Angiospermas

@misc{arnold1947introduction1,
    author = "Arnold, C. A",
    title = "Introducción a la Paleobotánica",
    year = "1947",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill, 433 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Arnold, C. A., 1947, Introducción a la Paleobotánica: New York, McGraw-Hill, 433 p.}"
}

@article{doi1023071943261,
    author = "Stebbins, G. Ledyard",
    title = "Evidencia sobre las tasas de evolución a partir de la distribución de especies vegetales existentes y fósiles",
    year = "1947",
    journal = "Ecological Monographs",
    url = "https://doi.org/10.2307/1943261",
    doi = "10.2307/1943261",
    openalex = "W1998160448"
}

@book{chaney1949evolutionary2,
    author = "Chaney, R. W",
    title = "Tendencias evolutivas en las angiospermas, en Jepsen, G. L., Simpson, G. G., y Mayr, E., eds., Genética, Paleontología y Evolución",
    year = "1949",
    publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Chaney, R. W., 1949, Tendencias evolutivas en las angiospermas, en Jepsen, G. L., Simpson, G. G., y Mayr, E., eds., Genética, Paleontología y Evolución: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p.}"
}

Artículo de revista A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION Obtener acceso Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod Universidad de California Los Angeles Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Evolución, Volumen 6, Número 1, 1 de marzo de 1952, Páginas 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Publicado: 01 de marzo de 1952 Historial del artículo Recibido: 22 de octubre de 1951 Publicado: 01 de marzo de 1952

@article{doi101111j155856461952tb02810x,
    author = "Axelrod, Daniel I.",
    title = "A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION",
    year = "1952",
    journal = "Evolución",
    abstract = "Artículo de revista A THEORY OF ANGIOSPERM EVOLUTION Obtener acceso Daniel I. Axelrod Daniel I. Axelrod Universidad de California Los Angeles Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Evolución, Volumen 6, Número 1, 1 de marzo de 1952, Páginas 29–60, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x Publicado: 01 de marzo de 1952 Historial del artículo Recibido: 22 de octubre de 1951 Publicado: 01 de marzo de 1952",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1952.tb02810.x",
    openalex = "W2320024939",
    references = "doi101144transglas211117"
}

@article{doi1023072405502,
    author = "Axelrod, Daniel I.",
    title = "Una teoría sobre la evolución de las angiospermas",
    year = "1952",
    journal = "Evolución",
    url = "https://doi.org/10.2307/2405502",
    doi = "10.2307/2405502",
    openalex = "W4240185923"
}

@inproceedings{whittaker1969evolution4,
    author = "Whittaker, R. H",
    title = "Evolución de la diversidad en comunidades vegetales",
    year = "1969",
    booktitle = "Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, p. 178-196",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Whittaker, R. H., 1969, Evolución de la diversidad en comunidades vegetales: Brookhaven Symposium on Biology, v. 22, p. 178-196.}"
}

@incollection{banks1970angiosperms,
    author = "Banks, Harlan P.",
    title = "Angiospermas — la culminación de la evolución de las plantas",
    year = "1970",
    booktitle = "Evolución y plantas del pasado",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
    doi = "10.1007/978-1-349-01818-5\_9",
    openalex = "W2482891615",
    pages = "147-160",
    references = "doi101111j155856461952tb02810x, doi101144gsljgs1923079010409, doi1023071943261, doi1023072405502, doi1023072799872, doi105962bhltitle110147, openalexw1560240034"
}

@article{doi1023071218350,
    author = "Cronquist, Arthur y Stebbins, G. Ledyard",
    title = "Plantas con flores. Evolución por encima del Nivel de Especie",
    year = "1975",
    journal = "Taxon",
    url = "https://doi.org/10.2307/1218350",
    doi = "10.2307/1218350",
    openalex = "W1589280229"
}

@article{doi1023072418725,
    author = "Thorne, Robert F. y Beck, Charles B.",
    title = "Origen y Evolución Temprana de las Angiospermas.",
    year = "1976",
    journal = "Systematic Botany",
    url = "https://doi.org/10.2307/2418725",
    doi = "10.2307/2418725",
    openalex = "W1981841294"
}

RESUMEN Según la 'hipótesis de Gause', una consecuencia del proceso de evolución por selección natural es que en una comunidad en equilibrio cada especie debe ocupar un nicho diferente. Muchos botánicos han encontrado esta idea improbable porque han ignorado los procesos de regeneración en las comunidades vegetales. La mayoría de las comunidades vegetales son más longevas que las plantas individuales que las constituyen. Cuando un individuo muere, puede o no ser reemplazado por un individuo de la misma especie. Es esta etapa de reemplazo la que es fundamental para el argumento presentado. Varios mecanismos que no involucran regeneración también contribuyen al mantenimiento de la riqueza de especies: diferencias en la forma de vida junto con la incapacidad de las plantas más grandes de agotar o cortar todos los recursos, también el desarrollo de relaciones de dependencia, diferencias en la fenología junto con la tolerancia a la supresión, fluctuaciones en el ambiente junto con diferencias relativamente pequeñas en la capacidad competitiva entre muchas especies, la capacidad de ciertos pares de especies para formar mezclas estables debido a un equilibrio entre la competencia intraespecífica y la competencia interespecífica, la producción de sustancias más tóxicas para la especie productora que para las otras especies, diferencias en los nutrientes minerales primarios limitantes o en el tamaño de los poros del suelo para plantas vecinas de diferentes especies, y diferencias en las capacidades competitivas de especies dependientes de su edad fisiológica junto con la estructura de edad desigual de muchas poblaciones. Los mecanismos listados anteriormente no explican en gran medida la persistencia indefinida en mezcla de las muchas especies en las comunidades más ricas en especies conocidas. Por el contrario, parecen existir casi infinitas posibilidades de diferencias entre especies en sus requisitos de regeneración, es decir, el reemplazo de las plantas individuales de una generación por las de la siguiente. Esta idea se ilustra para especies de árboles y se enfatiza que los forestales fueron los primeros, por un amplio margen, en apreciar su importancia. Los procesos involucrados en la invasión exitosa de un hueco por una especie vegetal dada y algunos caracteres del hueco que pueden ser importantes se resumen en la Tabla 2. La definición del nicho de una planta requiere el reconocimiento de cuatro componentes: el nicho de hábitat, el nicho de forma de vida, el nicho fenológico y el nicho de regeneración. Se da un breve relato de los patrones de regeneración en diferentes tipos de comunidad vegetal para proporcionar un contexto para estudios de diferenciación en el nicho de regeneración. Todas las etapas en el ciclo de regeneración son potencialmente importantes y se dan ejemplos de diferenciación entre especies para cada una de las siguientes etapas: Producción de semilla viable (incluyendo las sub-etapas de floración, polinización y formación de semillas), dispersión, en espacio y tiempo, germinación, establecimiento y desarrollo ulterior de la planta inmadura. En la discusión conclusiva se hace énfasis en los siguientes temas: los tipos de trabajo necesarios en el futuro para probar o refutar que la diferenciación en el nicho de regeneración es la explicación principal del mantenimiento de la riqueza de especies en las comunidades vegetales, la relación de la presente tesis con las ideas publicadas sobre el origen de la dispersión fenológica, la relevancia de la presente tesis para la discusión sobre la presencia de continuos en la vegetación, la coincidencia de la presente tesis con las ideas emergentes de los evolucionistas sobre la diferenciación de taxones de angiospermas, y la importancia de los estudios de regeneración para la conservación.

@article{doi101111j1469185x1977tb01347x,
    author = "Grubb, P. J.",
    title = "EL MANTENIMIENTO DE LA RIQUEZA DE ESPECIES EN LAS COMUNIDADES DE PLANTAS: LA IMPORTANCIA DEL NICHO DE REGENERACIÓN",
    year = "1977",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "RESUMEN Según la 'hipótesis de Gause', una consecuencia del proceso de evolución por selección natural es que en una comunidad en equilibrio cada especie debe ocupar un nicho diferente. Muchos botánicos han encontrado esta idea improbable porque han ignorado los procesos de regeneración en las comunidades de plantas. La mayoría de las comunidades de plantas son más longevas que las plantas individuales que las constituyen. Cuando un individuo muere, puede o no ser reemplazado por un individuo de la misma especie. Es esta etapa de reemplazo la que es fundamental para el argumento presentado. Varios mecanismos que no implican regeneración también contribuyen al mantenimiento de la riqueza de especies: diferencias en la forma de vida junto con la incapacidad de las plantas más grandes para agotar o cortar todos los recursos, también el desarrollo de relaciones de dependencia, diferencias en la fenología junto con la tolerancia a la supresión, fluctuaciones en el entorno junto con diferencias relativamente pequeñas en la capacidad competitiva entre muchas especies, la capacidad de ciertos pares de especies para formar mezclas estables debido a un equilibrio entre la competencia intraespecífica y la competencia interespecífica, la producción de sustancias más tóxicas para la especie productora que para las otras especies, diferencias en los nutrientes minerales primarios limitantes o en el tamaño de los poros del suelo para plantas vecinas de diferentes especies, y diferencias en las capacidades competitivas de especies dependientes de su edad fisiológica junto con la estructura de edad desigual de muchas poblaciones. Los mecanismos listados anteriormente no explican en gran medida la persistencia indefinida en mezcla de las muchas especies en las comunidades más ricas en especies conocidas. Por el contrario, parecen existir casi infinitas posibilidades de diferencias entre especies en sus requisitos de regeneración, es decir, el reemplazo de las plantas individuales de una generación por las de la siguiente. Esta idea se ilustra para especies de árboles y se enfatiza que los forestales fueron los primeros, por un amplio margen, en apreciar su importancia. Los procesos involucrados en la invasión exitosa de un hueco por una especie de planta dada y algunos caracteres del hueco que pueden ser importantes se resumen en la Tabla 2. La definición del nicho de una planta requiere el reconocimiento de cuatro componentes: el nicho de hábitat, el nicho de forma de vida, el nicho fenológico y el nicho de regeneración. Se da un breve relato de los patrones de regeneración en diferentes tipos de comunidades de plantas para proporcionar un fondo para estudios de diferenciación en el nicho de regeneración. Todas las etapas en el ciclo de regeneración son potencialmente importantes y se dan ejemplos de diferenciación entre especies para cada una de las siguientes etapas: Producción de semillas viables (incluyendo las subetapas de floración, polinización y formación de semillas), dispersión, en espacio y tiempo, germinación, establecimiento y desarrollo ulterior de la planta inmadura. En la discusión conclusiva se hace énfasis en los siguientes temas: los tipos de trabajo necesarios en el futuro para probar o refutar que la diferenciación en el nicho de regeneración es la explicación principal del mantenimiento de la riqueza de especies en las comunidades de plantas, la relación de la presente tesis con las ideas publicadas sobre el origen de la dispersión fenológica, la relevancia de la presente tesis para la discusión sobre la presencia de continuos en la vegetación, la coincidencia de la presente tesis con las ideas emergentes de los evolucionistas sobre la diferenciación de taxones de angiospermas, y la importancia de los estudios de regeneración para la conservación.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    openalex = "W2119259345",
    references = "doi101038242344a0, doi101086282070, doi101086282687, doi101093biomet3812196, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1473655250, doi1015159780691206912, doi1023071218190, doi1023071929601, doi1023072256497, doi1023072258550, doi1023072989767, openalexw1532540194"
}

@article{doi101007bf02806171,
    title = "Evolución y clasificación de plantas con flores",
    year = "1979",
    journal = "Brittonia",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02806171",
    doi = "10.1007/bf02806171",
    openalex = "W1589755459"
}

@article{doi101007bf02861082,
    author = "Doyle, James A. y Donoghue, Michael J.",
    title = "Filogenia de plantas con semillas y el origen de las angiospermas: Un enfoque cladístico experimental",
    year = "1986",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02861082",
    doi = "10.1007/bf02861082",
    openalex = "W2063845391",
    references = "doi101007bf02858880, doi101126science2314734129, doi1023072413454, doi105962bhltitle118957, openalexw3126336940"
}

La evolución y clasificación de las plantas con flores, La evolución y clasificación de las plantas con flores, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023072418914,
    author = "Keener, Carl S. y Cronquist, Arthur",
    title = "La evolución y clasificación de las plantas con flores.",
    year = "1989",
    journal = "Botánica Sistemática",
    abstract = "La evolución y clasificación de las plantas con flores, La evolución y clasificación de las plantas con flores, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/2418914",
    doi = "10.2307/2418914",
    openalex = "W3020856028"
}

@misc{freidman1990double3,
    author = "Freidman, W. E",
    title = "Doble fertilización en Ephedra, una planta no florífera; su relevancia para el origen de las angiospermas",
    year = "1990",
    howpublished = "Science, v. 247, p. 951",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Freidman, W. E., 1990, Doble fertilización en Ephedra, una planta no florífera; su relevancia para el origen de las angiospermas: Science, v. 247, p. 951.}"
}

Se observó una variación extensa en las tasas de sustitución sinónimas y no sinónimas entre 50 secuencias del gen que codifica la subunidad grande de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa (rbcL), representando taxones de briofitas, coníferas, dicotiledóneas y monocotiledóneas. Las pruebas de tasa relativa revelaron diferencias de hasta un 138% para sustituciones no sinónimas y hasta un 85% para las sinónimas. Dentro de las angiospermas, las formas anuales evolucionaron más rápidamente, en promedio, que las formas perennes. Esta heterogeneidad de tasas fue más extensa en sitios no sinónimos que en sinónimos, y resultó principalmente de una aceleración reciente de la tasa de sustitución en muchos grupos de angiospermas.

@article{doi101073pnas89167844,
    author = "Bousquet, Jean y Strauss, Steven H. y Doerksen, Allan H. y Price, Robert A.",
    title = "Variación extensa en la tasa evolutiva de las secuencias del gen rbcL entre plantas con semillas.",
    year = "1992",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Se observó una variación extensa en las tasas de sustitución sinónimas y no sinónimas entre 50 secuencias del gen que codifica la subunidad grande de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa (rbcL), representando taxones de briofitas, coníferas, dicotiledóneas y monocotiledóneas. Las pruebas de tasa relativa revelaron diferencias de hasta un 138% para sustituciones no sinónimas y hasta un 85% para las sinónimas. Dentro de las angiospermas, las formas anuales evolucionaron más rápidamente, en promedio, que las formas perennes. Esta heterogeneidad de tasas fue más extensa en sitios no sinónimos que en sinónimos, y resultó principalmente de una aceleración reciente de la tasa de sustitución en muchos grupos de angiospermas.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.89.16.7844",
    doi = "10.1073/pnas.89.16.7844",
    openalex = "W1968683533"
}

Las restricciones fisiológicas y ecológicas desempeñan roles clave en la evolución de los patrones de crecimiento de las plantas, especialmente en relación con las defensas contra los herbívoros. Las teorías fenotípicas e históricas de la vida se unifican dentro del marco del equilibrio crecimiento-diferenciación (GDB), formando un sistema integrado de teorías que explican y predicen los patrones de defensa de las plantas y las interacciones competitivas en escalas de tiempo ecológicas y evolutivas. La actividad vegetal a nivel celular puede clasificarse como crecimiento (división y expansión celular) o diferenciación (cambios químicos y morfológicos que conducen a la maduración y especialización celular). La hipótesis GDB de la defensa vegetal se basa en un compromiso fisiológico entre los procesos de crecimiento y diferenciación. El compromiso entre crecimiento y defensa existe porque el metabolismo secundario y el refuerzo estructural están fisiológicamente restringidos en células que se dividen y se expanden, y porque desvían recursos de la producción de nueva área foliar. Por lo tanto, el dilema de las plantas: deben crecer lo suficientemente rápido para completar su ciclo, pero mantener las defensas necesarias para sobrevivir en presencia de patógenos y herbívoros. El compromiso fisiológico entre crecimiento y procesos de diferenciación interactúa con la herbivoría y la competencia planta-planta para manifestarse como un compromiso genético entre crecimiento y defensa en la evolución de las estrategias de historia de vida de las plantas. Se revisan las teorías evolutivas de la defensa vegetal. También extendemos un modelo estándar de tasa de crecimiento separando sus componentes ecológicos y evolutivos, y formalizando el papel de la competencia en la evolución de la defensa vegetal. Concluimos con un modelo conceptual de la evolución de la defensa vegetal en el que los compromisos fisiológicos de las plantas interactúan con el ambiente abiótico, la competencia y la herbivoría.

@article{doi101086417659,
    author = "Herms, Daniel A. y Mattson, William J.",
    title = "El dilema de las plantas: Crecer o defenderse",
    year = "1992",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Las restricciones fisiológicas y ecológicas desempeñan roles clave en la evolución de los patrones de crecimiento de las plantas, especialmente en relación con las defensas contra los herbívoros. Las teorías fenotípicas e históricas de la vida se unifican dentro del marco del equilibrio crecimiento-diferenciación (GDB), formando un sistema integrado de teorías que explican y predicen los patrones de defensa de las plantas y las interacciones competitivas en escalas de tiempo ecológicas y evolutivas. La actividad vegetal a nivel celular puede clasificarse como crecimiento (división y expansión celular) o diferenciación (cambios químicos y morfológicos que conducen a la maduración y especialización celular). La hipótesis GDB de la defensa vegetal se basa en un compromiso fisiológico entre los procesos de crecimiento y diferenciación. El compromiso entre crecimiento y defensa existe porque el metabolismo secundario y el refuerzo estructural están fisiológicamente restringidos en células que se dividen y se expanden, y porque desvían recursos de la producción de nueva área foliar. Por lo tanto, el dilema de las plantas: deben crecer lo suficientemente rápido para completar su ciclo, pero mantener las defensas necesarias para sobrevivir en presencia de patógenos y herbívoros. El compromiso fisiológico entre crecimiento y procesos de diferenciación interactúa con la herbivoría y la competencia planta-planta para manifestarse como un compromiso genético entre crecimiento y defensa en la evolución de las estrategias de historia de vida de las plantas. Se revisan las teorías evolutivas de la defensa vegetal. También extendemos un modelo estándar de tasa de crecimiento separando sus componentes ecológicos y evolutivos, y formalizando el papel de la competencia en la evolución de la defensa vegetal. Concluimos con un modelo conceptual de la evolución de la defensa vegetal en el que los compromisos fisiológicos de las plantas interactúan con el ambiente abiótico, la competencia y la herbivoría.",
    url = "https://doi.org/10.1086/417659",
    doi = "10.1086/417659",
    openalex = "W1990151103",
    references = "doi101007bf02860717, doi101086283244, doi101086284531, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461985tb00391x, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science188418319, doi101126science2304728895, doi101146annureves19110188000551, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023072389364, openalexw2169917233"
}

En comparaciones entre taxones hermanos, existe una correlación significativa y positiva entre la tasa de evolución del gen de cloroplasto rbc L dentro de familias de plantas con flores (angiospermas) y el número de especies en esas familias. Brevemente discutimos escenarios evolutivos alternativos que podrían haber generado esta relación entre la diversificación de especies y la evolución molecular en plantas con flores.

@article{doi101098rspb19960088,
    author = "Barraclough, Timothy G. y Harvey, Paul y Nee, Sean",
    title = "Tasa de evolución de la secuencia del gen rbc L y diversificación de especies en plantas con flores (angiospermas)",
    year = "1996",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "En comparaciones entre taxones hermanos, existe una correlación significativa y positiva entre la tasa de evolución del gen de cloroplasto rbc L dentro de familias de plantas con flores (angiospermas) y el número de especies en esas familias. Brevemente discutimos escenarios evolutivos alternativos que podrían haber generado esta relación entre la diversificación de especies y la evolución molecular en plantas con flores.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.1996.0088",
    doi = "10.1098/rspb.1996.0088",
    openalex = "W2121360952",
    references = "doi101006mpev19931009, doi101038355511a0, doi101073pnas89167844, doi101098rspb19950031, doi101111j109600311989tb00482x, doi101146annureves22110191001433, doi1023071222465, doi1023072399846, doi1023074109916"
}

Los análisis cladísticos recientes están revelando la filogenia de las plantas con flores con cada vez más detalle, y existe apoyo para la monofilia de muchos grupos principales por encima del nivel de familia. Con muchos elementos de la secuencia de ramificación principal de la filogenia establecidos, una clasificación suprafamiliar revisada de las plantas con flores se vuelve tanto factible como deseable. Aquí presentamos una clasificación de 462 familias de plantas con flores en 40 órdenes presumiblemente monofiléticos y un pequeño número de grupos superiores informales monofiléticos. Estos últimos son las monocotiledóneas, comelinoides, eudicotiledóneas, eudicotiledóneas nucleares, rosídeas incluyendo eurosídeas I y II, y asterídeas incluyendo euasterídeas I y II. Bajo estos grupos informales también se listan un número de familias sin asignación a orden. Al final del sistema hay una lista adicional de familias de posición incierta para las cuales no existen datos firmes sobre su colocación en cualquier parte del sistema. ¿Por qué reordenar familias, y mucho menos formalizar órdenes? Las clasificaciones de alto nivel, el agrupamiento de especies en familias, órdenes, etc., son necesarias como herramientas de referencia no solo en sistemática sino también en muchas otras ramas de la biología. El conocimiento de las relaciones filogenéticas de los grupos principales de organismos, es decir, una perspectiva filogenética, está volviéndose cada vez más importante, y por lo tanto la necesidad de una clasificación filogenética como herramienta de referencia también se vuelve imperativa. Nuestro enfoque principal está en las órdenes con un énfasis secundario en las familias de plantas con flores. La familia es central en la sistemática de las plantas con flores. Por ejemplo, al estudiar una planta desconocida, usualmente primero la identificamos a nivel de familia. Las órdenes, por otro lado, hasta hace muy poco tiempo han sido de poca importancia, ya sea porque eran morfológicamente irreconocibles o, en la mayoría de los casos, carecían de cualquier coherencia evolutiva (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). Sin embargo, las órdenes son útiles para la enseñanza, para estudiar

@article{doi1023072992015,
    title = "Una clasificación ordinal para las familias de plantas con flores",
    year = "1998",
    journal = "Annals of the Missouri Botanical Garden",
    abstract = "Los análisis cladísticos recientes están revelando la filogenia de las plantas con flores con cada vez más detalle, y existe apoyo para la monofilia de muchos grupos principales por encima del nivel de familia. Con muchos elementos de la secuencia de ramificación principal de la filogenia establecidos, una clasificación suprafamiliar revisada de las plantas con flores se vuelve tanto factible como deseable. Aquí presentamos una clasificación de 462 familias de plantas con flores en 40 órdenes presumiblemente monofiléticos y un pequeño número de grupos superiores informales monofiléticos. Estos últimos son las monocotiledóneas, comelinoides, eudicotiledóneas, eudicotiledóneas nucleares, rosídeas incluyendo eurosídeas I y II, y asterídeas incluyendo euasterídeas I y II. Bajo estos grupos informales también se listan un número de familias sin asignación a orden. Al final del sistema hay una lista adicional de familias de posición incierta para las cuales no existen datos firmes sobre su colocación en cualquier parte del sistema. ¿Por qué reordenar familias, y mucho menos formalizar órdenes? Las clasificaciones de alto nivel, el agrupamiento de especies en familias, órdenes, etc., son necesarias como herramientas de referencia no solo en sistemática sino también en muchas otras ramas de la biología. El conocimiento de las relaciones filogenéticas de los grupos principales de organismos, es decir, una perspectiva filogenética, está volviéndose cada vez más importante, y por lo tanto la necesidad de una clasificación filogenética como herramienta de referencia también se vuelve imperativa. Nuestro enfoque principal está en las órdenes con un énfasis secundario en las familias de plantas con flores. La familia es central en la sistemática de las plantas con flores. Por ejemplo, al estudiar una planta desconocida, usualmente primero la identificamos a nivel de familia. Las órdenes, por otro lado, hasta hace muy poco tiempo han sido de poca importancia, ya sea porque eran morfológicamente irreconocibles o, en la mayoría de los casos, carecían de cualquier coherencia evolutiva (Heywood, 1977; Merxmiiller, 1977). Sin embargo, las órdenes son útiles para la enseñanza, para estudiar",
    url = "https://doi.org/10.2307/2992015",
    doi = "10.2307/2992015",
    openalex = "W143810700"
}

@misc{ramsay2000angiosperms,
    author = "Ramsay, Margaret M.",
    title = "Angiospermas",
    year = "2000",
    booktitle = "Enciclopedia de Tecnología Celular",
    url = "https://doi.org/10.1002/0471250570.spi004",
    doi = "10.1002/0471250570.spi004"
}

La extraordinaria riqueza de especies y predominancia ecológica de las plantas con flores (angiospermas) contemporáneas son aún más notables al considerar el inicio relativamente reciente de su diversificación evolutiva. Examinamos la diversificación evolutiva de las angiospermas y la distribución diferencial observada de especies en los clados de angiospermas estimando la tasa de diversificación para las angiospermas en su conjunto y para un gran conjunto de clados de angiospermas. También identificamos clados de angiospermas con una diversidad actual que es mucho mayor o menor de lo esperado, dado el estimado de tasa de diversificación de fondo. El reconocimiento de clados de angiospermas, las relaciones filogenéticas entre ellos y su composición taxonómica se basan en una compilación empírica de estudios filogenéticos primarios. Al hacer un uso integrador y crítico del registro paleobotánico, obtenemos aproximaciones razonablemente seguras para la edad de un gran conjunto de clados de angiospermas. La diversificación se modeló como un proceso estocástico de nacimiento y muerte homogéneo en el tiempo que depende de la tasa de diversificación (r) y la tasa de extinción relativa (epsilon). Luego se utilizó un análisis estadístico del proceso de nacimiento y muerte para obtener intervalos de confianza del 95% para el número esperado de especies a lo largo del tiempo en un clado que se diversifica a una tasa igual a la de las angiospermas en su conjunto. Los intervalos de confianza se obtuvieron para las edades del grupo troncal y del grupo corona en ausencia de extinción (e = 0.0) y bajo una alta tasa de extinción relativa (epsilon = 0.9). Luego se comparó la diversidad actual de los clados de angiospermas con la diversidad de especies esperada según la tasa de fondo de diversificación, y, dependiendo de su colocación con respecto a los intervalos de confianza calculados, se identificaron clados excepcionalmente ricos en especies o excepcionalmente pobres en especies. La tasa de diversificación para las angiospermas en su conjunto varía de 0.077 (epsilon = 0.9) a 0.089 (epsilon = 0.0) eventos netos de especiación por millón de años. Diez clados caen por encima de los intervalos de confianza de la diversidad de especies esperada, y se encontró que 13 clados son inesperadamente pobres en especies. La distribución filogenética de clados con un número excepcionalmente alto de especies sugiere que los rasgos que confieren altas tasas de diversificación evolucionaron de manera independiente en diferentes instancias y no caracterizan a las angiospermas en su conjunto.

