1. del 100º Meridiano (EE. UU.), Geographical Surveys West y Cope, E. D., 1874, Reporte sobre fósiles de vertebrados descubiertos en Nuevo México: con descripciones de nuevas especies /: Government Printing Office eBooks.
Resumen
Cope, paleontólogo, desde su campamento, en el arroyo Galinas, en la cuenca del río Grande, incluyendo una descripción de nuevas especies de fósiles de vertebrados, y de una extensa serie de depósitos de la edad Eoceno, indicando la existencia
BibTeX
@book{doi105962bhltitle166574,
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2. Haldane, J. B. S., 1949, SUGGESTIONES SOBRE LA MEDIDA CUANTITATIVA DE LAS TASAS DE EVOLUCIÓN: Evolution.
DOI: 10.1111/j.1558-5646.1949.tb00004.x
Resumen
Artículo de revista SUGGESTIONES SOBRE LA MEDIDA CUANTITATIVA DE LAS TASAS DE EVOLUCIÓN Obtener acceso J. B. S. Haldane J. B. S. Haldane Dept. of Biometry University College London Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Evolution, Volumen 3, Número 1, 1 de marzo de 1949, Páginas 51–56, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00004.x Publicado: 01 de marzo de 1949 Historial del artículo Recibido: 05 de noviembre de 1948 Publicado: 01 de marzo de 1949
BibTeX
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3. Haldane, J. B. S, 1949, Sugerencias sobre la medición cuantitativa de las tasas de evolución.
BibTeX
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4. Dobzhansky, T, 1950, Evolución en los Trópicos.
BibTeX
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5. Ehrilch, P. R. y Holm, R. W, 1963, El proceso de la evolución.
BibTeX
@misc{ehrilch1963the3,
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6. Patterson, Bryan y Pascual, Rosendo, 1968, La fauna de mamíferos fósiles de Sudamérica: The Quarterly Review of Biology.
Resumen
De los tres continentes del sur, Sudamérica estuvo más aislada durante el Terciario que África y menos aislada que Australia. Su registro de vida mamífera del Cenozoico es mejor que el de cualquiera de ellos. Este registro sugiere que alrededor del inicio del Cenozoico, Sudamérica recibió a unos pocos inmigrantes marinos—marsupiales, edentados, ungulados—que alcanzaron el continente a través de una barrera acuática. La zona de origen fue probablemente Centroamérica, que formó una península tropical de Norteamérica hasta cerca del final del Terciario. Algunos inmigrantes marinos más tardíos alcanzaron el continente a través de la barrera acuática: roedores en la parte posterior del Eoceno, primates entonces o en el Oligoceno temprano, y prociónidos quizás a finales del Mioceno. De los descendientes de estos pocos inmigrantes evolucionó una fauna equilibrada que fue notablemente diferente en composición a la de otros continentes. La evolución de los diversos grupos que la componen se presenta y discute brevemente. Al final del Terciario, el aislamiento del continente terminó con la formación del Istmo de Panamá. Entonces comenzó el intercambio faunístico entre Norteamérica y Sudamérica y continúa hasta hoy. La mayoría de los participantes del norte en este intercambio penetraron profundamente en Sudamérica. Los participantes del sur, avanzando hacia un continente sometido a glaciaciones continentales periódicas, tuvieron menos éxito; la mayoría de ellos no penetró más allá de la zona tropical. La competencia y la extinción durante el intercambio faunístico ocurrieron principalmente entre los carnívoros, siendo los marsupiales del sur reemplazados por los placentarios del norte. Las extinciones espectaculares, que involucraron principalmente mamíferos grandes de ascendencia tanto del norte como del sur, ocurrieron al final del Pleistoceno; la llegada del hombre fue probablemente un factor importante.
BibTeX
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7. Glaessner, Martin F., 1969, RASTRAS FÓSILES DEL PRECÁMBRICO Y DEL BÁSICO CÁMBRICO: Lethaia.
DOI: 10.1111/j.1502-3931.1969.tb01258.x
Resumen
Ciertas configuraciones similares a gusanos en las rocas se reconocen como rellenos de grietas de contracción. Se describen brevemente algunos auténticos rastros fósiles precámbricos. El Cámbrico temprano contiene un ensamblaje más rico, que incluye algunos géneros de formas distintivos y ampliamente distribuidos. El estudio de los primeros rastros fósiles lleva a conclusiones no solo sobre facies, sino también sobre la evolución del comportamiento y la morfología funcional en organismos de cuerpo blando.
BibTeX
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8. Schlitter, Duane A. y Misonne, Xavier, 1973, Muridae africanos e indoaustralianos: Tendencias evolutivas: Journal of Mammalogy.
Resumen
Misonne, X. Muridae africanos e indoaustralianos: Tendencias evolutivas. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Bélgica. Annales, Serie In-8°, Ciencias Zoológicas, 172:1–219 Obtener acceso Misonne X.Muridae africanos e indoaustralianos: Tendencias evolutivas. Musee Royal de L'Afrique Centrale, Tervuren, Bélgica. Annales, Serie In-8°, Ciencias Zoológicas, 172: 1–219, 27 pls., 10 figs, en texto, 1969. No se indica precio. Duane A. Schlitter Duane A. Schlitter Departamento de Zoología, Universidad de Maryland, College Park, 20742 Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Journal of Mammalogy, Volumen 54, Número 3, 31 de agosto de 1973, Páginas 795–796, https://doi.org/10.2307/1378990 Publicado: 31 de agosto de 1973
BibTeX
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9. Valen, Leigh Van, 1973, UNA NUEVA LEY DE LA EVOLUCIÓN.: Entomología Médica y Zoología.
BibTeX
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10. Gingerich, Philip D., 1974, VARIABILIDAD DEL TAMAÑO DE LOS DIENTES EN MAMÍFEROS VIVOS Y EL DIAGNÓSTICO DE ESPECIES FÓSILES SIMPÁTRICAS CERCANAMENTE RELACIONADAS: Journal of Paleontology.
Resumen
Las denticiones de especies fósiles (o vivas) de mamíferos simpátricas que comparten un ancestro común relativamente reciente a menudo no pueden distinguirse por la forma sola. En tales casos, las diferencias de tamaño son importantes para diagnosticar las especies. Las mediciones de la longitud y el ancho de los molares y premolares inferiores de grandes muestras de 19 especies de mamíferos vivos demuestran que M1 es usualmente el menos variable en tamaño, y que P3, P4 y M3 son los más variables. La baja variabilidad de M1 se presume que está relacionada con el hecho de que es el primer diente permanente en formarse y erupcionar, y con su posición central en la fila de dientes. Debido a su baja variabilidad, M1 es el mejor diente sobre el cual basar diagnósticos de tamaño de especies fósiles simpátricas muy cercanamente relacionadas. Se dan ejemplos del diagnóstico de dos especies de los primates fósiles Plesiadapis (en Cernay), Pelycodus (en Avenay) y Protoadapis (en Grauves). La capacidad de distinguir especies simpátricas cercanamente relacionadas es fundamental para reconstruir la historia filogenética de cualquier grupo a partir del registro fósil.
BibTeX
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11. 1977, Patrones de la evolución ilustrados por el registro fósil: Avances en Paleontología y Estratigrafía.
DOI: 10.1016/s0920-5446(08)x7012-8
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12. Gingerich, P. D, 1977, Patrones de evolución en el registro fósil de los mamíferos, en Hallam, A., ed., Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil: Ámsterdam, Elsevier, p. 469-500.
BibTeX
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13. Hallam, A, 1977, Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil, 5 de Avances en Paleontología y Estratigrafía: Ámsterdam, Elsevier.
BibTeX
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14. Bretsky, Sara S., 1978, Patrones de la evolución ilustrados por el registro fósil. A. Hallam: The Quarterly Review of Biology: v. 53, no. 4: p. 431-432.
BibTeX
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15. SIMPSON, G, 1978, Patrones de evolución, como se ilustra por el registro fósil: Earth-Science Reviews: v. 14, no. 2: p. 177-178.
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16. Cowen, R., 1979, Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil: Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology: v. 28: p. 323-324.
DOI: 10.1016/0031-0182(79)90127-5
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17. Haugh, Bruce N., 1979, Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil: Precambrian Research: v. 8, no. 1-2: p. 147-148.
DOI: 10.1016/0301-9268(79)90046-9
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18. Sepkoski, J. John, 1981, Una descripción analítica de factores del registro fósil marino del Fanerozoico: Paleobiología.
DOI: 10.1017/s0094837300003778
Resumen
Se analizan datos sobre el número de familias marinas dentro de 91 clases metazoanas conocidas a partir del registro fósil del Fanerozoico. La distribución de las 2800 familias fósiles entre las clases es muy desigual, con la mayoría perteneciendo a una pequeña minoría de clases. De manera similar, la distribución estratigráfica de las clases es muy desigual, con la mayoría apareciendo por primera vez a principios del Paleozoico y con muchas de las clases más pequeñas extinguiéndose antes del final de esa era. Sin embargo, a pesar de esta desigualdad, un análisis de factores en modo Q indica que la estructura de estos datos es bastante simple. Solo se necesitan tres factores para explicar más del 90% de los datos. Estos factores se interpretan como reflejo de las tres grandes «faunas evolutivas» del registro fósil marino del Fanerozoico: una fauna cámbrica dominada por trilobites, una fauna paleozoica tardía dominada por braquiópodos y una fauna mesozoica-cenozoica, o «moderna», dominada por moluscos. Factores menores se relacionan con el lento cambio taxonómico dentro de las faunas principales a lo largo del tiempo y con aspectos únicos de taxones y tiempos particulares. Cada una de las tres faunas principales parece tener su propia diversidad característica, de modo que su expansión o contracción parece estar íntimamente asociada con una fase particular en la historia de la diversidad marina total. La fauna cámbrica se expande rápidamente durante las radiaciones cámbricas tempranas y mantiene la dominancia durante el «equilibrio» cámbrico medio a tardío. La fauna paleozoica asciende entonces a la dominancia durante las radiaciones ordovícicas, que aumentan drásticamente la diversidad; esta nueva fauna mantiene entonces la dominancia a lo largo del largo intervalo de aparente equilibrio que dura hasta el final de la Era Paleozoica. La fauna moderna, que aumenta lentamente en importancia durante la Era Paleozoica, asciende rápidamente a la dominancia con las extinciones del Pérmico tardío y mantiene ese estatus durante el aumento general de la diversidad hasta el aparente máximo en el Neógeno. El aumento de diversidad asociado con la expansión de cada nueva fauna parece coincidir con una disminución aproximadamente exponencial de la fauna previamente dominante, sugiriendo un posible desplazamiento de cada fauna evolutiva por su sucesora.
BibTeX
@article{doi101017s0094837300003778,
author = "Sepkoski, J. John",
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19. Cloudsley‐Thompson, J. L. y Soulé, Michael E. y Wilcox, Bruce A., 1981, Conservation Biology. An Evolutionary-Ecological Perspective.: Journal of Applied Ecology.
BibTeX
@article{doi1023072402394,
author = "Cloudsley‐Thompson, J. L. y Soulé, Michael E. y Wilcox, Bruce A.",
title = "Conservation Biology. An Evolutionary-Ecological Perspective.",
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journal = "Journal of Applied Ecology",
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20. Funk, Vicki A. y Eldredge, Niles y Cracraft, Joël, 1981, Patrones filogenéticos y el proceso evolutivo.: Brittonia.
BibTeX
@article{doi1023072806339,
author = "Funk, Vicki A. y Eldredge, Niles y Cracraft, Joël",
title = "Patrones filogenéticos y el proceso evolutivo.",
year = "1981",
journal = "Brittonia",
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doi = "10.2307/2806339",
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21. Jaanusson, V, 1981, Umbrales funcionales en el progreso evolutivo.
BibTeX
@misc{jaanusson1981functional7,
author = "Jaanusson, V",
title = "Umbrales funcionales en el progreso evolutivo",
year = "1981",
howpublished = "Lethaia, v. 14, p. 251-260",
note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Jaanusson, V., 1981, Umbrales funcionales en el progreso evolutivo: Lethaia, v. 14, p. 251-260.}"
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22. Gingerich, Philip D. y Smith, B. Holly y Rosenberg, Karen, 1982, Escalamiento alométrico en la dentición de primates y predicción del peso corporal a partir del tamaño de los dientes en fósiles: American Journal of Physical Anthropology.
Resumen
El tamaño de los dientes varía exponencialmente con el peso corporal en los primates. La transformación logarítmica del área de la corona dental y el peso corporal produce un modelo lineal con pendiente 0.67 como línea base isométrica (geométrica) para el estudio de la alometría dental. Este modelo se compara con el predicho por el escalamiento metabólico (pendiente = 0.75). Tarsius y otros insectívoros tienen dientes más grandes para su tamaño corporal que los primates generalizados y no se incluyen en este análisis. Entre los primates generalizados, el tamaño de los dientes está altamente correlacionado con el tamaño corporal. Las correlaciones de los dientes laterales superiores e inferiores con el tamaño corporal varían de 0.90 a 0.97, dependiendo de la posición del diente. Los dientes laterales centrales (P44 y M11) tienen coeficientes alométricos que varían de 0.57 a 0.65, cayendo muy por debajo del escalamiento geométrico. Los dientes laterales anteriores y posteriores escalan a o por encima del escalamiento metabólico. Considerados individualmente o como un grupo, los dientes laterales superiores escalan alométricamente con coeficientes más bajos que los dientes laterales inferiores correspondientes; lo contrario es cierto para los incisivos. La suma de las áreas de las coronas de todos los dientes laterales superiores escala significativamente por debajo del escalamiento geométrico, mientras que la suma de las áreas de las coronas de todos los dientes laterales inferiores aproxima el escalamiento geométrico. El tamaño de los dientes puede utilizarse para predecir el peso corporal de los primates fósiles generalizados. Esto se ilustra para Aegyptopithecus y otros primates del Eoceno, Oligoceno y Mioceno. Las regresiones basadas en el tamaño de los dientes en primates generalizados producen estimaciones razonables del peso corporal, pero queda mucho por aprender sobre el escalamiento del tamaño de los dientes y el tamaño corporal en grupos sistemáticos más restringidos y gremios dietéticos.
BibTeX
@article{doi101002ajpa1330580110,
author = "Gingerich, Philip D. and Smith, B. Holly and Rosenberg, Karen",
title = "Escalamiento alométrico en la dentición de primates y predicción del peso corporal a partir del tamaño de los dientes en fósiles",
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journal = "American Journal of Physical Anthropology",
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23. Raup, David M. y Sepkoski, J. John, 1982, Extinciones masivas en el registro fósil marino: Science.
DOI: 10.1126/science.215.4539.1501
Resumen
Una nueva compilación de datos fósiles sobre familias de invertebrados y vertebrados indica que cuatro extinciones masivas en el ámbito marino son estadísticamente distintas de los niveles de extinción de fondo. Estas cuatro ocurrieron a finales de los períodos Ordovícico, Pérmico, Triásico y Cretácico. Un quinto evento de extinción en el Devónico destaca del fondo pero no es estadísticamente significativo en estos datos. Las tasas de extinción de fondo parecen haber disminuido desde la época Cámbrica, lo cual es consistente con la predicción de que la optimización de la aptitud debería aumentar a través del tiempo evolutivo.
BibTeX
@article{doi101126science21545391501,
author = "Raup, David M. and Sepkoski, J. John",
title = "Mass Extinctions in the Marine Fossil Record",
year = "1982",
journal = "Science",
abstract = "A new compilation of fossil data on invertebrate and vertebrate families indicates that four mass extinctions in the marine realm are statistically distinct from background extinction levels. These four occurred late in the Ordovician, Permian, Triassic, and Cretaceous periods. A fifth extinction event in the Devonian stands out from the background but is not statistically significant in these data. Background extinction rates appear to have declined since Cambrian time, which is consistent with the prediction that optimization of fitness should increase through evolutionary time.",
url = "https://doi.org/10.1126/science.215.4539.1501",
doi = "10.1126/science.215.4539.1501",
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24. Jablonski, David y Sepkoski, J. John y Bottjer, David J. y Sheehan, Peter M., 1983, Patrones costero-continental en la evolución de comunidades de plataforma del Fanerozoico: Science.
DOI: 10.1126/science.222.4628.1123
Resumen
El análisis de conglomerados de comunidades bentónicas marinas del Cámbrico-Ordovícico y el análisis de comunidades y trófico de faunas de plataforma del Cretácico tardío indican que las innovaciones ecológicas principales aparecieron en entornos costeros y luego se expandieron hacia afuera a través de la plataforma a expensas de tipos de comunidad más antiguos. Este patrón evolutivo de innovación costera y arcaico continental es sorprendente a la luz de las tasas de turnover de especies generalmente más altas de los clados continentales. Este patrón probablemente resulta de tasas de extinción diferenciales de los clados costeros en comparación con los clados continentales, o de tasas de origen diferenciales de nuevas asociaciones ecológicas o novedades evolutivas en entornos costeros.
BibTeX
@article{doi101126science22246281123,
author = "Jablonski, David y Sepkoski, J. John y Bottjer, David J. y Sheehan, Peter M.",
title = "Patrones costero-continental en la evolución de comunidades de plataforma del Fanerozoico",
year = "1983",
journal = "Science",
abstract = "El análisis de conglomerados de comunidades bentónicas marinas del Cámbrico-Ordovícico y el análisis de comunidades y trófico de faunas de plataforma del Cretácico tardío indican que las innovaciones ecológicas principales aparecieron en entornos costeros y luego se expandieron hacia afuera a través de la plataforma a expensas de tipos de comunidad más antiguos. Este patrón evolutivo de innovación costera y arcaico continental es sorprendente a la luz de las tasas de turnover de especies generalmente más altas de los clados continentales. Este patrón probablemente resulta de tasas de extinción diferenciales de los clados costeros en comparación con los clados continentales, o de tasas de origen diferenciales de nuevas asociaciones ecológicas o novedades evolutivas en entornos costeros.",
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25. Ali, M. A, 1984, Fotorecepción y Visión en Invertebrados: Nueva York, Plenum Press.
BibTeX
@book{ali1984photoreception1,
author = "Ali, M. A",
title = "Fotorecepción y Visión en Invertebrados",
year = "1984",
publisher = "Nueva York, Plenum Press",
note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ali, M. A., 1984, Fotorecepción y Visión en Invertebrados: Nueva York, Plenum Press.}"
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26. Gingerich, Philip D., 1984, Evolución de los primates: Evidencia del registro fósil, morfología comparada y biología molecular: American Journal of Physical Anthropology.
Resumen
Nuestra comprensión de la evolución de los primatos se basa finalmente en los patrones de relación filética y cambio morfológico documentados en el registro fósil. La interpretación estratofenética de los primates vivos y fósiles ofrece una alternativa objetiva a la arbitraria escala de la naturaleza asumida implícitamente en la biología comparada tradicional. Los fósiles proporcionan un esquema de la historia de los primatos que limita los análisis comparativos que incorporan taxones y características morfológicas no representados en el registro fósil. Los taxones existentes sin parientes prehistóricos conocidos pueden interpolarse en este esquema mediante análisis cladístico deductivo de características morfológicas y similitud molecular general. El análisis cladístico proporciona un método para evaluar la fuerza relativa de los vínculos estratofenéticos entre taxones. El nodo filético que conecta Anthropoidea-Adapoidea-Lemuroidea se analiza aquí como ejemplo: el vínculo entre Adapoidea del Eoceno y Anthropoidea primitivos parece más fuerte que el entre Adapoidea y Lemuroidea porque se basa en características compartidas derivadas en lugar de características compartidas primitivas. La integración completa de los resultados moleculares con la información morfológica requiere una mejor comprensión de las tasas de cambio molecular a lo largo del tiempo geológico. Las tasas de evolución molecular pueden estudiarse utilizando tiempos de divergencia documentados paleontológicamente para Prosimii-Anthropoidea (ca. 55 m.y.B.P.), Platyrrhini-Catarrhini (ca. 40 m.y.B.P.) y Hominoidea-Cercopithecoidea (ca. 25 m.y.B.P.). Las distancias inmunológicas combinadas con estos tiempos de divergencia indican que la albúmina de los primates, ampliamente utilizada como reloj molecular en primatología, ha evolucionado de manera no lineal a lo largo del tiempo geológico. Un reloj de albúmina no lineal arroja tiempos de divergencia de aproximadamente 9 millones de años antes del presente para humanos y chimpancés, y aproximadamente 13 millones de años antes del presente para humanos y orangutanes (comparado con 4 m.y.B.P. y 7 m.y.B.P., respectivamente, basándose en un reloj de albúmina lineal). La aparente desaceleración de la evolución de la albúmina con el tiempo aún queda por explicarse completamente. Otras proteínas y ácidos nucleicos pueden proporcionar mejores relojes. El análisis cladístico de características morfológicas y el estudio comparativo de la estructura molecular, interpretados en el contexto del registro fósil, prometen contribuir a una comprensión más completa de la evolución de los primatos.
BibTeX
@article{doi101002ajpa1330270504,
author = "Gingerich, Philip D.",
title = "Primate evolution: Evidence from the fossil record, comparative morphology, and molecular biology",
year = "1984",
journal = "American Journal of Physical Anthropology",
abstract = "Nuestra comprensión de la evolución de los primatos se basa finalmente en los patrones de relación filética y cambio morfológico documentados en el registro fósil. La interpretación estratofenética de los primates vivos y fósiles ofrece una alternativa objetiva a la arbitraria escala de la naturaleza asumida implícitamente en la biología comparada tradicional. Los fósiles proporcionan un esquema de la historia de los primatos que limita los análisis comparativos que incorporan taxones y características morfológicas no representados en el registro fósil. Los taxones existentes sin parientes prehistóricos conocidos pueden interpolarse en este esquema mediante análisis cladístico deductivo de características morfológicas y similitud molecular general. El análisis cladístico proporciona un método para evaluar la fuerza relativa de los vínculos estratofenéticos entre taxones. El nodo filético que conecta Anthropoidea-Adapoidea-Lemuroidea se analiza aquí como ejemplo: el vínculo entre Adapoidea del Eoceno y Anthropoidea primitivos parece más fuerte que el entre Adapoidea y Lemuroidea porque se basa en características compartidas derivadas en lugar de características compartidas primitivas. La integración completa de los resultados moleculares con la información morfológica requiere una mejor comprensión de las tasas de cambio molecular a lo largo del tiempo geológico. Las tasas de evolución molecular pueden estudiarse utilizando tiempos de divergencia documentados paleontológicamente para Prosimii-Anthropoidea (ca. 55 m.y.B.P.), Platyrrhini-Catarrhini (ca. 40 m.y.B.P.) y Hominoidea-Cercopithecoidea (ca. 25 m.y.B.P.). Las distancias inmunológicas combinadas con estos tiempos de divergencia indican que la albúmina de los primates, ampliamente utilizada como reloj molecular en primatología, ha evolucionado de manera no lineal a lo largo del tiempo geológico. Un reloj de albúmina no lineal arroja tiempos de divergencia de aproximadamente 9 millones de años antes del presente para humanos y chimpancés, y aproximadamente 13 millones de años antes del presente para humanos y orangutanes (comparado con 4 m.y.B.P. y 7 m.y.B.P., respectivamente, basándose en un reloj de albúmina lineal). La aparente desaceleración de la evolución de la albúmina con el tiempo aún queda por explicarse completamente. Otras proteínas y ácidos nucleicos pueden proporcionar mejores relojes. El análisis cladístico de características morfológicas y el estudio comparativo de la estructura molecular, interpretados en el contexto del registro fósil, prometen contribuir a una comprensión más completa de la evolución de los primatos.",
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doi = "10.1002/ajpa.1330270504",
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references = "doi101093sysbio242209, doi101126science1683931578, doi1023072412851"
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27. Charlesworth, Brian, 1984, Algunos métodos cuantitativos para estudiar patrones evolutivos en caracteres individuales: Paleobiología.
DOI: 10.1017/s0094837300008289
Resumen
Se describen algunos métodos estadísticos para la detección y estimación de la variabilidad en la tasa de evolución, a partir de datos biométricos sobre caracteres individuales en linajes fósiles. Los métodos se aplicaron a algunos ejemplos publicados de linajes protistas y mamíferos, que abarcan entre 0,8 y 6,4 millones de años de duración. De los seis casos examinados, solo uno no mostró evidencia de variación significativa en la tasa de evolución, y solo cuatro se desviaron significativamente de un patrón de paseo aleatorio, a pesar de que en todos los casos excepto uno hubo un cambio evolutivo neto significativo.
BibTeX
@article{doi101017s0094837300008289,
author = "Charlesworth, Brian",
title = "Algunos métodos cuantitativos para estudiar patrones evolutivos en caracteres individuales",
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abstract = "Se describen algunos métodos estadísticos para la detección y estimación de la variabilidad en la tasa de evolución, a partir de datos biométricos sobre caracteres individuales en linajes fósiles. Los métodos se aplicaron a algunos ejemplos publicados de linajes protistas y mamíferos, que abarcan entre 0,8 y 6,4 millones de años de duración. De los seis casos examinados, solo uno no mostró evidencia de variación significativa en la tasa de evolución, y solo cuatro se desviaron significativamente de un patrón de paseo aleatorio, a pesar de que en todos los casos excepto uno hubo un cambio evolutivo neto significativo.",
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28. Vianey‐Liaud, Monique, 1985, Posibles Relaciones Evolutivas entre Roedores del Eoceno y Oligoceno Inferior de Asia, Europa y América del Norte.
DOI: 10.1007/978-1-4899-0539-0_10
BibTeX
@incollection{doi101007978148990539010,
author = "Vianey‐Liaud, Monique",
title = "Posibles Relaciones Evolutivas entre Roedores del Eoceno y Oligoceno Inferior de Asia, Europa y América del Norte",
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29. Wilson, Allan C. y Cann, Rebecca L. y Carr, Steven M. y George, Matthew y GYLLENSTEN, ULF B. y Helm‐Bychowski, Kathleen y Higuchi, Russell y Palumbi, Stephen R. y Prager, Ellen M. y Sage, Richard D. y Stoneking, Mark, 1985, ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva: Biological Journal of the Linnean Society.
DOI: 10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x
Resumen
Artículo de revista ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva Obtener acceso ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.2Instituto Médico Howard Hughes, U426, Universidad de California, San Francisco, California 94143, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.3Laboratorio de Genética de Vida Silvestre, Departamento de Ciencias de Vida Silvestre y Pesca, Universidad Texas A & M, College Station, Texas 77843, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.4Departamento de Bioquímica, Universidad Howard, Washington, DC 20059, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caja 60500, S-104 01 Estocolmo, Suecia Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.6Departamento de Zoología, Universidad de Hawaii, Honolulu, Hawaii 96822, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A.7Museo de Zoología de Vertebrados, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar más MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, E.U.A. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volumen 26, Número 4, Diciembre 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 de junio de 2008 Historial del artículo Aceptado: 01 de julio de 1985 Publicado: 28 de junio de 2008
BibTeX
@article{doi101111j109583121985tb02048x,
author = "Wilson, Allan C. y Cann, Rebecca L. y Carr, Steven M. y George, Matthew y GYLLENSTEN, ULF B. y Helm‐Bychowski, Kathleen y Higuchi, Russell y Palumbi, Stephen R. y Prager, Ellen M. y Sage, Richard D. y Stoneking, Mark",
title = "ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva",
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journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
abstract = "Artículo de revista ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva Obtener acceso ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.2Instituto Médico Howard Hughes, U426, Universidad de California, San Francisco, California 94143, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.3Laboratorio de Genética de Vida Silvestre, Departamento de Ciencias de Vida Silvestre y Pesca, Universidad Texas A & M, College Station, Texas 77843, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.4Departamento de Bioquímica, Universidad Howard, Washington, DC 20059, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caja 60500, S-104 01 Estocolmo, Suecia Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.6Departamento de Zoología, Universidad de Hawái, Honolulu, Hawái 96822, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.7Museo de Zoología de Vertebrados, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar más MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volumen 26, Número 4, Diciembre 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 de junio de 2008 Historial del artículo Aceptado: 01 de julio de 1985 Publicado: 28 de junio de 2008",
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doi = "10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
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30. Cheetham, Alan H., 1986, Tempo de la evolución en un briozoico del Neógeno: tasas de cambio morfológico dentro y entre límites de especies: Paleobiología.
