Teoría de la evolución

@misc{lamarck1809zoological24,
    author = "Lamarck, J. B",
    title = "Filosofía Zoológica",
    year = "1809",
    howpublished = "Traducido al inglés por H. Elliott, 1914. Macmillan \& Co., Nueva York",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lamarck, J. B., 1809, Filosofía Zoológica. Traducido al inglés por H. Elliott, 1914. Macmillan \& Co., Nueva York.}"
}

@misc{kellogg1907darwinism22,
    author = "Kellogg, V. L",
    title = "El darwinismo de hoy",
    year = "1907",
    howpublished = "Londres, Inglaterra, Bell \& Hnos",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kellogg, V. L., 1907, El darwinismo de hoy: Londres, Inglaterra, Bell \& Hnos.}"
}

No es necesario añadir que la contemplación en la ciencia natural de un dominio más amplio que el real conduce a una comprensión mucho mejor del real.' (p. 267, La Naturaleza del Mundo Físico.)x PREFACE La teoría evolutiva fue así principalmente retrograda; el poderoso cuerpo de investigaciones mendelianas en todo el mundo ha evidentemente superado las falacias con las que fue inicialmente fomentada. Como pionero de la genética, ha hecho más que suficiente para expiar las polémicas precipitadas de sus primeros escritos. Tratar la selección natural como un agente basado independientemente en sus propias fundaciones no es minimizar su importancia en la teoría de la evolución. Por el contrario, tan pronto como requerimos formar opiniones por otros medios que mediante comparación y analogía, tal base deductiva independiente se convierte en una necesidad. Esta necesidad es particularmente que se note para la humanidad; ya que tenemos algún conocimiento de la estructura de la sociedad, de los motivos humanos y de las estadísticas vitales de esta especie, el uso del método deductivo puede suministrar un conocimiento más íntimo de los procesos evolutivos que es posible en otro lugar. Además, será de importancia para nuestro tema llamar la atención a varias consecuencias del principio de la selección natural, las cuales, ya que no consisten en la modificación adaptativa de formas específicas, han necesariamente escapado a la atención. Los fenómenos genéticos de dominancia y ligadura parecen ofrecer ejemplos de esta clase, la futura investigación de los cuales puede añadir grandemente al alcance de nuestro tema. Ningún esfuerzo mío podría valer para hacer el libro una lectura fácil. He procurado asistir al lector dando breves resúmenes al final de todos los capítulos, excepto el Capítulo IV, que se resume conjuntamente con el Capítulo V. Aquellos que prefieran hacerlo pueden considerar el Capítulo IV como un apéndice matemático a la parte correspondiente del resumen. Las deducciones respecto al Hombre están estrictamente inseparables de los capítulos más generales, pero han sido colocadas juntas en un grupo que comienza con el Capítulo VIII. Creo que nadie se sorprenderá de que un gran número de los puntos considerados demanden un tratamiento mucho más completo, más riguroso y más comprensivo. Parece imposible que se haga plena justicia al tema de esta manera, hasta que se haya construido una tradición de trabajo matemático dedicado a problemas biológicos, comparable a las investigaciones sobre las cuales un físico matemático puede recurrir en la resolución de dificultades especiales.

@book{doi105962bhltitle27468,
    author = "Fisher, Ronald Aylmer",
    title = "The genetical theory of natural selection",
    year = "1930",
    booktitle = "Clarendon Press eBooks",
    abstract = "No es necesario añadir que la contemplación en la ciencia natural de un dominio más amplio que el real conduce a una comprensión mucho mejor del real.' (p. 267, La Naturaleza del Mundo Físico.)x PREFACE La teoría evolutiva fue así principalmente retrograda; el poderoso cuerpo de investigaciones mendelianas en todo el mundo ha evidentemente superado las falacias con las que fue inicialmente fomentada. Como pionero de la genética, ha hecho más que suficiente para expiar las polémicas precipitadas de sus primeros escritos. Tratar la selección natural como un agente basado independientemente en sus propias fundaciones no es minimizar su importancia en la teoría de la evolución. Por el contrario, tan pronto como requerimos formar opiniones por otros medios que mediante comparación y analogía, tal base deductiva independiente se convierte en una necesidad. Esta necesidad es particularmente que se note para la humanidad; ya que tenemos algún conocimiento de la estructura de la sociedad, de los motivos humanos y de las estadísticas vitales de esta especie, el uso del método deductivo puede suministrar un conocimiento más íntimo de los procesos evolutivos que es posible en otro lugar. Además, será de importancia para nuestro tema llamar la atención a varias consecuencias del principio de la selección natural, las cuales, ya que no consisten en la modificación adaptativa de formas específicas, han necesariamente escapado a la atención. Los fenómenos genéticos de dominancia y ligadura parecen ofrecer ejemplos de esta clase, la futura investigación de los cuales puede añadir grandemente al alcance de nuestro tema. Ningún esfuerzo mío podría valer para hacer el libro una lectura fácil. He procurado asistir al lector dando breves resúmenes al final de todos los capítulos, excepto el Capítulo IV, que se resume conjuntamente con el Capítulo V. Aquellos que prefieran hacerlo pueden considerar el Capítulo IV como un apéndice matemático a la parte correspondiente del resumen. Las deducciones respecto al Hombre están estrictamente inseparables de los capítulos más generales, pero han sido colocadas juntas en un grupo que comienza con el Capítulo VIII. Creo que nadie se sorprenderá de que un gran número de los puntos considerados demanden un tratamiento mucho más completo, más riguroso y más comprensivo. Parece imposible que se haga plena justicia al tema de esta manera, hasta que se haya construido una tradición de trabajo matemático dedicado a problemas biológicos, comparable a las investigaciones sobre las cuales un físico matemático puede recurrir en la resolución de dificultades especiales.",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.27468",
    doi = "10.5962/bhl.title.27468",
    openalex = "W2004778468",
    references = "darwin2009the, doi101017cbo9780511693946006, doi101017cbo9780511702884, doi101038033529a0, doi101111j136523111908tb02141x, doi1023071929022, doi1023074345450, doi105962bhltitle121292, doi105962bhltitle61004, doi105962bhltitle87899, openalexw2163836228"
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@book{lovejoy1936the28,
    author = "Lovejoy, A. D",
    title = "The Great Chain of Being",
    year = "1936",
    publisher = "Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lovejoy, A. D., 1936, The Great Chain of Being: Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
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@book{lack1947darwins23,
    author = "Lack, D",
    title = "Darwin's Finches",
    year = "1947",
    publisher = "An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Lack, D., 1947, Darwin's Finches: An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press.}"
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@misc{haldane1949suggestions16,
    author = "Haldane, J. B. S",
    title = "Sugerencias sobre la medición cuantitativa de las tasas de evolución",
    year = "1949",
    howpublished = "Evolución, v. 3, p. 51-56",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Haldane, J. B. S., 1949, Sugerencias sobre la medición cuantitativa de las tasas de evolución: Evolución, v. 3, p. 51-56.}"
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@book{simpson1949the39,
    author = "Simpson, G. G",
    title = "El Significado de la Evolución",
    year = "1949",
    publisher = "New Haven, Connecticut, Yale University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Simpson, G. G., 1949, El Significado de la Evolución: New Haven, Connecticut, Yale University Press.}"
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@article{doi101001jama195002910300087029,
    title = "Factores de la Evolución:. La Teoría de la Selección Estabilizadora",
    year = "1950",
    journal = "Journal of the American Medical Association",
    url = "https://doi.org/10.1001/jama.1950.02910300087029",
    doi = "10.1001/jama.1950.02910300087029",
    openalex = "W1504663309"
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@misc{irvine1955apes19,
    author = "Irvine, W",
    title = "Apes, Angels, and Victorians",
    year = "1955",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Irvine, W., 1955, Apes, Angels, and Victorians: New York, McGraw-Hill.}"
}

@misc{eiseley1958darwins5,
    author = "Eiseley, L. C",
    title = "El Siglo de Darwin",
    year = "1958",
    howpublished = "Evolución y los hombres que la descubrieron: Nueva York, Doubleday",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Eiseley, L. C., 1958, El Siglo de Darwin: Evolución y los hombres que la descubrieron: Nueva York, Doubleday.}"
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@book{glass1959the8,
    author = "Glass, B. O. y Strauss, W. L. y Jr",
    title = "Los precursores de Darwin",
    year = "1959",
    publisher = "1745- 1859: Baltimore, Johns Hopkins Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Glass, B. O., y Strauss, W. L., Jr., 1959, Los precursores de Darwin: 1745- 1859: Baltimore, Johns Hopkins Press.}"
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@inproceedings{lerner1959the25,
    author = "Lerner, I. M",
    title = "El concepto de selección natural",
    year = "1959",
    booktitle = "Una visión centennial: Proceedings of the American Philosophical Society, v. 103, p. 173-182",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lerner, I. M., 1959, El concepto de selección natural: Una visión centennial: Proceedings of the American Philosophical Society, v. 103, p. 173-182.}"
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@book{millhauser1959just32,
    author = "Millhauser, M",
    title = "Just Before Darwin",
    year = "1959",
    publisher = "Robert Chambers and Vestiges: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Millhauser, M., 1959, Just Before Darwin: Robert Chambers and Vestiges: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press.}"
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@misc{scriven1959explanation38,
    author = "Scriven, M",
    title = "Explicación y predicción en la teoría de la evolución",
    year = "1959",
    howpublished = "Science, v. 130, p. 477-482",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Scriven, M., 1959, Explicación y predicción en la teoría de la evolución: Science, v. 130, p. 477-482.}"
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@phdthesis{ross1962a36,
    author = "Ross, HH",
    title = "Una síntesis de la teoría de la evolución",
    year = "1962",
    publisher = "Englewood Cliffs, Nueva Jersey, Prentice-Hall",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ross,, HH, 1962, Una síntesis de la teoría de la evolución: Englewood Cliffs, Nueva Jersey, Prentice-Hall.}"
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@misc{ehrilch1963the4,
    author = "Ehrilch, P. R. y Holm, R. W",
    title = "El proceso de la evolución",
    year = "1963",
    howpublished = "New York, McGraw-Hill, 347 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ehrilch, P. R., y Holm, R. W., 1963, El proceso de la evolución: New York, McGraw-Hill, 347 p.}"
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@misc{gasking1967investigations7,
    author = "Gasking, E",
    title = "Investigations into Generation",
    year = "1967",
    howpublished = "1651-1828: London, Hutchinson",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gasking, E., 1967, Investigations into Generation: 1651-1828: London, Hutchinson.}"
}

@misc{moorehead1969darwin34,
    author = "Moorehead, A",
    title = "Darwin and the Beagle",
    year = "1969",
    howpublished = "London, Hamish Hamilton",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Moorehead, A., 1969, Darwin and the Beagle: London, Hamish Hamilton.}"
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@book{mckinney1971lamarck30,
    author = "McKinney, H. L",
    title = "Lamarck to Darwin",
    year = "1971",
    publisher = "Contributions to Evolutionary Biology, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {McKinney, H. L., 1971, Lamarck to Darwin: Contributions to Evolutionary Biology, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press.}"
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@misc{jukes1972evolutionary21,
    author = "Jukes, T. H. y Holmquist, W. R",
    title = "Relojes evolutivos; no constancia de la tasa en diferentes especies",
    year = "1972",
    howpublished = "Science, v. 177, p. 530-532",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Jukes, T. H., y Holmquist, W. R., 1972, Relojes evolutivos; no constancia de la tasa en diferentes especies: Science, v. 177, p. 530-532.}"
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@book{mckinney1972wallace31,
    author = "McKinney, H. L",
    title = "Wallace y la selección natural",
    year = "1972",
    publisher = "New Haven, Connecticut, Yale University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {McKinney, H. L., 1972, Wallace y la selección natural: New Haven, Connecticut, Yale University Press.}"
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@article{openalexw2145250129,
    author = "Valen, Leigh Van",
    title = "UNA NUEVA LEY DE LA EVOLUCIÓN.",
    year = "1973",
    journal = "Entomología Médica y Zoología",
    openalex = "W2145250129"
}

@misc{vanvalen1973a44,
    author = "Van Valen, L",
    title = "Una nueva ley evolutiva",
    year = "1973",
    howpublished = "Teoría Evolutiva, v. 1, p. 1-30",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Van Valen, L., 1973, Una nueva ley evolutiva: Teoría Evolutiva, v. 1, p. 1-30.}"
}

@article{doi101111j155856461975tb00851x,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE GENÉTICA DE LA BASE DEL CAMBIO EVOLUCIONISTA",
    year = "1975",
    journal = "Evolución",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    openalex = "W1547248981"
}

@misc{maynardsmith1975the29,
    author = "Maynard Smith, J",
    title = "The Theory of Evolution [3rd ed.]",
    year = "1975",
    howpublished = "New York, Penguin",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Maynard Smith, J., 1975, The Theory of Evolution [3rd ed.]: New York, Penguin.}"
}

@inproceedings{stanley1975a40,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Una teoría de la evolución por encima del nivel de especie",
    year = "1975",
    booktitle = "Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, v. 72, p. 646-650",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Stanley, S. M., 1975, A theory of evolution above the species level: Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, v. 72, p. 646-650.}"
}

@book{crossref1977patterns,
    title = "Patrones de la evolución ilustrados por el registro fósil",
    year = "1977",
    booktitle = "Avances en Paleontología y Estratigrafía",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    doi = "10.1016/s0920-5446(08)x7012-8",
    openalex = "W563635432"
}

@book{gould1977eternal9,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Metáforas Eternas de la Paleontología, en Hallam, A., ed., Patrones de la Evolución Ilustrados por el Registro Fósil",
    year = "1977",
    publisher = "Ámsterdam, Elsevier, p. 1-26",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gould, S. J., 1977, Metáforas Eternas de la Paleontología, en Hallam, A., ed., Patrones de la Evolución Ilustrados por el Registro Fósil: Ámsterdam, Elsevier, p. 1-26.}"
}

@misc{gould1977the15,
    author = "Gould, S. J. y Raup, D. M. y Sepkoski, J. J. y Schopf, T. J. M. y Simberloff, D. S",
    title = "La forma de la evolución",
    year = "1977",
    howpublished = "Una comparación de clados reales y aleatorios: Paleobiología, v. 3, p. 23-40",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gould, S. J., Raup, D. M., Sepkoski, J. J., Schopf, T. J. M., y Simberloff, D. S., 1977, La forma de la evolución: Una comparación de clados reales y aleatorios: Paleobiología, v. 3, p. 23-40.}"
}

@book{hallam1977patterns17,
    author = "Hallam, A",
    title = "Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil, 5 de Desarrollos en Paleontología y Estratigrafía",
    year = "1977",
    publisher = "Ámsterdam, Elsevier",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Hallam, A., 1977, Patrones de evolución ilustrados por el registro fósil, 5 de Desarrollos en Paleontología y Estratigrafía: Ámsterdam, Elsevier.}"
}

@book{hanson1977the18,
    author = "Hanson, E. D",
    title = "El Origen y la Evolución Temprana de los Animales",
    year = "1977",
    publisher = "Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hanson, E. D., 1977, El Origen y la Evolución Temprana de los Animales: Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press.}"
}

@article{doi101038scientificamerican117998,
    author = "Kimura, Motoo",
    title = "La Teoría Neutral de la Evolución Molecular",
    year = "1979",
    journal = "Scientific American",
    url = "https://doi.org/10.1038/scientificamerican1179-98",
    doi = "10.1038/scientificamerican1179-98",
    openalex = "W2045391589"
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@techreport{schwartz1979models37,
    author = "Schwartz, J. H. y Rollins, H. B",
    title = "Modelos y metodologías en la teoría de la evolución, 13 de Bulletin of Carnegie Museum of Natural History",
    year = "1979",
    howpublished = "Pittsburgh, Pa",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Schwartz, J. H., y Rollins, H. B., 1979, Modelos y metodologías en la teoría de la evolución, 13 de Bulletin of Carnegie Museum of Natural History: Pittsburgh, Pa.}"
}

@misc{stanley1979macroevolution41,
    author = "Stanley, S. M",
    title = "Macroevolución",
    year = "1979",
    howpublished = "Pattern and Process: San Francisco, W.H. Freeman",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Stanley, S. M., 1979, Macroevolución: Pattern and Process: San Francisco, W.H. Freeman.}"
}

@article{doi101007bf01731581,
    author = "Kimura, Motoo",
    title = "Un método sencillo para estimar las tasas evolutivas de sustituciones de bases mediante estudios comparativos de secuencias de nucleótidos",
    year = "1980",
    journal = "Journal of Molecular Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf01731581",
    doi = "10.1007/bf01731581",
    openalex = "W2065461553",
    references = "doi101007bf01653945, doi101007bf01732067, doi101007bf01732340, doi101016b9781483232119500097, doi101016s0021925817401566, doi101038217624a0, doi101038267275a0, doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas7172848, doi101126science1643881788"
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@misc{lewin1980evolutionary26,
    author = "Lewin, R",
    title = "Teoría de la evolución bajo ataque",
    year = "1980",
    howpublished = "Science, v. 210, p. 883-887",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lewin, R., 1980, Teoría de la evolución bajo ataque: Science, v. 210, p. 883-887.}"
}

Se presenta un enfoque teórico para el análisis de factores históricos (Raup 1972) en la morfología evolutiva que aborda hipótesis transformacionales sobre sistemas estructurales. Este enfoque (estructural) para probar hipótesis históricas sobre las restricciones filogenéticas en la forma y función y la versatilidad estructural y funcional implica (1) la reconstrucción de conjuntos anidados de características estructurales en taxones monofiléticos, (2) el uso de propiedades organizativas generales o emergentes de sistemas estructurales y funcionales (en contraposición a características morfológicas derivadas de manera única), y (3) el examen comparativo de las consecuencias para la diversidad estructural y funcional de estas características generales en taxones monofiléticos relacionados. Se consideran tres ejemplos de propiedades organizativas emergentes: complejidad estructural, repetición de partes y el desacoplamiento de sistemas primitivamente restringidos. Se proponen dos clases de hipótesis sobre la evolución del diseño. Las hipótesis transformacionales se refieren a las vías históricas de cambio en la forma como consecuencia de características organizativas generales que son primitivas para una línea. Las hipótesis relacionales implican correlaciones entre redes estructura-función primitivas para un clado y la diversidad morfológica tanto entre como dentro de taxones terminales. En la medida en que las hipótesis transformacionales y relacionales sobre la forma se corroboran, proporcionan evidencia de una regularidad subyacente en la transformación del diseño orgánico que puede ser una consecuencia de la organización jerárquica de patrones estructurales y funcionales en los organismos.