@article{doi101111j001438202001tb00826x,
    author = "Magallón, Susana y Sanderson, Michael J.",
    title = "TASAS ABSOLUTAS DE DIVERSIFICACIÓN EN CLADOS DE ANGIOSPERMAS",
    year = "2001",
    journal = "Evolución",
    abstract = "La extraordinaria riqueza de especies y predominancia ecológica de las plantas con flores (angiospermas) contemporáneas son aún más notables al considerar el inicio relativamente reciente de su diversificación evolutiva. Examinamos la diversificación evolutiva de las angiospermas y la distribución diferencial observada de especies en los clados de angiospermas estimando la tasa de diversificación para las angiospermas en su conjunto y para un gran conjunto de clados de angiospermas. También identificamos clados de angiospermas con una diversidad actual que es mucho mayor o menor de lo esperado, dado el estimado de tasa de diversificación de fondo. El reconocimiento de clados de angiospermas, las relaciones filogenéticas entre ellos y su composición taxonómica se basan en una compilación empírica de estudios filogenéticos primarios. Al hacer un uso integrador y crítico del registro paleobotánico, obtenemos aproximaciones razonablemente seguras para la edad de un gran conjunto de clados de angiospermas. La diversificación se modeló como un proceso estocástico de nacimiento y muerte homogéneo en el tiempo que depende de la tasa de diversificación (r) y la tasa de extinción relativa (epsilon). Luego se utilizó un análisis estadístico del proceso de nacimiento y muerte para obtener intervalos de confianza del 95% para el número esperado de especies a lo largo del tiempo en un clado que se diversifica a una tasa igual a la de las angiospermas en su conjunto. Los intervalos de confianza se obtuvieron para las edades del grupo troncal y del grupo corona en ausencia de extinción (e = 0.0) y bajo una alta tasa de extinción relativa (epsilon = 0.9). Luego se comparó la diversidad actual de los clados de angiospermas con la diversidad de especies esperada según la tasa de fondo de diversificación, y, dependiendo de su colocación con respecto a los intervalos de confianza calculados, se identificaron clados excepcionalmente ricos en especies o excepcionalmente pobres en especies. La tasa de diversificación para las angiospermas en su conjunto varía de 0.077 (epsilon = 0.9) a 0.089 (epsilon = 0.0) eventos netos de especiación por millón de años. Diez clados caen por encima de los intervalos de confianza de la diversidad de especies esperada, y se encontró que 13 clados son inesperadamente pobres en especies. La distribución filogenética de clados con un número excepcionalmente alto de especies sugiere que los rasgos que confieren altas tasas de diversificación evolucionaron de manera independiente en diferentes instancias y no caracterizan a las angiospermas en su conjunto.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2001.tb00826.x",
    openalex = "W2031187632",
    references = "doi1010029781444313918, doi101006bojl20000380, doi1010079783642616631, doi101007bf02860537, doi101007bf02860540, doi101017s0094837300006539, doi10103846536, doi101086285258, doi101098rspb19960088, doi101098rstb19940068, doi101126science13334591105, doi101214aoms1177730285, doi1023071266137, doi1023072399030, doi1023072992015, openalexw1978269554, openalexw409616968"
}

@article{doi101038nature01019,
    author = "Diamond, Jared M.",
    title = "Evolución, consecuencias y futuro de la domesticación de plantas y animales",
    year = "2002",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature01019",
    doi = "10.1038/nature01019",
    openalex = "W2128616554",
    references = "crossref2022quaternary, doi101002sici10969136199712145s7aiddia52233co2i, doi101038414782a, doi101086300102, doi101093acprofosobl97801995490610010001, doi101111j155856461991tb04425x, doi1023071185219, doi1023072137390, doi1023072403680, doi1023072485224, doi1023072803166, doi102307jctv301gjp"
}

Resumen El concepto de tipo funcional de planta propone que las especies pueden agruparse según respuestas comunes al medio ambiente y/o efectos comunes sobre los procesos del ecosistema. Sin embargo, el conocimiento de las relaciones entre los rasgos asociados con la respuesta de las plantas a factores ambientales como los recursos y las perturbaciones (rasgos de respuesta), y los rasgos que determinan los efectos de las plantas sobre las funciones del ecosistema (rasgos de efecto), como el ciclo biogeoquímico o la propensión a las perturbaciones, sigue siendo rudimentario. Presentamos un marco utilizando conceptos y resultados de la ecología de comunidades, la ecología de ecosistemas y la biología evolutiva para proporcionar este vínculo. El funcionamiento del ecosistema es el resultado final de la operación de múltiples filtros ambientales en una jerarquía de escalas que, al seleccionar individuos con respuestas apropiadas, dan lugar a ensamblajes con una composición de rasgos variable. Los vínculos funcionales y las compensaciones entre rasgos, cada uno de los cuales se relaciona con uno o varios procesos, determinan si el filtrado por diferentes factores da una coincidencia y si los efectos del ecosistema pueden deducirse fácilmente del conocimiento de los filtros. Para ilustrar este marco analizamos un conjunto de factores ambientales clave y procesos del ecosistema. Mientras que los rasgos asociados con la respuesta a los gradientes de nutrientes se solapan fuertemente con los que determinan la producción primaria neta, se encontró poco solapamiento directo entre la respuesta al fuego y la inflamabilidad. Hipotetizamos que estos patrones reflejan tendencias generales. Las respuestas a la disponibilidad de recursos estarían determinadas por rasgos que también están involucrados en el ciclo biogeoquímico, porque tanto estas respuestas como los efectos son impulsados por la compensación entre la adquisición y la conservación. Por otro lado, los rasgos de regeneración y demográficos asociados con la respuesta a las perturbaciones, que se sabe que tienen poca conexión con los rasgos adultos involucrados en la ecofisiología de las plantas, tendrían poca relevancia para los procesos del ecosistema. Este marco es probablemente ampliamente aplicable, aunque se debe tener precaución para utilizar los vínculos de rasgos y las compensaciones apropiados a la escala, las condiciones ambientales y el contexto evolutivo. Puede dirigir la selección de tipos funcionales de plantas para los modelos de vegetación en una gama de escalas y ayudar en el diseño de estudios experimentales de las relaciones entre la diversidad de plantas y las propiedades del ecosistema.

@article{doi101046j13652435200200664x,
    author = "Lavorel, Sandra and Garnier, Éric",
    title = "Predicting changes in community composition and ecosystem functioning from plant traits: revisiting the Holy Grail",
    year = "2002",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Resumen El concepto de tipo funcional de planta propone que las especies pueden agruparse según respuestas comunes al medio ambiente y/o efectos comunes sobre los procesos del ecosistema. Sin embargo, el conocimiento de las relaciones entre los rasgos asociados con la respuesta de las plantas a factores ambientales como los recursos y las perturbaciones (rasgos de respuesta), y los rasgos que determinan los efectos de las plantas sobre las funciones del ecosistema (rasgos de efecto), como el ciclo biogeoquímico o la propensión a las perturbaciones, sigue siendo rudimentario. Presentamos un marco utilizando conceptos y resultados de la ecología de comunidades, la ecología de ecosistemas y la biología evolutiva para proporcionar este vínculo. El funcionamiento del ecosistema es el resultado final de la operación de múltiples filtros ambientales en una jerarquía de escalas que, al seleccionar individuos con respuestas apropiadas, dan lugar a ensamblajes con una composición de rasgos variable. Los vínculos funcionales y las compensaciones entre rasgos, cada uno de los cuales se relaciona con uno o varios procesos, determinan si el filtrado por diferentes factores da una coincidencia y si los efectos del ecosistema pueden deducirse fácilmente del conocimiento de los filtros. Para ilustrar este marco analizamos un conjunto de factores ambientales clave y procesos del ecosistema. Mientras que los rasgos asociados con la respuesta a los gradientes de nutrientes se solapan fuertemente con los que determinan la producción primaria neta, se encontró poco solapamiento directo entre la respuesta al fuego y la inflamabilidad. Hipotetizamos que estos patrones reflejan tendencias generales. Las respuestas a la disponibilidad de recursos estarían determinadas por rasgos que también están involucrados en el ciclo biogeoquímico, porque tanto estas respuestas como los efectos son impulsados por la compensación entre la adquisición y la conservación. Por otro lado, los rasgos de regeneración y demográficos asociados con la respuesta a las perturbaciones, que se sabe que tienen poca conexión con los rasgos adultos involucrados en la ecofisiología de las plantas, tendrían poca relevancia para los procesos del ecosistema. Este marco es probablemente ampliamente aplicable, aunque se debe tener precaución para utilizar los vínculos de rasgos y las compensaciones apropiados a la escala, las condiciones ambientales y el contexto evolutivo. Puede dirigir la selección de tipos funcionales de plantas para los modelos de vegetación en una gama de escalas y ayudar en el diseño de estudios experimentales de las relaciones entre la diversidad de plantas y las propiedades del ecosistema.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    openalex = "W2168173042",
    references = "doi1010079783642809132, doi101007bf00002772, doi101023a1004327224729, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}

Aquí, se evalúa la coevolución de los hongos micorrícicos y las raíces a la luz de la evidencia ahora disponible, de estudios paleobotánicos y morfológicos y del análisis de filogenias basadas en el ADN. Las primeras plantas terrestres similares a briofitas, en el Devónico temprano (hace 400 millones de años), tenían asociaciones endofíticas que parecían micorrizas vesículo-arbusculares (VAM) incluso antes de que evolucionaran las raíces. La evolución de las micorrizas habría progresado desde hifas endofíticas hacia asociaciones equilibradas donde los socios eran interdependientes debido al intercambio de recursos energéticos y nutricionales limitantes. La mayoría de las micorrizas son mutualistas, pero en algunos casos la tendencia hacia un mayor control de las plantas sobre los hongos culmina en las micorrizas explotadoras de plantas aclorofílicas y micoheterótrofas. Las micorrizas ectomicorrícicas, ericoides y de orquídeas, así como las raíces no micorrícicas, evolucionaron durante el período de rápida radiación de las angiospermas en el Cretácico. Se hipotetiza que las raíces evolucionaron gradualmente desde los rizomas para proporcionar hábitats más adecuados para los hongos micorrícicos y proporcionar a las plantas ramas complejas y hojas con agua y nutrientes. Las presiones de selección han causado la divergencia morfológica de las raíces con diferentes tipos de micorrizas. El grosor de la corteza de la raíz y la suberización del exodermis son mayores en las plantas obligadamente micorrícicas, mientras que las plantas no micorrícicas tienden a tener raíces finas, con más pelos radiculares y defensas químicas relativamente avanzadas. Se discuten las principales tendencias coevolutivas y el éxito relativo de las plantas con diferentes tipos de raíces. Resumen del contenido 275 I. Introducción 276 II. Hongos micorrícicos 276 III. El amanecer de las micorrizas 279 IV. Asociaciones micorrícicas de plantas vivas y extintas 282 V. Evolución de las raíces 288 VI. La raíz como hábitat para los hongos 290 VII. Tendencias de evolución de las micorrizas 295 Agradecimientos 298 Referencias 298.

@article{doi101046j14698137200200397x,
    author = "Brundrett, Mark",
    title = "Coevolution of roots and mycorrhizas of land plants",
    year = "2002",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Aquí, se evalúa la coevolución de los hongos micorrícicos y las raíces a la luz de la evidencia ahora disponible, de estudios paleobotánicos y morfológicos y del análisis de filogenias basadas en el ADN. Las primeras plantas terrestres similares a briofitas, en el Devónico temprano (hace 400 millones de años), tenían asociaciones endofíticas que parecían micorrizas vesículo-arbusculares (VAM) incluso antes de que evolucionaran las raíces. La evolución de las micorrizas habría progresado desde hifas endofíticas hacia asociaciones equilibradas donde los socios eran interdependientes debido al intercambio de recursos energéticos y nutricionales limitantes. La mayoría de las micorrizas son mutualistas, pero en algunos casos la tendencia hacia un mayor control de las plantas sobre los hongos culmina en las micorrizas explotadoras de plantas aclorofílicas y micoheterótrofas. Las micorrizas ectomicorrícicas, ericoides y de orquídeas, así como las raíces no micorrícicas, evolucionaron durante el período de rápida radiación de las angiospermas en el Cretácico. Se hipotetiza que las raíces evolucionaron gradualmente desde los rizomas para proporcionar hábitats más adecuados para los hongos micorrícicos y proporcionar a las plantas ramas complejas y hojas con agua y nutrientes. Las presiones de selección han causado la divergencia morfológica de las raíces con diferentes tipos de micorrizas. El grosor de la corteza de la raíz y la suberización del exodermis son mayores en las plantas obligadamente micorrícicas, mientras que las plantas no micorrícicas tienden a tener raíces finas, con más pelos radiculares y defensas químicas relativamente avanzadas. Se discuten las principales tendencias coevolutivas y el éxito relativo de las plantas con diferentes tipos de raíces. Resumen del contenido 275 I. Introducción 276 II. Hongos micorrícicos 276 III. El amanecer de las micorrizas 279 IV. Asociaciones micorrícicas de plantas vivas y extintas 282 V. Evolución de las raíces 288 VI. La raíz como hábitat para los hongos 290 VII. Tendencias de evolución de las micorrizas 295 Agradecimientos 298 Referencias 298.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
    doi = "10.1046/j.1469-8137.2002.00397.x",
    openalex = "W2142191074",
    references = "doi101017s1464793101005735, doi10103837918, doi101146annurevearth261379"
}

La dormancia de la semilla juega un papel importante en la ecología de la germinación y la evolución de las plantas con semillas. La dormancia morfológica de la semilla es causada por un embrión inmaduro que debe madurar antes de la germinación. Se ha sugerido que la presencia de un embrión inmaduro es plesiomórfica entre las plantas con semillas y que ha ocurrido un cambio direccional paralelo en la morfología del embrión por separado en gimnospermas y en angiospermas. Probamos estas hipótesis utilizando datos originales sobre la morfología del embrión de taxones basales clave, un conjunto de datos publicado y el método de reconstrucción del estado ancestral de caracteres mediante mínimos cuadrados generalizados (GLS). Las reconstrucciones para la relación embrión a semilla (E:S) utilizando promedios familiares para 179 familias mostraron que la relación E:S ha aumentado entre la angiosperma ancestral y casi todos los taxones de angiospermas existentes. Las especies en el clado rosid tienen embriones particularmente grandes en relación con la angiosperma ancestral. Los resultados para las gimnospermas muestran un aumento similar pero menor. No hubo diferencias estadísticamente significativas en la relación E:S entre los taxones basales y ningún grupo derivado debido a errores estándar extremadamente grandes producidos por los modelos GLS. Sin embargo, las diferencias entre los valores reconstruidos para la angiosperma ancestral y nodos más altamente anidados son grandes y estos resultados son robustos a manipulaciones topológicas y de longitud de rama. Nuestro análisis apoya la idea de que el embrión inmaduro es primitivo entre las plantas con semillas y que ha habido un cambio direccional en la relación E:S tanto dentro de las angiospermas como de las gimnospermas. Nuestro análisis sugiere que la dormancia impuesta por un embrión inmaduro es plesiomórfica entre las angiospermas y que la no dormancia y otros tipos de dormancia probablemente evolucionaron dentro de las angiospermas. El cambio en la relación E:S fue probablemente un cambio heterocrónico y tiene importantes implicaciones para el ciclo de vida de las plantas con semillas.

@article{doi101111j001438202002tb00137x,
    author = "Forbis, Tara A. y Floyd, Sandra K. y de Queiroz, Alan",
    title = "LA EVOLUCIÓN DEL TAMAÑO DEL EMBRIÓN EN ANGIOSPERMAS Y OTRAS PLANTAS SEMILLERAS: IMPLICACIONES PARA LA EVOLUCIÓN DE LA DORMANCIA DE LAS SEMILLAS",
    year = "2002",
    journal = "Evolution",
    abstract = "La dormancia de la semilla juega un papel importante en la ecología de la germinación y la evolución de las plantas con semillas. La dormancia morfológica de la semilla es causada por un embrión inmaduro que debe madurar antes de la germinación. Se ha sugerido que la presencia de un embrión inmaduro es plesiomórfica entre las plantas con semillas y que ha ocurrido un cambio direccional paralelo en la morfología del embrión por separado en gimnospermas y en angiospermas. Probamos estas hipótesis utilizando datos originales sobre la morfología del embrión de taxones basales clave, un conjunto de datos publicado y el método de reconstrucción del estado ancestral de caracteres mediante mínimos cuadrados generalizados (GLS). Las reconstrucciones para la relación embrión a semilla (E:S) utilizando promedios familiares para 179 familias mostraron que la relación E:S ha aumentado entre la angiosperma ancestral y casi todos los taxones de angiospermas existentes. Las especies en el clado rosid tienen embriones particularmente grandes en relación con la angiosperma ancestral. Los resultados para las gimnospermas muestran un aumento similar pero menor. No hubo diferencias estadísticamente significativas en la relación E:S entre los taxones basales y ningún grupo derivado debido a errores estándar extremadamente grandes producidos por los modelos GLS. Sin embargo, las diferencias entre los valores reconstruidos para la angiosperma ancestral y nodos más altamente anidados son grandes y estos resultados son robustos a manipulaciones topológicas y de longitud de rama. Nuestro análisis apoya la idea de que el embrión inmaduro es primitivo entre las plantas con semillas y que ha habido un cambio direccional en la relación E:S tanto dentro de las angiospermas como de las gimnospermas. Nuestro análisis sugiere que la dormancia impuesta por un embrión inmaduro es plesiomórfica entre las angiospermas y que la no dormancia y otros tipos de dormancia probablemente evolucionaron dentro de las angiospermas. El cambio en la relación E:S fue probablemente un cambio heterocrónico y tiene importantes implicaciones para el ciclo de vida de las plantas con semillas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2002.tb00137.x",
    openalex = "W2179841627",
    references = "doi101007bf02101694, doi10103844766, doi101093oso97801985464120010001, doi1023072529087, doi105860choice185809, doi105860choice295104, doi105860choice362164, openalexw1546962148, openalexw2506868775, openalexw3217097258"
}

@article{doi101046j109583392003t01100158x,
    author = "GROUP*, LA FILogenia DE LAS ANGIOSPERMAS",
    title = "Una actualización de la clasificación del Grupo de Filogenia de las Angiospermas para los órdenes y familias de plantas con flores: APG II",
    year = "2003",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    doi = "10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    openalex = "W2980373194",
    references = "doi1023072399846"
}

El gradiente latitudinal en la riqueza de especies es una característica omnipresente del mundo vivo, pero sus causas subyacentes siguen siendo poco claras. Evaluamos la hipótesis de que la energía ambiental impulsa las tasas evolutivas y, por tanto, la diversificación en plantas con flores. Estimamos los niveles de energía a través de las distribuciones de familias de angiospermas en términos de evapotranspiración, temperatura y radiación UV obtenidos de bases de datos satelitales y climáticas. Utilizando el árbol filogenético basado en ADN más completo para angiospermas hasta la fecha, el análisis de 86 comparaciones entre familias hermanas muestra que las tasas de evolución molecular han sido efectivamente más rápidas en regiones de alta energía, pero que esto no es un paso intermedio entre la energía y la diversidad. La energía tiene efectos fuertes, pero independientes, tanto sobre la riqueza de especies como sobre las tasas de evolución molecular.

@article{doi101098rspb20042849,
    author = "Davies, T. Jonathan y Savolainen, Vincent y Chase, Mark W. y Moat, Justin y Barraclough, Timothy G.",
    title = "Energía ambiental y tasas evolutivas en plantas con flores",
    year = "2004",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "El gradiente latitudinal en la riqueza de especies es una característica omnipresente del mundo vivo, pero sus causas subyacentes siguen siendo poco claras. Evaluamos la hipótesis de que la energía ambiental impulsa las tasas evolutivas y, por tanto, la diversificación en plantas con flores. Estimamos los niveles de energía a través de las distribuciones de familias de angiospermas en términos de evapotranspiración, temperatura y radiación UV obtenidos de bases de datos satelitales y climáticas. Utilizando el árbol filogenético basado en ADN más completo para angiospermas hasta la fecha, el análisis de 86 comparaciones entre familias hermanas muestra que las tasas de evolución molecular han sido efectivamente más rápidas en regiones de alta energía, pero que esto no es un paso intermedio entre la energía y la diversidad. La energía tiene efectos fuertes, pero independientes, tanto sobre la riqueza de especies como sobre las tasas de evolución molecular.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2004.2849",
    doi = "10.1098/rspb.2004.2849",
    openalex = "W2145421207",
    references = "doi101098rspb19960088"
}

@misc{crossref2005angiosperms,
    title = "Angiospermas",
    year = "2005",
    booktitle = "Enciclopedia Científica Van Nostrand",
    url = "https://doi.org/10.1002/0471743984.vse0445",
    doi = "10.1002/0471743984.vse0445"
}

@article{doi101016jpalaeo200507006,
    author = "Friis, Else Marie y Pedersen, Kaj Raunsgaard y Crane, Peter R.",
    title = "Flores de angiospermas del Cretácico: Innovación y evolución en la reproducción de las plantas",
    year = "2005",
    journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    doi = "10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    openalex = "W2001715812",
    references = "doi101007bf02860067, doi101007bf02860540, doi101007bf02861082, doi101016s0012821x0000159x, doi101038363342a0, doi10103846536, doi101038nature01420, doi1010719780643090149, doi1023071485834, doi1023072399030, doi1023072418725, doi1023072807789, doi105860choice323883, doi105860choice323884"
}

@incollection{kenrick2005angiosperms,
    author = "Kenrick, P.",
    title = "Angiospermas",
    year = "2005",
    booktitle = "Encyclopedia of Geology",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
    doi = "10.1016/b978-0-08-102908-4.00202-2",
    pages = "501-510"
}

Aunque se ha logrado un gran progreso en la clarificación de las relaciones profundas entre angiospermas, varios nodos tempranos en la rama de las angiospermas del Árbol de la Vida han resultado difíciles de resolver. Quizás la última gran pregunta pendiente en la filogenia de las angiospermas basales involucra el orden de ramificación entre los cinco grandes clados de mesangiospermas (Ceratophyllum, Chloranthaceae, eudicotiledóneas, magnolioides y monocotiledóneas). Los análisis anteriores no han encontrado un apoyo consistente para las relaciones entre estos clados. En un esfuerzo por resolver estas relaciones, realizamos análisis filogenéticos de 61 genes de plástidos (aproximadamente 42.000 pb) para 45 taxones, incluyendo miembros de todos los linajes principales de angiospermas basales. También reportamos la secuencia completa del genoma de plástidos de Ceratophyllum demersum. Los análisis de parsimonia de conjuntos de datos combinados y particionados variaron en la colocación de varios taxones, particularmente Ceratophyllum, mientras que los árboles de máxima verosimilitud (ML) fueron más topológicamente estables. Los análisis de evidencia total ML recuperaron un clado de Chloranthaceae + magnolioides como hermano de un clado bien apoyado de monocotiledóneas + (Ceratophyllum + eudicotiledóneas). Los valores de apoyo ML bootstrap y bayesiano para estas relaciones fueron generalmente altos, aunque las pruebas de topología aproximadamente no sesgadas no pudieron rechazar varias topologías alternativas. Las ramas extremadamente cortas que separan estos cinco linajes implican una diversificación rápida estimada que ocurrió entre 143,8 +/- 4,8 y 140,3 +/- 4,8 millones de años atrás.

@article{doi101073pnas0708072104,
    author = "Moore, Michael J. y Bell, Charles D. y Soltis, Pamela S. y Soltis, Pamela S.",
    title = "Utilizando datos a escala de genoma de plástidos para resolver relaciones enigmáticas entre angiospermas basales",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Aunque se ha logrado un gran progreso en la clarificación de las relaciones profundas entre angiospermas, varios nodos tempranos en la rama de las angiospermas del Árbol de la Vida han resultado difíciles de resolver. Quizás la última gran pregunta pendiente en la filogenia de las angiospermas basales involucra el orden de ramificación entre los cinco grandes clados de mesangiospermas (Ceratophyllum, Chloranthaceae, eudicotiledóneas, magnolioides y monocotiledóneas). Los análisis anteriores no han encontrado un apoyo consistente para las relaciones entre estos clados. En un esfuerzo por resolver estas relaciones, realizamos análisis filogenéticos de 61 genes de plástidos (aproximadamente 42.000 pb) para 45 taxones, incluyendo miembros de todos los linajes principales de angiospermas basales. También reportamos la secuencia completa del genoma de plástidos de Ceratophyllum demersum. Los análisis de parsimonia de conjuntos de datos combinados y particionados variaron en la colocación de varios taxones, particularmente Ceratophyllum, mientras que los árboles de máxima verosimilitud (ML) fueron más topológicamente estables. Los análisis de evidencia total ML recuperaron un clado de Chloranthaceae + magnolioides como hermano de un clado bien apoyado de monocotiledóneas + (Ceratophyllum + eudicotiledóneas). Los valores de apoyo ML bootstrap y bayesiano para estas relaciones fueron generalmente altos, aunque las pruebas de topología aproximadamente no sesgadas no pudieron rechazar varias topologías alternativas. Las ramas extremadamente cortas que separan estos cinco linajes implican una diversificación rápida estimada que ocurrió entre 143,8 +/- 4,8 y 140,3 +/- 4,8 millones de años atrás.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0708072104",
    doi = "10.1073/pnas.0708072104",
    openalex = "W2114217421",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi1023072399030, openalexw2163836228"
}

Las angiospermas son el clado más grande y exitoso de plantas terrestres con >250.000 especies distribuidas en casi todos los hábitats terrestres. Muchos estudios filogenéticos se han basado en secuencias de ADN de uno a varios genes, pero, a pesar de décadas de esfuerzos intensivos, las relaciones entre las primeras líneas divergentes y varios de los clados principales permanecen incompletamente resueltas o débilmente apoyadas. Realizamos análisis filogenéticos de 81 genes de plastidios en 64 genomas secuenciados, incluidos 13 genomas nuevos, para estimar las relaciones entre los clados principales de angiospermas, y los árboles resultantes se utilizan para examinar la evolución del contenido de genes e intrones. Los árboles filogenéticos de múltiples métodos, incluidos los enfoques basados en modelos, proporcionan un fuerte apoyo para la posición de Amborella como la primera línea divergente de plantas con flores, seguida por Nymphaeales y Austrobaileyales. Los árboles del genoma de plastidios también proporcionan un fuerte apoyo para una relación de hermandad entre eudicotiledóneas y monocotiledóneas, y este grupo es hermano de un clado que incluye Chloranthales y magnoliids. La resolución de las relaciones entre los clados principales de angiospermas proporciona el marco necesario para abordar numerosas preguntas evolutivas sobre la rápida diversificación de las angiospermas. El contenido de genes e intrones está altamente conservado entre las angiospermas tempranas divergentes y las eudicotiledóneas basales, pero 62 pérdidas independientes de genes e intrones están limitadas a los clados más derivados de monocotiledóneas y eudicotiledóneas. Además, se detectó una correlación específica de linaje entre las tasas de sustituciones de nucleótidos, indels y reordenamientos genómicos.

