Cladística

@article{macfadden1976cladistic,
    author = "MacFadden, Bruce J.",
    title = "Análisis cladístico de équidos primitivos, con notas sobre otros perisodáctilos",
    year = "1976",
    journal = "Systematic Zoology",
    url = "https://doi.org/10.2307/2412774",
    doi = "10.2307/2412774",
    number = "1",
    openalex = "W2124811114",
    pages = "1",
    volume = "25",
    references = "doi101086394242, doi101111j109636421952tb00784x, doi1023072405671, doi1023072412606, doi1023073037993, doi105281zenodo18028696, doi105962bhltitle156460, doi107312simp92414, openalexw1988829823, openalexw3135630760"
}

@misc{macfadden1976cladistic2,
    author = "MacFadden, B. J",
    title = "Análisis cladístico de équidos primitivos, con notas sobre otros perisodáctilos",
    year = "1976",
    howpublished = "Systematic Zoology, v. 25, p. 1-15",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {MacFadden, B. J., 1976, Análisis cladístico de équidos primitivos, con notas sobre otros perisodáctilos: Systematic Zoology, v. 25, p. 1-15.}"
}

@misc{gould1977the1,
    author = "Gould, S. J. y Raup, D. M. y Sepkoski, J. J. y Schopf, T. J. M. y Simberloff, D. S",
    title = "La forma de la evolución",
    year = "1977",
    howpublished = "Una comparación de clados reales y aleatorios: Paleobiología, v. 3, p. 23-40",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gould, S. J., Raup, D. M., Sepkoski, J. J., Schopf, T. J. M., y Simberloff, D. S., 1977, La forma de la evolución: Una comparación de clados reales y aleatorios: Paleobiología, v. 3, p. 23-40.}"
}

@article{doi1023072413039,
    author = "Brooks, Daniel R. y Nelson, Gareth y Platnick, Norman I.",
    title = "Sistemática y Biogeografía: Cladística y Vicarianza.",
    year = "1982",
    journal = "Zoología Sistemática",
    url = "https://doi.org/10.2307/2413039",
    doi = "10.2307/2413039",
    openalex = "W2321544600"
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@article{benton1990the,
    author = "Benton, Michael J.",
    title = "La evolución de los perisodáctilos",
    year = "1990",
    journal = "Tendencias en Ecología \& Evolución",
    url = "https://doi.org/10.1016/0169-5347(90)90187-i",
    doi = "10.1016/0169-5347(90)90187-i",
    number = "10",
    openalex = "W2094377919",
    pages = "347",
    volume = "5",
    references = "doi1010160169534788900468, doi1010160169534788901048, doi101111j109600311986tb00463x"
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@article{crossref1990the,
    title = "La evolución de los perisodáctilos",
    year = "1990",
    journal = "Choice Reviews Online",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.27-5770",
    doi = "10.5860/choice.27-5770",
    number = "10",
    openalex = "W116621164",
    pages = "27-5770-27-5770",
    volume = "27"
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@incollection{crossref1990transformed,
    title = "Cladística transformada y evolución",
    year = "1990",
    booktitle = "Cladística transformada, taxonomía y evolución",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511525759.008",
    doi = "10.1017/cbo9780511525759.008",
    openalex = "W2490755409",
    pages = "160-184"
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Resumen— Se revisa y apoya la equivalencia lógica entre las nociones de homología y sinapomorfía. La llamada homología transformacional encarna dos componentes lógicos distintos, uno relacionado con comparaciones entre organismos diferentes y el otro restringido a comparaciones dentro del mismo organismo. El primero es esencialmente de naturaleza jerárquica, por lo que es de hecho una forma menos obvia de homología taxonómica. El segundo es lógicamente equivalente a la llamada homología serial en un sentido amplio (incluyendo homonimia, homología masiva o homología iterativa). De las tres pruebas de homología propuestas hasta la fecha (similitud, conjunción y congruencia), solo la congruencia sirve como prueba en el sentido estricto. La similitud se sitúa en un nivel básico en las proposiciones de homología, siendo la fuente de la conjetura de homología en primer lugar. La conjunción es sin duda un indicador de no-homología, pero no es específica sobre la comparación por pares donde está presente la no-homología, y depende de un esquema específico de relación para refutar una hipótesis de homología. La prueba de congruencia ha sido vista previamente como una aplicación del análisis de compatibilidad. Sin embargo, la congruencia se ve más apropiadamente como una expresión del análisis de parsimonia estricta. Se propone una solución teórica general para determinar la evolución de caracteres con distribuciones ambiguas, basada en la noción de maximización de proposiciones de homología. Según esa noción, las distribuciones ambiguas de estados de caracteres deberían resolverse mediante una optimización que maximice las reversas en relación con los paralelismos. Las nociones de homología en morfología y biología molecular son esencialmente las mismas. La tendencia actual de adoptar terminologías diferentes para las dos fuentes de datos debería evitarse, para no oscurecer la uniformidad fundamental del concepto de homología en la biología comparada. "Una jerarquía similar se encuentra tanto en 'estructuras' como en 'funciones'. En última instancia, la estructura (es decir, el orden de las partes) y la función (orden de los procesos) pueden ser la misma cosa [...]." L. von Bertalanffy "[...] es el hecho de que ciertos criterios nos permiten emparejar consistentemente partes de las cosas lo que sugiere que mecanismos de cierto tipo deben haber estado involucrados en su origen." N. Jardine y C. Jardine

@article{doi101111j109600311991tb00045x,
    author = "de Pinna, Mário C. C.",
    title = "CONCEPTOS Y PRUEBAS DE HOMOLOGÍA EN EL PARADIGMA CLADÍSTICO",
    year = "1991",
    journal = "Cladistics",
    abstract = "Resumen— Se revisa y apoya la equivalencia lógica entre las nociones de homología y sinapomorfía. La llamada homología transformacional encarna dos componentes lógicos distintos, uno relacionado con comparaciones entre organismos diferentes y el otro restringido a comparaciones dentro del mismo organismo. El primero es esencialmente de naturaleza jerárquica, por lo que es de hecho una forma menos obvia de homología taxonómica. El segundo es lógicamente equivalente a la llamada homología serial en un sentido amplio (incluyendo homonimia, homología masiva o homología iterativa). De las tres pruebas de homología propuestas hasta la fecha (similitud, conjunción y congruencia), solo la congruencia sirve como prueba en el sentido estricto. La similitud se sitúa en un nivel básico en las proposiciones de homología, siendo la fuente de la conjetura de homología en primer lugar. La conjunción es sin duda un indicador de no-homología, pero no es específica sobre la comparación por pares donde está presente la no-homología, y depende de un esquema específico de relación para refutar una hipótesis de homología. La prueba de congruencia ha sido vista previamente como una aplicación del análisis de compatibilidad. Sin embargo, la congruencia se ve más apropiadamente como una expresión del análisis de parsimonia estricta. Se propone una solución teórica general para determinar la evolución de caracteres con distribuciones ambiguas, basada en la noción de maximización de proposiciones de homología. Según esa noción, las distribuciones ambiguas de estados de caracteres deberían resolverse mediante una optimización que maximice las reversas en relación con los paralelismos. Las nociones de homología en morfología y biología molecular son esencialmente las mismas. La tendencia actual de adoptar terminologías diferentes para las dos fuentes de datos debería evitarse, para no oscurecer la uniformidad fundamental del concepto de homología en la biología comparada. "Una jerarquía similar se encuentra tanto en 'estructuras' como en 'funciones'. En última instancia, la estructura (es decir, el orden de las partes) y la función (orden de los procesos) pueden ser la misma cosa [...]." L. von Bertalanffy "[...] es el hecho de que ciertos criterios nos permiten emparejar consistentemente partes de las cosas lo que sugiere que mecanismos de cierto tipo deben haber estado involucrados en su origen." N. Jardine y C. Jardine",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.1991.tb00045.x",
    doi = "10.1111/j.1096-0031.1991.tb00045.x",
    openalex = "W2142398288",
    references = "doi101007bf02603120, doi101093sysbio19183, doi101093sysbio242233, doi101126science7280687, doi101146annureven10010165000525, doi1023072411550, doi1023072412028, doi1023072412448, doi1023072413454, doi1023072806339, doi1023072992444, doi107312crac92306005, openalexw1988829823, openalexw3184837389"
}

