Evolutionstheorie

@misc{lamarck1809zoological24,
    author = "Lamarck, J. B",
    title = "Zoologische Philosophie",
    year = "1809",
    howpublished = "Übersetzt ins Englische von H. Elliott, 1914. Macmillan \& Co., New York",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lamarck, J. B., 1809, Zoologische Philosophie. Übersetzt ins Englische von H. Elliott, 1914. Macmillan \& Co., New York.}"
}

@misc{kellogg1907darwinism22,
    author = "Kellogg, V. L",
    title = "Darwinism heute",
    year = "1907",
    howpublished = "London, England, Bell \& Sons",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kellogg, V. L., 1907, Darwinism heute: London, England, Bell \& Sons.}"
}

Wir müssen kaum hinzufügen, dass die Betrachtung in den Naturwissenschaften eines weiteren Bereichs als des tatsächlichen zu einem viel besseren Verständnis des tatsächlichen führt.' (S. 267, The, Nature of the Physical World.)x VORWORT Die evolutionäre Theorie war somit hauptsächlich rückläufig; die mächtige Masse der mendelischen Forschungen auf der ganzen Welt hat offensichtlich die Irrtümer überwachsen, mit denen sie zunächst gefördert wurde. Als Pionier der Genetik hat er mehr als genug getan, um die übereilten Polemik seiner frühen Schriften zu sühnen. Natürliche Selektion als eine Kraft zu behandeln, die unabhängig auf ihren eigenen Grundlagen basiert, bedeutet nicht, ihre Bedeutung in der Theorie der Evolution zu minimieren. Im Gegenteil, sobald wir Meinungen durch andere Mittel als durch Vergleich und Analogie bilden müssen, wird eine solche unabhängige deduktive Grundlage zur Notwendigkeit. Diese Notwendigkeit ist insbesondere für die Menschheit zu beachten; da wir einige Kenntnisse über die Struktur der Gesellschaft, menschliche Motive und die Vitalstatistiken dieser Spezies haben, kann die Anwendung der deduktiven Methode ein intimeres Wissen über die evolutionären Prozesse liefern als anderweitig möglich. Zusätzlich wird es für unser Thema von Bedeutung sein, auf mehrere Konsequenzen des Prinzips der natürlichen Selektion hinzuweisen, die, da sie nicht in der adaptiven Modifikation spezifischer Formen bestehen, notwendigerweise der Aufmerksamkeit entgangen sind. Die genetischen Phänomene der Dominanz und Verknüpfung scheinen Beispiele dieser Klasse zu bieten, deren zukünftige Untersuchung unser Thema erheblich erweitern kann. Keine meiner Bemühungen könnte das Buch leicht lesbar machen. Ich habe versucht, dem Leser zu helfen, indem ich kurze Zusammenfassungen am Ende aller Kapitel gegeben habe, mit Ausnahme von Kapitel IV, das zusammen mit Kapitel V zusammengefasst wird. Wer dies vorzieht, kann Kapitel IV als mathematischen Anhang zum entsprechenden Teil der Zusammenfassung betrachten. Die Schlussfolgerungen bezüglich des Menschen sind streng untrennbar von den allgemeineren Kapiteln, wurden aber in einer Gruppe zusammengefasst, die mit Kapitel VIII beginnt. Ich glaube, niemand wird überrascht sein, dass eine große Anzahl der betrachteten Punkte eine viel umfassendere, strengere und umfassendere Behandlung erfordern. Es scheint unmöglich, dem Thema auf diese Weise volle Gerechtigkeit zu widerfahren, bis eine Tradition mathematischer Arbeit aufgebaut ist, die sich biologischen Problemen widmet und mit den Forschungen vergleichbar ist, auf die ein mathematischer Physiker bei der Lösung spezieller Schwierigkeiten zurückgreifen kann.

@book{doi105962bhltitle27468,
    author = "Fisher, Ronald Aylmer",
    title = "The genetical theory of natürliche Selektion",
    year = "1930",
    booktitle = "Clarendon Press eBooks",
    abstract = "Wir müssen kaum hinzufügen, dass die Betrachtung in den Naturwissenschaften eines weiteren Bereichs als des tatsächlichen zu einem viel besseren Verständnis des tatsächlichen führt.' (S. 267, The, Nature of the Physical World.)x VORWORT Die evolutionäre Theorie war somit hauptsächlich rückläufig; die mächtige Masse der mendelischen Forschungen auf der ganzen Welt hat offensichtlich die Irrtümer überwachsen, mit denen sie zunächst gefördert wurde. Als Pionier der Genetik hat er mehr als genug getan, um die übereilten Polemik seiner frühen Schriften zu sühnen. Natürliche Selektion als eine Kraft zu behandeln, die unabhängig auf ihren eigenen Grundlagen basiert, bedeutet nicht, ihre Bedeutung in der Theorie der Evolution zu minimieren. Im Gegenteil, sobald wir Meinungen durch andere Mittel als durch Vergleich und Analogie bilden müssen, wird eine solche unabhängige deduktive Grundlage zur Notwendigkeit. Diese Notwendigkeit ist insbesondere für die Menschheit zu beachten; da wir einige Kenntnisse über die Struktur der Gesellschaft, menschliche Motive und die Vitalstatistiken dieser Spezies haben, kann die Anwendung der deduktiven Methode ein intimeres Wissen über die evolutionären Prozesse liefern als anderweitig möglich. Zusätzlich wird es für unser Thema von Bedeutung sein, auf mehrere Konsequenzen des Prinzips der natürlichen Selektion hinzuweisen, die, da sie nicht in der adaptiven Modifikation spezifischer Formen bestehen, notwendigerweise der Aufmerksamkeit entgangen sind. Die genetischen Phänomene der Dominanz und Verknüpfung scheinen Beispiele dieser Klasse zu bieten, deren zukünftige Untersuchung unser Thema erheblich erweitern kann. Keine meiner Bemühungen könnte das Buch leicht lesbar machen. Ich habe versucht, dem Leser zu helfen, indem ich kurze Zusammenfassungen am Ende aller Kapitel gegeben habe, mit Ausnahme von Kapitel IV, das zusammen mit Kapitel V zusammengefasst wird. Wer dies vorzieht, kann Kapitel IV als mathematischen Anhang zum entsprechenden Teil der Zusammenfassung betrachten. Die Schlussfolgerungen bezüglich des Menschen sind streng untrennbar von den allgemeineren Kapiteln, wurden aber in einer Gruppe zusammengefasst, die mit Kapitel VIII beginnt. Ich glaube, niemand wird überrascht sein, dass eine große Anzahl der betrachteten Punkte eine viel umfassendere, strengere und umfassendere Behandlung erfordern. Es scheint unmöglich, dem Thema auf diese Weise volle Gerechtigkeit zu widerfahren, bis eine Tradition mathematischer Arbeit aufgebaut ist, die sich biologischen Problemen widmet und mit den Forschungen vergleichbar ist, auf die ein mathematischer Physiker bei der Lösung spezieller Schwierigkeiten zurückgreifen kann.",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.27468",
    doi = "10.5962/bhl.title.27468",
    openalex = "W2004778468",
    references = "darwin2009the, doi101017cbo9780511693946006, doi101017cbo9780511702884, doi101038033529a0, doi101111j136523111908tb02141x, doi1023071929022, doi1023074345450, doi105962bhltitle121292, doi105962bhltitle61004, doi105962bhltitle87899, openalexw2163836228"
}

@book{lovejoy1936the28,
    author = "Lovejoy, A. D",
    title = "The Great Chain of Being",
    year = "1936",
    publisher = "Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lovejoy, A. D., 1936, The Great Chain of Being: Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
}

@book{lack1947darwins23,
    author = "Lack, D",
    title = "Darwin's Finches",
    year = "1947",
    publisher = "An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lack, D., 1947, Darwin's Finches: An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@misc{haldane1949suggestions16,
    author = "Haldane, J. B. S",
    title = "Vorschläge zur quantitativen Messung der Raten der Evolution",
    year = "1949",
    howpublished = "Evolution, v. 3, p. 51-56",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Haldane, J. B. S., 1949, Vorschläge zur quantitativen Messung der Raten der Evolution: Evolution, v. 3, p. 51-56.}"
}

@book{simpson1949the39,
    author = "Simpson, G. G",
    title = "The Meaning of Evolution",
    year = "1949",
    publisher = "New Haven, Conecticut, Yale University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Simpson, G. G., 1949, The Meaning of Evolution: New Haven, Conecticut, Yale University Press.}"
}

@article{doi101001jama195002910300087029,
    title = "Faktoren der Evolution:. Die Theorie der stabilisierenden Selektion",
    year = "1950",
    journal = "Journal of the American Medical Association",
    url = "https://doi.org/10.1001/jama.1950.02910300087029",
    doi = "10.1001/jama.1950.02910300087029",
    openalex = "W1504663309"
}

@misc{irvine1955apes19,
    author = "Irvine, W",
    title = "Affen, Engel und Victorianer",
    year = "1955",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Irvine, W., 1955, Affen, Engel und Victorianer: New York, McGraw-Hill.}"
}

@misc{eiseley1958darwins5,
    author = "Eiseley, L. C",
    title = "Darwin's Century",
    year = "1958",
    howpublished = "Evolution und die Männer, die sie entdeckten: New York, Doubleday",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Eiseley, L. C., 1958, Darwin's Century: Evolution und die Männer, die sie entdeckten: New York, Doubleday.}"
}

@book{glass1959the8,
    author = "Glass, B. O. und Strauss, W. L. und Jr",
    title = "The Forerunners of Darwin",
    year = "1959",
    publisher = "1745- 1859: Baltimore, Johns Hopkins Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Glass, B. O., und Strauss, W. L., Jr., 1959, The Forerunners of Darwin: 1745- 1859: Baltimore, Johns Hopkins Press.}"
}

@inproceedings{lerner1959the25,
    author = "Lerner, I. M",
    title = "The concept of natural selection",
    year = "1959",
    booktitle = "A centennial view: Proceedings of the American Philosophical Society, v. 103, p. 173-182",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lerner, I. M., 1959, The concept of natural selection: A centennial view: Proceedings of the American Philosophical Society, v. 103, p. 173-182.}"
}

@book{millhauser1959just32,
    author = "Millhauser, M",
    title = "Just Before Darwin",
    year = "1959",
    publisher = "Robert Chambers and Vestiges: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Millhauser, M., 1959, Just Before Darwin: Robert Chambers and Vestiges: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press.}"
}

@misc{scriven1959explanation38,
    author = "Scriven, M",
    title = "Erklärung und Vorhersage in der Evolutionstheorie",
    year = "1959",
    howpublished = "Science, v. 130, p. 477-482",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Scriven, M., 1959, Erklärung und Vorhersage in der Evolutionstheorie: Science, v. 130, p. 477-482.}"
}

@phdthesis{ross1962a36,
    author = "Ross, HH",
    title = "A Synthesis of Evolutionary Theory",
    year = "1962",
    publisher = "Englewood Cliffs, New Jersey, Prentice-Hall",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ross,, HH, 1962, A Synthesis of Evolutionary Theory: Englewood Cliffs, New Jersey, Prentice-Hall.}"
}

@misc{ehrilch1963the4,
    author = "Ehrilch, P. R. und Holm, R. W",
    title = "Der Prozess der Evolution",
    year = "1963",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill, 347 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ehrilch, P. R., und Holm, R. W., 1963, Der Prozess der Evolution: New York, McGraw-Hill, 347 p.}"
}

@misc{gasking1967investigations7,
    author = "Gasking, E",
    title = "Untersuchungen zur Generation",
    year = "1967",
    howpublished = "1651-1828: London, Hutchinson",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gasking, E., 1967, Untersuchungen zur Generation: 1651-1828: London, Hutchinson.}"
}

@misc{moorehead1969darwin34,
    author = "Moorehead, A",
    title = "Darwin und die Beagle",
    year = "1969",
    howpublished = "London, Hamish Hamilton",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Moorehead, A., 1969, Darwin und die Beagle: London, Hamish Hamilton.}"
}

@book{mckinney1971lamarck30,
    author = "McKinney, H. L",
    title = "Lamarck to Darwin",
    year = "1971",
    publisher = "Beiträge zur Evolutionsbiologie, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {McKinney, H. L., 1971, Lamarck to Darwin: Beiträge zur Evolutionsbiologie, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press.}"
}

@misc{jukes1972evolutionary21,
    author = "Jukes, T. H. und Holmquist, W. R",
    title = "Evolutionary clocks; nonconstancy of rate in different species",
    year = "1972",
    howpublished = "Science, v. 177, p. 530-532",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Jukes, T. H., und Holmquist, W. R., 1972, Evolutionary clocks; nonconstancy of rate in different species: Science, v. 177, p. 530-532.}"
}

@book{mckinney1972wallace31,
    author = "McKinney, H. L",
    title = "Wallace und natürliche Selektion",
    year = "1972",
    publisher = "New Haven, Connecticut, Yale University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {McKinney, H. L., 1972, Wallace und natürliche Selektion: New Haven, Connecticut, Yale University Press.}"
}

@article{openalexw2145250129,
    author = "Valen, Leigh Van",
    title = "A NEW EVOLUTIONARY LAW.",
    year = "1973",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    openalex = "W2145250129"
}

@misc{vanvalen1973a44,
    author = "Van Valen, L",
    title = "Ein neues evolutionäres Gesetz",
    year = "1973",
    howpublished = "Evolutionary Theory, v. 1, p. 1-30",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Van Valen, L., 1973, Ein neues evolutionäres Gesetz: Evolutionary Theory, v. 1, p. 1-30.}"
}

@article{doi101111j155856461975tb00851x,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE GENETIC BASIS OF EVOLUTIONARY CHANGE",
    year = "1975",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    openalex = "W1547248981"
}

@misc{maynardsmith1975the29,
    author = "Maynard Smith, J",
    title = "The Theory of Evolution [3rd ed.]",
    year = "1975",
    howpublished = "New York, Penguin",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Maynard Smith, J., 1975, The Theory of Evolution [3rd ed.]: New York, Penguin.}"
}

@inproceedings{stanley1975a40,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Eine Theorie der Evolution über der Artenebene",
    year = "1975",
    booktitle = "Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, v. 72, p. 646-650",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stanley, S. M., 1975, A theory of evolution above the species level: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, v. 72, p. 646-650.}"
}

@book{crossref1977patterns,
    title = "Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record",
    year = "1977",
    booktitle = "Developments in Palaeontology and Stratigraphy",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    doi = "10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    openalex = "W563635432"
}

@book{gould1977eternal9,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Ewige Metaphern der Paläontologie, in Hallam, A., ed., Muster der Evolution wie sie im Fossilbericht illustriert werden",
    year = "1977",
    publisher = "Amsterdam, Elsevier, S. 1-26",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1977, Ewige Metaphern der Paläontologie, in Hallam, A., ed., Muster der Evolution wie sie im Fossilbericht illustriert werden: Amsterdam, Elsevier, S. 1-26.}"
}

@misc{gould1977the15,
    author = "Gould, S. J. und Raup, D. M. und Sepkoski, J. J. und Schopf, T. J. M. und Simberloff, D. S",
    title = "The shape of evolution",
    year = "1977",
    howpublished = "A comparison of real and random clades: Paleobiology, v. 3, p. 23-40",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., Raup, D. M., Sepkoski, J. J., Schopf, T. J. M., und Simberloff, D. S., 1977, The shape of evolution: A comparison of real and random clades: Paleobiology, v. 3, p. 23-40.}"
}

@book{hallam1977patterns17,
    author = "Hallam, A",
    title = "Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record, 5 of Developments in Palaeontology and Stratigraphy",
    year = "1977",
    publisher = "Amsterdam, Elsevier",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hallam, A., 1977, Patterns of Evolution as Illustrated by the Fossil Record, 5 of Developments in Palaeontology and Stratigraphy: Amsterdam, Elsevier.}"
}

@book{hanson1977the18,
    author = "Hanson, E. D",
    title = "The Origin and Early Evolution of Animals",
    year = "1977",
    publisher = "Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hanson, E. D., 1977, The Origin and Early Evolution of Animals: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press.}"
}

@article{doi101038scientificamerican117998,
    author = "Kimura, Motoo",
    title = "The Neutral Theory of Molecular Evolution",
    year = "1979",
    journal = "Scientific American",
    url = "https://doi.org/10.1038/scientificamerican1179-98",
    doi = "10.1038/scientificamerican1179-98",
    openalex = "W2045391589"
}

@techreport{schwartz1979models37,
    author = "Schwartz, J. H. und Rollins, H. B",
    title = "Modelle und Methoden in der Evolutionstheorie, 13 von Bulletin of Carnegie Museum of Natural History",
    year = "1979",
    howpublished = "Pittsburgh, Pa",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Schwartz, J. H., und Rollins, H. B., 1979, Modelle und Methoden in der Evolutionstheorie, 13 von Bulletin of Carnegie Museum of Natural History: Pittsburgh, Pa.}"
}

@misc{stanley1979macroevolution41,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Makroevolution",
    year = "1979",
    howpublished = "Pattern and Process: San Francisco, W.H. Freeman",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stanley, S. M., 1979, Makroevolution: Pattern and Process: San Francisco, W.H. Freeman.}"
}

@article{doi101007bf01731581,
    author = "Kimura, Motoo",
    title = "Eine einfache Methode zur Schätzung evolutionärer Raten von Basen substitutionsen durch vergleichende Studien von Nukleotidsequenzen",
    year = "1980",
    journal = "Journal of Molecular Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf01731581",
    doi = "10.1007/bf01731581",
    openalex = "W2065461553",
    references = "doi101007bf01653945, doi101007bf01732067, doi101007bf01732340, doi101016b9781483232119500097, doi101016s0021925817401566, doi101038217624a0, doi101038267275a0, doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas7172848, doi101126science1643881788"
}

@misc{lewin1980evolutionary26,
    author = "Lewin, R",
    title = "Evolutionstheorie unter Beschuss",
    year = "1980",
    howpublished = "Science, v. 210, p. 883-887",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lewin, R., 1980, Evolutionstheorie unter Beschuss: Science, v. 210, p. 883-887.}"
}

Es wird ein theoretischer Ansatz zur Analyse historischer Faktoren (Raup 1972) in der evolutionären Morphologie vorgestellt, der transformativen Hypothesen über strukturelle Systeme adressiert. Dieser (strukturelle) Ansatz zum Testen historischer Hypothesen über phylogenetische Beschränkungen von Form und Funktion sowie über strukturelle und funktionelle Vielseitigkeit umfasst (1) die Rekonstruktion verschachtelter Sätze struktureller Merkmale in monophyletischen Taxa, (2) die Verwendung allgemeiner oder emergenter organisatorischer Eigenschaften struktureller und funktioneller Systeme (im Gegensatz zu einzigartig abgeleiteten morphologischen Merkmalen) und (3) die vergleichende Untersuchung der Konsequenzen für die strukturelle und funktionelle Vielfalt dieser allgemeinen Merkmale in verwandten monophyletischen Taxa. Drei Beispiele emergenter organisatorischer Eigenschaften werden betrachtet: strukturelle Komplexität, Wiederholung von Teilen und die Entkopplung primitiv beschränkter Systeme. Zwei Klassen von Hypothesen über die Evolution von Design werden vorgeschlagen. Transformative Hypothesen betreffen historische Wege der Formänderung als Folge allgemeiner organisatorischer Merkmale, die für eine Linie primitiv sind. Relationale Hypothesen beinhalten Korrelationen zwischen strukturell-funktionalen Netzwerken, die für ein Kladus primitiv sind, und morphologischer Vielfalt sowohl zwischen als auch innerhalb terminaler Taxa. In dem Maße, in dem transformative und relationale Hypothesen über Form bestätigt werden, liefern sie Beweise für eine zugrundeliegende Regelmäßigkeit in der Transformation von organischem Design, die eine Folge der hierarchischen Organisation struktureller und funktioneller Muster in Organismen sein kann.

@article{doi101017s0094837300025495,
    author = "Lauder, George",
    title = "Form und Funktion: strukturelle Analyse in der evolutionären Morphologie",
    year = "1981",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Es wird ein theoretischer Ansatz zur Analyse historischer Faktoren (Raup 1972) in der evolutionären Morphologie vorgestellt, der transformativen Hypothesen über strukturelle Systeme adressiert. Dieser (strukturelle) Ansatz zum Testen historischer Hypothesen über phylogenetische Beschränkungen von Form und Funktion sowie über strukturelle und funktionelle Vielseitigkeit umfasst (1) die Rekonstruktion verschachtelter Sätze struktureller Merkmale in monophyletischen Taxa, (2) die Verwendung allgemeiner oder emergenter organisatorischer Eigenschaften struktureller und funktioneller Systeme (im Gegensatz zu einzigartig abgeleiteten morphologischen Merkmalen) und (3) die vergleichende Untersuchung der Konsequenzen für die strukturelle und funktionelle Vielfalt dieser allgemeinen Merkmale in verwandten monophyletischen Taxa. Drei Beispiele emergenter organisatorischer Eigenschaften werden betrachtet: strukturelle Komplexität, Wiederholung von Teilen und die Entkopplung primitiv beschränkter Systeme. Zwei Klassen von Hypothesen über die Evolution von Design werden vorgeschlagen. Transformative Hypothesen betreffen historische Wege der Formänderung als Folge allgemeiner organisatorischer Merkmale, die für eine Linie primitiv sind. Relationale Hypothesen beinhalten Korrelationen zwischen strukturell-funktionalen Netzwerken, die für ein Kladus primitiv sind, und morphologischer Vielfalt sowohl zwischen als auch innerhalb terminaler Taxa. In dem Maße, in dem transformative und relationale Hypothesen über Form bestätigt werden, liefern sie Beweise für eine zugrundeliegende Regelmäßigkeit in der Transformation von organischem Design, die eine Folge der hierarchischen Organisation struktureller und funktioneller Muster in Organismen sein kann.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300025495",
    doi = "10.1017/s0094837300025495",
    openalex = "W2275850409",
    references = "doi101111j155856461965tb01720x, doi1023072412293, doi1023072412953, doi107312crac92306005, openalexw1869415094, openalexw2128666103"
}

@book{eldredge1981phylogenetic6,
    author = "Eldredge, N. und Cracraft, J",
    title = "Phylogenetische Muster und der evolutionäre Prozess",
    year = "1981",
    publisher = "Methodik und Theorie in der vergleichenden Biologie: New York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Eldredge, N., und Cracraft, J., 1981, Phylogenetische Muster und der evolutionäre Prozess: Methodik und Theorie in der vergleichenden Biologie: New York, Columbia University Press.}"
}

@misc{jaanusson1981functional20,
    author = "Jaanusson, V",
    title = "Funktionsschwellen im evolutionären Fortschritt",
    year = "1981",
    howpublished = "Lethaia, v. 14, p. 251-260",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Jaanusson, V., 1981, Funktionsschwellen im evolutionären Fortschritt: Lethaia, v. 14, p. 251-260.}"
}

@misc{lewin1981no27,
    author = "Lewin, R",
    title = "Kein Lücke hier im Fossilbericht",
    year = "1981",
    howpublished = "Science, v. 214, p. 645-646",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lewin, R., 1981, Kein Lücke hier im Fossilbericht: Science, v. 214, p. 645-646.}"
}

@book{ospovat1981the35,
    author = "Ospovat, D",
    title = "The Development of Darwin's Theory",
    year = "1981",
    publisher = "Natural History, Natural Theology, and Natural Selection, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ospovat, D., 1981, The Development of Darwin's Theory: Natural History, Natural Theology, and Natural Selection, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@phdthesis{stebbins1981is42,
    author = "Stebbins, G. L. und Ayala, F. J",
    title = "Ist eine neue Evolutionssynthese notwendig?",
    year = "1981",
    publisher = "Science, v. 213, S. 967-971",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stebbins, G. L., und Ayala, F. J., 1981, Ist eine neue Evolutionssynthese notwendig?: Science, v. 213, S. 967-971.}"
}

Eine neue Zusammenstellung von Fossilien-Daten zu Wirbellosen- und Wirbeltierfamilien zeigt, dass vier Massenaussterben im marinen Bereich statistisch von den Hintergrundaussterberaten unterschiedlich sind. Diese vier ereigneten sich spät im Ordovizium, Perm, Trias und Kreidezeit. Ein fünftes Aussterbeereignis im Devon sticht aus dem Hintergrund hervor, ist in diesen Daten jedoch nicht statistisch signifikant. Die Hintergrundaussterberaten scheinen seit der Zeit des Kambriums zurückgegangen zu sein, was mit der Vorhersage übereinstimmt, dass die Optimierung der Fitness sich im Laufe der evolutionären Zeit erhöhen sollte.

