Anfíbios

@article{owen1841description5,
    author = "Owen, R",
    title = "Descrição de Lepidosiren annectens",
    year = "1841",
    journal = "Transactions of the Linnean Society of London, v. 18, p. 327-361",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Owen, R., 1841, Descrição de Lepidosiren annectens: Transactions of the Linnean Society of London, v. 18, p. 327-361.}"
}

@misc{noble1931biology4,
    author = "Noble, G. K",
    title = "Biologia dos Anfíbios",
    year = "1931",
    howpublished = "Nova York, McGraw-Hill",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Noble, G. K., 1931, Biologia dos Anfíbios: Nova York, McGraw-Hill.}"
}

@misc{stebbins1954amphibians7,
    author = "Stebbins, R. C",
    title = "Anfíbios e Répteis da América do Norte Ocidental",
    year = "1954",
    howpublished = "Nova York, McGraw-Hill",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stebbins, R. C., 1954, Anfíbios e Répteis da América do Norte Ocidental: Nova York, McGraw-Hill.}"
}

@book{moore1964physiology3,
    author = "Moore, J. A",
    title = "Fisiologia dos Anfíbios",
    year = "1964",
    publisher = "Londres, Academic Press, v. 1; [Volumes 2 \& 3 editados por B. Lofts]",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Moore, J. A., 1964, Fisiologia dos Anfíbios: Londres, Academic Press, v. 1; [Volumes 2 \& 3 editados por B. Lofts].}"
}

@misc{bentley1966adaptations1,
    author = "Bentley, P. J",
    title = "Adaptações de anfíbios a ambientes áridos",
    year = "1966",
    howpublished = "Science, v. 152, p. 619-623",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Bentley, P. J., 1966, Adaptações de anfíbios a ambientes áridos: Science, v. 152, p. 619-623.}"
}

@misc{porter1972herpetology6,
    author = "Porter, K. R",
    title = "Herpetologia",
    year = "1972",
    howpublished = "Londres, W.B. Saunders",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Porter, K. R., 1972, Herpetologia: Londres, W.B. Saunders.}"
}

@misc{langston1974nonmammalian2,
    author = "Langston, W. and Jr",
    title = "Tetrapodes não mamíferos do Comanchian",
    year = "1974",
    howpublished = "Geoscience and Man, v. 8, p. 39-55",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Langston, W., Jr., 1974, Tetrapodes não mamíferos do Comanchian: Geoscience and Man, v. 8, p. 39-55.}"
}

@misc{tyler1976frogs8,
    author = "Tyler, J. M",
    title = "Rãs",
    year = "1976",
    howpublished = "Sydney, Collins",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Tyler, J. M., 1976, Rãs: Sydney, Collins.}"
}

@article{crossref1987amphibians,
    title = "anfíbios",
    year = "1987",
    journal = "International Zoo Yearbook",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1748-1090.1987.tb01553.x",
    doi = "10.1111/j.1748-1090.1987.tb01553.x",
    number = "1",
    pages = "345-346",
    volume = "27"
}

@article{crossref1989amphibians,
    title = "Amphibians",
    year = "1989",
    journal = "International Zoo Yearbook",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1748-1090.1989.tb03305.x",
    doi = "10.1111/j.1748-1090.1989.tb03305.x",
    number = "1",
    pages = "391-391",
    volume = "28"
}

@article{doi101016000334728990081x,
    author = "Arak, Anthony",
    title = "The evolution of the amphibian auditory system",
    year = "1989",
    journal = "Animal Behaviour",
    url = "https://doi.org/10.1016/0003-3472(89)90081-x",
    doi = "10.1016/0003-3472(89)90081-x",
    openalex = "W2914409230"
}

As extinções são fenômenos biológicos normais. Tanto as extinções em massa no tempo geológico quanto as extinções locais no tempo ecológico estão bem documentadas, mas as taxas de extinção aumentaram nos últimos anos — especialmente em vertebrados, incluindo anfíbios — conforme ilustrado por relatórios recentes sobre o declínio de suas populações e a redução de seu alcance. Sugerimos que dados de longo prazo sobre populações são necessários para avaliar rigorosamente a significância do declínio dos anfíbios. Devido às restrições fisiológicas, à mobilidade relativamente baixa e à fidelidade ao local dos anfíbios, sugerimos que muitas populações de anfíbios podem ser incapazes de recolonizar áreas após a extinção local.

@article{doi101046j15231739199408010060x,
    author = "Blaustein, Andrew R. e Wake, David B. e Sousa, Wayne P.",
    title = "Amphibian Declines: Judging Stability, Persistence, and Susceptibility of Populations to Local and Global Extinctions",
    year = "1994",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "As extinções são fenômenos biológicos normais. Tanto as extinções em massa no tempo geológico quanto as extinções locais no tempo ecológico estão bem documentadas, mas as taxas de extinção aumentaram nos últimos anos — especialmente em vertebrados, incluindo anfíbios — conforme ilustrado por relatórios recentes sobre o declínio de suas populações e a redução de seu alcance. Sugerimos que dados de longo prazo sobre populações são necessários para avaliar rigorosamente a significância do declínio dos anfíbios. Devido às restrições fisiológicas, à mobilidade relativamente baixa e à fidelidade ao local dos anfíbios, sugerimos que muitas populações de anfíbios podem ser incapazes de recolonizar áreas após a extinção local.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.1994.08010060.x",
    doi = "10.1046/j.1523-1739.1994.08010060.x",
    openalex = "W2111287983",
    references = "doi101016000334727790118x, doi101086283547, doi101086284105, doi101093besa153237, doi101111j109583121991tb00548x, doi101111j109583121991tb00554x, doi101146annureves04110173000245, doi101146annureves11110180000435, doi1023071936969, doi1023073564801, doi10560219780801847806, openalexw1489366593, openalexw1500291103"
}

A rã dourada endêmica (Bufo periglenes) era abundante no Refúgio de Floresta de Nuvem de Monteverde, Costa Rica, em abril–maio de 1987, mas depois desapareceu, juntamente com populações locais da rã arlequim (Atelopus varius). Examinamos a possível relação entre esses declínios súbitos e condições excepcionalmente quentes e secas em 1987. Para nossas análises dos padrões climáticos locais, definimos um ciclo de umidade-temperatura de anfíbios de 12 meses (julho–junho) composto por quatro períodos: (1) final da estação chuvosa; (2) transição para a estação seca; (3) estação seca; e (4) pós-estação seca (recuperação no início da estação chuvosa). O ciclo de 1986–1987 foi o único registrado (de 20 analisados) com precipitação anormalmente baixa em todos os quatro períodos, e as anomalias de temperatura em 1987 atingiram recordes. O fluxo em riachos alimentados por aquíferos locais durante a estação seca e o período de recuperação pós-estação seca atingiu um mínimo recorde. Esta perturbação climática, associada ao El Niño/Oscilação Sul de 1986–1987, foi mais severa do que um evento similar associado ao El Niño de 1982–1983, embora essa oscilação anterior tenha sido a mais forte do século passado. Dados demográficos de uma população de rã arlequim, coletados durante esses dois eventos climáticos, apoiam a hipótese de que, em 1987, pouco antes do colapso da população, as rãs sofreram uma mudança sem precedentes na distribuição dentro do habitat em resposta a condições dessecantes. A juxtaposição desses raros eventos demográficos sugere que estavam causalmente ligados, mas não lança muita luz sobre os mecanismos subjacentes ao declínio súbito. Embora a dessecação ou efeitos diretos da temperatura possam ter sido fatores levando à alta mortalidade adulta, as condições de umidade-temperatura podem ter interagido com outro agente não identificado. Discutimos duas hipóteses sobre possíveis efeitos sinérgicos: na hipótese da epidemia ligada ao clima, microparasitas são o agente adicional. Na hipótese do pulso de contaminantes ligado ao clima, contaminantes atmosféricos capturados por neblina e água de nuvem em áreas montanhosas atingem concentrações críticas quando as condições são excepcionalmente quentes e secas.

@article{doi101046j15231739199408010072x,
    author = "Pounds, J. Alan e Crump, Martha L.",
    title = "Declínios de Anfíbios e Perturbações Climáticas: O Caso da Rã Dourada e da Rã Arlequim",
    year = "1994",
    journal = "Biologia da Conservação",
    abstract = "A rã dourada endêmica (Bufo periglenes) era abundante no Refúgio de Floresta de Nuvem de Monteverde, Costa Rica, em abril–maio de 1987, mas depois desapareceu, juntamente com populações locais da rã arlequim (Atelopus varius). Examinamos a possível relação entre esses declínios súbitos e condições excepcionalmente quentes e secas em 1987. Para nossas análises dos padrões climáticos locais, definimos um ciclo de umidade-temperatura de anfíbios de 12 meses (julho–junho) composto por quatro períodos: (1) final da estação chuvosa; (2) transição para a estação seca; (3) estação seca; e (4) pós-estação seca (recuperação no início da estação chuvosa). O ciclo de 1986–1987 foi o único registrado (de 20 analisados) com precipitação anormalmente baixa em todos os quatro períodos, e as anomalias de temperatura em 1987 atingiram recordes. O fluxo em riachos alimentados por aquíferos locais durante a estação seca e o período de recuperação pós-estação seca atingiu um mínimo recorde. Esta perturbação climática, associada ao El Niño/Oscilação Sul de 1986–1987, foi mais severa do que um evento similar associado ao El Niño de 1982–1983, embora essa oscilação anterior tenha sido a mais forte do século passado. Dados demográficos de uma população de rã arlequim, coletados durante esses dois eventos climáticos, apoiam a hipótese de que, em 1987, pouco antes do colapso da população, as rãs sofreram uma mudança sem precedentes na distribuição dentro do habitat em resposta a condições dessecantes. A juxtaposição desses raros eventos demográficos sugere que estavam causalmente ligados, mas não lança muita luz sobre os mecanismos subjacentes ao declínio súbito. Embora a dessecação ou efeitos diretos da temperatura possam ter sido fatores levando à alta mortalidade adulta, as condições de umidade-temperatura podem ter interagido com outro agente não identificado. Discutimos duas hipóteses sobre possíveis efeitos sinérgicos: na hipótese da epidemia ligada ao clima, microparasitas são o agente adicional. Na hipótese do pulso de contaminantes ligado ao clima, contaminantes atmosféricos capturados por neblina e água de nuvem em áreas montanhosas atingem concentrações críticas quando as condições são excepcionalmente quentes e secas.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.1994.08010072.x",
    doi = "10.1046/j.1523-1739.1994.08010072.x",
    openalex = "W2020680740"
}

Introdução aos anfíbios - o mundo dos anfíbios, resumo histórico, perspectivas para o futuro. Parte 1 História de Vida: estratégias reprodutivas - ciclos reprodutivos, modo reprodutivo, aspectos quantitativos, cuidado parental, evolução das estratégias reprodutivas cortejo e acasalamento - localização do local de reprodução, caracteres sexuais secundários, comportamento de cortejo, fertilização e oviposição, seleção sexual, evolução dos sistemas de acasalamento vocalização - sistema de comunicação anuro, mecanismos de produção e recepção de som, tipos de vocalizações e suas funções, fatores abióticos que afetam a vocalização, significado interespecífico da vocalização, implicações filogenéticas da vocalização ovos e desenvolvimento - espermatozóides e fertilização, estrutura do ovo, desenvolvimento do ovo, eclosão e nascimento, desenvolvimento e diversidade de anfíbios larvas - morfologia das larvas, tipos adaptativos de larvas, fisiologia e ecologia, comportamento social, significado evolutivo das larvas metamorfose - controle endócrino, outras mudanças bioquímicas, mudanças morfológicas, neotenia, significado ecológico e evolutivo da metamorfose. Parte 2 Ecologia: relações com o ambiente - economia de água, temperatura, troca gasosa, metabolismo energético e orçamentos energéticos, síntese ecológica alimentação e alimentação - seleção de presas, localização de presas, captura de presas, evolução de mecanismos e estratégias de captura de presas inimigos e defesa - doenças, parasitas, predadores, mecanismos anti-predadores, evolução de mecanismos de defesa biologia populacional - características de indivíduos, movimentos e territorialidade, demografia, fatores que regulam populações ecologia comunitária e diversidade de espécies - estrutura comunitária, diversidade de espécies, evolução de comunidades de anfíbios. Parte 3 Morfologia: sistema musculoesquelético - crânio e hiobrânquio, sistema axial, sistema apendicular, integração de unidades funcionais sistemas tegumentar, sensorial e visceral - tegumento, sistemas de receptores sensoriais, sistema nervoso, sistemas circulatório e respiratório, sistema urogenital, sistema digestivo, glândulas endócrinas, considerações evolutivas. Parte 4 Evolução: origem e evolução inicial - natureza de um tetrápode, tetrápodes primitivos, afinidades dos tetrápodes (peixes pulmonados ou peixes de nadadeiras lobadas?), diversidade e evolução dos tetrápodes iniciais, status dos lissamphibia evolução citogenética, molecular e genômica - citogenética, evolução molecular, evolução genômica filogenia - caudata, gymnophiona, anura biogeografia - princípios biogeográficos, contexto histórico, lissamphibia, caudata, gymnophiona, anura classificação.

@book{doi10560219780801847806,
    author = "Duellman, William E.",
    title = "Biology of Amphibians",
    year = "1994",
    booktitle = "Johns Hopkins University Press eBooks",
    abstract = "Introduction to amphibia - the world of amphibians, historical resume, prospects for the future. Part 1 Life History: reproductive strategies - reproductive cycles, reproductive mode, quantitative aspects, parental care, evolution of reproductive strategies courtship and mating - location of breeding site, secondary sexual characters, courtship behaviour, fertilization and oviposition, sexual selection, evolution of mating systems vocalization - anuran communication system, mechanisms of sound production and reception, kinds of vocalizations and their functions, abiotic factors affecting vocalization, interspecific significance of vocalization, phylogenetic implications of vocalization eggs and development - spermatozoa and fertilization, egg structure, egg development, hatching and birth, development and amphibian diversity larvae - morphology of larvae, adaptive types of larvae, physiology and ecology, social behaviour, evolutionary significance of larvae metamorphosis - endocrine control, other biochemical changes, morphological changes, neoteny, ecological and evolutionary significance of metamorphosis. Part 2 Ecology: relationships with the environment - water economy, temperature, gas exchange, energy metabolism and energy budgets, ecological synthesis food and feeding - prey selection, location of prey, capture of prey, evolution of prey-capturing mechanisms and strategies enemies and defence - diseases, parasites, predators, anti-predator mechanisms, evolution of defence mechanisms population biology - characteristics of individuals, movements and territoriality, demography, factors regulating populations community ecology and species diversity - community structure, species diversity, evolution of amphibian communities. Part 3 Morphology: musculoskeletal system - skull and hyobranchium, axial system, appendicular system, integration of functional units integumentary, sensory and visceral systems - integument, sensory receptor systems, nervous system, circulatory and respiratory systems, urogenital system, digestive system, endocrine glands, evolutionary considerations. Part 4 Evolution: origin and early evolution - nature of a tetrapod, primitive tetrapods, tetrapod affinities (lungfishes or lobe-fins?), diversity and evolution of early tetrapods, status of the lissamphibia cytogenetic, molecular and genomic evolution - cytogenetics, molecular evolution, genomic evolution phylogeny - caudata, gymnophiona, anura biogeography - biogeographic principles, historical setting, lissamphibia, caudata, gymnophiona, anura classification.",
    url = "https://doi.org/10.56021/9780801847806",
    doi = "10.56021/9780801847806",
    openalex = "W1486210610"
}

@article{crossref1995amphibians,
    title = "anfíbios",
    year = "1995",
    journal = "International Zoo Yearbook",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1748-1090.1995.tb00691.x",
    doi = "10.1111/j.1748-1090.1995.tb00691.x",
    number = "1",
    pages = "355-356",
    volume = "34"
}

@article{doi101016000632079400102v,
    author = "Fahrig, Lenore e Pedlar, John e Pope, Shealagh E. e Taylor, Philip e Wegner, John",
    title = "Efeito do tráfego rodoviário na densidade de anfíbios",
    year = "1995",
    journal = "Biological Conservation",
    url = "https://doi.org/10.1016/0006-3207(94)00102-v",
    doi = "10.1016/0006-3207(94)00102-v",
    openalex = "W2157813798",
    references = "doi101046j15231739199408010060x"
}

@article{crossref1997amphibians,
    title = "Anfíbios",
    year = "1997",
    journal = "International Zoo Yearbook",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1748-1090.1997.tb01238.x",
    doi = "10.1111/j.1748-1090.1997.tb01238.x",
    number = "1",
    pages = "467-467",
    volume = "35"
}

Revisamos pesquisas recentes sobre a patologia, ecologia e biogeografia de duas doenças infecciosas emergentes em vida selvagem, a quitridiomicose e a doença ranaviral, no contexto da biologia populacional hospedeiro-parasita. Examinamos o papel dessas doenças no declínio global das populações de anfíbios e propomos hipóteses sobre as origens e o impacto dessas panzootias. Finalmente, discutimos as doenças infecciosas emergentes como uma ameaça global às populações de vida selvagem.

@article{doi103201eid0506990601,
    author = "Daszak, Peter e Berger, Lee e Cunningham, Andrew A. e Hyatt, Alex D. e Green, D. Earl e Speare, Rick",
    title = "Doenças Infecciosas Emergentes e Declínios Populacionais de Anfíbios",
    year = "1999",
    journal = "Doenças infecciosas emergentes",
    abstract = "Revisamos pesquisas recentes sobre a patologia, ecologia e biogeografia de duas doenças infecciosas emergentes em vida selvagem, a quitridiomicose e a doença ranaviral, no contexto da biologia populacional hospedeiro-parasita. Examinamos o papel dessas doenças no declínio global das populações de anfíbios e propomos hipóteses sobre as origens e o impacto dessas panzootias. Finalmente, discutimos as doenças infecciosas emergentes como uma ameaça global às populações de vida selvagem.",
    url = "https://doi.org/10.3201/eid0506.990601",
    doi = "10.3201/eid0506.990601",
    openalex = "W2008397302"
}

@article{doi10103835008052,
    author = "Houlahan, Jeff E. e Findlay, C. Scott e Schmidt, Benedikt R. e Meyer, Andrea H. e Kuzmin, Sergius L.",
    title = "Evidências quantitativas para o declínio global das populações de anfíbios",
    year = "2000",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/35008052",
    doi = "10.1038/35008052",
    openalex = "W1595231589",
    references = "doi101046j15231739199408010060x, doi101126science2535022892"
}

As espécies de répteis estão em declínio em escala global. Seis ameaças significativas às populações de répteis são perda e degradação de habitat, espécies invasoras introduzidas, poluição ambiental, doenças, uso insustentável e mudança climática global.

@article{doi1016410006356820000500653tgdord20co2,
    author = "GIBBON, J. WHITFIELD e Scott, David E. e Ryan, Travis J. e Buhlmann, Kurt A. e Tuberville, Tracey D. e Metts, Brian S. e Greene, Judith L. e Mills, Tony M. e Leiden, Yale A e Poppy, Sean M. e Winne, Christopher T.",
    title = "The Global Decline of Reptiles, Déjà Vu Amphibians",
    year = "2000",
    journal = "BioScience",
    abstract = "As espécies de répteis estão em declínio em escala global. Seis ameaças significativas às populações de répteis são perda e degradação de habitat, espécies invasoras introduzidas, poluição ambiental, doenças, uso insustentável e mudança climática global.",
    url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2000)050[0653:tgdord]2.0.co;2",
    doi = "10.1641/0006-3568(2000)050[0653:tgdord]2.0.co;2",
    openalex = "W2102670626",
    references = "doi101046j15231739199408010060x, doi101126science2535022892"
}

@article{doi10103835070552,
    author = "Kiesecker, Joseph M. e Blaustein, Andrew R. e Belden, Lisa K.",
    title = "Causas complexas do declínio das populações de anfíbios",
    year = "2001",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/35070552",
    doi = "10.1038/35070552",
    openalex = "W1655609833"
}

Os Albanerpetontidae são anfíbios do Jurássico Médio ao Mioceno que foram variados considerados como caudados (salamandras), um clado distinto dos caudados, ou lissamfíbios incertae sedis. Aqui, testo a monofilia dos Albanerpetontidae e examino as afinidades do grupo, dentro do quadro de um Temnospondyli mais inclusivo, realizando uma análise cladística usando 59 caracteres informativos pontuados para quatro gêneros de temnospondilos não-lissamfíbios, caudados do clado estipe e clado coroa, salientianos (sapos), gimnofionanos (cecílias) e os dois gêneros albanerpetontídeos reconhecidos, Albanerpeton e Celtedens. A monofilia dos Albanerpetontidae é corroborada. Interpreto as sinapomorfias dos dentes marginais (não pedicelados; coroas em forma de cinzel, comprimidas labiolingualmente, com três cúspides alinhadas mesiodistalmente) nos albanerpetontídeos como estando associadas a uma mordida cortante. Outras sinapomorfias evidentemente fortaleceram e aumentaram a mobilidade do crânio, mandíbula e região cervical para escavação, alimentação ou ambos. Conjuntos aninhados de sinapomorfias colocam os Albanerpetontidae dentro dos Lissamphibia, como o táxon-irmão de Caudata mais Salientia. Nenhum dos 17 caracteres anteriormente propostos como sinapomorfias albanerpetontídeo-caudado coloca convincentemente os Albanerpetontidae dentro dos Caudata ou alia os dois grupos como táxons-irmãos. Os albanerpetontídeos são melhor interpretados não como caudados aberrantes, mas como um clado distinto de lissamfíbios no qual numerosas apomorfias são sobrepostas a um plano corporal de lissamfíbio de outra forma primitivo.

@article{doi101111j109636422001tb02240x,
    author = "Gardner, James D.",
    title = "Monofilia e afinidades de anfíbios albanerpetontídeos (Temnospondyli; Lissamphibia)",
    year = "2001",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Os Albanerpetontidae são anfíbios do Jurássico Médio ao Mioceno que foram variados considerados como caudados (salamandras), um clado distinto dos caudados, ou lissamfíbios incertae sedis. Aqui, testo a monofilia dos Albanerpetontidae e examino as afinidades do grupo, dentro do quadro de um Temnospondyli mais inclusivo, realizando uma análise cladística usando 59 caracteres informativos pontuados para quatro gêneros de temnospondilos não-lissamfíbios, caudados do clado estipe e clado coroa, salientianos (sapos), gimnofionanos (cecílias) e os dois gêneros albanerpetontídeos reconhecidos, Albanerpeton e Celtedens. A monofilia dos Albanerpetontidae é corroborada. Interpreto as sinapomorfias dos dentes marginais (não pedicelados; coroas em forma de cinzel, comprimidas labiolingualmente, com três cúspides alinhadas mesiodistalmente) nos albanerpetontídeos como estando associadas a uma mordida cortante. Outras sinapomorfias evidentemente fortaleceram e aumentaram a mobilidade do crânio, mandíbula e região cervical para escavação, alimentação ou ambos. Conjuntos aninhados de sinapomorfias colocam os Albanerpetontidae dentro dos Lissamphibia, como o táxon-irmão de Caudata mais Salientia. Nenhum dos 17 caracteres anteriormente propostos como sinapomorfias albanerpetontídeo-caudado coloca convincentemente os Albanerpetontidae dentro dos Caudata ou alia os dois grupos como táxons-irmãos. Os albanerpetontídeos são melhor interpretados não como caudados aberrantes, mas como um clado distinto de lissamfíbios no qual numerosas apomorfias são sobrepostas a um plano corporal de lissamfíbio de outra forma primitivo.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-3642.2001.tb02240.x",
    doi = "10.1111/j.1096-3642.2001.tb02240.x",
    openalex = "W2025048561"
}

Resumo: As populações de anfíbios estão em declínio em todos os continentes onde ocorrem, mas nem todas as espécies foram afetadas igualmente. Populações de algumas espécies foram extintas, outras declinaram mas sobreviveram, algumas não declinaram obviamente e outras estão aumentando. Se as populações de anfíbios em múltiplos locais fossem afetadas pelos mesmos fatores, então as espécies sobreviventes devem compartilhar características que promovem a persistência, enquanto as espécies em declínio devem compartilhar características que promovem a suscetibilidade. Identificar essas características pode ajudar a diagnosticar causas potenciais e, assim, ajudar a direcionar ações de conservação. Usando regressão logística, quantificamos a vulnerabilidade das populações de anfíbios em quatro áreas na América Central. Analisamos um banco de dados específico de espécies de identidade taxonômica, faixa geográfica e elevacional, distribuição elevacional, habitat adulto e larval, período de atividade e tamanho máximo do corpo adulto. Encontramos que (1) todos os quatro locais exibiram o mesmo padrão de declínio (não houve interações entre o local e outras variáveis); (2) as populações em declínio compartilharam habitats aquáticos, faixas elevacionais restritas e grandes tamanhos corporais; e (3) houve uma interação entre tamanho corporal e faixa elevacional. A variável mais significativa no modelo foi o índice aquático vitalício, um fator não relacionado à vulnerabilidade demográfica e que, portanto, pode indicar o(s) agente(s) causativo(s) potencial(is). Nossos resultados fornecem um modelo preditivo para avaliar causas potenciais de declínios populacionais em outras áreas, e geramos uma lista de 52 espécies previstas para declinar em um local atualmente não afetado no Panamá central.

