Mendelsche Populationen

Zusammenfassung. Es werden Ausdrücke (2·1), (3·1), (4·1), (5·1) für die Zusammensetzung mendelscher Populationen gefunden, die der partiellen Selbstbefruchtung, Inzucht, assortativen Paarung oder selektiven Befruchtung unterworfen sind, und Gleichungen (2·2), (3·2), (4·2), (5·2) werden für den Effekt der Selektion auf solche Populationen abgeleitet. Der Effekt der Selektion wird durch Inzucht und Selbstbefruchtung stark erhöht.

@article{doi101111j1469185x1924tb00546x,
    author = "Haldane, J. B. S.",
    title = "A MATHEMATICAL THEORY OF NATURAL AND ARTIFICIAL SELECTION. PART II THE INFLUENCE OF PARTIAL SELF‐FERTILISATION, INBREEDING, ASSORTATIVE MATING, AND SELECTIVE FERTILISATION ON THE COMPOSITION OF MENDELIAN POPULATIONS, AND ON NATURAL SELECTION.",
    year = "1924",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Zusammenfassung. Es werden Ausdrücke (2·1), (3·1), (4·1), (5·1) für die Zusammensetzung mendelscher Populationen gefunden, die der partiellen Selbstbefruchtung, Inzucht, assortativen Paarung oder selektiven Befruchtung unterworfen sind, und Gleichungen (2·2), (3·2), (4·2), (5·2) werden für den Effekt der Selektion auf solche Populationen abgeleitet. Der Effekt der Selektion wird durch Inzucht und Selbstbefruchtung stark erhöht.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1924.tb00546.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1924.tb00546.x",
    openalex = "W2020102511"
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@article{doi101007bf02459575,
    author = "Wright, S.",
    title = "Evolution in mendelian populations",
    year = "1931",
    journal = "Bulletin of Mathematical Biology",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/3503eae0498c30435e10d71f96e8eda2f0df0f14",
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    number = "1-2",
    pages = "241-295",
    semanticscholar_citation_count = "3522",
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    volume = "52"
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@article{doi101016s0092824005800114,
    author = "Wright, S.",
    title = "Evolution in Mendelian Populations.",
    year = "1931",
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    volume = "52"
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Seite 108, letzte Zeile des Textes, für P/P″ lesen P′/P″. Seite 120, letzte Zeile, für δ v lesen δ y. Seite 123, Zeile 10, für 4Nn lesen 4Nu. Seite 125, Zeile 1, für q lesen q. Seite 126, Zeile 12, für q lesen q. Seite 135, Zeile 5 von unten, für y4Nsq lesen e4Nsq. Seite 141, Zeilen 8

@article{doi101093genetics16297,
    author = "Wright, Sewall",
    title = "EVOLUTION IN MENDELIAN POPULATIONS",
    year = "1931",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Seite 108, letzte Zeile des Textes, für P/P″ lesen P′/P″. Seite 120, letzte Zeile, für δ v lesen δ y. Seite 123, Zeile 10, für 4Nn lesen 4Nu. Seite 125, Zeile 1, für q lesen q. Seite 126, Zeile 12, für q lesen q. Seite 135, Zeile 5 von unten, für y4Nsq lesen e4Nsq. Seite 141, Zeilen 8",
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    doi = "10.1093/genetics/16.2.97",
    openalex = "W2171463101",
    references = "doi101017s0080456800012163, doi101017s0305004100015644, doi101086279846, doi101086279872, doi101086280193, doi101086280260, doi101111j160152231928tb02483x, doi101126science2870649, doi1023072965538, doi105962bhltitle27468"
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lesen Sie für "I1 6" "IV 6." Seite 423, Zeile 12, lesen Sie für "IV 13, IV 15" "IV 14, IV 16." Seite 427, Zeile 6, lesen Sie für "I1 (6)" "I1 (4)."

@article{doi101093genetics163290,
    author = "Wright, Sewall",
    title = "EVOLUTION IN MENDELIAN POPULATIONS",
    year = "1931",
    journal = "Genetics",
    abstract = {lesen Sie für "I1 6" "IV 6." Seite 423, Zeile 12, lesen Sie für "IV 13, IV 15" "IV 14, IV 16." Seite 427, Zeile 6, lesen Sie für "I1 (6)" "I1 (4)."},
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    doi = "10.1093/genetics/16.3.290",
    openalex = "W4251848466"
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@misc{wright1931evolution1,
    author = "Wright, S",
    title = "Evolution in Mendelian populations",
    year = "1931",
    howpublished = "Genetics, v. 16, p. 97- 159",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Wright, S., 1931, Evolution in Mendelian populations: Genetics, v. 16, p. 97- 159.}"
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@article{dobzhansky1950mendelian,
    author = "Dobzhansky, Theodosius",
    title = "Mendelische Populationen und ihre Evolution",
    year = "1950",
    journal = "The American Naturalist",
    url = "https://doi.org/10.1086/281638",
    doi = "10.1086/281638",
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    openalex = "W2012665350",
    pages = "401-418",
    volume = "84"
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@article{doi101086281638,
    author = "Dobzhansky, Theodosius",
    title = "Mendelische Populationen und ihre Evolution",
    year = "1950",
    journal = "The American Naturalist",
    url = "https://doi.org/10.1086/281638",
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    openalex = "W2012665350"
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Es wird ein Verfahren vorgestellt, mit dem die Gendiversität (Heterozygotie) einer unterteilten Population in ihre Komponenten zerlegt werden kann, d. h. die Gendiversitäten innerhalb und zwischen den Unterpopulationen. Dieses Verfahren ist für jede Population anwendbar, unabhängig von der Anzahl der Allele pro Locus, dem Muster evolutionärer Kräfte wie Mutation, Selektion und Migration sowie der Reproduktionsmethode des verwendeten Organismus. Zudem werden Maße für die absoluten und relativen Größen der Gendifferenzierung zwischen den Unterpopulationen vorgeschlagen.

