Phylogenie

@misc{garstang1894preliminary11,
    author = "Garstang, W",
    title = "Vorläufige Notiz zu einer neuen Theorie der Phylogenie der Chordata",
    year = "1894",
    howpublished = "Zoologischer Anzeiger, v. 17, p. 122-125",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Garstang, W., 1894, Vorläufige Notiz zu einer neuen Theorie der Phylogenie der Chordata: Zoologischer Anzeiger, v. 17, p. 122-125.}"
}

@article{garstang1928the12,
    author = "Garstang, W",
    title = "The morphology of the Tunicata and its bearings on the phylogeny of the Chordata",
    year = "1928",
    journal = "Quarterly Journal of Microscopical Science, v. 72, p. 51-187",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Garstang, W., 1928, The morphology of the Tunicata and its bearings on the phylogeny of the Chordata: Quarterly Journal of Microscopical Science, v. 72, p. 51-187.}"
}

@misc{franz1932vivaparus10,
    author = "Franz, V",
    title = "Vivaparus; Morphometrie, Phylogenie und Geographie der europäischen, fossilen und rezenten Paludinen",
    year = "1932",
    howpublished = "Med.-Naturw. Ges. Jena, Denkschr., v. 18",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Franz, V., 1932, Vivaparus; Morphometrie, Phylogenie und Geographie der europäischen, fossilen und rezenten Paludinen: Med.-Naturw. Ges. Jena, Denkschr., v. 18.}"
}

@book{baker1938the1,
    author = "Baker, J. R",
    title = "The Evolution of Breeding Systems, in Evolution, Essays presented to E.S. Goodrich",
    year = "1938",
    publisher = "Oxford, Oxford University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Baker, J. R., 1938, The Evolution of Breeding Systems, in Evolution, Essays presented to E.S. Goodrich: Oxford, Oxford University Press.}"
}

@book{camp1942phylogeny3,
    author = "Camp, C. L. und Smith, N",
    title = "Phylogenie und Funktion der digitalen Bänder des Pferdes",
    year = "1942",
    publisher = "Memoirs of the University of California, Berkeley, v. 13, S. 69-124",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Camp, C. L., und Smith, N., 1942, Phylogenie und Funktion der digitalen Bänder des Pferdes: Memoirs of the University of California, Berkeley, v. 13, S. 69-124.}"
}

@techreport{greenwood1966phyletic17,
    author = "Greenwood, P. H. und Miles, R. S. und Patterson, C. und Rosen, D. E. und Weitzman, S. H. und Myers, G. S",
    title = "Phyletische Studien an Teleostei-Fischen mit einer vorläufigen Klassifikation lebender Formen",
    year = "1966",
    howpublished = "Bulletin of the American Museum of Natural History, v. 131, no. Art. 4, p. 339-456",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Greenwood, P. H., Miles, R. S., Patterson, C., Rosen, D. E., Weitzman, S. H., und Myers, G. S., 1966, Phyletische Studien an Teleostei-Fischen mit einer vorläufigen Klassifikation lebender Formen: Bulletin of the American Museum of Natural History, v. 131, no. Art. 4, p. 339-456.}"
}

@book{hennig1966phylogenetic18,
    author = "Hennig, W",
    title = "Phylogenetic Systematics",
    year = "1966",
    publisher = "Urbana, Illinois, University of Illinois Press; [2nd edition, 1979]",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hennig, W., 1966, Phylogenetic Systematics: Urbana, Illinois, University of Illinois Press; [2nd edition, 1979].}"
}

@misc{fay1967phylogeny8,
    author = "Fay, R. O",
    title = "Phylogenie und Evolution, S",
    year = "1967",
    howpublished = "S392-S396, in Moore, R. C., ed., Treatise on Invertebrate Paleontology, pt. S (Echinodermata I), v.2 (Blastoids), p. S297-S650",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Fay, R. O., 1967, Phylogenie und Evolution, S. S392-S396, in Moore, R. C., ed., Treatise on Invertebrate Paleontology, pt. S (Echinodermata I), v.2 (Blastoids), p. S297-S650.}"
}

