Forstwirtschaft

@article{brown1943some1,
    author = "Brown, R. W",
    title = "Some prehistoric trees of the United States",
    year = "1943",
    journal = "Journal of Forestry, v. 41, p. 861-868",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brown, R. W., 1943, Some prehistoric trees of the United States: Journal of Forestry, v. 41, p. 861-868.}"
}

@misc{cheney1948metasequoia3,
    author = "Cheney, R. W",
    title = "Metasequoia-Erkundung",
    year = "1948",
    howpublished = "American Scientist, v. 36, p. 490- 494",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cheney, R. W., 1948, Metasequoia-Erkundung: American Scientist, v. 36, p. 490- 494.}"
}

@book{chaney1949evolutionary2,
    author = "Chaney, R. W",
    title = "Evolutionäre Trends in den Angiospermen, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., und Mayr, E., Hgg., Genetics, Paleontology and Evolution",
    year = "1949",
    publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, S. 190-201; 474 S",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Chaney, R. W., 1949, Evolutionäre Trends in den Angiospermen, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., und Mayr, E., Hgg., Genetics, Paleontology and Evolution: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, S. 190-201; 474 S.}"
}

Zeitschriftenartikel POLLINATION SYSTEMS AS ISOLATING MECHANISMS IN ANGIOSPERMS Zugriff erhalten Verne Grant Verne Grant Department of Botany University of California Berkeley Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 3, Ausgabe 1, 1. März 1949, Seiten 82–97, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x Veröffentlicht: 01. März 1949 Artikelverlauf Eingegangen: 08. Dezember 1948 Veröffentlicht: 01. März 1949

@article{doi101111j155856461949tb00007x,
    author = "Grant, Verne",
    title = "POLLINATION SYSTEMS AS ISOLATING MECHANISMS IN ANGIOSPERMS",
    year = "1949",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Zeitschriftenartikel POLLINATION SYSTEMS AS ISOLATING MECHANISMS IN ANGIOSPERMS Zugriff erhalten Verne Grant Verne Grant Department of Botany University of California Berkeley Suchen Sie nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Band 3, Ausgabe 1, 1. März 1949, Seiten 82–97, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x Veröffentlicht: 01. März 1949 Artikelverlauf Eingegangen: 08. Dezember 1948 Veröffentlicht: 01. März 1949",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x",
    openalex = "W2318566535",
    references = "doi101093aesa304641"
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@article{beal1950genetics,
    author = "Beal, J. M.",
    title = "Genetics, Paleontology, and Evolution. G. L. Jepsen, G. G. Simpson, Ernst Mayr",
    year = "1950",
    journal = "Botanical Gazette",
    url = "https://doi.org/10.1086/335639",
    doi = "10.1086/335639",
    number = "1",
    pages = "141-141",
    volume = "112"
}

@article{crossref1950genetics,
    title = "Genetics, Paleontology, and Evolution. Glenn L. Jepsen, Ernst Mayr, George Gaylord Simpson",
    year = "1950",
    journal = "The Journal of Geology",
    url = "https://doi.org/10.1086/625741",
    doi = "10.1086/625741",
    number = "3",
    pages = "283-283",
    volume = "58"
}

@article{glass1951genetics,
    author = "Glass, Bentley",
    title = "Genetics, Paleontology, and Evolution. Glenn L. Jepsen, Ernst Mayr, George Gaylord Simpson",
    year = "1951",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/398105",
    doi = "10.1086/398105",
    number = "2",
    pages = "202-203",
    volume = "26"
}

@incollection{doi101016s0065266008600486,
    author = "Bradshaw, A. D.",
    title = "Evolutionäre Bedeutung der phänotypischen Plastizität bei Pflanzen",
    year = "1965",
    booktitle = "Advances in genetics",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0065-2660(08)60048-6",
    doi = "10.1016/s0065-2660(08)60048-6",
    openalex = "W206110177",
    references = "doi101016s0065211308603971, doi101111j146918091949tb02451x, doi104159harvard9780674865327, doi107312steb94536"
}

@article{bryant1971genetics,
    author = "Bryant, Peter J.",
    title = "Genetics of Evolution Genetics of the Evolutionary Process T. Dobzhansky",
    year = "1971",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.2307/1295826",
    doi = "10.2307/1295826",
    number = "16",
    openalex = "W2325350562",
    pages = "879-879",
    volume = "21"
}

Der Streit über den evolutionären Vorteil der Rekombination, der zunächst von Fisher und von Muller entdeckt wurde, wird hier zusammengefasst. Autoren, deren Modelle Effekte endlicher Populationen berücksichtigten, fanden einen Vorteil der Rekombination, während Autoren, deren Modelle unendliche Populationen annahmen, keinen Vorteil fanden. Der Vorteil der Rekombination besteht darin, dass sie die zufällige Linkage Disequilibrium auflöst, die durch genetische Drift erzeugt wird. Hill und Robertson stellten fest, dass der durchschnittliche Effekt dieser zufällig erzeugten Linkage Disequilibrium darin besteht, dass verknüpfte Loci miteinander interferieren und so auf Selektion reagieren, selbst wenn es zwischen den Loci keine Geninteraktion gibt. Dieser Effekt zeigt sich identisch mit dem ursprünglichen Argument von Fisher und Muller. Er sagt auch den „Ratchet-Mechanismus" voraus, den Muller entdeckte, der darauf hinwies, dass schädliche Mutanten in einer Population ohne Rekombination leichter zunehmen würden. Computersimulationen des Ersatzes günstiger Mutanten und des langfristigen Anstiegs schädlicher Mutanten bestätigten die wesentliche Richtigkeit des ursprünglichen Fisher-Muller-Arguments und die Realität des Muller-Ratchet-Mechanismus. Es wird argumentiert, dass dies einen intrinsischen Vorteil der Rekombination darstellt, der ihre Persistenz trotz der Selektion für eine engere Verknüpfung zwischen interagierenden Polymorphismen erklären kann und möglicherweise auch ihren Ursprung erklären kann.

@article{doi101093genetics782737,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE EVOLUTIONARY ADVANTAGE OF RECOMBINATION",
    year = "1974",
    journal = "Genetics",
    abstract = {The controversy over the evolutionary advantage of recombination initially discovered by Fisher and by Muller is reviewed. Those authors whose models had finite-population effects found an advantage of recombination, and those whose models had infinite populations found none. The advantage of recombination is that it breaks down random linkage disequilibrium generated by genetic drift. Hill and Robertson found that the average effect of this randomly-generated linkage disequilibrium was to cause linked loci to interfere with each other's response to selection, even where there was no gene interaction between the loci. This effect is shown to be identical to the original argument of Fisher and Muller. It also predicts the "ratchet mechanism" discovered by Muller, who pointed out that deleterious mutants would more readily increase in a population without recombination. Computer simulations of substitution of favorable mutants and of the long-term increase of deleterious mutants verified the essential correctness of the original Fisher-Muller argument and the reality of the Muller ratchet mechanism. It is argued that these constitute an intrinsic advantage of recombination capable of accounting for its persistence in the face of selection for tighter linkage between interacting polymorphisms, and possibly capable of accounting for its origin.},
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/78.2.737",
    doi = "10.1093/genetics/78.2.737",
    openalex = "W2130315111",
    references = "doi1023072341823"
}

@article{doi101111j155856461975tb00851x,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE GENETIC BASIS OF EVOLUTIONARY CHANGE",
    year = "1975",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    openalex = "W1547248981"
}

Ursprünglich 1982 veröffentlicht, untersucht The Masterpiece of Nature die Sexualität als repräsentativ für die wichtigste Herausforderung für die moderne Theorie der Evolution. Das Buch schlägt vor, dass die Sexualität sich nicht als Ergebnis normaler darwinistischer Prozesse der natürlichen Selektion entwickelt hat, sondern durch Konkurrenz zwischen Populationen oder Arten – eine Hypothese, die anderswo fast universell als widerlegt gilt. Das Buch diskutiert auch die Natur der Sexualität und ihre Konsequenzen für den Einzelnen und die Population sowie verschiedene andere Theorien zur Sexualität. Da der Wert dieser Theorien ganz in ihrer Fähigkeit gesehen wird, die Muster der Sexualität zu erklären, die in der Natur beobachtet werden, sucht das Buch eine umfassende Übersicht über die Umstände zu bieten, unter denen die Sexualität im Tierreich abgeschwächt oder verloren geht, und diese Fakten werden dann verwendet, um die Vorzüge der rivalisierenden Theorien abzuwägen. Dieses Buch wird für Forscher im Bereich der Genetik, Ökologie und Evolutionsbiologie von Interesse sein.

@book{openalexw1523843460,
    author = "Bell, Graham",
    title = "The Masterpiece of Nature: Die Evolution und Genetik der Sexualität",
    year = "1981",
    abstract = "Ursprünglich 1982 veröffentlicht, untersucht The Masterpiece of Nature die Sexualität als repräsentativ für die wichtigste Herausforderung für die moderne Theorie der Evolution. Das Buch schlägt vor, dass die Sexualität sich nicht als Ergebnis normaler darwinistischer Prozesse der natürlichen Selektion entwickelt hat, sondern durch Konkurrenz zwischen Populationen oder Arten – eine Hypothese, die anderswo fast universell als widerlegt gilt. Das Buch diskutiert auch die Natur der Sexualität und ihre Konsequenzen für den Einzelnen und die Population sowie verschiedene andere Theorien zur Sexualität. Da der Wert dieser Theorien ganz in ihrer Fähigkeit gesehen wird, die Muster der Sexualität zu erklären, die in der Natur beobachtet werden, sucht das Buch eine umfassende Übersicht über die Umstände zu bieten, unter denen die Sexualität im Tierreich abgeschwächt oder verloren geht, und diese Fakten werden dann verwendet, um die Vorzüge der rivalisierenden Theorien abzuwägen. Dieses Buch wird für Forscher im Bereich der Genetik, Ökologie und Evolutionsbiologie von Interesse sein.",
    openalex = "W1523843460"
}

Teil 1 Genetische Variation: genetische und molekulare Grundlagen, Arten von Polymorphismen, Organisation der genetischen Variation, Inzucht. Teil 2 Ursachen der Evolution: Mutation, Migration, natürliche Selektion, zufällige genetische Drift. Teil 3 Molekulare Populationsgenetik: molekulare Polymorphismen, Muster des Wandels in Nukleotid- und Aminosäuresequenzen, Polymorphismus und Divergenz, molekulare Phylogenie, transposable Elemente. Teil 4 Die genetische Architektur komplexer Merkmale: Arten komplexer Merkmale, phänotypische Variation, Genetik und Umwelt, künstliche Selektion, Korrelation zwischen Verwandten, quantitative Genetik natürlicher Populationen, komplexe Merkmale mit diskretem Ausdruck, quantitative Merkmalsloci (QTLs).

@book{openalexw1525494019,
    author = "Hartl, Daniel L.",
    title = "A primer of population genetics",
    year = "1981",
    abstract = "Teil 1 Genetische Variation: genetische und molekulare Grundlagen, Arten von Polymorphismen, Organisation der genetischen Variation, Inzucht. Teil 2 Ursachen der Evolution: Mutation, Migration, natürliche Selektion, zufällige genetische Drift. Teil 3 Molekulare Populationsgenetik: molekulare Polymorphismen, Muster des Wandels in Nukleotid- und Aminosäuresequenzen, Polymorphismus und Divergenz, molekulare Phylogenie, transposable Elemente. Teil 4 Die genetische Architektur komplexer Merkmale: Arten komplexer Merkmale, phänotypische Variation, Genetik und Umwelt, künstliche Selektion, Korrelation zwischen Verwandten, quantitative Genetik natürlicher Populationen, komplexe Merkmale mit diskretem Ausdruck, quantitative Merkmalsloci (QTLs).",
    openalex = "W1525494019"
}

Zeitschriftenartikel An Evolutionary Theory of Economic Change Zugriff erhalten An Evolutionary Theory of Economic Change. Von Richard R. Nelson und Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts & London: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby University of Stirling Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Band 93, Ausgabe 371, 1. September 1983, Seiten 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Veröffentlicht: 01. September 1983

@article{doi1023072232409,
    author = "Loasby, Brian J. und Nelson, Richard R. und Winter, Sidney G.",
    title = "An Evolutionary Theory of Economic Change.",
    year = "1983",
    journal = "The Economic Journal",
    abstract = "Zeitschriftenartikel An Evolutionary Theory of Economic Change Zugriff erhalten An Evolutionary Theory of Economic Change. Von Richard R. Nelson und Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts \& London: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby University of Stirling Suche nach weiteren Werken dieses Autors auf: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Band 93, Ausgabe 371, 1. September 1983, Seiten 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Veröffentlicht: 01. September 1983",
    url = "https://doi.org/10.2307/2232409",
    doi = "10.2307/2232409",
    openalex = "W2137358449"
}

Die vierte Auflage von Populationsgenetik ist die aktuellste, umfassendste und zugänglichste Einführung in das Fach für fortgeschrittene Studierende im Bachelor- und Masterstudium sowie für Forschende in den Bereichen Genetik, Evolution, Naturschutz und verwandte Gebiete. In den letzten Jahren ist das Interesse an der Anwendung von Prinzipien der Populationsgenetik auf neue molekulare Daten stark gestiegen, und die neue Auflage von Dr. Hedrick spiegelt sein Engagement wider, Schritt mit diesem dynamischen Forschungsbereich zu halten. Um es Studierenden zu ermöglichen, sich stärker auf das Kernmaterial zu konzentrieren, integriert die vierte Auflage die Behandlung theoretischer Fragen mit einer klaren Darstellung der experimentellen Populationsgenetik und empirischer Daten. Unter Bezugnahme auf Beispiele aus sowohl aktuellen als auch klassischen Studien und unter Verwendung einer Vielzahl von Organismen, um die weitreichenden Entwicklungen der Populationsgenetik zu veranschaulichen, bietet dieses Werk Studierenden und Forschenden die umfassendste Ressource in diesem Bereich.

@book{openalexw1495050269,
    author = "Hedrick, Philip W.",
    title = "Genetics of populations",
    year = "1983",
    abstract = "The Fourth Edition of Genetics of Populations is the most current, comprehensive, and accessible introduction to the field for advanced undergraduate and graduate students, and researchers in genetics, evolution, conservation, and related fields. In the past several years, interest in the application of population genetics principles to new molecular data has increased greatly, and Dr. Hedrick's new edition exemplifies his commitment to keeping pace with this dynamic area of study. Reorganized to allow students to focus more sharply on key material, the Fourth Edition integrates coverage of theoretical issues with a clear presentation of experimental population genetics and empirical data. Drawing examples from both recent and classic studies, and using a variety of organisms to illustrate the vast developments of population genetics, this text provides students and researchers with the most comprehensive resource in the field.",
    openalex = "W1495050269"
}

@incollection{doi10100797836425158802,
    author = "Nevo, Eviatar und Beiles, Avigdor und Ben‐Shlomo, Rachel",
    title = "Die evolutionäre Bedeutung genetischer Vielfalt: Ökologische, demografische und lebensgeschichtliche Korrelate",
    year = "1984",
    booktitle = "Lecture notes in biomathematics",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-642-51588-0\_2",
    doi = "10.1007/978-3-642-51588-0\_2",
    openalex = "W175060409",
    references = "doi101111j155856461960tb03113x, doi101126science16238611453, doi101146annureves10110179001133, openalexw1523843460"
}

(Hochgeladen von Plazi für das Bat Literature Project) Keine Zusammenfassung bereitgestellt.

@article{doi101146annureves18110187001321,
    author = "Charlesworth, Deborah und Charlesworth, Brian",
    title = "INBREEDING DEPRESSION AND ITS EVOLUTIONARY CONSEQUENCES",
    year = "1987",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "(Hochgeladen von Plazi für das Bat Literature Project) Keine Zusammenfassung bereitgestellt.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.18.110187.001321",
    doi = "10.1146/annurev.es.18.110187.001321",
    openalex = "W2167243456",
    references = "doi101017s0305004100015644, doi101073pnas4211855, doi101111j155856461975tb00851x, doi105962bhltitle122451, doi107312steb94536, openalexw2062594085"
}

Die Vorhersage des Aussterbens einzelner Populationen oder Arten erfordert ökologische und evolutionäre Informationen. Primäre demografische Faktoren, die die Populationsdynamik beeinflussen, umfassen die soziale Struktur, die Variation der Lebensgeschichte, verursacht durch Umweltfluktuation, die Ausbreitung in räumlich heterogenen Umgebungen sowie lokales Aussterben und Kolonisierung. In kleinen Populationen kann Inzucht die durchschnittliche individuelle Fitness stark reduzieren, und der Verlust genetischer Variabilität durch zufällige genetische Drift kann die zukünftige Anpassungsfähigkeit an eine sich verändernde Umwelt verringern. Theorie und empirische Beispiele deuten darauf hin, dass Demografie in der Regel von größerer unmittelbarer Bedeutung ist als Populationsgenetik bei der Bestimmung der minimalen lebensfähigen Größen wilder Populationen. Der praktische Bedarf im Bereich des biologischen Schutzes, die Wechselwirkung zwischen demografischen und genetischen Faktoren beim Aussterben zu verstehen, könnte einen Fokus für grundlegende Fortschritte an der Schnittstelle von Ökologie und Evolution bieten.

@article{doi101126science3420403,
    author = "Lande, Russell",
    title = "Genetics and Demography in Biological Conservation",
    year = "1988",
    journal = "Science",
    abstract = "Predicting the extinction of single populations or species requires ecological and evolutionary information. Primary demographic factors affecting population dynamics include social structure, life history variation caused by environmental fluctuation, dispersal in spatially heterogeneous environments, and local extinction and colonization. In small populations, inbreeding can greatly reduce the average individual fitness, and loss of genetic variability from random genetic drift can diminish future adaptability to a changing environment. Theory and empirical examples suggest that demography is usually of more immediate importance than population genetics in determining the minimum viable sizes of wild populations. The practical need in biological conservation for understanding the interaction of demographic and genetic factors in extinction may provide a focus for fundamental advances at the interface of ecology and evolution.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3420403",
    doi = "10.1126/science.3420403",
    openalex = "W2094387116",
    references = "doi101016000632078690025x, doi101016c20090029523, doi101017s0016672300016037, doi101093besa153237, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461975tb00851x, doi101126science2214609459, doi101126science2314734129, doi101146annureves18110187001321, doi1015159781400881376, doi1023071308256, doi1023072529912, openalexw1500291103, openalexw2318111898"
}

Zusammenfassung Seit Darwin ist es für Evolutionsbiologen zur zweiten Natur geworden, vergleichend zu denken, da Vergleiche die Allgemeingültigkeit evolutionärer Phänomene begründen. Verlangsamen große Genome die Entwicklung? Welche Lebensweisen selektieren für große Gehirne? Stehen Aussterberaten mit der Körpergröße in Zusammenhang? Dies sind alle Fragen der vergleichenden Methode, und dieses Buch behandelt, wie solche Fragen beantwortet werden können. Das erste Kapitel erläutert geeignete Fragen für den vergleichenden Ansatz und zeigt, wie er andere Problemlösungsansätze in der Evolution ergänzt. Das zweite Kapitel identifiziert die biologischen Ursachen für Ähnlichkeiten zwischen eng verwandten Arten für fast jedes beobachtete Merkmal. Das dritte Kapitel diskutiert Methoden zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Merkmalszustände. Das vierte Kapitel entwickelt statistische Tests, die bestimmen sollen, ob verschiedene Merkmale, die in diskreten Zuständen existieren, Hinweise auf korrelierte Evolution zeigen. Kapitel 5 wendet sich vergleichenden Analysen kontinuierlich variierender Merkmale zu. Kapitel 6 betrachtet Allometrie, um die zuvor diskutierten Themen und Methoden zu veranschaulichen, während das letzte Kapitel die zukünftige Entwicklung des vergleichenden Ansatzes in der molekularen und organismischen Biologie betrachtet.

@book{doi101093oso97801985464120010001,
    author = "Harvey, Paul und Pagel, Mark",
    title = "The Comparative Method in Evolutionary Biology",
    year = "1991",
    abstract = "Zusammenfassung Seit Darwin ist es für Evolutionsbiologen zur zweiten Natur geworden, vergleichend zu denken, da Vergleiche die Allgemeingültigkeit evolutionärer Phänomene begründen. Verlangsamen große Genome die Entwicklung? Welche Lebensweisen selektieren für große Gehirne? Stehen Aussterberaten mit der Körpergröße in Zusammenhang? Dies sind alle Fragen der vergleichenden Methode, und dieses Buch behandelt, wie solche Fragen beantwortet werden können. Das erste Kapitel erläutert geeignete Fragen für den vergleichenden Ansatz und zeigt, wie er andere Problemlösungsansätze in der Evolution ergänzt. Das zweite Kapitel identifiziert die biologischen Ursachen für Ähnlichkeiten zwischen eng verwandten Arten für fast jedes beobachtete Merkmal. Das dritte Kapitel diskutiert Methoden zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Merkmalszustände. Das vierte Kapitel entwickelt statistische Tests, die bestimmen sollen, ob verschiedene Merkmale, die in diskreten Zuständen existieren, Hinweise auf korrelierte Evolution zeigen. Kapitel 5 wendet sich vergleichenden Analysen kontinuierlich variierender Merkmale zu. Kapitel 6 betrachtet Allometrie, um die zuvor diskutierten Themen und Methoden zu veranschaulichen, während das letzte Kapitel die zukünftige Entwicklung des vergleichenden Ansatzes in der molekularen und organismischen Biologie betrachtet.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    openalex = "W4388245928"
}

Die vergleichende Methode zur Erforschung der Anpassung: Warum sich um die Phylogenie kümmern? Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und ancestraler Charakterzustände vergleichende Analyse diskreter Daten vergleichende Analyse kontinuierlicher Variablen Bestimmung der Form vergleichender Beziehungen.

