Ecologia

@misc{elton1927animal29,
    author = "Elton, C. S",
    title = "Ecologia animal",
    year = "1927",
    howpublished = "Londres, Sidgwick and Jackson, 209 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elton, C. S., 1927, Ecologia animal: Londres, Sidgwick and Jackson, 209 p.}"
}

@misc{dammerman1948the27,
    author = "Dammerman, K. W",
    title = "The fauna of Krakatau",
    year = "1948",
    howpublished = "1883-1933: Verhandel. Kon-Inkl. Ned. Akad. Wetenschap. Afdel. Natuurk., v. 44, p. 1-594",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Dammerman, K. W., 1948, The fauna of Krakatau: 1883-1933: Verhandel. Kon-Inkl. Ned. Akad. Wetenschap. Afdel. Natuurk., v. 44, p. 1-594.}"
}

@misc{allee1949principles1,
    author = "Allee, W. C. e Emerson, A. E. e Park, O. e Park, T. e Schmidt, K. P",
    title = "Principles of Animal Ecology",
    year = "1949",
    howpublished = "Philadelphia, Saunders, 837 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Allee, W. C., Emerson, A. E., Park, O., Park, T., e Schmidt, K. P., 1949, Principles of Animal Ecology: Philadelphia, Saunders, 837 p.}"
}

@misc{clements1949dynamics17,
    author = "Clements, F. E",
    title = "Dynamics of Vegetation",
    year = "1949",
    howpublished = "New York, Hafner, 296 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Clements, F. E., 1949, Dynamics of Vegetation: New York, Hafner, 296 p.}"
}

@book{clarke1954elements16,
    author = "Clarke, G",
    title = "Elements of Ecology",
    year = "1954",
    publisher = "New York, Wiley, 560 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Clarke, G., 1954, Elements of Ecology: New York, Wiley, 560 p.}"
}

@misc{elton1958the30,
    author = "Elton, C. S",
    title = "The ecology of invasions by animals and plants",
    year = "1958",
    howpublished = "London, England, Methuen, 181 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elton, C. S., 1958, The ecology of invasions by animals and plants: London, England, Methuen, 181 p.}"
}

@misc{bartlett1960stochastic4,
    author = "Bartlett, M. S",
    title = "Modelos Estocásticos de Populações em Ecologia e Epidemiologia",
    year = "1960",
    howpublished = "Londres, Methuen, 90 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Bartlett, M. S., 1960, Modelos Estocásticos de Populações em Ecologia e Epidemiologia: Londres, Methuen, 90 p.}"
}

@misc{carson1962silent11,
    author = "Carson, R",
    title = "Primavera Silenciosa",
    year = "1962",
    howpublished = "Boston, Houghton-Mifflin",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Carson, R., 1962, Primavera Silenciosa: Boston, Houghton-Mifflin.}"
}

@book{doi104159harvard9780674865327,
    author = "Mayr, Ernst",
    title = "Animal Species and Evolution",
    year = "1963",
    booktitle = "Harvard University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.4159/harvard.9780674865327",
    doi = "10.4159/harvard.9780674865327",
    openalex = "W2007993714"
}

@misc{caughley1966mortality14,
    author = "Caughley, G",
    title = "Padrões de mortalidade em mamíferos",
    year = "1966",
    howpublished = "Ecologia, v. 47, p. 906-918",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Caughley, G., 1966, Padrões de mortalidade em mamíferos: Ecologia, v. 47, p. 906-918.}"
}

@misc{cody1966a18,
    author = "Cody, M. L",
    title = "Uma teoria geral do tamanho da ninhada",
    year = "1966",
    howpublished = "Evolução, v. 20, p. 174- 184",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Cody, M. L., 1966, Uma teoria geral do tamanho da ninhada: Evolução, v. 20, p. 174- 184.}"
}

A radiação adaptativa tem sido definida como a divergência evolutiva de membros de uma linha filética em diferentes nichos ou zonas adaptativas (Mayr, 1963:633). Embora tenha sido costume pensar na radiação adaptativa apenas em termos de espécies ou raças, um crescente corpo de evidências indica que algum grau de radiação ocorre também dentro de populações, à medida que os indivíduos passam a ocupar diferentes subnichos ou subzonas adaptativas, subdividindo e, talvez, expandindo o nicho ou zona total utilizado pela população. Provavelmente todas as espécies apresentam algum grau de variação ecológica, seja polimórfica ou contínua. Mas este fenômeno está sendo estudado apenas em poucos grupos de organismos, notadamente em Drosophila, na qual o polimorfismo cromossômico tem sido interpretado como um meio de adaptação de populações a ambientes heterogêneos (Dobzhansky, * 1961, 1963, 1965). As bases teóricas para pesquisas sobre variação ecológica em populações animais foram fornecidas por Ludwig (1950), Levene (1953)) da Cunha e Dobzhansky (1954), Dempster (1955), Li (1955), Carson (1959) e Levins (1962, 1963). Em aves, como em outros vertebrados, os sexos geralmente diferem em tamanho, se não também em proporções de partes do corpo, incluindo aquelas usadas na alimentação (Amadon, 1959); e, especialmente onde o grau de dimorfismo sexual, que é uma forma de polimorfismo (Ford, 1961: 12), é acentuado, parece provável que a divergência morfológica tenha significado ecológico na adaptação dos sexos a diferentes subnichos. No entanto, há apenas uma referência ocasional na literatura ao dimorfismo sexual em relação à utilização de nicho (por exemplo, Pitelka, 1950; Rand, 19.52), e, em geral, o problema inteiro da variação ecológica em populações tem sido negligenciado por ecólogos de vertebrados. O propósito principal deste relatório é apresentar evidências de uma função adaptativa do dimorfismo sexual em tamanho em picos, relacionando graus de dimorfismo morfológico e divergência sexual no comportamento de forrageamento em duas espécies melanépinas, o Pico-da-Haiti (Centurus striatus) fortemente dimórfico de Haiti e República Dominicana e o Pico-Fronte-Dourada (Ce&zmus awifrons) moderadamente dimórfico da América do Norte e Central continental. Além disso, o artigo revisa outras evidências de que o dimorfismo sexual em aves está relacionado à utilização diferencial de nicho. Finalmente, alguns aspectos evolutivos do dimorfismo sexual e da variação ecológica são considerados.

@article{doi1023071365712,
    author = "Selander, Robert K.",
    title = "Dimorfismo Sexual e Utilização Diferencial de Nicho em Aves",
    year = "1966",
    journal = "Aplicações Ornitológicas",
    abstract = "A radiação adaptativa tem sido definida como a divergência evolutiva de membros de uma linha filética em diferentes nichos ou zonas adaptativas (Mayr, 1963:633). Embora tenha sido costume pensar na radiação adaptativa apenas em termos de espécies ou raças, um crescente corpo de evidências indica que algum grau de radiação ocorre também dentro de populações, à medida que os indivíduos passam a ocupar diferentes subnichos ou subzonas adaptativas, subdividindo e, talvez, expandindo o nicho ou zona total utilizado pela população. Provavelmente todas as espécies apresentam algum grau de variação ecológica, seja polimórfica ou contínua. Mas este fenômeno está sendo estudado apenas em poucos grupos de organismos, notadamente em Drosophila, na qual o polimorfismo cromossômico tem sido interpretado como um meio de adaptação de populações a ambientes heterogêneos (Dobzhansky, * 1961, 1963, 1965). As bases teóricas para pesquisas sobre variação ecológica em populações animais foram fornecidas por Ludwig (1950), Levene (1953)) da Cunha e Dobzhansky (1954), Dempster (1955), Li (1955), Carson (1959) e Levins (1962, 1963). Em aves, como em outros vertebrados, os sexos geralmente diferem em tamanho, se não também em proporções de partes do corpo, incluindo aquelas usadas na alimentação (Amadon, 1959); e, especialmente onde o grau de dimorfismo sexual, que é uma forma de polimorfismo (Ford, 1961: 12), é acentuado, parece provável que a divergência morfológica tenha significado ecológico na adaptação dos sexos a diferentes subnichos. No entanto, há apenas uma referência ocasional na literatura ao dimorfismo sexual em relação à utilização de nicho (por exemplo, Pitelka, 1950; Rand, 19.52), e, em geral, o problema inteiro da variação ecológica em populações tem sido negligenciado por ecólogos de vertebrados. O propósito principal deste relatório é apresentar evidências de uma função adaptativa do dimorfismo sexual em tamanho em picos, relacionando graus de dimorfismo morfológico e divergência sexual no comportamento de forrageamento em duas espécies melanépinas, o Pico-da-Haiti (Centurus striatus) fortemente dimórfico de Haiti e República Dominicana e o Pico-Fronte-Dourada (Ce\&zmus awifrons) moderadamente dimórfico da América do Norte e Central continental. Além disso, o artigo revisa outras evidências de que o dimorfismo sexual em aves está relacionado à utilização diferencial de nicho. Finalmente, alguns aspectos evolutivos do dimorfismo sexual e da variação ecológica são considerados.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1365712",
    doi = "10.2307/1365712",
    openalex = "W2084499670",
    references = "crowell1961the, crowell1962reduced, doi101086281792, doi101111j155856461963tb03295x, doi101111j155856461963tb03296x, doi101537ase188722495, doi1023071931600, doi1023071931976, doi1023071932042, doi1023072407089, doi1023072407090, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle110063, doi105962bhltitle27468, doi107312rens91062, openalexw1595343243, openalexw1973833797, openalexw2128666103"
}

@misc{clark1967the15,
    author = "Clark, L. R. e Geier, P. W. e Hughes, R. D. e Morris, R. F",
    title = "The Ecology of Insect Populations in Theory and Practice",
    year = "1967",
    howpublished = "London, Methuen, 232 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Clark, L. R., Geier, P. W., Hughes, R. D., e Morris, R. F., 1967, The Ecology of Insect Populations in Theory and Practice: London, Methuen, 232 p.}"
}

@misc{cody1968on19,
    author = "Cody, M. L",
    title = "On the methods of resource division in grassland bird communities",
    year = "1968",
    howpublished = "American Naturalist, v. 102, p. 107-147",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cody, M. L., 1968, On the methods of resource division in grassland bird communities: American Naturalist, v. 102, p. 107-147.}"
}

@misc{brown1970seeds8,
    author = "Brown, J. L",
    title = "Sementes de mudança. A revolução verde e o desenvolvimento nos anos 1970",
    year = "1970",
    howpublished = "Nova York, Praeger",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brown, J. L., 1970, Sementes de mudança. A revolução verde e o desenvolvimento nos anos 1970: Nova York, Praeger.}"
}

@misc{cody1970chilean20,
    author = "Cody, M. L",
    title = "Distribuição de aves do Chile",
    year = "1970",
    howpublished = "Ecologia, v. 51, p. 455-463",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cody, M. L., 1970, Distribuição de aves do Chile: Ecologia, v. 51, p. 455-463.}"
}

@misc{dale1970systems26,
    author = "Dale, M. B",
    title = "Análise de sistemas e ecologia",
    year = "1970",
    howpublished = "Ecologia, v. 51, p. 2-16",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Dale, M. B., 1970, Análise de sistemas e ecologia: Ecologia, v. 51, p. 2-16.}"
}

@misc{bakker1971ecology3,
    author = "Bakker, R. T",
    title = "Ecologia dos brontossauros",
    year = "1971",
    howpublished = "Nature, v. 229, p. 172-174",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Bakker, R. T., 1971, Ecologia dos brontossauros: Nature, v. 229, p. 172-174.}"
}

@misc{cailliet1971everymans9,
    author = "Cailliet, G. e Setzer, P. e Love, M",
    title = "Everyman's Guide to Ecological Living",
    year = "1971",
    howpublished = "New York, 119 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cailliet, G., Setzer, P., e Love, M., 1971, Everyman's Guide to Ecological Living: New York, 119 p.}"
}

Estimativas confiáveis da densidade populacional absoluta, distintas de índices de abundância relativa, têm sido virtualmente indisponíveis para aves terrestres não agrupadas, exceto na época de reprodução, quando os machos cantantes, que representam pares acasalados, restringem-se a territórios mais ou menos fixos onde eles ou seus ninhos podem ser contados. A falta de métodos de censo eficientes e razoavelmente precisos aplicáveis em qualquer estação tem seriamente prejudicado o progresso dos estudos quantitativos da ecologia populacional das aves. Este artigo, após revisar as potencialidades e limitações dos métodos atualmente disponíveis, descreve um novo método que é: 1) aplicável em todas as estações, 2) mais eficiente em termos de área coberta por unidade de esforço do que os métodos de contagem de ninhos ou territórios, e 3) comparável em precisão. O método utiliza o padrão de distribuição lateral de todos os pontos de detecção para cada espécie para derivar coeficientes de detectabilidade com os quais as contagens de trilhas podem ser convertidas diretamente em valores de densidade em unidades de aves por 100 acres. O método foi desenvolvido ao longo de um período de 3 anos enquanto o autor coletava dados sobre a distribuição ecológica de aves em pradarias de mesquite no sul do Texas, florestas de pinheiros na Flórida e nas Bahamas, e florestas mistas no Wisconsin e no Michigan.

