Coccolitos

@inproceedings{gartner1971phylogenetic1,
    author = "Gartner, S. and Jr",
    title = "Líneas filogenéticas en el género de coccolitos Chiasmolithus del Terciario Inferior",
    year = "1971",
    booktitle = "Convención Paleontológica de América del Norte, Actas, p. 930-957; Parte G",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gartner, S., Jr., 1971, Líneas filogenéticas en el género de coccolitos Chiasmolithus del Terciario Inferior: Convención Paleontológica de América del Norte, Actas, p. 930-957; Parte G.}"
}

@article{black1972british,
    author = "Black, Maurice",
    title = "British Lower Cretaceous Coccoliths. I. Gault Clay",
    year = "1972",
    journal = "Monografías de la Sociedad Paleontográfica",
    url = "https://doi.org/10.1080/25761900.2022.12131720",
    doi = "10.1080/25761900.2022.12131720",
    number = "534",
    openalex = "W4296160015",
    pages = "1-50",
    volume = "126"
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Comentario: En ensamblajes de aguas cálidas del océano abierto, Nephrolithus frequens y Lithraphidites quadratus no se observan comúnmente. El intervalo zonal original se indicó entre la primera aparición de estas especies. Micula mura y Tetralithus trifidus son indicadores estratigráficos más consistentes para el mismo intervalo general en ensamblajes oceánicos de baja latitud.

@incollection{doi102973dsdpproc151161973,
    author = "Bukry, David",
    title = "Zonación bioestratigráfica de cocolitos de baja latitud",
    year = "1973",
    booktitle = "eBooks de la Oficina de Imprenta del Gobierno de los EE. UU.",
    abstract = "Comentario: En ensamblajes de aguas cálidas del océano abierto, Nephrolithus frequens y Lithraphidites quadratus no se observan comúnmente. El intervalo zonal original se indicó entre la primera aparición de estas especies. Micula mura y Tetralithus trifidus son indicadores estratigráficos más consistentes para el mismo intervalo general en ensamblajes oceánicos de baja latitud.",
    url = "https://doi.org/10.2973/dsdp.proc.15.116.1973",
    doi = "10.2973/dsdp.proc.15.116.1973",
    openalex = "W2499395972",
    references = "doi101038225289a0, doi101111j216409471970tb02746x, doi102110pec74200094, doi1023071484276, doi1023071484577, doi102973dsdpproc141141972, doi102973dsdpproc431171979, doi103929ethza000086603, openalexw1505582348, openalexw2270089487, openalexw2722196962, openalexw2725455224"
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@article{doi1010160377839876900050,
    author = "Honjo, Susumu",
    title = "Coccolitos: Producción, transporte y sedimentación",
    year = "1976",
    journal = "Marine Micropaleontology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0377-8398(76)90005-0",
    doi = "10.1016/0377-8398(76)90005-0",
    openalex = "W2036323089",
    references = "doi1010160011747167900654, doi1010160011747173900594, doi101016001282527290102x, doi101111j216409471970tb02746x, doi101126science15437561542, doi102307201400, doi104319lo19731840534, doi104319lo19741960881, openalexw100537358, openalexw2913708518"
}

En este estudio biométrico preliminar de las especies de nanofósiles calcáreos Chiasmolithus expansus, Chiasmolithus oamaruensis y Chiasmolithus altus del Eoceno medio superior al Oligoceno inferior de los Sitios 647 y 748, documentamos una gradación completa de formas entre las tres especies. Chiasmolithus oamaruensis presenta una varianza morfológica significativamente mayor que las otras especies. La población de Chiasmolithus en cada sitio cambia de C. expansus a C. oamaruensis y luego a C. altus. Esto puede no reflejar una secuencia evolutiva verdadera porque una reversión mayor en el cambio de forma de la estructura transversal central acompaña a esta secuencia, y porque C. altus es morfológicamente más cercano a C. expansus que a C. oamaruensis. El cambio en el ancho de la estructura transversal es principalmente resultado de cambios en la alineación de la barra central conectora, en lugar de cambios en el ángulo transversal. En el Sitio 748, dos fluctuaciones morfológicas producen poblaciones de muestras intermedias entre las tres especies. Además, las ocurrencias estratigráficas y paleogeográficas reportadas de C. oamaruensis y C. altus muestran distribuciones latitudinales diferentes. Estos patrones morfológicos y de distribución pueden explicarse por un gradiente morfológico continuo entre C. oamaruensis y C. altus, con C. oamaruensis ocurriendo más comúnmente en paleoambientes de agua fresca, y C. altus ocurriendo más comúnmente en paleoambientes de agua fría. Por lo tanto, las fluctuaciones paleoambientales en el Sitio 748 pueden ser la causa de las fluctuaciones morfológicas en Chiasmolithus. Esta hipótesis puede probarse contra los modelos evolutivos previamente propuestos mediante una muestreo más detallado de secciones a lo largo de un transecto latitudinal.

