Diversidade de espécies

@article{connell1964the,
    author = "Connell, Joseph H. e Orias, Eduardo",
    title = "A Regulação Ecológica da Diversidade de Espécies",
    year = "1964",
    journal = "The American Naturalist",
    url = "https://doi.org/10.1086/282335",
    doi = "10.1086/282335",
    number = "903",
    pages = "399-414",
    volume = "98"
}

@misc{erhlich1969differentiations2,
    author = "Erhlich, P. R. e Raven, P. H",
    title = "Diferenciações em populações",
    year = "1969",
    howpublished = "Science, v. 165, p. 1228-1231",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Erhlich, P. R., e Raven, P. H., 1969, Diferenciações em populações: Science, v. 165, p. 1228-1231.}"
}

A deriva ecológica faz com que as abundâncias das espécies flutuem aleatoriamente, reduzindo a diversidade dentro das comunidades e aumentando as diferenças entre comunidades de outra forma equivalentes. Apesar do amplo interesse na deriva ecológica, os ecólogos têm pouca evidência experimental de suas consequências na natureza, onde as forças competitivas modulam as abundâncias das espécies. Manipulamos a deriva impondo uma variação de 40 vezes no tamanho de comunidades de plantas anuais experimentalmente montadas e mantendo suas proporções de borda para interior comparáveis. A deriva ao longo de três gerações foi maior do que previsto por modelos neutros, causando altas taxas de extinção e rápida divergência na composição entre comunidades menores. Assimetrias competitivas levaram as populações da maioria das espécies a tamanhos pequenos o suficiente para que a estocasticidade demográfica pudesse influenciar marcadamente a dinâmica, aumentando a importância da deriva nas comunidades. Os fortes efeitos da deriva ocorreram apesar das diferenças de nicho estabilizadoras, que fazem com que as espécies tenham maiores taxas de crescimento populacional quando em baixa abundância local. No geral, a importância da deriva ecológica parece ser maior em comunidades não neutras do que anteriormente reconhecido, e varia com o tamanho da comunidade e o tipo e a força da dependência de densidade.

@article{doi101098rspb20170507,
    author = "Gilbert, B. e Levine, J.",
    title = "Deriva ecológica e a distribuição da diversidade de espécies",
    year = "2017",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences",
    abstract = "A deriva ecológica faz com que as abundâncias das espécies flutuem aleatoriamente, reduzindo a diversidade dentro das comunidades e aumentando as diferenças entre comunidades de outra forma equivalentes. Apesar do amplo interesse na deriva ecológica, os ecólogos têm pouca evidência experimental de suas consequências na natureza, onde as forças competitivas modulam as abundâncias das espécies. Manipulamos a deriva impondo uma variação de 40 vezes no tamanho de comunidades de plantas anuais experimentalmente montadas e mantendo suas proporções de borda para interior comparáveis. A deriva ao longo de três gerações foi maior do que previsto por modelos neutros, causando altas taxas de extinção e rápida divergência na composição entre comunidades menores. Assimetrias competitivas levaram as populações da maioria das espécies a tamanhos pequenos o suficiente para que a estocasticidade demográfica pudesse influenciar marcadamente a dinâmica, aumentando a importância da deriva nas comunidades. Os fortes efeitos da deriva ocorreram apesar das diferenças de nicho estabilizadoras, que fazem com que as espécies tenham maiores taxas de crescimento populacional quando em baixa abundância local. No geral, a importância da deriva ecológica parece ser maior em comunidades não neutras do que anteriormente reconhecido, e varia com o tamanho da comunidade e o tipo e a força da dependência de densidade.",
    url = "https://royalsocietypublishing.org/doi/pdf/10.1098/rspb.2017.0507",
    doi = "10.1098/rspb.2017.0507",
    is_oa = "true",
    number = "1855",
    pages = "20170507",
    semanticscholar_citation_count = "173",
    semanticscholar_id = "357621918a10eefdfa8f55f60cf1f2590cf8a7c2",
    volume = "284"
}

Resumo. Banaybanay DP, Amparado OA, Morilla LJG, Estaño LA. 2024. Diversidade de espécies de Odonata no ecossistema urbano da cidade de Iligan, Filipinas. Biodiversitas 25: 890-899. A urbanização impacta a função e os serviços dos ecossistemas, resultando em mudanças nos processos ecológicos, aumento da população humana e perda de biodiversidade. Esta ameaça pode influenciar a abundância, diversidade e distribuição das espécies de Odonata em habitats de água doce. A pesquisa de Odonata no ecossistema urbano na cidade de Iligan foi realizada de dezembro de 2022 a março de 2023 para determinar a diversidade de espécies, abundância, endemismo, distribuição e sua correlação com vários parâmetros ambientais no habitat de água doce nesta área. A coleta de campo foi realizada em seis bairros identificados: Barangay Tubod, Bagong Silang, Del Carmen, Villa Verde, Poblacion e Ubaldo Laya. O estudo registrou 569 indivíduos pertencentes a duas famílias principais de Odonatos, a Família Libellulidae, composta por nove espécies: Acisoma panorpoides, Brachydiplax chalybea, Crocothemis servilia, Diplacodes trivialis, Neurothemis terminata, Neurothemis ramburii, Orthetrum sabina, Rhodothemis rufa e Trithemis aurora; e a Família Coenagrionidae com quatro espécies: Agriocnemis femina, Ceriagrion lieftincki, Ischnura senegalensis e Pseudagrion pilidorsum. Entre as espécies registradas, I. senegalensis (34,80%) foi encontrada como a espécie mais abundante, seguida por A. femina (32,51%) e O. sabina (10,54%), que foram encontradas em todos os locais de amostragem. Enquanto isso, a baixa diversidade e o baixo endemismo (7,69%) foram registrados em todas as áreas de amostragem, com C. lieftincki sendo o único endêmico filipino registrado no Iligan City Wet Park e no Barangay Bagong Silang. A análise de correspondência canônica revela que fatores ambientais, como temperatura do ar, temperatura da água, pH da água, turbidez da água e umidade relativa, são parâmetros cruciais para determinar o agrupamento de Odonata. No geral, os ecossistemas urbanos na cidade de Iligan são dominados por espécies orientais, indicando que as áreas estão fortemente perturbadas. Portanto, é necessária uma gestão urgente dos ecossistemas urbanos para melhorar a saúde ecológica, a sustentabilidade e a biodiversidade de insetos da cidade.