@article{doi1023074083883,
    author = "Emlen, John T.",
    title = "Population Densities of Birds Derived from Transect Counts",
    year = "1971",
    journal = "The Auk",
    abstract = "Estimativas confiáveis da densidade populacional absoluta, distintas de índices de abundância relativa, têm sido virtualmente indisponíveis para aves terrestres não agrupadas, exceto na época de reprodução, quando os machos cantantes, que representam pares acasalados, restringem-se a territórios mais ou menos fixos onde eles ou seus ninhos podem ser contados. A falta de métodos de censo eficientes e razoavelmente precisos aplicáveis em qualquer estação tem seriamente prejudicado o progresso dos estudos quantitativos da ecologia populacional das aves. Este artigo, após revisar as potencialidades e limitações dos métodos atualmente disponíveis, descreve um novo método que é: 1) aplicável em todas as estações, 2) mais eficiente em termos de área coberta por unidade de esforço do que os métodos de contagem de ninhos ou territórios, e 3) comparável em precisão. O método utiliza o padrão de distribuição lateral de todos os pontos de detecção para cada espécie para derivar coeficientes de detectabilidade com os quais as contagens de trilhas podem ser convertidas diretamente em valores de densidade em unidades de aves por 100 acres. O método foi desenvolvido ao longo de um período de 3 anos enquanto o autor coletava dados sobre a distribuição ecológica de aves em pradarias de mesquite no sul do Texas, florestas de pinheiros na Flórida e nas Bahamas, e florestas mistas no Wisconsin e no Michigan.",
    url = "https://doi.org/10.2307/4083883",
    doi = "10.2307/4083883",
    openalex = "W2326423025"
}

@inproceedings{tappen1971microplankton38,
    author = "Tappen, H",
    title = "Microplankton, sucessão ecológica e evolução",
    year = "1971",
    booktitle = "North American Paleontological Convention, Proceedings, p. 1058-1103; Parte H",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Tappen, H., 1971, Microplankton, sucessão ecológica e evolução: North American Paleontological Convention, Proceedings, p. 1058-1103; Parte H.}"
}

@misc{campbell1972society10,
    author = "Campbell, R. R. e Wade, J. L",
    title = "Sociedade e Ambiente",
    year = "1972",
    howpublished = "The Coming Collision: Boston, Allyn and Bacon, 375 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Campbell, R. R., e Wade, J. L., 1972, Sociedade e Ambiente: The Coming Collision: Boston, Allyn and Bacon, 375 p.}"
}

@book{caswell1972an12,
    author = "Caswell, H. and Koenig, H. E. and Resh, J. A. and Ross, Q. E",
    title = "An Introduction to Systems Science for Ecologists, in Patten, B., ed., Systems Analysis and Simulation in Ecology",
    year = "1972",
    publisher = "New York, Academic Press, v. 2, p. 4-78; 592 pp",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Caswell, H., Koenig, H. E., Resh, J. A., and Ross, Q. E., 1972, An Introduction to Systems Science for Ecologists, in Patten, B., ed., Systems Analysis and Simulation in Ecology: New York, Academic Press, v. 2, p. 4-78; 592 pp.}"
}

@book{colinvaux1973introduction22,
    author = "Colinvaux, P. A",
    title = "Introdução à Ecologia",
    year = "1973",
    publisher = "Nova York, Wiley, 621 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Colinvaux, P. A., 1973, Introdução à Ecologia: Nova York, Wiley, 621 p.}"
}

@misc{collier1973dynamic23,
    author = "Collier, B. e Cox, G. W. e Johnson, A. W. e Miller, P. C",
    title = "Dynamic Ecology",
    year = "1973",
    howpublished = "Englewood Cliffs, New Jersey, Prentice-Hall, 563 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Collier, B., Cox, G. W., Johnson, A. W., e Miller, P. C., 1973, Dynamic Ecology: Englewood Cliffs, New Jersey, Prentice-Hall, 563 p.}"
}

Os conceitos pelos quais MacArthur e Wilson transformaram a ciência da ecologia na última década, e os resultados de estudos ecológicos como o meu sobre comunidades de aves na Nova Guiné, têm implicações para as políticas de conservação. Por exemplo, a floresta tropical primária, o habitat mais rico em espécies e ecologicamente complexo do planeta, serviu por milhões de anos como a fonte evolutiva definitiva dos grupos dominantes de plantas e animais do mundo. Atualmente, nos trópicos, as florestas tropicais estão sendo destruídas a uma taxa tal que pouco restará em algumas décadas. Quando as florestas tropicais forem reduzidas a tratos isolados separados por áreas abertas, a distribuição de espécies obrigatórias de floresta tropical tenderá a assemelhar-se às distribuições de aves em ilhas de ponte terrestre na Nova Guiné após o corte das pontes terrestres. Quanto menor o trato, mais rapidamente as espécies florestais tenderão a desaparecer e ser substituídas por espécies de segunda geração amplamente distribuídas que menos precisam de proteção (13). Este processo ominoso é ilustrado pela Ilha Barro Colorado, uma antiga colina no Panamá que se tornou uma ilha quando a construção do Canal do Panamá inundou os vales circundantes para criar o Lago Gatun. Nos 60 anos seguintes, várias espécies de aves florestais já desapareceram de Barro Colorado e não conseguiram recolonizar através do curto intervalo de água entre a floresta na costa próxima do Lago Gatun. As consequências da relação espécie-área (Fig. 1) devem ser consideradas durante o planejamento de parques de floresta tropical (13). Em uma área geográfica relativamente homogênea em relação à fauna, um grande parque seria preferível a uma área equivalente na forma de vários parques menores. Faixas contínuas não florestais através do parque (por exemplo, largas faixas de rodovia) converteriam uma "ilha" de floresta tropical em duas ilhas de tamanho reduzido e devem ser evitadas. Se outras considerações exigirem que uma área seja dividida em vários parques pequenos, conectá-los por corredores florestais pode melhorar significativamente sua função de conservação com pouco custo adicional em terras retiradas do desenvolvimento. Estudos ecológicos modernos também podem ser relevantes para a compreensão das populações humanas. Por exemplo, durante um longo período de evolução humana, parece ter havido não uma, mas duas linhagens de hominídeos coexistentes na África, a linhagem Australopithecus robustus-A. boisei ("Zinjanthropus"), que se extinguiu, e a linhagem Australopithecus africanus-A. habilis, que levou ao Homo sapiens (27). A necessidade de manter diferenças de nicho entre essas linhagens deve ter fornecido uma das pressões seletivas mais importantes sobre os ancestrais do homem moderno no Plioceno tardio e Pleistoceno inicial. Assim, qualquer tentativa de entender a evolução humana deve confrontar o problema de quais eram esses mecanismos ecológicos segregantes. Até que ponto as espécies contemporâneas das duas linhagens eram separadas por habitat, por dieta, por diferença de tamanho ou por técnica de forrageamento, e suas distribuições espaciais locais eram amplamente sobrepostas ou então afiadas por interações comportamentais, como no caso dos saltitadores Crateroscelis da Fig. 6? Para levar outro exemplo, há paralelos marcantes entre as distribuições atuais de populações humanas e de populações de aves nas ilhas de Vitiaz e Dampier, estreitos entre a Nova Guiné e a Nova Bretanha. Algumas dessas ilhas foram esterilizadas por explosões vulcânicas cataclísmicas nos últimos séculos. As aves que recolonizaram essas ilhas foram caracterizadas como especialistas de costa e de ilhas pequenas de alto potencial reprodutivo, altas capacidades de dispersão e baixa capacidade competitiva, ao contrário das aves do continente da Nova Guiné, geograficamente mais próximas, competitivamente superiores, de dispersão lenta e reprodução (10, 11, 13). Restará para ver se os povos das ilhas de Vitiaz-Dampier, os polinésios e outras populações humanas que colonizam habitats insulares ou instáveis também possuem ecologias populacionais distintas.

@article{doi101126science1794075759,
    author = "Diamond, Jared M.",
    title = "Ecologia Distribucional das Aves da Nova Guiné",
    year = "1973",
    journal = "Science",
    abstract = {Os conceitos pelos quais MacArthur e Wilson transformaram a ciência da ecologia na última década, e os resultados de estudos ecológicos como o meu sobre comunidades de aves na Nova Guiné, têm implicações para as políticas de conservação. Por exemplo, a floresta tropical primária, o habitat mais rico em espécies e ecologicamente complexo do planeta, serviu por milhões de anos como a fonte evolutiva definitiva dos grupos dominantes de plantas e animais do mundo. Atualmente, nos trópicos, as florestas estão sendo destruídas a uma taxa tal que pouco restará em algumas décadas. Quando as florestas forem reduzidas a fragmentos isolados separados por áreas abertas, a distribuição de espécies obrigatórias de floresta tropical tenderá a assemelhar-se às distribuições de aves nas ilhas de ponte terrestre da Nova Guiné após a ruptura das pontes terrestres. Quanto menor o fragmento, mais rapidamente as espécies florestais tenderão a desaparecer e ser substituídas pelas espécies de segunda geração amplamente distribuídas que menos precisam de proteção (13). Este processo ominoso é ilustrado pela Ilha Barro Colorado, uma antiga colina no Panamá que se tornou uma ilha quando a construção do Canal do Panamá inundou os vales circundantes para criar o Lago Gatun. Nos 60 anos seguintes, várias espécies de aves florestais já desapareceram de Barro Colorado e não conseguiram recolonizar através da pequena lacuna aquática intermediária da floresta na costa próxima do Lago Gatun. As consequências da relação espécie-área (Fig. 1) devem ser consideradas durante o planejamento de parques de floresta tropical (13). Em uma área geográfica relativamente homogênea em relação à fauna, um grande parque seria preferível a uma área equivalente na forma de vários parques menores. Faixas contínuas não florestais através do parque (por exemplo, faixas largas de rodovias) converteriam uma "ilha" de floresta tropical em duas ilhas de tamanho reduzido e devem ser evitadas. Se outras considerações exigirem que uma área seja dividida em vários parques pequenos, conectá-los por corredores florestais pode melhorar significativamente sua função de conservação com pouco custo adicional em terra retirada do desenvolvimento. Estudos ecológicos modernos também podem ser relevantes para a compreensão das populações humanas. Por exemplo, durante um longo período de evolução humana, parece ter havido não uma, mas duas linhagens coexistentes de hominídeos na África, a linhagem Australopithecus robustus-A. boisei ("Zinjanthropus"), que se extinguiu, e a linhagem Australopithecus africanus-A. habilis, que levou ao Homo sapiens (27). A necessidade de manter diferenças de nicho entre essas linhagens deve ter fornecido uma das pressões seletivas mais importantes sobre os ancestrais do homem moderno no Plioceno tardio e Pleistoceno inicial. Assim, qualquer tentativa de entender a evolução humana deve confrontar o problema de quais eram esses mecanismos ecológicos segregantes. Até que ponto as espécies contemporâneas das duas linhagens eram separadas por habitat, por dieta, por diferença de tamanho ou por técnica de forrageamento, e suas distribuições espaciais locais eram amplamente sobrepostas ou então afiadas por interações comportamentais, como no caso dos saltitadores Crateroscelis da Fig. 6? Para tomar outro exemplo, há paralelos marcantes entre as distribuições atuais de populações humanas e de populações de aves nas ilhas de Vitiaz e Dampier, estreitos entre a Nova Guiné e a Nova Bretanha. Algumas dessas ilhas foram esterilizadas por explosões vulcânicas cataclísmicas nos últimos séculos. As aves que recolonizaram essas ilhas foram caracterizadas como especialistas de costa e de ilhas pequenas de alto potencial reprodutivo, altas capacidades de dispersão e baixa capacidade competitiva, ao contrário das aves geograficamente mais próximas, competitivamente superiores, de dispersão lenta e reprodução da Nova Guiné continental (10, 11, 13). Restará para ver se os povos das ilhas de Vitiaz-Dampier, os polinésios e outras populações humanas que colonizam habitats insulares ou instáveis também possuem ecologias populacionais distintas.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.179.4075.759",
    doi = "10.1126/science.179.4075.759",
    openalex = "W2082049451",
    references = "doi101073pnas5161207, doi101073pnas6951109, doi101086282454, doi101086282738, doi101111j1469185x1965tb00815x, doi101111j155856461963tb03295x, doi101722611310, doi1023071931976, doi1023071934090, doi1023072407089, doi104159harvard9780674865327"
}

@inproceedings{stanley1973an37,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Uma teoria ecológica para a origem súbita da vida multicelular no Precambriano Tardio",
    year = "1973",
    booktitle = "Proceedings of the National Academy of Sciences, v. 70, p. 1486-1489",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Stanley, S. M., 1973, Uma teoria ecológica para a origem súbita da vida multicelular no Precambriano Tardio: Proceedings of the National Academy of Sciences, v. 70, p. 1486-1489.}"
}

@misc{ellenberger1974le28,
    author = "Ellenberger, P",
    title = "Le Stormberg superior-I le biome de la zone B/1",
    year = "1974",
    howpublished = "Palaeovert., Mem. extraord. Montpellier, v. 5, p. 1-141",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ellenberger, P., 1974, Le Stormberg superior-I le biome de la zone B/1: Palaeovert., Mem. extraord. Montpellier, v. 5, p. 1-141.}"
}

@article{berry1975ecological5,
    author = "Berry, R. J. e Jakobson, M. E",
    title = "Genética ecológica de uma população insular do rato-doméstico (Mus musculus)",
    year = "1975",
    journal = "Journal of Zoology, v. 175, p. 532-540",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Berry, R. J., e Jakobson, M. E., 1975, Genética ecológica de uma população insular do rato-doméstico (Mus musculus): Journal of Zoology, v. 175, p. 532-540.}"
}

@article{doi101038260204c0,
    author = "Cody, Martin L. e Diamond, Jared M.",
    title = "Ecology and Evolution of Communities",
    year = "1976",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/260204c0",
    doi = "10.1038/260204c0",
    openalex = "W2321937847"
}

@misc{peters1976tautology36,
    author = "Peters, R. H",
    title = "Tautologia na Evolução e Ecologia",
    year = "1976",
    howpublished = "American Naturalist, v. 110, p. 1-12",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Peters, R. H., 1976, Tautologia na Evolução e Ecologia: American Naturalist, v. 110, p. 1-12.}"
}

@book{houstan1979the31,
    author = "Houstan, D. C",
    title = "The Adaptations of Scavengers, in Sinclair, A. R. E., and Norton-Griffiths, M., eds., Serengeti",
    year = "1979",
    publisher = "Dynamics of an Ecosystem: Chicago, University of Chicago Press, p. 263-286",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Houstan, D. C., 1979, The Adaptations of Scavengers, in Sinclair, A. R. E., and Norton-Griffiths, M., eds., Serengeti: Dynamics of an Ecosystem: Chicago, University of Chicago Press, p. 263-286.}"
}

@techreport{morman1979distribution35,
    author = "Morman, R. H",
    title = "Distribuição e ecologia de lampreias na península inferior de Michigan, 1957-1975",
    year = "1979",
    howpublished = "Great Lakes Fishery Commission, Technical Report No. 33, 59 pp",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Morman, R. H., 1979, Distribuição e ecologia de lampreias na península inferior de Michigan, 1957-1975. Great Lakes Fishery Commission, Technical Report No. 33, 59 pp.}"
}

Modelos de distribuição de espécies (SDMs) são ferramentas numéricas que combinam observações de ocorrência ou abundância de espécies com estimativas ambientais. Eles são usados para obter insights ecológicos e evolutivos e para prever distribuições em paisagens,...Leia mais