@article{doi101073pnas70123321,
    author = "Nei, Masatoshi",
    title = "Analysis of Gene Diversity in Subdivided Populations",
    year = "1973",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "A method is presented by which the gene diversity (heterozygosity) of a subdivided population can be analyzed into its components, i.e., the gene diversities within and between subpopulations. This method is applicable to any population without regard to the number of alleles per locus, the pattern of evolutionary forces such as mutation, selection, and migration, and the reproductive method of the organism used. Measures of the absolute and relative magnitudes of gene differentiation among subpopulations are also proposed.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.70.12.3321",
    doi = "10.1073/pnas.70.12.3321",
    openalex = "W1988182864"
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Transposable elements sind DNA-Sequenzen, die in allen Eukaryoten vorkommen, sich replikativ transponieren und zahlreiche genetische und entwicklungsbiologische Effekte auf ihre Wirte verursachen. Ein Modell der Evolution von Transposable elements in mendelischen Populationen wird vorgeschlagen. Aus seiner Analyse werden Formeln für die mittlere Kopienzahl und das Frequenzspektrum abgeleitet.

@article{doi101093genetics1043457,
    author = "Langley, C. und Brookfield, J. und Kaplan, N.",
    title = "Transposable elements in mendelian populations. I. A theory.",
    year = "1983",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Transposable elements sind DNA-Sequenzen, die in allen Eukaryoten vorkommen, sich replikativ transponieren und zahlreiche genetische und entwicklungsbiologische Effekte auf ihre Wirte verursachen. Ein Modell der Evolution von Transposable elements in mendelischen Populationen wird vorgeschlagen. Aus seiner Analyse werden Formeln für die mittlere Kopienzahl und das Frequenzspektrum abgeleitet.",
    url = "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1202088",
    doi = "10.1093/genetics/104.3.457",
    is_oa = "true",
    number = "3",
    pages = "457-471",
    semanticscholar_citation_count = "123",
    semanticscholar_id = "4217c8cc4b1e0a99451d53a184f7ecbb40599e13",
    volume = "104"
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Es werden Methoden vorgeschlagen, um die Parameter im Frequenzspektrum zu schätzen, die aus dem Modell von Langley, Brookfield und Kaplan für die Evolution eines transposable Elements in einer endlichen mendelschen Population abgeleitet wurden. Die statistischen Eigenschaften dieser Schätzungen werden untersucht, und die Ergebnisse werden mit Simulationsdaten gestützt. Auch die Auswirkungen auf die Schätzungen, die durch mögliche Unempfindlichkeiten der experimentellen Technik verursacht werden, werden diskutiert. Um die vorgeschlagene Methodologie zu veranschaulichen, werden die Daten von Montgomery und Langley analysiert.

@article{doi101093genetics1043485,
    author = "Kaplan, N. und Brookfield, J.",
    title = "Transposable Elements in Mendelian Populations. III. Statistical Results.",
    year = "1983",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Es werden Methoden vorgeschlagen, um die Parameter im Frequenzspektrum zu schätzen, die aus dem Modell von Langley, Brookfield und Kaplan für die Evolution eines transposable Elements in einer endlichen mendelschen Population abgeleitet wurden. Die statistischen Eigenschaften dieser Schätzungen werden untersucht, und die Ergebnisse werden mit Simulationsdaten gestützt. Auch die Auswirkungen auf die Schätzungen, die durch mögliche Unempfindlichkeiten der experimentellen Technik verursacht werden, werden diskutiert. Um die vorgeschlagene Methodologie zu veranschaulichen, werden die Daten von Montgomery und Langley analysiert.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/104.3.485",
    doi = "10.1093/genetics/104.3.485",
    is_oa = "true",
    number = "3",
    pages = "485-495",
    semanticscholar_citation_count = "44",
    semanticscholar_id = "03183764c7f99b266004292b2debfa9e3278afd5",
    volume = "104"
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Es wird ein Modell zur Evolution einer Familie transposierbarer Elemente in einer mendelschen Wirtspopulation vorgeschlagen, das vererbte phänotypische Mutationen in den Elementen berücksichtigt. Das zeitliche Verhalten der Anzahl der mutierten und wildtypischen Elemente wird untersucht, und die erwartete Aussterbedauer der Familie transposierbarer Elemente wird geprüft. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass, wenn das Mutant gleich gut transponiert werden kann, wenn der Wildtyp vorhanden ist, mit einer Überzahl davon zu rechnen ist, wohingegen Elemente, wie Retroviren, bei denen das transponierende Genom und sein phänotypischer Ausdruck gekoppelt sind, durch eine niedrige Mutantenfrequenz gekennzeichnet sein können.

