Biologia molecular

@misc{britten1986rates1,
    author = "Britten, R. J",
    title = "As taxas de evolução de sequências de DNA diferem entre grupos taxonômicos",
    year = "1986",
    howpublished = "Science, v. 231, p. 1393-1398",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Britten, R. J., 1986, As taxas de evolução de sequências de DNA diferem entre grupos taxonômicos: Science, v. 231, p. 1393-1398.}"
}

FUNDO: Relógios circadianos são osciladores biológicos que regulam ritmos moleculares, fisiológicos e comportamentais em uma ampla variedade de organismos. Embora os ritmos comportamentais sejam tipicamente monitorados ao longo de muitos ciclos, uma abordagem similar para ritmos moleculares não era possível até recentemente; o advento da análise em tempo real usando relatórios transgênicos agora permite a observação de ritmos moleculares ao longo de muitos ciclos também. Este desenvolvimento sugere que novos detalhes sobre a relação entre ritmos moleculares e comportamentais podem ser revelados. Mesmo assim, a ritmicidade comportamental e molecular tem sido analisada usando métodos diferentes, tornando tais comparações difíceis de alcançar. Para abordar essa limitação, entre outras, desenvolvemos um conjunto de ferramentas analíticas integradas para unificar a análise de ritmos biológicos através de modalidades. RESULTADOS: Demonstramos uma adaptação da análise de sinais digitais que permite tratamento similar tanto de dados comportamentais quanto moleculares de nossos estudos de Drosophila. Para ambos os tipos de dados, aplicamos filtros digitais para extrair e esclarecer detalhes de interesse; empregamos métodos de autocorrelação e análise espectral para avaliar a ritmicidade e estimar o período; avaliamos deslocamentos de fase usando correlação cruzada; e usamos estatísticas circulares para extrair informações sobre a fase. CONCLUSÃO: Usando dados gerados por nossa investigação de ritmos em Drosophila, demonstramos como uma agregação única de ferramentas analíticas pode ser usada para analisar e comparar ritmos comportamentais e moleculares. Estes métodos são mostrados como versáteis e também serão adaptáveis a experimentos futuros, em parte devido à natureza não proprietária do código que desenvolvemos.

@article{doi1011861471220231,
    author = "Levine, Joel D and Funes, Pablo and Dowse, Harold B and Hall, Jeffrey C",
    title = "Signal analysis of behavioral and molecular cycles.",
    year = "2002",
    journal = "BMC neuroscience",
    abstract = "FUNDO: Relógios circadianos são osciladores biológicos que regulam ritmos moleculares, fisiológicos e comportamentais em uma ampla variedade de organismos. Embora os ritmos comportamentais sejam tipicamente monitorados ao longo de muitos ciclos, uma abordagem similar para ritmos moleculares não era possível até recentemente; o advento da análise em tempo real usando relatórios transgênicos agora permite a observação de ritmos moleculares ao longo de muitos ciclos também. Este desenvolvimento sugere que novos detalhes sobre a relação entre ritmos moleculares e comportamentais podem ser revelados. Mesmo assim, a ritmicidade comportamental e molecular tem sido analisada usando métodos diferentes, tornando tais comparações difíceis de alcançar. Para abordar essa limitação, entre outras, desenvolvemos um conjunto de ferramentas analíticas integradas para unificar a análise de ritmos biológicos através de modalidades. RESULTADOS: Demonstramos uma adaptação da análise de sinais digitais que permite tratamento similar tanto de dados comportamentais quanto moleculares de nossos estudos de Drosophila. Para ambos os tipos de dados, aplicamos filtros digitais para extrair e esclarecer detalhes de interesse; empregamos métodos de autocorrelação e análise espectral para avaliar a ritmicidade e estimar o período; avaliamos deslocamentos de fase usando correlação cruzada; e usamos estatísticas circulares para extrair informações sobre a fase. CONCLUSÃO: Usando dados gerados por nossa investigação de ritmos em Drosophila, demonstramos como uma agregação única de ferramentas analíticas pode ser usada para analisar e comparar ritmos comportamentais e moleculares. Estes métodos são mostrados como versáteis e também serão adaptáveis a experimentos futuros, em parte devido à natureza não proprietária do código que desenvolvemos.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC65508/",
    doi = "10.1186/1471-2202-3-1",
    pmcid = "PMC65508",
    pmid = "11825337"
}

@article{cranston2005molecular,
    author = "Cranston, K e Rannala, B",
    title = "Relógios moleculares: Fechando a lacuna entre rochas e relógios",
    year = "2005",
    journal = "Heredity",
    url = "https://doi.org/10.1038/sj.hdy.6800644",
    doi = "10.1038/sj.hdy.6800644",
    number = "5",
    pages = "461-462",
    volume = "94"
}

O ritmo circadiano é a aproximadamente 24 horas de ritmicidade que regula a fisiologia e o comportamento em uma variedade de organismos. O sistema circadiano mamífero é organizado de forma hierárquica. Oscilações circadianas moleculares impulsionadas por loops de feedback genético são encontradas em células individuais, enquanto os ritmos circadianos em diferentes sistemas do corpo são orquestrados pelo relógio mestre no núcleo supraquiasmático (SCN) do hipotálamo anterior. O SCN recebe input fotico da retina e sincroniza ritmos endógenos com os ciclos externos de luz/escuro. O SCN regula ritmos circadianos nos osciladores periféricos via sinais neurais e humorais, que explicam as flutuações diárias dos processos fisiológicos nesses órgãos. A interrupção dos ritmos circadianos pode causar problemas de saúde e a disfunção circadiana tem sido associada a muitas doenças humanas.

@misc{cao2019molecular,
    author = "Cao, Ruifeng",
    title = "Biologia Molecular e Fisiologia dos Relógios Circadianos",
    year = "2019",
    booktitle = "Oxford Research Encyclopedia of Neuroscience",
    abstract = "O ritmo circadiano é a aproximadamente 24 horas de ritmicidade que regula a fisiologia e o comportamento em uma variedade de organismos. O sistema circadiano mamífero é organizado de forma hierárquica. Oscilações circadianas moleculares impulsionadas por loops de feedback genético são encontradas em células individuais, enquanto os ritmos circadianos em diferentes sistemas do corpo são orquestrados pelo relógio mestre no núcleo supraquiasmático (SCN) do hipotálamo anterior. O SCN recebe input fotico da retina e sincroniza ritmos endógenos com os ciclos externos de luz/escuro. O SCN regula ritmos circadianos nos osciladores periféricos via sinais neurais e humorais, que explicam as flutuações diárias dos processos fisiológicos nesses órgãos. A interrupção dos ritmos circadianos pode causar problemas de saúde e a disfunção circadiana tem sido associada a muitas doenças humanas.",
    url = "https://doi.org/10.1093/acrefore/9780190264086.013.28",
    doi = "10.1093/acrefore/9780190264086.013.28"
}