Gêneros

Artigo de Revista O MODELO ALLOPATRICO E A FILOGENIA EM INVERTEBRADOS PALEOZOICOS Obter acesso Niles Eldredge Niles Eldredge The American Museum of Natural History Central Park West at 79th New York New York 10024 Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Evolução, Volume 25, Edição 1, 1 de Março de 1971, Páginas 156–167, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1971.tb01868.x Publicado: 01 de Março de 1971 Histórico do Artigo Recebido: 10 de Junho de 1970 Publicado: 01 de Março de 1971

@article{doi101111j155856461971tb01868x,
    author = "Eldredge, Niles",
    title = "O MODELO ALLOPATRICO E A FILOGENIA EM INVERTEBRADOS PALEOZOICOS",
    year = "1971",
    journal = "Evolução",
    abstract = "Artigo de Revista O MODELO ALLOPATRICO E A FILOGENIA EM INVERTEBRADOS PALEOZOICOS Obter acesso Niles Eldredge Niles Eldredge The American Museum of Natural History Central Park West at 79th New York New York 10024 Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Evolução, Volume 25, Edição 1, 1 de Março de 1971, Páginas 156–167, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1971.tb01868.x Publicado: 01 de Março de 1971 Histórico do Artigo Recebido: 10 de Junho de 1970 Publicado: 01 de Março de 1971",
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}

Os taxonomistas que trabalham com faunas do Cenozóico tardio tendem a ver as espécies vivas como pontos de partida para a avaliação de cronospecies (ou seja, segmentos de linhagens evolutivas subjetivamente designados como espécies) que se estendem para trás no tempo a partir do Recente. Esta prática torna possível construir uma curva de sobrevivência para cronospecies do Cenozóico tardio avaliando todas as linhagens fóssis acreditadas terem sobrevivido até os dias de hoje. Uma curva de sobrevivência é produzida plotando a fração dessas linhagens existentes em qualquer momento que não tenham sofrido evolução filética suficiente para que seus representantes atuais sejam atribuídos a novas espécies. Este tipo de curva de sobrevivência foi plotada para cronospecies de mamíferos usando o início do Würm, em vez do Recente, como ponto final, a fim de evitar os efeitos da extinção em massa do Würm e pós-Würm. A curva de sobrevivência revela que, exceto por uma pequena fração, as cronospecies estabelecidas têm durações longas relativas a intervalos de tempo durante os quais taxons superiores distintos surgiram. A turnover filética de espécies tem sido notavelmente lenta. A maioria da mudança evolutiva líquida deve ter sido associada à especiação saltacional. Até mesmo a grande maioria dos gêneros deve ter surgido rapidamente por um ou mais eventos de especiação divergente. Estimativas das taxas de extinção sugerem que o efeito gargalo, no qual a constrição de uma linhagem é seguida por re-expansão como uma espécie distinta, não pode ser uma fonte majoritária de mudança evolutiva. Essas conclusões, baseadas na avaliação da filogenia de mamíferos, parecem também se aplicar a outros taxons de animais, apoiando o modelo punctuacional da evolução. As longas durações das espécies de hominídeos implicam que a evolução dos humanos, como a de outros mamíferos, conforma-se a este modelo.

