1. 1903, Origem das Fins dos Peixes: Scientific American: v. 55, no. 1415supp: p. 22671-22671.

BibTeX
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    title = "Origem das Fins dos Peixes",
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    journal = "Scientific American",
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2. 1969, Paleontologia Vertebrada: Peixes de Fins Lobados: Nature: v. 221, no. 5183: p. 803-804.

BibTeX
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    title = "Paleontologia Vertebrada: Peixes de Fins Lobados",
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    volume = "221"
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3. THOMSON, KEITH STEWART, 1969, THE BIOLOGY OF THE LOBE‐FINNED FISHES: Biological Reviews: v. 44, no. 1: p. 91-154.

Resumo

Resumo 1. A interpretação da evolução estrutural em um grupo como os Sarcopterygii requer a consideração de uma combinação de todas as funções possíveis, em vez de funções únicas. 2. Os Dipnoi estão provavelmente mais estreitamente relacionados aos Crossopterygii do que a outros grupos de peixes. Os Sarcopterygii são um grupo 'natural'. Certos caracteres em comum entre os elasmobrânquios e os Dipnoi ou Coelacanthini parecem ser o resultado da evolução convergente. 3. A evolução do crânio, em conexão com ambos os mecanismos respiratórios e alimentares, resultou em especialização extrema em todos os Sarcopterygii. A cinésia intracraniana dos crossopterygii evoluiu de uma mobilidade anterior entre o crânio e o pescoço e está adaptada para aumentar a força da mordida e para envolver a presa tanto de cima quanto de baixo, além de outros fatores. A radiação adaptativa é observada nos mecanismos alimentares de todas as formas. A evolução dos Anfíbios procedeu através do alongamento da divisão anterior do crânio (que não está correlacionada com quaisquer mudanças na morfologia cerebral) e a perda do mecanismo cinético nesta sequência está pelo menos parcialmente associada a mecanismos de bombeamento bucal melhorados para ventilação pulmonar. 4. A radiação adaptativa do sistema respiratório nos Dipnoi mostra um aumento progressivo no uso da respiração aérea. A condição aquática observada em Neoceratodus é provavelmente secundária. A comparação dos três gêneros vivos mostra uma correlação marcante entre a fisiologia respiratória e o hábito. Há pouca indicação de redução do sistema respiratório branquial nos Rhipidistia conhecidos, nos quais a respiração era provavelmente primariamente aquática. Nos Dipnoi e Rhipidistia, a evolução do pulmão permitiu um controle parcial das propriedades hidrostáticas do corpo. Nos coelacantos, a respiração aérea foi abandonada, exceto em certas formas de água doce secundariamente, e o único pulmão é modificado como um órgão de equilíbrio hidrostático. Essas mudanças são refletidas nas proporções corporais gerais. 5. A locomoção nos Sarcopterygii (exceto os coelacantos Laugia e Piveteauia) está adaptada para contato com o substrato em águas relativamente rasas na maioria dos casos. A radiação adaptativa do aparelho locomotor é observada em relação aos papéis e funções relativos das nadadeiras pares e impares, à forma geral do corpo, à forma da nadadeira caudal e ao tamanho absoluto. Uma função importante das nadadeiras peitorais nos Rhipidistia avançados foi em suportar o corpo em águas rasas e, assim, auxiliar na ventilação pulmonar. 6. A estivação é um traço precoce da biologia dos dipnoas, mas não evoluiu nos Rhipidistia. A faculdade comum de produção de ureia via ciclo da ornitina e retenção de ureia nos coelacantos e dipnoas são adaptações a condições nas quais os tecidos corporais podem ficar desidratados (água salgada e dessecação, respectivamente). O padrão comum de metabolismo de nitrogênio parece ter evoluído durante uma fase marinha na evolução dos sarcopterygii. 7. Há evidências de que os membros mais antigos de todas as linhagens de sarcopterygii incluíam formas marinhas. No entanto, as radiações principais subsequentes dos Dipnoi e Rhipidistia ocorreram em águas doces. A distribuição dos Sarcopterygii foi inteiramente tropical. A distribuição das formas de água doce do Paleozóico tardio parece oferecer evidências para a ocorrência da Deriva Continental. Os coelacantos eram peixes principalmente costeiros. 8. A evolução de um grupo majoritário de organismos requer um padrão diferente de mudança evolutiva do que aquele pelo qual as radiações adaptativas são produzidas. Ela evolui a correlação estrutural e temporal da modificação em um número de diferentes sistemas funcionais, em vez da modificação separada de cada sistema sem referência a outros sistemas. 9. Os primeiros tetrápodes evoluíram em um ambiente pantanoso altamente sazonal nas margens de lagos ou rios interiores, em condições permanentemente úmidas.

BibTeX
@article{thomson1969the,
    author = "THOMSON, KEITH STEWART",
    title = "THE BIOLOGY OF THE LOBE‐FINNED FISHES",
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4. Thompson, K. S, 1980, The Ecology of the Lobe-Finned Fishes, in Panchen, A. L., ed., The Terrestrial Environment and the Origin of Land Vertebrates: London, Academic Press.