@article{doi101017s0094837300025495,
    author = "Lauder, George",
    title = "Form and function: structural analysis in evolutionary morphology",
    year = "1981",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Se presenta un enfoque teórico para el análisis de factores históricos (Raup 1972) en la morfología evolutiva que aborda hipótesis transformacionales sobre sistemas estructurales. Este enfoque (estructural) para probar hipótesis históricas sobre las restricciones filogenéticas en la forma y función y la versatilidad estructural y funcional implica (1) la reconstrucción de conjuntos anidados de características estructurales en taxones monofiléticos, (2) el uso de propiedades organizativas generales o emergentes de sistemas estructurales y funcionales (en contraposición a características morfológicas derivadas de manera única), y (3) el examen comparativo de las consecuencias para la diversidad estructural y funcional de estas características generales en taxones monofiléticos relacionados. Se consideran tres ejemplos de propiedades organizativas emergentes: complejidad estructural, repetición de partes y el desacoplamiento de sistemas primitivamente restringidos. Se proponen dos clases de hipótesis sobre la evolución del diseño. Las hipótesis transformacionales se refieren a las vías históricas de cambio en la forma como consecuencia de características organizativas generales que son primitivas para una línea. Las hipótesis relacionales implican correlaciones entre redes estructura-función primitivas para un clado y la diversidad morfológica tanto entre como dentro de taxones terminales. En la medida en que las hipótesis transformacionales y relacionales sobre la forma se corroboran, proporcionan evidencia de una regularidad subyacente en la transformación del diseño orgánico que puede ser una consecuencia de la organización jerárquica de patrones estructurales y funcionales en los organismos.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300025495",
    doi = "10.1017/s0094837300025495",
    openalex = "W2275850409",
    references = "doi101111j155856461965tb01720x, doi1023072412293, doi1023072412953, doi107312crac92306005, openalexw1869415094, openalexw2128666103"
}

@book{eldredge1981phylogenetic6,
    author = "Eldredge, N. y Cracraft, J",
    title = "Patrones Filogenéticos y el Proceso Evolutivo",
    year = "1981",
    publisher = "Método y Teoría en Biología Comparativa: Nueva York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Eldredge, N., y Cracraft, J., 1981, Patrones Filogenéticos y el Proceso Evolutivo: Método y Teoría en Biología Comparativa: Nueva York, Columbia University Press.}"
}

@misc{jaanusson1981functional20,
    author = "Jaanusson, V",
    title = "Umbrales funcionales en el progreso evolutivo",
    year = "1981",
    howpublished = "Lethaia, v. 14, p. 251-260",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Jaanusson, V., 1981, Umbrales funcionales en el progreso evolutivo: Lethaia, v. 14, p. 251-260.}"
}

@misc{lewin1981no27,
    author = "Lewin, R",
    title = "No gap here in the fossil record",
    year = "1981",
    howpublished = "Science, v. 214, p. 645-646",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lewin, R., 1981, No gap here in the fossil record: Science, v. 214, p. 645-646.}"
}

@book{ospovat1981the35,
    author = "Ospovat, D",
    title = "El desarrollo de la teoría de Darwin",
    year = "1981",
    publisher = "Historia natural, Teología natural y Selección natural, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ospovat, D., 1981, El desarrollo de la teoría de Darwin: Historia natural, Teología natural y Selección natural, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@phdthesis{stebbins1981is42,
    author = "Stebbins, G. L. y Ayala, F. J",
    title = "¿Es Necesaria una Nueva Síntesis Evolutiva?",
    year = "1981",
    publisher = "Science, v. 213, p. 967-971",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stebbins, G. L., y Ayala, F. J., 1981, ¿Es Necesaria una Nueva Síntesis Evolutiva?: Science, v. 213, p. 967-971.}"
}

Una nueva compilación de datos fósiles sobre familias de invertebrados y vertebrados indica que cuatro extinciones masivas en el ámbito marino son estadísticamente distintas de los niveles de extinción de fondo. Estas cuatro ocurrieron a finales de los períodos Ordovícico, Pérmico, Triásico y Cretácico. Un quinto evento de extinción en el Devónico destaca del fondo pero no es estadísticamente significativo en estos datos. Las tasas de extinción de fondo parecen haber disminuido desde la época Cámbrica, lo cual es consistente con la predicción de que la optimización de la aptitud debería aumentar a través del tiempo evolutivo.

@article{doi101126science21545391501,
    author = "Raup, David M. and Sepkoski, J. John",
    title = "Mass Extinctions in the Marine Fossil Record",
    year = "1982",
    journal = "Science",
    abstract = "A new compilation of fossil data on invertebrate and vertebrate families indicates that four mass extinctions in the marine realm are statistically distinct from background extinction levels. These four occurred late in the Ordovician, Permian, Triassic, and Cretaceous periods. A fifth extinction event in the Devonian stands out from the background but is not statistically significant in these data. Background extinction rates appear to have declined since Cambrian time, which is consistent with the prediction that optimization of fitness should increase through evolutionary time.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.215.4539.1501",
    doi = "10.1126/science.215.4539.1501",
    openalex = "W1976721572",
    references = "doi101017s009483730000511x, doi101017s0094837300006539, doi101130spe89p63, doi105281zenodo16226412, openalexw2335729143, openalexw2591197405, openalexw2596207362"
}

@article{doi1023071936778,
    author = "Lande, Russell",
    title = "Una teoría genética cuantitativa de la evolución de la historia de vida",
    year = "1982",
    journal = "Ecology",
    url = "https://doi.org/10.2307/1936778",
    doi = "10.2307/1936778",
    openalex = "W2089325551",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101086404940, doi101111j146918091957tb01874x, doi101111j155856461980tb04817x"
}

@misc{gould1982darwinism10,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Darwinismo y la expansión de la teoría evolutiva",
    year = "1982",
    howpublished = "Science, v. 216, p. 380-387",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1982, Darwinismo y la expansión de la teoría evolutiva: Science, v. 216, p. 380-387.}"
}

@article{sulloway1982darwin43,
    author = "Sulloway, F",
    title = "Darwin y sus pinzones",
    year = "1982",
    journal = "la evolución de una leyenda: Journal of Historical Biology, v. 15, p. 1-53",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sulloway, F., 1982, Darwin y sus pinzones: la evolución de una leyenda: Journal of Historical Biology, v. 15, p. 1-53.}"
}

Con el objetivo de analizar e interpretar datos sobre polimorfismo de ADN obtenidos mediante secuenciación de ADN o técnica de enzimas de restricción, se desarrolla una teoría matemática sobre la relación evolutiva esperada entre las secuencias de ADN (nucleones) muestreadas, bajo la suposición de que el cambio evolutivo de los nucleones está determinado únicamente por la mutación y la deriva genética aleatoria. Se investiga la propiedad estadística del número de diferencias de nucleótidos entre nucleones elegidos al azar y la de heterocigosidad o diversidad de nucleones utilizando esta teoría. Estos estudios indican que las estimaciones del número promedio de diferencias de nucleótidos y la diversidad de nucleones tienen una gran varianza, y una gran parte de esta varianza se debe a factores estocásticos. Por lo tanto, aumentar el tamaño de la muestra no ayuda a reducir significativamente la varianza. También se estudia la distribución de las frecuencias alélicas (nucleomorfos) de la muestra, y se demuestra que un pequeño número de muestras es suficiente para conocer el patrón de distribución.

@article{doi101093genetics1052437,
    author = "Tajima, Fumio",
    title = "RELACIÓN EVOLUTIVA DE LAS SECUENCIAS DE ADN EN POBLACIONES FINITAS",
    year = "1983",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Con el objetivo de analizar e interpretar datos sobre polimorfismo de ADN obtenidos mediante secuenciación de ADN o técnica de enzimas de restricción, se desarrolla una teoría matemática sobre la relación evolutiva esperada entre las secuencias de ADN (nucleones) muestreadas, bajo la suposición de que el cambio evolutivo de los nucleones está determinado únicamente por la mutación y la deriva genética aleatoria. Se investiga la propiedad estadística del número de diferencias de nucleótidos entre nucleones elegidos al azar y la de heterocigosidad o diversidad de nucleones utilizando esta teoría. Estos estudios indican que las estimaciones del número promedio de diferencias de nucleótidos y la diversidad de nucleones tienen una gran varianza, y una gran parte de esta varianza se debe a factores estocásticos. Por lo tanto, aumentar el tamaño de la muestra no ayuda a reducir significativamente la varianza. También se estudia la distribución de las frecuencias alélicas (nucleomorfos) de la muestra, y se demuestra que un pequeño número de muestras es suficiente para conocer el patrón de distribución.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/105.2.437",
    doi = "10.1093/genetics/105.2.437",
    openalex = "W1928220195",
    references = "doi1010160040580972900354, doi1010160040580974900252, doi1010160040580975900209, doi101017s000186780003994x, doi101073pnas7763605, doi101093genetics1032287, doi101093genetics893583, doi101093genetics971145, doi101111j155856461983tb05528x, doi1023072408186"
}

Artículo de revista Una teoría evolutiva del cambio económico Obtener acceso Una teoría evolutiva del cambio económico. Por Richard R. Nelson y Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts & Londres: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby Universidad de Stirling Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Volumen 93, Número 371, 1 de septiembre de 1983, Páginas 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Publicado: 01 de septiembre de 1983

@article{doi1023072232409,
    author = "Loasby, Brian J. y Nelson, Richard R. y Winter, Sidney G.",
    title = "Una teoría evolutiva del cambio económico.",
    year = "1983",
    journal = "The Economic Journal",
    abstract = "Artículo de revista Una teoría evolutiva del cambio económico Obtener acceso Una teoría evolutiva del cambio económico. Por Richard R. Nelson y Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts \& Londres: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby Universidad de Stirling Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Volumen 93, Número 371, 1 de septiembre de 1983, Páginas 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Publicado: 01 de septiembre de 1983",
    url = "https://doi.org/10.2307/2232409",
    doi = "10.2307/2232409",
    openalex = "W2137358449"
}

@book{bowler1984evolution2,
    author = "Bowler, P. J",
    title = "Evolución",
    year = "1984",
    publisher = "El Historia de una Idea: Berkeley, University of California Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Bowler, P. J., 1984, Evolución: El Historia de una Idea: Berkeley, University of California Press.}"
}

@misc{dodson1985the3,
    author = "Dodson, E. O",
    title = "La teoría de la evolución, en Enciclopedia Britannica [1ª ed.]",
    year = "1985",
    howpublished = "Chicago, Illinois, Encyclopedia Britannica, Inc., v. 18, p. 981-1011",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Dodson, E. O., 1985, La teoría de la evolución, en Enciclopedia Britannica [1ª ed.]: Chicago, Illinois, Encyclopedia Britannica, Inc., v. 18, p. 981-1011.}"
}

Artículo de Revista ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva Obtener acceso ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.2Instituto Médico Howard Hughes, U426, Universidad de California, San Francisco, California 94143, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.3Laboratorio de Genética de Vida Silvestre, Departamento de Ciencias de Vida Silvestre y Pesca, Universidad Texas A & M, College Station, Texas 77843, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.4Departamento de Bioquímica, Universidad Howard, Washington, DC 20059, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caja 60500, S-104 01 Estocolmo, Suecia Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.6Departamento de Zoología, Universidad de Hawái, Honolulu, Hawái 96822, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.7Museo de Zoología de Vertebrados, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar más MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volumen 26, Número 4, Diciembre 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 de junio de 2008 Historial del artículo Aceptado: 01 de julio de 1985 Publicado: 28 de junio de 2008

@article{doi101111j109583121985tb02048x,
    author = "Wilson, Allan C. y Cann, Rebecca L. y Carr, Steven M. y George, Matthew y GYLLENSTEN, ULF B. y Helm‐Bychowski, Kathleen y Higuchi, Russell y Palumbi, Stephen R. y Prager, Ellen M. y Sage, Richard D. y Stoneking, Mark",
    title = "ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva",
    year = "1985",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Artículo de revista ADN mitocondrial y dos perspectivas sobre la genética evolutiva Obtener acceso ALLAN C. WILSON, ALLAN C. WILSON 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar REBECCA L. CANN, REBECCA L. CANN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.2Instituto Médico Howard Hughes, U426, Universidad de California, San Francisco, California 94143, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEVEN M. CARR, STEVEN M. CARR 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.3Laboratorio de Genética de Vida Silvestre, Departamento de Ciencias de Vida Silvestre y Pesca, Universidad Texas A & M, College Station, Texas 77843, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar MATTHEW GEORGE, MATTHEW GEORGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.4Departamento de Bioquímica, Universidad Howard, Washington, DC 20059, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ULF B. GYLLENSTEN, ULF B. GYLLENSTEN 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.5Departamento de Genética Clínica, Hospital Karolinska, Caja 60500, S-104 01 Estocolmo, Suecia Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI, KATHLEEN M. HELM-BYCHOWSKI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RUSSELL G. HIGUCHI, RUSSELL G. HIGUCHI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar STEPHEN R. PALUMBI, STEPHEN R. PALUMBI 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.6Departamento de Zoología, Universidad de Hawái, Honolulu, Hawái 96822, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar ELLEN M. PRAGER, ELLEN M. PRAGER 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar RICHARD D. SAGE, RICHARD D. SAGE 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU.7Museo de Zoología de Vertebrados, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar... Mostrar más MARK STONEKING MARK STONEKING 1Departamento de Bioquímica, Universidad de California, Berkeley, California 94720, EE. UU. Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Biological Journal of the Linnean Society, Volumen 26, Número 4, Diciembre 1985, Páginas 375–400, https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x Publicado: 28 de junio de 2008 Historial del artículo Aceptado: 01 de julio de 1985 Publicado: 28 de junio de 2008",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1985.tb02048.x",
    openalex = "W2065697254",
    references = "doi101038202147a0, doi101073pnas504672, doi101073pnas581142, doi101111j155856461983tb05533x, doi101126science15838051200, doi1023071438156, doi1023072407274, doi107312simp93764, openalexw788933220, sarich1967immunological"
}

@phdthesis{beardsley1986fossil1,
    author = "Beardsley, T",
    title = "Un ave fósil sacude la hipótesis evolutiva",
    year = "1986",
    publisher = "Nature, v. 322, p. 677",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Beardsley, T., 1986, Un ave fósil sacude la hipótesis evolutiva: Nature, v. 322, p. 677.}"
}

Se determinaron y compararon las secuencias de genes de ARNr de subunidad pequeña de los protistas flagelados Euglena gracilis y Trypanosoma brucei con las de otros eucariotas. Se construyó un árbol filogenético en el que la rama más temprana entre los eucariotas está representada por E. gracilis. La divergencia de E. gracilis precede con mucho a un período de radiación evolutiva masiva que dio origen a las plantas, animales, hongos y ciertos grupos de protistas como los ciliados y las acantamoebas. La diversidad genética en esta colección de eucariotas se observa que excede la mostrada dentro de las líneas de descendencia eubacteriana o arqueobacteriana.

@article{doi101073pnas8351383,
    author = "Sogin, M L y Elwood, Hille J. y Gunderson, John H.",
    title = "Diversidad evolutiva de los genes de ARNr de subunidad pequeña eucariota.",
    year = "1986",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Se determinaron y compararon las secuencias de genes de ARNr de subunidad pequeña de los protistas flagelados Euglena gracilis y Trypanosoma brucei con las de otros eucariotas. Se construyó un árbol filogenético en el que la rama más temprana entre los eucariotas está representada por E. gracilis. La divergencia de E. gracilis precede con mucho a un período de radiación evolutiva masiva que dio origen a las plantas, animales, hongos y ciertos grupos de protistas como los ciliados y las acantamoebas. La diversidad genética en esta colección de eucariotas se observa que excede la mostrada dentro de las líneas de descendencia eubacteriana o arqueobacteriana.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.83.5.1383",
    doi = "10.1073/pnas.83.5.1383",
    openalex = "W2062738309"
}

@misc{monastersky1986reining33,
    author = "Monastersky, R",
    title = "Reining in a runaway theory",
    year = "1986",
    howpublished = "Science News, v. 130, p. 374",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Monastersky, R., 1986, Reining in a runaway theory: Science News, v. 130, p. 374.}"
}

@book{doi107312nei92038,
    author = "Nei, Masatoshi",
    title = "Genética Evolutiva Molecular",
    year = "1987",
    booktitle = "Columbia University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.7312/nei-92038",
    doi = "10.7312/nei-92038",
    openalex = "W93588716"
}

@misc{gould1987asymmetry14,
    author = "Gould, S. J. y Gilinsky, N. L. y German, R. Z",
    title = "Asimetría de linajes y las direcciones del tiempo evolutivo",
    year = "1987",
    howpublished = "Science, v. 236, p. 1437-1441",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., Gilinsky, N. L., y German, R. Z., 1987, Asimetría de linajes y las direcciones del tiempo evolutivo: Science, v. 236, p. 1437-1441.}"
}

@misc{gould1987bushes12,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Arbustos hasta el final",
    year = "1987",
    howpublished = "Revista Natural History, v. 96 (junio), p. 12-19",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gould, S. J., 1987, Arbustos hasta el final: Revista Natural History, v. 96 (junio), p. 12-19.}"
}

@misc{gould1987lifes11,
    author = "Gould, S. J",
    title = "La pequeña broma de la vida",
    year = "1987",
    howpublished = "Revista Natural History, v. 96 (abril), p. 16- 25",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Gould, S. J., 1987, La pequeña broma de la vida: Revista Natural History, v. 96 (abril), p. 16- 25.}"
}

@article{doi101007978146847862422,
    author = "Smith, John Maynard",
    title = "Evolución y la teoría de los juegos",
    year = "1988",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4684-7862-4\_22",
    doi = "10.1007/978-1-4684-7862-4\_22",
    openalex = "W1960351623",
    references = "doi101038246015a0, doi101038254463b0, doi105962bhltitle27468, openalexw175750636"
}

@misc{gould1988a13,
    author = "Gould, S. J",
    title = "A web of tales",
    year = "1988",
    howpublished = "Natural History Magazine, v. 97 (October), p. 16-23",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1988, A web of tales: Natural History Magazine, v. 97 (October), p. 16-23.}"
}

Resumen Las preferencias contemporáneas de pareja pueden proporcionar pistas importantes sobre la historia reproductiva humana. Poco se sabe sobre qué características valoran las personas en posibles parejas. Se formularon cinco predicciones sobre las diferencias sexuales en las preferencias de pareja humanas basadas en concepciones evolutivas de la inversión parental, la selección sexual, la capacidad reproductiva humana y las asimetrías sexuales respecto a la certeza de la paternidad frente a la maternidad. Las predicciones se centraron en cómo cada sexo valoraba la capacidad de generar ingresos, la ambición—diligencia, la juventud, la belleza física y la castidad. Las predicciones se probaron con datos de 37 muestras extraídas de 33 países ubicados en seis continentes y cinco islas (N total = 10.047). Para 27 países, los datos demográficos sobre la edad real de matrimonio proporcionaron una verificación de validez de los datos de cuestionario. Se encontró que las mujeres valoran más las señales de adquisición de recursos en posibles parejas que los hombres. Las características que señalan la capacidad reproductiva fueron valoradas más por los hombres que por las mujeres. Estas diferencias sexuales pueden reflejar diferentes presiones de selección evolutiva sobre los hombres y las mujeres humanas; proporcionan evidencia transcultural poderosa de las actuales diferencias sexuales en las estrategias reproductivas. La discusión se centra en los mecanismos proximales subyacentes a las preferencias de pareja, las consecuencias para la competencia intrasexual humana y las limitaciones de este estudio.

