Conservación

@book{dasmann1972environmental1,
    author = "Dasmann, R. F",
    title = "Conservación ambiental [3ª ed.]",
    year = "1972",
    publisher = "Nueva York, Wiley, 473 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Dasmann, R. F., 1972, Conservación ambiental [3ª ed.]: Nueva York, Wiley, 473 p.}"
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I. Descuento y conservación, 359. — II. Un modelo para la asignación de recursos ambientales naturales: el concepto de tasas de descuento efectivas, 362. — III. Comentarios finales, 370.

@article{doi1023071885257,
    author = "Fisher, Anthony C. y Krutilla, John V.",
    title = "Conservación de recursos, preservación ambiental y la tasa de descuento",
    year = "1975",
    journal = "The Quarterly Journal of Economics",
    abstract = "I. Descuento y conservación, 359. — II. Un modelo para la asignación de recursos ambientales naturales: el concepto de tasas de descuento efectivas, 362. — III. Comentarios finales, 370.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1885257",
    doi = "10.2307/1885257",
    openalex = "W2068341906"
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@book{openalexw2123629586,
    author = "Young, Anthony",
    title = "Agroforestry for Soil Conservation",
    year = "1989",
    booktitle = "OpenGrey (Institut de l'Information Scientifique et Technique)",
    openalex = "W2123629586",
    references = "doi101016s0065211308603971"
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La degradación del suelo por erosión ha sido considerada por muchos como un problema de proporción significativa, que afecta a aproximadamente el 30–50% de la superficie terrestre. En el momento de la primera publicación de este libro en 1993, las estimaciones indicaban que se perdían 10–15 millones de hectáreas de tierra cada año a través de la erosión y la salinización por riego, y que a tal ritmo de pérdida, las reservas de suelo superficial en la mayoría de las tierras inclinadas se agotarían dentro de doscientos años. Dado que la dependencia de la humanidad de la tierra para la alimentación es casi total, la erosión del suelo representa una amenaza real para la seguridad de nuestro suministro de alimentos. Por lo tanto, es clara la necesidad de la conservación inmediata de los recursos del suelo del mundo. Como parte de la respuesta a esta necesidad, la Comisión de Ecología de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza convocó un grupo de trabajo especial para considerar el problema de la erosión del suelo mundial y proponer soluciones prácticas para la conservación del suelo. Este importante libro presenta los resultados de su trabajo.

@book{doi101017cbo9780511735394,
    author = "Pimentel, David",
    title = "World Soil Erosion and Conservation",
    year = "1993",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "La degradación del suelo por erosión ha sido considerada por muchos como un problema de proporción significativa, que afecta a aproximadamente el 30–50% de la superficie terrestre. En el momento de la primera publicación de este libro en 1993, las estimaciones indicaban que se perdían 10–15 millones de hectáreas de tierra cada año a través de la erosión y la salinización por riego, y que a tal ritmo de pérdida, las reservas de suelo superficial en la mayoría de las tierras inclinadas se agotarían dentro de doscientos años. Dado que la dependencia de la humanidad de la tierra para la alimentación es casi total, la erosión del suelo representa una amenaza real para la seguridad de nuestro suministro de alimentos. Por lo tanto, es clara la necesidad de la conservación inmediata de los recursos del suelo del mundo. Como parte de la respuesta a esta necesidad, la Comisión de Ecología de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza convocó un grupo de trabajo especial para considerar el problema de la erosión del suelo mundial y proponer soluciones prácticas para la conservación del suelo. Este importante libro presenta los resultados de su trabajo.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511735394",
    doi = "10.1017/cbo9780511735394",
    openalex = "W1509812492"
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La erosión del suelo es una amenaza ambiental mayor para la sostenibilidad y la capacidad productiva de la agricultura. Durante los últimos 40 años, casi un tercio de la tierra cultivable del mundo se ha perdido por erosión y continúa perdiéndose a una tasa de más de 10 millones de hectáreas por año. Con la adición de un cuarto de millón de personas cada día, la demanda de alimentos de la población mundial está aumentando en un momento en que la productividad per cápita de los alimentos comienza a disminuir.

@article{doi101126science26752011117,
    author = "Pimentel, David y Harvey, Célia A. y Resosudarmo, Ida Aju Pradnja y Sinclair, K.B. y Kurz, Daniel y McNair, Michael y Crist, Scott D. y Shpritz, L. y Fitton, L. y Saffouri, R. y Blair, Ryan",
    title = "Costos ambientales y económicos de la erosión del suelo y beneficios de la conservación",
    year = "1995",
    journal = "Science",
    abstract = "La erosión del suelo es una amenaza ambiental mayor para la sostenibilidad y la capacidad productiva de la agricultura. Durante los últimos 40 años, casi un tercio de la tierra cultivable del mundo se ha perdido por erosión y continúa perdiéndose a una tasa de más de 10 millones de hectáreas por año. Con la adición de un cuarto de millón de personas cada día, la demanda de alimentos de la población mundial está aumentando en un momento en que la productividad per cápita de los alimentos comienza a disminuir.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.267.5201.1117",
    doi = "10.1126/science.267.5201.1117",
    openalex = "W2050154560",
    references = "doi101017cbo9780511735394, doi101071sr9910745, doi101111j136523891984tb00278x, doi1012019781351072519, doi102307215130, doi1023073451509, doi102307633494, doi105860choice451769, openalexw2123629586, openalexw3141838726"
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Lista de contribuyentes Agradecimientos y una advertencia al lector Lista de figuras Lista de tablas I. Cambio social y conservación: una visión general de problemas y conceptos Krishna B. Ghimire y Michel P. Pimbert II. Biodiversidad y bienestar humano Piers Blaikie y Sally Jeanrenaud III. Gestión de parques nacionales y áreas protegidas en Costa Rica y Alemania: un análisis comparativo Jens Briiggemann IV. Salvando la naturaleza: pueblos indígenas y áreas protegidas Marcus Colchester V. Mujeres, productos forestales y áreas protegidas: un estudio de caso del Santuario de Vida Silvestre de Jaldapara, Bengala Occidental, India Chandana Dey VI. Desarrollo local y parques en Francia Andrea Finger-Stich y Krishna B. Ghimire VII. Conservación y desarrollo social: una evaluación de Wolong y otras reservas de pandas en China Krishna B. Ghirnire VIII. Ecoturismo y reconstrucción rural en Sudáfrica: ¿realidad o retórica? Eddie Koch IX. Gestión de vida silvestre, turismo y comunidades locales en Zimbabwe Chris Mayor X. Áreas protegidas, conservacionistas e intereses aborígenes en Canadá James Morrison XI. Parques, personas y profesionales: poniendo la 'participación' en la gestión de áreas protegidas Michel P. Pimbert y Jules N. Pretty Lista de abreviaturas y siglas Mediciones de tierra y peso Conversión de divisas

@book{openalexw1546506088,
    author = "Ghimire, Krishna B. y Pimbert, Michel",
    title = "Cambio social y conservación: política ambiental e impactos de los parques nacionales y áreas protegidas.",
    year = "1997",
    booktitle = "Earthscan Publications Ltd eBooks",
    abstract = "Lista de contribuyentes Agradecimientos y una advertencia al lector Lista de figuras Lista de tablas I. Cambio social y conservación: una visión general de problemas y conceptos Krishna B. Ghimire y Michel P. Pimbert II. Biodiversidad y bienestar humano Piers Blaikie y Sally Jeanrenaud III. Gestión de parques nacionales y áreas protegidas en Costa Rica y Alemania: un análisis comparativo Jens Briiggemann IV. Salvando la naturaleza: pueblos indígenas y áreas protegidas Marcus Colchester V. Mujeres, productos forestales y áreas protegidas: un estudio de caso del Santuario de Vida Silvestre de Jaldapara, Bengala Occidental, India Chandana Dey VI. Desarrollo local y parques en Francia Andrea Finger-Stich y Krishna B. Ghimire VII. Conservación y desarrollo social: una evaluación de Wolong y otras reservas de pandas en China Krishna B. Ghirnire VIII. Ecoturismo y reconstrucción rural en Sudáfrica: ¿realidad o retórica? Eddie Koch IX. Gestión de vida silvestre, turismo y comunidades locales en Zimbabwe Chris Mayor X. Áreas protegidas, conservacionistas e intereses aborígenes en Canadá James Morrison XI. Parques, personas y profesionales: poniendo la 'participación' en la gestión de áreas protegidas Michel P. Pimbert y Jules N. Pretty Lista de abreviaturas y siglas Mediciones de tierra y peso Conversión de divisas",
    url = "https://openalex.org/W1546506088",
    openalex = "W1546506088"
}

Garantizar el apoyo local para las áreas protegidas se considera cada vez más un elemento importante de la conservación de la biodiversidad. Esto a menudo se basa en la provisión de beneficios derivados de las áreas protegidas, y un medio común para proporcionar tales beneficios es el desarrollo turístico. Sin embargo, la relación entre la recepción de beneficios turísticos y el apoyo a la conservación no ha sido explorada. Este estudio examinó las actitudes locales hacia el turismo en áreas protegidas y los efectos de los beneficios turísticos en el apoyo local al Parque Nacional de Komodo, Indonesia. El Parque Nacional de Komodo es un referente del turismo en una región donde las áreas protegidas son cada vez más visitadas y donde el apoyo local a la conservación no ha sido investigado. Los resultados de una encuesta por cuestionario revelaron actitudes positivas hacia el turismo y un alto apoyo a la conservación (93,7%), así como el reconocimiento de que el turismo depende de la existencia del parque. Las actitudes positivas hacia el turismo estuvieron positivamente relacionadas con la recepción de beneficios económicos y con el apoyo a la conservación. Sin embargo, no se identificó una relación positiva entre la recepción de beneficios turísticos y el apoyo a la conservación, lo que sugiere que los beneficios de la conservación de áreas protegidas no tienen ningún efecto en el apoyo local a la conservación. La población local reconoció las desigualdades distributivas en los beneficios turísticos, y las quejas más comunes fueron la inflación local y el código de vestimenta de los turistas. Para identificar plenamente los impactos del turismo en áreas protegidas, se recomiendan estudios a largo plazo de las actitudes locales junto con evaluaciones económicas y ecológicas tradicionales.

@article{doi101017s0376892901000169,
    author = "Walpole, Matthew J. y Goodwin, Harold",
    title = "Actitudes locales hacia la conservación y el turismo alrededor del Parque Nacional de Komodo, Indonesia",
    year = "2001",
    journal = "Environmental Conservation",
    abstract = "Garantizar el apoyo local para las áreas protegidas se considera cada vez más un elemento importante de la conservación de la biodiversidad. Esto a menudo se basa en la provisión de beneficios derivados de las áreas protegidas, y un medio común para proporcionar tales beneficios es el desarrollo turístico. Sin embargo, la relación entre la recepción de beneficios turísticos y el apoyo a la conservación no ha sido explorada. Este estudio examinó las actitudes locales hacia el turismo en áreas protegidas y los efectos de los beneficios turísticos en el apoyo local al Parque Nacional de Komodo, Indonesia. El Parque Nacional de Komodo es un referente del turismo en una región donde las áreas protegidas son cada vez más visitadas y donde el apoyo local a la conservación no ha sido investigado. Los resultados de una encuesta por cuestionario revelaron actitudes positivas hacia el turismo y un alto apoyo a la conservación (93,7%), así como el reconocimiento de que el turismo depende de la existencia del parque. Las actitudes positivas hacia el turismo estuvieron positivamente relacionadas con la recepción de beneficios económicos y con el apoyo a la conservación. Sin embargo, no se identificó una relación positiva entre la recepción de beneficios turísticos y el apoyo a la conservación, lo que sugiere que los beneficios de la conservación de áreas protegidas no tienen ningún efecto en el apoyo local a la conservación. La población local reconoció las desigualdades distributivas en los beneficios turísticos, y las quejas más comunes fueron la inflación local y el código de vestimenta de los turistas. Para identificar plenamente los impactos del turismo en áreas protegidas, se recomiendan estudios a largo plazo de las actitudes locales junto con evaluaciones económicas y ecológicas tradicionales.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0376892901000169",
    doi = "10.1017/s0376892901000169",
    openalex = "W2089900098",
    references = "doi101007bf00051774, doi101016000632079390507w, doi1010160160738387900454, doi101016016073839090029q, doi101016s0160738399000882, doi101017s037689290001064x, doi101017s037689299800040x, doi1023071444685, openalexw1546506088, openalexw1756902206, vitt1982the"
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Solo registro de metadatos

@article{doi101080089419202317174011,
    author = "Brechin, Steven R. y Wilshusen, Peter R. y Fortwangler, Crystal y West, Patrick C.",
    title = "Más allá de la rueda cuadrada: Hacia una comprensión más completa de la conservación de la biodiversidad como proceso social y político",
    year = "2002",
    journal = "Society \& Natural Resources",
    abstract = "Solo registro de metadatos",
    url = "https://doi.org/10.1080/089419202317174011",
    doi = "10.1080/089419202317174011",
    openalex = "W2092666883",
    references = "doi105860choice330904, openalexw1546506088"
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Los arrecifes de coral son los ecosistemas marinos de aguas someras con mayor diversidad biológica, pero están siendo degradados a nivel mundial por las actividades humanas y el calentamiento climático. Los análisis de los rangos geográficos de 3235 especies de peces de arrecife, corales, caracoles y langostas revelaron que entre el 7,2% y el 53,6% de cada taxón tienen rangos altamente restringidos, lo que los hace vulnerables a la extinción. Las especies de rango restringido se agrupan en centros de endemismo, como los descritos para los taxones terrestres. Los 10 centros de endemismo más ricos cubren el 15,8% de los arrecifes de coral del mundo (0,012% de los océanos) pero incluyen entre el 44,8% y el 54,2% de las especies de rango restringido. Muchos ocurren en regiones donde los arrecifes están siendo severamente afectados por las personas, lo que potencialmente podría llevar a numerosas extinciones. Los centros de endemismo amenazados son calientes de biodiversidad principales, y los esfuerzos de conservación dirigidos hacia ellos podrían ayudar a evitar la pérdida de la biodiversidad de los arrecifes tropicales.

@article{doi101126science1067728,
    author = "Roberts, Callum M. y McClean, Colin J. y Veron, J. E. N. y Hawkins, Julie P. y Allen, Gerald R. y McAllister, Don E. y Mittermeier, Cristina G. y Schueler, Frederick W y Spalding, Mark y Wells, Fred E. y Vynne, Carly y Werner, Timothy B.",
    title = "Calientes de Biodiversidad Marina y Prioridades de Conservación para Arrecifes Tropicales",
    year = "2002",
    journal = "Science",
    abstract = "Los arrecifes de coral son los ecosistemas marinos de aguas someras con mayor diversidad biológica, pero están siendo degradados a nivel mundial por las actividades humanas y el calentamiento climático. Los análisis de los rangos geográficos de 3235 especies de peces de arrecife, corales, caracoles y langostas revelaron que entre el 7,2% y el 53,6% de cada taxón tienen rangos altamente restringidos, lo que los hace vulnerables a la extinción. Las especies de rango restringido se agrupan en centros de endemismo, como los descritos para los taxones terrestres. Los 10 centros de endemismo más ricos cubren el 15,8% de los arrecifes de coral del mundo (0,012% de los océanos) pero incluyen entre el 44,8% y el 54,2% de las especies de rango restringido. Muchos ocurren en regiones donde los arrecifes están siendo severamente afectados por las personas, lo que potencialmente podría llevar a numerosas extinciones. Los centros de endemismo amenazados son calientes de biodiversidad principales, y los esfuerzos de conservación dirigidos hacia ellos podrían ayudar a evitar la pérdida de la biodiversidad de los arrecifes tropicales.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1067728",
    doi = "10.1126/science.1067728",
    openalex = "W2149529243",
    references = "doi101126science26752011117"
}

Solo registro de metadatos

@misc{openalexw915666225,
    author = "Landell-Mills, Natasha y Porras, I.",
    title = "¿Bala de plata o oro de tontos? Una revisión global de los mercados de servicios ambientales forestales y su impacto en los pobres.",
    year = "2002",
    booktitle = "VTechWorks (Virginia Tech)",
    abstract = "Solo registro de metadatos",
    openalex = "W915666225"
}

Las discusiones sobre el uso sostenible se han polarizado. Los welfaristas se oponen a todo uso que implique matar animales. Entre los conservacionistas, la polarización surge en parte por la falta de distinción entre diferentes ideas anidadas bajo el término paraguas de 'uso sostenible'. Estas incluyen el uso directo como imperativo o elección, el ideal de mantener cualquier uso dentro de límites biológicamente sostenibles, y el uso como una posible estrategia de conservación que puede crear incentivos positivos, que son clave donde la tierra podría de otro modo convertirse en prácticas no amigables con la biodiversidad. Las personas continuarán utilizando recursos vivos silvestres, que las crecientes poblaciones humanas podrían agotar aún más. En respuesta, la comunidad de conservación puede seguir uno de dos enfoques. Por un lado, puede intentar detener el uso mediante la creación de áreas estrictamente protegidas y aplicando la legislación, aunque muchos cuestionarían la posición ética de imponer tal enfoque. Por otro lado, puede trabajar para introducir los sistemas de gestión más amplios necesarios para lograr el uso sostenible y, si es posible, la conservación impulsada por incentivos. Dado que la mayoría de las poblaciones rurales continuarán utilizando recursos vivos silvestres en paisajes dominados por el ser humano, tanto el uso sostenible como la conservación impulsada por incentivos deberían estar en el centro de la agenda de conservación de este siglo. Tanto la gestión basada en especies como la basada en ecosistemas probablemente tendrán un papel en el uso sostenible. Sin embargo, el actual entusiasmo por el enfoque de ecosistemas podría arrojar consecuencias inesperadas, haciendo que la búsqueda de la sostenibilidad sea aún más polarizada. No obstante, el uso directo de especies no puede proporcionar incentivos suficientes para garantizar la continua prestación de servicios de ecosistemas, que deben incorporarse plenamente en el sistema de contabilidad global.

@article{doi101017s0030605303000395,
    author = "Hutton, Jon y Leader‐Williams, Nigel",
    title = "Uso sostenible y conservación impulsada por incentivos: realineando los intereses humanos y de conservación",
    year = "2003",
    journal = "Oryx",
    abstract = "Las discusiones sobre el uso sostenible se han polarizado. Los welfaristas se oponen a todo uso que implique matar animales. Entre los conservacionistas, la polarización surge en parte por la falta de distinción entre diferentes ideas anidadas bajo el término paraguas de 'uso sostenible'. Estas incluyen el uso directo como imperativo o elección, el ideal de mantener cualquier uso dentro de límites biológicamente sostenibles, y el uso como una posible estrategia de conservación que puede crear incentivos positivos, que son clave donde la tierra podría de otro modo convertirse en prácticas no amigables con la biodiversidad. Las personas continuarán utilizando recursos vivos silvestres, que las crecientes poblaciones humanas podrían agotar aún más. En respuesta, la comunidad de conservación puede seguir uno de dos enfoques. Por un lado, puede intentar detener el uso mediante la creación de áreas estrictamente protegidas y aplicando la legislación, aunque muchos cuestionarían la posición ética de imponer tal enfoque. Por otro lado, puede trabajar para introducir los sistemas de gestión más amplios necesarios para lograr el uso sostenible y, si es posible, la conservación impulsada por incentivos. Dado que la mayoría de las poblaciones rurales continuarán utilizando recursos vivos silvestres en paisajes dominados por el ser humano, tanto el uso sostenible como la conservación impulsada por incentivos deberían estar en el centro de la agenda de conservación de este siglo. Tanto la gestión basada en especies como la basada en ecosistemas probablemente tendrán un papel en el uso sostenible. Sin embargo, el actual entusiasmo por el enfoque de ecosistemas podría arrojar consecuencias inesperadas, haciendo que la búsqueda de la sostenibilidad sea aún más polarizada. No obstante, el uso directo de especies no puede proporcionar incentivos suficientes para garantizar la continua prestación de servicios de ecosistemas, que deben incorporarse plenamente en el sistema de contabilidad global.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0030605303000395",
    doi = "10.1017/s0030605303000395",
    openalex = "W2150470222",
    references = "openalexw1546506088"
}

Resumen La creciente preocupación por el impacto ambiental de la agricultura en Europa ha llevado a la introducción de esquemas agroambientales. Estos esquemas compensan a los agricultores financieramente por cualquier pérdida de ingresos asociada a medidas que buscan beneficiar al medio ambiente o la biodiversidad. Actualmente existen esquemas agroambientales en 26 de los 44 países europeos. Los esquemas agroambientales varían notablemente entre países, incluso dentro de la Unión Europea. Los principales objetivos incluyen la reducción de emisiones de nutrientes y pesticidas, la protección de la biodiversidad, la restauración de paisajes y la prevención de la despoblación rural. En prácticamente todos los países, la adopción de esquemas es mayor en zonas de agricultura extensiva donde la biodiversidad sigue siendo relativamente alta y menor en zonas de cultivo intensivo donde la biodiversidad es baja. Se han gastado aproximadamente 24·3 mil millones de euros en esquemas agroambientales en la Unión Europea (UE) desde 1994, una proporción desconocida de la cual en esquemas con objetivos de conservación de la biodiversidad. Realizamos una búsqueda exhaustiva de estudios que prueban la efectividad de los esquemas agroambientales en publicaciones o informes. Solo se encontraron 62 estudios de evaluación procedentes de solo cinco países de la UE y Suiza (5). De hecho, el 76% de los estudios procedían de los Países Bajos y el Reino Unido, donde hasta ahora solo se ha gastado aproximadamente el 6% del presupuesto agroambiental de la UE. Otros estudios procedían de Alemania (6), Irlanda (3) y Portugal (1). En la mayoría de los estudios, el diseño de la investigación era inadecuado para evaluar de manera fiable la efectividad de los esquemas. El 31% no contenía un análisis estadístico. Cuando se utilizó un enfoque experimental, los diseños eran usualmente débiles y sesgados hacia dar un resultado favorable. El diseño experimental más común (37% de los estudios) fue una comparación de la biodiversidad en esquemas agroambientales y áreas de control. Sin embargo, existe un riesgo de sesgo si los agricultores o los coordinadores de los esquemas seleccionan los sitios para los esquemas agroambientales. En tales casos, es probable que los sitios tengan una biodiversidad más alta al principio en comparación con los controles. Este problema puede abordarse recopilando datos de línea base (34% de los estudios), comparando tendencias (32%) o cambios (26%) en la biodiversidad entre áreas con y sin esquemas o emparejando sitios de esquemas y de control que experimentan condiciones ambientales similares (16%). En general, el 54% de las especies (grupos) examinadas demostraron aumentos y el 6% disminuciones en la riqueza o abundancia de especies en comparación con los controles. El 17% mostró aumentos para algunas especies y disminuciones para otras especies, mientras que el 23% no mostró ningún cambio en respuesta a los esquemas agroambientales. La respuesta varió entre taxones. De 19 estudios que examinaron la respuesta de aves e incluían un análisis estadístico, cuatro mostraron aumentos significativos en la riqueza o abundancia de especies, dos mostraron disminuciones y nueve mostraron tanto aumentos como disminuciones. Las cifras comparativas para 20 estudios de artrópodos dieron como resultado 11 estudios que mostraron un aumento en la riqueza o abundancia de especies, ningún estudio mostró una disminución y tres mostraron tanto aumentos como disminuciones. Catorce estudios de plantas dieron como resultado seis estudios que mostraron aumentos en la riqueza o abundancia de especies, dos mostraron disminuciones y ningún estudio mostró tanto aumentos como disminuciones. Síntesis y aplicaciones. La falta de estudios de evaluación robustos no permite un juicio general sobre la efectividad de los esquemas agroambientales europeos. Sugerimos que en el futuro, las evaluaciones ecológicas deben convertirse en una parte integral de cualquier esquema, incluyendo la recopilación de datos de línea base, la colocación aleatoria de sitios de esquemas y de control en áreas con condiciones iniciales similares, y una replicación suficiente. Los resultados de estos estudios deben recopilarse y difundirse de manera más amplia, con el fin de identificar los enfoques y prescripciones que mejor aporten el mejoramiento de la biodiversidad y la rentabilidad del apoyo comunitario.

@article{doi101111j13652664200300868x,
    author = "Kleijn, David and Sutherland, William J.",
    title = "¿Qué tan efectivas son las esquemas agroambientales europeos en la conservación y promoción de la biodiversidad?",
    year = "2003",
    journal = "Journal of Applied Ecology",
    abstract = "Resumen La creciente preocupación por el impacto ambiental de la agricultura en Europa ha llevado a la introducción de esquemas agroambientales. Estos esquemas compensan a los agricultores financieramente por cualquier pérdida de ingresos asociada con medidas que buscan beneficiar al medio ambiente o la biodiversidad. Actualmente existen esquemas agroambientales en 26 de los 44 países europeos. Los esquemas agroambientales varían notablemente entre países, incluso dentro de la Unión Europea. Los principales objetivos incluyen reducir las emisiones de nutrientes y pesticidas, proteger la biodiversidad, restaurar paisajes y prevenir la despoblación rural. En prácticamente todos los países, la adopción de esquemas es mayor en áreas de agricultura extensiva donde la biodiversidad sigue siendo relativamente alta y menor en áreas de cultivo intensivo donde la biodiversidad es baja. Aproximadamente 24,3 mil millones de euros se han gastado en esquemas agroambientales en la Unión Europea (UE) desde 1994, una proporción desconocida de ello en esquemas con objetivos de conservación de la biodiversidad. Realizamos una búsqueda exhaustiva de estudios que prueban la efectividad de los esquemas agroambientales en publicaciones o informes. Solo se encontraron 62 estudios de evaluación procedentes de solo cinco países de la UE y Suiza (5). De hecho, el 76% de los estudios procedían de los Países Bajos y el Reino Unido, donde hasta ahora solo se ha gastado aproximadamente el 6% del presupuesto agroambiental de la UE. Otros estudios procedían de Alemania (6), Irlanda (3) y Portugal (1). En la mayoría de los estudios, el diseño de la investigación era inadecuado para evaluar de manera fiable la efectividad de los esquemas. El 31% no contenía un análisis estadístico. Cuando se utilizó un enfoque experimental, los diseños eran generalmente débiles y sesgados hacia dar un resultado favorable. El diseño experimental más común (37% de los estudios) fue una comparación de la biodiversidad en esquemas agroambientales y áreas de control. Sin embargo, existe un riesgo de sesgo si los agricultores o los coordinadores de los esquemas seleccionan los sitios para los esquemas agroambientales. En tales casos, es probable que los sitios tengan una biodiversidad más alta al principio en comparación con los controles. Este problema puede abordarse recopilando datos de línea base (34% de los estudios), comparando tendencias (32%) o cambios (26%) en la biodiversidad entre áreas con y sin esquemas o emparejando sitios de esquemas y de control que experimentan condiciones ambientales similares (16%). En general, el 54% de las especies (grupos) examinadas demostraron aumentos y el 6% disminuciones en la riqueza o abundancia de especies en comparación con los controles. El 17% mostró aumentos para algunas especies y disminuciones para otras especies, mientras que el 23% no mostró ningún cambio en respuesta a los esquemas agroambientales. La respuesta varió entre taxones. De los 19 estudios que examinaron la respuesta de las aves e incluyeron un análisis estadístico, cuatro mostraron aumentos significativos en la riqueza o abundancia de especies, dos mostraron disminuciones y nueve mostraron tanto aumentos como disminuciones. Las cifras comparativas para 20 estudios de artrópodos arrojaron 11 estudios que mostraron un aumento en la riqueza o abundancia de especies, ningún estudio mostró una disminución y tres mostraron tanto aumentos como disminuciones. Catorce estudios de plantas arrojaron seis estudios que mostraron aumentos en la riqueza o abundancia de especies, dos mostraron disminuciones y ningún estudio mostró tanto aumentos como disminuciones. Síntesis y aplicaciones. La falta de estudios de evaluación robustos no permite un juicio general sobre la efectividad de los esquemas agroambientales europeos. Sugerimos que en el futuro, las evaluaciones ecológicas deben convertirse en una parte integral de cualquier esquema, incluyendo la recopilación de datos de línea base, la colocación aleatoria de sitios de esquemas y de control en áreas con condiciones iniciales similares y una replicación suficiente. Los resultados de estos estudios deben recopilarse y difundirse de manera más amplia, con el fin de identificar los enfoques y prescripciones que mejor entregan el mejoramiento de la biodiversidad y la relación calidad-precio del apoyo comunitario.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2664.2003.00868.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2664.2003.00868.x",
    openalex = "W2119442719",
    references = "openalexw2112482114"
}

Esta es una excelente colección de artículos...Todos están claramente redactados y cualquiera de ellos podría utilizarse en la enseñanza universitaria. Además, la variedad de estudios de casos es impresionantemente global...Los artículos todos exhiben una buena capacidad para provocar...El resultado es un libro agradable que probablemente sea útil para profesores, estudiantes y practicantes del ambientalismo. - Anthropological Forum Los antropólogos saben que la conservación a menudo despoja de poder a grupos ya desfavorecidos, y que también falla en proteger los entornos. A través de una serie de estudios etnográficos, este libro argumenta que el problema real no es la desaparición de la naturaleza virgen ni siquiera las prácticas de uso de la tierra de las personas no educadas. Por el contrario, lo que sabemos sobre los patrones culturalmente determinados de consumo, producción y distribución desigual, sugiere que la atención crítica debería dirigirse mejor a los discursos sobre la primitividad y la naturaleza virgen tan prevalentes dentro de la ideología de conservación, y a las relaciones de poder y intercambio históricamente formadas que ayudan a perpetuar. David G. Anderson es Profesor Senior en el Departamento de Antropología de la Universidad de Aberdeen. Eeva Berglund fue Profesora de Antropología en Goldsmiths College de 1998 a 2002 y ha escrito sobre la antropología e historia de la política ambiental.

@book{openalexw1497677346,
    author = "Anderson, David G. y Berglund, Eeva",
    title = "Etnografías de la conservación: ambientalismo y la distribución del privilegio",
    year = "2003",
    abstract = "Esta es una excelente colección de artículos...Todos están claramente redactados y cualquiera de ellos podría utilizarse en la enseñanza universitaria. Además, la variedad de estudios de casos es impresionantemente global...Los artículos todos exhiben una buena capacidad para provocar...El resultado es un libro agradable que probablemente sea útil para profesores, estudiantes y practicantes del ambientalismo. - Anthropological Forum Los antropólogos saben que la conservación a menudo despoja de poder a grupos ya desfavorecidos, y que también falla en proteger los entornos. A través de una serie de estudios etnográficos, este libro argumenta que el problema real no es la desaparición de la naturaleza virgen ni siquiera las prácticas de uso de la tierra de las personas no educadas. Por el contrario, lo que sabemos sobre los patrones culturalmente determinados de consumo, producción y distribución desigual, sugiere que la atención crítica debería dirigirse mejor a los discursos sobre la primitividad y la naturaleza virgen tan prevalentes dentro de la ideología de conservación, y a las relaciones de poder y intercambio históricamente formadas que ayudan a perpetuar. David G. Anderson es Profesor Senior en el Departamento de Antropología de la Universidad de Aberdeen. Eeva Berglund fue Profesora de Antropología en Goldsmiths College de 1998 a 2002 y ha escrito sobre la antropología e historia de la política ambiental.",
    url = "https://openalex.org/W1497677346",
    openalex = "W1497677346"
}

@article{doi101016jenvsci200402004,
    author = "Colchester, Marcus",
    title = "Política de conservación y pueblos indígenas",
    year = "2004",
    journal = "Environmental Science \& Policy",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.envsci.2004.02.004",
    doi = "10.1016/j.envsci.2004.02.004",
    openalex = "W2040897528",
    references = "openalexw1546506088"
}

@article{doi101016jtree200403018,
    author = "Sutherland, William J. y Pullin, Andrew S. y Dolman, Paul M. y Knight, Teri",
    title = "La necesidad de una conservación basada en la evidencia",
    year = "2004",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2004.03.018",
    doi = "10.1016/j.tree.2004.03.018",
    openalex = "W2096369236"
}

Resumen: La conservación basada en la comunidad (CBC) se basa en la idea de que si la conservación y el desarrollo pudieran lograrse simultáneamente, entonces los intereses de ambos podrían ser atendidos. Ha sido controvertido porque los objetivos de desarrollo comunitario no son necesariamente consistentes con los objetivos de conservación en un caso dado. Examiné la CBC desde dos ángulos. Primero, la CBC puede verse en el contexto de los cambios de paradigma en la ecología y la ecología aplicada. Identifiqué tres cambios conceptuales: hacia una visión de sistemas, hacia la inclusión de los humanos en el ecosistema y hacia enfoques participativos en la gestión de ecosistemas, que están interrelacionados y se refieren a una comprensión de los ecosistemas como sistemas complejos adaptativos en los que los humanos son una parte integral. Segundo, investigué la viabilidad de la CBC, informada por un número de campos interdisciplinarios emergentes que han estado persiguiendo varios aspectos de los sistemas acoplados de humanos y naturaleza. Estos campos—propiedad común, conocimiento ecológico tradicional, ética ambiental, ecología política e historia ambiental—proporcionan perspectivas para la CBC. Pueden contribuir al desarrollo de una ciencia de la conservación interdisciplinaria con una comprensión más sofisticada de las interacciones socioecológicas. Las lecciones de estos campos incluyen la importancia de la conservación a múltiples escalas, la cogestión adaptativa, la cuestión de los incentivos y múltiples partes interesadas, el uso del conocimiento ecológico tradicional y el desarrollo de una ética de conservación transcultural.

@article{doi101111j15231739200400077x,
    author = "Berkes, Fikret",
    title = "Reconsiderando la conservación basada en la comunidad",
    year = "2004",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "Resumen: La conservación basada en la comunidad (CBC) se basa en la idea de que si la conservación y el desarrollo pudieran lograrse simultáneamente, entonces los intereses de ambos podrían ser atendidos. Ha sido controvertido porque los objetivos de desarrollo comunitario no son necesariamente consistentes con los objetivos de conservación en un caso dado. Examiné la CBC desde dos ángulos. Primero, la CBC puede verse en el contexto de los cambios de paradigma en la ecología y la ecología aplicada. Identifiqué tres cambios conceptuales: hacia una visión de sistemas, hacia la inclusión de los humanos en el ecosistema y hacia enfoques participativos en la gestión de ecosistemas, que están interrelacionados y se refieren a una comprensión de los ecosistemas como sistemas complejos adaptativos en los que los humanos son una parte integral. Segundo, investigué la viabilidad de la CBC, informada por un número de campos interdisciplinarios emergentes que han estado persiguiendo varios aspectos de los sistemas acoplados de humanos y naturaleza. Estos campos—propiedad común, conocimiento ecológico tradicional, ética ambiental, ecología política e historia ambiental—proporcionan perspectivas para la CBC. Pueden contribuir al desarrollo de una ciencia de la conservación interdisciplinaria con una comprensión más sofisticada de las interacciones socioecológicas. Las lecciones de estos campos incluyen la importancia de la conservación a múltiples escalas, la cogestión adaptativa, la cuestión de los incentivos y múltiples partes interesadas, el uso del conocimiento ecológico tradicional y el desarrollo de una ética de conservación transcultural.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2004.00077.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2004.00077.x",
    openalex = "W2101873753",
    references = "doi101007s1002100101015, openalexw2010189956"
}

Hemos aplicado la "secuenciación shotgun de genoma completo" a poblaciones microbianas recolectadas en masa en filtros de flujo tangencial e impacto a partir de muestras de agua de mar recolectadas del Mar de Sargasso cerca de Bermudas. Se generaron, anotaron y analizaron un total de 1.045 mil millones de pares de bases de secuencia no redundante para elucidar el contenido génico, la diversidad y la abundancia relativa de los organismos dentro de estas muestras ambientales. Se estima que estos datos derivan de al menos 1800 especies genómicas basadas en la similitud de la secuencia, incluyendo 148 filotipos bacterianos previamente desconocidos. Hemos identificado más de 1,2 millones de genes previamente desconocidos representados en estas muestras, incluyendo más de 782 nuevos fotorreceptores similares a la rodopsina. La variación en las especies presentes y la estequiometría sugiere una diversidad microbiana oceánica sustancial.

@article{doi101126science1093857,
    author = "Venter, J. Craig y Remington, Karin y Heidelberg, John F. y Halpern, Aaron L. y Rusch, Doug y Eisen, Jonathan A. y Wu, Dongying y Paulsen, Ian T. y Nelson, Karen E. y Nelson, William y Fouts, Derrick E. y Lévy, Samuel y Knap, Anthony H. y Lomas, Michael W. y Nealson, K. y White, Owen y Peterson, Jeremy y Hoffman, Jeff y Parsons, Rachel y Baden-Tillson, Holly y Pfannkoch, Cynthia y Rogers, Yu-Hui y Smith, Hamilton O.",
    title = "Secuenciación Shotgun del Genoma Ambiental del Mar de Sargasso",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = {Hemos aplicado la "secuenciación shotgun de genoma completo" a poblaciones microbianas recolectadas en masa en filtros de flujo tangencial e impacto a partir de muestras de agua de mar recolectadas del Mar de Sargasso cerca de Bermudas. Se generaron, anotaron y analizaron un total de 1.045 mil millones de pares de bases de secuencia no redundante para elucidar el contenido génico, la diversidad y la abundancia relativa de los organismos dentro de estas muestras ambientales. Se estima que estos datos derivan de al menos 1800 especies genómicas basadas en la similitud de la secuencia, incluyendo 148 filotipos bacterianos previamente desconocidos. Hemos identificado más de 1,2 millones de genes previamente desconocidos representados en estas muestras, incluyendo más de 782 nuevos fotorreceptores similares a la rodopsina. La variación en las especies presentes y la estequiometría sugiere una diversidad microbiana oceánica sustancial.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1093857",
    doi = "10.1126/science.1093857",
    openalex = "W2113601822",
    references = "doi101038nature01947, doi101073pnas142680199, doi101093nargkg039, doi101093nargkg095, doi101126science28754612196, doi101126science28954861902, doi101128aem335122512281977, doi101128aem666254125472000, doi1023073875, openalexw1558982506"
}

Es ampliamente aceptado que la pérdida de biodiversidad y la pobreza son problemas vinculados y que la conservación y la reducción de la pobreza deben abordarse conjuntamente. Sin embargo, el éxito con estrategias integradas es elusivo. Existe un debate intenso sobre los impactos sociales de los programas de conservación y el éxito de los enfoques basados en la comunidad para la conservación. Se necesitan marcos conceptuales claros si las políticas en estas dos áreas van a combinarse. Revisamos los vínculos entre la erradicación de la pobreza y la conservación de la biodiversidad y presentamos una tipología conceptual de estas relaciones.

