockholm, Schweden Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA6Institut für Zoologie, Universität von Hawaii, Honolulu, Hawaii 96822, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA7Museum für Wirbeltierzoo, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar... Mehr anzeigen MARK STONEKING MARK STONEKING 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Band 26, Ausgabe 4, Dezember 1985, Seiten 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Veröffentlicht: 28. Juni 2008 Artikelverlauf Angenommen: 01. Juli 1985 Veröffentlicht: 28. Juni 2008",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    openalex = "W2065697254",
    references = "doi101038202147a0, doi101073pnas504672, doi101073pnas581142, doi101111j155856461983tb05533x, doi101126science15838051200, doi1023071438156, doi1023072407274, doi107312simp93764, openalexw788933220, sarich1967immunological"
}

Mängel in der stratigraphischen Auflösung oder Vollständigkeit können es unmöglich machen, wahre Raten morphologischer Veränderungen über geologische Zeit präzise zu schätzen. Allerdings können relative Raten ausreichen, um zu testen, ob das Tempo der Veränderung innerhalb einer Art morphologische Unterschiede über Artgrenzen hinweg erklären kann und somit zwischen graduellen und unterbrochenen Mustern der Evolution zu unterscheiden. Die Bedingungen, unter denen diese Muster statistisch unterschieden werden können, werden untersucht, indem verschiedene Grade der innerhalb-artspezifischen Ratenvariabilität relativ zu zwischen-artspezifischen morphologischen Unterschieden simuliert werden. Die statistischen Methoden werden dann auf mehrdimensionale morphologische Daten von eng beieinander liegenden sequentiellen Populationen des neogenen Bryozoans Metrarabdotos angewendet, wobei die Diskriminanzanalyse verwendet wird, um die Gesamtmorphologien zu vergleichen. Bei neun Vergleichen von Vorfahr-Nachfolger-Art-Paaren zeigen alle innerhalb-artspezifische Raten morphologischer Veränderungen, die sich nicht signifikant von null unterscheiden, und erklären somit keinen der zwischen-artspezifischen Unterschied. In allen Fällen ist das Verhältnis der innerhalb-artspezifischen Schwankung zum zwischen-artspezifischen Unterschied niedrig genug, um das unterbrochene Muster mit fast sicherer Gewissheit zu unterscheiden. In mindestens sieben der Fälle persistierten Vorfahr-Arten nach der Entstehung ihrer Nachfolger, im Einklang mit dem Modus der unterbrochenen Gleichgewichts-Evolution.

@article{doi101017s0094837300013658,
    author = "Cheetham, Alan H.",
    title = "Tempo der Evolution in einem neogenen Bryozoen: Raten morphologischer Veränderungen innerhalb und über Artgrenzen hinweg",
    year = "1986",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Mängel in der stratigraphischen Auflösung oder Vollständigkeit können es unmöglich machen, wahre Raten morphologischer Veränderungen über geologische Zeit präzise zu schätzen. Allerdings können relative Raten ausreichen, um zu testen, ob das Tempo der Veränderung innerhalb einer Art morphologische Unterschiede über Artgrenzen hinweg erklären kann und somit zwischen graduellen und unterbrochenen Mustern der Evolution zu unterscheiden. Die Bedingungen, unter denen diese Muster statistisch unterschieden werden können, werden untersucht, indem verschiedene Grade der innerhalb-artspezifischen Ratenvariabilität relativ zu zwischen-artspezifischen morphologischen Unterschieden simuliert werden. Die statistischen Methoden werden dann auf mehrdimensionale morphologische Daten von eng beieinander liegenden sequentiellen Populationen des neogenen Bryozoans Metrarabdotos angewendet, wobei die Diskriminanzanalyse verwendet wird, um die Gesamtmorphologien zu vergleichen. Bei neun Vergleichen von Vorfahr-Nachfolger-Art-Paaren zeigen alle innerhalb-artspezifische Raten morphologischer Veränderungen, die sich nicht signifikant von null unterscheiden, und erklären somit keinen der zwischen-artspezifischen Unterschied. In allen Fällen ist das Verhältnis der innerhalb-artspezifischen Schwankung zum zwischen-artspezifischen Unterschied niedrig genug, um das unterbrochene Muster mit fast sicherer Gewissheit zu unterscheiden. In mindestens sieben der Fälle persistierten Vorfahr-Arten nach der Entstehung ihrer Nachfolger, im Einklang mit dem Modus der unterbrochenen Gleichgewichts-Evolution.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300013658",
    doi = "10.1017/s0094837300013658",
    openalex = "W2500056974",
    references = "doi101017s0094837300004000"
}

Die Sequenzen der small-subunit rRNA-Gene der flagellierten Protisten Euglena gracilis und Trypanosoma brucei wurden bestimmt und mit denen anderer Eukaryoten verglichen. Ein phylogenetischer Baum wurde erstellt, in dem die früheste Verzweigung unter den Eukaryoten durch E. gracilis repräsentiert wird. Die Divergenz von E. gracilis geht weit vor eine Periode massiver evolutionärer Strahlung zurück, die zu Pflanzen, Tieren, Pilzen und bestimmten Gruppen von Protisten wie Ciliaten und Acanthamoeben führte. Die genetische Vielfalt in dieser Sammlung von Eukaryoten wird als größer gesehen als die innerhalb der eubakteriellen oder archäbakteriellen Abstammungslinien.

@article{doi101073pnas8351383,
    author = "Sogin, M L und Elwood, Hille J. und Gunderson, John H.",
    title = "Evolutionäre Vielfalt eukaryotischer small-subunit rRNA-Gene.",
    year = "1986",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Die Sequenzen der small-subunit rRNA-Gene der flagellierten Protisten Euglena gracilis und Trypanosoma brucei wurden bestimmt und mit denen anderer Eukaryoten verglichen. Ein phylogenetischer Baum wurde erstellt, in dem die früheste Verzweigung unter den Eukaryoten durch E. gracilis repräsentiert wird. Die Divergenz von E. gracilis geht weit vor eine Periode massiver evolutionärer Strahlung zurück, die zu Pflanzen, Tieren, Pilzen und bestimmten Gruppen von Protisten wie Ciliaten und Acanthamoeben führte. Die genetische Vielfalt in dieser Sammlung von Eukaryoten wird als größer gesehen als die innerhalb der eubakteriellen oder archäbakteriellen Abstammungslinien.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.83.5.1383",
    doi = "10.1073/pnas.83.5.1383",
    openalex = "W2062738309"
}

Die Mutationsraten von DNA-Sequenzen während der Evolution können aus interspezifischen DNA-Sequenzunterschieden geschätzt werden, indem Veränderungen untersucht werden, die wenig oder keinen Einfluss auf das Phänotyp haben (neutrale Mutationen). Die Untersuchung verfügbarer Messungen zeigt, dass die Raten der DNA-Veränderung verschiedener phylogenetischer Gruppen sich um einen Faktor von 5 unterscheiden. Die langsamsten Raten werden bei höheren Primaten und einigen Vogellinien beobachtet, während schnellere Raten bei Nagetieren, Seesternen und Drosophila festgestellt werden. Die Rate der DNA-Sequenzveränderung hat sich während der Primatenentwicklung deutlich verringert. Der Unterschied in den Raten der DNA-Sequenzveränderung ist wahrscheinlich auf evolutionäre Variation und Selektion biochemischer Mechanismen wie DNA-Replikation oder -Reparatur zurückzuführen.

@article{doi101126science3082006,
    author = "Britten, Roy J.",
    title = "Rates of DNA Sequence Evolution Differ Between Taxonomic Groups",
    year = "1986",
    journal = "Science",
    abstract = "Die Mutationsraten von DNA-Sequenzen während der Evolution können aus interspezifischen DNA-Sequenzunterschieden geschätzt werden, indem Veränderungen untersucht werden, die wenig oder keinen Einfluss auf das Phänotyp haben (neutrale Mutationen). Die Untersuchung verfügbarer Messungen zeigt, dass die Raten der DNA-Veränderung verschiedener phylogenetischer Gruppen sich um einen Faktor von 5 unterscheiden. Die langsamsten Raten werden bei höheren Primaten und einigen Vogellinien beobachtet, während schnellere Raten bei Nagetieren, Seesternen und Drosophila festgestellt werden. Die Rate der DNA-Sequenzveränderung hat sich während der Primatenentwicklung deutlich verringert. Der Unterschied in den Raten der DNA-Sequenzveränderung ist wahrscheinlich auf evolutionäre Variation und Selektion biochemischer Mechanismen wie DNA-Replikation oder -Reparatur zurückzuführen.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3082006",
    doi = "10.1126/science.3082006",
    openalex = "W2027574957",
    references = "doi101038233604a0"
}

Culture and the evolutionary process Culture and the evolutionary process. Robert Boyd, Peter J. Richerson(ed.), 1985. The University of Chicago Press, Chicago viii + 331 pages. $29.95 Marcy F. Lawton Marcy F. Lawton Search for other works by this author on: Oxford Academic Google Scholar The Condor, Volume 88, Issue 1, 1 February 1986, Pages 123–124, https://doi.org/10.2307/1367778 Published: 01 February 1986

@article{doi1023071367778,
    author = "Griesemer, James R. und Boyd, Robert und Richerson, Peter J.",
    title = "Culture and the Evolutionary Process",
    year = "1986",
    journal = "Ornithological Applications",
    abstract = "Culture and the evolutionary process Culture and the evolutionary process. Robert Boyd, Peter J. Richerson(ed.), 1985. The University of Chicago Press, Chicago viii + 331 pages. $29.95 Marcy F. Lawton Marcy F. Lawton Search for other works by this author on: Oxford Academic Google Scholar The Condor, Volume 88, Issue 1, 1 February 1986, Pages 123–124, https://doi.org/10.2307/1367778 Published: 01 February 1986",
    url = "https://doi.org/10.2307/1367778",
    doi = "10.2307/1367778",
    openalex = "W1811781384"
}

Säugetiere verfügen über einen ungewöhnlich guten Fossilbericht des Känozoikums, der Belege für ihre evolutionäre Diversifizierung liefert. Wir betrachten diesen Bericht rückblickend, was unsere Wahrnehmung auf vielfältige Weise verzerrt. Die weltweite Vielfalt scheint insgesamt exponentiell mit der Zeit zu steigen, während intensive Stichproben in lokalen Gebieten zeigen, dass moderne Diversitätsniveaus bereits früh im Känozoikum erreicht wurden. Die offensichtliche Bedeutung der pleistozänen Aussterben hängt entscheidend davon ab, wie Aussterberaten quantifiziert werden. Unsere taxonomische Hierarchie spiegelt wahrscheinlich die Anzahl der großen faunistischen Umbrüche wider, die eine Gruppe überstanden hat, anstatt die abnehmende Intensität aufeinanderfolgender Umbrüche. Morphologische Innovation und taxonomische Diversifizierung scheinen nach Intervallen klimatischer Abkühlung aufzutreten, was darauf hindeutet, dass wesentliche Merkmale der Evolution extrinsisch gesteuert sind. Günstige stratigraphische Settings liefern detaillierte Aufzeichnungen von gradueller Anagenese und Kladogenese bei Säugetieren, wobei Intermediäre als Belege für den Übergang vorhanden sind. Die scheinbare Dichotomie zwischen hohen evolutionären Raten, die von Neontologen über kurze Zeitintervalle gemessen werden, und niedrigen evolutionären Raten, die von Paläontologen über lange Zeitintervalle gemessen werden, verschwindet, wenn Raten auf intermediären Zeitskalen gemessen werden. Mikroevolution und Makroevolution sind Manifestationen gemeinsamer zugrunde liegender Prozesse, die auf unterschiedlichen Zeitskalen ausgedrückt werden.

@article{gingerich1987evolution,
    author = "Gingerich, Philip D.",
    title = "Evolution und der Fossilbericht: Muster, Raten und Prozesse",
    year = "1987",
    journal = "Canadian Journal of Zoology",
    abstract = "Säugetiere verfügen über einen ungewöhnlich guten Fossilbericht des Känozoikums, der Belege für ihre evolutionäre Diversifizierung liefert. Wir betrachten diesen Bericht rückblickend, was unsere Wahrnehmung auf vielfältige Weise verzerrt. Die weltweite Vielfalt scheint insgesamt exponentiell mit der Zeit zu steigen, während intensive Stichproben in lokalen Gebieten zeigen, dass moderne Diversitätsniveaus bereits früh im Känozoikum erreicht wurden. Die offensichtliche Bedeutung der pleistozänen Aussterben hängt entscheidend davon ab, wie Aussterberaten quantifiziert werden. Unsere taxonomische Hierarchie spiegelt wahrscheinlich die Anzahl der großen faunistischen Umbrüche wider, die eine Gruppe überstanden hat, anstatt die abnehmende Intensität aufeinanderfolgender Umbrüche. Morphologische Innovation und taxonomische Diversifizierung scheinen nach Intervallen klimatischer Abkühlung aufzutreten, was darauf hindeutet, dass wesentliche Merkmale der Evolution extrinsisch gesteuert sind. Günstige stratigraphische Settings liefern detaillierte Aufzeichnungen von gradueller Anagenese und Kladogenese bei Säugetieren, wobei Intermediäre als Belege für den Übergang vorhanden sind. Die scheinbare Dichotomie zwischen hohen evolutionären Raten, die von Neontologen über kurze Zeitintervalle gemessen werden, und niedrigen evolutionären Raten, die von Paläontologen über lange Zeitintervalle gemessen werden, verschwindet, wenn Raten auf intermediären Zeitskalen gemessen werden. Mikroevolution und Makroevolution sind Manifestationen gemeinsamer zugrunde liegender Prozesse, die auf unterschiedlichen Zeitskalen ausgedrückt werden.",
    url = "https://doi.org/10.1139/z87-169",
    doi = "10.1139/z87-169",
    number = "5",
    openalex = "W2089767140",
    pages = "1053-1060",
    volume = "65",
    references = "doi101017s0094837300005649, doi101093aibsbulletin2214b, doi101111j155856461949tb00004x, doi1023071218194, doi1023072412851, doi105281zenodo13648988, openalexw201159638, openalexw2065039187, openalexw2989964553, openalexw610180004"
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@misc{runnegar1987rates9,
    author = "Runnegar, B",
    title = "Rates and Modes of Evolution in the Mollusca, in Campbell, K. S. W., and Day, M. F., eds., Rates of Evolution",
    year = "1987",
    howpublished = "London, Allen and Unwin, p. 39-60",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Runnegar, B., 1987, Rates and Modes of Evolution in the Mollusca, in Campbell, K. S. W., and Day, M. F., eds., Rates of Evolution: London, Allen and Unwin, p. 39-60.}"
}

Zusammenfassung - Mehrere prominente Kladisten haben die Bedeutung von Fossilien für die phylogenetische Inferenz in Frage gestellt, und es wird zunehmend populär, ausgestorbene Formen, falls sie überhaupt berücksichtigt werden, einfach einem Kladogramm von rezenten Taxa anzupassen. Die Studie von Gardiner (1982) und Løvtrup (1985) zur Phylogenie der Amnioten veranschaulicht diese differenzielle Behandlung, und wir konzentrierten uns auf diese Gruppe von Organismen, um die These zu testen, dass Fossilien eine auf der rezenten Biota basierende Theorie der Beziehungen nicht umstürzen können. Unsere Parsimonieanalyse der Amnioten-Phylogenie, wobei spezielles Wissen, das von Fossilien beigesteuert wurde, sorgfältig vermieden wurde, führte zur folgenden besten Anpassung, die der neuartigen Hypothese ähnelt, die Gardiner veröffentlichte: (lepidosauria (schildkröten (säugetiere (vögel, krokodile)))). Allerdings führte das Hinzufügen von Fossilien zu einem deutlich anderen höchst parsimonischen Kladogramm der rezenten Taxa: (säugetiere (schildkröten (lepidosauria (vögel, krokodile)))). Diese Klassifikation ähnelt der traditionellen Hypothese und bietet eine bessere Anpassung an den stratigraphischen Bericht. Um die ausgestorbenen Taxa zu isolieren, die für die letztere Klassifikation verantwortlich sind, wurden die Daten bei jeder phylogenetischen Analyse sukzessive partitioniert, und wir schlossen, dass: (1) die Ingroup-Fossilien, nicht die Outgroup-Fossilien, wichtig waren; (2) Synapsid-Fossilien, nicht Reptilien-Fossilien, entscheidend waren; (3) bestimmte Synapsid-Fossilien, nicht die frühesten oder spätesten, verantwortlich waren. Die kritische Natur der Synapsid-Fossilien schien in der besonderen Kombination von primitiven und abgeleiteten Charakterlisten zu liegen, die sie zeigten. Die Klassifizierung dieser Fossilien zusammen mit Säugetieren als Schwestergruppe der Linie, bestehend aus Vögeln und Krokodilen, führte zu einer relativ schlechten Anpassung an die Daten; eine mit einer 2-4-fachen Zunahme evolutionärer Reversalien! Daher scheint die Bedeutung der kritischen Fossilien, kollektiv oder einzeln, in ihrer relativen Primitivität zu liegen, und die einfachste Erklärung für ihre konservativere Natur ist, dass sie weniger Zeit hatten, sich zu entwickeln. Während Fossilien möglicherweise nur unter bestimmten Bedingungen in der phylogenetischen Inferenz wichtig sein können, gibt es keinen zwingenden Grund, ihren Beitrag vorab zu bewerten. Wir drängen Systematiker, alle verfügbaren Beweise fair zu bewerten.

@article{doi101111j109600311988tb00514x,
    author = "Gauthier, Jacques and Kluge, Arnold G. and Rowe, Timothy",
    title = "AMNIOTE PHYLOGENY AND THE IMPORTANCE OF FOSSILS",
    year = "1988",
    journal = "Cladistics",
    abstract = "Zusammenfassung - Mehrere prominente Kladisten haben die Bedeutung von Fossilien für die phylogenetische Inferenz in Frage gestellt, und es wird zunehmend populär, ausgestorbene Formen, falls sie überhaupt berücksichtigt werden, einfach einem Kladogramm von rezenten Taxa anzupassen. Die Studie von Gardiner (1982) und Løvtrup (1985) zur Phylogenie der Amnioten veranschaulicht diese differenzielle Behandlung, und wir konzentrierten uns auf diese Gruppe von Organismen, um die These zu testen, dass Fossilien eine auf der rezenten Biota basierende Theorie der Beziehungen nicht umstürzen können. Unsere Parsimonieanalyse der Amnioten-Phylogenie, wobei spezielles Wissen, das von Fossilien beigesteuert wurde, sorgfältig vermieden wurde, führte zur folgenden besten Anpassung, die der neuartigen Hypothese ähnelt, die Gardiner veröffentlichte: (lepidosauria (schildkröten (säugetiere (vögel, krokodile)))). Allerdings führte das Hinzufügen von Fossilien zu einem deutlich anderen höchst parsimonischen Kladogramm der rezenten Taxa: (säugetiere (schildkröten (lepidosauria (vögel, krokodile)))). Diese Klassifikation ähnelt der traditionellen Hypothese und bietet eine bessere Anpassung an den stratigraphischen Bericht. Um die ausgestorbenen Taxa zu isolieren, die für die letztere Klassifikation verantwortlich sind, wurden die Daten bei jeder phylogenetischen Analyse sukzessive partitioniert, und wir schlossen, dass: (1) die Ingroup-Fossilien, nicht die Outgroup-Fossilien, wichtig waren; (2) Synapsid-Fossilien, nicht Reptilien-Fossilien, entscheidend waren; (3) bestimmte Synapsid-Fossilien, nicht die frühesten oder spätesten, verantwortlich waren. Die kritische Natur der Synapsid-Fossilien schien in der besonderen Kombination von primitiven und abgeleiteten Charakterlisten zu liegen, die sie zeigten. Die Klassifizierung dieser Fossilien zusammen mit Säugetieren als Schwestergruppe der Linie, bestehend aus Vögeln und Krokodilen, führte zu einer relativ schlechten Anpassung an die Daten; eine mit einer 2-4-fachen Zunahme evolutionärer Reversalien! Daher scheint die Bedeutung der kritischen Fossilien, kollektiv oder einzeln, in ihrer relativen Primitivität zu liegen, und die einfachste Erklärung für ihre konservativere Natur ist, dass sie weniger Zeit hatten, sich zu entwickeln. Während Fossilien möglicherweise nur unter bestimmten Bedingungen in der phylogenetischen Inferenz wichtig sein können, gibt es keinen zwingenden Grund, ihren Beitrag vorab zu bewerten. Wir drängen Systematiker, alle verfügbaren Beweise fair zu bewerten.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.1988.tb00514.x",
    doi = "10.1111/j.1096-0031.1988.tb00514.x",
    openalex = "W1978557909",
    references = "crossref1943the, currie1985cranial, doi101001jama194302840160064031, doi1010079781468488517, doi101007978146848851721, doi101016002555648290027x, doi1010160169534789901626, doi101016b9781483198279500198, doi101016b9781483231426500124, doi101017cbo9780511693281002, doi101038142004a0, doi10108002724634198810011708, doi101086628623, doi101093sysbio1811, doi101093sysbio33183, doi1010970000505319311100000026, doi101098rstb19830079, doi101111j109636421977tb01031x, doi101111j109636421985tb01796x, doi101146annureven10010165000525, doi1023071005355, doi1023071220820, doi1023071292217, doi1023071441916, doi1023072412407, doi1023072412685, doi1023072413134, doi1023072413259, doi1023072413454, doi1023072485224, doi105281zenodo16171435, doi10560219780801847806, doi105962bhltitle6408, doi105962bhltitle82144, openalexw1534787790, openalexw1534857865, openalexw2954279587, openalexw2983381470, openalexw3146596760, openalexw3184837389, openalexw575222456, roaf1943the"
}

Zeitschriftenartikel Die evolutionäre Bedeutung der phänotypischen Plastizität: Phänotypische Quellen der Variation zwischen Organismen können durch entwicklungsbiologische Schalter und Reaktionsnormen beschrieben werden Zugriff Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Band 39, Ausgabe 7, Juli/August 1989, Seiten 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Veröffentlicht: 01. August 1989

@article{doi1023071311135,
    author = "Stearns, Stephen C.",
    title = "The Evolutionary Significance of Phenotypic Plasticity",
    year = "1989",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Journal Article The Evolutionary Significance of Phenotypic Plasticity: Phenotypic sources of variation among organisms can be described by developmental switches and reaction norms Get access Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Search for other works by this author on: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 39, Issue 7, July/August 1989, Pages 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Published: 01 August 1989",
    url = "https://doi.org/10.2307/1311135",
    doi = "10.2307/1311135",
    openalex = "W2058670567",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi1015159780691224244, doi1023071439305, doi1023072389364, openalexw1635425035"
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@misc{milner1990the8,
    author = "Milner, R",
    title = "The Encyclopedia of Evolution",
    year = "1990",
    howpublished = "Humanity's Search for Its Origin: New York, Facts on File, Inc., 482 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Milner, R., 1990, The Encyclopedia of Evolution: Humanity's Search for Its Origin: New York, Facts on File, Inc., 482 p.}"
}

ZUSAMMENFASSUNG Die vergleichende Osteologie und die phylogenetischen Beziehungen fossiler und lebender Störartigen (Polyodontidae) werden erstmals im Detail untersucht. Diese eigenartige, wenig bekannte Gruppe ist für phylogenetische Studien primitiver Actinopterygier von großer Bedeutung, da sie eine von nur zwei Chondrostea-Familien ist, die bis heute überlebt haben. Folglich wird die Gruppe häufig als Ausgruppe für Studien vieler fossiler Chondrostea-Gruppen und für höherstufige Studien der Interbeziehungen bei Actinopterygiern (und sogar Osteichthyes) verwendet. Die Familie hat einen langen, aber lückenhaften Fossilbericht, der bis in das Oberkreide reicht, einschließlich Arten, die durch relativ vollständige Skelette oder zumindest Schädel vertreten sind. Diese relativ vollständigen Fossilien sind extrem selten und gehören zu den Arten †Paleopsephurus wilsoni MacAlpin, 1947 aus der Oberkreide-Hell-Creek-Formation von Montana (hier neu beschrieben); †Polyodon sp. nov. aus der unteren Paläozän-Tullock-Formation von Montana (hier beschrieben); und †Crossopholis magnicaudatus Cope, 1883 aus unteren Eozän-Schichten der Green-River-Formation in Wyoming (hier erstmals auf Basis viel neuen Materials im Detail beschrieben). Unter den Fossilien ist †Crossopholis von besonderem Interesse, da es nun durch mehrere nahezu vollständige Skelette bekannt ist (hier erstmals berichtet und beschrieben). †Paleopsephurus und †Polyodon sp. nov. sind jeweils von einem einzelnen partiellen Schädel und etwas fragmentarischem postkranialen Material bekannt, sind aber gut genug vertreten, um in unsere phylogenetische Analyse aufgenommen zu werden. Andere, fragmentarischere, oberkreide und paläozäne Materialien (einige hier erstmals berichtet) werden in Polyodontidae incertae sedis eingeordnet. Es gibt zwei lebende Arten in der Familie, die in der Literatur häufig als „lebende Fossilien" bezeichnet werden. Diese beiden Arten sind Polyodon spathula aus dem Mississippi-Fluss-Drainagegebiet Nordamerikas und Psephurus gladius, hauptsächlich aus dem oberen Jangtse-Fluss-Drainagegebiet in China. Die Osteologie von Psephurus gladius wird hier erstmals im Detail beschrieben. Vorherige Studien zu Polyodontidae basierten fast ausschließlich auf Polyodon spathula, da Exemplare der anderen Art extrem selten und sehr schlecht bekannt sind. Nach jahrelanger Sammlung und Vorbereitung von Material konnten wir alle polyodontiden Arten umfassender beschreiben und die Familie phylogenetisch untersuchen. Unsere Studie zeigt, dass Polyodon spathula ein hoch abgeleitetes Mitglied der Familie ist und im Allgemeinen kein guter Vertreter der Familie ist, wenn die Familie als Ausgruppe für höherstufige phylogenetische Studien von Actinopterygiern verwendet wird. Die Verwendung von Polyodon spathula als primitives Polyodontid hat in der Vergangenheit zu mehreren schwerwiegenden Fehlern in der Literatur geführt. Wir fassen daher auch bestimmte primitive Merkmale der Polyodontidae in diesem Papier zusammen. Im Gegensatz zu früheren Studien zeigen wir, dass †Paleopsephurus die sternförmigen rostralen Knochen besitzt, die einzigartig für Polyodontidae sind (zusätzlich zu den langen medianen rostralen Knochen und dem extrem verlängerten Schnauzenbereich, die ebenfalls einzigartig für die Gruppe sind). Im Gegensatz zu früheren Studien besitzen Polyodontidae (zumindest primitiv) Ossifikationen des Quadratojugals, Interclavicels und Postcleithrums. Wir berichten auch über mehrere andere osteologische Merkmale, die zuvor für die Familie unbekannt waren. Unsere Studie führt zu einer phylogenetischen Hypothese für Störartige, die radikal von dem einzigen anderen veröffentlichten Kladogramm (Gardiner, 1984b) abweicht. Wir zeigen, dass †Paleopsephurus eindeutig in Polyodontidae gehört, nicht in Acipenseridae, wie von Gardiner (1984b) vorgeschlagen. †Paleopsephurus ist die Schwestergruppe zu Polyodontinae, neue Unterfamilie (eine Gruppe, die Psephurus, †Crossopholis und zwei Arten von Polyodon enthält). Psephurus ist die Schwestergruppe zu Polyodontini, neuer Stamm (eine Gruppe, die †Crossopholis und Polyodon enthält). Polyodon enthält die lebende Polyodon spathula sowie eine neue fossile Art aus frühen paläozänen Süßwassersedimenten von Montana. Ein besseres Verständnis der polyodontiden Osteologie ermöglicht es uns auch, eine phylogenetische Hypothese für Acipenseriformes (unter der Annahme der Monophylie von Acipenseridae) anzubieten, die sich von der früherer Autoren unterscheidet. Insbesondere finden wir, dass †Chondrosteidae die Schwestergruppe zu einer Gruppe ist, die Acipenseridae plus Polyodontidae enthält. Polyodontidae liefern auch Belege dafür, dass die Supraneurals bei Actinopterygiern die seriellen Homologe von Epurals sind und nicht von Flossenradialen. Wie zuvor ersichtlich, ist Polyodontidae eine von mehreren Gruppen, die eine transpazifische biogeographische Beziehung für West-Nordamerika (westlich des kontinentalen Wasserscheids) während des frühen Tertiärs anzeigen. Wir beschreiben auch ontogenetische und intraspezifische Variationen in der Störartigen-Osteologie. Basierend auf der großen Menge an Variationen schließen wir, dass es bei zumindest einigen Fischen wichtig ist, große Zahlen von Exemplaren zu untersuchen, einschließlich extrem alter Individuen (d. h. „oberes Ende der Ontogenese") in der Entwicklungsreihe, um die Morphologie vollständiger zu dokumentieren. Normalgroße, fortpflanzungsfähige erwachsene Störartige fehlen bestimmte Ossifikationen des Scapulocoracoide, der Wirbelsäule und des Neurocraniums, die bei anderen Osteichthyes vorhanden sind; aber wie wir hier zeigen, ossifizieren diese Elemente schließlich bei sehr großen, älteren Individuen. In diesem Sinne scheinen Störartige die Axolotls der Fischwelt zu sein und bieten einen der am besten dokumentierten Fälle von Paedomorphose (oder Neotenie), die bisher bekannt sind.