BibTeX
@book{thompson1980the1,
    author = "Thompson, K. S",
    title = "The Ecology of the Lobe-Finned Fishes, in Panchen, A. L., ed., The Terrestrial Environment and the Origin of Land Vertebrates",
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    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Thompson, K. S., 1980, The Ecology of the Lobe-Finned Fishes, in Panchen, A. L., ed., The Terrestrial Environment and the Origin of Land Vertebrates: London, Academic Press.}"
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5. Olson, Everett C., 1981, O AMBIENTE TERRESTRE E A ORIGEM DOS VERTEBRADOS TERRESTRES: Evolução.

Resumo

Há cerca de 405 milhões de anos, plantas e animais multicelulares começaram uma lenta colonização dos continentes. As primeiras marcas estão nas águas rasas do Silúrio Tardio, seguidas por registros rapidamente crescentes de plantas durante o Devoniano e de invertebrados e vertebrados a partir do Devoniano Tardio e Carbonífero. Grande parte da história mais antiga tanto dos animais quanto das plantas permanece obscura, mas nos séculos XIX e XX, durante os quais a especulação e a acumulação de dados progrediram rapidamente, dados substanciais foram acumulados e as formas de encarar os problemas mudaram imensamente. Uma maneira mais antiga de encarar a evolução durante o Paleozóico tardio, através de uma análise grupo por grupo, cedeu parcialmente lugar a estudos coordenados de associações de organismos em sistemas comunitários e considerações sobre a ecologia e tafonomia de suas ocorrências. A. L. Panchen, a força motriz por trás do simpósio apresentado neste volume, expandiu o plano original para tratar a origem dos tetrápodes de seus ancestrais peixes, para incluir plantas, invertebrados e vertebrados e o campo dos aspectos ecológicos da origem dos tetrápodes. O resultado foi uma feliz síntese de morfologia, sistemática, ecologia e tafonomia dentro de um quadro evolutivo. No total, 20 estudantes contribuíram para o volume. Os temas abrangem biogeografia, plantas, invertebrados e vertebrados vistos em diversos contextos. O volume é uma mina de ouro de informações sobre a origem dos tetrápodes e assuntos relacionados. Para alguém que tem interesse nesta área há muitos anos e acompanhou a mudança de atitudes e filosofias, um dos aspectos marcantes do volume é sua clara retratação da controvérsia contínua entre a sistemática e filogenética chamadas "ortodoxa" e "cladística". O amplo impacto do desenvolvimento dos métodos cladísticos, conforme apresentado por Hennig e grandemente modificados até hoje, é evidente em todo o livro, mesmo nos artigos de alguns que rejeitam a abordagem. A consciência da necessidade de erigir hipóteses testáveis é encontrada na maioria dos artigos. Embora o método tenha tido um efeito fortemente afirmativo na sistemática e filogenia, permanece claro que, nos passos iniciais da análise, e,

BibTeX
@article{doi101111j155856461981tb04969x,
    author = "Olson, Everett C.",
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6. Kluge, Arnold G. e Panchen, Alec L., 1981, O Ambiente Terrestre e a Origem dos Vertebrados Terrestres.: Systematic Zoology.

BibTeX
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    author = "Kluge, Arnold G. e Panchen, Alec L.",
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7. Sordino, Paolo e van der Hoeven, F. e Duboule, Denis, 1995, Expressão de genes Hox em nadadeiras de teleósteos e a origem dos dígitos dos vertebrados: Nature.

BibTeX
@article{doi101038375678a0,
    author = "Sordino, Paolo e van der Hoeven, F. e Duboule, Denis",
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8. Lauder, George, 2000, Função da Cauda Durante a Locomoção em Peixes: Cinemática, Visualização de Fluxo e Padrões Evolutivos1: American Zoologist.