@article{doi101093genetics1092459,
    author = "Kaplan, Norman und Darden, Tom und Langley, Charles H.",
    title = "EVOLUTION UND EXTINKTION VON TRANSPOSIERBAREN ELEMENTEN IN MENDELSCHEN POPULATIONEN",
    year = "1985",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Es wird ein Modell zur Evolution einer Familie transposierbarer Elemente in einer mendelschen Wirtspopulation vorgeschlagen, das vererbte phänotypische Mutationen in den Elementen berücksichtigt. Das zeitliche Verhalten der Anzahl der mutierten und wildtypischen Elemente wird untersucht, und die erwartete Aussterbedauer der Familie transposierbarer Elemente wird geprüft. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass, wenn das Mutant gleich gut transponiert werden kann, wenn der Wildtyp vorhanden ist, mit einer Überzahl davon zu rechnen ist, wohingegen Elemente, wie Retroviren, bei denen das transponierende Genom und sein phänotypischer Ausdruck gekoppelt sind, durch eine niedrige Mutantenfrequenz gekennzeichnet sein können.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/109.2.459",
    doi = "10.1093/genetics/109.2.459",
    openalex = "W1959616200",
    references = "doi1010160022283682904703, doi1010160092867482904627, doi1010160092867482904639, doi1010160092867483901332, doi101038295025a0, doi101038302119a0, doi101093genetics1043473, doi101093nar8246113, doi101146annurevge15120181001251, doi101146annurevge17120183001531"
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Es wird ein Modell zur Evolution einer Familie von transponierbaren Elementen in einer mendelischen Wirtspopulation vorgeschlagen, das vererbte phänotypische Mutationen in den Elementen berücksichtigt. Das zeitliche Verhalten der Anzahl der mutierten und wildtypischen Elemente wird untersucht, und die erwartete Aussterbedauer der Familie der transponierbaren Elemente wird geprüft. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass, wenn das Mutant gleich gut transponiert werden kann, wenn der Wildtyp vorhanden ist, dann kann erwartet werden, dass es in der Überzahl vorkommt, wohingegen Elemente, wie Retroviren, bei denen das transponierende Genom und sein phänotypischer Ausdruck gekoppelt sind, durch eine niedrige Mutantenfrequenz gekennzeichnet sein können.

@article{s261fc62d3d7d6b3f15635b277ce3b707355a1a32e,
    author = "Kaplan, N. und Darden, T. und Langley, C.",
    title = "Evolution und Aussterben von transponierbaren Elementen in mendelischen Populationen.",
    year = "1985",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Es wird ein Modell zur Evolution einer Familie von transponierbaren Elementen in einer mendelischen Wirtspopulation vorgeschlagen, das vererbte phänotypische Mutationen in den Elementen berücksichtigt. Das zeitliche Verhalten der Anzahl der mutierten und wildtypischen Elemente wird untersucht, und die erwartete Aussterbedauer der Familie der transponierbaren Elemente wird geprüft. Unsere Ergebnisse deuten darauf hin, dass, wenn das Mutant gleich gut transponiert werden kann, wenn der Wildtyp vorhanden ist, dann kann erwartet werden, dass es in der Überzahl vorkommt, wohingegen Elemente, wie Retroviren, bei denen das transponierende Genom und sein phänotypischer Ausdruck gekoppelt sind, durch eine niedrige Mutantenfrequenz gekennzeichnet sein können.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/61fc62d3d7d6b3f15635b277ce3b707355a1a32e",
    doi = "10.1093/genetics/109.2.459",
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    number = "2",
    pages = "459-480",
    semanticscholar_citation_count = "126",
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    volume = "109"
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@article{doi101111j155856461987tb05876x,
    author = "Wilson, D. S.",
    title = "ALTRUISM IN MENDELIAN POPULATIONS DERIVED FROM SIBLING GROUPS: THE HAYSTACK MODEL REVISITED",
    year = "1987",
    journal = "Evolution",
    url = "https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1111/j.1558-5646.1987.tb05876.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1987.tb05876.x",
    is_oa = "true",
    number = "5",
    pages = "1059-1070",
    semanticscholar_citation_count = "136",
    semanticscholar_id = "0e1b47b104865ed5d5845acf022f5e72f531b724",
    volume = "41"
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Bei den meisten Arten gibt es eine beträchtliche geografische Variation sowohl in der Morphologie als auch in der Allelfrequenz. Das Ausmaß der geografischen Variation ergibt sich aus einem Gleichgewicht zwischen Kräften, die zur lokalen genetischen Differenzierung neigen, und Kräften, die zur genetischen Homogenität neigen. Mutation, genetische Drift aufgrund der endlichen Populationsgröße und natürliche Selektion, die Anpassungen an lokale Umweltbedingungen begünstigt, führen alle zur genetischen Differenzierung lokaler Populationen, und die Bewegung von Gameten, Individuen und sogar ganzer Populationen – gemeinsam als Genfluss bezeichnet – wird dieser Differenzierung entgegenwirken. Genfluss kann entweder die Evolution einschränken, indem er die Anpassung an lokale Bedingungen verhindert, oder die Evolution fördern, indem er neue Gene und Genkombinationen im gesamten Verbreitungsgebiet einer Art verbreitet. Es stehen mehrere Methoden zur Verfügung, um die Menge des Genflusses zu schätzen. Direkte Methoden überwachen den laufenden Genfluss, und indirekte Methoden nutzen räumliche Verteilungen von Allelfrequenzen, um vergangenen Genfluss zu erschließen. Anwendungen dieser Methoden zeigen, dass sich Arten in dem Genfluss, den sie erfahren, stark unterscheiden. Besonders interessant sind jene Arten, bei denen direkte Methoden wenig aktuellen Genfluss anzeigen, während indirekte Methoden deutlich höhere Niveaus von Genfluss in der jüngeren Vergangenheit anzeigen. Solche Arten haben wahrscheinlich relativ häufig großräumige demografische Veränderungen durchlaufen.