@article{doi101126science21545391501,
    author = "Raup, David M. und Sepkoski, J. John",
    title = "Mass Extinctions in the Marine Fossil Record",
    year = "1982",
    journal = "Science",
    abstract = "Eine neue Zusammenstellung von Fossilien-Daten zu Wirbellosen- und Wirbeltierfamilien zeigt, dass vier Massenaussterben im marinen Bereich statistisch von den Hintergrundaussterberaten unterschiedlich sind. Diese vier ereigneten sich spät im Ordovizium, Perm, Trias und Kreidezeit. Ein fünftes Aussterbeereignis im Devon sticht aus dem Hintergrund hervor, ist in diesen Daten jedoch nicht statistisch signifikant. Die Hintergrundaussterberaten scheinen seit der Zeit des Kambriums zurückgegangen zu sein, was mit der Vorhersage übereinstimmt, dass die Optimierung der Fitness sich im Laufe der evolutionären Zeit erhöhen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.215.4539.1501",
    doi = "10.1126/science.215.4539.1501",
    openalex = "W1976721572",
    references = "doi101017s009483730000511x, doi101017s0094837300006539, doi101130spe89p63, doi105281zenodo16226412, openalexw2335729143, openalexw2591197405, openalexw2596207362"
}

@article{doi1023071936778,
    author = "Lande, Russell",
    title = "A Quantitative Genetic Theory of Life History Evolution",
    year = "1982",
    journal = "Ecology",
    url = "https://doi.org/10.2307/1936778",
    doi = "10.2307/1936778",
    openalex = "W2089325551",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101086404940, doi101111j146918091957tb01874x, doi101111j155856461980tb04817x"
}

@misc{gould1982darwinism10,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Darwinismus und die Ausweitung der evolutionären Theorie",
    year = "1982",
    howpublished = "Science, v. 216, p. 380-387",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1982, Darwinismus und die Ausweitung der evolutionären Theorie: Science, v. 216, p. 380-387.}"
}

@article{sulloway1982darwin43,
    author = "Sulloway, F",
    title = "Darwin und seine Finken",
    year = "1982",
    journal = "die Evolution einer Legende: Journal of Historical Biology, v. 15, S. 1-53",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sulloway, F., 1982, Darwin und seine Finken: die Evolution einer Legende: Journal of Historical Biology, v. 15, S. 1-53.}"
}

Mit dem Ziel, Daten über DNA-Polymorphismus zu analysieren und zu interpretieren, die durch DNA-Sequenzierung oder Restriktionsenzym-Technik gewonnen wurden, wird eine mathematische Theorie zur erwarteten evolutionären Beziehung zwischen DNA-Sequenzen (Nukleonen) entwickelt, die untersucht wurden, unter der Annahme, dass die evolutionäre Veränderung von Nukleonen ausschließlich durch Mutation und zufällige genetische Drift bestimmt wird. Die statistischen Eigenschaften der Anzahl der Nukleotidunterschiede zwischen zufällig ausgewählten Nukleonen und der von Heterozygotie oder Nukleon-Diversität werden unter Verwendung dieser Theorie untersucht. Diese Studien zeigen, dass die Schätzungen der durchschnittlichen Anzahl von Nukleotidunterschieden und Nukleon-Diversität eine große Varianz aufweisen und ein großer Teil dieser Varianz auf stochastische Faktoren zurückzuführen ist. Daher hilft eine Vergrößerung der Stichprobengröße nicht, die Varianz signifikant zu reduzieren. Die Verteilung der Stichproben-Allel (Nukleomorph)-Frequenzen wird ebenfalls untersucht, und es wird gezeigt, dass eine kleine Anzahl von Proben ausreicht, um das Verteilungsmuster zu kennen.

@article{doi101093genetics1052437,
    author = "Tajima, Fumio",
    title = "EVOLUTIONÄRE BEZIEHUNG VON DNA-SEQUENZEN IN ENDLICHEN POPULATIONEN",
    year = "1983",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Mit dem Ziel, Daten über DNA-Polymorphismus zu analysieren und zu interpretieren, die durch DNA-Sequenzierung oder Restriktionsenzym-Technik gewonnen wurden, wird eine mathematische Theorie zur erwarteten evolutionären Beziehung zwischen DNA-Sequenzen (Nukleonen) entwickelt, die untersucht wurden, unter der Annahme, dass die evolutionäre Veränderung von Nukleonen ausschließlich durch Mutation und zufällige genetische Drift bestimmt wird. Die statistischen Eigenschaften der Anzahl der Nukleotidunterschiede zwischen zufällig ausgewählten Nukleonen und der von Heterozygotie oder Nukleon-Diversität werden unter Verwendung dieser Theorie untersucht. Diese Studien zeigen, dass die Schätzungen der durchschnittlichen Anzahl von Nukleotidunterschieden und Nukleon-Diversität eine große Varianz aufweisen und ein großer Teil dieser Varianz auf stochastische Faktoren zurückzuführen ist. Daher hilft eine Vergrößerung der Stichprobengröße nicht, die Varianz signifikant zu reduzieren. Die Verteilung der Stichproben-Allel (Nukleomorph)-Frequenzen wird ebenfalls untersucht, und es wird gezeigt, dass eine kleine Anzahl von Proben ausreicht, um das Verteilungsmuster zu kennen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/105.2.437",
    doi = "10.1093/genetics/105.2.437",
    openalex = "W1928220195",
    references = "doi1010160040580972900354, doi1010160040580974900252, doi1010160040580975900209, doi101017s000186780003994x, doi101073pnas7763605, doi101093genetics1032287, doi101093genetics893583, doi101093genetics971145, doi101111j155856461983tb05528x, doi1023072408186"
}

Zeitschriftenartikel An Evolutionary Theory of Economic Change Zugriff erhalten An Evolutionary Theory of Economic Change. Von Richard R. Nelson und Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts & London: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby University of Stirling Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Band 93, Ausgabe 371, 1. September 1983, Seiten 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Veröffentlicht: 01. September 1983

@article{doi1023072232409,
    author = "Loasby, Brian J. und Nelson, Richard R. und Winter, Sidney G.",
    title = "An Evolutionary Theory of Economic Change.",
    year = "1983",
    journal = "The Economic Journal",
    abstract = "Zeitschriftenartikel An Evolutionary Theory of Economic Change Zugriff erhalten An Evolutionary Theory of Economic Change. Von Richard R. Nelson und Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts \& London: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby University of Stirling Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Band 93, Ausgabe 371, 1. September 1983, Seiten 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Veröffentlicht: 01. September 1983",
    url = "https://doi.org/10.2307/2232409",
    doi = "10.2307/2232409",
    openalex = "W2137358449"
}

@book{bowler1984evolution2,
    author = "Bowler, P. J",
    title = "Evolution",
    year = "1984",
    publisher = "The History of an Idea: Berkeley, University of California Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Bowler, P. J., 1984, Evolution: The History of an Idea: Berkeley, University of California Press.}"
}

@misc{dodson1985the3,
    author = "Dodson, E. O",
    title = "Die Theorie der Evolution, in Encyclopedia Britannica [1. Aufl.]",
    year = "1985",
    howpublished = "Chicago, Illinois, Encyclopedia Britannica, Inc., v. 18, p. 981-1011",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dodson, E. O., 1985, Die Theorie der Evolution, in Encyclopedia Britannica [1. Aufl.]: Chicago, Illinois, Encyclopedia Britannica, Inc., v. 18, p. 981-1011.}"
}

Zeitschriftenartikel Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die evolutionäre Genetik Zugang erhalten ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA2Howard Hughes Medical Institute, U426, University of California, San Francisco, Kalifornien 94143, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA3Wildlife Genetics Laboraiory, Department of Wildlge and Fisheries Sciences, Texas A & M University, College Station, Texas 77843, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA4Institut für Biochemie, Howard University, Washington, DC 20059, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA5Institut für Klinische Genetik, Karolinska Hospital, Box 60500, S-104 01 Stockholm, Schweden Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA6Institut für Zoologie, University of Hawaii, Honolulu, Hawaii 96822, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA7Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar... Mehr anzeigen MARK STONEKING MARK STONEKING 1Institut für Biochemie, University of California, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Band 26, Ausgabe 4, Dezember 1985, Seiten 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Veröffentlicht: 28. Juni 2008 Artikelverlauf Angenommen: 01. Juli 1985 Veröffentlicht: 28. Juni 2008

@article{doi101111j109583121985tb02048x,
    author = "Wilson, Allan C. und Cann, Rebecca L. und Carr, Steven M. und George, Matthew und GYLLENSTEN, ULF B. und Helm‐Bychowski, Kathleen und Higuchi, Russell und Palumbi, Stephen R. und Prager, Ellen M. und Sage, Richard D. und Stoneking, Mark",
    title = "Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die Evolutionärgenetik",
    year = "1985",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Journal Article Mitochondriale DNA und zwei Perspektiven auf die Evolutionärgenetik Zugriff erhalten ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA2Howard Hughes Medical Institute, U426, Universität von Kalifornien, San Francisco, Kalifornien 94143, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA3Wildlife Genetics Laboratorium, Abteilung für Wildtier- und Fischereiwissenschaften, Texas A & M University, College Station, Texas 77843, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA4Institut für Biochemie, Howard University, Washington, DC 20059, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA5Abteilung für Klinische Genetik, Karolinska Hospital, Box 60500, S-104 01 Stockholm, Schweden Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA6Abteilung für Zoologie, Universität von Hawaii, Honolulu, Hawaii 96822, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA7Museum für Wirbeltierzoo, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar... Mehr anzeigen MARK STONEKING MARK STONEKING 1Institut für Biochemie, Universität von Kalifornien, Berkeley, Kalifornien 94720, USA Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Band 26, Ausgabe 4, Dezember 1985, Seiten 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Veröffentlicht: 28. Juni 2008 Artikelverlauf Angenommen: 01. Juli 1985 Veröffentlicht: 28. Juni 2008",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    openalex = "W2065697254",
    references = "doi101038202147a0, doi101073pnas504672, doi101073pnas581142, doi101111j155856461983tb05533x, doi101126science15838051200, doi1023071438156, doi1023072407274, doi107312simp93764, openalexw788933220, sarich1967immunological"
}

@phdthesis{beardsley1986fossil1,
    author = "Beardsley, T",
    title = "Fossil bird shakes evolutionary hypothesis",
    year = "1986",
    publisher = "Nature, v. 322, p. 677",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Beardsley, T., 1986, Fossil bird shakes evolutionary hypothesis: Nature, v. 322, p. 677.}"
}

Die Sequenzen der small-subunit rRNA-Gene der flagellierten Protisten Euglena gracilis und Trypanosoma brucei wurden bestimmt und mit denen anderer Eukaryoten verglichen. Ein phylogenetischer Baum wurde erstellt, in dem die früheste Verzweigung unter den Eukaryoten durch E. gracilis repräsentiert wird. Die Divergenz von E. gracilis geht weit vor eine Periode massiver evolutionärer Strahlung zurück, die zu Pflanzen, Tieren, Pilzen und bestimmten Gruppen von Protisten wie Ciliaten und Acanthamoeben führte. Die genetische Vielfalt in dieser Sammlung von Eukaryoten wird als größer gesehen als die innerhalb der eubakteriellen oder archäbakteriellen Abstammungslinien.

@article{doi101073pnas8351383,
    author = "Sogin, M L und Elwood, Hille J. und Gunderson, John H.",
    title = "Evolutionäre Vielfalt eukaryotischer small-subunit rRNA-Gene.",
    year = "1986",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Die Sequenzen der small-subunit rRNA-Gene der flagellierten Protisten Euglena gracilis und Trypanosoma brucei wurden bestimmt und mit denen anderer Eukaryoten verglichen. Ein phylogenetischer Baum wurde erstellt, in dem die früheste Verzweigung unter den Eukaryoten durch E. gracilis repräsentiert wird. Die Divergenz von E. gracilis geht weit vor eine Periode massiver evolutionärer Strahlung zurück, die zu Pflanzen, Tieren, Pilzen und bestimmten Gruppen von Protisten wie Ciliaten und Acanthamoeben führte. Die genetische Vielfalt in dieser Sammlung von Eukaryoten wird als größer gesehen als die innerhalb der eubakteriellen oder archäbakteriellen Abstammungslinien.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.83.5.1383",
    doi = "10.1073/pnas.83.5.1383",
    openalex = "W2062738309"
}

@misc{monastersky1986reining33,
    author = "Monastersky, R",
    title = "Reining in a runaway theory",
    year = "1986",
    howpublished = "Science News, v. 130, p. 374",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Monastersky, R., 1986, Reining in a runaway theory: Science News, v. 130, p. 374.}"
}

@book{doi107312nei92038,
    author = "Nei, Masatoshi",
    title = "Molekulare Evolutionsgenetik",
    year = "1987",
    booktitle = "Columbia University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.7312/nei-92038",
    doi = "10.7312/nei-92038",
    openalex = "W93588716"
}

@misc{gould1987asymmetry14,
    author = "Gould, S. J. und Gilinsky, N. L. und German, R. Z",
    title = "Asymmetrie von Linien und die Richtungen der evolutionären Zeit",
    year = "1987",
    howpublished = "Science, v. 236, p. 1437-1441",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., Gilinsky, N. L., und German, R. Z., 1987, Asymmetrie von Linien und die Richtungen der evolutionären Zeit: Science, v. 236, p. 1437-1441.}"
}

@misc{gould1987bushes12,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Bushes all the way down",
    year = "1987",
    howpublished = "Natural History Magazine, v. 96 (Juni), S. 12-19",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1987, Bushes all the way down: Natural History Magazine, v. 96 (Juni), S. 12-19.}"
}

@misc{gould1987lifes11,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Life's little joke",
    year = "1987",
    howpublished = "Natural History Magazine, v. 96 (April), p. 16- 25",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1987, Life's little joke: Natural History Magazine, v. 96 (April), p. 16- 25.}"
}

@article{doi101007978146847862422,
    author = "Smith, John Maynard",
    title = "Evolution und die Spieltheorie",
    year = "1988",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4684-7862-4\_22",
    doi = "10.1007/978-1-4684-7862-4\_22",
    openalex = "W1960351623",
    references = "doi101038246015a0, doi101038254463b0, doi105962bhltitle27468, openalexw175750636"
}

@misc{gould1988a13,
    author = "Gould, S. J",
    title = "A web of tales",
    year = "1988",
    howpublished = "Natural History Magazine, v. 97 (Oktober), S. 16-23",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1988, A web of tales: Natural History Magazine, v. 97 (Oktober), S. 16-23.}"
}

Zusammenfassung Aktuelle Partnerpräferenzen können wichtige Hinweise auf die menschliche Reproduktionsgeschichte liefern. Wenig ist über die Merkmale bekannt, die Menschen in potenziellen Partnern schätzen. Fünf Vorhersagen wurden über Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen auf der Grundlage evolutionärer Konzepte der elterlichen Investition, der sexuellen Selektion, der menschlichen Reproduktionsfähigkeit und sexueller Asymmetrien bezüglich der Gewissheit der Vaterschaft versus Mutterschaft gemacht. Die Vorhersagen konzentrierten sich darauf, wie jedes Geschlecht Erwerbsfähigkeit, Ambition— Fleiß, Jugend, körperliche Attraktivität und Keuschheit bewertet. Die Vorhersagen wurden in Daten aus 37 Stichproben getestet, die aus 33 Ländern auf sechs Kontinenten und fünf Inseln stammen (insgesamt N = 10.047). Für 27 Länder boten demografische Daten zum tatsächlichen Heiratsalter eine Validitätsprüfung der Fragebogendaten. Es wurde festgestellt, dass Frauen Hinweise auf die Ressourcengewinnung in potenziellen Partnern höher bewerten als Männer. Merkmale, die die Reproduktionsfähigkeit signalisieren, wurden von Männern höher bewertet als von Frauen. Diese Geschlechtsunterschiede können unterschiedlichen evolutionären Selektionsdrücken auf menschliche Männer und Frauen entsprechen; sie liefern starke kulturübergreifende Evidenz für aktuelle Geschlechtsunterschiede in Reproduktionsstrategien. Die Diskussion konzentriert sich auf unmittelbare Mechanismen, die Partnerpräferenzen zugrunde liegen, Konsequenzen für den menschlichen intrasexuellen Wettbewerb und die Grenzen dieser Studie.

@article{doi101017s0140525x00023992,
    author = "Buss, David M.",
    title = "Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen: Evolutionäre Hypothesen, die in 37 Kulturen getestet wurden",
    year = "1989",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Zusammenfassung Aktuelle Partnerpräferenzen können wichtige Hinweise auf die menschliche Reproduktionsgeschichte liefern. Wenig ist über die Merkmale bekannt, die Menschen in potenziellen Partnern schätzen. Fünf Vorhersagen wurden über Geschlechtsunterschiede in menschlichen Partnerpräferenzen auf der Grundlage evolutionärer Konzepte der elterlichen Investition, der sexuellen Selektion, der menschlichen Reproduktionsfähigkeit und sexueller Asymmetrien bezüglich der Gewissheit der Vaterschaft versus Mutterschaft gemacht. Die Vorhersagen konzentrierten sich darauf, wie jedes Geschlecht Erwerbsfähigkeit, Ambition— Fleiß, Jugend, körperliche Attraktivität und Keuschheit bewertet. Die Vorhersagen wurden in Daten aus 37 Stichproben getestet, die aus 33 Ländern auf sechs Kontinenten und fünf Inseln stammen (insgesamt N = 10.047). Für 27 Länder boten demografische Daten zum tatsächlichen Heiratsalter eine Validitätsprüfung der Fragebogendaten. Es wurde festgestellt, dass Frauen Hinweise auf die Ressourcengewinnung in potenziellen Partnern höher bewerten als Männer. Merkmale, die die Reproduktionsfähigkeit signalisieren, wurden von Männern höher bewertet als von Frauen. Diese Geschlechtsunterschiede können unterschiedlichen evolutionären Selektionsdrücken auf menschliche Männer und Frauen entsprechen; sie liefern starke kulturübergreifende Evidenz für aktuelle Geschlechtsunterschiede in Reproduktionsstrategien. Die Diskussion konzentriert sich auf unmittelbare Mechanismen, die Partnerpräferenzen zugrunde liegen, Konsequenzen für den menschlichen intrasexuellen Wettbewerb und die Grenzen dieser Studie.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x00023992",
    doi = "10.1017/s0140525x00023992",
    openalex = "W2157338817",
    references = "doi101007978146847862422, doi1010160022519364900384, doi1010160022519366901846, doi1010160162309582900279, doi1010160162309583900274, doi101016s0065260122x00026, doi101017cbo9780511806292, doi101017s0140525x00010128, doi10103711774000, doi10103712293000, doi101038246015a0, doi101038369716c0, doi101086284064, doi101111j155856461957tb02911x, doi101126science327542, doi1011425786, doi1011770022022190211001, doi101537ase188722495, doi1023072393017, doi1023072412191, doi1023072485224, doi1023072576242, doi1023075530, doi102307582242, doi1043249781315129266, doi10432497813151292667, doi1043249781410606266, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw1649242647, openalexw2000871817"
}

Zeitschriftenartikel Die evolutionäre Bedeutung der phänotypischen Plastizität: Phänotypische Quellen der Variation zwischen Organismen können durch entwicklungsbiologische Schalter und Reaktionsnormen beschrieben werden Zugriff Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Band 39, Ausgabe 7, Juli/August 1989, Seiten 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Veröffentlicht: 01. August 1989

@article{doi1023071311135,
    author = "Stearns, Stephen C.",
    title = "The Evolutionary Significance of Phenotypic Plasticity",
    year = "1989",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Zeitschriftenartikel Die evolutionäre Bedeutung der phänotypischen Plastizität: Phänotypische Quellen der Variation zwischen Organismen können durch entwicklungsbiologische Schalter und Reaktionsnormen beschrieben werden Zugriff Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Band 39, Ausgabe 7, Juli/August 1989, Seiten 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Veröffentlicht: 01. August 1989",
    url = "https://doi.org/10.2307/1311135",
    doi = "10.2307/1311135",
    openalex = "W2058670567",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi1015159780691224244, doi1023071439305, doi1023072389364, openalexw1635425035"
}

Zusammenfassung Seit Darwin ist es für Evolutionsbiologen zur zweiten Natur geworden, vergleichend zu denken, da Vergleiche die Allgemeingültigkeit evolutionärer Phänomene begründen. Verlangsamen große Genome die Entwicklung? Welche Lebensweisen selektieren für große Gehirne? Stehen Aussterberaten mit der Körpergröße in Zusammenhang? Dies sind alle Fragen der vergleichenden Methode, und dieses Buch behandelt, wie solche Fragen beantwortet werden können. Das erste Kapitel erläutert geeignete Fragen für den vergleichenden Ansatz und zeigt, wie er andere Problemlösungsansätze in der Evolution ergänzt. Das zweite Kapitel identifiziert die biologischen Ursachen für Ähnlichkeiten zwischen eng verwandten Arten für fast jedes beobachtete Merkmal. Das dritte Kapitel diskutiert Methoden zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Merkmalszustände. Das vierte Kapitel entwickelt statistische Tests, die bestimmen sollen, ob verschiedene Merkmale, die in diskreten Zuständen existieren, Hinweise auf korrelierte Evolution zeigen. Kapitel 5 wendet sich vergleichenden Analysen kontinuierlich variierender Merkmale zu. Kapitel 6 betrachtet Allometrie, um die zuvor diskutierten Themen und Methoden zu veranschaulichen, während das letzte Kapitel die zukünftige Entwicklung des vergleichenden Ansatzes sowohl in der molekularen als auch in der organismischen Biologie betrachtet.

