Cocais

@article{lutz1971osmotic,
    author = "LUTZ, PETER L. e ROBERTSON, JAMES D.",
    title = "CONSTITUINTES OSMÓTICOS DO COELACANTHO LATIMERIA CHALUMNAE SMITH",
    year = "1971",
    journal = "The Biological Bulletin",
    url = "https://doi.org/10.2307/1540268",
    doi = "10.2307/1540268",
    number = "3",
    openalex = "W2292291155",
    pages = "553-560",
    volume = "141",
    references = "doi1010160010406x6992091x, doi101038161583a0, doi101042bj0580426, doi101088095076713210302, doi1023071441916, doi105694j132653771956tb56924x, doi105962bhltitle6856, openalexw2170405949, openalexw590803689"
}

Resumo Os constituintes inorgânicos e orgânicos foram estudados no soro sanguíneo coletado de um espécime vivo de celacanto, Latimeria chalumnae. Os eletrólitos inorgânicos determinados incluíram sódio (196,7 mM/l), potássio (5,78 mM/l), magnésio (5,30 mM/l), cálcio (4,94 mM/l), cloreto (186,7 mM/l), bicarbonato (9,60 mM/l), fosfato (5,08 mM/l) e sulfato (4,80 mM/l). A ureia sérica (377 mM/l) e a óxido de trimetilamina (122 mM/l) estavam elevadas, conforme relatado anteriormente, e representaram a maior parte do nitrogênio não proteico total (1199 mg%); os aminoácidos totais adicionaram uma fração pequena, mas não insignificante (21,9 mg%). Os níveis séricos de lactato (16,5 mM/l) e glicose (6,57 mM/l) provavelmente eram indicativos de estresse; a glicose era o único carboidrato presente em quantidades apreciáveis no soro, embora traços de ácido glucurônico e ramnose tenham sido encontrados. O colesterol total sérico foi de 3,91 mM/l, o fósforo organicamente ligado 1,99 mM/l e as proteínas totais 2,84 g%. Três frações proteicas principais foram evidentes da eletroforese em acetato de celulose e pelo menos 11 picos foram demonstráveis por eletroforese em gel de acrilamida. O soro de Latimeria carece de um componente proteico com mobilidade próxima à da albumina sérica humana. A osmolaridade sérica (932 mOsm/l) era um pouco menor que a da água do mar coletada no local de captura do espécime (1035 mOsm/l). As implicações evolutivas da semelhança da química sérica de Latimeria com a de outros peixes marinhos são discutidas.

@article{doi101002jez1401870111,
    author = "Griffith, Robert W. and Umminger, Bruce L. and Grant, Blake F. and Pang, Peter K.T. and Pickford, Grace E.",
    title = "Composição do soro do celacanto, Latimeria chalumnae Smith",
    year = "1974",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Resumo Os constituintes inorgânicos e orgânicos foram estudados no soro sanguíneo coletado de um espécime vivo de celacanto, Latimeria chalumnae. Os eletrólitos inorgânicos determinados incluíram sódio (196,7 mM/l), potássio (5,78 mM/l), magnésio (5,30 mM/l), cálcio (4,94 mM/l), cloreto (186,7 mM/l), bicarbonato (9,60 mM/l), fosfato (5,08 mM/l) e sulfato (4,80 mM/l). A ureia sérica (377 mM/l) e a óxido de trimetilamina (122 mM/l) estavam elevadas, conforme relatado anteriormente, e representaram a maior parte do nitrogênio não proteico total (1199 mg\%); os aminoácidos totais adicionaram uma fração pequena, mas não insignificante (21,9 mg\%). Os níveis séricos de lactato (16,5 mM/l) e glicose (6,57 mM/l) provavelmente eram indicativos de estresse; a glicose era o único carboidrato presente em quantidades apreciáveis no soro, embora traços de ácido glucurônico e ramnose tenham sido encontrados. O colesterol total sérico foi de 3,91 mM/l, o fósforo organicamente ligado 1,99 mM/l e as proteínas totais 2,84 g\%. Três frações proteicas principais foram evidentes da eletroforese em acetato de celulose e pelo menos 11 picos foram demonstráveis por eletroforese em gel de acrilamida. O soro de Latimeria carece de um componente proteico com mobilidade próxima à da albumina sérica humana. A osmolaridade sérica (932 mOsm/l) era um pouco menor que a da água do mar coletada no local de captura do espécime (1035 mOsm/l). As implicações evolutivas da semelhança da química sérica de Latimeria com a de outros peixes marinhos são discutidas.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.1401870111",
    doi = "10.1002/jez.1401870111",
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O fluido do canal notocordal do celacanto, Latimeria chalumnae, foi analisado para constituintes inorgânicos e orgânicos principais e comparado com soro sanguíneo do mesmo peixe. Níveis significativamente ou sugestivamente menores de sódio, magnésio, cálcio, bicarbonato, sulfato, carboidratos totais, glicose, lactato, colesterol, fosfato ligado e proteínas totais foram encontrados no fluido notocordal em comparação com o soro, enquanto potássio, cloreto, ureia, óxido de trimetilamina e aminoácidos livres totais foram maiores e o fósforo inorgânico essencialmente idêntico. A osmolaridade do fluido notocordal (1058 mOsm) excede a do soro (942 mOsm). Um precipitado branco no fluido consistia em uma matriz de fibras de 100 A de diâmetro e de comprimento indefinido. Assemelhou-se a uma sialoglicoproteína em composição e foi estabilizada por ligações dissulfeto. O fluido continua detritos celulares.