@article{doi1013057biodivd250249,
    author = "Banaybanay, Dranreb P. e Amparado, Olive A. e Morilla, L. J. G. e Estaño, L.",
    title = "Diversidade de espécies de Odonata no ecossistema urbano da cidade de Iligan, Filipinas",
    year = "2024",
    journal = "Biodiversitas Journal of Biological Diversity",
    abstract = "Resumo. Banaybanay DP, Amparado OA, Morilla LJG, Estaño LA. 2024. Diversidade de espécies de Odonata no ecossistema urbano da cidade de Iligan, Filipinas. Biodiversitas 25: 890-899. A urbanização impacta a função e os serviços dos ecossistemas, resultando em mudanças nos processos ecológicos, aumento da população humana e perda de biodiversidade. Esta ameaça pode influenciar a abundância, diversidade e distribuição das espécies de Odonata em habitats de água doce. A pesquisa de Odonata no ecossistema urbano na cidade de Iligan foi realizada de dezembro de 2022 a março de 2023 para determinar a diversidade de espécies, abundância, endemismo, distribuição e sua correlação com vários parâmetros ambientais no habitat de água doce nesta área. A coleta de campo foi realizada em seis bairros identificados: Barangay Tubod, Bagong Silang, Del Carmen, Villa Verde, Poblacion e Ubaldo Laya. O estudo registrou 569 indivíduos pertencentes a duas famílias principais de Odonatos, a Família Libellulidae, composta por nove espécies: Acisoma panorpoides, Brachydiplax chalybea, Crocothemis servilia, Diplacodes trivialis, Neurothemis terminata, Neurothemis ramburii, Orthetrum sabina, Rhodothemis rufa e Trithemis aurora; e a Família Coenagrionidae com quatro espécies: Agriocnemis femina, Ceriagrion lieftincki, Ischnura senegalensis e Pseudagrion pilidorsum. Entre as espécies registradas, I. senegalensis (34,80%) foi encontrada como a espécie mais abundante, seguida por A. femina (32,51%) e O. sabina (10,54%), que foram encontradas em todos os locais de amostragem. Enquanto isso, a baixa diversidade e o baixo endemismo (7,69%) foram registrados em todas as áreas de amostragem, com C. lieftincki sendo o único endêmico filipino registrado no Iligan City Wet Park e no Barangay Bagong Silang. A análise de correspondência canônica revela que fatores ambientais, como temperatura do ar, temperatura da água, pH da água, turbidez da água e umidade relativa, são parâmetros cruciais para determinar o agrupamento de Odonata. No geral, os ecossistemas urbanos na cidade de Iligan são dominados por espécies orientais, indicando que as áreas estão fortemente perturbadas. Portanto, é necessária uma gestão urgente dos ecossistemas urbanos para melhorar a saúde ecológica, a sustentabilidade e a biodiversidade de insetos da cidade.",
    url = "https://smujo.id/biodiv/article/download/17119/7557",
    doi = "10.13057/biodiv/d250249",
    is_oa = "true",
    number = "2",
    semanticscholar_id = "6f1d7c8b91e3b7fb4c1eb913d1c9a540e85b7cc0",
    volume = "25"
}

Barreiras fluviais desempenharam, há muito tempo, um papel central nos modelos de diversificação de regiões tropicais, incluindo a excepcionalmente biodiversa ilha de Madagascar. Embora seu papel seja melhor compreendido ao integrar fatores adicionais, como altitude e o nicho ecológico de uma espécie, estudos empíricos que integram essas variáveis permanecem raros. Utilizamos sequenciamento de DNA associado a sítios de restrição para avaliar o efeito combinado de rios, topografia, clima e cobertura florestal sobre as distribuições e a diversidade de quatro espécies de Microcebus e duas espécies de Avahi (Primates, Lemuriformes) no nordeste de Madagascar. Inferimos a estrutura populacional, o fluxo gênico e a diversidade genética, e avaliamos a associação dessas variáveis ecogeográficas e da diferenciação genética utilizando modelos de isolamento por resistência. Nossos resultados mostram que diferenças significativas na diversidade genética e conectividade entre espécies podem ser explicadas por respostas específicas de espécie a características da paisagem e histórias filogeográficas. Especificamente, os rios apresentam barreiras gerais ao fluxo gênico, mas a dispersão entre sistemas interfluviais é possível por meio de regiões de cabeceira de alta altitude. Embora isso tenha levado a alta conectividade e diversidade genética em M. lehilahytsara e A. laniger, o fluxo gênico entre populações de M. jonahi é limitado pela baixa adequação do nicho climático em altitudes mais elevadas. Além disso, as distribuições mais restritas de M. macarthurii, M. simmonsi e A. mooreorum provavelmente resultaram de dinâmicas de refúgio e flutuações do nível do mar que levaram à divergência alopátrica e ao microendemismo. Juntos, as descobertas ilustram como as diferenças ecológicas entre espécies e as dinâmicas temporais da paisagem mediam o papel dos rios como barreiras de dispersão. Elas também destacam a importância de priorizar as cabeceiras dos rios e regiões topograficamente complexas, que foram mostradas a promover a conectividade, nos esforços de conservação.

