Anóxia

@article{waters1941anoxia,
    author = "WATERS, RALPH M.",
    title = "Anóxia",
    year = "1941",
    journal = "Anesthesiology",
    url = "https://doi.org/10.1097/00000542-194103000-00018",
    doi = "10.1097/00000542-194103000-00018",
    number = "2",
    pages = "214-215",
    volume = "2"
}

@article{doi101130001676061968791315tailif20co2,
    author = "Lawrence, David R.",
    title = "Taphonomia e Perdas de Informação em Comunidades Fóssis",
    year = "1968",
    journal = "Bulletin da Sociedade Geológica da América",
    url = "https://doi.org/10.1130/0016-7606(1968)79[1315:tailif]2.0.co;2",
    doi = "10.1130/0016-7606(1968)79[1315:tailif]2.0.co;2",
    openalex = "W2134383609"
}

Dados sobre o número de famílias marinhas dentro de 91 classes metazoanas conhecidas a partir do registro fóssil do Fanerozoico são analisados. A distribuição das 2800 famílias fósseis entre as classes é muito desigual, com a maioria pertencendo a uma pequena minoria de classes. Da mesma forma, a distribuição estratigráfica das classes é muito desigual, com a maioria aparecendo pela primeira vez no início do Paleozóico e com muitas das classes menores extinguindo-se antes do fim dessa era. No entanto, apesar dessa desigualdade, uma análise de fatores em modo Q indica que a estrutura desses dados é bastante simples. Apenas três fatores são necessários para explicar mais de 90% dos dados. Esses fatores são interpretados como refletindo as três grandes "faunas evolutivas" do registro fóssil marinho do Fanerozoico: uma fauna cambriana dominada por trilobitas, uma fauna paleozóica posterior dominada por braquiópodes e uma fauna mesozóica-cenozóica, ou "moderna", dominada por moluscos. Fatores menores relacionam-se à lenta taxa de turnover taxonômico dentro das faunas principais ao longo do tempo e a aspectos únicos de taxons e períodos específicos. Cada uma das três faunas principais parece ter sua própria diversidade característica, de modo que sua expansão ou contração parece estar intimamente associada a uma fase particular na história da diversidade marinha total. A fauna cambriana expande-se rapidamente durante as radiações cambrianas iniciais e mantém a dominância durante o "equilíbrio" do Cambriano Médio a Final. A fauna paleozóica então ascende à dominância durante as radiações ordovicianas, que aumentam dramaticamente a diversidade; essa nova fauna então mantém a dominância durante o longo intervalo de aparente equilíbrio que dura até o fim da Era Paleozóica. A fauna moderna, que aumenta lentamente em importância durante a Era Paleozóica, rapidamente atinge a dominância com as extinções do Permiano Final e mantém esse status durante o aumento geral na diversidade até o aparente máximo no Neógeno. O aumento na diversidade associado à expansão de cada nova fauna parece coincidir com um declínio aproximadamente exponencial da fauna anteriormente dominante, sugerindo uma possível substituição de cada fauna evolutiva por sua sucessora.

@article{doi101017s0094837300003778,
    author = "Sepkoski, J. John",
    title = "A factor analytic description of the Phanerozoic marine fossil record",
    year = "1981",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Data on numbers of marine families within 91 metazoan classes known from the Phanerozoic fossil record are analyzed. The distribution of the 2800 fossil families among the classes is very uneven, with most belonging to a small minority of classes. Similarly, the stratigraphic distribution of the classes is very uneven, with most first appearing early in the Paleozoic and with many of the smaller classes becoming extinct before the end of that era. However, despite this unevenness, a Q -mode factor analysis indicates that the structure of these data is rather simple. Only three factors are needed to account for more than 90\% of the data. These factors are interpreted as reflecting the three great “evolutionary faunas” of the Phanerozoic marine record: a trilobite-dominated Cambrian fauna, a brachiopod-dominated later Paleozoic fauna, and a mollusc-dominated Mesozoic-Cenozoic, or “modern,” fauna. Lesser factors relate to slow taxonomic turnover within the major faunas through time and to unique aspects of particular taxa and times. Each of the three major faunas seems to have its own characteristic diversity so that its expansion or contraction appears as being intimately associated with a particular phase in the history of total marine diversity. The Cambrian fauna expands rapidly during the Early Cambrian radiations and maintains dominance during the Middle to Late Cambrian “equilibrium.” The Paleozoic fauna then ascends to dominance during the Ordovician radiations, which increase diversity dramatically; this new fauna then maintains dominance throughout the long interval of apparent equilibrium that lasts until the end of the Paleozoic Era. The modern fauna, which slowly increases in importance during the Paleozoic Era, quickly rises to dominance with the Late Permian extinctions and maintains that status during the general rise in diversity to the apparent maximum in the Neogene. The increase in diversity associated with the expansion of each new fauna appears to coincide with an approximately exponential decline of the previously dominant fauna, suggesting possible displacement of each evolutionary fauna by its successor.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300003778",
    doi = "10.1017/s0094837300003778",
    openalex = "W2505144080",
    references = "doi10100797814613088367, doi1010160012825272900724, doi101017s0094837300004917, doi101017s009483730000508x, doi101017s0094837300005236, doi101017s0094837300005352, doi101017s0094837300005649, doi101017s0094837300005972, doi101017s0094837300012549, doi101126science17740541065, doi101126science2064415217, doi101130spe89p63, doi1023071483846, doi1023071796560, doi1023072405671, doi1023072412725, doi1023072412728, doi1023072806339, doi107312simp93764, openalexw1504049102, openalexw645218623"
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@article{doi1010160278416583900089,
    author = "Shipman, Pat e Rose, Jennie J.",
    title = "Caça, abate e comportamentos de processamento de carcaças de hominídeos primitivos: Abordagens ao registro fóssil",
    year = "1983",
    journal = "Journal of Anthropological Archaeology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0278-4165(83)90008-9",
    doi = "10.1016/0278-4165(83)90008-9",
    openalex = "W2002557964",
    references = "doi101016b9780120031047500132, doi101017s0094837300005820, doi101038scientificamerican096062, doi102113gsrocky8specialpaper11, doi1023072798801, doi105962bhlpart22969, openalexw1974359478"
}

Fósseis de xisto do Burgess Shale de corpo mole e levemente esclerotizado foram encontrados em mais de uma dúzia de novas localidades em uma área que se estende por 20 quilômetros ao longo da frente do Escarpamento da Catedral na Formação Stephen do Cambriano Médio das Montanhas Rochosas canadenses. Foram reconhecidos cinco diferentes conjuntos fósseis de quatro níveis estratigráficos. Estes conjuntos representam comunidades marinhas distintas quase contemporâneas que, juntas, constituem um complexo faunístico normal de frente de recife.

@article{doi101126science2224620163,
    author = "Collins, Desmond e Briggs, Derek E. G. e Morris, Simon Conway",
    title = "Novos Sítios Fóssis do Burgess Shale Revelam Complexo Faunístico do Cambriano Médio",
    year = "1983",
    journal = "Science",
    abstract = "Fósseis de xisto do Burgess Shale de corpo mole e levemente esclerotizado foram encontrados em mais de uma dúzia de novas localidades em uma área que se estende por 20 quilômetros ao longo da frente do Escarpamento da Catedral na Formação Stephen do Cambriano Médio das Montanhas Rochosas canadenses. Foram reconhecidos cinco diferentes conjuntos fósseis de quatro níveis estratigráficos. Estes conjuntos representam comunidades marinhas distintas quase contemporâneas que, juntas, constituem um complexo faunístico normal de frente de recife.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.222.4620.163",
    doi = "10.1126/science.222.4620.163",
    openalex = "W1994380053",
    references = "doi101017s0094837300006539, doi101038scientificamerican0779122, doi101098rstb19810033, doi101130gsab51731, doi105281zenodo15932730, doi105281zenodo16490103, openalexw2600671946, openalexw2608196808, openalexw614215761"
}

@article{doi1010160278416584900047,
    author = "Lyman, R. Lee",
    title = "Densidade óssea e sobrevivência diferencial de classes fósseis",
    year = "1984",
    journal = "Journal of Anthropological Archaeology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0278-4165(84)90004-7",
    doi = "10.1016/0278-4165(84)90004-7",
    openalex = "W1996561641",
    references = "doi101016030544038590072x, doi102113gsrocky8specialpaper11, doi102307281081, doi105962bhlpart22969, openalexw2167869521"
}

Resumo A preservação de estruturas não mineralizadas (incluindo plantas) e de esqueletos articulados resulta de condições hidrológicas, sedimentares e diagênicas iniciais extraordinárias. Os principais efeitos causativos correspondentes (estagnação, obrução e selagem bacteriana) definem um continuum conceitual no qual as ocorrências individuais podem ser mapeadas. Uma classificação mais pragmática e tipológica de depósitos de conservação, utilizando um questionário padrão, revela substituições ecológicas, bem como tendências relacionadas à evolução da biosfera, ao longo do tempo geológico.

@article{doi101098rstb19850134,
    author = "Seilacher, Adolf e Reif, Wolf‐Ernst e Westphal, Florian",
    title = "Padrões sedimentológicos, ecológicos e temporais de Lagerstätten fósseis",
    year = "1985",
    journal = "Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences",
    abstract = "Resumo A preservação de estruturas não mineralizadas (incluindo plantas) e de esqueletos articulados resulta de condições hidrológicas, sedimentares e diagênicas iniciais extraordinárias. Os principais efeitos causativos correspondentes (estagnação, obrução e selagem bacteriana) definem um continuum conceitual no qual as ocorrências individuais podem ser mapeadas. Uma classificação mais pragmática e tipológica de depósitos de conservação, utilizando um questionário padrão, revela substituições ecológicas, bem como tendências relacionadas à evolução da biosfera, ao longo do tempo geológico.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1985.0134",
    doi = "10.1098/rstb.1985.0134",
    openalex = "W2111944730",
    references = "doi101007978364269317510, doi1010079783642758294, doi101007bfb0009832, doi101111j136530911982tb00072x, doi101111j150239311985tb00688x, doi101126science2224620163, doi101126science2244651872, doi101127njgpa1591980324, doi101306ad4616f116f711d78645000102c1865d"
}

@misc{allison1988the1,
    author = "Allison, P. A",
    title = "O papel da anóxia na decomposição e mineralização de macrofósseis proteicos",
    year = "1988",
    howpublished = "Paleobiologia, v. 14, p. 139-154",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Allison, P. A., 1988, O papel da anóxia na decomposição e mineralização de macrofósseis proteicos: Paleobiologia, v. 14, p. 139-154.}"
}

Experimentos atualísticos quantificaram a taxa de decomposição anaeróbica e a mineralização associada ao redor de macro-organismos proteicos. Carcaças do verme poliqueta Nereis e dos eumalacostráceos Nephrops e Palaemon foram enterradas em frascos de vidro herméticos preenchidos com sedimento e água de ambientes marinhos, salobros e lacustres. Durante um período de 25 semanas, o conteúdo foi examinado para determinar o estado de decomposição e analisado quimicamente para monitorar a mineralização diagênese precoce (dois métodos para tal análise são revisados). Os processos de decomposição foram ativos nas condições experimentais apesar da anóxia e virtualmente destruíram as carcaças dentro de 25 semanas. No entanto, a taxa de decomposição no sistema marinho redutor de sulfato foi maior do que nos ambientes de água doce metanogênicos. As análises petrológicas e geoquímicas dos restos orgânicos identificaram camadas discretas de monossulfeto de ferro autigênico (um precursor da pirita) na superfície da cutícula de Nephrops em decomposição dentro de semanas do início do experimento. A análise química da carne em decomposição mostrou um aumento significativo no teor de cálcio da água dos poros com o tempo. Os resultados mostram claramente que a anóxia é ineficaz como meio de conservação de longo prazo na preservação de fósseis de corpo mole. No entanto, a mineralização induzida pela decomposição pode ser muito rápida, de modo que mesmo uma pequena redução na taxa de decomposição pode levar a níveis melhorados de preservação de fósseis. Tradicionalmente, a estagnação e o rápido enterramento são considerados os principais pré-requisitos para a preservação de fósseis de corpo mole e a formação de Konservat-Lagerstätten. Claramente, esses fatores são importantes apenas no sentido de que promovem a mineralização diagênese precoce. Esta é a única maneira de interromper a perda de informações através da decomposição.