@article{doi101146annureves13110182000245,
    author = "Greenwood, P. J. e Harvey, Paul",
    title = "A Natalidade e a Dispersão Reprodutiva de Aves",
    year = "1982",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Modelos de distribuição de espécies (SDMs) são ferramentas numéricas que combinam observações de ocorrência ou abundância de espécies com estimativas ambientais. Eles são usados para obter insights ecológicos e evolutivos e para prever distribuições em paisagens,...Leia mais",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.13.110182.000245",
    doi = "10.1146/annurev.es.13.110182.000245",
    openalex = "W2116166795",
    references = "doi1010160040580978900394, doi1023072828, openalexw2014317435"
}

@misc{leather1986the34,
    author = "Leather, D",
    title = "The tale of the Tasaday",
    year = "1986",
    howpublished = "The Geographical Magazine, v. 58, no. 10, p. 490-491",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Leather, D., 1986, The tale of the Tasaday: The Geographical Magazine, v. 58, no. 10, p. 490-491.}"
}

Modelos de distribuição de espécies (SDMs) são ferramentas numéricas que combinam observações de ocorrência ou abundância de espécies com estimativas ambientais. Eles são usados para obter insights ecológicos e evolutivos e prever distribuições em paisagens,...Leia mais

@article{doi101146annureves18110187002421,
    author = "Avise, John C. e Arnold, Jonathan e Ball, Robert e Bermingham, Eldredge e Lamb, Trip e Neigel, Joseph E. e Reeb, Carol A. e Saunders, Nancy C.",
    title = "GEOGRAFIA FISIOLÓGICA INTRASPECÍFICA: A Ponte do DNA Mitocôndrial entre a Genética de Populações e a Sistemática",
    year = "1987",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Modelos de distribuição de espécies (SDMs) são ferramentas numéricas que combinam observações de ocorrência ou abundância de espécies com estimativas ambientais. Eles são usados para obter insights ecológicos e evolutivos e prever distribuições em paisagens,...Leia mais",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.18.110187.002421",
    doi = "10.1146/annurev.es.18.110187.002421",
    openalex = "W2150477652",
    references = "doi10100703064746897, doi101007bf01734101, doi101038095550b0, doi101038325031a0, doi101073pnas7641967, doi101093aibsbulletin2214b, doi101093genetics1052437, doi101098rspb19790086, doi101111j155856461975tb00851x, doi101111j155856461983tb05533x, doi1023072407692, doi104159harvard9780674865327, doi107312nei92038, openalexw1495050269, openalexw2062594085, openalexw3135630760"
}

Os parasitoides e predadores de herbívoros evoluíram e funcionam dentro de um contexto multitrófico. Consequentemente, sua fisiologia e comportamento são influenciados por elementos de outros níveis tróficos, como sua presa herbívora (segundo nível trófico) e sua fonte alimentar vegetal (primeiro nível trófico) (126). Os inimigos naturais baseiam suas decisões de forrageamento em informações desses diferentes níveis tróficos, e a informação química desempenha um papel importante. Esta revisão restringe-se à ecologia da informação química dos primeiros e segundos níveis tróficos. A importância dos chamados infoquímicos, uma subcategoria de semioquímicos, no forrageamento por parasitoides e predadores tem sido bem documentada (por exemplo, revisados em 31,78, 111,183,185), e não pretendemos repetir os detalhes. Mas, devido à falta de hipóteses testáveis, toda essa pesquisa é conduzida de forma bastante aleatória: o quebra-cabeça total do uso de infoquímicos não foi resolvido para nenhuma espécie de inimigo natural. Aqui, abordamos o uso de infoquímicos por inimigos naturais sob uma perspectiva evolutiva e ecológica. Nosso conceito básico é que a informação dos primeiros e segundos níveis tróficos difere em disponibilidade e confiabilidade, uma diferença que molda a maneira como os infoquímicos são usados por uma espécie. Geramos hipóteses sobre (a)

@article{doi101146annureven37010192001041,
    author = "Vet, L.E.M. e Dicke, Marcel",
    title = "Ecologia do Uso de Infoquímicos por Inimigos Naturais em um Contexto Tritrófico",
    year = "1992",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Os parasitoides e predadores de herbívoros evoluíram e funcionam dentro de um contexto multitrófico. Consequentemente, sua fisiologia e comportamento são influenciados por elementos de outros níveis tróficos, como sua presa herbívora (segundo nível trófico) e sua fonte alimentar vegetal (primeiro nível trófico) (126). Os inimigos naturais baseiam suas decisões de forrageamento em informações desses diferentes níveis tróficos, e a informação química desempenha um papel importante. Esta revisão restringe-se à ecologia da informação química dos primeiros e segundos níveis tróficos. A importância dos chamados infoquímicos, uma subcategoria de semioquímicos, no forrageamento por parasitoides e predadores tem sido bem documentada (por exemplo, revisados em 31,78, 111,183,185), e não pretendemos repetir os detalhes. Mas, devido à falta de hipóteses testáveis, toda essa pesquisa é conduzida de forma bastante aleatória: o quebra-cabeça total do uso de infoquímicos não foi resolvido para nenhuma espécie de inimigo natural. Aqui, abordamos o uso de infoquímicos por inimigos naturais sob uma perspectiva evolutiva e ecológica. Nosso conceito básico é que a informação dos primeiros e segundos níveis tróficos difere em disponibilidade e confiabilidade, uma diferença que molda a maneira como os infoquímicos são usados por uma espécie. Geramos hipóteses sobre (a)",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.en.37.010192.001041",
    doi = "10.1146/annurev.en.37.010192.001041",
    openalex = "W2163028358",
    references = "doi101086282454, doi101126science185414527, doi101126science2114485887"
}

Argumenta-se que o problema do padrão e da escala é o problema central na ecologia, unificando a biologia de populações e a ciência dos ecossistemas, e unindo a ecologia básica e aplicada. Desafios aplicados, como a previsão das causas ecológicas e consequências das mudanças climáticas globais, exigem a interface de fenômenos que ocorrem em escalas muito diferentes de espaço, tempo e organização ecológica. Além disso, não existe uma única escala natural na qual os fenômenos ecológicos devam ser estudados; os sistemas geralmente apresentam variabilidade característica em uma gama de escalas espaciais, temporais e organizacionais. O observador impõe um viés perceptual, um filtro através do qual o sistema é visto. Isso tem significado evolutivo fundamental, pois todo organismo é um "observador" do ambiente, e adaptações do histórico de vida, como dispersão e dormência, alteram as escalas perceptuais da espécie e a variabilidade observada. Isso também tem significado fundamental para nosso próprio estudo de sistemas ecológicos, pois os padrões que são únicos para qualquer gama de escalas terão causas e consequências biológicas únicas. A chave para a previsão e compreensão reside na elucidação dos mecanismos subjacentes aos padrões observados. Tipicamente, esses mecanismos operam em escalas diferentes daquelas nas quais os padrões são observados; em alguns casos, os padrões devem ser compreendidos como emergindo dos comportamentos coletivos de grandes conjuntos de unidades de menor escala. Em outros casos, o padrão é imposto por restrições de maior escala. O exame de tais fenômenos requer o estudo de como o padrão e a variabilidade mudam com a escala de descrição, e o desenvolvimento de leis para simplificação, agregação e escalonamento. Exemplos são dados das literaturas marinha e terrestre.

@article{doi1023071941447,
    author = "Levin, Simon A.",
    title = "The Problem of Pattern and Scale in Ecology: The Robert H. MacArthur Award Lecture",
    year = "1992",
    journal = "Ecology",
    abstract = {It is argued that the problem of pattern and scale is the central problem in ecology, unifying population biology and ecosystems science, and marrying basic and applied ecology. Applied challenges, such as the prediction of the ecological causes and consequences of global climate change, require the interfacing of phenomena that occur on very different scales of space, time, and ecological organization. Furthermore, there is no single natural scale at which ecological phenomena should be studied; systems generally show characteristic variability on a range of spatial, temporal, and organizational scales. The observer imposes a perceptual bias, a filter through which the system is viewed. This has fundamental evolutionary significance, since every organism is an "observer" of the environment, and life history adaptations such as dispersal and dormancy alter the perceptual scales of the species, and the observed variability. It likewise has fundamental significance for our own study of ecological systems, since the patterns that are unique to any range of scales will have unique causes and biological consequences. The key to prediction and understanding lies in the elucidation of mechanisms underlying observed patterns. Typically, these mechanisms operate at different scales than those on which the patterns are observed; in some cases, the patterns must be understood as emerging form the collective behaviors of large ensembles of smaller scale units. In other cases, the pattern is imposed by larger scale constraints. Examination of such phenomena requires the study of how pattern and variability change with the scale of description, and the development of laws for simplification, aggregation, and scaling. Examples are given from the marine and terrestrial literatures.},
    url = "https://doi.org/10.2307/1941447",
    doi = "10.2307/1941447",
    openalex = "W2322480672",
    references = "doi101007bfb0091924, doi101086282400, doi101098rstb19520012, doi101111j146918091937tb02153x, doi101111j155856461964tb01674x, doi1015159781400881376, doi1023071941447, doi1023072529912, doi105860choice295104, doi107551mitpress30140010001, openalexw1558456135, openalexw1576847343"
}

@article{doi101007bf02338839,
    author = "Rannala, Bruce e Yang, Ziheng",
    title = "Distribuição de probabilidade de árvores evolutivas moleculares: Um novo método de inferência filogenética",
    year = "1996",
    journal = "Journal of Molecular Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02338839",
    doi = "10.1007/bf02338839",
    openalex = "W2150783480",
    references = "doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093sysbio422182, doi1023072992540"
}

▪ Resumo À medida que melhores hipóteses filogenéticas se tornam disponíveis para muitos grupos de organismos, os estudos em ecologia de comunidades podem ser informados pelo conhecimento das relações evolutivas entre espécies coexistentes. Notamos três abordagens primárias para integrar informações filogenéticas em estudos de organização de comunidades: 1. examinar a estrutura filogenética de assembleias de comunidades, 2. explorar a base filogenética da estrutura de nicho de comunidades e 3. adicionar um contexto de comunidade a estudos de evolução de traços e biogeografia. Reconhecemos um padrão comum de conservadorismo filogenético em caracteres ecológicos e destacamos os desafios de usar filogenias de linhagens parciais. Também revisamos abordagens filogenéticas para três propriedades emergentes de comunidades: diversidade de espécies, distribuições de abundância relativa e tamanhos de distribuição. Avanços metodológicos na construção de supérbores filogenéticos, reconstrução de caracteres, modelos nulos para montagem de comunidades e evolução de caracteres, e métricas de estrutura filogenética de comunidades sustentam o recente progresso nessas áreas. Destacamos o potencial de ecólogos de comunidades se beneficiarem do conhecimento filogenético e sugerimos várias vias para pesquisa futura.

@article{doi101146annurevecolsys33010802150448,
    author = "Webb, Campbell O. e Ackerly, David D. e McPeek, Mark A. e Donoghue, Michael J.",
    title = "Filogenias e Ecologia de Comunidades",
    year = "2002",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Resumo À medida que melhores hipóteses filogenéticas se tornam disponíveis para muitos grupos de organismos, os estudos em ecologia de comunidades podem ser informados pelo conhecimento das relações evolutivas entre espécies coexistentes. Notamos três abordagens primárias para integrar informações filogenéticas em estudos de organização de comunidades: 1. examinar a estrutura filogenética de assembleias de comunidades, 2. explorar a base filogenética da estrutura de nicho de comunidades e 3. adicionar um contexto de comunidade a estudos de evolução de traços e biogeografia. Reconhecemos um padrão comum de conservadorismo filogenético em caracteres ecológicos e destacamos os desafios de usar filogenias de linhagens parciais. Também revisamos abordagens filogenéticas para três propriedades emergentes de comunidades: diversidade de espécies, distribuições de abundância relativa e tamanhos de distribuição. Avanços metodológicos na construção de supérbores filogenéticos, reconstrução de caracteres, modelos nulos para montagem de comunidades e evolução de caracteres, e métricas de estrutura filogenética de comunidades sustentam o recente progresso nessas áreas. Destacamos o potencial de ecólogos de comunidades se beneficiarem do conhecimento filogenético e sugerimos várias vias para pesquisa futura.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150448",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150448",
    openalex = "W2109628725",
    references = "doi10100797814615696881, doi101007978303487527124, doi101007bf02806171, doi101016s0169534701021619, doi101038363342a0, doi10108010292389509380518, doi101086282106, doi101086282505, doi101086284325, doi101086285258, doi101086285357, doi101086627905, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oso97801985464120010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101093oxfordjournalsmolbeva025892, doi101098rstb19950125, doi101111j001438202001tb00826x, doi101111j109583122001tb01368x, doi101126science20343871299, doi101126science2354785167, doi101126science2785338692, doi101126science27953592115, doi101126science28554311265, doi101146annurevecolsys311343, doi1015159781400881376, doi1023071446122, doi1023071939377, doi1023072412182, doi1023072413039, doi1023072485224, doi1023073071998, doi1023073544421, doi1023075503, doi102307jctv1nzfgj7, doi105860choice295104, doi105860choice375647, doi105860choice392183, openalexw2273605253, openalexw3035987306"
}

A previsão de distribuições de espécies é central para diversas aplicações em ecologia, evolução e ciência da conservação. Existe um acesso eletrônico crescente a vastos conjuntos de registros de ocorrência em museus e herbários, porém há pouca orientação eficaz sobre como melhor utilizar essas informações no contexto de numerosas abordagens para modelar distribuições. Para atender a essa necessidade, comparamos 16 métodos de modelagem em 226 espécies de 6 regiões do mundo, criando o conjunto mais abrangente de comparações de modelos até hoje. Usamos dados de presença‐apenas para ajustar modelos e dados independentes de presença‐ausência para avaliar as previsões. Além de métodos de modelagem bem estabelecidos, como modelos aditivos generalizados e GARP e BIOCLIM, exploramos métodos que foram desenvolvidos recentemente ou raramente foram aplicados à modelagem de distribuições de espécies. Estes incluem métodos de aprendizado de máquina e modelos de comunidade, ambos os quais possuem características que podem torná-los particularmente adequados para informações ruidosas ou esparsas, como é típico dos dados de ocorrência de espécies. Dados de presença‐apenas foram eficazes para modelar distribuições de espécies para muitas espécies e regiões. Os métodos inovadores consistentemente superaram métodos mais estabelecidos. Os resultados de nossa análise são promissores para o uso de dados de museus e herbários, especialmente à medida que métodos adequados ao ruído inerente a tais dados melhoram.