@article{doi101073pnas0709121104,
    author = "Jansen, Robert K. y Cai, Zhengqiu y Raubeson, Linda A. y Daniell, Henry y dePamphilis, Claude W. y Leebens-Mack, James y Müller, Kai y Guisinger-Bellian, Mary y Haberle, Rosemarie C. y Hansen, Anne y Chumley, Timothy W. y Lee, Seung Bum y Peery, Rhiannon M. y McNeal, Joel R. y Kuehl, Jennifer V. y Boore, Jeffrey L.",
    title = "Análisis de 81 genes de 64 genomas de plastidios resuelve las relaciones en angiospermas e identifica patrones evolutivos a escala de genoma",
    year = "2007",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Las angiospermas son el clado más grande y exitoso de plantas terrestres con >250.000 especies distribuidas en casi todos los hábitats terrestres. Muchos estudios filogenéticos se han basado en secuencias de ADN de uno a varios genes, pero, a pesar de décadas de esfuerzos intensivos, las relaciones entre las primeras líneas divergentes y varios de los clados principales permanecen incompletamente resueltas o débilmente apoyadas. Realizamos análisis filogenéticos de 81 genes de plastidios en 64 genomas secuenciados, incluidos 13 genomas nuevos, para estimar las relaciones entre los clados principales de angiospermas, y los árboles resultantes se utilizan para examinar la evolución del contenido de genes e intrones. Los árboles filogenéticos de múltiples métodos, incluidos los enfoques basados en modelos, proporcionan un fuerte apoyo para la posición de Amborella como la primera línea divergente de plantas con flores, seguida por Nymphaeales y Austrobaileyales. Los árboles del genoma de plastidios también proporcionan un fuerte apoyo para una relación de hermandad entre eudicotiledóneas y monocotiledóneas, y este grupo es hermano de un clado que incluye Chloranthales y magnoliids. La resolución de las relaciones entre los clados principales de angiospermas proporciona el marco necesario para abordar numerosas preguntas evolutivas sobre la rápida diversificación de las angiospermas. El contenido de genes e intrones está altamente conservado entre las angiospermas tempranas divergentes y las eudicotiledóneas basales, pero 62 pérdidas independientes de genes e intrones están limitadas a los clados más derivados de monocotiledóneas y eudicotiledóneas. Además, se detectó una correlación específica de linaje entre las tasas de sustituciones de nucleótidos, indels y reordenamientos genómicos.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0709121104",
    doi = "10.1073/pnas.0709121104",
    openalex = "W2127735379",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi10108010635150290069913, doi101093bioinformatics17121246, doi101111boj12385"
}

Los estudios filogenéticos están revelando que los nichos ecológicos principales se conservan más a través de la historia evolutiva de lo esperado, lo que implica que las adaptaciones a los cambios climáticos principales no se han logrado fácilmente en todos los linajes. La conservación del nicho filogenético tiene importantes consecuencias para la ensamblaje tanto de comunidades locales como de los pools regionales de especies de los cuales estas se derivan. Si están disponibles corredores para el movimiento, los nuevos entornos emergentes tenderán a ser llenados por especies que filtran desde áreas en las cuales las adaptaciones relevantes ya han evolucionado, en lugar de ser llenados por la evolución in situ de estas adaptaciones. Los ejemplos incluyen disyunciones intercontinentales de plantas tropicales, la expansión de linajes vegetales alrededor del Hemisferio Norte después de la evolución de la tolerancia al frío, y la radiación de plantas alpinas del norte hacia los Andes. Estas observaciones resaltan el papel del conocimiento filogenético y la biogeografía histórica en las explicaciones de los patrones globales de biodiversidad. También tienen implicaciones para el futuro de la biodiversidad.

@article{doi101073pnas0801962105,
    author = "Donoghue, Michael J.",
    title = "A phylogenetic perspective on the distribution of plant diversity",
    year = "2008",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Los estudios filogenéticos están revelando que los nichos ecológicos principales se conservan más a través de la historia evolutiva de lo esperado, lo que implica que las adaptaciones a los cambios climáticos principales no se han logrado fácilmente en todos los linajes. La conservación del nicho filogenético tiene importantes consecuencias para el ensamblaje tanto de comunidades locales como de los pools regionales de especies de los cuales estas se derivan. Si están disponibles corredores para el movimiento, los nuevos entornos emergentes tenderán a ser llenados por especies que filtran desde áreas en las cuales las adaptaciones relevantes ya han evolucionado, en lugar de ser llenados por la evolución in situ de estas adaptaciones. Los ejemplos incluyen disyunciones intercontinentales de plantas tropicales, la expansión de linajes vegetales alrededor del Hemisferio Norte después de la evolución de la tolerancia al frío, y la radiación de plantas alpinas del norte hacia los Andes. Estas observaciones resaltan el papel del conocimiento filogenético y la biogeografía histórica en las explicaciones de los patrones globales de biodiversidad. También tienen implicaciones para el futuro de la biodiversidad.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0801962105",
    doi = "10.1073/pnas.0801962105",
    openalex = "W2064987933",
    references = "doi101007bf02806171, doi101126science1130880, doi1023072395199, doi1023073224530"
}

@incollection{leng2008angiosperms,
    author = "Leng, Qin y Wu, Shun-qing y Friis, Else Marie",
    title = "ANGIOSPERMS",
    year = "2008",
    booktitle = "The Jehol Fossils",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
    doi = "10.1016/b978-012374173-8.50021-1",
    pages = "178-179-185"
}

Estudios filogenéticos recientes han revelado el papel fundamental que jugó el levantamiento de los Andes en la extraordinaria diversificación de la flora neotropical. Sin embargo, estos estudios han considerado típicamente el levantamiento andino como un único evento limitado en el tiempo que fomentó la evolución de elementos de alta montaña. Esto contrasta con las reconstrucciones geológicas que indican que el levantamiento ocurrió en periodos discretos de oeste a este y que afectó diferentes regiones en momentos distintos. Presentamos un enfoque para integrar la tectónica andina con las reconstrucciones biogeográficas de las plantas neotropicales, utilizando la familia del café (Rubiaceae) como grupo modelo. La distribución de esta familia abarca hábitats de alta montaña y montañosos, así como las tierras bajas tropicales de América Central y del Sur, ofreciendo así una oportunidad única para estudiar la influencia del levantamiento andino en toda la flora neotropical. Nuestros resultados sugieren que la Rubiaceae se originó en el Paleotrópico y utilizó la conexión boreotropical para llegar a América del Sur. Los patrones biogeográficos encontrados corroboran la existencia de una barrera de dispersión duradera entre los Andes del Norte y los Andes Centrales, el "Portal Andino Occidental". El levantamiento de la Cordillera Oriental puso fin a esta barrera, permitiendo la dispersión de linajes boreotrópicos hacia el Sur, pero dio lugar a un enorme sistema de humedales ("Lago Pebas") en la Amazonía occidental que impidió la especiación in situ y la dispersión florística entre los Andes y la Amazonía durante al menos 6 millones de años. Aquí, proporcionamos evidencia de estos eventos en las plantas.

@article{doi101073pnas0811421106,
    author = "Antonelli, Alexandre and Nylander, Johan A. A. and Persson, Claes and Sanmartín, Isabel",
    title = "Tracing the impact of the Andean uplift on Neotropical plant evolution",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Estudios filogenéticos recientes han revelado el papel fundamental que jugó el levantamiento de los Andes en la extraordinaria diversificación de la flora neotropical. Sin embargo, estos estudios han considerado típicamente el levantamiento andino como un único evento limitado en el tiempo que fomentó la evolución de elementos de alta montaña. Esto contrasta con las reconstrucciones geológicas que indican que el levantamiento ocurrió en periodos discretos de oeste a este y que afectó diferentes regiones en momentos distintos. Presentamos un enfoque para integrar la tectónica andina con las reconstrucciones biogeográficas de las plantas neotropicales, utilizando la familia del café (Rubiaceae) como grupo modelo. La distribución de esta familia abarca hábitats de alta montaña y montañosos, así como las tierras bajas tropicales de América Central y del Sur, ofreciendo así una oportunidad única para estudiar la influencia del levantamiento andino en toda la flora neotropical. Nuestros resultados sugieren que la Rubiaceae se originó en el Paleotrópico y utilizó la conexión boreotropical para llegar a América del Sur. Los patrones biogeográficos encontrados corroboran la existencia de una barrera de dispersión duradera entre los Andes del Norte y los Andes Centrales, el "Portal Andino Occidental". El levantamiento de la Cordillera Oriental puso fin a esta barrera, permitiendo la dispersión de linajes boreotrópicos hacia el Sur, pero dio lugar a un enorme sistema de humedales ("Lago Pebas") en la Amazonía occidental que impidió la especiación in situ y la dispersión florística entre los Andes y la Amazonía durante al menos 6 millones de años. Aquí, proporcionamos evidencia de estos eventos en las plantas.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0811421106",
    doi = "10.1073/pnas.0811421106",
    openalex = "W2026781465",
    references = "doi101007978146133485919, doi101111j109583122001tb01368x, doi1011300016760620001121091uhotca23co2, doi1023073515620, doi105962bhlpart13183, openalexw3001739384"
}

El clado rosida (70.000 especies) contiene más de una cuarta parte de todas las especies de angiospermas e incluye la mayoría de los linajes de árboles de bosques templados y tropicales existentes. A pesar de los avances en la elucidación de las relaciones dentro de las angiospermas, los rosidos siguen siendo el mayor clado principal mal resuelto; las relaciones profundas dentro de los rosidos son particularmente enigmáticas. Basándonos en análisis de parsimonia y máxima verosimilitud (MV) de conjuntos de datos separados y combinados de 12 genes (10 genes plastidiales, 2 nucleares; >18.000 pb) y repetición invertida plastidial (RI; 24 genes y espaciadores intermedios; >25.000 pb) para >100 especies rosidas, proporcionamos una comprensión mucho mejorada de la filogenia rosida. Vitaceas son hermanas de todos los demás rosidos, los cuales a su vez forman 2 grandes clados, cada uno con un valor de bootstrap MV del 100%: (i) eurosidos I (Fabidae) incluyen el clado fijador de nitrógeno, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales y Oxalidales; y (ii) eurosidos II (Malvidae) incluyen Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales y Picramniaceae. El clado rosida se diversificó rápidamente en estos linajes principales, posiblemente en un período de <15 millones de años, y quizás en tan solo 4 a 5 millones de años. El momento de la rápida radiación inferida de los rosidos [de 108 a 91 millones de años atrás (Ma) y 107-83 Ma para Fabidae y Malvidae, respectivamente] corresponde con el rápido ascenso de bosques dominados por angiospermas y la concomitante diversificación de otros clados que habitan estos bosques, incluyendo anfibios, hormigas, mamíferos placentarios y helechos.

@article{doi101073pnas0813376106,
    author = "Wang, Hengchang y Moore, Michael J. y Soltis, Pamela S. y Bell, Charles D. y Brockington, Samuel F. y Alexandre, Roolse y Davis, Charles C. y Latvis, Maribeth y Manchester, Steven R. y Soltis, Pamela S.",
    title = "Radiación rosida y el rápido ascenso de bosques dominados por angiospermas",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "El clado rosida (70.000 especies) contiene más de una cuarta parte de todas las especies de angiospermas e incluye la mayoría de los linajes de árboles de bosques templados y tropicales existentes. A pesar de los avances en la elucidación de las relaciones dentro de las angiospermas, los rosidos siguen siendo el mayor clado principal mal resuelto; las relaciones profundas dentro de los rosidos son particularmente enigmáticas. Basándonos en análisis de parsimonia y máxima verosimilitud (MV) de conjuntos de datos separados y combinados de 12 genes (10 genes plastidiales, 2 nucleares; >18.000 pb) y repetición invertida plastidial (RI; 24 genes y espaciadores intermedios; >25.000 pb) para >100 especies rosidas, proporcionamos una comprensión mucho mejorada de la filogenia rosida. Vitaceas son hermanas de todos los demás rosidos, los cuales a su vez forman 2 grandes clados, cada uno con un valor de bootstrap MV del 100%: (i) eurosidos I (Fabidae) incluyen el clado fijador de nitrógeno, Celastrales, Huaceae, Zygophyllales, Malpighiales y Oxalidales; y (ii) eurosidos II (Malvidae) incluyen Tapisciaceae, Brassicales, Malvales, Sapindales, Geraniales, Myrtales, Crossosomatales y Picramniaceae. El clado rosida se diversificó rápidamente en estos linajes principales, posiblemente en un período de <15 millones de años, y quizás en tan solo 4 a 5 millones de años. El momento de la rápida radiación inferida de los rosidos [de 108 a 91 millones de años atrás (Ma) y 107-83 Ma para Fabidae y Malvidae, respectivamente] corresponde con el rápido ascenso de bosques dominados por angiospermas y la concomitante diversificación de otros clados que habitan estos bosques, incluyendo anfibios, hormigas, mamíferos placentarios y helechos.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0813376106",
    doi = "10.1073/pnas.0813376106",
    openalex = "W2158722151",
    references = "doi101146annurevento53103106093304"
}

La importancia relativa de los procesos ecológicos locales y de procesos históricos a gran escala en la causa de las diferencias en la riqueza de especies a través del globo sigue siendo debatida con gran intensidad. Para obtener información sobre estas preguntas, investigamos el ensamblaje de la diversidad de plantas en el Cerrado en Sudamérica, la sabana tropical más rica en especies del mundo. Las filogenias calibradas en el tiempo sugieren que las linajes del Cerrado comenzaron a diversificarse hace menos de 10 millones de años, con la mayoría de los linajes diversificándose hace 4 millones de años o menos, coincidiendo con el ascenso al dominio de las gramíneas C4 inflamables y la expansión del bioma de sabana en todo el mundo. Estas filogenias de plantas muestran que los linajes del Cerrado están fuertemente asociados con adaptaciones al fuego y tienen grupos hermanos en bosques húmedos cercanos mayormente libres de fuego, bosques estacionalmente secos, praderas subtropicales o vegetación de humedales. Estos hallazgos implican que el Cerrado se formó in situ mediante cambios adaptativos recientes y frecuentes para resistir el fuego, en lugar de mediante la dispersión de linajes ya adaptados al fuego. La ubicación del Cerrado rodeada por una diversa gama de biomas ricos en especies, y la barrera adaptativa aparentemente modesta planteada por el fuego, probablemente hayan contribuido a su striking riqueza de especies. Estos hallazgos añaden a la creciente evidencia de que los orígenes y el ensamblaje histórico de biomas ricos en especies han sido idiosincrásicos, impulsados en gran parte por características únicas de la geohistoria a escala regional y continental, y que diferentes procesos históricos pueden conducir a niveles similares de riqueza de especies moderna.

@article{doi101073pnas0903410106,
    author = "Simon, Marcelo Fragomeni y Grether, Rosaura y de Queiroz, Luciano Paganucci y Skema, Cynthia y Pennington, R. Toby y Hughes, Colin E.",
    title = "Reciente ensamblaje del Cerrado, un punto caliente de diversidad de plantas neotropicales, mediante evolución in situ de adaptaciones al fuego",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "La importancia relativa de los procesos ecológicos locales y de procesos históricos a gran escala en la causa de las diferencias en la riqueza de especies a través del globo sigue siendo debatida con gran intensidad. Para obtener información sobre estas preguntas, investigamos el ensamblaje de la diversidad de plantas en el Cerrado en Sudamérica, la sabana tropical más rica en especies del mundo. Las filogenias calibradas en el tiempo sugieren que los linajes del Cerrado comenzaron a diversificarse hace menos de 10 millones de años, con la mayoría de los linajes diversificándose hace 4 millones de años o menos, coincidiendo con el ascenso al dominio de las gramíneas C4 inflamables y la expansión del bioma de sabana en todo el mundo. Estas filogenias de plantas muestran que los linajes del Cerrado están fuertemente asociados con adaptaciones al fuego y tienen grupos hermanos en bosques húmedos cercanos mayormente libres de fuego, bosques estacionalmente secos, praderas subtropicales o vegetación de humedales. Estos hallazgos implican que el Cerrado se formó in situ mediante cambios adaptativos recientes y frecuentes para resistir el fuego, en lugar de mediante la dispersión de linajes ya adaptados al fuego. La ubicación del Cerrado rodeada por una diversa gama de biomas ricos en especies, y la barrera adaptativa aparentemente modesta planteada por el fuego, probablemente hayan contribuido a su striking riqueza de especies. Estos hallazgos añaden a la creciente evidencia de que los orígenes y el ensamblaje histórico de biomas ricos en especies han sido idiosincrásicos, impulsados en gran parte por características únicas de la geohistoria a escala regional y continental, y que diferentes procesos históricos pueden conducir a niveles similares de riqueza de especies moderna.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0903410106",
    doi = "10.1073/pnas.0903410106",
    openalex = "W2151396518",
    references = "doi101073pnas0608361104, doi101146annurevecolsys110308120327, openalexw2611511275"
}

Se demuestra que las venas que irrigan las hojas durante la fotosíntesis son notablemente más abundantes en las plantas con flores que en cualquier otro linaje de plantas vasculares. Las densidades de venas en angiospermas promedian 8 mm de vena por mm(2) de área foliar y pueden alcanzar 25 mm mm(-2), mientras que tales altas densidades están ausentes en todas las demás plantas, vivas o extintas. Las hojas de no-angiospermas han mantenido consistentemente un promedio cercano a 2 mm mm(-2) a lo largo de 380 millones de años de evolución, a pesar de una historia compleja que ha implicado cuatro o más orígenes independientes de hojas laminadas con muchas venas y cambios dramáticos en el clima y la composición atmosférica. Además demostramos que las altas densidades de venas foliares únicas de las angiospermas permiten tasas de transpiración sin precedentes, extendiendo trabajos previos que indican una fuerte correlación entre la densidad de venas y las tasas de asimilación. Dado que la densidad de venas es directamente medible en fósiles, estas correlaciones proporcionan un nuevo acceso a la fisiología de las plantas extintas y a cómo pudieron haber impactado sus entornos. Primero, las altas tasas de asimilación actualmente confinadas a las angiospermas entre las plantas vivas probablemente fueron únicas a lo largo de la historia evolutiva. Segundo, el reciclaje de agua impulsado por la transpiración que es importante para reforzar las precipitaciones en las selvas tropicales modernas podría haber sido significativamente menor en un mundo antes de las angiospermas.

@article{doi101098rspb20081919,
    author = "Boyce, C. Kevin y Brodribb, Timothy J. y Feild, Taylor S. y Zwieniecki, Maciej A.",
    title = "La evolución de las venas foliares en angiospermas fue fisiológica y ambientalmente transformadora",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Se demuestra que las venas que irrigan las hojas durante la fotosíntesis son notablemente más abundantes en las plantas con flores que en cualquier otro linaje de plantas vasculares. Las densidades de venas en angiospermas promedian 8 mm de vena por mm(2) de área foliar y pueden alcanzar 25 mm mm(-2), mientras que tales altas densidades están ausentes en todas las demás plantas, vivas o extintas. Las hojas de no-angiospermas han mantenido consistentemente un promedio cercano a 2 mm mm(-2) a lo largo de 380 millones de años de evolución, a pesar de una historia compleja que ha implicado cuatro o más orígenes independientes de hojas laminadas con muchas venas y cambios dramáticos en el clima y la composición atmosférica. Además demostramos que las altas densidades de venas foliares únicas de las angiospermas permiten tasas de transpiración sin precedentes, extendiendo trabajos previos que indican una fuerte correlación entre la densidad de venas y las tasas de asimilación. Dado que la densidad de venas es directamente medible en fósiles, estas correlaciones proporcionan un nuevo acceso a la fisiología de las plantas extintas y a cómo pudieron haber impactado sus entornos. Primero, las altas tasas de asimilación actualmente confinadas a las angiospermas entre las plantas vivas probablemente fueron únicas a lo largo de la historia evolutiva. Segundo, el reciclaje de agua impulsado por la transpiración que es importante para reforzar las precipitaciones en las selvas tropicales modernas podría haber sido significativamente menor en un mundo antes de las angiospermas.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2008.1919",
    doi = "10.1098/rspb.2008.1919",
    openalex = "W2119610202",
    references = "doi101016s0065250408601191, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0608361104, doi10108000241160310004657, doi101104pp107101352, doi101111boj12385, doi101126science24749481322, doi101146annurevarplant56032604144141, doi10230725065646, doi1023073515620, openalexw1584176508"
}

Se proporciona una clasificación revisada y actualizada para las familias de plantas con flores. Muchos estudios recientes han proporcionado evidencia cada vez más detallada sobre la posición de familias anteriormente sin clasificar, lo que ha resultado en la adopción de varios nuevos órdenes, incluyendo Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales y Zygophyllales. Se incluyen aquí varios géneros y familias anteriormente sin clasificar en órdenes, reduciendo considerablemente el número de taxones sin clasificar; estos incluyen Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae y Rafflesiaceae (ambas Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae y Strasburgeriaceae (todas Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae y Gerrardinaceae (ambas Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) y Boraginaceae (ahora al menos conocida como miembro del clado lamiid). Las familias recién segregadas para géneros anteriormente entendidos como pertenecientes a otras familias reconocidas por APG incluyen Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae y Cleomaceae (ambas Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae y Talinaceae (todas Caryophyllales) y Linderniaceae y Thomandersiaceae (ambas Lamiales). El uso de familias entre corchetes se abandona debido a su impopularidad, y en la mayoría de los casos se mantienen las circunscripciones más amplias; estas incluyen Amaryllidaceae, Asparagaceace y Xanthorrheaceae (todas Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) y varias otras familias más pequeñas. Artículos separados en este mismo volumen tratan sobre un nuevo orden lineal para APG, nombres subfamiliares que pueden usarse para una comunicación más precisa en Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. y Xanthorrheaceae s.l. (todas Asparagales) y una clasificación supraordinal formal para las plantas con flores.

@article{doi101111j10958339200900996x,
    author = "GROUP, THE ANGIOSPERM PHYLOGENY",
    title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III",
    year = "2009",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    abstract = "A revised and updated classification for the families of flowering plants is provided. Many recent studies have yielded increasingly detailed evidence for the positions of formerly unplaced families, resulting in a number of newly adopted orders, including Amborellales, Berberidopsidales, Bruniales, Buxales, Chloranthales, Escalloniales, Huerteales, Nymphaeales, Paracryphiales, Petrosaviales, Picramniales, Trochodendrales, Vitales and Zygophyllales. A number of previously unplaced genera and families are included here in orders, greatly reducing the number of unplaced taxa; these include Hydatellaceae (Nymphaeales), Haptanthaceae (Buxales), Peridiscaceae (Saxifragales), Huaceae (Oxalidales), Centroplacaceae and Rafflesiaceae (both Malpighiales), Aphloiaceae, Geissolomataceae and Strasburgeriaceae (all Crossosomatales), Picramniaceae (Picramniales), Dipentodontaceae and Gerrardinaceae (both Huerteales), Cytinaceae (Malvales), Balanophoraceae (Santalales), Mitrastemonaceae (Ericales) and Boraginaceae (now at least known to be a member of lamiid clade). Newly segregated families for genera previously understood to be in other APG-recognized families include Petermanniaceae (Liliales), Calophyllaceae (Malpighiales), Capparaceae and Cleomaceae (both Brassicales), Schoepfiaceae (Santalales), Anacampserotaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae and Talinaceae (all Caryophyllales) and Linderniaceae and Thomandersiaceae (both Lamiales). Use of bracketed families is abandoned because of its unpopularity, and in most cases the broader circumscriptions are retained; these include Amaryllidaceae, Asparagaceace and Xanthorrheaceae (all Asparagales), Passifloraceae (Malpighiales), Primulaceae (Ericales) and several other smaller families. Separate papers in this same volume deal with a new linear order for APG, subfamilial names that can be used for more accurate communication in Amaryllidaceae s.l., Asparagaceace s.l. and Xanthorrheaceae s.l. (all Asparagales) and a formal supraordinal classification for the flowering plants.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x",
    openalex = "W4245471709",
    references = "doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas0708072104, doi101073pnas0709121104, doi101073pnas0813376106, doi101111j175348871981tb06752x, doi1023072484473, doi1023072992015, doi103732ajb0800047, doi103732ajb891132, doi105860choice453190, openalexw2961549061"
}

La evolución de las angiospermas transformó la ecología global, y gran parte de este impacto deriva de la productividad vegetativa sin rival de los clados dominantes de angiospermas. Sin embargo, los orígenes de la alta capacidad fotosintética en las angiospermas siguen siendo desconocidos. En este estudio, describimos la trayectoria pronunciada de la evolución de la densidad de las venas foliares (D(v)) en las angiospermas y predecimos que esta innovación en la plomería foliar permitió un cambio mayor en la capacidad de las hojas para asimilar CO(2). Reconstruyendo la evolución de las venas foliares mediante el examen de 504 especies de angiospermas, encontramos que un aumento rápido de tres a cuatro veces en D(v) ocurrió durante la evolución temprana de las angiospermas. Demostramos cómo este cambio mayor en la arquitectura de las venas foliares permitió potencialmente que la capacidad fotosintética máxima en las angiospermas superara a los grupos competidores hace 140-100 millones de años. Nuestros datos sugieren que las angiospermas terrestres tempranas produjeron hojas con tasas fotosintéticas bajas, pero que el éxito posterior de las angiospermas está vinculado a un aumento en la capacidad fotosintética durante su diversificación temprana.

