Genética

@book{fisher1930the23,
    author = "Fisher, R. A",
    title = "A Teoria Genética da Seleção Natural",
    year = "1930",
    publisher = "Oxford, Clarendon Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Fisher, R. A., 1930, A Teoria Genética da Seleção Natural: Oxford, Clarendon Press.}"
}

Página 108, última linha do texto, para P/P″ leia P′/P″. Página 120, última linha, para δ v leia δ y. Página 123, linha 10, para 4Nn leia 4Nu. Página 125, linha 1, para q leia q. Página 126, linha 12, para q leia q. Página 135, linha 5 a partir de baixo, para y4Nsq leia e4Nsq. Página 141, linhas 8

@article{doi101093genetics16297,
    author = "Wright, Sewall",
    title = "EVOLUÇÃO EM POPULAÇÕES MENDELIANAS",
    year = "1931",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Página 108, última linha do texto, para P/P″ leia P′/P″. Página 120, última linha, para δ v leia δ y. Página 123, linha 10, para 4Nn leia 4Nu. Página 125, linha 1, para q leia q. Página 126, linha 12, para q leia q. Página 135, linha 5 a partir de baixo, para y4Nsq leia e4Nsq. Página 141, linhas 8",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/16.2.97",
    doi = "10.1093/genetics/16.2.97",
    openalex = "W2171463101",
    references = "doi101017s0080456800012163, doi101017s0305004100015644, doi101086279846, doi101086279872, doi101086280193, doi101086280260, doi101111j160152231928tb02483x, doi101126science2870649, doi1023072965538, doi105962bhltitle27468"
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@misc{wright1931evolution47,
    author = "Wright, S",
    title = "Evolução em populações mendelianas",
    year = "1931",
    howpublished = "Genetics, v. 16, p. 97- 159",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Wright, S., 1931, Evolução em populações mendelianas: Genetics, v. 16, p. 97- 159.}"
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@book{dobzhansky1937genetics16,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Genética e a Origem das Espécies [1ª ed.]",
    year = "1937",
    publisher = "Nova York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dobzhansky, T., 1937, Genética e a Origem das Espécies [1ª ed.]: Nova York, Columbia University Press.}"
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@article{doi1023071435536,
    author = "Schmidt, Karl P. e Dobzhansky, Theodosius",
    title = "Genética e a Origem das Espécies",
    year = "1938",
    journal = "Copeia",
    url = "https://doi.org/10.2307/1435536",
    doi = "10.2307/1435536",
    openalex = "W4230640447"
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@misc{dobzhansky1947evolutionary18,
    author = "Dobzhansky, T. e Spassky, B",
    title = "Mudanças evolutivas em culturas de laboratório de D. pseudoobscura",
    year = "1947",
    howpublished = "Evolution, v. 1, p. 191-216",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Dobzhansky, T., e Spassky, B., 1947, Mudanças evolutivas em culturas de laboratório de D. pseudoobscura: Evolution, v. 1, p. 191-216.}"
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@book{chaney1949evolutionary10,
    author = "Chaney, R. W",
    title = "Tendências evolutivas nas angiospermas, em Jepsen, G. L., Simpson, G. G., e Mayr, E., eds., Genética, Paleontologia e Evolução",
    year = "1949",
    publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Chaney, R. W., 1949, Evolutionary trends in the angiosperms, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., and Mayr, E., eds., Genetics, Paleontology and Evolution: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p.}"
}

@misc{darlington1949the13,
    author = "Darlington, C. D. and Mather, K",
    title = "The Elements of Genetics",
    year = "1949",
    howpublished = "London, Allen and Unwin, 446 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darlington, C. D., and Mather, K., 1949, The Elements of Genetics: London, Allen and Unwin, 446 p.}"
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@book{dobzhansky1951genetics17,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Genetics and the Origin of Species [3rd ed.]",
    year = "1951",
    publisher = "New York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dobzhansky, T., 1951, Genetics and the Origin of Species [3rd ed.]: New York, Columbia University Press.}"
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@article{doi1023071439305,
    author = "Dobzhansky, Theodosius",
    title = "Genética e a Origem das Espécies",
    year = "1952",
    journal = "Copeia",
    url = "https://doi.org/10.2307/1439305",
    doi = "10.2307/1439305",
    openalex = "W4297899606"
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@misc{mayr1954change38,
    author = "Mayr, E",
    title = "Mudança do Ambiente Genético e Evolução, em Huxley, J., Hardy, A. C., e Ford, E. B., eds., Evolução como um Processo",
    year = "1954",
    howpublished = "Londres, Allen and Unwin, p. 157-180",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Mayr, E., 1954, Mudança do Ambiente Genético e Evolução, em Huxley, J., Hardy, A. C., e Ford, E. B., eds., Evolução como um Processo: Londres, Allen and Unwin, p. 157-180.}"
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@book{dobzhansky1955evolution19,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Evolução, Genética e o Homem",
    year = "1955",
    publisher = "Nova York, John Wiley \& Sons, 398 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dobzhansky, T., 1955, Evolução, Genética e o Homem: Nova York, John Wiley \& Sons, 398 p.}"
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@incollection{doi101016b9781483227344500176,
    author = "Zuckerkandl, Emile e Pauling, Linus",
    title = "Divergência e Convergência Evolutivas em Proteínas",
    year = "1965",
    booktitle = "Elsevier eBooks",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-1-4832-2734-4.50017-6",
    doi = "10.1016/b978-1-4832-2734-4.50017-6",
    openalex = "W1534406401",
    references = "doi1043249781315081083"
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@misc{ayala1968genotype2,
    author = "Ayala, F. J",
    title = "Genótipo, ambiente e número populacional",
    year = "1968",
    howpublished = "Science, v. 162, p. 1453-1459",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Ayala, F. J., 1968, Genótipo, ambiente e número populacional: Science, v. 162, p. 1453-1459.}"
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@article{crick1968the12,
    author = "Crick, F. H. C",
    title = "A origem do código genético",
    year = "1968",
    journal = "Journal of Molecular Biology, v. 38, p. 367-379",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Crick, F. H. C., 1968, A origem do código genético: Journal of Molecular Biology, v. 38, p. 367-379.}"
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@article{doi101038217624a0,
    author = "KIMURA, MOTOO",
    title = "Taxa Evolutiva no Nível Molecular",
    year = "1968",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/217624a0",
    doi = "10.1038/217624a0",
    openalex = "W1993351732",
    references = "doi101001jama196603100230164053, doi101007bf02984069, doi101016b9781483227344500176, doi101093genetics16297, doi101093genetics494725, doi101093genetics542577, doi101093genetics542595, doi101098rspb19660032, doi101126science147365368, openalexw2171582839"
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@book{wright1968197848,
    author = "Wright, S",
    title = "-1978, Evolução e a Genética de Populações. Um Tratado em Quatro Volumes",
    year = "1968",
    publisher = "Chicago, Illinois, University of Chicago Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Wright, S., 1968-1978, Evolução e a Genética de Populações. Um Tratado em Quatro Volumes: Chicago, Illinois, University of Chicago Press.}"
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@book{dobzhanshy1970genetics15,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Genética do Processo Evolutivo",
    year = "1970",
    publisher = "Nova York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Dobzhansky, T., 1970, Genética do Processo Evolutivo: Nova York, Columbia University Press.}"
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@book{doi1010079783642866593,
    author = "Ohno, Susumu",
    title = "Evolução por Duplicação Gênica",
    year = "1970",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-642-86659-3",
    doi = "10.1007/978-3-642-86659-3",
    openalex = "W2135123683"
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@misc{klotz1970genes32,
    author = "Klotz, J. W",
    title = "Genes, Genesis, and Evolution",
    year = "1970",
    howpublished = "St. Louis, Mo., Concordia Publishing Co",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Klotz, J. W., 1970, Genes, Genesis, and Evolution: St. Louis, Mo., Concordia Publishing Co.}"
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@book{bajema1971natural5,
    author = "Bajema, C. J",
    title = "Seleção Natural em Populações Humanas, a Medição da Evolução Genética Contínua em Sociedades Contemporâneas",
    year = "1971",
    publisher = "Nova York, Wiley, 406 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Bajema, C. J., 1971, Seleção Natural em Populações Humanas, a Medição da Evolução Genética Contínua em Sociedades Contemporâneas: Nova York, Wiley, 406 p.}"
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@article{kohne1972evolution33,
    author = "Kohne, D. E. e Chiscon, J. A. e Hoyer, B. H",
    title = "Evolução de sequências de DNA de primatas",
    year = "1972",
    journal = "Journal of Human Evolution, v. 1, p. 627-644",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kohne, D. E., Chiscon, J. A., e Hoyer, B. H., 1972, Evolução de sequências de DNA de primatas: Journal of Human Evolution, v. 1, p. 627-644.}"
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@article{gottlieb1973genetic28,
    author = "Gottlieb, L. D",
    title = "Diferenciação genética, especiação simpátrica e a origem de uma espécie diploide de Stephanomeria",
    year = "1973",
    journal = "American Journal of Botany, v. 60, p. 545-553",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gottlieb, L. D., 1973, Diferenciação genética, especiação simpátrica e a origem de uma espécie diploide de Stephanomeria: American Journal of Botany, v. 60, p. 545-553.}"
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@article{openalexw2145250129,
    author = "Valen, Leigh Van",
    title = "A NEW EVOLUTIONARY LAW.",
    year = "1973",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    openalex = "W2145250129"
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@article{berry1975ecological7,
    author = "Berry, R. J. e Jakobson, M. E",
    title = "Genética ecológica de uma população insular do rato-doméstico (Mus musculus)",
    year = "1975",
    journal = "Journal of Zoology, v. 175, p. 532-540",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Berry, R. J., e Jakobson, M. E., 1975, Genética ecológica de uma população insular do rato-doméstico (Mus musculus): Journal of Zoology, v. 175, p. 532-540.}"
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@article{doi101111j155856461975tb00851x,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE GENÉTICA DA BASE DA MUDANÇA EVOLUCIONÁRIA",
    year = "1975",
    journal = "Evolução",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    openalex = "W1547248981"
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@article{doi1023072407274,
    author = "Felsenstein, Joseph e Lewontin, Richard C",
    title = "The Genetic Basis of Evolutionary Change.",
    year = "1975",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2407274",
    doi = "10.2307/2407274",
    openalex = "W4301156742"
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@misc{valentine1975genetic43,
    author = "Valentine, J. W. e Campbell, C. A",
    title = "Regulação Genética e o Registro Fóssil",
    year = "1975",
    howpublished = "American Scientist, v. 63, p. 673",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Valentine, J. W., e Campbell, C. A., 1975, Regulação Genética e o Registro Fóssil: American Scientist, v. 63, p. 673.}"
}

@book{dawkins1976the14,
    author = "Dawkins, R",
    title = "The Selfish Gene",
    year = "1976",
    publisher = "New York, Oxford University Press, 224 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dawkins, R., 1976, The Selfish Gene: New York, Oxford University Press, 224 p.}"
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@misc{winchester1976heredity45,
    author = "Winchester, A. M",
    title = "Heredity, Evolution and Humankind",
    year = "1976",
    howpublished = "St. Paul, Minn., West Publishing Co",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Winchester, A. M., 1976, Heredity, Evolution and Humankind: St. Paul, Minn., West Publishing Co.}"
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@misc{ayala1977the3,
    author = "Ayala, F. J",
    title = "A Estrutura Genética de Populações, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução",
    year = "1977",
    howpublished = "San Francisco, Califórnia, W.H. Freeman \& Co., p. 20-56",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ayala, F. J., 1977, A Estrutura Genética de Populações, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução: San Francisco, Califórnia, W.H. Freeman \& Co., p. 20-56.}"
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@misc{ayala1977the4,
    author = "Ayala, F. J",
    title = "A Origem da Variação Hereditária, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução",
    year = "1977",
    howpublished = "San Francisco, Califórnia, W.H. Freeman \& Co., p. 57-94",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ayala, F. J., 1977, A Origem da Variação Hereditária, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução: San Francisco, Califórnia, W.H. Freeman \& Co., p. 57-94.}"
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@misc{berry1977inheritance6,
    author = "Berry, R. J",
    title = "Herança e História Natural",
    year = "1977",
    howpublished = "Londres, Collins",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Berry, R. J., 1977, Herança e História Natural: Londres, Collins.}"
}

@misc{kimura1977causes31,
    author = "Kimura, M",
    title = "Causas da Evolução e Polimorfismo no Nível Molecular, em Kimura, M., ed., Evolução Molecular e Polimorfismo",
    year = "1977",
    howpublished = "Mishima, Japão, Instituto Nacional de Genética, p. 1-28",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Kimura, M., 1977, Causas da Evolução e Polimorfismo no Nível Molecular, em Kimura, M., ed., Evolução Molecular e Polimorfismo: Mishima, Japão, Instituto Nacional de Genética, p. 1-28.}"
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@misc{winchester1977genetics46,
    author = "Winchester, A. M",
    title = "Genética [5ª ed.]",
    year = "1977",
    howpublished = "Boston, Mass., Houghton Mifflin Co",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Winchester, A. M., 1977, Genética [5ª ed.]: Boston, Mass., Houghton Mifflin Co.}"
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@misc{powers1978biochemical39,
    author = "Powers, D. A. e Place, A. R",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). 1. Variação temporal e espacial nas frequências gênicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B e Pgm-A",
    year = "1978",
    howpublished = "Genética Bioquímica, v. 16, p. 593-607",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Powers, D. A., e Place, A. R., 1978, Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). 1. Variação temporal e espacial nas frequências gênicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B e Pgm-A: Genética Bioquímica, v. 16, p. 593-607.}"
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@book{wilson1981genes44,
    author = "Wilson, E. O. e Lumden, C",
    title = "Genes, Mind, and Culture",
    year = "1981",
    publisher = "The Evolutionary Process: Cambridge, Mass., Harvard University Press, 248 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Wilson, E. O., e Lumden, C., 1981, Genes, Mind, and Culture: The Evolutionary Process: Cambridge, Mass., Harvard University Press, 248 p.}"
}

@misc{crick1982life11,
    author = "Crick, F",
    title = "Life Itself",
    year = "1982",
    howpublished = "Its Origin and Nature: New York, W.W. Norton, 192 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Crick, F., 1982, Life Itself: Its Origin and Nature: New York, W.W. Norton, 192 p.}"
}

Artigo de Revista DNA Mitocôndrial e duas perspectivas sobre genética evolutiva Obter acesso ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA2Instituto Howard Hughes de Medicina, U426, Universidade da Califórnia, São Francisco, Califórnia 94143, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA3Laboratório de Genética da Vida Selvagem, Departamento de Ciências da Vida Selvagem e Pesca, Universidade Texas A & M, College Station, Texas 77843, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA4Departamento de Bioquímica, Universidade Howard, Washington, DC 20059, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caixa 60500, S-104 01 Estocolmo, Suécia Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA6Departamento de Zoologia, Universidade do Havaí, Honolulu, Havaí 96822, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA7Museu de Zoologia de Vertebrados, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar mais MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volume 26, Issue 4, Dezembro 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 Junho 2008 Histórico do Artigo Aceito: 01 Julho 1985 Publicado: 28 Junho 2008

@article{doi101111j109583121985tb02048x,
    author = "Wilson, Allan C. and Cann, Rebecca L. and Carr, Steven M. and George, Matthew and GYLLENSTEN, ULF B. and Helm‐Bychowski, Kathleen and Higuchi, Russell and Palumbi, Stephen R. and Prager, Ellen M. and Sage, Richard D. and Stoneking, Mark",
    title = "DNA mitocondrial e duas perspectivas sobre a genética da evolução",
    year = "1985",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Artigo de Revista DNA mitocondrial e duas perspectivas sobre a genética da evolução Acesse ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA2Instituto Howard Hughes de Medicina, U426, Universidade da Califórnia, São Francisco, Califórnia 94143, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA3Laboratório de Genética da Vida Selvagem, Departamento de Ciências da Vida Selvagem e Pesca, Universidade Texas A & M, College Station, Texas 77843, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA4Departamento de Bioquímica, Universidade Howard, Washington, DC 20059, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caixa 60500, S-104 01 Estocolmo, Suécia Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA6Departamento de Zoologia, Universidade do Havaí, Honolulu, Havaí 96822, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA7Museu de Zoologia de Vertebrados, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar mais MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidade da Califórnia, Berkeley, Califórnia 94720, EUA Pesquisar outros trabalhos deste autor em: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volume 26, Issue 4, Dezembro 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 Junho 2008 Histórico do Artigo Aceito: 01 Julho 1985 Publicado: 28 Junho 2008",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    openalex = "W2065697254",
    references = "doi101038202147a0, doi101073pnas504672, doi101073pnas581142, doi101111j155856461983tb05533x, doi101126science15838051200, doi1023071438156, doi1023072407274, doi107312simp93764, openalexw788933220, sarich1967immunological"
}

As quantidades de depressão por endogamia na autofecundação e de heterose no cruzamento entre indivíduos determinam a força da seleção sobre a taxa de autofecundação em uma população quando esta evolui poligenicamente por pequenos passos. Modelos genéticos são construídos que permitem que a depressão por endogamia mude com a taxa média de autofecundação em uma população ao incorporar tanto a mutação para alelos recessivos e parcialmente dominantes letais e subletais em muitos loci quanto a mutação em caracteres quantitativos sob seleção estabilizadora. Os modelos ajudam a explicar observações de alta depressão por endogamia (> 50%) na autofecundação em populações predominantemente de cruzamento entre indivíduos, bem como considerável heterose no cruzamento entre indivíduos em populações predominantemente de autofecundação. Autofecundação predominante e cruzamento entre indivíduos predominante são encontrados como estados alternativos estáveis do sistema de acasalamento na maioria das populações de plantas. Qual desses estados estáveis uma espécie atinge depende da história de sua estrutura populacional e da magnitude do efeito de genes que influenciam a taxa de autofecundação.

@article{doi101111j155856461985tb04077x,
    author = "Lande, Russell and Schemske, Douglas W.",
    title = "A EVOLUÇÃO DA AUTOFECUNDAÇÃO E DA DEPRESSÃO POR ENDOGAMIA EM PLANTAS. I. MODELOS GENÉTICOS",
    year = "1985",
    journal = "Evolution",
    abstract = "As quantidades de depressão por endogamia na autofecundação e de heterose no cruzamento entre indivíduos determinam a força da seleção sobre a taxa de autofecundação em uma população quando esta evolui poligenicamente por pequenos passos. Modelos genéticos são construídos que permitem que a depressão por endogamia mude com a taxa média de autofecundação em uma população ao incorporar tanto a mutação para alelos recessivos e parcialmente dominantes letais e subletais em muitos loci quanto a mutação em caracteres quantitativos sob seleção estabilizadora. Os modelos ajudam a explicar observações de alta depressão por endogamia (> 50\%) na autofecundação em populações predominantemente de cruzamento entre indivíduos, bem como considerável heterose no cruzamento entre indivíduos em populações predominantemente de autofecundação. Autofecundação predominante e cruzamento entre indivíduos predominante são encontrados como estados alternativos estáveis do sistema de acasalamento na maioria das populações de plantas. Qual desses estados estáveis uma espécie atinge depende da história de sua estrutura populacional e da magnitude do efeito de genes que influenciam a taxa de autofecundação.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1985.tb04077.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1985.tb04077.x",
    openalex = "W2316973238",
    references = "doi101017s0016672300016037, doi101111j155856461983tb00236x, doi1023072407274"
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@article{ghiselin1986we25,
    author = "Ghiselin, M. T",
    title = "We Are All Contraptions",
    year = "1986",
    journal = "New York Times Book Review, p. 18-19",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ghiselin, M. T., 1986, We Are All Contraptions: New York Times Book Review, p. 18-19.}"
}

@misc{max1986plagiarized37,
    author = "Max, E. E",
    title = "Erros Plagiados e Genética Molecular",
    year = "1986",
    howpublished = "Outro Argumento na Controvérsia Evolução-Criacionismo: Creation/Evolution, v. 19, p. 34-46",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Max, E. E., 1986, Erros Plagiados e Genética Molecular: Outro Argumento na Controvérsia Evolução-Criacionismo: Creation/Evolution, v. 19, p. 34-46.}"
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@misc{cann1987mitochondrial9,
    author = "Cann, R. L. e Stoncking, M. e Wilson, A. C",
    title = "DNA mitocondrial e evolução humana",
    year = "1987",
    howpublished = "Nature, v. 325, p. 31-36",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cann, R. L., Stoncking, M., e Wilson, A. C., 1987, DNA mitocondrial e evolução humana: Nature, v. 325, p. 31-36.}"
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Existe uma abundante variação geográfica tanto na morfologia quanto na frequência gênica na maioria das espécies. O grau de variação geográfica resulta de um equilíbrio entre forças que tendem a produzir diferenciação genética local e forças que tendem a produzir homogeneidade genética. A mutação, a deriva genética devido ao tamanho finito da população e a seleção natural favorecendo adaptações às condições ambientais locais levarão todas à diferenciação genética de populações locais, e o movimento de gametas, indivíduos e até mesmo populações inteiras -- coletivamente chamado de fluxo gênico -- opor-se-á a essa diferenciação. O fluxo gênico pode tanto restringir a evolução impedindo a adaptação às condições locais quanto promover a evolução espalhando novos genes e combinações de genes por toda a distribuição de uma espécie. Existem vários métodos disponíveis para estimar a quantidade de fluxo gênico. Métodos diretos monitoram o fluxo gênico em curso, e métodos indiretos usam distribuições espaciais de frequências gênicas para inferir o fluxo gênico passado. Aplicações desses métodos mostram que as espécies diferem amplamente no fluxo gênico que experimentam. De particular interesse são aquelas espécies para as quais métodos diretos indicam pouco fluxo gênico atual, mas métodos indiretos indicam níveis muito mais altos de fluxo gênico no passado recente. Tais espécies provavelmente sofreram mudanças demográficas em grande escala relativamente frequentemente.