@article{doi10108002724634199110011424,
    author = "Grande, Lance and Bemis, William E.",
    title = "Osteology and Phylogenetic Relationships of Fossil and Recent Paddlefishes (Polyodontidae) with Comments on the Interrelationships of Acipenseriformes",
    year = "1991",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "ABSTRACT The comparative osteology and phylogenetic relationships of fossil and living paddlefishes (Polyodontidae) are investigated in detail for the first time. This peculiar, poorly known group is of great significance to phylogenetic studies of primitive actinopterygians, because it is one of only two chondrostean families that have survived to the present. Consequently the group is frequently used as an outgroup for studies of the many fossil chondrostean groups and for higher-level studies of actinopterygian (and even osteichthyan) interrelationships. The family has a long but spotty fossil record dating back to the Upper Cretaceous, including species represented by relatively complete skeletons or at least skulls. These relatively complete fossils are extremely rare and belong to the species †Paleopsephurus wilsoni MacAlpin, 1947 from the Upper Cretaceous Hell Creek Formation of Montana (redescribed here); †Polyodon sp. nov. from the lower Paleocene Tullock Formation of Montana (described here); and †Crossopholis magnicaudatus Cope, 1883 from lower Eocene deposits of the Green River Formation in Wyoming (described in detail here for the first time based on much new material). Among the fossils, †Crossopholis is of particular interest, because it is now known by several nearly complete skeletons (reported and described here for the first time). †Paleopsephurus and †Polyodon sp. nov. are known from a single partial skull each, and some fragmentary postcranial material, but are well enough represented to include in our phylogenetic analysis. Other, more fragmentary, Upper Cretaceous and Paleocene material (some newly reported here) is placed in Polyodontidae incertae sedis. There are two extant species in the family, frequently referred to in the literature as “living fossils.” These two species are Polyodon spathula from the Mississippi River drainage of North America, and Psephurus gladius primarily from the upper Yangtze River drainage in China. The osteology of Psephurus gladius is described here in detail for the first time. Previous studies of Polyodontidae have been almost exclusively based on Polyodon spathula, because specimens of the other species are extremely rare and very poorly known. After accumulating and preparing material for several years, we were able to describe more fully all polyodontid species and examine the family phylogenetically. Our study reveals that Polyodon spathula is a highly derived member of the family, and generally not a good representative of the family when the family is used as an outgroup for higher-level phylogenetic studies of actinopterygians. The use of Polyodon spathula as the primitive polyodontid has previously led to several serious errors in the literature. We therefore also summarize certain primitive characters of Polyodontidae in this paper. Contrary to previous studies, we show that †Paleopsephurus has the stellate rostral bones unique to polyodontids (in addition to the long median rostral bones and extremely elongate snout also unique to the group). Also contrary to previous studies, Polyodontidae (at least primitively) does have ossifications of the quadratojugal, interclavicle and postcleithrum. We also report several other osteological features previously unknown from the family. Our study results in a phylogenetic hypothesis for paddlefishes that is radically different from the only other published cladogram (Gardiner, 1984b). We demonstrate that †Paleopsephurus clearly belongs in Polyodontidae, rather than Acipenseridae as proposed by Gardiner (1984b). †Paleopsephurus is the sistergroup to Polyodontinae, new subfamily (a group containing Psephurus, †Crossopholis, and two species of Polyodon). Psephurus is the sistergroup to Polyodontini, new tribe (a group containing †Crossopholis and Polyodon). Polyodon contains the extant Polyodon spathula as well as a new fossil species from early Paleocene freshwater deposits of Montana. A better understanding of polyodontid osteology also enables us to provide a phylogenetic hypothesis for Acipenseriformes (assuming monophyly of Acipenseridae) that differs from that of previous authors. In particular we find that †Chondrosteidae is the sistergroup to a group containing Acipenseridae plus Polyodontidae. Polyodontidae also provide evidence that the supraneurals in actinopterygians are the serial homologues of epurals, and not of fin radials. As has previously been apparent, Polyodontidae is one of several groups that indicate a transpacific biogeographic relationship for western North America (west of the continental divide) during the Early Tertiary. We also describe ontogenetic and intraspecific variation in paddlefish osteology. Based on the large amount of variation, we conclude that, in at least some fishes, it is important to examine large numbers of specimens, including extremely old individuals (i.e., “upper end ontogeny”) in the developmental series to more completely document the morphology. Normal-sized, reproductively active adult paddlefishes lack particular ossifications of the scapulocoracoid, vertebral column and neurocranium present in other osteichthyans; but as we show here, these elements eventually ossify in very large, older individuals. In this sense, paddlefishes appear to be the axolotls of the fish world, offering one of the best documented cases of paedomorphosis (or neoteny) known to date.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.1991.10011424",
    doi = "10.1080/02724634.1991.10011424",
    openalex = "W1980955783",
    references = "doi101038170405e0, doi101111j109636421932tb01553x, doi105281zenodo16298542, doi105962bhltitle159141, doi105962bhltitle6408, gardiner1989interrelationships, openalexw2246336267, openalexw610180004"
}

Die vergleichende Methode zur Untersuchung der Anpassung: Warum sich um die Phylogenie kümmern? Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Charakterzustände vergleichende Analyse diskreter Daten vergleichende Analyse kontinuierlicher Variablen Bestimmung der Form vergleichender Beziehungen.

@article{doi105860choice295104,
    title = "The comparative method in evolutionary biology",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "The comparative method for studying adaptation why worry about phylogeny? reconstructing phylogenetic trees and ancestral character states comparative analysis of discrete data comparative analysis of continuous variables determining the form of comparative relationships.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.29-5104",
    doi = "10.5860/choice.29-5104",
    openalex = "W1488393970"
}

@article{doi101038361219a0,
    author = "Morris, Simon Conway",
    title = "The fossil record and the early evolution of the Metazoa",
    year = "1993",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/361219a0",
    doi = "10.1038/361219a0",
    openalex = "W2143380472",
    references = "doi101016001670379290064p, doi1010160301926885900518, doi101016030192688590066x, doi101016s0959437x05801923, doi101017cbo9780511601064002, doi101038345802a0, doi101093oso97801985771880010001, doi101111j146364091991tb00303x, doi101111j150239311989tb01332x, doi101126science1585174, doi101126science1598573, doi101126science2464928339, doi101126science3277277, doi101144gsjgs14920171, doi101144gsjgs14940607, doi1023072992562, doi105860choice273873"
}

Insekten verfügen über einen überraschend umfangreichen Fossilbericht. Die Zusammenstellung der geochronologischen Bereiche von Insektenfamilien zeigt, dass ihre Vielfalt in 91 Prozent ihrer evolutionären Geschichte die der erhaltenen Wirbeltetrapoden übersteigt. Die große Vielfalt der Insekten wurde nicht durch hohe Entstehungsraten erreicht, sondern durch niedrige Aussterberaten, die mit den niedrigen Raten langsam sich entwickelnder mariner Wirbellose vergleichbar sind. Die große Radiation moderner Insekten begann vor 245 Millionen Jahren und wurde nicht durch die Expansion der Angiospermen während des Kreidezeitraums beschleunigt. Die grundlegende trophische Maschinerie der Insekten war fast 100 Millionen Jahre vor dem Erscheinen der Angiospermen im Fossilbericht vorhanden.

@article{doi101126science11536548,
    author = "Labandeira, Conrad C. und Sepkoski, J. John",
    title = "Insect Diversity in the Fossil Record",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "Insects possess a surprisingly extensive fossil record. Compilation of the geochronologic ranges of insect families demonstrates that their diversity exceeds that of preserved vertebrate tetrapods through 91 percent of their evolutionary history. The great diversity of insects was achieved not by high origination rates but rather by low extinction rates comparable to the low rates of slowly evolving marine invertebrate groups. The great radiation of modern insects began 245 million years ago and was not accelerated by the expansion of angiosperms during the Cretaceous period. The basic trophic machinery of insects was in place nearly 100 million years before angiosperms appeared in the fossil record.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.11536548",
    doi = "10.1126/science.11536548",
    openalex = "W1984084181",
    references = "doi1010079781468491814, doi101017s0094837300003778, doi101038293435a0, doi101038303614a0, doi101086284840, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461966tb03364x, doi101126science13334591105, doi101126science21545391501, doi101126science2314734129, doi101146annureves10110179001335, doi107312simp93764, openalexw2038423019"
}

Nah am Beginn des Kambriums ereignete sich eine explosive Episode der biologischen Diversifizierung. Die Evolutionsraten im Kambrium waren aufgrund des Mangels an hochpräzisen Altersdaten schwer genau zu quantifizieren. Derzeit ist die Uran-Blei-Zirkon-Geochemie die leistungsfähigste Methode zur Datierung von Gesteinen kambriums Alter. Uran-Blei-Zirkon-Daten aus unterkambriischen Gesteinen in Nordostsibirien deuten darauf hin, dass das Kambrium vor etwa 544 Millionen Jahren begann und dass seine älteste (Manykaian) Stufe nicht weniger als 10 Millionen Jahre dauerte. Andere Daten zeigen, dass die Tommotian- und Atdabanian-Stufen zusammen nur 5 bis 10 Millionen Jahre dauerten. Die daraus resultierende Kompression der frühen Kambrium-Zeit unterstreicht die Schnelligkeit sowohl der faunistischen Diversifizierung als auch des anschließenden Kambrium-Turnovers.

@article{doi101126science11539488,
    author = "Bowring, Samuel A. und Grotzinger, J. P. und Isachsen, C. E. und Knoll, Andrew H. und Pelechaty, Shane M. und Kolosov, Peter",
    title = "Calibrating Rates of Early Cambrian Evolution",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "Nah am Beginn des Kambriums ereignete sich eine explosive Episode der biologischen Diversifizierung. Die Evolutionsraten im Kambrium waren aufgrund des Mangels an hochpräzisen Altersdaten schwer genau zu quantifizieren. Derzeit ist die Uran-Blei-Zirkon-Geochemie die leistungsfähigste Methode zur Datierung von Gesteinen kambriums Alter. Uran-Blei-Zirkon-Daten aus unterkambriischen Gesteinen in Nordostsibirien deuten darauf hin, dass das Kambrium vor etwa 544 Millionen Jahren begann und dass seine älteste (Manykaian) Stufe nicht weniger als 10 Millionen Jahre dauerte. Andere Daten zeigen, dass die Tommotian- und Atdabanian-Stufen zusammen nur 5 bis 10 Millionen Jahre dauerten. Die daraus resultierende Kompression der frühen Kambrium-Zeit unterstreicht die Schnelligkeit sowohl der faunistischen Diversifizierung als auch des anschließenden Kambrium-Turnovers.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.11539488",
    doi = "10.1126/science.11539488",
    openalex = "W2080974066",
    references = "doi101017s0094837300005649, doi101017s0094837300005972, doi101017s0094837300006539"
}

Eine phylogenetische Struktur, die aus Vergleichen von Sequenzen der kleinen Untereinheit der ribosomalen RNA abgeleitet wurde, beschreibt den evolutionären Ursprung und die frühen Verzweigungsmuster des Reiches Animalia. Maximum-Likelihood-Analysen zeigen, dass die Tierlinie monophyletisch ist und Choanoflagellaten einschließt. Innerhalb des Metazoen-Ensembles folgt auf die Divergenz der Schwämme die Ctenophora, die Cnidaria plus der Placozoa Trichoplax adhaerens und schließlich eine ungelöste Polychotomie der bilateralen Tierstämme. Aus diesen Daten wurde geschlossen, dass Tiere und Pilze eine einzigartige evolutionäre Geschichte teilen und dass ihr letzter gemeinsamer Vorfahre ein flagellierter Protist war, der den heute lebenden Choanoflagellaten ähnelt.

@article{doi101126science8469985,
    author = "Wainright, Patricia O. und Hinkle, Gregory und Sogin, Mitchell L. und Stickel, Shawn K.",
    title = "Monophyletic Origins of the Metazoa: an Evolutionary Link with Fungi",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "A phylogenetic framework inferred from comparisons of small subunit ribosomal RNA sequences describes the evolutionary origin and early branching patterns of the kingdom Animalia. Maximum likelihood analyses show the animal lineage is monophyletic and includes choanoflagellates. Within the metazoan assemblage, the divergence of sponges is followed by the Ctenophora, the Cnidaria plus the placozoan Trichoplax adhaerens, and finally by an unresolved polychotomy of bilateral animal phyla. From these data, it was inferred that animals and fungi share a unique evolutionary history and that their last common ancestor was a flagellated protist similar to extant choanoflagellates.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.8469985",
    doi = "10.1126/science.8469985",
    openalex = "W2034733986",
    references = "doi101126science3277277, openalexw2076004673"
}

Einführung. Basale Gruppen. Monera (Bakterien, Blaualgen). Pilze. Algen. Tiere: Wirbellose. Protozoen. Schwämme. Nesseltiere. Weichtiere: Amphineura und Monoplacophora. Weichtiere: Schnecken. Weichtiere: Kopffüßer (Nautiloidea). Weichtiere: Kopffüßer (vorjurassische Ammonoidea). Weichtiere: Kopffüßer (Ammonoidea: Phylloceratina, Lytoceratina, Ammonitina, Ancyloceratina). Weichtiere: Kopffüßer (Coleoidea). Weichtiere: Rostroconchia, Scaphopoda und Zweischaler. Weichtiere: incertae sedis. Ringelwürmer. Gliederfüßer (Trilobiten). Gliederfüßer (Aglaspidida, Chelicerata, Pycnogonida). Gliederfüßer (Krebse, außer Ostrakoden). Gliederfüßer (Krebse: Ostrakoden). Gliederfüßer (Euthycarcinoidea und Tausendfüßer). Gliederfüßer (Hexapoden: Insekten). Stachelhäuter. Basale Deuterostomata (Chaetognatha, Hemichordata, Calcichordata, Cephalochordata und Tunicata). Graptolithina. Problematica. Miscellania. Tiere: Wirbeltiere. Conodonta. Agnatha. Placodermi. Acanthodii. Knorpelfische. Knochenfische: basale Actinopterygii. Knochenfische: Teleostei. Knochenfische: Sarcopterygii. Amphibienähnliche Tetrapoden. Reptilien. Vögel. Säugetiere. Pflanzen. Moosartige Pflanzen. Farnartige Pflanzen. Gymnospermen. Bedecktsamige Pflanzen (Angiospermae). Index.

@book{openalexw1599677799,
    author = "Benton, Michael J.",
    title = "The fossil record 2",
    year = "1993",
    abstract = "Einführung. Basale Gruppen. Monera (Bakterien, Blaualgen). Pilze. Algen. Tiere: Wirbellose. Protozoen. Schwämme. Nesseltiere. Weichtiere: Amphineura und Monoplacophora. Weichtiere: Schnecken. Weichtiere: Kopffüßer (Nautiloidea). Weichtiere: Kopffüßer (vorjurassische Ammonoidea). Weichtiere: Kopffüßer (Ammonoidea: Phylloceratina, Lytoceratina, Ammonitina, Ancyloceratina). Weichtiere: Kopffüßer (Coleoidea). Weichtiere: Rostroconchia, Scaphopoda und Zweischaler. Weichtiere: incertae sedis. Ringelwürmer. Gliederfüßer (Trilobiten). Gliederfüßer (Aglaspidida, Chelicerata, Pycnogonida). Gliederfüßer (Krebse, außer Ostrakoden). Gliederfüßer (Krebse: Ostrakoden). Gliederfüßer (Euthycarcinoidea und Tausendfüßer). Gliederfüßer (Hexapoden: Insekten). Stachelhäuter. Basale Deuterostomata (Chaetognatha, Hemichordata, Calcichordata, Cephalochordata und Tunicata). Graptolithina. Problematica. Miscellania. Tiere: Wirbeltiere. Conodonta. Agnatha. Placodermi. Acanthodii. Knorpelfische. Knochenfische: basale Actinopterygii. Knochenfische: Teleostei. Knochenfische: Sarcopterygii. Amphibienähnliche Tetrapoden. Reptilien. Vögel. Säugetiere. Pflanzen. Moosartige Pflanzen. Farnartige Pflanzen. Gymnospermen. Bedecktsamige Pflanzen (Angiospermae). Index.",
    openalex = "W1599677799"
}

Cantius ist ein früheozäner Adapidenprimat mit einem außergewöhnlich gut dokumentierten Fossilbericht. Messungen wurden aufgezeichnet, um die Größe und Form der oberen und unteren ersten Molaren zu beschreiben, die aus einer vermessenen stratigraphischen Schicht im Clarks Fork Basin von Wyoming gesammelt wurden. Die Änderungsraten von Größe und Form werden quantifiziert, indem evolutionäre Raten in Standardabweichungseinheiten pro Generation (Haldanes) berechnet werden. Die zeitliche Skalierung der Raten zeigt, dass die Größenänderung durch einen signifikant nicht-zufälligen gerichteten Prozess und die Formänderung durch einen signifikant nicht-zufälligen stabilisierenden Prozess erzeugt wurde. Die Größenänderung bei Cantius wird als Ergebnis schwacher gerichteter Selektion interpretiert, und die Formänderung wird als Ergebnis starker stabilisierender Selektion interpretiert.

@article{doi101017s0094837300012963,
    author = "Clyde, William C. und Gingerich, Philip D.",
    title = "Rates of evolution in the dentition of early Eocene Cantius: comparison of size and shape",
    year = "1994",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Cantius ist ein früheozäner Adapidenprimat mit einem außergewöhnlich gut dokumentierten Fossilbericht. Messungen wurden aufgezeichnet, um die Größe und Form der oberen und unteren ersten Molaren zu beschreiben, die aus einer vermessenen stratigraphischen Schicht im Clarks Fork Basin von Wyoming gesammelt wurden. Die Änderungsraten von Größe und Form werden quantifiziert, indem evolutionäre Raten in Standardabweichungseinheiten pro Generation (Haldanes) berechnet werden. Die zeitliche Skalierung der Raten zeigt, dass die Größenänderung durch einen signifikant nicht-zufälligen gerichteten Prozess und die Formänderung durch einen signifikant nicht-zufälligen stabilisierenden Prozess erzeugt wurde. Die Größenänderung bei Cantius wird als Ergebnis schwacher gerichteter Selektion interpretiert, und die Formänderung wird als Ergebnis starker stabilisierender Selektion interpretiert.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300012963",
    doi = "10.1017/s0094837300012963",
    openalex = "W1408983869",
    references = "openalexw201159638"
}

Wir berichten über eine neue Transformation, den LogDet, die für Sequenzen mit unterschiedlicher Nukleotidzusammensetzung konsistent ist und die unter einfachen, aber asymmetrischen stochastischen Modellen der Evolution entstanden sind. Diese Transformation ist erforderlich, weil bestehende Methoden dazu neigen, Sequenzen unabhängig von ihrer evolutionären Geschichte allein auf der Grundlage ihrer Nukleotidzusammensetzung zu gruppieren. Dieser Effekt unterschiedlicher Nukleotidfrequenzen wird veranschaulicht, indem ein Baumauswahlkriterium auf eine einfache Distanzmaß definiert wird, das ausschließlich auf der Grundlage der Basenzusammensetzung und unabhängig von den tatsächlichen Sequenzen basiert. Die neue LogDet-Transformation verwendet Determinanten der beobachteten Divergenzmatrizen und funktioniert, weil die Multiplikation von Determinanten (reelle Zahlen) kommutativ ist, während die Multiplikation von Matrizen dies nicht ist, außer in speziellen symmetrischen Fällen. Die Verwendung von Determinanten ermöglicht somit allgemeinere Modelle der Evolution mit symmetrischen Raten der Nukleotidänderung. Die Transformation wird an einem theoretischen Datensatz (wo bestehende Methoden den falschen Baum auswählen) und mit drei biologischen Datensätzen veranschaulicht: Chloroplasten, Vögel/Säugetiere (kernkodiert) und Honigbienen (mitochondrial). Die LogDet-Transformation unterstreicht die logische Unterscheidung zwischen Transformationen auf den Daten und Baumauswahlkriterien. Die allgemeinen Schlussfolgerungen aus dieser Studie sind, dass unregelmäßige A,C,G,T-Zusammensetzungen eine wichtige und mögliche allgemeine Ursache für Muster sind, die Baumrekonstruktionsmethoden täuschen können, selbst wenn hohe Bootstrap-Werte erzielt werden. Folglich müssen viele veröffentlichte Studien möglicherweise erneut überprüft werden.

@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva040136,
    author = "Lockhart, Peter J. und Steel, Mike und Hendy, Michael D. und Penny, David",
    title = "Recovering evolutionary trees under a more realistic model of sequence evolution.",
    year = "1994",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Wir berichten über eine neue Transformation, den LogDet, die für Sequenzen mit unterschiedlicher Nukleotidzusammensetzung konsistent ist und die unter einfachen, aber asymmetrischen stochastischen Modellen der Evolution entstanden sind. Diese Transformation ist erforderlich, weil bestehende Methoden dazu neigen, Sequenzen unabhängig von ihrer evolutionären Geschichte allein auf der Grundlage ihrer Nukleotidzusammensetzung zu gruppieren. Dieser Effekt unterschiedlicher Nukleotidfrequenzen wird veranschaulicht, indem ein Baumauswahlkriterium auf eine einfache Distanzmaß definiert wird, das ausschließlich auf der Grundlage der Basenzusammensetzung und unabhängig von den tatsächlichen Sequenzen basiert. Die neue LogDet-Transformation verwendet Determinanten der beobachteten Divergenzmatrizen und funktioniert, weil die Multiplikation von Determinanten (reelle Zahlen) kommutativ ist, während die Multiplikation von Matrizen dies nicht ist, außer in speziellen symmetrischen Fällen. Die Verwendung von Determinanten ermöglicht somit allgemeinere Modelle der Evolution mit symmetrischen Raten der Nukleotidänderung. Die Transformation wird an einem theoretischen Datensatz (wo bestehende Methoden den falschen Baum auswählen) und mit drei biologischen Datensätzen veranschaulicht: Chloroplasten, Vögel/Säugetiere (kernkodiert) und Honigbienen (mitochondrial). Die LogDet-Transformation unterstreicht die logische Unterscheidung zwischen Transformationen auf den Daten und Baumauswahlkriterien. Die allgemeinen Schlussfolgerungen aus dieser Studie sind, dass unregelmäßige A,C,G,T-Zusammensetzungen eine wichtige und mögliche allgemeine Ursache für Muster sind, die Baumrekonstruktionsmethoden täuschen können, selbst wenn hohe Bootstrap-Werte erzielt werden. Folglich müssen viele veröffentlichte Studien möglicherweise erneut überprüft werden.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    openalex = "W2162443218",
    references = "doi101093oxfordjournalsmolbeva040752, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101126science3277277"
}

Drei veröffentlichte Schätzungen der Häufigkeit von Polyploidie in Angiospermen (30 bis 35 Prozent, 47 Prozent und 70 bis 80 Prozent) wurden getestet, indem die Genomgröße ausgestorbener holziger Angiospermen geschätzt wurde, wobei die Größe fossiler Schließzellen als Proxy für den zellulären DNA-Gehalt verwendet wurde. Die abgeleiteten Chromosomenzahlen dieser ausgestorbenen Arten deuten darauf hin, dass sieben bis neun die ursprüngliche haploide Chromosomenzahl der Angiospermen ist und dass die meisten Angiospermen (ungefähr 70 Prozent) in ihrer Geschichte Polyploidie aufweisen.

@article{doi101126science2645157421,
    author = "Masterson, Jane",
    title = "Stomatal Size in Fossil Plants: Evidence for Polyploidy in Majority of Angiosperms",
    year = "1994",
    journal = "Science",
    abstract = "Three published estimates of the frequency of polyploidy in angiosperms (30 to 35 percent, 47 percent, and 70 to 80 percent) were tested by estimating the genome size of extinct woody angiosperms with the use of fossil guard cell size as a proxy for cellular DNA content. The inferred chromosome numbers of these extinct species suggest that seven to nine is the primitive haploid chromosome number of angiosperms and that most angiosperms (approximately 70 percent) have polyploidy in their history.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.264.5157.421",
    doi = "10.1126/science.264.5157.421",
    openalex = "W2049670427",
    references = "doi1023072412932, openalexw2065039187"
}

Größe und Form werden für pliozäne Linien der Nagetiergattung Stephanomys Schaub 1938 analysiert. Vorherige phylogenetische Studien basierten hauptsächlich auf Größenvariation und deskriptiven Vergleichen, ohne jeglichen Versuch, Formveränderungen zu quantifizieren. Daher wurde Stephanomys aufgrund des regelmäßigen Größenwachstums als ein vorzügliches Beispiel für phyletischen Gradualismus betrachtet. Um die morphologische Variation innerhalb der Linie zu quantifizieren, wurde eine Methode zur Analyse komplexer Umrisse, die elliptische Fourier-Transformation, auf den Zahnumriss (oberer und unterer erster Molare) angewendet. Es war dann möglich, die Evolution in der Größe, geschätzt durch die Zahnfläche, sowie die Evolution der Form, dargestellt durch Fourier-Koeffizienten, zu vergleichen. Während die Größe scheinbar im Laufe der Zeit graduell verändert, gibt die Morphologie ein eher diskontinuierliches evolutionäres Muster sowohl für den oberen als auch für den unteren Molaren. Eine solche Diskrepanz zwischen der Evolution der Größe und Form einer einzelnen Struktur deutet darauf hin, dass unterschiedliche genetische Determinismen und mechanische Constraints auf Größe und Form wirken können. Daher kann es irreführend sein, generalisierte evolutionäre Prozesse allein aus Größe oder Form zu ableiten.