DOI: 10.1017/s0094837300013658
Resumen
Las deficiencias en la resolución estratigráfica o la completitud pueden hacer imposible estimar con precisión las tasas verdaderas de cambio morfológico a lo largo del tiempo geológico. Sin embargo, las tasas relativas pueden ser suficientes para probar si el ritmo de cambio dentro de las especies puede explicar las diferencias morfológicas entre límites de especies, y por lo tanto distinguir entre patrones graduales y de equilibrio puntuado de la evolución. Se exploran las condiciones bajo las cuales estos patrones pueden distinguirse estadísticamente mediante la simulación de diversos grados de variabilidad de la tasa dentro de la especie en relación con la diferencia morfológica entre especies. Los métodos estadísticos se aplican luego a datos morfológicos de múltiples caracteres de poblaciones secuenciales estrechamente espaciadas del briozoico del Neógeno Metrarabdotos, utilizando análisis discriminante para comparar morfologías generales. En nueve comparaciones de pares de especies ancestro-descendiente, todas muestran tasas de cambio morfológico dentro de la especie que no varían significativamente de cero, por lo tanto explicando ninguna de la diferencia entre especies. En todos los casos, la relación entre la fluctuación dentro de la especie y la diferencia entre especies es lo suficientemente baja como para permitir distinguir el patrón de equilibrio puntuado con certeza virtual. En al menos siete de los casos, la especie ancestro persistió después de dar origen a descendientes, en conformidad con el modo de evolución de equilibrio puntuado.
BibTeX
@article{doi101017s0094837300013658,
author = "Cheetham, Alan H.",
title = "Tempo de la evolución en un briozoico del Neógeno: tasas de cambio morfológico dentro y entre límites de especies",
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31. Sogin, M L y Elwood, Hille J. y Gunderson, John H., 1986, Diversidad evolutiva de genes de ARNr de subunidad pequeña eucariota.: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumen
Se determinaron y compararon las secuencias de genes de ARNr de subunidad pequeña de los protistas flagelados Euglena gracilis y Trypanosoma brucei con las de otros eucariotas. Se construyó un árbol filogenético en el que la rama más temprana entre los eucariotas está representada por E. gracilis. La divergencia de E. gracilis precede con mucho a un período de radiación evolutiva masiva que dio origen a las plantas, animales, hongos y ciertos grupos de protistas como los ciliados y los acantamoebas. La diversidad genética en esta colección de eucariotas se observa que excede la mostrada dentro de las líneas de descendencia eubacteriana o arqueobacteriana.
BibTeX
@article{doi101073pnas8351383,
author = "Sogin, M L y Elwood, Hille J. y Gunderson, John H.",
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32. Britten, Roy J., 1986, Las tasas de evolución de secuencias de ADN difieren entre grupos taxonómicos: Science.
Resumen
Las tasas de mutación de las secuencias de ADN durante la evolución pueden estimarse a partir de las diferencias en secuencias de ADN entre especies mediante el análisis de cambios que tienen poco o ningún efecto sobre el fenotipo (mutaciones neutrales). El examen de las mediciones disponibles muestra que las tasas de cambio de ADN de diferentes grupos filogenéticos difieren por un factor de 5. Las tasas más lentas se observan en los primates superiores y en algunas líneas de aves, mientras que las tasas más rápidas se ven en roedores, erizos de mar y drosófilas. La tasa de cambio de secuencias de ADN ha disminuido notablemente durante la evolución de los primates. El contraste en las tasas de cambio de secuencias de ADN probablemente se debe a la variación evolutiva y la selección de mecanismos bioquímicos como la replicación del ADN o su reparación.
BibTeX
@article{doi101126science3082006,
author = "Britten, Roy J.",
title = "Rates of DNA Sequence Evolution Differ Between Taxonomic Groups",
year = "1986",
journal = "Science",
abstract = "The mutation rates of DNA sequences during evolution can be estimated from interspecies DNA sequence differences by assaying changes that have little or no effect on the phenotype (neutral mutations). Examination of available measurements shows that rates of DNA change of different phylogenetic groups differ by a factor of 5. The slowest rates are observed for higher primates and some bird lineages, while faster rates are seen in rodents, sea urchins, and drosophila. The rate of DNA sequence change has decreased markedly during primate evolution. The contrast in rates of DNA sequence change is probably due to evolutionary variation and selection of biochemical mechanisms such as DNA replication or repair.",
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doi = "10.1126/science.3082006",
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references = "doi101038233604a0"
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33. Griesemer, James R. y Boyd, Robert y Richerson, Peter J., 1986, Culture and the Evolutionary Process: Aplicaciones ornitológicas.
Resumen
Culture and the evolutionary process Culture and the evolutionary process. Robert Boyd, Peter J. Richerson(ed.), 1985. The University of Chicago Press, Chicago viii + 331 páginas. $29.95 Marcy F. Lawton Marcy F. Lawton Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Condor, Volumen 88, Número 1, 1 de febrero de 1986, Páginas 123–124, https://doi.org/10.2307/1367778 Publicado: 01 de febrero de 1986
BibTeX
@article{doi1023071367778,
author = "Griesemer, James R. y Boyd, Robert y Richerson, Peter J.",
title = "Culture and the Evolutionary Process",
year = "1986",
journal = "Ornithological Applications",
abstract = "Culture and the evolutionary process Culture and the evolutionary process. Robert Boyd, Peter J. Richerson(ed.), 1985. The University of Chicago Press, Chicago viii + 331 páginas. $29.95 Marcy F. Lawton Marcy F. Lawton Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Condor, Volumen 88, Número 1, 1 de febrero de 1986, Páginas 123–124, https://doi.org/10.2307/1367778 Publicado: 01 de febrero de 1986",
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doi = "10.2307/1367778",
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34. Gingerich, Philip D., 1987, Evolución y el registro fósil: patrones, tasas y procesos: Canadian Journal of Zoology: v. 65, no. 5: p. 1053-1060.
Resumen
Los mamíferos tienen un registro fósil del Cenozoico excepcionalmente bueno que proporciona evidencia de su diversificación evolutiva. Observamos este registro con la ventaja de la retrospectiva, lo que sesga nuestra percepción de muchas maneras. En general, la diversidad mundial parece aumentar exponencialmente a lo largo del tiempo, mientras que la muestre intensiva en áreas locales indica que los niveles modernos de diversidad se alcanzaron temprano en el Cenozoico. La evidente importancia de las extinciones del Pleistoceno depende críticamente de cómo se cuantifican las tasas de extinción. Nuestra jerarquía taxonómica probablemente refleja el número de grandes cambios faunísticos que un grupo ha sobrevivido en lugar de la intensidad decreciente de los cambios sucesivos. La innovación morfológica y la diversificación taxonómica aparecen después de intervalos de enfriamiento climático, sugiriendo que las características principales de la evolución están controladas extrínsecamente. Los estratigrafías favorables producen registros detallados de anagénesis y cladogénesis graduales en mamíferos, con intermediarios presentes como evidencia de transición. La aparente dicotomía entre altas tasas evolutivas medidas por neontólogos en intervalos cortos de tiempo y bajas tasas evolutivas medidas por paleontólogos en intervalos largos de tiempo desaparece cuando las tasas se miden en escalas intermedias de tiempo. La microevolución y la macroevolución son manifestaciones de procesos subyacentes comunes expresados en diferentes escalas de tiempo.
BibTeX
@article{gingerich1987evolution,
author = "Gingerich, Philip D.",
title = "Evolución y el registro fósil: patrones, tasas y procesos",
year = "1987",
journal = "Canadian Journal of Zoology",
abstract = "Los mamíferos tienen un registro fósil del Cenozoico excepcionalmente bueno que proporciona evidencia de su diversificación evolutiva. Observamos este registro con la ventaja de la retrospectiva, lo que sesga nuestra percepción de muchas maneras. En general, la diversidad mundial parece aumentar exponencialmente a lo largo del tiempo, mientras que la muestre intensiva en áreas locales indica que los niveles modernos de diversidad se alcanzaron temprano en el Cenozoico. La evidente importancia de las extinciones del Pleistoceno depende críticamente de cómo se cuantifican las tasas de extinción. Nuestra jerarquía taxonómica probablemente refleja el número de grandes cambios faunísticos que un grupo ha sobrevivido en lugar de la intensidad decreciente de los cambios sucesivos. La innovación morfológica y la diversificación taxonómica aparecen después de intervalos de enfriamiento climático, sugiriendo que las características principales de la evolución están controladas extrínsecamente. Los estratigrafías favorables producen registros detallados de anagénesis y cladogénesis graduales en mamíferos, con intermediarios presentes como evidencia de transición. La aparente dicotomía entre altas tasas evolutivas medidas por neontólogos en intervalos cortos de tiempo y bajas tasas evolutivas medidas por paleontólogos en intervalos largos de tiempo desaparece cuando las tasas se miden en escalas intermedias de tiempo. La microevolución y la macroevolución son manifestaciones de procesos subyacentes comunes expresados en diferentes escalas de tiempo.",
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35. Runnegar, B, 1987, Tasas y Modos de Evolución en los Moluscos, en Campbell, K. S. W., y Day, M. F., eds., Tasas de Evolución.
BibTeX
@misc{runnegar1987rates9,
author = "Runnegar, B",
title = "Tasas y Modos de Evolución en los Moluscos, en Campbell, K. S. W., y Day, M. F., eds., Tasas de Evolución",
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howpublished = "Londres, Allen and Unwin, p. 39-60",
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36. Gauthier, Jacques y Kluge, Arnold G. y Rowe, Timothy, 1988, FILOGENIA DE AMNIOTOS Y LA IMPORTANCIA DE LOS FÓSILES: Cladística.
DOI: 10.1111/j.1096-0031.1988.tb00514.x
Resumen
Resumen - Varios cladistas prominentes han cuestionado la importancia de los fósiles en la inferencia filogenética, y cada vez es más popular simplemente ajustar las formas extintas, si se las considera en absoluto, a un cladograma de taxones recientes. El estudio de la filogenia de amniotas de Gardiner (1982) y Løvtrup (1985) ejemplifica este tratamiento diferencial, y nos enfocamos en ese grupo de organismos para probar la proposición de que los fósiles no pueden derrocar una teoría de relaciones basada únicamente en la biota reciente. Nuestro análisis de parsimonia de la filogenia de amniotas, evitando cuidadosamente el conocimiento especial aportado por los fósiles, llevó a la siguiente clasificación que mejor se ajusta, que es similar a la hipótesis novedosa publicada por Gardiner: (lepidosaurios (tortugas (mamíferos (aves, cocodrilos)))). Sin embargo, añadir fósiles resultó en un cladograma más parsimonioso de los taxones existentes marcadamente diferente: (mamíferos (tortugas (lepidosaurios (aves, cocodrilos)))). Esa clasificación es como la hipótesis tradicional, y proporciona un mejor ajuste al registro estratigráfico. Para aislar los taxones extintos responsables de dicha clasificación, los datos se dividieron sucesivamente en cada análisis filogenético, y concluimos que: (1) los fósiles del grupo interno, no los del grupo externo, fueron importantes; (2) los fósiles sinápsidos, no los reptilianos, fueron determinantes; (3) ciertos fósiles sinápsidos, no los más antiguos o más recientes, fueron responsables. La naturaleza crítica de los fósiles sinápsidos parece residir en la combinación particular de listas de caracteres primitivos y derivados que exhibieron. Clasificar esos fósiles, junto con los mamíferos, como el grupo hermano de la línea que consiste en aves y cocodrilos resultó en un ajuste relativamente pobre a los datos; uno que involucró un aumento de 2 a 4 veces en las reversales evolutivas. Por lo tanto, la importancia de los fósiles críticos, colectiva o individualmente, parece residir en su relativa primitividad, y la explicación más sencilla para su naturaleza más conservadora es que han tenido menos tiempo para evolucionar. Aunque los fósiles pueden ser importantes en la inferencia filogenética solo bajo ciertas condiciones, no hay razón convincente para prejuzgar su contribución. Instamos a los sistemáticos a evaluar con equidad toda la evidencia disponible.
BibTeX
@article{doi101111j109600311988tb00514x,
author = "Gauthier, Jacques and Kluge, Arnold G. and Rowe, Timothy",
title = "AMNIOTE PHYLOGENY AND THE IMPORTANCE OF FOSSILS",
year = "1988",
journal = "Cladistics",
abstract = "Resumen - Varios cladistas prominentes han cuestionado la importancia de los fósiles en la inferencia filogenética, y cada vez es más popular simplemente ajustar las formas extintas, si se las considera en absoluto, a un cladograma de taxones recientes. El estudio de la filogenia de amniotas de Gardiner (1982) y Løvtrup (1985) ejemplifica este tratamiento diferencial, y nos enfocamos en ese grupo de organismos para probar la proposición de que los fósiles no pueden derrocar una teoría de relaciones basada únicamente en la biota reciente. Nuestro análisis de parsimonia de la filogenia de amniotas, evitando cuidadosamente el conocimiento especial aportado por los fósiles, llevó a la siguiente clasificación que mejor se ajusta, que es similar a la hipótesis novedosa publicada por Gardiner: (lepidosaurios (tortugas (mamíferos (aves, cocodrilos)))). Sin embargo, añadir fósiles resultó en un cladograma más parsimonioso de los taxones existentes marcadamente diferente: (mamíferos (tortugas (lepidosaurios (aves, cocodrilos)))). Esa clasificación es como la hipótesis tradicional, y proporciona un mejor ajuste al registro estratigráfico. Para aislar los taxones extintos responsables de dicha clasificación, los datos se dividieron sucesivamente en cada análisis filogenético, y concluimos que: (1) los fósiles del grupo interno, no los del grupo externo, fueron importantes; (2) los fósiles sinápsidos, no los reptilianos, fueron determinantes; (3) ciertos fósiles sinápsidos, no los más antiguos o más recientes, fueron responsables. La naturaleza crítica de los fósiles sinápsidos parece residir en la combinación particular de listas de caracteres primitivos y derivados que exhibieron. Clasificar esos fósiles, junto con los mamíferos, como el grupo hermano de la línea que consiste en aves y cocodrilos resultó en un ajuste relativamente pobre a los datos; uno que involucró un aumento de 2 a 4 veces en las reversales evolutivas. Por lo tanto, la importancia de los fósiles críticos, colectiva o individualmente, parece residir en su relativa primitividad, y la explicación más sencilla para su naturaleza más conservadora es que han tenido menos tiempo para evolucionar. Aunque los fósiles pueden ser importantes en la inferencia filogenética solo bajo ciertas condiciones, no hay razón convincente para prejuzgar su contribución. Instamos a los sistemáticos a evaluar con equidad toda la evidencia disponible.",
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37. Stearns, Stephen C., 1989, La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica: BioScience.
Resumen
Artículo de Revista La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica: Las fuentes fenotípicas de variación entre organismos pueden describirse mediante interruptores del desarrollo y normas de reacción Obtener acceso Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volumen 39, Número 7, Julio/Agosto 1989, Páginas 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Publicado: 01 de agosto de 1989
BibTeX
@article{doi1023071311135,
author = "Stearns, Stephen C.",
title = "La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica",
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url = "https://doi.org/10.2307/1311135",
doi = "10.2307/1311135",
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38. Milner, R, 1990, The Encyclopedia of Evolution.
BibTeX
@misc{milner1990the8,
author = "Milner, R",
title = "The Encyclopedia of Evolution",
year = "1990",
howpublished = "Humanity's Search for Its Origin: New York, Facts on File, Inc., 482 p",
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39. Grande, Lance y Bemis, William E., 1991, Osteología y Relaciones Filogenéticas de Paddlefishes Fósiles y Recientes (Polyodontidae) con Comentarios sobre las Interrelaciones de Acipenseriformes: Journal of Vertebrate Paleontology.
DOI: 10.1080/02724634.1991.10011424
Resumen
RESUMEN La osteología comparada y las relaciones filogenéticas de los peces palos (Polyodontidae) fósiles y vivos se investigan a fondo por primera vez. Este grupo peculiar y poco conocido es de gran importancia para los estudios filogenéticos de los actinopterigios primitivos, ya que es una de las dos únicas familias de condosteos que han sobrevivido hasta la actualidad. En consecuencia, el grupo se utiliza frecuentemente como grupo externo para estudios de los muchos grupos fósiles de condosteos y para estudios de niveles superiores de las interrelaciones actinopterigios (e incluso osteictios). La familia tiene un registro fósil largo pero discontinuo que se remonta al Cretácico Superior, incluyendo especies representadas por esqueletos relativamente completos o al menos cráneos. Estos fósiles relativamente completos son extremadamente raros y pertenecen a las especies †Paleopsephurus wilsoni MacAlpin, 1947 de la Formación Hell Creek del Cretácico Superior de Montana (re-descrita aquí); †Polyodon sp. nov. de la Formación Tullock del Paleoceno inferior de Montana (descrita aquí); y †Crossopholis magnicaudatus Cope, 1883 de depósitos del Eoceno inferior de la Formación Green River en Wyoming (descrita detalladamente aquí por primera vez basándose en mucho nuevo material). Entre los fósiles, †Crossopholis es de particular interés, porque ahora se conoce por varios esqueletos casi completos (informados y descritos aquí por primera vez). †Paleopsephurus y †Polyodon sp. nov. se conocen por un solo cráneo parcial cada uno, y algo de material postcraneal fragmentario, pero están bien representados para incluirlos en nuestro análisis filogenético. Otros materiales más fragmentarios del Cretácico Superior y Paleoceno (algunos informados aquí por primera vez) se colocan en Polyodontidae incertae sedis. Hay dos especies actuales en la familia, frecuentemente referidas en la literatura como "fósiles vivos". Estas dos especies son Polyodon spathula de la cuenca del río Misisipi de América del Norte, y Psephurus gladius principalmente de la cuenca superior del río Yangtsé en China. La osteología de Psephurus gladius se describe aquí detalladamente por primera vez. Estudios anteriores de Polyodontidae han sido casi exclusivamente basados en Polyodon spathula, porque especímenes de la otra especie son extremadamente raros y muy poco conocidos. Después de acumular y preparar material durante varios años, pudimos describir más completamente todas las especies de polodontidos y examinar la filogenia de la familia. Nuestro estudio revela que Polyodon spathula es un miembro altamente derivado de la familia, y generalmente no es un buen representante de la familia cuando la familia se usa como grupo externo para estudios filogenéticos de niveles superiores de actinopterigios. El uso de Polyodon spathula como el polodontido primitivo ha llevado previamente a varios errores graves en la literatura. Por lo tanto, también resumimos ciertos caracteres primitivos de Polyodontidae en este artículo. Contrario a estudios anteriores, mostramos que †Paleopsephurus tiene los huesos rostrales estelares únicos de los polodontidos (además de los largos huesos rostrales medianos y el hocico extremadamente alargado también únicos del grupo). También contrario a estudios anteriores, Polyodontidae (al menos primitivamente) sí tiene osificaciones del cuadratojugal, interclavícula y postcleitro. También informamos de varias otras características osteológicas previamente desconocidas de la familia. Nuestro estudio resulta en una hipótesis filogenética para los peces palos que es radicalmente diferente del único otro cladograma publicado (Gardiner, 1984b). Demostramos que †Paleopsephurus claramente pertenece en Polyodontidae, en lugar de Acipenseridae como propuso Gardiner (1984b). †Paleopsephurus es el grupo hermano de Polyodontinae, nueva subfamilia (un grupo que contiene Psephurus, †Crossopholis y dos especies de Polyodon). Psephurus es el grupo hermano de Polyodontini, nuevo tribu (un grupo que contiene †Crossopholis y Polyodon). Polyodon contiene el actual Polyodon spathula así como una nueva especie fósil de depósitos de agua dulce del Paleoceno temprano de Montana. Una mejor comprensión de la osteología de los polodontidos también nos permite proporcionar una hipótesis filogenética para Acipenseriformes (asumiendo la monofilia de Acipenseridae) que difiere de la de autores anteriores. En particular encontramos que †Chondrosteidae es el grupo hermano de un grupo que contiene Acipenseridae más Polyodontidae. Polyodontidae también proporcionan evidencia de que los supraneurales en actinopterigios son los homólogos seriados de epurales, y no de radios de aletas. Como ha sido previamente aparente, Polyodontidae es uno de varios grupos que indican una relación biogeográfica transpacífica para el oeste de América del Norte (al oeste de la divisoria continental) durante el Terciario temprano. También describimos variación ontogenética e intraspecífica en la osteología de los peces palos. Basado en la gran cantidad de variación, concluimos que, en al menos algunos peces, es importante examinar grandes números de especímenes, incluyendo individuos extremadamente viejos (i.e., "ontogenía de extremo superior") en la serie de desarrollo para documentar más completamente la morfología. Los peces palos de tamaño normal y reproductivamente activos carecen de ciertas osificaciones del escapulocoracoide, columna vertebral y neurocráneo presentes en otros osteictios; pero como mostramos aquí, estos elementos eventualmente se osifican en individuos muy grandes y viejos. En este sentido, los peces palos parecen ser los axolotes del mundo de los peces, ofreciendo uno de los casos mejor documentados de paedomorfosis (o neotenia) conocidos hasta la fecha.
BibTeX
@article{doi10108002724634199110011424,
author = "Grande, Lance and Bemis, William E.",
title = "Osteology and Phylogenetic Relationships of Fossil and Recent Paddlefishes (Polyodontidae) with Comments on the Interrelationships of Acipenseriformes",
year = "1991",
journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
abstract = "ABSTRACT The comparative osteology and phylogenetic relationships of fossil and living paddlefishes (Polyodontidae) are investigated in detail for the first time. This peculiar, poorly known group is of great significance to phylogenetic studies of primitive actinopterygians, because it is one of only two chondrostean families that have survived to the present. Consequently the group is frequently used as an outgroup for studies of the many fossil chondrostean groups and for higher-level studies of actinopterygian (and even osteichthyan) interrelationships. The family has a long but spotty fossil record dating back to the Upper Cretaceous, including species represented by relatively complete skeletons or at least skulls. These relatively complete fossils are extremely rare and belong to the species †Paleopsephurus wilsoni MacAlpin, 1947 from the Upper Cretaceous Hell Creek Formation of Montana (redescribed here); †Polyodon sp. nov. from the lower Paleocene Tullock Formation of Montana (described here); and †Crossopholis magnicaudatus Cope, 1883 from lower Eocene deposits of the Green River Formation in Wyoming (described in detail here for the first time based on much new material). Among the fossils, †Crossopholis is of particular interest, because it is now known by several nearly complete skeletons (reported and described here for the first time). †Paleopsephurus and †Polyodon sp. nov. are known from a single partial skull each, and some fragmentary postcranial material, but are well enough represented to include in our phylogenetic analysis. Other, more fragmentary, Upper Cretaceous and Paleocene material (some newly reported here) is placed in Polyodontidae incertae sedis. There are two extant species in the family, frequently referred to in the literature as “living fossils.” These two species are Polyodon spathula from the Mississippi River drainage of North America, and Psephurus gladius primarily from the upper Yangtze River drainage in China. The osteology of Psephurus gladius is described here in detail for the first time. Previous studies of Polyodontidae have been almost exclusively based on Polyodon spathula, because specimens of the other species are extremely rare and very poorly known. After accumulating and preparing material for several years, we were able to describe more fully all polyodontid species and examine the family phylogenetically. Our study reveals that Polyodon spathula is a highly derived member of the family, and generally not a good representative of the family when the family is used as an outgroup for higher-level phylogenetic studies of actinopterygians. The use of Polyodon spathula as the primitive polyodontid has previously led to several serious errors in the literature. We therefore also summarize certain primitive characters of Polyodontidae in this paper. Contrary to previous studies, we show that †Paleopsephurus has the stellate rostral bones unique to polyodontids (in addition to the long median rostral bones and extremely elongate snout also unique to the group). Also contrary to previous studies, Polyodontidae (at least primitively) does have ossifications of the quadratojugal, interclavicle and postcleithrum. We also report several other osteological features previously unknown from the family. Our study results in a phylogenetic hypothesis for paddlefishes that is radically different from the only other published cladogram (Gardiner, 1984b). We demonstrate that †Paleopsephurus clearly belongs in Polyodontidae, rather than Acipenseridae as proposed by Gardiner (1984b). †Paleopsephurus is the sistergroup to Polyodontinae, new subfamily (a group containing Psephurus, †Crossopholis, and two species of Polyodon). Psephurus is the sistergroup to Polyodontini, new tribe (a group containing †Crossopholis and Polyodon). Polyodon contains the extant Polyodon spathula as well as a new fossil species from early Paleocene freshwater deposits of Montana. A better understanding of polyodontid osteology also enables us to provide a phylogenetic hypothesis for Acipenseriformes (assuming monophyly of Acipenseridae) that differs from that of previous authors. In particular we find that †Chondrosteidae is the sistergroup to a group containing Acipenseridae plus Polyodontidae. Polyodontidae also provide evidence that the supraneurals in actinopterygians are the serial homologues of epurals, and not of fin radials. As has previously been apparent, Polyodontidae is one of several groups that indicate a transpacific biogeographic relationship for western North America (west of the continental divide) during the Early Tertiary. We also describe ontogenetic and intraspecific variation in paddlefish osteology. Based on the large amount of variation, we conclude that, in at least some fishes, it is important to examine large numbers of specimens, including extremely old individuals (i.e., “upper end ontogeny”) in the developmental series to more completely document the morphology. Normal-sized, reproductively active adult paddlefishes lack particular ossifications of the scapulocoracoid, vertebral column and neurocranium present in other osteichthyans; but as we show here, these elements eventually ossify in very large, older individuals. In this sense, paddlefishes appear to be the axolotls of the fish world, offering one of the best documented cases of paedomorphosis (or neoteny) known to date.",
url = "https://doi.org/10.1080/02724634.1991.10011424",
doi = "10.1080/02724634.1991.10011424",
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references = "doi101038170405e0, doi101111j109636421932tb01553x, doi105281zenodo16298542, doi105962bhltitle159141, doi105962bhltitle6408, gardiner1989interrelationships, openalexw2246336267, openalexw610180004"
}
40. 1992, El método comparativo en biología evolutiva: Choice Reviews Online.
Resumen
El método comparativo para estudiar la adaptación ¿por qué preocuparse por la filogenia? reconstrucción de árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales análisis comparativo de datos discretos análisis comparativo de variables continuas determinación de la forma de las relaciones comparativas.
