Genética ecológica

@misc{connell1970readings1,
    author = "Connell, J. H. y Mertz, D. B. y Murdoch, W. W",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics",
    year = "1970",
    howpublished = "New York, Harper and Row, 397 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Connell, J. H., Mertz, D. B., y Murdoch, W. W., 1970, Readings in Ecology and Ecological Genetics: New York, Harper and Row, 397 p.}"
}

Los dos artículos presentados aquí fueron preparados a solicitud del Comité Especial del Programa Biológico Internacional, como parte de un amplio programa sobre la ecología y el control natural de ácaros araña (Tetranychidae) a nivel mundial. La Parte I es una revisión de la literatura pertinente y una discusión sobre la biología y ecología de varios enemigos de los ácaros araña, su potencial como agentes de control biológico y los efectos de los pesticidas en sus poblaciones. La Parte II revisa la literatura relativa a la abundancia de tetránquidos y la evidencia que respalda varias hipótesis concernientes a sus poblaciones. Evalúa la acción de varios depredadores y discute posibles formas de implementar el control biológico. Un tercer artículo de esta serie (Parte III), por los mismos autores, revisará la literatura y discutirá el problema de los ácaros araña desde el punto de vista de su biología, ecología, estado de plaga y su relación con las plantas hospederas. Se espera que este artículo sea publicado pronto.

@article{doi103733hilgv40n11p331,
    author = "McMurtry, J. A. y Huffaker, C. B. y van de Vrie, M.",
    title = "Ecología de ácaros tetránquidos y sus enemigos naturales: Una revisión: I. Enemigos tetránquidos: Sus caracteres biológicos y el impacto de las prácticas de pulverización",
    year = "1970",
    journal = "Hilgardia",
    abstract = "Los dos artículos presentados aquí fueron preparados a solicitud del Comité Especial del Programa Biológico Internacional, como parte de un amplio programa sobre la ecología y el control natural de ácaros araña (Tetranychidae) a nivel mundial. La Parte I es una revisión de la literatura pertinente y una discusión sobre la biología y ecología de varios enemigos de los ácaros araña, su potencial como agentes de control biológico y los efectos de los pesticidas en sus poblaciones. La Parte II revisa la literatura relativa a la abundancia de tetránquidos y la evidencia que respalda varias hipótesis concernientes a sus poblaciones. Evalúa la acción de varios depredadores y discute posibles formas de implementar el control biológico. Un tercer artículo de esta serie (Parte III), por los mismos autores, revisará la literatura y discutirá el problema de los ácaros araña desde el punto de vista de su biología, ecología, estado de plaga y su relación con las plantas hospederas. Se espera que este artículo sea publicado pronto.",
    url = "https://doi.org/10.3733/hilg.v40n11p331",
    doi = "10.3733/hilg.v40n11p331",
    openalex = "W2324497467"
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Los dos artículos presentados aquí fueron preparados a solicitud del Comité Especial del Programa Biológico Internacional, como parte de un amplio programa sobre la ecología y el control natural de ácaros araña (Tetranychidae) a nivel mundial. La Parte I es una revisión de la literatura pertinente y una discusión sobre la biología y ecología de varios enemigos de los ácaros araña, su potencial como agentes de control biológico y los efectos de los pesticidas en sus poblaciones. La Parte II revisa la literatura relativa a la abundancia de tetránquidos y la evidencia que respalda varias hipótesis concernientes a sus poblaciones. Evalúa la acción de varios depredadores y discute posibles formas de implementar el control biológico. Un tercer artículo de esta serie (Parte III), por los mismos autores, revisará la literatura y discutirá el problema de los ácaros araña desde el punto de vista de su biología, ecología, estado de plaga y su relación con las plantas hospederas. Se espera que este artículo sea publicado pronto.

@article{doi103733hilgv40n11p391,
    author = "Huffaker, C. B. y van de Vrie, M. y McMurtry, J. A.",
    title = "Ecología de ácaros tetránquidos y sus enemigos naturales: Una revisión: II. Poblaciones de tetránquidos y su posible control por depredadores: Una evaluación",
    year = "1970",
    journal = "Hilgardia",
    abstract = "Los dos artículos presentados aquí fueron preparados a solicitud del Comité Especial del Programa Biológico Internacional, como parte de un amplio programa sobre la ecología y el control natural de ácaros araña (Tetranychidae) a nivel mundial. La Parte I es una revisión de la literatura pertinente y una discusión sobre la biología y ecología de varios enemigos de los ácaros araña, su potencial como agentes de control biológico y los efectos de los pesticidas en sus poblaciones. La Parte II revisa la literatura relativa a la abundancia de tetránquidos y la evidencia que respalda varias hipótesis concernientes a sus poblaciones. Evalúa la acción de varios depredadores y discute posibles formas de implementar el control biológico. Un tercer artículo de esta serie (Parte III), por los mismos autores, revisará la literatura y discutirá el problema de los ácaros araña desde el punto de vista de su biología, ecología, estado de plaga y su relación con las plantas hospederas. Se espera que este artículo sea publicado pronto.",
    url = "https://doi.org/10.3733/hilg.v40n11p391",
    doi = "10.3733/hilg.v40n11p391",
    openalex = "W2073176131"
}

Introducción a la teoría de la genética de poblaciones, Introducción a la teoría de la genética de poblaciones, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@book{openalexw2062594085,
    author = "Crow, James F. y Kimura, Makoto",
    title = "Introducción a la teoría de la genética de poblaciones",
    year = "1970",
    abstract = "Introducción a la teoría de la genética de poblaciones, Introducción a la teoría de la genética de poblaciones, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    openalex = "W2062594085"
}

@book{openalexw580562315,
    author = "Connell, Joseph H. y Mertz, David B. y Murdoch, William W.",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics",
    year = "1970",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    url = "https://openalex.org/W580562315",
    openalex = "W580562315"
}

@article{gilbert1971readings,
    author = "Gilbert, Edward E.",
    title = "Readings in Ecology and Ecological Genetics. Joseph H. Connell, David B. Mertz, William W. Murdoch",
    year = "1971",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/406801",
    doi = "10.1086/406801",
    number = "1",
    openalex = "W2513664272",
    pages = "92-93",
    volume = "46"
}

Numerosos insectos y otros artrópodos colonizan y se reproducen en entornos alterados y creados por el hombre. Esto es particularmente evidente en áreas Juban. El grado en que estos organismos explotan los entornos urbanos solo ha sido recientemente apreciado. Nuestra ignorancia en este ámbito puede atribuirse, en gran parte, a la escasez general de estudios ecológicos relevantes. El propósito de esta revisión es evaluar y sintetizar información importante para comprender las bases ecológicas de la reproducción y supervivencia de insectos (y en menor medida otros artrópodos) en entornos urbanos. Más específicamente, enfatizamos la necesidad de evaluar dos componentes principales del entorno del insecto: los recursos necesarios para la supervivencia y la influencia omnipresente del hombre. Se analizan estudios de casos poblacionales, comunitarios y evolutivos dentro de este marco conceptual. Se presta especial consideración a los estudios comparativos en más de un hábitat. Finalmente, se ofrecen sugerencias para futuros estudios sobre preguntas básicas y aplicadas en entomología urbana. La información sobre insectos en entornos urbanos está dispersa en toda la literatura agrícola y biológica. Esto no es sorprendente, ya que la mayor parte de la información ha sido recopilada por especialistas en una amplia variedad de campos. Ejemplos de estos campos y estudios representativos incluyen: ciencias ecológicas y ambientales (56, 64, 81, 92, 117, 118, 137, 138, 159, 165, 166), genética de poblaciones y biología evolutiva (14, 17, 18,36,38-41,75,99, 151), identificación y control general de plagas (43, 72, 150), control biológico e integrado (91, 107, 108, 121, 122), entomología forestal (25, 50, 51, 71, 91, 103, 130), fitopatología (53, 143), entomología médica (61, 85, 99, 124, 149, 157), entomología de productos almacenados (10, 19,49, 70, 88, 102, 168, 174) y toxicología de insecticidas (16).

@article{doi101146annureven23010178002055,
    author = "Frankie, Gordon W. y Ehler, L. E.",
    title = "Ecología de insectos en entornos urbanos",
    year = "1978",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Numerosos insectos y otros artrópodos colonizan y se reproducen en entornos alterados y creados por el hombre. Esto es particularmente evidente en áreas Juban. El grado en que estos organismos explotan los entornos urbanos solo ha sido recientemente apreciado. Nuestra ignorancia en este ámbito puede atribuirse, en gran parte, a la escasez general de estudios ecológicos relevantes. El propósito de esta revisión es evaluar y sintetizar información importante para comprender las bases ecológicas de la reproducción y supervivencia de insectos (y en menor medida otros artrópodos) en entornos urbanos. Más específicamente, enfatizamos la necesidad de evaluar dos componentes principales del entorno del insecto: los recursos necesarios para la supervivencia y la influencia omnipresente del hombre. Se analizan estudios de casos poblacionales, comunitarios y evolutivos dentro de este marco conceptual. Se presta especial consideración a los estudios comparativos en más de un hábitat. Finalmente, se ofrecen sugerencias para futuros estudios sobre preguntas básicas y aplicadas en entomología urbana. La información sobre insectos en entornos urbanos está dispersa en toda la literatura agrícola y biológica. Esto no es sorprendente, ya que la mayor parte de la información ha sido recopilada por especialistas en una amplia variedad de campos. Ejemplos de estos campos y estudios representativos incluyen: ciencias ecológicas y ambientales (56, 64, 81, 92, 117, 118, 137, 138, 159, 165, 166), genética de poblaciones y biología evolutiva (14, 17, 18,36,38-41,75,99, 151), identificación y control general de plagas (43, 72, 150), control biológico e integrado (91, 107, 108, 121, 122), entomología forestal (25, 50, 51, 71, 91, 103, 130), fitopatología (53, 143), entomología médica (61, 85, 99, 124, 149, 157), entomología de productos almacenados (10, 19,49, 70, 88, 102, 168, 174) y toxicología de insecticidas (16).",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.en.23.010178.002055",
    doi = "10.1146/annurev.en.23.010178.002055",
    openalex = "W2140087242",
    references = "doi101111j155856461972tb00186x"
}

Métodos ecológicos: con referencia particular al estudio de poblaciones de insectos, Métodos ecológicos: con referencia particular al estudio de poblaciones de insectos, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023071936977,
    author = "Smith, Paul E. y Southwood, T. R. E.",
    title = "Métodos ecológicos con referencia particular al estudio de poblaciones de insectos",
    year = "1979",
    journal = "Ecología",
    abstract = "Métodos ecológicos: con referencia particular al estudio de poblaciones de insectos, Métodos ecológicos: con referencia particular al estudio de poblaciones de insectos, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/1936977",
    doi = "10.2307/1936977",
    openalex = "W2111703506"
}

Parte 1 Constitución genética de una población: equilibrio de Hardy-Weinberg. Parte 2 Cambios en la frecuencia génica: migración mutación. Parte 3 Poblaciones pequeñas - cambios en la frecuencia génica bajo condiciones simplificadas. Parte 4 Poblaciones pequeñas - condiciones menos simplificadas. Parte 5 Poblaciones pequeñas - poblaciones con linaje y consanguinidad cercana. Parte 6 Variación continua. Parte 7 Valores y medias. Parte 8 Varianza. Parte 9 Similitud entre parientes. Parte 10 Heredabilidad. Parte 11 Selección - la respuesta y su predicción. Parte 12 Selección - los resultados de los experimentos. Parte 13 Selección - información de parientes. Parte 14 Consanguinidad y cruzamiento - cambios en el valor medio. Parte 15 Consanguinidad y cruzamiento - cambios en la varianza. Parte 16 Consanguinidad y cruzamiento - aplicaciones. Parte 17 Escala. Parte 18 Caracteres umbral. Parte 19 Caracteres correlacionados. Parte 20 Caracteres métricos bajo selección natural.

@article{doi1023072529912,
    author = "Edwards, A. W. F. y Falconer, D. S.",
    title = "Introducción a la genética cuantitativa.",
    year = "1982",
    journal = "Biometría",
    abstract = "Parte 1 Constitución genética de una población: equilibrio de Hardy-Weinberg. Parte 2 Cambios en la frecuencia génica: migración mutación. Parte 3 Poblaciones pequeñas - cambios en la frecuencia génica bajo condiciones simplificadas. Parte 4 Poblaciones pequeñas - condiciones menos simplificadas. Parte 5 Poblaciones pequeñas - poblaciones con linaje y consanguinidad cercana. Parte 6 Variación continua. Parte 7 Valores y medias. Parte 8 Varianza. Parte 9 Similitud entre parientes. Parte 10 Heredabilidad. Parte 11 Selección - la respuesta y su predicción. Parte 12 Selección - los resultados de los experimentos. Parte 13 Selección - información de parientes. Parte 14 Consanguinidad y cruzamiento - cambios en el valor medio. Parte 15 Consanguinidad y cruzamiento - cambios en la varianza. Parte 16 Consanguinidad y cruzamiento - aplicaciones. Parte 17 Escala. Parte 18 Caracteres umbral. Parte 19 Caracteres correlacionados. Parte 20 Caracteres métricos bajo selección natural.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2529912",
    doi = "10.2307/2529912",
    openalex = "W2141088880"
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L. Margolis, G. W. Esch, J. C. Holmes, A. M. Kuris, G. A. Schad, El uso de términos ecológicos en parasitología (Informe de un comité ad hoc de la Sociedad Americana de Parasitólogos), The Journal of Parasitology, Vol. 68, No. 1 (Feb., 1982), pp. 131-133

@article{doi1023073281335,
    author = "Margolis, Leo y Esch, G. W. y Holmes, John C. y Kuris, Armand M. y Schad, G. A.",
    title = "El uso de términos ecológicos en parasitología (Informe de un comité ad hoc de la Sociedad Americana de Parasitólogos)",
    year = "1982",
    journal = "Journal of Parasitology",
    abstract = "L. Margolis, G. W. Esch, J. C. Holmes, A. M. Kuris, G. A. Schad, El uso de términos ecológicos en parasitología (Informe de un comité ad hoc de la Sociedad Americana de Parasitólogos), The Journal of Parasitology, Vol. 68, No. 1 (Feb., 1982), pp. 131-133",
    url = "https://doi.org/10.2307/3281335",
    doi = "10.2307/3281335",
    openalex = "W2059029412"
}

La Cuarta Edición de Genética de Poblaciones es la introducción más actual, completa y accesible al campo para estudiantes de pregrado y posgrado avanzados, y para investigadores en genética, evolución, conservación y campos relacionados. En los últimos años, el interés en la aplicación de los principios de la genética de poblaciones a nuevos datos moleculares ha aumentado considerablemente, y la nueva edición del Dr. Hedrick ejemplifica su compromiso de mantenerse al día con este área dinámica de estudio. Reorganizada para permitir que los estudiantes se enfoquen más claramente en el material clave, la Cuarta Edición integra la cobertura de cuestiones teóricas con una presentación clara de la genética de poblaciones experimental y datos empíricos. Tomando ejemplos de estudios recientes y clásicos, y utilizando una variedad de organismos para ilustrar los vastos desarrollos de la genética de poblaciones, este texto proporciona a los estudiantes e investigadores el recurso más completo en el campo.

@book{openalexw1495050269,
    author = "Hedrick, Philip W.",
    title = "Genética de poblaciones",
    year = "1983",
    abstract = "La Cuarta Edición de Genética de Poblaciones es la introducción más actual, completa y accesible al campo para estudiantes de pregrado y posgrado avanzados, y para investigadores en genética, evolución, conservación y campos relacionados. En los últimos años, el interés en la aplicación de los principios de la genética de poblaciones a nuevos datos moleculares ha aumentado considerablemente, y la nueva edición del Dr. Hedrick ejemplifica su compromiso de mantenerse al día con este área dinámica de estudio. Reorganizada para permitir que los estudiantes se enfoquen más claramente en el material clave, la Cuarta Edición integra la cobertura de cuestiones teóricas con una presentación clara de la genética de poblaciones experimental y datos empíricos. Tomando ejemplos de estudios recientes y clásicos, y utilizando una variedad de organismos para ilustrar los vastos desarrollos de la genética de poblaciones, este texto proporciona a los estudiantes e investigadores el recurso más completo en el campo.",
    openalex = "W1495050269"
}

Muchos análisis empíricos de las tácticas de la historia de la vida se basan en la suposición de que la variación demográfica debería ser mayor entre poblaciones o especies que viven en diferentes entornos. Sin embargo, en una sola población del ascidio colonial sésil Botryllus schlosseri, existen dos morfotipos discretos de historia de la vida. Las colonias semíparas se caracterizan por a) muerte inmediatamente después de la producción de un solo lote, b) edad temprana en la primera reproducción, c) crecimiento rápido hasta la primera reproducción y d) alto esfuerzo reproductivo. En contraste, las colonias iteroparas a) producen al menos tres lotes antes de morir, b) posponen la reproducción sexual hasta que son casi el doble de edad que las colonias semíparas, c) crecen a aproximadamente la mitad de la tasa de las colonias semíparas y d) invierten aproximadamente un 75% menos en el esfuerzo reproductivo que las colonias semíparas. Las colonias semíparas dominan numéricamente la población hasta mediados del verano; más tarde en el verano, las colonias iteroparas son las más numerosas. Experimentos de campo y de laboratorio en jardín común, junto con estudios de cría, indican que las diferencias demográficas entre los morfotipos están genéticamente determinadas. En consecuencia, el cambio estacional de la dominancia por parte de las colonias semíparas a la dominancia por parte de las colonias iteroparas puede ser una respuesta evolucionada a un entorno que cambia estacionalmente. Por razones teóricas, se cree que la variación temporal en la selección juega un papel relativamente poco importante en el mantenimiento del polimorfismo genético; sin embargo, el polimorfismo de la historia de la vida recurrente estacionalmente mostrado en este estudio indica que la variación temporal en la selección puede conducir al mantenimiento del polimorfismo genético para rasgos que afectan fuertemente la aptitud.