@book{doi101093oso97801985464120010001,
    author = "Harvey, Paul und Pagel, Mark",
    title = "The Comparative Method in Evolutionary Biology",
    year = "1991",
    abstract = "Zusammenfassung Seit Darwin ist es für Evolutionsbiologen zur zweiten Natur geworden, vergleichend zu denken, da Vergleiche die Allgemeingültigkeit evolutionärer Phänomene begründen. Verlangsamen große Genome die Entwicklung? Welche Lebensweisen selektieren für große Gehirne? Stehen Aussterberaten mit der Körpergröße in Zusammenhang? Dies sind alle Fragen der vergleichenden Methode, und dieses Buch behandelt, wie solche Fragen beantwortet werden können. Das erste Kapitel erläutert geeignete Fragen für den vergleichenden Ansatz und zeigt, wie er andere Problemlösungsansätze in der Evolution ergänzt. Das zweite Kapitel identifiziert die biologischen Ursachen für Ähnlichkeiten zwischen eng verwandten Arten für fast jedes beobachtete Merkmal. Das dritte Kapitel diskutiert Methoden zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Merkmalszustände. Das vierte Kapitel entwickelt statistische Tests, die bestimmen sollen, ob verschiedene Merkmale, die in diskreten Zuständen existieren, Hinweise auf korrelierte Evolution zeigen. Kapitel 5 wendet sich vergleichenden Analysen kontinuierlich variierender Merkmale zu. Kapitel 6 betrachtet Allometrie, um die zuvor diskutierten Themen und Methoden zu veranschaulichen, während das letzte Kapitel die zukünftige Entwicklung des vergleichenden Ansatzes sowohl in der molekularen als auch in der organismischen Biologie betrachtet.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    openalex = "W4388245928"
}

Unser Verständnis der Evolution basiert auf einem darwinistischen Dreibein aus drei grundlegenden Beobachtungen: (1) Lebewesen sind Einheiten der Organisation, die sich fortpflanzen; (2) Individuen unterscheiden sich voneinander, und einige ihrer Unterschiede sind vererbbar, und (3) in einer Population genießen Individuen unterschiedliche Grade an Fortpflanzungserfolg, der zumindest teilweise auf diese vererbten Unterschiede basiert. Diese differenzielle Fortpflanzung ist das, was mit natürlicher Selektion gemeint ist.

@incollection{goldsmith1991evolutionary,
    author = "Goldsmith, Timothy H",
    title = "Evolutionary Theory Since Darwin",
    year = "1991",
    booktitle = "The Biological Roots of Human Nature",
    abstract = "Our understanding of evolution is built on a Darwinian tripod of three fundamental observations: (1) living organisms are units of organization that reproduce; (2) individuals differ from one another, and some of their differences are inherited, and (3) in a population, individuals enjoy differing degrees of reproductive success based at least in part on these heritable differences. This differential reproduction is what is meant by natural selection.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195062885.003.0003",
    doi = "10.1093/oso/9780195062885.003.0003",
    openalex = "W4388079806",
    pages = "23-45"
}

Die vergleichende Methode zur Untersuchung der Anpassung: Warum sich um die Phylogenie kümmern? Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Charakterzustände. Vergleichende Analyse diskreter Daten. Vergleichende Analyse kontinuierlicher Variablen. Bestimmung der Form vergleichender Beziehungen.

@article{doi105860choice295104,
    title = "The comparative method in evolutionary biology",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "The comparative method for studying adaptation why worry about phylogeny? reconstructing phylogenetic trees and ancestral character states comparative analysis of discrete data comparative analysis of continuous variables determining the form of comparative relationships.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.29-5104",
    doi = "10.5860/choice.29-5104",
    openalex = "W1488393970"
}

Eine phylogenetische Struktur, die aus Vergleichen von kleinen Untereinheiten ribosomaler RNA-Sequenzen abgeleitet wurde, beschreibt den evolutionären Ursprung und frühe Verzweigungsmuster des Reiches Animalia. Maximum-Likelihood-Analysen zeigen, dass die Tierlinie monophyletisch ist und Choanoflagellaten einschließt. Innerhalb des metazoischen Assemblages folgt auf die Divergenz der Schwämme die Ctenophora, die Cnidaria plus der Placozoa Trichoplax adhaerens und schließlich eine ungelöste Polychotomie der bilateralen Tierstämme. Aus diesen Daten wurde geschlossen, dass Tiere und Pilze eine einzigartige evolutionäre Geschichte teilen und dass ihr letzter gemeinsamer Vorfahre ein flagellierter Protist war, der den heute existierenden Choanoflagellaten ähnelt.

@article{doi101126science8469985,
    author = "Wainright, Patricia O. und Hinkle, Gregory und Sogin, Mitchell L. und Stickel, Shawn K.",
    title = "Monophyletic Origins of the Metazoa: an Evolutionary Link with Fungi",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "A phylogenetic framework inferred from comparisons of small subunit ribosomal RNA sequences describes the evolutionary origin and early branching patterns of the kingdom Animalia. Maximum likelihood analyses show the animal lineage is monophyletic and includes choanoflagellates. Within the metazoan assemblage, the divergence of sponges is followed by the Ctenophora, the Cnidaria plus the placozoan Trichoplax adhaerens, and finally by an unresolved polychotomy of bilateral animal phyla. From these data, it was inferred that animals and fungi share a unique evolutionary history and that their last common ancestor was a flagellated protist similar to extant choanoflagellates.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.8469985",
    doi = "10.1126/science.8469985",
    openalex = "W2034733986",
    references = "doi101126science3277277, openalexw2076004673"
}

Einführung. Basale Gruppen. Monera (Bakterien, Blaualgen). Pilze. Algen. Tiere: Wirbellose. Protozoen. Schwämme. Nesseltiere. Weichtiere: Amphineura und Monoplacophora. Weichtiere: Schnecken. Weichtiere: Kopffüßer (Nautiloidea). Weichtiere: Kopffüßer (vorjurassische Ammonoidea). Weichtiere: Kopffüßer (Ammonoidea: Phylloceratina, Lytoceratina, Ammonitina, Ancyloceratina). Weichtiere: Kopffüßer (Coleoidea). Weichtiere: Rostroconchia, Scaphopoda und Zweischaler. Weichtiere: incertae sedis. Ringelwürmer. Gliederfüßer (Trilobiten). Gliederfüßer (Aglaspidida, Chelicerata, Pycnogonida). Gliederfüßer (Krebstiere, ohne Ostrakoden). Gliederfüßer (Krebstiere: Ostrakoden). Gliederfüßer (Euthycarcinoidea und Tausendfüßer). Gliederfüßer (Sechsfüßer: Insekten). Brachiopoden. Phoroniden. Moostierchen. Stachelhäuter. Basale Deuterostomata (Chaetognatha, Hemichordata, Calcichordata, Cephalochordata und Tunicata). Graptolithina. Problematica. Miscellania. Tiere: Wirbeltiere. Conodonta. Agnatha. Placodermi. Acanthodii. Knorpelfische. Knochenfische: basale Actinopterygier. Knochenfische: Teleostei. Knochenfische: Lungenfische. Amphibienähnliche Tetrapoden. Reptilien. Vögel. Säugetiere. Pflanzen. Moosartige Pflanzen. Farnartige Pflanzen. Gymnospermen. Bedecktsamige Pflanzen (Angiospermae). Index.

@book{openalexw1599677799,
    author = "Benton, Michael J.",
    title = "The fossil record 2",
    year = "1993",
    abstract = "Einführung. Basale Gruppen. Monera (Bakterien, Blaualgen). Pilze. Algen. Tiere: Wirbellose. Protozoen. Schwämme. Nesseltiere. Weichtiere: Amphineura und Monoplacophora. Weichtiere: Schnecken. Weichtiere: Kopffüßer (Nautiloidea). Weichtiere: Kopffüßer (vorjurassische Ammonoidea). Weichtiere: Kopffüßer (Ammonoidea: Phylloceratina, Lytoceratina, Ammonitina, Ancyloceratina). Weichtiere: Kopffüßer (Coleoidea). Weichtiere: Rostroconchia, Scaphopoda und Zweischaler. Weichtiere: incertae sedis. Ringelwürmer. Gliederfüßer (Trilobiten). Gliederfüßer (Aglaspidida, Chelicerata, Pycnogonida). Gliederfüßer (Krebstiere, ohne Ostrakoden). Gliederfüßer (Krebstiere: Ostrakoden). Gliederfüßer (Euthycarcinoidea und Tausendfüßer). Gliederfüßer (Sechsfüßer: Insekten). Brachiopoden. Phoroniden. Moostierchen. Stachelhäuter. Basale Deuterostomata (Chaetognatha, Hemichordata, Calcichordata, Cephalochordata und Tunicata). Graptolithina. Problematica. Miscellania. Tiere: Wirbeltiere. Conodonta. Agnatha. Placodermi. Acanthodii. Knorpelfische. Knochenfische: basale Actinopterygier. Knochenfische: Teleostei. Knochenfische: Lungenfische. Amphibienähnliche Tetrapoden. Reptilien. Vögel. Säugetiere. Pflanzen. Moosartige Pflanzen. Farnartige Pflanzen. Gymnospermen. Bedecktsamige Pflanzen (Angiospermae). Index.",
    openalex = "W1599677799"
}

@book{doi1010079781461523819,
    author = "Avise, John C.",
    title = "Molecular Markers, Naturgeschichte und Evolution",
    year = "1994",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4615-2381-9",
    doi = "10.1007/978-1-4615-2381-9",
    openalex = "W2037882155"
}

Wir berichten über eine neue Transformation, den LogDet, die für Sequenzen mit unterschiedlicher Nukleotidzusammensetzung konsistent ist und die unter einfachen, aber asymmetrischen stochastischen Modellen der Evolution entstanden sind. Diese Transformation ist erforderlich, weil bestehende Methoden dazu neigen, Sequenzen unabhängig von ihrer evolutionären Geschichte allein auf der Grundlage ihrer Nukleotidzusammensetzung zu gruppieren. Dieser Effekt unterschiedlicher Nukleotidfrequenzen wird veranschaulicht, indem ein Baumauswahlkriterium auf einer einfachen Distanzmaß definiert wird, das ausschließlich auf der Grundlage der Basenzusammensetzung und unabhängig von den tatsächlichen Sequenzen basiert. Die neue LogDet-Transformation verwendet Determinanten der beobachteten Divergenzmatrizen und funktioniert, weil die Multiplikation von Determinanten (reelle Zahlen) kommutativ ist, während die Multiplikation von Matrizen dies nicht ist, außer in speziellen symmetrischen Fällen. Die Verwendung von Determinanten ermöglicht somit allgemeinere Modelle der Evolution mit symmetrischen Raten der Nukleotidänderung. Die Transformation wird an einem theoretischen Datensatz (wo bestehende Methoden den falschen Baum auswählen) und mit drei biologischen Datensätzen veranschaulicht: Chloroplasten, Vögel/Säugetiere (nuklear) und Honigbienen (mitochondrial). Die LogDet-Transformation unterstreicht die logische Unterscheidung zwischen Transformationen auf den Daten und Baumauswahlkriterien. Die allgemeinen Schlussfolgerungen aus dieser Studie sind, dass unregelmäßige A,C,G,T-Zusammensetzungen eine wichtige und mögliche allgemeine Ursache für Muster sind, die Baumrekonstruktionsmethoden täuschen können, selbst wenn hohe Bootstrap-Werte erzielt werden. Folglich müssen viele veröffentlichte Studien möglicherweise erneut überprüft werden.

@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva040136,
    author = "Lockhart, Peter J. und Steel, Mike und Hendy, Michael D. und Penny, David",
    title = "Recovering evolutionary trees under a more realistic model of sequence evolution.",
    year = "1994",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Wir berichten über eine neue Transformation, den LogDet, die für Sequenzen mit unterschiedlicher Nukleotidzusammensetzung konsistent ist und die unter einfachen, aber asymmetrischen stochastischen Modellen der Evolution entstanden sind. Diese Transformation ist erforderlich, weil bestehende Methoden dazu neigen, Sequenzen unabhängig von ihrer evolutionären Geschichte allein auf der Grundlage ihrer Nukleotidzusammensetzung zu gruppieren. Dieser Effekt unterschiedlicher Nukleotidfrequenzen wird veranschaulicht, indem ein Baumauswahlkriterium auf einer einfachen Distanzmaß definiert wird, das ausschließlich auf der Grundlage der Basenzusammensetzung und unabhängig von den tatsächlichen Sequenzen basiert. Die neue LogDet-Transformation verwendet Determinanten der beobachteten Divergenzmatrizen und funktioniert, weil die Multiplikation von Determinanten (reelle Zahlen) kommutativ ist, während die Multiplikation von Matrizen dies nicht ist, außer in speziellen symmetrischen Fällen. Die Verwendung von Determinanten ermöglicht somit allgemeinere Modelle der Evolution mit symmetrischen Raten der Nukleotidänderung. Die Transformation wird an einem theoretischen Datensatz (wo bestehende Methoden den falschen Baum auswählen) und mit drei biologischen Datensätzen veranschaulicht: Chloroplasten, Vögel/Säugetiere (nuklear) und Honigbienen (mitochondrial). Die LogDet-Transformation unterstreicht die logische Unterscheidung zwischen Transformationen auf den Daten und Baumauswahlkriterien. Die allgemeinen Schlussfolgerungen aus dieser Studie sind, dass unregelmäßige A,C,G,T-Zusammensetzungen eine wichtige und mögliche allgemeine Ursache für Muster sind, die Baumrekonstruktionsmethoden täuschen können, selbst wenn hohe Bootstrap-Werte erzielt werden. Folglich müssen viele veröffentlichte Studien möglicherweise erneut überprüft werden.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    openalex = "W2162443218",
    references = "doi101093oxfordjournalsmolbeva040752, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101126science3277277"
}

@article{crossref1995systematics,
    title = "Systematics und der Fossilbericht: Dokumentation evolutionärer Muster",
    year = "1995",
    journal = "Choice Reviews Online",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.32-3881",
    doi = "10.5860/choice.32-3881",
    number = "07",
    openalex = "W626899126",
    pages = "32-3881-32-3881",
    volume = "32"
}

@article{doi101006mpev19980495,
    author = "Goodman, Morris und Porter, Calvin A. und Czelusniak, John und Page, Scott L. und Schneider, Horacio und Shoshani, Jeheskel und Gunnell, Gregg F. und Groves, Colin P.",
    title = "Toward a Phylogenetic Classification of Primates Based on DNA Evidence Complemented by Fossil Evidence",
    year = "1998",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1006/mpev.1998.0495",
    doi = "10.1006/mpev.1998.0495",
    openalex = "W2058993504",
    references = "crossref1995systematics, doi102110pec9504, doi102110pec9554, doi1023071375443, doi1023072412685, doi1043249781315081083, doi105281zenodo18028696, doi105860choice323881, doi105860choice352112, openalexw1964182146"
}

@article{doi10103844766,
    author = "Pagel, Mark",
    title = "Inferring the historical patterns of biological evolution",
    year = "1999",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/44766",
    doi = "10.1038/44766",
    openalex = "W2114525641",
    references = "doi101016s0092867400803104, doi10103818872, doi101038366223a0, doi101038384055a0, doi101086284325, doi101086286013, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio41118, doi101098rspb19940006, doi101111j146364091997tb00423x, doi101126science2740904, doi101126science2765313734, doi101128mr5122212711987, doi1015159781503621534, doi1023072407154, doi1023072485224, doi105860choice295104, rambaut1998estimating"
}

@book{doi102307jctvjsf433,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory",
    year = "2002",
    booktitle = "Harvard University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctvjsf433",
    doi = "10.2307/j.ctvjsf433",
    openalex = "W4300925890"
}

* *1. Definition und Überarbeitung der Struktur der Evolutionstheorie * Teil I: Die Geschichte der darwinistischen Logik und Debatte *2. Das Wesen des Darwinismus und die Grundlage der modernen Orthodoxie: Eine Auslegung des Ursprungs der Arten *3. Samen der Hierarchie *4. Internalismus und Gesetze der Form: Prädarwinistische Alternativen zum Funktionalismus *5. Die fruchtbaren Facetten von Galtons Polyeder: Kanäle und Sprünge im postdarwinistischen Formalismus *6. Muster und Fortschritt auf der geologischen Bühne *7. Die moderne Synthese als begrenzter Konsens * Teil II: Hin zu einer überarbeiteten und erweiterten Evolutionstheorie *8. Arten als Individuen in der hierarchischen Selektionstheorie *9. Punctuated Equilibrium und die Validierung der makroevolutionären Theorie *10. Die Integration von Einschränkung und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Historische Einschränkungen und die Evolution der Entwicklung *11. Die Integration von Einschränkung und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Strukturelle Einschränkungen, Spandrels und die Zentralität der Exaptation in der Makroevolution *12. Ebenen der Zeit und Versuche der Extrapolation, mit einem Epilog über die Wechselwirkung von Allgemeiner Theorie und kontingenter Geschichte * Bibliographie * Index

@article{doi105860choice396411,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The structure of evolutionary theory",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "* *1. Definition und Überarbeitung der Struktur der Evolutionstheorie * Teil I: Die Geschichte der darwinistischen Logik und Debatte *2. Das Wesen des Darwinismus und die Grundlage der modernen Orthodoxie: Eine Auslegung des Ursprungs der Arten *3. Samen der Hierarchie *4. Internalismus und Gesetze der Form: Prädarwinistische Alternativen zum Funktionalismus *5. Die fruchtbaren Facetten von Galtons Polyeder: Kanäle und Sprünge im postdarwinistischen Formalismus *6. Muster und Fortschritt auf der geologischen Bühne *7. Die moderne Synthese als begrenzter Konsens * Teil II: Hin zu einer überarbeiteten und erweiterten Evolutionstheorie *8. Arten als Individuen in der hierarchischen Selektionstheorie *9. Punctuated Equilibrium und die Validierung der makroevolutionären Theorie *10. Die Integration von Einschränkung und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Historische Einschränkungen und die Evolution der Entwicklung *11. Die Integration von Einschränkung und Anpassung (Struktur und Funktion) in Ontogenie und Phylogenie: Strukturelle Einschränkungen, Spandrels und die Zentralität der Exaptation in der Makroevolution *12. Ebenen der Zeit und Versuche der Extrapolation, mit einem Epilog über die Wechselwirkung von Allgemeiner Theorie und kontingenter Geschichte * Bibliographie * Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-6411",
    doi = "10.5860/choice.39-6411",
    openalex = "W1539968307"
}

Epidemiologische Beobachtungen haben zur Hypothese geführt, dass das Risiko, im Erwachsenenalter bestimmte chronische nichtübertragbare Krankheiten zu entwickeln, nicht nur von genetischen und lebensstilbedingten Faktoren im Erwachsenenalter beeinflusst wird, sondern auch von Umweltfaktoren, die in der frühen Lebensphase wirken. Forschung in der Evolutionsbiologie, Entwicklungsbiologie sowie der Tier- und Menschenphysiologie unterstützt diese Idee und deutet darauf hin, dass Umweltprozesse, die die Krankheitsneigung im Erwachsenenalter beeinflussen, während der perikonzeptionellen, fetalen und infantilen Lebensphasen ablaufen. Dieses Konzept der „Entwicklungsursprünge von Gesundheit und Krankheit" kann wichtige biologische, medizinische und sozioökonomische Implikationen haben.

@article{doi101126science1095292,
    author = "Gluckman, Peter D. und Hanson, Mark A.",
    title = "Living with the Past: Evolution, Development, and Patterns of Disease",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = {Epidemiologische Beobachtungen haben zur Hypothese geführt, dass das Risiko, im Erwachsenenalter bestimmte chronische nichtübertragbare Krankheiten zu entwickeln, nicht nur von genetischen und lebensstilbedingten Faktoren im Erwachsenenalter beeinflusst wird, sondern auch von Umweltfaktoren, die in der frühen Lebensphase wirken. Forschung in der Evolutionsbiologie, Entwicklungsbiologie sowie der Tier- und Menschenphysiologie unterstützt diese Idee und deutet darauf hin, dass Umweltprozesse, die die Krankheitsneigung im Erwachsenenalter beeinflussen, während der perikonzeptionellen, fetalen und infantilen Lebensphasen ablaufen. Dieses Konzept der „Entwicklungsursprünge von Gesundheit und Krankheit" kann wichtige biologische, medizinische und sozioökonomische Implikationen haben.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1095292",
    doi = "10.1126/science.1095292",
    openalex = "W2125089843",
    references = "doi105694j132653771958tb86500x"
}

Die evolutionäre Geschichte einer Gruppe von Taxa wird üblicherweise durch einen phylogenetischen Baum dargestellt, und dieses Modell hat die Diskussion und Überprüfung von Hypothesen erheblich erleichtert. Es ist jedoch gut bekannt, dass komplexere evolutionäre Szenarien durch solche Modelle schlecht beschrieben werden. Darüber hinaus ist die Analyse der Daten auch dann, wenn die Evolution baumartig verläuft, möglicherweise nicht am besten durch Methoden unterstützt, die eine Baumstruktur erzwingen, sondern durch eine reichhaltigere Visualisierung der Daten, um deren Eigenschaften zu bewerten, zumindest als wesentlichen ersten Schritt. Daher sollten phylogenetische Netzwerke eingesetzt werden, wenn retikuläre Ereignisse wie Hybridisierung, horizontaler Gentransfer, Rekombination oder Genverdopplung und -verlust als beteiligt angesehen werden, und selbst in Abwesenheit solcher Ereignisse spielen phylogenetische Netzwerke eine nützliche Rolle. Dieser Artikel überprüft die für phylogenetische Netzwerke verwendete Terminologie und behandelt sowohl Split-Netzwerke als auch retikuläre Netzwerke, wie sie definiert sind und wie sie interpretiert werden können. Darüber hinaus skizziert der Artikel die Anfänge eines umfassenden statistischen Rahmens für die Anwendung von Split-Netzwerk-Methoden. Wir zeigen, wie Split-Netzwerke Vertrauensmengen von Bäumen darstellen können, und führen einen konservativen statistischen Test ein, um zu prüfen, ob das widersprüchliche Signal in einem Netzwerk baumartig ist. Schließlich beschreibt dieser Artikel ein neues Programm, SplitsTree4, ein interaktives und umfassendes Werkzeug zur Inferenz verschiedener Arten phylogenetischer Netzwerke aus Sequenzen, Entfernungen und Bäumen.