@article{doi102973odpprocsr1201571992,
    author = "Firth, John V. y Wise, S.W. Jr.",
    title = "Un estudio preliminar sobre la evolución de Chiasmolithus en el Eoceno medio a Oligoceno de los Sitios 647 y 748",
    year = "1992",
    abstract = "En este estudio biométrico preliminar de las especies de nanofósiles calcáreos Chiasmolithus expansus, Chiasmolithus oamaruensis y Chiasmolithus altus del Eoceno medio superior al Oligoceno inferior de los Sitios 647 y 748, documentamos una gradación completa de formas entre las tres especies. Chiasmolithus oamaruensis presenta una varianza morfológica significativamente mayor que las otras especies. La población de Chiasmolithus en cada sitio cambia de C. expansus a C. oamaruensis y luego a C. altus. Esto puede no reflejar una secuencia evolutiva verdadera porque una reversión mayor en el cambio de forma de la estructura transversal central acompaña a esta secuencia, y porque C. altus es morfológicamente más cercano a C. expansus que a C. oamaruensis. El cambio en el ancho de la estructura transversal es principalmente resultado de cambios en la alineación de la barra central conectora, en lugar de cambios en el ángulo transversal. En el Sitio 748, dos fluctuaciones morfológicas producen poblaciones de muestras intermedias entre las tres especies. Además, las ocurrencias estratigráficas y paleogeográficas reportadas de C. oamaruensis y C. altus muestran distribuciones latitudinales diferentes. Estos patrones morfológicos y de distribución pueden explicarse por un gradiente morfológico continuo entre C. oamaruensis y C. altus, con C. oamaruensis ocurriendo más comúnmente en paleoambientes de agua fresca, y C. altus ocurriendo más comúnmente en paleoambientes de agua fría. Por lo tanto, las fluctuaciones paleoambientales en el Sitio 748 pueden ser la causa de las fluctuaciones morfológicas en Chiasmolithus. Esta hipótesis puede probarse contra los modelos evolutivos previamente propuestos mediante una muestreo más detallado de secciones a lo largo de un transecto latitudinal.",
    url = "https://doi.org/10.2973/odp.proc.sr.120.157.1992",
    doi = "10.2973/odp.proc.sr.120.157.1992",
    openalex = "W2186724448",
    references = "doi101016003101828690009x, doi1010160377839889900340, doi101144gslmem19850100115, doi1023071484276, doi102973dsdpproc431171979, doi102973dsdpproc801171985, doi102973odpprocsr1051471989, doi102973odpprocsr1191651991, openalexw1523529762, openalexw2725455224"
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@article{bralower1996morphometrics,
    author = "Bralower, Timothy J. y Parrow, Matthew",
    title = "Morfometría de los géneros de coccolitos del Paleoceno Cruciplacolithus, Chiasmolithus y Sullivania: una compleja historia evolutiva",
    year = "1996",
    journal = "Publicaciones Especiales de la Sociedad Paleontológica",
    url = "https://doi.org/10.1017/s2475262200000459",
    doi = "10.1017/s2475262200000459",
    openalex = "W4251350497",
    pages = "43-43",
    volume = "8"
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@article{doi101016s037783989600028x,
    author = "Bollmann, Jörg",
    title = "Morfología y biogeografía de los coccolitos de Gephyrocapsa en sedimentos del Holoceno",
    year = "1997",
    journal = "Marine Micropaleontology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0377-8398(96)00028-x",
    doi = "10.1016/s0377-8398(96)00028-x",
    openalex = "W1990111902",
    references = "doi1010160011747167900654, doi1010160011747173900594, doi1010160012825272900384, doi101016001282529190035e, doi101029eo064i049p0096202, doi101111j216409471970tb02746x, doi101126science19142321131, doi1011300091761319775400gsolqc20co2, openalexw1505582348, openalexw1532540194, openalexw1593551441, openalexw653466241"
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coccolitos, biomineralización, calcita, AFM, SPM, morfología cristalina, función

@article{doi1021130540189,
    author = "Young, J. R.",
    title = "Biomineralización dentro de vesículas: La calcita de los coccolitos",
    year = "2003",
    journal = "Reviews in Mineralogy and Geochemistry",
    abstract = "coccolitos, biomineralización, calcita, AFM, SPM, morfología cristalina, función",
    url = "https://doi.org/10.2113/0540189",
    doi = "10.2113/0540189",
    openalex = "W2057382012",
    references = "doi101006jsbi19994132, doi1010079783662062784, doi1010079789401149020, doi101016092181819390061r, doi101016s0016703799002392, doi101038365499a0, doi101073pnas1132069100, doi101093oxfordjournalsmolbeva026092, doi102216i003188844065031, doi105860choice330923"
}

Botryosphaeria es un género rico en especies con una distribución cosmopolita, comúnmente asociado con marchitez y chancros de plantas leñosas. Hasta 18 géneros anamórficos se han asociado con Botryosphaeria, la mayoría de los cuales han sido reducidos a sinónimos bajo Diplodia (conidios mayormente ovoideos, pigmentados, de pared gruesa), o Fusicoccum (conidios mayormente fusoides, hialinos, de pared delgada). Sin embargo, existen numerosos anamorfos conidiales que tienen características morfológicas intermedias entre Diplodia y Fusicoccum, y hay varios registros de especies fuera de las Botryosphaeriaceae que tienen anamorfos aparentemente típicos de Botryosphaeria s.str. Estudios recientes también han vinculado a Botryosphaeria con especies que tienen ascósporas pigmentadas y septadas, y anamorfos Dothiorella, o anamorfos Fusicoccum con sinanamorfos Dichomera. El objetivo de este estudio fue emplear datos de secuencias de ADN del 28S rDNA para resolver las líneas aparentes dentro de las Botryosphaeriaceae. A partir de estos datos, se reconocen 12 clados. Dos de estas líneas se agruparon fuera de las Botryosphaeriaceae, a saber, anamorfos similares a Diplodia que ocurren en maíz, que se acomodan mejor en Stenocarpella (Diaporthales), así como un clado no resuelto que incluye especies de Camarosporium/Microdiplodia. Reconocemos 10 líneas dentro de las Botryosphaeriaceae, incluyendo un clado no resuelto (Diplodia/Lasiodiplodia/Tiarosporella), Botryosphaeria s.str. (anamorfos Fusicoccum), Macrophomina, Neoscytalidium gen. nov., Dothidotthia (anamorfos Dothiorella), Neofusicoccum gen. nov. (teleomorfos similares a Botryosphaeria, sinanamorfos similares a Dichomera), Pseudofusicoccum gen. nov., Saccharata (sinanamorfos similares a Fusicoccum y Diplodia), "Botryosphaeria" quercuum (anamorfo similar a Diplodia) y Guignardia (anamorfos Phyllosticta). No se proporcionan nombres separados de teleomorfo y anamorfo para los géneros recién introducidos, incluso cuando se conocen ambos morfismos. La taxonomía de algunos clados e aislados (por ejemplo, B. mamane) permanece no resuelta debido a la ausencia de cultivos ex-tipo.