BibTeX
@article{doi105860choice295104,
title = "El método comparativo en biología evolutiva",
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journal = "Choice Reviews Online",
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doi = "10.5860/choice.29-5104",
openalex = "W1488393970"
}
41. Morris, Simon Conway, 1993, El registro fósil y la evolución temprana de los Metazoa: Nature.
BibTeX
@article{doi101038361219a0,
author = "Morris, Simon Conway",
title = "El registro fósil y la evolución temprana de los Metazoa",
year = "1993",
journal = "Nature",
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}
42. Labandeira, Conrad C. y Sepkoski, J. John, 1993, Diversidad de insectos en el registro fósil: Science.
Resumen
Los insectos poseen un registro fósil sorprendentemente extenso. La compilación de los rangos geocronológicos de las familias de insectos demuestra que su diversidad supera a la de los tetrápodos vertebrados preservados durante el 91 por ciento de su historia evolutiva. La gran diversidad de insectos se logró no mediante altas tasas de origen, sino mediante bajas tasas de extinción comparables a las bajas tasas de los grupos de invertebrados marinos de evolución lenta. La gran radiación de los insectos modernos comenzó hace 245 millones de años y no fue acelerada por la expansión de las angiospermas durante el período Cretácico. La maquinaria trófica básica de los insectos estaba en su lugar casi 100 millones de años antes de que las angiospermas aparecieran en el registro fósil.
BibTeX
@article{doi101126science11536548,
author = "Labandeira, Conrad C. y Sepkoski, J. John",
title = "Diversidad de insectos en el registro fósil",
year = "1993",
journal = "Science",
abstract = "Los insectos poseen un registro fósil sorprendentemente extenso. La compilación de los rangos geocronológicos de las familias de insectos demuestra que su diversidad supera a la de los tetrápodos vertebrados preservados durante el 91 por ciento de su historia evolutiva. La gran diversidad de insectos se logró no mediante altas tasas de origen, sino mediante bajas tasas de extinción comparables a las bajas tasas de los grupos de invertebrados marinos de evolución lenta. La gran radiación de los insectos modernos comenzó hace 245 millones de años y no fue acelerada por la expansión de las angiospermas durante el período Cretácico. La maquinaria trófica básica de los insectos estaba en su lugar casi 100 millones de años antes de que las angiospermas aparecieran en el registro fósil.",
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doi = "10.1126/science.11536548",
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references = "doi1010079781468491814, doi101017s0094837300003778, doi101038293435a0, doi101038303614a0, doi101086284840, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461966tb03364x, doi101126science13334591105, doi101126science21545391501, doi101126science2314734129, doi101146annureves10110179001335, doi107312simp93764, openalexw2038423019"
}
43. Bowring, Samuel A. y Grotzinger, J. P. y Isachsen, C. E. y Knoll, Andrew H. y Pelechaty, Shane M. y Kolosov, Peter, 1993, Calibrando las tasas de evolución del Cámbrico temprano: Science.
Resumen
Un episodio explosivo de diversificación biológica ocurrió cerca del comienzo del período Cámbrico. Las tasas evolutivas en el Cámbrico han sido difíciles de cuantificar con precisión debido a la falta de edades de alta precisión. Actualmente, la geocronología de circones de uranio-plomo es el método más potente para fechar rocas de edad cámbrica. Los datos de circones de uranio-plomo de rocas del Cámbrico inferior ubicadas en el noreste de Siberia indican que el período Cámbrico comenzó hace aproximadamente 544 millones de años y que su etapa más antigua (Manykaian) duró no menos de 10 millones de años. Otros datos indican que las etapas Tommotiense y Atdabanense juntas duraron solo de 5 a 10 millones de años. La resultante compresión del tiempo del Cámbrico temprano acentúa la rapidez tanto de la diversificación faunística como del posterior cambio del Cámbrico.
BibTeX
@article{doi101126science11539488,
author = "Bowring, Samuel A. y Grotzinger, J. P. y Isachsen, C. E. y Knoll, Andrew H. y Pelechaty, Shane M. y Kolosov, Peter",
title = "Calibrando las tasas de evolución del Cámbrico temprano",
year = "1993",
journal = "Science",
abstract = "Un episodio explosivo de diversificación biológica ocurrió cerca del comienzo del período Cámbrico. Las tasas evolutivas en el Cámbrico han sido difíciles de cuantificar con precisión debido a la falta de edades de alta precisión. Actualmente, la geocronología de circones de uranio-plomo es el método más potente para fechar rocas de edad cámbrica. Los datos de circones de uranio-plomo de rocas del Cámbrico inferior ubicadas en el noreste de Siberia indican que el período Cámbrico comenzó hace aproximadamente 544 millones de años y que su etapa más antigua (Manykaian) duró no menos de 10 millones de años. Otros datos indican que las etapas Tommotiense y Atdabanense juntas duraron solo de 5 a 10 millones de años. La resultante compresión del tiempo del Cámbrico temprano acentúa la rapidez tanto de la diversificación faunística como del posterior cambio del Cámbrico.",
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doi = "10.1126/science.11539488",
openalex = "W2080974066",
references = "doi101017s0094837300005649, doi101017s0094837300005972, doi101017s0094837300006539"
}
44. Wainright, Patricia O. y Hinkle, Gregory y Sogin, Mitchell L. y Stickel, Shawn K., 1993, Orígenes monofiléticos de los Metazoa: un vínculo evolutivo con los hongos: Science.
Resumen
Un marco filogenético inferido a partir de comparaciones de secuencias de ARN ribosómico de subunidad pequeña describe el origen evolutivo y los patrones de ramificación temprana del reino Animalia. Los análisis de máxima verosimilitud muestran que la línea animal es monofilética e incluye a los coliflagelados. Dentro del ensamblaje metazoano, la divergencia de las esponjas es seguida por los Ctenóforos, los Cnidarios más el placozoario Trichoplax adhaerens, y finalmente por una policotomía no resuelta de los filos animales bilaterales. A partir de estos datos, se inferió que los animales y los hongos comparten un historial evolutivo único y que su último ancestro común fue un protista flagelado similar a los coliflagelados existentes.
BibTeX
@article{doi101126science8469985,
author = "Wainright, Patricia O. y Hinkle, Gregory y Sogin, Mitchell L. y Stickel, Shawn K.",
title = "Orígenes monofiléticos de los Metazoa: un vínculo evolutivo con los hongos",
year = "1993",
journal = "Science",
abstract = "Un marco filogenético inferido a partir de comparaciones de secuencias de ARN ribosómico de subunidad pequeña describe el origen evolutivo y los patrones de ramificación temprana del reino Animalia. Los análisis de máxima verosimilitud muestran que la línea animal es monofilética e incluye a los coliflagelados. Dentro del ensamblaje metazoano, la divergencia de las esponjas es seguida por los Ctenóforos, los Cnidarios más el placozoario Trichoplax adhaerens, y finalmente por una policotomía no resuelta de los filos animales bilaterales. A partir de estos datos, se inferió que los animales y los hongos comparten un historial evolutivo único y que su último ancestro común fue un protista flagelado similar a los coliflagelados existentes.",
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doi = "10.1126/science.8469985",
openalex = "W2034733986",
references = "doi101126science3277277, openalexw2076004673"
}
45. Benton, Michael J., 1993, El registro fósil 2.
Resumen
Introducción. Grupos basales. Monera (bacterias algas verde-azules). Hongos. Algas. Animales: Invertebrados. Protozoos. Poríferos. Celentéreos. Moluscos: Amphineura y Monoplacóforos. Moluscos: Gasterópodos. Moluscos: Cefalópodos (Nautiloideos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos prejurásicos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos: Filoceratinos, Litoceratinos, Ammonitinos, Anciloceratinos). Moluscos: Cefalópodos (Coleoideos). Moluscos: Rostroconchias, Escapópodos y Bivalvos. Moluscos: incertae sedis. Anélidos. Artrópodos (Trilobites). Artrópodos (Aglaspididos, Quelicerados, Pycnogonidos). Artrópodos (Crustáceos, excluyendo Ostrácodos). Artrópodos (Crustáceos: Ostrácodos). Artrópodos (Euticarcinoideos y Milpiados). Artrópodos (Hexápodos: Insectos). Briozoos. Equinodermos. Deuterostomios basales (quetognatos, hemiordados, calcicordados, cefalocordados y tunicados). Graptolitos. Problemáticos. Miscelánea. Animales: Vertebrados. Conodontos. Agnatos. Placodermos. Acanthodios. Condrictios. Osteictios: actinopterigios basales. Osteictios: Teleósteos. Osteictios: Sarcopterigios. Tetrapodos de grado anfibio. Reptiles. Aves. Mamíferos. Plantas. Briófitas. Pteridófitas. Gimnospermas. Magnoliófitas (Angiospermas). Índice.
BibTeX
@book{openalexw1599677799,
author = "Benton, Michael J.",
title = "El registro fósil 2",
year = "1993",
abstract = "Introducción. Grupos basales. Monera (bacterias algas verde-azules). Hongos. Algas. Animales: Invertebrados. Protozoos. Poríferos. Celentéreos. Moluscos: Amphineura y Monoplacóforos. Moluscos: Gasterópodos. Moluscos: Cefalópodos (Nautiloideos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos prejurásicos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos: Filoceratinos, Litoceratinos, Ammonitinos, Anciloceratinos). Moluscos: Cefalópodos (Coleoideos). Moluscos: Rostroconchias, Escapópodos y Bivalvos. Moluscos: incertae sedis. Anélidos. Artrópodos (Trilobites). Artrópodos (Aglaspididos, Quelicerados, Pycnogonidos). Artrópodos (Crustáceos, excluyendo Ostrácodos). Artrópodos (Crustáceos: Ostrácodos). Artrópodos (Euticarcinoideos y Milpiados). Artrópodos (Hexápodos: Insectos). Briozoos. Equinodermos. Deuterostomios basales (quetognatos, hemiordados, calcicordados, cefalocordados y tunicados). Graptolitos. Problemáticos. Miscelánea. Animales: Vertebrados. Conodontos. Agnatos. Placodermos. Acanthodios. Condrictios. Osteictios: actinopterigios basales. Osteictios: Teleósteos. Osteictios: Sarcopterigios. Tetrapodos de grado anfibio. Reptiles. Aves. Mamíferos. Plantas. Briófitas. Pteridófitas. Gimnospermas. Magnoliófitas (Angiospermas). Índice.",
openalex = "W1599677799"
}
46. Clyde, William C. y Gingerich, Philip D., 1994, Tasas de evolución en la dentición de Cantius del Eoceno temprano: comparación de tamaño y forma: Paleobiología.
DOI: 10.1017/s0094837300012963
Resumen
Cantius es un primate adapido del Eoceno temprano con un registro fósil excepcionalmente bien conocido. Se registraron mediciones para describir el tamaño y la forma de los primeros molares superiores e inferiores recolectados de una sección estratigráfica medida en la cuenca de Clarks Fork, Wyoming. Las tasas de cambio de tamaño y forma se cuantifican calculando las tasas evolutivas en unidades de desviación estándar por generación (haldanes). La escala temporal de las tasas muestra que el cambio en el tamaño fue generado por un proceso direccional significativamente no aleatorio, mientras que el cambio en la forma fue generado por un proceso estabilizador significativamente no aleatorio. El cambio de tamaño en Cantius se interpreta como el resultado de una selección direccional débil, y el cambio de forma se interpreta como el resultado de una selección estabilizadora fuerte.
BibTeX
@article{doi101017s0094837300012963,
author = "Clyde, William C. y Gingerich, Philip D.",
title = "Tasas de evolución en la dentición de Cantius del Eoceno temprano: comparación de tamaño y forma",
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journal = "Paleobiología",
abstract = "Cantius es un primate adapido del Eoceno temprano con un registro fósil excepcionalmente bien conocido. Se registraron mediciones para describir el tamaño y la forma de los primeros molares superiores e inferiores recolectados de una sección estratigráfica medida en la cuenca de Clarks Fork, Wyoming. Las tasas de cambio de tamaño y forma se cuantifican calculando las tasas evolutivas en unidades de desviación estándar por generación (haldanes). La escala temporal de las tasas muestra que el cambio en el tamaño fue generado por un proceso direccional significativamente no aleatorio, mientras que el cambio en la forma fue generado por un proceso estabilizador significativamente no aleatorio. El cambio de tamaño en Cantius se interpreta como el resultado de una selección direccional débil, y el cambio de forma se interpreta como el resultado de una selección estabilizadora fuerte.",
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doi = "10.1017/s0094837300012963",
openalex = "W1408983869",
references = "openalexw201159638"
}
47. Lockhart, Peter J. y Steel, Mike y Hendy, Michael D. y Penny, David, 1994, Recuperando árboles evolutivos bajo un modelo más realista de la evolución de secuencias.: Molecular Biology and Evolution.
DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136
Resumen
Informamos sobre una nueva transformación, la LogDet, que es consistente para secuencias con composición de nucleótidos diferente y que han surgido bajo modelos estocásticos simples pero asimétricos de evolución. Esta transformación es necesaria porque los métodos existentes tienden a agrupar secuencias en función de su composición de nucleótidos, independientemente de su historia evolutiva. Este efecto de las frecuencias de nucleótidos diferentes se ilustra utilizando un criterio de selección de árboles sobre una medida de distancia simple definida únicamente en función de la composición de bases, independiente de las secuencias reales. La nueva transformación LogDet utiliza determinantes de las matrices de divergencia observadas y funciona porque la multiplicación de determinantes (números reales) es conmutativa, mientras que la multiplicación de matrices no lo es, excepto en casos especiales simétricos. El uso de determinantes permite así modelos más generales de evolución con tasas simétricas de cambio de nucleótidos. La transformación se ilustra con un conjunto de datos teórico (donde los métodos existentes seleccionan el árbol incorrecto) y con tres conjuntos de datos biológicos: cloroplastos, aves/mamíferos (nucleares) y abejas melíferas (mitocondriales). La transformación LogDet refuerza la distinción lógica entre transformaciones sobre los datos y criterios de selección de árboles. Las conclusiones generales de este estudio son que las composiciones irregulares de A,C,G,T son una causa importante y posible general de patrones que pueden engañar a los métodos de reconstrucción de árboles, incluso cuando se obtienen valores de bootstrap altos. En consecuencia, muchos estudios publicados pueden necesitar ser reexaminados.
BibTeX
@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva040136,
author = "Lockhart, Peter J. y Steel, Mike y Hendy, Michael D. y Penny, David",
title = "Recuperando árboles evolutivos bajo un modelo más realista de la evolución de secuencias.",
year = "1994",
journal = "Molecular Biology and Evolution",
abstract = "Informamos sobre una nueva transformación, la LogDet, que es consistente para secuencias con composición de nucleótidos diferente y que han surgido bajo modelos estocásticos simples pero asimétricos de evolución. Esta transformación es necesaria porque los métodos existentes tienden a agrupar secuencias en función de su composición de nucleótidos, independientemente de su historia evolutiva. Este efecto de las frecuencias de nucleótidos diferentes se ilustra utilizando un criterio de selección de árboles sobre una medida de distancia simple definida únicamente en función de la composición de bases, independiente de las secuencias reales. La nueva transformación LogDet utiliza determinantes de las matrices de divergencia observadas y funciona porque la multiplicación de determinantes (números reales) es conmutativa, mientras que la multiplicación de matrices no lo es, excepto en casos especiales simétricos. El uso de determinantes permite así modelos más generales de evolución con tasas simétricas de cambio de nucleótidos. La transformación se ilustra con un conjunto de datos teórico (donde los métodos existentes seleccionan el árbol incorrecto) y con tres conjuntos de datos biológicos: cloroplastos, aves/mamíferos (nucleares) y abejas melíferas (mitocondriales). La transformación LogDet refuerza la distinción lógica entre transformaciones sobre los datos y criterios de selección de árboles. Las conclusiones generales de este estudio son que las composiciones irregulares de A,C,G,T son una causa importante y posible general de patrones que pueden engañar a los métodos de reconstrucción de árboles, incluso cuando se obtienen valores de bootstrap altos. En consecuencia, muchos estudios publicados pueden necesitar ser reexaminados.",
url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
openalex = "W2162443218",
references = "doi101093oxfordjournalsmolbeva040752, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101126science3277277"
}
48. Masterson, Jane, 1994, Tamaño de los estomas en plantas fósiles: Evidencia de poliploidía en la mayoría de las angiospermas: Science.
DOI: 10.1126/science.264.5157.421
Resumen
Se probaron tres estimaciones publicadas de la frecuencia de poliploidía en angiospermas (30 al 35 por ciento, 47 por ciento y 70 al 80 por ciento) estimando el tamaño del genoma de angiospermas leñosas extintas mediante el uso del tamaño de las células de guarda fósiles como un sustituto del contenido de ADN celular. Los números de cromosomas inferidos de estas especies extintas sugieren que de siete a nueve es el número cromosómico haploide primitivo de las angiospermas y que la mayoría de las angiospermas (aproximadamente el 70 por ciento) han tenido poliploidía en su historia.
BibTeX
@article{doi101126science2645157421,
author = "Masterson, Jane",
title = "Tamaño de los estomas en plantas fósiles: Evidencia de poliploidía en la mayoría de las angiospermas",
year = "1994",
journal = "Science",
abstract = "Se probaron tres estimaciones publicadas de la frecuencia de poliploidía en angiospermas (30 al 35 por ciento, 47 por ciento y 70 al 80 por ciento) estimando el tamaño del genoma de angiospermas leñosas extintas mediante el uso del tamaño de las células de guarda fósiles como un sustituto del contenido de ADN celular. Los números de cromosomas inferidos de estas especies extintas sugieren que de siete a nueve es el número cromosómico haploide primitivo de las angiospermas y que la mayoría de las angiospermas (aproximadamente el 70 por ciento) han tenido poliploidía en su historia.",
url = "https://doi.org/10.1126/science.264.5157.421",
doi = "10.1126/science.264.5157.421",
openalex = "W2049670427",
references = "doi1023072412932, openalexw2065039187"
}
49. Renaud, Sabrina y Michaux, Jacques y Jaeger, Jean‐Jacques y Auffray, Jean‐Christophe, 1996, Análisis de Fourier aplicado a los molares de Stephanomys (Rodentia, Muridae): patrón evolutivo no progresivo en una línea gradual: Paleobiología.
DOI: 10.1017/s0094837300016201
Resumen
Se analizan el tamaño y la forma de las líneas del género roedor Stephanomys Schaub 1938 del Plioceno. Los estudios filogenéticos anteriores se basaron principalmente en la variación del tamaño y comparaciones descriptivas, sin ningún intento de cuantificar los cambios de forma. Por lo tanto, basándose en el aumento regular del tamaño, Stephanomys ha sido considerado un ejemplo primario de gradualismo filético. Con el fin de cuantificar la variación morfológica dentro de la línea, se aplicó un método para analizar contornos complejos, la transformada de Fourier elíptica, al contorno del diente (primeros molares superiores e inferiores). Luego fue posible comparar la evolución del tamaño, estimada por el área del diente, así como la evolución de la forma, representada por los coeficientes de Fourier. Mientras que el tamaño parece cambiar gradualmente a lo largo del tiempo, la morfología da un patrón evolutivo bastante discontinuo tanto para el molar superior como para el inferior. Tal discrepancia entre la evolución del tamaño y la forma de una sola estructura sugiere que diferentes determinismos genéticos y restricciones mecánicas pueden actuar sobre el tamaño y la forma. Por lo tanto, puede ser engañoso inferir procesos evolutivos generalizados a partir del tamaño o la forma por separado.
BibTeX
@article{doi101017s0094837300016201,
author = "Renaud, Sabrina y Michaux, Jacques y Jaeger, Jean‐Jacques y Auffray, Jean‐Christophe",
title = "Análisis de Fourier aplicado a Stephanomys (Rodentia, Muridae) molares: patrón evolutivo no progresivo en una línea gradual",
year = "1996",
journal = "Paleobiology",
abstract = "Se analizan el tamaño y la forma de las líneas del género roedor Stephanomys Schaub 1938 del Plioceno. Los estudios filogenéticos anteriores se basaron principalmente en la variación del tamaño y comparaciones descriptivas, sin ningún intento de cuantificar los cambios de forma. Por lo tanto, basándose en el aumento regular del tamaño, Stephanomys ha sido considerado un ejemplo primario de gradualismo filético. Con el fin de cuantificar la variación morfológica dentro de la línea, se aplicó un método para analizar contornos complejos, la transformada de Fourier elíptica, al contorno del diente (primeros molares superiores e inferiores). Luego fue posible comparar la evolución del tamaño, estimada por el área del diente, así como la evolución de la forma, representada por los coeficientes de Fourier. Mientras que el tamaño parece cambiar gradualmente a lo largo del tiempo, la morfología da un patrón evolutivo bastante discontinuo tanto para el molar superior como para el inferior. Tal discrepancia entre la evolución del tamaño y la forma de una sola estructura sugiere que diferentes determinismos genéticos y restricciones mecánicas pueden actuar sobre el tamaño y la forma. Por lo tanto, puede ser engañoso inferir procesos evolutivos generalizados a partir del tamaño o la forma por separado.",
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doi = "10.1017/s0094837300016201",
openalex = "W2504052297",
references = "doi1010160146664x8290034x, doi101016016953479390024j, doi101017s0094837300008289, doi101017s0094837300012963, doi101017s0094837300013658, doi101038366223a0, doi101038368696a0, doi1023071378990, doi1023072413076, doi1023072413345, gingerich1987evolution"
}
50. Foote, Mike, 1996, PERSPECTIVA: PATRONES EVOLUTIVOS EN EL REGISTRO FÓSIL: Evolution: v. 50, no. 1: p. 1-11.
DOI: 10.1111/j.1558-5646.1996.tb04467.x
BibTeX
@article{foote1996perspective,
author = "Foote, Mike",
title = "PERSPECTIVA: PATRONES EVOLUTIVOS EN EL REGISTRO FÓSIL",
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pages = "1-11",
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}
51. Reznick, David N. y Shaw, Frank H. y Rodd, F. Helen y Shaw, Ruth G., 1997, Evaluación de la tasa de evolución en poblaciones naturales de peces payaso (Poecilia reticulata): Science.
DOI: 10.1126/science.275.5308.1934
Resumen
Se sometieron poblaciones naturales de peces payaso a un episodio de selección direccional que imitó procesos naturales. La tasa resultante de evolución de la edad y el tamaño al alcanzar la madurez fue similar a las tasas típicamente obtenidas para rasgos sometidos a selección artificial en entornos de laboratorio y hasta siete órdenes de magnitud mayores que las tasas inferidas del registro paleontológico. Los rasgos masculinos evolucionaron más rápidamente que los rasgos femeninos principalmente porque los machos tenían más variación genética sobre la cual la selección natural podía actuar. Estos resultados se consideran a la luz del debate en curso sobre la importancia de la selección natural frente a otros procesos en el registro paleontológico de la evolución.
BibTeX
@article{doi101126science27553081934,
author = "Reznick, David N. y Shaw, Frank H. y Rodd, F. Helen y Shaw, Ruth G.",
title = "Evaluación de la tasa de evolución en poblaciones naturales de peces payaso (Poecilia reticulata)",
year = "1997",
journal = "Science",
abstract = "Se sometieron poblaciones naturales de peces payaso a un episodio de selección direccional que imitó procesos naturales. La tasa resultante de evolución de la edad y el tamaño al alcanzar la madurez fue similar a las tasas típicamente obtenidas para rasgos sometidos a selección artificial en entornos de laboratorio y hasta siete órdenes de magnitud mayores que las tasas inferidas del registro paleontológico. Los rasgos masculinos evolucionaron más rápidamente que los rasgos femeninos principalmente porque los machos tenían más variación genética sobre la cual la selección natural podía actuar. Estos resultados se consideran a la luz del debate en curso sobre la importancia de la selección natural frente a otros procesos en el registro paleontológico de la evolución.",
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doi = "10.1126/science.275.5308.1934",
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}
52. Thorne, Jeffrey L. y Kishino, Hirohisa y Painter, Ian, 1998, Estimando la tasa de evolución de la tasa de evolución molecular: Molecular Biology and Evolution.
DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025892
Resumen
Se presenta un modelo sencillo para la evolución de la tasa de evolución molecular. Con un enfoque bayesiano, este modelo puede servir como base para estimar las fechas de eventos evolutivos importantes incluso en ausencia de la suposición de tasas constantes entre linajes evolutivos. El método puede utilizarse junto con cualquiera de los modelos ampliamente utilizados para la sustitución de nucleótidos o el reemplazo de aminoácidos. Se ilustra mediante el análisis de un conjunto de datos de secuencias de proteínas rbcL.
BibTeX
@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva025892,
author = "Thorne, Jeffrey L. y Kishino, Hirohisa y Painter, Ian",
title = "Estimando la tasa de evolución de la tasa de evolución molecular",
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journal = "Molecular Biology and Evolution",
abstract = "Se presenta un modelo sencillo para la evolución de la tasa de evolución molecular. Con un enfoque bayesiano, este modelo puede servir como base para estimar las fechas de eventos evolutivos importantes incluso en ausencia de la suposición de tasas constantes entre linajes evolutivos. El método puede utilizarse junto con cualquiera de los modelos ampliamente utilizados para la sustitución de nucleótidos o el reemplazo de aminoácidos. Se ilustra mediante el análisis de un conjunto de datos de secuencias de proteínas rbcL.",
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doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a025892",
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53. Pagel, Mark, 1999, Inferir los patrones históricos de la evolución biológica: Nature.
BibTeX
@article{doi10103844766,
author = "Pagel, Mark",
title = "Inferir los patrones históricos de la evolución biológica",
year = "1999",
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}
54. Alroy, John, 1999, El registro fósil de los mamíferos de Norteamérica: Evidencia de una radiación evolutiva del Paleoceno: Systematic Biology.
Resumen
Los paleontólogos han argumentado durante mucho tiempo que la radiación evolutiva más importante de los mamíferos ocurrió durante el Cenozoico temprano, o incluso que todos los euterios se originaron de un único ancestro común postcretácico. No obstante, varios análisis moleculares recientes afirman demostrar que, debido a que varias divisiones interordinales ocurrieron durante el Cretácico, una radiación teriana mayor estaba en curso en ese momento. Esta afirmación entra en conflicto con la evidencia estadística del registro fósil de Norteamérica del Cretácico tardío y del Cenozoico, bien muestreado. Los datos paleofaunísticos confirman que había menos especies de mamíferos durante el Cretácico tardío que durante cualquier intervalo del Cenozoico, y que una diversificación masiva tuvo lugar durante el Paleoceno temprano, inmediatamente después de una extinción masiva. Los datos de medición muestran que los mamíferos cretácicos eran en promedio pequeños y ocupaban un rango estrecho de tamaños corporales; después de la extinción masiva Cretácico-Terciario, hubo un cambio rápido y permanente en la media. El hecho de que hubo una radiación de mamíferos del Cenozoico temprano es totalmente compatible con la existencia de algunas divisiones cretácicas entre las líneas modernas de mamíferos.