@article{doi101017s0094837300005662,
    author = "Stanley, Steven M.",
    title = "Longevidades de 'cronospecies', a origem de gêneros e o modelo punctuacional da evolução",
    year = "1978",
    journal = "Paleobiologia",
    abstract = "Os taxonomistas que trabalham com faunas do Cenozóico tardio tendem a ver as espécies vivas como pontos de partida para a avaliação de cronospecies (ou seja, segmentos de linhagens evolutivas subjetivamente designados como espécies) que se estendem para trás no tempo a partir do Recente. Esta prática torna possível construir uma curva de sobrevivência para cronospecies do Cenozóico tardio avaliando todas as linhagens fóssis acreditadas terem sobrevivido até os dias de hoje. Uma curva de sobrevivência é produzida plotando a fração dessas linhagens existentes em qualquer momento que não tenham sofrido evolução filética suficiente para que seus representantes atuais sejam atribuídos a novas espécies. Este tipo de curva de sobrevivência foi plotada para cronospecies de mamíferos usando o início do Würm, em vez do Recente, como ponto final, a fim de evitar os efeitos da extinção em massa do Würm e pós-Würm. A curva de sobrevivência revela que, exceto por uma pequena fração, as cronospecies estabelecidas têm durações longas relativas a intervalos de tempo durante os quais taxons superiores distintos surgiram. A turnover filética de espécies tem sido notavelmente lenta. A maioria da mudança evolutiva líquida deve ter sido associada à especiação saltacional. Até mesmo a grande maioria dos gêneros deve ter surgido rapidamente por um ou mais eventos de especiação divergente. Estimativas das taxas de extinção sugerem que o efeito gargalo, no qual a constrição de uma linhagem é seguida por re-expansão como uma espécie distinta, não pode ser uma fonte majoritária de mudança evolutiva. Essas conclusões, baseadas na avaliação da filogenia de mamíferos, parecem também se aplicar a outros taxons de animais, apoiando o modelo punctuacional da evolução. As longas durações das espécies de hominídeos implicam que a evolução dos humanos, como a de outros mamíferos, conforma-se a este modelo.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300005662",
    doi = "10.1017/s0094837300005662",
    openalex = "W2484245196",
    references = "doi10100703064746897, doi101017s0094837300005224, doi101093aesa383396, doi101126science1653891349, doi1023071441916, doi1023072407738, doi1023072411924, doi104159harvard9780674865327, openalexw2145250129, openalexw3135630760"
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@misc{stanley1978chronospecies1,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Longevidades de 'espécies-crono', a origem de gêneros e o modelo pontuacionista da evolução",
    year = "1978",
    howpublished = "Paleobiologia, v. 4, p. 26-40",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Stanley, S. M., 1978, Longevidades de 'espécies-crono', a origem de gêneros e o modelo pontuacionista da evolução: Paleobiologia, v. 4, p. 26-40.}"
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@article{stanley1989the,
    author = "Stanley, Steven M",
    title = "O caso empírico para o modelo evolutivo pontuado",
    year = "1989",
    journal = "Journal of Social and Biological Structures",
    url = "https://doi.org/10.1016/0140-1750(89)90042-0",
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    number = "2-3",
    openalex = "W2038851461",
    pages = "159-172",
    volume = "12",
    references = "doi101017s0094837300005224, doi101038325031a0, doi101086282975, doi101093genetics16297, doi101093genetics9441011, doi101111j155856461969tb03508x, doi1023072482053, doi104159harvard9780674865327, doi107312steb94536, openalexw2971318137"
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É introduzido um modelo simples e robusto da evolução biológica de uma ecologia de espécies interagentes. O modelo se auto-organiza em um estado estacionário crítico com avalanches coevolutivas intermitentes de todos os tamanhos; ou seja, ele exibe comportamento de ``equilíbrio pontuado''. Essa evolução colaborativa é muito mais rápida do que cenários não cooperativos, uma vez que não estão envolvidas mutações grandes e coordenadas, e, portanto, proibitivamente improváveis.