@article{doi105860choice295104,
    title = "The comparative method in evolutionary biology",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "The comparative method for studying adaptation why worry about phylogeny? reconstructing phylogenetic trees and ancestral character states comparative analysis of discrete data comparative analysis of continuous variables determining the form of comparative relationships.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.29-5104",
    doi = "10.5860/choice.29-5104",
    openalex = "W1488393970"
}

@article{doi1010160304377093900688,
    author = "Barrett, Spencer C. H. und Eckert, Christopher G. und Husband, Brian C.",
    title = "Evolutionäre Prozesse in aquatischen Pflanzenpopulationen",
    year = "1993",
    journal = "Aquatic Botany",
    url = "https://doi.org/10.1016/0304-3770(93)90068-8",
    doi = "10.1016/0304-3770(93)90068-8",
    openalex = "W1985368951",
    references = "doi101016037811199090073z, doi101086282771, doi101093genetics16297, doi101111j146918091949tb02451x, doi101146annureves16110185002141, doi1023072402622, doi1023072444338, doi1023072529912, laushman1993population, openalexw2021831883, openalexw2077454220, openalexw2146778590"
}

@article{laushman1993population,
    author = "Laushman, Roger H.",
    title = "Population genetics of hydrophilous angiosperms",
    year = "1993",
    journal = "Aquatic Botany",
    url = "https://doi.org/10.1016/0304-3770(93)90069-9",
    doi = "10.1016/0304-3770(93)90069-9",
    number = "2-3",
    openalex = "W2060939568",
    pages = "147-158",
    volume = "44",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi1010160304377093900688, doi101093oxfordjournalsjhereda109497, doi101111j155856461975tb00851x, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi1023072444338, openalexw1495050269, openalexw1525494019, openalexw2146778590"
}

Genetische Vielfalt ist eine von drei Ebenen der biologischen Vielfalt, die Schutz erfordert. Die genetische Theorie sagt voraus, dass die Ebenen der genetischen Variation mit der effektiven Populationsgröße zunehmen sollten. Soulé (1976) erstellte den ersten überzeugenden Beweis, dass die Ebenen der genetischen Variation in der Wildnis mit der Populationsgröße zusammenhängen, aber dieses Thema bleibt umstritten. Die Hypothese, dass genetische Variation mit der Populationsgröße zusammenhängt, führt zu folgenden Vorhersagen: (1) genetische Variation innerhalb von Arten sollte mit der Populationsgröße zusammenhängen; (2) genetische Variation innerhalb von Arten sollte mit der Inselgröße zusammenhängen; (3) genetische Variation sollte mit der Populationsgröße innerhalb taxonomischer Gruppen zusammenhängen; (4) weit verbreitete Arten sollten mehr genetische Variation haben als eingeschränkte Arten; (5) genetische Variation bei Tieren sollte negativ mit der Körpergröße korrelieren; (6) genetische Variation sollte negativ mit der Rate der Chromosomen-Evolution korrelieren; (7) genetische Variation über Arten hinweg sollte mit der Populationsgröße zusammenhängen; (8) Wirbeltiere sollten weniger genetische Variation haben als Wirbellose oder Pflanzen; (9) Inselpopulationen sollten weniger genetische Variation haben als Festlandpopulationen; und (10) gefährdete Arten sollten weniger genetische Variation haben als nicht gefährdete Arten. Empirische Beobachtungen unterstützen alle diese Hypothesen. Es kann keinen Zweifel geben, dass genetische Variation mit der Populationsgröße zusammenhängt, wie Soulé vorgeschlagen hat. Eine kleine Populationsgröße reduziert das evolutionäre Potenzial von Wildtierarten.

@article{doi101046j15231739199610061500x,
    author = "Frankham, Richard",
    title = "Relationship of Genetic Variation to Population Size in Wildlife",
    year = "1996",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "Genetic diversity is one of three levels of biological diversity requiring conservation. Genetic theory predicts that levels of genetic variation should increase with effective population size. Soulé (1976) compiled the first convincing evidence that levels of genetic variation in wildlife were related to population size, but this issue remains controversial. The hypothesis that genetic variation is related to population size leads to the following predictions: (1) genetic variation within species should be related to population size; (2) genetic variation within species should be related to island size; (3) genetic variation should be related to population size within taxonomic groups; (4) widespread species should have more genetic variation than restricted species; (5) genetic variation in animals should be negatively correlated with body size; (6) genetic variation should be negatively correlated with rate of chromosome evolution; (7) genetic variation across species should be related to population size; (8) vertebrates should have less genetic variation than invertebrates or plants; (9) island populations should have less genetic variation than mainland populations; and (10) endangered species should have less genetic variation than nonendangered species. Empirical observations support all these hypotheses. There can be no doubt that genetic variation is related to population size, as Soulé proposed. Small population size reduces the evolutionary potential of wildlife species.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.1996.10061500.x",
    doi = "10.1046/j.1523-1739.1996.10061500.x",
    openalex = "W2164595396",
    references = "openalexw2146778590"
}

▪ Zusammenfassung Die Untersuchung natürlicher Pflanzenpopulationen hat einige der stärksten und überzeugendsten Fälle für den Betrieb der natürlichen Selektion geliefert, die derzeit bekannt sind, teilweise aufgrund der Eignung für Reziprozitäts-Transplantat-Experimente, Arbeit in gemeinsamen Gärten und langfristige in situ Manipulation. Genetische Differenzierung zwischen Pflanzenpopulationen über kleine Skalen (einige cm bis einige hundert cm) wurde dokumentiert und wird hier in krautigen Einjährigen und Mehrjährigen, holzigen Mehrjährigen, Aquatischen, Terrestrialen, engen Endemiten und weit verbreiteten Arten überprüft. Charakterdifferenzierung wurde für die meisten wichtigen Merkmale der Pflanzenstruktur und -funktion dokumentiert. Beispiele sind für Samenmerkmale, Blattmerkmale, Phänologie, physiologische und biochemische Aktivitäten, Schwermetalltoleranz, Herbizidresistenz, Parasitenresistenz, Wettbewerbsfähigkeit, Organellenmerkmale, Züchtungssysteme und Lebensgeschichte bekannt. Zu den Kräften, die diese Muster der Differenzierung geformt haben, gehören giftige Böden, Düngemittel, Mähen und Weiden, Bodenfeuchtigkeit, Temperatur, Lichtintensität, bestäubende Vektoren, Parasitismus, Genfluss und natürliche Dynamiken. Die Breite und Tiefe der hier überprüften Evidenz unterstützen stark die Idee, dass die natürliche Selektion die Hauptkraft ist, die die genetische Architektur in natürlichen Pflanzenpopulationen formt; diese Sichtweise muss mehr verbreitet geschätzt werden als es derzeit der Fall ist.

@article{doi101146annurevecolsys271237,
    author = "Linhart, Yan B. und Grant, Michael C.",
    title = "EVOLUTIONÄRE BEDEUTUNG LOKALER GENETISCHER DIFFERENZIERUNG IN PFLANZEN",
    year = "1996",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Zusammenfassung Die Untersuchung natürlicher Pflanzenpopulationen hat einige der stärksten und überzeugendsten Fälle für den Betrieb der natürlichen Selektion geliefert, die derzeit bekannt sind, teilweise aufgrund der Eignung für Reziprozitäts-Transplantat-Experimente, Arbeit in gemeinsamen Gärten und langfristige in situ Manipulation. Genetische Differenzierung zwischen Pflanzenpopulationen über kleine Skalen (einige cm bis einige hundert cm) wurde dokumentiert und wird hier in krautigen Einjährigen und Mehrjährigen, holzigen Mehrjährigen, Aquatischen, Terrestrialen, engen Endemiten und weit verbreiteten Arten überprüft. Charakterdifferenzierung wurde für die meisten wichtigen Merkmale der Pflanzenstruktur und -funktion dokumentiert. Beispiele sind für Samenmerkmale, Blattmerkmale, Phänologie, physiologische und biochemische Aktivitäten, Schwermetalltoleranz, Herbizidresistenz, Parasitenresistenz, Wettbewerbsfähigkeit, Organellenmerkmale, Züchtungssysteme und Lebensgeschichte bekannt. Zu den Kräften, die diese Muster der Differenzierung geformt haben, gehören giftige Böden, Düngemittel, Mähen und Weiden, Bodenfeuchtigkeit, Temperatur, Lichtintensität, bestäubende Vektoren, Parasitismus, Genfluss und natürliche Dynamiken. Die Breite und Tiefe der hier überprüften Evidenz unterstützen stark die Idee, dass die natürliche Selektion die Hauptkraft ist, die die genetische Architektur in natürlichen Pflanzenpopulationen formt; diese Sichtweise muss mehr verbreitet geschätzt werden als es derzeit der Fall ist.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.27.1.237",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.27.1.237",
    openalex = "W2130703487",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi10100797814615694425, doi1010079781489930439, doi101016037811199090073z, doi101038scientificamerican117998, doi101111j155856461993tb01215x, doi101126science15739260, doi101146annureves06110175002011, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi101146annureves18110187000323, doi101146annureves19110188000551, doi101146annurevge25120191000245, doi1015159781400820108, doi1023072444338, doi104159harvard9780674865327, openalexw2080618944, openalexw2146778590"
}

Umwelten und wurden aquatisch. Aquatische Pflanzen sind Arten, die ihren Lebenszyklus in stehendem oder fließendem Wasser oder auf überfluteten oder nicht überfluteten hydromorphen Böden perpetuieren. Aquatische Angiospermen bewohnen Ozeane, Seen, Flüsse und Feuchtgebiete. Der Übergang zu einem aquatischen Leben wurde nur von 2 % der etwa 350.000 Angiospermen-Arten erreicht (Cook 1990). Dennoch wird geschätzt, dass die evolutionäre Invasion aquatischer Umwelten durch terrestrische Angiospermen 50–100 unabhängige Ereignisse darstellt (Cook 1990). Obwohl aquatische Pflanzen typischerweise als eine einheitliche biologische Gruppe diskutiert werden, sind die Wege, auf denen sich Arten an das Leben in der aquatischen Umwelt angepasst haben, so vielfältig wie die verschiedenen

@article{doi1023071312967,
    author = "Philbrick, C. Thomas und Les, Donald H.",
    title = "Evolution der reproduktiven Systeme aquatischer Angiospermen",
    year = "1996",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Umwelten und wurden aquatisch. Aquatische Pflanzen sind Arten, die ihren Lebenszyklus in stehendem oder fließendem Wasser oder auf überfluteten oder nicht überfluteten hydromorphen Böden perpetuieren. Aquatische Angiospermen bewohnen Ozeane, Seen, Flüsse und Feuchtgebiete. Der Übergang zu einem aquatischen Leben wurde nur von 2 % der etwa 350.000 Angiospermen-Arten erreicht (Cook 1990). Dennoch wird geschätzt, dass die evolutionäre Invasion aquatischer Umwelten durch terrestrische Angiospermen 50–100 unabhängige Ereignisse darstellt (Cook 1990). Obwohl aquatische Pflanzen typischerweise als eine einheitliche biologische Gruppe diskutiert werden, sind die Wege, auf denen sich Arten an das Leben in der aquatischen Umwelt angepasst haben, so vielfältig wie die verschiedenen",
    url = "https://doi.org/10.2307/1312967",
    doi = "10.2307/1312967",
    openalex = "W1847045724",
    references = "laushman1993population"
}

Organisationen entwickeln sich durch Perioden inkrementeller oder evolutionärer Veränderungen, die durch diskontinuierliche oder revolutionäre Veränderungen unterbrochen werden. Die Herausforderung für Manager besteht darin, die Kultur und Strategie ihrer Organisationen an die aktuelle Umgebung anzupassen, dies jedoch so zu tun, dass die Fähigkeit zur Anpassung an radikale Veränderungen in dieser Umgebung nicht untergraben wird. Sie müssen also eine ambidextre Organisation schaffen – eine, die gleichzeitig sowohl inkrementelle als auch diskontinuierliche Innovationen verfolgen kann.

@article{doi10230741165852,
    author = "Tushman, Michael L. und O'Reilly, Charles A.",
    title = "Ambidextre Organisationen: Management evolutionärer und revolutionärer Veränderungen",
    year = "1996",
    journal = "California Management Review",
    abstract = "Organisationen entwickeln sich durch Perioden inkrementeller oder evolutionärer Veränderungen, die durch diskontinuierliche oder revolutionäre Veränderungen unterbrochen werden. Die Herausforderung für Manager besteht darin, die Kultur und Strategie ihrer Organisationen an die aktuelle Umgebung anzupassen, dies jedoch so zu tun, dass die Fähigkeit zur Anpassung an radikale Veränderungen in dieser Umgebung nicht untergraben wird. Sie müssen also eine ambidextre Organisation schaffen – eine, die gleichzeitig sowohl inkrementelle als auch diskontinuierliche Innovationen verfolgen kann.",
    url = "https://doi.org/10.2307/41165852",
    doi = "10.2307/41165852",
    openalex = "W2023596193"
}

Donald H. Les, Maryke A. Cleland, Michelle Waycott, Phylogenetische Studien in Alismatidae, II: Evolution mariner Angiospermen (Seegras) und Hydrophilie, Systematic Botany, Vol. 22, No. 3 (Jul. - Sep., 1997), pp. 443-463

@article{doi1023072419820,
    author = "Les, Donald H. und Cleland, Maryke A. und Waycott, Michelle",
    title = "Phylogenetische Studien in Alismatidae, II: Evolution mariner Angiospermen (Seegras) und Hydrophilie",
    year = "1997",
    journal = "Systematic Botany",
    abstract = "Donald H. Les, Maryke A. Cleland, Michelle Waycott, Phylogenetische Studien in Alismatidae, II: Evolution mariner Angiospermen (Seegras) und Hydrophilie, Systematic Botany, Vol. 22, No. 3 (Jul. - Sep., 1997), pp. 443-463",
    url = "https://doi.org/10.2307/2419820",
    doi = "10.2307/2419820",
    openalex = "W2149777618",
    references = "doi1010160304377093900688"
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Die Hawaii-Inseln entstehen, während die Pazifische Platte über einen „Hot Spot" im Erdmantel wandert, an dem Magma durch die Kruste austritt und riesige Schildvulkane aufbaut. Die Inseln sinken und erodieren, während die Platte sie nach Nordwesten trägt, bis sie schließlich zu Riffatollen und Seamounts werden. Daher sind die Inseln linear nach Alter geordnet, wobei die ältesten Inseln im Nordwesten (z. B. Kauai bei 5,1 Ma) und die jüngsten im Südosten (z. B. Hawaii bei 0,43 Ma) liegen. K-Ar-Schätzungen des Entstehungsdatums einer Insel liefern ein maximales Alter für die dort lebenden Taxa. Diese Altersdaten können verwendet werden, um Raten molekularer Veränderungen unter folgenden Annahmen zu kalibrieren: (i) K-Ar-Daten sind genau; (ii) Baumtopologien zeigen, dass die Ableitung von Taxa dem Zeitpunkt der Inselentstehung parallel verläuft; (iii) Populationen kolonisieren die Insel nicht lange nach deren Entstehung; (iv) der Koaleszenzpunkt für Schwestertaxa liegt nicht weit vor der Entstehung der kolonisierten jüngeren Insel; (v) Sättigungseffekte und (vi) zwischenlinienratevariationen sind minimal oder korrigierbar; und (vii) unvoreingenommene Standardfehler von Distanzen und Regressionen aus mehreren paarweisen Vergleichen geschätzt werden können. Wir verwenden diesen Ansatz, um insgesamt korrigierte Ratenkalibrierungen für folgende Bereiche zu erhalten: (i) einen Teil des mitochondrialen Cytochrom-b-Gens bei hawaiianischen Drepanidinen (0,016 Sequenzdivergenz/Myr); (ii) das Yp1-Gen bei hawaiianischen Drosophila (0,019/Myr Kambysellis et al. 1995); und (iii) Teile des mitochondrialen 12S- und 16S-rRNA sowie tRNAval bei Laupala-Käfern (0,024–0,102/Myr, Shaw 1996). Wir diskutieren die Zuverlässigkeit der Schätzungen unter Berücksichtigung der oben genannten Annahmen (i–vii) und vergleichen die Ergebnisse mit früheren Kalibrierungen von Adh bei hawaiianischen Drosophila und von Chloroplasten-DNA bei Lobelien.

@article{doi101046j1365294x199800364x,
    author = "Fleischer, Robert C. und McIntosh, Carl und Tarr, Cheryl L.",
    title = "Evolution auf einem vulkanischen Förderband: Nutzung phylogeographischer Rekonstruktionen und K–Ar-basierter Altersbestimmungen der Hawaii-Inseln zur Schätzung molekularer Evolutionsraten",
    year = "1998",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Die Hawaii-Inseln entstehen, während die Pazifische Platte über einen „Hot Spot" im Erdmantel wandert, an dem Magma durch die Kruste austritt und riesige Schildvulkane aufbaut. Die Inseln sinken und erodieren, während die Platte sie nach Nordwesten trägt, bis sie schließlich zu Riffatollen und Seamounts werden. Daher sind die Inseln linear nach Alter geordnet, wobei die ältesten Inseln im Nordwesten (z. B. Kauai bei 5,1 Ma) und die jüngsten im Südosten (z. B. Hawaii bei 0,43 Ma) liegen. K-Ar-Schätzungen des Entstehungsdatums einer Insel liefern ein maximales Alter für die dort lebenden Taxa. Diese Altersdaten können verwendet werden, um Raten molekularer Veränderungen unter folgenden Annahmen zu kalibrieren: (i) K-Ar-Daten sind genau; (ii) Baumtopologien zeigen, dass die Ableitung von Taxa dem Zeitpunkt der Inselentstehung parallel verläuft; (iii) Populationen kolonisieren die Insel nicht lange nach deren Entstehung; (iv) der Koaleszenzpunkt für Schwestertaxa liegt nicht weit vor der Entstehung der kolonisierten jüngeren Insel; (v) Sättigungseffekte und (vi) zwischenlinienratevariationen sind minimal oder korrigierbar; und (vii) unvoreingenommene Standardfehler von Distanzen und Regressionen aus mehreren paarweisen Vergleichen geschätzt werden können. Wir verwenden diesen Ansatz, um insgesamt korrigierte Ratenkalibrierungen für folgende Bereiche zu erhalten: (i) einen Teil des mitochondrialen Cytochrom-b-Gens bei hawaiianischen Drepanidinen (0,016 Sequenzdivergenz/Myr); (ii) das Yp1-Gen bei hawaiianischen Drosophila (0,019/Myr Kambysellis et al. 1995); und (iii) Teile des mitochondrialen 12S- und 16S-rRNA sowie tRNAval bei Laupala-Käfern (0,024–0,102/Myr, Shaw 1996). Wir diskutieren die Zuverlässigkeit der Schätzungen unter Berücksichtigung der oben genannten Annahmen (i–vii) und vergleichen die Ergebnisse mit früheren Kalibrierungen von Adh bei hawaiianischen Drosophila und von Chloroplasten-DNA bei Lobelien.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.1998.00364.x",
    doi = "10.1046/j.1365-294x.1998.00364.x",
    openalex = "W2093111338",
    references = "doi101093oxfordjournalsjhereda109497"
}

Wir wissen sehr wenig über die genetische Basis der Anpassung. Tatsächlich können wir keine theoretischen Vorhersagen, wie auch immer heuristisch, über die Verteilung der phänotypischen Effekte unter den Faktoren, die während der Anpassung fixiert werden, noch über die erwartete "Größe" des größten fixierten Faktors treffen. Die Untersuchung dieses Problems erfordert die Berücksichtigung, dass Populationen während der Anpassung schrittweise einen phänotypischen Optimalwert durch die schrittweise Substitution günstiger Mutationen erreichen. Unter Verwendung von Fishers geometrischem Modell der Anpassung analysiere ich diesen Ansatz zum Optimum und leite eine Näherungslösung für die Größenverteilung der während der Anpassung fixierten Faktoren ab. Ich verallgemeinere diese Ergebnisse weiter, um die Eingabe einer beliebigen Verteilung mutativer Effekte zu ermöglichen. Die Verteilung der während der Anpassung fixierten Faktoren nimmt eine erfreulich einfache, exponentielle Form an. Dieses Ergebnis ist bemerkenswert unempfindlich gegenüber Änderungen in der Fitnessfunktion und in der Verteilung mutativer Effekte. Ein exponentieller Trend unter den fixierten Faktoren scheint eine allgemeine Eigenschaft der Anpassung in Richtung eines fixierten Optimums zu sein.

@article{doi101111j155856461998tb01823x,
    author = "Orr, H. Allen",
    title = "POPULATIONSGENETIK DER ANPASSUNG: DIE VERTEILUNG DER FAKTOREN, DIE WÄHREND ADAPTIVER EVOLUTION FIXIERT WERDEN",
    year = "1998",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Wir wissen sehr wenig über die genetische Basis der Anpassung. Tatsächlich können wir keine theoretischen Vorhersagen, wie auch immer heuristisch, über die Verteilung der phänotypischen Effekte unter den Faktoren, die während der Anpassung fixiert werden, noch über die erwartete "Größe" des größten fixierten Faktors treffen. Die Untersuchung dieses Problems erfordert die Berücksichtigung, dass Populationen während der Anpassung schrittweise einen phänotypischen Optimalwert durch die schrittweise Substitution günstiger Mutationen erreichen. Unter Verwendung von Fishers geometrischem Modell der Anpassung analysiere ich diesen Ansatz zum Optimum und leite eine Näherungslösung für die Größenverteilung der während der Anpassung fixierten Faktoren ab. Ich verallgemeinere diese Ergebnisse weiter, um die Eingabe einer beliebigen Verteilung mutativer Effekte zu ermöglichen. Die Verteilung der während der Anpassung fixierten Faktoren nimmt eine erfreulich einfache, exponentielle Form an. Dieses Ergebnis ist bemerkenswert unempfindlich gegenüber Änderungen in der Fitnessfunktion und in der Verteilung mutativer Effekte. Ein exponentieller Trend unter den fixierten Faktoren scheint eine allgemeine Eigenschaft der Anpassung in Richtung eines fixierten Optimums zu sein.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1998.tb01823.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1998.tb01823.x",
    openalex = "W2004671976",
    references = "doi101038376479a0, doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas91156808, doi101093aibsbulletin2214b, doi101098rspb19790086, doi101146annurevge27120193001225, doi1023071435536, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, doi107312gumb92958, doi107312rens91062"
}

@article{doi1023072411226,
    author = "Orr, H. Allen",
    title = "The Population Genetics of Adaptation: The Distribution of Factors Fixed during Adaptive Evolution",
    year = "1998",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2411226",
    doi = "10.2307/2411226",
    openalex = "W4252998353"
}

Zusammenfassung 1 Langstreckenausbreitungsereignisse sind für Pflanzen biologisch sehr wichtig, da sie die Besiedlungswahrscheinlichkeiten, die Wahrscheinlichkeiten der Bestandsfortdauer in einem fragmentierten Lebensraum und die Metapopulationsstruktur beeinflussen. Sie sind jedoch aufgrund ihrer niedrigen Häufigkeit sehr schwer zu untersuchen. Wir haben die Verwendung molekularer Marker im populationsgenetischen Ansatz zur Untersuchung der Ausbreitung überprüft. Mit diesen Methoden werden die Konsequenzen der Langstreckenausbreitung untersucht, nicht die Häufigkeit der Ausbreitungsereignisse selbst. 2 Molekulare Marker variieren und zeigen unterschiedliche Mengen an Variation und unterschiedliche Vererbungsarten: Sie können entweder dominant oder kodominant sein und können der genetischen Rekombination unterliegen oder nicht. Die Verwendung von Markern hat die Entwicklung von Maximum-Likelihood-Techniken inspiriert, die die evolutionäre Geschichte von Allelen berücksichtigen, während der Genfluss geschätzt wird. 3 Die Inferenz von Samenverbreitungsraten aus indirekten Messungen des Genflusses umfasst drei Schritte: (i) Quantifizierung der genetischen Differenzierung zwischen Populationen und Verwendung dieser zur Schätzung der Rate des Genflusses; (ii) Erstellung einer genetischen Ausbreitungskurve durch Regression des geografischen Abstands zwischen Populationen gegen die Menge des Genflusses; und (iii) Trennung der Samen-vermittelten von der Pollen-vermittelten Genfluss, indem die Differenzierung in nuklearen vs. zytoplasmatischen molekularen Markern verglichen wird. Auf diese Weise können potenziell sehr niedrige Ebenen des Genflusses detektiert werden. 4 Der indirekte Ansatz basiert auf einer Reihe von Annahmen. Die Gültigkeit jeder Annahme sollte durch unabhängige Methoden bewertet werden oder die Schätzungen des Genflusses und der Ausbreitung sollten hauptsächlich in einem vergleichenden Kontext verwendet werden. In Metapopulationen, mit häufigem Aussterben und Besiedlung, ist die Beziehung zwischen genetischer Differenzierung und Genfluss nicht einfach, und andere Methoden sollten verwendet werden. 5 Hochvariable molekulare Marker, insbesondere Mikrosatelliten, haben einen direkten genetischen Ansatz zur Messung des Genflusses, basierend auf elterlichen Analysen, erleichtert. 6 Der populationsgenetische Ansatz liefert unterschiedliche Informationen über die Ausbreitung als ökologische Methoden. Somit können populationsgenetische und ökologische Methoden sich ergänzen und zusammen zu einem besseren Einblick in den Ausbreitungsprozess führen als jede der Methoden für sich allein.

