Populationsgenetik

@book{elton1942voles9,
    author = "Elton, C. S",
    title = "Voles, mice and lemmings",
    year = "1942",
    publisher = "Probleme in der Populationsdynamik: London, England, Oxford University Press, 496 S",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elton, C. S., 1942, Voles, mice and lemmings: Probleme in der Populationsdynamik: London, England, Oxford University Press, 496 S.}"
}

@article{elton1946competition10,
    author = "Elton, C. S",
    title = "Competition and the structure of ecological communities",
    year = "1946",
    journal = "Journal of Animal Ecology, v. 15, p. 54-68",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elton, C. S., 1946, Competition and the structure of ecological communities: Journal of Animal Ecology, v. 15, p. 54-68.}"
}

@article{elton1949population11,
    author = "Elton, C. S",
    title = "Population interspersion",
    year = "1949",
    journal = "an essay on animal community patterns: Journal of Ecology, v. 37, p. 1-23",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elton, C. S., 1949, Population interspersion: an essay on animal community patterns: Journal of Ecology, v. 37, p. 1-23.}"
}

@misc{deevey1960population7,
    author = "Deevey, E. S",
    title = "Population",
    year = "1960",
    howpublished = "Scientific American, v. 203, no. 5, p. 194-204",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Deevey, E. S., 1960, Population: Scientific American, v. 203, no. 5, p. 194-204.}"
}

@book{cole1965dynamics6,
    author = "Cole, L. C",
    title = "Dynamics of Animal Population Growth, in Sheps, M. C., and Ridley, J. C., eds., Public Health and Population Change",
    year = "1965",
    publisher = "Pittsburgh, Penn., University of Pittsburgh Press, p. 221-241",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cole, L. C., 1965, Dynamics of Animal Population Growth, in Sheps, M. C., and Ridley, J. C., eds., Public Health and Population Change: Pittsburgh, Penn., University of Pittsburgh Press, p. 221-241.}"
}

@misc{asimov1967is2,
    author = "Asimov, I",
    title = "Ist jemand da?",
    year = "1967",
    howpublished = "New York, Avon Books",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Asimov, I., 1967, Ist jemand da?: New York, Avon Books.}"
}

@misc{birch1967evolutionary4,
    author = "Birch, L. C. und Ehrlich, P. R",
    title = "Evolutionary History and Population Biology",
    year = "1967",
    howpublished = "Nature, v. 214, p. 349-352",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Birch, L. C., und Ehrlich, P. R., 1967, Evolutionary History and Population Biology: Nature, v. 214, p. 349-352.}"
}

@misc{ehrlich1967the8,
    author = "Ehrlich, P. R. und Birch, L. C",
    title = {The balance of nature" und "population control},
    year = "1967",
    howpublished = "American Naturalist, v. 101, p. 97-107",
    note = {talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ehrlich, P. R., und Birch, L. C., 1967, "The balance of nature" und "population control": American Naturalist, v. 101, p. 97-107.}}
}

@misc{erhlich1969differentiations12,
    author = "Erhlich, P. R. und Raven, P. H",
    title = "Differentiations in populations",
    year = "1969",
    howpublished = "Science, v. 165, p. 1228-1231",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Erhlich, P. R., und Raven, P. H., 1969, Differentiations in populations: Science, v. 165, p. 1228-1231.}"
}

@inproceedings{kauffman1970population14,
    author = "Kauffman, E. G",
    title = "Population systematics, radiometrics and zonation - a neue Biostratigraphie",
    year = "1970",
    booktitle = "North American Paleontological Convention, Proceedings, S. 612-666; Teil F",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kauffman, E. G., 1970, Population systematics, radiometrics and zonation - a neue Biostratigraphie: North American Paleontological Convention, Proceedings, S. 612-666; Teil F.}"
}

@book{mayr1970populations15,
    author = "Mayr, E",
    title = "Populations, Arten und Evolution",
    year = "1970",
    publisher = "Cambridge, Mass, Belknap Press of Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Mayr, E., 1970, Populations, Species and Evolution: Cambridge, Mass, Belknap Press of Harvard University Press.}"
}