@misc{fitch1967construction9,
    author = "Fitch, W. M. und Margoliash, E",
    title = "Konstruktion phylogenetischer Bäume",
    year = "1967",
    howpublished = "Science, v. 155, p. 279-284",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Fitch, W. M., und Margoliash, E., 1967, Konstruktion phylogenetischer Bäume: Science, v. 155, p. 279-284.}"
}

@incollection{rvig1967phylogeny25,
    author = "rvig, T",
    editor = "Miles, A. E. W.",
    title = "Phylogenie von Zahngewebe: Evolution einiger verkalkter Gewebe bei frühen Wirbeltieren",
    year = "1967",
    booktitle = "Strukturelle und chemische Organisation von Zähnen",
    publisher = "London, Academic Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {rvig, T., 1967, Phylogenie von Zahngewebe: Evolution einiger verkalkter Gewebe bei frühen Wirbeltieren, in Miles, A. E. W., ed., Strukturelle und chemische Organisation von Zähnen: London, Academic Press.}"
}

@misc{eldredge1971the7,
    author = "Eldredge, N",
    title = "The allopatric model and phylogeny of Paleozoic invertebrates",
    year = "1971",
    howpublished = "Evolution, v. 25, p. 156-167",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Eldredge, N., 1971, The allopatric model and phylogeny of Paleozoic invertebrates: Evolution, v. 25, p. 156-167.}"
}

@book{hubbs1971distribution19,
    author = "Hubbs, C. L. und Potter, I. C",
    title = "Distribution, Phylogeny and Taxonomy, in Hardisty, M. W., und Potter, I. C., eds., The Biology of Lampreys",
    year = "1971",
    publisher = "London, Academic Press, v. 1, p. 1-65",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hubbs, C. L., und Potter, I. C., 1971, Distribution, Phylogeny and Taxonomy, in Hardisty, M. W., und Potter, I. C., eds., The Biology of Lampreys: London, Academic Press, v. 1, p. 1-65.}"
}

@misc{kavanaugh1972hennigs20,
    author = "Kavanaugh, D. H",
    title = "Hennig's principles and methods of phylogenetic systematics",
    year = "1972",
    howpublished = "The Biologist, v. 54, p. 115-127",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kavanaugh, D. H., 1972, Hennig's principles and methods of phylogenetic systematics: The Biologist, v. 54, p. 115-127.}"
}

@article{greenwood1973interrelationships16,
    author = "Greenwood, P. H. und Miles, R. S. und Patterson, C",
    title = "Interrelationships of Fishes",
    year = "1973",
    journal = "London, Academic Press; [Supplement No.1 to the Zoological Journal of the Linnean Society, 53]",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Greenwood, P. H., Miles, R. S., und Patterson, C., 1973, Interrelationships of Fishes: London, Academic Press; [Supplement No.1 to the Zoological Journal of the Linnean Society, 53].}"
}

@article{raup1973stochastic22,
    author = "Raup, D. M. und Gould, S. J. und Schopf, T. J. M. und Simberloff, D. S",
    title = "Stochastische Modelle der Phylogenie und die Evolution der Vielfalt",
    year = "1973",
    journal = "Journal of Geology, v. 81, no. 5, p. 525-542",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Raup, D. M., Gould, S. J., Schopf, T. J. M., und Simberloff, D. S., 1973, Stochastic models of phylogeny and the evolution of diversity: Journal of Geology, v. 81, no. 5, p. 525-542.}"
}

@inproceedings{dilly1975the6,
    author = "Dilly, P. N",
    title = "The pterobranch Rhabdopleura compacta",
    year = "1975",
    booktitle = "its nervous system and phylogenetic position: Symposium of the Zoological Society, London, v. 36, p. 1-16",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dilly, P. N., 1975, The pterobranch Rhabdopleura compacta: its nervous system and phylogenetic position: Symposium of the Zoological Society, London, v. 36, p. 1-16.}"
}

@inproceedings{southward1975fine24,
    author = "Southward, E. C",
    title = "Feinstruktur und Phylogenie der Pogonomorpha",
    year = "1975",
    booktitle = "Symposium der Zoologischen Gesellschaft, London, v. 36, S. 235-251",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Southward, E. C., 1975, Fine structure and phylogeny of the Pogonomorpha: Symposium of the Zoological Society, London, v. 36, p. 235-251.}"
}