Anteriormente desarrollamos un enfoque cladístico para identificar subconjuntos de haplotipos definidos por mapeo de endonucleasas de restricción o secuenciación de ADN que están asociados con desviaciones fenotípicas significativas. Nuestro enfoque se limitaba a segmentos de ADN en los que ocurre poca recombinación. En tales casos, se puede construir un cladograma a partir de los datos del sitio de restricción o de la secuencia que represente los pasos evolutivos que interrelacionan los haplotipos observados. El cladograma se utiliza para definir un diseño estadístico anidado para identificar los pasos mutacionales asociados con desviaciones fenotípicas significativas. La suposición central detrás de esta estrategia es que cualquier mutación no detectada que cause un efecto fenotípico está incrustada en la misma historia evolutiva que representa el cladograma. El poder de este enfoque depende de la confianza que uno tenga en el cladograma particular utilizado para extraer inferencias. En este artículo, presentamos una estrategia para estimar el conjunto de cladogramas que son consistentes con una muestra particular de datos de sitios de restricción o secuencias de nucleótidos e incluye la posibilidad de recombinación. Primero evaluamos los límites de la parsimonia en la construcción de cladogramas. Una vez determinados estos límites, construimos el conjunto de cladogramas parsimoniosos y no parsimoniosos que es consistente con estos límites. Nuestro procedimiento de estimación también identifica haplotipos que son candidatos para ser productos de recombinación. Si la recombinación es extensa, nuestro algoritmo subdivide la región de ADN en dos o más subsecciones, cada una con poca o ninguna recombinación interna. Aplicamos este procedimiento de estimación a tres conjuntos de datos para ilustrar grados variables de ambigüedad del cladograma y recombinación.

@article{doi101093genetics1322619,
    author = "Templeton, Alan R. y Crandall, Keith A. y Sing, Charles F.",
    title = "Análisis cladístico de asociaciones fenotípicas con haplotipos inferidos a partir de mapeo de endonucleasas de restricción y datos de secuencias de ADN. III. Estimación de cladogramas.",
    year = "1992",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Anteriormente desarrollamos un enfoque cladístico para identificar subconjuntos de haplotipos definidos por mapeo de endonucleasas de restricción o secuenciación de ADN que están asociados con desviaciones fenotípicas significativas. Nuestro enfoque se limitaba a segmentos de ADN en los que ocurre poca recombinación. En tales casos, se puede construir un cladograma a partir de los datos del sitio de restricción o de la secuencia que represente los pasos evolutivos que interrelacionan los haplotipos observados. El cladograma se utiliza para definir un diseño estadístico anidado para identificar los pasos mutacionales asociados con desviaciones fenotípicas significativas. La suposición central detrás de esta estrategia es que cualquier mutación no detectada que cause un efecto fenotípico está incrustada en la misma historia evolutiva que representa el cladograma. El poder de este enfoque depende de la confianza que uno tenga en el cladograma particular utilizado para extraer inferencias. En este artículo, presentamos una estrategia para estimar el conjunto de cladogramas que son consistentes con una muestra particular de datos de sitios de restricción o secuencias de nucleótidos e incluye la posibilidad de recombinación. Primero evaluamos los límites de la parsimonia en la construcción de cladogramas. Una vez determinados estos límites, construimos el conjunto de cladogramas parsimoniosos y no parsimoniosos que es consistente con estos límites. Nuestro procedimiento de estimación también identifica haplotipos que son candidatos para ser productos de recombinación. Si la recombinación es extensa, nuestro algoritmo subdivide la región de ADN en dos o más subsecciones, cada una con poca o ninguna recombinación interna. Aplicamos este procedimiento de estimación a tres conjuntos de datos para ilustrar grados variables de ambigüedad del cladograma y recombinación.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/132.2.619",
    doi = "10.1093/genetics/132.2.619",
    openalex = "W1901627773",
    references = "doi101007bf01734101, doi101111j155856461983tb05533x, doi101146annurevge22120188002513"
}

Resumen- Los datos puntuados para análisis cladísticos pueden ser cuantitativos o cualitativos, continuos o discretos, y mostrar valores superpuestos o no superpuestos entre taxones. Cuantitativo y cualitativo son modos de expresión de los datos, mientras que continuo o discreto se refieren a las propiedades del conjunto de números que expresan los datos; ambos pares de términos han sido confundidos con superpuestos y no superpuestos. El grado de superposición de valores entre taxones a menudo se utiliza para filtrar caracteres en análisis cladísticos: si se supera una cantidad mínima de superposición o no se alcanza una cantidad mínima de disyunción, los caracteres se rechazan como "no cladísticos". Sin embargo, esto se basa en una confusión entre características de taxones y características de organismos individuales (atributos). Los caracteres cladísticos son características de taxones y comprenden distribuciones de frecuencia de valores de atributos sobre individuos de un taxón. Los caracteres cladísticos lógicamente no pueden superponerse, aunque los taxones pueden tener valores de atributos superpuestos. Por lo tanto, el rechazo a priori de caracteres que tienen valores de atributos superpuestos es insensato. Tales datos aún pueden ser rechazados de la consideración para el análisis cladístico si se puede demostrar que contienen poca señal filogenética recuperable. Pocas publicaciones han probado empíricamente esto. Un análisis de datos morfométricos superpuestos de tres series de Banksia sugiere que, al menos en estos casos, mapean la filogenia casi tan acertadamente como los datos morfológicos cualitativos más convencionales. Si bien se requieren más pruebas de este tipo, los datos morfométricos no deben ser rechazados a priori de los análisis cladísticos.

@article{doi101111j109600311993tb00226x,
    author = "Thiele, Kevin R.",
    title = "EL SANTO GRIAL DEL CARÁCTER PERFECTO: EL TRATAMIENTO CLADÍSTICO DE LOS DATOS MORFOMÉTRICOS",
    year = "1993",
    journal = "Cladistics",
    abstract = {Resumen- Los datos puntuados para análisis cladísticos pueden ser cuantitativos o cualitativos, continuos o discretos, y mostrar valores superpuestos o no superpuestos entre taxones. Cuantitativo y cualitativo son modos de expresión de los datos, mientras que continuo o discreto se refieren a las propiedades del conjunto de números que expresan los datos; ambos pares de términos han sido confundidos con superpuestos y no superpuestos. El grado de superposición de valores entre taxones a menudo se utiliza para filtrar caracteres en análisis cladísticos: si se supera una cantidad mínima de superposición o no se alcanza una cantidad mínima de disyunción, los caracteres se rechazan como "no cladísticos". Sin embargo, esto se basa en una confusión entre características de taxones y características de organismos individuales (atributos). Los caracteres cladísticos son características de taxones y comprenden distribuciones de frecuencia de valores de atributos sobre individuos de un taxón. Los caracteres cladísticos lógicamente no pueden superponerse, aunque los taxones pueden tener valores de atributos superpuestos. Por lo tanto, el rechazo a priori de caracteres que tienen valores de atributos superpuestos es insensato. Tales datos aún pueden ser rechazados de la consideración para el análisis cladístico si se puede demostrar que contienen poca señal filogenética recuperable. Pocas publicaciones han probado empíricamente esto. Un análisis de datos morfométricos superpuestos de tres series de Banksia sugiere que, al menos en estos casos, mapean la filogenia casi tan acertadamente como los datos morfológicos cualitativos más convencionales. Si bien se requieren más pruebas de este tipo, los datos morfométricos no deben ser rechazados a priori de los análisis cladísticos.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.1993.tb00226.x",
    doi = "10.1111/j.1096-0031.1993.tb00226.x",
    openalex = "W2077186234",
    references = "doi1023072412452"
}

Utilizando la técnica de la cladística, el autor y sus colaboradores han podido reconstruir la filogenia dentro de la familia Asteraceae (Compositae).

