Crescimento

@book{thompson1961on3,
    author = "Thompson, D'A. W",
    title = "On Growth and Form",
    year = "1961",
    publisher = "Cambridge, Cambridge University Press; [Edição abreviada por J.T. Bonner]",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Thompson, D'A. W., 1961, On Growth and Form: Cambridge, Cambridge University Press; [Edição abreviada por J.T. Bonner].}"
}

Resumo Invertebrados modulares (coloniais) são majoritariamente aquáticos, sésseis, alimentadores ativos ou passivos por suspensão. Este artigo propõe e discute algumas generalizações sobre a forma que aparentemente estão relacionadas ao modo de vida colonial sésseis. Em contraste com o tamanho das formas unitárias relacionadas, os módulos são pequenos, maximizando a superfície de alimentação relativa à massa metabólica e favorecendo a produção de um alto excedente energético. O aumento da integração colonial em ascídias e hidróides está associado à diminuição do tamanho do módulo, mas em Bryozoa, com o lophophore como índice, há algum aumento no tamanho. Os menores lophophores são encontrados em espécies com ramificação aparentemente primitiva, quase linear. Entre os briozoários com colônias encrustantes compactas, no entanto, espécies com lophophores maiores podem superar vizinhos adjacentes com lophophores menores. O tamanho do lophophore pode então ser um compromisso entre vantagem energética e desvantagem competitiva. Enquanto os filtradores internos tendem a ter módulos agrupados para produzir aberturas exhalantes maiores, favorecendo um fluxo de descarga mais forte, em Bryozoa parece vantajoso atingir a cobertura máxima de lophophores expandidos. Em Cheilostomata, os lophophores estão geralmente muito próximos, exceto nas chaminés excurrentes, e o tamanho e a forma dos zooides estão então diretamente ligados às dimensões do lophophore. Bryozoa Cyclostomata, no entanto, evoluíram para longe de lophophores muito próximos e zooides quincunciais em direção a arranjos fasciculados, possivelmente fornecendo canais excurrentes estruturais em um grupo que carece da coordenação colonial para manter chaminés não esqueléticas. Variações na forma da colônia estão relacionadas ao modo de crescimento, à disposição dos módulos para maximizar a filtração e às interações com fatores ambientais. O aumento da área superficial leva ao aumento do arrasto imposto pelos movimentos da água. Isso pode impor restrições ao crescimento e à forma, ou pode ser explorado para aumentar a filtração. Filtradores passivos frequentemente produzem colônias eretas, ramificadas e planares orientadas normalmente às correntes direcionais. Colônias simétricas bilateralmente, em forma de tigela, com zooides a jusante podem ocorrer em fluxo unidirecional. Colônias eretas de briozoários são mais comumente irregularmente tuftadas ou regularmente ramificadas em três dimensões, sendo então adaptadas a fluxos que variam em direção ou velocidade, ou ambos.

@article{doi101098rstb19860025,
    author = "Ryland, J. S. e Warner, George F.",
    title = "Crescimento e forma em animais modulares: ideias sobre o tamanho e a disposição dos zooides",
    year = "1986",
    journal = "Philosophical transactions of the Royal Society of London. Série B, Biological sciences",
    abstract = "Resumo Invertebrados modulares (coloniais) são majoritariamente aquáticos, sésseis, alimentadores ativos ou passivos por suspensão. Este artigo propõe e discute algumas generalizações sobre a forma que aparentemente estão relacionadas ao modo de vida colonial sésseis. Em contraste com o tamanho das formas unitárias relacionadas, os módulos são pequenos, maximizando a superfície de alimentação relativa à massa metabólica e favorecendo a produção de um alto excedente energético. O aumento da integração colonial em ascídias e hidróides está associado à diminuição do tamanho do módulo, mas em Bryozoa, com o lophophore como índice, há algum aumento no tamanho. Os menores lophophores são encontrados em espécies com ramificação aparentemente primitiva, quase linear. Entre os briozoários com colônias encrustantes compactas, no entanto, espécies com lophophores maiores podem superar vizinhos adjacentes com lophophores menores. O tamanho do lophophore pode então ser um compromisso entre vantagem energética e desvantagem competitiva. Enquanto os filtradores internos tendem a ter módulos agrupados para produzir aberturas exhalantes maiores, favorecendo um fluxo de descarga mais forte, em Bryozoa parece vantajoso atingir a cobertura máxima de lophophores expandidos. Em Cheilostomata, os lophophores estão geralmente muito próximos, exceto nas chaminés excurrentes, e o tamanho e a forma dos zooides estão então diretamente ligados às dimensões do lophophore. Bryozoa Cyclostomata, no entanto, evoluíram para longe de lophophores muito próximos e zooides quincunciais em direção a arranjos fasciculados, possivelmente fornecendo canais excurrentes estruturais em um grupo que carece da coordenação colonial para manter chaminés não esqueléticas. Variações na forma da colônia estão relacionadas ao modo de crescimento, à disposição dos módulos para maximizar a filtração e às interações com fatores ambientais. O aumento da área superficial leva ao aumento do arrasto imposto pelos movimentos da água. Isso pode impor restrições ao crescimento e à forma, ou pode ser explorado para aumentar a filtração. Filtradores passivos frequentemente produzem colônias eretas, ramificadas e planares orientadas normalmente às correntes direcionais. Colônias simétricas bilateralmente, em forma de tigela, com zooides a jusante podem ocorrer em fluxo unidirecional. Colônias eretas de briozoários são mais comumente irregularmente tuftadas ou regularmente ramificadas em três dimensões, sendo então adaptadas a fluxos que variam em direção ou velocidade, ou ambos.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1986.0025",
    doi = "10.1098/rstb.1986.0025",
    openalex = "W2153028084",
    references = "doi101007bf01722007"
}