@article{doi101111j14610248200901410x,
    author = "Brodribb, Timothy J. y Feild, Taylor S.",
    title = "La evolución de la hidráulica foliar precedió a un aumento en la capacidad fotosintética foliar durante la diversificación temprana de las angiospermas",
    year = "2009",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "La evolución de las angiospermas transformó la ecología global, y gran parte de este impacto deriva de la productividad vegetativa sin rival de los clados dominantes de angiospermas. Sin embargo, los orígenes de la alta capacidad fotosintética en las angiospermas siguen siendo desconocidos. En este estudio, describimos la trayectoria pronunciada de la evolución de la densidad de las venas foliares (D(v)) en las angiospermas y predecimos que esta innovación en la plomería foliar permitió un cambio mayor en la capacidad de las hojas para asimilar CO(2). Reconstruyendo la evolución de las venas foliares mediante el examen de 504 especies de angiospermas, encontramos que un aumento rápido de tres a cuatro veces en D(v) ocurrió durante la evolución temprana de las angiospermas. Demostramos cómo este cambio mayor en la arquitectura de las venas foliares permitió potencialmente que la capacidad fotosintética máxima en las angiospermas superara a los grupos competidores hace 140-100 millones de años. Nuestros datos sugieren que las angiospermas terrestres tempranas produjeron hojas con tasas fotosintéticas bajas, pero que el éxito posterior de las angiospermas está vinculado a un aumento en la capacidad fotosintética durante su diversificación temprana.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01410.x",
    openalex = "W2153946082",
    references = "doi101038282424a0, doi101046j14698137200200397x, doi101073pnas0709121104, doi101098rspb20081919, doi101111j14698137200400974x, doi101126science1155121, doi101126science2815374237, doi1023071218350, doi102475ajs294156, doi102475ajs3012182, doi103732ajb0800047, doi104159harvard9780674864856"
}

La poliploidía ha sido reconocida durante mucho tiempo como una fuerza importante en la evolución de las angiospermas. Las investigaciones genómicas recientes no solo indican que la poliploidía es ubicua entre las angiospermas, sino que también sugieren varios eventos antiguos de duplicación del genoma. Estos incluyen eventos antiguos de duplicación del genoma completo (WGD) en linajes basales de angiospermas, así como un evento propuesto de paleohexaploidía que pudo haber ocurrido cerca de la divergencia de las eudicotiledóneas. Sin embargo, actualmente no hay evidencia de WGD en Amborella, la especie hermana presumida de otras angiospermas existentes. La pregunta ya no es "¿Qué proporción de angiospermas son poliploides?", sino "¿Cuántos episodios de poliploidía caracterizan a cualquier linaje dado?". Los nuevos algoritmos ofrecen la promesa de que los genomas ancestrales pueden ser reconstruidos para divergencias profundas (por ejemplo, puede ser posible reconstruir el genoma ancestral de las eudicotiledóneas o incluso el genoma ancestral de las angiospermas). Las comparaciones de las tasas de diversificación sugieren que la duplicación del genoma pudo haber llevado a un aumento dramático en la riqueza de especies en varios linajes de angiospermas, incluyendo Poaceae, Solanaceae, Fabaceae y Brassicaceae. Sin embargo, se necesitan estudios genómicos adicionales para precisar la colocación filogenética exacta de los eventos antiguos de poliploidía dentro de estos linajes y para determinar cuándo los genes novedosos resultantes de la poliploidía han permitido radiaciones adaptativas.

@article{doi103732ajb0800079,
    author = "Soltis, Pamela S. y Albert, Victor A. y Leebens‐Mack, Jim y Bell, Charles D. y Paterson, Andrew H. y Zheng, Chunfang y Sankoff, David y de Pamphilis, Claude W. y Wall, P. Kerr y Soltis, Pamela S.",
    title = "Poliploidía y diversificación de angiospermas",
    year = "2009",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = {La poliploidía ha sido reconocida durante mucho tiempo como una fuerza importante en la evolución de las angiospermas. Las investigaciones genómicas recientes no solo indican que la poliploidía es ubicua entre las angiospermas, sino que también sugieren varios eventos antiguos de duplicación del genoma. Estos incluyen eventos antiguos de duplicación del genoma completo (WGD) en linajes basales de angiospermas, así como un evento propuesto de paleohexaploidía que pudo haber ocurrido cerca de la divergencia de las eudicotiledóneas. Sin embargo, actualmente no hay evidencia de WGD en Amborella, la especie hermana presumida de otras angiospermas existentes. La pregunta ya no es "¿Qué proporción de angiospermas son poliploides?", sino "¿Cuántos episodios de poliploidía caracterizan a cualquier linaje dado?". Los nuevos algoritmos ofrecen la promesa de que los genomas ancestrales pueden ser reconstruidos para divergencias profundas (por ejemplo, puede ser posible reconstruir el genoma ancestral de las eudicotiledóneas o incluso el genoma ancestral de las angiospermas). Las comparaciones de las tasas de diversificación sugieren que la duplicación del genoma pudo haber llevado a un aumento dramático en la riqueza de especies en varios linajes de angiospermas, incluyendo Poaceae, Solanaceae, Fabaceae y Brassicaceae. Sin embargo, se necesitan estudios genómicos adicionales para precisar la colocación filogenética exacta de los eventos antiguos de poliploidía dentro de estos linajes y para determinar cuándo los genes novedosos resultantes de la poliploidía han permitido radiaciones adaptativas.},
    url = "https://doi.org/10.3732/ajb.0800079",
    doi = "10.3732/ajb.0800079",
    openalex = "W2064911343",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101111j001438202001tb00826x, doi101146annurevgenet341401, doi101196annals1438005"
}

Se sabe bien que el reciclaje del agua transpirada es una fuente importante de precipitaciones, especialmente en los trópicos, y los angiospermas tienen capacidades de transpiración superiores a las de cualquier otra planta a lo largo de la historia evolutiva. Por lo tanto, se propone que la evolución y el ascenso a la dominancia ecológica de las plantas con flores hayan alterado fuertemente el clima. La capacidad de transpiración está estrechamente correlacionada con la densidad de las venas de las hojas, y la densidad promedio de venas de las hojas de los angiospermas es cuatro veces mayor que la de todas las demás plantas, vivas o extintas. Una transición rápida a altas densidades de venas ocurrió por separado en tres o más linajes de plantas con flores hace aproximadamente 100 millones de años. Los modelos climáticos del impacto de esta revolución fisiológica indican que los trópicos serían más cálidos, más secos y más estacionales en ausencia de los angiospermas, y el área total de la selva tropical disminuiría sustancialmente. Dado que la diversidad de los angiospermas está influenciada por el área de la selva tropical y por la abundancia y uniformidad de las precipitaciones, la alta diversidad de los angiospermas es parcialmente un producto de un bucle de retroalimentación positiva con las modificaciones climáticas iniciadas por los propios angiospermas. Las diversificaciones de linajes entre animales vertebrados e invertebrados y plantas no angiospermas tras la radiación de los angiospermas pueden estar vinculadas al impacto sin precedentes de los angiospermas sobre el clima.

@article{doi1034172009143,
    author = "Boyce, C. Kevin y Lee, Jung‐Eun y Feild, Taylor S. y Brodribb, Timothy J. y Zwieniecki, Maciej A.",
    title = "Los Angiospermas Ayudaron a Poner la Lluvia en las Selvas Tropicales: El Impacto de la Evolución Fisiológica de las Plantas en la Biodiversidad Tropical 1",
    year = "2010",
    journal = "Anales del Jardín Botánico de Missouri",
    abstract = "Se sabe bien que el reciclaje del agua transpirada es una fuente importante de precipitaciones, especialmente en los trópicos, y los angiospermas tienen capacidades de transpiración superiores a las de cualquier otra planta a lo largo de la historia evolutiva. Por lo tanto, se propone que la evolución y el ascenso a la dominancia ecológica de las plantas con flores hayan alterado fuertemente el clima. La capacidad de transpiración está estrechamente correlacionada con la densidad de las venas de las hojas, y la densidad promedio de venas de las hojas de los angiospermas es cuatro veces mayor que la de todas las demás plantas, vivas o extintas. Una transición rápida a altas densidades de venas ocurrió por separado en tres o más linajes de plantas con flores hace aproximadamente 100 millones de años. Los modelos climáticos del impacto de esta revolución fisiológica indican que los trópicos serían más cálidos, más secos y más estacionales en ausencia de los angiospermas, y el área total de la selva tropical disminuiría sustancialmente. Dado que la diversidad de los angiospermas está influenciada por el área de la selva tropical y por la abundancia y uniformidad de las precipitaciones, la alta diversidad de los angiospermas es parcialmente un producto de un bucle de retroalimentación positiva con las modificaciones climáticas iniciadas por los propios angiospermas. Las diversificaciones de linajes entre animales vertebrados e invertebrados y plantas no angiospermas tras la radiación de los angiospermas pueden estar vinculadas al impacto sin precedentes de los angiospermas sobre el clima.",
    url = "https://doi.org/10.3417/2009143",
    doi = "10.3417/2009143",
    openalex = "W2100361465",
    references = "doi101038nature05634, doi101073pnas0608361104, doi101086282687, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science1066854, doi101126science1100217, doi101126science1164033, doi101126science1177265, doi1023073071998, doi102475ajs294156"
}

@incollection{crossref2011angiosperms,
    title = "Angiospermas",
    year = "2011",
    booktitle = "Un libro de texto de botánica",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9781139105231.012",
    doi = "10.1017/cbo9781139105231.012",
    pages = "466-586"
}

Las hojas de las angiospermas manifiestan una diversidad notable de formas que van desde secuencias de desarrollo dentro de un brote y dentro de la respuesta de la copa al microambiente hasta la variación entre especies dentro y entre comunidades y entre órdenes o familias. Generalmente se asume que, dado que las hojas fotosintéticas son críticas para el crecimiento y la supervivencia de las plantas, la variación en su forma refleja la selección natural que actúa sobre la función. Se han propuesto varias teorías no mutuamente excluyentes para explicar la diversidad de formas de las hojas. Estas incluyen: la termorregulación de las hojas, especialmente en ambientes áridos y cálidos, las restricciones hidráulicas, los patrones de expansión de las hojas en especies caducifolias, las restricciones biomecánicas, las adaptaciones para evitar la herbivoría, las adaptaciones para optimizar la interceptación de la luz e incluso que la variación en la forma de las hojas es una respuesta a la selección sobre la forma de la flor. Sin embargo, la importancia relativa o la probabilidad de cada uno de estos factores es incierta. Aquí revisamos el contexto evolutivo de la diversificación de la forma de las hojas, discutimos los mecanismos proximales que generan la diversidad en los sistemas existentes y consideramos la evidencia para cada una de las hipótesis anteriores en el contexto de la significación funcional de la forma de las hojas. La síntesis de estas áreas de amplio alcance ayuda a identificar puntos de convergencia conceptual para el debate en curso y direcciones integradas para la investigación futura.

@article{doi101071fp11057,
    author = "Nicotra, Adrienne B. y Leigh, Andrea y Boyce, C. Kevin y Jones, Cynthia S. y Niklas, Karl J. y Royer, Dana L. y Tsukaya, Hirokazu",
    title = "La evolución y la significación funcional de la forma de las hojas en las angiospermas",
    year = "2011",
    journal = "Functional Plant Biology",
    abstract = "Las hojas de las angiospermas manifiestan una diversidad notable de formas que van desde secuencias de desarrollo dentro de un brote y dentro de la respuesta de la copa al microambiente hasta la variación entre especies dentro y entre comunidades y entre órdenes o familias. Generalmente se asume que, dado que las hojas fotosintéticas son críticas para el crecimiento y la supervivencia de las plantas, la variación en su forma refleja la selección natural que actúa sobre la función. Se han propuesto varias teorías no mutuamente excluyentes para explicar la diversidad de formas de las hojas. Estas incluyen: la termorregulación de las hojas, especialmente en ambientes áridos y cálidos, las restricciones hidráulicas, los patrones de expansión de las hojas en especies caducifolias, las restricciones biomecánicas, las adaptaciones para evitar la herbivoría, las adaptaciones para optimizar la interceptación de la luz e incluso que la variación en la forma de las hojas es una respuesta a la selección sobre la forma de la flor. Sin embargo, la importancia relativa o la probabilidad de cada uno de estos factores es incierta. Aquí revisamos el contexto evolutivo de la diversificación de la forma de las hojas, discutimos los mecanismos proximales que generan la diversidad en los sistemas existentes y consideramos la evidencia para cada una de las hipótesis anteriores en el contexto de la significación funcional de la forma de las hojas. La síntesis de estas áreas de amplio alcance ayuda a identificar puntos de convergencia conceptual para el debate en curso y direcciones integradas para la investigación futura.",
    url = "https://doi.org/10.1071/fp11057",
    doi = "10.1071/fp11057",
    openalex = "W2144704825",
    references = "doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}

La poliploidía puede ser un factor importante en el éxito de la invasión de especies a través de una combinación de (1) 'pre-adaptación', mediante la cual las linajes poliploides están predispuestos a las condiciones en el nuevo rango y, por lo tanto, tienen tasas de supervivencia y aptitud más altas en la fase inicial de establecimiento; y (2) la posibilidad de adaptación posterior debido a una mayor diversidad genética que puede asistir a la 'evolución de la invasividad'. Alternativamente, la poliploidización puede desempeñar un papel importante al (3) restaurar la reproducción sexual tras la hibridación o, por el contrario, (4) la reproducción asexual en ausencia de parejas adecuadas. Por lo tanto, alentamos a los biólogos de la invasión a incorporar evaluaciones de la ploidía en sus estudios de especies exóticas invasoras.

@article{doi101093aobmcr277,
    author = "te Beest, Mariska y Roux, Johannes J. Le y Richardson, David M. y Brysting, Anne K. y Suda, Jan y Kubešová, Magdalena y Pyšek, Petr",
    title = "¿Cuanto más, mejor? El papel de la poliploidía en la facilitación de invasiones vegetales",
    year = "2011",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "La poliploidía puede ser un factor importante en el éxito de la invasión de especies a través de una combinación de (1) 'pre-adaptación', mediante la cual las linajes poliploides están predispuestos a las condiciones en el nuevo rango y, por lo tanto, tienen tasas de supervivencia y aptitud más altas en la fase inicial de establecimiento; y (2) la posibilidad de adaptación posterior debido a una mayor diversidad genética que puede asistir a la 'evolución de la invasividad'. Alternativamente, la poliploidización puede desempeñar un papel importante al (3) restaurar la reproducción sexual tras la hibridación o, por el contrario, (4) la reproducción asexual en ausencia de parejas adecuadas. Por lo tanto, alentamos a los biólogos de la invasión a incorporar evaluaciones de la ploidía en sus estudios de especies exóticas invasoras.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcr277",
    doi = "10.1093/aob/mcr277",
    openalex = "W2061325948",
    references = "doi101016jtplants200912003, doi101038nrg1711, doi101038nrg2600, doi101073pnas0900906106, doi101111j10958339200900996x, doi101111j13669516200600302x, doi1011910309133306pp490pr"
}

Resumen Las características de las plantas – las características morfológicas, anatómicas, fisiológicas, bioquímicas y fenológicas de las plantas y sus órganos – determinan cómo los productores primarios responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos, influyen en los procesos y servicios de los ecosistemas y proporcionan un vínculo entre la riqueza de especies y la diversidad funcional de los ecosistemas. Por lo tanto, los datos de características representan la materia prima para una amplia gama de investigaciones que van desde la biología evolutiva, la ecología comunitaria y funcional hasta la biogeografía. Aquí presentamos la iniciativa de base de datos global denominada TRY, que ha unido a una amplia gama de la comunidad de investigación de características de plantas en todo el mundo y ha logrado una adhesión sin precedentes a los datos de características: hasta la fecha se han aportado 93 bases de datos de características. El repositorio de datos actualmente contiene casi tres millones de entradas de características para 69 000 de las 300 000 especies de plantas del mundo, con un enfoque en 52 grupos de características que caracterizan las etapas vegetativa y de regeneración del ciclo de vida de la planta, incluyendo crecimiento, dispersión, establecimiento y persistencia. Un primer análisis de datos muestra que la mayoría de las características de las plantas están distribuidas aproximadamente de forma log-normal, con rangos de variación muy diferentes entre características. La mayoría de la variación de características es entre especies (interespecífica), pero también se documenta una variación intraspecífica significativa, hasta el 40% de la variación total. Los tipos funcionales de plantas (PFT), como se utilizan comúnmente en los modelos de vegetación, capturan una fracción sustancial de la variación observada – pero para varias características la mayoría de la variación ocurre dentro de los PFT, hasta el 75% de la variación total. En el contexto de los modelos de vegetación, estas características deberían representarse mejor mediante variables de estado en lugar de valores fijos de parámetros. Se espera que la mayor disponibilidad de datos de características de plantas en la base de datos global unificada apoye un cambio de paradigma de la ecología basada en especies a la ecología basada en características, ofrezca nuevas oportunidades para la investigación sintética de características de plantas y permita una representación más realista y empíricamente fundamentada de la vegetación terrestre en los modelos de sistemas terrestres.

@article{doi101111j13652486201102451x,
    author = "Kattge, Jens and Dı́az, Soledad y Lavorel, Sandra y Prentice, I. Colin y Leadley, Paul y Bönisch, Gerhard y Garnier, Éric y Westoby, Mark y Reich, Peter B. y Wright, Ian J. y Cornelissen, J. H. C. y Violle, Cyrille y Harrison, Sandy P. y van Bodegom, Peter M. y Reichstein, Markus y Enquist, Brian J. y Soudzilovskaia, Nadejda A. y Ackerly, David D. y Anand, M. y Atkin, Owen K. y Bahn, Michael y Baker, Timothy R. y Baldocchi, Dennis y Bekker, R.M. y Blanco, C. y Blonder, Benjamin y Bond, William J. y Bradstock, Ross A. y Bunker, Dan y Casanoves, Fernando y Cavender‐Bares, Jeannine y Chambers, Jeffrey Q. y Chapin, F. Stuart y Chave, Jérôme y Coomes, David A. y Cornwell, William K. y Craine, Joseph M. y Dobrin, Barbara y Duarte, Leandro y Durka, Walter y Elser, James J. y Esser, G. y Estiarte, Marc y Fagan, William F. y Fang, Jinwei y Fernández‐Méndez, Fernando y Fidélis, Alessandra y Finegan, Bryan y Flores, Olivier y FORD, HENRY y Frank, Dorothea y Freschet, Grégoire T. y Fyllas, Nikolaos M. y Gallagher, Rachael V. y GREEN, W. A. y Gutiérrez, Álvaro G. y Hickler, Thomas y Higgins, Steven I. y Hodgson, J. G. y Jalili, Amir y Jansen, Steven y Joly, Carlos Alfredo y Kerkhoff, Andrew J. y Kirkup, Donald W. y Kitajima, Kaoru y Kleyer, Michael y Klotz, Stefan y Knops, Johannes M. H. y Krämer, K. y Kühn, Ingolf y Kurokawa, H. y Laughlin, Daniel C. y Lee, Tali D. y Leishman, Michelle R. y Lens, Frederic y Lenz, Tanja I. y Lewis, Simon L. y Lloyd, Jon y Llusià, Joan y Louault, Frédérique y Ma, Sai y Mahecha, Miguel D. y Manning, Peter y Massad, Tara Joy y Medlyn, Belinda E. y Messier, J. y Moles, Angela T. y Müller, Sandra Cristina y Nadrowski, Karin y NAEEM, S. y Niinemets, Ülo y Nöllert, Stephanie y Nuske, Alison y Ogaya, Romà y Oleksyn, Jacek y Onipchenko, V. G. y Onoda, Yusuke y Ordóñez, Jenny y Overbeck, Gerhard E. y Ozinga, W.A.",
    title = "TRY – una base de datos global de rasgos de las plantas",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Resumen Los rasgos de las plantas – las características morfológicas, anatómicas, fisiológicas, bioquímicas y fenológicas de las plantas y sus órganos – determinan cómo los productores primarios responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos, influyen en los procesos y servicios de los ecosistemas y proporcionan un vínculo entre la riqueza de especies y la diversidad funcional de los ecosistemas. Los datos de rasgos representan por tanto la materia prima para una amplia gama de investigaciones, desde la biología evolutiva y la ecología comunitaria y funcional hasta la biogeografía. Aquí presentamos la iniciativa de base de datos global denominada TRY, que ha unido a una amplia gama de la comunidad de investigación de rasgos de las plantas en todo el mundo y ha obtenido una adhesión sin precedentes a los datos de rasgos: hasta la fecha se han aportado 93 bases de datos de rasgos. El repositorio de datos contiene actualmente casi tres millones de entradas de rasgos para 69 000 de las 300 000 especies de plantas del mundo, con un enfoque en 52 grupos de rasgos que caracterizan las etapas vegetativa y de regeneración del ciclo de vida de la planta, incluyendo el crecimiento, la dispersión, el establecimiento y la persistencia. Un primer análisis de los datos muestra que la mayoría de los rasgos de las plantas se distribuyen aproximadamente de forma log‐normal, con rangos de variación muy diferentes entre rasgos. La mayoría de la variación de rasgos es entre especies (interespecífica), pero también se documenta una variación intraspecífica significativa, hasta el 40% de la variación total. Los tipos funcionales de las plantas (PFT), como se utilizan comúnmente en los modelos de vegetación, capturan una fracción sustancial de la variación observada – pero para varios rasgos la mayoría de la variación ocurre dentro de los PFT, hasta el 75% de la variación total. En el contexto de los modelos de vegetación, estos rasgos deberían representarse mejor mediante variables de estado que mediante valores fijos de parámetros. Se espera que la disponibilidad mejorada de datos de rasgos de las plantas en la base de datos global unificada apoye un cambio de paradigma de la ecología basada en especies a la ecología basada en rasgos, ofrezca nuevas oportunidades para la investigación sintética de rasgos de las plantas y permita una representación más realista y empíricamente fundamentada de la vegetación terrestre en los modelos del sistema terrestre.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    openalex = "W2162584119",
    references = "doi101007bf00386231, doi1010160165176580900245, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652486200300569x, doi101071bt02124, doi101086283244, doi101111j00301299200715559x, doi101111j14610248200600924x, doi101111j14610248200801219x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi1011552009421425"
}

Nuestras análisis confirman que con grandes cantidades de datos de secuencia, la mayoría de las relaciones de nivel profundo dentro de las angiospermas pueden resolverse. Anticipamos que este árbol bien resuelto de angiospermas será de amplia utilidad para muchas áreas de la biología, incluyendo fisiología, ecología, paleobiología y genómica.

@article{doi103732ajb1000404,
    author = "Soltis, Pamela S. y Smith, Stephen A. y Cellinese, Nico y Wurdack, Kenneth J. y Tank, David C. y Brockington, Samuel F. y Refulio, Nancy y Walker, Jay B. y Moore, Michael J. y Carlsward, Barbara S. y Bell, Charles D. y Latvis, Maribeth y Crawley, Sunny y Black, Chelsea M. y Diouf, Diaga y Xi, Zhenxiang y Rushworth, Catherine A. y Gitzendanner, Matthew A. y Sytsma, Kenneth J. y Qiu, Yin‐Long y Hilu, Khidir W. y Davis, Charles C. y Sanderson, Michael J. y Beaman, Reed S. y Olmstead, Richard G. y Judd, Walter S. y Donoghue, Michael J. y Soltis, Pamela S.",
    title = "Filogenia de angiospermas: 17 genes, 640 taxones",
    year = "2011",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Nuestras análisis confirman que con grandes cantidades de datos de secuencia, la mayoría de las relaciones de nivel profundo dentro de las angiospermas pueden resolverse. Anticipamos que este árbol bien resuelto de angiospermas será de amplia utilidad para muchas áreas de la biología, incluyendo fisiología, ecología, paleobiología y genómica.",
    url = "https://doi.org/10.3732/ajb.1000404",
    doi = "10.3732/ajb.1000404",
    openalex = "W2123023543",
    references = "doi101016jympev200802011"
}

Los rasgos funcionales de las plantas son las características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representan estrategias ecológicas y determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades del ecosistema. La variación en los rasgos funcionales de las plantas y en los síndromes de rasgos ha demostrado ser útil para abordar muchas preguntas ecológicas importantes a diversas escalas, generando una demanda de métodos estandarizados para medir rasgos de plantas con significado ecológico. Esta línea de investigación ha sido una de las vías más fructíferas para comprender los patrones y procesos ecológicos y evolutivos. También tiene el potencial tanto de construir un conjunto predictivo de relaciones locales, regionales y globales entre las plantas y el entorno como de cuantificar una amplia gama de procesos naturales e impulsados por el ser humano, incluidos los cambios en la biodiversidad, los impactos de las invasiones de especies, las alteraciones en los procesos biogeoquímicos y las interacciones entre la vegetación y la atmósfera. La importancia de estos temas dicta la necesidad urgente de más y mejores datos, e incrementa el valor de los protocolos estandarizados para cuantificar la variación de rasgos de diferentes especies, en particular para rasgos con capacidad para predecir procesos a nivel de planta y de ecosistema, y para rasgos que pueden medirse relativamente con facilidad. Actualizado y ampliado a partir de la versión anterior ampliamente utilizada, este manual mantiene el enfoque en recetas paso a paso presentadas claramente y de amplia aplicación, con un mínimo de texto sobre teoría, e incluye no solo métodos actualizados para los rasgos previamente cubiertos, sino también introduce muchos nuevos protocolos para otros rasgos. Este nuevo manual tiene un mejor equilibrio entre rasgos de planta entera, rasgos foliares, rasgos de raíz y tallo y rasgos regenerativos, y pone un énfasis particular en los rasgos importantes para predecir los efectos de las especies sobre las propiedades clave del ecosistema. Esperamos que este nuevo manual se convierta en un compañero estándar en los esfuerzos locales y globales para aprender sobre las respuestas e impactos de diferentes especies de plantas con respecto a los cambios ambientales en el presente, el pasado y el futuro.