@article{doi101017s0094837300016201,
    author = "Renaud, Sabrina und Michaux, Jacques und Jaeger, Jean‐Jacques und Auffray, Jean‐Christophe",
    title = "Fourier-Analyse angewendet auf Stephanomys (Rodentia, Muridae) Molaren: nicht-progressive evolutionäres Muster in einer graduellen Linie",
    year = "1996",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Größe und Form werden für pliozäne Linien der Nagetiergattung Stephanomys Schaub 1938 analysiert. Vorherige phylogenetische Studien basierten hauptsächlich auf Größenvariation und deskriptiven Vergleichen, ohne jeglichen Versuch, Formveränderungen zu quantifizieren. Daher wurde Stephanomys aufgrund des regelmäßigen Größenwachstums als ein vorzügliches Beispiel für phyletischen Gradualismus betrachtet. Um die morphologische Variation innerhalb der Linie zu quantifizieren, wurde eine Methode zur Analyse komplexer Umrisse, die elliptische Fourier-Transformation, auf den Zahnumriss (oberer und unterer erster Molare) angewendet. Es war dann möglich, die Evolution in der Größe, geschätzt durch die Zahnfläche, sowie die Evolution der Form, dargestellt durch Fourier-Koeffizienten, zu vergleichen. Während die Größe scheinbar im Laufe der Zeit graduell verändert, gibt die Morphologie ein eher diskontinuierliches evolutionäres Muster sowohl für den oberen als auch für den unteren Molaren. Eine solche Diskrepanz zwischen der Evolution der Größe und Form einer einzelnen Struktur deutet darauf hin, dass unterschiedliche genetische Determinismen und mechanische Constraints auf Größe und Form wirken können. Daher kann es irreführend sein, generalisierte evolutionäre Prozesse allein aus Größe oder Form zu ableiten.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300016201",
    doi = "10.1017/s0094837300016201",
    openalex = "W2504052297",
    references = "doi1010160146664x8290034x, doi101016016953479390024j, doi101017s0094837300008289, doi101017s0094837300012963, doi101017s0094837300013658, doi101038366223a0, doi101038368696a0, doi1023071378990, doi1023072413076, doi1023072413345, gingerich1987evolution"
}

@article{foote1996perspective,
    author = "Foote, Mike",
    title = "PERSPECTIVE: EVOLUTIONARY PATTERNS IN THE FOSSIL RECORD",
    year = "1996",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1996.tb04467.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1996.tb04467.x",
    number = "1",
    openalex = "W2327034943",
    pages = "1-11",
    volume = "50",
    references = "doi10100703064746897, doi101017s0094837300003778, doi101093aesa383396, doi101111j155856461985tb00420x, doi101146annureven10010165000525, doi1015159780691224244, doi1023073224530, doi107312simp93764, openalexw1528487914, openalexw2145250129"
}

Natürliche Populationen von Guppys wurden einer Episode gerichteter Selektion unterzogen, die natürliche Prozesse nachahmte. Die resultierende Evolutionsrate von Alter und Größe bei der Geschlechtsreife war ähnlich den Raten, die typischerweise für Merkmale erhalten werden, die künstlicher Selektion in Laborumgebungen unterzogen wurden, und bis zu sieben Größenordnungen höher als die aus dem paläontologischen Rekord abgeleiteten Raten. Männliche Merkmale entwickelten sich schneller als weibliche Merkmale, hauptsächlich, weil Männchen mehr genetische Variation besaßen, auf die die natürliche Selektion wirken konnte. Diese Ergebnisse werden im Kontext der anhaltenden Debatte über die Bedeutung der natürlichen Selektion gegenüber anderen Prozessen im paläontologischen Evolutionsrekorde betrachtet.

@article{doi101126science27553081934,
    author = "Reznick, David N. und Shaw, Frank H. und Rodd, F. Helen und Shaw, Ruth G.",
    title = "Evaluation of the Rate of Evolution in Natural Populations of Guppies (Poecilia reticulata)",
    year = "1997",
    journal = "Science",
    abstract = "Natürliche Populationen von Guppys wurden einer Episode gerichteter Selektion unterzogen, die natürliche Prozesse nachahmte. Die resultierende Evolutionsrate von Alter und Größe bei der Geschlechtsreife war ähnlich den Raten, die typischerweise für Merkmale erhalten werden, die künstlicher Selektion in Laborumgebungen unterzogen wurden, und bis zu sieben Größenordnungen höher als die aus dem paläontologischen Rekord abgeleiteten Raten. Männliche Merkmale entwickelten sich schneller als weibliche Merkmale, hauptsächlich, weil Männchen mehr genetische Variation besaßen, auf die die natürliche Selektion wirken konnte. Diese Ergebnisse werden im Kontext der anhaltenden Debatte über die Bedeutung der natürlichen Selektion gegenüber anderen Prozessen im paläontologischen Evolutionsrekorde betrachtet.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.275.5308.1934",
    doi = "10.1126/science.275.5308.1934",
    openalex = "W1981048891",
    references = "doi10100797894015768267, doi101111j155856461949tb00004x, doi101126science2224620159"
}

Ein einfaches Modell für die Evolution der Rate der molekularen Evolution wird vorgestellt. Mit einem bayesschen Ansatz kann dieses Modell als Grundlage für die Schätzung von Daten wichtiger evolutionärer Ereignisse dienen, auch ohne die Annahme konstanter Raten unter evolutionären Linien. Die Methode kann in Verbindung mit jedem der weit verbreiteten Modelle für Nukleotidsubstitution oder Aminosäureaustausch verwendet werden. Sie wird durch die Analyse eines Datensatzes von rbcL-Proteinsequenzen illustriert.

@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva025892,
    author = "Thorne, Jeffrey L. und Kishino, Hirohisa und Painter, Ian",
    title = "Schätzung der Evolutionsrate der Rate der molekularen Evolution",
    year = "1998",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Ein einfaches Modell für die Evolution der Rate der molekularen Evolution wird vorgestellt. Mit einem bayesschen Ansatz kann dieses Modell als Grundlage für die Schätzung von Daten wichtiger evolutionärer Ereignisse dienen, auch ohne die Annahme konstanter Raten unter evolutionären Linien. Die Methode kann in Verbindung mit jedem der weit verbreiteten Modelle für Nukleotidsubstitution oder Aminosäureaustausch verwendet werden. Sie wird durch die Analyse eines Datensatzes von rbcL-Proteinsequenzen illustriert.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a025892",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a025892",
    openalex = "W2051296828",
    references = "doi101007bf01734359, doi101007bf01797451, doi101007bf02111276, doi101007bf02338839, doi101016b9781483227344500176, doi101016b9781483232119500097, doi101038scientificamerican117998, doi101093bioinformatics83275, doi101093biomet57197, doi101198tech2001s608, doi1012019780429258411, doi1023072291187"
}

@article{doi10103844766,
    author = "Pagel, Mark",
    title = "Inferring the historical patterns of biological evolution",
    year = "1999",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/44766",
    doi = "10.1038/44766",
    openalex = "W2114525641",
    references = "doi101016s0092867400803104, doi10103818872, doi101038366223a0, doi101038384055a0, doi101086284325, doi101086286013, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio41118, doi101098rspb19940006, doi101111j146364091997tb00423x, doi101126science2740904, doi101126science2765313734, doi101128mr5122212711987, doi1015159781503621534, doi1023072407154, doi1023072485224, doi105860choice295104, rambaut1998estimating"
}

Paläontologen haben lange argumentiert, dass die wichtigste evolutionäre Strahlung der Säugetiere während des frühen Känozoikum stattfand, wenn nicht sogar, dass alle Eutherier von einem einzigen gemeinsamen post-kreidezeitlichen Vorfahren abstammen. Dennoch behaupten mehrere jüngere molekulare Analysen zu zeigen, dass, weil mehrere interordinale Aufspaltungen während der Kreidezeit stattfanden, eine große therianische Strahlung damals bereits im Gange war. Diese Behauptung steht im Konflikt mit statistischen Beweisen aus dem gut untersuchten späten kreidezeitlichen und känozoischen nordamerikanischen Fossilbericht. Paläofaunale Daten bestätigen, dass es während des späten Kreidezeit weniger Säugetierarten gab als während irgendeines Intervalls des Känozoikums, und dass eine massive Diversifizierung während des frühen Paläozän, unmittelbar nach einer Massenauslöschung, stattfand. Messdaten zeigen, dass kreidezeitliche Säugetiere durchschnittlich klein waren und einen engen Bereich von Körpergrößen einnahmen; nach der Kreide-Tertiär-Massenauslöschung gab es einen schnellen und dauerhaften Verschiebung des Mittels. Die Tatsache, dass es eine frühe känozoische Säugetierstrahlung gab, ist vollständig mit der Existenz weniger kreidezeitlicher Aufspaltungen unter modernen Säugetierlinien vereinbar.

@article{doi101080106351599260472,
    author = "Alroy, John",
    title = "The Fossil Record of North American Mammals: Evidence for a Paleocene Evolutionary Radiation",
    year = "1999",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "Paleontologists long have argued that the most important evolutionary radiation of mammals occurred during the early Cenozoic, if not that all eutherians originated from a single common post-Cretaceous ancestor. Nonetheless, several recent molecular analyses claim to show that because several interordinal splits occurred during the Cretaceous, a major therian radiation was then underway. This claim conflicts with statistical evidence from the well-sampled latest Cretaceous and Cenozoic North American fossil record. Paleofaunal data confirm that there were fewer mammalian species during the latest Cretaceous than during any interval of the Cenozoic, and that a massive diversification took place during the early Paleocene, immediately after a mass extinction. Measurement data show that Cretaceous mammals were on average small and occupied a narrow range of body sizes; after the Cretaceous-Tertiary mass extinction, there was a rapid and permanent shift in the mean. The fact that there was an early Cenozoic mammalian radiation is entirely compatible with the existence of a few Cretaceous splits among modern mammal lineages.",
    url = "https://doi.org/10.1080/106351599260472",
    doi = "10.1080/106351599260472",
    openalex = "W2099893880",
    references = "doi1023071218194, openalexw610180004"
}

Die Trias-Jura-Grenze markiert eine massive Aussterbewelle bei Tieren, doch Aufzeichnungen über begleitende Umweltveränderungen sind begrenzt. Paläobotanische Belege deuten auf eine vierfache Zunahme der atmosphärischen Kohlendioxidkonzentration hin und legen nahe, dass dies zu einer damit verbundenen Erwärmung von 3 bis 4 Grad Celsius „Treibhauseffekt" über die Grenze hinweg führte. Diese Umweltbedingungen wurden berechnet, die Blatttemperaturen über einen hochkonservierten tödlichen Grenzwert zu erhöhen, was möglicherweise zum >95-prozentigen Artenumsatz der Trias-Jura-Megaflora beigetragen hat.

@article{doi101126science28554321386,
    author = "McElwain, Jennifer C. und Beerling, David J. und Woodward, F. I.",
    title = "Fossilpflanzen und globale Erwärmung an der Trias-Jura-Grenze",
    year = "1999",
    journal = "Science",
    abstract = {Die Trias-Jura-Grenze markiert eine massive Aussterbewelle bei Tieren, doch Aufzeichnungen über begleitende Umweltveränderungen sind begrenzt. Paläobotanische Belege deuten auf eine vierfache Zunahme der atmosphärischen Kohlendioxidkonzentration hin und legen nahe, dass dies zu einer damit verbundenen Erwärmung von 3 bis 4 Grad Celsius „Treibhauseffekt" über die Grenze hinweg führte. Diese Umweltbedingungen wurden berechnet, die Blatttemperaturen über einen hochkonservierten tödlichen Grenzwert zu erhöhen, was möglicherweise zum >95-prozentigen Artenumsatz der Trias-Jura-Megaflora beigetragen hat.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.285.5432.1386",
    doi = "10.1126/science.285.5432.1386",
    openalex = "W2007663434",
    references = "doi1010160034666777900070, doi1010160034666780900226, doi1010160034666781900695, doi101093oso97801985491780010001, doi101126science21545391501, doi101126science2845414616, doi101126science3616622, doi101126science7701342, doi101144gsjgs15450773"
}

Stromatolithe sind angeheftete, versteinerte sedimentäre Wachstumsstrukturen, die sich von einem Punkt oder einer begrenzten Initiationsfläche anlagern. Obwohl der Anlagerungsprozess allgemein als Ergebnis der Sedimentfänger- oder Niederschlags-induzierenden Aktivitäten mikrobieller Matten angesehen wird, ist in den meisten präkambrischen Stromatolithen wenig Beweise für diesen Prozess erhalten. Die erfolgreiche Untersuchung und Interpretation von Stromatolithen erfordert einen prozessorientierten Ansatz, der darauf ausgerichtet ist, die Ersatzstrukturen alter Stromatolithe zu entwirren. Zuerst müssen die Effekte diagenetischer Rekristallisation berücksichtigt werden, gefolgt von der Analyse von Laminationstexturen und der Ableitung möglicher Anlagerungsmechanismen. Anlagerungshypothesen können durch numerische Simulationen auf Basis moderner Stromatolith-Wachstumsprozesse getestet werden. Die Anwendung dieses Ansatzes hat gezeigt, dass Stromatolithe ursprünglich größtenteils durch in situ Niederschlag von Lamellen während der archaischen und älteren proterozoischen Zeiten gebildet wurden, während jüngere proterozoische Stromatolithe größtenteils durch die Anlagerung von Karbonatsedimenten wuchsen, höchstwahrscheinlich durch den physikalischen Prozess des mikrobiellen Fangens und Bindens. Dieser Trend spiegelt höchstwahrscheinlich die langfristige Evolution der Umwelt der Erde wider, anstatt mikrobieller Gemeinschaften.

@article{doi101146annurevearth271313,
    author = "Grotzinger, J. P. und Knoll, Andrew H.",
    title = "STROMATOLITES IN PRECAMBRIAN CARBONATES: Evolutionary Mileposts or Environmental Dipsticks?",
    year = "1999",
    journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
    abstract = "Stromatolithe sind angeheftete, versteinerte sedimentäre Wachstumsstrukturen, die sich von einem Punkt oder einer begrenzten Initiationsfläche anlagern. Obwohl der Anlagerungsprozess allgemein als Ergebnis der Sedimentfänger- oder Niederschlags-induzierenden Aktivitäten mikrobieller Matten angesehen wird, ist in den meisten präkambrischen Stromatolithen wenig Beweise für diesen Prozess erhalten. Die erfolgreiche Untersuchung und Interpretation von Stromatolithen erfordert einen prozessorientierten Ansatz, der darauf ausgerichtet ist, die Ersatzstrukturen alter Stromatolithe zu entwirren. Zuerst müssen die Effekte diagenetischer Rekristallisation berücksichtigt werden, gefolgt von der Analyse von Laminationstexturen und der Ableitung möglicher Anlagerungsmechanismen. Anlagerungshypothesen können durch numerische Simulationen auf Basis moderner Stromatolith-Wachstumsprozesse getestet werden. Die Anwendung dieses Ansatzes hat gezeigt, dass Stromatolithe ursprünglich größtenteils durch in situ Niederschlag von Lamellen während der archaischen und älteren proterozoischen Zeiten gebildet wurden, während jüngere proterozoische Stromatolithe größtenteils durch die Anlagerung von Karbonatsedimenten wuchsen, höchstwahrscheinlich durch den physikalischen Prozess des mikrobiellen Fangens und Bindens. Dieser Trend spiegelt höchstwahrscheinlich die langfristige Evolution der Umwelt der Erde wider, anstatt mikrobieller Gemeinschaften.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.earth.27.1.313",
    doi = "10.1146/annurev.earth.27.1.313",
    openalex = "W2142539052",
    references = "doi101007978364276884234, doi101016001670379390347y, doi101016030192688590066x, doi101016s0070457108711373, doi101016s0070457108711567, doi101016s0070457108x70451, doi101017cbo9780511599798, doi101017cbo9780511601064, doi101038324055a0, doi101038368046a0, doi101038383423a0, doi101086628623, doi101103physrevb275686, doi101103physrevlett56889, doi101126science11539686, doi101126science1585174, doi101126science1744011825, doi101139e79088, doi101146annurevecolsys281129, doi1023073514631, doi1023073514973"
}

Stressbedingte Umweltbedingungen können als solche definiert werden, die zu einer starken Verringerung der Fitness in Populationen führen. Das heißt, wenn veränderte Umweltbedingungen eine drastische Verringerung der Reproduktionsleistung verursachen und wenn die Persistenz dieser Bedingungen zu dauerhaften Schäden führt, stellen diese Bedingungen einen Umwelteinfluss dar. Physische Belastungen, die in Populationen selten vorkommen – wie Trockenperioden oder extreme Kälte – oder die von einer Minderheit einer Art betroffen sind – wie in Populationen, die sich an Verbreitungsgrenzen befinden oder lokalen chemischen Belastungen ausgesetzt sind, die durch menschliche Aktivitäten entstehen – können durch ihre direkten oder indirekten Auswirkungen zu deutlichen Verringerungen der Populationsgröße führen (Glynn 1988, Hoffmann und Parsons 1991) sowie zu wiederholten Zyklen der Kolonisation und des Aussterbens (Andrewartha und Birch 1954).

@article{doi1016410006356820000500217esaaef23co2,
    author = "Hoffmann, Ary A. und Hercus, Miriam J.",
    title = "Environmental Stress as an Evolutionary Force",
    year = "2000",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Stressful environmental conditions can be defined as those that lead to a sharp reduction in fitness in populations. That is, when changed environmental con­ ditions cause a drastic reduction in reproductive output, and when persistence of the conditions leads to permanent damage, these conditions constitute an environmental stress. Physical stresses that are encountered rarely in populations-such as periods of drought or extreme cold­ or that are encountered by a minority of a species-such as in populations that are located at distribution borders or are exposed to local chemical stresses arising from human activities-can, through their direct or indirect effects, lead to marked reductions in the size of populations (Glynn 1988, Hoffmann and Parsons 1991) and to repeated cycles of colonization and extinction (Andrewartha and Birch 1954).",
    url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2000)050[0217:esaaef]2.3.co;2",
    doi = "10.1641/0006-3568(2000)050[0217:esaaef]2.3.co;2",
    openalex = "W2157843549",
    references = "doi101016s0031018296000995, doi101146annureves10110179001335"
}

@article{doi101016s0031018201002085,
    author = "Steiner, Michael und Wallis, Eckart und Erdtmann, Bernd-Dietrich und Zhao, Yuanlong und Yang, Ruidong",
    title = "Submarine-hydrothermale exhalative Erzschichten in schwarzen Schiefern aus Südchina und damit verbundene Fossilien — Einblicke in eine Unterkambrium-Fazies und die bio-Evolution",
    year = "2001",
    journal = "Paläogeographie Paläoklimatologie Paläoökologie",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0031-0182(01)00208-5",
    doi = "10.1016/s0031-0182(01)00208-5",
    openalex = "W2115053158",
    references = "doi1010160009254180900479, doi1010160009254186900781, doi1010160012821x84900396, doi101016003101829390065q, doi1010160031920186900932, doi101016003192018990263x, doi101017cbo9780511601064, doi101038267403a0, doi101126science2464928339, doi101126science2705236598, doi1011300091761319940220179pcbgsr23co2, doi101144gsjgs14920171, doi101306m20377, doi10182618200374742199101, doi1023072992562, openalexw1624806571"
}

In den letzten Jahren gab es eine Debatte über verschiedene Methoden, die den Erhaltungswert unterhalb der Art-Ebene objektiv priorisieren könnten. Am prominentesten dabei war die evolutionär signifikante Einheit (ESU). Wir haben ESU-Konzepte überprüft, um ein einheitlicheres Konzept vorzuschlagen, das gegensätzliche Ansichten in Einklang bringt. Wie Art-Konzepte zielen auch widersprüchliche ESU-Konzepte im Wesentlichen darauf ab, dasselbe zu definieren: Segmente von Arten, deren Divergenz gemessen oder bewertet werden kann, indem unterschiedlichen Gewichtungen auf die Rolle evolutionärer Kräfte zu verschiedenen zeitlichen Skalen gegeben werden. Daher liegen die Unterschiede zwischen ESU-Konzepten mehr in den Kriterien, die verwendet werden, um die ESUs selbst zu definieren, als in ihrem grundlegenden Wesen. Wir stellen einen kontextbasierten Rahmen zur Abgrenzung von ESUs bereit, der einen Großteil dieser Situation umgeht. Anstatt sich in einer verwirrten Debatte über ein optimales Kriterium zu verwickeln, besteht der Schlüssel zu einer Lösung darin, anzuerkennen, dass unterschiedliche Kriterien dynamischer wirken können als andere und je nach Situation allein oder in Kombination verwendet werden können. Diese Behauptungen bilden den Anstoß für die adaptive evolutionäre Erhaltung.

@article{doi101046j1365294x2001t01101411x,
    author = "Fraser, Dylan J. und Bernatchez, Louis",
    title = "Adaptive evolutionary conservation: towards a unified concept for defining conservation units",
    year = "2001",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "In den letzten Jahren gab es eine Debatte über verschiedene Methoden, die den Erhaltungswert unterhalb der Art-Ebene objektiv priorisieren könnten. Am prominentesten dabei war die evolutionär signifikante Einheit (ESU). Wir haben ESU-Konzepte überprüft, um ein einheitlicheres Konzept vorzuschlagen, das gegensätzliche Ansichten in Einklang bringt. Wie Art-Konzepte zielen auch widersprüchliche ESU-Konzepte im Wesentlichen darauf ab, dasselbe zu definieren: Segmente von Arten, deren Divergenz gemessen oder bewertet werden kann, indem unterschiedlichen Gewichtungen auf die Rolle evolutionärer Kräfte zu verschiedenen zeitlichen Skalen gegeben werden. Daher liegen die Unterschiede zwischen ESU-Konzepten mehr in den Kriterien, die verwendet werden, um die ESUs selbst zu definieren, als in ihrem grundlegenden Wesen. Wir stellen einen kontextbasierten Rahmen zur Abgrenzung von ESUs bereit, der einen Großteil dieser Situation umgeht. Anstatt sich in einer verwirrten Debatte über ein optimales Kriterium zu verwickeln, besteht der Schlüssel zu einer Lösung darin, anzuerkennen, dass unterschiedliche Kriterien dynamischer wirken können als andere und je nach Situation allein oder in Kombination verwendet werden können. Diese Behauptungen bilden den Anstoß für die adaptive evolutionäre Erhaltung.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.2001.t01-1-01411.x",
    doi = "10.1046/j.1365-294x.2001.t01-1-01411.x",
    openalex = "W2141234232",
    references = "doi10100797814615678136, doi101126science27953592115, doi1023073224530, doi107202032681ar, doi107312simp92414"
}

Die Raten der molekularen Evolution variieren über die Zeit und damit auch zwischen Abstammungslinien. Im Gegensatz dazu gehen weit verbreitete Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten aus molekularen Sequenzdaten von der Konstanz der Raten aus. Daher sind Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten, die die Ratenvariation berücksichtigen, attraktiv. Verbesserungen einer zuvor vorgeschlagenen bayesschen Technik zur Schätzung von Divergenzzeiten werden beschrieben. Die neue Parametrisierung erfasst die phylogenetische Struktur der Ratenentwicklung auf einem Baum effektiver. Fossilinformationen und andere Beweise können nun in bayesschen Analysen in Form von Einschränkungen für Divergenzzeiten einbezogen werden. Simulationsergebnisse zeigen, dass die Genauigkeit der Schätzung von Divergenzzeiten erheblich verbessert wird, wenn Einschränkungen berücksichtigt werden.

@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva003811,
    author = "Kishino, Hirohisa und Thorne, Jeffrey L. und Bruno, William",
    title = "Performance of a Divergence Time Estimation Method under a Probabilistic Model of Rate Evolution",
    year = "2001",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Die Raten der molekularen Evolution variieren über die Zeit und damit auch zwischen Abstammungslinien. Im Gegensatz dazu gehen weit verbreitete Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten aus molekularen Sequenzdaten von der Konstanz der Raten aus. Daher sind Methoden zur Schätzung von Divergenzzeiten, die die Ratenvariation berücksichtigen, attraktiv. Verbesserungen einer zuvor vorgeschlagenen bayesschen Technik zur Schätzung von Divergenzzeiten werden beschrieben. Die neue Parametrisierung erfasst die phylogenetische Struktur der Ratenentwicklung auf einem Baum effektiver. Fossilinformationen und andere Beweise können nun in bayesschen Analysen in Form von Einschränkungen für Divergenzzeiten einbezogen werden. Simulationsergebnisse zeigen, dass die Genauigkeit der Schätzung von Divergenzzeiten erheblich verbessert wird, wenn Einschränkungen berücksichtigt werden.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a003811",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a003811",
    openalex = "W2045517599"
}

Wir analysierten Muster der Tierausbreitung, -vicariance und -diversifizierung in der Holarktik auf Basis vollständiger Phylogenien von 57 extanten nicht-marinen Taxa, die zusammen 770 Arten umfassen und biogeografische Ereignisse vom späten Mesozoikum bis zur Gegenwart dokumentieren. Für die Analysen wurden vier Hauptbereiche verwendet, die jeweils einem historisch persistenten Landmass entsprechen: östliche Nearktik (EN), westliche Nearktik (WN), östliche Paläoarktik (EP) und westliche Paläoarktik (WP). Die auf Parsimonie basierende Baum-Anpassung zeigte, dass es für den Datensatz kein signifikant unterstütztes allgemeines Arealkladogramm gibt. Dennoch sind die Verbreitungen stark phylogenetisch konserviert, wie die dispersal-vicariance-Analyse (DIVA) zeigt. DIVA-basierte Permutationstests wurden verwendet, um phylogenetisch bestimmte biogeografische Muster zu identifizieren. Wie erwartet sind kontinentale Ausbreitungen (WP↓EP und WN↓EN) signifikant häufiger als paläokontinentale Ausbreitungen (WN↓EP und EN↓WP), die ihrerseits häufiger sind als disjunkte Ausbreitungen (EN↓EP und WN↓WP). Es gibt eine signifikante Ausbreitungsasymmetrie sowohl innerhalb der Nearktik (WN⇒EN häufiger als EN⇒WN) als auch der Paläoarktik (EP⇒WP häufiger als WP⇒EP). Kreuz-Beringische faunistische Verbindungen wurden traditionell betont, sind aber in unserem Datensatz nicht wichtiger als die kross-Atlantischen Verbindungen. Um Veränderungen über die Zeit zu analysieren, sortierten wir biogeografische Ereignisse in vier Hauptzeitperioden ein, indem wir fossile, biogeografische und molekulare Beweise mit einer «branching clock» kombinierten. Diese Analysen zeigen, dass trans-Atlantische Verbreitungen (EN–WP) im frühen bis mittleren Tertiär (70–20 Myr) häufig waren, während trans-Beringische Verbreitungen (WN–EP) in dieser Periode selten waren. Die meisten EN–EP Disjunktionen datieren auf das frühe Tertiär (70–45 Myr) zurück und deuten darauf hin, dass sie aus der Aufteilung von trans-Atlantischen statt trans-Beringischen Verbreitungen resultierten. Die Diversifizierung in WN und WP nahm im Quartär (< 3 Myr) zu, während sie in EP und EN von einem Maximum im frühen bis mittleren Tertiär abnahm.