@article{doi101111mec70195,
    author = "van Elst, Tobias e Schüßler, Dominik e Rafamantanantsoa, Stephan M e Radriarimanga, Tahiriniaina e Rabemananjara, Naina R e Rasolofoson, David W e Randimbiharinirina, R Doménico e Hohenlohe, Paul A e Radespiel, Ute",
    title = "Respostas Específicas de Espécie às Mudanças Paleoclimáticas e Barreiras de Paisagem Impulsionam Filogeografias Contrastantes de Espécies de Lêmures Co-distribuídas no Nordeste de Madagascar.",
    year = "2025",
    journal = "Molecular ecology",
    abstract = "Barreiras fluviais desempenharam, há muito tempo, um papel central nos modelos de diversificação de regiões tropicais, incluindo a excepcionalmente biodiversa ilha de Madagascar. Embora seu papel seja melhor compreendido ao integrar fatores adicionais, como altitude e o nicho ecológico de uma espécie, estudos empíricos que integram essas variáveis permanecem raros. Utilizamos sequenciamento de DNA associado a sítios de restrição para avaliar o efeito combinado de rios, topografia, clima e cobertura florestal sobre as distribuições e a diversidade de quatro espécies de Microcebus e duas espécies de Avahi (Primates, Lemuriformes) no nordeste de Madagascar. Inferimos a estrutura populacional, o fluxo gênico e a diversidade genética, e avaliamos a associação dessas variáveis ecogeográficas e da diferenciação genética utilizando modelos de isolamento por resistência. Nossos resultados mostram que diferenças significativas na diversidade genética e conectividade entre espécies podem ser explicadas por respostas específicas de espécie a características da paisagem e histórias filogeográficas. Especificamente, os rios apresentam barreiras gerais ao fluxo gênico, mas a dispersão entre sistemas interfluviais é possível por meio de regiões de cabeceira de alta altitude. Embora isso tenha levado a alta conectividade e diversidade genética em M. lehilahytsara e A. laniger, o fluxo gênico entre populações de M. jonahi é limitado pela baixa adequação do nicho climático em altitudes mais elevadas. Além disso, as distribuições mais restritas de M. macarthurii, M. simmonsi e A. mooreorum provavelmente resultaram de dinâmicas de refúgio e flutuações do nível do mar que levaram à divergência alopátrica e ao microendemismo. Juntos, as descobertas ilustram como as diferenças ecológicas entre espécies e as dinâmicas temporais da paisagem mediam o papel dos rios como barreiras de dispersão. Elas também destacam a importância de priorizar as cabeceiras dos rios e regiões topograficamente complexas, que foram mostradas a promover a conectividade, nos esforços de conservação.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12717996/",
    doi = "10.1111/mec.70195",
    pmcid = "PMC12717996",
    pmid = "41367356"
}

Fundo As limitações de dispersão variam entre espécies na mesma região. Para algumas espécies, a distância geográfica é a principal restrição, enquanto para outras, fatores ambientais, como padrões climáticos e de vegetação, desempenham um papel maior. Esses efeitos impulsionados pela paisagem são moldados por traços ecológicos específicos de cada espécie. Apesar de serem conceitualmente intuitivos, as hipóteses de genética da paisagem — como Isolamento por Distância e Isolamento por Ambiente — permanecem em grande parte pouco exploradas em regiões tropicais. Realizamos um estudo comparativo de genética da paisagem para avaliar a influência de características geográficas e ambientais da paisagem na diferenciação genética em duas espécies de anuros ecologicamente distintas: Dendropsophus oliveirai, um sapos diminuto que usa poças para reprodução e desenvolvimento larval, e Physalaemus cuvieri, um sapo terrestre que se reproduz tanto em poças quanto em poças de chuva, depositando ovos em ninhos de espuma onde os embriões se desenvolvem. Essas espécies co-ocorrem em enclaves florestais de altitude dentro de uma matriz de vegetação seca ao longo do Planalto da Borborema, nordeste do Brasil. Métodos Amostramos indivíduos de ambas as espécies em sete enclaves florestais de altitude para avaliar padrões filogeográficos e variação genética ao longo do acentuado gradiente climático e de vegetação NE-SW que caracteriza o planalto. Além disso, coletamos dados geográficos, climáticos e de vegetação para cada local. Analisamos as relações entre distância geográfica, variação ambiental, variação climática e diferenciação genética de mtDNA em ambas as espécies usando testes de Mantel e Modelagem de Equações Estruturais. Resultados Encontramos menor diferenciação genética em P. cuvieri, que foi principalmente associada à distância geográfica entre os enclaves, com apenas uma influência fraca da variação ambiental entre os locais de amostragem. Por outro lado, maior diferenciação genética foi detectada entre populações geográficas de D. oliveirai, impulsionada principalmente por uma combinação de distância geográfica, heterogeneidade ambiental e variação climática passada. Conclusões As estruturas genéticas contrastantes das duas espécies provavelmente resultam de diferenças em sua capacidade de atravessar áreas baixas secas entre florestas de altitude úmidas, com Isolamento por Distância e Isolamento por Ambiente afetando cada espécie de maneira diferente. Essas descobertas sugerem que tanto mecanismos seletivos quanto neutros contribuem para a variação genética. Nosso estudo destaca que as florestas de altitude no nordeste do Brasil podem abrigar populações de anuros geneticamente distintas, onde o fluxo gênico é restrito não apenas pela distância geográfica, mas também por fatores ambientais, especialmente em espécies diminutas com necessidades reprodutivas específicas.