@article{doi101002jez1401920206,
    author = "Griffith, Robert W. e Mathews, Martin B. e Umminger, Bruce L. e Grant, Blake F. e Pang, Peter K.T. e Thomson, Keith Stewart e Pickford, Grace E.",
    title = "Composição do fluido do canal notocordal do celacanto, Latimeria chalumnae",
    year = "1975",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "O fluido do canal notocordal do celacanto, Latimeria chalumnae, foi analisado para constituintes inorgânicos e orgânicos principais e comparado com soro sanguíneo do mesmo peixe. Níveis significativamente ou sugestivamente menores de sódio, magnésio, cálcio, bicarbonato, sulfato, carboidratos totais, glicose, lactato, colesterol, fosfato ligado e proteínas totais foram encontrados no fluido notocordal em comparação com o soro, enquanto potássio, cloreto, ureia, óxido de trimetilamina e aminoácidos livres totais foram maiores e o fósforo inorgânico essencialmente idêntico. A osmolaridade do fluido notocordal (1058 mOsm) excede a do soro (942 mOsm). Um precipitado branco no fluido consistia em uma matriz de fibras de 100 A de diâmetro e de comprimento indefinido. Assemelhou-se a uma sialoglicoproteína em composição e foi estabilizada por ligações dissulfeto. O fluido continha detritos celulares.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.1401920206",
    doi = "10.1002/jez.1401920206",
    openalex = "W2038295841",
    references = "cole1973intraocular, doi101016s0021925818722801, doi101016s0021925818767999, doi101016s0021925818838248, doi101016s0021925818943334, doi101016s1546509808600825, doi101017s0025315400005750, doi101017s0025315400018105, doi101038237175a0, doi1010970000505319311100000026, doi101111j1469185x1969tb00823x, doi107326000348196136071"
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@article{lagios1975the,
    author = "Lagios, Michael D.",
    title = "A glândula pituitária do celacanto Latimeria chalumnae Smith",
    year = "1975",
    journal = "Endocrinologia Geral e Comparada",
    url = "https://doi.org/10.1016/0016-6480(75)90184-7",
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    number = "2",
    openalex = "W1998564185",
    pages = "126-146",
    volume = "25",
    references = "doi1010079783642866593, doi1010160016648068900865, doi1010160016648075902014, doi101016s1546509808600965, doi101038237175a0, doi101111j1469185x1969tb00823x, doi1023072412482, griffith1974serum, openalexw251296685, openalexw563680134"
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Resumo O coelacanto, Latimeria chalumnae, possui uma química sanguínea quase idêntica à dos peixes elasmobrânquios e contrasta com a dos peixes ósseos e tetrápodes. Especialmente notável é a retenção de altas concentrações de ureia (377 mM) e de óxido de trimetilamina (122 mM), que ajudam a elevar a osmolaridade sanguínea (942 mosm/I) para perto da do ambiente de água do mar. Essas características também caracterizam outros fluidos corporais do coelacanto, como o fluido notocordal, os humores aquoso e vítreo, o fluido ventricular, o fluido celômico e a bile. Os tecidos de Latimeria, como o músculo, também são caracterizados por altas concentrações de ureia. O equilíbrio osmótico entre fluidos extracelulares e tecidos parece ser alcançado pela presença de níveis muito altos de óxido de trimetilamina nos tecidos (ca. 300 mmol/(kg H2O)), que contrabalançam as baixas concentrações de íons encontradas nos tecidos. A função renal em Latimeria parece envolver a eliminação seletiva de certos íons divalentes (magnésio, fosfato e sulfato) e de substâncias orgânicas (glucuronato, creatina e alguns aminoácidos). Diferente de outros peixes ureosmóticos, o coelacanto não possui a capacidade renal de reabsorver ureia. Evidências sugerem que a glândula retal, estruturalmente muito semelhante àquelas dos condrictíneos, funciona para excretar excesso de cloreto de sódio. Como a osmolaridade sanguínea de Latimeria é um pouco menor que a da água do mar (942 cf. 1026 mosm/l), ela está em balanço negativo de água. Algumas evidências sugerem que isso é superado pela ingestão de água do mar de uma maneira semelhante à dos teleósteos. A questão de saber se a regulação ureosmótica é homóloga em Latimeria e nos condrictíneos é debatível, embora favoreçamos a possibilidade de que ela tenha sido adquirida independentemente pelos seguintes motivos. (1) A reabsorção renal de ureia está ausente em Latimeria, embora seja crucial para a regulação ureosmótica nos condrictíneos. (2) A fecundação interna e o desenvolvimento são concomitantes necessários da regulação ureosmótica em peixes e a fecundação interna nos dois grupos é alcançada por mecanismos não homólogos. (3) A regulação ureosmótica evoluiu independentemente em um terceiro grupo de vertebrados, o anfíbio eurialino Rana cancrivora.

