Cristales

@book{cairnssmith1971the1,
    author = "Cairns-Smith, A. G",
    title = "The Life Puzzle",
    year = "1971",
    publisher = "On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal As an Ancestor: Toronto, University of Toronto Press, 165 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Cairns-Smith, A. G., 1971, The Life Puzzle: On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal As an Ancestor: Toronto, University of Toronto Press, 165 p.}"
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¿Cuál es el origen de la vida? La biología molecular nos muestra un tipo, pero al pensarlo debemos considerar aquellos aspectos generalizados de la organización viva que son comunes a todas las formas de vida concebibles. El autor cree que solo una combinación de teoría biológica general y conocimiento químico particular puede resolver los problemas del origen y la re-creación de la vida. Este libro no se adscribe a ninguna de las dos escuelas clásicas de pensamiento sobre el origen de la vida, Haldane o Oparin, sino que avanza una tesis propia, la cual, según el profesor C.H. Waddington, es uno de los desarrollos intelectuales más importantes recientes en este campo. La Parte I considera el papel de la biología molecular en la formulación de una visión de la vida tal como existe ahora. La Parte II se dirige a aspectos más generales de la organización de la materia. En la Parte III el autor avanza sus propias teorías sobre el origen de la vida —teorías que son tanto revolucionarias como reaccionarias. Como él mismo señala, 'Si mis conclusiones son correctas, puede ser difícil encontrar el sistema adecuado, pero sería fácil crear un organismo muy simple una vez que lo tengamos.'

@book{doi1031389781487589684,
    author = "Cairns-Smith, A. G.",
    title = "The Life Puzzle: On Crystals and Organisms and on the Possibility of a Crystal as an Ancestor",
    year = "1971",
    booktitle = "Project Muse (Johns Hopkins University)",
    abstract = "¿Cuál es el origen de la vida? La biología molecular nos muestra un tipo, pero al pensarlo debemos considerar aquellos aspectos generalizados de la organización viva que son comunes a todas las formas de vida concebibles. El autor cree que solo una combinación de teoría biológica general y conocimiento químico particular puede resolver los problemas del origen y la re-creación de la vida. Este libro no se adscribe a ninguna de las dos escuelas clásicas de pensamiento sobre el origen de la vida, Haldane o Oparin, sino que avanza una tesis propia, la cual, según el profesor C.H. Waddington, es uno de los desarrollos intelectuales más importantes recientes en este campo. La Parte I considera el papel de la biología molecular en la formulación de una visión de la vida tal como existe ahora. La Parte II se dirige a aspectos más generales de la organización de la materia. En la Parte III el autor avanza sus propias teorías sobre el origen de la vida —teorías que son tanto revolucionarias como reaccionarias. Como él mismo señala, 'Si mis conclusiones son correctas, puede ser difícil encontrar el sistema adecuado, pero sería fácil crear un organismo muy simple una vez que lo tengamos.'",
    url = "https://doi.org/10.3138/9781487589684",
    doi = "10.3138/9781487589684",
    openalex = "W149028925"
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@article{doi101038236239a0,
    author = "Bunn, C. W.",
    title = "Vida desde Cristales",
    year = "1972",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/236239a0",
    doi = "10.1038/236239a0",
    openalex = "W165208592"