@article{doi101186s1371702500625w,
    author = "de Andrade Lima, J. H. and Katzenberger, Marco and Gehara, Marcelo and Simões, P. I.",
    title = "Genética da paisagem destaca influências ecológicas específicas da espécie no fluxo gênico em populações de sapos de montanha do nordeste do Brasil",
    year = "2025",
    journal = "Ecological Processes",
    abstract = "Background As limitações de dispersão variam entre espécies na mesma região. Para algumas espécies, a distância geográfica é a principal restrição, enquanto para outras, fatores ambientais, como padrões climáticos e de vegetação, desempenham um papel maior. Esses efeitos impulsionados pela paisagem são moldados por traços ecológicos específicos da espécie. Embora sejam conceitualmente intuitivos, as hipóteses de genética da paisagem — como Isolamento por Distância e Isolamento por Ambiente — permanecem em grande parte pouco exploradas em regiões tropicais. Realizamos um estudo comparativo de genética da paisagem para avaliar a influência de características geográficas e ambientais da paisagem na diferenciação genética em duas espécies de anuros ecologicamente distintas: Dendropsophus oliveirai, um sapo-arbóreo diminuto que utiliza poças para reprodução e desenvolvimento larval, e Physalaemus cuvieri, um sapo terrestre que se reproduz tanto em poças quanto em poças de chuva, depositando ovos em ninhos de espuma onde os embriões se desenvolvem. Essas espécies co-ocorrem em enclaves florestais de montanha dentro de uma matriz de vegetação seca ao longo da Planície Borborema, nordeste do Brasil. Methods Amostramos indivíduos de ambas as espécies em sete enclaves florestais de montanha para avaliar padrões filogeográficos e variação genética ao longo do acentuado gradiente climático e de vegetação NE-SW que caracteriza a planície. Além disso, coletamos dados geográficos, climáticos e de vegetação para cada local. Analisamos as relações entre distância geográfica, variação ambiental, variação climática e diferenciação genética de mtDNA em ambas as espécies usando testes de Mantel e Modelagem de Equações Estruturais. Results Encontramos menor diferenciação genética em P. cuvieri, que foi principalmente associada à distância geográfica entre os enclaves, com apenas uma influência fraca da variação ambiental entre os locais de amostragem. Por outro lado, maior diferenciação genética foi detectada entre populações geográficas de D. oliveirai, impulsionada principalmente por uma combinação de distância geográfica, heterogeneidade ambiental e variação climática passada. Conclusions As estruturas genéticas contrastantes das duas espécies provavelmente resultam de diferenças em sua capacidade de atravessar áreas baixas secas entre florestas de montanha úmidas, com Isolamento por Distância e Isolamento por Ambiente afetando cada espécie de maneira diferente. Essas descobertas sugerem que tanto mecanismos seletivos quanto neutros contribuem para a variação genética. Nosso estudo destaca que as florestas de montanha no nordeste do Brasil podem abrigar populações de anuros geneticamente distintas, onde o fluxo gênico é restrito não apenas pela distância geográfica, mas também por fatores ambientais, especialmente em espécies diminutas com necessidades reprodutivas específicas.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/f460792e7975888d2784e16cddda67a6c21069f1",
    doi = "10.1186/s13717-025-00625-w",
    is_oa = "true",
    number = "1",
    semanticscholar_id = "f460792e7975888d2784e16cddda67a6c21069f1",
    volume = "14"
}

As proteínas IAP desempenham papéis centrais na regulação da apoptose e diversos processos celulares, influenciando a biologia do câncer ou a resistência ao estresse em espécies economicamente importantes, destacando sua relevância biomédica e ecológica majoritária. Apesar dessa importância, a diversidade evolutiva e a história das IAP permanecem em grande parte inexploradas. Aqui, apresentamos uma análise comparativa em grande escala de 2.843 proteínas IAP de 312 espécies abrangendo todas as principais linhagens animais, revelando variações marcantes no tamanho do repertório de IAP e uma diversidade arquitetônica excepcional. Mostramos que a expansão de IAP emergiu repetidamente através de eventos de duplicação específicos de linhagem, aparentemente moldados por dinâmicas de duplicação diferentes, com expansões de famílias gênicas mais recentes em artrópodes em comparação com moluscos e cordados. Dados de expressão mostram que a expansão de IAP suporta estratégias distintas. Bivalvos e gastrópodes mobilizam múltiplas subfamílias de IAP em resposta a estresses bióticos e abióticos, enquanto pulgões exibem expressão diferencial de IAP associada ao polifenismo. Esses padrões contrastantes indicam que pressões seletivas heterogêneas têm remodelado recorrentemente os repertórios de IAP, promovendo diversificação funcional específica de linhagem e espécie. Apesar dessa diversificação, análises filogenéticas revelam a manutenção de um conjunto central de três tipos de IAP. As IAPs Survivin/Deterin-like e Bruce-like emergiram precocemente nos metazoanos e permaneceram estruturalmente conservadas, embora as IAPs Bruce-like tenham sido perdidas independentemente em quelicerados, a maioria dos nematoides e alguns insetos hemípteros. As IAPs contendo RING também originaram-se precocemente, mas seguiram trajetórias evolutivas mais dinâmicas, sendo perdidas em nematoides e platelmintos enquanto se expandiam em outras linhagens através da aquisição de domínios (por exemplo, gnatostomados) ou duplicação e perda repetidas de domínios (por exemplo, moluscos e insetos). Nossos resultados estabelecem um quadro evolutivo abrangente para as IAPs metazoanas, ligando a diversificação específica de linhagem à inovação estrutural e especialização funcional.