@article{doi101111j20060906759004596x,
    author = "Elith, Jane e Graham, Catherine H. e Anderson, Robert P. e Dudı́k, Miroslav e Ferrier, Simon e Guisan, Antoine e Hijmans, Robert J. e Huettmann, Falk e Leathwick, John R. e Lehmann, Anthony e Li, Jin e Lohmann, Lúcia G. e Loiselle, Bette A. e Manion, Glenn e Moritz, Craig e Nakamura, Miguel e Nakazawa, Yoshinori e Overton, Jacob McC. e Peterson, A. Townsend e Phillips, Steven J. e Richardson, Karen e Scachetti‐Pereira, Ricardo e Schapire, Robert E. e Soberón, Jorge e Williams, Stephen E. e Wisz, Mary S. e Zimmermann, Niklaus E.",
    title = "Novos métodos melhoram a previsão de distribuições de espécies a partir de dados de ocorrência",
    year = "2006",
    journal = "Ecography",
    abstract = "A previsão de distribuições de espécies é central para diversas aplicações em ecologia, evolução e ciência da conservação. Existe um acesso eletrônico crescente a vastos conjuntos de registros de ocorrência em museus e herbários, porém há pouca orientação eficaz sobre como melhor utilizar essas informações no contexto de numerosas abordagens para modelar distribuições. Para atender a essa necessidade, comparamos 16 métodos de modelagem em 226 espécies de 6 regiões do mundo, criando o conjunto mais abrangente de comparações de modelos até hoje. Usamos dados de presença‐apenas para ajustar modelos e dados independentes de presença‐ausência para avaliar as previsões. Além de métodos de modelagem bem estabelecidos, como modelos aditivos generalizados e GARP e BIOCLIM, exploramos métodos que foram desenvolvidos recentemente ou raramente foram aplicados à modelagem de distribuições de espécies. Estes incluem métodos de aprendizado de máquina e modelos de comunidade, ambos os quais possuem características que podem torná-los particularmente adequados para informações ruidosas ou esparsas, como é típico dos dados de ocorrência de espécies. Dados de presença‐apenas foram eficazes para modelar distribuições de espécies para muitas espécies e regiões. Os métodos inovadores consistentemente superaram métodos mais estabelecidos. Os resultados de nossa análise são promissores para o uso de dados de museus e herbários, especialmente à medida que métodos adequados ao ruído inerente a tais dados melhoram.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.2006.0906-7590.04596.x",
    doi = "10.1111/j.2006.0906-7590.04596.x",
    openalex = "W2112315008",
    references = "doi101002joc1276, doi101016s0006320700000744, doi101038nature02121, doi101111j001438202004tb00461x, doi101111j09067590200503957x, doi101111j20060906759004272x, doi101148radiology14317063747, doi1023072669574, doi1023073802723, doi1023073803117, doi1023073808148, doi105860choice332720, openalexw2032279931"
}

A crescente disponibilidade de dados filogenéticos, poder computacional e ferramentas de informática facilitou uma rápida expansão de estudos que aplicam dados e métodos filogenéticos à ecologia de comunidades. São revisados vários domínios-chave nos quais as informações filogenéticas ajudam a resolver controvérsias de longa data na ecologia de comunidades, desafiam pressupostos anteriores e abrem novas áreas de investigação. Em particular, estudos em ecologia filogenética de comunidades ajudaram a revelar a multiplicidade de processos que impulsionam a montagem de comunidades e demonstraram a importância da evolução no processo de montagem. As abordagens filogenéticas também aumentaram a compreensão das consequências das interações de comunidades para a especiação, adaptação e extinção. Finalmente, a estrutura e composição filogenética das comunidades oferecem perspectivas promissoras para prever processos ecossistêmicos e impactos das mudanças globais. Permanecem desafios principais para o avanço destas áreas. Em particular, determinar em que medida as características ecologicamente relevantes são filogeneticamente conservadas ou convergentes, e em que escala temporal, é crítico para compreender as causas da estrutura filogenética das comunidades e suas consequências evolutivas e ecossistêmicas. Aproveitar as informações filogenéticas para compreender e prever mudanças na diversidade e dinâmica das comunidades é um passo crítico na gestão e restauração da biota da Terra em tempos de rápida mudança global.

@article{doi101111j14610248200901314x,
    author = "Cavender‐Bares, Jeannine and Kozak, Kenneth H. and Fine, Paul V. A. and Kembel, Steven W.",
    title = "The merging of community ecology and phylogenetic biology",
    year = "2009",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "A crescente disponibilidade de dados filogenéticos, poder computacional e ferramentas de informática facilitou uma rápida expansão de estudos que aplicam dados e métodos filogenéticos à ecologia de comunidades. São revisados vários domínios-chave nos quais as informações filogenéticas ajudam a resolver controvérsias de longa data na ecologia de comunidades, desafiam pressupostos anteriores e abrem novas áreas de investigação. Em particular, estudos em ecologia filogenética de comunidades ajudaram a revelar a multiplicidade de processos que impulsionam a montagem de comunidades e demonstraram a importância da evolução no processo de montagem. As abordagens filogenéticas também aumentaram a compreensão das consequências das interações de comunidades para a especiação, adaptação e extinção. Finalmente, a estrutura e composição filogenética das comunidades oferecem perspectivas promissoras para prever processos ecossistêmicos e impactos das mudanças globais. Permanecem desafios principais para o avanço destas áreas. Em particular, determinar em que medida as características ecologicamente relevantes são filogeneticamente conservadas ou convergentes, e em que escala temporal, é crítico para compreender as causas da estrutura filogenética das comunidades e suas consequências evolutivas e ecossistêmicas. Aproveitar as informações filogenéticas para compreender e prever mudanças na diversidade e dinâmica das comunidades é um passo crítico na gestão e restauração da biota da Terra em tempos de rápida mudança global.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01314.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01314.x",
    openalex = "W2102384105",
    references = "doi1010160006320792912013, doi101016jppees200710001, doi101016jtree200409011, doi101038nature02403, doi10108010635150802302427, doi101086282505, doi101086282687, doi101093aibsbulletin2214b, doi101098rspb20080630, doi101111j14610248200701020x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j15585646200800317x, doi101126science2304728895, doi101126science2354785167, doi101126science27953592115, doi101146annurevecolsys311343, doi101146annurevecolsys33010802150448, doi1015159781400881376, doi101722611310, doi1023071435536, doi1023071446122, doi1023072259756, doi1023073071998, doi1023073544421, doi1023074549, doi105860choice432194, doi105962bhltitle56234, doi107208chicago97802261186970010001, openalexw2273605253"
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A oportunidade ecológica—através da entrada em um novo ambiente, a origem de uma inovação chave ou a extinção de antagonistas—é amplamente considerada como o elo entre a dinâmica populacional ecológica e a diversificação evolutiva. Os processos em nível populacional decorrentes da oportunidade ecológica estão bem documentados sob o conceito de liberação ecológica. No entanto, há pouco consenso sobre como esses processos promovem a diversificação fenotípica, a especiação rápida e a radiação adaptativa. Propomos que a oportunidade ecológica poderia promover a radiação adaptativa ao gerar mudanças específicas nos regimes seletivos que atuam sobre populações naturais, tanto ao relaxar a seleção estabilizadora efetiva quanto ao criar condições que, em última análise, geram seleção diversificadora. Avaliamos as evidências teóricas e empíricas para esses efeitos da oportunidade ecológica e revisamos as abordagens filogenéticas emergentes que tentam detectar a assinatura da oportunidade ecológica ao longo do tempo geológico. Finalmente, avaliamos as evidências para os efeitos evolutivos da oportunidade ecológica na diversificação dos lagartos Anolis do Caribe. Alguns dos processos que poderiam ligar a oportunidade ecológica à radiação adaptativa estão bem documentados, mas outros permanecem sem suporte. Sugerimos que mais estudos são necessários para caracterizar a forma da seleção natural atuando sobre populações naturais e para melhor descrever a relação entre oportunidade ecológica e taxas de especiação.