@article{doi101071bt12225,
    author = "Harguindeguy, Natalia Pérez and Dı́az, Sandra and Garnier, Éric and Lavorel, Sandra and Poorter, Hendrik and Jaureguiberry, Pedro and Bret‐Harte, M. Syndonia and Cornwell, William K. and Craine, Joseph M. and Gurvich, Diego E. and Urcelay, Carlos and Veneklaas, Erik J. and Reich, Peter B. and Poorter, Lourens and Wright, Ian J. and Ray, Peter M. and Enrico, Lucas and Pausas, Juli G. and de Vos, Arjen C. and Buchmann, Nina and Funes, Guillermo and Quétier, Fabien and Hodgson, John and Thompson, K. y Morgan, Huw D. y ter Steege, Hans y van der Heijden, Marcel G. A. y Sack, Lawren y Blonder, B. y Poschlod, Peter y Vaieretti, María V. y Conti, Georgina y Staver, A. Carla y Aquino, Sâmia y Cornelissen, J. H. C.",
    title = "Nuevo manual para la medición estandarizada de rasgos funcionales de plantas en todo el mundo",
    year = "2013",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Los rasgos funcionales de las plantas son las características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representan estrategias ecológicas y determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades del ecosistema. La variación en los rasgos funcionales de las plantas y los síndromes de rasgos ha demostrado ser útil para abordar muchas preguntas ecológicas importantes en una variedad de escalas, dando lugar a una demanda de formas estandarizadas para medir rasgos de plantas con significado ecológico. Esta línea de investigación ha sido una de las vías más fructíferas para comprender los patrones y procesos ecológicos y evolutivos. También tiene el potencial tanto de construir un conjunto predictivo de relaciones locales, regionales y globales entre las plantas y el entorno como de cuantificar una amplia gama de procesos naturales e impulsados por el ser humano, incluidos los cambios en la biodiversidad, los impactos de las invasiones de especies, las alteraciones en los procesos biogeoquímicos y las interacciones entre la vegetación y la atmósfera. La importancia de estos temas dicta la necesidad urgente de más y mejores datos, e incrementa el valor de los protocolos estandarizados para cuantificar la variación de rasgos de diferentes especies, en particular para rasgos con poder para predecir procesos a nivel de planta y de ecosistema, y para rasgos que pueden medirse relativamente fácilmente. Actualizado y ampliado a partir de la versión anterior ampliamente utilizada, este manual mantiene el enfoque en recetas paso a paso claramente presentadas y ampliamente aplicables, con un mínimo de texto sobre teoría, e incluye no solo métodos actualizados para los rasgos previamente cubiertos, sino también introduce muchos nuevos protocolos para otros rasgos. Este nuevo manual tiene un mejor equilibrio entre rasgos de planta entera, rasgos de hoja, rasgos de raíz y tallo y rasgos regenerativos, y pone un énfasis particular en los rasgos importantes para predecir los efectos de las especies sobre las propiedades clave del ecosistema. Esperamos que este nuevo manual se convierta en un compañero estándar en los esfuerzos locales y globales para aprender sobre las respuestas e impactos de diferentes especies de plantas con respecto a los cambios ambientales en el presente, el pasado y el futuro.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt12225",
    doi = "10.1071/bt12225",
    openalex = "W2101020813",
    references = "doi101006anbo20001261, doi101007s004420050100x, doi1010160031942281851345, doi101016b9780124735422x50007, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi10103835012241, doi101038nature02403, doi101038nature11148, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi101146annurevpp40060189002443, doi1023073241344, doi105860choice324498, openalexw1573494572, openalexw2058502945, openalexw2764433274, openalexw569951484"
}

El crecimiento de los árboles filogenéticos en alcance y tamaño es prometedor desde el punto de vista de comprender una amplia variedad de patrones y procesos evolutivos. Con árboles compuestos por clados más grandes, antiguos y distribuidos globalmente, es probable que la labilidad de un carácter binario difiera significativamente entre linajes, lo que podría llevar a errores en la estimación de las tasas de transición y la inferencia asociada de los estados ancestrales. Aquí desarrollamos e implementamos un nuevo método para identificar diferentes tasas de evolución en un carácter binario a lo largo de diferentes ramas de una filogenia. Ilustramos este enfoque explorando la evolución del hábito de crecimiento en Campanulidae, un clado de plantas con flores que contiene aproximadamente 35.000 especies. La distribución de especies leñosas versus herbáceas pone en cuestión el uso de modelos tradicionales de evolución de caracteres binarios. El reconocimiento y la acomodación de cambios en la tasa de evolución de la forma de crecimiento en diferentes linajes demuestra, por primera vez, una imagen robusta de la evolución de la forma de crecimiento a través de un clado de plantas con flores muy grande, muy antiguo y muy extendido.

@article{doi101093sysbiosyt034,
    author = "Beaulieu, Jeremy M. and O’Meara, Brian C. and Donoghue, Michael J.",
    title = "Identifying Hidden Rate Changes in the Evolution of a Binary Morphological Character: The Evolution of Plant Habit in Campanulid Angiosperms",
    year = "2013",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "El crecimiento de los árboles filogenéticos en alcance y tamaño es prometedor desde el punto de vista de comprender una amplia variedad de patrones y procesos evolutivos. Con árboles compuestos por clados más grandes, antiguos y distribuidos globalmente, es probable que la labilidad de un carácter binario difiera significativamente entre linajes, lo que podría llevar a errores en la estimación de las tasas de transición y la inferencia asociada de los estados ancestrales. Aquí desarrollamos e implementamos un nuevo método para identificar diferentes tasas de evolución en un carácter binario a lo largo de diferentes ramas de una filogenia. Ilustramos este enfoque explorando la evolución del hábito de crecimiento en Campanulidae, un clado de plantas con flores que contiene aproximadamente 35.000 especies. La distribución de especies leñosas versus herbáceas pone en cuestión el uso de modelos tradicionales de evolución de caracteres binarios. El reconocimiento y la acomodación de cambios en la tasa de evolución de la forma de crecimiento en diferentes linajes demuestra, por primera vez, una imagen robusta de la evolución de la forma de crecimiento a través de un clado de plantas con flores muy grande, muy antiguo y muy extendido.",
    url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syt034",
    doi = "10.1093/sysbio/syt034",
    openalex = "W2112282403",
    references = "doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093nargkh340, doi101109tac19741100705, doi101111j10958339200900996x, doi1023071266136, doi1023072004114, doi1023073802723, openalexw2611511275, openalexw3149745985"
}

Amborella trichopoda está fuertemente respaldada como la única especie viva de la rama hermana de todas las demás plantas con flores existentes, proporcionando una referencia única para inferir el contenido y la estructura del genoma del ancestro común más reciente (ACMR) de las angiospermas vivas. Al secuenciar el genoma de Amborella, identificamos una duplicación del genoma antigua que precede a la diversificación de las angiospermas, sin evidencia de duplicaciones del genoma posteriores y específicas de la rama. Las comparaciones entre Amborella y otras angiospermas facilitaron la reconstrucción del contenido génico ancestral y el orden de los genes en el ACMR de las eudicotiledóneas centrales. Identificamos nuevas familias de genes, duplicaciones génicas e interacciones proteína-proteína florales que aparecieron por primera vez en la angiosperma ancestral. Los elementos transponibles en Amborella son antiguos y altamente divergentes, sin radiaciones recientes de transposones. El análisis genómico de poblaciones a lo largo del rango nativo de Amborella en Nueva Caledonia revela un cuello de botella genético reciente y una estructura geográfica con implicaciones para la conservación.

@article{doi101126science1241089,
    author = "Project, Amborella Genome and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Leebens-Mack, James and Mā, Hong and Palmer, Jeffrey D. and Rounsley, Steve and Sankoff, David and Schuster, Stephan C. and Soltis, Pamela S. and Soltis, Pamela S. and Wessler, Susan R. and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Ammiraju, Jetty S. S. and Barbazuk, W. Bradley and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Determann, Ronald and Leebens-Mack, James and Ma, Hong and Ralph, Paula E. and Rounsley, Steve and Schuster, Stephan C. and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Talag, Jason and Tomsho, Lynn and Walts, Brandon and Wanke, Stefan and Wing, Rod A. and Albert, Victor A. and Barbazuk, W. Brad and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chang, Tien-Hao and Determann, Ronald and Lan, Tianying and Soltis, Douglas E. and Soltis, Pamela S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Ayyampalayam, Saravanaraj and Barbazuk, W. Brad and Burnette, James M. and Chamala, Srikar and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Farrell, Nina and Harkess, Alex and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Meyers, Blake C. and Shahid, Saima and Wafula, Eric and Walts, Brandon and Wessler, Susan R. and Zhai, Jixian and Zhang, Xiaoyu and Albert, Victor A. and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Lyons, Eric and Sankoff, David and Tang, Haibao and Wafula, Eric and Zheng, Chunfang and Albert, Victor A. and Altman, Naomi S. and Barbazuk, W. Bradley and Carretero-Paulet, Lorenzo and dePamphilis, Claude W. and Der, Joshua P. and Estill, James C. and Jiao, Yuannian and Leebens-Mack, James and Liu, Kun and Mei, Wenbin and Wafula, Eric and Altman, Naomi S. and Arikit, Siwaret and Axtell, Michael J. and Chamala, Srikar and Chanderbali, Andre S. and Chen, Feng and Chen, Jian‐Qun and Chiang, Vincent L. and Paoli, Emanuele De and dePamphilis, Claude W.",
    title = "The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants",
    year = "2013",
    journal = "Science",
    abstract = "Amborella trichopoda is strongly supported as the single living species of the sister lineage to all other extant flowering plants, providing a unique reference for inferring the genome content and structure of the most recent common ancestor (MRCA) of living angiosperms. Sequencing the Amborella genome, we identified an ancient genome duplication predating angiosperm diversification, without evidence of subsequent, lineage-specific genome duplications. Comparisons between Amborella and other angiosperms facilitated reconstruction of the ancestral angiosperm gene content and gene order in the MRCA of core eudicots. We identify new gene families, gene duplications, and floral protein-protein interactions that first appeared in the ancestral angiosperm. Transposable elements in Amborella are ancient and highly divergent, with no recent transposon radiations. Population genomic analysis across Amborella's native range in New Caledonia reveals a recent genetic bottleneck and geographic structure with conservation implications.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1241089",
    doi = "10.1126/science.1241089",
    openalex = "W2058378183",
    references = "doi101016jpalaeo200507006, doi101146annurevearth042711105313, doi101196annals1438005"
}

@misc{crossref2014angiosperms,
    title = "ANGIOSPERMS",
    year = "2014",
    booktitle = "Enciclopedia del Cambio Ambiental",
    url = "https://doi.org/10.4135/9781446247501.n178",
    doi = "10.4135/9781446247501.n178"
}

Las asociaciones simbióticas ocurren en cada hábitat de la Tierra, pero sabemos muy poco sobre sus historias evolutivas. Los modelos actuales de evolución de rasgos no pueden reconstruir adecuadamente la historia profunda de la innovación simbiótica, porque asumen procesos evolutivos homogéneos a lo largo de millones de años. Aquí utilizamos un marco filogenético recientemente desarrollado, heterogéneo y cuantitativo para estudiar el origen de la simbiosis entre angiospermas y simbiontes bacterianos fijadores de nitrógeno (N2) alojados en nódulos. Compilamos la base de datos más grande de especies de plantas nodulantes globales y reconstruimos la evolución de la simbiosis. Identificamos una única innovación evolutiva oculta que impulsa la evolución de la fijación simbiótica de N2, seguida de múltiples ganancias y pérdidas de la simbiosis, y la posterior aparición de 'fijadores estables' (clados extremadamente improbables de perder la simbiosis). Originada hace más de 100 MYA, esta innovación sugiere homología profunda en la fijación simbiótica de N2. Identificar innovaciones ocultas en el árbol de la vida es clave para comprender la evolución de rasgos complejos, incluidas las asociaciones simbióticas.

@article{doi101038ncomms5087,
    author = "Werner, Gijsbert D. A. y Cornwell, William K. y Sprent, Janet I. y Kattge, Jens y Kiers, E. Toby",
    title = "Una única innovación evolutiva impulsa la evolución profunda de la fijación simbiótica de N2 en angiospermas",
    year = "2014",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Las asociaciones simbióticas ocurren en cada hábitat de la Tierra, pero sabemos muy poco sobre sus historias evolutivas. Los modelos actuales de evolución de rasgos no pueden reconstruir adecuadamente la historia profunda de la innovación simbiótica, porque asumen procesos evolutivos homogéneos a lo largo de millones de años. Aquí utilizamos un marco filogenético recientemente desarrollado, heterogéneo y cuantitativo para estudiar el origen de la simbiosis entre angiospermas y simbiontes bacterianos fijadores de nitrógeno (N2) alojados en nódulos. Compilamos la base de datos más grande de especies de plantas nodulantes globales y reconstruimos la evolución de la simbiosis. Identificamos una única innovación evolutiva oculta que impulsa la evolución de la fijación simbiótica de N2, seguida de múltiples ganancias y pérdidas de la simbiosis, y la posterior aparición de 'fijadores estables' (clados extremadamente improbables de perder la simbiosis). Originada hace más de 100 MYA, esta innovación sugiere homología profunda en la fijación simbiótica de N2. Identificar innovaciones ocultas en el árbol de la vida es clave para comprender la evolución de rasgos complejos, incluidas las asociaciones simbióticas.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms5087",
    doi = "10.1038/ncomms5087",
    openalex = "W2031705623",
    references = "doi101038nature10625, doi101038nature12872, doi101038nrmicro1987, doi101038nrmicro2990, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi101111j13652486201102451x, doi101111j155856461985tb00420x, doi103758bf03206482"
}

Reconstruir el origen y la evolución de las plantas terrestres y sus parientes algales es un problema fundamental en la filogenia de las plantas, y es esencial para comprender cómo surgieron adaptaciones críticas, incluido el embrión, el tejido vascular, las semillas y las flores. A pesar de los avances en la sistemática molecular, algunas hipótesis de relaciones permanecen poco resueltas. Inferir filogenias profundas con episodios de rápida diversificación puede ser problemático; sin embargo, los datos a escala genómica deberían aumentar significativamente el número de caracteres informativos para los análisis. Las recientes reconstrucciones filogenómicas centradas en las principales divergencias de las plantas han dado lugar a resultados prometedores pero inconsistentes. Una limitación es la escasa muestra de taxones, probablemente resultado de la dificultad y el costo de la generación de datos. Para abordar esta limitación, se generaron y analizaron datos de transcriptoma para 92 taxones de estreptófitos junto con 11 secuencias de genomas de plantas publicadas. Las reconstrucciones filogenéticas se realizaron utilizando hasta 852 genes nucleares y 1.701.170 sitios alineados. Se realizaron 69 análisis para probar la robustez de las inferencias filogenéticas ante permutaciones de la matriz de datos o ante el método filogenético, incluidos los enfoques de supermatriz, supárbol y basados en coalescencia, métodos de máxima verosimilitud y bayesianos, análisis particionados y no particionados, y alineamientos de aminoácidos versus ADN. Entre otros resultados, encontramos un apoyo robusto para una relación de grupo hermano entre las plantas terrestres y un grupo de algas verdes estreptófitas, las Zygnematophyceae. El fuerte y robusto apoyo para un clado que comprende hepáticas y musgos es inconsistente con una visión ampliamente aceptada de la evolución temprana de las plantas terrestres, y sugiere que las hipótesis filogenéticas utilizadas para comprender la evolución de los rasgos fundamentales de las plantas deben ser reevaluadas.

@article{doi101073pnas1323926111,
    author = "Wickett, Norman J. y Mirarab, Siavash y Nguyen, Nam y Warnow, Tandy y Carpenter, Eric y Matasci, Naim y Ayyampalayam, Saravanaraj y Barker, Michael S. y Burleigh, J. Gordon y Gitzendanner, Matthew A. y Ruhfel, Brad R. y Wafula, Eric y Der, Joshua P. y Graham, Sean W. y Mathews, Sarah y Melkonian, Michael y Soltis, Pamela S. y Soltis, Pamela S. y Miles, Nicholas W. y Rothfels, Carl J. y Pokorny, Lisa y Shaw, A. Jonathan y DeGironimo, Lisa y Stevenson, Dennis y Surek, Barbara y Villarreal, Juan Carlos y Roure, Béatrice y Philippe, Hervé y dePamphilis, Claude W. y Chen, Tao y Deyholos, Michael K. y Baucom, Regina S. y Kutchan, Toni M. y Augustin, Megan M. y Wang, Jun y Zhang, Yong y Tian, Zhijian y Yan, Zhixiang y Wu, Xiaolei y Sun, Xiao y Wong, Gane Ka‐Shu y Leebens-Mack, James",
    title = "Análisis filotranscriptómico del origen y la temprana diversificación de las plantas terrestres",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Reconstruir el origen y la evolución de las plantas terrestres y sus parientes algales es un problema fundamental en la filogenia de las plantas, y es esencial para comprender cómo surgieron adaptaciones críticas, incluido el embrión, el tejido vascular, las semillas y las flores. A pesar de los avances en la sistemática molecular, algunas hipótesis de relaciones permanecen poco resueltas. Inferir filogenias profundas con episodios de rápida diversificación puede ser problemático; sin embargo, los datos a escala genómica deberían aumentar significativamente el número de caracteres informativos para los análisis. Las recientes reconstrucciones filogenómicas centradas en las principales divergencias de las plantas han dado lugar a resultados prometedores pero inconsistentes. Una limitación es la escasa muestra de taxones, probablemente resultado de la dificultad y el costo de la generación de datos. Para abordar esta limitación, se generaron y analizaron datos de transcriptoma para 92 taxones de estreptófitos junto con 11 secuencias de genomas de plantas publicadas. Las reconstrucciones filogenéticas se realizaron utilizando hasta 852 genes nucleares y 1.701.170 sitios alineados. Se realizaron 69 análisis para probar la robustez de las inferencias filogenéticas ante permutaciones de la matriz de datos o ante el método filogenético, incluidos los enfoques de supermatriz, supárbol y basados en coalescencia, métodos de máxima verosimilitud y bayesianos, análisis particionados y no particionados, y alineamientos de aminoácidos versus ADN. Entre otros resultados, encontramos un apoyo robusto para una relación de grupo hermano entre las plantas terrestres y un grupo de algas verdes estreptófitas, las Zygnematophyceae. El fuerte y robusto apoyo para un clado que comprende hepáticas y musgos es inconsistente con una visión ampliamente aceptada de la evolución temprana de las plantas terrestres, y sugiere que las hipótesis filogenéticas utilizadas para comprender la evolución de los rasgos fundamentales de las plantas deben ser reevaluadas.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1323926111",
    doi = "10.1073/pnas.1323926111",
    openalex = "W2013277649",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101016s0022283605803602, doi10103837918, doi101046j109583392003t01100158x, doi101093bioinformatics83275, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbio463523, doi101093sysbiosyt022, doi101111boj12385, doi101111j10958339200900996x, doi101111j10960031200800217x, doi1011861471214811104, doi101371journalpcbi1002195, doi1023072346830, openalexw3148514506"
}

El papel principal de la venación foliar es suministrar agua a través de la superficie fotosintética para mantener los estomas abiertos y permitir el acceso al CO2 atmosférico a pesar de la demanda evaporativa. La entrega uniforme óptima de agua ocurre cuando la distancia entre las venas es igual a la profundidad de la colocación de las venas dentro de la hoja lejos de la superficie evaporativa. Como se presenta aquí, solo las angiospermas mantienen este óptimo anatómico a través de todos los grosores de hoja y diferentes hábitats, incluidos los entornos protegidos donde esta optimización no es necesaria. Intrigantemente, las linajes basales de angiospermas tienden a estar subinvertidos hidráulicamente; la optimización uniformemente alta se deriva independientemente en las magnoliids, monocotiledóneas y eudicotiledóneas centrales. Las gimnospermas y helechos, incluidos los fósiles disponibles, están limitados por su incapacidad para producir altas densidades de venas. La asociación común de los helechos con entornos húmedos y sombreados puede, en parte, ser una consecuencia evolutiva directa de su incapacidad para producir hojas hidráulicamente optimizadas. Algunas gimnospermas se acercan a la colocación óptima de venas, pero solo por virtud de su capacidad para producir hojas gruesas más apropiadas en entornos que requieren conservación de agua. Por lo tanto, este simple métrico anatómico presenta una perspectiva importante sobre la evolución y la distribución filogenética de las ecologías de las plantas y más evidencia de que la biología vegetativa de las plantas con flores -no solo su biología reproductiva- es única.

@article{doi101098rspb20132829,
    author = "Zwieniecki, Maciej A. y Boyce, C. Kevin",
    title = "Evolución de una precisión anatómica única en la venación foliar de las angiospermas alivia las restricciones sobre la ecología de las plantas vasculares",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "El papel principal de la venación foliar es suministrar agua a través de la superficie fotosintética para mantener los estomas abiertos y permitir el acceso al CO2 atmosférico a pesar de la demanda evaporativa. La entrega uniforme óptima de agua ocurre cuando la distancia entre las venas es igual a la profundidad de la colocación de las venas dentro de la hoja lejos de la superficie evaporativa. Como se presenta aquí, solo las angiospermas mantienen este óptimo anatómico a través de todos los grosores de hoja y diferentes hábitats, incluidos los entornos protegidos donde esta optimización no es necesaria. Intrigantemente, las linajes basales de angiospermas tienden a estar subinvertidos hidráulicamente; la optimización uniformemente alta se deriva independientemente en las magnoliids, monocotiledóneas y eudicotiledóneas centrales. Las gimnospermas y helechos, incluidos los fósiles disponibles, están limitados por su incapacidad para producir altas densidades de venas. La asociación común de los helechos con entornos húmedos y sombreados puede, en parte, ser una consecuencia evolutiva directa de su incapacidad para producir hojas hidráulicamente optimizadas. Algunas gimnospermas se acercan a la colocación óptima de venas, pero solo por virtud de su capacidad para producir hojas gruesas más apropiadas en entornos que requieren conservación de agua. Por lo tanto, este simple métrico anatómico presenta una perspectiva importante sobre la evolución y la distribución filogenética de las ecologías de las plantas y más evidencia de que la biología vegetativa de las plantas con flores -no solo su biología reproductiva- es única.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2013.2829",
    doi = "10.1098/rspb.2013.2829",
    openalex = "W2118988740",
    references = "doi101007b138533, doi101086300102, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j14610248200901410x, doi1016660094837320040300082dadani20co2, doi1023073515620, openalexw2097450069"
}

Resumen El espectro de la economía de las hojas (LES) proporciona un marco útil para examinar las estrategias de las especies moldeadas por su historia evolutiva. Sin embargo, ese espectro, tal como se describió originalmente, involucraba solo dos recursos clave (carbono y nutrientes) y uno de tres órganos vegetales de importancia económica. En este trabajo, evalúo si la idea del espectro económico puede ampliarse de manera general al agua –el tercer recurso clave–, tallos, raíces y plantas enteras, y a escalas individuales, de comunidad y de ecosistema. Mi hipótesis general es que la fuerte selección a lo largo de los ejes de compensación de rasgos, junto con las restricciones biofísicas, resulta en la convergencia para cualquier taxón en una estrategia uniformemente rápida, media o lenta (es decir, tasas de adquisición y procesamiento de recursos) para todos los órganos y todos los recursos. Existe evidencia de espectros de rasgos económicos para tallos y raíces, así como para hojas, y para rasgos relacionados con el agua, así como con el carbono y los nutrientes. Estos se aplican generalmente dentro y entre escalas (dentro y entre comunidades, zonas climáticas, biomas y linajes). Existen vínculos entre órganos y acoplamiento entre recursos, lo que da lugar a un espectro de economía de planta entera integrado. Las especies capaces de mover agua rápidamente tienen baja densidad de tejido, corta vida útil del tejido y altas tasas de adquisición y flujo de recursos a escala de órgano e individual. Lo contrario es cierto para las especies con la estrategia lenta. Diferentes rasgos pueden ser importantes en diferentes condiciones, pero al ser rápido en un aspecto generalmente requiere ser rápido en otros, ser rápido o lento es una característica general de las especies. Los rasgos económicos influyen en el rendimiento y la aptitud de manera consistente con la teoría basada en rasgos sobre los mecanismos adaptativos subyacentes. Los rasgos ayudan a explicar las diferencias en crecimiento y supervivencia a lo largo de gradientes de recursos y, por lo tanto, ayudan a explicar la distribución de las especies y el ensamblaje de comunidades a lo largo de gradientes de luz, agua y nutrientes. Los rasgos escalan hacia arriba: los rasgos rápidos se asocian con tasas más rápidas de procesos ecosistémicos como la descomposición o la productividad primaria, y los rasgos lentos con tasas de proceso lentas. Síntesis. Los rasgos importan. Un único espectro de economía de plantas 'rápido–lento' que integra hojas, tallos y raíces es una característica clave del universo vegetal y ayuda a explicar las estrategias ecológicas individuales, los procesos de ensamblaje de comunidades y el funcionamiento de los ecosistemas.