Modelos de balanço de fluxo do metabolismo usam a estequiometria das vias metabólicas, as demandas metabólicas do crescimento e princípios de otimalidade para prever a distribuição de fluxo metabólico e o crescimento celular sob condições ambientais especificadas. Esses modelos forneceram uma interpretação mecanística da fisiologia metabólica sistêmica e também são úteis como uma ferramenta quantitativa para o projeto de vias metabólicas. Previsões quantitativas do crescimento celular e da secreção de subprodutos metabólicos que podem ser testadas experimentalmente podem ser obtidas a partir desses modelos. No presente relatório, usamos medições independentes para determinar os parâmetros do modelo para a cepa de tipo selvagem Escherichia coli W3110. Determinamos experimentalmente a taxa máxima de utilização de oxigênio (15 mmol de O2 por g [peso seco] por h), a taxa máxima de utilização aeróbica de glicose (10,5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), a taxa máxima de utilização anaeróbica de glicose (18,5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), os requisitos de manutenção não associados ao crescimento (7,6 mmol de ATP por g [peso seco] por h) e os requisitos de manutenção associados ao crescimento (13 mmol de ATP por g de biomassa). O modelo de balanço de fluxo especificado por esses parâmetros foi encontrado para prever quantitativamente as taxas de absorção de glicose e oxigênio, bem como as taxas de secreção de acetato observadas em experimentos com quimiostato. Formulamos um algoritmo preditivo para aplicar o modelo de balanço de fluxo a descrever o crescimento em estado não estacionário e a secreção de subprodutos em culturas em lote aeróbicas, em lote alimentado e em lote anaeróbicas. Em experimentos aeróbicos observamos a secreção de acetato, acúmulo no meio de cultura e reutilização a partir do meio de cultura. Em culturas em lote alimentado, o acetato é cometabolizado com glicose durante a parte final do período de cultura.(RESUMO CORTADO EM 250 PALAVRAS)