@inproceedings{willner1975the26,
    author = "Willner, E. N",
    title = "Der mögliche Beitrag von Nemertinen zum Problem der Phylogenie der Protochordaten",
    year = "1975",
    booktitle = "Symposium der Zoologischen Gesellschaft, London, v. 36, S. 319-345",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Willner, E. N., 1975, Der mögliche Beitrag von Nemertinen zum Problem der Phylogenie der Protochordaten: Symposium der Zoologischen Gesellschaft, London, v. 36, S. 319-345.}"
}

@article{gingerich1976paleontology14,
    author = "Gingerich, P. D",
    title = "Paleontology and phylogeny",
    year = "1976",
    journal = "patterns of evolution of the species level in early Tertiary mammals: American Journal of Science, v. 276, p. 1-28",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gingerich, P. D., 1976, Paleontology and phylogeny: patterns of evolution of the species level in early Tertiary mammals: American Journal of Science, v. 276, p. 1-28.}"
}

@misc{compagno1977phyletic5,
    author = "Compagno, L. J. V",
    title = "Phyletic relationships of living sharks and rays",
    year = "1977",
    howpublished = "American Zoologist, v. 17, p. 303-322",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Compagno, L. J. V., 1977, Phyletic relationships of living sharks and rays: American Zoologist, v. 17, p. 303-322.}"
}

@book{gould1977ontogeny15,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Ontogeny and Phylogeny",
    year = "1977",
    publisher = "Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1977, Ontogeny and Phylogeny: Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
}

@article{brace1981tales2,
    author = "Brace, C. L",
    title = "Tales of the phylogenetic woods",
    year = "1981",
    journal = "die Evolution und Bedeutung evolutionärer Bäume: American Journal of Physical Anthropology, v. 56, no. 4, p. 411-429",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brace, C. L., 1981, Tales of the phylogenetic woods: die Evolution und Bedeutung evolutionärer Bäume: American Journal of Physical Anthropology, v. 56, no. 4, p. 411-429.}"
}

@misc{chatterjee1982phylogeny4,
    author = "Chatterjee, S",
    title = "Phylogenie und Klassifikation der thecodontian Reptilien",
    year = "1982",
    howpublished = "Nature, v. 295, p. 317-320",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Chatterjee, S., 1982, Phylogenie und Klassifikation der thecodontian Reptilien: Nature, v. 295, p. 317-320.}"
}

@misc{gauthier1984phylogenetic13,
    author = "Gauthier, J. und Padian, K",
    title = "Phylogenetische, funktionale und aerodynamische Analyse des Ursprungs der Vögel, in Hecht, M. K., Ostrom, J. H., Viohl, G., und Wellnhofer, P., Hgg., The Beginnings of Birds",
    year = "1984",
    howpublished = "Eichstatt, Freunde des Jura-Museums, S. 185-198",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gauthier, J., und Padian, K., 1984, Phylogenetische, funktionale und aerodynamische Analyse des Ursprungs der Vögel, in Hecht, M. K., Ostrom, J. H., Viohl, G., und Wellnhofer, P., Hgg., The Beginnings of Birds: Eichstatt, Freunde des Jura-Museums, S. 185-198.}"
}

@incollection{paul1984the21,
    author = "Paul, G. S",
    editor = "Reif, W. E. and Westphal, F.",
    title = "The Archosaurs: A Phylogenetic Study",
    year = "1984",
    booktitle = "Third Symposium on Mesozoic Terrestrial Ecosystems",
    publisher = "Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 175-180",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Paul, G. S., 1984, The Archosaurs: A Phylogenetic Study, in Reif, W. E., and Westphal, F., eds., Third Symposium on Mesozoic Terrestrial Ecosystems: Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 175-180.}"
}

@inproceedings{sereno1984the23,
    author = "Sereno, P. C",
    title = "The Phylogeny of the Ornithischia, a reappraisal, in Reif, W. E., and Westphal, F., eds., Third Symposium on Mesozoic Terrestrial Environments",
    year = "1984",
    booktitle = "Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 219-226",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sereno, P. C., 1984, The Phylogeny of the Ornithischia, a reappraisal, in Reif, W. E., and Westphal, F., eds., Third Symposium on Mesozoic Terrestrial Environments: Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 219-226.}"
}