@article{doi101046j15231739200301623x,
    author = "Lips, Karen R. and Reeve, John D. and Witters, Lani R.",
    title = "Ecological Traits Predicting Amphibian Population Declines in Central America",
    year = "2003",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "Resumo: As populações de anfíbios estão em declínio em todos os continentes onde ocorrem, mas nem todas as espécies foram afetadas igualmente. Populações de algumas espécies foram extintas, outras declinaram mas sobreviveram, algumas não declinaram obviamente e outras estão aumentando. Se as populações de anfíbios em múltiplos locais fossem afetadas pelos mesmos fatores, então as espécies sobreviventes devem compartilhar características que promovem a persistência, enquanto as espécies em declínio devem compartilhar características que promovem a suscetibilidade. Identificar essas características pode ajudar a diagnosticar causas potenciais e, assim, ajudar a direcionar ações de conservação. Usando regressão logística, quantificamos a vulnerabilidade das populações de anfíbios em quatro áreas na América Central. Analisamos um banco de dados específico de espécies de identidade taxonômica, faixa geográfica e elevacional, distribuição elevacional, habitat adulto e larval, período de atividade e tamanho máximo do corpo adulto. Encontramos que (1) todos os quatro locais exibiram o mesmo padrão de declínio (não houve interações entre o local e outras variáveis); (2) as populações em declínio compartilharam habitats aquáticos, faixas elevacionais restritas e grandes tamanhos corporais; e (3) houve uma interação entre tamanho corporal e faixa elevacional. A variável mais significativa no modelo foi o índice aquático vitalício, um fator não relacionado à vulnerabilidade demográfica e que, portanto, pode indicar o(s) agente(s) causativo(s) potencial(is). Nossos resultados fornecem um modelo preditivo para avaliar causas potenciais de declínios populacionais em outras áreas, e geramos uma lista de 52 espécies previstas para declinar em um local atualmente não afetado no Panamá central.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.2003.01623.x",
    doi = "10.1046/j.1523-1739.2003.01623.x",
    openalex = "W2086206658",
    references = "doi101016s0012825297834848, doi101098rstb19940045"
}

Resumo: Relatos generalizados de anfíbios malformados são de crescente preocupação para a conservação. Embora relatos de malformações em massa (>5%) em populações de anfíbios da América do Norte remontem aos anos 1940, eles são frequentemente mal documentados e raramente explicados. Revisamos informações disponíveis para nove relatos históricos da Califórnia, Colorado, Idaho, Mississippi, Montana, Ohio e Texas, relatados entre 1946 e 1988. Em seguida, fizemos as seguintes perguntas: (1) Quais desses casos estavam associados à infecção por Ribeiroia (Trematoda: Digenea)? (2) As malformações ainda estão ocorrendo nesses locais? E (3) se sim, a frequência ou os tipos de anomalias mudaram? Cada local foi resurveyado entre 1999 e 2002, e os espécimes originais foram redescritos e examinados para infecção por trematódeos. A identificação direta e classificação por análise de função discriminante indicaram que as malformações históricas em seis dos oito locais estavam associadas à infecção por Ribeiroia, datando de tão longe quanto 1946. As malformações registradas historicamente nesses locais foram consistentes com os efeitos documentados da infecção por Ribeiroia, incluindo membros extras, fusão cutânea e triângulos ósseos. Dos seis locais que ainda suportavam anfíbios no resurvey, três continuaram a suportar malformações severas de membros em frequências de 7–50% em uma ou mais espécies. Embora nenhum pesticida tenha sido detectado, anfíbios de cada um desses locais foram infectados com metacercárias de Ribeiroia. Juntos, esses resultados sugerem que a infecção por Ribeiroia historicamente tem sido uma causa importante de malformações em massa em anfíbios. Concluímos que, embora as malformações induzidas por parasitas não sejam um fenômeno novo, há evidências qualitativas sugerindo que sua prevalência aumentou recentemente, e destacamos a necessidade de pesquisa de longo prazo para avaliar os impactos das malformações na viabilidade populacional de anfíbios.

@article{doi101111j15231739200300217x,
    author = "Johnson, Pieter T. J. and Lunde, Kevin B. and Zelmer, Derek A. and Werner, J. Kent",
    title = "Limb Deformities as an Emerging Parasitic Disease in Amphibians: Evidence from Museum Specimens and Resurvey Data",
    year = "2003",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "Resumo: Relatos generalizados de anfíbios malformados são de crescente preocupação para a conservação. Embora relatos de malformações em massa (>5\%) em populações de anfíbios da América do Norte remontem aos anos 1940, eles são frequentemente mal documentados e raramente explicados. Revisamos informações disponíveis para nove relatos históricos da Califórnia, Colorado, Idaho, Mississippi, Montana, Ohio e Texas, relatados entre 1946 e 1988. Em seguida, fizemos as seguintes perguntas: (1) Quais desses casos estavam associados à infecção por Ribeiroia (Trematoda: Digenea)? (2) As malformações ainda estão ocorrendo nesses locais? E (3) se sim, a frequência ou os tipos de anomalias mudaram? Cada local foi resurveyado entre 1999 e 2002, e os espécimes originais foram redescritos e examinados para infecção por trematódeos. A identificação direta e classificação por análise de função discriminante indicaram que as malformações históricas em seis dos oito locais estavam associadas à infecção por Ribeiroia, datando de tão longe quanto 1946. As malformações registradas historicamente nesses locais foram consistentes com os efeitos documentados da infecção por Ribeiroia, incluindo membros extras, fusão cutânea e triângulos ósseos. Dos seis locais que ainda suportavam anfíbios no resurvey, três continuaram a suportar malformações severas de membros em frequências de 7–50\% em uma ou mais espécies. Embora nenhum pesticida tenha sido detectado, anfíbios de cada um desses locais foram infectados com metacercárias de Ribeiroia. Juntos, esses resultados sugerem que a infecção por Ribeiroia historicamente tem sido uma causa importante de malformações em massa em anfíbios. Concluímos que, embora as malformações induzidas por parasitas não sejam um fenômeno novo, há evidências qualitativas sugerindo que sua prevalência aumentou recentemente, e destacamos a necessidade de pesquisa de longo prazo para avaliar os impactos das malformações na viabilidade populacional de anfíbios.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2003.00217.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2003.00217.x",
    openalex = "W2034273505"
}

@article{doi101016jbiocon200504009,
    author = "Beebee, Trevor J. C. e Griffiths, Richard A.",
    title = "The amphibian decline crisis: A watershed for conservation biology?",
    year = "2005",
    journal = "Biological Conservation",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biocon.2005.04.009",
    doi = "10.1016/j.biocon.2005.04.009",
    openalex = "W2139117306",
    references = "doi101046j14724642200300016x, doi101046j15231739199408010060x, doi101093genetics14442001, doi101126science2535022892"
}

Os anfíbios globalmente estão em declínio, mas ainda existe uma quantidade tremenda de diversidade não reconhecida, exigindo uma aceleração da exploração taxonômica. Este processo será grandemente facilitado por um sistema de código de barras de DNA; no entanto, a estrutura populacional mitocondrial de muitas espécies de anfíbios apresenta numerosos desafios para tal abordagem padronizada de único locus. Aqui analisamos padrões intra- e interespecíficos de variação mitocondrial em dois grupos de anfíbios distantes, sapos mantelídeos e salamandras, para determinar a promessa do código de barras de DNA com sequências de subunidade I da citocromo oxidase (cox1) neste táxon. Foram observadas altas divergências intraespecíficas de cox1 de 7-14% (18% em um caso) dentro de todo o conjunto de sequências de anfíbios analisado. Estes altos valores não são causados por taxas de substituição particularmente altas deste gene, mas por divergências mitocondriais geralmente profundas dentro e entre espécies de anfíbios. Apesar destas altas divergências, as sequências de cox1 foram capazes de identificar corretamente espécies incluindo variantes geográficas distintas. Os principais problemas com o código de barras de cox1 de anfíbios são (i) a alta variabilidade de sítios de priming que dificultam a aplicação de primers universais a todas as espécies e (ii) a sobreposição distinta observada de valores de divergência intraespecífica e interespecífica, o que implica dificuldades na definição de valores de limite para identificar espécies candidatas. Discordâncias comuns entre assinaturas geográficas de marcadores mitocondriais e nucleares em anfíbios indicam que uma abordagem de único locus pode ser problemática quando é necessária alta precisão do código de barras de DNA. Sugerimos que um número de genes mitocondriais e nucleares podem ser usados como marcadores de código de barras de DNA para complementar cox1.

@article{doi101098rstb20051717,
    author = "Vences, Miguel e Thomas, Meike e Bonett, Ronald M. e Vieites, David R.",
    title = "Decifrando a diversidade de anfíbios através do código de barras de DNA: chances e desafios",
    year = "2005",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Os anfíbios globalmente estão em declínio, mas ainda existe uma quantidade tremenda de diversidade não reconhecida, exigindo uma aceleração da exploração taxonômica. Este processo será grandemente facilitado por um sistema de código de barras de DNA; no entanto, a estrutura populacional mitocondrial de muitas espécies de anfíbios apresenta numerosos desafios para tal abordagem padronizada de único locus. Aqui analisamos padrões intra- e interespecíficos de variação mitocondrial em dois grupos de anfíbios distantes, sapos mantelídeos e salamandras, para determinar a promessa do código de barras de DNA com sequências de subunidade I da citocromo oxidase (cox1) neste táxon. Foram observadas altas divergências intraespecíficas de cox1 de 7-14\% (18\% em um caso) dentro de todo o conjunto de sequências de anfíbios analisado. Estes altos valores não são causados por taxas de substituição particularmente altas deste gene, mas por divergências mitocondriais geralmente profundas dentro e entre espécies de anfíbios. Apesar destas altas divergências, as sequências de cox1 foram capazes de identificar corretamente espécies incluindo variantes geográficas distintas. Os principais problemas com o código de barras de cox1 de anfíbios são (i) a alta variabilidade de sítios de priming que dificultam a aplicação de primers universais a todas as espécies e (ii) a sobreposição distinta observada de valores de divergência intraespecífica e interespecífica, o que implica dificuldades na definição de valores de limite para identificar espécies candidatas. Discordâncias comuns entre assinaturas geográficas de marcadores mitocondriais e nucleares em anfíbios indicam que uma abordagem de único locus pode ser problemática quando é necessária alta precisão do código de barras de DNA. Sugerimos que um número de genes mitocondriais e nucleares podem ser usados como marcadores de código de barras de DNA para complementar cox1.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2005.1717",
    doi = "10.1098/rstb.2005.1717",
    openalex = "W2097709171",
    references = "doi101007bf01731581, doi101016s0022283605803602, doi101073pnas0406166101, doi101098rspb20022218, doi101126science1103538, doi101146annurevecolsys34011802132421, doi1011861742999425, doi101371journalpbio0020312, doi1016441545154220010820960atotgs20co2, doi102307jctv1nzfgj7, doi105860choice375647, openalexw3217097258"
}

Os anfíbios são frequentemente caracterizados por terem capacidades limitadas de dispersão, forte fidelidade ao local e habitat de reprodução espacialmente disjuntivo. Como tal, as espécies que se reproduzem em lagoas são frequentemente alegadas a formar metapopulações. Espécies de anfíbios em todo o mundo parecem estar sofrendo declínios no nível populacional causados, pelo menos em parte, pela degradação e fragmentação do habitat e das áreas intercalares entre os fragmentos de habitat. Se a simplificação de que os anfíbios ocupam metapopulações é precisa, então uma estratégia de conservação baseada regionalmente, informada pela teoria de metapopulações, é uma ferramenta poderosa para estimar o isolamento e o risco de extinção de lagoas ou populações. No entanto, até hoje, não foi feita nenhuma tentativa de avaliar a generalização de classe das populações de anfíbios como metapopulações. Revisamos a literatura sobre anfíbios como metapopulações (53 artigos de periódicos ou teses) e dispersão de anfíbios (166 artigos de periódicos ou teses para 53 espécies de anuros e 37 espécies de salamandras) para avaliar se as condições para a estrutura de metapopulação foram testadas, se o isolamento da lagoa foi baseado apenas na suposição de dispersão limitada e se a dispersão de anfíbios foi uniformemente limitada. Encontramos que na maioria dos casos (74%) as suposições do paradigma de metapopulação não foram testadas. O isolamento do fragmento de reprodução via dispersão limitada e/ou forte fidelidade ao local foi a condição de metapopulação mais frequentemente implicada ou testada, no entanto, encontramos fortes evidências de que a dispersão de anfíbios não é tão uniformemente limitada quanto frequentemente se pensa. A distribuição de frequência dos movimentos máximos para anuros e salamandras foi bem descrita por uma lei de potência inversa. Esta relação prevê que distâncias abaixo de 11–13 e 8–9 km, respectivamente, estão em uma faixa na qual elas podem receber um indivíduo emigrante. Populações isoladas por distâncias que se aproximam desta faixa são talvez mais propensas a exibir estrutura de metapopulação do que populações menos isoladas. Os estudos que cobriram áreas maiores também tendiam a relatar maiores distâncias de movimento máximo – um padrão com implicações para o desenho de estudos de marcação e recaptura. Deve-se ter cautela na aplicação da abordagem de metapopulação à conservação de populações de anfíbios. Algumas populações de anfíbios são estruturadas como metapopulações – mas não todas.

@article{doi101111j09067590200504042x,
    author = "Smith, M. Alex and Green, David M.",
    title = "Dispersal and the metapopulation paradigm in amphibian ecology and conservation: are all amphibian populations metapopulations?",
    year = "2005",
    journal = "Ecography",
    abstract = "Os anfíbios são frequentemente caracterizados por terem capacidades limitadas de dispersão, forte fidelidade ao local e habitat de reprodução espacialmente disjuntivo. Como tal, as espécies que se reproduzem em lagoas são frequentemente alegadas a formar metapopulações. Espécies de anfíbios em todo o mundo parecem estar sofrendo declínios no nível populacional causados, pelo menos em parte, pela degradação e fragmentação do habitat e das áreas intercalares entre os fragmentos de habitat. Se a simplificação de que os anfíbios ocupam metapopulações é precisa, então uma estratégia de conservação baseada regionalmente, informada pela teoria de metapopulações, é uma ferramenta poderosa para estimar o isolamento e o risco de extinção de lagoas ou populações. No entanto, até hoje, não foi feita nenhuma tentativa de avaliar a generalização de classe das populações de anfíbios como metapopulações. Revisamos a literatura sobre anfíbios como metapopulações (53 artigos de periódicos ou teses) e dispersão de anfíbios (166 artigos de periódicos ou teses para 53 espécies de anuros e 37 espécies de salamandras) para avaliar se as condições para a estrutura de metapopulação foram testadas, se o isolamento da lagoa foi baseado apenas na suposição de dispersão limitada e se a dispersão de anfíbios foi uniformemente limitada. Encontramos que na maioria dos casos (74\%) as suposições do paradigma de metapopulação não foram testadas. O isolamento do fragmento de reprodução via dispersão limitada e/ou forte fidelidade ao local foi a condição de metapopulação mais frequentemente implicada ou testada, no entanto, encontramos fortes evidências de que a dispersão de anfíbios não é tão uniformemente limitada quanto frequentemente se pensa. A distribuição de frequência dos movimentos máximos para anuros e salamandras foi bem descrita por uma lei de potência inversa. Esta relação prevê que distâncias abaixo de 11–13 e 8–9 km, respectivamente, estão em uma faixa na qual elas podem receber um indivíduo emigrante. Populações isoladas por distâncias que se aproximam desta faixa são talvez mais propensas a exibir estrutura de metapopulação do que populações menos isoladas. Os estudos que cobriram áreas maiores também tendiam a relatar maiores distâncias de movimento máximo – um padrão com implicações para o desenho de estudos de marcação e recaptura. Deve-se ter cautela na aplicação da abordagem de metapopulação à conservação de populações de anfíbios. Algumas populações de anfíbios são estruturadas como metapopulações – mas não todas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0906-7590.2005.04042.x",
    doi = "10.1111/j.0906-7590.2005.04042.x",
    openalex = "W2077386988",
    references = "doi101046j15231739199408010060x, doi101111j109583121991tb00552x, doi10560219780801847806"
}

Resumo: Doenças infecciosas emergentes podem estar contribuindo para o declínio global das populações de anfíbios. Em particular, a quitridiomicose, uma infecção fúngica cutânea de anfíbios causada pelo quitrídio Batrachochytrium dendrobatidis, ganhou atenção na década de 1990 como um patógeno aparentemente novo. Este fungo tem sido implicado como o agente causador de mortalidades generalizadas entre anfíbios selvagens em partes geograficamente distintas do mundo. Para investigar a distribuição global, a ocorrência histórica e a infectividade deste patógeno, examinamos 3371 anfíbios pós-metamorfose e adultos coletados entre 1895 e 2001 de 25 países em busca de fungos quitrídeos na epiderme. A infecção quitrídia cutânea foi diagnosticada em 383 de 2931 (13,1%) espécimes de 12 espécies comuns de anfíbios de cinco províncias canadenses e sete estados americanos, incluindo 30 de 69 locais examinados no Vale do Rio São Lourenço, em Québec. Quitrídeos foram observados em 7,0% (46/655) dos adultos coletados na década de 1960, sendo os primeiros casos dois sapos-verdes (Rana clamitans) coletados em 1961 em Saint‐Pierre‐de‐Wakefield, Québec. Em estudos recentes, não foram observadas morbidade e mortalidade atribuíveis à quitridiomicose em anfíbios infectados de Québec, apesar de uma prevalência de 17,8% (302/1698) de infecção por quitrídeos durante o período 1990–2001. A prevalência de infecção durante este último período não foi estatisticamente diferente quando comparada com o período 1960–1969. Infecções quitrídeas epidermais não foram observadas em 440 anfíbios examinados de 23 outros países. À luz do fato de que a infecção por B. dendrobatidis é amplamente distribuída e aparentemente enzootica em anfíbios aparentemente saudáveis da América do Norte leste, surtos letais de quitridiomicose entre populações de anfíbios parecem ter causas complexas e podem ser o resultado de fatores predisponentes subjacentes.

@article{doi101111j15231739200500108x,
    author = "Ouellet, Martin e Mikaelian, Igor e Pauli, Bruce D. e Rodrigue, Jean‐Paul e Green, David M.",
    title = "Evidências Históricas de Infecção Generalizada por Chytrid em Populações de Anfíbios da América do Norte",
    year = "2005",
    journal = "Biologia da Conservação",
    abstract = "Resumo: Doenças infecciosas emergentes podem estar contribuindo para o declínio global das populações de anfíbios. Em particular, a quitridiomicose, uma infecção fúngica cutânea de anfíbios causada pelo quitrídio Batrachochytrium dendrobatidis, ganhou atenção na década de 1990 como um patógeno aparentemente novo. Este fungo tem sido implicado como o agente causador de mortalidades generalizadas entre anfíbios selvagens em partes geograficamente distintas do mundo. Para investigar a distribuição global, a ocorrência histórica e a infectividade deste patógeno, examinamos 3371 anfíbios pós-metamorfose e adultos coletados entre 1895 e 2001 de 25 países em busca de fungos quitrídeos na epiderme. A infecção quitrídia cutânea foi diagnosticada em 383 de 2931 (13,1\%) espécimes de 12 espécies comuns de anfíbios de cinco províncias canadenses e sete estados americanos, incluindo 30 de 69 locais examinados no Vale do Rio São Lourenço, em Québec. Quitrídeos foram observados em 7,0\% (46/655) dos adultos coletados na década de 1960, sendo os primeiros casos dois sapos-verdes (Rana clamitans) coletados em 1961 em Saint‐Pierre‐de‐Wakefield, Québec. Em estudos recentes, não foram observadas morbidade e mortalidade atribuíveis à quitridiomicose em anfíbios infectados de Québec, apesar de uma prevalência de 17,8\% (302/1698) de infecção por quitrídeos durante o período 1990–2001. A prevalência de infecção durante este último período não foi estatisticamente diferente quando comparada com o período 1960–1969. Infecções quitrídeas epidermais não foram observadas em 440 anfíbios examinados de 23 outros países. À luz do fato de que a infecção por B. dendrobatidis é amplamente distribuída e aparentemente enzootica em anfíbios aparentemente saudáveis da América do Norte leste, surtos letais de quitridiomicose entre populações de anfíbios parecem ter causas complexas e podem ser o resultado de fatores predisponentes subjacentes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2005.00108.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2005.00108.x",
    openalex = "W2097847544"
}

FUNDO: A identificação de espécies de organismos por sequências curtas de DNA tem sido no centro de discussões contínuas sob os termos DNA barcoding ou taxonomia de DNA. Um fragmento C-terminal do gene mitocondrial para citocromo oxidase subunidade I (COI) foi proposto como marcador universal para este propósito entre animais. RESULTADOS: Aqui apresentamos evidências experimentais de que o gene mitocondrial 16S rRNA cumpre os requisitos para um marcador universal de DNA barcoding em anfíbios. Em termos de universalidade de sítios de priming e identificação de clados principais de vertebrados, o fragmento 16S estudado é superior ao COI. O sucesso de amplificação foi de 100% para 16S em um subconjunto de amostras de sapos de Madagascar frescas e bem preservadas, enquanto várias combinações de primers de COI tiveram taxas de sucesso menores. Os sítios de priming de COI mostraram alta variabilidade entre anfíbios tanto no nível de grupos quanto de espécies estreitamente relacionadas, enquanto os sítios de priming de 16S foram altamente conservados entre vertebrados. Divergências pareadas interespecíficas de 16S em um grupo de teste de sapos de Madagascar estavam em um nível adequado para atribuição de estágios larvais a espécies (1-17%), com baixos graus de divergência de haplótipos pareados dentro de populações (0-1%). CONCLUSÃO: Defendemos fortemente o uso de 16S rRNA como marcador padrão de DNA barcoding para vertebrados para complementar o COI, especialmente se as amostras a priori puderem pertencer a vários táxons filogeneticamente distantes e falsos negativos constituiriam um problema majoritário.

