Espécies

@book{dobzhansky1937genetics2,
    author = "Dobzhansky, T",
    title = "Genetics and the Origin of Species [1st ed.]",
    year = "1937",
    publisher = "New York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dobzhansky, T., 1937, Genetics and the Origin of Species [1st ed.]: New York, Columbia University Press.}"
}

@article{alexander1963animal,
    author = "Alexander, Richard D.",
    title = "Animal Species, Evolução, e Isolamento Geográfico",
    year = "1963",
    journal = "Systematic Zoology",
    url = "https://doi.org/10.2307/2411761",
    doi = "10.2307/2411761",
    number = "4",
    pages = "202",
    volume = "12"
}

@misc{cain1963animal1,
    author = "Cain, A. J",
    title = "Animal Species and Their Evolution [2ª ed.]",
    year = "1963",
    howpublished = "Londres, Hutchinson",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cain, A. J., 1963, Animal Species and Their Evolution [2ª ed.]: Londres, Hutchinson.}"
}

@misc{mayr1963animal,
    author = "Mayr, Ernst",
    title = "Espécies Animais e Evolução",
    year = "1963",
    url = "https://doi.org/10.4159/harvard.9780674865327",
    doi = "10.4159/harvard.9780674865327"
}

@book{mayr1963animal3,
    author = "Mayr, E",
    title = "Animal Species and Evolution",
    year = "1963",
    publisher = "Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Mayr, E., 1963, Animal Species and Evolution: Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
}

@article{inger1964animal,
    author = "Inger, Robert F. e Mayr, Ernst",
    title = "Animal Species and Evolution",
    year = "1964",
    journal = "Copeia",
    url = "https://doi.org/10.2307/1440881",
    doi = "10.2307/1440881",
    number = "1",
    pages = "245",
    volume = "1964"
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@article{s2343636acfd7b4e72e423ba2a4426e2fd7af7b01e,
    author = "Horridge, G.",
    title = "Animal species and evolution.",
    year = "1964",
    journal = "The Eugenics Review",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/343636acfd7b4e72e423ba2a4426e2fd7af7b01e",
    is_oa = "true",
    semanticscholar_citation_count = "4604",
    semanticscholar_id = "343636acfd7b4e72e423ba2a4426e2fd7af7b01e"
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@article{stebbins1964the,
    author = "Stebbins, G. Ledyard",
    title = "THE EVOLUTION OF ANIMAL SPECIES",
    year = "1964",
    journal = "Evolução",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1964.tb01582.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1964.tb01582.x",
    number = "1",
    pages = "134-137",
    volume = "18"
}

@article{cain1965animal,
    author = "Cain, Arthur J.",
    title = "Animal Species and Evolution Ernst Mayr",
    year = "1965",
    journal = "The Auk",
    url = "https://doi.org/10.2307/4083237",
    doi = "10.2307/4083237",
    number = "4",
    pages = "654-657",
    volume = "82"
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@misc{raup1976species4,
    author = "Raup, D. M",
    title = "Diversidade de espécies no Fanerozoico",
    year = "1976",
    howpublished = "uma interpretação: Paleobiologia, v. 2, p. 289-297",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Raup, D. M., 1976, Diversidade de espécies no Fanerozoico: uma interpretação: Paleobiologia, v. 2, p. 289-297.}"
}

@misc{valentine1977transspecific5,
    author = "Valentine, J. W",
    title = "Evolução Transespecífica, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução",
    year = "1977",
    howpublished = "San Francisco, W. H. Freeman \& Co., p. 233-261",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Valentine, J. W., 1977, Evolução Transespecífica, em Dobzhansky, T., Ayala, F. J., Stebbins, G. L., e Valentine, J. W., eds., Evolução: San Francisco, W. H. Freeman \& Co., p. 233-261.}"
}