@article{doi101126science3576198,
    author = "Slatkin, Montgomery",
    title = "Gene Flow and the Geographic Structure of Natural Populations",
    year = "1987",
    journal = "Science",
    abstract = "There is abundant geographic variation in both morphology and gene frequency in most species. The extent of geographic variation results from a balance of forces tending to produce local genetic differentiation and forces tending to produce genetic homogeneity. Mutation, genetic drift due to finite population size, and natural selection favoring adaptations to local environmental conditions will all lead to the genetic differentiation of local populations, and the movement of gametes, individuals, and even entire populations--collectively called gene flow--will oppose that differentiation. Gene flow may either constrain evolution by preventing adaptation to local conditions or promote evolution by spreading new genes and combinations of genes throughout a species' range. Several methods are available for estimating the amount of gene flow. Direct methods monitor ongoing gene flow, and indirect methods use spatial distributions of gene frequencies to infer past gene flow. Applications of these methods show that species differ widely in the gene flow that they experience. Of particular interest are those species for which direct methods indicate little current gene flow but indirect methods indicate much higher levels of gene flow in the recent past. Such species probably have undergone large-scale demographic changes relatively frequently.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3576198",
    doi = "10.1126/science.3576198",
    openalex = "W2066362596",
    references = "doi1010079783642686351, doi1010160040580977900454, doi1010382011145a0, doi101086410450, doi101093genetics16297, doi101098rspb19830075, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461981tb04864x, doi101111j155856461984tb05657x, doi101111j155856461985tb04079x, doi101146annureves16110185002141, doi101722611310, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, openalexw1593551567, openalexw1606400913"
}

@book{doi107312nei92038,
    author = "Nei, Masatoshi",
    title = "Genética Evolutiva Molecular",
    year = "1987",
    booktitle = "Columbia University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.7312/nei-92038",
    doi = "10.7312/nei-92038",
    openalex = "W93588716"
}

@book{dulbecco1987the20,
    author = "Dulbecco, R",
    title = "The Design of Life",
    year = "1987",
    publisher = "New Haven, Connecticut, Yale University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dulbecco, R., 1987, The Design of Life: New Haven, Connecticut, Yale University Press.}"
}

@article{doi101016016953478890033x,
    author = "Hewitt, Godfrey M.",
    title = "Zonas de hibridação-laboratórios naturais para estudos evolutivos",
    year = "1988",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/0169-5347(88)90033-x",
    doi = "10.1016/0169-5347(88)90033-x",
    openalex = "W2032950375",
    references = "doi101086282975, doi101146annureves06110175002011, doi1023071439305, doi1023072412932"
}

Prever a extinção de populações ou espécies individuais requer informações ecológicas e evolutivas. Fatores demográficos primários que afetam a dinâmica populacional incluem estrutura social, variação no histórico de vida causada por flutuações ambientais, dispersão em ambientes espacialmente heterogêneos, e extinção e colonização locais. Em populações pequenas, a endogamia pode reduzir significativamente a aptidão média individual, e a perda de variabilidade genética devido à deriva genética aleatória pode diminuir a adaptabilidade futura a um ambiente em mudança. Teoria e exemplos empíricos sugerem que a demografia é geralmente de importância mais imediata do que a genética de populações na determinação dos tamanhos mínimos viáveis de populações selvagens. A necessidade prática na conservação biológica de compreender a interação de fatores demográficos e genéticos na extinção pode fornecer um foco para avanços fundamentais na interface entre ecologia e evolução.

@article{doi101126science3420403,
    author = "Lande, Russell",
    title = "Genetics and Demography in Biological Conservation",
    year = "1988",
    journal = "Science",
    abstract = "Prever a extinção de populações ou espécies individuais requer informações ecológicas e evolutivas. Fatores demográficos primários que afetam a dinâmica populacional incluem estrutura social, variação no histórico de vida causada por flutuações ambientais, dispersão em ambientes espacialmente heterogêneos, e extinção e colonização locais. Em populações pequenas, a endogamia pode reduzir significativamente a aptidão média individual, e a perda de variabilidade genética devido à deriva genética aleatória pode diminuir a adaptabilidade futura a um ambiente em mudança. Teoria e exemplos empíricos sugerem que a demografia é geralmente de importância mais imediata do que a genética de populações na determinação dos tamanhos mínimos viáveis de populações selvagens. A necessidade prática na conservação biológica de compreender a interação de fatores demográficos e genéticos na extinção pode fornecer um foco para avanços fundamentais na interface entre ecologia e evolução.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3420403",
    doi = "10.1126/science.3420403",
    openalex = "W2094387116",
    references = "doi101016000632078690025x, doi101016c20090029523, doi101017s0016672300016037, doi101093besa153237, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461975tb00851x, doi101126science2214609459, doi101126science2314734129, doi101146annureves18110187001321, doi1015159781400881376, doi1023071308256, doi1023072529912, openalexw1500291103, openalexw2318111898"
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@misc{frauenfelder1988biomolecules24,
    author = "Frauenfelder, H",
    title = "Biomolecules, in Pines, D., ed., Emerging Syntheses in Science",
    year = "1988",
    howpublished = "Redwood City, California, Addison-Wesley",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Frauenfelder, H., 1988, Biomolecules, in Pines, D., ed., Emerging Syntheses in Science: Redwood City, California, Addison-Wesley.}"
}

@misc{lewin1988conflict35,
    author = "Lewin, R",
    title = "Conflito sobre os Resultados do Relógio de DNA",
    year = "1988",
    howpublished = "Science, v. 241, p. 1598-1600",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Lewin, R., 1988, Conflito sobre os Resultados do Relógio de DNA: Science, v. 241, p. 1598-1600.}"
}

@misc{lewin1988family36,
    author = "Lewin, R",
    title = "Relacionamentos familiares são um enigma biológico",
    year = "1988",
    howpublished = "Science, v. 242, p. 671",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Lewin, R., 1988, Relacionamentos familiares são um enigma biológico: Science, v. 242, p. 671.}"
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@misc{rubin1988drosophilia40,
    author = "Rubin, G. M",
    title = "Drosophila melanogaster como um Organismo Experimental",
    year = "1988",
    howpublished = "Science, v. 240, p. 1453-1459",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Rubin, G. M., 1988, Drosophila melanogaster como um Organismo Experimental: Science, v. 240, p. 1453-1459.}"
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Artigo de Revista A Importância Evolutiva da Plasticidade Fenotípica: As fontes fenotípicas de variação entre organismos podem ser descritas por interruptores de desenvolvimento e normas de reação. Acesse Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 39, Issue 7, Julho/Agosto 1989, Páginas 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Publicado: 01 de Agosto de 1989

@article{doi1023071311135,
    author = "Stearns, Stephen C.",
    title = "A Importância Evolutiva da Plasticidade Fenotípica",
    year = "1989",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Artigo de Revista A Importância Evolutiva da Plasticidade Fenotípica: As fontes fenotípicas de variação entre organismos podem ser descritas por interruptores de desenvolvimento e normas de reação. Acesse Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Pesquisar outras obras deste autor em: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 39, Issue 7, Julho/Agosto 1989, Páginas 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Publicado: 01 de Agosto de 1989",
    url = "https://doi.org/10.2307/1311135",
    doi = "10.2307/1311135",
    openalex = "W2058670567",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi1015159780691224244, doi1023071439305, doi1023072389364, openalexw1635425035"
}

@misc{elmerdewitt1989the22,
    author = "Elmer-Dewitt, P",
    title = "Os Perigos de Pisar na Hereditariedade",
    year = "1989",
    howpublished = "Time, v. 133, no. 12, p. 70-71",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Elmer-Dewitt, P., 1989, Os Perigos de Pisar na Hereditariedade: Time, v. 133, no. 12, p. 70-71.}"
}

@book{glover1989genes27,
    author = "Glover, D. M. e Hames, B. D",
    title = "Genes and Embryos",
    year = "1989",
    publisher = "Nova York, Oxford University Press, 228 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Glover, D. M., e Hames, B. D., 1989, Genes and Embryos: Nova York, Oxford University Press, 228 p.}"
}

@book{suzuki1989genethics42,
    author = "Suzuki, D. e Knudtson, P",
    title = "Genethics",
    year = "1989",
    publisher = "O Conflito Entre a Nova Genética e os Valores Humanos: Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Suzuki, D., e Knudtson, P., 1989, Genethics: O Conflito Entre a Nova Genética e os Valores Humanos: Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
}

@misc{sachs1990translational41,
    author = "Sachs, A. B. e Davis, R. W",
    title = "Iniciação translacional e biogênese ribossomal",
    year = "1990",
    howpublished = "envolvimento de uma helicase de rRNA putativa e RPL46: Science, v. 247, p. 1077",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Sachs, A. B., e Davis, R. W., 1990, Iniciação translacional e biogênese ribossomal: envolvimento de uma helicase de rRNA putativa e RPL46: Science, v. 247, p. 1077.}"
}

@article{doi101038359826a0,
    author = "Nowak, Martin A. e May, Robert M.",
    title = "Jogos evolutivos e caos espacial",
    year = "1992",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/359826a0",
    doi = "10.1038/359826a0",
    openalex = "W2025490132",
    references = "doi101007978146847862422, doi101007bf00450633, doi101017cbo9780511806292, doi101038280445a0, doi102307257983"
}

Uma árvore genealógica resolvida com precisão pode não ser congruente com a árvore de espécies devido ao ordenamento de linhagens de polimorfismos ancestrais. Sequências de DNA de genes codificados mitocondrialmente (mtDNA) são fontes atraentes de caracteres para estimar as filogenias de táxons recentemente evoluídos porque o mtDNA evolui rapidamente, mas sua utilidade é limitada porque os genes mitocondriais são herdados como um único grupo de ligação (haplótipo) e fornecem apenas uma estimativa independente da árvore de espécies. Em contraste, um conjunto de genes nucleares pode ser selecionado de cromossomos distintos, de modo que cada árvore genealógica fornece uma estimativa independente da árvore de espécies. Outro aspecto do problema da árvore genealógica versus a árvore de espécies, no entanto, favorece o uso de mtDNA para inferir árvores de espécies. Para um segmento de três espécies de uma filogenia, a ordem de ramificação de uma árvore genealógica corresponderá à da árvore de espécies se a coalescência dos alelos ou haplótipos ocorrer no internódo entre a primeira e a segunda bifurcação. Da teoria neutra, é evidente que a probabilidade de coalescência aumenta à medida que o tamanho efetivo da população diminui. Como o genoma mitocondrial é herdado maternamente e efetivamente haploide, seu tamanho efetivo da população é um quarto do de um gene nuclear-autossômico. Assim, a árvore de haplótipo mitocondrial tem uma probabilidade substancialmente maior de rastrear com precisão um internódo curto do que uma árvore de gene nuclear-autossômico. Quando um internódo é suficientemente longo para que a probabilidade de que a árvore de haplótipo mitocondrial seja congruente com a árvore de espécies seja 0,95, a probabilidade de que uma árvore de gene nuclear-autossômico seja congruente é apenas 0,62. Se cada uma das k árvores de genes nucleares amostradas independentemente tiver uma probabilidade de congruência com a árvore de espécies de 0,62, então seria necessário uma amostra de 16 dessas árvores para ser tão confiante na inferência baseada na árvore de haplótipo mitocondrial. Um levantamento da diversidade de haplótipos de mtDNA em 34 espécies de aves indica que a coalescência é geralmente muito recente, o que sugere que os tempos de coalescência são tipicamente muito mais curtos do que os comprimentos dos ramos internodais da árvore de espécies, e que o ordenamento de linhagens de mtDNA não é provável que confunda a árvore de espécies. A hibridização resultando na transferência de haplótipos de mtDNA entre ramos também poderia resultar em uma árvore de haplótipos que é incongruente com a árvore de espécies; se não detectada, isso poderia confundir a árvore de espécies. No entanto, a hibridização é geralmente fácil de detectar e deve ser incorporada na narrativa histórica do grupo, porque a reticulação, bem como os eventos cladísticos, contribuíram para a evolução do grupo.

@article{doi101111j155856461995tb02308x,
    author = "Moore, William S.",
    title = "INFERRING PHYLOGENIES FROM mt DNA VARIATION: MITOCHONDRIAL-GENE TREES VERSUS NUCLEAR-GENE TREES",
    year = "1995",
    journal = "Evolution",
    abstract = "An accurately resolved gene tree may not be congruent with the species tree because of lineage sorting of ancestral polymorphisms. DNA sequences from the mitochondrially encoded genes (mtDNA) are attractive sources of characters for estimating the phylogenies of recently evolved taxa because mtDNA evolves rapidly, but its utility is limited because the mitochondrial genes are inherited as a single linkage group (haplotype) and provide only one independent estimate of the species tree. In contrast, a set of nuclear genes can be selected from distinct chromosomes, such that each gene tree provides an independent estimate of the species tree. Another aspect of the gene-tree versus species-tree problem, however, favors the use of mtDNA for inferring species trees. For a three-species segment of a phylogeny, the branching order of a gene tree will correspond to that of the species tree if coalescence of the alleles or haplotypes occurred in the internode between the first and second bifurcation. From neutral theory, it is apparent that the probability of coalescence increases as effective population size decreases. Because the mitochondrial genome is maternally inherited and effectively haploid, its effective population size is one-fourth that of a nuclear-autosomal gene. Thus, the mitochondrial-haplotype tree has a substantially higher probability of accurately tracking a short internode than does a nuclear-autosomal-gene tree. When an internode is sufficiently long that the probability that the mitochondrial-haplotype tree will be congruent with the species tree is 0.95, the probability that a nuclear-autosomalgene tree will be congruent is only 0.62. If each of k independently sampled nuclear-gene trees has a probability of congruence with the species tree of 0.62, then a sample of 16 such trees would be required to be as confident of the inference based on the mitochondrial-haplotype tree. A survey of mtDNA-haplotype diversity in 34 species of birds indicates that coalescence is generally very recent, which suggests that coalescence times are typically much shorter than internodal branch lengths of the species tree, and that sorting of mtDNA lineages is not likely to confound the species tree. Hybridization resulting in transfer of mtDNA haplotypes among branches could also result in a haplotype tree that is incongruent with the species tree; if undetected, this could confound the species tree. However, hybridization is usually easy to detect and should be incorporated in the historical narrative of the group, because reticulation, as well as cladistic events, contributed to the evolution of the group.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1995.tb02308.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1995.tb02308.x",
    openalex = "W2088587174",
    references = "doi101038347550a0"
}

A origem da complexidade dos organismos é geralmente considerada estar intimamente acoplada à evolução de novas funções gênicas que surgem subsequentemente à duplicação gênica. Sob o modelo clássico para a evolução de genes duplicados, um membro do par duplicado geralmente degenera dentro de alguns milhões de anos ao acumular mutações deletérias, enquanto o outro duplicado mantém a função original. Este modelo prevê ainda que, em ocasiões raras, um duplicado pode adquirir uma nova função adaptativa, resultando na preservação de ambos os membros do par, um com a nova função e o outro mantendo a antiga. No entanto, dados empíricos sugerem que uma proporção muito maior de genes duplicados é preservada do que previsto pelo modelo clássico. Aqui, apresentamos um novo quadro conceitual para compreender a evolução de genes duplicados que pode ajudar a explicar este enigma. Focando na complexidade regulatória de genes eucarióticos, mostramos como mutações degenerativas complementares em diferentes elementos regulatórios de genes duplicados podem facilitar a preservação de ambos os duplicados, aumentando assim as oportunidades de longo prazo para a evolução de novas funções gênicas. O modelo de duplicação-degeneração-complementação (DDC) prevê que (1) mutações degenerativas em elementos regulatórios podem aumentar, em vez de reduzir, a probabilidade de preservação de genes duplicados e (2) o mecanismo usual de preservação de genes duplicados é a partição de funções ancestrais, em vez da evolução de novas funções. Apresentamos vários exemplos (incluindo análise de um novo gene engrailed em peixe-zebra) que parecem ser consistentes com o modelo DDC, e sugerimos várias abordagens analíticas e experimentais para determinar se a perda complementar de subfunções gênicas ou a aquisição de funções novas são prováveis de serem os mecanismos primários para a preservação de genes duplicados. Para um paralog recém-duplicado, a sobrevivência depende do resultado da corrida entre o decaimento entrópico e a aquisição acidental de uma mutação regulatória vantajosa. Sidow 1996(p. 717) De um lado, pode fixar um alelo vantajoso, dando-lhe uma função ligeiramente diferente e selecionável em relação à sua cópia original. Esta fixação inicial fornece proteção substancial contra a futura fixação de mutações nulo, permitindo que mutações adicionais se acumulem para refinar a diferenciação funcional. Alternativamente, um locus duplicado pode, em vez disso, primeiro fixar um alelo nulo, tornando-se um pseudogene. Walsh 1995 (p. 426) Genes duplicados persistem apenas se as mutações criarem novas e funções proteicas essenciais, um evento que é previsto ocorrer raramente. Nadeau e Sankoff 1997 (p. 1259) Assim, no geral, com metazoários complexos, o mecanismo principal para a retenção de genes duplicados antigos parece ter sido a aquisição de novos locais de expressão para genes de desenvolvimento, com a oportunidade acompanhante de novos papéis gênicos subjacente à extensão progressiva do desenvolvimento em si. Cooke et al. 1997 (p. 362)

@article{doi101093genetics15141531,
    author = "Force, Allan e Lynch, Michael e Pickett, F. Bryan e Amores, Angel e Yan, Yi‐Lin e Postlethwait, John H.",
    title = "Preservação de Genes Duplicados por Mutações Degenerativas Complementares",
    year = "1999",
    journal = "Genetics",
    abstract = "A origem da complexidade dos organismos é geralmente considerada estar intimamente acoplada à evolução de novas funções gênicas surgidas subsequentemente à duplicação gênica. Sob o modelo clássico para a evolução de genes duplicados, um membro do par duplicado geralmente degenera dentro de alguns milhões de anos ao acumular mutações deletérias, enquanto o outro gene duplicado mantém a função original. Este modelo prevê ainda que, em ocasiões raras, um gene duplicado pode adquirir uma nova função adaptativa, resultando na preservação de ambos os membros do par, um com a nova função e o outro mantendo a antiga. No entanto, dados empíricos sugerem que uma proporção muito maior de genes duplicados é preservada do que previsto pelo modelo clássico. Aqui, apresentamos um novo quadro conceitual para entender a evolução de genes duplicados que pode ajudar a explicar este enigma. Focando na complexidade regulatória de genes eucarióticos, mostramos como mutações degenerativas complementares em diferentes elementos regulatórios de genes duplicados podem facilitar a preservação de ambos os duplicados, aumentando assim as oportunidades de longo prazo para a evolução de novas funções gênicas. O modelo de duplicação-degeneração-complementação (DDC) prevê que (1) mutações degenerativas em elementos regulatórios podem aumentar, em vez de reduzir, a probabilidade de preservação de genes duplicados e (2) o mecanismo usual de preservação de genes duplicados é a partição de funções ancestrais, em vez da evolução de novas funções. Apresentamos vários exemplos (incluindo análise de um novo gene engrailed em peixe-zebra) que parecem ser consistentes com o modelo DDC, e sugerimos várias abordagens analíticas e experimentais para determinar se a perda complementar de subfunções gênicas ou a aquisição de funções novas são prováveis de serem os mecanismos primários para a preservação de genes duplicados. Para um paralog recém-duplicado, a sobrevivência depende do resultado da corrida entre o decaimento entrópico e a aquisição acidental de uma mutação regulatória vantajosa. Sidow 1996(p. 717) De um lado, pode fixar um alelo vantajoso, dando-lhe uma função ligeiramente diferente e selecionável em relação à sua cópia original. Esta fixação inicial fornece proteção substancial contra a futura fixação de mutações nulas, permitindo que mutações adicionais se acumulem que refinam a diferenciação funcional. Alternativamente, um locus duplicado pode, em vez disso, primeiro fixar um alelo nulo, tornando-se um pseudogene. Walsh 1995 (p. 426) Genes duplicados persistem apenas se as mutações criarem novas e funções proteicas essenciais, um evento que é previsto ocorrer raramente. Nadeau e Sankoff 1997 (p. 1259) Assim, no geral, com metazoários complexos, o mecanismo principal para a retenção de genes duplicados antigos parece ter sido a aquisição de novos locais de expressão para genes de desenvolvimento, com a oportunidade acompanhante de novos papéis gênicos subjacente à extensão progressiva do desenvolvimento em si. Cooke et al. 1997 (p. 362)",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/151.4.1531",
    doi = "10.1093/genetics/151.4.1531",
    openalex = "W2152075687",
    references = "doi101006dbio19960034, doi1010079783642866593, doi1010160092867494902909, doi101038276565a0, doi101038346035a0, doi101038353031a0, doi10103841710, doi10103842711, doi101038ng0498345, doi101038scientificamerican117998, doi101046j14390388200200356x, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101126science28253941711, doi101242dev1994supplement125"
}