@article{doi101128aem6010372437311994,
    author = "Varma, Amit e Palsson, Bernhard Ø.",
    title = "Modelos de balanço estequiométrico de fluxo preveem quantitativamente o crescimento e a secreção de subprodutos metabólicos em Escherichia coli W3110 de tipo selvagem",
    year = "1994",
    journal = "Applied and Environmental Microbiology",
    abstract = "Modelos de balanço de fluxo do metabolismo usam a estequiometria das vias metabólicas, as demandas metabólicas do crescimento e princípios de otimalidade para prever a distribuição de fluxo metabólico e o crescimento celular sob condições ambientais especificadas. Esses modelos forneceram uma interpretação mecanística da fisiologia metabólica sistêmica e também são úteis como uma ferramenta quantitativa para o projeto de vias metabólicas. Previsões quantitativas do crescimento celular e da secreção de subprodutos metabólicos que podem ser testadas experimentalmente podem ser obtidas a partir desses modelos. No presente relatório, usamos medições independentes para determinar os parâmetros do modelo para a cepa de tipo selvagem Escherichia coli W3110. Determinamos experimentalmente a taxa máxima de utilização de oxigênio (15 mmol de O2 por g [peso seco] por h), a taxa máxima de utilização aeróbica de glicose (10,5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), a taxa máxima de utilização anaeróbica de glicose (18,5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), os requisitos de manutenção não associados ao crescimento (7,6 mmol de ATP por g [peso seco] por h) e os requisitos de manutenção associados ao crescimento (13 mmol de ATP por g de biomassa). O modelo de balanço de fluxo especificado por esses parâmetros foi encontrado para prever quantitativamente as taxas de absorção de glicose e oxigênio, bem como as taxas de secreção de acetato observadas em experimentos com quimiostato. Formulamos um algoritmo preditivo para aplicar o modelo de balanço de fluxo a descrever o crescimento em estado não estacionário e a secreção de subprodutos em culturas em lote aeróbicas, em lote alimentado e em lote anaeróbicas. Em experimentos aeróbicos observamos a secreção de acetato, acúmulo no meio de cultura e reutilização a partir do meio de cultura. Em culturas em lote alimentado, o acetato é cometabolizado com glicose durante a parte final do período de cultura.(RESUMO CORTADO EM 250 PALAVRAS)",
    url = "https://doi.org/10.1128/aem.60.10.3724-3731.1994",
    doi = "10.1128/aem.60.10.3724-3731.1994",
    openalex = "W2143861551"
}

@misc{crossref2007bioenergetics,
    title = "Bioenergética e Metabolismo",
    year = "2007",
    booktitle = "Princípios e Prática do Treinamento de Resistência",
    url = "https://doi.org/10.5040/9781492596875.part-002",
    doi = "10.5040/9781492596875.part-002",
    openalex = "W4251395485",
    pages = "61-62"
}

@article{bouillaud2010ucp2,
    author = "Bouillaud, Frédéric e Pecqueur, Claire",
    title = "Bioenergética e metabolismo de UCP2",
    year = "2010",
    journal = "Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergética",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2010.04.252",
    doi = "10.1016/j.bbabio.2010.04.252",
    openalex = "W2000325152",
    pages = "84",
    volume = "1797"
}

O metabolismo gera radicais de oxigênio, que contribuem para mutações oncogênicas. Oncogenes ativados e perda de supressores de tumores, por sua vez, alteram o metabolismo e induzem glicólise aeróbica. A glicólise aeróbica ou o efeito Warburg liga a alta taxa de fermentação de glicose ao câncer. Juntamente com a glutamina, a glicose via glicólise fornece os esqueletos de carbono, NADPH e ATP para construir novas células cancerígenas, que persistem em hipóxia que, por sua vez, reconfigura vias metabólicas para crescimento e sobrevivência celular. O excesso de ingestão calórica está associado a um risco aumentado de cânceres, enquanto a restrição calórica é protetora, talvez através da limpeza de mitocôndrias ou mitofagia, reduzindo assim o estresse oxidativo. Portanto, as ligações entre metabolismo e câncer são multifacetadas, abrangendo desde a baixa incidência de câncer em mamíferos grandes com baixas taxas metabólicas específicas até alterações no metabolismo das células cancerígenas resultantes de enzimas mutadas ou genes cancerígenos.

@article{doi101101gad189365112,
    author = "Dang, Chi V.",
    title = "Links between metabolism and cancer",
    year = "2012",
    journal = "Genes \& Development",
    abstract = "Metabolism generates oxygen radicals, which contribute to oncogenic mutations. Activated oncogenes and loss of tumor suppressors in turn alter metabolism and induce aerobic glycolysis. Aerobic glycolysis or the Warburg effect links the high rate of glucose fermentation to cancer. Together with glutamine, glucose via glycolysis provides the carbon skeletons, NADPH, and ATP to build new cancer cells, which persist in hypoxia that in turn rewires metabolic pathways for cell growth and survival. Excessive caloric intake is associated with an increased risk for cancers, while caloric restriction is protective, perhaps through clearance of mitochondria or mitophagy, thereby reducing oxidative stress. Hence, the links between metabolism and cancer are multifaceted, spanning from the low incidence of cancer in large mammals with low specific metabolic rates to altered cancer cell metabolism resulting from mutated enzymes or cancer genes.",
    url = "https://doi.org/10.1101/gad.189365.112",
    doi = "10.1101/gad.189365.112",
    openalex = "W2105665764",
    references = "doi101016jcellsig201201008, doi101016jcmet200602002, doi101038nature08617, doi101038nrc2981, doi101038nrc3038, doi101038nrm3025, doi101056nejmoa0808710, doi101126science1160809, doi101126science1164382, doi101126science1233191309"
}