Resumo

Uma das características mais proeminentes dos vertebrados primitivos é a nadadeira caudal alongada que possui raios da nadadeira. A nadadeira caudal representa uma característica de design fundamental dos vertebrados que antecede a origem das mandíbulas e é encontrada tanto em agnatos quanto em gnatosstomas. A nadadeira caudal também representa a região mais posterior do eixo vertebrado e é o local onde o fluido, acelerado pelo movimento do corpo para a frente, é descartado no meio circundante. Apesar do extenso registro fóssil da nadadeira caudal, do uso de caracteres caudais para estudos sistemáticos e da importância da função da cauda para a compreensão da dinâmica locomotora em peixes, poucos estudos experimentais foram realizados sobre a função da nadadeira caudal. Neste artigo, reviso duas abordagens experimentais que prometem fornecer novas perspectivas sobre a função e a evolução da nadadeira caudal: análise cinemática tridimensional e medições quantitativas de fluxo na esteira de peixes nadando livremente usando velocimetria por imagem de partículas digitais (DPIV). Esses métodos são então aplicados à função da nadadeira caudal durante natação estável em peixes com morfologias heterocercais e homocercais: condricteios (tubarões-leopardo) e peixes de nadadeiras raiadas (esturjão e sunfish azul). A nadadeira caudal dos tubarões-leopardo funciona de uma maneira consistente com o modelo clássico da função da cauda heterocerca, no qual a superfície caudal se move em um ângulo agudo em relação ao plano horizontal e, portanto, espera-se que gere forças de sustentação e torques que devem ser contrabalançados anteriormente pelo corpo e pelas nadadeiras peitorais. Um modelo alternativo no qual a cauda do tubarão produz uma força reativa que atua através do centro de massa não é apoiado. A cauda heterocerca do esturjão é extremamente flexível e o lobo superior da cauda fica atrás do lobo inferior durante o ciclo de batida da nadadeira. A cauda do esturjão não funciona de acordo com o modelo clássico da cauda heterocerca e é hipotetizado que gera forças reativas orientadas próximo ao centro de massa do corpo, que está inclinado em um ângulo em relação ao fluxo durante a locomoção estável. A análise funcional da cauda homocerca do sunfish azul mostra que os lobos dorsal e ventral não funcionam simetricamente como esperado. Em vez disso, o lobo dorsal sofre maiores excursões laterais e se move em velocidades mais altas do que o lobo ventral. A superfície do lobo dorsal também alcança um ângulo significativamente agudo em relação ao plano horizontal, sugerindo que a cauda homocerca do sunfish azul gera sustentação durante a natação estável. Esses movimentos são gerados ativamente pelo músculo longitudinalis hipocordal dentro da cauda. Este resultado, combinado com dados de visualização de fluxo DPIV, sugere uma nova hipótese para a função da cauda homocerca: a cauda homocerca gera anéis de vórtice inclinados e interligados com um jato central inclinado posteroventralmente, produzindo uma força reativa anterodorsal no corpo que gera sustentação e torque da maneira esperada para uma cauda heterocerca. Estes resultados mostram que a aplicação de novas técnicas ao estudo da função da nadadeira caudal em peixes revela uma diversidade previamente desconhecida da função das caudas homocercais e heterocercais, e que as caracterizações morfológicas das nadadeiras caudais não refletem com precisão a função in vivo.

BibTeX
@article{doi1016680003156920000400101fotcfd20co2,
    author = "Lauder, George",
    title = "Função da nadadeira caudal durante a locomoção em peixes: cinemática, visualização de fluxo e padrões evolutivos1",
    year = "2000",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = "Uma das características mais proeminentes dos vertebrados primitivos é a nadadeira caudal alongada com raios da nadadeira. A nadadeira caudal representa uma característica fundamental do design dos vertebrados que antecede a origem das mandíbulas e é encontrada tanto em agnatos quanto em gnatosstomas. A nadadeira caudal também representa a região mais posterior do eixo vertebrado e é o local onde o fluido, acelerado pelo movimento do corpo para a frente, é descartado no meio circundante. Apesar do extenso registro fóssil da nadadeira caudal, do uso de caracteres caudais para estudos sistemáticos e da importância da função da cauda para compreender a dinâmica locomotora em peixes, poucos estudos experimentais foram realizados sobre a função da nadadeira caudal. Neste artigo, reviso duas abordagens experimentais que prometem fornecer novas perspectivas sobre a função e a evolução da nadadeira caudal: análise cinemática tridimensional e medições quantitativas de fluxo na esteira de peixes nadando livremente usando velocimetria por imagem de partículas digitais (DPIV). Esses métodos são então aplicados à função da nadadeira caudal durante a natação estável em peixes com morfologias heterocercais e homocercais: condricteios (tubarões-leopardo) e peixes de nadadeiras raiadas (esturjão e sunfish azul). A nadadeira caudal dos tubarões-leopardo funciona de uma maneira consistente com o modelo clássico da função da cauda heterocercais, no qual a superfície caudal se move em um ângulo agudo em relação ao plano horizontal e, portanto, espera-se que gere forças de sustentação e torques que devem ser contrabalançados anteriormente pelo corpo e pelas nadadeiras peitorais. Um modelo alternativo no qual a cauda do tubarão produz uma força reativa que atua através do centro de massa não é apoiado. A cauda heterocercais do esturjão é extremamente flexível e o lobo superior da cauda segue o inferior durante o ciclo de batida da nadadeira. A cauda do esturjão não funciona de acordo com o modelo clássico da cauda heterocercais e é hipotetizada para gerar forças reativas orientadas perto do centro de massa do corpo, que está inclinado em um ângulo em relação ao fluxo durante a locomoção estável. A análise funcional da cauda homocercais do sunfish azul mostra que os lobos dorsal e ventral não funcionam simetricamente como esperado. Em vez disso, o lobo dorsal sofre maiores excursões laterais e se move em velocidades mais altas do que o lobo ventral. A superfície do lobo dorsal também alcança um ângulo significativamente agudo em relação ao plano horizontal, sugerindo que a cauda homocercais do sunfish azul gera sustentação durante a natação estável. Esses movimentos são gerados ativamente pelo músculo longitudinalis hipocordal dentro da cauda. Este resultado, combinado com dados de visualização de fluxo DPIV, sugere uma nova hipótese para a função da cauda homocercais: a cauda homocercais gera anéis de vórtice inclinados e ligados com um jato central inclinado posteroventralmente, produzindo uma força reativa anterodorsal no corpo que gera sustentação e torque da maneira esperada de uma cauda heterocercais. Estes resultados mostram que a aplicação de novas técnicas ao estudo da função da nadadeira caudal em peixes revela uma diversidade previamente desconhecida da função das caudas homocercais e heterocercais, e que as caracterizações morfológicas das nadadeiras caudais não refletem com precisão a função in vivo.",
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9. Lauder, G. V., 2002, Hidrodinâmica Experimental e Evolução: Função das Aletas Medianas em Peixes de Raio: Biologia Integrativa e Comparativa: v. 42, no. 5: p. 1009-1017.