@misc{anderson1971discriminant1,
    author = "Anderson, E. J",
    title = "Diskriminanz-Funktions-Analyse der Variation zwischen Populationen des Brachiopoden Gypidula coeymanensis",
    year = "1971",
    howpublished = "Geological Society of America, Abstracts with Programs, v. 3, no. 1, p. 14-15",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Anderson, E. J., 1971, Diskriminanz-Funktions-Analyse der Variation zwischen Populationen des Brachiopoden Gypidula coeymanensis: Geological Society of America, Abstracts with Programs, v. 3, no. 1, p. 14-15.}"
}

@misc{wilson1971a16,
    author = "Wilson, E. O. und Bossert, W. H",
    title = "A Primer of Population Biology",
    year = "1971",
    howpublished = "Sunderland, Mass., Sinauer",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Wilson, E. O., und Bossert, W. H., 1971, A Primer of Population Biology: Sunderland, Mass., Sinauer.}"
}

@misc{ayala1977the3,
    author = "Ayala, F. J",
    title = "The Genetic Structure of Populations, in Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., and Valentine, J. W., eds., Evolution",
    year = "1977",
    howpublished = "San Francisco, California, W.H. Freeman \& Co., p. 20-56",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ayala, F. J., 1977, The Genetic Structure of Populations, in Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., and Valentine, J. W., eds., Evolution: San Francisco, California, W.H. Freeman \& Co., p. 20-56.}"
}

@article{hartl1979fourvolume,
    author = "Hartl, Daniel L.",
    title = "Four-Volume Treatise on Population Biology Evolution and the Genetics of Populations Sewall Wright",
    year = "1979",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.2307/1307799",
    doi = "10.2307/1307799",
    number = "3",
    pages = "179-180",
    volume = "29"
}

@article{jain1981plant,
    author = "Jain, S. K.",
    title = "Plant Population Biology Demography and Evolution in Plant Populations Otto T. Solbrig",
    year = "1981",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.2307/1308651",
    doi = "10.2307/1308651",
    number = "9",
    pages = "685-685",
    volume = "31"
}

@misc{hollingsworth1983population13,
    author = "Hollingsworth, T. H",
    title = "Population, in Collier's Encyclopedia",
    year = "1983",
    howpublished = "New York, Macmillan, v. 19, p. 248-253",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hollingsworth, T. H., 1983, Population, in Collier's Encyclopedia: New York, Macmillan, v. 19, p. 248-253.}"
}

@misc{bogue1985population5,
    author = "Bogue, D. J",
    title = "Population, in Encyclopedia Americana",
    year = "1985",
    howpublished = "Danbury, Connecticut, Grolier, v. 22, p. 402-408",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Bogue, D. J., 1985, Population, in Encyclopedia Americana: Danbury, Connecticut, Grolier, v. 22, p. 402-408.}"
}

@article{pamilo1985population,
    author = "Pamilo, Pekka",
    title = "Population Biology. The Evolution and Ecology of Populations. Philip W. Hedrick",
    year = "1985",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/414659",
    doi = "10.1086/414659",
    number = "4",
    pages = "530-531",
    volume = "60"
}

Die Sprache ist das Ergebnis zweier gleichzeitiger evolutionärer Prozesse: biologischer und kultureller Vererbung. Eine einflussreiche evolutionäre Hypothese, das sogenannte „moving target problem", impliziert inhärente Grenzen für die Interaktionen zwischen unseren beiden Vererbungsströmen, die auf einem Geschwindigkeitsunterschied beruhen: Die Geschwindigkeit der kulturellen Evolution wird als ausschlaggebend für die kognitive Anpassung an kulturell sich entwickelnde Aspekte der Sprache angesehen. Wir untersuchen diese Hypothese formal, indem wir sie als Problem der Anpassung in zeitlich veränderlichen Umgebungen formulieren. Wir präsentieren ein mathematisches Modell der Biology-Culture Co-evolution in endlichen Populationen: eine Verallgemeinerung des Moran-Prozesses, die die Co-evolution als gekoppelte, nicht-unabhängige Markov-Prozesse behandelt und eine allgemeine Formulierung der moving target hypothesis in präzisen probabilistischen Begriffen liefert. Schnell verändernde Kultur verringert die Wahrscheinlichkeit biologischer Anpassung. Wir zeigen jedoch, dass dieser Effekt mit der Populationsgröße und mit stärkeren Verbindungen zwischen Biologie und Kultur abnimmt: In realistisch dimensionierten endlichen Populationen können stochastische Effekte kognitive Spezialisierungen trotz variabler Kultur zur Fixierung bringen, insbesondere wenn die Effekte dieser Spezialisierungen durch kulturelle Evolution verstärkt werden. Diese Ergebnisse stützen die Ansicht, dass die Sprache aus Interaktionen zwischen unseren beiden Hauptvererbungsströmen entsteht, anstatt aus einem primären evolutionären Prozess, der einen anderen dominiert.