@article{doi101126science3576198,
    author = "Slatkin, Montgomery",
    title = "Gene Flow and the Geographic Structure of Natural Populations",
    year = "1987",
    journal = "Science",
    abstract = "Bei den meisten Arten gibt es eine beträchtliche geografische Variation sowohl in der Morphologie als auch in der Allelfrequenz. Das Ausmaß der geografischen Variation ergibt sich aus einem Gleichgewicht zwischen Kräften, die zur lokalen genetischen Differenzierung neigen, und Kräften, die zur genetischen Homogenität neigen. Mutation, genetische Drift aufgrund der endlichen Populationsgröße und natürliche Selektion, die Anpassungen an lokale Umweltbedingungen begünstigt, führen alle zur genetischen Differenzierung lokaler Populationen, und die Bewegung von Gameten, Individuen und sogar ganzer Populationen – gemeinsam als Genfluss bezeichnet – wird dieser Differenzierung entgegenwirken. Genfluss kann entweder die Evolution einschränken, indem er die Anpassung an lokale Bedingungen verhindert, oder die Evolution fördern, indem er neue Gene und Genkombinationen im gesamten Verbreitungsgebiet einer Art verbreitet. Es stehen mehrere Methoden zur Verfügung, um die Menge des Genflusses zu schätzen. Direkte Methoden überwachen den laufenden Genfluss, und indirekte Methoden nutzen räumliche Verteilungen von Allelfrequenzen, um vergangenen Genfluss zu erschließen. Anwendungen dieser Methoden zeigen, dass sich Arten in dem Genfluss, den sie erfahren, stark unterscheiden. Besonders interessant sind jene Arten, bei denen direkte Methoden wenig aktuellen Genfluss anzeigen, während indirekte Methoden deutlich höhere Niveaus von Genfluss in der jüngeren Vergangenheit anzeigen. Solche Arten haben wahrscheinlich relativ häufig großräumige demografische Veränderungen durchlaufen.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3576198",
    doi = "10.1126/science.3576198",
    openalex = "W2066362596",
    references = "doi1010079783642686351, doi1010160040580977900454, doi1010382011145a0, doi101086410450, doi101093genetics16297, doi101098rspb19830075, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461981tb04864x, doi101111j155856461984tb05657x, doi101111j155856461985tb04079x, doi101146annureves16110185002141, doi101722611310, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, openalexw1593551567, openalexw1606400913"
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@article{s24c673a97833c84983ffb64be47bd646861e8c848,
    author = "Wright, S.",
    title = "Evolution in Mendelian populations. 1931.",
    year = "1990",
    journal = "Bulletin of mathematical biology",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/4c673a97833c84983ffb64be47bd646861e8c848",
    doi = "10.1007/BF02459575",
    is_oa = "true",
    pmid = "2185860",
    semanticscholar_citation_count = "37",
    semanticscholar_id = "4c673a97833c84983ffb64be47bd646861e8c848"
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Die These, dass alle mitochondrialen DNA (mtDNA)-Typen bei heutigen Menschen auf einen gemeinsamen Vorfahren zurückgehen, der in einer afrikanischen Population vor etwa 200.000 Jahren lebte, hat viel Aufmerksamkeit erregt. Um diese These weiter zu untersuchen, wurden zwei hypervariabel Segmente der mtDNA von 189 Personen unterschiedlicher geografischer Herkunft, einschließlich 121 einheimischer Afrikaner, sequenziert. Es wurde geografische Spezifität beobachtet, da identische mtDNA-Typen innerhalb, aber nicht zwischen Populationen geteilt werden. Ein Baum, der diese mtDNA-Sequenzen untereinander und zu einer Schimpansen-Sequenz in Beziehung setzt, weist viele tiefe Äste auf, die ausschließlich zu afrikanischen mtDNAs führen. Ein afrikanischer Ursprung für menschliche mtDNA wird durch zwei statistische Tests gestützt. Durch die Verwendung der Schimpansen- und menschlichen Sequenzen zur Kalibrierung der Rate der mtDNA-Evolution wird das Alter des gemeinsamen menschlichen mtDNA-Vorfahren zwischen 166.000 und 249.000 Jahren datiert. Diese Ergebnisse stützen und erweitern somit die Hypothese des afrikanischen Ursprungs der menschlichen mtDNA-Evolution.

@article{doi101126science1840702,
    author = "Vigilant, Linda und Stoneking, Mark und Harpending, Henry und Hawkes, Kristen und Wilson, Allan C.",
    title = "African Populations and the Evolution of Human Mitochondrial DNA",
    year = "1991",
    journal = "Science",
    abstract = "Die These, dass alle mitochondrialen DNA (mtDNA)-Typen bei heutigen Menschen auf einen gemeinsamen Vorfahren zurückgehen, der in einer afrikanischen Population vor etwa 200.000 Jahren lebte, hat viel Aufmerksamkeit erregt. Um diese These weiter zu untersuchen, wurden zwei hypervariabel Segmente der mtDNA von 189 Personen unterschiedlicher geografischer Herkunft, einschließlich 121 einheimischer Afrikaner, sequenziert. Es wurde geografische Spezifität beobachtet, da identische mtDNA-Typen innerhalb, aber nicht zwischen Populationen geteilt werden. Ein Baum, der diese mtDNA-Sequenzen untereinander und zu einer Schimpansen-Sequenz in Beziehung setzt, weist viele tiefe Äste auf, die ausschließlich zu afrikanischen mtDNAs führen. Ein afrikanischer Ursprung für menschliche mtDNA wird durch zwei statistische Tests gestützt. Durch die Verwendung der Schimpansen- und menschlichen Sequenzen zur Kalibrierung der Rate der mtDNA-Evolution wird das Alter des gemeinsamen menschlichen mtDNA-Vorfahren zwischen 166.000 und 249.000 Jahren datiert. Diese Ergebnisse stützen und erweitern somit die Hypothese des afrikanischen Ursprungs der menschlichen mtDNA-Evolution.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1840702",
    doi = "10.1126/science.1840702",
    openalex = "W2072889251",
    references = "doi101007bf01734101, doi101038325031a0, doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas7641967, doi101073pnas77116715, doi101073pnas85166002, doi101126science147365368, doi101126science3125610, doi101146annurevge22120188002513, doi102307530156"
}