@article{doi101126science1097920,
    author = "Adams, William M. y Aveling, Ros y Brockington, Dan y Dickson, Barney y Elliott, J y Hutton, Jon y Roe, Dilys y Vira, Bhaskar y Wolmer, William",
    title = "Conservación de la biodiversidad y la erradicación de la pobreza",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = "Es ampliamente aceptado que la pérdida de biodiversidad y la pobreza son problemas vinculados y que la conservación y la reducción de la pobreza deben abordarse conjuntamente. Sin embargo, el éxito con estrategias integradas es elusivo. Existe un debate intenso sobre los impactos sociales de los programas de conservación y el éxito de los enfoques basados en la comunidad para la conservación. Se necesitan marcos conceptuales claros si las políticas en estas dos áreas van a combinarse. Revisamos los vínculos entre la erradicación de la pobreza y la conservación de la biodiversidad y presentamos una tipología conceptual de estas relaciones.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1097920",
    doi = "10.1126/science.1097920",
    openalex = "W2073321019"
}

La conservación de sitios es una de las formas más efectivas para reducir la pérdida global de biodiversidad. Por lo tanto, es fundamental identificar aquellos sitios donde la biodiversidad única debe conservarse inmediatamente. Con este fin, se ha desarrollado el concepto de áreas de biodiversidad clave (KBAs), buscando identificar y, en última instancia, garantizar que las redes de sitios de importancia global estén protegidas. Esta metodología se basa en la identificación de objetivos de conservación de especies (a través de la Lista Roja de la UICN) y se enmarca dentro de enfoques de conservación a mayor escala. Los sitios se seleccionan utilizando criterios estandarizados, aplicables a nivel global y basados en umbrales, impulsados por la distribución y la población de especies que requieren conservación a nivel de sitio. Los criterios abordan los dos problemas clave para establecer prioridades de conservación de sitios: vulnerabilidad e irremplazabilidad. También proponemos umbrales cuantitativos para la identificación de KBAs que cumplan cada criterio, basados en una revisión de los enfoques existentes y la teoría ecológica hasta la fecha. Sin embargo, estos umbrales requieren una extensa prueba, especialmente en sistemas acuáticos.

@article{doi1016410006356820040541110kbaasc20co2,
    author = "Eken, Güven y Bennun, Leon y Brooks, Thomas M. y Darwall, Will y Fishpool, Lincoln y Foster, Matt y Knox, David y Langhammer, Penny F. y Matiku, Paul y Radford, Elizabeth A. y Salaman, Paul y Sechrest, Wes y Smith, Michael L. y Spector, Sacha y Tordoff, Andrew W.",
    title = "Áreas de Biodiversidad Clave como Objetivos de Conservación de Sitios",
    year = "2004",
    journal = "BioScience",
    abstract = "La conservación de sitios es una de las formas más efectivas para reducir la pérdida global de biodiversidad. Por lo tanto, es fundamental identificar aquellos sitios donde la biodiversidad única debe conservarse inmediatamente. Con este fin, se ha desarrollado el concepto de áreas de biodiversidad clave (KBAs), buscando identificar y, en última instancia, garantizar que las redes de sitios de importancia global estén protegidas. Esta metodología se basa en la identificación de objetivos de conservación de especies (a través de la Lista Roja de la UICN) y se enmarca dentro de enfoques de conservación a mayor escala. Los sitios se seleccionan utilizando criterios estandarizados, aplicables a nivel global y basados en umbrales, impulsados por la distribución y la población de especies que requieren conservación a nivel de sitio. Los criterios abordan los dos problemas clave para establecer prioridades de conservación de sitios: vulnerabilidad e irremplazabilidad. También proponemos umbrales cuantitativos para la identificación de KBAs que cumplan cada criterio, basados en una revisión de los enfoques existentes y la teoría ecológica hasta la fecha. Sin embargo, estos umbrales requieren una extensa prueba, especialmente en sistemas acuáticos.",
    url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2004)054[1110:kbaasc]2.0.co;2",
    doi = "10.1641/0006-3568(2004)054[1110:kbaasc]2.0.co;2",
    openalex = "W2154735712"
}

La biodiversidad de agua dulce es la prioridad de conservación más importante durante la Década Internacional de la Acción - 'Agua para la Vida' - de 2005 a 2015. El agua dulce constituye solo el 0,01% del agua del mundo y aproximadamente el 0,8% de la superficie de la Tierra, sin embargo esta pequeña fracción del agua global alberga al menos 100.000 especies de aproximadamente 1,8 millones, casi el 6% de todas las especies descritas. Las aguas continentales y la biodiversidad de agua dulce constituyen un recurso natural valioso en términos económicos, culturales, estéticos, científicos y educativos. Su conservación y gestión son críticas para los intereses de todos los seres humanos, naciones y gobiernos. Sin embargo, este patrimonio preciado está en crisis. Las aguas dulces están experimentando disminuciones en la biodiversidad mucho mayores que las de los ecosistemas terrestres más afectados, y si las tendencias en la demanda humana de agua permanecen sin cambios y las pérdidas de especies continúan a las tasas actuales, la oportunidad de conservar gran parte de la biodiversidad restante en agua dulce desaparecerá antes de que termine la década 'Agua para la Vida' en 2015. ¿Por qué es así y qué se está haciendo al respecto? Este artículo explora las características especiales de los hábitats de agua dulce y la biodiversidad que sostienen que los hace especialmente vulnerables a las actividades humanas. Documentamos las amenazas a la biodiversidad global de agua dulce bajo cinco encabezados: sobreexplotación; contaminación del agua; modificación del flujo; destrucción o degradación del hábitat; e invasión por especies exóticas. Sus influencias combinadas e interactivas han resultado en disminuciones poblacionales y reducción del rango de la biodiversidad de agua dulce en todo el mundo. La conservación de la biodiversidad se complica por la posición del paisaje de los ríos y humedales como 'receptores' de efluentes del uso del suelo, y los problemas planteados por el endemismo y por tanto la no sustituibilidad. Además, en muchas partes del mundo, el agua dulce está sujeta a una competencia severa entre múltiples partes interesadas humanas. La protección de la biodiversidad de agua dulce es quizás el desafío de conservación definitivo porque está influenciada por la red de drenaje aguas arriba, la tierra circundante, la zona ribereña y -en el caso de la fauna acuática migratoria- tramos aguas abajo. Tales requisitos apenas se cumplen nunca. Se necesita acción inmediata donde existan oportunidades para apartar ecosistemas de lagos y ríos intactos dentro de grandes áreas protegidas. Para la mayor parte de la superficie terrestre global, son necesarias compensaciones entre la conservación de la biodiversidad de agua dulce y el uso humano de bienes y servicios del ecosistema. Abogamos por continuar los intentos de frenar la pérdida de especies pero, en muchas situaciones, instamos a adoptar una posición de compromiso de gestión para la conservación de la biodiversidad, el funcionamiento del ecosistema y la resiliencia, y los medios de vida humanos para proporcionar una base viable a largo plazo para la conservación de agua dulce. El reconocimiento de esta necesidad requerirá la adopción de un nuevo paradigma para la protección de la biodiversidad y la gestión de ecosistemas de agua dulce -uno que ha sido apropiadamente denominado 'ecología de reconciliación'.

@article{doi101017s1464793105006950,
    author = "Dudgeon, David and Arthington, Angela H. and Gessner, Mark O. and Kawabata, Zen'ichiro y Knowler, Duncan y Lévêque, Christian y Naiman, Robert J. y Prieur‐Richard, Anne‐Hélène y Soto, Doris y Stiassny, Melanie L. J. y Sullivan, Caroline A",
    title = "Biodiversidad de agua dulce: importancia, amenazas, estado y desafíos de conservación",
    year = "2005",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Sociedad Filosófica de Cambridge",
    abstract = "La biodiversidad de agua dulce es la prioridad de conservación principal durante la Década Internacional de la Acción - 'Agua para la Vida' - 2005 a 2015. El agua dulce constituye solo el 0,01% del agua del mundo y aproximadamente el 0,8% de la superficie de la Tierra, sin embargo esta pequeña fracción del agua global alberga al menos 100000 especies de aproximadamente 1,8 millones - casi el 6% de todas las especies descritas. Las aguas continentales y la biodiversidad de agua dulce constituyen un recurso natural valioso, en términos económicos, culturales, estéticos, científicos y educativos. Su conservación y gestión son críticas para los intereses de todos los humanos, naciones y gobiernos. Sin embargo, este patrimonio preciado está en crisis. Las aguas dulces están experimentando disminuciones en la biodiversidad mucho mayores que las de los ecosistemas terrestres más afectados, y si las tendencias en la demanda humana de agua permanecen sin cambios y las pérdidas de especies continúan a las tasas actuales, la oportunidad de conservar gran parte de la biodiversidad restante en agua dulce desaparecerá antes de que termine la década 'Agua para la Vida' en 2015. ¿Por qué es así, y qué se está haciendo al respecto? Este artículo explora las características especiales de los hábitats de agua dulce y la biodiversidad que sostienen que los hace especialmente vulnerables a las actividades humanas. Documentamos las amenazas a la biodiversidad global de agua dulce bajo cinco encabezados: sobreexplotación; contaminación del agua; modificación del flujo; destrucción o degradación del hábitat; e invasión por especies exóticas. Sus influencias combinadas e interactivas han resultado en disminuciones poblacionales y reducción del rango de la biodiversidad de agua dulce en todo el mundo. La conservación de la biodiversidad se complica por la posición del paisaje de los ríos y humedales como 'receptores' de efluentes del uso de la tierra, y los problemas planteados por el endemismo y por tanto la no sustituibilidad. Además, en muchas partes del mundo, el agua dulce está sujeta a una competencia severa entre múltiples partes interesadas humanas. La protección de la biodiversidad de agua dulce es quizás el desafío de conservación definitivo porque está influenciada por la red de drenaje aguas arriba, la tierra circundante, la zona ribereña, y - en el caso de la fauna acuática migratoria - tramos aguas abajo. Tales requisitos apenas se cumplen nunca. Se necesita acción inmediata donde existan oportunidades para apartar ecosistemas de lagos y ríos intactos dentro de grandes áreas protegidas. Para la mayor parte de la superficie terrestre global, son necesarios compromisos entre la conservación de la biodiversidad de agua dulce y el uso humano de bienes y servicios del ecosistema. Abogamos por continuar los intentos de frenar la pérdida de especies pero, en muchas situaciones, instamos a la adopción de una posición de compromiso de gestión para la conservación de la biodiversidad, el funcionamiento del ecosistema y la resiliencia, y los medios de vida humanos con el fin de proporcionar una base viable a largo plazo para la conservación de agua dulce. El reconocimiento de esta necesidad requerirá la adopción de un nuevo paradigma para la protección de la biodiversidad y la gestión de los ecosistemas de agua dulce - uno que ha sido apropiadamente denominado 'ecología de reconciliación'.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s1464793105006950",
    doi = "10.1017/s1464793105006950",
    openalex = "W2107140090",
    references = "doi1010079789400958517, doi101007s1053300403700, doi10103835002501, doi101038387253a0, doi101065espr200212142, doi101093acprofoso97801985208630010001, doi101126science1064088, doi101126science1103538, doi101126science27753331808, doi101126science28754591770, doi101126science2895477284, doi1016410006356820010510933teotwa20co2, doi101890040922, doi1023071313099, doi1023072257385, doi105860choice496872"
}

Resumen El enfoque dominante para la conservación en el siglo XX fue la creación de áreas protegidas de las que se excluía a la gente. Sin embargo, en la década de 1980, los enfoques descentralizados y basados en la comunidad para la conservación de la biodiversidad y la gestión de recursos naturales comenzaron a propagarse rápidamente, especialmente en el sur de África. Desde principios de la década de 1990, ha habido una creciente división entre los defensores de los enfoques basados en la comunidad para la conservación (particularmente la gestión de recursos naturales basada en la comunidad, CBNRM) y los que abogan por un retorno a enfoques más tradicionales de preservacionismo para la conservación de la biodiversidad. Aquí examinamos el crecimiento de la narrativa comunitaria y el posterior renacimiento de lo que llamamos el movimiento «de vuelta a las barreras». Discutimos la importancia de diversos actores y conjuntos de ideas políticas para este renacimiento en África. Los cambios en las narrativas han tenido impactos profundos sobre la conservación y la gestión de recursos naturales, las estrategias de subsistencia y los procesos políticos. Sugerimos que el debate político necesita volverse menos formulaico si los resultados han de ser positivos.

@article{doi1010800803941020059666319,
    author = "Hutton, Jon y Adams, William M. y Murombedzi, James",
    title = "¿De vuelta a las barreras? Narrativas cambiantes en la conservación de la biodiversidad",
    year = "2005",
    journal = "Forum for Development Studies",
    abstract = "Resumen El enfoque dominante para la conservación en el siglo XX fue la creación de áreas protegidas de las que se excluía a la gente. Sin embargo, en la década de 1980, los enfoques descentralizados y basados en la comunidad para la conservación de la biodiversidad y la gestión de recursos naturales comenzaron a propagarse rápidamente, especialmente en el sur de África. Desde principios de la década de 1990, ha habido una creciente división entre los defensores de los enfoques basados en la comunidad para la conservación (particularmente la gestión de recursos naturales basada en la comunidad, CBNRM) y los que abogan por un retorno a enfoques más tradicionales de preservacionismo para la conservación de la biodiversidad. Aquí examinamos el crecimiento de la narrativa comunitaria y el posterior renacimiento de lo que llamamos el movimiento «de vuelta a las barreras». Discutimos la importancia de diversos actores y conjuntos de ideas políticas para este renacimiento en África. Los cambios en las narrativas han tenido impactos profundos sobre la conservación y la gestión de recursos naturales, las estrategias de subsistencia y los procesos políticos. Sugerimos que el debate político necesita volverse menos formulaico si los resultados han de ser positivos.",
    url = "https://doi.org/10.1080/08039410.2005.9666319",
    doi = "10.1080/08039410.2005.9666319",
    openalex = "W2039275157",
    references = "doi105860choice330904, openalexw1546506088"
}

Los pagos por servicios ambientales (PSA) forman parte de un nuevo paradigma de conservación más directo, reconociendo explícitamente la necesidad de conciliar los intereses de los propietarios de la tierra y los agentes externos. Evaluaciones teóricas elocuentes han alabado las ventajas absolutas de los PSA frente a los enfoques tradicionales de conservación. Existen algunos proyectos piloto de PSA en los trópicos, pero muchos profesionales de campo, compradores y vendedores potenciales de servicios permanecen escépticos respecto al concepto. Este artículo busca ayudar a desmitificar los PSA para no economistas, comenzando con una definición simple y coherente del término. A continuación, ofrece consejos prácticos sobre el diseño de los PSA. Examina el nicho probable de los PSA en el portafolio de enfoques de conservación. Esta evaluación se basa en una revisión de la literatura, combinada con observaciones de campo de investigaciones en América Latina y Asia. Concluye que los usuarios de servicios seguirán impulsando los PSA, pero su disposición a pagar solo aumentará si los esquemas pueden demostrar una adición clara en relación con líneas base cuidadosamente establecidas, si se mantienen procesos de construcción de confianza con los proveedores de servicios y si se comprende mejor la dinámica de medios de vida de los receptores de PSA. Los PSA se adaptan mejor a escenarios de amenaza intermedios y/o proyectados, a menudo en tierras marginales con costos de oportunidad de conservación moderados. Las personas que enfrentan degradación ambiental creíble pero de tamaño medio tienen más probabilidades de convertirse en receptores de PSA que aquellas que viven en relativa armonía con la Naturaleza. La elección entre pagos en efectivo y en especie de PSA depende altamente del contexto. Los receptores pobres de PSA probablemente se beneficiarán de la participación, aunque su acceso podría estar limitado y los pobres sin tierra que no participen podrían perder. Los PSA son un enfoque de conservación muy prometedor que puede beneficiar a compradores y vendedores e mejorar la base de recursos, pero es poco probable que supere completamente a otros instrumentos de conservación.

@book{doi1017528cifor001760,
    author = "Wunder, Sven",
    title = "Pagos por servicios ambientales: algunos detalles técnicos",
    year = "2005",
    booktitle = "eBooks del Centro de Investigación Forestal Internacional (CIFOR)",
    abstract = "Los pagos por servicios ambientales (PSA) forman parte de un nuevo paradigma de conservación más directo, reconociendo explícitamente la necesidad de conciliar los intereses de los propietarios de la tierra y los agentes externos. Evaluaciones teóricas elocuentes han alabado las ventajas absolutas de los PSA frente a los enfoques tradicionales de conservación. Existen algunos proyectos piloto de PSA en los trópicos, pero muchos profesionales de campo, compradores y vendedores potenciales de servicios permanecen escépticos respecto al concepto. Este artículo busca ayudar a desmitificar los PSA para no economistas, comenzando con una definición simple y coherente del término. A continuación, ofrece consejos prácticos sobre el diseño de los PSA. Examina el nicho probable de los PSA en el portafolio de enfoques de conservación. Esta evaluación se basa en una revisión de la literatura, combinada con observaciones de campo de investigaciones en América Latina y Asia. Concluye que los usuarios de servicios seguirán impulsando los PSA, pero su disposición a pagar solo aumentará si los esquemas pueden demostrar una adición clara en relación con líneas base cuidadosamente establecidas, si se mantienen procesos de construcción de confianza con los proveedores de servicios y si se comprende mejor la dinámica de medios de vida de los receptores de PSA. Los PSA se adaptan mejor a escenarios de amenaza intermedios y/o proyectados, a menudo en tierras marginales con costos de oportunidad de conservación moderados. Las personas que enfrentan degradación ambiental creíble pero de tamaño medio tienen más probabilidades de convertirse en receptores de PSA que aquellas que viven en relativa armonía con la Naturaleza. La elección entre pagos en efectivo y en especie de PSA depende altamente del contexto. Los receptores pobres de PSA probablemente se beneficiarán de la participación, aunque su acceso podría estar limitado y los pobres sin tierra que no participen podrían perder. Los PSA son un enfoque de conservación muy prometedor que puede beneficiar a compradores y vendedores e mejorar la base de recursos, pero es poco probable que supere completamente a otros instrumentos de conservación.",
    url = "https://doi.org/10.17528/cifor/001760",
    doi = "10.17528/cifor/001760",
    openalex = "W1836765585"
}

@article{doi101016jtree200611004,
    author = "Bickford, David y Lohman, David J. y Sodhi, Navjot S. y Ng, Peter K. L. y Meier, Rudolf y Winker, Kevin y Ingram, Krista K. y Das, Indraneil",
    title = "Especies crípticas como una ventana a la diversidad y la conservación",
    year = "2006",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2006.11.004",
    doi = "10.1016/j.tree.2006.11.004",
    openalex = "W2116226846",
    references = "doi1010079781461523819, doi101016jtree200501003, doi10103835059215, doi101073pnas0406166101, doi101098rspb20022218, doi101146annurevecolsys34012103144032, doi101146annureves24110193001201, doi101146annureves25110194002555, doi104159harvard9780674865327, doi107312steb94536"
}

Resumen Como se argumentó recientemente en Forum for Development Studies, un enfoque de 'volver a las barreras' para la conservación de la biodiversidad está nuevamente predominando, después de unas dos décadas de énfasis en iniciativas 'basadas en la comunidad'. Esto implica el establecimiento y expansión de parques nacionales de los cuales se excluye a las personas de diversas maneras. En este artículo, sin embargo, sugiero que los enfoques basados en la comunidad, como la Gestión de Recursos Naturales Basada en la Comunidad (CBNRM), siguen siendo importantes y, de muchas maneras, simplemente constituyen el otro lado de la misma moneda de la práctica de conservación moderna bajo el marco de valores políticos, económicos y culturales del neoliberalismo. Mi objetivo es destacar algunas conceptualizaciones y racionalizaciones compartidas respecto a las percepciones de 'el medio ambiente' y de las relaciones entre las personas y el medio ambiente que informan tanto estas dos amplias orientaciones de política y práctica hacia la 'conservación de la biodiversidad'. El artículo, por lo tanto, se basa en un análisis foucaultiano para 'problematizar' la episteme neoliberal contemporánea y globalizadora dentro de la cual se producen ambos estos enfoques; y para abrir un espacio donde las orientaciones (hacia 'el medio ambiente') que son 'otras' y, por lo tanto, silenciadas por este marco puedan ser articuladas.

@article{doi1010800803941020069666337,
    author = "Sullivan, Sian",
    title = "Elephant in the Room? Problematising 'New' (Neoliberal) Biodiversity Conservation",
    year = "2006",
    journal = "Forum for Development Studies",
    abstract = "Resumen Como se argumentó recientemente en Forum for Development Studies, un enfoque de 'volver a las barreras' para la conservación de la biodiversidad está nuevamente predominando, después de unas dos décadas de énfasis en iniciativas 'basadas en la comunidad'. Esto implica el establecimiento y expansión de parques nacionales de los cuales se excluye a las personas de diversas maneras. En este artículo, sin embargo, sugiero que los enfoques basados en la comunidad, como la Gestión de Recursos Naturales Basada en la Comunidad (CBNRM), siguen siendo importantes y, de muchas maneras, simplemente constituyen el otro lado de la misma moneda de la práctica de conservación moderna bajo el marco de valores políticos, económicos y culturales del neoliberalismo. Mi objetivo es destacar algunas conceptualizaciones y racionalizaciones compartidas respecto a las percepciones de 'el medio ambiente' y de las relaciones entre las personas y el medio ambiente que informan tanto estas dos amplias orientaciones de política y práctica hacia la 'conservación de la biodiversidad'. El artículo, por lo tanto, se basa en un análisis foucaultiano para 'problematizar' la episteme neoliberal contemporánea y globalizadora dentro de la cual se producen ambos estos enfoques; y para abrir un espacio donde las orientaciones (hacia 'el medio ambiente') que son 'otras' y, por lo tanto, silenciadas por este marco puedan ser articuladas.",
    url = "https://doi.org/10.1080/08039410.2006.9666337",
    doi = "10.1080/08039410.2006.9666337",
    openalex = "W2028878025",
    references = "openalexw1497677346"
}

Un número creciente de disciplinas aplicadas está utilizando marcos basados en la evidencia para revisar y difundir la efectividad de las intervenciones de gestión y políticas. La premisa es que el mayor acceso a la mejor evidencia disponible proporcionará una plataforma más eficiente y menos sesgada para la toma de decisiones. Argumentamos que existen beneficios significativos para la conservación al utilizar tal marco, pero la comunidad científica necesita realizar y difundir más revisiones sistemáticas antes de que se pueda lograr el beneficio completo. Diseñamos un conjunto de directrices para realizar una revisión sistemática formalizada, basada en un modelo de servicios de salud. Las etapas de la directriz incluyen la planificación y realización de una revisión, que incluye la formación del protocolo, la estrategia de búsqueda, la inclusión de datos, la extracción de datos y el análisis. La difusión de la revisión se aborda en términos de desarrollos actuales y planes futuros para una biblioteca de acceso abierto basada en la web. Mediante el uso de estudios de caso, destacamos modificaciones críticas a las directrices para la formulación de protocolos, la evaluación de la calidad de los datos, la extracción de datos y la síntesis de datos para la conservación y la gestión ambiental. Los datos ecológicos presentaron desafíos significativos pero solucionables para el proceso de revisión sistemática, particularmente en términos de la cantidad, accesibilidad y diversa calidad de los datos disponibles. En el campo de la conservación y la gestión ambiental, es necesario un mayor compromiso de científicos y profesionales para desarrollar y asumir la propiedad de un marco basado en la evidencia.

@article{doi101111j15231739200600485x,
    author = "Pullin, Andrew S. y Stewart, Gavin",
    title = "Directrices para la revisión sistemática en conservación y gestión ambiental",
    year = "2006",
    journal = "Biología de la conservación",
    abstract = "Un número creciente de disciplinas aplicadas está utilizando marcos basados en la evidencia para revisar y difundir la efectividad de las intervenciones de gestión y políticas. La premisa es que el mayor acceso a la mejor evidencia disponible proporcionará una plataforma más eficiente y menos sesgada para la toma de decisiones. Argumentamos que existen beneficios significativos para la conservación al utilizar tal marco, pero la comunidad científica necesita realizar y difundir más revisiones sistemáticas antes de que se pueda lograr el beneficio completo. Diseñamos un conjunto de directrices para realizar una revisión sistemática formalizada, basada en un modelo de servicios de salud. Las etapas de la directriz incluyen la planificación y realización de una revisión, que incluye la formación del protocolo, la estrategia de búsqueda, la inclusión de datos, la extracción de datos y el análisis. La difusión de la revisión se aborda en términos de desarrollos actuales y planes futuros para una biblioteca de acceso abierto basada en la web. Mediante el uso de estudios de caso, destacamos modificaciones críticas a las directrices para la formulación de protocolos, la evaluación de la calidad de los datos, la extracción de datos y la síntesis de datos para la conservación y la gestión ambiental. Los datos ecológicos presentaron desafíos significativos pero solucionables para el proceso de revisión sistemática, particularmente en términos de la cantidad, accesibilidad y diversa calidad de los datos disponibles. En el campo de la conservación y la gestión ambiental, es necesario un mayor compromiso de científicos y profesionales para desarrollar y asumir la propiedad de un marco basado en la evidencia.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2006.00485.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2006.00485.x",
    openalex = "W2027094073",
    references = "doi101001jama199503520290060030, doi101001jama2735408, doi101001jama282111054, doi1010029781119536604, doi101016019724569400031w, doi101016jtree200403018, doi101177001316446002000104, doi1023071164691, doi1023072533295, openalexw612372977"
}

Los pagos por servicios ambientales (PSA) representan una nueva y más directa forma de promover la conservación. Reconocen explícitamente la necesidad de abordar difíciles compensaciones al conectar los intereses de los propietarios de la tierra y los actores externos a través de compensaciones. Las evaluaciones teóricas elogian las ventajas de los PSA sobre los enfoques indirectos, pero en los trópicos la aplicación de los PSA ha permanecido incipiente. Aquí pretendo desmitificar los PSA y aclarar su alcance para su aplicación como herramienta para la conservación tropical. Me centro en el lado de la oferta de los PSA (es decir, cómo convertir la financiación de los PSA en una conservación efectiva en el terreno), que hasta ahora ha sido ampliamente ignorado. Revisé la literatura sobre los PSA para países en desarrollo y combiné estos hallazgos con observaciones de mis propios estudios de campo en América Latina y Asia. Un esquema de PSA, dicho simplemente, es un acuerdo voluntario y condicional entre al menos un "vendedor" y un "comprador" sobre un servicio ambiental bien definido o un uso de la tierra presumido para producir ese servicio. Los principales obstáculos para los PSA efectivos incluyen limitaciones del lado de la demanda y una falta de conocimientos sobre el lado de la oferta en cuanto a la implementación. El diseño de los programas de PSA puede mejorarse delineando explícitamente las líneas base, calculando los costos de oportunidad de la conservación, personalizando las modalidades de pago y dirigiéndose a agentes con reclamaciones de tierra creíbles y amenazas a la conservación. La expansión de los PSA puede ocurrir si los esquemas pueden demostrar una adición clara (es decir, efectos incrementales de conservación en relación con las líneas base predefinidas), si se comprenden mejor las dinámicas de subsistencia de los receptores de los PSA, y si los objetivos de eficiencia se equilibran con consideraciones de equidad. Los PSA son probablemente más adecuados para escenarios de costos de oportunidad de conservación moderados en tierras marginales y en entornos con amenazas emergentes, aún no realizadas. Los actores que representan amenazas creíbles al medio ambiente recibirán con más probabilidad los PSA que aquellos que ya viven en armonía con la naturaleza. Un esquema de PSA puede beneficiar tanto a compradores como a vendedores al mejorar la base de recursos, pero es poco probable que reemplace completamente otros instrumentos de conservación.

@article{doi101111j15231739200600559x,
    author = "Wunder, Sven",
    title = "La eficiencia de los pagos por servicios ambientales en la conservación tropical",
    year = "2006",
    journal = "Biología de la Conservación",
    abstract = {Los pagos por servicios ambientales (PSA) representan una nueva y más directa forma de promover la conservación. Reconocen explícitamente la necesidad de abordar difíciles compensaciones al conectar los intereses de los propietarios de la tierra y los actores externos a través de compensaciones. Las evaluaciones teóricas elogian las ventajas de los PSA sobre los enfoques indirectos, pero en los trópicos la aplicación de los PSA ha permanecido incipiente. Aquí pretendo desmitificar los PSA y aclarar su alcance para su aplicación como herramienta para la conservación tropical. Me centro en el lado de la oferta de los PSA (es decir, cómo convertir la financiación de los PSA en una conservación efectiva en el terreno), que hasta ahora ha sido ampliamente ignorado. Revisé la literatura sobre los PSA para países en desarrollo y combiné estos hallazgos con observaciones de mis propios estudios de campo en América Latina y Asia. Un esquema de PSA, dicho simplemente, es un acuerdo voluntario y condicional entre al menos un "vendedor" y un "comprador" sobre un servicio ambiental bien definido o un uso de la tierra presumido para producir ese servicio. Los principales obstáculos para los PSA efectivos incluyen limitaciones del lado de la demanda y una falta de conocimientos sobre el lado de la oferta en cuanto a la implementación. El diseño de los programas de PSA puede mejorarse delineando explícitamente las líneas base, calculando los costos de oportunidad de la conservación, personalizando las modalidades de pago y dirigiéndose a agentes con reclamaciones de tierra creíbles y amenazas a la conservación. La expansión de los PSA puede ocurrir si los esquemas pueden demostrar una adición clara (es decir, efectos incrementales de conservación en relación con las líneas base predefinidas), si se comprenden mejor las dinámicas de subsistencia de los receptores de los PSA, y si los objetivos de eficiencia se equilibran con consideraciones de equidad. Los PSA son probablemente más adecuados para escenarios de costos de oportunidad de conservación moderados en tierras marginales y en entornos con amenazas emergentes, aún no realizadas. Los actores que representan amenazas creíbles al medio ambiente recibirán con más probabilidad los PSA que aquellos que ya viven en armonía con la naturaleza. Un esquema de PSA puede beneficiar tanto a compradores como a vendedores al mejorar la base de recursos, pero es poco probable que reemplace completamente otros instrumentos de conservación.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2006.00559.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2006.00559.x",
    openalex = "W2082252945",
    references = "doi101016jagee200401015, doi101037003329091256627, doi101111j09567976200400757x, doi101111j15231739200400077x, doi101126science1078104, doi101126science1097920, doi101126science2915501125, doi101371journalpbio0040105, doi1017528cifor001760, openalexw915666225"
}

El campo de la política de conservación debe adoptar métodos de evaluación de programas de última generación para determinar qué funciona y cuándo, si queremos frenar el declive global de la biodiversidad y mejorar la efectividad de las inversiones en conservación.

@article{doi101371journalpbio0040105,
    author = "Ferraro, Paul J. y Pattanayak, Subhrendu K.",
    title = "¿Dinero por nada? Un llamado a la evaluación empírica de las inversiones en conservación de la biodiversidad",
    year = "2006",
    journal = "PLoS Biology",
    abstract = "El campo de la política de conservación debe adoptar métodos de evaluación de programas de última generación para determinar qué funciona y cuándo, si queremos frenar el declive global de la biodiversidad y mejorar la efectividad de las inversiones en conservación.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040105",
    doi = "10.1371/journal.pbio.0040105",
    openalex = "W2027133828"
}

@book{doi10478869781888569797,
    author = "U.S Geological Survey 12201 Sunrise Park Drive, MS-301 Reston, Virginia 20192 y Kolar, Cindy S. y Chapman, Duane y Courtenay, Walter R. y Housel, Christine M. y Williams, James D. y Jennings, Dawn P. y Fish, U.S. y Wildlife Service North Florida Field Office 6620 Southpoint Drive South, Suite 310 Jacksonville, Florida 32216-0958",
    title = "Bigheaded Carps: A Biological Synopsis and Environmental Risk Assessment",
    year = "2007",
    booktitle = "American Fisheries Society eBooks",
    url = "https://doi.org/10.47886/9781888569797",
    doi = "10.47886/9781888569797",
    openalex = "W64675103"
}

"La acción para conservar la biodiversidad, particularmente a través de la creación de áreas protegidas (AP), es inherentemente política. La ecología política es un campo de estudio que abarca las interacciones entre la manera en que se entiende la naturaleza y la política e impactos de la acción ambiental. Este artículo explora la ecología política de la conservación, particularmente el establecimiento de AP. Discute las implicaciones de la idea de naturaleza virgen, los impactos sociales y la política del establecimiento de AP y la manera en que se asignan los beneficios y costos de las AP. Considera tres cuestiones políticas clave en la política de conservación internacional contemporánea: los derechos de los pueblos indígenas, la relación entre la conservación de la biodiversidad y la reducción de la pobreza, y los argumentos de quienes abogan por un retorno a las AP convencionales que excluyen a las personas."

@article{openalexw2117551548,
    author = "Adams, William M. and Hutton, Jon",
    title = "People, Parks and Poverty: Ecología política y conservación de la biodiversidad",
    year = "2007",
    journal = "Repositorio de la Biblioteca Digital de los Commons (Universidad de Indiana)",
    abstract = {"La acción para conservar la biodiversidad, particularmente a través de la creación de áreas protegidas (AP), es inherentemente política. La ecología política es un campo de estudio que abarca las interacciones entre la manera en que se entiende la naturaleza y la política e impactos de la acción ambiental. Este artículo explora la ecología política de la conservación, particularmente el establecimiento de AP. Discute las implicaciones de la idea de naturaleza virgen, los impactos sociales y la política del establecimiento de AP y la manera en que se asignan los beneficios y costos de las AP. Considera tres cuestiones políticas clave en la política de conservación internacional contemporánea: los derechos de los pueblos indígenas, la relación entre la conservación de la biodiversidad y la reducción de la pobreza, y los argumentos de quienes abogan por un retorno a las AP convencionales que excluyen a las personas."},
    openalex = "W2117551548",
    references = "doi101111j13669516200500143x, doi105860choice330904, openalexw1546506088"
}

Los esfuerzos globales para conservar la biodiversidad tienen el potencial de generar beneficios económicos para las personas (es decir, "servicios ecosistémicos"). Sin embargo, no se pueden identificar las regiones para las que la conservación beneficia tanto la biodiversidad como los servicios ecosistémicos a menos que los servicios ecosistémicos puedan cuantificarse y valorarse y mapearse sus áreas de producción. Aquí revisamos la teoría, los datos y los análisis necesarios para producir tales mapas y encontramos que la disponibilidad de datos nos permite cuantificar solo cuatro servicios ecosistémicos con proxies globales imperfectos. Utilizando este conjunto incompleto como ilustración, comparamos los mapas de servicios ecosistémicos con las distribuciones globales de los objetivos convencionales para la conservación de la biodiversidad. Nuestros resultados preliminares muestran que las regiones seleccionadas para maximizar la biodiversidad no proporcionan más servicios ecosistémicos que las regiones elegidas al azar. Además, la concordancia espacial entre diferentes servicios, y entre los servicios ecosistémicos y las prioridades de conservación establecidas, varía ampliamente. A pesar de esta falta de concordancia general, se pueden identificar de manera útil las áreas "ganar-ganar" (regiones importantes tanto para los servicios ecosistémicos como para la biodiversidad), tanto entre las ecorregiones como a escalas más finas dentro de ellas. Se necesita un esfuerzo de investigación interdisciplinario ambicioso para ir más allá de estos análisis preliminares e ilustrativos y evaluar completamente las sinergias y las compensaciones en la conservación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos.

@article{doi101073pnas0707823105,
    author = "Naidoo, Robin and Balmford, Andrew and Costanza, Robert and Fisher, Brendan and Green, R. E. and Lehner, Bernhard and Malcolm, Trent R. and Ricketts, Taylor H.",
    title = "Global mapping of ecosystem services and conservation priorities",
    year = "2008",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Global efforts to conserve biodiversity have the potential to deliver economic benefits to people (i.e., "ecosystem services"). However, regions for which conservation benefits both biodiversity and ecosystem services cannot be identified unless ecosystem services can be quantified and valued and their areas of production mapped. Here we review the theory, data, and analyses needed to produce such maps and find that data availability allows us to quantify imperfect global proxies for only four ecosystem services. Using this incomplete set as an illustration, we compare ecosystem service maps with the global distributions of conventional targets for biodiversity conservation. Our preliminary results show that regions selected to maximize biodiversity provide no more ecosystem services than regions chosen randomly. Furthermore, spatial concordance among different services, and between ecosystem services and established conservation priorities, varies widely. Despite this lack of general concordance, "win-win" areas-regions important for both ecosystem services and biodiversity-can be usefully identified, both among ecoregions and at finer scales within them. An ambitious interdisciplinary research effort is needed to move beyond these preliminary and illustrative analyses to fully assess synergies and trade-offs in conserving biodiversity and ecosystem services.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0707823105",
    doi = "10.1073/pnas.0707823105",
    openalex = "W2027370059",
    references = "doi101111j15231739200600559x"
}

Resumen Dos experimentos de campo examinaron la efectividad de señales que solicitaban la participación de los huéspedes del hotel en un programa de conservación ambiental. Los llamamientos que empleaban normas descriptivas (por ejemplo, "la mayoría de los huéspedes reutilizan sus toallas") resultaron superiores a un llamamiento tradicional ampliamente utilizado por los hoteles que se centraba únicamente en la protección ambiental. Además, los llamamientos normativos fueron más efectivos cuando describían el comportamiento grupal que ocurrió en el entorno que más se ajustaba a las circunstancias situacionales inmediatas de los individuos (por ejemplo, "la mayoría de los huéspedes en esta habitación reutilizan sus toallas"), a lo que nos referimos como normas provinciales. Se discuten las implicaciones teóricas y prácticas para la gestión de esfuerzos proambientales.