@article{doi101098rspb19800054,
    author = "Griffith, Robert W.",
    title = "Chemistry of the body fluids of the coelacanth, Latimeria chalumnae",
    year = "1980",
    journal = "Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences",
    abstract = "Resumo O coelacanto, Latimeria chalumnae, possui uma química sanguínea quase idêntica à dos peixes elasmobrânquios e contrasta com a dos peixes ósseos e tetrápodes. Especialmente notável é a retenção de altas concentrações de ureia (377 mM) e de óxido de trimetilamina (122 mM), que ajudam a elevar a osmolaridade sanguínea (942 mosm/I) para perto da do ambiente de água do mar. Essas características também caracterizam outros fluidos corporais do coelacanto, como o fluido notocordal, os humores aquoso e vítreo, o fluido ventricular, o fluido celômico e a bile. Os tecidos de Latimeria, como o músculo, também são caracterizados por altas concentrações de ureia. O equilíbrio osmótico entre fluidos extracelulares e tecidos parece ser alcançado pela presença de níveis muito altos de óxido de trimetilamina nos tecidos (ca. 300 mmol/(kg H2O)), que contrabalançam as baixas concentrações de íons encontradas nos tecidos. A função renal em Latimeria parece envolver a eliminação seletiva de certos íons divalentes (magnésio, fosfato e sulfato) e de substâncias orgânicas (glucuronato, creatina e alguns aminoácidos). Diferente de outros peixes ureosmóticos, o coelacanto não possui a capacidade renal de reabsorver ureia. Evidências sugerem que a glândula retal, estruturalmente muito semelhante àquelas dos condrictíneos, funciona para excretar excesso de cloreto de sódio. Como a osmolaridade sanguínea de Latimeria é um pouco menor que a da água do mar (942 cf. 1026 mosm/l), ela está em balanço negativo de água. Algumas evidências sugerem que isso é superado pela ingestão de água do mar de uma maneira semelhante à dos teleósteos. A questão de saber se a regulação ureosmótica é homóloga em Latimeria e nos condrictíneos é debatível, embora favoreçamos a possibilidade de que ela tenha sido adquirida independentemente pelos seguintes motivos. (1) A reabsorção renal de ureia está ausente em Latimeria, embora seja crucial para a regulação ureosmótica nos condrictíneos. (2) A fecundação interna e o desenvolvimento são concomitantes necessários da regulação ureosmótica em peixes e a fecundação interna nos dois grupos é alcançada por mecanismos não homólogos. (3) A regulação ureosmótica evoluiu independentemente em um terceiro grupo de vertebrados, o anfíbio eurialino Rana cancrivora.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.1980.0054",
    doi = "10.1098/rspb.1980.0054",
    openalex = "W2010533513",
    references = "cole1973intraocular, doi101016s1546509808600825, doi101093icb172365, doi101111j1469185x1936tb00497x, doi101111j1469185x1967tb01528x, doi101126science1313401670, doi101152ajplegacy1930932480, doi101152ajplegacy19762304925, doi101242jeb383659, doi1023072412985, doi1024448ethz1890, hamoir1973muscle"
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@incollection{doi101007978940113194027,
    author = "Bruton, Michael N. e Coutouvidis, Sheila E. e Pote, Jean",
    title = "Bibliografia do coelacante vivo Latimeria chalumnae, com comentários sobre tendências de publicação",
    year = "1991",
    booktitle = "Desenvolvimentos na biologia ambiental de peixes",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-011-3194-0\_27",
    doi = "10.1007/978-94-011-3194-0\_27",
    openalex = "W4253917218",
    references = "chavin1972thyroid, cole1973intraocular, dingerkus1978the, doi1010079783642828584, doi1010160047248488900693, doi1010160169534789901626, doi101042bj1830317, doi101139f75110, doi1023071438971, doi1023071539358, doi1023072412482, doi1023072413058, hamoir1973muscle"
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@article{doi101007bf00007469,
    author = "Bruton, Michael N. e Coutouvidis, Sheila E. e Pote, Jean",
    title = "Bibliografia do celacanto vivo Latimeria chalumnae, com comentários sobre tendências de publicação",
    year = "1991",
    journal = "Environmental Biology of Fishes",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00007469",
    doi = "10.1007/bf00007469",
    openalex = "W2014018754",
    references = "chavin1972thyroid, cole1973intraocular, dingerkus1978the, doi1010079783642828584, doi101007bf00007469, doi1010160300962985908965, doi101042bj1830317, doi101139f75110, doi1023071437499, doi1023071539358, doi1023072412482, doi1023072413058, doi1023072413259, hamoir1973muscle, kihira1984bile"
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FUNDO: Os hormônios neurohipofisários dos mamíferos, a vasopressina e a ocitocina, estão envolvidos na osmoregulação e na contração do músculo liso uterino, respectivamente. Todos os vertebrados com mandíbula contêm pelo menos um homólogo de cada um da vasopressina e da ocitocina, enquanto os vertebrados sem mandíbula contêm um único hormônio neurohipofisário chamado vasotocina. O homólogo da vasopressina em vertebrados não mamíferos é a vasotocina; e o homólogo da ocitocina é a mesotocina em tetrápodes não euterianos, mesotocina e [Phe2]mesotocina em peixes pulmonados, e isotocina em peixes de escamas raiadas. Os genes que codificam os genes da vasopressina e da ocitocina estão estreitamente ligados nos genomas humano e de roedores em uma orientação de cauda para cauda. Em contraste, seus homólogos em peixe-porco-espinho (vasotocina e isotocina) estão localizados no mesmo filamento de DNA, com o gene da isotocina localizado a montante do gene da vasotocina, separados por cinco genes, sugerindo que este locus experimentou rearranjos em linhagem de mamíferos ou de peixes de escamas raiadas, ou em ambas as linhagens. Os coelacantos ocupam uma posição filogenética única próxima à divergência das linhagens de mamíferos e de peixes de escamas raiadas. RESULTADOS: Sequenciamos um clone BAC de coelacanto (Latimeria menadoensis) que abrange os genes dos hormônios neurohipofisários e investigamos a história evolutiva do locus do gene do hormônio neurohipofisário dos vertebrados dentro de um framework de genômica comparativa. O coelacanto contém genes de vasotocina e mesotocina, como os tetrápodes não mamíferos. Os genes do coelacanto estão presentes no mesmo filamento de DNA, sem genes intercalados, com o gene da vasotocina localizado a montante do gene da mesotocina. As sequências de nucleotídeos dos segundos éxons dos dois genes estão sob seleção purificadora, implicando uma função regulatória. Também analisamos o locus do gene do hormônio neurohipofisário nos genomas de gambá, galinha e Xenopus tropicalis. O gambá contém duas cópias tandem de genes de vasopressina e mesotocina. Os genes de vasotocina e mesotocina em galinha e Xenopus, e os genes de vasopressina e mesotocina no gambá, estão ligados de cauda para cabeça, semelhantes aos seus ortólogos em coelacanto e diferentes de seus homólogos em humanos e roedores. CONCLUSÃO: Nossos resultados indicam que o locus do gene do hormônio neurohipofisário experimentou rearranjos independentes tanto em mamíferos placentários quanto em peixes teleósteos. O genoma do coelacanto parece ser mais estável do que os genomas de mamíferos e peixes teleósteos. Assim, ele serve como um grupo externo valioso para estudar a evolução dos genomas de mamíferos e peixes teleósteos.