@article{doi101017s0140525x00023992,
    author = "Buss, David M.",
    title = "Diferencias sexuales en las preferencias de pareja en humanos: hipótesis evolutivas probadas en 37 culturas",
    year = "1989",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Resumen Las preferencias contemporáneas de pareja pueden proporcionar pistas importantes sobre la historia reproductiva humana. Poco se sabe sobre qué características valoran las personas en posibles parejas. Se formularon cinco predicciones sobre las diferencias sexuales en las preferencias de pareja humanas basadas en concepciones evolutivas de la inversión parental, la selección sexual, la capacidad reproductiva humana y las asimetrías sexuales respecto a la certeza de la paternidad frente a la maternidad. Las predicciones se centraron en cómo cada sexo valoraba la capacidad de generar ingresos, la ambición—diligencia, la juventud, la belleza física y la castidad. Las predicciones se probaron con datos de 37 muestras extraídas de 33 países ubicados en seis continentes y cinco islas (N total = 10.047). Para 27 países, los datos demográficos sobre la edad real de matrimonio proporcionaron una verificación de validez de los datos de cuestionario. Se encontró que las mujeres valoran más las señales de adquisición de recursos en posibles parejas que los hombres. Las características que señalan la capacidad reproductiva fueron valoradas más por los hombres que por las mujeres. Estas diferencias sexuales pueden reflejar diferentes presiones de selección evolutiva sobre los hombres y las mujeres humanas; proporcionan evidencia transcultural poderosa de las actuales diferencias sexuales en las estrategias reproductivas. La discusión se centra en los mecanismos proximales subyacentes a las preferencias de pareja, las consecuencias para la competencia intrasexual humana y las limitaciones de este estudio.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x00023992",
    doi = "10.1017/s0140525x00023992",
    openalex = "W2157338817",
    references = "doi101007978146847862422, doi1010160022519364900384, doi1010160022519366901846, doi1010160162309582900279, doi1010160162309583900274, doi101016s0065260122x00026, doi101017cbo9780511806292, doi101017s0140525x00010128, doi10103711774000, doi10103712293000, doi101038246015a0, doi101038369716c0, doi101086284064, doi101111j155856461957tb02911x, doi101126science327542, doi1011425786, doi1011770022022190211001, doi101537ase188722495, doi1023072393017, doi1023072412191, doi1023072485224, doi1023072576242, doi1023075530, doi102307582242, doi1043249781315129266, doi10432497813151292667, doi1043249781410606266, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw1649242647, openalexw2000871817"
}

Artículo de Revista La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica: Las fuentes fenotípicas de variación entre organismos pueden describirse mediante interruptores del desarrollo y normas de reacción Obtener acceso Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volumen 39, Número 7, Julio/Agosto 1989, Páginas 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Publicado: 01 de agosto de 1989

@article{doi1023071311135,
    author = "Stearns, Stephen C.",
    title = "La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica",
    year = "1989",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Artículo de Revista La Significación Evolutiva de la Plasticidad Fenotípica: Las fuentes fenotípicas de variación entre organismos pueden describirse mediante interruptores del desarrollo y normas de reacción Obtener acceso Stephen C. Stearns Stephen C. Stearns Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volumen 39, Número 7, Julio/Agosto 1989, Páginas 436–445, https://doi.org/10.2307/1311135 Publicado: 01 de agosto de 1989",
    url = "https://doi.org/10.2307/1311135",
    doi = "10.2307/1311135",
    openalex = "W2058670567",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi1015159780691224244, doi1023071439305, doi1023072389364, openalexw1635425035"
}

Resumen Desde Darwin en adelante, ha sido segunda naturaleza para los biólogos evolutivos pensar de manera comparativa porque las comparaciones establecen la generalidad de los fenómenos evolutivos. ¿Frenan los genomas grandes el desarrollo? ¿Qué estilos de vida seleccionan cerebros grandes? ¿Están las tasas de extinción relacionadas con el tamaño corporal? Todas estas son preguntas para el método comparativo, y este libro trata sobre cómo se pueden responder tales preguntas. El primer capítulo profundiza en las preguntas adecuadas para el enfoque comparativo y muestra cómo complementa otros enfoques para la resolución de problemas en la evolución. El segundo capítulo identifica las causas biológicas de la similitud entre especies estrechamente relacionadas para casi cualquier carácter observado. El tercer capítulo discute métodos para reconstruir árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales. El cuarto capítulo se propone desarrollar pruebas estadísticas que determinarán si diferentes caracteres que existen en estados discretos muestran evidencia de evolución correlacionada. El capítulo 5 se centra en análisis comparativos de caracteres que varían continuamente. El capítulo 6 examina la alometría para ejemplificar los temas y métodos discutidos anteriormente, mientras que el último capítulo mira hacia el futuro desarrollo del enfoque comparativo tanto en biología molecular como en biología orgánica.

@book{doi101093oso97801985464120010001,
    author = "Harvey, Paul y Pagel, Mark",
    title = "The Comparative Method in Evolutionary Biology",
    year = "1991",
    abstract = "Resumen Desde Darwin en adelante, ha sido segunda naturaleza para los biólogos evolutivos pensar de manera comparativa porque las comparaciones establecen la generalidad de los fenómenos evolutivos. ¿Frenan los genomas grandes el desarrollo? ¿Qué estilos de vida seleccionan cerebros grandes? ¿Están las tasas de extinción relacionadas con el tamaño corporal? Todas estas son preguntas para el método comparativo, y este libro trata sobre cómo se pueden responder tales preguntas. El primer capítulo profundiza en las preguntas adecuadas para el enfoque comparativo y muestra cómo complementa otros enfoques para la resolución de problemas en la evolución. El segundo capítulo identifica las causas biológicas de la similitud entre especies estrechamente relacionadas para casi cualquier carácter observado. El tercer capítulo discute métodos para reconstruir árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales. El cuarto capítulo se propone desarrollar pruebas estadísticas que determinarán si diferentes caracteres que existen en estados discretos muestran evidencia de evolución correlacionada. El capítulo 5 se centra en análisis comparativos de caracteres que varían continuamente. El capítulo 6 examina la alometría para ejemplificar los temas y métodos discutidos anteriormente, mientras que el último capítulo mira hacia el futuro desarrollo del enfoque comparativo tanto en biología molecular como en biología orgánica.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    openalex = "W4388245928"
}

Nuestra comprensión de la evolución se basa en un trípode darwiniano de tres observaciones fundamentales: (1) los organismos vivos son unidades de organización que se reproducen; (2) los individuos difieren entre sí, y algunas de sus diferencias son heredables, y (3) en una población, los individuos disfrutan de diferentes grados de éxito reproductivo basado al menos en parte en estas diferencias heredables. Esta reproducción diferencial es lo que se entiende por selección natural.

@incollection{goldsmith1991evolutionary,
    author = "Goldsmith, Timothy H",
    title = "Teoría evolutiva desde Darwin",
    year = "1991",
    booktitle = "Las raíces biológicas de la naturaleza humana",
    abstract = "Nuestra comprensión de la evolución se basa en un trípode darwiniano de tres observaciones fundamentales: (1) los organismos vivos son unidades de organización que se reproducen; (2) los individuos difieren entre sí, y algunas de sus diferencias son heredables, y (3) en una población, los individuos disfrutan de diferentes grados de éxito reproductivo basado al menos en parte en estas diferencias heredables. Esta reproducción diferencial es lo que se entiende por selección natural.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195062885.003.0003",
    doi = "10.1093/oso/9780195062885.003.0003",
    openalex = "W4388079806",
    pages = "23-45"
}

El método comparativo para estudiar la adaptación ¿por qué preocuparse por la filogenia? reconstrucción de árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales análisis comparativo de datos discretos análisis comparativo de variables continuas determinación de la forma de las relaciones comparativas.

@article{doi105860choice295104,
    title = "El método comparativo en biología evolutiva",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "El método comparativo para estudiar la adaptación ¿por qué preocuparse por la filogenia? reconstrucción de árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales análisis comparativo de datos discretos análisis comparativo de variables continuas determinación de la forma de las relaciones comparativas.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.29-5104",
    doi = "10.5860/choice.29-5104",
    openalex = "W1488393970"
}

Un marco filogenético inferido a partir de comparaciones de secuencias de ARN ribosómico de subunidad pequeña describe el origen evolutivo y los patrones de ramificación temprana del reino Animalia. Los análisis de máxima verosimilitud muestran que la línea animal es monofilética e incluye a los coliflagelados. Dentro del ensamblaje metazoano, la divergencia de las esponjas es seguida por los Ctenóforos, los Cnidarios más el placozoario Trichoplax adhaerens, y finalmente por una policotomía no resuelta de los filos de animales bilaterales. A partir de estos datos, se inferió que los animales y los hongos comparten un historial evolutivo único y que su último ancestro común fue un protista flagelado similar a los coliflagelados existentes.

@article{doi101126science8469985,
    author = "Wainright, Patricia O. y Hinkle, Gregory y Sogin, Mitchell L. y Stickel, Shawn K.",
    title = "Orígenes monofiléticos de los Metazoa: un vínculo evolutivo con los hongos",
    year = "1993",
    journal = "Science",
    abstract = "Un marco filogenético inferido a partir de comparaciones de secuencias de ARN ribosómico de subunidad pequeña describe el origen evolutivo y los patrones de ramificación temprana del reino Animalia. Los análisis de máxima verosimilitud muestran que la línea animal es monofilética e incluye a los coliflagelados. Dentro del ensamblaje metazoano, la divergencia de las esponjas es seguida por los Ctenóforos, los Cnidarios más el placozoario Trichoplax adhaerens, y finalmente por una policotomía no resuelta de los filos de animales bilaterales. A partir de estos datos, se inferió que los animales y los hongos comparten un historial evolutivo único y que su último ancestro común fue un protista flagelado similar a los coliflagelados existentes.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.8469985",
    doi = "10.1126/science.8469985",
    openalex = "W2034733986",
    references = "doi101126science3277277, openalexw2076004673"
}

Introducción. Grupos basales. Monera (bacterias algas verde-azules). Hongos. Algas. Animales: Invertebrados. Protozoos. Poríferos. Celenterados. Moluscos: Amphineura y Monoplacóforos. Moluscos: Gasterópodos. Moluscos: Cefalópodos (Nautiloideos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos prejurásicos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos: Filoceratinos, Litoceratinos, Ammonitinos, Anciloceratinos). Moluscos: Cefalópodos (Coleoideos). Moluscos: Rostroconchios, Escapópodos y Bivalvos. Moluscos: incertae sedis. Anélidos. Artrópodos (Trilobites). Artrópodos (Aglaspididos, Quelicerados, Pycnogonidos). Artrópodos (Crustáceos, excluyendo Ostrácodos). Artrópodos (Crustáceos: Ostrácodos). Artrópodos (Euticarcinoideos y Milpiados). Artrópodos (Hexápodos: Insectos). Briozoos. Equinodermos. Deuterostomios basales (quetognatos, hemiordados, calcicordados, cefalocordados y tunicados). Graptolitos. Problemáticos. Miscelánea. Animales: Vertebrados. Conodontos. Agnatos. Placodermos. Acanthodios. Condrictios. Osteictios: actinopterigios basales. Osteictios: Teleósteos. Osteictios: Sarcopterigios. Tetrapodos de grado anfibio. Reptiles. Aves. Mamíferos. Plantas. Briofitas. Pteridofitas. Gimnospermas. Magnoliófitas (Angiospermas). Índice.

@book{openalexw1599677799,
    author = "Benton, Michael J.",
    title = "The fossil record 2",
    year = "1993",
    abstract = "Introducción. Grupos basales. Monera (bacterias algas verde-azules). Hongos. Algas. Animales: Invertebrados. Protozoos. Poríferos. Celenterados. Moluscos: Amphineura y Monoplacóforos. Moluscos: Gasterópodos. Moluscos: Cefalópodos (Nautiloideos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos prejurásicos). Moluscos: Cefalópodos (Ammonoideos: Filoceratinos, Litoceratinos, Ammonitinos, Anciloceratinos). Moluscos: Cefalópodos (Coleoideos). Moluscos: Rostroconchios, Escapópodos y Bivalvos. Moluscos: incertae sedis. Anélidos. Artrópodos (Trilobites). Artrópodos (Aglaspididos, Quelicerados, Pycnogonidos). Artrópodos (Crustáceos, excluyendo Ostrácodos). Artrópodos (Crustáceos: Ostrácodos). Artrópodos (Euticarcinoideos y Milpiados). Artrópodos (Hexápodos: Insectos). Briozoos. Equinodermos. Deuterostomios basales (quetognatos, hemiordados, calcicordados, cefalocordados y tunicados). Graptolitos. Problemáticos. Miscelánea. Animales: Vertebrados. Conodontos. Agnatos. Placodermos. Acanthodios. Condrictios. Osteictios: actinopterigios basales. Osteictios: Teleósteos. Osteictios: Sarcopterigios. Tetrapodos de grado anfibio. Reptiles. Aves. Mamíferos. Plantas. Briofitas. Pteridofitas. Gimnospermas. Magnoliófitas (Angiospermas). Índice.",
    openalex = "W1599677799"
}

@book{doi1010079781461523819,
    author = "Avise, John C.",
    title = "Marcadores Moleculares, Historia Natural y Evolución",
    year = "1994",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4615-2381-9",
    doi = "10.1007/978-1-4615-2381-9",
    openalex = "W2037882155"
}

Informamos sobre una nueva transformación, la LogDet, que es consistente para secuencias con composición de nucleótidos diferente y que han surgido bajo modelos estocásticos simples pero asimétricos de evolución. Esta transformación es necesaria porque los métodos existentes tienden a agrupar secuencias en función de su composición de nucleótidos, independientemente de su historia evolutiva. Este efecto de las frecuencias de nucleótidos diferentes se ilustra utilizando un criterio de selección de árboles sobre una medida de distancia simple definida únicamente en función de la composición de bases, independiente de las secuencias reales. La nueva transformación LogDet utiliza determinantes de las matrices de divergencia observadas y funciona porque la multiplicación de determinantes (números reales) es conmutativa, mientras que la multiplicación de matrices no lo es, excepto en casos simétricos especiales. El uso de determinantes permite así modelos más generales de evolución con tasas simétricas de cambio de nucleótidos. La transformación se ilustra con un conjunto de datos teórico (donde los métodos existentes seleccionan el árbol incorrecto) y con tres conjuntos de datos biológicos: cloroplastos, aves/mamíferos (nucleares) y abejas melíferas (mitocondriales). La transformación LogDet refuerza la distinción lógica entre transformaciones sobre los datos y criterios de selección de árboles. Las conclusiones generales de este estudio son que las composiciones irregulares de A,C,G,T son una causa importante y posible general de patrones que pueden engañar a los métodos de reconstrucción de árboles, incluso cuando se obtienen valores de bootstrap altos. En consecuencia, muchos estudios publicados pueden necesitar ser reexaminados.

@article{doi101093oxfordjournalsmolbeva040136,
    author = "Lockhart, Peter J. and Steel, Mike and Hendy, Michael D. and Penny, David",
    title = "Recovering evolutionary trees under a more realistic model of sequence evolution.",
    year = "1994",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Informamos sobre una nueva transformación, la LogDet, que es consistente para secuencias con composición de nucleótidos diferente y que han surgido bajo modelos estocásticos simples pero asimétricos de evolución. Esta transformación es necesaria porque los métodos existentes tienden a agrupar secuencias en función de su composición de nucleótidos, independientemente de su historia evolutiva. Este efecto de las frecuencias de nucleótidos diferentes se ilustra utilizando un criterio de selección de árboles sobre una medida de distancia simple definida únicamente en función de la composición de bases, independiente de las secuencias reales. La nueva transformación LogDet utiliza determinantes de las matrices de divergencia observadas y funciona porque la multiplicación de determinantes (números reales) es conmutativa, mientras que la multiplicación de matrices no lo es, excepto en casos simétricos especiales. El uso de determinantes permite así modelos más generales de evolución con tasas simétricas de cambio de nucleótidos. La transformación se ilustra con un conjunto de datos teórico (donde los métodos existentes seleccionan el árbol incorrecto) y con tres conjuntos de datos biológicos: cloroplastos, aves/mamíferos (nucleares) y abejas melíferas (mitocondriales). La transformación LogDet refuerza la distinción lógica entre transformaciones sobre los datos y criterios de selección de árboles. Las conclusiones generales de este estudio son que las composiciones irregulares de A,C,G,T son una causa importante y posible general de patrones que pueden engañar a los métodos de reconstrucción de árboles, incluso cuando se obtienen valores de bootstrap altos. En consecuencia, muchos estudios publicados pueden necesitar ser reexaminados.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.molbev.a040136",
    openalex = "W2162443218",
    references = "doi101093oxfordjournalsmolbeva040752, doi101093oxfordjournalsmolbeva040771, doi101126science3277277"
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@article{crossref1995systematics,
    title = "Sistemática y el registro fósil: documentando patrones evolutivos",
    year = "1995",
    journal = "Choice Reviews Online",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.32-3881",
    doi = "10.5860/choice.32-3881",
    number = "07",
    openalex = "W626899126",
    pages = "32-3881-32-3881",
    volume = "32"
}

@article{doi101006mpev19980495,
    author = "Goodman, Morris y Porter, Calvin A. y Czelusniak, John y Page, Scott L. y Schneider, Horacio y Shoshani, Jeheskel y Gunnell, Gregg F. y Groves, Colin P.",
    title = "Hacia una clasificación filogenética de los primates basada en evidencia de ADN complementada por evidencia fósil",
    year = "1998",
    journal = "Molecular Phylogenetics and Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1006/mpev.1998.0495",
    doi = "10.1006/mpev.1998.0495",
    openalex = "W2058993504",
    references = "crossref1995systematics, doi102110pec9504, doi102110pec9554, doi1023071375443, doi1023072412685, doi1043249781315081083, doi105281zenodo18028696, doi105860choice323881, doi105860choice352112, openalexw1964182146"
}