BibTeX
@article{lauder2002experimental,
    author = "Lauder, G. V.",
    title = "Hidrodinâmica Experimental e Evolução: Função das Aletas Medianas em Peixes de Raio",
    year = "2002",
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10. Johanson, Zerina e Joss, Jean M.P. e Boisvert, Catherine e Ericsson, Rolf e Sutija, Margareta e Ahlberg, Per, 2007, Dedos de peixe: homólogos de dígitos nas nadadeiras de peixes sarcopterígeos: Journal of Experimental Zoology Part B Molecular and Developmental Evolution.

Resumo

Uma característica definidora das origens evolutivas dos tetrápodes é a transição de nadadeiras de peixe para membros de tetrápodes. Uma mudança importante durante esta transição é o aparecimento do autopódio (mãos, pés), que compreende duas regiões distintas, o pulso/tartaruga e os dígitos. Quando o autopódio apareceu pela primeira vez em tetrápodes fósseis do Devoniano Superior, estava incompleto: os dígitos evoluíram antes do conjunto completo de ossos do pulso/tartaruga. Pulsos/tartarugas de tetrápodes iniciais, incluindo aqueles com um conjunto completo de ossos, também mostram uma descontinuidade de padrão aguda entre elementos proximais e distais. Isso sugere a presença de uma descontinuidade na sequência de desenvolvimento proximal-distal. Tal descontinuidade ocorre em urodeles vivos, onde os dígitos se formam antes da conclusão do pulso/tartaruga, implicando independência de desenvolvimento dos dígitos em relação aos elementos do pulso/tartaruga. Observamos um desenvolvimento independente comparável dos radiais da nadadeira peitoral no peixe pulmonar Neoceratodus (Osteichthyes: Sarcopterygii), em relação aos homólogos do membro de tetrápode e elementos proximais do pulso no eixo principal da nadadeira. Além disso, na nadadeira do Neoceratodus, a expressão de Hoxd13 corresponde de perto aos padrões de expressão tardia observados no autopódio de tetrápodes. Esta evidência sugere que os radiais da nadadeira do Neoceratodus e os dígitos de tetrápodes podem ser padronizados por mecanismos compartilhados distintos daqueles que padronizam os elementos proximais da nadadeira/membro e, nesse sentido, são homólogos. A presença de radiais em desenvolvimento independente na parte distal da nadadeira peitoral (e pélvica) pode ser uma característica geral dos Sarcopterygii.

BibTeX
@article{doi101002jezb21197,
    author = "Johanson, Zerina e Joss, Jean M.P. e Boisvert, Catherine e Ericsson, Rolf e Sutija, Margareta e Ahlberg, Per",
    title = "Dedos de peixe: homólogos de dígitos nas nadadeiras de peixes sarcopterígeos",
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    openalex = "W2165420842",
    references = "doi10103827421, doi101098rstb19840103, doi101111j109636421995tb00119x"
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11. King, Heather M. e Shubin, Neil H. e Coates, Michael I. e Hale, Melina E., 2011, Evidências comportamentais para a evolução da locomoção de caminhada e salto antes da terrestriality em peixes sarcopterígeos: Proceedings of the National Academy of Sciences.

Resumo

Tetrápodos evoluíram de peixes sarcopterígeos no Devoniano e foram os primeiros vertebrados a colonizar a terra. O componente locomotor dessa transição pode ser dividido em quatro eventos principais: terrestriality, as origens de membros digitados, locomoção baseada em substrato sólido e ritmos alternados que usam apêndices pélvicos como principais propulsores. Como grupo irmão dos tetrápodos, os peixes pulmonados são um táxon sarcopterígeo morfologicamente e filogeneticamente relevante para entender a ordem em que esses eventos ocorreram. Descobrimos que uma espécie de peixe pulmona africano (Protopterus annectens) utiliza uma variedade de ritmos impulsionados pelas nadadeiras pélvicas, semelhantes aos dos tetrápodos, incluindo caminhada e salto, em um ambiente aquático, apesar de possuir um esqueleto endoesquelético de membros derivado e uma pélvis primitivamente pequena e suportada muscularmente. Surpreendentemente, dada essas características morfológicas, P. annectens também levanta seu corpo completamente do substrato usando suas nadadeiras pélvicas, uma capacidade considerada uma inovação dos tetrápodos. Nossas descobertas sugerem que algumas características fundamentais da locomoção dos tetrápodos, incluindo padrões de ritmo de membros pélvicos e associação com substrato, provavelmente surgiram nos sarcopterígeos antes da origem de membros digitados ou da terrestriality. Consequentemente, a atribuição de algumas das trilhas fósseis devonianas não digitadas a tetrápodos com membros pode precisar ser revisitada.