@article{doi101086586910,
    author = "Goldstein, Noah J. y Cialdini, Robert B. y Griskevicius, Vladas",
    title = "Una habitación con una perspectiva: Usando normas sociales para motivar la conservación ambiental en hoteles",
    year = "2008",
    journal = "Journal of Consumer Research",
    abstract = "Resumen Dos experimentos de campo examinaron la efectividad de señales que solicitaban la participación de los huéspedes del hotel en un programa de conservación ambiental. Los llamamientos que empleaban normas descriptivas (por ejemplo, "la mayoría de los huéspedes reutilizan sus toallas") resultaron superiores a un llamamiento tradicional ampliamente utilizado por los hoteles que se centraba únicamente en la protección ambiental. Además, los llamamientos normativos fueron más efectivos cuando describían el comportamiento grupal que ocurrió en el entorno que más se ajustaba a las circunstancias situacionales inmediatas de los individuos (por ejemplo, "la mayoría de los huéspedes en esta habitación reutilizan sus toallas"), a lo que nos referimos como normas provinciales. Se discuten las implicaciones teóricas y prácticas para la gestión de esfuerzos proambientales.",
    url = "https://doi.org/10.1086/586910",
    doi = "10.1086/586910",
    openalex = "W2130950828",
    references = "doi101016s0065260108603305, doi101086208911, doi101086209186, doi101086266996, doi101111j14679280200701917x, doi101146annurevpsych55090902142015, doi101177001872675400700202, doi1011770146167296228002, doi1023072089062, openalexw1871433632"
}

La evaluación de la distribución de especies es una fase crítica inicial de los estudios de biodiversidad y es necesaria para muchas disciplinas como la biogeografía, la biología de la conservación y la ecología. Sin embargo, varias especies son difíciles de detectar, especialmente durante períodos de tiempo particulares o etapas de desarrollo, lo que puede sesgar los resultados del estudio. Aquí presentamos un enfoque novedoso, basado en la persistencia limitada del ADN en el medio ambiente, para detectar la presencia de una especie en agua dulce. Utilizamos cebadores específicos que amplifican secuencias cortas de ADN mitocondrial para rastrear la presencia de una rana (Rana catesbeiana) en entornos controlados y humedales naturales. Un enfoque de muestreo múltiple permitió la detección de especies en todos los entornos donde estaba presente, incluso a bajas densidades. La fiabilidad de los resultados se demostró mediante la identificación de fragmentos de ADN amplificados, utilizando técnicas de secuenciación tradicionales y secuenciación por pirronsecuenciación paralela. Dado que el medio ambiente puede retener la huella molecular de las especies que habitan en él, nuestro enfoque permite la detección fiable de organismos sigilosos en humedales sin observación directa. Combinado con la secuenciación masiva y el desarrollo de códigos de barras de ADN que permiten la identificación de especies, este enfoque abre nuevas perspectivas para la evaluación de la biodiversidad actual a partir de muestras ambientales.

@article{doi101098rsbl20080118,
    author = "Ficetola, Gentile Francesco y Miaud, Claude y Pompanon, François y Taberlet, Pierre",
    title = "Detección de especies utilizando ADN ambiental de muestras de agua",
    year = "2008",
    journal = "Biology Letters",
    abstract = "La evaluación de la distribución de especies es una fase crítica inicial de los estudios de biodiversidad y es necesaria para muchas disciplinas como la biogeografía, la biología de la conservación y la ecología. Sin embargo, varias especies son difíciles de detectar, especialmente durante períodos de tiempo particulares o etapas de desarrollo, lo que puede sesgar los resultados del estudio. Aquí presentamos un enfoque novedoso, basado en la persistencia limitada del ADN en el medio ambiente, para detectar la presencia de una especie en agua dulce. Utilizamos cebadores específicos que amplifican secuencias cortas de ADN mitocondrial para rastrear la presencia de una rana (Rana catesbeiana) en entornos controlados y humedales naturales. Un enfoque de muestreo múltiple permitió la detección de especies en todos los entornos donde estaba presente, incluso a bajas densidades. La fiabilidad de los resultados se demostró mediante la identificación de fragmentos de ADN amplificados, utilizando técnicas de secuenciación tradicionales y secuenciación por pirronsecuenciación paralela. Dado que el medio ambiente puede retener la huella molecular de las especies que habitan en él, nuestro enfoque permite la detección fiable de organismos sigilosos en humedales sin observación directa. Combinado con la secuenciación masiva y el desarrollo de códigos de barras de ADN que permiten la identificación de especies, este enfoque abre nuevas perspectivas para la evaluación de la biodiversidad actual a partir de muestras ambientales.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsbl.2008.0118",
    doi = "10.1098/rsbl.2008.0118",
    openalex = "W2131545754",
    references = "doi101038nature03959, doi101046j14610248200100230x, doi101093nar24163189, doi101093nargkl938, doi101111j13652664200601227x, doi101126science1084114, doi101126science1093857, doi101126science28954821139b, doi105860choice421547, openalexw1513215516"
}

Una base esencial de cualquier ciencia es un léxico estándar. Cualquier proyecto de conservación determinado puede describirse en términos de los objetivos de biodiversidad, las amenazas directas, los factores contribuyentes en el sitio del proyecto y las acciones de conservación que el equipo del proyecto está empleando para cambiar la situación. Estos elementos comunes pueden enlazarse en una cadena causal, que representa una teoría del cambio sobre cómo las acciones de conservación están destinadas a producir los resultados del proyecto deseados. Si los equipos de proyectos quieren describir y compartir su trabajo y aprender unos de otros, necesitan un léxico estándar y preciso para describir específicamente cada nodo a lo largo de esta cadena. Hasta la fecha, ha habido varios esfuerzos independientes para desarrollar clasificaciones estándar para las amenazas directas que afectan la biodiversidad y las acciones de conservación necesarias para contrarrestar estas amenazas. Reconociendo que es mucho más efectivo tener solo un esquema global aceptado, fusionamos estos esfuerzos separados en clasificaciones unificadas de amenazas y acciones, que presentamos aquí. Cada clasificación es una lista jerárquica de términos y definiciones asociadas. Las clasificaciones son exhaustivas y exclusivas en los niveles superiores de la jerarquía, expansibles en los niveles inferiores y simples, consistentes y escalables en todos los niveles. Probamos estas clasificaciones aplicándolas post hoc a 1191 especies de aves amenazadas y 737 proyectos de conservación. Casi todas las amenazas y acciones pudieron asignarse a los nuevos sistemas de clasificación, salvo algunos casos que carecían de información detallada. Además, los nuevos sistemas de clasificación proporcionaron una forma mejorada de analizar y comparar información entre proyectos en comparación con los sistemas anteriores. Creemos que la adopción generalizada de estas clasificaciones ayudará a los profesionales a identificar de manera más sistemática las amenazas y las acciones apropiadas, a los gestores para establecer prioridades y asignar recursos de manera más eficiente, y, lo más importante, facilitará el aprendizaje entre proyectos y el desarrollo de una ciencia sistemática de la conservación.

@article{doi101111j15231739200800937x,
    author = "Salafsky, Nick y Salzer, Daniel W. y Stattersfield, Alison J. y Hilton‐Taylor, Craig y Neugarten, Rachel y Butchart, Stuart H. M. y Collen, Ben y Cox, Neil A. y Master, Lawrence L. y O’Connor, Sheila y Wilkie, David",
    title = "Un léxico estándar para la conservación de la biodiversidad: Clasificaciones unificadas de amenazas y acciones",
    year = "2008",
    journal = "Biología de la Conservación",
    abstract = "Una base esencial de cualquier ciencia es un léxico estándar. Cualquier proyecto de conservación determinado puede describirse en términos de los objetivos de biodiversidad, las amenazas directas, los factores contribuyentes en el sitio del proyecto y las acciones de conservación que el equipo del proyecto está empleando para cambiar la situación. Estos elementos comunes pueden enlazarse en una cadena causal, que representa una teoría del cambio sobre cómo las acciones de conservación están destinadas a producir los resultados del proyecto deseados. Si los equipos de proyectos quieren describir y compartir su trabajo y aprender unos de otros, necesitan un léxico estándar y preciso para describir específicamente cada nodo a lo largo de esta cadena. Hasta la fecha, ha habido varios esfuerzos independientes para desarrollar clasificaciones estándar para las amenazas directas que afectan la biodiversidad y las acciones de conservación necesarias para contrarrestar estas amenazas. Reconociendo que es mucho más efectivo tener solo un esquema global aceptado, fusionamos estos esfuerzos separados en clasificaciones unificadas de amenazas y acciones, que presentamos aquí. Cada clasificación es una lista jerárquica de términos y definiciones asociadas. Las clasificaciones son exhaustivas y exclusivas en los niveles superiores de la jerarquía, expansibles en los niveles inferiores y simples, consistentes y escalables en todos los niveles. Probamos estas clasificaciones aplicándolas post hoc a 1191 especies de aves amenazadas y 737 proyectos de conservación. Casi todas las amenazas y acciones pudieron asignarse a los nuevos sistemas de clasificación, salvo algunos casos que carecían de información detallada. Además, los nuevos sistemas de clasificación proporcionaron una forma mejorada de analizar y comparar información entre proyectos en comparación con los sistemas anteriores. Creemos que la adopción generalizada de estas clasificaciones ayudará a los profesionales a identificar de manera más sistemática las amenazas y las acciones apropiadas, a los gestores para establecer prioridades y asignar recursos de manera más eficiente, y, lo más importante, facilitará el aprendizaje entre proyectos y el desarrollo de una ciencia sistemática de la conservación.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2008.00937.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2008.00937.x",
    openalex = "W2068031289",
    references = "doi101111j15231739200600485x"
}

@article{doi101016jbiocon200902021,
    author = "Ribeiro, Milton Cézar y Metzger, Jean Paul y Martensen, Alexandre Camargo y Ponzoni, Flávio Jorge y Hirota, Márcia Makiko",
    title = "El Bosque Atlántico brasileño: ¿Cuánto queda y cómo se distribuye el bosque restante? Implicaciones para la conservación",
    year = "2009",
    journal = "Biological Conservation",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biocon.2009.02.021",
    doi = "10.1016/j.biocon.2009.02.021",
    openalex = "W2104462056",
    references = "doi101016jbiocon200602019, doi101111j14610248200701114x"
}

@article{doi101016jecolecon200911006,
    author = "Muradian, Roldán y Corbera, Esteve y Pascual, Unai y Kosoy, Nicolás y May, Peter H.",
    title = "Conciliando teoría y práctica: Un marco conceptual alternativo para comprender los pagos por servicios ambientales",
    year = "2009",
    journal = "Ecological Economics",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ecolecon.2009.11.006",
    doi = "10.1016/j.ecolecon.2009.11.006",
    openalex = "W2117386630",
    references = "doi101111j15231739200600559x"
}

@article{doi101007s1066101015825,
    author = "Conrad, Cathy y Hilchey, Krista G.",
    title = "A review of citizen science and community-based environmental monitoring: issues and opportunities",
    year = "2010",
    journal = "Environmental Monitoring and Assessment",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10661-010-1582-5",
    doi = "10.1007/s10661-010-1582-5",
    openalex = "W2152608856"
}

¿Por qué la gente compra productos proambientales "verdes"? Argumentamos que comprar tales productos puede interpretarse como altruista, ya que los productos verdes a menudo cuestan más y son de menor calidad que sus contrapartes convencionales, pero los bienes verdes benefician al medio ambiente para todos. Dado que los biólogos han observado que el altruismo podría funcionar como una "señal costosa" asociada con el estatus, examinamos en 3 experimentos cómo los motivos de estatus influyeron en el deseo de productos verdes. Activar los motivos de estatus llevó a la gente a elegir productos verdes sobre productos no verdes más lujosos. Apoyando la noción de que el altruismo señala la voluntad y la capacidad de incurrir en costos por el beneficio de otros, los motivos de estatus aumentaron el deseo de productos verdes cuando se compraba en público (pero no en privado) y cuando los productos verdes costaban más (pero no menos) que los productos no verdes. Los hallazgos sugieren que la competencia por el estatus puede utilizarse para promover el comportamiento proambiental.

@article{doi101037a0017346,
    author = "Griskevicius, Vladas y Tybur, Joshua M. y den Bergh, Bram Van",
    title = "Going green to be seen: Status, reputation, and conspicuous conservation.",
    year = "2010",
    journal = "Journal of Personality and Social Psychology",
    abstract = {¿Por qué la gente compra productos proambientales "verdes"? Argumentamos que comprar tales productos puede interpretarse como altruista, ya que los productos verdes a menudo cuestan más y son de menor calidad que sus contrapartes convencionales, pero los bienes verdes benefician al medio ambiente para todos. Dado que los biólogos han observado que el altruismo podría funcionar como una "señal costosa" asociada con el estatus, examinamos en 3 experimentos cómo los motivos de estatus influyeron en el deseo de productos verdes. Activar los motivos de estatus llevó a la gente a elegir productos verdes sobre productos no verdes más lujosos. Apoyando la noción de que el altruismo señala la voluntad y la capacidad de incurrir en costos por el beneficio de otros, los motivos de estatus aumentaron el deseo de productos verdes cuando se compraba en público (pero no en privado) y cuando los productos verdes costaban más (pero no menos) que los productos no verdes. Los hallazgos sugieren que la competencia por el estatus puede utilizarse para promover el comportamiento proambiental.},
    url = "https://doi.org/10.1037/a0017346",
    doi = "10.1037/a0017346",
    openalex = "W2157399030",
    references = "doi101086586910, doi101111j154045601994tb02420x"
}

Muchos de los servicios suministrados por la naturaleza son externalidades. La teoría económica sugiere que alguna forma de subsidio o contratación entre los beneficiarios y los proveedores podría resultar en un suministro óptimo de servicios ambientales. Además, si los pobres poseen recursos que les otorgan una ventaja comparativa en el suministro de servicios ambientales, entonces los pagos por servicios ambientales (PES) pueden mejorar los resultados ambientales y de pobreza. Aunque la teoría es relativamente sencilla, la práctica no lo es, especialmente en países en desarrollo donde las instituciones son débiles. Este artículo revisa la literatura empírica sobre la adicionalidad de los PES al preguntar: "¿Los pagos entregan servicios ambientales, todo lo demás siendo igual, o, al menos, los cambios en el uso de la tierra que se cree que generan servicios ambientales?" Examinamos tanto estudios de caso cualitativos como análisis cuasi-experimentales econométricos rigurosos. Encontramos que los PES coordinados por el gobierno han causado una reversión modesta o nula de la deforestación. Los estudios de caso de esquemas de PES a menor escala y financiados por los usuarios afirman tener impactos más sustanciales, pero pocos de estos estudios eliminan explicaciones rivales para los efectos positivos. Concluimos discutiendo cómo la escasez de evidencia sobre los impactos de los PES y las preguntas sin responder sobre las condiciones institucionales previas y el "desplazamiento motivacional" limitan las perspectivas de utilizar los pagos internacionales de carbono para reducir las emisiones provenientes de la deforestación y la degradación.

@article{doi101093reepreq006,
    author = "Pattanayak, Subhrendu K. y Wunder, Sven y Ferraro, Paul J.",
    title = "Show Me the Money: Do Payments Supply Environmental Services in Developing Countries?",
    year = "2010",
    journal = "Review of Environmental Economics and Policy",
    abstract = "Muchos de los servicios suministrados por la naturaleza son externalidades. La teoría económica sugiere que alguna forma de subsidio o contratación entre los beneficiarios y los proveedores podría resultar en un suministro óptimo de servicios ambientales. Además, si los pobres poseen recursos que les otorgan una ventaja comparativa en el suministro de servicios ambientales, entonces los pagos por servicios ambientales (PES) pueden mejorar los resultados ambientales y de pobreza. Aunque la teoría es relativamente sencilla, la práctica no lo es, especialmente en países en desarrollo donde las instituciones son débiles. Este artículo revisa la literatura empírica sobre la adicionalidad de los PES al preguntar: "¿Los pagos entregan servicios ambientales, todo lo demás siendo igual, o, al menos, los cambios en el uso de la tierra que se cree que generan servicios ambientales?" Examinamos tanto estudios de caso cualitativos como análisis cuasi-experimentales econométricos rigurosos. Encontramos que los PES coordinados por el gobierno han causado una reversión modesta o nula de la deforestación. Los estudios de caso de esquemas de PES a menor escala y financiados por los usuarios afirman tener impactos más sustanciales, pero pocos de estos estudios eliminan explicaciones rivales para los efectos positivos. Concluimos discutiendo cómo la escasez de evidencia sobre los impactos de los PES y las preguntas sin responder sobre las condiciones institucionales previas y el "desplazamiento motivacional" limitan las perspectivas de utilizar los pagos internacionales de carbono para reducir las emisiones provenientes de la deforestación y la degradación.",
    url = "https://doi.org/10.1093/reep/req006",
    doi = "10.1093/reep/req006",
    openalex = "W2157805396",
    references = "doi101111j15231739200600559x"
}

Los ecosistemas de agua dulce están entre los hábitats más amenazados de la Tierra, con miles de especies animales conocidas que están amenazadas o ya están extintas. La monitorización fiable de organismos amenazados es crucial para las acciones de conservación basadas en datos, pero sigue siendo un desafío debido a métodos no estandarizados que dependen de la experiencia práctica y taxonómica, la cual está disminuyendo rápidamente. Aquí, mostramos que una diversidad de animales de agua dulce raros y amenazados —que representan anfibios, peces, mamíferos, insectos y crustáceos— pueden ser detectados y cuantificados basándose en el ADN obtenido directamente de pequeñas muestras de agua de lagos, estanques y arroyos. Hemos validado exitosamente nuestros hallazgos en un experimento controlado de mesocosma y mostramos que el ADN se vuelve indetectable dentro de las 2 semanas después de la eliminación de los animales, indicando que las trazas de ADN son casi contemporáneas con la presencia de la especie. Además, demostramos que las faunas completas de anfibios y peces pueden ser detectadas mediante secuenciación de alto rendimiento del ADN extraído del agua de estanque. Nuestros hallazgos respaldan la naturaleza ubicua de las trazas de ADN en el medio ambiente y establecen el ADN ambiental como una herramienta para monitorizar especies raras y amenazadas en una amplia gama de grupos taxonómicos.

@article{doi101111j1365294x201105418x,
    author = "Thomsen, Philip Francis y Kielgast, Jos e Iversen, Lars y Wiuf, Carsten y Rasmussen, Morten y Gilbert, M. Thomas P. y Orlando, Ludovic y Willerslev, Eske",
    title = "Monitorización de la biodiversidad de agua dulce en peligro de extinción utilizando ADN ambiental",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Los ecosistemas de agua dulce están entre los hábitats más amenazados de la Tierra, con miles de especies animales conocidas que están amenazadas o ya están extintas. La monitorización fiable de organismos amenazados es crucial para las acciones de conservación basadas en datos, pero sigue siendo un desafío debido a métodos no estandarizados que dependen de la experiencia práctica y taxonómica, la cual está disminuyendo rápidamente. Aquí, mostramos que una diversidad de animales de agua dulce raros y amenazados —que representan anfibios, peces, mamíferos, insectos y crustáceos— pueden ser detectados y cuantificados basándose en el ADN obtenido directamente de pequeñas muestras de agua de lagos, estanques y arroyos. Hemos validado exitosamente nuestros hallazgos en un experimento controlado de mesocosma y mostramos que el ADN se vuelve indetectable dentro de las 2 semanas después de la eliminación de los animales, indicando que las trazas de ADN son casi contemporáneas con la presencia de la especie. Además, demostramos que las faunas completas de anfibios y peces pueden ser detectadas mediante secuenciación de alto rendimiento del ADN extraído del agua de estanque. Nuestros hallazgos respaldan la naturaleza ubicua de las trazas de ADN en el medio ambiente y establecen el ADN ambiental como una herramienta para monitorizar especies raras y amenazadas en una amplia gama de grupos taxonómicos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2011.05418.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2011.05418.x",
    openalex = "W2163290397",
    references = "doi101017s1464793105006950, doi101038362709a0, doi101038nature09678, doi101038nrg2626, doi101098rsbl20080118, doi101111j1755263x201000158x, doi101126science2695222347, doi101126science28754591770, doi101186147121051238, doi105860choice496872"
}

Resumen La gestión efectiva de especies raras, incluidas las especies nativas en peligro de extinción y las especies no nativas introducidas recientemente, requiere la detección de poblaciones de baja densidad. Para las especies en peligro de extinción, detectar la distribución localizada permite identificar y proteger el hábitat crítico para mejorar la supervivencia o el éxito reproductivo. Del mismo modo, la detección temprana de una invasión incipiente por parte de una especie dañina aumenta la viabilidad de respuestas rápidas para erradicar la especie o contener su expansión. Aquí demostramos la eficacia del ADN ambiental (ADNe) como herramienta de detección en ambientes de agua dulce. Específicamente, delimitamos las frentes de invasión de dos especies de carpas asiáticas en los canales y vías de agua del área de Chicago, Illinois, EE. UU. Las comparaciones cuantitativas con herramientas tradicionales de vigilancia pesquera ilustran la mayor sensibilidad del ADNe y revelan que el riesgo de invasión a los Grandes Lagos Laurentianos es inminente.

@article{doi101111j1755263x201000158x,
    author = "Jerde, Christopher L. y Mahon, Andrew R. y Chadderton, W. Lindsay y Lodge, David M.",
    title = "«Sight‐unseen» detection of rare aquatic species using environmental DNA",
    year = "2011",
    journal = "Conservation Letters",
    abstract = "Resumen La gestión efectiva de especies raras, incluidas las especies nativas en peligro de extinción y las especies no nativas introducidas recientemente, requiere la detección de poblaciones de baja densidad. Para las especies en peligro de extinción, detectar la distribución localizada permite identificar y proteger el hábitat crítico para mejorar la supervivencia o el éxito reproductivo. Del mismo modo, la detección temprana de una invasión incipiente por parte de una especie dañina aumenta la viabilidad de respuestas rápidas para erradicar la especie o contener su expansión. Aquí demostramos la eficacia del ADN ambiental (ADNe) como herramienta de detección en ambientes de agua dulce. Específicamente, delimitamos las frentes de invasión de dos especies de carpas asiáticas en los canales y vías de agua del área de Chicago, Illinois, EE. UU. Las comparaciones cuantitativas con herramientas tradicionales de vigilancia pesquera ilustran la mayor sensibilidad del ADNe y revelan que el riesgo de invasión a los Grandes Lagos Laurentianos es inminente.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1755-263x.2010.00158.x",
    doi = "10.1111/j.1755-263x.2010.00158.x",
    openalex = "W1552342091",
    references = "doi101007s1053000481226, doi101016jtree200502004, doi101016s0006320703001903, doi101093bibbbn017, doi101098rsbl20080118, doi101098rspb20022179, doi101111j17550998200902699x, doi1018901051076120060162035birfup20co2, doi10478869781888569797, openalexw2946440777"
}

Duffy (

@article{doi101080104557522012674149,
    author = "Büscher, Bram y Sullivan, Sian y Neves, Katja y Igoe, Jim y Brockington, Dan",
    title = "Hacia una crítica sintetizada de la conservación de la biodiversidad neoliberal",
    year = "2012",
    journal = "Capitalismo Naturaleza Socialismo",
    abstract = "Duffy (",
    url = "https://doi.org/10.1080/10455752.2012.674149",
    doi = "10.1080/10455752.2012.674149",
    openalex = "W2095184253",
    references = "doi101016s0016718502000891, openalexw1497677346"
}

El ADN ambiental (eDNA) de vertebrados acuáticos se ha utilizado recientemente para estimar la presencia de una especie. Hipotetizamos que los peces liberan ADN al agua a una tasa proporcional a su biomasa. Por lo tanto, la concentración de eDNA de una especie objetivo puede utilizarse para estimar la biomasa de la especie. Desarrollamos un método de eDNA para estimar la biomasa de la carpa común (Cyprinus carpio L.) utilizando experimentos de laboratorio y de campo. En el acuario, la concentración de eDNA cambió inicialmente, pero alcanzó un equilibrio después de 6 días. La temperatura no tuvo efecto sobre las concentraciones de eDNA en los acuarios. La concentración de eDNA estuvo positivamente correlacionada con la biomasa de la carpa tanto en acuarios como en estanques experimentales. Utilizamos este método para estimar la biomasa y la distribución de la carpa en una laguna de agua dulce natural. Demostramos que la distribución de la concentración de eDNA de la carpa se explica por la temperatura del agua. Nuestros resultados sugieren que los datos de biomasa estimados a partir de la concentración de eDNA reflejan la distribución potencial de la carpa común en el entorno natural. Medir la concentración de eDNA ofrece un método no invasivo, sencillo y rápido para estimar la biomasa. Este método podría informar los planes de gestión para la conservación de los ecosistemas.

@article{doi101371journalpone0035868,
    author = "Takahara, Teruhiko y Minamoto, Toshifumi y Yamanaka, Hiroki y Doi, Hideyuki y Kawabata, Zen'ichiro",
    title = "Estimación de la biomasa de peces utilizando ADN ambiental",
    year = "2012",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "El ADN ambiental (eDNA) de vertebrados acuáticos se ha utilizado recientemente para estimar la presencia de una especie. Hipotetizamos que los peces liberan ADN al agua a una tasa proporcional a su biomasa. Por lo tanto, la concentración de eDNA de una especie objetivo puede utilizarse para estimar la biomasa de la especie. Desarrollamos un método de eDNA para estimar la biomasa de la carpa común (Cyprinus carpio L.) utilizando experimentos de laboratorio y de campo. En el acuario, la concentración de eDNA cambió inicialmente, pero alcanzó un equilibrio después de 6 días. La temperatura no tuvo efecto sobre las concentraciones de eDNA en los acuarios. La concentración de eDNA estuvo positivamente correlacionada con la biomasa de la carpa tanto en acuarios como en estanques experimentales. Utilizamos este método para estimar la biomasa y la distribución de la carpa en una laguna de agua dulce natural. Demostramos que la distribución de la concentración de eDNA de la carpa se explica por la temperatura del agua. Nuestros resultados sugieren que los datos de biomasa estimados a partir de la concentración de eDNA reflejan la distribución potencial de la carpa común en el entorno natural. Medir la concentración de eDNA ofrece un método no invasivo, sencillo y rápido para estimar la biomasa. Este método podría informar los planes de gestión para la conservación de los ecosistemas.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0035868",
    doi = "10.1371/journal.pone.0035868",
    openalex = "W2063726689",
    references = "doi101111j13652427200601592x"
}

Los ecosistemas marinos de todo el mundo están amenazados, con muchas especies y poblaciones de peces sufriendo la sobreexplotación humana. Esto está impactando gravemente la biodiversidad global, la economía y la salud humana. Intrigantemente, los peces marinos se investigan principalmente mediante métodos selectivos e invasivos, que se limitan mayormente a especies comerciales y están restringidos a áreas particulares con condiciones favorables. Además, la identificación errónea de especies representa un problema mayor. Aquí, investigamos el potencial de utilizar el metabarcoding del ADN ambiental (ADNe) obtenido directamente de muestras de agua de mar para contabilizar la biodiversidad de peces marinos. Este enfoque de ADNe ha sido utilizado recientemente con éxito en entornos de agua dulce, pero nunca en entornos marinos. Aislamos ADNe de muestras de agua de mar de ½ litro recolectadas en un ecosistema marino templado en Dinamarca. Utilizando secuenciación de ADN de nueva generación de amplicones de PCR, obtenemos ADNe de 15 especies de peces diferentes, incluidas tanto especies de consumo importantes como especies raramente o nunca registradas por el monitoreo convencional. También detectamos ADNe de una especie vagante rara en el área; anchoa europea (Sardina pilchardus). Además, detectamos cuatro especies de aves. Los registros en bases de datos nacionales confirmaron la ocurrencia de todas las especies detectadas. Para investigar la eficiencia del enfoque de ADNe, comparamos su rendimiento con 9 métodos convencionalmente utilizados en encuestas de peces marinos. Prometedoramente, el ADNe cubrió la diversidad de peces mejor que o igual a cualquiera de los métodos convencionales aplicados. Nuestro estudio demuestra que incluso pequeñas muestras de agua de mar contienen ADNe de una amplia gama de especies locales de peces. Finalmente, con el fin de examinar el potencial de dispersión del ADNe en los océanos, realizamos un experimento que aborda la degradación del ADNe en agua de mar, lo que muestra que incluso fragmentos pequeños (100-pb) de ADNe se degradan más allá de la detectabilidad en cuestión de días. Aunque se necesitan más estudios para validar el enfoque de ADNe en condiciones ambientales variables, nuestros hallazgos proporcionan una sólida prueba de concepto con grandes perspectivas para el futuro monitoreo de la biodiversidad marina y los recursos.

@article{doi101371journalpone0041732,
    author = "Thomsen, Philip Francis y Kielgast, Jos e Iversen, Lars y Møller, Peter Rask y Rasmussen, Morten y Willerslev, Eske",
    title = "Detección de una Diversa Fauna de Peces Marinos Utilizando ADN Ambiental de Muestras de Agua de Mar",
    year = "2012",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Los ecosistemas marinos de todo el mundo están amenazados, con muchas especies y poblaciones de peces sufriendo la sobreexplotación humana. Esto está impactando gravemente la biodiversidad global, la economía y la salud humana. Intrigantemente, los peces marinos se investigan principalmente mediante métodos selectivos e invasivos, que se limitan mayormente a especies comerciales y están restringidos a áreas particulares con condiciones favorables. Además, la identificación errónea de especies representa un problema mayor. Aquí, investigamos el potencial de utilizar el metabarcoding del ADN ambiental (ADNe) obtenido directamente de muestras de agua de mar para contabilizar la biodiversidad de peces marinos. Este enfoque de ADNe ha sido utilizado recientemente con éxito en entornos de agua dulce, pero nunca en entornos marinos. Aislamos ADNe de muestras de agua de mar de ½ litro recolectadas en un ecosistema marino templado en Dinamarca. Utilizando secuenciación de ADN de nueva generación de amplicones de PCR, obtenemos ADNe de 15 especies de peces diferentes, incluidas tanto especies de consumo importantes como especies raramente o nunca registradas por el monitoreo convencional. También detectamos ADNe de una especie vagante rara en el área; anchoa europea (Sardina pilchardus). Además, detectamos cuatro especies de aves. Los registros en bases de datos nacionales confirmaron la ocurrencia de todas las especies detectadas. Para investigar la eficiencia del enfoque de ADNe, comparamos su rendimiento con 9 métodos convencionalmente utilizados en encuestas de peces marinos. Prometedoramente, el ADNe cubrió la diversidad de peces mejor que o igual a cualquiera de los métodos convencionales aplicados. Nuestro estudio demuestra que incluso pequeñas muestras de agua de mar contienen ADNe de una amplia gama de especies locales de peces. Finalmente, con el fin de examinar el potencial de dispersión del ADNe en los océanos, realizamos un experimento que aborda la degradación del ADNe en agua de mar, lo que muestra que incluso fragmentos pequeños (100-pb) de ADNe se degradan más allá de la detectabilidad en cuestión de días. Aunque se necesitan más estudios para validar el enfoque de ADNe en condiciones ambientales variables, nuestros hallazgos proporcionan una sólida prueba de concepto con grandes perspectivas para el futuro monitoreo de la biodiversidad marina y los recursos.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0041732",
    doi = "10.1371/journal.pone.0041732",
    openalex = "W2039133821",
    references = "doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1755263x201000158x, doi105860choice501469"
}

@article{doi101016jgloenvcha201305014,
    author = "Klöckner, Christian A.",
    title = "Un modelo integral de la psicología del comportamiento ambiental: un metaanálisis",
    year = "2013",
    journal = "Global Environmental Change",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.gloenvcha.2013.05.014",
    doi = "10.1016/j.gloenvcha.2013.05.014",
    openalex = "W2056753197",
    references = "doi101016jjenvp200612002, doi101086586910, doi1011110022453700175, doi101111j154045601994tb02420x"
}

Los métodos de ADN ambiental (eDNA) para detectar especies acuáticas están avanzando rápidamente, pero con poca evaluación de los protocolos de campo o la precisión de las estimaciones resultantes. Comparamos los resultados de muestreo de métodos tradicionales de campo con métodos de eDNA para dos anfibios en 13 arroyos en Idaho central, EE. UU. También evaluamos tres protocolos de recolección de agua y la influencia de la ubicación de muestreo, la hora del día y la distancia de los animales sobre la concentración de eDNA en el agua. No encontramos diferencias en la detección o cantidad de eDNA entre los protocolos de recolección de agua. Los métodos de eDNA tuvieron tasas de detección ligeramente más altas que los métodos tradicionales de campo, especialmente cuando las especies ocurrían a bajas densidades. La concentración de eDNA estaba positivamente relacionada con la densidad medida en campo, la biomasa y la proporción de transectos ocupados. La precisión de las estimaciones de abundancia basadas en eDNA aumentó con la cantidad de eDNA en el agua y el número de submuestras replicadas recolectadas. La concentración de eDNA no varió significativamente con la ubicación de la muestra en el arroyo, la hora del día o la distancia aguas abajo de los animales. Nuestros resultados avanzan aún más la implementación de métodos de eDNA para monitorear vertebrados acuáticos en hábitats de arroyo.

@article{doi101139cjfas20130047,
    author = "Pilliod, David S. and Goldberg, Caren S. and Arkle, Robert S. and Waits, Lisette P.",
    title = "Estimating occupancy and abundance of stream amphibians using environmental DNA from filtered water samples",
    year = "2013",
    journal = "Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences",
    abstract = "Los métodos de ADN ambiental (eDNA) para detectar especies acuáticas están avanzando rápidamente, pero con poca evaluación de los protocolos de campo o la precisión de las estimaciones resultantes. Comparamos los resultados de muestreo de métodos tradicionales de campo con métodos de eDNA para dos anfibios en 13 arroyos en Idaho central, EE. UU. También evaluamos tres protocolos de recolección de agua y la influencia de la ubicación de muestreo, la hora del día y la distancia de los animales sobre la concentración de eDNA en el agua. No encontramos diferencias en la detección o cantidad de eDNA entre los protocolos de recolección de agua. Los métodos de eDNA tuvieron tasas de detección ligeramente más altas que los métodos tradicionales de campo, especialmente cuando las especies ocurrían a bajas densidades. La concentración de eDNA estaba positivamente relacionada con la densidad medida en campo, la biomasa y la proporción de transectos ocupados. La precisión de las estimaciones de abundancia basadas en eDNA aumentó con la cantidad de eDNA en el agua y el número de submuestras replicadas recolectadas. La concentración de eDNA no varió significativamente con la ubicación de la muestra en el arroyo, la hora del día o la distancia aguas abajo de los animales. Nuestros resultados avanzan aún más la implementación de métodos de eDNA para monitorear vertebrados acuáticos en hábitats de arroyo.",
    url = "https://doi.org/10.1139/cjfas-2013-0047",
    doi = "10.1139/cjfas-2013-0047",
    openalex = "W2000256327",
    references = "doi101016jbiocon201411019, doi101016jbiocon201411038, doi101021es404734p, doi101098rsbl20080118, doi1011111365266412306, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1755263x201000158x, doi101371journalpone0035868, openalexw2054580376"
}

Este artículo conecta explícitamente un cuerpo creciente de literatura específica, la ecología política de la conservación, con algunos de los componentes conceptuales principales a menudo ignorados que emergen de la antropología política y la geografía (fuentes de legitimidad, gubernamentalidad, territorialidad o construcción del estado), la economía política (commoditización, integración de mercados, mercados de nicho o gentrificación) y los estudios culturales del medio ambiente (transformaciones culturales de la naturaleza, patrimonio cultural y paisajes, gusto y política de identidad). Todos estos conceptos y campos literarios son la base del análisis social contemporáneo de las políticas de conservación y sus consecuencias. El artículo también proporciona una amplia bibliografía actualizada sobre los conceptos potencialmente relevantes para una ecología política de la conservación.

@article{doi102458v20i121748,
    author = "Vaccaro, Ismael y Beltrán, Oriol y Paquet, Pierre",
    title = "Ecología política y políticas de conservación: algunas genealogías teóricas",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Political Ecology",
    abstract = "Este artículo conecta explícitamente un cuerpo creciente de literatura específica, la ecología política de la conservación, con algunos de los componentes conceptuales principales a menudo ignorados que emergen de la antropología política y la geografía (fuentes de legitimidad, gubernamentalidad, territorialidad o construcción del estado), la economía política (commoditización, integración de mercados, mercados de nicho o gentrificación) y los estudios culturales del medio ambiente (transformaciones culturales de la naturaleza, patrimonio cultural y paisajes, gusto y política de identidad). Todos estos conceptos y campos literarios son la base del análisis social contemporáneo de las políticas de conservación y sus consecuencias. El artículo también proporciona una amplia bibliografía actualizada sobre los conceptos potencialmente relevantes para una ecología política de la conservación.",
    url = "https://doi.org/10.2458/v20i1.21748",
    doi = "10.2458/v20i1.21748",
    openalex = "W2781593193",
    references = "openalexw1497677346"
}

El declive continuo de la biodiversidad de la Tierra representa una crisis y un desafío mayor para el siglo XXI, y existe un acuerdo político internacional para frenar o detener este declive. El desafío está en gran parte obstaculizado por la falta de conocimiento sobre el estado y la distribución de la biodiversidad, especialmente ya que la mayoría de las especies de la Tierra no han sido descritas por la ciencia. Todos los esfuerzos de conservación para salvar la biodiversidad dependen esencialmente del monitoreo de especies y poblaciones para obtener patrones de distribución confiables y estimaciones del tamaño de la población. Tal monitoreo ha dependido tradicionalmente de la identificación física de especies mediante encuestas visuales y conteo de individuos. Sin embargo, las técnicas de monitoreo tradicionales siguen siendo problemáticas debido a las dificultades asociadas con la identificación correcta de especies crípticas o etapas juveniles de vida, un declive continuo en la experiencia taxonómica, la falta de estandarización en la toma de muestras y la naturaleza invasiva de algunas técnicas de encuesta. Por lo tanto, existe una necesidad urgente de técnicas alternativas y eficientes para el monitoreo a gran escala de la biodiversidad. El ADN ambiental (eDNA) – definido aquí como: material genético obtenido directamente de muestras ambientales (suelo, sedimento, agua, etc.) sin signos evidentes de material biológico de origen – es un enfoque de muestreo eficiente, no invasivo y fácil de estandarizar. Acoplado con tecnología de secuenciación de ADN sensible, rentable y en constante avance, podría ser un candidato adecuado para el desafío del monitoreo de la biodiversidad. El ADN ambiental se ha obtenido de muestras antiguas y modernas y abarca desde la detección de especies individuales hasta el análisis de ecosistemas. La investigación sobre eDNA se inició en la microbiología, reconociendo que los métodos basados en cultivo representan de manera errónea la diversidad microbiana en la naturaleza. Posteriormente, como método para evaluar la diversidad de comunidades de macroorganismos, el eDNA se analizó primero en sedimentos, revelando ADN de animales y plantas extintos y existentes, pero desde entonces se ha obtenido de diversas muestras ambientales terrestres y acuáticas. Los resultados de los enfoques de eDNA han proporcionado valiosas perspectivas para el estudio de entornos antiguos y se han demostrado útiles para el monitoreo de la biodiversidad contemporánea en ecosistemas terrestres y acuáticos. En el futuro, esperamos que los enfoques basados en eDNA pasen de los análisis de marcadores individuales de especies o comunidades a encuestas metagenómicas de ecosistemas enteros para predecir patrones espaciales y temporales de biodiversidad. Tales avances tienen aplicaciones para una amplia gama de ciencias biológicas, geológicas y ambientales. Aquí revisamos los logros obtenidos mediante el análisis de eDNA de macroorganismos en un contexto de conservación, y discutimos sus ventajas y limitaciones potenciales para el monitoreo de la biodiversidad.