@article{doi101046j13652745199900389x,
    author = "Ouborg, N. Joop und Piquot, Yves und van Groenendael, J.M.",
    title = "Populationsgenetik, molekulare Marker und die Untersuchung der Ausbreitung bei Pflanzen",
    year = "1999",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Zusammenfassung 1 Langstreckenausbreitungsereignisse sind für Pflanzen biologisch sehr wichtig, da sie die Besiedlungswahrscheinlichkeiten, die Wahrscheinlichkeiten der Bestandsfortdauer in einem fragmentierten Lebensraum und die Metapopulationsstruktur beeinflussen. Sie sind jedoch aufgrund ihrer niedrigen Häufigkeit sehr schwer zu untersuchen. Wir haben die Verwendung molekularer Marker im populationsgenetischen Ansatz zur Untersuchung der Ausbreitung überprüft. Mit diesen Methoden werden die Konsequenzen der Langstreckenausbreitung untersucht, nicht die Häufigkeit der Ausbreitungsereignisse selbst. 2 Molekulare Marker variieren und zeigen unterschiedliche Mengen an Variation und unterschiedliche Vererbungsarten: Sie können entweder dominant oder kodominant sein und können der genetischen Rekombination unterliegen oder nicht. Die Verwendung von Markern hat die Entwicklung von Maximum-Likelihood-Techniken inspiriert, die die evolutionäre Geschichte von Allelen berücksichtigen, während der Genfluss geschätzt wird. 3 Die Inferenz von Samenverbreitungsraten aus indirekten Messungen des Genflusses umfasst drei Schritte: (i) Quantifizierung der genetischen Differenzierung zwischen Populationen und Verwendung dieser zur Schätzung der Rate des Genflusses; (ii) Erstellung einer genetischen Ausbreitungskurve durch Regression des geografischen Abstands zwischen Populationen gegen die Menge des Genflusses; und (iii) Trennung der Samen-vermittelten von der Pollen-vermittelten Genfluss, indem die Differenzierung in nuklearen vs. zytoplasmatischen molekularen Markern verglichen wird. Auf diese Weise können potenziell sehr niedrige Ebenen des Genflusses detektiert werden. 4 Der indirekte Ansatz basiert auf einer Reihe von Annahmen. Die Gültigkeit jeder Annahme sollte durch unabhängige Methoden bewertet werden oder die Schätzungen des Genflusses und der Ausbreitung sollten hauptsächlich in einem vergleichenden Kontext verwendet werden. In Metapopulationen, mit häufigem Aussterben und Besiedlung, ist die Beziehung zwischen genetischer Differenzierung und Genfluss nicht einfach, und andere Methoden sollten verwendet werden. 5 Hochvariable molekulare Marker, insbesondere Mikrosatelliten, haben einen direkten genetischen Ansatz zur Messung des Genflusses, basierend auf elterlichen Analysen, erleichtert. 6 Der populationsgenetische Ansatz liefert unterschiedliche Informationen über die Ausbreitung als ökologische Methoden. Somit können populationsgenetische und ökologische Methoden sich ergänzen und zusammen zu einem besseren Einblick in den Ausbreitungsprozess führen als jede der Methoden für sich allein.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2745.1999.00389.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2745.1999.00389.x",
    openalex = "W2032487465",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

@article{doi10103835046017,
    author = "Kopp, Artyom und Duncan, Ian und Carroll, Sean B.",
    title = "Genetische Kontrolle und Evolution geschlechtsdimorpher Merkmale bei Drosophila",
    year = "2000",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/35046017",
    doi = "10.1038/35046017",
    openalex = "W1588649406",
    references = "doi101038384236a0, doi101073pnas7863721, doi101093oxfordjournalsmolbeva040214, doi101111j155856461982tb05003x, doi101111j155856461998tb05132x, doi101146annurevgenet301637, doi101242dev1212333, doi1015159780691207278, doi1023072341823, doi105962bhltitle27468"
}

Zusammenfassung: In diesem umfassenden Überblick werden eine Reihe von Faktoren betrachtet, die die Bedeutung der genetischen Vielfalt für das Überleben einer Population beeinflussen können. Genetische Variation ist für die Anpassungsfähigkeit einer Population unerlässlich, in der quantitativ vererbte, mit der Fitness verbundene Merkmale von entscheidender Bedeutung sind. Daher sollte die Beziehung zwischen genetischer Vielfalt und Fitness untersucht werden, um Vorhersagen über die Bedeutung der genetischen Vielfalt für eine bestimmte Population treffen zu können. Das Niveau der genetischen Vielfalt, das in einer Population gefunden wird, hängt stark vom Paarungssystem, der evolutionären Geschichte einer Art und der Populationsgeschichte (letztere ist in der Regel unbekannt) sowie vom Niveau der Umwelt-Heterogenität ab. Eine genaue Schätzung der Fitness bleibt komplex, trotz der Verfügbarkeit einer Reihe direkter und indirekter Fitnessparameter. Es gibt keine allgemeine Beziehung zwischen genetischer Vielfalt und verschiedenen Fitnesskomponenten. Wenn jedoch ein niedrigeres Niveau der Heterozygotie ein erhöhtes Niveau der Inzucht darstellt, kann eine Reduktion der Fitness erwartet werden. Molekulare Marker können verwendet werden, um Anpassungsfähigkeit oder Fitness zu untersuchen, sofern sie einen Quantitativen Merkmalsort (QTL) darstellen oder selbst funktionelle Gene sind, die an diesen Prozessen beteiligt sind. Neben einer genetischen Reaktion einer Population auf Umweltveränderungen kann phänotypische Plastizität in einem Genotyp die Fitness beeinflussen. Die relative Bedeutung der Plastizität gegenüber der genetischen Vielfalt hängt von der untersuchten Art und Population sowie von den Umweltbedingungen ab. Die Möglichkeiten der Anwendung des aktuellen Wissens über genetische Vielfalt und Populationsüberleben für das Management natürlicher Populationen werden diskutiert.

@article{doi101055s20005958,
    author = "Booy, G. und Hendriks, Rob J. J. und Smulders, M.J.M. und van Groenendael, J.M. und Vosman, B.",
    title = "Genetic Diversity and the Survival of Populations",
    year = "2000",
    journal = "Plant Biology",
    abstract = "Zusammenfassung: In diesem umfassenden Überblick werden eine Reihe von Faktoren betrachtet, die die Bedeutung der genetischen Vielfalt für das Überleben einer Population beeinflussen können. Genetische Variation ist für die Anpassungsfähigkeit einer Population unerlässlich, in der quantitativ vererbte, mit der Fitness verbundene Merkmale von entscheidender Bedeutung sind. Daher sollte die Beziehung zwischen genetischer Vielfalt und Fitness untersucht werden, um Vorhersagen über die Bedeutung der genetischen Vielfalt für eine bestimmte Population treffen zu können. Das Niveau der genetischen Vielfalt, das in einer Population gefunden wird, hängt stark vom Paarungssystem, der evolutionären Geschichte einer Art und der Populationsgeschichte (letztere ist in der Regel unbekannt) sowie vom Niveau der Umwelt-Heterogenität ab. Eine genaue Schätzung der Fitness bleibt komplex, trotz der Verfügbarkeit einer Reihe direkter und indirekter Fitnessparameter. Es gibt keine allgemeine Beziehung zwischen genetischer Vielfalt und verschiedenen Fitnesskomponenten. Wenn jedoch ein niedrigeres Niveau der Heterozygotie ein erhöhtes Niveau der Inzucht darstellt, kann eine Reduktion der Fitness erwartet werden. Molekulare Marker können verwendet werden, um Anpassungsfähigkeit oder Fitness zu untersuchen, sofern sie einen Quantitativen Merkmalsort (QTL) darstellen oder selbst funktionelle Gene sind, die an diesen Prozessen beteiligt sind. Neben einer genetischen Reaktion einer Population auf Umweltveränderungen kann phänotypische Plastizität in einem Genotyp die Fitness beeinflussen. Die relative Bedeutung der Plastizität gegenüber der genetischen Vielfalt hängt von der untersuchten Art und Population sowie von den Umweltbedingungen ab. Die Möglichkeiten der Anwendung des aktuellen Wissens über genetische Vielfalt und Populationsüberleben für das Management natürlicher Populationen werden diskutiert.",
    url = "https://doi.org/10.1055/s-2000-5958",
    doi = "10.1055/s-2000-5958",
    openalex = "W1970411761",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi101086285558"
}

Seltene Arten werden typischerweise als solche betrachtet, die niedrige Niveaus genetischer Variation aufrechterhalten, und diese Ansicht wurde durch mehrere Übersichten großer Zahlen von Isozym-Studien gestützt. Obwohl diese Übersichten wertvolle Daten zu den Niveaus der Variabilität bei Pflanzenarten im Allgemeinen und bei seltenen Arten im Besonderen geliefert haben, beinhalten diese breiten Übersichten Vergleiche, die die Effekte der Seltenheit mit einer Vielzahl anderer Faktoren verwechseln können, die die genetische Variabilität beeinflussen. Darüber hinaus gehen die eingesetzten statistischen Analysen davon aus, dass die Daten unabhängig sind, was nicht der Fall ist für Organismen, die eine gemeinsame phylogenetische Geschichte teilen. Da die Rolle der evolutionären Geschichte und historischer Einschränkungen besser verstanden wurde, haben mehr Forscher weit verbreitete Kongeneren untersucht, wenn sie die genetische Vielfalt seltener Arten untersuchen, um diese Effekte zu kontrollieren. Wir fassen die verfügbaren Daten aus solchen Studien zusammen und vergleichen für seltene und weit verbreitete Kongeneren (1) die Niveaus genetischer Variabilität auf Populations- und Artenebene und (2) Maße der Populationsunterstrukturierung. Auf Populationsniveau haben wir Daten für den Prozentsatz polymorpher Loci (%P(pop)), die mittlere Anzahl von Allelen pro Locus (A(pop)) und die beobachtete Heterozygotie (H(o)) zusammengefasst. Auf Artenebene wurden verwendet: Prozentsatz polymorpher Loci (%P(spp)), mittlere Anzahl von Allelen pro Locus (A(spp)) und die gesamte genetische Vielfalt (H(T)). Auch Indizes der Populationsunterteilung (entweder F(ST) oder G(ST)) wurden untersucht. Mit Wilcoxon-Vorzeichenrangtests fanden wir signifikante, aber kleine Unterschiede zwischen seltenen und weit verbreiteten Arten für alle Diversitätsmaße außer H(T). Es scheint jedoch keinen Unterschied zwischen seltenen und weit verbreiteten Kongeneren zu geben, was die Aufteilung genetischer Variation innerhalb und zwischen Populationen betrifft. Die Niveaus der Diversität, für alle untersuchten Maße, zwischen seltenen und weit verbreiteten Kongeneren sind stark korreliert.

@article{doi1023072656886,
    author = "Gitzendanner, Matthew A. und Soltis, Pamela S.",
    title = "Patterns of genetic variation in rare and widespread plant congeners",
    year = "2000",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Rare species are typically considered to maintain low levels of genetic variation, and this view has been supported by several reviews of large numbers of isozyme studies. Although these reviews have provided valuable data on levels of variability in plant species in general, and rare species in particular, these broad overviews involve comparisons that may confound the effects of rarity with a multitude of other factors that affect genetic variability. Additionally, the statistical analyses employed assume the data to be independent, which is not the case for organisms that share a common phylogenetic history. As the role of evolutionary history and historical constraints has become better understood, more researchers have studied widespread congeners when investigating the genetic diversity of rare species in an effort to control for these effects. We summarize the available data from such studies, comparing for rare and widespread congeners (1) the levels of genetic variability at the population and species levels and (2) measures of population substructuring. At the population level, we summarized data for percentage polymorphic loci (\%P(pop)), mean number of alleles per locus (A(pop)), and observed heterozygosity (H(o)). Species-level measures used were percentage polymorphic loci (\%P(spp)), mean number of alleles per locus (A(spp)), and total genetic diversity (H(T)). Indices of population subdivision (either F(ST) or G(ST)) were also examined. Using Wilcoxon signed rank tests, we found significant, but small, differences between rare and widespread species for all diversity measures except H(T). However, there does not appear to be a difference between rare and widespread congeners in terms of how genetic variation is partitioned within and among populations. Levels of diversity, for all measures examined, between rare and widespread congeners are highly correlated.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2656886",
    doi = "10.2307/2656886",
    openalex = "W2141860334",
    references = "doi101146annureves10110179001133"
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@book{doi101016b9780127300559x50058,
    title = "Das Konzept des Charakters in der Evolutionären Biologie",
    year = "2001",
    booktitle = "Elsevier eBooks",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-12-730055-9.x5005-8",
    doi = "10.1016/b978-0-12-730055-9.x5005-8",
    openalex = "W565848724",
    references = "doi101038384236a0"
}

Evolutionary Ecology vereint gleichzeitig konzeptionelle und empirische Fortschritte in der Evolutionary Ecology und bietet ein Werk, das sowohl als Hauptlehrbuch als auch als ergänzende Lektüre in einem fortgeschrittenen Bachelor- oder Masterkurs verwendet werden kann. Der Fokus des Buches liegt auf aktuellen Konzepten in der Evolutionary Ecology und der empirischen Untersuchung dieser Konzepte. Die Herausgeber haben eine Gruppe prominenter Biologen zusammengestellt, die bedeutende Beiträge zu diesem Feld geleistet haben. Sie synthetisieren sowohl den aktuellen Stand des Wissens als auch identifizieren Bereiche für zukünftige Untersuchungen. Evolutionary Ecology wird für Forscher und Studierende in beiden Bereichen der Ökologie und der Evolutionsbiologie von allgemeinem Interesse sein. Forscher in der Evolutionary Ecology, die einen Überblick über den aktuellen Stand des Feldes wünschen, und Masterstudierende, die eine Einführung in das Feld suchen, werden dieses Buch sehr wertvoll finden. Dieses Werk kann auch als Hauptlehrbuch oder als ergänzende Lektüre in sowohl Oberstufen- als auch Masterkursen/Seminaren in Evolutionary Ecology verwendet werden.

@book{doi101093oso97801951315430010001,
    title = "Evolutionary Ecology",
    year = "2001",
    booktitle = "Oxford University Press eBooks",
    abstract = "Evolutionary Ecology vereint gleichzeitig konzeptionelle und empirische Fortschritte in der Evolutionary Ecology und bietet ein Werk, das sowohl als Hauptlehrbuch als auch als ergänzende Lektüre in einem fortgeschrittenen Bachelor- oder Masterkurs verwendet werden kann. Der Fokus des Buches liegt auf aktuellen Konzepten in der Evolutionary Ecology und der empirischen Untersuchung dieser Konzepte. Die Herausgeber haben eine Gruppe prominenter Biologen zusammengestellt, die bedeutende Beiträge zu diesem Feld geleistet haben. Sie synthetisieren sowohl den aktuellen Stand des Wissens als auch identifizieren Bereiche für zukünftige Untersuchungen. Evolutionary Ecology wird für Forscher und Studierende in beiden Bereichen der Ökologie und der Evolutionsbiologie von allgemeinem Interesse sein. Forscher in der Evolutionary Ecology, die einen Überblick über den aktuellen Stand des Feldes wünschen, und Masterstudierende, die eine Einführung in das Feld suchen, werden dieses Buch sehr wertvoll finden. Dieses Werk kann auch als Hauptlehrbuch oder als ergänzende Lektüre in sowohl Oberstufen- als auch Masterkursen/Seminaren in Evolutionary Ecology verwendet werden.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195131543.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780195131543.001.0001",
    openalex = "W4235189111"
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@article{gibson2001evolution,
    author = "Gibson, Greg und Palsson, Arnar",
    title = "Evolution: Eine Ergänzung für die evolutionäre Genetik",
    year = "2001",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0960-9822(01)00014-8",
    doi = "10.1016/s0960-9822(01)00014-8",
    number = "2",
    pages = "R74-R76",
    volume = "11"
}

@article{doi101038sjhdy6800154,
    author = "Gostling, Neil J.",
    title = "Von DNA zur Vielfalt: Molekulargenetik und die Evolution des Tierbaus",
    year = "2002",
    journal = "Heredity",
    url = "https://doi.org/10.1038/sj.hdy.6800154",
    doi = "10.1038/sj.hdy.6800154",
    openalex = "W1968814137",
    references = "doi101016s0168952598016710"
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Vorwort.1. Eine kurze Geschichte der Tiere.2. Das genetische Werkzeugkasten für die Entwicklung.3. Tiere bauen.4. Evolution des Werkzeugkastens.5. Diversifizierung von Körperplänen und Körperteilen.6. Evolution morphologischer Neuheiten.7. Morphologische Variation und Artverwandtschaft.8. Von DNA zu Vielfalt: Die Primat der regulatorischen Evolution.Glossar.Index

@article{doi105860choice395182,
    title = "Von DNA zu Vielfalt: Molekulargenetik und die Evolution des Tierdesigns",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Vorwort.1. Eine kurze Geschichte der Tiere.2. Das genetische Werkzeugkasten für die Entwicklung.3. Tiere bauen.4. Evolution des Werkzeugkastens.5. Diversifizierung von Körperplänen und Körperteilen.6. Evolution morphologischer Neuheiten.7. Morphologische Variation und Artverwandtschaft.8. Von DNA zu Vielfalt: Die Primat der regulatorischen Evolution.Glossar.Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-5182",
    doi = "10.5860/choice.39-5182",
    openalex = "W2034536549",
    references = "doi1010079783642455322, doi101016b9780122053511x50009, doi101016b9780127300559x50058, doi101016s0070215321x00026, doi101037003329091274504, doi105860choice341536, openalexw1865748464, openalexw2506868775, openalexw587813093"
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@article{doi101038nature01568,
    author = "Lenski, Richard E. und Ofria, Charles und Pennock, Robert T. und Adami, Christoph",
    title = "The evolutionary origin of complex features",
    year = "2003",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature01568",
    doi = "10.1038/nature01568",
    openalex = "W2005946215",
    references = "doi101002j232619511995tb03633x, doi101002sici10990526199609102132aidcplx830co2h, doi10103835023115, doi10103835085569, doi101038nature01151, doi101093genetics14841667, doi101126science860134, doi1023072485224, doi107551mitpress10900010001, openalexw2074397232"
}

@article{doi101038nrg1088,
    author = "Elena, Santiago F. und Lenski, Richard E.",
    title = "Evolutionsexperimente mit Mikroorganismen: die Dynamik und genetischen Grundlagen der Anpassung",
    year = "2003",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg1088",
    doi = "10.1038/nrg1088",
    openalex = "W2112945902",
    references = "doi101007978940115210512, doi101023a1017067816551, doi101038336435a0, doi10103842701, doi101038nature01568, doi101073pnas74115088, doi101073pnas91156808, doi101086285289, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oso97801985464120010001, doi101111j155856461998tb01823x, doi101126science147365368, doi101126science28854691251, doi1011289781555816704, doi1015159780691209418, doi1023072485224, doi1023074785, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice273873, doi105860choice295104, doi105962bhltitle27468"
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@article{doi101038nature02415,
    author = "Shapiro, Michael D. und Marks, Melissa E. und Peichel, Catherine L. und Blackman, Benjamin K. und Nereng, Kirsten S. und Jónsson, Bjarni und Schluter, Dolph und Kingsley, David M.",
    title = "Genetische und entwicklungsbiologische Grundlagen der evolutionären Reduktion des Beckens bei Dreistachligen Stichlingen",
    year = "2004",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature02415",
    doi = "10.1038/nature02415",
    openalex = "W2066908868",
    references = "doi1010020471142905, doi101016s0092867400808685, doi101016s0092867401004937, doi10103820944, doi10103835046017, doi101038414901a, doi101038nature02064, doi101073pnas9794530, doi101111j001438202000tb00544x, openalexw2062594085"
}

@article{doi101038nature02698,
    author = "Wittkopp, Patricia J. und Haerum, Belinda K. und Clark, Andrew G.",
    title = "Evolutionäre Veränderungen in cis- und trans-Genregulation",
    year = "2004",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature02698",
    doi = "10.1038/nature02698",
    openalex = "W2085454778",
    references = "doi101093molbevmsg140, doi105860choice395182"
}

@article{doi101038nrmicro863,
    author = "Moyá, Andrés und Holmes, Edward C. und Gónzález‐Candelas, Fernando",
    title = "The population genetics and evolutionary epidemiology of RNA viruses",
    year = "2004",
    journal = "Nature Reviews Microbiology",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrmicro863",
    doi = "10.1038/nrmicro863",
    openalex = "W1990653767",
    references = "doi101038nature01151, doi101128mmbr6511511852001"
}

Avida ist eine Softwareplattform für Experimente mit sich selbst replizierenden und sich entwickelnden Computerprogrammen. Sie bietet detaillierte Kontrolle über experimentelle Einstellungen und Protokolle, eine große Auswahl an Messwerkzeugen sowie ausgefeilte Methoden zur Analyse und Nachbearbeitung experimenteller Daten. Wir erläutern die allgemeinen Prinzipien, auf denen Avida basiert, sowie ihre Hauptkomponenten und deren Wechselwirkungen. Zudem erklären wir, wie Experimente eingerichtet, durchgeführt und analysiert werden.