@article{doi1011111365274512211,
    author = "Reich, Peter B.",
    title = "The world‐wide 'fast–slow' plant economics spectrum: a traits manifesto",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Resumen El espectro de la economía de las hojas (LES) proporciona un marco útil para examinar las estrategias de las especies moldeadas por su historia evolutiva. Sin embargo, ese espectro, tal como se describió originalmente, involucraba solo dos recursos clave (carbono y nutrientes) y uno de tres órganos vegetales de importancia económica. En este trabajo, evalúo si la idea del espectro económico puede ampliarse de manera general al agua –el tercer recurso clave–, tallos, raíces y plantas enteras, y a escalas individuales, de comunidad y de ecosistema. Mi hipótesis general es que la fuerte selección a lo largo de los ejes de compensación de rasgos, junto con las restricciones biofísicas, resulta en la convergencia para cualquier taxón en una estrategia uniformemente rápida, media o lenta (es decir, tasas de adquisición y procesamiento de recursos) para todos los órganos y todos los recursos. Existe evidencia de espectros de rasgos económicos para tallos y raíces, así como para hojas, y para rasgos relacionados con el agua, así como con el carbono y los nutrientes. Estos se aplican generalmente dentro y entre escalas (dentro y entre comunidades, zonas climáticas, biomas y linajes). Existen vínculos entre órganos y acoplamiento entre recursos, lo que da lugar a un espectro de economía de planta entera integrado. Las especies capaces de mover agua rápidamente tienen baja densidad de tejido, corta vida útil del tejido y altas tasas de adquisición y flujo de recursos a escala de órgano e individual. Lo contrario es cierto para las especies con la estrategia lenta. Diferentes rasgos pueden ser importantes en diferentes condiciones, pero al ser rápido en un aspecto generalmente requiere ser rápido en otros, ser rápido o lento es una característica general de las especies. Los rasgos económicos influyen en el rendimiento y la aptitud de manera consistente con la teoría basada en rasgos sobre los mecanismos adaptativos subyacentes. Los rasgos ayudan a explicar las diferencias en crecimiento y supervivencia a lo largo de gradientes de recursos y, por lo tanto, ayudan a explicar la distribución de las especies y el ensamblaje de comunidades a lo largo de gradientes de luz, agua y nutrientes. Los rasgos escalan hacia arriba: los rasgos rápidos se asocian con tasas más rápidas de procesos ecosistémicos como la descomposición o la productividad primaria, y los rasgos lentos con tasas de proceso lentas. Síntesis. Los rasgos importan. Un único espectro de economía de plantas 'rápido–lento' que integra hojas, tallos y raíces es una característica clave del universo vegetal y ayuda a explicar las estrategias ecológicas individuales, los procesos de ensamblaje de comunidades y el funcionamiento de los ecosistemas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12211",
    doi = "10.1111/1365-2745.12211",
    openalex = "W2127928904",
    references = "doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652745199800306x, doi101086283244, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annureves11110180001313, doi1018900012965819970781958cafasa20co2, doi1023072259756, doi1023074549, doi1034172009143, openalexw1564371012, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}

La dormancia de las semillas, al controlar el momento de la germinación, puede afectar fuertemente la supervivencia de las plantas. Por lo tanto, el tipo de dormancia de las semillas puede influir en procesos a nivel de población y de especie, como la colonización, la adaptación, la especiación y la extinción. Utilizamos un conjunto de datos que comprende más de 14.000 taxones en 318 familias a través de las plantas con semillas para probar hipótesis sobre la evolución de diferentes tipos de dormancia de las semillas y su asociación con la diversificación de las líneas. Encontramos que la dormancia morfofisiológica es el estado ancestral más probable de las plantas con semillas, lo que sugiere que la dormancia regulada fisiológicamente en respuesta a señales ambientales estaba presente en el origen de las plantas con semillas. Además, encontramos que la dormancia fisiológica (PD), una vez disociada de la dormancia morfológica, actuó como un 'centro evolutivo' desde el cual evolucionaron otras clases de dormancia, y que estaba asociada con mayores tasas de diversificación de las líneas a través de mayores tasas de especiación. La sensibilidad ambiental proporcionada por la dormancia en general, y por la PD en particular, parece ser un rasgo clave en la diversificación de las plantas con semillas.

@article{doi101111nph12782,
    author = "Willis, Charles G. y Baskin, Carol C. y Baskin, Jerry M. y Auld, Josh R. y Venable, D. Lawrence y Cavender‐Bares, Jeannine y Donohue, Kathleen y de Casas, Rafael Rubio y Grupo, The NESCent Germination Working",
    title = "La evolución de la dormancia de las semillas: señales ambientales, centros evolutivos y diversificación de las plantas con semillas",
    year = "2014",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "La dormancia de las semillas, al controlar el momento de la germinación, puede afectar fuertemente la supervivencia de las plantas. Por lo tanto, el tipo de dormancia de las semillas puede influir en procesos a nivel de población y de especie, como la colonización, la adaptación, la especiación y la extinción. Utilizamos un conjunto de datos que comprende más de 14.000 taxones en 318 familias a través de las plantas con semillas para probar hipótesis sobre la evolución de diferentes tipos de dormancia de las semillas y su asociación con la diversificación de las líneas. Encontramos que la dormancia morfofisiológica es el estado ancestral más probable de las plantas con semillas, lo que sugiere que la dormancia regulada fisiológicamente en respuesta a señales ambientales estaba presente en el origen de las plantas con semillas. Además, encontramos que la dormancia fisiológica (PD), una vez disociada de la dormancia morfológica, actuó como un 'centro evolutivo' desde el cual evolucionaron otras clases de dormancia, y que estaba asociada con mayores tasas de diversificación de las líneas a través de mayores tasas de especiación. La sensibilidad ambiental proporcionada por la dormancia en general, y por la PD en particular, parece ser un rasgo clave en la diversificación de las plantas con semillas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.12782",
    doi = "10.1111/nph.12782",
    openalex = "W2110336319",
    references = "doi101111j001438202002tb00137x, doi10118614712105788"
}

¿Qué factores influyen en si una línea evolutiva puede transicionar exitosamente a un nuevo bioma, y por qué algunos cambios de bioma han sido más frecuentes que otros? Para orientar esta línea de investigación, desarrollamos un marco conceptual en el cual la probabilidad de un cambio de bioma es una función de (a) la exposición a entornos contrastantes a lo largo del tiempo, (b) la accesibilidad evolutiva de las adaptaciones relevantes, y (c) las interacciones bióticas cambiantes. Evaluamos la literatura sobre cambios de bioma en plantas en relación con un conjunto de hipótesis sobre el tamaño, la conectividad y la edad absoluta de los biomas, así como sobre la adaptabilidad de líneas evolutivas particulares e interacciones ecológicas a lo largo del tiempo. También criticamos la inferencia filogenética de biomas pasados y un enfoque basado en modelos "global" para la evolución de biomas. Generalizaciones más robustas sobre los cambios de bioma requerirán estudios detallados de clados bien muestreados y bien resueltos, teniendo en cuenta los cambios en los factores abióticos y bióticos relevantes a lo largo del tiempo.

@article{doi101146annurevecolsys120213091905,
    author = "Donoghue, Michael J. y Edwards, Erika J.",
    title = "Cambios de Biomas y Evolución de Nicho en Plantas",
    year = "2014",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "¿Qué factores influyen en si una línea evolutiva puede transicionar exitosamente a un nuevo bioma, y por qué algunos cambios de bioma han sido más frecuentes que otros? Para orientar esta línea de investigación, desarrollamos un marco conceptual en el cual la probabilidad de un cambio de bioma es una función de (a) la exposición a entornos contrastantes a lo largo del tiempo, (b) la accesibilidad evolutiva de las adaptaciones relevantes, y (c) las interacciones bióticas cambiantes. Evaluamos la literatura sobre cambios de bioma en plantas en relación con un conjunto de hipótesis sobre el tamaño, la conectividad y la edad absoluta de los biomas, así como sobre la adaptabilidad de líneas evolutivas particulares e interacciones ecológicas a lo largo del tiempo. También criticamos la inferencia filogenética de biomas pasados y un enfoque basado en modelos "global" para la evolución de biomas. Generalizaciones más robustas sobre los cambios de bioma requerirán estudios detallados de clados bien muestreados y bien resueltos, teniendo en cuenta los cambios en los factores abióticos y bióticos relevantes a lo largo del tiempo.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
    doi = "10.1146/annurev-ecolsys-120213-091905",
    openalex = "W2141294262",
    references = "doi101002joc1276, doi101016jtplants201009008, doi101016jtree200409011, doi101038nature12872, doi101093oso97801951223430010001, doi101093sysbiosyt034, doi101111j14610248200801229x, doi101111j14610248201001515x, doi101146annurevecolsys36102803095431, doi1016410006356820010510933teotwa20co2, openalexw2273605253"
}

Realizar inferencias significativas a partir de datos comparativos filogenéticos requiere un modelo significativo de la evolución de los rasgos. Por lo tanto, es importante determinar si el modelo es adecuado para los datos y la pregunta que se está abordando. Una forma de evaluar esto es preguntar si el modelo proporciona una explicación estadística adecuada para la variación en los datos. Hasta la fecha, los investigadores se han centrado principalmente en el poder explicativo de un modelo en relación con modelos alternativos. Se han desarrollado métodos para evaluar la adecuación, o el poder explicativo absoluto, de los modelos de rasgos filogenéticos, pero estos se han limitado a modelos o preguntas específicas. Aquí presentamos un marco estadístico general para evaluar la adecuación de los modelos de rasgos filogenéticos. Utilizamos nuestro enfoque para evaluar el rendimiento estadístico de los modelos de rasgos comúnmente utilizados en 337 conjuntos de datos comparativos que abarcan tres rasgos funcionales clave de las angiospermas. En general, los modelos que probamos a menudo proporcionaron explicaciones estadísticas pobres para la evolución de estos rasgos. Esto fue cierto para muchos grupos diferentes y a muchas escalas diferentes. Si esta inadecuación estadística alterará cualitativamente las inferencias extraídas de los conjuntos de datos comparativos dependerá del contexto. Independientemente de ello, evaluar la adecuación del modelo puede proporcionar interesantes conocimientos biológicos: cómo y por qué un modelo falla al describir la variación en un conjunto de datos nos da pistas sobre qué procesos evolutivos pueden haber impulsado la evolución de los rasgos a lo largo del tiempo.

@article{doi101086682022,
    author = "Pennell, Matthew W. y FitzJohn, Richard G. y Cornwell, William K. y Harmon, Luke J.",
    title = "Adecuación del modelo y la macroevolución de los rasgos funcionales de las angiospermas",
    year = "2015",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Realizar inferencias significativas a partir de datos comparativos filogenéticos requiere un modelo significativo de la evolución de los rasgos. Por lo tanto, es importante determinar si el modelo es adecuado para los datos y la pregunta que se está abordando. Una forma de evaluar esto es preguntar si el modelo proporciona una explicación estadística adecuada para la variación en los datos. Hasta la fecha, los investigadores se han centrado principalmente en el poder explicativo de un modelo en relación con modelos alternativos. Se han desarrollado métodos para evaluar la adecuación, o el poder explicativo absoluto, de los modelos de rasgos filogenéticos, pero estos se han limitado a modelos o preguntas específicas. Aquí presentamos un marco estadístico general para evaluar la adecuación de los modelos de rasgos filogenéticos. Utilizamos nuestro enfoque para evaluar el rendimiento estadístico de los modelos de rasgos comúnmente utilizados en 337 conjuntos de datos comparativos que abarcan tres rasgos funcionales clave de las angiospermas. En general, los modelos que probamos a menudo proporcionaron explicaciones estadísticas pobres para la evolución de estos rasgos. Esto fue cierto para muchos grupos diferentes y a muchas escalas diferentes. Si esta inadecuación estadística alterará cualitativamente las inferencias extraídas de los conjuntos de datos comparativos dependerá del contexto. Independientemente de ello, evaluar la adecuación del modelo puede proporcionar interesantes conocimientos biológicos: cómo y por qué un modelo falla al describir la variación en un conjunto de datos nos da pistas sobre qué procesos evolutivos pueden haber impulsado la evolución de los rasgos a lo largo del tiempo.",
    url = "https://doi.org/10.1086/682022",
    doi = "10.1086/682022",
    openalex = "W2952286239",
    references = "doi101146annurevecolsys120213091905"
}

Nuestra comprensión creciente del árbol de la vida de las plantas ofrece una oportunidad novedosa para descubrir los principales impulsores de la diversidad de las angiospermas. Utilizando una filogenia calibrada en el tiempo, caracterizamos los puntos calientes y fríos de la diversificación de linajes a lo largo del árbol de la vida de las angiospermas modelando la diversificación evolutiva mediante AIC paso a paso (MEDUSA). También probamos el modelo de retraso temporal de radiación de duplicación del genoma completo (WGD), que postula que los aumentos en la diversificación tienden a retrasarse detrás de los eventos de WGD establecidos. Las tasas de diversificación han sido increíblemente heterogéneas a lo largo de la historia evolutiva de las angiospermas y revelan un patrón de 'radiaciones anidadas' - aumentos en la diversificación neta anidados dentro de otras radiaciones. Este patrón, a su vez, genera una relación negativa entre la edad del clado y la diversidad tanto en familias como en órdenes. Sugerimos que las tasas de diversificación que cambian estocásticamente a lo largo de la filogenia explican estos patrones. Finalmente, demostramos un apoyo estadístico significativo para el modelo de retraso temporal de radiación de WGD. En las angiospermas, los cambios anidados en la diversificación condujeron a una tasa general de diversificación neta creciente y a tasas de extinción relativa decrecientes a lo largo del tiempo. Estos cambios de diversificación solo raramente están perfectamente asociados con eventos de WGD, pero comúnmente los siguen después de un período de retraso.

@article{doi101111nph13491,
    author = "Tank, David C. y Eastman, Jonathan M. y Pennell, Matthew W. y Soltis, Pamela S. y Soltis, Pamela S. y Hinchliff, Cody E. y Brown, Joseph W. y Sessa, Emily B. y Harmon, Luke J.",
    title = "Radiaciones anidadas y el pulso de la diversificación de las angiospermas: las tasas de diversificación aumentadas a menudo siguen a las duplicaciones del genoma completo",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Nuestra comprensión creciente del árbol de la vida de las plantas ofrece una oportunidad novedosa para descubrir los principales impulsores de la diversidad de las angiospermas. Utilizando una filogenia calibrada en el tiempo, caracterizamos los puntos calientes y fríos de la diversificación de linajes a lo largo del árbol de la vida de las angiospermas modelando la diversificación evolutiva mediante AIC paso a paso (MEDUSA). También probamos el modelo de retraso temporal de radiación de duplicación del genoma completo (WGD), que postula que los aumentos en la diversificación tienden a retrasarse detrás de los eventos de WGD establecidos. Las tasas de diversificación han sido increíblemente heterogéneas a lo largo de la historia evolutiva de las angiospermas y revelan un patrón de 'radiaciones anidadas' - aumentos en la diversificación neta anidados dentro de otras radiaciones. Este patrón, a su vez, genera una relación negativa entre la edad del clado y la diversidad tanto en familias como en órdenes. Sugerimos que las tasas de diversificación que cambian estocásticamente a lo largo de la filogenia explican estos patrones. Finalmente, demostramos un apoyo estadístico significativo para el modelo de retraso temporal de radiación de WGD. En las angiospermas, los cambios anidados en la diversificación condujeron a una tasa general de diversificación neta creciente y a tasas de extinción relativa decrecientes a lo largo del tiempo. Estos cambios de diversificación solo raramente están perfectamente asociados con eventos de WGD, pero comúnmente los siguen después de un período de retraso.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13491",
    doi = "10.1111/nph.13491",
    openalex = "W2159372152",
    references = "doi101111j14610248200901410x, doi101111j14754983201001011x"
}

Los rasgos funcionales de las plantas son las características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representan estrategias ecológicas y determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades del ecosistema. La variación en los rasgos funcionales de las plantas y los síndromes de rasgos ha demostrado ser útil para abordar muchas preguntas ecológicas importantes a diferentes escalas, dando lugar a la necesidad de métodos estandarizados para medir rasgos de plantas con significado ecológico. Esta línea de investigación ha sido una de las vías más fructíferas para comprender los patrones y procesos ecológicos y evolutivos. También tiene el potencial tanto de construir un conjunto predictivo de relaciones locales, regionales y globales entre las plantas y el medio ambiente como de cuantificar una amplia gama de procesos naturales e impulsados por el ser humano, incluidos los cambios en la biodiversidad, los impactos de las invasiones de especies, las alteraciones en los procesos biogeoquímicos y las interacciones entre la vegetación y la atmósfera. La importancia de estos temas dicta la necesidad urgente de más y mejores datos, e incrementa el valor de los protocolos estandarizados para cuantificar la variación de rasgos de diferentes especies, en particular para rasgos con la capacidad de predecir procesos a nivel de planta y de ecosistema, y para rasgos que pueden medirse relativamente fácilmente. Actualizado y ampliado a partir de la versión anterior ampliamente utilizada, este manual mantiene el enfoque en recetas paso a paso claramente presentadas y ampliamente aplicables, con un mínimo de texto sobre teoría, e incluye no solo métodos actualizados para los rasgos previamente cubiertos, sino también introduce muchos nuevos protocolos para otros rasgos. Este nuevo manual tiene un mejor equilibrio entre rasgos de planta entera, rasgos de hoja, rasgos de raíz y tallo y rasgos regenerativos, y pone un énfasis particular en los rasgos importantes para predecir los efectos de las especies sobre las propiedades clave del ecosistema. Esperamos que este nuevo manual se convierta en un compañero estándar en los esfuerzos locales y globales para aprender sobre las respuestas e impactos de diferentes especies de plantas con respecto a los cambios ambientales en el presente, el pasado y el futuro.

@article{doi101071bt12225co,
    author = "Harguindeguy, Natalia Pérez and Díaz, Silvia and Garnier, Éric and Lavorel, Sandra and Poorter, Hendrik and Jaureguiberry, Pedro and Bret‐Harte, M. Syndonia and Cornwell, William K. and Craine, Joseph M. and Gurvich, Diego E. and Urcelay, Carlos and Veneklaas, Erik J. and Reich, Peter B. and Poorter, Lourens and Wright, Ian J. and Ray, Prasun and Enrico, Lucas and Pausas, Juli G. and Vos, Ad and Buchmann, Nina and Funes, Guillermo and Quétier, Fabien and Hodgson, John and Thompson, Ken and Morgan, Huw D. and ter Steege, Hans and Sack, Lawren and Blonder, B. and Poschlod, Peter and Vaieretti, María V. and Conti, Georgina and Staver, A. Carla and Aquino, Sâmia and Cornelissen, J. H. C.",
    title = "Corrigendum to: New handbook for standardised measurement of plant functional traits worldwide",
    year = "2016",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Los rasgos funcionales de las plantas son las características (morfológicas, fisiológicas, fenológicas) que representan estrategias ecológicas y determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades del ecosistema. La variación en los rasgos funcionales de las plantas y los síndromes de rasgos ha demostrado ser útil para abordar muchas preguntas ecológicas importantes a diferentes escalas, dando lugar a la necesidad de métodos estandarizados para medir rasgos de plantas con significado ecológico. Esta línea de investigación ha sido una de las vías más fructíferas para comprender los patrones y procesos ecológicos y evolutivos. También tiene el potencial tanto de construir un conjunto predictivo de relaciones locales, regionales y globales entre las plantas y el medio ambiente como de cuantificar una amplia gama de procesos naturales e impulsados por el ser humano, incluidos los cambios en la biodiversidad, los impactos de las invasiones de especies, las alteraciones en los procesos biogeoquímicos y las interacciones entre la vegetación y la atmósfera. La importancia de estos temas dicta la necesidad urgente de más y mejores datos, e incrementa el valor de los protocolos estandarizados para cuantificar la variación de rasgos de diferentes especies, en particular para rasgos con la capacidad de predecir procesos a nivel de planta y de ecosistema, y para rasgos que pueden medirse relativamente fácilmente. Actualizado y ampliado a partir de la versión anterior ampliamente utilizada, este manual mantiene el enfoque en recetas paso a paso claramente presentadas y ampliamente aplicables, con un mínimo de texto sobre teoría, e incluye no solo métodos actualizados para los rasgos previamente cubiertos, sino también introduce muchos nuevos protocolos para otros rasgos. Este nuevo manual tiene un mejor equilibrio entre rasgos de planta entera, rasgos de hoja, rasgos de raíz y tallo y rasgos regenerativos, y pone un énfasis particular en los rasgos importantes para predecir los efectos de las especies sobre las propiedades clave del ecosistema. Esperamos que este nuevo manual se convierta en un compañero estándar en los esfuerzos locales y globales para aprender sobre las respuestas e impactos de diferentes especies de plantas con respecto a los cambios ambientales en el presente, el pasado y el futuro.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt12225\_co",
    doi = "10.1071/bt12225\_co",
    openalex = "W2561479186",
    references = "doi101006anbo20001261, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j14610248200901410x"
}

© 2016 The Linnean Society of London. Se presenta una actualización de la clasificación del Grupo de Filogenia de Angiospermas (APG) de los órdenes y familias de angiospermas. Se reconocen varios nuevos órdenes: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales y Vahliales. Esto eleva el número total de órdenes y familias reconocidas en el sistema APG a 64 y 416, respectivamente. Proponemos dos clados mayores informales adicionales, superrosids y superasterids, que cada uno comprende los órdenes adicionales incluidos en los clados mayores dominados por los rosids y asterids. Las familias que formaban potencialmente órdenes monofamiliales, Dasypogonaceae y Sabiaceae, se refieren ahora a Arecales y Proteales, respectivamente. Dos familias parásitas que anteriormente tenían posiciones inciertas ahora se colocan: Cynomoriaceae en Saxifragales y Apodanthaceae en Cucurbitales. Aunque existe evidencia de que algunas familias reconocidas en APG III no son monofiléticas, no realizamos cambios en Dioscoreales y Santalales en relación con APG III y dejamos algunos géneros en Lamiales sin clasificar (por ejemplo, Peltanthera). Estos cambios en la circunscripción y reconocimiento de familias han resultado todos de nuevos resultados publicados desde APG III, excepto por algunos cambios simplemente debidos a cuestiones nomenclaturales, que incluyen sustituir Asphodelaceae por Xanthorrhoeaceae (Asparagales) y Francoaceae por Melianthaceae (Geraniales); sin embargo, en Francoaceae también incluimos Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae y Vivianiaceae. Otros cambios a los límites de las familias no son drásticos ni numerosos y se centran principalmente en algunos miembros de los lamiids, especialmente la antigua Icacinaceae que ha sido problemática durante mucho tiempo con varios géneros trasladados a la anteriormente monogénerica Metteniusaceae, pero los cambios menores en la circunscripción incluyen Aristolochiaceae (ahora incluyendo Lactoridaceae y Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (eliminada de Juncaginaceae; Alismatales), Restionaceae (ahora re-incluyendo Anarthriaceae y Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (ahora incluyendo Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (dividida de Euphorbiaceae; Malpighiales), reconocimiento de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae y Microteaceae (todos Caryophyllales), Petiveriaceae dividida de Phytolaccaceae (Caryophyllales), cambios en la composición genérica de Ixonanthaceae e Irvingiaceae (con transferencia de Allantospermum de la primera a la segunda; Malpighiales), transferencia de Pakaraimaea (anteriormente Dipterocarpaceae) a Cistaceae (Malvales), transferencia de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis y Tirania (anteriormente todas Capparaceae) a Resedaceae (Brassicales), Nyssaceae dividida de Cornaceae (Cornales), Pteleocarpa trasladada a Gelsemiaceae (Gentianales), cambios en la composición genérica de Gesneriaceae (Sanango trasladado de Loganiaceae) y Orobanchaceae (ahora incluyendo Lindenbergiaceae y Rehmanniaceae) y reconocimiento de Mazaceae distinta de Phrymaceae (todos Lamiales).

@article{doi101111boj12385,
    author = "Group, The Angiosperm Phylogeny",
    title = "Una actualización de la clasificación del Grupo de Filogenia de Angiospermas para los órdenes y familias de plantas con flores: APG IV",
    year = "2016",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    abstract = "© 2016 The Linnean Society of London. Se presenta una actualización de la clasificación del Grupo de Filogenia de Angiospermas (APG) de los órdenes y familias de angiospermas. Se reconocen varios nuevos órdenes: Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales y Vahliales. Esto lleva el número total de órdenes y familias reconocidas en el sistema APG a 64 y 416, respectivamente. Proponemos dos clados mayores informales adicionales, superrosids y superasterids, que cada uno comprende los órdenes adicionales que se incluyen en los clados mayores dominados por los rosids y asterids. Las familias que formaban potencialmente órdenes monofamiliales, Dasypogonaceae y Sabiaceae, se refieren ahora a Arecales y Proteales, respectivamente. Dos familias parásitas que anteriormente tenían posiciones inciertas ahora se colocan: Cynomoriaceae en Saxifragales y Apodanthaceae en Cucurbitales. Aunque hay evidencia de que algunas familias reconocidas en APG III no son monofiléticas, no realizamos cambios en Dioscoreales y Santalales en relación con APG III y dejamos algunos géneros en Lamiales sin clasificar (por ejemplo, Peltanthera). Estos cambios en la circunscripción y reconocimiento familiar han resultado todos de nuevos resultados publicados desde APG III, excepto por algunos cambios simplemente debido a cuestiones nomenclatoriales, que incluyen sustituir Asphodelaceae por Xanthorrhoeaceae (Asparagales) y Francoaceae por Melianthaceae (Geraniales); sin embargo, en Francoaceae también incluimos Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae y Vivianiaceae. Otros cambios a los límites familiares no son drásticos ni numerosos y se centran principalmente en algunos miembros de los lamiids, especialmente la antigua Icacinaceae que ha sido problemática durante mucho tiempo con varios géneros trasladados a la anteriormente monogénerica Metteniusaceae, pero los cambios menores en la circunscripción incluyen Aristolochiaceae (ahora incluyendo Lactoridaceae y Hydnoraceae; Aristolochiales), Maundiaceae (eliminada de Juncaginaceae; Alismatales), Restionaceae (ahora re-incluyendo Anarthriaceae y Centrolepidaceae; Poales), Buxaceae (ahora incluyendo Haptanthaceae; Buxales), Peraceae (dividida de Euphorbiaceae; Malpighiales), reconocimiento de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae y Microteaceae (todos Caryophyllales), Petiveriaceae dividida de Phytolaccaceae (Caryophyllales), cambios en la composición genérica de Ixonanthaceae e Irvingiaceae (con transferencia de Allantospermum de la primera a la segunda; Malpighiales), transferencia de Pakaraimaea (anteriormente Dipterocarpaceae) a Cistaceae (Malvales), transferencia de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis y Tirania (anteriormente todas Capparaceae) a Resedaceae (Brassicales), Nyssaceae dividida de Cornaceae (Cornales), Pteleocarpa trasladada a Gelsemiaceae (Gentianales), cambios en la composición genérica de Gesneriaceae (Sanango trasladado de Loganiaceae) y Orobanchaceae (ahora incluyendo Lindenbergiaceae y Rehmanniaceae) y reconocimiento de Mazaceae distinta de Phrymaceae (todos Lamiales).",
    url = "https://doi.org/10.1111/boj.12385",
    doi = "10.1111/boj.12385",
    openalex = "W2166152751",
    references = "doi1010079783642143977, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas1323926111, doi101111j10958339200900996x, doi101111j109600311996tb00196x, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023071222465, doi1023072399846, doi10230725065646, doi103732ajb0800047, openalexw3148514506, openalexw70084438"
}

Los avances recientes en la filogenética molecular y una serie de importantes descubrimientos paleobotánicos han revolucionado nuestra comprensión de la diversificación de las angiospermas. Sin embargo, el origen y la evolución temprana de su característica más distintiva, la flor, siguen siendo poco comprendidos. En particular, la estructura de la flor ancestral de todas las angiospermas vivas sigue siendo incierta. Aquí presentamos reconstrucciones basadas en modelos para las flores ancestrales en los nodos más profundos de la filogenia de las angiospermas, utilizando el conjunto de datos más grande de caracteres florales jamás ensamblado. Reconstruimos la flor ancestral de las angiospermas como bisexual y simétrica radialmente, con más de dos verticilos de tres órganos periantales separados cada uno (tépalos indiferenciados), más de dos verticilos de tres estambres separados cada uno, y más de cinco carpelos separados dispuestos en espiral. Aunque persiste la incertidumbre para algunos de los caracteres, nuestra reconstrucción nos permite proponer un nuevo escenario plausible para la temprana diversificación de las flores, dando lugar a nuevas hipótesis comprobables para futuras investigaciones sobre las angiospermas.