BibTeX
@article{doi101073pnas1118669109,
    author = "King, Heather M. and Shubin, Neil H. and Coates, Michael I. and Hale, Melina E.",
    title = "Behavioral evidence for the evolution of walking and bounding before terrestriality in sarcopterygian fishes",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Tetrapods evolved from sarcopterygian fishes in the Devonian and were the first vertebrates to colonize land. The locomotor component of this transition can be divided into four major events: terrestriality, the origins of digited limbs, solid substrate-based locomotion, and alternating gaits that use pelvic appendages as major propulsors. As the sister group to tetrapods, lungfish are a morphologically and phylogenetically relevant sarcopterygian taxon for understanding the order in which these events occurred. We found that a species of African lungfish (Protopterus annectens) uses a range of pelvic fin-driven, tetrapod-like gaits, including walking and bounding, in an aquatic environment, despite having a derived limb endoskeleton and primitively small, muscularly supported pelvis. Surprisingly, given these morphological traits, P. annectens also lifts its body clear of the substrate using its pelvic fins, an ability thought to be a tetrapod innovation. Our findings suggest that some fundamental features of tetrapod locomotion, including pelvic limb gait patterns and substrate association, probably arose in sarcopterygians before the origin of digited limbs or terrestriality. It follows that the attribution of some of the nondigited Devonian fossil trackways to limbed tetrapods may need to be revisited.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1118669109",
    doi = "10.1073/pnas.1118669109",
    openalex = "W2051103595",
    references = "doi101002jmor1051900412"
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12. Dores, Robert M. e Majeed, Qais e Komorowski, Leanne, 2011, Observações sobre a radiação de peixes de nadadeiras lobadas, peixes de nadadeiras raiadas e peixes cartilaginosos: Filogenia da família de genes opioides/orfanina e a hipótese 2R: Endocrinologia Geral e Comparativa: v. 170, no. 2: p. 253-264.

BibTeX
@article{dores2011observations,
    author = "Dores, Robert M. e Majeed, Qais e Komorowski, Leanne",
    title = "Observações sobre a radiação de peixes de nadadeiras lobadas, peixes de nadadeiras raiadas e peixes cartilaginosos: Filogenia da família de genes opioides/orfanina e a hipótese 2R",
    year = "2011",
    journal = "Endocrinologia Geral e Comparativa",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ygcen.2010.09.023",
    doi = "10.1016/j.ygcen.2010.09.023",
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    openalex = "W2082700706",
    pages = "253-264",
    volume = "170",
    references = "doi101016s0016699588800664, doi101038258577a0, doi101038278423a0, doi101038377532a0, doi101093genetics15141531, doi101126science2705237792, doi101242dev1994supplement125, doi101371journalpone, doi1023073514548, doi105962bhltitle82448"
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13. 2015, Aletas flexíveis e raios de aletas como transformações-chave em peixes de nadadeiras raiadas: Grandes Transformações na Evolução Vertebrada: p. 31-46.

BibTeX
@incollection{crossref2015flexible,
    title = "Aletas flexíveis e raios de aletas como transformações-chave em peixes de nadadeiras raiadas",
    year = "2015",
    booktitle = "Grandes Transformações na Evolução Vertebrada",
    url = "https://doi.org/10.7208/chicago/9780226268392.003.0002",
    doi = "10.7208/chicago/9780226268392.003.0002",
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    pages = "31-46",
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14. Clack, Jennifer A. e Ahlberg, Per Erik, 2016, Sarcopterygians: From Lobe-Finned Fishes to the Tetrapod Stem Group: Springer Handbook of Auditory Research: p. 51-70.

BibTeX
@incollection{clack2016sarcopterygians,
    author = "Clack, Jennifer A. e Ahlberg, Per Erik",
    title = "Sarcopterygians: From Lobe-Finned Fishes to the Tetrapod Stem Group",
    year = "2016",
    booktitle = "Springer Handbook of Auditory Research",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-319-46661-3\_3",
    doi = "10.1007/978-3-319-46661-3\_3",
    openalex = "W2563056895",
    pages = "51-70",
    references = "doi101016b9780126709506500187, doi10103827421, doi101038nature04639, doi10108003115519608619475, doi101111j109636421977tb01031x, doi101111j109636421991tb00905x, doi1023071539358, doi1023072413058, openalexw1587561751, openalexw628087051"
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15. Hughes, Lily C. e Ortı́, Guillermo e Huang, Yu e Sun, Ying e Baldwin, Carole C. e Thompson, Andrew W. e Arcila, Dahiana e Betancur‐R, Ricardo e Li, Chenhong e Becker, L.A. e Bellora, Nicolás e Zhao, Xiaomeng e Li, Xiaofeng e Wang, Min e Fang, Chao e Xie, Bing e Zhou, Zhuocheng e Huang, Hai e Chen, Songlin e Venkatesh, Byrappa e Shi, Qiong, 2018, Filogenia abrangente de peixes de nadadeiras raiadas (Actinopterygii) baseada em dados transcriptômicos e genômicos: Proceedings of the National Academy of Sciences.