@article{doi101111j109583122001tb01368x,
    author = "Sanmartín, Isabel und Enghoff, Henrik und Ronquist, Fredrik",
    title = "Patterns of animal dispersal, vicariance and diversification in the Holarctic",
    year = "2001",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Wir analysierten Muster der Tierausbreitung, -vicariance und -diversifizierung in der Holarktik auf Basis vollständiger Phylogenien von 57 extanten nicht-marinen Taxa, die zusammen 770 Arten umfassen und biogeografische Ereignisse vom späten Mesozoikum bis zur Gegenwart dokumentieren. Für die Analysen wurden vier Hauptbereiche verwendet, die jeweils einem historisch persistenten Landmass entsprechen: östliche Nearktik (EN), westliche Nearktik (WN), östliche Paläoarktik (EP) und westliche Paläoarktik (WP). Die auf Parsimonie basierende Baum-Anpassung zeigte, dass es für den Datensatz kein signifikant unterstütztes allgemeines Arealkladogramm gibt. Dennoch sind die Verbreitungen stark phylogenetisch konserviert, wie die dispersal-vicariance-Analyse (DIVA) zeigt. DIVA-basierte Permutationstests wurden verwendet, um phylogenetisch bestimmte biogeografische Muster zu identifizieren. Wie erwartet sind kontinentale Ausbreitungen (WP↓EP und WN↓EN) signifikant häufiger als paläokontinentale Ausbreitungen (WN↓EP und EN↓WP), die ihrerseits häufiger sind als disjunkte Ausbreitungen (EN↓EP und WN↓WP). Es gibt eine signifikante Ausbreitungsasymmetrie sowohl innerhalb der Nearktik (WN⇒EN häufiger als EN⇒WN) als auch der Paläoarktik (EP⇒WP häufiger als WP⇒EP). Kreuz-Beringische faunistische Verbindungen wurden traditionell betont, sind aber in unserem Datensatz nicht wichtiger als die kross-Atlantischen Verbindungen. Um Veränderungen über die Zeit zu analysieren, sortierten wir biogeografische Ereignisse in vier Hauptzeitperioden ein, indem wir fossile, biogeografische und molekulare Beweise mit einer «branching clock» kombinierten. Diese Analysen zeigen, dass trans-Atlantische Verbreitungen (EN–WP) im frühen bis mittleren Tertiär (70–20 Myr) häufig waren, während trans-Beringische Verbreitungen (WN–EP) in dieser Periode selten waren. Die meisten EN–EP Disjunktionen datieren auf das frühe Tertiär (70–45 Myr) zurück und deuten darauf hin, dass sie aus der Aufteilung von trans-Atlantischen statt trans-Beringischen Verbreitungen resultierten. Die Diversifizierung in WN und WP nahm im Quartär (< 3 Myr) zu, während sie in EP und EN von einem Maximum im frühen bis mittleren Tertiär abnahm.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2001.tb01368.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.2001.tb01368.x",
    openalex = "W2142884638",
    references = "doi101007978146133485919, doi101007978303487527124, doi1010160169534794901635, doi10103835025052, doi101093oxfordjournalsmolbeva026092, doi101093sysbio461195, doi101146annurevecolsys301421, doi101146annureven15010170000525, doi1023071440574, doi1023072395021, doi1023072412970, doi105962bhlpart13183, openalexw1486025919, openalexw2989964553"
}

@book{doi102307jctvjsf433,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory",
    year = "2002",
    booktitle = "Harvard University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctvjsf433",
    doi = "10.2307/j.ctvjsf433",
    openalex = "W4300925890"
}

* *1. Definition und Revision der Struktur der Evolutionstheorie * Teil I: Die Geschichte der darwinistischen Logik und Debatte *2. Das Wesen des Darwinismus und die Grundlage der modernen Orthodoxie: Eine Auslegung des Ursprungs der Arten *3. Samen der Hierarchie *4. Internalismus und Gesetze der Form: Prädarwinistische Alternativen zum Funktionalismus *5. Die fruchtbaren Facetten von Galtons Polyeder: Kanäle und Sprünge im postdarwinistischen Formalismus *6. Muster und Fortschritt auf der geologischen Bühne *7. Die moderne Synthese als begrenzter Konsens * Teil II: Hin zu einer revidierten und erweiterten Evolutionstheorie *8. Arten als Individuen in der hierarchischen Theorie der Selektion *9. Punctuated Equilibrium und die Validierung der makroevolutionären Theorie *10. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Historische Constraints und die Evolution der Entwicklung *11. Die Integration von Constraint und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Strukturbeschränkungen, Spandrels und die Zentralität der Exaptation in der Makroevolution *12. Ebenen der Zeit und Versuche des Extrapolationismus, mit einem Epilog über die Interaktion von Allgemeiner Theorie und kontingenter Geschichte * Bibliographie * Index

@article{doi105860choice396411,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The structure of evolutionary theory",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "* *1. Defining and Revising the Structure of Evolutionary Theory * Part I: The History of Darwinian Logic and Debate *2. The Essence of Darwinism and the Basis of Modern Orthodoxy: An Exegesis of the Origin of Species *3. Seeds of Hierarchy *4. Internalism and Laws of Form: Pre-Darwinian Alternatives to Functionalism *5. The Fruitful Facets of Galton's Polyhedron: Channels and Saltations in Post-Darwinian Formalism *6. Pattern and Progress on the Geological Stage *7. The Modern Synthesis as a Limited Consensus * Part II: Towards a Revised and Expanded Evolutionary Theory *8. Species as Individuals in the Hierarchical Theory of Selection *9. Punctuated Equilibrium and the Validation of Macroevolutionary Theory *10. The Integration of Constraint and Adaptation (Structure and Function) in Ontogeny and Phylogeny: Historical Constraints and the Evolution of Development *11. The Integration of Constraint and Adaptation (Structure and Function) in Ontogeny and Phylogeny: Structural Constraints, Spandrels, and the Centrality of Exaptation in Macroevolution *12. Tiers of Time and Trials of Extrapolationism, With an Epilog on the Interaction of General Theory and Contingent History * Bibliography * Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-6411",
    doi = "10.5860/choice.39-6411",
    openalex = "W1539968307"
}

ZUSAMMENFASSUNG Es besteht wenig Konsistenz in der Notation und Orientierungsterminologie, die in Diskussionen über fossile Zahnreihen nicht-mammalischer Fossilien verwendet wird. Die Standardisierung dieser Terminologie, wie sie in den medizinischen und zahnmedizinischen Wissenschaften durchgeführt wird, würde alle zukünftigen Forschungen zu fossilen Zähnen erleichtern. Für Säugetiere empfehlen wir die Einhaltung der Konvention, bei der Schneidezähne, Eckzähne, Prämolaren und Molaren in Oberkiefern als In, Cn, Pn und Mn (n = Zahnnummer) und in Unterkiefern als in, cn, pn und mn abgekürzt werden. Rechte, linke und Milchzähne werden durch R, L und D gekennzeichnet (z. B. DP4, Rp2). Bei Nicht-Säugetieren, die zahntragende Prämaxillae, Maxillae und Dentale sowie zusätzliche zahntragende Knochen (z. B. Vomer, Palatine, Pterygoide, Ektopterygoide, Sphenoid, Spleniale und sogar Parasphenoid) aufweisen können, empfehlen wir die Identifizierung von Zähnen unter Verwendung der Knochenabkürzung (z. B. pmn, mxn, dn, vn, pain). Eine Kombination aus Zahl und Schrägstrich (/) kann verwendet werden, um zwischen mehreren Zahnreihen zu unterscheiden (z. B. Pal1/n, Pal2/n), und für sehr komplizierte Zahnreihen können specimen-spezifische Karten erstellt werden. Wir schlagen die Verwendung der Begriffe mesial und distal vor, um Zahnoberflächen und Richtungen zu bezeichnen, die sich zum und vom Kiefergelenk hinwenden. Labial wird für jene Oberflächen und Richtungen angeboten, die den Lippen oder Wangen zugewandt sind, und lingual für jene, die der Zunge zugewandt sind. Wir bieten die Begriffe basal für die Richtung zu den Kronenbasen, apikal für die Richtung zu den Kronenspitzen, okklusal für Ansichten der okklusalen Oberflächen und basal sowie root apikal für Ansichten der Kronenbasen und Wurzeln an.

@article{doi101671027246342003231apfast20co2,
    author = "Smith, Joshua B. und Dodson, Peter",
    title = "A proposal for a standard terminology of anatomical notation and orientation in fossil vertebrate dentitions",
    year = "2003",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "ZUSAMMENFASSUNG Es besteht wenig Konsistenz in der Notation und Orientierungsterminologie, die in Diskussionen über fossile Zahnreihen nicht-mammalischer Fossilien verwendet wird. Die Standardisierung dieser Terminologie, wie sie in den medizinischen und zahnmedizinischen Wissenschaften durchgeführt wird, würde alle zukünftigen Forschungen zu fossilen Zähnen erleichtern. Für Säugetiere empfehlen wir die Einhaltung der Konvention, bei der Schneidezähne, Eckzähne, Prämolaren und Molaren in Oberkiefern als In, Cn, Pn und Mn (n = Zahnnummer) und in Unterkiefern als in, cn, pn und mn abgekürzt werden. Rechte, linke und Milchzähne werden durch R, L und D gekennzeichnet (z. B. DP4, Rp2). Bei Nicht-Säugetieren, die zahntragende Prämaxillae, Maxillae und Dentale sowie zusätzliche zahntragende Knochen (z. B. Vomer, Palatine, Pterygoide, Ektopterygoide, Sphenoid, Spleniale und sogar Parasphenoid) aufweisen können, empfehlen wir die Identifizierung von Zähnen unter Verwendung der Knochenabkürzung (z. B. pmn, mxn, dn, vn, pain). Eine Kombination aus Zahl und Schrägstrich (/) kann verwendet werden, um zwischen mehreren Zahnreihen zu unterscheiden (z. B. Pal1/n, Pal2/n), und für sehr komplizierte Zahnreihen können specimen-spezifische Karten erstellt werden. Wir schlagen die Verwendung der Begriffe mesial und distal vor, um Zahnoberflächen und Richtungen zu bezeichnen, die sich zum und vom Kiefergelenk hinwenden. Labial wird für jene Oberflächen und Richtungen angeboten, die den Lippen oder Wangen zugewandt sind, und lingual für jene, die der Zunge zugewandt sind. Wir bieten die Begriffe basal für die Richtung zu den Kronenbasen, apikal für die Richtung zu den Kronenspitzen, okklusal für Ansichten der okklusalen Oberflächen und basal sowie root apikal für Ansichten der Kronenbasen und Wurzeln an.",
    url = "https://doi.org/10.1671/0272-4634(2003)23[1:apfast]2.0.co;2",
    doi = "10.1671/0272-4634(2003)23[1:apfast]2.0.co;2",
    openalex = "W2177918895",
    references = "doi101001jama191104260090143037, doi101007bf02987808, doi101017cbo9780511608377011, doi101017s0094837300016201, doi10108002724634198710011638, doi10108002724634199510011250, doi10108002724634199810011101, doi10108002724634199810011114, doi101086273307, doi101098rstb19740001, doi101111j109636421978tb01049x, doi101126science10246376, doi101126science2665183267, doi101126science2725264986, doi101144gsjgs15310005, doi1016660022336020010750208lcsdaf20co2, doi1023073514548, doi1023073514751, doi105281zenodo1048848, doi105281zenodo16492064, doi105860choice383310, openalexw197683541, openalexw2609000594, rowe1989a, sues1978a"
}

Mit seiner theoretischen Grundlage, die fest in der molekularen evolutionären und Populationsgenetik verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution und der Inferenz der Natur und des Umfangs der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, dank der Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken und neuer statistischer und computergestützter Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für automatisches und manuelles Sequenzalignment, webbasierte Datenbanksuche, Inferenz phylogenetischer Bäume, Schätzung evolutionärer Distanzen und Testung evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.

@article{doi101093bib52150,
    author = "Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment",
    year = "2004",
    journal = "Briefings in Bioinformatics",
    abstract = "Mit seiner theoretischen Grundlage, die fest in der molekularen evolutionären und Populationsgenetik verankert ist, spielt die vergleichende DNA- und Proteinsequenzanalyse eine zentrale Rolle bei der Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und Multigenfamilien, der Schätzung von Raten der molekularen Evolution und der Inferenz der Natur und des Umfangs der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Genomen prägen. Der Umfang dieser Untersuchungen hat sich nun erheblich erweitert, dank der Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken und neuer statistischer und computergestützter Methoden. Diese Methoden erfordern benutzerfreundliche Computerprogramme. Ein solcher Versuch bestand darin, die Software für die Analyse der molekularen evolutionären Genetik (MEGA) zu entwickeln, mit dem Fokus auf die Förderung der Erforschung und Analyse der DNA- und Proteinsequenzvariation aus einer evolutionären Perspektive. In seiner dritten Hauptversion enthält MEGA3 Funktionen für automatisches und manuelles Sequenzalignment, webbasierte Datenbanksuche, Inferenz phylogenetischer Bäume, Schätzung evolutionärer Distanzen und Testung evolutionärer Hypothesen. Dieser Artikel bietet einen Überblick über die statistischen Methoden, computergestützten Werkzeuge und visuellen Erforschungsmodule für die Dateneingabe sowie die in MEGA erhältlichen Ergebnisse.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150",
    doi = "10.1093/bib/5.2.150",
    openalex = "W2146396346",
    references = "doi101007bf01731581, doi101007bf02407308, doi101016b9781483232119500097, doi101093bioinformatics17121244, doi101093genetics1233585, doi101093nar22224673, doi101093nar25173389, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093oxfordjournalsmolbeva040343, doi101093oxfordjournalsmolbeva040410, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023072408678, doi1023072412074, doi105860choice392183, openalexw2032279931, openalexw3217097258"
}

Die evolutionäre Geschichte einer Gruppe von Taxa wird üblicherweise durch einen phylogenetischen Baum dargestellt, und dieses Modell hat die Diskussion und Überprüfung von Hypothesen erheblich erleichtert. Es ist jedoch gut bekannt, dass komplexere evolutionäre Szenarien durch solche Modelle schlecht beschrieben werden. Darüber hinaus ist die Analyse der Daten auch dann, wenn die Evolution baumartig verläuft, möglicherweise nicht am besten durch Methoden unterstützt, die eine Baumstruktur erzwingen, sondern durch eine reichhaltigere Visualisierung der Daten, um deren Eigenschaften zu bewerten, zumindest als wesentlichen ersten Schritt. Daher sollten phylogenetische Netzwerke eingesetzt werden, wenn retikuläre Ereignisse wie Hybridisierung, horizontaler Gentransfer, Rekombination oder Genverdopplung und -verlust als beteiligt angesehen werden, und selbst in Abwesenheit solcher Ereignisse spielen phylogenetische Netzwerke eine nützliche Rolle. Dieser Artikel überprüft die für phylogenetische Netzwerke verwendete Terminologie und behandelt sowohl Split-Netzwerke als auch retikuläre Netzwerke, wie sie definiert sind und wie sie interpretiert werden können. Darüber hinaus skizziert der Artikel die Anfänge eines umfassenden statistischen Rahmens für die Anwendung von Split-Netzwerk-Methoden. Wir zeigen, wie Split-Netzwerke Konfidenzsets von Bäumen darstellen können, und führen einen konservativen statistischen Test ein, um zu prüfen, ob das widersprüchliche Signal in einem Netzwerk baumartig ist. Schließlich beschreibt dieser Artikel ein neues Programm, SplitsTree4, ein interaktives und umfassendes Werkzeug zur Inferenz verschiedener Arten phylogenetischer Netzwerke aus Sequenzen, Entfernungen und Bäumen.

@article{doi101093molbevmsj030,
    author = "Huson, Daniel H. und Bryant, David",
    title = "Anwendung phylogenetischer Netzwerke in evolutionären Studien",
    year = "2005",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Die evolutionäre Geschichte einer Gruppe von Taxa wird üblicherweise durch einen phylogenetischen Baum dargestellt, und dieses Modell hat die Diskussion und Überprüfung von Hypothesen erheblich erleichtert. Es ist jedoch gut bekannt, dass komplexere evolutionäre Szenarien durch solche Modelle schlecht beschrieben werden. Darüber hinaus ist die Analyse der Daten auch dann, wenn die Evolution baumartig verläuft, möglicherweise nicht am besten durch Methoden unterstützt, die eine Baumstruktur erzwingen, sondern durch eine reichhaltigere Visualisierung der Daten, um deren Eigenschaften zu bewerten, zumindest als wesentlichen ersten Schritt. Daher sollten phylogenetische Netzwerke eingesetzt werden, wenn retikuläre Ereignisse wie Hybridisierung, horizontaler Gentransfer, Rekombination oder Genverdopplung und -verlust als beteiligt angesehen werden, und selbst in Abwesenheit solcher Ereignisse spielen phylogenetische Netzwerke eine nützliche Rolle. Dieser Artikel überprüft die für phylogenetische Netzwerke verwendete Terminologie und behandelt sowohl Split-Netzwerke als auch retikuläre Netzwerke, wie sie definiert sind und wie sie interpretiert werden können. Darüber hinaus skizziert der Artikel die Anfänge eines umfassenden statistischen Rahmens für die Anwendung von Split-Netzwerk-Methoden. Wir zeigen, wie Split-Netzwerke Konfidenzsets von Bäumen darstellen können, und führen einen konservativen statistischen Test ein, um zu prüfen, ob das widersprüchliche Signal in einem Netzwerk baumartig ist. Schließlich beschreibt dieser Artikel ein neues Programm, SplitsTree4, ein interaktives und umfassendes Werkzeug zur Inferenz verschiedener Arten phylogenetischer Netzwerke aus Sequenzen, Entfernungen und Bäumen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msj030",
    doi = "10.1093/molbev/msj030",
    openalex = "W2055298722",
    references = "doi101016s0169534700020267, doi101038nrg929, doi10108010635150390235520, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsi111, doi101093sysbio463523, doi101111j155856461985tb00420x"
}

Fledermäuse stellen mehr als 20% der heute lebenden Säugetiere, doch ihre evolutionäre Geschichte ist weitgehend unbekannt aufgrund eines begrenzten Fossilberichts und widersprüchlicher oder unvollständiger Phylogenien. Hier präsentieren wir eine hochaufgelöste molekulare Phylogenie für alle heute lebenden Fledermausfamilien. Unsere Ergebnisse stützen die Hypothese, dass Megafledermäuse innerhalb von vier großen Mikrofledermaus-Linien eingebettet sind, die im frühen Eozän [52 bis 50 Millionen Jahre vor heute (Mya)] entstanden, zeitgleich mit einem signifikanten globalen Temperaturanstieg, einer Zunahme der Pflanzenvielfalt und -abundanz sowie dem Höhepunkt der Tertiär-Insektenvielfalt. Unsere Daten deuten darauf hin, dass Fledermäuse in Laurasien entstanden sind, möglicherweise in Nordamerika, und dass drei der großen Mikrofledermaus-Linien laurasischen Ursprungs sind, während die vierte gongwanischen Ursprungs ist. Durch die Kombination von Prinzipien der Ghost-Lineage-Analyse mit molekularen Divergenzdaten schätzen wir, dass der Fossilbericht von Fledermäusern die ersten Vorkommen im Durchschnitt um 73% unterschätzt (unrepräsentierte basale Astlänge, UBBL) und dass die Summe der fehlenden Fossilgeschichte 61% beträgt.

@article{doi101126science1105113,
    author = "Teeling, Emma C. und Springer, Mark S. und Madsen, Ole und Bates, Paul J. J. und O’Brien, Stephen J. und Murphy, William J.",
    title = "Eine molekulare Phylogenie für Fledermäuse beleuchtet Biogeographie und den Fossilbericht",
    year = "2005",
    journal = "Science",
    abstract = "Fledermäuse stellen mehr als 20% der heute lebenden Säugetiere, doch ihre evolutionäre Geschichte ist weitgehend unbekannt aufgrund eines begrenzten Fossilberichts und widersprüchlicher oder unvollständiger Phylogenien. Hier präsentieren wir eine hochaufgelöste molekulare Phylogenie für alle heute lebenden Fledermausfamilien. Unsere Ergebnisse stützen die Hypothese, dass Megafledermäuse innerhalb von vier großen Mikrofledermaus-Linien eingebettet sind, die im frühen Eozän [52 bis 50 Millionen Jahre vor heute (Mya)] entstanden, zeitgleich mit einem signifikanten globalen Temperaturanstieg, einer Zunahme der Pflanzenvielfalt und -abundanz sowie dem Höhepunkt der Tertiär-Insektenvielfalt. Unsere Daten deuten darauf hin, dass Fledermäuse in Laurasien entstanden sind, möglicherweise in Nordamerika, und dass drei der großen Mikrofledermaus-Linien laurasischen Ursprungs sind, während die vierte gongwanischen Ursprungs ist. Durch die Kombination von Prinzipien der Ghost-Lineage-Analyse mit molekularen Divergenzdaten schätzen wir, dass der Fossilbericht von Fledermäusern die ersten Vorkommen im Durchschnitt um 73% unterschätzt (unrepräsentierte basale Astlänge, UBBL) und dass die Summe der fehlenden Fossilgeschichte 61% beträgt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1105113",
    doi = "10.1126/science.1105113",
    openalex = "W1997655974",
    references = "doi101007bf01454359, doi101017cbo9780511529924, doi10103835003188, doi10103835055536, doi101073pnas0334222100, doi101073pnas111551998, doi101126science1067179, doi101126science11536548, doi101126science15437541333, doi101126science28454232153, doi1023071223169"
}

Artenstrahlungen bieten einzigartige Einblicke in die evolutionären Prozesse, die der Artenvielfalt und Mustern der Biodiversität zugrunde liegen. Um die Pflanzenstrahlung über einen ähnlichen Zeitraum mit den jüngsten Strahlungen der Buntbarsche zu vergleichen, die ein Zehnfaches schneller sind als dokumentierte Strahlungen bei Vögeln, Gliederfüßern und Pflanzen, konzentrieren wir uns auf die Hochlandflora der Anden, die artenreichste aller tropischen Berge. Aufgrund der jüngsten Hebung der nördlichen Anden waren die Hochlandumgebungen, in denen ein Großteil dieser reichen endemischen Flora vorkommt, erst seit dem späten Pliozän oder Pleistozän, vor 2-4 Millionen Jahren (Myr), für die Besiedlung verfügbar. Mit DNA-Sequenzdaten identifizieren wir eine monophyletische Gruppe innerhalb der Gattung Lupinus, die 81 Arten umfasst, die endemisch für die Anden sind. Das Alter dieses Kladus wird auf 1,18-1,76 Myr geschätzt, was einer Diversifikationsrate von 2,49-3,72 Arten pro Myr entspricht. Dies übersteigt frühere Schätzungen für Pflanzen und stellt das spektakulärste Beispiel für eine explosive Diversifikation von Pflanzenarten dar, das bisher dokumentiert wurde. Darüber hinaus deutet dies darauf hin, dass die hohen Diversifikationsraten der Buntbarsche nicht einzigartig sind. Das Fehlen von Schlüsselinnovationen, die mit dem andinischen Lupinus-Kladus verbunden sind, deutet darauf hin, dass die Diversifikation durch ökologische Möglichkeiten angetrieben wurde, die durch die Entstehung von inselartigen Lebensräumen nach der Hebung der Anden ermöglicht wurden. Daten aus anderen Gattungen zeigen, dass Lupinen zu einer Reihe von ähnlich schnellen andinischen Pflanzenstrahlungen gehören, die kontinentalen Ausmaßes und inselartigen Stimulus aufweisen, was darauf hindeutet, dass die Hochlandflora der Anden ein System bietet, das andere Gruppen, einschließlich Buntbarsche, für das Verständnis schneller Artenvielfalt rivalisiert.

@article{doi101073pnas0601928103,
    author = "Hughes, Colin E. und Eastwood, Ruth J.",
    title = "Island radiation on a continental scale: Exceptional rates of plant diversification after uplift of the Andes",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Artenstrahlungen bieten einzigartige Einblicke in die evolutionären Prozesse, die der Artenvielfalt und Mustern der Biodiversität zugrunde liegen. Um die Pflanzenstrahlung über einen ähnlichen Zeitraum mit den jüngsten Strahlungen der Buntbarsche zu vergleichen, die ein Zehnfaches schneller sind als dokumentierte Strahlungen bei Vögeln, Gliederfüßern und Pflanzen, konzentrieren wir uns auf die Hochlandflora der Anden, die artenreichste aller tropischen Berge. Aufgrund der jüngsten Hebung der nördlichen Anden waren die Hochlandumgebungen, in denen ein Großteil dieser reichen endemischen Flora vorkommt, erst seit dem späten Pliozän oder Pleistozän, vor 2-4 Millionen Jahren (Myr), für die Besiedlung verfügbar. Mit DNA-Sequenzdaten identifizieren wir eine monophyletische Gruppe innerhalb der Gattung Lupinus, die 81 Arten umfasst, die endemisch für die Anden sind. Das Alter dieses Kladus wird auf 1,18-1,76 Myr geschätzt, was einer Diversifikationsrate von 2,49-3,72 Arten pro Myr entspricht. Dies übersteigt frühere Schätzungen für Pflanzen und stellt das spektakulärste Beispiel für eine explosive Diversifikation von Pflanzenarten dar, das bisher dokumentiert wurde. Darüber hinaus deutet dies darauf hin, dass die hohen Diversifikationsraten der Buntbarsche nicht einzigartig sind. Das Fehlen von Schlüsselinnovationen, die mit dem andinischen Lupinus-Kladus verbunden sind, deutet darauf hin, dass die Diversifikation durch ökologische Möglichkeiten angetrieben wurde, die durch die Entstehung von inselartigen Lebensräumen nach der Hebung der Anden ermöglicht wurden. Daten aus anderen Gattungen zeigen, dass Lupinen zu einer Reihe von ähnlich schnellen andinischen Pflanzenstrahlungen gehören, die kontinentalen Ausmaßes und inselartigen Stimulus aufweisen, was darauf hindeutet, dass die Hochlandflora der Anden ein System bietet, das andere Gruppen, einschließlich Buntbarsche, für das Verständnis schneller Artenvielfalt rivalisiert.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0601928103",
    doi = "10.1073/pnas.0601928103",
    openalex = "W2045366837",
    references = "doi101038nrg1316, doi101073pnas0506330102, doi101073pnas89178322, doi1011300016760620001121091uhotca23co2, doi1023072419593"
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Ökologische Veränderungen in der Phänologie und Verbreitung von Pflanzen und Tieren finden in allen gut untersuchten marinen, Süßwasser- und terrestrischen Gruppen statt. Diese beobachteten Veränderungen sind stark in den von der globalen Erwärmung vorhergesagten Richtungen verzerrt und wurden durch Korrelationen zwischen Klima und biologischer Variation, Feld- und Laborversuchen sowie physiologischen Forschungsergebnissen mit lokalem oder regionalem Klimawandel in Verbindung gebracht. Arten mit begrenztem Verbreitungsgebiet, insbesondere polare und Berggipfelarten, zeigen schwere Verbreitungsgebietskontraktionen und waren die ersten Gruppen, in denen ganze Arten aufgrund des jüngsten Klimawandels ausgestorben sind. Tropische Korallenriffe und Amphibien wurden am stärksten negativ betroffen. Räuber-Beute- und Pflanzen-Insekten-Interaktionen wurden gestört, wenn interagierende Arten unterschiedlich auf die Erwärmung reagierten. Evolutionäre Anpassungen an wärmere Bedingungen haben in den Innenräumen der Verbreitungsgebiete von Arten stattgefunden, und Ressourcennutzung und Ausbreitung haben sich an sich ausdehnenden Verbreitungsgrenzen schnell entwickelt. Beobachtete genetische Verschiebungen modulieren lokale Effekte des Klimawandels, aber es gibt wenig Beweise dafür, dass sie negative Effekte auf Artenebene mildern werden.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110100,
    author = "Parmesan, Camille",
    title = "Ecological and Evolutionary Responses to Recent Climate Change",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Ecological changes in the phenology and distribution of plants and animals are occurring in all well-studied marine, freshwater, and terrestrial groups. These observed changes are heavily biased in the directions predicted from global warming and have been linked to local or regional climate change through correlations between climate and biological variation, field and laboratory experiments, and physiological research. Range-restricted species, particularly polar and mountaintop species, show severe range contractions and have been the first groups in which entire species have gone extinct due to recent climate change. Tropical coral reefs and amphibians have been most negatively affected. Predator-prey and plant-insect interactions have been disrupted when interacting species have responded differently to warming. Evolutionary adaptations to warmer conditions have occurred in the interiors of species' ranges, and resource use and dispersal have evolved rapidly at expanding range margins. Observed genetic shifts modulate local effects of climate change, but there is little evidence that they will mitigate negative effects at the species level.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    openalex = "W2135858501",
    references = "doi1010160169534794902488, doi10103835079180, doi101038369448a0, doi101038382146a0, doi101038386698a0, doi101038nature01286, doi101038nature04095, doi101038nature04246, doi101071mf99078, doi101093aesa492190, doi101126science28954872068, doi101126science2925517673, doi1023071939337, doi1023071940431, doi105860choice301495, openalexw1500291103, openalexw2151235472"
}

Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110215,
    author = "Petit, Rémy J. und Hampe, Arndt",
    title = "Some Evolutionary Consequences of Being a Tree",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    openalex = "W2102352162",
    references = "doi101111j001438202001tb00826x, doi101111j14610248200500739x, doi101126science1061967, doi101146annurevecolsys271237, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi107208chicago97802261186970010001, openalexw2065039187, openalexw2145250129, openalexw2146778590"
}

@article{doi101016jcell200710022,
    author = "Otto, Sarah P.",
    title = "The Evolutionary Consequences of Polyploidy",
    year = "2007",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.10.022",
    doi = "10.1016/j.cell.2007.10.022",
    openalex = "W2010032067",
    references = "doi101371journalpbio0030314, openalexw1493831303, openalexw2065039187"
}

Die Natur der durch den Fossilbericht aufgezeichneten evolutionären Veränderungen war lange umstritten, insbesondere hinsichtlich der relativen Häufigkeit gradueller Veränderungen gegenüber Stasis innerhalb von Linien. Hier präsentiere ich eine groß angelegte statistische Erhebung des Evolutionsmodus in fossilen Linien. Über 250 Sequenzen sich entwickelnder Merkmale wurden mittels Maximum-Likelihood auf drei evolutionäre Modelle angepasst: gerichtete Veränderung, zufällige Irrfahrt und Stasis. Die Evolution dieser Merkmale war selten gerichtet; in nur 5 % der fossilen Sequenzen war gerichtete Evolution der am stärksten unterstützte der drei Veränderungsmodi. Die restlichen 95 % der Sequenzen wurden nahezu gleichmäßig zwischen zufälligen Irrfahrten und Stasis aufgeteilt. Variablen, die mit der Körpergröße zusammenhängen, waren signifikant weniger wahrscheinlich als Formmerkmale, Stasis zu erfahren. Diese Befunde stimmen mit früheren Vorschlägen überein, dass die Größe möglicherweise evolutionär labiler als die Form ist, und sind mit einigen, aber nicht allen Mechanismen konsistent, die zur Erklärung der evolutionären Stasis vorgeschlagen wurden. Im Allgemeinen werden ähnliche evolutionäre Muster bei anderen Variablen beobachtet, wie z. B. bei der Zugehörigkeit zu Klades und der zeitlichen Auflösung, doch gibt es einige Hinweise darauf, dass gerichtete Veränderungen bei planktonischen Organismen häufiger auftreten als bei benthischen Organismen. Die Seltenheit, mit der gerichtete Evolution in dieser Studie beobachtet wurde, bestätigt eine zentrale Behauptung der unterbrochenen Gleichgewichte und deutet darauf hin, dass wahrhaft gerichtete Evolution selten ist oder, vielleicht noch wichtiger, eine so kurze Dauer hat, dass sie in paläontologischen Stichproben selten erfasst wird.