▪ Zusammenfassung Inbreeding Depression beeinflusst sowohl die Evolution des Paarungssystems als auch die Persistenz kleiner Populationen, die anfällig für die Akkumulation von Mutationen sind, kritisch. Unter bestimmten Umständen neigt Inbreeding jedoch dazu, Populationen von genügend schädlichen rezessiven Mutationen zu befreien, um die Inbreeding Depression (ID) zu reduzieren. Das Ausmaß der Reinigung hängt von vielen Populations- und genetischen Faktoren ab, was universelle Vorhersagen unmöglich macht. Wir überprüfen 52 Studien, die ID-Niveaus zwischen Arten, Populationen und Linien vergleichen, die sich in ihrer Inbreeding-Historie zu unterscheiden scheinen. Von 34 Studien, die ID zwischen Populationen und Arten verglichen, zeigten 14 signifikante Evidenz für Reinigung. Innerhalb von Populationen berichten viele Studien über zwischenfamiliäre Variation in ID, und 6 von 18 Studien fanden Evidenz für Reinigung zwischen Linien. Regressionsanalysen deuten darauf hin, dass Reinigung am wahrscheinlichsten ID für frühe Merkmale mildert (6 Studien), aber diese Rückgänge sind typischerweise bescheiden (5–10%). Meta-Analysen von Ergebnissen aus 45 Populationen in 11 Studien zeigen keine signifikante Gesamtevidenz für Reinigung, sondern eher das Gegenteil, dass sich Populationen mit mehr Selbstbefruchtung für frühe Merkmale einer höheren ID aussetzen. Die Wahrscheinlichkeit, Reinigung zu finden, variiert systematisch nicht mit dem experimentellen Design oder ob frühe oder späte Merkmale betrachtet werden. Perennien zeigen etwas weniger oft Reinigung als Einjährige (2 von 10 vs. 7 von 14). Wir schließen, dass diese Ergebnisse zwar zweifellos Variationen in Populations- und genetischen Parametern widerspiegeln, aber auch darauf hindeuten, dass Reinigung eine inkonsistente Kraft innerhalb von Populationen ist. Solche Ergebnisse implizieren auch, dass Versuche, die Last gezielt durch Inbreeding in Zuchtprogrammen zu reduzieren, fehlgeleitet sein können. Zukünftige Studien sollten männliche und weibliche Fitnessmerkmale über den gesamten Lebenszyklus untersuchen, Paarungsgeschichten auf allen Ebenen schätzen (d.h. Populationen und Familien innerhalb von Populationen), Daten für Meta-Analysen berichten und statistisch auf die Reinigung genetischer Lasten testen.

@article{doi101146annurevecolsys301479,
    author = "Byers, Diane L. und Waller, Donald M.",
    title = "Do Plant Populations Purge Their Genetic Load? Effects of Population Size and Mating History on Inbreeding Depression",
    year = "1999",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Zusammenfassung Inbreeding Depression beeinflusst sowohl die Evolution des Paarungssystems als auch die Persistenz kleiner Populationen, die anfällig für die Akkumulation von Mutationen sind, kritisch. Unter bestimmten Umständen neigt Inbreeding jedoch dazu, Populationen von genügend schädlichen rezessiven Mutationen zu befreien, um die Inbreeding Depression (ID) zu reduzieren. Das Ausmaß der Reinigung hängt von vielen Populations- und genetischen Faktoren ab, was universelle Vorhersagen unmöglich macht. Wir überprüfen 52 Studien, die ID-Niveaus zwischen Arten, Populationen und Linien vergleichen, die sich in ihrer Inbreeding-Historie zu unterscheiden scheinen. Von 34 Studien, die ID zwischen Populationen und Arten verglichen, zeigten 14 signifikante Evidenz für Reinigung. Innerhalb von Populationen berichten viele Studien über zwischenfamiliäre Variation in ID, und 6 von 18 Studien fanden Evidenz für Reinigung zwischen Linien. Regressionsanalysen deuten darauf hin, dass Reinigung am wahrscheinlichsten ID für frühe Merkmale mildert (6 Studien), aber diese Rückgänge sind typischerweise bescheiden (5–10%). Meta-Analysen von Ergebnissen aus 45 Populationen in 11 Studien zeigen keine signifikante Gesamtevidenz für Reinigung, sondern eher das Gegenteil, dass sich Populationen mit mehr Selbstbefruchtung für frühe Merkmale einer höheren ID aussetzen. Die Wahrscheinlichkeit, Reinigung zu finden, variiert systematisch nicht mit dem experimentellen Design oder ob frühe oder späte Merkmale betrachtet werden. Perennien zeigen etwas weniger oft Reinigung als Einjährige (2 von 10 vs. 7 von 14). Wir schließen, dass diese Ergebnisse zwar zweifellos Variationen in Populations- und genetischen Parametern widerspiegeln, aber auch darauf hindeuten, dass Reinigung eine inkonsistente Kraft innerhalb von Populationen ist. Solche Ergebnisse implizieren auch, dass Versuche, die Last gezielt durch Inbreeding in Zuchtprogrammen zu reduzieren, fehlgeleitet sein können. Zukünftige Studien sollten männliche und weibliche Fitnessmerkmale über den gesamten Lebenszyklus untersuchen, Paarungsgeschichten auf allen Ebenen schätzen (d.h. Populationen und Familien innerhalb von Populationen), Daten für Meta-Analysen berichten und statistisch auf die Reinigung genetischer Lasten testen.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.30.1.479",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.30.1.479",
    openalex = "W2139787612",
    references = "doi101093genetics25466, doi101093oxfordjournalsjhereda023085"
}