@article{doi101162106454604773563612,
    author = "Ofria, Charles und Wilke, Claus O.",
    title = "Avida: Eine Softwareplattform für Forschung in der computergestützten evolutionären Biologie",
    year = "2004",
    journal = "Artificial Life",
    abstract = "Avida ist eine Softwareplattform für Experimente mit sich selbst replizierenden und sich entwickelnden Computerprogrammen. Sie bietet detaillierte Kontrolle über experimentelle Einstellungen und Protokolle, eine große Auswahl an Messwerkzeugen sowie ausgefeilte Methoden zur Analyse und Nachbearbeitung experimenteller Daten. Wir erläutern die allgemeinen Prinzipien, auf denen Avida basiert, sowie ihre Hauptkomponenten und deren Wechselwirkungen. Zudem erklären wir, wie Experimente eingerichtet, durchgeführt und analysiert werden.",
    url = "https://doi.org/10.1162/106454604773563612",
    doi = "10.1162/106454604773563612",
    openalex = "W2147276070",
    references = "doi101038nature01151, doi101038nature01568"
}

@article{bell2005evolutionary,
    author = "Bell, G",
    title = "Evolutionary genetics: The evolution of evolution",
    year = "2005",
    journal = "Heredity",
    url = "https://doi.org/10.1038/sj.hdy.6800608",
    doi = "10.1038/sj.hdy.6800608",
    number = "1",
    pages = "1-2",
    volume = "94"
}

@article{doi101038nature03842,
    author = "Dekel, E. und Alon, Uri",
    title = "Optimalität und evolutionäre Abstimmung des Expressionsniveaus eines Proteins",
    year = "2005",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature03842",
    doi = "10.1038/nature03842",
    openalex = "W2068872007",
    references = "doi101038nrg1088, doi101146annurevge18120184000335"
}

▪ Zusammenfassung Beim gemischten Befruchtungssystem, bei dem hermaphroditische Pflanzenarten sich sowohl durch Selbst- als auch durch Fremdbefruchtung fortpflanzen, handelt es sich um eine herausfordernde Aufgabe für Evolutionsbiologen. Die Theorie besagt, dass Inzuchtdepression, der Hauptselektionsfaktor, der der Evolution der Selbstbefruchtung entgegenwirkt, durch Selbstbefruchtung eliminiert werden kann, ein Prozess, der dazu führen soll, dass sich reine Strategien entweder der Fremdbefruchtung oder der Selbstbefruchtung durchsetzen. Hier präsentieren wir aktualisierte Belege, die darauf hindeuten, dass gemischte Befruchtungssysteme bei Samenpflanzen häufig sind. Wir skizzieren die blüten- und Bestäubungsmechanismen, die zu einer intermediären Fremdbefruchtung führen können, überblicken die theoretischen Modelle, die die Stabilität der intermediären Fremdbefruchtung behandeln, und untersuchen relevante empirische Belege. Eine vergleichende Analyse geschätzter Inzucht-Koeffizienten und Fremdbefruchtungsquoten deutet darauf hin, dass gemischte Befruchtung trotz starker Inzuchtdepression oft evolviert. Die adaptive Bedeutung der gemischten Befruchtung ist für jede Art noch nicht vollständig erklärt worden. Jüngere theoretische und empirische Arbeiten deuten darauf hin, dass zukünftige Fortschritte von einer besseren Integration von Studien zu blütenmechanismen, Genetik und Ökologie sowie von der Anerkennung abhängen, wie sich Selektionsdrücke im Raum und in der Zeit verändern.

@article{doi101146annurevecolsys36091704175539,
    author = "Goodwillie, Carol und Kalisz, Susan und Eckert, Christopher G.",
    title = "The Evolutionary Enigma of Mixed Mating Systems in Plants: Occurrence, Theoretical Explanations, and Empirical Evidence",
    year = "2005",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "▪ Zusammenfassung Beim gemischten Befruchtungssystem, bei dem hermaphroditische Pflanzenarten sich sowohl durch Selbst- als auch durch Fremdbefruchtung fortpflanzen, handelt es sich um eine herausfordernde Aufgabe für Evolutionsbiologen. Die Theorie besagt, dass Inzuchtdepression, der Hauptselektionsfaktor, der der Evolution der Selbstbefruchtung entgegenwirkt, durch Selbstbefruchtung eliminiert werden kann, ein Prozess, der dazu führen soll, dass sich reine Strategien entweder der Fremdbefruchtung oder der Selbstbefruchtung durchsetzen. Hier präsentieren wir aktualisierte Belege, die darauf hindeuten, dass gemischte Befruchtungssysteme bei Samenpflanzen häufig sind. Wir skizzieren die blüten- und Bestäubungsmechanismen, die zu einer intermediären Fremdbefruchtung führen können, überblicken die theoretischen Modelle, die die Stabilität der intermediären Fremdbefruchtung behandeln, und untersuchen relevante empirische Belege. Eine vergleichende Analyse geschätzter Inzucht-Koeffizienten und Fremdbefruchtungsquoten deutet darauf hin, dass gemischte Befruchtung trotz starker Inzuchtdepression oft evolviert. Die adaptive Bedeutung der gemischten Befruchtung ist für jede Art noch nicht vollständig erklärt worden. Jüngere theoretische und empirische Arbeiten deuten darauf hin, dass zukünftige Fortschritte von einer besseren Integration von Studien zu blütenmechanismen, Genetik und Ökologie sowie von der Anerkennung abhängen, wie sich Selektionsdrücke im Raum und in der Zeit verändern.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.36.091704.175539",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.36.091704.175539",
    openalex = "W2127588110",
    references = "doi10100797814615694425, doi101111j109583122000tb01221x, doi101146annureves15110184000433, doi105860choice355054, doi105962bhltitle110800, openalexw2491318968"
}

Epistasis für Fitness bedeutet, dass der selektive Effekt einer Mutation vom genetischen Hintergrund abhängt, in dem sie auftritt. Obwohl Epistasis in der Natur weit verbreitet ist, bleibt unser Verständnis ihrer Konsequenzen für die Evolution durch natürliche Selektion unvollständig. Insbesondere konzentriert sich viel Aufmerksamkeit nur auf ihren Einfluss auf die momentane Änderungsrate der Frequenz ausgewählter Allele über den epistatischen Beitrag zur additiven genetischen Varianz für Fitness. Somit hat Epistasis in diesem Rahmen nur evolutionäre Bedeutung, wenn die interagierenden Loci gleichzeitig in der Population segregieren. Allerdings kann die selektive Zugänglichkeit mutatorischer Trajektorien zu Genotypen hoher Fitness vom genetischen Hintergrund abhängen, in dem neue Mutationen auftreten, und dieser Effekt ist unabhängig von der Populationspolymorphie an anderen Loci. Hier untersuchen wir diesen zweiten Einfluss der Epistasis auf die Evolution durch natürliche Selektion. Wir zeigen, dass er die Konsequenz einer besonderen Form der Epistasis ist, die wir Sign-Epistasis nennen. Sign-Epistasis bedeutet, dass das Vorzeichen des Fitness-Effekts einer Mutation unter epistatischer Kontrolle steht; somit ist eine solche Mutation auf einigen genetischen Hintergründen vorteilhaft und auf anderen nachteilig. Jüngste experimentelle Innovationen in mikrobiellen Systemen erlauben nun die Bewertung der Fitness-Effekte einzelner Mutationen auf mehreren genetischen Hintergründen. Wir rezensieren diese Literatur und identifizieren viele Beispiele für Sign-Epistasis und schlagen vor, dass die Implikationen dieser Ergebnisse auf andere Organismen verallgemeinert werden können. Diese theoretischen und empirischen Überlegungen implizieren, dass starke genetische Beschränkungen auf die selektive Zugänglichkeit von Trajektorien zu Genotypen hoher Fitness bestehen können und spezifische Bereiche für zukünftige Forschung vorschlagen.

@article{doi10155404272,
    author = "Weinreich, Daniel und Watson, Richard A. und Chao, Lin",
    title = "PERSPECTIVE: SIGN EPISTASIS UND GENETISCHE BESCHRÄNKUNG EVOLUTIONÄRER TRAJECTORIEN",
    year = "2005",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Epistasis für Fitness bedeutet, dass der selektive Effekt einer Mutation vom genetischen Hintergrund abhängt, in dem sie auftritt. Obwohl Epistasis in der Natur weit verbreitet ist, bleibt unser Verständnis ihrer Konsequenzen für die Evolution durch natürliche Selektion unvollständig. Insbesondere konzentriert sich viel Aufmerksamkeit nur auf ihren Einfluss auf die momentane Änderungsrate der Frequenz ausgewählter Allele über den epistatischen Beitrag zur additiven genetischen Varianz für Fitness. Somit hat Epistasis in diesem Rahmen nur evolutionäre Bedeutung, wenn die interagierenden Loci gleichzeitig in der Population segregieren. Allerdings kann die selektive Zugänglichkeit mutatorischer Trajektorien zu Genotypen hoher Fitness vom genetischen Hintergrund abhängen, in dem neue Mutationen auftreten, und dieser Effekt ist unabhängig von der Populationspolymorphie an anderen Loci. Hier untersuchen wir diesen zweiten Einfluss der Epistasis auf die Evolution durch natürliche Selektion. Wir zeigen, dass er die Konsequenz einer besonderen Form der Epistasis ist, die wir Sign-Epistasis nennen. Sign-Epistasis bedeutet, dass das Vorzeichen des Fitness-Effekts einer Mutation unter epistatischer Kontrolle steht; somit ist eine solche Mutation auf einigen genetischen Hintergründen vorteilhaft und auf anderen nachteilig. Jüngste experimentelle Innovationen in mikrobiellen Systemen erlauben nun die Bewertung der Fitness-Effekte einzelner Mutationen auf mehreren genetischen Hintergründen. Wir rezensieren diese Literatur und identifizieren viele Beispiele für Sign-Epistasis und schlagen vor, dass die Implikationen dieser Ergebnisse auf andere Organismen verallgemeinert werden können. Diese theoretischen und empirischen Überlegungen implizieren, dass starke genetische Beschränkungen auf die selektive Zugänglichkeit von Trajektorien zu Genotypen hoher Fitness bestehen können und spezifische Bereiche für zukünftige Forschung vorschlagen.",
    url = "https://doi.org/10.1554/04-272",
    doi = "10.1554/04-272",
    openalex = "W4246887724"
}

Das Fehlen genetischer Varianz in Merkmalen unter Selektion ist vielleicht die älteste Erklärung für eine Grenze der evolutionären Veränderung, wurde aber auch am leichtesten abgetan. Wir überprüfen eine Reihe theoretischer und empirischer Ergebnisse, die sich von einzelnen Merkmalen bis zu komplexeren multivariaten Systemen erstrecken, und zeigen, dass das Fehlen genetischer Varianz häufiger sein könnte, als derzeit angenommen wird. Aus der Perspektive eines einzelnen Merkmals heben wir hervor, dass es zunehmend klar wird, dass einige Merkmalsarten keine signifikanten Stufen genetischer Variation aufweisen, und wir erheben die Möglichkeit, dass Arten mit eingeschränkten Verbreitungsgebieten sich qualitativ von weit verbreiteteren Arten in Bezug auf das Niveau der genetischen Varianz in ökologisch wichtigen Merkmalen unterscheiden. Ein weit verbreiteter Irrtum in vielen Lebenszyklusstudien ist, dass ein Mangel an genetischer Varianz bei einzelnen Merkmalen und genetische Einschränkungen als Folge bivariater genetischer Korrelationen unterschiedliche Ursachen für Selektionsgrenzen sind. Wir erläutern, wie Interpretationen bivariater Muster in vielen Fällen unwahrscheinlich sind, genetische Grenzen der Selektion nachzuweisen. Wir befürworten eine multivariate Definition genetischer Einschränkungen, die das Vorhandensein (oder Fehlen) genetischer Varianz in der multivariaten Richtung der Selektion betont. Für Multimerkmalssysteme deuten jüngere Ergebnisse aus langfristigen Studien an Organismen, bei denen mehr über Merkmale verstanden wird, die unter Selektion stehen könnten, darauf hin, dass die Selektion die genetische Varianz erschöpfen kann, was zu einer Grenze der Selektionsantwort führt.

@article{doi101890041209,
    author = "Blows, Mark W. und Hoffmann, Ary A.",
    title = "A REASSESSMENT OF GENETIC LIMITS TO EVOLUTIONARY CHANGE",
    year = "2005",
    journal = "Ecology",
    abstract = "An absence of genetic variance in traits under selection is perhaps the oldest explanation for a limit to evolutionary change, but has also been the most easily dismissed. We review a range of theoretical and empirical results covering single traits to more complex multivariate systems, and show that an absence of genetic variance may be more common than is currently appreciated. From a single-trait perspective, we highlight that it is becoming clear that some trait types do not display significant levels of genetic variation, and we raise the possibility that species with restricted ranges may differ qualitatively from more widespread species in levels of genetic variance in ecologically important traits. A common misconception in many life-history studies is that a lack of genetic variance in single traits, and genetic constraints as a consequence of bivariate genetic correlations, are different causes of selection limits. We detail how interpretations of bivariate patterns are unlikely to demonstrate genetic limits to selection in many cases. We advocate a multivariate definition of genetic constraints that emphasizes the presence (or otherwise) of genetic variance in the multivariate direction of selection. For multitrait systems, recent results using longer term studies of organisms, in which more is understood concerning what traits may be under selection, have indicated that selection may exhaust genetic variance, resulting in a limit to the selection response.",
    url = "https://doi.org/10.1890/04-1209",
    doi = "10.1890/04-1209",
    openalex = "W1991431672",
    references = "doi1023072411226"
}

@article{doi101038nrc2013,
    author = "Merlo, Lauren M.F. und Pepper, John W. und Reid, Brian J. und Maley, Carlo C.",
    title = "Krebs als evolutionärer und ökologischer Prozess",
    year = "2006",
    journal = "Nature reviews. Cancer",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrc2013",
    doi = "10.1038/nrc2013",
    openalex = "W2123558100",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016s0169534701021012, doi101016s0169534702024953, doi10103842701, doi101038nrg1088, doi101146annurevgenet341401, doi1023072407274"
}

Warum hören Individuen nach einem bestimmten Alter auf sich fortzupflanzen, und wie wird dieses Alter bestimmt? Die Theorie der antagonistischen Pleiotropie für die Evolution der Seneszenz sagt voraus, dass eine erhöhte Leistung im frühen Leben von einer früheren (oder schnelleren) Seneszenz begleitet sein sollte. Daher sollte ein Individuum, das früh mit der Fortpflanzung begonnen hat, auch früh seine Fortpflanzungsfähigkeiten verlieren. Wir untersuchen hier die Beziehung zwischen dem Alter bei der ersten Fortpflanzung (AFR) und dem Alter bei der letzten Fortpflanzung (ALR) in einer Population von wildlebenden Grauen Schwänen (Cygnus olor), die über 36 Jahre hinweg überwacht wurde. Unter Verwendung multivariater Analysen an den Längsschnittdaten zeigen wir, dass beide Merkmale in entgegengesetzte Richtungen stark selektiert werden. Die Analyse der phänotypischen Kovarianz zwischen diesen Merkmalen zeigt, dass Individuen in ihrer inhärenten Qualität variieren, sodass einige Individuen eine frühere AFR und eine spätere ALR aufweisen als erwartet. Quantitative genetische Stammbaum-Analysen zeigen, dass beide Merkmale additive genetische Varianz besitzen, aber auch, dass AFR und ALR positiv genetisch korreliert sind. Daher ist ihre Evolution, obwohl beide Merkmale vererbliche Variation aufweisen und unter entgegengesetzter gerichteter Selektion stehen, durch einen starken evolutionären Tradeoff eingeschränkt. Diese Ergebnisse sind konsistent mit der Theorie, dass eine erhöhte Leistung im frühen Leben aufgrund genetischer Tradeoffs mit einer schnelleren Seneszenz einhergeht.

@article{doi101073pnas0511123103,
    author = "Charmantier, Anne and Perrins, Christopher M. and McCleery, R. H. and Sheldon, Ben C.",
    title = "Quantitative genetics of age at reproduction in wild swans: Support for antagonistic pleiotropy models of senescence",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Warum hören Individuen nach einem bestimmten Alter auf sich fortzupflanzen, und wie wird dieses Alter bestimmt? Die Theorie der antagonistischen Pleiotropie für die Evolution der Seneszenz sagt voraus, dass eine erhöhte Leistung im frühen Leben von einer früheren (oder schnelleren) Seneszenz begleitet sein sollte. Daher sollte ein Individuum, das früh mit der Fortpflanzung begonnen hat, auch früh seine Fortpflanzungsfähigkeiten verlieren. Wir untersuchen hier die Beziehung zwischen dem Alter bei der ersten Fortpflanzung (AFR) und dem Alter bei der letzten Fortpflanzung (ALR) in einer Population von wildlebenden Grauen Schwänen (Cygnus olor), die über 36 Jahre hinweg überwacht wurde. Unter Verwendung multivariater Analysen an den Längsschnittdaten zeigen wir, dass beide Merkmale in entgegengesetzte Richtungen stark selektiert werden. Die Analyse der phänotypischen Kovarianz zwischen diesen Merkmalen zeigt, dass Individuen in ihrer inhärenten Qualität variieren, sodass einige Individuen eine frühere AFR und eine spätere ALR aufweisen als erwartet. Quantitative genetische Stammbaum-Analysen zeigen, dass beide Merkmale additive genetische Varianz besitzen, aber auch, dass AFR und ALR positiv genetisch korreliert sind. Daher ist ihre Evolution, obwohl beide Merkmale vererbliche Variation aufweisen und unter entgegengesetzter gerichteter Selektion stehen, durch einen starken evolutionären Tradeoff eingeschränkt. Diese Ergebnisse sind konsistent mit der Theorie, dass eine erhöhte Leistung im frühen Leben aufgrund genetischer Tradeoffs mit einer schnelleren Seneszenz einhergeht.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0511123103",
    doi = "10.1073/pnas.0511123103",
    openalex = "W2036516886",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

Der Artikel erläutert die Gemeinsamkeiten und Unterschiede zwischen neoklassischen, institutionellen und evolutionären Ansätzen, die in den letzten Jahrzehnten in der Wirtschaftsgeographie einflussreich waren. Indem wir die drei Ansätze hinsichtlich des theoretischen Inhalts und der Forschungsmethodologie trennen, können wir sowohl die Gemeinsamkeiten als auch die Unterschiede zwischen den drei Ansätzen würdigen. Es ist auch ersichtlich, dass innovatives Theoretisieren derzeit an der Schnittstelle zwischen neoklassischer und evolutionärer Theorie (insbesondere in der Modellierung) und an der Schnittstelle zwischen institutioneller und evolutionärer Theorie (insbesondere in der „appreciative theorizing") stattfindet. Zusammengefasst argumentieren wir, dass die Evolutionary Economic Geography ein aufkommendes Paradigma in der Wirtschaftsgeographie ist, dies jedoch ohne sich von Entwicklungen in anderen theoretischen Ansätzen zu isolieren.

@article{doi101093jeglbi022,
    author = "Boschma, Ron und Frenken, Koen",
    title = "Warum ist die Wirtschaftsgeographie keine evolutionäre Wissenschaft? Hin zu einer evolutionären Wirtschaftsgeographie",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Economic Geography",
    abstract = "Der Artikel erläutert die Gemeinsamkeiten und Unterschiede zwischen neoklassischen, institutionellen und evolutionären Ansätzen, die in den letzten Jahrzehnten in der Wirtschaftsgeographie einflussreich waren. Indem wir die drei Ansätze hinsichtlich des theoretischen Inhalts und der Forschungsmethodologie trennen, können wir sowohl die Gemeinsamkeiten als auch die Unterschiede zwischen den drei Ansätzen würdigen. Es ist auch ersichtlich, dass innovatives Theoretisieren derzeit an der Schnittstelle zwischen neoklassischer und evolutionärer Theorie (insbesondere in der Modellierung) und an der Schnittstelle zwischen institutioneller und evolutionärer Theorie (insbesondere in der „appreciative theorizing") stattfindet. Zusammengefasst argumentieren wir, dass die Evolutionary Economic Geography ein aufkommendes Paradigma in der Wirtschaftsgeographie ist, dies jedoch ohne sich von Entwicklungen in anderen theoretischen Ansätzen zu isolieren.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jeg/lbi022",
    doi = "10.1093/jeg/lbi022",
    openalex = "W2130277684",
    references = "doi101002sici10970266199708187509aidsmj88230co2z, doi101007s001910050089, doi101017cbo9780511808678, doi101017cbo9780511815478, doi101086228311, doi101093iccdth026, doi101093oxfordjournalscjea013725, doi101103revmodphys7447, doi101111j146802971997tb00064x, doi101126science2865439509, doi1015159780691206820, doi1023071060065, doi1023071884852, doi1023072232409, doi105860choice416654, openalexw2061901927"
}

Zusammenfassung Beziehungen zwischen Pflanzenpopulationengröße, Fitness und innerhalb-populationsgenetischer Vielfalt sind grundlegend für Pflanzenökologie, Evolution und Naturschutz. Wir führten Meta-Analysen von Studien durch, die zwischen 1987 und 2005 veröffentlicht wurden, um zu testen, ob diese Beziehungen im Allgemeinen positiv sind, ob sie empfindlich auf methodische Unterschiede zwischen Studien reagieren, ob sie zwischen Arten unterschiedlicher Lebensdauer, Paarungssystem oder Seltenheit variieren und ob sie von den Größenbereichen der untersuchten Populationen abhängen. Die mittleren Korrelationen zwischen Populationengröße, Fitness und genetischer Variation waren alle signifikant positiv. Die positive Korrelation zwischen Populationengröße und weiblicher Fitness neigte dazu, in Feldstudien stärker zu sein als in Gemeinschaftsgartenstudien, und die positive Korrelation zwischen genetischer Variation und Fitness war signifikant stärker in DNA-Studien als in Isoenzymstudien. Stärke und Richtung der Korrelationen zwischen Populationengröße, Fitness und genetischer Variation waren unabhängig von der Pflanzenlebensdauer und dem Größenbereich der untersuchten Populationen. Die mittleren Korrelationen neigten dazu, für seltene Arten stärker zu sein als für häufige Arten. Erwartete Heterozygotie, die Anzahl der Allele und die Anzahl oder der Anteil polymorpher Loci stiegen signifikant mit der Populationengröße an, aber das Inzuchtlevel F IS war unabhängig von der Populationengröße. Die positive Beziehung zwischen Populationengröße und der Anzahl der Allele sowie der Anzahl oder dem Anteil polymorpher Loci war bei selbstinkompatiblen Arten stärker als bei selbstkompatiblen Arten. Darüber hinaus waren Fitness und genetische Variation bei selbstinkompatiblen Arten positiv korreliert, aber bei selbstkompatiblen Arten unabhängig voneinander. Die engen Beziehungen zwischen Populationengröße, genetischer Variation und Fitness legen nahe, dass die Populationengröße in Multipopulationsstudien zur Pflanzenfitness oder genetischen Variation immer berücksichtigt werden sollte. Die beobachtete Allgemeingültigkeit der positiven Beziehungen zwischen Populationengröße, Pflanzenfitness und genetischer Vielfalt impliziert, dass die negativen Auswirkungen der Habitatfragmentierung auf die Pflanzenfitness und genetische Variation häufig sind. Darüber hinaus deuten die stärkeren positiven Assoziationen, die bei selbstinkompatiblen Arten und in gewissem Maße bei seltenen Arten beobachtet wurden, darauf hin, dass diese Arten am anfälligsten für die negativen Auswirkungen der Habitatfragmentierung sind.