@book{openalexw2094558211,
    author = "Bremer, Kåre y Anderberg, Arne A.",
    title = "Asteraceae: Cladística y Clasificación",
    year = "1994",
    abstract = "Utilizando la técnica de la cladística, el autor y sus colaboradores han podido reconstruir la filogenia dentro de la familia Asteraceae (Compositae).",
    url = "https://openalex.org/W2094558211",
    openalex = "W2094558211"
}

Una serie de análisis cladísticos evalúa el estatus y la membresía del taxón Poliquetos. La literatura disponible y una revisión de Fauchald & Rouse (1997) sobre las 80 familias aceptadas de los Poliquetos se utilizan para desarrollar caracteres y matrices de datos. Además de las familias de poliquetos, se incluyen en los análisis taxones no poliquetos, como los Equisura, Euartrópodos, Onicóforos, Pogonóforos (como Frenulata y Vestimentífera), Clitellata, Aeolosomatidae y Potamodrilidae. Todos los árboles se enraízan utilizando los Sipuncula como grupo externo. Los caracteres se basan en características (cuando están presentes) como el prostomio, peristomio, antenas, palpos, órganos nucales, parapodios, estomodeo, estructura y distribución de los órganos segmentarios, circulación y quetas. Se realizan varios análisis, involucrando diferentes formas de codificar y ponderar los caracteres, así como el número de taxones incluidos. Se proporcionan series de transformación para varios de estos análisis. Se elige uno de los análisis para proporcionar una nueva clasificación. Se encuentra que los Anélidos son monofiléticos, aunque con un apoyo débil, e incluyen los Clitellata y Poliquetos. Los Poliquetos son monofiléticos solo si se incluyen taxones como los Pogonóforos, Aeolosomatidae y Potamodrilidae, y también tienen un apoyo débil. Los Pogonóforos se reducen al rango de familia dentro de los Poliquetos y vuelven a llamarse Siboglinidae Caullery, 1914. La nueva clasificación no utiliza categorías lineanas, y los Poliquetos comprenden dos clados, los Scolecida y Palpata. Los Palpata tienen los clados Aciculata y Canalipalpata. La Aciculata contiene los Filodocida y Eunícida. La Canalipalpata tiene tres clados: los Sabélida (incluyendo los Siboglinidae), Espionida y Terebelida. La posición de varias familias requiere más investigación.

@article{doi101111j146364091997tb00412x,
    author = "Rouse, Greg W. y Fauchald, Kristian",
    title = "Cladística y poliquetos",
    year = "1997",
    journal = "Zoologica Scripta",
    abstract = "Una serie de análisis cladísticos evalúa el estatus y la membresía del taxón Poliquetos. La literatura disponible y una revisión de Fauchald \& Rouse (1997) sobre las 80 familias aceptadas de los Poliquetos se utilizan para desarrollar caracteres y matrices de datos. Además de las familias de poliquetos, se incluyen en los análisis taxones no poliquetos, como los Equisura, Euartrópodos, Onicóforos, Pogonóforos (como Frenulata y Vestimentífera), Clitellata, Aeolosomatidae y Potamodrilidae. Todos los árboles se enraízan utilizando los Sipuncula como grupo externo. Los caracteres se basan en características (cuando están presentes) como el prostomio, peristomio, antenas, palpos, órganos nucales, parapodios, estomodeo, estructura y distribución de los órganos segmentarios, circulación y quetas. Se realizan varios análisis, involucrando diferentes formas de codificar y ponderar los caracteres, así como el número de taxones incluidos. Se proporcionan series de transformación para varios de estos análisis. Se elige uno de los análisis para proporcionar una nueva clasificación. Se encuentra que los Anélidos son monofiléticos, aunque con un apoyo débil, e incluyen los Clitellata y Poliquetos. Los Poliquetos son monofiléticos solo si se incluyen taxones como los Pogonóforos, Aeolosomatidae y Potamodrilidae, y también tienen un apoyo débil. Los Pogonóforos se reducen al rango de familia dentro de los Poliquetos y vuelven a llamarse Siboglinidae Caullery, 1914. La nueva clasificación no utiliza categorías lineanas, y los Poliquetos comprenden dos clados, los Scolecida y Palpata. Los Palpata tienen los clados Aciculata y Canalipalpata. La Aciculata contiene los Filodocida y Eunícida. La Canalipalpata tiene tres clados: los Sabélida (incluyendo los Siboglinidae), Espionida y Terebelida. La posición de varias familias requiere más investigación.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1463-6409.1997.tb00412.x",
    doi = "10.1111/j.1463-6409.1997.tb00412.x",
    openalex = "W2099988673",
    references = "doi101007978140206754912413, doi1010160305197885900559, doi101093oso97801985464120010001, doi101111j109600311994tb00179x, doi101111j109600311995tb00092x, doi101111j146364091997tb00411x, doi101111j1469185x1974tb01572x, doi101111j1469185x1988tb00631x, doi101111j155856461988tb02497x, doi1023072408870, doi1023072412182, doi1023072413134, doi105860choice295104, openalexw1575297980, openalexw1809736813, openalexw659399033"
}

"La sistemática es la base de toda la biología. La cladística es un método de clasificación sistemática que busca reconstruir genealogías basadas en la ascendencia común, revelando así las relaciones filogenéticas entre los taxones. Sus aplicaciones varían desde el análisis lingüístico hasta el estudio de la conservación y la biodiversidad, y se ha convertido en un método de elección para los estudios comparativos en todos los campos de la biología." "Para todos los estudiantes interesados en las relaciones sistemáticas entre los organismos, este libro ofrece una descripción integrada y de vanguardia de las técnicas y métodos de la cladística moderna, y cómo ponerlos en práctica."--LÍNEA DEL LIBRO.