@article{doi10103844766,
    author = "Pagel, Mark",
    title = "Inferir los patrones históricos de la evolución biológica",
    year = "1999",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/44766",
    doi = "10.1038/44766",
    openalex = "W2114525641",
    references = "doi101016s0092867400803104, doi10103818872, doi101038366223a0, doi101038384055a0, doi101086284325, doi101086286013, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio41118, doi101098rspb19940006, doi101111j146364091997tb00423x, doi101126science2740904, doi101126science2765313734, doi101128mr5122212711987, doi1015159781503621534, doi1023072407154, doi1023072485224, doi105860choice295104, rambaut1998estimating"
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@book{doi102307jctvjsf433,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory",
    year = "2002",
    booktitle = "Harvard University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctvjsf433",
    doi = "10.2307/j.ctvjsf433",
    openalex = "W4300925890"
}

* *1. Definiendo y Revisando la Estructura de la Teoría de la Evolución * Parte I: La Historia de la Lógica Darwiniana y el Debate *2. La Esencia del Darwinismo y la Base de la Ortodoxia Moderna: Una Exégesis del Origen de las Especies *3. Semillas de Jerarquía *4. Internalismo y Leyes de la Forma: Alternativas Pre-Darwinianas al Funcionalismo *5. Las Facetas Fructíferas del Poliedro de Galton: Canales y Saltaciones en el Formalismo Post-Darwiniano *6. Patrón y Progreso en el Escenario Geológico *7. La Síntesis Moderna como un Consenso Limitado * Parte II: Hacia una Teoría Evolutiva Revisada y Ampliada *8. Especies como Individuos en la Teoría Jerárquica de la Selección *9. Equilibrio Puntuado y la Validación de la Teoría Macroevolutiva *10. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en Ontogenia y Filogenia: Restricciones Históricas y la Evolución del Desarrollo *11. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en Ontogenia y Filogenia: Restricciones Estructurales, Spandrels, y la Centralidad de la Exaptación en la Macroevolución *12. Niveles de Tiempo y Pruebas del Extrapolacionismo, Con un Epílogo sobre la Interacción de la Teoría General e Historia Contingente * Bibliografía * Índice

@article{doi105860choice396411,
    author = "Gould, Stephen Jay",
    title = "The structure of evolutionary theory",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "* *1. Definiendo y Revisando la Estructura de la Teoría de la Evolución * Parte I: La Historia de la Lógica Darwiniana y el Debate *2. La Esencia del Darwinismo y la Base de la Ortodoxia Moderna: Una Exégesis del Origen de las Especies *3. Semillas de Jerarquía *4. Internalismo y Leyes de la Forma: Alternativas Pre-Darwinianas al Funcionalismo *5. Las Facetas Fructíferas del Poliedro de Galton: Canales y Saltaciones en el Formalismo Post-Darwiniano *6. Patrón y Progreso en el Escenario Geológico *7. La Síntesis Moderna como un Consenso Limitado * Parte II: Hacia una Teoría Evolutiva Revisada y Ampliada *8. Especies como Individuos en la Teoría Jerárquica de la Selección *9. Equilibrio Puntuado y la Validación de la Teoría Macroevolutiva *10. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en Ontogenia y Filogenia: Restricciones Históricas y la Evolución del Desarrollo *11. La Integración de la Restricción y la Adaptación (Estructura y Función) en Ontogenia y Filogenia: Restricciones Estructurales, Spandrels, y la Centralidad de la Exaptación en la Macroevolución *12. Niveles de Tiempo y Pruebas del Extrapolacionismo, Con un Epílogo sobre la Interacción de la Teoría General e Historia Contingente * Bibliografía * Índice",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-6411",
    doi = "10.5860/choice.39-6411",
    openalex = "W1539968307"
}

Las observaciones epidemiológicas han llevado a la hipótesis de que el riesgo de desarrollar algunas enfermedades crónicas no transmisibles en la edad adulta está influenciado no solo por factores genéticos y de estilo de vida adulto, sino también por factores ambientales que actúan en la vida temprana. La investigación en biología evolutiva, biología del desarrollo y fisiología animal y humana proporciona apoyo a esta idea y sugiere que los procesos ambientales que influyen en la propensión a la enfermedad en la edad adulta operan durante las fases periconceptuales, fetales e infantiles de la vida. Este concepto de "orígenes del desarrollo de la salud y la enfermedad" puede tener importantes implicaciones biológicas, médicas y socioculturales.

@article{doi101126science1095292,
    author = "Gluckman, Peter D. y Hanson, Mark A.",
    title = "Vivir con el pasado: Evolución, Desarrollo y Patrones de Enfermedad",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = {Las observaciones epidemiológicas han llevado a la hipótesis de que el riesgo de desarrollar algunas enfermedades crónicas no transmisibles en la edad adulta está influenciado no solo por factores genéticos y de estilo de vida adulto, sino también por factores ambientales que actúan en la vida temprana. La investigación en biología evolutiva, biología del desarrollo y fisiología animal y humana proporciona apoyo a esta idea y sugiere que los procesos ambientales que influyen en la propensión a la enfermedad en la edad adulta operan durante las fases periconceptuales, fetales e infantiles de la vida. Este concepto de "orígenes del desarrollo de la salud y la enfermedad" puede tener importantes implicaciones biológicas, médicas y socioculturales.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1095292",
    doi = "10.1126/science.1095292",
    openalex = "W2125089843",
    references = "doi105694j132653771958tb86500x"
}

La historia evolutiva de un conjunto de taxones suele representarse mediante un árbol filogenético, y este modelo ha facilitado enormemente la discusión y la prueba de hipótesis. Sin embargo, es bien sabido que los escenarios evolutivos más complejos no se describen bien con tales modelos. Además, incluso cuando la evolución progresa de manera arborescente, el análisis de los datos puede no beneficiarse de métodos que imponen una estructura de árbol, sino de una visualización más rica de los datos para evaluar sus propiedades, al menos como un primer paso esencial. Por lo tanto, se deben emplear redes filogenéticas cuando se cree que están involucrados eventos reticulados como la hibridación, el transferencia horizontal de genes, la recombinación o la duplicación y pérdida de genes, y, incluso en ausencia de tales eventos, las redes filogenéticas tienen un papel útil que desempeñar. Este artículo revisa la terminología utilizada para las redes filogenéticas y abarca tanto las redes de división como las redes reticuladas, cómo se definen y cómo pueden interpretarse. Además, el artículo traza los inicios de un marco estadístico integral para aplicar métodos de redes de división. Mostramos cómo las redes de división pueden representar conjuntos de confianza de árboles e introducimos una prueba estadística conservadora para determinar si la señal conflictiva en una red es arborescente. Finalmente, este artículo describe un nuevo programa, SplitsTree4, una herramienta interactiva e integral para inferir diferentes tipos de redes filogenéticas a partir de secuencias, distancias y árboles.

@article{doi101093molbevmsj030,
    author = "Huson, Daniel H. y Bryant, David",
    title = "Aplicación de redes filogenéticas en estudios evolutivos",
    year = "2005",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "La historia evolutiva de un conjunto de taxones suele representarse mediante un árbol filogenético, y este modelo ha facilitado enormemente la discusión y la prueba de hipótesis. Sin embargo, es bien sabido que los escenarios evolutivos más complejos no se describen bien con tales modelos. Además, incluso cuando la evolución progresa de manera arborescente, el análisis de los datos puede no beneficiarse de métodos que imponen una estructura de árbol, sino de una visualización más rica de los datos para evaluar sus propiedades, al menos como un primer paso esencial. Por lo tanto, se deben emplear redes filogenéticas cuando se cree que están involucrados eventos reticulados como la hibridación, el transferencia horizontal de genes, la recombinación o la duplicación y pérdida de genes, y, incluso en ausencia de tales eventos, las redes filogenéticas tienen un papel útil que desempeñar. Este artículo revisa la terminología utilizada para las redes filogenéticas y abarca tanto las redes de división como las redes reticuladas, cómo se definen y cómo pueden interpretarse. Además, el artículo traza los inicios de un marco estadístico integral para aplicar métodos de redes de división. Mostramos cómo las redes de división pueden representar conjuntos de confianza de árboles e introducimos una prueba estadística conservadora para determinar si la señal conflictiva en una red es arborescente. Finalmente, este artículo describe un nuevo programa, SplitsTree4, una herramienta interactiva e integral para inferir diferentes tipos de redes filogenéticas a partir de secuencias, distancias y árboles.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msj030",
    doi = "10.1093/molbev/msj030",
    openalex = "W2055298722",
    references = "doi101016s0169534700020267, doi101038nrg929, doi10108010635150390235520, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101093molbevmsi111, doi101093sysbio463523, doi101111j155856461985tb00420x"
}

Los murciélagos constituyen más del 20% de los mamíferos existentes, sin embargo, su historia evolutiva es en gran parte desconocida debido a un registro fósil limitado y filogenias conflictivas o incompletas. Aquí, presentamos una filogenia molecular altamente resuelta para todas las familias de murciélagos existentes. Nuestros resultados apoyan la hipótesis de que los megabatos están anidados entre cuatro linajes principales de microbatos, que originaron en el Eoceno temprano [de 52 a 50 millones de años atrás (Mya)], coincidiendo con un aumento global significativo en la temperatura, un aumento en la diversidad y abundancia de plantas, y el cenit de la diversidad de insectos del Terciario. Nuestros datos sugieren que los murciélagos originaron en Laurasia, posiblemente en América del Norte, y que tres de los linajes principales de microbatos son de origen Laurásico, mientras que el cuarto es de origen Gondwaniano. Combinando principios del análisis de linaje fantasma con fechas de divergencia molecular, estimamos que el registro fósil de murciélagos subestima (longitud de rama basal no representada, UBBL) las primeras ocurrencias en un promedio del 73% y que la suma de la historia fósil faltante es del 61%.

@article{doi101126science1105113,
    author = "Teeling, Emma C. y Springer, Mark S. y Madsen, Ole y Bates, Paul J. J. y O'Brien, Stephen J. y Murphy, William J.",
    title = "Una Filogenia Molecular para los Murciélagos Ilumina la Biogeografía y el Registro Fósil",
    year = "2005",
    journal = "Science",
    abstract = "Los murciélagos constituyen más del 20% de los mamíferos existentes, sin embargo, su historia evolutiva es en gran parte desconocida debido a un registro fósil limitado y filogenias conflictivas o incompletas. Aquí, presentamos una filogenia molecular altamente resuelta para todas las familias de murciélagos existentes. Nuestros resultados apoyan la hipótesis de que los megabatos están anidados entre cuatro linajes principales de microbatos, que originaron en el Eoceno temprano [de 52 a 50 millones de años atrás (Mya)], coincidiendo con un aumento global significativo en la temperatura, un aumento en la diversidad y abundancia de plantas, y el cenit de la diversidad de insectos del Terciario. Nuestros datos sugieren que los murciélagos originaron en Laurasia, posiblemente en América del Norte, y que tres de los linajes principales de microbatos son de origen Laurásico, mientras que el cuarto es de origen Gondwaniano. Combinando principios del análisis de linaje fantasma con fechas de divergencia molecular, estimamos que el registro fósil de murciélagos subestima (longitud de rama basal no representada, UBBL) las primeras ocurrencias en un promedio del 73% y que la suma de la historia fósil faltante es del 61%.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1105113",
    doi = "10.1126/science.1105113",
    openalex = "W1997655974",
    references = "doi101007bf01454359, doi101017cbo9780511529924, doi10103835003188, doi10103835055536, doi101073pnas0334222100, doi101073pnas111551998, doi101126science1067179, doi101126science11536548, doi101126science15437541333, doi101126science28454232153, doi1023071223169"
}

La ciencia biomédica ha considerado poco la relevancia de la teoría de la historia de vida y la biología del desarrollo evolutiva y ecológica para la medicina clínica. Sin embargo, las observaciones de que las influencias tempranas de la vida pueden alterar el riesgo de enfermedades posteriores--el paradigma de los "orígenes del desarrollo de la salud y la enfermedad" (DOHaD)--han llevado a reconocer que estas perspectivas pueden informar nuestra comprensión de la biología humana. Proponemos que el fenómeno DOHaD puede considerarse como un subconjunto de los procesos más amplios de plasticidad del desarrollo mediante los cuales los organismos se adaptan a su entorno durante su curso vital. Tales procesos adaptativos permiten que la variación genotípica se preserve a través de cambios ambientales transitorios. Las señales para la plasticidad operan particularmente durante el desarrollo temprano; pueden afectar un solo órgano o sistema, pero generalmente inducen ajustes integrados en el fenotipo maduro, un proceso sustentado por mecanismos epigenéticos e influenciado por la predicción del entorno maduro. En los mamíferos, un entorno intrauterino adverso resulta en un conjunto integrado de respuestas, sugiriendo la participación de unos pocos genes reguladores clave, que restablece la trayectoria del desarrollo en expectativa de condiciones postnatales pobres. El desajuste entre el entorno maduro anticipado y el real expone al organismo al riesgo de consecuencias adversas--cuanto mayor sea el desajuste, mayor será el riesgo. Para los humanos, la predicción es inexacta para muchos individuos debido a cambios en el entorno postnatal hacia una nutrición densa en energía y bajo gasto energético, contribuyendo a la epidemia de enfermedades crónicas no transmisibles. Esta visión de la enfermedad humana desde las perspectivas de la biología de la historia de vida y la teoría evolutiva ofrece nuevos enfoques para la prevención, el diagnóstico y la intervención.

@article{doi101002ajhb20590,
    author = "Gluckman, Peter D. y Hanson, Mark A. y Beedle, Alan S.",
    title = "Eventos tempranos de la vida y sus consecuencias para enfermedades posteriores: Una perspectiva de historia de vida y evolución",
    year = "2006",
    journal = "American Journal of Human Biology",
    abstract = {La ciencia biomédica ha considerado poco la relevancia de la teoría de la historia de vida y la biología del desarrollo evolutiva y ecológica para la medicina clínica. Sin embargo, las observaciones de que las influencias tempranas de la vida pueden alterar el riesgo de enfermedades posteriores--el paradigma de los "orígenes del desarrollo de la salud y la enfermedad" (DOHaD)--han llevado a reconocer que estas perspectivas pueden informar nuestra comprensión de la biología humana. Proponemos que el fenómeno DOHaD puede considerarse como un subconjunto de los procesos más amplios de plasticidad del desarrollo mediante los cuales los organismos se adaptan a su entorno durante su curso vital. Tales procesos adaptativos permiten que la variación genotípica se preserve a través de cambios ambientales transitorios. Las señales para la plasticidad operan particularmente durante el desarrollo temprano; pueden afectar un solo órgano o sistema, pero generalmente inducen ajustes integrados en el fenotipo maduro, un proceso sustentado por mecanismos epigenéticos e influenciado por la predicción del entorno maduro. En los mamíferos, un entorno intrauterino adverso resulta en un conjunto integrado de respuestas, sugiriendo la participación de unos pocos genes reguladores clave, que restablece la trayectoria del desarrollo en expectativa de condiciones postnatales pobres. El desajuste entre el entorno maduro anticipado y el real expone al organismo al riesgo de consecuencias adversas--cuanto mayor sea el desajuste, mayor será el riesgo. Para los humanos, la predicción es inexacta para muchos individuos debido a cambios en el entorno postnatal hacia una nutrición densa en energía y bajo gasto energético, contribuyendo a la epidemia de enfermedades crónicas no transmisibles. Esta visión de la enfermedad humana desde las perspectivas de la biología de la historia de vida y la teoría evolutiva ofrece nuevos enfoques para la prevención, el diagnóstico y la intervención.},
    url = "https://doi.org/10.1002/ajhb.20590",
    doi = "10.1002/ajhb.20590",
    openalex = "W2050014967",
    references = "doi105694j132653771958tb86500x"
}

La dinámica evolutiva subyacente al gradiente latitudinal en la biodiversidad ha sido controvertida durante más de un siglo. Utilizando un enfoque espacialmente explícito que incorpora no solo la origina y la extinción sino también la inmigración, un análisis global de géneros y subgéneros de bivalvos marinos durante los últimos 11 millones de años apoya un modelo "fuera de los trópicos", en el que los taxones se originan preferentemente en los trópicos y se expanden hacia los polos sin perder su presencia tropical. Los trópicos son por tanto tanto un cuna como un museo de la biodiversidad, contrario a la dicotomía conceptual dominante desde 1974; una crisis de diversidad tropical tendría por tanto profundas efectos evolutivos en todas las latitudes.