@article{doi101073pnas0704088104,
    author = "Hunt, Gene",
    title = "The relative importance of directional change, random walks, and stasis in the evolution of fossil lineages",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "The nature of evolutionary changes recorded by the fossil record has long been controversial, with particular disagreement concerning the relative frequency of gradual change versus stasis within lineages. Here, I present a large-scale, statistical survey of evolutionary mode in fossil lineages. Over 250 sequences of evolving traits were fit by using maximum likelihood to three evolutionary models: directional change, random walk, and stasis. Evolution in these traits was rarely directional; in only 5\% of fossil sequences was directional evolution the most strongly supported of the three modes of change. The remaining 95\% of sequences were divided nearly equally between random walks and stasis. Variables related to body size were significantly less likely than shape traits to experience stasis. This finding is in accord with previous suggestions that size may be more evolutionarily labile than shape and is consistent with some but not all of the mechanisms proposed to explain evolutionary stasis. In general, similar evolutionary patterns are observed across other variables, such as clade membership and temporal resolution, but there is some evidence that directional change in planktonic organisms is more frequent than in benthic organisms. The rarity with which directional evolution was observed in this study corroborates a key claim of punctuated equilibria and suggests that truly directional evolution is infrequent or, perhaps more importantly, of short enough duration so as to rarely register in paleontological sampling.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0704088104",
    doi = "10.1073/pnas.0704088104",
    openalex = "W2123848440",
    references = "doi10100703064746897, doi10100797814613088367, doi101016s003101829600096x, doi101016s0031018296000995, doi101017s0094837300004000, doi101017s0094837300005224, doi101017s0094837300012549, doi101093aesa383396, doi101111j155856461979tb04694x, doi101111j155856461982tb05068x, doi1023073803199, doi102307jctvjsf433, doi105860choice333929, doi105860choice396411"
}

Diese Open-Source-Software ist vollständig in der R-Sprache geschrieben und ist über das Comprehensive R Archive Network (CRAN) unter http://cran.r-project.org/ frei verfügbar.

@article{doi101093bioinformaticsbtm538,
    author = "Harmon, Luke J. und Weir, Jason T. und Brock, Chad D. und Glor, Richard E. und Challenger, Wendell",
    title = "GEIGER: Untersuchung evolutionärer Strahlungen",
    year = "2007",
    journal = "Bioinformatics",
    abstract = "Diese Open-Source-Software ist vollständig in der R-Sprache geschrieben und ist über das Comprehensive R Archive Network (CRAN) unter http://cran.r-project.org/ frei verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm538",
    doi = "10.1093/bioinformatics/btm538",
    openalex = "W2117368100",
    references = "doi10103844766, doi101093oso97801985052350010001, doi101111j001438202001tb00826x"
}

Zusammenfassung Wir überblicken theoretische und empirische Studien, um Fälle zu identifizieren, in denen evolutionäre Prozesse die Dynamik von Populationen, Gemeinschaften und Ökosystemen erheblich beeinflussen. Frühe theoretische Arbeiten zur eco‐evolutionären Dynamik befassten sich mit der Wirkung von (ko)evolutionärer Entwicklung auf die Stabilität von zweispeziesigen Räuber–Beute-Systemen und das Auftreten von Charakterverschiebung in einfachen Konkurrenzsystemen. Heutige theoretische Ökologen erweitern diese Arbeiten, um die eco‐evolutionäre Dynamik von mehrspeziesigen Gemeinschaften sowie das Funktionieren und die evolutionäre Entstehung von Ökosystemen zu untersuchen. Hinsichtlich der Methodik hat die eco‐evolutionäre Modellierung sich von einfachen, locus-basierten Modellen der Populationsgenetik zu Modellen der klonalen Selektion, der Quantitätsmerkmal-Dynamik und der adaptiven Dynamik erweitert. Die wenigen empirischen Studien zur Gemeinschaftsdynamik, die evolutionäre Prozesse explizit berücksichtigten, unterstützen die Ansicht, dass evolutionäre und ökologische Dynamiken oft auf ähnlichen Zeitskalen stattfinden und sie gemeinsam das dynamische Verhalten ökologischer Gemeinschaften bestimmen.

@article{doi101111j13652435200701275x,
    author = "Fussmann, Gregor F. und Loreau, Michel und Abrams, Peter A.",
    title = "Eco‐evolutionäre Dynamik von Gemeinschaften und Ökosystemen",
    year = "2007",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Zusammenfassung Wir überblicken theoretische und empirische Studien, um Fälle zu identifizieren, in denen evolutionäre Prozesse die Dynamik von Populationen, Gemeinschaften und Ökosystemen erheblich beeinflussen. Frühe theoretische Arbeiten zur eco‐evolutionären Dynamik befassten sich mit der Wirkung von (ko)evolutionärer Entwicklung auf die Stabilität von zweispeziesigen Räuber–Beute-Systemen und das Auftreten von Charakterverschiebung in einfachen Konkurrenzsystemen. Heutige theoretische Ökologen erweitern diese Arbeiten, um die eco‐evolutionäre Dynamik von mehrspeziesigen Gemeinschaften sowie das Funktionieren und die evolutionäre Entstehung von Ökosystemen zu untersuchen. Hinsichtlich der Methodik hat die eco‐evolutionäre Modellierung sich von einfachen, locus-basierten Modellen der Populationsgenetik zu Modellen der klonalen Selektion, der Quantitätsmerkmal-Dynamik und der adaptiven Dynamik erweitert. Die wenigen empirischen Studien zur Gemeinschaftsdynamik, die evolutionäre Prozesse explizit berücksichtigten, unterstützen die Ansicht, dass evolutionäre und ökologische Dynamiken oft auf ähnlichen Zeitskalen stattfinden und sie gemeinsam das dynamische Verhalten ökologischer Gemeinschaften bestimmen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2435.2007.01275.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2435.2007.01275.x",
    openalex = "W2143913979",
    references = "doi101023a1006554906681, doi101038116461b0, doi10103822521, doi101086282160, doi101111j155856461976tb00911x, doi101126science1070315, doi1015159780691209418, doi1015159780691224244, doi1015159781400847266, doi101890039000, doi1023072408012, doi1023072411924, doi102307jctvx5wbbh, openalexw1528487914"
}

Zusammenfassung: Die Verteilung organischer Formen ist auf jeder Skala von Populationen bis zu den höchsten taxonomischen Kategorien klumpig, und zwar sowohl innerhalb von Kladien als auch innerhalb von Ökosystemen. Der Fossilbericht bietet wenig Unterstützung für die Erwartung, dass die morphologischen Lücken zwischen Arten oder Gruppen von Arten im Laufe der Zeit zunehmen, wie es der Fall wäre, wenn diese Lücken durch das Aussterben einer homogeneren Verteilung von Morphologien entstanden wären. Da quantitative Bewertungen der Morphologie die Zählungen höherer Taxa als Maß für die morphologische Disparität ersetzt haben, haben zahlreiche Studien die schnelle Konstruktion des Morphoraums zu Beginn evolutionärer Strahlungen nachgewiesen und den Unterschied zwischen taxonomischen Maßnahmen der morphologischen Vielfalt und quantitativen Bewertungen der Disparität betont. Andere Studien haben sich mit sich ändernden Mustern der Disparität über Massenaussterben hinweg, ekomorphologischen Mustern und den Mustern der Konvergenz innerhalb ökologischer Gemeinschaften befasst, während die Entwicklung der theoretischen Morphologie die Bemühungen, zu verstehen, warum einige Formen nicht vorkommen, erheblich unterstützt hat. Eine parallele und bis vor kurzem weitgehend getrennte Forschungsanstrengung in der evolutionären Entwicklungsbiologie hat gezeigt, dass das Entwicklungswerkzeug, das der bemerkenswerten Breite der Metazoenform zugrunde liegt, bei den Bilateria weitgehend identisch ist und viele Komponenten von allen Metazoen geteilt werden. Hinter diesem Interesse an der Disparität steht die Frage nach der zeitlichen Variation bei der Produktion morphologischer Innovationen, eine Debatte über die relative Bedeutung der Generierung neuer Morphologien versus die unterschiedlichen Wahrscheinlichkeiten ihrer erfolgreichen Einführung sowie die relative Bedeutung von Einschränkung, Konvergenz und Zufälligkeit in der Evolution der Form.

@article{doi101111j14754983200600614x,
    author = "Erwin, Douglas H.",
    title = "DISPARITÄT: MORPHOLOGISCHES MUSTER UND ENTWICKLUNGSKONTEXT",
    year = "2007",
    journal = "Palaeontology",
    abstract = "Zusammenfassung: Die Verteilung organischer Formen ist auf jeder Skala von Populationen bis zu den höchsten taxonomischen Kategorien klumpig, und zwar sowohl innerhalb von Kladien als auch innerhalb von Ökosystemen. Der Fossilbericht bietet wenig Unterstützung für die Erwartung, dass die morphologischen Lücken zwischen Arten oder Gruppen von Arten im Laufe der Zeit zunehmen, wie es der Fall wäre, wenn diese Lücken durch das Aussterben einer homogeneren Verteilung von Morphologien entstanden wären. Da quantitative Bewertungen der Morphologie die Zählungen höherer Taxa als Maß für die morphologische Disparität ersetzt haben, haben zahlreiche Studien die schnelle Konstruktion des Morphoraums zu Beginn evolutionärer Strahlungen nachgewiesen und den Unterschied zwischen taxonomischen Maßnahmen der morphologischen Vielfalt und quantitativen Bewertungen der Disparität betont. Andere Studien haben sich mit sich ändernden Mustern der Disparität über Massenaussterben hinweg, ekomorphologischen Mustern und den Mustern der Konvergenz innerhalb ökologischer Gemeinschaften befasst, während die Entwicklung der theoretischen Morphologie die Bemühungen, zu verstehen, warum einige Formen nicht vorkommen, erheblich unterstützt hat. Eine parallele und bis vor kurzem weitgehend getrennte Forschungsanstrengung in der evolutionären Entwicklungsbiologie hat gezeigt, dass das Entwicklungswerkzeug, das der bemerkenswerten Breite der Metazoenform zugrunde liegt, bei den Bilateria weitgehend identisch ist und viele Komponenten von allen Metazoen geteilt werden. Hinter diesem Interesse an der Disparität steht die Frage nach der zeitlichen Variation bei der Produktion morphologischer Innovationen, eine Debatte über die relative Bedeutung der Generierung neuer Morphologien versus die unterschiedlichen Wahrscheinlichkeiten ihrer erfolgreichen Einführung sowie die relative Bedeutung von Einschränkung, Konvergenz und Zufälligkeit in der Evolution der Form.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1475-4983.2006.00614.x",
    doi = "10.1111/j.1475-4983.2006.00614.x",
    openalex = "W2091948436",
    references = "doi101016jprecamres200511003, doi101017cbo9781139164856, doi101017s009483730001263x, doi101017s0094837300015864, doi101073pnas050586297, doi101111j1525142x200600101x, doi101666009483731999251mditer20co2, doi1016660094837320000260056cefisg20co2, doi1016660094837320040300652atrode20co2, doi105860choice333929, foote1996perspective, openalexw2055967869, openalexw635257420"
}

Die Assemblage der Ediacara-Fossilien von Mistaken Point wird von Rangeomorphen mit homologen fraktalen Verzweigungselementen dominiert. Die auffälligsten sind die fusiformen Fossilien, hier als Fractofusus misrai n.gen. und n.sp. sowie Fractofusus andersoni n.gen. und n.sp. bezeichnet. Obwohl sie endemisch für den neufundländischen Teil des Avalonia-Terrans sind, dominierten sie Tiefseebodengemeinschaften unter der photischen Zone während der mittleren Ediacaran-Periode (ca. 575–560 Ma). Ihre biologischen Verwandtschaften bleiben unklar, doch ihre Architektur deutet auf eine phylogenetische Position nahe der Basis der Metazoa hin.

@article{doi101139e07003,
    author = "Gehlîng, James G. und Narbonne, Guy M.",
    title = "Spindle-shaped Ediacara fossils from the Mistaken Point assemblage, Avalon Zone, Newfoundland",
    year = "2007",
    journal = "Canadian Journal of Earth Sciences",
    abstract = "Die Assemblage der Ediacara-Fossilien von Mistaken Point wird von Rangeomorphen mit homologen fraktalen Verzweigungselementen dominiert. Die auffälligsten sind die fusiformen Fossilien, hier als Fractofusus misrai n.gen. und n.sp. sowie Fractofusus andersoni n.gen. und n.sp. bezeichnet. Obwohl sie endemisch für den neufundländischen Teil des Avalonia-Terrans sind, dominierten sie Tiefseebodengemeinschaften unter der photischen Zone während der mittleren Ediacaran-Periode (ca. 575–560 Ma). Ihre biologischen Verwandtschaften bleiben unklar, doch ihre Architektur deutet auf eine phylogenetische Position nahe der Basis der Metazoa hin.",
    url = "https://doi.org/10.1139/e07-003",
    doi = "10.1139/e07-003",
    openalex = "W2142748826",
    references = "doi101016jearscirev200508004"
}

BEAST ist ein leistungsstarkes und flexibles Analysepaket für die evolutionäre Analyse molekularer Sequenzvariationen. Es stellt zudem eine Ressource für die weitere Entwicklung neuer Modelle und statistischer Methoden der evolutionären Analyse bereit.

@article{doi101186147121487214,
    author = "Drummond, Alexei J. und Rambaut, Andrew",
    title = "BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees",
    year = "2007",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    abstract = "BEAST ist ein leistungsstarkes und flexibles Analysepaket für die evolutionäre Analyse molekularer Sequenzvariationen. Es stellt zudem eine Ressource für die weitere Entwicklung neuer Modelle und statistischer Methoden der evolutionären Analyse bereit.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1471-2148-7-214",
    doi = "10.1186/1471-2148-7-214",
    openalex = "W2110835349",
    references = "doi101007bf00160154, doi101007bf02101694, doi101007bf02101990, doi101016b9781483227344500176, doi101016s0169534703002167, doi10106311699114, doi101073pnas6341088, doi10108010635150290102456, doi101093bioinformatics178754, doi101093biomet57197, doi101093molbevmsi103, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101093oxfordjournalsmolbeva025892, doi101093oxfordjournalsmolbeva040153, doi101126science1101074, doi101371journalpbio0040088, rambaut1998estimating"
}

@article{doi101016jjhevol200811001,
    author = "Lyman, R. Lee",
    title = "Graphing evolutionary pattern and process: a history of techniques in archaeology and paleobiology",
    year = "2008",
    journal = "Journal of Human Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.jhevol.2008.11.001",
    doi = "10.1016/j.jhevol.2008.11.001",
    openalex = "W2111567600",
    references = "doi101017s001675680008660x, doi101111j1469185x1930tb00901x, doi101111j155856461947tb01335x, openalexw201159638"
}

Der disziplinweite Versuch, den Fossilbericht auf der Ebene der Vorkommen zu erfassen, hat es ermöglicht, die Aussterbe- und Entstehungsraten mariner Wirbellose mit viel größerer Genauigkeit zu schätzen. Die neuen Daten zeigen, dass zwei biologische Mechanismen die Erholung von Massenaussterben beschleunigt und die Vielfalt über die letzten 500 Millionen Jahre (Myr) auf einen relativ engen Bereich beschränkt haben. Erstens korreliert ein Rückgang der Vielfalt jeder Größe mit niedrigen Aussterberaten unmittelbar danach, so sehr, dass das Aussterben fast zum Erliegen käme, wenn die Vielfalt um 90% sinken würde. Zweitens werden sehr hohe Aussterberaten von ebenso hohen Entstehungsraten gefolgt. Die beiden Beziehungen sagen voraus, dass die Erholung von der aktuellen Massenauslöschung mindestens 10 Myr dauern wird und möglicherweise 40 Myr, wenn sie der Perm-Trias-Katastrophe gleichkommt. Unabhängig davon wird jedes große Ereignis zu einer dramatischen ökologischen und taxonomischen Umstrukturierung der Biosphäre führen. Die Daten bestätigen auch, dass sowohl Aussterbe- als auch Entstehungsraten während des Phanerozoikums zurückgingen und dass mehrere Aussterbeereignisse zusätzlich zum Perm-Trias-Ereignis besonders schwerwiegend waren. Allerdings könnte der Trend durch taxonomische Verzerrungen getrieben sein, und die Raten variieren gemäß einer einfachen log-normalen Verteilung, sodass es keinen scharfen Unterschied zwischen Hintergrund- und Massenaussterben gibt. Darüber hinaus ist das Fehlen einer signifikanten Autokorrelation in den Daten unvereinbar mit makroevolutionären Theorien der Periodizität oder der selbstorganisierten Kritikalität.

@article{doi101073pnas0802597105,
    author = "Alroy, John",
    title = "Dynamics of origination and extinction in the marine fossil record",
    year = "2008",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Der disziplinweite Versuch, den Fossilbericht auf der Ebene der Vorkommen zu erfassen, hat es ermöglicht, die Aussterbe- und Entstehungsraten mariner Wirbellose mit viel größerer Genauigkeit zu schätzen. Die neuen Daten zeigen, dass zwei biologische Mechanismen die Erholung von Massenaussterben beschleunigt und die Vielfalt über die letzten 500 Millionen Jahre (Myr) auf einen relativ engen Bereich beschränkt haben. Erstens korreliert ein Rückgang der Vielfalt jeder Größe mit niedrigen Aussterberaten unmittelbar danach, so sehr, dass das Aussterben fast zum Erliegen käme, wenn die Vielfalt um 90% sinken würde. Zweitens werden sehr hohe Aussterberaten von ebenso hohen Entstehungsraten gefolgt. Die beiden Beziehungen sagen voraus, dass die Erholung von der aktuellen Massenauslöschung mindestens 10 Myr dauern wird und möglicherweise 40 Myr, wenn sie der Perm-Trias-Katastrophe gleichkommt. Unabhängig davon wird jedes große Ereignis zu einer dramatischen ökologischen und taxonomischen Umstrukturierung der Biosphäre führen. Die Daten bestätigen auch, dass sowohl Aussterbe- als auch Entstehungsraten während des Phanerozoikums zurückgingen und dass mehrere Aussterbeereignisse zusätzlich zum Perm-Trias-Ereignis besonders schwerwiegend waren. Allerdings könnte der Trend durch taxonomische Verzerrungen getrieben sein, und die Raten variieren gemäß einer einfachen log-normalen Verteilung, sodass es keinen scharfen Unterschied zwischen Hintergrund- und Massenaussterben gibt. Darüber hinaus ist das Fehlen einer signifikanten Autokorrelation in den Daten unvereinbar mit makroevolutionären Theorien der Periodizität oder der selbstorganisierten Kritikalität.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0802597105",
    doi = "10.1073/pnas.0802597105",
    openalex = "W2075331526",
    references = "doi101017s0094837300003778, doi101017s0094837300004917, doi101017s0094837300006539, doi101073pnas111144698, doi101073pnas813801, doi101126science1156963, doi101666009483731999251mditer20co2, doi1016660094837320040300522oeamdo20co2, doi1016660094837320050310006poaeit20co2"
}

Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen der Natur und des Umfangs der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von entscheidender Bedeutung. Hiermit verkünden wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5), einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, Biomedizin und Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen ML-Baum-Schließungsalgorithmen in MEGA5 andere Softwarepakete hinsichtlich der Recheneffizienz und der Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen Sites günstig. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun verbessert, um aktivitätsgetrieben zu sein, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net verfügbar.

@article{doi101093molbevmsr121,
    author = "Tamura, Koichiro und Peterson, Daniel G. und Peterson, Nora und Stecher, Glen und Nei, M und Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA5: Molekulare Evolutionsgenetik-Analyse unter Verwendung von Maximum-Likelihood-, Evolutionärer Distanz- und Maximum-Parsimony-Methoden",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Der vergleichende Analyse molekularer Sequenzdaten ist für die Rekonstruktion der evolutionären Geschichte von Arten und das Schließen der Natur und des Umfangs der selektiven Kräfte, die die Evolution von Genen und Arten prägen, von entscheidender Bedeutung. Hiermit verkünden wir die Veröffentlichung von Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 5 (MEGA5), einer benutzerfreundlichen Software zur Auswertung von Online-Datenbanken, zum Aufbau von Sequenzalignments und phylogenetischen Bäumen sowie zur Anwendung von Methoden der evolutionären Bioinformatik in der Grundlagenbiologie, Biomedizin und Evolution. Die neueste Ergänzung in MEGA5 ist eine Sammlung von Maximum-Likelihood (ML)-Analysen zum Schließen evolutionärer Bäume, zur Auswahl der besten Anpassungs-Substitutionsmodelle (Nukleotid oder Aminosäure), zum Schließen von Vorfahrenzuständen und -sequenzen (zusammen mit Wahrscheinlichkeiten) sowie zur Schätzung evolutionärer Raten site-by-site. In Computersimulationen verglichen ML-Baum-Schließungsalgorithmen in MEGA5 andere Softwarepakete hinsichtlich der Recheneffizienz und der Genauigkeit der Schätzungen phylogenetischer Bäume, Substitutionsparameter und Ratenvariationen zwischen Sites günstig. Die MEGA-Benutzeroberfläche wurde nun verbessert, um aktivitätsgetrieben zu sein, um die Nutzung sowohl für Anfänger als auch für erfahrene Wissenschaftler zu erleichtern. Diese Version von MEGA ist für die Windows-Plattform vorgesehen und wurde für eine effektive Nutzung auf Mac OS X und Linux-Desktops konfiguriert. Sie ist kostenlos unter http://www.megasoftware.net verfügbar.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msr121",
    doi = "10.1093/molbev/msr121",
    openalex = "W2132632499",
    references = "doi101007bf01734359, doi101007bf02101694, doi10108010635150390235520, doi10108010635150490522304, doi101093bioinformatics149817, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet762297, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093sysbiosyq010, doi101111j155856461985tb00420x, doi101186147121055113, openalexw3217097258"
}

Wie schnell kann ein Säugetier von der Größe einer Maus zur Größe eines Elefanten evolvieren? Das Erreichen einer solchen großen Transformation erfordert eine umfassende biologische Neuorganisation. Daher hat die Geschwindigkeit, mit der dies geschieht, wichtige Implikationen für weitreichende faunistische Veränderungen, einschließlich adaptiver Radiationen und der Erholung von Massenaussterben. Um das Tempo der großräumigen Evolution zu quantifizieren, haben wir eine Metrik entwickelt, die clade maximum rate, die die maximale Evolutionsrate eines Merkmals innerhalb eines Clades darstellt. Wir haben diese Metrik auf die Evolution der Körpermasse bei Säugetieren über die letzten 70 Millionen Jahre angewendet, in der mehrere große evolutionäre Übergänge in Ozeanen und auf Kontinenten sowie Inseln stattfanden. Unsere Berechnungen deuten darauf hin, dass es mindestens 1,6, 5,1 und 10 Millionen Generationen dauerte, bis die Masse terrestrischer Säugetiere um das 100-, 1.000- und 5.000-fache zunahm. Die Werte für Wale waren bis zur Hälfte der Länge (d. h. 1,1, 3 und 5 Millionen Generationen) reduziert, möglicherweise aufgrund der reduzierten mechanischen Einschränkungen des Lebens in einer aquatischen Umgebung. Wenn Unterschiede in der Generationenzeit berücksichtigt werden, finden wir einen exponentiellen Anstieg der maximalen Körpermasse bei Säugetieren während der 35 Millionen Jahre nach dem Kretaz-Paläogen (K-Pg) Aussterbeereignis. Unsere Ergebnisse zeigen auch eine grundlegende Asymmetrie in der Makroevolution: sehr große Abnahmen (wie extremes insuläres Zwergwuchs) können mit mehr als 10-facher Rate als Zunahmen auftreten. Unsere Erkenntnisse ermöglichen rigorosere Vergleiche von mikroevolutionären und makroevolutionären Mustern und Prozessen.

@article{doi101073pnas1120774109,
    author = "Evans, Alistair R. und Jones, David und Boyer, Alison G. und Brown, James H. und Costa, Daniel P. und Ernest, S. K. Morgan und Fitzgerald, Erich M. G. und Fortelius, Mikael und Gittleman, John L. und Hamilton, Marcus J. und Harding, Larisa E. und Lintulaakso, Kari und Lyons, S. Kathleen und Okie, Jordan G. und Saarinen, Juha und Sibly, Richard M. und Smith, Felisa A. und Stephens, Patrick R. und Theodor, Jessica M. und Uhen, Mark D.",
    title = "The maximum rate of mammal evolution",
    year = "2012",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Wie schnell kann ein Säugetier von der Größe einer Maus zur Größe eines Elefanten evolvieren? Das Erreichen einer solchen großen Transformation erfordert eine umfassende biologische Neuorganisation. Daher hat die Geschwindigkeit, mit der dies geschieht, wichtige Implikationen für weitreichende faunistische Veränderungen, einschließlich adaptiver Radiationen und der Erholung von Massenaussterben. Um das Tempo der großräumigen Evolution zu quantifizieren, haben wir eine Metrik entwickelt, die clade maximum rate, die die maximale Evolutionsrate eines Merkmals innerhalb eines Clades darstellt. Wir haben diese Metrik auf die Evolution der Körpermasse bei Säugetieren über die letzten 70 Millionen Jahre angewendet, in der mehrere große evolutionäre Übergänge in Ozeanen und auf Kontinenten sowie Inseln stattfanden. Unsere Berechnungen deuten darauf hin, dass es mindestens 1,6, 5,1 und 10 Millionen Generationen dauerte, bis die Masse terrestrischer Säugetiere um das 100-, 1.000- und 5.000-fache zunahm. Die Werte für Wale waren bis zur Hälfte der Länge (d. h. 1,1, 3 und 5 Millionen Generationen) reduziert, möglicherweise aufgrund der reduzierten mechanischen Einschränkungen des Lebens in einer aquatischen Umgebung. Wenn Unterschiede in der Generationenzeit berücksichtigt werden, finden wir einen exponentiellen Anstieg der maximalen Körpermasse bei Säugetieren während der 35 Millionen Jahre nach dem Kretaz-Paläogen (K-Pg) Aussterbeereignis. Unsere Ergebnisse zeigen auch eine grundlegende Asymmetrie in der Makroevolution: sehr große Abnahmen (wie extremes insuläres Zwergwuchs) können mit mehr als 10-facher Rate als Zunahmen auftreten. Unsere Erkenntnisse ermöglichen rigorosere Vergleiche von mikroevolutionären und makroevolutionären Mustern und Prozessen.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1120774109",
    doi = "10.1073/pnas.1120774109",
    openalex = "W2035228868",
    references = "colbert1948evolution, doi101017cbo9780511608551, doi101017cbo9781139167826, doi101017s0094837300016201, doi101038387173a0, doi1018900814941, doi1023072405671, doi1023072529762, doi107312simp93764, openalexw1504049102, openalexw1558456135"
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Während der devonischen Nekton-Revolution zeigen Ammonoide eine fortschreitende Windung ihrer Schale, genau wie viele andere pelagische Muschelgruppen. Diese heute ausgestorbenen, extern geschälten Cephalopoden stammen von bactritoiden Cephalopoden mit einer geraden Schale im frühen Devon ab. Während des Devons traten evolutionäre Trends hin zu einer engeren Windung und einer Größenreduktion bei den embryonalen Schalen der Ammonoide auf. Bei mindestens drei Linien entwickelten Nachkommen mit einem geschlossenen Nabel konvergent aus Formen mit einer Öffnung im ersten Windungsgang (Nabelfenster). Andere Linien, die Vertreter mit offenen Nabeln aufwiesen, starben um wichtige devonische Ereignisse herum aus, während nur diejenigen mit enger gewundenen embryonalen Schalen überlebten. Diese Änderung ging mit einem evolutionären Trend in der Form der ersten Kammer einher, jedoch ohne einen klaren Trend in ihrer Größe. Die Tatsache, dass mehrere ammonoiden Linien unabhängig voneinander das Nabelfenster mehr oder weniger synchron reduzierten und schlossen, deutet darauf hin, dass gemeinsame treibende Faktoren involviert waren. Ein Trend zur Größenabnahme der Embryonen sowie die gleichzeitige Zunahme der Erwachsenengröße in einigen Linien spiegelt wahrscheinlich einen grundlegenden Wandel in den Reproduktionsstrategien hin zu einer höheren Fruchtbarkeit zu Beginn der evolutionären Geschichte der Ammonoide wider. Dies könnte eine wichtige Rolle für ihren späteren Erfolg sowie für ihr Aussterben gespielt haben.