@article{doi101017s009483730001188x,
    author = "Allison, Peter A.",
    title = "The role of anoxia in the decay and mineralization of proteinaceous macro-fossils",
    year = "1988",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Actualistic experiments have quantified rate of anaerobic decay and associated mineralization around proteinaceous macro-organisms. Carcasses of the polychaete worm Nereis and the eumalacostracans Nephrops and Palaemon were buried in airtight glass jars filled with sediment and water from marine, brackish, and lacustrine environments. Over a period of 25 weeks the contents were examined to determine the state of decay and were chemically analyzed to monitor early diagenetic mineralization (two methods for such analysis are reviewed). Decay processes were active in the experimental conditions despite anoxia and had virtually destroyed the carcasses within 25 weeks. However, decay-rate in the sulfate-reducing marine system was greater than in the methanogenic freshwater environments. Petrological and geochemical analyses of the organic remains identified discrete layers of authigenic iron monosulfide (a pyrite precursor) on the surface of the decaying Nephrops cuticle within weeks of initiating the experiment. Chemical analysis of decomposing flesh showed a marked increase in pore-water calcium content with time. The results clearly show that anoxia is ineffective as a long-term conservation medium in the preservation of soft-bodied fossils. However, decay-induced mineralization can be very rapid so that even a slight reduction in decay rate can lead to improved levels of fossil preservation. Traditionally, stagnation and rapid burial are considered to be the main prerequisites for the preservation of soft-bodied fossils and the formation of Konservat-Lagerstätten. Clearly these factors are only important in that they promote early diagenetic mineralization. This is the only way to halt information loss through decay.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s009483730001188x",
    doi = "10.1017/s009483730001188x",
    openalex = "W2487864689",
    references = "doi1010160016703784900899, doi101098rstb19850134, doi101130001676061968791315tailif20co2, doi1015159780691209401, doi102475ajs26811, doi104319lo19842920236, doi105962bhlpart22969, openalexw2754161204, openalexw599354073"
}

Experimentos de laboratório com equinóides regulares indicam que baixas temperaturas da água retardam a decomposição orgânica muito mais eficazmente do que a anóxia, e que o papel primário da anóxia na preservação de esqueletos calcários articulados de múltiplos elementos pode estar na exclusão de organismos necrófagos. Quando agitados a 20 rpm, espécimes que foram inicialmente deixados para decompor-se por dois dias em água salgada quente (30°C) desintegraram-se mais de seis vezes mais rápido do que espécimes tratados à temperatura ambiente (23°C) e mais de uma ordem de magnitude mais rápido do que espécimes tratados em água fria (11°C). Em contraste, os efeitos da decomposição aeróbica versus anaeróbica nas taxas de desintegração foram insignificantes. Quanto maior o período que os espécimes foram deixados para decompor-se antes da agitação, maior foi a taxa na qual os espécimes desintegraram-se, até um tempo limite que parece marcar a decomposição dos ligamentos colágenos. Isso exigiu alguns dias a 30°C, cerca de duas semanas a 23°C e mais de 4 semanas a 11°C para Strongylocentrotus. Até este limite, as coroas desintegram-se por uma combinação de fraturas transversais às placas e separação ao longo das suturas das placas; portanto, as fraturas transversais às placas podem ter origem tafonômica e não estão necessariamente relacionadas à predação. Especimes decompostos por períodos de tempo superiores ao limite desintegram-se virtualmente instantaneamente ao serem agitados apenas pela separação sutural. Coroas não perturbadas podem permanecer intactas por meses, tempo suficiente para a ocupação por epibiontes. As taxas de desintegração foram documentadas semi-quantitativamente reconhecendo sete estágios de desarticulação do teste, e quantitativamente por medidas de tensômetro da resistência e tenacidade do teste. Os efeitos da temperatura e do oxigênio na decomposição e a existência de um limite de decomposição na desintegração devem aplicar-se, pelo menos em sentido qualitativo, a muitos outros animais cujos esqueletos consistem em múltiplos elementos unidos por colágeno. Os equinóides regulares ainda devem ser percebidos como organismos tafonomicamente frágeis, mas nossos resultados sugerem o potencial para gradientes latitudinais, bem como batimétricos, na preservação de faunas fósseis de equinóides. A preservação de equinóides sob qualquer conjunto de condições também deve ser uma função das diferenças taxonômicas na construção do teste (particularmente o entrelaçamento de estereoma ao longo das suturas das placas), conforme sugerido por trabalhadores anteriores, embora nossos experimentos indiquem que esses efeitos devem ser significativos apenas entre espécimes pós-limite. Um levantamento de equinóides regulares de facies de giz branco do Cretáceo Superior da Grã-Bretanha substantia os padrões experimentais básicos, fornecendo exemplos de todos os estágios de desarticulação e diferenças taxonômicas significativas na qualidade de preservação. Uma variedade diversificada de perfuradores e incrustantes em coroas fósseis também corrobora a persistência pós-morte de alguns testes em fundos marinhos de latitudes médias.

@article{doi101017s0094837300009982,
    author = "Kidwell, Susan M. e Baumiller, Tomasz K.",
    title = "Desintegração experimental de equinóides regulares: papéis da temperatura, oxigênio e limiares de decomposição",
    year = "1990",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Experimentos de laboratório com equinóides regulares indicam que baixas temperaturas da água retardam a decomposição orgânica muito mais eficazmente do que a anóxia, e que o papel primário da anóxia na preservação de esqueletos calcários articulados de múltiplos elementos pode estar na exclusão de organismos necrófagos. Quando girados a 20 rpm, espécimes que foram inicialmente deixados para decompor-se por dois dias em água salgada quente (30°C) desintegraram-se mais de seis vezes mais rápido do que espécimes tratados à temperatura ambiente (23°C) e mais de uma ordem de magnitude mais rápido do que espécimes tratados em água fria (11°C). Em contraste, os efeitos da decomposição aeróbica versus anaeróbica nas taxas de desintegração foram insignificantes. Quanto maior o período que os espécimes foram deixados para decompor-se antes da agitação, maior foi a taxa na qual os espécimes desintegraram-se, até um tempo limite que parece marcar a decomposição de ligamentos colágenos. Isso exigiu alguns dias a 30°C, cerca de duas semanas a 23°C e mais de 4 semanas a 11°C para Strongylocentrotus. Até este limite, as coroas desintegram-se por uma combinação de fraturas transversais às placas e separação ao longo das suturas das placas; portanto, as fraturas transversais às placas podem ter origem tafonômica e não estão necessariamente relacionadas à predação. Especimes decompostos por períodos de tempo superiores ao limite desintegram-se virtualmente instantaneamente ao serem agitados, apenas pela separação sutural. Coroas não perturbadas podem permanecer intactas por meses, tempo suficiente para a ocupação por epibiontes. As taxas de desintegração foram documentadas semi-quantitativamente reconhecendo sete estágios de desarticulação do teste e quantitativamente por medidas de tensômetro da resistência e tenacidade do teste. Os efeitos da temperatura e do oxigênio na decomposição e a existência de um limiar de decomposição na desintegração devem aplicar-se, pelo menos em sentido qualitativo, a muitos outros animais cujos esqueletos consistem em múltiplos elementos ligados por colágeno. Equinóides regulares ainda devem ser percebidos como organismos tafonomicamente frágeis, mas nossos resultados sugerem o potencial para gradientes latitudinais, bem como batimétricos, na preservação de faunas fósseis de equinóides. A preservação de equinóides sob qualquer conjunto de condições também deve ser uma função de diferenças taxonômicas na construção do teste (particularmente o entrelaçamento de estereoma ao longo das suturas das placas), conforme sugerido por trabalhadores anteriores, embora nossos experimentos indiquem que esses efeitos devem ser significativos apenas entre espécimes pós-limiar. Um levantamento de equinóides regulares de facies de giz branco do Cretáceo Superior da Grã-Bretanha substantia os padrões experimentais básicos, fornecendo exemplos de todos os estágios de desarticulação e diferenças taxonômicas significativas na qualidade de preservação. Uma variedade diversa de perfuradores e incrustantes em coroas fósseis também corrobora a persistência pós-morte de alguns testes em fundos marinhos de latitudes médias.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300009982",
    doi = "10.1017/s0094837300009982",
    openalex = "W2493502125",
    references = "doi101017s0094837300005248"
}

@incollection{doi10100797814899503457,
    author = "Canfield, Donald E. e Raiswell, R.",
    title = "Formação de pirita e preservação fóssil",
    year = "1991",
    booktitle = "Tópicos em geobiologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4899-5034-5\_7",
    doi = "10.1007/978-1-4899-5034-5\_7",
    openalex = "W2483523994",
    references = "doi101017s0094837300012082, doi1023073514686"
}

O registro fóssil de traços Oldhamia reflete a mineração sistemática em faixas de um alimentador de sedimentos infaunal, semelhante a um verme. É conhecido de muitas partes do mundo em complexos cambrianos, cujos caráter semelhante a flysch e acréscimo sugere deposição em uma encosta continental profunda. Em rochas similares do Cinturão de Ardósias da Carolina do Norte, Oldhamia está associada a espécimes raros do fóssil corporal do tipo Ediacara Pteridinium, bem como marcas de ferramentas de um organismo rígido problemático que lembra estipes de graptolitos (Vendospica). Esta ocorrência (1) estende o intervalo estratigráfico de Oldhamia para o Proterozóico Superior. Também nos lembra que, naquela época, bilaterianos endobentônicos semelhantes a vermes (2) haviam se especializado comportamentalmente e (3) haviam colonizado fundos de plataforma e oceânicos profundos muito antes da explosão evolutiva cambriana. (4) Como os bioturbaadores eram pequenos e cavavam estritamente ao longo dos planos de estratificação, seu efeito de mistura era ainda insignificante. (5) Os novos fósseis de marcas de ferramentas nos dizem que organismos complexos, com paredes orgânicas e talvez coloniais, estavam presentes além dos corais de areia (Psammocorallia), possivelmente esponjas e os provavelmente plasmódicos Vendobionta.

@article{doi101017s247526220000825x,
    author = "Seilacher, Adolf and Pflüger, Friedrich",
    title = "Trace fossils from the Late Proterozoic of North Carolina: early conquest of deep-sea bottoms",
    year = "1992",
    journal = "The Paleontological Society Special Publications",
    abstract = "The trace fossil Oldhamia reflects systematic strip mining of an infaunal, worm-like sediment feeder. It is known from many parts of the world in Cambrian complexes, whose flysch-like and accreted character suggests deposition on a deep continental slope. In similar rocks of the North Carolina Slate Belt. Oldhamia is associated with rare specimens of the Ediacara-type body fossil Pteridinium, as well as tool marks of a problematic stiff organism reminiscent of graptolite stipes (Vendospica). This occurrence (1) extends the stratigraphic range of Oldhamia into the Late Proterozoic. It also reminds us that, by that time, worm-like, endobenthic bilaterians (2) had become behaviorally specialized and (3) had colonized shelf and deep-sea bottoms well before the Cambrian evolutionary explosion. (4) Since bioturbators were small and did burrow strictly along bedding planes, their mixing effect was as yet negligible. (5) The new tool-mark fossils tell us that complex, organic-walled and perhaps colonial organisms were around in addition to sand-corals (Psammocorallia), possibly sponges and the probably plasmodial Vendobionta.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s247526220000825x",
    doi = "10.1017/s247526220000825x",
    openalex = "W2784002077"
}

@article{doi105860choice300309,
    author = "Allison, PA e Briggs, DEG",
    title = "Taphonomia: liberando os dados trancados no registro fóssil",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.30-0309",
    doi = "10.5860/choice.30-0309",
    openalex = "W1587340106"
}

Foi realizada uma série de experimentos para investigar a natureza e os fatores de controle (oxigênio, populações microbianas, agitação) na degradação de tecidos moles. A decomposição foi monitorada em termos de mudança morfológica, perda de peso e alteração na composição química na poliqueta Nereis virens. Poliquetas incluem uma variedade de tipos de tecidos com composições químicas e potenciais de preservação diferentes: músculo, cutícula, cerdas e mandíbulas. Independentemente das condições, todo o músculo se degradou e a perda de fluido através da cutícula rompida reduziu a carcaça a duas dimensões em 8 dias a 20°C. Na maioria dos casos, alguma cutícula, além das mandíbulas e cerdas, permaneceu após 30 dias. Onde o oxigênio foi completamente eliminado, a taxa de degradação dos componentes mais voláteis foi significativamente reduzida. O grau tanto de absorção osmótica de água pela carcaça quanto de mudanças no pH da água diferiu dependendo se o sistema estava aberto ou fechado à difusão de oxigênio. Processos autolíticos e químicos não são suficientes para degradar completamente a carcaça na ausência de bactérias. Onde bactérias internas estão presentes, a presença ou ausência de bactérias na coluna de água fez pouca diferença na taxa de decomposição. A degradação inicial (nos primeiros 3 dias) afeta principalmente a fração lipídica e o colágeno da cutícula. A decomposição posterior reduz a proteína insolúvel e aumenta a proporção relativa de componentes estruturais refratários (quitina curtida e colágeno) para mais de 95% até o dia 30. Assim, apenas os tecidos esclerotizados provavelmente sobreviverão além de 30 dias na ausência de mineralização diagênese precoce. A sequência de degradação prevista a partir da resistência relativa à decomposição de macromoléculas no registro sedimentar (proteína → carboidrato → lipídio) não é, portanto, um indicador consistente do potencial de preservação de tecidos estruturais que os incorporam. Os experimentos revelam cinco estágios na decomposição de carcaças de poliquetas: inteiro/murchado, flácido, intestino sem suporte, saco de cutícula, mandíbulas e cerdas. Todos estão representados no registro fóssil. Isso permite uma estimativa de até que ponto a decomposição prosseguiu antes de ser interrompida pelo processo de fossilização. As preservações mais completas ocorrem no Cambriano, onde o Burgess Shale preserva evidências de tecidos musculares. Rastros do intestino e da cutícula são mais amplamente preservados, como em Mazon Creek, Grès à Voltzia, Solnhofen e Hakel. A preservação varia dentro das Konservat-Lagerstätten. A preservação mais comum de corpo inteiro inclui apenas os tecidos mais recalcitrantes, mandíbulas (quando presentes) e cerdas, com uma impressão do contorno do corpo. O estágio de decomposição pode ser usado como um limiar tafonômico, para fornecer uma indicação de como significativamente a diversidade de uma biota excepcionalmente preservada provavelmente foi reduzida pela perda tafonômica.