@article{doi103114sim551235,
    author = "Crous, P.W. y Slippers, Bernard y Wingfield, Michael J. y Rheeder, John P. y Marasas, Walter F. O. y Philips, Alan J L y Alves, Artur y Burgess, Treena I. y Barber, P.A. y Groenewald, J.Z.",
    title = "Líneas filogenéticas en las Botryosphaeriaceae",
    year = "2006",
    journal = "Estudios en Micología",
    abstract = {Botryosphaeria es un género rico en especies con una distribución cosmopolita, comúnmente asociado con marchitez y chancros de plantas leñosas. Hasta 18 géneros anamórficos se han asociado con Botryosphaeria, la mayoría de los cuales han sido reducidos a sinónimos bajo Diplodia (conidios mayormente ovoideos, pigmentados, de pared gruesa), o Fusicoccum (conidios mayormente fusoides, hialinos, de pared delgada). Sin embargo, existen numerosos anamorfos conidiales que tienen características morfológicas intermedias entre Diplodia y Fusicoccum, y hay varios registros de especies fuera de las Botryosphaeriaceae que tienen anamorfos aparentemente típicos de Botryosphaeria s.str. Estudios recientes también han vinculado a Botryosphaeria con especies que tienen ascósporas pigmentadas y septadas, y anamorfos Dothiorella, o anamorfos Fusicoccum con sinanamorfos Dichomera. El objetivo de este estudio fue emplear datos de secuencias de ADN del 28S rDNA para resolver las líneas aparentes dentro de las Botryosphaeriaceae. A partir de estos datos, se reconocen 12 clados. Dos de estas líneas se agruparon fuera de las Botryosphaeriaceae, a saber, anamorfos similares a Diplodia que ocurren en maíz, que se acomodan mejor en Stenocarpella (Diaporthales), así como un clado no resuelto que incluye especies de Camarosporium/Microdiplodia. Reconocemos 10 líneas dentro de las Botryosphaeriaceae, incluyendo un clado no resuelto (Diplodia/Lasiodiplodia/Tiarosporella), Botryosphaeria s.str. (anamorfos Fusicoccum), Macrophomina, Neoscytalidium gen. nov., Dothidotthia (anamorfos Dothiorella), Neofusicoccum gen. nov. (teleomorfos similares a Botryosphaeria, sinanamorfos similares a Dichomera), Pseudofusicoccum gen. nov., Saccharata (sinanamorfos similares a Fusicoccum y Diplodia), "Botryosphaeria" quercuum (anamorfo similar a Diplodia) y Guignardia (anamorfos Phyllosticta). No se proporcionan nombres separados de teleomorfo y anamorfo para los géneros recién introducidos, incluso cuando se conocen ambos morfismos. La taxonomía de algunos clados e aislados (por ejemplo, B. mamane) permanece no resuelta debido a la ausencia de cultivos ex-tipo.},
    url = "https://doi.org/10.3114/sim.55.1.235",
    doi = "10.3114/sim.55.1.235",
    openalex = "W2156957853",
    references = "doi101128jb1728423842461990, openalexw2733548038"
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@article{crous2013phylogenetic,
    author = "Crous, P.W. y Braun, U. y Hunter, G.C. y Wingfield, M.J. y Verkley, G.J.M. y Shin, H.-D. y Nakashima, C. y Groenewald, J.Z.",
    title = "Líneas filogenéticas en Pseudocercospora",
    year = "2013",
    journal = "Estudios en Micología",
    url = "https://doi.org/10.3114/sim0005",
    doi = "10.3114/sim0005",
    openalex = "W2093219539",
    pages = "37-114",
    volume = "75",
    references = "doi1010160968000490902527, doi101016b9780123721808500421, doi101073pnas1117018109, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsm092, doi101093nargki198, doi101093sysbio422182, doi101128jb1728423842461990, doi1023072992540, doi105860choice392183"
}