Resumo

Nossa compreensão das relações filogenéticas entre peixes ósseos foi transformada pela análise de um pequeno número de genes, mas incertezas permanecem em torno de nós críticos. Inferências em escala de genoma até agora têm amostrado um número limitado de táxons e genes. Aqui, utilizamos 144 genomas e 159 transcriptomas para investigar a evolução de peixes com uma escala de dados sem precedentes: >0,5 Mb de 1.105 sequências de éxons ortólogos de 303 espécies, representando 66 das 72 ordens de peixes de nadadeiras raiadas. Aplicamos testes filogenéticos projetados para rastrear o efeito de eventos de duplicação do genoma inteiro em árvores gênicas e encontramos loci livres de paralogia usando uma abordagem de bioinformática. Dados em escala de genoma apoiam a estrutura da filogenia de peixes, e procedimentos de teste de hipóteses apropriados para conjuntos de dados filogenômicos usando interrogação explícita de genealogia gênica resolvem algumas incertezas de longa data, como a ordem de ramificação na base dos teleósteos e entre euteleósteos iniciais, e a linhagem irmã das radiações acantomorfos e percomorfos. Calibrações fóssil abrangentes datam a origem de todas as principais linhagens de peixes antes do fim do Cretáceo.

BibTeX
@article{doi101073pnas1719358115,
    author = "Hughes, Lily C. e Ortı́, Guillermo e Huang, Yu e Sun, Ying e Baldwin, Carole C. e Thompson, Andrew W. e Arcila, Dahiana e Betancur‐R, Ricardo e Li, Chenhong e Becker, L.A. e Bellora, Nicolás e Zhao, Xiaomeng e Li, Xiaofeng e Wang, Min e Fang, Chao e Xie, Bing e Zhou, Zhuocheng e Huang, Hai e Chen, Songlin e Venkatesh, Byrappa e Shi, Qiong",
    title = "Filogenia abrangente de peixes de nadadeiras raiadas (Actinopterygii) baseada em dados transcriptômicos e genômicos",
    year = "2018",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Nossa compreensão das relações filogenéticas entre peixes ósseos foi transformada pela análise de um pequeno número de genes, mas incertezas permanecem em torno de nós críticos. Inferências em escala de genoma até agora têm amostrado um número limitado de táxons e genes. Aqui, utilizamos 144 genomas e 159 transcriptomas para investigar a evolução de peixes com uma escala de dados sem precedentes: >0,5 Mb de 1.105 sequências de éxons ortólogos de 303 espécies, representando 66 das 72 ordens de peixes de nadadeiras raiadas. Aplicamos testes filogenéticos projetados para rastrear o efeito de eventos de duplicação do genoma inteiro em árvores gênicas e encontramos loci livres de paralogia usando uma abordagem de bioinformática. Dados em escala de genoma apoiam a estrutura da filogenia de peixes, e procedimentos de teste de hipóteses apropriados para conjuntos de dados filogenômicos usando interrogação explícita de genealogia gênica resolvem algumas incertezas de longa data, como a ordem de ramificação na base dos teleósteos e entre euteleósteos iniciais, e a linhagem irmã das radiações acantomorfos e percomorfos. Calibrações fóssil abrangentes datam a origem de todas as principais linhagens de peixes antes do fim do Cretáceo.",
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    doi = "10.1073/pnas.1719358115",
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16. Clement, Alice M., 2019, Peixes Sarcopterígeos, as "Afinas de Lóbulos": Ciências da Vida Fascinantes: p. 119-142.

BibTeX
@incollection{clement2019sarcopterygian,
    author = "Clement, Alice M.",
    title = "Peixes Sarcopterígeos, as "Afinas de Lóbulos"",
    year = "2019",
    booktitle = "Ciências da Vida Fascinantes",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-319-93560-7\_6",
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17. Striedter, Georg F. e Northcutt, R. Glenn, 2019, A Origem das Mandíbulas e das Aletas Pareadas.

Resumo

Resumo Entre 450 e 500 milhões de anos atrás, alguns vertebrados evoluíram aletas pareadas e mandíbulas, o que os tornou nadadores mais eficientes e predadores mais ferozes. Estes vertebrados com mandíbulas (ou seja, gnatosstomas) diversificaram-se no período Devoniano, mas a maioria extinguiu-se durante a extinção em massa do final do Devoniano. Os gnatosstomas sobreviventes possuíam um aparelho vestibular mais complexo do que seus ancestrais sem mandíbulas, um conjunto expandido de genes de receptores olfativos e receptores vomeronasais. Uma inovação importante nos cérebros dos gnatosstomas foi o surgimento de um cerebelo distinto das áreas semelhantes ao cerebelo encontradas em todos os vertebrados. O telencéfalo dos primeiros vertebrados processava principalmente informações olfativas, mas essa dominância olfativa foi independentemente reduzida em três linhagens posteriores, a saber, nos peixes cartilaginosos, nos peixes de aletas raiadas e nos tetrápodes. Em conjunto com a redução da dominância olfativa, essas linhagens ampliaram seu telencéfalo, em relação a outras regiões cerebrais, e evoluíram um "pálido dorsal" telencéfalo que recebe informações sensoriais não olfativas do diencéfalo.