@article{doi101017s0094837300012343,
    author = "Briggs, Derek E. G. e Kear, Amanda J.",
    title = "Decaimento e preservação de poliquetas: limiares tafonômicos em organismos de corpo mole",
    year = "1993",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Uma série de experimentos foi realizada para investigar a natureza e os controles (oxigênio, populações microbianas, agitação) sobre a degradação de tecidos moles. O decaimento foi monitorado em termos de mudança morfológica, perda de peso e mudança na composição química no poliqueta Nereis virens. Poliquetas incluem uma variedade de tipos de tecidos de composição química e potencial de preservação diferentes: músculo, cutícula, cerdas e mandíbulas. Independentemente das condições, todo o músculo se degradou e a perda de fluido através da cutícula rompida reduziu a carcaça a duas dimensões em 8 dias a 20°C. Na maioria dos casos, alguma cutícula, além das mandíbulas e cerdas, permaneceu após 30 dias. Onde o oxigênio foi completamente eliminado, a taxa de decaimento das partes mais voláteis foi significativamente reduzida. O grau tanto de absorção osmótica de água pela carcaça quanto de mudanças no pH da água diferiu dependendo se o sistema estava aberto ou fechado à difusão de oxigênio. Processos autolíticos e químicos não são suficientes para degradar completamente a carcaça na ausência de bactérias. Onde bactérias internas estão presentes, a presença ou ausência de bactérias na coluna de água fez pouca diferença na taxa de decaimento. A degradação inicial (nos primeiros 3 dias) afeta principalmente a fração lipídica e o colágeno da cutícula. O decaimento posterior reduz a proteína insolúvel e aumenta a proporção relativa de componentes estruturais refratários (quitina curtida e colágeno) para mais de 95% até o dia 30. Assim, apenas os tecidos esclerotizados provavelmente sobreviverão além de 30 dias na ausência de mineralização diagênese precoce. A sequência de degradação prevista a partir da resistência relativa ao decaimento de macromoléculas no registro sedimentar (proteína → carboidrato → lipídio) não é, portanto, um indicador consistente do potencial de preservação de tecidos estruturais que as incorporam. Os experimentos revelam cinco estágios no decaimento de carcaças de poliquetas: inteiro/murchado, flácido, intestino sem suporte, saco de cutícula, mandíbulas e cerdas. Todos estão representados no registro fóssil. Isso permite uma estimativa de até que ponto o decaimento prosseguiu antes de ser interrompido pelo processo de fossilização. As preservações mais completas ocorrem no Cambriano, onde o Burgess Shale preserva evidências de tecidos musculares. Rastros do intestino e da cutícula são mais amplamente preservados, como em Mazon Creek, Grès à Voltzia, Solnhofen e Hakel. A preservação varia dentro das Konservat-Lagerstätten. A preservação mais comum do corpo inteiro inclui apenas os tecidos mais recalcitrantes, mandíbulas (quando presentes) e cerdas, com uma impressão do contorno do corpo. O estágio de decaimento pode ser usado como um limiar tafonômico, para fornecer uma indicação de como significativamente a diversidade de uma biota excepcionalmente preservada provavelmente foi reduzida pela perda tafonômica.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300012343",
    doi = "10.1017/s0094837300012343",
    openalex = "W1959245684",
    references = "doi101016003101829390065q, doi101038345802a0, doi10108003115517908565437, doi101144gsjgs14940631, doi105860choice295135"
}

@article{briggs1994decay,
    author = "Briggs, Derek E. G. e Kear, Amanda J.",
    title = "Decay and Mineralization of Shrimps",
    year = "1994",
    journal = "PALAIOS",
    url = "https://doi.org/10.2307/3515135",
    doi = "10.2307/3515135",
    number = "5",
    openalex = "W2015000408",
    pages = "431",
    volume = "9",
    references = "allison1988the, doi101017s0094837300009982, doi101017s0094837300009994, doi101017s0094837300012343, doi101038346171a0, doi101126science1593811195, doi101126science25951001439, doi101144gsjgs15061035, doi101306d42676db2b2611d78648000102c1865d, doi10310910520298309066811"
}

@article{doi101016s0031018297001089,
    author = "Markwick, Paul",
    title = "Fossil crocodilians as indicators of Late Cretaceous and Cenozoic climates: implications for using palaeontological data in reconstructing palaeoclimate",
    year = "1998",
    journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0031-0182(97)00108-9",
    doi = "10.1016/s0031-0182(97)00108-9",
    openalex = "W2092060384",
    references = "doi10100797814899503456, doi10100797894011125435, doi1010160031018265900131, doi101016003101829290096n, doi101016003192018990263x, doi1010160195667191900155, doi101017s0094837300006060, doi101029pa002i001p00001, doi1010719781486309702, doi101098rstb19930109, doi101126science19142321131, doi101126science24148691043, doi10113000917613198614535scaia20co2, doi101146annurevph57030195000441, doi102110pec88010071, doi1023071444927, doi1023071563593, doi1023073514444, doi1023073514548, doi1023073669094, doi102973odpprocsr1192001991, openalexw2983381470, openalexw575222456, spotila1973a"
}

Por muito tempo assumiu-se que os filos bilaterianos existentes geralmente têm sua origem na explosão cambriana, quando aparecem em uma forma essencialmente moderna. Ambas essas suposições são questionáveis. Uma aplicação rigorosa dos conceitos de grupo caule e grupo coroa aos filos mostra que, embora os pontos de ramificação de muitos clados possam ter ocorrido no Cambriano Inferior ou antes, a aparência dos planos corporais modernos foi, na maioria dos casos, posterior: muito poucos filos bilaterianos sensu stricto têm representantes demonstráveis no Cambriano mais antigo. Dado que os pontos de ramificação iniciais de clados principais são um resultado inevitável da geometria da diversi®cação de clados, o fenômeno alegado de filos aparecendo cedo e permanecendo morfologicamente estático é visto como não requerendo explicação particular. A confusão na de®nição de um filo levou, assim, a tentativas de explicar (especialmente sob uma perspectiva desenvolvimental) um traço que é parcialmente inevitável, parcialmente ilusório. Discutimos criticamente modelos para a diversi®cação proterozóica baseados em pequeno tamanho corporal, capacidade desenvolvimental limitada e má preservação e hábitos cripticos, e mostramos que a perspectiva de diversi®cação de linhagens ocorrendo cedo no Proterozóico pode ser vista como improvável com base tanto na parcimônia quanto na morfologia funcional. De fato, a combinação do registro fóssil corporal e de rastro demonstra uma diversi®cação progressiva até o fim do Proterozóico, bem no Cambriano e além, uma imagem consistente com planos corporais sendo montados durante este período. É provável que os caracteres do plano corporal tenham sido adquiridos monofileticamente na história dos bilaterianos, e é apresentado um modelo explicando a diversidade em apenas um deles, o celoma. Esta análise aponta para a necessidade de uma aplicação cuidadosa da metodologia sistemática antes que se busquem explicações para padrões alegados de restrição e ¯fexibilidade.

@article{doi101017s000632310000548x,
    author = "Budd, Graham E. e Jensen, Sören",
    title = "Uma reavaliação crítica do registro fóssil dos filos bilaterianos",
    year = "2000",
    journal = "Biological reviews/Revisões biológicas da Sociedade Filosófica de Cambridge",
    abstract = "Por muito tempo assumiu-se que os filos bilaterianos existentes geralmente têm sua origem na explosão cambriana, quando aparecem em uma forma essencialmente moderna. Ambas essas suposições são questionáveis. Uma aplicação rigorosa dos conceitos de grupo caule e grupo coroa aos filos mostra que, embora os pontos de ramificação de muitos clados possam ter ocorrido no Cambriano Inferior ou antes, a aparência dos planos corporais modernos foi, na maioria dos casos, posterior: muito poucos filos bilaterianos sensu stricto têm representantes demonstráveis no Cambriano mais antigo. Dado que os pontos de ramificação iniciais de clados principais são um resultado inevitável da geometria da diversi®cação de clados, o fenômeno alegado de filos aparecendo cedo e permanecendo morfologicamente estático é visto como não requerendo explicação particular. A confusão na de®nição de um filo levou, assim, a tentativas de explicar (especialmente sob uma perspectiva desenvolvimental) um traço que é parcialmente inevitável, parcialmente ilusório. Discutimos criticamente modelos para a diversi®cação proterozóica baseados em pequeno tamanho corporal, capacidade desenvolvimental limitada e má preservação e hábitos cripticos, e mostramos que a perspectiva de diversi®cação de linhagens ocorrendo cedo no Proterozóico pode ser vista como improvável com base tanto na parcimônia quanto na morfologia funcional. De fato, a combinação do registro fóssil corporal e de rastro demonstra uma diversi®cação progressiva até o fim do Proterozóico, bem no Cambriano e além, uma imagem consistente com planos corporais sendo montados durante este período. É provável que os caracteres do plano corporal tenham sido adquiridos monofileticamente na história dos bilaterianos, e é apresentado um modelo explicando a diversidade em apenas um deles, o celoma. Esta análise aponta para a necessidade de uma aplicação cuidadosa da metodologia sistemática antes que se busquem explicações para padrões alegados de restrição e ¯fexibilidade.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s000632310000548x",
    doi = "10.1017/s000632310000548x",
    openalex = "W2148377177",
    references = "doi101002aja1002030302, doi101002jmor1050540103, doi101017s0022336000024963, doi101017s0094837300012793, doi101017s009483730001681x, doi10103835318, doi101038361490a0, doi101038377720a0, doi101038382127a0, doi101038387489a0, doi10103846965, doi101098rstb19780005, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19950029, doi101111j109583121996tb01693x, doi101111j109600311991tb00045x, doi101111j146363951991tb00312x, doi101111j146363951995tb00988x, doi101111j146364091991tb00303x, doi101111j1469185x1988tb00631x, doi101111j150239311975tb01311x, doi101111j150239311990tb01373x, doi101111j150239311998tb00509x, doi101126science28354091919, doi101126science28454232129, doi101126science7886451, doi101139e87124, doi101508300037918, doi101826182003741571989, doi101826182003769311997, doi1023073515360, doi1023073515362, doi1023073515363, doi105281zenodo16238847, dzik1988the, openalexw2055967869, openalexw2598873191, openalexw2754161204"
}

▪ Resumo Os depósitos fósseis que preservam organismos de corpo mole fornecem evidências críticas da história da vida. Geralmente, apenas materiais mais resistentes à decomposição, por exemplo, cutículas, sobrevivem como restos orgânicos como resultado da preservação seletiva e subsequente diagênese em biopolímeros mais resistentes. A permineralização, a permeação dos tecidos por fluidos mineralizantes, pode preservar detalhes notáveis, particularmente de plantas. No entanto, evidências de tecidos mais láveis, por exemplo, músculos, normalmente requerem a replicação de sua morfologia pelo crescimento rápido in situ de minerais, ou seja, mineralização autígena. Este processo depende dos gradientes geoquímicos íngenes gerados por micróbios de decomposição. Os minerais envolvidos e o nível de detalhe preservado (que pode ser subcelular) dependem de uma série de fatores, incluindo a natureza da atividade microbiana e a quantidade de decomposição, disponibilidade de íons e o tipo de organismo que é fossilizado. Compreender esses controles é essencial para determinar as condições que favorecem a preservação excepcional.