@article{doi101093molbevmsj030,
    author = "Huson, Daniel H. und Bryant, David",
    title = "Anwendung phylogenetischer Netzwerke in evolutionären Studien",
    year = "2005",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Die evolutionäre Geschichte einer Gruppe von Taxa wird üblicherweise durch einen phylogenetischen Baum dargestellt, und dieses Modell hat die Diskussion und Überprüfung von Hypothesen erheblich erleichtert. Es ist jedoch gut bekannt, dass komplexere evolutionäre Szenarien durch solche Modelle schlecht beschrieben werden. Darüber hinaus ist die Analyse der Daten auch dann, wenn die Evolution baumartig verläuft, möglicherweise nicht am besten durch Methoden unterstützt, die eine Baumstruktur erzwingen, sondern durch eine reichhaltigere Visualisierung der Daten, um deren Eigenschaften zu bewerten, zumindest als wesentlichen ersten Schritt. Daher sollten phylogenetische Netzwerke eingesetzt werden, wenn retikuläre Ereignisse wie Hybridisierung, horizontaler Gentransfer, Rekombination oder Genverdopplung und -verlust als beteiligt angesehen werden, und selbst in Abwesenheit solcher Ereignisse spielen phylogenetische Netzwerke eine nützliche Rolle. Dieser Artikel überprüft die für phylogenetische Netzwerke verwendete Terminologie und behandelt sowohl Split-Netzwerke als auch retikuläre Netzwerke, wie sie definiert sind und wie sie interpretiert werden können. Darüber hinaus skizziert der Artikel die Anfänge eines umfassenden statistischen Rahmens für die Anwendung von Split-Netzwerk-Methoden. Wir zeigen, wie Split-Netzwerke Vertrauensmengen von Bäumen darstellen können, und führen einen konservativen statistischen Test ein, um zu prüfen, ob das widersprüchliche Signal in einem Netzwerk baumartig ist. Schließlich beschreibt dieser Artikel ein neues Programm, SplitsTree4, ein interaktives und umfassendes Werkzeug zur Inferenz verschiedener Arten phylogenetischer Netzwerke aus Sequenzen, Entfernungen und Bäumen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msj030",
    doi = "10.1093/molbev/msj030",
    openalex = "W2055298722",
    references = "doi101016s0169534700020267, doi101038nrg929, doi10108010635150390235520, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsi111, doi101093sysbio463523, doi101111j155856461985tb00420x"
}

Fledermäuse machen mehr als 20% der heute lebenden Säugetiere aus, doch ihre evolutionäre Geschichte ist weitgehend unbekannt aufgrund eines begrenzten Fossilberichts und widersprüchlicher oder unvollständiger Phylogenien. Hier präsentieren wir eine hochaufgelöste molekulare Phylogenie für alle heute lebenden Fledermausfamilien. Unsere Ergebnisse stützen die Hypothese, dass Megafledermäuse innerhalb von vier großen Mikrofledermaus-Linien eingebettet sind, die im frühen Eozän [52 bis 50 Millionen Jahre vor heute (Mya)] entstanden, zeitgleich mit einem signifikanten globalen Temperaturanstieg, einer Zunahme der Pflanzenvielfalt und -abundanz sowie dem Höhepunkt der Tertiär-Insektenvielfalt. Unsere Daten deuten darauf hin, dass Fledermäuse in Laurasien entstanden sind, möglicherweise in Nordamerika, und dass drei der großen Mikrofledermaus-Linien laurasischen Ursprungs sind, während die vierte gongwanischen Ursprungs ist. Durch die Kombination von Prinzipien der Ghost-Lineage-Analyse mit molekularen Divergenzdaten schätzen wir, dass der Fossilbericht von Fledermäusern die ersten Vorkommen im Durchschnitt um 73% unterschätzt (unrepräsentierte basale Astlänge, UBBL) und dass die Summe der fehlenden Fossilgeschichte 61% beträgt.

@article{doi101126science1105113,
    author = "Teeling, Emma C. und Springer, Mark S. und Madsen, Ole und Bates, Paul J. J. und O’Brien, Stephen J. und Murphy, William J.",
    title = "A Molecular Phylogeny for Bats Illuminates Biogeography and the Fossil Record",
    year = "2005",
    journal = "Science",
    abstract = "Fledermäuse machen mehr als 20% der heute lebenden Säugetiere aus, doch ihre evolutionäre Geschichte ist weitgehend unbekannt aufgrund eines begrenzten Fossilberichts und widersprüchlicher oder unvollständiger Phylogenien. Hier präsentieren wir eine hochaufgelöste molekulare Phylogenie für alle heute lebenden Fledermausfamilien. Unsere Ergebnisse stützen die Hypothese, dass Megafledermäuse innerhalb von vier großen Mikrofledermaus-Linien eingebettet sind, die im frühen Eozän [52 bis 50 Millionen Jahre vor heute (Mya)] entstanden, zeitgleich mit einem signifikanten globalen Temperaturanstieg, einer Zunahme der Pflanzenvielfalt und -abundanz sowie dem Höhepunkt der Tertiär-Insektenvielfalt. Unsere Daten deuten darauf hin, dass Fledermäuse in Laurasien entstanden sind, möglicherweise in Nordamerika, und dass drei der großen Mikrofledermaus-Linien laurasischen Ursprungs sind, während die vierte gongwanischen Ursprungs ist. Durch die Kombination von Prinzipien der Ghost-Lineage-Analyse mit molekularen Divergenzdaten schätzen wir, dass der Fossilbericht von Fledermäusern die ersten Vorkommen im Durchschnitt um 73% unterschätzt (unrepräsentierte basale Astlänge, UBBL) und dass die Summe der fehlenden Fossilgeschichte 61% beträgt.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1105113",
    doi = "10.1126/science.1105113",
    openalex = "W1997655974",
    references = "doi101007bf01454359, doi101017cbo9780511529924, doi10103835003188, doi10103835055536, doi101073pnas0334222100, doi101073pnas111551998, doi101126science1067179, doi101126science11536548, doi101126science15437541333, doi101126science28454232153, doi1023071223169"
}

Biomedizinische Wissenschaft hat die Relevanz der Life-History-Theorie und der evolutionären sowie ökologischen Entwicklungsbiologie für die klinische Medizin kaum berücksichtigt. Die Beobachtungen, dass Einflüsse im frühen Leben das spätere Krankheitsrisiko verändern können – das Paradigma der „developmental origins of health and disease" (DOHaD) – haben jedoch zu der Erkenntnis geführt, dass diese Perspektiven unser Verständnis der menschlichen Biologie informieren können. Wir schlagen vor, dass das DOHaD-Phänomen als Teilmenge der breiteren Prozesse der entwicklungsbedingten Plastizität betrachtet werden kann, durch die Organismen während ihres Lebenslaufs an ihre Umwelt anpassen. Solche adaptiven Prozesse ermöglichen es, genetische Variationen durch vorübergehende Umweltveränderungen zu erhalten. Hinweise auf Plastizität wirken besonders während der frühen Entwicklung; sie können einen einzelnen Organismus oder ein System betreffen, führen aber im Allgemeinen zu integrierten Anpassungen im ausgereiften Phänotyp, ein Prozess, der durch epigenetische Mechanismen gestützt wird und durch die Vorhersage der ausgereiften Umwelt beeinflusst wird. Bei Säugetieren führt eine ungünstige intrauterine Umgebung zu einem integrierten Bündel von Reaktionen, was auf die Beteiligung weniger Schlüsselregulatorgene hindeutet, die die Entwicklungstrajektorie unter der Erwartung schlechter postnataler Bedingungen zurücksetzen. Eine Diskrepanz zwischen der erwarteten und der tatsächlichen ausgereiften Umgebung setzt den Organismus einem Risiko für nachteilige Folgen aus – je größer die Diskrepanz, desto größer das Risiko. Für Menschen ist die Vorhersage für viele Individuen ungenau aufgrund von Veränderungen in der postnatalen Umgebung hin zu energiedichter Ernährung und geringer Energieausgabe, was zur Epidemie chronischer nichtübertragbarer Krankheiten beiträgt. Diese Sichtweise menschlicher Krankheiten aus den Perspektiven der Life-History-Biologie und der evolutionären Theorie bietet neue Ansätze für Prävention, Diagnose und Intervention.

@article{doi101002ajhb20590,
    author = "Gluckman, Peter D. und Hanson, Mark A. und Beedle, Alan S.",
    title = "Early life events and their consequences for later disease: A life history and evolutionary perspective",
    year = "2006",
    journal = "American Journal of Human Biology",
    abstract = {Biomedizinische Wissenschaft hat die Relevanz der Life-History-Theorie und der evolutionären sowie ökologischen Entwicklungsbiologie für die klinische Medizin kaum berücksichtigt. Die Beobachtungen, dass Einflüsse im frühen Leben das spätere Krankheitsrisiko verändern können – das Paradigma der „developmental origins of health and disease" (DOHaD) – haben jedoch zu der Erkenntnis geführt, dass diese Perspektiven unser Verständnis der menschlichen Biologie informieren können. Wir schlagen vor, dass das DOHaD-Phänomen als Teilmenge der breiteren Prozesse der entwicklungsbedingten Plastizität betrachtet werden kann, durch die Organismen während ihres Lebenslaufs an ihre Umwelt anpassen. Solche adaptiven Prozesse ermöglichen es, genetische Variationen durch vorübergehende Umweltveränderungen zu erhalten. Hinweise auf Plastizität wirken besonders während der frühen Entwicklung; sie können einen einzelnen Organismus oder ein System betreffen, führen aber im Allgemeinen zu integrierten Anpassungen im ausgereiften Phänotyp, ein Prozess, der durch epigenetische Mechanismen gestützt wird und durch die Vorhersage der ausgereiften Umwelt beeinflusst wird. Bei Säugetieren führt eine ungünstige intrauterine Umgebung zu einem integrierten Bündel von Reaktionen, was auf die Beteiligung weniger Schlüsselregulatorgene hindeutet, die die Entwicklungstrajektorie unter der Erwartung schlechter postnataler Bedingungen zurücksetzen. Eine Diskrepanz zwischen der erwarteten und der tatsächlichen ausgereiften Umgebung setzt den Organismus einem Risiko für nachteilige Folgen aus – je größer die Diskrepanz, desto größer das Risiko. Für Menschen ist die Vorhersage für viele Individuen ungenau aufgrund von Veränderungen in der postnatalen Umgebung hin zu energiedichter Ernährung und geringer Energieausgabe, was zur Epidemie chronischer nichtübertragbarer Krankheiten beiträgt. Diese Sichtweise menschlicher Krankheiten aus den Perspektiven der Life-History-Biologie und der evolutionären Theorie bietet neue Ansätze für Prävention, Diagnose und Intervention.},
    url = "https://doi.org/10.1002/ajhb.20590",
    doi = "10.1002/ajhb.20590",
    openalex = "W2050014967",
    references = "doi105694j132653771958tb86500x"
}

Die evolutionären Dynamiken, die dem latitudinalen Gradienten der biologischen Vielfalt zugrunde liegen, sind seit über einem Jahrhundert umstritten. Unter Verwendung eines räumlich expliziten Ansatzes, der nicht nur die Entstehung und das Aussterben, sondern auch die Immigration berücksichtigt, unterstützt eine globale Analyse von Gattungen und Untergattungen mariner Muscheln über die letzten 11 Millionen Jahre ein „Out of the Tropics"-Modell, bei dem Taxa bevorzugt in den Tropen entstehen und sich ohne Verlust ihrer tropischen Präsenz zu den Polen ausdehnen. Die Tropen sind somit sowohl Wiege als auch Museum der biologischen Vielfalt, im Gegensatz zur seit 1974 vorherrschenden konzeptionellen Dichotomie; eine tropische Diversitätskrise hätte daher tiefgreifende evolutionäre Auswirkungen auf allen Breitengraden.

@article{doi101126science1130880,
    author = "Jablonski, David und Roy, Kaustuv und Valentine, James W.",
    title = "Out of the Tropics: Evolutionary Dynamics of the Latitudinal Diversity Gradient",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    abstract = {The evolutionary dynamics underlying the latitudinal gradient in biodiversity have been controversial for over a century. Using a spatially explicit approach that incorporates not only origination and extinction but immigration, a global analysis of genera and subgenera of marine bivalves over the past 11 million years supports an "out of the tropics" model, in which taxa preferentially originate in the tropics and expand toward the poles without losing their tropical presence. The tropics are thus both a cradle and a museum of biodiversity, contrary to the conceptual dichotomy dominant since 1974; a tropical diversity crisis would thus have profound evolutionary effects at all latitudes.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1130880",
    doi = "10.1126/science.1130880",
    openalex = "W2147544980",
    references = "darlington1959area, doi1010160169534794901635, doi101016jtree200409011, doi101017cbo9780511623387, doi10103835012228, doi101086381004, doi101093oso97801985052350010001, doi101146annurevecolsys34012103144032, doi1016660094837320050310192meam20co2, doi101890038006, doi1023072389612, doi105860choice332720"
}

Ökologische Veränderungen in der Phänologie und Verbreitung von Pflanzen und Tieren treten in allen gut untersuchten marinen, Süßwasser- und terrestrischen Gruppen auf. Diese beobachteten Veränderungen sind stark in den von der globalen Erwärmung vorhergesagten Richtungen verzerrt und wurden über Korrelationen zwischen Klima und biologischer Variation, Feld- und Laborversuchen sowie physiologischen Forschungsergebnissen mit lokalem oder regionalem Klimawandel in Verbindung gebracht. Arten mit begrenztem Verbreitungsgebiet, insbesondere polare und Berggipfelarten, zeigen schwere Verbreitungsgebietseinengungen und waren die ersten Gruppen, in denen ganze Arten aufgrund des jüngsten Klimawandels ausgestorben sind. Tropische Korallenriffe und Amphibien wurden am stärksten negativ betroffen. Räuber-Beute- und Pflanzen-Insekten-Interaktionen wurden gestört, wenn interagierende Arten unterschiedlich auf die Erwärmung reagierten. Evolutionäre Anpassungen an wärmere Bedingungen haben im Inneren der Verbreitungsgebiete von Arten stattgefunden, und Ressourcennutzung und Ausbreitung haben sich an den sich ausdehnenden Verbreitungsgrenzen schnell entwickelt. Beobachtete genetische Verschiebungen modulieren lokale Effekte des Klimawandels, aber es gibt wenig Beweise dafür, dass sie negative Effekte auf der Artenebene mildern werden.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110100,
    author = "Parmesan, Camille",
    title = "Ecological and Evolutionary Responses to Recent Climate Change",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Ecological changes in the phenology and distribution of plants and animals are occurring in all well-studied marine, freshwater, and terrestrial groups. These observed changes are heavily biased in the directions predicted from global warming and have been linked to local or regional climate change through correlations between climate and biological variation, field and laboratory experiments, and physiological research. Range-restricted species, particularly polar and mountaintop species, show severe range contractions and have been the first groups in which entire species have gone extinct due to recent climate change. Tropical coral reefs and amphibians have been most negatively affected. Predator-prey and plant-insect interactions have been disrupted when interacting species have responded differently to warming. Evolutionary adaptations to warmer conditions have occurred in the interiors of species' ranges, and resource use and dispersal have evolved rapidly at expanding range margins. Observed genetic shifts modulate local effects of climate change, but there is little evidence that they will mitigate negative effects at the species level.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    openalex = "W2135858501",
    references = "doi1010160169534794902488, doi10103835079180, doi101038369448a0, doi101038382146a0, doi101038386698a0, doi101038nature01286, doi101038nature04095, doi101038nature04246, doi101071mf99078, doi101093aesa492190, doi101126science28954872068, doi101126science2925517673, doi1023071939337, doi1023071940431, doi105860choice301495, openalexw1500291103, openalexw2151235472"
}

@article{doi101016jcell200806030,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evo-Devo und eine sich erweiternde evolutionäre Synthese: Eine genetische Theorie der morphologischen Evolution",
    year = "2008",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.030",
    doi = "10.1016/j.cell.2008.06.030",
    openalex = "W2171193618",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016b9781483227344500176, doi101038276565a0, doi101038376479a0, doi10103841710, doi101038nature02415, doi101038nature03158, doi101038nrg2063, doi101086406830, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200700105x, doi101126science1090005, doi101126science1107239, doi101126science147365368, doi101126science7892602, doi101242dev1212333, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, openalexw591049712, openalexw614012683"
}

@incollection{doi10100797814020965011,
    author = "Favareau, Donald",
    title = "Einleitung: Eine evolutionäre Geschichte der Biosemiotik",
    year = "2009",
    booktitle = "Biosemiotik/Biosemiotik. Bookseries",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4020-9650-1\_1",
    doi = "10.1007/978-1-4020-9650-1\_1",
    openalex = "W2098182790",
    references = "doi101007978140209650112"
}

@article{doi101038nrg3028,
    author = "Danchin, Étienne und Charmantier, Anne und Champagne, Frances A. und Mesoudi, Alex und Pujol, Benoît und Blanchet, Simon",
    title = "Beyond DNA: Integration des inklusiven Erbes in eine erweiterte Theorie der Evolution",
    year = "2011",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3028",
    doi = "10.1038/nrg3028",
    openalex = "W2162016759",
    references = "doi101002evan10110, doi101016jtree200603015, doi101017s0140525x06009083, doi101038374227a0, doi101098rstb20061998, doi101111j15585646201001012x, doi1043249781315801889, doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Biologische Systeme, die mehrere Aufgaben erfüllen, stehen vor einem grundlegenden Kompromiss: Ein gegebener Phänotyp kann bei allen Aufgaben nicht optimal sein. Hier untersuchen wir, wie Kompromisse den Bereich der in der Natur vorkommenden Phänotypen beeinflussen. Unter Verwendung des Konzepts der Pareto-Front aus der Wirtschaftswissenschaft und dem Ingenieurwesen finden wir, dass Phänotypen mit dem besten Kompromiss gewichtete Mittelwerte von Archetypen sind – Phänotypen, die für einzelne Aufgaben spezialisiert sind. Bei zwei Aufgaben liegen Phänotypen auf der Linie, die die beiden Archetypen verbindet, was lineare Merkmalskorrelationen, allometrische Beziehungen sowie bakterielle Genexpressionsmuster erklären könnte. Bei drei Aufgaben liegen Phänotypen innerhalb eines Dreiecks im Phänotyp-Raum, dessen Eckpunkte die Archetypen sind, wie morphologische Studien zeigen, einschließlich Studien an Darwins Finken. Aufgaben können aus gemessenen Phänotypen abgeleitet werden, basierend auf dem Verhalten von Organismen, die den Archetypen am nächsten liegen.

@article{doi101126science1217405,
    author = "Shoval, Oren und Sheftel, Hila und Shinar, Guy und Hart, Yuval und Ramote, Omer und Mayo, Avi und Dekel, E. und Kavanagh, Kathryn D. und Alon, Uri",
    title = "Evolutionäre Kompromisse, Pareto-Optimalität und die Geometrie des Phänotyp-Raums",
    year = "2012",
    journal = "Science",
    abstract = "Biologische Systeme, die mehrere Aufgaben erfüllen, stehen vor einem grundlegenden Kompromiss: Ein gegebener Phänotyp kann bei allen Aufgaben nicht optimal sein. Hier untersuchen wir, wie Kompromisse den Bereich der in der Natur vorkommenden Phänotypen beeinflussen. Unter Verwendung des Konzepts der Pareto-Front aus der Wirtschaftswissenschaft und dem Ingenieurwesen finden wir, dass Phänotypen mit dem besten Kompromiss gewichtete Mittelwerte von Archetypen sind – Phänotypen, die für einzelne Aufgaben spezialisiert sind. Bei zwei Aufgaben liegen Phänotypen auf der Linie, die die beiden Archetypen verbindet, was lineare Merkmalskorrelationen, allometrische Beziehungen sowie bakterielle Genexpressionsmuster erklären könnte. Bei drei Aufgaben liegen Phänotypen innerhalb eines Dreiecks im Phänotyp-Raum, dessen Eckpunkte die Archetypen sind, wie morphologische Studien zeigen, einschließlich Studien an Darwins Finken. Aufgaben können aus gemessenen Phänotypen abgeleitet werden, basierend auf dem Verhalten von Organismen, die den Archetypen am nächsten liegen.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1217405",
    doi = "10.1126/science.1217405",
    openalex = "W2010025771",
    references = "doi101098rstb19870030, openalexw1869415094"
}

Unsere Laborarbeit wird durch Fördergelder BIO2008-00090 des spanischen Ministeriums für Wissenschaft und Innovation sowie KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR) und HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) der Europäischen Union unterstützt.