@article{ferraris2000phylogeny,
    author = "Ferraris, Carl J.",
    title = "Phylogenie und Klassifikation neotropischer Fische",
    year = "2000",
    journal = "Copeia",
    url = "https://doi.org/10.1643/0045-8511(2000)2000[0314:br]2.0.co;2",
    doi = "10.1643/0045-8511(2000)2000[0314:br]2.0.co;2",
    number = "1",
    pages = "314-315",
    volume = "2000"
}

@incollection{kapoor2004evolution,
    author = "Kapoor, B. G. und Khanna, Bhavna",
    title = "Evolution; Phylogenie; Klassifikation",
    year = "2004",
    booktitle = "Ichthyology Handbook",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-662-07844-0\_1",
    doi = "10.1007/978-3-662-07844-0\_1",
    pages = "1-30"
}

@article{betancurr2017phylogenetic,
    author = "Betancur-R, Ricardo und Wiley, Edward O. und Arratia, Gloria und Acero, Arturo und Bailly, Nicolas und Miya, Masaki und Lecointre, Guillaume und Ortí, Guillermo",
    title = "Phylogenetische Klassifikation der Knochenfische",
    year = "2017",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12862-017-0958-3",
    doi = "10.1186/s12862-017-0958-3",
    number = "1",
    volume = "17"
}

@incollection{ji2021phylogeny,
    author = "Ji, Yunheng",
    title = "Phylogenie, Klassifikation, Biogeographie und Evolution",
    year = "2021",
    booktitle = "Ein Monograph über Paris (Melanthiaceae)",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-981-15-7903-5\_5",
    doi = "10.1007/978-981-15-7903-5\_5",
    pages = "69-81"
}

@article{near2024phylogenetic,
    author = "Near, Thomas J. und Thacker, Christine E.",
    title = "Phylogenetische Klassifikation lebender und fossiler Strahlenflossiger Fische (Actinopterygii)",
    year = "2024",
    journal = "Bulletin of the Peabody Museum of Natural History",
    url = "https://doi.org/10.3374/014.065.0101",
    doi = "10.3374/014.065.0101",
    number = "1",
    volume = "65"
}

Die Evolution von Kiefern wird als Treiber für Radiationen unter Wirbeltieren angenommen und hat zu ihrem überwältigenden Erfolg in der Gegenwart beigetragen. Frühere Arbeiten zeigen eine schnelle frühe Expansion der Vielfalt in der Kieferstruktur in vielen Linien; jedoch sind die evolutionären Dynamiken, die diesem Muster zugrunde liegen, unklar und durch den Mangel an einem robusten vergleichenden Rahmen behindert. Hier untersuchen wir unter Verwendung eines makroevolutionären Ansatzes die Diversifizierung der Unterkiefer bei frühen knöchernen Fischen, einem wichtigen Beitrag zu dieser initialen Radiation. Unter Verwendung neu generierter dreidimensionaler Daten zur Mandibelform von 86 Arten finden wir Hinweise auf eine adaptive Radiation der Kiefer während des frühesten Intervalls der evolutionären Geschichte der knöchernen Fische (423-359 Ma). Diese Muster werden hauptsächlich von frühen Lungenfischen und Coelacanthen angetrieben, die hohe Raten der Kieferdiversifizierung, schnelle Verschiebungen in neuartige funktionelle Bereiche des Merkmalsraums und erhebliche Innovationen in der Kiefermorphologie und der Fütterungsökologie aufweisen, im Gegensatz zu ihren „lebenden Fossilien"-Nachkommen von heute. Im Gegensatz dazu zeigen Strahlenflosser und Tetrapodomorphen, morphologisch diverse Gruppen in der Gegenwart, wenig Anzeichen für ihren zukünftigen Erfolg, da sie langsame Raten der Kieferentwicklung und geringe funktionelle Vielfalt aufweisen. Diese tiefgreifende Inversion von Mustern bei modernen Taxa unterstreicht die Bedeutung paläontologischer Daten für das Verständnis der Treiber der evolutionären Diversifizierung und die Grenzen von Ansätzen, die nur lebende Arten verwenden. Insgesamt bieten unsere Erkenntnisse Einblicke in die evolutionären Dynamiken, die mit der Evolution von Kiefern verbunden sind, und liefern Kontext für die Rolle von Kiefern im Wirbeltiererfolg.

