1. Arnold, C. A, 1947, Introdução à Paleobotânica.
BibTeX
@misc{arnold1947introduction1,
author = "Arnold, C. A",
title = "Introdução à Paleobotânica",
year = "1947",
howpublished = "Nova York, McGraw-Hill, 433 p",
note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Arnold, C. A., 1947, Introdução à Paleobotânica: Nova York, McGraw-Hill, 433 p.}"
}
2. Stebbins, G. Ledyard, 1947, Evidências sobre as taxas de evolução a partir da distribuição de espécies vegetais existentes e fósseis: Ecological Monographs.
BibTeX
@article{doi1023071943261,
author = "Stebbins, G. Ledyard",
title = "Evidências sobre as taxas de evolução a partir da distribuição de espécies vegetais existentes e fósseis",
year = "1947",
journal = "Ecological Monographs",
url = "https://doi.org/10.2307/1943261",
doi = "10.2307/1943261",
openalex = "W1998160448"
}
3. Chaney, R. W, 1949, Tendências evolutivas nas angiospermas, em Jepsen, G. L., Simpson, G. G., e Mayr, E., eds., Genética, Paleontologia e Evolução: Princeton, Nova Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p.
BibTeX
@book{chaney1949evolutionary2,
author = "Chaney, R. W",
title = "Tendências evolutivas nas angiospermas, em Jepsen, G. L., Simpson, G. G., e Mayr, E., eds., Genética, Paleontologia e Evolução",
year = "1949",
publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p",
note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Chaney, R. W., 1949, Evolutionary trends in the angiosperms, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., and Mayr, E., eds., Genetics, Paleontology and Evolution: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p.}"
}
4. Axelrod, Daniel I., 1952, UMA TEORIA DA EVOLUÇÃO DE ANGIOSPERMAS: Evolução.
DOI: 10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x
Resumo
Artigo de Revista UMA TEORIA DA EVOLUÇÃO DE ANGIOSPERMAS Obter acesso Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod Universidade da Califórnia Los Angeles Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Evolução, Volume 6, Edição 1, 1 de março de 1952, Páginas 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Publicado: 01 de março de 1952 Histórico do artigo Recebido: 22 de outubro de 1951 Publicado: 01 de março de 1952
BibTeX
@article{doi101111j155856461952tb02810x,
author = "Axelrod, Daniel I.",
title = "UMA TEORIA DA EVOLUÇÃO DE ANGIOSPERMAS",
year = "1952",
journal = "Evolução",
abstract = "Artigo de Revista UMA TEORIA DA EVOLUÇÃO DE ANGIOSPERMAS Obter acesso Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod Universidade da Califórnia Los Angeles Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Evolução, Volume 6, Edição 1, 1 de março de 1952, Páginas 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Publicado: 01 de março de 1952 Histórico do artigo Recebido: 22 de outubro de 1951 Publicado: 01 de março de 1952",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
doi = "10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
openalex = "W2320024939",
references = "doi101144transglas211117"
}
5. Axelrod, Daniel I., 1952, A Theory of Angiosperm Evolution: Evolução.
BibTeX
@article{doi1023072405502,
author = "Axelrod, Daniel I.",
title = "A Theory of Angiosperm Evolution",
year = "1952",
journal = "Evolução",
url = "https://doi.org/10.2307/2405502",
doi = "10.2307/2405502",
openalex = "W4240185923"
}
6. Whittaker, R. H, 1969, Evolução da diversidade em comunidades vegetais: Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, p. 178-196.
BibTeX
@inproceedings{whittaker1969evolução4,
author = "Whittaker, R. H",
title = "Evolução da diversidade em comunidades vegetais",
year = "1969",
booktitle = "Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, p. 178-196",
note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Whittaker, R. H., 1969, Evolução da diversidade em comunidades vegetais: Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, p. 178-196.}"
}
7. Banks, Harlan P., 1970, Angiospermas — o Culminado da Evolução das Plantas: Evolução e Plantas do Passado: p. 147-160.
DOI: 10.1007/978-1-349-01818-5_9
BibTeX
@incollection{banks1970angiosperms,
author = "Banks, Harlan P.",
title = "Angiospermas — o Culminado da Evolução das Plantas",
year = "1970",
booktitle = "Evolução e Plantas do Passado",
url = "https://doi.org/10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
doi = "10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
openalex = "W2482891615",
pages = "147-160",
references = "doi101111j155856461952tb02810x, doi101144gsljgs1923079010409, doi1023071943261, doi1023072405502, doi1023072799872, doi105962bhltitle110147, openalexw1560240034"
}
8. Cronquist, Arthur e Stebbins, G. Ledyard, 1975, Flowering Plants. Evolution above the Species Level: Taxon.
BibTeX
@article{doi1023071218350,
author = "Cronquist, Arthur e Stebbins, G. Ledyard",
title = "Flowering Plants. Evolution above the Species Level",
year = "1975",
journal = "Taxon",
url = "https://doi.org/10.2307/1218350",
doi = "10.2307/1218350",
openalex = "W1589280229"
}
9. Thorne, Robert F. e Beck, Charles B., 1976, Origem e Evolução Inicial das Angiospermas.: Systematic Botany.
BibTeX
@article{doi1023072418725,
author = "Thorne, Robert F. e Beck, Charles B.",
title = "Origem e Evolução Inicial das Angiospermas.",
year = "1976",
journal = "Systematic Botany",
url = "https://doi.org/10.2307/2418725",
doi = "10.2307/2418725",
openalex = "W1981841294"
}
10. Grubb, P. J., 1977, A MANUTENÇÃO DA RIQUEZA DE ESPÉCIES EM COMUNIDADES DE PLANTAS: A IMPORTÂNCIA DA NICHE DE REGENERAÇÃO: Biological reviews/Revisões biológicas da Sociedade Filosófica de Cambridge.
DOI: 10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x
Resumo
RESUMO De acordo com a 'hipótese de Gause', uma consequência do processo de evolução por seleção natural é que, em uma comunidade em equilíbrio, cada espécie deve ocupar um nicho diferente. Muitos botânicos consideraram essa ideia improvável porque ignoraram os processos de regeneração em comunidades vegetais. A maioria das comunidades vegetais é mais duradoura do que as plantas individuais que as constituem. Quando um indivíduo morre, ele pode ou não ser substituído por um indivíduo da mesma espécie. É esta etapa de substituição que é fundamental para o argumento apresentado. Vários mecanismos que não envolvem regeneração também contribuem para a manutenção da riqueza de espécies: diferenças na forma de vida combinadas com a incapacidade de plantas maiores de esgotar ou cortar todos os recursos, também o desenvolvimento de relações de dependência, diferenças na fenologia combinadas com tolerância à supressão, flutuações no ambiente combinadas com diferenças relativamente pequenas na capacidade competitiva entre muitas espécies, a capacidade de certos pares de espécies formarem misturas estáveis devido a um equilíbrio entre a competição intraespecífica e a competição interespecífica, a produção de substâncias mais tóxicas para a espécie produtora do que para as outras espécies, diferenças nos nutrientes minerais primários limitantes ou nos tamanhos dos poros no solo para plantas vizinhas de diferentes espécies, e diferenças nas capacidades competitivas de espécies dependentes de sua idade fisiológica combinadas com a estrutura de idade desigual de muitas populações. Os mecanismos listados acima não explicam muito bem a persistência indefinida em mistura de muitas espécies nas comunidades mais ricas em espécies conhecidas. Em contraste, parecem existir quase infinitas possibilidades de diferenças entre espécies em seus requisitos para regeneração, ou seja, a substituição das plantas individuais de uma geração por aquelas da próxima. Esta ideia é ilustrada para espécies arbóreas e enfatiza-se que os florestais foram, por uma ampla margem, os primeiros a perceber sua importância. Os processos envolvidos na invasão bem-sucedida de uma abertura por uma dada espécie vegetal e algumas características da abertura que podem ser importantes são resumidos na Tabela 2. A definição do nicho de uma planta requer o reconhecimento de quatro componentes: o nicho de habitat, o nicho de forma de vida, o nicho fenológico e o nicho de regeneração. É fornecido um breve relato dos padrões de regeneração em diferentes tipos de comunidade vegetal para fornecer um pano de fundo para estudos de diferenciação no nicho de regeneração. Todas as etapas no ciclo de regeneração são potencialmente importantes e exemplos de diferenciação entre espécies são fornecidos para cada uma das seguintes etapas: Produção de semente viável (incluindo as sub-etapas de floração, polinização e formação de sementes), dispersão, no espaço e no tempo, germinação, estabelecimento e desenvolvimento posterior da planta imatura. Na discussão conclusiva, ênfase é colocada nos seguintes temas: os tipos de trabalho necessários no futuro para provar ou refutar que a diferenciação no nicho de regeneração é a explicação principal para a manutenção da riqueza de espécies em comunidades vegetais, a relação da presente tese com ideias publicadas sobre a origem da dispersão fenológica, a relevância da presente tese para a discussão sobre a presença de contínuos na vegetação, a coincidência da presente tese com as ideias emergentes dos evolucionistas sobre a diferenciação de táxons de angiospermas e a importância dos estudos de regeneração para a conservação.
BibTeX
@article{doi101111j1469185x1977tb01347x,
author = "Grubb, P. J.",
title = "A MANUTENÇÃO DA RIQUEZA DE ESPÉCIES EM COMUNIDADES DE PLANTAS: A IMPORTÂNCIA DA NICHE DE REGENERAÇÃO",
year = "1977",
journal = "Biological reviews/Biological reviews da Sociedade Filosófica de Cambridge",
abstract = "RESUMO De acordo com a 'hipótese de Gause', uma consequência do processo de evolução por seleção natural é que, em uma comunidade em equilíbrio, cada espécie deve ocupar uma nicho diferente. Muitos botânicos encontraram essa ideia improvável porque ignoraram os processos de regeneração em comunidades de plantas. A maioria das comunidades de plantas é mais duradoura do que as plantas individuais que as constituem. Quando um indivíduo morre, ele pode ou não ser substituído por um indivíduo da mesma espécie. É esta etapa de substituição que é fundamental para o argumento apresentado. Vários mecanismos que não envolvem regeneração também contribuem para a manutenção da riqueza de espécies: diferenças na forma de vida combinadas com a incapacidade de plantas maiores de esgotar ou cortar todos os recursos, também o desenvolvimento de relações de dependência, diferenças na fenologia combinadas com tolerância à supressão, flutuações no ambiente combinadas com diferenças relativamente pequenas na capacidade competitiva entre muitas espécies, a capacidade de certos pares de espécies formarem misturas estáveis devido a um equilíbrio entre a competição intraespecífica e a competição interespecífica, a produção de substâncias mais tóxicas para a espécie produtora do que para as outras espécies, diferenças nos nutrientes minerais primários limitantes ou nos tamanhos dos poros no solo para plantas vizinhas de diferentes espécies, e diferenças nas capacidades competitivas de espécies dependentes de sua idade fisiológica combinadas com a estrutura de idade desigual de muitas populações. Os mecanismos listados acima não vão longe para explicar a persistência indefinida em mistura de muitas espécies nas comunidades mais ricas em espécies conhecidas. Em contraste, parecem existir quase infinitas possibilidades de diferenças entre espécies em seus requisitos para regeneração, ou seja, a substituição das plantas individuais de uma geração por aquelas da próxima. Essa ideia é ilustrada para espécies de árvores e enfatiza-se que os florestais foram, por uma larga margem, os primeiros a apreciar sua importância. Os processos envolvidos na invasão bem-sucedida de uma abertura por uma dada espécie vegetal e alguns caracteres da abertura que podem ser importantes são resumidos na Tabela 2. A definição da nicho de uma planta requer o reconhecimento de quatro componentes: a nicho de habitat, a nicho de forma de vida, a nicho fenológica e a nicho de regeneração. É dado um breve relato dos padrões de regeneração em diferentes tipos de comunidade de plantas para fornecer um pano de fundo para estudos de diferenciação na nicho de regeneração. Todas as etapas no ciclo de regeneração são potencialmente importantes e exemplos de diferenciação entre espécies são dados para cada uma das seguintes etapas: Produção de semente viável (incluindo as sub-etapas de floração, polinização e formação de sementes), dispersão, no espaço e no tempo, germinação, estabelecimento e desenvolvimento ulterior da planta imatura. Na discussão conclusiva, ênfase é colocada nos seguintes temas: os tipos de trabalho necessários no futuro para provar ou refutar que a diferenciação na nicho de regeneração é a explicação principal para a manutenção da riqueza de espécies em comunidades de plantas, a relação da presente tese com ideias publicadas sobre a origem da dispersão fenológica, a relevância da presente tese para a discussão sobre a presença de contínuos na vegetação, a coincidência da presente tese com as ideias emergentes dos evolucionistas sobre a diferenciação de táxons de angiospermas, e a importância dos estudos de regeneração para a conservação.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
doi = "10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
openalex = "W2119259345",
references = "doi101038242344a0, doi101086282070, doi101086282687, doi101093biomet3812196, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1473655250, doi1015159780691206912, doi1023071218190, doi1023071929601, doi1023072256497, doi1023072258550, doi1023072989767, openalexw1532540194"
}
11. 1979, Evolução e classificação de plantas com flores: Brittonia.
BibTeX
@article{doi101007bf02806171,
title = "Evolução e classificação de plantas com flores",
year = "1979",
journal = "Brittonia",
url = "https://doi.org/10.1007/bf02806171",
doi = "10.1007/bf02806171",
openalex = "W1589755459"
}
12. Doyle, James A. e Donoghue, Michael J., 1986, Filogenia de plantas com sementes e a origem das angiospermas: Uma abordagem cladística experimental: The Botanical Review.
BibTeX
@article{doi101007bf02861082,
author = "Doyle, James A. e Donoghue, Michael J.",
title = "Filogenia de plantas com sementes e a origem das angiospermas: Uma abordagem cladística experimental",
year = "1986",
journal = "The Botanical Review",
url = "https://doi.org/10.1007/bf02861082",
doi = "10.1007/bf02861082",
openalex = "W2063845391",
references = "doi101007bf02858880, doi101126science2314734129, doi1023072413454, doi105962bhltitle118957, openalexw3126336940"
}
13. Keener, Carl S. e Cronquist, Arthur, 1989, A Evolução e Classificação das Plantas com Flores.: Botânica Sistemática.
Resumo
A evolução e classificação das plantas com flores, A evolução e classificação das plantas com flores, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی
BibTeX
@article{doi1023072418914,
author = "Keener, Carl S. e Cronquist, Arthur",
title = "A Evolução e Classificação das Plantas com Flores.",
year = "1989",
journal = "Botânica Sistemática",
abstract = "A evolução e classificação das plantas com flores, A evolução e classificação das plantas com flores, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
url = "https://doi.org/10.2307/2418914",
doi = "10.2307/2418914",
openalex = "W3020856028"
}
14. Freidman, W. E, 1990, Dupla fecundação em Ephedra, uma planta não-florífera; suas implicações para a origem das angiospermas.
BibTeX
@misc{freidman1990double3,
author = "Freidman, W. E",
title = "Dupla fecundação em Ephedra, uma planta não-florífera; suas implicações para a origem das angiospermas",
year = "1990",
howpublished = "Science, v. 247, p. 951",
note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Freidman, W. E., 1990, Dupla fecundação em Ephedra, uma planta não-florífera; suas implicações para a origem das angiospermas: Science, v. 247, p. 951.}"
}
15. Bousquet, Jean e Strauss, Steven H. e Doerksen, Allan H. e Price, Robert A., 1992, Variação extensiva na taxa evolutiva de sequências do gene rbcL entre plantas com sementes.: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Observou-se variação extensiva nas taxas de substituição sinônimas e não sinônimas entre 50 sequências do gene que codifica a subunidade grande da ribulose-1,5-bisfosfato carboxilase (rbcL), representando táxons de briófitas, coníferas, dicotiledôneas e monocotiledôneas. Testes de taxa relativa revelaram diferenças de até 138% para substituições não sinônimas e até 85% para as sinônimas. Dentro das angiospermas, as formas anuais evoluíram mais rapidamente, em média, do que as formas perenes. Essa heterogeneidade de taxa foi mais extensa em sítios não sinônimos do que nos sinônimos, e resultou principalmente de uma aceleração recente da taxa de substituição em muitos grupos de angiospermas.
BibTeX
@article{doi101073pnas89167844,
author = "Bousquet, Jean e Strauss, Steven H. e Doerksen, Allan H. e Price, Robert A.",
title = "Variação extensiva na taxa evolutiva de sequências do gene rbcL entre plantas com sementes.",
year = "1992",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Observou-se variação extensiva nas taxas de substituição sinônimas e não sinônimas entre 50 sequências do gene que codifica a subunidade grande da ribulose-1,5-bisfosfato carboxilase (rbcL), representando táxons de briófitas, coníferas, dicotiledôneas e monocotiledôneas. Testes de taxa relativa revelaram diferenças de até 138\% para substituições não sinônimas e até 85\% para as sinônimas. Dentro das angiospermas, as formas anuais evoluíram mais rapidamente, em média, do que as formas perenes. Essa heterogeneidade de taxa foi mais extensa em sítios não sinônimos do que nos sinônimos, e resultou principalmente de uma aceleração recente da taxa de substituição em muitos grupos de angiospermas.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.89.16.7844",
doi = "10.1073/pnas.89.16.7844",
openalex = "W1968683533"
}
16. Herms, Daniel A. e Mattson, William J., 1992, O Dilema das Plantas: Crescer ou Defender: The Quarterly Review of Biology.
Resumo
Restrições fisiológicas e ecológicas desempenham papéis-chave na evolução dos padrões de crescimento vegetal, especialmente em relação às defesas contra herbívoros. Teorias fenotípicas e de história de vida são unificadas dentro do quadro de equilíbrio crescimento-diferenciação (GDB), formando um sistema integrado de teorias que explicam e preveem padrões de defesa vegetal e interações competitivas em escalas ecológicas e evolutivas. A atividade vegetal no nível celular pode ser classificada como crescimento (divisão e aumento celular) ou diferenciação (mudanças químicas e morfológicas que levam à maturação e especialização celular). A hipótese de defesa vegetal do GDB baseia-se em um compromisso fisiológico entre processos de crescimento e diferenciação. O compromisso entre crescimento e defesa existe porque o metabolismo secundário e o reforço estrutural são fisiologicamente restritos em células que se dividem e aumentam de tamanho, e porque desviam recursos da produção de nova área foliar. Portanto, o dilema das plantas: elas devem crescer rápido o suficiente para completar, mas manter as defesas necessárias para sobreviver na presença de patógenos e herbívoros. O compromisso fisiológico entre crescimento e processos de diferenciação interage com a herbivoria e a competição planta-planta para se manifestar como um compromisso genético entre crescimento e defesa na evolução das estratégias de história de vida vegetal. São revisadas as teorias evolutivas de defesa vegetal. Também estendemos um modelo padrão de taxa de crescimento separando seus componentes ecológicos e evolutivos e formalizando o papel da competição na evolução da defesa vegetal. Concluímos com um modelo conceitual da evolução da defesa vegetal no qual os compromissos fisiológicos vegetais interagem com o ambiente abiótico, competição e herbivoria.
BibTeX
@article{doi101086417659,
author = "Herms, Daniel A. and Mattson, William J.",
title = "The Dilemma of Plants: To Grow or Defend",
year = "1992",
journal = "The Quarterly Review of Biology",
abstract = "Restrições fisiológicas e ecológicas desempenham papéis-chave na evolução dos padrões de crescimento vegetal, especialmente em relação às defesas contra herbívoros. Teorias fenotípicas e de história de vida são unificadas dentro do quadro de equilíbrio crescimento-diferenciação (GDB), formando um sistema integrado de teorias que explicam e preveem padrões de defesa vegetal e interações competitivas em escalas ecológicas e evolutivas. A atividade vegetal no nível celular pode ser classificada como crescimento (divisão e aumento celular) ou diferenciação (mudanças químicas e morfológicas que levam à maturação e especialização celular). A hipótese de defesa vegetal do GDB baseia-se em um compromisso fisiológico entre processos de crescimento e diferenciação. O compromisso entre crescimento e defesa existe porque o metabolismo secundário e o reforço estrutural são fisiologicamente restritos em células que se dividem e aumentam de tamanho, e porque desviam recursos da produção de nova área foliar. Portanto, o dilema das plantas: elas devem crescer rápido o suficiente para completar, mas manter as defesas necessárias para sobreviver na presença de patógenos e herbívoros. O compromisso fisiológico entre crescimento e processos de diferenciação interage com a herbivoria e a competição planta-planta para se manifestar como um compromisso genético entre crescimento e defesa na evolução das estratégias de história de vida vegetal. São revisadas as teorias evolutivas de defesa vegetal. Também estendemos um modelo padrão de taxa de crescimento separando seus componentes ecológicos e evolutivos e formalizando o papel da competição na evolução da defesa vegetal. Concluímos com um modelo conceitual da evolução da defesa vegetal no qual os compromissos fisiológicos vegetais interagem com o ambiente abiótico, competição e herbivoria.",
url = "https://doi.org/10.1086/417659",
doi = "10.1086/417659",
openalex = "W1990151103",
references = "doi101007bf02860717, doi101086283244, doi101086284531, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461985tb00391x, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science188418319, doi101126science2304728895, doi101146annureves19110188000551, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023072389364, openalexw2169917233"
}
17. Barraclough, Timothy G. e Harvey, Paul e Nee, Sean, 1996, Taxa de evolução da sequência do gene rbc L e diversificação de espécies em plantas com flores (angiospermas): Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences.
Resumo
Em comparações entre táxons irmãos, existe uma correlação significativa e positiva entre a taxa de evolução do gene cloroplástico rbc L dentro de famílias de plantas com flores (angiospermas) e o número de espécies nessas famílias. Discutimos brevemente cenários evolutivos alternativos que podem ter gerado essa relação entre a diversificação de espécies e a evolução molecular em plantas com flores.
BibTeX
@article{doi101098rspb19960088,
author = "Barraclough, Timothy G. e Harvey, Paul e Nee, Sean",
title = "Taxa de evolução da sequência do gene rbc L e diversificação de espécies em plantas com flores (angiospermas)",
year = "1996",
journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
abstract = "Em comparações entre táxons irmãos, existe uma correlação significativa e positiva entre a taxa de evolução do gene cloroplástico rbc L dentro de famílias de plantas com flores (angiospermas) e o número de espécies nessas famílias. Discutimos brevemente cenários evolutivos alternativos que podem ter gerado essa relação entre a diversificação de espécies e a evolução molecular em plantas com flores.",
url = "https://doi.org/10.1098/rspb.1996.0088",
doi = "10.1098/rspb.1996.0088",
openalex = "W2121360952",
references = "doi101006mpev19931009, doi101038355511a0, doi101073pnas89167844, doi101098rspb19950031, doi101111j109600311989tb00482x, doi101146annureves22110191001433, doi1023071222465, doi1023072399846, doi1023074109916"
}
18. 1998, Uma Classificação Ordinal para as Famílias de Plantas com Flores: Anais do Jardim Botânico do Missouri.
Resumo
Análises cladísticas recentes estão revelando a filogenia das plantas com flores em cada vez mais detalhes, e há suporte para a monofilia de muitos grupos principais acima do nível de família. Com muitos elementos da sequência de ramificação principal da filogenia estabelecidos, uma classificação suprafamiliar revisada de plantas com flores torna-se tanto viável quanto desejável. Aqui, apresentamos uma classificação de 462 famílias de plantas com flores em 40 ordens putativamente monofiléticas e um pequeno número de grupos superiores informais monofiléticos. Estes últimos são as monocotiledôneas, comelinóides, eudicotiledôneas, eudicotiledôneas centrais, rosídeas incluindo eurosídeas I e II, e asterídeas incluindo euasterídeas I e II. Sob esses grupos informais, também são listadas várias famílias sem atribuição a ordem. No final do sistema, há uma lista adicional de famílias de posição incerta para as quais não existem dados firmes sobre a colocação em qualquer lugar dentro do sistema. Por que rearranjar famílias, ainda menos formalizar ordens? Classificações de nível superior, o agrupamento de espécies em famílias, ordens, etc., são necessárias como ferramentas de referência não apenas na sistemática, mas também em muitas outras áreas da biologia. O conhecimento das relações filogenéticas de grupos principais de organismos, ou seja, uma perspectiva filogenética, está se tornando cada vez mais importante, e, portanto, a necessidade de uma classificação filogenética como uma ferramenta de referência também está se tornando imperativa. Nosso foco principal está nas ordens com uma ênfase secundária nas famílias de plantas com flores. A família é central na sistemática de plantas com flores. Por exemplo, ao estudar uma planta desconhecida, geralmente primeiro identificamos-a até a família. As ordens, por outro lado, até bem recentemente foram de pouca importância, seja por serem morfologicamente indistinguíveis ou, na maioria dos casos, carecerem de qualquer coerência evolutiva (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). No entanto, as ordens são úteis no ensino, para estudar
BibTeX
@article{doi1023072992015,
title = "Uma Classificação Ordinal para as Famílias de Plantas com Flores",
year = "1998",
journal = "Anais do Jardim Botânico do Missouri",
abstract = "Análises cladísticas recentes estão revelando a filogenia das plantas com flores em cada vez mais detalhes, e há suporte para a monofilia de muitos grupos principais acima do nível de família. Com muitos elementos da sequência de ramificação principal da filogenia estabelecidos, uma classificação suprafamiliar revisada de plantas com flores torna-se tanto viável quanto desejável. Aqui, apresentamos uma classificação de 462 famílias de plantas com flores em 40 ordens putativamente monofiléticas e um pequeno número de grupos superiores informais monofiléticos. Estes últimos são as monocotiledôneas, comelinóides, eudicotiledôneas, eudicotiledôneas centrais, rosídeas incluindo eurosídeas I e II, e asterídeas incluindo euasterídeas I e II. Sob esses grupos informais, também são listadas várias famílias sem atribuição a ordem. No final do sistema, há uma lista adicional de famílias de posição incerta para as quais não existem dados firmes sobre a colocação em qualquer lugar dentro do sistema. Por que rearranjar famílias, ainda menos formalizar ordens? Classificações de nível superior, o agrupamento de espécies em famílias, ordens, etc., são necessárias como ferramentas de referência não apenas na sistemática, mas também em muitas outras áreas da biologia. O conhecimento das relações filogenéticas de grupos principais de organismos, ou seja, uma perspectiva filogenética, está se tornando cada vez mais importante, e, portanto, a necessidade de uma classificação filogenética como uma ferramenta de referência também está se tornando imperativa. Nosso foco principal está nas ordens com uma ênfase secundária nas famílias de plantas com flores. A família é central na sistemática de plantas com flores. Por exemplo, ao estudar uma planta desconhecida, geralmente primeiro identificamos-a até a família. As ordens, por outro lado, até bem recentemente foram de pouca importância, seja por serem morfologicamente indistinguíveis ou, na maioria dos casos, carecerem de qualquer coerência evolutiva (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). No entanto, as ordens são úteis no ensino, para estudar",
url = "https://doi.org/10.2307/2992015",
doi = "10.2307/2992015",
openalex = "W143810700"
}
19. Ramsay, Margaret M., 2000, Angiosperms: Encyclopedia of Cell Technology.
DOI: 10.1002/0471250570.spi004
BibTeX
@misc{ramsay2000angiosperms,
author = "Ramsay, Margaret M.",
title = "Angiosperms",
year = "2000",
booktitle = "Encyclopedia of Cell Technology",
url = "https://doi.org/10.1002/0471250570.spi004",
doi = "10.1002/0471250570.spi004"
}
20. Magallón, Susana e Sanderson, Michael J., 2001, TAXAS ABSOLUTAS DE DIVERSIFICAÇÃO EM CLADOS DE ANGIOSPERMAS: Evolução.
DOI: 10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x
Resumo
A extraordinária riqueza de espécies contemporânea e predominância ecológica das plantas com flores (angiospermas) são ainda mais notáveis quando se considera o início relativamente recente de sua diversificação evolutiva. Examinamos a diversificação evolutiva das angiospermas e a distribuição diferencial observada de espécies em clados de angiospermas, estimando a taxa de diversificação para as angiospermas como um todo e para um grande conjunto de clados de angiospermas. Também identificamos clados de angiospermas com diversidade estabelecida que é muito maior ou menor do que o esperado, dado a taxa de diversificação de fundo estimada. O reconhecimento de clados de angiospermas, as relações filogenéticas entre eles e sua composição taxonômica baseia-se em uma compilação empírica de estudos filogenéticos primários. Ao fazer um uso integrativo e crítico do registro paleobotânico, obtemos aproximações razoavelmente seguras para a idade de um grande conjunto de clados de angiospermas. A diversificação foi modelada como um processo estocástico, homogêneo no tempo, de nascimento e morte, que depende da taxa de diversificação (r) e da taxa de extinção relativa (epsilon). Uma análise estatística do processo de nascimento e morte foi então utilizada para obter intervalos de confiança de 95% para o número esperado de espécies ao longo do tempo em um clado que se diversifica a uma taxa igual à das angiospermas como um todo. Intervalos de confiança foram obtidos para as idades do grupo caule e do grupo coroa na ausência de extinção (e = 0.0) e sob uma alta taxa de extinção relativa (epsilon = 0.9). A diversidade estabelecida dos clados de angiospermas foi então comparada à diversidade de espécies esperada de acordo com a taxa de diversificação de fundo e, dependendo de sua posição em relação aos intervalos de confiança calculados, clados excepcionalmente ricos ou excepcionalmente pobres em espécies foram identificados. A taxa de diversificação para as angiospermas como um todo varia de 0,077 (epsilon = 0.9) a 0,089 (epsilon = 0.0) eventos de especiação líquidos por milhão de anos. Dez clados ficam acima dos intervalos de confiança da diversidade de espécies esperada, e 13 clados foram encontrados como inesperadamente pobres em espécies. A distribuição filogenética de clados com um número excepcionalmente alto de espécies sugere que as características que conferem altas taxas de diversificação evoluíram independentemente em diferentes instâncias e não caracterizam as angiospermas como um todo.