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Aquí argumentamos que la vida emergió en la Tierra desde un frente de redox y pH a c. 4,2 Ga. Este frente ocurrió donde aguas submarinas de filtración extremadamente reducidas, alcalinas, portadoras de bisulfuro y calientes (c. 150 grados C) se encontraban con el océano hadeano ácido, cálido (c. 90 grados C) y portador de hierro. El bajo pH del océano fue impartido por las diez barras de CO2 consideradas dominantes en la atmósfera/hidrosfera hadeana. El desequilibrio entre las dos soluciones fue mantenido por la precipitación espontánea de una membrana coloidal de FeS. Las burbujas de monosulfuro de hierro que componían esta membrana fueron infladas por la solución hidrotermal sobre montículos de sulfuro en los sitios de filtración. Nuestra hipótesis es que la membrana de FeS, salpicada de níquel, actuó como una frontera catalítica semipermeable entre los dos fluidos, fomentando la síntesis de aniones orgánicos mediante la hidrogenación y carboxilación de primarios orgánicos hidrotermales. El océano proporcionó carbonato, fosfato, hierro, níquel y protones; la solución hidrotermal fue la fuente de amoníaco, acetato, HS-, H2 y tungsteno, así como concentraciones menores de sulfuros orgánicos y quizás cianuro y acetaldehído. El potencial redox medio (delta Eh) a través de la membrana, con la energía para impulsar la síntesis, habría aproximado a 300 milivoltios. La generación de aniones orgánicos habría llevado a un aumento en la presión osmótica dentro de las burbujas de FeS. Así, la presión osmótica podría tomar el relevo de la presión hidráulica como la fuerza impulsora para la distensión, brotación y reproducción de las burbujas. La condensación de las moléculas orgánicas a polímeros, particularmente sulfuros orgánicos, fue impulsada por la hidrólisis de pirofosfato. La regeneración de pirofosfato a partir del monofosfato en la membrana fue facilitada por protones contribuidos desde el océano hadeano. Este fue el primer uso por un sistema metabolizador de fuerza protonmotriz (impulsada por el delta pH natural) que también habría amounted a c. 300 milivoltios. La fuerza protonmotriz es el mecanismo universal de transducción de energía de la vida. Tomado junto con el potencial redox a través de la membrana, la energía electroquímica y química total disponible para el protometabolismo amounted a un suministro continuo de más de medio voltio. El papel de la membrana de sulfuro de hierro en mantener separadas las dos soluciones fue apropiado por los polímeros de sulfuro orgánico recién sintetizados. Esta toma orgánica del material de la membrana llevó a la miniaturización del sistema metabolizador. Los sistemas de información para gobernar la replicación podrían haberse desarrollado penecontemporáneamente en este mismo medio. Pero el hierro, el azufre y el fosfato, componentes inorgánicos de la vida más temprana, continuaron involucrados en el metabolismo.

@article{doi101144gsjgs15430377,
    author = "Russell, Michael J. and Hall, A. J.",
    title = "El surgimiento de la vida desde burbujas de monosulfuro de hierro en un frente redox y de pH submarino hidrotermal",
    year = "1997",
    journal = "Journal of the Geological Society",
    abstract = "Aquí argumentamos que la vida surgió en la Tierra desde un frente redox y de pH hace aproximadamente 4,2 Ga. Este frente ocurrió donde aguas submarinas de filtración extremadamente reducidas, alcalinas, portadoras de bisulfuro y calientes (c. 150 grados C) interfirieron con el océano hadeano ácido, cálido (c. 90 grados C) y portador de hierro. El bajo pH del océano fue impartido por las diez barras de CO2 consideradas dominantes en la atmósfera/hidrosfera hadeana. El desequilibrio entre las dos soluciones se mantuvo por la precipitación espontánea de una membrana coloidal de FeS. Las burbujas de monosulfuro de hierro que componen esta membrana se inflaron con la solución hidrotermal sobre montículos de sulfuro en los sitios de filtración. Nuestra hipótesis es que la membrana de FeS, salpicada de níquel, actuó como una frontera catalítica semipermeable entre los dos fluidos, fomentando la síntesis de aniones orgánicos mediante la hidrogenación y carboxilación de primarios orgánicos hidrotermales. El océano proporcionó carbonato, fosfato, hierro, níquel