@article{doi101016jcub202508008,
    author = "Troyer, Emily M und Rivero-Vega, Rafael A und Cui, Xindong und Zhu, Min und Qiao, Tuo und Saad, Hadeel H und Figueroa, Rodrigo T und Andrews, James V und Clement, Alice M und Lebedev, Oleg A und Higgins, Robert und Igielman, Benjamin und Pierce, Stephanie E und Giles, Sam und Friedman, Matt",
    title = "Macroevolutionäre Rollenwechsel in der frühesten Radiation der knöchernen Fische.",
    year = "2025",
    journal = "Current biology: CB",
    abstract = {Die Evolution von Kiefern wird als Treiber für Radiationen unter Wirbeltieren angenommen und hat zu ihrem überwältigenden Erfolg in der Gegenwart beigetragen. Frühere Arbeiten zeigen eine schnelle frühe Expansion der Vielfalt in der Kieferstruktur in vielen Linien; jedoch sind die evolutionären Dynamiken, die diesem Muster zugrunde liegen, unklar und durch den Mangel an einem robusten vergleichenden Rahmen behindert. Hier untersuchen wir unter Verwendung eines makroevolutionären Ansatzes die Diversifizierung der Unterkiefer bei frühen knöchernen Fischen, einem wichtigen Beitrag zu dieser initialen Radiation. Unter Verwendung neu generierter dreidimensionaler Daten zur Mandibelform von 86 Arten finden wir Hinweise auf eine adaptive Radiation der Kiefer während des frühesten Intervalls der evolutionären Geschichte der knöchernen Fische (423-359 Ma). Diese Muster werden hauptsächlich von frühen Lungenfischen und Coelacanthen angetrieben, die hohe Raten der Kieferdiversifizierung, schnelle Verschiebungen in neuartige funktionelle Bereiche des Merkmalsraums und erhebliche Innovationen in der Kiefermorphologie und der Fütterungsökologie aufweisen, im Gegensatz zu ihren „lebenden Fossilien"-Nachkommen von heute. Im Gegensatz dazu zeigen Strahlenflosser und Tetrapodomorphen, morphologisch diverse Gruppen in der Gegenwart, wenig Anzeichen für ihren zukünftigen Erfolg, da sie langsame Raten der Kieferentwicklung und geringe funktionelle Vielfalt aufweisen. Diese tiefgreifende Inversion von Mustern bei modernen Taxa unterstreicht die Bedeutung paläontologischer Daten für das Verständnis der Treiber der evolutionären Diversifizierung und die Grenzen von Ansätzen, die nur lebende Arten verwenden. Insgesamt bieten unsere Erkenntnisse Einblicke in die evolutionären Dynamiken, die mit der Evolution von Kiefern verbunden sind, und liefern Kontext für die Rolle von Kiefern im Wirbeltiererfolg.},
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40897172/",
    doi = "10.1016/j.cub.2025.08.008",
    pmid = "40897172"
}

