Em 1996, a Free Press publicou um livro do bioquímico da Universidade Lehigh e defensor do design inteligente Michael Behe chamado A Caixa Preta de Darwin: O Desafio Bioquímico à Evolução. A tese central do livro é que muitos sistemas biológicos são "irredutivelmente complexos" no nível molecular. Behe fornece a seguinte definição de complexidade irredutível:

Por complexidade irredutível entendo um sistema único composto por várias partes bem ajustadas e interagentes que contribuem para a função básica, onde a remoção de qualquer uma das partes faz com que o sistema cesse efetivamente de funcionar. Um sistema complexamente irredutível não pode ser produzido diretamente (isto é, melhorando continuamente a função inicial, que continua a funcionar pelo mesmo mecanismo) por meio de modificações sucessivas e ligeiras de um sistema precursor, porque qualquer precursor de um sistema complexamente irredutível que estiver faltando uma parte é, por definição, não funcional. Um sistema biológico complexamente irredutível, se tal coisa existe, seria um desafio poderoso para a evolução darwiniana. (p. 39)

Embora o argumento da complexidade irredutível seja essencialmente uma releitura do famoso e falho relógio argumentado por William Paley no início do século XIX, o livro de Behe atraiu muita atenção tanto de criacionistas quanto de não criacionistas. Os artigos coletados aqui abordam as alegações feitas por Behe em seu livro.

O Duplo Passo de Müller: Adicionar uma parte, torná-la necessária (ou, Por que a "Complexidade Irredutível" de Behe é Tonta)

Uma explicação simples e concisa sobre por que o argumento anti-evolutivo baseado na "complexidade irredutível" é falho — a evolução gradual por seleção natural evolui facilmente estruturas "irredutivelmente complexas".

A Caixa Preta de Darwin: Complexidade Irredutível ou Irreprodutibilidade Irredutível?

Keith Robison faz uma revisão do livro de Michael Behe A Caixa Preta de Darwin, que afirma que muitos sistemas biológicos são "irredutivelmente complexos" — ou seja, para evoluir, múltiplas partes teriam que surgir simultaneamente. Mas isso é verdade?

Publicar ou Morrer: Algumas Obras Publicadas sobre Evolução Bioquímica

Esta lista de artigos foi compilada em resposta à alegação de Michael Behe de que a literatura científica é praticamente silenciosa sobre o tema da evolução molecular.

A Crítica de Behe à Evolução em Livros Didáticos de Bioquímica

Além de alegar que a literatura científica não dedica tempo às questões da evolução molecular, Michael Behe também afirmou que o mesmo vale para livros didáticos universitários de bioquímica. Aqui, o autor de alguns dos livros didáticos que Behe revisou demonstra que essa alegação é falsa.

O Sistema Complementar é Irredutivelmente Complexo?

Uma das assemblagens moleculares que Michael Behe afirma ser "irredutivelmente complexa" é o sistema complementar, um braço do sistema imunológico dos vertebrados assim chamado porque ele "complementa" o efeito dos anticorpos. Este ensaio descreve o funcionamento do sistema complementar e enfraquece o argumento de Behe ao mostrar que versões mais simples, mas ainda funcionais, dele existem na natureza.

Artigos adicionais sobre complexidade irredutível e design inteligente podem ser encontrados no site irmão do Arquivo TalkOrigins, Talkdesign.org: Examinando Críticamente o Movimento do "Design Inteligente":

Complexidade Irredutível Desmistificada

Este FAQ demonstra que a evolução molecular é muito flexível para que a CI seja um obstáculo, mostra que o argumento de Behe é falacioso e, usando a planta carnívora Venus, demonstra que a analogia da armadilha para ratos é enganosa.

Imunidade em Evolução Uma Resposta ao Capítulo 6 de A Caixa Preta de Darwin

Revisa os sistemas imunes de vários animais e conclui que sua complexidade não é o problema intratável que Behe nos faria acreditar.

Evolução no Espaço (Browniano): Um Modelo para a Origem do Flagelo Bacteriano

Michael Behe, William Dembski e outros defensores do design inteligente afirmam que o flagelo bacteriano é muito complexo para ter evoluído. Este artigo propõe um possível modelo passo a passo para a evolução do flagelo. Este artigo é bastante técnico e, portanto, possui um arquivo de contexto que linka para material introdutório, artigos de defensores do design inteligente sobre o flagelo e refutações aos seus argumentos.

Dois documentos neste Arquivo possuem uma subseção que aborda as alegações de Behe sobre características complexas irredutíveis:

Aplicando o Método à Natureza: Complexidade Irredutível

Discute como William Dembski, colega defensor do design inteligente de Behe, usa argumentos de complexidade irredutível em seu livro No Free Lunch. Parte de Não é um Jantar Gratuito, mas uma Caixa de Chocolates.

Subotimização e Complexidade Irredutível

Discute as implicações das características biológicas subótimas no argumento de Behe. Parte de 29+ Evidências para a Macroevolução.

O Projeto Mine de Citações examina algumas das citações utilizadas pelo Dr. Behe.

Orr e Coyne descobrem inesperadamente que há pouca evidência para a visão neo-darwiniana

John McDonald acredita que a pesquisa sobre a base genética da adaptação levou a uma grande paradoxo darwiniano

Behe, A Caixa Preta de Darwin e complexidade irredutível são o tema de dois posts vencedores e um post vice-campeão do Post do Mês do concurso do grupo de notícias talk.origins, que estão arquivados neste site.

Fevereiro de 1997: Behe e a Cascata de Coagulação Sanguínea

Dezembro de 1999: Behe, o Ciclo de Krebs e Modelos de Origem de Estruturas Bioquímicas Complexas

Terceiro lugar em Outubro de 2003: Por que a Caixa Preta de Behe Está Vazia

Setembro de 2006: Complexidade Irredutível como uma Previsão Evolutiva

Este Arquivo também possui uma cópia do depoimento de Behe nas Ouvintes sobre a Evolução no Kansas e seu depoimento no julgamento em Kitzmiller et al. v. Dover Area School District et al. Respostas curtas a muitos argumentos feitos por Behe e outros defensores do design inteligente podem ser encontradas nas seções de biologia molecular e detectando design de um Índice de alegações criacionistas.