@article{doi101111j155856461988tb02510x,
    author = "Grosberg, Richard K.",
    title = "VARIACIÓN EN LA HISTORIA DE LA VIDA DENTRO DE UNA POBLACIÓN DEL ASCIDIA COLONIAL BOTRYLLUS SCHLOSSERI. I. EL CONTROL GENÉTICO Y AMBIENTAL DE LA VARIACIÓN ESTACIONAL",
    year = "1988",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Muchos análisis empíricos de las tácticas de la historia de la vida se basan en la suposición de que la variación demográfica debería ser mayor entre poblaciones o especies que viven en diferentes entornos. Sin embargo, en una sola población del ascidio colonial sésil Botryllus schlosseri, existen dos morfotipos discretos de historia de la vida. Las colonias semíparas se caracterizan por a) muerte inmediatamente después de la producción de un solo lote, b) edad temprana en la primera reproducción, c) crecimiento rápido hasta la primera reproducción y d) alto esfuerzo reproductivo. En contraste, las colonias iteroparas a) producen al menos tres lotes antes de morir, b) posponen la reproducción sexual hasta que son casi el doble de edad que las colonias semíparas, c) crecen a aproximadamente la mitad de la tasa de las colonias semíparas y d) invierten aproximadamente un 75% menos en el esfuerzo reproductivo que las colonias semíparas. Las colonias semíparas dominan numéricamente la población hasta mediados del verano; más tarde en el verano, las colonias iteroparas son las más numerosas. Experimentos de campo y de laboratorio en jardín común, junto con estudios de cría, indican que las diferencias demográficas entre los morfotipos están genéticamente determinadas. En consecuencia, el cambio estacional de la dominancia por parte de las colonias semíparas a la dominancia por parte de las colonias iteroparas puede ser una respuesta evolucionada a un entorno que cambia estacionalmente. Por razones teóricas, se cree que la variación temporal en la selección juega un papel relativamente poco importante en el mantenimiento del polimorfismo genético; sin embargo, el polimorfismo de la historia de la vida recurrente estacionalmente mostrado en este estudio indica que la variación temporal en la selección puede conducir al mantenimiento del polimorfismo genético para rasgos que afectan fuertemente la aptitud.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1988.tb02510.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1988.tb02510.x",
    openalex = "W2312721243",
    references = "doi10103711774000, doi101086409052, doi101146annureves08110177001045, doi1023071419292, doi1023071605, doi1023071936778, doi1023072402622, doi1023072529912, openalexw1495050269, openalexw2077454220, openalexw580562315"
}

Actualmente existe una buena comprensión teórica de la evolución de la historia de vida, y se han construido modelos explícitos de optimidad detallados. Estos plantean un desafío para el trabajo empírico que examina algunas de las suposiciones, como la magnitud y los mecanismos de los costos del crecimiento y la reproducción. Además, existe una necesidad obvia de pruebas comparativas de los modelos. Estas pruebas, aplicadas correctamente, pueden ser particularmente informativas porque pueden abordar múltiples variables independientes, incluidas las variables ecológicas, y pueden revelar tendencias generales frente a un fondo de restricciones sobre los óptimos y la tasa de aproximación evolutiva a ellos. Las historias de vida son las probabilidades de supervivencia y las tasas de reproducción en cada edad durante la vida. La reproducción es costosa, por lo que la fertilidad en todas las edades no puede maximizarse simultáneamente por la selección natural. La asignación del esfuerzo reproductivo ha evolucionado en respuesta al impacto demográfico de diferentes entornos, pero está restringida por la varianza genética y la historia evolutiva.

@article{doi101126science24148721449,
    author = "Partridge, Linda y Harvey, Paul",
    title = "El Contexto Ecológico de la Evolución de la Historia de Vida",
    year = "1988",
    journal = "Science",
    abstract = "Actualmente existe una buena comprensión teórica de la evolución de la historia de vida, y se han construido modelos explícitos de optimidad detallados. Estos plantean un desafío para el trabajo empírico que examina algunas de las suposiciones, como la magnitud y los mecanismos de los costos del crecimiento y la reproducción. Además, existe una necesidad obvia de pruebas comparativas de los modelos. Estas pruebas, aplicadas correctamente, pueden ser particularmente informativas porque pueden abordar múltiples variables independientes, incluidas las variables ecológicas, y pueden revelar tendencias generales frente a un fondo de restricciones sobre los óptimos y la tasa de aproximación evolutiva a ellos. Las historias de vida son las probabilidades de supervivencia y las tasas de reproducción en cada edad durante la vida. La reproducción es costosa, por lo que la fertilidad en todas las edades no puede maximizarse simultáneamente por la selección natural. La asignación del esfuerzo reproductivo ha evolucionado en respuesta al impacto demográfico de diferentes entornos, pero está restringida por la varianza genética y la historia evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.241.4872.1449",
    doi = "10.1126/science.241.4872.1449",
    openalex = "W1974377563",
    references = "doi101007bf00378945, doi1010160040580974900537, doi101146annureves15110184002235"
}

Se describe un nuevo método para estimar el parentesco genético a partir de marcadores genéticos como polimorfismos de proteínas. Se basa en el coeficiente de parentesco de Grafen (1985) y se interpreta más fácilmente en términos de identidad por descendencia que como una regresión genética. Tiene varias ventajas sobre los métodos actualmente en uso: elimina un sesgo a la baja para tamaños de muestra pequeños; mejora la estimación del parentesco para subconjuntos de muestras de población; y permite estimar el parentesco para un solo grupo o para un solo par de individuos. Las estimaciones individuales de parentesco tienden a ser altamente variables, pero, en conjunto, pueden seguir siendo muy útiles como datos para pruebas no paramétricas. Tales pruebas permiten probar diferencias en parentesco entre dos muestras o correlacionar valores individuales de parentesco con otra variable.

@article{doi101111j155856461989tb04226x,
    author = "Queller, David C. y Goodnight, Keith F.",
    title = "ESTIMANDO PARENTESCO UTILIZANDO MARCADORES GENÉTICOS",
    year = "1989",
    journal = "Evolución",
    abstract = "Se describe un nuevo método para estimar el parentesco genético a partir de marcadores genéticos como polimorfismos de proteínas. Se basa en el coeficiente de parentesco de Grafen (1985) y se interpreta más fácilmente en términos de identidad por descendencia que como una regresión genética. Tiene varias ventajas sobre los métodos actualmente en uso: elimina un sesgo a la baja para tamaños de muestra pequeños; mejora la estimación del parentesco para subconjuntos de muestras de población; y permite estimar el parentesco para un solo grupo o para un solo par de individuos. Las estimaciones individuales de parentesco tienden a ser altamente variables, pero, en conjunto, pueden seguir siendo muy útiles como datos para pruebas no paramétricas. Tales pruebas permiten probar diferencias en parentesco entre dos muestras o correlacionar valores individuales de parentesco con otra variable.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1989.tb04226.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1989.tb04226.x",
    openalex = "W1973214225",
    references = "doi1010160022519364900396, doi101073pnas721143"
}

@article{doi101007bf00328407,
    author = "Rice, Kevin J. y Mack, Richard N.",
    title = "Genética ecológica de Bromus tectorum",
    year = "1991",
    journal = "Oecologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00328407",
    doi = "10.1007/bf00328407",
    openalex = "W2086094837"
}

Parte 1 Selección natural e historias de vida: modelos evolutivos en ecología del comportamiento evolución de las historias de vida ecología del comportamiento humano. Parte 2 Explotación de recursos: toma de decisiones competencia por recursos interacciones entre depredadores y presas. Parte 3 Selección sexual y estrategias reproductivas: selección sexual inversión parental sistemas de apareamiento. Parte 4 Cooperación y conflicto: crianza cooperativa en aves y mamíferos conflicto y cooperación en insectos comunicación.

@article{doi1023075530,
    author = "Adams, Jonathan y Krebs, J. R. y Davies, N. B.",
    title = "Ecología del comportamiento: un enfoque evolutivo",
    year = "1992",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Parte 1 Selección natural e historias de vida: modelos evolutivos en ecología del comportamiento evolución de las historias de vida ecología del comportamiento humano. Parte 2 Explotación de recursos: toma de decisiones competencia por recursos interacciones entre depredadores y presas. Parte 3 Selección sexual y estrategias reproductivas: selección sexual inversión parental sistemas de apareamiento. Parte 4 Cooperación y conflicto: crianza cooperativa en aves y mamíferos conflicto y cooperación en insectos comunicación.",
    url = "https://doi.org/10.2307/5530",
    doi = "10.2307/5530",
    openalex = "W2136284908"
}

Para lograr una teoría evolutiva coherente, es necesario tener en cuenta los efectos del entorno sobre el proceso de desarrollo. La plasticidad fenotípica es el cambio en el fenotipo expresado de un genotipo como función del entorno. Existen diversas medidas de plasticidad, muchas de las cuales pueden unificarse dentro del marco de una función polinómica. Esta función es la norma de reacción. Para el caso especial de una norma de reacción lineal, la variación genética puede dividirse en porciones que son independientes y dependientes del entorno. A partir de esta división se derivan dos medidas de heredabilidad que pueden usarse, alternativamente, para comparar poblaciones o hacer predicciones sobre la respuesta a la selección. Genéticamente, la plasticidad probablemente se debe tanto a diferencias en la expresión alélica entre entornos como a cambios en las interacciones entre loci; la plasticidad no es una función de la heterocigosidad. La plasticidad responde tanto a la selección artificial como a la selección natural. La evolución de la plasticidad se modela de tres maneras: modelos de optimalidad, modelos genéticos cuantitativos y modelos gaméticos. Todos los modelos hacen predicciones similares sobre las condiciones que favorecerán la plasticidad. Se necesita más desarrollo en la extensión de los modelos genéticos cuantitativos y los modelos de poblaciones estructuradas; también se necesitan datos sobre las formas verdaderas de las normas de reacción y la variación genética y la covariación para los parámetros de normas de reacción no lineales y múltiples entornos.

@article{doi101146annureves24110193000343,
    author = "Scheiner, Samuel M.",
    title = "Genética y evolución de la plasticidad fenotípica",
    year = "1993",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Para lograr una teoría evolutiva coherente, es necesario tener en cuenta los efectos del entorno sobre el proceso de desarrollo. La plasticidad fenotípica es el cambio en el fenotipo expresado de un genotipo como función del entorno. Existen diversas medidas de plasticidad, muchas de las cuales pueden unificarse dentro del marco de una función polinómica. Esta función es la norma de reacción. Para el caso especial de una norma de reacción lineal, la variación genética puede dividirse en porciones que son independientes y dependientes del entorno. A partir de esta división se derivan dos medidas de heredabilidad que pueden usarse, alternativamente, para comparar poblaciones o hacer predicciones sobre la respuesta a la selección. Genéticamente, la plasticidad probablemente se debe tanto a diferencias en la expresión alélica entre entornos como a cambios en las interacciones entre loci; la plasticidad no es una función de la heterocigosidad. La plasticidad responde tanto a la selección artificial como a la selección natural. La evolución de la plasticidad se modela de tres maneras: modelos de optimalidad, modelos genéticos cuantitativos y modelos gaméticos. Todos los modelos hacen predicciones similares sobre las condiciones que favorecerán la plasticidad. Se necesita más desarrollo en la extensión de los modelos genéticos cuantitativos y los modelos de poblaciones estructuradas; también se necesitan datos sobre las formas verdaderas de las normas de reacción y la variación genética y la covariación para los parámetros de normas de reacción no lineales y múltiples entornos.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.24.110193.000343",
    doi = "10.1146/annurev.es.24.110193.000343",
    openalex = "W2134835006",
    references = "doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101111j155856461985tb00391x, doi1023072389364, doi1023075403"
}

Artículo de Revista GENEPOP (Versión 1.2): Software de Genética de Poblaciones para Pruebas Exactas y Ecumenicismo Obtener acceso M. Raymond, M. Raymond Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic PubMed Google Scholar F. Rousset F. Rousset Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic PubMed Google Scholar Journal of Heredity, Volumen 86, Número 3, Mayo 1995, Páginas 248–249, https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573 Publicado: 01 Mayo 1995 Historial del artículo Recibido: 28 Marzo 1994 Aceptado: 04 Octubre 1994 Publicado: 01 Mayo 1995

@article{doi101093oxfordjournalsjhereda111573,
    author = "Raymond, Michel y Rousset, François",
    title = "GENEPOP (Versión 1.2): Software de Genética de Poblaciones para Pruebas Exactas y Ecumenicismo",
    year = "1995",
    journal = "Journal of Heredity",
    abstract = "Artículo de Revista GENEPOP (Versión 1.2): Software de Genética de Poblaciones para Pruebas Exactas y Ecumenicismo Obtener acceso M. Raymond, M. Raymond Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic PubMed Google Scholar F. Rousset F. Rousset Institut des Sciences de l'Evolution, URA CNRS 327, Laboratoire de Genetique et Environnement, Universite de Montpellier II (CC 065)Place E. Bataillon, 34095 Montpellier cedex 05, France Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic PubMed Google Scholar Journal of Heredity, Volumen 86, Número 3, Mayo 1995, Páginas 248–249, https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573 Publicado: 01 Mayo 1995 Historial del artículo Recibido: 28 Marzo 1994 Aceptado: 04 Octubre 1994 Publicado: 01 Mayo 1995",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.jhered.a111573",
    openalex = "W2253414912"
}

Resumen Los peces teleósteos (de esqueleto óseo) representan el grupo taxonómico más abundante de vertebrados. Se encuentran en todos los tipos concebibles de ambientes acuáticos y son extremadamente diversos en cuanto a su comportamiento. Su éxito evolutivo como grupo taxonómico se debe en parte a su notable plasticidad conductual. Por lo tanto, también son organismos extremadamente útiles para probar modelos mecanísticos y funcionales del comportamiento. En la última década se ha logrado un considerable progreso en la comprensión de cómo el comportamiento, la ecología y la genética interactúan para determinar la supervivencia individual y el éxito reproductivo en los peces, y por lo tanto la evolución de su comportamiento. Ecología del comportamiento de los peces teleósteos revisa los últimos avances en adaptaciones conductuales para la supervivencia y la reproducción en peces, y propone nuevas direcciones y enfoques para la investigación futura. El libro se centra en las estrategias y tácticas conductuales de selección de hábitat y uso del espacio, alimentación, evitación y escape de depredadores, y reproducción. También considera cómo el comportamiento de los individuos afecta los procesos ecológicos a nivel de población y comunidad. El texto beneficiará a todos aquellos con un interés general en la ecología del comportamiento, y será lectura obligatoria para estudiantes, profesores e investigadores interesados en el comportamiento y la ecología de los peces. También será una valiosa fuente de referencia para biólogos, acuicultores y conservacionistas.

@book{doi101093oso97801985478460010001,
    author = "Godin, Jean‐Guy J.",
    title = "Ecología del comportamiento de los peces teleósteos",
    year = "1997",
    abstract = "Resumen Los peces teleósteos (de esqueleto óseo) representan el grupo taxonómico más abundante de vertebrados. Se encuentran en todos los tipos concebibles de ambientes acuáticos y son extremadamente diversos en cuanto a su comportamiento. Su éxito evolutivo como grupo taxonómico se debe en parte a su notable plasticidad conductual. Por lo tanto, también son organismos extremadamente útiles para probar modelos mecanísticos y funcionales del comportamiento. En la última década se ha logrado un considerable progreso en la comprensión de cómo el comportamiento, la ecología y la genética interactúan para determinar la supervivencia individual y el éxito reproductivo en los peces, y por lo tanto la evolución de su comportamiento. Ecología del comportamiento de los peces teleósteos revisa los últimos avances en adaptaciones conductuales para la supervivencia y la reproducción en peces, y propone nuevas direcciones y enfoques para la investigación futura. El libro se centra en las estrategias y tácticas conductuales de selección de hábitat y uso del espacio, alimentación, evitación y escape de depredadores, y reproducción. También considera cómo el comportamiento de los individuos afecta los procesos ecológicos a nivel de población y comunidad. El texto beneficiará a todos aquellos con un interés general en la ecología del comportamiento, y será lectura obligatoria para estudiantes, profesores e investigadores interesados en el comportamiento y la ecología de los peces. También será una valiosa fuente de referencia para biólogos, acuicultores y conservacionistas.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198547846.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198547846.001.0001",
    openalex = "W1925505063"
}

Aphis gossypii Glover es una plaga destructiva de más de dos docenas de cultivos en todo el mundo. El daño a algunos de estos cultivos se debe a la alimentación directa, pero para la mayoría de estos cultivos su impacto es a través de su papel como vector de virus. Como cabía esperar, esto ha resultado en muchos artículos que tratan sobre métodos de control de este insecto. El pulgón tiene la capacidad de volverse resistente a muchos pesticidas y existe una creciente preocupación por los impactos ambientales del uso de pesticidas. Como resultado, la manipulación del agroecosistema jugará un papel cada vez más importante en la gestión de este insecto. La mayoría de los aspectos de la biología de este pulgón se abordan en esta revisión. El tema recurrente se centra en la importancia de las influencias de la planta hospedadora en la biología del pulgón. Además de examinar la literatura sobre la biología del pulgón, una gran sección está dedicada a qué influye en la mortalidad del pulgón y a los virus transmitidos por el pulgón que se propagan a través de este pulgón. Esta revisión cubre la literatura desde 1912 hasta 1995, pero se omitieron artículos sobre la gestión del pulgón (por ejemplo, eficacia de pesticidas, fecha de siembra) excepto donde traten sobre la biología o ecología del pulgón. La investigación sobre la biología de este pulgón se ha sesgado fuertemente hacia varias categorías dispares. Primero, la investigación se ha centrado en la influencia de la planta hospedadora y la temperatura en la tasa reproductiva de este pulgón. Segundo, la investigación se ha centrado en la causa de la producción de alatas, como el estrés nutricional, otros factores nutricionales, la hacinamiento y la temperatura. Tercero, la investigación se ha centrado en los patógenos transmitidos por este pulgón. Se destacan tres casos específicos: tristeza del cítrico, virus del mosaico del pepino y los potyvirus. Por último, la investigación se ha centrado en el papel de los que se alimentan de este pulgón. Debido a la complejidad de la investigación posible en este área, muy poca investigación ha explorado el efecto de estos organismos beneficiosos sobre los rasgos del ciclo de vida de este pulgón.