y protones; la solución hidrotermal fue la fuente de amoníaco, acetato, HS-, H2 y tungsteno, así como concentraciones menores de sulfuros orgánicos y quizás cianuro y acetaldehído. El potencial redox medio (delta Eh) a través de la membrana, con la energía para impulsar la síntesis, habría aproximado a 300 milivoltios. La generación de aniones orgánicos habría llevado a un aumento en la presión osmótica dentro de las burbujas de FeS. Así, la presión osmótica podría tomar el relevo de la presión hidráulica como la fuerza impulsora para la distensión, brotación y reproducción de las burbujas. La condensación de las moléculas orgánicas a polímeros, particularmente sulfuros orgánicos, fue impulsada por la hidrólisis de pirofosfato. La regeneración de pirofosfato desde el monofosfato en la membrana fue facilitada por protones contribuidos desde el océano hadeano. Este fue el primer uso por un sistema metabolizador de fuerza protonmotriz (impulsada por un delta pH natural) que también habría amounted a c. 300 milivoltios. La fuerza protonmotriz es el mecanismo universal de transducción de energía de la vida. Tomado junto con el potencial redox a través de la membrana, la energía electroquímica y química total disponible para el protometabolismo amounted a un suministro continuo de más de medio voltio. El papel de la membrana de sulfuro de hierro en mantener separadas las dos soluciones fue apropiado por los polímeros de sulfuro orgánico recién sintetizados. Esta toma orgánica del material de la membrana llevó a la miniaturización del sistema metabolizador. Los sistemas de información para gobernar la replicación podrían haberse desarrollado penecontemporáneamente en este mismo medio. Pero el hierro, el azufre y el fosfato, componentes inorgánicos de la vida más temprana, continuaron involucrados en el metabolismo.",
    url = "https://doi.org/10.1144/gsjgs.154.3.0377",
    doi = "10.1144/gsjgs.154.3.0377",
    openalex = "W2145198797",
    references = "darwin2009the, doi10100797894015805408, doi101007bf00032643, doi101007bf01140180, doi101007bf01808177, doi1010160003986161900339, doi1010160016703789901506, doi1010160016703794902887, doi1010160020711x94901198, doi1010160076687987550236, doi1010161074552195900314, doi101016s0022283667800378, doi101038191144a0, doi101038319618a0, doi101038331612a0, doi101038336117a0, doi101038343129a0, doi101038355125a0, doi101073pnas87124576, doi101111j174966321936tb56976x, doi101126science1173046528, doi101128br4111001801977, doi101130001676061951621111ghosw20co2, doi1023073514674, fox1995thermal, openalexw1491459594, openalexw1882072473, openalexw1986779979, openalexw2139291338"
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La fijación de carbono inorgánico en material orgánico (autotrofía) es un requisito previo para la vida y establece el punto de partida de la evolución biológica. En la biosfera actual, el ciclo reductor del fosfato de pentosa (ciclo de Calvin-Benson) es el mecanismo predominante mediante el cual muchos procariotas y todas las plantas fijan CO(2) en biomasa. Sin embargo, el hecho de que existan cinco vías autotróficas alternativas en procariotas a menudo se pasa por alto. Este sesgo puede llevar a errores graves en los modelos del ciclo global del carbono, en las hipótesis sobre la evolución del metabolismo y en las interpretaciones de los registros geológicos. Aquí, reviso estas vías alternativas que difieren fundamentalmente del ciclo de Calvin-Benson. Reveladoramente, estas cinco vías alternativas giran en torno a la acetil-coenzima A, el eje del metabolismo, lo que exige una vía gluconeogénica que parta de la acetil-coenzima A y el CO(2). Parece que la formación de un ácido acético activado a partir de carbono inorgánico representa el paso inicial hacia el metabolismo. En consecuencia, las biosíntesis probablemente comenzaron a partir del ácido acético activado y la gluconeogénesis precedió a la glucólisis.

