1. Cairns-Smith, A. G, 1971, The Life Puzzle: On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal As an Ancestor: Toronto, University of Toronto Press, 165 p.
BibTeX
@book{cairnssmith1971the1,
author = "Cairns-Smith, A. G",
title = "The Life Puzzle",
year = "1971",
publisher = "On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal As an Ancestor: Toronto, University of Toronto Press, 165 p",
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2. Cairns-Smith, A. G., 1971, The Life Puzzle: On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal as an Ancestor: Project Muse (Johns Hopkins University).
Resumo
Qual é a origem da vida? A biologia molecular nos mostra um tipo, mas ao pensar nisso, devemos considerar aqueles aspectos generalizados da organização viva que são comuns a todas as formas de vida concebíveis. O autor acredita que apenas uma combinação de teoria biológica geral e conhecimento químico particular pode resolver os problemas da origem e recriação da vida. Este livro não se enquadra nem na escola de pensamento clássica de Haldane nem na de Oparin sobre a origem da vida, mas avança uma tese própria, que, segundo o Professor C.H. Waddington, é um dos desenvolvimentos intelectuais mais importantes recentes neste campo. A Parte I considera o papel da biologia molecular na formulação de uma visão da vida como ela existe agora. A Parte II volta para aspectos mais gerais da organização da matéria. Na Parte III, o autor avança suas próprias teorias sobre a origem da vida — teorias que são tanto revolucionárias quanto reacionárias. Como ele observa, 'Se minhas conclusões estiverem corretas, pode ser difícil encontrar o sistema certo, mas seria fácil criar um organismo muito simples uma vez que o tenhamos.'
BibTeX
@book{doi1031389781487589684,
author = "Cairns-Smith, A. G.",
title = "The Life Puzzle: On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal as an Ancestor",
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booktitle = "Project Muse (Johns Hopkins University)",
abstract = "Qual é a origem da vida? A biologia molecular nos mostra um tipo, mas ao pensar nisso, devemos considerar aqueles aspectos generalizados da organização viva que são comuns a todas as formas de vida concebíveis. O autor acredita que apenas uma combinação de teoria biológica geral e conhecimento químico particular pode resolver os problemas da origem e recriação da vida. Este livro não se enquadra nem na escola de pensamento clássica de Haldane nem na de Oparin sobre a origem da vida, mas avança uma tese própria, que, segundo o Professor C.H. Waddington, é um dos desenvolvimentos intelectuais mais importantes recentes neste campo. A Parte I considera o papel da biologia molecular na formulação de uma visão da vida como ela existe agora. A Parte II volta para aspectos mais gerais da organização da matéria. Na Parte III, o autor avança suas próprias teorias sobre a origem da vida — teorias que são tanto revolucionárias quanto reacionárias. Como ele observa, 'Se minhas conclusões estiverem corretas, pode ser difícil encontrar o sistema certo, mas seria fácil criar um organismo muito simples uma vez que o tenhamos.'",
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doi = "10.3138/9781487589684",
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3. Bunn, C. W., 1972, Vida a partir de Cristais: Nature.
BibTeX
@article{doi101038236239a0,
author = "Bunn, C. W.",
title = "Vida a partir de Cristais",
year = "1972",
journal = "Nature",
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4. Russell, Michael J. e Hall, A. J., 1997, A emergência da vida a partir de bolhas de monossulfeto de ferro em uma frente redox e de pH em fontes hidrotermais submarinas: Journal of the Geological Society.