Die genomische Evolution kann die Artbildung vorantreiben und einschränken. Schnelle molekulare Evolution und genomische Umordnung sind oft mit einer erhöhten Artbildung verbunden, aber es bleibt unklar, ob die evolutionäre Entwicklung der Genomstruktur in langlebigen, artenarmen Linien ein langsames Tempo aufweist. Hier präsentieren wir zwei Chromosom-Ebene-Genome von Alligatorfischen (gars), einer Linie aus sieben lebenden Arten von Süßwasserfischen, die anatomisch fast identisch mit ausgestorbenen Arten aus vor Tens von Millionen Jahren sind. Unter Verwendung der neuen Genome zeigen wir, dass Gars die langsamsten Raten der genomischen strukturellen und sequenziellen Evolution aller Wirbeltiere aufweisen. Bei Arten der beiden lebenden Gargattus Atractosteus und Lepisosteus bleiben 83,35 % der Genome identisch, obwohl sie vor über 100 Millionen Jahren divergierten. Die Variation der Genomgröße unter Gars ist fast ausschließlich auf einzelne Basenpaar-Insertionen und Deletionen zurückzuführen. Dennoch detektieren wir auch aufgestaute GC-Wiederholungsanzahlen auf Chromosomen 14 und 23 von Atractosteus spatula, die in Lepisosteus fehlen, und zeigen, dass Gars-Mikrochromosomen und Makrochromosomen unterschiedliche Raten der strukturellen Evolution aufweisen. Unsere Analysen deuten darauf hin, dass die genomische Stabilität von Gars, die möglicherweise die Fähigkeit tief divergenter Gars-Arten zur Hybridisierung erklärt und zu ihrer höheren strukturellen Ähnlichkeit zu Tetrapoden-Genomen im Vergleich zu den weit enger verwandten Knochenfischen beigetragen hat, auf sehr niedrigen Raten der Entstehung von Transposon-Elementen und hoher Inaktivität im Vergleich zu anderen Wirbeltieren zurückzuführen sein könnte. Neben der Bereitstellung eines Referenzpunkts für vergleichende Wirbeltiergenomstudien beleuchten die neuen Gars-Genome einen strukturellen Bestandteil der langsamen genomischen Evolution in lebenden Fossilien und molekulare Mechanismen, die eine außergewöhnliche Genomstabilität zugrunde liegen könnten.

@article{doi101101gr280800125,
    author = "Wang, Cheng und Brownstein, Chase D und Chen, Wenjun und Ding, Zufa und Yu, Dan und Deng, Yu und Feng, Chenguang und Near, Thomas J und He, Shunping und Yang, Liandong",
    title = "Stable genome structures in living fossil fishes.",
    year = "2026",
    journal = "Genome research",
    abstract = "Die genomische Evolution kann die Artbildung vorantreiben und einschränken. Schnelle molekulare Evolution und genomische Umordnung sind oft mit einer erhöhten Artbildung verbunden, aber es bleibt unklar, ob die evolutionäre Entwicklung der Genomstruktur in langlebigen, artenarmen Linien ein langsames Tempo aufweist. Hier präsentieren wir zwei Chromosom-Ebene-Genome von Alligatorfischen (gars), einer Linie aus sieben lebenden Arten von Süßwasserfischen, die anatomisch fast identisch mit ausgestorbenen Arten aus vor Tens von Millionen Jahren sind. Unter Verwendung der neuen Genome zeigen wir, dass Gars die langsamsten Raten der genomischen strukturellen und sequenziellen Evolution aller Wirbeltiere aufweisen. Bei Arten der beiden lebenden Gargattus Atractosteus und Lepisosteus bleiben 83,35 % der Genome identisch, obwohl sie vor über 100 Millionen Jahren divergierten. Die Variation der Genomgröße unter Gars ist fast ausschließlich auf einzelne Basenpaar-Insertionen und Deletionen zurückzuführen. Dennoch detektieren wir auch aufgestaute GC-Wiederholungsanzahlen auf Chromosomen 14 und 23 von Atractosteus spatula, die in Lepisosteus fehlen, und zeigen, dass Gars-Mikrochromosomen und Makrochromosomen unterschiedliche Raten der strukturellen Evolution aufweisen. Unsere Analysen deuten darauf hin, dass die genomische Stabilität von Gars, die möglicherweise die Fähigkeit tief divergenter Gars-Arten zur Hybridisierung erklärt und zu ihrer höheren strukturellen Ähnlichkeit zu Tetrapoden-Genomen im Vergleich zu den weit enger verwandten Knochenfischen beigetragen hat, auf sehr niedrigen Raten der Entstehung von Transposon-Elementen und hoher Inaktivität im Vergleich zu anderen Wirbeltieren zurückzuführen sein könnte. Neben der Bereitstellung eines Referenzpunkts für vergleichende Wirbeltiergenomstudien beleuchten die neuen Gars-Genome einen strukturellen Bestandteil der langsamen genomischen Evolution in lebenden Fossilien und molekulare Mechanismen, die eine außergewöhnliche Genomstabilität zugrunde liegen könnten.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12863190/",
    doi = "10.1101/gr.280800.125",
    pmcid = "PMC12863190",
    pmid = "41530049"
}