@article{doi1011861742999425,
    author = "Vences, Miguel e Thomas, Meike e van der Meijden, Arie e Chiari, Ylenia e Vieites, David R.",
    title = "Desempenho comparativo do gene 16S rRNA no DNA barcoding de anfíbios",
    year = "2005",
    journal = "Frontiers in Zoology",
    abstract = "FUNDO: A identificação de espécies de organismos por sequências curtas de DNA tem sido no centro de discussões contínuas sob os termos DNA barcoding ou taxonomia de DNA. Um fragmento C-terminal do gene mitocondrial para citocromo oxidase subunidade I (COI) foi proposto como marcador universal para este propósito entre animais. RESULTADOS: Aqui apresentamos evidências experimentais de que o gene mitocondrial 16S rRNA cumpre os requisitos para um marcador universal de DNA barcoding em anfíbios. Em termos de universalidade de sítios de priming e identificação de clados principais de vertebrados, o fragmento 16S estudado é superior ao COI. O sucesso de amplificação foi de 100\% para 16S em um subconjunto de amostras de sapos de Madagascar frescas e bem preservadas, enquanto várias combinações de primers de COI tiveram taxas de sucesso menores. Os sítios de priming de COI mostraram alta variabilidade entre anfíbios tanto no nível de grupos quanto de espécies estreitamente relacionadas, enquanto os sítios de priming de 16S foram altamente conservados entre vertebrados. Divergências pareadas interespecíficas de 16S em um grupo de teste de sapos de Madagascar estavam em um nível adequado para atribuição de estágios larvais a espécies (1-17\%), com baixos graus de divergência de haplótipos pareados dentro de populações (0-1\%). CONCLUSÃO: Defendemos fortemente o uso de 16S rRNA como marcador padrão de DNA barcoding para vertebrados para complementar o COI, especialmente se as amostras a priori puderem pertencer a vários táxons filogeneticamente distantes e falsos negativos constituiriam um problema majoritário.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1742-9994-2-5",
    doi = "10.1186/1742-9994-2-5",
    openalex = "W2109560743",
    references = "doi101016s0022283605803602, doi101016s0022534701635407, doi101073pnas0406166101, doi101093bioinformaticsbtg359, doi101098rsbl20030025, doi101098rspb20022218, doi101126science1093857, doi101128aem666254125472000, doi101146annurevecolsys34011802132421, doi101371journalpbio0020312"
}

@incollection{clayton2006amphibians,
    author = "Clayton, Mark M. e Wombey, John C. e Mason, Ian J. e Chesser, R. Terry e Wells, Alice",
    title = "Anfíbios",
    year = "2006",
    booktitle = "Lista de Vertebrados Australianos do CSIRO",
    url = "https://doi.org/10.1071/978064309303402.9.16.2006.2",
    doi = "10.1071/978064309303402.9.16.2006.2"
}

@article{doi101038nature04246,
    author = "Pounds, J. Alan e Bustamante, Martín R. e Coloma, Luis A. e Consuegra, Jamie A. e Fogden, Michael P. L. e Foster, Pru N. e Marca, Enrique La e Masters, Karen L. e Merino‐Viteri, Andrés e Puschendorf, Robert e Ron, Santiago R. e Sánchez‐Azofeifa, Arturo e Still, Christopher J. e Young, Bruce E.",
    title = "Extinções generalizadas de anfíbios causadas por doenças epidêmicas impulsionadas pelo aquecimento global",
    year = "2006",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature04246",
    doi = "10.1038/nature04246",
    openalex = "W2014225118",
    references = "doi10100797836620308372, doi101007bf01025401, doi10103819297, doi101038nature01286, doi101038nature01333, doi101038nature02121, doi101046j14724642200300016x, doi101073pnas95159031, doi101126science1063699, doi101126science1103538, doi10230720033020"
}

Patógenos raramente causam extinções de espécies hospedeiras, e há poucos exemplos de um patógeno alterar a riqueza e a diversidade de espécies de uma comunidade ecológica ao causar extinções locais em uma ampla gama de espécies. Relatamos a ligação entre a rápida aparição de um fungo quitrídio patogênico Batrachochytrium dendrobatidis em uma comunidade de anfíbios em El Copé, Panamá, e a subsequente mortalidade em massa e perda da biodiversidade de anfíbios em oito famílias de sapos e salamandras. Descrevemos um surto de quitridiomicose no Panamá e argumentamos que esta doença infecciosa desempenhou um papel importante no declínio das populações de anfíbios. A alta virulência e o grande número de hospedeiros potenciais desta doença infecciosa emergente ameaçam a diversidade global de anfíbios.

@article{doi101073pnas0506889103,
    author = "Lips, Karen R. e Brem, Forrest e Brenes, Roberto e Reeve, John D. e Alford, Ross A. e Voyles, Jamie e Carey, Cynthia e Livo, Lauren J. e Pessier, Allan P. e Collins, James P.",
    title = "Doença infecciosa emergente e a perda da biodiversidade em uma comunidade de anfíbios neotropicais",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Patógenos raramente causam extinções de espécies hospedeiras, e há poucos exemplos de um patógeno alterar a riqueza e a diversidade de espécies de uma comunidade ecológica ao causar extinções locais em uma ampla gama de espécies. Relatamos a ligação entre a rápida aparição de um fungo quitrídio patogênico Batrachochytrium dendrobatidis em uma comunidade de anfíbios em El Copé, Panamá, e a subsequente mortalidade em massa e perda da biodiversidade de anfíbios em oito famílias de sapos e salamandras. Descrevemos um surto de quitridiomicose no Panamá e argumentamos que esta doença infecciosa desempenhou um papel importante no declínio das populações de anfíbios. A alta virulência e o grande número de hospedeiros potenciais desta doença infecciosa emergente ameaçam a diversidade global de anfíbios.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0506889103",
    doi = "10.1073/pnas.0506889103",
    openalex = "W2109538719",
    references = "doi101046j14724642200300016x, doi101126science2535022892, doi103201eid1012030804"
}

Resumo Objetivo: Exploramos a relação entre as distribuições atuais de espécies de anfíbios e répteis na Europa e o clima observado, e projetamos as distribuições potenciais das espécies para o futuro. Os impactos potenciais do aquecimento climático são avaliados quantificando a magnitude e a direção das mudanças de distribuição modeladas para cada espécie. Em particular, perguntamos, primeiro, que proporção de espécies de anfíbios e répteis é projetada perder e ganhar espaço climático adequado no futuro? Em segundo lugar, as projeções das espécies variam de acordo com propriedades taxonômicas, espaciais ou ambientais? E, em terceiro lugar, quais fatores climáticos podem estar impulsionando as projeções de perda ou ganho de ambientes adequados para as espécies? Localização: Europa. Métodos: As distribuições das espécies são modeladas com quatro técnicas de envoltório espécie-clima (redes neurais artificiais, modelos lineares generalizados, modelos aditivos generalizados e análises de árvores de classificação) e as distribuições são projetadas para o futuro usando cinco cenários de mudança climática para 2050. As projeções futuras são feitas considerando duas suposições extremas: as espécies têm capacidade de dispersão ilimitada e as espécies não têm capacidade de dispersão. Em seguida, é utilizada uma abordagem híbrida inovadora para combinar conjuntos de previsões, agrupando projeções linearmente covariantes em clusters com variabilidade inter-modelo reduzida. Resultados: Mostramos que uma grande proporção de espécies de anfíbios e répteis é projetada expandir suas distribuições se a dispersão for ilimitada. Isso ocorre porque o aquecimento nas faunas setentrionais mais frias das espécies cria novas oportunidades de colonização. Se as espécies não forem capazes de dispersar, então a maioria das espécies é projetada perder seu alcance. A perda de espaço climático adequado para as espécies é projetada ocorrer principalmente no sudoeste da Europa, incluindo a Península Ibérica, enquanto as espécies no sudeste são projetadas ganhar clima adequado. Isso ocorre porque as condições secas no sudoeste são projetadas aumentar, aproximando-se dos níveis encontrados no Norte da África, onde poucas espécies de anfíbios são capazes de persistir. Conclusões principais: O impacto do aumento das temperaturas nas espécies de anfíbios e répteis pode ser menos deletério do que anteriormente postulado; de fato, o resfriamento climático seria mais deletério para a persistência de espécies de anfíbios e répteis do que o aquecimento. A capacidade das espécies de lidar com o aquecimento climático pode, no entanto, ser compensada por projeções de diminuição na disponibilidade de água. Isso deve ser particularmente verdadeiro para anfíbios. A capacidade limitada de dispersão pode aumentar ainda mais a vulnerabilidade de anfíbios e répteis às mudanças climáticas.

@article{doi101111j13652699200601482x,
    author = "Araújo, Miguel B. and Thuiller, Wilfried and Pearson, Richard G.",
    title = "Climate warming and the decline of amphibians and reptiles in Europe",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Biogeography",
    abstract = "Resumo Objetivo: Exploramos a relação entre as distribuições atuais de espécies de anfíbios e répteis na Europa e o clima observado, e projetamos as distribuições potenciais das espécies para o futuro. Os impactos potenciais do aquecimento climático são avaliados quantificando a magnitude e a direção das mudanças de distribuição modeladas para cada espécie. Em particular, perguntamos, primeiro, que proporção de espécies de anfíbios e répteis é projetada perder e ganhar espaço climático adequado no futuro? Em segundo lugar, as projeções das espécies variam de acordo com propriedades taxonômicas, espaciais ou ambientais? E, em terceiro lugar, quais fatores climáticos podem estar impulsionando as projeções de perda ou ganho de ambientes adequados para as espécies? Localização: Europa. Métodos: As distribuições das espécies são modeladas com quatro técnicas de envoltório espécie-clima (redes neurais artificiais, modelos lineares generalizados, modelos aditivos generalizados e análises de árvores de classificação) e as distribuições são projetadas para o futuro usando cinco cenários de mudança climática para 2050. As projeções futuras são feitas considerando duas suposições extremas: as espécies têm capacidade de dispersão ilimitada e as espécies não têm capacidade de dispersão. Em seguida, é utilizada uma abordagem híbrida inovadora para combinar conjuntos de previsões, agrupando projeções linearmente covariantes em clusters com variabilidade inter-modelo reduzida. Resultados: Mostramos que uma grande proporção de espécies de anfíbios e répteis é projetada expandir suas distribuições se a dispersão for ilimitada. Isso ocorre porque o aquecimento nas faunas setentrionais mais frias das espécies cria novas oportunidades de colonização. Se as espécies não forem capazes de dispersar, então a maioria das espécies é projetada perder seu alcance. A perda de espaço climático adequado para as espécies é projetada ocorrer principalmente no sudoeste da Europa, incluindo a Península Ibérica, enquanto as espécies no sudeste são projetadas ganhar clima adequado. Isso ocorre porque as condições secas no sudoeste são projetadas aumentar, aproximando-se dos níveis encontrados no Norte da África, onde poucas espécies de anfíbios são capazes de persistir. Conclusões principais: O impacto do aumento das temperaturas nas espécies de anfíbios e répteis pode ser menos deletério do que anteriormente postulado; de fato, o resfriamento climático seria mais deletério para a persistência de espécies de anfíbios e répteis do que o aquecimento. A capacidade das espécies de lidar com o aquecimento climático pode, no entanto, ser compensada por projeções de diminuição na disponibilidade de água. Isso deve ser particularmente verdadeiro para anfíbios. A capacidade limitada de dispersão pode aumentar ainda mais a vulnerabilidade de anfíbios e répteis às mudanças climáticas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2699.2006.01482.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2699.2006.01482.x",
    openalex = "W2105635509",
    references = "doi101046j14724642200300016x, doi101046j15231739199408010060x, doi101111j13669516200500143x"
}

Abstract A base de evidências da classificação atualmente aceita de anfíbios vivos é discutida e demonstrada como não justificando o grau de autoridade conferido a ela pelo uso e tradição. Propõe-se uma nova taxonomia de anfíbios vivos para corrigir as deficiências da antiga. Esta nova taxonomia baseia-se na maior análise filogenética de Anfíbios vivos realizada até o momento. Combinamos as evidências de caracteres anatômicos comparativos de Haas (2003) com sequências de DNA da unidade transcrita mitocondrial H1 (genes de RNA ribossômico 12S e 16S e tRNAValine, ≈ 2.400 pb de sequências mitocondriais) e os genes nucleares histona H3, rodopsina, tirosinase e seven in absentia, e o grande subunidade ribossômica 28S (≈ 2.300 pb de sequências nucleares; ca. 1,8 milhão de pares de bases; x̄ = 3,7 kb/terminal). O conjunto de dados inclui 532 terminais amostrados de 522 espécies representativas da diversidade global de anfíbios, bem como sete dos parentes vivos mais próximos de anfíbios para comparações de grupo externo. O propósito principal da nossa estratégia de amostragem de táxons foi fornecer testes robustos da monofilia de todos os táxons do "grupo familiar". Todas as famílias e subfamílias nominais atualmente reconhecidas foram amostradas, com exceção de Protohynobiinae (Hynobiidae). Muitos dos gêneros atualmente reconhecidos também foram amostrados. Embora discutamos a monofilia de gêneros e forneçamos remédios para não-monofilia onde possível, também fazemos recomendações para pesquisas futuras. Uma análise de parcimônia foi realizada sob Direta Otimização, que simultaneamente otimiza a homologia de nucleotídeos (alinhamento) e custos de árvores, usando o mesmo conjunto de pressupostos ao longo da análise. Vários algoritmos de busca foram executados no programa POY ao longo de um período de sete meses de tempo de computação no Cluster de Computação Paralela do AMNH. Os resultados demonstram que os seguintes grupos taxonômicos principais, conforme atualmente reconhecidos, são não-monofílicos: Ichthyophiidae (parafílico em relação a Uraeotyphlidae), Caeciliidae (parafílico em relação a Typhlonectidae e Scolecomorphidae), Salamandroidea (parafílico em relação a Sirenidae), Leiopelmatanura (parafílico em relação a Ascaphidae), Discoglossanura (parafílico em relação a Bombinatoridae), Mesobatrachia (parafílico em relação a Neobatrachia), Pipanura (parafílico em relação a Bombinatoridae e Discoglossidae/Alytidae), Hyloidea (no sentido de conter Heleophrynidae; parafílico em relação a Ranoidea), Leptodactylidae (polifílica, com Batrachophrynidae formando o táxon irmão de Myobatrachidae + Limnodynastidae, e amplamente parafílico em relação a Hemiphractinae, Rhinodermatidae, Hylidae, Allophrynidae, Centrolenidae, Brachycephalidae, Dendrobatidae e Bufonidae), Microhylidae (polifílica, com Brevicipitinae sendo o táxon irmão de Hemisotidae), Microhylinae (poli/parafílica em relação aos microhílidos não-brevicipitinos restantes), Hyperoliidae (para/polifílica, com Leptopelinae formando o táxon irmão de Arthroleptidae + Astylosternidae), Astylosternidae (parafílico em relação a Arthroleptinae), Ranidae (parafílico em relação a Rhacophoridae e Mantellidae). Além disso, muitos táxons subsidiários são demonstrados como não-monofílicos, tais como (1) Eleutherodactylus em relação a Brachycephalus; (2) Rana (sensu Dubois, 1992), que é polifílica, com vários elementos ficando muito distantes uns dos outros na árvore; e (3) Bufo, em relação a vários gêneros bufonídeos nominais. Propõe-se uma nova taxonomia de anfíbios vivos, e as evidências para isso são apresentadas para promover investigações futuras e aquisição de dados relacionados à história evolutiva dos anfíbios. A taxonomia fornecida é consistente com o Código Internacional de Nomenclatura Zoológica (ICZN, 1999). As características salientes da nova taxonomia são (1) os três grupos principais de anfíbios vivos, cecilianos/Gymnophiona, salamandras/Caudata e sapos/Anura, formam um grupo monofilético, ao qual restringimos o nome Amphibia; (2) Gymnophiona forma o táxon irmão de Batrachia (salamandras + sapos) e é composto por dois grupos, Rhinatrematidae e Stegokrotaphia; (3) Stegokrotaphia é composto por duas famílias, Ichthyophiidae (incluindo Uraeotyphlidae) e Caeciliidae (incluindo Scolecomorphidae e Typhlonectidae, que são consideradas subfamílias); (4) Batrachia é um grupo monofilético altamente corroborado, composto por dois táxons, Caudata (salamandras) e Anura (sapos); (5) Caudata é composto por dois táxons, Cryptobranchoidei (Cryptobranchidae e Hynobiidae) e Diadectosalamandroidei novo táxon (todas as outras salamandras); (6) Diadectosalamandroidei é composto por dois táxons, Hydatinosalamandroidei novo táxon (composto por Perennibranchia e Treptobranchia novo táxon) e Plethosalamandroidei novo táxon; (7) Perennibranchia é composto por Proteidae e Sirenidae; (8) Treptobranchia novo táxon é composto por dois táxons, Ambystomatidae (incluindo Dicamptodontidae) e Salamandridae; (9) Plethosalamandroidei novo táxon é composto por Rhyacotritonidae e Xenosalamandroidei novo táxon; (10) Xenosalamandroidei é composto por Plethodontidae e Amphiumidae; (11) Anura é monofilético e composto por dois clados, Leiopelmatidae (incluindo Ascaphidae) e Lalagobatrachia novo táxon (todas as outras rãs); (12) Lalagobatrachia é composto por dois clados, Xenoanura (Pipidae e Rhinophrynidae) e Sokolanura novo táxon (todos os outros lalagobatrachianos); (13) Bombinatoridae e Alytidae (antiga Discoglossidae) são parentes mais próximos uns dos outros e em um clado chamado Costata, que, excluindo Leiopelmatidae e Xenoanura, forma o táxon irmão de todas as outras rãs, Acosmanura; (14) Acosmanura é composto por dois clados, Anomocoela (= Pelobatoidea de outros autores) e Neobatrachia; (15) Anomocoela contém Pelobatoidea (Pelobatidae e Megophryidae) e Pelodytoidea (Pelodytidae e Scaphiopodidae), e forma o táxon irmão de Neobatrachia, formando juntos Acosmanura; (16) Neobatrachia é composto por doisclados, Heleophrynidae, e todos os neobatrachianos, Phthanobatrachia novo táxon; (17) Phthanobatrachia é composto por duas unidades principais, Hyloides e Ranoides; (18) Hyloides compreende Sooglossidae (incluindo Nasikabatrachidae) e Notogaeanura novo táxon (os restantes hiloideos); (19) Notogaeanura contém dois táxons, Australobatrachia novo táxon e Nobleobatrachia novo táxon; (20) Australobatrachia é um clado composto por Batrachophrynidae e seu táxon irmão, Myobatrachoidea (Myobatrachidae e Limnodynastidae), que forma o táxon irmão de todos os outros hiloideos, excluindo os sooglósidos; (21) Nobleobatrachia novo táxon, é dominado em sua base por sapos de um morfotipo de sapo-arbóreo, vários com cartilagens falangeais intercalares—Hemiphractus (Hemiphractidae) forma o táxon irmão dos membros restantes deste grupo, aqui denominado Meridianura novo táxon; (22) Meridianura compreende Brachycephalidae (antiga Eleutherodactylinae + Brachycephalus) e Cladophrynia novo táxon; (23) Cladophrynia é composta por dois grupos, Cryptobatrachidae (composto por Cryptobatrachus e Stefania, anteriormente um fragmento da polifilética Hemiphractinae) e Tinctanura novo táxon; (24) Tinctanura é composta por Amphignathodontidae (Gastrotheca e Flectonotus, outro fragmento da polifilética Hemiphractinae) e Athesphatanura novo táxon; (25) Athesphatanura é composta por Hylidae (Hylinae, Pelodryadinae, e Phyllomedusinae, e excluindo a antiga Hemiphractinae, cuja inclusão teria tornado este táxon polifilético) e Leptodactyliformes novo táxon; (26) Leptodactyliformes é composto por Diphyabatrachia novo táxon (composto por Centrolenidae [incluindo Allophryne] e Leptodactylidae, sensu stricto, incluindo Leptodactylus e parentes) e Chthonobatrachia novo táxon; (27) Chthonobatrachia é composto por uma reformulação de Ceratophrynidae (que exclui gêneros como Odontophrynus e Proceratophrys e inclui outros táxons, como Telmatobius) e Hesticobatrachia novo táxon; (28) Hesticobatrachia é composta por uma reformulação de Cycloramphidae (que inclui Rhinoderma) e Agastorophrynia novo táxon; (29) Agastorophrynia é composta por Bufonidae (que é parcialmente revisado) e Dendrobatoidea (Dendrobatidae e Thoropidae); (30) Ranoides novo táxon forma o táxon irmão de Hyloides e é composto por dois componentes monofiléticos principais, Allodapanura novo táxon (microhílidos, hiperolídeos e aliados) e Natatanura novo táxon (ranídeos e aliados); (31) Allodapanura é composto por Microhylidae (que é parcialmente revisado) e Afrobatrachia novo táxon; (32) Afrobatrachia é composto por Xenosyneunitanura novo táxon (os "companheiros estranhos" Brevicipitidae [anteriormente em Microhylidae] e Hemisotidae) e um grupo de sapos que parece mais normal, Laurentobatrachia novo táxon (Hyperoliidae e Arthroleptidae, que inclui Leptopelinae e a antiga Astylosternidae); (33) Natatanura novo táxon é composto por dois táxons, a africana Ptychadenidae e a mundial Victoranura novo táxon; (34) Victoranura é composta por Ceratobatrachidae e Telmatobatrachia novo táxon; (35) Telmatobatrachia é composta por Micrixalidae e um grupo mundial de ranóides, Ametrobatrachia novo táxon; (36) Ametrobatrachia é composto por Africanura novo táxon e Saukrobatrachia novo táxon; (37) Africanura é composto por dois táxons: Phrynobatrachidae (Phrynobatrachus, incluindo Dimorphognathus e Phrynodon como sinônimos) e Pyxicephaloidea; (38) Pyxicephaloidea é composta por Petropedetidae (Conraua, Indirana, Arthroleptides, e Petropedetes), e Pyxicephalidae (incluindo uma série de gêneros africanos, e.g. Amietia [incluindo Afrana], Arthroleptella, Pyxicephalus, Strongylopus, e Tomopterna); e (39) Saukrobatrachia novo táxon é o táxon irmão de Africanura e é composto por Dicroglossidae e Aglaioanura novo táxon, que, por sua vez, é composto por Rhacophoroidea (Mantellidae e Rhacophoridae) e Ranoidea (Nyctibatrachidae e Ranidae, sensu stricto). Muitas revisões gênicas são feitas tanto para tornar um monofilético