@article{doi101126science1130880,
    author = "Jablonski, David y Roy, Kaustuv y Valentine, James W.",
    title = "Out of the Tropics: Dinámica evolutiva del gradiente de diversidad latitudinal",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    abstract = {La dinámica evolutiva subyacente al gradiente latitudinal en la biodiversidad ha sido controvertida durante más de un siglo. Utilizando un enfoque espacialmente explícito que incorpora no solo la origina y la extinción sino también la inmigración, un análisis global de géneros y subgéneros de bivalvos marinos durante los últimos 11 millones de años apoya un modelo "fuera de los trópicos", en el que los taxones se originan preferentemente en los trópicos y se expanden hacia los polos sin perder su presencia tropical. Los trópicos son por tanto tanto un cuna como un museo de la biodiversidad, contrario a la dicotomía conceptual dominante desde 1974; una crisis de diversidad tropical tendría por tanto profundas efectos evolutivos en todas las latitudes.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1130880",
    doi = "10.1126/science.1130880",
    openalex = "W2147544980",
    references = "darlington1959area, doi1010160169534794901635, doi101016jtree200409011, doi101017cbo9780511623387, doi10103835012228, doi101086381004, doi101093oso97801985052350010001, doi101146annurevecolsys34012103144032, doi1016660094837320050310192meam20co2, doi101890038006, doi1023072389612, doi105860choice332720"
}

Los cambios ecológicos en la fenología y distribución de plantas y animales están ocurriendo en todos los grupos marinos, de agua dulce y terrestres bien estudiados. Estos cambios observados están fuertemente sesgados en las direcciones predichas por el calentamiento global y se han vinculado al cambio climático local o regional a través de correlaciones entre el clima y la variación biológica, experimentos de campo y laboratorio, e investigación fisiológica. Las especies con rangos restringidos, particularmente las polares y de cumbres montañosas, muestran contracciones severas de su rango y han sido los primeros grupos en los que especies enteras han desaparecido debido al cambio climático reciente. Los arrecifes de coral tropicales y los anfibios han sido los más afectados negativamente. Las interacciones depredador-presa y planta-insecto se han visto interrumpidas cuando las especies interactuantes han respondido de manera diferente al calentamiento. Las adaptaciones evolutivas a condiciones más cálidas han ocurrido en el interior de los rangos de las especies, y el uso de recursos y la dispersión han evolucionado rápidamente en los márgenes de los rangos en expansión. Los cambios genéticos observados modulan los efectos locales del cambio climático, pero hay poca evidencia de que mitiguen los efectos negativos a nivel de especie.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110100,
    author = "Parmesan, Camille",
    title = "Respuestas ecológicas y evolutivas al cambio climático reciente",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Los cambios ecológicos en la fenología y distribución de plantas y animales están ocurriendo en todos los grupos marinos, de agua dulce y terrestres bien estudiados. Estos cambios observados están fuertemente sesgados en las direcciones predichas por el calentamiento global y se han vinculado al cambio climático local o regional a través de correlaciones entre el clima y la variación biológica, experimentos de campo y laboratorio, e investigación fisiológica. Las especies con rangos restringidos, particularmente las polares y de cumbres montañosas, muestran contracciones severas de su rango y han sido los primeros grupos en los que especies enteras han desaparecido debido al cambio climático reciente. Los arrecifes de coral tropicales y los anfibios han sido los más afectados negativamente. Las interacciones depredador-presa y planta-insecto se han visto interrumpidas cuando las especies interactuantes han respondido de manera diferente al calentamiento. Las adaptaciones evolutivas a condiciones más cálidas han ocurrido en el interior de los rangos de las especies, y el uso de recursos y la dispersión han evolucionado rápidamente en los márgenes de los rangos en expansión. Los cambios genéticos observados modulan los efectos locales del cambio climático, pero hay poca evidencia de que mitiguen los efectos negativos a nivel de especie.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110100",
    openalex = "W2135858501",
    references = "doi1010160169534794902488, doi10103835079180, doi101038369448a0, doi101038382146a0, doi101038386698a0, doi101038nature01286, doi101038nature04095, doi101038nature04246, doi101071mf99078, doi101093aesa492190, doi101126science28954872068, doi101126science2925517673, doi1023071939337, doi1023071940431, doi105860choice301495, openalexw1500291103, openalexw2151235472"
}

@article{doi101016jcell200806030,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evo-Devo y una Síntesis Evolutiva en Expansión: Una Teoría Genética de la Evolución Morfológica",
    year = "2008",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.030",
    doi = "10.1016/j.cell.2008.06.030",
    openalex = "W2171193618",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016b9781483227344500176, doi101038276565a0, doi101038376479a0, doi10103841710, doi101038nature02415, doi101038nature03158, doi101038nrg2063, doi101086406830, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200700105x, doi101126science1090005, doi101126science1107239, doi101126science147365368, doi101126science7892602, doi101242dev1212333, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, openalexw591049712, openalexw614012683"
}

@incollection{doi10100797814020965011,
    author = "Favareau, Donald",
    title = "Introducción: Una historia evolutiva de la biosemiótica",
    year = "2009",
    booktitle = "Biosemiotics/Biosemiotics. Bookseries",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-1-4020-9650-1\_1",
    doi = "10.1007/978-1-4020-9650-1\_1",
    openalex = "W2098182790",
    references = "doi101007978140209650112"
}

@article{doi101038nrg3028,
    author = "Danchin, Étienne y Charmantier, Anne y Champagne, Frances A. y Mesoudi, Alex y Pujol, Benoît y Blanchet, Simon",
    title = "Más allá del ADN: integrando la herencia inclusiva en una teoría extendida de la evolución",
    year = "2011",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3028",
    doi = "10.1038/nrg3028",
    openalex = "W2162016759",
    references = "doi101002evan10110, doi101016jtree200603015, doi101017s0140525x06009083, doi101038374227a0, doi101098rstb20061998, doi101111j15585646201001012x, doi1043249781315801889, doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Los sistemas biológicos que realizan múltiples tareas enfrentan una compensación fundamental: un fenotipo dado no puede ser óptimo en todas las tareas. Aquí preguntamos cómo las compensaciones afectan el rango de fenotipos encontrados en la naturaleza. Utilizando el concepto de frente de Pareto de la economía y la ingeniería, encontramos que los fenotipos de mejor compensación son promedios ponderados de arquetipos--fenotipos especializados para tareas individuales. Para dos tareas, los fenotipos caen sobre la línea que conecta los dos arquetipos, lo que podría explicar las correlaciones lineales de rasgos, las relaciones alométricas, así como los patrones de expresión génica bacteriana. Para tres tareas, los fenotipos caen dentro de un triángulo en el espacio de fenotipos, cuyos vértices son los arquetipos, como se evidencia en estudios morfológicos, incluidos los de los pinzones de Darwin. Las tareas pueden inferirse a partir de fenotipos medidos basándose en el comportamiento de los organismos más cercanos a los arquetipos.

@article{doi101126science1217405,
    author = "Shoval, Oren y Sheftel, Hila y Shinar, Guy y Hart, Yuval y Ramote, Omer y Mayo, Avi y Dekel, E. y Kavanagh, Kathryn D. y Alon, Uri",
    title = "Compensaciones evolutivas, optimalidad de Pareto y la geometría del espacio de fenotipos",
    year = "2012",
    journal = "Science",
    abstract = "Los sistemas biológicos que realizan múltiples tareas enfrentan una compensación fundamental: un fenotipo dado no puede ser óptimo en todas las tareas. Aquí preguntamos cómo las compensaciones afectan el rango de fenotipos encontrados en la naturaleza. Utilizando el concepto de frente de Pareto de la economía y la ingeniería, encontramos que los fenotipos de mejor compensación son promedios ponderados de arquetipos--fenotipos especializados para tareas individuales. Para dos tareas, los fenotipos caen sobre la línea que conecta los dos arquetipos, lo que podría explicar las correlaciones lineales de rasgos, las relaciones alométricas, así como los patrones de expresión génica bacteriana. Para tres tareas, los fenotipos caen dentro de un triángulo en el espacio de fenotipos, cuyos vértices son los arquetipos, como se evidencia en estudios morfológicos, incluidos los de los pinzones de Darwin. Las tareas pueden inferirse a partir de fenotipos medidos basándose en el comportamiento de los organismos más cercanos a los arquetipos.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1217405",
    doi = "10.1126/science.1217405",
    openalex = "W2010025771",
    references = "doi101098rstb19870030, openalexw1869415094"
}

El trabajo en nuestro laboratorio está respaldado por las subvenciones BIO2008-00090 del Ministerio de Ciencia e Innovación de España y KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR) y HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) de la Unión Europea.

@article{doi103389fmicb201200001,
    author = "Martínez, José Luis",
    title = "Resistencia Antibiótica Natural y Contaminación por Determinantes de Resistencia a Antibióticos: Las Dos Eras en la Evolución de la Resistencia a Antimicrobianos",
    year = "2012",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "El trabajo en nuestro laboratorio está respaldado por las subvenciones BIO2008-00090 del Ministerio de Ciencia e Innovación de España y KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR) y HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) de la Unión Europea.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2012.00001",
    doi = "10.3389/fmicb.2012.00001",
    openalex = "W2026352429",
    references = "doi101017s0094837300004310, doi101128mmbr0001610, doi103929ethzb000667478"
}

Resumo estudios marinos sobre respuestas plásticas versus adaptativas al cambio global. Debido a la falta de series temporales, esta revisión se centra principalmente en el potencial de la evolución adaptativa en animales y plantas marinos. Los enfoques fueron principalmente comparaciones sincrónicas de poblaciones fenotípicamente divergentes, sustituyendo contrastes espaciales en entornos de temperatura o CO2 por cambios temporales, o en evaluaciones de la diversidad genética adaptativa dentro de poblaciones para rasgos importantes bajo el cambio global. La literatura disponible está sesgada hacia gasterópodos, crustáceos, cnidarios y macroalgas. Los rasgos focales fueron mayormente tolerancias ambientales, que corresponden al amortiguamiento fenotípico, un tipo de plasticidad que mantiene un fenotipo funcional a pesar de la perturbación externa. Casi todos los estudios abordan especies costeras que ya hoy están expuestas a fluctuaciones en los niveles de temperatura, pH y oxígeno. Las recomendaciones para futuras investigaciones incluyen (i) inicio y análisis de estudios temporales observacionales y experimentales que abarquen diversos rasgos fenotípicos (incluyendo señales de diapausa, rasgos de dispersión, tiempo reproductivo, morfología) (ii) cuantificación de efectos transgeneracionales no genéticos junto con componentes de la varianza genética aditiva (iii) cambios adaptativos en asociaciones microbio-huésped bajo el modelo holobionte en respuesta al cambio global (iv) evolución de patrones de plasticidad bajo entornos cada vez más fluctuantes y condiciones extremas y (v) consideración conjunta de demografía y adaptación evolutiva en enfoques de rescate evolutivo.

@article{doi101111eva12109,
    author = "Reusch, Thorsten B. H.",
    title = "Cambio climático en los océanos: respuestas evolutivas versus plásticas fenotípicas de animales y plantas marinos",
    year = "2013",
    journal = "Evolutionary Applications",
    abstract = "Resumo estudios marinos sobre respuestas plásticas versus adaptativas al cambio global. Debido a la falta de series temporales, esta revisión se centra principalmente en el potencial de la evolución adaptativa en animales y plantas marinos. Los enfoques fueron principalmente comparaciones sincrónicas de poblaciones fenotípicamente divergentes, sustituyendo contrastes espaciales en entornos de temperatura o CO2 por cambios temporales, o en evaluaciones de la diversidad genética adaptativa dentro de poblaciones para rasgos importantes bajo el cambio global. La literatura disponible está sesgada hacia gasterópodos, crustáceos, cnidarios y macroalgas. Los rasgos focales fueron mayormente tolerancias ambientales, que corresponden al amortiguamiento fenotípico, un tipo de plasticidad que mantiene un fenotipo funcional a pesar de la perturbación externa. Casi todos los estudios abordan especies costeras que ya hoy están expuestas a fluctuaciones en los niveles de temperatura, pH y oxígeno. Las recomendaciones para futuras investigaciones incluyen (i) inicio y análisis de estudios temporales observacionales y experimentales que abarquen diversos rasgos fenotípicos (incluyendo señales de diapausa, rasgos de dispersión, tiempo reproductivo, morfología) (ii) cuantificación de efectos transgeneracionales no genéticos junto con componentes de la varianza genética aditiva (iii) cambios adaptativos en asociaciones microbio-huésped bajo el modelo holobionte en respuesta al cambio global (iv) evolución de patrones de plasticidad bajo entornos cada vez más fluctuantes y condiciones extremas y (v) consideración conjunta de demografía y adaptación evolutiva en enfoques de rescate evolutivo.",
    url = "https://doi.org/10.1111/eva.12109",
    doi = "10.1111/eva.12109",
    openalex = "W2071187584",
    references = "doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Las respuestas evolutivas son necesarias para que las poblaciones de árboles puedan seguir el cambio climático. Los resultados de 250 años de experimentos de jardín común muestran que la mayoría de los árboles forestales han evolucionado una adaptación local, como se evidencia por la diferenciación adaptativa de poblaciones en rasgos cuantitativos, que refleja las condiciones ambientales de los orígenes de las poblaciones. Basándonos en los patrones de variación cuantitativa de 19 rasgos relacionados con la adaptación estudiados en 59 especies de árboles (principalmente especies templadas y boreales del hemisferio norte), encontramos que la diferenciación genética entre poblaciones y la variación clinal a lo largo de gradientes ambientales son muy comunes (respectivamente, 90% y 78% de los casos). Por lo tanto, responder al cambio climático probablemente requerirá que los rasgos cuantitativos de las poblaciones vuelvan a coincidir con sus entornos. Examinamos qué tipo de información se necesita para evaluar el potencial de respuesta y qué información ya está disponible. Revisamos los modelos genéticos relacionados con las respuestas a la selección y lo que se sabe actualmente sobre la base genética de los rasgos. Abordamos problemas especiales que se encuentran en los márgenes del rango y destacamos la necesidad de más modelado para comprender problemas específicos en los márgenes sur y norte. Necesitamos nuevos experimentos de jardín común para especies menos conocidas. Para especies ampliamente estudiadas, se necesitan nuevos experimentos fuera de los rangos actuales. Mejorar la información genómica permitirá una mejor predicción de las respuestas. Las interacciones competitivas y otras dentro de la especie y las interacciones entre especies merecen más consideración. A pesar de los largos tiempos generacionales, el fuerte trasfondo en genética cuantitativa y los crecientes recursos genómicos hacen que los árboles forestales sean especies útiles para la investigación del cambio climático. Se espera la mayor respuesta adaptativa cuando las poblaciones son grandes, tienen alta variabilidad genética, la selección es fuerte y hay oportunidad ecológica para el establecimiento de genotipos mejor adaptados.

@article{doi101111gcb12181,
    author = "Alberto, Florian y Aitken, Sally N. y Alı́a, Ricardo y González‐Martínez, Santiago C. y Hänninen, Heikki y Kremer, Antoine y Lefèvre, François y Lenormand, Thomas y Yeaman, Sam y Whetten, Ross y Savolainen, Outi",
    title = "Potencial para respuestas evolutivas al cambio climático – evidencia de poblaciones de árboles",
    year = "2013",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Las respuestas evolutivas son necesarias para que las poblaciones de árboles puedan seguir el cambio climático. Los resultados de 250 años de experimentos de jardín común muestran que la mayoría de los árboles forestales han evolucionado una adaptación local, como se evidencia por la diferenciación adaptativa de poblaciones en rasgos cuantitativos, que refleja las condiciones ambientales de los orígenes de las poblaciones. Basándonos en los patrones de variación cuantitativa de 19 rasgos relacionados con la adaptación estudiados en 59 especies de árboles (principalmente especies templadas y boreales del hemisferio norte), encontramos que la diferenciación genética entre poblaciones y la variación clinal a lo largo de gradientes ambientales son muy comunes (respectivamente, 90\% y 78\% de los casos). Por lo tanto, responder al cambio climático probablemente requerirá que los rasgos cuantitativos de las poblaciones vuelvan a coincidir con sus entornos. Examinamos qué tipo de información se necesita para evaluar el potencial de respuesta y qué información ya está disponible. Revisamos los modelos genéticos relacionados con las respuestas a la selección y lo que se sabe actualmente sobre la base genética de los rasgos. Abordamos problemas especiales que se encuentran en los márgenes del rango y destacamos la necesidad de más modelado para comprender problemas específicos en los márgenes sur y norte. Necesitamos nuevos experimentos de jardín común para especies menos conocidas. Para especies ampliamente estudiadas, se necesitan nuevos experimentos fuera de los rangos actuales. Mejorar la información genómica permitirá una mejor predicción de las respuestas. Las interacciones competitivas y otras dentro de la especie y las interacciones entre especies merecen más consideración. A pesar de los largos tiempos generacionales, el fuerte trasfondo en genética cuantitativa y los crecientes recursos genómicos hacen que los árboles forestales sean especies útiles para la investigación del cambio climático. Se espera la mayor respuesta adaptativa cuando las poblaciones son grandes, tienen alta variabilidad genética, la selección es fuerte y hay oportunidad ecológica para el establecimiento de genotipos mejor adaptados.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.12181",
    doi = "10.1111/gcb.12181",
    openalex = "W2152279961",
    references = "doi101111j00221112200400433x, doi101111j14209101200701445x"
}

Las incertidumbres que rodean el origen evolutivo de la familia de peces epipelágicos Scombridae (atunes y caballas) son sintomáticas de las dificultades para resolver las relaciones suprafamiliares dentro de los Percomorpha, una radiación de teleósteos hiperdiversa que contiene aproximadamente 17.000 especies colocadas en 13 órdenes mal definidos y 269 familias. Aquí encontramos que los scombridos comparten un ancestro común con 14 familias basado en (i) análisis bioinformáticos utilizando secuencias parciales de genes mitocondriales y nucleares de todos los percomorfos depositados en GenBank (10.733 secuencias) y (ii) un posterior análisis mitogenómico basado en 57 especies de esas 15 familias objetivo y 67 taxones de grupo externo. La heterogeneidad morfológica entre estas 15 familias es tan extraordinaria que han sido colocadas en seis subórdenes perciformes diferentes. Sin embargo, los miembros de las 15 familias son costeros u oceánicos pelágicos en su ecología con diversos modos de vida, lo que sugiere que representan una radiación adaptativa previamente no detectada en el reino pelágico. Las filogenias calibradas en el tiempo implican que los scombridos se originaron a partir de un ancestro de aguas profundas y comenzaron a radiarse después del fin del Cretácico cuando los grandes peces epipelágicos depredadores fueron víctimas selectivas de la extinción masiva Cretácico-Paleógeno. Nombramos este clado de peces de aguas abiertas que contiene a los Scombridae "Pelagia" en referencia a la preferencia de hábitat común que vincula a las 15 familias.

@article{doi101371journalpone0073535,
    author = "Miya, Masaki y Friedman, Matt y Satoh, Takashi y Takeshima, Hirohiko y Sado, Tetsuya e Iwasaki, Wataru y Yamanoue, Yusuke y Nakatani, Masanori y Mabuchi, Kohji e Inoue, Jun y Poulsen, Jan Yde y Fukunaga, Tsukasa y Sato, Yukuto y Nishida, Mutsumi",
    title = "Origen evolutivo de la familia Scombridae (atunes y caballas): Miembros de una radiación adaptativa del Paleógeno con otras 14 familias de peces pelágicos",
    year = "2013",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = {Las incertidumbres que rodean el origen evolutivo de la familia de peces epipelágicos Scombridae (atunes y caballas) son sintomáticas de las dificultades para resolver las relaciones suprafamiliares dentro de los Percomorpha, una radiación de teleósteos hiperdiversa que contiene aproximadamente 17.000 especies colocadas en 13 órdenes mal definidos y 269 familias. Aquí encontramos que los scombridos comparten un ancestro común con 14 familias basado en (i) análisis bioinformáticos utilizando secuencias parciales de genes mitocondriales y nucleares de todos los percomorfos depositados en GenBank (10.733 secuencias) y (ii) un posterior análisis mitogenómico basado en 57 especies de esas 15 familias objetivo y 67 taxones de grupo externo. La heterogeneidad morfológica entre estas 15 familias es tan extraordinaria que han sido colocadas en seis subórdenes perciformes diferentes. Sin embargo, los miembros de las 15 familias son costeros u oceánicos pelágicos en su ecología con diversos modos de vida, lo que sugiere que representan una radiación adaptativa previamente no detectada en el reino pelágico. Las filogenias calibradas en el tiempo implican que los scombridos se originaron a partir de un ancestro de aguas profundas y comenzaron a radiarse después del fin del Cretácico cuando los grandes peces epipelágicos depredadores fueron víctimas selectivas de la extinción masiva Cretácico-Paleógeno. Nombramos este clado de peces de aguas abiertas que contiene a los Scombridae "Pelagia" en referencia a la preferencia de hábitat común que vincula a las 15 familias.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0073535",
    doi = "10.1371/journal.pone.0073535",
    openalex = "W2087061078",
    references = "doi101111j14754983201201165x"
}

En la era de la síntesis evolutiva extendida, que ya no considera la selección natural como el único factor principal de la evolución, es significativo revisar el legado de los biólogos que discutieron el papel de factores alternativos. Aquí analizamos las perspectivas evolutivas de Sergei Meyen (1935-1987), un paleobotánico que argumentó que la teoría de la evolución debería incorporar un enfoque "nomotético" que infiere las leyes de la morfogénesis (es decir, la generación de formas) a partir de los patrones observados de variación en organismos vivos y en los registros fósiles. Meyen desarrolló una teoría de "conjuntos polimórficos repetidos" (RPS), que aplicó consistentemente para describir la variación interorganismo en poblaciones, la variación intraorganismo de órganos metaméricos, la variación de anomalías, la heterotopía, los cambios durante el desarrollo embrionario y la variación interespecífica dentro de linajes evolutivos. La noción de RPS asume la naturaleza activa de los organismos que poseen capacidades morfogénicas y conductuales ocultas. La teoría de Meyen es compatible con la selección natural de Darwin; sin embargo, Meyen enfatizó la importancia de otras formas de selección (por ejemplo, selección de trayectorias de desarrollo, hábitats y comportamientos) en la elección de elementos específicos de los RPS. Finalmente, Meyen desarrolló un nuevo concepto tipológico del tiempo, donde el tiempo representa la variabilidad (es decir, el cambio) de objetos reales como organismos vivos o formaciones geológicas.