@article{doi101111j15585646201101567x,
    author = "Baets, Kenneth De und Klug, Christian und Korn, Dieter und Landman, Neil H.",
    title = "FRÜHE EVOLUTIONÄRE TRENDS IN DER AMMONOIDEN-EMBRYONALEN ENTWICKLUNG",
    year = "2012",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Während der devonischen Nekton-Revolution zeigen Ammonoide eine fortschreitende Windung ihrer Schale, genau wie viele andere pelagische Muschelgruppen. Diese heute ausgestorbenen, extern geschälten Cephalopoden stammen von bactritoiden Cephalopoden mit einer geraden Schale im frühen Devon ab. Während des Devons traten evolutionäre Trends hin zu einer engeren Windung und einer Größenreduktion bei den embryonalen Schalen der Ammonoide auf. Bei mindestens drei Linien entwickelten Nachkommen mit einem geschlossenen Nabel konvergent aus Formen mit einer Öffnung im ersten Windungsgang (Nabelfenster). Andere Linien, die Vertreter mit offenen Nabeln aufwiesen, starben um wichtige devonische Ereignisse herum aus, während nur diejenigen mit enger gewundenen embryonalen Schalen überlebten. Diese Änderung ging mit einem evolutionären Trend in der Form der ersten Kammer einher, jedoch ohne einen klaren Trend in ihrer Größe. Die Tatsache, dass mehrere ammonoiden Linien unabhängig voneinander das Nabelfenster mehr oder weniger synchron reduzierten und schlossen, deutet darauf hin, dass gemeinsame treibende Faktoren involviert waren. Ein Trend zur Größenabnahme der Embryonen sowie die gleichzeitige Zunahme der Erwachsenengröße in einigen Linien spiegelt wahrscheinlich einen grundlegenden Wandel in den Reproduktionsstrategien hin zu einer höheren Fruchtbarkeit zu Beginn der evolutionären Geschichte der Ammonoide wider. Dies könnte eine wichtige Rolle für ihren späteren Erfolg sowie für ihr Aussterben gespielt haben.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2011.01567.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2011.01567.x",
    openalex = "W1919528436",
    references = "doi101007978147579153213, doi101007978147579153216, doi1011861471214811115, openalexw2531009674"
}

Vergleichende Biologen versuchen oft, Rückschlüsse auf Tempo und Modus der Evolution zu ziehen, indem sie die Anpassung evolutionärer Modelle an phylogenetische Vergleichsdaten vergleichen, die aus einer molekularen Phylogenie mit Astlängen und Merkmalsschätzungen von existierenden Taxa bestehen. Diese Arten von Ansätzen ignorieren historische Beweise für evolutionäre Muster und Prozesse, die im Fossilbericht enthalten sind. In diesem Artikel zeigen wir durch Simulation, dass die Einbeziehung fossiler Informationen unsere Fähigkeit, zwischen Modellen der quantitativen Merkmalsentwicklung zu unterscheiden, erheblich verbessert. Wir schlagen ferner einen neuen Bayesschen Ansatz vor, der es ermöglicht, fossile Informationen auch dann zu integrieren, wenn für ausgestorbene Vertreter existierender Klade keine expliziten phylogenetischen Hypothesen vorliegen. Durch Anwendung dieses Ansatzes auf einen Vergleichsdatensatz, der Körpergrößen für caniforme Karnivoren umfasst, zeigen wir, dass die Einbeziehung fossiler Informationen nicht nur die Schätzungen des ancestralen Zustands im Vergleich zu denen, die allein aus existierenden Taxa abgeleitet wurden, verbessert, sondern auch zu einer Präferenz für ein Evolutionsmodell mit Tendenz zu großer Körpergröße führt, gegenüber alternativen Modellen wie Brownscher Bewegung oder Ornstein-Uhlenbeck-Prozessen. Unser Ansatz unterstreicht die Bedeutung der Berücksichtigung fossiler Informationen bei der makroevolutionären Inferenz und bietet einen Weg, die Art der spärlichen fossilen Informationen zu integrieren, die den meisten evolutionären Biologen zur Verfügung stehen.

@article{doi101111j15585646201201723x,
    author = "Slater, Graham J. und Harmon, Luke J. und Alfaro, Michael E.",
    title = "INTEGRATING FOSSILS WITH MOLECULAR PHYLOGENIES IMPROVES INFERENCE OF TRAIT EVOLUTION",
    year = "2012",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Vergleichende Biologen versuchen oft, Rückschlüsse auf Tempo und Modus der Evolution zu ziehen, indem sie die Anpassung evolutionärer Modelle an phylogenetische Vergleichsdaten vergleichen, die aus einer molekularen Phylogenie mit Astlängen und Merkmalsschätzungen von existierenden Taxa bestehen. Diese Arten von Ansätzen ignorieren historische Beweise für evolutionäre Muster und Prozesse, die im Fossilbericht enthalten sind. In diesem Artikel zeigen wir durch Simulation, dass die Einbeziehung fossiler Informationen unsere Fähigkeit, zwischen Modellen der quantitativen Merkmalsentwicklung zu unterscheiden, erheblich verbessert. Wir schlagen ferner einen neuen Bayesschen Ansatz vor, der es ermöglicht, fossile Informationen auch dann zu integrieren, wenn für ausgestorbene Vertreter existierender Klade keine expliziten phylogenetischen Hypothesen vorliegen. Durch Anwendung dieses Ansatzes auf einen Vergleichsdatensatz, der Körpergrößen für caniforme Karnivoren umfasst, zeigen wir, dass die Einbeziehung fossiler Informationen nicht nur die Schätzungen des ancestralen Zustands im Vergleich zu denen, die allein aus existierenden Taxa abgeleitet wurden, verbessert, sondern auch zu einer Präferenz für ein Evolutionsmodell mit Tendenz zu großer Körpergröße führt, gegenüber alternativen Modellen wie Brownscher Bewegung oder Ornstein-Uhlenbeck-Prozessen. Unser Ansatz unterstreicht die Bedeutung der Berücksichtigung fossiler Informationen bei der makroevolutionären Inferenz und bietet einen Weg, die Art der spärlichen fossilen Informationen zu integrieren, die den meisten evolutionären Biologen zur Verfügung stehen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2012.01723.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2012.01723.x",
    openalex = "W1735656240",
    references = "doi101007s116920129171x, doi101017s0022336000059126, doi10106311699114, doi101073pnas0704088104, doi10108001621459199510476572, doi101086284325, doi101093bioinformaticsbtm538, doi101093biomet57197, doi101093oso97801985052350010001, doi101093sysbio274401, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j1469185x201100178x, doi101146annurevearth271463, doi101186147121487214, doi1023073802723, foote1996perspective, gingerich1987evolution"
}

Obwohl Fossilien einige der wichtigsten Beweise für die Evolution geliefert haben, hat die Disziplin der Paläontologie nicht immer eine zentrale Rolle in der Evolutionsbiologie gespielt. Seit Darwins Zeit und für einen Großteil des 20. Jahrhunderts wurden Paläontologen von vielen Evolutionsbiologen oft als bloße Fossil-Sammler betrachtet, und ihre Versuche, zur evolutionären Theorie beizutragen, wurden ignoriert oder mit Verachtung betrachtet. In den 1950er Jahren jedoch begannen Paläontologen, eine Gegenbewegung zu starten, die auf den gültigen, wichtigen und originären Beitrag der Paläontologie zur evolutionären Theorie bestand. Diese Bewegung, die von ihren Befürwortern so genannt wurde, plädierte für einen Ansatz zum Fossilbericht, der theoretisch, quantitativ und darauf ausgerichtet war, die breiten Muster der Evolution und des Aussterbens in der Geschichte des Lebens zu erklären. Rereading the Fossil Record bietet, wie noch nie zuvor, eine historische Darstellung des Ursprungs, des Aufstiegs und der Bedeutung der Paläobiologie, vom späten 19. Jahrhundert bis in die späten 1980er Jahre. Unter Zuhilfenahme einer Fülle von Archivmaterial zeigt David Sepkoski, wie die Bewegung von einer kleinen, aber einflussreichen Gruppe von Paläontologen – darunter Stephen Jay Gould und Niles Eldredge unter anderem – konzipiert und gefördert wurde, und untersucht die intellektuellen, disziplinären und politischen Dynamiken, die in dem Aufstieg der Paläobiologie eine Rolle spielten. Indem sie die enge Beziehung zwischen Paläobiologie und anderen evolutionären Disziplinen betont, schreibt dieses Buch ein neues Kapitel in der Geschichte der Evolutionsbiologie und bietet gleichzeitig Einblicke in die Dynamiken des disziplinären Wandels in der modernen Wissenschaft.

@article{doi105860choice500902,
    title = "Rereading the fossil record: the growth of paleobiology as an evolutionary discipline",
    year = "2012",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Obwohl Fossilien einige der wichtigsten Beweise für die Evolution geliefert haben, hat die Disziplin der Paläontologie nicht immer eine zentrale Rolle in der Evolutionsbiologie gespielt. Seit Darwins Zeit und für einen Großteil des 20. Jahrhunderts wurden Paläontologen von vielen Evolutionsbiologen oft als bloße Fossil-Sammler betrachtet, und ihre Versuche, zur evolutionären Theorie beizutragen, wurden ignoriert oder mit Verachtung betrachtet. In den 1950er Jahren jedoch begannen Paläontologen, eine Gegenbewegung zu starten, die auf den gültigen, wichtigen und originären Beitrag der Paläontologie zur evolutionären Theorie bestand. Diese Bewegung, die von ihren Befürwortern so genannt wurde, plädierte für einen Ansatz zum Fossilbericht, der theoretisch, quantitativ und darauf ausgerichtet war, die breiten Muster der Evolution und des Aussterbens in der Geschichte des Lebens zu erklären. Rereading the Fossil Record bietet, wie noch nie zuvor, eine historische Darstellung des Ursprungs, des Aufstiegs und der Bedeutung der Paläobiologie, vom späten 19. Jahrhundert bis in die späten 1980er Jahre. Unter Zuhilfenahme einer Fülle von Archivmaterial zeigt David Sepkoski, wie die Bewegung von einer kleinen, aber einflussreichen Gruppe von Paläontologen – darunter Stephen Jay Gould und Niles Eldredge unter anderem – konzipiert und gefördert wurde, und untersucht die intellektuellen, disziplinären und politischen Dynamiken, die in dem Aufstieg der Paläobiologie eine Rolle spielten. Indem sie die enge Beziehung zwischen Paläobiologie und anderen evolutionären Disziplinen betont, schreibt dieses Buch ein neues Kapitel in der Geschichte der Evolutionsbiologie und bietet gleichzeitig Einblicke in die Dynamiken des disziplinären Wandels in der modernen Wissenschaft.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.50-0902",
    doi = "10.5860/choice.50-0902",
    openalex = "W653308317"
}

@article{doi101038ncomms2958,
    author = "Rabosky, Daniel L. und Santini, Francesco und Eastman, Jonathan M. und Smith, Stephen A. und Sidlauskas, Brian L. und Chang, Jonathan und Alfaro, Michael E.",
    title = "Rates of speciation and morphological evolution are correlated across the largest vertebrate radiation",
    year = "2013",
    journal = "Nature Communications",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms2958",
    doi = "10.1038/ncomms2958",
    openalex = "W2054715003",
    references = "doi10100797894010058529, doi101016jtree201204012, doi101017s009483730001280x, doi101023a1013311015886, doi10103714088000, doi101038248107a0, doi101038nature07893, doi101038nature10516, doi101038nrg2278, doi101073pnas0704088104, doi101086303327, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet824711, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101093oxfordjournalsmolbeva025811, doi101111j155856461971tb01868x, doi101111j15585646201001026x, doi101146annurevecolsys281129, doi101146annurevecolsys291293, doi101186147121055113, doi1011861471214811275, doi1023072405671, doi105962bhltitle82303, doi107312simp93764"
}

Unsicherheiten bezüglich der evolutionären Herkunft der epipelagischen Fischfamilie Scombridae (Thunfische und Makrelen) sind ein Symptom der Schwierigkeiten, überfamiliäre Beziehungen innerhalb der Percomorpha zu klären, einer hyperdiversen Teleost-Strahlung, die etwa 17.000 Arten umfasst, die in 13 unpräzise definierte Ordnungen und 269 Familien eingeordnet sind. Hier zeigen wir, dass Scombridae eine gemeinsame Abstammung mit 14 Familien aufweisen, basierend auf (i) bioinformatischen Analysen unter Verwendung partieller mitochondrialer und nukleärer Gensequenzen aller Percomorpha, die in GenBank hinterlegt sind (10.733 Sequenzen) und (ii) einer nachfolgenden Mitogenom-Analyse basierend auf 57 Arten aus diesen 15 Ziel-Familien und 67 Ausgruppierungstaxa. Die morphologische Heterogenität unter diesen 15 Familien ist so außergewöhnlich, dass sie in sechs verschiedene perciforme Unterordnungen eingeordnet wurden. Allerdings sind Mitglieder der 15 Familien entweder küsten- oder ozeanisch pelagisch in ihrer Ökologie mit diversen Lebensweisen, was darauf hindeutet, dass sie eine zuvor nicht erkannte adaptive Radiation im pelagischen Bereich darstellen. Zeitkalibrierte Phylogenien legen nahe, dass Scombridae von einem Tiefsee-Vorfahren abstammen und nach dem Ende des Kreidezeits begann, sich zu verbreiten, als große räuberische epipelagische Fische selektive Opfer der Kreide-Paläogen-Massenextinktion wurden. Wir benennen diesen Kladus offener Ozean-Fische, der die Scombridae enthält, „Pelagia" als Bezug auf die gemeinsame Habitatpräferenz, die die 15 Familien verbindet.

@article{doi101371journalpone0073535,
    author = "Miya, Masaki und Friedman, Matt und Satoh, Takashi und Takeshima, Hirohiko und Sado, Tetsuya und Iwasaki, Wataru und Yamanoue, Yusuke und Nakatani, Masanori und Mabuchi, Kohji und Inoue, Jun und Poulsen, Jan Yde und Fukunaga, Tsukasa und Sato, Yukuto und Nishida, Mutsumi",
    title = "Evolutionary Origin of the Scombridae (Tunas and Mackerels): Members of a Paleogene Adaptive Radiation with 14 Other Pelagic Fish Families",
    year = "2013",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = {Unsicherheiten bezüglich der evolutionären Herkunft der epipelagischen Fischfamilie Scombridae (Thunfische und Makrelen) sind ein Symptom der Schwierigkeiten, überfamiliäre Beziehungen innerhalb der Percomorpha zu klären, einer hyperdiversen Teleost-Strahlung, die etwa 17.000 Arten umfasst, die in 13 unpräzise definierte Ordnungen und 269 Familien eingeordnet sind. Hier zeigen wir, dass Scombridae eine gemeinsame Abstammung mit 14 Familien aufweisen, basierend auf (i) bioinformatischen Analysen unter Verwendung partieller mitochondrialer und nukleärer Gensequenzen aller Percomorpha, die in GenBank hinterlegt sind (10.733 Sequenzen) und (ii) einer nachfolgenden Mitogenom-Analyse basierend auf 57 Arten aus diesen 15 Ziel-Familien und 67 Ausgruppierungstaxa. Die morphologische Heterogenität unter diesen 15 Familien ist so außergewöhnlich, dass sie in sechs verschiedene perciforme Unterordnungen eingeordnet wurden. Allerdings sind Mitglieder der 15 Familien entweder küsten- oder ozeanisch pelagisch in ihrer Ökologie mit diversen Lebensweisen, was darauf hindeutet, dass sie eine zuvor nicht erkannte adaptive Radiation im pelagischen Bereich darstellen. Zeitkalibrierte Phylogenien legen nahe, dass Scombridae von einem Tiefsee-Vorfahren abstammen und nach dem Ende des Kreidezeits begann, sich zu verbreiten, als große räuberische epipelagische Fische selektive Opfer der Kreide-Paläogen-Massenextinktion wurden. Wir benennen diesen Kladus offener Ozean-Fische, der die Scombridae enthält, „Pelagia" als Bezug auf die gemeinsame Habitatpräferenz, die die 15 Familien verbindet.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0073535",
    doi = "10.1371/journal.pone.0073535",
    openalex = "W2087061078",
    references = "doi101111j14754983201201165x"
}

Untersuchungen, die Formdaten aus geometrischen morphometrischen (GM) Methoden in der Ökologie und der Evolutionsbiologie verwenden, sind in der Regel vergleichend und analysieren Formen und Formveränderungen an verschiedenen Punkten entlang ökologischer oder evolutionärer Gradienten. Während standardisierte multivariate statistische Verfahren für „statische" Variationen gut geeignet sind – das Testen von Lageunterschieden von Gruppen in multivariaten Datenräumen –, sind sie für „dynamische" Variationen begrenzt – das Testen spezifischer Unterschiede in den Arten, wie Gruppen ihre Lage im Zusammenhang mit Zustandsveränderungen entlang ökologischer, entwicklungsbiologischer oder evolutionärer Gradienten verändern. In diesem Artikel zeigen wir, dass kontinuierliche phänotypische Veränderungen durch Trajektorien in multivariaten Datenräumen beschrieben werden können. Wir beschreiben die geometrischen Attribute von phänotypischen Veränderungstrajectorien (Größe, Richtung und Form), speziell für GM-Daten. Wir illustrieren mit Beispielen, wie Unterschiede in solchen Attributen als Teststatistiken für vergleichende Analysen fungieren können, um die Mechanismen zu verstehen, die dynamische Unterschiede in Formveränderungen hervorrufen. Wir zeigen, dass die Analyse solcher Attribute – sogenannte phänotypische Trajektorienanalyse (PTA) – eine allgemeine Analyse ist, die auf verschiedene Arten von Forschungsfragen angewendet werden kann, die sich mit der Messung dynamischer Variationen befassen. Schließlich stellen wir einige Herausforderungen für die Zukunft dieser neuartigen analytischen Methode auf.

@article{doi104404hystrix2416298,
    author = "Collyer, Michael L. und Adams, Dean C.",
    title = "Phenotypic trajectory analysis: comparison of shape change patterns in evolution and ecology",
    year = "2013",
    journal = "Bollettino del CILEA (CILEA)",
    abstract = {Untersuchungen, die Formdaten aus geometrischen morphometrischen (GM) Methoden in der Ökologie und der Evolutionsbiologie verwenden, sind in der Regel vergleichend und analysieren Formen und Formveränderungen an verschiedenen Punkten entlang ökologischer oder evolutionärer Gradienten. Während standardisierte multivariate statistische Verfahren für „statische" Variationen gut geeignet sind – das Testen von Lageunterschieden von Gruppen in multivariaten Datenräumen –, sind sie für „dynamische" Variationen begrenzt – das Testen spezifischer Unterschiede in den Arten, wie Gruppen ihre Lage im Zusammenhang mit Zustandsveränderungen entlang ökologischer, entwicklungsbiologischer oder evolutionärer Gradienten verändern. In diesem Artikel zeigen wir, dass kontinuierliche phänotypische Veränderungen durch Trajektorien in multivariaten Datenräumen beschrieben werden können. Wir beschreiben die geometrischen Attribute von phänotypischen Veränderungstrajectorien (Größe, Richtung und Form), speziell für GM-Daten. Wir illustrieren mit Beispielen, wie Unterschiede in solchen Attributen als Teststatistiken für vergleichende Analysen fungieren können, um die Mechanismen zu verstehen, die dynamische Unterschiede in Formveränderungen hervorrufen. Wir zeigen, dass die Analyse solcher Attribute – sogenannte phänotypische Trajektorienanalyse (PTA) – eine allgemeine Analyse ist, die auf verschiedene Arten von Forschungsfragen angewendet werden kann, die sich mit der Messung dynamischer Variationen befassen. Schließlich stellen wir einige Herausforderungen für die Zukunft dieser neuartigen analytischen Methode auf.},
    url = "https://doi.org/10.4404/hystrix-24.1-6298",
    doi = "10.4404/hystrix-24.1-6298",
    openalex = "W2156451393",
    references = "doi1011861471214811115"
}

Arten im Fossilbericht sind Populationenpools genetischer und phänotypischer Variation an einem Ort und zu einer Zeit, die morphologisch erkennbar und von anderen durch empirische Standards unterscheidbar sind. Veränderungen im Laufe der Zeit können erheblich sein und erfordern die Unterteilung von Abstammungslinien, die willkürlicher wird, je vollständiger sie werden. Evolution geht um Form, Raum und Zeit; sie geht um Variation und Wandel. Die Interpretation von Arten im Fossilbericht berührt all dies.

@article{doi101002evan21400,
    author = "Gingerich, Philip D.",
    title = "Species in the primate fossil record",
    year = "2014",
    journal = "Evolutionary Anthropology Issues News and Reviews",
    abstract = "Species in the fossil record are population pools of genetic and phenetic variation at a place and time, morphologically recognizable and distinguishable from others by empirical standards. Change through time can be substantial, requiring subdivision of lineages that becomes more arbitrary as they become more complete. Evolution is about form, space, and time; it is about variation and change. Interpretation of species in the fossil record touches all of these.",
    url = "https://doi.org/10.1002/evan.21400",
    doi = "10.1002/evan.21400",
    openalex = "W1543237746",
    references = "openalexw201159638"
}

Die menschliche Spezies ist mehr auf kulturelle Anpassung angewiesen als jede andere Spezies, doch es ist unklar, wie das beobachtende Lernen die treue Weitergabe kultureller Anpassungen hervorbringen kann. Eine Möglichkeit besteht darin, dass das Lehren eine genaue soziale Weitergabe durch die Einschränkung des Spektrums an Schlussfolgerungen, die Lernende ziehen, ermöglicht. Allerdings herrscht eine weit verbreitete Uneinigkeit darüber, wie man Lehren definieren und wie man die empirischen Belege für Lehren über Kulturen und Spezies hinweg interpretieren soll. In diesem Artikel argumentiere ich, dass Streitigkeiten über die Natur und Verbreitung von Lehren in menschlichen Gesellschaften und nichtmenschlichen Tieren auf einer Reihe von tief verwurzelten theoretischen Unterschieden zwischen Disziplinen sowie auf wichtigen Unterschieden in der Definition von Lehren beruhen. Um diese disparaten Forschungsbereiche zu versöhnen, überblicke ich die drei Hauptansätze zur Erforschung von Lehren – mentalistisch, kulturbezogen und funktionalistisch – und skizziere die Forschungsfragen zu Lehren, die jeder davon adressiert. Ich argumentiere dann für einen neuen, integrierten Rahmen, der Lehrarten entsprechend den spezifischen adaptiven Problemen unterscheidet, die jede Art löst, und wende diesen Rahmen an, um die aktuellen empirischen Belege für Lehren bei Menschen und nichtmenschlichen Tieren neu zu strukturieren. Dieser integrative Rahmen generiert neue Erkenntnisse mit weitreichenden Implikationen für die Erforschung der Evolution von Lehren, einschließlich der Rollen kognitiver Einschränkungen und kooperativer Dilemmata bei der Art und Weise und dem Zeitpunkt, zu dem Lehren evolviert. Schließlich schlage ich eine Erklärung dafür vor, warum einige Arten von Lehren einzigartig menschlich sind, und diskutiere neue Forschungsrichtungen, die durch diesen Rahmen motiviert werden.

@article{doi101017s0140525x14000090,
    author = "Kline, Michelle A.",
    title = "Wie man über das Lehren lernt: Ein evolutionärer Rahmen für die Erforschung des Lehrverhaltens bei Menschen und anderen Tieren",
    year = "2014",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Die menschliche Spezies ist mehr auf kulturelle Anpassung angewiesen als jede andere Spezies, doch es ist unklar, wie das beobachtende Lernen die treue Weitergabe kultureller Anpassungen hervorbringen kann. Eine Möglichkeit besteht darin, dass das Lehren eine genaue soziale Weitergabe durch die Einschränkung des Spektrums an Schlussfolgerungen, die Lernende ziehen, ermöglicht. Allerdings herrscht eine weit verbreitete Uneinigkeit darüber, wie man Lehren definieren und wie man die empirischen Belege für Lehren über Kulturen und Spezies hinweg interpretieren soll. In diesem Artikel argumentiere ich, dass Streitigkeiten über die Natur und Verbreitung von Lehren in menschlichen Gesellschaften und nichtmenschlichen Tieren auf einer Reihe von tief verwurzelten theoretischen Unterschieden zwischen Disziplinen sowie auf wichtigen Unterschieden in der Definition von Lehren beruhen. Um diese disparaten Forschungsbereiche zu versöhnen, überblicke ich die drei Hauptansätze zur Erforschung von Lehren – mentalistisch, kulturbezogen und funktionalistisch – und skizziere die Forschungsfragen zu Lehren, die jeder davon adressiert. Ich argumentiere dann für einen neuen, integrierten Rahmen, der Lehrarten entsprechend den spezifischen adaptiven Problemen unterscheidet, die jede Art löst, und wende diesen Rahmen an, um die aktuellen empirischen Belege für Lehren bei Menschen und nichtmenschlichen Tieren neu zu strukturieren. Dieser integrative Rahmen generiert neue Erkenntnisse mit weitreichenden Implikationen für die Erforschung der Evolution von Lehren, einschließlich der Rollen kognitiver Einschränkungen und kooperativer Dilemmata bei der Art und Weise und dem Zeitpunkt, zu dem Lehren evolviert. Schließlich schlage ich eine Erklärung dafür vor, warum einige Arten von Lehren einzigartig menschlich sind, und diskutiere neue Forschungsrichtungen, die durch diesen Rahmen motiviert werden.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x14000090",
    doi = "10.1017/s0140525x14000090",
    openalex = "W2064673991",
    references = "doi1010160022519364900384, doi1010160022519364900396, doi101016s1090513800000714, doi101017cbo9780511815355, doi101017s0140525x0100396x, doi101017s0140525x05000129, doi101086667653, doi101086668207, doi101126science7466396, doi101371journalpone0045150, doi101515mamm19673111, doi1023071367778, doi1023072804509, openalexw2135943618, openalexw2798374369"
}

Umfangreiche adaptive Strahlungen könnten die außerordentliche Erfolgsstory einer Minderheit der heute lebenden Wirbeltier-Clans erklären. Diese Hypothese sagt unter anderem voraus, dass sich während der frühen Geschichte großer Gruppen schnelle Raten der morphologischen Evolution ereignen, während Linien disparate ökologische Nischen besetzen. Allerdings haben nur wenige Studien zur adaptiven Strahlung tiefe Zeitdaten einbezogen, sodass die Verbindungen zwischen der heutigen Vielfalt und den großen ausgestorbenen Strahlungen unklar sind. Der intensiv untersuchte mesozoische Dinosaurier-Bericht bietet ein Modell für solche Untersuchungen und stellt eine ökologisch diverse Gruppe dar, die terrestrische Ökosysteme für 170 Millionen Jahre dominierte. Darüber hinaus sind die heute lebenden Dinosaurier (Vögel) mit 10.000 Arten der artenreichste lebende Tetrapoden-Clan. Wir haben zusammengesetzte Stammbäume von 614-622 mesozoischen Dinosauriern/Vögeln sowie einen umfassenden Datensatz zur Körpermasse erstellt, der auf der Skalierungsbeziehung der Robustheit von Gliedmaßenknochen basiert. Maximum-Likelihood-Modellierung und der Knotenhöhen-Test zeigen schnelle evolutionäre Raten und eine Prävalenz schneller Verschiebungen zwischen Größenklassen bei frühen (triassischen) Dinosauriern. Dies deutet auf ein frühes „burst"-Muster der Nischenbesetzung hin und steht im Gegensatz zu früheren Studien, die allmähliche Raten bevorzugten. Anschließend sanken die Raten in den meisten Linien, die selten neue ökologische Nischen ausnutzten. Allerdings unterhielten gefiederte maniraptorane Dinosaurier (einschließlich mesozoischer Vögel) eine schnelle Evolution seit mindestens dem mittleren Jura, was darauf hindeutet, dass diese Taxa den Effekten der Nischen-Sättigung entkamen. Dies zeigt, dass eine lange evolutionäre Geschichte anhaltender ökologischer Innovation den Weg für eine zweite große Strahlung der Dinosaurier, bei den Vögeln, ebnete. Wir demonstrieren daher Verbindungen zwischen der überwiegend ausgestorbenen tiefzeitlichen adaptiven Strahlung der nicht-vogelartigen Dinosaurier und der phänomenalen Diversifizierung der Vögel durch anhaltende schnelle evolutionäre Raten entlang des phylogenetischen Stamm-Linien. Dies wirft die Möglichkeit auf, dass die ungleiche Verteilung der Biodiversität nicht nur auf eine großflächige Extrapolation des Prozesses der adaptiven Strahlung in wenigen heute lebenden Clans zurückzuführen ist, sondern auch auf die Aufrechterhaltung der Evolvierbarkeit über enorme Zeitskalen hinweg in der Geschichte des Lebens in Schlüssel-Linien.