El género Diaporthe comprende especies patógenas, endofíticas y saprófitas con distribuciones tanto templadas como tropicales. La diversificación críptica, la plasticidad fenotípica y las extensas asociaciones con hospedadores han complicado durante mucho tiempo las identificaciones precisas de especies en este género. La delimitación de la especie tipo del género Diaporthe eres ha sido incierta debido a la falta de cultivos ex-tipo. Los límites de las especies de D. eres y especies estrechamente relacionadas se evaluaron utilizando análisis filogenético molecular de ocho genes, incluyendo espaciador transcrito interno ribosomal nuclear (ITS), secuencias parciales de actina (ACT), DNA-lyase (Apn2), factor de elongación de la traducción 1-α (EF1-α), beta-tubulina (TUB), calmodulina (CAL), proteína ribosomal 60s L37 (FG1093) e histona-3 (HIS). Se observa la ocurrencia de heterogeneidad de secuencias de ITS dentro de D. eres, lo que complica el análisis y puede llevar a una sobreestimación de la diversidad de especies. Se aplicaron los criterios estrictos de Reconocimiento de Especies Filogenéticas de Concordancia Genealógica (GCPSR) para resolver los límites de las especies basándose en análisis individuales y combinados de los otros siete genes excepto el ITS. Aceptamos nueve especies filogenéticas distintas, incluyendo Diaporthe alleghaniensis, D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis, D. neilliae, D. pulla y D. vaccinii. Se designan epítipos para D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis y D. pulla. Se proporcionan descripciones modernas e ilustraciones para estas especies. Se introducen nuevos cebadores diseñados para amplificar y secuenciar el gen Apn2 (DNA-lyase) en Diaporthe. Basándose en los perfiles de informatividad filogenética, los genes EF1-α, Apn2 y HIS se reconocen como los mejores marcadores para definir especies en el complejo de especies D. eres.

@article{doi101007s1322501402972,
    author = "Udayanga, Dhanushka y Castlebury, Lisa A. y Rossman, Amy Y. y Chukeatirote, Ekachai y Hyde, Kevin D.",
    title = "Perspectivas sobre el género Diaporthe: delimitación de especies filogenéticas en el complejo de especies D. eres",
    year = "2014",
    journal = "Fungal Diversity",
    abstract = "El género Diaporthe comprende especies patógenas, endofíticas y saprófitas con distribuciones tanto templadas como tropicales. La diversificación críptica, la plasticidad fenotípica y las extensas asociaciones con hospedadores han complicado durante mucho tiempo las identificaciones precisas de especies en este género. La delimitación de la especie tipo del género Diaporthe eres ha sido incierta debido a la falta de cultivos ex-tipo. Los límites de las especies de D. eres y especies estrechamente relacionadas se evaluaron utilizando análisis filogenético molecular de ocho genes, incluyendo espaciador transcrito interno ribosomal nuclear (ITS), secuencias parciales de actina (ACT), DNA-lyase (Apn2), factor de elongación de la traducción 1-α (EF1-α), beta-tubulina (TUB), calmodulina (CAL), proteína ribosomal 60s L37 (FG1093) e histona-3 (HIS). Se observa la ocurrencia de heterogeneidad de secuencias de ITS dentro de D. eres, lo que complica el análisis y puede llevar a una sobreestimación de la diversidad de especies. Se aplicaron los criterios estrictos de Reconocimiento de Especies Filogenéticas de Concordancia Genealógica (GCPSR) para resolver los límites de las especies basándose en análisis individuales y combinados de los otros siete genes excepto el ITS. Aceptamos nueve especies filogenéticas distintas, incluyendo Diaporthe alleghaniensis, D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis, D. neilliae, D. pulla y D. vaccinii. Se designan epítipos para D. alnea, D. bicincta, D. celastrina, D. eres, D. helicis y D. pulla. Se proporcionan descripciones modernas e ilustraciones para estas especies. Se introducen nuevos cebadores diseñados para amplificar y secuenciar el gen Apn2 (DNA-lyase) en Diaporthe. Basándose en los perfiles de informatividad filogenética, los genes EF1-α, Apn2 y HIS se reconocen como los mejores marcadores para definir especies en el complejo de especies D. eres.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s13225-014-0297-2",
    doi = "10.1007/s13225-014-0297-2",
    openalex = "W2001517763",
    references = "doi103114sim0012"
}

@misc{crossref2018review,
    title = {Revisión de: A refinement of coccolith separation methods: Measuring the sinking characters of coccoliths},
    year = "2018",
    url = "https://doi.org/10.5194/bg-2018-82-rc2",
    doi = "10.5194/bg-2018-82-rc2",
    openalex = "W4234196604"
}