@article{doi103389fmicb201200001,
    author = "Martínez, José Luis",
    title = "Natürliche Antibiotikaresistenz und Kontamination durch Resistenzdeterminanten: Die zwei Epochen in der Evolution der Resistenz gegen Antimikrobielle",
    year = "2012",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "Unsere Laborarbeit wird durch Fördergelder BIO2008-00090 des spanischen Ministeriums für Wissenschaft und Innovation sowie KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR) und HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) der Europäischen Union unterstützt.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2012.00001",
    doi = "10.3389/fmicb.2012.00001",
    openalex = "W2026352429",
    references = "doi101017s0094837300004310, doi101128mmbr0001610, doi103929ethzb000667478"
}

Ich fasse marine Studien zu plastischen versus adaptiven Reaktionen auf den globalen Wandel zusammen. Aufgrund des Mangels an Zeitreihen konzentriert sich dieser Überblick weitgehend auf das Potenzial für adaptive Evolution bei marinen Tieren und Pflanzen. Die Ansätze waren hauptsächlich synchronische Vergleiche phänotypisch divergenter Populationen, bei denen räumliche Kontraste in Temperatur- oder CO2-Umgebungen für zeitliche Veränderungen substituiert wurden, oder in Bewertungen der adaptiven genetischen Vielfalt innerhalb von Populationen für Merkmale, die unter globalem Wandel wichtig sind. Die verfügbare Literatur ist gegenüber Gastropoden, Krebstieren, Nesseltieren und Makroalgen verzerrt. Fokale Merkmale waren vor allem Umwelttoleranzen, die einem phänotypischen Puffering entsprechen, einem Plastizitätstyp, der ein funktionelles Phänotyp trotz externer Störung aufrechterhält. Fast alle Studien befassen sich mit Küstenarten, die bereits heute Schwankungen in Temperatur, pH-Wert und Sauerstoffgehalt ausgesetzt sind. Empfehlungen für zukünftige Forschung umfassen (i) Initiierung und Analyse von beobachtenden und experimentellen zeitlichen Studien, die diverse phänotypische Merkmale umfassen (einschließlich diapauser Auslöser, Dispersionsmerkmale, Reproduktionszeitpunkt, Morphologie) (ii) Quantifizierung nicht-genetischer trans-generationaler Effekte zusammen mit Komponenten der additiven genetischen Varianz (iii) adaptive Veränderungen in Mikroben-Wirt-Assoziationen unter dem Holobiont-Modell als Reaktion auf den globalen Wandel (iv) Evolution von Plastizitätsmustern unter zunehmend schwankenden Umgebungen und extremen Bedingungen und (v) gemeinsame Berücksichtigung von Demografie und evolutionärer Anpassung in evolutionären Rettungsansätzen.

@article{doi101111eva12109,
    author = "Reusch, Thorsten B. H.",
    title = "Climate change in the oceans: evolutionary versus phenotypically plastic responses of marine animals and plants",
    year = "2013",
    journal = "Evolutionary Applications",
    abstract = "I summarize marine studies on plastic versus adaptive responses to global change. Due to the lack of time series, this review focuses largely on the potential for adaptive evolution in marine animals and plants. The approaches were mainly synchronic comparisons of phenotypically divergent populations, substituting spatial contrasts in temperature or CO2 environments for temporal changes, or in assessments of adaptive genetic diversity within populations for traits important under global change. The available literature is biased towards gastropods, crustaceans, cnidarians and macroalgae. Focal traits were mostly environmental tolerances, which correspond to phenotypic buffering, a plasticity type that maintains a functional phenotype despite external disturbance. Almost all studies address coastal species that are already today exposed to fluctuations in temperature, pH and oxygen levels. Recommendations for future research include (i) initiation and analyses of observational and experimental temporal studies encompassing diverse phenotypic traits (including diapausing cues, dispersal traits, reproductive timing, morphology) (ii) quantification of nongenetic trans-generational effects along with components of additive genetic variance (iii) adaptive changes in microbe-host associations under the holobiont model in response to global change (iv) evolution of plasticity patterns under increasingly fluctuating environments and extreme conditions and (v) joint consideration of demography and evolutionary adaptation in evolutionary rescue approaches.",
    url = "https://doi.org/10.1111/eva.12109",
    doi = "10.1111/eva.12109",
    openalex = "W2071187584",
    references = "doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Evolutionäre Antworten sind erforderlich, damit Baumpopulationen der Klimaveränderung folgen können. Ergebnisse von 250 Jahren gemeinsamen Gartenexperimenten zeigen, dass die meisten Waldbäume eine lokale Anpassung entwickelt haben, wie durch die adaptive Differenzierung von Populationen in quantitativen Merkmalen belegt wird, die die Umweltbedingungen der Ursprungsorte der Populationen widerspiegeln. Basierend auf Mustern quantitativer Variation für 19 anpassungsbezogene Merkmale, die bei 59 Baumarten (meist gemäßigte und boreale Arten aus der nördlichen Hemisphäre) untersucht wurden, stellten wir fest, dass genetische Differenzierung zwischen Populationen und klineale Variation entlang Umweltgradienten sehr häufig sind (bzw. 90 % und 78 % der Fälle). Daher wird die Reaktion auf den Klimawandel wahrscheinlich erfordern, dass die quantitativen Merkmale der Populationen erneut mit ihren Umgebungen übereinstimmen. Wir untersuchen, welche Informationen für die Bewertung des Potenzials zur Reaktion benötigt werden, und welche Informationen bereits verfügbar sind. Wir überblicken die genetischen Modelle im Zusammenhang mit Selektionsantworten und das, was derzeit über die genetische Basis der Merkmale bekannt ist. Wir behandeln spezielle Probleme, die sich an den Randbereichen des Verbreitungsgebiets finden, und betonen die Notwendigkeit weiterer Modellierungen, um spezifische Fragen an den südlichen und nördlichen Rändern zu verstehen. Für weniger bekannte Arten sind neue gemeinsame Gartenexperimente erforderlich. Für umfassend untersuchte Arten sind neue Experimente außerhalb der aktuellen Verbreitungsgebiete notwendig. Die Verbesserung genomischer Informationen wird eine bessere Vorhersage von Reaktionen ermöglichen. Wettbewerbs- und andere Interaktionen innerhalb von Arten sowie Interaktionen zwischen Arten verdienen mehr Beachtung. Trotz der langen Generationszeiten machen der starke Hintergrund in der Populationsgenetik und die wachsenden genomischen Ressourcen Waldbäume zu nützlichen Arten für die Klimaforschung. Die größte adaptive Reaktion ist zu erwarten, wenn Populationen groß sind, eine hohe genetische Variabilität aufweisen, die Selektion stark ist und es ökologische Gelegenheiten für die Etablierung besser angepasster Genotypen gibt.

@article{doi101111gcb12181,
    author = "Alberto, Florian und Aitken, Sally N. und Alı́a, Ricardo und González‐Martínez, Santiago C. und Hänninen, Heikki und Kremer, Antoine und Lefèvre, François und Lenormand, Thomas und Yeaman, Sam und Whetten, Ross und Savolainen, Outi",
    title = "Potential for evolutionary responses to climate change – evidence from tree populations",
    year = "2013",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Evolutionäre Antworten sind erforderlich, damit Baumpopulationen der Klimaveränderung folgen können. Ergebnisse von 250 Jahren gemeinsamen Gartenexperimenten zeigen, dass die meisten Waldbäume eine lokale Anpassung entwickelt haben, wie durch die adaptive Differenzierung von Populationen in quantitativen Merkmalen belegt wird, die die Umweltbedingungen der Ursprungsorte der Populationen widerspiegeln. Basierend auf Mustern quantitativer Variation für 19 anpassungsbezogene Merkmale, die bei 59 Baumarten (meist gemäßigte und boreale Arten aus der nördlichen Hemisphäre) untersucht wurden, stellten wir fest, dass genetische Differenzierung zwischen Populationen und klineale Variation entlang Umweltgradienten sehr häufig sind (bzw. 90\% und 78\% der Fälle). Daher wird die Reaktion auf den Klimawandel wahrscheinlich erfordern, dass die quantitativen Merkmale der Populationen erneut mit ihren Umgebungen übereinstimmen. Wir untersuchen, welche Informationen für die Bewertung des Potenzials zur Reaktion benötigt werden, und welche Informationen bereits verfügbar sind. Wir überblicken die genetischen Modelle im Zusammenhang mit Selektionsantworten und das, was derzeit über die genetische Basis der Merkmale bekannt ist. Wir behandeln spezielle Probleme, die sich an den Randbereichen des Verbreitungsgebiets finden, und betonen die Notwendigkeit weiterer Modellierungen, um spezifische Fragen an den südlichen und nördlichen Rändern zu verstehen. Für weniger bekannte Arten sind neue gemeinsame Gartenexperimente erforderlich. Für umfassend untersuchte Arten sind neue Experimente außerhalb der aktuellen Verbreitungsgebiete notwendig. Die Verbesserung genomischer Informationen wird eine bessere Vorhersage von Reaktionen ermöglichen. Wettbewerbs- und andere Interaktionen innerhalb von Arten sowie Interaktionen zwischen Arten verdienen mehr Beachtung. Trotz der langen Generationszeiten machen der starke Hintergrund in der Populationsgenetik und die wachsenden genomischen Ressourcen Waldbäume zu nützlichen Arten für die Klimaforschung. Die größte adaptive Reaktion ist zu erwarten, wenn Populationen groß sind, eine hohe genetische Variabilität aufweisen, die Selektion stark ist und es ökologische Gelegenheiten für die Etablierung besser angepasster Genotypen gibt.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.12181",
    doi = "10.1111/gcb.12181",
    openalex = "W2152279961",
    references = "doi101111j00221112200400433x, doi101111j14209101200701445x"
}

Unsicherheiten bezüglich der evolutionären Herkunft der epipelagischen Fischfamilie Scombridae (Thunfische und Makrelen) sind ein Symptom der Schwierigkeiten, überfamiliäre Beziehungen innerhalb der Percomorpha zu klären, einer hyperdiversen Teleost-Strahlung, die etwa 17.000 Arten umfasst, die in 13 unklaren Ordnungen und 269 Familien eingeordnet sind. Hier zeigen wir, dass Scombridae eine gemeinsame Abstammung mit 14 Familien aufweisen, basierend auf (i) bioinformatischen Analysen unter Verwendung partieller mitochondrialer und nukleärer Gensequenzen aller Percomorphen, die in GenBank hinterlegt sind (10.733 Sequenzen) und (ii) einer nachfolgenden Mitogenom-Analyse basierend auf 57 Arten aus diesen 15 Ziel-Familien und 67 Ausgruppierungstaxa. Die morphologische Heterogenität unter diesen 15 Familien ist so außergewöhnlich, dass sie in sechs verschiedene perciforme Unterordnungen eingeordnet wurden. Allerdings sind Mitglieder der 15 Familien entweder küsten- oder ozeanisch pelagisch in ihrer Ökologie mit diversen Lebensweisen, was darauf hindeutet, dass sie eine zuvor nicht erkannte adaptive Radiation im pelagischen Bereich darstellen. Zeitkalibrierte Phylogenien legen nahe, dass Scombridae von einem Tiefsee-Vorfahren abstammen und nach dem Ende des Kreidezeits begann, sich auszubreiten, als große räuberische epipelagische Fische selektive Opfer der Kreide-Paläogen-Massenextinktion wurden. Wir benennen diesen Kladus offener Ozean-Fische, der die Scombridae enthält, „Pelagia" als Bezug auf die gemeinsame Habitatpräferenz, die die 15 Familien verbindet.

@article{doi101371journalpone0073535,
    author = "Miya, Masaki und Friedman, Matt und Satoh, Takashi und Takeshima, Hirohiko und Sado, Tetsuya und Iwasaki, Wataru und Yamanoue, Yusuke und Nakatani, Masanori und Mabuchi, Kohji und Inoue, Jun und Poulsen, Jan Yde und Fukunaga, Tsukasa und Sato, Yukuto und Nishida, Mutsumi",
    title = "Evolutionary Origin of the Scombridae (Tunas and Mackerels): Members of a Paleogene Adaptive Radiation with 14 Other Pelagic Fish Families",
    year = "2013",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = {Unsicherheiten bezüglich der evolutionären Herkunft der epipelagischen Fischfamilie Scombridae (Thunfische und Makrelen) sind ein Symptom der Schwierigkeiten, überfamiliäre Beziehungen innerhalb der Percomorpha zu klären, einer hyperdiversen Teleost-Strahlung, die etwa 17.000 Arten umfasst, die in 13 unklaren Ordnungen und 269 Familien eingeordnet sind. Hier zeigen wir, dass Scombridae eine gemeinsame Abstammung mit 14 Familien aufweisen, basierend auf (i) bioinformatischen Analysen unter Verwendung partieller mitochondrialer und nukleärer Gensequenzen aller Percomorphen, die in GenBank hinterlegt sind (10.733 Sequenzen) und (ii) einer nachfolgenden Mitogenom-Analyse basierend auf 57 Arten aus diesen 15 Ziel-Familien und 67 Ausgruppierungstaxa. Die morphologische Heterogenität unter diesen 15 Familien ist so außergewöhnlich, dass sie in sechs verschiedene perciforme Unterordnungen eingeordnet wurden. Allerdings sind Mitglieder der 15 Familien entweder küsten- oder ozeanisch pelagisch in ihrer Ökologie mit diversen Lebensweisen, was darauf hindeutet, dass sie eine zuvor nicht erkannte adaptive Radiation im pelagischen Bereich darstellen. Zeitkalibrierte Phylogenien legen nahe, dass Scombridae von einem Tiefsee-Vorfahren abstammen und nach dem Ende des Kreidezeits begann, sich auszubreiten, als große räuberische epipelagische Fische selektive Opfer der Kreide-Paläogen-Massenextinktion wurden. Wir benennen diesen Kladus offener Ozean-Fische, der die Scombridae enthält, „Pelagia" als Bezug auf die gemeinsame Habitatpräferenz, die die 15 Familien verbindet.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0073535",
    doi = "10.1371/journal.pone.0073535",
    openalex = "W2087061078",
    references = "doi101111j14754983201201165x"
}

In der Ära der erweiterten evolutionären Synthese, die die natürliche Selektion nicht mehr als den einzigen führenden Faktor der Evolution betrachtet, ist es sinnvoll, das Erbe von Biologen zu überdenken, die die Rolle alternativer Faktoren diskutierten. Hier analysieren wir die evolutionären Ansichten von Sergei Meyen (1935-1987), einem Paläobotaniker, der argumentierte, dass die Evolutionstheorie einen „nomothetischen" Ansatz integrieren sollte, der die Gesetze der Morphogenese (d. h. Formbildung) aus den beobachteten Mustern der Variation bei lebenden Organismen und im Fossilbericht ableitet. Meyen entwickelte eine Theorie der „wiederholten polymorphen Mengen" (RPSs), die er konsequent anwandte, um die Variation zwischen Organismen in Populationen, die Variation metamerer Organe innerhalb eines Organismus, die Variation von Anomalien, Heterotopie, Veränderungen während der Embryonalentwicklung und die Variation zwischen Arten innerhalb evolutionärer Linien zu beschreiben. Das Konzept der RPS geht von der aktiven Natur der Organismen aus, die versteckte morphogene und verhaltensbezogene Fähigkeiten besitzen. Meyens Theorie ist mit Darwins natürlicher Selektion vereinbar; jedoch betonte Meyen die Bedeutung anderer Formen der Selektion (z. B. Selektion von Entwicklungsverläufen, Lebensräumen und Verhaltensweisen) bei der Auswahl spezifischer Elemente aus den RPSs. Schließlich entwickelte Meyen ein neues typologisches Konzept der Zeit, bei dem Zeit die Variabilität (d. h. Veränderung) realer Objekte wie lebender Organismen oder geologischer Formationen darstellt.

@article{doi101016jbiosystems201406008,
    author = "Sharov, Alexei A und Igamberdiev, Abir U",
    title = "Inferring directions of evolution from patterns of variation: the legacy of Sergei Meyen.",
    year = "2014",
    journal = "Bio Systems",
    abstract = {In der Ära der erweiterten evolutionären Synthese, die die natürliche Selektion nicht mehr als den einzigen führenden Faktor der Evolution betrachtet, ist es sinnvoll, das Erbe von Biologen zu überdenken, die die Rolle alternativer Faktoren diskutierten. Hier analysieren wir die evolutionären Ansichten von Sergei Meyen (1935-1987), einem Paläobotaniker, der argumentierte, dass die Evolutionstheorie einen „nomothetischen" Ansatz integrieren sollte, der die Gesetze der Morphogenese (d. h. Formbildung) aus den beobachteten Mustern der Variation bei lebenden Organismen und im Fossilbericht ableitet. Meyen entwickelte eine Theorie der „wiederholten polymorphen Mengen" (RPSs), die er konsequent anwandte, um die Variation zwischen Organismen in Populationen, die Variation metamerer Organe innerhalb eines Organismus, die Variation von Anomalien, Heterotopie, Veränderungen während der Embryonalentwicklung und die Variation zwischen Arten innerhalb evolutionärer Linien zu beschreiben. Das Konzept der RPS geht von der aktiven Natur der Organismen aus, die versteckte morphogene und verhaltensbezogene Fähigkeiten besitzen. Meyens Theorie ist mit Darwins natürlicher Selektion vereinbar; jedoch betonte Meyen die Bedeutung anderer Formen der Selektion (z. B. Selektion von Entwicklungsverläufen, Lebensräumen und Verhaltensweisen) bei der Auswahl spezifischer Elemente aus den RPSs. Schließlich entwickelte Meyen ein neues typologisches Konzept der Zeit, bei dem Zeit die Variabilität (d. h. Veränderung) realer Objekte wie lebender Organismen oder geologischer Formationen darstellt.},
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4254149/",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2014.06.008",
    openalex = "W2018299764",
    pmcid = "PMC4254149",
    pmid = "25072709",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101086276408, doi101126science1130880, doi101126science1483671754, doi1015159780691183978018, doi101890039000, doi105694j132653771958tb86500x, doi105962bhltitle27468, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw1869415094"
}

@article{doi101038514161a,
    author = "Laland, Kevin N. und Uller, Tobias und Feldman, Marc und Sterelny, Kim und Müller, Gerd B. und Moczek, Armin P. und Jablonka, Eva und Odling‐Smee, John und Wray, Gregory A. und Hoekstra, Hopi E. und Futuyma, Douglas J. und Lenski, Richard E. und Mackay, Trudy F. C. und Schluter, Dolph und Strassmann, Joan E.",
    title = "Braucht die Evolutionstheorie eine Neubewertung?",
    year = "2014",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/514161a",
    doi = "10.1038/514161a",
    openalex = "W1991285543",
    references = "doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw135071171"
}

@article{doi101038nrg3982,
    author = "Gilbert, Scott F. und Bosch, Thomas C. G. und Ledón‐Rettig, Cristina C.",
    title = "Eco-Evo-Devo: Entwicklungs-Symbiose und entwicklungsbedingte Plastizität als evolutionäre Agenten",
    year = "2015",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3982",
    doi = "10.1038/nrg3982",
    openalex = "W2219314901",
    references = "doi101146annurevmarine120709142753, doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Wissenschaftliche Aktivitäten finden innerhalb strukturierter Mengen von Ideen und Annahmen statt, die ein Feld und seine Praktiken definieren. Das konzeptionelle Rahmenwerk der Evolutionsbiologie entstand mit der modernen Synthese im frühen zwanzigsten Jahrhundert und hat sich seitdem zu einem höchst erfolgreichen Forschungsprogramm entwickelt, um die Prozesse der Diversifizierung und Anpassung zu erforschen. Dennoch wurde die Fähigkeit dieses Rahmens, die raschen Fortschritte in der Entwicklungsbiologie, Genomik und Ökologie zufriedenstellend zu berücksichtigen, in Frage gestellt. Wir überprüfen einige dieser Argumente, wobei wir uns auf Literatur konzentrieren (evo-devo, entwicklungsbedingte Plastizität, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion), deren Implikationen für die Evolution auf zwei Arten interpretiert werden können – eine, die die interne Struktur der gegenwärtigen evolutionären Theorie bewahrt, und eine, die auf ein alternatives konzeptionelles Rahmenwerk hinweist. Letzteres, das wir als 'extended evolutionary synthesis' (EES) bezeichnen, behält die Fundamente der evolutionären Theorie bei, unterscheidet sich jedoch in seiner Betonung der Rolle konstruktiver Prozesse in Entwicklung und Evolution sowie in der gegenseitigen Darstellung von Kausalität. Im EES teilen Entwicklungsprozesse, die über entwicklungsbedingte Verzerrung, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion operieren, die Verantwortung für Richtung und Tempo der Evolution, den Ursprung von Charaktervariation und Organismus-Umwelt-Komplementarität. Wir erläutern die Struktur, Kernannahmen und neuen Vorhersagen des EES und zeigen, wie er eingesetzt werden kann, um Forschung in denjenigen Feldern zu stimulieren und voranzutreiben, die Evolutionsbiologie studieren oder anwenden.