BibTeX
@article{doi101080106351599260472,
author = "Alroy, John",
title = "The Fossil Record of North American Mammals: Evidence for a Paleocene Evolutionary Radiation",
year = "1999",
journal = "Systematic Biology",
abstract = "Paleontologists long have argued that the most important evolutionary radiation of mammals occurred during the early Cenozoic, if not that all eutherians originated from a single common post-Cretaceous ancestor. Nonetheless, several recent molecular analyses claim to show that because several interordinal splits occurred during the Cretaceous, a major therian radiation was then underway. This claim conflicts with statistical evidence from the well-sampled latest Cretaceous and Cenozoic North American fossil record. Paleofaunal data confirm that there were fewer mammalian species during the latest Cretaceous than during any interval of the Cenozoic, and that a massive diversification took place during the early Paleocene, immediately after a mass extinction. Measurement data show that Cretaceous mammals were on average small and occupied a narrow range of body sizes; after the Cretaceous-Tertiary mass extinction, there was a rapid and permanent shift in the mean. The fact that there was an early Cenozoic mammalian radiation is entirely compatible with the existence of a few Cretaceous splits among modern mammal lineages.",
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doi = "10.1080/106351599260472",
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references = "doi1023071218194, openalexw610180004"
}
55. McElwain, Jennifer C. y Beerling, David J. y Woodward, F. I., 1999, Plantas fósiles y calentamiento global en el límite Triásico-Jurásico: Science.
DOI: 10.1126/science.285.5432.1386
Resumen
El límite Triásico-Jurásico marca una extinción masiva de fauna importante, pero los registros de los cambios ambientales concomitantes son limitados. La evidencia paleobotánica indica un aumento cuatro veces mayor en la concentración de dióxido de carbono atmosférico y sugiere un calentamiento asociado de 3 a 4 grados C de "efecto invernadero" a través del límite. Se calcula que estas condiciones ambientales elevaron las temperaturas de las hojas por encima de un límite letal altamente conservado, contribuyendo quizás al cambio de más del 95 por ciento a nivel de especie de la megaflora del Triásico-Jurásico.
BibTeX
@article{doi101126science28554321386,
author = "McElwain, Jennifer C. y Beerling, David J. y Woodward, F. I.",
title = "Plantas fósiles y calentamiento global en el límite Triásico-Jurásico",
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journal = "Science",
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references = "doi1010160034666777900070, doi1010160034666780900226, doi1010160034666781900695, doi101093oso97801985491780010001, doi101126science21545391501, doi101126science2845414616, doi101126science3616622, doi101126science7701342, doi101144gsjgs15450773"
}
56. Grotzinger, J. P. y Knoll, Andrew H., 1999, ESTROMATOLITOS EN CARBONATOS PRECAMBRIANOS: Hitos evolutivos o indicadores ambientales?: Annual Review of Earth and Planetary Sciences.
DOI: 10.1146/annurev.earth.27.1.313
Resumen
Los estromatolitos son estructuras de crecimiento sedimentario adheridas y litificadas, que se acumulan alejadas de un punto o superficie limitada de inicio. Aunque el proceso de acumulación se considera comúnmente que resulta de las actividades de atrapamiento de sedimentos o inducción de precipitación de las mantas microbianas, poca evidencia de este proceso se conserva en la mayoría de los estromatolitos precámbricos. El estudio e interpretación exitosos de los estromatolitos requieren un enfoque basado en procesos, orientado a desconvolucionar las texturas de reemplazo de los estromatolitos antiguos. Primero deben tenerse en cuenta los efectos de la recristalización diagénica, seguido del análisis de las texturas de laminación y la deducción de posibles mecanismos de acumulación. Las hipótesis de acumulación pueden probarse utilizando simulaciones numéricas basadas en procesos de crecimiento de estromatolitos modernos. La aplicación de este enfoque ha demostrado que los estromatolitos se formaron originalmente en gran parte mediante la precipitación in situ de láminas durante el Arcaico y tiempos proterozoicos más antiguos, pero que los estromatolitos proterozoicos más jóvenes crecieron en gran parte mediante la acumulación de sedimentos carbonatados, muy probablemente a través del proceso físico de atrapamiento y unión microbianos. Esta tendencia refleja muy probablemente la evolución a largo plazo del entorno de la Tierra en lugar de las comunidades microbianas.
BibTeX
@article{doi101146annurevearth271313,
author = "Grotzinger, J. P. y Knoll, Andrew H.",
title = "ESTROMATOLITOS EN CARBONATOS PRECAMBRIANOS: Hitos evolutivos o indicadores ambientales?",
year = "1999",
journal = "Annual Review of Earth and Planetary Sciences",
abstract = "Los estromatolitos son estructuras de crecimiento sedimentario adheridas y litificadas, que se acumulan alejadas de un punto o superficie limitada de inicio. Aunque el proceso de acumulación se considera comúnmente que resulta de las actividades de atrapamiento de sedimentos o inducción de precipitación de las mantas microbianas, poca evidencia de este proceso se conserva en la mayoría de los estromatolitos precámbricos. El estudio e interpretación exitosos de los estromatolitos requieren un enfoque basado en procesos, orientado a desconvolucionar las texturas de reemplazo de los estromatolitos antiguos. Primero deben tenerse en cuenta los efectos de la recristalización diagénica, seguido del análisis de las texturas de laminación y la deducción de posibles mecanismos de acumulación. Las hipótesis de acumulación pueden probarse utilizando simulaciones numéricas basadas en procesos de crecimiento de estromatolitos modernos. La aplicación de este enfoque ha demostrado que los estromatolitos se formaron originalmente en gran parte mediante la precipitación in situ de láminas durante el Arcaico y tiempos proterozoicos más antiguos, pero que los estromatolitos proterozoicos más jóvenes crecieron en gran parte mediante la acumulación de sedimentos carbonatados, muy probablemente a través del proceso físico de atrapamiento y unión microbianos. Esta tendencia refleja muy probablemente la evolución a largo plazo del entorno de la Tierra en lugar de las comunidades microbianas.",
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doi = "10.1146/annurev.earth.27.1.313",
openalex = "W2142539052",
references = "doi101007978364276884234, doi101016001670379390347y, doi101016030192688590066x, doi101016s0070457108711373, doi101016s0070457108711567, doi101016s0070457108x70451, doi101017cbo9780511599798, doi101017cbo9780511601064, doi101038324055a0, doi101038368046a0, doi101038383423a0, doi101086628623, doi101103physrevb275686, doi101103physrevlett56889, doi101126science11539686, doi101126science1585174, doi101126science1744011825, doi101139e79088, doi101146annurevecolsys281129, doi1023073514631, doi1023073514973"
}
57. Hoffmann, Ary A. y Hercus, Miriam J., 2000, El estrés ambiental como una fuerza evolutiva: BioScience.
DOI: 10.1641/0006-3568(2000)050[0217:esaaef]2.3.co;2
Resumen
Las condiciones ambientales estresantes pueden definirse como aquellas que conducen a una reducción drástica de la aptitud en las poblaciones. Es decir, cuando las condiciones ambientales cambian y causan una reducción drástica en la producción reproductiva, y cuando la persistencia de las condiciones conduce a daños permanentes, estas condiciones constituyen un estrés ambiental. Los estreses físicos que se encuentran raramente en las poblaciones, como períodos de sequía o frío extremo, o que son experimentados por una minoría de una especie, como en poblaciones ubicadas en los límites de su distribución o expuestas a estreses químicos locales derivados de actividades humanas, pueden, a través de sus efectos directos o indirectos, conducir a reducciones significativas en el tamaño de las poblaciones (Glynn 1988, Hoffmann y Parsons 1991) y a ciclos repetidos de colonización y extinción (Andrewartha y Birch 1954).
BibTeX
@article{doi1016410006356820000500217esaaef23co2,
author = "Hoffmann, Ary A. y Hercus, Miriam J.",
title = "El estrés ambiental como una fuerza evolutiva",
year = "2000",
journal = "BioScience",
abstract = "Las condiciones ambientales estresantes pueden definirse como aquellas que conducen a una reducción drástica de la aptitud en las poblaciones. Es decir, cuando las condiciones ambientales cambian y causan una reducción drástica en la producción reproductiva, y cuando la persistencia de las condiciones conduce a daños permanentes, estas condiciones constituyen un estrés ambiental. Los estreses físicos que se encuentran raramente en las poblaciones, como períodos de sequía o frío extremo, o que son experimentados por una minoría de una especie, como en poblaciones ubicadas en los límites de su distribución o expuestas a estreses químicos locales derivados de actividades humanas, pueden, a través de sus efectos directos o indirectos, conducir a reducciones significativas en el tamaño de las poblaciones (Glynn 1988, Hoffmann y Parsons 1991) y a ciclos repetidos de colonización y extinción (Andrewartha y Birch 1954).",
url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2000)050[0217:esaaef]2.3.co;2",
doi = "10.1641/0006-3568(2000)050[0217:esaaef]2.3.co;2",
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references = "doi101016s0031018296000995, doi101146annureves10110179001335"
}
58. Steiner, Michael y Wallis, Eckart y Erdtmann, Bernd-Dietrich y Zhao, Yuanlong y Yang, Ruidong, 2001, Capas de menas exhalativas hidrotermales submarinas en pizarras negras del sur de China y fósiles asociados — perspectivas sobre una facies del Cámbrico Inferior y bio-evolución: Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology.
DOI: 10.1016/s0031-0182(01)00208-5
BibTeX
@article{doi101016s0031018201002085,
author = "Steiner, Michael y Wallis, Eckart y Erdtmann, Bernd-Dietrich y Zhao, Yuanlong y Yang, Ruidong",
title = "Capas de menas exhalativas hidrotermales submarinas en pizarras negras del sur de China y fósiles asociados — perspectivas sobre una facies del Cámbrico Inferior y bio-evolución",
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journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
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doi = "10.1016/s0031-0182(01)00208-5",
openalex = "W2115053158",
references = "doi1010160009254180900479, doi1010160009254186900781, doi1010160012821x84900396, doi101016003101829390065q, doi1010160031920186900932, doi101016003192018990263x, doi101017cbo9780511601064, doi101038267403a0, doi101126science2464928339, doi101126science2705236598, doi1011300091761319940220179pcbgsr23co2, doi101144gsjgs14920171, doi101306m20377, doi10182618200374742199101, doi1023072992562, openalexw1624806571"
}
59. Fraser, Dylan J. y Bernatchez, Louis, 2001, Conservación evolutiva adaptativa: hacia un concepto unificado para definir unidades de conservación: Molecular Ecology.
DOI: 10.1046/j.1365-294x.2001.t01-1-01411.x
Resumen
En los últimos años se ha debatido sobre varios métodos que podrían priorizar objetivamente el valor de conservación por debajo del nivel de especie. El más destacado entre estos ha sido la unidad evolutivamente significativa (UES). Revisamos los conceptos de UES con el objetivo de proponer un concepto más unificado que reconcilie las posturas opuestas. Al igual que los conceptos de especie, los conceptos de UES conflictivos están esencialmente buscando definir lo mismo: segmentos de especies cuya divergencia puede medirse o evaluarse poniendo énfasis diferencial en el papel de las fuerzas evolutivas en escalas temporales variadas. Por lo tanto, las diferencias entre los conceptos de UES radican más en los criterios utilizados para definir las propias UES que en su esencia fundamental. Proporcionamos un marco basado en el contexto para delimitar las UES que evita gran parte de esta situación. En lugar de involucrarse en un debate confuso sobre un criterio óptimo, la clave para una solución es aceptar que los criterios diferentes funcionarán de manera más dinámica que otros y pueden utilizarse solos o en combinación dependiendo de la situación. Estas afirmaciones constituyen el impulso detrás de la conservación evolutiva adaptativa.
BibTeX
@article{doi101046j1365294x2001t01101411x,
author = "Fraser, Dylan J. y Bernatchez, Louis",
title = "Conservación evolutiva adaptativa: hacia un concepto unificado para definir unidades de conservación",
year = "2001",
journal = "Molecular Ecology",
abstract = "En los últimos años se ha debatido sobre varios métodos que podrían priorizar objetivamente el valor de conservación por debajo del nivel de especie. El más destacado entre estos ha sido la unidad evolutivamente significativa (UES). Revisamos los conceptos de UES con el objetivo de proponer un concepto más unificado que reconcilie las posturas opuestas. Al igual que los conceptos de especie, los conceptos de UES conflictivos están esencialmente buscando definir lo mismo: segmentos de especies cuya divergencia puede medirse o evaluarse poniendo énfasis diferencial en el papel de las fuerzas evolutivas en escalas temporales variadas. Por lo tanto, las diferencias entre los conceptos de UES radican más en los criterios utilizados para definir las propias UES que en su esencia fundamental. Proporcionamos un marco basado en el contexto para delimitar las UES que evita gran parte de esta situación. En lugar de involucrarse en un debate confuso sobre un criterio óptimo, la clave para una solución es aceptar que los criterios diferentes funcionarán de manera más dinámica que otros y pueden utilizarse solos o en combinación dependiendo de la situación. Estas afirmaciones constituyen el impulso detrás de la conservación evolutiva adaptativa.",
url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.2001.t01-1-01411.x",
doi = "10.1046/j.1365-294x.2001.t01-1-01411.x",
openalex = "W2141234232",
references = "doi10100797814615678136, doi101126science27953592115, doi1023073224530, doi107202032681ar, doi107312simp92414"
}
60. Kishino, Hirohisa y Thorne, Jeffrey L. y Bruno, William, 2001, Rendimiento de un método de estimación de tiempos de divergencia bajo un modelo probabilístico de evolución de tasas: Molecular Biology and Evolution.
DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003811
Resumen
Las tasas de evolución molecular varían con el tiempo y, por lo tanto, entre linajes. Por el contrario, los métodos ampliamente utilizados para estimar tiempos de divergencia a partir de datos de secuencias moleculares asumen constancia de las tasas. Por lo tanto, los métodos para la estimación de tiempos de divergencia que incorporan la variación de tasas son atractivos. Se describen mejoras en una técnica bayesiana previamente propuesta para la estimación de tiempos de divergencia. Una nueva parametrización captura más eficazmente la estructura filogenética de la evolución de tasas en un árbol. La información fósil y otras evidencias ahora pueden incluirse en los análisis bayesianos en forma de restricciones sobre los tiempos de divergencia. Los resultados de simulación demuestran que la precisión de la estimación de tiempos de divergencia se mejora sustancialmente cuando se incluyen restricciones.
BibTeX
@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva003811,
author = "Kishino, Hirohisa and Thorne, Jeffrey L. and Bruno, William",
title = "Performance of a Divergence Time Estimation Method under a Probabilistic Model of Rate Evolution",
year = "2001",
journal = "Molecular Biology and Evolution",
abstract = "Rates of molecular evolution vary over time and, hence, among lineages. In contrast, widely used methods for estimating divergence times from molecular sequence data assume constancy of rates. Therefore, methods for estimation of divergence times that incorporate rate variation are attractive. Improvements on a previously proposed Bayesian technique for divergence time estimation are described. New parameterization more effectively captures the phylogenetic structure of rate evolution on a tree. Fossil information and other evidence can now be included in Bayesian analyses in the form of constraints on divergence times. Simulation results demonstrate that the accuracy of divergence time estimation is substantially enhanced when constraints are included.",
url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a003811",
doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a003811",
openalex = "W2045517599"
}
61. Sanmartín, Isabel y Enghoff, Henrik y Ronquist, Fredrik, 2001, Patrones de dispersión animal, vicarianza y diversificación en el Holarctico: Biological Journal of the Linnean Society.
DOI: 10.1111/j.1095-8312.2001.tb01368.x
Resumen
Analizamos los patrones de dispersión animal, vicarianza y diversificación en el Holarctico basándonos en filogenias completas de 57 taxones no marinos extantes, que juntos comprenden 770 especies, documentando eventos biogeográficos desde el Mesozoico tardío hasta la actualidad. Se utilizaron en los análisis cuatro áreas principales, cada una correspondiente a una masa terrestre históricamente persistente: Nearctico oriental (EN), Nearctico occidental (WN), Paleoarctico oriental (EP) y Paleoarctico occidental (WP). El ajuste de árboles basado en parsimonia mostró que no existe un cladograma de área general significativamente apoyado para el conjunto de datos. Sin embargo, las distribuciones están fuertemente conservadas filogenéticamente, como revela el análisis de dispersión-vicarianza (DIVA). Se utilizaron pruebas de permutación basadas en DIVA para identificar patrones biogeográficos determinados filogenéticamente. Coherente con las expectativas, las dispersiones continentales (WP↓EP y WN↓EN) son significativamente más comunes que las dispersiones paleocontinentales (WN↓EP y EN↓WP), las cuales a su vez son más comunes que las dispersiones disjuntas (EN↓EP y WN↓WP). Existe una asimetría de dispersión significativa tanto dentro del Nearctico (WN⇒EN más común que EN⇒WN) como del Paleoarctico (EP⇒WP más común que WP⇒EP). Las conexiones faunísticas trans-Beringianas han sido tradicionalmente enfatizadas, pero no son más importantes que las conexiones transatlánticas en nuestro conjunto de datos. Para analizar los cambios a lo largo del tiempo, clasificamos los eventos biogeográficos en cuatro períodos temporales principales utilizando evidencia fósil, biogeográfica y molecular combinada con un «reloj de ramificación». Estos análisis muestran que las distribuciones transatlánticas (EN–WP) fueron comunes en el Terciario temprano-medio (70–20 Myr), mientras que las distribuciones trans-Beringianas (WN–EP) fueron raras en ese período. La mayoría de las disyunciones EN–EP se remontan al Terciario temprano (70–45 Myr), lo que sugiere que resultaron de la división de distribuciones transatlánticas en lugar de trans-Beringianas. La diversificación en WN y WP aumentó en el Cuaternario (< 3 Myr), mientras que en EP y EN disminuyó desde un máximo en el Terciario temprano-medio.
BibTeX
@article{doi101111j109583122001tb01368x,
author = "Sanmartín, Isabel and Enghoff, Henrik and Ronquist, Fredrik",
title = "Patterns of animal dispersal, vicariance and diversification in the Holarctic",
year = "2001",
journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
abstract = "We analysed patterns of animal dispersal, vicariance and diversification in the Holarctic based on complete phylogenies of 57 extant non-marine taxa, together comprising 770 species, documenting biogeographic events from the Late Mesozoic to the present. Four major areas, each corresponding to a historically persistent landmass, were used in the analyses: eastern Nearctic (EN), western Nearctic (WN), eastern Palaeoarctic (EP) and western Palaeoarctic (WP). Parsimony-based tree fitting showed that there is no significantly supported general area cladogram for the dataset. Yet, distributions are strongly phylogenetically conserved, as revealed by dispersal-vicariance analysis (DIVA). DIVA-based permutation tests were used to pinpoint phylogenetically determined biogeographic patterns. Consistent with expectations, continental dispersals (WP↓EP and WN↓EN) are significantly more common than palaeocontinental dispersals (WN↓EP and EN↓WP), which in turn are more common than disjunct dispersals (EN↓EP and WN↓WP). There is significant dispersal asymmetry both within the Nearctic (WN⇒EN more common than EN⇒WN) and the Palaeoarctic (EP⇒WP more common than WP⇒EP). Cross-Beringian faunal connections have traditionally been emphasized but are not more important than cross-Atlantic connections in our data set. To analyse changes over time, we sorted biogeographic events into four major time periods using fossil, biogeographic and molecular evidence combined with a «branching clock». These analyses show that trans-Atlantic distributions (EN–WP) were common in the Early–Mid Tertiary (70–20 Myr), whereas trans-Beringian distributions (WN–EP) were rare in that period. Most EN–EP disjunctions date back to the Early Tertiary (70–45 Myr), suggesting that they resulted from division of cross-Atlantic rather than cross-Beringian distributions. Diversification in WN and WP increased in the Quaternary (< 3 Myr), whereas in EP and EN it decreased from a maximum in the Early–Mid Tertiary.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2001.tb01368.x",
doi = "10.1111/j.1095-8312.2001.tb01368.x",
openalex = "W2142884638",
references = "doi101007978146133485919, doi101007978303487527124, doi1010160169534794901635, doi10103835025052, doi101093oxfordjournalsmolbeva026092, doi101093sysbio461195, doi101146annurevecolsys301421, doi101146annureven15010170000525, doi1023071440574, doi1023072395021, doi1023072412970, doi105962bhlpart13183, openalexw1486025919, openalexw2989964553"
}
62. Gould, Stephen Jay, 2002, The Structure of Evolutionary Theory: Harvard University Press eBooks.
BibTeX
@book{doi102307jctvjsf433,
author = "Gould, Stephen Jay",
title = "The Structure of Evolutionary Theory",
year = "2002",
booktitle = "Harvard University Press eBooks",
url = "https://doi.org/10.2307/j.ctvjsf433",
doi = "10.2307/j.ctvjsf433",
openalex = "W4300925890"
}
63. Gould, Stephen Jay, 2002, The structure of evolutionary theory: Choice Reviews Online.
Resumen
* *1. Definiendo y Revisando la Estructura de la Teoría de la Evolución * Parte I: La Historia de la Lógica Darwiniana y el Debate *2. La Esencia del Darwinismo y la Base de la Ortodoxia Moderna: Una Exégesis del Origen de las Especies *3. Semillas de Jerarquía *4. Internalismo y Leyes de la Forma: Alternativas Pre-Darwinianas al Funcionalismo *5. Las Facetas Fructíferas del Poliedro de Galton: Canales y Saltaciones en el Formalismo Post-Darwiniano *6. Patrón y Progreso en el Escenario Geológico *7. La Síntesis Moderna como un Consenso Limitado * Parte II: Hacia una Teoría Evolutiva Revisada y Ampliada *8. Especies como Individuos en la Teoría Jerárquica de la Selección *9. Equilibrio Puntuado y la Validación de la Teoría Macroevolutiva *10. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en la Ontogenia y la Filogenia: Restricciones Históricas y la Evolución del Desarrollo *11. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en la Ontogenia y la Filogenia: Restricciones Estructurales, Arcoíris y la Centralidad de la Exaptación en la Macroevolución *12. Niveles de Tiempo y Pruebas del Extrapolacionismo, Con un Epílogo sobre la Interacción de la Teoría General e Historia Contingente * Bibliografía * Índice
BibTeX
@article{doi105860choice396411,
author = "Gould, Stephen Jay",
title = "The structure of evolutionary theory",
year = "2002",
journal = "Choice Reviews Online",
abstract = "* *1. Definiendo y Revisando la Estructura de la Teoría de la Evolución * Parte I: La Historia de la Lógica Darwiniana y el Debate *2. La Esencia del Darwinismo y la Base de la Ortodoxia Moderna: Una Exégesis del Origen de las Especies *3. Semillas de Jerarquía *4. Internalismo y Leyes de la Forma: Alternativas Pre-Darwinianas al Funcionalismo *5. Las Facetas Fructíferas del Poliedro de Galton: Canales y Saltaciones en el Formalismo Post-Darwiniano *6. Patrón y Progreso en el Escenario Geológico *7. La Síntesis Moderna como un Consenso Limitado * Parte II: Hacia una Teoría Evolutiva Revisada y Ampliada *8. Especies como Individuos en la Teoría Jerárquica de la Selección *9. Equilibrio Puntuado y la Validación de la Teoría Macroevolutiva *10. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en la Ontogenia y la Filogenia: Restricciones Históricas y la Evolución del Desarrollo *11. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en la Ontogenia y la Filogenia: Restricciones Estructurales, Arcoíris y la Centralidad de la Exaptación en la Macroevolución *12. Niveles de Tiempo y Pruebas del Extrapolacionismo, Con un Epílogo sobre la Interacción de la Teoría General e Historia Contingente * Bibliografía * Índice",
url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-6411",
doi = "10.5860/choice.39-6411",
openalex = "W1539968307"
}
64. Smith, Joshua B. y Dodson, Peter, 2003, Una propuesta para una terminología estándar de notación anatómica y orientación en denticiones fósiles de vertebrados no mamíferos: Journal of Vertebrate Paleontology.
DOI: 10.1671/0272-4634(2003)23[1:apfast]2.0.co;2
Resumen
RESUMEN Hay poca consistencia en la notación y terminología de orientación utilizada en discusiones sobre denticiones fósiles de vertebrados no mamíferos. La estandarización de esta terminología, como se hace en las ciencias médicas y dentales, facilitaría toda la investigación futura sobre dientes fósiles. Para los mamíferos, recomendamos seguir la convención donde los incisivos, caninos, premolares y molares se abrevian como In, Cn, Pn y Mn (n = número del diente) en las mandíbulas superiores y como in, cn, pn y mn en las mandíbulas inferiores. Los dientes derechos, izquierdos y deciduos se indican con R, L y D (por ejemplo, DP4, Rp2). Para los no mamíferos, que pueden tener premaxilares, maxilares y dentarios dentígeros, así como huesos adicionales portadores de dientes (por ejemplo, vomeros, palatinos, pterigoideos, ectopterigoideos, esfenoides, spleniales e incluso parasfenoides), alentamos identificar los dientes utilizando la abreviatura del hueso (por ejemplo, pmn, mxn, dn, vn, pain). Se puede utilizar una combinación de número y barra (/) para distinguir entre múltiples filas de dientes (por ejemplo, Pal1/n, Pal2/n), y se pueden crear mapas específicos de especímenes para denticiones muy complicadas. Sugerimos el uso de los términos mesial y distal para designar superficies dentales y direcciones que miran hacia y lejos de la sínfisis mandibular. Labial se ofrece para aquellas superficies y direcciones que miran hacia los labios o mejillas y lingual para aquellas que miran hacia la lengua. Ofrecemos los términos basal para la dirección hacia las bases de la corona, apical para la dirección hacia las puntas de la corona, oclusal para las vistas de las superficies oclusales, y basal y apical de la raíz para las vistas de las bases de la corona y las raíces, respectivamente.
BibTeX
@article{doi101671027246342003231apfast20co2,
author = "Smith, Joshua B. y Dodson, Peter",
title = "Una propuesta para una terminología estándar de notación anatómica y orientación en denticiones fósiles de vertebrados",
year = "2003",
journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
abstract = "RESUMEN Hay poca consistencia en la notación y terminología de orientación utilizada en discusiones sobre denticiones fósiles de vertebrados no mamíferos. La estandarización de esta terminología, como se hace en las ciencias médicas y dentales, facilitaría toda la investigación futura sobre dientes fósiles. Para los mamíferos, recomendamos seguir la convención donde los incisivos, caninos, premolares y molares se abrevian como In, Cn, Pn y Mn (n = número del diente) en las mandíbulas superiores y como in, cn, pn y mn en las mandíbulas inferiores. Los dientes derechos, izquierdos y deciduos se indican con R, L y D (por ejemplo, DP4, Rp2). Para los no mamíferos, que pueden tener premaxilares, maxilares y dentarios dentígeros, así como huesos adicionales portadores de dientes (por ejemplo, vomeros, palatinos, pterigoideos, ectopterigoideos, esfenoides, spleniales e incluso parasfenoides), alentamos identificar los dientes utilizando la abreviatura del hueso (por ejemplo, pmn, mxn, dn, vn, pain). Se puede utilizar una combinación de número y barra (/) para distinguir entre múltiples filas de dientes (por ejemplo, Pal1/n, Pal2/n), y se pueden crear mapas específicos de especímenes para denticiones muy complicadas. Sugerimos el uso de los términos mesial y distal para designar superficies dentales y direcciones que miran hacia y lejos de la sínfisis mandibular. Labial se ofrece para aquellas superficies y direcciones que miran hacia los labios o mejillas y lingual para aquellas que miran hacia la lengua. Ofrecemos los términos basal para la dirección hacia las bases de la corona, apical para la dirección hacia las puntas de la corona, oclusal para las vistas de las superficies oclusales, y basal y apical de la raíz para las vistas de las bases de la corona y las raíces, respectivamente.",
url = "https://doi.org/10.1671/0272-4634(2003)23[1:apfast]2.0.co;2",
doi = "10.1671/0272-4634(2003)23[1:apfast]2.0.co;2",
openalex = "W2177918895",
references = "doi101001jama191104260090143037, doi101007bf02987808, doi101017cbo9780511608377011, doi101017s0094837300016201, doi10108002724634198710011638, doi10108002724634199510011250, doi10108002724634199810011101, doi10108002724634199810011114, doi101086273307, doi101098rstb19740001, doi101111j109636421978tb01049x, doi101126science10246376, doi101126science2665183267, doi101126science2725264986, doi101144gsjgs15310005, doi1016660022336020010750208lcsdaf20co2, doi1023073514548, doi1023073514751, doi105281zenodo1048848, doi105281zenodo16492064, doi105860choice383310, openalexw197683541, openalexw2609000594, rowe1989a, sues1978a"
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65. Kumar, Sudhir, 2004, MEGA3: Software integrado para el Análisis de Genética Evolutiva Molecular y alineamiento de secuencias: Briefings in Bioinformatics.