O DNA mitocondrial foi purificado de quatro espécies de primatas superiores (babuíno-da-guiné, macaco-rhesus, guenon e humano) e digerido com 11 endonucleases de restrição. Um mapa de clivagem foi construído para o DNA mitocondrial de cada espécie. A comparação dos mapas, alinhados em relação à origem e direção da replicação do DNA, revelou que as espécies diferem entre si na maioria dos sítios de clivagem. O grau de divergência na sequência de nucleotídeos nesses sítios foi calculado a partir da fração de sítios de clivagem compartilhados por cada par de espécies. Ao plotar o grau de divergência no DNA mitocondrial contra o tempo de divergência, a taxa de substituição de bases poderia ser calculada a partir da inclinação inicial da curva. O valor obtido, 0,02 substituições por par de bases por milhão de anos, foi comparado com o valor para DNA nuclear de cópia única. A taxa de evolução do genoma mitocondrial parece exceder a da fração de cópia única do genoma nuclear por um fator de aproximadamente 10. Esta alta taxa pode ser devido, em parte, a uma taxa elevada de mutação no DNA mitocondrial. Devido à alta taxa de evolução, o DNA mitocondrial é provavelmente uma molécula extremamente útil para empregar na análise de alta resolução do processo evolutivo.

@article{doi101073pnas7641967,
    author = "Brown, W. and George, M. and Wilson, A.",
    title = "Rapid evolution of animal mitochondrial DNA.",
    year = "1979",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America",
    abstract = "Mitochondrial DNA was purified from four species of higher primates (Guinea baboon, rhesus macaque, guenon, and human) and digested with 11 restriction endonucleases. A cleavage map was constructed for the mitochondrial DNA of each species. Comparison of the maps, aligned with respect to the origin and direction of DNA replication, revealed that the species differ from one another at most of the cleavage sites. The degree of divergence in nucleotide sequence at these sites was calculated from the fraction of cleavage sites shared by each pair of species. By plotting the degree of divergence in mitochondrial DNA against time of divergence, the rate of base substitution could be calculated from the initial slope of the curve. The value obtained, 0.02 substitutions per base pair per million years, was compared with the value for single-copy nuclear DNA. The rate of evolution of the mitochondrial genome appears to exceed that of the single-copy fraction of the nuclear genome by a factor of about 10. This high rate may be due, in part, to an elevated rate of mutation in mitochondrial DNA. Because of the high rate of evolution, mitochondrial DNA is likely to be an extremely useful molecule to employ for high-resolution analysis of the evolutionary process.",
    url = "https://europepmc.org/articles/pmc383514?pdf=render",
    doi = "10.1073/PNAS.76.4.1967",
    is_oa = "true",
    number = "4",
    pages = "1967-1971",
    semanticscholar_citation_count = "3300",
    semanticscholar_id = "b4cf89e5bbc66ef2100dd357d09d0068d9bac90d",
    volume = "76"
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@book{cain1993animal,
    author = "Cain, Arthur J.",
    title = "Espécies Animais e Sua Evolução",
    year = "1993",
    url = "https://doi.org/10.1515/9781400863273",
    doi = "10.1515/9781400863273"
}

@article{brooks1994animal,
    author = "Brooks, Daniel R.",
    title = "Espécies animais e sua evolução",
    year = "1994",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/0169-5347(94)90187-2",
    doi = "10.1016/0169-5347(94)90187-2",
    number = "4",
    pages = "153-154",
    volume = "9"
}