BibTeX
@article{doi101111j001438202001tb00826x,
author = "Magallón, Susana and Sanderson, Michael J.",
title = "ABSOLUTE DIVERSIFICATION RATES IN ANGIOSPERM CLADES",
year = "2001",
journal = "Evolution",
abstract = "A extraordinária riqueza de espécies contemporânea e predominância ecológica das plantas com flores (angiospermas) são ainda mais notáveis quando se considera o início relativamente recente de sua diversificação evolutiva. Examinamos a diversificação evolutiva das angiospermas e a distribuição diferencial observada de espécies em clados de angiospermas, estimando a taxa de diversificação para as angiospermas como um todo e para um grande conjunto de clados de angiospermas. Também identificamos clados de angiospermas com diversidade estabelecida que é muito maior ou menor do que o esperado, dado a taxa de diversificação de fundo estimada. O reconhecimento de clados de angiospermas, as relações filogenéticas entre eles e sua composição taxonômica baseia-se em uma compilação empírica de estudos filogenéticos primários. Ao fazer um uso integrativo e crítico do registro paleobotânico, obtemos aproximações razoavelmente seguras para a idade de um grande conjunto de clados de angiospermas. A diversificação foi modelada como um processo estocástico, homogêneo no tempo, de nascimento e morte, que depende da taxa de diversificação (r) e da taxa de extinção relativa (epsilon). Uma análise estatística do processo de nascimento e morte foi então utilizada para obter intervalos de confiança de 95% para o número esperado de espécies ao longo do tempo em um clado que se diversifica a uma taxa igual à das angiospermas como um todo. Intervalos de confiança foram obtidos para as idades do grupo caule e do grupo coroa na ausência de extinção (e = 0.0) e sob uma alta taxa de extinção relativa (epsilon = 0.9). A diversidade estabelecida dos clados de angiospermas foi então comparada à diversidade de espécies esperada de acordo com a taxa de diversificação de fundo e, dependendo de sua posição em relação aos intervalos de confiança calculados, clados excepcionalmente ricos ou excepcionalmente pobres em espécies foram identificados. A taxa de diversificação para as angiospermas como um todo varia de 0,077 (epsilon = 0.9) a 0,089 (epsilon = 0.0) eventos de especiação líquidos por milhão de anos. Dez clados ficam acima dos intervalos de confiança da diversidade de espécies esperada, e 13 clados foram encontrados como inesperadamente pobres em espécies. A distribuição filogenética de clados com um número excepcionalmente alto de espécies sugere que as características que conferem altas taxas de diversificação evoluíram independentemente em diferentes instâncias e não caracterizam as angiospermas como um todo.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
doi = "10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
openalex = "W2031187632",
references = "doi1010029781444313918, doi101006bojl20000380, doi1010079783642616631, doi101007bf02860537, doi101007bf02860540, doi101017s0094837300006539, doi10103846536, doi101086285258, doi101098rspb19960088, doi101098rstb19940068, doi101126science13334591105, doi101214aoms1177730285, doi1023071266137, doi1023072399030, doi1023072992015, openalexw1978269554, openalexw409616968"
}
21. Diamond, Jared M., 2002, Evolução, consequências e futuro da domesticação de plantas e animais: Nature.
BibTeX
@article{doi101038nature01019,
author = "Diamond, Jared M.",
title = "Evolução, consequências e futuro da domesticação de plantas e animais",
year = "2002",
journal = "Nature",
url = "https://doi.org/10.1038/nature01019",
doi = "10.1038/nature01019",
openalex = "W2128616554",
references = "crossref2022quaternary, doi101002sici10969136199712145s7aiddia52233co2i, doi101038414782a, doi101086300102, doi101093acprofosobl97801995490610010001, doi101111j155856461991tb04425x, doi1023071185219, doi1023072137390, doi1023072403680, doi1023072485224, doi1023072803166, doi102307jctv301gjp"
}
22. Lavorel, Sandra e Garnier, Éric, 2002, Prever mudanças na composição da comunidade e no funcionamento do ecossistema a partir de características das plantas: revisitando o Santo Graal: Functional Ecology.
DOI: 10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x
Resumo
Resumo O conceito de tipo funcional de planta propõe que as espécies podem ser agrupadas de acordo com respostas comuns ao ambiente e/ou efeitos comuns sobre os processos do ecossistema. No entanto, o conhecimento das relações entre características associadas à resposta das plantas a fatores ambientais, como recursos e perturbações (características de resposta), e características que determinam os efeitos das plantas sobre as funções do ecossistema (características de efeito), como o ciclo biogeoquímico ou a propensão à perturbação, permanece rudimentar. Apresentamos um quadro de referência usando conceitos e resultados da ecologia de comunidades, ecologia de ecossistemas e biologia evolutiva para fornecer essa ligação. O funcionamento do ecossistema é o resultado final da operação de múltiplos filtros ambientais em uma hierarquia de escalas que, ao selecionar indivíduos com respostas apropriadas, resultam em conjuntos com composição variável de características. As ligações funcionais e compensações entre características, cada uma das quais se relaciona com um ou vários processos, determinam se ou não o filtramento por diferentes fatores dá um ajuste, e se os efeitos do ecossistema podem ser facilmente deduzidos do conhecimento dos filtros. Para ilustrar este quadro de referência, analisamos um conjunto de fatores ambientais chave e processos do ecossistema. Embora as características associadas à resposta a gradientes de nutrientes sobreponham-se fortemente às que determinam a produção primária líquida, encontrou-se pouca sobreposição direta entre a resposta ao fogo e a inflamabilidade. Hipotetizamos que esses padrões refletem tendências gerais. As respostas à disponibilidade de recursos seriam determinadas por características que também estão envolvidas no ciclo biogeoquímico, porque tanto essas respostas quanto os efeitos são impulsionados pela compensação entre aquisição e conservação. Por outro lado, características de regeneração e demográficas associadas à resposta à perturbação, que são conhecidas por ter pouca conexão com características adultas envolvidas na ecofisiologia vegetal, seriam de pouca relevância para os processos do ecossistema. Este quadro de referência provavelmente será amplamente aplicável, embora deva ser exercida cautela para usar ligações de características e compensações apropriadas à escala, condições ambientais e contexto evolutivo. Pode orientar a seleção de tipos funcionais de plantas para modelos de vegetação em uma variedade de escalas e ajudar no desenho de estudos experimentais sobre as relações entre a diversidade vegetal e as propriedades do ecossistema.
BibTeX
@article{doi101046j13652435200200664x,
author = "Lavorel, Sandra e Garnier, Éric",
title = "Prever mudanças na composição da comunidade e no funcionamento do ecossistema a partir de características das plantas: revisitando o Santo Graal",
year = "2002",
journal = "Functional Ecology",
abstract = "Resumo O conceito de tipo funcional de planta propõe que as espécies podem ser agrupadas de acordo com respostas comuns ao ambiente e/ou efeitos comuns sobre os processos do ecossistema. No entanto, o conhecimento das relações entre características associadas à resposta das plantas a fatores ambientais, como recursos e perturbações (características de resposta), e características que determinam os efeitos das plantas sobre as funções do ecossistema (características de efeito), como o ciclo biogeoquímico ou a propensão à perturbação, permanece rudimentar. Apresentamos um quadro de referência usando conceitos e resultados da ecologia de comunidades, ecologia de ecossistemas e biologia evolutiva para fornecer essa ligação. O funcionamento do ecossistema é o resultado final da operação de múltiplos filtros ambientais em uma hierarquia de escalas que, ao selecionar indivíduos com respostas apropriadas, resultam em conjuntos com composição variável de características. As ligações funcionais e compensações entre características, cada uma das quais se relaciona com um ou vários processos, determinam se ou não o filtramento por diferentes fatores dá um ajuste, e se os efeitos do ecossistema podem ser facilmente deduzidos do conhecimento dos filtros. Para ilustrar este quadro de referência, analisamos um conjunto de fatores ambientais chave e processos do ecossistema. Embora as características associadas à resposta a gradientes de nutrientes sobreponham-se fortemente às que determinam a produção primária líquida, encontrou-se pouca sobreposição direta entre a resposta ao fogo e a inflamabilidade. Hipotetizamos que esses padrões refletem tendências gerais. As respostas à disponibilidade de recursos seriam determinadas por características que também estão envolvidas no ciclo biogeoquímico, porque tanto essas respostas quanto os efeitos são impulsionados pela compensação entre aquisição e conservação. Por outro lado, características de regeneração e demográficas associadas à resposta à perturbação, que são conhecidas por ter pouca conexão com características adultas envolvidas na ecofisiologia vegetal, seriam de pouca relevância para os processos do ecossistema. Este quadro de referência provavelmente será amplamente aplicável, embora deva ser exercida cautela para usar ligações de características e compensações apropriadas à escala, condições ambientais e contexto evolutivo. Pode orientar a seleção de tipos funcionais de plantas para modelos de vegetação em uma variedade de escalas e ajudar no desenho de estudos experimentais sobre as relações entre a diversidade vegetal e as propriedades do ecossistema.",
url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
doi = "10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
openalex = "W2168173042",
references = "doi1010079783642809132, doi101007bf00002772, doi101023a1004327224729, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}
23. Brundrett, Mark, 2002, Coevolução de raízes e micorrizas de plantas terrestres: New Phytologist.
DOI: 10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x
Resumo
Aqui, a coevolução de fungos micorrízicos e raízes é avaliada à luz das evidências agora disponíveis, provenientes de estudos paleobotânicos e morfológicos e da análise de filogenias baseadas em DNA. As primeiras plantas terrestres semelhantes a briófitas, no Devoniano inferior (400 milhões de anos atrás), já possuíam associações endofíticas semelhantes às micorrizas vesículo-arbusculares (VAM), mesmo antes da evolução das raízes. A evolução das micorrizas teria progredido de hifas endofíticas para associações equilibradas onde os parceiros eram interdependentes devido à troca de recursos energéticos e nutricionais limitantes. A maioria das micorrizas é mutualística, mas em alguns casos a tendência para um maior controle das plantas sobre os fungos culmina nas micorrizas exploratórias de plantas aclorofiladas e micoheterotróficas. As micorrizas ectomicorrízicas, ericóides e de orquídeas, bem como as raízes não micorrízicas, evoluíram durante o período de rápida radiação das angiospermas no Cretáceo. Hipotetiza-se que as raízes evoluíram gradualmente a partir de rizomas para fornecer habitats mais adequados para fungos micorrízicos e fornecer às plantas ramificações complexas e folhas com água e nutrientes. Pressões seletivas causaram a divergência morfológica das raízes com diferentes tipos de micorrizas. A espessura do córtex radicular e a suberização da exoderme são maiores em plantas obrigatoriamente micorrízicas, enquanto as plantas não micorrízicas tendem a ter raízes finas, com mais pelos radiculares e defesas químicas relativamente avançadas. As principais tendências coevolutivas e o sucesso relativo das plantas com diferentes tipos de raízes são discutidos. Sumário dos Conteúdos 275 I. Introdução 276 II. Fungos Micorrízicos 276 III. O Amanhecer das Micorrizas 279 IV. Associações Micorrízicas de Plantas Vivas e Extintas 282 V. Evolução das Raízes 288 VI. A Raiz como Habitat para Fungos 290 VII. Tendências de Evolução das Micorrizas 295 Agradecimentos 298 Referências 298.
BibTeX
@article{doi101046j14698137200200397x,
author = "Brundrett, Mark",
title = "Coevolution of roots and mycorrhizas of land plants",
year = "2002",
journal = "New Phytologist",
abstract = "Aqui, a coevolução de fungos micorrízicos e raízes é avaliada à luz das evidências agora disponíveis, provenientes de estudos paleobotânicos e morfológicos e da análise de filogenias baseadas em DNA. As primeiras plantas terrestres semelhantes a briófitas, no Devoniano inferior (400 milhões de anos atrás), já possuíam associações endofíticas semelhantes às micorrizas vesículo-arbusculares (VAM), mesmo antes da evolução das raízes. A evolução das micorrizas teria progredido de hifas endofíticas para associações equilibradas onde os parceiros eram interdependentes devido à troca de recursos energéticos e nutricionais limitantes. A maioria das micorrizas é mutualística, mas em alguns casos a tendência para um maior controle das plantas sobre os fungos culmina nas micorrizas exploratórias de plantas aclorofiladas e micoheterotróficas. As micorrizas ectomicorrízicas, ericóides e de orquídeas, bem como as raízes não micorrízicas, evoluíram durante o período de rápida radiação das angiospermas no Cretáceo. Hipotetiza-se que as raízes evoluíram gradualmente a partir de rizomas para fornecer habitats mais adequados para fungos micorrízicos e fornecer às plantas ramificações complexas e folhas com água e nutrientes. Pressões seletivas causaram a divergência morfológica das raízes com diferentes tipos de micorrizas. A espessura do córtex radicular e a suberização da exoderme são maiores em plantas obrigatoriamente micorrízicas, enquanto as plantas não micorrízicas tendem a ter raízes finas, com mais pelos radiculares e defesas químicas relativamente avançadas. As principais tendências coevolutivas e o sucesso relativo das plantas com diferentes tipos de raízes são discutidos. Sumário dos Conteúdos 275 I. Introdução 276 II. Fungos Micorrízicos 276 III. O Amanhecer das Micorrizas 279 IV. Associações Micorrízicas de Plantas Vivas e Extintas 282 V. Evolução das Raízes 288 VI. A Raiz como Habitat para Fungos 290 VII. Tendências de Evolução das Micorrizas 295 Agradecimentos 298 Referências 298.",
url = "https://doi.org/10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
doi = "10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
openalex = "W2142191074",
references = "doi101017s1464793101005735, doi10103837918, doi101146annurevearth261379"
}
24. Forbis, Tara A. e Floyd, Sandra K. e de Queiroz, Alan, 2002, A EVOLUÇÃO DO TAMANHO DO EMBRIÃO EM ANGIOSPERMAS E OUTRAS PLANTAS SEMENTEIRAS: IMPLICAÇÕES PARA A EVOLUÇÃO DA DORMÊNCIA DE SEMENTAS: Evolution.
DOI: 10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x
Resumo
A dormência de sementes desempenha um papel importante na ecologia da germinação e na evolução das plantas sementeiras. A dormência morfológica de sementes é causada por um embrião subdesenvolvido que deve amadurecer antes da germinação. Sugeriu-se que a presença de um embrião subdesenvolvido é plesiomórfica entre as plantas sementeiras e que mudanças direcionais paralelas na morfologia do embrião ocorreram separadamente em gimnospermas e em angiospermas. Testamos essas hipóteses usando dados originais sobre a morfologia do embrião de táxons basais chave, um conjunto de dados publicado e o método de reconstrução de estados ancestrais de caracteres por mínimos quadrados generalizados (GLS). Reconstruções para a razão embrião para semente (E:S) usando médias familiares para 179 famílias mostraram que a E:S aumentou entre a angiosperma ancestral e quase todos os táxons de angiospermas existentes. Espécies no clado rosid têm embriões particularmente grandes em relação à angiosperma ancestral. Os resultados para as gimnospermas mostram um aumento similar, mas menor. Não houve diferenças estatisticamente significativas na E:S entre táxons basais e qualquer grupo derivado devido a erros-padrão extremamente grandes produzidos pelos modelos GLS. No entanto, as diferenças entre os valores reconstruídos para a angiosperma ancestral e nós mais altamente aninhados são grandes e esses resultados são robustos a manipulações topológicas e de comprimento de ramo. Nossa análise apoia a ideia de que o embrião subdesenvolvido é primitivo entre as plantas sementeiras e que houve uma mudança direcional na E:S tanto dentro das angiospermas quanto das gimnospermas. Nossa análise sugere que a dormência imposta por um embrião subdesenvolvido é plesiomórfica entre as angiospermas e que a não-dormência e outros tipos de dormência provavelmente evoluíram dentro das angiospermas. A mudança na E:S foi provavelmente uma mudança heterocrônica e tem implicações importantes para o histórico de vida das plantas sementeiras.
BibTeX
@article{doi101111j001438202002tb00137x,
author = "Forbis, Tara A. e Floyd, Sandra K. e de Queiroz, Alan",
title = "A EVOLUÇÃO DO TAMANHO DO EMBRIÃO EM ANGIOSPERMAS E OUTRAS PLANTAS SEMENTEIRAS: IMPLICAÇÕES PARA A EVOLUÇÃO DA DORMÊNCIA DE SEMENTAS",
year = "2002",
journal = "Evolution",
abstract = "A dormência de sementes desempenha um papel importante na ecologia da germinação e na evolução das plantas sementeiras. A dormência morfológica de sementes é causada por um embrião subdesenvolvido que deve amadurecer antes da germinação. Sugeriu-se que a presença de um embrião subdesenvolvido é plesiomórfica entre as plantas sementeiras e que mudanças direcionais paralelas na morfologia do embrião ocorreram separadamente em gimnospermas e em angiospermas. Testamos essas hipóteses usando dados originais sobre a morfologia do embrião de táxons basais chave, um conjunto de dados publicado e o método de reconstrução de estados ancestrais de caracteres por mínimos quadrados generalizados (GLS). Reconstruções para a razão embrião para semente (E:S) usando médias familiares para 179 famílias mostraram que a E:S aumentou entre a angiosperma ancestral e quase todos os táxons de angiospermas existentes. Espécies no clado rosid têm embriões particularmente grandes em relação à angiosperma ancestral. Os resultados para as gimnospermas mostram um aumento similar, mas menor. Não houve diferenças estatisticamente significativas na E:S entre táxons basais e qualquer grupo derivado devido a erros-padrão extremamente grandes produzidos pelos modelos GLS. No entanto, as diferenças entre os valores reconstruídos para a angiosperma ancestral e nós mais altamente aninhados são grandes e esses resultados são robustos a manipulações topológicas e de comprimento de ramo. Nossa análise apoia a ideia de que o embrião subdesenvolvido é primitivo entre as plantas sementeiras e que houve uma mudança direcional na E:S tanto dentro das angiospermas quanto das gimnospermas. Nossa análise sugere que a dormência imposta por um embrião subdesenvolvido é plesiomórfica entre as angiospermas e que a não-dormência e outros tipos de dormência provavelmente evoluíram dentro das angiospermas. A mudança na E:S foi provavelmente uma mudança heterocrônica e tem implicações importantes para o histórico de vida das plantas sementeiras.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
doi = "10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
openalex = "W2179841627",
references = "doi101007bf02101694, doi10103844766, doi101093oso97801985464120010001, doi1023072529087, doi105860choice185809, doi105860choice295104, doi105860choice362164, openalexw1546962148, openalexw2506868775, openalexw3217097258"
}
25. GROUP*, A FILogenia DAS ANGIOSPERMAS, 2003, Uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas para as ordens e famílias de plantas com flores: APG II: Botanical Journal of the Linnean Society.
DOI: 10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x
BibTeX
@article{doi101046j109583392003t01100158x,
author = "GROUP*, A FILogenia DAS ANGIOSPERMAS",
title = "Uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas para as ordens e famílias de plantas com flores: APG II",
year = "2003",
journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
url = "https://doi.org/10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
doi = "10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
openalex = "W2980373194",
references = "doi1023072399846"
}
26. Davies, T. Jonathan e Savolainen, Vincent e Chase, Mark W. e Moat, Justin e Barraclough, Timothy G., 2004, Energia ambiental e taxas evolutivas em plantas com flores: Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences.
Resumo
O gradiente latitudinal na riqueza de espécies é uma característica pervasiva do mundo vivo, mas suas causas subjacentes permanecem incertas. Avaliamos a hipótese de que a energia ambiental impulsiona as taxas evolutivas e, consequentemente, a diversificação em plantas com flores. Estimamos os níveis de energia ao longo das distribuições de famílias de angiospermas em termos de evapotranspiração, temperatura e radiação UV retirados de bancos de dados de satélite e climáticos. Utilizando a árvore filogenética baseada em DNA mais abrangente para angiospermas até a data, a análise de 86 comparações entre famílias irmãs mostra que as taxas evolutivas moleculares foram, de fato, mais rápidas em regiões de alta energia, mas que isso não é um passo intermediário entre energia e diversidade. A energia tem efeitos fortes, mas independentes, tanto na riqueza de espécies quanto nas taxas evolutivas moleculares.
BibTeX
@article{doi101098rspb20042849,
author = "Davies, T. Jonathan e Savolainen, Vincent e Chase, Mark W. e Moat, Justin e Barraclough, Timothy G.",
title = "Energia ambiental e taxas evolutivas em plantas com flores",
year = "2004",
journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
abstract = "O gradiente latitudinal na riqueza de espécies é uma característica pervasiva do mundo vivo, mas suas causas subjacentes permanecem incertas. Avaliamos a hipótese de que a energia ambiental impulsiona as taxas evolutivas e, consequentemente, a diversificação em plantas com flores. Estimamos os níveis de energia ao longo das distribuições de famílias de angiospermas em termos de evapotranspiração, temperatura e radiação UV retirados de bancos de dados de satélite e climáticos. Utilizando a árvore filogenética baseada em DNA mais abrangente para angiospermas até a data, a análise de 86 comparações entre famílias irmãs mostra que as taxas evolutivas moleculares foram, de fato, mais rápidas em regiões de alta energia, mas que isso não é um passo intermediário entre energia e diversidade. A energia tem efeitos fortes, mas independentes, tanto na riqueza de espécies quanto nas taxas evolutivas moleculares.",
url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2004.2849",
doi = "10.1098/rspb.2004.2849",
openalex = "W2145421207",
references = "doi101098rspb19960088"
}
27. 2005, Angiospermas: Enciclopédia Científica Van Nostrand.
DOI: 10.1002/0471743984.vse0445
BibTeX
@misc{crossref2005angiosperms,
title = "Angiospermas",
year = "2005",
booktitle = "Enciclopédia Científica Van Nostrand",
url = "https://doi.org/10.1002/0471743984.vse0445",
doi = "10.1002/0471743984.vse0445"
}
28. Friis, Else Marie e Pedersen, Kaj Raunsgaard e Crane, Peter R., 2005, Flores de angiospermas do Cretáceo: Inovação e evolução na reprodução vegetal: Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology.
DOI: 10.1016/j.palaeo.2005.07.006
BibTeX
@article{doi101016jpalaeo200507006,
author = "Friis, Else Marie e Pedersen, Kaj Raunsgaard e Crane, Peter R.",
title = "Flores de angiospermas do Cretáceo: Inovação e evolução na reprodução vegetal",
year = "2005",
journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
doi = "10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
openalex = "W2001715812",
references = "doi101007bf02860067, doi101007bf02860540, doi101007bf02861082, doi101016s0012821x0000159x, doi101038363342a0, doi10103846536, doi101038nature01420, doi1010719780643090149, doi1023071485834, doi1023072399030, doi1023072418725, doi1023072807789, doi105860choice323883, doi105860choice323884"
}
29. Kenrick, P., 2005, Angiospermas: Encyclopedia of Geology: p. 501-510.
DOI: 10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2
BibTeX
@incollection{kenrick2005angiosperms,
author = "Kenrick, P.",
title = "Angiospermas",
year = "2005",
booktitle = "Encyclopedia of Geology",
url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
doi = "10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
pages = "501-510"
}
30. Moore, Michael J. e Bell, Charles D. e Soltis, Pamela S. e Soltis, Pamela S., 2007, Usando dados em escala de genoma de plastídeo para resolver relações enigmáticas entre angiospermas basais: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Embora grandes progressos tenham sido feitos na clarificação das relações profundas entre angiospermas, vários nós iniciais no ramo das angiospermas da Árvore da Vida provaram ser difíceis de resolver. Talvez a última grande questão remanescente na filogenia das angiospermas basais envolva a ordem de ramificação entre os cinco principais clados de mesangiospermas (Ceratophyllum, Chloranthaceae, eudicotiledôneas, magnolióides e monocotiledôneas). Análises anteriores não encontraram suporte consistente para as relações entre esses clados. Em um esforço para resolver essas relações, realizamos análises filogenéticas de 61 genes de plastídeo (aproximadamente 42.000 pb) para 45 táxons, incluindo membros de todas as principais linhagens de angiospermas basais. Também relatamos a sequência completa do genoma de plastídeo de Ceratophyllum demersum. As análises de parcimônia de conjuntos de dados combinados e particionados variaram na colocação de vários táxons, particularmente Ceratophyllum, enquanto as árvores de máxima verossimilhança (MV) foram mais topologicamente estáveis. As análises de MV de evidência total recuperaram um clado de Chloranthaceae + magnolióides como irmão de um clado bem suportado de monocotiledôneas + (Ceratophyllum + eudicotiledôneas). Os valores de suporte de bootstrap de MV e Bayesiana para essas relações foram geralmente altos, embora testes de topologia aproximadamente não enviesados não pudessem rejeitar várias topologias alternativas. Os ramos extremamente curtos que separam essas cinco linhagens implicam uma diversificação rápida estimada ter ocorrido entre 143,8 +/- 4,8 e 140,3 +/- 4,8 Mya.
BibTeX
@article{doi101073pnas0708072104,
author = "Moore, Michael J. e Bell, Charles D. e Soltis, Pamela S. e Soltis, Pamela S.",
title = "Usando dados em escala de genoma de plastídeo para resolver relações enigmáticas entre angiospermas basais",
year = "2007",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Embora grandes progressos tenham sido feitos na clarificação das relações profundas entre angiospermas, vários nós iniciais no ramo das angiospermas da Árvore da Vida provaram ser difíceis de resolver. Talvez a última grande questão remanescente na filogenia das angiospermas basais envolva a ordem de ramificação entre os cinco principais clados de mesangiospermas (Ceratophyllum, Chloranthaceae, eudicotiledôneas, magnolióides e monocotiledôneas). Análises anteriores não encontraram suporte consistente para as relações entre esses clados. Em um esforço para resolver essas relações, realizamos análises filogenéticas de 61 genes de plastídeo (aproximadamente 42.000 pb) para 45 táxons, incluindo membros de todas as principais linhagens de angiospermas basais. Também relatamos a sequência completa do genoma de plastídeo de Ceratophyllum demersum. As análises de parcimônia de conjuntos de dados combinados e particionados variaram na colocação de vários táxons, particularmente Ceratophyllum, enquanto as árvores de máxima verossimilhança (MV) foram mais topologicamente estáveis. As análises de MV de evidência total recuperaram um clado de Chloranthaceae + magnolióides como irmão de um clado bem suportado de monocotiledôneas + (Ceratophyllum + eudicotiledôneas). Os valores de suporte de bootstrap de MV e Bayesiana para essas relações foram geralmente altos, embora testes de topologia aproximadamente não enviesados não pudessem rejeitar várias topologias alternativas. Os ramos extremamente curtos que separam essas cinco linhagens implicam uma diversificação rápida estimada ter ocorrido entre 143,8 +/- 4,8 e 140,3 +/- 4,8 Mya.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0708072104",
doi = "10.1073/pnas.0708072104",
openalex = "W2114217421",
references = "doi101016jpalaeo200507006, doi1023072399030, openalexw2163836228"
}
31. Jansen, Robert K. e Cai, Zhengqiu e Raubeson, Linda A. e Daniell, Henry e dePamphilis, Claude W. e Leebens-Mack, James e Müller, Kai e Guisinger-Bellian, Mary e Haberle, Rosemarie C. e Hansen, Anne e Chumley, Timothy W. e Lee, Seung Bum e Peery, Rhiannon M. e McNeal, Joel R. e Kuehl, Jennifer V. e Boore, Jeffrey L., 2007, Análise de 81 genes de 64 genomas plastídicos resolve relações em angiospermas e identifica padrões evolutivos em escala de genoma: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Angiospermas são o clado maior e mais bem-sucedido de plantas terrestres, com mais de 250.000 espécies distribuídas em quase todos os habitats terrestres. Muitos estudos filogenéticos basearam-se em sequências de DNA de um a vários genes, mas, apesar de décadas de esforços intensivos, as relações entre linhagens que divergiram precocemente e vários dos principais clados permanecem ou incompletamente resolvidas ou fracamente suportadas. Realizamos análises filogenéticas de 81 genes plastídicos em 64 genomas sequenciados, incluindo 13 novos genomas, para estimar as relações entre os principais clados de angiospermas, e as árvores resultantes são usadas para examinar a evolução do conteúdo de genes e intrões. Árvores filogenéticas de múltiplos métodos, incluindo abordagens baseadas em modelos, fornecem forte suporte para a posição de Amborella como a linhagem que divergiu mais cedo entre as plantas com flores, seguida por Nymphaeales e Austrobaileyales. As árvores do genoma plastídico também fornecem forte suporte para uma relação de irmã entre eudicotiledôneas e monocotiledôneas, e este grupo é irmão de um clado que inclui Chloranthales e magnolióides. A resolução das relações entre os principais clados de angiospermas fornece a estrutura necessária para abordar inúmeras questões evolutivas sobre a rápida diversificação de angiospermas. O conteúdo de genes e intrões é altamente conservado entre as angiospermas que divergiram precocemente e as eudicotiledôneas basais, mas 62 perdas independentes de genes e intrões estão limitadas aos clados de monocotiledôneas e eudicotiledôneas mais derivados. Além disso, foi detectada uma correlação específica de linhagem entre as taxas de substituições de nucleotídeos, indels e rearranjos genômicos.