Resumo
Aqui argumentamos que a vida emergiu na Terra a partir de um frente de redox e pH por volta de 4,2 Ga. Este frente ocorreu onde águas subterrâneas quentes (cerca de 150 graus C), extremamente reduzidas, alcalinas, ricas em bissulfeto, de vazamento submarino, entravam em contato com o oceano Hadeano ácido, quente (cerca de 90 graus C) e rico em ferro. O baixo pH do oceano foi conferido pelas dez barras de CO2 consideradas dominantes na atmosfera/hidrosfera Hadeana. O desequilíbrio entre as duas soluções foi mantido pela precipitação espontânea de uma membrana coloidal de FeS. Bolhas de monossulfeto de ferro que compõem esta membrana foram infladas pela solução hidrotermal sobre montes de sulfeto nos locais de vazamento. Nossa hipótese é que a membrana de FeS, reforçada com níquel, atuou como uma fronteira catalítica semipermeável entre os dois fluidos, incentivando a síntese de ânions orgânicos por hidrogenação e carboxilação de primers orgânicos hidrotermais. O oceano forneceu carbonato, fosfato, ferro, níquel e prótons; a solução hidrotermal foi a fonte de amônia, acetato, HS-, H2 e tungstênio, bem como concentrações menores de sulfetos orgânicos e talvez cianeto e acetaldeído. O potencial redox médio (delta Eh) através da membrana, com a energia para impulsionar a síntese, teria aproximado-se de 300 milivolts. A geração de ânions orgânicos teria levado a um aumento na pressão osmótica dentro das bolhas de FeS. Assim, a pressão osmótica poderia assumir o lugar da pressão hidráulica como força motriz para distensão, brotamento e reprodução das bolhas. A condensação das moléculas orgânicas em polímeros, particularmente sulfetos orgânicos, foi impulsionada pela hidrólise de pirofosfato. A regeneração de pirofosfato a partir do monofosfato na membrana foi facilitada por prótons contribuídos pelo oceano Hadeano. Esta foi a primeira utilização por um sistema metabólico de força protonmotora (impulsionada pelo delta pH natural), que também teria correspondido a cerca de 300 milivolts. A força protonmotora é o mecanismo universal de transdução de energia da vida. Considerada juntamente com o potencial redox através da membrana, a energia eletroquímica e química total disponível para o protometabolismo correspondia a um fornecimento contínuo de mais de meio volt. O papel da membrana de sulfeto de ferro em manter as duas soluções separadas foi apropriado pelos polímeros de sulfeto orgânico recém-sintetizados. Esta tomada de posse orgânica do material da membrana levou à miniaturização do sistema metabólico. Sistemas de informação para governar a replicação poderiam ter desenvolvido-se quase simultaneamente neste mesmo meio. Mas o ferro, o enxofre e o fosfato, componentes inorgânicos da vida mais antiga, continuaram a estar envolvidos no metabolismo.
BibTeX
@article{doi101144gsjgs15430377,
author = "Russell, Michael J. and Hall, A. J.",
title = "A emergência da vida a partir de bolhas de monossulfeto de ferro em uma frente redox e de pH em um sistema hidrotermal submarino",
year = "1997",
journal = "Journal of the Geological Society",
abstract = "Aqui argumentamos que a vida emergiu na Terra a partir de uma frente redox e de pH há c. 4,2 Ga. Esta frente ocorreu onde águas quentes (c. 150 graus C), extremamente reduzidas, alcalinas, ricas em bissulfeto, de vazamento submarino, entravam em contato com o oceano hádico ácido, quente (c. 90 graus C) e rico em ferro. O baixo pH do oceano foi causado pelas dez barras de CO2 consideradas dominantes na atmosfera/hidrosfera hádica. O desequilíbrio entre as duas soluções foi mantido pela precipitação espontânea de uma membrana coloidal de FeS. Bolhas de monossulfeto de ferro que compõem esta membrana foram infladas pela solução hidrotermal sobre montes de sulfeto nos locais de vazamento. Nossa hipótese é que a membrana de FeS, reforçada com níquel, atuou como uma fronteira catalítica semipermeável entre os dois fluidos, incentivando a síntese de ânions orgânicos por hidrogenação e carboxilação de primers orgânicos hidrotermais. O oceano forneceu carbonato, fosfato, ferro, níquel e prótons; a solução hidrotermal foi a fonte de amônia, acetato, HS-, H2 e tungstênio, bem como concentrações menores de sulfetos orgânicos e talvez cianeto e acetaldeído. O potencial redox médio (delta Eh) através da membrana, com a energia para impulsionar a síntese, teria se aproximado de 300 milivolts. A geração de ânions orgânicos teria levado a um aumento na pressão osmótica dentro das bolhas de FeS. Assim, a pressão osmótica poderia assumir o lugar da pressão hidráulica como a força motriz para distensão, brotamento e reprodução das bolhas. A condensação das moléculas orgânicas em polímeros, particularmente sulfetos orgânicos, foi impulsionada pela hidrólise de pirofosfato. A regeneração de pirofosfato a partir do monofosfato na membrana foi facilitada por prótons contribuídos pelo oceano hádico. Esta foi a primeira utilização por um sistema metabolizador de força protonmotora (impulsionada pelo delta pH natural) que também teria correspondido a c. 300 milivolts. A força protonmotora é o mecanismo universal de transdução de energia da vida. Juntamente com o potencial redox através da membrana, a energia eletroquímica e química total disponível para o protometabolismo correspondia a um suprimento contínuo de mais de meio volt. O papel da membrana de sulfeto de ferro em manter as duas soluções separadas foi assumido pelos polímeros de sulfeto orgânico recém-sintetizados. Esta tomada orgânica do material da membrana levou à miniaturização do sistema metabolizador. Sistemas de informação para governar a replicação poderiam ter se desenvolvido quase simultaneamente neste mesmo ambiente. Mas o ferro, o enxofre e o fosfato, componentes inorgânicos da vida mais antiga, continuaram a estar envolvidos no metabolismo.",
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doi = "10.1144/gsjgs.154.3.0377",
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5. Fuchs, Georg, 2010, Caminhos Alternativos de Fixação de Dióxido de Carbono: Perspectivas sobre a Evolução Precoce da Vida?: Annual Review of Microbiology.