@article{doi101146annurevmicro090110102801,
    author = "Fuchs, Georg",
    title = "Vías Alternativas de la Fijación de Dióxido de Carbono: Perspectivas sobre la Evolución Temprana de la Vida?",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Microbiology",
    abstract = "La fijación de carbono inorgánico en material orgánico (autotrofía) es un requisito previo para la vida y establece el punto de partida de la evolución biológica. En la biosfera actual, el ciclo reductor del fosfato de pentosa (ciclo de Calvin-Benson) es el mecanismo predominante mediante el cual muchos procariotas y todas las plantas fijan CO(2) en biomasa. Sin embargo, el hecho de que existan cinco vías autotróficas alternativas en procariotas a menudo se pasa por alto. Este sesgo puede llevar a errores graves en los modelos del ciclo global del carbono, en las hipótesis sobre la evolución del metabolismo y en las interpretaciones de los registros geológicos. Aquí, reviso estas vías alternativas que difieren fundamentalmente del ciclo de Calvin-Benson. Reveladoramente, estas cinco vías alternativas giran en torno a la acetil-coenzima A, el eje del metabolismo, lo que exige una vía gluconeogénica que parta de la acetil-coenzima A y el CO(2). Parece que la formación de un ácido acético activado a partir de carbono inorgánico representa el paso inicial hacia el metabolismo. En consecuencia, las biosíntesis probablemente comenzaron a partir del ácido acético activado y la gluconeogénesis precedió a la glucólisis.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-micro-090110-102801",
    doi = "10.1146/annurev-micro-090110-102801",
    openalex = "W2130107304",
    references = "doi101002bies200900131, doi101002cbdv200790052, doi101007bf00032643, doi101038nrmicro1852, doi101038nrmicro1991, doi10108010409230490460765"
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Comprender cómo un sistema químico simple puede replicar con precisión información combinatoria, como una secuencia, es una pregunta importante tanto para el estudio de la vida en el universo como para el desarrollo de técnicas de diseño molecular evolutivo. Durante la replicación de secuencias biológicas, un polímero de ácido nucleico sirve como plantilla para el ensamblaje de una secuencia complementaria catalizado por enzimas. Las enzimas luego separan la plantilla y el complemento antes de la siguiente ronda de replicación. Los intentos de comprender cómo podría ocurrir la replicación de manera más simple, como sin enzimas, se han centrado principalmente en desarrollar versiones mínimas de este proceso de replicación. Aquí describimos cómo un mecanismo diferente, el crecimiento y la escisión de cristales, puede replicar con precisión secuencias químicas sin enzimas. El crecimiento de cristales propaga una secuencia de bits mientras que la escisión inducida mecánicamente crea nuevos frentes de crecimiento. Juntos, estos procesos aumentan exponencialmente el número de secuencias de cristales. En el sistema que describimos, las secuencias son arreglos de monómeros de azulejos de ADN dentro de cristales en forma de cinta. El 99,98% de los bits se copian correctamente y el 78% de las secuencias de 4 bits son correctas después de dos generaciones; se realizan aproximadamente 40 copias de secuencia por frente de crecimiento por generación. En principio, este proceso es lo suficientemente preciso para la replicación 1.000 veces de secuencias de 4 bits con un rendimiento del 50%, la replicación de secuencias más largas y la evolución darwiniana. Por lo tanto, demostramos que ni las enzimas ni la formación de enlaces covalentes son necesarias para la replicación robusta de secuencias químicas. La forma de la información replicada también es compatible con la replicación y la evolución de una amplia clase de materiales con geometría precisa a escala nanométrica, como nanoestructuras plasmónicas o ensamblajes de proteínas heterogéneos.

@article{doi101073pnas1117813109,
    author = "Schulman, Rebecca and Yurke, Bernard and Winfree, Erik",
    title = "Robust self-replication of combinatorial information via crystal growth and scission",