@article{briggs2003the,
    author = "Briggs, Derek E.G.",
    title = "The Role of Decay and Mineralization in the Preservation of Soft-Bodied Fossils",
    year = "2003",
    journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
    abstract = "▪ Resumo Os depósitos fósseis que preservam organismos de corpo mole fornecem evidências críticas da história da vida. Geralmente, apenas materiais mais resistentes à decomposição, por exemplo, cutículas, sobrevivem como restos orgânicos como resultado da preservação seletiva e subsequente diagênese em biopolímeros mais resistentes. A permineralização, a permeação dos tecidos por fluidos mineralizantes, pode preservar detalhes notáveis, particularmente de plantas. No entanto, evidências de tecidos mais láveis, por exemplo, músculos, normalmente requerem a replicação de sua morfologia pelo crescimento rápido in situ de minerais, ou seja, mineralização autígena. Este processo depende dos gradientes geoquímicos íngenes gerados por micróbios de decomposição. Os minerais envolvidos e o nível de detalhe preservado (que pode ser subcelular) dependem de uma série de fatores, incluindo a natureza da atividade microbiana e a quantidade de decomposição, disponibilidade de íons e o tipo de organismo que é fossilizado. Compreender esses controles é essencial para determinar as condições que favorecem a preservação excepcional.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.earth.31.100901.144746",
    doi = "10.1146/annurev.earth.31.100901.144746",
    number = "1",
    openalex = "W2125375419",
    pages = "275-301",
    volume = "31",
    references = "allison1988the, briggs1994decay, briggs1996the, doi1010160016703789901919, doi1010160016703794902984, doi101016002532279390147n, doi1010160034666775900056, doi101017s0006323199005472, doi101017s0022336000040026, doi101017s0094837300009994, doi101017s009483730001188x, doi101017s0094837300012082, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19850134, doi101098rstb19930082, doi101111j150239311983tb01993x, doi101126science25951001439, doi101126science28153801173, doi1011300091761319880160149mibbbs23co2, doi1015159781501509247, doi1016660094837320020280155lgatio20co2, doi1023071222284, doi1023073515360, doi1023073515363, doi105860choice284524, doi107208chicago97802261597130010001, openalexw2754161204"
}

Fósseis excepcionalmente preservados e não biomineralizantes contribuem de forma importante para resolver detalhes da explosão cambriana, mas pouco para seus padrões gerais. São identificados seis tipos distintos de "preservação excepcional" para o intervalo terminal Proterozóico-Cambriano, cada um dos quais depende de circunstâncias tafonômicas particulares, tipicamente restritas tanto no espaço quanto no tempo. As vias tafonômicas que resultam em preservação excepcional foram particularmente variáveis durante a transição Proterozóico-Cambriana, pelo menos em parte uma consequência de inovações evolutivas contemporâneas. Combinadas com o registro razoavelmente contínuo de "preservação do tipo Doushantuo" e os registros fundamentalmente mais robustos de fósseis com conchas, cistos de fitoplâncton e fósseis de rastro, essas perturbações tafonômicas contribuem para a documentação de grandes mudanças evolutivas e biogeoquímicas através do terminal Proterozóico e do Cambriano inicial. A apreciação da relação entre a via tafonômica e a expressão fóssil serve como uma ferramenta útil para interpretar fósseis excepcionalmente preservados, frequentemente problemáticos, do Cambriano inicial. Em fácies de xisto, por exemplo, estruturas achatadas não biomineralizantes tipicamente representam os restos de tecidos acelulares e extracelulares resistentes à degradação, como cerdas e cutículas, enquanto a preservação tridimensional representa tecidos celulares labéis com propensão para atrair e precipitar minerais de diagênese inicial. Tal distinção ajuda a identificar o tegumento acuticular dos hiolítidos, a natureza de cerdas dos escleritos de Wiwaxia, o tegumento semelhante a quetognatos de Amiskwia, as glândulas do intestino médio de vários artrópodes do Burgess Shale e a identificação errônea de artrópodes alimentadores de sedimentos na biota de Chengjiang. Pela mesma razão, os lobópodes supostos na biota de Sirius Passet e os deuterostomes supostos na biota de Chengjiang são melhor interpretados como artrópodes.

@article{doi101093icb431166,
    author = "Butterfield, Nicholas J.",
    title = "Preservação Excepcional de Fósseis e a Explosão Cambriana",
    year = "2003",
    journal = "Biologia Integrativa e Comparativa",
    abstract = {Fósseis excepcionalmente preservados e não biomineralizantes contribuem de forma importante para resolver detalhes da explosão cambriana, mas pouco para seus padrões gerais. São identificados seis tipos distintos de "preservação excepcional" para o intervalo terminal Proterozóico-Cambriano, cada um dos quais depende de circunstâncias tafonômicas particulares, tipicamente restritas tanto no espaço quanto no tempo. As vias tafonômicas que resultam em preservação excepcional foram particularmente variáveis durante a transição Proterozóico-Cambriana, pelo menos em parte uma consequência de inovações evolutivas contemporâneas. Combinadas com o registro razoavelmente contínuo de "preservação do tipo Doushantuo" e os registros fundamentalmente mais robustos de fósseis com conchas, cistos de fitoplâncton e fósseis de rastro, essas perturbações tafonômicas contribuem para a documentação de grandes mudanças evolutivas e biogeoquímicas através do terminal Proterozóico e do Cambriano inicial. A apreciação da relação entre a via tafonômica e a expressão fóssil serve como uma ferramenta útil para interpretar fósseis excepcionalmente preservados, frequentemente problemáticos, do Cambriano inicial. Em fácies de xisto, por exemplo, estruturas achatadas não biomineralizantes tipicamente representam os restos de tecidos acelulares e extracelulares resistentes à degradação, como cerdas e cutículas, enquanto a preservação tridimensional representa tecidos celulares labéis com propensão para atrair e precipitar minerais de diagênese inicial. Tal distinção ajuda a identificar o tegumento acuticular dos hiolítidos, a natureza de cerdas dos escleritos de Wiwaxia, o tegumento semelhante a quetognatos de Amiskwia, as glândulas do intestino médio de vários artrópodes do Burgess Shale e a identificação errônea de artrópodes alimentadores de sedimentos na biota de Chengjiang. Pela mesma razão, os lobópodes supostos na biota de Sirius Passet e os deuterostomes supostos na biota de Chengjiang são melhor interpretados como artrópodes.},
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/43.1.166",
    doi = "10.1093/icb/43.1.166",
    openalex = "W2181027699",
    references = "doi101016001670378990191919, doi101017s000632310000548x, doi101017s0094837300009994, doi101017s0094837300012082, doi10103834391, doi10103835318, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19850005, doi101111j1469185x1999tb00046x, doi101111j150239311975tb01311x, doi101111j150239311994tb01558x, doi101111j150239311995tb01587x, doi101111j150239311995tb01591x, doi101126science1066611, doi101126science28153801173, doi1016660094837320000260386bpngns20co2, doi1016660094837320020280155lgatio20co2, doi1023073514743, doi1023073515360, openalexw2326083785, openalexw2754161204, openalexw3127114020, openalexw659399033"
}

O uso de sequências de nucleotídeos e aminoácidos permite uma melhor compreensão do tempo dos eventos evolutivos da vida na Terra. No entanto, as estimativas moleculares de tempos de divergência são controversas e geralmente são muito mais antigas do que sugerido pelo registro fóssil. O número limitado de genes e espécies explorados e as variações pervasivas nas taxas evolutivas são as fontes mais prováveis de tais discrepâncias. Aqui, comparamos sequências concatenadas de aminoácidos de 129 proteínas de 36 eucariotos para determinar os tempos de divergência de vários clados principais, incluindo animais, fungos, plantas e vários protistas. Devido às variações significativas em suas taxas evolutivas e para lidar com a incerteza do registro fóssil, utilizamos um relógio molecular relaxado bayesiano simultaneamente calibrado por seis restrições paleontológicas. Mostramos que, de acordo com intervalos de credibilidade de 95%, os reinos eucarióticos diversificaram-se há 950-1.259 milhões de anos (Mya), os animais divergiram dos coanoflagelados há 761-957 Mya e a idade debatida da divisão entre protostômios e deuterostômios ocorreu há 642-761 Mya. Os tempos de divergência parecem ser robustos em relação às suposições prévias e calibrações paleontológicas. Interessantemente, essas estimativas de tempo de relógio relaxado são muito mais recentes do que aquelas obtidas sob a suposição de um relógio molecular global, embora a diversificação bilateriana pareça ser aproximadamente 100 milhões de anos mais antiga do que a fronteira Cambriana.

@article{doi101073pnas0403984101,
    author = "Douzery, Emmanuel and Snell, Elizabeth A. and Bapteste, Éric and Delsuc, Frédéric and Philippe, Hervé",
    title = "The timing of eukaryotic evolution: Does a relaxed molecular clock reconcile proteins and fossils?",
    year = "2004",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "O uso de sequências de nucleotídeos e aminoácidos permite uma melhor compreensão do tempo dos eventos evolutivos da vida na Terra. No entanto, as estimativas moleculares de tempos de divergência são controversas e geralmente são muito mais antigas do que sugerido pelo registro fóssil. O número limitado de genes e espécies explorados e as variações pervasivas nas taxas evolutivas são as fontes mais prováveis de tais discrepâncias. Aqui, comparamos sequências concatenadas de aminoácidos de 129 proteínas de 36 eucariotos para determinar os tempos de divergência de vários clados principais, incluindo animais, fungos, plantas e vários protistas. Devido às variações significativas em suas taxas evolutivas e para lidar com a incerteza do registro fóssil, utilizamos um relógio molecular relaxado bayesiano simultaneamente calibrado por seis restrições paleontológicas. Mostramos que, de acordo com intervalos de credibilidade de 95%, os reinos eucarióticos diversificaram-se há 950-1.259 milhões de anos (Mya), os animais divergiram dos coanoflagelados há 761-957 Mya e a idade debatida da divisão entre protostômios e deuterostômios ocorreu há 642-761 Mya. Os tempos de divergência parecem ser robustos em relação às suposições prévias e calibrações paleontológicas. Interessantemente, essas estimativas de tempo de relógio relaxado são muito mais recentes do que aquelas obtidas sob a suposição de um relógio molecular global, embora a diversificação bilateriana pareça ser aproximadamente 100 milhões de anos mais antiga do que a fronteira Cambriana.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0403984101",
    doi = "10.1073/pnas.0403984101",
    openalex = "W2059383371",
    references = "doi101016b9781483227344500176, doi10103835083562, doi10103844766, doi101038nrg1020, doi101093bioinformatics133235, doi101093molbevmsh075, doi101093oxfordjournalsmolbeva025731, doi101093oxfordjournalsmolbeva025892, doi101126science1061457, doi101126science1069651, doi101126science147365368, doi101126science28554301033, doi10182618200376494199401"
}

Palavras iniciais.Prefácio.Parte I: Contexto Geológico e Evolutivo da Biota.1. Tempo Geológico e a Evolução da Vida Precoce na Terra.2. Significado Evolutivo da Biota de Chengjiang.3. A Descoberta e Estudo Inicial da Lagerstätte de Chengjiang.4. Distribuição e Contexto Geológico da Lagerstätte de Chengjiang.5. Tafonomia e Preservação dos Fósseis de Chengjiang.6. Paleoecologia da Biota de Chengjiang.Parte II: Fósseis de Chengjiang.7. Algas.8. Filo Porifera.9. Filo Cnidaria.10. Filo Ctenophora.11. Filo Nematomorpha.12. Filo Priapulida.13. Filo Hyolitha.14. Filo Lobopodia.15. Anomalocarididae (Filo Incerto).16. Filo Arthropoda.17. Filo Brachiopoda.18. Filo? Vetulicolia.19. Filo Chordata.20. Animais Enigmáticos.21. Espécies Registradas da Biota de Chengjiang.Referências.Índice

@article{doi105860choice416546,
    title = "The Cambrian fossils of Chengjiang, China: the flowering of early animal life",
    year = "2004",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Palavras iniciais.Prefácio.Parte I: Contexto Geológico e Evolutivo da Biota.1. Tempo Geológico e a Evolução da Vida Precoce na Terra.2. Significado Evolutivo da Biota de Chengjiang.3. A Descoberta e Estudo Inicial da Lagerstätte de Chengjiang.4. Distribuição e Contexto Geológico da Lagerstätte de Chengjiang.5. Tafonomia e Preservação dos Fósseis de Chengjiang.6. Paleoecologia da Biota de Chengjiang.Parte II: Fósseis de Chengjiang.7. Algas.8. Filo Porifera.9. Filo Cnidaria.10. Filo Ctenophora.11. Filo Nematomorpha.12. Filo Priapulida.13. Filo Hyolitha.14. Filo Lobopodia.15. Anomalocarididae (Filo Incerto).16. Filo Arthropoda.17. Filo Brachiopoda.18. Filo? Vetulicolia.19. Filo Chordata.20. Animais Enigmáticos.21. Espécies Registradas da Biota de Chengjiang.Referências.Índice",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.41-6546",
    doi = "10.5860/choice.41-6546",
    openalex = "W1529107977"
}

@article{doi101038nature04890,
    author = "Donoghue, Philip C. J. e Bengtson, Stefan e Dong, Xi-ping e Gostling, Neil J. e Huldtgren, Therese e Cunningham, John A. e Yin, Chongyu e Zhao, Yue e Peng, Fan e Stampanoni, Marco",
    title = "Microscopia tomográfica de raios-X de sincrotrão de embriões fósseis",
    year = "2006",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature04890",
    doi = "10.1038/nature04890",
    openalex = "W2099181563",
    references = "briggs2003the, doi101006dbio20020714, doi101016jgeobios200308001, doi101016jtoxlet200611011, doi10103835318, doi101073pnas250491697, doi101073pnas9794457, doi101111j150239311989tb01679x, doi101126science1099213, doi101126science27753321645, doi102517prpsj771"
}

Este volume ilustrado de 2007 descreve toda a flora e fauna da famosa Formação Crato do Cretáceo Inferior do Brasil - um dos depósitos fósseis mais importantes do mundo, exibindo uma preservação excepcional. Uma ampla gama de invertebrados e vertebrados é abordada, incluindo seções extensas sobre pterossauros e insetos. Dois capítulos são dedicados às plantas. Muitos dos capítulos incluem descrições de novas espécies, re-descrições e avaliações de táxons publicados em lugares obscuras, tornando-os disponíveis para um público mais amplo. As descrições fósseis são apoiadas por explicações detalhadas da história geológica do depósito e de seu contexto tectônico. Baseando-se em expertise de todo o mundo e em espécimes das coleções de museus mais importantes, este livro constitui uma referência essencial para pesquisadores e entusiastas interessados em fósseis do Mesozoico