Este artículo es la 13ª contribución en la serie Notas de Diversidad Fúngica, en la que se tratan 125 taxones de cuatro filos, diez clases, 31 órdenes, 69 familias, 92 géneros y tres géneros incertae sedis, demostrando una distribución mundial y geográfica. Los taxones fúngicos descritos e ilustrados en el presente estudio incluyen tres nuevos géneros, 69 nuevas especies, una nueva combinación, un espécimen de referencia y 51 nuevos registros en nuevos hospedadores y nuevas distribuciones geográficas. Se introducen tres nuevos géneros, Cylindrotorula (Torulaceae), Scolecoleotia (Leotiales género incertae sedis) y Xenovaginatispora (Lindomycetaceae), basados en linajes filogenéticos distintos y morfologías únicas. Las especies recién descritas son Aspergillus lannaensis, Cercophora dulciaquae, Cladophialophora aquatica, Coprinellus punjabensis, Cortinarius alutarius, C. mammillatus, C. quercoflocculosus, Coryneum fagi, Cruentomycena uttarakhandina, Cryptocoryneum rosae, Cyathus uniperidiolus, Cylindrotorula indica, Diaporthe chamaeropicola, Didymella azollae, Diplodia alanphillipsii, Dothiora coronicola, Efibula rodriguezarmasiae, Erysiphe salicicola, Fusarium queenslandicum, Geastrum gorgonicum, G. hansagiense, Helicosporium sexualis, Helminthosporium chiangraiensis, Hongkongmyces kokensis, Hydrophilomyces hydraenae, Hygrocybe boertmannii, Hyphoderma australosetigerum, Hyphodontia yunnanensis, Khaleijomyces umikazeana, Laboulbenia divisa, Laboulbenia triarthronis, Laccaria populina, Lactarius pallidozonarius, Lepidosphaeria strobelii, Longipedicellata megafusiformis, Lophiotrema lincangensis, Marasmius benghalensis, M. jinfoshanensis, M. subtropicus, Mariannaea camelliae, Melanographium smilaxii, Microbotryum polycnemoides, Mimeomyces digitatus, Minutisphaera thailandensis, Mortierella solitaria, Mucor harpali, Nigrograna jinghongensis, Odontia huanrenensis, O. parvispina, Paraconiothyrium ajrekarii, Parafuscosporella niloticus, Phaeocytostroma yomensis, Phaeoisaria synnematicus, Phanerochaete hainanensis, Pleopunctum thailandicum, Pleurotheciella dimorphospora, Pseudochaetosphaeronema chiangraiense, Pseudodactylaria albicolonia, Rhexoacrodictys nigrospora, Russula paravioleipes, Scolecoleotia eriocamporesi, Seriascoma honghense, Synandromyces makranczyi, Thyridaria aureobrunnea, Torula lancangjiangensis, Tubeufia longihelicospora, Wicklowia fusiformispora, Xenovaginatispora phichaiensis y Xylaria apiospora. Se propone una nueva combinación, Pseudobactrodesmium stilboideus. Se designa un espécimen de referencia de Comoclathris permunda. Se proporcionan nuevos registros de hospedador o distribución para Acrocalymma fici, Aliquandostipite khaoyaiensis, Camarosporidiella laburni, Canalisporium caribense, Chaetoscutula juniperi, Chlorophyllum demangei, C. globosum, C. hortense, Cladophialophora abundans, Dendryphion hydei, Diaporthe foeniculina, D. pseudophoenicicola, D. pyracanthae, Dictyosporium pandanicola, Dyfrolomyces distoseptatus, Ernakulamia tanakae, Eutypa flavovirens, E. lata, Favolus septatus, Fusarium atrovinosum, F. clavum, Helicosporium luteosporum, Hermatomyces nabanheensis, Hermatomyces sphaericoides, Longipedicellata aquatica, Lophiostoma caudata, L. clematidis-vitalbae, Lophiotrema hydei, L. neoarundinaria, Marasmiellus palmivorus, Megacapitula villosa, Micropsalliota globocystis, M. gracilis, Montagnula thailandica, Neohelicosporium irregulare, N. parisporum, Paradictyoarthrinium diffractum, Phaeoisaria aquatica, Poaceascoma taiwanense, Saproamanita manicata, Spegazzinia camelliae, Submersispora variabilis, Thyronectria caudata, T. mackenziei, Tubeufia chiangmaiensis, T. roseohelicospora, Vaginatispora nypae, Wicklowia submersa, Xanthagaricus necopinatus y Xylaria haemorrhoidalis. Los datos presentados aquí se basan en el examen morfológico de especímenes frescos, junto con el análisis de datos de secuencias filogenéticas para integrar mejor los taxones en rangos taxonómicos apropiados e inferir sus relaciones evolutivas.