@article{doi101016jbiosystems201406008,
    author = "Sharov, Alexei A e Igamberdiev, Abir U",
    title = "Inferir direcciones de la evolución a partir de patrones de variación: el legado de Sergei Meyen.",
    year = "2014",
    journal = "Bio Systems",
    abstract = {En la era de la síntesis evolutiva extendida, que ya no considera la selección natural como el único factor principal de la evolución, es significativo revisar el legado de los biólogos que discutieron el papel de factores alternativos. Aquí analizamos las perspectivas evolutivas de Sergei Meyen (1935-1987), un paleobotánico que argumentó que la teoría de la evolución debería incorporar un enfoque "nomotético" que infiere las leyes de la morfogénesis (es decir, la generación de formas) a partir de los patrones observados de variación en organismos vivos y en los registros fósiles. Meyen desarrolló una teoría de "conjuntos polimórficos repetidos" (RPS), que aplicó consistentemente para describir la variación interorganismo en poblaciones, la variación intraorganismo de órganos metaméricos, la variación de anomalías, la heterotopía, los cambios durante el desarrollo embrionario y la variación interespecífica dentro de linajes evolutivos. La noción de RPS asume la naturaleza activa de los organismos que poseen capacidades morfogénicas y conductuales ocultas. La teoría de Meyen es compatible con la selección natural de Darwin; sin embargo, Meyen enfatizó la importancia de otras formas de selección (por ejemplo, selección de trayectorias de desarrollo, hábitats y comportamientos) en la elección de elementos específicos de los RPS. Finalmente, Meyen desarrolló un nuevo concepto tipológico del tiempo, donde el tiempo representa la variabilidad (es decir, el cambio) de objetos reales como organismos vivos o formaciones geológicas.},
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4254149/",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2014.06.008",
    openalex = "W2018299764",
    pmcid = "PMC4254149",
    pmid = "25072709",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101086276408, doi101126science1130880, doi101126science1483671754, doi1015159780691183978018, doi101890039000, doi105694j132653771958tb86500x, doi105962bhltitle27468, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw1869415094"
}

@article{doi101038514161a,
    author = "Laland, Kevin N. y Uller, Tobias y Feldman, Marc y Sterelny, Kim y Müller, Gerd B. y Moczek, Armin P. y Jablonka, Eva y Odling‐Smee, John y Wray, Gregory A. y Hoekstra, Hopi E. y Futuyma, Douglas J. y Lenski, Richard E. y Mackay, Trudy F. C. y Schluter, Dolph y Strassmann, Joan E.",
    title = "¿Necesita la teoría de la evolución una reevaluación?",
    year = "2014",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/514161a",
    doi = "10.1038/514161a",
    openalex = "W1991285543",
    references = "doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw135071171"
}

@article{doi101038nrg3982,
    author = "Gilbert, Scott F. y Bosch, Thomas C. G. y Ledón‐Rettig, Cristina C.",
    title = "Eco-Evo-Devo: simbiosis del desarrollo y plasticidad del desarrollo como agentes evolutivos",
    year = "2015",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3982",
    doi = "10.1038/nrg3982",
    openalex = "W2219314901",
    references = "doi101146annurevmarine120709142753, doi107551mitpress97802625136780010001"
}

Las actividades científicas tienen lugar dentro de conjuntos estructurados de ideas y supuestos que definen un campo y sus prácticas. El marco conceptual de la biología evolutiva surgió con la Síntesis Moderna a principios del siglo XX y desde entonces se ha expandido en un programa de investigación altamente exitoso para explorar los procesos de diversificación y adaptación. No obstante, la capacidad de ese marco para acomodar satisfactoriamente los rápidos avances en biología del desarrollo, genómica y ecología ha sido cuestionada. Revisamos algunos de estos argumentos, centrándonos en literaturas (evo-devo, plasticidad del desarrollo, herencia inclusiva y construcción de nicho) cuyas implicaciones para la evolución pueden interpretarse de dos maneras: una que preserva la estructura interna de la teoría evolutiva contemporánea y otra que apunta hacia un marco conceptual alternativo. Esta última, que denominamos 'síntesis evolutiva extendida' (SEE), retiene los fundamentos de la teoría evolutiva, pero difiere en su énfasis en el papel de los procesos constructivos en el desarrollo y la evolución, y en las representaciones recíprocas de la causalidad. En la SEE, los procesos de desarrollo, que operan a través del sesgo del desarrollo, la herencia inclusiva y la construcción de nicho, comparten la responsabilidad por la dirección y la tasa de la evolución, el origen de la variación de caracteres y la complementariedad organismo-ambiente. Especificamos la estructura, los supuestos centrales y las predicciones novedosas de la SEE, y mostramos cómo puede ser desplegada para estimular y avanzar la investigación en aquellos campos que estudian o utilizan la biología evolutiva.

@article{doi101098rspb20151019,
    author = "Laland, Kevin N. y Uller, Tobias y Feldman, Marcus W. y Sterelny, Kim y Müller, Gerd B. y Moczek, Armin P. y Jablonka, Eva y Odling‐Smee, John",
    title = "La síntesis evolutiva extendida: su estructura, supuestos y predicciones",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Las actividades científicas tienen lugar dentro de conjuntos estructurados de ideas y supuestos que definen un campo y sus prácticas. El marco conceptual de la biología evolutiva surgió con la Síntesis Moderna a principios del siglo XX y desde entonces se ha expandido en un programa de investigación altamente exitoso para explorar los procesos de diversificación y adaptación. No obstante, la capacidad de ese marco para acomodar satisfactoriamente los rápidos avances en biología del desarrollo, genómica y ecología ha sido cuestionada. Revisamos algunos de estos argumentos, centrándonos en literaturas (evo-devo, plasticidad del desarrollo, herencia inclusiva y construcción de nicho) cuyas implicaciones para la evolución pueden interpretarse de dos maneras: una que preserva la estructura interna de la teoría evolutiva contemporánea y otra que apunta hacia un marco conceptual alternativo. Esta última, que denominamos 'síntesis evolutiva extendida' (SEE), retiene los fundamentos de la teoría evolutiva, pero difiere en su énfasis en el papel de los procesos constructivos en el desarrollo y la evolución, y en las representaciones recíprocas de la causalidad. En la SEE, los procesos de desarrollo, que operan a través del sesgo del desarrollo, la herencia inclusiva y la construcción de nicho, comparten la responsabilidad por la dirección y la tasa de la evolución, el origen de la variación de caracteres y la complementariedad organismo-ambiente. Especificamos la estructura, los supuestos centrales y las predicciones novedosas de la SEE, y mostramos cómo puede ser desplegada para estimular y avanzar la investigación en aquellos campos que estudian o utilizan la biología evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2015.1019",
    doi = "10.1098/rspb.2015.1019",
    openalex = "W2103794982",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511621123, doi101038218525a0, doi10106313050879, doi101086346135, doi101093auk1002507, doi101093oso97801951223430010001, doi101111j155856461982tb05068x, doi101126science1113832, doi101146annureves01110170000245, doi1015159780691209418, doi1015159781400847266, doi1023071367778, doi1023072260026, doi102307jctvjsf433, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice364478, doi105860choice396411, doi105962bhltitle27468, doi107208chicago97802263088830010001, doi107551mitpress97802625136780010001, openalexw2080618944, openalexw227636185"
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La datación del árbol de la vida es una labor fundamental en la biología evolutiva. Las tasas de evolución son fundamentales para casi todos los modelos y procesos evolutivos. Las tasas necesitan fechas. Existe mucho debate sobre las formas más apropiadas y razonables de datar el árbol de la vida, y el trabajo reciente ha destacado algunas confusiones y complejidades que pueden evitarse. Ya sea que los árboles filogenéticos se daten después de haberse establecido, o como parte del proceso de búsqueda del árbol, los profesionales necesitan saber qué calibraciones utilizar. Enfatizamos la importancia de identificar fósiles de corona (no de tallo), los niveles de confianza en su atribución a la corona, la precisión cronestratigráfica actual, la primacía de la formación geológica anfitriona y los intervalos de confianza asimétricos. Aquí presentamos calibraciones para 88 nodos clave a lo largo de la filogenia de los animales, que van desde la raíz de Metazoa hasta el último ancestro común de Homo sapiens. Se requiere constantemente una atención minuciosa a los detalles: por ejemplo, la fecha clásica de aves-mamíferos (base de la corona Amniota) a menudo se ha dado como 310-315 Ma; la escala de tiempo internacional de 2014 indica una edad mínima de 318 Ma.

@article{doi1026879424,
    author = "Benton, Michael J. y Donoghue, PCJ y Vinther, Jakob y Asher, RJ y Friedman, Mary M. y Near, Thomas J.",
    title = "Restricciones sobre la escala de tiempo de la historia evolutiva animal",
    year = "2015",
    journal = "Palaeontologia Electronica",
    abstract = "La datación del árbol de la vida es una labor fundamental en la biología evolutiva. Las tasas de evolución son fundamentales para casi todos los modelos y procesos evolutivos. Las tasas necesitan fechas. Existe mucho debate sobre las formas más apropiadas y razonables de datar el árbol de la vida, y el trabajo reciente ha destacado algunas confusiones y complejidades que pueden evitarse. Ya sea que los árboles filogenéticos se daten después de haberse establecido, o como parte del proceso de búsqueda del árbol, los profesionales necesitan saber qué calibraciones utilizar. Enfatizamos la importancia de identificar fósiles de corona (no de tallo), los niveles de confianza en su atribución a la corona, la precisión cronestratigráfica actual, la primacía de la formación geológica anfitriona y los intervalos de confianza asimétricos. Aquí presentamos calibraciones para 88 nodos clave a lo largo de la filogenia de los animales, que van desde la raíz de Metazoa hasta el último ancestro común de Homo sapiens. Se requiere constantemente una atención minuciosa a los detalles: por ejemplo, la fecha clásica de aves-mamíferos (base de la corona Amniota) a menudo se ha dado como 310-315 Ma; la escala de tiempo internacional de 2014 indica una edad mínima de 318 Ma.",
    url = "https://doi.org/10.26879/424",
    doi = "10.26879/424",
    openalex = "W1962669040",
    references = "doi10100703064746897, doi101007978146139246016, doi101007bf02101694, doi101016b9780126709506500187, doi101016b9780444594259000196, doi101016b9780444594259000202, doi101016b9780444594259000214, doi101016b9780444594259000238, doi101016b9780444594259000287, doi101016jpalaeo200703046, doi101016jpalwor200911007, doi101016s0301926899000777, doi101016s096098220900431x, doi101017s0006323199005472, doi101017s0016756811000720, doi101017s1464793102006103, doi101017s1464793105006779, doi101017s1477201906002008, doi101023a1018471324332, doi101038377720a0, doi101038nature01264, doi101038nature03150, doi101038nature05634, doi101038nature06134, doi101038nature06277, doi101038nature06614, doi101038nature07855, doi101038nature08322, doi101038nature09810, doi101038nature09864, doi101038nature10291, doi101038nature13718, doi101073pnas1010350107, doi101073pnas1110395108, doi101073pnas9794469, doi10108002724634198110011886, doi10108002724634199710010948, doi10108002724634199810011114, doi10108010635150590950326, doi10108010635150600755396, doi10108010635150701397635, doi101098rstb19790006, doi101098rstb19990489, doi101111j109636421995tb00932x, doi101111j10963642200600293x, doi101111j1469185x1999tb00046x, doi101111j1469185x200900094x, doi101111j1469185x201200220x, doi101111j14754983201001019x, doi101111j14754983201201165x, doi101111pala12125, doi101111zoj12111, doi101126science1157704, doi101139e87124, doi1011861471214813208, doi1012060003009020062970001tatol20co2, doi1012066231, doi101242dev066712, doi101371journalpone0009586, doi101643004585112002002053220co2, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi102307jctt1xp3v3r, doi105252g2010n4a1, doi105281zenodo18028696, doi105860choice320949, doi105860choice355657, doi105860choice405235, doi105860choice432801, doi105860choice503272, doi107312kiel11918, gardiner1989interrelationships, openalexw2898156694, openalexw78894702"
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Los conjuntos de datos multigénicos y genómicos se han vuelto comunes en el campo de la filogenia, pero muchas herramientas existentes no están diseñadas para dichos conjuntos de datos, lo que a menudo hace que el análisis sea lento y tedioso. Aquí presentamos PhyloSuite, una plataforma de escritorio de flujo de trabajo (interfaz gráfica de usuario Python de código abierto, multiplataforma y autónoma) fácil de usar dedicada a simplificar la gestión de datos de secuencias moleculares y los estudios de filogenética evolutiva. Utiliza un sistema basado en complementos que integra varias herramientas filogenéticas y bioinformáticas, simplificando así todo el procedimiento, desde la adquisición de datos hasta la anotación del árbol filogenético (en combinación con iTOL). Sus características son: (a) interfaz gráfica de usuario de hacer clic y arrastrar y soltar; (b) un espacio de trabajo para gestionar y organizar datos de secuencias moleculares y resultados de análisis; (c) extracción de entradas de GenBank y estadísticas comparativas; y (d) un flujo de trabajo filogenético con capacidad de procesamiento por lotes, que incluye alineación de secuencias (mafft y macse), optimización de alineación (trimAl, HmmCleaner y Gblocks), concatenación de conjuntos de datos, selección del mejor esquema de particionamiento y del mejor modelo evolutivo (PartitionFinder y modelfinder), e inferencia filogenética (MrBayes y iq-tree). PhyloSuite está diseñado tanto para principiantes como para investigadores experimentados, permitiendo a los primeros iniciar rápidamente su camino en el análisis filogenético, y a los segundos realizar, almacenar y gestionar su trabajo de manera simplificada, y dedicar más tiempo a investigar preguntas científicas en lugar de perderlo transfiriendo archivos de un programa de software a otro.

@article{doi1011111755099813096,
    author = "Zhang, Dong y Gao, Fangluan y Jakovlić, Ivan y Zou, Hong y Zhang, Jin y Li, Wen X. y Wang, Gui T.",
    title = "PhyloSuite: Una plataforma de escritorio integrada y escalable para la gestión simplificada de datos de secuencias moleculares y estudios de filogenética evolutiva",
    year = "2019",
    journal = "Molecular Ecology Resources",
    abstract = "Los conjuntos de datos multigénicos y genómicos se han vuelto comunes en el campo de la filogenia, pero muchas herramientas existentes no están diseñadas para dichos conjuntos de datos, lo que a menudo hace que el análisis sea lento y tedioso. Aquí presentamos PhyloSuite, una plataforma de escritorio de flujo de trabajo (interfaz gráfica de usuario Python de código abierto, multiplataforma y autónoma) fácil de usar dedicada a simplificar la gestión de datos de secuencias moleculares y los estudios de filogenética evolutiva. Utiliza un sistema basado en complementos que integra varias herramientas filogenéticas y bioinformáticas, simplificando así todo el procedimiento, desde la adquisición de datos hasta la anotación del árbol filogenético (en combinación con iTOL). Sus características son: (a) interfaz gráfica de usuario de hacer clic y arrastrar y soltar; (b) un espacio de trabajo para gestionar y organizar datos de secuencias moleculares y resultados de análisis; (c) extracción de entradas de GenBank y estadísticas comparativas; y (d) un flujo de trabajo filogenético con capacidad de procesamiento por lotes, que incluye alineación de secuencias (mafft y macse), optimización de alineación (trimAl, HmmCleaner y Gblocks), concatenación de conjuntos de datos, selección del mejor esquema de particionamiento y del mejor modelo evolutivo (PartitionFinder y modelfinder), e inferencia filogenética (MrBayes y iq-tree). PhyloSuite está diseñado tanto para principiantes como para investigadores experimentados, permitiendo a los primeros iniciar rápidamente su camino en el análisis filogenético, y a los segundos realizar, almacenar y gestionar su trabajo de manera simplificada, y dedicar más tiempo a investigar preguntas científicas en lugar de perderlo transfiriendo archivos de un programa de software a otro.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1755-0998.13096",
    doi = "10.1111/1755-0998.13096",
    openalex = "W2979811825",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nmeth4285, doi10108010635150701472164, doi101093bioinformaticsbtp348, doi101093bioinformaticsbts199, doi101093molbevmst010, doi101093sysbiosys029"
}

La elaboración de métodos de inferencia filogenética bayesiana ha continuado a un ritmo acelerado en los últimos años, con importantes avances nuevos en casi todos los aspectos del modelado conjunto de datos evolutivos. Se aprecia cada vez más que algunas preguntas evolutivas solo pueden responderse adecuadamente combinando evidencias de múltiples fuentes independientes de datos, incluidas secuencias genómicas, fechas de muestreo, datos fenotípicos, fechas de radiocarbono, ocurrencias fósiles e información de rango biogeográfico, entre otros. Incluir todos los datos relevantes en un único modelo conjunto es muy desafiante tanto conceptual como computacionalmente. Los paquetes de software computacional avanzado que permiten el desarrollo robusto de modelos compatibles (sub-)modelos que pueden componerse en una jerarquía de modelos completa han jugado un papel clave en estos desarrollos. El desarrollo de tales marcos de software es cada vez más una actividad científica importante en sí misma y conlleva desafíos específicos, desde desafíos prácticos de diseño, desarrollo e ingeniería de software hasta desafíos de modelado estadístico y conceptual. BEAST 2 es una de estas plataformas de software computacional, y fue anunciado por primera vez hace más de 4 años. Aquí describimos una serie de importantes nuevos desarrollos en la plataforma central y jerarquía de modelos de BEAST 2 que han ocurrido desde el primer lanzamiento del software, culminando en el reciente lanzamiento 2.5.