Genetische Parameter, die weit verbreitet zur Überwachung genetischer Variation in Schutzprogrammen verwendet werden, wie effektive Anzahl der Gründer, Gründer-Genomäquivalente und effektive Populationsgröße, stehen in Bezug auf Verwandtschaftsgrade und Varianzen der Beiträge von Vorfahren zu Nachkommen in Beziehung zueinander. Ein neuer Parameter, die effektive Anzahl der Nicht-Gründer, wird eingeführt, um die Beziehung zwischen der effektiven Anzahl der Gründer und den Gründer-Genomäquivalenten zu beschreiben. Praktische Empfehlungen für die Aufrechterhaltung genetischer Variation in kleinen, in Gefangenschaft gehaltenen Populationen werden diskutiert. Um die genetische Vielfalt zu erhalten, sollte ein minimales Verwandtschaftsmaß zwischen Individuen angestrebt werden. Dies minimiert die Varianzen der Beiträge von Vorfahren zu Nachkommen in allen vorherigen Generationen. Die Methode der Auswahl der Eltern und das Paarungssystem sollten unabhängig voneinander sein, da für letzteres keine klare Empfehlung gegeben werden kann.

@article{doi101017s0016672399004449,
    author = "Caballero, Armando und Toro, M. Á.",
    title = "Interrelationen zwischen effektiver Populationsgröße und anderen Stammbaum-Tools für die Verwaltung von geschützten Populationen",
    year = "2000",
    journal = "Genetics Research",
    abstract = "Genetische Parameter, die weit verbreitet zur Überwachung genetischer Variation in Schutzprogrammen verwendet werden, wie effektive Anzahl der Gründer, Gründer-Genomäquivalente und effektive Populationsgröße, stehen in Bezug auf Verwandtschaftsgrade und Varianzen der Beiträge von Vorfahren zu Nachkommen in Beziehung zueinander. Ein neuer Parameter, die effektive Anzahl der Nicht-Gründer, wird eingeführt, um die Beziehung zwischen der effektiven Anzahl der Gründer und den Gründer-Genomäquivalenten zu beschreiben. Praktische Empfehlungen für die Aufrechterhaltung genetischer Variation in kleinen, in Gefangenschaft gehaltenen Populationen werden diskutiert. Um die genetische Vielfalt zu erhalten, sollte ein minimales Verwandtschaftsmaß zwischen Individuen angestrebt werden. Dies minimiert die Varianzen der Beiträge von Vorfahren zu Nachkommen in allen vorherigen Generationen. Die Methode der Auswahl der Eltern und das Paarungssystem sollten unabhängig voneinander sein, da für letzteres keine klare Empfehlung gegeben werden kann.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0016672399004449",
    doi = "10.1017/s0016672399004449",
    openalex = "W2047578253",
    references = "doi101093genetics163290"
}

@misc{s272efbcfd0f91184c48056f26841a2286a4a85d8d,
    author = "Wright, S.",
    title = "EVOLUTION IN MENDELIAN POPULATIONS",
    year = "2001",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/72efbcfd0f91184c48056f26841a2286a4a85d8d",
    is_oa = "true",
    semanticscholar_citation_count = "1",
    semanticscholar_id = "72efbcfd0f91184c48056f26841a2286a4a85d8d"
}

Die Genidentität durch Abstammung (IBD) ist ein grundlegendes Konzept, das genetisch vermittelte Ähnlichkeiten unter Verwandten zugrunde liegt. Die Gen-IBD wird über urtümliche Meiosen verfolgt und ist relativ zu Gründern eines Stammbaums oder zu einem bestimmten Zeitpunkt oder mutationalen Ursprung in der Koaleszenz einer Reihe von existierenden Genen in einer Population definiert. Der zufällige Prozess, der Änderungen in den Mustern der IBD über das Genom bewirkt, ist die Rekombination, sodass der natürliche Kontext zur Definition der IBD der urtümliche Rekombinationsgraph (ARG) ist, der die vollständige Abstammung einer Sammlung von Chromosomen festlegt. Der ARG bestimmt sowohl die Sequenz der koaleszenten Abstammungen über das Chromosom hinweg als auch die existierenden DNA-Segmente, die ununterbrochen durch Rekombination von ihrem jüngsten gemeinsamen Vorfahren (MRCA) abstammen. DNA-Segmente, die IBD von einem jüngsten gemeinsamen Vorfahren haben, weisen eine hohe Wahrscheinlichkeit auf, vom gleichen allelischen Typ zu sein. Nicht-IBD-DNA wird als unabhängigem allelischen Typ modelliert, aber der populationsbezogene Bezugsrahmen zur Definition der allelischen Unabhängigkeit kann variieren. Ob es sich um IBD, allelische Ähnlichkeit oder phänotypische Kovarianz handelt, können Vergleiche mit anderen genomischen Regionen derselben Gameten oder mit denselben genomischen Regionen in anderen Sätzen von Gameten oder diploiden Individuen angestellt werden. In diesem Überblicksvortrag stelle ich die IBD als den Rahmen vor, der die evolutionäre und koaleszente Theorie mit der Analyse genetischer Daten verbindet, die an Individuen beobachtet werden. Ich konzentriere mich auf die hohe Varianz der Prozesse, die die IBD bestimmen, ihre Änderungen über das Genom hinweg und ihre Auswirkung auf beobachtbare Daten.