@article{doi10118614712148893,
    author = "Gwee, Pai-Chung and Amemiya, Chris T. and Brenner, Sydney and Venkatesh, Byrappa",
    title = "Sequence and organization of coelacanth neurohypophysial hormone genes: Evolutionary history of the vertebrate neurohypophysial hormone gene locus",
    year = "2008",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    abstract = "FUNDO: Os hormônios neurohipofisários dos mamíferos, a vasopressina e a ocitocina, estão envolvidos na osmoregulação e na contração do músculo liso uterino, respectivamente. Todos os vertebrados com mandíbula contêm pelo menos um homólogo de cada um da vasopressina e da ocitocina, enquanto os vertebrados sem mandíbula contêm um único hormônio neurohipofisário chamado vasotocina. O homólogo da vasopressina em vertebrados não mamíferos é a vasotocina; e o homólogo da ocitocina é a mesotocina em tetrápodes não euterianos, mesotocina e [Phe2]mesotocina em peixes pulmonados, e isotocina em peixes de escamas raiadas. Os genes que codificam os genes da vasopressina e da ocitocina estão estreitamente ligados nos genomas humano e de roedores em uma orientação de cauda para cauda. Em contraste, seus homólogos em peixe-porco-espinho (vasotocina e isotocina) estão localizados no mesmo filamento de DNA, com o gene da isotocina localizado a montante do gene da vasotocina, separados por cinco genes, sugerindo que este locus experimentou rearranjos em linhagem de mamíferos ou de peixes de escamas raiadas, ou em ambas as linhagens. Os coelacantos ocupam uma posição filogenética única próxima à divergência das linhagens de mamíferos e de peixes de escamas raiadas. RESULTADOS: Sequenciamos um clone BAC de coelacanto (Latimeria menadoensis) que abrange os genes dos hormônios neurohipofisários e investigamos a história evolutiva do locus do gene do hormônio neurohipofisário dos vertebrados dentro de um framework de genômica comparativa. O coelacanto contém genes de vasotocina e mesotocina, como os tetrápodes não mamíferos. Os genes do coelacanto estão presentes no mesmo filamento de DNA, sem genes intercalados, com o gene da vasotocina localizado a montante do gene da mesotocina. As sequências de nucleotídeos dos segundos éxons dos dois genes estão sob seleção purificadora, implicando uma função regulatória. Também analisamos o locus do gene do hormônio neurohipofisário nos genomas de gambá, galinha e Xenopus tropicalis. O gambá contém duas cópias tandem de genes de vasopressina e mesotocina. Os genes de vasotocina e mesotocina em galinha e Xenopus, e os genes de vasopressina e mesotocina no gambá, estão ligados de cauda para cabeça, semelhantes aos seus ortólogos em coelacanto e diferentes de seus homólogos em humanos e roedores. CONCLUSÃO: Nossos resultados indicam que o locus do gene do hormônio neurohipofisário experimentou rearranjos independentes tanto em mamíferos placentários quanto em peixes teleósteos. O genoma do coelacanto parece ser mais estável do que os genomas de mamíferos e peixes teleósteos. Assim, ele serve como um grupo externo valioso para estudar a evolução dos genomas de mamíferos e peixes teleósteos.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1471-2148-8-93",
    doi = "10.1186/1471-2148-8-93",
    openalex = "W2098940871",
    references = "doi101016jcell200412035, doi101016s0021925817392360, doi101016s0168952503001161, doi101038nature04696, doi101073pnas0400609101, doi101093nar25244876, doi101126science1073774, doi101152physrev2001812629, doi101159000073702, openalexw164690857"
}