BibTeX
@article{doi101073pnas0709121104,
author = "Jansen, Robert K. e Cai, Zhengqiu e Raubeson, Linda A. e Daniell, Henry e dePamphilis, Claude W. e Leebens-Mack, James e Müller, Kai e Guisinger-Bellian, Mary e Haberle, Rosemarie C. e Hansen, Anne e Chumley, Timothy W. e Lee, Seung Bum e Peery, Rhiannon M. e McNeal, Joel R. e Kuehl, Jennifer V. e Boore, Jeffrey L.",
title = "Análise de 81 genes de 64 genomas plastídicos resolve relações em angiospermas e identifica padrões evolutivos em escala de genoma",
year = "2007",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Angiospermas são o clado maior e mais bem-sucedido de plantas terrestres, com mais de 250.000 espécies distribuídas em quase todos os habitats terrestres. Muitos estudos filogenéticos basearam-se em sequências de DNA de um a vários genes, mas, apesar de décadas de esforços intensivos, as relações entre linhagens que divergiram precocemente e vários dos principais clados permanecem ou incompletamente resolvidas ou fracamente suportadas. Realizamos análises filogenéticas de 81 genes plastídicos em 64 genomas sequenciados, incluindo 13 novos genomas, para estimar as relações entre os principais clados de angiospermas, e as árvores resultantes são usadas para examinar a evolução do conteúdo de genes e intrões. Árvores filogenéticas de múltiplos métodos, incluindo abordagens baseadas em modelos, fornecem forte suporte para a posição de Amborella como a linhagem que divergiu mais cedo entre as plantas com flores, seguida por Nymphaeales e Austrobaileyales. As árvores do genoma plastídico também fornecem forte suporte para uma relação de irmã entre eudicotiledôneas e monocotiledôneas, e este grupo é irmão de um clado que inclui Chloranthales e magnolióides. A resolução das relações entre os principais clados de angiospermas fornece a estrutura necessária para abordar inúmeras questões evolutivas sobre a rápida diversificação de angiospermas. O conteúdo de genes e intrões é altamente conservado entre as angiospermas que divergiram precocemente e as eudicotiledôneas basais, mas 62 perdas independentes de genes e intrões estão limitadas aos clados de monocotiledôneas e eudicotiledôneas mais derivados. Além disso, foi detectada uma correlação específica de linhagem entre as taxas de substituições de nucleotídeos, indels e rearranjos genômicos.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0709121104",
doi = "10.1073/pnas.0709121104",
openalex = "W2127735379",
references = "doi101016jpalaeo200507006, doi10108010635150290069913, doi101093bioinformatics17121246, doi101111boj12385"
}
32. Donoghue, Michael J., 2008, Uma perspectiva filogenética sobre a distribuição da diversidade vegetal: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Estudos filogenéticos estão revelando que nichos ecológicos principais são mais conservados ao longo da história evolutiva do que o esperado, implicando que adaptações a mudanças climáticas principais não foram facilmente alcançadas em todas as linhagens. O conservadorismo de nicho filogenético tem consequências importantes para a montagem tanto de comunidades locais quanto dos pools regionais de espécies de onde estas são extraídas. Se corredores para movimento estiverem disponíveis, novos ambientes emergentes tenderão a ser preenchidos por espécies que filtram de áreas nas quais as adaptações relevantes já evoluíram, em oposição a serem preenchidos pela evolução in situ dessas adaptações. Exemplos incluem disjunções intercontinentais de plantas tropicais, a disseminação de linhagens vegetais ao redor do Hemisfério Norte após a evolução de tolerância ao frio, e a radiação de plantas alpinas do norte para os Andes. Essas observações destacam o papel do conhecimento filogenético e da biogeografia histórica nas explicações de padrões globais de biodiversidade. Elas também têm implicações para o futuro da biodiversidade.
BibTeX
@article{doi101073pnas0801962105,
author = "Donoghue, Michael J.",
title = "A phylogenetic perspective on the distribution of plant diversity",
year = "2008",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Estudos filogenéticos estão revelando que nichos ecológicos principais são mais conservados ao longo da história evolutiva do que o esperado, implicando que adaptações a mudanças climáticas principais não foram facilmente alcançadas em todas as linhagens. O conservadorismo de nicho filogenético tem consequências importantes para a montagem tanto de comunidades locais quanto dos pools regionais de espécies de onde estas são extraídas. Se corredores para movimento estiverem disponíveis, novos ambientes emergentes tenderão a ser preenchidos por espécies que filtram de áreas nas quais as adaptações relevantes já evoluíram, em oposição a serem preenchidos pela evolução in situ dessas adaptações. Exemplos incluem disjunções intercontinentais de plantas tropicais, a disseminação de linhagens vegetais ao redor do Hemisfério Norte após a evolução de tolerância ao frio, e a radiação de plantas alpinas do norte para os Andes. Essas observações destacam o papel do conhecimento filogenético e da biogeografia histórica nas explicações de padrões globais de biodiversidade. Elas também têm implicações para o futuro da biodiversidade.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0801962105",
doi = "10.1073/pnas.0801962105",
openalex = "W2064987933",
references = "doi101007bf02806171, doi101126science1130880, doi1023072395199, doi1023073224530"
}
33. Leng, Qin e Wu, Shun-qing e Friis, Else Marie, 2008, ANGIOSPERMS: Os Fóssis de Jehol: p. 178-179-185.
DOI: 10.1016/b978-012374173-8.50021-1
BibTeX
@incollection{leng2008angiosperms,
author = "Leng, Qin e Wu, Shun-qing e Friis, Else Marie",
title = "ANGIOSPERMS",
year = "2008",
booktitle = "The Jehol Fossils",
url = "https://doi.org/10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
doi = "10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
pages = "178-179-185"
}
34. Antonelli, Alexandre e Nylander, Johan A. A. e Persson, Claes e Sanmartín, Isabel, 2009, Rastreando o impacto do levantamento andino na evolução da flora neotropical: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Estudos filogenéticos recentes revelaram o papel fundamental desempenhado pelo levantamento dos Andes na extraordinária diversificação da flora neotropical. No entanto, esses estudos geralmente consideraram o levantamento andino como um único evento limitado no tempo que fomentou a evolução de elementos de altitude. Isso contrasta com reconstruções geológicas que indicam que o levantamento ocorreu em períodos discretos de oeste para leste e que afetou diferentes regiões em momentos diferentes. Apresentamos uma abordagem para integrar a tectônica andina com reconstruções biogeográficas de plantas neotropicais, utilizando a família das café (Rubiaceae) como grupo modelo. A distribuição dessa família abrange habitats de altitude e montanhosos, bem como terras baixas tropicais da América Central e do Sul, oferecendo assim uma oportunidade única para estudar a influência do levantamento andino na flora neotropical inteira. Nossos resultados sugerem que as Rubiaceae originaram-se no Paleotrópico e utilizaram a conexão boreotropical para alcançar a América do Sul. Os padrões biogeográficos encontrados corroboram a existência de uma barreira de dispersão duradoura entre os Andes Setentrionais e Centrais, o "Portal Andino Ocidental". O levantamento da Cordilheira Oriental pôs fim a essa barreira, permitindo a dispersão de linhagens boreotrópicas para o sul, mas deu origem a um enorme sistema de pântanos ("Lagoa Pebas") na Amazônia ocidental que impediu a especiação in situ e a dispersão florística entre os Andes e a Amazônia por pelo menos 6 milhões de anos. Aqui, fornecemos evidências desses eventos em plantas.
BibTeX
@article{doi101073pnas0811421106,
author = "Antonelli, Alexandre and Nylander, Johan A. A. and Persson, Claes and Sanmartín, Isabel",
title = "Tracing the impact of the Andean uplift on Neotropical plant evolution",
year = "2009",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = {Recent phylogenetic studies have revealed the major role played by the uplift of the Andes in the extraordinary diversification of the Neotropical flora. These studies, however, have typically considered the Andean uplift as a single, time-limited event fostering the evolution of highland elements. This contrasts with geological reconstructions indicating that the uplift occurred in discrete periods from west to east and that it affected different regions at different times. We introduce an approach for integrating Andean tectonics with biogeographic reconstructions of Neotropical plants, using the coffee family (Rubiaceae) as a model group. The distribution of this family spans highland and montane habitats as well as tropical lowlands of Central and South America, thus offering a unique opportunity to study the influence of the Andean uplift on the entire Neotropical flora. Our results suggest that the Rubiaceae originated in the Paleotropics and used the boreotropical connection to reach South America. The biogeographic patterns found corroborate the existence of a long-lasting dispersal barrier between the Northern and Central Andes, the "Western Andean Portal." The uplift of the Eastern Cordillera ended this barrier, allowing dispersal of boreotropical lineages to the South, but gave rise to a huge wetland system ("Lake Pebas") in western Amazonia that prevented in situ speciation and floristic dispersal between the Andes and Amazonia for at least 6 million years. Here, we provide evidence of these events in plants.},
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0811421106",
doi = "10.1073/pnas.0811421106",
openalex = "W2026781465",
references = "doi101007978146133485919, doi101111j109583122001tb01368x, doi1011300016760620001121091uhotca23co2, doi1023073515620, doi105962bhlpart13183, openalexw3001739384"
}
35. Wang, Hengchang e Moore, Michael J. e Soltis, Pamela S. e Bell, Charles D. e Brockington, Samuel F. e Alexandre, Roolse e Davis, Charles C. e Latvis, Maribeth e Manchester, Steven R. e Soltis, Pamela S., 2009, Radiação rosida e o rápido surgimento de florestas dominadas por angiospermas: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
O clado rosídeo (70.000 espécies) contém mais de um quarto de todas as espécies de angiospermas e inclui a maioria dos linhagens de árvores de florestas temperadas e tropicais existentes. Apesar dos progressos na elucidação das relações dentro das angiospermas, os rosídeos permanecem como o maior clado majoritário mal resolvido; as relações profundas dentro dos rosídeos são particularmente enigmáticas. Com base em análises de parcimônia e máxima verossimilhança (MV) de conjuntos de dados separados e combinados de 12 genes (10 genes plastídios, 2 nucleares; >18.000 pb) e repetições invertidas plastídicas (IR; 24 genes e espaçadores intercalares; >25.000 pb) para >100 espécies rosídeas, fornecemos uma compreensão muito melhorada da filogenia rosídea. As Vitaceae são irmãs de todos os outros rosídeos, que por sua vez formam 2 grandes clados, cada um com um valor de bootstrap MV de 100%: (i) eurosídeos I (Fabidae) incluem o clado fixador de nitrogênio, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales e Oxalidales; e (ii) eurosídeos II (Malvidae) incluem Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales e Picramniaceae. O clado rosídeo diversificou-se rapidamente nessas principais linhagens, possivelmente ao longo de um período de <15 milhões de anos, e talvez em tão pouco quanto 4 a 5 milhões de anos. O momento da radiação rápida inferida dos rosídeos [108 a 91 milhões de anos atrás (Mya) e 107-83 Mya para Fabidae e Malvidae, respectivamente] corresponde ao rápido surgimento de florestas dominadas por angiospermas e à concomitante diversificação de outros clados que habitam essas florestas, incluindo anfíbios, formigas, mamíferos placentários e samambaias.
BibTeX
@article{doi101073pnas0813376106,
author = "Wang, Hengchang e Moore, Michael J. e Soltis, Pamela S. e Bell, Charles D. e Brockington, Samuel F. e Alexandre, Roolse e Davis, Charles C. e Latvis, Maribeth e Manchester, Steven R. e Soltis, Pamela S.",
title = "Radiação rosídea e o rápido surgimento de florestas dominadas por angiospermas",
year = "2009",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "O clado rosídeo (70.000 espécies) contém mais de um quarto de todas as espécies de angiospermas e inclui a maioria dos linhagens de árvores de florestas temperadas e tropicais existentes. Apesar dos progressos na elucidação das relações dentro das angiospermas, os rosídeos permanecem como o maior clado majoritário mal resolvido; as relações profundas dentro dos rosídeos são particularmente enigmáticas. Com base em análises de parcimônia e máxima verossimilhança (MV) de conjuntos de dados separados e combinados de 12 genes (10 genes plastídios, 2 nucleares; >18.000 pb) e repetições invertidas plastídicas (IR; 24 genes e espaçadores intercalares; >25.000 pb) para >100 espécies rosídeas, fornecemos uma compreensão muito melhorada da filogenia rosídea. As Vitaceae são irmãs de todos os outros rosídeos, que por sua vez formam 2 grandes clados, cada um com um valor de bootstrap MV de 100%: (i) eurosídeos I (Fabidae) incluem o clado fixador de nitrogênio, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales e Oxalidales; e (ii) eurosídeos II (Malvidae) incluem Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales e Picramniaceae. O clado rosídeo diversificou-se rapidamente nessas principais linhagens, possivelmente ao longo de um período de <15 milhões de anos, e talvez em tão pouco quanto 4 a 5 milhões de anos. O momento da radiação rápida inferida dos rosídeos [108 a 91 milhões de anos atrás (Mya) e 107-83 Mya para Fabidae e Malvidae, respectivamente] corresponde ao rápido surgimento de florestas dominadas por angiospermas e à concomitante diversificação de outros clados que habitam essas florestas, incluindo anfíbios, formigas, mamíferos placentários e samambaias.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0813376106",
doi = "10.1073/pnas.0813376106",
openalex = "W2158722151",
references = "doi101146annurevento53103106093304"
}
36. Simon, Marcelo Fragomeni e Grether, Rosaura e de Queiroz, Luciano Paganucci e Skema, Cynthia e Pennington, R. Toby e Hughes, Colin E., 2009, Montagem recente do Cerrado, um hotspot de diversidade vegetal neotropical, por evolução in situ de adaptações ao fogo: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
A importância relativa dos processos ecológicos locais e históricos de maior escala na causa das diferenças na riqueza de espécies em todo o mundo continua a ser debatida intensamente. Para obter insights sobre essas questões, investigamos a montagem da diversidade vegetal no Cerrado na América do Sul, a savana tropical mais rica em espécies do mundo. Filogenias calibradas no tempo sugerem que as linhagens do Cerrado começaram a se diversificar há menos de 10 milhões de anos, com a maioria das linhagens se diversificando há 4 milhões de anos ou menos, coincidindo com o surgimento da dominância de gramíneas C4 inflamáveis e a expansão do bioma de savana em todo o mundo. Essas filogenias vegetais mostram que as linhagens do Cerrado estão fortemente associadas a adaptações ao fogo e possuem grupos-irmãos em florestas úmidas vizinhas predominantemente livres de fogo, florestas sazonalmente secas, pradarias subtropicais ou vegetação de áreas úmidas. Essas descobertas implicam que o Cerrado se formou in situ por meio de mudanças adaptativas recentes e frequentes para resistir ao fogo, em vez de por meio da dispersão de linhagens já adaptadas ao fogo. A localização do Cerrado cercada por uma variedade diversa de biomas ricos em espécies e a aparente barreira adaptativa modesta imposta pelo fogo provavelmente contribuíram para sua riqueza de espécies notável. Essas descobertas somam-se a evidências crescentes de que as origens e a montagem histórica de biomas ricos em espécies têm sido idiossincráticas, impulsionadas em grande parte por características únicas da geohistória em escala regional e continental e de que diferentes processos históricos podem levar a níveis similares de riqueza de espécies moderna.
BibTeX
@article{doi101073pnas0903410106,
author = "Simon, Marcelo Fragomeni and Grether, Rosaura and de Queiroz, Luciano Paganucci and Skema, Cynthia and Pennington, R. Toby and Hughes, Colin E.",
title = "Recent assembly of the Cerrado, a neotropical plant diversity hotspot, by in situ evolution of adaptations to fire",
year = "2009",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "A importância relativa dos processos ecológicos locais e históricos de maior escala na causa das diferenças na riqueza de espécies em todo o mundo continua a ser debatida intensamente. Para obter insights sobre essas questões, investigamos a montagem da diversidade vegetal no Cerrado na América do Sul, a savana tropical mais rica em espécies do mundo. Filogenias calibradas no tempo sugerem que as linhagens do Cerrado começaram a se diversificar há menos de 10 milhões de anos, com a maioria das linhagens se diversificando há 4 milhões de anos ou menos, coincidindo com o surgimento da dominância de gramíneas C4 inflamáveis e a expansão do bioma de savana em todo o mundo. Essas filogenias vegetais mostram que as linhagens do Cerrado estão fortemente associadas a adaptações ao fogo e possuem grupos-irmãos em florestas úmidas vizinhas predominantemente livres de fogo, florestas sazonalmente secas, pradarias subtropicais ou vegetação de áreas úmidas. Essas descobertas implicam que o Cerrado se formou in situ por meio de mudanças adaptativas recentes e frequentes para resistir ao fogo, em vez de por meio da dispersão de linhagens já adaptadas ao fogo. A localização do Cerrado cercada por uma variedade diversa de biomas ricos em espécies e a aparente barreira adaptativa modesta imposta pelo fogo provavelmente contribuíram para sua riqueza de espécies notável. Essas descobertas somam-se a evidências crescentes de que as origens e a montagem histórica de biomas ricos em espécies têm sido idiossincráticas, impulsionadas em grande parte por características únicas da geohistória em escala regional e continental e de que diferentes processos históricos podem levar a níveis similares de riqueza de espécies moderna.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0903410106",
doi = "10.1073/pnas.0903410106",
openalex = "W2151396518",
references = "doi101073pnas0608361104, doi101146annurevecolsys110308120327, openalexw2611511275"
}
37. Boyce, C. Kevin e Brodribb, Timothy J. e Feild, Taylor S. e Zwieniecki, Maciej A., 2009, A evolução das veias foliares de angiospermas foi fisiologicamente e ambientalmente transformadora: Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences.
Resumo
As veias que irrigam as folhas durante a fotossíntese demonstraram ser notavelmente mais abundantes em plantas com flores do que em qualquer outra linhagem de plantas vasculares. As densidades de veias de angiospermas variam em média de 8 mm de veia por mm(2) de área foliar e podem chegar a 25 mm mm(-2), enquanto tais altas densidades estão ausentes em todas as outras plantas, vivas ou extintas. As folhas de não-angiospermas têm consistentemente variado em média próximo de 2 mm mm(-2) ao longo de 380 milhões de anos de evolução, apesar de uma história complexa que envolveu quatro ou mais origens independentes de folhas laminadas com muitas veias e mudanças dramáticas no clima e na composição atmosférica. Demonstramos ainda que as altas densidades de veias foliares únicas das angiospermas permitem taxas de transpiração sem precedentes, estendendo trabalhos anteriores que indicam uma forte correlação entre densidade de veias e taxas de assimilação. Como a densidade de veias é diretamente mensurável em fósseis, essas correlações fornecem novo acesso à fisiologia de plantas extintas e a como elas podem ter impactado seus ambientes. Primeiro, as altas taxas de assimilação atualmente restritas às angiospermas entre as plantas vivas provavelmente foram únicas ao longo da história evolutiva. Segundo, a reciclagem de água impulsionada pela transpiração que é importante para fortalecer a precipitação nas florestas tropicais modernas pode ter sido significativamente menor em um mundo antes das angiospermas.
BibTeX
@article{doi101098rspb20081919,
author = "Boyce, C. Kevin e Brodribb, Timothy J. e Feild, Taylor S. e Zwieniecki, Maciej A.",
title = "A evolução das veias foliares de angiospermas foi fisiologicamente e ambientalmente transformadora",
year = "2009",
journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
abstract = "As veias que irrigam as folhas durante a fotossíntese demonstraram ser notavelmente mais abundantes em plantas com flores do que em qualquer outra linhagem de plantas vasculares. As densidades de veias de angiospermas variam em média de 8 mm de veia por mm(2) de área foliar e podem chegar a 25 mm mm(-2), enquanto tais altas densidades estão ausentes em todas as outras plantas, vivas ou extintas. As folhas de não-angiospermas têm consistentemente variado em média próximo de 2 mm mm(-2) ao longo de 380 milhões de anos de evolução, apesar de uma história complexa que envolveu quatro ou mais origens independentes de folhas laminadas com muitas veias e mudanças dramáticas no clima e na composição atmosférica. Demonstramos ainda que as altas densidades de veias foliares únicas das angiospermas permitem taxas de transpiração sem precedentes, estendendo trabalhos anteriores que indicam uma forte correlação entre densidade de veias e taxas de assimilação. Como a densidade de veias é diretamente mensurável em fósseis, essas correlações fornecem novo acesso à fisiologia de plantas extintas e a como elas podem ter impactado seus ambientes. Primeiro, as altas taxas de assimilação atualmente restritas às angiospermas entre as plantas vivas provavelmente foram únicas ao longo da história evolutiva. Segundo, a reciclagem de água impulsionada pela transpiração que é importante para fortalecer a precipitação nas florestas tropicais modernas pode ter sido significativamente menor em um mundo antes das angiospermas.",
url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2008.1919",
doi = "10.1098/rspb.2008.1919",
openalex = "W2119610202",
references = "doi101016s0065250408601191, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0608361104, doi10108000241160310004657, doi101104pp107101352, doi101111boj12385, doi101126science24749481322, doi101146annurevarplant56032604144141, doi10230725065646, doi1023073515620, openalexw1584176508"
}
38. GROUP, THE ANGIOSPERM PHYLOGENY, 2009, Uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas para as ordens e famílias de plantas com flores: APG III: Botanical Journal of the Linnean Society.
DOI: 10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x
Resumo
Fornece-se uma classificação revisada e atualizada para as famílias de plantas com flores. Muitos estudos recentes forneceram evidências cada vez mais detalhadas para as posições de famílias anteriormente não classificadas, resultando na adoção de várias novas ordens, incluindo Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales e Zygophyllales. Vários gêneros e famílias anteriormente não classificados são incluídos aqui em ordens, reduzindo significativamente o número de táxons não classificados; estes incluem Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae e Rafflesiaceae (ambas Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae e Strasburgeriaceae (todas Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae e Gerrardinaceae (ambas Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) e Boraginaceae (agora pelo menos conhecida como membro do clade lamiid). Novas famílias segregadas para gêneros anteriormente entendidos como estando em outras famílias reconhecidas pela APG incluem Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae e Cleomaceae (ambas Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae e Talinaceae (todas Caryophyllales) e Linderniaceae e Thomandersiaceae (ambas Lamiales). O uso de famílias entre colchetes foi abandonado devido à sua impopularidade, e na maioria dos casos, as circunscrições mais amplas foram mantidas; estas incluem Amaryllidaceae, Asparagaceace e Xanthorrheaceae (todas Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) e várias outras famílias menores. Artigos separados neste mesmo volume tratam de uma nova ordem linear para a APG, nomes subfamiliares que podem ser usados para uma comunicação mais precisa em Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. e Xanthorrheaceae s.l. (todas Asparagales) e uma classificação supraordinal formal para as plantas com flores.
BibTeX
@article{doi101111j10958339200900996x,
author = "GROUP, THE ANGIOSPERM PHYLOGENY",
title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III",
year = "2009",
journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
abstract = "A revised and updated classification for the families of flowering plants is provided. Many recent studies have yielded increasingly detailed evidence for the positions of formerly unplaced families, resulting in a number of newly adopted orders, including Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales and Zygophyllales. A number of previously unplaced genera and families are included here in orders, greatly reducing the number of unplaced taxa; these include Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae and Rafflesiaceae (both Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae and Strasburgeriaceae (all Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae and Gerrardinaceae (both Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) and Boraginaceae (now at least known to be a member of lamiid clade). Newly segregated families for genera previously understood to be in other APG-recognized families include Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae and Cleomaceae (both Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae and Talinaceae (all Caryophyllales) and Linderniaceae and Thomandersiaceae (both Lamiales). Use of bracketed families is abandoned because of its unpopularity, and in most cases the broader circumscriptions are retained; these include Amaryllidaceae, Asparagaceace and Xanthorrheaceae (all Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) and several other smaller families. Separate papers in this same volume deal with a new linear order for APG, subfamilial names that can be used for more accurate communication in Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. and Xanthorrheaceae s.l. (all Asparagales) and a formal supraordinal classification for the flowering plants.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
doi = "10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
openalex = "W4245471709",
references = "doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0708072104, doi101073pnas0709121104, doi101073pnas0813376106, doi101111j175348871981tb06752x, doi1023072484473, doi1023072992015, doi103732ajb0800047, doi103732ajb891132, doi105860choice453190, openalexw2961549061"
}
39. Brodribb, Timothy J. e Feild, Taylor S., 2009, A evolução hidráulica das folhas precedeu um aumento na capacidade fotossintética das folhas durante a diversificação inicial das angiospermas: Ecology Letters.
DOI: 10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x
Resumo
A evolução das angiospermas transformou a ecologia global, e grande parte desse impacto deriva da produtividade vegetativa inigualável dos clados dominantes de angiospermas. No entanto, as origens da alta capacidade fotossintética nas angiospermas permanecem desconhecidas. Neste estudo, descrevemos a trajetória íngreme da evolução da densidade de veias das folhas (D(v)) nas angiospermas e prevermos que essa inovação na hidráulica das folhas permitiu uma mudança significativa na capacidade das folhas de assimilar CO(2). Reconstituindo a evolução das veias das folhas através do exame de 504 espécies de angiospermas, descobrimos que um aumento rápido de três a quatro vezes em D(v) ocorreu durante a evolução inicial das angiospermas. Demonstramos como essa mudança significativa na arquitetura das veias das folhas potencialmente permitiu que a capacidade fotossintética máxima nas angiospermas ultrapassasse os grupos concorrentes entre 140-100 Ma. Nossos dados sugerem que as angiospermas terrestres iniciais produziram folhas com taxas fotossintéticas baixas, mas que o subsequente sucesso das angiospermas está ligado a um aumento na capacidade fotossintética durante sua diversificação inicial.
BibTeX
@article{doi101111j14610248200901410x,
author = "Brodribb, Timothy J. e Feild, Taylor S.",
title = "A evolução hidráulica das folhas precedeu um aumento na capacidade fotossintética das folhas durante a diversificação inicial das angiospermas",
year = "2009",
journal = "Ecology Letters",
abstract = "A evolução das angiospermas transformou a ecologia global, e grande parte desse impacto deriva da produtividade vegetativa inigualável dos clados dominantes de angiospermas. No entanto, as origens da alta capacidade fotossintética nas angiospermas permanecem desconhecidas. Neste estudo, descrevemos a trajetória íngreme da evolução da densidade de veias das folhas (D(v)) nas angiospermas e prevermos que essa inovação na hidráulica das folhas permitiu uma mudança significativa na capacidade das folhas de assimilar CO(2). Reconstituindo a evolução das veias das folhas através do exame de 504 espécies de angiospermas, descobrimos que um aumento rápido de três a quatro vezes em D(v) ocorreu durante a evolução inicial das angiospermas. Demonstramos como essa mudança significativa na arquitetura das veias das folhas potencialmente permitiu que a capacidade fotossintética máxima nas angiospermas ultrapassasse os grupos concorrentes entre 140-100 Ma. Nossos dados sugerem que as angiospermas terrestres iniciais produziram folhas com taxas fotossintéticas baixas, mas que o subsequente sucesso das angiospermas está ligado a um aumento na capacidade fotossintética durante sua diversificação inicial.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
openalex = "W2153946082",
references = "doi101038282424a0, doi101046j14698137200200397x, doi101073pnas0709121104, doi101098rspb20081919, doi101111j14698137200400974x, doi101126science1155121, doi101126science2815374237, doi1023071218350, doi102475ajs294156, doi102475ajs3012182, doi103732ajb0800047, doi104159harvard9780674864856"
}
40. Soltis, Pamela S. e Albert, Victor A. e Leebens‐Mack, Jim e Bell, Charles D. e Paterson, Andrew H. e Zheng, Chunfang e Sankoff, David e de Pamphilis, Claude W. e Wall, P. Kerr e Soltis, Pamela S., 2009, Poliploidia e diversificação de angiospermas: American Journal of Botany.
Resumo
A poliploidia tem sido reconhecida há muito tempo como uma força importante na evolução das angiospermas. Investigações genômicas recentes não apenas indicam que a poliploidia é ubíqua entre as angiospermas, mas também sugerem vários eventos antigos de duplicação do genoma. Estes incluem eventos antigos de duplicação do genoma inteiro (WGD) em linhagens basais de angiospermas, bem como um evento paleohexaploide proposto que pode ter ocorrido próximo à divergência das eudicotiledôneas. No entanto, atualmente não há evidências de WGD em Amborella, a espécie irmã presumida de outras angiospermas existentes. A questão não é mais "Que proporção das angiospermas são poliploides?", mas "Quantos episódios de poliploidia caracterizam qualquer linhagem dada?" Novos algoritmos oferecem a promessa de que genomas ancestrais podem ser reconstruídos para divergências profundas (por exemplo, pode ser possível reconstruir o genoma ancestral das eudicotiledôneas ou mesmo o genoma ancestral das angiospermas). Comparações das taxas de diversificação sugerem que a duplicação do genoma pode ter levado a um aumento dramático na riqueza de espécies em várias linhagens de angiospermas, incluindo Poaceae, Solanaceae, Fabaceae e Brassicaceae. No entanto, são necessários estudos genômicos adicionais para identificar a colocação filogenética exata dos eventos antigos de poliploidia dentro dessas linhagens e para determinar quando genes novos resultantes da poliploidia permitiram radiações adaptativas.