@article{doi101371journalpbio1001853,
    author = "Benson, Roger and Campione, Nicolás E. and Carrano, Matthew T. and Mannion, Philip D. and Sullivan, Corwin and Upchurch, Paul and Evans, David C.",
    title = "Rates of Dinosaur Body Mass Evolution Indicate 170 Million Years of Sustained Ecological Innovation on the Avian Stem Lineage",
    year = "2014",
    journal = "PLoS Biology",
    abstract = "Umfangreiche adaptive Strahlungen könnten die außerordentliche Erfolgsstory einer Minderheit der heute lebenden Wirbeltier-Clans erklären. Diese Hypothese sagt unter anderem voraus, dass sich während der frühen Geschichte großer Gruppen schnelle Raten der morphologischen Evolution ereignen, während Linien disparate ökologische Nischen besetzen. Allerdings haben nur wenige Studien zur adaptiven Strahlung tiefe Zeitdaten einbezogen, sodass die Verbindungen zwischen der heutigen Vielfalt und den großen ausgestorbenen Strahlungen unklar sind. Der intensiv untersuchte mesozoische Dinosaurier-Bericht bietet ein Modell für solche Untersuchungen und stellt eine ökologisch diverse Gruppe dar, die terrestrische Ökosysteme für 170 Millionen Jahre dominierte. Darüber hinaus sind die heute lebenden Dinosaurier (Vögel) mit 10.000 Arten der artenreichste lebende Tetrapoden-Clan. Wir haben zusammengesetzte Stammbäume von 614-622 mesozoischen Dinosauriern/Vögeln sowie einen umfassenden Datensatz zur Körpermasse erstellt, der auf der Skalierungsbeziehung der Robustheit von Gliedmaßenknochen basiert. Maximum-Likelihood-Modellierung und der Knotenhöhen-Test zeigen schnelle evolutionäre Raten und eine Prävalenz schneller Verschiebungen zwischen Größenklassen bei frühen (triassischen) Dinosauriern. Dies deutet auf ein frühes „burst"-Muster der Nischenbesetzung hin und steht im Gegensatz zu früheren Studien, die allmähliche Raten bevorzugten. Anschließend sanken die Raten in den meisten Linien, die selten neue ökologische Nischen ausnutzten. Allerdings unterhielten gefiederte maniraptorane Dinosaurier (einschließlich mesozoischer Vögel) eine schnelle Evolution seit mindestens dem mittleren Jura, was darauf hindeutet, dass diese Taxa den Effekten der Nischen-Sättigung entkamen. Dies zeigt, dass eine lange evolutionäre Geschichte anhaltender ökologischer Innovation den Weg für eine zweite große Strahlung der Dinosaurier, bei den Vögeln, ebnete. Wir demonstrieren daher Verbindungen zwischen der überwiegend ausgestorbenen tiefzeitlichen adaptiven Strahlung der nicht-vogelartigen Dinosaurier und der phänomenalen Diversifizierung der Vögel durch anhaltende schnelle evolutionäre Raten entlang des phylogenetischen Stamm-Linien. Dies wirft die Möglichkeit auf, dass die ungleiche Verteilung der Biodiversität nicht nur auf eine großflächige Extrapolation des Prozesses der adaptiven Strahlung in wenigen heute lebenden Clans zurückzuführen ist, sondern auch auf die Aufrechterhaltung der Evolvierbarkeit über enorme Zeitskalen hinweg in der Geschichte des Lebens in Schlüssel-Linien.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001853",
    doi = "10.1371/journal.pbio.1001853",
    openalex = "W2155522161",
    references = "doi101007b97636, doi101017s009483730001263x, doi101017s009483730001280x, doi10103835086500, doi10103844766, doi101038nature11631, doi10108010635150490445706, doi101086284325, doi101093bioinformaticsbtm538, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oso97801985404720010001, doi101098rspb20122526, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j1469185x201000137x, doi101111j15585646201201723x, doi101126science1144066, doi101126science1161833, doi101146annurevecolsys39110707173447, doi101159000452856, doi101186174170071060, doi101198tech2003s146, doi101371journalpbio1001853, doi101371journalpone0007390, doi101371journalpone0044318, doi10166612041, martinsander2006bone, openalexw2145250129"
}

Zusammenfassung Wir stellen mv morph vor, ein Paket multivariater phylogenetischer vergleichender Methoden für die R-Statistik-Umgebung. mv morph ist kostenlos im cran-Paket-Repository verfügbar (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). mv morph ermöglicht die Anpassung einer Reihe multivariater evolutionärer Modelle unter einem Maximum-Likelihood-Kriterium. Ursprünglich im Kontext der phylogenetischen Analyse mehrerer morphometrischer Merkmale entwickelt, kann seine Anwendung auf jeden biologischen Datensatz mit einem oder mehreren kovariierenden kontinuierlichen Merkmalen erweitert werden. Alle Anpassungsmodelle beinhalten die Möglichkeit, simmap-artige Zuordnungen zu verwenden, was für die Anpassung von Änderungen entlang von Abstammungslinien zu einem bestimmten Zeitpunkt nützlich sein kann. Alle Modelle bieten diagnostische Metriken für Konvergenz und Zuverlässigkeit der Schätzungen sowie die Möglichkeit, Messfehler von Merkmalen in die Modellschätzungen einzubeziehen. Neue Funktionen des mv morph-Pakets umfassen die Möglichkeit, Modelle mit Änderungen im Evolutionsmodus entlang der Phylogenie anzupassen, was in vergleichenden Analysen, die ausgestorbene Taxa einschließen, besonders bedeutsam sein wird, beispielsweise beim Testen von Änderungen im Evolutionsmodus im Zusammenhang mit globalen biotischen/abiotischen Ereignissen. Wir beschreiben kurz die bereits in mv morph enthaltenen Modelle und geben einige Demonstrationen der Verwendung des Pakets mit zwei simulierten Beispielen.

@article{doi1011112041210x12420,
    author = "Clavel, Julien und Escarguel, Gilles und Merceron, Gildas",
    title = "mv morph: ein R-Paket zur Anpassung multivariater evolutionärer Modelle an morphometrische Daten",
    year = "2015",
    journal = "Methods in Ecology and Evolution",
    abstract = "Zusammenfassung Wir stellen mv morph vor, ein Paket multivariater phylogenetischer vergleichender Methoden für die R-Statistik-Umgebung. mv morph ist kostenlos im cran-Paket-Repository verfügbar (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). mv morph ermöglicht die Anpassung einer Reihe multivariater evolutionärer Modelle unter einem Maximum-Likelihood-Kriterium. Ursprünglich im Kontext der phylogenetischen Analyse mehrerer morphometrischer Merkmale entwickelt, kann seine Anwendung auf jeden biologischen Datensatz mit einem oder mehreren kovariierenden kontinuierlichen Merkmalen erweitert werden. Alle Anpassungsmodelle beinhalten die Möglichkeit, simmap-artige Zuordnungen zu verwenden, was für die Anpassung von Änderungen entlang von Abstammungslinien zu einem bestimmten Zeitpunkt nützlich sein kann. Alle Modelle bieten diagnostische Metriken für Konvergenz und Zuverlässigkeit der Schätzungen sowie die Möglichkeit, Messfehler von Merkmalen in die Modellschätzungen einzubeziehen. Neue Funktionen des mv morph-Pakets umfassen die Möglichkeit, Modelle mit Änderungen im Evolutionsmodus entlang der Phylogenie anzupassen, was in vergleichenden Analysen, die ausgestorbene Taxa einschließen, besonders bedeutsam sein wird, beispielsweise beim Testen von Änderungen im Evolutionsmodus im Zusammenhang mit globalen biotischen/abiotischen Ereignissen. Wir beschreiben kurz die bereits in mv morph enthaltenen Modelle und geben einige Demonstrationen der Verwendung des Pakets mit zwei simulierten Beispielen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.12420",
    doi = "10.1111/2041-210x.12420",
    openalex = "W1527504944",
    references = "doi1010079783662024522, doi1010079783662053898, doi10103844766, doi101086284325, doi101086383584, doi1011112041210x12035, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j155856461979tb04694x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101111j15585646201201723x, doi101111j2041210x201100169x, doi10118614712105788, doi1023073802723"
}

Diese Ergebnisse stützen die Pareto-Optimalitätstheorie als Ansatz zur Untersuchung evolutionärer Trade-offs und zeigen, wie dieser Ansatz genutzt werden kann, um die mutmaßlichen Aufgaben abzuleiten, die die natürliche Selektion von Phänotypen prägen können.

@article{doi101186s129180150149z,
    author = "Tendler, Avichai und Mayo, Avi und Alon, Uri",
    title = "Evolutionäre Trade-offs, Pareto-Optimalität und die Morphologie von Ammoniten-Schalen",
    year = "2015",
    journal = "BMC Systems Biology",
    abstract = "Diese Ergebnisse stützen die Pareto-Optimalitätstheorie als Ansatz zur Untersuchung evolutionärer Trade-offs und zeigen, wie dieser Ansatz genutzt werden kann, um die mutmaßlichen Aufgaben abzuleiten, die die natürliche Selektion von Phänotypen prägen können.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12918-015-0149-z",
    doi = "10.1186/s12918-015-0149-z",
    openalex = "W2061815181",
    references = "doi101007978147579153216, doi101111jzo12118, doi1011861471214811115, doi101666100271"
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Die Datierung des Lebensbaums ist ein Kernanliegen der Evolutionsbiologie. Evolutionsraten sind grundlegend für fast jedes Evolutionsmodell und jeden Prozess. Raten benötigen Daten. Es gibt viel Kontroverse über die angemessensten und vernünftigsten Methoden, um den Lebensbaum zu datieren, und jüngere Arbeiten haben einige Verwirrungen und Komplexitäten hervorgehoben, die vermieden werden können. Unabhängig davon, ob phylogenetische Bäume nach ihrer Etablierung oder als Teil des Prozesses der Baumfindung datiert werden, müssen Praktiker wissen, welche Kalibrierungen sie verwenden sollen. Wir betonen die Bedeutung der Identifizierung von Kronen- (nicht Stamm-) Fossilien, des Vertrauensniveaus in ihre Zuordnung zur Krone, der aktuellen chronostratigraphischen Präzision, der Primärstellung der beherbergenden geologischen Formation und asymmetrischen Vertrauensintervallen. Hier präsentieren wir Kalibrierungen für 88 wichtige Knoten über die Phylogenie der Tiere, vom Wurzelknoten der Metazoa bis zum letzten gemeinsamen Vorfahren von Homo sapiens. Eine ständige genaue Aufmerksamkeit für Details ist erforderlich: Beispielsweise wurde das klassische Datum für Vögel und Säugetiere (Basis der Kronen-Amniota) oft als 310-315 Ma angegeben; die internationale Zeitskala von 2014 zeigt ein Mindestalter von 318 Ma.

@article{doi1026879424,
    author = "Benton, Michael J. und Donoghue, PCJ und Vinther, Jakob und Asher, RJ und Friedman, Mary M. und Near, Thomas J.",
    title = "Constraints on the timescale of animal evolutionary history",
    year = "2015",
    journal = "Palaeontologia Electronica",
    abstract = "Die Datierung des Lebensbaums ist ein Kernanliegen der Evolutionsbiologie. Evolutionsraten sind grundlegend für fast jedes Evolutionsmodell und jeden Prozess. Raten benötigen Daten. Es gibt viel Kontroverse über die angemessensten und vernünftigsten Methoden, um den Lebensbaum zu datieren, und jüngere Arbeiten haben einige Verwirrungen und Komplexitäten hervorgehoben, die vermieden werden können. Unabhängig davon, ob phylogenetische Bäume nach ihrer Etablierung oder als Teil des Prozesses der Baumfindung datiert werden, müssen Praktiker wissen, welche Kalibrierungen sie verwenden sollen. Wir betonen die Bedeutung der Identifizierung von Kronen- (nicht Stamm-) Fossilien, des Vertrauensniveaus in ihre Zuordnung zur Krone, der aktuellen chronostratigraphischen Präzision, der Primärstellung der beherbergenden geologischen Formation und asymmetrischen Vertrauensintervallen. Hier präsentieren wir Kalibrierungen für 88 wichtige Knoten über die Phylogenie der Tiere, vom Wurzelknoten der Metazoa bis zum letzten gemeinsamen Vorfahren von Homo sapiens. Eine ständige genaue Aufmerksamkeit für Details ist erforderlich: Beispielsweise wurde das klassische Datum für Vögel und Säugetiere (Basis der Kronen-Amniota) oft als 310-315 Ma angegeben; die internationale Zeitskala von 2014 zeigt ein Mindestalter von 318 Ma.",
    url = "https://doi.org/10.26879/424",
    doi = "10.26879/424",
    openalex = "W1962669040",
    references = "doi10100703064746897, doi101007978146139246016, doi101007bf02101694, doi101016b9780126709506500187, doi101016b9780444594259000196, doi101016b9780444594259000202, doi101016b9780444594259000214, doi101016b9780444594259000238, doi101016b9780444594259000287, doi101016jpalaeo200703046, doi101016jpalwor200911007, doi101016s0301926899000777, doi101016s096098220900431x, doi101017s0006323199005472, doi101017s0016756811000720, doi101017s1464793102006103, doi101017s1464793105006779, doi101017s1477201906002008, doi101023a1018471324332, doi101038377720a0, doi101038nature01264, doi101038nature03150, doi101038nature05634, doi101038nature06134, doi101038nature06277, doi101038nature06614, doi101038nature07855, doi101038nature08322, doi101038nature09810, doi101038nature09864, doi101038nature10291, doi101038nature13718, doi101073pnas1010350107, doi101073pnas1110395108, doi101073pnas9794469, doi10108002724634198110011886, doi10108002724634199710010948, doi10108002724634199810011114, doi10108010635150590950326, doi10108010635150600755396, doi10108010635150701397635, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19990489, doi101111j109636421995tb00932x, doi101111j10963642200600293x, doi101111j1469185x1999tb00046x, doi101111j1469185x200900094x, doi101111j1469185x201200220x, doi101111j14754983201001019x, doi101111j14754983201201165x, doi101111pala12125, doi101111zoj12111, doi101126science1157704, doi101139e87124, doi1011861471214813208, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012066231, doi101242dev066712, doi101371journalpone0009586, doi101643004585112002002053220co2, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi102307jctt1xp3v3r, doi105252g2010n4a1, doi105281zenodo18028696, doi105860choice320949, doi105860choice355657, doi105860choice405235, doi105860choice432801, doi105860choice503272, doi107312kiel11918, gardiner1989interrelationships, openalexw2898156694, openalexw78894702"
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Waring, T. M., M. A. Kline, J. S. Brooks, S. H. Goff, J. Gowdy, M. A. Janssen, P. E. Smaldino, und J. Jacquet. 2015. A multilevel evolutionary framework for sustainability analysis. Ecology and Society 20(2): 34. https://doi.org/10.5751/ES-07634-200234

@article{doi105751es07634200234,
    author = "Waring, Timothy M. und Kline, Michelle A. und Brooks, Jeremy und Goff, Sandra und Gowdy, John M. und Janssen, Marco A. und Smaldino, Paul E. und Jacquet, Jennifer",
    title = "A multilevel evolutionary framework for sustainability analysis",
    year = "2015",
    journal = "Ecology and Society",
    abstract = "Waring, T. M., M. A. Kline, J. S. Brooks, S. H. Goff, J. Gowdy, M. A. Janssen, P. E. Smaldino, und J. Jacquet. 2015. A multilevel evolutionary framework for sustainability analysis. Ecology and Society 20(2): 34. https://doi.org/10.5751/ES-07634-200234",
    url = "https://doi.org/10.5751/es-07634-200234",
    doi = "10.5751/es-07634-200234",
    openalex = "W2471972841",
    references = "doi101371journalpone0045150"
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Wenig nach dem Verschwinden der nicht-vogelartigen Dinosaurier erschienen die ersten Säugetiere, die Merkmale aufwiesen, die denen von Primaten ähnelten. Diese ersten primitiven Formen entwickelten sich zu einer reichen Vielfalt von Plesiadapiformen, die oft als archaische Primaten bezeichnet werden. Wie viele lebende Primaten waren Plesiadapiformen kleine baumlebende Tiere, die im Allgemeinen Früchte, Insekten und gelegentlich Blätter fraßen. Allerdings fehlten dieser Gruppe mehrere diagnostische Merkmale der Euprimaten. Zudem besaßen sie außerordentlich diverse Spezialisierungen, die in elf Familien und mehr als 140 Arten vertreten waren, die in einigen Fällen nichts Ähnliches mehr im Primatenorden zeigten. Plesiadapiformen sind von allen drei nördlichen Kontinenten bekannt, mit Vertretern, die bis mindestens vor 37 Millionen Jahren überdauerten. In diesem Artikel geben wir eine Zusammenfassung der unglaublichen Vielfalt der Plesiadapiformen-Morphologie und Anpassungen wieder und überprüfen unser Wissen über alle elf Familien. Zudem diskutieren wir die Herausforderungen, die in unserem Verständnis ihrer Ökologie und Evolution noch bestehen.

@article{doi101002evan21526,
    author = "Silcox, Mary und Bloch, Jonathan I. und Boyer, Douglas und Chester, Stephen G. B. und López‐Torres, Sergi",
    title = "The evolutionary radiation of plesiadapiforms",
    year = "2017",
    journal = "Evolutionary Anthropology Issues News and Reviews",
    abstract = "Wenig nach dem Verschwinden der nicht-vogelartigen Dinosaurier erschienen die ersten Säugetiere, die Merkmale aufwiesen, die denen von Primaten ähnelten. Diese ersten primitiven Formen entwickelten sich zu einer reichen Vielfalt von Plesiadapiformen, die oft als archaische Primaten bezeichnet werden. Wie viele lebende Primaten waren Plesiadapiformen kleine baumlebende Tiere, die im Allgemeinen Früchte, Insekten und gelegentlich Blätter fraßen. Allerdings fehlten dieser Gruppe mehrere diagnostische Merkmale der Euprimaten. Zudem besaßen sie außerordentlich diverse Spezialisierungen, die in elf Familien und mehr als 140 Arten vertreten waren, die in einigen Fällen nichts Ähnliches mehr im Primatenorden zeigten. Plesiadapiformen sind von allen drei nördlichen Kontinenten bekannt, mit Vertretern, die bis mindestens vor 37 Millionen Jahren überdauerten. In diesem Artikel geben wir eine Zusammenfassung der unglaublichen Vielfalt der Plesiadapiformen-Morphologie und Anpassungen wieder und überprüfen unser Wissen über alle elf Familien. Zudem diskutieren wir die Herausforderungen, die in unserem Verständnis ihrer Ökologie und Evolution noch bestehen.",
    url = "https://doi.org/10.1002/evan.21526",
    doi = "10.1002/evan.21526",
    openalex = "W2607369018",
    references = "doi101002ajpa22724, doi101098rspb20132792, doi101126science1503697743, doi105281zenodo13648988, openalexw16475780"
}

@article{doi101016jcub201701027,
    author = "Peters, Ralph S. und Krogmann, Lars und Mayer, Christoph und Donath, Alexander und Gunkel, Simon und Meusemann, Karen und Kozlov, Alexey M. und Podsiadłowski, Lars und Petersen, Malte und Lanfear, Robert und Diez, Patricia A. und Heraty, John M. und Kjer, Karl M. und Klopfstein, Seraina und Meier, Rudolf und Polidori, Carlo und Schmitt, Thomas und Liu, Shanlin und Zhou, Xin und Wappler, Torsten und Rust, Jes und Misof, Bernhard und Niehuis, Oliver",
    title = "Evolutionary History of the Hymenoptera",
    year = "2017",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2017.01.027",
    doi = "10.1016/j.cub.2017.01.027",
    openalex = "W2602840959",
    references = "doi101016jympev201104003, doi101093sysbiosyr107, doi101126science1257570, doi101186147121481452, doi107717peerj1719, openalexw1900040508"
}

@article{doi101016jjebo201709014,
    author = "Glowacki, Luke und Wilson, Michael L. und Wrangham, Richard W.",
    title = "The evolutionary anthropology of war",
    year = "2017",
    journal = "Journal of Economic Behavior \& Organization",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.jebo.2017.09.014",
    doi = "10.1016/j.jebo.2017.09.014",
    openalex = "W2757278824",
    references = "doi101038nature16477, doi101086409471, doi101086667653, doi101371journalpone0045150"
}

@article{doi101038nature21074,
    author = "Cooney, Christopher R. und Bright, Jen A. und Capp, Elliot J. R. und Chira, Angela M. und Hughes, Emma C. und Moody, Christopher J. und Nouri, L. O. und Varley, Zoë K. und Thomas, Gavin H.",
    title = "Mega-evolutionäre Dynamik der adaptiven Radiation von Vögeln",
    year = "2017",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature21074",
    doi = "10.1038/nature21074",
    openalex = "W2585565608",
    references = "doi10100703064746897, doi101016c20100662092, doi101016jcub201508003, doi101038nature10516, doi101038nature11631, doi101038nature15697, doi101073pnas1302642110, doi101093molbevmss075, doi1011112041210x12035, doi101111j2041210x201100169x, doi101126science1157704, doi101126science1160662, doi1018637jssv033i02, doi105860choice485062"
}

Die groß angelegte Analyse des Fossilberichts erfordert die Aggregation paläontologischer Daten aus einzelnen Fossilfundstellen. Vor Computern wurden diese synoptischen Datensätze manuell zusammengestellt, eine mühsame Aufgabe, die Jahre an Aufwand erforderte und Paläontologen zwang, schwierige Entscheidungen darüber zu treffen, welche Arten von Daten tabuliert werden sollten. Die Einführung von Desktop-Computern leitete die erste digitale Revolution der Paläontologie ein – online, literaturbasierte Datenbanken wie die Paleobiology Database (PBDB). Allerdings stellt die veröffentlichte Literatur nur einen kleinen Anteil der paläontologischen Daten dar, die in Museums-Sammlungen untergebracht sind. Obwohl dieses Problem seit langem anerkannt ist, war die Größenordnung und damit die potenzielle Bedeutung dieser sogenannten 'dunklen Daten' schwer zu bestimmen. Hier, in den frühen Phasen einer zweiten digitalen Revolution in der Paläontologie – der Digitalisierung von Museums-Sammlungen – geben wir eine Schätzung der Größenordnung der dunklen Daten der Paläontologie ab. Die Digitalisierung der Bestände unserer neun Institutionen von zünotischen marinen Wirbellosen-Sammlungen aus Kalifornien, Oregon und Washington in den USA zeigt, dass sie 23-mal mehr einzigartige Fundstellen repräsentieren als derzeit in der PBDB verfügbar sind. Diese Daten und die enorme Menge an ähnlich ungenutzten dunklen Daten in anderen Museums-Sammlungen werden, wenn sie digital mobilisiert werden, die Fähigkeit der Paläontologen verbessern, Schlussfolgerungen über die Muster und Prozesse vergangener evolutionärer und ökologischer Veränderungen zu ziehen.

@article{doi101098rsbl20180431,
    author = "Marshall, Charles R. und Finnegan, Seth und Clites, Erica C. und Holroyd, Patricia A. und Bonuso, N. und Cortez, Célia Martins und Davis, Edward und Dietl, Gregory P. und Druckenmiller, Patrick S. und Eng, Ronald und Garcia, Christine und Estes-Smargiassi, Kathryn und Hendy, Austin und Hollis, Kathy und Little, Holly und Nesbitt, Elizabeth A. und Roopnarine, Peter D. und Skibinski, L. und Vendetti, Jann E. und White, Lisa D.",
    title = "Quantifizierung der dunklen Daten in Museumsfossilien-Sammlungen, während die Paläontologie eine zweite digitale Revolution durchläuft",
    year = "2018",
    journal = "Biology Letters",
    abstract = "Die groß angelegte Analyse des Fossilberichts erfordert die Aggregation paläontologischer Daten aus einzelnen Fossilfundstellen. Vor Computern wurden diese synoptischen Datensätze manuell zusammengestellt, eine mühsame Aufgabe, die Jahre an Aufwand erforderte und Paläontologen zwang, schwierige Entscheidungen darüber zu treffen, welche Arten von Daten tabuliert werden sollten. Die Einführung von Desktop-Computern leitete die erste digitale Revolution der Paläontologie ein – online, literaturbasierte Datenbanken wie die Paleobiology Database (PBDB). Allerdings stellt die veröffentlichte Literatur nur einen kleinen Anteil der paläontologischen Daten dar, die in Museums-Sammlungen untergebracht sind. Obwohl dieses Problem seit langem anerkannt ist, war die Größenordnung und damit die potenzielle Bedeutung dieser sogenannten 'dunklen Daten' schwer zu bestimmen. Hier, in den frühen Phasen einer zweiten digitalen Revolution in der Paläontologie – der Digitalisierung von Museums-Sammlungen – geben wir eine Schätzung der Größenordnung der dunklen Daten der Paläontologie ab. Die Digitalisierung der Bestände unserer neun Institutionen von zünotischen marinen Wirbellosen-Sammlungen aus Kalifornien, Oregon und Washington in den USA zeigt, dass sie 23-mal mehr einzigartige Fundstellen repräsentieren als derzeit in der PBDB verfügbar sind. Diese Daten und die enorme Menge an ähnlich ungenutzten dunklen Daten in anderen Museums-Sammlungen werden, wenn sie digital mobilisiert werden, die Fähigkeit der Paläontologen verbessern, Schlussfolgerungen über die Muster und Prozesse vergangener evolutionärer und ökologischer Veränderungen zu ziehen.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsbl.2018.0431",
    doi = "10.1098/rsbl.2018.0431",
    openalex = "W2890070252",
    references = "crossref1977patterns, doi101080027246342012716114, doi101093bioscibiv104, doi101126science3526287762, doi101126scienceaah4787, doi105860choice500902, doi105962bhltitle22153, openalexw1599677799, openalexw45809738, simpson1978patterns"
}

Der Fossilbericht von Pinnipeden (Robben, Seebären und Walrosse) ist weltweit verbreitet und reicht vom späten Oligozän bis zum Holozän. Dieser Bericht zeigt eine komplexe evolutionäre Geschichte, die aus den noch lebenden Verwandten nicht anderweitig abgeleitet werden könnte, einschließlich mehrerer Radiationen und iterativer ekomorphologischer Spezialisierungen unter verschiedenen Linien, von denen viele ausgestorben sind. Der Fossilbericht von Pinnipeden ist jedoch nicht räumlich und zeitlich einheitlich vertreten, was einige Lücken in unserem Wissen hinterlässt. Wir haben eine historiographische Untersuchung des veröffentlichten Fossilberichts von Pinnipeden durchgeführt, basierend auf den im Paleobiology Database verfügbaren Informationen, mit dem Ziel, ihn aus taxonomischer, geografischer und zeitlicher Perspektive allgemein zu charakterisieren und zu bewerten. Wir haben die wichtigsten Trends, Stärken und Schwächen des Fossilberichts von Pinnipeden identifiziert, einschließlich potenzieller Verzerrungen, die unsere Interpretationen beeinflussen könnten. Wir stellten fest, dass 39 % des Berichts lebenden Taxa entspricht, die im Wesentlichen aus dem Pleistozän und Holozän stammen. Es gibt einen größeren Bericht aus der nördlichen Hemisphäre, was auf Verzerrungen in der Stichprobenahme und dem Sammelaufwand hindeutet. Der Bericht ist nicht stark durch Sedimentausbruchs-Verzerrung verzerrt. Insbesondere für ausgestorbene Arten werden fast die Hälfte von ihnen durch ein einziges Vorkommen repräsentiert und ein großer Anteil hat Typusproben, die aus einzelnen isolierten postkranialen Elementen bestehen. Während der Fossilbericht von Pinnipeden möglicherweise eine ausreichende zeitliche und taxonomische Abdeckung aufweist, weist er eine starke geografische Verzerrung auf, und seine Vergleichbarkeit wird durch die Unvollständigkeit der Typusproben behindert. Diese Ergebnisse sollten berücksichtigt werden, wenn es um Muster ihrer vergangenen Vielfalt, ihrer evolutionären Geschichte und ihrer Paläoökologie geht.