@article{doi101007s13225019004292,
    author = "Hyde, Kevin D. and Tennakoon, Danushka S. and Jeewon, Rajesh and Bhat, D. Jayarama and Maharachchikumbura, Sajeewa S. N. and Rossi, Walter and Leonardi, Marco and Lee, Hyang Burm and Mun, Hye Yeon and Houbraken, Jos and Nguyen, Thuong T. T. and Jeon, Sun Jeong and Frisvad, Jens C. and Wanasinghe, Dhanushka N. and Lücking, Robert and Aptroot, André and Cáceres, Marcela E. S. and Karunarathna, Samantha C. and Hongsanan, Sinang and Phookamsak, Rungtiwa and de Silva, Nimali I. and Thambugala, Kasun M. and Jayawardena, Ruvishika S. and Senanayake, Indunil C. and Boonmee, Saranyaphat and Chen, Jie and Luo, Zong-Long and Phukhamsakda, Chayanard and Pereira, Olinto Liparini and de Abreu, Vanessa Pereira and Rosado, André Wilson Campos and Bart, Buyck and Randrianjohany, Émile and Hofstetter, Valérie and Gibertoni, Tatiana Baptista and Soares, A.M. and Plautz, Helio Longoni and Sotão, Helen Maria Pontes and Xavier, William Kalhy Silva and Bezerra, Jadson Diogo Pereira and de Oliveira, Thays Gabrielle Lins and de Souza‐Motta, Cristina Maria and Magalhães, Oliane Maria Correia and Bundhun, Digvijayini and Harishchandra, Dulanjalee and Manawasinghe, Ishara S. and Dong, Wei and Zhang, Shengnan and Bao, Dan-Feng and Samarakoon, Milan C. and Pem, Dhandevi and Karunarathna, Anuruddha and Lin, Chuan-Gen and Yang, Jing and Perera, Rekhani H. and Kumar, Vinit and Huang, Shi-Ke and Dayarathne, Monika C. and Ekanayaka, Anusha H. and Jayasiri, Subashini C. and Xiao, Yuan-Pin and Konta, Sirinapa and Niskanen, Tuula and Liimatainen, Kare and Dai, Yu-Cheng and Ji, Xiao-Hong and Tian, Xue-Mei and Mešić, Armin and Singh, Sanjay K. and Phutthacharoen, Kunthida and Cai, Lei and Sorvongxay, Touny and Thiyagaraja, Vinodhini and Norphanphoun, Chada and Chaiwan, Napalai and Lu, Yong‐Zhong and Jiang, Hong-Bo and Zhang, Jin-Feng and Abeywickrama, Pranami D. and Aluthmuhandiram, Janith V. S. and Brahmanage, Rashika S. and Zeng, Ming and Chethana, K. W. Thilini and Wei, De-Ping and Réblová, Martina and Fournier, Jacques and Nekvindová, Jana and do Nascimento Barbosa, Renan and dos Santos, José Ewerton Felinto and de Oliveira, Neiva Tinti and Li, Guojie and Ertz, Damien and Shang, Qiu-Ju and Phillips, Alan J. L. and KUO, CHANG-HSIN and Camporesi, Erio and Bulgakov, Timur S. and Lumyong, Saisamorn and Jones, E. B. Gareth and Chomnunti, Putarak",
    title = "Fungal diversity notes 1036–1150: taxonomic and phylogenetic contributions on genera and species of fungal taxa",
    year = "2019",
    journal = "Fungal Diversity",
    abstract = "This article is the 13th contribution in the Fungal Diversity Notes series, wherein 125 taxa from four phyla, ten classes, 31 orders, 69 families, 92 genera and three genera incertae sedis are treated, demonstrating worldwide and geographic distribution. Fungal taxa described and illustrated in the present study include three new genera, 69 new species, one new combination, one reference specimen and 51 new records on new hosts and new geographical distributions. Three new genera, Cylindrotorula (Torulaceae), Scolecoleotia (Leotiales genus incertae sedis) and Xenovaginatispora (Lindomycetaceae) are introduced based on distinct phylogenetic lineages and unique morphologies. Newly described species are Aspergillus lannaensis, Cercophora dulciaquae, Cladophialophora aquatica, Coprinellus punjabensis, Cortinarius alutarius, C. mammillatus, C. quercoflocculosus, Coryneum fagi, Cruentomycena uttarakhandina, Cryptocoryneum rosae, Cyathus uniperidiolus, Cylindrotorula indica, Diaporthe chamaeropicola, Didymella azollae, Diplodia alanphillipsii, Dothiora coronicola, Efibula rodriguezarmasiae, Erysiphe salicicola, Fusarium queenslandicum, Geastrum gorgonicum, G. hansagiense, Helicosporium sexualis, Helminthosporium chiangraiensis, Hongkongmyces kokensis, Hydrophilomyces hydraenae, Hygrocybe boertmannii, Hyphoderma australosetigerum, Hyphodontia yunnanensis, Khaleijomyces umikazeana, Laboulbenia divisa, Laboulbenia triarthronis, Laccaria populina, Lactarius pallidozonarius, Lepidosphaeria strobelii, Longipedicellata megafusiformis, Lophiotrema lincangensis, Marasmius benghalensis, M. jinfoshanensis, M. subtropicus, Mariannaea camelliae, Melanographium smilaxii, Microbotryum polycnemoides, Mimeomyces digitatus, Minutisphaera thailandensis, Mortierella solitaria, Mucor harpali, Nigrograna jinghongensis, Odontia huanrenensis, O. parvispina, Paraconiothyrium ajrekarii, Parafuscosporella niloticus, Phaeocytostroma yomensis, Phaeoisaria synnematicus, Phanerochaete hainanensis, Pleopunctum thailandicum, Pleurotheciella dimorphospora, Pseudochaetosphaeronema chiangraiense, Pseudodactylaria albicolonia, Rhexoacrodictys nigrospora, Russula paravioleipes, Scolecoleotia eriocamporesi, Seriascoma honghense, Synandromyces makranczyi, Thyridaria aureobrunnea, Torula lancangjiangensis, Tubeufia longihelicospora, Wicklowia fusiformispora, Xenovaginatispora phichaiensis and Xylaria apiospora. One new combination, Pseudobactrodesmium stilboideus is proposed. A reference specimen of Comoclathris permunda is designated. New host or distribution records are provided for Acrocalymma fici, Aliquandostipite khaoyaiensis, Camarosporidiella laburni, Canalisporium caribense, Chaetoscutula juniperi, Chlorophyllum demangei, C. globosum, C. hortense, Cladophialophora abundans, Dendryphion hydei, Diaporthe foeniculina, D. pseudophoenicicola, D. pyracanthae, Dictyosporium pandanicola, Dyfrolomyces distoseptatus, Ernakulamia tanakae, Eutypa flavovirens, E. lata, Favolus septatus, Fusarium atrovinosum, F. clavum, Helicosporium luteosporum, Hermatomyces nabanheensis, Hermatomyces sphaericoides, Longipedicellata aquatica, Lophiostoma caudata, L. clematidis-vitalbae, Lophiotrema hydei, L. neoarundinaria, Marasmiellus palmivorus, Megacapitula villosa, Micropsalliota globocystis, M. gracilis, Montagnula thailandica, Neohelicosporium irregulare, N. parisporum, Paradictyoarthrinium diffractum, Phaeoisaria aquatica, Poaceascoma taiwanense, Saproamanita manicata, Spegazzinia camelliae, Submersispora variabilis, Thyronectria caudata, T. mackenziei, Tubeufia chiangmaiensis, T. roseohelicospora, Vaginatispora nypae, Wicklowia submersa, Xanthagaricus necopinatus and Xylaria haemorrhoidalis. The data presented herein are based on morphological examination of fresh specimens, coupled with analysis of phylogenetic sequence data to better integrate taxa into appropriate taxonomic ranks and infer their evolutionary relationships.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s13225-019-00429-2",
    doi = "10.1007/s13225-019-00429-2",
    openalex = "W2953029298",
    references = "doi101007s1322501703860"
}