@article{openalexw1513341262,
    author = "Ebert, Timothy A. y Cartwright, B.",
    title = "Biología y ecología de Aphis gossypii glover (Homoptera: Aphididae)",
    year = "1997",
    journal = "Southwestern Entomologist",
    abstract = "Aphis gossypii Glover es una plaga destructiva de más de dos docenas de cultivos en todo el mundo. El daño a algunos de estos cultivos se debe a la alimentación directa, pero para la mayoría de estos cultivos su impacto es a través de su papel como vector de virus. Como cabía esperar, esto ha resultado en muchos artículos que tratan sobre métodos de control de este insecto. El pulgón tiene la capacidad de volverse resistente a muchos pesticidas y existe una creciente preocupación por los impactos ambientales del uso de pesticidas. Como resultado, la manipulación del agroecosistema jugará un papel cada vez más importante en la gestión de este insecto. La mayoría de los aspectos de la biología de este pulgón se abordan en esta revisión. El tema recurrente se centra en la importancia de las influencias de la planta hospedadora en la biología del pulgón. Además de examinar la literatura sobre la biología del pulgón, una gran sección está dedicada a qué influye en la mortalidad del pulgón y a los virus transmitidos por el pulgón que se propagan a través de este pulgón. Esta revisión cubre la literatura desde 1912 hasta 1995, pero se omitieron artículos sobre la gestión del pulgón (por ejemplo, eficacia de pesticidas, fecha de siembra) excepto donde traten sobre la biología o ecología del pulgón. La investigación sobre la biología de este pulgón se ha sesgado fuertemente hacia varias categorías dispares. Primero, la investigación se ha centrado en la influencia de la planta hospedadora y la temperatura en la tasa reproductiva de este pulgón. Segundo, la investigación se ha centrado en la causa de la producción de alatas, como el estrés nutricional, otros factores nutricionales, la hacinamiento y la temperatura. Tercero, la investigación se ha centrado en los patógenos transmitidos por este pulgón. Se destacan tres casos específicos: tristeza del cítrico, virus del mosaico del pepino y los potyvirus. Por último, la investigación se ha centrado en el papel de los que se alimentan de este pulgón. Debido a la complejidad de la investigación posible en este área, muy poca investigación ha explorado el efecto de estos organismos beneficiosos sobre los rasgos del ciclo de vida de este pulgón.",
    openalex = "W1513341262",
    references = "doi101111j157074581994tb01769x"
}

La identificación individual mediante muestreo no invasivo es de suma importancia en la genética de la conservación y en la ecología del comportamiento. Este enfoque permite estudios genéticos de animales salvajes sin necesidad de capturarlos, ni siquiera de observarlos. El material utilizado como fuente de ADN suele ser heces, pelos caídos o plumas caídas. Recientemente se ha demostrado que este material puede conducir a errores de genotipado, principalmente debido a la pérdida alélica. Además de estos errores técnicos, existen problemas para estimar con precisión la probabilidad de identidad (PI, o la probabilidad de que dos individuos tengan genotipos idénticos) debido a la presencia de parientes cercanos en poblaciones naturales. En consecuencia, antes de iniciar un estudio extenso que implique muestreo no invasivo, sugerimos encarecidamente realizar un estudio piloto para evaluar tanto las dificultades técnicas como la PI para los marcadores genéticos a utilizar. Este estudio piloto podría llevarse a cabo en tres pasos: (i) estimación de la PI utilizando datos genéticos preliminares; (ii) simulaciones que tengan en cuenta la PI y elijan la tasa de error técnico que sea lo suficientemente baja para evaluar la pregunta científica; (iii) experimentos de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para verificar si es técnicamente posible lograr esta tasa de error.

@article{doi101111j109583121999tb01157x,
    author = "Taberlet, Pierre and Luikart, Gordon",
    title = "Non-invasive genetic sampling and individual identification",
    year = "1999",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Individual identification via non-invasive sampling is of prime importance in conservation genetics and in behavioural ecology. This approach allows for genetics studies of wild animals without having to catch them, or even to observe them. The material used as a source of DNA is usually faeces, shed hairs, or shed feathers. It has been recendy shown that this material may lead to genotyping errors, mainly due to allelic dropout. In addition to these technical errors, there are problems with accurately estimating the probability of identity (PI, or the probability of two individuals having identical genotypes) because of the presence of close relatives in natural populations. As a consequence, before initiating an extensive study involving non-invasive sampling, we strongly suggest conducting a pilot study to assess both the technical difficulties and the PI for the genetic markers to be used. This pilot study could be carried out in three steps: (i) estimation of the PI using preliminary genetic data; (ii) simulations taking into account the PI and choosing the technical error rate mat is sufficiently low for assessing the scientific question; (iii) polymerase chain reaction (PCR) experiments to check if it is technically possible to achieve this error rate.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1999.tb01157.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1999.tb01157.x",
    openalex = "W2010722055"
}

@article{allen2002ecology,
    author = "Allen, Phil S. y Meyer, Susan E.",
    title = "Ecología y genética ecológica de la dormancia de semillas en el bromo lanoso",
    year = "2002",
    journal = "Weed Science",
    url = "https://doi.org/10.1614/0043-1745(2002)050[0241:eaegos]2.0.co;2",
    doi = "10.1614/0043-1745(2002)050[0241:eaegos]2.0.co;2",
    number = "2",
    openalex = "W2172657677",
    pages = "241-247",
    volume = "50",
    references = "doi10100797813490462709, doi101007bf00328407, doi101016000632079290659b, doi1010160304374681900275, doi101016s0065266008600486, doi10108007060660109506904, doi101093jxb376729, doi101104pp942840, doi101146annureves23110192000431, doi1016140043174520020500248aohttq20co2"
}

1. La ecología del paisaje se ocupa de la influencia de los patrones espaciales sobre los procesos ecológicos. Examina las consecuencias ecológicas de dónde se encuentran las cosas en el espacio, dónde se encuentran en relación con otras cosas, y cómo estas relaciones y sus consecuencias dependen de las características del mosaico del paisaje circundante a múltiples escalas en el tiempo y el espacio. Tradicionalmente, los ecólogos del paisaje han centrado su atención en los ecosistemas terrestres, y los ríos y arroyos han sido considerados ya sea como elementos de mosaicos de paisaje o como unidades vinculadas al paisaje terrestre mediante flujos a través de límites o ecotonos. Menos a menudo, la heterogeneidad que existe dentro de un río o arroyo ha sido vista como un `paisaje fluvial' en sí mismo. 2. La ecología del paisaje puede unificarse en torno a seis temas centrales: (1) los parches difieren en calidad, (2) los límites de los parches afectan los flujos, (3) el contexto del parche importa, (4) la conectividad es crítica, (5) los organismos son importantes, y (6) la importancia de la escala. Aunque los sistemas fluviales difieren de los sistemas terrestres por la fuerte fuerza física de la hidrología y la conectividad inherente proporcionada por el flujo de agua, todos estos temas se aplican igualmente a los ecosistemas acuáticos y terrestres, y a las vinculaciones entre ambos. 3. Por lo tanto, la ecología del paisaje puede ofrecer importantes perspectivas para el estudio de los ecosistemas fluviales, pero estos sistemas también pueden proporcionar excelentes oportunidades para desarrollar y probar la teoría de la ecología del paisaje. Los principios y enfoques de la ecología del paisaje deben extenderse para incluir los sistemas de agua dulce; es hora de sacar la `tierra' de la ecología del paisaje.

@article{doi101046j13652427200200887x,
    author = "Wiens, John A.",
    title = "Riverine landscapes: taking landscape ecology into the water",
    year = "2002",
    journal = "Freshwater Biology",
    abstract = "1. La ecología del paisaje se ocupa de la influencia de los patrones espaciales sobre los procesos ecológicos. Examina las consecuencias ecológicas de dónde se encuentran las cosas en el espacio, dónde se encuentran en relación con otras cosas, y cómo estas relaciones y sus consecuencias dependen de las características del mosaico del paisaje circundante a múltiples escalas en el tiempo y el espacio. Tradicionalmente, los ecólogos del paisaje han centrado su atención en los ecosistemas terrestres, y los ríos y arroyos han sido considerados ya sea como elementos de mosaicos de paisaje o como unidades vinculadas al paisaje terrestre mediante flujos a través de límites o ecotonos. Menos a menudo, la heterogeneidad que existe dentro de un río o arroyo ha sido vista como un `paisaje fluvial' en sí mismo. 2. La ecología del paisaje puede unificarse en torno a seis temas centrales: (1) los parches difieren en calidad, (2) los límites de los parches afectan los flujos, (3) el contexto del parche importa, (4) la conectividad es crítica, (5) los organismos son importantes, y (6) la importancia de la escala. Aunque los sistemas fluviales difieren de los sistemas terrestres por la fuerte fuerza física de la hidrología y la conectividad inherente proporcionada por el flujo de agua, todos estos temas se aplican igualmente a los ecosistemas acuáticos y terrestres, y a las vinculaciones entre ambos. 3. Por lo tanto, la ecología del paisaje puede ofrecer importantes perspectivas para el estudio de los ecosistemas fluviales, pero estos sistemas también pueden proporcionar excelentes oportunidades para desarrollar y probar la teoría de la ecología del paisaje. Los principios y enfoques de la ecología del paisaje deben extenderse para incluir los sistemas de agua dulce; es hora de sacar la `tierra' de la ecología del paisaje.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2427.2002.00887.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2427.2002.00887.x",
    openalex = "W2159194951"
}

El resumen de spag e d i versión 1.0 es un software diseñado principalmente para caracterizar la estructura genética espacial de individuos o poblaciones mapeadas utilizando datos de genotipos de marcadores codominantes. Calcula varias estadísticas que describen la parentesco genético o la diferenciación entre individuos o poblaciones mediante comparaciones por pares y prueba su significancia mediante muestreo numérico apropiado. spag e d i es útil para: (i) detectar el aislamiento por distancia dentro o entre poblaciones y estimar los parámetros de dispersión génica; (ii) evaluar el parentesco genético entre individuos y su varianza real, un parámetro de interés para las inferencias basadas en marcadores de la herencia cuantitativa; (iii) evaluar la diferenciación genética entre poblaciones, incluido el caso de haploides o autoploides.

@article{doi101046j14718286200200305x,
    author = "Hardy, Olivier J. y Vekemans, Xavier",
    title = "spag e d i: un programa informático versátil para analizar la estructura genética espacial a nivel individual o de poblaciones",
    year = "2002",
    journal = "Molecular Ecology Notes",
    abstract = "El resumen de spag e d i versión 1.0 es un software diseñado principalmente para caracterizar la estructura genética espacial de individuos o poblaciones mapeadas utilizando datos de genotipos de marcadores codominantes. Calcula varias estadísticas que describen el parentesco genético o la diferenciación entre individuos o poblaciones mediante comparaciones por pares y prueba su significancia mediante muestreo numérico apropiado. spag e d i es útil para: (i) detectar el aislamiento por distancia dentro o entre poblaciones y estimar los parámetros de dispersión génica; (ii) evaluar el parentesco genético entre individuos y su varianza real, un parámetro de interés para las inferencias basadas en marcadores de la herencia cuantitativa; (iii) evaluar la diferenciación genética entre poblaciones, incluido el caso de haploides o autoploides.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2002.00305.x",
    doi = "10.1046/j.1471-8286.2002.00305.x",
    openalex = "W2107356656",
    references = "doi101093genetics1391457, doi101093genetics893583, doi101093oxfordjournalsjhereda111573"
}

Estudiamos la estructura de las poblaciones humanas utilizando genotipos en 377 loci de microsatélites autosómicos en 1056 individuos de 52 poblaciones. Las diferencias dentro de la población entre individuos explican del 93 al 95% de la variación genética; las diferencias entre los grupos principales constituyen solo del 3 al 5%. No obstante, sin utilizar información previa sobre los orígenes de los individuos, identificamos seis grupos genéticos principales, cinco de los cuales corresponden a regiones geográficas principales, y subgrupos que a menudo corresponden a poblaciones individuales. El acuerdo general entre las poblaciones genéticas y predefinidas sugiere que la ascendencia autodeclarada puede facilitar la evaluación de riesgos epidemiológicos, pero no elimina la necesidad de utilizar información genética en estudios de asociación genética.

@article{doi101126science1078311,
    author = "Rosenberg, Noah A. y Pritchard, Jonathan K. y Weber, James L. y Cann, Howard M. y Kídd, Kenneth K. y Zhivotovsky, Lev A. y Feldman, Marcus W.",
    title = "Estructura genética de las poblaciones humanas",
    year = "2002",
    journal = "Science",
    abstract = "Estudiamos la estructura de las poblaciones humanas utilizando genotipos en 377 loci de microsatélites autosómicos en 1056 individuos de 52 poblaciones. Las diferencias dentro de la población entre individuos explican del 93 al 95% de la variación genética; las diferencias entre los grupos principales constituyen solo del 3 al 5%. No obstante, sin utilizar información previa sobre los orígenes de los individuos, identificamos seis grupos genéticos principales, cinco de los cuales corresponden a regiones geográficas principales, y subgrupos que a menudo corresponden a poblaciones individuales. El acuerdo general entre las poblaciones genéticas y predefinidas sugiere que la ascendencia autodeclarada puede facilitar la evaluación de riesgos epidemiológicos, pero no elimina la necesidad de utilizar información genética en estudios de asociación genética.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1078311",
    doi = "10.1126/science.1078311",
    openalex = "W2141042406",
    references = "doi101006tpbi20011543, doi101038368455a0, doi101038ng761, doi101073pnas9494516, doi101086302825, doi101086339929, doi101093genetics1552945, doi101093genetics1592699, doi101126science2965566261b, doi101186gb200237comment2007"
}

Los métodos de asignación genética utilizan probabilidades de genotipo para inferir dónde nacieron o no nacieron los individuos, lo que potencialmente permite estimaciones directas y en tiempo real de la dispersión. Utilizamos conjuntos de datos simulados para probar el poder y la precisión de los métodos de remuestreo de Monte Carlo en la generación de umbrales estadísticos para identificar inmigrantes F0 en poblaciones con flujo génico continuo, y por lo tanto para proporcionar estimaciones directas y en tiempo real de las tasas de migración. La identificación de valores críticos precisos requería que los métodos de remuestreo preservaran el desequilibrio de ligamiento derivado de generaciones recientes de inmigrantes y reflejaran la varianza de muestreo presente en el conjunto de datos que se estaba analizando. Se propuso un novedoso método de remuestreo de Monte Carlo que tiene en cuenta estos aspectos y se evaluó su eficiencia. El poder y el error fueron relativamente insensibles a la frecuencia asumida para los alelos faltantes. El poder para identificar inmigrantes F0 se mejoró utilizando un tamaño de muestra grande (hasta aproximadamente 50 individuos) y muestreando todas las poblaciones de las cuales podrían haber originado los migrantes. Una combinación de graficar probabilidades de genotipo y calcular razones medias de probabilidad de genotipo (DLR) pareció ser una manera efectiva de predecir si se podrían identificar inmigrantes F0 para un par particular de poblaciones utilizando un conjunto dado de marcadores.

@article{doi101046j1365294x200402008x,
    author = "Paetkau, David y Slade, Robert y Burden, Michael y Estoup, Arnaud",
    title = "Métodos de asignación genética para la estimación directa y en tiempo real de la tasa de migración: una exploración basada en simulaciones de la precisión y el poder",
    year = "2003",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Los métodos de asignación genética utilizan probabilidades de genotipo para inferir dónde nacieron o no nacieron los individuos, lo que potencialmente permite estimaciones directas y en tiempo real de la dispersión. Utilizamos conjuntos de datos simulados para probar el poder y la precisión de los métodos de remuestreo de Monte Carlo en la generación de umbrales estadísticos para identificar inmigrantes F0 en poblaciones con flujo génico continuo, y por lo tanto para proporcionar estimaciones directas y en tiempo real de las tasas de migración. La identificación de valores críticos precisos requería que los métodos de remuestreo preservaran el desequilibrio de ligamiento derivado de generaciones recientes de inmigrantes y reflejaran la varianza de muestreo presente en el conjunto de datos que se estaba analizando. Se propuso un novedoso método de remuestreo de Monte Carlo que tiene en cuenta estos aspectos y se evaluó su eficiencia. El poder y el error fueron relativamente insensibles a la frecuencia asumida para los alelos faltantes. El poder para identificar inmigrantes F0 se mejoró utilizando un tamaño de muestra grande (hasta aproximadamente 50 individuos) y muestreando todas las poblaciones de las cuales podrían haber originado los migrantes. Una combinación de graficar probabilidades de genotipo y calcular razones medias de probabilidad de genotipo (DLR) pareció ser una manera efectiva de predecir si se podrían identificar inmigrantes F0 para un par particular de poblaciones utilizando un conjunto dado de marcadores.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.2004.02008.x",
    doi = "10.1046/j.1365-294x.2004.02008.x",
    openalex = "W2152021152",
    references = "doi101017s0016672300012994, doi101073pnas94179197, doi10108001621459198310477973, doi101086282771, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16297, doi101093genetics16331177, doi101093genetics762379, doi101111j1365294x1995tb00227x, doi101111j1365294x200402396x, doi101111j155856461984tb05657x, doi101111j251761611995tb02031x"
}

Presentamos evidencia de que la variación genética heredable dentro de especies individuales, especialmente especies dominantes y clave, tiene consecuencias a nivel de comunidad y ecosistema. Estas consecuencias representan fenotipos extendidos, es decir, los efectos de los genes a niveles superiores a la población. Utilizando diversos ejemplos que van desde microbios hasta vertebrados, demostramos que el fenotipo extendido puede rastrearse desde los individuos que poseen el rasgo, hasta la comunidad, y hasta procesos de ecosistema como la descomposición de hojarasca y la mineralización de nitrógeno. En nuestro desarrollo de una perspectiva de genética de poblaciones, nos enfocamos en la variación genética intraspecífica porque los fenotipos extendidos de estos genes pueden transmitirse de una generación a la siguiente, lo que proporciona un mecanismo para la heredabilidad. En apoyo de esta visión, experimentos de jardín común utilizando cruces sintéticos de un árbol dominante muestran que sus descendientes tienden a sostener comunidades de artrópodos que se asemejan a las de sus padres. También argumentamos que las interacciones combinadas de fenotipos extendidos contribuyen a la varianza entre comunidades en los rasgos de los individuos dentro de las comunidades. Los factores genéticos subyacentes a esta varianza entre comunidades en la expresión de rasgos, particularmente aquellos que involucran interacciones genéticas entre especies, constituyen la heredabilidad de la comunidad. Estos hallazgos tienen diversas implicaciones. (1) Proporcionan un marco genético para comprender la estructura de la comunidad y los procesos de ecosistema. Los efectos de los fenotipos extendidos a estos niveles superiores no necesariamente son difusos; pueden ser directos o actuar en relativamente pocos pasos, lo que mejora nuestra capacidad para detectar y predecir sus efectos. (2) Desde una perspectiva de conservación, introducimos el concepto de población viable mínima interactiva (PVM), que representa el tamaño de una población necesario para mantener la diversidad genética a los niveles requeridos por otras especies interactuantes en la comunidad. (3) Las interacciones genotipo × ambiente en especies dominantes y clave pueden desplazar los fenotipos extendidos para tener consecuencias inesperadas a nivel de comunidad y ecosistema, un tema especialmente importante en relación con el cambio global. (4) Documentar la heredabilidad de la comunidad justifica una perspectiva de genética de comunidades y es un primer paso esencial para demostrar la evolución de la comunidad. (5) La genética de comunidades requiere y promueve un enfoque integrador, desde genes hasta ecosistemas, que es necesario para la unión de la ecología y la genética. Pocos estudios abarcan desde genes hasta ecosistemas, pero tal integración es probablemente esencial para comprender el mundo natural. Editor correspondiente: A. A. Agrawal