@misc{crossref2009coelacanths,
    title = "Coelacanthes",
    year = "2009",
    booktitle = "Encyclopedia of Time: Ciência, Filosofia, Teologia, \& Cultura",
    url = "https://doi.org/10.4135/9781412963961.n99",
    doi = "10.4135/9781412963961.n99",
    openalex = "W4230651611"
}

Uma série de estudos recentes sobre celacantos existentes tem enfatizado a lenta taxa de evolução molecular e morfológica nessas espécies. Esses estudos basearam-se na premissa de que um celacanto é um 'fóssil vivo' que mostrou pouca mudança morfológica desde o Devoniano, e propuseram um vínculo causal entre a baixa taxa de evolução molecular e a estase morfológica. Aqui, examinamos os dados moleculares e morfológicos disponíveis e mostramos que: (i) a baixa diversidade molecular intra-específica não implica baixa taxa de mutação, (ii) estudos que não mostram baixas taxas de substituição em celacantos são frequentemente negligenciados, (iii) a estabilidade morfológica dos celacantos não é apoiada por evidências paleontológicas. Lembramos que os níveis de diversidade molecular intra-especie, as taxas de divergência genômica inter-especie e as taxas de divergência morfológica estão sob diferentes restrições e não são necessariamente correlacionadas. Finalmente, enfatizamos que conceitos como 'fóssil vivo', 'linha basal' ou 'espécie existente primitiva' não fazem sentido sob uma perspectiva de pensamento em árvore.

@article{doi101002bies201200145,
    author = "Casañe, Didier e Laurenti, Patrick",
    title = "Por que os celacantos não são 'fósseis vivos'",
    year = "2013",
    journal = "BioEssays",
    abstract = "Uma série de estudos recentes sobre celacantos existentes tem enfatizado a lenta taxa de evolução molecular e morfológica nessas espécies. Esses estudos basearam-se na premissa de que um celacanto é um 'fóssil vivo' que mostrou pouca mudança morfológica desde o Devoniano, e propuseram um vínculo causal entre a baixa taxa de evolução molecular e a estase morfológica. Aqui, examinamos os dados moleculares e morfológicos disponíveis e mostramos que: (i) a baixa diversidade molecular intra-específica não implica baixa taxa de mutação, (ii) estudos que não mostram baixas taxas de substituição em celacantos são frequentemente negligenciados, (iii) a estabilidade morfológica dos celacantos não é apoiada por evidências paleontológicas. Lembramos que os níveis de diversidade molecular intra-especie, as taxas de divergência genômica inter-especie e as taxas de divergência morfológica estão sob diferentes restrições e não são necessariamente correlacionadas. Finalmente, enfatizamos que conceitos como 'fóssil vivo', 'linha basal' ou 'espécie existente primitiva' não fazem sentido sob uma perspectiva de pensamento em árvore.",
    url = "https://doi.org/10.1002/bies.201200145",
    doi = "10.1002/bies.201200145",
    openalex = "W1560120724",
    references = "doi101016jtig201005003, doi101038nrg2146, doi101038scientificamerican117998, doi101046j1365294x200301731x, doi101146annureven10010165000525, doi101146annureves23110192001403, doi105860choice375647, doi105860choice396411, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303"
}

A descoberta de um espécime de celacanto vivo em 1938 foi notável, pois essa linhagem de peixes de nadadeiras lobadas era considerada extinta há 70 milhões de anos. O celacanto moderno parece notavelmente semelhante a muitos de seus parentes antigos, e sua proximidade evolutiva com nossos ancestrais peixes oferece uma visão dos peixes que primeiro caminharam em terra. Aqui, relatamos a sequência do genoma do celacanto africano, Latimeria chalumnae. Por meio de uma análise filogenômica, concluímos que o peixe-sapo, e não o celacanto, é o parente vivo mais próximo dos tetrápodes. Os genes codificadores de proteínas do celacanto evoluem significativamente mais lentamente do que os dos tetrápodes, ao contrário de outras características genômicas. As análises das mudanças em genes e elementos regulatórios durante a adaptação dos vertebrados à terra destacam genes envolvidos na imunidade, excreção de nitrogênio e no desenvolvimento de nadadeiras, cauda, ouvido, olho, cérebro e olfação. Ensaios funcionais de potenciadores envolvidos na transição de nadadeira para membro e na emergência de tecidos extraembrionários mostram a importância do genoma do celacanto como um plano para entender a evolução dos tetrápodes.