@book{openalexw634659594,
    author = "Kitching, Ian J.",
    title = "Cladística: La teoría y la práctica del análisis de parcimonia",
    year = "1998",
    abstract = {"La sistemática es la base de toda la biología. La cladística es un método de clasificación sistemática que busca reconstruir genealogías basadas en la ascendencia común, revelando así las relaciones filogenéticas entre los taxones. Sus aplicaciones varían desde el análisis lingüístico hasta el estudio de la conservación y la biodiversidad, y se ha convertido en un método de elección para los estudios comparativos en todos los campos de la biología." "Para todos los estudiantes interesados en las relaciones sistemáticas entre los organismos, este libro ofrece una descripción integrada y de vanguardia de las técnicas y métodos de la cladística moderna, y cómo ponerlos en práctica."--LÍNEA DEL LIBRO.},
    url = "https://openalex.org/W634659594",
    openalex = "W634659594"
}

A pesar de un excelente registro fósil, la filogenia de los Perissodactyla no está bien comprendida, tanto en términos de las relaciones dentro de los Perissodactyla como de la posición de los Perissodactyla entre los órdenes de mamíferos. Este artículo proporciona un análisis filogenético de una importante línea de perisodáctilos, los Tapiromorpha. Este análisis combina una muestra más completa de caracteres y taxones con métodos rigurosos de búsqueda de árboles para crear una nueva hipótesis de las relaciones tapiromorfas. La filogenia de los perisodáctilos tapiromorfos se analiza utilizando 45 caracteres del cráneo, el esqueleto postcraneal y la dentición puntuados para 29 taxones, incluidos tres grupos externos no tapiromorfos. Se construyen definiciones taxonómicas filogenéticas para taxones supragenericos. Según los resultados de este análisis, los Chalicotherioidea no pueden asignarse inequívocamente a los Tapiromorpha, ni tampoco Homogalax o Cardiolophus. Isectolophus, Tapiroidea y Rhinocerotoidea son miembros inequívocos de los Tapiromorpha. Heptodon se incluye en un Tapiroidea monofilético. Los rinocerontoides amynodontidos resultan ser el grupo hermano de los rinocerontidos, y los indricoterios no caen dentro de los Hyracodontidae. Los resultados de este estudio proporcionan argumentos adicionales de que los tapiromorfos (y los tapiromorfos putativos) pueden ser importantes para comprender la morfología ancestral de los Perissodactyla.

@article{doi101111j109600311999tb00270x,
    author = "Holbrook, Luke",
    title = "The Phylogeny and Classification of Tapiromorph Perissodactyls (Mammalia)",
    year = "1999",
    journal = "Cladistics",
    abstract = "Despite an excellent fossil record, the phylogeny of Perissodactyla is not well understood, in terms of both the relationships within Perissodactyla and the position of the Perissodactyla among the orders of mammals. This paper provides a phylogenetic analysis of one major perissodactyl lineage, the Tapiromorpha. This analysis combines a more comprehensive sampling of characters and taxa with rigorous tree‐searching methods to create a new hypothesis of tapiromorph relationships. The phylogeny of tapiromorph perissodactyls is analyzed using 45 characters of the skull, postcranial skeleton, and dentition scored for 29 taxa, including three nontapiromorph outgroups. Phylogenetic taxonomic definitions are constructed for suprageneric taxa. According to the results of this analysis, the Chalicotherioidea cannot be unequivocally assigned to the Tapiromorpha, nor can Homogalax or Cardiolophus. Isectolophus, Tapiroidea, and Rhinocerotoidea are unequivocal members of the Tapiromorpha. Heptodon is included in a monophyletic Tapiroidea. Amynodontid rhinocerotoids come out as the sister group to rhinocerotids, and indricotheres do not fall within the Hyracodontidae. The results of this study provide further arguments that tapiromorphs (and putative tapiromorphs) may be important for understanding the ancestral morphology of Perissodactyla.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.1999.tb00270.x",
    doi = "10.1111/j.1096-0031.1999.tb00270.x",
    openalex = "W4242212312",
    references = "doi10100797814684216682, doi101111j109600311993tb00234x, doi101111j109636421994tb00311x, doi101144gsljgs1848004010221, doi1023071375443, doi1023072992353, doi105281zenodo18028457, doi105281zenodo18028696, doi105860choice355657, doi105860choice392183, macfadden1976cladistic, openalexw638862129"
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@article{doi101006jasc20010681,
    author = "O’Brien, Michael J. y Darwent, John y Lyman, R. Lee",
    title = "La cladística es útil para reconstruir filogenias arqueológicas: Puntas paleoindias de los Estados Unidos sureños",
    year = "2001",
    journal = "Journal of Archaeological Science",
    url = "https://doi.org/10.1006/jasc.2001.0681",
    doi = "10.1006/jasc.2001.0681",
    openalex = "W1973175607",
    references = "doi101017s0094837300005224, doi101086200289, doi101093auk1002507, doi101146annureven10010165000525, doi101722611310, doi1023071367778, doi1023071377078, doi104324978020376680411, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle68064, openalexw1550375751, openalexw1988829823, openalexw3135630760, openalexw634659594"
}

Se ha desarrollado una nueva y considerablemente simplificada metodología para la evaluación de las adaptaciones dietéticas de taxones vivos y fósiles, que permite analizar con precisión la topografía de las cicatrices de micropulido a baja magnificación (35×) utilizando un microscopio estereoscópico estándar. Además de los números tradicionales de rayaduras y hoyos, introducimos cuatro variables cualitativas: textura de las rayaduras, rayaduras cruzadas, grandes hoyos y surcos, que proporcionan subdivisiones más finas dentro de las categorías dietéticas básicas. Se presenta e interpreta una gran base de datos comparativa de micropulido de ungulados existentes (809 individuos; 50 especies) para elucidar las dietas de los ungulados actuales. Distinguimos tres fases tróficas principales en los ungulados existentes: pastores y herbívoros tradicionales, dos fases representadas por solo unas pocas especies, y una fase transicional de pastoreo-navegación donde se incluyen la mayoría de las especies, incluidos todos los alimentadores mixtos. Existen dos tipos de alimentadores mixtos: alimentadores mixtos estacionales o regionales y alimentadores mixtos por comida. Algunas especies tienen resultados que las separan de los miembros tradicionales de su grupo trófico; es decir, navegadores, pastores y alimentadores mixtos. Los duikers son únicos al abarcar casi todo el espectro dietético. Las especies de Okapia, Tapirus, Tragulus y Moschus tienen desgaste similar al de los duikers. Los proboscidios caen en la fase transicional de pastoreo-navegación, al igual que los dos suidos estudiados. Estos últimos difieren entre sí por su grado de excavación. Los équidos fósiles arcaicos que abarcan la supuesta transición de pastoreo-navegación se compararon con los ungulados existentes. Se discernen dos agrupaciones principales: (1) Hyracotherium tiene un micropulido más similar al del duiker Cephalopus silvicultor y era un navegador que se alimentaba de frutas/semillas. (2) Mesohippus spp., M. bairdii, Mesohippus hypostylus, Meso-Miohippus (una forma transicional más grande que M. bairdii), Parahippus spp. y Merychippus insignis difieren de Hyracotherium y son más similares al ungulado existente Cervus canadensis. El grupo (2) se caracteriza por rayaduras finas que son el resultado del pastoreo de C3, una fase inicial de pastoreo en équidos que probablemente no ocurrió en hábitats abiertos. Una diferenciación más fina de las dietas del grupo (2) muestra un cambio dietético en la dirección esperada (hacia la incorporación de más pasto en la dieta) y sigue la transición evolutiva esperada desde el Eoceno hasta el Oligoceno y el Mioceno temprano. En consecuencia, estos taxones de équidos se reconstruyen aquí como alimentadores mixtos que pastorean pastos C3 de bosque. La diferenciación dietética más fina muestra una disminución progresiva en el número de rayaduras y hoyos. Mesohippus tiene los más hoyos y rayaduras, seguido por Parahippus y luego Merychippus (que tiene los menos). El taxón que incorpora más pasto en su régimen dietético en este conjunto es Merychippus. En la comparación entre Mesohippus-Parahippus y Merychippus, las diferencias en la morfología dental son importantes, pero las diferencias en el micropulido son leves.