@article{doi101103physrevlett714083,
    author = "Bak, Per e Sneppen, Kim",
    title = "Equilíbrio pontuado e criticidade em um modelo simples de evolução",
    year = "1993",
    journal = "Physical Review Letters",
    abstract = "É introduzido um modelo simples e robusto da evolução biológica de uma ecologia de espécies interagentes. O modelo se auto-organiza em um estado estacionário crítico com avalanches coevolutivas intermitentes de todos os tamanhos; ou seja, ele exibe comportamento de ``equilíbrio pontuado''. Essa evolução colaborativa é muito mais rápida do que cenários não cooperativos, uma vez que não estão envolvidas mutações grandes e coordenadas, e, portanto, proibitivamente improváveis.",
    url = "https://doi.org/10.1103/physrevlett.71.4083",
    doi = "10.1103/physrevlett.71.4083",
    openalex = "W1966151890",
    references = "doi1010160004698180901493, doi101016s0022519305800943, doi101017s0094837300005224, doi101038342780a0, doi101103physreva38364, doi101103physreva466724, doi101103physrevlett59381, doi101103physrevlett693539, doi101103physrevlett71101, doi1012019780429492594, pines2018emerging"
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@incollection{clube1996evolution,
    author = "Clube, S. V. M.",
    title = "Evolução, Crises Puntuacionais e a Ameaça à Civilização",
    year = "1996",
    booktitle = "Mundos em Interação: Pequenos Corpos e Planetas do Sistema Solar",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-009-0209-1\_54",
    doi = "10.1007/978-94-009-0209-1\_54",
    openalex = "W2078463644",
    pages = "433-440",
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@article{doi101016jtree200310013,
    author = "Johnson, Jerald B. e Omland, Kristian Shawn",
    title = "Seleção de modelos em ecologia e evolução",
    year = "2003",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2003.10.013",
    doi = "10.1016/j.tree.2003.10.013",
    openalex = "W2146081698",
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@article{crossref2006gradual,
    title = "Gradual Versus Punctuational Evolution",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.314.5796.13g",
    doi = "10.1126/science.314.5796.13g",
    number = "5796",
    openalex = "W4210646514",
    pages = "13g-13g",
    volume = "314"
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Compreender a taxa na qual novas espécies se formam é uma questão fundamental no estudo da evolução da vida na Terra. Aqui, revisamos nossa compreensão atual das taxas de especiação, focando em estudos baseados no registro fóssil, filogenias e modelos matemáticos. Descobrimos que as taxas de especiação estimadas a partir desses diferentes estudos podem ser dramaticamente diferentes: alguns estudos encontram que novas espécies se formam rapidamente e frequentemente, enquanto outros encontram que novas espécies se formam muito menos frequentemente. Sugerimos que, em vez de serem contraditórias, as diferenças nas taxas de especiação em diferentes escalas podem ser reconciliadas por um modelo comum. Sob o "modelo de especiação efêmero", a especiação é muito comum e muito rápida, mas as novas espécies produzidas quase nunca persistem. Portanto, os estudos evolutivos devem focar não apenas na formação, mas também na persistência de novas espécies.

@article{doi101007s116920129171x,
    author = "Rosenblum, Erica Bree e Sarver, Brice A. J. e Brown, Joseph W. e Roches, Simone Des e Hardwick, Kayla M. e Hether, Tyler e Eastman, Jonathan M. e Pennell, Matthew W. e Harmon, Luke J.",
    title = "Goldilocks encontra Santa Rosalia: Um modelo de especiação efêmero explica padrões de diversificação em escalas de tempo",
    year = "2012",
    journal = "Biologia Evolutiva",
    abstract = {Compreender a taxa na qual novas espécies se formam é uma questão fundamental no estudo da evolução da vida na Terra. Aqui, revisamos nossa compreensão atual das taxas de especiação, focando em estudos baseados no registro fóssil, filogenias e modelos matemáticos. Descobrimos que as taxas de especiação estimadas a partir desses diferentes estudos podem ser dramaticamente diferentes: alguns estudos encontram que novas espécies se formam rapidamente e frequentemente, enquanto outros encontram que novas espécies se formam muito menos frequentemente. Sugerimos que, em vez de serem contraditórias, as diferenças nas taxas de especiação em diferentes escalas podem ser reconciliadas por um modelo comum. Sob o "modelo de especiação efêmero", a especiação é muito comum e muito rápida, mas as novas espécies produzidas quase nunca persistem. Portanto, os estudos evolutivos devem focar não apenas na formação, mas também na persistência de novas espécies.},
    url = "https://doi.org/10.1007/s11692-012-9171-x",
    doi = "10.1007/s11692-012-9171-x",
    openalex = "W1997489023",
    references = "doi101016jtree200611004, doi101017s0094837300005662, doi10108010635150600852011, doi101086282070, doi101093aesa383396, doi101093oso97801985052350010001, doi1023073071998, doi102307jctv1nzfgj7, doi104159harvard9780674865327, doi105860choice375647, openalexw2764433274, stanley1978chronospecies"
}

Apesar da introdução de métodos baseados em verossimilhança para estimar árvores filogenéticas a partir de dados fenotípicos, a parsimônia permanece sendo o critério de otimalidade mais amplamente utilizado para construir árvores a partir de dados morfológicos discretos. No entanto, há décadas sabe-se que existem regiões do espaço de soluções nas quais a parsimônia é um estimador pobre da topologia da árvore. Existem inúmeras implementações de software de modelos baseados em verossimilhança para a estimação de filogenia a partir de dados morfológicos discretos, especialmente para o modelo Mk de evolução de caracteres discretos. Aqui, exploramos a eficácia da estimação bayesiana de filogenia, usando o modelo Mk, sob condições comumente encontradas em estudos paleontológicos. Usando dados simulados, descrevemos o desempenho relativo da parsimônia e do modelo Mk sob uma variedade de condições realistas que incluem cenários comuns de dados faltantes e heterogeneidade de taxas.