@article{doi101534genetics112148825,
    author = "Thompson, E. A.",
    title = "Identity by Descent: Variation in Meiosis, Across Genomes, and in Populations",
    year = "2013",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Gene identity by descent (IBD) is a fundamental concept that underlies genetically mediated similarities among relatives. Gene IBD is traced through ancestral meioses and is defined relative to founders of a pedigree, or to some time point or mutational origin in the coalescent of a set of extant genes in a population. The random process underlying changes in the patterns of IBD across the genome is recombination, so the natural context for defining IBD is the ancestral recombination graph (ARG), which specifies the complete ancestry of a collection of chromosomes. The ARG determines both the sequence of coalescent ancestries across the chromosome and the extant segments of DNA descending unbroken by recombination from their most recent common ancestor (MRCA). DNA segments IBD from a recent common ancestor have high probability of being of the same allelic type. Non-IBD DNA is modeled as of independent allelic type, but the population frame of reference for defining allelic independence can vary. Whether of IBD, allelic similarity, or phenotypic covariance, comparisons may be made to other genomic regions of the same gametes, or to the same genomic regions in other sets of gametes or diploid individuals. In this review, I present IBD as the framework connecting evolutionary and coalescent theory with the analysis of genetic data observed on individuals. I focus on the high variance of the processes that determine IBD, its changes across the genome, and its impact on observable data.",
    url = "https://doi.org/10.1534/genetics.112.148825",
    doi = "10.1534/genetics.112.148825",
    openalex = "W2113697014",
    references = "doi101017s0370164600023993"
}

Die Identifizierung genomischer Regionen, die von positiver Selektion betroffen sind, war ein langjähriges Interesse evolutionärer Biologen. Dieses Ziel war bis zum jüngsten Aufkommen der Next-Generation-Sequenzierung schwer zu erreichen, was die Entwicklung groß angelegter Kataloge genetischer Variation für eine wachsende Anzahl von Arten fördert. In jüngster Zeit wurden mehrere statistische Methoden entwickelt, um diese reichhaltigen Datensätze zu analysieren, doch das Verständnis der Bedingungen, unter denen diese Methoden zuverlässige Ergebnisse liefern, ist nach wie vor unzureichend. Diese Studie zielt darauf ab, diese Lücke zu schließen, indem sie die Leistung von Genom-Scan-Methoden bewertet, die explizit die physikalische Verknüpfung unter SNPs in der Umgebung einer selektierten Variante berücksichtigen. Unsere Studie vergleicht die Leistung von sieben jüngsten Methoden zur Detektion von Selektionssweeps (iHS, nSL, EHHST, xp-EHH, XP-EHHST, XPCLR und hapFLK). Wir verwenden einen individualbasierten Simulationsansatz, um die Leistungsfähigkeit und Genauigkeit dieser Methoden unter einer breiten Palette von Populationsmodellen sowohl bei harten als auch bei weichen Sweeps zu untersuchen. Unsere Ergebnisse zeigen, dass XPCLR und hapFLK am besten abschneiden und weiche Sweeps unter einfachen Populationsstruktur-Szenarien erkennen können, wenn die Migrationsrate niedrig ist. Alle Methoden schneiden bei moderaten bis hohen Migrationsraten schlecht ab oder bei schwacher Selektion sehr schlecht, insbesondere unter einer hierarchischen Populationsstruktur. Schließlich ist keine einzelne Methode in der Lage, sowohl beginnende als auch nahezu abgeschlossene Selektionssweeps zu detektieren. Allerdings kann die Kombination mehrerer Methoden (XPCLR oder hapFLK mit iHS oder nSL) die Leistungsfähigkeit, die selektierte Region zu lokalisieren, erheblich steigern.

@article{doi101111mec13360,
    author = "Vatsiou, Alexandra und Bazin, Éric und Gaggiotti, Oscar E.",
    title = "Detection of selective sweeps in structured populations: a comparison of recent methods",
    year = "2015",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Identifying genomic regions targeted by positive selection has been a long-standing interest of evolutionary biologists. This objective was difficult to achieve until the recent emergence of next-generation sequencing, which is fostering the development of large-scale catalogues of genetic variation for increasing number of species. Several statistical methods have been recently developed to analyse these rich data sets, but there is still a poor understanding of the conditions under which these methods produce reliable results. This study aims at filling this gap by assessing the performance of genome-scan methods that consider explicitly the physical linkage among SNPs surrounding a selected variant. Our study compares the performance of seven recent methods for the detection of selective sweeps (iHS, nSL, EHHST, xp-EHH, XP-EHHST, XPCLR and hapFLK). We use an individual-based simulation approach to investigate the power and accuracy of these methods under a wide range of population models under both hard and soft sweeps. Our results indicate that XPCLR and hapFLK perform best and can detect soft sweeps under simple population structure scenarios if migration rate is low. All methods perform poorly with moderate-to-high migration rates, or with weak selection and very poorly under a hierarchical population structure. Finally, no single method is able to detect both starting and nearly completed selective sweeps. However, combining several methods (XPCLR or hapFLK with iHS or nSL) can greatly increase the power to pinpoint the selected region.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13360",
    doi = "10.1111/mec.13360",
    openalex = "W2131888512",
    references = "doi101016s0092824005800114, doi101017s0016672300014634, doi101038nature01140, doi101038nature06250, doi101038nbt1486, doi101093bioinformaticsbti623, doi101093genetics15531405, doi101093molbevmsi237, doi101098rspb19960237, doi101371journalpbio0040072, doi101534genetics108092221"
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@article{barton2016sewall,
    author = "Barton, Nicholas H",
    title = "Sewall Wright über Evolution in mendelischen Populationen und das „Shifting Balance”",
    year = "2016",
    journal = "Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1534/genetics.115.184796",
    doi = "10.1534/genetics.115.184796",
    number = "1",
    openalex = "W2225028202",
    pages = "3-4",
    volume = "202",
    references = "doi101093genetics16297, doi101093genetics196506, doi101093genetics244538, doi101093genetics282114, doi101093genetics282139, doi101093genetics284304, doi101093genetics31139, doi101093genetics62111, doi101111j155856461997tb03650x, doi1023071981923"
}