@book{doi101017cbo9780511535512,
    author = "Martill, David M. and Bechly, Günter and Loveridge, Robert F.",
    title = "The Crato Fossil Beds of Brazil: Window into an Ancient World",
    year = "2007",
    abstract = "Este volume ilustrado de 2007 descreve toda a flora e fauna da famosa Formação Crato do Cretáceo Inferior do Brasil - um dos depósitos fósseis mais importantes do mundo, exibindo uma preservação excepcional. Uma ampla gama de invertebrados e vertebrados é abordada, incluindo seções extensas sobre pterossauros e insetos. Dois capítulos são dedicados às plantas. Muitos dos capítulos incluem descrições de novas espécies, re-descrições e avaliações de táxons publicados em lugares obscuras, tornando-os disponíveis para um público mais amplo. As descrições fósseis são apoiadas por explicações detalhadas da história geológica do depósito e de seu contexto tectônico. Baseando-se em expertise de todo o mundo e em espécimes das coleções de museus mais importantes, este livro constitui uma referência essencial para pesquisadores e entusiastas interessados em fósseis do Mesozoico",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511535512",
    doi = "10.1017/cbo9780511535512",
    openalex = "W1575411947",
    references = "doi101002mmng20010040112, doi1010079783642143977, doi1010160031018279901639, doi101016s0031018203006436, doi101017s0094837300012331, doi10103821872, doi101038292051a0, doi10103831635, doi101038nature01342, doi101038nature01420, doi101038nature02855, doi101038nature03150, doi101038nature03996, doi101046j1365202820010270ex, doi10108002724634199810011114, doi10108002724634199910011201, doi101098rspb20042692, doi101126science23547931156, doi101126science27953581915, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1016660022336020040780989dapftc20co2, doi1018590euscorpius2003vol2003iss111, doi1023071466954, doi1023073223017, doi10560219780801847806, doi105860choice405235, doi105962bhltitle4275, hasiotis1995termite, openalexw1486025919, openalexw1725516486, openalexw1900040508, openalexw193970361, openalexw2242001249, openalexw2786463731"
}

Apesar do enorme potencial das análises de DNA antigo para estudos filogeográficos de populações passadas, o impacto dessas análises, a maioria das quais é realizada com amostras fósseis de coleções de museus de história natural, tem sido limitado em certa medida pela recuperação ineficiente de material genético antigo. Aqui mostramos que as condições de armazenamento padrão e/ou tratamentos de ossos fósseis nessas coleções podem ser prejudiciais à sobrevivência do DNA. Usando uma análise paleogenética quantitativa de 247 ossos fósseis de herbívoros com até 50.000 anos de idade e originários de 60 contextos arqueológicos e paleontológicos diferentes, demonstramos que ossos recém-excavados e não tratados, não lavados, contêm seis vezes mais DNA e produzem o dobro de sequências de DNA autênticas em comparação com ossos tratados com procedimentos padrão. Este efeito foi ainda mais pronunciado com ossos de um sítio neolítico, onde apenas ossos recém-excavados produziram resultados. Finalmente, comparamos o conteúdo de DNA nos ossos fósseis de um animal, um aurochs com aproximadamente 3.200 anos de idade, excavado em duas estações separadas com 57 anos de intervalo. Enquanto os ossos fósseis lavados e armazenados no museu não permitiram qualquer amplificação de DNA, todos os ossos recentemente excavados produziram sequências autênticas de aurochs. Estabelecemos que durante os 57 anos em que os ossos de aurochs foram armazenados em uma coleção, pelo menos tanto DNA amplificável foi perdido quanto durante os 3.200 anos anteriores de sepultamento. Este resultado exige uma revisão do tratamento pós-excavação de ossos fósseis para melhor preservar o patrimônio genético de formas de vida passadas.

@article{doi101073pnas0610257104,
    author = "Pruvost, Mélanie e Schwarz, Reinhard e Correia, Virginia e Champlot, Sophie e Braguier, Séverine e Morel, Nicolás e Fernández–Jalvo, Yolanda e Grange, Thierry e Geigl, Eva-María",
    title = "Ossos fósseis recém-excavados são os melhores para amplificação de DNA antigo",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Apesar do enorme potencial das análises de DNA antigo para estudos filogeográficos de populações passadas, o impacto dessas análises, a maioria das quais é realizada com amostras fósseis de coleções de museus de história natural, tem sido limitado em certa medida pela recuperação ineficiente de material genético antigo. Aqui mostramos que as condições de armazenamento padrão e/ou tratamentos de ossos fósseis nessas coleções podem ser prejudiciais à sobrevivência do DNA. Usando uma análise paleogenética quantitativa de 247 ossos fósseis de herbívoros com até 50.000 anos de idade e originários de 60 contextos arqueológicos e paleontológicos diferentes, demonstramos que ossos recém-excavados e não tratados, não lavados, contêm seis vezes mais DNA e produzem o dobro de sequências de DNA autênticas em comparação com ossos tratados com procedimentos padrão. Este efeito foi ainda mais pronunciado com ossos de um sítio neolítico, onde apenas ossos recém-excavados produziram resultados. Finalmente, comparamos o conteúdo de DNA nos ossos fósseis de um animal, um aurochs com aproximadamente 3.200 anos de idade, excavado em duas estações separadas com 57 anos de intervalo. Enquanto os ossos fósseis lavados e armazenados no museu não permitiram qualquer amplificação de DNA, todos os ossos recentemente excavados produziram sequências autênticas de aurochs. Estabelecemos que durante os 57 anos em que os ossos de aurochs foram armazenados em uma coleção, pelo menos tanto DNA amplificável foi perdido quanto durante os 3.200 anos anteriores de sepultamento. Este resultado exige uma revisão do tratamento pós-excavação de ossos fósseis para melhor preservar o patrimônio genético de formas de vida passadas.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0610257104",
    doi = "10.1073/pnas.0610257104",
    openalex = "W1968608712"
}

Resumo: Os modelos atuais para a preservação excepcional de fósseis do Burgess Shale focaram tanto nas compressões carbonáceas extratáveis por HF quanto nos filmes minerais identificados por mapeamento elementar. A análise BSEM, EDX e de microsonda de Marpolia, Wiwaxia e Burgessia preservados em duas dimensões identifica a presença de filmes tanto carbonáceos quanto aluminossilicatos para a maioria das características, independentemente da labilidade original. À luz do enterramento profundo e do metamorfismo de fácies greenschist documentados para o Burgess Shale, os filmes aluminossilicatos são identificados como produtos de volatilização tardia e mineralização concomitante de fósseis de compressão pré-existentes, enquanto o sistema intestinal-cecal de Burgessia preservado em três dimensões é interpretado como uma substituição aluminossilicática de uma fase carbonática pré-existente. O caso do emplacamento diagênético tardio de minerais aluminossilicatos é suportado pela extensa aluminossilicificação do carapaça de trilobites e (originalmente) veios calcários no Burgess Shale, bem como pela documentação de outros fósseis de compressão secundariamente aluminossilicificados. Ao distinguir a alteração diagênética tardia dos processos diagênicos iniciais responsáveis pela preservação excepcional, é possível conciliar a gama de modos de preservação atualmente expressos no Burgess Shale.

@article{doi101111j14754983200700656x,
    author = "Butterfield, Nicholas J. and Balthasar, Uwe and WILSON, LUCY A.",
    title = "FOSSIL DIAGENESIS IN THE BURGESS SHALE",
    year = "2007",
    journal = "Palaeontology",
    abstract = "Resumo: Os modelos atuais para a preservação excepcional de fósseis do Burgess Shale focaram tanto nas compressões carbonáceas extratáveis por HF quanto nos filmes minerais identificados por mapeamento elementar. A análise BSEM, EDX e de microsonda de Marpolia, Wiwaxia e Burgessia preservados em duas dimensões identifica a presença de filmes tanto carbonáceos quanto aluminossilicatos para a maioria das características, independentemente da labilidade original. À luz do enterramento profundo e do metamorfismo de fácies greenschist documentados para o Burgess Shale, os filmes aluminossilicatos são identificados como produtos de volatilização tardia e mineralização concomitante de fósseis de compressão pré-existentes, enquanto o sistema intestinal-cecal de Burgessia preservado em três dimensões é interpretado como uma substituição aluminossilicática de uma fase carbonática pré-existente. O caso do emplacamento diagênético tardio de minerais aluminossilicatos é suportado pela extensa aluminossilicificação do carapaça de trilobites e (originalmente) veios calcários no Burgess Shale, bem como pela documentação de outros fósseis de compressão secundariamente aluminossilicificados. Ao distinguir a alteração diagênética tardia dos processos diagênicos iniciais responsáveis pela preservação excepcional, é possível conciliar a gama de modos de preservação atualmente expressos no Burgess Shale.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1475-4983.2007.00656.x",
    doi = "10.1111/j.1475-4983.2007.00656.x",
    openalex = "W2035625131",
    references = "briggs1994decay, doi1010079783642878138, doi101016jpalaeo200407034, doi101017s0094837300009994, doi101093icb431166, doi101111j150239311995tb01587x, doi101126science28153801173, doi101130g206401, doi1016660094837320020280155lgatio20co2, doi105281zenodo15992748, doi105860choice284524, openalexw3127114020"
}

Conjuntos de restos mortais de ambientes marinhos marginais contemporâneos esculpidos em depósitos antigos de conchas são compostos por conchas fósseis exumadas por correntes ou marés e conchas derivadas de populações vivas. Uma melhor compreensão do viés produzido por tal processo de mistura é de interesse para estudos que utilizam conjuntos de restos mortais modernos como análogos de habitats passados semelhantes. A fim de avaliar a magnitude do reprocessamento e da redeposição de conchas fósseis em ambientes modernos, foi realizado um estudo taxonômico (composição, abundância e riqueza) e tafonômico (tafofacies) na lagoa costeira Mar Chiquita, Argentina (37°40′S, 57°20′W). A natureza e a extensão do reprocessamento foram exploradas ao longo de um gradiente de energia das marés, desde as áreas externas até as internas da lagoa costeira. Os resultados indicam que os conjuntos de restos mortais modernos na lagoa são compostos principalmente por conchas fósseis (Holoceno tardio) reprocessadas e que o reprocessamento varia ao longo de um gradiente de energia das marés, sendo maior nas áreas externas da lagoa costeira, onde a ação das marés é mais significativa. A mistura temporal na lagoa costeira parece estar associada à condensação (remanié) e não a uma mistura sutil de conchas, como ocorre em depósitos com média temporal. Este processo de reprocessamento leva a uma abundância de conchas antigas nos conjuntos de restos mortais modernos, o que tem consequências negativas para sua utilização como análogos modernos de lagoas passadas. Estudos multidisciplinares envolvendo vários indicadores biológicos precisam levar em consideração este tipo de viés a fim de evitar inferências errôneas sobre a evolução quaternária das lagoas costeiras.

@article{doi102110palo2006p06124r,
    author = "Francesco, Claudio G. De e Hassan, Gabriela S.",
    title = "DOMINÂNCIA DE CONCHAS FÓSSEIS REPROCESSADAS EM AMBIENTES ESTUARINOS MODERNOS: IMPLICAÇÕES PARA RECONSTRUÇÕES PALEOAMBIENTAIS BASEADAS EM RESTOS BIOLÓGICOS",
    year = "2008",
    journal = "Palaios",
    abstract = "Conjuntos de restos mortais de ambientes marinhos marginais contemporâneos esculpidos em depósitos antigos de conchas são compostos por conchas fósseis exumadas por correntes ou marés e conchas derivadas de populações vivas. Uma melhor compreensão do viés produzido por tal processo de mistura é de interesse para estudos que utilizam conjuntos de restos mortais modernos como análogos de habitats passados semelhantes. A fim de avaliar a magnitude do reprocessamento e da redeposição de conchas fósseis em ambientes modernos, foi realizado um estudo taxonômico (composição, abundância e riqueza) e tafonômico (tafofacies) na lagoa costeira Mar Chiquita, Argentina (37°40′S, 57°20′W). A natureza e a extensão do reprocessamento foram exploradas ao longo de um gradiente de energia das marés, desde as áreas externas até as internas da lagoa costeira. Os resultados indicam que os conjuntos de restos mortais modernos na lagoa são compostos principalmente por conchas fósseis (Holoceno tardio) reprocessadas e que o reprocessamento varia ao longo de um gradiente de energia das marés, sendo maior nas áreas externas da lagoa costeira, onde a ação das marés é mais significativa. A mistura temporal na lagoa costeira parece estar associada à condensação (remanié) e não a uma mistura sutil de conchas, como ocorre em depósitos com média temporal. Este processo de reprocessamento leva a uma abundância de conchas antigas nos conjuntos de restos mortais modernos, o que tem consequências negativas para sua utilização como análogos modernos de lagoas passadas. Estudos multidisciplinares envolvendo vários indicadores biológicos precisam levar em consideração este tipo de viés a fim de evitar inferências errôneas sobre a evolução quaternária das lagoas costeiras.",
    url = "https://doi.org/10.2110/palo.2006.p06-124r",
    doi = "10.2110/palo.2006.p06-124r",
    openalex = "W2145345219",
    references = "doi101016001669959180043y, doi101016s001282520300014x"
}

Este estudo trata da formação, tafonomia e preservação de pegadas humanas em tapetes microbianos de ambientes de maré presente. Devido às diferenças no teor de água e na natureza dos tapetes microbianos e do sedimento subjacente, uma ampla gama de morfologias de pegadas foi produzida pelo mesmo criador de rastros. A maioria das pegadas verdadeiras está sujeita a modificações devido a processos tafonômicos, levando a pegadas verdadeiras modificadas. Além da formação de biolaminites, os tapetes microbianos desempenham um papel importante na preservação de pegadas em planícies de maré. Uma pegada pode ser consolidada por dessiccação ou litificação do tapete, ou pelo crescimento contínuo do tapete. Este último processo pode levar à formação de sobrepegadas. Entre as pegadas consolidadas ou (parcialmente) litificadas encontradas em planícies de maré presente, as pegadas verdadeiras pouco definidas, as pegadas verdadeiras modificadas e as sobrepegadas foram as mais frequentemente encontradas, enquanto as pegadas verdadeiras não modificadas e bem definidas são bastante raras. Sugerimos que as pegadas verdadeiras modificadas e as sobrepegadas constituem uma porcentagem importante das pegadas fósseis e que podem ser tão comuns quanto as subpegadas. No entanto, fazer distinções inequívocas entre pegadas verdadeiras pouco definidas, pegadas verdadeiras modificadas, subpegadas e sobrepegadas no registro fóssil permanecerá uma tarefa difícil, o que exige escavação sistemática de pegadas combinada com análise cuidadosa do sedimento envolvente.