@article{doi101371journalpone0109210,
    author = "Wright, April e Hillis, David M.",
    title = "Análise Bayesiana Usando um Modelo de Verossimilhança Simples Supera a Parsimônia para a Estimação de Filogenia a partir de Dados Morfológicos Discretos",
    year = "2014",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Apesar da introdução de métodos baseados em verossimilhança para estimar árvores filogenéticas a partir de dados fenotípicos, a parsimônia permanece sendo o critério de otimalidade mais amplamente utilizado para construir árvores a partir de dados morfológicos discretos. No entanto, há décadas sabe-se que existem regiões do espaço de soluções nas quais a parsimônia é um estimador pobre da topologia da árvore. Existem inúmeras implementações de software de modelos baseados em verossimilhança para a estimação de filogenia a partir de dados morfológicos discretos, especialmente para o modelo Mk de evolução de caracteres discretos. Aqui, exploramos a eficácia da estimação bayesiana de filogenia, usando o modelo Mk, sob condições comumente encontradas em estudos paleontológicos. Usando dados simulados, descrevemos o desempenho relativo da parsimônia e do modelo Mk sob uma variedade de condições realistas que incluem cenários comuns de dados faltantes e heterogeneidade de taxas.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0109210",
    doi = "10.1371/journal.pone.0109210",
    openalex = "W2067046632",
    references = "doi10108010635150802022231, doi101111j10963642200600293x, doi101111j15585646201201723x"
}

Análises anteriores de padrões evolutivos, ou modos, em linhagens fósseis focaram quase exclusivamente em três modelos simples: estase, passeios aleatórios e evolução direcional. Aqui, usamos métodos de verossimilhança para ajustar um conjunto expandido de modelos evolutivos a uma grande compilação de séries de ancestrais e descendentes de populações do registro fóssil. Além dos três modelos padrão, avaliamos modelos mais complexos com pontuações e transições de um modo evolutivo para outro. Como em estudos anteriores, encontramos que a estase é comum no registro fóssil, assim como uma versão estrita de estase que não envolve mudanças evolutivas reais. A incidência de evolução direcional é relativamente baixa (13%), mas maior do que em estudos anteriores porque nossa abordagem analítica pode detectar tendências ruidosas com mais sensibilidade. Modelos evolutivos complexos são frequentemente favorecidos, de forma esmagadora para sequências que compreendem muitas amostras. Esta descoberta é consistente com dinâmicas evolutivas que, na realidade, são mais complexas do que qualquer um dos modelos que consideramos. Além disso, o tempo das transições nas dinâmicas evolutivas varia entre traços medidos da mesma série. Finalmente, usamos nossa coleção empírica de sequências evolutivas e um proxy longo e altamente resolvido para o clima global para informar simulações nas quais traços adaptativamente acompanham mudanças de temperatura ao longo do tempo. Quando realisticamente calibrado, encontramos que este modelo simples pode reproduzir aspectos importantes de nossos resultados paleontológicos. Concluímos que os padrões paleontológicos observados, incluindo a prevalência de estase, não precisam ser inconsistentes com a evolução adaptativa, mesmo diante de ambientes físicos instáveis.