As bactérias devem constantemente adaptar seu crescimento às mudanças na disponibilidade de nutrientes; no entanto, apesar das grandes mudanças na expressão de proteínas associadas à detecção, adaptação e processamento de diferentes nutrientes ambientais, leis de crescimento simples conectam a abundância de ribossomos e a taxa de crescimento. Aqui, investigamos a origem dessas leis de crescimento analisando as características da regulação ribossomal que coordenam mudanças na expressão em toda a proteoma com o crescimento celular em uma variedade de condições nutricionais na organismo modelo Escherichia coli. Identificamos a ativação feedforward impulsionada pelo suprimento da síntese de proteínas ribossomais como o motivo regulatório chave que maximiza o fluxo de aminoácidos e autonomamente guia uma célula para alcançar o crescimento ótimo em diferentes ambientes. As leis de crescimento emergem naturalmente da estratégia regulatória robusta subjacente ao controle da taxa de crescimento, independentemente dos detalhes da implementação molecular. O estudo destaca a interação entre modelagem fenomenológica e mecanismos moleculares na descoberta de restrições operacionais fundamentais, com implicações para o design endógeno e sintético de microrganismos.

@article{doi1015252msb20145379,
    author = "Scott, Matthew P. e Klumpp, Stefan e Mateescu, Eduard M. e Hwa, Terence",
    title = "Emergência de leis de crescimento robustas a partir da regulação ótima da síntese de ribossomos",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Systems Biology",
    abstract = "As bactérias devem constantemente adaptar seu crescimento às mudanças na disponibilidade de nutrientes; no entanto, apesar das grandes mudanças na expressão de proteínas associadas à detecção, adaptação e processamento de diferentes nutrientes ambientais, leis de crescimento simples conectam a abundância de ribossomos e a taxa de crescimento. Aqui, investigamos a origem dessas leis de crescimento analisando as características da regulação ribossomal que coordenam mudanças na expressão em toda a proteoma com o crescimento celular em uma variedade de condições nutricionais na organismo modelo Escherichia coli. Identificamos a ativação feedforward impulsionada pelo suprimento da síntese de proteínas ribossomais como o motivo regulatório chave que maximiza o fluxo de aminoácidos e autonomamente guia uma célula para alcançar o crescimento ótimo em diferentes ambientes. As leis de crescimento emergem naturalmente da estratégia regulatória robusta subjacente ao controle da taxa de crescimento, independentemente dos detalhes da implementação molecular. O estudo destaca a interação entre modelagem fenomenológica e mecanismos moleculares na descoberta de restrições operacionais fundamentais, com implicações para o design endógeno e sintético de microrganismos.",
    url = "https://doi.org/10.15252/msb.20145379",
    doi = "10.15252/msb.20145379",
    openalex = "W2111354165",
    references = "doi101038msb200982"
}

Introdução John Tyler Bonner VII 1. Introdução 2. Sobre a magnitude 3. As formas das células 4. As formas dos tecidos, dos agregados celulares 5. Sobre espinhas e esqueletos espiculares 6. A espiral equiangular 7. As formas de chifres e de dentes ou presas 8. Sobre a forma e a eficiência mecânica 9. Sobre a teoria das transformações, ou a comparação de formas relacionadas 10. Epílogo Índice.

@book{doi1015159780691183978018,
    author = "Thompson, D’Arcy Wentworth",
    title = "On Growth and Form, 1917",
    year = "2019",
    booktitle = "Princeton University Press eBooks",
    abstract = "Introdução John Tyler Bonner VII 1. Introdução 2. Sobre a magnitude 3. As formas das células 4. As formas dos tecidos, dos agregados celulares 5. Sobre espinhas e esqueletos espiculares 6. A espiral equiangular 7. As formas de chifres e de dentes ou presas 8. Sobre a forma e a eficiência mecânica 9. Sobre a teoria das transformações, ou a comparação de formas relacionadas 10. Epílogo Índice.",
    url = "https://doi.org/10.1515/9780691183978-018",
    doi = "10.1515/9780691183978-018",
    openalex = "W2100983000"
}