    year = "2012",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Comprender cómo un sistema químico simple puede replicar con precisión información combinatoria, como una secuencia, es una pregunta importante tanto para el estudio de la vida en el universo como para el desarrollo de técnicas de diseño molecular evolutivo. Durante la replicación de secuencias biológicas, un polímero de ácido nucleico sirve como plantilla para el ensamblaje de una secuencia complementaria catalizado por enzimas. Las enzimas luego separan la plantilla y el complemento antes de la siguiente ronda de replicación. Los intentos de comprender cómo podría ocurrir la replicación de manera más simple, como sin enzimas, se han centrado principalmente en desarrollar versiones mínimas de este proceso de replicación. Aquí describimos cómo un mecanismo diferente, el crecimiento y la escisión de cristales, puede replicar con precisión secuencias químicas sin enzimas. El crecimiento de cristales propaga una secuencia de bits mientras que la escisión inducida mecánicamente crea nuevos frentes de crecimiento. Juntos, estos procesos aumentan exponencialmente el número de secuencias de cristales. En el sistema que describimos, las secuencias son arreglos de monómeros de azulejos de ADN dentro de cristales en forma de cinta. El 99,98% de los bits se copian correctamente y el 78% de las secuencias de 4 bits son correctas después de dos generaciones; se realizan aproximadamente 40 copias de secuencia por frente de crecimiento por generación. En principio, este proceso es lo suficientemente preciso para la replicación 1.000 veces de secuencias de 4 bits con un rendimiento del 50%, la replicación de secuencias más largas y la evolución darwiniana. Por lo tanto, demostramos que ni las enzimas ni la formación de enlaces covalentes son necesarias para la replicación robusta de secuencias químicas. La forma de la información replicada también es compatible con la replicación y la evolución de una amplia clase de materiales con geometría precisa a escala nanométrica, como nanoestructuras plasmónicas o ensamblajes de proteínas heterogéneos.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1117813109",
    doi = "10.1073/pnas.1117813109",
    openalex = "W2070783600",
    references = "doi101137070680266"
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Este artículo presenta una reformulación de la teoría de fuentes hidrotermales alcalinas submarinas para el origen de la vida en respuesta a hallazgos experimentales recientes. La teoría considera la vida, como otros sistemas autoorganizados en el Universo, como un resultado inevitable de ciertos desequilibrios. En este caso, los desequilibrios fueron dos: (1) en potencial redox, entre hidrógeno más metano con aceptores de electrones que completan el circuito como nitrito, nitrato, hierro férrico y dióxido de carbono, y (2) en gradiente de pH entre un océano externo ácido y un fluido hidrotermal alcalino. Tanto el CO2 como el CH4 fueron igualmente las fuentes últimas de carbono orgánico, y los sulfuros metálicos y oxihidróxidos actuaron como catalizadores protoenzimáticos. La realización, ahora de hace 50 años, de que los gradientes que atraviesan la membrana, en lugar de intermediarios orgánicos, juegan un papel vital en las operaciones de la vida, pone en cuestión la idea de la "química prebiótica". Informa nuestra propia sugerencia de que la experimentación debe buscar el tipo de nanomotores que debieron ser los precursores de los motores moleculares —como la pirrofosfato sintetasa y similares impulsados por estos gradientes— que hacen que la vida funcione. Son estos supuestos convertidores de energía libre o desequilibrios, presumiblemente construidos a partir de minerales que componían las primeras membranas inorgánicas, que, como obstáculos a los flujos iónicos vectoriales, se presentan como candidatos para futuros experimentos. Palabras clave: Metanotrofia-Origen de la vida. Astrobiology 14, 308-343. La fijación de carbono inorgánico en material orgánico (autotrofia) es un prerrequisito para la vida y establece el punto de partida de la evolución biológica. (Fuchs, 2011) Los avances significativos adicionales con la familia H(+)-PPase fuertemente unida a la membrana deberían conducir a una mayor comprensión de los requisitos básicos para el transporte biológico de protones a través de membranas y su acoplamiento a la fosforilación. (Baltscheffsky et al., 1999).

@article{doi101089ast20131110,
    author = "Russell, Michael J. y Barge, Laura M. y Bhartia, R. y Bocanegra, Dylan y Bracher, Paul J. y Branscomb, Elbert y Kidd, Richard y McGlynn, Shawn E. y Meier, David H. y Nitschke, Wolfgang y Shibuya, Takazo y Vance, S. y White, Lauren M. y Kanik, I.",
    title = "The Drive to Life on Wet and Icy Worlds",
    year = "2014",
    journal = "Astrobiology",