DOI: 10.1146/annurev-micro-090110-102801
Resumo
A fixação de carbono inorgânico em material orgânico (autotrofia) é um pré-requisito para a vida e define o ponto de partida da evolução biológica. Na biosfera atual, o ciclo redutor do fosfato de pentose (ciclo de Calvin-Benson) é o mecanismo predominante pelo qual muitos procariotos e todas as plantas fixam CO(2) em biomassa. No entanto, o fato de que existem cinco caminhos autotróficos alternativos em procariotos é frequentemente negligenciado. Esse viés pode levar a erros graves em modelos do ciclo global do carbono, em hipóteses sobre a evolução do metabolismo e em interpretações de registros geológicos. Aqui, reviso esses caminhos alternativos que diferem fundamentalmente do ciclo de Calvin-Benson. Reveladoramente, esses cinco caminhos alternativos giram em torno do acetil-coenzima A, o disco de rotação do metabolismo, exigindo um caminho gluconeogênico que comece a partir do acetil-coenzima A e CO(2). Parece que a formação de um ácido acético ativado a partir de carbono inorgânico representa o passo inicial em direção ao metabolismo. Consequentemente, as biossínteses provavelmente começaram a partir do ácido acético ativado e a gluconeogênese precedeu a glicólise.
BibTeX
@article{doi101146annurevmicro090110102801,
author = "Fuchs, Georg",
title = "Alternative Pathways of Carbon Dioxide Fixation: Insights into the Early Evolution of Life?",
year = "2010",
journal = "Annual Review of Microbiology",
abstract = "The fixation of inorganic carbon into organic material (autotrophy) is a prerequisite for life and sets the starting point of biological evolution. In the extant biosphere the reductive pentose phosphate (Calvin-Benson) cycle is the predominant mechanism by which many prokaryotes and all plants fix CO(2) into biomass. However, the fact that five alternative autotrophic pathways exist in prokaryotes is often neglected. This bias may lead to serious misjudgments in models of the global carbon cycle, in hypotheses on the evolution of metabolism, and in interpretations of geological records. Here, I review these alternative pathways that differ fundamentally from the Calvin-Benson cycle. Revealingly, these five alternative pathways pivot on acetyl-coenzyme A, the turntable of metabolism, demanding a gluconeogenic pathway starting from acetyl-coenzyme A and CO(2). It appears that the formation of an activated acetic acid from inorganic carbon represents the initial step toward metabolism. Consequently, biosyntheses likely started from activated acetic acid and gluconeogenesis preceded glycolysis.",
url = "https://doi.org/10.1146/annurev-micro-090110-102801",
doi = "10.1146/annurev-micro-090110-102801",
openalex = "W2130107304",
references = "doi101002bies200900131, doi101002cbdv200790052, doi101007bf00032643, doi101038nrmicro1852, doi101038nrmicro1991, doi10108010409230490460765"
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6. Schulman, Rebecca e Yurke, Bernard e Winfree, Erik, 2012, Replicação autônoma robusta de informação combinatória via crescimento e cisão de cristais: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumo
Compreender como um sistema químico simples pode replicar com precisão informações combinatórias, como uma sequência, é uma questão importante tanto para o estudo da vida no universo quanto para o desenvolvimento de técnicas de design molecular evolutivo. Durante a replicação biológica de sequências, um polímero de ácido nucleico serve como molde para a montagem catalisada por enzimas de uma sequência complementar. As enzimas então separam o molde e o complemento antes da próxima rodada de replicação. Tentativas de compreender como a replicação poderia ocorrer de forma mais simples, como sem enzimas, focaram principalmente no desenvolvimento de versões mínimas deste processo de replicação. Aqui, descrevemos como um mecanismo