@article{doi101111j13652745200601150x,
    author = "Leimu, Roosa und Mutikäinen, Pia und Koricheva, Julia und Fischer, Markus",
    title = "Wie allgemein sind positive Beziehungen zwischen Pflanzenpopulationengröße, Fitness und genetischer Variation?",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Zusammenfassung Beziehungen zwischen Pflanzenpopulationengröße, Fitness und innerhalb-populationsgenetischer Vielfalt sind grundlegend für Pflanzenökologie, Evolution und Naturschutz. Wir führten Meta-Analysen von Studien durch, die zwischen 1987 und 2005 veröffentlicht wurden, um zu testen, ob diese Beziehungen im Allgemeinen positiv sind, ob sie empfindlich auf methodische Unterschiede zwischen Studien reagieren, ob sie zwischen Arten unterschiedlicher Lebensdauer, Paarungssystem oder Seltenheit variieren und ob sie von den Größenbereichen der untersuchten Populationen abhängen. Die mittleren Korrelationen zwischen Populationengröße, Fitness und genetischer Variation waren alle signifikant positiv. Die positive Korrelation zwischen Populationengröße und weiblicher Fitness neigte dazu, in Feldstudien stärker zu sein als in Gemeinschaftsgartenstudien, und die positive Korrelation zwischen genetischer Variation und Fitness war signifikant stärker in DNA-Studien als in Isoenzymstudien. Stärke und Richtung der Korrelationen zwischen Populationengröße, Fitness und genetischer Variation waren unabhängig von der Pflanzenlebensdauer und dem Größenbereich der untersuchten Populationen. Die mittleren Korrelationen neigten dazu, für seltene Arten stärker zu sein als für häufige Arten. Erwartete Heterozygotie, die Anzahl der Allele und die Anzahl oder der Anteil polymorpher Loci stiegen signifikant mit der Populationengröße an, aber das Inzuchtlevel F IS war unabhängig von der Populationengröße. Die positive Beziehung zwischen Populationengröße und der Anzahl der Allele sowie der Anzahl oder dem Anteil polymorpher Loci war bei selbstinkompatiblen Arten stärker als bei selbstkompatiblen Arten. Darüber hinaus waren Fitness und genetische Variation bei selbstinkompatiblen Arten positiv korreliert, aber bei selbstkompatiblen Arten unabhängig voneinander. Die engen Beziehungen zwischen Populationengröße, genetischer Variation und Fitness legen nahe, dass die Populationengröße in Multipopulationsstudien zur Pflanzenfitness oder genetischen Variation immer berücksichtigt werden sollte. Die beobachtete Allgemeingültigkeit der positiven Beziehungen zwischen Populationengröße, Pflanzenfitness und genetischer Vielfalt impliziert, dass die negativen Auswirkungen der Habitatfragmentierung auf die Pflanzenfitness und genetische Variation häufig sind. Darüber hinaus deuten die stärkeren positiven Assoziationen, die bei selbstinkompatiblen Arten und in gewissem Maße bei seltenen Arten beobachtet wurden, darauf hin, dass diese Arten am anfälligsten für die negativen Auswirkungen der Habitatfragmentierung sind.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2745.2006.01150.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2745.2006.01150.x",
    openalex = "W2041902086",
    references = "doi101146annureves10110179001133"
}

Wir überprüfen gängige Populationsdefinitionen sowohl unter dem ökologischen Paradigma (das demografische Kohäsion betont) als auch unter dem evolutionären Paradigma (das reproduktive Kohäsion betont) und stellen fest, dass keine davon wirklich operationalisierbar sind. Wir schlagen mehrere quantitative Kriterien vor, die verwendet werden könnten, um zu bestimmen, wann Gruppen von Individuen unterschiedlich genug sind, um als 'Populationen' betrachtet zu werden. Die Einheiten für diese Kriterien sind die Wanderungsrate (m) für das ökologische Paradigma und die Migranten pro Generation (Nm) für das evolutionäre Paradigma. Diese Kriterien werden dann bewertet, indem analytische Methoden auf simulierte genetische Daten für ein endliches Inselmodell angewendet werden. Unter dem Standardparameter-Satz, der L = 20 Hochmutation (mikrosatellitenähnliche) Loci und Proben von S = 50 Individuen aus jeweils n = 4 Subpopulationen umfasst, war die Power, Abweichungen von Panmixie zu erkennen, sehr hoch (ungefähr 100%; P < 0.001), selbst bei hoher Genfluss (Nm = 25). Eine neue Methode, die die Anzahl der korrekten Populationszuordnungen mit der zufälligen Erwartung vergleicht, performte ebenso gut wie ein multilocus Kontingenztest und verdient weitere Berücksichtigung. Die Verwendung von Low mutation (allozymenähnlichen) Markern reduzierte die Power mehr als das Halbieren von S oder L. Unter dem Standardparameter-Satz kann die Power, eingeschränkten Genfluss unter einem bestimmten Niveau X (H(0): Nm < X) zu erkennen, ebenfalls hoch sein, sofern wahre Nm < oder = 0.5X. Die Entwicklung des entsprechenden Testkriteriums erfordert jedoch Annahmen über mehrere Schlüsselparameter, die in den meisten natürlichen Populationen schwer zu schätzen sind. Methoden, die Individuen ohne Verwendung von a priori Stichprobeninformationen gruppieren, erkannten die wahre Anzahl von Populationen nur unter Bedingungen von moderatem oder niedrigem Genfluss (Nm < oder = 5), und die Power sank scharf mit kleineren Stichproben von Loci und Individuen. Ein einfacher Algorithmus, der auf einem multilocus Kontingenztest von Allelfrequenzen in Paaren von Proben basiert, hat eine hohe Power, die wahre Anzahl von Populationen zu erkennen, selbst bei Nm = 25, erfordert jedoch eine strengere statistische Bewertung. Das ökologische Paradigma bleibt für Bewertungen unter Verwendung genetischer Marker herausfordernd, weil der Übergang von der demografischen Abhängigkeit zur Unabhängigkeit in einem Bereich hoher Migration stattfindet, in dem genetische Methoden relativ wenig Power haben. Einige jüngste theoretische Entwicklungen und anhaltende Fortschritte in der Rechenleistung geben Hoffnung, dass sich diese Situation in Zukunft ändern könnte.

@article{doi101111j1365294x200602890x,
    author = "Waples, Robin S. and Gaggiotti, Oscar E.",
    title = "INVITED REVIEW: Was ist eine Population? Eine empirische Bewertung einiger genetischer Methoden zur Identifizierung der Anzahl von Genpools und ihres Grades der Vernetzung",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Wir überprüfen gängige Populationsdefinitionen sowohl unter dem ökologischen Paradigma (das demografische Kohäsion betont) als auch unter dem evolutionären Paradigma (das reproduktive Kohäsion betont) und stellen fest, dass keine davon wirklich operationalisierbar sind. Wir schlagen mehrere quantitative Kriterien vor, die verwendet werden könnten, um zu bestimmen, wann Gruppen von Individuen unterschiedlich genug sind, um als 'Populationen' betrachtet zu werden. Die Einheiten für diese Kriterien sind die Wanderungsrate (m) für das ökologische Paradigma und die Migranten pro Generation (Nm) für das evolutionäre Paradigma. Diese Kriterien werden dann bewertet, indem analytische Methoden auf simulierte genetische Daten für ein endliches Inselmodell angewendet werden. Unter dem Standardparameter-Satz, der L = 20 Hochmutation (mikrosatellitenähnliche) Loci und Proben von S = 50 Individuen aus jeweils n = 4 Subpopulationen umfasst, war die Power, Abweichungen von Panmixie zu erkennen, sehr hoch (ungefähr 100\%; P < 0.001), selbst bei hoher Genfluss (Nm = 25). Eine neue Methode, die die Anzahl der korrekten Populationszuordnungen mit der zufälligen Erwartung vergleicht, performte ebenso gut wie ein multilocus Kontingenztest und verdient weitere Berücksichtigung. Die Verwendung von Low mutation (allozymenähnlichen) Markern reduzierte die Power mehr als das Halbieren von S oder L. Unter dem Standardparameter-Satz kann die Power, eingeschränkten Genfluss unter einem bestimmten Niveau X (H(0): Nm < X) zu erkennen, ebenfalls hoch sein, sofern wahre Nm < oder = 0.5X. Die Entwicklung des entsprechenden Testkriteriums erfordert jedoch Annahmen über mehrere Schlüsselparameter, die in den meisten natürlichen Populationen schwer zu schätzen sind. Methoden, die Individuen ohne Verwendung von a priori Stichprobeninformationen gruppieren, erkannten die wahre Anzahl von Populationen nur unter Bedingungen von moderatem oder niedrigem Genfluss (Nm < oder = 5), und die Power sank scharf mit kleineren Stichproben von Loci und Individuen. Ein einfacher Algorithmus, der auf einem multilocus Kontingenztest von Allelfrequenzen in Paaren von Proben basiert, hat eine hohe Power, die wahre Anzahl von Populationen zu erkennen, selbst bei Nm = 25, erfordert jedoch eine strengere statistische Bewertung. Das ökologische Paradigma bleibt für Bewertungen unter Verwendung genetischer Marker herausfordernd, weil der Übergang von der demografischen Abhängigkeit zur Unabhängigkeit in einem Bereich hoher Migration stattfindet, in dem genetische Methoden relativ wenig Power haben. Einige jüngste theoretische Entwicklungen und anhaltende Fortschritte in der Rechenleistung geben Hoffnung, dass sich diese Situation in Zukunft ändern könnte.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2006.02890.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2006.02890.x",
    openalex = "W2172086791",
    references = "doi101046j1365294x200402008x, doi101093jheredesh074, doi101111j146918091975tb00129x, doi105281zenodo10742832, openalexw1495050269"
}

Pathogene Escherichia coli verursachen über 160 Millionen Fälle von Ruhr und eine Million Todesfälle pro Jahr, wohingegen nicht-pathogene E. coli Teil der normalen Darmflora gesunder Säugetiere und Vögel sind. Die evolutionären Wege, die dieser Dichotomie im bakteriellen Lebensstil zugrunde liegen, wurden durch Multilocus-Sequenztypisierung einer globalen Sammlung von Isolatien untersucht. Spezifische Pathogentypen [enterohämorrhagische E. coli, enteropathogene E. coli, enteroinvasive E. coli, K1 und Shigella] sind in mehreren Linien unabhängig und wiederholt entstanden, wohingegen andere Linien nur wenige Pathogene enthalten. Die Evolutionsraten haben sich in pathogenen Linien beschleunigt, was zu hochvirulenten Organismen führte, deren genomische Inhalte häufig durch erhöhte Raten homologer Rekombination verändert werden; somit ist die Evolution der Virulenz mit dem bakteriellen Sex verknüpft. Dieses langfristige evolutionäre Muster wurde in Genen beobachtet, die im gesamten Genom verteilt sind, und ist daher wahrscheinlich das Ergebnis episodischer Selektion für Stämme, die der Wirtsimmunantwort entkommen können.

@article{doi101111j13652958200605172x,
    author = "Wirth, Thierry und Falush, Daniel und Lan, Ruiting und Colles, Frances M. und Mensa, Patience und Wieler, Lothar H. und Karch, Helge und Reeves, Peter R. und Maiden, Martin und Ochman, Howard und Achtman, Mark",
    title = "Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Microbiology",
    abstract = "Pathogene Escherichia coli verursachen über 160 Millionen Fälle von Ruhr und eine Million Todesfälle pro Jahr, wohingegen nicht-pathogene E. coli Teil der normalen Darmflora gesunder Säugetiere und Vögel sind. Die evolutionären Wege, die dieser Dichotomie im bakteriellen Lebensstil zugrunde liegen, wurden durch Multilocus-Sequenztypisierung einer globalen Sammlung von Isolatien untersucht. Spezifische Pathogentypen [enterohämorrhagische E. coli, enteropathogene E. coli, enteroinvasive E. coli, K1 und Shigella] sind in mehreren Linien unabhängig und wiederholt entstanden, wohingegen andere Linien nur wenige Pathogene enthalten. Die Evolutionsraten haben sich in pathogenen Linien beschleunigt, was zu hochvirulenten Organismen führte, deren genomische Inhalte häufig durch erhöhte Raten homologer Rekombination verändert werden; somit ist die Evolution der Virulenz mit dem bakteriellen Sex verknüpft. Dieses langfristige evolutionäre Muster wurde in Genen beobachtet, die im gesamten Genom verteilt sind, und ist daher wahrscheinlich das Ergebnis episodischer Selektion für Stämme, die der Wirtsimmunantwort entkommen können.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2006.05172.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2958.2006.05172.x",
    openalex = "W2161060487",
    references = "doi101007bf02111283, doi10103842701, doi101093bioinformatics183502, doi101111j1365294x200502553x"
}

Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110215,
    author = "Petit, Rémy J. und Hampe, Arndt",
    title = "Some Evolutionary Consequences of Being a Tree",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Bäume bilden keine natürliche Gruppe, sondern teilen Merkmale wie große Größe, Langlebigkeit und hohe Reproduktionsleistung, die ihre Art und Geschwindigkeit der Evolution beeinflussen. Insbesondere sind Bäume einzigartig darin, dass sie hohe Diversitätsniveaus aufrechterhalten, während sie neue Mutationen nur langsam akkumulieren. Sie sind auch in der Lage, eine schnelle lokale Anpassung zu vollziehen und können sich schnell von nicht-baumartigen Vorfahren entwickeln, aber die meisten bestehenden Baumlinien erfahren typischerweise niedrige Artbildungs- und Aussterberaten. Wir diskutieren, warum das Baumwachstumsmuster zu diesen scheinbar paradoxen Merkmalen führen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    openalex = "W2102352162",
    references = "doi101111j001438202001tb00826x, doi101111j14610248200500739x, doi101126science1061967, doi101146annurevecolsys271237, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi107208chicago97802261186970010001, openalexw2065039187, openalexw2145250129, openalexw2146778590"
}

@article{doi101038nrg2063,
    author = "Wray, Gregory A.",
    title = "The evolutionary significance of cis-regulatory mutations",
    year = "2007",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2063",
    doi = "10.1038/nrg2063",
    openalex = "W2012354488",
    references = "doi101016s0022283661800727, doi10103835046017, doi101038nature02415, doi101038ng1946, doi101038sjmp4001851, doi101056nejm197608052950602, doi101073pnas0431157100, doi101073pnas9794530, doi101086406830, doi101086421051, doi101093genetics15141531, doi101093molbevmsg140, doi101111j001438202000tb00544x, doi101126science1071829, doi101126science1072290, doi101126science1090005"
}

Evolutionäre Diversifizierungen werden häufig auf die fortlaufende Modifikation eines konservierten genetischen Werkzeugkastens aus Entwicklungswegen zurückgeführt, sodass Komplexität und Konvergenz in Organismenformen als Folge von Ähnlichkeiten in genetischen Mechanismen oder Umweltbedingungen angenommen werden. Dieser Ansatz vermischt jedoch die Ursachen der Organismenentwicklung mit den Ursachen von Organismenunterschieden und ist daher nur von begrenzter Nützlichkeit zur Aufklärung der Ursache evolutionärer Veränderungen. Molekulare Mechanismen, die sowohl an die entwicklungsbiologische Reaktion auf Umweltsignale als auch an große evolutionäre Innovationen und Diversifizierungen beteiligt sind, eignen sich einzigartig, diese Lücke zu überbrücken, indem sie die Ursachen der Variation innerhalb einer Generation explizit mit den Ursachen der Divergenz von Taxa verbinden. Entwicklungswegen der Knochenbildung und eine gemeinsame Rolle von Knochenmorphogenetischen Proteinen (BMPs) sowohl bei der epigenetischen Knochenremodellierung als auch bei der Evolution großer adaptiver Diversifizierungen bieten eine solche Gelegenheit. Wir zeigen, dass Variationen im Zeitpunkt der Ossifikation durch epigenetisch induzierte Veränderungen der Genexpression zu ähnlichen phänotypischen Mustern führen können, und wir schlagen vor, dass sowohl die genetische Akkommodation umweltinduzierter Entwicklungswegen als auch die Flexibilität der Entwicklung über verschiedene Umgebungen hinweg durch heterochronische Verschiebungen in der Knochenreifung relativ zur Exposition gegenüber unvorhersehbaren Umgebungen entstehen. Wir vermuten, dass solche heterochronischen Verschiebungen in der Ossifikation nicht nur die Entwicklung unter schwankenden Umgebungen puffern können, während sie die für die normale Skelettbildung kritische epigenetische Sensitivität aufrechterhalten, sondern auch epigenetisch induzierte Genexpression ermöglichen, um spezialisierte morphologische Anpassungen zu erzeugen. Wir besprechen Studien zur Umweltsensitivität von BMP-Wegen und ihrer Regulation der Bildung, Remodellierung und Reparatur von Knorpel und Knochen, um die Hypothese zu prüfen, dass BMP-vermittelte Skelettanpassungen durch die evolvierte Reaktivität von BMPs gegenüber externen Signalen erleichtert werden. Überraschenderweise hat bisher keine empirische Studie den molekularen Mechanismus hinter der entwicklungsbiologischen Plastizität bei Skelettmerkmalen identifiziert. Wir skizzieren ein konzeptionelles Rahmenwerk für zukünftige Studien, die sich auf die Vermittlung phänotypischer Plastizität in der Skelettentwicklung durch Muster der BMP-Expression konzentrieren.

@article{doi101093icbicm025,
    author = "Young, Rebecca L. and Badyaev, Alexander V.",
    title = "Evolution of ontogeny: linking epigenetic remodeling and genetic adaptation in skeletal structures",
    year = "2007",
    journal = "Integrative and Comparative Biology",
    abstract = "Evolutionary diversifications are commonly attributed to the continued modifications of a conserved genetic toolkit of developmental pathways, such that complexity and convergence in organismal forms are assumed to be due to similarity in genetic mechanisms or environmental conditions. This approach, however, confounds the causes of organismal development with the causes of organismal differences and, as such, has only limited utility for addressing the cause of evolutionary change. Molecular mechanisms that are closely involved in both developmental response to environmental signals and major evolutionary innovations and diversifications are uniquely suited to bridge this gap by connecting explicitly the causes of within-generation variation with the causes of divergence of taxa. Developmental pathways of bone formation and a common role for bone morphogenetic proteins (BMPs) in both epigenetic bone remodeling and the evolution of major adaptive diversifications provide such opportunity. We show that variation in timing of ossification can result in similar phenotypic patterns through epigenetically induced changes in gene expression and propose that both genetic accommodation of environmentally induced developmental pathways and flexibility in development across environments evolve through heterochronic shifts in bone maturation relative to exposure to unpredictable environments. We suggest that such heterochronic shifts in ossification can not only buffer development under fluctuating environments while maintaining epigenetic sensitivity critical for normal skeletal formation, but also enable epigenetically induced gene expression to generate specialized morphological adaptations. We review studies of environmental sensitivity of BMP pathways and their regulation of formation, remodeling, and repair of cartilage and bone to examine the hypothesis that BMP-mediated skeletal adaptations are facilitated by evolved reactivity of BMPs to external signals. Surprisingly, no empirical study to date has identified the molecular mechanism behind developmental plasticity in skeletal traits. We outline a conceptual framework for future studies that focus on mediation of phenotypic plasticity in skeletal development by the patterns of BMP expression.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/icm025",
    doi = "10.1093/icb/icm025",
    openalex = "W2129912251",
    references = "doi101046j14209101200200455x"
}

Ein wichtiges Grundprinzip der evolutionären Entwicklungsbiologie ("evo devo") besagt, dass adaptive Mutationen, die die Morphologie betreffen, eher in den cis-regulatorischen Regionen als in den protein-kodierenden Regionen von Genen auftreten. Dieses Argument stützt sich auf zwei Behauptungen: (1) die modulare Natur der cis-regulatorischen Elemente befreit sie weitgehend von schädlichen pleiotropen Effekten, und (2) eine wachsende Menge empirischer Evidenz scheint die vorherrschende Rolle der Genregulationsänderung bei der Anpassung, insbesondere der morphologischen Anpassung, zu unterstützen. Hier diskutieren und kritisieren wir diese Behauptungen. Wir zeigen zunächst, dass es weder eine theoretische noch eine empirische Grundlage für die evo devo-Aussage gibt, dass Anpassungen, die die Morphologie betreffen, durch genetische Mechanismen entstehen, die sich von denen unterscheiden, die Physiologie und andere Merkmale betreffen. Darüber hinaus können einige Formen der Proteinevolution die negativen Konsequenzen der Pleiotropie vermeiden, vor allem durch Gen-Duplikation. Im Lichte der evo devo-Behauptungen untersuchen wir sodann die umfangreichen Daten zur genetischen Basis der Anpassung aus sowohl genomweiten als auch Einzellocus-Studien. Genomstudien stützen die cis-regulatorische Theorie kaum: Viele davon haben Anpassungen in protein-kodierenden Regionen, einschließlich Transkriptionsfaktoren, nachgewiesen, während nur wenige regulatorische Regionen untersucht haben. Bei Einzellocus-Studien stellen wir fest, dass die am häufigsten zitierten Beispiele adaptiver cis-regulatorischer Mutationen sich auf Merkmalverluste statt auf Merkmalsgewinne konzentrieren und keines hat bisher eine evolvierte regulatorische Stelle identifiziert. Im Gegensatz dazu gibt es viele Studien, die sowohl strukturelle Mutationen identifiziert als auch ihren Beitrag zur Anpassung und Artbildung funktionell verifiziert haben. Weder die theoretischen Argumente noch die Daten aus der Natur unterstützen also die Behauptung einer Vorherrschaft cis-regulatorischer Mutationen in der Evolution. Obwohl diese Behauptung wahr sein mag, ist sie bestenfalls vorzeitig. Anpassung und Artbildung erfolgen wahrscheinlich durch eine Kombination aus cis-regulatorischen und strukturellen Mutationen, wobei die letzteren einen wesentlichen Beitrag leisten.