@article{doi101016jbiocon201411019,
    author = "Thomsen, Philip Francis and Willerslev, Eske",
    title = "ADN ambiental – Una herramienta emergente en la conservación para monitorear la biodiversidad pasada y presente",
    year = "2014",
    journal = "Biological Conservation",
    abstract = "El declive continuo de la biodiversidad de la Tierra representa una crisis y un desafío mayor para el siglo XXI, y existe un acuerdo político internacional para frenar o detener este declive. El desafío está en gran parte obstaculizado por la falta de conocimiento sobre el estado y la distribución de la biodiversidad – especialmente desde que la mayoría de las especies de la Tierra no han sido descritas por la ciencia. Todos los esfuerzos de conservación para salvar la biodiversidad esencialmente dependen del monitoreo de especies y poblaciones para obtener patrones de distribución confiables y estimaciones del tamaño de la población. Tal monitoreo ha dependido tradicionalmente de la identificación física de especies mediante encuestas visuales y conteo de individuos. Sin embargo, las técnicas de monitoreo tradicionales siguen siendo problemáticas debido a las dificultades asociadas con la identificación correcta de especies crípticas o etapas juveniles de vida, un declive continuo en la experiencia taxonómica, muestreo no estandarizado y la naturaleza invasiva de algunas técnicas de encuesta. Por lo tanto, existe una necesidad urgente de técnicas alternativas y eficientes para el monitoreo a gran escala de la biodiversidad. El ADN ambiental (eDNA) – definido aquí como: material genético obtenido directamente de muestras ambientales (suelo, sedimento, agua, etc.) sin signos evidentes de material biológico de origen – es un enfoque de muestreo eficiente, no invasivo y fácil de estandarizar. Acoplado con tecnología de secuenciación de ADN sensible, rentable y en constante avance, podría ser un candidato apropiado para el desafío del monitoreo de la biodiversidad. El ADN ambiental se ha obtenido de muestras antiguas y modernas y abarca desde la detección de especies individuales hasta análisis de ecosistemas. La investigación sobre eDNA se inició en la microbiología, reconociendo que los métodos basados en cultivo representan de manera errónea la diversidad microbiana en la naturaleza. Posteriormente, como método para evaluar la diversidad de comunidades de macroorganismos, el eDNA se analizó primero en sedimentos, revelando ADN de animales y plantas extintos y existentes, pero desde entonces se ha obtenido de diversas muestras ambientales terrestres y acuáticas. Los resultados de los enfoques de eDNA han proporcionado valiosas perspectivas para el estudio de entornos antiguos y se han demostrado útiles para el monitoreo de la biodiversidad contemporánea en ecosistemas terrestres y acuáticos. En el futuro, esperamos que los enfoques basados en eDNA se desplacen desde análisis de marcadores individuales de especies o comunidades hacia encuestas metagenómicas de ecosistemas enteros para predecir patrones espaciales y temporales de biodiversidad. Tales avances tienen aplicaciones para una gama de ciencias biológicas, geológicas y ambientales. Aquí revisamos los logros obtenidos mediante el análisis de eDNA de macroorganismos en un contexto de conservación, y discutimos sus ventajas y limitaciones potenciales para el monitoreo de la biodiversidad.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biocon.2014.11.019",
    doi = "10.1016/j.biocon.2014.11.019",
    openalex = "W2063580733",
    references = "doi101038nature09678, doi101038nature10574, doi101038nature12921, doi101038nmethf303, doi101073pnas0507535103, doi101073pnas0605127103, doi101073pnas1117018109, doi101098rsbl20080118, doi101098rspb20022218, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1365294x201205537x, doi101111j1755263x201000158x, doi101126science1093857, doi101126science1187512, doi101126science1251817, doi101139cjfas20130047, doi101371journalpone0059520, doi101373clinchem2008112797"
}

@article{doi101016jtree201404003,
    author = "Bohmann, Kristine y Evans, Alice y Gilbert, M. Thomas P. y Carvalho, Gary R. y Creer, Simon y Knapp, Michael y Yu, Douglas W. y de Bruyn, Mark",
    title = "ADN ambiental para biología de la vida silvestre y monitoreo de la biodiversidad",
    year = "2014",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2014.04.003",
    doi = "10.1016/j.tree.2014.04.003",
    openalex = "W1979060637",
    references = "doi101016jtree200809011, doi101038362709a0, doi101038nature12921, doi101038nrmicro2832, doi101098rsbl20030025, doi101098rsbl20080118, doi101111j1365294x201105403x, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1365294x201205470x, doi101111j1365294x201205537x, doi101111j1755263x201000158x, doi101371journalpone0059520"
}

La vigilancia de ADN ambiental (eDNA) ofrece grandes posibilidades para mejorar la conservación y gestión de especies. Sin embargo, pocos estudios han investigado la dinámica de eDNA bajo condiciones naturales, y las interpretaciones de los resultados de la vigilancia de eDNA se ven oscurecidas por incertidumbres sobre la degradación de eDNA. Realizamos una revisión de la literatura para evaluar la comprensión actual de la degradación de eDNA en sistemas acuáticos y un experimento que explora cómo las condiciones ambientales pueden influir en la degradación de eDNA. Estudios anteriores han reportado persistencia de eDNA macrobica que varía desde menos de 1 día hasta más de 2 semanas, sin intentos de cuantificar los factores que afectan la degradación. Utilizando un ensayo de PCR cuantitativa con SYBR Green para observar la degradación de eDNA de Carpa Común (Cyprinus carpio) en mesocosmos de laboratorio, nuestra tasa de detección de eDNA de Carpa Común disminuyó con el tiempo. La concentración de eDNA de Carpa Común siguió un patrón de decaimiento exponencial, y las tasas de decaimiento observadas superaron los valores previamente publicados para eDNA macrobica acuática. Contrario a nuestras expectativas, la tasa de degradación de eDNA disminuyó a medida que aumentaba la demanda bioquímica de oxígeno, la clorofila y la concentración total de eDNA (es decir, de cualquier organismo). Nuestros resultados ayudan a explicar las estimaciones previamente publicadas, ampliamente divergentes, para la degradación de eDNA. Las mediciones de las condiciones ambientales locales, la consideración de la influencia ambiental en la detección de eDNA y la cuantificación de las tasas locales de degradación de eDNA ayudarán a interpretar los futuros resultados de la vigilancia de eDNA.

@article{doi101021es404734p,
    author = "Barnes, Matthew A. y Turner, Cameron R. y Jerde, Christopher L. y Renshaw, Mark A. y Chadderton, W. Lindsay y Lodge, David M.",
    title = "Las Condiciones Ambientales Influyen en la Persistencia de eDNA en Sistemas Acuáticos",
    year = "2014",
    journal = "Environmental Science \& Technology",
    abstract = "La vigilancia de ADN ambiental (eDNA) ofrece grandes posibilidades para mejorar la conservación y gestión de especies. Sin embargo, pocos estudios han investigado la dinámica de eDNA bajo condiciones naturales, y las interpretaciones de los resultados de la vigilancia de eDNA se ven oscurecidas por incertidumbres sobre la degradación de eDNA. Realizamos una revisión de la literatura para evaluar la comprensión actual de la degradación de eDNA en sistemas acuáticos y un experimento que explora cómo las condiciones ambientales pueden influir en la degradación de eDNA. Estudios anteriores han reportado persistencia de eDNA macrobica que varía desde menos de 1 día hasta más de 2 semanas, sin intentos de cuantificar los factores que afectan la degradación. Utilizando un ensayo de PCR cuantitativa con SYBR Green para observar la degradación de eDNA de Carpa Común (Cyprinus carpio) en mesocosmos de laboratorio, nuestra tasa de detección de eDNA de Carpa Común disminuyó con el tiempo. La concentración de eDNA de Carpa Común siguió un patrón de decaimiento exponencial, y las tasas de decaimiento observadas superaron los valores previamente publicados para eDNA macrobica acuática. Contrario a nuestras expectativas, la tasa de degradación de eDNA disminuyó a medida que aumentaba la demanda bioquímica de oxígeno, la clorofila y la concentración total de eDNA (es decir, de cualquier organismo). Nuestros resultados ayudan a explicar las estimaciones previamente publicadas, ampliamente divergentes, para la degradación de eDNA. Las mediciones de las condiciones ambientales locales, la consideración de la influencia ambiental en la detección de eDNA y la cuantificación de las tasas locales de degradación de eDNA ayudarán a interpretar los futuros resultados de la vigilancia de eDNA.",
    url = "https://doi.org/10.1021/es404734p",
    doi = "10.1021/es404734p",
    openalex = "W2329540589",
    references = "doi101139cjfas20130047"
}

Resumen El conocimiento de la distribución de las especies es crítico para la gestión ecológica y la biología de la conservación. Una gestión efectiva requiere la detección de poblaciones, que a veces pueden estar a bajas densidades y que generalmente se basa en la detección visual y el conteo. Recientemente, ha habido un considerable interés en la detección de fragmentos cortos de ADN ambiental (eDNA) específicos de la especie para permitir el monitoreo de especies acuáticas en diferentes entornos debido al potencial de una mayor sensibilidad en comparación con los métodos tradicionales de encuesta, que pueden ser laboriosos y costosos. El análisis de ADN ambiental se está utilizando cada vez más en la detección de especies raras o invasoras y también se ha aplicado a estudios de persistencia de eDNA y estimaciones de la biomasa y distribución de las especies. Cuando se combina con métodos de secuenciación de nueva generación, se ha demostrado que se pueden identificar faunas enteras. Diferentes entornos requieren diferentes metodologías de muestreo, pero aún quedan áreas donde las metodologías de laboratorio podrían estandarizarse para permitir que los resultados se comparen entre estudios. Síntesis y aplicaciones. Revisamos estudios recientemente publicados que utilizan eDNA para monitorear poblaciones acuáticas, discutimos las metodologías utilizadas y la aplicación del análisis de eDNA como herramienta de encuesta en ecología. Incluimos ideas innovadoras sobre cómo eDNA puede utilizarse para la conservación y la gestión citando casos de prueba, por ejemplo, el potencial de análisis in situ, incluida la aplicación del análisis de eDNA a plataformas de nanotubos de carbono o espectroscopía de transmisión láser para facilitar detecciones rápidas in situ. El uso del monitoreo de eDNA ya se está adoptando en el Reino Unido para encuestas ecológicas.

@article{doi1011111365266412306,
    author = "Rees, Helen C. y Maddison, Ben C. y Middleditch, David J. y Patmore, James R. M. y Gough, Kevin C.",
    title = "REVISIÓN: La detección de especies de animales acuáticos utilizando ADN ambiental – una revisión del eDNA como herramienta de encuesta en ecología",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Applied Ecology",
    abstract = "Resumen El conocimiento de la distribución de las especies es crítico para la gestión ecológica y la biología de la conservación. Una gestión efectiva requiere la detección de poblaciones, que a veces pueden estar a bajas densidades y que generalmente se basa en la detección visual y el conteo. Recientemente, ha habido un considerable interés en la detección de fragmentos cortos de ADN ambiental (eDNA) específicos de la especie para permitir el monitoreo de especies acuáticas en diferentes entornos debido al potencial de una mayor sensibilidad en comparación con los métodos tradicionales de encuesta, que pueden ser laboriosos y costosos. El análisis de ADN ambiental se está utilizando cada vez más en la detección de especies raras o invasoras y también se ha aplicado a estudios de persistencia de eDNA y estimaciones de la biomasa y distribución de las especies. Cuando se combina con métodos de secuenciación de nueva generación, se ha demostrado que se pueden identificar faunas enteras. Diferentes entornos requieren diferentes metodologías de muestreo, pero aún quedan áreas donde las metodologías de laboratorio podrían estandarizarse para permitir que los resultados se comparen entre estudios. Síntesis y aplicaciones. Revisamos estudios recientemente publicados que utilizan eDNA para monitorear poblaciones acuáticas, discutimos las metodologías utilizadas y la aplicación del análisis de eDNA como herramienta de encuesta en ecología. Incluimos ideas innovadoras sobre cómo eDNA puede utilizarse para la conservación y la gestión citando casos de prueba, por ejemplo, el potencial de análisis in situ, incluida la aplicación del análisis de eDNA a plataformas de nanotubos de carbono o espectroscopía de transmisión láser para facilitar detecciones rápidas in situ. El uso del monitoreo de eDNA ya se está adoptando en el Reino Unido para encuestas ecológicas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2664.12306",
    doi = "10.1111/1365-2664.12306",
    openalex = "W2088695664",
    references = "doi101093nar24163189, doi101111j13652427200601592x, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1755263x201000158x, doi101139cjfas20130047, doi101371journalpone0059520"
}

El monitoreo de ADN ambiental (eDNA) es una técnica molecular novedosa para detectar especies en hábitats naturales. Muchos estudios de eDNA en sistemas acuáticos se han centrado en lagos o estanques y/o en especies de vertebrados grandes, pero las aplicaciones a invertebrados en sistemas fluviales están emergiendo. Un desafío al aplicar el monitoreo de eDNA en aguas corrientes es que el ADN de una especie puede ser transportado aguas abajo. Si y hasta qué distancia puede detectarse el eDNA debido al transporte aguas abajo sigue siendo en gran parte desconocido. En este estudio probamos la detección aguas abajo de eDNA para dos especies de invertebrados, Daphnia longispina y Unio tumidus, que son especies de agua dulce en nuestra zona de estudio. El objetivo fue determinar hasta qué distancia de la población fuente en un lago se podría detectar su eDNA en un río de salida. Muestreamos agua de once sitios fluviales en intervalos regulares hasta 12,3 km aguas abajo del lago, desarrollamos nuevos cebadores de eDNA para ambas especies y utilizamos un método estándar de detección por PCR y secuenciación Sanger para confirmar la presencia del eDNA de cada especie en el río. Detectamos D. longispina en todas las ubicaciones y en dos puntos temporales (julio y octubre); mientras que con U. tumidus, observamos una tasa de detección disminuida y no detectamos su eDNA después de 9,1 km. También observamos una diferencia en la detección para esta especie en diferentes momentos del año. El movimiento observado de eDNA desde la fuente, que asciende a casi 10 km para estas especies, indica que la resolución de una muestra de eDNA puede ser grande en sistemas fluviales. Nuestros resultados indican que puede haber distancias de transporte específicas de la especie para el eDNA y demuestran por primera vez que el eDNA de invertebrados puede persistir a lo largo de distancias relativamente grandes en un sistema fluvial natural.

@article{doi101371journalpone0088786,
    author = "Deiner, Kristy y Altermatt, Florian",
    title = "Distancia de transporte del ADN ambiental de invertebrados en un río natural",
    year = "2014",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "El monitoreo de ADN ambiental (eDNA) es una técnica molecular novedosa para detectar especies en hábitats naturales. Muchos estudios de eDNA en sistemas acuáticos se han centrado en lagos o estanques y/o en especies de vertebrados grandes, pero las aplicaciones a invertebrados en sistemas fluviales están emergiendo. Un desafío al aplicar el monitoreo de eDNA en aguas corrientes es que el ADN de una especie puede ser transportado aguas abajo. Si y hasta qué distancia puede detectarse el eDNA debido al transporte aguas abajo sigue siendo en gran parte desconocido. En este estudio probamos la detección aguas abajo de eDNA para dos especies de invertebrados, Daphnia longispina y Unio tumidus, que son especies de agua dulce en nuestra zona de estudio. El objetivo fue determinar hasta qué distancia de la población fuente en un lago se podría detectar su eDNA en un río de salida. Muestreamos agua de once sitios fluviales en intervalos regulares hasta 12,3 km aguas abajo del lago, desarrollamos nuevos cebadores de eDNA para ambas especies y utilizamos un método estándar de detección por PCR y secuenciación Sanger para confirmar la presencia del eDNA de cada especie en el río. Detectamos D. longispina en todas las ubicaciones y en dos puntos temporales (julio y octubre); mientras que con U. tumidus, observamos una tasa de detección disminuida y no detectamos su eDNA después de 9,1 km. También observamos una diferencia en la detección para esta especie en diferentes momentos del año. El movimiento observado de eDNA desde la fuente, que asciende a casi 10 km para estas especies, indica que la resolución de una muestra de eDNA puede ser grande en sistemas fluviales. Nuestros resultados indican que puede haber distancias de transporte específicas de la especie para el eDNA y demuestran por primera vez que el eDNA de invertebrados puede persistir a lo largo de distancias relativamente grandes en un sistema fluvial natural.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088786",
    doi = "10.1371/journal.pone.0088786",
    openalex = "W2093478636",
    references = "doi101139cjfas20130047, doi101371journalpone0059520"
}

La rápida expansión de las actividades humanas amenaza la biodiversidad a nivel mundial. Numerosas poblaciones de animales marinos han disminuido, pero aún no está claro si estas tendencias son sintomáticas de una acumulación crónica del riesgo global de extinción marina. Presentamos el primer análisis sistemático de amenazas para una linaje globalmente distribuido de 1.041 peces condrictios: tiburones, rayas y quimeras. Estimamos que una cuarta parte están amenazadas según los criterios de la Lista Roja de la UICN debido a la sobrepesca (dirigida e incidental). Las especies de gran tamaño y de aguas someras están en mayor riesgo y cinco de las siete familias más amenazadas son rayas. El riesgo global de extinción de los condrictios es sustancialmente mayor que para la mayoría de otros vertebrados, y solo un tercio de las especies se consideran seguras. El agotamiento de las poblaciones ha ocurrido en todo el mundo en aguas libres de hielo, pero es particularmente prevalente en el Triángulo de Biodiversidad del Indo-Pacífico y el Mar Mediterráneo. Se necesita urgentemente una mejor gestión de la pesca y el comercio para evitar extinciones y promover la recuperación de las poblaciones. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.00590.001.

@article{doi107554elife00590,
    author = "Dulvy, Nicholas K. y Fowler, Sarah y Musick, John A. y Cavanagh, Rachel D. y Kyne, Peter M. y Harrison, Lucy R. y Carlson, John K. y Davidson, Lindsay N. K. y Fordham, Sonja V. y Francis, Malcolm P. y Pollock, Caroline M. y Simpfendorfer, Colin A. y Burgess, George H. y Carpenter, Kent E. y Compagno, Leonard J. V. y Ebert, David A. y Gibson, Claudine y Heupel, Michelle R. y Livingstone, Suzanne R. y Sanciangco, Jonnell C. y Stevens, John D. y Valenti, Sarah y White, William T.",
    title = "Riesgo de extinción y conservación de los tiburones y rayas del mundo",
    year = "2014",
    journal = "eLife",
    abstract = "La rápida expansión de las actividades humanas amenaza la biodiversidad a nivel mundial. Numerosas poblaciones de animales marinos han disminuido, pero aún no está claro si estas tendencias son sintomáticas de una acumulación crónica del riesgo global de extinción marina. Presentamos el primer análisis sistemático de amenazas para una linaje globalmente distribuido de 1.041 peces condrictios: tiburones, rayas y quimeras. Estimamos que una cuarta parte están amenazadas según los criterios de la Lista Roja de la UICN debido a la sobrepesca (dirigida e incidental). Las especies de gran tamaño y de aguas someras están en mayor riesgo y cinco de las siete familias más amenazadas son rayas. El riesgo global de extinción de los condrictios es sustancialmente mayor que para la mayoría de otros vertebrados, y solo un tercio de las especies se consideran seguras. El agotamiento de las poblaciones ha ocurrido en todo el mundo en aguas libres de hielo, pero es particularmente prevalente en el Triángulo de Biodiversidad del Indo-Pacífico y el Mar Mediterráneo. Se necesita urgentemente una mejor gestión de la pesca y el comercio para evitar extinciones y promover la recuperación de las poblaciones. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.00590.001.",
    url = "https://doi.org/10.7554/elife.00590",
    doi = "10.7554/elife.00590",
    openalex = "W2105316344",
    references = "doi101017s0376892909990191, doi101111j13652486200902128x, doi101111j15231739200801044x, doi101126science1103538, doi101126science1187512"
}

El ADN ambiental (eDNA) se refiere al material genético que puede extraerse de muestras ambientales masivas como suelo, agua e incluso aire. El estudio en rápido crecimiento del eDNA ha generado una capacidad sin precedentes para detectar especies y realizar análisis genéticos para la conservación, la gestión y la investigación, especialmente en escenarios donde la recolección de organismos completos es impráctica o imposible. Si bien el número de estudios que demuestran una detección exitosa de eDNA ha aumentado rápidamente en los últimos años, menos investigación ha explorado la ''ecología'' del eDNA—las innumerables interacciones entre el material genético extraorganismal y su entorno—y su influencia en la detección, cuantificación, análisis y aplicación del eDNA a la conservación y la investigación. Aquí, delineamos un marco para comprender la ecología del eDNA, incluyendo el origen, estado, transporte y destino del material genético extraorganismal. Utilizando este marco, revisamos y sintetizamos los hallazgos de estudios de eDNA de diversos entornos, taxones y campos de estudio para destacar conceptos importantes y lagunas de conocimiento en el estudio y aplicación del eDNA. Además, identificamos las fronteras de la aplicación del eDNA centrada en la conservación donde vemos el mayor potencial de crecimiento, incluido el uso del eDNA para estimar el tamaño poblacional, análisis genéticos y genómicos de poblaciones mediante eDNA, inclusión de otras biomoléculas indicadoras como ARN ambiental o proteínas, recolección y análisis automatizados de muestras, y consideración de una amplia gama de muestras ambientales creativas. Discutimos cómo una comprensión más completa de la ecología del eDNA es integral para avanzar en estas fronteras y maximizar el potencial de futuras aplicaciones de eDNA en conservación e investigación.

@article{doi101007s1059201507754,
    author = "Barnes, Matthew A. y Turner, Cameron R.",
    title = "La ecología del ADN ambiental e implicaciones para la genética de la conservación",
    year = "2015",
    journal = "Conservation Genetics",
    abstract = "El ADN ambiental (eDNA) se refiere al material genético que puede extraerse de muestras ambientales masivas como suelo, agua e incluso aire. El estudio en rápido crecimiento del eDNA ha generado una capacidad sin precedentes para detectar especies y realizar análisis genéticos para la conservación, la gestión y la investigación, especialmente en escenarios donde la recolección de organismos completos es impráctica o imposible. Si bien el número de estudios que demuestran una detección exitosa de eDNA ha aumentado rápidamente en los últimos años, menos investigación ha explorado la ''ecología'' del eDNA—las innumerables interacciones entre el material genético extraorganismal y su entorno—y su influencia en la detección, cuantificación, análisis y aplicación del eDNA a la conservación y la investigación. Aquí, delineamos un marco para comprender la ecología del eDNA, incluyendo el origen, estado, transporte y destino del material genético extraorganismal. Utilizando este marco, revisamos y sintetizamos los hallazgos de estudios de eDNA de diversos entornos, taxones y campos de estudio para destacar conceptos importantes y lagunas de conocimiento en el estudio y aplicación del eDNA. Además, identificamos las fronteras de la aplicación del eDNA centrada en la conservación donde vemos el mayor potencial de crecimiento, incluido el uso del eDNA para estimar el tamaño poblacional, análisis genéticos y genómicos de poblaciones mediante eDNA, inclusión de otras biomoléculas indicadoras como ARN ambiental o proteínas, recolección y análisis automatizados de muestras, y consideración de una amplia gama de muestras ambientales creativas. Discutimos cómo una comprensión más completa de la ecología del eDNA es integral para avanzar en estas fronteras y maximizar el potencial de futuras aplicaciones de eDNA en conservación e investigación.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10592-015-0775-4",
    doi = "10.1007/s10592-015-0775-4",
    openalex = "W1815195908",
    references = "doi101016jbiocon201411019, doi101016jtree201404003, doi101038362709a0, doi101093bioinformaticsbtv401, doi101098rsbl20080118, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1365294x201205505x, doi101111j1755263x201000158x, doi101139cjfas20130047, doi101146annurevanimal090414014900, doi101371journalpone0027310, doi101371journalpone0059520, doi10261816153922fe919c"
}

@article{doi101016jtree201511005,
    author = "Socolar, Jacob B. y Gilroy, James J. y Kunin, William E. y Edwards, David P.",
    title = "¿Cómo debería la diversidad beta informar la conservación de la biodiversidad?",
    year = "2015",
    journal = "Trends in Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tree.2015.11.005",
    doi = "10.1016/j.tree.2015.11.005",
    openalex = "W2216692843",
    references = "doi101111j14610248201101628x, doi101126science1251817"
}

Desarrollamos un conjunto de cebadores universales de PCR (MiFish-U/E) para el metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) de peces. Los cebadores fueron diseñados utilizando secuencias completas alineadas de genomas mitocondriales (mitogenomas) de 880 especies, complementadas con secuencias parciales de mitogenomas de 160 elasmobranquios (tiburones y rayas). Los cebadores apuntan a una región hipervariable del gen 12S rRNA (163-185 pb), que contiene suficiente información para identificar peces a nivel de familia taxonómica, género y especie, excepto para algunos congéneres estrechamente relacionados. Para probar la versatilidad de los cebadores en una amplia gama de peces, muestreamos eDNA de cuatro tanques en el Acuario Okinawa Churaumi con composiciones de especies conocidas, preparamos bibliotecas con índices duales y realizamos secuenciación de extremo emparejado de la región utilizando tecnologías de secuenciación de nueva generación de alto rendimiento. De las 180 especies de peces marinos contenidas en los cuatro tanques con secuencias de referencia en una base de datos personalizada, detectamos 168 especies (93,3%) distribuidas en 59 familias y 123 géneros. Estos peces no solo son taxonómicamente diversos, abarcando desde tiburones y rayas hasta teleósteos superiores, sino que también presentan una gran variación en su ecología, incluyendo tanto especies pelágicas como bentónicas que viven en aguas costeras someras hasta profundas. También muestreamos aguas naturales alrededor de arrecifes de coral cerca del acuario y detectamos 93 especies de peces utilizando este enfoque. De las 93 especies, 64 no fueron detectadas en los cuatro tanques del acuario, lo que eleva el número total de especies detectadas a 232 (de 70 familias y 152 géneros). El enfoque de metabarcoding presentado aquí es no invasivo, más eficiente, más rentable y más sensible que los métodos tradicionales de encuesta. Tiene el potencial de servir como una herramienta alternativa (o complementaria) para el monitoreo de la biodiversidad que revoluciona la gestión de recursos naturales y los estudios ecológicos de comunidades de peces en escalas espaciales y temporales más grandes.

@article{doi101098rsos150088,
    author = "Miya, Masaki and Sato, Yukuto and Fukunaga, Tsukasa and Sado, Tetsuya and Poulsen, Jan Yde and Sato, Keiichi and Minamoto, Toshifumi and Yamamoto, Satoshi and Yamanaka, Hiroki and Araki, Hitoshi and Kondoh, Michio and Iwasaki, Wataru",
    title = "MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species",
    year = "2015",
    journal = "Royal Society Open Science",
    abstract = "We developed a set of universal PCR primers (MiFish-U/E) for metabarcoding environmental DNA (eDNA) from fishes. Primers were designed using aligned whole mitochondrial genome (mitogenome) sequences from 880 species, supplemented by partial mitogenome sequences from 160 elasmobranchs (sharks and rays). The primers target a hypervariable region of the 12S rRNA gene (163-185 bp), which contains sufficient information to identify fishes to taxonomic family, genus and species except for some closely related congeners. To test versatility of the primers across a diverse range of fishes, we sampled eDNA from four tanks in the Okinawa Churaumi Aquarium with known species compositions, prepared dual-indexed libraries and performed paired-end sequencing of the region using high-throughput next-generation sequencing technologies. Out of the 180 marine fish species contained in the four tanks with reference sequences in a custom database, we detected 168 species (93.3\%) distributed across 59 families and 123 genera. These fishes are not only taxonomically diverse, ranging from sharks and rays to higher teleosts, but are also greatly varied in their ecology, including both pelagic and benthic species living in shallow coastal to deep waters. We also sampled natural seawaters around coral reefs near the aquarium and detected 93 fish species using this approach. Of the 93 species, 64 were not detected in the four aquarium tanks, rendering the total number of species detected to 232 (from 70 families and 152 genera). The metabarcoding approach presented here is non-invasive, more efficient, more cost-effective and more sensitive than the traditional survey methods. It has the potential to serve as an alternative (or complementary) tool for biodiversity monitoring that revolutionizes natural resource management and ecological studies of fish communities on larger spatial and temporal scales.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsos.150088",
    doi = "10.1098/rsos.150088",
    openalex = "W2254267781",
    references = "doi101016jbiocon201411019, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtq461, doi101093bioinformaticsbtr507, doi101093nargkm234, doi101093nargkp1137, doi101098rsbl20080118, doi101098rspb20042813, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1365294x201205470x, doi101111j1755263x201000158x, doi1011861471210510421, doi1011861471210511485, doi101371journalpone0059520"
}

Más de la mitad del paisaje europeo está bajo gestión agrícola y lo ha sido durante milenios. Muchas especies y ecosistemas de interés para la conservación en Europa dependen de la gestión agrícola y están mostrando declives continuos. Los esquemas agroambientales (AES) están diseñados en parte para abordar esto. Son una fuente principal de financiación para la conservación de la naturaleza dentro de la Unión Europea (UE) y el mayor gasto en conservación en Europa. Revisamos la estructura de los AES actuales en toda Europa. Desde una revisión de 2003 que cuestionó la eficacia general de los AES para la biodiversidad, ha habido una gran cantidad de estudios de caso y metaanálisis que examinan su eficacia. La mayoría de las síntesis demuestran aumentos generales en la biodiversidad de tierras agrícolas en respuesta a los AES, con el tamaño del efecto dependiendo de la estructura y la gestión del paisaje circundante. Esto es importante a la luz de las sucesivas ampliaciones de la UE y las reformas continuas de los AES. Examinamos el cambio en el tamaño del efecto a lo largo del tiempo al fusionar los conjuntos de datos de 3 metaanálisis recientes y encontramos que los esquemas implementados después de la revisión de los programas agroambientales de la UE en 2007 no fueron más efectivos que los esquemas implementados antes de la revisión. Además, los esquemas dirigidos a áreas fuera de producción (como los bordes de los campos y los setos) son más efectivos para aumentar la riqueza de especies que los dirigidos a áreas productivas (como los cultivos de cereal o los prados). Las preguntas de investigación pendientes incluyen si los AES mejoran los servicios ecosistémicos, si son más efectivos en áreas agrícolas marginales que en áreas intensivamente cultivadas, si son más o menos rentables para la biodiversidad de tierras agrícolas que las áreas protegidas y en qué medida su eficacia está influenciada por la formación y asesoramiento a los agricultores? La lección general de la experiencia europea es que los AES pueden ser efectivos para conservar la vida silvestre en tierras agrícolas, pero son costosos y deben diseñarse y dirigirse cuidadosamente.

@article{doi101111cobi12536,
    author = "Batáry, Péter y Dicks, Lynn V. y Kleijn, David y Sutherland, William J.",
    title = "El papel de los esquemas agroambientales en la conservación y la gestión ambiental",
    year = "2015",
    journal = "Biología de la Conservación",
    abstract = "Más de la mitad del paisaje europeo está bajo gestión agrícola y lo ha sido durante milenios. Muchas especies y ecosistemas de interés para la conservación en Europa dependen de la gestión agrícola y están mostrando declives continuos. Los esquemas agroambientales (AES) están diseñados en parte para abordar esto. Son una fuente principal de financiación para la conservación de la naturaleza dentro de la Unión Europea (UE) y el mayor gasto en conservación en Europa. Revisamos la estructura de los AES actuales en toda Europa. Desde una revisión de 2003 que cuestionó la eficacia general de los AES para la biodiversidad, ha habido una gran cantidad de estudios de caso y metaanálisis que examinan su eficacia. La mayoría de las síntesis demuestran aumentos generales en la biodiversidad de tierras agrícolas en respuesta a los AES, con el tamaño del efecto dependiendo de la estructura y la gestión del paisaje circundante. Esto es importante a la luz de las sucesivas ampliaciones de la UE y las reformas continuas de los AES. Examinamos el cambio en el tamaño del efecto a lo largo del tiempo al fusionar los conjuntos de datos de 3 metaanálisis recientes y encontramos que los esquemas implementados después de la revisión de los programas agroambientales de la UE en 2007 no fueron más efectivos que los esquemas implementados antes de la revisión. Además, los esquemas dirigidos a áreas fuera de producción (como los bordes de los campos y los setos) son más efectivos para aumentar la riqueza de especies que los dirigidos a áreas productivas (como los cultivos de cereal o los prados). Las preguntas de investigación pendientes incluyen si los AES mejoran los servicios ecosistémicos, si son más efectivos en áreas agrícolas marginales que en áreas intensivamente cultivadas, si son más o menos rentables para la biodiversidad de tierras agrícolas que las áreas protegidas y en qué medida su eficacia está influenciada por la formación y asesoramiento a los agricultores? La lección general de la experiencia europea es que los AES pueden ser efectivos para conservar la vida silvestre en tierras agrícolas, pero son costosos y deben diseñarse y dirigirse cuidadosamente.",
    url = "https://doi.org/10.1111/cobi.12536",
    doi = "10.1111/cobi.12536",
    openalex = "W1594129108",
    references = "doi101016jjenvman200907005, doi101038nature10452, doi101046j13652664200200695x, doi101098rstb20100143, doi101111j13652664200300868x, doi101111j13652664200501005x, doi101111j14610248200801255x, doi1018637jssv036i03, doi1023071164953, doi1023072531069"
}

La biodiversidad global en aguas dulces y en los océanos está disminuyendo a altas tasas. Las herramientas fiables para evaluar y monitorizar la biodiversidad acuática, especialmente para especies raras y secretivas, son importantes para una gestión eficiente y oportuna. Los avances recientes en la secuenciación de ADN han proporcionado una nueva herramienta para la detección de especies a partir del ADN presente en el medio ambiente. En este estudio, probamos si un enfoque de metabarcoding de ADN ambiental (eDNA), utilizando muestras de agua, puede utilizarse para abordar preguntas significativas en ecología y conservación. Se dirigieron dos grupos clave de vertebrados acuáticos: anfibios y peces óseos. La fiabilidad de este método se validó cuidadosamente in silico, in vitro e in situ. Al compararse con encuestas tradicionales o datos históricos, el metabarcoding de eDNA mostró una probabilidad de detección mucho mejor en general. Para los anfibios, la probabilidad de detección con metabarcoding de eDNA fue 0,97 (IC = 0,90-0,99) frente a 0,58 (IC = 0,50-0,63) para las encuestas tradicionales. Para los peces, en el 89% de los sitios estudiados, el número de taxones detectados utilizando el enfoque de metabarcoding de eDNA fue mayor o idéntico al número detectado utilizando métodos tradicionales. Argumentamos que el enfoque basado en ADN propuesto tiene el potencial de convertirse en la herramienta de próxima generación para estudios ecológicos y la monitorización estandarizada de la biodiversidad en una amplia gama de ecosistemas acuáticos.

@article{doi101111mec13428,
    author = "Valentini, Alice y Taberlet, Pierre y Miaud, Claude y Civade, Raphaël y Herder, Jelger y Thomsen, Philip Francis y Bellemain, Eva y Besnard, Aurélien y Coissac, Éric y Boyer, Frédéric y Gaboriaud, Coline y Jean, Pauline y Poulet, Nicolas y Roset, Nicolas y Copp, Gordon H. y Géniez, Philippe y Pont, Didier y Argillier, Christine y Baudoin, Jean‐Marc y Peroux, Tiphaine y Crivellì, Alain J. y Olivier, Anthony y Acqueberge, Manon y Brun, Matthieu Le y Møller, Peter Rask y Willerslev, Eske y Déjean, Tony",
    title = "Monitorización de la biodiversidad acuática de próxima generación mediante metabarcoding de ADN ambiental",
    year = "2015",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "La biodiversidad global en aguas dulces y en los océanos está disminuyendo a altas tasas. Las herramientas fiables para evaluar y monitorizar la biodiversidad acuática, especialmente para especies raras y secretivas, son importantes para una gestión eficiente y oportuna. Los avances recientes en la secuenciación de ADN han proporcionado una nueva herramienta para la detección de especies a partir del ADN presente en el medio ambiente. En este estudio, probamos si un enfoque de metabarcoding de ADN ambiental (eDNA), utilizando muestras de agua, puede utilizarse para abordar preguntas significativas en ecología y conservación. Se dirigieron dos grupos clave de vertebrados acuáticos: anfibios y peces óseos. La fiabilidad de este método se validó cuidadosamente in silico, in vitro e in situ. Al compararse con encuestas tradicionales o datos históricos, el metabarcoding de eDNA mostró una probabilidad de detección mucho mejor en general. Para los anfibios, la probabilidad de detección con metabarcoding de eDNA fue 0,97 (IC = 0,90-0,99) frente a 0,58 (IC = 0,50-0,63) para las encuestas tradicionales. Para los peces, en el 89% de los sitios estudiados, el número de taxones detectados utilizando el enfoque de metabarcoding de eDNA fue mayor o idéntico al número detectado utilizando métodos tradicionales. Argumentamos que el enfoque basado en ADN propuesto tiene el potencial de convertirse en la herramienta de próxima generación para estudios ecológicos y la monitorización estandarizada de la biodiversidad en una amplia gama de ecosistemas acuáticos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13428",
    doi = "10.1111/mec.13428",
    openalex = "W2171100005",
    references = "doi101016jbiocon201411019, doi101038nature09678, doi101073pnas77116715, doi101098rsos150088, doi101111j1365294x201105418x, doi101126science1103538, doi101126science1246752, doi1011770049124104268644, doi1018637jssv043i10, doi1018900012965820020832248esorwd20co2"
}

Resumen Preservar la biodiversidad es un desafío global que requiere datos sobre la distribución y abundancia de las especies a grandes escalas geográficas y temporales. Sin embargo, los métodos tradicionales para investigar la distribución y abundancia de especies móviles en entornos marinos a menudo son ineficientes, destructivos para el medio ambiente o intensivos en recursos. El metabarcoding del ADN ambiental (eDNA) ofrece un nuevo medio para evaluar la biodiversidad y a escalas mucho más grandes, pero la adopción de este enfoque para investigar comunidades animales completas en sistemas acuáticos grandes y dinámicos ha sido ralentizada por incertidumbres significativas relacionadas con las tasas de error de detección y la resolución espacial relevante de las encuestas de eDNA. Aquí, reportamos los resultados de una encuesta de transecto de eDNA de 2,5 km que investiga la fauna de vertebrados presente a lo largo de una gradación de diversos hábitats marinos asociados con un ecosistema de bosque de kelp. Utilizando cebadores de PCR que apuntan al gen de ARN ribosómico 12S mitocondrial de peces y mamíferos marinos, generamos datos de secuencias de eDNA y los comparamos con encuestas de buceo visual simultáneas. Encontramos concordancia espacial entre las tendencias de eDNA y de encuesta visual de especies individuales, y que el eDNA es capaz de distinguir ensamblajes de comunidades de vertebrados de hábitats separados por tan poco como ~60 m. El eDNA detectó de manera fiable vertebrados con bajas tasas de error de falsos negativos (1/12 de los taxones) en comparación con las encuestas, y reveló especies crípticas conocidas por ocupar los hábitats pero pasadas por alto por los métodos visuales. Este estudio también presenta una contabilidad explícita de falsos negativos y positivos en los datos de metabarcoding, que ilustran la influencia de la selección de marcadores genéticos, la replicación, la contaminación, los sesgos que impactan los datos de conteo de eDNA y la ecología de las especies objetivo en las tasas de detección de eDNA en un ecosistema abierto.