diferente, crescimento e cisão de cristais, pode replicar com precisão sequências químicas sem enzimas. O crescimento de cristais propaga uma sequência de bits, enquanto a cisão induzida mecanicamente cria novas frentes de crescimento. Juntos, esses processos aumentam exponencialmente o número de sequências de cristais. No sistema que descrevemos, as sequências são arranjos de monômeros de azulejos de DNA dentro de cristais em forma de fita. 99,98% dos bits são copiados corretamente e 78% das sequências de 4 bits estão corretas após duas gerações; aproximadamente 40 cópias de sequência são feitas por frente de crescimento por geração. Em princípio, este processo é preciso o suficiente para replicação 1.000 vezes de sequências de 4 bits com rendimento de 50%, replicação de sequências mais longas e evolução darwiniana. Assim, demonstramos que nem enzimas nem formação de ligações covalentes são necessárias para a replicação robusta de sequências químicas. A forma da informação replicada também é compatível com a replicação e evolução de uma ampla classe de materiais com geometria nanométrica precisa, como nanoestruturas plasmônicas ou assembleias proteicas heterogêneas.
BibTeX
@article{doi101073pnas1117813109,
author = "Schulman, Rebecca e Yurke, Bernard e Winfree, Erik",
title = "Replicação autônoma robusta de informação combinatória via crescimento e cisão de cristais",
year = "2012",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Compreender como um sistema químico simples pode replicar com precisão informações combinatórias, como uma sequência, é uma questão importante tanto para o estudo da vida no universo quanto para o desenvolvimento de técnicas de design molecular evolutivo. Durante a replicação biológica de sequências, um polímero de ácido nucleico serve como molde para a montagem catalisada por enzimas de uma sequência complementar. As enzimas então separam o molde e o complemento antes da próxima rodada de replicação. Tentativas de compreender como a replicação poderia ocorrer de forma mais simples, como sem enzimas, focaram principalmente no desenvolvimento de versões mínimas deste processo de replicação. Aqui, descrevemos como um mecanismo diferente, crescimento e cisão de cristais, pode replicar com precisão sequências químicas sem enzimas. O crescimento de cristais propaga uma sequência de bits, enquanto a cisão induzida mecanicamente cria novas frentes de crescimento. Juntos, esses processos aumentam exponencialmente o número de sequências de cristais. No sistema que descrevemos, as sequências são arranjos de monômeros de azulejos de DNA dentro de cristais em forma de fita. 99,98% dos bits são copiados corretamente e 78% das sequências de 4 bits estão corretas após duas gerações; aproximadamente 40 cópias de sequência são feitas por frente de crescimento por geração. Em princípio, este processo é preciso o suficiente para replicação 1.000 vezes de sequências de 4 bits com rendimento de 50%, replicação de sequências mais longas e evolução darwiniana. Assim, demonstramos que nem enzimas nem formação de ligações covalentes são necessárias para a replicação robusta de sequências químicas. A forma da informação replicada também é compatível com a replicação e evolução de uma ampla classe de materiais com geometria nanométrica precisa, como nanoestruturas plasmônicas ou assembleias proteicas heterogêneas.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1117813109",
doi = "10.1073/pnas.1117813109",
openalex = "W2070783600",
references = "doi101137070680266"
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7. Russell, Michael J. e Barge, Laura M. e Bhartia, R. e Bocanegra, Dylan e Bracher, Paul J. e Branscomb, Elbert e Kidd, Richard e McGlynn, Shawn E. e Meier, David H. e Nitschke, Wolfgang e Shibuya, Takazo e Vance, S. e White, Lauren M. e Kanik, I., 2014, The Drive to Life on Wet and Icy Worlds: Astrobiology.