@article{doi1012060003008220023660001aitrou20co2,
    author = "Solounias, Nikos y Semprebon, Gina M.",
    title = "Avances en la reconstrucción de la eco morfología de los ungulados con aplicación a los équidos fósiles tempranos",
    year = "2002",
    journal = "American Museum Novitates",
    abstract = "Se ha desarrollado una nueva y considerablemente simplificada metodología para la evaluación de las adaptaciones dietéticas de taxones vivos y fósiles, que permite analizar con precisión la topografía de las cicatrices de micropulido a baja magnificación (35×) utilizando un microscopio estereoscópico estándar. Además de los conteos tradicionales de rayaduras y hoyos, introducimos cuatro variables cualitativas: textura de las rayaduras, rayaduras cruzadas, hoyos grandes y surcos, que proporcionan subdivisiones más finas dentro de las categorías dietéticas básicas. Se presenta e interpreta una gran base de datos comparativa de micropulido de ungulados existentes (809 individuos; 50 especies) para elucidar las dietas de los ungulados actuales. Distinguimos tres fases tróficas principales en los ungulados existentes: pastores y herbívoros tradicionales, dos fases representadas por solo unas pocas especies, y una fase transicional de pastoreo-navegación donde se encuentran la mayoría de las especies, incluidos todos los alimentadores mixtos. Existen dos tipos de alimentadores mixtos: alimentadores mixtos estacionales o regionales y alimentadores mixtos por comida. Algunas especies tienen resultados que las separan de los miembros tradicionales de su grupo trófico; es decir, navegadores, pastores y alimentadores mixtos. Los duikers son únicos al abarcar casi todo el espectro dietético. Las especies de Okapia, Tapirus, Tragulus y Moschus tienen un desgaste similar al de los duikers. Los proboscidios caen en la fase transicional de pastoreo-navegación, al igual que los dos suidos estudiados. Estos últimos difieren entre sí por su grado de excavación. Los équidos fósiles arcaicos que abarcan la supuesta transición de pastoreo-navegación se compararon con los ungulados existentes. Se discernen dos agrupaciones principales: (1) Hyracotherium tiene un micropulido más similar al del duiker Cephalopus silvicultor y era un navegador que se alimentaba de frutas/semillas. (2) Mesohippus spp., M. bairdii, Mesohippus hypostylus, Meso-Miohippus (una forma transicional más grande que M. bairdii), Parahippus spp. y Merychippus insignis difieren de Hyracotherium y son más similares al ungulado existente Cervus canadensis. El grupo (2) se caracteriza por rayaduras finas que son el resultado del pastoreo C3, una fase inicial de pastoreo en équidos que probablemente no ocurrió en hábitats abiertos. Una diferenciación más fina de las dietas del grupo (2) muestra un cambio dietético en la dirección esperada (hacia la incorporación de más pasto en la dieta) y sigue la transición evolutiva esperada desde el Eoceno hasta el Oligoceno y el Mioceno temprano. En consecuencia, estos taxones de équidos se reconstruyen aquí como alimentadores mixtos que pastorean pastos C3 de bosque. La diferenciación dietética más fina muestra una disminución progresiva en el número de rayaduras y hoyos. Mesohippus tiene más hoyos y rayaduras, seguido por Parahippus y luego Merychippus (que tiene los menos). El taxón que incorpora más pasto en su régimen dietético en este conjunto es Merychippus. En la comparación Mesohippus-Parahippus versus Merychippus, las diferencias en la morfología dental son importantes, pero las diferencias en el micropulido son leves.",
    url = "https://doi.org/10.1206/0003-0082(2002)366<0001:aitrou>2.0.co;2",
    doi = "10.1206/0003-0082(2002)366<0001:aitrou>2.0.co;2",
    openalex = "W2169973548",
    references = "doi101007bf00378733, doi101086394242, doi101111j1469185x1982tb00370x, doi101111j1469185x1988tb00630x"
}

Resumen La adquisición independiente de dientes molares de corona alta (hipsoodontía) en varias líneas de ungulados (por ejemplo, camellos, équidos, rinocerontes) en el Mioceno temprano a medio de América del Norte se ha utilizado clásicamente como indicio de que la vegetación de sabana se extendió durante este período. Implícita en esta interpretación está la suposición no probada de que la hipsoodontía fue una respuesta evolutiva a la alimentación en hábitats abiertos, ya sea debido a un cambio en la fuente de alimento (de pastoreo a pastura) o a un mayor incorporación de arena en el aire en la dieta. Examiné la explicación adaptativa de la hipsoodontía en équidos utilizando criterios relativos al proceso y patrón de adaptaciones establecidos en la literatura de métodos comparativos. Específicamente, probé si la hipsoodontía apareció coincidente con o justo después de la expansión de hábitats abiertos dominados por pastos en las Grandes Llanuras de América del Norte. El análisis de fitolitos (opal de planta) de 99 conjuntos de fitolitos extraídos de muestras de sedimento de Montana/Idaho, Nebraska/Wyoming y Colorado se utilizó para establecer el primer registro continuo del cambio de vegetación del Eoceno medio al Mioceno tardío en las Grandes Llanuras septentrionales a centrales. Este registro se comparó con el registro fósil de équidos de la misma área en un marco filogenético. El estudio mostró que los hábitats dominados por pastos C3 se establecieron en las Grandes Llanuras centrales a principios del Arikareano tardío (≥21.9 Ma), al menos 4 Myr antes de la aparición de équidos hipsoodontes (Equinae). No obstante, la hipótesis adaptativa de la hipsoodontía en équidos no pudo ser rechazada, porque las primeras sabanas-bosques coincidieron aproximadamente con miembros del grado que constituyen los grupos externos más cercanos a Equinae ("Parahippus") que muestran dentición mesodonta. Las explicaciones para la evolución lenta de la hipsoodontía completa pueden incluir presiones selectivas débiles y cambiantes y/o inercia filogenética. Estos resultados sugieren que se debe tener cuidado al usar solo la morfología funcional para reconstruir el cambio de hábitat.

@article{doi10166600948373200632236eohiet20co2,
    author = "Strömberg, Caroline A. E.",
    title = "Evolución de la hipsoodontía en équidos: prueba de una hipótesis de adaptación",
    year = "2006",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Resumen La adquisición independiente de dientes molares de corona alta (hipsoodontía) en varias líneas de ungulados (por ejemplo, camellos, équidos, rinocerontes) en el Mioceno temprano a medio de América del Norte se ha utilizado clásicamente como indicio de que la vegetación de sabana se extendió durante este período. Implícita en esta interpretación está la suposición no probada de que la hipsoodontía fue una respuesta evolutiva a la alimentación en hábitats abiertos, ya sea debido a un cambio en la fuente de alimento (de pastoreo a pastura) o a un mayor incorporación de arena en el aire en la dieta. Examiné la explicación adaptativa de la hipsoodontía en équidos utilizando criterios relativos al proceso y patrón de adaptaciones establecidos en la literatura de métodos comparativos. Específicamente, probé si la hipsoodontía apareció coincidente con o justo después de la expansión de hábitats abiertos dominados por pastos en las Grandes Llanuras de América del Norte. El análisis de fitolitos (opal de planta) de 99 conjuntos de fitolitos extraídos de muestras de sedimento de Montana/Idaho, Nebraska/Wyoming y Colorado se utilizó para establecer el primer registro continuo del cambio de vegetación del Eoceno medio al Mioceno tardío en las Grandes Llanuras septentrionales a centrales. Este registro se comparó con el registro fósil de équidos de la misma área en un marco filogenético. El estudio mostró que los hábitats dominados por pastos C3 se establecieron en las Grandes Llanuras centrales a principios del Arikareano tardío (≥21.9 Ma), al menos 4 Myr antes de la aparición de équidos hipsoodontes (Equinae). No obstante, la hipótesis adaptativa de la hipsoodontía en équidos no pudo ser rechazada, porque las primeras sabanas-bosques coincidieron aproximadamente con miembros del grado que constituyen los grupos externos más cercanos a Equinae ("Parahippus") que muestran dentición mesodonta. Las explicaciones para la evolución lenta de la hipsoodontía completa pueden incluir presiones selectivas débiles y cambiantes y/o inercia filogenética. Estos resultados sugieren que se debe tener cuidado al usar solo la morfología funcional para reconstruir el cambio de hábitat.",
    url = "https://doi.org/10.1666/0094-8373(2006)32[236:eohiet]2.0.co;2",
    doi = "10.1666/0094-8373(2006)32[236:eohiet]2.0.co;2",
    openalex = "W2176339957",
    references = "crossref1990the, doi10100703064746897, doi101017s0094837300004310, doi101017s009483730001157x, doi101086394242, doi101093icb232347, doi101111j155856461997tb01457x, doi101146annurevecolsys311367, doi1015159781400820108, doi1023072576242, doi104159harvard9780674865327, doi105860choice295104, doi105860choice396411, macfadden1976cladistic"
}