Resumen
Con su base teórica firmemente establecida en la genética evolutiva molecular y de poblaciones, el análisis comparativo de secuencias de ADN y proteínas desempeña un papel central en la reconstrucción de las historias evolutivas de especies y familias de genes múltiples, la estimación de las tasas de evolución molecular y la inferencia de la naturaleza y extensión de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y genomas. El alcance de estas investigaciones se ha ampliado enormemente gracias al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento y nuevos métodos estadísticos y computacionales. Estos métodos requieren programas informáticos fáciles de usar. Uno de estos esfuerzos ha sido producir el software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA), con su enfoque en facilitar la exploración y el análisis de la variación de secuencias de ADN y proteínas desde una perspectiva evolutiva. Actualmente en su tercera versión mayor, MEGA3 contiene facilidades para el alineamiento automático y manual de secuencias, la minería basada en web de bases de datos, la inferencia de árboles filogenéticos, la estimación de distancias evolutivas y la prueba de hipótesis evolutivas. Este artículo proporciona una visión general de los métodos estadísticos, las herramientas computacionales y los módulos de exploración visual para la entrada de datos y los resultados obtenibles en MEGA.
BibTeX
@article{doi101093bib52150,
author = "Kumar, Sudhir",
title = "MEGA3: Software integrado para el Análisis de Genética Evolutiva Molecular y alineamiento de secuencias",
year = "2004",
journal = "Briefings in Bioinformatics",
abstract = "Con su base teórica firmemente establecida en la genética evolutiva molecular y de poblaciones, el análisis comparativo de secuencias de ADN y proteínas desempeña un papel central en la reconstrucción de las historias evolutivas de especies y familias de genes múltiples, la estimación de las tasas de evolución molecular y la inferencia de la naturaleza y extensión de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y genomas. El alcance de estas investigaciones se ha ampliado enormemente gracias al desarrollo de técnicas de secuenciación de alto rendimiento y nuevos métodos estadísticos y computacionales. Estos métodos requieren programas informáticos fáciles de usar. Uno de estos esfuerzos ha sido producir el software de Análisis de Genética Evolutiva Molecular (MEGA), con su enfoque en facilitar la exploración y el análisis de la variación de secuencias de ADN y proteínas desde una perspectiva evolutiva. Actualmente en su tercera versión mayor, MEGA3 contiene facilidades para el alineamiento automático y manual de secuencias, la minería basada en web de bases de datos, la inferencia de árboles filogenéticos, la estimación de distancias evolutivas y la prueba de hipótesis evolutivas. Este artículo proporciona una visión general de los métodos estadísticos, las herramientas computacionales y los módulos de exploración visual para la entrada de datos y los resultados obtenibles en MEGA.",
url = "https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150",
doi = "10.1093/bib/5.2.150",
openalex = "W2146396346",
references = "doi101007bf01731581, doi101007bf02407308, doi101016b9781483232119500097, doi101093bioinformatics17121244, doi101093genetics1233585, doi101093nar22224673, doi101093nar25173389, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040259, doi101093oxfordjournalsmolbeva040343, doi101093oxfordjournalsmolbeva040410, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023072408678, doi1023072412074, doi105860choice392183, openalexw2032279931, openalexw3217097258"
}
66. Huson, Daniel H. y Bryant, David, 2005, Aplicación de redes filogenéticas en estudios evolutivos: Molecular Biology and Evolution.
Resumen
La historia evolutiva de un conjunto de taxones suele representarse mediante un árbol filogenético, y este modelo ha facilitado enormemente la discusión y la prueba de hipótesis. Sin embargo, es bien sabido que los escenarios evolutivos más complejos no se describen bien con tales modelos. Además, incluso cuando la evolución procede de manera arborescente, el análisis de los datos puede beneficiarse más de métodos que no imponen una estructura de árbol, sino de una visualización más rica de los datos para evaluar sus propiedades, al menos como un primer paso esencial. Por lo tanto, se deben emplear redes filogenéticas cuando se cree que están involucrados eventos reticulados como la hibridación, el transferencia horizontal de genes, la recombinación o la duplicación y pérdida de genes, y, incluso en ausencia de tales eventos, las redes filogenéticas tienen un papel útil que desempeñar. Este artículo revisa la terminología utilizada para las redes filogenéticas y abarca tanto las redes de división como las redes reticuladas, cómo se definen y cómo pueden interpretarse. Además, el artículo esboza los inicios de un marco estadístico integral para aplicar métodos de redes de división. Mostramos cómo las redes de división pueden representar conjuntos de confianza de árboles e introducimos una prueba estadística conservadora para determinar si la señal conflictiva en una red es arborescente. Finalmente, este artículo describe un nuevo programa, SplitsTree4, una herramienta interactiva e integral para inferir diferentes tipos de redes filogenéticas a partir de secuencias, distancias y árboles.
BibTeX
@article{doi101093molbevmsj030,
author = "Huson, Daniel H. y Bryant, David",
title = "Aplicación de redes filogenéticas en estudios evolutivos",
year = "2005",
journal = "Molecular Biology and Evolution",
abstract = "La historia evolutiva de un conjunto de taxones suele representarse mediante un árbol filogenético, y este modelo ha facilitado enormemente la discusión y la prueba de hipótesis. Sin embargo, es bien sabido que los escenarios evolutivos más complejos no se describen bien con tales modelos. Además, incluso cuando la evolución procede de manera arborescente, el análisis de los datos puede beneficiarse más de métodos que no imponen una estructura de árbol, sino de una visualización más rica de los datos para evaluar sus propiedades, al menos como un primer paso esencial. Por lo tanto, se deben emplear redes filogenéticas cuando se cree que están involucrados eventos reticulados como la hibridación, el transferencia horizontal de genes, la recombinación o la duplicación y pérdida de genes, y, incluso en ausencia de tales eventos, las redes filogenéticas tienen un papel útil que desempeñar. Este artículo revisa la terminología utilizada para las redes filogenéticas y abarca tanto las redes de división como las redes reticuladas, cómo se definen y cómo pueden interpretarse. Además, el artículo esboza los inicios de un marco estadístico integral para aplicar métodos de redes de división. Mostramos cómo las redes de división pueden representar conjuntos de confianza de árboles e introducimos una prueba estadística conservadora para determinar si la señal conflictiva en una red es arborescente. Finalmente, este artículo describe un nuevo programa, SplitsTree4, una herramienta interactiva e integral para inferir diferentes tipos de redes filogenéticas a partir de secuencias, distancias y árboles.",
url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msj030",
doi = "10.1093/molbev/msj030",
openalex = "W2055298722",
references = "doi101016s0169534700020267, doi101038nrg929, doi10108010635150390235520, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsi111, doi101093sysbio463523, doi101111j155856461985tb00420x"
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67. Teeling, Emma C. y Springer, Mark S. y Madsen, Ole y Bates, Paul J. J. y O’Brien, Stephen J. y Murphy, William J., 2005, Una filogenia molecular para murciélagos ilumina la biogeografía y el registro fósil: Science.
Resumen
Los murciélagos constituyen más del 20% de los mamíferos existentes, sin embargo, su historia evolutiva es en gran parte desconocida debido a un registro fósil limitado y filogenias conflictivas o incompletas. Aquí, presentamos una filogenia molecular altamente resuelta para todas las familias de murciélagos existentes. Nuestros resultados apoyan la hipótesis de que los megabatos están anidados entre cuatro linajes principales de microbatos, que se originaron en el Eoceno temprano [de 52 a 50 millones de años atrás (Mya)], coincidiendo con un aumento significativo global de la temperatura, un aumento en la diversidad y abundancia de plantas, y el cenit de la diversidad de insectos del Terciario. Nuestros datos sugieren que los murciélagos se originaron en Laurasia, posiblemente en América del Norte, y que tres de los linajes principales de microbatos son de origen Laurásico, mientras que el cuarto es de origen Gondwaniano. Combinando principios de análisis de linaje fantasma con fechas de divergencia molecular, estimamos que el registro fósil de murciélagos subestima (longitud de rama basal no representada, UBBL) las primeras apariciones en un promedio del 73% y que la suma de la historia fósil faltante es del 61%.
BibTeX
@article{doi101126science1105113,
author = "Teeling, Emma C. y Springer, Mark S. y Madsen, Ole y Bates, Paul J. J. y O’Brien, Stephen J. y Murphy, William J.",
title = "Una filogenia molecular para murciélagos ilumina la biogeografía y el registro fósil",
year = "2005",
journal = "Science",
abstract = "Los murciélagos constituyen más del 20% de los mamíferos existentes, sin embargo, su historia evolutiva es en gran parte desconocida debido a un registro fósil limitado y filogenias conflictivas o incompletas. Aquí, presentamos una filogenia molecular altamente resuelta para todas las familias de murciélagos existentes. Nuestros resultados apoyan la hipótesis de que los megabatos están anidados entre cuatro linajes principales de microbatos, que se originaron en el Eoceno temprano [de 52 a 50 millones de años atrás (Mya)], coincidiendo con un aumento significativo global de la temperatura, un aumento en la diversidad y abundancia de plantas, y el cenit de la diversidad de insectos del Terciario. Nuestros datos sugieren que los murciélagos se originaron en Laurasia, posiblemente en América del Norte, y que tres de los linajes principales de microbatos son de origen Laurásico, mientras que el cuarto es de origen Gondwaniano. Combinando principios de análisis de linaje fantasma con fechas de divergencia molecular, estimamos que el registro fósil de murciélagos subestima (longitud de rama basal no representada, UBBL) las primeras apariciones en un promedio del 73% y que la suma de la historia fósil faltante es del 61%.",
url = "https://doi.org/10.1126/science.1105113",
doi = "10.1126/science.1105113",
openalex = "W1997655974",
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}
68. Hughes, Colin E. y Eastwood, Ruth J., 2006, Radiación insular a escala continental: Tasas excepcionales de diversificación de plantas tras el levantamiento de los Andes: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumen
Las radiaciones de especies proporcionan conocimientos únicos sobre los procesos evolutivos subyacentes a la diversificación de especies y los patrones de biodiversidad. Para comparar la diversificación de plantas durante un período de tiempo similar a las recientes radiaciones de peces cíclidos, que son un orden de magnitud más rápidas que las radiaciones documentadas de aves, artrópodos y plantas, nos centramos en la flora de alta montaña de los Andes, que es la más rica en especies de cualquier montaña tropical. Debido al reciente levantamiento de los Andes septentrionales, los entornos de tierras altas donde se encuentra gran parte de esta rica flora endémica solo han estado disponibles para la colonización desde el Plioceno tardío o el Pleistoceno, hace 2-4 millones de años (Ma). Utilizando datos de secuencias de ADN, identificamos un grupo monofilético dentro del género Lupinus que representa 81 especies endémicas de los Andes. La edad de este clado se estima en 1,18-1,76 Ma, lo que implica una tasa de diversificación de 2,49-3,72 especies por Ma. Esto supera las estimaciones anteriores para las plantas, proporcionando el ejemplo más espectacular de diversificación explosiva de especies de plantas documentado hasta la fecha. Además, sugiere que las altas tasas de diversificación de cíclidos no son únicas. La falta de innovaciones clave asociadas con el clado de Lupinus andino sugiere que la diversificación fue impulsada por las oportunidades ecológicas ofrecidas por la aparición de hábitats similares a islas tras el levantamiento de los Andes. Datos de otros géneros indican que los lupinos son uno de un conjunto de radiaciones de plantas andinas igualmente rápidas, continentales en escala e insulares en estímulo, lo que sugiere que la flora de alta montaña de los Andes proporciona un sistema que rivaliza con otros grupos, incluidos los cíclidos, para comprender la rápida diversificación de especies.
BibTeX
@article{doi101073pnas0601928103,
author = "Hughes, Colin E. y Eastwood, Ruth J.",
title = "Radiación insular a escala continental: Tasas excepcionales de diversificación de plantas tras el levantamiento de los Andes",
year = "2006",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "Las radiaciones de especies proporcionan conocimientos únicos sobre los procesos evolutivos subyacentes a la diversificación de especies y los patrones de biodiversidad. Para comparar la diversificación de plantas durante un período de tiempo similar a las recientes radiaciones de peces cíclidos, que son un orden de magnitud más rápidas que las radiaciones documentadas de aves, artrópodos y plantas, nos centramos en la flora de alta montaña de los Andes, que es la más rica en especies de cualquier montaña tropical. Debido al reciente levantamiento de los Andes septentrionales, los entornos de tierras altas donde se encuentra gran parte de esta rica flora endémica solo han estado disponibles para la colonización desde el Plioceno tardío o el Pleistoceno, hace 2-4 millones de años (Ma). Utilizando datos de secuencias de ADN, identificamos un grupo monofilético dentro del género Lupinus que representa 81 especies endémicas de los Andes. La edad de este clado se estima en 1,18-1,76 Ma, lo que implica una tasa de diversificación de 2,49-3,72 especies por Ma. Esto supera las estimaciones anteriores para las plantas, proporcionando el ejemplo más espectacular de diversificación explosiva de especies de plantas documentado hasta la fecha. Además, sugiere que las altas tasas de diversificación de cíclidos no son únicas. La falta de innovaciones clave asociadas con el clado de Lupinus andino sugiere que la diversificación fue impulsada por las oportunidades ecológicas ofrecidas por la aparición de hábitats similares a islas tras el levantamiento de los Andes. Datos de otros géneros indican que los lupinos son uno de un conjunto de radiaciones de plantas andinas igualmente rápidas, continentales en escala e insulares en estímulo, lo que sugiere que la flora de alta montaña de los Andes proporciona un sistema que rivaliza con otros grupos, incluidos los cíclidos, para comprender la rápida diversificación de especies.",
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69. Parmesan, Camille, 2006, Respuestas ecológicas y evolutivas al cambio climático reciente: Annual Review of Ecology Evolution and Systematics.
DOI: 10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100
Resumen
Los cambios ecológicos en la fenología y distribución de plantas y animales están ocurriendo en todos los grupos marinos, de agua dulce y terrestres bien estudiados. Estos cambios observados están fuertemente sesgados en las direcciones predichas por el calentamiento global y se han vinculado al cambio climático local o regional a través de correlaciones entre el clima y la variación biológica, experimentos de campo y laboratorio, e investigación fisiológica. Las especies con rangos restringidos, particularmente las polares y de cumbres montañosas, muestran contracciones severas de su rango y han sido los primeros grupos en los que especies enteras han desaparecido debido al cambio climático reciente. Los arrecifes de coral tropicales y los anfibios han sido los más afectados negativamente. Las interacciones depredador-presa y planta-insecto se han visto interrumpidas cuando las especies interactuantes han respondido de manera diferente al calentamiento. Las adaptaciones evolutivas a condiciones más cálidas han ocurrido en el interior de los rangos de las especies, y el uso de recursos y la dispersión han evolucionado rápidamente en los márgenes de los rangos en expansión. Los cambios genéticos observados modulan los efectos locales del cambio climático, pero hay poca evidencia de que mitiguen los efectos negativos a nivel de especie.
BibTeX
@article{doi101146annurevecolsys37091305110100,
author = "Parmesan, Camille",
title = "Respuestas ecológicas y evolutivas al cambio climático reciente",
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abstract = "Los cambios ecológicos en la fenología y distribución de plantas y animales están ocurriendo en todos los grupos marinos, de agua dulce y terrestres bien estudiados. Estos cambios observados están fuertemente sesgados en las direcciones predichas por el calentamiento global y se han vinculado al cambio climático local o regional a través de correlaciones entre el clima y la variación biológica, experimentos de campo y laboratorio, e investigación fisiológica. Las especies con rangos restringidos, particularmente las polares y de cumbres montañosas, muestran contracciones severas de su rango y han sido los primeros grupos en los que especies enteras han desaparecido debido al cambio climático reciente. Los arrecifes de coral tropicales y los anfibios han sido los más afectados negativamente. Las interacciones depredador-presa y planta-insecto se han visto interrumpidas cuando las especies interactuantes han respondido de manera diferente al calentamiento. Las adaptaciones evolutivas a condiciones más cálidas han ocurrido en el interior de los rangos de las especies, y el uso de recursos y la dispersión han evolucionado rápidamente en los márgenes de los rangos en expansión. Los cambios genéticos observados modulan los efectos locales del cambio climático, pero hay poca evidencia de que mitiguen los efectos negativos a nivel de especie.",
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70. Petit, Rémy J. y Hampe, Arndt, 2006, Algunas Consecuencias Evolutivas de Ser un Árbol: Annual Review of Ecology Evolution and Systematics.
DOI: 10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215
Resumen
Los árboles no forman un grupo natural, pero comparten atributos como gran tamaño, longevidad y alta capacidad reproductiva que afectan su modo y ritmo de evolución. En particular, los árboles son únicos en que mantienen altos niveles de diversidad mientras acumulan nuevas mutaciones solo lentamente. También son capaces de una adaptación local rápida y pueden evolucionar rápidamente a partir de ancestros no arbóreos, pero la mayoría de las líneas filogenéticas de árboles existentes típicamente experimentan bajas tasas de especiación y extinción. Discutimos por qué el hábito de crecimiento arbóreo debería llevar a estas características aparentemente paradójicas.
BibTeX
@article{doi101146annurevecolsys37091305110215,
author = "Petit, Rémy J. y Hampe, Arndt",
title = "Algunas Consecuencias Evolutivas de Ser un Árbol",
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71. Otto, Sarah P., 2007, Las Consecuencias Evolutivas de la Poliploidía: Cell.
DOI: 10.1016/j.cell.2007.10.022
BibTeX
@article{doi101016jcell200710022,
author = "Otto, Sarah P.",
title = "The Evolutionary Consequences of Polyploidy",
year = "2007",
journal = "Cell",
url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.10.022",
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72. Hunt, Gene, 2007, La importancia relativa del cambio direccional, los paseos aleatorios y la estasis en la evolución de linajes fósiles: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumen
La naturaleza de los cambios evolutivos registrados por el registro fósil ha sido objeto de controversia durante mucho tiempo, con desacuerdos particulares sobre la frecuencia relativa del cambio gradual frente a la estasis dentro de los linajes. Aquí, presento una encuesta estadística a gran escala del modo evolutivo en linajes fósiles. Más de 250 secuencias de rasgos evolutivos se ajustaron utilizando máxima verosimilitud a tres modelos evolutivos: cambio direccional, paseo aleatorio y estasis. La evolución en estos rasgos raramente fue direccional; en solo el 5% de las secuencias fósiles, la evolución direccional fue el modo de cambio más fuertemente apoyado de los tres. El restante 95% de las secuencias se dividió casi por igual entre paseos aleatorios y estasis. Las variables relacionadas con el tamaño corporal fueron significativamente menos propensas a experimentar estasis que los rasgos de forma. Este hallazgo está de acuerdo con sugerencias anteriores de que el tamaño puede ser más evolutivamente lable que la forma y es consistente con algunos, pero no con todos, los mecanismos propuestos para explicar la estasis evolutiva. En general, patrones evolutivos similares se observan en otras variables, como la pertenencia al clado y la resolución temporal, pero hay alguna evidencia de que el cambio direccional en organismos planctónicos es más frecuente que en organismos bentónicos. La rareza con la que se observó la evolución direccional en este estudio corrobora una afirmación clave del equilibrio puntuado y sugiere que la evolución verdaderamente direccional es infrecuente o, quizás más importante aún, de duración lo suficientemente corta como para raramente registrarse en la muestra paleontológica.
BibTeX
@article{doi101073pnas0704088104,
author = "Hunt, Gene",
title = "La importancia relativa del cambio direccional, los paseos aleatorios y la estasis en la evolución de linajes fósiles",
year = "2007",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "La naturaleza de los cambios evolutivos registrados por el registro fósil ha sido objeto de controversia durante mucho tiempo, con desacuerdos particulares sobre la frecuencia relativa del cambio gradual frente a la estasis dentro de los linajes. Aquí, presento una encuesta estadística a gran escala del modo evolutivo en linajes fósiles. Más de 250 secuencias de rasgos evolutivos se ajustaron utilizando máxima verosimilitud a tres modelos evolutivos: cambio direccional, paseo aleatorio y estasis. La evolución en estos rasgos raramente fue direccional; en solo el 5% de las secuencias fósiles, la evolución direccional fue el modo de cambio más fuertemente apoyado de los tres. El restante 95% de las secuencias se dividió casi por igual entre paseos aleatorios y estasis. Las variables relacionadas con el tamaño corporal fueron significativamente menos propensas a experimentar estasis que los rasgos de forma. Este hallazgo está de acuerdo con sugerencias anteriores de que el tamaño puede ser más evolutivamente lable que la forma y es consistente con algunos, pero no con todos, los mecanismos propuestos para explicar la estasis evolutiva. En general, patrones evolutivos similares se observan en otras variables, como la pertenencia al clado y la resolución temporal, pero hay alguna evidencia de que el cambio direccional en organismos planctónicos es más frecuente que en organismos bentónicos. La rareza con la que se observó la evolución direccional en este estudio corrobora una afirmación clave del equilibrio puntuado y sugiere que la evolución verdaderamente direccional es infrecuente o, quizás más importante aún, de duración lo suficientemente corta como para raramente registrarse en la muestra paleontológica.",
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73. Harmon, Luke J. y Weir, Jason T. y Brock, Chad D. y Glor, Richard E. y Challenger, Wendell, 2007, GEIGER: investigando radiaciones evolutivas: Bioinformatics.
DOI: 10.1093/bioinformatics/btm538
Resumen
Este software de código abierto está escrito completamente en el lenguaje R y está disponible gratuitamente a través de la Comprehensive R Archive Network (CRAN) en http://cran.r-project.org/.
BibTeX
@article{doi101093bioinformaticsbtm538,
author = "Harmon, Luke J. y Weir, Jason T. y Brock, Chad D. y Glor, Richard E. y Challenger, Wendell",
title = "GEIGER: investigando radiaciones evolutivas",
year = "2007",
journal = "Bioinformatics",
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doi = "10.1093/bioinformatics/btm538",
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74. Fussmann, Gregor F. y Loreau, Michel y Abrams, Peter A., 2007, Dinámica eco‐evolutiva de comunidades y ecosistemas: Functional Ecology.
DOI: 10.1111/j.1365-2435.2007.01275.x
Resumen
Resumen Revisamos estudios teóricos y empíricos para identificar casos en los que los procesos evolutivos afectan significativamente la dinámica de poblaciones, comunidades y ecosistemas. El trabajo teórico temprano sobre dinámica eco‐evolutiva se centró en el efecto de la (co)evolución sobre la estabilidad de sistemas depredador‐presa de dos especies y la aparición de desplazamiento de caracteres en sistemas competitivos simples. Los ecólogos teóricos de hoy están extendiendo este trabajo para estudiar la dinámica eco‐evolutiva de comunidades de múltiples especies y el funcionamiento y la emergencia evolutiva de los ecosistemas. En cuanto a la metodología, el modelado eco‐evolutivo se ha diversificado desde modelos genéticos de poblaciones simples basados en locus para abarcar modelos de selección clonal, dinámica de caracteres cuantitativos y dinámica adaptativa. Los pocos estudios empíricos sobre dinámica de comunidades que consideraron explícitamente los procesos evolutivos apoyan la visión de que la dinámica evolutiva y ecológica a menudo ocurren en escalas de tiempo similares, y que co‐determinan el comportamiento dinámico de las comunidades ecológicas.
BibTeX
@article{doi101111j13652435200701275x,
author = "Fussmann, Gregor F. y Loreau, Michel y Abrams, Peter A.",
title = "Dinámica eco‐evolutiva de comunidades y ecosistemas",
year = "2007",
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abstract = "Resumen Revisamos estudios teóricos y empíricos para identificar casos en los que los procesos evolutivos afectan significativamente la dinámica de poblaciones, comunidades y ecosistemas. El trabajo teórico temprano sobre dinámica eco‐evolutiva se centró en el efecto de la (co)evolución sobre la estabilidad de sistemas depredador‐presa de dos especies y la aparición de desplazamiento de caracteres en sistemas competitivos simples. Los ecólogos teóricos de hoy están extendiendo este trabajo para estudiar la dinámica eco‐evolutiva de comunidades de múltiples especies y el funcionamiento y la emergencia evolutiva de los ecosistemas. En cuanto a la metodología, el modelado eco‐evolutivo se ha diversificado desde modelos genéticos de poblaciones simples basados en locus para abarcar modelos de selección clonal, dinámica de caracteres cuantitativos y dinámica adaptativa. Los pocos estudios empíricos sobre dinámica de comunidades que consideraron explícitamente los procesos evolutivos apoyan la visión de que la dinámica evolutiva y ecológica a menudo ocurren en escalas de tiempo similares, y que co‐determinan el comportamiento dinámico de las comunidades ecológicas.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2435.2007.01275.x",
doi = "10.1111/j.1365-2435.2007.01275.x",
openalex = "W2143913979",
references = "doi101023a1006554906681, doi101038116461b0, doi10103822521, doi101086282160, doi101111j155856461976tb00911x, doi101126science1070315, doi1015159780691209418, doi1015159780691224244, doi1015159781400847266, doi101890039000, doi1023072408012, doi1023072411924, doi102307jctvx5wbbh, openalexw1528487914"
}
75. Erwin, Douglas H., 2007, DISPARIDAD: PATRÓN MORFOLÓGICO Y CONTEXTO DEL DESARROLLO: Palaeontology.
DOI: 10.1111/j.1475-4983.2006.00614.x
Resumen
Resumen: La distribución de formas orgánicas es agrupada en cualquier escala, desde poblaciones hasta las categorías taxonómicas más altas, ya sea que se consideren dentro de clados o dentro de ecosistemas. El registro fósil proporciona poco apoyo a las expectativas de que las brechas morfológicas entre especies o grupos de especies hayan aumentado con el tiempo, como podría ser si las brechas se crearan por la extinción de una distribución más homogénea de morfologías. A medida que las evaluaciones cuantitativas de la morfología han reemplazado los conteos de taxones superiores como métrica de la disparidad morfológica, numerosos estudios han demostrado la rápida construcción del espacio morfológico al inicio de las radiaciones evolutivas y han enfatizado la diferencia entre las medidas taxonómicas de la diversidad morfológica y las evaluaciones cuantitativas de la disparidad. Otros estudios han evaluado los patrones cambiantes de disparidad a través de las extinciones masivas, los patrones eco-morfológicos y los patrones de convergencia dentro de las comunidades ecológicas, mientras que el desarrollo de la morfología teórica ha ayudado enormemente a los esfuerzos por entender por qué algunas formas no ocurren. Un esfuerzo de investigación paralelo y, hasta hace poco, en gran medida separado en la biología evolutiva del desarrollo ha establecido que el kit de herramientas del desarrollo que subyace a la notable amplitud de la forma metazoana es en gran parte idéntico entre los Bilateria, y muchos componentes son compartidos entre todos los metazoos. Subyacente a esta preocupación por la disparidad está una pregunta sobre la variación temporal en la producción de innovaciones morfológicas, un debate sobre la importancia relativa de la generación de nuevas morfologías frente a las probabilidades diferenciales de su introducción exitosa, y la importancia relativa de la restricción, la convergencia y la contingencia en la evolución de la forma.