@article{doi10103835046017,
    author = "Kopp, Artyom e Duncan, Ian e Carroll, Sean B.",
    title = "Controle genético e evolução de caracteres sexualmente dimórficos em Drosophila",
    year = "2000",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/35046017",
    doi = "10.1038/35046017",
    openalex = "W1588649406",
    references = "doi101038384236a0, doi101073pnas7863721, doi101093oxfordjournalsmolbeva040214, doi101111j155856461982tb05003x, doi101111j155856461998tb05132x, doi101146annurevgenet301637, doi101242dev1212333, doi1015159780691207278, doi1023072341823, doi105962bhltitle27468"
}

Em 1950, G. Ledyard Stebbins dedicou dois capítulos de seu livro Variation and Evolution in Plants (Columbia Univ. Press, Nova York) à poliploidia, um sobre ocorrência e natureza e outro sobre distribuição e significado. Cinquenta anos depois, muitas das questões levantadas por Stebbins ainda não foram respondidas, e muitas novas questões surgiram. Neste artigo, revisamos alguns dos atributos genéticos dos poliploides que foram sugeridos para explicar o tremendo sucesso das plantas poliploides. Com base em um número limitado de estudos, concluímos: (i) Poliploides, tanto indivíduos quanto populações, geralmente mantêm níveis mais altos de heterozigose do que seus progenitores diplóides. (ii) Poliploides exibem menos depressão por endogamia do que seus pais diplóides e, portanto, podem tolerar níveis mais altos de autogamia; poliploides de samambaias realmente têm níveis mais altos de autogamia do que seus pais diplóides, mas poliploides de angiospermas não diferem em taxas de cruzamento entre indivíduos em relação aos seus pais diplóides. (iii) A maioria das espécies poliploides é polifilética, tendo se formado recorrentemente a partir de pais diplóides geneticamente diferentes. Este modo de formação incorpora diversidade genética de múltiplas populações progenitoras na espécie "poliploide"; assim, a diversidade genética em espécies poliploides é muito maior do que o esperado por modelos de formação de poliploides envolvendo uma única origem. (iv) Rearranjo genômico pode ser um atributo comum de poliploides, com base em evidências de hibridização in situ de genoma (GISH), análise de polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e mapeamento cromossômico. (v) Vários grupos de plantas podem ser poliploides antigos, com grandes regiões de DNA homólogo. Esses genes e genomas duplicados podem sofrer evolução divergente e evoluir novas funções. Esses atributos genéticos e genômicos dos poliploides podem ter benefícios tanto bioquímicos quanto ecológicos que contribuem para o sucesso dos poliploides na natureza.

@article{doi101073pnas97137051,
    author = "Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S.",
    title = "The role of genetic and genomic attributes in the success of polyploids",
    year = "2000",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Em 1950, G. Ledyard Stebbins dedicou dois capítulos de seu livro Variation and Evolution in Plants (Columbia Univ. Press, Nova York) à poliploidia, um sobre ocorrência e natureza e outro sobre distribuição e significado. Cinquenta anos depois, muitas das questões levantadas por Stebbins ainda não foram respondidas, e muitas novas questões surgiram. Neste artigo, revisamos alguns dos atributos genéticos dos poliploides que foram sugeridos para explicar o tremendo sucesso das plantas poliploides. Com base em um número limitado de estudos, concluímos: (i) Poliploides, tanto indivíduos quanto populações, geralmente mantêm níveis mais altos de heterozigose do que seus progenitores diplóides. (ii) Poliploides exibem menos depressão por endogamia do que seus pais diplóides e, portanto, podem tolerar níveis mais altos de autogamia; poliploides de samambaias realmente têm níveis mais altos de autogamia do que seus pais diplóides, mas poliploides de angiospermas não diferem em taxas de cruzamento entre indivíduos em relação aos seus pais diplóides. (iii) A maioria das espécies poliploides é polifilética, tendo se formado recorrentemente a partir de pais diplóides geneticamente diferentes. Este modo de formação incorpora diversidade genética de múltiplas populações progenitoras na espécie "poliploide"; assim, a diversidade genética em espécies poliploides é muito maior do que o esperado por modelos de formação de poliploides envolvendo uma única origem. (iv) Rearranjo genômico pode ser um atributo comum de poliploides, com base em evidências de hibridização in situ de genoma (GISH), análise de polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e mapeamento cromossômico. (v) Vários grupos de plantas podem ser poliploides antigos, com grandes regiões de DNA homólogo. Esses genes e genomas duplicados podem sofrer evolução divergente e evoluir novas funções. Esses atributos genéticos e genômicos dos poliploides podem ter benefícios tanto bioquímicos quanto ecológicos que contribuem para o sucesso dos poliploides na natureza.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.97.13.7051",
    doi = "10.1073/pnas.97.13.7051",
    openalex = "W2001670067",
    references = "doi1010079781489930439"
}

Um dos problemas mais antigos na biologia evolutiva permanece em grande parte sem solução. Quais mutações geram variação fenotípica evolutivamente relevante? Que tipos de mudanças moleculares elas envolvem? Quais são as magnitudes fenotípicas, as frequências de origem e os efeitos pleiotrópicos de tais mutações? Como o genoma é construído para permitir a abundância observada de diversidade fenotípica? Historicamente, os sintetizadores neodarwinianos enfatizaram a predominância de micromutações na evolução, enquanto outros notaram as semelhanças entre algumas mutações dramáticas e transições evolutivas para argumentar a favor do macromutacionismo. Argumentos de ambos os lados foram enviesados por concepções equivocadas dos efeitos do desenvolvimento das mutações. Por exemplo, a visão tradicional de que mutações de genes de desenvolvimento importantes sempre têm grandes efeitos pleiotrópicos pode agora ser vista como uma conclusão tirada de observações de uma pequena classe de mutações com efeitos dramáticos. É possível que algumas mutações, por exemplo, aquelas em DNA cis-regulatório, tenham poucos ou nenhum efeito pleiotrópico e possam ser a fonte predominante da evolução morfológica. Em contraste, mutações que causam efeitos fenotípicos dramáticos, embora superficialmente semelhantes a transições evolutivas hipotetizadas, é improvável que representem de forma justa o verdadeiro caminho da evolução. Estudos recentes de desenvolvimento da função gênica fornecem uma nova maneira de conceituar e estudar a variação que contrasta com a visão genética tradicional que foi incorporada na teoria neodarwiniana e na genética de populações. Esta nova abordagem na biologia do desenvolvimento é tão importante para estudos microevolutivos quanto os resultados reais de estudos recentes de biologia evolutiva do desenvolvimento. Em particular, esta abordagem auxiliará na tarefa de identificar as mutações específicas que geram variação fenotípica e elucidar como elas alteram a função gênica. Estes dados fornecerão o elo ausente atual entre variação molecular e fenotípica em populações naturais.

@article{doi101111j001438202000tb00544x,
    author = "Stern, David L.",
    title = "PERSPECTIVA: BIOLOGIA DO DESENVOLVIMENTO EVOLUCIONÁRIO E O PROBLEMA DA VARIAÇÃO",
    year = "2000",
    journal = "Evolução",
    abstract = "Um dos problemas mais antigos na biologia evolutiva permanece em grande parte sem solução. Quais mutações geram variação fenotípica evolutivamente relevante? Que tipos de mudanças moleculares elas envolvem? Quais são as magnitudes fenotípicas, as frequências de origem e os efeitos pleiotrópicos de tais mutações? Como o genoma é construído para permitir a abundância observada de diversidade fenotípica? Historicamente, os sintetizadores neodarwinianos enfatizaram a predominância de micromutações na evolução, enquanto outros notaram as semelhanças entre algumas mutações dramáticas e transições evolutivas para argumentar a favor do macromutacionismo. Argumentos de ambos os lados foram enviesados por concepções equivocadas dos efeitos do desenvolvimento das mutações. Por exemplo, a visão tradicional de que mutações de genes de desenvolvimento importantes sempre têm grandes efeitos pleiotrópicos pode agora ser vista como uma conclusão tirada de observações de uma pequena classe de mutações com efeitos dramáticos. É possível que algumas mutações, por exemplo, aquelas em DNA cis-regulatório, tenham poucos ou nenhum efeito pleiotrópico e possam ser a fonte predominante da evolução morfológica. Em contraste, mutações que causam efeitos fenotípicos dramáticos, embora superficialmente semelhantes a transições evolutivas hipotetizadas, é improvável que representem de forma justa o verdadeiro caminho da evolução. Estudos recentes de desenvolvimento da função gênica fornecem uma nova maneira de conceituar e estudar a variação que contrasta com a visão genética tradicional que foi incorporada na teoria neodarwiniana e na genética de populações. Esta nova abordagem na biologia do desenvolvimento é tão importante para estudos microevolutivos quanto os resultados reais de estudos recentes de biologia evolutiva do desenvolvimento. Em particular, esta abordagem auxiliará na tarefa de identificar as mutações específicas que geram variação fenotípica e elucidar como elas alteram a função gênica. Estes dados fornecerão o elo ausente atual entre variação molecular e fenotípica em populações naturais.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2000.tb00544.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2000.tb00544.x",
    openalex = "W3028418616",
    references = "doi101016016895259090017z, doi101038276565a0, doi101038347550a0, doi101038386485a0, doi101111j155856461975tb00851x, doi1023071438156, doi1023071439305, doi1023072407274, doi105962bhltitle27468, openalexw1493831303"
}

A duplicação gênica tem geralmente sido vista como uma fonte necessária de material para a origem de novidades evolutivas, mas não está claro com que frequência genes duplicados surgem e com que frequência eles evoluem novas funções. Observações provenientes de bancos de dados genômicos de várias espécies eucarióticas sugerem que genes duplicados surgem a uma taxa muito alta, em média 0,01 por gene por milhão de anos. A maioria dos genes duplicados experimenta um breve período de seleção relaxada no início de sua história, com uma fração moderada deles evoluindo de maneira efetivamente neutra durante este período. No entanto, a vasta maioria dos genes duplicados é silenciada dentro de alguns milhões de anos, com os poucos sobreviventes posteriormente experimentando forte seleção purificadora. Embora genes duplicados possam raramente evoluir novas funções, o silenciamento estocástico de tais genes pode desempenhar um papel significativo na origem passiva de novas espécies.

@article{doi101126science29054941151,
    author = "Lynch, Michael e Conery, John S.",
    title = "O Destino Evolutivo e as Consequências dos Genes Duplicados",
    year = "2000",
    journal = "Science",
    abstract = "A duplicação gênica tem geralmente sido vista como uma fonte necessária de material para a origem de novidades evolutivas, mas não está claro com que frequência genes duplicados surgem e com que frequência eles evoluem novas funções. Observações provenientes de bancos de dados genômicos de várias espécies eucarióticas sugerem que genes duplicados surgem a uma taxa muito alta, em média 0,01 por gene por milhão de anos. A maioria dos genes duplicados experimenta um breve período de seleção relaxada no início de sua história, com uma fração moderada deles evoluindo de maneira efetivamente neutra durante este período. No entanto, a vasta maioria dos genes duplicados é silenciada dentro de alguns milhões de anos, com os poucos sobreviventes posteriormente experimentando forte seleção purificadora. Embora genes duplicados possam raramente evoluir novas funções, o silenciamento estocástico de tais genes pode desempenhar um papel significativo na origem passiva de novas espécies.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.290.5494.1151",
    doi = "10.1126/science.290.5494.1151",
    openalex = "W2019591778",
    references = "doi101023a1006392424384, doi101038387489a0, doi101046j14390388200200356x, doi101093genetics15141531, doi101093genetics1541459, doi101093nar25173389, doi101098rspb19940058, doi101126science28253941711, doi101126science28754612204, doi101242dev1994supplement125, doi1023072412932"
}

Introduções e Conceitos 1. Por que a genética evolutiva nem sempre se soma 2. Além da média: a importância evolutiva das interações gênicas e da variabilidade dos efeitos epistáticos 3. Epistasia e Traços Complexos 4. Detectando epistasia entre loci de traços quantitativos 5. A evolução das interações desenvolvimentais: Epistasia, canalização e integração 6. Epistasia e a manutenção do sexo 7. Parceiros genéticos no crime: Evolução de um supergene ultraegoísta especializado em sabotagem de espermatozoides 8. Modelagem de interação gênica em populações estruturadas 9. Epistasia, ligação e seleção balanceadora 10. Efeitos genéticos indiretos e interações gênicas 11. Epistasia em morfologia e comportamento de acasalamento Diferenciação Genética: De Populações à Especiação 12. Interações gênicas e a origem das espécies 13. Epistasia como restrição genética dentro das populações e acelerador da divergência adaptativa entre elas 14. A contribuição da epistasia para a evolução de populações naturais: Um estudo de caso de uma planta anual 15. Epistasia e a evolução de arquiteturas genéticas em populações naturais 16. Inferindo Epistasia em zonas híbridas de girassóis selvagens Literatura citada Índice

@book{openalexw1554403518,
    author = "Wolf, Jason B. e Brodie, Edmund D. e Wade, Michael J.",
    title = "Epistasia e o Processo Evolutivo",
    year = "2000",
    abstract = "Introduções e Conceitos 1. Por que a genética evolutiva nem sempre se soma 2. Além da média: a importância evolutiva das interações gênicas e da variabilidade dos efeitos epistáticos 3. Epistasia e Traços Complexos 4. Detectando epistasia entre loci de traços quantitativos 5. A evolução das interações desenvolvimentais: Epistasia, canalização e integração 6. Epistasia e a manutenção do sexo 7. Parceiros genéticos no crime: Evolução de um supergene ultraegoísta especializado em sabotagem de espermatozoides 8. Modelagem de interação gênica em populações estruturadas 9. Epistasia, ligação e seleção balanceadora 10. Efeitos genéticos indiretos e interações gênicas 11. Epistasia em morfologia e comportamento de acasalamento Diferenciação Genética: De Populações à Especiação 12. Interações gênicas e a origem das espécies 13. Epistasia como restrição genética dentro das populações e acelerador da divergência adaptativa entre elas 14. A contribuição da epistasia para a evolução de populações naturais: Um estudo de caso de uma planta anual 15. Epistasia e a evolução de arquiteturas genéticas em populações naturais 16. Inferindo Epistasia em zonas híbridas de girassóis selvagens Literatura citada Índice",
    url = "https://openalex.org/W1554403518",
    openalex = "W1554403518"
}

@article{doi101023a1012294324713,
    author = "Bouchard, Thomas J. e Loehlin, John C.",
    title = "Genes, Evolução, e Personalidade",
    year = "2001",
    journal = "Behavior Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1023/a:1012294324713",
    doi = "10.1023/a:1012294324713",
    openalex = "W1734767862",
    references = "doi1010160198971590900504, doi101046j14390388200200356x, doi101111j174465701991tb00688x, doi101126science27452921527, doi101537ase188722495, doi1023075403, doi1041359781446220986n8, doi105962bhltitle17416, doi107208chicago97802261495160010001, openalexw1486903121, openalexw1554403518, openalexw1556033561, openalexw1617412188, openalexw1641003075"
}

@article{doi101016s0169534702025545,
    author = "Lee, Carol Eunmi",
    title = "Genética evolutiva de espécies invasoras",
    year = "2002",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0169-5347(02)02554-5",
    doi = "10.1016/s0169-5347(02)02554-5",
    openalex = "W2155928419",
    references = "doi101038sjhdy6886170, doi101073pnas97137043, doi101073pnas97137051, doi101111j155856461951tb02788x, doi101126science2925517673, doi1016410006356820000500053eaecon23co2, doi1023072261425, doi1023072265769, doi1023072412809, doi104159harvard9780674865327, openalexw1554403518, openalexw1584633894"
}

@article{doi101038nature01025,
    author = "Enard, Wolfgang e Przeworski, Molly e Fisher, Simon E. e Lai, Cecilia e Wiebe, Victor e Kitano, Takashi e Monaco, Anthony P. e Pääbo, Svante",
    title = "Evolução molecular de FOXP2, um gene envolvido na fala e na linguagem",
    year = "2002",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature01025",
    doi = "10.1038/nature01025",
    openalex = "W2107934935",
    references = "doi10103831927, doi101093bioinformatics152174, doi101111j155856461991tb04425x"
}

Estudamos a estrutura de populações humanas utilizando genótipos em 377 loci de microsatélitos autossômicos em 1056 indivíduos de 52 populações. Diferenças intra-populacionais entre indivíduos explicam de 93 a 95% da variação genética; diferenças entre grupos principais constituem apenas 3 a 5%. No entanto, sem utilizar informações prévias sobre as origens dos indivíduos, identificamos seis principais agrupamentos genéticos, cinco dos quais correspondem a regiões geográficas principais, e subagrupamentos que frequentemente correspondem a populações individuais. O acordo geral entre populações genéticas e pré-definidas sugere que a ascendência auto-relatada pode facilitar a avaliação de riscos epidemiológicos, mas não elimina a necessidade de utilizar informações genéticas em estudos de associação genética.

@article{doi101126science1078311,
    author = "Rosenberg, Noah A. e Pritchard, Jonathan K. e Weber, James L. e Cann, Howard M. e Kídd, Kenneth K. e Zhivotovsky, Lev A. e Feldman, Marcus W.",
    title = "Estrutura Genética de Populações Humanas",
    year = "2002",
    journal = "Science",
    abstract = "Estudamos a estrutura de populações humanas utilizando genótipos em 377 loci de microsatélitos autossômicos em 1056 indivíduos de 52 populações. Diferenças intra-populacionais entre indivíduos explicam de 93 a 95% da variação genética; diferenças entre grupos principais constituem apenas 3 a 5%. No entanto, sem utilizar informações prévias sobre as origens dos indivíduos, identificamos seis principais agrupamentos genéticos, cinco dos quais correspondem a regiões geográficas principais, e subagrupamentos que frequentemente correspondem a populações individuais. O acordo geral entre populações genéticas e pré-definidas sugere que a ascendência auto-relatada pode facilitar a avaliação de riscos epidemiológicos, mas não elimina a necessidade de utilizar informações genéticas em estudos de associação genética.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1078311",
    doi = "10.1126/science.1078311",
    openalex = "W2141042406",
    references = "doi101006tpbi20011543, doi101038368455a0, doi101038ng761, doi101073pnas9494516, doi101086302825, doi101086339929, doi101093genetics1552945, doi101093genetics1592699, doi101126science2965566261b, doi101186gb200237comment2007"
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@article{doi101016jtree200309010,
    author = "Olden, Julian D. e Poff, N. LeRoy e Douglas, Marlis R. e Douglas, Michael E. e Fausch, Kurt D.",
    title = "Consequências ecológicas e evolutivas da homogeneização biótica",
    year = "2003",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2003.09.010",
    doi = "10.1016/j.tree.2003.09.010",
    openalex = "W2159330259",
    references = "doi1010079789400958517, doi101016s0169534701022832, doi101016s0169534702000447, doi101016s0169534702025545, doi101016s0169534703000089, doi101016s0169534703001009, doi101016s0169534799016791, doi101046j13652745200000473x, doi101111j155856461954tb01504x, doi101111j155856461987tb02459x, doi101126science25350241099, doi101126science27753301300, doi101126science2885467854, doi101146annurevecolsys27183, doi1015159780691209418, doi1023072257385, doi1023072409086, doi102307jctvx5wbbh"
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A robustez é a invariância dos fenótipos face à perturbação. A robustez dos fenótipos manifesta-se em vários níveis de organização biológica, incluindo expressão génica, dobramento de proteínas, fluxo metabólico, homeostase fisiológica, desenvolvimento e até mesmo a aptidão do organismo. Os mecanismos subjacentes à robustez são diversos, variando da estabilidade termodinâmica ao nível do RNA e das proteínas ao comportamento ao nível do organismo. Os fenótipos podem ser robustos tanto contra perturbações hereditárias (por exemplo, mutações) como contra perturbações não hereditárias (por exemplo, o clima). Aqui, focamo-nos principalmente no primeiro tipo de robustez — a robustez genética — e analisamos três áreas de investigação em crescimento: (1) medir a robustez genética na natureza e no laboratório; (2) compreender a evolução da robustez genética; e (3) explorar as implicações da robustez genética para a evolução futura.