O temperamento descreve a ideia de que as diferenças comportamentais individuais são repetíveis ao longo do tempo e em diferentes situações. Este fenômeno comum abrange numerosos traços, como agressividade, evitação de novidades, disposição para assumir riscos, exploração e sociabilidade. O estudo do temperamento é central para a psicologia animal, genética comportamental, farmacologia e criação animal, mas relativamente poucos estudos examinaram a ecologia e evolução dos traços de temperamento. Esta situação é surpreendente, dado que o temperamento provavelmente exerce uma influência importante em muitos aspectos da ecologia e evolução animal, e que a variação individual no temperamento parece ser ubíqua entre as espécies animais. Explicações possíveis para este negligenciamento do temperamento incluem uma percepção de irrelevância, uma compreensão insuficiente do vínculo entre traços de temperamento e aptidão, e uma falta de coerência na terminologia, com traços semelhantes frequentemente recebendo nomes diferentes, ou traços diferentes recebendo o mesmo nome. Propomos que o temperamento pode e deve ser estudado dentro de um quadro de ecologia evolutiva e fornecemos uma terminologia que poderia ser usada como uma ferramenta de trabalho para estudos ecológicos do temperamento. Nossa terminologia inclui cinco categorias principais de traços de temperamento: timidez-ousadia, exploração-evitação, atividade, sociabilidade e agressividade. Esta terminologia não faz inferências sobre disposições subjacentes ou processos psicológicos, o que pode ter restringido ecologistas e biólogos evolutivos de trabalharem nesses traços. Apresentamos revisões extensas da literatura que demonstram que os traços de temperamento são hereditários e ligados à aptidão e a vários outros traços de importância para a ecologia e evolução. Além disso, descrevemos métodos de medição ecologicamente relevantes e apontamos para vários tópicos ecológicos e evolutivos que se beneficiariam de considerar o temperamento, como plasticidade fenotípica, biologia da conservação, amostragem populacional e biologia de invasões.

@article{doi101111j1469185x200700010x,
    author = "Réale, D. e Reader, S. e Sol, D. e McDougall, P. T. e Dingemanse, N.",
    title = "Integrando o temperamento animal dentro da ecologia e evolução",
    year = "2007",
    journal = "Biological Reviews",
    abstract = "O temperamento descreve a ideia de que as diferenças comportamentais individuais são repetíveis ao longo do tempo e em diferentes situações. Este fenômeno comum abrange numerosos traços, como agressividade, evitação de novidades, disposição para assumir riscos, exploração e sociabilidade. O estudo do temperamento é central para a psicologia animal, genética comportamental, farmacologia e criação animal, mas relativamente poucos estudos examinaram a ecologia e evolução dos traços de temperamento. Esta situação é surpreendente, dado que o temperamento provavelmente exerce uma influência importante em muitos aspectos da ecologia e evolução animal, e que a variação individual no temperamento parece ser ubíqua entre as espécies animais. Explicações possíveis para este negligenciamento do temperamento incluem uma percepção de irrelevância, uma compreensão insuficiente do vínculo entre traços de temperamento e aptidão, e uma falta de coerência na terminologia, com traços semelhantes frequentemente recebendo nomes diferentes, ou traços diferentes recebendo o mesmo nome. Propomos que o temperamento pode e deve ser estudado dentro de um quadro de ecologia evolutiva e fornecemos uma terminologia que poderia ser usada como uma ferramenta de trabalho para estudos ecológicos do temperamento. Nossa terminologia inclui cinco categorias principais de traços de temperamento: timidez-ousadia, exploração-evitação, atividade, sociabilidade e agressividade. Esta terminologia não faz inferências sobre disposições subjacentes ou processos psicológicos, o que pode ter restringido ecologistas e biólogos evolutivos de trabalharem nesses traços. Apresentamos revisões extensas da literatura que demonstram que os traços de temperamento são hereditários e ligados à aptidão e a vários outros traços de importância para a ecologia e evolução. Além disso, descrevemos métodos de medição ecologicamente relevantes e apontamos para vários tópicos ecológicos e evolutivos que se beneficiariam de considerar o temperamento, como plasticidade fenotípica, biologia da conservação, amostragem populacional e biologia de invasões.",
    url = "https://dspace.library.uu.nl/bitstream/handle/1874/25732/reader\_07\_integratinganimaltemperament.pdf?sequence=1\&isAllowed=y",
    doi = "10.1111/j.1469-185X.2007.00010.x",
    is_oa = "true",
    number = "2",
    pages = "291-318",
    semanticscholar_citation_count = "3268",
    semanticscholar_id = "6c8a3a23a9dda76402597d002ba0ca649befabe0",
    volume = "82"
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@article{doi101016jympev201406016,
    author = "Peng, Guangda e Shi, Xiao e Kadowaki, Tatsuhiko",
    title = "Evolução de canais TRP inferida por sua classificação em diversas espécies animais",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.06.016",
    doi = "10.1016/j.ympev.2014.06.016",
    openalex = "W2066880427",
    references = "doi101242dev085464"
}