BibTeX
@article{doi103732ajb0800079,
author = "Soltis, Pamela S. e Albert, Victor A. e Leebens‐Mack, Jim e Bell, Charles D. e Paterson, Andrew H. e Zheng, Chunfang e Sankoff, David e de Pamphilis, Claude W. e Wall, P. Kerr e Soltis, Pamela S.",
title = "Poliploidia e diversificação de angiospermas",
year = "2009",
journal = "American Journal of Botany",
abstract = {A poliploidia tem sido reconhecida há muito tempo como uma força importante na evolução das angiospermas. Investigações genômicas recentes não apenas indicam que a poliploidia é ubíqua entre as angiospermas, mas também sugerem vários eventos antigos de duplicação do genoma. Estes incluem eventos antigos de duplicação do genoma inteiro (WGD) em linhagens basais de angiospermas, bem como um evento paleohexaploide proposto que pode ter ocorrido próximo à divergência das eudicotiledôneas. No entanto, atualmente não há evidências de WGD em Amborella, a espécie irmã presumida de outras angiospermas existentes. A questão não é mais "Que proporção das angiospermas são poliploides?", mas "Quantos episódios de poliploidia caracterizam qualquer linhagem dada?" Novos algoritmos oferecem a promessa de que genomas ancestrais podem ser reconstruídos para divergências profundas (por exemplo, pode ser possível reconstruir o genoma ancestral das eudicotiledôneas ou mesmo o genoma ancestral das angiospermas). Comparações das taxas de diversificação sugerem que a duplicação do genoma pode ter levado a um aumento dramático na riqueza de espécies em várias linhagens de angiospermas, incluindo Poaceae, Solanaceae, Fabaceae e Brassicaceae. No entanto, são necessários estudos genômicos adicionais para identificar a colocação filogenética exata dos eventos antigos de poliploidia dentro dessas linhagens e para determinar quando genes novos resultantes da poliploidia permitiram radiações adaptativas.},
url = "https://doi.org/10.3732/ajb.0800079",
doi = "10.3732/ajb.0800079",
openalex = "W2064911343",
references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101111j001438202001tb00826x, doi101146annurevgenet341401, doi101196annals1438005"
}
41. Boyce, C. Kevin e Lee, Jung‐Eun e Feild, Taylor S. e Brodribb, Timothy J. e Zwieniecki, Maciej A., 2010, Angiospermas ajudaram a colocar a chuva nas florestas tropicais: O impacto da evolução fisiológica vegetal na biodiversidade tropical 1: Anais do Jardim Botânico do Missouri.
Resumo
A reciclagem de água transpirada é bem conhecida como uma fonte importante de precipitação, particularmente nos trópicos, e as angiospermas possuem capacidades de transpiração superiores às de qualquer outra planta ao longo da história evolutiva. Assim, a evolução e o ascenso ao domínio ecológico das plantas com flores são propostos como tendo alterado fortemente o clima. A capacidade de transpiração está estreitamente correlacionada com a densidade de veias foliares, e a densidade média de veias das folhas de angiospermas é quatro vezes maior do que a de todas as outras plantas, vivas ou extintas. Uma transição rápida para altas densidades de veias ocorreu separadamente em três ou mais linhagens de plantas com flores há cerca de 100 milhões de anos. Modelagem climática do impacto dessa revolução fisiológica indica que os trópicos seriam mais quentes, mais secos e mais sazonais na ausência das angiospermas, e a área geral de floresta tropical diminuiria substancialmente. Como a diversidade de angiospermas é influenciada pela área de floresta tropical e pela abundância e uniformidade das precipitações, a alta diversidade de angiospermas é parcialmente um produto de um ciclo de retroalimentação positiva com as modificações climáticas iniciadas pelas próprias angiospermas. As diversificações de linhagens entre animais vertebrados e invertebrados e plantas não-angiospermas no rastro da radiação de angiospermas podem estar ligadas ao impacto sem precedentes das angiospermas no clima.
BibTeX
@article{doi1034172009143,
author = "Boyce, C. Kevin e Lee, Jung‐Eun e Feild, Taylor S. e Brodribb, Timothy J. e Zwieniecki, Maciej A.",
title = "Angiospermas ajudaram a colocar a chuva nas florestas tropicais: O impacto da evolução fisiológica vegetal na biodiversidade tropical 1",
year = "2010",
journal = "Anais do Jardim Botânico do Missouri",
abstract = "A reciclagem de água transpirada é bem conhecida como uma fonte importante de precipitação, particularmente nos trópicos, e as angiospermas possuem capacidades de transpiração superiores às de qualquer outra planta ao longo da história evolutiva. Assim, a evolução e o ascenso ao domínio ecológico das plantas com flores são propostos como tendo alterado fortemente o clima. A capacidade de transpiração está estreitamente correlacionada com a densidade de veias foliares, e a densidade média de veias das folhas de angiospermas é quatro vezes maior do que a de todas as outras plantas, vivas ou extintas. Uma transição rápida para altas densidades de veias ocorreu separadamente em três ou mais linhagens de plantas com flores há cerca de 100 milhões de anos. Modelagem climática do impacto dessa revolução fisiológica indica que os trópicos seriam mais quentes, mais secos e mais sazonais na ausência das angiospermas, e a área geral de floresta tropical diminuiria substancialmente. Como a diversidade de angiospermas é influenciada pela área de floresta tropical e pela abundância e uniformidade das precipitações, a alta diversidade de angiospermas é parcialmente um produto de um ciclo de retroalimentação positiva com as modificações climáticas iniciadas pelas próprias angiospermas. As diversificações de linhagens entre animais vertebrados e invertebrados e plantas não-angiospermas no rastro da radiação de angiospermas podem estar ligadas ao impacto sem precedentes das angiospermas no clima.",
url = "https://doi.org/10.3417/2009143",
doi = "10.3417/2009143",
openalex = "W2100361465",
references = "doi101038nature05634, doi101073pnas0608361104, doi101086282687, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science1066854, doi101126science1100217, doi101126science1164033, doi101126science1177265, doi1023073071998, doi102475ajs294156"
}
42. 2011, Angiospermas: Um Livro-Texto de Botânica: p. 466-586.
DOI: 10.1017/cbo9781139105231.012
BibTeX
@incollection{crossref2011angiosperms,
title = "Angiospermas",
year = "2011",
booktitle = "Um Livro-Texto de Botânica",
url = "https://doi.org/10.1017/cbo9781139105231.012",
doi = "10.1017/cbo9781139105231.012",
pages = "466-586"
}
43. Nicotra, Adrienne B. e Leigh, Andrea e Boyce, C. Kevin e Jones, Cynthia S. e Niklas, Karl J. e Royer, Dana L. e Tsukaya, Hirokazu, 2011, A evolução e a significância funcional da forma foliar nas angiospermas: Functional Plant Biology.
Resumo
As folhas de angiospermas manifestam uma diversidade notável de formas que variam desde sequências de desenvolvimento dentro de um broto e resposta da copa ao microambiente até variações entre espécies dentro e entre comunidades e entre ordens ou famílias. Geralmente assume-se que, como as folhas fotossintéticas são críticas para o crescimento e sobrevivência das plantas, a variação em sua forma reflete a seleção natural atuando sobre a função. Várias teorias não mutuamente exclusivas foram propostas para explicar a diversidade de formas foliares. Estas incluem: termorregulação de folhas, especialmente em ambientes áridos e quentes, restrições hidráulicas, padrões de expansão foliar em espécies decíduas, restrições biomecânicas, adaptações para evitar herbivoria, adaptações para otimizar a interceptação de luz e até mesmo que a variação na forma foliar é uma resposta à seleção sobre a forma floral. No entanto, a importância relativa ou probabilidade de cada um desses fatores é incerta. Aqui, revisamos o contexto evolutivo da diversificação da forma foliar, discutimos os mecanismos proximais que geram a diversidade em sistemas existentes e consideramos as evidências para cada uma das hipóteses acima no contexto da significância funcional da forma foliar. A síntese dessas áreas amplas ajuda a identificar pontos de convergência conceitual para discussões em andamento e direções integradas para pesquisas futuras.
BibTeX
@article{doi101071fp11057,
author = "Nicotra, Adrienne B. e Leigh, Andrea e Boyce, C. Kevin e Jones, Cynthia S. e Niklas, Karl J. e Royer, Dana L. e Tsukaya, Hirokazu",
title = "The evolution and functional significance of leaf shape in the angiosperms",
year = "2011",
journal = "Functional Plant Biology",
abstract = "As folhas de angiospermas manifestam uma diversidade notável de formas que variam desde sequências de desenvolvimento dentro de um broto e resposta da copa ao microambiente até variações entre espécies dentro e entre comunidades e entre ordens ou famílias. Geralmente assume-se que, como as folhas fotossintéticas são críticas para o crescimento e sobrevivência das plantas, a variação em sua forma reflete a seleção natural atuando sobre a função. Várias teorias não mutuamente exclusivas foram propostas para explicar a diversidade de formas foliares. Estas incluem: termorregulação de folhas, especialmente em ambientes áridos e quentes, restrições hidráulicas, padrões de expansão foliar em espécies decíduas, restrições biomecânicas, adaptações para evitar herbivoria, adaptações para otimizar a interceptação de luz e até mesmo que a variação na forma foliar é uma resposta à seleção sobre a forma floral. No entanto, a importância relativa ou probabilidade de cada um desses fatores é incerta. Aqui, revisamos o contexto evolutivo da diversificação da forma foliar, discutimos os mecanismos proximais que geram a diversidade em sistemas existentes e consideramos as evidências para cada uma das hipóteses acima no contexto da significância funcional da forma foliar. A síntese dessas áreas amplas ajuda a identificar pontos de convergência conceitual para discussões em andamento e direções integradas para pesquisas futuras.",
url = "https://doi.org/10.1071/fp11057",
doi = "10.1071/fp11057",
openalex = "W2144704825",
references = "doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}
44. te Beest, Mariska e Roux, Johannes J. Le e Richardson, David M. e Brysting, Anne K. e Suda, Jan e Kubešová, Magdalena e Pyšek, Petr, 2011, O mais é melhor? O papel da poliploidia na facilitação de invasões vegetais: Annals of Botany.
Resumo
A poliploidia pode ser um fator importante no sucesso da invasão de espécies através de uma combinação de (1) 'pré-adaptação', na qual linhagens poliploides são predispostas às condições no novo intervalo e, portanto, têm taxas de sobrevivência e aptidão mais altas na fase inicial de estabelecimento; e (2) a possibilidade de adaptação subsequente devido a uma maior diversidade genética que pode auxiliar a 'evolução da invasividade'. Alternativamente, a poliploidização pode desempenhar um papel importante ao (3) restaurar a reprodução sexual após a hibridização ou, inversamente, (4) reprodução assexuada na ausência de parceiros adequados. Portanto, encorajamos biólogos de invasão a incorporar avaliações de ploidia em seus estudos de espécies alienígenas invasoras.
BibTeX
@article{doi101093aobmcr277,
author = "te Beest, Mariska e Roux, Johannes J. Le e Richardson, David M. e Brysting, Anne K. e Suda, Jan e Kubešová, Magdalena e Pyšek, Petr",
title = "O mais é melhor? O papel da poliploidia na facilitação de invasões vegetais",
year = "2011",
journal = "Annals of Botany",
abstract = "A poliploidia pode ser um fator importante no sucesso da invasão de espécies através de uma combinação de (1) 'pré-adaptação', na qual linhagens poliploides são predispostas às condições no novo intervalo e, portanto, têm taxas de sobrevivência e aptidão mais altas na fase inicial de estabelecimento; e (2) a possibilidade de adaptação subsequente devido a uma maior diversidade genética que pode auxiliar a 'evolução da invasividade'. Alternativamente, a poliploidização pode desempenhar um papel importante ao (3) restaurar a reprodução sexual após a hibridização ou, inversamente, (4) reprodução assexuada na ausência de parceiros adequados. Portanto, encorajamos biólogos de invasão a incorporar avaliações de ploidia em seus estudos de espécies alienígenas invasoras.",
url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcr277",
doi = "10.1093/aob/mcr277",
openalex = "W2061325948",
references = "doi101016jtplants200912003, doi101038nrg1711, doi101038nrg2600, doi101073pnas0900906106, doi101111j10958339200900996x, doi101111j13669516200600302x, doi1011910309133306pp490pr"
}
45. Kattge, Jens e Dı́az, Soledad e Lavorel, Sandra e Prentice, I. Colin e Leadley, Paul e Bönisch, Gerhard e Garnier, Éric e Westoby, Mark e Reich, Peter B. e Wright, Ian J. e Cornelissen, J. H. C. e Violle, Cyrille e Harrison, Sandy P. e van Bodegom, Peter M. e Reichstein, Markus e Enquist, Brian J. e Soudzilovskaia, Nadejda A. e Ackerly, David D. e Anand, M. e Atkin, Owen K. e Bahn, Michael e Baker, Timothy R. e Baldocchi, Dennis e Bekker, R.M. e Blanco, C. e Blonder, Benjamin e Bond, William J. e Bradstock, Ross A. e Bunker, Dan e Casanoves, Fernando e Cavender‐Bares, Jeannine e Chambers, Jeffrey Q. e Chapin, F. Stuart e Chave, Jérôme e Coomes, David A. e Cornwell, William K. e Craine, Joseph M. e Dobrin, Barbara e Duarte, Leandro e Durka, Walter e Elser, James J. e Esser, G. e Estiarte, Marc e Fagan, William F. e Fang, Jinwei e Fernández‐Méndez, Fernando e Fidélis, Alessandra e Finegan, Bryan e Flores, Olivier e FORD, HENRY e Frank, Dorothea e Freschet, Grégoire T. e Fyllas, Nikolaos M. e Gallagher, Rachael V. e GREEN, W. A. e Gutiérrez, Álvaro G. e Hickler, Thomas e Higgins, Steven I. e Hodgson, J. G. e Jalili, Amir e Jansen, Steven e Joly, Carlos Alfredo e Kerkhoff, Andrew J. e Kirkup, Donald W. e Kitajima, Kaoru e Kleyer, Michael e Klotz, Stefan e Knops, Johannes M. H. e Krämer, K. e Kühn, Ingolf e Kurokawa, H. e Laughlin, Daniel C. e Lee, Tali D. e Leishman, Michelle R. e Lens, Frederic e Lenz, Tanja I. e Lewis, Simon L. e Lloyd, Jon e Llusià, Joan e Louault, Frédérique e Ma, Sai e Mahecha, Miguel D. e Manning, Peter e Massad, Tara Joy e Medlyn, Belinda E. e Messier, J. e Moles, Angela T. e Müller, Sandra Cristina e Nadrowski, Karin e NAEEM, S. e Niinemets, Ülo e Nöllert, Stephanie e Nuske, Alison e Ogaya, Romà e Oleksyn, Jacek e Onipchenko, V. G. e Onoda, Yusuke e Ordóñez, Jenny e Overbeck, Gerhard E. e Ozinga, W.A., 2011, TRY – um banco de dados global de características de plantas: Global Change Biology.
DOI: 10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x
Resumo
Resumo As características das plantas – as características morfológicas, anatômicas, fisiológicas, bioquímicas e fenológicas das plantas e seus órgãos – determinam como os produtores primários respondem aos fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos, influenciam os processos e serviços dos ecossistemas e fornecem uma ligação entre a riqueza de espécies e a diversidade funcional dos ecossistemas. Os dados de características representam, portanto, a matéria-prima para uma ampla gama de pesquisas, da biologia evolutiva à ecologia comunitária e funcional, até a biogeografia. Aqui apresentamos a iniciativa de banco de dados global denominada TRY, que uniu uma ampla gama da comunidade de pesquisa de características de plantas em todo o mundo e obteve um engajamento sem precedentes de dados de características: até agora, 93 bancos de dados de características foram contribuídos. O repositório de dados atualmente contém quase três milhões de entradas de características para 69 000 das 300 000 espécies de plantas do mundo, com foco em 52 grupos de características que caracterizam as etapas vegetativa e de regeneração do ciclo de vida das plantas, incluindo crescimento, dispersão, estabelecimento e persistência. Uma primeira análise de dados mostra que a maioria das características das plantas é aproximadamente distribuída log-normalmente, com amplamente diferentes faixas de variação entre as características. A maioria da variação das características ocorre entre espécies (interspecífica), mas também é documentada uma variação intraspecífica significativa, até 40% da variação total. Os tipos funcionais de plantas (PFTs), como comumente usados em modelos de vegetação, capturam uma fração substancial da variação observada – mas para várias características, a maioria da variação ocorre dentro dos PFTs, até 75% da variação total. No contexto de modelos de vegetação, essas características seriam melhor representadas por variáveis de estado em vez de valores de parâmetros fixos. A melhor disponibilidade de dados de características de plantas no banco de dados global unificado é esperada para apoiar uma mudança de paradigma da ecologia baseada em espécies para a ecologia baseada em características, oferecer novas oportunidades para pesquisas sintéticas de características de plantas e permitir uma representação mais realista e empiricamente fundamentada da vegetação terrestre em modelos de sistemas terrestres.
BibTeX
@article{doi101111j13652486201102451x,
author = "Kattge, Jens and Dı́az, Soledad e Lavorel, Sandra e Prentice, I. Colin e Leadley, Paul e Bönisch, Gerhard e Garnier, Éric e Westoby, Mark e Reich, Peter B. e Wright, Ian J. e Cornelissen, J. H. C. e Violle, Cyrille e Harrison, Sandy P. e van Bodegom, Peter M. e Reichstein, Markus e Enquist, Brian J. e Soudzilovskaia, Nadejda A. e Ackerly, David D. e Anand, M. e Atkin, Owen K. e Bahn, Michael e Baker, Timothy R. e Baldocchi, Dennis e Bekker, R.M. e Blanco, C. e Blonder, Benjamin e Bond, William J. e Bradstock, Ross A. e Bunker, Dan e Casanoves, Fernando e Cavender‐Bares, Jeannine e Chambers, Jeffrey Q. e Chapin, F. Stuart e Chave, Jérôme e Coomes, David A. e Cornwell, William K. e Craine, Joseph M. e Dobrin, Barbara e Duarte, Leandro e Durka, Walter e Elser, James J. e Esser, G. e Estiarte, Marc e Fagan, William F. e Fang, Jinwei e Fernández‐Méndez, Fernando e Fidélis, Alessandra e Finegan, Bryan e Flores, Olivier e FORD, HENRY e Frank, Dorothea e Freschet, Grégoire T. e Fyllas, Nikolaos M. e Gallagher, Rachael V. e GREEN, W. A. e Gutiérrez, Álvaro G. e Hickler, Thomas e Higgins, Steven I. e Hodgson, J. G. e Jalili, Amir e Jansen, Steven e Joly, Carlos Alfredo e Kerkhoff, Andrew J. e Kirkup, Donald W. e Kitajima, Kaoru e Kleyer, Michael e Klotz, Stefan e Knops, Johannes M. H. e Krämer, K. e Kühn, Ingolf e Kurokawa, H. e Laughlin, Daniel C. e Lee, Tali D. e Leishman, Michelle R. e Lens, Frederic e Lenz, Tanja I. e Lewis, Simon L. e Lloyd, Jon e Llusià, Joan e Louault, Frédérique e Ma, Sai e Mahecha, Miguel D. e Manning, Peter e Massad, Tara Joy e Medlyn, Belinda E. e Messier, J. e Moles, Angela T. e Müller, Sandra Cristina e Nadrowski, Karin e NAEEM, S. e Niinemets, Ülo e Nöllert, Stephanie e Nuske, Alison e Ogaya, Romà e Oleksyn, Jacek e Onipchenko, V. G. e Onoda, Yusuke e Ordóñez, Jenny e Overbeck, Gerhard E. e Ozinga, W.A.",
title = "TRY – um banco de dados global de características das plantas",
year = "2011",
journal = "Global Change Biology",
abstract = "Resumo As características das plantas – as características morfológicas, anatômicas, fisiológicas, bioquímicas e fenológicas das plantas e seus órgãos – determinam como os produtores primários respondem aos fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos, influenciam os processos e serviços dos ecossistemas e fornecem uma ligação entre a riqueza de espécies e a diversidade funcional dos ecossistemas. Os dados de características representam, portanto, a matéria-prima para uma ampla gama de pesquisas, da biologia evolutiva à ecologia comunitária e funcional, até a biogeografia. Aqui apresentamos a iniciativa de banco de dados global denominada TRY, que uniu uma ampla gama da comunidade de pesquisa de características das plantas em todo o mundo e obteve uma adesão sem precedentes aos dados de características: até agora, 93 bancos de dados de características foram contribuídos. O repositório de dados atualmente contém quase três milhões de entradas de características para 69 000 das 300 000 espécies de plantas do mundo, com foco em 52 grupos de características que caracterizam as etapas vegetativa e de regeneração do ciclo de vida das plantas, incluindo crescimento, dispersão, estabelecimento e persistência. Uma primeira análise de dados mostra que a maioria das características das plantas é aproximadamente distribuída log‐normalmente, com amplamente diferentes faixas de variação entre as características. A maioria da variação das características ocorre entre espécies (interspecífica), mas também é documentada uma variação intraspecífica significativa, até 40% da variação total. Os tipos funcionais das plantas (PFTs), como comumente usados em modelos de vegetação, capturam uma fração substancial da variação observada – mas para várias características, a maioria da variação ocorre dentro dos PFTs, até 75% da variação total. No contexto de modelos de vegetação, essas características seriam melhor representadas por variáveis de estado em vez de valores de parâmetros fixos. A melhor disponibilidade de dados de características das plantas no banco de dados global unificado é esperada para apoiar uma mudança de paradigma da ecologia baseada em espécies para a ecologia baseada em características, oferecer novas oportunidades para pesquisas sintéticas de características das plantas e permitir uma representação mais realista e empiricamente fundamentada da vegetação terrestre nos modelos do sistema terrestre.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
openalex = "W2162584119",
references = "doi101007bf00386231, doi1010160165176580900245, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652486200300569x, doi101071bt02124, doi101086283244, doi101111j00301299200715559x, doi101111j14610248200600924x, doi101111j14610248200801219x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi1011552009421425"
}
46. Soltis, Pamela S. e Smith, Stephen A. e Cellinese, Nico e Wurdack, Kenneth J. e Tank, David C. e Brockington, Samuel F. e Refulio, Nancy e Walker, Jay B. e Moore, Michael J. e Carlsward, Barbara S. e Bell, Charles D. e Latvis, Maribeth e Crawley, Sunny e Black, Chelsea M. e Diouf, Diaga e Xi, Zhenxiang e Rushworth, Catherine A. e Gitzendanner, Matthew A. e Sytsma, Kenneth J. e Qiu, Yin‐Long e Hilu, Khidir W. e Davis, Charles C. e Sanderson, Michael J. e Beaman, Reed S. e Olmstead, Richard G. e Judd, Walter S. e Donoghue, Michael J. e Soltis, Pamela S., 2011, Filogenia de angiospermas: 17 genes, 640 táxons: American Journal of Botany.
Resumo
Nossas análises confirmam que, com grandes quantidades de dados de sequência, a maioria das relações de nível profundo dentro das angiospermas pode ser resolvida. Antecipamos que esta árvore de angiospermas bem resolvida será de ampla utilidade para muitas áreas da biologia, incluindo fisiologia, ecologia, paleobiologia e genômica.
BibTeX
@article{doi103732ajb1000404,
author = "Soltis, Pamela S. e Smith, Stephen A. e Cellinese, Nico e Wurdack, Kenneth J. e Tank, David C. e Brockington, Samuel F. e Refulio, Nancy e Walker, Jay B. e Moore, Michael J. e Carlsward, Barbara S. e Bell, Charles D. e Latvis, Maribeth e Crawley, Sunny e Black, Chelsea M. e Diouf, Diaga e Xi, Zhenxiang e Rushworth, Catherine A. e Gitzendanner, Matthew A. e Sytsma, Kenneth J. e Qiu, Yin‐Long e Hilu, Khidir W. e Davis, Charles C. e Sanderson, Michael J. e Beaman, Reed S. e Olmstead, Richard G. e Judd, Walter S. e Donoghue, Michael J. e Soltis, Pamela S.",
title = "Filogenia de angiospermas: 17 genes, 640 táxons",
year = "2011",
journal = "American Journal of Botany",
abstract = "Nossas análises confirmam que, com grandes quantidades de dados de sequência, a maioria das relações de nível profundo dentro das angiospermas pode ser resolvida. Antecipamos que esta árvore de angiospermas bem resolvida será de ampla utilidade para muitas áreas da biologia, incluindo fisiologia, ecologia, paleobiologia e genômica.",
url = "https://doi.org/10.3732/ajb.1000404",
doi = "10.3732/ajb.1000404",
openalex = "W2123023543",
references = "doi101016jympev200802011"
}
47. Harguindeguy, Natalia Pérez e Dı́az, Sandra e Garnier, Éric e Lavorel, Sandra e Poorter, Hendrik e Jaureguiberry, Pedro e Bret‐Harte, M. Syndonia e Cornwell, William K. e Craine, Joseph M. e Gurvich, Diego E. e Urcelay, Carlos e Veneklaas, Erik J. e Reich, Peter B. e Poorter, Lourens e Wright, Ian J. e Ray, Peter M. e Enrico, Lucas e Pausas, Juli G. e de Vos, Arjen C. e Buchmann, Nina e Funes, Guillermo e Quétier, Fabien e Hodgson, John e Thompson, K. e Morgan, Huw D. e ter Steege, Hans e van der Heijden, Marcel G. A. e Sack, Lawren e Blonder, B. e Poschlod, Peter e Vaieretti, María V. e Conti, Georgina e Staver, A. Carla e Aquino, Sâmia e Cornelissen, J. H. C., 2013, Novo manual para medição padronizada de traços funcionais de plantas em todo o mundo: Australian Journal of Botany.
Resumo
Os traços funcionais das plantas são as características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representam estratégias ecológicas e determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam propriedades do ecossistema. A variação nos traços funcionais das plantas e nas síndromes de traços provou-se útil para abordar muitas questões ecológicas importantes em uma variedade de escalas, gerando uma demanda por métodos padronizados para medir traços de plantas ecologicamente significativos. Esta linha de pesquisa tem sido uma das vias mais férteis para compreender padrões e processos ecológicos e evolutivos. Ela também tem o potencial tanto de construir um conjunto preditivo de relações locais, regionais e globais entre plantas e ambiente quanto de quantificar uma ampla gama de processos naturais e impulsionados pelo ser humano, incluindo mudanças na biodiversidade, os impactos de invasões de espécies, alterações em processos biogeoquímicos e interações vegetação-atmosfera. A importância desses tópicos dita a necessidade urgente de mais e melhores dados, e aumenta o valor de protocolos padronizados para quantificar a variação de traços de diferentes espécies, particularmente para traços com poder de prever processos em nível de planta e ecossistema, e para traços que podem ser medidos relativamente facilmente. Atualizado e expandido a partir da versão anterior amplamente utilizada, este manual mantém o foco em receitas passo a passo claramente apresentadas e amplamente aplicáveis, com um mínimo de texto sobre teoria, e não apenas inclui métodos atualizados para os traços anteriormente cobertos, mas também introduz muitos novos protocolos para traços adicionais. Este novo manual tem um melhor equilíbrio entre traços de planta inteira, traços de folhas, traços de raízes e caules e traços regenerativos, e coloca ênfase particular em traços importantes para prever os efeitos das espécies em propriedades-chave do ecossistema. Esperamos que este novo manual se torne um companheiro padrão nos esforços locais e globais para aprender sobre as respostas e impactos de diferentes espécies de plantas em relação às mudanças ambientais no presente, passado e futuro.