@article{doi1018900012965820030840559caegac20co2,
    author = "Whitham, Thomas G. and Young, William P. and Martinsen, Gregory D. and Gehring, Catherine A. and Schweitzer, Jennifer A. and Shuster, Stephen M. and Wimp, Gina M. and Fischer, Dylan G. and Bailey, Joseph K. and Lindroth, Richard L. and Woolbright, Scott A. and Kuske, Cheryl R.",
    title = "GENÉTICA DE COMUNIDADES Y ECOSISTEMAS: UNA CONSECUENCIA DEL FENOTIPO EXTENDIDO",
    year = "2003",
    journal = "Ecología",
    abstract = "Presentamos evidencia de que la variación genética heredable dentro de especies individuales, especialmente especies dominantes y clave, tiene consecuencias a nivel de comunidad y ecosistema. Estas consecuencias representan fenotipos extendidos, es decir, los efectos de los genes a niveles superiores a la población. Utilizando diversos ejemplos que van desde microbios hasta vertebrados, demostramos que el fenotipo extendido puede rastrearse desde los individuos que poseen el rasgo, hasta la comunidad, y hasta procesos de ecosistema como la descomposición de hojarasca y la mineralización de nitrógeno. En nuestro desarrollo de una perspectiva de genética de comunidades, nos enfocamos en la variación genética intraespecífica porque los fenotipos extendidos de estos genes pueden transmitirse de una generación a la siguiente, lo que proporciona un mecanismo para la heredabilidad. En apoyo de esta visión, experimentos de jardín común utilizando cruces sintéticas de un árbol dominante muestran que sus descendientes tienden a sostener comunidades de artrópodos que se asemejan a las de sus padres. También argumentamos que las interacciones combinadas de fenotipos extendidos contribuyen a la varianza entre comunidades en los rasgos de los individuos dentro de las comunidades. Los factores genéticos subyacentes a esta varianza entre comunidades en la expresión de rasgos, particularmente aquellos que involucran interacciones genéticas entre especies, constituyen la heredabilidad de la comunidad. Estos hallazgos tienen diversas implicaciones. (1) Proporcionan un marco genético para comprender la estructura de la comunidad y los procesos de ecosistema. Los efectos de los fenotipos extendidos a estos niveles superiores no necesariamente son difusos; pueden ser directos o actuar en relativamente pocos pasos, lo que mejora nuestra capacidad para detectar y predecir sus efectos. (2) Desde una perspectiva de conservación, introducimos el concepto de población viable mínima interactiva (PVM), que representa el tamaño de una población necesario para mantener la diversidad genética a los niveles requeridos por otras especies interactuantes en la comunidad. (3) Las interacciones genotipo × ambiente en especies dominantes y clave pueden desplazar los fenotipos extendidos para tener consecuencias inesperadas a nivel de comunidad y ecosistema, un asunto especialmente importante en relación con el cambio global. (4) Documentar la heredabilidad de la comunidad justifica una perspectiva de genética de comunidades y es un primer paso esencial para demostrar la evolución de la comunidad. (5) La genética de comunidades requiere y promueve un enfoque integrador, desde genes hasta ecosistemas, que es necesario para la unión de la ecología y la genética. Pocos estudios abarcan desde genes hasta ecosistemas, pero tal integración es probablemente esencial para comprender el mundo natural. Editor correspondiente: A. A. Agrawal",
    url = "https://doi.org/10.1890/0012-9658(2003)084[0559:caegac]2.0.co;2",
    doi = "10.1890/0012-9658(2003)084[0559:caegac]2.0.co;2",
    openalex = "W2108013961",
    references = "doi101016s0169534701022832, doi101046j14390388200200356x, doi101086410450, doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi1015159780691185507, doi1023072408842, doi1023072529912, doi1023072531471, doi107208chicago97802264249720010001, doi107208chicago97802267976700010001, goodnight1992contextual, openalexw2798374369"
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Con su base teórica firmemente establecida en la genética evolutiva molecular y de poblaciones, el análisis comparativo de secuencias de ADN y proteínas desempeña un papel central en la reconstrucción de las historias evolutivas de especies y familias de genes múltiples, la estimación de las tasas de evolución molecular y la inferencia de la naturaleza y alcance de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y genomas. El alcance de estas investigaciones se ha ampliado enormemente gracias al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento y nuevos métodos estadísticos y computacionales. Estos métodos requieren programas informáticos fáciles de usar. Uno de estos esfuerzos ha sido producir el software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA), con su enfoque en facilitar la exploración y el análisis de la variación de secuencias de ADN y proteínas desde una perspectiva evolutiva. Actualmente en su tercera versión mayor, MEGA3 contiene facilidades para el alineamiento automático y manual de secuencias, la minería basada en web de bases de datos, la inferencia de árboles filogenéticos, la estimación de distancias evolutivas y la prueba de hipótesis evolutivas. Este artículo proporciona una visión general de los métodos estadísticos, las herramientas computacionales y los módulos de exploración visual para la entrada de datos y los resultados obtenibles en MEGA.

@article{doi101093bib52150,
    author = "Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA3: Software integrado para el Análisis de Genética Evolutiva Molecular y alineamiento de secuencias",
    year = "2004",
    journal = "Briefings in Bioinformatics",
    abstract = "Con su base teórica firmemente establecida en la genética evolutiva molecular y de poblaciones, el análisis comparativo de secuencias de ADN y proteínas desempeña un papel central en la reconstrucción de las historias evolutivas de especies y familias de genes múltiples, la estimación de las tasas de evolución molecular y la inferencia de la naturaleza y alcance de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y genomas. El alcance de estas investigaciones se ha ampliado enormemente gracias al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento y nuevos métodos estadísticos y computacionales. Estos métodos requieren programas informáticos fáciles de usar. Uno de estos esfuerzos ha sido producir el software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA), con su enfoque en facilitar la exploración y el análisis de la variación de secuencias de ADN y proteínas desde una perspectiva evolutiva. Actualmente en su tercera versión mayor, MEGA3 contiene facilidades para el alineamiento automático y manual de secuencias, la minería basada en web de bases de datos, la inferencia de árboles filogenéticos, la estimación de distancias evolutivas y la prueba de hipótesis evolutivas. Este artículo proporciona una visión general de los métodos estadísticos, las herramientas computacionales y los módulos de exploración visual para la entrada de datos y los resultados obtenibles en MEGA.",
    url = "https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150",
    doi = "10.1093/bib/5.2.150",
    openalex = "W2146396346",
    references = "doi101007bf01731581, doi101007bf02407308, doi101016b9781483232119500097, doi101093bioinformatics17121244, doi101093genetics1233585, doi101093nar22224673, doi101093nar25173389, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093oxfordjournalsmolbeva040343, doi101093oxfordjournalsmolbeva040410, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023072408678, doi1023072412074, doi105860choice392183, openalexw2032279931, openalexw3217097258"
}

Resumen Los humanos individuales y los miembros de diversas otras especies muestran diferencias consistentes en agresividad, timidez, sociabilidad y actividad. Tales diferencias intraspecíficas en el comportamiento han sido ampliamente asumidas como variación no adaptativa alrededor del comportamiento promedio de la población (posiblemente adaptativo). No obstante, de acuerdo con los recientes llamados a aplicar el razonamiento darwiniano a escalas cada vez más finas de variación biológica, bosquejamos los fundamentos de una teoría adaptativa de las diferencias individuales consistentes en el comportamiento. Nuestra tesis se basa en la noción de que tales «diferencias de personalidad» pueden ser seleccionadas si los beneficios de aptitud dependen tanto de las frecuencias con las que se juegan las estrategias competidoras como del historial de comportamiento de un individuo. Con este fin, revisamos los modelos existentes que ilustran esto y proponemos un enfoque de teoría de juegos para analizar las diferencias de personalidad que es tanto dinámico como dependiente del estado. Nuestra motivación es proporcionar conocimientos sobre la evolución y el mantenimiento de un rasgo animal aparentemente común: la personalidad, que tiene implicaciones ecológicas y evolutivas de gran alcance.

@article{doi101111j14610248200400618x,
    author = "Dall, Sasha R. X. y Houston, Alasdair I. y McNamara, John M.",
    title = "La ecología del comportamiento de la personalidad: diferencias individuales consistentes desde una perspectiva adaptativa",
    year = "2004",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Resumen Los humanos individuales y los miembros de diversas otras especies muestran diferencias consistentes en agresividad, timidez, sociabilidad y actividad. Tales diferencias intraspecíficas en el comportamiento han sido ampliamente asumidas como variación no adaptativa alrededor del comportamiento promedio de la población (posiblemente adaptativo). No obstante, de acuerdo con los recientes llamados a aplicar el razonamiento darwiniano a escalas cada vez más finas de variación biológica, bosquejamos los fundamentos de una teoría adaptativa de las diferencias individuales consistentes en el comportamiento. Nuestra tesis se basa en la noción de que tales «diferencias de personalidad» pueden ser seleccionadas si los beneficios de aptitud dependen tanto de las frecuencias con las que se juegan las estrategias competidoras como del historial de comportamiento de un individuo. Con este fin, revisamos los modelos existentes que ilustran esto y proponemos un enfoque de teoría de juegos para analizar las diferencias de personalidad que es tanto dinámico como dependiente del estado. Nuestra motivación es proporcionar conocimientos sobre la evolución y el mantenimiento de un rasgo animal aparentemente común: la personalidad, que tiene implicaciones ecológicas y evolutivas de gran alcance.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2004.00618.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2004.00618.x",
    openalex = "W1980446206",
    references = "doi101023a1012294324713, openalexw1973833797"
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genalex es un paquete de uso fácil y multiplataforma que funciona dentro de Microsoft Excel, permitiendo análisis de genética de poblaciones de datos codominantes, haploides y binarios. Los análisis basados en frecuencia alélica incluyen heterocigosidad, estadísticas F, distancia genética de Nei, asignación de poblaciones, probabilidades de identidad y parentesco par a par. Los cálculos basados en distancia incluyen amova, análisis de coordenadas principales (PCA), pruebas de Mantel, autocorrelación espacial multivariante y 2D, y twogener. Más de 20 gráficos diferentes resumen los datos y facilitan la exploración. Los datos de secuencia y genotipo pueden importarse desde secuenciadores automatizados y exportarse a otros programas. Inicialmente diseñado como herramienta para la enseñanza, genalex 6 ahora ofrece características para investigadores también. La documentación y el programa están disponibles en http://www.anu.edu.au/BoZo/GenAlEx/

@article{doi101111j14718286200501155x,
    author = "Peakall, Rod y Smouse, Peter E.",
    title = "genalex 6: análisis genético en Excel. Software de genética de poblaciones para enseñanza e investigación",
    year = "2005",
    journal = "Molecular Ecology Notes",
    abstract = "genalex es un paquete de uso fácil y multiplataforma que funciona dentro de Microsoft Excel, permitiendo análisis de genética de poblaciones de datos codominantes, haploides y binarios. Los análisis basados en frecuencia alélica incluyen heterocigosidad, estadísticas F, distancia genética de Nei, asignación de poblaciones, probabilidades de identidad y parentesco par a par. Los cálculos basados en distancia incluyen amova, análisis de coordenadas principales (PCA), pruebas de Mantel, autocorrelación espacial multivariante y 2D, y twogener. Más de 20 gráficos diferentes resumen los datos y facilitan la exploración. Los datos de secuencia y genotipo pueden importarse desde secuenciadores automatizados y exportarse a otros programas. Inicialmente diseñado como herramienta para la enseñanza, genalex 6 ahora ofrece características para investigadores también. La documentación y el programa están disponibles en http://www.anu.edu.au/BoZo/GenAlEx/",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x",
    doi = "10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x",
    openalex = "W2004444667",
    references = "doi101017s0016672300033620, doi101046j1365294x200301702x, doi101046j1365294x200402008x, doi101093genetics1312479, doi101093genetics15241753, doi101111j109583121999tb01157x, doi101111j1365294x1995tb00227x, doi101111j155856461989tb04226x, doi1023071942552, doi1023072413122"
}

Arlequin ver 3.0 es un paquete de software que integra varios métodos básicos y avanzados para el análisis de datos de genética de poblaciones, como el cálculo de índices estándar de diversidad genética, la estimación de frecuencias alélicas y haplotípicas, pruebas de desviación del equilibrio de ligamiento, desviación de la neutralidad selectiva y el equilibrio demográfico, estimación de parámetros de expansiones poblacionales pasadas, y análisis exhaustivos de la subdivisión poblacional bajo el marco AMOVA. Arlequin 3 introduce una interfaz gráfica completamente nueva escrita en C++, un análisis semántico más robusto de los archivos de entrada, y dos nuevos métodos: una estimación bayesiana de la fase gamética a partir de genotipos multilocus, y una estimación de los parámetros de una expansión espacial instantánea a partir del polimorfismo de secuencias de ADN. Arlequin puede manejar varios tipos de datos como secuencias de ADN, datos de microsatélites o genotipos multilocus estándar. Una versión de Windows del software está disponible gratuitamente en http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.

@article{doi101177117693430500100003,
    author = "Excoffier, Laurent y Laval, Guillaume y Schneider, Stefan",
    title = "Arlequin (versión 3.0): Un paquete de software integrado para el análisis de datos de genética de poblaciones",
    year = "2005",
    journal = "Evolutionary Bioinformatics",
    abstract = "Arlequin ver 3.0 es un paquete de software que integra varios métodos básicos y avanzados para el análisis de datos de genética de poblaciones, como el cálculo de índices estándar de diversidad genética, la estimación de frecuencias alélicas y haplotípicas, pruebas de desviación del equilibrio de ligamiento, desviación de la neutralidad selectiva y el equilibrio demográfico, estimación de parámetros de expansiones poblacionales pasadas, y análisis exhaustivos de la subdivisión poblacional bajo el marco AMOVA. Arlequin 3 introduce una interfaz gráfica completamente nueva escrita en C++, un análisis semántico más robusto de los archivos de entrada, y dos nuevos métodos: una estimación bayesiana de la fase gamética a partir de genotipos multilocus, y una estimación de los parámetros de una expansión espacial instantánea a partir del polimorfismo de secuencias de ADN. Arlequin puede manejar varios tipos de datos como secuencias de ADN, datos de microsatélites o genotipos multilocus estándar. Una versión de Windows del software está disponible gratuitamente en http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.",
    url = "https://doi.org/10.1177/117693430500100003",
    doi = "10.1177/117693430500100003",
    openalex = "W4239149238",
    references = "doi101093bioinformaticsbtg359, doi101093genetics1053767, doi101093genetics1233585, doi101093genetics1312479, doi101093genetics1391457, doi101093genetics1472915, doi101093oxfordjournalsjhereda111573"
}

La interacción entre individuos es universal, tanto en animales como en plantas, y afecta sustancialmente la evolución de poblaciones naturales y las respuestas a la selección artificial en la agricultura. Aunque la genética cuantitativa se ha aplicado con éxito a muchos rasgos, no proporciona una teoría general que explique la interacción entre individuos y la selección actuando en múltiples niveles. En consecuencia, la teoría genética cuantitativa actual falla al explicar por qué algunos rasgos no responden a la selección entre individuos, pero responden enormemente a la selección entre grupos. Comprender los impactos completos de las interacciones heredables en los resultados de la selección requiere un marco genético cuantitativo que incluya todos los niveles de selección y parentesco. Aquí presentamos tal marco y proporcionamos expresiones para la respuesta a la selección. Los resultados muestran que la interacción entre individuos puede crear variación heredable sustancial, que queda oculta para los análisis clásicos. La selección actuando en niveles superiores de organización captura esta variación oculta y, por lo tanto, siempre produce una respuesta positiva, mientras que la selección individual puede producir una respuesta en dirección opuesta. Nuestro trabajo proporciona predicciones comprobables de la respuesta a la selección multinivel y se reduce a la teoría clásica en ausencia de interacción. La metodología estadística proporcionada en otro lugar permite la aplicación empírica de nuestro trabajo tanto a poblaciones naturales como domésticas.

@article{doi101534genetics106062711,
    author = "Bijma, Piter and Muir, William M. and van Arendonk, J.A.M.",
    title = "Selección Multinivel 1: Genética Cuantitativa de la Herencia y la Respuesta a la Selección",
    year = "2006",
    journal = "Genetics",
    abstract = "La interacción entre individuos es universal, tanto en animales como en plantas, y afecta sustancialmente la evolución de poblaciones naturales y las respuestas a la selección artificial en la agricultura. Aunque la genética cuantitativa se ha aplicado con éxito a muchos rasgos, no proporciona una teoría general que explique la interacción entre individuos y la selección actuando en múltiples niveles. En consecuencia, la teoría genética cuantitativa actual falla al explicar por qué algunos rasgos no responden a la selección entre individuos, pero responden enormemente a la selección entre grupos. Comprender los impactos completos de las interacciones heredables en los resultados de la selección requiere un marco genético cuantitativo que incluya todos los niveles de selección y parentesco. Aquí presentamos tal marco y proporcionamos expresiones para la respuesta a la selección. Los resultados muestran que la interacción entre individuos puede crear variación heredable sustancial, que queda oculta para los análisis clásicos. La selección actuando en niveles superiores de organización captura esta variación oculta y, por lo tanto, siempre produce una respuesta positiva, mientras que la selección individual puede producir una respuesta en dirección opuesta. Nuestro trabajo proporciona predicciones comprobables de la respuesta a la selección multinivel y se reduce a la teoría clásica en ausencia de interacción. La metodología estadística proporcionada en otro lugar permite la aplicación empírica de nuestro trabajo tanto a poblaciones naturales como domésticas.",
    url = "https://doi.org/10.1534/genetics.106.062711",
    doi = "10.1534/genetics.106.062711",
    openalex = "W2132362070",
    references = "cooper2004group, doi1010160022519364900384, doi101016s0065345408603526, doi101038238413a0, doi10103835012234, doi101046j14390388200200356x, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461965tb01731x, doi101111j155856461977tb00991x, doi101111j155856461983tb00236x, doi1023072408842, doi1023072529912, doi105962bhltitle27468, goodnight1992contextual"
}

El temperamento describe la idea de que las diferencias conductuales individuales son repetibles a lo largo del tiempo y en diferentes situaciones. Este fenómeno común abarca numerosos rasgos, como la agresividad, la evitación de lo novedoso, la disposición a asumir riesgos, la exploración y la sociabilidad. El estudio del temperamento es central para la psicología animal, la genética conductual, la farmacología y la ganadería, pero relativamente pocos estudios han examinado la ecología y la evolución de los rasgos de temperamento. Esta situación es sorprendente, dado que el temperamento probablemente ejerce una influencia importante en muchos aspectos de la ecología y la evolución animal, y que la variación individual en el temperamento parece ser omnipresente entre las especies animales. Posibles explicaciones para este descuido del temperamento incluyen una percepción de irrelevancia, una comprensión insuficiente del vínculo entre los rasgos de temperamento y la aptitud, y una falta de coherencia en la terminología, con rasgos similares que a menudo reciben nombres diferentes, o rasgos diferentes que reciben el mismo nombre. Proponemos que el temperamento puede y debe estudiarse dentro de un marco de ecología evolutiva y proporcionamos una terminología que podría utilizarse como herramienta de trabajo para estudios ecológicos del temperamento. Nuestra terminología incluye cinco categorías principales de rasgos de temperamento: timidez-valentía, exploración-evitación, actividad, sociabilidad y agresividad. Esta terminología no realiza inferencias sobre disposiciones subyacentes o procesos psicológicos, lo que podría haber restringido a los ecólogos y biólogos evolutivos a trabajar sobre estos rasgos. Presentamos revisiones extensas de la literatura que demuestran que los rasgos de temperamento son heredables y están vinculados a la aptitud y a varios otros rasgos de importancia para la ecología y la evolución. Además, describimos métodos de medición ecológicamente relevantes y señalamos varios temas ecológicos y evolutivos que se beneficiarían de considerar el temperamento, como la plasticidad fenotípica, la biología de la conservación, la muestrejo de poblaciones y la biología de invasiones.