@article{doi1012060003009020062970001tatol20co2,
    author = "Frost, Darrel R. and Grant, Taran and Faivovich, Julián and Bain, Raoul H. and Haas, Alexander and Haddad, Célio F. B. and de Sá, Rafael O. and Channing, Alan and Wilkinson, Mark and Donnellan, Stephen C. and Raxworthy, Christopher J. and Campbell, Jonathan A. and Blotto, Boris L. and Moler, Paul E. and Drewes, Robert C. and Nussbaum, Ronald A. and Lynch, John D. and Green, David M. and Wheeler, Ward C.",
    title = "THE AMPHIBIAN TREE OF LIFE",
    year = "2006",
    journal = "Bulletin of the American Museum of Natural History",
    abstract = "Abstract The evidentiary basis of the currently accepted classification of living amphibians is discussed and shown not to warrant the degree of authority conferred on it by use and tradition. A new taxonomy of living amphibians is proposed to correct the deficiencies of the old one. This new taxonomy is based on the largest phylogenetic analysis of living Amphibia so far accomplished. We combined the comparative anatomical character evidence of Haas (2003) with DNA sequences from the mitochondrial transcription unit H1 (12S and 16S ribosomal RNA and tRNAValine genes, ≈ 2,400 bp of mitochondrial sequences) and the nuclear genes histone H3, rhodopsin, tyrosinase, and seven in absentia, and the large ribosomal subunit 28S (≈ 2,300 bp of nuclear sequences; ca. 1.8 million base pairs; x̄ = 3.7 kb/terminal). The dataset includes 532 terminals sampled from 522 species representative of the global diversity of amphibians as well as seven of the closest living relatives of amphibians for outgroup comparisons. The primary purpose of our taxon sampling strategy was to provide strong tests of the monophyly of all “family-group” taxa. All currently recognized nominal families and subfamilies were sampled, with the exception of Protohynobiinae (Hynobiidae). Many of the currently recognized genera were also sampled. Although we discuss the monophyly of genera, and provide remedies for nonmonophyly where possible, we also make recommendations for future research. A parsimony analysis was performed under Direct Optimization, which simultaneously optimizes nucleotide homology (alignment) and tree costs, using the same set of assumptions throughout the analysis. Multiple search algorithms were run in the program POY over a period of seven months of computing time on the AMNH Parallel Computing Cluster. Results demonstrate that the following major taxonomic groups, as currently recognized, are nonmonophyletic: Ichthyophiidae (paraphyletic with respect to Uraeotyphlidae), Caeciliidae (paraphyletic with respect to Typhlonectidae and Scolecomorphidae), Salamandroidea (paraphyletic with respect to Sirenidae), Leiopelmatanura (paraphyletic with respect to Ascaphidae), Discoglossanura (paraphyletic with respect to Bombinatoridae), Mesobatrachia (paraphyletic with respect to Neobatrachia), Pipanura (paraphyletic with respect to Bombinatoridae and Discoglossidae/Alytidae), Hyloidea (in the sense of containing Heleophrynidae; paraphyletic with respect to Ranoidea), Leptodactylidae (polyphyletic, with Batrachophrynidae forming the sister taxon of Myobatrachidae + Limnodynastidae, and broadly paraphyletic with respect to Hemiphractinae, Rhinodermatidae, Hylidae, Allophrynidae, Centrolenidae, Brachycephalidae, Dendrobatidae, and Bufonidae), Microhylidae (polyphyletic, with Brevicipitinae being the sister taxon of Hemisotidae), Microhylinae (poly/paraphyletic with respect to the remaining non-brevicipitine microhylids), Hyperoliidae (para/polyphyletic, with Leptopelinae forming the sister taxon of Arthroleptidae + Astylosternidae), Astylosternidae (paraphyletic with respect to Arthroleptinae), Ranidae (paraphyletic with respect to Rhacophoridae and Mantellidae). In addition, many subsidiary taxa are demonstrated to be nonmonophyletic, such as (1) Eleutherodactylus with respect to Brachycephalus; (2) Rana (sensu Dubois, 1992), which is polyphyletic, with various elements falling far from each other on the tree; and (3) Bufo, with respect to several nominal bufonid genera. A new taxonomy of living amphibians is proposed, and the evidence for this is presented to promote further investigation and data acquisition bearing on the evolutionary history of amphibians. The taxonomy provided is consistent with the International Code of Zoological Nomenclature (ICZN, 1999). Salient features of the new taxonomy are (1) the three major groups of living amphibians, caecilians/Gymnophiona, salamanders/Caudata, and frogs/Anura, form a monophyletic group, to which we restrict the name Amphibia; (2) Gymnophiona forms the sister taxon of Batrachia (salamanders + frogs) and is composed of two groups, Rhinatrematidae and Stegokrotaphia; (3) Stegokrotaphia is composed of two families, Ichthyophiidae (including Uraeotyphlidae) and Caeciliidae (including Scolecomorphidae and Typhlonectidae, which are regarded as subfamilies); (4) Batrachia is a highly corroborated monophyletic group, composed of two taxa, Caudata (salamanders) and Anura (frogs); (5) Caudata is composed of two taxa, Cryptobranchoidei (Cryptobranchidae and Hynobiidae) and Diadectosalamandroidei new taxon (all other salamanders); (6) Diadectosalamandroidei is composed of two taxa, Hydatinosalamandroidei new taxon (composed of Perennibranchia and Treptobranchia new taxon) and Plethosalamandroidei new taxon; (7) Perennibranchia is composed of Proteidae and Sirenidae; (8) Treptobranchia new taxon is composed of two taxa, Ambystomatidae (including Dicamptodontidae) and Salamandridae; (9) Plethosalamandroidei new taxon is composed of Rhyacotritonidae and Xenosalamandroidei new taxon; (10) Xenosalamandroidei is composed of Plethodontidae and Amphiumidae; (11) Anura is monophyletic and composed of two clades, Leiopelmatidae (including Ascaphidae) and Lalagobatrachia new taxon (all other frogs); (12) Lalagobatrachia is composed of two clades, Xenoanura (Pipidae and Rhinophrynidae) and Sokolanura new taxon (all other lalagobatrachians); (13) Bombinatoridae and Alytidae (former Discoglossidae) are each others' closest relatives and in a clade called Costata, which, excluding Leiopelmatidae and Xenoanura, forms the sister taxon of all other frogs, Acosmanura; (14) Acosmanura is composed of two clades, Anomocoela (= Pelobatoidea of other authors) and Neobatrachia; (15) Anomocoela contains Pelobatoidea (Pelobatidae and Megophryidae) and Pelodytoidea (Pelodytidae and Scaphiopodidae), and forms the sister taxon of Neobatrachia, together forming Acosmanura; (16) Neobatrachia is composed of two clades, Heleophrynidae, and all other neobatrachians, Phthanobatrachia new taxon; (17) Phthanobatrachia is composed of two major units, Hyloides and Ranoides; (18) Hyloides comprises Sooglossidae (including Nasikabatrachidae) and Notogaeanura new taxon (the remaining hyloids); (19) Notogaeanura contains two taxa, Australobatrachia new taxon and Nobleobatrachia new taxon; (20) Australobatrachia is a clade composed of Batrachophrynidae and its sister taxon, Myobatrachoidea (Myobatrachidae and Limnodynastidae), which forms the sister taxon of all other hyloids, excluding sooglossids; (21) Nobleobatrachia new taxon, is dominated at its base by frogs of a treefrog morphotype, several with intercalary phalangeal cartilages—Hemiphractus (Hemiphractidae) forms the sister taxon of the remaining members of this group, here termed Meridianura new taxon; (22) Meridianura comprises Brachycephalidae (former Eleutherodactylinae + Brachycephalus) and Cladophrynia new taxon; (23) Cladophrynia is composed of two groups, Cryptobatrachidae (composed of Cryptobatrachus and Stefania, previously a fragment of the polyphyletic Hemiphractinae) and Tinctanura new taxon; (24) Tinctanura is composed of Amphignathodontidae (Gastrotheca and Flectonotus, another fragment of the polyphyletic Hemiphractinae) and Athesphatanura new taxon; (25) Athesphatanura is composed of Hylidae (Hylinae, Pelodryadinae, and Phyllomedusinae, and excluding former Hemiphractinae, whose inclusion would have rendered this taxon polyphyletic) and Leptodactyliformes new taxon; (26) Leptodactyliformes is composed of Diphyabatrachia new taxon (composed of Centrolenidae [including Allophryne] and Leptodactylidae, sensu stricto, including Leptodactylus and relatives) and Chthonobatrachia new taxon; (27) Chthonobatrachia is composed of a reformulated Ceratophryidae (which excludes such genera as Odontophrynus and Proceratophrys and includes other taxa, such as Telmatobius) and Hesticobatrachia new taxon; (28) Hesticobatrachia is composed of a reformulated Cycloramphidae (which includes Rhinoderma) and Agastorophrynia new taxon; (29) Agastorophrynia is composed of Bufonidae (which is partially revised) and Dendrobatoidea (Dendrobatidae and Thoropidae); (30) Ranoides new taxon forms the sister taxon of Hyloides and is composed of two major monophyletic components, Allodapanura new taxon (microhylids, hyperoliids, and allies) and Natatanura new taxon (ranids and allies); (31) Allodapanura is composed of Microhylidae (which is partially revised) and Afrobatrachia new taxon; (32) Afrobatrachia is composed of Xenosyneunitanura new taxon (the “strange-bedfellows” Brevicipitidae [formerly in Microhylidae] and Hemisotidae) and a more normal-looking group of frogs, Laurentobatrachia new taxon (Hyperoliidae and Arthroleptidae, which includes Leptopelinae and former Astylosternidae); (33) Natatanura new taxon is composed of two taxa, the African Ptychadenidae and the worldwide Victoranura new taxon; (34) Victoranura is composed of Ceratobatrachidae and Telmatobatrachia new taxon; (35) Telmatobatrachia is composed of Micrixalidae and a worldwide group of ranoids, Ametrobatrachia new taxon; (36) Ametrobatrachia is composed of Africanura new taxon and Saukrobatrachia new taxon; (37) Africanura is composed of two taxa: Phrynobatrachidae (Phrynobatrachus, including Dimorphognathus and Phrynodon as synonyms) and Pyxicephaloidea; (38) Pyxicephaloidea is composed of Petropedetidae (Conraua, Indirana, Arthroleptides, and Petropedetes), and Pyxicephalidae (including a number of African genera, e.g. Amietia [including Afrana], Arthroleptella, Pyxicephalus, Strongylopus, and Tomopterna); and (39) Saukrobatrachia new taxon is the sister taxon of Africanura and is composed of Dicroglossidae and Aglaioanura new taxon, which is, in turn, composed of Rhacophoroidea (Mantellidae and Rhacophoridae) and Ranoidea (Nyctibatrachidae and Ranidae, sensu stricto). Many generic revisions are made either to render a monophyle",
    url = "https://doi.org/10.1206/0003-0090(2006)297[0001:tatol]2.0.co;2",
    doi = "10.1206/0003-0090(2006)297[0001:tatol]2.0.co;2",
    openalex = "W2162229689",
    references = "doi101002jmor1050970203, doi101017s1464793102006103, doi101086417338, doi101093bioinformatics149817, doi101093nar22224673, doi101093nar25244876, doi101093sysbio1811, doi101093sysbio492369, doi101111j109600311988tb00514x, doi101111j109600311994tb00179x, doi101111j109600311999tb00277x, doi101111j109600312002tb00157x, doi101126science1103538, doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1023071466954, doi1023071466987, doi1023072412407, doi1023073243026, doi105281zenodo16435343"
}

Resumo A diversidade conhecida de espécies de sapos venenosos de dardo aumentou de 70 na década de 1960 para 247 atualmente, sem sinais de que a descoberta de novas espécies diminuirá no futuro previsível. Embora esse crescimento no conhecimento da diversidade desse grupo tenha sido acompanhado por investigações detalhadas de muitos aspectos da biologia dos dendrobatídeos, suas relações filogenéticas permanecem pouco compreendidas. Este estudo foi projetado para testar hipóteses de diversificação de dendrobatídeos combinando novas e evidências genotípicas e fenotípicas anteriores em uma análise de evidência total. Sequências de DNA foram amostradas para cinco loci mitocondriais e seis loci nucleares (aproximadamente 6.100 pares de bases [bp]; x¯ = 3.740 bp por terminal; conjunto de dados total composto de aproximadamente 1,55 milhão de bp), e 174 caracteres fenotípicos foram pontuados a partir da morfologia de adultos e larvas, perfis de alcaloides e comportamento. Esses dados foram combinados com sequências de DNA publicadas relevantes. A amostragem do grupo interno (ingroup) direcionou-se para várias espécies anteriormente não amostradas, incluindo Aromobates nocturnus, que foi hipotetizado anteriormente como irmã de todos os outros dendrobatídeos. Espécies não descritas e problemáticas foram amostradas de múltiplas localidades quando possível. O conjunto de dados final consistiu em 414 terminais: 367 terminais do grupo interno de 156 espécies e 47 terminais do grupo externo (outgroup) de 46 espécies. A análise de parcimônia de otimização direta da evidência igualmente ponderada resultou em 25.872 árvores ótimas. Quarenta nós colapsam no consenso estrito, com todo o conflito restrito a terminais conspecíficos. Os dendrobatídeos foram recuperados como monofiléticos, e seu grupo irmão consistiu em Crossodactylus, Hylodes e Megaelosia, reconhecidos aqui como Hylodidae. Entre os táxons do grupo externo, Centrolenidae foi encontrado como o grupo irmão de todos os athesphatanurans exceto Hylidae, Leptodactyidae foi polifilético, Thoropa estava inserido dentro de Cycloramphidae e Ceratophryinae foi parafilético em relação a Telmatobiinae. Entre os dendrobatídeos, a monofilia e o conteúdo de Mannophryne e Phyllobates foram corroborados. Aromobates nocturnus e Colostethus saltuensis foram encontrados inseridos dentro de Nephelobates, e Minyobates foi parafilético e inserido dentro de Dendrobates. Colostethus mostrou-se amplamente não monofilético, com a maioria das espécies caindo em dois clados cis- e trans-Andinos não relacionados. Um clado morfologicamente e comportamentalmente diverso de espécies com processo lingual mediano foi descoberto. À luz dessas descobertas e do crescimento no conhecimento da diversidade desse grande clado ao longo dos últimos 40 anos, propomos uma nova taxonomia monofilética para dendrobatídeos, reconhecendo o clado inclusivo como uma superfamília (Dendrobatoidea) composta por duas famílias (uma das quais é nova), seis subfamílias (três novas) e 16 gêneros (quatro novos). Embora os sapos venenosos não tenham formado um grupo monofilético, as três linhagens venenosas estão todas confinadas à família revisada Dendrobatidae, em conformidade com a aplicação tradicional deste nome. Também propomos mudanças para alcançar uma taxonomia de nível superior monofilética para os táxons do grupo externo athesphatanurans. A análise da evolução de caracteres revelou múltiplas origens de reprodução em fitotelmata, provisão parental de oócitos nutritivos para consumo larval (oofagia larval) e endotrofia. Evidências disponíveis indicam que o transporte de girinos no dorso de sapos-nursas parentais — uma sinapomorfia de dendrobatídeos — é realizado primitivamente por sapos-nursas machos, com três origens independentes de transporte feminino e cinco origens independentes de transporte biparental. O amplexo reprodutivo é melhor explicado como tendo sido perdido no ancestral comum mais recente de Dendrobatoidea, com o amplexo cefálico surgindo independentemente três vezes.

@article{doi1012060003009020062991psodfa20co2,
    author = "Grant, Taran and Frost, Darrel R. and Caldwell, Janalee P. and Gagliardo, Ron and Haddad, Célio F. B. and Kok, Philippe J. R. and Means, D. Bruce and Noonan, Brice P. and Schargel, Walter E. and Wheeler, Ward C.",
    title = "SISTEMÁTICA FILogenÉTICA DE RÃS VENENOSAS DE SETAS E SEUS PARENTES (AMPHIBIA: ATHESPHATANURA: DENDROBATIDAE)",
    year = "2006",
    journal = "Bulletin of the American Museum of Natural History",
    abstract = "Abstract A diversidade conhecida de espécies de rãs venenosas de setas cresceu de 70 na década de 1960 para 247 atualmente, sem sinais de que a descoberta de novas espécies diminuirá no futuro previsível. Embora esse crescimento no conhecimento da diversidade desse grupo tenha sido acompanhado por investigações detalhadas de muitos aspectos da biologia dos dendrobatídeos, suas relações filogenéticas permanecem mal compreendidas. Este estudo foi projetado para testar hipóteses de diversificação de dendrobatídeos combinando novas e evidências genotípicas e fenotípicas anteriores em uma análise de evidência total. Sequências de DNA foram amostradas para cinco loci mitocondriais e seis loci nucleares (aproximadamente 6.100 pares de bases [bp]; x¯ = 3.740 bp por terminal; conjunto de dados total composto de aproximadamente 1,55 milhão de bp), e 174 caracteres fenotípicos foram pontuados a partir da morfologia de adultos e larvas, perfis de alcaloides e comportamento. Esses dados foram combinados com sequências de DNA publicadas relevantes. A amostragem do grupo interno direcionou-se para várias espécies anteriormente não amostradas, incluindo Aromobates nocturnus, que foi hipotetizado anteriormente como a irmã de todos os outros dendrobatídeos. Espécies não descritas e problemáticas foram amostradas de múltiplas localidades quando possível. O conjunto de dados final consistiu em 414 terminais: 367 terminais do grupo interno de 156 espécies e 47 terminais do grupo externo de 46 espécies. A análise de parcimônia de otimização direta da evidência igualmente ponderada resultou em 25.872 árvores ótimas. Quarenta nós colapsam no consenso estrito, com todo o conflito restrito a terminais conspecíficos. Os dendrobatídeos foram recuperados como monofiléticos, e seu grupo irmão consistiu em Crossodactylus, Hylodes e Megaelosia, reconhecidos aqui como Hylodidae. Entre os táxons do grupo externo, Centrolenidae foi encontrado como o grupo irmão de todos os athesphatanuros exceto Hylidae, Leptodactyidae foi polifilético, Thoropa estava inserido dentro de Cycloramphidae e Ceratophryinae foi parafilético em relação a Telmatobiinae. Entre os dendrobatídeos, a monofilia e o conteúdo de Mannophryne e Phyllobates foram corroborados. Aromobates nocturnus e Colostethus saltuensis foram encontrados inseridos dentro de Nephelobates, e Minyobates foi parafilético e inserido dentro de Dendrobates. Colostethus mostrou-se amplamente não monofilético, com a maioria das espécies caindo em dois clados cis- e trans-Andinos não relacionados. Um clado morfologicamente e comportamentalmente diverso de espécies com processo lingual mediano foi descoberto. À luz dessas descobertas e do crescimento no conhecimento da diversidade desse grande clado nos últimos 40 anos, propomos uma nova taxonomia monofilética para dendrobatídeos, reconhecendo o clado inclusivo como uma superfamília (Dendrobatoidea) composta por duas famílias (uma das quais é nova), seis subfamílias (três novas) e 16 gêneros (quatro novos). Embora rãs venenosas não tenham formado um grupo monofilético, as três linhagens venenosas estão todas confinadas à família revisada Dendrobatidae, de acordo com a aplicação tradicional deste nome. Também propomos mudanças para alcançar uma taxonomia de nível superior monofilética para os táxons do grupo externo athesphatanuro. A análise da evolução de caracteres revelou múltiplas origens de reprodução em fitotelmata, provisão parental de oócitos nutritivos para consumo larval (oofagia larval) e endotrofia. Evidências disponíveis indicam que o transporte de girinos no dorso de rãs mães de guarda — uma sinapomorfia de dendrobatídeos — é realizado primitivamente por rãs mães de guarda machos, com três origens independentes de transporte feminino e cinco origens independentes de transporte biparental. O amplexo reprodutivo é melhor explicado como tendo sido perdido no ancestral comum mais recente de Dendrobatoidea, com amplexo cefálico surgindo independentemente três vezes.",
    url = "https://doi.org/10.1206/0003-0090(2006)299[1:psodfa]2.0.co;2",
    doi = "10.1206/0003-0090(2006)299[1:psodfa]2.0.co;2",
    openalex = "W2175103997",
    references = "doi101016jwatres2020115687, doi101073pnas86166196, doi101086273307, doi101086417338, doi101093nar22224673, doi101093nar25244876, doi101111j109600311989tb00573x, doi101111j109600311994tb00179x, doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1014601phytopatholmediterr14998u129, doi1023071466954, doi1023071466987, doi1023072412407, dunlap1960the"
}

Populações de anfíbios estão em declínio globalmente a uma taxa alarmante. Os pesticidas estão entre várias causas propostas para esses declínios. Embora exista uma base de dados considerável que examina os efeitos dos pesticidas sobre os anfíbios, a grande maioria desses estudos foca em efeitos toxicológicos (letalidade, malformações externas, etc.) em doses relativamente altas (partes por milhão). Muito poucos estudos focam em efeitos como a desregulação endócrina em baixas concentrações. Além disso, a maioria dos estudos examina exposições a apenas um químico por vez. O presente estudo examinou nove pesticidas (quatro herbicidas, dois fungicidas e três inseticidas) utilizados em campos de milho no meio-oeste dos Estados Unidos. Foram examinados os efeitos de cada pesticida isoladamente (0,1 ppb) ou em combinação. Além disso, também examinamos a atrazina e o S-metolachlor combinados (0,1 ou 10 ppb cada) e a formulação comercial Bicep II Magnum, que contém ambos esses herbicidas. Estes dois pesticidas foram examinados em combinação porque são persistentes durante todo o ano na natureza. Examinamos o crescimento e desenvolvimento larval, diferenciação sexual e função imune em sapos-leopardo (Rana pipiens). Em um estudo de acompanhamento, também examinamos os efeitos da mistura de nove compostos nos níveis de corticosterona plasmática em machos de sapos-palmistas africanos (Xenopus laevis). Embora alguns dos pesticidas individualmente inibissem o crescimento e desenvolvimento larval, as misturas de pesticidas tiveram efeitos muito maiores. O crescimento e desenvolvimento larval foram retardados, mas, mais significativamente, as misturas de pesticidas anularam ou inverteram a correlação tipicamente positiva entre o tempo até a metamorfose e o tamanho na metamorfose observada nos controles: larvas expostas que demoraram mais para metamorfosear foram menores do que suas contrapartes que metamorfosearam mais cedo. A mistura de nove pesticidas também induziu danos ao timo, resultando em imunossupressão e contração de meningite flavobacteriana. O estudo em X. laevis revelou que esses efeitos adversos podem ser devidos a um aumento nos níveis plasmáticos do hormônio do estresse corticosterona. Embora não possa ser determinado se todos os pesticidas na mistura contribuem para esses efeitos adversos ou se alguns pesticidas são efetores, alguns são potenciadores e alguns são neutros, o presente estudo revelou que estimar o risco ecológico e o impacto dos pesticidas sobre os anfíbios usando estudos que examinam apenas pesticidas únicos em altas concentrações pode levar a subestimativas grosseiras do papel dos pesticidas nos declínios de anfíbios.

@article{doi101289ehp8051,
    author = "Hayes, Tyrone B. e Case, Paola e Chui, Sarah e Chung, Duc e Haeffele, Cathryn e Haston, Kelly e Lee, Melissa e Phoung, Vien e Marjuoa, Youssra e Parker, John M. e Tsui, Mable",
    title = "Misturas de Pesticidas, Desregulação Endócrina e Declínios de Anfíbios: Estamos Subestimando o Impacto?",
    year = "2006",
    journal = "Environmental Health Perspectives",
    abstract = "Populações de anfíbios estão em declínio globalmente a uma taxa alarmante. Os pesticidas estão entre várias causas propostas para esses declínios. Embora exista uma base de dados considerável que examina os efeitos dos pesticidas sobre os anfíbios, a grande maioria desses estudos foca em efeitos toxicológicos (letalidade, malformações externas, etc.) em doses relativamente altas (partes por milhão). Muito poucos estudos focam em efeitos como a desregulação endócrina em baixas concentrações. Além disso, a maioria dos estudos examina exposições a apenas um químico por vez. O presente estudo examinou nove pesticidas (quatro herbicidas, dois fungicidas e três inseticidas) utilizados em campos de milho no meio-oeste dos Estados Unidos. Foram examinados os efeitos de cada pesticida isoladamente (0,1 ppb) ou em combinação. Além disso, também examinamos a atrazina e o S-metolachlor combinados (0,1 ou 10 ppb cada) e a formulação comercial Bicep II Magnum, que contém ambos esses herbicidas. Estes dois pesticidas foram examinados em combinação porque são persistentes durante todo o ano na natureza. Examinamos o crescimento e desenvolvimento larval, diferenciação sexual e função imune em sapos-leopardo (Rana pipiens). Em um estudo de acompanhamento, também examinamos os efeitos da mistura de nove compostos nos níveis de corticosterona plasmática em machos de sapos-palmistas africanos (Xenopus laevis). Embora alguns dos pesticidas individualmente inibissem o crescimento e desenvolvimento larval, as misturas de pesticidas tiveram efeitos muito maiores. O crescimento e desenvolvimento larval foram retardados, mas, mais significativamente, as misturas de pesticidas anularam ou inverteram a correlação tipicamente positiva entre o tempo até a metamorfose e o tamanho na metamorfose observada nos controles: larvas expostas que demoraram mais para metamorfosear foram menores do que suas contrapartes que metamorfosearam mais cedo. A mistura de nove pesticidas também induziu danos ao timo, resultando em imunossupressão e contração de meningite flavobacteriana. O estudo em X. laevis revelou que esses efeitos adversos podem ser devidos a um aumento nos níveis plasmáticos do hormônio do estresse corticosterona. Embora não possa ser determinado se todos os pesticidas na mistura contribuem para esses efeitos adversos ou se alguns pesticidas são efetores, alguns são potenciadores e alguns são neutros, o presente estudo revelou que estimar o risco ecológico e o impacto dos pesticidas sobre os anfíbios usando estudos que examinam apenas pesticidas únicos em altas concentrações pode levar a subestimativas grosseiras do papel dos pesticidas nos declínios de anfíbios.",
    url = "https://doi.org/10.1289/ehp.8051",
    doi = "10.1289/ehp.8051",
    openalex = "W2063737179",
    references = "doi103201eid1012030804"
}

Estudos recentes sugerem que a incidência de anomalias morfológicas aumentou em muitas populações de anfíbios, frequentemente excedendo a frequência de deformidades de fundo estimada de 0–5%. Muitos contaminantes químicos, incluindo agroquímicos, podem causar anomalias em anfíbios, mas os dados sobre a ocorrência de anomalias morfológicas em populações de anfíbios selvagens na Europa são, no melhor dos casos, anedóticos. Em um estudo em grande escala abrangendo 264 ha e 26 populações de reprodução em terras agrícolas da Rã comum (Rana temporaria) no sul da Finlândia, investigamos se a incidência de anomalias morfológicas em metamorfos diferia do nível de fundo de 0–5% e entre populações ao longo de um gradiente de agroquímicos. As anomalias ocorreram em uma baixa frequência (1% dos indivíduos estudados; 40/4115), sendo a frequência específica da população mais alta de 4%. Não encontramos evidências de aumento nas frequências de anomalias nos habitats mais provavelmente expostos a agroquímicos. Portanto, os dados sugerem que as práticas atuais de agroquímicos na Finlândia não estão causando aumentos na incidência de anomalias morfológicas em populações de rãs comuns que se reproduzem em áreas de terras agrícolas.