El fitoplancton marino forma biominerales funcionales con morfologías y arquitecturas intrincadas. Los coccolitóforos ocupan una posición especial entre estos organismos debido a su producción de escamas de calcita intrincadas, llamadas coccolitos. Aunque las morfologías de los coccolitos difieren entre diferentes especies, los cristales se organizan sistemáticamente alrededor de una matriz orgánica para formar una disposición de asombrosa simetría. Demostramos las oportunidades que surgen de la microscopía electrónica de transmisión de barrido de cuatro dimensiones (4D-STEM), para resolver espacialmente la cristalografía de tales biominerales. A través del desarrollo de un pipeline computacional, que resuelve automáticamente la orientación en los píxeles de la imagen correspondientes a cristales, podemos mapear la orientación de los bloques de construcción cristalinos entrelazados y superpuestos que componen el coccolito. El presente trabajo ejemplifica cómo las grabaciones paralelas en espacio real y espacio de difracción pueden facilitar y mejorar el rendimiento de descifrar la red compleja de superestructuras de biominerales.

@article{doi101093mamozaf087,
    author = "Leghziel, Rebecca C y Addadi, Lia y Gal, Assaf y Houben, Lothar",
    title = "Solving the Crystal Architecture of Coccoliths Using 4D-STEM.",
    year = "2025",
    journal = "Microscopy and microanalysis: the official journal of Microscopy Society of America, Microbeam Analysis Society, Microscopical Society of Canada",
    abstract = "El fitoplancton marino forma biominerales funcionales con morfologías y arquitecturas intrincadas. Los coccolitóforos ocupan una posición especial entre estos organismos debido a su producción de escamas de calcita intrincadas, llamadas coccolitos. Aunque las morfologías de los coccolitos difieren entre diferentes especies, los cristales se organizan sistemáticamente alrededor de una matriz orgánica para formar una disposición de asombrosa simetría. Demostramos las oportunidades que surgen de la microscopía electrónica de transmisión de barrido de cuatro dimensiones (4D-STEM), para resolver espacialmente la cristalografía de tales biominerales. A través del desarrollo de un pipeline computacional, que resuelve automáticamente la orientación en los píxeles de la imagen correspondientes a cristales, podemos mapear la orientación de los bloques de construcción cristalinos entrelazados y superpuestos que componen el coccolito. El presente trabajo ejemplifica cómo las grabaciones paralelas en espacio real y espacio de difracción pueden facilitar y mejorar el rendimiento de descifrar la red compleja de superestructuras de biominerales.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41056096/",
    doi = "10.1093/mam/ozaf087",
    openalex = "W4414912265",
    pmid = "41056096",
    references = "doi101006jcis19960217, doi101006jsbi19994132, doi101016jactbio201405024, doi101017s1431927619000497, doi101017s1431927621000477, doi101038356516a0, doi101093icb244893, doi101093oso97801950497700010001, doi1021130540189, openalexw92296177"
}

Los coccolitos son estructuras de calcita multicristal formadas por microalgas dentro de un vesículo intracelular. La morfología de cada cristal es compleja, y estudios recientes postulan que la morfogénesis de los coccolitos está regulada por la membrana que delimita su vesículo. Sin embargo, la información limitada sobre la organización del estado nativo dentro de la célula dificulta comprender qué aspectos estructurales de la membrana son responsables de la morfogénesis. Aquí, examinamos el ambiente vesicular durante la formación de coccolitos de Calcidiscus leptoporus, utilizando microscopía electrónica de criotransmisión avanzada y tomografía de fluorescencia de rayos X. Nuestros hallazgos muestran dos tipos distintos de superficies cristalinas que persisten durante el desarrollo de los coccolitos: planas y curvas, que también difieren en rugosidad. Curiosamente, aunque ambos tipos de superficies tienen grados variables de confinamiento de la membrana, están separados por bandas distintas de contacto íntimo entre los cristales y la membrana. Proponemos que estas "bandas" sirven como límites, creando subcompartimentos dentro del vesículo del coccolito que regulan el crecimiento del cristal y su cese. Estos resultados sugieren que la membrana del vesículo del coccolito mantiene ambientes químicos distintos y funcionales a escala nanométrica.

@article{doi101021jacs6c02151,
    author = "Avrahami, Emanuel M y Karpov, Dmitry y Aram, Lior y Elad, Nadav y Safadi, Razi y Rosenhek-Goldian, Irit y Sui, Xiao-Meng y de Haan, Diede y Varsano, Neta y Cohen, Sidney R y Zlotnikov, Igor y Gal, Assaf",
    title = "Relaciones espaciales entre coccolitos y su membrana confinante durante la morfogénesis del cristal.",
    year = "2026",
    journal = "Journal of the American Chemical Society",
    abstract = {Los coccolitos son estructuras de calcita multicristal formadas por microalgas dentro de un vesículo intracelular. La morfología de cada cristal es compleja, y estudios recientes postulan que la morfogénesis de los coccolitos está regulada por la membrana que delimita su vesículo. Sin embargo, la información limitada sobre la organización del estado nativo dentro de la célula dificulta comprender qué aspectos estructurales de la membrana son responsables de la morfogénesis. Aquí, examinamos el ambiente vesicular durante la formación de coccolitos de Calcidiscus leptoporus, utilizando microscopía electrónica de criotransmisión avanzada y tomografía de fluorescencia de rayos X. Nuestros hallazgos muestran dos tipos distintos de superficies cristalinas que persisten durante el desarrollo de los coccolitos: planas y curvas, que también difieren en rugosidad. Curiosamente, aunque ambos tipos de superficies tienen grados variables de confinamiento de la membrana, están separados por bandas distintas de contacto íntimo entre los cristales y la membrana. Proponemos que estas "bandas" sirven como límites, creando subcompartimentos dentro del vesículo del coccolito que regulan el crecimiento del cristal y su cese. Estos resultados sugieren que la membrana del vesículo del coccolito mantiene ambientes químicos distintos y funcionales a escala nanométrica.},
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC13067266/",
    doi = "10.1021/jacs.6c02151",
    openalex = "W7140159870",
    pmcid = "PMC13067266",
    pmid = "41875313",
    references = "doi101006jsbi19994132, doi101021ie800900f, doi101038356516a0, doi101038nature04382, doi101038nature14365, doi101073pnas1118120109, doi10108800344885684r03, doi101146annurevmarine122414034032, doi1021130540189, doi102216i003188844065031"
}