BibTeX
@article{doi101111j14754983200600614x,
author = "Erwin, Douglas H.",
title = "DISPARIDAD: PATRÓN MORFOLÓGICO Y CONTEXTO DEL DESARROLLO",
year = "2007",
journal = "Palaeontology",
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doi = "10.1111/j.1475-4983.2006.00614.x",
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references = "doi101016jprecamres200511003, doi101017cbo9781139164856, doi101017s009483730001263x, doi101017s0094837300015864, doi101073pnas050586297, doi101111j1525142x200600101x, doi101666009483731999251mditer20co2, doi1016660094837320000260056cefisg20co2, doi1016660094837320040300652atrode20co2, doi105860choice333929, foote1996perspective, openalexw2055967869, openalexw635257420"
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76. Gehlîng, James G. y Narbonne, Guy M., 2007, Fósiles de Ediacara en forma de huso del conjunto Mistaken Point, Zona Avalon, Terranova: Canadian Journal of Earth Sciences.
Resumen
El conjunto de fósiles de Ediacara de Mistaken Point está dominado por rangeomorfos con elementos de ramificación fractal homólogos. Los más distintivos son los fósiles fusiformes, aquí denominados Fractofusus misrai n.gen., y n.sp., y Fractofusus andersoni n.gen., y n.sp. Aunque endémicos de la porción de Terranova del terráneo Avalonia, dominaron las comunidades del fondo marino profundo por debajo de la zona fótica, en el período Ediacarano medio (ca. 575–560 Ma). Sus afinidades biológicas permanecen inciertas, pero su arquitectura sugiere una posición filogenética cerca de la base de los Metazoa.
BibTeX
@article{doi101139e07003,
author = "Gehlîng, James G. y Narbonne, Guy M.",
title = "Fósiles de Ediacara en forma de huso del conjunto Mistaken Point, Zona Avalon, Terranova",
year = "2007",
journal = "Canadian Journal of Earth Sciences",
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url = "https://doi.org/10.1139/e07-003",
doi = "10.1139/e07-003",
openalex = "W2142748826",
references = "doi101016jearscirev200508004"
}
77. Drummond, Alexei J. y Rambaut, Andrew, 2007, BEAST: Análisis evolutivo bayesiano mediante muestreo de árboles: BMC Evolutionary Biology.
Resumen
BEAST es un paquete de análisis evolutivo potente y flexible para la variación de secuencias moleculares. También proporciona un recurso para el desarrollo ulterior de nuevos modelos y métodos estadísticos de análisis evolutivo.
BibTeX
@article{doi101186147121487214,
author = "Drummond, Alexei J. y Rambaut, Andrew",
title = "BEAST: Análisis evolutivo bayesiano mediante muestreo de árboles",
year = "2007",
journal = "BMC Evolutionary Biology",
abstract = "BEAST es un paquete de análisis evolutivo potente y flexible para la variación de secuencias moleculares. También proporciona un recurso para el desarrollo ulterior de nuevos modelos y métodos estadísticos de análisis evolutivo.",
url = "https://doi.org/10.1186/1471-2148-7-214",
doi = "10.1186/1471-2148-7-214",
openalex = "W2110835349",
references = "doi101007bf00160154, doi101007bf02101694, doi101007bf02101990, doi101016b9781483227344500176, doi101016s0169534703002167, doi10106311699114, doi101073pnas6341088, doi10108010635150290102456, doi101093bioinformatics178754, doi101093biomet57197, doi101093molbevmsi103, doi101093oxfordjournalsmolbeva003974, doi101093oxfordjournalsmolbeva025892, doi101093oxfordjournalsmolbeva040153, doi101126science1101074, doi101371journalpbio0040088, rambaut1998estimating"
}
78. Lyman, R. Lee, 2008, Graficación de patrones y procesos evolutivos: un historial de técnicas en arqueología y paleobiología: Journal of Human Evolution.
DOI: 10.1016/j.jhevol.2008.11.001
BibTeX
@article{doi101016jjhevol200811001,
author = "Lyman, R. Lee",
title = "Graficación de patrones y procesos evolutivos: un historial de técnicas en arqueología y paleobiología",
year = "2008",
journal = "Journal of Human Evolution",
url = "https://doi.org/10.1016/j.jhevol.2008.11.001",
doi = "10.1016/j.jhevol.2008.11.001",
openalex = "W2111567600",
references = "doi101017s001675680008660x, doi101111j1469185x1930tb00901x, doi101111j155856461947tb01335x, openalexw201159638"
}
79. Alroy, John, 2008, Dinámica de la especiación y extinción en el registro fósil marino: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumen
El esfuerzo a nivel disciplinario para crear una base de datos del registro fósil a nivel de ocurrencia ha permitido estimar las tasas de extinción y especiación de invertebrados marinos con mucha mayor precisión. Los nuevos datos muestran que dos mecanismos bióticos han acelerado las recuperaciones tras las extinciones masivas y han confinado la diversidad a un rango relativamente estrecho durante los últimos 500 millones de años (Ma). En primer lugar, una disminución de la diversidad de cualquier magnitud se correlaciona con bajas tasas de extinción inmediatamente después, tanto que la extinción casi se detendría si la diversidad disminuyera un 90%. En segundo lugar, tasas de extinción muy altas son seguidas por tasas de especiación igualmente altas. Ambas relaciones predicen que la recuperación de la actual extinción masiva tomará al menos 10 Ma, y quizás 40 Ma si rivaliza con la catástrofe Pérmico-Triásico. De todos modos, cualquier evento grande resultará en una reestructuración ecológica y taxonómica dramática de la biosfera. Los datos también confirman que las tasas de extinción y especiación ambas disminuyeron a lo largo del Fanerozoico y que varias extinciones, además del evento Pérmico-Triásico, fueron particularmente severas. Sin embargo, la tendencia puede estar impulsada por sesgos taxonómicos y las tasas varían de acuerdo con una distribución log normal simple, por lo que no hay una distinción nítida entre extinciones de fondo y masivas. Además, la falta de cualquier autocorrelación significativa en los datos es inconsistente con las teorías macroevolutivas de periodicidad o criticidad autoorganizada.
BibTeX
@article{doi101073pnas0802597105,
author = "Alroy, John",
title = "Dinámica de la especiación y extinción en el registro fósil marino",
year = "2008",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "El esfuerzo a nivel disciplinario para crear una base de datos del registro fósil a nivel de ocurrencia ha permitido estimar las tasas de extinción y especiación de invertebrados marinos con mucha mayor precisión. Los nuevos datos muestran que dos mecanismos bióticos han acelerado las recuperaciones tras las extinciones masivas y han confinado la diversidad a un rango relativamente estrecho durante los últimos 500 millones de años (Ma). En primer lugar, una disminución de la diversidad de cualquier magnitud se correlaciona con bajas tasas de extinción inmediatamente después, tanto que la extinción casi se detendría si la diversidad disminuyera un 90%. En segundo lugar, tasas de extinción muy altas son seguidas por tasas de especiación igualmente altas. Ambas relaciones predicen que la recuperación de la actual extinción masiva tomará al menos 10 Ma, y quizás 40 Ma si rivaliza con la catástrofe Pérmico-Triásico. De todos modos, cualquier evento grande resultará en una reestructuración ecológica y taxonómica dramática de la biosfera. Los datos también confirman que las tasas de extinción y especiación ambas disminuyeron a lo largo del Fanerozoico y que varias extinciones, además del evento Pérmico-Triásico, fueron particularmente severas. Sin embargo, la tendencia puede estar impulsada por sesgos taxonómicos y las tasas varían de acuerdo con una distribución log normal simple, por lo que no hay una distinción nítida entre extinciones de fondo y masivas. Además, la falta de cualquier autocorrelación significativa en los datos es inconsistente con las teorías macroevolutivas de periodicidad o criticidad autoorganizada.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0802597105",
doi = "10.1073/pnas.0802597105",
openalex = "W2075331526",
references = "doi101017s0094837300003778, doi101017s0094837300004917, doi101017s0094837300006539, doi101073pnas111144698, doi101073pnas813801, doi101126science1156963, doi101666009483731999251mditer20co2, doi1016660094837320040300522oeamdo20co2, doi1016660094837320050310006poaeit20co2"
}
80. Tamura, Koichiro y Peterson, Daniel G. y Peterson, Nora y Stecher, Glen y Nei, M y Kumar, Sudhir, 2011, MEGA5: Análisis de Genética Evolutiva Molecular Utilizando Métodos de Verosimilitud Máxima, Distancia Evolutiva y Parsimonia Máxima: Biología Molecular y Evolución.
Resumen
El análisis comparativo de datos de secuencias moleculares es esencial para reconstruir las historias evolutivas de las especies e inferir la naturaleza y extensión de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y especies. Aquí, anunciamos el lanzamiento de Molecular Evolutionary Genetics Analysis versión 5 (MEGA5), que es un software de fácil uso para extraer datos de bases de datos en línea, construir alineamientos de secuencias y árboles filogenéticos, y utilizar métodos de bioinformática evolutiva en biología básica, biomedicina y evolución. La novedad más reciente en MEGA5 es una colección de análisis de verosimilitud máxima (ML) para inferir árboles evolutivos, seleccionar modelos de sustitución de mejor ajuste (nucleótido o aminoácido), inferir estados y secuencias ancestrales (junto con probabilidades) y estimar tasas evolutivas sitio por sitio. En análisis de simulación por computadora, los algoritmos de inferencia de árboles ML en MEGA5 se compararon favorablemente con otros paquetes de software en términos de eficiencia computacional y la precisión de las estimaciones de árboles filogenéticos, parámetros de sustitución y variación de tasas entre sitios. La interfaz de usuario de MEGA ahora se ha mejorado para ser impulsada por actividades, lo que facilita su uso tanto para principiantes como para científicos experimentados. Esta versión de MEGA está destinada a la plataforma Windows y se ha configurado para un uso efectivo en escritorios de Mac OS X y Linux. Está disponible gratuitamente en http://www.megasoftware.net.
BibTeX
@article{doi101093molbevmsr121,
author = "Tamura, Koichiro y Peterson, Daniel G. y Peterson, Nora y Stecher, Glen y Nei, M y Kumar, Sudhir",
title = "MEGA5: Análisis de Genética Evolutiva Molecular Utilizando Métodos de Verosimilitud Máxima, Distancia Evolutiva y Parsimonia Máxima",
year = "2011",
journal = "Biología Molecular y Evolución",
abstract = "El análisis comparativo de datos de secuencias moleculares es esencial para reconstruir las historias evolutivas de las especies e inferir la naturaleza y extensión de las fuerzas selectivas que moldean la evolución de genes y especies. Aquí, anunciamos el lanzamiento de Molecular Evolutionary Genetics Analysis versión 5 (MEGA5), que es un software de fácil uso para extraer datos de bases de datos en línea, construir alineamientos de secuencias y árboles filogenéticos, y utilizar métodos de bioinformática evolutiva en biología básica, biomedicina y evolución. La novedad más reciente en MEGA5 es una colección de análisis de verosimilitud máxima (ML) para inferir árboles evolutivos, seleccionar modelos de sustitución de mejor ajuste (nucleótido o aminoácido), inferir estados y secuencias ancestrales (junto con probabilidades) y estimar tasas evolutivas sitio por sitio. En análisis de simulación por computadora, los algoritmos de inferencia de árboles ML en MEGA5 se compararon favorablemente con otros paquetes de software en términos de eficiencia computacional y la precisión de las estimaciones de árboles filogenéticos, parámetros de sustitución y variación de tasas entre sitios. La interfaz de usuario de MEGA ahora se ha mejorado para ser impulsada por actividades, lo que facilita su uso tanto para principiantes como para científicos experimentados. Esta versión de MEGA está destinada a la plataforma Windows y se ha configurado para un uso efectivo en escritorios de Mac OS X y Linux. Está disponible gratuitamente en http://www.megasoftware.net.",
url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msr121",
doi = "10.1093/molbev/msr121",
openalex = "W2132632499",
references = "doi101007bf01734359, doi101007bf02101694, doi10108010635150390235520, doi10108010635150490522304, doi101093bioinformatics149817, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093biomet762297, doi101093oso97801951358480010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva040023, doi101093oxfordjournalsmolbeva040454, doi101093sysbiosyq010, doi101111j155856461985tb00420x, doi101186147121055113, openalexw3217097258"
}
81. Evans, Alistair R. y Jones, David y Boyer, Alison G. y Brown, James H. y Costa, Daniel P. y Ernest, S. K. Morgan y Fitzgerald, Erich M. G. y Fortelius, Mikael y Gittleman, John L. y Hamilton, Marcus J. y Harding, Larisa E. y Lintulaakso, Kari y Lyons, S. Kathleen y Okie, Jordan G. y Saarinen, Juha y Sibly, Richard M. y Smith, Felisa A. y Stephens, Patrick R. y Theodor, Jessica M. y Uhen, Mark D., 2012, La velocidad máxima de la evolución de los mamíferos: Proceedings of the National Academy of Sciences.
Resumen
¿Qué tan rápido puede evolucionar un mamífero desde el tamaño de un ratón hasta el tamaño de un elefante? Lograr tal transformación grande requiere una reorganización biológica importante. Por lo tanto, la velocidad a la que esto ocurre tiene implicaciones importantes para cambios faunísticos extensos, incluyendo radiaciones adaptativas y recuperación de extinciones masivas. Para cuantificar el ritmo de la evolución a gran escala, desarrollamos una métrica, la tasa máxima del clado, que representa la tasa evolutiva máxima de un rasgo dentro de un clado. Aplicamos esta métrica a la evolución de la masa corporal en mamíferos durante los últimos 70 millones de años, durante los cuales ocurrieron múltiples transiciones evolutivas grandes en océanos y en continentes e islas. Nuestros cálculos sugieren que se necesitaron un mínimo de 1.6, 5.1 y 10 millones de generaciones para que la masa de los mamíferos terrestres aumentara 100-, y 1.000-, y 5.000 veces, respectivamente. Los valores para las ballenas bajaron a la mitad de la longitud (es decir, 1.1, 3 y 5 millones de generaciones), quizás debido a las reducidas restricciones mecánicas de vivir en un ambiente acuático. Cuando se consideran las diferencias en el tiempo de generación, encontramos un aumento exponencial en la masa corporal máxima de los mamíferos durante los 35 millones de años siguientes al evento de extinción Cretácico-Paleógeno (K-Pg). Nuestros resultados también indican una asimetría básica en la macroevolución: las disminuciones muy grandes (como el enanismo insular extremo) pueden ocurrir a más de 10 veces la tasa de los aumentos. Nuestros hallazgos permiten comparaciones más rigurosas de los patrones y procesos microevolutivos y macroevolutivos.
BibTeX
@article{doi101073pnas1120774109,
author = "Evans, Alistair R. y Jones, David y Boyer, Alison G. y Brown, James H. y Costa, Daniel P. y Ernest, S. K. Morgan y Fitzgerald, Erich M. G. y Fortelius, Mikael y Gittleman, John L. y Hamilton, Marcus J. y Harding, Larisa E. y Lintulaakso, Kari y Lyons, S. Kathleen y Okie, Jordan G. y Saarinen, Juha y Sibly, Richard M. y Smith, Felisa A. y Stephens, Patrick R. y Theodor, Jessica M. y Uhen, Mark D.",
title = "La velocidad máxima de la evolución de los mamíferos",
year = "2012",
journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
abstract = "¿Qué tan rápido puede evolucionar un mamífero desde el tamaño de un ratón hasta el tamaño de un elefante? Lograr tal transformación grande requiere una reorganización biológica importante. Por lo tanto, la velocidad a la que esto ocurre tiene implicaciones importantes para cambios faunísticos extensos, incluyendo radiaciones adaptativas y recuperación de extinciones masivas. Para cuantificar el ritmo de la evolución a gran escala, desarrollamos una métrica, la tasa máxima del clado, que representa la tasa evolutiva máxima de un rasgo dentro de un clado. Aplicamos esta métrica a la evolución de la masa corporal en mamíferos durante los últimos 70 millones de años, durante los cuales ocurrieron múltiples transiciones evolutivas grandes en océanos y en continentes e islas. Nuestros cálculos sugieren que se necesitaron un mínimo de 1.6, 5.1 y 10 millones de generaciones para que la masa de los mamíferos terrestres aumentara 100-, y 1.000-, y 5.000 veces, respectivamente. Los valores para las ballenas bajaron a la mitad de la longitud (es decir, 1.1, 3 y 5 millones de generaciones), quizás debido a las reducidas restricciones mecánicas de vivir en un ambiente acuático. Cuando se consideran las diferencias en el tiempo de generación, encontramos un aumento exponencial en la masa corporal máxima de los mamíferos durante los 35 millones de años siguientes al evento de extinción Cretácico-Paleógeno (K-Pg). Nuestros resultados también indican una asimetría básica en la macroevolución: las disminuciones muy grandes (como el enanismo insular extremo) pueden ocurrir a más de 10 veces la tasa de los aumentos. Nuestros hallazgos permiten comparaciones más rigurosas de los patrones y procesos microevolutivos y macroevolutivos.",
url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1120774109",
doi = "10.1073/pnas.1120774109",
openalex = "W2035228868",
references = "colbert1948evolution, doi101017cbo9780511608551, doi101017cbo9781139167826, doi101017s0094837300016201, doi101038387173a0, doi1018900814941, doi1023072405671, doi1023072529762, doi107312simp93764, openalexw1504049102, openalexw1558456135"
}
82. Baets, Kenneth De y Klug, Christian y Korn, Dieter y Landman, Neil H., 2012, TENDENCIAS EVOLUTIVAS TEMPRANAS EN EL DESARROLLO EMBRIONARIO DE AMMONOIDES: Evolución.
DOI: 10.1111/j.1558-5646.2011.01567.x
Resumen
Durante la Revolución del Nekton del Devónico, los ammonoides muestran un enrollamiento progresivo de su concha, al igual que muchos otros grupos de moluscos pelágicos. Estos cefalópodos extintos, con concha externa, derivaron de cefalópodos bactritoides con concha recta en el Devónico temprano. Durante el Devónico, ocurrieron tendencias evolutivas hacia un enrollamiento más apretado y una reducción de tamaño en las conchas embrionarias de ammonoides. En al menos tres linajes, descendientes con un umbílico cerrado evolucionaron convergentemente a partir de formas con una abertura en el primer giro (ventana umbilical). Otros linajes que tenían representantes con umbílicos abiertos se extinguieron alrededor de eventos devónicos importantes, mientras que solo aquellos con conchas embrionarias más apretadamente enrolladas sobrevivieron. Este cambio estuvo acompañado de una tendencia evolutiva en la forma de la cámara inicial, pero no de una tendencia clara en su tamaño. El hecho de que varios linajes de ammonoides redujeron e independientemente cerraron la ventana umbilical más o menos simultáneamente indica que estuvieron involucrados factores impulsores comunes. Una tendencia de disminución de tamaño de los embriones, así como el aumento concurrente del tamaño adulto en algunos linajes, probablemente refleja un cambio fundamental en las estrategias reproductivas hacia una mayor fecundidad temprano en la historia evolutiva de los ammonoides. Esto podría haber jugado un papel importante en su posterior éxito, así como en su extinción.
BibTeX
@article{doi101111j15585646201101567x,
author = "Baets, Kenneth De y Klug, Christian y Korn, Dieter y Landman, Neil H.",
title = "TENDENCIAS EVOLUTIVAS TEMPRANAS EN EL DESARROLLO EMBRIONARIO DE AMMONOIDES",
year = "2012",
journal = "Evolución",
abstract = "Durante la Revolución del Nekton del Devónico, los ammonoides muestran un enrollamiento progresivo de su concha, al igual que muchos otros grupos de moluscos pelágicos. Estos cefalópodos extintos, con concha externa, derivaron de cefalópodos bactritoides con concha recta en el Devónico temprano. Durante el Devónico, ocurrieron tendencias evolutivas hacia un enrollamiento más apretado y una reducción de tamaño en las conchas embrionarias de ammonoides. En al menos tres linajes, descendientes con un umbílico cerrado evolucionaron convergentemente a partir de formas con una abertura en el primer giro (ventana umbilical). Otros linajes que tenían representantes con umbílicos abiertos se extinguieron alrededor de eventos devónicos importantes, mientras que solo aquellos con conchas embrionarias más apretadamente enrolladas sobrevivieron. Este cambio estuvo acompañado de una tendencia evolutiva en la forma de la cámara inicial, pero no de una tendencia clara en su tamaño. El hecho de que varios linajes de ammonoides redujeron e independientemente cerraron la ventana umbilical más o menos simultáneamente indica que estuvieron involucrados factores impulsores comunes. Una tendencia de disminución de tamaño de los embriones, así como el aumento concurrente del tamaño adulto en algunos linajes, probablemente refleja un cambio fundamental en las estrategias reproductivas hacia una mayor fecundidad temprano en la historia evolutiva de los ammonoides. Esto podría haber jugado un papel importante en su posterior éxito, así como en su extinción.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2011.01567.x",
doi = "10.1111/j.1558-5646.2011.01567.x",
openalex = "W1919528436",
references = "doi101007978147579153213, doi101007978147579153216, doi1011861471214811115, openalexw2531009674"
}
83. Slater, Graham J. y Harmon, Luke J. y Alfaro, Michael E., 2012, INTEGRAR FÓSILES CON FILOGENIAS MOLECULARES MEJORA LA INFERENCIA DE LA EVOLUCIÓN DE TRAITOS: Evolution.
DOI: 10.1111/j.1558-5646.2012.01723.x
Resumen
Los biólogos comparativos a menudo intentan sacar inferencias sobre el ritmo y el modo en la evolución al comparar la adecuación de los modelos evolutivos a datos comparativos filogenéticos que consisten en una filogenia molecular con longitudes de rama y mediciones de rasgos de taxones existentes. Estos tipos de enfoques ignoran la evidencia histórica sobre el patrón y el proceso evolutivo contenida en el registro fósil. En este artículo, mostramos mediante simulación que la incorporación de información fósil mejora drásticamente nuestra capacidad para distinguir entre modelos de evolución de rasgos cuantitativos utilizando datos comparativos. Además, sugerimos un enfoque novedoso bayesiano que permite integrar la información fósil incluso cuando faltan hipótesis filogenéticas explícitas para representantes extintos de clados existentes. Al aplicar este enfoque a un conjunto de datos comparativo que comprende tamaños corporales de carnívoros caniformes, mostramos que la incorporación de información fósil no solo mejora las estimaciones del estado ancestral en relación con aquellas derivadas únicamente de taxones existentes, sino que también resulta en la preferencia de un modelo de evolución con tendencia hacia un gran tamaño corporal sobre modelos alternativos como el movimiento browniano o los procesos de Ornstein-Uhlenbeck. Nuestro enfoque destaca la importancia de considerar la información fósil al realizar inferencias macroevolutivas y proporciona una manera de integrar el tipo de información fósil dispersa que está disponible para la mayoría de los biólogos evolutivos.
BibTeX
@article{doi101111j15585646201201723x,
author = "Slater, Graham J. y Harmon, Luke J. y Alfaro, Michael E.",
title = "INTEGRAR FÓSILES CON FILOGENIAS MOLECULARES MEJORA LA INFERENCIA DE LA EVOLUCIÓN DE TRAITOS",
year = "2012",
journal = "Evolution",
abstract = "Los biólogos comparativos a menudo intentan sacar inferencias sobre el ritmo y el modo en la evolución al comparar la adecuación de los modelos evolutivos a datos comparativos filogenéticos que consisten en una filogenia molecular con longitudes de rama y mediciones de rasgos de taxones existentes. Estos tipos de enfoques ignoran la evidencia histórica sobre el patrón y el proceso evolutivo contenida en el registro fósil. En este artículo, mostramos mediante simulación que la incorporación de información fósil mejora drásticamente nuestra capacidad para distinguir entre modelos de evolución de rasgos cuantitativos utilizando datos comparativos. Además, sugerimos un enfoque novedoso bayesiano que permite integrar la información fósil incluso cuando faltan hipótesis filogenéticas explícitas para representantes extintos de clados existentes. Al aplicar este enfoque a un conjunto de datos comparativo que comprende tamaños corporales de carnívoros caniformes, mostramos que la incorporación de información fósil no solo mejora las estimaciones del estado ancestral en relación con aquellas derivadas únicamente de taxones existentes, sino que también resulta en la preferencia de un modelo de evolución con tendencia hacia un gran tamaño corporal sobre modelos alternativos como el movimiento browniano o los procesos de Ornstein-Uhlenbeck. Nuestro enfoque destaca la importancia de considerar la información fósil al realizar inferencias macroevolutivas y proporciona una manera de integrar el tipo de información fósil dispersa que está disponible para la mayoría de los biólogos evolutivos.",
url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2012.01723.x",
doi = "10.1111/j.1558-5646.2012.01723.x",
openalex = "W1735656240",
references = "doi101007s116920129171x, doi101017s0022336000059126, doi10106311699114, doi101073pnas0704088104, doi10108001621459199510476572, doi101086284325, doi101093bioinformaticsbtm538, doi101093biomet57197, doi101093oso97801985052350010001, doi101093sysbio274401, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j1469185x201100178x, doi101146annurevearth271463, doi101186147121487214, doi1023073802723, foote1996perspective, gingerich1987evolution"
}
84. 2012, Releyendo el registro fósil: el crecimiento de la paleobiología como disciplina evolutiva: Choice Reviews Online.
Resumen
Aunque los fósiles han proporcionado algunas de las pruebas más importantes para la evolución, la disciplina de la paleontología no siempre ha tenido un lugar central en la biología evolutiva. Desde los días de Darwin y durante gran parte del siglo XX, los paleontólogos a menudo eran considerados por muchos biólogos evolutivos como simples recolectores de fósiles, ignorándose o despreciándose sus intentos de contribuir a la teoría evolutiva. Sin embargo, en la década de 1950, los paleontólogos comenzaron a montar un contramovimiento que insistía en la contribución válida, importante y original de la paleontología a la teoría evolutiva. Este movimiento, llamado por sus defensores, abogaba por un enfoque al registro fósil que fuera teórico, cuantitativo y orientado a explicar los patrones amplios de evolución y extinción en la historia de la vida. Releyendo el Registro Fósil proporciona, como nunca antes, un relato histórico del origen, ascenso e importancia de la paleobiología, desde mediados del siglo XIX hasta finales de la década de 1980. Basándose en una gran cantidad de material de archivo, David Sepkoski muestra cómo el movimiento fue concebido y promovido por un pequeño pero influyente grupo de paleontólogos -incluyendo a Stephen Jay Gould y Niles Eldredge, entre otros- y examina las dinámicas intelectuales, disciplinares y políticas involucradas en el ascenso de la paleobiología. Al enfatizar la estrecha relación entre la paleobiología y otras disciplinas evolutivas, este libro escribe un nuevo capítulo en la historia de la biología evolutiva, mientras también ofrece perspectivas sobre las dinámicas del cambio disciplinario en la ciencia moderna.