@article{doi101371journalpcbi1006650,
    author = "Bouckaert, Remco y Vaughan, Timothy G. y Barido‐Sottani, Joëlle y Duchêne, Sebastián y Fourment, Mathieu y Gavryushkina, Alexandra y Heled, Joseph y Jones, Graham y Kühnert, Denise y Maio, Nicola De y Matschiner, Michael y Mendes, Fábio K. y Müller, Nicola F. y Ogilvie, Huw A. y du Plessis, Louis y Popinga, Alex y Rambaut, Andrew y Rasmussen, David A. y Siveroni, Igor y Suchard, Marc A. y Wu, Chieh‐Hsi y Xie, Dong y Zhang, Chi y Stadler, Tanja y Drummond, Alexei J.",
    title = "BEAST 2.5: Una plataforma de software avanzada para análisis evolutivo bayesiano",
    year = "2019",
    journal = "PLoS Computational Biology",
    abstract = "La elaboración de métodos de inferencia filogenética bayesiana ha continuado a un ritmo acelerado en los últimos años, con importantes avances nuevos en casi todos los aspectos del modelado conjunto de datos evolutivos. Se aprecia cada vez más que algunas preguntas evolutivas solo pueden responderse adecuadamente combinando evidencias de múltiples fuentes independientes de datos, incluidas secuencias genómicas, fechas de muestreo, datos fenotípicos, fechas de radiocarbono, ocurrencias fósiles e información de rango biogeográfico, entre otros. Incluir todos los datos relevantes en un único modelo conjunto es muy desafiante tanto conceptual como computacionalmente. Los paquetes de software computacional avanzado que permiten el desarrollo robusto de modelos compatibles (sub-)modelos que pueden componerse en una jerarquía de modelos completa han jugado un papel clave en estos desarrollos. El desarrollo de tales marcos de software es cada vez más una actividad científica importante en sí misma y conlleva desafíos específicos, desde desafíos prácticos de diseño, desarrollo e ingeniería de software hasta desafíos de modelado estadístico y conceptual. BEAST 2 es una de estas plataformas de software computacional, y fue anunciado por primera vez hace más de 4 años. Aquí describimos una serie de importantes nuevos desarrollos en la plataforma central y jerarquía de modelos de BEAST 2 que han ocurrido desde el primer lanzamiento del software, culminando en el reciente lanzamiento 2.5.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1006650",
    doi = "10.1371/journal.pcbi.1006650",
    openalex = "W2901954177",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nature10231, doi101038nature13726, doi101073pnas1319091111, doi101073pnas89178322, doi101080106351501753462876, doi101093acprofoso97801985670280010001, doi101093genetics1551431, doi101093molbevmsp274, doi101093sysbiosyq085, doi101093sysbiosyr047, doi101093sysbiosyv080, doi101093vevey016, doi101098rspa19270118, doi101186147121487214, doi101186s1286201708906, doi1012019780429258411, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpcbi1003537"
}

@incollection{doi101007978303065536513,
    author = "Granovitch, Andrei I.",
    title = "Selección natural, morfoproceso y un campo lógico de conceptos evolutivos",
    year = "2021",
    booktitle = "Biología evolutiva/Biología de la evolución",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-030-65536-5\_13",
    doi = "10.1007/978-3-030-65536-5\_13",
    openalex = "W3134657069",
    references = "doi101016jbiosystems201406008, doi101016jtree200611004, doi101038nrm2632, doi10106313050879, doi101093genetics16297, doi101093genetics286491, doi101093oso97801951223430010001, doi101098rstb19520012, doi101111j155856461975tb00851x, doi1015159781400820108, openalexw2624262714"
}

@incollection{doi10100797830306553656,
    author = "Ochoa, Carlos",
    title = "Los Orígenes de la Genética del Desarrollo Teórica: Reinterpretando el Papel de William Bateson en la Historia del Pensamiento Evolutivo",
    year = "2021",
    booktitle = "Biología Evolutiva/Biología de la evolución",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-030-65536-5\_6",
    doi = "10.1007/978-3-030-65536-5\_6",
    openalex = "W3133716585",
    references = "doi101007978303065536513"
}

@article{doi101016jbiosystems2021104454,
    author = "Igamberdiev, Abir U.",
    title = "El puente levadizo de la naturaleza: la complejización evolutiva como generación e interpretación novedosa de los sistemas de codificación",
    year = "2021",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2021.104454",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2021.104454",
    openalex = "W3171803253",
    references = "doi101016jbiosystems2019104063, doi101016jbiosystems2020104279"
}

La Síntesis Moderna (o "neodarwinismo"), que surgió de la reconciliación de la teoría de la selección natural de Darwin y la investigación de Mendel sobre la genética, sigue siendo la base de la teoría de la evolución. Sin embargo, desde su inicio, ha sido un objetivo de crítica, que ha variado desde pequeñas objeciones hasta un rechazo completo. Entre los críticos más famosos se encontraba Stephen Jay Gould, quien, en 1980, proclamó que la Síntesis Moderna estaba "efectivamente muerta". Gould y otros afirmaron que la acción de la selección natural sobre mutaciones aleatorias era insuficiente por sí sola para explicar los patrones de diversidad y divergencia macroevolutivos, y que se requerían nuevos procesos para explicar los hallazgos del registro fósil. En 1982, Charlesworth, Lande y Slatkin publicaron una respuesta a esta crítica en Evolution, en la que argumentaron que el neodarwinismo era efectivamente suficiente para explicar los patrones macroevolutivos. En esta Perspectiva para el 75.º Aniversario de la Sociedad para el Estudio de la Evolución, revisamos a Charlesworth et al. en su contexto histórico y proporcionamos apoyo moderno a sus argumentos. Enfatizamos la importancia de los procesos microevolutivos en el estudio de los patrones macroevolutivos. En última instancia, concluimos que el equilibrio puntuado no representó una revolución mayor en la biología evolutiva -aunque el debate sobre este punto estimuló una investigación significativa y avanzó el campo- y que el neodarwinismo está vivo y bien.

@article{doi101111evo14268,
    author = "Hancock, Zachary B. y Lehmberg, Emma S. y Bradburd, Gideon S.",
    title = "El neodarwinismo aún acecha a la teoría de la evolución: una perspectiva moderna sobre Charlesworth, Lande y Slatkin (1982)",
    year = "2021",
    journal = "Evolution",
    abstract = {La Síntesis Moderna (o "neodarwinismo"), que surgió de la reconciliación de la teoría de la selección natural de Darwin y la investigación de Mendel sobre la genética, sigue siendo la base de la teoría de la evolución. Sin embargo, desde su inicio, ha sido un objetivo de crítica, que ha variado desde pequeñas objeciones hasta un rechazo completo. Entre los críticos más famosos se encontraba Stephen Jay Gould, quien, en 1980, proclamó que la Síntesis Moderna estaba "efectivamente muerta". Gould y otros afirmaron que la acción de la selección natural sobre mutaciones aleatorias era insuficiente por sí sola para explicar los patrones de diversidad y divergencia macroevolutivos, y que se requerían nuevos procesos para explicar los hallazgos del registro fósil. En 1982, Charlesworth, Lande y Slatkin publicaron una respuesta a esta crítica en Evolution, en la que argumentaron que el neodarwinismo era efectivamente suficiente para explicar los patrones macroevolutivos. En esta Perspectiva para el 75.º Aniversario de la Sociedad para el Estudio de la Evolución, revisamos a Charlesworth et al. en su contexto histórico y proporcionamos apoyo moderno a sus argumentos. Enfatizamos la importancia de los procesos microevolutivos en el estudio de los patrones macroevolutivos. En última instancia, concluimos que el equilibrio puntuado no representó una revolución mayor en la biología evolutiva -aunque el debate sobre este punto estimuló una investigación significativa y avanzó el campo- y que el neodarwinismo está vivo y bien.},
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.14268",
    doi = "10.1111/evo.14268",
    openalex = "W3163859581",
    references = "doi101016jtree200611004, doi101016jtree200901009, doi101017s0094837300005224, doi101093sysbio463523, doi101111j001438202006tb01143x, doi101111j00221112200400433x, doi101128mmbr0001610, doi101146annureves01110170000245, doi1023071438156, doi1023072485224"
}

@incollection{doi10100797830310478319,
    author = "Granovitch, Andrei I.",
    title = "El morfoproceso y la diversidad de mecanismos evolutivos de estructuras metastables",
    year = "2022",
    booktitle = "Biología evolutiva/Biología de la evolución",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-04783-1\_9",
    doi = "10.1007/978-3-031-04783-1\_9",
    openalex = "W4285188686",
    references = "doi101007978303065536513"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104706,
    author = "Olovnikov, A. M.",
    title = "Eco-crossover, or environmentally regulated crossing-over, and natural selection are two irreplaceable drivers of adaptive evolution: Eco-crossover hypothesis",
    year = "2022",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104706",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104706",
    openalex = "W4281478058",
    references = "doi101007bf02984069, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jmolcel201806034, doi101016jygeno201601008, doi101017s0094837300005224, doi101038227561a0, doi101038366223a0, doi101038s415800200243y, doi101073pnas1508347112, doi101093auk1002507, doi1015252embj2018100836, doi1023071437764"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104719,
    author = "Shklovskiy-Kordi, Nikita E. y Matsuno, Koichiro y Marijuán, Pedro C. y Lgamberdiev, Abir U",
    title = "Editorial: Principios fundamentales de la computación biológica: De la computación molecular a la complejidad evolutiva",
    year = "2022",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104719",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104719",
    openalex = "W4281989749",
    references = "doi101016jbiosystems2022104712"
}

@article{doi101016jbiosystems2022104779,
    author = "Cottam, Ron e Iurato, Giuseppe e Igamberdiev, Abir U.",
    title = "Fundamentos de las transformaciones evolutivas en sistemas biológicos",
    year = "2022",
    journal = "Biosistemas",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2022.104779",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2022.104779",
    openalex = "W4295166759",
    references = "doi101016jbiosystems2021104567, doi101016jbiosystems2022104706"
}

Resumen La orientación hacia un objetivo de la evolución biológica se realiza mediante el logro anticipado del estado final del sistema que corresponde a la condición de su perfección en el mantenimiento de sí mismo y en la adaptabilidad. A lo largo del desarrollo individual, un sistema biológico maximiza su potencia mediante efectos sinérgicos y se vuelve capaz de realizar trabajo externo de la manera más eficiente. En este estado, definido como estasis, las configuraciones robustas de mantenimiento de sí mismo actúan como atractores resistentes a perturbaciones externas e internas. Esto corresponde a las restricciones locales de energía-tiempo que se ajustan de manera más eficiente a la optimización integral de todo el sistema. En la evolución, las transiciones evolutivas mayores que establecen nuevos estados de estasis se logran mediante codepoiesis, un proceso en el que las declaraciones indecisas de los sistemas de codificación existentes forman la base para el despliegue evolutivo del sistema asignándoles nuevos valores. La fijación genética de este proceso macroevolutivo conduce a nuevos programas de desarrollo individual que representan el proceso de computación natural. El fenómeno de complejificación en la evolución representa una transición de metasistema que resulta en la maximización de la potencia de un sistema y en la capacidad de aumentar el trabajo externo realizado por el sistema.

@article{doi101093biolinneanblac093,
    author = "Igamberdiev, Abir U.",
    title = "Superar los límites de la computación natural en la evolución biológica hacia la maximización de la eficiencia del sistema",
    year = "2022",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Resumen La orientación hacia un objetivo de la evolución biológica se realiza mediante el logro anticipado del estado final del sistema que corresponde a la condición de su perfección en el mantenimiento de sí mismo y en la adaptabilidad. A lo largo del desarrollo individual, un sistema biológico maximiza su potencia mediante efectos sinérgicos y se vuelve capaz de realizar trabajo externo de la manera más eficiente. En este estado, definido como estasis, las configuraciones robustas de mantenimiento de sí mismo actúan como atractores resistentes a perturbaciones externas e internas. Esto corresponde a las restricciones locales de energía-tiempo que se ajustan de manera más eficiente a la optimización integral de todo el sistema. En la evolución, las transiciones evolutivas mayores que establecen nuevos estados de estasis se logran mediante codepoiesis, un proceso en el que las declaraciones indecisas de los sistemas de codificación existentes forman la base para el despliegue evolutivo del sistema asignándoles nuevos valores. La fijación genética de este proceso macroevolutivo conduce a nuevos programas de desarrollo individual que representan el proceso de computación natural. El fenómeno de complejificación en la evolución representa una transición de metasistema que resulta en la maximización de la potencia de un sistema y en la capacidad de aumentar el trabajo externo realizado por el sistema.",
    url = "https://doi.org/10.1093/biolinnean/blac093",
    doi = "10.1093/biolinnean/blac093",
    openalex = "W4296816592",
    references = "doi1010160022519373901987, doi1010160303264774900318, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jbiosystems2022104706, doi101017s0094837300004310, doi101038nrn2787, doi101073pnas86147, doi101086276408, doi1023072103745, doi1023072412825, doi105860choice294505, openalexw1556913189"
}

Los naturalistas pioneros como Whewell, Lyell, Humboldt, Darwin y Wallace reconocieron las interacciones entre las fuerzas ecológicas y evolutivas, así como los roles del movimiento continental, la formación de montañas y las variaciones climáticas, en la configuración de los patrones de biodiversidad. Los desarrollos recientes en modelado por computadora y reconstrucción paleoambiental han permitido a los científicos estudiar in silico cómo emerge la biodiversidad a partir de procesos dinámicos eco‐evolutivos y ambientales y sus interacciones. La simulación de la biodiversidad emergente permite experimentar con múltiples hipótesis interconectadas en un panorama científico mayormente fragmentado, con el objetivo final de aproximar exitosamente los mecanismos naturales (es decir, generalizaciones hipotéticas espaciotemporalmente ilimitadas que se mantienen a través de múltiples patrones empíricos de biodiversidad). Este nuevo enfoque interdisciplinario abre vías científicas sin precedentes, facilitando la comunicación y la contemplación de las implicaciones causales de las complejas interacciones eco‐evolutivas y ambientales. En esta revisión proporciono una visión general exhaustiva de los modelos eco‐evolutivos mecanísticos explícitos espacialmente basados en poblaciones (MEEMs) disponibles que se basan en reconstrucciones paleoambientales, discutiendo críticamente su relevancia y limitaciones para nuestra comprensión de la biodiversidad. Para lograr esto, primero introduzco diversos modelos de biodiversidad y contextualizo los MEEMs. Segundo, defino los MEEMs y sintetizo los principales hallazgos de estudios que utilizan MEEMs combinados con dinámicas ambientales de larga duración (> 0,1 Ma). Por último, discuto los desafíos y perspectivas de resolver enigmas de larga data sobre la biodiversidad acoplando mecanismos eco‐evolutivos con dinámicas ambientales de larga duración. Los estudios muestran que vincular entornos dinámicos y procesos eco‐evolutivos es necesario para reproducir simultáneamente múltiples patrones de biodiversidad a gran escala. Los mecanismos relacionados con las adaptaciones (por ejemplo, evolución de nicho), capacidades de dispersión y otras interacciones eco‐evolutivas (por ejemplo, aquellas que resultan en eventos de especiación o extinción) muestran una importancia universal, aunque sus firmas a través de escalas espaciales y temporales permanecen en gran medida desconocidas. Las investigaciones con MEEMS que abarcan múltiples niveles de complejidad en el espacio y el tiempo fomentan la cooperación interdisciplinaria en las ciencias naturales y muestran promesa para resolver algunos de los enigmas de la biodiversidad de la Tierra.

@article{doi101111ecog06132,
    author = "Hagen, Oskar",
    title = "Acoplamiento de mecanismos eco‐evolutivos con dinámicas ambientales de larga duración para comprender los patrones de biodiversidad",
    year = "2022",
    journal = "Ecography",
    abstract = "Los naturalistas pioneros como Whewell, Lyell, Humboldt, Darwin y Wallace reconocieron las interacciones entre las fuerzas ecológicas y evolutivas, así como los roles del movimiento continental, la formación de montañas y las variaciones climáticas, en la configuración de los patrones de biodiversidad. Los desarrollos recientes en modelado por computadora y reconstrucción paleoambiental han permitido a los científicos estudiar in silico cómo emerge la biodiversidad a partir de procesos dinámicos eco‐evolutivos y ambientales y sus interacciones. La simulación de la biodiversidad emergente permite experimentar con múltiples hipótesis interconectadas en un panorama científico mayormente fragmentado, con el objetivo final de aproximar exitosamente los mecanismos naturales (es decir, generalizaciones hipotéticas espaciotemporalmente ilimitadas que se mantienen a través de múltiples patrones empíricos de biodiversidad). Este nuevo enfoque interdisciplinario abre vías científicas sin precedentes, facilitando la comunicación y la contemplación de las implicaciones causales de las complejas interacciones eco‐evolutivas y ambientales. En esta revisión proporciono una visión general exhaustiva de los modelos eco‐evolutivos mecanísticos explícitos espacialmente basados en poblaciones (MEEMs) disponibles que se basan en reconstrucciones paleoambientales, discutiendo críticamente su relevancia y limitaciones para nuestra comprensión de la biodiversidad. Para lograr esto, primero introduzco diversos modelos de biodiversidad y contextualizo los MEEMs. Segundo, defino los MEEMs y sintetizo los principales hallazgos de estudios que utilizan MEEMs combinados con dinámicas ambientales de larga duración (> 0,1 Ma). Por último, discuto los desafíos y perspectivas de resolver enigmas de larga data sobre la biodiversidad acoplando mecanismos eco‐evolutivos con dinámicas ambientales de larga duración. Los estudios muestran que vincular entornos dinámicos y procesos eco‐evolutivos es necesario para reproducir simultáneamente múltiples patrones de biodiversidad a gran escala. Los mecanismos relacionados con las adaptaciones (por ejemplo, evolución de nicho), capacidades de dispersión y otras interacciones eco‐evolutivas (por ejemplo, aquellas que resultan en eventos de especiación o extinción) muestran una importancia universal, aunque sus firmas a través de escalas espaciales y temporales permanecen en gran medida desconocidas. Las investigaciones con MEEMS que abarcan múltiples niveles de complejidad en el espacio y el tiempo fomentan la cooperación interdisciplinaria en las ciencias naturales y muestran promesa para resolver algunos de los enigmas de la biodiversidad de la Tierra.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ecog.06132",
    doi = "10.1111/ecog.06132",
    openalex = "W4288050970",
    references = "doi101111ecog05778, doi101111evo14407"
}

Las teorías fundamentales exitosas se basan en principios verificables que incluyen variables medibles. Este artículo muestra que la teoría inclusiva de Darwin se construye sobre tales principios y sigue su camino accidentado hacia las teorías operativas modernas. Además de la reproducción, la variación y la herencia, las condiciones de diversificación de Darwin también incluyen el potencial de crecimiento poblacional exponencial (geométrico) y su naturaleza necesariamente limitada. La Lucha por la Existencia (Doctrina de Malthus), los Principios de la Selección Natural, la Exclusión Competitiva (Regla de los Contrastes Similares) y la Divergencia son meras deducciones de estas condiciones. La teoría de sistemas dinámicos de coexistencia robusta, la teoría de la dinámica adaptativa y la teoría extendida de la evolución todas asumen los principios inclusivos de Darwin como esenciales. Incorporar los retroalimentados que controlan el crecimiento poblacional y las compensaciones entre los componentes de aptitud en el núcleo de la teoría evolutiva lleva a la conclusión de que la diversificación es una característica fundamental e inherente de la vida y proporciona leyes que apoyan la determinación de la dirección esperada de la evolución en cualquier caso particular.