@article{doi101073pnas1403662111,
    author = "Hunt, Gene e Hopkins, Melanie J. e Lidgard, Scott",
    title = "Modelos simples versus complexos da evolução de traços e estase como resposta à mudança ambiental",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Análises anteriores de padrões evolutivos, ou modos, em linhagens fósseis focaram quase exclusivamente em três modelos simples: estase, passeios aleatórios e evolução direcional. Aqui, usamos métodos de verossimilhança para ajustar um conjunto expandido de modelos evolutivos a uma grande compilação de séries de ancestrais e descendentes de populações do registro fóssil. Além dos três modelos padrão, avaliamos modelos mais complexos com pontuações e transições de um modo evolutivo para outro. Como em estudos anteriores, encontramos que a estase é comum no registro fóssil, assim como uma versão estrita de estase que não envolve mudanças evolutivas reais. A incidência de evolução direcional é relativamente baixa (13%), mas maior do que em estudos anteriores porque nossa abordagem analítica pode detectar tendências ruidosas com mais sensibilidade. Modelos evolutivos complexos são frequentemente favorecidos, de forma esmagadora para sequências que compreendem muitas amostras. Esta descoberta é consistente com dinâmicas evolutivas que, na realidade, são mais complexas do que qualquer um dos modelos que consideramos. Além disso, o tempo das transições nas dinâmicas evolutivas varia entre traços medidos da mesma série. Finalmente, usamos nossa coleção empírica de sequências evolutivas e um proxy longo e altamente resolvido para o clima global para informar simulações nas quais traços adaptativamente acompanham mudanças de temperatura ao longo do tempo. Quando realisticamente calibrado, encontramos que este modelo simples pode reproduzir aspectos importantes de nossos resultados paleontológicos. Concluímos que os padrões paleontológicos observados, incluindo a prevalência de estase, não precisam ser inconsistentes com a evolução adaptativa, mesmo diante de ambientes físicos instáveis.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1403662111",
    doi = "10.1073/pnas.1403662111",
    openalex = "W2157019229",
    references = "doi101002bimj200810425, doi10100703064746897, doi101017s0094837300005224, doi1010292004pa001071, doi101046j14724642199900046x, doi101086303400, doi101093aesa383396, doi1023072485224, doi105860choice396411, openalexw3135630760, stanley1989the"
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Resumo Apresentamos o mv morph, um pacote de métodos comparativos filogenéticos multivariados para o ambiente estatístico r. O mv morph está disponível gratuitamente no repositório de pacotes cran (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). O mv morph permite ajustar uma variedade de modelos evolutivos multivariados sob um critério de máxima verossimilhança. Inicialmente desenvolvido no contexto da análise filogenética de múltiplos traços morfométricos, seu uso pode ser estendido a qualquer conjunto de dados biológicos com um ou múltiplos traços contínuos covariantes. Todos os modelos de ajuste incluem a possibilidade de usar mapeamento semelhante ao simmap, o que pode ser útil para ajustar mudanças ao longo de linhagens em um determinado ponto no tempo. Todos os modelos fornecem métricas diagnósticas para convergência e confiabilidade das estimativas, bem como a possibilidade de incluir erros de medição de traços nas estimativas do modelo. Novas funcionalidades fornecidas pelo pacote mv morph incluem a possibilidade de ajustar modelos com mudanças no modo de evolução ao longo da filogenia, o que será particularmente significativo em análises comparativas que incluem táxons extintos, por exemplo, ao testar mudanças no modo evolutivo associadas a eventos bióticos/abióticos globais. Descrevemos brevemente os modelos já incluídos no mv morph e fornecemos algumas demonstrações do uso do pacote com dois exemplos de trabalho simulados.

@article{doi1011112041210x12420,
    author = "Clavel, Julien e Escarguel, Gilles e Merceron, Gildas",
    title = "mv morph: um pacote r para ajustar modelos evolutivos multivariados a dados morfométricos",
    year = "2015",
    journal = "Methods in Ecology and Evolution",
    abstract = "Resumo Apresentamos o mv morph, um pacote de métodos comparativos filogenéticos multivariados para o ambiente estatístico r. O mv morph está disponível gratuitamente no repositório de pacotes cran (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). O mv morph permite ajustar uma variedade de modelos evolutivos multivariados sob um critério de máxima verossimilhança. Inicialmente desenvolvido no contexto da análise filogenética de múltiplos traços morfométricos, seu uso pode ser estendido a qualquer conjunto de dados biológicos com um ou múltiplos traços contínuos covariantes. Todos os modelos de ajuste incluem a possibilidade de usar mapeamento semelhante ao simmap, o que pode ser útil para ajustar mudanças ao longo de linhagens em um determinado ponto no tempo. Todos os modelos fornecem métricas diagnósticas para convergência e confiabilidade das estimativas, bem como a possibilidade de incluir erros de medição de traços nas estimativas do modelo. Novas funcionalidades fornecidas pelo pacote mv morph incluem a possibilidade de ajustar modelos com mudanças no modo de evolução ao longo da filogenia, o que será particularmente significativo em análises comparativas que incluem táxons extintos, por exemplo, ao testar mudanças no modo evolutivo associadas a eventos bióticos/abióticos globais. Descrevemos brevemente os modelos já incluídos no mv morph e fornecemos algumas demonstrações do uso do pacote com dois exemplos de trabalho simulados.",
    url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.12420",
    doi = "10.1111/2041-210x.12420",
    openalex = "W1527504944",
    references = "doi1010079783662024522, doi1010079783662053898, doi10103844766, doi101086284325, doi101086383584, doi1011112041210x12035, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j155856461979tb04694x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101111j15585646201201723x, doi101111j2041210x201100169x, doi10118614712105788, doi1023073802723"
}