BibTeX
@incollection{doi101093oso97801951256890030003,
    author = "Striedter, Georg F. e Northcutt, R. Glenn",
    title = "A Origem das Mandíbulas e das Aletas Pareadas",
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    abstract = "Resumo Entre 450 e 500 milhões de anos atrás, alguns vertebrados evoluíram aletas pareadas e mandíbulas, o que os tornou nadadores mais eficientes e predadores mais ferozes. Estes vertebrados com mandíbulas (ou seja, gnatosstomas) diversificaram-se no período Devoniano, mas a maioria extinguiu-se durante a extinção em massa do final do Devoniano. Os gnatosstomas sobreviventes possuíam um aparelho vestibular mais complexo do que seus ancestrais sem mandíbulas, um conjunto expandido de genes de receptores olfativos e receptores vomeronasais. Uma inovação importante nos cérebros dos gnatosstomas foi o surgimento de um cerebelo distinto das áreas semelhantes ao cerebelo encontradas em todos os vertebrados. O telencéfalo dos primeiros vertebrados processava principalmente informações olfativas, mas essa dominância olfativa foi independentemente reduzida em três linhagens posteriores, a saber, nos peixes cartilaginosos, nos peixes de aletas raiadas e nos tetrápodes. Em conjunto com a redução da dominância olfativa, essas linhagens ampliaram seu telencéfalo, em relação a outras regiões cerebrais, e evoluíram um "pálido dorsal" telencéfalo que recebe informações sensoriais não olfativas do diencéfalo.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195125689.003.0003",
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18. Schmidt, Matthias, 2020, Evolução do Hipotálamo e do Lobo Inferior em Peixes de Raio: Cérebro, Comportamento e Evolução: v. 95, no. 6: p. 302-316.

Resumo

Os lobos inferiores são áreas bilaterais proeminentes do cérebro no hipotálamo dos neopterígeos entre os peixes de raio. São conhecidos como centros de integração multisensorial. Como tal, devem desempenhar um papel importante na evolução dos peixes. Neste estudo, foi realizada uma análise morfométrica comparativa. A morfologia do hipotálamo, onde o lobo inferior é considerado totalmente desenvolvido primeiro em Lepisosteus, foi então reexaminada. Cem cérebros de diferentes espécies de 60 famílias de peixes de raio foram corados com cresil violeta e incorporados em metacrilato. Em seguida, foram cortados em um microtomo enquanto realizavam imageamento de face de bloco. Os volumes foram determinados para o cérebro inteiro, áreas cerebrais e núcleos. Como a entrada visual representa uma entrada sensorial importante para o lobo inferior, o núcleo glomerulosus, um núcleo relacionado à visão em paracantopterígeos e acantopterígeos teleósteos, e o tectum opticum foram incluídos nas investigações. A análise morfométrica revelou que o volume relativo dos lobos inferiores aumenta significativamente das espécies dos Lepisosteiformes aos Tetraodontiformes. Além disso, foi detectada uma correlação positiva entre o volume relativo dos lobos inferiores e o volume relativo do núcleo glomerulosus ou o volume relativo do tectum opticum. Essas correlações, em combinação com achados de estudos hodológicos e comportamentais anteriores, levam à especulação de que os lobos inferiores podem estar envolvidos em processos cognitivos superiores e interações sociais complexas.

BibTeX
@article{schmidt2020evolução,
    author = "Schmidt, Matthias",
    title = "Evolução do Hipotálamo e do Lobo Inferior em Peixes de Raio",
    year = "2020",
    journal = "Cérebro, Comportamento e Evolução",
    abstract = "Os lobos inferiores são áreas bilaterais proeminentes do cérebro no hipotálamo dos neopterígeos entre os peixes de raio. São conhecidos como centros de integração multisensorial. Como tal, devem desempenhar um papel importante na evolução dos peixes. Neste estudo, foi realizada uma análise morfométrica comparativa. A morfologia do hipotálamo, onde o lobo inferior é considerado totalmente desenvolvido primeiro em Lepisosteus, foi então reexaminada. Cem cérebros de diferentes espécies de 60 famílias de peixes de raio foram corados com cresil violeta e incorporados em metacrilato. Em seguida, foram cortados em um microtomo enquanto realizavam imageamento de face de bloco. Os volumes foram determinados para o cérebro inteiro, áreas cerebrais e núcleos. Como a entrada visual representa uma entrada sensorial importante para o lobo inferior, o núcleo glomerulosus, um núcleo relacionado à visão em paracantopterígeos e acantopterígeos teleósteos, e o tectum opticum foram incluídos nas investigações. A análise morfométrica revelou que o volume relativo dos lobos inferiores aumenta significativamente das espécies dos Lepisosteiformes aos Tetraodontiformes. Além disso, foi detectada uma correlação positiva entre o volume relativo dos lobos inferiores e o volume relativo do núcleo glomerulosus ou o volume relativo do tectum opticum. Essas correlações, em combinação com achados de estudos hodológicos e comportamentais anteriores, levam à especulação de que os lobos inferiores podem estar envolvidos em processos cognitivos superiores e interações sociais complexas.",
    url = "https://doi.org/10.1159/000505898",
    doi = "10.1159/000505898",
    number = "6",
    openalex = "W3012704817",
    pages = "302-316",
    volume = "95",
    references = "doi1010029781119174844, doi101002ara20253, doi101002cne20183, doi101002cne20853, doi101016016622369593932n, doi101016s0361923001006992, doi101093icb424743, doi101098rspb19980569, doi101098rspb20063748, doi101159000101067"
}