@article{doi101111j001438202003tb00377x,
    author = "de Visser, J. Arjan G. M. e Hermisson, Joachim e Wagner, Günter P. e Meyers, Lauren Ancel e Bagheri, Homayoun C. e Blanchard, Jeffrey L. e Chao, Lin e Cheverud, James M. e Elena, Santiago F. e Fontana, Walter e Gibson, Greg e Hansen, Thomas F. e Krakauer, David C. e Lewontin, Richard C e Ofria, Charles e Rice, Sean H. e von Dassow, George e Wagner, Andreas e Whitlock, Michael C.",
    title = "PERSPECTIVA: EVOLUÇÃO E DETECÇÃO DE ROBUSTEZ GENÉTICA",
    year = "2003",
    journal = "Evolução",
    abstract = "A robustez é a invariância dos fenótipos face à perturbação. A robustez dos fenótipos manifesta-se em vários níveis de organização biológica, incluindo expressão génica, dobramento de proteínas, fluxo metabólico, homeostase fisiológica, desenvolvimento e até mesmo a aptidão do organismo. Os mecanismos subjacentes à robustez são diversos, variando da estabilidade termodinâmica ao nível do RNA e das proteínas ao comportamento ao nível do organismo. Os fenótipos podem ser robustos tanto contra perturbações hereditárias (por exemplo, mutações) como contra perturbações não hereditárias (por exemplo, o clima). Aqui, focamo-nos principalmente no primeiro tipo de robustez — a robustez genética — e analisamos três áreas de investigação em crescimento: (1) medir a robustez genética na natureza e no laboratório; (2) compreender a evolução da robustez genética; e (3) explorar as implicações da robustez genética para a evolução futura.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2003.tb00377.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2003.tb00377.x",
    openalex = "W2168338628",
    references = "doi10103824550, doi10103835018085, doi101038nature749, doi101038ng881, doi101086280193, doi101086283602, doi101086414425, doi101093nar309e36, doi101111j155856461953tb00070x, doi101146annurevphysiol611243, doi1043249781315765471, openalexw1554403518, openalexw3135630760"
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@article{doi101038nature02415,
    author = "Shapiro, Michael D. e Marks, Melissa E. e Peichel, Catherine L. e Blackman, Benjamin K. e Nereng, Kirsten S. e Jónsson, Bjarni e Schluter, Dolph e Kingsley, David M.",
    title = "Base genética e do desenvolvimento da redução pélvica evolutiva em espinhos-de-três-espinhos",
    year = "2004",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature02415",
    doi = "10.1038/nature02415",
    openalex = "W2066908868",
    references = "doi1010020471142905, doi101016s0092867400808685, doi101016s0092867401004937, doi10103820944, doi10103835046017, doi101038414901a, doi101038nature02064, doi101073pnas9794530, doi101111j001438202000tb00544x, openalexw2062594085"
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Estimar a base genética de características quantitativas pode ser complicado para populações selvagens em ambientes naturais, pois a variação ambiental frequentemente obscurece os padrões evolutivos subjacentes. Reviso a aplicação recente de modelos "animal" de máxima verossimilhança restrita a dados multigeracionais de populações naturais e mostro como a estimação de componentes de variância e a previsão de valores de reprodução usando esses métodos oferecem um meio poderoso de lidar com os efeitos potencialmente confusos da variação ambiental, bem como gerar uma riqueza de novas áreas de investigação.

@article{doi101098rstb20031437,
    author = "Kruuk, Loeske E. B.",
    title = "Estimando parâmetros genéticos em populações naturais usando o modelo 'animal'",
    year = "2004",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = {Estimar a base genética de características quantitativas pode ser complicado para populações selvagens em ambientes naturais, pois a variação ambiental frequentemente obscurece os padrões evolutivos subjacentes. Reviso a aplicação recente de modelos "animal" de máxima verossimilhança restrita a dados multigeracionais de populações naturais e mostro como a estimação de componentes de variância e a previsão de valores de reprodução usando esses métodos oferecem um meio poderoso de lidar com os efeitos potencialmente confusos da variação ambiental, bem como gerar uma riqueza de novas áreas de investigação.},
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2003.1437",
    doi = "10.1098/rstb.2003.1437",
    openalex = "W2073035337",
    references = "doi101016s0169534702000447, doi101038nrg700, doi101111j155856461984tb00344x, doi105860choice355054"
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O conhecimento emergente sobre a evolução dos organismos sugere que mudanças na regulação da expressão gênica desempenharam um papel importante - uma tese proposta há 30 anos por King e Wilson.

@article{doi101371journalpbio0030245,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evolução em Dois Níveis: Sobre Genes e Forma",
    year = "2005",
    journal = "PLoS Biology",
    abstract = "O conhecimento emergente sobre a evolução dos organismos sugere que mudanças na regulação da expressão gênica desempenharam um papel importante - uma tese proposta há 30 anos por King e Wilson.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030245",
    doi = "10.1371/journal.pbio.0030245",
    openalex = "W1999027354",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016b9781483227344500176, doi101016s0022283661800727, doi10103835046017, doi10103835097076, doi101038376479a0, doi101038nature01025, doi101038nature01262, doi101073pnas6341181, doi101073pnas7183028, doi101073pnas9794530, doi101111j001438202000tb00544x, doi101126science1090005, doi101126science1653891349, doi101126science29054941151, doi101126science860134, doi105860choice395182"
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Prefácio 1. ELEMENTOS GENÉTICOS EGÓISTAS Cooperação e Conflito Genético Três Maneiras de Alcançar Conflitos de Parentesco Dentro do Indivíduo Taxas de Disseminação Efeitos na População Hospedeira O Estudo de Elementos Genéticos Egóistas Design deste Livro 2. MATADES AUTOSSÔMICAS O Haplótipo t Descoberta Estrutura do Haplótipo t História e Distribuição Genética do Drive Importância do Sistema de Acasalamento e Competição Gamética Destino dos Alelos Resistentes Seleção para Inversões Letais Recessivos em Complexos t Facilitadores e Supressores t e o Complexo de Histocompatibilidade Principal Efeitos de Fitness Heterozigoto (+/t): Antagonismo Sexual? Contabilizando Frequências de t na Natureza Outras Matades Gaméticas Distorcedor de Segregação em Drosophila Matades de Esporos em Fungos Incidência de Matades Gaméticas Matades de Efeito Materno Medea em Baratas de Farinha HSR, scat+ e OmDDK em Camundongos A Evolução das Matades de Efeito Materno Drive Gestacional? Fatores de Gametófito em Plantas 3. CROMOSSOMOS SEXUAIS EGÓISTAS Drive de Cromossomos Sexuais em Diptera Cromossomos X Mata Cromossomos Y Mata Distribuição Taxonômica de Cromossomos Sexuais Mata Cycles Evolutivos de Determinação Sexual Cromossomos Feminizantes X (e Y) em Roedores O Lemming Variável O Lemming de Madeira Outros Murídeos Outros Conflitos: Proporções Sexuais e Escolha de Parceiros 4. IMPRIMENTAÇÃO GENÔMICA Imprinting e Investimento Parental em Mamíferos Igf2 e Igf2r: Fatores de Crescimento Imprimidos e Agindo Opostamente em Camundongos Efeitos de Crescimento de Genes Imprimidos em Camundongos e Humanos Evolução do Aparelho de Imprinting Os Mecanismos de Imprinting Envolvem Metilação e São Complexos Conflito entre Diferentes Componentes da Máquina de Imprinting História do Conflito Refletida no Aparelho de Imprinting Turnover Evolutivo do Aparelho de Imprinting Interações Intralocus, Superdominância Polar e Paramutação Distorção da Proporção de Transmissão em Loci Imprimidos Imprinting Biparental e Outras Possibilidades Outras Características: Interações Sociais após o Período de Investimento Parental Comportamento Materno em Camundongos Endogamia e Dispersão Reconhecimento de Parentesco Interpretação Funcional de Efeitos Teciduais em Camundongos Quiméricos Engano e Auto-Engano Imprinting e Cromossomos Sexuais Imprinting Genômico em Outros Taxa Plantas com Flores Outros Taxa Previstos para Ter Imprinting 5. DNA MITOCONDRIAL EGÓISTO Genômica Mitocondrial: Um Guia Seleção Mitocondrial Dentro do Indivíduo Mutações Petite em Levedura Seleção Dentro do Indivíduo e a Evolução da Herança Uniparental Seleção Dentro do Indivíduo sob Herança Uniparental DUI: Herança mtDNA de Mãe para Filha e de Pai para Filho em Mexilhões Esterilidade Masculina Citoplasmática Herança Uniparental Implica Seleção Unissexual Papel Desproporcional de mtDNA na Esterilidade Masculina em Plantas Mecanismos de Ação Mitocondrial e Reação Nuclear CMS e Restauradores em Populações Naturais CMS, Masculinização e a Evolução de Sexos Separados Limitação de Pólen, Dependência de Frequência e Extinção Local Realocação de Recursos versus Evitação de Endogamia Importância da Variação Mutacional CMS e Transmissão Paternal Outras Rastros de Conflito Mito-Nuclear Mitocondrias e Apoptose Mitocondrias e Determinação de Células Germinativas Mitocondrias e Edição de RNA 6. CONVERSÃO GENÉTICA E HOMING Conversão Genética Viciada Mecanismos Moleculares Coeficientes de Seleção Efetivos Devido à BCG em Fungos BCG e Evolução do Genoma BCG e Evolução da Máquina Meiótica Homing e Retrohoming Como HEGs Fazem Home HEGs Geralmente Associados a Introns de Auto-Esplicing ou Inteins HEGs e Evolução do Sistema de Acasalamento do Hospedeiro Ciclo Evolutivo de Transmissão Horizontal, Degradação e Perda Domesticação de HEG e Troca de Tipo de Acasalamento em Levedura Introns do Grupo II HEGs Artificiais Como Ferramentas para Engenharia Genética de Populações A Construção Básica Aumentando a Carga Prevenindo Resistência Natural e Transmissão Horizontal Engenharia Genética de Populações Outros Usos 7. ELEMENTOS TRANSPOSÍVEIS Estrutura Molecular e Mecanismos Transposons de DNA LINEs e SINEs Retroelementos LTR Biologia de População e Seleção Natural Taxas de Transposição Baixas, Mas Maiores que as Taxas de Excisão Seleção Natural no Hospedeiro Retarda a Disseminação de Elementos Transposáveis Disseminação Rápida de Elementos P em D. melanogaster Taxa Reprodutiva Líquida como Função da Taxa de Transposição e Efeito no Fitness do Hospedeiro Reduzindo Danos ao Hospedeiro Taxa de Transposição e Regulação de Número de Cópias Seleção para Auto-Reconhecimento Elementos Defeituosos e Repressores Extinção de Elementos Ativos em Espécies Hospedeiras Transmissão Horizontal e Persistência de Longo Prazo Elementos Transposáveis em Populações Endogâmicas e Cruzadas Elementos Transposáveis e Evolução do Hospedeiro Elementos Transposáveis e Rearranjos Cromossômicos Elementos Transposáveis e Tamanho do Genoma Co-Otupação de Funções de Elementos Transposáveis e Defesas do Hospedeiro Elementos Transposáveis como Parasitas, Não Adaptações ou Mutualistas do Hospedeiro Origens Antigas, Quiméricas e Polifiléticas 8. DRIVE FEMININO Centromeros Egóistas e Meiose Feminina Cromossomo 10 Anormal do Milho Outros Botões no Milho Efeitos Deleterios de Botões no Milho Botões, Segmentos Supranumerários e Neocentromeros em Outras Espécies Centromeros Específicos de Meiose e Cromossomos Holocêntricos Centromeros Egóistas e Meiose I A Importância do Número de Centromeros: Translocações Robertsonianas em Mamíferos Drive Feminino Dependente de Esperma? Drive Feminino e Evolução de Cariótipo Corpos Polares Rejuntando a Linha Germinativa 9. CROMOSSOMOS B Tipos de Drive Genética de Fatores A e B Afetando o Drive B Taxas de Transmissão em Espécies Bem Estudadas Ausência de Drive Grau de Cruzamento e Efeitos de Drive no Fenótipo Efeitos no Tamanho do Genoma, Tamanho Celular e Ciclo Celular Efeitos no Fenótipo Externo Desaparecimento de Tecido Somatico Número B e o Efeito Ímpar-Par Efeitos Negativos de Bs Mais Pronunciados sob Condições Mais Severas O Sexo do Drive Está Associado ao Sexo do Efeito Fenotípico? Efeitos de B na Recombinação Entre os As Pareamento de Cromossomos A em Híbridos Bs Neutros e Benéficos Cromossomos B Benéficos Cromossomos Bem Eyprepocnemis plorans: Um Caso de Neutralização Contínua? Estrutura e Tamanho do Conteúdo Polimorfismo Heterocromatina Genes Repetições em Tandem A Origem dos Fatores Associados à Presença de B Tamanho do Genoma Número de Cromossomos Ploidia Forma dos Cromossomos A Bs e a Proporção Sexual Proporção Sexual Paterna (PSR) em Nasonia Associações X-B em Orthoptera O Y de Drosophila Evoluiu de um B? Outros Efeitos dos Bs na Proporção Sexual Esterilidade Masculina em Plantago 10. EXCLUSÃO GENÔMICA Perda do Genoma Paterno em Machos, ou Parahaploidia Perda do Genoma Paterno (PGL) em Ácaros PGL em Insetos Escamas PGL no Besouro Furo de Café PGL em Colêmbolos? Evolução do PGL PGL e Haploidia Sistema Cromossômico de Sciaridae Características Notáveis do Sistema de Sciaridae Uma Hipótese Evolutiva Mecanismos PGL em Mosquitos de Galhas Hibridogênese, ou Reprodução Hemiclonal O Topominnow Poeciliopsis A Rã-d'água Rana esculenta O Inseto Saltador Bacillus rossius-grandii Evolução da Hibridogênese Androgênese, ou Perda do Genoma Materno O Pinheiro Cupressus dupreziana A Vela Corbicula O Inseto Saltador Bacillus rossius-grandii 11. LINHAGENS CELULARES EGÓISTAS Mosaicos Seleção da Linhagem Celular Somática: Câncer e o Sistema Imune Adaptativo Seleção da Linhagem Celular na Linha Germinativa Evolução da Linha Germinativa Genes Egóístas e DNA Limitado à Linha Germinativa Quimeras Inquérito Taxonômico da Quimerismo Quimerismo Somático e Corpos Polares 12. RESUMO E DIREÇÕES FUTURAS Lógica dos Elementos Genéticos Egóístas Genética Molecular Genes Egóístas e Sexo Destino de um Gene Egóista dentro de uma Espécie Movimento entre Espécies Distribuição entre Espécies Papel na Evolução do Hospedeiro O Mundo Oculto dos Elementos Genéticos Egóístas Referências Glossário Índice

@article{doi105860choice435875,
    title = "Genes in conflict: the biology of selfish genetic elements",
    year = "2006",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Preface 1. SELFISH GENETIC ELEMENTS Genetic Cooperation and Conflict Three Ways to Achieve Within-Individual Kinship Conflicts Rates of Spread Effects on the Host Population The Study of Selfish Genetic Elements Design of This Book 2. AUTOSOMAL KILLERS The t Haplotype Discovery Structure of the t Haplotype History and Distribution Genetics of Drive Importance of Mating System and Gamete Competition Fate of Resistant Alleles Selection for Inversions Recessive Lethals in t Complexes Enhancers and Suppressors t and the Major Histocompatability Complex Heterozygous (+/t) Fitness Effects: Sex Antagonistic? Accounting for t Frequencies in Nature Other Gamete Killers Segregation Distorter in Drosophila Spore Killers in Fungi Incidence of Gamete Killers Maternal-Effect Killers Medea in Flour Beetles HSR, scat+, and OmDDK in Mice The Evolution of Maternal-Effect Killers Gestational Drive? Gametophyte Factors in Plants 3. SELFISH SEX CHROMOSOMES Sex Chromosome Drive in the Diptera Killer X Chromosomes Killer Y Chromosomes Taxonomic Distribution of Killer Sex Chromosomes Evolutionary Cycles of Sex Determination Feminizing X (and Y) Chromosomes in Rodents The Varying Lemming The Wood Lemming Other Murids Other Conflicts: Sex Ratios and Mate Choice 4. GENOMIC IMPRINTING Imprinting and Parental Investment in Mammals Igf2 and Igf2r: Oppositely Imprinted, Oppositely Acting Growth Factors in Mice Growth Effects of Imprinted Genes in Mice and Humans Evolution of the Imprinting Apparatus The Mechanisms of Imprinting Involve Methylation and Are Complex Conflict Between Different Components of the Imprinting Machinery History of Conflict Reflected in the Imprinting Apparatus Evolutionary Turnover of the Imprinting Apparatus Intralocus Interactions, Polar Overdominance, and Paramutation Transmission Ratio Distortion at Imprinted Loci Biparental Imprinting and Other Possibilities Other Traits: Social Interactions after the Period of Parental Investment Maternal Behavior in Mice Inbreeding and Dispersal Kin Recognition Functional Interpretation of Tissue Effects in Chimeric Mice Deceit and Selves-Deception Imprinting and the Sex Chromosomes Genomic Imprinting in Other Taxa Flowering Plants Other Taxa Predicted to Have Imprinting 5. SELFISH MITOCHONDRIAL DNA Mitochondrial Genomics: A Primer Mitochondrial Selection within the Individual Petite Mutations in Yeast Within-Individual Selection and the Evolution of Uniparental Inheritance Within-Individual Selection under Uniparental Inheritance DUI: Mother-to-Daughter and Father-to-Son mtDNA Inheritance in Mussels Cytoplasmic Male Sterility Uniparental Inheritance Implies Unisexual Selection Disproportionate Role of mtDNA in Plant Male Sterility Mechanisms of Mitochondrial Action and Nuclear Reaction CMS and Restorers in Natural Populations CMS, Masculinization, and the Evolution of Separate Sexes Pollen Limitation, Frequency Dependence, and Local Extinction Resource Reallocation Versus Inbreeding Avoidance Importance of Mutational Variation CMS and Paternal Transmission Other Traces of Mito-Nuclear Conflict Mitochondria and Apoptosis Mitochondria and Germ Cell Determination Mitochondria and RNA Editing 6. GENE CONVERSION AND HOMING Biased Gene Conversion Molecular Mechanisms Effective Selection Coefficients Due to BGC in Fungi BGC and Genome Evolution BGC and Evolution of the Meiotic Machinery Homing and Retrohoming How HEGs Home HEGs Usually Associated with Self-Splicing Introns or Inteins HEGs and Host Mating System Evolutionary Cycle of Horizontal Transmission, Degeneration, and Loss HEG Domestication and Mating-Type Switching in Yeast Group II Introns Artificial HEGs As Tools for Population Genetic Engineering The Basic Construct Increasing the Load Preventing Natural Resistance and Horizontal Transmission Population Genetic Engineering Other Uses 7. TRANSPOSABLE ELEMENTS Molecular Structure and Mechanisms DNA Transposons LINEs and SINEs LTR Retroelements Population Biology and Natural Selection Transposition Rates Low But Greater Than Excision Rates Natural Selection on the Host Slows the Spread of Transposable Elements Rapid Spread of P Elements in D. melanogaster Net Reproductive Rate a Function of Transposition Rate and Effect on Host Fitness Reducing Harm to the Host Transposition Rate and Copy Number Regulation Selection for Self-Recognition Defective and Repressor Elements Extinction of Active Elements in Host Species Horizontal Transmission and Long-Term Persistence Transposable Elements in Inbred and Outcrossed Populations Beneficial Inserts Rates of Fixation Transposable Elements and Host Evolution Transposable Elements and Chromosomal Rearrangements Transposable Elements and Genome Size Co-Option of Transposable Element Functions and Host Defenses Transposable Elements As Parasites, Not Host Adaptations or Mutualists Origins Ancient, Chimeric, and Polyphyletic Origins 8. FEMALE DRIVE Selfish Centromeres and Female Meiosis Abnormal Chromosome 10 of Maize Other Knobs in Maize Deleterious Effects of Knobs in Maize Knobs, Supernumerary Segments, and Neocentromeres in Other Species Meiosis-Specific Centromeres and Holocentric Chromosomes Selfish Centromeres and Meiosis I The Importance of Centromere Number: Robertsonian Translocations in Mammals Sperm-Dependent Female Drive? Female Drive and Karyotype Evolution Polar Bodies Rejoining the Germline 9. B CHROMOSOMES Drive Types of Drive Genetics of A and B Factors Affecting B Drive Transmission Rates inWell-Studied Species Absence of Drive Degree of Outcrossing and Drive Effects on the Phenotype Effects on Genome Size, Cell Size, and Cell Cycle Effects on the External Phenotype Disappearance from Somatic Tissue B Number and the Odd-Even Effect Negative Effects of Bs More Pronounced under Harsher Conditions Is the Sex of Drive Associated with the Sex of Phenotypic Effect? B Effects on Recombination Among the As Pairing of A Chromosomes in Hybrids Neutral and Beneficial Bs Beneficial B Chromosomes B Chromosomes in Eyprepocnemis plorans: A Case of Continuous Neutralization? Structure and Content Size Polymorphism Heterochromatin Genes Tandem Repeats The Origin of Bs A Factors Associated with B Presence Genome Size Chromosome Number Ploidy Shape of A Chromosomes Bs and the Sex Ratio Paternal Sex Ratio (PSR) in Nasonia X-B Associations in Orthoptera Has the Drosophila Y Evolved from a B? Other Effects of Bs on the Sex Ratio Male Sterility in Plantago 10. GENOMIC EXCLUSION Paternal Genome Loss in Males, or Parahaplodiploidy PGL in Mites PGL in Scale Insects PGL in the Coffee Borer Beetle PGL in Springtails? Evolution of PGL PGL and Haplodiploidy Sciarid Chromosome System Notable Features of the Sciarid System An Evolutionary Hypothesis Mechanisms PGL in Gall Midges Hybridogenesis, or Hemiclonal Reproduction The Topminnow Poeciliopsis The Water Frog Rana esculenta The Stick Insect Bacillus rossius-grandii Evolution of Hybridogenesis Androgenesis, or Maternal Genome Loss The Conifer Cupressus dupreziana The Clam Corbicula The Stick Insect Bacillus rossius-grandii 11. SELFISH CELL LINEAGES Mosaics Somatic Cell Lineage Selection: Cancer and the Adaptive Immune System Cell Lineage Selection in the Germline Evolution of the Germline Selfish Genes and Germline-Limited DNA Chimeras Taxonomic Survey of Chimerism Somatic Chimerism and Polar Bodies 12. SUMMARY AND FUTURE DIRECTIONS Logic of Selfish Genetic Elements Molecular Genetics Selfish Genes and Sex Fate of a Selfish Gene within a Species Movement between Species Distribution among Species Role in Host Evolution The HiddenWorld of Selfish Genetic Elements References Glossary Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.43-5875",
    doi = "10.5860/choice.43-5875",
    openalex = "W1608363683"
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@article{doi101016jcell200710022,
    author = "Otto, Sarah P.",
    title = "As Consequências Evolutivas da Poliploidia",
    year = "2007",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.10.022",
    doi = "10.1016/j.cell.2007.10.022",
    openalex = "W2010032067",
    references = "doi101371journalpbio0030314, openalexw1493831303, openalexw2065039187"
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@article{doi101016jcub200706004,
    author = "West, Stuart A. e Griffin, Ashleigh S. e Gardner, Andy",
    title = "Explicações Evolutivas para a Cooperação",
    year = "2007",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2007.06.004",
    doi = "10.1016/j.cub.2007.06.004",
    openalex = "W2143868963",
    references = "doi1010160022519364900384, doi101038359826a0, doi101038415137a, doi10108019390450903037302, doi101086383541, doi101086406755, doi101111j143903101963tb01161x, doi101126science1133755, doi101126science16238591243, doi101126science7466396, doi105860choice435875, openalexw2624262714"
}