@article{andersen2009some,
    author = "Andersen, N. Møller",
    title = "Algunos principios y métodos de análisis cladístico con notas sobre el uso de la cladística en la clasificación y la biogeografía",
    year = "2009",
    journal = "Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1439-0469.1978.tb00679.x",
    doi = "10.1111/j.1439-0469.1978.tb00679.x",
    number = "4",
    openalex = "W2152249538",
    pages = "242-255",
    volume = "16",
    references = "doi101093sysbio20163, doi101111j155856461965tb01722x, doi101146annureven10010165000525, doi1023071793007, doi1023072411550, doi1023072412182, doi1023072412452, doi1023073151168, doi107312simp93764"
}

Resumen Ambos tipos de eventos evolutivos, la división y la anagénesis, no pueden combinarse dentro de una sola clasificación. Solo una clasificación cladística es objetiva y comprobable. Una clasificación evolutiva permanece subjetiva y ambigua, pero a pesar de esto contiene mucha información valiosa. Por lo tanto, ambos tipos de clasificación deberían superponerse. Zusammenfassung Kladistische oder evolutionäre Klassifikation - eine endlose Debatte? In der immer mehr mit philosophischen Argumenten geführten Debatte über kladistische oder evo-lutionäre Klassifikation in "Systematic Zoology" wird immer wieder gefordert, daß eine Klassifikation beide Evolutionsereignisse, Aufspaltung und Anagenese, widerspiegeln sollte. Es wird gezeigt, daß das unmóglich ist und daß nur eine kladistische Klassifikation objektiv und falsifizierbar ist, daß aber eine notwendigerweise mehr oder wenier subjektive evolutionäre Klassifikation auch so viel Information enthält, daß man beide Klassifikationen nebeneinanderstellen sollte.

@article{doi101111j143904691979tb00714x,
    author = "Weygoldt, Peter",
    title = "Cladistic versus phenetic classification - an endless debate?",
    year = "2009",
    journal = "Journal of Zoological Systematics \& Evolutionary Research",
    abstract = "Resumen Ambos tipos de eventos evolutivos, la división y la anagénesis, no pueden combinarse dentro de una sola clasificación. Solo una clasificación cladística es objetiva y comprobable. Una clasificación evolutiva permanece subjetiva y ambigua, pero a pesar de esto contiene mucha información valiosa. Por lo tanto, ambos tipos de clasificación deberían superponerse. Zusammenfassung Kladistische oder evolutionäre Klassifikation - eine endlose Debatte? In der immer mehr mit philosophischen Argumenten geführten Debatte über kladistische oder evo-lutionäre Klassifikation in "Systematic Zoology" wird immer wieder gefordert, daß eine Klassifikation beide Evolutionsereignisse, Aufspaltung und Anagenese, widerspiegeln sollte. Es wird gezeigt, daß das unmóglich ist und daß nur eine kladistische Klassifikation objektiv und falsifizierbar ist, daß aber eine notwendigerweise mehr oder wenier subjektive evolutionäre Klassifikation auch so viel Information enthält, daß man beide Klassifikationen nebeneinanderstellen sollte.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1439-0469.1979.tb00714.x",
    doi = "10.1111/j.1439-0469.1979.tb00714.x",
    openalex = "W1971833370",
    references = "andersen2009some, doi101146annureven10010165000525, doi1023072412606, doi1023072412883, doi1023072412889, doi1023072412890, doi1023072412891"
}

...ción en el esmalte dental de mamíferos perisodáctilos. Acta Palaeontologica Polonica 56 (1): 11–32. Se observaron cuatro configuraciones diferentes de bandas Hunter-Schreger (HSB) en los dientes de perisodáctilos fósiles y actuales. Esta variabilidad supera la observada en Artiodáctilos o Proboscídeos. Las cuatro configuraciones de HSB representan dos vías evolutivas diferentes. Las HSB transversales encontradas en muchos taxones mamíferos fuera de los Perisodáctilos representan la configuración de HSB más primitiva. Ocurre en varias familias perisodáctilas primitivas y se conserva en Palaeotheriidae y Equidae actuales. Las HSB curvadas evolucionaron a partir de las HSB transversales y ocurren en Tapiridae, Helaletidae y Lophiodontidae, así como en Ancylopoda y Titanotheriomorpha. Esto probablemente indica una evolución independiente de las HSB curvadas en dos o más linajes, pero el número de casos de paralelismo de esta configuración se oscurece por la incertidumbre en las relaciones entre estos taxones y por la falta de datos para algunos taxones basales importantes. Una segunda vía evolutiva conduce desde las HSB transversales a través de las HSB compuestas hasta las HSB verticales. Las HSB compuestas se detectaron en Hyrachyidae, Deperetellidae y el rinocerontido primitivo Uintaceras. La configuración de HSB vertical caracteriza la dentición molar de otros Rhinocerotidae, Hyracodontidae, Indricotheriidae y Amynodontidae. A menudo, los incisivos de los rinocerontidos conservan rastros de HSB compuestas. Por lo tanto, la configuración de HSB refleja en cierto grado las relaciones filogenéticas. El valor selectivo de las configuraciones de HSB modificadas se interpreta funcionalmente como un mecanismo para reducir la abrasión durante la masticación, asumiendo que la intersección perpendicular de los prismas con las superficies de molienda reales resiste mejor el desgaste que los prismas que corren paralelos a la superficie oclusal.