19. Figueroa, Rodrigo Tinoco e Goodvin, Danielle e Kolmann, Matthew A. e Coates, Michael I. e Caron, Abigail M. e Friedman, Matt e Giles, Sam, 2022, Preservação excepcional de fósseis e evolução do cérebro de peixes de nadadeiras raiadas: bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory).

Resumo

RESUMO A anatomia cerebral fornece evidências chave para as relações entre peixes de nadadeiras raiadas 1, mas duas limitações principais obscurecem nossa compreensão da evolução neuroanatômica neste grande grupo de vertebrados. Primeiro, as linhagens vivas mais profundamente ramificadas estão separadas do ancestral comum do grupo por centenas de milhões de anos, com indicações de que aspectos de sua morfologia cerebral – como outros aspectos de sua anatomia 2,3 – são especializados em relação às condições primitivas. Segundo, não há restrições diretas sobre a morfologia cerebral nos primeiros peixes de nadadeiras raiadas além da imagem grosseira fornecida pelos endocastos cranianos: preenchimentos naturais ou virtuais de espaços vazios dentro do crânio 4–8. Aqui, relatamos a preservação de tecidos moles do cérebro e nervos cranianos em † Coccocephalichthys wildi, um peixe de nadadeiras raiadas com aproximadamente 319 milhões de anos (Myr). Este é o exemplo mais antigo de um cérebro de vertebrado bem preservado, fornecendo uma janela única para a anatomia neural profundamente dentro da filogenia dos peixes de nadadeiras raiadas. † Coccocephalichthys indica um padrão mais complicado de evolução cerebral do que sugerido apenas pelas espécies vivas, destacando apomorfias cladísticas 9 e fornecendo restrições temporais sobre a origem de traços que unem todos os peixes de nadadeiras raiadas extantes 9–11. Nossas descobertas, juntamente com um conjunto crescente de estudos em outros grupos animais 12–16, apontam para a importância da preservação de tecidos moles antigos na compreensão da montagem evolutiva profunda de sistemas anatômicos principais fora do estreito subconjunto de tecidos esqueléticos 17–20.

BibTeX
@misc{doi10110120220604492470,
    author = "Figueroa, Rodrigo Tinoco e Goodvin, Danielle e Kolmann, Matthew A. e Coates, Michael I. e Caron, Abigail M. e Friedman, Matt e Giles, Sam",
    title = "Preservação excepcional de fósseis e evolução do cérebro de peixes de nadadeiras raiadas",
    year = "2022",
    booktitle = "bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)",
    abstract = "RESUMO A anatomia cerebral fornece evidências chave para as relações entre peixes de nadadeiras raiadas 1, mas duas limitações principais obscurecem nossa compreensão da evolução neuroanatômica neste grande grupo de vertebrados. Primeiro, as linhagens vivas mais profundamente ramificadas estão separadas do ancestral comum do grupo por centenas de milhões de anos, com indicações de que aspectos de sua morfologia cerebral – como outros aspectos de sua anatomia 2,3 – são especializados em relação às condições primitivas. Segundo, não há restrições diretas sobre a morfologia cerebral nos primeiros peixes de nadadeiras raiadas além da imagem grosseira fornecida pelos endocastos cranianos: preenchimentos naturais ou virtuais de espaços vazios dentro do crânio 4–8. Aqui, relatamos a preservação de tecidos moles do cérebro e nervos cranianos em † Coccocephalichthys wildi, um peixe de nadadeiras raiadas com aproximadamente 319 milhões de anos (Myr). Este é o exemplo mais antigo de um cérebro de vertebrado bem preservado, fornecendo uma janela única para a anatomia neural profundamente dentro da filogenia dos peixes de nadadeiras raiadas. † Coccocephalichthys indica um padrão mais complicado de evolução cerebral do que sugerido apenas pelas espécies vivas, destacando apomorfias cladísticas 9 e fornecendo restrições temporais sobre a origem de traços que unem todos os peixes de nadadeiras raiadas extantes 9–11. Nossas descobertas, juntamente com um conjunto crescente de estudos em outros grupos animais 12–16, apontam para a importância da preservação de tecidos moles antigos na compreensão da montagem evolutiva profunda de sistemas anatômicos principais fora do estreito subconjunto de tecidos esqueléticos 17–20.",
    url = "https://doi.org/10.1101/2022.06.04.492470",
    doi = "10.1101/2022.06.04.492470",
    openalex = "W4281693793",
    references = "schmidt2020evolution"
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