BibTeX
@article{doi101071bt12225,
author = "Harguindeguy, Natalia Pérez and Dı́az, Sandra and Garnier, Éric and Lavorel, Sandra and Poorter, Hendrik and Jaureguiberry, Pedro and Bret‐Harte, M. Syndonia and Cornwell, William K. and Craine, Joseph M. and Gurvich, Diego E. and Urcelay, Carlos and Veneklaas, Erik J. and Reich, Peter B. and Poorter, Lourens and Wright, Ian J. and Ray, Peter M. and Enrico, Lucas and Pausas, Juli G. and de Vos, Arjen C. and Buchmann, Nina and Funes, Guillermo and Quétier, Fabien and Hodgson, John and Thompson, K. e Morgan, Huw D. e ter Steege, Hans e van der Heijden, Marcel G. A. e Sack, Lawren e Blonder, B. e Poschlod, Peter e Vaieretti, María V. e Conti, Georgina e Staver, A. Carla e Aquino, Sâmia e Cornelissen, J. H. C.",
title = "Novo manual para medição padronizada de traços funcionais de plantas em todo o mundo",
year = "2013",
journal = "Australian Journal of Botany",
abstract = "Os traços funcionais das plantas são as características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representam estratégias ecológicas e determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam as propriedades do ecossistema. A variação nos traços funcionais das plantas e nas síndromes de traços provou-se útil para abordar muitas questões ecológicas importantes em uma variedade de escalas, gerando uma demanda por maneiras padronizadas de medir traços de plantas ecologicamente significativos. Esta linha de pesquisa tem sido uma das vias mais férteis para compreender padrões e processos ecológicos e evolutivos. Também tem o potencial tanto de construir um conjunto preditivo de relações locais, regionais e globais entre plantas e ambiente quanto de quantificar uma ampla gama de processos naturais e impulsionados pelo ser humano, incluindo mudanças na biodiversidade, os impactos de invasões de espécies, alterações em processos biogeoquímicos e interações vegetação-atmosfera. A importância desses tópicos dita a necessidade urgente de mais e melhores dados e aumenta o valor de protocolos padronizados para quantificar a variação de traços de diferentes espécies, particularmente para traços com poder de prever processos em nível de planta e de ecossistema, e para traços que podem ser medidos relativamente facilmente. Atualizado e expandido a partir da versão anterior amplamente utilizada, este manual mantém o foco em receitas passo a passo claramente apresentadas e amplamente aplicáveis, com um mínimo de texto sobre teoria, e não apenas inclui métodos atualizados para os traços anteriormente cobertos, mas também introduz muitos novos protocolos para outros traços. Este novo manual tem um melhor equilíbrio entre traços de planta inteira, traços de folhas, traços de raízes e caules e traços regenerativos, e coloca ênfase particular em traços importantes para prever os efeitos das espécies em propriedades-chave do ecossistema. Esperamos que este novo manual se torne um companheiro padrão nos esforços locais e globais para aprender sobre as respostas e impactos de diferentes espécies de plantas em relação às mudanças ambientais no presente, passado e futuro.",
url = "https://doi.org/10.1071/bt12225",
doi = "10.1071/bt12225",
openalex = "W2101020813",
references = "doi101006anbo20001261, doi101007s004420050100x, doi1010160031942281851345, doi101016b9780124735422x50007, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi10103835012241, doi101038nature02403, doi101038nature11148, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi101146annurevpp40060189002443, doi1023073241344, doi105860choice324498, openalexw1573494572, openalexw2058502945, openalexw2764433274, openalexw569951484"
}
48. Beaulieu, Jeremy M. e O’Meara, Brian C. e Donoghue, Michael J., 2013, Identifying Hidden Rate Changes in the Evolution of a Binary Morphological Character: The Evolution of Plant Habit in Campanulid Angiosperms: Systematic Biology.
Resumo
O crescimento de árvores filogenéticas em escopo e em tamanho é promissor do ponto de vista da compreensão de uma ampla variedade de padrões e processos evolutivos. Com árvores compostas por clados maiores, mais antigos e globalmente distribuídos, é provável que a labilidade de um caráter binário diferirá significativamente entre linhagens, o que poderia levar a erros na estimativa de taxas de transição e na inferência associada de estados ancestrais. Aqui, desenvolvemos e implementamos um novo método para identificar diferentes taxas de evolução em um caráter binário ao longo de diferentes ramos de uma filogenia. Ilustramos essa abordagem explorando a evolução do hábito de crescimento em Campanulidae, um clado de plantas com flor contendo cerca de 35.000 espécies. A distribuição de espécies lenhosas versus herbáceas coloca em questão o uso de modelos tradicionais de evolução de caráter binário. O reconhecimento e acomodação de mudanças na taxa de evolução da forma de crescimento em diferentes linhagens demonstra, pela primeira vez, uma imagem robusta da evolução da forma de crescimento ao longo de um clado de plantas com flor muito grande, muito antigo e muito amplamente distribuído.
BibTeX
@article{doi101093sysbiosyt034,
author = "Beaulieu, Jeremy M. and O’Meara, Brian C. and Donoghue, Michael J.",
title = "Identifying Hidden Rate Changes in the Evolution of a Binary Morphological Character: The Evolution of Plant Habit in Campanulid Angiosperms",
year = "2013",
journal = "Systematic Biology",
abstract = "O crescimento de árvores filogenéticas em escopo e em tamanho é promissor do ponto de vista da compreensão de uma ampla variedade de padrões e processos evolutivos. Com árvores compostas por clados maiores, mais antigos e globalmente distribuídos, é provável que a labilidade de um caráter binário diferirá significativamente entre linhagens, o que poderia levar a erros na estimativa de taxas de transição e na inferência associada de estados ancestrais. Aqui, desenvolvemos e implementamos um novo método para identificar diferentes taxas de evolução em um caráter binário ao longo de diferentes ramos de uma filogenia. Ilustramos essa abordagem explorando a evolução do hábito de crescimento em Campanulidae, um clado de plantas com flor contendo cerca de 35.000 espécies. A distribuição de espécies lenhosas versus herbáceas coloca em questão o uso de modelos tradicionais de evolução de caráter binário. O reconhecimento e acomodação de mudanças na taxa de evolução da forma de crescimento em diferentes linhagens demonstra, pela primeira vez, uma imagem robusta da evolução da forma de crescimento ao longo de um clado de plantas com flor muito grande, muito antigo e muito amplamente distribuído.",
url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syt034",
doi = "10.1093/sysbio/syt034",
openalex = "W2112282403",
references = "doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093nargkh340, doi101109tac19741100705, doi101111j10958339200900996x, doi1023071266136, doi1023072004114, doi1023073802723, openalexw2611511275, openalexw3149745985"
}
49. Project, Amborella Genome and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Leebens-Mack, James and Mā, Hong and Palmer, Jeffrey D. and Rounsley, Steve and Sankoff, David and Schuster, Stephan C. and Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S. and Wessler, Susan R. and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Ammiraju, Jetty S. S. and Barbazuk, W. Bradley and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Determann, Ronald and Leebens-Mack, James and Ma, Hong and Ralph, Paula E. and Rounsley, Steve and Schuster, Stephan C. and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Talag, Jason and Tomsho, Lynn and Walts, Brandon and Wanke, Stefan and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chang, Tien-Hao and Determann, Ronald and Lan, Tianying and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Ayyampalayam, Saravanaraj and Barbazuk, W. Brad and Burnette, James M. and Chamala, Srikar and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Farrell, Nina and Harkess, Alex and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Meyers, Blake C. and Shahid, Saima and Wafula, Eric and Walts, Brandon and Wessler, Susan R. and Zhai, Jixian and Zhang, Xiaoyu and Albert, Victor A. and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Lyons, Eric and Sankoff, David and Tang, Haibao and Wafula, Eric and Zheng, Chunfang and Albert, Victor A. and Altman, Naomi S. and Barbazuk, W. Bradley and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Wafula, Eric and Altman, Naomi S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chen, Feng and Chen, Jian‐Qun and Chiang, Vincent L. and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W., 2013, O Genoma de Amborella e a Evolução das Plantas com Flores: Science.
Resumo
Amborella trichopoda é fortemente apoiada como a única espécie viva da linhagem irmã de todas as outras plantas com flores existentes, fornecendo uma referência única para inferir o conteúdo e a estrutura do genoma do ancestral comum mais recente (MRCA) das angiospermas vivas. A sequenciação do genoma de Amborella identificou uma duplicação genômica antiga que antecedeu a diversificação das angiospermas, sem evidências de duplicações genômicas subsequentes e específicas de linhagem. Comparações entre Amborella e outras angiospermas facilitaram a reconstrução do conteúdo gênico ancestral e da ordem dos genes no MRCA das eudicotiledôneas centrais. Identificamos novas famílias gênicas, duplicações gênicas e interações proteína-proteína florais que apareceram pela primeira vez na angiosperma ancestral. Elementos transponíveis em Amborella são antigos e altamente divergentes, sem radiações recentes de transposons. A análise genômica populacional ao longo da área nativa de Amborella na Nova Caledônia revela um gargalo genético recente e estrutura geográfica com implicações para a conservação.
BibTeX
@article{doi101126science1241089,
author = "Project, Amborella Genome and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Leebens-Mack, James and Mā, Hong and Palmer, Jeffrey D. and Rounsley, Steve and Sankoff, David and Schuster, Stephan C. and Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S. and Wessler, Susan R. and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Ammiraju, Jetty S. S. and Barbazuk, W. Bradley and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Determann, Ronald and Leebens-Mack, James and Ma, Hong and Ralph, Paula E. and Rounsley, Steve and Schuster, Stephan C. and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Talag, Jason and Tomsho, Lynn and Walts, Brandon and Wanke, Stefan and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chang, Tien-Hao and Determann, Ronald and Lan, Tianying and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Ayyampalayam, Saravanaraj and Barbazuk, W. Brad and Burnette, James M. and Chamala, Srikar and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Farrell, Nina and Harkess, Alex and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Meyers, Blake C. and Shahid, Saima and Wafula, Eric and Walts, Brandon and Wessler, Susan R. and Zhai, Jixian and Zhang, Xiaoyu and Albert, Victor A. and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Lyons, Eric and Sankoff, David and Tang, Haibao and Wafula, Eric and Zheng, Chunfang and Albert, Victor A. and Altman, Naomi S. and Barbazuk, W. Bradley and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Wafula, Eric and Altman, Naomi S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chen, Feng and Chen, Jian‐Qun and Chiang, Vincent L. and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W.",
title = "The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants",
year = "2013",
journal = "Science",
abstract = "Amborella trichopoda is strongly supported as the single living species of the sister lineage to all other extant flowering plants, providing a unique reference for inferring the genome content and structure of the most recent common ancestor (MRCA) of living angiosperms. Sequencing the Amborella genome, we identified an ancient genome duplication predating angiosperm diversification, without evidence of subsequent, lineage-specific genome duplications. Comparisons between Amborella and other angiosperms facilitated reconstruction of the ancestral angiosperm gene content and gene order in the MRCA of core eudicots. We identify new gene families, gene duplications, and floral protein-protein interactions that first appeared in the ancestral angiosperm. Transposable elements in Amborella are ancient and highly divergent, with no recent transposon radiations. Population genomic analysis across Amborella's native range in New Caledonia reveals a recent genetic bottleneck and geographic structure with conservation implications.",
url = "https://doi.org/10.1126/science.1241089",
doi = "10.1126/science.1241089",
openalex = "W2058378183",
references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101146annurevearth042711105313, doi101196annals1438005"
}
50. 2014, ANGIOSPERMS: Enciclopédia da Mudança Ambiental.
DOI: 10.4135/9781446247501.n178
BibTeX
@misc{crossref2014angiosperms,
title = "ANGIOSPERMS",
year = "2014",
booktitle = "Enciclopédia da Mudança Ambiental",
url = "https://doi.org/10.4135/9781446247501.n178",
doi = "10.4135/9781446247501.n178"
}
51. Werner, Gijsbert D. A. e Cornwell, William K. e Sprent, Janet I. e Kattge, Jens e Kiers, E. Toby, 2014, Uma única inovação evolutiva impulsiona a evolução profunda da fixação simbiótica de N2 em angiospermas: Nature Communications.
Resumo
Associações simbióticas ocorrem em todos os habitats da Terra, mas sabemos muito pouco sobre suas histórias evolutivas. Modelos atuais de evolução de traços não podem reconstruir adequadamente a história profunda da inovação simbiótica, porque assumem processos evolutivos homogêneos ao longo de milhões de anos. Aqui, usamos um framework filogenético recentemente desenvolvido, heterogêneo e quantitativo, para estudar a origem da simbiose entre angiospermas e simbiontes bacterianos fixadores de nitrogênio (N2) alojados em nódulos. Compilamos o maior banco de dados de espécies de plantas nodulantes globais e reconstruímos a evolução da simbiose. Identificamos uma única inovação evolutiva oculta que impulsiona a evolução da fixação simbiótica de N2, seguida por múltiplos ganhos e perdas da simbiose, e o subsequente surgimento de 'fixadores estáveis' (clados extremamente improváveis de perder a simbiose). Originando-se há mais de 100 MYA, esta inovação sugere homologia profunda na fixação simbiótica de N2. Identificar inovações ocultas na árvore da vida é fundamental para entender a evolução de traços complexos, incluindo parcerias simbióticas.
BibTeX
@article{doi101038ncomms5087,
author = "Werner, Gijsbert D. A. e Cornwell, William K. e Sprent, Janet I. e Kattge, Jens e Kiers, E. Toby",
title = "Uma única inovação evolutiva impulsiona a evolução profunda da fixação simbiótica de N2 em angiospermas",
year = "2014",
journal = "Nature Communications",
abstract = "Associações simbióticas ocorrem em todos os habitats da Terra, mas sabemos muito pouco sobre suas histórias evolutivas. Modelos atuais de evolução de traços não podem reconstruir adequadamente a história profunda da inovação simbiótica, porque assumem processos evolutivos homogêneos ao longo de milhões de anos. Aqui, usamos um framework filogenético recentemente desenvolvido, heterogêneo e quantitativo, para estudar a origem da simbiose entre angiospermas e simbiontes bacterianos fixadores de nitrogênio (N2) alojados em nódulos. Compilamos o maior banco de dados de espécies de plantas nodulantes globais e reconstruímos a evolução da simbiose. Identificamos uma única inovação evolutiva oculta que impulsiona a evolução da fixação simbiótica de N2, seguida por múltiplos ganhos e perdas da simbiose, e o subsequente surgimento de 'fixadores estáveis' (clados extremamente improváveis de perder a simbiose). Originando-se há mais de 100 MYA, esta inovação sugere homologia profunda na fixação simbiótica de N2. Identificar inovações ocultas na árvore da vida é fundamental para entender a evolução de traços complexos, incluindo parcerias simbióticas.",
url = "https://doi.org/10.1038/ncomms5087",
doi = "10.1038/ncomms5087",
openalex = "W2031705623",
references = "doi101038nature10625, doi101038nature12872, doi101038nrmicro1987, doi101038nrmicro2990, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi101111j13652486201102451x, doi101111j155856461985tb00420x, doi103758bf03206482"
}
52. Wickett, Norman J. e Mirarab, Siavash e Nguyen, Nam e Warnow, Tandy e Carpenter, Eric e Matasci, Naim e Ayyampalayam, Saravanaraj e Barker, Michael S. e Burleigh, J. Gordon e Gitzendanner, Matthew A. e Ruhfel, Brad R. e Wafula, Eric e Der, Joshua P. e Graham, Sean W. e Mathews, Sarah e Melkonian, Michael e Soltis, Pamela S. e Soltis, Pamela S. e Miles, Nicholas W. e Rothfels, Carl J. e Pokorny, Lisa e Shaw, A. Jonathan e DeGironimo, Lisa e Stevenson, Dennis e Surek, Barbara e Villarreal, Juan Carlos e Roure, Béatrice e Philippe, Hervé e dePamphilis, Claude W. e Chen, Tao e Deyholos, Michael K. e Baucom, Regina S. e Kutchan, Toni M. e Augustin, Megan M. e Wang, Jun e Zhang, Yong e Tian, Zhijian e Yan, Zhixiang e Wu, Xiaolei e Sun, Xiao e Wong, Gane Ka‐Shu e Leebens-Mack, James, 2014, Análise filotranscritômica da origem e da diversificação inicial das plantas terrestres: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Reconstruir a origem e a evolução das plantas terrestres e seus parentes algais é um problema fundamental na filogenia vegetal, e é essencial para compreender como surgiram adaptações críticas, incluindo o embrião, o tecido vascular, as sementes e as flores. Apesar dos avanços na sistemática molecular, algumas hipóteses de relações permanecem pouco resolvidas. Inferir filogenias profundas com episódios de rápida diversificação pode ser problemático; no entanto, dados em escala genômica devem aumentar significativamente o número de caracteres informativos para as análises. Reconstruções filogenômicas recentes focadas nas principais divergências das plantas resultaram em resultados promissores, mas inconsistentes. Uma limitação é a amostragem esparsa de táxons, provavelmente resultante da dificuldade e do custo da geração de dados. Para abordar essa limitação, dados de transcriptoma para 92 táxons de estreptófitos foram gerados e analisados juntamente com 11 sequências de genoma vegetal publicadas. Reconstruções filogenéticas foram conduzidas usando até 852 genes nucleares e 1.701.170 sítios alinhados. Foram realizadas 69 análises para testar a robustez das inferências filogenéticas a permutações da matriz de dados ou ao método filogenético, incluindo abordagens de supermatriz, supérárvore e baseadas em coalescência, métodos de máxima verossimilhança e Bayesianos, análises particionadas e não particionadas, e alinhamentos de aminoácidos versus DNA. Entre outros resultados, encontramos suporte robusto para uma relação de grupo-irmão entre plantas terrestres e um grupo de algas verdes estreptófitas, as Zygnematophyceae. Suporte forte e robusto para um clado composto por hepáticas e musgos é inconsistente com uma visão amplamente aceita da evolução inicial das plantas terrestres e sugere que as hipóteses filogenéticas usadas para compreender a evolução de traços fundamentais das plantas devem ser reavaliadas.
BibTeX
@article{doi101073pnas1323926111,
author = "Wickett, Norman J. and Mirarab, Siavash and Nguyen, Nam and Warnow, Tandy and Carpenter, Eric and Matasci, Naim and Ayyampalayam, Saravanaraj and Barker, Michael S. and Burleigh, J. Gordon and Gitzendanner, Matthew A. and Ruhfel, Brad R. and Wafula, Eric and Der, Joshua P. and Graham, Sean W. and Mathews, Sarah and Melkonian, Michael and Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S. and Miles, Nicholas W. and Rothfels, Carl J. and Pokorny, Lisa and Shaw, A. Jonathan and DeGironimo, Lisa and Stevenson, Dennis and Surek, Barbara and Villarreal, Juan Carlos and Roure, Béatrice and Philippe, Hervé and dePamphilis, Claude W. and Chen, Tao and Deyholos, Michael K. and Baucom, Regina S. and Kutchan, Toni M. and Augustin, Megan M. and Wang, Jun and Zhang, Yong and Tian, Zhijian and Yan, Zhixiang and Wu, Xiaolei and Sun, Xiao and Wong, Gane Ka‐Shu and Leebens-Mack, James",
title = "Phylotranscriptomic analysis of the origin and early diversification of land plants",
year = "2014",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Reconstruir a origem e a evolução das plantas terrestres e seus parentes algais é um problema fundamental na filogenia vegetal, e é essencial para compreender como surgiram adaptações críticas, incluindo o embrião, o tecido vascular, as sementes e as flores. Apesar dos avanços na sistemática molecular, algumas hipóteses de relações permanecem pouco resolvidas. Inferir filogenias profundas com episódios de rápida diversificação pode ser problemático; no entanto, dados em escala genômica devem aumentar significativamente o número de caracteres informativos para as análises. Reconstruções filogenômicas recentes focadas nas principais divergências das plantas resultaram em resultados promissores, mas inconsistentes. Uma limitação é a amostragem esparsa de táxons, provavelmente resultante da dificuldade e do custo da geração de dados. Para abordar essa limitação, dados de transcriptoma para 92 táxons de estreptófitos foram gerados e analisados juntamente com 11 sequências de genoma vegetal publicadas. Reconstruções filogenéticas foram conduzidas usando até 852 genes nucleares e 1.701.170 sítios alinhados. Foram realizadas 69 análises para testar a robustez das inferências filogenéticas a permutações da matriz de dados ou ao método filogenético, incluindo abordagens de supermatriz, supérárvore e baseadas em coalescência, métodos de máxima verossimilhança e Bayesianos, análises particionadas e não particionadas, e alinhamentos de aminoácidos versus DNA. Entre outros resultados, encontramos suporte robusto para uma relação de grupo-irmão entre plantas terrestres e um grupo de algas verdes estreptófitas, as Zygnematophyceae. Suporte forte e robusto para um clado composto por hepáticas e musgos é inconsistente com uma visão amplamente aceita da evolução inicial das plantas terrestres e sugere que as hipóteses filogenéticas usadas para compreender a evolução de traços fundamentais das plantas devem ser reavaliadas.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1323926111",
doi = "10.1073/pnas.1323926111",
openalex = "W2013277649",
references = "doi101016jtree200901009, doi101016s0022283605803602, doi10103837918, doi101046j109583392003t01100158x, doi101093bioinformatics83275, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbio463523, doi101093sysbiosyt022, doi101111boj12385, doi101111j10958339200900996x, doi101111j10960031200800217x, doi1011861471214811104, doi101371journalpcbi1002195, doi1023072346830, openalexw3148514506"
}
53. Zwieniecki, Maciej A. e Boyce, C. Kevin, 2014, A evolução de uma precisão anatômica única na veiação foliar de angiospermas alivia restrições à ecologia de plantas vasculares: Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences.
Resumo
O papel principal da veiação foliar é fornecer água através da superfície fotossintética para manter os estômatos abertos e permitir o acesso ao CO2 atmosférico, apesar da demanda evaporativa. A entrega uniforme ótima de água ocorre quando a distância entre as veias é igual à profundidade da colocação das veias dentro da folha, afastada da superfície evaporativa. Conforme apresentado aqui, apenas as angiospermas mantêm este ótimo anatômico em todas as espessuras de folha e diferentes habitats, incluindo ambientes protegidos onde tal otimização não é necessária. Intrigantemente, linhagens basais de angiospermas tendem a ser subinvestidas hidráulica; uma otimização uniformemente alta é derivada independentemente nas magnolióides, monocotiledôneas e eudicotiledôneas centrais. Gimnospermas e samambaias, incluindo fósseis disponíveis, são limitadas pela sua incapacidade de produzir altas densidades de veias. A associação comum de samambaias com ambientes úmidos sombreados pode, em parte, ser uma consequência evolutiva direta de sua incapacidade de produzir folhas otimizadas hidráulicamente. Algumas gimnospermas se aproximam da colocação ótima de veias, mas apenas em virtude de sua capacidade de produzir folhas grossas mais apropriadas em ambientes que exigem conservação de água. Assim, esta métrica anatômica simples apresenta uma perspectiva importante sobre a evolução e distribuição filogenética de ecologias vegetais e mais evidências de que a biologia vegetativa de plantas com flores - não apenas sua biologia reprodutiva - é única.
BibTeX
@article{doi101098rspb20132829,
author = "Zwieniecki, Maciej A. e Boyce, C. Kevin",
title = "A evolução de uma precisão anatômica única na veiação foliar de angiospermas alivia restrições à ecologia de plantas vasculares",
year = "2014",
journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
abstract = "O papel principal da veiação foliar é fornecer água através da superfície fotossintética para manter os estômatos abertos e permitir o acesso ao CO2 atmosférico, apesar da demanda evaporativa. A entrega uniforme ótima de água ocorre quando a distância entre as veias é igual à profundidade da colocação das veias dentro da folha, afastada da superfície evaporativa. Conforme apresentado aqui, apenas as angiospermas mantêm este ótimo anatômico em todas as espessuras de folha e diferentes habitats, incluindo ambientes protegidos onde tal otimização não é necessária. Intrigantemente, linhagens basais de angiospermas tendem a ser subinvestidas hidráulica; uma otimização uniformemente alta é derivada independentemente nas magnolióides, monocotiledôneas e eudicotiledôneas centrais. Gimnospermas e samambaias, incluindo fósseis disponíveis, são limitadas pela sua incapacidade de produzir altas densidades de veias. A associação comum de samambaias com ambientes úmidos sombreados pode, em parte, ser uma consequência evolutiva direta de sua incapacidade de produzir folhas otimizadas hidráulicamente. Algumas gimnospermas se aproximam da colocação ótima de veias, mas apenas em virtude de sua capacidade de produzir folhas grossas mais apropriadas em ambientes que exigem conservação de água. Assim, esta métrica anatômica simples apresenta uma perspectiva importante sobre a evolução e distribuição filogenética de ecologias vegetais e mais evidências de que a biologia vegetativa de plantas com flores - não apenas sua biologia reprodutiva - é única.",
url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2013.2829",
doi = "10.1098/rspb.2013.2829",
openalex = "W2118988740",
references = "doi101007b138533, doi101086300102, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j14610248200901410x, doi1016660094837320040300082dadani20co2, doi1023073515620, openalexw2097450069"
}
54. Reich, Peter B., 2014, O espectro econômico de plantas 'rápido-lento' em todo o mundo: um manifesto de traços: Journal of Ecology.
Resumo
Resumo O espectro da economia foliar (LES) fornece um quadro útil para examinar as estratégias das espécies moldadas por sua história evolutiva. No entanto, esse espectro, conforme originalmente descrito, envolvia apenas dois recursos-chave (carbono e nutrientes) e um dos três órgãos vegetais economicamente importantes. Aqui, avalio se a ideia do espectro econômico pode ser amplamente estendida à água – o terceiro recurso-chave – caules, raízes e plantas inteiras e para escalas individuais, comunitárias e de ecossistema. Minha hipótese abrangente é que a seleção forte ao longo dos eixos de compromisso de características, em conjunto com restrições biofísicas, resulta em convergência para qualquer táxon em uma estratégia uniformemente rápida, média ou lenta (ou seja, taxas de aquisição e processamento de recursos) para todos os órgãos e todos os recursos. Evidências para espectros de características econômicas existem para caules e raízes, bem como para folhas, e para características relacionadas à água, bem como ao carbono e nutrientes. Estas aplicam-se geralmente dentro e entre escalas (dentro e entre comunidades, zonas climáticas, biomas e linhagens). Existem ligações entre órgãos e acoplamento entre recursos, resultando em um espectro econômico integrado de planta inteira. Espécies capazes de mover água rapidamente têm baixa densidade de tecido, curta vida útil do tecido e altas taxas de aquisição e fluxo de recursos em escalas de órgão e individual. O inverso é verdadeiro para espécies com a estratégia lenta. Diferentes características podem ser importantes em diferentes condições, mas, como ser rápido em um aspecto geralmente requer ser rápido em outros, ser rápido ou lento é uma característica geral das espécies. Características econômicas influenciam o desempenho e a aptidão de acordo com a teoria baseada em características sobre mecanismos adaptativos subjacentes. Características ajudam a explicar diferenças no crescimento e sobrevivência ao longo de gradientes de recursos e, portanto, ajudam a explicar a distribuição de espécies e a montagem de comunidades ao longo de gradientes de luz, água e nutrientes. Características se escalonam – características rápidas estão associadas a taxas mais rápidas de processos ecossistêmicos, como decomposição ou produtividade primária, e características lentas a taxas de processo lentas. Síntese. Características importam. Um único espectro de economia vegetal 'rápido–lento' que integra folhas, caules e raízes é uma característica chave do universo vegetal e ajuda a explicar estratégias ecológicas individuais, processos de montagem de comunidades e o funcionamento de ecossistemas.
BibTeX
@article{doi1011111365274512211,
author = "Reich, Peter B.",
title = "The world‐wide 'fast–slow' plant economics spectrum: a traits manifesto",
year = "2014",
journal = "Journal of Ecology",
abstract = "Resumo O espectro da economia foliar (LES) fornece um quadro útil para examinar as estratégias das espécies moldadas por sua história evolutiva. No entanto, esse espectro, conforme originalmente descrito, envolvia apenas dois recursos-chave (carbono e nutrientes) e um dos três órgãos vegetais economicamente importantes. Aqui, avalio se a ideia do espectro econômico pode ser amplamente estendida à água – o terceiro recurso-chave – caules, raízes e plantas inteiras e para escalas individuais, comunitárias e de ecossistema. Minha hipótese abrangente é que a seleção forte ao longo dos eixos de compromisso de características, em conjunto com restrições biofísicas, resulta em convergência para qualquer táxon em uma estratégia uniformemente rápida, média ou lenta (ou seja, taxas de aquisição e processamento de recursos) para todos os órgãos e todos os recursos. Evidências para espectros de características econômicas existem para caules e raízes, bem como para folhas, e para características relacionadas à água, bem como ao carbono e nutrientes. Estas aplicam-se geralmente dentro e entre escalas (dentro e entre comunidades, zonas climáticas, biomas e linhagens). Existem ligações entre órgãos e acoplamento entre recursos, resultando em um espectro econômico integrado de planta inteira. Espécies capazes de mover água rapidamente têm baixa densidade de tecido, curta vida útil do tecido e altas taxas de aquisição e fluxo de recursos em escalas de órgão e individual. O inverso é verdadeiro para espécies com a estratégia lenta. Diferentes características podem ser importantes em diferentes condições, mas, como ser rápido em um aspecto geralmente requer ser rápido em outros, ser rápido ou lento é uma característica geral das espécies. Características econômicas influenciam o desempenho e a aptidão de acordo com a teoria baseada em características sobre mecanismos adaptativos subjacentes. Características ajudam a explicar diferenças no crescimento e sobrevivência ao longo de gradientes de recursos e, portanto, ajudam a explicar a distribuição de espécies e a montagem de comunidades ao longo de gradientes de luz, água e nutrientes. Características se escalonam – características rápidas estão associadas a taxas mais rápidas de processos ecossistêmicos, como decomposição ou produtividade primária, e características lentas a taxas de processo lentas. Síntese. Características importam. Um único espectro de economia vegetal 'rápido–lento' que integra folhas, caules e raízes é uma característica chave do universo vegetal e ajuda a explicar estratégias ecológicas individuais, processos de montagem de comunidades e o funcionamento de ecossistemas.",
url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12211",
doi = "10.1111/1365-2745.12211",
openalex = "W2127928904",
references = "doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652745199800306x, doi101086283244, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annureves11110180001313, doi1018900012965819970781958cafasa20co2, doi1023072259756, doi1023074549, doi1034172009143, openalexw1564371012, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}
55. Willis, Charles G. e Baskin, Carol C. e Baskin, Jerry M. e Auld, Josh R. e Venable, D. Lawrence e Cavender‐Bares, Jeannine e Donohue, Kathleen e de Casas, Rafael Rubio e Grupo, The NESCent Germination Working, 2014, A evolução da dormência de sementes: sinais ambientais, hubs evolutivos e diversificação das plantas com sementes: New Phytologist.