@article{doi101093molbevmsag078,
    author = "Ribeiro Lopes, Mélanie e Parisot, Nicolas e Peignier, Sergio e Renoz, François e Baa-Puyoulet, Patrice e Jousselin, Emmanuelle e Charles, Hubert e Callaerts, Patrick e Brochier-Armanet, Céline e Calevro, Federica",
    title = "Trajetórias evolutivas, diversificação inicial e amplificação específica de espécie do repertório de Inibidor de Apoptose (IAP) metazoano.",
    year = "2026",
    journal = "Biologia molecular e evolução",
    abstract = "As proteínas IAP desempenham papéis centrais na regulação da apoptose e diversos processos celulares, influenciando a biologia do câncer ou a resistência ao estresse em espécies economicamente importantes, destacando sua relevância biomédica e ecológica majoritária. Apesar dessa importância, a diversidade evolutiva e a história das IAP permanecem em grande parte inexploradas. Aqui, apresentamos uma análise comparativa em grande escala de 2.843 proteínas IAP de 312 espécies abrangendo todas as principais linhagens animais, revelando variações marcantes no tamanho do repertório de IAP e uma diversidade arquitetônica excepcional. Mostramos que a expansão de IAP emergiu repetidamente através de eventos de duplicação específicos de linhagem, aparentemente moldados por dinâmicas de duplicação diferentes, com expansões de famílias gênicas mais recentes em artrópodes em comparação com moluscos e cordados. Dados de expressão mostram que a expansão de IAP suporta estratégias distintas. Bivalvos e gastrópodes mobilizam múltiplas subfamílias de IAP em resposta a estresses bióticos e abióticos, enquanto pulgões exibem expressão diferencial de IAP associada ao polifenismo. Esses padrões contrastantes indicam que pressões seletivas heterogêneas têm remodelado recorrentemente os repertórios de IAP, promovendo diversificação funcional específica de linhagem e espécie. Apesar dessa diversificação, análises filogenéticas revelam a manutenção de um conjunto central de três tipos de IAP. As IAPs Survivin/Deterin-like e Bruce-like emergiram precocemente nos metazoanos e permaneceram estruturalmente conservadas, embora as IAPs Bruce-like tenham sido perdidas independentemente em quelicerados, a maioria dos nematoides e alguns insetos hemípteros. As IAPs contendo RING também originaram-se precocemente, mas seguiram trajetórias evolutivas mais dinâmicas, sendo perdidas em nematoides e platelmintos enquanto se expandiam em outras linhagens através da aquisição de domínios (por exemplo, gnatostomados) ou duplicação e perda repetidas de domínios (por exemplo, moluscos e insetos). Nossos resultados estabelecem um quadro evolutivo abrangente para as IAPs metazoanas, ligando a diversificação específica de linhagem à inovação estrutural e especialização funcional.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41876750/",
    doi = "10.1093/molbev/msag078",
    pmid = "41876750"
}

Resumo. Lekitoo MN, Lekitoo T, Santoso B, Saragih EW, Yoku O, Hariadi BT, Iyai DA, Sonbait LY. 2026. Diversidade e composição de espécies forrageiras e capacidade de suporte de pastagens naturais no município de Teluk Wondama, Papua Ocidental, Indonésia. Biodiversitas 27 (1): d270111. https://doi.org/10.13057/biodiv/d270111. Pastagens naturais e pastagens naturais servem como a espinha dorsal da alimentação animal. No entanto, há dados empíricos limitados sobre sua produtividade e capacidade de sustentar populações animais em regiões menos conhecidas, como a Papua. O estudo visa avaliar a diversidade botânica e a composição de forragem em pastagens naturais no município de Teluk Wondama, Papua Ocidental, Indonésia, e avaliar sua capacidade de suporte. A amostragem botânica foi realizada estabelecendo 30 parcelas de amostragem de 1×1 m² em áreas de 64 ha dentro das pastagens naturais de Warayaro. A produtividade da forragem foi estimada com base na composição botânica, forragem fresca, matéria seca e nutrientes digestíveis totais. Os resultados revelam que a pastagem em Warayaro é uma pastagem heterogênea composta por 5 tipos de forragem, incluindo 4 gramíneas e 1 espécie de leguminosa. Espécies não nativas de 3 famílias dominaram a pastagem, a saber Paspalum dilatatum, seguido por Paspalum conjugatum, Centrosema pubescens, Eleusine indica e Cyperus rotundus. A composição botânica consistiu em 86,7% de gramíneas e 13,3% de leguminosas. A produtividade média da forragem é de 2,0 t FM, 0,4 t ha-1 e 1,02 t ha-1 TDN. A forragem existente em Warayaro tem capacidade de suporte para gado de 0,4 AU ha-1 ano-1 (FM), 0,3 AU ha-1 ano-1 (DM) e 0,8 AU ha-1 ano-1 (TDN). A pastagem natural de Warayaro tem baixo potencial produtivo (264,7 kg TDN por 100 kg de peso corporal do gado) e qualidade nutricional moderada, com teor de proteína de apenas 11,2%. A pastagem de Warayaro é mais adequada para o crescimento de rebanho jovem para atingir um peso corporal de 182 kg. A capacidade de suporte da pastagem para gado e cabra é de 32 cabeças ano-1 e 320 cabeças ano-1, respectivamente. As principais recomendações ecológicas incluem aumentar a proporção de leguminosas através do ressemeio, implementar pastejo rotativo e monitorar e controlar Cyperus rotundus para evitar a exclusão competitiva de espécies forrageiras.