@article{doi101111mec13481,
    author = "Port, Jesse A. y O'Donnell, James L. y Romero‐Maraccini, Ofelia C. y Leary, Paul y Litvin, Steven Y. y Nickols, Kerry J. y Yamahara, Kevan M. y Kelly, Ryan P.",
    title = "Evaluando la biodiversidad de vertebrados en un ecosistema de bosque de kelp utilizando ADN ambiental",
    year = "2015",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Resumen Preservar la biodiversidad es un desafío global que requiere datos sobre la distribución y abundancia de las especies a grandes escalas geográficas y temporales. Sin embargo, los métodos tradicionales para investigar la distribución y abundancia de especies móviles en entornos marinos a menudo son ineficientes, destructivos para el medio ambiente o intensivos en recursos. El metabarcoding del ADN ambiental (eDNA) ofrece un nuevo medio para evaluar la biodiversidad y a escalas mucho más grandes, pero la adopción de este enfoque para investigar comunidades animales completas en sistemas acuáticos grandes y dinámicos ha sido ralentizada por incertidumbres significativas relacionadas con las tasas de error de detección y la resolución espacial relevante de las encuestas de eDNA. Aquí, reportamos los resultados de una encuesta de transecto de eDNA de 2,5 km que investiga la fauna de vertebrados presente a lo largo de una gradación de diversos hábitats marinos asociados con un ecosistema de bosque de kelp. Utilizando cebadores de PCR que apuntan al gen de ARN ribosómico 12S mitocondrial de peces y mamíferos marinos, generamos datos de secuencias de eDNA y los comparamos con encuestas de buceo visual simultáneas. Encontramos concordancia espacial entre las tendencias de eDNA y de encuesta visual de especies individuales, y que el eDNA es capaz de distinguir ensamblajes de comunidades de vertebrados de hábitats separados por tan poco como \textasciitilde 60 m. El eDNA detectó de manera fiable vertebrados con bajas tasas de error de falsos negativos (1/12 de los taxones) en comparación con las encuestas, y reveló especies crípticas conocidas por ocupar los hábitats pero pasadas por alto por los métodos visuales. Este estudio también presenta una contabilidad explícita de falsos negativos y positivos en los datos de metabarcoding, que ilustran la influencia de la selección de marcadores genéticos, la replicación, la contaminación, los sesgos que impactan los datos de conteo de eDNA y la ecología de las especies objetivo en las tasas de detección de eDNA en un ecosistema abierto.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13481",
    doi = "10.1111/mec.13481",
    openalex = "W2248984422",
    references = "doi101098rsos150088"
}

El ADN extraído del entorno (ADNe) es una forma útil de descubrir patrones de biodiversidad. Al combinar un modelo conceptual y datos empíricos, probamos si el ADNe transportado en redes fluviales puede utilizarse como una forma integradora para evaluar la biodiversidad eucariota a escalas espaciales amplias y a través de la interfaz tierra-agua. Utilizando un enfoque de metabarcodificación de ADNe, detectamos 296 familias de eucariotas, abarcando 19 filos en la cuenca de un río. Mostramos para un subconjunto de estas familias que las muestras de ADNe superan los sesgos de autocorrelación espacial asociados con las evaluaciones clásicas de comunidades al integrar la información de biodiversidad en el espacio. Además, demostramos que se detectan muchas especies terrestres; por lo tanto, sugiriendo que el ADNe en el agua de río también incorpora información de biodiversidad a través de los biomas terrestres y acuáticos. El ADN ambiental transportado en redes fluviales ofrece una forma novedosa y espacialmente integrada para evaluar la biodiversidad total de paisajes completos y transformará la adquisición de datos de biodiversidad en ecología.

@article{doi101038ncomms12544,
    author = "Deiner, Kristy y Fronhofer, Emanuel A. y Mächler, Elvira y Walser, Jean‐Claude y Altermatt, Florian",
    title = "El ADN ambiental revela que los ríos son cintas transportadoras de información de biodiversidad",
    year = "2016",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "El ADN extraído del entorno (ADNe) es una forma útil de descubrir patrones de biodiversidad. Al combinar un modelo conceptual y datos empíricos, probamos si el ADNe transportado en redes fluviales puede utilizarse como una forma integradora para evaluar la biodiversidad eucariota a escalas espaciales amplias y a través de la interfaz tierra-agua. Utilizando un enfoque de metabarcodificación de ADNe, detectamos 296 familias de eucariotas, abarcando 19 filos en la cuenca de un río. Mostramos para un subconjunto de estas familias que las muestras de ADNe superan los sesgos de autocorrelación espacial asociados con las evaluaciones clásicas de comunidades al integrar la información de biodiversidad en el espacio. Además, demostramos que se detectan muchas especies terrestres; por lo tanto, sugiriendo que el ADNe en el agua de río también incorpora información de biodiversidad a través de los biomas terrestres y acuáticos. El ADN ambiental transportado en redes fluviales ofrece una forma novedosa y espacialmente integrada para evaluar la biodiversidad total de paisajes completos y transformará la adquisición de datos de biodiversidad en ecología.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms12544",
    doi = "10.1038/ncomms12544",
    openalex = "W2951985551",
    references = "doi101016jtree201404003"
}

Resumen La detección de especies utilizando ADN ambiental (ADNe) tiene un gran potencial para contribuir a la comprensión de la ecología y la conservación de las especies acuáticas. La detección de especies utilizando métodos de ADNe, en lugar de muestrear directamente los organismos, puede reducir los impactos sobre las especies sensibles y aumentar la potencia de las encuestas de campo para especies raras y elusivas. Sin embargo, la sensibilidad de los métodos de ADNe requiere una mayor conciencia y atención a los protocolos de garantía y control de calidad. Además, la interpretación de los datos de ADNe exige una consideración cuidadosa de múltiples factores. A medida que los métodos de ADNe han crecido en su aplicación, se han implementado diversos enfoques para abordar estos problemas. Con el interés en el ADNe que continúa expandiéndose, se necesitan enormemente directrices de apoyo para llevar a cabo estudios de ADNe. Investigadores de ADN ambiental de todo el mundo han colaborado para producir este conjunto de directrices y consideraciones para la implementación de métodos de ADNe para detectar macroorganismos acuáticos. Las consideraciones críticas para el diseño del estudio incluyen prevenir la contaminación en el campo y en el laboratorio, elegir métodos de análisis de muestras apropiados, validar los ensayos, probar la inhibición de las muestras y seguir las directrices mínimas de reporte. Las consideraciones críticas para la inferencia incluyen procesos temporales y espaciales, límites de la correlación del ADNe con la abundancia, incertidumbre de resultados positivos y negativos, y fuentes potenciales de ADN aloctónico. Presentamos una síntesis del conocimiento en esta etapa para la aplicación de este nuevo y potente método de detección.

@article{doi1011112041210x12595,
    author = "Goldberg, Caren S. y Turner, Cameron R. y Deiner, Kristy y Klymus, Katy E. y Thomsen, Philip Francis y Murphy, Melanie A. y Spear, Stephen F. y McKee, Anna M. y Oyler‐McCance, Sara J. y Cornman, Robert S. y Laramie, Matthew B. y Mahon, Andrew R. y Lance, Richard F. y Pilliod, David S. y Strickler, Katherine M. y Waits, Lisette P. y Fremier, Alexander K. y Takahara, Teruhiko y Herder, Jelger y Taberlet, Pierre",
    title = "Consideraciones críticas para la aplicación de métodos de ADN ambiental para detectar especies acuáticas",
    year = "2016",
    journal = "Methods in Ecology and Evolution",
    abstract = "Resumen La detección de especies utilizando ADN ambiental (ADNe) tiene un gran potencial para contribuir a la comprensión de la ecología y la conservación de las especies acuáticas. La detección de especies utilizando métodos de ADNe, en lugar de muestrear directamente los organismos, puede reducir los impactos sobre las especies sensibles y aumentar la potencia de las encuestas de campo para especies raras y elusivas. Sin embargo, la sensibilidad de los métodos de ADNe requiere una mayor conciencia y atención a los protocolos de garantía y control de calidad. Además, la interpretación de los datos de ADNe exige una consideración cuidadosa de múltiples factores. A medida que los métodos de ADNe han crecido en su aplicación, se han implementado diversos enfoques para abordar estos problemas. Con el interés en el ADNe que continúa expandiéndose, se necesitan enormemente directrices de apoyo para llevar a cabo estudios de ADNe. Investigadores de ADN ambiental de todo el mundo han colaborado para producir este conjunto de directrices y consideraciones para la implementación de métodos de ADNe para detectar macroorganismos acuáticos. Las consideraciones críticas para el diseño del estudio incluyen prevenir la contaminación en el campo y en el laboratorio, elegir métodos de análisis de muestras apropiados, validar los ensayos, probar la inhibición de las muestras y seguir las directrices mínimas de reporte. Las consideraciones críticas para la inferencia incluyen procesos temporales y espaciales, límites de la correlación del ADNe con la abundancia, incertidumbre de resultados positivos y negativos, y fuentes potenciales de ADN aloctónico. Presentamos una síntesis del conocimiento en esta etapa para la aplicación de este nuevo y potente método de detección.",
    url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.12595",
    doi = "10.1111/2041-210x.12595",
    openalex = "W2398092094",
    references = "doi101111j1755263x201000158x, doi101111mec13428, doi101139cjfas20130047, doi101371journalpone0059520, doi101373clinchem2008112797"
}

Los organismos liberan continuamente ADN en sus entornos a través de células desprendidas, excretas, gametos y material en descomposición. El análisis de este 'ADN ambiental' (eDNA) está revolucionando el monitoreo de la biodiversidad. El eDNA supera a muchos métodos de encuesta establecidos para la detección dirigida de especies individuales, pero pocos estudios han investigado qué tan bien el eDNA refleja comunidades enteras de organismos en entornos naturales. Investigamos si el eDNA puede recuperar información cualitativa y cuantitativa precisa sobre comunidades de peces en grandes lagos, en comparación con el conjunto de datos de redes de branquias a largo plazo más completo disponible en el Reino Unido. Se recolectaron setenta y ocho muestras de agua de 2L a lo largo de transectos de perfil de profundidad, sitios de redes de branquias y desde la orilla en tres grandes lagos profundos (Windermere, Bassenthwaite Lake y Derwent Water) en el Distrito de Lagos de Inglaterra. Las muestras de agua se analizaron mediante metabarcoding de eDNA de las regiones mitocondriales 12S y citocromo b. Catorce de las 16 especies históricamente registradas en Windermere fueron detectadas utilizando eDNA, en comparación con cuatro especies en la encuesta más reciente de redes de branquias, demostrando que el eDNA es extremadamente sensible para detectar especies. Una pregunta clave para el monitoreo de la biodiversidad es si el eDNA puede estimar con precisión la abundancia. Para probar esto, utilizamos el número de lecturas de secuencia por especie y la proporción de sitios de muestreo en los que una especie fue detectada con eDNA (es decir, ocupación del sitio) como sustitutos de la abundancia. Los datos de abundancia de eDNA se correlacionaron consistentemente con las estimaciones de abundancia por rango de encuestas establecidas. Estos resultados demuestran que el metabarcoding de eDNA puede describir comunidades de peces en grandes lagos, tanto cualitativa como cuantitativamente, y tiene gran potencial como herramienta complementaria a los métodos de monitoreo establecidos.

@article{doi101111mec13660,
    author = "Hänfling, Bernd y Handley, Lori Lawson y Read, Daniel S. y Hahn, Christoph y Li, Jianlong y Nichols, Paul y Blackman, Rosetta C. y Oliver, Anna y Winfield, Ian J.",
    title = "Metabarcoding de ADN ambiental de comunidades de peces de lagos refleja datos a largo plazo de métodos de encuesta establecidos",
    year = "2016",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Los organismos liberan continuamente ADN en sus entornos a través de células desprendidas, excretas, gametos y material en descomposición. El análisis de este 'ADN ambiental' (eDNA) está revolucionando el monitoreo de la biodiversidad. El eDNA supera a muchos métodos de encuesta establecidos para la detección dirigida de especies individuales, pero pocos estudios han investigado qué tan bien el eDNA refleja comunidades enteras de organismos en entornos naturales. Investigamos si el eDNA puede recuperar información cualitativa y cuantitativa precisa sobre comunidades de peces en grandes lagos, en comparación con el conjunto de datos de redes de branquias a largo plazo más completo disponible en el Reino Unido. Se recolectaron setenta y ocho muestras de agua de 2L a lo largo de transectos de perfil de profundidad, sitios de redes de branquias y desde la orilla en tres grandes lagos profundos (Windermere, Bassenthwaite Lake y Derwent Water) en el Distrito de Lagos de Inglaterra. Las muestras de agua se analizaron mediante metabarcoding de eDNA de las regiones mitocondriales 12S y citocromo b. Catorce de las 16 especies históricamente registradas en Windermere fueron detectadas utilizando eDNA, en comparación con cuatro especies en la encuesta más reciente de redes de branquias, demostrando que el eDNA es extremadamente sensible para detectar especies. Una pregunta clave para el monitoreo de la biodiversidad es si el eDNA puede estimar con precisión la abundancia. Para probar esto, utilizamos el número de lecturas de secuencia por especie y la proporción de sitios de muestreo en los que una especie fue detectada con eDNA (es decir, ocupación del sitio) como sustitutos de la abundancia. Los datos de abundancia de eDNA se correlacionaron consistentemente con las estimaciones de abundancia por rango de encuestas establecidas. Estos resultados demuestran que el metabarcoding de eDNA puede describir comunidades de peces en grandes lagos, tanto cualitativa como cuantitativamente, y tiene gran potencial como herramienta complementaria a los métodos de monitoreo establecidos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13660",
    doi = "10.1111/mec.13660",
    openalex = "W2337259322",
    references = "doi101016jtree201404003, doi101098rsos150088, doi101111mec13428"
}

reveló la estructura de la comunidad de peces a una resolución de especies. El metabarcoding de eDNA basado en una recolección de 6 horas de muestras de agua detectó 128 especies de peces, de las cuales el 62,5% (40 especies) también fueron observadas por censos visuales submarinos realizados durante un período de 14 años. Este método también detectó otros peces locales (≥23 especies) que no fueron observados por los censos visuales. Estas características de metabarcoding de eDNA mejorarán la investigación relacionada con los ecosistemas marinos, y el método potencialmente se convertirá en una herramienta estándar para el estudio de comunidades de peces.

@article{doi101038srep40368,
    author = "Yamamoto, Satoshi y Masuda, Reiji y Sato, Yukuto y Sado, Tetsuya y Araki, Hitoshi y Kondoh, Michio y Minamoto, Toshifumi y Miya, Masaki",
    title = "Metabarcoding de ADN ambiental revela comunidades locales de peces en un mar costero rico en especies",
    year = "2017",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "reveló la estructura de la comunidad de peces a una resolución de especies. El metabarcoding de eDNA basado en una recolección de 6 horas de muestras de agua detectó 128 especies de peces, de las cuales el 62,5% (40 especies) también fueron observadas por censos visuales submarinos realizados durante un período de 14 años. Este método también detectó otros peces locales (≥23 especies) que no fueron observados por los censos visuales. Estas características de metabarcoding de eDNA mejorarán la investigación relacionada con los ecosistemas marinos, y el método potencialmente se convertirá en una herramienta estándar para el estudio de comunidades de peces.",
    url = "https://doi.org/10.1038/srep40368",
    doi = "10.1038/srep40368",
    openalex = "W2576417104",
    references = "doi101007s1059201507754, doi101016jbiocon201411019, doi101016jtree201404003, doi101038nature01610, doi101038nmeth1184, doi101093bioinformaticsbtr381, doi101093bioinformaticsbtr507, doi101098rsbl20080118, doi101098rsos150088, doi101111mec13428, doi1011861471210510421, openalexw1558982506"
}

Resumen El metabarcoding de muestras ambientales presenta muchos desafíos y limitaciones que requieren flujos de trabajo de laboratorio y análisis cuidadosamente considerados para garantizar resultados confiables. Exploramos cómo las decisiones sobre el diseño del estudio, la configuración del laboratorio y el procesamiento bioinformático afectan los resultados finales, y proporcionamos directrices para el estudio confiable de muestras ambientales. Evaluamos el rendimiento de cuatro conjuntos de cebadores que apuntan a las regiones COI y 16S que caracterizan la diversidad de artrópodos en muestras fecales de murciélagos, e investigamos cómo los resultados del metabarcoding se ven afectados por parámetros que incluyen: (1) número de réplicas de PCR por muestra, (2) profundidad de secuenciación, (3) estrategia de procesamiento de réplicas de PCR (es decir, de manera aditiva, combinando las secuencias obtenidas de las réplicas de PCR, o de manera restrictiva, reteniendo solo las secuencias que ocurren en múltiples réplicas de PCR para cada muestra), (4) número mínimo de copias para que las secuencias sean retenidas, (5) eliminación de quimeras, y (6) umbrales de similitud para el agrupamiento de Unidades Taxonómicas Operativas (OTU). Por último, medimos las disimilaridades intra e inter taxones cuando se utilizan secuencias de bases de datos públicas para determinar los umbrales más apropiados para el agrupamiento de OTU y la asignación taxonómica. Nuestros resultados muestran que el uso de múltiples conjuntos de cebadores reduce los sesgos taxonómicos y aumenta la cobertura taxonómica. Los perfiles taxonómicos resultantes de cada conjunto de cebadores se ven principalmente afectados por el número de réplicas de PCR realizadas por muestra y por cómo se filtran las secuencias entre ellas, el umbral de número de copias de secuencia y el umbral de agrupamiento de OTU. También informamos de considerables diferencias de diversidad entre las réplicas de PCR de cada muestra. La profundidad de secuenciación aumenta la disimilaridad entre las réplicas de PCR a menos que las estrategias bioinformáticas para eliminar supuestas secuencias artefactuales se ajusten según el número de secuencias analizadas. Finalmente, mostramos que los umbrales de identidad apropiados para el agrupamiento de OTU y la asignación taxonómica difieren entre marcadores. El metabarcoding de muestras ambientales complejas idealmente requiere (1) investigar si se necesitan más de un conjunto de cebadores que apunten al mismo grupo taxonómico para compensar los sesgos de los cebadores, (2) más de una réplica de PCR por muestra, (3) procesamiento bioinformático de secuencias que equilibre la detección de diversidad con la eliminación de secuencias artefactuales, y (4) selección empírica de umbrales de agrupamiento de OTU y asignación taxonómica adaptados a cada marcador y a los taxones obtenidos.

@article{doi1011112041210x12849,
    author = "Alberdi, Antton and Aizpurua, Ostaizka and Gilbert, M. Thomas P. and Bohmann, Kristine",
    title = "Scrutinizing key steps for reliable metabarcoding of environmental samples",
    year = "2017",
    journal = "Methods in Ecology and Evolution",
    abstract = "Resumen El metabarcoding de muestras ambientales presenta muchos desafíos y limitaciones que requieren flujos de trabajo de laboratorio y análisis cuidadosamente considerados para garantizar resultados confiables. Exploramos cómo las decisiones sobre el diseño del estudio, la configuración del laboratorio y el procesamiento bioinformático afectan los resultados finales, y proporcionamos directrices para el estudio confiable de muestras ambientales. Evaluamos el rendimiento de cuatro conjuntos de cebadores que apunten a las regiones COI y 16S que caracterizan la diversidad de artrópodos en muestras fecales de murciélagos, e investigamos cómo los resultados del metabarcoding se ven afectados por parámetros que incluyen: (1) número de réplicas de PCR por muestra, (2) profundidad de secuenciación, (3) estrategia de procesamiento de réplicas de PCR (es decir, de manera aditiva, combinando las secuencias obtenidas de las réplicas de PCR, o de manera restrictiva, reteniendo solo las secuencias que ocurren en múltiples réplicas de PCR para cada muestra), (4) número mínimo de copias para que las secuencias sean retenidas, (5) eliminación de quimeras, y (6) umbrales de similitud para el agrupamiento de Unidades Taxonómicas Operativas (OTU). Por último, medimos las disimilaridades intra e inter taxones cuando se utilizan secuencias de bases de datos públicas para determinar los umbrales más apropiados para el agrupamiento de OTU y la asignación taxonómica. Nuestros resultados muestran que el uso de múltiples conjuntos de cebadores reduce los sesgos taxonómicos y aumenta la cobertura taxonómica. Los perfiles taxonómicos resultantes de cada conjunto de cebadores se ven principalmente afectados por el número de réplicas de PCR realizadas por muestra y por cómo se filtran las secuencias entre ellas, el umbral de número de copias de secuencia y el umbral de agrupamiento de OTU. También informamos de considerables diferencias de diversidad entre las réplicas de PCR de cada muestra. La profundidad de secuenciación aumenta la disimilaridad entre las réplicas de PCR a menos que las estrategias bioinformáticas para eliminar supuestas secuencias artefactuales se ajusten según el número de secuencias analizadas. Finalmente, mostramos que los umbrales de identidad apropiados para el agrupamiento de OTU y la asignación taxonómica difieren entre marcadores. El metabarcoding de muestras ambientales complejas idealmente requiere (1) investigar si se necesitan más de un conjunto de cebadores que apunten al mismo grupo taxonómico para compensar los sesgos de los cebadores, (2) más de una réplica de PCR por muestra, (3) procesamiento bioinformático de secuencias que equilibre la detección de diversidad con la eliminación de secuencias artefactuales, y (4) selección empírica de umbrales de agrupamiento de OTU y asignación taxonómica adaptados a cada marcador y a los taxones obtenidos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.12849",
    doi = "10.1111/2041-210x.12849",
    openalex = "W2724989966",
    references = "doi101016jtree201404003, doi101111j1365294x201205537x"
}

La revolución genómica ha cambiado fundamentalmente cómo investigamos la biodiversidad en la Tierra. Las plataformas de secuenciación de alto rendimiento ("SHR") ahora permiten la secuenciación rápida de ADN de diversos tipos de muestras ambientales (denominadas "ADN ambiental" o "eDNA"). Acoplar la SHR con nuestra capacidad para asociar secuencias de eDNA con un nombre taxonómico se llama "metabarcoding de eDNA" y ofrece una poderosa herramienta molecular capaz de investigar de forma no invasiva la riqueza de especies de muchos ecosistemas. Aquí, revisamos el uso del metabarcoding de eDNA para investigar la riqueza animal y vegetal, y los desafíos en el uso de enfoques de eDNA para estimar la abundancia relativa. Destacamos las aplicaciones de eDNA en ambientes de agua dulce, marinos y terrestres, y en este amplio contexto, resumimos lo que se sabe sobre la capacidad de diferentes tipos de muestras de eDNA para aproximar la riqueza en el espacio y a través del tiempo. Proporcionamos preguntas guía para el diseño de estudios y discutimos el flujo de trabajo del metabarcoding de eDNA con un enfoque en los cebadores y los métodos de preparación de bibliotecas. Además, discutimos criterios importantes para considerar el filtrado bioinformático de conjuntos de datos, con recomendaciones para aumentar la transparencia. Finalmente, mirando hacia el futuro, discutimos las aplicaciones emergentes del metabarcoding de eDNA en ecología, conservación, biología de invasiones, biomonitorización, y cómo el metabarcoding de eDNA puede empoderar la ciencia ciudadana y la educación en biodiversidad.

@article{doi101111mec14350,
    author = "Deiner, Kristy y Bik, Holly M. y Mächler, Elvira y Seymour, Mathew y Lacoursière‐Roussel, Anaïs y Altermatt, Florian y Creer, Simon y Bista, Iliana y Lodge, David M. y de Vere, Natasha y Pfrender, Michael E. y Bernatchez, Louis",
    title = "Metabarcoding de ADN ambiental: Transformando cómo investigamos las comunidades animales y vegetales",
    year = "2017",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = {La revolución genómica ha cambiado fundamentalmente cómo investigamos la biodiversidad en la Tierra. Las plataformas de secuenciación de alto rendimiento ("SHR") ahora permiten la secuenciación rápida de ADN de diversos tipos de muestras ambientales (denominadas "ADN ambiental" o "eDNA"). Acoplar la SHR con nuestra capacidad para asociar secuencias de eDNA con un nombre taxonómico se llama "metabarcoding de eDNA" y ofrece una poderosa herramienta molecular capaz de investigar de forma no invasiva la riqueza de especies de muchos ecosistemas. Aquí, revisamos el uso del metabarcoding de eDNA para investigar la riqueza animal y vegetal, y los desafíos en el uso de enfoques de eDNA para estimar la abundancia relativa. Destacamos las aplicaciones de eDNA en ambientes de agua dulce, marinos y terrestres, y en este amplio contexto, resumimos lo que se sabe sobre la capacidad de diferentes tipos de muestras de eDNA para aproximar la riqueza en el espacio y a través del tiempo. Proporcionamos preguntas guía para el diseño de estudios y discutimos el flujo de trabajo del metabarcoding de eDNA con un enfoque en los cebadores y los métodos de preparación de bibliotecas. Además, discutimos criterios importantes para considerar el filtrado bioinformático de conjuntos de datos, con recomendaciones para aumentar la transparencia. Finalmente, mirando hacia el futuro, discutimos las aplicaciones emergentes del metabarcoding de eDNA en ecología, conservación, biología de invasiones, biomonitorización, y cómo el metabarcoding de eDNA puede empoderar la ciencia ciudadana y la educación en biodiversidad.},
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.14350",
    doi = "10.1111/mec.14350",
    openalex = "W2754769271",
    references = "doi101007s1059201507754, doi101016jbiocon201411019, doi101038nature03959, doi101038nature12921, doi101038nmethf303, doi101038srep40368, doi101073pnas0905845106, doi101073pnas1000080107, doi101093bioinformaticsbtq461, doi101093bioinformaticsbtr381, doi101093nargks1219, doi101098rsbl20080118, doi101098rsos150088, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1755263x201000158x, doi101111mec13428, doi101126science1187512, doi101126science1256688, doi101128aem0006207, doi101128aem0154109, doi101139cjfas20130047, doi1011861471210510421, doi107717peerj2584"
}

El análisis de ADN ambiental (eDNA) es una herramienta de monitoreo de la biodiversidad rápida, no invasiva y rentable, con un enorme potencial para informar la conservación y gestión acuáticas. El desarrollo está en curso, con un fuerte interés comercial, y se descubren continuamente nuevos usos. Se han establecido aplicaciones generales de eDNA y directrices para las mejores prácticas en sistemas de agua dulce, pero faltan evaluaciones específicas del hábitat. Las charcas son sistemas altamente diversos, pero poco estudiados, que podrían beneficiarse del monitoreo de eDNA. Sin embargo, las aplicaciones de eDNA en charcas y las limitaciones metodológicas específicas de estos entornos siguen sin abordarse. Tras un taller de partes interesadas en 2017, los investigadores combinaron conocimientos y experiencia para revisar estas aplicaciones y desafíos que deben abordarse para el futuro y la consistencia del monitoreo de eDNA en charcas. Los mayores desafíos para las encuestas de eDNA en charcas son la muestreo representativo, la captura de eDNA y la posible inhibición de la PCR. Ofrecemos recomendaciones para el muestreo, la captura de eDNA, las pruebas de inhibición y las prácticas de laboratorio, que deberían ayudar a nuevos y proyectos de eDNA en curso en charcas. Si se implementan, estas recomendaciones contribuirán hacia una eventual normalización amplia de la investigación y práctica de eDNA, con espacio para adaptar los flujos de trabajo para un análisis óptimo y diferentes aplicaciones. Tal normalización proporcionará datos más robustos, comparables y ecológicamente significativos para permitir una conservación y gestión efectiva de la biodiversidad de las charcas.

@article{doi101007s1075001837505,
    author = "Harper, Lynsey R. y Buxton, Andrew S. y Rees, Helen C. y Bruce, Kat y Brys, Rein y Halfmaerten, David y Read, Daniel S. y Watson, Hayley V. y Sayer, Carl D. y Jones, Eleanor P. y Priestley, Victoria y Mächler, Elvira y Múrria, Cesc y Garcés‐Pastor, Sandra y Medupin, Cecilia y Burgess, Katherine B. y Benson, G. B. G. y Boonham, Neil y Griffiths, Richard A. y Handley, Lori Lawson y Hänfling, Bernd",
    title = "Perspectivas y desafíos del monitoreo de ADN ambiental (eDNA) en charcas de agua dulce",
    year = "2018",
    journal = "Hydrobiologia",
    abstract = "El análisis de ADN ambiental (eDNA) es una herramienta de monitoreo de la biodiversidad rápida, no invasiva y rentable, con un enorme potencial para informar la conservación y gestión acuáticas. El desarrollo está en curso, con un fuerte interés comercial, y se descubren continuamente nuevos usos. Se han establecido aplicaciones generales de eDNA y directrices para las mejores prácticas en sistemas de agua dulce, pero faltan evaluaciones específicas del hábitat. Las charcas son sistemas altamente diversos, pero poco estudiados, que podrían beneficiarse del monitoreo de eDNA. Sin embargo, las aplicaciones de eDNA en charcas y las limitaciones metodológicas específicas de estos entornos siguen sin abordarse. Tras un taller de partes interesadas en 2017, los investigadores combinaron conocimientos y experiencia para revisar estas aplicaciones y desafíos que deben abordarse para el futuro y la consistencia del monitoreo de eDNA en charcas. Los mayores desafíos para las encuestas de eDNA en charcas son la muestreo representativo, la captura de eDNA y la posible inhibición de la PCR. Ofrecemos recomendaciones para el muestreo, la captura de eDNA, las pruebas de inhibición y las prácticas de laboratorio, que deberían ayudar a nuevos y proyectos de eDNA en curso en charcas. Si se implementan, estas recomendaciones contribuirán hacia una eventual normalización amplia de la investigación y práctica de eDNA, con espacio para adaptar los flujos de trabajo para un análisis óptimo y diferentes aplicaciones. Tal normalización proporcionará datos más robustos, comparables y ecológicamente significativos para permitir una conservación y gestión efectiva de la biodiversidad de las charcas.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10750-018-3750-5",
    doi = "10.1007/s10750-018-3750-5",
    openalex = "W2889134269",
    references = "doi101016jwatres201803003"
}

Después de la independencia y de acuerdo con las políticas ambientales globales, el gobierno de Namibia transfirió parcialmente la responsabilidad de gestionar la vida silvestre y el agua a las comunidades locales. En este artículo, utilizamos el concepto de justicia ambiental como guía teórica para explorar los efectos combinados que estas nuevas políticas han tenido para los pastores en Namibia rural y árida. Encontramos, en primer lugar, que debido en parte a los esfuerzos de conservación, la población de elefantes ha aumentado significativamente. Si bien una población sana de elefantes apoya un turismo exclusivo e internacional, los elefantes están causando una destrucción cada vez mayor en los puntos de agua comunitarios, lo que lleva a un aumento de los costos financieros locales. Sin embargo, solo una pequeña fracción de los ingresos del turismo basado en la comunidad permanece en las comunidades, y relativamente pocas personas se benefician directamente de estos ingresos. En segundo lugar, a medida que surgen nuevas instituciones de intercambio a nivel comunitario para el agua, los pastores que están económicamente marginados están subsidiando los costos financieros del agua tanto para sus vecinos ricos como para la industria turística. Al examinar los efectos combinados de las políticas de CBNRM para la gestión del agua y la vida silvestre, es probable que estas políticas conduzcan a una mejor gestión de los recursos pero a una mayor desigualdad económica. Para interpretar estos hallazgos, consideramos cómo la CBNRM transforma los paisajes y la vida silvestre en mercancías globales. Este proceso arrastra a las comunidades hacia nuevos regímenes de propiedad común y, al mismo tiempo, hacia la privatización, y ayuda a explicar los cambios socioecológicos que observamos.

@article{doi101016jgeoforum201805010,
    author = "Schnegg, Michael y Kiaka, Richard Dimba",
    title = "Elefantes subsidiados: gobernanza de recursos basada en la comunidad y justicia ambiental (in)justicia en Namibia",
    year = "2018",
    journal = "Geoforum",
    abstract = "Después de la independencia y de acuerdo con las políticas ambientales globales, el gobierno de Namibia transfirió parcialmente la responsabilidad de gestionar la vida silvestre y el agua a las comunidades locales. En este artículo, utilizamos el concepto de justicia ambiental como guía teórica para explorar los efectos combinados que estas nuevas políticas han tenido para los pastores en Namibia rural y árida. Encontramos, en primer lugar, que debido en parte a los esfuerzos de conservación, la población de elefantes ha aumentado significativamente. Si bien una población sana de elefantes apoya un turismo exclusivo e internacional, los elefantes están causando una destrucción cada vez mayor en los puntos de agua comunitarios, lo que lleva a un aumento de los costos financieros locales. Sin embargo, solo una pequeña fracción de los ingresos del turismo basado en la comunidad permanece en las comunidades, y relativamente pocas personas se benefician directamente de estos ingresos. En segundo lugar, a medida que surgen nuevas instituciones de intercambio a nivel comunitario para el agua, los pastores que están económicamente marginados están subsidiando los costos financieros del agua tanto para sus vecinos ricos como para la industria turística. Al examinar los efectos combinados de las políticas de CBNRM para la gestión del agua y la vida silvestre, es probable que estas políticas conduzcan a una mejor gestión de los recursos pero a una mayor desigualdad económica. Para interpretar estos hallazgos, consideramos cómo la CBNRM transforma los paisajes y la vida silvestre en mercancías globales. Este proceso arrastra a las comunidades hacia nuevos regímenes de propiedad común y, al mismo tiempo, hacia la privatización, y ayuda a explicar los cambios socioecológicos que observamos.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.geoforum.2018.05.010",
    doi = "10.1016/j.geoforum.2018.05.010",
    openalex = "W2803787839",
    references = "openalexw1497677346"
}

A pesar de la importancia ecológica y social de los grandes ríos, la muestre de peces sigue siendo costosa y limitada a hábitats específicos (por ejemplo, orillas de ríos). Utilizando un enfoque de metabarcoding de eDNA, muestreamos regularmente 500 km de un gran río (Río Ródano). Las comparaciones con encuestas de electrofishing a largo plazo demostraron la capacidad del metabarcoding de eDNA para revelar cualitativa y cuantitativamente las estructuras de ensamblajes de peces (abundancia relativa de especies), pero el eDNA integró un espacio más grande que la ubicación de muestreo clásica. La combinación de una revisión de la literatura y datos de campo mostró que el eDNA se comporta en la columna de agua como materia orgánica particulada fina. Su distancia de detección varió desde unos pocos km en un arroyo pequeño hasta más de 100 km en un gran río. Hasta donde sabemos, nuestros resultados son la primera demostración de la capacidad del metabarcoding de eDNA para describir patrones longitudinales de ensamblajes de peces en un gran río, y el metabarcoding parece ser un método confiable y rentable para el monitoreo futuro.

@article{doi101038s41598018284248,
    author = "Pont, Didier y Rocle, Mathieu y Valentini, Alice y Civade, Raphaël y Jean, Pauline y Maire, Anthony y Roset, Nicolas y Schabuss, Michael y Zornig, Horst y Déjean, Tony",
    title = "Environmental DNA reveals quantitative patterns of fish biodiversity in large rivers despite its downstream transportation",
    year = "2018",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "A pesar de la importancia ecológica y social de los grandes ríos, la muestre de peces sigue siendo costosa y limitada a hábitats específicos (por ejemplo, orillas de ríos). Utilizando un enfoque de metabarcoding de eDNA, muestreamos regularmente 500 km de un gran río (Río Ródano). Las comparaciones con encuestas de electrofishing a largo plazo demostraron la capacidad del metabarcoding de eDNA para revelar cualitativa y cuantitativamente las estructuras de ensamblajes de peces (abundancia relativa de especies), pero el eDNA integró un espacio más grande que la ubicación de muestreo clásica. La combinación de una revisión de la literatura y datos de campo mostró que el eDNA se comporta en la columna de agua como materia orgánica particulada fina. Su distancia de detección varió desde unos pocos km en un arroyo pequeño hasta más de 100 km en un gran río. Hasta donde sabemos, nuestros resultados son la primera demostración de la capacidad del metabarcoding de eDNA para describir patrones longitudinales de ensamblajes de peces en un gran río, y el metabarcoding parece ser un método confiable y rentable para el monitoreo futuro.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-018-28424-8",
    doi = "10.1038/s41598-018-28424-8",
    openalex = "W2809994961",
    references = "doi101038srep40368, doi101111mec14350"
}

A medida que el ADN ambiental (eDNA) se convierte en un recurso cada vez más valioso para el monitoreo de los ecosistemas marinos, comprender la variación en su persistencia a través de entornos contrastantes es crítico. Aquí, cuantificamos la descomposición del eDNA macrobico a lo largo de un eje espacio-temporal de condiciones localmente extremas, que varían desde zonas marinas influenciadas por el océano hasta zonas costanas urbanas, y entre invierno y verano. Informamos que el eDNA se degrada 1,6 veces más rápido en el entorno costano que en el entorno marino, pero, contrariamente a las expectativas, no encontramos diferencias según la estación. El análisis de las covariables ambientales muestra un gradiente espacial de salinidad y un gradiente temporal de pH, siendo la salinidad —o las correlaciones bióticas de la misma— lo más importante. Basándonos en nuestra estimación de la vida media del eDNA costano y las concentraciones naturales de eDNA, estimamos que el eDNA puede detectarse durante aproximadamente 48 horas, ofreciendo el potencial de recopilar datos de la comunidad ecológica con alta fidelidad local. Concluimos situando estos resultados en el contexto de las tasas de descomposición del eDNA publicadas previamente.