Resumo
A dormência de sementes, ao controlar o momento da germinação, pode afetar fortemente a sobrevivência das plantas. O tipo de dormência de sementes, portanto, pode influenciar tanto processos em nível populacional quanto em nível de espécie, como colonização, adaptação, especiação e extinção. Utilizamos um conjunto de dados composto por mais de 14.000 táxons em 318 famílias ao longo das plantas com sementes para testar hipóteses sobre a evolução de diferentes tipos de dormência de sementes e sua associação com a diversificação de linhagens. Encontramos que a dormência morfofisiológica é o estado ancestral mais provável das plantas com sementes, sugerindo que a dormência regulada fisiologicamente em resposta a sinais ambientais estava presente na origem das plantas com sementes. Além disso, descobrimos que a dormência fisiológica (PD), uma vez dissociada da dormência morfológica, atuou como um 'hub evolutivo' a partir do qual outras classes de dormência evoluíram, e que ela estava associada a taxas mais altas de diversificação de linhagens por meio de taxas mais altas de especiação. A sensibilidade ambiental fornecida pela dormência em geral, e pela PD em particular, parece ser uma característica chave na diversificação das plantas com sementes.
BibTeX
@article{doi101111nph12782,
author = "Willis, Charles G. e Baskin, Carol C. e Baskin, Jerry M. e Auld, Josh R. e Venable, D. Lawrence e Cavender‐Bares, Jeannine e Donohue, Kathleen e de Casas, Rafael Rubio e Grupo, The NESCent Germination Working",
title = "A evolução da dormência de sementes: sinais ambientais, hubs evolutivos e diversificação das plantas com sementes",
year = "2014",
journal = "New Phytologist",
abstract = "A dormência de sementes, ao controlar o momento da germinação, pode afetar fortemente a sobrevivência das plantas. O tipo de dormência de sementes, portanto, pode influenciar tanto processos em nível populacional quanto em nível de espécie, como colonização, adaptação, especiação e extinção. Utilizamos um conjunto de dados composto por mais de 14.000 táxons em 318 famílias ao longo das plantas com sementes para testar hipóteses sobre a evolução de diferentes tipos de dormência de sementes e sua associação com a diversificação de linhagens. Encontramos que a dormência morfofisiológica é o estado ancestral mais provável das plantas com sementes, sugerindo que a dormência regulada fisiologicamente em resposta a sinais ambientais estava presente na origem das plantas com sementes. Além disso, descobrimos que a dormência fisiológica (PD), uma vez dissociada da dormência morfológica, atuou como um 'hub evolutivo' a partir do qual outras classes de dormência evoluíram, e que ela estava associada a taxas mais altas de diversificação de linhagens por meio de taxas mais altas de especiação. A sensibilidade ambiental fornecida pela dormência em geral, e pela PD em particular, parece ser uma característica chave na diversificação das plantas com sementes.",
url = "https://doi.org/10.1111/nph.12782",
doi = "10.1111/nph.12782",
openalex = "W2110336319",
references = "doi101111j001438202002tb00137x, doi10118614712105788"
}
56. Donoghue, Michael J. e Edwards, Erika J., 2014, Mudanças de Bioma e Evolução de Nicho em Plantas: Annual Review of Ecology Evolution and Systematics.
DOI: 10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905
Resumo
Quais fatores influenciam se uma linhagem pode transitar com sucesso para um novo bioma, e por que algumas mudanças de bioma foram mais frequentes que outras? Para orientar essa linha de pesquisa, desenvolvemos um quadro conceitual no qual a probabilidade de uma mudança de bioma é uma função de (a) exposição a ambientes contrastantes ao longo do tempo, (b) a acessibilidade evolutiva de adaptações relevantes e (c) interações bióticas em mudança. Avaliamos a literatura sobre mudanças de bioma em plantas em relação a um conjunto de hipóteses sobre o tamanho, conectividade e idade absoluta dos biomas, bem como sobre a adaptabilidade de linhagens particulares e interações ecológicas ao longo do tempo. Também criticamos a inferência filogenética de biomas passados e uma abordagem baseada em modelo "global" para a evolução de biomas. Generalizações mais robustas sobre mudanças de bioma exigiriam estudos detalhados de clados bem amostrados e bem resolvidos, levando em conta as mudanças nos fatores abióticos e bióticos relevantes ao longo do tempo.
BibTeX
@article{doi101146annurevecolsys120213091905,
author = "Donoghue, Michael J. e Edwards, Erika J.",
title = "Mudanças de Bioma e Evolução de Nicho em Plantas",
year = "2014",
journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
abstract = "Quais fatores influenciam se uma linhagem pode transitar com sucesso para um novo bioma, e por que algumas mudanças de bioma foram mais frequentes que outras? Para orientar essa linha de pesquisa, desenvolvemos um quadro conceitual no qual a probabilidade de uma mudança de bioma é uma função de (a) exposição a ambientes contrastantes ao longo do tempo, (b) a acessibilidade evolutiva de adaptações relevantes e (c) interações bióticas em mudança. Avaliamos a literatura sobre mudanças de bioma em plantas em relação a um conjunto de hipóteses sobre o tamanho, conectividade e idade absoluta dos biomas, bem como sobre a adaptabilidade de linhagens particulares e interações ecológicas ao longo do tempo. Também criticamos a inferência filogenética de biomas passados e uma abordagem baseada em modelo "global" para a evolução de biomas. Generalizações mais robustas sobre mudanças de bioma exigiriam estudos detalhados de clados bem amostrados e bem resolvidos, levando em conta as mudanças nos fatores abióticos e bióticos relevantes ao longo do tempo.",
url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
doi = "10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
openalex = "W2141294262",
references = "doi101002joc1276, doi101016jtplants201009008, doi101016jtree200409011, doi101038nature12872, doi101093oso97801951223430010001, doi101093sysbiosyt034, doi101111j14610248200801229x, doi101111j14610248201001515x, doi101146annurevecolsys36102803095431, doi1016410006356820010510933teotwa20co2, openalexw2273605253"
}
57. Pennell, Matthew W. e FitzJohn, Richard G. e Cornwell, William K. e Harmon, Luke J., 2015, Adequacy do Modelo e a Macroevolução de Traços Funcionais de Angiospermas: The American Naturalist.
Resumo
Fazer inferências significativas a partir de dados comparativos filogenéticos exige um modelo significativo da evolução de traços. Portanto, é importante determinar se o modelo é adequado para os dados e a questão em questão. Uma maneira de avaliar isso é perguntar se o modelo fornece uma boa explicação estatística para a variação nos dados. Até agora, os pesquisadores focaram principalmente no poder explicativo de um modelo em relação a modelos alternativos. Métodos foram desenvolvidos para avaliar a adequação, ou poder explicativo absoluto, de modelos de traços filogenéticos, mas estes foram restritos a modelos ou questões específicas. Aqui, apresentamos um quadro estatístico geral para avaliar a adequação de modelos de traços filogenéticos. Usamos nossa abordagem para avaliar o desempenho estatístico de modelos de traços comumente usados em 337 conjuntos de dados comparativos que cobrem três traços funcionais chave de angiospermas. Em geral, os modelos que testamos frequentemente forneceram explicações estatísticas pobres para a evolução desses traços. Isso foi verdade para muitos grupos diferentes e em muitas escalas diferentes. Se tal inadequação estatística alterará qualitativamente as inferências tiradas de conjuntos de dados comparativos dependerá do contexto. Independentemente disso, avaliar a adequação do modelo pode fornecer insights biológicos interessantes—como e por que um modelo falha em descrever a variação em um conjunto de dados nos dá pistas sobre quais processos evolutivos podem ter impulsionado a evolução de traços ao longo do tempo.
BibTeX
@article{doi101086682022,
author = "Pennell, Matthew W. e FitzJohn, Richard G. e Cornwell, William K. e Harmon, Luke J.",
title = "Adequacy do Modelo e a Macroevolução de Traços Funcionais de Angiospermas",
year = "2015",
journal = "The American Naturalist",
abstract = "Fazer inferências significativas a partir de dados comparativos filogenéticos exige um modelo significativo da evolução de traços. Portanto, é importante determinar se o modelo é adequado para os dados e a questão em questão. Uma maneira de avaliar isso é perguntar se o modelo fornece uma boa explicação estatística para a variação nos dados. Até agora, os pesquisadores focaram principalmente no poder explicativo de um modelo em relação a modelos alternativos. Métodos foram desenvolvidos para avaliar a adequação, ou poder explicativo absoluto, de modelos de traços filogenéticos, mas estes foram restritos a modelos ou questões específicas. Aqui, apresentamos um quadro estatístico geral para avaliar a adequação de modelos de traços filogenéticos. Usamos nossa abordagem para avaliar o desempenho estatístico de modelos de traços comumente usados em 337 conjuntos de dados comparativos que cobrem três traços funcionais chave de angiospermas. Em geral, os modelos que testamos frequentemente forneceram explicações estatísticas pobres para a evolução desses traços. Isso foi verdade para muitos grupos diferentes e em muitas escalas diferentes. Se tal inadequação estatística alterará qualitativamente as inferências tiradas de conjuntos de dados comparativos dependerá do contexto. Independentemente disso, avaliar a adequação do modelo pode fornecer insights biológicos interessantes—como e por que um modelo falha em descrever a variação em um conjunto de dados nos dá pistas sobre quais processos evolutivos podem ter impulsionado a evolução de traços ao longo do tempo.",
url = "https://doi.org/10.1086/682022",
doi = "10.1086/682022",
openalex = "W2952286239",
references = "doi101146annurevecolsys120213091905"
}
58. Tank, David C. e Eastman, Jonathan M. e Pennell, Matthew W. e Soltis, Pamela S. e Soltis, Pamela S. e Hinchliff, Cody E. e Brown, Joseph W. e Sessa, Emily B. e Harmon, Luke J., 2015, Radiações aninhadas e o pulso da diversificação das angiospermas: taxas de diversificação aumentadas frequentemente seguem duplicações do genoma inteiro: New Phytologist.
Resumo
Nossa compreensão crescente da árvore da vida das plantas oferece uma oportunidade nova para descobrir os principais impulsionadores da diversidade das angiospermas. Usando uma filogenia calibrada no tempo, caracterizamos pontos quentes e frios de diversificação de linhagens em toda a árvore da vida das angiospermas, modelando a diversificação evolutiva usando AIC passo a passo (MEDUSA). Também testamos o modelo de atraso de radiação de duplicação do genoma inteiro (WGD), que postula que aumentos na diversificação tendem a ficar atrás de eventos de WGD estabelecidos. As taxas de diversificação têm sido incrivelmente heterogêneas ao longo da história evolutiva das angiospermas e revelam um padrão de 'radiações aninhadas' - aumentos na diversificação líquida aninhados dentro de outras radiações. Este padrão, por sua vez, gera uma relação negativa entre a idade do clado e a diversidade em ambas as famílias e ordens. Sugerimos que taxas de diversificação que mudam estocasticamente ao longo da filogenia explicam esses padrões. Finalmente, demonstramos suporte estatístico significativo para o modelo de atraso de radiação de WGD. Em todas as angiospermas, mudanças aninhadas na diversificação levaram a uma taxa geral crescente de diversificação líquida e taxas de extinção relativa decrescentes ao longo do tempo. Essas mudanças de diversificação raramente estão perfeitamente associadas a eventos de WGD, mas comumente os seguem após um período de atraso.
BibTeX
@article{doi101111nph13491,
author = "Tank, David C. e Eastman, Jonathan M. e Pennell, Matthew W. e Soltis, Pamela S. e Soltis, Pamela S. e Hinchliff, Cody E. e Brown, Joseph W. e Sessa, Emily B. e Harmon, Luke J.",
title = "Radiações aninhadas e o pulso da diversificação das angiospermas: taxas de diversificação aumentadas frequentemente seguem duplicações do genoma inteiro",
year = "2015",
journal = "New Phytologist",
abstract = "Nossa compreensão crescente da árvore da vida das plantas oferece uma oportunidade nova para descobrir os principais impulsionadores da diversidade das angiospermas. Usando uma filogenia calibrada no tempo, caracterizamos pontos quentes e frios de diversificação de linhagens em toda a árvore da vida das angiospermas, modelando a diversificação evolutiva usando AIC passo a passo (MEDUSA). Também testamos o modelo de atraso de radiação de duplicação do genoma inteiro (WGD), que postula que aumentos na diversificação tendem a ficar atrás de eventos de WGD estabelecidos. As taxas de diversificação têm sido incrivelmente heterogêneas ao longo da história evolutiva das angiospermas e revelam um padrão de 'radiações aninhadas' - aumentos na diversificação líquida aninhados dentro de outras radiações. Este padrão, por sua vez, gera uma relação negativa entre a idade do clado e a diversidade em ambas as famílias e ordens. Sugerimos que taxas de diversificação que mudam estocasticamente ao longo da filogenia explicam esses padrões. Finalmente, demonstramos suporte estatístico significativo para o modelo de atraso de radiação de WGD. Em todas as angiospermas, mudanças aninhadas na diversificação levaram a uma taxa geral crescente de diversificação líquida e taxas de extinção relativa decrescentes ao longo do tempo. Essas mudanças de diversificação raramente estão perfeitamente associadas a eventos de WGD, mas comumente os seguem após um período de atraso.",
url = "https://doi.org/10.1111/nph.13491",
doi = "10.1111/nph.13491",
openalex = "W2159372152",
references = "doi101111j14610248200901410x, doi101111j14754983201001011x"
}
59. Harguindeguy, Natalia Pérez e Díaz, Silvia e Garnier, Éric e Lavorel, Sandra e Poorter, Hendrik e Jaureguiberry, Pedro e Bret‐Harte, M. Syndonia e Cornwell, William K. e Craine, Joseph M. e Gurvich, Diego E. e Urcelay, Carlos e Veneklaas, Erik J. e Reich, Peter B. e Poorter, Lourens e Wright, Ian J. e Ray, Prasun e Enrico, Lucas e Pausas, Juli G. e Vos, Ad e Buchmann, Nina e Funes, Guillermo e Quétier, Fabien e Hodgson, John e Thompson, Ken e Morgan, Huw D. e ter Steege, Hans e Sack, Lawren e Blonder, B. e Poschlod, Peter e Vaieretti, María V. e Conti, Georgina e Staver, A. Carla e Aquino, Sâmia e Cornelissen, J. H. C., 2016, Corrigendum a: Novo manual para medição padronizada de traços funcionais de plantas em todo o mundo: Australian Journal of Botany.
Resumo
Os traços funcionais das plantas são as características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representam estratégias ecológicas e determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam propriedades do ecossistema. A variação nos traços funcionais das plantas e nas síndromes de traços provou-se útil para abordar muitas questões ecológicas importantes em uma variedade de escalas, gerando uma demanda por métodos padronizados para medir traços de plantas ecologicamente significativos. Esta linha de pesquisa tem sido uma das vias mais férteis para compreender padrões e processos ecológicos e evolutivos. Ela também tem o potencial tanto de construir um conjunto preditivo de relações locais, regionais e globais entre plantas e ambiente quanto de quantificar uma ampla gama de processos naturais e impulsionados pelo ser humano, incluindo mudanças na biodiversidade, os impactos de invasões de espécies, alterações em processos biogeoquímicos e interações vegetação-atmosfera. A importância desses tópicos dita a necessidade urgente de mais e melhores dados e aumenta o valor de protocolos padronizados para quantificar a variação de traços de diferentes espécies, em particular para traços com poder de prever processos em nível de planta e ecossistema, e para traços que podem ser medidos relativamente facilmente. Atualizado e expandido a partir da versão anterior amplamente utilizada, este manual mantém o foco em receitas passo a passo claramente apresentadas e amplamente aplicáveis, com um mínimo de texto sobre teoria, e não apenas inclui métodos atualizados para os traços anteriormente cobertos, mas também introduz muitos novos protocolos para outros traços. Este novo manual tem um melhor equilíbrio entre traços de planta inteira, traços foliares, traços de raízes e caules e traços regenerativos, e coloca ênfase particular em traços importantes para prever os efeitos das espécies em propriedades-chave do ecossistema. Esperamos que este novo manual se torne um companheiro padrão nos esforços locais e globais para aprender sobre as respostas e impactos de diferentes espécies de plantas em relação às mudanças ambientais no presente, passado e futuro.
BibTeX
@article{doi101071bt12225co,
author = "Harguindeguy, Natalia Pérez and Díaz, Silvia and Garnier, Éric and Lavorel, Sandra and Poorter, Hendrik and Jaureguiberry, Pedro and Bret‐Harte, M. Syndonia and Cornwell, William K. and Craine, Joseph M. and Gurvich, Diego E. and Urcelay, Carlos and Veneklaas, Erik J. and Reich, Peter B. and Poorter, Lourens and Wright, Ian J. and Ray, Prasun and Enrico, Lucas and Pausas, Juli G. and Vos, Ad and Buchmann, Nina and Funes, Guillermo and Quétier, Fabien and Hodgson, John and Thompson, Ken and Morgan, Huw D. and ter Steege, Hans and Sack, Lawren and Blonder, B. and Poschlod, Peter and Vaieretti, María V. and Conti, Georgina and Staver, A. Carla and Aquino, Sâmia and Cornelissen, J. H. C.",
title = "Corrigendum to: New handbook for standardised measurement of plant functional traits worldwide",
year = "2016",
journal = "Australian Journal of Botany",
abstract = "Os traços funcionais das plantas são as características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representam estratégias ecológicas e determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam propriedades do ecossistema. A variação nos traços funcionais das plantas e nas síndromes de traços provou-se útil para abordar muitas questões ecológicas importantes em uma variedade de escalas, gerando uma demanda por métodos padronizados para medir traços de plantas ecologicamente significativos. Esta linha de pesquisa tem sido uma das vias mais férteis para compreender padrões e processos ecológicos e evolutivos. Ela também tem o potencial tanto de construir um conjunto preditivo de relações locais, regionais e globais entre plantas e ambiente quanto de quantificar uma ampla gama de processos naturais e impulsionados pelo ser humano, incluindo mudanças na biodiversidade, os impactos de invasões de espécies, alterações em processos biogeoquímicos e interações vegetação-atmosfera. A importância desses tópicos dita a necessidade urgente de mais e melhores dados e aumenta o valor de protocolos padronizados para quantificar a variação de traços de diferentes espécies, em particular para traços com poder de prever processos em nível de planta e ecossistema, e para traços que podem ser medidos relativamente facilmente. Atualizado e expandido a partir da versão anterior amplamente utilizada, este manual mantém o foco em receitas passo a passo claramente apresentadas e amplamente aplicáveis, com um mínimo de texto sobre teoria, e não apenas inclui métodos atualizados para os traços anteriormente cobertos, mas também introduz muitos novos protocolos para outros traços. Este novo manual tem um melhor equilíbrio entre traços de planta inteira, traços foliares, traços de raízes e caules e traços regenerativos, e coloca ênfase particular em traços importantes para prever os efeitos das espécies em propriedades-chave do ecossistema. Esperamos que este novo manual se torne um companheiro padrão nos esforços locais e globais para aprender sobre as respostas e impactos de diferentes espécies de plantas em relação às mudanças ambientais no presente, passado e futuro.",
url = "https://doi.org/10.1071/bt12225\_co",
doi = "10.1071/bt12225\_co",
openalex = "W2561479186",
references = "doi101006anbo20001261, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}
60. Group, A Filogenia das Angiospermas, 2016, Uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas para as ordens e famílias de plantas com flores: APG IV: Botanical Journal of the Linnean Society.
Resumo
© 2016 The Linnean Society of London. Apresenta-se uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas (APG) dos ordens e famílias das angiospermas. São reconhecidos vários novos ordens: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales e Vahliales. Isso eleva o número total de ordens e famílias reconhecidas no sistema APG para 64 e 416, respectivamente. Propomos dois clados informais adicionais, superrosids e superasterids, que cada um compreende os ordens adicionais incluídos nos clados maiores dominados pelos rosids e asterids. As famílias que compunham potencialmente ordens monofamiliais, Dasypogonaceae e Sabiaceae, são agora referidas a Arecales e Proteales, respectivamente. Duas famílias parasitas anteriormente de posições incertas agora são colocadas: Cynomoriaceae em Saxifragales e Apodanthaceae em Cucurbitales. Embora haja evidências de que algumas famílias reconhecidas em APG III não são monofiléticas, não fazemos alterações em Dioscoreales e Santalales em relação a APG III e deixamos alguns gêneros em Lamiales sem classificação (por exemplo, Peltanthera). Essas alterações na circunscrição e reconhecimento de famílias resultaram todas de novos resultados publicados desde APG III, exceto por algumas alterações simplesmente devido a questões nomenclaturais, que incluem substituir Asphodelaceae por Xanthorrhoeaceae (Asparagales) e Francoaceae por Melianthaceae (Geraniales); no entanto, em Francoaceae também incluímos Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae e Vivianiaceae. Outras alterações aos limites das famílias não são drásticas ou numerosas e estão majoritariamente focadas em alguns membros dos lamiids, especialmente a antiga Icacinaceae que tem sido problemática há muito tempo, com vários gêneros transferidos para a anteriormente monogênérica Metteniusaceae, mas alterações menores na circunscrição incluem Aristolochiaceae (agora incluindo Lactoridaceae e Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (removida de Juncaginaceae; Alismatales), Restionaceae (agora re-incluindo Anarthriaceae e Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (agora incluindo Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (dividida de Euphorbiaceae; Malpighiales), reconhecimento de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae e Microteaceae (todas Caryophyllales), Petiveriaceae dividida de Phytolaccaceae (Caryophyllales), alterações na composição genérica de Ixonanthaceae e Irvingiaceae (com transferência de Allantospermum do primeiro para o segundo; Malpighiales), transferência de Pakaraimaea (anteriormente Dipterocarpaceae) para Cistaceae (Malvales), transferência de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis e Tirania (anteriormente todas Capparaceae) para Resedaceae (Brassicales), Nyssaceae dividida de Cornaceae (Cornales), Pteleocarpa transferida para Gelsemiaceae (Gentianales), alterações na composição genérica de Gesneriaceae (Sanango transferido de Loganiaceae) e Orobanchaceae (agora incluindo Lindenbergiaceae e Rehmanniaceae) e reconhecimento de Mazaceae distinta de Phrymaceae (todas Lamiales).
BibTeX
@article{doi101111boj12385,
author = "Group, The Angiosperm Phylogeny",
title = "Uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas para as ordens e famílias de plantas com flores: APG IV",
year = "2016",
journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
abstract = "© 2016 The Linnean Society of London. Apresenta-se uma atualização da classificação do Grupo de Filogenia das Angiospermas (APG) das ordens e famílias de angiospermas. São reconhecidas várias novas ordens: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales e Vahliales. Isso eleva o número total de ordens e famílias reconhecidas no sistema APG para 64 e 416, respectivamente. Propomos dois clados informais adicionais, superrosids e superasterids, que cada um compreende as ordens adicionais incluídas nos clados maiores dominados pelos rosids e asterids. Famílias que compunham ordens potencialmente monofiléticas, Dasypogonaceae e Sabiaceae, são agora referidas a Arecales e Proteales, respectivamente. Duas famílias parasitas anteriormente de posições incertas são agora colocadas: Cynomoriaceae em Saxifragales e Apodanthaceae em Cucurbitales. Embora haja evidências de que algumas famílias reconhecidas na APG III não são monofiléticas, não fazemos alterações em Dioscoreales e Santalales em relação à APG III e deixamos alguns gêneros em Lamiales sem classificação (por exemplo, Peltanthera). Essas alterações na circunscrição e reconhecimento de famílias resultaram todas de novos resultados publicados desde a APG III, exceto por algumas alterações simplesmente devido a questões nomenclaturais, que incluem substituir Asphodelaceae por Xanthorrhoeaceae (Asparagales) e Francoaceae por Melianthaceae (Geraniales); no entanto, na Francoaceae também incluímos Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae e Vivianiaceae. Outras alterações aos limites das famílias não são drásticas ou numerosas e estão majoritariamente focadas em alguns membros dos lamiids, especialmente a antiga Icacinaceae, que tem sido problemática há muito tempo, com vários gêneros transferidos para a antiga monogênérica Metteniusaceae, mas alterações menores na circunscrição incluem Aristolochiaceae (agora incluindo Lactoridaceae e Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (removida de Juncaginaceae; Alismatales), Restionaceae (agora re-incluindo Anarthriaceae e Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (agora incluindo Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (dividida de Euphorbiaceae; Malpighiales), reconhecimento de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae e Microteaceae (todas Caryophyllales), Petiveriaceae dividida de Phytolaccaceae (Caryophyllales), alterações na composição genérica de Ixonanthaceae e Irvingiaceae (com transferência de Allantospermum da primeira para a segunda; Malpighiales), transferência de Pakaraimaea (antiga Dipterocarpaceae) para Cistaceae (Malvales), transferência de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis e Tirania (todas antigamente Capparaceae) para Resedaceae (Brassicales), Nyssaceae dividida de Cornaceae (Cornales), Pteleocarpa transferida para Gelsemiaceae (Gentianales), alterações na composição genérica de Gesneriaceae (Sanango movido de Loganiaceae) e Orobanchaceae (agora incluindo Lindenbergiaceae e Rehmanniaceae) e reconhecimento de Mazaceae distinta de Phrymaceae (todas Lamiales).",
url = "https://doi.org/10.1111/boj.12385",
doi = "10.1111/boj.12385",
openalex = "W2166152751",
references = "doi1010079783642143977, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas1323926111, doi101111j10958339200900996x, doi101111j109600311996tb00196x, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023071222465, doi1023072399846, doi10230725065646, doi103732ajb0800047, openalexw3148514506, openalexw70084438"
}
61. Sauquet, Hervé e von Balthazar, Maria e Magallón, Susana e Doyle, James A. e Endress, Peter K. e Bailes, Emily J. e de Morais, Érica Barroso e Bull–Hereñu, Kester e Carrive, Laetitia e Chartier, Marion e Chomicki, Guillaume e Coiro, Mario e Cornette, Raphaël e Ottra, Juliana Hanna Leite El e Epicoco, Cyril e Foster, Charles S. P. e Jabbour, Florian e Haevermans, Agathe e Haevermans, Thomas e Hernández, Rebeca e Little, Stefan A. e Löfstrand, Stefan e Luna, Javier A. e Massoni, Julien e Nadot, Sophie e Pamperl, Susanne e Prieu, Charlotte e Reyes, Elisabeth e dos Santos, Patrícia e Schoonderwoerd, Kristel M. e Sontag, Susanne e Soulebeau, Anaëlle e Staedler, Yannick M. e Tschan, Georg F. e Leung, Amy Wing-Sze e Schönenberger, Jürg, 2017, A flor ancestral das angiospermas e sua diversificação inicial: Nature Communications.
Resumo
Avanços recentes na filogenética molecular e uma série de importantes descobertas paleobotânicas revolucionaram nossa compreensão da diversificação das angiospermas. No entanto, a origem e a evolução inicial de sua característica mais característica, a flor, permanecem mal compreendidas. Em particular, a estrutura da flor ancestral de todas as angiospermas vivas ainda é incerta. Aqui, relatamos reconstruções baseadas em modelos para flores ancestrais nos nós mais profundos da filogenia das angiospermas, utilizando o maior conjunto de dados de características florais já montado. Reconstruímos a flor ancestral das angiospermas como hermafrodita e radialmente simétrica, com mais de dois verticilos de três órgãos periantos separados cada um (tépalas indiferenciadas), mais de dois verticilos de três estames separados cada um, e mais de cinco carpelos separados dispostos em espiral. Embora a incerteza permaneça para alguns dos caracteres, nossa reconstrução nos permite propor um novo cenário plausível para a diversificação inicial das flores, levando a novas hipóteses testáveis para futuras pesquisas sobre angiospermas.
BibTeX
@article{doi101038ncomms16047,
author = "Sauquet, Hervé e von Balthazar, Maria e Magallón, Susana e Doyle, James A. e Endress, Peter K. e Bailes, Emily J. e de Morais, Érica Barroso e Bull–Hereñu, Kester e Carrive, Laetitia e Chartier, Marion e Chomicki, Guillaume e Coiro, Mario e Cornette, Raphaël e Ottra, Juliana Hanna Leite El e Epicoco, Cyril e Foster, Charles S. P. e Jabbour, Florian e Haevermans, Agathe e Haevermans, Thomas e Hernández, Rebeca e Little, Stefan A. e Löfstrand, Stefan e Luna, Javier A. e Massoni, Julien e Nadot, Sophie e Pamperl, Susanne e Prieu, Charlotte e Reyes, Elisabeth e dos Santos, Patrícia e Schoonderwoerd, Kristel M. e Sontag, Susanne e Soulebeau, Anaëlle e Staedler, Yannick M. e Tschan, Georg F. e Leung, Amy Wing-Sze e Schönenberger, Jürg",
title = "A flor ancestral das angiospermas e sua diversificação inicial",
year = "2017",
journal = "Nature Communications",
abstract = "Avanços recentes na filogenética molecular e uma série de importantes descobertas paleobotânicas revolucionaram nossa compreensão da diversificação das angiospermas. No entanto, a origem e a evolução inicial de sua característica mais característica, a flor, permanecem mal compreendidas. Em particular, a estrutura da flor ancestral de todas as angiospermas vivas ainda é incerta. Aqui, relatamos reconstruções baseadas em modelos para flores ancestrais nos nós mais profundos da filogenia das angiospermas, utilizando o maior conjunto de dados de características florais já montado. Reconstruímos a flor ancestral das angiospermas como hermafrodita e radialmente simétrica, com mais de dois verticilos de três órgãos periantos separados cada um (tépalas indiferenciadas), mais de dois verticilos de três estames separados cada um, e mais de cinco carpelos separados dispostos em espiral. Embora a incerteza permaneça para alguns dos caracteres, nossa reconstrução nos permite propor um novo cenário plausível para a diversificação inicial das flores, levando a novas hipóteses testáveis para futuras pesquisas sobre angiospermas.",
url = "https://doi.org/10.1038/ncomms16047",
doi = "10.1038/ncomms16047",
openalex = "W2741748285",
references = "doi101073pnas0709121104, doi101073pnas1323926111, doi101080106351501753462876, doi10108010635150490522232, doi10108010635150490522304, doi10108010635150701607033, doi101086675935, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093molbevmss075, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi1011112041210x12420, doi101111boj12385, doi101146annurevearth042711105313, doi103732ajb0800047"
}
62. Alix, Karine e Gérard, P. e Schwarzacher, Trude e Heslop‐Harrison, J. S., 2017, Poliploidia e hibridização interespecífica: parceiros para adaptação, especiação e evolução em plantas: Annals of Botany.