@article{doi101098rspb20151019,
    author = "Laland, Kevin N. und Uller, Tobias und Feldman, Marcus W. und Sterelny, Kim und Müller, Gerd B. und Moczek, Armin P. und Jablonka, Eva und Odling‐Smee, John",
    title = "The extended evolutionary synthesis: its structure, assumptions and predictions",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Wissenschaftliche Aktivitäten finden innerhalb strukturierter Mengen von Ideen und Annahmen statt, die ein Feld und seine Praktiken definieren. Das konzeptionelle Rahmenwerk der Evolutionsbiologie entstand mit der modernen Synthese im frühen zwanzigsten Jahrhundert und hat sich seitdem zu einem höchst erfolgreichen Forschungsprogramm entwickelt, um die Prozesse der Diversifizierung und Anpassung zu erforschen. Dennoch wurde die Fähigkeit dieses Rahmens, die raschen Fortschritte in der Entwicklungsbiologie, Genomik und Ökologie zufriedenstellend zu berücksichtigen, in Frage gestellt. Wir überprüfen einige dieser Argumente, wobei wir uns auf Literatur konzentrieren (evo-devo, entwicklungsbedingte Plastizität, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion), deren Implikationen für die Evolution auf zwei Arten interpretiert werden können – eine, die die interne Struktur der gegenwärtigen evolutionären Theorie bewahrt, und eine, die auf ein alternatives konzeptionelles Rahmenwerk hinweist. Letzteres, das wir als 'extended evolutionary synthesis' (EES) bezeichnen, behält die Fundamente der evolutionären Theorie bei, unterscheidet sich jedoch in seiner Betonung der Rolle konstruktiver Prozesse in Entwicklung und Evolution sowie in der gegenseitigen Darstellung von Kausalität. Im EES teilen Entwicklungsprozesse, die über entwicklungsbedingte Verzerrung, inklusive Vererbung und Nischenkonstruktion operieren, die Verantwortung für Richtung und Tempo der Evolution, den Ursprung von Charaktervariation und Organismus-Umwelt-Komplementarität. Wir erläutern die Struktur, Kernannahmen und neuen Vorhersagen des EES und zeigen, wie er eingesetzt werden kann, um Forschung in denjenigen Feldern zu stimulieren und voranzutreiben, die Evolutionsbiologie studieren oder anwenden.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2015.1019",
    doi = "10.1098/rspb.2015.1019",
    openalex = "W2103794982",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511621123, doi101038218525a0, doi10106313050879, doi101086346135, doi101093auk1002507, doi101093oso97801951223430010001, doi101111j155856461982tb05068x, doi101126science1113832, doi101146annureves01110170000245, doi1015159780691209418, doi1015159781400847266, doi1023071367778, doi1023072260026, doi102307jctvjsf433, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice364478, doi105860choice396411, doi105962bhltitle27468, doi107208chicago97802263088830010001, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw2080618944, openalexw227636185"
}

Die Datierung des Lebensbaums ist ein Kernanliegen der Evolutionsbiologie. Evolutionsraten sind grundlegend für fast jedes Evolutionsmodell und jeden Prozess. Raten benötigen Daten. Es gibt viel Kontroverse über die angemessensten und vernünftigsten Methoden zur Datierung des Lebensbaums, und jüngere Arbeiten haben einige Verwirrungen und Komplexitäten hervorgehoben, die vermieden werden können. Unabhängig davon, ob phylogenetische Bäume nach ihrer Etablierung oder als Teil des Prozesses der Baumfindung datiert werden, müssen Praktiker wissen, welche Kalibrierungen sie verwenden sollen. Wir betonen die Bedeutung der Identifizierung von Kronen- (nicht Stamm-) Fossilien, des Vertrauensniveaus in ihre Zuordnung zur Krone, der aktuellen chronostratigraphischen Präzision, der Primärheit der beherbergenden geologischen Formation und asymmetrischen Vertrauensintervallen. Hier präsentieren wir Kalibrierungen für 88 Schlüsselknoten über die Phylogenie der Tiere, vom Wurzelknoten der Metazoa bis zum letzten gemeinsamen Vorfahren von Homo sapiens. Eine ständige genaue Aufmerksamkeit für Details ist erforderlich: Beispielsweise wurde das klassische Datum für Vögel und Säugetiere (Basis der Kronen-Amniota) oft als 310-315 Ma angegeben; die internationale Zeitskala von 2014 zeigt ein Mindestalter von 318 Ma.

@article{doi1026879424,
    author = "Benton, Michael J. und Donoghue, PCJ und Vinther, Jakob und Asher, RJ und Friedman, Mary M. und Near, Thomas J.",
    title = "Constraints on the timescale of animal evolutionary history",
    year = "2015",
    journal = "Palaeontologia Electronica",
    abstract = "Die Datierung des Lebensbaums ist ein Kernanliegen der Evolutionsbiologie. Evolutionsraten sind grundlegend für fast jedes Evolutionsmodell und jeden Prozess. Raten benötigen Daten. Es gibt viel Kontroverse über die angemessensten und vernünftigsten Methoden zur Datierung des Lebensbaums, und jüngere Arbeiten haben einige Verwirrungen und Komplexitäten hervorgehoben, die vermieden werden können. Unabhängig davon, ob phylogenetische Bäume nach ihrer Etablierung oder als Teil des Prozesses der Baumfindung datiert werden, müssen Praktiker wissen, welche Kalibrierungen sie verwenden sollen. Wir betonen die Bedeutung der Identifizierung von Kronen- (nicht Stamm-) Fossilien, des Vertrauensniveaus in ihre Zuordnung zur Krone, der aktuellen chronostratigraphischen Präzision, der Primärheit der beherbergenden geologischen Formation und asymmetrischen Vertrauensintervallen. Hier präsentieren wir Kalibrierungen für 88 Schlüsselknoten über die Phylogenie der Tiere, vom Wurzelknoten der Metazoa bis zum letzten gemeinsamen Vorfahren von Homo sapiens. Eine ständige genaue Aufmerksamkeit für Details ist erforderlich: Beispielsweise wurde das klassische Datum für Vögel und Säugetiere (Basis der Kronen-Amniota) oft als 310-315 Ma angegeben; die internationale Zeitskala von 2014 zeigt ein Mindestalter von 318 Ma.",
    url = "https://doi.org/10.26879/424",
    doi = "10.26879/424",
    openalex = "W1962669040",
    references = "doi10100703064746897, doi101007978146139246016, doi101007bf02101694, doi101016b9780126709506500187, doi101016b9780444594259000196, doi101016b9780444594259000202, doi101016b9780444594259000214, doi101016b9780444594259000238, doi101016b9780444594259000287, doi101016jpalaeo200703046, doi101016jpalwor200911007, doi101016s0301926899000777, doi101016s096098220900431x, doi101017s0006323199005472, doi101017s0016756811000720, doi101017s1464793102006103, doi101017s1464793105006779, doi101017s1477201906002008, doi101023a1018471324332, doi101038377720a0, doi101038nature01264, doi101038nature03150, doi101038nature05634, doi101038nature06134, doi101038nature06277, doi101038nature06614, doi101038nature07855, doi101038nature08322, doi101038nature09810, doi101038nature09864, doi101038nature10291, doi101038nature13718, doi101073pnas1010350107, doi101073pnas1110395108, doi101073pnas9794469, doi10108002724634198110011886, doi10108002724634199710010948, doi10108002724634199810011114, doi10108010635150590950326, doi10108010635150600755396, doi10108010635150701397635, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19990489, doi101111j109636421995tb00932x, doi101111j10963642200600293x, doi101111j1469185x1999tb00046x, doi101111j1469185x200900094x, doi101111j1469185x201200220x, doi101111j14754983201001019x, doi101111j14754983201201165x, doi101111pala12125, doi101111zoj12111, doi101126science1157704, doi101139e87124, doi1011861471214813208, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012066231, doi101242dev066712, doi101371journalpone0009586, doi101643004585112002002053220co2, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi102307jctt1xp3v3r, doi105252g2010n4a1, doi105281zenodo18028696, doi105860choice320949, doi105860choice355657, doi105860choice405235, doi105860choice432801, doi105860choice503272, doi107312kiel11918, gardiner1989interrelationships, openalexw2898156694, openalexw78894702"
}

Multigen- und genomische Datensätze sind im Bereich der Phylogenie mittlerweile üblich, doch viele bestehende Werkzeuge sind für solche Datensätze nicht konzipiert, was die Analyse oft zeitaufwändig und mühsam macht. Hier stellen wir PhyloSuite vor, eine benutzerfreundliche Workflow-Desktop-Plattform (cross-platform, Open-Source, standalone Python-Grafische Benutzeroberfläche), die sich darauf spezialisiert hat, die Verwaltung molekularer Sequenzdaten und evolutionäre phylogenetische Studien zu vereinfachen. Sie nutzt ein plugin-basiertes System, das mehrere phylogenetische und bioinformatische Werkzeuge integriert und dadurch das gesamte Verfahren von der Datenerfassung bis zur Annotation phylogenetischer Bäume (in Kombination mit iTOL) vereinfacht. Es verfügt über folgende Funktionen: (a) eine grafische Benutzeroberfläche mit Klick-und-Ziehen- und Drag-and-Drop-Funktion; (b) einen Arbeitsplatz zur Verwaltung und Organisation molekularer Sequenzdaten und Analyseergebnisse; (c) Extraktion von GenBank-Einträgen und vergleichende Statistik; und (d) einen phylogenetischen Workflow mit Batch-Verarbeitungsfähigkeit, der Sequenzalignment (mafft und macse), Alignment-Optimierung (trimAl, HmmCleaner und Gblocks), Datensatz-Konkatenation, beste Partitionierungsschemata und beste evolutionäre Modellauswahl (PartitionFinder und modelfinder) sowie phylogenetische Inferenz (MrBayes und iq-tree) umfasst. PhyloSuite ist sowohl für Anfänger als auch für erforschte Forscher konzipiert, wobei es den Erstgenannten ermöglicht, schnell in die phylogenetische Analyse einzusteigen, und den Letzteren erlaubt, ihre Arbeit auf effiziente Weise durchzuführen, zu speichern und zu verwalten, und mehr Zeit für die Untersuchung wissenschaftlicher Fragen zu verwenden, anstatt sie mit dem Übertragen von Dateien von einem Softwareprogramm zum anderen zu verschwenden.

@article{doi1011111755099813096,
    author = "Zhang, Dong und Gao, Fangluan und Jakovlić, Ivan und Zou, Hong und Zhang, Jin und Li, Wen X. und Wang, Gui T.",
    title = "PhyloSuite: Eine integrierte und skalierbare Desktop-Plattform für die effiziente Verwaltung molekularer Sequenzdaten und evolutionäre phylogenetische Studien",
    year = "2019",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "Multigen- und genomische Datensätze sind im Bereich der Phylogenie mittlerweile üblich, doch viele bestehende Werkzeuge sind für solche Datensätze nicht konzipiert, was die Analyse oft zeitaufwändig und mühsam macht. Hier stellen wir PhyloSuite vor, eine benutzerfreundliche Workflow-Desktop-Plattform (cross-platform, Open-Source, standalone Python-Grafische Benutzeroberfläche), die sich darauf spezialisiert hat, die Verwaltung molekularer Sequenzdaten und evolutionäre phylogenetische Studien zu vereinfachen. Sie nutzt ein plugin-basiertes System, das mehrere phylogenetische und bioinformatische Werkzeuge integriert und dadurch das gesamte Verfahren von der Datenerfassung bis zur Annotation phylogenetischer Bäume (in Kombination mit iTOL) vereinfacht. Es verfügt über folgende Funktionen: (a) eine grafische Benutzeroberfläche mit Klick-und-Ziehen- und Drag-and-Drop-Funktion; (b) einen Arbeitsplatz zur Verwaltung und Organisation molekularer Sequenzdaten und Analyseergebnisse; (c) Extraktion von GenBank-Einträgen und vergleichende Statistik; und (d) einen phylogenetischen Workflow mit Batch-Verarbeitungsfähigkeit, der Sequenzalignment (mafft und macse), Alignment-Optimierung (trimAl, HmmCleaner und Gblocks), Datensatz-Konkatenation, beste Partitionierungsschemata und beste evolutionäre Modellauswahl (PartitionFinder und modelfinder) sowie phylogenetische Inferenz (MrBayes und iq-tree) umfasst. PhyloSuite ist sowohl für Anfänger als auch für erforschte Forscher konzipiert, wobei es den Erstgenannten ermöglicht, schnell in die phylogenetische Analyse einzusteigen, und den Letzteren erlaubt, ihre Arbeit auf effiziente Weise durchzuführen, zu speichern und zu verwalten, und mehr Zeit für die Untersuchung wissenschaftlicher Fragen zu verwenden, anstatt sie mit dem Übertragen von Dateien von einem Softwareprogramm zum anderen zu verschwenden.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1755-0998.13096",
    doi = "10.1111/1755-0998.13096",
    openalex = "W2979811825",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nmeth4285, doi10108010635150701472164, doi101093bioinformaticsbtp348, doi101093bioinformaticsbts199, doi101093molbevmst010, doi101093sysbiosys029"
}

Die Weiterentwicklung bayesianischer phylogenetischer Inferenzmethoden hat in den letzten Jahren mit großem Tempo fortgeschritten, wobei in nahezu allen Aspekten der gemeinsamen Modellierung evolutionärer Daten bedeutende neue Fortschritte erzielt wurden. Es wird zunehmend anerkannt, dass einige evolutionäre Fragen nur durch die Kombination von Beweisen aus mehreren unabhängigen Datenquellen adäquat beantwortet werden können, einschließlich Genomsequenzen, Stichprobenzeitpunkten, phänotypischen Daten, Radiokohlenstoffdatierungen, Fossilvorkommen und biogeographischer Verbreitungsdaten unter anderem. Die Einbeziehung aller relevanten Daten in ein einziges gemeinsames Modell ist sowohl konzeptionell als auch rechnerisch sehr herausfordernd. Fortgeschrittene computergestützte Softwarepakete, die eine robuste Entwicklung kompatibler (Sub-)Modelle ermöglichen, die zu einer vollständigen Modellhierarchie zusammengefügt werden können, haben eine Schlüsselrolle in diesen Entwicklungen gespielt. Die Entwicklung solcher Softwarerahmen ist zunehmend eine eigenständige wissenschaftliche Aktivität von erheblicher Bedeutung und bringt spezifische Herausforderungen mit sich, von praktischen Herausforderungen im Software-Design, der Entwicklung und dem Engineering bis hin zu statistischen und konzeptionellen Modellierungsproblemen. BEAST 2 ist eine solche computergestützte Softwareplattform und wurde erstmals vor mehr als 4 Jahren angekündigt. Hier beschreiben wir eine Reihe bedeutender neuer Entwicklungen in der BEAST 2 Kernplattform und Modellhierarchie, die seit der ersten Veröffentlichung der Software stattgefunden haben und in der jüngsten Version 2.5 gipfeln.

@article{doi101371journalpcbi1006650,
    author = "Bouckaert, Remco und Vaughan, Timothy G. und Barido‐Sottani, Joëlle und Duchêne, Sebastián und Fourment, Mathieu und Gavryushkina, Alexandra und Heled, Joseph und Jones, Graham und Kühnert, Denise und Maio, Nicola De und Matschiner, Michael und Mendes, Fábio K. und Müller, Nicola F. und Ogilvie, Huw A. und du Plessis, Louis und Popinga, Alex und Rambaut, Andrew und Rasmussen, David A. und Siveroni, Igor und Suchard, Marc A. und Wu, Chieh‐Hsi und Xie, Dong und Zhang, Chi und Stadler, Tanja und Drummond, Alexei J.",
    title = "BEAST 2.5: Eine fortschrittliche Softwareplattform für bayesianische evolutionäre Analyse",
    year = "2019",
    journal = "PLoS Computational Biology",
    abstract = "Die Weiterentwicklung bayesianischer phylogenetischer Inferenzmethoden hat in den letzten Jahren mit großem Tempo fortgeschritten, wobei in nahezu allen Aspekten der gemeinsamen Modellierung evolutionärer Daten bedeutende neue Fortschritte erzielt wurden. Es wird zunehmend anerkannt, dass einige evolutionäre Fragen nur durch die Kombination von Beweisen aus mehreren unabhängigen Datenquellen adäquat beantwortet werden können, einschließlich Genomsequenzen, Stichprobenzeitpunkten, phänotypischen Daten, Radiokohlenstoffdatierungen, Fossilvorkommen und biogeographischer Verbreitungsdaten unter anderem. Die Einbeziehung aller relevanten Daten in ein einziges gemeinsames Modell ist sowohl konzeptionell als auch rechnerisch sehr herausfordernd. Fortgeschrittene computergestützte Softwarepakete, die eine robuste Entwicklung kompatibler (Sub-)Modelle ermöglichen, die zu einer vollständigen Modellhierarchie zusammengefügt werden können, haben eine Schlüsselrolle in diesen Entwicklungen gespielt. Die Entwicklung solcher Softwarerahmen ist zunehmend eine eigenständige wissenschaftliche Aktivität von erheblicher Bedeutung und bringt spezifische Herausforderungen mit sich, von praktischen Herausforderungen im Software-Design, der Entwicklung und dem Engineering bis hin zu statistischen und konzeptionellen Modellierungsproblemen. BEAST 2 ist eine solche computergestützte Softwareplattform und wurde erstmals vor mehr als 4 Jahren angekündigt. Hier beschreiben wir eine Reihe bedeutender neuer Entwicklungen in der BEAST 2 Kernplattform und Modellhierarchie, die seit der ersten Veröffentlichung der Software stattgefunden haben und in der jüngsten Version 2.5 gipfeln.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1006650",
    doi = "10.1371/journal.pcbi.1006650",
    openalex = "W2901954177",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nature10231, doi101038nature13726, doi101073pnas1319091111, doi101073pnas89178322, doi101080106351501753462876, doi101093acprofoso97801985670280010001, doi101093genetics1551431, doi101093molbevmsp274, doi101093sysbiosyq085, doi101093sysbiosyr047, doi101093sysbiosyv080, doi101093vevey016, doi101098rspa19270118, doi101186147121487214, doi101186s1286201708906, doi1012019780429258411, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpcbi1003537"
}

@incollection{doi101007978303065536513,
    author = "Granovitch, Andrei I.",
    title = "Natural Selection, Morphoprocess and a Logical Field of Evolutionary Concepts",
    year = "2021",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-030-65536-5\_13",
    doi = "10.1007/978-3-030-65536-5\_13",
    openalex = "W3134657069",
    references = "doi101016jbiosystems201406008, doi101016jtree200611004, doi101038nrm2632, doi10106313050879, doi101093genetics16297, doi101093genetics286491, doi101093oso97801951223430010001, doi101098rstb19520012, doi101111j155856461975tb00851x, doi1015159781400820108, openalexw2624262714"
}

@incollection{doi10100797830306553656,
    author = "Ochoa, Carlos",
    title = "The Origins of Theoretical Developmental Genetics: Reinterpreting William Bateson’s Role in the History of Evolutionary Thought",
    year = "2021",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-030-65536-5\_6",
    doi = "10.1007/978-3-030-65536-5\_6",
    openalex = "W3133716585",
    references = "doi101007978303065536513"
}

@article{doi101016jbiosystems2021104454,
    author = "Igamberdiev, Abir U.",
    title = "The drawbridge of nature: Evolutionäre Komplexifizierung als Generierung und neuartige Interpretation von Codierungssystemen",
    year = "2021",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2021.104454",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2021.104454",
    openalex = "W3171803253",
    references = "doi101016jbiosystems2019104063, doi101016jbiosystems2020104279"
}

Die Moderne Synthese (oder „Neo-Darwinismus"), die aus der Versöhnung von Darwins Theorie der natürlichen Selektion und Mendels Forschung zur Genetik hervorging, bleibt das Fundament der Evolutionstheorie. Seit ihrer Entstehung jedoch war sie ein Blitzableiter für Kritik, die von kleinen Einwänden bis zur vollständigen Ablehnung reichte. Zu den bekanntesten Kritikern gehörte Stephen Jay Gould, der 1980 verkündete, die Moderne Synthese sei „effektiv tot". Gould und andere behaupteten, dass die Wirkung der natürlichen Selektion auf zufällige Mutationen allein nicht ausreiche, um Muster der makroevolutionären Vielfalt und Divergenz zu erklären, und dass neue Prozesse erforderlich seien, um Befunde aus dem Fossilbericht zu erklären. 1982 veröffentlichten Charlesworth, Lande und Slatkin eine Antwort auf diese Kritik in Evolution, in der sie argumentierten, dass Neo-Darwinismus tatsächlich ausreiche, um makroevolutionäre Muster zu erklären. In dieser Perspektive zum 75. Jahrestag der Society for the Study of Evolution überblicken wir Charlesworth et al. in ihrem historischen Kontext und bieten moderne Unterstützung für ihre Argumente. Wir betonen die Bedeutung von mikroevolutionären Prozessen in der Erforschung makroevolutionärer Muster. Schließlich kommen wir zu dem Schluss, dass das unterbrochene Gleichgewicht keine große Revolution in der Evolutionsbiologie darstellte – obwohl die Debatte über diesen Punkt erhebliche Forschung anregte und das Feld voranbrachte – und dass Neo-Darwinismus lebendig und wohlbehalten ist.