Resumo
Este artigo apresenta uma reformulação da teoria das fontes hidrotermais alcalinas subaquáticas para a emergência da vida em resposta a descobertas experimentais recentes. A teoria vê a vida, como outros sistemas auto-organizados no Universo, como um resultado inevitável de desequilíbrios particulares. Neste caso, os desequilíbrios foram dois: (1) em potencial redox, entre hidrogênio mais metano com aceptores de elétrons que completam o circuito, como nitrito, nitrato, ferro férrico e dióxido de carbono, e (2) em gradiente de pH entre um oceano externo ácido e um fluido hidrotermal alcalino. Tanto o CO2 quanto o CH4 foram igualmente as fontes finais de carbono orgânico, e os sulfetos metálicos e os oxihidróxidos atuaram como catalisadores protoenzimáticos. A realização, agora com 50 anos, de que gradientes que atravessam membranas, em vez de intermediários orgânicos, desempenham um papel vital nas operações da vida, coloca em questão a ideia de "química pré-biótica". Informa nossa própria sugestão de que a experimentação deve procurar o tipo de nanoengines que devem ter sido os precursores dos motores moleculares — como a pirifosfatase sintetase e similares impulsionados por esses gradientes — que fazem a vida funcionar. São esses conversores putativos de energia livre ou desequilíbrios, presumivelmente construídos a partir de minerais que compõem as primeiras membranas inorgânicas, que, como obstáculos aos fluxos iônicos vetoriais, apresentam-se como candidatos para experimentos futuros. Palavras-chave: Metanotrofia — Origem da vida. Astrobiology 14, 308-343. A fixação de carbono inorgânico em material orgânico (autotrofia) é um pré-requisito para a vida e define o ponto de partida da evolução biológica. (Fuchs, 2011) Progressos significativos adicionais com a família H(+)-PPase fortemente ligada à membrana devem levar a um maior insight nos requisitos básicos para o transporte biológico de prótons através de membranas e seu acoplamento à fosforilação. (Baltscheffsky et al., 1999).
BibTeX
@article{doi101089ast20131110,
author = "Russell, Michael J. and Barge, Laura M. and Bhartia, R. and Bocanegra, Dylan and Bracher, Paul J. and Branscomb, Elbert and Kidd, Richard and McGlynn, Shawn E. and Meier, David H. and Nitschke, Wolfgang and Shibuya, Takazo and Vance, S. and White, Lauren M. and Kanik, I.",
title = "The Drive to Life on Wet and Icy Worlds",
year = "2014",
journal = "Astrobiology",
abstract = {Este artigo apresenta uma reformulação da teoria das fontes hidrotermais alcalinas subaquáticas para a emergência da vida em resposta a descobertas experimentais recentes. A teoria vê a vida, como outros sistemas auto-organizados no Universo, como um resultado inevitável de desequilíbrios particulares. Neste caso, os desequilíbrios foram dois: (1) em potencial redox, entre hidrogênio mais metano com aceptores de elétrons que completam o circuito, como nitrito, nitrato, ferro férrico e dióxido de carbono, e (2) em gradiente de pH entre um oceano externo ácido e um fluido hidrotermal alcalino. Tanto o CO2 quanto o CH4 foram igualmente as fontes finais de carbono orgânico, e os sulfetos metálicos e os oxihidróxidos atuaram como catalisadores protoenzimáticos. A realização, agora com 50 anos, de que gradientes que atravessam membranas, em vez de intermediários orgânicos, desempenham um papel vital nas operações da vida, coloca em questão a ideia de "química pré-biótica". Informa nossa própria sugestão de que a experimentação deve procurar o tipo de nanoengines que devem ter sido os precursores dos motores moleculares — como a pirifosfatase sintetase e similares impulsionados por esses gradientes — que fazem a vida funcionar. São esses conversores putativos de energia livre ou