@article{doi101111j1469185x200700010x,
    author = "Réale, D. y Reader, S. y Sol, D. y McDougall, P. T. y Dingemanse, N.",
    title = "Integrating animal temperament within ecology and evolution",
    year = "2007",
    journal = "Biological Reviews",
    abstract = "El temperamento describe la idea de que las diferencias conductuales individuales son repetibles a lo largo del tiempo y en diferentes situaciones. Este fenómeno común abarca numerosos rasgos, como la agresividad, la evitación de lo novedoso, la disposición a asumir riesgos, la exploración y la sociabilidad. El estudio del temperamento es central para la psicología animal, la genética conductual, la farmacología y la ganadería, pero relativamente pocos estudios han examinado la ecología y la evolución de los rasgos de temperamento. Esta situación es sorprendente, dado que el temperamento probablemente ejerce una influencia importante en muchos aspectos de la ecología y la evolución animal, y que la variación individual en el temperamento parece ser omnipresente entre las especies animales. Posibles explicaciones para este descuido del temperamento incluyen una percepción de irrelevancia, una comprensión insuficiente del vínculo entre los rasgos de temperamento y la aptitud, y una falta de coherencia en la terminología, con rasgos similares que a menudo reciben nombres diferentes, o rasgos diferentes que reciben el mismo nombre. Proponemos que el temperamento puede y debe estudiarse dentro de un marco de ecología evolutiva y proporcionamos una terminología que podría utilizarse como herramienta de trabajo para estudios ecológicos del temperamento. Nuestra terminología incluye cinco categorías principales de rasgos de temperamento: timidez-valentía, exploración-evitación, actividad, sociabilidad y agresividad. Esta terminología no realiza inferencias sobre disposiciones subyacentes o procesos psicológicos, lo que podría haber restringido a los ecólogos y biólogos evolutivos a trabajar sobre estos rasgos. Presentamos revisiones extensas de la literatura que demuestran que los rasgos de temperamento son heredables y están vinculados a la aptitud y a varios otros rasgos de importancia para la ecología y la evolución. Además, describimos métodos de medición ecológicamente relevantes y señalamos varios temas ecológicos y evolutivos que se beneficiarían de considerar el temperamento, como la plasticidad fenotípica, la biología de la conservación, la muestrejo de poblaciones y la biología de invasiones.",
    url = "https://dspace.library.uu.nl/bitstream/handle/1874/25732/reader_07_integratinganimaltemperament.pdf?sequence=1\&isAllowed=y",
    doi = "10.1111/j.1469-185X.2007.00010.x",
    is_oa = "true",
    number = "2",
    pages = "291-318",
    semanticscholar_citation_count = "3268",
    semanticscholar_id = "6c8a3a23a9dda76402597d002ba0ca649befabe0",
    volume = "82"
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Arlequin ver 3.0 es un paquete de software que integra varios métodos básicos y avanzados para el análisis de datos de genética de poblaciones, como el cálculo de índices estándar de diversidad genética, la estimación de frecuencias alélicas y haplotípicas, pruebas de desviación del equilibrio de ligamiento, desviación de la neutralidad selectiva y el equilibrio demográfico, estimación de parámetros de expansiones poblacionales pasadas, y análisis exhaustivos de la subdivisión poblacional bajo el marco AMOVA. Arlequin 3 introduce una interfaz gráfica completamente nueva escrita en C++, un análisis semántico más robusto de los archivos de entrada, y dos nuevos métodos: una estimación bayesiana de la fase gamética a partir de genotipos multilocus, y una estimación de los parámetros de una expansión espacial instantánea a partir del polimorfismo de secuencias de ADN. Arlequin puede manejar varios tipos de datos como secuencias de ADN, datos de microsatélites, o genotipos multilocus estándar. Una versión de Windows del software está disponible gratuitamente en http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.

@article{openalexw2119799171,
    author = "Excoffier, Laurent y Laval, Guillaume y Schneider, Stefan",
    title = "Arlequin (versión 3.0): un paquete de software integrado para el análisis de datos de genética de poblaciones.",
    year = "2007",
    journal = "PubMed",
    abstract = "Arlequin ver 3.0 es un paquete de software que integra varios métodos básicos y avanzados para el análisis de datos de genética de poblaciones, como el cálculo de índices estándar de diversidad genética, la estimación de frecuencias alélicas y haplotípicas, pruebas de desviación del equilibrio de ligamiento, desviación de la neutralidad selectiva y el equilibrio demográfico, estimación de parámetros de expansiones poblacionales pasadas, y análisis exhaustivos de la subdivisión poblacional bajo el marco AMOVA. Arlequin 3 introduce una interfaz gráfica completamente nueva escrita en C++, un análisis semántico más robusto de los archivos de entrada, y dos nuevos métodos: una estimación bayesiana de la fase gamética a partir de genotipos multilocus, y una estimación de los parámetros de una expansión espacial instantánea a partir del polimorfismo de secuencias de ADN. Arlequin puede manejar varios tipos de datos como secuencias de ADN, datos de microsatélites, o genotipos multilocus estándar. Una versión de Windows del software está disponible gratuitamente en http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3.",
    openalex = "W2119799171",
    references = "doi101093bioinformaticsbtg359, doi101093genetics1053767, doi101093genetics1233585, doi101093genetics1312479, doi101093genetics1391457, doi101093genetics1472915, doi101093oxfordjournalsjhereda111573, doi101093oxfordjournalsjhereda111627, doi101093oxfordjournalsmolbeva040727, doi101111j155856461995tb04456x, doi1023072409372, doi1023072532296"
}

Esta introducción al número temático sobre enfoques evolutivos y ecológicos para el estudio de la personalidad ofrece una visión general del progreso conceptual, teórico y metodológico en la investigación sobre personalidades animales durante la última década, y sitúa las contribuciones a este volumen en su contexto. El número tiene tres objetivos principales. En primer lugar, buscamos reunir a teóricos para contribuir al desarrollo de modelos que proporcionen explicaciones adaptativas para la personalidad animal que puedan guiar a los empiristas y fomentar el intercambio de ideas entre ambos grupos de investigadores. En segundo lugar, buscamos fomentar la fertilización cruzada entre diferentes campos científicos que estudian la personalidad, a saber, ecología del comportamiento, psicología, genómica, genética cuantitativa, neuroendocrinología y biología del desarrollo. En tercer lugar, buscamos promover la aplicación de un marco evolutivo al estudio de la personalidad.

@article{doi101098rstb20100222,
    author = "Réale, Denis y Dingemanse, Niels J. y Kazem, Anahita J.N. y Wright, Jonathan",
    title = "Enfoques evolutivos y ecológicos para el estudio de la personalidad",
    year = "2010",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Esta introducción al número temático sobre enfoques evolutivos y ecológicos para el estudio de la personalidad ofrece una visión general del progreso conceptual, teórico y metodológico en la investigación sobre personalidades animales durante la última década, y sitúa las contribuciones a este volumen en su contexto. El número tiene tres objetivos principales. En primer lugar, buscamos reunir a teóricos para contribuir al desarrollo de modelos que proporcionen explicaciones adaptativas para la personalidad animal que puedan guiar a los empiristas y fomentar el intercambio de ideas entre ambos grupos de investigadores. En segundo lugar, buscamos fomentar la fertilización cruzada entre diferentes campos científicos que estudian la personalidad, a saber, ecología del comportamiento, psicología, genómica, genética cuantitativa, neuroendocrinología y biología del desarrollo. En tercer lugar, buscamos promover la aplicación de un marco evolutivo al estudio de la personalidad.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2010.0222",
    doi = "10.1098/rstb.2010.0222",
    openalex = "W2170542651",
    references = "doi101073pnas931910262"
}

El análisis comparativo de datos de secuencias moleculares es esencial para reconstruir las historias evolutivas de las especies e inferir la naturaleza y el alcance de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y especies. Aquí, anunciamos el lanzamiento de Molecular Evolutionary Genetics Analysis versión 5 (MEGA5), que es un software amigable para usuarios para minar bases de datos en línea, construir alineamientos de secuencias y árboles filogenéticos, y usar métodos de bioinformática evolutiva en biología básica, biomedicina y evolución. La novedad más reciente en MEGA5 es una colección de análisis de verosimilitud máxima (ML) para inferir árboles evolutivos, seleccionar modelos de sustitución de mejor ajuste (nucleótido o aminoácido), inferir estados y secuencias ancestrales (junto con probabilidades) y estimar tasas evolutivas sitio por sitio. En análisis de simulación por computadora, los algoritmos de inferencia de árboles ML en MEGA5 se compararon favorablemente con otros paquetes de software en términos de eficiencia computacional y la precisión de las estimaciones de árboles filogenéticos, parámetros de sustitución y variación de tasas entre sitios. La interfaz de usuario de MEGA ahora se ha mejorado para ser impulsada por actividades para facilitar su uso tanto por principiantes como por científicos experimentados. Esta versión de MEGA está destinada para la plataforma Windows, y se ha configurado para un uso efectivo en escritorios de Mac OS X y Linux. Está disponible gratuitamente en http://www.megasoftware.net.

@article{doi101093molbevmsr121,
    author = "Tamura, Koichiro y Peterson, Daniel G. y Peterson, Nora y Stecher, Glen y Nei, M y Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA5: Análisis de Genética Evolutiva Molecular usando Métodos de Verosimilitud Máxima, Distancia Evolutiva y Parsimonia Máxima",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "El análisis comparativo de datos de secuencias moleculares es esencial para reconstruir las historias evolutivas de las especies e inferir la naturaleza y el alcance de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y especies. Aquí, anunciamos el lanzamiento de Molecular Evolutionary Genetics Analysis versión 5 (MEGA5), que es un software amigable para usuarios para minar bases de datos en línea, construir alineamientos de secuencias y árboles filogenéticos, y usar métodos de bioinformática evolutiva en biología básica, biomedicina y evolución. La novedad más reciente en MEGA5 es una colección de análisis de verosimilitud máxima (ML) para inferir árboles evolutivos, seleccionar modelos de sustitución de mejor ajuste (nucleótido o aminoácido), inferir estados y secuencias ancestrales (junto con probabilidades) y estimar tasas evolutivas sitio por sitio. En análisis de simulación por computadora, los algoritmos de inferencia de árboles ML en MEGA5 se compararon favorablemente con otros paquetes de software en términos de eficiencia computacional y la precisión de las estimaciones de árboles filogenéticos, parámetros de sustitución y variación de tasas entre sitios. La interfaz de usuario de MEGA ahora se ha mejorado para ser impulsada por actividades para facilitar su uso tanto por principiantes como por científicos experimentados. Esta versión de MEGA está destinada para la plataforma Windows, y se ha configurado para un uso efectivo en escritorios de Mac OS X y Linux. Está disponible gratuitamente en http://www.megasoftware.net.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msr121",
    doi = "10.1093/molbev/msr121",
    openalex = "W2132632499",
    references = "doi101007bf01734359, doi101007bf02101694, doi10108010635150390235520, doi10108010635150490522304, doi101093bioinformatics149817, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet762297, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093sysbiosyq010, doi101111j155856461985tb00420x, doi101186147121055113, openalexw3217097258"
}

Esta revisión examina la contribución de la investigación sobre peces al creciente campo de los síndromes de comportamiento. Se revisa el conocimiento actual sobre los síndromes de comportamiento en peces en relación con cinco ejes principales de la personalidad animal: (1) timidez-valentía, (2) exploración-evitación, (3) actividad, (4) agresividad y (5) sociabilidad. En comparación con otros taxones, la investigación sobre peces ha desempeñado un papel líder en la descripción del eje de personalidad tímido-valiente y ha realizado contribuciones innovadoras al estudio de la dimensión de la sociabilidad mediante la incorporación de la teoría de redes sociales. Los peces son prácticamente el único taxón mayor en el que se han comparado correlaciones de comportamiento entre poblaciones. Esta investigación ha guiado al campo en el examen de cómo la variación en el régimen de selección puede dar forma a la personalidad. La investigación reciente sobre peces también ha realizado avances importantes en la comprensión de las bases genéticas y neuroendocrinas de los síndromes de comportamiento utilizando enfoques que involucran la selección artificial, el mapeo genético, los genes candidatos y la genómica funcional. Este trabajo ha ilustrado una variación individual consistente en vías neuroendocrinas y de expresión génica altamente complejas. En contraste, relativamente poco trabajo sobre peces ha examinado la estabilidad ontogenética de los síndromes de comportamiento o sus consecuencias para la aptitud. Finalmente, adoptar un marco de síndrome de comportamiento en temas de gestión de la pesca, incluida la propagación artificial, la restauración de hábitats y las especies invasoras, puede promover el éxito de la restauración. Sin embargo, pocos estudios han examinado la relevancia ecológica de los síndromes de comportamiento en el campo. El conocimiento de cómo se manifiestan los síndromes de comportamiento en la naturaleza será crucial para incorporar tal marco en las prácticas de gestión.

@article{doi101111j10958649201002874x,
    author = "Conrad, J. Louise y Weinersmith, Kelly L. y Brodin, Tomas y Saltz, Julia B. y Sih, Andrew",
    title = "Síndromes de comportamiento en peces: una revisión con implicaciones para la ecología y la gestión de la pesca",
    year = "2011",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Esta revisión examina la contribución de la investigación sobre peces al creciente campo de los síndromes de comportamiento. Se revisa el conocimiento actual sobre los síndromes de comportamiento en peces en relación con cinco ejes principales de la personalidad animal: (1) timidez-valentía, (2) exploración-evitación, (3) actividad, (4) agresividad y (5) sociabilidad. En comparación con otros taxones, la investigación sobre peces ha desempeñado un papel líder en la descripción del eje de personalidad tímido-valiente y ha realizado contribuciones innovadoras al estudio de la dimensión de la sociabilidad mediante la incorporación de la teoría de redes sociales. Los peces son prácticamente el único taxón mayor en el que se han comparado correlaciones de comportamiento entre poblaciones. Esta investigación ha guiado al campo en el examen de cómo la variación en el régimen de selección puede dar forma a la personalidad. La investigación reciente sobre peces también ha realizado avances importantes en la comprensión de las bases genéticas y neuroendocrinas de los síndromes de comportamiento utilizando enfoques que involucran la selección artificial, el mapeo genético, los genes candidatos y la genómica funcional. Este trabajo ha ilustrado una variación individual consistente en vías neuroendocrinas y de expresión génica altamente complejas. En contraste, relativamente poco trabajo sobre peces ha examinado la estabilidad ontogenética de los síndromes de comportamiento o sus consecuencias para la aptitud. Finalmente, adoptar un marco de síndrome de comportamiento en temas de gestión de la pesca, incluida la propagación artificial, la restauración de hábitats y las especies invasoras, puede promover el éxito de la restauración. Sin embargo, pocos estudios han examinado la relevancia ecológica de los síndromes de comportamiento en el campo. El conocimiento de cómo se manifiestan los síndromes de comportamiento en la naturaleza será crucial para incorporar tal marco en las prácticas de gestión.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2010.02874.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8649.2010.02874.x",
    openalex = "W2144863680",
    references = "doi101016jtree200806001, doi101093behecoarp018"
}

Las mejoras recientes en la velocidad, el costo y la precisión de la secuenciación de nueva generación están revolucionando el descubrimiento de polimorfismos de nucleótido simple (SNPs). Los SNPs se están utilizando cada vez más como una adición al kit de herramientas de la ecología molecular en organismos no modelo, pero su uso eficiente sigue siendo un desafío. Aquí, discutimos los problemas comunes al emplear marcadores SNP, incluyendo el alto número de marcadores típicamente empleados, los efectos del sesgo de ascertainment y la inclusión de loci no neutrales en un panel de marcadores. Proporcionamos una crítica de las consideraciones específicamente asociadas con la aplicación y el análisis genético de poblaciones de SNPs en taxones no modelo, centrándonos específicamente en algunos de los métodos más comúnmente aplicados.