@article{doi1016430045851120066810maiaia20co2,
    author = "Piha, Henna e Pekkonen, Minna e Merilä, Juha",
    title = "Anomalias Morfológicas em Anfíbios em Habitats Agrícolas: Um Estudo de Caso da Rã Comum Rana Temporaria",
    year = "2006",
    journal = "Copeia",
    abstract = "Estudos recentes sugerem que a incidência de anomalias morfológicas aumentou em muitas populações de anfíbios, frequentemente excedendo a frequência de deformidades de fundo estimada de 0–5\%. Muitos contaminantes químicos, incluindo agroquímicos, podem causar anomalias em anfíbios, mas os dados sobre a ocorrência de anomalias morfológicas em populações de anfíbios selvagens na Europa são, no melhor dos casos, anedóticos. Em um estudo em grande escala abrangendo 264 ha e 26 populações de reprodução em terras agrícolas da Rã comum (Rana temporaria) no sul da Finlândia, investigamos se a incidência de anomalias morfológicas em metamorfos diferia do nível de fundo de 0–5\% e entre populações ao longo de um gradiente de agroquímicos. As anomalias ocorreram em uma baixa frequência (1\% dos indivíduos estudados; 40/4115), sendo a frequência específica da população mais alta de 4\%. Não encontramos evidências de aumento nas frequências de anomalias nos habitats mais provavelmente expostos a agroquímicos. Portanto, os dados sugerem que as práticas atuais de agroquímicos na Finlândia não estão causando aumentos na incidência de anomalias morfológicas em populações de rãs comuns que se reproduzem em áreas de terras agrícolas.",
    url = "https://doi.org/10.1643/0045-8511(2006)6[810:maiaia]2.0.co;2",
    doi = "10.1643/0045-8511(2006)6[810:maiaia]2.0.co;2",
    openalex = "W2041886386"
}

@article{doi101007s1075000790322,
    author = "Vences, Miguel e Köhler, Jörn",
    title = "Diversidade global de anfíbios (Amphibia) em água doce",
    year = "2007",
    journal = "Hydrobiologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10750-007-9032-2",
    doi = "10.1007/s10750-007-9032-2",
    openalex = "W2148137316",
    references = "doi101038nature04246, doi101046j14724642200300016x, doi101046j15231739199408010060x, doi101126science1103538, doi1011861742999425, doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi102307jctv1nzfgj7, doi10560219780801847806, doi105860choice375647"
}

@misc{crossref2008amphibianstoads,
    title = "Anfíbios—Rãs, Sapos, Salamandras e Tritões (Classe: Amphibia)",
    year = "2008",
    booktitle = "Toxicologia Médica de Substâncias Naturais",
    url = "https://doi.org/10.1002/9780470330319.ch174",
    doi = "10.1002/9780470330319.ch174",
    openalex = "W1508227859",
    pages = "996-1007",
    references = "doi101002jps2600561202, doi1010160040816679900296, doi1010160041010187902650, doi1010160041010194900817, doi1010160378874194900515, doi101016s0031699725071583, doi101016s0041010102001150, doi101073pnas200346897, doi101081txr100103081, doi101136heart894e14"
}

@incollection{doi101007978140208259754,
    author = "Vences, Miguel e Köhler, Jörn",
    title = "Diversidade global de anfíbios (Amphibia) em água doce",
    year = "2008",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4020-8259-7\_54",
    doi = "10.1007/978-1-4020-8259-7\_54",
    openalex = "W4206543438",
    references = "doi101038nature04246, doi101046j14724642200300016x, doi101046j15231739199408010060x, doi101098rstb20051717, doi101126science1103538, doi1011861742999425, doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi102307jctv1nzfgj7, doi103201eid1012030804"
}

@article{doi101016jcvex200803006,
    author = "Allender, Matthew C. e Fry, Michael M.",
    title = "Hematologia de Anfíbios",
    year = "2008",
    journal = "Veterinary Clinics of North America Exotic Animal Practice",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cvex.2008.03.006",
    doi = "10.1016/j.cvex.2008.03.006",
    openalex = "W4254693788"
}

@article{doi1011606issn23169079v7i2p149150,
    author = "MacCulloch, Ross D.",
    title = "Anfíbios Ameaçados do Mundo",
    year = "2008",
    journal = "Phyllomedusa Journal of Herpetology",
    url = "https://doi.org/10.11606/issn.2316-9079.v7i2p149-150",
    doi = "10.11606/issn.2316-9079.v7i2p149-150",
    openalex = "W1977745099",
    references = "doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1012060003009020062991psodfa20co2"
}

Os anfíbios estão em declínio em todo o mundo. No entanto, seus padrões de diversidade, especialmente nos trópicos, não são bem compreendidos, principalmente devido à informação incompleta sobre taxonomia e distribuição. Avaliamos a variação morfológica, bioacústica e genética dos anfíbios de Madagascar, uma das primeiras amostragens quase completas de táxons de um hotspot de biodiversidade. Com base em sequências de DNA de 2.850 espécimes amostrados de mais de 170 localidades, nossas análises revelam uma proporção extrema de diversidade de anfíbios, projetando um aumento quase duas vezes maior no número de espécies, indo das 244 espécies atualmente descritas para um mínimo de 373 e até 465. Essa diversidade é amplamente distribuída geograficamente e através da maioria das principais linhagens filogenéticas, exceto em alguns gêneros previamente bem estudados, e não está restrita a clados morfologicamente crípticos. Classificamos as linhagens genealógicas em espécies candidatas confirmadas e não confirmadas ou linhagens conspecíficas profundamente divergentes com base na concordância das divergências genéticas com outros caracteres. Essa abordagem integrativa pode ser amplamente aplicável para melhorar as estimativas da diversidade de organismos. Nossos resultados sugerem que em Madagascar o padrão espacial da riqueza e endemismo de anfíbios deve ser revisitado, e a destruição atual de habitat pode estar afetando mais espécies do que se pensava anteriormente, tanto em anfíbios quanto em outros grupos animais. Este estudo de caso sugere que a diversidade de anfíbios tropicais em todo o mundo provavelmente é subestimada em um nível sem precedentes e enfatiza a necessidade de levantamentos taxonômicos integrados como base para priorizar esforços de conservação dentro de hotspots de biodiversidade.

@article{doi101073pnas0810821106,
    author = "Vieites, David R. e Valero, Katharina C. Wollenberg e Andreone, Franco e Köhler, Jörn e Glaw, Frank e Vences, Miguel",
    title = "Subestimação massiva da biodiversidade de Madagascar evidenciada por um inventário integrativo de anfíbios",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Os anfíbios estão em declínio em todo o mundo. No entanto, seus padrões de diversidade, especialmente nos trópicos, não são bem compreendidos, principalmente devido à informação incompleta sobre taxonomia e distribuição. Avaliamos a variação morfológica, bioacústica e genética dos anfíbios de Madagascar, uma das primeiras amostragens quase completas de táxons de um hotspot de biodiversidade. Com base em sequências de DNA de 2.850 espécimes amostrados de mais de 170 localidades, nossas análises revelam uma proporção extrema de diversidade de anfíbios, projetando um aumento quase duas vezes maior no número de espécies, indo das 244 espécies atualmente descritas para um mínimo de 373 e até 465. Essa diversidade é amplamente distribuída geograficamente e através da maioria das principais linhagens filogenéticas, exceto em alguns gêneros previamente bem estudados, e não está restrita a clados morfologicamente crípticos. Classificamos as linhagens genealógicas em espécies candidatas confirmadas e não confirmadas ou linhagens conspecíficas profundamente divergentes com base na concordância das divergências genéticas com outros caracteres. Essa abordagem integrativa pode ser amplamente aplicável para melhorar as estimativas da diversidade de organismos. Nossos resultados sugerem que em Madagascar o padrão espacial da riqueza e endemismo de anfíbios deve ser revisitado, e a destruição atual de habitat pode estar afetando mais espécies do que se pensava anteriormente, tanto em anfíbios quanto em outros grupos animais. Este estudo de caso sugere que a diversidade de anfíbios tropicais em todo o mundo provavelmente é subestimada em um nível sem precedentes e enfatiza a necessidade de levantamentos taxonômicos integrados como base para priorizar esforços de conservação dentro de hotspots de biodiversidade.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0810821106",
    doi = "10.1073/pnas.0810821106",
    openalex = "W2046002090",
    references = "doi101098rstb20051717, doi1012060003009020052940001srotff20co2"
}

Muitos anfíbios modernos têm ciclos de vida bifásicos com larvas aquáticas e adultos terrestres. As questões centrais são como e quando essa ontogenia complicada foi estabelecida e o que se sabe sobre as vidas dos anfíbios no Paleozoico. Evidências fósseis acumularam-se que lançam luz sobre as histórias de vida dos primeiros anfíbios, a origem da metamorfose e a transição para uma existência totalmente terrestre. A maioria dos primeiros anfíbios era aquática ou anfíbia e sofreu apenas mudanças ontogenéticas graduais. A plasticidade do desenvolvimento desempenhou um papel importante em alguns táxons, mas foi restrita a modificações menores da ontogenia. Nos dissoróides permo-carboníferos, observa-se uma condensação de etapas ontogenéticas cruciais em uma fase curta (metamorfose). É provável que a origem tanto da metamorfose quanto da neotenia caia dentro desses táxons. As evidências fósseis também revelam a sequência de mudanças evolutivas: aparentemente, a mudança ontogenética na alimentação, não a transição para uma existência terrestre em si, tornou uma metamorfose drástica necessária.

@article{doi101146annurevearth031208100113,
    author = "Schoch, Rainer R.",
    title = "Evolução dos Ciclos de Vida em Anfíbios Antigos",
    year = "2009",
    journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
    abstract = "Muitos anfíbios modernos têm ciclos de vida bifásicos com larvas aquáticas e adultos terrestres. As questões centrais são como e quando essa ontogenia complicada foi estabelecida e o que se sabe sobre as vidas dos anfíbios no Paleozoico. Evidências fósseis acumularam-se que lançam luz sobre as histórias de vida dos primeiros anfíbios, a origem da metamorfose e a transição para uma existência totalmente terrestre. A maioria dos primeiros anfíbios era aquática ou anfíbia e sofreu apenas mudanças ontogenéticas graduais. A plasticidade do desenvolvimento desempenhou um papel importante em alguns táxons, mas foi restrita a modificações menores da ontogenia. Nos dissoróides permo-carboníferos, observa-se uma condensação de etapas ontogenéticas cruciais em uma fase curta (metamorfose). É provável que a origem tanto da metamorfose quanto da neotenia caia dentro desses táxons. As evidências fósseis também revelam a sequência de mudanças evolutivas: aparentemente, a mudança ontogenética na alimentação, não a transição para uma existência terrestre em si, tornou uma metamorfose drástica necessária.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.earth.031208.100113",
    doi = "10.1146/annurev.earth.031208.100113",
    openalex = "W2125472918",
    references = "doi101017s0263593300002340, doi101017s1477201906002008, doi1023072421869, doi105860choice402180, doi105860choice503274"
}

@article{doi101016jympev201106012,
    author = "Pyron, R. Alexander e Wiens, John J.",
    title = "Uma filogenia em grande escala de Anfíbios incluindo mais de 2800 espécies, e uma classificação revisada de sapos, salamandras e cecilianos existentes",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ympev.2011.06.012",
    doi = "10.1016/j.ympev.2011.06.012",
    openalex = "W2129491952",
    references = "doi10108010635150701397635, doi101093sysbiosyr047, doi1012060003009020052940001srotff20co2, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012060003009020062991psodfa20co2, doi10560219780801847806"
}

Duplicação do genoma (levando à poliploidia) é amplamente aceita como uma força evolutiva importante em plantas, mas é menos reconhecida como um motor da diversificação animal. No entanto, ocorre em uma ampla gama de animais; esta revisão investiga por que é particularmente comum em peixes e anfíbios, enquanto é rara entre outros vertebrados. Revisamos as distribuições geográficas, ecológicas e filogenéticas atuais de táxons poliploides que se reproduzem sexualmente antes de nos concentrarmos mais especificamente nos fatores que impulsionam a formação e o estabelecimento da poliploidia. Em resumo, (1) a poliploidia é filogeneticamente restrita tanto em anfíbios quanto em peixes, embora linhagens inteiras de peixes, mas não de anfíbios, sejam derivadas de ancestrais poliploides. (2) Embora mecanismos como a polispermia sejam viáveis, a formação de poliploides parece ocorrer principalmente através da formação de gametas não reduzidos, o que pode ser induzido experimentalmente por choque térmico ou de pressão em ambos os grupos. (3) A reprodução externa e a fecundação em ambientes de água doce predominantemente temperados podem expor os zigotos ao estresse térmico, o que pode promover um aumento na produção de gametas não reduzidos. (4) Grandes números de gametas e reprodução em grupo em áreas relativamente confinadas poderiam aumentar a probabilidade de combinações de gametas compatíveis em ambos os grupos. (5) Tanto peixes quanto anfíbios têm uma propensão a formar híbridos reprodutivamente bem-sucedidos; embora a frequência relativa de autopoliploidia versus alloploidia seja difícil de ascertainment, múltiplas origens envolvendo hibridização foram confirmadas para várias espécies em ambos os grupos. (6) Problemas relacionados ao estabelecimento de linhagens poliploides associados à exclusão de citotipos minoritários poderiam ser superados em anfíbios através do acasalamento assortativo por reconhecimento acústico do mesmo nível de poliploidia, mas menos atenção tem sido dada a mecanismos químicos ou acústicos que poderiam operar em peixes. (7) Não há evidências fortes de que peixes ou anfíbios poliploides atualmente existam em ambientes mais extremos do que seus progenitores diploides ou tenham faunas ecológicas mais amplas. (8) Embora os patógenos possam desempenhar um papel na aptidão relativa de espécies poliploides, particularmente dada a duplicação de genes envolvidos na imunidade, este permanece um campo pouco estudado tanto em peixes quanto em anfíbios. (9) Como nas plantas, muitas cópias duplicadas de genes são mantidas por longos períodos de tempo, indicativo da manutenção seletiva das cópias duplicadas, mas não encontramos razões fisiológicas ou outras que possam explicar uma vantagem para a complexidade alélica ou genética. (10) Espécies poliploides existentes não parecem ser mais ou menos propensas à extinção do que diploides relacionados em nenhum dos grupos. Concluímos que, embora peixes e anfíbios poliploides compartilhem um número de atributos que facilitam a poliploidia, motores claros de duplicação do genoma não emergem da comparação. A falta de uma associação clara de poliploides que se reproduzem sexualmente com expansão de faixa, ambientes hostis ou risco de extinção poderia sugerir que correlações mais fortes em plantas podem ser impulsionadas por mudanças no sistema de acasalamento mais do que pela poliploidia. No entanto, dados insuficientes existem atualmente para fornecer testes rigorosos dessas hipóteses e fazemos um apelo para que zoólogos também considerem a poliploidia como uma possibilidade em levantamentos taxonômicos contínuos.

@article{doi101111j14697998201100829x,
    author = "Mable, Barbara K. and Alexandrou, Markos A. and Taylor, Martin I.",
    title = "Duplicação do genoma em anfíbios e peixes: uma síntese estendida",
    year = "2011",
    journal = "Journal of Zoology",
    abstract = "A duplicação do genoma inteiro (levando à poliploidia) é amplamente aceita como uma força evolutiva importante em plantas, mas é menos reconhecida como um motor da diversificação animal. No entanto, ela ocorre em uma ampla gama de animais; esta revisão investiga por que é particularmente comum em peixes e anfíbios, enquanto é rara entre outros vertebrados. Revisamos as distribuições geográficas, ecológicas e filogenéticas atuais de táxons poliploides que se reproduzem sexualmente antes de nos concentrarmos mais especificamente nos fatores que impulsionam a formação e o estabelecimento da poliploidia. Em resumo, (1) a poliploidia é filogeneticamente restrita tanto em anfíbios quanto em peixes, embora linhagens inteiras de peixes, mas não de anfíbios, sejam derivadas de ancestrais poliploides. (2) Embora mecanismos como a polispermia sejam viáveis, a formação poliploide parece ocorrer principalmente através da formação de gametas não reduzidos, o que pode ser induzido experimentalmente por choque de temperatura ou pressão em ambos os grupos. (3) A reprodução externa e a fecundação em ambientes de água doce predominantemente temperados potencialmente expõem os zigotos ao estresse térmico, o que pode promover um aumento na produção de gametas não reduzidos. (4) Grandes números de gametas e reprodução em grupo em áreas relativamente confinadas poderiam aumentar a probabilidade de combinações de gametas compatíveis em ambos os grupos. (5) Tanto peixes quanto anfíbios têm uma propensão a formar híbridos reprodutivamente bem-sucedidos; embora a frequência relativa de autopoliploidia versus alloploidia seja difícil de determinar, múltiplas origens envolvendo hibridização foram confirmadas para várias espécies em ambos os grupos. (6) Problemas associados ao estabelecimento de linhagens poliploides, relacionados à exclusão de citotipos minoritários, poderiam ser superados em anfíbios através do acasalamento assortativo por reconhecimento acústico do mesmo nível de poliploidia, mas menos atenção tem sido dada a mecanismos químicos ou acústicos que poderiam operar em peixes. (7) Não há evidências fortes de que peixes ou anfíbios poliploides atualmente existam em ambientes mais extremos do que seus progenitores diploides ou tenham faixas ecológicas mais amplas. (8) Embora os patógenos possam desempenhar um papel na aptidão relativa das espécies poliploides, particularmente dada a duplicação de genes envolvidos na imunidade, este permanece um campo pouco estudado tanto em peixes quanto em anfíbios. (9) Assim como em plantas, muitas cópias duplicadas de genes são mantidas por longos períodos, indicando a manutenção seletiva das cópias duplicadas, mas não encontramos razões fisiológicas ou outras que possam explicar uma vantagem para a complexidade alélica ou genética. (10) Espécies poliploides existentes não parecem ser mais ou menos propensas à extinção do que diploides relacionados em nenhum dos grupos. Concluímos que, embora peixes e anfíbios poliploides compartilhem um número de atributos que facilitam a poliploidia, drivers claros da duplicação do genoma não emergem da comparação. A falta de uma associação clara entre poliploides que se reproduzem sexualmente, expansão de faixa, ambientes hostis ou risco de extinção poderia sugerir que correlações mais fortes em plantas podem ser impulsionadas por mudanças no sistema de acasalamento mais do que pela poliploidia. No entanto, dados insuficientes existem atualmente para fornecer testes rigorosos dessas hipóteses e fazemos um apelo para que zoólogos também considerem a poliploidia como uma possibilidade em levantamentos taxonômicos contínuos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-7998.2011.00829.x",
    doi = "10.1111/j.1469-7998.2011.00829.x",
    openalex = "W2120868323",
    references = "doi1010079783642866593, doi101007s1075000790322, doi1010160047248480900779, doi101016jppees201002002, doi10103842711, doi101038nature03025, doi101111j1365294x200703529x, doi101146annurevecolsys291467, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1023071442619, doi10560219780801847806, doi107312steb94536, openalexw1599639077"
}

@article{doi101007s1002101296027,
    author = "Whiles, Matt R. e Hall, Robert O. e Dodds, Walter K. e Verburg, Piet e Huryn, Alexander D. e Pringle, C. M. e Lips, Karen R. e Kilham, S. S. e Colón-Gaud, J. Checo e Rugenski, Amanda T. e Peterson, Sharon e Connelly, Scott",
    title = "Declines de Anfíbios Impulsionados por Doenças Alteram Processos de Ecossistemas em um Rio Tropical",
    year = "2012",
    journal = "Ecosystems",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10021-012-9602-7",
    doi = "10.1007/s10021-012-9602-7",
    openalex = "W1983354498",
    references = "doi101899081181"
}

Propõe-se uma nova abordagem para avaliar a ocorrência de deformidades em anfíbios em populações naturais. Sugere-se separar a ocorrência de fundo e em massa por um nível conveniente de 5 por cento de animais malformados (recomenda-se um tamanho de amostra >100 espécimes). Considera-se um sistema contendo três grupos de parâmetros quantitativos: a) frequência de animais malformados, Pas; b) frequência de anomalias (A), incluindo parciais (Ap) e frequência relativa (Ar); e c) espectro de anomalias (Sa), incluindo diversidade de deformidades individuais (Sai) e populacionais (Sap) em populações naturais e alguns outros parâmetros (μ e h de Zhivotovsky 1980). Também são analisadas algumas medidas de ocorrência combinada de anomalias e sobreposição de anomalias (índices de Morisita e de Czekanovsky–Sorensen). Discutem-se alguns aspectos do trabalho de campo (amostragem, grupos etários, classificação de anomalias, bem como expressão de síndrome de malformações).

@article{doi1031610trudyzin20123164324,
    author = "Borkin, Leo J. e Bezman-Moseyko, Olga S. e Litvinchuk, Spartak N.",
    title = "Avaliação da ocorrência de deformidades animais em populações naturais (um exemplo de anfíbios)",
    year = "2012",
    journal = "Proceedings of the Zoological Institute RAS",
    abstract = "Propõe-se uma nova abordagem para avaliar a ocorrência de deformidades em anfíbios em populações naturais. Sugere-se separar a ocorrência de fundo e em massa por um nível conveniente de 5 por cento de animais malformados (recomenda-se um tamanho de amostra >100 espécimes). Considera-se um sistema contendo três grupos de parâmetros quantitativos: a) frequência de animais malformados, Pas; b) frequência de anomalias (A), incluindo parciais (Ap) e frequência relativa (Ar); e c) espectro de anomalias (Sa), incluindo diversidade de deformidades individuais (Sai) e populacionais (Sap) em populações naturais e alguns outros parâmetros (μ e h de Zhivotovsky 1980). Também são analisadas algumas medidas de ocorrência combinada de anomalias e sobreposição de anomalias (índices de Morisita e de Czekanovsky–Sorensen). Discutem-se alguns aspectos do trabalho de campo (amostragem, grupos etários, classificação de anomalias, bem como expressão de síndrome de malformações).",
    url = "https://doi.org/10.31610/trudyzin/2012.316.4.324",
    doi = "10.31610/trudyzin/2012.316.4.324",
    openalex = "W4295108600",
    references = "doi101086282436, doi101111j15231739200300217x, doi101163157075403323012205, doi1015259780520942530, doi1016430045851120066810maiaia20co2, doi1018901540929520030010087tcoda20co2, doi1018960seitai1162524, doi1023071936817, doi1023074045, doi1075890090355833195, openalexw115311278"
}

As origens dos anfíbios extantes (sapos, salamandras, cecilianos) permanecem controversas após mais de um século de debate. Três grupos de hipóteses persistem na literatura atual: a "hipótese temnospóndila" (TH), que situa Lissamphibia Haeckel, 1866 (o menor clado composto pelos anfíbios extantes) dentro dos temnospóndilos do Paleozóico, a "hipótese lepospóndila" (LH), que postula um Lissamphibia monofilético aninhado dentro dos lepospóndilos do Paleozóico, e a "hipótese de polifilia" (PH), de acordo com a qual os sapos e as salamandras são temnospóndilos, enquanto os cecilianos são lepospóndilos. A descoberta dos albanerpetontídeos do Jurássico Médio ao Plioceno, que são muito semelhantes aos anfíbios extantes, complicou em vez de resolver essa situação. Apresentamos uma revisão de publicações recentes e teses nesta área, várias das quais mostram mais apoio para a LH do que para a TH e consideravelmente mais do que para a PH. Além disso, mostramos que não há atração particular entre lissamfíbios de corpo longo (cecilianos) e lepospóndilos de corpo longo (como os lisorófilos): quando são removidos de duas matrizes publicadas, as reanálises ainda encontram a LH. Em um caso, a LH é encontrada mesmo quando todas as salamandras são removidas também. Propomos ainda que o complexo de caracteres chamado modo de desenvolvimento do autopódio das salamandras é (em suas formas menos extremas) plesiomórfico para vertebrados com membros, de modo que a aparente presença desse modo de desenvolvimento nos temnospóndilos não pode apoiar a TH ou a PH. Ainda assim, um consenso não será alcançado em breve, apesar do crescente escopo de dados e tipos de análise utilizados (filogenética morfológica, molecular e combinada, biologia do desenvolvimento, datação de divergência molecular, datação paleontológica de supertree, datação combinada e cálculo de intervalos de confiança sobre as primeiras aparições no registro fóssil). Apresentamos exemplos de distribuições de estados de caracteres pertinentes e exploramos uma grande lacuna no registro fóssil de pequenos estegocéfalos.