    abstract = {Este artículo presenta una reformulación de la teoría de fuentes hidrotermales alcalinas submarinas para el origen de la vida en respuesta a hallazgos experimentales recientes. La teoría considera la vida, como otros sistemas autoorganizados en el Universo, como un resultado inevitable de ciertos desequilibrios. En este caso, los desequilibrios fueron dos: (1) en potencial redox, entre hidrógeno más metano con aceptores de electrones que completan el circuito como nitrito, nitrato, hierro férrico y dióxido de carbono, y (2) en gradiente de pH entre un océano externo ácido y un fluido hidrotermal alcalino. Tanto el CO2 como el CH4 fueron igualmente las fuentes últimas de carbono orgánico, y los sulfuros metálicos y oxihidróxidos actuaron como catalizadores protoenzimáticos. La realización, ahora de hace 50 años, de que los gradientes que atraviesan la membrana, en lugar de intermediarios orgánicos, juegan un papel vital en las operaciones de la vida, pone en cuestión la idea de la "química prebiótica". Informa nuestra propia sugerencia de que la experimentación debe buscar el tipo de nanomotores que debieron ser los precursores de los motores moleculares —como la pirrofosfato sintetasa y similares impulsados por estos gradientes— que hacen que la vida funcione. Son estos supuestos convertidores de energía libre o desequilibrios, presumiblemente construidos a partir de minerales que componían las primeras membranas inorgánicas, que, como obstáculos a los flujos iónicos vectoriales, se presentan como candidatos para futuros experimentos. Palabras clave: Metanotrofia-Origen de la vida. Astrobiology 14, 308-343. La fijación de carbono inorgánico en material orgánico (autotrofia) es un prerrequisito para la vida y establece el punto de partida de la evolución biológica. (Fuchs, 2011) Los avances significativos adicionales con la familia H(+)-PPase fuertemente unida a la membrana deberían conducir a una mayor comprensión de los requisitos básicos para el transporte biológico de protones a través de membranas y su acoplamiento a la fosforilación. (Baltscheffsky et al., 1999).},
    url = "https://doi.org/10.1089/ast.2013.1110",
    doi = "10.1089/ast.2013.1110",
    openalex = "W2081345082",
    references = "doi101002cbdv200790052, doi101016jastropartphys201303001, doi101016jepsl201110040, doi101098rsob130156, doi101128mmbr0001009"
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@article{doi101007s1108401909580x,
    author = "Mariscal, Carlos y Barahona, Ana y Aubert-Kato, Nathanaël y Aydınoğlu, Arsev Umur y Bartlett, Stuart y Cárdenas, Marı́a Luz y Chandru, Kuhan y Cleland, Carol E. y Cocanougher, Ben y Comfort, Nathaniel y Cornish‐Bowden, Athel y Deacon, Terrence W. y Froese, Tom y Giovannelli, Donato y Hernlund, J. W. y Hut, Piet y Kimura, Jun y Maurel, Marie-Christine y Merino, Nancy y Moreno, Álvaro y Nakagawa, Mayuko y Peretό, Juli y Virgo, Nathaniel y Witkowski, Olaf y Cleaves, Henderson James",
    title = "Conceptos Ocultos en la Historia y Filosofía de los Estudios sobre el Origen de la Vida: un Informe de Taller",
    year = "2019",
    journal = "Origen de la Vida y Evolución de las Esferas Biológicas",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11084-019-09580-x",
    doi = "10.1007/s11084-019-09580-x",
    openalex = "W2967455602",
    references = "doi1010079789400989474, doi1010160020711x94901198, doi101038171737a0, doi101038scientificamerican117998, doi10106313050879, doi101103physrevlett59381, doi1023072005041, doi1031389781487589684, openalexw1916207017"
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La investigación sobre el origen de la vida es altamente heterogénea. Después de un peculiar desarrollo histórico, aún incluye puntos de vista fuertemente opuestos que potencialmente obstaculizan el progreso. En la 1ª Reunión Interdisciplinaria sobre el Origen de la Vida, investigadores de principios de carrera se reunieron para explorar las similitudes entre teorías y enfoques, puntos críticos de divergencia y expectativas para el futuro. Encontramos que, aunque los enfoques y teorías clásicas —por ejemplo, de abajo hacia arriba y de arriba hacia abajo, mundo de ARN versus metabolismo primero— han prevalecido en la investigación sobre el origen de la vida, están dejando de ser mutuamente excluyentes y pueden y deben alimentar enfoques integradores. Aquí nos centramos en preguntas urgentes y desarrollos recientes que unen las disciplinas y enfoques clásicos, y destacamos las expectativas para futuros esfuerzos en la investigación sobre el origen de la vida.