@incollection{crossref2019part,
    title = "DREITEIL. EVOLUTION IN MENDELSCHEN POPULATIONEN: TELEOLOGIE WIRD MATHEMATISCH",
    year = "2019",
    booktitle = "Not by Design",
    url = "https://doi.org/10.1525/9780520944404-004",
    doi = "10.1525/9780520944404-004",
    openalex = "W4256520976",
    pages = "151-254"
}

Ein interessantes evolutionäres Thema, das noch offen ist, ist die Vernetzung zwischen marinen Populationen. Meeresströmungen können die Ausbreitung von Larven oder Erwachsenen begünstigen, können aber auch Wirbel und Gyre erzeugen, die ozeanografische Fronten bilden und so den Genfluss einschränken. Um dieses Thema zu untersuchen, haben wir den Übergang zwischen dem Atlantik und dem Mittelmeer ausgewählt, an dem sich mehrere Fronten befinden: Straße von Gibraltar (GS), Almeria-Oran-Front (AOF) und Ibiza-Kanal (IC). Sieben Populationen des Meereskrabben Liocarcinus depurator (Cádiz, West- und Ost-Alboran, Alacant, Valencia, Ebro-Delta und Nordkatalonien), die entlang dieses Übergangs liegen, wurden über sechs aufeinanderfolgende Jahre (2014-2019) unter Verwendung eines Fragments des COI (Cytochrom-Oxidase-Untereinheit I)-Gens analysiert. Alle Sequenzen (966) gehörten zu zwei gut definierten Haplogruppen: ATL (am häufigsten in atlantischen Gewässern) und MED (vorherrschend in mediterranen Gewässern). Nach einer geografischen Variation nahm die Häufigkeit von ATL signifikant von Cádiz bis Nordkatalonien ab. Diese Variation zeigte jedoch Stufen aufgrund des Effekts ozeanografischer Einschränkungen/Fronten. Signifikante Effekte wurden für GS (2015, 2017, 2018 und 2019), AOF (alle Jahre außer 2018) und IC (2016) aufgezeichnet. Die Intensität und der genaue Standort dieser Fronten änderten sich im Laufe der Zeit. Multivariate Analysen unterschieden drei Hauptpopulationengruppen: Cádiz, Alboran-See und die restlichen mediterranen Populationen. Diese Ergebnisse könnten relevant sein, um Meeresschutzgebiete korrekt zu definieren und für Naturschutz- und Fischereipolitiken.

@article{doi101038s41598022139414,
    author = "Ojeda, Víctor Pedro Cuadros und Serra, Bruna und Lagares, Clàudia und Rojo-Francàs, Eva und Sellés, Maria und Marco‐Herrero, Elena und García, Encarnación und Farré, Marc und Arenas, C. und Abelló, Pere und Mestres, Francesc",
    title = "Interannual fluctuations in connectivity among crab populations (Liocarcinus depurator) along the Atlantic-Mediterranean transition",
    year = "2022",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "Ein interessantes evolutionäres Thema, das noch offen ist, ist die Vernetzung zwischen marinen Populationen. Meeresströmungen können die Ausbreitung von Larven oder Erwachsenen begünstigen, können aber auch Wirbel und Gyre erzeugen, die ozeanografische Fronten bilden und so den Genfluss einschränken. Um dieses Thema zu untersuchen, haben wir den Übergang zwischen dem Atlantik und dem Mittelmeer ausgewählt, an dem sich mehrere Fronten befinden: Straße von Gibraltar (GS), Almeria-Oran-Front (AOF) und Ibiza-Kanal (IC). Sieben Populationen des Meereskrabben Liocarcinus depurator (Cádiz, West- und Ost-Alboran, Alacant, Valencia, Ebro-Delta und Nordkatalonien), die entlang dieses Übergangs liegen, wurden über sechs aufeinanderfolgende Jahre (2014-2019) unter Verwendung eines Fragments des COI (Cytochrom-Oxidase-Untereinheit I)-Gens analysiert. Alle Sequenzen (966) gehörten zu zwei gut definierten Haplogruppen: ATL (am häufigsten in atlantischen Gewässern) und MED (vorherrschend in mediterranen Gewässern). Nach einer geografischen Variation nahm die Häufigkeit von ATL signifikant von Cádiz bis Nordkatalonien ab. Diese Variation zeigte jedoch Stufen aufgrund des Effekts ozeanografischer Einschränkungen/Fronten. Signifikante Effekte wurden für GS (2015, 2017, 2018 und 2019), AOF (alle Jahre außer 2018) und IC (2016) aufgezeichnet. Die Intensität und der genaue Standort dieser Fronten änderten sich im Laufe der Zeit. Multivariate Analysen unterschieden drei Hauptpopulationengruppen: Cádiz, Alboran-See und die restlichen mediterranen Populationen. Diese Ergebnisse könnten relevant sein, um Meeresschutzgebiete korrekt zu definieren und für Naturschutz- und Fischereipolitiken.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-022-13941-4",
    doi = "10.1038/s41598-022-13941-4",
    openalex = "W4282581500",
    references = "doi103934dcdsb201419883"
}