@article{doi104202app20100021,
    author = "von Koenigswald, Wighart y Holbrook, Luke y Rose, Kenneth D.",
    title = "Diversidad y evolución de la configuración de bandas Hunter-Schreger en el esmalte dental de mamíferos perisodáctilos",
    year = "2010",
    journal = "Acta Palaeontologica Polonica",
    abstract = "...ción en el esmalte dental de mamíferos perisodáctilos. Acta Palaeontologica Polonica 56 (1): 11–32. Se observaron cuatro configuraciones diferentes de bandas Hunter-Schreger (HSB) en los dientes de perisodáctilos fósiles y actuales. Esta variabilidad supera la observada en Artiodáctilos o Proboscídeos. Las cuatro configuraciones de HSB representan dos vías evolutivas diferentes. Las HSB transversales encontradas en muchos taxones mamíferos fuera de los Perisodáctilos representan la configuración de HSB más primitiva. Ocurre en varias familias perisodáctilas primitivas y se conserva en Palaeotheriidae y Equidae actuales. Las HSB curvadas evolucionaron a partir de las HSB transversales y ocurren en Tapiridae, Helaletidae y Lophiodontidae, así como en Ancylopoda y Titanotheriomorpha. Esto probablemente indica una evolución independiente de las HSB curvadas en dos o más linajes, pero el número de casos de paralelismo de esta configuración se oscurece por la incertidumbre en las relaciones entre estos taxones y por la falta de datos para algunos taxones basales importantes. Una segunda vía evolutiva conduce desde las HSB transversales a través de las HSB compuestas hasta las HSB verticales. Las HSB compuestas se detectaron en Hyrachyidae, Deperetellidae y el rinocerontido primitivo Uintaceras. La configuración de HSB vertical caracteriza la dentición molar de otros Rhinocerotidae, Hyracodontidae, Indricotheriidae y Amynodontidae. A menudo, los incisivos de los rinocerontidos conservan rastros de HSB compuestas. Por lo tanto, la configuración de HSB refleja en cierto grado las relaciones filogenéticas. El valor selectivo de las configuraciones de HSB modificadas se interpreta funcionalmente como un mecanismo para reducir la abrasión durante la masticación, asumiendo que la intersección perpendicular de los prismas con las superficies de molienda reales resiste mejor el desgaste que los prismas que corren paralelos a la superficie oclusal.",
    url = "https://doi.org/10.4202/app.2010.0021",
    doi = "10.4202/app.2010.0021",
    openalex = "W2071964024",
    references = "doi101111j109600311999tb00270x"
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Resumen 1. Aquí presento un nuevo paquete multifuncional de filogenética, phytools, para el entorno de computación estadística R. 2. El enfoque del paquete está en los métodos para la biología comparativa filogenética; sin embargo, también incluye herramientas para la inferencia de árboles, entrada/salida de filogenias, gráficos, manipulación y varias otras tareas. 3. Describo y tabulo los principales métodos implementados en phytools, y además proporciono una demostración de su uso en forma de dos ejemplos ilustrativos. 4. Finalmente, concluyo describiendo brevemente un blog activo que utilizo para documentar los desarrollos presentes y futuros para phytools. También señalo otros recursos web para la filogenética en el entorno computacional R.

@article{doi101111j2041210x201100169x,
    author = "Revell, Liam J.",
    title = "phytools: un paquete de R para biología comparativa filogenética (y otras cosas)",
    year = "2011",
    journal = "Métodos en Ecología y Evolución",
    abstract = "Resumen 1. Aquí presento un nuevo paquete multifuncional de filogenética, phytools, para el entorno de computación estadística R. 2. El enfoque del paquete está en los métodos para la biología comparativa filogenética; sin embargo, también incluye herramientas para la inferencia de árboles, entrada/salida de filogenias, gráficos, manipulación y varias otras tareas. 3. Describo y tabulo los principales métodos implementados en phytools, y además proporciono una demostración de su uso en forma de dos ejemplos ilustrativos. 4. Finalmente, concluyo describiendo brevemente un blog activo que utilizo para documentar los desarrollos presentes y futuros para phytools. También señalo otros recursos web para la filogenética en el entorno computacional R.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.2041-210x.2011.00169.x",
    doi = "10.1111/j.2041-210x.2011.00169.x",
    openalex = "W1605984840",
    references = "doi1010179781316276259010, doi10103844766, doi10108010635150802302427, doi101086284325, doi101086343873, doi101086383584, doi101086660020, doi101093bioinformaticsbtg412, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093oso97801985464120010001, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j15585646201001026x, doi10118614712105788, doi105860choice295104, openalexw1549853756, openalexw229097380"
}

El género Equus está ampliamente representado en el registro fósil, sin embargo, nuestra comprensión de las relaciones taxonómicas dentro de este género sigue siendo limitada. Para estimar las relaciones filogenéticas entre caballos modernos, cebras, burros y asnos, generamos el primer conjunto de datos que incluye secuencias mitocondriales completas de las siete linajes extantes dentro del género Equus. La inferencia filogenética bayesiana y de máxima verosimilitud confirma que las cebras son monofiléticas dentro del género, y las cebras de las llanuras y de Grevy forman un grupo monofilético bien soportado. Utilizando técnicas de ADN antiguo, caracterizamos además los genomas mitocondriales completos de tres linajes de équidos extintos (los caballos de patas estilizadas del Nuevo Mundo, NWSLH; el subgénero Sussemionus; y el Quagga, Equus quagga quagga). Las comparaciones con taxones extantes confirman que los NWSLH forman parte de los caballines, y que el Quagga y las cebras de las llanuras son conspecíficos. Sin embargo, las relaciones evolutivas entre los linajes no caballinos, incluido el ahora extinto subgénero Sussemionus, permanecen sin resolver, probablemente debido a una radiación extremadamente rápida dentro de este grupo. Los grupos externos vivos más cercanos (rinocerontes y tapires) se encontraron demasiado filogenéticamente distantes para calibrar relojes moleculares confiables. Se requerirán datos adicionales de secuencias de genomas mitocondriales, incluidos équidos antiguos con datación por radiocarbono, antes de volver a examinar el momento exacto de la radiación de linajes que condujo a los équidos modernos, los cuales, por ahora, se encontraron haber compartido posiblemente un ancestro común tan atrás como hace 4 millones de años (Ma).

@article{doi101371journalpone0055950,
    author = "Vilstrup, Julia T. y Seguin‐Orlando, Andaine y Stiller, Mathias y Ginolhac, Aurélien y Raghavan, Maanasa y Nielsen, Sandra C. A. y Weinstock, Jacobo y Froese, Duane y Vasiliev, Sergei K. y Ovodov, Nikolai D. y Clary, Joël y Helgen, Kristofer M. y Fleischer, Robert C. y Cooper, Alan y Shapiro, Beth y Orlando, Ludovic",
    title = "Filogenómica mitocondrial de équidos modernos y antiguos",
    year = "2013",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "El género Equus está ampliamente representado en el registro fósil, sin embargo, nuestra comprensión de las relaciones taxonómicas dentro de este género sigue siendo limitada. Para estimar las relaciones filogenéticas entre caballos modernos, cebras, burros y asnos, generamos el primer conjunto de datos que incluye secuencias mitocondriales completas de las siete linajes extantes dentro del género Equus. La inferencia filogenética bayesiana y de máxima verosimilitud confirma que las cebras son monofiléticas dentro del género, y que las cebras de las llanuras y de Grevy forman un grupo monofilético bien soportado. Utilizando técnicas de ADN antiguo, caracterizamos además los genomas mitocondriales completos de tres linajes de équidos extintos (los caballos de patas estilizadas del Nuevo Mundo, NWSLH; el subgénero Sussemionus; y el Quagga, Equus quagga quagga). Las comparaciones con taxones extantes confirman que los NWSLH forman parte de los caballines, y que el Quagga y las cebras de las llanuras son conspecíficos. Sin embargo, las relaciones evolutivas entre los linajes no caballinos, incluido el ahora extinto subgénero Sussemionus, permanecen sin resolver, probablemente debido a una radiación extremadamente rápida dentro de este grupo. Los grupos externos vivos más cercanos (rinocerontes y tapires) se encontraron demasiado filogenéticamente distantes para calibrar relojes moleculares confiables. Se requerirán datos adicionales de secuencias de genomas mitocondriales, incluidos équidos antiguos con datación por radiocarbono, antes de volver a examinar el momento exacto de la radiación de linajes que condujo a los équidos modernos, los cuales, por ahora, se encontraron haber compartido posiblemente un ancestro común tan atrás como hace 4 millones de años (Ma).",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0055950",
    doi = "10.1371/journal.pone.0055950",
    openalex = "W2003372336",
    references = "doi101093sysbio293272"
}