@article{doi103390life10030020,
    author = "Preiner, Martina y Asche, Silke y Becker, Sidney y Betts, Holly C. y Boniface, Adrien y Camprubí, Eloi y Chandru, Kuhan y Erastova, Valentina y Garg, Sriram G. y Khawaja, Nozair y Kostyrka, Gladys y Machné, Rainer y Moggioli, Giacomo y Muchowska, Kamila B. y Neukirchen, Sinje y Peter, Benedikt y Pichlhöfer, Edith y Radványi, Ádám y Rossetto, Daniele y Salditt, Annalena y Schmelling, Nicolas y Sousa, Filipa L. y Tria, Fernando D. K. y Vörös, Dániel y Xavier, Joana C.",
    title = "El Futuro de la Investigación sobre el Origen de la Vida: Uniendo Divisiones de Décadas de Antigüedad",
    year = "2020",
    journal = "Life",
    abstract = "La investigación sobre el origen de la vida es altamente heterogénea. Después de un peculiar desarrollo histórico, aún incluye puntos de vista fuertemente opuestos que potencialmente obstaculizan el progreso. En la 1ª Reunión Interdisciplinaria sobre el Origen de la Vida, investigadores de principios de carrera se reunieron para explorar las similitudes entre teorías y enfoques, puntos críticos de divergencia y expectativas para el futuro. Encontramos que, aunque los enfoques y teorías clásicas —por ejemplo, de abajo hacia arriba y de arriba hacia abajo, mundo de ARN versus metabolismo primero— han prevalecido en la investigación sobre el origen de la vida, están dejando de ser mutuamente excluyentes y pueden y deben alimentar enfoques integradores. Aquí nos centramos en preguntas urgentes y desarrollos recientes que unen las disciplinas y enfoques clásicos, y destacamos las expectativas para futuros esfuerzos en la investigación sobre el origen de la vida.",
    url = "https://doi.org/10.3390/life10030020",
    doi = "10.3390/life10030020",
    openalex = "W3007934451",
    references = "branscomb2018frankenstein, doi101002bies201700179, doi101002bies201700182, doi101007bf00623322, doi101007s1108401909580x, doi1010160092867482904147, doi1010160092867483901174, doi101016jchembiol201303012, doi101016jgsf201707007, doi101038319618a0, doi101038nrmicro1931, doi101038nrmicro1991, doi101038s4158601914364, doi101093nargkw1092, doi101126science1173046528, doi101126science1303370245, doi101126science13434891501, doi101126scienceaax2747, doi1020944preprints2018060035v1, doi1020944preprints2018060035v2, doi103390life5021239"
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La vida en la Tierra y el código genético evolucionaron alrededor del tRNA y el anticodón del tRNA. Planteamos que el código genético inicialmente evolucionó para sintetizar poliglicina como agente de entrecruzamiento para estabilizar protocélulas. Planteamos que los aminoácidos iniciales que ingresaron al código ocuparon sectores más grandes del código que luego fueron invadidos por aminoácidos entrantes. Los desplazamientos de aminoácidos siguen reglas de selección. El código se segmentó desde un código de glicina a un código de cuatro aminoácidos, a un código de ocho aminoácidos, a un código de ~16 aminoácidos y al código estándar de 20 aminoácidos con paradas. Los patrones propuestos de segmentación del código ahora son más evidentes a partir de los patrones de evolución de las aminoacil-tRNA sintetasas. El cierre anticodón-codón de la GTPasa del factor de elongación-Tu que verifica la precisión de la traducción parece haber evolucionado alrededor de la etapa de ocho aminoácidos a ~16 aminoácidos. Antes de la evolución del cierre EF-Tu, planteamos que tanto la 1ª como la 3ª posiciones del anticodón eran posiciones de wobble. El código genético evolucionó mediante errores de carga de tRNA y mediante modificaciones enzimáticas de aminoácidos unidos a tRNAs, seguidas de la diferenciación del tRNA y las aminoacil-tRNA sintetasas. Los mecanismos de fidelidad congelaron el código al inhibir la innovación adicional.