@article{doi101038s4200301801926,
    author = "Collins, Rupert A. y Wangensteen, Owen S. y O’Gorman, Eoin J. y Mariani, Stefano y Sims, David y Genner, Martin J.",
    title = "Persistencia del ADN ambiental en sistemas marinos",
    year = "2018",
    journal = "Communications Biology",
    abstract = "A medida que el ADN ambiental (eDNA) se convierte en un recurso cada vez más valioso para el monitoreo de los ecosistemas marinos, comprender la variación en su persistencia a través de entornos contrastantes es crítico. Aquí, cuantificamos la descomposición del eDNA macrobico a lo largo de un eje espacio-temporal de condiciones localmente extremas, que varían desde zonas marinas influenciadas por el océano hasta zonas costanas urbanas, y entre invierno y verano. Informamos que el eDNA se degrada 1,6 veces más rápido en el entorno costano que en el entorno marino, pero, contrariamente a las expectativas, no encontramos diferencias según la estación. El análisis de las covariables ambientales muestra un gradiente espacial de salinidad y un gradiente temporal de pH, siendo la salinidad —o las correlaciones bióticas de la misma— lo más importante. Basándonos en nuestra estimación de la vida media del eDNA costano y las concentraciones naturales de eDNA, estimamos que el eDNA puede detectarse durante aproximadamente 48 horas, ofreciendo el potencial de recopilar datos de la comunidad ecológica con alta fidelidad local. Concluimos situando estos resultados en el contexto de las tasas de descomposición del eDNA publicadas previamente.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s42003-018-0192-6",
    doi = "10.1038/s42003-018-0192-6",
    openalex = "W2899195544",
    references = "doi1010079780387874586, doi101007s1059201507754, doi101016jbiocon201411019, doi101016jtree201404003, doi101038srep40368, doi101093nargks596, doi101098rstb20051716, doi1011111365266412306, doi101111mec14350, doi1013851592591922365, openalexw3086315876"
}

Resumen El ADN ambiental (eDNA), es decir, el ADN liberado en el entorno por cualquier forma de vida, representa una oportunidad formidable para recopilar información de alto rendimiento y estandarizada sobre la distribución o los hábitos alimenticios de las especies. Por lo tanto, tiene un gran potencial para aplicaciones en ecología y gestión de la biodiversidad. Sin embargo, este campo de investigación está evolucionando rápidamente, involucra diferentes áreas de experiencia y actualmente carece de enfoques estandarizados, lo que requiere una síntesis actualizada y completa. El ADN ambiental para la investigación y el monitoreo de la biodiversidad cubre los métodos actuales basados en eDNA, con un enfoque particular en el «metabarcoding de eDNA». Destinado a científicos y gestores, proporciona la información de base necesaria para diseñar experimentos sólidos. Revisa todos los pasos necesarios para producir datos de metabarcoding de alta calidad, como la muestreo, el diseño de metabarcodas, la optimización de los protocolos de PCR y secuenciación, así como el análisis de grandes conjuntos de datos de secuenciación. Todos estos diferentes pasos se presentan discutiendo el potencial y los desafíos actuales de los enfoques basados en eDNA para inferir parámetros sobre la biodiversidad o los procesos ecológicos. Los últimos capítulos de este libro revisan cómo se ha utilizado el metabarcoding de ADN hasta ahora para desentrañar nuevos patrones de diversidad en el espacio y el tiempo, para detectar especies particulares y para responder a nuevas preguntas ecológicas en diversos ecosistemas y para diversos organismos. El ADN ambiental para la investigación y el monitoreo de la biodiversidad constituye una lectura esencial para todos los estudiantes de posgrado, investigadores y profesionales que no tienen un fuerte conocimiento de fondo en genética molecular y que están dispuestos a utilizar enfoques de eDNA en ecología y biomonitorización.

@book{doi101093oso97801987672200010001,
    author = "Taberlet, Pierre y Bonin, Aurélie y Zinger, Lucie y Coissac, Éric",
    title = "ADN ambiental",
    year = "2018",
    abstract = "Resumen El ADN ambiental (eDNA), es decir, el ADN liberado en el entorno por cualquier forma de vida, representa una oportunidad formidable para recopilar información de alto rendimiento y estandarizada sobre la distribución o los hábitos alimenticios de las especies. Por lo tanto, tiene un gran potencial para aplicaciones en ecología y gestión de la biodiversidad. Sin embargo, este campo de investigación está evolucionando rápidamente, involucra diferentes áreas de experiencia y actualmente carece de enfoques estandarizados, lo que requiere una síntesis actualizada y completa. El ADN ambiental para la investigación y el monitoreo de la biodiversidad cubre los métodos actuales basados en eDNA, con un enfoque particular en el «metabarcoding de eDNA». Destinado a científicos y gestores, proporciona la información de base necesaria para diseñar experimentos sólidos. Revisa todos los pasos necesarios para producir datos de metabarcoding de alta calidad, como la muestreo, el diseño de metabarcodas, la optimización de los protocolos de PCR y secuenciación, así como el análisis de grandes conjuntos de datos de secuenciación. Todos estos diferentes pasos se presentan discutiendo el potencial y los desafíos actuales de los enfoques basados en eDNA para inferir parámetros sobre la biodiversidad o los procesos ecológicos. Los últimos capítulos de este libro revisan cómo se ha utilizado el metabarcoding de ADN hasta ahora para desentrañar nuevos patrones de diversidad en el espacio y el tiempo, para detectar especies particulares y para responder a nuevas preguntas ecológicas en diversos ecosistemas y para diversos organismos. El ADN ambiental para la investigación y el monitoreo de la biodiversidad constituye una lectura esencial para todos los estudiantes de posgrado, investigadores y profesionales que no tienen un fuerte conocimiento de fondo en genética molecular y que están dispuestos a utilizar enfoques de eDNA en ecología y biomonitorización.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198767220.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198767220.001.0001",
    openalex = "W4250963355",
    references = "doi101007s1059201507754, doi101016b9780123721808500421, doi101016jtree200504005, doi101016jtree201404003, doi101038nmeth3869, doi101038nmethf303, doi101038srep40368, doi101073pnas74125463, doi101093nar25173389, doi101093nargks1219, doi101098rsos150088, doi101111j1365294x201105418x, doi101111j1365294x201205537x, doi101111j175348871981tb06752x, doi101111j1755263x201000158x, doi101126science2448875, doi101126scienceaac9323, doi101126scienceaam9695, doi101128aem0006207, doi101128aem0154109, doi101139cjfas20130047, doi101146annurevgenet37110801143214, doi101371journalpone0059520, doi1018901119521"
}

Aunque en los últimos años las encuestas de metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) han demostrado un gran potencial como método de monitoreo alternativo, su integración en los programas existentes de monitoreo marino podría verse obstaculizada por la dispersión de la señal de eDNA. Las corrientes y las influencias de las mareas podrían transportar eDNA a grandes distancias, induciendo la detección falsa de especies, lo que lleva a evaluaciones inexactas de la biodiversidad y, en última instancia, a una mala gestión de los entornos marinos. En este estudio, determinamos la capacidad de las encuestas de metabarcoding de eDNA para distinguir señales localizadas obtenidas de cuatro hábitats marinos dentro de una escala espacial pequeña (<5 km) sometidas a una significativa marea y flujo de agua a lo largo de la costa. Nuestra encuesta de metabarcoding de eDNA detectó 86 géneros, dentro de 77 familias y a través de 11 filos utilizando tres ensayos de metabarcoding establecidos que apuntan a la diversidad de peces (gen 16S rRNA), crustáceos (gen 16S rRNA) y eucariotas (subunidad 1 de citocromo oxidasa). Los análisis de ordenación y agrupación para ambos conjuntos de datos taxonómicos y de OTU muestran señales de eDNA distintas entre los hábitats muestreados, sugiriendo que la dispersión de eDNA entre hábitats fue limitada. Los taxones individuales con fuertes preferencias de hábitat mostraron señales de eDNA localizadas de acuerdo con su respectivo hábitat, mientras que los taxones conocidos por ser menos específicos del hábitat generaron señales más ubicuas. Nuestros datos añaden evidencia de que las encuestas de metabarcoding de eDNA en entornos marinos detectan un amplio rango de taxones que son espacialmente discretos. Nuestro trabajo también destaca que el refinamiento de la elección del ensayo es esencial para realizar el pleno potencial de las encuestas de metabarcoding de eDNA en los programas de monitoreo de la biodiversidad marina.

@article{doi1011111755099812982,
    author = "Jeunen, Gert‐Jan y Knapp, Michael y Spencer, Hamish G. y Lamare, Miles D. y Taylor, Helen R. y Stat, Michael y Bunce, Michael y Gemmell, Neil J.",
    title = "El metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) revela una fuerte discriminación entre diversos hábitats marinos conectados por el movimiento del agua",
    year = "2018",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "Aunque en los últimos años las encuestas de metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) han demostrado un gran potencial como método de monitoreo alternativo, su integración en los programas existentes de monitoreo marino podría verse obstaculizada por la dispersión de la señal de eDNA. Las corrientes y las influencias de las mareas podrían transportar eDNA a grandes distancias, induciendo la detección falsa de especies, lo que lleva a evaluaciones inexactas de la biodiversidad y, en última instancia, a una mala gestión de los entornos marinos. En este estudio, determinamos la capacidad de las encuestas de metabarcoding de eDNA para distinguir señales localizadas obtenidas de cuatro hábitats marinos dentro de una escala espacial pequeña (<5 km) sometidas a una significativa marea y flujo de agua a lo largo de la costa. Nuestra encuesta de metabarcoding de eDNA detectó 86 géneros, dentro de 77 familias y a través de 11 filos utilizando tres ensayos de metabarcoding establecidos que apuntan a la diversidad de peces (gen 16S rRNA), crustáceos (gen 16S rRNA) y eucariotas (subunidad 1 de citocromo oxidasa). Los análisis de ordenación y agrupación para ambos conjuntos de datos taxonómicos y de OTU muestran señales de eDNA distintas entre los hábitats muestreados, sugiriendo que la dispersión de eDNA entre hábitats fue limitada. Los taxones individuales con fuertes preferencias de hábitat mostraron señales de eDNA localizadas de acuerdo con su respectivo hábitat, mientras que los taxones conocidos por ser menos específicos del hábitat generaron señales más ubicuas. Nuestros datos añaden evidencia de que las encuestas de metabarcoding de eDNA en entornos marinos detectan un amplio rango de taxones que son espacialmente discretos. Nuestro trabajo también destaca que el refinamiento de la elección del ensayo es esencial para realizar el pleno potencial de las encuestas de metabarcoding de eDNA en los programas de monitoreo de la biodiversidad marina.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1755-0998.12982",
    doi = "10.1111/1755-0998.12982",
    openalex = "W2906482497",
    references = "doi101038s41598017125015"
}

En la era de la "defaunación del Antropoceno", las especies grandes a menudo ya no se detectan en los hábitats donde anteriormente ocurrían. Sin embargo, no está claro si esta aparente diversidad ausente o "oscura" de la megafauna resulta de extirpaciones locales de especies o del fracaso en detectar individuos remanentes elusivos. Encontramos que, a pesar de un esfuerzo de muestreo dos órdenes de magnitud menor, el ADN ambiental (eDNA) detecta un 44% más de especies de tiburones que los censos visuales submarinos tradicionales y los videos con señuelos en todo el archipiélago de Nueva Caledonia (Pacífico suroeste). Además, el análisis de eDNA revela la presencia de especies de tiburones previamente no observadas en áreas afectadas por el ser humano. En general, nuestros resultados destacan una mayor prevalencia de tiburones de la descrita por los métodos de encuesta tradicionales tanto en áreas impactadas como en áreas salvajes. Esto indica una necesidad urgente de evaluaciones a gran escala de eDNA para mejorar el monitoreo de la megafauna amenazada y elusiva. Finalmente, nuestros hallazgos enfatizan la necesidad de esfuerzos de conservación específicamente orientados hacia la protección de poblaciones remanentes elusivas.

@article{doi101126sciadvaap9661,
    author = "Boussarie, Germain y Bakker, Judith y Wangensteen, Owen S. y Mariani, Stefano y Bonnin, Lucas y Juhel, Jean‐Baptiste y Kiszka, Jérémy J. y Kulbicki, Michel y Manel, Stéphanie y Robbins, William D. y Vigliola, Laurent y Mouillot, David",
    title = "El ADN ambiental ilumina la diversidad oscura de los tiburones",
    year = "2018",
    journal = "Science Advances",
    abstract = {En la era de la "defaunación del Antropoceno", las especies grandes a menudo ya no se detectan en los hábitats donde anteriormente ocurrían. Sin embargo, no está claro si esta aparente diversidad ausente o "oscura" de la megafauna resulta de extirpaciones locales de especies o del fracaso en detectar individuos remanentes elusivos. Encontramos que, a pesar de un esfuerzo de muestreo dos órdenes de magnitud menor, el ADN ambiental (eDNA) detecta un 44% más de especies de tiburones que los censos visuales submarinos tradicionales y los videos con señuelos en todo el archipiélago de Nueva Caledonia (Pacífico suroeste). Además, el análisis de eDNA revela la presencia de especies de tiburones previamente no observadas en áreas afectadas por el ser humano. En general, nuestros resultados destacan una mayor prevalencia de tiburones de la descrita por los métodos de encuesta tradicionales tanto en áreas impactadas como en áreas salvajes. Esto indica una necesidad urgente de evaluaciones a gran escala de eDNA para mejorar el monitoreo de la megafauna amenazada y elusiva. Finalmente, nuestros hallazgos enfatizan la necesidad de esfuerzos de conservación específicamente orientados hacia la protección de poblaciones remanentes elusivas.},
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.aap9661",
    doi = "10.1126/sciadv.aap9661",
    openalex = "W2802297949",
    references = "doi101038s41598017125015"
}

La síntesis fiable de los diversos y rápidamente crecientes cuerpos de evidencia es vital para el proceso de toma de decisiones basada en evidencia en políticas, prácticas e investigación ambientales. Con el auge de la medicina basada en evidencia y el aumento del número de revisiones sistemáticas publicadas, se han desarrollado criterios para evaluar la calidad de los informes. Primero QUOROM (Lancet 354:1896–1900, 1999) y luego PRISMA (Ann Intern Med 151:264, 2009) se desarrollaron como directrices y estándares de informe para asegurar que las meta-análisis y revisiones sistemáticas médicas se informen con un alto nivel de detalle. PRISMA es ahora ampliamente utilizado por una variedad de revistas como una lista de verificación previa a la presentación. Sin embargo, debido a su desarrollo para revisiones sistemáticas en atención sanitaria, PRISMA tiene una aplicabilidad limitada para revisiones en conservación y gestión ambiental. Destacamos 12 problemas clave con la aplicación de PRISMA a este campo, incluyendo un énfasis excesivo en el meta-análisis y ninguna consideración para otros métodos de síntesis. Presentamos ROSES (RepOrting standards for Systematic Evidence Syntheses), un formulario y diagrama de flujo diseñado específicamente para revisiones sistemáticas y mapas sistemáticos en el campo de la conservación y la gestión ambiental. Describimos cómo ROSES resuelve los problemas de PRISMA. Esbozamos los beneficios clave de nuestro enfoque para diseñar ROSES, en particular el nivel de detalle e inclusión de declaraciones de guía ricas. También presentamos la extracción de metadatos que describen aspectos clave de la realización de la revisión. Recopilados juntos, este registro de resumen puede ayudar a facilitar la revisión y evaluación rápida de la realización de una revisión sistemática o mapa, potencialmente acelerando el proceso de revisión por pares. Presentamos los resultados de las pruebas iniciales de campo de ROSES con expertos en revisiones sistemáticas y proponemos un plan para el desarrollo futuro de ROSES.

@article{doi101186s1375001801217,
    author = "Haddaway, Neal y Macura, Biljana y Whaley, Paul y Pullin, Andrew S.",
    title = "ROSES RepOrting standards for Systematic Evidence Syntheses: pro forma, flow-diagram and descriptive summary of the plan and conduct of environmental systematic reviews and systematic maps",
    year = "2018",
    journal = "Environmental Evidence",
    abstract = "La síntesis fiable de los diversos y rápidamente crecientes cuerpos de evidencia es vital para el proceso de toma de decisiones basada en evidencia en políticas, prácticas e investigación ambientales. Con el auge de la medicina basada en evidencia y el aumento del número de revisiones sistemáticas publicadas, se han desarrollado criterios para evaluar la calidad de los informes. Primero QUOROM (Lancet 354:1896–1900, 1999) y luego PRISMA (Ann Intern Med 151:264, 2009) se desarrollaron como directrices y estándares de informe para asegurar que las meta-análisis y revisiones sistemáticas médicas se informen con un alto nivel de detalle. PRISMA es ahora ampliamente utilizado por una variedad de revistas como una lista de verificación previa a la presentación. Sin embargo, debido a su desarrollo para revisiones sistemáticas en atención sanitaria, PRISMA tiene una aplicabilidad limitada para revisiones en conservación y gestión ambiental. Destacamos 12 problemas clave con la aplicación de PRISMA a este campo, incluyendo un énfasis excesivo en el meta-análisis y ninguna consideración para otros métodos de síntesis. Presentamos ROSES (RepOrting standards for Systematic Evidence Syntheses), un formulario y diagrama de flujo diseñado específicamente para revisiones sistemáticas y mapas sistemáticos en el campo de la conservación y la gestión ambiental. Describimos cómo ROSES resuelve los problemas de PRISMA. Esbozamos los beneficios clave de nuestro enfoque para diseñar ROSES, en particular el nivel de detalle e inclusión de declaraciones de guía ricas. También presentamos la extracción de metadatos que describen aspectos clave de la realización de la revisión. Recopilados juntos, este registro de resumen puede ayudar a facilitar la revisión y evaluación rápida de la realización de una revisión sistemática o mapa, potencialmente acelerando el proceso de revisión por pares. Presentamos los resultados de las pruebas iniciales de campo de ROSES con expertos en revisiones sistemáticas y proponemos un plan para el desarrollo futuro de ROSES.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s13750-018-0121-7",
    doi = "10.1186/s13750-018-0121-7",
    openalex = "W2795357522",
    references = "doi101111j15231739200600485x"
}

Resumen El debate entre compartir tierras y ahorrar tierras se ha estancado recientemente, careciendo de una perspectiva integradora en los paisajes agrícolas así como de una consideración de los servicios ecosistémicos. Aquí, argumentamos que compartir tierras (es decir, sistemas de cultivo amigables con la vida silvestre) y ahorrar tierras (es decir, separación de la agricultura de alto rendimiento y los hábitats naturales) no son mutuamente excluyentes, ya que ambos son necesarios para equilibrar las necesidades de gestión para la multifuncionalidad de los paisajes agrícolas. Compartir tierras promueve servicios ecosistémicos en entornos agrícolas, permitiendo así una producción ambientalmente amigable. Las tierras apartadas en áreas protegidas mediante el ahorro de tierras son cruciales para la conservación de aquellas especies que son incompatibles con la agricultura. Lo importante es que, a medida que las especies se mueven a través del paisaje y explotan diferentes hábitats, se necesita una mayor conectividad entre las áreas gestionadas ambientalmente amigables y las áreas protegidas para (a) promover el desbordamiento de proveedores de servicios ecosistémicos de las medidas de compartir/ahorrar tierras a la producción agrícola y rescatar especies que proporcionan servicios de las áreas hostiles de la extinción, (b) facilitar la inmigración y contrarrestar posibles extinciones en hábitats ahorrados y (c) conservar la diversidad de respuesta de las comunidades de especies para garantizar la resiliencia de los servicios ecosistémicos en entornos cambiantes. En conclusión, la gestión exitosa de paisajes multifuncionales requiere la combinación de medidas específicas de contexto de compartir tierras y ahorrar tierras dentro de mosaicos de paisajes espacialmente bien conectados, resultando en paisajes de conectividad de compartir/ahorrar tierras. Está disponible un resumen en lenguaje sencillo para este artículo.

@article{doi101002pan321,
    author = "Graß, Ingo y Loos, Jacqueline y Baensch, Svenja y Batáry, Péter y Librán‐Embid, Felipe y Ficiciyan, Anoush y Klaus, Felix y Riechers, Maraja y Rosa, Julia y Tiede, Julia y Udy, Kristy y Westphal, Catrin y Wurz, Annemarie y Tscharntke, Teja",
    title = "Paisajes de conectividad de compartir/ahorrar tierras para servicios ecosistémicos y conservación de la biodiversidad",
    year = "2019",
    journal = "Personas y Naturaleza",
    abstract = "Resumen El debate entre compartir tierras y ahorrar tierras se ha estancado recientemente, careciendo de una perspectiva integradora en los paisajes agrícolas así como de una consideración de los servicios ecosistémicos. Aquí, argumentamos que compartir tierras (es decir, sistemas de cultivo amigables con la vida silvestre) y ahorrar tierras (es decir, separación de la agricultura de alto rendimiento y los hábitats naturales) no son mutuamente excluyentes, ya que ambos son necesarios para equilibrar las necesidades de gestión para la multifuncionalidad de los paisajes agrícolas. Compartir tierras promueve servicios ecosistémicos en entornos agrícolas, permitiendo así una producción ambientalmente amigable. Las tierras apartadas en áreas protegidas mediante el ahorro de tierras son cruciales para la conservación de aquellas especies que son incompatibles con la agricultura. Lo importante es que, a medida que las especies se mueven a través del paisaje y explotan diferentes hábitats, se necesita una mayor conectividad entre las áreas gestionadas ambientalmente amigables y las áreas protegidas para (a) promover el desbordamiento de proveedores de servicios ecosistémicos de las medidas de compartir/ahorrar tierras a la producción agrícola y rescatar especies que proporcionan servicios de las áreas hostiles de la extinción, (b) facilitar la inmigración y contrarrestar posibles extinciones en hábitats ahorrados y (c) conservar la diversidad de respuesta de las comunidades de especies para garantizar la resiliencia de los servicios ecosistémicos en entornos cambiantes. En conclusión, la gestión exitosa de paisajes multifuncionales requiere la combinación de medidas específicas de contexto de compartir tierras y ahorrar tierras dentro de mosaicos de paisajes espacialmente bien conectados, resultando en paisajes de conectividad de compartir/ahorrar tierras. Está disponible un resumen en lenguaje sencillo para este artículo.",
    url = "https://doi.org/10.1002/pan3.21",
    doi = "10.1002/pan3.21",
    openalex = "W2942710351",
    references = "doi101038nature24457, doi101111cobi12536"
}

La educación ambiental efectiva representa más que una transferencia unidireccional de información: por el contrario, este conjunto de herramientas desarrolla y mejora las actitudes, valores y conocimientos ambientales, así como construye habilidades que preparan a individuos y comunidades para emprender conjuntamente acciones ambientales positivas. La educación ambiental también facilita conexiones entre los hallazgos de investigación accionables y las prácticas en el terreno, creando espacios sinérgicos donde las partes interesadas colaboran para abordar problemas ambientales dinámicos a lo largo del tiempo. Debido a este compromiso con la aplicación y la iteración, la educación ambiental puede resultar en beneficios directos para el medio ambiente y abordar problemas de conservación de manera concreta. Sin embargo, el camino para lograr esos impactos tangibles puede ser tortuoso, con datos robustos que documentan cambios difíciles de producir. Para comprender mejor los espacios de investigación-implementación donde ocurren, se miden y se reportan esos resultados de educación ambiental, realizamos una revisión sistemática de la investigación sobre las contribuciones de la educación ambiental a los resultados de conservación y calidad ambiental. Dada la variación en los diseños de investigación y los datos, utilizamos un enfoque de métodos mixtos para la revisión; el análisis de los 105 estudios resultantes documentó resultados de educación ambiental fuertemente positivos en general y destacó espacios de investigación-implementación productivos. Los análisis de chi-cuadrado revelaron que los programas que reportan resultados directos, en comparación con aquellos que reportan resultados indirectos, difieren en el tema principal abordado. Un análisis narrativo indicó que los programas de educación ambiental que documentan impactos directos incluyen: un enfoque en problemas localizados o dimensiones localmente relevantes de problemas más amplios; colaboración con científicos, gestores de recursos y/u organizaciones comunitarias; elementos de acción integrados; y estructuras de medición/reporteo intencionales. Esas temáticas sugieren ideas para el desarrollo y documentación de programas, así como más oportunidades para espacios de investigación-implementación productivos.

@article{doi101016jbiocon2019108224,
    author = "Ardoin, Nicole M. and Bowers, Alison W. and Gaillard, Estelle",
    title = "Environmental education outcomes for conservation: A systematic review",
    year = "2019",
    journal = "Biological Conservation",
    abstract = "La educación ambiental efectiva representa más que una transferencia unidireccional de información: por el contrario, este conjunto de herramientas desarrolla y mejora las actitudes, valores y conocimientos ambientales, así como construye habilidades que preparan a individuos y comunidades para emprender conjuntamente acciones ambientales positivas. La educación ambiental también facilita conexiones entre los hallazgos de investigación accionables y las prácticas en el terreno, creando espacios sinérgicos donde las partes interesadas colaboran para abordar problemas ambientales dinámicos a lo largo del tiempo. Debido a este compromiso con la aplicación y la iteración, la educación ambiental puede resultar en beneficios directos para el medio ambiente y abordar problemas de conservación de manera concreta. Sin embargo, el camino para lograr esos impactos tangibles puede ser tortuoso, con datos robustos que documentan cambios difíciles de producir. Para comprender mejor los espacios de investigación-implementación donde ocurren, se miden y se reportan esos resultados de educación ambiental, realizamos una revisión sistemática de la investigación sobre las contribuciones de la educación ambiental a los resultados de conservación y calidad ambiental. Dada la variación en los diseños de investigación y los datos, utilizamos un enfoque de métodos mixtos para la revisión; el análisis de los 105 estudios resultantes documentó resultados de educación ambiental fuertemente positivos en general y destacó espacios de investigación-implementación productivos. Los análisis de chi-cuadrado revelaron que los programas que reportan resultados directos, en comparación con aquellos que reportan resultados indirectos, difieren en el tema principal abordado. Un análisis narrativo indicó que los programas de educación ambiental que documentan impactos directos incluyen: un enfoque en problemas localizados o dimensiones localmente relevantes de problemas más amplios; colaboración con científicos, gestores de recursos y/u organizaciones comunitarias; elementos de acción integrados; y estructuras de medición/reporteo intencionales. Esas temáticas sugieren ideas para el desarrollo y documentación de programas, así como más oportunidades para espacios de investigación-implementación productivos.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biocon.2019.108224",
    doi = "10.1016/j.biocon.2019.108224",
    openalex = "W2984404402",
    references = "doi101111j15231739200600485x"
}

El metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) es un método novedoso para evaluar la biodiversidad mediante el cual se toman muestras del entorno a través del agua, sedimento o aire, de las cuales se extrae el ADN, y luego se amplifica utilizando cebadores generales o universales en la reacción en cadena de la polimerasa y se secuencia utilizando secuenciación de nueva generación para generar miles a millones de lecturas. A partir de estos datos, se puede determinar la presencia de especies y evaluar la biodiversidad general. Es un método interdisciplinario que une la ecología de campo tradicional con métodos moleculares profundos y herramientas computacionales avanzadas. Como un método de monitoreo emergente, hay muchos obstáculos y dificultades que deben considerarse y evitarse, pero el método aún puede tener la capacidad de revolucionar las encuestas modernas de biodiversidad para la era molecular. En este artículo, revisamos la metodología básica, los beneficios y las preocupaciones del metabarcoding de eDNA, y cubrimos sistemáticamente las aplicaciones del método en la ecología global hasta la fecha, incluido el monitoreo de la biodiversidad en todos los hábitats y grupos taxonómicos, la reconstrucción de ecosistemas antiguos, las interacciones planta-polinizador, el análisis de dieta, la detección de especies invasoras, las respuestas a la contaminación y el monitoreo de la calidad del aire. También discutimos las aplicaciones futuras del método, así como los avances tecnológicos esperados y cómo pueden impactar la manera en que se utilizará el metabarcoding de eDNA en el futuro. El metabarcoding de eDNA es un método único que aún está en desarrollo y probablemente permanecerá en evolución durante algún tiempo a medida que avancen la tecnología y los procedimientos se estandaricen. Sin embargo, a medida que el metabarcoding se optimice y su uso se vuelva más generalizado, es probable que se convierta en una herramienta esencial para el monitoreo ecológico y el estudio de la conservación global.

@article{doi101016jgecco2019e00547,
    author = "Ruppert, Krista M. and Kline, Richard J. and Rahman, Md Saydur",
    title = "Past, present, and future perspectives of environmental DNA (eDNA) metabarcoding: A systematic review in methods, monitoring, and applications of global eDNA",
    year = "2019",
    journal = "Global Ecology and Conservation",
    abstract = "Environmental DNA (eDNA) metabarcoding is a novel method of assessing biodiversity wherein samples are taken from the environment via water, sediment or air from which DNA is extracted, and then amplified using general or universal primers in polymerase chain reaction and sequenced using next-generation sequencing to generate thousands to millions of reads. From this data, species presence can be determined, and overall biodiversity assessed. It is an interdisciplinary method that brings together traditional fieldbased ecology with in-depth molecular methods and advanced computational tools. As an emerging monitoring method, there are many pitfalls and roadblocks to be considered and avoided, but the method may still have the ability to revolutionize modern biodiversity surveys for the molecular era. In this paper, we review the basic methodology, benefits, and concerns of eDNA metabarcoding, and systematically cover the applications of the method in global ecology thus far, including biodiversity monitoring across all habitats and taxonomic groups, ancient ecosystem reconstruction, plant-pollinator interactions, diet analysis, invasive species detection, pollution responses, and air quality monitoring. We also discuss the future applications of the method as well as expected technological advances and how they may impact the way that eDNA metabarcoding may used in the future. eDNA metabarcoding is a unique method still in development and will likely remain in flux for some time as technology advances and procedures become standardized. However, as metabarcoding is optimized and its use becomes more widespread, it is likely to become an essential tool for ecological monitoring and global conservation study.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.gecco.2019.e00547",
    doi = "10.1016/j.gecco.2019.e00547",
    openalex = "W2912959159",
    references = "doi101007s1059201507754, doi101016jbiocon201411019, doi101016jtree201404003, doi101016jwatres201803003, doi101038nature12921, doi101038s41598017125015, doi101038srep40368, doi101098rsbl20080118, doi101098rsos150088, doi1011112041210x12595, doi101111j1365294x201205470x, doi101111j1365294x201205537x, doi101111mec13428, doi101111mec14350, doi101139cjfas20130047, doi101371journalpone0041732"
}

Resumen A medida que los estudios de ADN ambiental (eDNA) han ganado popularidad para su uso en aplicaciones ecológicas, se ha vuelto claro que sus resultados difieren de manera significativa de los de las encuestas tradicionales no basadas en PCR. En general, los estudios de eDNA que dependen de la secuenciación de amplicones pueden detectar cientos de especies presentes en un entorno muestreado, pero la composición resultante de especies puede ser idiosincrásica, reflejando mal o no en absoluto las abundancias de biomasa reales de las especies. Aquí, utilizamos un conjunto de simulaciones para desarrollar una comprensión mecanística de los procesos que conducen a los tipos de resultados comunes en estudios basados en PCR de plantilla mixta (metabarcodificación). En particular, nos centramos en los efectos del número de ciclos de PCR y la eficiencia de amplificación de los cebadores en los resultados de las métricas de diversidad en estudios de secuenciación. Luego mostramos que los índices proporcionales de lecturas de amplicones captan las tendencias en la biomasa de los taxones con alta precisión, especialmente donde la eficiencia de amplificación es alta (correlación mediana hasta 0,97). Nuestros resultados explican gran parte del comportamiento observado en los estudios basados en PCR y conducen a recomendaciones para las mejores prácticas en el campo.

@article{doi101038s4159801948546x,
    author = "Kelly, Ryan P. y Shelton, Andrew O. y Gallego, Ramón",
    title = "Understanding PCR Processes to Draw Meaningful Conclusions from Environmental DNA Studies",
    year = "2019",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "Resumen A medida que los estudios de ADN ambiental (eDNA) han ganado popularidad para su uso en aplicaciones ecológicas, se ha vuelto claro que sus resultados difieren de manera significativa de los de las encuestas tradicionales no basadas en PCR. En general, los estudios de eDNA que dependen de la secuenciación de amplicones pueden detectar cientos de especies presentes en un entorno muestreado, pero la composición resultante de especies puede ser idiosincrásica, reflejando mal o no en absoluto las abundancias de biomasa reales de las especies. Aquí, utilizamos un conjunto de simulaciones para desarrollar una comprensión mecanística de los procesos que conducen a los tipos de resultados comunes en estudios basados en PCR de plantilla mixta (metabarcodificación). En particular, nos centramos en los efectos del número de ciclos de PCR y la eficiencia de amplificación de los cebadores en los resultados de las métricas de diversidad en estudios de secuenciación. Luego mostramos que los índices proporcionales de lecturas de amplicones captan las tendencias en la biomasa de los taxones con alta precisión, especialmente donde la eficiencia de amplificación es alta (correlación mediana hasta 0,97). Nuestros resultados explican gran parte del comportamiento observado en los estudios basados en PCR y conducen a recomendaciones para las mejores prácticas en el campo.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-019-48546-x",
    doi = "10.1038/s41598-019-48546-x",
    openalex = "W2969600503",
    references = "doi101038s41598017125015, doi101073pnas0404300101"
}

= 0.68, p <.001); sin embargo, los números de copias de qPCR fueron en promedio 125 veces menores que los medidos utilizando ddPCR. Mediante metabarcoding hubo una mayor detección en muestras de agua al dirigirse al COI (40%) en comparación con 18S rRNA (5.4%). La diferencia fue menos pronunciada en muestras de bioincrustación (25% COI, 29% 18S rRNA). El modelado de ocupación mostró que, aunque la estimación de ocupación fue mayor para las muestras de bioincrustación (ψ = 1.0), se derivaron probabilidades de detección más altas para las muestras de agua. Las probabilidades de detección de ddPCR (1.0) y qPCR (0.93) fueron casi el doble que las de metabarcoding (0.57 a 0.27, dependiendo del marcador). Los estudios que buscan detectar especies invasoras o raras específicas en muestras ambientales deberían considerar el uso de enfoques dirigidos hasta tener un entendimiento detallado de cómo la complejidad de la comunidad y la matriz, y los sesgos de los cebadores, afectan los datos de metabarcoding.

@article{doi1011111755099813055,
    author = "Wood, Susanna A. y Pochon, Xavier y Laroche, Olivier y von Ammon, Ulla y Adamson, Janet y Zaiko, Anastasija",
    title = "Comparación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de gota digital, PCR cuantitativa y metabarcoding para la detección específica de especies en ADN ambiental",
    year = "2019",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "= 0.68, p <.001); sin embargo, los números de copias de qPCR fueron en promedio 125 veces menores que los medidos utilizando ddPCR. Mediante metabarcoding hubo una mayor detección en muestras de agua al dirigirse al COI (40%) en comparación con 18S rRNA (5.4%). La diferencia fue menos pronunciada en muestras de bioincrustación (25% COI, 29% 18S rRNA). El modelado de ocupación mostró que, aunque la estimación de ocupación fue mayor para las muestras de bioincrustación (ψ = 1.0), se derivaron probabilidades de detección más altas para las muestras de agua. Las probabilidades de detección de ddPCR (1.0) y qPCR (0.93) fueron casi el doble que las de metabarcoding (0.57 a 0.27, dependiendo del marcador). Los estudios que buscan detectar especies invasoras o raras específicas en muestras ambientales deberían considerar el uso de enfoques dirigidos hasta tener un entendimiento detallado de cómo la complejidad de la comunidad y la matriz, y los sesgos de los cebadores, afectan los datos de metabarcoding.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1755-0998.13055",
    doi = "10.1111/1755-0998.13055",
    openalex = "W2959499736",
    references = "doi101111mec15060"
}

Resumen El metabarcoding de ADN extraorganismal de muestras ambientales es ahora una técnica clave en la biomonitorización acuática y la evaluación de la salud de los ecosistemas. De consideración crítica al diseñar experimentos, y especialmente al desarrollar normas comunitarias y marcos legislativos, es la elección del marcador genético y del conjunto de cebadores. La subunidad I de la citocromo c oxidasa mitocondrial (COI), el marcador de código de barras de ADN estándar para animales, con su extensa biblioteca de referencia, poder discriminatorio taxonómico y variación de secuencia predecible, es la elección natural para muchas aplicaciones de metabarcoding. Sin embargo, para dirigirse a grupos taxonómicos específicos en muestras ambientales, la utilidad de COI aún no ha sido completamente examinada. Aquí, mediante un estudio de caso de peces marinos y de agua dulce de las Islas Británicas, cuantificamos el rendimiento in silico de doce pares de cebadores de cuatro loci mitocondriales – COI, citocromo b, 12S y 16S – en términos de cobertura de la biblioteca de referencia, poder discriminatorio taxonómico y universalidad de los cebadores. Posteriormente, probamos in vitro cuatro pares de cebadores – tres de COI y uno de 12S – por su especificidad, reproducibilidad y congruencia con conjuntos de datos independientes derivados de métodos tradicionales de encuesta en cinco sitios estuarinos y costeros alrededor del Canal de la Mancha y el Mar del Norte. Nuestros resultados muestran que para el ADN extraorganismal acuático a bajas concentraciones de plantilla, tanto los cebadores de COI dirigidos a metazoos como los dirigidos a peces funcionan mal en comparación con 12S, exhibiendo bajos niveles de reproducibilidad debido a la amplificación no específica de ADN procariótico y eucariótico no objetivo. Un metabarcóide ideal tendría una extensa biblioteca de referencia sobre la cual se podrían diseñar cebadores personalizados, ya sea para evaluaciones amplias de la biodiversidad o encuestas específicas de taxones. Tal base de datos está disponible para COI, pero la baja especificidad de los cebadores obstaculiza la aplicación práctica, mientras que, por el contrario, los cebadores de 12S ofrecen alta especificidad, pero carecen de referencias adecuadas. Este último problema, sin embargo, puede mitigarse ampliando el concepto de códigos de barras de ADN para incluir genomas mitocondriales completos generados por el filtrado de genomas de colecciones de tejidos existentes.