@article{doi101038nature06341,
    author = "Aquadro, Charles F. e Ram, K. Ravi e Wolfner, Mariana F. e Clark, Andrew G. e Wong, Alex e Yang, Hsiao-Pei e Singh, Nadia D. e Greenberg, Anthony J. e Huntley, Melanie A. e Larracuente, Amanda M. e Sirot, Laura K. e Sackton, Timothy B. e Barbash, Daniel A. e Eisen, Michael B. e Hoskins, Roger A. e Celniker, S e Eisen, Michael B. e Brand, Adrianne e Ebling, Heather e David, Robert e Wei, Tao e Bosak, Stephanie e Garvin, Barry E. e McKernan, Kevin e Rubenfield, Marc e Tsolas, Jason M. e Parisi, Matthew J. e Gustafson, Erik e Saranga, David J. e Smith, Douglas R. e McKernan, Brendan e Griffiths‐Jones, Sam e Bergman, Casey e Sturgill, David e Oliver, Brian e Parisi, Michael e Zhang, Yu e Markow, Therese A. e Watts, Thomas D. e Machado, Carlos A. e Matzkin, Luciano M. e Kwok, Roberta e Gilbert, Don e Kaufman, Thomas C. e Hahn, Matthew W. e Kheradpour, Pouya e Rasmussen, M. D. e Stark, Alexander e Kellis, M. e Lin, Michael F. e Parts, Leopold e Dupes, Alan e Jaffe, David B. e Farina, Abderrahim e Gnerre, Sante e Nguyen, Nga Thi Thuy e Shea, Terry e Zimmer, Andrew e Mauceli, Evan e Ryan, Elizabeth e Bourzgui, Imane e Sherpa, Ngawang e Wangdi, Tsering e Dhargay, Norbu e Lara, Marcia e Liu, Jinlei e Reyes, Rebecca e Vassiliev, Helen e Anderson, Erica e Liu, Shangtao e Mihova, Tanya e Negash, Tamrat e Strader, C. e Mehta, Teena e Rise, Cecil e Brockman, Will e Azer, Marc e Norbu, Choe e Hollinger, Andrew e Degray, Stuart e Fritz, P e Patti, Christopher e Phunkhang, Pema e Brown, Adam e Meldrim, James C. e Shi, Lu e Bachantsang, Pasang e Hall, Jennifer L. e Lokyitsang, Yeshi e Lui, Annie e D'Aco, Katie e MacDonald, Pen e Costello, Maura e Abdouelleil, Amr e Thoulutsang, Dawa e Meneus, Louis e Citroen, Mieke e Wilkinson, Jane e Lindblad-Toh, Kerstin e Gearin, Christina R.",
    title = "Evolução de genes e genomas na filogenia de Drosophila",
    year = "2007",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature06341",
    doi = "10.1038/nature06341",
    openalex = "W2099762535",
    references = "doi101016s0378111900005333, doi101038276565a0"
}

As rápidas mudanças climáticas provavelmente imporão fortes pressões seletivas sobre traços importantes para a aptidão, e, portanto, a microevolução em resposta à seleção mediada pelo clima pode ser um mecanismo importante para mitigar as consequências negativas das mudanças climáticas. Revisamos as evidências empíricas para respostas microevolutivas recentes às mudanças climáticas em estudos longitudinais, enfatizando as seguintes três perspectivas emergentes dos dados publicados. Primeiro, embora as assinaturas das mudanças climáticas sejam claramente visíveis em muitos processos ecológicos, exemplos semelhantes de respostas microevolutivas na literatura são, na verdade, muito raros. Segundo, a qualidade das evidências para respostas microevolutivas às mudanças climáticas está longe de ser satisfatória, pois as respostas documentadas são frequentemente — se não tipicamente — baseadas em dados não genéticos. Reforçamos a visão de que é tão importante deixar clara a distinção entre respostas genéticas (evolutivas) e fenotípicas (inclui um componente plástico não genético) quanto entender os papéis relativos da plasticidade e da genética na adaptação às mudanças climáticas. Terceiro, para ilustrar as dificuldades e sua potencial ubiquidade na detecção de microevolução em resposta à seleção natural, revisamos os estudos de genética quantitativa sobre respostas microevolutivas à seleção natural no contexto de estudos de longo prazo sobre vertebrados. As evidências disponíveis apontam para a conclusão geral de que muitas respostas percebidas como adaptações a condições ambientais em mudança podem ser respostas plásticas induzidas pelo ambiente, em vez de adaptações microevolutivas. Portanto, evidências claras indicando um papel significativo para a adaptação evolutiva ao aquecimento climático em curso são notavelmente escassas.

@article{doi101111j1365294x200703413x,
    author = "Gienapp, Phillip e Teplitsky, Céline e Alho, Jussi e Mills, James A. e Merilä, Juha",
    title = "Mudanças climáticas e evolução: separando respostas ambientais e genéticas",
    year = "2007",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "As rápidas mudanças climáticas provavelmente imporão fortes pressões seletivas sobre traços importantes para a aptidão, e, portanto, a microevolução em resposta à seleção mediada pelo clima pode ser um mecanismo importante para mitigar as consequências negativas das mudanças climáticas. Revisamos as evidências empíricas para respostas microevolutivas recentes às mudanças climáticas em estudos longitudinais, enfatizando as seguintes três perspectivas emergentes dos dados publicados. Primeiro, embora as assinaturas das mudanças climáticas sejam claramente visíveis em muitos processos ecológicos, exemplos semelhantes de respostas microevolutivas na literatura são, na verdade, muito raros. Segundo, a qualidade das evidências para respostas microevolutivas às mudanças climáticas está longe de ser satisfatória, pois as respostas documentadas são frequentemente — se não tipicamente — baseadas em dados não genéticos. Reforçamos a visão de que é tão importante deixar clara a distinção entre respostas genéticas (evolutivas) e fenotípicas (inclui um componente plástico não genético) quanto entender os papéis relativos da plasticidade e da genética na adaptação às mudanças climáticas. Terceiro, para ilustrar as dificuldades e sua potencial ubiquidade na detecção de microevolução em resposta à seleção natural, revisamos os estudos de genética quantitativa sobre respostas microevolutivas à seleção natural no contexto de estudos de longo prazo sobre vertebrados. As evidências disponíveis apontam para a conclusão geral de que muitas respostas percebidas como adaptações a condições ambientais em mudança podem ser respostas plásticas induzidas pelo ambiente, em vez de adaptações microevolutivas. Portanto, evidências claras indicando um papel significativo para a adaptação evolutiva ao aquecimento climático em curso são notavelmente escassas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2007.03413.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2007.03413.x",
    openalex = "W2153330886",
    references = "doi101007978940100585210, doi101016s0169534702000447, doi101038nature02415, doi101038nature04843, doi101126science1070315, doi101126science1098095"
}

Prevê-se que as espécies invasoras sofram com reduções na diversidade genética durante eventos fundadores, reduzindo o potencial adaptativo. Integrando evidências de duas revisões da literatura e dois estudos de caso, abordamos as seguintes questões: Quanto da diversidade genética é perdida em invasões? Múltiplas introduções atenuam essa perda? Há evidências de perda de diversidade em características quantitativas? Invasores que experimentaram gargalos fortes mostram evolução adaptativa? Como múltiplas introduções influenciam a adaptação em escala de paisagem? Revisamos estudos de 80 espécies de animais, plantas e fungos que quantificaram a diversidade molecular nuclear dentro de populações introduzidas e de origem. No geral, houve perdas significativas tanto na riqueza alélica quanto na heterozigose nas populações introduzidas, e grandes ganhos em diversidade foram raros. Evidências de múltiplas introduções estiveram associadas a maior diversidade, e a variação alélica pareceu aumentar ao longo de escalas de tempo longas (~100 anos), sugerindo um papel para o fluxo gênico em aumentar a diversidade a longo prazo. Em seguida, revisamos a literatura sobre diversidade de características quantitativas e descobrimos que a variação no sentido amplo raramente declina em introduções, mas comparações diretas da variância aditiva estavam ausentes. Nossos estudos de invasões de Hypericum canariense ilustram como populações com diversidade diminuída ainda podem evoluir rapidamente. Dada a prevalência de gargalos genéticos em populações invasoras bem-sucedidas e o potencial para evolução adaptativa em características quantitativas, sugerimos que as desvantagens associadas a eventos fundadores podem ter sido exageradas. No entanto, nosso trabalho sobre o invasor bem-sucedido Verbascum thapsus ilustra como múltiplas introduções podem levar tempo para se misturar, persistindo em vez disso como um 'mosaico de maladaptação' onde as características não estão distribuídas em um padrão consistente com a adaptação. Concluímos que o gerenciamento que limita o fluxo gênico entre populações introduzidas pode reduzir o potencial adaptativo, mas é improvável que previna a expansão ou a evolução de novo comportamento invasivo.

@article{doi101111j1365294x200703538x,
    author = "Dlugosch, Katrina M. e Parker, Ingrid M.",
    title = "Eventos fundadores em invasões de espécies: variação genética, evolução adaptativa e o papel de múltiplas introduções",
    year = "2007",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Prevê-se que as espécies invasoras sofram com reduções na diversidade genética durante eventos fundadores, reduzindo o potencial adaptativo. Integrando evidências de duas revisões da literatura e dois estudos de caso, abordamos as seguintes questões: Quanto da diversidade genética é perdida em invasões? Múltiplas introduções atenuam essa perda? Há evidências de perda de diversidade em características quantitativas? Invasores que experimentaram gargalos fortes mostram evolução adaptativa? Como múltiplas introduções influenciam a adaptação em escala de paisagem? Revisamos estudos de 80 espécies de animais, plantas e fungos que quantificaram a diversidade molecular nuclear dentro de populações introduzidas e de origem. No geral, houve perdas significativas tanto na riqueza alélica quanto na heterozigose nas populações introduzidas, e grandes ganhos em diversidade foram raros. Evidências de múltiplas introduções estiveram associadas a maior diversidade, e a variação alélica pareceu aumentar ao longo de escalas de tempo longas (\textasciitilde 100 anos), sugerindo um papel para o fluxo gênico em aumentar a diversidade a longo prazo. Em seguida, revisamos a literatura sobre diversidade de características quantitativas e descobrimos que a variação no sentido amplo raramente declina em introduções, mas comparações diretas da variância aditiva estavam ausentes. Nossos estudos de invasões de Hypericum canariense ilustram como populações com diversidade diminuída ainda podem evoluir rapidamente. Dada a prevalência de gargalos genéticos em populações invasoras bem-sucedidas e o potencial para evolução adaptativa em características quantitativas, sugerimos que as desvantagens associadas a eventos fundadores podem ter sido exageradas. No entanto, nosso trabalho sobre o invasor bem-sucedido Verbascum thapsus ilustra como múltiplas introduções podem levar tempo para se misturar, persistindo em vez disso como um 'mosaico de maladaptação' onde as características não estão distribuídas em um padrão consistente com a adaptação. Concluímos que o gerenciamento que limita o fluxo gênico entre populações introduzidas pode reduzir o potencial adaptativo, mas é improvável que previna a expansão ou a evolução de novo comportamento invasivo.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2007.03538.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2007.03538.x",
    openalex = "W2168307546",
    references = "doi101007978940100585210, doi101016s0169534702000447, doi101016s0169534702025545, doi101146annurevecolsys32081501114037"
}

Um princípio importante da biologia evolutiva do desenvolvimento ("evo devo") é que as mutações adaptativas que afetam a morfologia são mais propensas a ocorrer nas regiões cis-reguladoras do que nas regiões de codificação de proteínas dos genes. Este argumento baseia-se em duas alegações: (1) a natureza modular dos elementos cis-reguladores liberta-os em grande parte de efeitos pleiotrópicos deletérios, e (2) um crescente corpo de evidências empíricas parece apoiar o papel predominante da mudança na regulação gênica na adaptação, especialmente na adaptação morfológica. Aqui, discutimos e criticamos estas afirmações. Primeiro, mostramos que não há base teórica ou empírica para a controvérsia evo devo de que as adaptações envolvendo morfologia evoluem por mecanismos genéticos diferentes daqueles que envolvem fisiologia e outras características. Além disso, algumas formas de evolução proteica podem evitar as consequências negativas da pleiotropia, mais notavelmente via duplicação gênica. À luz das alegações evo devo, examinamos então os dados substanciais sobre a base genética da adaptação provenientes tanto de inquéritos em todo o genoma quanto de estudos de único locus. Estudos genômicos prestam pouco apoio à teoria cis-reguladora: muitos deles detectaram adaptação em regiões de codificação de proteínas, incluindo fatores de transcrição, enquanto poucos examinaram regiões reguladoras. Voltando aos estudos de único locus, notamos que os exemplos mais amplamente citados de mutações cis-reguladoras adaptativas focam na perda de características em vez do ganho, e nenhum deles ainda identificou um sítio regulador evoluído. Em contraste, existem muitos estudos que tanto identificaram mutações estruturais quanto verificaram funcionalmente sua contribuição para a adaptação e especiação. Nem os argumentos teóricos nem os dados da natureza, portanto, apoiam a alegação de uma predominância de mutações cis-reguladoras na evolução. Embora esta alegação possa ser verdadeira, é, no máximo, prematura. A adaptação e a especiação provavelmente prosseguem através de uma combinação de mutações cis-reguladoras e estruturais, com uma contribuição substancial destas últimas.

@article{doi101111j15585646200700105x,
    author = "Hoekstra, Hopi E. e Coyne, Jerry A.",
    title = "O LÓCUS DA EVOLUÇÃO: EVO DEVO E A GENÉTICA DA ADAPTAÇÃO",
    year = "2007",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Um princípio importante da biologia evolutiva do desenvolvimento ("evo devo") é que as mutações adaptativas que afetam a morfologia são mais propensas a ocorrer nas regiões cis-reguladoras do que nas regiões de codificação de proteínas dos genes. Este argumento baseia-se em duas alegações: (1) a natureza modular dos elementos cis-reguladores liberta-os em grande parte de efeitos pleiotrópicos deletérios, e (2) um crescente corpo de evidências empíricas parece apoiar o papel predominante da mudança na regulação gênica na adaptação, especialmente na adaptação morfológica. Aqui, discutimos e criticamos estas afirmações. Primeiro, mostramos que não há base teórica ou empírica para a controvérsia evo devo de que as adaptações envolvendo morfologia evoluem por mecanismos genéticos diferentes daqueles que envolvem fisiologia e outras características. Além disso, algumas formas de evolução proteica podem evitar as consequências negativas da pleiotropia, mais notavelmente via duplicação gênica. À luz das alegações evo devo, examinamos então os dados substanciais sobre a base genética da adaptação provenientes tanto de inquéritos em todo o genoma quanto de estudos de único locus. Estudos genômicos prestam pouco apoio à teoria cis-reguladora: muitos deles detectaram adaptação em regiões de codificação de proteínas, incluindo fatores de transcrição, enquanto poucos examinaram regiões reguladoras. Voltando aos estudos de único locus, notamos que os exemplos mais amplamente citados de mutações cis-reguladoras adaptativas focam na perda de características em vez do ganho, e nenhum deles ainda identificou um sítio regulador evoluído. Em contraste, existem muitos estudos que tanto identificaram mutações estruturais quanto verificaram funcionalmente sua contribuição para a adaptação e especiação. Nem os argumentos teóricos nem os dados da natureza, portanto, apoiam a alegação de uma predominância de mutações cis-reguladoras na evolução. Embora esta alegação possa ser verdadeira, é, no máximo, prematura. A adaptação e a especiação provavelmente prosseguem através de uma combinação de mutações cis-reguladoras e estruturais, com uma contribuição substancial destas últimas.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2007.00105.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2007.00105.x",
    openalex = "W2101103652",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016s0022283661800727, doi101017s0094837300005224, doi101038366223a0, doi10103847412, doi101038nature04843, doi101038nrg2063, doi101038scientificamerican117998, doi101038sjhdy6800154, doi101073pnas0431157100, doi101073pnas7183028, doi101073pnas9794530, doi101093molbevmsg140, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j001438202004tb00462x, doi101126science1090005, doi101126science1098095, doi101126science1113832, doi101126science29054941151, doi101126science860134, doi101146annurevphysiol631359, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, doi105962bhltitle27468, openalexw3135630760"
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@article{doi101038nrg2398,
    author = "López‐Maury, Luis e Marguerat, Samuel e Bähler, Jürg",
    title = "Ajustando a expressão gênica a ambientes em mudança: de respostas rápidas à adaptação evolutiva",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2398",
    doi = "10.1038/nrg2398",
    openalex = "W2028979517",
    references = "doi101038nrg1088, doi101038nrg2063"
}

@article{doi101038nrg2452,
    author = "Phillips, Patrick C.",
    title = "Epistasis — o papel essencial das interações gênicas na estrutura e evolução dos sistemas genéticos",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2452",
    doi = "10.1038/nrg2452",
    openalex = "W2094189284",
    references = "doi1010160020711x94901198, doi101017s0080456800012163, doi101038091009b0, doi101038nature05874, doi101038nature05911, doi101038ng1537, doi101073pnas0702207104, doi101093hmg11202463, doi101111j001438202003tb00377x, doi101126science1065810, doi101126science1091317, doi101126science1123348, doi101126science1123539, doi101126science860134, doi101159000073735, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle44575, openalexw1554403518"
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Resumo A dinâmica evolutiva molda o mundo vivo ao nosso redor. No centro de todo processo evolutivo está uma população de indivíduos reprodutores. A estrutura dessa população afeta a dinâmica evolutiva. Os indivíduos podem ser moléculas, células, vírus, organismos multicelulares ou humanos. Sempre que a aptidão dos indivíduos depende da abundância relativa de fenótipos na população, estamos no domínio da teoria dos jogos evolutiva. A teoria dos jogos evolutiva é uma abordagem geral que pode descrever a competição de espécies em um ecossistema, a interação entre hospedeiros e parasitas, entre vírus e células, e também a disseminação de ideias e comportamentos na população humana. Nesta perspectiva, revisamos os avanços recentes na dinâmica de jogos evolutivos, com ênfase particular em abordagens estocásticas em populações de tamanho finito e estruturadas. Apresentamos leis simples e fundamentais que determinam como a seleção natural escolhe entre estratégias concorrentes. Estudamos a população bem misturada, a teoria dos grafos evolutivos, jogos no espaço de fenótipos e teoria dos conjuntos evolutivos. Aplicamos esses resultados à evolução da cooperação. O mecanismo que leva à evolução da cooperação nesses contextos poderia ser chamado de 'seleção espacial': cooperadores prevalecem contra defensores ao se agrupar em espaços físicos ou outros.