@article{doi101038nature12027,
    author = "Amemiya, Chris T. and Alföldi, Jessica and Lee, Alison and Fan, Shaohua and Philippe, Hervé and MacCallum, Iain and Braasch, Ingo and Manousaki, Tereza and Schneider, Igor and Rohner, Nicolas and Organ, Chris L. and Chalopin, Domitille and Smith, Jeramiah J. and Robinson, Mark and Dorrington, Rosemary A. and Gerdol, Marco and Aken, Bronwen and Biscotti, Maria Assunta and Barucca, Marco and Baurain, Denis and Berlin, Aaron M. and Blatch, Gregory L. and Buonocore, Francesco and Burmester, Thorsten and Campbell, Michael S. and Canapa, Adriana and Cannon, John P. and Christoffels, Alan and Moro, Gianluca De and Edkins, Adrienne L. and Fan, Lin and Fausto, Anna Maria and Feiner, Nathalie and Forconi, Marikò and Gamieldien, Junaid and Gnerre, Sante and Gnirke, Andreas and Goldstone, Jared V. and Haerty, Wilfried and Hahn, Mark E. and Hesse, Uljana and Hoffmann, Steve and Johnson, Jeremy and Karchner, Sibel I. and Kuraku, Shigehiro and Lara, Marcia and Levin, Joshua Z. and Litman, Gary W. and Mauceli, Evan and Miyake, Tsutomu and Mueller, M. Gail and Nelson, David R. and Nitsche, Anne and Olmo, Ettore and Ota, Tatsuya and Pallavicini, Alberto and Panji, Sumir and Picone, Barbara and Ponting, Chris P. and Prohaska, Sonja J. and Przybylski, Dariusz and Saha, Nil Ratan and Ravi, Vydianathan and Ribeiro, Filipe J. and Sauka‐Spengler, Tatjana and Scapigliati, Giuseppe and Searle, Stephen M. J. and Sharpe, Ted and Simakov, Oleg and Stadler, Peter F. and Stegeman, John J. and Sumiyama, Kenta and Tabbaa, Diana and Tafer, Hakim and Turner-Maier, Jason and Heusden, Peter Van and White, Simon and Williams, Louise and Yandell, Mark and Brinkmann, Henner and Volff, Jean-Nicolas and Tabin, Clifford J. and Shubin, Neil H. and Schartl, Manfred and Jaffe, David B. and Postlethwait, John H. and Venkatesh, Byrappa and Palma, Federica Di and Lander, Eric S. and Meyer, Axel and Lindblad‐Toh, Kerstin",
    title = "The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution",
    year = "2013",
    journal = "Nature",
    abstract = "A descoberta de um espécime de celacanto vivo em 1938 foi notável, pois essa linhagem de peixes de nadadeiras lobadas era considerada extinta há 70 milhões de anos. O celacanto moderno parece notavelmente semelhante a muitos de seus parentes antigos, e sua proximidade evolutiva com nossos ancestrais peixes oferece uma visão dos peixes que primeiro caminharam em terra. Aqui, relatamos a sequência do genoma do celacanto africano, Latimeria chalumnae. Por meio de uma análise filogenômica, concluímos que o peixe-sapo, e não o celacanto, é o parente vivo mais próximo dos tetrápodes. Os genes codificadores de proteínas do celacanto evoluem significativamente mais lentamente do que os dos tetrápodes, ao contrário de outras características genômicas. As análises das mudanças em genes e elementos regulatórios durante a adaptação dos vertebrados à terra destacam genes envolvidos na imunidade, excreção de nitrogênio e no desenvolvimento de nadadeiras, cauda, ouvido, olho, cérebro e olfação. Ensaios funcionais de potenciadores envolvidos na transição de nadadeira para membro e na emergência de tecidos extraembrionários mostram a importância do genoma do celacanto como um plano para entender a evolução dos tetrápodes.",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature12027",
    doi = "10.1038/nature12027",
    openalex = "W1963630241",
    references = "doi101016jgene200501008, doi101038nature04072, doi101038nature07891, doi101038nature10944, doi101038nbt1883, doi101073pnas1017351108, doi101093bioinformaticsbti191, doi101093genetics1352599, doi101093molbevmsh112, doi101126science1098119, doi1011861471216414538, doi101242jeb1982273, doi1023073514548, doi105860choice300927, nieuwenhuys1998the"
}

FUNDO: Latimeria menadoensis é uma espécie de celacanto identificada pela primeira vez em 1997 na Indonésia, a 10.000 km de distância de seu congênere africano. Até a data, apenas seis espécimes foram capturados e apenas dados moleculares muito limitais estão disponíveis. No presente trabalho, descrevemos a montagem de novo do transcriptoma obtida a partir de amostras de fígado e testículo coletadas do quinto espécime já capturado desta espécie. RESULTADOS: A sequenciamento profundo de RNA realizado com tecnologias Illumina gerou 145.435.156 leituras em pares, correspondendo a ~14 GB de dados de sequência, que foram montados de novo usando uma estratégia combinada Trinity/CLC. A saída da montagem foi processada e filtrada, produzindo um conjunto de 66.308 contigs, cuja qualidade foi minuciosamente avaliada. A comparação com o genoma recentemente sequenciado do congênere africano Latimeria chalumnae e com os recursos genômicos disponíveis de outros vertebrados revelou uma boa reconstrução de transcritos de comprimento total e uma alta cobertura do transcriptoma completo de celacanto previsto. CONCLUSÃO: Dada a alta afinidade genômica entre as duas espécies de celacanto, a montagem de novo do transcriptoma aqui descrita pode ser considerada uma ferramenta de suporte valiosa para a melhoria da previsão de genes dentro do genoma de L. chalumnae e um recurso valioso para a investigação de muitos aspectos da evolução dos tetrápodes.