@article{doi101111evo14268,
    author = "Hancock, Zachary B. und Lehmberg, Emma S. und Bradburd, Gideon S.",
    title = "Neo‐Darwinismus heuchelt weiterhin die evolutionäre Theorie: Eine moderne Perspektive auf Charlesworth, Lande und Slatkin (1982)",
    year = "2021",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Die Moderne Synthese (oder „Neo-Darwinismus"), die aus der Versöhnung von Darwins Theorie der natürlichen Selektion und Mendels Forschung zur Genetik hervorging, bleibt das Fundament der Evolutionstheorie. Seit ihrer Entstehung jedoch war sie ein Blitzableiter für Kritik, die von kleinen Einwänden bis zur vollständigen Ablehnung reichte. Zu den bekanntesten Kritikern gehörte Stephen Jay Gould, der 1980 verkündete, die Moderne Synthese sei „effektiv tot". Gould und andere behaupteten, dass die Wirkung der natürlichen Selektion auf zufällige Mutationen allein nicht ausreiche, um Muster der makroevolutionären Vielfalt und Divergenz zu erklären, und dass neue Prozesse erforderlich seien, um Befunde aus dem Fossilbericht zu erklären. 1982 veröffentlichten Charlesworth, Lande und Slatkin eine Antwort auf diese Kritik in Evolution, in der sie argumentierten, dass Neo-Darwinismus tatsächlich ausreiche, um makroevolutionäre Muster zu erklären. In dieser Perspektive zum 75. Jahrestag der Society for the Study of Evolution überblicken wir Charlesworth et al. in ihrem historischen Kontext und bieten moderne Unterstützung für ihre Argumente. Wir betonen die Bedeutung von mikroevolutionären Prozessen in der Erforschung makroevolutionärer Muster. Schließlich kommen wir zu dem Schluss, dass das unterbrochene Gleichgewicht keine große Revolution in der Evolutionsbiologie darstellte – obwohl die Debatte über diesen Punkt erhebliche Forschung anregte und das Feld voranbrachte – und dass Neo-Darwinismus lebendig und wohlbehalten ist.},
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.14268",
    doi = "10.1111/evo.14268",
    openalex = "W3163859581",
    references = "doi101016jtree200611004, doi101016jtree200901009, doi101017s0094837300005224, doi101093sysbio463523, doi101111j001438202006tb01143x, doi101111j00221112200400433x, doi101128mmbr0001610, doi101146annureves01110170000245, doi1023071438156, doi1023072485224"
}

@incollection{doi10100797830310478319,
    author = "Granovitch, Andrei I.",
    title = "The Morphoprocess and the Diversity of Evolutionary Mechanisms of Metastable Structures",
    year = "2022",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-04783-1\_9",
    doi = "10.1007/978-3-031-04783-1\_9",
    openalex = "W4285188686",
    references = "doi101007978303065536513"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104706,
    author = "Olovnikov, A. M.",
    title = "Eco-crossover, oder umweltregulierter Crossing-over, und natürliche Selektion sind zwei unersetzliche Treiber der adaptiven Evolution: Eco-crossover-Hypothese",
    year = "2022",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104706",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104706",
    openalex = "W4281478058",
    references = "doi101007bf02984069, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jmolcel201806034, doi101016jygeno201601008, doi101017s0094837300005224, doi101038227561a0, doi101038366223a0, doi101038s415800200243y, doi101073pnas1508347112, doi101093auk1002507, doi1015252embj2018100836, doi1023071437764"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104719,
    author = "Shklovskiy-Kordi, Nikita E. und Matsuno, Koichiro und Marijuán, Pedro C. und Lgamberdiev, Abir U",
    title = "Editorial: Grundlegende Prinzipien der biologischen Berechnung: Von molekularer Berechnung bis zur evolutionären Komplexität",
    year = "2022",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104719",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104719",
    openalex = "W4281989749",
    references = "doi101016jbiosystems2022104712"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104779,
    author = "Cottam, Ron und Iurato, Giuseppe und Igamberdiev, Abir U.",
    title = "Fundamentals of evolutionärer Transformationen in biologischen Systemen",
    year = "2022",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104779",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104779",
    openalex = "W4295166759",
    references = "doi101016jbiosystems2021104567, doi101016jbiosystems2022104706"
}

Zusammenfassung Die zielgerichtete Natur der biologischen Evolution wird durch die antizipative Erreichung des Endzustands des Systems verwirklicht, der der Bedingung seiner Perfektion in der Selbsterhaltung und der Anpassungsfähigkeit entspricht. Im Verlauf der individuellen Entwicklung maximiert ein biologisches System seine Leistungsfähigkeit durch synergistische Effekte und wird in der Lage, externe Arbeit am effizientesten zu verrichten. In diesem Zustand, definiert als Stase, wirken robuste, sich selbst erhaltende Konfigurationen als Attraktoren, die gegenüber externen und internen Störungen resistent sind. Dies entspricht den lokalen Energie-Zeit-Beschränkungen, die der integralen Optimierung des gesamten Systems am besten entsprechen. In der Evolution werden wesentliche evolutionäre Übergänge, die neue Zustände der Stase etablieren, durch Codepoiesis erreicht, einen Prozess, bei dem die unentschiedenen Aussagen bestehender Codierungssysteme die Grundlage für die evolutionäre Entfaltung des Systems bilden, indem ihnen neue Werte zugewiesen werden. Die genetische Fixierung dieses makroevolutionären Prozesses führt zu neuen Programmen der individuellen Entwicklung, die den Prozess natürlicher Berechnung repräsentieren. Das Phänomen der Komplexifizierung in der Evolution stellt einen Metasystem-Übergang dar, der zur Maximierung der Leistungsfähigkeit eines Systems und zur Fähigkeit führt, die vom System verrichtete externe Arbeit zu erhöhen.

@article{doi101093biolinneanblac093,
    author = "Igamberdiev, Abir U.",
    title = "Überwindung der Grenzen natürlicher Berechnung in der biologischen Evolution zur Maximierung der Systemeffizienz",
    year = "2022",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Zusammenfassung Die zielgerichtete Natur der biologischen Evolution wird durch die antizipative Erreichung des Endzustands des Systems verwirklicht, der der Bedingung seiner Perfektion in der Selbsterhaltung und der Anpassungsfähigkeit entspricht. Im Verlauf der individuellen Entwicklung maximiert ein biologisches System seine Leistungsfähigkeit durch synergistische Effekte und wird in der Lage, externe Arbeit am effizientesten zu verrichten. In diesem Zustand, definiert als Stase, wirken robuste, sich selbst erhaltende Konfigurationen als Attraktoren, die gegenüber externen und internen Störungen resistent sind. Dies entspricht den lokalen Energie-Zeit-Beschränkungen, die der integralen Optimierung des gesamten Systems am besten entsprechen. In der Evolution werden wesentliche evolutionäre Übergänge, die neue Zustände der Stase etablieren, durch Codepoiesis erreicht, einen Prozess, bei dem die unentschiedenen Aussagen bestehender Codierungssysteme die Grundlage für die evolutionäre Entfaltung des Systems bilden, indem ihnen neue Werte zugewiesen werden. Die genetische Fixierung dieses makroevolutionären Prozesses führt zu neuen Programmen der individuellen Entwicklung, die den Prozess natürlicher Berechnung repräsentieren. Das Phänomen der Komplexifizierung in der Evolution stellt einen Metasystem-Übergang dar, der zur Maximierung der Leistungsfähigkeit eines Systems und zur Fähigkeit führt, die vom System verrichtete externe Arbeit zu erhöhen.",
    url = "https://doi.org/10.1093/biolinnean/blac093",
    doi = "10.1093/biolinnean/blac093",
    openalex = "W4296816592",
    references = "doi1010160022519373901987, doi1010160303264774900318, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jbiosystems2022104706, doi101017s0094837300004310, doi101038nrn2787, doi101073pnas86147, doi101086276408, doi1023072103745, doi1023072412825, doi105860choice294505, openalexw1556913189"
}

Pionier-Naturforscher wie Whewell, Lyell, Humboldt, Darwin und Wallace erkannten die Wechselwirkungen zwischen ökologischen und evolutionären Kräften sowie die Rolle der Kontinentalbewegung, Gebirgsbildung und Klimavariationen bei der Gestaltung von Biodiversitätsmustern. Neue Entwicklungen in der Computermodellierung und der paläoumweltlichen Rekonstruktion ermöglichen es Wissenschaftlern, in silico zu untersuchen, wie Biodiversität aus öko-evolutionären und umweltbedingten dynamischen Prozessen und deren Wechselwirkungen entsteht. Die Simulation emergenter Biodiversität ermöglicht die Experimentation mit mehreren miteinander verbundenen Hypothesen in einer weitgehend fragmentierten wissenschaftlichen Landschaft, mit dem endgültigen Ziel, natürliche Mechanismen erfolgreich zu approximieren (d. h. hypothetische räumlich-zeitlich unbeschränkte Verallgemeinerungen, die über mehrere empirische Biodiversitätsmuster hinweg gelten). Dieser neue interdisziplinäre Ansatz eröffnet beispiellose wissenschaftliche Wege und erleichtert die Kommunikation und Reflexion der kausalen Implikationen komplexer öko-evolutionärer und umweltbedingter Wechselwirkungen. In diesem Überblicksartikel gebe ich einen umfassenden Überblick über die verfügbaren populationsbasierten räumlich expliziten mechanistischen öko-evolutionären Modelle (MEEMs), die auf paläoumweltlichen Rekonstruktionen basieren, und diskutiere kritisch ihre Relevanz und Grenzen für unser Verständnis der Biodiversität. Um dies zu erreichen, stelle ich zunächst diverse Biodiversitätsmodelle vor und setze MEEMs in den Kontext. Zweitens definiere ich MEEMs und fasse die wichtigsten Erkenntnisse aus Studien zusammen, die MEEMs in Kombination mit tiefzeitlichen Umwelt dynamiken (> 0,1 Ma) verwenden. Schließlich diskutiere ich die Herausforderungen und Perspektiven, langjährige Biodiversitäts-Rätsel durch die Kopplung von öko-evolutionären Mechanismen mit tiefzeitlichen Umwelt dynamiken zu lösen. Studien zeigen, dass die Verknüpfung dynamischer Umgebungen und öko-evolutionärer Prozesse notwendig ist, um mehrere großräumige Biodiversitätsmuster gleichzeitig nachzubilden. Mechanismen, die mit Anpassungen (z. B. Nischenentwicklung), Ausbreitungsfähigkeiten und anderen öko-evolutionären Wechselwirkungen (z. B. solche, die zu Artbildungs- oder Aussterbeereignissen führen) zusammenhängen, zeigen universelle Bedeutung, obwohl ihre Signaturen über räumliche und zeitliche Skalen hinweg weitgehend unbekannt bleiben. Untersuchungen mit MEEMS, die mehrere Ebenen der Komplexität in Raum und Zeit umfassen, fördern die interdisziplinäre Zusammenarbeit in den Naturwissenschaften und zeigen vielversprechende Möglichkeiten, einige der Rätsel der Biodiversität der Erde zu lösen.

@article{doi101111ecog06132,
    author = "Hagen, Oskar",
    title = "Kopplung von Öko-Evolution-Mechanismen mit tiefzeitlichen Umwelt dynamiken zum Verständnis von Biodiversitätsmustern",
    year = "2022",
    journal = "Ecography",
    abstract = "Pionier-Naturforscher wie Whewell, Lyell, Humboldt, Darwin und Wallace erkannten die Wechselwirkungen zwischen ökologischen und evolutionären Kräften sowie die Rolle der Kontinentalbewegung, Gebirgsbildung und Klimavariationen bei der Gestaltung von Biodiversitätsmustern. Neue Entwicklungen in der Computermodellierung und der paläoumweltlichen Rekonstruktion ermöglichen es Wissenschaftlern, in silico zu untersuchen, wie Biodiversität aus öko-evolutionären und umweltbedingten dynamischen Prozessen und deren Wechselwirkungen entsteht. Die Simulation emergenter Biodiversität ermöglicht die Experimentation mit mehreren miteinander verbundenen Hypothesen in einer weitgehend fragmentierten wissenschaftlichen Landschaft, mit dem endgültigen Ziel, natürliche Mechanismen erfolgreich zu approximieren (d. h. hypothetische räumlich-zeitlich unbeschränkte Verallgemeinerungen, die über mehrere empirische Biodiversitätsmuster hinweg gelten). Dieser neue interdisziplinäre Ansatz eröffnet beispiellose wissenschaftliche Wege und erleichtert die Kommunikation und Reflexion der kausalen Implikationen komplexer öko-evolutionärer und umweltbedingter Wechselwirkungen. In diesem Überblicksartikel gebe ich einen umfassenden Überblick über die verfügbaren populationsbasierten räumlich expliziten mechanistischen öko-evolutionären Modelle (MEEMs), die auf paläoumweltlichen Rekonstruktionen basieren, und diskutiere kritisch ihre Relevanz und Grenzen für unser Verständnis der Biodiversität. Um dies zu erreichen, stelle ich zunächst diverse Biodiversitätsmodelle vor und setze MEEMs in den Kontext. Zweitens definiere ich MEEMs und fasse die wichtigsten Erkenntnisse aus Studien zusammen, die MEEMs in Kombination mit tiefzeitlichen Umwelt dynamiken (> 0,1 Ma) verwenden. Schließlich diskutiere ich die Herausforderungen und Perspektiven, langjährige Biodiversitäts-Rätsel durch die Kopplung von öko-evolutionären Mechanismen mit tiefzeitlichen Umwelt dynamiken zu lösen. Studien zeigen, dass die Verknüpfung dynamischer Umgebungen und öko-evolutionärer Prozesse notwendig ist, um mehrere großräumige Biodiversitätsmuster gleichzeitig nachzubilden. Mechanismen, die mit Anpassungen (z. B. Nischenentwicklung), Ausbreitungsfähigkeiten und anderen öko-evolutionären Wechselwirkungen (z. B. solche, die zu Artbildungs- oder Aussterbeereignissen führen) zusammenhängen, zeigen universelle Bedeutung, obwohl ihre Signaturen über räumliche und zeitliche Skalen hinweg weitgehend unbekannt bleiben. Untersuchungen mit MEEMS, die mehrere Ebenen der Komplexität in Raum und Zeit umfassen, fördern die interdisziplinäre Zusammenarbeit in den Naturwissenschaften und zeigen vielversprechende Möglichkeiten, einige der Rätsel der Biodiversität der Erde zu lösen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ecog.06132",
    doi = "10.1111/ecog.06132",
    openalex = "W4288050970",
    references = "doi101111ecog05778, doi101111evo14407"
}

Erfolgreiche fundamentale Theorien basieren auf überprüfbaren Prinzipien, die messbare Variablen umfassen. Dieser Artikel zeigt, dass Darwins inklusive Theorie auf solchen Prinzipien basiert und ihren steinigen Weg zu modernen operativen Theorien verfolgt. Neben Reproduktion, Variation und Vererbung umfassen Darwins Bedingungen der Diversifizierung auch das Potenzial für exponentiellen (geometrischen) Populationswachstum und dessen notwendige Begrenztheit. Der Kampf ums Dasein (Malthus-Doktrin), die Prinzipien der natürlichen Selektion, die Konkurrenzausschlussregel (Regel der ähnlichen Checks) und die Divergenz sind bloße Deduktionen aus diesen Bedingungen. Die dynamische Systemtheorie der robusten Koexistenz, die Theorie der adaptiven Dynamik und die erweiterte Evolutionstheorie setzen Darwins inklusive Prinzipien als wesentliche Bestandteile voraus. Die Integration der Rückkopplungen, die das Populationswachstum steuern, und der Kompromisse zwischen Fitnesskomponenten in den Kern der Evolutionstheorie führt zu dem Schluss, dass Diversifizierung ein fundamentales, inhärentes Merkmal des Lebens ist und Gesetze liefert, die die Bestimmung der erwarteten Richtung der Evolution in jedem einzelnen Fall unterstützen.

@misc{doi1032942osfiouh3jq,
    author = "Pásztor, Líz und Meszéna, Géza",
    title = "Stabile Gesetze in einer sich verändernden Welt: Die Struktur evolutionärer Theorien über die Jahrhunderte",
    year = "2022",
    abstract = "Erfolgreiche fundamentale Theorien basieren auf überprüfbaren Prinzipien, die messbare Variablen umfassen. Dieser Artikel zeigt, dass Darwins inklusive Theorie auf solchen Prinzipien basiert und ihren steinigen Weg zu modernen operativen Theorien verfolgt. Neben Reproduktion, Variation und Vererbung umfassen Darwins Bedingungen der Diversifizierung auch das Potenzial für exponentiellen (geometrischen) Populationswachstum und dessen notwendige Begrenztheit. Der Kampf ums Dasein (Malthus-Doktrin), die Prinzipien der natürlichen Selektion, die Konkurrenzausschlussregel (Regel der ähnlichen Checks) und die Divergenz sind bloße Deduktionen aus diesen Bedingungen. Die dynamische Systemtheorie der robusten Koexistenz, die Theorie der adaptiven Dynamik und die erweiterte Evolutionstheorie setzen Darwins inklusive Prinzipien als wesentliche Bestandteile voraus. Die Integration der Rückkopplungen, die das Populationswachstum steuern, und der Kompromisse zwischen Fitnesskomponenten in den Kern der Evolutionstheorie führt zu dem Schluss, dass Diversifizierung ein fundamentales, inhärentes Merkmal des Lebens ist und Gesetze liefert, die die Bestimmung der erwarteten Richtung der Evolution in jedem einzelnen Fall unterstützen.",
    url = "https://doi.org/10.32942/osf.io/uh3jq",
    doi = "10.32942/osf.io/uh3jq",
    openalex = "W4297539941",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Dieses Buch reflektiert Kerntheorien der Evolution in einem historischen und zeitgenössischen Kontext. Es verwendet biologische Modelle, um dies zu tun.

@book{doi1010079783031220289,
    author = "Dickins, Thomas E. und Dickins, Benjamin",
    title = "Evolutionary Biology: Contemporary and Historical Reflections Upon Core Theory",
    year = "2023",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    abstract = "Dieses Buch reflektiert Kerntheorien der Evolution in einem historischen und zeitgenössischen Kontext. Es verwendet biologische Modelle, um dies zu tun.",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-22028-9",
    doi = "10.1007/978-3-031-22028-9",
    openalex = "W4360981572",
    references = "doi101007978303122028911"
}

@incollection{doi101007978303122028911,
    author = "Svensson, Erik",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory: Beyond Neo-Darwinism, Neo-Lamarckism and Biased Historical Narratives About the Modern Synthesis",
    year = "2023",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-22028-9\_11",
    doi = "10.1007/978-3-031-22028-9\_11",
    openalex = "W4360982005",
    references = "doi101007s1206400000046, doi101016jtree200709008, doi101017s0080456800012163, doi101017s0094837300004310, doi101093genetics16297, doi101093oso97801951223430010001, doi101098rspb19790086, doi101111evo14268, doi1015159781400847266, doi102307jctvjsf433, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468"
}

@incollection{doi10100797830313030438,
    author = "Gefaell, Juan und Alejandro, Cristián",
    title = "Inkommensurabilität in der Evolutionsbiologie: Die Kontroverse um die erweiterte evolutionäre Synthese",
    year = "2023",
    booktitle = "Interdisziplinäre Evolutionforschung",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-30304-3\_8",
    doi = "10.1007/978-3-031-30304-3\_8",
    openalex = "W4380342996",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Der Ursprung des Lebens bleibt eines der größten Rätsel der Wissenschaft. Der enorme Sprung in der Komplexität zwischen präbiotischer Suppe und zellulärem Leben stellt historisch „chemie-vordergründige" und „biologie-hintergründige" Ansätze in Frage. Evolution muss diese Lücke in der Komplexität überbrückt haben, sodass das Verständnis von Faktoren, die evolutionäre Ergebnisse beeinflussen, entscheidend für die Erforschung des Entstehens des Lebens ist. Hier überblicken wir Erkenntnisse aus Ökologie und Evolution und deren Anwendung während der Abiogenese. Insbesondere diskutieren wir, wie ökologische und evolutionäre Einschränkungen die Evolution biologischer Innovationen formen. Wir schlagen einen „eco-evolutionary"-Ansatz vor, der gegenüber bestimmten Chemien oder Umgebungen agnostisch ist und stattdessen die verschiedenen Wege untersucht, auf denen ein evolvierbares System entstehen und Komplexität gewinnen kann.

@article{doi101093evolutqpad195,
    author = "Kalambokidis, Maria und Travisano, Michael",
    title = "The eco-evolutionary origins of life",
    year = "2023",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Der Ursprung des Lebens bleibt eines der größten Rätsel der Wissenschaft. Der enorme Sprung in der Komplexität zwischen präbiotischer Suppe und zellulärem Leben stellt historisch „chemie-vordergründige" und „biologie-hintergründige" Ansätze in Frage. Evolution muss diese Lücke in der Komplexität überbrückt haben, sodass das Verständnis von Faktoren, die evolutionäre Ergebnisse beeinflussen, entscheidend für die Erforschung des Entstehens des Lebens ist. Hier überblicken wir Erkenntnisse aus Ökologie und Evolution und deren Anwendung während der Abiogenese. Insbesondere diskutieren wir, wie ökologische und evolutionäre Einschränkungen die Evolution biologischer Innovationen formen. Wir schlagen einen „eco-evolutionary"-Ansatz vor, der gegenüber bestimmten Chemien oder Umgebungen agnostisch ist und stattdessen die verschiedenen Wege untersucht, auf denen ein evolvierbares System entstehen und Komplexität gewinnen kann.},
    url = "https://doi.org/10.1093/evolut/qpad195",
    doi = "10.1093/evolut/qpad195",
    openalex = "W4388410145",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Traditionell als die Wissenschaft vom Leben definiert oder als das Feld, das über anatomische Strukturen und Körperformen hinaus funktionale Organisation und Verhalten untersucht, wurde die Physiologie lange Zeit von der evolutionären Forschung ausgeschlossen. Der Hauptgrund für diesen Ausschluss ist, dass die Physiologie eine gegenwarts- und zukunftsorientierte Sicht auf das Leben hat, während die Evolutionstheorie traditionell als die Erforschung der Naturgeschichte definiert wird. In diesem Artikel bewerte ich diese klassischen wissenschaftlichen Einteilungen neu und ordne die Physiologie in die Geschichte der evolutionären Wissenschaften sowie in Debatten über die erweiterte evolutionäre Synthese und die Notwendigkeit eines Dritten Weges der Evolution ein. Anschließend zeige ich kurz auf, wie die evolutionäre Physiologie insbesondere zur Forschung zu Funktion, Kausalität, Teleonomie, Agency und Kognition beiträgt.

@article{doi101113jp284410,
    author = "Gontier, Nathalie",
    title = "Situating physiology within evolutionary theory",
    year = "2023",
    journal = "The Journal of Physiology",
    abstract = "Traditionell als die Wissenschaft vom Leben definiert oder als das Feld, das über anatomische Strukturen und Körperformen hinaus funktionale Organisation und Verhalten untersucht, wurde die Physiologie lange Zeit von der evolutionären Forschung ausgeschlossen. Der Hauptgrund für diesen Ausschluss ist, dass die Physiologie eine gegenwarts- und zukunftsorientierte Sicht auf das Leben hat, während die Evolutionstheorie traditionell als die Erforschung der Naturgeschichte definiert wird. In diesem Artikel bewerte ich diese klassischen wissenschaftlichen Einteilungen neu und ordne die Physiologie in die Geschichte der evolutionären Wissenschaften sowie in Debatten über die erweiterte evolutionäre Synthese und die Notwendigkeit eines Dritten Weges der Evolution ein. Anschließend zeige ich kurz auf, wie die evolutionäre Physiologie insbesondere zur Forschung zu Funktion, Kausalität, Teleonomie, Agency und Kognition beiträgt.",
    url = "https://doi.org/10.1113/jp284410",
    doi = "10.1113/jp284410",
    openalex = "W4387050144",
    references = "doi101093biolinneanblac093"
}

Dieser Aufsatz versucht, einige jüngere theoretische Ergebnisse in der (Bio-)Semiotik über Willkürlichkeit, semiotische Passform, Umwelt, Wahl und erweiterte Evolutionstheorie zu einem kohärenten Ganzen zu verbinden. Das vorgeschlagene Modell beschreibt ein Lebewesen durch seine Subjektivität und die Fähigkeit, Bedeutung zu schaffen, die in Modellen, die auf Reproduzierbarkeit basieren, oft übersehen werden. Das Konzept der Umwelt wird in zwei Teile geteilt – die synchronische Umwelt und die verteilte oder diachronische Umwelt. Für letztere wird ein neuer Begriff „umweb" eingeführt. Es wird ein Evolutionsmechanismus beschrieben, bei dem willkürliches Verknüpfen gefolgt von semiotischer Passform in gewisser Weise dem neodarwinistischen Mechanismus zufälliger Mutationen gefolgt von natürlicher Selektion analog ist. Der Artikel geht darauf ein, die Alternativität und Koexistenz dieser zwei radikal unterschiedlichen Wege der Evolution und des Lernens zu diskutieren.