Resumo
O sucesso da poliploidia, substituindo os ancestrais diploides de quase todas as plantas, é bem ilustrado pela enorme diversidade de angiospermas que se assume originar de eventos recorrentes de poliploidização. Notavelmente, a poliploidização frequentemente ocorreu antes ou simultaneamente com transições evolutivas principais e radiação adaptativa de espécies, apoiando o conceito de que a poliploidia desempenha um papel predominante em surtos de especiação adaptativa. A poliploidia resulta em redundância genética imediata e representa, com o surgimento de novas funções gênicas, uma importante fonte de novidade. Juntamente com a recombinação, mutação gênica, atividade de transposons e rearranjo cromossômico, a poliploidia e a duplicação do genoma inteiro atuam como impulsionadores da evolução e divergência no comportamento das plantas e na função gênica, permitindo diversificação, especiação e, portanto, evolução das plantas.
BibTeX
@article{doi101093aobmcx079,
author = "Alix, Karine e Gérard, P. e Schwarzacher, Trude e Heslop‐Harrison, J. S.",
title = "Poliploidia e hibridização interespecífica: parceiros para adaptação, especiação e evolução em plantas",
year = "2017",
journal = "Annals of Botany",
abstract = "O sucesso da poliploidia, substituindo os ancestrais diploides de quase todas as plantas, é bem ilustrado pela enorme diversidade de angiospermas que se assume originar de eventos recorrentes de poliploidização. Notavelmente, a poliploidização frequentemente ocorreu antes ou simultaneamente com transições evolutivas principais e radiação adaptativa de espécies, apoiando o conceito de que a poliploidia desempenha um papel predominante em surtos de especiação adaptativa. A poliploidia resulta em redundância genética imediata e representa, com o surgimento de novas funções gênicas, uma importante fonte de novidade. Juntamente com a recombinação, mutação gênica, atividade de transposons e rearranjo cromossômico, a poliploidia e a duplicação do genoma inteiro atuam como impulsionadores da evolução e divergência no comportamento das plantas e na função gênica, permitindo diversificação, especiação e, portanto, evolução das plantas.",
url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcx079",
doi = "10.1093/aob/mcx079",
openalex = "W2734942911",
references = "doi101002bies201100035, doi101016jpalaeo200507006, doi101111j14697998201100829x"
}
63. Martin, Francis e Uroz, Stéphane e Barker, David G., 2017, Alianças ancestrais: simbioses mutualísticas de plantas com fungos e bactérias: Science.
Resumo
Dentro da microbiota vegetal, os simbiontes fúngicos e bacterianos mutualísticos são exemplos marcantes de microrganismos que desempenham papéis cruciais na aquisição de nutrientes. Eles coevoluíram com seus hospedeiros desde a adaptação inicial das plantas ao solo. Apesar das distâncias evolutivas que separam as simbioses micorrízicas e fixadoras de nitrogênio, essas associações compartilham uma série de características altamente conservadas, incluindo vias de sinalização simbiótica específicas das plantas, estratégias de colonização radicular que contornam as respostas imunes das plantas, formação funcional da interface hospedeiro-microbio e o papel central dos fitormônios nas vias de desenvolvimento radicular associadas à simbiose. Destacamos áreas de investigação recentes e emergentes relacionadas a esses mecanismos evolutivamente conservados, com ênfase nas associações micorrízicas mais ancestrais, e consideramos em que medida esse conhecimento pode contribuir para a compreensão das associações planta-microbiota como um todo.
BibTeX
@article{doi101126scienceaad4501,
author = "Martin, Francis e Uroz, Stéphane e Barker, David G.",
title = "Alianças ancestrais: simbioses mutualísticas de plantas com fungos e bactérias",
year = "2017",
journal = "Science",
abstract = "Dentro da microbiota vegetal, os simbiontes fúngicos e bacterianos mutualísticos são exemplos marcantes de microrganismos que desempenham papéis cruciais na aquisição de nutrientes. Eles coevoluíram com seus hospedeiros desde a adaptação inicial das plantas ao solo. Apesar das distâncias evolutivas que separam as simbioses micorrízicas e fixadoras de nitrogênio, essas associações compartilham uma série de características altamente conservadas, incluindo vias de sinalização simbiótica específicas das plantas, estratégias de colonização radicular que contornam as respostas imunes das plantas, formação funcional da interface hospedeiro-microbio e o papel central dos fitormônios nas vias de desenvolvimento radicular associadas à simbiose. Destacamos áreas de investigação recentes e emergentes relacionadas a esses mecanismos evolutivamente conservados, com ênfase nas associações micorrízicas mais ancestrais, e consideramos em que medida esse conhecimento pode contribuir para a compreensão das associações planta-microbiota como um todo.",
url = "https://doi.org/10.1126/science.aad4501",
doi = "10.1126/science.aad4501",
openalex = "W2618012128",
references = "doi101038ncomms5087, doi101098rstb20110271"
}
64. Boyce, C. Kevin e Lee, Jung‐Eun, 2017, Plant Evolution and Climate Over Geological Timescales: Annual Review of Earth and Planetary Sciences.
DOI: 10.1146/annurev-earth-063016-015629
Resumo
A vegetação terrestre é inegavelmente um fator importante no sistema climático, modulando a troca de energia, momento, vapor de água e outros gases traço entre a terra e a atmosfera. Aqui, revisamos a evolução da flora terrestre desde o Proterozoico até o Neogeno em três escalas distintas — a evolução geral da composição floral, a evolução da fisiologia vegetal e a evolução da ocupação da paisagem tanto espacial quanto sazonalmente — tudo no contexto de como a vegetação pode ter influenciado o clima ao longo do tempo e quais transições evolutivas de longo prazo podem ter tido o maior efeito. Nosso foco está nos impactos diretos da vegetação sobre a temperatura e as precipitações, mas também consideramos os impactos indiretos das plantas no clima via composição atmosférica. Argumentamos que os períodos de maior mudança nos feedbacks climáticos das plantas provavelmente foram o Carbonífero e o Paleogeno inicial.
BibTeX
@article{doi101146annurevearth063016015629,
author = "Boyce, C. Kevin e Lee, Jung‐Eun",
title = "Plant Evolution and Climate Over Geological Timescales",
year = "2017",
journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
abstract = "A vegetação terrestre é inegavelmente um fator importante no sistema climático, modulando a troca de energia, momento, vapor de água e outros gases traço entre a terra e a atmosfera. Aqui, revisamos a evolução da flora terrestre desde o Proterozoico até o Neogeno em três escalas distintas — a evolução geral da composição floral, a evolução da fisiologia vegetal e a evolução da ocupação da paisagem tanto espacial quanto sazonalmente — tudo no contexto de como a vegetação pode ter influenciado o clima ao longo do tempo e quais transições evolutivas de longo prazo podem ter tido o maior efeito. Nosso foco está nos impactos diretos da vegetação sobre a temperatura e as precipitações, mas também consideramos os impactos indiretos das plantas no clima via composição atmosférica. Argumentamos que os períodos de maior mudança nos feedbacks climáticos das plantas provavelmente foram o Carbonífero e o Paleogeno inicial.",
url = "https://doi.org/10.1146/annurev-earth-063016-015629",
doi = "10.1146/annurev-earth-063016-015629",
openalex = "W2523635891",
references = "doi101098rspb20132829, doi101126science1260947"
}
65. Smith, Stephen A. e Brown, Joseph W., 2018, Construindo uma filogenia de plantas com sementes amplamente inclusiva: American Journal of Botany.
Resumo
Este estudo demonstra um meio de combinar recursos disponíveis para construir uma filogenia datada para plantas. No entanto, essa abordagem é um passo inicial e são necessárias mais desenvolvimentos para adicionar dados, incorporando melhor a incerteza subjacente e melhorar a resolução. Os métodos discutidos aqui também podem ser aplicados a outros grandes clados na árvore da vida.
BibTeX
@article{doi101002ajb21019,
author = "Smith, Stephen A. e Brown, Joseph W.",
title = "Construindo uma filogenia de plantas com sementes amplamente inclusiva",
year = "2018",
journal = "American Journal of Botany",
abstract = "Este estudo demonstra um meio de combinar recursos disponíveis para construir uma filogenia datada para plantas. No entanto, essa abordagem é um passo inicial e são necessárias mais desenvolvimentos para adicionar dados, incorporando melhor a incerteza subjacente e melhorar a resolução. Os métodos discutidos aqui também podem ser aplicados a outros grandes clados na árvore da vida.",
url = "https://doi.org/10.1002/ajb2.1019",
doi = "10.1002/ajb2.1019",
openalex = "W2792688220",
references = "doi101038nature11631, doi101038nature12872, doi101038ncomms16047, doi101038ncomms2958, doi101073pnas1323926111, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101111nph13264, doi101111syen12037"
}
66. Ran, Jin‐Hua e Shen, Tingting e Wang, Mingming e Wang, Xiaoquan, 2018, Filogenômica resolve a filogenia profunda de plantas com sementes e indica evolução convergente parcial ou homoplástica entre Gnetales e angiospermas: Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences.
Resumo
Após décadas de estudos filogenéticos moleculares, a filogenia profunda de gimnospermas não foi resolvida, e a colocação filogenética de Gnetales permanece uma das questões mais controversas na evolução de plantas com sementes. Para resolver a filogenia profunda de plantas com sementes e abordar as fontes de conflito filogenético, conduzimos um estudo filotranscriptômico com amostragem de todas as 13 famílias de gimnospermas e linhagens principais de angiospermas. Conjuntos de dados múltiplos contendo até 1 296 042 sítios em 1308 loci foram analisados, usando abordagens de concatenação e coalescência. Nosso estudo gerou uma filogenia consistente e bem resolvida de plantas com sementes, que coloca Gnetales como irmã de Pinaceae e, portanto, apoia a hipótese Gnepine. Cicadáceas mais Ginkgo são irmãs das gimnospermas restantes. Também descobrimos que Gnetales e angiospermas têm taxas de evolução molecular semelhantes, que são muito maiores do que as de outras gimnospermas. Isso implica que Gnetales e angiospermas podem ter experimentado pressões seletivas semelhantes em suas histórias evolutivas. A evolução molecular convergente ou homoplasia é parcialmente responsável pelos conflitos filogenéticos em plantas com sementes. Nosso estudo fornece uma filogenia espinhal robustamente reconstruída que é importante para futuros estudos moleculares e morfológicos de plantas com sementes, particularmente gimnospermas, à luz da evolução.
BibTeX
@article{doi101098rspb20181012,
author = "Ran, Jin‐Hua e Shen, Tingting e Wang, Mingming e Wang, Xiaoquan",
title = "Filogenômica resolve a filogenia profunda de plantas com sementes e indica evolução convergente parcial ou homoplástica entre Gnetales e angiospermas",
year = "2018",
journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
abstract = "Após décadas de estudos filogenéticos moleculares, a filogenia profunda de gimnospermas não foi resolvida, e a colocação filogenética de Gnetales permanece uma das questões mais controversas na evolução de plantas com sementes. Para resolver a filogenia profunda de plantas com sementes e abordar as fontes de conflito filogenético, conduzimos um estudo filotranscriptômico com amostragem de todas as 13 famílias de gimnospermas e linhagens principais de angiospermas. Conjuntos de dados múltiplos contendo até 1 296 042 sítios em 1308 loci foram analisados, usando abordagens de concatenação e coalescência. Nosso estudo gerou uma filogenia consistente e bem resolvida de plantas com sementes, que coloca Gnetales como irmã de Pinaceae e, portanto, apoia a hipótese Gnepine. Cicadáceas mais Ginkgo são irmãs das gimnospermas restantes. Também descobrimos que Gnetales e angiospermas têm taxas de evolução molecular semelhantes, que são muito maiores do que as de outras gimnospermas. Isso implica que Gnetales e angiospermas podem ter experimentado pressões seletivas semelhantes em suas histórias evolutivas. A evolução molecular convergente ou homoplasia é parcialmente responsável pelos conflitos filogenéticos em plantas com sementes. Nosso estudo fornece uma filogenia espinhal robustamente reconstruída que é importante para futuros estudos moleculares e morfológicos de plantas com sementes, particularmente gimnospermas, à luz da evolução.",
url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2018.1012",
doi = "10.1098/rspb.2018.1012",
openalex = "W2808886394",
references = "doi101038nbt1883, doi101038nprot2013084, doi101093bioinformaticsbtl158, doi101093bioinformaticsbtu033, doi101093bioinformaticsbtu170, doi101093molbevmsm088, doi101093molbevmst010, doi101093molbevmsw260, doi101093sysbiosys029, doi101186s1305901507212"
}
67. Brundrett, Mark e Tedersoo, Leho, 2018, História evolutiva das simbioses micorrízicas e diversidade global de plantas hospedeiras: New Phytologist.
Resumo
Resumo do Conteúdo 1108 I. Introdução 1108 II. Diversidade de plantas micorrízicas em escalas global e local 1108 III. Evolução micorrízica em plantas: uma breve atualização 1111 IV. Conclusões e perspectivas 1114 Referências 1114 RESUMO: A maioria das plantas vasculares é micorrízica: 72% são micorrizas arbusculares (AM), 2,0% são micorrizas ectomicorrízicas (EcM), 1,5% são micorrizas ericóides e 10% são micorrizas de orquídeas. Apenas 8% são completamente não micorrízicas (NM), enquanto 7% têm associações NM-AM inconsistentes. A maioria das plantas NM e NM-AM são especialistas nutricionais (por exemplo, carnívoros e parasitas) ou especialistas de habitat (por exemplo, hidrófitas e epífitas). As associações micorrízicas são consistentes na maioria das famílias, mas há exceções com raízes complexas (por exemplo, tanto EcM quanto AM). Reconhecemos três ondas de evolução micorrízica, começando com AM em plantas terrestres primitivas, continuando no Cretáceo com múltiplas novas linhagens NM ou EcM, micorrizas ericóides e de orquídeas. A terceira onda, que é recente e em andamento, resultou em complexidade radicular ligada à rápida diversificação vegetal em hotspots de biodiversidade.
BibTeX
@article{doi101111nph14976,
author = "Brundrett, Mark e Tedersoo, Leho",
title = "História evolutiva das simbioses micorrízicas e diversidade global de plantas hospedeiras",
year = "2018",
journal = "New Phytologist",
abstract = "Resumo do Conteúdo 1108 I. Introdução 1108 II. Diversidade de plantas micorrízicas em escalas global e local 1108 III. Evolução micorrízica em plantas: uma breve atualização 1111 IV. Conclusões e perspectivas 1114 Referências 1114 RESUMO: A maioria das plantas vasculares é micorrízica: 72% são micorrizas arbusculares (AM), 2,0% são micorrizas ectomicorrízicas (EcM), 1,5% são micorrizas ericóides e 10% são micorrizas de orquídeas. Apenas 8% são completamente não micorrízicas (NM), enquanto 7% têm associações NM-AM inconsistentes. A maioria das plantas NM e NM-AM são especialistas nutricionais (por exemplo, carnívoros e parasitas) ou especialistas de habitat (por exemplo, hidrófitas e epífitas). As associações micorrízicas são consistentes na maioria das famílias, mas há exceções com raízes complexas (por exemplo, tanto EcM quanto AM). Reconhecemos três ondas de evolução micorrízica, começando com AM em plantas terrestres primitivas, continuando no Cretáceo com múltiplas novas linhagens NM ou EcM, micorrizas ericóides e de orquídeas. A terceira onda, que é recente e em andamento, resultou em complexidade radicular ligada à rápida diversificação vegetal em hotspots de biodiversidade.",
url = "https://doi.org/10.1111/nph.14976",
doi = "10.1111/nph.14976",
openalex = "W2792482912",
references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038nrg201726, doi101146annurevearth261379"
}
68. Deans, Ross M. e Brodribb, Timothy J. e Busch, Florian A. e Farquhar, Graham D., 2018, Plant water‐use strategy mediates stomatal effects on the light induction of photosynthesis: New Phytologist.
Resumo
Estratégias mais eficientes de troca gasosa em ambientes de luz dinâmica foram hipotetizadas como contribuintes para a dominância das angiospermas na flora de plantas vasculares. No entanto, ainda não temos uma compreensão clara de como a dinâmica estomática afeta a dinâmica fotossintética e se existem diferenças entre linhagens. A dinâmica estomática e fotossintética após mudanças na irradiação foi estudada em 15 espécies, abrangendo samambaias, gimnospermas e angiospermas. Determinamos o efeito da velocidade estomática na fotossíntese dinâmica e na perda de água. Além disso, avaliamos se o comportamento dinâmico seguia divisões de linhagem evolutiva ou se a adaptação ecológica para maximizar o uso de manchas de luz poderia descrever o comportamento dinâmico. Encontramos que espécies com abertura estomática rápida, como samambaias, perdem menos fotossíntese durante a indução fotossintética. Por contraste, não houve relação entre a velocidade de fechamento estomático e a água desperdiçada por estômatos temporariamente mais abertos, porque espécies com taxas mais altas de troca gasosa também mostraram fechamento estomático mais rápido. Espécies adaptadas à sombra possuíam estômatos de abertura rápida, mas de fechamento lento, consistente com a adaptação ecológica para maximizar o uso de manchas de luz. Nossos resultados sugerem que o comportamento dinâmico segue tendências ecológicas adaptativas mais fortemente do que as evolutivas, mas as angiospermas podem se beneficiar de uma indução fotossintética relativamente mais rápida ao adotar uma estratégia de uso de água menos conservadora.
BibTeX
@article{doi101111nph15572,
author = "Deans, Ross M. and Brodribb, Timothy J. and Busch, Florian A. and Farquhar, Graham D.",
title = "Plant water‐use strategy mediates stomatal effects on the light induction of photosynthesis",
year = "2018",
journal = "New Phytologist",
abstract = "Estratégias mais eficientes de troca gasosa em ambientes de luz dinâmica foram hipotetizadas como contribuintes para a dominância das angiospermas na flora de plantas vasculares. No entanto, ainda não temos uma compreensão clara de como a dinâmica estomática afeta a dinâmica fotossintética e se existem diferenças entre linhagens. A dinâmica estomática e fotossintética após mudanças na irradiação foi estudada em 15 espécies, abrangendo samambaias, gimnospermas e angiospermas. Determinamos o efeito da velocidade estomática na fotossíntese dinâmica e na perda de água. Além disso, avaliamos se o comportamento dinâmico seguia divisões de linhagem evolutiva ou se a adaptação ecológica para maximizar o uso de manchas de luz poderia descrever o comportamento dinâmico. Encontramos que espécies com abertura estomática rápida, como samambaias, perdem menos fotossíntese durante a indução fotossintética. Por contraste, não houve relação entre a velocidade de fechamento estomático e a água desperdiçada por estômatos temporariamente mais abertos, porque espécies com taxas mais altas de troca gasosa também mostraram fechamento estomático mais rápido. Espécies adaptadas à sombra possuíam estômatos de abertura rápida, mas de fechamento lento, consistente com a adaptação ecológica para maximizar o uso de manchas de luz. Nossos resultados sugerem que o comportamento dinâmico segue tendências ecológicas adaptativas mais fortemente do que as evolutivas, mas as angiospermas podem se beneficiar de uma indução fotossintética relativamente mais rápida ao adotar uma estratégia de uso de água menos conservadora.",
url = "https://doi.org/10.1111/nph.15572",
doi = "10.1111/nph.15572",
openalex = "W2899292980",
references = "doi101098rspb20132829"
}
69. 2019, Angiospermas: Introdução a Fósseis de Plantas: p. 188-212.
DOI: 10.1017/9781108650021.010
BibTeX
@incollection{crossref2019angiosperms,
title = "Angiospermas",
year = "2019",
booktitle = "Introdução a Fósseis de Plantas",
url = "https://doi.org/10.1017/9781108650021.010",
doi = "10.1017/9781108650021.010",
pages = "188-212"
}
70. Zhang, Liangsheng e Chen, Fei e Zhang, Xingtan e Li, Zhen e Zhao, Yiyong e Lohaus, Rolf e Chang, Xiaojun e Dong, Wei e Ho, Simon Y. W. e Liu, Xing e Song, Aixia e Chen, Junhao e Guo, Wenlei e Wang, Zhengjia e Zhuang, Yingyu e Wang, Haifeng e Chen, Xuequn e Hu, Juan e Liu, Yanhui e Qin, Yuan e Wang, Kai e Dong, Shanshan e Liu, Yang e Zhang, Shouzhou e Yu, Xianxian e Wu, Qian e Wang, Liangsheng e Yan, Xueqing e Jiao, Yuannian e Kong, Hongzhi e Zhou, Xiaofan e Yu, Cuiwei e Chen, Yuchu e Li, Fan e Wang, Jihua e Chen, Wei e Chen, Xinlu e Jia, Qidong e Zhang, Chi e Jiang, Yifan e Zhang, Wanbo e Liu, Guanhua e Fu, Jianyu e Chen, Feng e Mā, Hong e de Peer, Yves Van e Tang, Haibao, 2019, O genoma da líria-d'água e a evolução inicial das plantas com flores: Nature.
DOI: 10.1038/s41586-019-1852-5
Resumo
As lírias-d'água pertencem à ordem de angiospermas Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales e Austrobaileyales formam juntos o chamado grupo ANA de angiospermas, que são representantes existentes de linhagens que divergiram mais cedo da linhagem que leva às angiospermas mesangiospermas atuais 1-3. Aqui relatamos a sequência do genoma de 409 megabases da líria-d'água de pétalas azuis (Nymphaea colorata). Nossas análises filogenômicas apoiam Amborellales e Nymphaeales como linhagens irmãs sucessivas de todas as outras angiospermas existentes. O genoma de N. colorata e 19 outros transcriptomas de líria-d'água revelam um evento de duplicação do genoma inteiro nymphaealiano, que é compartilhado por Nymphaeaceae e possivelmente Cabombaceae. Entre os genes retidos dessa duplicação do genoma inteiro estão homólogos de genes que regulam a transição para a floração e o desenvolvimento floral. A expressão ampla de homólogos de genes florais ABCE em N. colorata pode apoiar um modelo ancestral amplamente ativo de determinação de órgãos florais em angiospermas iniciais. As lírias-d'água evoluíram aromas florais atraentes e cores, que são características compartilhadas com mesangiospermas, e identificamos seus genes biossintéticos putativos em N. colorata. Os compostos químicos e genes biossintéticos por trás dos aromas florais sugerem que evoluíram em paralelo aos das mesangiospermas. Devido à sua posição filogenética única, o genoma de N. colorata lança luz sobre a evolução inicial das angiospermas.
BibTeX
@article{doi101038s4158601918525,
author = "Zhang, Liangsheng and Chen, Fei and Zhang, Xingtan and Li, Zhen and Zhao, Yiyong and Lohaus, Rolf and Chang, Xiaojun and Dong, Wei and Ho, Simon Y. W. and Liu, Xing and Song, Aixia and Chen, Junhao and Guo, Wenlei and Wang, Zhengjia and Zhuang, Yingyu and Wang, Haifeng and Chen, Xuequn and Hu, Juan and Liu, Yanhui and Qin, Yuan and Wang, Kai and Dong, Shanshan and Liu, Yang and Zhang, Shouzhou and Yu, Xianxian and Wu, Qian and Wang, Liangsheng and Yan, Xueqing and Jiao, Yuannian and Kong, Hongzhi and Zhou, Xiaofan and Yu, Cuiwei and Chen, Yuchu and Li, Fan and Wang, Jihua and Chen, Wei and Chen, Xinlu and Jia, Qidong and Zhang, Chi and Jiang, Yifan and Zhang, Wanbo and Liu, Guanhua and Fu, Jianyu and Chen, Feng and Mā, Hong and de Peer, Yves Van and Tang, Haibao",
title = "The water lily genome and the early evolution of flowering plants",
year = "2019",
journal = "Nature",
abstract = "Water lilies belong to the angiosperm order Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales and Austrobaileyales together form the so-called ANA-grade of angiosperms, which are extant representatives of lineages that diverged the earliest from the lineage leading to the extant mesangiosperms 1-3. Here we report the 409-megabase genome sequence of the blue-petal water lily (Nymphaea colorata). Our phylogenomic analyses support Amborellales and Nymphaeales as successive sister lineages to all other extant angiosperms. The N. colorata genome and 19 other water lily transcriptomes reveal a Nymphaealean whole-genome duplication event, which is shared by Nymphaeaceae and possibly Cabombaceae. Among the genes retained from this whole-genome duplication are homologues of genes that regulate flowering transition and flower development. The broad expression of homologues of floral ABCE genes in N. colorata might support a similarly broadly active ancestral ABCE model of floral organ determination in early angiosperms. Water lilies have evolved attractive floral scents and colours, which are features shared with mesangiosperms, and we identified their putative biosynthetic genes in N. colorata. The chemical compounds and biosynthetic genes behind floral scents suggest that they have evolved in parallel to those in mesangiosperms. Because of its unique phylogenetic position, the N. colorata genome sheds light on the early evolution of angiosperms.",
url = "https://doi.org/10.1038/s41586-019-1852-5",
doi = "10.1038/s41586-019-1852-5",
openalex = "W2995259736",
references = "doi101038ncomms16047, doi101111j14698137201103794x"
}
71. Zanne, Amy E. e Abarenkov, Kessy e Afkhami, Michelle E. e Aguilar‐Trigueros, Carlos A. e Bates, Scott T. e Bhatnagar, Jennifer e Busby, Posy E. e Christian, Natalie e Cornwell, William K. e Crowther, Thomas W. e Flores‐Moreno, Habacuc e Floudas, Dimitrios e Gazis, Romina e Hibbett, David S. e Kennedy, Peter G. e Lindner, Daniel L. e Maynard, Daniel S. e Milo, Amy M. e Nilsson, Rolf Henrik e Powell, Jeff R. e Schildhauer, Mark e Schilling, Jonathan S. e Treseder, Kathleen K., 2019, Ecologia funcional de fungos: trazendo uma abordagem baseada em traços para fungos associados a plantas: Biological reviews/Revisões biológicas da Sociedade Filosófica de Cambridge.
Resumo
Fungos desempenham muitos papéis essenciais nos ecossistemas. Eles facilitam o acesso das plantas a nutrientes e água, atuam como agentes de decomposição que ciclam carbono e nutrientes através do solo, água e atmosfera, e são grandes reguladores de populações de macro-organismos. Embora avanços tecnológicos estejam melhorando a detecção e identificação de fungos, ainda existem lacunas-chave em nosso conhecimento ecológico sobre este reino, especialmente relacionadas à função. Abordagens baseadas em traços têm sido fundamentais para fortalecer nossa compreensão da ecologia funcional de plantas e, portanto, fornecem excelentes modelos para aprofundar nossa compreensão da ecologia funcional de fungos de maneiras que complementam insights obtidos de técnicas tradicionais e baseadas em -ômica. Nesta revisão, sintetizamos o conhecimento atual sobre a ecologia funcional de fungos, taxonomia e sistemática e apresentamos um novo banco de dados de traços funcionais de fungos (Fun Fun). O Fun Fun foi construído para interfacear com outros bancos de dados para explorar e prever como a diversidade funcional de fungos varia por taxonomia, guilda e outras variáveis de agrupamento evolutivo ou ecológico. Para destacar como uma abordagem quantitativa baseada em traços pode fornecer novos insights, descrevemos múltiplos exemplos direcionados e terminamos sugerindo próximos passos no campo em rápido crescimento da ecologia funcional de fungos.