BibTeX
@article{doi105860choice500902,
title = "Releyendo el registro fósil: el crecimiento de la paleobiología como disciplina evolutiva",
year = "2012",
journal = "Choice Reviews Online",
abstract = "Aunque los fósiles han proporcionado algunas de las pruebas más importantes para la evolución, la disciplina de la paleontología no siempre ha tenido un lugar central en la biología evolutiva. Desde los días de Darwin y durante gran parte del siglo XX, los paleontólogos a menudo eran considerados por muchos biólogos evolutivos como simples recolectores de fósiles, ignorándose o despreciándose sus intentos de contribuir a la teoría evolutiva. Sin embargo, en la década de 1950, los paleontólogos comenzaron a montar un contramovimiento que insistía en la contribución válida, importante y original de la paleontología a la teoría evolutiva. Este movimiento, llamado por sus defensores, abogaba por un enfoque al registro fósil que fuera teórico, cuantitativo y orientado a explicar los patrones amplios de evolución y extinción en la historia de la vida. Releyendo el Registro Fósil proporciona, como nunca antes, un relato histórico del origen, ascenso e importancia de la paleobiología, desde mediados del siglo XIX hasta finales de la década de 1980. Basándose en una gran cantidad de material de archivo, David Sepkoski muestra cómo el movimiento fue concebido y promovido por un pequeño pero influyente grupo de paleontólogos -incluyendo a Stephen Jay Gould y Niles Eldredge, entre otros- y examina las dinámicas intelectuales, disciplinares y políticas involucradas en el ascenso de la paleobiología. Al enfatizar la estrecha relación entre la paleobiología y otras disciplinas evolutivas, este libro escribe un nuevo capítulo en la historia de la biología evolutiva, mientras también ofrece perspectivas sobre las dinámicas del cambio disciplinario en la ciencia moderna.",
url = "https://doi.org/10.5860/choice.50-0902",
doi = "10.5860/choice.50-0902",
openalex = "W653308317"
}
85. Rabosky, Daniel L. y Santini, Francesco y Eastman, Jonathan M. y Smith, Stephen A. y Sidlauskas, Brian L. y Chang, Jonathan y Alfaro, Michael E., 2013, Las tasas de especiación y evolución morfológica están correlacionadas a través de la mayor radiación de vertebrados: Nature Communications.
BibTeX
@article{doi101038ncomms2958,
author = "Rabosky, Daniel L. y Santini, Francesco y Eastman, Jonathan M. y Smith, Stephen A. y Sidlauskas, Brian L. y Chang, Jonathan y Alfaro, Michael E.",
title = "Las tasas de especiación y evolución morfológica están correlacionadas a través de la mayor radiación de vertebrados",
year = "2013",
journal = "Nature Communications",
url = "https://doi.org/10.1038/ncomms2958",
doi = "10.1038/ncomms2958",
openalex = "W2054715003",
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}
86. Miya, Masaki y Friedman, Matt y Satoh, Takashi y Takeshima, Hirohiko y Sado, Tetsuya y Iwasaki, Wataru y Yamanoue, Yusuke y Nakatani, Masanori y Mabuchi, Kohji e Inoue, Jun y Poulsen, Jan Yde y Fukunaga, Tsukasa y Sato, Yukuto y Nishida, Mutsumi, 2013, Origen evolutivo de la familia Scombridae (atunes y caballas): Miembros de una radiación adaptativa del Paleógeno con otras 14 familias de peces pelágicos: PLoS ONE.
DOI: 10.1371/journal.pone.0073535
Resumen
Las incertidumbres que rodean el origen evolutivo de la familia de peces epipelágicos Scombridae (atunes y caballas) son sintomáticas de las dificultades para resolver las relaciones suprafamiliares dentro de los Percomorpha, una radiación de teleósteos hiperdiversa que contiene aproximadamente 17.000 especies colocadas en 13 órdenes mal definidos y 269 familias. Aquí encontramos que los scombridos comparten un ancestro común con 14 familias basado en (i) análisis bioinformáticos utilizando secuencias parciales de genes mitocondriales y nucleares de todos los percomorfos depositados en GenBank (10.733 secuencias) y (ii) un análisis posterior de mitogenómica basado en 57 especies de esas 15 familias objetivo y 67 taxones de grupo externo. La heterogeneidad morfológica entre estas 15 familias es tan extraordinaria que han sido colocadas en seis subórdenes perciformes diferentes. Sin embargo, los miembros de las 15 familias son costeros u oceánicos pelágicos en su ecología con diversos modos de vida, lo que sugiere que representan una radiación adaptativa previamente no detectada en el reino pelágico. Las filogenias calibradas en el tiempo implican que los scombridos originaron de un ancestro de aguas profundas y comenzaron a radiarse después del fin del Cretácico cuando los grandes peces epipelágicos depredadores fueron víctimas selectivas de la extinción masiva Cretácico-Paleógeno. Nombramos este clado de peces de mar abierto que contiene a los Scombridae "Pelagia" en referencia a la preferencia de hábitat común que vincula a las 15 familias.
BibTeX
@article{doi101371journalpone0073535,
author = "Miya, Masaki y Friedman, Matt y Satoh, Takashi y Takeshima, Hirohiko y Sado, Tetsuya y Iwasaki, Wataru y Yamanoue, Yusuke y Nakatani, Masanori y Mabuchi, Kohji e Inoue, Jun y Poulsen, Jan Yde y Fukunaga, Tsukasa y Sato, Yukuto y Nishida, Mutsumi",
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87. Collyer, Michael L. y Adams, Dean C., 2013, Análisis de trayectorias fenotípicas: comparación de patrones de cambio de forma en evolución y ecología: Bollettino del CILEA (CILEA).
DOI: 10.4404/hystrix-24.1-6298
Resumen
La investigación que utiliza datos de forma procedentes de métodos morfométricos geométricos (GM) en ecología y biología evolutiva es típicamente comparativa, analizando formas y cambios de forma en diferentes puntos a lo largo de gradientes ecológicos o evolutivos. Mientras que los procedimientos estadísticos multivariados estándar son adecuados para la variación "estática" —pruebas de diferencias de ubicación de grupos en espacios de datos multivariados—, están limitados para la variación "dinámica" —pruebas de diferencias específicas en las formas en que los grupos cambian de ubicación asociadas a cambios de estado a lo largo de gradientes ecológicos, de desarrollo o evolutivos. En este artículo, mostramos que el cambio fenotípico continuo puede describirse mediante trayectorias en espacios de datos multivariados. Describimos los atributos geométricos de las trayectorias de cambio fenotípico (tamaño, dirección y forma), específicamente para datos GM. Ilustramos, con ejemplos, cómo las diferencias en dichos atributos pueden funcionar como estadísticos de prueba para análisis comparativos con el fin de comprender los mecanismos que producen diferencias dinámicas en el cambio de forma. Demostramos que el análisis de dichos atributos —llamado análisis de trayectorias fenotípicas (PTA)— es un análisis general que puede aplicarse a diversos tipos de preguntas de investigación relacionadas con la medición de la variación dinámica. Finalmente, planteamos algunos desafíos futuros para este novedoso método analítico.
BibTeX
@article{doi104404hystrix2416298,
author = "Collyer, Michael L. y Adams, Dean C.",
title = "Análisis de trayectorias fenotípicas: comparación de patrones de cambio de forma en evolución y ecología",
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88. Gingerich, Philip D., 2014, Especies en el registro fósil de los primates: Antropología Evolutiva, Noticias y Revisiones.
Resumen
Las especies en el registro fósil son pools de variación genética y fenética de poblaciones en un lugar y tiempo, reconocibles y distinguibles de otras por estándares empíricos. El cambio a través del tiempo puede ser sustancial, requiriendo la subdivisión de linajes que se vuelve más arbitraria a medida que se vuelven más completos. La evolución trata sobre forma, espacio y tiempo; trata sobre variación y cambio. La interpretación de las especies en el registro fósil toca todos estos aspectos.
BibTeX
@article{doi101002evan21400,
author = "Gingerich, Philip D.",
title = "Especies en el registro fósil de los primates",
year = "2014",
journal = "Antropología Evolutiva, Noticias y Revisiones",
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references = "openalexw201159638"
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89. Kline, Michelle A., 2014, Cómo aprender sobre la enseñanza: Un marco evolutivo para el estudio del comportamiento de enseñanza en humanos y otros animales: Behavioral and Brain Sciences.
DOI: 10.1017/s0140525x14000090
Resumen
La especie humana depende más de la adaptación cultural que cualquier otra especie, pero no está claro cómo el aprendizaje observacional puede dar lugar a la transmisión fiel de adaptaciones culturales. Una posibilidad es que la enseñanza facilite la transmisión social precisa al reducir el rango de inferencias que realizan los aprendices. Sin embargo, existe un amplio desacuerdo sobre cómo definir la enseñanza y cómo interpretar la evidencia empírica sobre la enseñanza a través de culturas y especies. En este artículo argumento que las disputas sobre la naturaleza y prevalencia de la enseñanza en sociedades humanas y animales no humanos se basan en una serie de diferencias teóricas profundamente arraigadas entre disciplinas, así como en diferencias importantes en cómo se define la enseñanza. Para reconciliar estos cuerpos de investigación dispares, reviso los tres enfoques principales para el estudio de la enseñanza: mentalista, basado en la cultura y funcionalista, y delineo las preguntas de investigación sobre la enseñanza que aborda cada uno. Luego argumento a favor de un nuevo marco integrado que diferencia entre tipos de enseñanza según los problemas adaptativos específicos que resuelve cada tipo, y aplico este marco para reestructurar la evidencia empírica actual sobre la enseñanza en humanos y animales no humanos. Este marco integrador genera nuevos conocimientos, con amplias implicaciones para el estudio de la evolución de la enseñanza, incluyendo los roles de las restricciones cognitivas y los dilemas cooperativos en cómo y cuándo evoluciona la enseñanza. Finalmente, propongo una explicación de por qué algunos tipos de enseñanza son exclusivamente humanos, y discuto nuevas direcciones para la investigación motivadas por este marco.
BibTeX
@article{doi101017s0140525x14000090,
author = "Kline, Michelle A.",
title = "Cómo aprender sobre la enseñanza: Un marco evolutivo para el estudio del comportamiento de enseñanza en humanos y otros animales",
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90. Benson, Roger y Campione, Nicolás E. y Carrano, Matthew T. y Mannion, Philip D. y Sullivan, Corwin y Upchurch, Paul y Evans, David C., 2014, Tasas de evolución de la masa corporal de dinosaurios indican 170 millones de años de innovación ecológica sostenida en la línea de descendencia aviar: PLoS Biology.
DOI: 10.1371/journal.pbio.1001853
Resumen
Las radiaciones adaptativas a gran escala podrían explicar el éxito desbocado de una minoría de clados de vertebrados existentes. Esta hipótesis predice, entre otras cosas, tasas rápidas de evolución morfológica durante la historia temprana de los grupos principales, a medida que las linajes invaden nichos ecológicos dispares. Sin embargo, pocos estudios sobre la radiación adaptativa han incluido datos de tiempo profundo, por lo que los vínculos entre la diversidad existente y las grandes radiaciones extintas son poco claros. El registro intensivamente estudiado de dinosaurios del Mesozoico proporciona un sistema modelo para tal investigación, representando un grupo ecológicamente diverso que dominó los ecosistemas terrestres durante 170 millones de años. Además, con 10,000 especies, los dinosaurios existentes (aves) son el clado de tetrápodos vivos más diverso. Ensamblamos árboles compuestos de 614-622 dinosaurios/aves del Mesozoico y un conjunto de datos exhaustivo de masa corporal utilizando la relación de escala de la robustez de los huesos de las extremidades. El modelado de máxima verosimilitud y la prueba de altura de nodo revelan tasas evolutivas rápidas y una predominancia de cambios rápidos entre clases de tamaño en dinosaurios tempranos (triásicos). Esto indica un patrón de llenado de nicho de estallido temprano y contrasta con estudios anteriores que favorecían tasas gradualistas. Posteriormente, las tasas disminuyeron en la mayoría de las linajes, que raramente explotaron nuevos nichos ecológicos. Sin embargo, los dinosaurios maniraptoranos emplumados (incluidas las aves del Mesozoico) sostuvieron una evolución rápida desde al menos el Jurásico Medio, sugiriendo que estos taxones esquivaron los efectos de la saturación del nicho. Esto indica que una larga historia evolutiva de innovación ecológica continua allanó el camino para una segunda gran radiación de dinosaurios, en las aves. Por lo tanto, demostramos vínculos entre la radiación adaptativa de tiempo profundo predominantemente extinta de dinosaurios no aviares y la fenomenal diversificación de las aves, a través de tasas continuas de evolución rápida a lo largo de la linaje de tallo filogenético. Esto plantea la posibilidad de que la distribución desigual de la biodiversidad resulte no solo de la extrapolación a gran escala del proceso de radiación adaptativa en unos pocos clados existentes, sino también del mantenimiento de la evolvibilidad en escalas de tiempo vastas a lo largo de la historia de la vida, en linajes clave.
BibTeX
@article{doi101371journalpbio1001853,
author = "Benson, Roger and Campione, Nicolás E. and Carrano, Matthew T. and Mannion, Philip D. and Sullivan, Corwin y Upchurch, Paul y Evans, David C.",
title = "Tasas de evolución de la masa corporal de dinosaurios indican 170 millones de años de innovación ecológica sostenida en la linaje de tallo aviar",
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journal = "PLoS Biology",
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91. Clavel, Julien y Escarguel, Gilles y Merceron, Gildas, 2015, mv morph: un paquete de R para ajustar modelos evolutivos multivariados a datos morfométricos: Methods in Ecology and Evolution.
Resumen
Resumen Presentamos mv morph, un paquete de métodos comparativos filogenéticos multivariados para el entorno estadístico R. mv morph está disponible gratuitamente en el repositorio de paquetes cran (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). mv morph permite ajustar una variedad de modelos evolutivos multivariados bajo un criterio de máxima verosimilitud. Inicialmente desarrollado en el contexto del análisis filogenético de múltiples rasgos morfométricos, su uso puede extenderse a cualquier conjunto de datos biológicos con uno o múltiples rasgos continuos covariantes. Todos los modelos de ajuste incluyen la posibilidad de utilizar mapeo similar a simmap, lo cual puede ser útil para ajustar cambios a lo largo de linajes en un punto dado en el tiempo. Todos los modelos proporcionan métricas diagnósticas para la convergencia y la fiabilidad de las estimaciones, así como la posibilidad de incluir errores de medición de rasgos en las estimaciones del modelo. Las nuevas características proporcionadas por el paquete mv morph incluyen la posibilidad de ajustar modelos con cambios en el modo de evolución a lo largo de la filogenia, lo cual será particularmente significativo en análisis comparativos que incluyen taxones extintos, por ejemplo, al probar cambios en el modo de evolución asociados con eventos bióticos/abióticos globales. Breve descripción de los modelos ya incluidos en mv morph y提供一些演示该包的使用的两个模拟工作示例。
BibTeX
@article{doi1011112041210x12420,
author = "Clavel, Julien and Escarguel, Gilles and Merceron, Gildas",
title = "mv morph: an r package for fitting multivariate evolutionary models to morphometric data",
year = "2015",
journal = "Methods in Ecology and Evolution",
abstract = "Resumen Presentamos mv morph, un paquete de métodos comparativos filogenéticos multivariados para el entorno estadístico R. mv morph está disponible gratuitamente en el repositorio de paquetes cran (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/). mv morph permite ajustar una variedad de modelos evolutivos multivariados bajo un criterio de máxima verosimilitud. Inicialmente desarrollado en el contexto del análisis filogenético de múltiples rasgos morfométricos, su uso puede extenderse a cualquier conjunto de datos biológicos con uno o múltiples rasgos continuos covariantes. Todos los modelos de ajuste incluyen la posibilidad de utilizar mapeo similar a simmap, lo cual puede ser útil para ajustar cambios a lo largo de linajes en un punto dado en el tiempo. Todos los modelos proporcionan métricas diagnósticas para la convergencia y la fiabilidad de las estimaciones, así como la posibilidad de incluir errores de medición de rasgos en las estimaciones del modelo. Las nuevas características proporcionadas por el paquete mv morph incluyen la posibilidad de ajustar modelos con cambios en el modo de evolución a lo largo de la filogenia, lo cual será particularmente significativo en análisis comparativos que incluyen taxones extintos, por ejemplo, al probar cambios en el modo de evolución asociados con eventos bióticos/abióticos globales. Breve descripción de los modelos ya incluidos en mv morph y提供一些演示该包的使用的两个模拟工作示例。",
url = "https://doi.org/10.1111/2041-210x.12420",
doi = "10.1111/2041-210x.12420",
openalex = "W1527504944",
references = "doi1010079783662024522, doi1010079783662053898, doi10103844766, doi101086284325, doi101086383584, doi1011112041210x12035, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j155856461979tb04694x, doi101111j155856461983tb00236x, doi101111j15585646201201723x, doi101111j2041210x201100169x, doi10118614712105788, doi1023073802723"
}
92. Tendler, Avichai y Mayo, Avi y Alon, Uri, 2015, Compensaciones evolutivas, optimalidad de Pareto y la morfología de las conchas de amonites: BMC Systems Biology.
DOI: 10.1186/s12918-015-0149-z
Resumen
Estos resultados apoyan la teoría de la optimalidad de Pareto como un enfoque para estudiar las compensaciones evolutivas, y demuestran cómo este enfoque puede utilizarse para inferir las tareas supuestas que pueden dar forma a la selección natural de los fenotipos.
BibTeX
@article{doi101186s129180150149z,
author = "Tendler, Avichai y Mayo, Avi y Alon, Uri",
title = "Compensaciones evolutivas, optimalidad de Pareto y la morfología de las conchas de amonites",
year = "2015",
journal = "BMC Systems Biology",
abstract = "Estos resultados apoyan la teoría de la optimalidad de Pareto como un enfoque para estudiar las compensaciones evolutivas, y demuestran cómo este enfoque puede utilizarse para inferir las tareas supuestas que pueden dar forma a la selección natural de los fenotipos.",
url = "https://doi.org/10.1186/s12918-015-0149-z",
doi = "10.1186/s12918-015-0149-z",
openalex = "W2061815181",
references = "doi101007978147579153216, doi101111jzo12118, doi1011861471214811115, doi101666100271"
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93. Benton, Michael J. y Donoghue, PCJ y Vinther, Jakob y Asher, RJ y Friedman, Mary M. y Near, Thomas J., 2015, Restricciones sobre la escala de tiempo de la historia evolutiva de los animales: Palaeontologia Electronica.
Resumen
La datación del árbol de la vida es una tarea central en la biología evolutiva. Las tasas de evolución son fundamentales para casi todos los modelos y procesos evolutivos. Las tasas necesitan fechas. Existe mucho debate sobre las formas más apropiadas y razonables de datar el árbol de la vida, y el trabajo reciente ha destacado algunas confusiones y complejidades que pueden evitarse. Ya sea que los árboles filogenéticos se fechen después de haberse establecido o como parte del proceso de búsqueda del árbol, los profesionales necesitan saber qué calibraciones utilizar. Enfatizamos la importancia de identificar fósiles corona (no tronco), los niveles de confianza en su atribución a la corona, la precisión cronestratigráfica actual, la primacía de la formación geológica anfitriona y los intervalos de confianza asimétricos. Aquí presentamos calibraciones para 88 nodos clave a lo largo de la filogenia de los animales, desde la raíz de Metazoa hasta el último ancestro común de Homo sapiens. Se requiere constantemente una atención detallada: por ejemplo, la fecha clásica de aves-mamíferos (base de la corona Amniota) a menudo se ha dado como 310-315 Ma; la escala de tiempo internacional de 2014 indica una edad mínima de 318 Ma.
BibTeX
@article{doi1026879424,
author = "Benton, Michael J. y Donoghue, PCJ y Vinther, Jakob y Asher, RJ y Friedman, Mary M. y Near, Thomas J.",
title = "Restricciones sobre la escala de tiempo de la historia evolutiva de los animales",
year = "2015",
journal = "Palaeontologia Electronica",
abstract = "La datación del árbol de la vida es una tarea central en la biología evolutiva. Las tasas de evolución son fundamentales para casi todos los modelos y procesos evolutivos. Las tasas necesitan fechas. Existe mucho debate sobre las formas más apropiadas y razonables de datar el árbol de la vida, y el trabajo reciente ha destacado algunas confusiones y complejidades que pueden evitarse. Ya sea que los árboles filogenéticos se fechen después de haberse establecido o como parte del proceso de búsqueda del árbol, los profesionales necesitan saber qué calibraciones utilizar. Enfatizamos la importancia de identificar fósiles corona (no tronco), los niveles de confianza en su atribución a la corona, la precisión cronestratigráfica actual, la primacía de la formación geológica anfitriona y los intervalos de confianza asimétricos. Aquí presentamos calibraciones para 88 nodos clave a lo largo de la filogenia de los animales, desde la raíz de Metazoa hasta el último ancestro común de Homo sapiens. Se requiere constantemente una atención detallada: por ejemplo, la fecha clásica de aves-mamíferos (base de la corona Amniota) a menudo se ha dado como 310-315 Ma; la escala de tiempo internacional de 2014 indica una edad mínima de 318 Ma.",
url = "https://doi.org/10.26879/424",
doi = "10.26879/424",
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94. Waring, Timothy M. y Kline, Michelle A. y Brooks, Jeremy y Goff, Sandra y Gowdy, John M. y Janssen, Marco A. y Smaldino, Paul E. y Jacquet, Jennifer, 2015, Un marco evolutivo multinivel para el análisis de sostenibilidad: Ecology and Society.
Resumen
Waring, T. M., M. A. Kline, J. S. Brooks, S. H. Goff, J. Gowdy, M. A. Janssen, P. E. Smaldino, y J. Jacquet. 2015. Un marco evolutivo multinivel para el análisis de sostenibilidad. Ecology and Society 20(2): 34. https://doi.org/10.5751/ES-07634-200234
BibTeX
@article{doi105751es07634200234,
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references = "doi101371journalpone0045150"
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95. Silcox, Mary y Bloch, Jonathan I. y Boyer, Douglas y Chester, Stephen G. B. y López‐Torres, Sergi, 2017, La radiación evolutiva de los plesiadapiformes: Evolutionary Anthropology Issues News and Reviews.
Resumen
Muy poco después de la desaparición de los dinosaurios no aviares, aparecieron los primeros mamíferos que tenían características similares a las de los primates. Estas primeras formas primitivas dieron origen a una rica diversidad de plesiadapiformes, a menudo referidos como primates arcaicos. Al igual que muchos primates vivos, los plesiadapiformes eran pequeños animales arborícolas que generalmente comían frutas, insectos y, ocasionalmente, hojas. Sin embargo, este grupo carecía de varias características diagnósticas de los euprimates. También tenían especializaciones extraordinariamente diversas, representadas en once familias y más de 140 especies, que, en algunos casos, no se habían visto desde entonces en el orden de los primates. Los plesiadapiformes son conocidos de los tres continentes del norte, con representantes que persistieron hasta al menos hace 37 millones de años. En este artículo proporcionamos un resumen de la increíble diversidad de la morfología y adaptaciones de los plesiadapiformes, revisando nuestro conocimiento de todas las once familias. También discutimos los desafíos que permanecen en nuestra comprensión de su ecología y evolución.
BibTeX
@article{doi101002evan21526,
author = "Silcox, Mary y Bloch, Jonathan I. y Boyer, Douglas y Chester, Stephen G. B. y López‐Torres, Sergi",
title = "La radiación evolutiva de los plesiadapiformes",
year = "2017",
journal = "Evolutionary Anthropology Issues News and Reviews",
abstract = "Muy poco después de la desaparición de los dinosaurios no aviares, aparecieron los primeros mamíferos que tenían características similares a las de los primates. Estas primeras formas primitivas dieron origen a una rica diversidad de plesiadapiformes, a menudo referidos como primates arcaicos. Al igual que muchos primates vivos, los plesiadapiformes eran pequeños animales arborícolas que generalmente comían frutas, insectos y, ocasionalmente, hojas. Sin embargo, este grupo carecía de varias características diagnósticas de los euprimates. También tenían especializaciones extraordinariamente diversas, representadas en once familias y más de 140 especies, que, en algunos casos, no se habían visto desde entonces en el orden de los primates. Los plesiadapiformes son conocidos de los tres continentes del norte, con representantes que persistieron hasta al menos hace 37 millones de años. En este artículo proporcionamos un resumen de la increíble diversidad de la morfología y adaptaciones de los plesiadapiformes, revisando nuestro conocimiento de todas las once familias. También discutimos los desafíos que permanecen en nuestra comprensión de su ecología y evolución.",
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96. Peters, Ralph S. y Krogmann, Lars y Mayer, Christoph y Donath, Alexander y Gunkel, Simon y Meusemann, Karen y Kozlov, Alexey M. y Podsiadłowski, Lars y Petersen, Malte y Lanfear, Robert y Diez, Patricia A. y Heraty, John M. y Kjer, Karl M. y Klopfstein, Seraina y Meier, Rudolf y Polidori, Carlo y Schmitt, Thomas y Liu, Shanlin y Zhou, Xin y Wappler, Torsten y Rust, Jes y Misof, Bernhard y Niehuis, Oliver, 2017, Historia evolutiva de los Himenópteros: Current Biology.
DOI: 10.1016/j.cub.2017.01.027
BibTeX
@article{doi101016jcub201701027,
author = "Peters, Ralph S. y Krogmann, Lars y Mayer, Christoph y Donath, Alexander y Gunkel, Simon y Meusemann, Karen y Kozlov, Alexey M. y Podsiadłowski, Lars y Petersen, Malte y Lanfear, Robert y Diez, Patricia A. y Heraty, John M. y Kjer, Karl M. y Klopfstein, Seraina y Meier, Rudolf y Polidori, Carlo y Schmitt, Thomas y Liu, Shanlin y Zhou, Xin y Wappler, Torsten y Rust, Jes y Misof, Bernhard y Niehuis, Oliver",
title = "Historia evolutiva de los Himenópteros",
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journal = "Current Biology",
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97. Glowacki, Luke y Wilson, Michael L. y Wrangham, Richard W., 2017, La antropología evolutiva de la guerra: Journal of Economic Behavior & Organization.
DOI: 10.1016/j.jebo.2017.09.014
BibTeX
@article{doi101016jjebo201709014,
author = "Glowacki, Luke y Wilson, Michael L. y Wrangham, Richard W.",
title = "La antropología evolutiva de la guerra",
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98. Cooney, Christopher R. y Bright, Jen A. y Capp, Elliot J. R. y Chira, Angela M. y Hughes, Emma C. y Moody, Christopher J. y Nouri, L. O. y Varley, Zoë K. y Thomas, Gavin H., 2017, Dinámica mega-evolutiva de la radiación adaptativa de las aves: Nature.