@article{doi1011112041210x13276,
    author = "Collins, Rupert A. y Bakker, Judith y Wangensteen, Owen S. y Soto, Ana Z. y Corrigan, Laura y Sims, David y Genner, Martin J. y Mariani, Stefano",
    title = "La amplificación no específica compromete el metabarcoding de ADN ambiental con COI",
    year = "2019",
    journal = "Métodos en Ecología y Evolución",
    abstract = "Resumen El metabarcoding de ADN extraorganismal de muestras ambientales es ahora una técnica clave en la biomonitorización acuática y la evaluación de la salud de los ecosistemas. De consideración crítica al diseñar experimentos, y especialmente al desarrollar normas comunitarias y marcos legislativos, es la elección del marcador genético y del conjunto de cebadores. La subunidad I de la citocromo c oxidasa mitocondrial (COI), el marcador de código de barras de ADN estándar para animales, con su extensa biblioteca de referencia, poder discriminatorio taxonómico y variación de secuencia predecible, es la elección natural para muchas aplicaciones de metabarcoding. Sin embargo, para dirigirse a grupos taxonómicos específicos en muestras ambientales, la utilidad de COI aún no ha sido completamente examinada. Aquí, mediante un estudio de caso de peces marinos y de agua dulce de las Islas Británicas, cuantificamos el rendimiento in silico de doce pares de cebadores de cuatro loci mitocondriales – COI, citocromo b, 12S y 16S – en términos de cobertura de la biblioteca de referencia, poder discriminatorio taxonómico y universalidad de los cebadores. Posteriormente, probamos in vitro cuatro pares de cebadores – tres de COI y uno de 12S – por su especificidad, reproducibilidad y congruencia con conjuntos de datos independientes derivados de métodos tradicionales de encuesta en cinco sitios estuarinos y costeros alrededor del Canal de la Mancha y el Mar del Norte. Nuestros resultados muestran que para el ADN extraorganismal acuático a bajas concentraciones de plantilla, tanto los cebadores de COI dirigidos a metazoos como los dirigidos a peces funcionan mal en comparación con 12S, exhibiendo bajos niveles de reproducibilidad debido a la amplificación no específica de ADN procariótico y eucariótico no objetivo. Un metabarcóide ideal tendría una extensa biblioteca de referencia sobre la cual se podrían diseñar cebadores personalizados, ya sea para evaluaciones amplias de la biodiversidad o encuestas específicas de taxones. Tal base de datos está disponible para COI, pero la baja especificidad de los cebadores obstaculiza la aplicación práctica, mientras que, por el contrario, los cebadores de 12S ofrecen alta especificidad, pero carecen de referencias adecuadas. Este último problema, sin embargo, puede mitigarse ampliando el concepto de códigos de barras de ADN para incluir genomas mitocondriales completos generados por el filtrado de genomas de colecciones de tejidos existentes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.13276",
    doi = "10.1111/2041-210x.13276",
    openalex = "W2965120276",
    references = "doi101016jwatres201803003, doi101038s41598017125015, doi101038s4200301801926, doi101093oso97801987672200010001"
}

Los datos de genética de poblaciones sustentan muchos estudios de procesos conductuales, ecológicos y evolutivos en poblaciones silvestres y contribuyen a una gestión de conservación efectiva. Sin embargo, la recolección de muestras genéticas puede ser desafiante al trabajar con especies en peligro, invasoras o crípticas. El ADN ambiental (eDNA) ofrece una forma de muestrear material genético de manera no invasiva sin requerir observación visual. Aunque el eDNA ha sido probado extensamente como una herramienta de monitoreo de biodiversidad y bioseguridad con un fuerte enfoque taxonómico, aún no se ha explorado completamente como un medio para obtener información de genética de poblaciones. Aquí, revisamos la investigación actual que emplea enfoques de eDNA para el estudio de poblaciones. Esbozamos los desafíos que enfrentan las metodologías de genética de poblaciones basadas en eDNA y sugerimos vías de investigación para desarrollos futuros. Abogamos por la idea de que, con optimizaciones adicionales, este campo emergente tiene un gran potencial como parte del kit de herramientas de genética de poblaciones.

@article{doi103390genes10030192,
    author = "Adams, Clare I. M. and Knapp, Michael and Gemmell, Neil J. and Jeunen, Gert‐Jan and Bunce, Michael and Lamare, Miles D. and Taylor, Helen R.",
    title = "Más allá de la biodiversidad: ¿Puede el ADN ambiental (eDNA) funcionar como una herramienta de genética de poblaciones?",
    year = "2019",
    journal = "Genes",
    abstract = "Los datos de genética de poblaciones sustentan muchos estudios de procesos conductuales, ecológicos y evolutivos en poblaciones silvestres y contribuyen a una gestión de conservación efectiva. Sin embargo, la recolección de muestras genéticas puede ser desafiante al trabajar con especies en peligro, invasoras o crípticas. El ADN ambiental (eDNA) ofrece una forma de muestrear material genético de manera no invasiva sin requerir observación visual. Aunque el eDNA ha sido probado extensamente como una herramienta de monitoreo de biodiversidad y bioseguridad con un fuerte enfoque taxonómico, aún no se ha explorado completamente como un medio para obtener información de genética de poblaciones. Aquí, revisamos la investigación actual que emplea enfoques de eDNA para el estudio de poblaciones. Esbozamos los desafíos que enfrentan las metodologías de genética de poblaciones basadas en eDNA y sugerimos vías de investigación para desarrollos futuros. Abogamos por la idea de que, con optimizaciones adicionales, este campo emergente tiene un gran potencial como parte del kit de herramientas de genética de poblaciones.",
    url = "https://doi.org/10.3390/genes10030192",
    doi = "10.3390/genes10030192",
    openalex = "W2913725860",
    references = "doi101038s4200301801926"
}

Resumen Las evaluaciones basadas en ADN ambiental (eDNA) de macroorganismos se han convertido ahora en un enfoque esencial para la biomonitorización. Los métodos de encuesta de eDNA tienen numerosas ventajas sobre los métodos de encuesta convencionales. Sin embargo, el valor de los datos que se acumularían se vería enormemente mejorado mediante la estandarización de los métodos de análisis, lo que nos permitiría comparar datos de múltiples sitios de monitoreo en diferentes momentos. La Sociedad eDNA (http://ednasociety.org/en/about), cuyos miembros fundadores son investigadores japoneses que realizan estudios de eDNA sobre macroorganismos, se estableció en 2018 con el objetivo de expandir la tecnología y la ciencia de la eDNA. Aquí, presentamos nuestra publicación clave, «Manual de muestreo y experimentación de ADN ambiental» (http://ednasociety.org/en/manual), que fue publicada bajo la iniciativa de la Sociedad eDNA. El manual describe los métodos detallados para las encuestas y los experimentos, incluida la selección de sitios de muestreo, métodos de muestreo, métodos de filtración, extracción de ADN, detección específica de especies mediante reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real y metabarcoding de eDNA de peces. El manual ayuda a los usuarios a realizar encuestas estandarizadas y experimentos de calidad, y proporciona una base para la recopilación de datos comparables. Dado que la eficacia de los métodos puede depender del contexto y ser variable, y que los procedimientos a veces pueden entrar en conflicto con la estandarización, es difícil garantizar que todos los procesos sean igualmente efectivos. Sin embargo, incluso en tales casos, es importante mantener una calidad de datos suficientemente alta estableciendo los estándares mínimos a seguir. La implementación de tales metodologías estandarizadas permitirá la recopilación sistemática y frecuente de datos de eDNA impecables y comparables de todo el mundo; esto proporcionará información fundamental importante para la conservación de la biodiversidad, así como para el uso sostenible de los recursos pesqueros.

@article{doi101002edn3121,
    author = "Minamoto, Toshifumi y Miya, Masaki y Sado, Tetsuya y SEINO, Satoquo y Doi, Hideyuki y Kondoh, Michio y Nakamura, Keigo y Takahara, Teruhiko y Yamamoto, Satoshi y Yamanaka, Hiroki y Araki, Hitoshi y Iwasaki, Wataru y Kasai, Akihide y Masuda, Reiji y Uchii, Kimiko",
    title = "Manual ilustrado para la investigación de ADN ambiental: directrices de muestreo de agua y protocolos experimentales",
    year = "2020",
    journal = "Environmental DNA",
    abstract = "Resumen Las evaluaciones basadas en ADN ambiental (eDNA) de macroorganismos se han convertido ahora en un enfoque esencial para la biomonitorización. Los métodos de encuesta de eDNA tienen numerosas ventajas sobre los métodos de encuesta convencionales. Sin embargo, el valor de los datos que se acumularían se vería enormemente mejorado mediante la estandarización de los métodos de análisis, lo que nos permitiría comparar datos de múltiples sitios de monitoreo en diferentes momentos. La Sociedad eDNA (http://ednasociety.org/en/about), cuyos miembros fundadores son investigadores japoneses que realizan estudios de eDNA sobre macroorganismos, se estableció en 2018 con el objetivo de expandir la tecnología y la ciencia de la eDNA. Aquí, presentamos nuestra publicación clave, «Manual de muestreo y experimentación de ADN ambiental» (http://ednasociety.org/en/manual), que fue publicada bajo la iniciativa de la Sociedad eDNA. El manual describe los métodos detallados para las encuestas y los experimentos, incluida la selección de sitios de muestreo, métodos de muestreo, métodos de filtración, extracción de ADN, detección específica de especies mediante reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real y metabarcoding de eDNA de peces. El manual ayuda a los usuarios a realizar encuestas estandarizadas y experimentos de calidad, y proporciona una base para la recopilación de datos comparables. Dado que la eficacia de los métodos puede depender del contexto y ser variable, y que los procedimientos a veces pueden entrar en conflicto con la estandarización, es difícil garantizar que todos los procesos sean igualmente efectivos. Sin embargo, incluso en tales casos, es importante mantener una calidad de datos suficientemente alta estableciendo los estándares mínimos a seguir. La implementación de tales metodologías estandarizadas permitirá la recopilación sistemática y frecuente de datos de eDNA impecables y comparables de todo el mundo; esto proporcionará información fundamental importante para la conservación de la biodiversidad, así como para el uso sostenible de los recursos pesqueros.",
    url = "https://doi.org/10.1002/edn3.121",
    doi = "10.1002/edn3.121",
    openalex = "W3048869260",
    references = "doi101016jgecco2019e00547"
}

El análisis de ADN ambiental (ADNe) a partir de muestras de agua es un nuevo método prometedor para identificar tanto especies objetivo como comunidades enteras de organismos acuáticos. Sin embargo, la literatura actual sobre las tasas de liberación de ADNe se centra principalmente en los peces y la mayoría de las constantes de tasa de degradación se reportan para aguas cálidas y soleadas. Aquí, realizamos experimentos para investigar cómo difiere la liberación de ADNe entre formas animales y cuánto tiempo puede persistir el ADNe en aguas con diferentes condiciones de temperatura y luz. Diseñamos ensayos de PCR cuantitativa para un pez (pez de barro, Fundulus heteroclitus), un crustáceo (camarón de pastos, Palaemon spp.) y dos medusas scyphomedusae (medusa luna, Aurelia aurita y medusa urticante, Chrysaora spp.) para estimar las tasas de liberación y degradación del ADNe. Encontramos que las tasas de liberación fueron altamente variables para todos los organismos, pero el camarón de pastos tuvo la tasa de liberación más baja. Cuantificamos las constantes de tasa de degradación del ADNe a 6, 15 y 23°C y encontramos que las constantes de tasa de degradación del pez de barro y el camarón de pastos fueron mayores a temperaturas más altas, mientras que las de las medusas scyphomedusae no mostraron una dependencia clara de la temperatura. También encontramos que los modelos de degradación de orden superior con colas encajan mejor con los datos que los modelos log-lineales de primer orden, sugiriendo variabilidad temporal en las tasas de degradación del ADNe. Los resultados indican que diferentes formas animales liberan diferentes tipos de ADNe, impactando tanto las tasas de liberación como las de degradación. Estos hallazgos llenan brechas críticas de conocimiento sobre la variación en la liberación y degradación del ADNe entre formas animales bajo una gama de condiciones de temperatura marina realistas. Estos datos serán útiles para interpretar estudios de campo que utilizan ADNe para investigar hábitats oceánicos que de otro modo serían difíciles de acceder.

@article{doi101002edn3141,
    author = "Allan, Elizabeth Andruszkiewicz and Zhang, Weifeng G. and Lavery, Andone C. and Govindarajan, Annette F.",
    title = "Environmental DNA shedding and decay rates from diverse animal forms and thermal regimes",
    year = "2020",
    journal = "Environmental DNA",
    abstract = "El análisis de ADN ambiental (ADNe) a partir de muestras de agua es un nuevo método prometedor para identificar tanto especies objetivo como comunidades enteras de organismos acuáticos. Sin embargo, la literatura actual sobre las tasas de liberación de ADNe se centra principalmente en los peces y la mayoría de las constantes de tasa de degradación se reportan para aguas cálidas y soleadas. Aquí, realizamos experimentos para investigar cómo difiere la liberación de ADNe entre formas animales y cuánto tiempo puede persistir el ADNe en aguas con diferentes condiciones de temperatura y luz. Diseñamos ensayos de PCR cuantitativa para un pez (pez de barro, Fundulus heteroclitus), un crustáceo (camarón de pastos, Palaemon spp.) y dos medusas scyphomedusae (medusa luna, Aurelia aurita y medusa urticante, Chrysaora spp.) para estimar las tasas de liberación y degradación del ADNe. Encontramos que las tasas de liberación fueron altamente variables para todos los organismos, pero el camarón de pastos tuvo la tasa de liberación más baja. Cuantificamos las constantes de tasa de degradación del ADNe a 6, 15 y 23°C y encontramos que las constantes de tasa de degradación del pez de barro y el camarón de pastos fueron mayores a temperaturas más altas, mientras que las de las medusas scyphomedusae no mostraron una dependencia clara de la temperatura. También encontramos que los modelos de degradación de orden superior con colas encajan mejor con los datos que los modelos log-lineales de primer orden, sugiriendo variabilidad temporal en las tasas de degradación del ADNe. Los resultados indican que diferentes formas animales liberan diferentes tipos de ADNe, impactando tanto las tasas de liberación como las de degradación. Estos hallazgos llenan brechas críticas de conocimiento sobre la variación en la liberación y degradación del ADNe entre formas animales bajo una gama de condiciones de temperatura marina realistas. Estos datos serán útiles para interpretar estudios de campo que utilizan ADNe para investigar hábitats oceánicos que de otro modo serían difíciles de acceder.",
    url = "https://doi.org/10.1002/edn3.141",
    doi = "10.1002/edn3.141",
    openalex = "W3090119047",
    references = "doi101016jgecco2019e00547, doi101038s4200301801926"
}

@article{doi101007s10531020019800,
    author = "Beng, Kingsly C. y Corlett, Richard T.",
    title = "Aplicaciones del ADN ambiental (eDNA) en ecología y conservación: oportunidades, desafíos y perspectivas",
    year = "2020",
    journal = "Biodiversidad y Conservación",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10531-020-01980-0",
    doi = "10.1007/s10531-020-01980-0",
    openalex = "W3016113032",
    references = "doi101007s1059201507754, doi101016jbiocon201411019, doi101016jwatres201803003, doi101038362709a0, doi101038s415980160028x, doi101038s41598018371862, doi101038s4200301801926, doi101038srep40368, doi101093bioinformaticsbtr381, doi101098rsbl20080118, doi101098rspb20191409, doi101111j13652672201205384x, doi101111j1365294x201205537x, doi101111j14718286200701678x, doi101111mec13428, doi101111mec14350, doi101186174299941034, doi101371journalpone0059520"
}

Resumen Revisamos la metodología y las prácticas actuales del enfoque de metabarcoding de ADN utilizando un par de cebadores universales de PCR MiFish, que co-amplifica un fragmento corto de ADN de pez (aprox. 170 pb del gen 12S rRNA mitocondrial) en una amplia variedad de taxones. Este método se ha aplicado principalmente al monitoreo de la biodiversidad utilizando ADN ambiental (eDNA) liberado por peces y, combinado con tecnologías de secuenciación de nueva generación, ha permitido la secuenciación masivamente paralela de varios cientos de muestras de eDNA simultáneamente. Desde la publicación de su esquema técnico en 2015, este método se ha utilizado ampliamente en diversos ambientes acuáticos dentro y alrededor de los seis continentes, y los cebadores MiFish han demostrado superar a otros cebadores competidores. Aquí, delineamos el progreso técnico en este método durante los últimos 5 años y destacamos algunos estudios de caso sobre comunidades de peces marinos, de agua dulce y estuarinos. Además, discutimos diversas aplicaciones del metabarcoding MiFish a organismos no peces, sistemas de detección de especies individuales, monitoreo cuantitativo de la biodiversidad y muestras de ADN en bloque además de eDNA. Reconociendo las fortalezas y limitaciones del metabarcoding de eDNA MiFish, argumentamos que este método es útil para las estrategias de conservación de ecosistemas y el uso sostenible de los recursos pesqueros en la «gestión pesquera basada en ecosistemas» mediante el monitoreo continuo de la biodiversidad en múltiples sitios.

@article{doi101007s1256202001461x,
    author = "Miya, Masaki and Gotoh, Ryo O. and Sado, Tetsuya",
    title = "MiFish metabarcoding: a high-throughput approach for simultaneous detection of multiple fish species from environmental DNA and other samples",
    year = "2020",
    journal = "Fisheries Science",
    abstract = "Resumen Revisamos la metodología y las prácticas actuales del enfoque de metabarcoding de ADN utilizando un par de cebadores universales de PCR MiFish, que co-amplifica un fragmento corto de ADN de pez (aprox. 170 pb del gen 12S rRNA mitocondrial) en una amplia variedad de taxones. Este método se ha aplicado principalmente al monitoreo de la biodiversidad utilizando ADN ambiental (eDNA) liberado por peces y, combinado con tecnologías de secuenciación de nueva generación, ha permitido la secuenciación masivamente paralela de varios cientos de muestras de eDNA simultáneamente. Desde la publicación de su esquema técnico en 2015, este método se ha utilizado ampliamente en diversos ambientes acuáticos dentro y alrededor de los seis continentes, y los cebadores MiFish han demostrado superar a otros cebadores competidores. Aquí, delineamos el progreso técnico en este método durante los últimos 5 años y destacamos algunos estudios de caso sobre comunidades de peces marinos, de agua dulce y estuarinos. Además, discutimos diversas aplicaciones del metabarcoding MiFish a organismos no peces, sistemas de detección de especies individuales, monitoreo cuantitativo de la biodiversidad y muestras de ADN en bloque además de eDNA. Reconociendo las fortalezas y limitaciones del metabarcoding de eDNA MiFish, argumentamos que este método es útil para las estrategias de conservación de ecosistemas y el uso sostenible de los recursos pesqueros en la «gestión pesquera basada en ecosistemas» mediante el monitoreo continuo de la biodiversidad en múltiples sitios.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s12562-020-01461-x",
    doi = "10.1007/s12562-020-01461-x",
    openalex = "W3085313947",
    references = "doi1010029781119174844, doi101007s10531020019800, doi101093oso97801987672200010001, doi101098rspb20191409"
}

La humanidad pronto definirá una nueva era para la naturaleza, una que busca transformar décadas de respuestas decepcionantes ante la crisis global de la biodiversidad. Los esfuerzos de conservación basados en áreas, que incluyen tanto áreas protegidas como otras medidas efectivas de conservación basadas en áreas, probablemente se extenderán y diversificarán. Sin embargo, las deficiencias persistentes en la representación ecológica y la efectividad de la gestión disminuyen el papel potencial de la conservación basada en áreas para frenar la pérdida de biodiversidad. Aquí mostramos cómo la expansión de las áreas protegidas por los gobiernos nacionales desde 2010 ha tenido un éxito limitado en aumentar la cobertura de diferentes elementos de la biodiversidad (ecorregiones, 12.056 especies amenazadas, 'Áreas Clave de Biodiversidad' y áreas silvestres) y servicios ecosistémicos (pesquerías productivas y servicios de carbono en tierra y mar). Para ser más exitosas después de 2020, la conservación basada en áreas debe contribuir más efectivamente al cumplimiento de los objetivos globales de biodiversidad, que van desde prevenir extinciones hasta conservar los ecosistemas más intactos, y debe colaborar mejor con los muchos pueblos indígenas, grupos comunitarios e iniciativas privadas que son centrales para la conservación exitosa de la biodiversidad. El éxito a largo plazo de la conservación basada en áreas requiere que las partes de la Convención sobre la Diversidad Biológica aseguren una financiación adecuada, planifiquen para el cambio climático y hagan que la conservación de la biodiversidad sea una parte mucho más fuerte de las políticas de gestión de tierra, agua y mar.

@article{doi101038s415860202773z,
    author = "Maxwell, Sean y Cazalis, Victor y Dudley, Nigel y Hoffmann, Michael y Rodrigues, Ana S. L. y Stolton, Sue y Visconti, Piero y Woodley, Stephen y Kingston, Naomi y Lewis, Edward y Maron, Martine y Strassburg, Bernardo B. N. y Wenger, Amelia y Jonas, Harry D. y Venter, Oscar y Watson, James",
    title = "Conservación basada en áreas en el siglo XXI",
    year = "2020",
    journal = "Nature",
    abstract = "La humanidad pronto definirá una nueva era para la naturaleza, una que busca transformar décadas de respuestas decepcionantes ante la crisis global de la biodiversidad. Los esfuerzos de conservación basados en áreas, que incluyen tanto áreas protegidas como otras medidas efectivas de conservación basadas en áreas, probablemente se extenderán y diversificarán. Sin embargo, las deficiencias persistentes en la representación ecológica y la efectividad de la gestión disminuyen el papel potencial de la conservación basada en áreas para frenar la pérdida de biodiversidad. Aquí mostramos cómo la expansión de las áreas protegidas por los gobiernos nacionales desde 2010 ha tenido un éxito limitado en aumentar la cobertura de diferentes elementos de la biodiversidad (ecorregiones, 12.056 especies amenazadas, 'Áreas Clave de Biodiversidad' y áreas silvestres) y servicios ecosistémicos (pesquerías productivas y servicios de carbono en tierra y mar). Para ser más exitosas después de 2020, la conservación basada en áreas debe contribuir más efectivamente al cumplimiento de los objetivos globales de biodiversidad, que van desde prevenir extinciones hasta conservar los ecosistemas más intactos, y debe colaborar mejor con los muchos pueblos indígenas, grupos comunitarios e iniciativas privadas que son centrales para la conservación exitosa de la biodiversidad. El éxito a largo plazo de la conservación basada en áreas requiere que las partes de la Convención sobre la Diversidad Biológica aseguren una financiación adecuada, planifiquen para el cambio climático y hagan que la conservación de la biodiversidad sea una parte mucho más fuerte de las políticas de gestión de tierra, agua y mar.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-020-2773-z",
    doi = "10.1038/s41586-020-2773-z",
    openalex = "W3091919204",
    references = "doi101002joc1276, doi101016jbiocon201609004, doi101038nature13947, doi101038nature21707, doi101038nclimate1958, doi101073pnas1710465114, doi101093bioscibix014, doi101126science1244693, doi101126scienceaax3100, doi101641b570707, doi102305iucnch2008paps2en, doi103389fmars201700158"
}

Una década después de que los científicos ambientales integraran tecnologías de secuenciación de alto rendimiento en su caja de herramientas, la monitorización basada en genómica de los impactos antropogénicos sobre la biodiversidad y el funcionamiento de los ecosistemas aún no ha sido implementada por los marcos regulatorios. A pesar del potencial ampliamente reconocido de la genómica ambiental para este fin, las limitaciones técnicas y los problemas conceptuales siguen obstaculizando su aplicación generalizada por parte de los usuarios finales. Además, la multiplicidad de estrategias de implementación potenciales puede contribuir a la percepción de que la aplicación rutinaria de esta metodología es prematura o "en desarrollo", lo que restringe a los reguladores para vincular estas herramientas en marcos legales. Aquí, revisamos las implementaciones recientes de métodos basados en genómica ambiental, aplicados a la biomonitorización de ecosistemas. Al tomar una visión general, sin estrechar nuestra perspectiva a hábitats particulares o grupos de organismos, este artículo tiene como objetivo comparar, revisar y discutir las fortalezas y limitaciones de cuatro estrategias generales de implementación de la genómica ambiental para la monitorización: (a) Análisis basados en taxonomía centrados en la identificación de bioindicadores conocidos o taxones descritos; (b) Análisis de bioindicadores de novo; (c) Métricas de comunidad estructural incluidas redes ecológicas inferidas; y (d) Métricas de comunidad funcional (metagenómica o metatranscriptómica). Enfatizamos la utilidad de las tres últimas estrategias para integrar la meiofauna y microorganismos que no se utilizan tradicionalmente en la biomonitorización debido a la difícil identificación taxonómica. Finalmente, proponemos una hoja de ruta para la implementación de la genómica ambiental en programas de monitorización rutinarios que aprovechen los avances analíticos recientes, mientras señalamos las limitaciones actuales y las necesidades de investigación futura.

@article{doi101111mec15472,
    author = "Cordier, Tristan y Alonso‐Sáez, Laura y Apothéloz‐Perret‐Gentil, Laure y Aylagas, Eva y Bohan, David A. y Bouchez, Agnès y Chariton, Anthony A. y Creer, Simon y Frühe, Larissa y Keck, François y Keeley, Nigel y Laroche, Olivier y Leese, Florian y Pochon, Xavier y Stoeck, Thorsten y Pawłowski, Jan y Lanzén, Anders",
    title = "Monitorización de ecosistemas impulsada por la genómica ambiental: Una revisión de las estrategias actuales con una hoja de ruta de implementación",
    year = "2020",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = {Una década después de que los científicos ambientales integraran tecnologías de secuenciación de alto rendimiento en su caja de herramientas, la monitorización basada en genómica de los impactos antropogénicos sobre la biodiversidad y el funcionamiento de los ecosistemas aún no ha sido implementada por los marcos regulatorios. A pesar del potencial ampliamente reconocido de la genómica ambiental para este fin, las limitaciones técnicas y los problemas conceptuales siguen obstaculizando su aplicación generalizada por parte de los usuarios finales. Además, la multiplicidad de estrategias de implementación potenciales puede contribuir a la percepción de que la aplicación rutinaria de esta metodología es prematura o "en desarrollo", lo que restringe a los reguladores para vincular estas herramientas en marcos legales. Aquí, revisamos las implementaciones recientes de métodos basados en genómica ambiental, aplicados a la biomonitorización de ecosistemas. Al tomar una visión general, sin estrechar nuestra perspectiva a hábitats particulares o grupos de organismos, este artículo tiene como objetivo comparar, revisar y discutir las fortalezas y limitaciones de cuatro estrategias generales de implementación de la genómica ambiental para la monitorización: (a) Análisis basados en taxonomía centrados en la identificación de bioindicadores conocidos o taxones descritos; (b) Análisis de bioindicadores de novo; (c) Métricas de comunidad estructural incluidas redes ecológicas inferidas; y (d) Métricas de comunidad funcional (metagenómica o metatranscriptómica). Enfatizamos la utilidad de las tres últimas estrategias para integrar la meiofauna y microorganismos que no se utilizan tradicionalmente en la biomonitorización debido a la difícil identificación taxonómica. Finalmente, proponemos una hoja de ruta para la implementación de la genómica ambiental en programas de monitorización rutinarios que aprovechen los avances analíticos recientes, mientras señalamos las limitaciones actuales y las necesidades de investigación futura.},
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.15472",
    doi = "10.1111/mec.15472",
    openalex = "W3002699777",
    references = "doi101016jgecco2019e00547, doi101016jwatres201803003, doi101038nature11148, doi101038nbt2676, doi101038nrmicro2832, doi101038s41598017125015, doi101038s4200301801926, doi101093nargks1219, doi101093nargky1022, doi101093oso97801987672200010001, doi1011111365243512425, doi101111brv12252, doi101111j14718286200701678x, doi101111mec15060, doi101111mec15472, doi101126science1187512, doi101146annurevecolsys33010802150448, doi1018900012961519970670345saaist20co2, doi101890040922"
}

La última década ha traído un desarrollo espectacular de los estudios denominados ADN ambiental (e)DNA. En general, el "ADN ambiental" se define como ADN aislado de muestras ambientales, en contraste con el ADN genómico que se extrae directamente de especímenes. Sin embargo, la variedad de diferentes fuentes de eDNA y el rango de grupos taxonómicos que son objeto de estudios de eDNA es grande, lo que ha llevado a cierta discusión sobre la amplitud del concepto de eDNA. En particular, existe una tendencia reciente a restringir el uso del término "eDNA" al ADN de macroorganismos, que no están físicamente presentes en las muestras ambientales. En este artículo, argumentamos que tal distinción puede no ser ideal, porque la señal de eDNA puede provenir de organismos de todo el árbol de la vida. En consecuencia, abogamos por que el término "eDNA" se utilice en su sentido genérico, tal como se definió originalmente, abarcando el ADN de todos los organismos presentes en muestras ambientales, incluidos taxones microbianos, meiofaunales y macrobianos. Primero sugerimos especificar el origen ambiental de la muestra de ADN, como eDNA de agua, eDNA de sedimento o eDNA de suelo. Una segunda especificación definiría entonces el grupo taxonómico objetivo a través de la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa, como eDNA de peces, eDNA de invertebrados y eDNA bacteriano. Esta terminología tampoco requiere suposiciones sobre el estado específico del ADN muestreado (intracelular o extracelular). Esperamos que tal terminología ayude a definir mejor el alcance de los estudios de eDNA, especialmente para los gestores ambientales, que los utilizan como referencia en la biomonitorización y bioevaluación rutinarias.

@article{doi101111mec15643,
    author = "Pawłowski, Jan y Apothéloz‐Perret‐Gentil, Laure y Altermatt, Florian",
    title = "ADN ambiental: ¿Qué hay detrás del término? Aclarando la terminología y recomendaciones para su uso futuro en biomonitorización",
    year = "2020",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = {La última década ha traído un desarrollo espectacular de los estudios denominados ADN ambiental (e)DNA. En general, el "ADN ambiental" se define como ADN aislado de muestras ambientales, en contraste con el ADN genómico que se extrae directamente de especímenes. Sin embargo, la variedad de diferentes fuentes de eDNA y el rango de grupos taxonómicos que son objeto de estudios de eDNA es grande, lo que ha llevado a cierta discusión sobre la amplitud del concepto de eDNA. En particular, existe una tendencia reciente a restringir el uso del término "eDNA" al ADN de macroorganismos, que no están físicamente presentes en las muestras ambientales. En este artículo, argumentamos que tal distinción puede no ser ideal, porque la señal de eDNA puede provenir de organismos de todo el árbol de la vida. En consecuencia, abogamos por que el término "eDNA" se utilice en su sentido genérico, tal como se definió originalmente, abarcando el ADN de todos los organismos presentes en muestras ambientales, incluidos taxones microbianos, meiofaunales y macrobianos. Primero sugerimos especificar el origen ambiental de la muestra de ADN, como eDNA de agua, eDNA de sedimento o eDNA de suelo. Una segunda especificación definiría entonces el grupo taxonómico objetivo a través de la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa, como eDNA de peces, eDNA de invertebrados y eDNA bacteriano. Esta terminología tampoco requiere suposiciones sobre el estado específico del ADN muestreado (intracelular o extracelular). Esperamos que tal terminología ayude a definir mejor el alcance de los estudios de eDNA, especialmente para los gestores ambientales, que los utilizan como referencia en la biomonitorización y bioevaluación rutinarias.},
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.15643",
    doi = "10.1111/mec.15643",
    openalex = "W3088144981",
    references = "doi101038s41598017125015, doi101093oso97801987672200010001, doi101111j1365294x201205505x"
}

: Los resultados de este análisis meta demuestran que, donde existe una comparación directa, los censos de eDNA de macroorganismos son más precisos y eficientes que los censos tradicionales. Esta conclusión, sin embargo, se basa solo en una fracción de los artículos de eDNA disponibles, ya que la mayoría no ofrece este nivel de detalle. Recomendamos que las conclusiones se sustenten con datos comparables y cuantitativos. Donde no se ha realizado una comparación directa, advertimos contra el uso de afirmaciones cualitativas sobre el rendimiento relativo. Esta consistencia y rigor simplificarán cómo la comunidad de investigación de eDNA rastrea los avances basados en métodos y también proporcionarán mayor claridad para los profesionales de la conservación. Con este fin, sugerimos estándares de reporte para estudios de eDNA.

@article{doi101002ece37382,
    author = "Fediajevaite, Julija y Priestley, Victoria y Arnold, Richard y Savolainen, Vincent",
    title = "Análisis meta muestra que el ADN ambiental supera a los censos tradicionales, pero requiere mejores estándares de reporte",
    year = "2021",
    journal = "Ecology and Evolution",
    abstract = ": Los resultados de este análisis meta demuestran que, donde existe una comparación directa, los censos de eDNA de macroorganismos son más precisos y eficientes que los censos tradicionales. Esta conclusión, sin embargo, se basa solo en una fracción de los artículos de eDNA disponibles, ya que la mayoría no ofrece este nivel de detalle. Recomendamos que las conclusiones se sustenten con datos comparables y cuantitativos. Donde no se ha realizado una comparación directa, advertimos contra el uso de afirmaciones cualitativas sobre el rendimiento relativo. Esta consistencia y rigor simplificarán cómo la comunidad de investigación de eDNA rastrea los avances basados en métodos y también proporcionarán mayor claridad para los profesionales de la conservación. Con este fin, sugerimos estándares de reporte para estudios de eDNA.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ece3.7382",
    doi = "10.1002/ece3.7382",
    openalex = "W3137998749",
    references = "doi101007s10531020019800, doi101016jwatres201803003"
}

Resumen El ADN ambiental (eDNA) ha revolucionado nuestra capacidad para identificar la presencia y distribuciones de organismos terrestres y acuáticos. La evidencia reciente sugiere que la concentración de eDNA también podría proporcionar un indicador rápido y rentable de la abundancia y/o biomasa para las evaluaciones de stocks de pesca. A nivel mundial, los recursos pesqueros están bajo una presión inmensa, y su cosecha sostenible requiere información precisa sobre el tamaño de los stocks de peces. Sin embargo, en muchos casos, la información necesaria sigue siendo elusiva debido a la dependencia de datos dependientes e independientes de la pesca imprecisos o costosos. Aquí, revisamos la literatura que describe las relaciones entre las concentraciones de eDNA y la abundancia y/o biomasa de peces, así como los factores clave influyentes, como precursor para determinar la utilidad más amplia del eDNA para monitorear poblaciones de peces. Revisamos 63 estudios publicados entre 2012 y 2020 y encontramos que el 90% identificó relaciones positivas entre las concentraciones de eDNA y la abundancia y/o biomasa de las especies objetivo. Los factores bióticos clave influyentes incluyeron el taxón examinado, así como su tamaño corporal, distribución, reproducción y migración. Los factores abióticos clave se componían principalmente de procesos hidrológicos que afectan la dispersión y persistencia del eDNA, especialmente el flujo de agua y la temperatura, aunque los métodos de recolección de eDNA también fueron influyentes. La influencia acumulativa de estos diferentes factores probablemente explica la variabilidad sustancial observada en las concentraciones de eDNA, tanto dentro como entre estudios. No obstante, hay considerable evidencia que respalda el uso del eDNA como una herramienta auxiliar para evaluar la abundancia y/o biomasa de poblaciones de peces a través de escalas espaciotemporales discretas, siguiendo investigaciones preliminares para determinar factores específicos de la especie y el contexto que influyen en la relación de abundancia/biomasa del eDNA. Las ventajas del monitoreo de eDNA en comparación con otros enfoques incluyen costos reducidos, mayor eficiencia y muestreo no letal.

@article{doi101002edn3185,
    author = "Rourke, Meaghan L. y Fowler, Ashley M. y Hughes, Julian M. y Broadhurst, Matt K. y DiBattista, Joseph D. y Fielder, D. Stewart y Walburn, Jackson Wilkes y Furlan, Elise M.",
    title = "ADN ambiental (eDNA) como herramienta para evaluar la biomasa de peces: Una revisión de enfoques y consideraciones futuras para los censos de recursos",
    year = "2021",
    journal = "ADN ambiental",
    abstract = "Resumen El ADN ambiental (eDNA) ha revolucionado nuestra capacidad para identificar la presencia y distribuciones de organismos terrestres y acuáticos. La evidencia reciente sugiere que la concentración de eDNA también podría proporcionar un indicador rápido y rentable de la abundancia y/o biomasa para las evaluaciones de stocks de pesca. A nivel mundial, los recursos pesqueros están bajo una presión inmensa, y su cosecha sostenible requiere información precisa sobre el tamaño de los stocks de peces. Sin embargo, en muchos casos, la información necesaria sigue siendo elusiva debido a la dependencia de datos dependientes e independientes de la pesca imprecisos o costosos. Aquí, revisamos la literatura que describe las relaciones entre las concentraciones de eDNA y la abundancia y/o biomasa de peces, así como los factores clave influyentes, como precursor para determinar la utilidad más amplia del eDNA para monitorear poblaciones de peces. Revisamos 63 estudios publicados entre 2012 y 2020 y encontramos que el 90% identificó relaciones positivas entre las concentraciones de eDNA y la abundancia y/o biomasa de las especies objetivo. Los factores bióticos clave influyentes incluyeron el taxón examinado, así como su tamaño corporal, distribución, reproducción y migración. Los factores abióticos clave se componían principalmente de procesos hidrológicos que afectan la dispersión y persistencia del eDNA, especialmente el flujo de agua y la temperatura, aunque los métodos de recolección de eDNA también fueron influyentes. La influencia acumulativa de estos diferentes factores probablemente explica la variabilidad sustancial observada en las concentraciones de eDNA, tanto dentro como entre estudios. No obstante, hay considerable evidencia que respalda el uso del eDNA como una herramienta auxiliar para evaluar la abundancia y/o biomasa de poblaciones de peces a través de escalas espaciotemporales discretas, siguiendo investigaciones preliminares para determinar factores específicos de la especie y el contexto que influyen en la relación de abundancia/biomasa del eDNA. Las ventajas del monitoreo de eDNA en comparación con otros enfoques incluyen costos reducidos, mayor eficiencia y muestreo no letal.",
    url = "https://doi.org/10.1002/edn3.185",
    doi = "10.1002/edn3.185",
    openalex = "W3133743945",
    references = "doi101016jtree200409004, doi101038s4200301801926, doi101038srep40368, doi101098rspb20191409, doi101111mec14350"
}

@article{doi101016jscitotenv2021146891,
    author = "Veilleux, Heather D. y Misutka, Melissa D. y Glover, Chris N.",
    title = "ADN ambiental y ARN ambiental: Aplicaciones actuales y prospectivas para el monitoreo biológico",
    year = "2021",
    journal = "The Science of The Total Environment",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.146891",
    doi = "10.1016/j.scitotenv.2021.146891",
    openalex = "W3145480541",
    references = "doi101007s10531020019800"
}

El análisis de ADN ambiental (eDNA) ha avanzado la biología de la conservación y la gestión de la biodiversidad. Sin embargo, la estimación precisa de la edad y el origen del eDNA se complica por el transporte de partículas y la presencia de material genético legado, lo que puede oscurecer la interpretación precisa de la detección y cuantificación del eDNA. Para comprender el estado del material genómico dentro del entorno, investigamos las relaciones de degradación entre (a) tamaño de fragmentos (largos vs cortos), (b) orígenes genómicos (mitocondrial vs nuclear), (c) ácidos nucleicos (eDNA vs eRNA) y (d) tipos de ARN (ARN mensajero (m)ARN vs ARN ribosomal (r)ARN) de mejillones Dreissena no nativos. Las concentraciones iniciales de eRNA siguieron las tendencias transcripcionales esperadas, con rARNs encontrados a > 1000 × que el eDNA, y un mRNA asociado a la mitosis cayendo por debajo de los límites de detección en 24 h. Además, la relación de eRNA:eDNA disminuyó significativamente a lo largo de la degradación, potencialmente proporcionando una estimación para la edad del material genómico. Por lo tanto, la cuantificación de eRNA puede aumentar la detección debido a las altas concentraciones de rARNs. Además, puede mejorar la interpretación de detecciones positivas a través de la relación eRNA:eDNA y/o mediante la detección de mRNAs asociados a la mitosis de baja abundancia que se degradan en ~ 24 h.