@article{doi101111j15585646200700105x,
    author = "Hoekstra, Hopi E. und Coyne, Jerry A.",
    title = "THE LOCUS OF EVOLUTION: EVO DEVO UND DIE GENETIK DER ANPASSUNG",
    year = "2007",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Ein wichtiges Grundprinzip der evolutionären Entwicklungsbiologie ("evo devo") besagt, dass adaptive Mutationen, die die Morphologie betreffen, eher in den cis-regulatorischen Regionen als in den protein-kodierenden Regionen von Genen auftreten. Dieses Argument stützt sich auf zwei Behauptungen: (1) die modulare Natur der cis-regulatorischen Elemente befreit sie weitgehend von schädlichen pleiotropen Effekten, und (2) eine wachsende Menge empirischer Evidenz scheint die vorherrschende Rolle der Genregulationsänderung bei der Anpassung, insbesondere der morphologischen Anpassung, zu unterstützen. Hier diskutieren und kritisieren wir diese Behauptungen. Wir zeigen zunächst, dass es weder eine theoretische noch eine empirische Grundlage für die evo devo-Aussage gibt, dass Anpassungen, die die Morphologie betreffen, durch genetische Mechanismen entstehen, die sich von denen unterscheiden, die Physiologie und andere Merkmale betreffen. Darüber hinaus können einige Formen der Proteinevolution die negativen Konsequenzen der Pleiotropie vermeiden, vor allem durch Gen-Duplikation. Im Lichte der evo devo-Behauptungen untersuchen wir sodann die umfangreichen Daten zur genetischen Basis der Anpassung aus sowohl genomweiten als auch Einzellocus-Studien. Genomstudien stützen die cis-regulatorische Theorie kaum: Viele davon haben Anpassungen in protein-kodierenden Regionen, einschließlich Transkriptionsfaktoren, nachgewiesen, während nur wenige regulatorische Regionen untersucht haben. Bei Einzellocus-Studien stellen wir fest, dass die am häufigsten zitierten Beispiele adaptiver cis-regulatorischer Mutationen sich auf Merkmalverluste statt auf Merkmalsgewinne konzentrieren und keines hat bisher eine evolvierte regulatorische Stelle identifiziert. Im Gegensatz dazu gibt es viele Studien, die sowohl strukturelle Mutationen identifiziert als auch ihren Beitrag zur Anpassung und Artbildung funktionell verifiziert haben. Weder die theoretischen Argumente noch die Daten aus der Natur unterstützen also die Behauptung einer Vorherrschaft cis-regulatorischer Mutationen in der Evolution. Obwohl diese Behauptung wahr sein mag, ist sie bestenfalls vorzeitig. Anpassung und Artbildung erfolgen wahrscheinlich durch eine Kombination aus cis-regulatorischen und strukturellen Mutationen, wobei die letzteren einen wesentlichen Beitrag leisten.},
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    doi = "10.1111/j.1558-5646.2007.00105.x",
    openalex = "W2101103652",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016s0022283661800727, doi101017s0094837300005224, doi101038366223a0, doi10103847412, doi101038nature04843, doi101038nrg2063, doi101038scientificamerican117998, doi101038sjhdy6800154, doi101073pnas0431157100, doi101073pnas7183028, doi101073pnas9794530, doi101093molbevmsg140, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j001438202004tb00462x, doi101126science1090005, doi101126science1098095, doi101126science1113832, doi101126science29054941151, doi101126science860134, doi101146annurevphysiol631359, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, doi105962bhltitle27468, openalexw3135630760"
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Die Moderne Synthese (MS) ist das aktuelle Paradigma in der Evolutionären Biologie. Sie wurde tatsächlich durch die Erweiterung der konzeptionellen Grundlagen errichtet, die von ihren Vorgängern, dem Darwinismus und dem Neodarwinismus, gelegt wurden. Seit geraumer Zeit wird über eine neue Erweiterte Evolutionssynthese (EES) gesprochen, und dieser Artikel beginnt zu umreißen, warum wir möglicherweise eine solche Erweiterung benötigen und wie sie zustande kommen könnte. Wie der Philosoph Karl Popper bemerkt hat, ist die aktuelle evolutionäre Theorie eine Theorie der Gene, und wir fehlen immer noch eine Theorie der Formen. Das Feld begann tatsächlich als eine Theorie der Formen in Darwins Tagen, und das Hauptziel, das eine EES anstreben wird, ist die Vereinheitlichung unserer Theorien der Gene und der Formen. Dies kann durch ein organisches Einpfropfen neuer Konzepte auf die fundamentale Struktur der MS erreicht werden, insbesondere Evolvierbarkeit, phänotypische Plastizität, epigenetische Vererbung, Komplexitätstheorie und die Theorie der Evolution in hochdimensionalen adaptiven Landschaften.

@article{doi101111j15585646200700246x,
    author = "Pigliucci, Massimo",
    title = "MÜSSEN WIR EINE ERWEITERTE EVOLUTIONSSYNTHETIK?",
    year = "2007",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Die Moderne Synthese (MS) ist das aktuelle Paradigma in der evolutionären Biologie. Sie wurde tatsächlich durch die Erweiterung der konzeptionellen Grundlagen errichtet, die von ihren Vorgängern, dem Darwinismus und dem Neodarwinismus, gelegt wurden. Seit geraumer Zeit wird über eine neue Erweiterte Evolutionssynthese (EES) gesprochen, und dieser Artikel beginnt zu umreißen, warum wir möglicherweise eine solche Erweiterung benötigen und wie sie zustande kommen könnte. Wie der Philosoph Karl Popper bemerkt hat, ist die aktuelle evolutionäre Theorie eine Theorie der Gene, und wir fehlen immer noch eine Theorie der Formen. Das Feld begann tatsächlich als eine Theorie der Formen in Darwins Tagen, und das Hauptziel, das eine EES anstreben wird, ist die Vereinheitlichung unserer Theorien der Gene und der Formen. Dies kann durch ein organisches Einpfropfen neuer Konzepte auf die fundamentale Struktur der MS erreicht werden, insbesondere Evolvierbarkeit, phänotypische Plastizität, epigenetische Vererbung, Komplexitätstheorie und die Theorie der Evolution in hochdimensionalen adaptiven Landschaften.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2007.00246.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2007.00246.x",
    openalex = "W2114930668",
    references = "doi1010021097010x200012152884304aidjez330co2g, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511701559, doi101046j14209101200200455x"
}

@article{turner2007the,
    author = "Turner, Thomas F.",
    title = "The Evolution of Evolutionary Genetics",
    year = "2007",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.1641/b570413",
    doi = "10.1641/b570413",
    number = "4",
    pages = "375-376",
    volume = "57"
}

@article{doi101016jcell200806030,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evo-Devo und eine sich erweiternde evolutionäre Synthese: Eine genetische Theorie der morphologischen Evolution",
    year = "2008",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.030",
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@article{doi101038nrg2323,
    author = "Duffy, Siobain und Shackelton, Laura A. und Holmes, Edward C.",
    title = "Rates of evolutionary change in viruses: patterns and determinants",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2323",
    doi = "10.1038/nrg2323",
    openalex = "W2020939898",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016s0169534703002167, doi101038nrg2146, doi101371journalpbio0040088"
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@article{doi101038nrg2398,
    author = "López‐Maury, Luis und Marguerat, Samuel und Bähler, Jürg",
    title = "Tuning gene expression to changing environments: from rapid responses to evolutionary adaptation",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2398",
    doi = "10.1038/nrg2398",
    openalex = "W2028979517",
    references = "doi101038nrg1088, doi101038nrg2063"
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@article{doi101038nrg2452,
    author = "Phillips, Patrick C.",
    title = "Epistasis — die essentielle Rolle von Gen-Interaktionen in der Struktur und Evolution genetischer Systeme",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2452",
    doi = "10.1038/nrg2452",
    openalex = "W2094189284",
    references = "doi1010160020711x94901198, doi101017s0080456800012163, doi101038091009b0, doi101038nature05874, doi101038nature05911, doi101038ng1537, doi101073pnas0702207104, doi101093hmg11202463, doi101111j001438202003tb00377x, doi101126science1065810, doi101126science1091317, doi101126science1123348, doi101126science1123539, doi101126science860134, doi101159000073735, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle44575, openalexw1554403518"
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Theoretisch sollten Weibchen, die sich asexuell fortpflanzen, eine zweifache Fitnessvorteil gegenüber sexuellen Weibchen haben, doch die Geschlechtsfortpflanzung bleibt bei fast allen Eukaryoten der vorherrschende Fortpflanzungsmodus. Die evolutionäre Aufrechterhaltung der Geschlechtsfortpflanzung ist bei klonalen Pflanzen besonders rätselhaft, da der Übergang von der sexuellen zur ausschließlich asexuellen Fortpflanzung bei diesen Arten eine ständige Möglichkeit darstellt. In diesem Artikel verwende ich veröffentlichte Daten zur Genotypenvielfalt von Populationen klonaler Pflanzen, um fünf Hypothesen über die ökologischen Situationen zu testen, die die klonale Fortpflanzung bei Gefäßpflanzen begrenzen oder begünstigen. Die Daten stammen aus 248 Studien, die 69.000 Individuen in >2000 Populationen von 218 Arten in 74 Pflanzenfamilien umfassen. Die Tests zeigten Folgendes: (1) die Häufigkeit der Klonalität nimmt mit dem Alter der Population zu, was darauf hindeutet, dass die klonale Fortpflanzung durch Störungen begrenzt wird; (2) die klonale Fortpflanzung wird durch die Ausbreitung begrenzt; Klone sind bei aquatischen und apomiktischen Arten häufiger, bei denen die Ausbreitung von klonal produzierten Propagulen weniger limitierend ist; (3) Klone sind in Populationen seltener oder gefährdeter Arten häufiger; (4) Populationen fremder Pflanzen weisen höhere Häufigkeiten der Klonalität auf; und (5) Klone sind an den Rändern der geografischen Verbreitungsgebiete von Arten häufiger. Es scheint also, dass die letztlich erfolgreiche klonale Pflanze eine seltene, aquatische, fremde apomiktische Pflanze sein würde, die in einem ungestörten, geografisch marginalen Lebensraum lebt. Da diese Kombination von Umständen so restriktiv ist, sollte sie vielleicht eher als Zeichen des sexuellen Scheiterns denn als Rezept für den klonalen Erfolg betrachtet werden.

@article{doi101086523357,
    author = "Silvertown, Jonathan",
    title = "The Evolutionary Maintenance of Sexual Reproduction: Evidence from the Ecological Distribution of Asexual Reproduction in Clonal Plants",
    year = "2008",
    journal = "International Journal of Plant Sciences",
    abstract = "Theoretisch sollten Weibchen, die sich asexuell fortpflanzen, eine zweifache Fitnessvorteil gegenüber sexuellen Weibchen haben, doch die Geschlechtsfortpflanzung bleibt bei fast allen Eukaryoten der vorherrschende Fortpflanzungsmodus. Die evolutionäre Aufrechterhaltung der Geschlechtsfortpflanzung ist bei klonalen Pflanzen besonders rätselhaft, da der Übergang von der sexuellen zur ausschließlich asexuellen Fortpflanzung bei diesen Arten eine ständige Möglichkeit darstellt. In diesem Artikel verwende ich veröffentlichte Daten zur Genotypenvielfalt von Populationen klonaler Pflanzen, um fünf Hypothesen über die ökologischen Situationen zu testen, die die klonale Fortpflanzung bei Gefäßpflanzen begrenzen oder begünstigen. Die Daten stammen aus 248 Studien, die 69.000 Individuen in >2000 Populationen von 218 Arten in 74 Pflanzenfamilien umfassen. Die Tests zeigten Folgendes: (1) die Häufigkeit der Klonalität nimmt mit dem Alter der Population zu, was darauf hindeutet, dass die klonale Fortpflanzung durch Störungen begrenzt wird; (2) die klonale Fortpflanzung wird durch die Ausbreitung begrenzt; Klone sind bei aquatischen und apomiktischen Arten häufiger, bei denen die Ausbreitung von klonal produzierten Propagulen weniger limitierend ist; (3) Klone sind in Populationen seltener oder gefährdeter Arten häufiger; (4) Populationen fremder Pflanzen weisen höhere Häufigkeiten der Klonalität auf; und (5) Klone sind an den Rändern der geografischen Verbreitungsgebiete von Arten häufiger. Es scheint also, dass die letztlich erfolgreiche klonale Pflanze eine seltene, aquatische, fremde apomiktische Pflanze sein würde, die in einem ungestörten, geografisch marginalen Lebensraum lebt. Da diese Kombination von Umständen so restriktiv ist, sollte sie vielleicht eher als Zeichen des sexuellen Scheiterns denn als Rezept für den klonalen Erfolg betrachtet werden.",
    url = "https://doi.org/10.1086/523357",
    doi = "10.1086/523357",
    openalex = "W2127863127",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

Der Erhalt der genetischen Vielfalt, eine der drei Hauptformen der Biodiversität, ist ein grundlegendes Anliegen der Naturschutzbiologie, da er das Rohmaterial für evolutionäre Veränderungen liefert und somit das Potenzial zur Anpassung an sich verändernde Umgebungen bietet. Mittels Meta-Analysen haben wir die Allgemeingültigkeit der Hypothesen getestet, dass die Habitatfragmentierung die genetische Vielfalt von Pflanzenpopulationen beeinflusst und dass bestimmte Lebensgeschichte- und ökologische Merkmale von Pflanzen unterschiedliche Anfälligkeit für genetische Erosion in fragmentierten Lebensräumen bestimmen können. Zusätzlich haben wir bewertet, ob bestimmte methodische Ansätze, die von Autoren verwendet werden, die Fähigkeit beeinflussen, Fragmentierungseffekte auf die genetische Vielfalt von Pflanzen zu erkennen. Wir fanden insgesamt große und negative Effekte der Fragmentierung auf die genetische Vielfalt und die Auskreuzungsraten, jedoch keine Effekte auf Inzidenz-Koeffizienten. Signifikante Anstiege des Inzidenz-Koeffizienten in fragmentierten Lebensräumen wurden nur in Studien beobachtet, die Nachkommen analysierten. Das Paarungssystem und der Seltenheitsstatus der Pflanzen erklärten den höchsten Anteil der Variation in den Effektgrößen zwischen den Arten. Das Alter des Fragments war ebenfalls entscheidend für die Erklärung der Variabilität zwischen den Effektgrößen: je größer die Anzahl der Generationen, die unter Fragmentierungsbedingungen vergangen sind, desto größer ist die negative Magnitude der Effektgrößen auf die Heterozygotie. Unsere Ergebnisse deuten auch darauf hin, dass die Fragmentierung die Paarungsmuster in Richtung erhöhter Selbstbestäubung verschiebt. Wir schließen, dass aktuelle Naturschutzbemühungen in fragmentierten Lebensräumen sich auf häufige oder kürzlich seltene Arten und hauptsächlich auf auskreuzende Arten konzentrieren sollten und wichtige Fragen skizzieren, die in zukünftigen Forschungsarbeiten zu diesem Bereich angesprochen werden müssen.

@article{doi101111j1365294x200803971x,
    author = "Aguilar, Ramiro und Quesada, Maurício und Ashworth, Lorena und Herrerías‐Diego, Yvonne und Lobo, Jorge A.",
    title = "Genetische Folgen der Habitatfragmentierung in Pflanzenpopulationen: anfällige Signale in Pflanzenmerkmalen und methodische Ansätze",
    year = "2008",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Der Erhalt der genetischen Vielfalt, eine der drei Hauptformen der Biodiversität, ist ein grundlegendes Anliegen der Naturschutzbiologie, da er das Rohmaterial für evolutionäre Veränderungen liefert und somit das Potenzial zur Anpassung an sich verändernde Umgebungen bietet. Mittels Meta-Analysen haben wir die Allgemeingültigkeit der Hypothesen getestet, dass die Habitatfragmentierung die genetische Vielfalt von Pflanzenpopulationen beeinflusst und dass bestimmte Lebensgeschichte- und ökologische Merkmale von Pflanzen unterschiedliche Anfälligkeit für genetische Erosion in fragmentierten Lebensräumen bestimmen können. Zusätzlich haben wir bewertet, ob bestimmte methodische Ansätze, die von Autoren verwendet werden, die Fähigkeit beeinflussen, Fragmentierungseffekte auf die genetische Vielfalt von Pflanzen zu erkennen. Wir fanden insgesamt große und negative Effekte der Fragmentierung auf die genetische Vielfalt und die Auskreuzungsraten, jedoch keine Effekte auf Inzidenz-Koeffizienten. Signifikante Anstiege des Inzidenz-Koeffizienten in fragmentierten Lebensräumen wurden nur in Studien beobachtet, die Nachkommen analysierten. Das Paarungssystem und der Seltenheitsstatus der Pflanzen erklärten den höchsten Anteil der Variation in den Effektgrößen zwischen den Arten. Das Alter des Fragments war ebenfalls entscheidend für die Erklärung der Variabilität zwischen den Effektgrößen: je größer die Anzahl der Generationen, die unter Fragmentierungsbedingungen vergangen sind, desto größer ist die negative Magnitude der Effektgrößen auf die Heterozygotie. Unsere Ergebnisse deuten auch darauf hin, dass die Fragmentierung die Paarungsmuster in Richtung erhöhter Selbstbestäubung verschiebt. Wir schließen, dass aktuelle Naturschutzbemühungen in fragmentierten Lebensräumen sich auf häufige oder kürzlich seltene Arten und hauptsächlich auf auskreuzende Arten konzentrieren sollten und wichtige Fragen skizzieren, die in zukünftigen Forschungsarbeiten zu diesem Bereich angesprochen werden müssen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2008.03971.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2008.03971.x",
    openalex = "W2143144439",
    references = "doi101126science8290956, doi101146annureves15110184000433"
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Ist genetische Evolution vorhersagbar? Evolutionsbiologen der Entwicklungsbiologie haben argumentiert, dass die Antwort für morphologische Merkmale zumindest ein klares Ja lautet. Die meisten Mutationen, die morphologische Variation verursachen, sollten sich in den cis-regulatorischen, nicht in den kodierenden Regionen von Entwicklungsgenen befinden. Diese „cis-regulatorische Hypothese" wurde kürzlich angegriffen. In diesem Überblick beschreiben und kritisieren wir zunächst die Argumente, die zur Unterstützung der cis-regulatorischen Hypothese vorgeschlagen wurden. Anschließend testen wir die empirische Unterstützung für die cis-regulatorische Hypothese mit einer umfassenden Erhebung von Mutationen, die für die phänotypische Evolution bei mehrzelligen Organismen verantwortlich sind. Cis-regulatorische Mutationen stellen derzeit etwa 22 % der 331 identifizierten genetischen Veränderungen dar, obwohl die Anzahl der jährlich veröffentlichten cis-regulatorischen Veränderungen rapide zunimmt. Über der Art-Ebene hinaus sind cis-regulatorische Mutationen, die die Morphologie verändern, häufiger als kodierende Veränderungen. Auch über der Art-Ebene dominieren cis-regulatorische Mutationen bei Genen, die nicht an der terminalen Differenzierung beteiligt sind. Diese Muster implizieren, dass die einfache Frage „Verursachen kodierende oder cis-regulatorische Mutationen mehr phänotypische Evolution?" interessantere Phänomene verbirgt. Evolution in verschiedenen Arten von Populationen und über unterschiedliche Zeiträume hinweg kann zur Selektion verschiedener Arten von Mutationen führen. Die Vorhersage der genetischen Grundlage der Evolution erfordert eine umfassende Synthese der molekularen Entwicklungsbiologie und der Populationsgenetik.

@article{doi101111j15585646200800450x,
    author = "Stern, David L. und Courtier‐Orgogozo, Virginie",
    title = "THE LOCI OF EVOLUTION: HOW PREDICTABLE IS GENETIC EVOLUTION?",
    year = "2008",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Ist genetische Evolution vorhersagbar? Evolutionsbiologen der Entwicklungsbiologie haben argumentiert, dass die Antwort für morphologische Merkmale zumindest ein klares Ja lautet. Die meisten Mutationen, die morphologische Variation verursachen, sollten sich in den cis-regulatorischen, nicht in den kodierenden Regionen von Entwicklungsgenen befinden. Diese „cis-regulatorische Hypothese" wurde kürzlich angegriffen. In diesem Überblick beschreiben und kritisieren wir zunächst die Argumente, die zur Unterstützung der cis-regulatorischen Hypothese vorgeschlagen wurden. Anschließend testen wir die empirische Unterstützung für die cis-regulatorische Hypothese mit einer umfassenden Erhebung von Mutationen, die für die phänotypische Evolution bei mehrzelligen Organismen verantwortlich sind. Cis-regulatorische Mutationen stellen derzeit etwa 22\% der 331 identifizierten genetischen Veränderungen dar, obwohl die Anzahl der jährlich veröffentlichten cis-regulatorischen Veränderungen rapide zunimmt. Über der Art-Ebene hinaus sind cis-regulatorische Mutationen, die die Morphologie verändern, häufiger als kodierende Veränderungen. Auch über der Art-Ebene dominieren cis-regulatorische Mutationen bei Genen, die nicht an der terminalen Differenzierung beteiligt sind. Diese Muster implizieren, dass die einfache Frage „Verursachen kodierende oder cis-regulatorische Mutationen mehr phänotypische Evolution?" interessantere Phänomene verbirgt. Evolution in verschiedenen Arten von Populationen und über unterschiedliche Zeiträume hinweg kann zur Selektion verschiedener Arten von Mutationen führen. Die Vorhersage der genetischen Grundlage der Evolution erfordert eine umfassende Synthese der molekularen Entwicklungsbiologie und der Populationsgenetik.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2008.00450.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2008.00450.x",
    openalex = "W2094005099",
    references = "doi101006dbio19960034, doi1010079783642866593, doi101016jibmb200403018, doi101038376479a0, doi101038nature05874, doi101073pnas9794530, doi101093genetics15141531, doi101093genetics16297, doi101098rspb19790086, doi101111j001438202000tb00002x, doi101126science1098095, doi101126science1113832, doi101126science29054941151, doi1023072529912, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle46292, doi105962bhltitle59991"
}

Evolutionäre Drücke auf Proteine werden häufig durch das Verhältnis der Substitutionsraten an nicht-synonymen und synonymen Stellen quantifiziert. Das dN/dS-Verhältnis wurde ursprünglich für die Anwendung auf weit divergierte Sequenzen entwickelt, deren Unterschiede Substitutionen darstellen, die entlang unabhängiger Linien fixiert wurden. Dennoch wird das dN/dS-Maß häufig auf Sequenzen angewendet, die aus einer einzigen Population stammen, deren Unterschiede segregierende Polymorphismen darstellen. Hier untersuchen wir das erwartete dN/dS-Verhältnis für aus einer einzigen Population unter Selektion gezogene Stichproben und finden, dass in diesem Kontext das dN/dS relativ unempfindlich gegenüber dem Selektionskoeffizienten ist. Darüber hinaus wird das charakteristische Merkmal positiver Selektion über divergente Linien, dN/dS>1, innerhalb einer Population verletzt. Für Populationsstichproben folgt die Beziehung zwischen Selektion und dN/dS keiner monotonen Funktion, und es kann daher unmöglich sein, Selektionsdrücke aus dem dN/dS zu ableiten. Diese Ergebnisse haben erhebliche Implikationen für die Interpretation von dN/dS-Messungen unter populationsgenetischen Stichproben.