@article{doi101111j14209101201002029x,
    author = "Yoder, Jeremy B. e Clancey, Erin e Roches, Simone Des e Eastman, Jonathan M. e Gentry, Lydia R. e Godsoe, William e Hagey, Travis J. e Jochimsen, Denim M. e Oswald, Benjamin P. e Robertson, Jeanne M. e Sarver, Brice A. J. e Schenk, John J. e Spear, Stephen F. e Harmon, Luke J.",
    title = "Oportunidade ecológica e a origem de radiações adaptativas",
    year = "2010",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "A oportunidade ecológica—através da entrada em um novo ambiente, a origem de uma inovação chave ou a extinção de antagonistas—é amplamente considerada como o elo entre a dinâmica populacional ecológica e a diversificação evolutiva. Os processos em nível populacional decorrentes da oportunidade ecológica estão bem documentados sob o conceito de liberação ecológica. No entanto, há pouco consenso sobre como esses processos promovem a diversificação fenotípica, a especiação rápida e a radiação adaptativa. Propomos que a oportunidade ecológica poderia promover a radiação adaptativa ao gerar mudanças específicas nos regimes seletivos que atuam sobre populações naturais, tanto ao relaxar a seleção estabilizadora efetiva quanto ao criar condições que, em última análise, geram seleção diversificadora. Avaliamos as evidências teóricas e empíricas para esses efeitos da oportunidade ecológica e revisamos as abordagens filogenéticas emergentes que tentam detectar a assinatura da oportunidade ecológica ao longo do tempo geológico. Finalmente, avaliamos as evidências para os efeitos evolutivos da oportunidade ecológica na diversificação dos lagartos Anolis do Caribe. Alguns dos processos que poderiam ligar a oportunidade ecológica à radiação adaptativa estão bem documentados, mas outros permanecem sem suporte. Sugerimos que mais estudos são necessários para caracterizar a forma da seleção natural atuando sobre populações naturais e para melhor descrever a relação entre oportunidade ecológica e taxas de especiação.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2010.02029.x",
    doi = "10.1111/j.1420-9101.2010.02029.x",
    openalex = "W1566874056",
    references = "crowell1962reduced, doi101007978940100585210, doi101016jtree200810011, doi101016s0169534702024990, doi101017s0094837300003778, doi101038303614a0, doi101086284196, doi101086285404, doi101086510633, doi101093molbevmsi103, doi101093oso97801985052350010001, doi101098rspb20080630, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j001438202004tb00462x, doi101111j109583121996tb01434x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461982tb05068x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101126science1157966, doi101186147121487214, doi101722611310, doi1023071438156, doi1023071932042, doi1023071934090, doi1023073071998, doi1043249780203509104"
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O Journal of Applied Ecology incentiva contribuições que possam influenciar a gestão ambiental, políticas ou ambas, com base em evidências provenientes da ciência mais robusta possível. A gestão de recursos naturais é frequentemente controversa, e quaisquer fraquezas percebidas na ciência subjacente são facilmente exploradas por grupos de interesse para minar o esforço mais amplo (veja, por exemplo, as experiências do Painel Intergovernamental sobre Mudanças Climáticas, Ravindranath 2010). Assim, a robustez da ciência projetada para fundamentar a gestão e as políticas é particularmente importante. Infelizmente, resultados robustos e não ambíguos são difíceis de obter em ecologia. Em particular, os caminhos causais em ecologia raramente são lineares, mas fazem parte de uma 'vast web of cause and effect' (teia vasta de causas e efeitos) da qual, tipicamente, podemos estudar apenas uma pequena parte (Peters 1991; p. 134). Escalas espaciais e temporais significativas para processos ecológicos frequentemente desafiam experimentos, manipulações controladas e replicação adequada; a maioria da ciência ecológica moderna depende de dados observacionais e a correlação é muito mais fácil de demonstrar do que a causalidade (cf. Sugihara et al. 2012). Experimentação formal é claramente impossível no contexto de muitas das questões mais prementes de relevância social, como aquelas relacionadas aos impactos das mudanças climáticas, intensificação agrícola em grande escala e perda de habitat. Os quadros conceituais que informam nossa compreensão desses processos frequentemente dependem de entidades que podem ser difíceis de medir diretamente e, portanto, os ecologistas frequentemente dependem de proxies ou surrogates para essas entidades. Na gestão de recursos naturais, por exemplo, proxies comuns incluem medidas assumidas para capturar o status de conservação de espécies, bem como medidas assumidas para fornecer informações sobre a distribuição, estrutura, funcionamento e prestação de serviços dos ecossistemas (Mace et al. 2008; Ayanu et al. 2012; Pettorelli et al. 2014). Vários estudos já apontaram questões e armadilhas relacionadas ao uso de proxies em ecologia e evolução (veja, por exemplo, Nieberding & Olivieri 2007; Sekar 2012; Best & Stachowicz 2013), mas menos consideração tem sido dada aos impactos dos proxies na robustez das recomendações de gestão em uma variedade de escalas (mas veja Eigenbrod et al. 2010). Isso ocorre apesar do fato de que os proxies são uma parte vital do kit de ferramentas de um ecologista aplicado e são frequentemente usados para ligar a ciência com a gestão e as políticas (Turnhout, Hisschemöller & Eijsackers 2007). Aqui, discutimos o papel dos proxies na ecologia aplicada e na gestão examinando três exemplos recentes de questões problemáticas: proxies para a abundância de populações animais; proxies para a qualidade do habitat; e proxies para funções de ecossistema e prestação de serviços ecossistêmicos. Embora esta lista esteja longe de ser exaustiva, são questões que frequentemente vemos como editores de revista. Elas fornecem um ponto de partida útil para discutir possíveis direções para melhorar nosso uso de proxies na gestão de recursos naturais. O tamanho da população é um requisito fundamental para apoiar a tomada de decisões locais na gestão baseada em espécies e também é usado para informar várias políticas e regulamentações nacionais e internacionais. Por exemplo, o tamanho da população e a taxa na qual ela muda são fundamentais para decisões de listagem e deslistagem de espécies sob a Endangered Species Act (Comitê do Senado dos EUA sobre Meio Ambiente e Obras Públicas 1973) e para a Lista Vermelha da UICN (Mace et al. 2008); essas decisões têm implicações em cascata para o comércio internacional de organismos (CITES 1973). O uso de índices como proxies para a abundância populacional é talvez uma das áreas de controvérsia mais amplamente reconhecidas na ecologia aplicada. Em vastas áreas geográficas, as abundâncias relativas de muitas populações de vida selvagem de importância cultural ou econômica são avaliadas usando levantamentos que produzem índices, em vez de estimativas, de abundância (Schwarz & Seber 1999). Estes incluem, por exemplo, contagens de rastros usadas para monitorar a abundância de muitas espécies de mamíferos, taxas de armadilha fotográfica usadas para indexar a abundância de espécies elusivas ou de baixa densidade, armadilhas de queda para avaliar populações de invertebrados e caça de captura usada como índice da abundância de muitas aves de caça e mamíferos. Todos esses métodos proxy têm sido o foco de considerável preocupação (McDonald & Harris 1999; Jennelle, Runge & MacKenzie 2002; Pollock et al. 2002; Webbon, Baker & Harris 2004; Keane, Jones & Milner-Gulland 2011; Saska et al. 2013). A crítica central relaciona-se à geralmente não verificada suposição de que a relação entre o índice e a verdadeira abundância é direta e constante (Pollock et al. 2002). Uma questão básica subjacente a esta crítica é que todos esses métodos dependem de encontros (entre observadores, câmeras, armadilhas ou caçadores e rastros, animais ou presas), que, por sua vez, dependem dos níveis de atividade dos indivíduos das populações focais, da detectabilidade de seus sinais e da extensão dos esforços para localizá-los. Estes fatores não são esperados ser estáticos nem no espaço nem no tempo (Pollock et al. 2002) e podem ser afetados por mudanças comportamentais ao longo de gradientes ecológicos de interesse de gestão (como intensificação agrícola). Apesar dessas críticas, os índices de abundância permanecem em uso generalizado por uma combinação de razões. Primeiro, coletar índices tende a ser uma abordagem de menor custo do que determinar estimativas absolutas de abundância (Jones 2011). Segundo, como Caughley (1977) observou, 'estimativas absolutas de densidade [são frequentemente] luxos desnecessários', e práticas de gestão como colheita por limiar ou estudos de utilização relativa de habitat não dependem de estimativas de abundância absoluta. Terceiro, em algumas situações, evidências sugerem que os índices podem fornecer um proxy razoável para a abundância. Um exemplo aplicado recente relaciona-se a uma questão crítica na gestão de vida selvagem australiana. Especificamente, o grau em que as contagens de rastros refletem a verdadeira abundância é uma preocupação chave sobre estudos dos impactos ecológicos do dingo Canis lupus dingo (Hayward & Marlow 2014). Em defence desses estudos, Nimmo et al. (2015) citam trabalhos mostrando que as contagens de pegadas estavam linearmente relacionadas às abundâncias reais de vários carnívoros em vários estudos específicos. Além disso, eles apontam que, para espécies elusivas, índices baseados em sinais de campo abundantes podem estar associados a menor incerteza do que estimativas populacionais baseadas em avistamentos diretos esporádicos, mas infrequentes (Nimmo et al. 2015). Em resumo, os proxies para abundância populacional são amplamente utilizados e frequentemente criticados. Eles podem ser adequados em algumas situações, mas isso geralmente dependerá da questão de gestão específica que está sendo abordada. Mais frequentemente, os índices de abundância são vulneráveis a críticas e exigirão calibração cuidadosa. Identificar locais potenciais adequados para translocações de espécies, ou locais em que devemos priorizar esforços de restauração, são atividades de gestão importantes em todo o mundo. O monitoramento de habitat é também fortemente encorajado por convenções internacionais: a Convenção sobre a conservação de espécies migratórias (CMS), por exemplo, afirma explicitamente que as 'partes que são estados de distribuição de uma espécie migratória devem esforçar-se para conservar e, quando viável e apropriado, restaurar aqueles habitats da espécie que são importantes para remover a espécie do perigo de extinção' (www.cms.int). Habitat é geralmente definido como os recursos e condições presentes em uma área que produzem ocupação – incluindo sobrevivência e reprodução – por um organismo dado (Morrison, Marcot & Mannan 1992). A extensão espacial e a resolução na qual o habitat é definido tendem a ser uma função de várias variáveis, como o número de indivíduos considerados, o tamanho corporal da espécie considerada e a resolução espacial na qual os padrões de seleção de habitat são explorados (próprio moldado pela disponibilidade de dados ambientais e de ocorrência de espécies; Pettorelli 2013a,b). Neste contexto, a qualidade do habitat é às vezes percebida como alguma função de aptidão ou crescimento populacional per capita (Van Horne 1983; Johnson 2007), onde estes são esperados para serem maiores em habitats de alta qualidade. O problema com esta definição de qualidade de habitat é que medir contribuições per capita para o crescimento populacional em um determinado habitat requer monitoramento intensivo, geralmente por um longo período. Como resultado, tentativas de capturar variações no crescimento populacional per capita frequentemente usam informações que são menos custosas e consomem menos tempo para obter, como abundância, sobrevivência, condição corporal ou níveis de corticosterona da espécie focal (veja, por exemplo, Van Horne 1983; Marra & Holberton 1998; Johnson 2007). Também tem sido assumido que a adequação do habitat, geralmente determinada a partir de dados de ocorrência ou presença/ausência usando modelos de distribuição de espécies (SDMs), fornecerá uma indicação útil da qualidade do habitat (veja, por exemplo, Larson et al. 2004; Martin et al. 2012). Trabalhando com o rato-canguru gigante Dipodomys ingens, Bean et al. (2014) compararam esses diferentes proxies para qualidade de habitat, usando SDMs gerados em uma variedade de escalas. Eles encontraram que a adequação do habitat a partir de SDMs correlacionou-se com a abundância (especialmente quando os SDMs foram parametrizados em uma escala fina), mas não com a sobrevivência ou condição corporal. A teoria de história de vida é tranquilizadora neste aspecto, fornecendo boas razões pelas quais nem a sobrevivência (Pilastro, Tavecchia & Marin 2003) nem a condição corporal (Houston & McNamara 1993) precisam estar fortemente relacionadas à qualidade do habitat. Mais preocupante, no entanto, é que a ecologia também fornece razões para questionar a relação entre abundância populacional e qualidade do habitat, especialmente onde processos comportamentais despóticos podem resultar em grandes números de indivíduos sendo excluídos de habitats de alta qualidade (e para habitats marginais) (Van Horne 1983). Essas considerações colocam em questão uma série de proxies amplamente utilizados para qualidade de habitat. A qualidade do habitat está inquestionavelmente relacionada à disponibilidade de recursos, mas também aos níveis de predação. Qual desses predomina na determinação da qualidade do habitat para uma dada população é frequentemente descrito usando a terminologia de controle 'bottom-up' vs. 'top-down' (por exemplo, Hunter & Price 1992). A proporção de mortalidade atribuível à predação é às vezes usada como um proxy para a extensão do controle top-down (Sinclair, Mduma & Brashares 2003; Hopcraft, Olff & Sinclair 2010). Paradoxalmente, no entanto, a modelagem comportamental de forrageamento sensível ao risco mostra que um aumento na predação pode resultar de uma diminuição na disponibilidade de alimentos (McNamara & Houston 1987). Esses resultados parecem ser confirmados em sistemas empíricos (Sinclair & Arcese 1995), minando o uso da taxa de predação como um índice de controle top-down e enfatizando a dificuldade de separar esses processos. No geral, considerações teóricas sugerem que os proxies para qualidade de habitat e os processos que a determinam frequentemente serão falhos. Como com os proxies para abundância, no entanto, os proxies para qualidade de habitat podem ser adequados para abordar questões de gestão em algumas escalas espaciais. O desafio permanece em identificar aquelas situações nas quais os proxies são úteis e determinar abordagens alternativas onde eles não podem ser usados. Com uma agenda de políticas cada vez mais focada na provisão de serviços ecossistêmicos (Perrings et al. 2010), entender a ecologia do funcionamento do ecossistema e suas implicações para a entrega de serviços ecossistêmicos nunca foi tão importante. Pode ser extremamente difícil medir a função ou o serviço do ecossistema diretamente, e proxies espaciais, como biomassa acima do solo em pequena escala em plantas, são frequentemente empregados (por exemplo, Tilman et al. 2001). Talvez menos amplamente apreciado, no entanto, é o fato de que certas funções do ecossistema facilmente medidas são às vezes usadas como proxies para funções e serviços do ecossistema mais difíceis de medir. Por exemplo, a maioria dos experimentos biodiversidade-função do ecossistema mede produtividade e assume que este parâmetro correlaciona-se com um conjunto mais amplo de funções e serviços do ecossistema. No entanto, trabalhos recentes mostraram que o ecosyA produtividade do caule pode ser bastante divergente de funções e serviços como o consumo de metano, o controle de pragas e a polinização (Werling et al. 2014). Uma vasta gama de abordagens para medir funções e/ou serviços ecossistêmicos está atualmente disponível para ecólogos e gestores. Grandes tentativas de avaliar a produtividade do ecossistema podem depender de proxies, como variáveis climáticas e estruturais que se correlacionam com a produtividade (Ruiz-Benito et al. 2014), ou índices de vegetação derivados de informações de sensoriamento remoto (Pettorelli 2013b). Identificar quais abordagens metodológicas e proxies são propensos a apoiar a tomada de decisão robusta em um determinado contexto é um desafio particular. A Diretiva-Quadro da Água da União Europeia (WFD), por exemplo, utiliza uma pontuação de status ecológico para habitats aquáticos para representar a quantidade de provisão de serviços ecossistêmicos. Uma avaliação recente do uso do status ecológico pela WFD descobriu que o status se correlaciona com alguns serviços ecossistêmicos e diversidade taxonômica (Tolonen et al. 2014), sugerindo que este proxy é útil para avaliar rapidamente a entrega geral de serviços (embora seja necessário cautela ao considerar serviços únicos ou poucos). Por outro lado, análises recentes mostraram que o tipo de cobertura do solo (por exemplo, Ayanu et al. 2012) é um proxy pobre para o serviço ecossistêmico, com potencial para enganar estratégias de gestão (Eigenbrod et al. 2010). Proxies baseados em espécies para avaliar a função ecossistêmica e a entrega de serviços também foram amplamente discutidos. Duas décadas de pesquisa foram agora dedicadas a testar as hipóteses de que uma maior diversidade de espécies leva a uma maior função ecossistêmica e entrega de serviços, com o objetivo de estabelecer a riqueza de espécies como um proxy para esses atributos ecossistêmicos (Balvanera et al. 2006; Cardinale et al. 2006). Os resultados até agora, no entanto, parecem indicar que a diversidade funcional (Petchey & Gaston 2006; Mouchet et al. 2010; Cadotte, Carscadden & Mirotchnick 2011), e não a riqueza de espécies em si, afeta diretamente a função ecossistêmica e a entrega de serviços ecossistêmicos (Tilman et al. 2001; Cadotte, Carscadden & Mirotchnick 2011; Woodcock et al. 2014). A perda de espécies pode ser funcionalmente aleatória, com o resultado de que certos cenários de extinção podem ter efeitos mínimos na diversidade funcional (Sasaki et al. 2014), tornando a perda de espécies um indicador não confiável da perda de função ecossistêmica. Curiosamente, tanto a diversidade funcional quanto a filogenética têm sido mostradas para explicar a variação na função ecossistêmica (Flynn et al. 2011; Cadotte 2013). No entanto, existem casos em que a diversidade filogenética e funcional podem não estar fortemente correlacionadas e, na verdade, mostrar respostas diferentes à perturbação ou gestão (Cadotte, Albert & Walker 2013; Bässler et al. 2014). Claramente, mais trabalho é necessário para entender o quão bem esses aspectos da diversidade correspondem às importantes diferenças ecológicas que influenciam as funções ecossistêmicas que podem atrair intervenções de gestão. No geral, a validade de diferentes proxies para função ecossistêmica e provisão de serviços tem sido o foco de muita pesquisa, mas poucos proxies foram mostrados para funcionar bem em uma ampla gama de cenários. Proxies devem ser usados com cautela em situações em que foram mostrados para funcionar, ou submetidos a validação adicional além dessas circunstâncias. Os exemplos acima destacam os desafios de tirar inferências robustas e relevantes para a gestão da ciência ecológica, fornecendo insights sobre o uso apropriado de proxies e formas de avançar. Aqui, sugerimos três considerações essenciais ao usar e/ou desenvolver proxies. Como em muito da ecologia, a relevância dos proxies frequentemente depende da escala de investigação. Como ilustrado por Bean et al. (2014), a resolução espacial e a extensão espacial são entidades correlacionadas na maioria das avaliações de qualidade de habitat. Não surpreendentemente, avaliações focadas em áreas menores ou que utilizam dados ambientais coletados em maior resolução espacial são capazes de detectar maior variabilidade na qualidade aparente do que estudos de grande escala mais grosseiros. Extensão e resolução são, portanto, parâmetros importantes que moldam diretamente a utilidade das avaliações de qualidade de habitat: modelos de grande escala são mais prováveis de serem adequados para identificar áreas potenciais de proteção, enquanto modelos de escala mais fina serão necessários para informar estratégias de gestão local, como a restauração de habitat. A escala espacial também é provavelmente fundamental para debates sobre a utilidade da disponibilidade de presas como um indicador de qualidade de habitat para predadores. Trabalhos recentes sobre os efeitos subletais da predação e a 'paisagem do medo' mostram que as presas frequentemente serão mais abundantes em áreas em que são relativamente inacessíveis aos predadores e, portanto, que a correlação entre a abundância de presas e a disponibilidade de presas pode ser baixa (Laundré 2010). Isso sugere que, em uma escala fina, a disponibilidade de presas pode ser um proxy pobre para a qualidade de habitat – mas, em uma escala de paisagem, os predadores ainda preferirão áreas com presas abundantes. Assim, a escala espacial na qual uma pergunta é formulada tem um forte impacto na relevância de um dado proxy. A escala temporal também pode moldar a relevância de um proxy. Devido à variação na atividade entre anos, proxies para densidade populacional baseados em taxas de avistamento ou abundância de rastros podem ser indicadores pobres de mudanças interanuais no tamanho da população. No entanto, a menos que a atividade ou detectabilidade mostrem tendências determinísticas de longo prazo, tais índices serão úteis para identificar a existência de tendências na abundância ao longo de períodos de tempo mais longos. Mesmo em períodos de tempo curtos, os índices podem ser úteis, desde que a variação na detectabilidade e atividade seja independente da abundância e de magnitude substancialmente menor do que a variação no tamanho da população que os pesquisadores desejam ou não que seja o foco do trabalho nesses proxies. estudos e que um entre espacial e a resolução de temporal Embora o uso recente de modelos de ocupação e detectabilidade incentive temporal isso pode, em um nível de compreensão importante da distribuição espacial das espécies, que, em muitos casos, pode ser mais importante do ponto de vista da conservação et al. 2014). em um dado proxy está diretamente relacionado à quantidade de evidência de seus Proxies para ser para local, então é frequentemente um requisito de vários proxies para a abundância populacional tem sido o foco de. Como Nimmo et al. (2015) uma variedade de evidências para apoiar o uso de abundância de trilhas como um proxy útil para a abundância de para grande isso não é que a abundância de trilhas será um proxy útil em todo o trabalho tem focado em índices de abundância e para fatores que determinam como a relação entre o índice e a abundância ao longo do tempo e Por exemplo, et al. dados de de em o para identificar fatores que Neste eles foram para para tempo de quando índice para absoluto Saska et al. avaliaram o de sobre a atividade de para controlar a atividade quando armadilha de queda para abundância relativa. para atividade ou também pode de índices de abundância entre espécies, aqueles índices são baseados em contagens de trilhas ou taxas de captura et al. 2008; et al. também estão disponíveis para para de quando usando índices de densidade populacional baseados em abundância. Especificamente, & abordagens para para de tanto observacionais e tanto de quais podem minar o uso de contagens como proxies para abundância. avaliando a validade de vários proxies de qualidade de habitat também são (veja, por exemplo, Johnson 2007; Pettorelli 2013b). para proxies de qualidade de habitat derivados de modelagem de adequação de habitat podem ser encontrados em trabalho que para a qualidade de Este usado por et al. para avaliar o de que modelagem de adequação de habitat pode áreas que esses modelos produzem proxies úteis para qualidade de habitat que é para o Um para isso é que modelagem de adequação de habitat baseada em ou dados de presença/ausência não pode entre e habitats. et al. medidas de para adequação de habitat no entanto, aquelas medidas frequentemente serão proxies para Como proxies para função de ecossistema e provisão de serviços também foram submetidos a mas com vários proxies têm serviço de ecossistema em particular, uma ampla variedade de processos Portanto, uma validação adicional provavelmente será necessária para mostrar que proxies bem em um Um dos fundamentais para proxies da escala espacial e temporal da maioria dos ecológicos No entanto, e pesquisa pode para e proxies e também nosso sobre eles. O por exemplo, é uma grande escala que fornecerá informações sobre distribuição com O é para ao longo de décadas em um de locais e tem o potencial de fornecer direto do link entre e ecossistema para nossa compreensão disso também ecológico com um de locais em todo o estão em escalas. O para incluirá monitoramento animal em uma pesquisa de O Isso monitoramento remoto do e de grandes números de indivíduos de espécies muito menores do que pode ser em muitos isso fornecerá direto do uso de habitat e o de habitat em uma escala além atualmente nossa compreensão da validade de proxies para qualidade de habitat. Ecológicos aplicados devem para o que gestão de recursos naturais e política ambiental o possível subjacente ao menor de trabalho de monitoramento, abordagens robustas para política e gestão frequentemente requerem monitoramento, para chave ecológico em uma escala que a necessidade de proxies. Como Martin do da temos que para que fornecerá vasto para para sobre – mas ainda estamos sobre o um onde já temos que não será sobre para monitoramento que fornecer insights sobre os processos ecológicos chave suportando em insights poderiam nossa compreensão de sistemas ecológicos e, o de e para com