@article{doi101038s41598021822054,
    author = "Marshall, Nathaniel T. y Vanderploeg, Henry A. y Chaganti, Subba Rao",
    title = "Environmental (e)RNA advances the reliability of eDNA by predicting its age",
    year = "2021",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "El análisis de ADN ambiental (eDNA) ha avanzado la biología de la conservación y la gestión de la biodiversidad. Sin embargo, la estimación precisa de la edad y el origen del eDNA se complica por el transporte de partículas y la presencia de material genético legado, lo que puede oscurecer la interpretación precisa de la detección y cuantificación del eDNA. Para comprender el estado del material genómico dentro del entorno, investigamos las relaciones de degradación entre (a) tamaño de fragmentos (largos vs cortos), (b) orígenes genómicos (mitocondrial vs nuclear), (c) ácidos nucleicos (eDNA vs eRNA) y (d) tipos de ARN (ARN mensajero (m)ARN vs ARN ribosomal (r)ARN) de mejillones Dreissena no nativos. Las concentraciones iniciales de eRNA siguieron las tendencias transcripcionales esperadas, con rARNs encontrados a > 1000 × que el eDNA, y un mRNA asociado a la mitosis cayendo por debajo de los límites de detección en 24 h. Además, la relación de eRNA:eDNA disminuyó significativamente a lo largo de la degradación, potencialmente proporcionando una estimación para la edad del material genómico. Por lo tanto, la cuantificación de eRNA puede aumentar la detección debido a las altas concentraciones de rARNs. Además, puede mejorar la interpretación de detecciones positivas a través de la relación eRNA:eDNA y/o mediante la detección de mRNAs asociados a la mitosis de baja abundancia que se degradan en \textasciitilde\ 24 h.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-021-82205-4",
    doi = "10.1038/s41598-021-82205-4",
    openalex = "W3126207216",
    references = "doi101007s10531020019800"
}

El abanico de tecnologías actualmente utilizadas en la conservación de la biodiversidad es abrumador, con usos innovadores a menudo adoptados de otras disciplinas y siendo probados en el campo. Proporcionamos la primera visión general exhaustiva del panorama actual (2020) de la tecnología de conservación, abarcando tecnologías para el monitoreo de vida silvestre y hábitats, así como para la gestión de conservación en el terreno (por ejemplo, combatir actividades ilegales). Cubrimos tanto tecnologías establecidas (despleutadas rutinariamente en conservación, respaldadas por una amplia experiencia de campo y literatura científica) como tecnologías o aplicaciones de tecnología novedosas (generalmente en etapa de prueba, utilizadas recientemente en conservación), proporcionando ejemplos de aplicaciones de conservación para ambos tipos. Describimos tecnologías que despliegan sensores fijos o portátiles, adjuntos a vehículos (terrestres, acuáticos o aéreos) o a animales (biologging), complementados con una sección sobre el rastreo de vida silvestre. Las dos últimas secciones cubren actuadores y computación (incluyendo plataformas web, algoritmos e inteligencia artificial).

@article{doi101093bioscibiab073,
    author = "Lahoz‐Monfort, José J. y Magrath, Michael J. L.",
    title = "Una visión general exhaustiva de las tecnologías para el monitoreo y la conservación de especies y hábitats",
    year = "2021",
    journal = "BioScience",
    abstract = "El abanico de tecnologías actualmente utilizadas en la conservación de la biodiversidad es abrumador, con usos innovadores a menudo adoptados de otras disciplinas y siendo probados en el campo. Proporcionamos la primera visión general exhaustiva del panorama actual (2020) de la tecnología de conservación, abarcando tecnologías para el monitoreo de vida silvestre y hábitats, así como para la gestión de conservación en el terreno (por ejemplo, combatir actividades ilegales). Cubrimos tanto tecnologías establecidas (despleutadas rutinariamente en conservación, respaldadas por una amplia experiencia de campo y literatura científica) como tecnologías o aplicaciones de tecnología novedosas (generalmente en etapa de prueba, utilizadas recientemente en conservación), proporcionando ejemplos de aplicaciones de conservación para ambos tipos. Describimos tecnologías que despliegan sensores fijos o portátiles, adjuntos a vehículos (terrestres, acuáticos o aéreos) o a animales (biologging), complementados con una sección sobre el rastreo de vida silvestre. Las dos últimas secciones cubren actuadores y computación (incluyendo plataformas web, algoritmos e inteligencia artificial).",
    url = "https://doi.org/10.1093/biosci/biab073",
    doi = "10.1093/biosci/biab073",
    openalex = "W3185673854",
    references = "doi101007s10531020019800, doi1011112041210x13256"
}

El descuento desempeña un papel central en las decisiones sobre el cambio ambiental global que afectan el bienestar de las generaciones futuras. Descuentar más pesadamente el futuro inclina las decisiones hacia el presente, haciendo menos probable que la sociedad emprenda acciones para mitigar el cambio climático u otros cambios ambientales globales. Este artículo revisa el enfoque económico estándar del descuento que surge de resolver el ahorro y la inversión óptimos a lo largo del tiempo. El descuento depende de la tasa pura de preferencia temporal y de las diferencias en los niveles de consumo a lo largo del tiempo, dando lugar a diferentes utilidades marginales del consumo. El descuento para problemas como el cambio climático que afectan a las generaciones futuras implica una dimensión ética. Este artículo incluye discusiones sobre las dimensiones éticas del descuento relacionadas con la equidad intrageneracional e intergeneracional y también cubre los enfoques de la economía del comportamiento, la economía ecológica y la economía convencional sobre el descuento. El artículo cierra con una revisión de los debates sobre el descuento en la política de cambio climático.

@article{doi101146annurevenviron020420042100,
    author = "Polasky, Stephen y Dampha, Nfamara K.",
    title = "Descuento y cambio ambiental global",
    year = "2021",
    journal = "Annual Review of Environment and Resources",
    abstract = "El descuento desempeña un papel central en las decisiones sobre el cambio ambiental global que afectan el bienestar de las generaciones futuras. Descuentar más pesadamente el futuro inclina las decisiones hacia el presente, haciendo menos probable que la sociedad emprenda acciones para mitigar el cambio climático u otros cambios ambientales globales. Este artículo revisa el enfoque económico estándar del descuento que surge de resolver el ahorro y la inversión óptimos a lo largo del tiempo. El descuento depende de la tasa pura de preferencia temporal y de las diferencias en los niveles de consumo a lo largo del tiempo, dando lugar a diferentes utilidades marginales del consumo. El descuento para problemas como el cambio climático que afectan a las generaciones futuras implica una dimensión ética. Este artículo incluye discusiones sobre las dimensiones éticas del descuento relacionadas con la equidad intrageneracional e intergeneracional y también cubre los enfoques de la economía del comportamiento, la economía ecológica y la economía convencional sobre el descuento. El artículo cierra con una revisión de los debates sobre el descuento en la política de cambio climático.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-environ-020420-042100",
    doi = "10.1146/annurev-environ-020420-042100",
    openalex = "W3157594988",
    references = "doi1023071885257"
}

El ADN ambiental (eDNA) es material genético que ha sido liberado por macroorganismos. Ha recibido mayor atención como un marcador indirecto para el monitoreo de la biodiversidad. Este artículo revisa el estado actual del metabarcoding de eDNA (detección simultánea de múltiples especies) como un enfoque no invasivo y rentable para el monitoreo de comunidades de peces marinos y discute las perspectivas de este campo en crecimiento. El metabarcoding de eDNA coamplifica fragmentos cortos de eDNA de peces en una amplia variedad de taxones y, junto con tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, permite realizar secuenciación masivamente paralela simultáneamente para decenas a cientos de muestras. Puede predecir la riqueza de especies en un área dada, detectar la segregación de hábitats y patrones biogeográficos desde escalas espaciales pequeñas hasta grandes, y monitorear la dinámica espacio-temporal de las comunidades de peces. Además, puede detectar un impacto antrópico en las comunidades de peces a través de la evaluación de su diversidad funcional. Reconocer las fortalezas y limitaciones del metabarcoding de eDNA ayudará a garantizar que el monitoreo continuo de la biodiversidad en múltiples sitios sea útil para la conservación de los ecosistemas y el uso sostenible de los recursos pesqueros, posiblemente contribuyendo al logro de las metas del Objetivo de Desarrollo Sostenible 14 de las Naciones Unidas para 2030.

@article{doi101146annurevmarine041421082251,
    author = "Miya, Masaki",
    title = "Metabarcoding de ADN ambiental: un método novedoso para el monitoreo de la biodiversidad de comunidades de peces marinos",
    year = "2021",
    journal = "Annual Review of Marine Science",
    abstract = "El ADN ambiental (eDNA) es material genético que ha sido liberado por macroorganismos. Ha recibido mayor atención como un marcador indirecto para el monitoreo de la biodiversidad. Este artículo revisa el estado actual del metabarcoding de eDNA (detección simultánea de múltiples especies) como un enfoque no invasivo y rentable para el monitoreo de comunidades de peces marinos y discute las perspectivas de este campo en crecimiento. El metabarcoding de eDNA coamplifica fragmentos cortos de eDNA de peces en una amplia variedad de taxones y, junto con tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, permite realizar secuenciación masivamente paralela simultáneamente para decenas a cientos de muestras. Puede predecir la riqueza de especies en un área dada, detectar la segregación de hábitats y patrones biogeográficos desde escalas espaciales pequeñas hasta grandes, y monitorear la dinámica espacio-temporal de las comunidades de peces. Además, puede detectar un impacto antrópico en las comunidades de peces a través de la evaluación de su diversidad funcional. Reconocer las fortalezas y limitaciones del metabarcoding de eDNA ayudará a garantizar que el monitoreo continuo de la biodiversidad en múltiples sitios sea útil para la conservación de los ecosistemas y el uso sostenible de los recursos pesqueros, posiblemente contribuyendo al logro de las metas del Objetivo de Desarrollo Sostenible 14 de las Naciones Unidas para 2030.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-marine-041421-082251",
    doi = "10.1146/annurev-marine-041421-082251",
    openalex = "W3187258794",
    references = "doi1010029781119174844, doi101007s10531020019800, doi101016jcub201704060, doi101016jgecco2019e00547, doi101038s41598017125015, doi101093oso97801987672200010001, doi101098rspb20191409"
}

@article{doi101016jcub202112014,
    author = "Lynggaard, Christina y Bertelsen, Mads F. y Jensen, Casper Vindahl y Johnson, Matthew S. y Frøslev, Tobias Guldberg y Olsen, Morten Tange y Bohmann, Kristine",
    title = "ADN ambiental aéreo para el monitoreo de comunidades de vertebrados terrestres",
    year = "2022",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.12.014",
    doi = "10.1016/j.cub.2021.12.014",
    openalex = "W4225722231",
    references = "doi101038s4146701701312x"
}

El uso creciente del análisis de ADN ambiental (eDNA) para la detección indirecta de especies ha impulsado la necesidad de comprender la persistencia del eDNA en el entorno. Comprender la persistencia del eDNA es complejo porque existe en una mezcla de diferentes estados (por ejemplo, disuelto, adsorbido a partículas, intracelular e intraorganelar), y cada estado se espera que tenga una tasa de descomposición específica que depende de los parámetros ambientales. Por lo tanto, es necesario mejorar el conocimiento sobre las tasas de conversión del eDNA entre estados y las reacciones que degradan el eDNA en diferentes estados. Aquí, nos centramos en el eDNA extraorganismoal eucariota, delineamos cómo la química del agua y las partículas minerales en suspensión probablemente afectan la conversión entre cada estado de eDNA, e indicamos cómo los parámetros ambientales afectan la persistencia de los estados en la columna de agua. Basándonos en la deducción de estos parámetros controladores, sintetizamos la literatura sobre eDNA para evaluar si ya podemos derivar una comprensión general de los estados de eDNA que persisten en el entorno. Sin embargo, encontramos que estos parámetros a menudo no se miden o se reportan cuando se miden, y en muchos casos existen muy pocos datos experimentales de los cuales sacar conclusiones. Por lo tanto, se necesita un estudio adicional de cómo los parámetros ambientales afectan la conversión de estados de eDNA y la descomposición del eDNA en entornos acuáticos. Recomendamos controles analíticos que pueden utilizarse durante el procesamiento del agua para evaluar las posibles pérdidas de diferentes estados de eDNA si todos estuvieran presentes en una muestra de agua, y delineamos el trabajo experimental futuro que ayudaría a determinar los estados dominantes de eDNA en el agua.

@article{doi101021acsest1c07638,
    author = "Mauvisseau, Quentin y Harper, Lynsey R. y Sander, Michael y Hanner, Robert y Kleyer, Hannah y Deiner, Kristy",
    title = "Los Múltiples Estados del ADN Ambiental y lo que se Sabe sobre su Persistencia en Entornos Acuáticos",
    year = "2022",
    journal = "Environmental Science \& Technology",
    abstract = "El uso creciente del análisis de ADN ambiental (eDNA) para la detección indirecta de especies ha impulsado la necesidad de comprender la persistencia del eDNA en el entorno. Comprender la persistencia del eDNA es complejo porque existe en una mezcla de diferentes estados (por ejemplo, disuelto, adsorbido a partículas, intracelular e intraorganelar), y cada estado se espera que tenga una tasa de descomposición específica que depende de los parámetros ambientales. Por lo tanto, es necesario mejorar el conocimiento sobre las tasas de conversión del eDNA entre estados y las reacciones que degradan el eDNA en diferentes estados. Aquí, nos centramos en el eDNA extraorganismoal eucariota, delineamos cómo la química del agua y las partículas minerales en suspensión probablemente afectan la conversión entre cada estado de eDNA, e indicamos cómo los parámetros ambientales afectan la persistencia de los estados en la columna de agua. Basándonos en la deducción de estos parámetros controladores, sintetizamos la literatura sobre eDNA para evaluar si ya podemos derivar una comprensión general de los estados de eDNA que persisten en el entorno. Sin embargo, encontramos que estos parámetros a menudo no se miden o se reportan cuando se miden, y en muchos casos existen muy pocos datos experimentales de los cuales sacar conclusiones. Por lo tanto, se necesita un estudio adicional de cómo los parámetros ambientales afectan la conversión de estados de eDNA y la descomposición del eDNA en entornos acuáticos. Recomendamos controles analíticos que pueden utilizarse durante el procesamiento del agua para evaluar las posibles pérdidas de diferentes estados de eDNA si todos estuvieran presentes en una muestra de agua, y delineamos el trabajo experimental futuro que ayudaría a determinar los estados dominantes de eDNA en el agua.",
    url = "https://doi.org/10.1021/acs.est.1c07638",
    doi = "10.1021/acs.est.1c07638",
    openalex = "W4225391021",
    references = "doi101098rspb20191409, doi101111mec15060"
}

La ciencia ciudadana es un enfoque cada vez más reconocido aplicado en muchos dominios científicos, y particularmente dentro de las ciencias ambientales y ecológicas, en el que los participantes no profesionales contribuyen a la recolección de datos para avanzar en la investigación científica. Presentamos la ciencia ciudadana contributiva como un método valioso para científicos y profesionales dentro de las ciencias ambientales y ecológicas, centrándonos en el ciclo completo de la práctica de la ciencia ciudadana, desde el diseño hasta la implementación, evaluación y gestión de datos. Destacamos los problemas clave en la ciencia ciudadana y cómo abordarlos, como la participación y retención de participantes, la garantía de calidad de los datos y la corrección de sesgos, así como consideraciones éticas sobre el intercambio de datos. También proporcionamos una serie de ejemplos para ilustrar la diversidad de aplicaciones, desde la investigación de la biodiversidad y la evaluación de la cobertura terrestre hasta el monitoreo de la salud forestal y la contaminación marina. Se consideran los aspectos de reproducibilidad e intercambio de datos, situando la ciencia ciudadana dentro de una perspectiva abarcadora de ciencia abierta. Finalmente, discutimos sus limitaciones y desafíos y presentamos una perspectiva sobre la aplicación de la ciencia ciudadana en múltiples dominios científicos. La ciencia ciudadana contributiva es un método en el que los participantes no profesionales contribuyen a la recolección de datos, total o parcialmente, para avanzar en la investigación científica. Este resumen presenta el uso de la ciencia ciudadana en las ciencias ambientales y ecológicas, discutiendo la participación de los participantes, la garantía de calidad de los datos y la corrección de sesgos.

@article{doi101038s43586022001444,
    author = "Fraisl, Dilek and Hager, Gerid and Bedessem, Baptiste and Gold, Margaret M. and Hsing, Pen‐Yuan and Danielsen, Finn and Hitchcock, Colleen and Hulbert, Joseph M. and Piera, Jaume and Spiers, Helen and Thiel, Martín and Haklay, Muki",
    title = "Citizen science in environmental and ecological sciences",
    year = "2022",
    journal = "Nature Reviews Methods Primers",
    abstract = "Citizen science is an increasingly acknowledged approach applied in many scientific domains, and particularly within the environmental and ecological sciences, in which non-professional participants contribute to data collection to advance scientific research. We present contributory citizen science as a valuable method to scientists and practitioners within the environmental and ecological sciences, focusing on the full life cycle of citizen science practice, from design to implementation, evaluation and data management. We highlight key issues in citizen science and how to address them, such as participant engagement and retention, data quality assurance and bias correction, as well as ethical considerations regarding data sharing. We also provide a range of examples to illustrate the diversity of applications, from biodiversity research and land cover assessment to forest health monitoring and marine pollution. The aspects of reproducibility and data sharing are considered, placing citizen science within an encompassing open science perspective. Finally, we discuss its limitations and challenges and present an outlook for the application of citizen science in multiple science domains. Contributory citizen science is a method in which non-professional participants contribute to data collection in whole or in part to advance scientific research. This Primer outlines the use of citizen science in the environmental and ecological sciences, discussing participant engagement, data quality assurance and bias correction.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s43586-022-00144-4",
    doi = "10.1038/s43586-022-00144-4",
    openalex = "W4293231014",
    references = "doi101016jbiocon201609004"
}

Resumen La pérdida de la biodiversidad es uno de los mayores problemas que enfrenta el mundo hoy en día. Conservation and the Genomics of Populations ofrece una visión general completa del fondo esencial, los conceptos y las herramientas necesarias para comprender cómo se puede utilizar la información genética para conservar las especies amenazadas de extinción y gestionar las especies de importancia ecológica o comercial. Las nuevas técnicas moleculares, métodos estadísticos y programas informáticos, principios genéticos y métodos están volviéndose cada vez más útiles en la conservación de la diversidad biológica. Utilizando un equilibrio de datos y teoría, junto con ejemplos de investigación básica y aplicada, este libro examina la variación genética y fenotípica en poblaciones naturales, los principios y mecanismos del cambio evolutivo, la interpretación de datos genéticos de poblaciones naturales y cómo estos pueden aplicarse a la conservación. El libro incluye ejemplos de plantas, animales y microbios en poblaciones silvestres y cautivas. Esta tercera edición ha sido revisada a fondo para incluir avances en genómica y contiene nuevos capítulos sobre genómica de poblaciones, monitoreo genético y genética de la conservación en la práctica, así como nuevas secciones sobre cambio climático, enfermedades emergentes, metagenómica y más. Más de un tercio de las referencias de esta edición fueron publicadas después de la edición anterior. Cada uno de los 24 capítulos y el Apéndice terminan con una Caja de invitación escrita por un experto que proporciona un ejemplo de los principios presentados en el capítulo de su propio trabajo. Este libro es esencial para estudiantes de pregrado avanzado y posgrado de genética de la conservación, gestión de recursos naturales y biología de la conservación, así como para biólogos de la conservación profesionales y responsables políticos que trabajan para agencias de gestión de vida silvestre y hábitats. Gran parte del libro también interesará a no profesionales que estén curiosos sobre el papel de la genética en la conservación y gestión de poblaciones silvestres y cautivas.

@book{doi101093oso97801988565660010001,
    author = "Allendorf, Fred W. y Funk, W. Chris y Aitken, Sally N. y Byrne, Margaret y Luikart, Gordon y Antunes, Agostinho",
    title = "Conservation and the Genomics of Populations",
    year = "2022",
    abstract = "Resumen La pérdida de la biodiversidad es uno de los mayores problemas que enfrenta el mundo hoy en día. Conservation and the Genomics of Populations ofrece una visión general completa del fondo esencial, los conceptos y las herramientas necesarias para comprender cómo se puede utilizar la información genética para conservar las especies amenazadas de extinción y gestionar las especies de importancia ecológica o comercial. Las nuevas técnicas moleculares, métodos estadísticos y programas informáticos, principios genéticos y métodos están volviéndose cada vez más útiles en la conservación de la diversidad biológica. Utilizando un equilibrio de datos y teoría, junto con ejemplos de investigación básica y aplicada, este libro examina la variación genética y fenotípica en poblaciones naturales, los principios y mecanismos del cambio evolutivo, la interpretación de datos genéticos de poblaciones naturales y cómo estos pueden aplicarse a la conservación. El libro incluye ejemplos de plantas, animales y microbios en poblaciones silvestres y cautivas. Esta tercera edición ha sido revisada a fondo para incluir avances en genómica y contiene nuevos capítulos sobre genómica de poblaciones, monitoreo genético y genética de la conservación en la práctica, así como nuevas secciones sobre cambio climático, enfermedades emergentes, metagenómica y más. Más de un tercio de las referencias de esta edición fueron publicadas después de la edición anterior. Cada uno de los 24 capítulos y el Apéndice terminan con una Caja de invitación escrita por un experto que proporciona un ejemplo de los principios presentados en el capítulo de su propio trabajo. Este libro es esencial para estudiantes de pregrado avanzado y posgrado de genética de la conservación, gestión de recursos naturales y biología de la conservación, así como para biólogos de la conservación profesionales y responsables políticos que trabajan para agencias de gestión de vida silvestre y hábitats. Gran parte del libro también interesará a no profesionales que estén curiosos sobre el papel de la genética en la conservación y gestión de poblaciones silvestres y cautivas.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198856566.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198856566.001.0001",
    openalex = "W4224274233",
    references = "doi101002evl3189, doi101007s10531020019800, doi101016jppees201002002, doi101046j14209101200100339x, doi101093czzow088, doi101093genetics902349, doi101111gcb13976"
}

Las vastas disminuciones globales de la diversidad y la abundancia poblacional de peces de agua dulce y marina plantean amenazas graves tanto para la sostenibilidad de los ecosistemas como para los medios de vida humanos. El biomonitorio basado en ADN ambiental (eDNA) proporciona una evaluación robusta, eficiente y rentable de las ocurrencias de especies y las tendencias poblacionales en diversos ambientes acuáticos. Por lo tanto, tiene un gran potencial para mejorar los marcos de vigilancia convencionales y facilitar la conservación de peces y la gestión pesquera. Sin embargo, las muchas consideraciones técnicas y los rápidos desarrollos en curso en el ámbito del eDNA pueden abrumar a los investigadores y profesionales nuevos en el campo. Aquí, analizamos sistemáticamente 416 estudios de eDNA de peces para resumir las tendencias de investigación en términos de objetivos investigados, objetivos de investigación y sistemas de estudio, y revisamos las aplicaciones, fundamentos, consideraciones metodológicas y limitaciones de los métodos de eDNA, con énfasis en la investigación de peces y pesquerías. Destacamos cómo la tecnología de eDNA puede avanzar nuestro conocimiento sobre el comportamiento de los peces, las distribuciones de especies, la genética de poblaciones, las estructuras comunitarias y las interacciones ecológicas. También sintetizamos el conocimiento actual sobre varias preocupaciones metodológicas importantes, incluida la capacidad cualitativa y cuantitativa que tiene el eDNA para recuperar la biodiversidad y la abundancia de peces, y las representaciones espaciales y temporales del eDNA con respecto a sus fuentes. Para facilitar las aplicaciones ecológicas que implementan técnicas de eDNA de peces, se resumió la literatura reciente para generar directrices para una muestreo efectivo en hábitats lenticos, lóticos y marinos. Finalmente, identificamos las brechas y limitaciones actuales y señalamos nuevas vías de investigación emergentes para el eDNA de peces. A medida que mejore la optimización y estandarización metodológica, la tecnología de eDNA debería revolucionar el monitoreo de peces y promover la conservación de la biodiversidad y la gestión pesquera que trasciende las fronteras geográficas y temporales.

@article{doi101111mec16659,
    author = "Yao, Meng y Zhang, Shan y Lu, Qi y Chen, Xiaoyu y Zhang, Si‐Yu y Kong, Yueqiao y Zhao, Jindong",
    title = "Pesca de ADN ambiental de peces: aplicaciones ecológicas, consideraciones metodológicas, diseños de sondeos y caminos a seguir",
    year = "2022",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Las vastas disminuciones globales de la diversidad y la abundancia poblacional de peces de agua dulce y marina plantean amenazas graves tanto para la sostenibilidad de los ecosistemas como para los medios de vida humanos. El biomonitorio basado en ADN ambiental (eDNA) proporciona una evaluación robusta, eficiente y rentable de las ocurrencias de especies y las tendencias poblacionales en diversos ambientes acuáticos. Por lo tanto, tiene un gran potencial para mejorar los marcos de vigilancia convencionales y facilitar la conservación de peces y la gestión pesquera. Sin embargo, las muchas consideraciones técnicas y los rápidos desarrollos en curso en el ámbito del eDNA pueden abrumar a los investigadores y profesionales nuevos en el campo. Aquí, analizamos sistemáticamente 416 estudios de eDNA de peces para resumir las tendencias de investigación en términos de objetivos investigados, objetivos de investigación y sistemas de estudio, y revisamos las aplicaciones, fundamentos, consideraciones metodológicas y limitaciones de los métodos de eDNA, con énfasis en la investigación de peces y pesquerías. Destacamos cómo la tecnología de eDNA puede avanzar nuestro conocimiento sobre el comportamiento de los peces, las distribuciones de especies, la genética de poblaciones, las estructuras comunitarias y las interacciones ecológicas. También sintetizamos el conocimiento actual sobre varias preocupaciones metodológicas importantes, incluida la capacidad cualitativa y cuantitativa que tiene el eDNA para recuperar la biodiversidad y la abundancia de peces, y las representaciones espaciales y temporales del eDNA con respecto a sus fuentes. Para facilitar las aplicaciones ecológicas que implementan técnicas de eDNA de peces, se resumió la literatura reciente para generar directrices para una muestreo efectivo en hábitats lenticos, lóticos y marinos. Finalmente, identificamos las brechas y limitaciones actuales y señalamos nuevas vías de investigación emergentes para el eDNA de peces. A medida que mejore la optimización y estandarización metodológica, la tecnología de eDNA debería revolucionar el monitoreo de peces y promover la conservación de la biodiversidad y la gestión pesquera que trasciende las fronteras geográficas y temporales.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.16659",
    doi = "10.1111/mec.16659",
    openalex = "W4291963967",
    references = "doi101002edn3232, doi101038s4146702121655w, doi101098rspb20191409, doi101111mec15472"
}

El ADN ambiental (eDNA) es la herramienta de biomonitorización que más rápido crece, impulsada por dos características clave: eficiencia temporal y sensibilidad. Los avances tecnológicos permiten la detección rápida de la biodiversidad a niveles tanto de especies como de comunidades con una precisión creciente. Al mismo tiempo, ha surgido una demanda global de estandarizar los métodos de eDNA, pero esto solo es posible con una visión general profunda de los avances tecnológicos y una discusión de las ventajas y desventajas de los métodos disponibles. Por lo tanto, realizamos una revisión sistemática de la literatura de 407 artículos revisados por pares sobre eDNA acuático publicados entre 2012 y 2021. Observamos un aumento gradual en el número anual de publicaciones, de cuatro (2012) a 28 (2018), seguido de un crecimiento rápido hasta 124 publicaciones en 2021. Esto se reflejó en una tremenda diversificación de métodos en todos los aspectos del flujo de trabajo de eDNA. Por ejemplo, en 2012 solo se aplicaba congelación para preservar muestras de filtros, mientras que en la literatura de 2021 registramos 12 métodos de preservación diferentes. A pesar de un debate continuo sobre la estandarización en la comunidad de eDNA, el campo parece estar avanzando rápidamente en dirección opuesta y discutimos las razones e implicaciones. Además, al compilar la base de datos de cebadores de PCR más grande hasta la fecha, proporcionamos información sobre 522 y 141 cebadores específicos de especie y de metabarcode publicados que apuntan a una amplia gama de organismos acuáticos. Esto funciona como una 'destilación' amigable para el usuario de la información de cebadores que hasta ahora estaba dispersa en cientos de artículos, pero la lista también refleja qué taxones se estudian comúnmente con tecnología de eDNA en ambientes acuáticos como peces y anfibios, y revela que grupos como corales, plancton y algas están subestudiados. Los esfuerzos para mejorar los métodos de muestreo y extracción, la especificidad de los cebadores y las bases de datos de referencia son cruciales para capturar estos taxones ecológicamente importantes en futuras encuestas de biomonitorización con eDNA. En un campo que se diversifica rápidamente, esta revisión sintetiza los procedimientos de eDNA acuáticos y puede guiar a los usuarios de eDNA hacia las mejores prácticas.

@article{doi101016jscitotenv2023162322,
    author = "Takahashi, Miwa y Saccò, Mattia y Kestel, Joshua H. y Nester, Georgia y Campbell, Matthew A. y van der Heyde, Mieke y Heydenrych, Matthew J. y Juszkiewicz, David J. y Nevill, Paul y Dawkins, Kathryn L. y Bessey, Cindy y Fernandes, Kristen y Miller, Haylea C. y Power, Matthew y Mousavi‐Derazmahalleh, Mahsa y Newton, Joshua P. y White, Nicole E. y Richards, Zoe T. y Allentoft, Morten E.",
    title = "ADN ambiental acuático: Una revisión de la revolución de la biomonitorización macroorganismal",
    year = "2023",
    journal = "The Science of The Total Environment",
    abstract = "El ADN ambiental (eDNA) es la herramienta de biomonitorización que más rápido crece, impulsada por dos características clave: eficiencia temporal y sensibilidad. Los avances tecnológicos permiten la detección rápida de la biodiversidad a niveles tanto de especies como de comunidades con una precisión creciente. Al mismo tiempo, ha surgido una demanda global de estandarizar los métodos de eDNA, pero esto solo es posible con una visión general profunda de los avances tecnológicos y una discusión de las ventajas y desventajas de los métodos disponibles. Por lo tanto, realizamos una revisión sistemática de la literatura de 407 artículos revisados por pares sobre eDNA acuático publicados entre 2012 y 2021. Observamos un aumento gradual en el número anual de publicaciones, de cuatro (2012) a 28 (2018), seguido de un crecimiento rápido hasta 124 publicaciones en 2021. Esto se reflejó en una tremenda diversificación de métodos en todos los aspectos del flujo de trabajo de eDNA. Por ejemplo, en 2012 solo se aplicaba congelación para preservar muestras de filtros, mientras que en la literatura de 2021 registramos 12 métodos de preservación diferentes. A pesar de un debate continuo sobre la estandarización en la comunidad de eDNA, el campo parece estar avanzando rápidamente en dirección opuesta y discutimos las razones e implicaciones. Además, al compilar la base de datos de cebadores de PCR más grande hasta la fecha, proporcionamos información sobre 522 y 141 cebadores específicos de especie y de metabarcode publicados que apuntan a una amplia gama de organismos acuáticos. Esto funciona como una 'destilación' amigable para el usuario de la información de cebadores que hasta ahora estaba dispersa en cientos de artículos, pero la lista también refleja qué taxones se estudian comúnmente con tecnología de eDNA en ambientes acuáticos como peces y anfibios, y revela que grupos como corales, plancton y algas están subestudiados. Los esfuerzos para mejorar los métodos de muestreo y extracción, la especificidad de los cebadores y las bases de datos de referencia son cruciales para capturar estos taxones ecológicamente importantes en futuras encuestas de biomonitorización con eDNA. En un campo que se diversifica rápidamente, esta revisión sintetiza los procedimientos de eDNA acuáticos y puede guiar a los usuarios de eDNA hacia las mejores prácticas.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.162322",
    doi = "10.1016/j.scitotenv.2023.162322",
    openalex = "W4321253950",
    references = "doi101002edn3232, doi101007s10531020019800, doi101111j1365294x201205505x"
}

La disponibilidad de recursos genómicos públicos puede ayudar enormemente a los esfuerzos de evaluación de la biodiversidad, conservación y restauración al proporcionar evidencia para decisiones de gestión informadas científicamente. Aquí revisamos los principales enfoques y aplicaciones en genómica de la biodiversidad y conservación, considerando factores prácticos, como el costo, el tiempo, las habilidades previas requeridas y las limitaciones actuales de las aplicaciones. La mayoría de los enfoques funcionan mejor en combinación con genomas de referencia de la especie objetivo o especies estrechamente relacionadas. Revisamos estudios de caso para ilustrar cómo los genomas de referencia pueden facilitar la investigación de la biodiversidad y la conservación a través del árbol de la vida. Concluimos que es el momento adecuado para considerar los genomas de referencia como recursos fundamentales e integrar su uso como una mejor práctica en la genómica de la conservación.

@article{doi101016jtig202301005,
    author = "Theißinger, Kathrin and Fernandes, Carlos and Formenti, Giulio and Bista, Iliana and Berg, Paul R. and Bleidorn, Christoph and Bombarely, Aureliano and Crottini, Angelica and Gallo, Guido Roberto and Godoy, José A. and Jentoft, Sissel and Malukiewicz, Joanna and Mouton, Alice and Oomen, Rebekah A. and Paez, Sadye and Palsbøll, Per J. and Pampoulie, Christophe and Ruiz‐López, María José and Secomandi, Simona and Svardal, Hannes and Theofanopoulou, Constantina and de Vries, Jan and Waldvogel, Ann‐Marie and Zhang, Guojie and Jarvis, Erich D. and Bálint, Miklós and Ciofi, Claúdio and Waterhouse, Robert M. and Mazzoni, Camila J. and Höglund, ‎Jacob and Aghayan, Sargis A. and Alioto, Tyler and Almudí, Isabel and Álvarez, Nadir and Alves, Paulo C. and Amorim, Isabel R. and Antunes, Agostinho and Arribas, Paula and Baldrián, Petr and Bertorelle, Giorgio and Böhne, Astrid and Bonisoli‐Alquati, Andrea and Boštjančić, Ljudevit Luka and Boussau, Bastien and Breton, Catherine and Bužan, Elena and Campos, Paula F. and Carreras, Carlos and Castro, L. Filipe C. and Chueca, Luis J. and Čiampor, Fedor and Conti, Elena and Cook‐Deegan, Robert and Croll, Daniel and Cunha, Mónica V. and Delsuc, Frédéric and Dennis, Alice B. and Dimitrov, Dimitar and Faria, Rui and Favre, Adrien and Fédrigo, Olivier and Fernández, Rosa and Ficetola, Gentile Francesco and Flot, Jean‐François and Gabaldón, Toni and Agius, D. and Giani, Alice Maria and Gilbert, M. Thomas P. and Grebenc, Tine and Guschanski, Katerina and Guyot, Romain and Hausdorf, Bernhard and Hawlitschek, Oliver and Heintzman, Peter D. and Heinze, Berthold and Hiller, Michael and Husemann, Martin and Iannucci, Alessio and Irisarri, Iker and Jakobsen, Kjetill S. and Klinga, Peter and Kloch, Agnieszka and Kratochwil, Claudius F. and Kusche, Henrik and Layton, Kara K S and Leonard, Jennifer A. and Lerat, Emmanuelle and Liti, Gianni and Manousaki, Tereza and Marquès‐Bonet, Tomàs and Matos‐Maraví, Pável and Matschiner, Michael and Maumus, Florian and Cartney, Ann M. Mc and Meiri, Shai and Melo‐Ferreira, José and Mengual, Ximo and Monaghan, Michael T. and Montagna, Matteo and Mysłajek, Robert W.",
    title = "Cómo la genómica puede ayudar a la conservación de la biodiversidad",
    year = "2023",
    journal = "Trends in Genetics",
    abstract = "La disponibilidad de recursos genómicos públicos puede ayudar enormemente a los esfuerzos de evaluación de la biodiversidad, conservación y restauración al proporcionar evidencia para decisiones de gestión informadas científicamente. Aquí revisamos los principales enfoques y aplicaciones en genómica de la biodiversidad y conservación, considerando factores prácticos, como el costo, el tiempo, las habilidades previas requeridas y las limitaciones actuales de las aplicaciones. La mayoría de los enfoques funcionan mejor en combinación con genomas de referencia de la especie objetivo o especies estrechamente relacionadas. Revisamos estudios de caso para ilustrar cómo los genomas de referencia pueden facilitar la investigación de la biodiversidad y la conservación a través del árbol de la vida. Concluimos que es el momento adecuado para considerar los genomas de referencia como recursos fundamentales e integrar su uso como una mejor práctica en la genómica de la conservación.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tig.2023.01.005",
    doi = "10.1016/j.tig.2023.01.005",
    openalex = "W4321019193",
    references = "doi101016jgecco2019e00547, doi101038s415590180717x, doi101111mec14350, doi101111mec14726"
}