@article{doi101038ncomms16047,
    author = "Sauquet, Hervé y von Balthazar, Maria y Magallón, Susana y Doyle, James A. y Endress, Peter K. y Bailes, Emily J. y de Morais, Érica Barroso y Bull–Hereñu, Kester y Carrive, Laetitia y Chartier, Marion y Chomicki, Guillaume y Coiro, Mario y Cornette, Raphaël y Ottra, Juliana Hanna Leite El y Epicoco, Cyril y Foster, Charles S. P. y Jabbour, Florian y Haevermans, Agathe y Haevermans, Thomas y Hernández, Rebeca y Little, Stefan A. y Löfstrand, Stefan y Luna, Javier A. y Massoni, Julien y Nadot, Sophie y Pamperl, Susanne y Prieu, Charlotte y Reyes, Elisabeth y dos Santos, Patrícia y Schoonderwoerd, Kristel M. y Sontag, Susanne y Soulebeau, Anaëlle y Staedler, Yannick M. y Tschan, Georg F. y Leung, Amy Wing-Sze y Schönenberger, Jürg",
    title = "La flor ancestral de las angiospermas y su temprana diversificación",
    year = "2017",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Los avances recientes en la filogenética molecular y una serie de importantes descubrimientos paleobotánicos han revolucionado nuestra comprensión de la diversificación de las angiospermas. Sin embargo, el origen y la evolución temprana de su característica más distintiva, la flor, siguen siendo poco comprendidos. En particular, la estructura de la flor ancestral de todas las angiospermas vivas sigue siendo incierta. Aquí presentamos reconstrucciones basadas en modelos para las flores ancestrales en los nodos más profundos de la filogenia de las angiospermas, utilizando el conjunto de datos más grande de caracteres florales jamás ensamblado. Reconstruimos la flor ancestral de las angiospermas como bisexual y simétrica radialmente, con más de dos verticilos de tres órganos periantales separados cada uno (tépalos indiferenciados), más de dos verticilos de tres estambres separados cada uno, y más de cinco carpelos separados dispuestos en espiral. Aunque persiste la incertidumbre para algunos de los caracteres, nuestra reconstrucción nos permite proponer un nuevo escenario plausible para la temprana diversificación de las flores, dando lugar a nuevas hipótesis comprobables para futuras investigaciones sobre las angiospermas.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms16047",
    doi = "10.1038/ncomms16047",
    openalex = "W2741748285",
    references = "doi101073pnas0709121104, doi101073pnas1323926111, doi101080106351501753462876, doi10108010635150490522232, doi10108010635150490522304, doi10108010635150701607033, doi101086675935, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093molbevmss075, doi101093sysbiosyt034, doi101098rspb19940006, doi1011112041210x12420, doi101111boj12385, doi101146annurevearth042711105313, doi103732ajb0800047"
}

El éxito de la poliploidía, desplazando a los ancestros diploides de casi todas las plantas, está bien ilustrado por la enorme diversidad de angiospermas que se asume que proviene de eventos recurrentes de poliploidización. Sorprendentemente, la poliploidización a menudo ocurrió antes o simultáneamente con las transiciones evolutivas mayores y la radiación adaptativa de especies, apoyando el concepto de que la poliploidía juega un papel predominante en los estallidos de especiación adaptativa. La poliploidía resulta en redundancia genética inmediata y representa, junto con el surgimiento de nuevas funciones génicas, una fuente importante de novedad. Junto con la recombinación, la mutación génica, la actividad de transposones y la reorganización cromosómica, la poliploidía y la duplicación del genoma completo actúan como impulsores de la evolución y la divergencia en el comportamiento de las plantas y la función génica, permitiendo la diversificación, la especiación y, por lo tanto, la evolución de las plantas.

@article{doi101093aobmcx079,
    author = "Alix, Karine y Gérard, P. y Schwarzacher, Trude y Heslop‐Harrison, J. S.",
    title = "Poliploidía e hibridación interespecífica: socios para la adaptación, la especiación y la evolución en plantas",
    year = "2017",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "El éxito de la poliploidía, desplazando a los ancestros diploides de casi todas las plantas, está bien ilustrado por la enorme diversidad de angiospermas que se asume que proviene de eventos recurrentes de poliploidización. Sorprendentemente, la poliploidización a menudo ocurrió antes o simultáneamente con las transiciones evolutivas mayores y la radiación adaptativa de especies, apoyando el concepto de que la poliploidía juega un papel predominante en los estallidos de especiación adaptativa. La poliploidía resulta en redundancia genética inmediata y representa, junto con el surgimiento de nuevas funciones génicas, una fuente importante de novedad. Junto con la recombinación, la mutación génica, la actividad de transposones y la reorganización cromosómica, la poliploidía y la duplicación del genoma completo actúan como impulsores de la evolución y la divergencia en el comportamiento de las plantas y la función génica, permitiendo la diversificación, la especiación y, por lo tanto, la evolución de las plantas.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcx079",
    doi = "10.1093/aob/mcx079",
    openalex = "W2734942911",
    references = "doi101002bies201100035, doi101016jpalaeo200507006, doi101111j14697998201100829x"
}

Dentro de la microbiota vegetal, los simbiontes fúngicos y bacterianos mutualistas son ejemplos notables de microorganismos que desempeñan roles cruciales en la adquisición de nutrientes. Han coevolucionado con sus huéspedes desde la adaptación inicial de las plantas a la tierra. A pesar de las distancias evolutivas que separan las simbiosis micorrízicas y fijadoras de nitrógeno, estas asociaciones comparten una serie de características altamente conservadas, incluidas vías de señalización simbiótica específicas de plantas, estrategias de colonización de raíces que eluden las respuestas inmunitarias de la planta, formación de interfaces funcionales huésped-microbio y el papel central de las fitohormonas en las vías de desarrollo radicular asociadas a la simbiosis. Destacamos áreas de investigación recientes y emergentes relacionadas con estos mecanismos evolutivamente conservados, con énfasis en las asociaciones micorrízicas más ancestrales, y consideramos en qué medida este conocimiento puede contribuir a la comprensión de las asociaciones planta-microbiota en su conjunto.

@article{doi101126scienceaad4501,
    author = "Martin, Francis y Uroz, Stéphane y Barker, David G.",
    title = "Alianzas ancestrales: simbiosis mutualistas de plantas con hongos y bacterias",
    year = "2017",
    journal = "Science",
    abstract = "Dentro de la microbiota vegetal, los simbiontes fúngicos y bacterianos mutualistas son ejemplos notables de microorganismos que desempeñan roles cruciales en la adquisición de nutrientes. Han coevolucionado con sus huéspedes desde la adaptación inicial de las plantas a la tierra. A pesar de las distancias evolutivas que separan las simbiosis micorrízicas y fijadoras de nitrógeno, estas asociaciones comparten una serie de características altamente conservadas, incluidas vías de señalización simbiótica específicas de plantas, estrategias de colonización de raíces que eluden las respuestas inmunitarias de la planta, formación de interfaces funcionales huésped-microbio y el papel central de las fitohormonas en las vías de desarrollo radicular asociadas a la simbiosis. Destacamos áreas de investigación recientes y emergentes relacionadas con estos mecanismos evolutivamente conservados, con énfasis en las asociaciones micorrízicas más ancestrales, y consideramos en qué medida este conocimiento puede contribuir a la comprensión de las asociaciones planta-microbiota en su conjunto.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aad4501",
    doi = "10.1126/science.aad4501",
    openalex = "W2618012128",
    references = "doi101038ncomms5087, doi101098rstb20110271"
}

La vegetación terrestre es sin lugar a dudas un factor importante en el sistema climático, modulando el intercambio de energía, momento, vapor de agua y otros gases de efecto invernadero entre la tierra y la atmósfera. Aquí, revisamos la evolución de la flora terrestre desde el Proterozoico hasta el Neógeno en tres escalas distintas: la evolución general de la composición floral, la evolución de la fisiología vegetal y la evolución de la ocupación del paisaje tanto espacial como estacionalmente, todo en el contexto de cómo la vegetación pudo haber influido en el clima a lo largo del tiempo y qué transiciones evolutivas de tiempos profundos pudieron haber tenido el mayor efecto. Nuestro enfoque está en los impactos directos de la vegetación sobre la temperatura y las precipitaciones, pero también consideramos los impactos indirectos de las plantas sobre el clima a través de la composición atmosférica. Argumentamos que los momentos de mayor cambio en los retroalimentaciones climáticas de las plantas probablemente fueron el Carbonífero y el Paleógeno temprano.

@article{doi101146annurevearth063016015629,
    author = "Boyce, C. Kevin y Lee, Jung‐Eun",
    title = "Evolución de las plantas y clima a escalas de tiempo geológico",
    year = "2017",
    journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
    abstract = "La vegetación terrestre es sin lugar a dudas un factor importante en el sistema climático, modulando el intercambio de energía, momento, vapor de agua y otros gases de efecto invernadero entre la tierra y la atmósfera. Aquí, revisamos la evolución de la flora terrestre desde el Proterozoico hasta el Neógeno en tres escalas distintas: la evolución general de la composición floral, la evolución de la fisiología vegetal y la evolución de la ocupación del paisaje tanto espacial como estacionalmente, todo en el contexto de cómo la vegetación pudo haber influido en el clima a lo largo del tiempo y qué transiciones evolutivas de tiempos profundos pudieron haber tenido el mayor efecto. Nuestro enfoque está en los impactos directos de la vegetación sobre la temperatura y las precipitaciones, pero también consideramos los impactos indirectos de las plantas sobre el clima a través de la composición atmosférica. Argumentamos que los momentos de mayor cambio en los retroalimentaciones climáticas de las plantas probablemente fueron el Carbonífero y el Paleógeno temprano.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-earth-063016-015629",
    doi = "10.1146/annurev-earth-063016-015629",
    openalex = "W2523635891",
    references = "doi101098rspb20132829, doi101126science1260947"
}

Este estudio demuestra un método para combinar los recursos disponibles para construir una filogenia datada de plantas. Sin embargo, este enfoque es un paso inicial y se necesitan más desarrollos para añadir datos, incorporando mejor la incertidumbre subyacente y mejorar la resolución. Los métodos discutidos aquí también pueden aplicarse a otros clados principales en el árbol de la vida.

@article{doi101002ajb21019,
    author = "Smith, Stephen A. y Brown, Joseph W.",
    title = "Construyendo una filogenia de plantas con semillas ampliamente inclusiva",
    year = "2018",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Este estudio demuestra un método para combinar los recursos disponibles para construir una filogenia datada de plantas. Sin embargo, este enfoque es un paso inicial y se necesitan más desarrollos para añadir datos, incorporando mejor la incertidumbre subyacente y mejorar la resolución. Los métodos discutidos aquí también pueden aplicarse a otros clados principales en el árbol de la vida.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ajb2.1019",
    doi = "10.1002/ajb2.1019",
    openalex = "W2792688220",
    references = "doi101038nature11631, doi101038nature12872, doi101038ncomms16047, doi101038ncomms2958, doi101073pnas1323926111, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101111nph13264, doi101111syen12037"
}

Después de décadas de estudios filogenéticos moleculares, la filogenia profunda de las gimnospermas no ha sido resuelta, y la colocación filogenética de Gnetales sigue siendo uno de los temas más controvertidos en la evolución de las plantas con semillas. Para resolver la filogenia profunda de las plantas con semillas y abordar las fuentes de conflicto filogenético, realizamos un estudio filotranscriptómico con una muestra de las 13 familias de gimnospermas y las principales linajes de angiospermas. Se analizaron múltiples conjuntos de datos que contienen hasta 1 296 042 sitios en 1308 loci, utilizando enfoques de concatenación y coalescencia. Nuestro estudio generó una filogenia de plantas con semillas consistente y bien resuelta, que coloca a Gnetales como hermana de Pinaceae y, por lo tanto, apoya la hipótesis Gnepine. Cycads más Ginkgo es hermana de las gimnospermas restantes. También encontramos que Gnetales y angiospermas tienen tasas de evolución molecular similares, que son mucho más altas que las de otras gimnospermas. Esto implica que Gnetales y angiospermas podrían haber experimentado presiones selectivas similares en sus historias evolutivas. La evolución molecular convergente o la homoplasia son parcialmente responsables de los conflictos filogenéticos en las plantas con semillas. Nuestro estudio proporciona una filogenia de esqueleto robustamente reconstruida que es importante para futuros estudios moleculares y morfológicos de plantas con semillas, en particular gimnospermas, a la luz de la evolución.

@article{doi101098rspb20181012,
    author = "Ran, Jin‐Hua y Shen, Tingting y Wang, Mingming y Wang, Xiaoquan",
    title = "La filogenómica resuelve la filogenia profunda de las plantas con semillas e indica una evolución convergente parcial o homoplásica entre Gnetales y angiospermas",
    year = "2018",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Después de décadas de estudios filogenéticos moleculares, la filogenia profunda de las gimnospermas no ha sido resuelta, y la colocación filogenética de Gnetales sigue siendo uno de los temas más controvertidos en la evolución de las plantas con semillas. Para resolver la filogenia profunda de las plantas con semillas y abordar las fuentes de conflicto filogenético, realizamos un estudio filotranscriptómico con una muestra de las 13 familias de gimnospermas y las principales linajes de angiospermas. Se analizaron múltiples conjuntos de datos que contienen hasta 1 296 042 sitios en 1308 loci, utilizando enfoques de concatenación y coalescencia. Nuestro estudio generó una filogenia de plantas con semillas consistente y bien resuelta, que coloca a Gnetales como hermana de Pinaceae y, por lo tanto, apoya la hipótesis Gnepine. Cycads más Ginkgo es hermana de las gimnospermas restantes. También encontramos que Gnetales y angiospermas tienen tasas de evolución molecular similares, que son mucho más altas que las de otras gimnospermas. Esto implica que Gnetales y angiospermas podrían haber experimentado presiones selectivas similares en sus historias evolutivas. La evolución molecular convergente o la homoplasia son parcialmente responsables de los conflictos filogenéticos en las plantas con semillas. Nuestro estudio proporciona una filogenia de esqueleto robustamente reconstruida que es importante para futuros estudios moleculares y morfológicos de plantas con semillas, en particular gimnospermas, a la luz de la evolución.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2018.1012",
    doi = "10.1098/rspb.2018.1012",
    openalex = "W2808886394",
    references = "doi101038nbt1883, doi101038nprot2013084, doi101093bioinformaticsbtl158, doi101093bioinformaticsbtu033, doi101093bioinformaticsbtu170, doi101093molbevmsm088, doi101093molbevmst010, doi101093molbevmsw260, doi101093sysbiosys029, doi101186s1305901507212"
}

Resumen del contenido 1108 I. Introducción 1108 II. Diversidad de plantas micorrízicas a escalas global y local 1108 III. Evolución micorrízica en plantas: una breve actualización 1111 IV. Conclusiones y perspectivas 1114 Referencias 1114 RESUMEN: La mayoría de las plantas vasculares son micorrízicas: el 72% son micorrizas arbusculares (AM), el 2,0% son micorrizas ectomicorrízicas (EcM), el 1,5% son micorrizas ericoides y el 10% son micorrizas de orquídeas. Solo el 8% son completamente no micorrízicas (NM), mientras que el 7% tienen asociaciones NM-AM inconsistentes. La mayoría de las plantas NM y NM-AM son especialistas nutricionales (por ejemplo, carnívoros y parásitos) o especialistas de hábitat (por ejemplo, hidrófitas y epífitas). Las asociaciones micorrízicas son consistentes en la mayoría de las familias, pero hay excepciones con raíces complejas (por ejemplo, tanto EcM como AM). Reconocemos tres oleadas de evolución micorrízica, comenzando con AM en las primeras plantas terrestres, continuando en el Cretácico con múltiples nuevas linajes NM o EcM, micorrizas ericoides y de orquídeas. La tercera oleada, que es reciente y en curso, ha resultado en complejidad de raíces vinculada a una rápida diversificación de plantas en los puntos calientes de biodiversidad.

@article{doi101111nph14976,
    author = "Brundrett, Mark y Tedersoo, Leho",
    title = "Historia evolutiva de las simbiosis micorrízicas y la diversidad global de plantas hospedadoras",
    year = "2018",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Resumen del contenido 1108 I. Introducción 1108 II. Diversidad de plantas micorrízicas a escalas global y local 1108 III. Evolución micorrízica en plantas: una breve actualización 1111 IV. Conclusiones y perspectivas 1114 Referencias 1114 RESUMEN: La mayoría de las plantas vasculares son micorrízicas: el 72% son micorrizas arbusculares (AM), el 2,0% son micorrizas ectomicorrízicas (EcM), el 1,5% son micorrizas ericoides y el 10% son micorrizas de orquídeas. Solo el 8% son completamente no micorrízicas (NM), mientras que el 7% tienen asociaciones NM-AM inconsistentes. La mayoría de las plantas NM y NM-AM son especialistas nutricionales (por ejemplo, carnívoros y parásitos) o especialistas de hábitat (por ejemplo, hidrófitas y epífitas). Las asociaciones micorrízicas son consistentes en la mayoría de las familias, pero hay excepciones con raíces complejas (por ejemplo, tanto EcM como AM). Reconocemos tres oleadas de evolución micorrízica, comenzando con AM en las primeras plantas terrestres, continuando en el Cretácico con múltiples nuevos linajes NM o EcM, micorrizas ericoides y de orquídeas. La tercera oleada, que es reciente y en curso, ha resultado en complejidad de raíces vinculada a una rápida diversificación de plantas en los puntos calientes de biodiversidad.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.14976",
    doi = "10.1111/nph.14976",
    openalex = "W2792482912",
    references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038nrg201726, doi101146annurevearth261379"
}

Se ha hipotetizado que las estrategias de intercambio gaseoso más eficientes en entornos de luz dinámica contribuyen a la dominancia de las angiospermas en la flora de plantas vasculares. Sin embargo, aún nos falta una comprensión clara de cómo la dinámica estomática afecta la dinámica fotosintética y si existen diferencias entre linajes. Se estudiaron las dinámicas estomáticas y fotosintéticas tras cambios en la irradiancia en 15 especies, abarcando helechos, gimnospermas y angiospermas. Determinamos el efecto de la velocidad estomática en la fotosíntesis dinámica y la pérdida de agua. Además, evaluamos si el comportamiento dinámico seguía las divisiones de linaje evolutivo o si la adaptación ecológica para maximizar el uso de parches de luz podría describir el comportamiento dinámico. Encontramos que las especies con apertura estomática rápida, como los helechos, renuncian a menos fotosíntesis durante la inducción fotosintética. Por el contrario, no hubo relación entre la velocidad de cierre estomático y el agua desperdiciada por estomas temporalmente más abiertos, ya que las especies con mayores tasas de intercambio gaseoso también mostraron un cierre estomático más rápido. Las especies adaptadas a la sombra poseían estomas de apertura rápida pero cierre lento, consistente con la adaptación ecológica para maximizar el uso de parches de luz. Nuestros resultados sugieren que el comportamiento dinámico sigue más fuertemente las tendencias ecológicas adaptativas que las evolutivas, pero las angiospermas pueden beneficiarse de una inducción fotosintética relativamente más rápida al adoptar una estrategia de uso de agua menos conservadora.

@article{doi101111nph15572,
    author = "Deans, Ross M. y Brodribb, Timothy J. y Busch, Florian A. y Farquhar, Graham D.",
    title = "La estrategia de uso de agua de las plantas media los efectos estomáticos en la inducción de la fotosíntesis por la luz",
    year = "2018",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Se ha hipotetizado que las estrategias de intercambio gaseoso más eficientes en entornos de luz dinámica contribuyen a la dominancia de las angiospermas en la flora de plantas vasculares. Sin embargo, aún nos falta una comprensión clara de cómo la dinámica estomática afecta la dinámica fotosintética y si existen diferencias entre linajes. Se estudiaron las dinámicas estomáticas y fotosintéticas tras cambios en la irradiancia en 15 especies, abarcando helechos, gimnospermas y angiospermas. Determinamos el efecto de la velocidad estomática en la fotosíntesis dinámica y la pérdida de agua. Además, evaluamos si el comportamiento dinámico seguía las divisiones de linaje evolutivo o si la adaptación ecológica para maximizar el uso de parches de luz podría describir el comportamiento dinámico. Encontramos que las especies con apertura estomática rápida, como los helechos, renuncian a menos fotosíntesis durante la inducción fotosintética. Por el contrario, no hubo relación entre la velocidad de cierre estomático y el agua desperdiciada por estomas temporalmente más abiertos, ya que las especies con mayores tasas de intercambio gaseoso también mostraron un cierre estomático más rápido. Las especies adaptadas a la sombra poseían estomas de apertura rápida pero cierre lento, consistente con la adaptación ecológica para maximizar el uso de parches de luz. Nuestros resultados sugieren que el comportamiento dinámico sigue más fuertemente las tendencias ecológicas adaptativas que las evolutivas, pero las angiospermas pueden beneficiarse de una inducción fotosintética relativamente más rápida al adoptar una estrategia de uso de agua menos conservadora.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.15572",
    doi = "10.1111/nph.15572",
    openalex = "W2899292980",
    references = "doi101098rspb20132829"
}

@incollection{crossref2019angiosperms,
    title = "Angiospermas",
    year = "2019",
    booktitle = "Introducción a los fósiles vegetales",
    url = "https://doi.org/10.1017/9781108650021.010",
    doi = "10.1017/9781108650021.010",
    pages = "188-212"
}

Los nenúfares pertenecen al orden de angiospermas Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales y Austrobaileyales forman juntos lo que se denomina el grado ANA de angiospermas, que son representantes existentes de linajes que divergieron más temprano que el linaje que conduce a las angiospermas mesangiospermas existentes 1-3. Aquí reportamos la secuencia del genoma de 409 megabases del nenúfar de pétalos azules (Nymphaea colorata). Nuestros análisis filogenómicos apoyan a Amborellales y Nymphaeales como linajes hermanos sucesivos de todas las demás angiospermas existentes. El genoma de N. colorata y otros 19 transcriptomas de nenúfares revelan un evento de duplicación del genoma completo nymphaeal, que es compartido por Nymphaeaceae y posiblemente Cabombaceae. Entre los genes retenidos de esta duplicación del genoma completo se encuentran homólogos de genes que regulan la transición de la floración y el desarrollo floral. La expresión amplia de homólogos de genes florales ABCE en N. colorata podría apoyar un modelo ancestral ABCE de determinación de órganos florales igualmente ampliamente activo en las primeras angiospermas. Los nenúfares han evolucionado aromas florales atractivos y colores, que son características compartidas con las mesangiospermas, e identificamos sus genes biosintéticos putativos en N. colorata. Los compuestos químicos y los genes biosintéticos detrás de los aromas florales sugieren que han evolucionado en paralelo a los de las mesangiospermas. Debido a su posición filogenética única, el genoma de N. colorata arroja luz sobre la evolución temprana de las angiospermas.

@article{doi101038s4158601918525,
    author = "Zhang, Liangsheng y Chen, Fei y Zhang, Xingtan y Li, Zhen y Zhao, Yiyong y Lohaus, Rolf y Chang, Xiaojun y Dong, Wei y Ho, Simon Y. W. y Liu, Xing y Song, Aixia y Chen, Junhao y Guo, Wenlei y Wang, Zhengjia y Zhuang, Yingyu y Wang, Haifeng y Chen, Xuequn y Hu, Juan y Liu, Yanhui y Qin, Yuan y Wang, Kai y Dong, Shanshan y Liu, Yang y Zhang, Shouzhou y Yu, Xianxian y Wu, Qian y Wang, Liangsheng y Yan, Xueqing y Jiao, Yuannian y Kong, Hongzhi y Zhou, Xiaofan y Yu, Cuiwei y Chen, Yuchu y Li, Fan y Wang, Jihua y Chen, Wei y Chen, Xinlu y Jia, Qidong y Zhang, Chi y Jiang, Yifan y Zhang, Wanbo y Liu, Guanhua y Fu, Jianyu y Chen, Feng y Mā, Hong y de Peer, Yves Van y Tang, Haibao",
    title = "El genoma del nenúfar y la evolución temprana de las plantas con flores",
    year = "2019",
    journal = "Nature",
    abstract = "Los nenúfares pertenecen al orden de angiospermas Nymphaeales. Amborellales, Nymphaeales y Austrobaileyales forman juntos lo que se denomina el grado ANA de angiospermas, que son representantes existentes de linajes que divergieron más temprano que el linaje que conduce a las angiospermas mesangiospermas existentes 1-3. Aquí reportamos la secuencia del genoma de 409 megabases del nenúfar de pétalos azules (Nymphaea colorata). Nuestros análisis filogenómicos apoyan a Amborellales y Nymphaeales como linajes hermanos sucesivos de todas las demás angiospermas existentes. El genoma de N. colorata y otros 19 transcriptomas de nenúfares revelan un evento de duplicación del genoma completo nymphaeal, que es compartido por Nymphaeaceae y posiblemente Cabombaceae. Entre los genes retenidos de esta duplicación del genoma completo se encuentran homólogos de genes que regulan la transición de la floración y el desarrollo floral. La expresión amplia de homólogos de genes florales ABCE en N. colorata podría apoyar un modelo ancestral ABCE de determinación de órganos florales igualmente ampliamente activo en las primeras angiospermas. Los nenúfares han evolucionado aromas florales atractivos y colores, que son características compartidas con las mesangiospermas, e identificamos sus genes biosintéticos putativos en N. colorata. Los compuestos químicos y los genes biosintéticos detrás de los aromas florales sugieren que han evolucionado en paralelo a los de las mesangiospermas. Debido a su posición filogenética única, el genoma de N. colorata arroja luz sobre la evolución temprana de las angiospermas.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-019-1852-5",
    doi = "10.1038/s41586-019-1852-5",
    openalex = "W2995259736",
    references = "doi101038ncomms16047, doi101111j14698137201103794x"
}

Los hongos desempeñan muchos roles esenciales en los ecosistemas. Facilitan el acceso de las plantas a nutrientes y agua, actúan como agentes de descomposición que ciclan carbono y nutrientes a través del suelo, el agua y la atmósfera, y son reguladores principales de las poblaciones de macroorganismos. Aunque los avances tecnológicos están mejorando la detección e identificación de hongos, aún existen brechas clave en nuestro conocimiento ecológico de este reino, especialmente relacionadas con la función. Los enfoques basados en rasgos han sido fundamentales para fortalecer nuestra comprensión de la ecología funcional de las plantas y, por lo tanto, ofrecen modelos excelentes para profundizar nuestra comprensión de la ecología funcional de los hongos de maneras que complementan las perspectivas obtenidas de técnicas tradicionales y basadas en ómicas. En esta revisión, sintetizamos el conocimiento actual sobre la ecología funcional de los hongos, la taxonomía y la sistemática e introducimos una base de datos novedosa de rasgos funcionales de hongos (Fun Fun). Fun Fun está diseñada para interactuar con otras bases de datos para explorar y predecir cómo la diversidad funcional de los hongos varía según la taxonomía, el gremio y otras variables de agrupación evolutiva o ecológica. Para destacar cómo un enfoque cuantitativo basado en rasgos puede proporcionar nuevas perspectivas, describimos múltiples ejemplos dirigidos y terminamos sugiriendo los siguientes pasos en el campo de la ecología funcional de los hongos, que está creciendo rápidamente.