O estudo de ilhas como sistemas modelo desempenhou um papel importante no desenvolvimento da teoria evolutiva e ecológica. O 50º aniversário do artigo de MacArthur e Wilson (dezembro de 1963), 'An equilibrium theory of insular zoogeography', foi um marco recente para este tema. Desde 1963, os sistemas insulares forneceram novas perspectivas sobre a formação de comunidades ecológicas. Aqui, baseando‐nos em tais desenvolvimentos, destacamos as perspectivas para a pesquisa em ilhas para melhorar nossa compreensão da ecologia e evolução das comunidades em geral. Ao longo do texto, enfatizamos como os atributos das ilhas se combinam para proporcionar oportunidades de pesquisa incomuns, cujas implicações estendem‐se muito além das ilhas. Ferramentas moleculares e a crescente aquisição de dados agora permitem a reavaliação de algumas questões fundamentais que interessaram a MacArthur e Wilson. Estas incluem a formação de redes ecológicas, distribuições de abundância de espécies e a contribuição da evolução para a montagem de comunidades. Também estendemos nossas perspectivas para outros campos da ecologia e evolução – compreensão do funcionamento dos ecossistemas, especiação e diversificação – empregando frequentemente os recursos de ilhas oceânicas para inferir a área geográfica dentro da qual a evolução ocorreu e potenciais barreiras ao fluxo gênico. Embora a teoria baseada em ilhas esteja continuamente sendo enriquecida, incorporar dinâmicas não‐equilibradas é identificada como um grande desafio para o futuro.

@article{doi101111ele12398,
    author = "Warren, Ben H. e Simberloff, Daniel e Ricklefs, Robert E. e Aguilée, Robin e Condamine, Fabien L. e Gravel, Dominique e Morlon, Hélène e Mouquet, Nicolas e Rosindell, James e Casquet, Juliane e Conti, Elena e Cornuault, Josselin e Fernández‐Palacios, José María e Hengl, Tomislav e Norder, Sietze J. e Rijsdijk, Kenneth F. e Sanmartín, Isabel e Strasberg, Dominique e Triantis, Kostas A. e Valente, Luís e Whittaker, Robert J. e Gillespie, Rosemary G. e Emerson, Brent C. e Thébaud, Christophe",
    title = "Ilhas como sistemas modelo em ecologia e evolução: perspectivas cinqüenta anos após MacArthur‐Wilson",
    year = "2015",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "O estudo de ilhas como sistemas modelo desempenhou um papel importante no desenvolvimento da teoria evolutiva e ecológica. O 50º aniversário do artigo de MacArthur e Wilson (dezembro de 1963), 'An equilibrium theory of insular zoogeography', foi um marco recente para este tema. Desde 1963, os sistemas insulares forneceram novas perspectivas sobre a formação de comunidades ecológicas. Aqui, baseando‐nos em tais desenvolvimentos, destacamos as perspectivas para a pesquisa em ilhas para melhorar nossa compreensão da ecologia e evolução das comunidades em geral. Ao longo do texto, enfatizamos como os atributos das ilhas se combinam para proporcionar oportunidades de pesquisa incomuns, cujas implicações estendem‐se muito além das ilhas. Ferramentas moleculares e a crescente aquisição de dados agora permitem a reavaliação de algumas questões fundamentais que interessaram a MacArthur e Wilson. Estas incluem a formação de redes ecológicas, distribuições de abundância de espécies e a contribuição da evolução para a montagem de comunidades. Também estendemos nossas perspectivas para outros campos da ecologia e evolução – compreensão do funcionamento dos ecossistemas, especiação e diversificação – empregando frequentemente os recursos de ilhas oceânicas para inferir a área geográfica dentro da qual a evolução ocorreu e potenciais barreiras ao fluxo gênico. Embora a teoria baseada em ilhas esteja continuamente sendo enriquecida, incorporar dinâmicas não‐equilibradas é identificada como um grande desafio para o futuro.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.12398",
    doi = "10.1111/ele.12398",
    openalex = "W2156521347",
    references = "doi101038nature07893, doi101038nrg3644, doi101126science1157966, doi101126science1193954"
}