@article{doi1011111365266412383,
    author = "Stephens, Philip A. and Pettorelli, Nathalie and Barlow, Jos and Whittingham, Mark J. and Cadotte, Marc W.",
    title = "Management by proxy? The use of indices in applied ecology",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Applied Ecology",
    abstract = "Journal of Applied Ecology encourages contributions that can influence environmental management, policy or both, with evidence based on the most robust science possible. Natural resource management is often contentious, and any perceived weaknesses in the underpinning science are easily exploited by interest groups to undermine the wider endeavour (see, e.g. the experiences of the Intergovernmental Panel on Climate Change, Ravindranath 2010). Thus, the robustness of science designed to underpin management and policy is particularly important. Unfortunately, robust and unambiguous results are difficult to obtain in ecology. In particular, causal pathways in ecology are seldom linear, but are part of a ‘vast web of cause and effect’ of which, typically, we can study only a small part (Peters 1991; p. 134). Meaningful spatial and temporal scales for ecological processes often defy experiments, controlled manipulations and adequate replication; most modern ecological science is reliant on observational data and correlation is far easier to demonstrate than causation (cf. Sugihara et al. 2012). Formal experimentation is clearly impossible in the context of many of the most pressing questions of societal relevance, such as those regarding the impacts of climate change, large-scale agricultural intensification and habitat loss. The conceptual frameworks that inform our understanding of these processes often rely on entities that can be hard to measure directly and, thus, ecologists often depend on proxies or surrogates for those entities. In natural resource management, for example, common proxies include measures assumed to capture the conservation status of species, as well as measures assumed to provide information on ecosystems’ distribution, structure, functioning and service delivery (Mace et al. 2008; Ayanu et al. 2012; Pettorelli et al. 2014). Several studies have already pointed out issues and pitfalls related to the use of proxies in ecology and evolution (see, e.g. Nieberding \& Olivieri 2007; Sekar 2012; Best \& Stachowicz 2013) but less consideration has been given to the impacts of proxies on the robustness of management recommendations at a range of scales (but see Eigenbrod et al. 2010). This is despite the fact that proxies are a vital part of an applied ecologist's toolkit and are frequently used to link science with management and policy (Turnhout, Hisschemöller \& Eijsackers 2007). Here, we discuss the role of proxies in applied ecology and management by examining three recent examples of problematic issues: proxies for the abundance of animal populations; proxies for habitat quality; and proxies for ecosystem functions and ecosystem services delivery. While this list is far from exhaustive, these are issues we frequently see as journal editors. They provide a useful starting point to discuss possible directions to improve our use of proxies in natural resource management. Population size is a key requirement for supporting local decision-making in species-based management and is also used to inform several national and international policies and regulations. For example, population size and the rate at which it changes are fundamental to species listing and delisting decisions under the Endangered Species Act (U.S. Senate Committee on Environment \& Public Works 1973) and for the IUCN Red List (Mace et al. 2008); these decisions have knock-on implications for the international trade of organisms (CITES 1973). The use of indices as proxies for population abundance is perhaps one of the most widely recognized areas of contention in applied ecology. Across vast geographic areas, the relative abundances of many wildlife populations of cultural or economic importance are assessed using surveys that yield indices, rather than estimates, of abundance (Schwarz \& Seber 1999). These include, for example, track counts used to monitor the abundance of many mammal species, camera trapping rates used to index the abundance of elusive or low-density species, pitfall traps to assess invertebrate populations, and hunting offtake used as an index of the abundance of many game birds and mammals. These proxy methods have all been the focus of considerable concern (McDonald \& Harris 1999; Jennelle, Runge \& MacKenzie 2002; Pollock et al. 2002; Webbon, Baker \& Harris 2004; Keane, Jones \& Milner-Gulland 2011; Saska et al. 2013). The central criticism relates to the generally unverified assumption that the relationship between the index and the true abundance is direct and constant (Pollock et al. 2002). One basic issue underpinning this criticism is that all of these methods depend on encounters (between observers, cameras, traps or hunters and tracks, animals or quarry) which, in turn, depend on the levels of activity of individuals of the focal populations, the detectability of their signs and the extent of efforts to locate them. These factors are not expected to be static in either space or time (Pollock et al. 2002) and could be affected by behavioural changes along ecological gradients of management interest (such as agricultural intensification). In spite of these criticisms, indices of abundance remain in widespread use for a combination of reasons. First, collecting indices tends to be a lower-cost approach than determining absolute estimates of abundance (Jones 2011). Second, as Caughley (1977) observed, ‘absolute estimates of density [are often] unnecessary luxuries’, and management practices such as threshold harvesting or studies of relative habitat utilization are not reliant on estimates of absolute abundance. Third, in some situations, evidence suggests that indices can provide a reasonable proxy for abundance. A recent applied example relates to a critical issue in Australian wildlife management. Specifically, the extent to which track counts reflect true abundance is a key concern about studies of the ecological impacts of the dingo Canis lupus dingo (Hayward \& Marlow 2014). In defence of those studies, Nimmo et al. (2015) cite work showing that track counts were linearly related to the true abundances of various carnivores in a number of specific studies. Moreover, they point out that, for elusive species, indices based on abundant field signs might well be associated with lower uncertainty than population estimates based on sporadic but infrequent direct sightings (Nimmo et al. 2015). In summary, proxies for population abundance are widely used and often criticized. They might be adequate in some situations but that will usually depend on the specific management question being addressed. More often, indices of abundance are vulnerable to criticism and will require careful calibration. Identifying potential sites suitable for species translocations, or sites at which we should prioritize restoration efforts, are important management activities world-wide. Habitat monitoring is also strongly encouraged by international conventions: the Convention on the conservation of migratory species (CMS), for example, explicitly states that ‘parties that are range states of a migratory species shall endeavour to conserve and, where feasible and appropriate, restore those habitats of the species which are of importance in removing the species from danger of extinction’ (www.cms.int). Habitat is usually defined as the resources and conditions present in an area that produce occupancy – including survival and reproduction – by a given organism (Morrison, Marcot \& Mannan 1992). The spatial extent and resolution at which habitat is defined tends to be a function of several variables, such as the number of individuals considered, the body size of the species considered, and the spatial resolution at which habitat selection patterns are explored (itself shaped by the availability of environmental and species occurrence data; Pettorelli 2013a,b). Within this context, habitat quality is sometimes perceived as some function of fitness or per-capita population growth (Van Horne 1983; Johnson 2007), where these are expected to be higher in high-quality habitats. The problem with this definition of habitat quality is that measuring per-capita contributions to population growth in a given habitat requires intensive monitoring, usually over a long period. As a result, attempts to capture variation in per-capita population growth often use information that is less costly and time consuming to obtain, such as abundance, survival, body condition or corticosterone levels of the focal species (see, e.g. Van Horne 1983; Marra \& Holberton 1998; Johnson 2007). It has also been assumed that habitat suitability, usually determined from occurrence or presence/absence data using species distribution models (SDMs), will provide a useful indication of habitat quality (see, e.g. Larson et al. 2004; Martin et al. 2012). Working with the giant kangaroo rat Dipodomys ingens, Bean et al. (2014) compared these different proxies for habitat quality, using SDMs generated at a range of scales. They found that habitat suitability from SDMs correlated with abundance (especially when SDMs were parameterized at a fine scale) but not with survival or body condition. Life-history theory is reassuring in this regard, providing good reasons why neither survival (Pilastro, Tavecchia \& Marin 2003) nor body condition (Houston \& McNamara 1993) need be strongly related to habitat quality. More troubling, however, is that ecology also provides reasons to question the relationship between population abundance and habitat quality, especially where despotic behavioural processes can result in large numbers of individuals being excluded from high-quality (and into marginal) habitats (Van Horne 1983). These considerations call into question a number of widely used proxies for habitat quality. Habitat quality is unquestionably related to the availability of resources, but also to levels of predation. Which of these predominates in determining the quality of habitat for a given population is often described using the terminology of ‘bottom-up’ vs. ‘top-down’ control (e.g. Hunter \& Price 1992). The proportion of mortality attributable to predation is sometimes used as a proxy for the extent of top-down control (Sinclair, Mduma \& Brashares 2003; Hopcraft, Olff \& Sinclair 2010). Paradoxically, however, behavioural modelling of risk-sensitive foraging shows that an increase in predation may well result from a decline in food availability (McNamara \& Houston 1987). These results appear to be borne out in empirical systems (Sinclair \& Arcese 1995), undermining the use of predation rate as an index of top-down control and emphasizing the difficulty of teasing apart these processes. Overall, theoretical considerations suggest that proxies for habitat quality and the processes that determine it will often be flawed. As with proxies for abundance, however, proxies for habitat quality might be suitable for addressing management questions at some spatial scales. The challenge remains to identify those situations under which proxies are useful and to determine alternative approaches where they cannot be used. With a policy agenda increasingly focused on ecosystem service provision (Perrings et al. 2010), understanding the ecology of ecosystem functioning and its implications for the delivery of ecosystem services has never been more important. It can be extremely difficult to measure ecosystem function or service directly, and spatial proxies, such as small-scale above-ground biomass in plants, are often employed (e.g. Tilman et al. 2001). Perhaps less widely appreciated, however, is the fact that certain easily measured ecosystem functions are sometimes used as proxies for more difficult to measure ecosystem functions and services. For example, most biodiversity–ecosystem function experiments measure productivity and assume that this parameter correlates with a broader suite of ecosystem functions and services. Yet recent work has shown that ecosystem productivity can be quite divergent from functions and services such as methane consumption, pest control and pollination (Werling et al. 2014). A vast array of approaches to measure ecosystem functions and/or ecosystem services is currently available to ecologists and managers. Large-scale attempts to assess ecosystem productivity might rely on proxies such as climatic and structural variables that correlate with productivity (Ruiz-Benito et al. 2014), or vegetation indices derived from remote sensing information (Pettorelli 2013b). Identifying which methodological approaches and proxies are likely to support robust decision-making in a given context is a particular challenge. The European Union's Water Framework Directive (WFD), for example, uses an ecological status score for aquatic habitats to represent the amount of ecosystem service provisioned. One recent assessment of the WFD's use of ecological status found that status correlates with some ecosystem services and taxonomic diversity (Tolonen et al. 2014), suggesting that this proxy is useful for quickly assessing overall service delivery (though caution is required when considering single or few services). By contrast, recent analyses have shown that land cover type (e.g. Ayanu et al. 2012) is a poor proxy for ecosystem service, with potential to mislead management strategies (Eigenbrod et al. 2010). Species-based proxies for assessing ecosystem function and service delivery have also been heavily discussed. Two decades of research have now been devoted to testing the hypotheses that higher species diversity leads to greater ecosystem function and service delivery, with the view to establishing species richness as a proxy for these ecosystem attributes (Balvanera et al. 2006; Cardinale et al. 2006). Results so far, however, seem to indicate that functional diversity (Petchey \& Gaston 2006; Mouchet et al. 2010; Cadotte, Carscadden \& Mirotchnick 2011), rather than species richness itself, directly affects ecosystem function and the delivery of ecosystem services (Tilman et al. 2001; Cadotte, Carscadden \& Mirotchnick 2011; Woodcock et al. 2014). Species loss may be functionally random, with the result that certain extinction scenarios may have minimal effects on functional diversity (Sasaki et al. 2014), rendering species loss an unreliable indicator of ecosystem function loss. Interestingly, both functional and phylogenetic diversity have actually been shown to explain variation in ecosystem function (Flynn et al. 2011; Cadotte 2013). However, there are cases where phylogenetic and functional diversity may not be strongly correlated and actually show different responses to disturbance or management (Cadotte, Albert \& Walker 2013; Bässler et al. 2014). Clearly, more work is required to understand how well these facets of diversity correspond to the important ecological differences that influence the ecosystem functions that may attract management interventions. Overall, the validity of different proxies for ecosystem function and service provision has been the focus of much research but few proxies have been shown to work well across a wide range of scenarios. Proxies should be used cautiously in situations in which they have been shown to work, or subjected to further validation beyond those circumstances. The examples above highlight the challenges of drawing robust management-relevant inferences from ecological science, providing insights into the appropriate use of proxies and ways to move forward. Here, we suggest three essential considerations when using and/or developing proxies. As with so much in ecology, the relevance of proxies often depends on the scale of enquiry. As illustrated by Bean et al. (2014), spatial resolution and spatial extent are correlated entities in most habitat quality assessments. Unsurprisingly, assessments focused on smaller areas or utilizing environmental data collected at greater spatial resolution are capable of detecting greater variability in apparent quality than coarser, large-scale studies. Extent and resolution are, thus, important parameters that directly shape the usefulness of habitat quality assessments: broad-scale models are more likely to be adequate for identifying potential protected areas, whilst finer-scale models will be required to inform local management strategies such as habitat restoration. Spatial scale is also likely to be fundamental to debates about the usefulness of prey availability as an indicator of habitat quality for predators. Recent work on the sublethal effects of predation and the ‘landscape of fear’, shows that prey will often be most abundant in areas in which they are relatively inaccessible to predators and, thus, that the correlation between prey abundance and prey availability may be low (Laundré 2010). This suggests that, at a fine scale, prey availability might be a poor proxy for habitat quality – but, at a landscape scale, predators will still prefer areas with abundant prey. Thus, the spatial scale at which a question is posed has a strong bearing on the relevance of a given proxy. Temporal scale might also shape the relevance of a proxy. Owing to variation in activity among years, proxies for population density based on either sighting rates or spoor abundance might be poor indicators of interannual changes in population size. However, unless activity or detectability show long-term, deterministic trends, such indices will be useful to identify the existence of trends in abundance over longer time frames. Even over short time frames, indices might be useful, as long as the variation in detectability and activity is independent of abundance and of substantially lower magnitude than the variation in population size that researchers wish to or not this is the should be a focus of work at these proxies. studies and which an between spatial and the resolution of temporal While the recent use of occupancy and detectability models encourages temporal this can at a of understanding important spatial of species which, in many may be more important from a conservation et al. 2014). in a given proxy is directly related to the amount of evidence its Proxies to be to local so is often a requirement of various proxies for population abundance has been the focus of As Nimmo et al. (2015) a range of evidence to support the use of track abundance as a useful proxy for abundance of to large this not that track abundance will be a useful proxy in all work has focused on indices of abundance and for factors that determine how the relationship between the index and abundance across time and For example, et al. data on of in the to identify factors that In this they were to for time of when index to absolute Saska et al. assessed the of on the activity of to control for activity when pitfall trapping to relative abundance. for activity or can also of abundance indices across species, those indices are based on track counts or trapping rates et al. 2008; et al. are also available for for of when using indices of population density based on abundance. Specifically, \& approaches for for from both observational and both of which can undermine the use of counts as proxies for abundance. assessing the validity of various proxies of habitat quality are also (see, e.g. Johnson 2007; Pettorelli 2013b). for proxies of habitat quality derived from habitat suitability modelling can be found in work that to the quality of This used by et al. for assessing the of that habitat suitability modelling can areas that these models produce useful proxies for habitat quality that is to the One to this is that habitat suitability modelling based on or presence/absence data cannot between and habitats. et al. measures of into habitat suitability however, those measures will often be proxies for As proxies for ecosystem function and service provision have also been subjected to but with several proxies have ecosystem service in particular, a wide array of processes Thus, further validation is likely to be required to show that proxies well across One of the fundamental for proxies from the spatial and temporal scale of most ecological However, and research can to and proxies and might also our on them. The for example, is a large-scale which will information on distribution with The is to over decades at an of sites and has the potential to provide direct of the link between and ecosystem to our understanding of this also ecological with a of sites across the are on scales. The for will include animal monitoring on a research of the This will remote monitoring of the and of large numbers of individuals of species far smaller than can be at many this will direct of habitat use and the of habitat on a scale beyond currently our understanding of the validity of proxies for habitat quality. Applied ecologists should to the that natural resource management and environmental policy the possible underpinning the lower of monitoring work, robust approaches to policy and management often require monitoring, to key ecological on a scale that the need for proxies. As Martin of the has we it for that will to provide vast to for on – but we still about the one where we already that not be about for monitoring that yield insights into the key ecological processes supporting on insights could our understanding of ecological systems and, the of and to with",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2664.12383",
    doi = "10.1111/1365-2664.12383",
    openalex = "W2021416891",
    references = "doi101038nature05202, doi101111j13652664201102048x, doi101111j14610248200600924x, doi101111j14610248200600963x, doi101126science1060391, doi101126science1227079, doi1023073808148, doi104324978184977263119, doi105281zenodo18167309, openalexw2014317435"
}

