Pogonomorpha

@incollection{dodge1973postscript,
    author = "DODGE, JOHN D.",
    title = "Postscript: Feinstruktur und Phylogenie",
    year = "1973",
    booktitle = "The Fine Structure of Algal Cells",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-12-219150-3.50018-2",
    doi = "10.1016/b978-0-12-219150-3.50018-2",
    pages = "223-226"
}

@inproceedings{southward1975fine1,
    author = "Southward, E. C",
    title = "Feinstruktur und Phylogenie der Pogonomorpha",
    year = "1975",
    booktitle = "Symposium der Zoologischen Gesellschaft, London, v. 36, S. 235-251",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Southward, E. C., 1975, Fine structure and phylogeny of the Pogonomorpha: Symposium of the Zoological Society, London, v. 36, p. 235-251.}"
}

@incollection{dodge1979the,
    author = "DODGE, JOHN D.",
    title = "The Phytoflagellates: Feine Struktur und Phylogenie",
    year = "1979",
    booktitle = "Biochemie und Physiologie der Protozoen",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-12-444601-4.50009-6",
    doi = "10.1016/b978-0-12-444601-4.50009-6",
    pages = "7-57"
}

@article{moro2002pyramimonas,
    author = "MORO, ISABELLA und LA ROCCA, NICOLETTA und DALLA VALLE, LUISA und MOSCHIN, EMANUELA und NEGRISOLO, ENRICO und ANDREOLI, CARLO",
    title = "Pyramimonas australis sp. nov. (Prasinophyceae, Chlorophyta) aus der Antarktis: Feinstruktur und molekulare Phylogenie",
    year = "2002",
    journal = "European Journal of Phycology",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0967026201003493",
    doi = "10.1017/s0967026201003493",
    number = "1",
    pages = "103-114",
    volume = "37"
}

@article{chiesa2011finescale,
    author = "Chiesa, S. und Scalici, M. und Negrini, R. und Gibertini, G. und Nonnis Marzano, F.",
    title = "Feinstruktur der genetischen Struktur, Phylogenie und Systematik einer bedrohten Komplexität von Krebsarten",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ympev.2011.03.031",
    doi = "10.1016/j.ympev.2011.03.031",
    number = "1",
    pages = "1-11",
    volume = "61"
}

ZIELE: Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc), die Bakterien, die für den Zitrusfleck verantwortlich sind, sind weltweit weit verbreitet und verursachen schwere Verluste in der Zitrusindustrie. Das Verständnis des Auftretens und der Ausbreitung von Xcc erfordert zuverlässige Methoden zur Identifizierung und Verfolgung von Stämmen. Diese Studie zielte darauf ab, ein robustes Multilocus-Sequenzierungstypisierungsschema (MLST) für Xcc zu entwickeln. METHODEN UND ERGEBNISSE: 123 Xcc-Stämme aus verschiedenen geografischen Herkunftsgebieten wurden molekular mit sieben konservierten Loci getypisiert. Es wurden 27 Sequenztypen (STs) identifiziert, die eine hohe genetische Vielfalt innerhalb der Population aufzeigen. Die eBURST-Clustering-Gruppierung ordnete diese STs weiter in drei Hauptklonale Komplexe (CC1, CC2 und CC3) ein. Um die Auflösung des MLST zu bewerten, wurde zudem eine Whole-Genome-Single-Nucleotide-Polymorphismus-Analyse (wgSNP) durchgeführt. Die phylogenetische Rekonstruktion von 49 repräsentativen Stämmen teilte diese in sieben Klade auf, die weitgehend mit den MLST-Ergebnissen übereinstimmen, jedoch eine überlegene Genauigkeit und Auflösung bieten. Eine geografische Strukturierung war in den evolutionären Mustern evident; jedoch teilten Stämme aus verschiedenen Wirtssorten identische Typen, und unter Stämmen, die aus derselben Sorte gesammelt wurden, wurden mehrere Typen beobachtet, was auf schwache Assoziationen mit der Wirtssorte hindeutet. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Das in dieser Studie entwickelte MLST-Schema bietet einen zuverlässigen Rahmen zur Identifizierung und Verfolgung von Xcc-Stämmen, während die wgSNP-Analyse eine erhöhte Auflösung für feinkörnige epidemiologische Studien bietet. Zusammen heben diese Ansätze die geografische Strukturierung von Xcc-Populationen hervor und tragen somit zum Verständnis der evolutionären Dynamik und Ausbreitung des Pathogens bei.

@article{doi101093jambiolxag073,
    author = "Xu, Xiaoli und Shi, Jia und Guo, Feng und Gao, Ruifang und Jiang, Na und Li, Jianqiang und Zhang, Guiming und Luo, Laixin",
    title = "Multilocus-Sequenzierung und Whole-Genome-Single-Nucleotide-Polymorphismen offenbaren die Phylogenie und Populationsstruktur von Xanthomonas citri subsp. citri.",
    year = "2026",
    journal = "Journal of applied microbiology",
    abstract = "ZIELE: Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc), die Bakterien, die für den Zitrusfleck verantwortlich sind, sind weltweit weit verbreitet und verursachen schwere Verluste in der Zitrusindustrie. Das Verständnis des Auftretens und der Ausbreitung von Xcc erfordert zuverlässige Methoden zur Identifizierung und Verfolgung von Stämmen. Diese Studie zielte darauf ab, ein robustes Multilocus-Sequenzierungstypisierungsschema (MLST) für Xcc zu entwickeln. METHODEN UND ERGEBNISSE: 123 Xcc-Stämme aus verschiedenen geografischen Herkunftsgebieten wurden molekular mit sieben konservierten Loci getypisiert. Es wurden 27 Sequenztypen (STs) identifiziert, die eine hohe genetische Vielfalt innerhalb der Population aufzeigen. Die eBURST-Clustering-Gruppierung ordnete diese STs weiter in drei Hauptklonale Komplexe (CC1, CC2 und CC3) ein. Um die Auflösung des MLST zu bewerten, wurde zudem eine Whole-Genome-Single-Nucleotide-Polymorphismus-Analyse (wgSNP) durchgeführt. Die phylogenetische Rekonstruktion von 49 repräsentativen Stämmen teilte diese in sieben Klade auf, die weitgehend mit den MLST-Ergebnissen übereinstimmen, jedoch eine überlegene Genauigkeit und Auflösung bieten. Eine geografische Strukturierung war in den evolutionären Mustern evident; jedoch teilten Stämme aus verschiedenen Wirtssorten identische Typen, und unter Stämmen, die aus derselben Sorte gesammelt wurden, wurden mehrere Typen beobachtet, was auf schwache Assoziationen mit der Wirtssorte hindeutet. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Das in dieser Studie entwickelte MLST-Schema bietet einen zuverlässigen Rahmen zur Identifizierung und Verfolgung von Xcc-Stämmen, während die wgSNP-Analyse eine erhöhte Auflösung für feinkörnige epidemiologische Studien bietet. Zusammen heben diese Ansätze die geografische Strukturierung von Xcc-Populationen hervor und tragen somit zum Verständnis der evolutionären Dynamik und Ausbreitung des Pathogens bei.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41823301/",
    doi = "10.1093/jambio/lxag073",
    pmid = "41823301"
}