Resumo Eu desenvolvi dois testes que colocam o pontuacionismo contra o gradualismo. O primeiro é o Teste de Radiação Adaptativa, que aplico a famílias de Mammalia do Eoceno médio e Bivalvia do Cretáceo tardio. Este teste mostra que as espécies em ambas essas classes duraram muito mais do que o necessário para que a evolução dentro delas (evolução filética) tivesse produzido as novas famílias que surgiram durante intervalos de tempo breves. Este teste produziria resultados semelhantes para muitos outros táxons. Ele apoia o modelo pontuacionista, assim como o Teste de Fósseis Vivos, que prevê que clados longos e estreitos, tendo experimentado pouca especiação, devem ter sofrido pouca evolução. Limitada principalmente à evolução filética, isso é exatamente o que aconteceu com eles. Vários estudos multivariados morfológicos de numerosas linhagens fósseis encontraram pouca ou nenhuma evolução gradual como a norma. Um desses incluiu 153 traços de linhagem e outro, 250. Outro produziu uma filogenia estratofenética retangular, com eventos de especiação horizontal inferidos conectando linhagens verticais. Juntos, esses estudos fornecem apoio esmagador para o modelo pontuacionista. Muitos estudos mostraram que eventos de especiação rápida ocorrem frequentemente e alguns são pontuacionistas. As águas-vivas que apareceram recentemente em lagos de água salgada na ilha do Pacífico de Palau são exemplos notáveis de especiação pontuacionista, assim como a súbita aparência da nova família de dólares de areia Dendrasteridae no Mioceno da Califórnia. O modelo pontuacionista mostra que o valor da reprodução sexual deve estar em produzir radiações adaptativas de longa duração, enquanto os clones desaparecem rapidamente.

@article{doi101017pab202510058,
    author = "Stanley, Steven M.",
    title = "Por que o modelo pontuacionista da evolução é válido",
    year = "2025",
    journal = "Paleobiologia",
    abstract = "Resumo Eu desenvolvi dois testes que colocam o pontuacionismo contra o gradualismo. O primeiro é o Teste de Radiação Adaptativa, que aplico a famílias de Mammalia do Eoceno médio e Bivalvia do Cretáceo tardio. Este teste mostra que as espécies em ambas essas classes duraram muito mais do que o necessário para que a evolução dentro delas (evolução filética) tivesse produzido as novas famílias que surgiram durante intervalos de tempo breves. Este teste produziria resultados semelhantes para muitos outros táxons. Ele apoia o modelo pontuacionista, assim como o Teste de Fósseis Vivos, que prevê que clados longos e estreitos, tendo experimentado pouca especiação, devem ter sofrido pouca evolução. Limitada principalmente à evolução filética, isso é exatamente o que aconteceu com eles. Vários estudos multivariados morfológicos de numerosas linhagens fósseis encontraram pouca ou nenhuma evolução gradual como a norma. Um desses incluiu 153 traços de linhagem e outro, 250. Outro produziu uma filogenia estratofenética retangular, com eventos de especiação horizontal inferidos conectando linhagens verticais. Juntos, esses estudos fornecem apoio esmagador para o modelo pontuacionista. Muitos estudos mostraram que eventos de especiação rápida ocorrem frequentemente e alguns são pontuacionistas. As águas-vivas que apareceram recentemente em lagos de água salgada na ilha do Pacífico de Palau são exemplos notáveis de especiação pontuacionista, assim como a súbita aparência da nova família de dólares de areia Dendrasteridae no Mioceno da Califórnia. O modelo pontuacionista mostra que o valor da reprodução sexual deve estar em produzir radiações adaptativas de longa duração, enquanto os clones desaparecem rapidamente.",
    url = "https://doi.org/10.1017/pab.2025.10058",
    doi = "10.1017/pab.2025.10058",
    openalex = "W4416981381",
    references = "doi101007s100219900037, doi101073pnas0704088104, doi101073pnas722646, doi101111j001438202004tb01740x, doi101111j155856461971tb01868x, doi101126science28854691211, doi101579004474472912, doi101890024045, doi107312simp93764, doi107312steb94536"
}