@article{doi101111brv12570,
    author = "Zanne, Amy E. y Abarenkov, Kessy y Afkhami, Michelle E. y Aguilar‐Trigueros, Carlos A. y Bates, Scott T. y Bhatnagar, Jennifer y Busby, Posy E. y Christian, Natalie y Cornwell, William K. y Crowther, Thomas W. y Flores‐Moreno, Habacuc y Floudas, Dimitrios y Gazis, Romina y Hibbett, David S. y Kennedy, Peter G. y Lindner, Daniel L. y Maynard, Daniel S. y Milo, Amy M. y Nilsson, Rolf Henrik y Powell, Jeff R. y Schildhauer, Mark y Schilling, Jonathan S. y Treseder, Kathleen K.",
    title = "Ecología funcional de los hongos: llevar un enfoque basado en rasgos a los hongos asociados a las plantas",
    year = "2019",
    journal = "Biological reviews/Reseñas biológicas de la Sociedad Filosófica de Cambridge",
    abstract = "Los hongos desempeñan muchos roles esenciales en los ecosistemas. Facilitan el acceso de las plantas a nutrientes y agua, actúan como agentes de descomposición que ciclan carbono y nutrientes a través del suelo, el agua y la atmósfera, y son reguladores principales de las poblaciones de macroorganismos. Aunque los avances tecnológicos están mejorando la detección e identificación de hongos, aún existen brechas clave en nuestro conocimiento ecológico de este reino, especialmente relacionadas con la función. Los enfoques basados en rasgos han sido fundamentales para fortalecer nuestra comprensión de la ecología funcional de las plantas y, por lo tanto, ofrecen modelos excelentes para profundizar nuestra comprensión de la ecología funcional de los hongos de maneras que complementan las perspectivas obtenidas de técnicas tradicionales y basadas en ómicas. En esta revisión, sintetizamos el conocimiento actual sobre la ecología funcional de los hongos, la taxonomía y la sistemática e introducimos una base de datos novedosa de rasgos funcionales de hongos (Fun Fun). Fun Fun está diseñada para interactuar con otras bases de datos para explorar y predecir cómo la diversidad funcional de los hongos varía según la taxonomía, el gremio y otras variables de agrupación evolutiva o ecológica. Para destacar cómo un enfoque cuantitativo basado en rasgos puede proporcionar nuevas perspectivas, describimos múltiples ejemplos dirigidos y terminamos sugiriendo los siguientes pasos en el campo de la ecología funcional de los hongos, que está creciendo rápidamente.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12570",
    doi = "10.1111/brv.12570",
    openalex = "W2991566198",
    references = "doi101093sysbiosyy031"
}

Presentamos V.PhyloMaker, un paquete disponible gratuitamente para R diseñado para generar filogenias de plantas vasculares. El megaárbol implementado en V.PhyloMaker (es decir, GBOTB.extended.tre), que se derivó de dos megaárboles recientemente publicados e incluye 74 533 especies y todas las familias de plantas vasculares existentes, es la filogenia con datación más grande para plantas vasculares. V.PhyloMaker puede generar filogenias para listas de especies muy grandes (la lista de especies más grande que probamos incluía 314 686 especies). V.PhyloMaker genera filogenias a una velocidad rápida, mucho más rápida que otros paquetes generadores de filogenias. Nuestras pruebas de V.PhyloMaker muestran que generar una filogenia para 60 000 especies requiere menos de seis horas. V.PhyloMaker incluye un enfoque para adjuntar géneros o especies a sus parientes cercanos en una filogenia. Proporcionamos un ejemplo sencillo en este artículo para mostrar cómo usar V.PhyloMaker para generar filogenias.

@article{doi101111ecog04434,
    author = "Jin, Yi y Qian, Hong",
    title = "V.PhyloMaker: un paquete de R que puede generar filogenias muy grandes para plantas vasculares",
    year = "2019",
    journal = "Ecografía",
    abstract = "Presentamos V.PhyloMaker, un paquete disponible gratuitamente para R diseñado para generar filogenias de plantas vasculares. El megaárbol implementado en V.PhyloMaker (es decir, GBOTB.extended.tre), que se derivó de dos megaárboles recientemente publicados e incluye 74 533 especies y todas las familias de plantas vasculares existentes, es la filogenia con datación más grande para plantas vasculares. V.PhyloMaker puede generar filogenias para listas de especies muy grandes (la lista de especies más grande que probamos incluía 314 686 especies). V.PhyloMaker genera filogenias a una velocidad rápida, mucho más rápida que otros paquetes generadores de filogenias. Nuestras pruebas de V.PhyloMaker muestran que generar una filogenia para 60 000 especies requiere menos de seis horas. V.PhyloMaker incluye un enfoque para adjuntar géneros o especies a sus parientes cercanos en una filogenia. Proporcionamos un ejemplo sencillo en este artículo para mostrar cómo usar V.PhyloMaker para generar filogenias.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ecog.04434",
    doi = "10.1111/ecog.04434",
    openalex = "W2922439782",
    references = "doi101038nature12872"
}

Los rasgos de las plantas —las características morfológicas, anatómicas, fisiológicas, bioquímicas y fenológicas de las plantas— determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades de los ecosistemas y sus beneficios y perjuicios para las personas. Por lo tanto, los datos de rasgos de las plantas representan la base de un vasto campo de investigación que abarca desde la biología evolutiva, la ecología comunitaria y funcional, hasta la conservación de la biodiversidad, la gestión de ecosistemas y paisajes, la restauración, la biogeografía y la modelización de sistemas terrestres. Desde su fundación en 2007, la base de datos TRY de rasgos de plantas ha crecido continuamente. Ahora ofrece una cobertura de datos sin precedentes bajo una política de acceso abierto a los datos y es la principal base de datos de rasgos de plantas utilizada por la comunidad de investigación en todo el mundo. Cada vez más, la base de datos TRY también apoya nuevas fronteras en la investigación basada en rasgos de plantas, incluyendo la identificación de lagunas de datos y la posterior movilización o medición de nuevos datos. Para apoyar este desarrollo, en este artículo evaluamos el alcance de los datos de rasgos compilados en TRY y analizamos los patrones emergentes de cobertura y representatividad de los datos. La mejor cobertura de especies se logra para los rasgos categóricos —casi una cobertura completa para la 'forma de crecimiento de la planta'. Sin embargo, la mayoría de los rasgos relevantes para la ecología y la modelización de la vegetación se caracterizan por una variación intraspecífica continua y relaciones rasgo-ambiente. Estos rasgos deben medirse en plantas individuales en su respectivo entorno. A pesar de la cobertura de datos sin precedentes, observamos una humillante falta de completitud y representatividad de estos rasgos continuos en muchos aspectos. Por lo tanto, concluimos que reducir las lagunas de datos y los sesgos en la base de datos TRY sigue siendo un desafío clave y requiere un enfoque coordinado para la movilización de datos y la medición de rasgos. Esto solo puede lograrse en colaboración con otras iniciativas.

@article{doi101111gcb14904,
    author = "Kattge, Jens y Bönisch, Gerhard y Dı́az, Sandra y Lavorel, Sandra y Prentice, I. Colin y Leadley, Paul y Tautenhahn, Susanne y Werner, Gijsbert D. A. y Aakala, Tuomas y Abedi, Mehdi y Acosta, Alicia Teresa Rosario y Adamidis, George C. y Adamson, Kairi y Aiba, Masahiro y Albert, Cécile H. y Alcántara, Julio M. y C, Carolina Alcázar y Aleixo, Izabela y Ali, Hamada E. y Amiaud, Bernard y Ammer, Christian y Amoroso, Mariano M. y Anand, Madhur y Anderson, C. y Anten, Niels P. R. y Antos, Joseph A. y Apgaua, Deborah M. G. y Ashman, Tia‐Lynn y Asmara, Degi Harja y Asner, Gregory P. y Aspinwall, Michael J. y Atkin, Owen K. y Aubin, Isabelle y Baastrup‐Spohr, Lars y Bahalkeh, Khadijeh y Bahn, Michael y Baker, Timothy R. y Baker, William J. y Bakker, Jan P. y Baldocchi, Dennis y Baltzer, Jennifer L. y Banerjee, Arindam y Baranger, Anne y Barlow, Jos y Barneche, Diego R. y Baruch, Zdravko y Bastianelli, Denis y Battles, John J. y Bauerle, William L. y Bauters, Marijn y Bazzato, Erika y Beckmann, Michael y Beeckman, Hans y Beierkuhnlein, Carl y Bekker, Renée M. y Belfry, Gavin y Belluau, Michaël y Beloiu, Mirela y Benavides, Raquel y Benomar, Lahcen y Berdugo‐Lattke, Mary Lee y Berenguer, Erika y Bergamin, Rodrigo Scarton y Bergmann, Joana y Carlucci, Marcos Bergmann y Berner, Logan T. y Bernhardt‐Römermann, Markus y Bigler, Christof y Bjorkman, Anne D. y Blackman, Chris J. y Blanco, C. y Blonder, Benjamin y Blumenthal, Dana M. y Bocanegra‐González, Kelly T. y Boeckx, Pascal y Bohlman, Stephanie y Böhning‐Gaese, Katrin y Boisvert‐Marsh, Laura y Bond, William J. y Bond‐Lamberty, Ben y Boom, Arnoud y Boonman, Coline C. F. y Bordin, Kauane Maiara y Boughton, Elizabeth H. y Boukili, Vanessa y Bowman, David M. J. S. y Bravo, Sandra y Brendel, Marco R. y Broadley, Martin R. y Brown, Kerry A. y Bruelheide, Helge y Brumnich, Federico y Bruun, Hans Henrik y Bruy, David y Buchanan, Serra-Willow y Bucher, Solveig Franziska y Buchmann, Nina y Buitenwerf, Robert y Bunker, Daniel E. y Bürger, Jana",
    title = "Base de datos de rasgos de plantas TRY – cobertura mejorada y acceso abierto",
    year = "2019",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Los rasgos de las plantas —las características morfológicas, anatómicas, fisiológicas, bioquímicas y fenológicas de las plantas— determinan cómo las plantas responden a los factores ambientales, afectan a otros niveles tróficos e influyen en las propiedades de los ecosistemas y sus beneficios y perjuicios para las personas. Por lo tanto, los datos de rasgos de plantas representan la base para un vasto campo de investigación que abarca desde la biología evolutiva, la ecología comunitaria y funcional, hasta la conservación de la biodiversidad, la gestión de ecosistemas y paisajes, la restauración, la biogeografía y la modelización de sistemas terrestres. Desde su fundación en 2007, la base de datos TRY de rasgos de plantas ha crecido continuamente. Ahora ofrece una cobertura de datos sin precedentes bajo una política de acceso abierto a los datos y es la principal base de datos de rasgos de plantas utilizada por la comunidad de investigación en todo el mundo. Cada vez más, la base de datos TRY también apoya nuevas fronteras en la investigación basada en rasgos de plantas, incluida la identificación de lagunas de datos y la posterior movilización o medición de nuevos datos. Para apoyar este desarrollo, en este artículo evaluamos la extensión de los datos de rasgos compilados en TRY y analizamos los patrones emergentes de cobertura y representatividad de los datos. La mejor cobertura de especies se logra para los rasgos categóricos —casi una cobertura completa para la 'forma de crecimiento de las plantas'. Sin embargo, la mayoría de los rasgos relevantes para la ecología y la modelización de la vegetación se caracterizan por una variación intraspecífica continua y relaciones rasgo-ambiente. Estos rasgos deben medirse en plantas individuales en su respectivo entorno. A pesar de la cobertura de datos sin precedentes, observamos una humillante falta de completitud y representatividad de estos rasgos continuos en muchos aspectos. Por lo tanto, concluimos que reducir las lagunas de datos y los sesgos en la base de datos TRY sigue siendo un desafío clave y requiere un enfoque coordinado para la movilización de datos y la medición de rasgos. Esto solo puede lograrse en colaboración con otras iniciativas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.14904",
    doi = "10.1111/gcb.14904",
    openalex = "W2983606184",
    references = "doi101038nature12872, doi101038ncomms5087, doi101038s4158601805637, doi101071bt12225, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x"
}

Las propiedades hidráulicas controlan las respuestas de las plantas al clima y probablemente estén bajo fuerte presión selectiva, pero su historia macroevolutiva permanece poco caracterizada. Para llenar este vacío, compilamos un conjunto de datos global de características hidráulicas que describen la conductividad del xilema (K s), la resistencia del xilema al embolismo (P50), la asignación de madera de savia relativa al área foliar (Hv) y la exposición a la sequía (ψ min), y la coincidimos con filogenias globales de plantas con semillas. Individualmente, estas características presentan niveles medios a altos de señal filogenética, parcialmente relacionados con presiones selectivas ambientales que moldean la evolución de las líneas. La mayoría de estas características evolucionaron de manera independiente entre sí, siendo co-seleccionadas por las mismas presiones ambientales. Sin embargo, las correlaciones evolutivas entre P50 y ψ min y entre K s y Hv muestran signos de una integración evolutiva más profunda debido a restricciones funcionales, de desarrollo o genéticas, conformando módulos evolutivos. No detectamos integración evolutiva entre la conductividad y la resistencia al embolismo, rechazando un compromiso inamovible para este par de características.

@article{doi101111ele13584,
    author = "Sanchez‐Martinez, Pablo y Martínez‐Vilalta, Jordi y Dexter, Kyle G. y Segovia, Ricardo A. y Mencuccini, Maurizio",
    title = "Adaptación y evolución coordinada de las características hidráulicas de las plantas",
    year = "2020",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Las propiedades hidráulicas controlan las respuestas de las plantas al clima y probablemente estén bajo fuerte presión selectiva, pero su historia macroevolutiva permanece poco caracterizada. Para llenar este vacío, compilamos un conjunto de datos global de características hidráulicas que describen la conductividad del xilema (K s), la resistencia del xilema al embolismo (P50), la asignación de madera de savia relativa al área foliar (Hv) y la exposición a la sequía (ψ min), y la coincidimos con filogenias globales de plantas con semillas. Individualmente, estas características presentan niveles medios a altos de señal filogenética, parcialmente relacionados con presiones selectivas ambientales que moldean la evolución de las líneas. La mayoría de estas características evolucionaron de manera independiente entre sí, siendo co-seleccionadas por las mismas presiones ambientales. Sin embargo, las correlaciones evolutivas entre P50 y ψ min y entre K s y Hv muestran signos de una integración evolutiva más profunda debido a restricciones funcionales, de desarrollo o genéticas, conformando módulos evolutivos. No detectamos integración evolutiva entre la conductividad y la resistencia al embolismo, rechazando un compromiso inamovible para este par de características.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.13584",
    doi = "10.1111/ele.13584",
    openalex = "W3073875730",
    references = "doi101098rspb20181012"
}

@incollection{crossref2021angiosperms,
    title = "ANGIOSPERMS:",
    year = "2021",
    booktitle = "The Ecology of the Trees, Shrubs, and Woody Vines of Northern Florida",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
    doi = "10.2307/j.ctv1t1kg94.10",
    pages = "57-360"
}

La biodiversidad actual tiene la propiedad inusual de que el 85% de las especies de plantas y animales viven en tierra en lugar de en el mar, y la mitad de estas viven en selvas tropicales. Un impulso explosivo a la diversidad terrestre ocurrió desde hace aproximadamente 100-50 millones de años, el Cretácico Tardío y el Paleógeno Temprano. Durante este intervalo, el sistema Tierra-vida en tierra se reinició, y la biosfera se expandió a un nuevo nivel de productividad, mejorando la capacidad y la diversidad de especies de los ambientes terrestres. Este impulso en la biodiversidad terrestre coincidió con innovaciones en la biología de las plantas con flores y la ecología evolutiva, incluyendo sus flores y eficiencias en la reproducción; coevolución con animales, especialmente polinizadores y herbívoros; capacidades fotosintéticas; adaptabilidad; y capacidad para modificar hábitats. El ascenso de las angiospermas desencadenó una revolución macroecológica en tierra y impulsó la biodiversidad moderna en un cambio secular y prolongado hacia nuevos niveles altos, una serie de procesos que aquí llamamos la Revolución Terrestre de las Angiospermas.

@article{doi101111nph17822,
    author = "Benton, Michael J. y Wilf, Peter y Sauquet, Hervé",
    title = "La Revolución Terrestre de las Angiospermas y los orígenes de la biodiversidad moderna",
    year = "2021",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "La biodiversidad actual tiene la propiedad inusual de que el 85% de las especies de plantas y animales viven en tierra en lugar de en el mar, y la mitad de estas viven en selvas tropicales. Un impulso explosivo a la diversidad terrestre ocurrió desde hace aproximadamente 100-50 millones de años, el Cretácico Tardío y el Paleógeno Temprano. Durante este intervalo, el sistema Tierra-vida en tierra se reinició, y la biosfera se expandió a un nuevo nivel de productividad, mejorando la capacidad y la diversidad de especies de los ambientes terrestres. Este impulso en la biodiversidad terrestre coincidió con innovaciones en la biología de las plantas con flores y la ecología evolutiva, incluyendo sus flores y eficiencias en la reproducción; coevolución con animales, especialmente polinizadores y herbívoros; capacidades fotosintéticas; adaptabilidad; y capacidad para modificar hábitats. El ascenso de las angiospermas desencadenó una revolución macroecológica en tierra y impulsó la biodiversidad moderna en un cambio secular y prolongado hacia nuevos niveles altos, una serie de procesos que aquí llamamos la Revolución Terrestre de las Angiospermas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.17822",
    doi = "10.1111/nph.17822",
    openalex = "W3209026994",
    references = "doi101016jcub201508003, doi101016jcub201804062, doi101016jgloplacha201804004, doi101016jtree201905008, doi101038nature06277, doi101038ncomms16047, doi101038s4158601916932, doi101073pnas1112694108, doi101073pnas1813206116, doi101073pnas1907847116, doi101093icbicq078, doi101093molbevmsx324, doi101093sysbiosyaa034, doi101098rspb20080715, doi101111syen12132, doi1023072399030, doi103390ijms140510242, doi1034172009143, doi107717peerj1719"
}

Una versión anterior de V.PhyloMaker ha sido ampliamente utilizada para generar árboles filogenéticos de plantas vasculares para estudios botánicos, biogeográficos y ecológicos. Aquí, actualizamos y ampliamos este paquete, que ahora se llama 'V.PhyloMaker2'. Con V.PhyloMaker2, se puede generar un árbol filogenético para plantas vasculares basado en uno de tres diferentes sistemas de nomenclatura botánica. V.PhyloMaker2 puede generar filogenias para listas de especies muy grandes (la lista de especies más grande que probamos incluía 365.198 especies). V.PhyloMaker2 genera filogenias a una velocidad rápida. Proporcionamos un ejemplo (incluyendo una lista de especies de muestra y un script de R para ejecutarlo) en este artículo para mostrar cómo usar V.PhyloMaker2 para generar árboles filogenéticos.

@article{doi101016jpld202205005,
    author = "Jin, Yi y Qian, Hong",
    title = "V.PhyloMaker2: Un paquete R actualizado y ampliado que puede generar filogenias muy grandes para plantas vasculares",
    year = "2022",
    journal = "Plant Diversity",
    abstract = "Una versión anterior de V.PhyloMaker ha sido ampliamente utilizada para generar árboles filogenéticos de plantas vasculares para estudios botánicos, biogeográficos y ecológicos. Aquí, actualizamos y ampliamos este paquete, que ahora se llama 'V.PhyloMaker2'. Con V.PhyloMaker2, se puede generar un árbol filogenético para plantas vasculares basado en uno de tres diferentes sistemas de nomenclatura botánica. V.PhyloMaker2 puede generar filogenias para listas de especies muy grandes (la lista de especies más grande que probamos incluía 365.198 especies). V.PhyloMaker2 genera filogenias a una velocidad rápida. Proporcionamos un ejemplo (incluyendo una lista de especies de muestra y un script de R para ejecutarlo) en este artículo para mostrar cómo usar V.PhyloMaker2 para generar árboles filogenéticos.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.pld.2022.05.005",
    doi = "10.1016/j.pld.2022.05.005",
    openalex = "W4281979425",
    references = "doi101038nature12872"
}

Las cícadas representan uno de los linajes más antiguos de plantas con semillas vivas. Identificar características genómicas compartidas únicamente por las cícadas y otras plantas con semillas existentes, pero no por las plantas no productoras de semillas, podría arrojar luz sobre el origen de las innovaciones clave, así como sobre la temprana diversificación de las plantas con semillas. Aquí, reportamos el genoma de referencia de 10,5 Gb de Cycas panzhihuaensis, complementado con los transcriptomas de 339 especies de cícadas. Los análisis filogenómicos nucleares y de plastidios sugieren fuertemente que las cícadas y el Ginkgo forman un clado hermano de todos los demás gimnospermas vivientes, en contraste con los datos mitocondriales, que colocan a las cícadas solas en esta posición. Encontramos evidencia de una duplicación antigua del genoma completo en el ancestro común de las gimnospermas existentes. El genoma de Cycas contiene cuatro homólogos de la familia de genes fitD que probablemente fueron adquiridos mediante transferencia horizontal de genes de hongos, y estos genes confieren resistencia a herbívoros en las cícadas. La región específica de macho del cromosoma Y de C. panzhihuaensis contiene un factor de transcripción MADS-box expresado exclusivamente en los conos masculinos que es similar a un sistema reportado en Ginkgo, sugiriendo que un mecanismo de determinación del sexo controlado por genes MADS-box pudo haber originado en el ancestro común de las cícadas y el Ginkgo. El genoma de C. panzhihuaensis proporciona un nuevo recurso importante de amplia utilidad para los biólogos.

@article{doi101038s41477022011297,
    author = "Liu, Yang y Wang, Sibo y Li, Linzhou y Yang, Ting y Dong, Shanshan y Wei, Tong y Wu, Shengdan y Liu, Yongbo y Gong, Yiqing y Feng, Xiuyan y Ma, Jianchao y Chang, Guanxiao y Huang, Jinling y Yang, Yong y Wang, Hongli y Liu, Min y Xu, Yan y Liang, Hongping y Jin, Yu y Cai, Yuqing y Zhang, Zhaowu y Fan, Yannan y Mu, Weixue y Sahu, Sunil Kumar y Liu, Shuchun y Lang, Xiaoan y Yang, Leilei y Li, Na y Habib, Sadaf y Yang, Yongqiong y Lindström, Anders J. y Liang, Pei y Goffinet, Bernard y Zaman, Sumaira y Wegrzyn, Jill y Li, Dexiang y Liu, Jian y Cui, Jie y Sonnenschein, Eva C. y Wang, Xiaobo y Ruan, Jue y Xue, Jia‐Yu y Shao, Zhu‐Qing y Song, Chi y Fan, Guangyi y Li, Zhen y Zhang, Liangsheng y Liu, Jianquan y Liu, Zhong‐Jian y Jiao, Yuannian y Wang, Xiaoquan y Wu, Hong y Wang, Ertao y Lisby, Michael y Yang, Huanming y Wang, Jian y Liu, Xin y Xu, Xun y Li, Nan y Soltis, Pamela S. y de Peer, Yves Van y Soltis, Douglas E. y Gong, Xun y Liu, Huan y Zhang, Shouzhou",
    title = "El genoma de Cycas y la evolución temprana de las plantas con semillas",
    year = "2022",
    journal = "Nature Plants",
    abstract = "Las cícadas representan uno de los linajes más antiguos de plantas con semillas vivas. Identificar características genómicas compartidas únicamente por las cícadas y otras plantas con semillas existentes, pero no por las plantas no productoras de semillas, podría arrojar luz sobre el origen de las innovaciones clave, así como sobre la temprana diversificación de las plantas con semillas. Aquí, reportamos el genoma de referencia de 10,5 Gb de Cycas panzhihuaensis, complementado con los transcriptomas de 339 especies de cícadas. Los análisis filogenómicos nucleares y de plastidios sugieren fuertemente que las cícadas y el Ginkgo forman un clado hermano de todos los demás gimnospermas vivientes, en contraste con los datos mitocondriales, que colocan a las cícadas solas en esta posición. Encontramos evidencia de una duplicación antigua del genoma completo en el ancestro común de las gimnospermas existentes. El genoma de Cycas contiene cuatro homólogos de la familia de genes fitD que probablemente fueron adquiridos mediante transferencia horizontal de genes de hongos, y estos genes confieren resistencia a herbívoros en las cícadas. La región específica de macho del cromosoma Y de C. panzhihuaensis contiene un factor de transcripción MADS-box expresado exclusivamente en los conos masculinos que es similar a un sistema reportado en Ginkgo, sugiriendo que un mecanismo de determinación del sexo controlado por genes MADS-box pudo haber originado en el ancestro común de las cícadas y el Ginkgo. El genoma de C. panzhihuaensis proporciona un nuevo recurso importante de amplia utilidad para los biólogos.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41477-022-01129-7",
    doi = "10.1038/s41477-022-01129-7",
    openalex = "W4223990635",
    references = "doi101098rspb20181012"
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@misc{crossrefNoneangiosperms,
    title = "Angiosperms",
    year = "None",
    booktitle = "AccessScience",
    url = "https://doi.org/10.1036/1097-8542.yb010070",
    doi = "10.1036/1097-8542.yb010070"
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