Mudanças em relação à versão 1: a discussão sobre metafísica foi transformada em uma FAQ separada; adicionou-se uma citação de Lysenko e comentários sobre ciência; adicionou-se uma nova seção discutindo contingência e condições iniciais e de contorno; e Loren Haarsma escreveu uma perspectiva cristã e adicionou referências.
Mudanças desde a versão 1: separação da FAQ Chance, discussão estendida de algumas alegações filosóficas de que o darwinismo é uma metafísica ou visão de mundo, novas referências.