@article{doi1011861471216414538,
    author = "Pallavicini, Alberto e Canapa, Adriana e Barucca, Marco e Alföldi, Jessica e Biscotti, Maria Assunta e Buonocore, Francesco e Moro, Gianluca De e Palma, Federica Di e Fausto, Anna Maria e Forconi, Marikò e Gerdol, Marco e Makapedua, Daisy Monica e Turner-Meier, Jason e Olmo, Ettore e Scapigliati, Giuseppe",
    title = "Análise do transcriptoma do celacanto indonésio Latimeria menadoensis",
    year = "2013",
    journal = "BMC Genomics",
    abstract = "FUNDO: Latimeria menadoensis é uma espécie de celacanto identificada pela primeira vez em 1997 na Indonésia, a 10.000 km de distância de seu congênere africano. Até a data, apenas seis espécimes foram capturados e apenas dados moleculares muito limitais estão disponíveis. No presente trabalho, descrevemos a montagem de novo do transcriptoma obtida a partir de amostras de fígado e testículo coletadas do quinto espécime já capturado desta espécie. RESULTADOS: A sequenciamento profundo de RNA realizado com tecnologias Illumina gerou 145.435.156 leituras em pares, correspondendo a \textasciitilde 14 GB de dados de sequência, que foram montados de novo usando uma estratégia combinada Trinity/CLC. A saída da montagem foi processada e filtrada, produzindo um conjunto de 66.308 contigs, cuja qualidade foi minuciosamente avaliada. A comparação com o genoma recentemente sequenciado do congênere africano Latimeria chalumnae e com os recursos genômicos disponíveis de outros vertebrados revelou uma boa reconstrução de transcritos de comprimento total e uma alta cobertura do transcriptoma completo de celacanto previsto. CONCLUSÃO: Dada a alta afinidade genômica entre as duas espécies de celacanto, a montagem de novo do transcriptoma aqui descrita pode ser considerada uma ferramenta de suporte valiosa para a melhoria da previsão de genes dentro do genoma de L. chalumnae e um recurso valioso para a investigação de muitos aspectos da evolução dos tetrápodes.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-538",
    doi = "10.1186/1471-2164-14-538",
    openalex = "W2131848830",
    references = "doi101016jtig200712007, doi101016jygeno200807001, doi101016jygeno201003001, doi101016s0022283605803602, doi101017s0094837300004310, doi101038nbt1883, doi101038nrg2484, doi101038nrg3068, doi101093bioinformatics179847, doi101093bioinformaticsbti610"
}

O estudo do desenvolvimento é crucial para revelar a evolução das principais linhagens de vertebrados. Os celacantos têm uma das histórias evolutivas mais longas entre os osteictios, mas, apesar do acesso a representantes extantes, o início de seu endoesqueleto fracamente ossificado ainda é pouco compreendido. Aqui, apresentamos o primeiro estudo paleohistológico e esquelto-cronológico de Miguashaia bureaui do Devoniano Superior do Canadá, fundamental para explorar a paleobiologia e a evolução inicial da osteogênese nos celacantos. Seções transversais dos ossos da nadadeira caudal mostram que a cortical é composta por camadas de osso primário separadas por linhas de crescimento interrompido, indicativas de um crescimento cíclico. A cavidade medular apresenta remanescentes de cartilagem calcificada associada a trabéculas ósseas, características da ossificação endocondral. Uma análise esquelto-cronológica indica que o crescimento rápido durante um curto período juvenil foi seguido por um crescimento mais lento na idade adulta. Nossa nova análise destaca o histórico de vida e a paleoecologia de Miguashaia bureaui e revela que, apesar das diferenças de tamanho e habitat, a pobre ossificação endoesquelética conhecida no extante Latimeria chalumnae pode ser rastreada até pelo menos 375 milhões de anos atrás.