desequilíbrios, presumivelmente construídos a partir de minerais que compõem as primeiras membranas inorgânicas, que, como obstáculos aos fluxos iônicos vetoriais, apresentam-se como candidatos para experimentos futuros. Palavras-chave: Metanotrofia — Origem da vida. Astrobiology 14, 308-343. A fixação de carbono inorgânico em material orgânico (autotrofia) é um pré-requisito para a vida e define o ponto de partida da evolução biológica. (Fuchs, 2011) Progressos significativos adicionais com a família H(+)-PPase fortemente ligada à membrana devem levar a um maior insight nos requisitos básicos para o transporte biológico de prótons através de membranas e seu acoplamento à fosforilação. (Baltscheffsky et al., 1999).},
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doi = "10.1089/ast.2013.1110",
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8. Mariscal, Carlos e Barahona, Ana e Aubert-Kato, Nathanaël e Aydınoğlu, Arsev Umur e Bartlett, Stuart e Cárdenas, Marı́a Luz e Chandru, Kuhan e Cleland, Carol E. e Cocanougher, Ben e Comfort, Nathaniel e Cornish‐Bowden, Athel e Deacon, Terrence W. e Froese, Tom e Giovannelli, Donato e Hernlund, J. W. e Hut, Piet e Kimura, Jun e Maurel, Marie-Christine e Merino, Nancy e Moreno, Álvaro e Nakagawa, Mayuko e Peretό, Juli e Virgo, Nathaniel e Witkowski, Olaf e Cleaves, Henderson James, 2019, Conceitos Ocultos na História e Filosofia dos Estudos sobre a Origem da Vida: um Relatório de Workshop: Origins of Life and Evolution of Biospheres.
DOI: 10.1007/s11084-019-09580-x
BibTeX
@article{doi101007s1108401909580x,
author = "Mariscal, Carlos e Barahona, Ana e Aubert-Kato, Nathanaël e Aydınoğlu, Arsev Umur e Bartlett, Stuart e Cárdenas, Marı́a Luz e Chandru, Kuhan e Cleland, Carol E. e Cocanougher, Ben e Comfort, Nathaniel e Cornish‐Bowden, Athel e Deacon, Terrence W. e Froese, Tom e Giovannelli, Donato e Hernlund, J. W. e Hut, Piet e Kimura, Jun e Maurel, Marie-Christine e Merino, Nancy e Moreno, Álvaro e Nakagawa, Mayuko e Peretό, Juli e Virgo, Nathaniel e Witkowski, Olaf e Cleaves, Henderson James",
title = "Conceitos Ocultos na História e Filosofia dos Estudos sobre a Origem da Vida: um Relatório de Workshop",
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}
9. Preiner, Martina e Asche, Silke e Becker, Sidney e Betts, Holly C. e Boniface, Adrien e Camprubí, Eloi e Chandru, Kuhan e Erastova, Valentina e Garg, Sriram G. e Khawaja, Nozair e Kostyrka, Gladys e Machné, Rainer e Moggioli, Giacomo e Muchowska, Kamila B. e Neukirchen, Sinje e Peter, Benedikt e Pichlhöfer, Edith e Radványi, Ádám e Rossetto, Daniele e Salditt, Annalena e Schmelling, Nicolas e Sousa, Filipa L. e Tria, Fernando D. K. e Vörös, Dániel e Xavier, Joana C., 2020, O Futuro da Pesquisa sobre a Origem da Vida: Conectando Divisões de Décadas: Life.
Resumo
A pesquisa sobre a origem da vida é altamente heterogênea. Após um desenvolvimento histórico peculiar, ela ainda inclui visões fortemente opostas que potencialmente dificultam o progresso. Na 1ª Reunião Interdisciplinar sobre a Origem da Vida, pesquisadores de carreira inicial reuniram-se para explorar as semelhanças entre teorias e abordagens, pontos críticos de divergência e expectativas para o futuro. Descobrimos que, embora as abordagens e teorias clássicas — por exemplo, de baixo para cima e de cima para baixo, mundo de RNA versus metabolismo primeiro — tenham sido prevalentes na pesquisa sobre a origem da vida, elas estão deixando de ser mutuamente exclusivas e podem e devem alimentar abordagens integradoras. Aqui, focamos em questões urgentes e desenvolvimentos recentes que conectam as disciplinas e abordagens clássicas, e destacamos expectativas para futuros empreendimentos na pesquisa sobre a origem da vida.