UNLABELLED: Los coccolitos son placas individuales de carbonato de calcio que constituyen las conchas de algas haptofitas calcificantes marinas. Sus restos proporcionan un excelente archivo sedimentario para la reconstrucción de parámetros ambientales pasados. Utilizando espectrometría de masas de iones secundarios a nanoescala (NanoSIMS), medimos los contenidos de Mg, Sr, Na y K en coccolitos individuales de Emiliania huxleyi, ahora denominada Gephyrocapsa huxleyi, para explorar su potencial como paleoproxy. Para muestras ambientales recientes del Mediterráneo y el Mar Negro, así como especímenes cultivados, todos los elementos aparecieron distribuidos homogéneamente dentro, pero altamente variables entre, los coccolitos individuales. Las proporciones Mg/Ca y Sr/Ca abarcaron un rango de 0,06–83 mmol mol−1 y 1,9–3,8 mmol mol−1, respectivamente, y coincidieron con los valores previamente determinados. La proporción Na/Ca osciló entre 1,6–186 mmol mol−1. La proporción K/Ca no pudo calibrarse, pero las proporciones de conteo de iones 39K+/44Ca+ medidas variaron entre 0,03–2,7. Aunque las proporciones Na/Ca disminuyeron significativamente con el aumento de la alcalinidad total y la salinidad en las muestras del Mediterráneo, estas tendencias no se observaron en muestras recolectadas de cultivos donde la alcalinidad y la salinidad variaron por separado. De manera similar, las proporciones K/Ca no mostraron tendencias claras con la alcalinidad total o la salinidad del medio de cultivo. La calcificación en los coccolitóforos está controlada biológicamente y esto puede enmascarar el impacto de los factores ambientales sobre la variación observada en el contenido de Na y K de los coccolitos individuales de E. huxleyi. INFORMACIÓN COMPLEMENTARIA: La versión en línea contiene material suplementario disponible en 10.1038/s41598-026-40623-2.

@article{doi101038s41598026406232,
    author = "Roepert, Anne y Middelburg, Jack J y Weiss, Gabriella M y van der Meer, Marcel T J y Polerecky, Lubos",
    title = "Análisis de sodio y potasio en coccolitos individuales mediante espectrometría de masas de iones secundarios.",
    year = "2026",
    journal = "Scientific reports",
    abstract = "UNLABELLED: Los coccolitos son placas individuales de carbonato de calcio que constituyen las conchas de algas haptofitas calcificantes marinas. Sus restos proporcionan un excelente archivo sedimentario para la reconstrucción de parámetros ambientales pasados. Utilizando espectrometría de masas de iones secundarios a nanoescala (NanoSIMS), medimos los contenidos de Mg, Sr, Na y K en coccolitos individuales de Emiliania huxleyi, ahora denominada Gephyrocapsa huxleyi, para explorar su potencial como paleoproxy. Para muestras ambientales recientes del Mediterráneo y el Mar Negro, así como especímenes cultivados, todos los elementos aparecieron distribuidos homogéneamente dentro, pero altamente variables entre, los coccolitos individuales. Las proporciones Mg/Ca y Sr/Ca abarcaron un rango de 0,06–83 mmol mol−1 y 1,9–3,8 mmol mol−1, respectivamente, y coincidieron con los valores previamente determinados. La proporción Na/Ca osciló entre 1,6–186 mmol mol−1. La proporción K/Ca no pudo calibrarse, pero las proporciones de conteo de iones 39K+/44Ca+ medidas variaron entre 0,03–2,7. Aunque las proporciones Na/Ca disminuyeron significativamente con el aumento de la alcalinidad total y la salinidad en las muestras del Mediterráneo, estas tendencias no se observaron en muestras recolectadas de cultivos donde la alcalinidad y la salinidad variaron por separado. De manera similar, las proporciones K/Ca no mostraron tendencias claras con la alcalinidad total o la salinidad del medio de cultivo. La calcificación en los coccolitóforos está controlada biológicamente y esto puede enmascarar el impacto de los factores ambientales sobre la variación observada en el contenido de Na y K de los coccolitos individuales de E. huxleyi. INFORMACIÓN COMPLEMENTARIA: La versión en línea contiene material suplementario disponible en 10.1038/s41598-026-40623-2.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC13048990/",
    doi = "10.1038/s41598-026-40623-2",
    openalex = "W7132837306",
    pmcid = "PMC13048990",
    pmid = "41764317",
    references = "doi10100797836620627845, doi101016007919467990106x, doi101016s0016703798000970, doi101038320129a0, doi101038330367a0, doi101038347462a0, doi101038nature10295, doi101111j152988171987tb04217x, doi101126sciadv1501822, doi101126science1110063"
}

@misc{crossrefNonetable,
    title = "Tabla 6: Densidades de hienas manchadas registradas en la literatura.",
    year = "Ninguna",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.12307/table-6",
    doi = "10.7717/peerj.12307/table-6"
}