@misc{doi107287peerj13175v01reviews2,
    author = "Mondéjar‐Fernández, Jorge and Meunier, François and Cloutier, Richard and Clément, Gaël and Laurin, Michel and Mondéjar‐Fernández, Jorge and Andrews, M and Long, J and Ahlberg, P and Barwick, R and Campbell, K and Amat, F and Meiri, S and Amprino, R and Brito, P and Meunier, F and Clment, G and Geffard-Kuriyama, D and Castanet, J and Castanet, J and Meunier, F and Bergot, C and Franois, Y and Castanet, J and Meunier, F-J and Ricqles, A De and Castanet, J and Francillon-Vieillot, H and Meunier, F-J and Ricqls, A De and Castanet, Francillon and Vieillot, H and Ricqls, A De and Chevrinais, M and Sire, J and A, Cloutier R; and Chevrinais, M and Jacquet, C and Cloutier, R and Cloutier, R and Cloutier, R and Cloutier, R and Proust, J and Tessier, B and Cupello, C and Meunier, F-J and Herbin, M and Clment, G and Brito, P and Cupello, C and Meunier, F-J and Herbin, M and Janvier, P and Clment, G and Brito, P and Downs, J and Donoghue, P and Daget, J and Bauchot, M and Arnoult, J and Dutel, H and Galland, M and Tafforeau, P and Long, J and Fagan, M and Janvier, P and Herrel, A and Santini, M and Clment, G and Herbin, M and Flower, S and Forey, P and Ahlberg, P and Lukevis, E and Zupin, I and Francillon, H and Meunier, F-J and Ngo, Tuan and Phong and Ricqles, A De and Francillon-Vieillot, H and Buffrenil, V De and Castanet, J and Graudie, J and Meunier, F-J and Sire, J-Y and Zylberberg, L and Ricqls, A De and Friedman, M and Coates, M and Anderson, P and Geffen, A and Pontual, H De and Wright, P and Mosegaard, H and Giraud, M and Castanet, J and Meunier, F and Bouligand, Y and Haines, R",
    title = {Peer Review \#2 de "Histórico de vida e padrões de ossificação em Miguashaia bureaui revelam a evolução inicial da osteogênese em celacantos (v0.1)"},
    year = "2022",
    abstract = "O estudo do desenvolvimento é crucial para revelar a evolução das principais linhagens de vertebrados. Os celacantos têm uma das histórias evolutivas mais longas entre os osteictios, mas, apesar do acesso a representantes extantes, o início de seu endoesqueleto fracamente ossificado ainda é pouco compreendido. Aqui, apresentamos o primeiro estudo paleohistológico e esquelto-cronológico de Miguashaia bureaui do Devoniano Superior do Canadá, fundamental para explorar a paleobiologia e a evolução inicial da osteogênese nos celacantos. Seções transversais dos ossos da nadadeira caudal mostram que a cortical é composta por camadas de osso primário separadas por linhas de crescimento interrompido, indicativas de um crescimento cíclico. A cavidade medular apresenta remanescentes de cartilagem calcificada associada a trabéculas ósseas, características da ossificação endocondral. Uma análise esquelto-cronológica indica que o crescimento rápido durante um curto período juvenil foi seguido por um crescimento mais lento na idade adulta. Nossa nova análise destaca o histórico de vida e a paleoecologia de Miguashaia bureaui e revela que, apesar das diferenças de tamanho e habitat, a pobre ossificação endoesquelética conhecida no extante Latimeria chalumnae pode ser rastreada até pelo menos 375 milhões de anos atrás.",
    url = "https://doi.org/10.7287/peerj.13175v0.1/reviews/2",
    doi = "10.7287/peerj.13175v0.1/reviews/2",
    openalex = "W4223452416",
    references = "doi101111joa13428"
}

Introdução As descobertas de populações de celacantos fora da costa leste-africana e no Indo-Pacífico justificam uma análise de suas distribuições potenciais, mas faltam as ferramentas necessárias para modelar e projetar suas distribuições em três dimensões. Métodos Usando registros de ocorrência do celacanto do oceano Índico, Latimeria chalumnae, produzimos modelos de nicho ecológico de máxima entropia em 3D e 2D e os projetamos no habitat do celacanto indonésio, Latimeria menadoensis. Avaliamos o sucesso de cada modelo com base em quão bem ele poderia prever as presenças de L. menadoensis registradas em observações de submersíveis. Resultados Embora o modelo 2D omitisse 33% das ocorrências no limiar mais permissivo, o modelo 3D previu com sucesso todas as ocorrências, independentemente do nível do limiar. Discussão Incorporar a profundidade resulta em maior precisão do modelo ao prever o habitat de celacantos, e projetar em três dimensões pode nos fornecer insights sobre onde direcionar futuras amostragens. Este framework de modelagem 3D pode ajudar-nos a entender melhor como as espécies marinhas são distribuídas por profundidade e permitir uma gestão de conservação mais direcionada.

@article{doi103389fmars20251521474,
    author = "Sheahan, Emmaline R. e Owens, Hannah L. e Guralnick, Robert e Naylor, Gavin J. P.",
    title = "Modelos de nicho ecológico 3D superam o 2D na previsão do habitat de celacantos (Latimeria spp.)",
    year = "2025",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Introdução As descobertas de populações de celacantos fora da costa leste-africana e no Indo-Pacífico justificam uma análise de suas distribuições potenciais, mas faltam as ferramentas necessárias para modelar e projetar suas distribuições em três dimensões. Métodos Usando registros de ocorrência do celacanto do oceano Índico, Latimeria chalumnae, produzimos modelos de nicho ecológico de máxima entropia em 3D e 2D e os projetamos no habitat do celacanto indonésio, Latimeria menadoensis. Avaliamos o sucesso de cada modelo com base em quão bem ele poderia prever as presenças de L. menadoensis registradas em observações de submersíveis. Resultados Embora o modelo 2D omitisse 33% das ocorrências no limiar mais permissivo, o modelo 3D previu com sucesso todas as ocorrências, independentemente do nível do limiar. Discussão Incorporar a profundidade resulta em maior precisão do modelo ao prever o habitat de celacantos, e projetar em três dimensões pode nos fornecer insights sobre onde direcionar futuras amostragens. Este framework de modelagem 3D pode ajudar-nos a entender melhor como as espécies marinhas são distribuídas por profundidade e permitir uma gestão de conservação mais direcionada.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2025.1521474",
    doi = "10.3389/fmars.2025.1521474",
    openalex = "W4408209087",
    references = "doi101038s41467024512384"
}