BibTeX
@article{doi101038nature21074,
author = "Cooney, Christopher R. y Bright, Jen A. y Capp, Elliot J. R. y Chira, Angela M. y Hughes, Emma C. y Moody, Christopher J. y Nouri, L. O. y Varley, Zoë K. y Thomas, Gavin H.",
title = "Dinámica mega-evolutiva de la radiación adaptativa de las aves",
year = "2017",
journal = "Nature",
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doi = "10.1038/nature21074",
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}
99. Marshall, Charles R. y Finnegan, Seth y Clites, Erica C. y Holroyd, Patricia A. y Bonuso, N. y Cortez, Célia Martins y Davis, Edward y Dietl, Gregory P. y Druckenmiller, Patrick S. y Eng, Ronald y Garcia, Christine y Estes-Smargiassi, Kathryn y Hendy, Austin y Hollis, Kathy y Little, Holly y Nesbitt, Elizabeth A. y Roopnarine, Peter D. y Skibinski, L. y Vendetti, Jann E. y White, Lisa D., 2018, Cuantificación de los datos oscuros en colecciones fósiles de museos mientras la paleontología experimenta una segunda revolución digital: Biology Letters.
Resumen
El análisis a gran escala del registro fósil requiere la agregación de datos paleontológicos de localidades fósiles individuales. Antes de las computadoras, estos conjuntos de datos sinópticos se compilaban a mano, una tarea laboriosa que requirió años de esfuerzo y obligó a los paleontólogos a tomar decisiones difíciles sobre qué tipos de datos tabular. El advenimiento de las computadoras de escritorio inauguró la primera revolución digital de la paleontología: bases de datos en línea basadas en la literatura, como la Paleobiology Database (PBDB). Sin embargo, la literatura publicada representa solo una pequeña proporción de los datos paleontológicos alojados en colecciones de museos. Aunque este problema ha sido apreciado durante mucho tiempo, la magnitud y, por lo tanto, la posible importancia de estos llamados 'datos oscuros' ha sido difícil de determinar. Aquí, en las primeras fases de una segunda revolución digital en la paleontología: la digitalización de colecciones de museos, proporcionamos una estimación de la magnitud de los datos oscuros de la paleontología. La digitalización de las colecciones de invertebrados marinos del Cenozoico de nuestras nueve instituciones de California, Oregón y Washington en EE. UU. revela que representan 23 veces el número de localidades únicas que actualmente están disponibles en la PBDB. Estos datos, y la vasta cantidad de datos oscuros similares no aprovechados en otras colecciones de museos, cuando se movilicen digitalmente, mejorarán la capacidad de los paleontólogos para hacer inferencias sobre los patrones y procesos de cambios evolutivos y ecológicos pasados.
BibTeX
@article{doi101098rsbl20180431,
author = "Marshall, Charles R. y Finnegan, Seth y Clites, Erica C. y Holroyd, Patricia A. y Bonuso, N. y Cortez, Célia Martins y Davis, Edward y Dietl, Gregory P. y Druckenmiller, Patrick S. y Eng, Ronald y Garcia, Christine y Estes-Smargiassi, Kathryn y Hendy, Austin y Hollis, Kathy y Little, Holly y Nesbitt, Elizabeth A. y Roopnarine, Peter D. y Skibinski, L. y Vendetti, Jann E. y White, Lisa D.",
title = "Cuantificación de los datos oscuros en colecciones fósiles de museos mientras la paleontología experimenta una segunda revolución digital",
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journal = "Biology Letters",
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100. Valenzuela‐Toro, Ana M. y Pyenson, Nicholas D., 2019, ¿Qué sabemos sobre el registro fósil de los pinnípedos? Una investigación historiográfica: Royal Society Open Science.
Resumen
El registro fósil de los pinnípedos (focas, focas de pelo y morsas) se distribuye globalmente, abarcando desde el Oligoceno tardío hasta el Holoceno. Este registro muestra una historia evolutiva compleja que no podría inferirse de otra manera a partir de sus parientes extantes, incluyendo múltiples radiaciones y especializaciones ecomorfológicas iterativas entre diferentes linajes, muchos de los cuales están extintos. Sin embargo, el registro fósil de los pinnípedos no está uniformemente representado en el espacio y el tiempo, dejando algunos vacíos en nuestro conocimiento. Realizamos una investigación historiográfica del registro fósil publicado de los pinnípedos basada en la información disponible en la Paleobiology Database, con el objetivo de caracterizar y evaluarlo de manera general desde una perspectiva taxonómica, geográfica y temporal. Identificamos las principales tendencias, fortalezas y debilidades del registro fósil de los pinnípedos, incluidos posibles sesgos que podrían afectar nuestras interpretaciones. Encontramos que el 39% del registro corresponde a taxones extantes, que son esencialmente del Pleistoceno y el Holoceno. Existe un registro más grande del Hemisferio Norte, lo que sugiere sesgos en el muestreo y el esfuerzo de recolección. El registro no está fuertemente sesgado por el sesgo de afloramiento sedimentario. Específicamente, para las especies extintas, casi la mitad de ellas están representadas por una sola ocurrencia y una gran proporción tiene especímenes tipo que consisten en elementos postcraneales aislados individuales. Si bien el registro fósil de los pinnípedos puede tener una cobertura temporal y taxonómica adecuada, tiene un fuerte sesgo geográfico y su comparabilidad se ve obstaculizada por la incompletitud de los especímenes tipo. Estos resultados deben tenerse en cuenta al abordar los patrones de su diversidad pasada, historia evolutiva y paleoecología.
BibTeX
@article{doi101098rsos191394,
author = "Valenzuela‐Toro, Ana M. y Pyenson, Nicholas D.",
title = "¿Qué sabemos sobre el registro fósil de los pinnípedos? Una investigación historiográfica",
year = "2019",
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abstract = "El registro fósil de los pinnípedos (focas, focas de pelo y morsas) se distribuye globalmente, abarcando desde el Oligoceno tardío hasta el Holoceno. Este registro muestra una historia evolutiva compleja que no podría inferirse de otra manera a partir de sus parientes extantes, incluyendo múltiples radiaciones y especializaciones ecomorfológicas iterativas entre diferentes linajes, muchos de los cuales están extintos. Sin embargo, el registro fósil de los pinnípedos no está uniformemente representado en el espacio y el tiempo, dejando algunos vacíos en nuestro conocimiento. Realizamos una investigación historiográfica del registro fósil publicado de los pinnípedos basada en la información disponible en la Paleobiology Database, con el objetivo de caracterizar y evaluarlo de manera general desde una perspectiva taxonómica, geográfica y temporal. Identificamos las principales tendencias, fortalezas y debilidades del registro fósil de los pinnípedos, incluidos posibles sesgos que podrían afectar nuestras interpretaciones. Encontramos que el 39% del registro corresponde a taxones extantes, que son esencialmente del Pleistoceno y el Holoceno. Existe un registro más grande del Hemisferio Norte, lo que sugiere sesgos en el muestreo y el esfuerzo de recolección. El registro no está fuertemente sesgado por el sesgo de afloramiento sedimentario. Específicamente, para las especies extintas, casi la mitad de ellas están representadas por una sola ocurrencia y una gran proporción tiene especímenes tipo que consisten en elementos postcraneales aislados individuales. Si bien el registro fósil de los pinnípedos puede tener una cobertura temporal y taxonómica adecuada, tiene un fuerte sesgo geográfico y su comparabilidad se ve obstaculizada por la incompletitud de los especímenes tipo. Estos resultados deben tenerse en cuenta al abordar los patrones de su diversidad pasada, historia evolutiva y paleoecología.",
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doi = "10.1098/rsos.191394",
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references = "doi101017s0094837300006060, doi101098rsbl20180431"
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101. Bouckaert, Remco y Vaughan, Timothy G. y Barido‐Sottani, Joëlle y Duchêne, Sebastián y Fourment, Mathieu y Gavryushkina, Alexandra y Heled, Joseph y Jones, Graham y Kühnert, Denise y Maio, Nicola De y Matschiner, Michael y Mendes, Fábio K. y Müller, Nicola F. y Ogilvie, Huw A. y du Plessis, Louis y Popinga, Alex y Rambaut, Andrew y Rasmussen, David A. y Siveroni, Igor y Suchard, Marc A. y Wu, Chieh‐Hsi y Xie, Dong y Zhang, Chi y Stadler, Tanja y Drummond, Alexei J., 2019, BEAST 2.5: Una plataforma de software avanzada para análisis evolutivo bayesiano: PLoS Computational Biology.
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006650
Resumen
La elaboración de métodos de inferencia filogenética bayesiana ha continuado a un ritmo acelerado en los últimos años, con avances importantes en casi todos los aspectos del modelado conjunto de datos evolutivos. Se valora cada vez más que algunas preguntas evolutivas solo pueden responderse adecuadamente combinando evidencias de múltiples fuentes independientes de datos, incluyendo secuencias genómicas, fechas de muestreo, datos fenotípicos, fechas de radiocarbono, ocurrencias fósiles e información sobre rangos biogeográficos, entre otros. Incluir todos los datos relevantes en un único modelo conjunto es muy desafiante tanto conceptual como computacionalmente. Los paquetes de software computacional avanzado que permiten el desarrollo robusto de modelos compatibles (sub-)modelos que pueden componerse en una jerarquía de modelos completa han jugado un papel clave en estos desarrollos. El desarrollo de tales marcos de software se ha convertido cada vez más en una actividad científica importante en sí misma, y conlleva desafíos específicos, desde desafíos prácticos de diseño, desarrollo e ingeniería de software hasta desafíos de modelado estadístico y conceptual. BEAST 2 es una de estas plataformas de software computacional, y fue anunciada por primera vez hace más de 4 años. Aquí describimos una serie de nuevos desarrollos importantes en la plataforma central y la jerarquía de modelos de BEAST 2 que han ocurrido desde el primer lanzamiento del software, culminando en el reciente lanzamiento 2.5.
BibTeX
@article{doi101371journalpcbi1006650,
author = "Bouckaert, Remco y Vaughan, Timothy G. y Barido‐Sottani, Joëlle y Duchêne, Sebastián y Fourment, Mathieu y Gavryushkina, Alexandra y Heled, Joseph y Jones, Graham y Kühnert, Denise y Maio, Nicola De y Matschiner, Michael y Mendes, Fábio K. y Müller, Nicola F. y Ogilvie, Huw A. y du Plessis, Louis y Popinga, Alex y Rambaut, Andrew y Rasmussen, David A. y Siveroni, Igor y Suchard, Marc A. y Wu, Chieh‐Hsi y Xie, Dong y Zhang, Chi y Stadler, Tanja y Drummond, Alexei J.",
title = "BEAST 2.5: Una plataforma de software avanzada para análisis evolutivo bayesiano",
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doi = "10.1371/journal.pcbi.1006650",
openalex = "W2901954177",
references = "doi101016jtree200901009, doi101038nature10231, doi101038nature13726, doi101073pnas1319091111, doi101073pnas89178322, doi101080106351501753462876, doi101093acprofoso97801985670280010001, doi101093genetics1551431, doi101093molbevmsp274, doi101093sysbiosyq085, doi101093sysbiosyr047, doi101093sysbiosyv080, doi101093vevey016, doi101098rspa19270118, doi101186147121487214, doi101186s1286201708906, doi1012019780429258411, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpcbi1003537"
}
102. Marshall, Charles R., 2019, Using the Fossil Record to Evaluate Timetree Timescales: Frontiers in Genetics.
Resumen
Los registros fósiles y geológicos proporcionan los datos primarios utilizados para establecer escalas de tiempo absolutas para los árboles de tiempo. Para la evaluación paleontológica de las escalas de tiempo de los árboles de tiempo propuestas, y para los métodos basados en nodos para construir árboles de tiempo, el registro fósil se utiliza para acotar los tiempos de divergencia. Los límites mínimos (edades mínimas) pueden establecerse de manera robusta utilizando fósiles bien datados que pueden asignarse de manera fiable a linajes basándose en evidencia morfológica positiva. Los límites máximos son mucho más difíciles de establecer, principalmente porque es difícil establecer evidencia definitiva de que la ausencia de un taxón en el registro fósil es real y no solo debido a la incompletitud de los registros fósiles y rocosos. Se han desarrollado cinco métodos principales para estimar los límites de edad máxima, cada uno de los cuales se discute. El hecho de que el potencial de fosilización de un grupo típicamente disminuya a medida que uno se acerca a su tiempo de origen aumenta el desafío de estimar los límites de edad máxima. Surgen complicaciones adicionales: 1) porque los datos fósiles realmente acotan el tiempo de origen de la primera morfología fosilizable relevante (apomorfía), no el tiempo de divergencia en sí mismo; 2) debido a la incertidumbre filogenética en la colocación de fósiles; 3) debido a las brechas temporales y geográficas idiosincrásicas en los registros rocosos y fósiles; y 4) si el potencial de preservación de un grupo cambió significativamente durante su historia. En contraste, las incertidumbres en las edades absolutas de los fósiles son típicamente relativamente poco importantes, incluso aunque la gran mayoría de los fósiles no puedan ser datados directamente. Se revisan estos problemas y los métodos cuantitativos relevantes, y se evalúan sus magnitudes relativas, que típicamente correlacionan con la edad del grupo, su rango geográfico y la riqueza de especies.
BibTeX
@article{doi103389fgene201901049,
author = "Marshall, Charles R.",
title = "Using the Fossil Record to Evaluate Timetree Timescales",
year = "2019",
journal = "Frontiers in Genetics",
abstract = "Los registros fósiles y geológicos proporcionan los datos primarios utilizados para establecer escalas de tiempo absolutas para los árboles de tiempo. Para la evaluación paleontológica de las escalas de tiempo de los árboles de tiempo propuestas, y para los métodos basados en nodos para construir árboles de tiempo, el registro fósil se utiliza para acotar los tiempos de divergencia. Los límites mínimos (edades mínimas) pueden establecerse de manera robusta utilizando fósiles bien datados que pueden asignarse de manera fiable a linajes basándose en evidencia morfológica positiva. Los límites máximos son mucho más difíciles de establecer, principalmente porque es difícil establecer evidencia definitiva de que la ausencia de un taxón en el registro fósil es real y no solo debido a la incompletitud de los registros fósiles y rocosos. Se han desarrollado cinco métodos principales para estimar los límites de edad máxima, cada uno de los cuales se discute. El hecho de que el potencial de fosilización de un grupo típicamente disminuya a medida que uno se acerca a su tiempo de origen aumenta el desafío de estimar los límites de edad máxima. Surgen complicaciones adicionales: 1) porque los datos fósiles realmente acotan el tiempo de origen de la primera morfología fosilizable relevante (apomorfía), no el tiempo de divergencia en sí mismo; 2) debido a la incertidumbre filogenética en la colocación de fósiles; 3) debido a las brechas temporales y geográficas idiosincrásicas en los registros rocosos y fósiles; y 4) si el potencial de preservación de un grupo cambió significativamente durante su historia. En contraste, las incertidumbres en las edades absolutas de los fósiles son típicamente relativamente poco importantes, incluso aunque la gran mayoría de los fósiles no puedan ser datados directamente. Se revisan estos problemas y los métodos cuantitativos relevantes, y se evalúan sus magnitudes relativas, que típicamente correlacionan con la edad del grupo, su rango geográfico y la riqueza de especies.",
url = "https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01049",
doi = "10.3389/fgene.2019.01049",
openalex = "W2983202100",
references = "doi101016jympev201705008, doi101098rsbl20180431"
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103. Archibald, S. Bruce y Cannings, Robert A., 2019, Libélulas fósiles (Odonata: Anisoptera) de las Alturas de Okanagan del Eoceno temprano, norte de América occidental: The Canadian Entomologist.
Resumen
Resumen Describimos las primeras libélulas (Odonata: Anisoptera) de las Alturas de Okanagan del Eoceno temprano del noroeste lejano de América del Norte a partir de nueve fósiles. Seis se asignan a cinco especies en cuatro géneros nuevos y nombrados de Aeshnidae: Antiquiala snyderae nuevo género y especie, Idemlinea versatilis nuevo género y especie, Ypshna brownleei nuevo género y especie, Ypshna latipennata nuevo género y especie, y Eoshna thompsonensis nuevo género y especie; tratamos uno como género A de Aeshnidae, especie A; uno se asigna a Gomphidae: Auroradraco eos nuevo género y especie; y tratamos un noveno fósil fragmentario de afinidad familiar desconocida como Anisoptera género indeterminado A, especie A, que representa un séptimo género y octava especie. La dominancia de Aeshnidae es consistente con otras localidades fósiles del Paleoceno y Eoceno. Auroradraco eos es el único fósil de Gomphidae en el hueco de aproximadamente 66 millones de años entre las ocurrencias en ámbar birmano del Cretácico medio y el Oligoceno temprano de Francia. Ypshna parece estar cerca de Parabaissaeshna ejerslevense de la Formación Fur del Eoceno temprano de Dinamarca; esto no es sorprendente dado las conexiones intercontinentales holarcticas en ese momento y una lista creciente de taxones de insectos compartidos entre las Alturas de Okanagan y la Formación Fur.
BibTeX
@article{doi104039tce201961,
author = "Archibald, S. Bruce y Cannings, Robert A.",
title = "Libélulas fósiles (Odonata: Anisoptera) de las Alturas de Okanagan del Eoceno temprano, norte de América occidental",
year = "2019",
journal = "The Canadian Entomologist",
abstract = "Resumen Describimos las primeras libélulas (Odonata: Anisoptera) de las Alturas de Okanagan del Eoceno temprano del noroeste lejano de América del Norte a partir de nueve fósiles. Seis se asignan a cinco especies en cuatro géneros nuevos y nombrados de Aeshnidae: Antiquiala snyderae nuevo género y especie, Idemlinea versatilis nuevo género y especie, Ypshna brownleei nuevo género y especie, Ypshna latipennata nuevo género y especie, y Eoshna thompsonensis nuevo género y especie; tratamos uno como género A de Aeshnidae, especie A; uno se asigna a Gomphidae: Auroradraco eos nuevo género y especie; y tratamos un noveno fósil fragmentario de afinidad familiar desconocida como Anisoptera género indeterminado A, especie A, que representa un séptimo género y octava especie. La dominancia de Aeshnidae es consistente con otras localidades fósiles del Paleoceno y Eoceno. Auroradraco eos es el único fósil de Gomphidae en el hueco de aproximadamente 66 millones de años entre las ocurrencias en ámbar birmano del Cretácico medio y el Oligoceno temprano de Francia. Ypshna parece estar cerca de Parabaissaeshna ejerslevense de la Formación Fur del Eoceno temprano de Dinamarca; esto no es sorprendente dado las conexiones intercontinentales holarcticas en ese momento y una lista creciente de taxones de insectos compartidos entre las Alturas de Okanagan y la Formación Fur.",
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doi = "10.4039/tce.2019.61",
openalex = "W2981968678",
references = "doi104039tce201759"
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104. Cashmore, Daniel D. y Mannion, Philip D. y Upchurch, Paul y Butler, Richard J., 2020, Ten more years of discovery: revisiting the quality of the sauropodomorph dinosaur fossil record: Palaeontology.
Resumen
Resumen Los cambios espaciotemporales en la completitud de los especímenes fósiles pueden sesgar nuestra comprensión de la historia evolutiva de un grupo. La calidad del registro fósil de los dinosaurios saurópodos se evaluó hace una década, pero desde entonces el número de especies válidas ha aumentado un 60% y el 17% de los taxones de ese estudio han sufrido una revisión taxonómica. Aquí, evaluamos cómo 10 años de investigación adicional han cambiado nuestra perspectiva sobre el registro fósil del grupo. Cuantificamos la completitud de las 307 especies de saurópodos actualmente consideradas válidas utilizando la métrica de completitud esquelética, que calcula la proporción de un esqueleto completo preservado para cada taxón. Las revisiones taxonómicas y de edad estratigráfica, en lugar de nuevas especies, son los impulsores de las diferencias más significativas entre los resultados actuales y los de la evaluación anterior. No aparecieron diferencias estadísticas cuando utilizamos nuestro nuevo conjunto de datos para generar curvas de completitud temporal basadas únicamente en taxones conocidos en 2009 o 1999. Ahora observamos una caída severa en los valores medios de completitud a través del límite Jurásico-Cretácico que nunca se recupera a los niveles precretácicos. Explicar este patrón es difícil, ya que no encontramos evidencia convincente de que esté relacionado con preferencias ambientales o cambios en el tamaño corporal. En su lugar, podría resultar de: (1) reducción del espacio de preservación fósil terrestre debido al aumento del nivel del mar; (2) especificidades ecológicas y relativa alta diagnosabilidad de las especies cretácicas; y/o (3) aumento de la muestreo de nuevos sitios explorados con muchos taxones previamente desconocidos. Revisar los patrones de esta manera nos permite probar la longevidad de las conclusiones hechas en estudios cuantitativos anteriores.
BibTeX
@article{doi101111pala12496,
author = "Cashmore, Daniel D. and Mannion, Philip D. and Upchurch, Paul and Butler, Richard J.",
title = "Ten more years of discovery: revisiting the quality of the sauropodomorph dinosaur fossil record",
year = "2020",
journal = "Palaeontology",
abstract = "Resumen Los cambios espaciotemporales en la completitud de los especímenes fósiles pueden sesgar nuestra comprensión de la historia evolutiva de un grupo. La calidad del registro fósil de los dinosaurios saurópodos se evaluó hace una década, pero desde entonces el número de especies válidas ha aumentado un 60% y el 17% de los taxones de ese estudio han sufrido una revisión taxonómica. Aquí, evaluamos cómo 10 años de investigación adicional han cambiado nuestra perspectiva sobre el registro fósil del grupo. Cuantificamos la completitud de las 307 especies de saurópodos actualmente consideradas válidas utilizando la métrica de completitud esquelética, que calcula la proporción de un esqueleto completo preservado para cada taxón. Las revisiones taxonómicas y de edad estratigráfica, en lugar de nuevas especies, son los impulsores de las diferencias más significativas entre los resultados actuales y los de la evaluación anterior. No aparecieron diferencias estadísticas cuando utilizamos nuestro nuevo conjunto de datos para generar curvas de completitud temporal basadas únicamente en taxones conocidos en 2009 o 1999. Ahora observamos una caída severa en los valores medios de completitud a través del límite Jurásico-Cretácico que nunca se recupera a los niveles precretácicos. Explicar este patrón es difícil, ya que no encontramos evidencia convincente de que esté relacionado con preferencias ambientales o cambios en el tamaño corporal. En su lugar, podría resultar de: (1) reducción del espacio de preservación fósil terrestre debido al aumento del nivel del mar; (2) especificidades ecológicas y relativa alta diagnosabilidad de las especies cretácicas; y/o (3) aumento de la muestreo de nuevos sitios explorados con muchos taxones previamente desconocidos. Revisar los patrones de esta manera nos permite probar la longevidad de las conclusiones hechas en estudios cuantitativos anteriores.",
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doi = "10.1111/pala.12496",
openalex = "W3017772092",
references = "doi1010079780387981413, doi1010079783319242774, doi101016jjsames201411008, doi101016jpalaeo200901002, doi101016jpalaeo200906004, doi101016s0016787876800077, doi101038s41467018051281, doi101038s41467019089972, doi101046j14209101200200472x, doi101073pnas1521478113, doi10108008912969009386535, doi101093bioinformaticsbty633, doi101093zoolinneanzlx103, doi101093zoolinneanzly009, doi101093zoolinneanzly068, doi101098rsbl20180431, doi101098rspb20122526, doi101111brv12255, doi101111j2041210x201100169x, doi101111j2041210x201200196x, doi101111j251761611995tb02031x, doi101126science1105113, doi101126science23547931156, doi101371journalpone0078573, openalexw2611511275"
}
105. Flannery‐Sutherland, Joseph T. y Silvestro, Daniele y Benton, Michael J., 2022, Las dinámicas de diversidad global en el registro fósil son heterogéneas a nivel regional: Nature Communications.
DOI: 10.1038/s41467-022-30507-0
Resumen
Los patrones de diversidad global en el registro fósil constituyen un mosaico de tendencias regionales, sustentados por conductores espacialmente no aleatorios y distorsionados por la variación en la intensidad de muestreo a través del tiempo y el espacio. Las estimaciones de diversidad corregidas por muestreo de conjuntos de datos fósiles espacialmente estandarizados conservan sus matices biogeográficos regionales y evitan estos sesgos, sin embargo, la diversidad a través del tiempo surge de la interacción entre la especiación y la extinción, los procesos que moldean la historia macroevolutiva. Aquí presentamos un algoritmo de submuestreo para eliminar el sesgo de muestreo espacial, junto con métodos probabilísticos avanzados para estimar las tasas de especiación y extinción y un método bayesiano para estimar la diversidad corregida por muestreo. Luego reexaminamos el registro fósil marino del Pérmico Tardío al Jurásico Temprano, un intervalo que abarca varios disturbios bióticos globales que moldearon los orígenes de la biosfera marina moderna. Encontramos que las tasas de especiación y extinción son regionalmente heterogéneas incluso durante eventos que se manifestaron globalmente, destacando la necesidad de perspectivas explícitas espacialmente de los procesos macroevolutivos a través del tiempo geológico.
BibTeX
@article{doi101038s41467022305070,
author = "Flannery‐Sutherland, Joseph T. y Silvestro, Daniele y Benton, Michael J.",
title = "Las dinámicas de diversidad global en el registro fósil son regionalmente heterogéneas",
year = "2022",
journal = "Nature Communications",
abstract = "Los patrones de diversidad global en el registro fósil constituyen un mosaico de tendencias regionales, sustentados por conductores espacialmente no aleatorios y distorsionados por la variación en la intensidad de muestreo a través del tiempo y el espacio. Las estimaciones de diversidad corregidas por muestreo de conjuntos de datos fósiles espacialmente estandarizados conservan sus matices biogeográficos regionales y evitan estos sesgos, sin embargo, la diversidad a través del tiempo surge de la interacción entre la especiación y la extinción, los procesos que moldean la historia macroevolutiva. Aquí presentamos un algoritmo de submuestreo para eliminar el sesgo de muestreo espacial, junto con métodos probabilísticos avanzados para estimar las tasas de especiación y extinción y un método bayesiano para estimar la diversidad corregida por muestreo. Luego reexaminamos el registro fósil marino del Pérmico Tardío al Jurásico Temprano, un intervalo que abarca varios disturbios bióticos globales que moldearon los orígenes de la biosfera marina moderna. Encontramos que las tasas de especiación y extinción son regionalmente heterogéneas incluso durante eventos que se manifestaron globalmente, destacando la necesidad de perspectivas explícitas espacialmente de los procesos macroevolutivos a través del tiempo geológico.",
url = "https://doi.org/10.1038/s41467-022-30507-0",
doi = "10.1038/s41467-022-30507-0",
openalex = "W4280565279",
references = "doi101016jcub202107071, doi101016jearscirev2020103282, doi101038s41467021237540, doi101038s41559021016088, doi101073pnas2020778118, doi101093sysbiosyab045, doi101126sciadvaba0099, doi101130g479071"
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