@article{doi1013057biodivd270111,
    author = "Lekitoo, M. e Lekitoo, Teddy e Santoso, Budi e Saragih, E. W. e Yoku, O. e Hariadi, Bambang e Iyai, D. e Sonbait, L. Y.",
    title = "Diversidade e composição de espécies forrageiras e capacidade de suporte de pastagens naturais no município de Teluk Wondama, Papua Ocidental, Indonésia",
    year = "2026",
    journal = "Biodiversitas Journal of Biological Diversity",
    abstract = "Resumo. Lekitoo MN, Lekitoo T, Santoso B, Saragih EW, Yoku O, Hariadi BT, Iyai DA, Sonbait LY. 2026. Diversidade e composição de espécies forrageiras e capacidade de suporte de pastagens naturais no município de Teluk Wondama, Papua Ocidental, Indonésia. Biodiversitas 27 (1): d270111. https://doi.org/10.13057/biodiv/d270111. Pastagens naturais e pastagens naturais servem como a espinha dorsal da alimentação animal. No entanto, há dados empíricos limitados sobre sua produtividade e capacidade de sustentar populações animais em regiões menos conhecidas, como a Papua. O estudo visa avaliar a diversidade botânica e a composição de forragem em pastagens naturais no município de Teluk Wondama, Papua Ocidental, Indonésia, e avaliar sua capacidade de suporte. A amostragem botânica foi realizada estabelecendo 30 parcelas de amostragem de 1×1 m² em áreas de 64 ha dentro das pastagens naturais de Warayaro. A produtividade da forragem foi estimada com base na composição botânica, forragem fresca, matéria seca e nutrientes digestíveis totais. Os resultados revelam que a pastagem em Warayaro é uma pastagem heterogênea composta por 5 tipos de forragem, incluindo 4 gramíneas e 1 espécie de leguminosa. Espécies não nativas de 3 famílias dominaram a pastagem, a saber Paspalum dilatatum, seguido por Paspalum conjugatum, Centrosema pubescens, Eleusine indica e Cyperus rotundus. A composição botânica consistiu em 86,7% de gramíneas e 13,3% de leguminosas. A produtividade média da forragem é de 2,0 t FM, 0,4 t ha-1 e 1,02 t ha-1 TDN. A forragem existente em Warayaro tem capacidade de suporte para gado de 0,4 AU ha-1 ano-1 (FM), 0,3 AU ha-1 ano-1 (DM) e 0,8 AU ha-1 ano-1 (TDN). A pastagem natural de Warayaro tem baixo potencial produtivo (264,7 kg TDN por 100 kg de peso corporal do gado) e qualidade nutricional moderada, com teor de proteína de apenas 11,2%. A pastagem de Warayaro é mais adequada para o crescimento de rebanho jovem para atingir um peso corporal de 182 kg. A capacidade de suporte da pastagem para gado e cabra é de 32 cabeças ano-1 e 320 cabeças ano-1, respectivamente. As principais recomendações ecológicas incluem aumentar a proporção de leguminosas através do ressemeio, implementar pastejo rotativo e monitorar e controlar Cyperus rotundus para evitar a exclusão competitiva de espécies forrageiras.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/0afa171ff85ce45d7705d06f60e2776cea25679b",
    doi = "10.13057/biodiv/d270111",
    is_oa = "true",
    number = "1",
    semanticscholar_id = "0afa171ff85ce45d7705d06f60e2776cea25679b",
    volume = "27"
}

Estudar a diferenciação intraespecífica em espécies estreitamente relacionadas é essencial para esclarecer as relações filogenéticas e os mecanismos de especiação em estágio inicial, particularmente em linhagens evolutivamente jovens afetadas por declínios populacionais impulsionados pelo ser humano. A falcão saker em perigo (Falco cherrug), com seus vínculos filogenéticos ambíguos com a falcão-águia (F. rusticolus), exemplifica este cenário. Este estudo apresenta uma análise genética abrangente de F. cherrug e F. rusticolus usando marcadores de mtDNA e loci de microsatélites, focando na diversidade das populações de falcão saker do sul da Sibéria. Os resultados de genotipagem para essas populações foram correlacionados com dados fenotípicos obtidos de monitoramento de longo prazo (1999–2021). Nossas descobertas fornecem novas perspectivas sobre a diferenciação subspecífica atual e os remanescentes de uma estrutura subspecífica incipiente que existiu antes do recente colapso demográfico. Além disso, nossos resultados apoiam a hipótese da origem da falcão-águia como uma espécie descendente da falcão saker asiática, ou seja, uma linhagem evolutivamente jovem em processo de divergência. Nossos dados contribuem para a compreensão da história evolutiva do Hierofalco, particularmente através da análise de taxas de mutação heterogêneas entre haplogrupos mitocondriais. Este estudo sublinha a importância crítica de esforços de conservação para populações selvagens em perigo através de monitoramento de longo prazo integrado com abordagens genéticas combinadas.