@incollection{crossref2014cladistics,
    title = "Cladística",
    year = "2014",
    booktitle = "Enciclopedia CIRP de Ingeniería de Producción",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-642-20617-7\_100063",
    doi = "10.1007/978-3-642-20617-7\_100063",
    openalex = "W4235739240",
    pages = "194-194"
}

Los estudios de correlaciones evolutivas comúnmente utilizan regresión filogenética (es decir, contrastes independientes y mínimos cuadrados generalizados filogenéticos) para evaluar la covariación de rasgos en un contexto filogenético. Sin embargo, aunque este enfoque es apropiado para evaluar tendencias en uno o pocos rasgos, es incapaz de evaluar patrones en datos altamente multivariados, ya que el gran número de variables en relación con el tamaño de la muestra impide el cálculo de estadísticas de prueba paramétricas. Esto plantea limitaciones serias para los biólogos comparativos, quienes deben o bien simplificar cómo cuantifican los rasgos fenotípicos, o bien alterar las hipótesis biológicas que desean examinar. En este artículo, propongo un nuevo procedimiento estadístico para realizar modelos de ANOVA y regresión en un contexto filogenético que pueda acomodar conjuntos de datos de alta dimensión. El enfoque se deriva de la equivalencia estadística entre métodos paramétricos que utilizan matrices de covarianza y métodos basados en matrices de distancia. Mediante simulaciones bajo movimiento browniano, demuestro que el método muestra tasas de error Tipo I apropiadas y potencia estadística, mientras que los procedimientos paramétricos estándar tienen una potencia decreciente a medida que aumenta la dimensionalidad de los datos. Por lo tanto, el nuevo procedimiento proporciona un medio útil para evaluar la covariación de rasgos a través de un conjunto de taxones relacionados por una filogenia, permitiendo a los biólogos de la macroevolución probar hipótesis de adaptación y cambio fenotípico en conjuntos de datos de alta dimensión.

@article{doi101111evo12463,
    author = "Adams, Dean C.",
    title = "UN MÉTODO PARA EVALUAR MODELOS DE MÍNIMOS CUADRADOS FILogenÉTICOS PARA FORMA Y OTROS DATOS MULTIVARIADOS DE ALTA DIMENSIÓN",
    year = "2014",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Los estudios de correlaciones evolutivas comúnmente utilizan regresión filogenética (es decir, contrastes independientes y mínimos cuadrados generalizados filogenéticos) para evaluar la covariación de rasgos en un contexto filogenético. Sin embargo, aunque este enfoque es apropiado para evaluar tendencias en uno o pocos rasgos, es incapaz de evaluar patrones en datos altamente multivariados, ya que el gran número de variables en relación con el tamaño de la muestra impide el cálculo de estadísticas de prueba paramétricas. Esto plantea limitaciones serias para los biólogos comparativos, quienes deben o bien simplificar cómo cuantifican los rasgos fenotípicos, o bien alterar las hipótesis biológicas que desean examinar. En este artículo, propongo un nuevo procedimiento estadístico para realizar modelos de ANOVA y regresión en un contexto filogenético que pueda acomodar conjuntos de datos de alta dimensión. El enfoque se deriva de la equivalencia estadística entre métodos paramétricos que utilizan matrices de covarianza y métodos basados en matrices de distancia. Mediante simulaciones bajo movimiento browniano, demuestro que el método muestra tasas de error Tipo I apropiadas y potencia estadística, mientras que los procedimientos paramétricos estándar tienen una potencia decreciente a medida que aumenta la dimensionalidad de los datos. Por lo tanto, el nuevo procedimiento proporciona un medio útil para evaluar la covariación de rasgos a través de un conjunto de taxones relacionados por una filogenia, permitiendo a los biólogos de la macroevolución probar hipótesis de adaptación y cambio fenotípico en conjuntos de datos de alta dimensión.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12463",
    doi = "10.1111/evo.12463",
    openalex = "W2102871571",
    references = "doi101093sysbiosyp106, doi101093sysbiosyt053, doi101111j14209101201102427x"
}

Los primeros perisodáctilos están representados por algunos fósiles equoides basales de Euramérica cerca del límite Paleoceno/Eoceno. Aún no se han reportado équidos inequívocos del Eoceno temprano de Asia, aunque otros grupos de primeros perisodáctilos sí estuvieron presentes en Asia. Aquí reportamos el primer équido asiático del Eoceno, Erihippus tingae gen. et sp. nov., basado en especímenes parciales inicialmente asignados al ceratomorfo Orientolophus hengdongensis, procedentes de la cuenca de Hengyang, provincia de Hunan, China. Los especímenes previamente asignados a 'Propachynolophus' hengyangensis de la misma fauna de Lingcha se han dividido y ahora se reasignan como un anquilópodo Protomoropus? hengyangensis y un brontoterio Danjiangia lambdodon sp. nov. La aparición casi simultánea de équidos, ceratomorfos, anquilópodos y brontoterios en la cuenca de Hengyang sugiere que los cuatro grupos principales de perisodáctilos divergieron tan temprano como, o no más tarde que, el inicio del Eoceno (aproximadamente 56 Ma), y mostraron diferentes escenarios de dispersión durante el Eoceno temprano.

@article{bai2018the,
    author = "Bai, Bin and Wang, Yuan-Qing and Meng, Jin",
    title = "The divergence and dispersal of early perissodactyls as evidenced by early Eocene equids from Asia",
    year = "2018",
    journal = "Communications Biology",
    abstract = "Los primeros perisodáctilos están representados por algunos fósiles equoides basales de Euramérica cerca del límite Paleoceno/Eoceno. Aún no se han reportado équidos inequívocos del Eoceno temprano de Asia, aunque otros grupos de primeros perisodáctilos sí estuvieron presentes en Asia. Aquí reportamos el primer équido asiático del Eoceno, Erihippus tingae gen. et sp. nov., basado en especímenes parciales inicialmente asignados al ceratomorfo Orientolophus hengdongensis, procedentes de la cuenca de Hengyang, provincia de Hunan, China. Los especímenes previamente asignados a 'Propachynolophus' hengyangensis de la misma fauna de Lingcha se han dividido y ahora se reasignan como un anquilópodo Protomoropus? hengyangensis y un brontoterio Danjiangia lambdodon sp. nov. La aparición casi simultánea de équidos, ceratomorfos, anquilópodos y brontoterios en la cuenca de Hengyang sugiere que los cuatro grupos principales de perisodáctilos divergieron tan temprano como, o no más tarde que, el inicio del Eoceno (aproximadamente 56 Ma), y mostraron diferentes escenarios de dispersión durante el Eoceno temprano.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s42003-018-0116-5",
    doi = "10.1038/s42003-018-0116-5",
    number = "1",
    openalex = "W2885310723",
    volume = "1",
    references = "doi101038nature14249, doi101046j10963642200200005x, doi101073pnas0511296103, doi10108002724634199910011129, doi101098rspb20142671, doi101111j109636421994tb00311x, doi101126science1068700, doi101130spe369, doi101371journalpone0107447, doi105860choice355657, doi105860choice432801, openalexw16475780, openalexw2896296657"
}

@misc{bai2020the,
    author = "Bai, B y Wang, Y y Meng, J",
    title = "La divergencia y dispersión de los primeros perisodáctilos como evidencia de équidos del Eoceno Temprano de Asia [X25498] Equidos tempranos de Asia",
    year = "2020",
    booktitle = "Conjuntos de datos de MorphoBank",
    url = "https://doi.org/10.7934/x25498",
    doi = "10.7934/x25498",
    openalex = "W2908400088"
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