Prólogo ix 1 Um Primata Enigmático 1 2 Não é Nossa Inteligência 8 3 Exploradores Europeus Perdidos 22 4 Como Criar uma Espécie Cultural 34 5 Para Que Servem os Cérebros Grandes? Ou, Como a Cultura Roubou Nosso Estômago 54 6 Por Que Algumas Pessoas Têm Olhos Azuis 83 7 Sobre a Origem da Fé 97 8 Prestígio, Dominância e Menopausa 117 9 Parentes por Casamento, Tabus de Incesto e Rituais 140 10 A Competição Intergrupal Molda a Evolução Cultural 166 11 Autodomesticação 185 12 Nossos Cérebros Coletivos 211 13 Ferramentas Comunicativas com Regras 231 14 Cérebros Enculturados e Hormônios Honrados 260 15 Quando Cruzamos o Rubicão 280 16 Por Que Nós? 296 17 Um Novo Tipo de Animal 314 Notas 333 Referências 373 Créditos das Ilustrações 429 Índice 431

@article{doi105860choice195747,
    title = "O segredo do nosso sucesso: como a cultura está impulsionando a evolução humana, domesticando nossa espécie e tornando-nos mais inteligentes",
    year = "2016",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Prólogo ix 1 Um Primata Enigmático 1 2 Não é Nossa Inteligência 8 3 Exploradores Europeus Perdidos 22 4 Como Criar uma Espécie Cultural 34 5 Para Que Servem os Cérebros Grandes? Ou, Como a Cultura Roubou Nosso Estômago 54 6 Por Que Algumas Pessoas Têm Olhos Azuis 83 7 Sobre a Origem da Fé 97 8 Prestígio, Dominância e Menopausa 117 9 Parentes por Casamento, Tabus de Incesto e Rituais 140 10 A Competição Intergrupal Molda a Evolução Cultural 166 11 Autodomesticação 185 12 Nossos Cérebros Coletivos 211 13 Ferramentas Comunicativas com Regras 231 14 Cérebros Enculturados e Hormônios Honrados 260 15 Quando Cruzamos o Rubicão 280 16 Por Que Nós? 296 17 Um Novo Tipo de Animal 314 Notas 333 Referências 373 Créditos das Ilustrações 429 Índice 431",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.195747",
    doi = "10.5860/choice.195747",
    openalex = "W2255750102"
}