@article{deboer2018biologyculture,
    author = "de Boer, Bart und Thompson, Bill",
    title = "Biology-Culture Co-evolution in Finite Populations",
    year = "2018",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "Die Sprache ist das Ergebnis zweier gleichzeitiger evolutionärer Prozesse: biologischer und kultureller Vererbung. Eine einflussreiche evolutionäre Hypothese, das sogenannte „moving target problem", impliziert inhärente Grenzen für die Interaktionen zwischen unseren beiden Vererbungsströmen, die auf einem Geschwindigkeitsunterschied beruhen: Die Geschwindigkeit der kulturellen Evolution wird als ausschlaggebend für die kognitive Anpassung an kulturell sich entwickelnde Aspekte der Sprache angesehen. Wir untersuchen diese Hypothese formal, indem wir sie als Problem der Anpassung in zeitlich veränderlichen Umgebungen formulieren. Wir präsentieren ein mathematisches Modell der Biology-Culture Co-evolution in endlichen Populationen: eine Verallgemeinerung des Moran-Prozesses, die die Co-evolution als gekoppelte, nicht-unabhängige Markov-Prozesse behandelt und eine allgemeine Formulierung der moving target hypothesis in präzisen probabilistischen Begriffen liefert. Schnell verändernde Kultur verringert die Wahrscheinlichkeit biologischer Anpassung. Wir zeigen jedoch, dass dieser Effekt mit der Populationsgröße und mit stärkeren Verbindungen zwischen Biologie und Kultur abnimmt: In realistisch dimensionierten endlichen Populationen können stochastische Effekte kognitive Spezialisierungen trotz variabler Kultur zur Fixierung bringen, insbesondere wenn die Effekte dieser Spezialisierungen durch kulturelle Evolution verstärkt werden. Diese Ergebnisse stützen die Ansicht, dass die Sprache aus Interaktionen zwischen unseren beiden Hauptvererbungsströmen entsteht, anstatt aus einem primären evolutionären Prozess, der einen anderen dominiert.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-017-18928-0",
    doi = "10.1038/s41598-017-18928-0",
    number = "1",
    volume = "8"
}

Schwarzer Knoblauch ist ein charakteristisches, tief verarbeitetes Knoblauchprodukt, das aus frischem Knoblauch bei hoher Temperatur und kontrollierter Luftfeuchtigkeit hergestellt wird. Um die mikrobielle Gemeinschaftsstruktur, die Vielfalt und das metabolische Potenzial während der 12-tägigen Verarbeitung von schwarzem Knoblauch zu untersuchen, wurde die Illumina MiSeq-Sequenzierungstechnologie eingesetzt, um die 16S rRNA V3-V4-Hypervariablenregion von Bakterien zu sequenzieren. Insgesamt wurden 677.917 hochwertige Reads mit einer durchschnittlichen Read-Länge von 416 bp erzeugt. Die Clusternanalyse der operationellen taxonomischen Einheiten (OTU) zeigte, dass die Anzahl der Arten-OTUs zwischen 148 und 1974 lag, wobei die Alpha-Diversität bemerkenswert zunahm, was auf eine hohe mikrobielle Gemeinschaftsabundanz und Vielfalt hinweist. Die taxonomische Analyse zeigte, dass die bakterielle Gemeinschaft in 45 Phyla und 1125 verschiedene Gattungen eingeteilt wurde, und das Mikrobiom der schwarzen Knoblauch-Proben basierend auf der phylogenetischen Analyse wurde von distincten Populationen von vier Gattungen dominiert: Thermus, Corynebacterium, Streptococcus und Brevundimonas. Die metabolischen Wege wurden für 16S rRNA-Markergensequenzen basierend auf der Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) vorhergesagt, was darauf hindeutet, dass Aminosäurestoffwechsel, Kohlenhydratstoffwechsel und Membrantransport für den schwarzen Knoblauch-Fermentationsprozess wichtig sind. Insgesamt war die Studie die erste, die die mikrobielle Gemeinschaftsstruktur offenlegte und die Zusammensetzung der funktionellen Gene in schwarzen Knoblauch-Proben spekuliert. Die Ergebnisse trugen zur weiteren Analyse der Interaktion zwischen der mikrobiellen Gemeinschaft und schwarzen Knoblauch-Komponenten in verschiedenen Stadien bei, was von großer Bedeutung für die Erforschung des Entstehungsmechanismus und der Qualitätsverbesserung von schwarzem Knoblauch in der Zukunft ist.