BibTeX
@article{doi103390life10030020,
author = "Preiner, Martina e Asche, Silke e Becker, Sidney e Betts, Holly C. e Boniface, Adrien e Camprubí, Eloi e Chandru, Kuhan e Erastova, Valentina e Garg, Sriram G. e Khawaja, Nozair e Kostyrka, Gladys e Machné, Rainer e Moggioli, Giacomo e Muchowska, Kamila B. e Neukirchen, Sinje e Peter, Benedikt e Pichlhöfer, Edith e Radványi, Ádám e Rossetto, Daniele e Salditt, Annalena e Schmelling, Nicolas e Sousa, Filipa L. e Tria, Fernando D. K. e Vörös, Dániel e Xavier, Joana C.",
title = "O Futuro da Pesquisa sobre a Origem da Vida: Conectando Divisões de Décadas",
year = "2020",
journal = "Life",
abstract = "A pesquisa sobre a origem da vida é altamente heterogênea. Após um desenvolvimento histórico peculiar, ela ainda inclui visões fortemente opostas que potencialmente dificultam o progresso. Na 1ª Reunião Interdisciplinar sobre a Origem da Vida, pesquisadores de carreira inicial reuniram-se para explorar as semelhanças entre teorias e abordagens, pontos críticos de divergência e expectativas para o futuro. Descobrimos que, embora as abordagens e teorias clássicas — por exemplo, de baixo para cima e de cima para baixo, mundo de RNA versus metabolismo primeiro — tenham sido prevalentes na pesquisa sobre a origem da vida, elas estão deixando de ser mutuamente exclusivas e podem e devem alimentar abordagens integradoras. Aqui, focamos em questões urgentes e desenvolvimentos recentes que conectam as disciplinas e abordagens clássicas, e destacamos expectativas para futuros empreendimentos na pesquisa sobre a origem da vida.",
url = "https://doi.org/10.3390/life10030020",
doi = "10.3390/life10030020",
openalex = "W3007934451",
references = "branscomb2018frankenstein, doi101002bies201700179, doi101002bies201700182, doi101007bf00623322, doi101007s1108401909580x, doi1010160092867482904147, doi1010160092867483901174, doi101016jchembiol201303012, doi101016jgsf201707007, doi101038319618a0, doi101038nrmicro1931, doi101038nrmicro1991, doi101038s4158601914364, doi101093nargkw1092, doi101126science1173046528, doi101126science1303370245, doi101126science13434891501, doi101126scienceaax2747, doi1020944preprints2018060035v1, doi1020944preprints2018060035v2, doi103390life5021239"
}
10. Lei, Lei e Burton, Zachary F., 2020, Evolução da Vida na Terra: tRNA, Aminoacyl-tRNA Sintetases e o Código Genético: Life.
Resumo
A vida na Terra e o código genético evoluíram em torno do tRNA e do anticódon do tRNA. Propomos que o código genético inicialmente evoluiu para sintetizar poliglicina como um agente de ligação cruzada para estabilizar protocélulas. Propomos que os aminoácidos iniciais a entrar no código ocuparam setores maiores do código que foram então invadidos por aminoácidos entrantes. Deslocamentos de aminoácidos seguem regras de seleção. O código se segmentou de um código de glicina para um código de quatro aminoácidos para um código de oito aminoácidos para um código de ~16 aminoácidos para o código padrão de 20 aminoácidos com paradas. Os padrões propostos de segmentação do código agora são mais aparentes a partir de padrões de evolução de aminoacyl-tRNA sintetases. O fecho anticódon-codão da GTPase Elongation Factor-Tu que verifica a precisão da tradução parece ter evoluído em torno da etapa de oito aminoácidos para ~16 aminoácidos. Antes da evolução do fecho EF-Tu, propomos que tanto a 1ª quanto a 3ª posições do anticódon eram posições de wobble. O código genético evoluiu via erros de carregamento de tRNA e via modificações enzimáticas de aminoácidos unidos a tRNAs, seguidos pela diferenciação de tRNA e aminoacyl-tRNA sintetases. Mecanismos de fidelidade congelaram o código inibindo inovação adicional.