A seleção de habitat é um comportamento animal fundamental que molda uma ampla gama de processos ecológicos, incluindo o movimento animal, transferência de nutrientes, dinâmicas tróficas e distribuição populacional. Embora a seleção de habitat tenha sido foco de estudos ecológicos por décadas, avanços tecnológicos, conceituais e metodológicos nos últimos 20 anos levaram a um aumento nos estudos que abordam esse processo. Apesar da vasta literatura focada na quantificação dos padrões de seleção de habitat dos animais, há uma falta marcante de orientação sobre as melhores práticas analíticas. As bases conceituais dos frameworks de modelagem mais comumente aplicados podem ser confusas, mesmo para aqueles bem versados em sua aplicação. Além disso, ainda não houve uma síntese dos avanços feitos nos últimos 20 anos. Portanto, há necessidade tanto de síntese do estado atual do conhecimento sobre seleção de habitat quanto de orientação para aqueles que buscam estudar esse processo. Aqui, fornecemos uma visão geral acessível e uma síntese da literatura sobre análises de seleção de habitat (HSAs) conduzidas usando funções de seleção, que são, de longe, o framework de modelagem mais aplicado para entender o processo de seleção de habitat. Esta revisão é intencionalmente não técnica e focada na compreensão sem notação matemática e estatística pesada, o que pode confundir muitos profissionais. Oferecemos uma visão geral e história das HSAs, descrevendo o tortuoso caminho conceitual até nossa compreensão atual. Através desta visão geral, também buscamos abordar as áreas de maior confusão na literatura. Sintetizamos a literatura que destaca os avanços conceituais mais emocionantes no campo da modelagem de seleção de habitat, discutindo as inferências ecológicas e evolutivas substanciais que podem ser feitas usando técnicas contemporâneas. Buscamos que este artigo forneça clareza para aqueles que navegam pela literatura complexa sobre HSAs, ao mesmo tempo em que atua como um guia de referência e melhores práticas para profissionais.

@article{doi101002eap2470,
    author = "Northrup, Joseph M. e Wal, Eric Vander e Bonar, Maegwin e Fieberg, John e Laforge, Michel P. e Leclerc, Martin e Prokopenko, Christina M. e Gerber, Brian D.",
    title = "Avanços conceituais e metodológicos na modelagem de seleção de habitat: diretrizes para ecologia e evolução",
    year = "2021",
    journal = "Ecological Applications",
    abstract = "A seleção de habitat é um comportamento animal fundamental que molda uma ampla gama de processos ecológicos, incluindo o movimento animal, transferência de nutrientes, dinâmicas tróficas e distribuição populacional. Embora a seleção de habitat tenha sido foco de estudos ecológicos por décadas, avanços tecnológicos, conceituais e metodológicos nos últimos 20 anos levaram a um aumento nos estudos que abordam esse processo. Apesar da vasta literatura focada na quantificação dos padrões de seleção de habitat dos animais, há uma falta marcante de orientação sobre as melhores práticas analíticas. As bases conceituais dos frameworks de modelagem mais comumente aplicados podem ser confusas, mesmo para aqueles bem versados em sua aplicação. Além disso, ainda não houve uma síntese dos avanços feitos nos últimos 20 anos. Portanto, há necessidade tanto de síntese do estado atual do conhecimento sobre seleção de habitat quanto de orientação para aqueles que buscam estudar esse processo. Aqui, fornecemos uma visão geral acessível e uma síntese da literatura sobre análises de seleção de habitat (HSAs) conduzidas usando funções de seleção, que são, de longe, o framework de modelagem mais aplicado para entender o processo de seleção de habitat. Esta revisão é intencionalmente não técnica e focada na compreensão sem notação matemática e estatística pesada, o que pode confundir muitos profissionais. Oferecemos uma visão geral e história das HSAs, descrevendo o tortuoso caminho conceitual até nossa compreensão atual. Através desta visão geral, também buscamos abordar as áreas de maior confusão na literatura. Sintetizamos a literatura que destaca os avanços conceituais mais emocionantes no campo da modelagem de seleção de habitat, discutindo as inferências ecológicas e evolutivas substanciais que podem ser feitas usando técnicas contemporâneas. Buscamos que este artigo forneça clareza para aqueles que navegam pela literatura complexa sobre HSAs, ao mesmo tempo em que atua como um guia de referência e melhores práticas para profissionais.",
    url = "https://doi.org/10.1002/eap.2470",
    doi = "10.1002/eap.2470",
    openalex = "W3207191671",
    references = "doi1011111365265612359, doi10249262020081320"
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Desde o início dos anos 1990, ecólogos e biólogos evolutivos têm agregado pesquisas primárias utilizando métodos meta-analíticos para compreender fenômenos ecológicos e evolutivos. Meta-análises podem resolver disputas de longa data, dissipar alegações falsas e gerar novas questões de pesquisa. No entanto, em seu pior cenário, publicações de meta-análises são lobos em pele de cordeiro: subjetivas com conclusões enviesadas, escondidas sob capas de autoridade objetiva. Conclusões podem ser tornadas não confiáveis por métodos estatísticos inadequados, problemas com os métodos utilizados para selecionar pesquisas primárias ou problemas dentro da pesquisa primária em si. Devido a esses riscos, meta-análises são cada vez mais realizadas como parte de revisões sistemáticas, que utilizam métodos estruturados, transparentes e reprodutíveis para compilar e resumir evidências. Para que os leitores determinem se as conclusões de uma revisão sistemática ou meta-análise devem ser confiadas - e para poderem construir sobre a revisão - os autores precisam relatar o que fizeram, por que fizeram e o que encontraram. Relato completo, transparente e reprodutível é medido pela 'qualidade do relato'. Para avaliar percepções e padrões de qualidade do relato de revisões sistemáticas e meta-análises publicadas em ecologia e biologia evolutiva, entrevistamos 208 pesquisadores com experiência relevante (como autores, revisores ou editores) e realizamos avaliações detalhadas de 102 artigos de revisão sistemática e meta-análise publicados entre 2010 e 2019. A qualidade do relato estava muito abaixo do ótimo e aproximadamente distribuída normalmente. A qualidade do relato medida foi menor do que o que a comunidade percebeu, particularmente para os métodos de revisão sistemática necessários para medir a confiabilidade. A minoria dos artigos avaliados que referenciaram uma diretriz (~16%) mostrou qualidade de relato substancialmente superior à média, e os pesquisadores entrevistados demonstraram interesse em utilizar uma diretriz de relato para melhorar a qualidade do relato. A diretriz líder para melhorar a qualidade do relato de revisões sistemáticas é a declaração Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-Analyses (PRISMA). Aqui, revelamos uma extensão do PRISMA para servir à comunidade de meta-análise em ecologia e biologia evolutiva: PRISMA-EcoEvo (versão 1.0). O PRISMA-EcoEvo é uma lista de verificação de 27 itens principais que, quando aplicáveis, devem ser relatados em publicações de revisão sistemática e meta-análise que resumem pesquisas primárias em ecologia e biologia evolutiva. Neste documento de explicação e elaboração, fornecemos orientação para autores, revisores e editores, com explicações para cada item na lista de verificação, incluindo exemplos suplementares de artigos publicados. Os autores podem consultar esta diretriz PRISMA-EcoEvo tanto nas etapas de planejamento e escrita de uma revisão sistemática e meta-análise, para aumentar a qualidade do relato de manuscritos submetidos. Revisores e editores podem utilizar a lista de verificação para avaliar a qualidade do relato nos manuscritos que revisam. No geral, o PRISMA-EcoEvo é um recurso para a comunidade de ecologia e biologia evolutiva para facilitar revisões sistemáticas e meta-análises transparentes e abrangentemente relatadas.