@article{doi105252g2013n1a8,
    author = "Marjanović, David e Laurin, Michel",
    title = "The origin(s) of extant amphibians: a review with emphasis on the “lepospondyl hypothesis”",
    year = "2013",
    journal = "Geodiversitas",
    abstract = "As origens dos anfíbios extantes (sapos, salamandras, cecilianos) permanecem controversas após mais de um século de debate. Três grupos de hipóteses persistem na literatura atual: a "hipótese temnospóndila" (TH), que situa Lissamphibia Haeckel, 1866 (o menor clado composto pelos anfíbios extantes) dentro dos temnospóndilos do Paleozóico, a "hipótese lepospóndila" (LH), que postula um Lissamphibia monofilético aninhado dentro dos lepospóndilos do Paleozóico, e a "hipótese de polifilia" (PH), de acordo com a qual os sapos e as salamandras são temnospóndilos, enquanto os cecilianos são lepospóndilos. A descoberta dos albanerpetontídeos do Jurássico Médio ao Plioceno, que são muito semelhantes aos anfíbios extantes, complicou em vez de resolver essa situação. Apresentamos uma revisão de publicações recentes e teses nesta área, várias das quais mostram mais apoio para a LH do que para a TH e consideravelmente mais do que para a PH. Além disso, mostramos que não há atração particular entre lissamfíbios de corpo longo (cecilianos) e lepospóndilos de corpo longo (como os lisorófilos): quando são removidos de duas matrizes publicadas, as reanálises ainda encontram a LH. Em um caso, a LH é encontrada mesmo quando todas as salamandras são removidas também. Propomos ainda que o complexo de caracteres chamado modo de desenvolvimento do autopódio das salamandras é (em suas formas menos extremas) plesiomórfico para vertebrados com membros, de modo que a aparente presença desse modo de desenvolvimento nos temnospóndilos não pode apoiar a TH ou a PH. Ainda assim, um consenso não será alcançado em breve, apesar do crescente escopo de dados e tipos de análise utilizados (filogenética morfológica, molecular e combinada, biologia do desenvolvimento, datação de divergência molecular, datação paleontológica de supertree, datação combinada e cálculo de intervalos de confiança sobre as primeiras aparições no registro fóssil). Apresentamos exemplos de distribuições de estados de caracteres pertinentes e exploramos uma grande lacuna no registro fóssil de pequenos estegocéfalos.",
    url = "https://doi.org/10.5252/g2013n1a8",
    doi = "10.5252/g2013n1a8",
    openalex = "W2170107220",
    references = "doi10100797814615698316, doi101016jcrvi200510001, doi101016jtig200312003, doi101016s076444690101318x, doi101073pnas0608378104, doi10108010635150490522340, doi101111j251761611995tb02031x, doi101126science2562999, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012063101, doi1012063521, doi10167102724634200626284toksst20co2"
}

Fornecemos uma pesquisa de DNA barcoding de anfíbios malgaxes, incluindo 251 das 292 espécies nominais conhecidas até a data, complementando dados anteriores com 280 novos fragmentos de sequências de barcoding do gene mitocondrial citocromo oxidase subunidade I (COI). O sucesso de amplificação para as sequências recém-determinadas foi o mais alto (94%) com um conjunto de primers universais COI (dgLCO1490-dgHCO2198), enquanto outros conjuntos de primers apresentaram taxas de sucesso significativamente menores. Em geral, observamos distâncias genéticas interespecíficas relativamente altas de 25-27% dentro das famílias Mantellidae e Microhylidae, e distâncias genéticas de 13-21% dentro da família Hyperoliidae. Valores menores de 6-7% foram observados entre algumas espécies irmãs em todas as famílias, com mínimos extremos de 0,2-0,3% entre alguns pares de espécies irmãs em microhílidos e mantelídeos, para os quais postulamos introgressão mitocondrial ou taxonomia ainda não resolvida. As divergências intraespecíficas foram relativamente altas, especialmente em mantelídeos, onde elas médias 5,3%, devido à inclusão de numerosos linhagens conspecíficas profundas (por definição com altas divergências para outros espécimes) em nosso estudo. Acima disso, o grau de polimorfismo foi difícil de estabelecer devido à amostragem limitada por população em nossa avaliação. Em comparação com uma avaliação anterior de 2009 baseada em sequências de 16S rDNA, identificamos 14 espécies candidatas adicionais não descritas e elevamos a estimativa máxima de espécies na batracofauna da ilha para muito mais de 500.

@article{doi1011631568538100002942,
    author = "Perl, R. G. Bina e Nagy, Zoltán T. e Sonet, Gontran e Glaw, Frank e Valero, Katharina C. Wollenberg e Vences, Miguel",
    title = "DNA barcoding da fauna anfíbia de Madagascar",
    year = "2014",
    journal = "Amphibia-Reptilia",
    abstract = "Fornecemos uma pesquisa de DNA barcoding de anfíbios malgaxes, incluindo 251 das 292 espécies nominais conhecidas até a data, complementando dados anteriores com 280 novos fragmentos de sequências de barcoding do gene mitocondrial citocromo oxidase subunidade I (COI). O sucesso de amplificação para as sequências recém-determinadas foi o mais alto (94%) com um conjunto de primers universais COI (dgLCO1490-dgHCO2198), enquanto outros conjuntos de primers apresentaram taxas de sucesso significativamente menores. Em geral, observamos distâncias genéticas interespecíficas relativamente altas de 25-27% dentro das famílias Mantellidae e Microhylidae, e distâncias genéticas de 13-21% dentro da família Hyperoliidae. Valores menores de 6-7% foram observados entre algumas espécies irmãs em todas as famílias, com mínimos extremos de 0,2-0,3% entre alguns pares de espécies irmãs em microhílidos e mantelídeos, para os quais postulamos introgressão mitocondrial ou taxonomia ainda não resolvida. As divergências intraespecíficas foram relativamente altas, especialmente em mantelídeos, onde elas médias 5,3%, devido à inclusão de numerosos linhagens conspecíficas profundas (por definição com altas divergências para outros espécimes) em nosso estudo. Acima disso, o grau de polimorfismo foi difícil de estabelecer devido à amostragem limitada por população em nossa avaliação. Em comparação com uma avaliação anterior de 2009 baseada em sequências de 16S rDNA, identificamos 14 espécies candidatas adicionais não descritas e elevamos a estimativa máxima de espécies na batracofauna da ilha para muito mais de 500.",
    url = "https://doi.org/10.1163/15685381-00002942",
    doi = "10.1163/15685381-00002942",
    openalex = "W2066933182",
    references = "doi1011861471214811217"
}

O Antropoceno é caracterizado por uma crise generalizada da biodiversidade que rivaliza com as extinções em massa pré-históricas. Os anfíbios são a classe de vertebrados mais ameaçada. Além das ameaças tradicionais, como a conversão de uso da terra e a poluição, espera-se que as mudanças climáticas e as doenças introduzidas reduzam ainda mais a biodiversidade dos anfíbios. A doença fúngica quitridiomicose causou a rápida extinção local de dezenas a possivelmente centenas de espécies de anfíbios. Avanços recentes revelaram uma profunda história evolutiva e considerável variação na virulência de cepas do patógeno fúngico, padrões que precisam ser reconciliados com a rápida disseminação da doença e o declínio das populações hospedeiras. Uma prioridade de conservação é a vigilância de uma nova espécie de fungo quitrídeo descoberta que está matando salamandras europeias. A descoberta acelerada de novas espécies de anfíbios desafia os recursos de conservação existentes, mas representa uma oportunidade para preencher lacunas geográficas e aprimorar programas destinados a preservar a biodiversidade dos anfíbios.

@article{doi101146annurevenviron102014021358,
    author = "Catenazzi, Alessandro",
    title = "Estado dos Anfíbios do Mundo",
    year = "2015",
    journal = "Annual Review of Environment and Resources",
    abstract = "O Antropoceno é caracterizado por uma crise generalizada da biodiversidade que rivaliza com as extinções em massa pré-históricas. Os anfíbios são a classe de vertebrados mais ameaçada. Além das ameaças tradicionais, como a conversão de uso da terra e a poluição, espera-se que as mudanças climáticas e as doenças introduzidas reduzam ainda mais a biodiversidade dos anfíbios. A doença fúngica quitridiomicose causou a rápida extinção local de dezenas a possivelmente centenas de espécies de anfíbios. Avanços recentes revelaram uma profunda história evolutiva e considerável variação na virulência de cepas do patógeno fúngico, padrões que precisam ser reconciliados com a rápida disseminação da doença e o declínio das populações hospedeiras. Uma prioridade de conservação é a vigilância de uma nova espécie de fungo quitrídeo descoberta que está matando salamandras europeias. A descoberta acelerada de novas espécies de anfíbios desafia os recursos de conservação existentes, mas representa uma oportunidade para preencher lacunas geográficas e aprimorar programas destinados a preservar a biodiversidade dos anfíbios.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-environ-102014-021358",
    doi = "10.1146/annurev-environ-102014-021358",
    openalex = "W2137345966",
    references = "doi101111j14724642201100862x, doi101111j15585646201201715x, doi101371journalpone0103958"
}

Comparamos a morfologia dos eritrócitos de cinco anuros, duas espécies de sapos - Bufo gargarizans (Cantor, 1842) e Duttaphrynus melanostictus (Schneider, 1799) e três espécies de rãs - Fejervarya limnocharis (Gravenhorst, 1829), Microhyla ornata (Duméril & Bibron, 1841) e Rana zhenhaiensis (Ye, Fei & Matsui, 1995). Em seguida, reconstruímos o estado ancestral do tamanho dos eritrócitos (ES) e do tamanho nuclear (NS) em anfíbios com base em uma árvore molecular. Nove traços morfológicos dos eritrócitos foram todos significativamente diferentes entre as cinco espécies. Os resultados da análise de componentes principais mostraram que o primeiro componente (49,1% da variância explicada) teve uma alta carga positiva para o comprimento dos eritrócitos, o comprimento nuclear, NS e a razão entre o comprimento dos eritrócitos/largura dos eritrócitos; o segundo eixo (28,5% da variância explicada) representou principalmente a largura dos eritrócitos e o ES. A análise de mínimos quadrados generalizados filogenéticos mostrou que a relação entre NS e ES não foi afetada pelas relações filogenéticas, embora houvesse uma relação linear significativa entre essas duas variáveis. Estes resultados sugeriram que (1) os nove traços morfológicos dos eritrócitos nas cinco espécies de anuros eram específicos da espécie; (2) em anfíbios, eritrócitos maiores geralmente tinham núcleos maiores.

@article{doi101590s198446702015000500005,
    author = "Wei, Jie e Li, Yanyan e Li, Wei e Ding, Guohua e Fan, Xiao-Li e Lin, Zhi‐Hua",
    title = "Evolução da morfologia de eritrócitos em anfíbios (Amphibia: Anura)",
    year = "2015",
    journal = "Zoologia (Curitiba)",
    abstract = "Comparamos a morfologia dos eritrócitos de cinco anuros, duas espécies de sapos - Bufo gargarizans (Cantor, 1842) e Duttaphrynus melanostictus (Schneider, 1799) e três espécies de rãs - Fejervarya limnocharis (Gravenhorst, 1829), Microhyla ornata (Duméril \& Bibron, 1841) e Rana zhenhaiensis (Ye, Fei \& Matsui, 1995). Em seguida, reconstruímos o estado ancestral do tamanho dos eritrócitos (ES) e do tamanho nuclear (NS) em anfíbios com base em uma árvore molecular. Nove traços morfológicos dos eritrócitos foram todos significativamente diferentes entre as cinco espécies. Os resultados da análise de componentes principais mostraram que o primeiro componente (49,1\% da variância explicada) teve uma alta carga positiva para o comprimento dos eritrócitos, o comprimento nuclear, NS e a razão entre o comprimento dos eritrócitos/largura dos eritrócitos; o segundo eixo (28,5\% da variância explicada) representou principalmente a largura dos eritrócitos e o ES. A análise de mínimos quadrados generalizados filogenéticos mostrou que a relação entre NS e ES não foi afetada pelas relações filogenéticas, embora houvesse uma relação linear significativa entre essas duas variáveis. Estes resultados sugeriram que (1) os nove traços morfológicos dos eritrócitos nas cinco espécies de anuros eram específicos da espécie; (2) em anfíbios, eritrócitos maiores geralmente tinham núcleos maiores.",
    url = "https://doi.org/10.1590/s1984-46702015000500005",
    doi = "10.1590/s1984-46702015000500005",
    openalex = "W2341883296",
    references = "doi101006bcmd20010457, doi101016jaquatox200610012, doi101016jcvex200803006, doi101016jmrgentox201404009, doi101016jympev201106012, doi101111j14209101201102372x, doi101111j1469185x2000tb00059x, doi1023072409910, doi10758900903558381143, doi10758900903558394830"
}

@article{doi101007s113560179364z,
    author = "Zhelev, Zhivko e Popgeorgiev, Georgi e Иванов, Иван Юрьевич e Boyadzhiev‍, Peter",
    title = "Mudanças nos parâmetros métricos de eritrócitos em Pelophylax ridibundus (Amphibia: Anura: Ranidae) que habitam corpos d'água com diferentes tipos de poluição antropogênica na Bulgária do Sul",
    year = "2017",
    journal = "Environmental Science and Pollution Research",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11356-017-9364-z",
    doi = "10.1007/s11356-017-9364-z",
    openalex = "W2625920719",
    references = "doi101590s198446702015000500005"
}

As microbiotas associadas a hospedeiros de vertebrados são comunidades diversas e complexas que contribuem para a saúde do hospedeiro. Em particular, para anfíbios, as comunidades microbianas cutâneas provavelmente desempenham um papel significativo na defesa contra patógenos; no entanto, nosso entendimento ecológico dessas comunidades ainda está em seus primórdios. Aqui, aproveitamos a fauna de anfíbios totalmente endêmica e localmente rica em espécies de Madagascar para investigar os fatores que estruturam a microbiota da pele de anfíbios em grande escala. Usando sequenciamento baseado em amplicons, avaliamos como múltiplos traços de espécies hospedeiras e fatores do local afetam a diversidade bacteriana e a estrutura da comunidade do hospedeiro. Madagascar é lar de mais de 400 espécies nativas de sapos, todas endêmicas da ilha; mais de 100 espécies diferentes são conhecidas por ocorrer em simpatria dentro de múltiplos locais de floresta tropical. Amostramos intensamente comunidades bacterianas da pele de sapos, de mais de 800 anfíbios de 89 espécies em 30 locais em Madagascar durante três visitas de campo, e descobrimos que as comunidades bacterianas da pele diferem fortemente daquelas do ambiente circundante. A riqueza de unidades taxonômicas operacionais (OTUs) bacterianas e a diversidade filogenética diferiram entre os ecomorfos hospedeiros, com sapos arborícolas exibindo menor riqueza e diversidade do que sapos terrestres e aquáticos. A ecomorfologia do hospedeiro foi o fator mais forte influenciando a estrutura da comunidade microbiana, com a filogenia do hospedeiro e parâmetros do local (latitude e altitude) explicando porções menores, mas significativas, da variação observada. A análise de correlação e análises de congruência topológica revelaram pouco ou nenhum filosimbiose para a microbiota da pele de anfíbios. Apesar da variação geográfica observada e da baixa filosimbiose, encontramos OTUs particulares que foram diferencialmente abundantes entre ecomorfos particulares. Por exemplo, o gênero Pigmentiphaga (Alcaligenaceae) foi significativamente enriquecido em sapos arborícolas, Methylotenera (Methylophilaceae) foi enriquecido em sapos aquáticos e Agrobacterium (Rhizobiaceae) foi enriquecido em sapos terrestres. A presença de OTUs bacterianas compartilhadas entre regiões geográficas para gêneros hospedeiros selecionados sugere a presença de comunidades microbianas centrais que, em Madagascar, podem ser impulsionadas mais fortemente pela preferência de uma espécie por microhabitats específicos do que pelas propriedades físicas, fisiológicas ou bioquímicas de sua pele. Estes resultados corroboram que tanto fatores do hospedeiro quanto ambientais estão impulsionando a montagem da comunidade de comunidades microbianas cutâneas de anfíbios e fornecem uma base aprimorada para elucidar seu papel na resistência a doenças.

@article{doi103389fmicb201701530,
    author = "Bletz, Molly C. and Archer, Holly and Harris, Reid N. and McKenzie, Valerie J. and Rabemananjara, Falitiana C. E. and Rakotoarison, Andolalao and Vences, Miguel",
    title = "Host Ecology Rather Than Host Phylogeny Drives Amphibian Skin Microbial Community Structure in the Biodiversity Hotspot of Madagascar",
    year = "2017",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "Host-associated microbiotas of vertebrates are diverse and complex communities that contribute to host health. In particular, for amphibians, cutaneous microbial communities likely play a significant role in pathogen defense; however, our ecological understanding of these communities is still in its infancy. Here, we take advantage of the fully endemic and locally species-rich amphibian fauna of Madagascar to investigate the factors structuring amphibian skin microbiota on a large scale. Using amplicon-based sequencing, we evaluate how multiple host species traits and site factors affect host bacterial diversity and community structure. Madagascar is home to over 400 native frog species, all of which are endemic to the island; more than 100 different species are known to occur in sympatry within multiple rainforest sites. We intensively sampled frog skin bacterial communities, from over 800 amphibians from 89 species across 30 sites in Madagascar during three field visits, and found that skin bacterial communities differed strongly from those of the surrounding environment. Richness of bacterial operational taxonomic units (OTUs) and phylogenetic diversity differed among host ecomorphs, with arboreal frogs exhibiting lower richness and diversity than terrestrial and aquatic frogs. Host ecomorphology was the strongest factor influencing microbial community structure, with host phylogeny and site parameters (latitude and elevation) explaining less but significant portions of the observed variation. Correlation analysis and topological congruency analyses revealed little to no phylosymbiosis for amphibian skin microbiota. Despite the observed geographic variation and low phylosymbiosis, we found particular OTUs that were differentially abundant between particular ecomorphs. For example, the genus Pigmentiphaga (Alcaligenaceae) was significantly enriched on arboreal frogs, Methylotenera (Methylophilaceae) was enriched on aquatic frogs, and Agrobacterium (Rhizobiaceae) was enriched on terrestrial frogs. The presence of shared bacterial OTUs across geographic regions for selected host genera suggests the presence of core microbial communities which in Madagascar, might be driven more strongly by a species' preference for specific microhabitats than by the physical, physiological or biochemical properties of their skin. These results corroborate that both host and environmental factors are driving community assembly of amphibian cutaneous microbial communities, and provide an improved foundation for elucidating their role in disease resistance.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01530",
    doi = "10.3389/fmicb.2017.01530",
    openalex = "W2740203422",
    references = "doi1011861471214811217"
}

@article{andmarushchak2018morphological,
    author = "Marushchak, O. e Muravynets, O.",
    title = "Anormalidades morfológicas em anfíbios sem cauda (Amphibia, Anura) na Ucrânia",
    year = "2018",
    journal = "Geo\&Bio",
    url = "https://doi.org/10.15407/gb.2018.16.076",
    doi = "10.15407/gb.2018.16.076",
    number = "16",
    openalex = "W2904825090",
    pages = "76-82",
    volume = "2018",
    references = "doi101163157075403323012205, doi1031610trudyzin20123164324"
}

@article{doi101038s4155901805155,
    author = "Jetz, Walter e Pyron, R. Alexander",
    title = "A interação entre a diversificação passada e o isolamento evolutivo com o perigo atual em toda a árvore da vida dos anfíbios",
    year = "2018",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41559-018-0515-5",
    doi = "10.1038/s41559-018-0515-5",
    openalex = "W2796242207",
    references = "doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012060003009020073031cfttbi20co2"
}

Doenças infecciosas globalizadas estão causando declínios de espécies em todo o mundo, mas sua origem frequentemente permanece elusiva. Utilizamos sequenciamento de genoma completo para resolver as origens espaço-temporais do pânico zoonótico mais devastador até hoje, causado pelo fungo Batrachochytrium dendrobatidis, um motor direto dos declínios globais de anfíbios. Rastreamos a origem de B. dendrobatidis para a península coreana, onde uma linhagem, Bd ASIA-1, exibe as marcas genéticas de uma população ancestral que originou o pânico zoonótico. Datamos o surgimento deste patógeno para o início do século XX, coincidindo com a expansão global do comércio comercial de anfíbios, e demonstramos que a transmissão intercontinental está em curso. Nossas descobertas apontam para a Ásia Oriental como um hotspot geográfico para a biodiversidade de B. dendrobatidis e a fonte original dessas linhagens que agora parasitam anfíbios em todo o mundo.

@article{doi101126scienceaar1965,
    author = "O’Hanlon, Simon J. e Rieux, Adrien e Farrer, Rhys A. e Rosa, Gonçalo M. e Waldman, Bruce e Bataille, Arnaud e Kosch, Tiffany A. e Murray, Kris A. e Brankovics, Balázs e Fumagalli, Matteo e Martin, Michael D. e Wales, Nathan e Alvarado‐Rybak, Mario e Bates, Kieran A. e Berger, Lee e Böll, Susanne e Brookes, Lola e Clare, Frances C. e Courtois, Élodie A. e Cunningham, Andrew A. e Doherty‐Bone, Thomas M. e Ghosh, Pria N. e Gower, David J. e Hintz, William E. e Höglund, ‎Jacob e Jenkinson, Thomas S. e Lin, Chun-Fu e Laurila, Anssi e Loyau, Adeline e Martel, An e Meurling, Sara e Miaud, Claude e Minting, Pete e Pasmans, Frank e Schmeller, Dirk S. e Schmidt, Benedikt R. e Shelton, Jennifer e Skerratt, Lee F. e Smith, Freya e Azat, Claudio e Spagnoletti, Matteo e Tessa, Giulia e Toledo, Luı́s Felipe e Valenzuela‐Sánchez, Andrés e Verster, Ruhan e Vörös, Judit e Webb, Rebecca J. e Wierzbicki, Claudia e Wombwell, Emma e Zamudio, Kelly R. e Aanensen, David M. e James, Timothy Y. e Gilbert, M. Thomas P. e Weldon, Ché e Bosch, Jaime e Balloux, François e Garner, Trenton W. J. e Fisher, Matthew C.",
    title = "Origem asiática recente dos fungos quitrídeos que causam declínios globais de anfíbios",
    year = "2018",
    journal = "Science",
    abstract = "Doenças infecciosas globalizadas estão causando declínios de espécies em todo o mundo, mas sua origem frequentemente permanece elusiva. Utilizamos sequenciamento de genoma completo para resolver as origens espaço-temporais do pânico zoonótico mais devastador até hoje, causado pelo fungo Batrachochytrium dendrobatidis, um motor direto dos declínios globais de anfíbios. Rastreamos a origem de B. dendrobatidis para a península coreana, onde uma linhagem, Bd ASIA-1, exibe as marcas genéticas de uma população ancestral que originou o pânico zoonótico. Datamos o surgimento deste patógeno para o início do século XX, coincidindo com a expansão global do comércio comercial de anfíbios, e demonstramos que a transmissão intercontinental está em curso. Nossas descobertas apontam para a Ásia Oriental como um hotspot geográfico para a biodiversidade de B. dendrobatidis e a fonte original dessas linhagens que agora parasitam anfíbios em todo o mundo.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aar1965",
    doi = "10.1126/science.aar1965",
    openalex = "W2799512068",
    references = "doi103201eid1012030804"
}

O presente trabalho trata de anomalias morfológicas externas em populações de anuros da Ucrânia. O trabalho baseia-se em materiais coletados entre 2013–2015 e em espécimes da coleção permanente do Museu Nacional de História Natural, NAS da Ucrânia (85 espécimes de 21 regiões). Foram criados os mapas correspondentes da Ucrânia mostrando as localizações com diferentes níveis de anomalia. Entre os anuros da Ucrânia, foi descoberta uma grande quantidade de anomalias morfológicas externas, descritas nas classificações mais recentes. A porcentagem total de anfíbios com anomalias tende a ser maior em áreas com pressão industrial significativa (por exemplo, regiões de Luhansk e Donetsk), o que pode estar associado ao impacto combinado de poluentes químicos, contração e fragmentação de habitat, e outros fatores. Além disso, vários casos de anomalias generalizadas foram encontrados em áreas sem impacto industrial notável (por exemplo, Zakarpattia). A maior variedade de malformações foi descoberta em sapos-comuns do distrito de Holosiivskyi, na cidade de Kiev. Observou-se também uma tendência de predominância de anomalias de origem traumática.