@article{doi101098rstb20090215,
    author = "Nowak, Martin A. e Tarnita, Corina E. e Antal, Tibor",
    title = "Dinâmica evolutiva em populações estruturadas",
    year = "2009",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Resumo A dinâmica evolutiva molda o mundo vivo ao nosso redor. No centro de todo processo evolutivo está uma população de indivíduos reprodutores. A estrutura dessa população afeta a dinâmica evolutiva. Os indivíduos podem ser moléculas, células, vírus, organismos multicelulares ou humanos. Sempre que a aptidão dos indivíduos depende da abundância relativa de fenótipos na população, estamos no domínio da teoria dos jogos evolutiva. A teoria dos jogos evolutiva é uma abordagem geral que pode descrever a competição de espécies em um ecossistema, a interação entre hospedeiros e parasitas, entre vírus e células, e também a disseminação de ideias e comportamentos na população humana. Nesta perspectiva, revisamos os avanços recentes na dinâmica de jogos evolutivos, com ênfase particular em abordagens estocásticas em populações de tamanho finito e estruturadas. Apresentamos leis simples e fundamentais que determinam como a seleção natural escolhe entre estratégias concorrentes. Estudamos a população bem misturada, a teoria dos grafos evolutivos, jogos no espaço de fenótipos e teoria dos conjuntos evolutivos. Aplicamos esses resultados à evolução da cooperação. O mecanismo que leva à evolução da cooperação nesses contextos poderia ser chamado de 'seleção espacial': cooperadores prevalecem contra defensores ao se agrupar em espaços físicos ou outros.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2009.0215",
    doi = "10.1098/rstb.2009.0215",
    openalex = "W2167637335",
    references = "doi101007bf00420631, doi101016jcub200706004, doi101023a1020504900646, doi101111j155856461977tb00991x"
}

A adaptação a uma mudança extrema súbita no ambiente, além da faixa usual de flutuações ambientais de fundo, é analisada usando um modelo genético quantitativo de plasticidade fenotípica. As gerações são discretas, com um atraso temporal tau entre um período crítico para a influência ambiental no desenvolvimento individual e a seleção natural sobre fenótipos adultos. O fenótipo ótimo e as normas de reação genotípicas são funções lineares do ambiente. A elevação e a inclinação da norma de reação (plasticidade) variam entre genótipos. Inicialmente, no ambiente de fundo médio, o caráter é canalizado com variação genética e fenotípica mínima, e sem correlação entre a elevação e a inclinação da norma de reação. A plasticidade ótima é proporcional à previsibilidade das flutuações ambientais ao longo do atraso temporal tau. Durante a primeira geração no novo ambiente, a aptidão média cai abruptamente e o fenótipo médio salta em direção ao novo fenótipo ótimo pela plasticidade. A adaptação subsequente ocorre em duas fases. A evolução rápida de plasticidade aumentada permite que o fenótipo médio se aproxime muito do novo ótimo. O novo fenótipo então sofre assimilação genética lenta, com a redução na plasticidade compensada pela evolução genética da elevação da norma de reação no ambiente original.

@article{doi101111j14209101200901754x,
    author = "Lande, Russell",
    title = "Adaptação a um ambiente extraordinário pela evolução da plasticidade fenotípica e da assimilação genética",
    year = "2009",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "A adaptação a uma mudança extrema súbita no ambiente, além da faixa usual de flutuações ambientais de fundo, é analisada usando um modelo genético quantitativo de plasticidade fenotípica. As gerações são discretas, com um atraso temporal tau entre um período crítico para a influência ambiental no desenvolvimento individual e a seleção natural sobre fenótipos adultos. O fenótipo ótimo e as normas de reação genotípicas são funções lineares do ambiente. A elevação e a inclinação da norma de reação (plasticidade) variam entre genótipos. Inicialmente, no ambiente de fundo médio, o caráter é canalizado com variação genética e fenotípica mínima, e sem correlação entre a elevação e a inclinação da norma de reação. A plasticidade ótima é proporcional à previsibilidade das flutuações ambientais ao longo do atraso temporal tau. Durante a primeira geração no novo ambiente, a aptidão média cai abruptamente e o fenótipo médio salta em direção ao novo fenótipo ótimo pela plasticidade. A adaptação subsequente ocorre em duas fases. A evolução rápida de plasticidade aumentada permite que o fenótipo médio se aproxime muito do novo ótimo. O novo fenótipo então sofre assimilação genética lenta, com a redução na plasticidade compensada pela evolução genética da elevação da norma de reação no ambiente original.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2009.01754.x",
    doi = "10.1111/j.1420-9101.2009.01754.x",
    openalex = "W2002666608",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi1010160168952596814582, doi101017s0016672300016037, doi101086276408, doi101111j001438202003tb00377x, doi101126science1157707, doi105962bhltitle84435, openalexw2416298343, openalexw2971318137"
}

@article{openalexw2611511275,
    author = "Maddison, Wayne P. e Maddison, David R.",
    title = "Mesquite: um sistema modular para análise evolutiva. Versão 2.6",
    year = "2009",
    openalex = "W2611511275"
}

@article{doi101038nrg3095,
    author = "Wittkopp, Patricia J. e Kalay, Gizem",
    title = "Elementos cis-regulatórios: mecanismos moleculares e processos evolutivos subjacentes à divergência",
    year = "2011",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3095",
    doi = "10.1038/nrg3095",
    openalex = "W2089806726",
    references = "doi101016jcell200806030, doi101038nrg2063, doi101111j15585646200700105x, doi101111j15585646200800450x, doi101126science1208227"
}

Explicar as origens de traços novos é central para a biologia evolutiva. A teoria consolidada sugere que a plasticidade do desenvolvimento, a capacidade de um indivíduo modificar seu desenvolvimento em resposta a condições ambientais, pode facilitar a evolução de traços novos. No entanto, se e como tal flexibilidade do desenvolvimento promove inovações que persistem ao longo do tempo evolutivo permanece incerto. Aqui, examinamos três maneiras distintas pelas quais a plasticidade do desenvolvimento pode promover inovação evolutiva. Primeiro, mostramos como o processo de acomodação genética fornece uma via viável e possivelmente comum pela qual fenótipos induzidos pelo ambiente podem se tornar sujeitos a modificação herdável. Segundo, postulamos que as bases do desenvolvimento da plasticidade aumentam os graus de liberdade pelos quais fatores ambientais e genéticos influenciam a ontogenia, diversificando assim os alvos para que os processos evolutivos atuem e aumentando as oportunidades para a construção de fenótipos novos, funcionais e potencialmente adaptativos. Finalmente, examinamos as arquiteturas genéticas do desenvolvimento da expressão de traços dependentes do ambiente e destacamos suas implicações específicas para a origem evolutiva de traços novos. Revisamos criticamente as evidências empíricas que suportam cada um desses processos e propomos experimentos e testes futuros que iluminariam ainda mais a interação entre fatores ambientais, desenvolvimento dependente de condições, e a iniciação e elaboração de fenótipos novos.

@article{doi101098rspb20110971,
    author = "Moczek, Armin P. e Sultan, Sonia E. e Foster, Susan A. e Ledón-Rettig, Cris C. e Dworkin, Ian e Nijhout, H. Fred e Abouheif, Ehab e Pfennig, David W.",
    title = "O papel da plasticidade do desenvolvimento na inovação evolutiva",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Explicar as origens de traços novos é central para a biologia evolutiva. A teoria consolidada sugere que a plasticidade do desenvolvimento, a capacidade de um indivíduo modificar seu desenvolvimento em resposta a condições ambientais, pode facilitar a evolução de traços novos. No entanto, se e como tal flexibilidade do desenvolvimento promove inovações que persistem ao longo do tempo evolutivo permanece incerto. Aqui, examinamos três maneiras distintas pelas quais a plasticidade do desenvolvimento pode promover inovação evolutiva. Primeiro, mostramos como o processo de acomodação genética fornece uma via viável e possivelmente comum pela qual fenótipos induzidos pelo ambiente podem se tornar sujeitos a modificação herdável. Segundo, postulamos que as bases do desenvolvimento da plasticidade aumentam os graus de liberdade pelos quais fatores ambientais e genéticos influenciam a ontogenia, diversificando assim os alvos para que os processos evolutivos atuem e aumentando as oportunidades para a construção de fenótipos novos, funcionais e potencialmente adaptativos. Finalmente, examinamos as arquiteturas genéticas do desenvolvimento da expressão de traços dependentes do ambiente e destacamos suas implicações específicas para a origem evolutiva de traços novos. Revisamos criticamente as evidências empíricas que suportam cada um desses processos e propomos experimentos e testes futuros que iluminariam ainda mais a interação entre fatores ambientais, desenvolvimento dependente de condições, e a iniciação e elaboração de fenótipos novos.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2011.0971",
    doi = "10.1098/rspb.2011.0971",
    openalex = "W2142774476",
    references = "doi101038sjhdy6800154, doi101098rstb20090263, doi101111j001438202003tb00377x, doi1023072411226"
}

@article{doi101038nrg3483,
    author = "Stern, David L.",
    title = "As causas genéticas da evolução convergente",
    year = "2013",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3483",
    doi = "10.1038/nrg3483",
    openalex = "W2046793790",
    references = "doi101016jcell200806030, doi101016jtree200709008, doi101038287795a0, doi101038nature10944, doi101038nature11041, doi101038ng1946, doi101038nrg2452, doi101073pnas9794530, doi101093acref97801995711230010001, doi101105tpc115949, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200800450x, doi101111j15585646201101289x, doi101126science1113832, doi101126science1123539, doi101126science1188021, doi101126science1208227, doi101146annurevento451371, openalexw2080618944"
}

@article{doi101038nrg3605,
    author = "Meyer, Rachel S. e Purugganan, Michael D.",
    title = "Evolução de espécies de culturas: genética da domesticação e diversificação",
    year = "2013",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3605",
    doi = "10.1038/nrg3605",
    openalex = "W2025987231",
    references = "doi101038386485a0, doi101146annureven10010165000525, doi105962bhltitle84435"
}

As espécies entram e persistem em comunidades locais devido ao seu ajuste ecológico às condições locais, e recentemente, os ecólogos passaram a medir a diversidade não apenas pela riqueza e uniformidade de espécies, mas utilizando medidas que refletem as diferenças ecológicas entre as espécies. Existem duas abordagens principais para quantificar as diferenças ecológicas entre espécies: distâncias funcionais (baseadas em traços) e distâncias filogenéticas entre pares de espécies. Ambas as abordagens produziram novos insights ecológicos, mas, ao mesmo tempo, questões metodológicas e suposições limitam-nas. Traços e filogenia podem fornecer informações diferentes, e talvez complementares, sobre as diferenças entre as espécies. Para testar adequadamente as hipóteses de montagem de comunidades, é necessário um quadro que integre as informações fornecidas por traços e filogenias. Propomos uma medida intuitiva para combinar distâncias funcionais e filogenéticas entre pares, que oferece uma maneira útil de avaliar como as distâncias funcionais e filogenéticas contribuem para a compreensão dos padrões de montagem de comunidades. Aqui, mostramos que tanto os traços quanto a filogenia informam os padrões de montagem de comunidades em comunidades de plantas alpinas ao longo de um gradiente de altitude, pois representam informações complementares. Diferenças nas pressões seletivas históricas produziram variações na força da correlação traço-filogenia, e, portanto, integrar traços e filogenia pode melhorar a capacidade de detectar padrões de montagem ao longo de habitats ou gradientes ambientais.

@article{doi101111ele12161,
    author = "Cadotte, Marc W. e Albert, Cécile H. e Walker, Steve C.",
    title = "The ecology of differences: assessing community assembly with trait and evolutionary distances",
    year = "2013",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "As espécies entram e persistem em comunidades locais devido ao seu ajuste ecológico às condições locais, e recentemente, os ecólogos passaram a medir a diversidade não apenas pela riqueza e uniformidade de espécies, mas utilizando medidas que refletem as diferenças ecológicas entre as espécies. Existem duas abordagens principais para quantificar as diferenças ecológicas entre espécies: distâncias funcionais (baseadas em traços) e distâncias filogenéticas entre pares de espécies. Ambas as abordagens produziram novos insights ecológicos, mas, ao mesmo tempo, questões metodológicas e suposições limitam-nas. Traços e filogenia podem fornecer informações diferentes, e talvez complementares, sobre as diferenças entre as espécies. Para testar adequadamente as hipóteses de montagem de comunidades, é necessário um quadro que integre as informações fornecidas por traços e filogenias. Propomos uma medida intuitiva para combinar distâncias funcionais e filogenéticas entre pares, que oferece uma maneira útil de avaliar como as distâncias funcionais e filogenéticas contribuem para a compreensão dos padrões de montagem de comunidades. Aqui, mostramos que tanto os traços quanto a filogenia informam os padrões de montagem de comunidades em comunidades de plantas alpinas ao longo de um gradiente de altitude, pois representam informações complementares. Diferenças nas pressões seletivas históricas produziram variações na força da correlação traço-filogenia, e, portanto, integrar traços e filogenia pode melhorar a capacidade de detectar padrões de montagem ao longo de habitats ou gradientes ambientais.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.12161",
    doi = "10.1111/ele.12161",
    openalex = "W2003019046",
    references = "doi101111j15585646201000960x"
}

@article{doi101007s0043801408892,
    author = "Glasauer, Stella M.K. e Neuhauss, Stephan C. F.",
    title = "Duplicação do genoma inteiro em peixes teleósteos e suas consequências evolutivas",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Genetics and Genomics",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00438-014-0889-2",
    doi = "10.1007/s00438-014-0889-2",
    openalex = "W2065636600",
    references = "doi101038nature06967, doi101038nrg2600, doi101073pnas0900906106, doi101073pnas1011803107, doi101073pnas1206625109, doi101093molbevmsn222, doi101111j15585646200700105x"
}

@article{doi101038514161a,
    author = "Laland, Kevin N. e Uller, Tobias e Feldman, Marc e Sterelny, Kim e Müller, Gerd B. e Moczek, Armin P. e Jablonka, Eva e Odling‐Smee, John e Wray, Gregory A. e Hoekstra, Hopi E. e Futuyma, Douglas J. e Lenski, Richard E. e Mackay, Trudy F. C. e Schluter, Dolph e Strassmann, Joan E.",
    title = "A teoria evolutiva precisa de uma reavaliação?",
    year = "2014",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/514161a",
    doi = "10.1038/514161a",
    openalex = "W1991285543",
    references = "doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw135071171"
}

O conservadismo de nicho filogenético (PNC) refere-se tipicamente à tendência de espécies estreitamente relacionadas de serem mais semelhantes entre si em termos de nicho do que com parentes mais distantes. Isso tem sido implicado como uma força motriz potencial na especiação e outros padrões de riqueza de espécies, como gradientes latitudinais. No entanto, o PNC não foi muito bem definido na maioria dos estudos anteriores. É um padrão ou um processo? Quais são os fatores endógenos (por exemplo, genéticos) e exógenos (por exemplo, ecológicos) subjacentes que causam a conservação de nichos? Que grau de similaridade é necessário para se qualificar como PNC? É possível que os processos evolutivos que causam a conservação de nichos também resultem em divergência de nicho em diferentes habitats? Aqui, revisitamos essas questões, codificando uma definição teórica e operacional do PNC como um processo evolutivo mecanístico resultante de vários fatores. Enquadramos isso tanto de uma perspectiva macroevolutiva quanto de genética de populações. Discutimos como diferentes eixos de heterogeneidade física (por exemplo, geográfica) e ambiental (por exemplo, climática) interagem com o processo fundamental do PNC para produzir diferentes resultados de especiação ecológica. Também revisamos testes para PNC e sugerimos maneiras pelas quais eles poderiam ser melhorados ou melhor utilizados em estudos futuros. Em última análise, o PNC como um processo tem uma base mecanística bem definida em organismos, e estudos futuros investigando especiação ecológica seriam bem servidos ao considerar isso e enquadrar o teste de hipóteses em termos dos processos e padrões esperados descritos aqui. O processo de PNC pode levar a padrões onde nichos são conservados (mais semelhantes do que o esperado), restritos (divergentes dentro de um subconjunto limitado de nichos disponíveis) ou divergentes (menos semelhantes do que o esperado), com base no grau de parentesco filogenético entre as espécies.

@article{doi101111brv12154,
    author = "Pyron, R. Alexander e Costa, Gabriel C. e Patten, Michael A. e Burbrink, Frank T.",
    title = "Conservadismo de nicho filogenético e a base evolutiva da especiação ecológica",
    year = "2014",
    journal = "Biological reviews/Revisões biológicas da Sociedade Filosófica de Cambridge",
    abstract = "O conservadismo de nicho filogenético (PNC) refere-se tipicamente à tendência de espécies estreitamente relacionadas de serem mais semelhantes entre si em termos de nicho do que com parentes mais distantes. Isso tem sido implicado como uma força motriz potencial na especiação e outros padrões de riqueza de espécies, como gradientes latitudinais. No entanto, o PNC não foi muito bem definido na maioria dos estudos anteriores. É um padrão ou um processo? Quais são os fatores endógenos (por exemplo, genéticos) e exógenos (por exemplo, ecológicos) subjacentes que causam a conservação de nichos? Que grau de similaridade é necessário para se qualificar como PNC? É possível que os processos evolutivos que causam a conservação de nichos também resultem em divergência de nicho em diferentes habitats? Aqui, revisitamos essas questões, codificando uma definição teórica e operacional do PNC como um processo evolutivo mecanístico resultante de vários fatores. Enquadramos isso tanto de uma perspectiva macroevolutiva quanto de genética de populações. Discutimos como diferentes eixos de heterogeneidade física (por exemplo, geográfica) e ambiental (por exemplo, climática) interagem com o processo fundamental do PNC para produzir diferentes resultados de especiação ecológica. Também revisamos testes para PNC e sugerimos maneiras pelas quais eles poderiam ser melhorados ou melhor utilizados em estudos futuros. Em última análise, o PNC como um processo tem uma base mecanística bem definida em organismos, e estudos futuros investigando especiação ecológica seriam bem servidos ao considerar isso e enquadrar o teste de hipóteses em termos dos processos e padrões esperados descritos aqui. O processo de PNC pode levar a padrões onde nichos são conservados (mais semelhantes do que o esperado), restritos (divergentes dentro de um subconjunto limitado de nichos disponíveis) ou divergentes (menos semelhantes do que o esperado), com base no grau de parentesco filogenético entre as espécies.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12154",
    doi = "10.1111/brv.12154",
    openalex = "W1956587275",
    references = "doi101111j15585646201000960x"
}

O fluxo gênico é um fator chave na evolução das espécies, influenciando o tamanho efetivo da população, a hibridização e a adaptação local. Analisamos o fluxo gênico local em oito grupos de carvalho-branco (principalmente Quercus petraea e Q. robur, mas também Q. pubescens e Q. faginea) distribuídos pela Europa. Árvores adultas dentro de uma área dada em cada grupo foram amostradas exaustivamente (faixa [239, 754], média 423), mapeadas, e bolotas foram coletadas ([17,147], 51) de várias árvores-mãe ([3], [47], 23). Mudas ([65,387], 178) foram colhidas e geo-referenciadas em seis dos oito grupos. Informações genéticas foram obtidas através da triagem de marcadores moleculares distintos espalhados pelo genoma, genotipagem de cada árvore, bolota ou muda. Todas as amostras foram, portanto, genotipadas em 5-8 loci de microsatélites nucleares. Pais/pais foram atribuídos a bolotas e mudas usando métodos de verossimilhança. O sucesso reprodutivo de pais masculinos e femininos, curvas de dispersão de pólen e sementes, e também taxas de hibridização foram estimados em cada grupo e comparados em escala continental. Em média, a porcentagem de pólen transportado pelo vento de fora do grupo foi de 60%, com grande variação entre grupos (21-88%). A imigração média de sementes para o grupo foi de 40%, um valor alto para carvalhos que geralmente são considerados ter dispersão de sementes limitada. No entanto, esta estimativa variou muito entre grupos (20-66%). O fluxo gênico foi principalmente intraespecífico, com grande variação, pois algumas árvores e grupos mostraram taxas particularmente altas de hibridização. Nossos resultados mostram que o sucesso reprodutivo foi distribuído de forma desigual entre as árvores. Os altos níveis de fluxo gênico sugerem que grupos de carvalho geograficamente remotos são improváveis de serem geneticamente isolados, questionando a definição estática de reservas gênicas e grupos de sementes.