@article{doi101371journalpgen1000304,
    author = "Kryazhimskiy, Sergey und Plotkin, Joshua B.",
    title = "The Population Genetics of dN/dS",
    year = "2008",
    journal = "PLoS Genetics",
    abstract = "Evolutionäre Drücke auf Proteine werden häufig durch das Verhältnis der Substitutionsraten an nicht-synonymen und synonymen Stellen quantifiziert. Das dN/dS-Verhältnis wurde ursprünglich für die Anwendung auf weit divergierte Sequenzen entwickelt, deren Unterschiede Substitutionen darstellen, die entlang unabhängiger Linien fixiert wurden. Dennoch wird das dN/dS-Maß häufig auf Sequenzen angewendet, die aus einer einzigen Population stammen, deren Unterschiede segregierende Polymorphismen darstellen. Hier untersuchen wir das erwartete dN/dS-Verhältnis für aus einer einzigen Population unter Selektion gezogene Stichproben und finden, dass in diesem Kontext das dN/dS relativ unempfindlich gegenüber dem Selektionskoeffizienten ist. Darüber hinaus wird das charakteristische Merkmal positiver Selektion über divergente Linien, dN/dS>1, innerhalb einer Population verletzt. Für Populationsstichproben folgt die Beziehung zwischen Selektion und dN/dS keiner monotonen Funktion, und es kann daher unmöglich sein, Selektionsdrücke aus dem dN/dS zu ableiten. Diese Ergebnisse haben erhebliche Implikationen für die Interpretation von dN/dS-Messungen unter populationsgenetischen Stichproben.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000304",
    doi = "10.1371/journal.pgen.1000304",
    openalex = "W2045641296",
    references = "doi101007978940115210512, doi101023a1017067816551, doi101146annureves23110192001403"
}

@article{doi101057jibs200995,
    author = "Cantwell, John und Dunning, John H. und Lundan, Sarianna M.",
    title = "An evolutionary approach to understanding international business activity: The co-evolution of MNEs and the institutional environment",
    year = "2009",
    journal = "Journal of International Business Studies",
    url = "https://doi.org/10.1057/jibs.2009.95",
    doi = "10.1057/jibs.2009.95",
    openalex = "W2093229054",
    references = "doi105860choice416654"
}

Sexuelle Fortpflanzung birgt eine Reihe von Kosten, und dennoch betreiben die meisten Eukaryoten Geschlechtsverkehr, zumindest gelegentlich. In diesem Artikel überprüfe ich frühe Modelle zur Erklärung der Evolution der sexuellen Fortpflanzung und warum sie dies nicht konnten. Neuere Bemühungen haben versucht, die Komplexitäten der Evolution in der realen Welt zu berücksichtigen, mit einer Selektion, die sich über Zeit und Raum verändert, mit Unterschieden zwischen Individuen in der Tendenz zur sexuellen Fortpflanzung und mit Populationen, die in ihrer Größe begrenzt sind. Diese jüngeren Bemühungen haben die Bedingungen geklärt, die am ehesten erklären, warum sexuelle Fortpflanzung so verbreitet ist, wie die Artikel in diesem Symposium-Heft des American Naturalist belegen.

@article{doi101086599084,
    author = "Otto, Sarah P.",
    title = "The Evolutionary Enigma of Sex",
    year = "2009",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Sexual reproduction entails a number of costs, and yet the majority of eukaryotes engage in sex, at least occasionally. In this article, I review early models to explain the evolution of sex and why they failed to do so. More recent efforts have attempted to account for the complexities of evolution in the real world, with selection that varies over time and space, with differences among individuals in the tendency to reproduce sexually, and with populations that are limited in size. These recent efforts have clarified the conditions that are most likely to explain why sex is so common, as exemplified by the articles in this symposium issue of the American Naturalist.",
    url = "https://doi.org/10.1086/599084",
    doi = "10.1086/599084",
    openalex = "W1995865334",
    references = "doi101111j001438202002tb00188x"
}

Viele, wenn nicht die meisten Enzyme können promiskuitiv Reaktionen katalysieren oder auf Substrate wirken, die nicht denen entsprechen, für die sie evolviert sind. Hier diskutieren wir die strukturellen, mechanistischen und evolutionären Implikationen dieser Manifestation der Untreue der molekularen Erkennung. Wir definieren Promiskuität und verwandte Phänomene und befassen uns auch mit ihrer Allgemeinheit und physiologischen Implikationen. Wir diskutieren die mechanistische Enzymologie der Promiskuität – wie Enzyme, die im Allgemeinen exquisite Spezifität ausüben, andere und manchmal kaum verwandte Reaktionen katalysieren. Schließlich befassen wir uns mit der Hypothese, dass promiskuitische enzymatische Aktivitäten als evolutionäre Ausgangspunkte dienen, und heben die einzigartigen evolutionären Merkmale promiskuitischer Enzymfunktionen hervor.

@article{doi101146annurevbiochem030409143718,
    author = "Khersonsky, Olga und Tawfik, Dan S.",
    title = "Enzyme Promiscuity: A Mechanistic and Evolutionary Perspective",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Biochemistry",
    abstract = "Viele, wenn nicht die meisten Enzyme können promiskuitiv Reaktionen katalysieren oder auf Substrate wirken, die nicht denen entsprechen, für die sie evolviert sind. Hier diskutieren wir die strukturellen, mechanistischen und evolutionären Implikationen dieser Manifestation der Untreue der molekularen Erkennung. Wir definieren Promiskuität und verwandte Phänomene und befassen uns auch mit ihrer Allgemeinheit und physiologischen Implikationen. Wir diskutieren die mechanistische Enzymologie der Promiskuität – wie Enzyme, die im Allgemeinen exquisite Spezifität ausüben, andere und manchmal kaum verwandte Reaktionen katalysieren. Schließlich befassen wir uns mit der Hypothese, dass promiskuitische enzymatische Aktivitäten als evolutionäre Ausgangspunkte dienen und heben die einzigartigen evolutionären Merkmale promiskuitischer Enzymfunktionen hervor.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-030409-143718",
    doi = "10.1146/annurev-biochem-030409-143718",
    openalex = "W2128312954",
    references = "doi1010079783642866593, doi101038nature06879, doi101038nrg2482, doi101073pnas95158420, doi101126science1123348, doi101126science1123539, doi101126science1152692, doi101126science860134, doi101146annurevmi30100176002205, doi105860choice370939, openalexw3086983054, openalexw588942190"
}

Viele blühende Pflanzen zeigen duale Reproduktionsweisen und produzieren sowohl sexuelle als auch asexuelle Nachkommen. Die häufigste Form der asexuellen Reproduktion ist das klonale Wachstum, bei dem vegetative Module (Rameten) vom elterlichen Genotyp (Genet) produziert werden. Bei Pflanzen treten sexuelle und asexuelle Reproduktion meist gleichzeitig auf, was zu Allokationskompromissen und Antagonismen zwischen den Reproduktionsweisen führen kann. Unsere Übersicht betrachtet die ökologischen und evolutionären Konsequenzen der funktionellen Interaktionen zwischen klonaler Reproduktion und Bestäubung sowie Paarung. Klonale Reproduktion ist häufig mit Massenblüte, eingeschränkter Pollenausbreitung und geitonogamer Selbstbestäubung verbunden, Prozesse, die zu Inzuchtdepression und Pollenabzug führen können. Wir überprüfen Belege für die korrelierte Evolution von Klonalität und sexuellen Systemen, insbesondere der Selbstinkompatibilität, und identifizieren mehrere Blütenmechanismen, die darauf abzielen, Paarungskosten durch Einschränkung der Selbstbestäubung und des Pollenabzugs zu reduzieren. Abschließend diskutieren wir den Verlust der Sexualität bei klonalen Pflanzen und betrachten die genetische und umweltbedingte Grundlage der sexuellen Dysfunktion.

@article{doi101146annurevecolsys110308120258,
    author = "Vallejo‐Marín, Mario und Dorken, Marcel E. und Barrett, Spencer C. H.",
    title = "The Ecological and Evolutionary Consequences of Clonality for Plant Mating",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Many flowering plants exhibit dual reproductive modes, producing both sexual and asexual offspring. The commonest form of asexual reproduction is clonal growth, in which vegetative modules (ramets) are produced by the parental genotype (genet). In plants, sexual and asexual reproduction usually occur simultaneously, and this can lead to allocation trade-offs and antagonism between reproductive modes. Our review considers the ecological and evolutionary consequences of functional interactions between clonal reproduction and pollination and mating. Clonal reproduction is commonly associated with mass flowering, restricted pollen dispersal, and geitonogamous self-pollination, processes that can result in inbreeding depression and pollen discounting. We review evidence for the correlated evolution of clonality and sexual systems, particularly self-incompatibility, and identify several floral mechanisms that function to reduce mating costs by limiting selfing and pollen discounting. We conclude by discussing the loss of sexuality in clonal plants and consider the genetic and environmental basis of sexual dysfunction.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.110308.120258",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.110308.120258",
    openalex = "W1993026968",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

Seit der Integration verschiedener Stränge evolutionärer Gedanken in das, was als die Moderne Synthese (MS) bekannt wurde, sind mehr als ein halbes Jahrhundert vergangen. Dies ist das konzeptionelle Rahmenwerk, das die evolutionäre Theorie seit den 1940er Jahren definiert hat. Trotz erheblicher Fortschritte seitdem in allen methodologischen und disziplinären Bereichen der Biologie, einschließlich der Molekulargenetik, der Entwicklungsbiologie und der „-omics"-Felder, ist das Rahmenwerk der Moderne Synthese überraschend unverändert geblieben. Obwohl es immer noch als das Standardtheoretische Paradigma der Evolutionsbiologie angesehen wird, haben sich seit einigen Jahren Kritiker aus verschiedenen Bereichen der Biologie mit Aspekten der Moderne Synthese befasst, und entscheidende neue Konzepte wurden entwickelt, die über ihren ursprünglichen Umfang hinausgehen (z. B. Maynard Smith und Szathmary 1995; Jablonka und Lamb 1995; Schlichting und Pigliucci 1998; Gould 2002; Muller und Newman 2003; Odling-Smee et al. 2003; West-Eberhard 2003; Kirschner und Gerhart 2005). Als Folge davon haben sich Forderungen nach einer Erweiterung des Rahmens der Moderne Synthese intensiviert (R. L. Carroll 2000; Love 2003a; Kutschera und Niklas 2004; Muller 2007; Pigliucci 2007; Rose und Oakley 2007; S. B. Carroll 2008), was zu weiteren wissenschaftlichen Debatten führte (Pennisi 2008; Whitfield 2008). Unter dem Titel „Erweiterte Synthese" stellt dieses Band eine umfassende Übersicht über Schlüsselideen in diesem facettenreichen Forschungsprogramm dar und einen ersten Blick auf eine erweiterte Theorie der Evolution als ein laufendes Projekt. Wir haben einige der prominentesten Autoren gesammelt, die über neue Richtungen in der Evolutionsbiologie geschrieben haben, und sie gebeten, zu erklären, wohin sie glauben, dass das Feld geht, und wie die neuen Konzepte mit der Sichtweise der Moderne Synthese auf das, was Evolution ist, übereinstimmen. Einige dieser Autoren sind skeptisch, dass irgendwelche fundamentalen Veränderungen in den aktuellen Positionen erkennbar sind, während andere zu großen Revisionen der MS neigen. Die meisten Beiträge liegen irgendwo dazwischen und akzeptieren viele von

@incollection{doi107551mitpress82780030003,
    author = "Pigliucci, Massimo und Müller, Gerd B.",
    title = "Elemente einer erweiterten evolutionären Synthese",
    year = "2010",
    booktitle = "The MIT Press eBooks",
    abstract = "Seit der Integration verschiedener Stränge evolutionärer Gedanken in das, was als die Moderne Synthese (MS) bekannt wurde, sind mehr als ein halbes Jahrhundert vergangen. Dies ist das konzeptionelle Rahmenwerk, das die evolutionäre Theorie seit den 1940er Jahren definiert hat. Trotz erheblicher Fortschritte seitdem in allen methodologischen und disziplinären Bereichen der Biologie, einschließlich der Molekulargenetik, der Entwicklungsbiologie und der „-omics"-Felder, ist das Rahmenwerk der Moderne Synthese überraschend unverändert geblieben. Obwohl es immer noch als das Standardtheoretische Paradigma der Evolutionsbiologie angesehen wird, haben sich seit einigen Jahren Kritiker aus verschiedenen Bereichen der Biologie mit Aspekten der Moderne Synthese befasst, und entscheidende neue Konzepte wurden entwickelt, die über ihren ursprünglichen Umfang hinausgehen (z. B. Maynard Smith und Szathmary 1995; Jablonka und Lamb 1995; Schlichting und Pigliucci 1998; Gould 2002; Muller und Newman 2003; Odling-Smee et al. 2003; West-Eberhard 2003; Kirschner und Gerhart 2005). Als Folge davon haben sich Forderungen nach einer Erweiterung des Rahmens der Moderne Synthese intensiviert (R. L. Carroll 2000; Love 2003a; Kutschera und Niklas 2004; Muller 2007; Pigliucci 2007; Rose und Oakley 2007; S. B. Carroll 2008), was zu weiteren wissenschaftlichen Debatten führte (Pennisi 2008; Whitfield 2008). Unter dem Titel „Erweiterte Synthese" stellt dieses Band eine umfassende Übersicht über Schlüsselideen in diesem facettenreichen Forschungsprogramm dar und einen ersten Blick auf eine erweiterte Theorie der Evolution als ein laufendes Projekt. Wir haben einige der prominentesten Autoren gesammelt, die über neue Richtungen in der Evolutionsbiologie geschrieben haben, und sie gebeten, zu erklären, wohin sie glauben, dass das Feld geht, und wie die neuen Konzepte mit der Sichtweise der Moderne Synthese auf das, was Evolution ist, übereinstimmen. Einige dieser Autoren sind skeptisch, dass irgendwelche fundamentalen Veränderungen in den aktuellen Positionen erkennbar sind, während andere zu großen Revisionen der MS neigen. Die meisten Beiträge liegen irgendwo dazwischen und akzeptieren viele von",
    url = "https://doi.org/10.7551/mitpress/8278.003.0003",
    doi = "10.7551/mitpress/8278.003.0003",
    openalex = "W2461851698",
    references = "doi101046j14209101200200455x"
}

@article{doi101038ng1034,
    author = "Toprak, Erdal und Veres, Adrian und Michel, Jean-Baptiste und Chait, Remy und Hartl, Daniel L. und Kishony, Roy",
    title = "Evolutionäre Wege zur Antibiotikaresistenz unter dynamisch aufrechterhaltener Arzneimittelselektion",
    year = "2011",
    journal = "Nature Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/ng.1034",
    doi = "10.1038/ng.1034",
    openalex = "W2012977051",
    references = "doi101126science1123539"
}

Die Erklärung der Entstehung neuer Merkmale ist zentral für die Evolution. Die etablierte Theorie besagt, dass entwicklungsbedingte Plastizität, die Fähigkeit eines Individuums, seine Entwicklung in Reaktion auf Umweltbedingungen zu modifizieren, die Evolution neuer Merkmale fördern könnte. Ob und wie jedoch diese entwicklungsbedingte Flexibilität Innovationen fördert, die über evolutionäre Zeiträume hinweg bestehen bleiben, bleibt unklar. Hier untersuchen wir drei verschiedene Wege, auf denen entwicklungsbedingte Plastizität die evolutionäre Innovation fördern kann. Erstens zeigen wir, wie der Prozess der genetischen Akkommodation einen machbaren und möglicherweise häufigen Weg darstellt, auf dem umweltinduzierte Phänotypen der vererbbaren Modifikation unterliegen können. Zweitens postulieren wir, dass die entwicklungsbedingten Grundlagen der Plastizität die Freiheitsgrade erhöhen, durch die Umwelt- und genetische Faktoren die Ontogenie beeinflussen, wodurch die Ziele für evolutionäre Prozesse diversifiziert und die Möglichkeiten zur Konstruktion neuer, funktionaler und potenziell adaptiver Phänotypen erhöht werden. Schließlich untersuchen wir die entwicklungsbedingten genetischen Architekturen der umweltabhängigen Merkmalsausdrücke und heben ihre spezifischen Implikationen für die evolutionäre Entstehung neuer Merkmale hervor. Wir überprüfen kritisch die empirischen Belege, die jeden dieser Prozesse unterstützen, und schlagen zukünftige Experimente und Tests vor, die die Wechselwirkung zwischen Umweltfaktoren, bedingungsabhängiger Entwicklung und der Einleitung sowie Ausformung neuer Phänotypen weiter aufklären würden.

@article{doi101098rspb20110971,
    author = "Moczek, Armin P. und Sultan, Sonia E. und Foster, Susan A. und Ledón-Rettig, Cris C. und Dworkin, Ian und Nijhout, H. Fred und Abouheif, Ehab und Pfennig, David W.",
    title = "Die Rolle der entwicklungsbedingten Plastizität bei der evolutionären Innovation",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Die Erklärung der Entstehung neuer Merkmale ist zentral für die Evolution. Die etablierte Theorie besagt, dass entwicklungsbedingte Plastizität, die Fähigkeit eines Individuums, seine Entwicklung in Reaktion auf Umweltbedingungen zu modifizieren, die Evolution neuer Merkmale fördern könnte. Ob und wie jedoch diese entwicklungsbedingte Flexibilität Innovationen fördert, die über evolutionäre Zeiträume hinweg bestehen bleiben, bleibt unklar. Hier untersuchen wir drei verschiedene Wege, auf denen entwicklungsbedingte Plastizität die evolutionäre Innovation fördern kann. Erstens zeigen wir, wie der Prozess der genetischen Akkommodation einen machbaren und möglicherweise häufigen Weg darstellt, auf dem umweltinduzierte Phänotypen der vererbbaren Modifikation unterliegen können. Zweitens postulieren wir, dass die entwicklungsbedingten Grundlagen der Plastizität die Freiheitsgrade erhöhen, durch die Umwelt- und genetische Faktoren die Ontogenie beeinflussen, wodurch die Ziele für evolutionäre Prozesse diversifiziert und die Möglichkeiten zur Konstruktion neuer, funktionaler und potenziell adaptiver Phänotypen erhöht werden. Schließlich untersuchen wir die entwicklungsbedingten genetischen Architekturen der umweltabhängigen Merkmalsausdrücke und heben ihre spezifischen Implikationen für die evolutionäre Entstehung neuer Merkmale hervor. Wir überprüfen kritisch die empirischen Belege, die jeden dieser Prozesse unterstützen, und schlagen zukünftige Experimente und Tests vor, die die Wechselwirkung zwischen Umweltfaktoren, bedingungsabhängiger Entwicklung und der Einleitung sowie Ausformung neuer Phänotypen weiter aufklären würden.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2011.0971",
    doi = "10.1098/rspb.2011.0971",
    openalex = "W2142774476",
    references = "doi101038sjhdy6800154, doi101098rstb20090263, doi101111j001438202003tb00377x, doi1023072411226"
}

@article{salverda2011evolutionary,
    author = "Salverda, Merijn L.M. und de Visser, J. Arjan G.M.",
    title = "Evolutionary Genetics: Evolution mit Voraussicht",
    year = "2011",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2011.04.023",
    doi = "10.1016/j.cub.2011.04.023",
    number = "10",
    pages = "R398-R400",
    volume = "21"
}

Exosymbiosen unter Rindenkäfern (Curculionidae, Scolytinae) und Pilzen (hauptsächlich ophiostomatoide Ascomyceten) sind weit verbreitet und vielfältig. Die Assoziationen reichen von mutualistisch bis kommensal und von fakultativ bis obligat. Einige Pilze sind hochspezifisch und assoziiert nur mit einer einzigen Käferspezies, während andere mit vielen assoziiert sein können. Darüber hinaus sind die meisten dieser Symbiosen multipartit, wobei der Wirtskäfer mit zwei oder mehr konsistenten Partnern assoziiert ist. Mycangia, Strukturen des Käferinteguments, die der Pilztransport dienen, haben sich in den Scolytinae mehrfach entwickelt. Die Evolution solcher komplexer, spezialisierter Strukturen deutet auf einen hohen Grad an gegenseitiger Abhängigkeit zwischen den Käfern und ihren Pilzpartnern hin. Leider bleiben die Prozesse, die die heutigen Käfer-Pilz-Symbiosen geformt haben, schlecht verstanden. Phylogenie, der Grad und die Art der Abhängigkeit von Partnern, Übertragungsmodus der Symbionten (vertikal vs. horizontal), Effekte der abiotischen Umwelt und Interaktionen zwischen Symbionten selbst oder mit anderen Mitgliedern der biotischen Gemeinschaft spielen alle wichtige Rollen bei der Bestimmung der Zusammensetzung, Treue und Langlebigkeit von Assoziationen zwischen Käfern und ihren Pilzpartnern. In diesem Review gebe ich einen Überblick über diese Assoziationen und diskutiere, wie Evolution und ökologische Prozesse zusammenwirkten, um diese faszinierenden, komplexen Symbiosen zu formen.