@article{doi10108010420940802471027,
    author = "Marty, Daniel e Strasser, André e Meyer, Christian A.",
    title = "Formação e Tafonomia de Pegadas Humanas em Tapetes Microbianos de Ambientes de Maré Presente: Implicações para o Estudo de Pegadas Fósseis",
    year = "2009",
    journal = "Ichnos/Ichnos : uma revista internacional para rastros de plantas e animais",
    abstract = "Este estudo trata da formação, tafonomia e preservação de pegadas humanas em tapetes microbianos de ambientes de maré presente. Devido às diferenças no teor de água e na natureza dos tapetes microbianos e do sedimento subjacente, uma ampla gama de morfologias de pegadas foi produzida pelo mesmo criador de rastros. A maioria das pegadas verdadeiras está sujeita a modificações devido a processos tafonômicos, levando a pegadas verdadeiras modificadas. Além da formação de biolaminites, os tapetes microbianos desempenham um papel importante na preservação de pegadas em planícies de maré. Uma pegada pode ser consolidada por dessiccação ou litificação do tapete, ou pelo crescimento contínuo do tapete. Este último processo pode levar à formação de sobrepegadas. Entre as pegadas consolidadas ou (parcialmente) litificadas encontradas em planícies de maré presente, as pegadas verdadeiras pouco definidas, as pegadas verdadeiras modificadas e as sobrepegadas foram as mais frequentemente encontradas, enquanto as pegadas verdadeiras não modificadas e bem definidas são bastante raras. Sugerimos que as pegadas verdadeiras modificadas e as sobrepegadas constituem uma porcentagem importante das pegadas fósseis e que podem ser tão comuns quanto as subpegadas. No entanto, fazer distinções inequívocas entre pegadas verdadeiras pouco definidas, pegadas verdadeiras modificadas, subpegadas e sobrepegadas no registro fóssil permanecerá uma tarefa difícil, o que exige escavação sistemática de pegadas combinada com análise cuidadosa do sedimento envolvente.",
    url = "https://doi.org/10.1080/10420940802471027",
    doi = "10.1080/10420940802471027",
    openalex = "W2103008101",
    references = "doi1010079789400904095, doi101016jtim200507008, doi10103820167, doi101046j13653091200000284x, doi101111j13653091200400649x, doi101144gslsp20042280106, doi1023073514674, doi1023073514964, doi1023073514973, doi105860choice273305, doi105860choice295709, doi105860choice332752, doi105860choice393984, doi107312lock90868, openalexw114509570, openalexw39955589, openalexw603337959"
}

@article{doi101038nature08745,
    author = "Sansom, Robert S. e Gabbott, Sarah E. e Purnell, Mark A.",
    title = "Decaimento não aleatório de caracteres de cordados causa viés na interpretação fóssil",
    year = "2010",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature08745",
    doi = "10.1038/nature08745",
    openalex = "W1980460712",
    references = "briggs2003the, doi101016jtree200504008, doi101016s0016703799000873, doi101017s0094837300009994, doi101038nature04336, doi101093icb431166, doi1010970000044619570500000033, doi101098rstb20072246, doi101111j146364091997tb00412x, doi101130g24961a1, doi101666061301"
}

@article{doi101038ngeo934,
    author = "Maloof, Adam C. e Rose, Catherine e Beach, Robert e Samuels, Bradley M. e Calmet, Claire e Erwin, Douglas H. e Poirier, Gerald e Yao, Nan e Simons, Frederik J.",
    title = "Possible animal-body fossils in pre-Marinoan limestones from South Australia",
    year = "2010",
    journal = "Nature Geoscience",
    url = "https://doi.org/10.1038/ngeo934",
    doi = "10.1038/ngeo934",
    openalex = "W2105844326",
    references = "briggs2003the, doi10103835318, doi101038nature07673, doi101046j13653091200000003x, doi101126science1107765, doi101128jb17320655865671991, doi101130b256301, doi101130g205191, openalexw2183707334, openalexw2912219260"
}

Nossa capacidade de correlacionar a evolução biológica com as mudanças climáticas, a evolução geológica e outros padrões históricos é essencial para compreender os processos que moldam a biodiversidade. Combinar dados do registro fóssil com a filogenética molecular representa uma abordagem sintética promissora para esse desafio. A primeira análise de datação de divergência molecular (Zuckerkandl e Pauling 1962) baseou-se em uma medida das diferenças de aminoácidos na molécula de hemoglobina, com taxas de substituição estabelecidas (calibradas) usando estimativas de idade paleontológicas de livros didáticos (por exemplo, Dodson 1960). Desde então, a quantidade de dados de sequência molecular aumentou dramaticamente, oferecendo oportunidades cada vez maiores para aplicar abordagens de divergência molecular a problemas fundamentais em biologia evolutiva.

@article{doi101093sysbiosyr107,
    author = "Parham, James F. e Donoghue, Philip C. J. e Bell, Christopher J. e Calway, Tyler e Head, Jason J. e Holroyd, Patricia A. e Inoue, Jun e Irmis, Randall B. e Joyce, Walter G. e Ksepka, Daniel T. e Patané, José Salvatore Leister e Smith, Nathan D. e Tarver, James E. e van Tuinen, Marcel e Yang, Ziheng e Angielczyk, Kenneth D. e Greenwood, Jenny M. e Hipsley, Christy A. e Jacobs, Louis L. e Makovicky, Peter J. e Müller, Johannes e Smith, Krister T. e Theodor, Jessica M. e Warnock, Rachel C. M. e Benton, Michael J.",
    title = "Best Practices for Justifying Fossil Calibrations",
    year = "2011",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "Nossa capacidade de correlacionar a evolução biológica com as mudanças climáticas, a evolução geológica e outros padrões históricos é essencial para compreender os processos que moldam a biodiversidade. Combinar dados do registro fóssil com a filogenética molecular representa uma abordagem sintética promissora para esse desafio. A primeira análise de datação de divergência molecular (Zuckerkandl e Pauling 1962) baseou-se em uma medida das diferenças de aminoácidos na molécula de hemoglobina, com taxas de substituição estabelecidas (calibradas) usando estimativas de idade paleontológicas de livros didáticos (por exemplo, Dodson 1960). Desde então, a quantidade de dados de sequência molecular aumentou dramaticamente, oferecendo oportunidades cada vez maiores para aplicar abordagens de divergência molecular a problemas fundamentais em biologia evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syr107",
    doi = "10.1093/sysbio/syr107",
    openalex = "W2113525598",
    references = "doi101016jepsl200909013, doi101016jgca201006017, doi101016jtig200403007, doi101017cbo9780511536045, doi101038nature08745, doi101093molbevmsj024, doi101093molbevmsl150, doi101093oxfordjournalsmolbeva025892, doi101093sysbio3817, doi101111j00310239200300301x, doi101111j14698137201103794x, doi101126science1101012, doi101126science13334591105, doi1012060003009020073021taoeoa20co2, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpone0009329, doi1023072992432, doi104095215638, openalexw1535663436, openalexw2989049194, openalexw592572837"
}

Neste catálogo, tentamos compilar todos os registros fóssis de Lepidoptera descritos formal ou informalmente na literatura mundial. Foram compilados um total de 667 registros envolvendo pelo menos 4.568 espécimes. Eles incluem descrições de 131 gêneros fósseis e 229 espécies fósseis, bem como 72 gêneros atuais e 21 espécies atuais aos quais alguns desses fósseis supostamente pertencem ou mostram semelhança superficial. São propostos nomes substitutos para dois gêneros fósseis para evitar homonímia: Baltopsyche Sohn, gen. nov. para Palaeopsyche Sobczyk e Kobbert, 2009 e Netoxena Sohn, gen. nov. para Xena Martins-Neto, 1999. Novas combinações genéricas são propostas para: Tortrix? destructus Cockerell, 1916, Tortrix florissantanus Cockerell, 1907, e Tortrix sp. sensu Gravenhorst (1835), todos três para Tortricites Kozlov, 1988; Pterophorus oligocenicus Bigot, Nel e Nel, 1986, para Merrifieldia Tutt, 1905; Aporia sp. sensu Branscheid (1969) para Pierites Heer, 1849; Noctua spp. sensu Hope (1836) e Lomnicki (1894), ambos para Noctuites Heer, 1849. Onze nomes indevidamente propostos para fósseis de lepidópteros são invalidados: Baltonides roeselliformis Skalski in Kosmowska-Ceranowicz e Popiolek, 1981; Baltodines Kupryjanowicz, 2001; Barbarothea Scudder, 1890; Lepidopterites Piton, 1936; Palaeozygaena Reiss, 1936; Psamateia calipsa Martins-Neto, 2002; Saxibatinca meyi Skalski in Kristensen e Skalski, 1998; Spatalistiforma submerga Skalski, 1976; Thanatites juvenalis Scudder, 1875; Tortricibaltia diakonoffi Skalski, 1976; e Zygaenites Reiss, 1936. Uma designação subsequente de tipo desnecessária para Pierites Heer, 1849, é discutida. Um total de 129 registros incluem fósseis de lepidópteros que não podem ser colocados em qualquer rank taxonômico. Existem também pelo menos 25 registros fósseis que carecem de qualquer evidência da suposta associação lepidóptera. Espécimes mal identificados, incluindo 18 gêneros fósseis, 29 espécies fósseis e 12 fósseis não nomeados, são excluídos de Lepidoptera. Todos os fósseis de lepidópteros conhecidos são anotados por tipo fóssil, deposição de espécime, local de escavação, associação com plantas quando presente, e idade geológica. É fornecida uma lista bibliográfica de fósseis de lepidópteros.

@article{doi1011646zootaxa328611,
    author = "Sohn, Jae‐Cheon and Labandeira, Conrad C. and Davis, Donald S. and Mitter, Charles",
    title = "An annotated catalog of fossil and subfossil Lepidoptera (Insecta: Holometabola) of the world",
    year = "2012",
    journal = "Zootaxa",
    abstract = "Neste catálogo, tentamos compilar todos os registros fóssis de Lepidoptera descritos formal ou informalmente na literatura mundial. Foram compilados um total de 667 registros envolvendo pelo menos 4.568 espécimes. Eles incluem descrições de 131 gêneros fósseis e 229 espécies fósseis, bem como 72 gêneros atuais e 21 espécies atuais aos quais alguns desses fósseis supostamente pertencem ou mostram semelhança superficial. São propostos nomes substitutos para dois gêneros fósseis para evitar homonímia: Baltopsyche Sohn, gen. nov. para Palaeopsyche Sobczyk e Kobbert, 2009 e Netoxena Sohn, gen. nov. para Xena Martins-Neto, 1999. Novas combinações genéricas são propostas para: Tortrix? destructus Cockerell, 1916, Tortrix florissantanus Cockerell, 1907, e Tortrix sp. sensu Gravenhorst (1835), todos três para Tortricites Kozlov, 1988; Pterophorus oligocenicus Bigot, Nel e Nel, 1986, para Merrifieldia Tutt, 1905; Aporia sp. sensu Branscheid (1969) para Pierites Heer, 1849; Noctua spp. sensu Hope (1836) e Lomnicki (1894), ambos para Noctuites Heer, 1849. Onze nomes indevidamente propostos para fósseis de lepidópteros são invalidados: Baltonides roeselliformis Skalski in Kosmowska-Ceranowicz e Popiolek, 1981; Baltodines Kupryjanowicz, 2001; Barbarothea Scudder, 1890; Lepidopterites Piton, 1936; Palaeozygaena Reiss, 1936; Psamateia calipsa Martins-Neto, 2002; Saxibatinca meyi Skalski in Kristensen e Skalski, 1998; Spatalistiforma submerga Skalski, 1976; Thanatites juvenalis Scudder, 1875; Tortricibaltia diakonoffi Skalski, 1976; e Zygaenites Reiss, 1936. Uma designação subsequente de tipo desnecessária para Pierites Heer, 1849, é discutida. Um total de 129 registros incluem fósseis de lepidópteros que não podem ser colocados em qualquer rank taxonômico. Existem também pelo menos 25 registros fósseis que carecem de qualquer evidência da suposta associação lepidóptera. Espécimes mal identificados, incluindo 18 gêneros fósseis, 29 espécies fósseis e 12 fósseis não nomeados, são excluídos de Lepidoptera. Todos os fósseis de lepidópteros conhecidos são anotados por tipo fóssil, deposição de espécime, local de escavação, associação com plantas quando presente, e idade geológica. É fornecida uma lista bibliográfica de fósseis de lepidópteros.",
    url = "https://doi.org/10.11646/zootaxa.3286.1.1",
    doi = "10.11646/zootaxa.3286.1.1",
    openalex = "W2131352892",
    references = "doi101016s0031018203006436, doi101071zo9550654, doi103133b71, openalexw3168794770"
}