BibTeX
@article{doi103390life10030021,
author = "Lei, Lei e Burton, Zachary F.",
title = "Evolução da Vida na Terra: tRNA, Aminoacyl-tRNA Sintetases e o Código Genético",
year = "2020",
journal = "Life",
abstract = "A vida na Terra e o código genético evoluíram em torno do tRNA e do anticódon do tRNA. Propomos que o código genético inicialmente evoluiu para sintetizar poliglicina como um agente de ligação cruzada para estabilizar protocélulas. Propomos que os aminoácidos iniciais a entrar no código ocuparam setores maiores do código que foram então invadidos por aminoácidos entrantes. Deslocamentos de aminoácidos seguem regras de seleção. O código se segmentou de um código de glicina para um código de quatro aminoácidos para um código de oito aminoácidos para um código de \textasciitilde 16 aminoácidos para o código padrão de 20 aminoácidos com paradas. Os padrões propostos de segmentação do código agora são mais aparentes a partir de padrões de evolução de aminoacyl-tRNA sintetases. O fecho anticódon-codão da GTPase Elongation Factor-Tu que verifica a precisão da tradução parece ter evoluído em torno da etapa de oito aminoácidos para \textasciitilde 16 aminoácidos. Antes da evolução do fecho EF-Tu, propomos que tanto a 1ª quanto a 3ª posições do anticódon eram posições de wobble. O código genético evoluiu via erros de carregamento de tRNA e via modificações enzimáticas de aminoácidos unidos a tRNAs, seguidos pela diferenciação de tRNA e aminoacyl-tRNA sintetases. Mecanismos de fidelidade congelaram o código inibindo inovação adicional.",
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doi = "10.3390/life10030021",
openalex = "W3009119289",
references = "doi101007s1108401909580x"
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11. Colón‐Santos, Stephanie e Vázquez-Salazar, Alberto e Adams, Alyssa e Campillo-Balderas, José Alberto e Hernández-Morales, Ricardo e Jácome, Rodrigo e Muñoz‐Velasco, Israel e Rodriguez, Laura E. e Schaible, Micah J. e Schaible, George A. e Szeinbaum, Nadia e Thweatt, Jennifer L. e Trubl, Gareth, 2024, Capítulo 2: O que é a vida?: Astrobiologia.
Resumo
A pergunta "O que é a vida?" existe desde o início da história registrada. No entanto, os contextos científico e filosófico dessa pergunta mudaram e foram refinados à medida que os avanços tecnológicos revelaram tanto detalhes finos quanto conexões amplas na rede de vida na Terra. Compreender o quadro da pergunta "O que é a vida?" é central para formular outras perguntas, como "Onde mais a vida poderia estar?" e "Como buscamos a vida em outros lugares?". Embora muitas dessas perguntas sejam abordadas em todo o Astrobiology Primer 3.0, este capítulo fornece contexto histórico para definir a vida, destaca características conceituais compartilhadas por toda a vida na Terra, bem como características-chave usadas para descrevê-la, discute por que isso importa para a astrobiologia e explora tanto desafios quanto oportunidades para encontrar uma definição operacional informativa.
BibTeX
@article{doi101089ast20210116,
author = "Colón‐Santos, Stephanie e Vázquez-Salazar, Alberto e Adams, Alyssa e Campillo-Balderas, José Alberto e Hernández-Morales, Ricardo e Jácome, Rodrigo e Muñoz‐Velasco, Israel e Rodriguez, Laura E. e Schaible, Micah J. e Schaible, George A. e Szeinbaum, Nadia e Thweatt, Jennifer L. e Trubl, Gareth",
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journal = "Astrobiology",
abstract = {A pergunta "O que é a vida?" existe desde o início da história registrada. No entanto, os contextos científico e filosófico dessa pergunta mudaram e foram refinados à medida que os avanços tecnológicos revelaram tanto detalhes finos quanto conexões amplas na rede de vida na Terra. Compreender o quadro da pergunta "O que é a vida?" é central para formular outras perguntas, como "Onde mais a vida poderia estar?" e "Como buscamos a vida em outros lugares?". Embora muitas dessas perguntas sejam abordadas em todo o Astrobiology Primer 3.0, este capítulo fornece contexto histórico para definir a vida, destaca características conceituais compartilhadas por toda a vida na Terra, bem como características-chave usadas para descrevê-la, discute por que isso importa para a astrobiologia e explora tanto desafios quanto oportunidades para encontrar uma definição operacional informativa.},
url = "https://doi.org/10.1089/ast.2021.0116",
doi = "10.1089/ast.2021.0116",
openalex = "W4392930411",
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