@article{doi1015407gb201816076,
    author = "Marushchak, Oleksii e Muravynets, O.",
    title = "Anomalias morfológicas em anfíbios sem cauda (Amphibia, Anura) na Ucrânia",
    year = "2018",
    journal = "Geo\&Bio",
    abstract = "O presente trabalho trata de anomalias morfológicas externas em populações de anuros da Ucrânia. O trabalho baseia-se em materiais coletados entre 2013–2015 e em espécimes da coleção permanente do Museu Nacional de História Natural, NAS da Ucrânia (85 espécimes de 21 regiões). Foram criados os mapas correspondentes da Ucrânia mostrando as localizações com diferentes níveis de anomalia. Entre os anuros da Ucrânia, foi descoberta uma grande quantidade de anomalias morfológicas externas, descritas nas classificações mais recentes. A porcentagem total de anfíbios com anomalias tende a ser maior em áreas com pressão industrial significativa (por exemplo, regiões de Luhansk e Donetsk), o que pode estar associado ao impacto combinado de poluentes químicos, contração e fragmentação de habitat, e outros fatores. Além disso, vários casos de anomalias generalizadas foram encontrados em áreas sem impacto industrial notável (por exemplo, Zakarpattia). A maior variedade de malformações foi descoberta em sapos-comuns do distrito de Holosiivskyi, na cidade de Kiev. Observou-se também uma tendência de predominância de anomalias de origem traumática.",
    url = "https://doi.org/10.15407/gb.2018.16.076",
    doi = "10.15407/gb.2018.16.076",
    openalex = "W2904825090",
    references = "doi101163157075403323012205, doi1031610trudyzin20123164324"
}

.

@article{doi1018502klsv4i32099,
    author = "Fayzulin, Alexander I. e Chikhlyaev, Igor V. e Mineev, A K e Кузовенко, А. Е. e Mihaylov, R A e Zaripova, F.F. e Popov, A.I. e Ermakov, Oleg A.",
    title = "Novos Dados sobre as Anomalias de Anfíbios Atrés de Bacia do Volga",
    year = "2018",
    journal = "KnE Life Sciences",
    abstract = ".",
    url = "https://doi.org/10.18502/kls.v4i3.2099",
    doi = "10.18502/kls.v4i3.2099",
    openalex = "W2802309343",
    references = "doi1031610trudyzin20123164324"
}

.

@article{doi1018502klsv4i32101,
    author = "Tytar, Volodymyr e Nekrasova, Oksana e Marushchak, Oleksii",
    title = "Análise Ecológica e Geográfica Gis de Anomalias em Anfíbios da Ucrânia",
    year = "2018",
    journal = "KnE Life Sciences",
    abstract = ".",
    url = "https://doi.org/10.18502/kls.v4i3.2101",
    doi = "10.18502/kls.v4i3.2101",
    openalex = "W2826467853",
    references = "doi1031610trudyzin20123164324"
}

.

@article{doi1018502klsv4i32117,
    author = "Svinin, Anton O. e Bashinskiy, I. V. e Neymark, Leonid A. e Кацман, Е. А. e Осипов, В. В.",
    title = "Deformidades Morfológicas em Anfíbios Anuros do Vale do Rio Khoper na Reserva Natural “Privolzhskaya Lesostep’” e Territórios Adjacentes",
    year = "2018",
    journal = "KnE Life Sciences",
    abstract = ".",
    url = "https://doi.org/10.18502/kls.v4i3.2117",
    doi = "10.18502/kls.v4i3.2117",
    openalex = "W2878693505",
    references = "doi1031610trudyzin20123164324"
}

Os efeitos da iluminação no desenvolvimento inicial de quatro espécies de anfíbios — Lissotriton vulgaris (Linnaeus, 1758), Triturus cristatus (Laurenti, 1768), Rana arvalis (Nilsson, 1842) e R. temporaria (Linnaeus, 1758) — foram estudados. Em geral, a taxa do seu desenvolvimento inicial é bastante independente da iluminação. Os ovos de anfíbios sem cauda desenvolvem-se quase igualmente sob quaisquer condições de iluminação, enquanto os ovos de anfíbios com cauda desenvolvem-se melhor sob uma iluminação de 700 lx. A iluminação influencia principalmente a taxa de sobrevivência dos embriões e prolarvas, que aumenta em baixas intensidades de luz e diminui no escuro. São discutidos os possíveis mecanismos e causas subjacentes aos fatos observados.

@article{doi1052571ptqv15n302018155periodico30pgs152159pdf,
    author = "Ruchin, Alexander B.",
    title = "OS EFEITOS DA ILUMINAÇÃO NO DESENVOLVIMENTO INICIAL DE AMPÍBIOS (AMPHIBIA: ANURA E CAUDATA)",
    year = "2018",
    journal = "PERIÓDICO TCHÊ QUÍMICA",
    abstract = "Os efeitos da iluminação no desenvolvimento inicial de quatro espécies de anfíbios — Lissotriton vulgaris (Linnaeus, 1758), Triturus cristatus (Laurenti, 1768), Rana arvalis (Nilsson, 1842) e R. temporaria (Linnaeus, 1758) — foram estudados. Em geral, a taxa do seu desenvolvimento inicial é bastante independente da iluminação. Os ovos de anfíbios sem cauda desenvolvem-se quase igualmente sob quaisquer condições de iluminação, enquanto os ovos de anfíbios com cauda desenvolvem-se melhor sob uma iluminação de 700 lx. A iluminação influencia principalmente a taxa de sobrevivência dos embriões e prolarvas, que aumenta em baixas intensidades de luz e diminui no escuro. São discutidos os possíveis mecanismos e causas subjacentes aos fatos observados.",
    url = "https://doi.org/10.52571/ptq.v15.n30.2018.155\_periodico30\_pgs\_152\_159.pdf",
    doi = "10.52571/ptq.v15.n30.2018.155\_periodico30\_pgs\_152\_159.pdf",
    openalex = "W3197043124"
}

O fotoperíodo regula o crescimento e o desenvolvimento de muitos animais. Realizamos experimentos e estudamos o efeito do fotoperíodo no crescimento e desenvolvimento das larvas e jovens de duas espécies de anfíbios, Rana temporaria e Xenopus laevis. Estudamos os seguintes fotoperíodos: ausência constante de luz – 0 h de luz/24 h de escuridão (0L/24D), 8 h de luz/16 h de escuridão (8L/16D), 12 h de luz/12 h de escuridão (12L/12D), 16 h de luz/8 h de escuridão (16L/8D) e iluminação ininterrupta (24L/0D). Descobrimos que o tamanho das girinas de Rana temporaria foi maior com os fotoperíodos 24L/0D, 16L/8D e 12L/12D. Uma diminuição nos parâmetros foi observada na ausência de luz e no fotoperíodo 8L/16D. O ritmo do desenvolvimento começou a diferir após o 10º dia do experimento. O desenvolvimento foi mais lento com o fotoperíodo 0L/24D. A maior porcentagem de mortalidade das girinas foi observada na escuridão total (0L/24D); a menor porcentagem foi observada no fotoperíodo 16L/8D. O fotoperíodo não teve efeito sobre os jovens de Xenopus laevis. Discutem-se os mecanismos do efeito do fotoperíodo no desenvolvimento larval e no crescimento de anfíbios.

@article{doi1010800929101620191631025,
    author = "Ruchin, Alexander B.",
    title = "The effect of the photoperiod on the larval development and growth of two amphibian species (Amphibia: anura)",
    year = "2019",
    journal = "Biological Rhythm Research",
    abstract = "The photoperiod regulates the growth and development of many animals. We conducted experiments and studied the effect of the photoperiod on the growth and development of the larvae and young of two amphibian species Rana temporaria and Xenopus laevis. We studied photoperiods: constant absence of light – 0 h light/24 h darkness (0L/24D), 8 h light/16 h darkness (8L/16D), 12 h light/12 h darkness (12L/12D), 16 h light/8 h dark (16L/8D), and round-the-clock lighting (24L/0D). We found out that the size of the Rana temporaria tadpoles was the highest with photoperiods 24L/0D, 16L/8D, 12L/12D. A decrease in the parameters was observed in the absence of light and the photoperiod 8L/16D. The pace of development began to differ after the 10th day of the experiment. The development was slower with the photoperiod 0L/24D. The highest percentage of tadpoles’ mortality was observed in total darkness (0L/24D), the lowest percentage was observed in the photoperiod 16L/8D. The photoperiod had no effect on the Xenopus laevis young. The mechanisms of the photoperiod’s effect on the larval development and growth of amphibians are discussed.",
    url = "https://doi.org/10.1080/09291016.2019.1631025",
    doi = "10.1080/09291016.2019.1631025",
    openalex = "W2991411521",
    references = "doi1052571ptqv15n302018155periodico30pgs152159pdf"
}

A salamandra de Lantz, ou a salamandra lisa do Cáucaso, Lissotriton lantzi, é uma espécie endêmica das florestas do Cáucaso. Foi incluída nos Livros de Dados Vermelhos da Federação Russa e da República do Azerbaijão. O projeto de uma tecnologia para manter e reproduzir esta espécie em cativeiro ajudará sua conservação. O artigo discute os resultados do crescimento larval da salamandra de Lantz em várias temperaturas. As salamandras foram obtidas de reprodução em condições artificiais. As larvas foram criadas em dupla repetição em quatro regimes de temperatura, a saber: 20,0-24,0°C (21,6°C em média), 23,0-25,5°C (24,7°C), 25,5-29,0°C (27,7°C) e 29,0-32,0°C (31,3°C). As larvas tiveram a maior taxa de sobrevivência na temperatura mais baixa (100%) e a menor taxa (78% em média) na temperatura mais alta. A duração do desenvolvimento larval antes que as primeiras jovens salamandras chegassem à terra foi similar em todas as temperaturas. A duração média do desenvolvimento antes da metamorfose foi a mais longa na temperatura mais alta (29,0-32,0°C). Além disso, as salamandras desse grupo tiveram os menores tamanhos médios (comprimento total e peso). Os custos de ração por metamorfose em crescimento foram os mais baixos nas temperaturas da água de 23,5-25,5°C e os mais altos quando 29,0-32,0°C. A maior quantidade de ração por unidade de peso foi gasta pelas salamandras nas temperaturas de 29,0-32,0°C, e a menor foi na temperatura de 23,5-25,5°C. O aumento da temperatura não acelerou o desenvolvimento larval. As larvas criadas nas temperaturas mais altas tiveram uma taxa de sobrevivência reduzida, pequenos tamanhos médios e consumiram o maior número de ração. Os autores recomendam o crescimento das larvas da salamandra de Lantz na faixa de temperatura de 20-26°C.

@article{doi10185001814609020191934125131,
    author = "Nemyko, Elena A. and Vyatkin, Yaroslav Aleksandrovich and Кидов, А. А.",
    title = "Growing of Larvae of the Caucasian Smooth Newt, Lissotriton lantzi (Wolterstorff, 1914) (Amphibia, Caudata) at Various Temperatures",
    year = "2019",
    journal = "Current Studies in Herpetology",
    abstract = "Lantz's newt, or the Caucasian smooth newt, Lissotriton lantzi, is an endemic species of Caucasian forests. It was included in the Red Data Books of the Russian Federation and Republic of Azerbaijan. The design of a technology for keeping and reproducing this species in captivity will help its conservation. The paper discusses the results of larval growing of Lantz's newt at several temperatures. Newts were obtained from reproduction in artificial conditions. Larvae were grown in double repetition in four temperature regimes, namely: 20.0-24.0C (21.6C on average), 23.0-25.5C (24.7C), 25.5-29.0C (27.7C), and 29.0-32.0C (31.3C). The larvae had the highest survival rate at the lowest temperature (100\%) and the lowest rate (78\% on average) at the highest temperature. The larval development duration before the first young newts came to land was similar at all the temperatures. The average duration of development before metamorphosis was longest at the highest temperature (29.0 -32.0C). Besides, the newts from this group had the smallest average sizes (total length and weight). The feed costs per metamorph growing were lowest at the water temperatures of 23.5-25.5C and highest when 29.0-32.0C. The greatest quantity of feed per weight unit was spent by the newts at the temperatures of 29.0-32.0C, and the lowest was at the temperature of 23.5-25.5C. Increasing temperature did not accelerate the larval development. The larvae grown at the highest temperatures had a lowered survival rate, small average sizes and consumed the largest number of feed. The authors recommend growing Lantz's newt larvae in the temperature range of 20-26C.",
    url = "https://doi.org/10.18500/1814-6090-2019-19-3-4-125-131",
    doi = "10.18500/1814-6090-2019-19-3-4-125-131",
    openalex = "W3038048666",
    references = "doi1052571ptqv15n302018155periodico30pgs152159pdf"
}

As filogenias moleculares forneceram forte suporte para muitas partes da Árvore da Vida dos anfíbios, mas pouco suporte para a resolução de nós mais profundos, incluindo relações entre famílias e ordens. Para esclarecer essas relações, fornecemos uma perspectiva filogenômica das relações entre anfíbios ao desenvolver um protocolo de Enriquecimento Híbrido Ancorado específico para táxons, direcionado a centenas de éxons conservados que são eficazes em toda a classe. Após obter dados de 220 loci para 286 espécies (representando 94% das famílias e 44% dos gêneros), estimamos uma filogenia para anfíbios existentes e identificamos conflito entre árvores gênicas e árvores de espécies ao longo das ramificações mais profundas da filogenia dos anfíbios. Realizamos uma interrogatório genealógico locus a locus de hipóteses topológicas alternativas para a monofilia dos anfíbios, focando em relações interordinais. Encontramos que o sinal filogenético profundamente na filogenia dos anfíbios varia muito entre loci de uma maneira consistente com a ordenação incompleta de linhagens na linhagem ancestral dos anfíbios existentes. Nossos resultados suportam de forma esmagadora a monofilia dos anfíbios e uma relação de irmã entre sapos e salamandras, consistente com a hipótese Batrachia. As análises de árvores de espécies convergem para um pequeno conjunto de hipóteses topológicas para as relações entre famílias de anfíbios existentes. Esses resultados esclarecem várias porções controversas da Árvore da Vida dos anfíbios, que, em conjunto com um conjunto de calibrações fóssis validadas, suportam uma escala de tempo surpreendentemente mais jovem para a diversificação de anfíbios de coroa e ordinais do que anteriormente relatado. De forma mais ampla, nosso estudo fornece insights sobre as fontes, magnitudes e heterogeneidade do suporte entre loci em conjuntos de dados filogenômicos.[AIC; Amphibia; Batrachia; Filogenia; discordância entre árvore gênica e árvore de espécies; genômica; teoria da informação.].

@article{doi101093sysbiosyaa034,
    author = "Hime, Paul M. e Lemmon, Alan R. e Lemmon, Emily Claire Moriarty e Prendini, Elizabeth e Brown, Jeremy M. e Thomson, Robert C. e Kratovil, Justin D. e Noonan, Brice P. e Pyron, R. Alexander e Peloso, Pedro L. V. e Kortyna, Michelle e Keogh, J. Scott e Donnellan, Stephen C. e Mueller, Rachel Lockridge e Raxworthy, Christopher J. e Kunte, Krushnamegh e Ron, Santiago R. e Das, Sandeep e Gaitonde, Nikhil e Green, David M. e Labisko, Jim e Che, Jing e Weisrock, David W.",
    title = "Phylogenomics Reveals Ancient Gene Tree Discordance in the Amphibian Tree of Life",
    year = "2020",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "As filogenias moleculares forneceram forte suporte para muitas partes da Árvore da Vida dos anfíbios, mas pouco suporte para a resolução de nós mais profundos, incluindo relações entre famílias e ordens. Para esclarecer essas relações, fornecemos uma perspectiva filogenômica das relações entre anfíbios ao desenvolver um protocolo de Enriquecimento Híbrido Ancorado específico para táxons, direcionado a centenas de éxons conservados que são eficazes em toda a classe. Após obter dados de 220 loci para 286 espécies (representando 94% das famílias e 44% dos gêneros), estimamos uma filogenia para anfíbios existentes e identificamos conflito entre árvores gênicas e árvores de espécies ao longo das ramificações mais profundas da filogenia dos anfíbios. Realizamos uma interrogatório genealógico locus a locus de hipóteses topológicas alternativas para a monofilia dos anfíbios, focando em relações interordinais. Encontramos que o sinal filogenético profundamente na filogenia dos anfíbios varia muito entre loci de uma maneira consistente com a ordenação incompleta de linhagens na linhagem ancestral dos anfíbios existentes. Nossos resultados suportam de forma esmagadora a monofilia dos anfíbios e uma relação de irmã entre sapos e salamandras, consistente com a hipótese Batrachia. As análises de árvores de espécies convergem para um pequeno conjunto de hipóteses topológicas para as relações entre famílias de anfíbios existentes. Esses resultados esclarecem várias porções controversas da Árvore da Vida dos anfíbios, que, em conjunto com um conjunto de calibrações fóssis validadas, suportam uma escala de tempo surpreendentemente mais jovem para a diversificação de anfíbios de coroa e ordinais do que anteriormente relatado. De forma mais ampla, nosso estudo fornece insights sobre as fontes, magnitudes e heterogeneidade do suporte entre loci em conjuntos de dados filogenômicos.[AIC; Amphibia; Batrachia; Filogenia; discordância entre árvore gênica e árvore de espécies; genômica; teoria da informação.].",
    url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syaa034",
    doi = "10.1093/sysbio/syaa034",
    openalex = "W3021325701",
    references = "doi101038nature06865, doi101038nbt1883, doi101038s4155901702405, doi101093bioinformaticsbts199, doi101093bioinformaticsbtu033, doi101093molbevmsm088, doi101093molbevmss020, doi101093molbevmst010, doi101093sysbiosyy032, doi101109tac19741100705, doi101371journalpone0189767, doi1023073802723, openalexw3217097258"
}

Na Ucrânia, as anomalias de anfíbios não foram suficientemente estudadas. As regiões mais estudadas são a região de Kiev e a zona estepária da Ucrânia. Na região de Kharkiv, estudos sobre anomalias externas de anfíbios não foram realizados anteriormente. Em 2016, começamos a estudar este problema. O objetivo deste estudo é examinar a variedade de anomalias externas de anfíbios na região de Kharkiv. O material consiste na amostragem de anfíbios das coleções de estoque do Museu de Natureza da Universidade Nacional V.N.Karazin de Kharkiv e na amostragem de anfíbios vivos de diferentes localidades da região de Kharkiv, exploradas no período de 2016 a 2018. As anomalias foram determinadas visualmente, de acordo com a classificação de V.L.Vershinin e O.D.Nekrasova. Para cada espécie de anfíbio, foram determinadas a frequência de animais malformados Pas (a proporção de indivíduos anormais de todos os indivíduos na amostra) e a frequência parcial de anomalias Ap (a proporção de indivíduos na amostra que possuem esta anomalia). Como resultado, foram identificados 17 variantes de anomalias morfológicas: bradicidactilia, oligodactilia, ectromelia, polifalangia, engrossamento dos dedos, rotação, sindactilia, esquizodactilia, ectrodactilia, pele em rede e crescimento no pé, taumelia, hemimelia, falta de membrana natatória, anoftalmia, braquicefalia e padrão anormal. A anomalia mais difundida encontrada nos anfíbios pesquisados é a bradicidactilia (representando quase metade dos casos relatados de anomalias morfológicas). Esta anomalia de membro é a menos prejudicial, portanto, indivíduos com tais anomalias são geralmente bastante viáveis. As anomalias de anfíbios estão distribuídas uniformemente entre as amostras: a maior ocorrência de indivíduos com anomalias foi registrada em Lissotriton vulgaris; em outras amostras de rãs (exceto Bufotes viridis e Bombina bombina), a ocorrência de indivíduos com anomalias não excedeu cinco por cento. Um novo tipo de anomalia de cor corporal no Bufotes viridis deste ano também foi identificado e descrito.

@article{doi1026565207554572020349,
    author = "Katrushenko, S. A.",
    title = "External morphological anomalies of the amphibians of the Kharkiv region",
    year = "2020",
    journal = "The Journal of V N Karazin Kharkiv National University Series Biology",
    abstract = "In Ukraine, amphibian anomalies have not been sufficiently studied. The most studied regions are Kyiv region and the steppe zone of Ukraine. In the Kharkiv region, studies of external anomalies of amphibians have not been conducted before. In 2016 we have begun to study this problem. The purpose of this study is to examine the variety of external anomalies of amphibians in the Kharkiv region. The material is sampling amphibians from the stock collections of the Museum of Nature of V.N.Karazin Kharkiv National University and sampling live amphibians from different localities of the Kharkiv region, explored in the period from 2016 to 2018. Anomalies were determined visually, according to the classification of V.L.Vershinin and O.D.Nekrasova. For each the amphibian species frequency of malformed animals Pas (the proportion of abnormal individuals from all individuals in the sample) and partial frequency of abnormalities Ap (the proportion of individuals in the sample having this anomaly) were determined. As a result 17 variants of morphological abnormalities were identified: brachydactyly, oligodactyly, ectromelia, polyphalangy, finger thickening, rotation, syndactyly, shizodactyly, ectrodactyly, skin web and growth on the foot, thaumelia, hemimelia, lack of a swimming membrane, anophthalmia, brachycephaly and pattern abnormal. The most widespread anomaly encountered in the surveyed amphibians is brachydactyly (accounting for almost half of the reported cases of morphological abnormalities). This limb anomaly is the least harmful, so individuals with such abnormalities are usually quite viable. Amphibian anomalies are evenly distributed among samples: the highest occurrence of individuals with anomalies was recorded in Lissotriton vulgaris, in other samplings of frog (except Bufotes viridis and Bombina bombina), the occurrence of individuals with anomalies did not exceed five percent. A new type of body color anomaly in this year's Bufotes viridis was also identified and described.",
    url = "https://doi.org/10.26565/2075-5457-2020-34-9",
    doi = "10.26565/2075-5457-2020-34-9",
    openalex = "W3143250313",
    references = "doi1031610trudyzin20123164324"
}

@article{doi101007s11270021050729,
    author = "Zhelev, Zhivko e Arnaudova, Desislava e Popgeorgiev, Georgi e Tsonev, Stefan",
    title = "Determinações de Tamanhos de Eritrócitos em Adultos de Pelophylax ridibundus (Amphibia: Anura: Ranidae) Habitantes de Área Industrial no Sul da Bulgária",
    year = "2021",
    journal = "Water Air \& Soil Pollution",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11270-021-05072-9",
    doi = "10.1007/s11270-021-05072-9",
    openalex = "W3136422542",
    references = "doi101590s198446702015000500005"
}

Os anfíbios passaram por importantes transições evolutivas nos modos reprodutivos e ciclos de vida. Comparamos padrões macroevolutivos em larga escala nessas transições ao longo dos três principais clados de anfíbios: sapos, salamandras e cecilias. Analisamos dados reprodutivos e filogenéticos correspondentes para 4025 espécies. Encontramos que ter larvas aquáticas é ancestral para todos os três grupos e é mantido por muitas espécies existentes (33-44%). As transições mais frequentes em cada grupo são para estados relativamente incomuns: viviparidade em cecilias, paedomorfose em salamandras e semi-terrestrialidade em sapos. Todos os três grupos mostram transições para modos reprodutivos mais terrestres, mas apenas nas cecilias essas evoluíram sequencialmente do mais aquático para o menos aquático. As taxas de diversificação são em grande parte independentes dos modos reprodutivos. No entanto, em salamandras, o desenvolvimento direto acelera a diversificação, enquanto a paedomorfose a diminui. No geral, encontramos uma retenção generalizada de modos ancestrais, desacoplamento das taxas de transição de traços dos padrões de riqueza de espécies e a independência geral dos modos reprodutivos e da diversificação.