BibTeX
@article{doi101111brv12570,
author = "Zanne, Amy E. e Abarenkov, Kessy e Afkhami, Michelle E. e Aguilar‐Trigueros, Carlos A. e Bates, Scott T. e Bhatnagar, Jennifer e Busby, Posy E. e Christian, Natalie e Cornwell, William K. e Crowther, Thomas W. e Flores‐Moreno, Habacuc e Floudas, Dimitrios e Gazis, Romina e Hibbett, David S. e Kennedy, Peter G. e Lindner, Daniel L. e Maynard, Daniel S. e Milo, Amy M. e Nilsson, Rolf Henrik e Powell, Jeff R. e Schildhauer, Mark e Schilling, Jonathan S. e Treseder, Kathleen K.",
title = "Ecologia funcional de fungos: trazendo uma abordagem baseada em traços para fungos associados a plantas",
year = "2019",
journal = "Biological reviews/Revisões biológicas da Sociedade Filosófica de Cambridge",
abstract = "Fungos desempenham muitos papéis essenciais nos ecossistemas. Eles facilitam o acesso das plantas a nutrientes e água, atuam como agentes de decomposição que ciclam carbono e nutrientes através do solo, água e atmosfera, e são grandes reguladores de populações de macro-organismos. Embora avanços tecnológicos estejam melhorando a detecção e identificação de fungos, ainda existem lacunas-chave em nosso conhecimento ecológico sobre este reino, especialmente relacionadas à função. Abordagens baseadas em traços têm sido fundamentais para fortalecer nossa compreensão da ecologia funcional de plantas e, portanto, fornecem excelentes modelos para aprofundar nossa compreensão da ecologia funcional de fungos de maneiras que complementam insights obtidos de técnicas tradicionais e baseadas em -ômica. Nesta revisão, sintetizamos o conhecimento atual sobre a ecologia funcional de fungos, taxonomia e sistemática e apresentamos um novo banco de dados de traços funcionais de fungos (Fun Fun). O Fun Fun foi construído para interfacear com outros bancos de dados para explorar e prever como a diversidade funcional de fungos varia por taxonomia, guilda e outras variáveis de agrupamento evolutivo ou ecológico. Para destacar como uma abordagem quantitativa baseada em traços pode fornecer novos insights, descrevemos múltiplos exemplos direcionados e terminamos sugerindo próximos passos no campo em rápido crescimento da ecologia funcional de fungos.",
url = "https://doi.org/10.1111/brv.12570",
doi = "10.1111/brv.12570",
openalex = "W2991566198",
references = "doi101093sysbiosyy031"
}
72. Jin, Yi e Qian, Hong, 2019, V.PhyloMaker: um pacote R que pode gerar filogenias muito grandes para plantas vasculares: Ecography.
Resumo
Apresentamos o V.PhyloMaker, um pacote disponível gratuitamente para R, projetado para gerar filogenias de plantas vasculares. A mega-árvore implementada no V.PhyloMaker (ou seja, GBOTB.extended.tre), que foi derivada de duas mega-árvores recentemente publicadas e inclui 74 533 espécies e todas as famílias de plantas vasculares existentes, é a maior filogenia datada para plantas vasculares. O V.PhyloMaker pode gerar filogenias para listas de espécies muito grandes (a maior lista de espécies que testamos incluía 314 686 espécies). O V.PhyloMaker gera filogenias a uma velocidade rápida, muito mais rápida do que outros pacotes geradores de filogenias. Nossos testes do V.PhyloMaker mostram que gerar uma filogenia para 60 000 espécies requer menos de seis horas. O V.PhyloMaker inclui uma abordagem para anexar gêneros ou espécies aos seus parentes próximos em uma filogenia. Fornecemos um exemplo simples neste artigo para mostrar como usar o V.PhyloMaker para gerar filogenias.
BibTeX
@article{doi101111ecog04434,
author = "Jin, Yi e Qian, Hong",
title = "V.PhyloMaker: um pacote R que pode gerar filogenias muito grandes para plantas vasculares",
year = "2019",
journal = "Ecography",
abstract = "Apresentamos o V.PhyloMaker, um pacote disponível gratuitamente para R, projetado para gerar filogenias de plantas vasculares. A mega-árvore implementada no V.PhyloMaker (ou seja, GBOTB.extended.tre), que foi derivada de duas mega-árvores recentemente publicadas e inclui 74 533 espécies e todas as famílias de plantas vasculares existentes, é a maior filogenia datada para plantas vasculares. O V.PhyloMaker pode gerar filogenias para listas de espécies muito grandes (a maior lista de espécies que testamos incluía 314 686 espécies). O V.PhyloMaker gera filogenias a uma velocidade rápida, muito mais rápida do que outros pacotes geradores de filogenias. Nossos testes do V.PhyloMaker mostram que gerar uma filogenia para 60 000 espécies requer menos de seis horas. O V.PhyloMaker inclui uma abordagem para anexar gêneros ou espécies aos seus parentes próximos em uma filogenia. Fornecemos um exemplo simples neste artigo para mostrar como usar o V.PhyloMaker para gerar filogenias.",
url = "https://doi.org/10.1111/ecog.04434",
doi = "10.1111/ecog.04434",
openalex = "W2922439782",
references = "doi101038nature12872"
}
73. Kattge, Jens e Bönisch, Gerhard e Dı́az, Sandra e Lavorel, Sandra e Prentice, I. Colin e Leadley, Paul e Tautenhahn, Susanne e Werner, Gijsbert D. A. e Aakala, Tuomas e Abedi, Mehdi e Acosta, Alicia Teresa Rosario e Adamidis, George C. e Adamson, Kairi e Aiba, Masahiro e Albert, Cécile H. e Alcántara, Julio M. e C, Carolina Alcázar e Aleixo, Izabela e Ali, Hamada E. e Amiaud, Bernard e Ammer, Christian e Amoroso, Mariano M. e Anand, Madhur e Anderson, C. e Anten, Niels P. R. e Antos, Joseph A. e Apgaua, Deborah M. G. e Ashman, Tia‐Lynn e Asmara, Degi Harja e Asner, Gregory P. e Aspinwall, Michael J. e Atkin, Owen K. e Aubin, Isabelle e Baastrup‐Spohr, Lars e Bahalkeh, Khadijeh e Bahn, Michael e Baker, Timothy R. e Baker, William J. e Bakker, Jan P. e Baldocchi, Dennis e Baltzer, Jennifer L. e Banerjee, Arindam e Baranger, Anne e Barlow, Jos e Barneche, Diego R. e Baruch, Zdravko e Bastianelli, Denis e Battles, John J. e Bauerle, William L. e Bauters, Marijn e Bazzato, Erika e Beckmann, Michael e Beeckman, Hans e Beierkuhnlein, Carl e Bekker, Renée M. e Belfry, Gavin e Belluau, Michaël e Beloiu, Mirela e Benavides, Raquel e Benomar, Lahcen e Berdugo‐Lattke, Mary Lee e Berenguer, Erika e Bergamin, Rodrigo Scarton e Bergmann, Joana e Carlucci, Marcos Bergmann e Berner, Logan T. e Bernhardt‐Römermann, Markus e Bigler, Christof e Bjorkman, Anne D. e Blackman, Chris J. e Blanco, C. e Blonder, Benjamin e Blumenthal, Dana M. e Bocanegra‐González, Kelly T. e Boeckx, Pascal e Bohlman, Stephanie e Böhning‐Gaese, Katrin e Boisvert‐Marsh, Laura e Bond, William J. e Bond‐Lamberty, Ben e Boom, Arnoud e Boonman, Coline C. F. e Bordin, Kauane Maiara e Boughton, Elizabeth H. e Boukili, Vanessa e Bowman, David M. J. S. e Bravo, Sandra e Brendel, Marco R. e Broadley, Martin R. e Brown, Kerry A. e Bruelheide, Helge e Brumnich, Federico e Bruun, Hans Henrik e Bruy, David e Buchanan, Serra-Willow e Bucher, Solveig Franziska e Buchmann, Nina e Buitenwerf, Robert e Bunker, Daniel E. e Bürger, Jana, 2019, TRY plant trait database – enhanced coverage and open access: Global Change Biology.
Resumo
As características das plantas — as características morfológicas, anatômicas, fisiológicas, bioquímicas e fenológicas das plantas — determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam as propriedades dos ecossistemas e seus benefícios e malefícios para as pessoas. Os dados de características das plantas representam, portanto, a base para uma vasta área de pesquisa que abrange desde a biologia evolutiva, ecologia comunitária e funcional, até a conservação da biodiversidade, gestão de ecossistemas e paisagens, restauração, biogeografia e modelagem de sistemas terrestres. Desde sua fundação em 2007, o banco de dados TRY de características das plantas cresceu continuamente. Ele agora fornece uma cobertura de dados sem precedentes sob uma política de acesso aberto a dados e é o principal banco de dados de características das plantas utilizado pela comunidade de pesquisa em todo o mundo. Cada vez mais, o banco de dados TRY também suporta novas fronteiras da pesquisa baseada em características das plantas, incluindo a identificação de lacunas de dados e a subsequente mobilização ou medição de novos dados. Para apoiar esse desenvolvimento, neste artigo avaliamos a extensão dos dados de características compilados no TRY e analisamos padrões emergentes de cobertura e representatividade dos dados. A melhor cobertura de espécies é alcançada para características categóricas — cobertura quase completa para 'forma de crescimento da planta'. No entanto, a maioria das características relevantes para ecologia e modelagem de vegetação é caracterizada por variação intraspecífica contínua e relações características-ambiente. Essas características devem ser medidas em plantas individuais em seus respectivos ambientes. Apesar da cobertura de dados sem precedentes, observamos uma humilhante falta de completude e representatividade dessas características contínuas em muitos aspectos. Portanto, concluímos que reduzir lacunas de dados e vieses no banco de dados TRY permanece um desafio chave e requer uma abordagem coordenada para mobilização de dados e medição de características. Isso só pode ser alcançado em colaboração com outras iniciativas.
BibTeX
@article{doi101111gcb14904,
author = "Kattge, Jens e Bönisch, Gerhard e Dı́az, Sandra e Lavorel, Sandra e Prentice, I. Colin e Leadley, Paul e Tautenhahn, Susanne e Werner, Gijsbert D. A. e Aakala, Tuomas e Abedi, Mehdi e Acosta, Alicia Teresa Rosario e Adamidis, George C. e Adamson, Kairi e Aiba, Masahiro e Albert, Cécile H. e Alcántara, Julio M. e C, Carolina Alcázar e Aleixo, Izabela e Ali, Hamada E. e Amiaud, Bernard e Ammer, Christian e Amoroso, Mariano M. e Anand, Madhur e Anderson, C. e Anten, Niels P. R. e Antos, Joseph A. e Apgaua, Deborah M. G. e Ashman, Tia‐Lynn e Asmara, Degi Harja e Asner, Gregory P. e Aspinwall, Michael J. e Atkin, Owen K. e Aubin, Isabelle e Baastrup‐Spohr, Lars e Bahalkeh, Khadijeh e Bahn, Michael e Baker, Timothy R. e Baker, William J. e Bakker, Jan P. e Baldocchi, Dennis e Baltzer, Jennifer L. e Banerjee, Arindam e Baranger, Anne e Barlow, Jos e Barneche, Diego R. e Baruch, Zdravko e Bastianelli, Denis e Battles, John J. e Bauerle, William L. e Bauters, Marijn e Bazzato, Erika e Beckmann, Michael e Beeckman, Hans e Beierkuhnlein, Carl e Bekker, Renée M. e Belfry, Gavin e Belluau, Michaël e Beloiu, Mirela e Benavides, Raquel e Benomar, Lahcen e Berdugo‐Lattke, Mary Lee e Berenguer, Erika e Bergamin, Rodrigo Scarton e Bergmann, Joana e Carlucci, Marcos Bergmann e Berner, Logan T. e Bernhardt‐Römermann, Markus e Bigler, Christof e Bjorkman, Anne D. e Blackman, Chris J. e Blanco, C. e Blonder, Benjamin e Blumenthal, Dana M. e Bocanegra‐González, Kelly T. e Boeckx, Pascal e Bohlman, Stephanie e Böhning‐Gaese, Katrin e Boisvert‐Marsh, Laura e Bond, William J. e Bond‐Lamberty, Ben e Boom, Arnoud e Boonman, Coline C. F. e Bordin, Kauane Maiara e Boughton, Elizabeth H. e Boukili, Vanessa e Bowman, David M. J. S. e Bravo, Sandra e Brendel, Marco R. e Broadley, Martin R. e Brown, Kerry A. e Bruelheide, Helge e Brumnich, Federico e Bruun, Hans Henrik e Bruy, David e Buchanan, Serra-Willow e Bucher, Solveig Franziska e Buchmann, Nina e Buitenwerf, Robert e Bunker, Daniel E. e Bürger, Jana",
title = "TRY plant trait database – enhanced coverage and open access",
year = "2019",
journal = "Global Change Biology",
abstract = "As características das plantas - as características morfológicas, anatômicas, fisiológicas, bioquímicas e fenológicas das plantas - determinam como as plantas respondem a fatores ambientais, afetam outros níveis tróficos e influenciam as propriedades dos ecossistemas e seus benefícios e malefícios para as pessoas. Os dados de características das plantas representam, portanto, a base para uma vasta área de pesquisa que abrange desde a biologia evolutiva, ecologia comunitária e funcional, até a conservação da biodiversidade, gestão de ecossistemas e paisagens, restauração, biogeografia e modelagem de sistemas terrestres. Desde sua fundação em 2007, o banco de dados TRY de características das plantas cresceu continuamente. Ele agora fornece uma cobertura de dados sem precedentes sob uma política de acesso aberto aos dados e é o principal banco de dados de características das plantas utilizado pela comunidade de pesquisa em todo o mundo. Cada vez mais, o banco de dados TRY também suporta novas fronteiras da pesquisa baseada em características das plantas, incluindo a identificação de lacunas de dados e a subsequente mobilização ou medição de novos dados. Para apoiar esse desenvolvimento, neste artigo avaliamos a extensão dos dados de características compilados no TRY e analisamos padrões emergentes de cobertura e representatividade dos dados. A melhor cobertura de espécies é alcançada para características categóricas - cobertura quase completa para 'forma de crescimento das plantas'. No entanto, a maioria das características relevantes para a ecologia e modelagem de vegetação é caracterizada por variação intraspecífica contínua e relações características-ambiente. Essas características devem ser medidas em plantas individuais em seus respectivos ambientes. Apesar da cobertura de dados sem precedentes, observamos uma humilde falta de completude e representatividade dessas características contínuas em muitos aspectos. Portanto, concluímos que reduzir as lacunas de dados e os vieses no banco de dados TRY continua sendo um desafio chave e requer uma abordagem coordenada para a mobilização de dados e medição de características. Isso só pode ser alcançado em colaboração com outras iniciativas.",
url = "https://doi.org/10.1111/gcb.14904",
doi = "10.1111/gcb.14904",
openalex = "W2983606184",
references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038s4158601805637, doi101071bt12225, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x"
}
74. Sanchez‐Martinez, Pablo e Martínez‐Vilalta, Jordi e Dexter, Kyle G. e Segovia, Ricardo A. e Mencuccini, Maurizio, 2020, Adaptação e evolução coordenada de características hidráulicas de plantas: Ecology Letters.
Resumo
Propriedades hidráulicas controlam as respostas das plantas ao clima e provavelmente estão sob forte pressão seletiva, mas sua história macroevolutiva permanece pouco caracterizada. Para preencher essa lacuna, compilamos um conjunto de dados global de características hidráulicas que descrevem a condutividade do xilema (K s), a resistência do xilema ao embolismo (P50), a alocação de madeira de seiva relativa à área foliar (Hv) e a exposição à seca (ψ min), e correspondemos esses dados com filogenias globais de plantas com sementes. Individualmente, essas características apresentam níveis médios a altos de sinal filogenético, parcialmente relacionados a pressões seletivas ambientais que moldam a evolução das linhagens. A maioria dessas características evoluiu independentemente umas das outras, sendo co-selecionadas pelas mesmas pressões ambientais. No entanto, as correlações evolutivas entre P50 e ψ min e entre K s e Hv apresentam sinais de integração evolutiva mais profunda devido a restrições funcionais, de desenvolvimento ou genéticas, conformando-se a módulos evolutivos. Não detectamos integração evolutiva entre condutividade e resistência ao embolismo, rejeitando um compromisso inato para este par de características.
BibTeX
@article{doi101111ele13584,
author = "Sanchez‐Martinez, Pablo e Martínez‐Vilalta, Jordi e Dexter, Kyle G. e Segovia, Ricardo A. e Mencuccini, Maurizio",
title = "Adaptação e evolução coordenada de características hidráulicas de plantas",
year = "2020",
journal = "Ecology Letters",
abstract = "Propriedades hidráulicas controlam as respostas das plantas ao clima e provavelmente estão sob forte pressão seletiva, mas sua história macroevolutiva permanece pouco caracterizada. Para preencher essa lacuna, compilamos um conjunto de dados global de características hidráulicas que descrevem a condutividade do xilema (K s), a resistência do xilema ao embolismo (P50), a alocação de madeira de seiva relativa à área foliar (Hv) e a exposição à seca (ψ min), e correspondemos esses dados com filogenias globais de plantas com sementes. Individualmente, essas características apresentam níveis médios a altos de sinal filogenético, parcialmente relacionados a pressões seletivas ambientais que moldam a evolução das linhagens. A maioria dessas características evoluiu independentemente umas das outras, sendo co-selecionadas pelas mesmas pressões ambientais. No entanto, as correlações evolutivas entre P50 e ψ min e entre K s e Hv apresentam sinais de integração evolutiva mais profunda devido a restrições funcionais, de desenvolvimento ou genéticas, conformando-se a módulos evolutivos. Não detectamos integração evolutiva entre condutividade e resistência ao embolismo, rejeitando um compromisso inato para este par de características.",
url = "https://doi.org/10.1111/ele.13584",
doi = "10.1111/ele.13584",
openalex = "W3073875730",
references = "doi101098rspb20181012"
}
75. 2021, ANGIOSPERMS:: A Ecologia das Árvores, Arbustos e Vinhas Lenhosas do Norte da Flórida: p. 57-360.
BibTeX
@incollection{crossref2021angiosperms,
title = "ANGIOSPERMS:",
year = "2021",
booktitle = "The Ecology of the Trees, Shrubs, and Woody Vines of Northern Florida",
url = "https://doi.org/10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
doi = "10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
pages = "57-360"
}
76. Benton, Michael J. e Wilf, Peter e Sauquet, Hervé, 2021, A Revolução Terrestre das Angiospermas e as origens da biodiversidade moderna: New Phytologist.
Resumo
A biodiversidade atual tem a propriedade incomum de que 85% das espécies de plantas e animais vivem em terra em vez de no mar, e metade dessas vivem em florestas tropicais. Um aumento explosivo na diversidade terrestre ocorreu de c. 100-50 milhões de anos atrás, o Cretáceo Tardio e o Paleógeno Inicial. Durante este intervalo, o sistema Terra-vida em terra foi reiniciado, e a biosfera expandiu-se para um novo nível de produtividade, aumentando a capacidade e a diversidade de espécies dos ambientes terrestres. Este aumento na biodiversidade terrestre coincidiu com inovações na biologia das plantas com flores e na ecologia evolutiva, incluindo suas flores e eficiências na reprodução; coevolução com animais, especialmente polinizadores e herbívoros; capacidades fotossintéticas; adaptabilidade; e capacidade de modificar habitats. O surgimento das angiospermas desencadeou uma revolução macroecológica em terra e impulsionou a biodiversidade moderna em uma mudança secular e prolongada para novos níveis altos, uma série de processos que nomeamos aqui como a Revolução Terrestre das Angiospermas.
BibTeX
@article{doi101111nph17822,
author = "Benton, Michael J. e Wilf, Peter e Sauquet, Hervé",
title = "A Revolução Terrestre das Angiospermas e as origens da biodiversidade moderna",
year = "2021",
journal = "New Phytologist",
abstract = "A biodiversidade atual tem a propriedade incomum de que 85% das espécies de plantas e animais vivem em terra em vez de no mar, e metade dessas vivem em florestas tropicais. Um aumento explosivo na diversidade terrestre ocorreu de c. 100-50 milhões de anos atrás, o Cretáceo Tardio e o Paleógeno Inicial. Durante este intervalo, o sistema Terra-vida em terra foi reiniciado, e a biosfera expandiu-se para um novo nível de produtividade, aumentando a capacidade e a diversidade de espécies dos ambientes terrestres. Este aumento na biodiversidade terrestre coincidiu com inovações na biologia das plantas com flores e na ecologia evolutiva, incluindo suas flores e eficiências na reprodução; coevolução com animais, especialmente polinizadores e herbívoros; capacidades fotossintéticas; adaptabilidade; e capacidade de modificar habitats. O surgimento das angiospermas desencadeou uma revolução macroecológica em terra e impulsionou a biodiversidade moderna em uma mudança secular e prolongada para novos níveis altos, uma série de processos que nomeamos aqui como a Revolução Terrestre das Angiospermas.",
url = "https://doi.org/10.1111/nph.17822",
doi = "10.1111/nph.17822",
openalex = "W3209026994",
references = "doi101016jcub201508003, doi101016jcub201804062, doi101016jgloplacha201804004, doi101016jtree201905008, doi101038nature06277, doi101038ncomms16047, doi101038s4158601916932, doi101073pnas1112694108, doi101073pnas1813206116, doi101073pnas1907847116, doi101093icbicq078, doi101093molbevmsx324, doi101093sysbiosyaa034, doi101098rspb20080715, doi101111syen12132, doi1023072399030, doi103390ijms140510242, doi1034172009143, doi107717peerj1719"
}
77. Jin, Yi e Qian, Hong, 2022, V.PhyloMaker2: Um pacote R atualizado e ampliado que pode gerar filogenias muito grandes para plantas vasculares: Plant Diversity.
DOI: 10.1016/j.pld.2022.05.005
Resumo
Uma versão anterior do V.PhyloMaker tem sido amplamente utilizada para gerar árvores filogenéticas de plantas vasculares para estudos botânicos, biogeográficos e ecológicos. Aqui, atualizamos e ampliamos este pacote, que agora é chamado de 'V.PhyloMaker2'. Com o V.PhyloMaker2, é possível gerar uma árvore filogenética para plantas vasculares com base em um dos três diferentes sistemas de nomenclatura botânica. O V.PhyloMaker2 pode gerar filogenias para listas de espécies muito grandes (a maior lista de espécies que testamos incluía 365.198 espécies). O V.PhyloMaker2 gera filogenias a uma velocidade rápida. Fornecemos um exemplo (incluindo uma lista de espécies de amostra e um script R para executá-lo) neste artigo para mostrar como usar o V.PhyloMaker2 para gerar árvores filogenéticas.
BibTeX
@article{doi101016jpld202205005,
author = "Jin, Yi and Qian, Hong",
title = "V.PhyloMaker2: An updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies for vascular plants",
year = "2022",
journal = "Plant Diversity",
abstract = "An earlier version of V.PhyloMaker has been broadly used to generate phylogenetic trees of vascular plants for botanical, biogeographical and ecological studies. Here, we update and enlarge this package, which is now called 'V.PhyloMaker2'. With V.PhyloMaker2, one can generate a phylogenetic tree for vascular plants based on one of three different botanical nomenclature systems. V.PhyloMaker2 can generate phylogenies for very large species lists (the largest species list that we tested included 365,198 species). V.PhyloMaker2 generates phylogenies at a fast speed. We provide an example (including a sample species list and an R script to run it) in this paper to show how to use V.PhyloMaker2 to generate phylogenetic trees.",
url = "https://doi.org/10.1016/j.pld.2022.05.005",
doi = "10.1016/j.pld.2022.05.005",
openalex = "W4281979425",
references = "doi101038nature12872"
}
78. Liu, Yang e Wang, Sibo e Li, Linzhou e Yang, Ting e Dong, Shanshan e Wei, Tong e Wu, Shengdan e Liu, Yongbo e Gong, Yiqing e Feng, Xiuyan e Ma, Jianchao e Chang, Guanxiao e Huang, Jinling e Yang, Yong e Wang, Hongli e Liu, Min e Xu, Yan e Liang, Hongping e Jin, Yu e Cai, Yuqing e Zhang, Zhaowu e Fan, Yannan e Mu, Weixue e Sahu, Sunil Kumar e Liu, Shuchun e Lang, Xiaoan e Yang, Leilei e Li, Na e Habib, Sadaf e Yang, Yongqiong e Lindström, Anders J. e Liang, Pei e Goffinet, Bernard e Zaman, Sumaira e Wegrzyn, Jill e Li, Dexiang e Liu, Jian e Cui, Jie e Sonnenschein, Eva C. e Wang, Xiaobo e Ruan, Jue e Xue, Jia‐Yu e Shao, Zhu‐Qing e Song, Chi e Fan, Guangyi e Li, Zhen e Zhang, Liangsheng e Liu, Jianquan e Liu, Zhong‐Jian e Jiao, Yuannian e Wang, Xiaoquan e Wu, Hong e Wang, Ertao e Lisby, Michael e Yang, Huanming e Wang, Jian e Liu, Xin e Xu, Xun e Li, Nan e Soltis, Pamela S. e de Peer, Yves Van e Soltis, Douglas E. e Gong, Xun e Liu, Huan e Zhang, Shouzhou, 2022, O genoma de Cycas e a evolução inicial das plantas com sementes: Nature Plants.
DOI: 10.1038/s41477-022-01129-7
Resumo
Cicadáceas representam um dos linhagens mais antigas de plantas com sementes vivas. Identificar características genômicas compartilhadas unicamente por cicadáceas e outras plantas com sementes existentes, mas não por plantas não produtoras de sementes, pode lançar luz sobre a origem de inovações-chave, bem como a diversificação inicial das plantas com sementes. Aqui, relatamos o genoma de referência de 10,5 Gb de Cycas panzhihuaensis, complementado pelos transcriptomas de 339 espécies de cicadáceas. As análises filogenômicas nucleares e plastidiais sugerem fortemente que as cicadáceas e o Ginkgo formam um clado irmão de todas as outras gimnospermas vivas, em contraste com os dados mitocondriais, que colocam as cicadáceas sozinhas nesta posição. Encontramos evidências de uma duplicação antiga do genoma inteiro no ancestral comum das gimnospermas existentes. O genoma de Cycas contém quatro homólogos da família de genes fitD que provavelmente foram adquiridos via transferência horizontal de genes de fungos, e esses genes conferem resistência a herbívoros em cicadáceas. A região específica do sexo masculino do cromossomo Y de C. panzhihuaensis contém um fator de transcrição MADS-box expresso exclusivamente em cones masculinos que é semelhante a um sistema relatado em Ginkgo, sugerindo que um mecanismo de determinação do sexo controlado por genes MADS-box pode ter se originado no ancestral comum de cicadáceas e Ginkgo. O genoma de C. panzhihuaensis fornece um importante novo recurso de ampla utilidade para biólogos.
BibTeX
@article{doi101038s41477022011297,
author = "Liu, Yang e Wang, Sibo e Li, Linzhou e Yang, Ting e Dong, Shanshan e Wei, Tong e Wu, Shengdan e Liu, Yongbo e Gong, Yiqing e Feng, Xiuyan e Ma, Jianchao e Chang, Guanxiao e Huang, Jinling e Yang, Yong e Wang, Hongli e Liu, Min e Xu, Yan e Liang, Hongping e Jin, Yu e Cai, Yuqing e Zhang, Zhaowu e Fan, Yannan e Mu, Weixue e Sahu, Sunil Kumar e Liu, Shuchun e Lang, Xiaoan e Yang, Leilei e Li, Na e Habib, Sadaf e Yang, Yongqiong e Lindström, Anders J. e Liang, Pei e Goffinet, Bernard e Zaman, Sumaira e Wegrzyn, Jill e Li, Dexiang e Liu, Jian e Cui, Jie e Sonnenschein, Eva C. e Wang, Xiaobo e Ruan, Jue e Xue, Jia‐Yu e Shao, Zhu‐Qing e Song, Chi e Fan, Guangyi e Li, Zhen e Zhang, Liangsheng e Liu, Jianquan e Liu, Zhong‐Jian e Jiao, Yuannian e Wang, Xiaoquan e Wu, Hong e Wang, Ertao e Lisby, Michael e Yang, Huanming e Wang, Jian e Liu, Xin e Xu, Xun e Li, Nan e Soltis, Pamela S. e de Peer, Yves Van e Soltis, Douglas E. e Gong, Xun e Liu, Huan e Zhang, Shouzhou",
title = "O genoma de Cycas e a evolução inicial das plantas com sementes",
year = "2022",
journal = "Nature Plants",
abstract = "Cicadáceas representam um dos linhagens mais antigas de plantas com sementes vivas. Identificar características genômicas compartilhadas unicamente por cicadáceas e outras plantas com sementes existentes, mas não por plantas não produtoras de sementes, pode lançar luz sobre a origem de inovações-chave, bem como a diversificação inicial das plantas com sementes. Aqui, relatamos o genoma de referência de 10,5 Gb de Cycas panzhihuaensis, complementado pelos transcriptomas de 339 espécies de cicadáceas. As análises filogenômicas nucleares e plastidiais sugerem fortemente que as cicadáceas e o Ginkgo formam um clado irmão de todas as outras gimnospermas vivas, em contraste com os dados mitocondriais, que colocam as cicadáceas sozinhas nesta posição. Encontramos evidências de uma duplicação antiga do genoma inteiro no ancestral comum das gimnospermas existentes. O genoma de Cycas contém quatro homólogos da família de genes fitD que provavelmente foram adquiridos via transferência horizontal de genes de fungos, e esses genes conferem resistência a herbívoros em cicadáceas. A região específica do sexo masculino do cromossomo Y de C. panzhihuaensis contém um fator de transcrição MADS-box expresso exclusivamente em cones masculinos que é semelhante a um sistema relatado em Ginkgo, sugerindo que um mecanismo de determinação do sexo controlado por genes MADS-box pode ter se originado no ancestral comum de cicadáceas e Ginkgo. O genoma de C. panzhihuaensis fornece um importante novo recurso de ampla utilidade para biólogos.",
url = "https://doi.org/10.1038/s41477-022-01129-7",
doi = "10.1038/s41477-022-01129-7",
openalex = "W4223990635",
references = "doi101098rspb20181012"
}
79. Nenhum, Angiospermas: AccessScience.
DOI: 10.1036/1097-8542.yb010070
BibTeX
@misc{crossrefNoneangiosperms,
title = "Angiospermas",
year = "Nenhum",
booktitle = "AccessScience",
url = "https://doi.org/10.1036/1097-8542.yb010070",
doi = "10.1036/1097-8542.yb010070"
}