@article{doi103390d18010050,
    author = "Rozhkova, D. and Shnayder, E. P. and Tambovtseva, V. and Karyakin, I. and Blekhman, A. V. and Lazebny, Oleg E and Sorokina, S. and Zinevich, L. and Kulikov, A. M.",
    title = "Relações Evolutivas e Diversidade Genética nas Populações Siberianas do Sul da Falcão Saker (Falco cherrug), uma Espécie Jovem e em Perigo",
    year = "2026",
    journal = "Diversity",
    abstract = "Estudar a diferenciação intraespecífica em espécies estreitamente relacionadas é essencial para esclarecer as relações filogenéticas e os mecanismos de especiação em estágio inicial, particularmente em linhagens evolutivamente jovens afetadas por declínios populacionais impulsionados pelo ser humano. A falcão saker em perigo (Falco cherrug), com seus vínculos filogenéticos ambíguos com a falcão-águia (F. rusticolus), exemplifica este cenário. Este estudo apresenta uma análise genética abrangente de F. cherrug e F. rusticolus usando marcadores de mtDNA e loci de microsatélites, focando na diversidade das populações de falcão saker do sul da Sibéria. Os resultados de genotipagem para essas populações foram correlacionados com dados fenotípicos obtidos de monitoramento de longo prazo (1999–2021). Nossas descobertas fornecem novas perspectivas sobre a diferenciação subspecífica atual e os remanescentes de uma estrutura subspecífica incipiente que existiu antes do recente colapso demográfico. Além disso, nossos resultados apoiam a hipótese da origem da falcão-águia como uma espécie descendente da falcão saker asiática, ou seja, uma linhagem evolutivamente jovem em processo de divergência. Nossos dados contribuem para a compreensão da história evolutiva do Hierofalco, particularmente através da análise de taxas de mutação heterogêneas entre haplogrupos mitocondriais. Este estudo sublinha a importância crítica de esforços de conservação para populações selvagens em perigo através de monitoramento de longo prazo integrado com abordagens genéticas combinadas.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/e42251a24980f0c4c7467a2384f68f00f9e274fd",
    doi = "10.3390/d18010050",
    is_oa = "true",
    number = "1",
    pages = "50",
    semanticscholar_id = "e42251a24980f0c4c7467a2384f68f00f9e274fd",
    volume = "18"
}

Este estudo investiga a diversidade de espécies vegetais, padrões de regeneração e os fatores ecológicos que influenciam as espécies vegetais ameaçadas de extinção na Reserva Natural Than Sa–Phuong Hoang, Província de Thai Nguyen, Vietnã. Embora os ecossistemas florestais tropicais da Ásia do Sul sejam conhecidos por sua alta biodiversidade, ainda há uma falta de estudos específicos do local que integrem a diversidade de espécies, a dinâmica de regeneração e os fatores ambientais na escala da reserva. Foram estabelecidos um total de 15 parcelas padrão (20 × 50 m) em três tipos principais de floresta (florestas de calcário, florestas de montanha de solo e florestas de transição) para avaliar a composição de espécies, a estrutura da comunidade e os padrões de regeneração. Foram aplicadas análises multivariadas, incluindo análise de componentes principais (PCA) e análise de agrupamento, para identificar os principais fatores ecológicos que moldam a distribuição de espécies e a regeneração. Os resultados registraram 1234 espécies vegetais pertencentes a 171 famílias, confirmando a alta biodiversidade da área de estudo. A capacidade de regeneração diferiu significativamente entre os tipos de floresta e foi fortemente influenciada por variáveis ambientais, como cobertura de dossel, umidade do solo, topografia e perturbação humana. Os resultados multivariados revelaram uma clara diferenciação ecológica entre os tipos de floresta, destacando o papel do filtro ambiental na estruturação das comunidades vegetais. As três espécies-alvo (Curculigo orchioides Gaertn, Parashorea chinensis e Paphiopedilum hirsutissimum Stein) exibiram forte dependência de condições de microhabitat estáveis e mostraram regeneração limitada em ambientes perturbados, indicando alta sensibilidade a mudanças ecológicas e pressão antrópica. Este estudo fornece novas perspectivas sobre as relações espécie-ambiente em escala local e destaca os principais fatores ecológicos da distribuição e regeneração de plantas ameaçadas, contribuindo para um planejamento de conservação e gestão da biodiversidade mais eficazes em ecossistemas florestais tropicais.

@article{doi103390d18040228,
    author = "Dang, Thi Thai Ha and Hoang, Van Hung and Nguyen, C. and Do, V.",
    title = "Diversity Conservation Status, and Ecological Characteristics of Endangered Plant Species in Than Sa–Phuong Hoang Nature Reserve, Thai Nguyen Province, Vietnam",
    year = "2026",
    journal = "Diversity",
    abstract = "Este estudo investiga a diversidade de espécies vegetais, padrões de regeneração e os fatores ecológicos que influenciam as espécies vegetais ameaçadas de extinção na Reserva Natural Than Sa–Phuong Hoang, Província de Thai Nguyen, Vietnã. Embora os ecossistemas florestais tropicais da Ásia do Sul sejam conhecidos por sua alta biodiversidade, ainda há uma falta de estudos específicos do local que integrem a diversidade de espécies, a dinâmica de regeneração e os fatores ambientais na escala da reserva. Foram estabelecidos um total de 15 parcelas padrão (20 × 50 m) em três tipos principais de floresta (florestas de calcário, florestas de montanha de solo e florestas de transição) para avaliar a composição de espécies, a estrutura da comunidade e os padrões de regeneração. Foram aplicadas análises multivariadas, incluindo análise de componentes principais (PCA) e análise de agrupamento, para identificar os principais fatores ecológicos que moldam a distribuição de espécies e a regeneração. Os resultados registraram 1234 espécies vegetais pertencentes a 171 famílias, confirmando a alta biodiversidade da área de estudo. A capacidade de regeneração diferiu significativamente entre os tipos de floresta e foi fortemente influenciada por variáveis ambientais, como cobertura de dossel, umidade do solo, topografia e perturbação humana. Os resultados multivariados revelaram uma clara diferenciação ecológica entre os tipos de floresta, destacando o papel do filtro ambiental na estruturação das comunidades vegetais. As três espécies-alvo (Curculigo orchioides Gaertn, Parashorea chinensis e Paphiopedilum hirsutissimum Stein) exibiram forte dependência de condições de microhabitat estáveis e mostraram regeneração limitada em ambientes perturbados, indicando alta sensibilidade a mudanças ecológicas e pressão antrópica. Este estudo fornece novas perspectivas sobre as relações espécie-ambiente em escala local e destaca os principais fatores ecológicos da distribuição e regeneração de plantas ameaçadas, contribuindo para um planejamento de conservação e gestão da biodiversidade mais eficazes em ecossistemas florestais tropicais.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/3e08c13a35200826c71f993ab4fcf48a8e31ea05",
    doi = "10.3390/d18040228",
    is_oa = "true",
    number = "4",
    pages = "228",
    semanticscholar_id = "3e08c13a35200826c71f993ab4fcf48a8e31ea05",
    volume = "18"
}