Desenvolvi dois testes que colocam o pontuacionismo contra o gradualismo. O primeiro é o Teste de Radiação Adaptativa, que aplico a famílias de Mammalia do Eoceno médio e Bivalvia do Cretáceo tardio. Este teste mostra que as espécies em ambas essas classes duraram muito mais do que o necessário para que a evolução dentro delas (evolução filética) tenha produzido as novas famílias que surgiram durante intervalos de tempo breves. Este teste produziria resultados similares para muitos outros táxons. Ele apoia o modelo pontuacionista, assim como o Teste de Fósseis Vivos, que prevê que clados longos e estreitos, tendo experimentado pouca especiação, devem ter sofrido pouca evolução. Limitada principalmente à evolução filética, isso é exatamente o que aconteceu com eles. Vários estudos multivariados morfológicos de numerosas linhagens fósseis encontraram pouca ou nenhuma evolução gradual como a norma. Um desses incluiu 153 traços de linhagem e outro, 250. Outro produziu uma filogenia estratofenética retangular, com eventos de especiação horizontal inferidos conectando linhagens verticais. Juntos, esses estudos fornecem apoio esmagador para o modelo pontuacionista. Muitos estudos mostraram que eventos de especiação rápida ocorrem frequentemente e alguns são pontuacionistas. As águas-vivas que apareceram recentemente em lagos de água salgada na ilha do Pacífico de Palau são exemplos notáveis de especiação pontuacionista, assim como a súbita aparência da nova família de dólares de areia Dendrasteridae no Mioceno da Califórnia. O modelo pontuacionista mostra que o valor da reprodução sexual deve estar em produzir radiações adaptativas de longa duração, enquanto os clones desaparecem rapidamente.

@article{stanley2025why,
    author = "Stanley, Steven M.",
    title = "Why the punctuational model of evolution is valid",
    year = "2025",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "I have devised two tests that pit punctuationalism against gradualism. The first is the Test of Adaptive Radiation, which I apply to families of middle Eocene Mammalia and Late Cretaceous Bivalvia. This test shows that species in both of these classes lasted much too long for evolution within them (phyletic evolution) to have produced the new families that arose during brief time intervals. This test would yield similar results for many other taxa. It supports the punctuational model, as does the Test of Living Fossils, which predicts that long, slender clades, having experienced little speciation, should have undergone little evolution. Limited largely to phyletic evolution, this is exactly what happened to them. Several multivariate morphological studies of numerous fossil lineages have found little or no gradual evolution to have been the norm. One of these included 153 lineage traits and another, 250. Still another produced a rectangular stratophenetic phylogeny, with inferred horizontal speciation events connecting vertical lineages. Taken together these studies provide overwhelming support for the punctuational model. Many studies have shown that rapid speciation events occur frequently and some are punctuational. Jellyfishes that have appeared recently in saltwater lakes on the Pacific island of Palau are remarkable examples of punctuational speciation, and so is the sudden appearance of the novel sand dollar family Dendrasteridae in the California Miocene. The punctuational model shows that the value of sexual reproduction must be in producing long-lived adaptive radiations, whereas clones die out quickly.",
    url = "https://doi.org/10.1017/pab.2025.10058",
    doi = "10.1017/pab.2025.10058",
    number = "4",
    openalex = "W4416981381",
    pages = "631-644",
    volume = "51",
    references = "doi101007s100219900037, doi101073pnas0704088104, doi101073pnas722646, doi101111j001438202004tb01740x, doi101111j155856461971tb01868x, doi101126science28854691211, doi101579004474472912, doi101890024045, doi107312simp93764, doi107312steb94536"
}