@article{doi103390insects3010339,
    author = "Six, Diana L.",
    title = "Ökologische und evolutionäre Determinanten der Rindenkäfer-Pilz-Symbiosen",
    year = "2012",
    journal = "Insects",
    abstract = "Exosymbiosen unter Rindenkäfern (Curculionidae, Scolytinae) und Pilzen (hauptsächlich ophiostomatoide Ascomyceten) sind weit verbreitet und vielfältig. Die Assoziationen reichen von mutualistisch bis kommensal und von fakultativ bis obligat. Einige Pilze sind hochspezifisch und assoziiert nur mit einer einzigen Käferspezies, während andere mit vielen assoziiert sein können. Darüber hinaus sind die meisten dieser Symbiosen multipartit, wobei der Wirtskäfer mit zwei oder mehr konsistenten Partnern assoziiert ist. Mycangia, Strukturen des Käferinteguments, die der Pilztransport dienen, haben sich in den Scolytinae mehrfach entwickelt. Die Evolution solcher komplexer, spezialisierter Strukturen deutet auf einen hohen Grad an gegenseitiger Abhängigkeit zwischen den Käfern und ihren Pilzpartnern hin. Leider bleiben die Prozesse, die die heutigen Käfer-Pilz-Symbiosen geformt haben, schlecht verstanden. Phylogenie, der Grad und die Art der Abhängigkeit von Partnern, Übertragungsmodus der Symbionten (vertikal vs. horizontal), Effekte der abiotischen Umwelt und Interaktionen zwischen Symbionten selbst oder mit anderen Mitgliedern der biotischen Gemeinschaft spielen alle wichtige Rollen bei der Bestimmung der Zusammensetzung, Treue und Langlebigkeit von Assoziationen zwischen Käfern und ihren Pilzpartnern. In diesem Review gebe ich einen Überblick über diese Assoziationen und diskutiere, wie Evolution und ökologische Prozesse zusammenwirkten, um diese faszinierenden, komplexen Symbiosen zu formen.",
    url = "https://doi.org/10.3390/insects3010339",
    doi = "10.3390/insects3010339",
    openalex = "W1982731458",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

@article{doi101038nrg3483,
    author = "Stern, David L.",
    title = "The genetic causes of convergent evolution",
    year = "2013",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3483",
    doi = "10.1038/nrg3483",
    openalex = "W2046793790",
    references = "doi101016jcell200806030, doi101016jtree200709008, doi101038287795a0, doi101038nature10944, doi101038nature11041, doi101038ng1946, doi101038nrg2452, doi101073pnas9794530, doi101093acref97801995711230010001, doi101105tpc115949, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200800450x, doi101111j15585646201101289x, doi101126science1113832, doi101126science1123539, doi101126science1188021, doi101126science1208227, doi101146annurevento451371, openalexw2080618944"
}

Eine zentrale biologische Frage ist, wie natürliche Organismen so evolvierbar sind (fähig, sich schnell an neue Umgebungen anzupassen). Ein Schlüsselfaktor für die Evolvierbarkeit ist die weit verbreitete Modularität biologischer Netzwerke – ihre Organisation als funktionale, spärlich verbundene Subeinheiten – doch es herrscht keine Einigkeit darüber, warum Modularität selbst evolviert ist. Obwohl die meisten Hypothesen eine indirekte Selektion für Evolvierbarkeit annehmen, zeigen wir hier, dass der allgegenwärtige, direkte Selektionsdruck, die Kosten von Verbindungen zwischen Netzwerkknoten zu reduzieren, die Entstehung modularer Netzwerke verursacht. Computerevolutionsexperimente mit Selektionsdrücken zur Maximierung der Netzwerkleistung und Minimierung der Verbindungskosten ergeben Netzwerke, die deutlich modularer und evolvierbarer sind als Kontrollexperimente, die nur die Leistung selektieren. Diese Ergebnisse werden die Forschung in zahlreichen Disziplinen, wie Neurobiologie und Genetik, katalysieren und unsere Fähigkeit verbessern, Evolution für ingenieurtechnische Zwecke zu nutzen.

@article{doi101098rspb20122863,
    author = "Clune, Jeff und Mouret, Jean-Baptiste und Lipson, Hod",
    title = "The evolutionary origins of modularity",
    year = "2013",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "A central biological question is how natural organisms are so evolvable (capable of quickly adapting to new environments). A key driver of evolvability is the widespread modularity of biological networks--their organization as functional, sparsely connected subunits--but there is no consensus regarding why modularity itself evolved. Although most hypotheses assume indirect selection for evolvability, here we demonstrate that the ubiquitous, direct selection pressure to reduce the cost of connections between network nodes causes the emergence of modular networks. Computational evolution experiments with selection pressures to maximize network performance and minimize connection costs yield networks that are significantly more modular and more evolvable than control experiments that only select for performance. These results will catalyse research in numerous disciplines, such as neuroscience and genetics, and enhance our ability to harness evolution for engineering purposes.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2012.2863",
    doi = "10.1098/rspb.2012.2863",
    openalex = "W2097351860",
    references = "doi101038nature01568, doi101038nrg2278"
}

Das Verständnis der Auswirkungen der Landschaftsheterogenität auf die räumliche genetische Variation ist ein primäres Ziel der Landschaftsgenetik. Ökologische und geografische Variablen können zur genetischen Struktur beitragen durch geografische Isolation, bei der geografische Barrieren und Entfernungen den Genfluss einschränken, und ökologische Isolation, bei der der Genfluss zwischen Populationen, die unterschiedliche Lebensräume bewohnen, durch Selektion gegen Dispersanten, die zwischen ihnen wandern, begrenzt wird. Obwohl Methoden entwickelt wurden, um die geografische Isolation im Detail zu untersuchen, hat die ökologische Isolation viel weniger Aufmerksamkeit erhalten, teilweise weil das Trennen der Wirkungen dieser Mechanismen von sich aus schwierig ist. Hier beschreibe ich einen neuen Ansatz zur Quantifizierung der Wirkungen von geografischer und ökologischer Isolation unter Verwendung der Multiplen Matrixregression mit Randomisierung. Ich untersuchte den Parameterraum, über den diese Methode wirksam ist, mit einer Reihe von Individuen-basierten Simulationen und fand, dass sie die Wirkungen von geografischer und ökologischer Isolation über einen weiten Bereich von Bedingungen genau beschreibt. Ich wendete diese Methode auch auf eine Reihe von realen Datensätzen an, um zu zeigen, dass ökologische Isolation ein oft übersehener, aber wichtiger Beitrag zu Mustern der räumlichen genetischen Variation ist, und um zu demonstrieren, wie diese Analyse neue Einblicke in die Frage liefern kann, wie Landschaften zur Evolution der genetischen Variation in der Natur beitragen.

@article{doi101111evo12134,
    author = "Wang, Ian",
    title = "DIE VOLLSTÄNDIGEN WIRKUNGEN DER LANDSCHAFTSHETEROGENEITÄT AUF DIE RÄUMLICHE GENETISCHE VARIATION UNTERSUCHEN: EIN ANSATZ DER MULTIPLIZEN MATRIXREGRESSION ZUR QUANTIFIZIERUNG VON GEOGRAFISCHER UND ÖKOLOGISCHER ISOLATION",
    year = "2013",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Das Verständnis der Auswirkungen der Landschaftsheterogenität auf die räumliche genetische Variation ist ein primäres Ziel der Landschaftsgenetik. Ökologische und geografische Variablen können zur genetischen Struktur beitragen durch geografische Isolation, bei der geografische Barrieren und Entfernungen den Genfluss einschränken, und ökologische Isolation, bei der der Genfluss zwischen Populationen, die unterschiedliche Lebensräume bewohnen, durch Selektion gegen Dispersanten, die zwischen ihnen wandern, begrenzt wird. Obwohl Methoden entwickelt wurden, um die geografische Isolation im Detail zu untersuchen, hat die ökologische Isolation viel weniger Aufmerksamkeit erhalten, teilweise weil das Trennen der Wirkungen dieser Mechanismen von sich aus schwierig ist. Hier beschreibe ich einen neuen Ansatz zur Quantifizierung der Wirkungen von geografischer und ökologischer Isolation unter Verwendung der Multiplen Matrixregression mit Randomisierung. Ich untersuchte den Parameterraum, über den diese Methode wirksam ist, mit einer Reihe von Individuen-basierten Simulationen und fand, dass sie die Wirkungen von geografischer und ökologischer Isolation über einen weiten Bereich von Bedingungen genau beschreibt. Ich wendete diese Methode auch auf eine Reihe von realen Datensätzen an, um zu zeigen, dass ökologische Isolation ein oft übersehener, aber wichtiger Beitrag zu Mustern der räumlichen genetischen Variation ist, und um zu demonstrieren, wie diese Analyse neue Einblicke in die Frage liefern kann, wie Landschaften zur Evolution der genetischen Variation in der Natur beitragen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12134",
    doi = "10.1111/evo.12134",
    openalex = "W1976017021",
    references = "doi101093aesa304641, doi101146annurevecolsys102209144644"
}

Natürliche Systeme beherbergen komplexe Wechselwirkungen, die grundlegende Bestandteile der Ökologie und der Evolution sind. Diese Wechselwirkungen stellen unsere Neigungen und Ausbildung in Frage, die einfachsten Erklärungen für Muster in der Natur zu suchen. Nicht zuletzt ist die Wahrscheinlichkeit, dass einige komplexe Prozesse übersehen werden, wenn ihre Muster den Vorhersagen für einfachere Mechanismen ähneln. In diese Richtung deuten Theorie und empirische Evidenz zunehmend darauf hin, dass Umwelt-, ökologische, phänotypische und genetische Prozesse eng miteinander verflochten sein können, was zu komplexen und manchmal überraschenden eco‐evolutionären Dynamiken führt. Das Ziel dieser Übersicht ist es, die Neigung, unreflektiert die einfachsten Erklärungen in Ökologie und Evolution zu suchen, zu mildern, indem anerkannt wird, dass einige eco‐evolutionäre Ergebnisse sehr ähnlich zu rein ökologischen, rein evolutionären oder sogar null-Erwartungen erscheinen können und somit kryptisch sind. Wir liefern theoretische und empirische Evidenz für Beobachtungsverzerrungen und Mechanismen, die zwischen den verschiedenen Verbindungen in eco‐evolutionären Rückkopplungen wirken können, um kryptische Muster zu erzeugen. Die Erkenntnis, dass kryptische Dynamiken mit Ergebnissen wie Stabilität, Resilienz, Erholung oder Koexistenz in einer dynamisch veränderlichen Welt verbunden sein können, bietet zusätzlichen Anreiz, Wege zu finden, um sie zu untersuchen.

@article{doi101111nyas12974,
    author = "Kinnison, Michael T. und Hairston, Nelson G. und Hendry, Andrew P.",
    title = "Cryptic eco‐evolutionary dynamics",
    year = "2015",
    journal = "Annals of the New York Academy of Sciences",
    abstract = "Natürliche Systeme beherbergen komplexe Wechselwirkungen, die grundlegende Bestandteile der Ökologie und der Evolution sind. Diese Wechselwirkungen stellen unsere Neigungen und Ausbildung in Frage, die einfachsten Erklärungen für Muster in der Natur zu suchen. Nicht zuletzt ist die Wahrscheinlichkeit, dass einige komplexe Prozesse übersehen werden, wenn ihre Muster den Vorhersagen für einfachere Mechanismen ähneln. In diese Richtung deuten Theorie und empirische Evidenz zunehmend darauf hin, dass Umwelt-, ökologische, phänotypische und genetische Prozesse eng miteinander verflochten sein können, was zu komplexen und manchmal überraschenden eco‐evolutionären Dynamiken führt. Das Ziel dieser Übersicht ist es, die Neigung, unreflektiert die einfachsten Erklärungen in Ökologie und Evolution zu suchen, zu mildern, indem anerkannt wird, dass einige eco‐evolutionäre Ergebnisse sehr ähnlich zu rein ökologischen, rein evolutionären oder sogar null-Erwartungen erscheinen können und somit kryptisch sind. Wir liefern theoretische und empirische Evidenz für Beobachtungsverzerrungen und Mechanismen, die zwischen den verschiedenen Verbindungen in eco‐evolutionären Rückkopplungen wirken können, um kryptische Muster zu erzeugen. Die Erkenntnis, dass kryptische Dynamiken mit Ergebnissen wie Stabilität, Resilienz, Erholung oder Koexistenz in einer dynamisch veränderlichen Welt verbunden sein können, bietet zusätzlichen Anreiz, Wege zu finden, um sie zu untersuchen.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nyas.12974",
    doi = "10.1111/nyas.12974",
    openalex = "W2173108007",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

@article{doi101038nrg2016104,
    author = "Lynch, Michael und Ackerman, Matthew S. und Goût, Jean-François und Long, Hongan und Sung, Way und Thomas, W. Kelley und Foster, Patricia L.",
    title = "Genetische Drift, Selektion und die Evolution der Mutationsrate",
    year = "2016",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg.2016.104",
    doi = "10.1038/nrg.2016.104",
    openalex = "W2529873061",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016jtig201005003, doi101038nrg2146, doi101073pnas0404656101"
}

Biologische Evolution ist eine Tatsache – doch die vielen widersprüchlichen Theorien der Evolution bleiben bis heute umstritten. Als Anpassung und natürliche Selektion 1966 erstmals veröffentlicht wurde, traf sie einen mächtigen Schlag gegen diejenigen, die für das Konzept der Gruppenselektion eintraten – die Idee, dass die Evolution ganze Arten statt Individuen selektiert. Williams' berühmte Arbeit zugunsten des einfachen Darwinismus gegenüber der Gruppenselektion ist zu einem Klassiker der Wissenschaftsliteratur geworden, geschätzt für ihre gründliche und überzeugende Argumentation sowie ihre Relevanz für viele Bereiche außerhalb der Biologie. Jetzt mit einem neuen Vorwort von Richard Dawkins ist Anpassung und natürliche Selektion ein unverzichtbarer Text zum Verständnis der Natur wissenschaftlicher Debatten.

@book{doi1015159780691185507,
    author = "Williams, George C.",
    title = "Anpassung und natürliche Selektion: Eine Kritik an einigen aktuellen evolutionären Gedanken",
    year = "2018",
    abstract = "Biologische Evolution ist eine Tatsache – doch die vielen widersprüchlichen Theorien der Evolution bleiben bis heute umstritten. Als Anpassung und natürliche Selektion 1966 erstmals veröffentlicht wurde, traf sie einen mächtigen Schlag gegen diejenigen, die für das Konzept der Gruppenselektion eintraten – die Idee, dass die Evolution ganze Arten statt Individuen selektiert. Williams' berühmte Arbeit zugunsten des einfachen Darwinismus gegenüber der Gruppenselektion ist zu einem Klassiker der Wissenschaftsliteratur geworden, geschätzt für ihre gründliche und überzeugende Argumentation sowie ihre Relevanz für viele Bereiche außerhalb der Biologie. Jetzt mit einem neuen Vorwort von Richard Dawkins ist Anpassung und natürliche Selektion ein unverzichtbarer Text zum Verständnis der Natur wissenschaftlicher Debatten",
    url = "https://doi.org/10.1515/9780691185507",
    doi = "10.1515/9780691185507",
    openalex = "W1480083809"
}

ein Prozess, der das Substrat übersteigt, in dem er stattfindet. Tatsächlich können viele Forscher auf dem Gebiet der digitalen Evolution Beispiele dafür liefern, wie ihre sich entwickelnden Algorithmen und Organismen ihre Erwartungen oder Absichten kreativ untergraben, unerkannte Bugs in ihrem Code aufgedeckt haben, unerwartet Anpassungen hervorgebracht oder Verhaltensweisen und Ergebnisse gezeigt haben, die beunruhigend konvergent mit solchen in der Natur sind. Solche Geschichten offenbaren routinemäßig Überraschung und Kreativität durch die Evolution in diesen digitalen Welten, passen aber selten in das standardmäßige wissenschaftliche Narrativ. Stattdessen werden sie oft als bloße Hindernisse behandelt, die überwunden werden müssen, anstatt als Ergebnisse, die ihrerseits untersucht werden sollten. Bugs werden behoben, Experimente werden neu fokussiert, und Einmalüberraschungen werden in einen einzigen Datenpunkt zusammengefasst. Die Geschichten selbst werden unter Forschern durch mündliche Tradition ausgetauscht, aber diese Art der Informationsübertragung ist ineffizient und anfällig für Fehler und outright Verlust. Darüber hinaus bedeutet die Tatsache, dass diese Geschichten tendenziell nur unter Praktikern geteilt werden, dass viele Naturwissenschaftler nicht erkennen, wie interessant und lebensähnlich digitale Organismen sind und wie natürlich ihre Evolution sein kann. Soweit unser Wissen reicht, wurde keine Sammlung solcher Anekdoten zuvor veröffentlicht. Dieser Artikel ist das crowdsourced Produkt von Forschern in den Bereichen künstliches Leben und evolutionäre Berechnung, die erste-hand Berichte über solche Fälle geliefert haben. Er dient somit als schriftliche, faktengeprüfte Sammlung wissenschaftlich wichtiger und sogar unterhaltsamer Geschichten. Dabei präsentieren wir hier auch erhebliche Beweise dafür, dass die Existenz und Bedeutung evolutionärer Überraschungen über die natürliche Welt hinausgeht und tatsächlich eine universelle Eigenschaft aller komplexen sich entwickelnden Systeme sein kann.

@article{doi101162artla00319,
    author = "Lehman, Joel and Clune, Jeff and Misevic, Dusan and Adami, Christoph and Altenberg, Lee and Beaulieu, Julie and Bentley, Peter J. and BERNARD, S and Beslon, Guillaume and Bryson, David M. and Cheney, Nick and Chrabąszcz, Patryk and Cully, Antoine and Doncieux, Stéphane and Dyer, Fred C. and Ellefsen, Kai Olav and Feldt, Robert and Fischer, Stephan and Forrest, Stephanie and Frénoy, Antoine and Gagné, Christian and Goff, Léni Le and Grabowski, Laura M. and Hodjat, Babak and Hutter, Frank and Keller, Laurent and Knibbe, Carole and Krčah, Peter and Lenski, Richard E. and Lipson, Hod and MacCurdy, Robert and Maestre, Carlos and Miikkulainen, Risto and Mitri, Sara and Moriarty, David E. and Mouret, Jean-Baptiste and Nguyen, Anh and Ofria, Charles and Parizeau, Marc and Parsons, David and Pennock, Robert T. and Punch, William F. and Ray, Thomas S. and Schoenauer, Marc and Schulte, Eric and Sims, Karl und Stanley, Kenneth O. und Taddei, François und Tarapore, Danesh und Thibault, Simon und Watson, Richard A. und Weimer, Westley und Yosinski, Jason",
    title = "The Surprising Creativity of Digital Evolution: A Collection of Anecdotes from the Evolutionary Computation and Artificial Life Research Communities",
    year = "2020",
    journal = "Artificial Life",
    abstract = "ein Prozess, der das Substrat übersteigt, in dem er stattfindet. Tatsächlich können viele Forscher auf dem Gebiet der digitalen Evolution Beispiele dafür liefern, wie ihre sich entwickelnden Algorithmen und Organismen ihre Erwartungen oder Absichten kreativ untergraben, unerkannte Bugs in ihrem Code aufgedeckt haben, unerwartet Anpassungen hervorgebracht oder Verhaltensweisen und Ergebnisse gezeigt haben, die beunruhigend konvergent mit solchen in der Natur sind. Solche Geschichten offenbaren routinemäßig Überraschung und Kreativität durch die Evolution in diesen digitalen Welten, passen aber selten in das standardmäßige wissenschaftliche Narrativ. Stattdessen werden sie oft als bloße Hindernisse behandelt, die überwunden werden müssen, anstatt als Ergebnisse, die ihrerseits untersucht werden sollten. Bugs werden behoben, Experimente werden neu fokussiert, und Einmalüberraschungen werden in einen einzigen Datenpunkt zusammengefasst. Die Geschichten selbst werden unter Forschern durch mündliche Tradition ausgetauscht, aber diese Art der Informationsübertragung ist ineffizient und anfällig für Fehler und outright Verlust. Darüber hinaus bedeutet die Tatsache, dass diese Geschichten tendenziell nur unter Praktikern geteilt werden, dass viele Naturwissenschaftler nicht erkennen, wie interessant und lebensähnlich digitale Organismen sind und wie natürlich ihre Evolution sein kann. Soweit unser Wissen reicht, wurde keine Sammlung solcher Anekdoten zuvor veröffentlicht. Dieser Artikel ist das crowdsourced Produkt von Forschern in den Bereichen künstliches Leben und evolutionäre Berechnung, die erste-hand Berichte über solche Fälle geliefert haben. Er dient somit als schriftliche, faktengeprüfte Sammlung wissenschaftlich wichtiger und sogar unterhaltsamer Geschichten. Dabei präsentieren wir hier auch erhebliche Beweise dafür, dass die Existenz und Bedeutung evolutionärer Überraschungen über die natürliche Welt hinausgeht und tatsächlich eine universelle Eigenschaft aller komplexen sich entwickelnden Systeme sein kann.",
    url = "https://doi.org/10.1162/artl\_a\_00319",
    doi = "10.1162/artl\_a\_00319",
    openalex = "W3015475346",
    references = "doi101017cbo9780511730191, doi101038nature01151"
}

@book{doi101016s0070215321x00026,
    title = "Evolutionäre Entwicklungsbiologie",
    year = "2021",
    booktitle = "Aktuelle Themen der Entwicklungsbiologie/Aktuelle Themen der Entwicklungsbiologie",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0070-2153(21)x0002-6",
    doi = "10.1016/s0070-2153(21)x0002-6",
    openalex = "W1556619877"
}

Die Ergebnisse der Synthese von evolutionärer Genetik und Entwicklungsbiologie werden vorgestellt, die Ursachen der Krise der evolutionären Genetik und Wege zu ihrer Überwindung werden erläutert, sowie der Mechanismus der Artbildung höherer Organismen erklärt. Schlüsselwörter: neue evolutionäre Synthese, evolutionäre Genetik, Genetik der Ontogenese, morphogenetisches Programm, Entwicklungsgene.

@article{vagyn2021evolution,
    author = "Vagyn, Yu. V.",
    title = "Evolution of darwinism. A new evolutionary synthesis: combining evolutionary genetics and development genetics",
    year = "2021",
    journal = "Visnik ukrains'kogo tovaristva genetikiv i selekcioneriv",
    abstract = "Die Ergebnisse der Synthese von evolutionärer Genetik und Entwicklungsbiologie werden vorgestellt, die Ursachen der Krise der evolutionären Genetik und Wege zu ihrer Überwindung werden erläutert, sowie der Mechanismus der Artbildung höherer Organismen erklärt. Schlüsselwörter: neue evolutionäre Synthese, evolutionäre Genetik, Genetik der Ontogenese, morphogenetisches Programm, Entwicklungsgene.",
    url = "https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    doi = "10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    number = "1-2",
    openalex = "W3134902110",
    pages = "70-75",
    volume = "18",
    references = "doi105860choice474406, doi105962bhltitle61216, doi107124visnykutgis161904, doi107124visnykutgis1711201"
}