@article{doi101016jfoodres201712081,
    author = "Qiu, Zhichang und Li, Ningyang und Lu, Xiaoming und Zheng, Zhenjia und Zhang, Mingjie und Qiao, Xuguang",
    title = "Charakterisierung der mikrobiellen Gemeinschaftsstruktur und des metabolischen Potenzials unter Verwendung der Illumina MiSeq-Plattform während der Verarbeitung von schwarzem Knoblauch.",
    year = "2018",
    journal = "Food research international (Ottawa, Ont.)",
    abstract = "Schwarzer Knoblauch ist ein charakteristisches, tief verarbeitetes Knoblauchprodukt, das aus frischem Knoblauch bei hoher Temperatur und kontrollierter Luftfeuchtigkeit hergestellt wird. Um die mikrobielle Gemeinschaftsstruktur, die Vielfalt und das metabolische Potenzial während der 12-tägigen Verarbeitung von schwarzem Knoblauch zu untersuchen, wurde die Illumina MiSeq-Sequenzierungstechnologie eingesetzt, um die 16S rRNA V3-V4-Hypervariablenregion von Bakterien zu sequenzieren. Insgesamt wurden 677.917 hochwertige Reads mit einer durchschnittlichen Read-Länge von 416 bp erzeugt. Die Clusternanalyse der operationellen taxonomischen Einheiten (OTU) zeigte, dass die Anzahl der Arten-OTUs zwischen 148 und 1974 lag, wobei die Alpha-Diversität bemerkenswert zunahm, was auf eine hohe mikrobielle Gemeinschaftsabundanz und Vielfalt hinweist. Die taxonomische Analyse zeigte, dass die bakterielle Gemeinschaft in 45 Phyla und 1125 verschiedene Gattungen eingeteilt wurde, und das Mikrobiom der schwarzen Knoblauch-Proben basierend auf der phylogenetischen Analyse wurde von distincten Populationen von vier Gattungen dominiert: Thermus, Corynebacterium, Streptococcus und Brevundimonas. Die metabolischen Wege wurden für 16S rRNA-Markergensequenzen basierend auf der Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) vorhergesagt, was darauf hindeutet, dass Aminosäurestoffwechsel, Kohlenhydratstoffwechsel und Membrantransport für den schwarzen Knoblauch-Fermentationsprozess wichtig sind. Insgesamt war die Studie die erste, die die mikrobielle Gemeinschaftsstruktur offenlegte und die Zusammensetzung der funktionellen Gene in schwarzen Knoblauch-Proben spekuliert. Die Ergebnisse trugen zur weiteren Analyse der Interaktion zwischen der mikrobiellen Gemeinschaft und schwarzen Knoblauch-Komponenten in verschiedenen Stadien bei, was von großer Bedeutung für die Erforschung des Entstehungsmechanismus und der Qualitätsverbesserung von schwarzem Knoblauch in der Zukunft ist.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29579944/",
    doi = "10.1016/j.foodres.2017.12.081",
    pmid = "29579944"
}