@article{doi101371journalpone0085130,
    author = "Gerber, Sophie e Chadœuf, Joël e Gugerli, Félix e Lascoux, Martin e Buiteveld, J. e Cottrell, Joan e Dounavi, Aikaterini e Fineschi, Silvia e Forrest, Laura L. e Fogelqvist, Johan e Goicoechea, P. G. e Jensen, Jan Svejgaard e Salvini, Daniela e Vendramin, Giovanni G. e Kremer, Antoine",
    title = "Altas Taxas de Fluxo Gênico por Pólen e Sementes em Populações de Carvalho na Europa",
    year = "2014",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "O fluxo gênico é um fator chave na evolução das espécies, influenciando o tamanho efetivo da população, a hibridização e a adaptação local. Analisamos o fluxo gênico local em oito grupos de carvalho-branco (principalmente Quercus petraea e Q. robur, mas também Q. pubescens e Q. faginea) distribuídos pela Europa. Árvores adultas dentro de uma área dada em cada grupo foram amostradas exaustivamente (faixa [239, 754], média 423), mapeadas, e bolotas foram coletadas ([17,147], 51) de várias árvores-mãe ([3], [47], 23). Mudas ([65,387], 178) foram colhidas e geo-referenciadas em seis dos oito grupos. Informações genéticas foram obtidas através da triagem de marcadores moleculares distintos espalhados pelo genoma, genotipagem de cada árvore, bolota ou muda. Todas as amostras foram, portanto, genotipadas em 5-8 loci de microsatélites nucleares. Pais/pais foram atribuídos a bolotas e mudas usando métodos de verossimilhança. O sucesso reprodutivo de pais masculinos e femininos, curvas de dispersão de pólen e sementes, e também taxas de hibridização foram estimados em cada grupo e comparados em escala continental. Em média, a porcentagem de pólen transportado pelo vento de fora do grupo foi de 60%, com grande variação entre grupos (21-88%). A imigração média de sementes para o grupo foi de 40%, um valor alto para carvalhos que geralmente são considerados ter dispersão de sementes limitada. No entanto, esta estimativa variou muito entre grupos (20-66%). O fluxo gênico foi principalmente intraespecífico, com grande variação, pois algumas árvores e grupos mostraram taxas particularmente altas de hibridização. Nossos resultados mostram que o sucesso reprodutivo foi distribuído de forma desigual entre as árvores. Os altos níveis de fluxo gênico sugerem que grupos de carvalho geograficamente remotos são improváveis de serem geneticamente isolados, questionando a definição estática de reservas gênicas e grupos de sementes.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0085130",
    doi = "10.1371/journal.pone.0085130",
    openalex = "W2092712028",
    references = "doi101111j1365294x200904137x"
}

A diversidade genética de nossas plantas cultivadas foi substancialmente reduzida durante o processo de domesticação e melhoramento. Essa redução na diversidade limita necessariamente nossa capacidade de expandir a área de cultivo de uma cultura para ambientes mais extremos do que aqueles em que ela foi domesticada, incluindo em sistemas agrícolas "sustentáveis" com redução na entrada de pesticidas, água e fertilizantes. Por outro lado, os progenitores selvagens das plantas cultivadas geralmente possuem altos níveis de diversidade genética, que sustentam uma gama expandida (em relação às cultivares) de características adaptativas que podem ser relevantes para a agricultura, incluindo resistência a pragas e patógenos, tolerância a extremos abióticos e redução da dependência de insumos. Apesar de seu claro potencial para o melhoramento de culturas, parentes selvagens raramente têm sido usados sistematicamente para o melhoramento de culturas e, em nenhum caso, conjuntos completos de diversidade selvagem foram introgressados em uma cultura. Em vez disso, a maioria dos esforços de melhoramento concentrou-se em características específicas e lidou com espécies selvagens de forma limitada e tipicamente ad hoc. Embora conveniente, essa abordagem perde a oportunidade de testar um grande conjunto de características e explorar todo o potencial de parentes selvagens de culturas no melhoramento para os desafios iminentes do século XXI. Aqui, revisamos exemplos de hibridização em várias espécies, tanto intencionalmente produzidas quanto naturalmente ocorridas, para ilustrar os ganhos possíveis. Começamos com híbridos naturalmente ocorridos e, em seguida, examinamos uma variedade de exemplos de hibridização em ambientes agrícolas.

@article{doi103732ajb1400116,
    author = "Warschefsky, Emily e Penmetsa, R. Varma e Cook, Douglas R. e von Wettberg, Eric",
    title = "Back to the wilds: Tapping evolutionary adaptations for resilient crops through systematic hybridization with crop wild relatives",
    year = "2014",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = {A diversidade genética de nossas plantas cultivadas foi substancialmente reduzida durante o processo de domesticação e melhoramento. Essa redução na diversidade limita necessariamente nossa capacidade de expandir a área de cultivo de uma cultura para ambientes mais extremos do que aqueles em que ela foi domesticada, incluindo em sistemas agrícolas "sustentáveis" com redução na entrada de pesticidas, água e fertilizantes. Por outro lado, os progenitores selvagens das plantas cultivadas geralmente possuem altos níveis de diversidade genética, que sustentam uma gama expandida (em relação às cultivares) de características adaptativas que podem ser relevantes para a agricultura, incluindo resistência a pragas e patógenos, tolerância a extremos abióticos e redução da dependência de insumos. Apesar de seu claro potencial para o melhoramento de culturas, parentes selvagens raramente têm sido usados sistematicamente para o melhoramento de culturas e, em nenhum caso, conjuntos completos de diversidade selvagem foram introgressados em uma cultura. Em vez disso, a maioria dos esforços de melhoramento concentrou-se em características específicas e lidou com espécies selvagens de forma limitada e tipicamente ad hoc. Embora conveniente, essa abordagem perde a oportunidade de testar um grande conjunto de características e explorar todo o potencial de parentes selvagens de culturas no melhoramento para os desafios iminentes do século XXI. Aqui, revisamos exemplos de hibridização em várias espécies, tanto intencionalmente produzidas quanto naturalmente ocorridas, para ilustrar os ganhos possíveis. Começamos com híbridos naturalmente ocorridos e, em seguida, examinamos uma variedade de exemplos de hibridização em ambientes agrícolas.},
    url = "https://doi.org/10.3732/ajb.1400116",
    doi = "10.3732/ajb.1400116",
    openalex = "W2027144299",
    references = "doi101111evo12399"
}

A evolução da vida na Terra tem sido impulsionada por um pequeno número de transições evolutivas principais. Essas transições têm sido caracterizadas por indivíduos que anteriormente podiam se replicar independentemente, cooperando para formar uma nova forma de vida mais complexa. Por exemplo, arqueias e eubactérias formaram células eucarióticas, e células formaram organismos multicelulares. No entanto, nem todos os grupos cooperativos estão a caminho de transições principais. Como podemos explicar por que as transições evolutivas principais ocorreram ou não ocorreram em diferentes ramos da árvore da vida? Dividimos as transições principais em dois passos: a formação de um grupo cooperativo e a transformação desse grupo em uma entidade integrada. Mostramos como esses passos requerem cooperação, divisão do trabalho, comunicação, dependência mútua e conflito dentro do grupo negligenciável. Descobrimos que certas condições ecológicas e as formas como os grupos se formaram desempenharam papéis recorrentes na condução de múltiplas transições. Em contraste, descobrimos que outros fatores desempenharam papéis relativamente menores em muitos pontos-chave, como discriminação de parentesco dentro do grupo e mecanismos para ativamente reprimir a competição. De forma mais geral, ao identificar o pequeno número de fatores que impulsionaram as transições principais, fornecemos uma descrição mais simples e unificada de como a vida na Terra evoluiu.

@article{doi101073pnas1421402112,
    author = "West, Stuart A. e Fisher, Roberta M. e Gardner, Andy e Kiers, E. Toby",
    title = "Transições evolutivas principais na individualidade",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "A evolução da vida na Terra tem sido impulsionada por um pequeno número de transições evolutivas principais. Essas transições têm sido caracterizadas por indivíduos que anteriormente podiam se replicar independentemente, cooperando para formar uma nova forma de vida mais complexa. Por exemplo, arqueias e eubactérias formaram células eucarióticas, e células formaram organismos multicelulares. No entanto, nem todos os grupos cooperativos estão a caminho de transições principais. Como podemos explicar por que as transições evolutivas principais ocorreram ou não ocorreram em diferentes ramos da árvore da vida? Dividimos as transições principais em dois passos: a formação de um grupo cooperativo e a transformação desse grupo em uma entidade integrada. Mostramos como esses passos requerem cooperação, divisão do trabalho, comunicação, dependência mútua e conflito dentro do grupo negligenciável. Descobrimos que certas condições ecológicas e as formas como os grupos se formaram desempenharam papéis recorrentes na condução de múltiplas transições. Em contraste, descobrimos que outros fatores desempenharam papéis relativamente menores em muitos pontos-chave, como discriminação de parentesco dentro do grupo e mecanismos para ativamente reprimir a competição. De forma mais geral, ao identificar o pequeno número de fatores que impulsionaram as transições principais, fornecemos uma descrição mais simples e unificada de como a vida na Terra evoluiu.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1421402112",
    doi = "10.1073/pnas.1421402112",
    openalex = "W2160332754",
    references = "doi101098rstb20090095, doi101111j14209101200801681x, doi101146annurevecolsys36102403114735"
}

As atividades científicas ocorrem dentro de conjuntos estruturados de ideias e pressupostos que definem um campo e suas práticas. O quadro conceitual da biologia evolutiva emergiu com a Síntese Moderna no início do século XX e, desde então, expandiu-se em um programa de pesquisa altamente bem-sucedido para explorar os processos de diversificação e adaptação. No entanto, a capacidade desse quadro de acomodar satisfatoriamente os avanços rápidos na biologia do desenvolvimento, genômica e ecologia tem sido questionada. Revisamos alguns desses argumentos, focando em literaturas (evo-devo, plasticidade do desenvolvimento, herança inclusiva e construção de nicho) cujas implicações para a evolução podem ser interpretadas de duas maneiras: uma que preserva a estrutura interna da teoria evolutiva contemporânea e outra que aponta para um quadro conceitual alternativo. Esta última, que rotulamos como 'síntese evolutiva estendida' (SEE), mantém os fundamentos da teoria evolutiva, mas difere em sua ênfase no papel dos processos construtivos no desenvolvimento e na evolução, e nas representações recíprocas da causalidade. Na SEE, os processos de desenvolvimento, operando por meio de viés de desenvolvimento, herança inclusiva e construção de nicho, compartilham a responsabilidade pela direção e taxa da evolução, a origem da variação de caracteres e a complementaridade organismo-ambiente. Esclarecemos a estrutura, os pressupostos centrais e as previsões novas da SEE, e mostramos como ela pode ser empregada para estimular e avançar a pesquisa nesses campos que estudam ou utilizam a biologia evolutiva.

@article{doi101098rspb20151019,
    author = "Laland, Kevin N. e Uller, Tobias e Feldman, Marcus W. e Sterelny, Kim e Müller, Gerd B. e Moczek, Armin P. e Jablonka, Eva e Odling‐Smee, John",
    title = "A síntese evolutiva estendida: sua estrutura, pressupostos e previsões",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "As atividades científicas ocorrem dentro de conjuntos estruturados de ideias e pressupostos que definem um campo e suas práticas. O quadro conceitual da biologia evolutiva emergiu com a Síntese Moderna no início do século XX e, desde então, expandiu-se em um programa de pesquisa altamente bem-sucedido para explorar os processos de diversificação e adaptação. No entanto, a capacidade desse quadro de acomodar satisfatoriamente os avanços rápidos na biologia do desenvolvimento, genômica e ecologia tem sido questionada. Revisamos alguns desses argumentos, focando em literaturas (evo-devo, plasticidade do desenvolvimento, herança inclusiva e construção de nicho) cujas implicações para a evolução podem ser interpretadas de duas maneiras: uma que preserva a estrutura interna da teoria evolutiva contemporânea e outra que aponta para um quadro conceitual alternativo. Esta última, que rotulamos como 'síntese evolutiva estendida' (SEE), mantém os fundamentos da teoria evolutiva, mas difere em sua ênfase no papel dos processos construtivos no desenvolvimento e na evolução, e nas representações recíprocas da causalidade. Na SEE, os processos de desenvolvimento, operando por meio de viés de desenvolvimento, herança inclusiva e construção de nicho, compartilham a responsabilidade pela direção e taxa da evolução, a origem da variação de caracteres e a complementaridade organismo-ambiente. Esclarecemos a estrutura, os pressupostos centrais e as previsões novas da SEE, e mostramos como ela pode ser empregada para estimular e avançar a pesquisa nesses campos que estudam ou utilizam a biologia evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2015.1019",
    doi = "10.1098/rspb.2015.1019",
    openalex = "W2103794982",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511621123, doi101038218525a0, doi10106313050879, doi101086346135, doi101093auk1002507, doi101093oso97801951223430010001, doi101111j155856461982tb05068x, doi101126science1113832, doi101146annureves01110170000245, doi1015159780691209418, doi1015159781400847266, doi1023071367778, doi1023072260026, doi102307jctvjsf433, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice364478, doi105860choice396411, doi105962bhltitle27468, doi107208chicago97802263088830010001, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw2080618944, openalexw227636185"
}

Estudos recentes geraram uma explosão de dados filogenéticos e biogeográficos e forneceram novas ferramentas para investigar os processos que impulsionam gradientes em grande escala na diversidade de espécies. Fósseis e estudos filogenéticos de plantas e animais demonstram que as regiões tropicais são a fonte para quase todos os grupos de organismos, e esses grupos são compostos por uma mistura de linhagens antigas e recentemente derivadas. Essas descobertas são consistentes com a hipótese de que a grande extensão de ambientes tropicais durante os últimos 10–50 milhões de anos, juntamente com uma maior estabilidade climática, promoveu a especiação e reduziu as taxas de extinção. A disponibilidade de energia parece contribuir apenas indiretamente para os padrões globais de diversidade de espécies, especialmente considerando como alguns gradientes de diversidade marinha podem estar completamente desacoplados de gradientes de temperatura e produtividade. Em vez disso, a estabilidade climática e a área integrada ao tempo determinam juntos as bases tanto dos padrões globais de diversidade terrestre quanto marinha. Interações bióticas provavelmente aumentam a diversificação e a coexistência nos trópicos.

@article{doi101146annurevecolsys112414054102,
    author = "Fine, Paul V. A.",
    title = "Drivers Ecológicos e Evolutivos da Variação Geográfica na Diversidade de Espécies",
    year = "2015",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Estudos recentes geraram uma explosão de dados filogenéticos e biogeográficos e forneceram novas ferramentas para investigar os processos que impulsionam gradientes em grande escala na diversidade de espécies. Fósseis e estudos filogenéticos de plantas e animais demonstram que as regiões tropicais são a fonte para quase todos os grupos de organismos, e esses grupos são compostos por uma mistura de linhagens antigas e recentemente derivadas. Essas descobertas são consistentes com a hipótese de que a grande extensão de ambientes tropicais durante os últimos 10–50 milhões de anos, juntamente com uma maior estabilidade climática, promoveu a especiação e reduziu as taxas de extinção. A disponibilidade de energia parece contribuir apenas indiretamente para os padrões globais de diversidade de espécies, especialmente considerando como alguns gradientes de diversidade marinha podem estar completamente desacoplados de gradientes de temperatura e produtividade. Em vez disso, a estabilidade climática e a área integrada ao tempo determinam juntos as bases tanto dos padrões globais de diversidade terrestre quanto marinha. Interações bióticas provavelmente aumentam a diversificação e a coexistência nos trópicos.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-112414-054102",
    doi = "10.1146/annurev-ecolsys-112414-054102",
    openalex = "W1908440753",
    references = "doi101007s116920129171x, doi101016jtree201309012, doi101016s003101829600096x, doi101038nature11631, doi101038nature14324, doi101073pnas0709472105, doi101086282687, doi101086680850, doi101093sysbiosyu131, doi101111j13652699201002375x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j15585646201000960x, doi101126science2304728895, doi101146annurevecolsys110512135800, doi101146annurevecolsys120213091905, doi101146annurevecolsys33010802150448, doi101371journalpbio1001775, doi101641b570707, doi101666090211, doi1023073071998, doi105860choice332720, doi105860choice485062"
}

@article{doi101038nrg201534,
    author = "Champer, Jackson e Buchman, Anna e Akbari, Omar S.",
    title = "Cheating evolução: engenharia de drives gênicos para manipular o destino de populações selvagens",
    year = "2016",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg.2015.34",
    doi = "10.1038/nrg.2015.34",
    openalex = "W2263233808",
    references = "alpheyNoneinsect, doi101146annurevento011613162002"
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A hibridização e suas consequências têm sido de interesse de longa data para biólogos evolutivos. Darwin (1859) incluiu um capítulo sobre híbridos e a expressão e causas da esterilidade híbrida em The Origin of Species, enquanto os principais defensores da síntese neodarwiniana discutiram o tópico em comprimentos variados na década de 1950 (

@article{doi101111mec13685,
    author = "Abbott, Richard J. e Barton, Nick e Good, Jeffrey M.",
    title = "Genômica da hibridização e suas consequências evolutivas",
    year = "2016",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "A hibridização e suas consequências têm sido de interesse de longa data para biólogos evolutivos. Darwin (1859) incluiu um capítulo sobre híbridos e a expressão e causas da esterilidade híbrida em The Origin of Species, enquanto os principais defensores da síntese neodarwiniana discutiram o tópico em comprimentos variados na década de 1950 (",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13685",
    doi = "10.1111/mec.13685",
    openalex = "W2345350775",
    references = "doi101016jppees201002002"
}

@article{doi101016jtree201711007,
    author = "Struck, Torsten H. e Feder, Jeffrey L. e Bendiksby, Mika e Birkeland, Siri e Cerca, José e Gusarov, Vladimir I. e Kistenich, Sonja e Larsson, Karl‐Henrik e Liow, Lee Hsiang e Nowak, Michael e Stedje, Brita e Bachmann, Lutz e Dimitrov, Dimitar",
    title = "Finding Evolutionary Processes Hidden in Cryptic Species",
    year = "2017",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.11.007",
    doi = "10.1016/j.tree.2017.11.007",
    openalex = "W2773211227",
    references = "doi101016jtree201109002, doi101073pnas1403662111, doi101073pnas1607921114, doi101111j15585646201000960x"
}

Os traços culturais humanos — comportamentos, ideias e tecnologias que podem ser aprendidos de outros indivíduos — podem exibir padrões complexos de transmissão e evolução, e os pesquisadores desenvolveram modelos teóricos, tanto verbais quanto matemáticos, para facilitar nossa compreensão desses padrões. Muitos dos primeiros modelos quantitativos da evolução cultural foram modificados a partir de conceitos existentes na genética de populações teórica, pois a evolução cultural tem muitas paralelas com, bem como diferenças claras da, evolução genética. Além disso, a evolução cultural e genética podem interagir entre si e influenciar tanto a transmissão quanto a seleção. Essa interação requer tratamentos teóricos da coevolução gene-cultura e da herança dupla, além da evolução cultural pura. Além disso, a teoria da evolução cultural é um componente natural de estudos em demografia, ecologia humana e muitas outras disciplinas. Aqui, revisamos os conceitos centrais na teoria da evolução cultural conforme se referem à extensão da biologia através da cultura, focando nas aplicações da evolução cultural em genética de populações, ecologia e demografia. Para cada uma dessas disciplinas, revisamos a literatura teórica e destacamos estudos empíricos relevantes. Também discutimos as implicações sociais do estudo da evolução cultural e das interações dos humanos uns com os outros e com seu ambiente.