HINTERGRUND: Pigmentmuster sind zentral für die Tierbiologie – sie formen Tarnung, Signalgebung und die Partnerwahl – und das Aufdecken der Mechanismen, die ihre Diversifizierung antreiben, ist entscheidend für das Verständnis der evolutionären Prinzipien, die diese grundlegende Dimension der Biodiversität erzeugen. Rifffische zeigen eine unglaubliche Vielfalt an Mustern, von einfachen Punkten bis hin zu komplexen Designs. Bislang bleiben die zugrundeliegenden evolutionären Prozesse, die ihre Diversifizierung steuern, unklar. ERGEBNISSE: Hier untersuchen wir die Beziehung zwischen der Vielfalt der Pigmentmuster, der Artenvielfalt und der Geographie über sechs ikonische Rifffischarten-Familien hinweg. Wir liefern Belege für einen positiven Zusammenhang zwischen Musterdiversität und Artenvielfalt, mit einer hohen Divergenz der Pigmentmuster in jeder biogeographischen Region. Anschließend zeigen wir durch eine Reihe phylogenetisch informierter vergleichender Analysen, dass die Evolution von Pigmentmustern durch eine Kombination aus schneller und eingeschränkter phänotypischer Diversifizierung gekennzeichnet ist. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Insgesamt beleuchten unsere Ergebnisse Faktoren, die die Vielfalt der Pigmentmuster bei lebenden Rifffischen erklären, und zeigen, dass Artbildungsereignisse zu einem ständigen hohen Niveau der Diskrepanz bei Pigmentmustern innerhalb von Unterstämmen und über global variabel zusammengesetzte Rifffisch-Assemblagen hinweg geführt haben.

@article{doi101186s12915026025444,
    author = "Frédérich, Bruno und Mittelheiser, Laurent und Gillet, Amandine und Hodge, Jennifer R und Laudet, Vincent und Dornburg, Alex",
    title = "Rapid and repeated evolution of pigmentation patterns in reef fishes.",
    year = "2026",
    journal = "BMC biology",
    abstract = "HINTERGRUND: Pigmentmuster sind zentral für die Tierbiologie – sie formen Tarnung, Signalgebung und die Partnerwahl – und das Aufdecken der Mechanismen, die ihre Diversifizierung antreiben, ist entscheidend für das Verständnis der evolutionären Prinzipien, die diese grundlegende Dimension der Biodiversität erzeugen. Rifffische zeigen eine unglaubliche Vielfalt an Mustern, von einfachen Punkten bis hin zu komplexen Designs. Bislang bleiben die zugrundeliegenden evolutionären Prozesse, die ihre Diversifizierung steuern, unklar. ERGEBNISSE: Hier untersuchen wir die Beziehung zwischen der Vielfalt der Pigmentmuster, der Artenvielfalt und der Geographie über sechs ikonische Rifffischarten-Familien hinweg. Wir liefern Belege für einen positiven Zusammenhang zwischen Musterdiversität und Artenvielfalt, mit einer hohen Divergenz der Pigmentmuster in jeder biogeographischen Region. Anschließend zeigen wir durch eine Reihe phylogenetisch informierter vergleichender Analysen, dass die Evolution von Pigmentmustern durch eine Kombination aus schneller und eingeschränkter phänotypischer Diversifizierung gekennzeichnet ist. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Insgesamt beleuchten unsere Ergebnisse Faktoren, die die Vielfalt der Pigmentmuster bei lebenden Rifffischen erklären, und zeigen, dass Artbildungsereignisse zu einem ständigen hohen Niveau der Diskrepanz bei Pigmentmustern innerhalb von Unterstämmen und über global variabel zusammengesetzte Rifffisch-Assemblagen hinweg geführt haben.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12927226/",
    doi = "10.1186/s12915-026-02544-4",
    pmcid = "PMC12927226",
    pmid = "41724958"
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