A metilação do DNA constitui uma camada primária de regulação epigenética em plantas, operando em três contextos de sequência (CG, CHG e CHH) através de vias enzimáticas distintas. Ao longo dos últimos quinze anos, evidências acumuladas mostraram que a metilação do DNA varia substancialmente entre indivíduos e populações de plantas selvagens, às vezes independentemente de polimorfismos genéticos subjacentes. Essa variação pode influenciar a expressão gênica, a atividade de elementos transponíveis e traços fenotípicos relevantes para a adaptação ecológica. A epigenética de populações, o estudo da variação de metilação na escala populacional, amadureceu de iniciais levantamentos usando polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados sensíveis à metilação (MS-AFLP) para uma disciplina cada vez mais dependente de sequenciamento de bissulfito de representação reduzida (epiGBS, bsRADseq), sequenciamento de bissulfito de genoma inteiro (WGBS), metilação enzimática (EM-seq) e detecção direta de leitura longa por sequenciamento de nanoporo. Esses avanços metodológicos estão abrindo a epigenética de populações para organismos não modelo em toda a amplitude da filogenia das plantas, desde angiospermas e gimnospermas até samambaias e briófitas. Cobrimos (i) a maquinaria molecular subjacente à metilação do DNA em plantas, incluindo o status debatido da N6-metiladenina (6mA); (ii) evidências empíricas para variação epigenética natural em populações de plantas, abrangendo espécies clonais, invasoras e de cruzamento aberto; (iii) o conjunto de ferramentas metodológicas disponíveis para perfilamento de metilação em escala populacional, com ênfase em abordagens adequadas para táxons não modelo; e (iv) a significância ecológica e evolutiva da variação epigenética de populações, incluindo herança transgeracional, memória de estresse, relógios epigenéticos, aplicações de conservação e a integração emergente da epigenética na síntese evolutiva estendida. Identificamos lacunas críticas de conhecimento, particularmente a quase completa ausência de dados epigenéticos em nível populacional para briófitas, samambaias e licófitas, e delineamos prioridades para pesquisas futuras.

@article{doi103390d18050259,
    author = "Sawicki, Jakub e Czochór, Wiktoria e Garbowska, Aniela e Koczwara, Kamil e Przyborowski, Jerzy Andrzej e Pupek, Natan e Sulima, P. e Szablińska, Joanna e Szczecińska, M.",
    title = "Variação Epigenética em Populações de Plantas: Metilação do DNA como Motor da Diversidade Fenotípica e Adaptação",
    year = "2026",
    journal = "Diversity",
    abstract = "A metilação do DNA constitui uma camada primária de regulação epigenética em plantas, operando em três contextos de sequência (CG, CHG e CHH) através de vias enzimáticas distintas. Ao longo dos últimos quinze anos, evidências acumuladas mostraram que a metilação do DNA varia substancialmente entre indivíduos e populações de plantas selvagens, às vezes independentemente de polimorfismos genéticos subjacentes. Essa variação pode influenciar a expressão gênica, a atividade de elementos transponíveis e traços fenotípicos relevantes para a adaptação ecológica. A epigenética de populações, o estudo da variação de metilação na escala populacional, amadureceu de iniciais levantamentos usando polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados sensíveis à metilação (MS-AFLP) para uma disciplina cada vez mais dependente de sequenciamento de bissulfito de representação reduzida (epiGBS, bsRADseq), sequenciamento de bissulfito de genoma inteiro (WGBS), metilação enzimática (EM-seq) e detecção direta de leitura longa por sequenciamento de nanoporo. Esses avanços metodológicos estão abrindo a epigenética de populações para organismos não modelo em toda a amplitude da filogenia das plantas, desde angiospermas e gimnospermas até samambaias e briófitas. Cobrimos (i) a maquinaria molecular subjacente à metilação do DNA em plantas, incluindo o status debatido da N6-metiladenina (6mA); (ii) evidências empíricas para variação epigenética natural em populações de plantas, abrangendo espécies clonais, invasoras e de cruzamento aberto; (iii) o conjunto de ferramentas metodológicas disponíveis para perfilamento de metilação em escala populacional, com ênfase em abordagens adequadas para táxons não modelo; e (iv) a significância ecológica e evolutiva da variação epigenética de populações, incluindo herança transgeracional, memória de estresse, relógios epigenéticos, aplicações de conservação e a integração emergente da epigenética na síntese evolutiva estendida. Identificamos lacunas críticas de conhecimento, particularmente a quase completa ausência de dados epigenéticos em nível populacional para briófitas, samambaias e licófitas, e delineamos prioridades para pesquisas futuras.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/73586a28532bd4c93909ae73eafa8aa933538cfc",
    doi = "10.3390/d18050259",
    is_oa = "true",
    number = "5",
    pages = "259",
    semanticscholar_id = "73586a28532bd4c93909ae73eafa8aa933538cfc",
    volume = "18"
}