@article{doi101111j17550998201002943x,
    author = "Helyar, Sarah y Hemmer‐Hansen, Jakob y Bekkevold, Dorte y Taylor, MI y Ogden, Rob y Limborg, Morten T. y Cariani, Alessia y Maes, Gregory E. y Diopere, Eveline y Carvalho, G. R. y Nielsen, Einar Eg",
    title = "Aplicación de SNPs para la genética de poblaciones de organismos no modelo: nuevas oportunidades y desafíos",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "Las mejoras recientes en la velocidad, el costo y la precisión de la secuenciación de nueva generación están revolucionando el descubrimiento de polimorfismos de nucleótido simple (SNPs). Los SNPs se están utilizando cada vez más como una adición al kit de herramientas de la ecología molecular en organismos no modelo, pero su uso eficiente sigue siendo un desafío. Aquí, discutimos los problemas comunes al emplear marcadores SNP, incluyendo el alto número de marcadores típicamente empleados, los efectos del sesgo de ascertainment y la inclusión de loci no neutrales en un panel de marcadores. Proporcionamos una crítica de las consideraciones específicamente asociadas con la aplicación y el análisis genético de poblaciones de SNPs en taxones no modelo, centrándonos específicamente en algunos de los métodos más comúnmente aplicados.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02943.x",
    doi = "10.1111/j.1755-0998.2010.02943.x",
    openalex = "W2155309921",
    references = "doi101093jheredesh074, doi101111j14718286200701931x"
}

FONDO Y OBJETIVOS: La latencia de las semillas varía dentro de las especies en respuesta al clima, tanto a largo plazo (a través de ecotipos o gradientes) como a corto plazo (a través de la influencia del ambiente de maduración de la semilla). Desentrañar ambos procesos es crucial para comprender la adaptación de las plantas a los cambios ambientales. En este estudio, se investigaron los patrones locales de latencia de las semillas en una especie endémica de distribución restringida, Centaurium somedanum, con el fin de determinar la influencia del ambiente de maduración de la semilla, la composición genética de la población y el clima. MÉTODOS: Se realizaron experimentos de germinación en laboratorio para medir la latencia en (1) semillas recolectadas de diferentes poblaciones silvestres a lo largo de un gradiente altitudinal local y (2) semillas de una generación posterior producidas en un jardín común. La composición genética de las poblaciones originales se caracterizó utilizando PCR de repetición de secuencias simples intercaladas (ISSR) y análisis de coordenadas principales (PCoA), y se analizó su correlación con los patrones de latencia de ambas generaciones. También se modeló el efecto del clima local sobre la latencia. RESULTADOS CLAVE: Se encontró un gradiente de latitudinal en las poblaciones silvestres, que se mantuvo en las plantas cultivadas en el jardín común. Sin embargo, las semillas del jardín común respondieron mejor a la estratificación y su liberación de la latencia fue más intensa. Los patrones de variación de la latencia se correlacionaron con la composición genética, mientras que las temperaturas más bajas y las precipitaciones estivales en los sitios de las poblaciones predijeron una mayor latencia en las semillas de ambas generaciones. CONCLUSIONES: El gradiente de latencia en C. somedanum está relacionado con un gradiente climático local y también corresponde a la diferenciación genética entre poblaciones. Este gradiente se ve afectado aún más por las condiciones meteorológicas durante la maduración de la semilla, que influyen en la receptividad a los factores que rompen la latencia. Estos resultados muestran que la latencia está influenciada tanto por la variación climática a largo como a corto plazo. Tales procesos a una escala espacial tan reducida destacan el potencial de las plantas para adaptarse a los cambios ambientales rápidos.

@article{doi101093aobmct154,
    author = "Fernández‐Pascual, Eduardo y Jiménez‐Alfaro, Borja y Caujapé‐Castells, Juli y Jaén‐Molina, Ruth y Díaz, Tomás E.",
    title = "Un gradiente de latencia local está relacionado con el ambiente de maduración de la semilla, la composición genética de la población y el clima",
    year = "2013",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = "FONDO Y OBJETIVOS: La latencia de las semillas varía dentro de las especies en respuesta al clima, tanto a largo plazo (a través de ecotipos o gradientes) como a corto plazo (a través de la influencia del ambiente de maduración de la semilla). Desentrañar ambos procesos es crucial para comprender la adaptación de las plantas a los cambios ambientales. En este estudio, se investigaron los patrones locales de latencia de las semillas en una especie endémica de distribución restringida, Centaurium somedanum, con el fin de determinar la influencia del ambiente de maduración de la semilla, la composición genética de la población y el clima. MÉTODOS: Se realizaron experimentos de germinación en laboratorio para medir la latencia en (1) semillas recolectadas de diferentes poblaciones silvestres a lo largo de un gradiente altitudinal local y (2) semillas de una generación posterior producidas en un jardín común. La composición genética de las poblaciones originales se caracterizó utilizando PCR de repetición de secuencias simples intercaladas (ISSR) y análisis de coordenadas principales (PCoA), y se analizó su correlación con los patrones de latencia de ambas generaciones. También se modeló el efecto del clima local sobre la latencia. RESULTADOS CLAVE: Se encontró un gradiente de latitudinal en las poblaciones silvestres, que se mantuvo en las plantas cultivadas en el jardín común. Sin embargo, las semillas del jardín común respondieron mejor a la estratificación y su liberación de la latencia fue más intensa. Los patrones de variación de la latencia se correlacionaron con la composición genética, mientras que las temperaturas más bajas y las precipitaciones estivales en los sitios de las poblaciones predijeron una mayor latencia en las semillas de ambas generaciones. CONCLUSIONES: El gradiente de latencia en C. somedanum está relacionado con un gradiente climático local y también corresponde a la diferenciación genética entre poblaciones. Este gradiente se ve afectado aún más por las condiciones meteorológicas durante la maduración de la semilla, que influyen en la receptividad a los factores que rompen la latencia. Estos resultados muestran que la latencia está influenciada tanto por la variación climática a largo como a corto plazo. Tales procesos a una escala espacial tan reducida destacan el potencial de las plantas para adaptarse a los cambios ambientales rápidos.",
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mct154",
    doi = "10.1093/aob/mct154",
    openalex = "W2171829639",
    references = "allen2002ecology"
}

El software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA) ha madurado para contener una gran colección de métodos y herramientas de evolución molecular computacional. Aquí, describimos nuevas adiciones que hacen de MEGA una herramienta más completa para construir árboles de tiempo de especies, patógenos y familias de genes utilizando métodos de reloj relajado rápido. Se han implementado métodos para estimar tiempos de divergencia e intervalos de confianza para utilizar densidades de probabilidad para restricciones de calibración en la datación de nodos y fechas de muestreo de secuencias para análisis de datación de puntas. Estas se apoyan con nuevas opciones para etiquetar secuencias con información de muestreo espacio-temporal, un Editor de Calibración de Nodos interactivo expandido y un Explorador de Árbol extendido para mostrar árboles de tiempo. También se ha añadido un método bayesiano para estimar probabilidades evolutivas neutras de alelos en una especie utilizando alineamientos de secuencias de múltiples especies y un método de aprendizaje automático para probar la autocorrelación de las tasas evolutivas en filogenias. Los requisitos de memoria de computadora para el análisis de máxima verosimilitud se han reducido significativamente mediante la reprogramación, y la interfaz gráfica de usuario se ha hecho más reactiva e interactiva para conjuntos de datos muy grandes. Estas mejoras mejorarán la experiencia del usuario, la calidad de los resultados y el ritmo del descubrimiento biológico. Las versiones nativamente compiladas de interfaz gráfica de usuario y de línea de comandos de MEGA11 están disponibles para Microsoft Windows, Linux y macOS desde www.megasoftware.net.

@article{doi101093molbevmst197,
    author = "Tamura, Koichiro y Stecher, Glen y Peterson, Daniel S. y Filipski, Alan y Kumar, Sudhir",
    title = "MEGA6: Análisis de Genética Evolutiva Molecular Versión 6.0",
    year = "2013",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "El software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA) ha madurado para contener una gran colección de métodos y herramientas de evolución molecular computacional. Aquí, describimos nuevas adiciones que hacen de MEGA una herramienta más completa para construir árboles de tiempo de especies, patógenos y familias de genes utilizando métodos de reloj relajado rápido. Se han implementado métodos para estimar tiempos de divergencia e intervalos de confianza para utilizar densidades de probabilidad para restricciones de calibración en la datación de nodos y fechas de muestreo de secuencias para análisis de datación de puntas. Estas se apoyan con nuevas opciones para etiquetar secuencias con información de muestreo espacio-temporal, un Editor de Calibración de Nodos interactivo expandido y un Explorador de Árbol extendido para mostrar árboles de tiempo. También se ha añadido un método bayesiano para estimar probabilidades evolutivas neutras de alelos en una especie utilizando alineamientos de secuencias de múltiples especies y un método de aprendizaje automático para probar la autocorrelación de las tasas evolutivas en filogenias. Los requisitos de memoria de computadora para el análisis de máxima verosimilitud se han reducido significativamente mediante la reprogramación, y la interfaz gráfica de usuario se ha hecho más reactiva e interactiva para conjuntos de datos muy grandes. Estas mejoras mejorarán la experiencia del usuario, la calidad de los resultados y el ritmo del descubrimiento biológico. Las versiones nativamente compiladas de interfaz gráfica de usuario y de línea de comandos de MEGA11 están disponibles para Microsoft Windows, Linux y macOS desde www.megasoftware.net.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/mst197",
    doi = "10.1093/molbev/mst197",
    openalex = "W2152207030",
    references = "doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas1213199109, doi101093bib52150, doi101093bioinformatics102189, doi101093bioinformatics17121244, doi101093bioinformaticsbts507, doi101093molbevmsr121, doi101093oso97801951358480010001, doi101126science1211028, openalexw3217097258"
}

Resumen Objetivo Utilizando marcadores genéticos de alta resolución en muestras recolectadas a lo largo de su amplio rango de distribución, nos esforzamos por delimitar la diversidad de especies en corales de Pocillopora constructores de arrecifes. Son comunes, ecológicamente importantes y ampliamente distribuidos por todo el Indo‐Pacífico, pero su plasticidad fenotípica en respuesta a las condiciones ambientales y sus estructuras microesqueléticas casi sin rasgos confunden las asignaciones taxonómicas y limitan la comprensión de su ecología y evolución. Ubicación Indo‐Pacífico, Mar Rojo, Golfo Árabe/Persico. Métodos El análisis de secuencias de loci ribosómicos nucleares (espaciador transcrito interno 2, ITS 2) y mitocondriales (marco de lectura abierta) se combinó con datos de genética de poblaciones (siete loci de microsatélites) para muestras de Pocillopora recolectadas en todo el Indo‐Pacífico, Mar Rojo y Golfo Árabe, con el fin de evaluar la divergencia evolutiva, el aislamiento reproductivo, la frecuencia de hibridación y las distribuciones geográficas del género. Resultados Se identificaron entre cinco y ocho linajes genéticamente distintos comparables a especies con mínima o ninguna hibridación entre ellos. La morfología de las colonias fue generalmente incongruente con la genética a lo largo de todo el rango de muestreo, y el número total de especies parece ser consistente con estimaciones más bajas de hipótesis competentes basadas en la morfología (aproximadamente siete u ocho taxones). Los linajes genéticos más comúnmente presentes estaban ampliamente distribuidos y exhibieron alta dispersión y flujo génico, factores que probablemente han minimizado la especiación alopátrica. De manera única entre los géneros escleractinios, este género contiene un grupo monofilético de desovadores de broadcast que evolucionó recientemente a partir de un ancestro incubador. Conclusiones principales La delimitación de la diversidad de especies guiada por la genética avanza fundamentalmente nuestra comprensión de las distribuciones geográficas, la ecología y la evolución de Pocillopora. Dado que las características diagnósticas tradicionales de la morfología de la colonia y los brazos se están demostrando de utilidad limitada, la identificación de especies de Pocillopora para futuros trabajos ecológicos y experimentales debería basarse en caracteres genéticos que mejorarán la investigación y ayudarán en las estrategias de conservación para estos y otros corales constructores de arrecifes, incluyendo la detección de poblaciones endémicas reales y erróneas.

@article{doi101111jbi12110,
    author = "Pinzón, Jorge H. and Sampayo, Eugenia M. and Cox, Evelyn F. and Chauka, Leonard J. and Chen, Chaolun Allen and Voolstra, Christian R. and LaJeunesse, Todd C.",
    title = "Blind to morphology: genetics identifies several widespread ecologically common species and few endemics among Indo‐Pacific cauliflower corals (Pocillopora, Scleractinia)",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Biogeography",
    abstract = "Resumen Objetivo Utilizando marcadores genéticos de alta resolución en muestras recolectadas a lo largo de su amplio rango de distribución, nos esforzamos por delimitar la diversidad de especies en corales de Pocillopora constructores de arrecifes. Son comunes, ecológicamente importantes y ampliamente distribuidos por todo el Indo‐Pacífico, pero su plasticidad fenotípica en respuesta a las condiciones ambientales y sus estructuras microesqueléticas casi sin rasgos confunden las asignaciones taxonómicas y limitan la comprensión de su ecología y evolución. Ubicación Indo‐Pacífico, Mar Rojo, Golfo Árabe/Persico. Métodos El análisis de secuencias de loci ribosómicos nucleares (espaciador transcrito interno 2, ITS 2) y mitocondriales (marco de lectura abierta) se combinó con datos de genética de poblaciones (siete loci de microsatélites) para muestras de Pocillopora recolectadas en todo el Indo‐Pacífico, Mar Rojo y Golfo Árabe, con el fin de evaluar la divergencia evolutiva, el aislamiento reproductivo, la frecuencia de hibridación y las distribuciones geográficas del género. Resultados Se identificaron entre cinco y ocho linajes genéticamente distintos comparables a especies con mínima o ninguna hibridación entre ellos. La morfología de las colonias fue generalmente incongruente con la genética a lo largo de todo el rango de muestreo, y el número total de especies parece ser consistente con estimaciones más bajas de hipótesis competentes basadas en la morfología (aproximadamente siete u ocho taxones). Los linajes genéticos más comúnmente presentes estaban ampliamente distribuidos y exhibieron alta dispersión y flujo génico, factores que probablemente han minimizado la especiación alopátrica. De manera única entre los géneros escleractinios, este género contiene un grupo monofilético de desovadores de broadcast que evolucionó recientemente a partir de un ancestro incubador. Conclusiones principales La delimitación de la diversidad de especies guiada por la genética avanza fundamentalmente nuestra comprensión de las distribuciones geográficas, la ecología y la evolución de Pocillopora. Dado que las características diagnósticas tradicionales de la morfología de la colonia y los brazos se están demostrando de utilidad limitada, la identificación de especies de Pocillopora para futuros trabajos ecológicos y experimentales debería basarse en caracteres genéticos que mejorarán la investigación y ayudarán en las estrategias de conservación para estos y otros corales constructores de arrecifes, incluyendo la detección de poblaciones endémicas reales y erróneas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jbi.12110",
    doi = "10.1111/jbi.12110",
    openalex = "W2149681625",
    references = "doi101093bioinformatics178754, doi101093bioinformaticsbtm233, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16441567, doi101093nar22224673, doi101093oxfordjournalsjhereda111573, doi101111j1365294x200502553x, doi101111j14718286200501155x, doi101111j14718286200701931x, openalexw3217097258"
}

@incollection{falk2013population,
    author = "Falk, Donald A. y Richards, Christopher M. y Montalvo, Arlee M. y Knapp, Eric E.",
    title = "Genética de poblaciones y ecológica en ecología de la restauración",
    year = "2013",
    booktitle = "Fundamentos de la ecología de la restauración",
    url = "https://doi.org/10.2307/jj.41003482.7",
    doi = "10.2307/jj.41003482.7",
    openalex = "W7151974137",
    pages = "14-41"
}

Los estudios moleculares han sido fundamentales para refinar los límites de las especies en el género de coral Pocillopora y revelar la diversidad oculta de especies dentro de la especie global extensamente estudiada Pocillopora damicornis. Aquí revisamos formalmente el estatus taxonómico de las especies estrechamente relacionadas y dentro del complejo de especies P. damicornis, teniendo en cuenta tanto la evidencia genética como nuevos datos sobre morfometría, incluida la estructura a escala fina de corallitos y coenosteo. Encontramos que las filogenias moleculares mitocondriales son congruentes con los grupos basados en la morfología general, reflejando así la diferenciación a nivel de especie. Sin embargo, altos niveles de plasticidad morfológica general y características morfológicas compartidas enmascaran una separación clara para algunos grupos. La variación morfológica a escala fina, particularmente la forma y tipo de columela, fue útil para diferenciar entre clados y proporciona una excelente firma de las relaciones evolutivas entre linajes genéticos. Dado que la hibridación introgresiva y la ordenación incompleta de linajes complican la delimitación de especies dentro del género basándose en un único concepto de especie, el Concepto Unificado de Especie podría representar un enfoque adecuado para revisar la taxonomía de Pocillopora. Se describen ocho especies (P. damicornis, P. acuta, P. aliciae, P. verrucosa, P. meandrina, P. eydouxi, P. cf. brevicornis), incluyendo un nuevo taxón – Pocillopora bairdi sp. nov. (Schmidt-Roach, este estudio). Se presentan sinónimos de citas y materiales tipo. © 2014 The Linnean Society of London

@article{doi101111zoj12092,
    author = "Schmidt‐Roach, Sebastian y Miller, Karen J. y Lundgren, Petra y Andreakis, Nikos",
    title = "Con los ojos bien abiertos: una revisión de las especies dentro y estrechamente relacionadas con el complejo de especies Pocillopora damicornis (Scleractinia; Pocilloporidae) utilizando morfología y genética",
    year = "2014",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Los estudios moleculares han sido fundamentales para refinar los límites de las especies en el género de coral Pocillopora y revelar la diversidad oculta de especies dentro de la especie global extensamente estudiada Pocillopora damicornis. Aquí revisamos formalmente el estatus taxonómico de las especies estrechamente relacionadas y dentro del complejo de especies P. damicornis, teniendo en cuenta tanto la evidencia genética como nuevos datos sobre morfometría, incluida la estructura a escala fina de corallitos y coenosteo. Encontramos que las filogenias moleculares mitocondriales son congruentes con los grupos basados en la morfología general, reflejando así la diferenciación a nivel de especie. Sin embargo, altos niveles de plasticidad morfológica general y características morfológicas compartidas enmascaran una separación clara para algunos grupos. La variación morfológica a escala fina, particularmente la forma y tipo de columela, fue útil para diferenciar entre clados y proporciona una excelente firma de las relaciones evolutivas entre linajes genéticos. Dado que la hibridación introgresiva y la ordenación incompleta de linajes complican la delimitación de especies dentro del género basándose en un único concepto de especie, el Concepto Unificado de Especie podría representar un enfoque adecuado para revisar la taxonomía de Pocillopora. Se describen ocho especies (P. damicornis, P. acuta, P. aliciae, P. verrucosa, P. meandrina, P. eydouxi, P. cf. brevicornis), incluyendo un nuevo taxón – Pocillopora bairdi sp. nov. (Schmidt-Roach, este estudio). Se presentan sinónimos de citas y materiales tipo. © 2014 The Linnean Society of London",
    url = "https://doi.org/10.1111/zoj.12092",
    doi = "10.1111/zoj.12092",
    openalex = "W2171806591",
    references = "doi101016jtree200401003, doi101017cbo9781139567411, doi10108010635150701701083, doi101093bioinformaticsbtn129, doi101093molbevmsm092, doi101093oxfordjournalsmolbeva026036, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101111j155856461985tb00420x, doi101111jbi12110, doi1023072408678, doi105860choice332723"
}

Los datos genéticos modernos combinados con métodos estadísticos apropiados tienen el potencial de contribuir sustancialmente a nuestra comprensión de la historia humana. Hemos desarrollado un enfoque que explota la estructura genómica de las poblaciones mezcladas para fechar y caracterizar eventos históricos de mezcla a escalas finas. Usamos esto para producir un atlas de la historia mundial de la mezcla humana, construido utilizando únicamente datos genéticos y que abarca más de 100 eventos ocurridos en los últimos 4000 años. Identificamos eventos cuyas fechas y participantes sugieren que describen los impactos genéticos del imperio mongol, el comercio de esclavos árabes, la expansión bantú, las migraciones del primer milenio d.C. en Europa del Este y el colonialismo europeo, así como eventos no registrados, revelando que la mezcla es una fuerza casi universal que moldea las poblaciones humanas.