@incollection{schmierer2013anoxia,
    author = "Schmierer, Bernhard",
    title = "Anóxia",
    year = "2013",
    booktitle = "Encyclopedia of Systems Biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4419-9863-7\_772",
    doi = "10.1007/978-1-4419-9863-7\_772",
    pages = "29-29"
}

@article{doi101016jpalaeo201410013,
    author = "Muscente, A.D. e Hawkins, Andrew D. e Xiao, Shuhai",
    title = "Preservação de fósseis através de fosfatização e silicificação na Formação Doushantuo Ediacarano (China do Sul): uma síntese comparativa",
    year = "2014",
    journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2014.10.013",
    doi = "10.1016/j.palaeo.2014.10.013",
    openalex = "W2040544606",
    references = "briggs1996the, doi101098rstb19850139, doi10166613009, doi102517prpsj771"
}

O filo Ascomycota é, de longe, o maior grupo no reino dos fungos. Associações mutualísticas ecologicamente importantes, como as micorrizas e os líquens, evoluíram neste grupo, sendo consideradas inovações-chave que apoiaram a evolução das plantas terrestres. Apenas algumas tentativas foram feitas para datar a origem das linhagens de Ascomycota usando métodos de relógio molecular, o que se deve principalmente à falta de dados de calibração fóssil satisfatórios. Por essa razão, avaliamos todos os fósseis de ascomicetos mais antigos disponíveis de âmbar (Albiano ao Mioceno) e chert (Devoniano e Maastrichtiano). Os fósseis representam cinco classes principais de ascomicetos (Coniocybomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Laboulbeniomycetes e Lecanoromycetes). Montamos um conjunto de dados multigênico (18SrDNA, 28SrDNA, RPB1 e RPB2) a partir de um total de 145 táxons representando a maioria dos grupos de Ascomycota e utilizamos pontos de calibração fóssil exclusivamente dentro dos ascomicetos para estimar os tempos de divergência das linhagens de Ascomycota com uma abordagem bayesiana. Nossos resultados sugerem uma diversificação inicial dos Pezizomycotina no Ordoviciano, seguida por divisões repetidas de linhagens ao longo do Fanerozoico, e indicam que essa diversificação contínua não foi afetada por extinções em massa. Sugerimos que a diversidade ecológica dentro de cada linhagem garantiu que pelo menos alguns táxons de cada grupo fossem capazes de sobreviver às crises globais e se recuperassem rapidamente.

@article{doi101016jympev201404024,
    author = "Beimforde, Christina e Feldberg, Kathrin e Nylinder, Stephan e Rikkinen, Jouko e Tuovila, Hanna e Dörfelt, Heinrich e Gube, Matthias e Jackson, Daniel J. e Reitner, Joachim e Seyfullah, Leyla J. e Schmidt, Alexander R.",
    title = "Estimando a história fanerozoica das linhagens de Ascomycota: Combinando dados fósseis e moleculares",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    abstract = "O filo Ascomycota é, de longe, o maior grupo no reino dos fungos. Associações mutualísticas ecologicamente importantes, como as micorrizas e os líquens, evoluíram neste grupo, sendo consideradas inovações-chave que apoiaram a evolução das plantas terrestres. Apenas algumas tentativas foram feitas para datar a origem das linhagens de Ascomycota usando métodos de relógio molecular, o que se deve principalmente à falta de dados de calibração fóssil satisfatórios. Por essa razão, avaliamos todos os fósseis de ascomicetos mais antigos disponíveis de âmbar (Albiano ao Mioceno) e chert (Devoniano e Maastrichtiano). Os fósseis representam cinco classes principais de ascomicetos (Coniocybomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Laboulbeniomycetes e Lecanoromycetes). Montamos um conjunto de dados multigênico (18SrDNA, 28SrDNA, RPB1 e RPB2) a partir de um total de 145 táxons representando a maioria dos grupos de Ascomycota e utilizamos pontos de calibração fóssil exclusivamente dentro dos ascomicetos para estimar os tempos de divergência das linhagens de Ascomycota com uma abordagem bayesiana. Nossos resultados sugerem uma diversificação inicial dos Pezizomycotina no Ordoviciano, seguida por divisões repetidas de linhagens ao longo do Fanerozoico, e indicam que essa diversificação contínua não foi afetada por extinções em massa. Sugerimos que a diversidade ecológica dentro de cada linhagem garantiu que pelo menos alguns táxons de cada grupo fossem capazes de sobreviver às crises globais e se recuperassem rapidamente.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.04.024",
    doi = "10.1016/j.ympev.2014.04.024",
    openalex = "W2076419712",
    references = "doi101016s0031018203006436, doi101144sp3396"
}

@article{doi101038ncomms6754,
    author = "Schiffbauer, James D. e Xiao, Shuhai e Cai, Yaoping e Wallace, Adam F. e Hua, Hong e Hunter, Jerry e Xu, Huifang e Peng, Yongbo e Kaufman, Alan J.",
    title = "Um modelo unificador para a preservação excepcional de fósseis do Neoproterozóico–Paleozóico através de piritização e compressão carbonácea",
    year = "2014",
    journal = "Nature Communications",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms6754",
    doi = "10.1038/ncomms6754",
    openalex = "W2090998939",
    references = "doi101016jpalaeo201202009, doi101038nature09038, doi101073pnas1111784109, doi101130g206401, doi101130g24961a1, doi101130g319691"
}

Foram re-analisados vinte fósseis candidatos com alegação de serem o representante mais antigo do Filo Porifera. Três critérios são utilizados para avaliar cada candidato: (i) os critérios diagnósticos necessários para categorizar esponjas no registro fóssil; (ii) a presença, ou ausência, de tais características diagnósticas nos fósseis poríferos supostos; e (iii) as restrições de idade para os fósseis candidatos. Todos os três critérios são críticos para a interpretação correta de qualquer fóssil e sua colocação dentro de um contexto evolutivo. Nossa análise mostra que nenhum candidato fóssil do Precambriano satisfaz ainda todos os três desses critérios para ser um fóssil de esponja confiável. O candidato mais antigo amplamente aceito, hexacts de sílica mongóis de c. 545 milhões de anos atrás (Ma), são aqui mostrados como cristais de arsenopirita cruciformes. Os restos de esponja mais antigos confiáveis são espinhos silicosos da Formação Soltanieh do Cambriano basal (Zona Protohertzina anabarica), Irã, que são descritos e analisados aqui em detalhes pela primeira vez. Extensos recifes de esponjas arqueociáticas emergem e se irradiam até meados do Estágio Fortuniano do Cambriano e demonstram uma montagem gradual de sua estrutura esquelética ao longo desse tempo, coincidente com a evolução de outros grupos metazoários. Como os Porifera são basais nos Metazoa, sua presença no Proterozóico tardio foi amplamente antecipada. A calibração do relógio molecular para os Porifera e Metazoa mais antigos deve agora ser baseada no material hexactinélido iraniano datado de c. 535 Ma. Os restos de fóssil de esponja mais convincentes apareceram por volta do tempo da fronteira Precambriano-Cambriano, associados aos grandes eventos de radiação desse intervalo.

@article{doi101111brv12090,
    author = "Antcliffe, Jonathan B. e Callow, Richard H. T. e Brasier, Martin D.",
    title = "Giving the early fossil record of sponges a squeeze",
    year = "2014",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Foram re-analisados vinte fósseis candidatos com alegação de serem o representante mais antigo do Filo Porifera. Três critérios são utilizados para avaliar cada candidato: (i) os critérios diagnósticos necessários para categorizar esponjas no registro fóssil; (ii) a presença, ou ausência, de tais características diagnósticas nos fósseis poríferos supostos; e (iii) as restrições de idade para os fósseis candidatos. Todos os três critérios são críticos para a interpretação correta de qualquer fóssil e sua colocação dentro de um contexto evolutivo. Nossa análise mostra que nenhum candidato fóssil do Precambriano satisfaz ainda todos os três desses critérios para ser um fóssil de esponja confiável. O candidato mais antigo amplamente aceito, hexacts de sílica mongóis de c. 545 milhões de anos atrás (Ma), são aqui mostrados como cristais de arsenopirita cruciformes. Os restos de esponja mais antigos confiáveis são espinhos silicosos da Formação Soltanieh do Cambriano basal (Zona Protohertzina anabarica), Irã, que são descritos e analisados aqui em detalhes pela primeira vez. Extensos recifes de esponjas arqueociáticas emergem e se irradiam até meados do Estágio Fortuniano do Cambriano e demonstram uma montagem gradual de sua estrutura esquelética ao longo desse tempo, coincidente com a evolução de outros grupos metazoários. Como os Porifera são basais nos Metazoa, sua presença no Proterozóico tardio foi amplamente antecipada. A calibração do relógio molecular para os Porifera e Metazoa mais antigos deve agora ser baseada no material hexactinélido iraniano datado de c. 535 Ma. Os restos de fóssil de esponja mais convincentes apareceram por volta do tempo da fronteira Precambriano-Cambriano, associados aos grandes eventos de radiação desse intervalo.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12090",
    doi = "10.1111/brv.12090",
    openalex = "W2130095841",
    references = "brasier1987microfossils, doi10100797814615074751, doi10100797814899242787, doi101016003192018990263x, doi101016jcub200902052, doi101016jearscirev201303008, doi101016jpalaeo200401022, doi101017s0016756811000720, doi101038416076a, doi101038nature07673, doi101038nature08745, doi101038nature09166, doi10109900207713522297, doi101111j1469185x1999tb00046x, doi101111j14724669201000246x, doi101126science1107765, doi101126science1169514, doi101126science1206375, doi101130b256301, doi101371journalpbio1000602, tiwari1999organicwalled"
}

Novas abordagens analíticas e descobertas estão exigindo novos pensamentos sobre o registro fóssil inicial. O chert de Gunflint de 1,88 Ga fornece um marco importante para a análise da preservação de fósseis iniciais. A análise de alta resolução de Gunflintia mostra que a microtafonomia pode ajudar a resolver questões paleobiológicas de longa data. Reconstruções 3D em nanoescala inovadoras do fóssil complexo mais antigo Eosphaera revelam características até agora sem precedentes em qualquer microrganismo do grupo corona. Embora Eosphaera possa preservar um consórcio simbiótico, uma conclusão mais forte é que o espaço morfológico multicelular foi ocupado de forma diferente no Paleoproterozoico. O chert de Apex de 3,46 Ga fornece um campo de teste para alegações de biogenicidade de estruturas semelhantes a células. Mapeamento combinado com usinagem por feixe de íons focado e dados de microscopia eletrônica de transmissão demonstram que táxons semelhantes a microfósseis, incluindo espécies de Archaeoscillatoriopsis e Primaevifilum, são pseudofósseis formados a partir de grãos filossilicatos vermiformes durante eventos de alteração hidrotermal. A Formação Strelley Pool de 3,43 Ga mostra que candidatos plausíveis a fósseis iniciais estão surgindo em configurações ambientais inesperadas. Nossos dados revelam como aglomerados celulares de coccoides inesperadamente grandes e envelopes tubulares semelhantes a bainhas foram presos entre grãos de areia e enterrados dentro de revestimentos de cimento de sílica de praia de pedra calcária. Estes fósseis vêm do depósito costeiro intertidal a supratidal mais antigo conhecido da Terra, acumulado sob condições aeradas, mas pobres em oxigênio.