Fluoridexposition, selbst bei niedrigen Konzentrationen, beeinträchtigt das Pflanzenwachstum und die Produktivität erheblich, indem sie metabolische Enzyme hemmt und die Photosynthese stört. Um dieser Herausforderung zu begegnen, stellt die mikrobielle Defluoridierung eine wichtige Strategie dar, um die Bodenqualität zu verbessern, das Pflanzenwachstum zu fördern und die landwirtschaftliche Nachhaltigkeit zu gewährleisten. Diese Studie untersuchte Oberbodenproben (0–0,2 m Tiefe) aus Reisfeldern in drei Blöcken des Distrikts Purulia, Westbengalen – Arsha, Jhalda-I und Joypur. Der Fluoridgehalt in den Proben schwankte zwischen 58,76 ± 0,76 mg/kg und 282,9 ± 4,9 mg/kg (gesamt) sowie zwischen 1,57 ± 0,02 mg/kg und 2,97 ± 0,03 mg/kg (verfügbar). Die metagenomische Analyse der gesammelten Bodenproben zeigte diverse mikrobielle Gemeinschaften, bestehend aus Archaeen, Bakterien, Pilzen und Viren, wobei Actinobacteria (Stamm), Hyphomicrobiales (Ordnung) und Nocardioidaceae (Familie) die dominierenden Prokaryoten waren. Der Arsha-Boden mit vergleichsweise geringer Fluoridbelastung wies die höchste mikrobielle Vielfalt auf (11.891 Taxa), gefolgt von Joypur (11.528 Taxa) und Jhalda-I (11.358 Taxa), wobei Arsha nahezu doppelt so viele einzigartige mikrobielle Taxa aufwies wie die anderen Standorte. Die funktionelle Analyse von Clustern orthologer Proteingruppen identifizierte 60.898 Gene in Arsha, 63.403 Gene in Jhalda-I und 73.334 Gene in Joypur, während die Analyse der Kyoto-Enzyklopädie von Genen und Genomen 9.385, 9.104 bzw. 10.633 Gene ergab. Schlüsselgene, die mit dem Fluoridstoffwechsel in Verbindung stehen – inorganisches Pyrophosphatase, divalenter Metallkationentransporter mntH und mutmaßlicher Fluoridionentransporter crcB – waren an allen Standorten reichlich vorhanden und unterstreichen den Einfluss von Fluorid auf die Struktur der mikrobiellen Gemeinschaft. Diese Studie liefert den ersten umfassenden Bericht über mikrobielle Boden Gemeinschaften in fluorphreichen Gebieten und hebt das Potenzial einheimischer fluortoleranter Mikroben hervor, die Fluoridtoxizität in landwirtschaftlichen Böden zu mildern und nachhaltige, auf Mikroben basierende Lösungen zur Bekämpfung der Fluoridkontamination anzubieten.

@article{doi101007s11274025044085,
    author = "Pramanik, Krishnendu und Sen, Arup und Dutta, Subrata und Mandal, Gouranga Sundar und Paramanik, Bappa und Das, Arpita und Chatterjee, Nitin und Ghorai, Ankit Kumar und Ali, Md Nasim",
    title = "Microbial populations under fluoride stress: a metagenomic exploration from Indian soil.",
    year = "2025",
    journal = "World journal of microbiology \& biotechnology",
    abstract = "Fluoride exposure, even at a low concentration, significantly impairs crop growth and productivity by inhibiting metabolic enzymes and disrupting photosynthesis. Addressing this challenge, microbial de-fluoridation emerges as a vital strategy to improve soil health, enhance crop growth, and ensure agricultural sustainability. This study analyzed topsoil samples (0-0.2 m depth) from rice fields in three blocks of Purulia district, West Bengal-Arsha, Jhalda-I, and Joypur. Fluoride content in the samples ranged from 58.76 ± 0.76 mg/kg to 282.9 ± 4.9 mg/kg (total) and 1.57 ± 0.02 mg/kg to 2.97 ± 0.03 mg/kg (available). The metagenomic analysis of the collected soil samples revealed diverse microbial communities comprising archaea, bacteria, fungi, and viruses, with Actinobacteria (phylum), Hyphomicrobiales (order), and Nocardioidaceae (family) being the dominant prokaryotes. Arsha soil with comparatively low fluoride contamination exhibited the highest microbial diversity (11,891 taxa), followed by Joypur (11,528 taxa) and Jhalda-I (11,358 taxa), with Arsha showing nearly double the unique microbial taxa compared to the other locations. Clusters of orthologous groups of proteins functional analysis identified 60,898 genes in Arsha, 63,403 genes in Jhalda-I, and 73,334 genes in Joypur, while Kyoto encyclopedia of genes and genomes analysis revealed 9,385, 9,104, and 10,633 genes, respectively. Key genes associated with fluoride metabolism-inorganic pyrophosphatase, divalent metal cation transporter mntH, and putative fluoride ion transporter crcB-were abundant across all sites, highlighting the influence of fluoride on microbial community structure. This study provides the first comprehensive report on soil microbial communities in fluoride-rich areas, highlighting the potential of native fluoride-tolerant microbes to mitigate fluoride toxicity in agricultural soils and offer sustainable, microbe-based solutions to fluoride contamination.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/5039924/",
    doi = "10.1007/s11274-025-04408-5",
    pmcid = "5039924",
    pmid = "40560512"
}