@article{doi101126science1243518,
    author = "Hellenthal, Garrett y Busby, George y Band, Gavin y Wilson, James F. y Capelli, Cristian y Falush, Daniel y Myers, Simon",
    title = "Un Atlas Genético de la Historia de la Mezcla Humana",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "Los datos genéticos modernos combinados con métodos estadísticos apropiados tienen el potencial de contribuir sustancialmente a nuestra comprensión de la historia humana. Hemos desarrollado un enfoque que explota la estructura genómica de las poblaciones mezcladas para fechar y caracterizar eventos históricos de mezcla a escalas finas. Usamos esto para producir un atlas de la historia mundial de la mezcla humana, construido utilizando únicamente datos genéticos y que abarca más de 100 eventos ocurridos en los últimos 4000 años. Identificamos eventos cuyas fechas y participantes sugieren que describen los impactos genéticos del imperio mongol, el comercio de esclavos árabes, la expansión bantú, las migraciones del primer milenio d.C. en Europa del Este y el colonialismo europeo, así como eventos no registrados, revelando que la mezcla es una fuerza casi universal que moldea las poblaciones humanas.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1243518",
    doi = "10.1126/science.1243518",
    openalex = "W1979677919",
    references = "doi101038nature02168, doi101038nature06258, doi101038ng1847, doi101086519795, doi101093genetics1552945, doi101093genetics16441567, doi101109518626, doi101111j14718286200501155x, doi101126science1172257, doi101371journalpgen0020190, doi101371journalpgen1000529, doi101371journalpgen1002453"
}

Los peces se han demostrado ser organismos modelo para el estudio de las personalidades animales, y una rica literatura documenta diferencias de comportamiento interindividuales consistentes en una variedad de especies. Sin embargo, relativamente pocos estudios han examinado las consecuencias ecológicas de tales diferencias de comportamiento interindividuales consistentes en peces u otros organismos, especialmente bajo condiciones de campo. En esta revisión y perspectiva, discutimos los factores que pueden llevar a la formación y mantenimiento de tipos de comportamiento en poblaciones de peces. Luego examinamos lo que se sabe sobre los efectos de la variación de personalidad en el crecimiento y supervivencia individuales, comportamientos de apareamiento y éxito reproductivo, uso de hábitat, dieta y cambios de nicho ontogenéticos, migración y dispersión, así como posibles consecuencias para las interacciones entre especies y el funcionamiento del ecosistema. Nos enfocamos tanto como sea posible en estudios realizados bajo condiciones naturales o seminaturales, ya que tales estudios de campo son los más relevantes para elucidar las consecuencias ecológicas de la variación de comportamiento. Finalmente, discutimos la posible importancia de las diferencias individuales consistentes en el comportamiento para la gestión y conservación de la pesca, examinando específicamente las consecuencias para la pesca recreativa y comercial, la cría en criaderos y el mejoramiento de stocks.

@article{doi101139cjfas20130558,
    author = "Mittelbach, Gary G. and Ballew, Nick and Kjelvik, Melissa K.",
    title = "Fish behavioral types and their ecological consequences",
    year = "2014",
    journal = "Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences",
    abstract = "Los peces se han demostrado ser organismos modelo para el estudio de las personalidades animales, y una rica literatura documenta diferencias de comportamiento interindividuales consistentes en una variedad de especies. Sin embargo, relativamente pocos estudios han examinado las consecuencias ecológicas de tales diferencias de comportamiento interindividuales consistentes en peces u otros organismos, especialmente bajo condiciones de campo. En esta revisión y perspectiva, discutimos los factores que pueden llevar a la formación y mantenimiento de tipos de comportamiento en poblaciones de peces. Luego examinamos lo que se sabe sobre los efectos de la variación de personalidad en el crecimiento y supervivencia individuales, comportamientos de apareamiento y éxito reproductivo, uso de hábitat, dieta y cambios de nicho ontogenéticos, migración y dispersión, así como posibles consecuencias para las interacciones entre especies y el funcionamiento del ecosistema. Nos enfocamos tanto como sea posible en estudios realizados bajo condiciones naturales o seminaturales, ya que tales estudios de campo son los más relevantes para elucidar las consecuencias ecológicas de la variación de comportamiento. Finalmente, discutimos la posible importancia de las diferencias individuales consistentes en el comportamiento para la gestión y conservación de la pesca, examinando específicamente las consecuencias para la pesca recreativa y comercial, la cría en criaderos y el mejoramiento de stocks.",
    url = "https://doi.org/10.1139/cjfas-2013-0558",
    doi = "10.1139/cjfas-2013-0558",
    openalex = "W1725059466",
    references = "doi101093behecoarp018"
}

Muchas poblaciones microbianas, fúngicas o de oomicetos violan los supuestos para el análisis de genética de poblaciones porque estas poblaciones son clonales, admixtas, parcialmente clonales y/o sexuales. Además, existen pocas herramientas diseñadas específicamente para analizar datos de poblaciones clonales, lo que hace que el análisis sea difícil y desordenado. Desarrollamos el paquete de R poppr, que proporciona herramientas únicas para el análisis de datos de poblaciones admixtas, clonales, mixtas y/o sexuales. Actualmente, poppr puede utilizarse para datos genéticos dominantes/codominantes y haploides/diploides. Los datos pueden importarse desde varios formatos, incluidos archivos de texto formateados con GenAlEx, y pueden analizarse en una jerarquía definida por el usuario que incluye niveles ilimitados de estructura de subpoblación y censura de clones. Las nuevas funciones incluyen el cálculo de la distancia de Bruvo para microsatélites, el análisis por lotes del índice de asociación con varios índices de diversidad genotípica y la representación gráfica, incluidos dendrogramas con soporte de bootstrap y redes de mínima expansión. Si bien las funciones para la diversidad genotípica y la censura de clones son específicas para poblaciones clonales, varias funciones encontradas en poppr también son valiosas para el análisis de cualquier población. Se proporciona un manual con documentación y ejemplos. Poppr es de código abierto y las versiones principales están disponibles en CRAN: http://cran.r-project.org/package=poppr. Más documentación de apoyo y tutoriales se pueden encontrar bajo 'recursos' en: http://grunwaldlab.cgrb.oregonstate.edu/.

@article{doi107717peerj281,
    author = "Kamvar, Zhian N. y Tabima, Javier F. y Grünwald, Niklaus J.",
    title = "Poppr: un paquete de R para el análisis genético de poblaciones con reproducción clonal, parcialmente clonal y/o sexual",
    year = "2014",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "Muchas poblaciones microbianas, fúngicas o de oomicetos violan los supuestos para el análisis de genética de poblaciones porque estas poblaciones son clonales, admixtas, parcialmente clonales y/o sexuales. Además, existen pocas herramientas diseñadas específicamente para analizar datos de poblaciones clonales, lo que hace que el análisis sea difícil y desordenado. Desarrollamos el paquete de R poppr, que proporciona herramientas únicas para el análisis de datos de poblaciones admixtas, clonales, mixtas y/o sexuales. Actualmente, poppr puede utilizarse para datos genéticos dominantes/codominantes y haploides/diploides. Los datos pueden importarse desde varios formatos, incluidos archivos de texto formateados con GenAlEx, y pueden analizarse en una jerarquía definida por el usuario que incluye niveles ilimitados de estructura de subpoblación y censura de clones. Las nuevas funciones incluyen el cálculo de la distancia de Bruvo para microsatélites, el análisis por lotes del índice de asociación con varios índices de diversidad genotípica y la representación gráfica, incluidos dendrogramas con soporte de bootstrap y redes de mínima expansión. Si bien las funciones para la diversidad genotípica y la censura de clones son específicas para poblaciones clonales, varias funciones encontradas en poppr también son valiosas para el análisis de cualquier población. Se proporciona un manual con documentación y ejemplos. Poppr es de código abierto y las versiones principales están disponibles en CRAN: http://cran.r-project.org/package=poppr. Más documentación de apoyo y tutoriales se pueden encontrar bajo 'recursos' en: http://grunwaldlab.cgrb.oregonstate.edu/.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.281",
    doi = "10.7717/peerj.281",
    openalex = "W2016603972",
    references = "doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093genetics893583, doi101111j14718286200501155x, doi1023071934145"
}

Comprender los procesos que moldean los patrones de estructura genética a través del espacio es un objetivo central de la genética de paisajes. Sin embargo, sigue siendo poco claro cómo las características geográficas y las variables ambientales moldean el flujo génico, particularmente para especies marinas en grandes paisajes marinos complejos. Aquí, evaluamos la composición genómica del pez payaso de dos bandas Amphiprion bicinctus en todo su rango geográfico en el Mar Rojo y el Golfo de Adén, así como su pariente cercano, Amphiprion omanensis, endémico de la costa sur de Omán. Tanto el Mar Rojo como el Mar Arábigo son sistemas marinos complejos y ambientalmente heterogéneos que ofrecen un escenario ideal para abordar estas preguntas. Nuestros hallazgos confirman la presencia de dos clusters genéticos previamente reportados para A. bicinctus en el Mar Rojo. Los análisis de estructura genética sugieren una configuración de paisaje marino compleja, con evidencia tanto de aislamiento por distancia (IBD) como de aislamiento por ambiente (IBE). Además de IBD e IBE, la estructura genética entre sitios se explicó mejor cuando también se tuvieron en cuenta dos barreras al flujo génico. Una de estas coincide con un fuerte gradiente oligotrófico-eutrófico alrededor de 16-20˚N en el Mar Rojo. La otra concuerda con una barrera batimétrica histórica en el estrecho de Bab al Mandab. Finalmente, estos datos apoyan la presencia de híbridos interespecíficos en una zona de sutura intermedia en Socotra e indican patrones complejos de admisión genómica en el Golfo de Adén con evidencia de introgresión entre especies. Nuestros hallazgos destacan el poder de los enfoques genómicos recientes para resolver patrones sutiles de flujo génico en paisajes marinos.

@article{doi101111mec13471,
    author = "Saenz‐Agudelo, Pablo y DiBattista, Joseph D. y Piatek, Marek J. y Gaither, Michelle R. y Harrison, Hugo B. y Nanninga, Gerrit B. y Berumen, Michael L.",
    title = "Genética de paisajes a lo largo de gradientes ambientales en la Península Arábiga: perspectivas de la secuenciación ddRAD de peces payaso",
    year = "2015",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Comprender los procesos que moldean los patrones de estructura genética a través del espacio es un objetivo central de la genética de paisajes. Sin embargo, sigue siendo poco claro cómo las características geográficas y las variables ambientales moldean el flujo génico, particularmente para especies marinas en grandes paisajes marinos complejos. Aquí, evaluamos la composición genómica del pez payaso de dos bandas Amphiprion bicinctus en todo su rango geográfico en el Mar Rojo y el Golfo de Adén, así como su pariente cercano, Amphiprion omanensis, endémico de la costa sur de Omán. Tanto el Mar Rojo como el Mar Arábigo son sistemas marinos complejos y ambientalmente heterogéneos que ofrecen un escenario ideal para abordar estas preguntas. Nuestros hallazgos confirman la presencia de dos clusters genéticos previamente reportados para A. bicinctus en el Mar Rojo. Los análisis de estructura genética sugieren una configuración de paisaje marino compleja, con evidencia tanto de aislamiento por distancia (IBD) como de aislamiento por ambiente (IBE). Además de IBD e IBE, la estructura genética entre sitios se explicó mejor cuando también se tuvieron en cuenta dos barreras al flujo génico. Una de estas coincide con un fuerte gradiente oligotrófico-eutrófico alrededor de 16-20˚N en el Mar Rojo. La otra concuerda con una barrera batimétrica histórica en el estrecho de Bab al Mandab. Finalmente, estos datos apoyan la presencia de híbridos interespecíficos en una zona de sutura intermedia en Socotra e indican patrones complejos de admisión genómica en el Golfo de Adén con evidencia de introgresión entre especies. Nuestros hallazgos destacan el poder de los enfoques genómicos recientes para resolver patrones sutiles de flujo génico en paisajes marinos.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.13471",
    doi = "10.1111/mec.13471",
    openalex = "W2197145080",
    references = "doi101111jbi12649"
}

La importancia de la diversidad genética de las plantas (PGD) ahora se reconoce como un área específica, ya que la explosión demográfica con la urbanización y la disminución de las tierras cultivables son factores críticos que contribuyen a la inseguridad alimentaria en el mundo en desarrollo. Los científicos agrícolas se dieron cuenta de que la PGD puede capturarse y almacenarse en forma de recursos genéticos de plantas (PGR), como bancos de genes, bibliotecas de ADN, etc., en el biobanco, que preserva el material genético por largos periodos. Sin embargo, los PGR conservados deben utilizarse para la mejora de cultivos con el fin de satisfacer los futuros desafíos globales relacionados con la seguridad alimentaria y nutricional. Este artículo revisa exhaustivamente cuatro áreas importantes: (i) la importancia de la diversidad genética de las plantas (PGD) y los PGR, especialmente en cultivos de importancia agrícola (principalmente cultivos de campo); (ii) el riesgo asociado con la reducción de la base genética de los cultivares comerciales actuales y el cambio climático; (iii) el análisis de los métodos analíticos existentes de PGD en la era pregenómica y genómica; y (iv) las herramientas modernas disponibles para el análisis de PGD en la era postgenómica. Esta discusión beneficia a la comunidad de científicos de plantas para utilizar los nuevos métodos y tecnologías para una mejor y más rápida evaluación, para la utilización de germoplasma de los bancos de genes en sus programas de mejoramiento aplicados. Con la llegada de nuevas técnicas biotecnológicas, este proceso de manipulación genética ahora se está acelerando y llevando a cabo con mayor precisión (ignorando los efectos ambientales) y de manera más rápida que las técnicas de mejoramiento clásicas. También cabe señalar que los bancos de genes examinan varios problemas con el fin de mejorar los niveles de distribución de germoplasma y su utilización, la duplicación de la identidad de la planta y el acceso a la base de datos, para actividades de premejoramiento. Dado que la investigación en mejoramiento de plantas y el desarrollo de cultivares son componentes integrales de la mejora de la producción de alimentos, por lo tanto, la disponibilidad y el acceso a diversas fuentes genéticas garantizarán que la red global de producción de alimentos se vuelva más sostenible. Los pros y los contras de las herramientas estadísticas básicas y avanzadas disponibles para medir la diversidad genética se discuten brevemente y se proporcionan sus enlaces de origen (principalmente) para facilitar el acceso; por lo tanto, mejora la comprensión de las herramientas y su aplicabilidad práctica para los investigadores.

@article{doi1011552015431487,
    author = "Govindaraj, Mahalingam and Vetriventhan, Mani and Srinivasan, Mahalingam",
    title = "Importance of Genetic Diversity Assessment in Crop Plants and Its Recent Advances: An Overview of Its Analytical Perspectives",
    year = "2015",
    journal = "Genetics Research International",
    abstract = "La importancia de la diversidad genética de las plantas (PGD) ahora se reconoce como un área específica, ya que la explosión demográfica con la urbanización y la disminución de las tierras cultivables son factores críticos que contribuyen a la inseguridad alimentaria en el mundo en desarrollo. Los científicos agrícolas se dieron cuenta de que la PGD puede capturarse y almacenarse en forma de recursos genéticos de plantas (PGR), como bancos de genes, bibliotecas de ADN, etc., en el biobanco, que preserva el material genético por largos periodos. Sin embargo, los PGR conservados deben utilizarse para la mejora de cultivos con el fin de satisfacer los futuros desafíos globales relacionados con la seguridad alimentaria y nutricional. Este artículo revisa exhaustivamente cuatro áreas importantes: (i) la importancia de la diversidad genética de las plantas (PGD) y los PGR, especialmente en cultivos de importancia agrícola (principalmente cultivos de campo); (ii) el riesgo asociado con la reducción de la base genética de los cultivares comerciales actuales y el cambio climático; (iii) el análisis de los métodos analíticos existentes de PGD en la era pregenómica y genómica; y (iv) las herramientas modernas disponibles para el análisis de PGD en la era postgenómica. Esta discusión beneficia a la comunidad de científicos de plantas para utilizar los nuevos métodos y tecnologías para una mejor y más rápida evaluación, para la utilización de germoplasma de los bancos de genes en sus programas de mejoramiento aplicados. Con la llegada de nuevas técnicas biotecnológicas, este proceso de manipulación genética ahora se está acelerando y llevando a cabo con mayor precisión (ignorando los efectos ambientales) y de manera más rápida que las técnicas de mejoramiento clásicas. También cabe señalar que los bancos de genes examinan varios problemas con el fin de mejorar los niveles de distribución de germoplasma y su utilización, la duplicación de la identidad de la planta y el acceso a la base de datos, para actividades de premejoramiento. Dado que la investigación en mejoramiento de plantas y el desarrollo de cultivares son componentes integrales de la mejora de la producción de alimentos, por lo tanto, la disponibilidad y el acceso a diversas fuentes genéticas garantizarán que la red global de producción de alimentos se vuelva más sostenible. Los pros y los contras de las herramientas estadísticas básicas y avanzadas disponibles para medir la diversidad genética se discuten brevemente y se proporcionan sus enlaces de origen (principalmente) para facilitar el acceso; por lo tanto, mejora la comprensión de las herramientas y su aplicabilidad práctica para los investigadores.",
    url = "https://doi.org/10.1155/2015/431487",
    doi = "10.1155/2015/431487",
    openalex = "W1969660305",
    references = "doi101093bioinformaticsbtp187, doi101093bioinformaticsbts460, doi101093oxfordjournalsjhereda109497, doi101111j14718286200501155x, doi101371journalpgen1002453, doi102135cropsci20031235, openalexw2119799171"
}

Las tasas de metabolismo aeróbico varían considerablemente a través de las líneas evolutivas, pero se sabe poco sobre los factores inmediatos y últimos que generan y mantienen esta variabilidad. Utilizando datos de 131 especies de peces teleósteos, realizamos un análisis comparativo filogenético a gran escala de cómo la variación interespecífica en las tasas metabólicas en reposo (RMR) y las tasas metabólicas máximas (MMR) se relaciona con varias variables ecológicas y morfológicas. Las RMR y MMR ajustadas por masa y temperatura están altamente correlacionadas a lo largo de un continuo que abarca un rango de 30 a 40 veces. Los modelos de mínimos cuadrados generalizados filogenéticos sugieren que las RMR y MMR son más altas en especies pelágicas y que las especies con niveles tróficos más altos exhiben MMR elevadas. Esta variación se refleja en varios niveles de organización estructural: el área superficial de las branquias, el contenido de proteínas musculares y la relación de aspecto de la aleta caudal (un proxy para la actividad) están positivamente relacionados con la capacidad aeróbica. El contenido de proteínas musculares y la relación de aspecto de la aleta caudal también están positivamente correlacionados con la RMR. Las líneas tolerantes a la hipoxia se sitúan en el extremo inferior del continuo metabólico. Diferentes estilos de vida ecológicos se asocian con niveles contrastantes de capacidad aeróbica, posiblemente reflejando la interacción entre la selección por un mayor rendimiento locomotor por un lado y la tolerancia a la baja disponibilidad de recursos, particularmente oxígeno, por otro. Estos resultados apoyan el modelo de capacidad aeróbica de la evolución de la endotermia, sugiriendo que las temperaturas corporales elevadas evolucionaron como respuestas correlacionadas a la selección por altos niveles de actividad.