@article{doi101038s4155902101488y,
    author = "Kahrl, A. e Snook, Rhonda R. e Fitzpatrick, J.",
    title = "O modo de fertilização impulsiona a evolução do comprimento dos espermatozoides em toda a árvore da vida animal",
    year = "2021",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/90f0f0d391364572f154e1e448bcf4b13332daf5",
    doi = "10.1038/s41559-021-01488-y",
    is_oa = "true",
    number = "8",
    pages = "1153-1164",
    semanticscholar_citation_count = "53",
    semanticscholar_id = "90f0f0d391364572f154e1e448bcf4b13332daf5",
    volume = "5"
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A metilação de citosinas é uma modificação epigenética prototípica do DNA. Ela tem sido implicada em vários mecanismos regulatórios em todo o reino animal e particularmente em vertebrados. Mapeamos a metilação de DNA em 580 espécies animais (535 vertebrados, 45 invertebrados), resultando em 2443 perfis de metilação de DNA em escala de genoma de múltiplos órgãos. A análise bioinformática deste grande conjunto de dados quantificou a associação da metilação de DNA com a sequência de DNA genômica subjacente ao longo da evolução vertebrada. Observamos um vínculo amplamente conservado com duas transições principais — uma nos primeiros vertebrados e outra com o surgimento dos répteis. Comparações entre espécies focadas em órgãos individuais apoiaram uma associação profundamente conservada da metilação de DNA com o tipo de tecido, e a análise de mapeamento cruzado da metilação de DNA em promotores de genes revelou mudanças evolutivas para genes ortólogos. Em resumo, este estudo estabelece um grande recurso de metilomas de DNA de vertebrados e invertebrados, destaca o poder da análise de epigenoma livre de referência em espécies para as quais não estão disponíveis genomas de referência e contribui com uma perspectiva epigenética para o estudo da evolução vertebrada. A metilação de DNA está envolvida em processos regulatórios em todo o reino animal. Aqui, os autores mapeiam a metilação de DNA em 535 vertebrados e 45 invertebrados, estabelecendo um conjunto de dados de referência para análise entre espécies e explorando a variação epigenética ao longo da evolução vertebrada.

@article{doi101038s4146702234828y,
    author = "Klughammer, J. e Romanovskaia, Daria e Nemc, A. e Posautz, A. e Seid, C. e Schuster, L. e Keinath, Melissa C. e Ramos, J. S. Lugo e Kosack, Lindsay e Evankow, Ann e Printz, D. e Kirchberger, Stefanie e Ergüner, B. e Datlinger, Paul e Fortelny, N. e Schmidl, Christian e Farlik, M. e Skjærven, K. e Bergthaler, A. e Liedvogel, Miriam e Thaller, Denise e Burger, P. e Hermann, Marcela e Distel, M. e Distel, D. e Kübber-Heiss, A. e Bock, Christoph",
    title = "Análise comparativa de perfis de metilação de DNA em escala de genoma e resolução de base em 580 espécies animais",
    year = "2022",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "A metilação de citosinas é uma modificação epigenética prototípica do DNA. Ela tem sido implicada em vários mecanismos regulatórios em todo o reino animal e particularmente em vertebrados. Mapeamos a metilação de DNA em 580 espécies animais (535 vertebrados, 45 invertebrados), resultando em 2443 perfis de metilação de DNA em escala de genoma de múltiplos órgãos. A análise bioinformática deste grande conjunto de dados quantificou a associação da metilação de DNA com a sequência de DNA genômica subjacente ao longo da evolução vertebrada. Observamos um vínculo amplamente conservado com duas transições principais — uma nos primeiros vertebrados e outra com o surgimento dos répteis. Comparações entre espécies focadas em órgãos individuais apoiaram uma associação profundamente conservada da metilação de DNA com o tipo de tecido, e a análise de mapeamento cruzado da metilação de DNA em promotores de genes revelou mudanças evolutivas para genes ortólogos. Em resumo, este estudo estabelece um grande recurso de metilomas de DNA de vertebrados e invertebrados, destaca o poder da análise de epigenoma livre de referência em espécies para as quais não estão disponíveis genomas de referência e contribui com uma perspectiva epigenética para o estudo da evolução vertebrada. A metilação de DNA está envolvida em processos regulatórios em todo o reino animal. Aqui, os autores mapeiam a metilação de DNA em 535 vertebrados e 45 invertebrados, estabelecendo um conjunto de dados de referência para análise entre espécies e explorando a variação epigenética ao longo da evolução vertebrada.",
    url = "https://www.nature.com/articles/s41467-022-34828-y.pdf",
    doi = "10.1038/s41467-022-34828-y",
    is_oa = "true",
    number = "1",
    semanticscholar_citation_count = "78",
    semanticscholar_id = "aa1b0f8a6fd5dad8f36085c6561d7223b47c47e8",
    volume = "14"
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