@article{doi101038s41467022344744,
    author = "Liedtke, H. Christoph e Wiens, John J. e Gómez-Mestre, Iván",
    title = "A evolução dos modos reprodutivos e ciclos de vida em anfíbios",
    year = "2022",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Os anfíbios passaram por importantes transições evolutivas nos modos reprodutivos e ciclos de vida. Comparamos padrões macroevolutivos em larga escala nessas transições ao longo dos três principais clados de anfíbios: sapos, salamandras e cecilias. Analisamos dados reprodutivos e filogenéticos correspondentes para 4025 espécies. Encontramos que ter larvas aquáticas é ancestral para todos os três grupos e é mantido por muitas espécies existentes (33-44%). As transições mais frequentes em cada grupo são para estados relativamente incomuns: viviparidade em cecilias, paedomorfose em salamandras e semi-terrestrialidade em sapos. Todos os três grupos mostram transições para modos reprodutivos mais terrestres, mas apenas nas cecilias essas evoluíram sequencialmente do mais aquático para o menos aquático. As taxas de diversificação são em grande parte independentes dos modos reprodutivos. No entanto, em salamandras, o desenvolvimento direto acelera a diversificação, enquanto a paedomorfose a diminui. No geral, encontramos uma retenção generalizada de modos ancestrais, desacoplamento das taxas de transição de traços dos padrões de riqueza de espécies e a independência geral dos modos reprodutivos e da diversificação.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-022-34474-4",
    doi = "10.1038/s41467-022-34474-4",
    openalex = "W4309232329",
    references = "doi101007s1068201497200, doi101007s1075000790322, doi101038s4155901805155, doi10108010635150701607033, doi101086503444, doi101093sysbiosyaa034, doi101093sysbiosyq085, doi101093sysbiosyw022, doi101109tac19741100705, doi10118614712105788, doi1011861471214811217, doi1016410006356820050550207rmifat20co2, doi103758bf03206482, doi107312simp93764"
}

Avaliações sistemáticas do risco de extinção de espécies em intervalos regulares são necessárias para informar ações de conservação 1,2. Desenvolvimentos contínuos em taxonomia, processos ameaçadores e pesquisas reforçam ainda mais a necessidade de reavaliação 3,4. Aqui, relatamos os resultados da segunda Avaliação Global de Anfíbios, avaliando 8.011 espécies para a Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da União Internacional para a Conservação da Natureza. Encontramos que os anfíbios são a classe de vertebrados mais ameaçada (40,7% das espécies estão globalmente ameaçadas). O Índice da Lista Vermelha atualizado mostra que o status dos anfíbios está se deteriorando globalmente, particularmente para salamandras e nos Neotrópicos. Doenças e perda de habitat impulsionaram 91% das deteriorações de status entre 1980 e 2004. Efeitos contínuos e projetados das mudanças climáticas agora são de crescente preocupação, impulsionando 39% das deteriorações de status desde 2004, seguido pela perda de habitat (37%). Embora sinais de recuperação de espécies incentivem ações imediatas de conservação, é urgentemente necessário investir em escala para reverter as tendências atuais.

@article{doi101038s41586023065784,
    author = "Luedtke, Jennifer and Chanson, Janice and Neam, Kelsey and Hobin, Louise and Maciel, Adriano Oliveira and Catenazzi, Alessandro and Borzée, Amaël and Hamidy, Amir and Aowphol, Anchalee and Jean, Anderson and Sosa-Bartuano, Ángel and G, A and de Silva, Anslem and Fouquet, Antoine and Angulo, Ariadne and Кидов, А. А. and Saravia, Arturo Muñoz and Diesmos, Arvin C. and Tominaga, A and Shrestha, Biraj and Gratwicke, Brian and Tjaturadi, Burhan and Rivera, Carlos C. Martínez and Almazán, Carlos R. Vásquez and Señaris, J. Celsa and Chandramouli, S.R. and Strüssmann, Christine and Fernández, Claudia Fabiola Cortez and Azat, Claudio and Hoskin, Conrad J. and Hilton‐Taylor, Craig and Whyte, Damion L. and Gower, David J. and Olson, Deanna H. and Cisneros‐Heredia, Diego F. and Santana, Diego José and Nagombi, Elizah and Najafi-Majd, Elnaz and Quah, Evan S. H. and Bolaños, Federico and Xie, Feng and Brusquetti, Francisco and Álvarez, Francisco S. and Andreone, Franco and Glaw, Frank and Castañeda, Franklin and Kraus, Fred and Parra‐Olea, Gabriela and Cháves, Gerardo and Medina-Rangel, Guido Fabián and GONZÁLEZ-DURÁN, GUSTAVO A. and Ortega‐Andrade, H. Mauricio and Machado, Iberê Farina and Das, Indraneil and Dias, Iuri Ribeiro and Urbina‐Cardona, J. Nicolás and Crnobrnja‐Isailović, Jelka and Yang, Jian-Huan and Jianping, Jiang and Wangyal, Jigme Tshelthrim and Rowley, Jodi J. L. and Measey, John and Vasudevan, Karthikeyan and Chan, Kin Onn and Gururaja, KV and Ovaska, Kristiina and Warr, Lauren C. and Canseco-Márquez, Luis and Toledo, Luı́s Felipe and Díaz, Luis M. and Khan, M. Monirul H. and Meegaskumbura, Madhava and Acevedo, Manuel E. and Napoli, Marcelo Felgueiras and Ponce, Marcos and Vaira, Marcos and Lampo, Margarita and Yánez-Muñóz, Mario H. and Scherz, Mark D. and Rödel, Mark‐Oliver and Matsui, Masafumi and Fildor, Maxon and Kusrini, Mirza Dikari and Ahmed, M. Firoz and Rais, Muhammad and Kouamé, N'Goran G. and García, Nieves and Gonwouo, Nono L. and Burrowes, Patricia A. and Imbun, Paul Y. and Wagner, Philipp and Kok, Philippe J. R. and Joglar, Rafael L. and Auguste, Renoir J. and Brandão, Reuber Albuquerque and Ibáñez, Roberto and von May, Rudolf and Hedges, S. Blair and Biju, S. D. and Ganesh, S.R.",
    title = "Declines contínuos dos anfíbios do mundo diante de ameaças emergentes",
    year = "2023",
    journal = "Nature",
    abstract = "Avaliações sistemáticas do risco de extinção de espécies em intervalos regulares são necessárias para informar ações de conservação 1,2. Desenvolvimentos contínuos em taxonomia, processos ameaçadores e pesquisas reforçam ainda mais a necessidade de reavaliação 3,4. Aqui, relatamos os resultados da segunda Avaliação Global de Anfíbios, avaliando 8.011 espécies para a Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da União Internacional para a Conservação da Natureza. Encontramos que os anfíbios são a classe de vertebrados mais ameaçada (40,7% das espécies estão globalmente ameaçadas). O Índice da Lista Vermelha atualizado mostra que o status dos anfíbios está se deteriorando globalmente, particularmente para salamandras e nos Neotrópicos. Doenças e perda de habitat impulsionaram 91% das deteriorações de status entre 1980 e 2004. Efeitos contínuos e projetados das mudanças climáticas agora são de crescente preocupação, impulsionando 39% das deteriorações de status desde 2004, seguido pela perda de habitat (37%). Embora sinais de recuperação de espécies incentivem ações imediatas de conservação, é urgentemente necessário investir em escala para reverter as tendências atuais.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-023-06578-4",
    doi = "10.1038/s41586-023-06578-4",
    openalex = "W4387344519"
}

Os anfíbios representam um grupo diverso de tetrápodes, marcado por tempos de divergência profundos entre suas três ordens sistemáticas e famílias. O estudo da biologia dos anfíbios através da lente da genômica aumenta nossa compreensão das características desta classe animal e de outros vertebrados terrestres. A necessidade de recursos genômicos de anfíbios é mais urgente do que nunca devido às crescentes ameaças a este grupo. Os anfíbios são um dos grupos taxonômicos mais ameaçados, com aproximadamente 41% das espécies ameaçadas de extinção devido à perda de habitat, mudanças nos padrões de uso da terra, doenças, mudanças climáticas e seus efeitos sinérgicos. Os recursos genômicos de anfíbios proporcionaram uma melhor compreensão da diversidade ontogenética, regeneração tecidual, história de vida diversa e modos reprodutivos, estratégias anti-predadores e resiliência e respostas adaptativas. Eles também servem como modelos essenciais para o estudo de traços genômicos amplos, como expansões e contrações evolutivas do genoma, pois exibem a maior variedade de tamanhos de genoma entre todos os táxons animais e possuem múltiplos mecanismos de determinação sexual genética. Apesar dessas características, a sequenciação do genoma de anfíbios tem ficado significativamente atrás da de outros vertebrados, principalmente devido aos desafios de montar seus grandes genomas ricos em repetições e à relativa falta de apoio social. O surgimento de tecnologias de sequenciamento de leitura longa, combinado com técnicas moleculares e computacionais avançadas que melhoram o esqueletização e reduzem a carga de trabalho computacional, agora torna possível enfrentar alguns desses desafios. Para promover e acelerar a produção e o uso de pesquisas em genômica de anfíbios por meio de coordenação e colaboração internacionais, lançamos o Consórcio de Genômica de Anfíbios (AGC, https://mvs.unimelb.edu.au/amphibian-genomics-consortium) no início de 2023. Esta comunidade em crescimento já tem mais de 282 membros de 41 países. O AGC visa aproveitar as diversas capacidades de seus membros para avançar os recursos genômicos para anfíbios e preencher a lacuna de implementação entre biólogos, bioinformáticos e praticantes de conservação. Aqui avaliamos o estado do campo da genômica de anfíbios, destacamos estudos anteriores, apresentamos desafios a serem superados e convidamos as comunidades de pesquisa e conservação a se unirem como parte do AGC para permitir que a pesquisa em genômica de anfíbios "pule" para o próximo nível.

@article{doi101186s12864024108997,
    author = "Kosch, Tiffany A. and Torres‐Sánchez, María and Liedtke, H. Christoph and Summers, Kyle and Yun, Maximina H. and Crawford, Andrew J. and Maddock, Simon T. and Ahammed, Md. Sabbir and Araújo, Victor and Bertola, Lorenzo V. and Bucciarelli, Gary M. and Carné, Albert and Carneiro, Céline M. and Chan, Kin Onn and Chen, Ying and Crottini, Angelica and da Silva, Jessica M. and Denton, Robert D. and Dittrich, C. and Themudo, Gonçalo Espregueira and Farquharson, Katherine A. and Forsdick, Natalie J. and Gilbert, Edward M. and Che, Jing and Katzenback, Barbara A. and Kotharambath, Ramachandran and Levis, Nicholas A. and Márquez, Roberto and Mazepa, Glib and Mulder, Kevin P. and Müller, Hendrik and O’Connell, Mary J. and Orozco‐terWengel, Pablo and Palomar, Gemma and Petzold, Alice and Pfennig, David W. and Pfennig, Karin S. and Reichert, Michael S. and Robert, Jacques and Scherz, Mark D. and Siu-Ting, Karen and Snead, Anthony A. and Stöck, Matthias and Stuckert, Adam M. M. and Stynoski, Jennifer L. and Tarvin, Rebecca D. and Valero, Katharina C. Wollenberg and Acevedo, Aldemar A. and Allain, Steven J. R. and Barrow, Lisa N. and Basanta, M. Delia and Biello, Roberto and Bittencourt-Silva, Gabriela B. and Borzée, Amaël and Brennan, Ian G. and Brown, Rafe M. and Calatayud, Natalie E. and Cayuela, Hugo and Chai, Jing and la Riva, Ignacio De and Deaton, Lana J. and Eisawi, Khalid A. E. and Elmer, Kathryn R. and Funk, W. Chris and Gagliardi‐Urrutia, Giussepe and Gao, Wei and Goodman, Mark J. and Goutte, Sandra and Poveda, Melissa Hernandez and Hrbek, Tomas and Iyiola, Oluyinka A. and Jongsma, Gregory F. M. and Keogh, J. Scott and Lan, Tianming and Lechuga-Paredes, Pablo and Lemmon, Emily Moriarty and Lougheed, Stephen C. and Lyons, T. and Lyra, Mariana L. and McGuire, Jimmy A. and Méndez, Marco A. and Mobarak, Hosne and Nemesházi, Edina and Nguyen, Tao Thien and Nicolaï, Michaël P. J. and Nneji, Lotanna M. and Owens, John Benjamin and Pérez‐Mendoza, Hibraim Adán and Pollet, Nicolas and Power, Megan L. and Rahman, Mizanur and Recknagel, Hans and Rodríguez-Frandsen, Ariel and Ron, Santiago R. and Sabino‐Pinto, Joana and Sang, Yongming and Sapkota, Suman and Schneider, Rosio Gabriela and Schulte, Laura and Silva, Ana Serra",
    title = "The Amphibian Genomics Consortium: advancing genomic and genetic resources for amphibian research and conservation",
    year = "2024",
    journal = "BMC Genomics",
    abstract = {Os anfíbios representam um grupo diverso de tetrápodes, marcado por tempos de divergência profunda entre seus três ordens sistemáticas e famílias. O estudo da biologia dos anfíbios através da lente da genômica aumenta nossa compreensão das características desta classe animal e de outros vertebrados terrestres. A necessidade de recursos genômicos para anfíbios é mais urgente do que nunca devido às ameaças crescentes a este grupo. Os anfíbios são um dos grupos taxonômicos mais ameaçados, com aproximadamente 41% das espécies ameaçadas de extinção devido à perda de habitat, mudanças nos padrões de uso da terra, doenças, mudanças climáticas e seus efeitos sinérgicos. Os recursos genômicos de anfíbios proporcionaram uma melhor compreensão da diversidade ontogenética, regeneração tecidual, história de vida diversa e modos reprodutivos, estratégias anti-predadores e resiliência e respostas adaptativas. Eles também servem como modelos essenciais para o estudo de amplos traços genômicos, como expansões e contrações evolutivas do genoma, pois exibem a maior variedade de tamanhos de genoma entre todos os táxons animais e possuem múltiplos mecanismos de determinação sexual genética. Apesar dessas características, a sequenciação do genoma de anfíbios tem ficado significativamente atrás da de outros vertebrados, principalmente devido aos desafios de montar seus grandes genomas ricos em repetições e à relativa falta de apoio social. O surgimento de tecnologias de sequenciamento de leitura longa, combinado com técnicas moleculares e computacionais avançadas que melhoram o *scaffolding* e reduzem a carga computacional, agora torna possível enfrentar alguns desses desafios. Para promover e acelerar a produção e o uso de pesquisas em genômica de anfíbios por meio de coordenação e colaboração internacionais, lançamos o Amphibian Genomics Consortium (AGC, https://mvs.unimelb.edu.au/amphibian-genomics-consortium) no início de 2023. Esta comunidade em crescimento já tem mais de 282 membros de 41 países. O AGC visa aproveitar as diversas capacidades de seus membros para avançar os recursos genômicos para anfíbios e preencher a lacuna de implementação entre biólogos, bioinformáticos e praticantes de conservação. Aqui avaliamos o estado do campo da genômica de anfíbios, destacamos estudos anteriores, apresentamos desafios a serem superados e convidamos as comunidades de pesquisa e conservação a se unirem como parte do AGC para permitir que a pesquisa em genômica de anfíbios "salte" para o próximo nível.},
    url = "https://doi.org/10.1186/s12864-024-10899-7",
    doi = "10.1186/s12864-024-10899-7",
    openalex = "W4403983166",
    references = "doi101038s41467022344744"
}

O Equador é reconhecido por possuir uma alta diversidade de espécies de anuros, que estão distribuídas principalmente ao sul das montanhas dos Andes. No entanto, devido à sua localização geográfica e acessibilidade, há poucos estudos relacionados à microbiota cultivável desses anfíbios nesta região. O objetivo deste estudo foi explorar a biodiversidade bacteriana e fúngica presente na pele de espécies silvestres de anuros nos Andes do sul do Equador e observar se as barreiras geográficas na região poderiam aumentar a variabilidade da microbiota cultivável por meio de espectrometria de massas MALDI-TOF. Esta análise revelou a presença de 29 táxons bacterianos e 9 táxons fúngicos, constituídos principalmente por: Pseudomonas chlororaphis (28%), Acinetobacter iwoffii (14%), Pseudomonas fluorescens (14%) e Hortaea werneckii (26,4%), Fusarium solani (20,5%), Syncephalastrum spp. (20,5%), respectivamente. A diversidade variou entre os cinco locais de amostragem, com a localização geográfica provando ser um fator significativo de diversidade. Alguns dos gêneros bacterianos e fúngicos mais abundantes têm associações importantes com doenças de pele em animais selvagens e humanos. Este trabalho representa um vislumbre da biodiversidade complexa de bactérias e fungos que habitam o substrato dérmico, e serão necessários estudos adicionais para melhor compreender a biodiversidade bacteriana e fúngica com implicações potenciais para o estabelecimento de estratégias de conservação, juntamente com o desenvolvimento de medidas necessárias de proteção animal.

@article{doi101007s00248025025558,
    author = "Salazar, J e González, José M. e Riofrío, Romel e Siavichay, Fausto R. e Carrera, Mónica e Mogrovejo, Adriana e Barrera-Galicia, Guadalupe C. e Valdez-Tenezaca, Adrián",
    title = "Caracterização por Espectrometria de Massas MALDI-TOF da Microbiota Cultivável Associada à Pele de Anfíbios das Montanhas dos Andes do Sul do Equador",
    year = "2025",
    journal = "Microbial Ecology",
    abstract = "O Equador é reconhecido por possuir uma alta diversidade de espécies de anuros, que estão distribuídas principalmente ao sul das montanhas dos Andes. No entanto, devido à sua localização geográfica e acessibilidade, há poucos estudos relacionados à microbiota cultivável desses anfíbios nesta região. O objetivo deste estudo foi explorar a biodiversidade bacteriana e fúngica presente na pele de espécies silvestres de anuros nos Andes do sul do Equador e observar se as barreiras geográficas na região poderiam aumentar a variabilidade da microbiota cultivável por meio de espectrometria de massas MALDI-TOF. Esta análise revelou a presença de 29 táxons bacterianos e 9 táxons fúngicos, constituídos principalmente por: Pseudomonas chlororaphis (28%), Acinetobacter iwoffii (14%), Pseudomonas fluorescens (14%) e Hortaea werneckii (26,4%), Fusarium solani (20,5%), Syncephalastrum spp. (20,5%), respectivamente. A diversidade variou entre os cinco locais de amostragem, com a localização geográfica provando ser um fator significativo de diversidade. Alguns dos gêneros bacterianos e fúngicos mais abundantes têm associações importantes com doenças de pele em animais selvagens e humanos. Este trabalho representa um vislumbre da biodiversidade complexa de bactérias e fungos que habitam o substrato dérmico, e serão necessários estudos adicionais para melhor compreender a biodiversidade bacteriana e fúngica com implicações potenciais para o estabelecimento de estratégias de conservação, juntamente com o desenvolvimento de medidas necessárias de proteção animal.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00248-025-02555-8",
    doi = "10.1007/s00248-025-02555-8",
    openalex = "W4410605956",
    references = "doi1010029780470278376, doi101007978140208259754, doi101038nrg3182, doi101038nrmicro1129, doi101038s41586023065784, doi101086600885, doi101126science1176765, doi101126scienceaav0379, doi101128cmr0001407, doi101128cmr122310, doi101128mmbr6744915022003"
}

@misc{doi1021203rs3rs5921108v1,
    author = "Salazar, Jazmín M. e Rojas, Juan Sebastián e Riofrío, Romel e Siavichay, Fausto R. e Carrera, Mónica e Mogrovejo, Adriana e Barrera-Galicia, Guadalupe C. e Valdez-Tenezaca, Adrián",
    title = "Caracterização da microbiota cultivável associada à pele de anfíbios (Anura) nos Andes do sul do Equador",
    year = "2025",
    booktitle = "Research Square",
    url = "https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-5921108/v1",
    doi = "10.21203/rs.3.rs-5921108/v1",
    openalex = "W4409095918",
    references = "doi1010029780470278376, doi101007978140208259754, doi101038nrg3182, doi101038nrmicro1129, doi101038s41586023065784, doi101086600885, doi101126science421074161, doi101126scienceaav0379, doi101128cmr0001407, doi101128cmr122310, doi101128mmbr6744915022003"
}

A introdução de espécies representa hoje um dos problemas mais importantes da conservação da natureza. Atenção especial é dada às plantas vasculares e vertebrados alienígenas. Na Região Afrotropical (África Subsaariana), no entanto, há uma falta de revisão abrangente de anfíbios e répteis alienígenas. O artigo apresentado constitui uma tentativa de revisar o status, distribuição e ameaças impostas por espécies de herpetos introduzidas à África Subsaariana desde a segunda metade do século XVIII. Esta revisão inclui 21 espécies de anfíbios (incluindo 10 estabelecidas) e 57 espécies de répteis (incluindo 33 estabelecidas) introduzidas na África Subsaariana. A maioria das espécies introduzidas na África Subsaariana que posteriormente desenvolveram populações viáveis originou-se das Regiões Malgaxe (32%), Afrotropical (30%) e Oriental (27%). A maioria das introduções ocorreu nas últimas duas décadas, principalmente como resultado de um aumento no comércio internacional e na indústria de répteis como animais de estimação, especialmente na África do Sul. A introdução clandestina e o comércio de animais de estimação são as vias de introdução mais comuns. Vários fatores determinam o estabelecimento bem-sucedido de espécies de herpetos alienígenas introduzidas na África Subsaariana, a saber: características comportamentais e morfológicas, pressão de propagulos, sobreposição climática e de habitat, e presença de espécies potencialmente competidoras. O impacto dos herpetos alienígenas na África Subsaariana sobre a biodiversidade local não está bem investigado. Em comparação com outros continentes, o número de espécies de herpetos introduzidas e estabelecidas na África Subsaariana é relativamente baixo. A Região Malgaxe tem o maior número de espécies de herpetos introduzidas na África Subsaariana.

@article{doi103390biology15080639,
    author = "Kopij, Grzegorz",
    title = "Herping the African Continent: Alien Amphibians and Reptiles in Sub-Saharan Africa.",
    year = "2026",
    journal = "Biology",
    abstract = "Introduction of species represents today one of the most important problems of nature conservation. Special attention is paid to alien vascular plants and vertebrates. In the Afrotropical Region (sub-Saharan Africa), however, there is a lack of comprehensive review of alien amphibians and reptiles. The presented paper constitutes an attempt to overview the status, distribution and threats posed by introduced herp species to sub-Saharan Africa since the second half of the 18th century. This review includes 21 amphibian (including 10 established) and 57 reptile (including 33 established) species introduced to sub-Saharan Africa. Most species introduced to sub-Saharan Africa which subsequently developed viable populations originated from the Malagasy (32\%), Afrotropical (30\%), and Oriental (27\%) Regions. Most introductions were made in the last two decades, mostly as results of an increase in international trade and herp pet industry, especially in South Africa. Stowaway and pet trade are the most common pathways of introductions. Several factors determine the successful establishment of introduced alien herp species in sub-Saharan Africa, viz. behavioral and morphological traits, propagule pressure, climate and habitat overlap, and presence of potentially competing species. The impact of alien herps in sub-Saharan Africa on the local biodiversity is not well investigated. In comparison with other continents the number of introduced and established herp species in sub-Saharan Africa is relatively low. The Malagasy Region has the highest number of introduced herp species in sub-Saharan Africa.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42041919/",
    doi = "10.3390/biology15080639",
    pmid = "42041919"
}