@article{doi101073pnas1620732114,
    author = "Creanza, Nicole e Kolodny, Oren e Feldman, Marcus W.",
    title = "Teoria da evolução cultural: Como a cultura evolui e por que isso importa",
    year = "2017",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Os traços culturais humanos — comportamentos, ideias e tecnologias que podem ser aprendidos de outros indivíduos — podem exibir padrões complexos de transmissão e evolução, e os pesquisadores desenvolveram modelos teóricos, tanto verbais quanto matemáticos, para facilitar nossa compreensão desses padrões. Muitos dos primeiros modelos quantitativos da evolução cultural foram modificados a partir de conceitos existentes na genética de populações teórica, pois a evolução cultural tem muitas paralelas com, bem como diferenças claras da, evolução genética. Além disso, a evolução cultural e genética podem interagir entre si e influenciar tanto a transmissão quanto a seleção. Essa interação requer tratamentos teóricos da coevolução gene-cultura e da herança dupla, além da evolução cultural pura. Além disso, a teoria da evolução cultural é um componente natural de estudos em demografia, ecologia humana e muitas outras disciplinas. Aqui, revisamos os conceitos centrais na teoria da evolução cultural conforme se referem à extensão da biologia através da cultura, focando nas aplicações da evolução cultural em genética de populações, ecologia e demografia. Para cada uma dessas disciplinas, revisamos a literatura teórica e destacamos estudos empíricos relevantes. Também discutimos as implicações sociais do estudo da evolução cultural e das interações dos humanos uns com os outros e com seu ambiente.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1620732114",
    doi = "10.1073/pnas.1620732114",
    openalex = "W2737859984",
    references = "doi101002evan20181, doi101002sici1520650520009251aidevan130co27, doi1010079781475729177, doi101007bf02207996, doi101017s0140525x0100396x, doi101017s0140525x06009083, doi101086300102, doi101093biomet333183, doi101126science1170165, doi101126science1185231, doi101257aer91273, doi1015159781400847266, doi101537ase188722495, doi1023071367778, doi1023072485224, doi1023072669574, doi104324978020371075335"
}

Um sistema de gene drive funcional poderia mudar fundamentalmente nossas estratégias para o controle de doenças transmitidas por vetores, facilitando a disseminação rápida de transgenes que previnem a transmissão de patógenos ou reduzem a capacidade do vetor. O gene drive CRISPR/Cas9 promete tal mecanismo, que funciona convertendo células que são heterozigotas para o construto de drive em homozigotos, permitindo assim uma herança super-Mendeliana. Embora a atividade de gene drive CRISPR já tenha sido demonstrada, um obstáculo chave para os sistemas atuais é sua propensão a gerar alelos de resistência, que não podem ser convertidos em alelos de drive. Neste estudo, desenvolvemos dois construtos de gene drive CRISPR baseados nos promotores nanos e vasa que nos permitiram elucidar os diferentes mecanismos pelos quais os alelos de resistência são formados no organismo modelo Drosophila melanogaster. Observamos a formação de alelos de resistência em altas taxas tanto antes da fertilização na linhagem germinativa quanto após a fertilização no embrião devido ao Cas9 depositado maternamente. A avaliação da atividade de drive em fundos geneticamente diversos revelou ainda diferenças substanciais na eficiência de conversão e nas taxas de resistência. Nossos resultados demonstram que a evolução da resistência provavelmente imporá uma limitação severa à eficácia das atuais abordagens de gene drive CRISPR, especialmente quando aplicadas a populações naturais diversas.

@article{doi101371journalpgen1006796,
    author = "Champer, Jackson e Reeves, Riona e Oh, Suh Yeon e Liu, Chen e Liu, Jingxian e Clark, Andrew G. e Messer, Philipp W.",
    title = "Novos construtos de gene drive CRISPR/Cas9 revelam insights sobre os mecanismos de formação de alelos de resistência e eficiência de drive em populações geneticamente diversas",
    year = "2017",
    journal = "PLoS Genetics",
    abstract = "Um sistema de gene drive funcional poderia mudar fundamentalmente nossas estratégias para o controle de doenças transmitidas por vetores, facilitando a disseminação rápida de transgenes que previnem a transmissão de patógenos ou reduzem a capacidade do vetor. O gene drive CRISPR/Cas9 promete tal mecanismo, que funciona convertendo células que são heterozigotas para o construto de drive em homozigotos, permitindo assim uma herança super-Mendeliana. Embora a atividade de gene drive CRISPR já tenha sido demonstrada, um obstáculo chave para os sistemas atuais é sua propensão a gerar alelos de resistência, que não podem ser convertidos em alelos de drive. Neste estudo, desenvolvemos dois construtos de gene drive CRISPR baseados nos promotores nanos e vasa que nos permitiram elucidar os diferentes mecanismos pelos quais os alelos de resistência são formados no organismo modelo Drosophila melanogaster. Observamos a formação de alelos de resistência em altas taxas tanto antes da fertilização na linhagem germinativa quanto após a fertilização no embrião devido ao Cas9 depositado maternamente. A avaliação da atividade de drive em fundos geneticamente diversos revelou ainda diferenças substanciais na eficiência de conversão e nas taxas de resistência. Nossos resultados demonstram que a evolução da resistência provavelmente imporá uma limitação severa à eficácia das atuais abordagens de gene drive CRISPR, especialmente quando aplicadas a populações naturais diversas.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006796",
    doi = "10.1371/journal.pgen.1006796",
    openalex = "W2950981781",
    references = "doi101146annurevento011613162002"
}

As abordagens atuais para a conservação da biodiversidade baseiam-se principalmente em áreas geográficas, ecossistemas, comunidades ecológicas e espécies, com menos atenção à diversidade genética e ao continuum evolutivo das populações para as espécies. A gestão da conservação geralmente repousa em categorias discretas, como espécies identificadas, e, para táxons ameaçados, unidades intraespecíficas. As espécies, em particular, fornecem uma medida comum da biodiversidade, mas tanto na teoria quanto na natureza, a especiação é tipicamente um processo prolongado que progride de populações conectadas a espécies inequívocas com taxas variáveis de divergência fenotípica, ecológica e genética. Assim, a maioria das espécies reconhecidas não é geneticamente uniforme e, por vezes, é altamente estruturada em populações historicamente isoladas dignas de consideração como unidades intraespecíficas que representam diversidade genética única para a conservação. Telas genômicas oferecem resolução sem precedentes da estrutura através de fronteiras taxonômicas em complexos de espécies e têm o potencial de sobredividir espécies se não forem interpretadas de forma conservadora. Isso destaca a linha tênue entre populações e espécies e pode confundir dicotomias simples de 'espécie' versus 'não espécie'. Ao mesmo tempo, como as plantas, há evidências crescentes de que até mesmo espécies animais distantly relacionadas podem hibridizar e trocar genes. Uma revisão da legislação de conservação revela que as definições legais de 'espécie' são bastante flexíveis e podem acomodar uma gama de táxons infraespecíficos e populações divergentes, bem como espécies reconhecidas taxonomicamente. Por exemplo, a definição legislativa de uma espécie em todo o mundo pode incluir: espécies, subespécies, variedades e populações geograficamente e/ou geneticamente distintas. Em princípio, essa flexibilidade permite a proteção da diversidade genética e a manutenção de processos evolutivos em uma ampla gama de níveis infraespecíficos. No entanto, biólogos evolutivos frequentemente falham em justificar adequadamente e, em seguida, traduzir suas evidências para unidades geneticamente definidas em categorias adequadas para avaliação sob legislação local. Recomendamos que (i). os dados genômicos sejam interpretados de forma conservadora ao nomear formalmente espécies, (ii). concomitantemente, haja um impulso mais forte e uma abordagem mais uniforme para identificar unidades intraespecíficas claramente justificadas, (iii). sejam desenvolvidas diretrizes para reconhecer e rotular dados intraespecíficos que se alinhem com as melhores práticas científicas, e (iv). que a visão mais matizada de espécies e especiação emergente das análises genômicas seja comunicada mais eficazmente pelos cientistas aos tomadores de decisão.

@article{doi103389fevo201800165,
    author = "Coates, David and Byrne, Margaret and Moritz, Craig",
    title = "Diversidade Genética e Unidades de Conservação: Lidando com o Continuum Espécie-População na Era da Genômica",
    year = "2018",
    journal = "Frontiers in Ecology and Evolution",
    abstract = "As abordagens atuais para a conservação da biodiversidade baseiam-se principalmente em áreas geográficas, ecossistemas, comunidades ecológicas e espécies, com menos atenção à diversidade genética e ao continuum evolutivo das populações para as espécies. A gestão da conservação geralmente repousa em categorias discretas, como espécies identificadas, e, para táxons ameaçados, unidades intraespecíficas. As espécies, em particular, fornecem uma medida comum da biodiversidade, mas tanto na teoria quanto na natureza, a especiação é tipicamente um processo prolongado que progride de populações conectadas a espécies inequívocas com taxas variáveis de divergência fenotípica, ecológica e genética. Assim, a maioria das espécies reconhecidas não é geneticamente uniforme e, às vezes, é altamente estruturada em populações historicamente isoladas dignas de consideração como unidades intraespecíficas que representam diversidade genética única para a conservação. Telas genômicas oferecem resolução sem precedentes da estrutura através das fronteiras taxonômicas em complexos de espécies e têm o potencial de superdividir espécies se não forem interpretadas de forma conservadora. Isso destaca a linha tênue entre populações e espécies e pode confundir dicotomias simples de 'espécie' versus 'não espécie'. Ao mesmo tempo, como as plantas, há evidências crescentes de que até mesmo espécies animais distantly relacionadas podem hibridizar e trocar genes. Uma revisão da legislação de conservação revela que as definições legais de 'espécie' são bastante flexíveis e podem acomodar uma gama de táxons infraespecíficos e populações divergentes, bem como espécies reconhecidas taxonomicamente. Por exemplo, a definição legislativa de uma espécie em todo o mundo pode incluir: espécies, subespécies, variedades e populações geograficamente e/ou geneticamente distintas. Em princípio, essa flexibilidade permite a proteção da diversidade genética e a manutenção de processos evolutivos em uma ampla gama de níveis infraespecíficos. No entanto, biólogos evolutivos frequentemente falham em justificar adequadamente e, em seguida, traduzir suas evidências para unidades geneticamente definidas em categorias adequadas para avaliação sob legislação local. Recomendamos que (i). os dados genômicos sejam interpretados de forma conservadora ao nomear formalmente espécies, (ii). concomitantemente, haja um impulso mais forte e uma abordagem mais uniforme para identificar unidades intraespecíficas claramente justificadas, (iii). sejam desenvolvidas diretrizes para reconhecer e rotular dados intraespecíficos que se alinhem com as melhores práticas científicas, e (iv). que a visão mais matizada de espécies e especiação emergente das análises genômicas seja comunicada mais eficazmente pelos cientistas aos tomadores de decisão.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fevo.2018.00165",
    doi = "10.3389/fevo.2018.00165",
    openalex = "W2897004916",
    references = "doi101007s116920129171x, doi1010160006320792912013, doi1010160169534794900574, doi101016jcub201709047, doi101016jtree200611004, doi101016jtree200901009, doi101016s0169534700018760, doi101073pnas1607921114, doi10108010635150701701083, doi101111j10958312200500503x, doi101111j1365294x200703529x, doi101146annurevento112408085432, doi101146annureves18110187002421, doi10118617429994716"
}

@article{doi101038s415590180777y,
    author = "Taylor, Scott A. e Larson, Erica L.",
    title = "Insights from genomes into the evolutionary importance and prevalence of hybridization in nature",
    year = "2019",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41559-018-0777-y",
    doi = "10.1038/s41559-018-0777-y",
    openalex = "W2911246394",
    references = "doi101038nature05706, doi101038ncomms14363, doi101111evo12399, doi101111j14209101201202599x, doi101111mec12415"
}

Existem crescentes evidências de que as paisagens antropogênicas podem influenciar fortemente a evolução da dispersão, particularmente através da fragmentação, e podem levar os organismos a uma armadilha evolutiva ao suprimir a dispersão. No entanto, a influência da variação antropogênica na taxa de renovação de manchas de habitat sobre a evolução da dispersão tem sido, até agora, largamente ignorada. Neste estudo, examinamos como a variação impulsionada pelo ser humano na persistência de manchas afeta as taxas e distâncias de dispersão, determina a especialização fenotípica relacionada à dispersão e impulsiona a estrutura genética neutra em populações estruturadas espacialmente. Abordamos essa questão em um anfíbio, Bombina variegata, utilizando uma abordagem integrativa que combina modelagem de captura-recaptura, simulação demográfica, experimentos de jardim comum e genética de populações. B. variegata reproduz-se em pequenas lagoas que ocorrem tanto em manchas de habitat persistentes (ou seja, várias décadas ou mais), localizadas em ambientes fluviais com atividade humana negligenciável, quanto em manchas altamente temporárias (ou seja, alguns anos), criadas por operações de desmatamento em florestas intensamente exploradas. Nossos modelos de captura-recaptura revelaram que as taxas e distâncias de dispersão natalícia e reprodutiva foram drasticamente maiores em populações estruturadas espacialmente (PSE) em ambientes de desmatamento do que em PSE fluviais. Simulações populacionais adicionais mostraram que os custos e benefícios da dispersão determinam o destino das PSE de desmatamento, que não podem persistir sem dispersão. Os experimentos de jardim comum revelaram que os girinos criados em condições laboratoriais apresentam especialização morfológica e comportamental que depende de seu habitat de origem. Os girinos provenientes de PSE de desmatamento foram encontrados a ter maior ousadia e propensão à exploração do que aqueles provenientes de PSE fluviais, indicando síndromes de dispersão transmitidas transgeracionalmente. Também encontramos padrões contrastantes de diversidade genética neutra e fluxo gênico em PSE fluviais e de desmatamento, com diversidade genética e tamanho efetivo da população consideravelmente maiores em PSE de desmatamento do que em PSE fluviais. Em paralelo, os níveis de endogamia e parentesco intra-mancha foram menores em PSE de desmatamento. Controlando o efeito da deriva genética e da conectividade da paisagem, o fluxo gênico foi encontrado ser maior em PSE de desmatamento do que em PSE fluviais. Em conjunto, esses resultados indicam que a variação antropogênica na taxa de renovação de manchas de habitat pode ter um efeito pelo menos tão importante quanto a fragmentação da paisagem na evolução da dispersão e na viabilidade a longo prazo e estrutura genética de populações selvagens.

@misc{cayuela2020anthropogenic,
    author = "Cayuela, Hugo",
    title = "Anthropogenic disturbance drives dispersal syndromes, demography, and gene flow in amphibian populations",
    year = "2020",
    publisher = "Dryad",
    abstract = "Existem crescentes evidências de que as paisagens antropogênicas podem influenciar fortemente a evolução da dispersão, particularmente através da fragmentação, e podem levar os organismos a uma armadilha evolutiva ao suprimir a dispersão. No entanto, a influência da variação antropogênica na taxa de renovação de manchas de habitat sobre a evolução da dispersão tem sido, até agora, largamente ignorada. Neste estudo, examinamos como a variação impulsionada pelo ser humano na persistência de manchas afeta as taxas e distâncias de dispersão, determina a especialização fenotípica relacionada à dispersão e impulsiona a estrutura genética neutra em populações estruturadas espacialmente. Abordamos essa questão em um anfíbio, Bombina variegata, utilizando uma abordagem integrativa que combina modelagem de captura-recaptura, simulação demográfica, experimentos de jardim comum e genética de populações. B. variegata reproduz-se em pequenas lagoas que ocorrem tanto em manchas de habitat persistentes (ou seja, várias décadas ou mais), localizadas em ambientes fluviais com atividade humana negligenciável, quanto em manchas altamente temporárias (ou seja, alguns anos), criadas por operações de desmatamento em florestas intensamente exploradas. Nossos modelos de captura-recaptura revelaram que as taxas e distâncias de dispersão natalícia e reprodutiva foram drasticamente maiores em populações estruturadas espacialmente (PSE) em ambientes de desmatamento do que em PSE fluviais. Simulações populacionais adicionais mostraram que os custos e benefícios da dispersão determinam o destino das PSE de desmatamento, que não podem persistir sem dispersão. Os experimentos de jardim comum revelaram que os girinos criados em condições laboratoriais apresentam especialização morfológica e comportamental que depende de seu habitat de origem. Os girinos provenientes de PSE de desmatamento foram encontrados a ter maior ousadia e propensão à exploração do que aqueles provenientes de PSE fluviais, indicando síndromes de dispersão transmitidas transgeracionalmente. Também encontramos padrões contrastantes de diversidade genética neutra e fluxo gênico em PSE fluviais e de desmatamento, com diversidade genética e tamanho efetivo da população consideravelmente maiores em PSE de desmatamento do que em PSE fluviais. Em paralelo, os níveis de endogamia e parentesco intra-mancha foram menores em PSE de desmatamento. Controlando o efeito da deriva genética e da conectividade da paisagem, o fluxo gênico foi encontrado ser maior em PSE de desmatamento do que em PSE fluviais. Em conjunto, esses resultados indicam que a variação antropogênica na taxa de renovação de manchas de habitat pode ter um efeito pelo menos tão importante quanto a fragmentação da paisagem na evolução da dispersão e na viabilidade a longo prazo e estrutura genética de populações selvagens.",
    url = "https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.q83bk3jdz",
    doi = "10.5061/dryad.q83bk3jdz"
}

Resumo A perda de biodiversidade está entre os maiores problemas que o mundo enfrenta hoje. Conservation and the Genomics of Populations oferece uma visão geral abrangente do conhecimento de base essencial, conceitos e ferramentas necessários para entender como as informações genéticas podem ser utilizadas para conservar espécies ameaçadas de extinção e para gerenciar espécies de importância ecológica ou comercial. Novas técnicas moleculares, métodos estatísticos e programas de computador, princípios genéticos e métodos estão se tornando cada vez mais úteis na conservação da diversidade biológica. Usando um equilíbrio de dados e teoria, juntamente com exemplos de pesquisa básica e aplicada, este livro examina a variação genética e fenotípica em populações naturais, os princípios e mecanismos de mudança evolutiva, a interpretação de dados genéticos de populações naturais e como esses podem ser aplicados à conservação. O livro inclui exemplos de plantas, animais e micróbios em populações selvagens e em cativeiro. Esta terceira edição foi revisada minuciosamente para incluir avanços em genômica e contém novos capítulos sobre genômica de populações, monitoramento genético e genética da conservação na prática, bem como novas seções sobre mudanças climáticas, doenças emergentes, metagenômica e muito mais. Mais de um terço das referências nesta edição foram publicadas após a edição anterior. Cada um dos 24 capítulos e o Apêndice terminam com uma Guest Box escrita por um especialista que fornece um exemplo dos princípios apresentados no capítulo a partir do seu próprio trabalho. Este livro é essencial para estudantes de graduação avançada e pós-graduação em genética da conservação, gestão de recursos naturais e biologia da conservação, bem como biólogos da conservação profissionais e formuladores de políticas que trabalham para agências de gestão de vida selvagem e habitats. Grande parte do livro também interessará a não profissionais que estão curiosos sobre o papel da genética na conservação e gestão de populações selvagens e em cativeiro.

@book{doi101093oso97801988565660010001,
    author = "Allendorf, Fred W. e Funk, W. Chris e Aitken, Sally N. e Byrne, Margaret e Luikart, Gordon e Antunes, Agostinho",
    title = "Conservation and the Genomics of Populations",
    year = "2022",
    abstract = "Resumo A perda de biodiversidade está entre os maiores problemas que o mundo enfrenta hoje. Conservation and the Genomics of Populations oferece uma visão geral abrangente do conhecimento de base essencial, conceitos e ferramentas necessários para entender como as informações genéticas podem ser utilizadas para conservar espécies ameaçadas de extinção e para gerenciar espécies de importância ecológica ou comercial. Novas técnicas moleculares, métodos estatísticos e programas de computador, princípios genéticos e métodos estão se tornando cada vez mais úteis na conservação da diversidade biológica. Usando um equilíbrio de dados e teoria, juntamente com exemplos de pesquisa básica e aplicada, este livro examina a variação genética e fenotípica em populações naturais, os princípios e mecanismos de mudança evolutiva, a interpretação de dados genéticos de populações naturais e como esses podem ser aplicados à conservação. O livro inclui exemplos de plantas, animais e micróbios em populações selvagens e em cativeiro. Esta terceira edição foi revisada minuciosamente para incluir avanços em genômica e contém novos capítulos sobre genômica de populações, monitoramento genético e genética da conservação na prática, bem como novas seções sobre mudanças climáticas, doenças emergentes, metagenômica e muito mais. Mais de um terço das referências nesta edição foram publicadas após a edição anterior. Cada um dos 24 capítulos e o Apêndice terminam com uma Guest Box escrita por um especialista que fornece um exemplo dos princípios apresentados no capítulo a partir do seu próprio trabalho. Este livro é essencial para estudantes de graduação avançada e pós-graduação em genética da conservação, gestão de recursos naturais e biologia da conservação, bem como biólogos da conservação profissionais e formuladores de políticas que trabalham para agências de gestão de vida selvagem e habitats. Grande parte do livro também interessará a não profissionais que estão curiosos sobre o papel da genética na conservação e gestão de populações selvagens e em cativeiro.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198856566.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198856566.001.0001",
    openalex = "W4224274233",
    references = "doi101002evl3189, doi101007s10531020019800, doi101016jppees201002002, doi101046j14209101200100339x, doi101093czzow088, doi101093genetics902349, doi101111gcb13976"
}