@article{doi1012697sss202351108,
    author = "Kull, Kalevi",
    title = "Weitergehende Überlegungen zur Semiose in der Evolution: Willkürlichkeit plus semiotische Passform, und/oder Veränderbarkeit plus natürliche Selektion",
    year = "2023",
    journal = "Sign Systems Studies",
    abstract = "Dieser Aufsatz versucht, einige jüngere theoretische Ergebnisse in der (Bio-)Semiotik über Willkürlichkeit, semiotische Passform, Umwelt, Wahl und erweiterte Evolutionstheorie zu einem kohärenten Ganzen zu verbinden. Das vorgeschlagene Modell beschreibt ein Lebewesen durch seine Subjektivität und die Fähigkeit, Bedeutung zu schaffen, die in Modellen, die auf Reproduzierbarkeit basieren, oft übersehen werden. Das Konzept der Umwelt wird in zwei Teile geteilt – die synchronische Umwelt und die verteilte oder diachronische Umwelt. Für letztere wird ein neuer Begriff „umweb" eingeführt. Es wird ein Evolutionsmechanismus beschrieben, bei dem willkürliches Verknüpfen gefolgt von semiotischer Passform in gewisser Weise dem neodarwinistischen Mechanismus zufälliger Mutationen gefolgt von natürlicher Selektion analog ist. Der Artikel geht darauf ein, die Alternativität und Koexistenz dieser zwei radikal unterschiedlichen Wege der Evolution und des Lernens zu diskutieren.",
    url = "https://doi.org/10.12697/sss.2023.51.1.08",
    doi = "10.12697/sss.2023.51.1.08",
    openalex = "W4378233472",
    references = "doi101007978303122028911"
}

@article{doi101016jbiosystems2024105383,
    author = "Melkikh, Alexey V.",
    title = "The problem of evolutionary directionality 50 years following the works of Sergei Meyen",
    year = "2024",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2024.105383",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2024.105383",
    openalex = "W4405531738",
    references = "doi101007bf02983073, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jplrev201307001, doi101038s41467018054455, doi101038s41586021042696, doi101073pnas0500398102, doi101073pnas1120658109, doi101096fj201500083, doi101126science13434891501, doi101186gb20131410r115, openalexw4207021716"
}

Falls es in der Evolutionstheorie ein fragwürdiges Element gibt, so ist dies wahrscheinlich die Zufälligkeit von Mutationen, die als primäre Quelle des evolutionären Wandels angesehen wird. Die Vorstellung, dass Fehler in DNA-Sequenzen die Quelle des Artenwandels sind, scheint vielen Wissenschaftlern und Philosophen nicht akzeptabel. Nach ihrer Meinung ist eine adaptive Evolution, die nahelegt, dass bestimmte Mutationen absichtlich auftreten, möglich. Beide Ansichten scheinen wissenschaftlich haltbar. Allerdings schließt die Wissenschaft typischerweise Zwecke aus, insbesondere aufgrund ihrer Implikationen für das Übernatürliche. Daher betrifft das philosophische Problem hier, welches metaphysische Rahmenwerk die natürliche Welt besser erklären würde, in der Zwecke wirken, unter der Annahme, dass die adaptive Evolution real ist. In diesem Artikel schlage ich Panpsychismus als Kandidaten für eine solche Erklärung vor. Obwohl Panpsychismus eine bekannte metaphysische Sichtweise ist, wurde er selten mit Evolution in Verbindung gebracht. Panpsychismus besagt einfach, dass alle tatsächlichen natürlichen Entitäten eine Form von Mentalität besitzen, die intrinsisch mit Materie verbunden ist. Mentalität muss auf der grundlegendsten Ebene der Existenz vorhanden sein, um sich in jeder höheren Form zu manifestieren. Diese Idee des Panpsychismus, wonach sich Mentalität schrittlich entwickelt, ist bereits mit der traditionellen Evolutionstheorie vereinbar, wonach sich Arten langsam und inkrementell durch kleine Schritte verändern. Dennoch fordert die Hypothese der adaptiven Evolution mehr. Die Idee, dass Organismen ihre eigene DNA als Reaktion auf Umweltbedingungen verändern können, impliziert, dass dieser Prozess freiwillig und kontrolliert abläuft. Allerdings tritt Anpassung nicht immer freiwillig auf, und ein solches Verständnis wird schwer akzeptabel, da es höheren kognitiven Funktionen wie Wählen, Wille und Entscheidungsfindung Zellen und Molekülen zuschreibt. Daher ist ein natürlicherer Ansatz erforderlich. Panpsychismus kann viele Formen annehmen, wie dualistischer Panpsychismus oder idealistischer Panpsychismus. Ich schlage dual-aspect Panpsychismus als eine vollständig naturalistische Version dieses Konzepts vor. Demnach sind Mentalität und Physische zwei Aspekte derselben Sache oder des selben Stoffs. Genau wie es keine mentale Kausalität vom Mentalen zum Physischen gibt, gibt es auch keine physische Kausalität vom Physischen zum Mentalen. Es gibt Prozesse oder Ereignisse, die sich als physische Geschehnisse manifestieren, wenn sie von außen beobachtet werden, und als mentale Geschehnisse, wenn sie von innen erlebt werden. Zusammen mit einer Interpretation des dual-aspect Panpsychismus, die mit Physicalismus vereinbar ist, und wenn wir akzeptieren, dass der plausibelste Weg, Mentalität auf alle tatsächlichen Entitäten auszudehnen, darin besteht, sie als Intentionalität zu betrachten, könnte es noch einfacher werden, die adaptive Evolution in einen naturalistischen Rahmen einzuordnen. Nicht-zufällige Mutationen treten nicht als mentale Handlungen der Wahl auf, sondern entstehen aus dem Verhalten des Organismus, das sich auf oder auf selektive Umweltbedingungen gerichtet ist, um das Überleben zu gewährleisten. Der Artikel besteht aus zwei Hauptteilen. Der erste Teil sucht danach, die Möglichkeit zu begründen, dass einige Mutationen nicht zufällig sein können, auf einer wissenschaftlich-philosophischen Grundlage. Der zweite Teil zielt darauf ab, die Vereinbarkeit dieser Möglichkeit mit dem dual-aspect Panpsychismus zu zeigen. Als Ergebnis wird gehofft, dass eine akzeptable Interpretation der Evolutionstheorie, kombiniert mit einer naturalistischen Interpretation des Panpsychismus, zu einer fruchtbaren Synthese führen wird, die die scheinbar zweckmäßigen Handlungen von Zellen und Organismen erklärt.

@article{doi1014395hid1521378,
    author = "ONUR, Ferhat",
    title = "Eine panpsychistische Interpretation der Evolutionstheorie",
    year = "2024",
    journal = "Hitit İlahiyat Dergisi",
    abstract = "Wenn es in der Evolutionstheorie ein fragwürdiges Element gibt, dann ist dies wahrscheinlich die Zufälligkeit von Mutationen, die als primäre Quelle des evolutionären Wandels angesehen wird. Die Vorstellung, dass Fehler in DNA-Sequenzen die Quelle des Artenwandels sind, scheint vielen Wissenschaftlern und Philosophen nicht akzeptabel. Nach ihrer Meinung ist eine adaptive Evolution möglich, die vorschlägt, dass einige Mutationen absichtlich auftreten. Beide Ansichten scheinen wissenschaftlich haltbar. Allerdings schließt die Wissenschaft typischerweise Zwecke aus, insbesondere aufgrund ihrer Implikationen für das Übernatürliche. Das philosophische Problem besteht daher darin, welches metaphysische Rahmenwerk eine natürliche Welt besser erklären würde, in der Zwecke wirken, unter der Annahme, dass die adaptive Evolution real ist. In diesem Artikel schlage ich Panpsychismus als Kandidaten für eine solche Erklärung vor. Obwohl Panpsychismus eine bekannte metaphysische Sichtweise ist, wurde er selten mit Evolution in Verbindung gebracht. Panpsychismus besagt einfach, dass alle tatsächlichen natürlichen Entitäten eine Form von Mentalität besitzen, die der Materie inhärent ist. Mentalität muss auf der grundlegendsten Ebene der Existenz vorhanden sein, um sich in jeder höheren Form zu manifestieren. Diese Idee des Panpsychismus, wonach sich Mentalität schrittlich entwickelt, ist bereits mit der traditionellen Evolutionstheorie vereinbar, wonach sich Arten langsam und inkrementell durch kleine Schritte verändern. Dennoch fordert die Hypothese der adaptiven Evolution mehr. Die Vorstellung, dass Organismen ihre eigene DNA als Reaktion auf Umweltbedingungen verändern können, impliziert, dass dieser Prozess freiwillig und kontrolliert abläuft. Allerdings tritt Anpassung nicht immer freiwillig auf, und ein solches Verständnis wird schwer akzeptabel, da es höheren kognitiven Funktionen wie Wählen, Wille und Entscheidungsfindung Zellen und Molekülen zuschreibt. Daher ist ein natürlicherer Ansatz erforderlich. Panpsychismus kann viele Formen annehmen, wie dualistischer Panpsychismus oder idealistischer Panpsychismus. Ich schlage dual-aspect Panpsychismus als eine vollständig naturalistische Version dieses Konzepts vor. Demnach sind Mentalität und Physische zwei Aspekte derselben Sache oder desselben Stoffs. Genau wie es keine mentale Kausalität vom Mentalen zum Physischen gibt, gibt es auch keine physische Kausalität vom Physischen zum Mentalen. Es gibt Prozesse oder Ereignisse, die sich von außen betrachtet als physische Geschehnisse und von innen erlebt als mentale Geschehnisse manifestieren. Zusammen mit einer Interpretation des dual-aspect Panpsychismus, die mit Physicalismus vereinbar ist, und wenn wir annehmen, dass der plausibelste Weg, Mentalität auf alle tatsächlichen Entitäten auszudehnen, darin besteht, sie als Intentionalität zu betrachten, könnte es noch einfacher werden, die adaptive Evolution in einen naturalistischen Rahmen einzuordnen. Nicht-zufällige Mutationen treten nicht als mentale Handlungen der Wahl auf, sondern entstehen aus dem Verhalten des Organismus, das sich auf oder auf selektive Umweltbedingungen ausgerichtet ist, um das Überleben zu gewährleisten. Der Artikel besteht aus zwei Hauptteilen. Der erste Teil sucht nach der Möglichkeit, dass einige Mutationen nicht zufällig sein können, auf einer wissenschaftlich-philosophischen Grundlage. Der zweite Teil zielt darauf ab, die Vereinbarkeit dieser Möglichkeit mit dem dual-aspect Panpsychismus zu zeigen. Als Ergebnis wird erwartet, dass eine akzeptable Interpretation der Evolutionstheorie, kombiniert mit einer naturalistischen Interpretation des Panpsychismus, zu einer fruchtbaren Synthese führt, die die scheinbar zielgerichteten Handlungen von Zellen und Organismen erklärt.",
    url = "https://doi.org/10.14395/hid.1521378",
    doi = "10.14395/hid.1521378",
    openalex = "W4405793730",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Die Evolutionäre Biologie wurde zuvor als historische Wissenschaft betrachtet, bei der Vorhersagen über evolutionäre Trajektorien als nahezu unmöglich galten. Die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierung und Datenanalyse-Technologien hat diese Überzeugung herausgefordert und eine Fülle von Daten bereitgestellt, die neue Einblicke in evolutionäre Prozesse liefern. Evolutionäre Vorhersagen werden zunehmend genutzt, um grundlegendes Wissen über sich entwickelnde Systeme zu entwickeln und/oder evolutionäre Kontrolle zu demonstrieren. Hier untersuchen wir die Faktoren, die die Wahrscheinlichkeit der evolutionären Wiederholbarkeit erhöhen oder verringern und damit die Genauigkeit evolutionärer Vorhersagen beeinflussen. Wir identifizieren herausragende Fragen und bieten einen potenziellen Ausgangspunkt, um zu bestimmen, wie die evolutionäre Wiederholbarkeit durch genetische Verwandtschaft beeinflusst wird.

@article{doi103389fevo20241335452,
    author = "Pearless, Stella M. und Freed, Nikki E.",
    title = "Unravelling the factors of evolutionary repeatability: insights and perspectives on predictability in evolutionary biology",
    year = "2024",
    journal = "Frontiers in Ecology and Evolution",
    abstract = "Die Evolutionäre Biologie wurde zuvor als historische Wissenschaft betrachtet, bei der Vorhersagen über evolutionäre Trajektorien als nahezu unmöglich galten. Die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierung und Datenanalyse-Technologien hat diese Überzeugung herausgefordert und eine Fülle von Daten bereitgestellt, die neue Einblicke in evolutionäre Prozesse liefern. Evolutionäre Vorhersagen werden zunehmend genutzt, um grundlegendes Wissen über sich entwickelnde Systeme zu entwickeln und/oder evolutionäre Kontrolle zu demonstrieren. Hier untersuchen wir die Faktoren, die die Wahrscheinlichkeit der evolutionären Wiederholbarkeit erhöhen oder verringern und damit die Genauigkeit evolutionärer Vorhersagen beeinflussen. Wir identifizieren herausragende Fragen und bieten einen potenziellen Ausgangspunkt, um zu bestimmen, wie die evolutionäre Wiederholbarkeit durch genetische Verwandtschaft beeinflusst wird.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fevo.2024.1335452",
    doi = "10.3389/fevo.2024.1335452",
    openalex = "W4395036902",
    references = "doi101038nature04742, doi101038nrg2626, doi101038nrmicro3380, doi101093genetics14841667, doi101093oso97801985464120010001, doi101111evo14268, doi101111j1469185x201100216x, doi101126science959840, doi105860choice273873, doi105962bhltitle68064, doi107312simp92414"
}

Efim Liberman (1925-2011) führte 1972 die Idee der natürlichen Berechnung ein, die von lebenden Systemen intern realisiert wird. Er betrachtete die physikalischen Prinzipien, die von lebenden Systemen angewendet werden, als wesentliche Beschränkungen, die den Berechnungsprozess begrenzen, der im Verlauf der Anpassung, der Morphogenese und der neuronalen Aktivität stattfindet. Die allgemeinsten Grenzen, die durch die physikalischen Grundkonstanten bestimmt werden, sind für die gesamte Natur universell. Die spezifischeren Beschränkungen sind jedoch jedem biologischen System eigen und können im Laufe des evolutionären Prozesses überwunden werden. Wir diskutieren die Rollen biologischer Makromoleküle, insbesondere des Zytoskeletts, bei der Gestaltung der Realisierungsmuster, die im internen Messprozess, der in lebenden Systemen stattfindet, gebildet werden. Zytoskelett-Umordnungen bestimmen zelluläre, morphogenetische und wahrnehmungsbezogene Transformationen in lebenden Systemen und nehmen an kombinatorischen genetischen Ereignissen teil, die zu evolutionären Transformationen führen. Die Funktion von Neuronen basiert auf der Signalübertragung über das Zytoskelett, wobei ein digitales Ausgangssignal erzeugt wird, das durch eine reflexive Handlung des wahrnehmenden Agents decodiert werden kann. Es wird geschlossen, dass die Prinzipien der natürlichen Berechnung, die von Liberman formuliert wurden, das grundlegendste Merkmal von Lebewesen darstellen und die Grundlage für die allgemeine Theorie biologischer Systeme bilden, mit wesentlichen Konsequenzen für das Verständnis des metabolischen Schließens, der Morphogenese, der Evolution und des Bewusstseins.

@article{doi101016jbiosystems2025105451,
    author = "Igamberdiev, Abir U. und Shklovskiy-Kordi, Nikita E.",
    title = "Physikalische Grenzen natürlicher Berechnung als biologische Beschränkungen der Morphogenese, der Evolution und des Bewusstseins: Zum 100. Geburtstag von Efim Liberman (1925–2011)",
    year = "2025",
    journal = "Biosystems",
    abstract = "Efim Liberman (1925-2011) führte 1972 die Idee der natürlichen Berechnung ein, die von lebenden Systemen intern realisiert wird. Er betrachtete die physikalischen Prinzipien, die von lebenden Systemen angewendet werden, als wesentliche Beschränkungen, die den Berechnungsprozess begrenzen, der im Verlauf der Anpassung, der Morphogenese und der neuronalen Aktivität stattfindet. Die allgemeinsten Grenzen, die durch die physikalischen Grundkonstanten bestimmt werden, sind für die gesamte Natur universell. Die spezifischeren Beschränkungen sind jedoch jedem biologischen System eigen und können im Laufe des evolutionären Prozesses überwunden werden. Wir diskutieren die Rollen biologischer Makromoleküle, insbesondere des Zytoskeletts, bei der Gestaltung der Realisierungsmuster, die im internen Messprozess, der in lebenden Systemen stattfindet, gebildet werden. Zytoskelett-Umordnungen bestimmen zelluläre, morphogenetische und wahrnehmungsbezogene Transformationen in lebenden Systemen und nehmen an kombinatorischen genetischen Ereignissen teil, die zu evolutionären Transformationen führen. Die Funktion von Neuronen basiert auf der Signalübertragung über das Zytoskelett, wobei ein digitales Ausgangssignal erzeugt wird, das durch eine reflexive Handlung des wahrnehmenden Agents decodiert werden kann. Es wird geschlossen, dass die Prinzipien der natürlichen Berechnung, die von Liberman formuliert wurden, das grundlegendste Merkmal von Lebewesen darstellen und die Grundlage für die allgemeine Theorie biologischer Systeme bilden, mit wesentlichen Konsequenzen für das Verständnis des metabolischen Schließens, der Morphogenese, der Evolution und des Bewusstseins.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2025.105451",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2025.105451",
    openalex = "W4408252251",
    references = "doi101016jbiosystems2022104706, doi101093biolinneanblac093, doi101093biolinneanblad037"
}

Dieser Aufsatz untersucht Agency, also Verhalten, das einem Organismus eigen ist und von ihm initiiert wird, im Zusammenhang mit der Entwicklung mehrzelliger Organismen und deren Evolution. Wir fragen, wie agentives Verhalten zur Evolution beiträgt und sich gemeinsam mit evolutionären Übergängen von der Einzelligkeit zur Multizellularität verändert, einschließlich der Evolution von Tieren von ihren nächsten einzelligen Vorfahren. Wir betrachten den Zusammenhang zwischen organisatorischen Eigenschaften und der Agency mehrzelliger Organismen und kommen überraschenderweise zu dem Schluss, dass dieser nicht so streng ist wie bei einzelnen Zellen. Die Hauptgründe dafür sind zuvor nicht anerkannte morphogenetische Eigenheiten mehrzelliger Materie und die Fähigkeit der Entwicklung, Funktionalitäten der konstituierenden Zellen zu verstärken und zu partitionieren. Diese Modalitäten erzeugen neue phänotypische Ermöglichungen, die den Umfang des agentiven Verhaltens erweitern. Wir diskutieren experimentelle Ansätze, um zwischen Agency und evolvierten, stereotypen Verhaltensweisen von Organismen, einschließlich absichtlicher Handlungen, zu unterscheiden. Wir argumentieren, dass die evolvierten Komplexitäten der Tierentwicklung sie ungeeignet machen, um einzelne Zell-zu-Multizellular-Transformationen in der Agency experimentell zu erforschen. Wir lenken unsere Aufmerksamkeit stattdessen auf die Agency in den Lebenszyklen von sozialen Bakterien und Amöben sowie auf die Übergänge zwischen mehrzelligen und einzelligen Zuständen bei Krebs. Schließlich diskutieren wir mathematische Darstellungen von unvollständig spezifizierten dynamischen Systemen und wie sie verwendet werden können, um biologische Autonomie und Agency zu charakterisieren.

@article{doi101086735964,
    author = "Newman, Stuart A. und Benítez, Mariana und Bhat, Ramray und Glimm, Tilmann und Kumar, K. Vijay und Nanjundiah, Vidyanand und Nicholson, Daniel J. und Sarkar, Sahotra",
    title = "Agency in the Evolutionary Transition to Multicellularity",
    year = "2025",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Dieser Aufsatz untersucht Agency, also Verhalten, das einem Organismus eigen ist und von ihm initiiert wird, im Zusammenhang mit der Entwicklung mehrzelliger Organismen und deren Evolution. Wir fragen, wie agentives Verhalten zur Evolution beiträgt und sich gemeinsam mit evolutionären Übergängen von der Einzelligkeit zur Multizellularität verändert, einschließlich der Evolution von Tieren von ihren nächsten einzelligen Vorfahren. Wir betrachten den Zusammenhang zwischen organisatorischen Eigenschaften und der Agency mehrzelliger Organismen und kommen überraschenderweise zu dem Schluss, dass dieser nicht so streng ist wie bei einzelnen Zellen. Die Hauptgründe dafür sind zuvor nicht anerkannte morphogenetische Eigenheiten mehrzelliger Materie und die Fähigkeit der Entwicklung, Funktionalitäten der konstituierenden Zellen zu verstärken und zu partitionieren. Diese Modalitäten erzeugen neue phänotypische Ermöglichungen, die den Umfang des agentiven Verhaltens erweitern. Wir diskutieren experimentelle Ansätze, um zwischen Agency und evolvierten, stereotypen Verhaltensweisen von Organismen, einschließlich absichtlicher Handlungen, zu unterscheiden. Wir argumentieren, dass die evolvierten Komplexitäten der Tierentwicklung sie ungeeignet machen, um einzelne Zell-zu-Multizellular-Transformationen in der Agency experimentell zu erforschen. Wir lenken unsere Aufmerksamkeit stattdessen auf die Agency in den Lebenszyklen von sozialen Bakterien und Amöben sowie auf die Übergänge zwischen mehrzelligen und einzelligen Zuständen bei Krebs. Schließlich diskutieren wir mathematische Darstellungen von unvollständig spezifizierten dynamischen Systemen und wie sie verwendet werden können, um biologische Autonomie und Agency zu charakterisieren.",
    url = "https://doi.org/10.1086/735964",
    doi = "10.1086/735964",
    openalex = "W4410763737",
    references = "doi101007s13752024004717, doi1010179781108616751"
}

@article{doi101093evolutqpaf036,
    author = "Bailey, Nick",
    title = "Schritte zu einer vereinheitlichten „evolutionären Genomik”",
    year = "2025",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1093/evolut/qpaf036",
    doi = "10.1093/evolut/qpaf036",
    openalex = "W4407796936",
    references = "doi101007978303122028911"
}