@article{doi101111brv12721,
    author = "O’Dea, Rose E. and Lagisz, Malgorzata and Jennions, Michael D. and Koricheva, Julia and Noble, Daniel W. A. and Parker, Timothy and Gurevitch, Jessica and Page, Matthew J. and Stewart, Gavin and Moher, David and Nakagawa, Shinichi",
    title = "Itens de relato preferenciais para revisões sistemáticas e meta-análises em ecologia e biologia evolutiva: uma extensão PRISMA",
    year = "2021",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews da Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Desde o início dos anos 1990, ecólogos e biólogos evolutivos têm agregado pesquisas primárias usando métodos meta-analíticos para compreender fenômenos ecológicos e evolutivos. Meta-análises podem resolver disputas de longa data, dissipar alegações falsas e gerar novas questões de pesquisa. No entanto, em seu pior aspecto, as publicações de meta-análises são lobos vestidos de ovelhas: subjetivas com conclusões enviesadas, escondidas sob capas de autoridade objetiva. Conclusões podem ser tornadas não confiáveis por métodos estatísticos inadequados, problemas com os métodos usados para selecionar pesquisas primárias ou problemas dentro da pesquisa primária em si. Devido a esses riscos, meta-análises são cada vez mais realizadas como parte de revisões sistemáticas, que usam métodos estruturados, transparentes e reprodutíveis para compilar e resumir evidências. Para que os leitores determinem se as conclusões de uma revisão sistemática ou meta-análise devem ser confiadas - e para poderem construir sobre a revisão - os autores precisam relatar o que fizeram, por que fizeram e o que encontraram. O relato completo, transparente e reprodutível é medido pela 'qualidade de relato'. Para avaliar percepções e padrões de qualidade de relato de revisões sistemáticas e meta-análises publicadas em ecologia e biologia evolutiva, entrevistamos 208 pesquisadores com experiência relevante (como autores, revisores ou editores) e realizamos avaliações detalhadas de 102 artigos de revisão sistemática e meta-análise publicados entre 2010 e 2019. A qualidade de relato estava muito abaixo do ótimo e aproximadamente distribuída normalmente. A qualidade de relato medida foi menor do que o que a comunidade percebeu, particularmente para os métodos de revisão sistemática necessários para medir confiabilidade. A minoria dos artigos avaliados que referenciaram uma diretriz (\textasciitilde 16%) mostrou qualidade de relato substancialmente maior do que a média, e os pesquisadores entrevistados mostraram interesse em usar uma diretriz de relato para melhorar a qualidade de relato. A diretriz líder para melhorar a qualidade de relato de revisões sistemáticas é o Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-Analyses (PRISMA) statement. Aqui, revelamos uma extensão do PRISMA para servir à comunidade de meta-análises em ecologia e biologia evolutiva: PRISMA-EcoEvo (versão 1.0). O PRISMA-EcoEvo é uma lista de verificação de 27 itens principais que, quando aplicáveis, devem ser relatados em publicações de revisão sistemática e meta-análise que resumem pesquisas primárias em ecologia e biologia evolutiva. Neste documento de explicação e elaboração, fornecemos orientação para autores, revisores e editores, com explicações para cada item na lista de verificação, incluindo exemplos suplementares de artigos publicados. Os autores podem consultar esta diretriz PRISMA-EcoEvo tanto nas etapas de planejamento e escrita de uma revisão sistemática e meta-análise, para aumentar a qualidade de relato de manuscritos submetidos. Revisores e editores podem usar a lista de verificação para avaliar a qualidade de relato nos manuscritos que revisam. No geral, o PRISMA-EcoEvo é um recurso para a comunidade de ecologia e biologia evolutiva para facilitar revisões sistemáticas e meta-análises transparentes e abrangentemente relatadas.",
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    doi = "10.1111/brv.12721",
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    references = "doi101016jbiocon201506006, doi101038s4155901704025"
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Os traços funcionais oferecem um quadro quantitativo rico para o desenvolvimento e teste de teorias em biologia evolutiva, ecologia e ciência dos ecossistemas. No entanto, o potencial dos traços funcionais para impulsionar avanços teóricos e refinar modelos de mudanças globais só pode ser plenamente realizado quando as informações ao nível das espécies estiverem completas. Aqui apresentamos o conjunto de dados AVONET contendo dados abrangentes de traços funcionais para todas as aves, incluindo seis variáveis ecológicas, 11 traços morfológicos contínuos e informações sobre o tamanho e localização da área de distribuição. Medidas morfológicas brutas são apresentadas para 90.020 indivíduos de 11.009 espécies de aves extantes amostradas de 181 países. Estes dados também são resumidos como médias de espécies em três formatos taxonômicos, permitindo integração com uma filogenia global, mapas de áreas de distribuição geográfica, dados da Lista Vermelha da UICN e o banco de dados de ciência cidadã eBird. O conjunto de dados AVONET fornece a imagem mais detalhada da variação de traços contínuos para qualquer radiação majoritária de organismos, oferecendo um modelo global para testar hipóteses e explorar as origens evolutivas, estrutura e funcionamento da biodiversidade.

@article{doi101111ele13898,
    author = "Tobias, Joseph A. e Sheard, Catherine e Pigot, Alex L. e Devenish, Adam J. M. e Yang, Jingyi e Sayol, Ferran e Neate‐Clegg, Montague H. C. e Alioravainen, Nico e Weeks, Thomas e Barber, Robert A. e Walkden, Patrick A. e MacGregor, Hannah E. A. e Jones, Samuel E. I. e Vincent, Claire e Phillips, Anna G. e Marples, Nicola M. e Montaño‐Centellas, Flavia e Leandro‐Silva, Victor e Claramunt, Santiago e Darski, Bianca e Freeman, Benjamin G. e Bregman, Tom P. e Cooney, Christopher R. e Hughes, Emma C. e Capp, Elliot J. R. e Varley, Zoë K. e Friedman, Nicholas R. e Korntheuer, Heiko e Corrales‐Vargas, Andrea e Trisos, Christopher H. e Weeks, Brian C. e Hanz, Dagmar M. e Töpfer, Till e Bravo, Gustavo A. e Remeš, Vladimír e Nowak, Larissa e Carneiro, Lincoln Silva e R., Amilkar J. Moncada e Matysioková, Beata e Baldassarre, Daniel T. e Martínez‐Salinas, Alejandra e Wolfe, Jared D. e Chapman, Philip M. e Daly, Benjamin G. e Sorensen, Marjorie C. e Neu, Alexander e Ford, Michael A. e Mayhew, Rebekah J. e Silveira, Luís Fábio e Kelly, David e Annorbah, Nathaniel N. D. e Pollock, Henry S. e Grabowska-Zhang, Ada e McEntee, Jay P. e Gonzalez, Juan Carlos T. e Meneses, Camila G. e Muñoz, Marcia C. e Powell, Luke L. e Jamie, Gabriel A. e Matthews, Thomas J. e Johnson, Oscar W. e Brito, Guilherme Renzo Rocha e Zyskowski, Kristof e Crates, Ross e Harvey, Michael e Zevallos, Maura Jurado e Hosner, Peter A. e Bradfer‐Lawrence, Tom e Maley, James M. e Stiles, F. Gary e Lima, Hevana S. e Provost, Kaiya L. e Chibesa, Moses e Mashao, Mmatjie e Howard, Jeffrey T. e Mlamba, Edson e Chua, Marcus A.H. e Li, Bicheng e Gómez, María Isabel e García, Natalia C. e Päckert, Martin e Fuchs, Jérôme e Ali, Jarome R. e Derryberry, Elizabeth P. e Carlson, Monica L. e Urriza, Rolly C. e Brzeski, Kristin E. e Prawiradilaga, Dewi M. e Rayner, Matt J. e Miller, Eliot T. e Bowie, Rauri C. K. e Lafontaine, René‐Marie e Scofield, R. Paul e Lou, Yingqiang e Somarathna, Lankani e Lepage, Denis e Illif, Marshall e Neuschulz, Eike Lena e Templin, Mathias e Dehling, D. Matthias",
    title = "AVONET: dados morfológicos, ecológicos e geográficos para todas as aves",
    year = "2022",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Os traços funcionais oferecem um quadro quantitativo rico para o desenvolvimento e teste de teorias em biologia evolutiva, ecologia e ciência dos ecossistemas. No entanto, o potencial dos traços funcionais para impulsionar avanços teóricos e refinar modelos de mudanças globais só pode ser plenamente realizado quando as informações ao nível das espécies estiverem completas. Aqui apresentamos o conjunto de dados AVONET contendo dados abrangentes de traços funcionais para todas as aves, incluindo seis variáveis ecológicas, 11 traços morfológicos contínuos e informações sobre o tamanho e localização da área de distribuição. Medidas morfológicas brutas são apresentadas para 90.020 indivíduos de 11.009 espécies de aves extantes amostradas de 181 países. Estes dados também são resumidos como médias de espécies em três formatos taxonômicos, permitindo integração com uma filogenia global, mapas de áreas de distribuição geográfica, dados da Lista Vermelha da UICN e o banco de dados de ciência cidadã eBird. O conjunto de dados AVONET fornece a imagem mais detalhada da variação de traços contínuos para qualquer radiação majoritária de organismos, oferecendo um modelo global para testar hipóteses e explorar as origens evolutivas, estrutura e funcionamento da biodiversidade.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.13898",
    doi = "10.1111/ele.13898",
    openalex = "W4213419599",
    references = "doi101038nature11631, doi101038nature21074, doi101038s4155901704025, doi101111j13652664201102048x, doi101111j14610248201001509x, doi1018900814941, openalexw1904943263"
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Sistemas de alta elevação abrigam espécies adaptadas a condições extremas, e seu terreno acidentado e microclimas variáveis moldam fortemente a evolução e a persistência. No entanto, poucos estudos avaliaram como a geografia e o clima moldam conjuntamente a diversidade genética, a adaptação local e a vulnerabilidade à mudança ambiental. Aqui, investigamos esses processos no Peruco Tibetano (Perdix hodgsoniae), um endêmico de alta altitude distribuído por regiões áridas do oeste e úmidas do nordeste da paisagem Sino-Himalaia. A topografia complexa e as condições climáticas contrastantes dessa região fornecem um cenário natural para examinar a divergência populacional, a adaptação associada ao clima e a resiliência futura. Integramos sequenciamento de genoma completo, dados ecológicos, climáticos, de paisagem e morfológicos para examinar padrões atuais de adaptação local e prever riscos induzidos pelo clima. Nossos resultados mostram que tanto as barreiras biogeográficas quanto os gradientes climáticos impulsionam a rápida divergência populacional em P. hodgsoniae, refletida em traços morfológicos distintos e estrutura genética populacional. Populações em paisagens ocidentais secas e fragmentadas mostram adaptação à temperatura, enquanto aquelas em regiões úmidas do nordeste exibem adaptação principalmente à precipitação. Essas trajetórias adaptativas contrastantes levam a níveis variados de vulnerabilidade, com paisagens áridas e isoladas limitando o fluxo gênico e a diversidade genética, aumentando assim a sensibilidade às mudanças climáticas futuras. Em contraste, as regiões úmidas mantêm uma conectividade mais forte e tamanhos efetivos de população maiores, suportando maior diversidade genética e facilitando a adaptação ligada à precipitação. Juntos, demonstramos que as paisagens montanhosas funcionam como uma "espada de dois gumes", gerando e limitando a biodiversidade simultaneamente através do isolamento e restringindo a persistência dentro de refúgios microclimáticos. Este estudo sublinha o valor de integrar dados genômicos, ecológicos, climáticos e de paisagem para revelar mecanismos de divergência e informar o planejamento de conservação sob rápida mudança ambiental.

@article{doi101111mec70274,
    author = "Wang, Nan e Ghimire, Prashant e Chhetri, Pritam e Dahal, Nishma e Yi, Cheng e Zhang, Tong e Zhuoga, Suonan e Jiangyong, Zhaxi e Lamichhaney, Sangeet",
    title = "Biogeografia e Clima Impulsionam a Divergência Populacional e a Vulnerabilidade Genômica em Pássaros Endêmicos de Alta Montanha.",
    year = "2026",
    journal = "Molecular ecology",
    abstract = "Sistemas de alta elevação abrigam espécies adaptadas a condições extremas, e seu terreno acidentado e microclimas variáveis moldam fortemente a evolução e a persistência. No entanto, poucos estudos avaliaram como a geografia e o clima moldam conjuntamente a diversidade genética, a adaptação local e a vulnerabilidade à mudança ambiental. Aqui, investigamos esses processos no Peruco Tibetano (Perdix hodgsoniae), um endêmico de alta altitude distribuído por regiões áridas do oeste e úmidas do nordeste da paisagem Sino-Himalaia. A topografia complexa e as condições climáticas contrastantes dessa região fornecem um cenário natural para examinar a divergência populacional, a adaptação associada ao clima e a resiliência futura. Integramos sequenciamento de genoma completo, dados ecológicos, climáticos, de paisagem e morfológicos para examinar padrões atuais de adaptação local e prever riscos induzidos pelo clima. Nossos resultados mostram que tanto as barreiras biogeográficas quanto os gradientes climáticos impulsionam a rápida divergência populacional em P. hodgsoniae, refletida em traços morfológicos distintos e estrutura genética populacional. Populações em paisagens ocidentais secas e fragmentadas mostram adaptação à temperatura, enquanto aquelas em regiões úmidas do nordeste exibem adaptação principalmente à precipitação. Essas trajetórias adaptativas contrastantes levam a níveis variados de vulnerabilidade, com paisagens áridas e isoladas limitando o fluxo gênico e a diversidade genética, aumentando assim a sensibilidade às mudanças climáticas futuras. Em contraste, as regiões úmidas mantêm uma conectividade mais forte e tamanhos efetivos de população maiores, suportando maior diversidade genética e facilitando a adaptação ligada à precipitação. Juntos, demonstramos que as paisagens montanhosas funcionam como uma "espada de dois gumes", gerando e limitando a biodiversidade simultaneamente através do isolamento e restringindo a persistência dentro de refúgios microclimáticos. Este estudo sublinha o valor de integrar dados genômicos, ecológicos, climáticos e de paisagem para revelar mecanismos de divergência e informar o planejamento de conservação sob rápida mudança ambiental.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12924089/",
    doi = "10.1111/mec.70274",
    openalex = "W7130831913",
    pmcid = "PMC12924089",
    pmid = "41721581",
    references = "doi1010020471250953bi1110s43, doi101002joc5086, doi101093bioinformaticsbtp324, doi101093bioinformaticsbtr330, doi101093sysbiosyy032, doi101111j13652664200601214x, doi101148radiology14317063747, doi101186147121487214, doi101371journalpone0009490, doi1018637jssv022i04"
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