@article{doi101098rsos191394,
    author = "Valenzuela‐Toro, Ana M. und Pyenson, Nicholas D.",
    title = "Was wissen wir über den Fossilbericht von Pinnipeden? Eine historiographische Untersuchung",
    year = "2019",
    journal = "Royal Society Open Science",
    abstract = "Der Fossilbericht von Pinnipeden (Robben, Seebären und Walrosse) ist weltweit verbreitet und reicht vom späten Oligozän bis zum Holozän. Dieser Bericht zeigt eine komplexe evolutionäre Geschichte, die aus den noch lebenden Verwandten nicht anderweitig abgeleitet werden könnte, einschließlich mehrerer Radiationen und iterativer ekomorphologischer Spezialisierungen unter verschiedenen Linien, von denen viele ausgestorben sind. Der Fossilbericht von Pinnipeden ist jedoch nicht räumlich und zeitlich einheitlich vertreten, was einige Lücken in unserem Wissen hinterlässt. Wir haben eine historiographische Untersuchung des veröffentlichten Fossilberichts von Pinnipeden durchgeführt, basierend auf den im Paleobiology Database verfügbaren Informationen, mit dem Ziel, ihn aus taxonomischer, geografischer und zeitlicher Perspektive allgemein zu charakterisieren und zu bewerten. Wir haben die wichtigsten Trends, Stärken und Schwächen des Fossilberichts von Pinnipeden identifiziert, einschließlich potenzieller Verzerrungen, die unsere Interpretationen beeinflussen könnten. Wir stellten fest, dass 39\% des Berichts lebenden Taxa entspricht, die im Wesentlichen aus dem Pleistozän und Holozän stammen. Es gibt einen größeren Bericht aus der nördlichen Hemisphäre, was auf Verzerrungen in der Stichprobenahme und dem Sammelaufwand hindeutet. Der Bericht ist nicht stark durch Sedimentausbruchs-Verzerrung verzerrt. Insbesondere für ausgestorbene Arten werden fast die Hälfte von ihnen durch ein einziges Vorkommen repräsentiert und ein großer Anteil hat Typusproben, die aus einzelnen isolierten postkranialen Elementen bestehen. Während der Fossilbericht von Pinnipeden möglicherweise eine ausreichende zeitliche und taxonomische Abdeckung aufweist, weist er eine starke geografische Verzerrung auf, und seine Vergleichbarkeit wird durch die Unvollständigkeit der Typusproben behindert. Diese Ergebnisse sollten berücksichtigt werden, wenn es um Muster ihrer vergangenen Vielfalt, ihrer evolutionären Geschichte und ihrer Paläoökologie geht.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsos.191394",
    doi = "10.1098/rsos.191394",
    openalex = "W2990272826",
    references = "doi101017s0094837300006060, doi101098rsbl20180431"
}

Die Weiterentwicklung von Methoden zur bayesianischen phylogenetischen Inferenz hat in den letzten Jahren mit großem Tempo fortgeschritten, wobei in fast allen Aspekten der gemeinsamen Modellierung evolutionärer Daten bedeutende neue Fortschritte erzielt wurden. Es wird zunehmend anerkannt, dass einige evolutionäre Fragen nur durch die Kombination von Beweisen aus mehreren unabhängigen Datenquellen angemessen beantwortet werden können, einschließlich Genomsequenzen, Stichprobenzeitpunkten, phänotypischen Daten, Radiokohlenstoffdatierungen, Fossilvorkommen und biogeographischer Verbreitungsdaten unter anderem. Die Einbeziehung aller relevanten Daten in ein einziges gemeinsames Modell ist sowohl konzeptionell als auch rechnerisch sehr herausfordernd. Fortgeschrittene computergestützte Softwarepakete, die eine robuste Entwicklung kompatibler (Sub-)Modelle ermöglichen, die zu einer vollständigen Modellhierarchie zusammengesetzt werden können, haben eine Schlüsselrolle in diesen Entwicklungen gespielt. Die Entwicklung solcher Software-Rahmenwerke ist zunehmend eine eigenständige wissenschaftliche Aktivität von erheblicher Bedeutung und bringt spezifische Herausforderungen mit sich, von praktischen Herausforderungen im Software-Design, der Entwicklung und dem Engineering bis hin zu statistischen und konzeptionellen Modellierungs-Herausforderungen. BEAST 2 ist eine solche computergestützte Softwareplattform und wurde erstmals vor über 4 Jahren angekündigt. Hier beschreiben wir eine Reihe bedeutender neuer Entwicklungen in der BEAST 2 Kernplattform und Modellhierarchie, die seit der ersten Veröffentlichung der Software stattgefunden haben und in der jüngsten Version 2.5 gipfeln.

@article{doi101371journalpcbi1006650,
    author = "Bouckaert, Remco und Vaughan, Timothy G. und Barido‐Sottani, Joëlle und Duchêne, Sebastián und Fourment, Mathieu und Gavryushkina, Alexandra und Heled, Joseph und Jones, Graham und Kühnert, Denise und Maio, Nicola De und Matschiner, Michael und Mendes, Fábio K. und Müller, Nicola F. und Ogilvie, Huw A. und du Plessis, Louis und Popinga, Alex und Rambaut, Andrew und Rasmussen, David A. und Siveroni, Igor und Suchard, Marc A. und Wu, Chieh‐Hsi und Xie, Dong und Zhang, Chi und Stadler, Tanja und Drummond, Alexei J.",
    title = "BEAST 2.5: Eine fortschrittliche Softwareplattform für bayesianische evolutionäre Analyse",
    year = "2019",
    journal = "PLoS Computational Biology",
    abstract = "Die Weiterentwicklung von Methoden zur bayesianischen phylogenetischen Inferenz hat in den letzten Jahren mit großem Tempo fortgeschritten, wobei in fast allen Aspekten der gemeinsamen Modellierung evolutionärer Daten bedeutende neue Fortschritte erzielt wurden. Es wird zunehmend anerkannt, dass einige evolutionäre Fragen nur durch die Kombination von Beweisen aus mehreren unabhängigen Datenquellen angemessen beantwortet werden können, einschließlich Genomsequenzen, Stichprobenzeitpunkten, phänotypischen Daten, Radiokohlenstoffdatierungen, Fossilvorkommen und biogeographischer Verbreitungsdaten unter anderem. Die Einbeziehung aller relevanten Daten in ein einziges gemeinsames Modell ist sowohl konzeptionell als auch rechnerisch sehr herausfordernd. Fortgeschrittene computergestützte Softwarepakete, die eine robuste Entwicklung kompatibler (Sub-)Modelle ermöglichen, die zu einer vollständigen Modellhierarchie zusammengesetzt werden können, haben eine Schlüsselrolle in diesen Entwicklungen gespielt. Die Entwicklung solcher Software-Rahmenwerke ist zunehmend eine eigenständige wissenschaftliche Aktivität von erheblicher Bedeutung und bringt spezifische Herausforderungen mit sich, von praktischen Herausforderungen im Software-Design, der Entwicklung und dem Engineering bis hin zu statistischen und konzeptionellen Modellierungs-Herausforderungen. BEAST 2 ist eine solche computergestützte Softwareplattform und wurde erstmals vor über 4 Jahren angekündigt. Hier beschreiben wir eine Reihe bedeutender neuer Entwicklungen in der BEAST 2 Kernplattform und Modellhierarchie, die seit der ersten Veröffentlichung der Software stattgefunden haben und in der jüngsten Version 2.5 gipfeln.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1006650",
    doi = "10.1371/journal.pcbi.1006650",
    openalex = "W2901954177",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nature10231, doi101038nature13726, doi101073pnas1319091111, doi101073pnas89178322, doi101080106351501753462876, doi101093acprofoso97801985670280010001, doi101093genetics1551431, doi101093molbevmsp274, doi101093sysbiosyq085, doi101093sysbiosyr047, doi101093sysbiosyv080, doi101093vevey016, doi101098rspa19270118, doi101186147121487214, doi101186s1286201708906, doi1012019780429258411, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpcbi1003537"
}

Der Fossilbericht und die geologischen Aufzeichnungen liefern die primären Daten zur Festlegung absoluter Zeitskalen für Stammbäume. Für die paläontologische Bewertung vorgeschlagener Zeitskalen für Stammbäume und für knotenbasierte Methoden zur Konstruktion von Stammbäumen wird der Fossilbericht verwendet, um die Divergenzzeiten einzugrenzen. Mindestgrenzen (minimale Altersangaben) können robust festgelegt werden, indem gut datierte Fossilien verwendet werden, die aufgrund positiver morphologischer Evidenz zuverlässig bestimmten Linien zugeordnet werden können. Maximale Grenzen sind viel schwieriger festzulegen, hauptsächlich, weil es schwierig ist, definitive Beweise dafür zu erbringen, dass das Fehlen einer Taxa im Fossilbericht real ist und nicht nur auf die Unvollständigkeit der Fossil- und Gesteinsaufzeichnungen zurückzuführen ist. Es wurden fünf primäre Methoden entwickelt, um maximale Altersgrenzen zu schätzen, jede davon wird diskutiert. Die Tatsache, dass das Fossilisationspotential einer Gruppe in der Regel abnimmt, je näher man ihrem Entstehungszeitpunkt kommt, erhöht die Herausforderung, maximale Altersgrenzen zu schätzen. Es ergeben sich zusätzliche Komplikationen: 1) weil fossile Daten tatsächlich die Zeit des Ursprungs der ersten relevanten fossilisierbaren Morphologie (Apomorphie) einrahmen, nicht die Divergenzzeit selbst; 2) aufgrund der phylogenetischen Unsicherheit bei der Platzierung von Fossilien; 3) wegen idiosynkratischer zeitlicher und geografischer Lücken in den Gesteins- und Fossilaufzeichnungen; und 4) wenn das Erhaltungspotential einer Gruppe während ihrer Geschichte signifikant verändert wurde. Im Gegensatz dazu sind Unsicherheiten in den absoluten Altersangaben von Fossilien in der Regel relativ unbedeutend, obwohl die vast majority of fossil cannot be dated directly. Diese Probleme und relevanten quantitativen Methoden werden überprüft, und ihre relativen Größenordnungen werden bewertet, die in der Regel mit dem Alter der Gruppe, ihrem geografischen Verbreitungsgebiet und der Artenvielfalt korrelieren.

@article{doi103389fgene201901049,
    author = "Marshall, Charles R.",
    title = "Using the Fossil Record to Evaluate Timetree Timescales",
    year = "2019",
    journal = "Frontiers in Genetics",
    abstract = "Der Fossilbericht und die geologischen Aufzeichnungen liefern die primären Daten zur Festlegung absoluter Zeitskalen für Stammbäume. Für die paläontologische Bewertung vorgeschlagener Zeitskalen für Stammbäume und für knotenbasierte Methoden zur Konstruktion von Stammbäumen wird der Fossilbericht verwendet, um die Divergenzzeiten einzugrenzen. Mindestgrenzen (minimale Altersangaben) können robust festgelegt werden, indem gut datierte Fossilien verwendet werden, die aufgrund positiver morphologischer Evidenz zuverlässig bestimmten Linien zugeordnet werden können. Maximale Grenzen sind viel schwieriger festzulegen, hauptsächlich, weil es schwierig ist, definitive Beweise dafür zu erbringen, dass das Fehlen einer Taxa im Fossilbericht real ist und nicht nur auf die Unvollständigkeit der Fossil- und Gesteinsaufzeichnungen zurückzuführen ist. Es wurden fünf primäre Methoden entwickelt, um maximale Altersgrenzen zu schätzen, jede davon wird diskutiert. Die Tatsache, dass das Fossilisationspotential einer Gruppe in der Regel abnimmt, je näher man ihrem Entstehungszeitpunkt kommt, erhöht die Herausforderung, maximale Altersgrenzen zu schätzen. Es ergeben sich zusätzliche Komplikationen: 1) weil fossile Daten tatsächlich die Zeit des Ursprungs der ersten relevanten fossilisierbaren Morphologie (Apomorphie) einrahmen, nicht die Divergenzzeit selbst; 2) aufgrund der phylogenetischen Unsicherheit bei der Platzierung von Fossilien; 3) wegen idiosynkratischer zeitlicher und geografischer Lücken in den Gesteins- und Fossilaufzeichnungen; und 4) wenn das Erhaltungspotential einer Gruppe während ihrer Geschichte signifikant verändert wurde. Im Gegensatz dazu sind Unsicherheiten in den absoluten Altersangaben von Fossilien in der Regel relativ unbedeutend, obwohl die vast majority of fossil cannot be dated directly. Diese Probleme und relevanten quantitativen Methoden werden überprüft, und ihre relativen Größenordnungen werden bewertet, die in der Regel mit dem Alter der Gruppe, ihrem geografischen Verbreitungsgebiet und der Artenvielfalt korrelieren.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01049",
    doi = "10.3389/fgene.2019.01049",
    openalex = "W2983202100",
    references = "doi101016jympev201705008, doi101098rsbl20180431"
}

Zusammenfassung Wir beschreiben die ersten Libellen (Odonata: Anisoptera) aus dem frühen Eozän der Okanagan Highlands im äußersten Westen Nordamerikas anhand von neun Fossilien. Sechs davon werden fünf Arten in vier neuen, benannten Gattungen der Aeshnidae zugeordnet: Antiquiala snyderae neue Gattung und Art, Idemlinea versatilis neue Gattung und Art, Ypshna brownleei neue Gattung und Art, Ypshna latipennata neue Gattung und Art sowie Eoshna thompsonensis neue Gattung und Art; eine wird als Aeshnidae Gattung A, Art A behandelt; eine wird der Gomphidae zugeordnet: Auroradraco eos neue Gattung und Art; und ein neuntens, fragmentarisches Fossil unbekannter Familienzugehörigkeit wird als Anisoptera unbestimmte Gattung A, Art A behandelt, was eine siebente Gattung und achte Art darstellt. Die Dominanz der Aeshnidae ist mit anderen paläozänen und eozänen Fossilfundstellen konsistent. Auroradraco eos ist das einzige fossile Gomphidae in der etwa 66-Millionen-Jahre langen Lücke zwischen Vorkommen im mittlere Kreidezeitlichen Burmesischen Bernstein und dem frühen Oligozän Frankreichs. Ypshna scheint nahe zu Parabaissaeshna ejerslevense aus der frühen Eozän Fur-Formation Dänemarks zu stehen; dies ist angesichts der holarktischen interkontinentalen Verbindungen zu dieser Zeit und einer wachsenden Liste von Insektentaxa, die zwischen den Okanagan Highlands und der Fur-Formation gemeinsam sind, nicht überraschend.

@article{doi104039tce201961,
    author = "Archibald, S. Bruce und Cannings, Robert A.",
    title = "Fossil Libellen (Odonata: Anisoptera) aus dem frühen Eozän der Okanagan Highlands, westliches Nordamerika",
    year = "2019",
    journal = "The Canadian Entomologist",
    abstract = "Zusammenfassung Wir beschreiben die ersten Libellen (Odonata: Anisoptera) aus dem frühen Eozän der Okanagan Highlands im äußersten Westen Nordamerikas anhand von neun Fossilien. Sechs davon werden fünf Arten in vier neuen, benannten Gattungen der Aeshnidae zugeordnet: Antiquiala snyderae neue Gattung und Art, Idemlinea versatilis neue Gattung und Art, Ypshna brownleei neue Gattung und Art, Ypshna latipennata neue Gattung und Art sowie Eoshna thompsonensis neue Gattung und Art; eine wird als Aeshnidae Gattung A, Art A behandelt; eine wird der Gomphidae zugeordnet: Auroradraco eos neue Gattung und Art; und ein neuntens, fragmentarisches Fossil unbekannter Familienzugehörigkeit wird als Anisoptera unbestimmte Gattung A, Art A behandelt, was eine siebente Gattung und achte Art darstellt. Die Dominanz der Aeshnidae ist mit anderen paläozänen und eozänen Fossilfundstellen konsistent. Auroradraco eos ist das einzige fossile Gomphidae in der etwa 66-Millionen-Jahre langen Lücke zwischen Vorkommen im mittlere Kreidezeitlichen Burmesischen Bernstein und dem frühen Oligozän Frankreichs. Ypshna scheint nahe zu Parabaissaeshna ejerslevense aus der frühen Eozän Fur-Formation Dänemarks zu stehen; dies ist angesichts der holarktischen interkontinentalen Verbindungen zu dieser Zeit und einer wachsenden Liste von Insektentaxa, die zwischen den Okanagan Highlands und der Fur-Formation gemeinsam sind, nicht überraschend.",
    url = "https://doi.org/10.4039/tce.2019.61",
    doi = "10.4039/tce.2019.61",
    openalex = "W2981968678",
    references = "doi104039tce201759"
}

Abstract Räumlich-zeitliche Veränderungen in der Vollständigkeit von Fossilien können unser Verständnis der evolutionären Geschichte einer Gruppe verzerren. Die Qualität des Fossilberichts der Sauropodomorpha wurde vor einem Jahrzehnt bewertet, doch seitdem ist die Anzahl der gültigen Arten um 60 % gestiegen, und 17 % der Taxa aus dieser Studie haben seither einer taxonomischen Revision unterzogen. Hier bewerten wir, wie 10 Jahre zusätzliche Forschung unsere Sicht auf den Fossilbericht dieser Gruppe verändert haben. Wir quantifizierten die Vollständigkeit aller 307 derzeit als gültig betrachteten Sauropodomorph-Arten unter Verwendung des Skelett-Vollständigkeits-Metriks, die den Anteil eines vollständigen Skeletts berechnet, der für jedes Taxon erhalten ist. Taxonomische und stratigraphische Altersrevisionen, nicht neue Arten, sind die Treiber der bedeutendsten Unterschiede zwischen den aktuellen Ergebnissen und denen der vorherigen Bewertung. Es traten keine statistischen Unterschiede auf, wenn wir unseren neuen Datensatz verwenden, um zeitliche Vollständigkeitskurven ausschließlich auf Basis von Taxa zu generieren, die 2009 oder 1999 bekannt waren. Wir beobachten nun einen starken Rückgang der mittleren Vollständigkeitswerte über der Grenze zwischen Jura und Kreide, der sich nie auf das Niveau vor der Kreide erholt. Die Erklärung dieses Musters ist schwierig, da wir keine überzeugenden Beweise dafür finden, dass es mit Umweltpräferenzen oder Veränderungen der Körpergröße zusammenhängt. Stattdessen könnte es auf folgende Faktoren zurückzuführen sein: (1) Reduktion des terrestrischen Fossil-Erhaltungssraums aufgrund des Anstiegs des Meeresspiegels; (2) ökologische Spezifika und relativ hohe Diagnosefähigkeit kreidezeitlicher Arten; und/oder (3) verstärkte Erfassung neu erkundeter Standorte mit vielen zuvor unbekannten Taxa. Eine solche Neubewertung von Mustern ermöglicht es uns, die Langlebigkeit von Schlussfolgerungen aus früheren quantitativen Studien zu testen.

@article{doi101111pala12496,
    author = "Cashmore, Daniel D. and Mannion, Philip D. and Upchurch, Paul and Butler, Richard J.",
    title = "Ten more years of discovery: revisiting the quality of the sauropodomorph dinosaur fossil record",
    year = "2020",
    journal = "Palaeontology",
    abstract = "Abstract Räumlich-zeitliche Veränderungen in der Vollständigkeit von Fossilien können unser Verständnis der evolutionären Geschichte einer Gruppe verzerren. Die Qualität des Fossilberichts der Sauropodomorpha wurde vor einem Jahrzehnt bewertet, doch seitdem ist die Anzahl der gültigen Arten um 60 % gestiegen, und 17 % der Taxa aus dieser Studie haben seither einer taxonomischen Revision unterzogen. Hier bewerten wir, wie 10 Jahre zusätzliche Forschung unsere Sicht auf den Fossilbericht dieser Gruppe verändert haben. Wir quantifizierten die Vollständigkeit aller 307 derzeit als gültig betrachteten Sauropodomorph-Arten unter Verwendung des Skelett-Vollständigkeits-Metriks, die den Anteil eines vollständigen Skeletts berechnet, der für jedes Taxon erhalten ist. Taxonomische und stratigraphische Altersrevisionen, nicht neue Arten, sind die Treiber der bedeutendsten Unterschiede zwischen den aktuellen Ergebnissen und denen der vorherigen Bewertung. Es traten keine statistischen Unterschiede auf, wenn wir unseren neuen Datensatz verwenden, um zeitliche Vollständigkeitskurven ausschließlich auf Basis von Taxa zu generieren, die 2009 oder 1999 bekannt waren. Wir beobachten nun einen starken Rückgang der mittleren Vollständigkeitswerte über der Grenze zwischen Jura und Kreide, der sich nie auf das Niveau vor der Kreide erholt. Die Erklärung dieses Musters ist schwierig, da wir keine überzeugenden Beweise dafür finden, dass es mit Umweltpräferenzen oder Veränderungen der Körpergröße zusammenhängt. Stattdessen könnte es auf folgende Faktoren zurückzuführen sein: (1) Reduktion des terrestrischen Fossil-Erhaltungssraums aufgrund des Anstiegs des Meeresspiegels; (2) ökologische Spezifika und relativ hohe Diagnosefähigkeit kreidezeitlicher Arten; und/oder (3) verstärkte Erfassung neu erkundeter Standorte mit vielen zuvor unbekannten Taxa. Eine solche Neubewertung von Mustern ermöglicht es uns, die Langlebigkeit von Schlussfolgerungen aus früheren quantitativen Studien zu testen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/pala.12496",
    doi = "10.1111/pala.12496",
    openalex = "W3017772092",
    references = "doi1010079780387981413, doi1010079783319242774, doi101016jjsames201411008, doi101016jpalaeo200901002, doi101016jpalaeo200906004, doi101016s0016787876800077, doi101038s41467018051281, doi101038s41467019089972, doi101046j14209101200200472x, doi101073pnas1521478113, doi10108008912969009386535, doi101093bioinformaticsbty633, doi101093zoolinneanzlx103, doi101093zoolinneanzly009, doi101093zoolinneanzly068, doi101098rsbl20180431, doi101098rspb20122526, doi101111brv12255, doi101111j2041210x201100169x, doi101111j2041210x201200196x, doi101111j251761611995tb02031x, doi101126science1105113, doi101126science23547931156, doi101371journalpone0078573, openalexw2611511275"
}

Globale Diversitätsmuster im Fossilbericht bestehen aus einem Mosaik regionaler Trends, die durch räumlich nicht-zufällige Treiber gestützt und durch Variationen in der Stichprobenintensität über die Zeit und den Raum verzerrt werden. Stichprobengekorrigierte Schätzungen der Diversität aus räumlich standardisierten Fossil-Datensätzen bewahren ihre regionalen biogeografischen Nuancen und vermeiden diese Verzerrungen, doch die Diversität über die Zeit hinweg entsteht aus dem Zusammenspiel von Entstehung und Aussterben, den Prozessen, die die makroevolutionäre Geschichte formen. Hier stellen wir einen Unterstichproben-Algorithmus vor, um räumliche Stichprobenverzerrung zu eliminieren, gekoppelt mit fortschrittlichen probabilistischen Methoden zur Schätzung von Entstehungs- und Aussterberaten sowie einer Bayes'schen Methode zur Schätzung der stichprobengekorrigierten Diversität. Wir untersuchen dann erneut den marinen Fossilbericht vom späten Perm bis zum frühen Jura, ein Intervall, das mehrere globale biotische Umwälzungen umfasst, die die Entstehung der modernen marinen Biosphäre geformt haben. Wir finden, dass Entstehungs- und Aussterberaten auch während Ereignisse, die sich global manifestierten, regional heterogen sind, was die Notwendigkeit räumlich expliziter Ansichten makroevolutionärer Prozesse über geologische Zeiträume hinweg unterstreicht.

@article{doi101038s41467022305070,
    author = "Flannery‐Sutherland, Joseph T. und Silvestro, Daniele und Benton, Michael J.",
    title = "Globale Diversitätsdynamiken im Fossilbericht sind regional heterogen",
    year = "2022",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Globale Diversitätsmuster im Fossilbericht bestehen aus einem Mosaik regionaler Trends, die durch räumlich nicht-zufällige Treiber gestützt und durch Variationen in der Stichprobenintensität über die Zeit und den Raum verzerrt werden. Stichprobengekorrigierte Schätzungen der Diversität aus räumlich standardisierten Fossil-Datensätzen bewahren ihre regionalen biogeografischen Nuancen und vermeiden diese Verzerrungen, doch die Diversität über die Zeit hinweg entsteht aus dem Zusammenspiel von Entstehung und Aussterben, den Prozessen, die die makroevolutionäre Geschichte formen. Hier stellen wir einen Unterstichproben-Algorithmus vor, um räumliche Stichprobenverzerrung zu eliminieren, gekoppelt mit fortschrittlichen probabilistischen Methoden zur Schätzung von Entstehungs- und Aussterberaten sowie einer Bayes'schen Methode zur Schätzung der stichprobengekorrigierten Diversität. Wir untersuchen dann erneut den marinen Fossilbericht vom späten Perm bis zum frühen Jura, ein Intervall, das mehrere globale biotische Umwälzungen umfasst, die die Entstehung der modernen marinen Biosphäre geformt haben. Wir finden, dass Entstehungs- und Aussterberaten auch während Ereignisse, die sich global manifestierten, regional heterogen sind, was die Notwendigkeit räumlich expliziter Ansichten makroevolutionärer Prozesse über geologische Zeiträume hinweg unterstreicht.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-022-30507-0",
    doi = "10.1038/s41467-022-30507-0",
    openalex = "W4280565279",
    references = "doi101016jcub202107071, doi101016jearscirev2020103282, doi101038s41467021237540, doi101038s41559021016088, doi101073pnas2020778118, doi101093sysbiosyab045, doi101126sciadvaba0099, doi101130g479071"
}