@article{doi103390life10030021,
    author = "Lei, Lei y Burton, Zachary F.",
    title = "Evolución de la vida en la Tierra: tRNA, aminoacil-tRNA sintetasas y el código genético",
    year = "2020",
    journal = "Life",
    abstract = "La vida en la Tierra y el código genético evolucionaron alrededor del tRNA y el anticodón del tRNA. Planteamos que el código genético inicialmente evolucionó para sintetizar poliglicina como agente de entrecruzamiento para estabilizar protocélulas. Planteamos que los aminoácidos iniciales que ingresaron al código ocuparon sectores más grandes del código que luego fueron invadidos por aminoácidos entrantes. Los desplazamientos de aminoácidos siguen reglas de selección. El código se segmentó desde un código de glicina a un código de cuatro aminoácidos, a un código de ocho aminoácidos, a un código de \textasciitilde 16 aminoácidos y al código estándar de 20 aminoácidos con paradas. Los patrones propuestos de segmentación del código ahora son más evidentes a partir de los patrones de evolución de las aminoacil-tRNA sintetasas. El cierre anticodón-codón de la GTPasa del factor de elongación-Tu que verifica la precisión de la traducción parece haber evolucionado alrededor de la etapa de ocho aminoácidos a \textasciitilde 16 aminoácidos. Antes de la evolución del cierre EF-Tu, planteamos que tanto la 1ª como la 3ª posiciones del anticodón eran posiciones de wobble. El código genético evolucionó mediante errores de carga de tRNA y mediante modificaciones enzimáticas de aminoácidos unidos a tRNAs, seguidas de la diferenciación del tRNA y las aminoacil-tRNA sintetasas. Los mecanismos de fidelidad congelaron el código al inhibir la innovación adicional.",
    url = "https://doi.org/10.3390/life10030021",
    doi = "10.3390/life10030021",
    openalex = "W3009119289",
    references = "doi101007s1108401909580x"
}

La pregunta "¿Qué es la vida?" existe desde el comienzo de la historia registrada. Sin embargo, los contextos científicos y filosóficos de esta pregunta han cambiado y se han refinado a medida que los avances tecnológicos han revelado tanto detalles finos como conexiones amplias en la red de la vida en la Tierra. Comprender el marco de la pregunta "¿Qué es la vida?" es central para formular otras preguntas como "¿Dónde más podría existir la vida?" y "¿Cómo buscamos la vida en otros lugares?". Aunque muchas de estas preguntas se abordan en todo el Primer de Astrobiología 3.0, este capítulo proporciona el contexto histórico para definir la vida, destaca las características conceptuales compartidas por toda la vida en la Tierra así como las características clave utilizadas para describirla, discute por qué es importante para la astrobiología y explora tanto los desafíos como las oportunidades para encontrar una definición operativa informativa.

@article{doi101089ast20210116,
    author = "Colón‐Santos, Stephanie y Vázquez-Salazar, Alberto y Adams, Alyssa y Campillo-Balderas, José Alberto y Hernández-Morales, Ricardo y Jácome, Rodrigo y Muñoz‐Velasco, Israel y Rodriguez, Laura E. y Schaible, Micah J. y Schaible, George A. y Szeinbaum, Nadia y Thweatt, Jennifer L. y Trubl, Gareth",
    title = "Capítulo 2: ¿Qué es la vida?",
    year = "2024",
    journal = "Astrobiology",
    abstract = {La pregunta "¿Qué es la vida?" existe desde el comienzo de la historia registrada. Sin embargo, los contextos científicos y filosóficos de esta pregunta han cambiado y se han refinado a medida que los avances tecnológicos han revelado tanto detalles finos como conexiones amplias en la red de la vida en la Tierra. Comprender el marco de la pregunta "¿Qué es la vida?" es central para formular otras preguntas como "¿Dónde más podría existir la vida?" y "¿Cómo buscamos la vida en otros lugares?". Aunque muchas de estas preguntas se abordan en todo el Primer de Astrobiología 3.0, este capítulo proporciona el contexto histórico para definir la vida, destaca las características conceptuales compartidas por toda la vida en la Tierra así como las características clave utilizadas para describirla, discute por qué es importante para la astrobiología y explora tanto los desafíos como las oportunidades para encontrar una definición operativa informativa.},
    url = "https://doi.org/10.1089/ast.2021.0116",
    doi = "10.1089/ast.2021.0116",
    openalex = "W4392930411",
    references = "doi101007s1108401909580x"
}