@article{doi101073pnas1405338111,
    author = "Brasier, Martin D. e Antcliffe, Jonathan B. e Saunders, Martin e Wacey, David",
    title = "Mudando a imagem dos fósseis mais antigos da Terra (3,5–1,9 Ga) com novas abordagens e novas descobertas",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Novas abordagens analíticas e descobertas estão exigindo novos pensamentos sobre o registro fóssil inicial. O chert de Gunflint de 1,88 Ga fornece um marco importante para a análise da preservação de fósseis iniciais. A análise de alta resolução de Gunflintia mostra que a microtafonomia pode ajudar a resolver questões paleobiológicas de longa data. Reconstruções 3D em nanoescala inovadoras do fóssil complexo mais antigo Eosphaera revelam características até agora sem precedentes em qualquer microrganismo do grupo corona. Embora Eosphaera possa preservar um consórcio simbiótico, uma conclusão mais forte é que o espaço morfológico multicelular foi ocupado de forma diferente no Paleoproterozoico. O chert de Apex de 3,46 Ga fornece um campo de teste para alegações de biogenicidade de estruturas semelhantes a células. Mapeamento combinado com usinagem por feixe de íons focado e dados de microscopia eletrônica de transmissão demonstram que táxons semelhantes a microfósseis, incluindo espécies de Archaeoscillatoriopsis e Primaevifilum, são pseudofósseis formados a partir de grãos filossilicatos vermiformes durante eventos de alteração hidrotermal. A Formação Strelley Pool de 3,43 Ga mostra que candidatos plausíveis a fósseis iniciais estão surgindo em configurações ambientais inesperadas. Nossos dados revelam como aglomerados celulares de coccoides inesperadamente grandes e envelopes tubulares semelhantes a bainhas foram presos entre grãos de areia e enterrados dentro de revestimentos de cimento de sílica de praia de pedra calcária. Estes fósseis vêm do depósito costeiro intertidal a supratidal mais antigo conhecido da Terra, acumulado sob condições aeradas, mas pobres em oxigênio.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1405338111",
    doi = "10.1073/pnas.1405338111",
    openalex = "W2075006569",
    references = "doi101038nature08745"
}

@incollection{yeghiazarians2015anoxia,
    author = "Yeghiazarians, Yerem e Harris, Adrian L. e Ameri, Kurosh",
    title = "Anóxia",
    year = "2015",
    booktitle = "Encyclopedia of Cancer",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-662-46875-3\_292",
    doi = "10.1007/978-3-662-46875-3\_292",
    pages = "249-258"
}

@misc{duffus2016anoxia,
    author = "Duffus, John H. e Nordberg, Monica e Templeton, Douglas M.",
    title = "Anoxia",
    year = "2016",
    booktitle = "Padrões Online da IUPAC",
    url = "https://doi.org/10.1515/iupac.79.0820",
    doi = "10.1515/iupac.79.0820"
}

@misc{templeton2016anoxia,
    author = "Templeton, Douglas M. e Schwenk, Michael e Duffus, John H.",
    title = "Anoxia",
    year = "2016",
    booktitle = "Padrões Online da IUPAC",
    url = "https://doi.org/10.1515/iupac.87.0046",
    doi = "10.1515/iupac.87.0046"
}

Fósseis excepcionalmente preservados são o produto de interações complexas entre processos biológicos e geológicos, incluindo sepultamento, autólise e decomposição microbiana, mineralização autígena, diagênese, metamorfismo e, finalmente, intemperismo e exumação. Determinar quais tecidos são preservados e como os vieses afetam suas vias de preservação é importante para interpretar fósseis em quadros filogenéticos, ecológicos e evolutivos. Embora experimentos de decomposição em laboratório revelem aspectos importantes da fossilização, aplicar os resultados diretamente à interpretação de fósseis excepcionalmente preservados pode negligenciar o impacto de outros processos-chave que removem ou preservam informações morfológicas. Investigações de fósseis que preservam tecidos não biomineralizados sugerem que certas estruturas resistentes à decomposição (por exemplo, o notocorda) raramente são preservadas (mesmo onde componentes carbonáceos sobrevivem), e estruturas propensas à decomposição (por exemplo, sistemas nervosos) podem fossilizar, embora raramente. Como revisamos aqui, a resistência à decomposição é um indicador imperfeito do potencial de fossilização, e uma série de processos biológicos e geológicos explica as características preservadas em fósseis excepcionais.

@article{doi101002bies201700167,
    author = "Parry, Luke A. e Smithwick, Fiann M. e Nordén, Klara K. e Saitta, Evan T. e Lozano-Fernández, Jesús e Tanner, Alastair R. e Caron, Jean‐Bernard e Edgecombe, Gregory D. e Briggs, Derek E. G. e Vinther, Jakob",
    title = "Fósseis de Corpo Macio Não São Simplesmente Cadáveres Apodrecidos – Em Busca de uma Compreensão Holística da Preservação Excepcional de Fósseis",
    year = "2017",
    journal = "BioEssays",
    abstract = "Fósseis excepcionalmente preservados são o produto de interações complexas entre processos biológicos e geológicos, incluindo sepultamento, autólise e decomposição microbiana, mineralização autígena, diagênese, metamorfismo e, finalmente, intemperismo e exumação. Determinar quais tecidos são preservados e como os vieses afetam suas vias de preservação é importante para interpretar fósseis em quadros filogenéticos, ecológicos e evolutivos. Embora experimentos de decomposição em laboratório revelem aspectos importantes da fossilização, aplicar os resultados diretamente à interpretação de fósseis excepcionalmente preservados pode negligenciar o impacto de outros processos-chave que removem ou preservam informações morfológicas. Investigações de fósseis que preservam tecidos não biomineralizados sugerem que certas estruturas resistentes à decomposição (por exemplo, o notocorda) raramente são preservadas (mesmo onde componentes carbonáceos sobrevivem), e estruturas propensas à decomposição (por exemplo, sistemas nervosos) podem fossilizar, embora raramente. Como revisamos aqui, a resistência à decomposição é um indicador imperfeito do potencial de fossilização, e uma série de processos biológicos e geológicos explica as características preservadas em fósseis excepcionais.",
    url = "https://doi.org/10.1002/bies.201700167",
    doi = "10.1002/bies.201700167",
    openalex = "W2768543413",
    references = "briggs1996the, doi101016jcub201606065, doi101038nature04894, doi101038nature12520, doi101038nature13414, doi101038ncomms4210, doi101038ncomms4560, doi101038s415590160022, doi101073pnas1111784109, doi101098rspb20063761, doi101111j1469185x201200220x, doi101111pala12219, doi101130g24961a1, doi10166609147r21, doi102110palo2003p05070r"
}

@misc{crossref2018anoxia,
    title = "Anóxia",
    year = "2018",
    booktitle = "The SAGE Encyclopedia of Intellectual and Developmental Disorders",
    url = "https://doi.org/10.4135/9781483392271.n30",
    doi = "10.4135/9781483392271.n30"
}

@incollection{diamond2018anoxia,
    author = "Diamond, Bruce J.",
    title = "Anóxia",
    year = "2018",
    booktitle = "Enciclopédia de Neuropsicologia Clínica",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-319-56782-2\_2153-3",
    doi = "10.1007/978-3-319-56782-2\_2153-3",
    pages = "1-2"
}

@article{doi101016jearscirev201902020,
    author = "Klompmaker, Adiël A. e Kelley, Patricia H. e Chattopadhyay, Devapriya e Clements, Jeff C. e Huntley, John Warren e Kowalewski, Michał",
    title = "Predação no registro fóssil marinho: Estudos, dados, reconhecimento, fatores ambientais e comportamento",
    year = "2019",
    journal = "Earth-Science Reviews",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2019.02.020",
    doi = "10.1016/j.earscirev.2019.02.020",
    openalex = "W2917611271",
    references = "doi101016001669959180043y, doi1010160195667182900416, doi101016jpalaeo200909010, doi101016jpalwor201104001, doi101016s001282520300014x, doi101080027246342011601714, doi101111j150239312002tb00062x, doi101111pala12042, doi101111pala12254, doi101146annureves10110179001551, doi101371journalpone0052200, morris1979the"
}

A análise de proteínas antigas é um campo de pesquisa em rápido desenvolvimento. Proteínas com idades que variam do Quaternário ao Jurássico estão sendo utilizadas para responder a perguntas sobre filogenia, evolução e extinção. No entanto, essas análises são por vezes controversas e concentram-se principalmente em vertebrados grandes em ambientes de fossilização sedimentar; há poucos estudos sobre a preservação de proteínas em fósseis em âmbar. Aqui mostramos taxas de racemização excepcionalmente lentas durante experimentos de degradação térmica de penas encerradas em resina, em comparação com experimentos anteriores de degradação térmica de casca de ovo de avestruz, esqueleto de coral e concha de limpet. Também recuperamos ácidos amino de dois espécimes de penas fósseis em âmbar. As composições de ácidos amino são amplamente semelhantes às de penas degradadas, mas as concentrações são muito baixas, sugerindo que grande parte da proteína original foi degradada e perdida. Altos níveis de racemização em ácidos amino mais apolares e de racemização lenta sugerem que alguns dos ácidos amino eram antigos e, portanto, originais. Nossas descobertas indicam que o ambiente de fossilização único dentro do âmbar mostra potencial para a recuperação de ácidos amino e proteínas antigas.

@article{doi101038s41598019429389,
    author = "McCoy, Victoria E. e Gabbott, Sarah E. e Penkman, Kirsty e Collins, Matthew J. e Presslee, Samantha e Holt, J. W. e Grossman, Harrison e Wáng, Bó e Solórzano‐Kraemer, Mónica M. e Delclòs, Xavier e Peñalver, Enrique",
    title = "Ácidos amino antigos de penas fósseis em âmbar",
    year = "2019",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "A análise de proteínas antigas é um campo de pesquisa em rápido desenvolvimento. Proteínas com idades que variam do Quaternário ao Jurássico estão sendo utilizadas para responder a perguntas sobre filogenia, evolução e extinção. No entanto, essas análises são por vezes controversas e concentram-se principalmente em vertebrados grandes em ambientes de fossilização sedimentar; há poucos estudos sobre a preservação de proteínas em fósseis em âmbar. Aqui mostramos taxas de racemização excepcionalmente lentas durante experimentos de degradação térmica de penas encerradas em resina, em comparação com experimentos anteriores de degradação térmica de casca de ovo de avestruz, esqueleto de coral e concha de limpet. Também recuperamos ácidos amino de dois espécimes de penas fósseis em âmbar. As composições de ácidos amino são amplamente semelhantes às de penas degradadas, mas as concentrações são muito baixas, sugerindo que grande parte da proteína original foi degradada e perdida. Altos níveis de racemização em ácidos amino mais apolares e de racemização lenta sugerem que alguns dos ácidos amino eram antigos e, portanto, originais. Nossas descobertas indicam que o ambiente de fossilização único dentro do âmbar mostra potencial para a recuperação de ácidos amino e proteínas antigas.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-019-42938-9",
    doi = "10.1038/s41598-019-42938-9",
    openalex = "W2941236146",
    references = "doi101016s0031018203006436, doi101038nature14249"
}

Os Lagerstätten fósseis do tipo Burgess Shale fornecem as melhores evidências para decifrar os padrões bióticos e a magnitude da explosão cambriana. Aqui, relatamos um Lagerstätte da China do Sul, a biota de Qingjiang (~518 milhões de anos), que é dominada por táxons de corpo mole de um ambiente de plataforma distal. A biota de Qingjiang distingue-se pela preservação carbonácea imaculada de características orgânicas labéis, uma proporção muito alta de novos táxons (~53%) e diversidade taxonômica preliminar que sugere que ela poderia rivalizar com as biotas de Chengjiang e Burgess Shale. Aspectos definidores da biota de Qingjiang incluem uma alta abundância de cnidários, incluindo formas medusoide e polipoide; novos táxons semelhantes a cinorinques existentes; e formas larvais ou juvenis abundantes. Esta composição distinta oferece perspectivas para fornecer insights sobre a evolução dos ecossistemas cambrianos através de gradientes ambientais.

@article{doi101126scienceaau8800,
    author = "Fu, Dongjing e Tong, Guanghui e Dai, Tao e Liu, Wei e Yang, Yuning e Zhang, Yuan e Cui, Linhao e Li, Luoyang e Yun, Hao e Wu, Yu e Sun, Ao e Liu, Cong e Pei, Wenrui e Gaines, Robert R. e Zhang, Xingliang",
    title = "A biota de Qingjiang—Um Lagerstätte fóssil do tipo Burgess Shale do Cambriano inferior da China do Sul",
    year = "2019",
    journal = "Science",
    abstract = "Os Lagerstätten fósseis do tipo Burgess Shale fornecem as melhores evidências para decifrar os padrões bióticos e a magnitude da explosão cambriana. Aqui, relatamos um Lagerstätte da China do Sul, a biota de Qingjiang (\textasciitilde 518 milhões de anos), que é dominada por táxons de corpo mole de um ambiente de plataforma distal. A biota de Qingjiang distingue-se pela preservação carbonácea imaculada de características orgânicas labéis, uma proporção muito alta de novos táxons (\textasciitilde 53\%), e diversidade taxonômica preliminar que sugere que ela poderia rivalizar com as biotas de Chengjiang e Burgess Shale. Aspectos definidores da biota de Qingjiang incluem uma alta abundância de cnidários, incluindo formas medusoide e polipoide; novos táxons semelhantes a cinorinques existentes; e formas larvais ou juvenis abundantes. Esta composição distinta oferece perspectivas para fornecer insights sobre a evolução dos ecossistemas cambrianos através de gradientes ambientais.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aau8800",
    doi = "10.1126/science.aau8800",
    openalex = "W2923733494",
    references = "doi1010029781118896372, doi101007s114340140419y, doi1010160016703795000382, doi101016b9780444594259000196, doi101016jearscirev201707017, doi101016jpalwor201510001, doi101017s108933260000276x, doi101038nature11874, doi101038ncomms4210, doi101073pnas1111784109, doi101073pnas1719962115, doi101111j14754983200700656x, doi101130g24961a1, doi101144jgs1582211, doi101144jgs2015083, doi10166612056, doi102110palo2009p09004r"
}

@misc{crossrefNoneanoxia,
    title = "Anóxia",
    year = "None",
    booktitle = "SpringerReference",
    url = "https://doi.org/10.1007/springerreference\_179680",
    doi = "10.1007/springerreference\_179680"
}