@article{doi101086685893,
    author = "Killen, Shaun S. and Glazier, Douglas S. and Rezende, Enrico L. and Clark, Thomas D. and Atkinson, David and Willener, Astrid S. T. and Halsey, Lewis G.",
    title = "Ecological Influences and Morphological Correlates of Resting and Maximal Metabolic Rates across Teleost Fish Species",
    year = "2016",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Rates of aerobic metabolism vary considerably across evolutionary lineages, but little is known about the proximate and ultimate factors that generate and maintain this variability. Using data for 131 teleost fish species, we performed a large-scale phylogenetic comparative analysis of how interspecific variation in resting metabolic rates (RMRs) and maximum metabolic rates (MMRs) is related to several ecological and morphological variables. Mass- and temperature-adjusted RMR and MMR are highly correlated along a continuum spanning a 30- to 40-fold range. Phylogenetic generalized least squares models suggest that RMR and MMR are higher in pelagic species and that species with higher trophic levels exhibit elevated MMR. This variation is mirrored at various levels of structural organization: gill surface area, muscle protein content, and caudal fin aspect ratio (a proxy for activity) are positively related with aerobic capacity. Muscle protein content and caudal fin aspect ratio are also positively correlated with RMR. Hypoxia-tolerant lineages fall at the lower end of the metabolic continuum. Different ecological lifestyles are associated with contrasting levels of aerobic capacity, possibly reflecting the interplay between selection for increased locomotor performance on one hand and tolerance to low resource availability, particularly oxygen, on the other. These results support the aerobic capacity model of the evolution of endothermy, suggesting elevated body temperatures evolved as correlated responses to selection for high activity levels.",
    url = "https://doi.org/10.1086/685893",
    doi = "10.1086/685893",
    openalex = "W2290005196",
    references = "doi101098rstb20072099, doi101111j1469185x201000122x"
}

FONDO: En los últimos años, varios tipos de marcadores moleculares y nuevos caracteres esqueléticos a microescala han demostrado su potencial como herramientas poderosas para las reconstrucciones filogenéticas y la taxonomía de alto nivel de los corales escleractinios. No obstante, la discriminación de taxones estrechamente relacionados sigue siendo altamente controvertida en la investigación de corales escleractinios. Aquí utilizamos genomas mitocondriales completos secuenciados recientemente y 30 microsatélites para definir la divergencia genética entre dos taxones azooxantelados estrechamente relacionados de la familia Caryophylliidae: el solitario Desmophyllum dianthus y el colonial Lophelia pertusa. RESULTADOS: En la región control mitocondrial, un asombroso 99,8 % de los nucleótidos entre L. pertusa y D. dianthus fueron idénticos. La variabilidad de los genomas mitocondriales de las dos especies está representada por solo 12 sustituciones no sinónimas de un total de 19 sustituciones de nucleótidos. El análisis de la secuencia de microsatélites (37 loci) de L. pertusa y D. dianthus mostró que la similitud genética es de aproximadamente el 97 %. Nuestros resultados también indicaron que L. pertusa y D. dianthus muestran una alta plasticidad esquelética en la forma del corallum y similitud en la ontogenia esquelética, caracteres micromorfológicos (granulaciones septales y de pared) y microestructurales (disposición de depósitos de acreción rápida, depósitos de engrosamiento). CONCLUSIONES: Molecular y morfológicamente, el solitario Desmophyllum y el dendroide Lophelia parecen ser significativamente más similares entre sí que otros géneros de coral inequívocos analizados hasta la fecha. Esto conduce consecuentemente a asignar ambos taxones bajo el nombre genérico Desmophyllum (prioridad por fecha de publicación). Los hallazgos de este estudio demuestran que la colonialidad puede no ser un carácter taxonómico robusto en los corales escleractinios.

@article{doi101186s1286201606548,
    author = "Addamo, Anna Maria y Vertino, Agostina y Stolarski, Jarosław y García-Jiménez, Ricardo y Taviani, Marco y Machordom, Annie",
    title = "Fusión de géneros de corales escleractinios: la abrumadora similitud genética entre el solitario Desmophyllum y el colonial Lophelia",
    year = "2016",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    abstract = "FONDO: En los últimos años, varios tipos de marcadores moleculares y nuevos caracteres esqueléticos a microescala han demostrado su potencial como herramientas poderosas para las reconstrucciones filogenéticas y la taxonomía de alto nivel de los corales escleractinios. No obstante, la discriminación de taxones estrechamente relacionados sigue siendo altamente controvertida en la investigación de corales escleractinios. Aquí utilizamos genomas mitocondriales completos secuenciados recientemente y 30 microsatélites para definir la divergencia genética entre dos taxones azooxantelados estrechamente relacionados de la familia Caryophylliidae: el solitario Desmophyllum dianthus y el colonial Lophelia pertusa. RESULTADOS: En la región control mitocondrial, un asombroso 99,8 % de los nucleótidos entre L. pertusa y D. dianthus fueron idénticos. La variabilidad de los genomas mitocondriales de las dos especies está representada por solo 12 sustituciones no sinónimas de un total de 19 sustituciones de nucleótidos. El análisis de la secuencia de microsatélites (37 loci) de L. pertusa y D. dianthus mostró que la similitud genética es de aproximadamente el 97 %. Nuestros resultados también indicaron que L. pertusa y D. dianthus muestran una alta plasticidad esquelética en la forma del corallum y similitud en la ontogenia esquelética, caracteres micromorfológicos (granulaciones septales y de pared) y microestructurales (disposición de depósitos de acreción rápida, depósitos de engrosamiento). CONCLUSIONES: Molecular y morfológicamente, el solitario Desmophyllum y el dendroide Lophelia parecen ser significativamente más similares entre sí que otros géneros de coral inequívocos analizados hasta la fecha. Esto conduce consecuentemente a asignar ambos taxones bajo el nombre genérico Desmophyllum (prioridad por fecha de publicación). Los hallazgos de este estudio demuestran que la colonialidad puede no ser un carácter taxonómico robusto en los corales escleractinios.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12862-016-0654-8",
    doi = "10.1186/s12862-016-0654-8",
    openalex = "W2402769049",
    references = "doi101111zoj12092"
}

) se ha convertido en una industria compleja y multimillonaria. La pesca es motivo de preocupación debido a los altos niveles de captura y a los posibles impactos indirectos de la eliminación de cabrillas de California sobre la estructura y función de los ecosistemas de bosques de algas. Las cabrillas de California son hermafroditas protoginos que, como depredadoras de erizos de mar y otros invertebrados, son componentes críticos de los ecosistemas de bosques de algas en el noroeste del Pacífico. La sobrepesca puede desencadenar cascadas tróficas y disfunción ecológica generalizada cuando también se pierden otros depredadores de erizos del sistema. Se sabe poco sobre la ecología y la abundancia de las cabrillas antes de la explotación comercial. La falta de una perspectiva histórica crea un vacío para evaluar las medidas de gestión pesquera y las reservas marinas que buscan reconstruir las poblaciones de cabrillas hasta las condiciones de referencia históricas. Utilizamos datos de abundancia poblacional y estructura de tamaño procedentes del registro zooarqueológico, junto con datos isotópicos, para evaluar la salud y viabilidad a largo plazo de la pesca de cabrillas en el sur de California. Nuestros resultados indican que la importancia de las cabrillas en la dieta de los nativos chumash variaba espacialmente a lo largo de las Islas del Canal, reflejando patrones biogeográficos modernos. Al comparar muestras antiguas (~10.000 años calibrados antes del presente hasta 1825 d.C.) y modernas, observamos variabilidad y disminuciones significativas en la abundancia relativa de cabrillas, reducciones en las distribuciones de frecuencia de tamaño y cambios en el nicho dietético entre las colecciones antiguas y modernas. Estos resultados destacan cómo la pesca selectiva por tamaño puede alterar el papel ecológico de los depredadores clave y cómo los datos zooarqueológicos pueden informar la gestión pesquera al establecer líneas base históricas que ayuden a la futura conservación.

@article{doi101126sciadv1601759,
    author = "Braje, Todd J. y Rick, Torben C. y Szpak, Paul y Newsome, Seth D. y McCain, Joseph M. y Smith, Emma A. Elliott y Glassow, Michael A. y Hamilton, Scott L.",
    title = "Ecología histórica y la conservación de peces grandes, hermafroditas, en ecosistemas de bosques de algas de la costa del Pacífico",
    year = "2017",
    journal = "Science Advances",
    abstract = ") se ha convertido en una industria compleja y multimillonaria. La pesca es motivo de preocupación debido a los altos niveles de captura y a los posibles impactos indirectos de la eliminación de cabrillas de California sobre la estructura y función de los ecosistemas de bosques de algas. Las cabrillas de California son hermafroditas protoginos que, como depredadoras de erizos de mar y otros invertebrados, son componentes críticos de los ecosistemas de bosques de algas en el noroeste del Pacífico. La sobrepesca puede desencadenar cascadas tróficas y disfunción ecológica generalizada cuando también se pierden otros depredadores de erizos del sistema. Se sabe poco sobre la ecología y la abundancia de las cabrillas antes de la explotación comercial. La falta de una perspectiva histórica crea un vacío para evaluar las medidas de gestión pesquera y las reservas marinas que buscan reconstruir las poblaciones de cabrillas hasta las condiciones de referencia históricas. Utilizamos datos de abundancia poblacional y estructura de tamaño procedentes del registro zooarqueológico, junto con datos isotópicos, para evaluar la salud y viabilidad a largo plazo de la pesca de cabrillas en el sur de California. Nuestros resultados indican que la importancia de las cabrillas en la dieta de los nativos chumash variaba espacialmente a lo largo de las Islas del Canal, reflejando patrones biogeográficos modernos. Al comparar muestras antiguas (\textasciitilde 10.000 años calibrados antes del presente hasta 1825 d.C.) y modernas, observamos variabilidad y disminuciones significativas en la abundancia relativa de cabrillas, reducciones en las distribuciones de frecuencia de tamaño y cambios en el nicho dietético entre las colecciones antiguas y modernas. Estos resultados destacan cómo la pesca selectiva por tamaño puede alterar el papel ecológico de los depredadores clave y cómo los datos zooarqueológicos pueden informar la gestión pesquera al establecer líneas base históricas que ayuden a la futura conservación.",
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.1601759",
    doi = "10.1126/sciadv.1601759",
    openalex = "W2584763220",
    references = "doi101111j14672979201200464x"
}

expuestos a condiciones de blanqueamiento en un experimento de mesocosma a largo plazo e inoculados con un consorcio BMC seleccionado o un placebo de solución salina. Todos los corales se vieron afectados por el estrés térmico, pero el "trastorno post-estrés térmico" observado fue mitigado por los BMCs, indicado por patrones de degradación de dimetilsulfoniopropionato, mantenimiento de lípidos y reprogramación transcripcional del hospedador coral de genes de reestructuración celular, reparación, protección contra el estrés e inmunidad, concomitante con un aumento del 40% en la tasa de supervivencia y un rendimiento fotosintético estable por parte de las algas endosimbióticas. Este estudio proporciona información sobre las respuestas que subyacen a la manipulación del hospedador probiótico. Demostramos que los BMCs desencadenan un proceso dinámico de reestructuración del microbioma que instiga alteraciones genéticas y metabólicas en el hospedador coral que finalmente mitigan el blanqueamiento y la mortalidad del coral.

@article{doi101126sciadvabg3088,
    author = "Santoro, Érika P. y Borges, Ricardo M. y Espinoza, Josh L. y Freire, Marcelo y Messias, Camila S. M. A. y Villela, Helena y de Mattos Pereira, Leandro y Vilela, Caren L. S. y Rosado, João G. y Cardoso, Pedro y Rosado, Phillipe M. y Assis, Juliana M. y Duarte, Gustavo y Perna, Gabriela y Rosado, Alexandre Soares y Macrae, Andrew y Dupont, Christopher L. y Nelson, Karen E. y Sweet, Michael y Voolstra, Christian R. y Peixoto, Raquel S.",
    title = "La manipulación del microbioma de coral provoca una reestructuración metabólica y genética para mitigar el estrés térmico y evitar la mortalidad",
    year = "2021",
    journal = "Science Advances",
    abstract = {expuestos a condiciones de blanqueamiento en un experimento de mesocosma a largo plazo e inoculados con un consorcio BMC seleccionado o un placebo de solución salina. Todos los corales se vieron afectados por el estrés térmico, pero el "trastorno post-estrés térmico" observado fue mitigado por los BMCs, indicado por patrones de degradación de dimetilsulfoniopropionato, mantenimiento de lípidos y reprogramación transcripcional del hospedador coral de genes de reestructuración celular, reparación, protección contra el estrés e inmunidad, concomitante con un aumento del 40% en la tasa de supervivencia y un rendimiento fotosintético estable por parte de las algas endosimbióticas. Este estudio proporciona información sobre las respuestas que subyacen a la manipulación del hospedador probiótico. Demostramos que los BMCs desencadenan un proceso dinámico de reestructuración del microbioma que instiga alteraciones genéticas y metabólicas en el hospedador coral que finalmente mitigan el blanqueamiento y la mortalidad del coral.},
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.abg3088",
    doi = "10.1126/sciadv.abg3088",
    openalex = "W3191241810",
    references = "doi101016jzool201802004, doi101038s41467019109695"
}

La evaluación de riesgos ecológicos (ERE) se ha utilizado ampliamente para evaluar la vulnerabilidad de las especies a los impactos de la pesca y, posteriormente, para priorizar cualquier acción de gestión adicional para reducir dichos impactos. El marco de Evaluación de Riesgos Ecológicos para los Efectos de la Pesca se basa en una jerarquía de herramientas cualitativas y semicuantitativas que funcionan bien en situaciones con datos insuficientes. Este estudio utilizó primero las herramientas de Escala de Intensidad y Consecuencia (SICA) y Análisis de Productividad y Susceptibilidad (PSA) para evaluar los impactos del arrastre de fondo industrial de camarón de fondo marrón del sur sobre la plataforma continental amazónica en el norte de Brasil. Se identificaron un total de 540 especies con interacción directa o indirecta con los arrastreros. La SICA identificó que el principal riesgo estaba relacionado con las actividades de captura de pesca, lo que podría afectar el tamaño de la población de las especies. De las 47 especies evaluadas en el PSA, 12 mostraron baja vulnerabilidad, 23 mostraron vulnerabilidad moderada y 12 mostraron alta vulnerabilidad a los impactos de la pesca. La futura gestión de la pesca debería centrarse en reducir la vulnerabilidad de las especies priorizando la recopilación de datos para las especies más en riesgo. Además, se deben emplear modificaciones en el equipo de pesca, como dispositivos de exclusión de captura incidental (BRDs), para disminuir la vulnerabilidad de las especies.

@article{doi103389fmars20251490894,
    author = "Peixoto, Ualerson Iran y Hijaz, Miriana y Hobday, Alistair J. y Bentes, Bianca y Passarone, Rafaela y Lucena‐Frédou, Flávia y Isaac, Victoria",
    title = "Evaluación de riesgos ecológicos de los recursos marinos capturados como captura incidental en la pesca industrial de camarón de arrastre de fondo en la plataforma continental amazónica",
    year = "2025",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "La evaluación de riesgos ecológicos (ERE) se ha utilizado ampliamente para evaluar la vulnerabilidad de las especies a los impactos de la pesca y, posteriormente, para priorizar cualquier acción de gestión adicional para reducir dichos impactos. El marco de Evaluación de Riesgos Ecológicos para los Efectos de la Pesca se basa en una jerarquía de herramientas cualitativas y semicuantitativas que funcionan bien en situaciones con datos insuficientes. Este estudio utilizó primero las herramientas de Escala de Intensidad y Consecuencia (SICA) y Análisis de Productividad y Susceptibilidad (PSA) para evaluar los impactos del arrastre de fondo industrial de camarón de fondo marrón del sur sobre la plataforma continental amazónica en el norte de Brasil. Se identificaron un total de 540 especies con interacción directa o indirecta con los arrastreros. La SICA identificó que el principal riesgo estaba relacionado con las actividades de captura de pesca, lo que podría afectar el tamaño de la población de las especies. De las 47 especies evaluadas en el PSA, 12 mostraron baja vulnerabilidad, 23 mostraron vulnerabilidad moderada y 12 mostraron alta vulnerabilidad a los impactos de la pesca. La futura gestión de la pesca debería centrarse en reducir la vulnerabilidad de las especies priorizando la recopilación de datos para las especies más en riesgo. Además, se deben emplear modificaciones en el equipo de pesca, como dispositivos de exclusión de captura incidental (BRDs), para disminuir la vulnerabilidad de las especies.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2025.1490894",
    doi = "10.3389/fmars.2025.1490894",
    openalex = "W4407112428",
    references = "doi101016jtree200409004, doi101038s41586020031739, doi101086401873, doi101126science1059199, doi101126science1098222, doi101126science1255641, doi101126science2795352860, doi101146annurevecolsys33010802150515, doi1023071440619, doi1023071930126, openalexw580562315"
}