@misc{doi1032942osfiouh3jq,
    author = "Pásztor, Líz and Meszéna, Géza",
    title = "Leyes estables en un mundo cambiante: La estructura de las teorías evolutivas a lo largo de los siglos",
    year = "2022",
    abstract = "Las teorías fundamentales exitosas se basan en principios verificables que incluyen variables medibles. Este artículo muestra que la teoría inclusiva de Darwin se construye sobre tales principios y sigue su camino accidentado hacia las teorías operativas modernas. Además de la reproducción, la variación y la herencia, las condiciones de diversificación de Darwin también incluyen el potencial de crecimiento poblacional exponencial (geométrico) y su naturaleza necesariamente limitada. La Lucha por la Existencia (Doctrina de Malthus), los Principios de la Selección Natural, la Exclusión Competitiva (Regla de los Contrastes Similares) y la Divergencia son meras deducciones de estas condiciones. La teoría de sistemas dinámicos de coexistencia robusta, la teoría de la dinámica adaptativa y la teoría extendida de la evolución todas asumen los principios inclusivos de Darwin como esenciales. Incorporar los retroalimentados que controlan el crecimiento poblacional y las compensaciones entre los componentes de aptitud en el núcleo de la teoría evolutiva lleva a la conclusión de que la diversificación es una característica fundamental e inherente de la vida y proporciona leyes que apoyan la determinación de la dirección esperada de la evolución en cualquier caso particular.",
    url = "https://doi.org/10.32942/osf.io/uh3jq",
    doi = "10.32942/osf.io/uh3jq",
    openalex = "W4297539941",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Este libro reflexiona sobre las teorías centrales en biología evolutiva en un contexto histórico y contemporáneo. Utiliza modelos biológicos para hacerlo.

@book{doi1010079783031220289,
    author = "Dickins, Thomas E. y Dickins, Benjamin",
    title = "Biología evolutiva: Reflexiones contemporáneas e históricas sobre la teoría central",
    year = "2023",
    booktitle = "Biología evolutiva/Biología evolutiva",
    abstract = "Este libro reflexiona sobre las teorías centrales en biología evolutiva en un contexto histórico y contemporáneo. Utiliza modelos biológicos para hacerlo.",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-22028-9",
    doi = "10.1007/978-3-031-22028-9",
    openalex = "W4360981572",
    references = "doi101007978303122028911"
}

@incollection{doi101007978303122028911,
    author = "Svensson, Erik",
    title = "The Structure of Evolutionary Theory: Beyond Neo-Darwinism, Neo-Lamarckism and Biased Historical Narratives About the Modern Synthesis",
    year = "2023",
    booktitle = "Evolutionary Biology/Evolutionary biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-22028-9\_11",
    doi = "10.1007/978-3-031-22028-9\_11",
    openalex = "W4360982005",
    references = "doi101007s1206400000046, doi101016jtree200709008, doi101017s0080456800012163, doi101017s0094837300004310, doi101093genetics16297, doi101093oso97801951223430010001, doi101098rspb19790086, doi101111evo14268, doi1015159781400847266, doi102307jctvjsf433, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468"
}

@incollection{doi10100797830313030438,
    author = "Gefaell, Juan y Alejandro, Cristián",
    title = "Incommensurability in Evolutionary Biology: The Extended Evolutionary Synthesis Controversy",
    year = "2023",
    booktitle = "Investigación interdisciplinaria en evolución",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-30304-3\_8",
    doi = "10.1007/978-3-031-30304-3\_8",
    openalex = "W4380342996",
    references = "doi101007978303122028911"
}

El origen de la vida sigue siendo uno de los mayores enigmas de la ciencia. El enorme salto en la complejidad entre la sopa prebiótica y la vida celular desafía los enfoques históricamente "orientados a la química" y "orientados a la biología". La evolución debe haber superado esta brecha en la complejidad, por lo que comprender los factores que influyen en los resultados evolutivos es crucial para explorar el surgimiento de la vida. Aquí, revisamos los conocimientos de la ecología y la evolución y su aplicación a lo largo de la abiogénesis. En particular, discutimos cómo las restricciones ecológicas y evolutivas moldean la evolución de la innovación biológica. Proponemos un enfoque "eco-evolutivo", que es agnóstico hacia químicas o entornos particulares y, en su lugar, explora las varias maneras en que un sistema evolvable puede emerger y ganar complejidad.

@article{doi101093evolutqpad195,
    author = "Kalambokidis, Maria y Travisano, Michael",
    title = "Los orígenes eco-evolutivos de la vida",
    year = "2023",
    journal = "Evolución",
    abstract = {El origen de la vida sigue siendo uno de los mayores enigmas de la ciencia. El enorme salto en la complejidad entre la sopa prebiótica y la vida celular desafía los enfoques históricamente "orientados a la química" y "orientados a la biología". La evolución debe haber superado esta brecha en la complejidad, por lo que comprender los factores que influyen en los resultados evolutivos es crucial para explorar el surgimiento de la vida. Aquí, revisamos los conocimientos de la ecología y la evolución y su aplicación a lo largo de la abiogénesis. En particular, discutimos cómo las restricciones ecológicas y evolutivas moldean la evolución de la innovación biológica. Proponemos un enfoque "eco-evolutivo", que es agnóstico hacia químicas o entornos particulares y, en su lugar, explora las varias maneras en que un sistema evolvable puede emerger y ganar complejidad.},
    url = "https://doi.org/10.1093/evolut/qpad195",
    doi = "10.1093/evolut/qpad195",
    openalex = "W4388410145",
    references = "doi101007978303122028911"
}

Tradicionalmente definida como la ciencia de lo vivo, o como el campo que, más allá de la estructura anatómica y la forma corporal, estudia la organización funcional y el comportamiento, la fisiología ha sido excluida durante mucho tiempo de la investigación evolutiva. La razón principal de esta exclusión es que la fisiología tiene una perspectiva presencial y futurista sobre la vida, mientras que la teoría evolutiva se define tradicionalmente como el estudio de la historia natural. En este artículo, reevalúo estas divisiones clásicas de la ciencia y sitúo la fisiología dentro de la historia de las ciencias evolutivas, así como dentro de los debates sobre la Síntesis Evolutiva Extendida y la necesidad de una Tercera Vía de la Evolución. Luego, señalo brevemente cómo la fisiología evolutiva en particular contribuye a la investigación sobre función, causalidad, teleonomía, agencia y cognición.

@article{doi101113jp284410,
    author = "Gontier, Nathalie",
    title = "Situating physiology within evolutionary theory",
    year = "2023",
    journal = "The Journal of Physiology",
    abstract = "Traditionally defined as the science of the living, or as the field that beyond anatomical structure and bodily form studies functional organization and behaviour, physiology has long been excluded from evolutionary research. The main reason for this exclusion is that physiology has a presential and futuristic outlook on life, while evolutionary theory is traditionally defined as the study of natural history. In this paper, I re-evaluate these classic science divisions and situate physiology within the history of the evolutionary sciences, as well as within debates on the Extended Evolutionary Synthesis and the need for a Third Way of Evolution. I then briefly point out how evolutionary physiology in particular contributes to research on function, causation, teleonomy, agency and cognition.",
    url = "https://doi.org/10.1113/jp284410",
    doi = "10.1113/jp284410",
    openalex = "W4387050144",
    references = "doi101093biolinneanblac093"
}

Este ensayo intenta combinar algunos resultados teóricos recientes en (bio)semiótica sobre la arbitrariedad, el ajuste semiótico, el umwelt, la elección y la teoría extendida de la evolución en un todo más coherente. El modelo propuesto describe un ser vivo a través de su subjetividad y la capacidad de crear significado, aspectos que a menudo se pasan por alto en los modelos basados en la replicabilidad. El concepto de umwelt se divide en dos: el umwelt sincrónico y el umwelt distribuido o diacrónico. Para este último, se introduce un nuevo término 'umweb'. Se describe un mecanismo de evolución en el que la relación arbitraria seguida por el ajuste semiótico es algo análoga al mecanismo neodarwiniano de mutaciones aleatorias seguidas de selección natural. El artículo continúa discutiendo la alternancia y coexistencia de estas dos formas radicalmente diferentes de evolución y aprendizaje.

@article{doi1012697sss202351108,
    author = "Kull, Kalevi",
    title = "Consideraciones adicionales sobre la semiósisis en la evolución: Arbitrariedad más ajuste semiótico, y/o mutabilidad más selección natural",
    year = "2023",
    journal = "Sign Systems Studies",
    abstract = "Este ensayo intenta combinar algunos resultados teóricos recientes en (bio)semiótica sobre la arbitrariedad, el ajuste semiótico, el umwelt, la elección y la teoría extendida de la evolución en un todo más coherente. El modelo propuesto describe un ser vivo a través de su subjetividad y la capacidad de crear significado, aspectos que a menudo se pasan por alto en los modelos basados en la replicabilidad. El concepto de umwelt se divide en dos: el umwelt sincrónico y el umwelt distribuido o diacrónico. Para este último, se introduce un nuevo término 'umweb'. Se describe un mecanismo de evolución en el que la relación arbitraria seguida por el ajuste semiótico es algo análoga al mecanismo neodarwiniano de mutaciones aleatorias seguidas de selección natural. El artículo continúa discutiendo la alternancia y coexistencia de estas dos formas radicalmente diferentes de evolución y aprendizaje.",
    url = "https://doi.org/10.12697/sss.2023.51.1.08",
    doi = "10.12697/sss.2023.51.1.08",
    openalex = "W4378233472",
    references = "doi101007978303122028911"
}

@article{doi101016jbiosystems2024105383,
    author = "Melkikh, Alexey V.",
    title = "El problema de la direccionalidad evolutiva 50 años después de las obras de Sergei Meyen",
    year = "2024",
    journal = "Biosystems",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2024.105383",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2024.105383",
    openalex = "W4405531738",
    references = "doi101007bf02983073, doi101016jbiosystems201406008, doi101016jplrev201307001, doi101038s41467018054455, doi101038s41586021042696, doi101073pnas0500398102, doi101073pnas1120658109, doi101096fj201500083, doi101126science13434891501, doi101186gb20131410r115, openalexw4207021716"
}

Si hay un elemento cuestionable en la teoría de la evolución, es probable que sea la aleatoriedad de las mutaciones, que se considera la fuente principal del cambio evolutivo. La idea de que los errores en las secuencias de ADN son la fuente del cambio de especies no parece aceptable para muchos científicos y filósofos. Según ellos, la evolución adaptativa, que sugiere que algunas mutaciones ocurren de manera intencional, es posible. Ambas posturas parecen científicamente defendibles. Sin embargo, la ciencia suele excluir propósitos, especialmente debido a sus implicaciones sobrenaturales. Por lo tanto, el problema filosófico aquí concierne qué marco metafísico explicaría mejor un mundo natural en el que los propósitos están en acción, asumiendo que la evolución adaptativa es real. En este artículo, propongo el panpsiquismo como candidato para tal explicación. Aunque el panpsiquismo es una visión metafísica bien conocida, raramente se ha asociado con la evolución. El panpsiquismo simplemente establece que todas las entidades naturales reales poseen alguna forma de mentalidad que es intrínseca a la materia. La mentalidad debe estar presente en el nivel más fundamental de la existencia para manifestarse en cualquier forma de nivel superior. Esta idea de panpsiquismo de que la mentalidad se desarrolla gradualmente ya es compatible con la visión tradicional de la evolución de que las especies cambian lentamente e incrementalmente mediante pequeños pasos. No obstante, la hipótesis de la evolución adaptativa exige más. La idea de que los organismos pueden alterar su propio ADN en respuesta a las condiciones ambientales implica que este proceso ocurre voluntariamente de manera controlada. Sin embargo, la adaptación no siempre ocurre voluntariamente, y tal comprensión se vuelve difícil de aceptar al atribuir funciones cognitivas de nivel superior, como elegir, voluntad y toma de decisiones, a células y moléculas. Por lo tanto, se necesita un enfoque más naturalista. El panpsiquismo puede tomar muchas formas, como el panpsiquismo dualista o el panpsiquismo idealista. Sugeriría el panpsiquismo de dos aspectos como una versión totalmente naturalista de este concepto. En consecuencia, la mentalidad y la fisicalidad son dos aspectos de la misma cosa o sustancia. Al igual que no hay causalidad mental desde lo mental hacia lo físico, no hay causalidad física desde lo físico hacia lo mental. Hay procesos o eventos que se manifiestan como hechos físicos cuando se observan desde el exterior y como hechos mentales cuando se experimentan desde el interior. Junto con una interpretación del panpsiquismo de dos aspectos que sea compatible con el fisicalismo, cuando aceptamos que la forma más plausible de extender la mentalidad a todas las entidades reales es considerar la intencionalidad, puede resultar aún más fácil situar la evolución adaptativa dentro de un marco naturalista. Las mutaciones no aleatorias no ocurren como actos mentales de elección, sino que surgen del comportamiento del organismo estar sobre o dirigido hacia condiciones ambientales selectivas con el fin de asegurar la supervivencia. El artículo consta de dos partes principales. La primera parte busca establecer la posibilidad de que algunas mutaciones puedan no ser aleatorias sobre una base científico-filosófica. La segunda parte tiene como objetivo mostrar la compatibilidad de esta posibilidad con el panpsiquismo de dos aspectos. Como resultado, se espera que una interpretación aceptable de la teoría de la evolución, combinada con una interpretación naturalista del panpsiquismo, dé lugar a una síntesis fructífera que explique las acciones aparentemente intencionales de las células y los organismos.

@article{doi1014395hid1521378,
    author = "ONUR, Ferhat",
    title = "Una interpretación panpsiquista de la teoría de la evolución",
    year = "2024",
    journal = "Hitit İlahiyat Dergisi",
    abstract = "Si hay un elemento cuestionable en la teoría de la evolución, probablemente sea la aleatoriedad de las mutaciones, que se considera la fuente principal del cambio evolutivo. La idea de que los errores en las secuencias de ADN son la fuente del cambio de especies no parece aceptable para muchos científicos y filósofos. Según ellos, la evolución adaptativa, que sugiere que algunas mutaciones ocurren de manera intencional, es posible. Ambas posturas parecen científicamente defendibles. Sin embargo, la ciencia suele excluir propósitos, especialmente debido a sus implicaciones sobrenaturales. Por lo tanto, el problema filosófico aquí concierne qué marco metafísico explicaría mejor un mundo natural en el que los propósitos están en funcionamiento, asumiendo que la evolución adaptativa es real. En este artículo, propongo el panpsiquismo como candidato para tal explicación. Aunque el panpsiquismo es una visión metafísica bien conocida, raramente se ha asociado con la evolución. El panpsiquismo simplemente afirma que todas las entidades naturales reales poseen alguna forma de mentalidad que es intrínseca a la materia. La mentalidad debe estar presente en el nivel más fundamental de la existencia para manifestarse en cualquier forma de nivel superior. Esta idea de panpsiquismo de que la mentalidad se desarrolla gradualmente ya es compatible con la visión tradicional de la evolución de que las especies cambian lentamente e incrementalmente mediante pequeños pasos. No obstante, la hipótesis de la evolución adaptativa exige más. La idea de que los organismos pueden alterar su propio ADN en respuesta a las condiciones ambientales implica que este proceso ocurre voluntariamente de manera controlada. Sin embargo, la adaptación no siempre ocurre voluntariamente, y tal comprensión se vuelve difícil de aceptar al atribuir funciones cognitivas de nivel superior, como elegir, voluntad y toma de decisiones, a células y moléculas. Por lo tanto, se necesita un enfoque más naturalista. El panpsiquismo puede tomar muchas formas, como el panpsiquismo dualista o el panpsiquismo idealista. Sugiero el panpsiquismo de dos aspectos como una versión totalmente naturalista de este concepto. De acuerdo con ello, la mentalidad y la fisicalidad son dos aspectos de la misma cosa o sustancia. Al igual que no hay causalidad mental desde lo mental hacia lo físico, no hay causalidad física desde lo físico hacia lo mental. Hay procesos o eventos que se manifiestan como sucesos físicos cuando se observan desde el exterior y como sucesos mentales cuando se experimentan desde el interior. Junto con una interpretación del panpsiquismo de dos aspectos que sea compatible con el fisicalismo, cuando aceptamos que la forma más plausible de extender la mentalidad a todas las entidades reales es pensar en ella como intencionalidad, puede resultar aún más fácil situar la evolución adaptativa dentro de un marco naturalista. Las mutaciones no aleatorias no ocurren como actos mentales de elección, sino que surgen del comportamiento del organismo estar dirigido hacia condiciones ambientales selectivas con el fin de asegurar la supervivencia. El artículo consta de dos partes principales. La primera parte busca establecer la posibilidad de que algunas mutaciones no sean aleatorias sobre una base científico-filosófica. La segunda parte tiene como objetivo mostrar la compatibilidad de esta posibilidad con el panpsiquismo de dos aspectos. Como resultado, se espera que una interpretación aceptable de la teoría de la evolución, combinada con una interpretación naturalista del panpsiquismo, dé lugar a una síntesis fructífera que explique las acciones aparentemente intencionales de las células y los organismos.",
    url = "https://doi.org/10.14395/hid.1521378",
    doi = "10.14395/hid.1521378",
    openalex = "W4405793730",
    references = "doi101007978303122028911"
}

La biología evolutiva se consideraba anteriormente una ciencia histórica, con predicciones sobre trayectorias evolutivas que se creía que eran casi imposibles. El desarrollo de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento y análisis de datos ha desafiado esta creencia y ha proporcionado una abundancia de datos que arroja nuevos conocimientos sobre los procesos evolutivos. Las predicciones evolutivas ahora se utilizan cada vez más para desarrollar conocimientos fundamentales sobre sistemas en evolución y/o para demostrar el control evolutivo. Aquí investigamos los factores que hacen que la repetibilidad evolutiva sea más o menos probable para aumentar la precisión de las predicciones evolutivas. Identificamos preguntas pendientes y proporcionamos un punto de partida potencial para determinar cómo la repetibilidad evolutiva se ve afectada por la parentela genética.

@article{doi103389fevo20241335452,
    author = "Pearless, Stella M. y Freed, Nikki E.",
    title = "Desentrañando los factores de la repetibilidad evolutiva: perspectivas e ideas sobre la predictibilidad en biología evolutiva",
    year = "2024",
    journal = "Frontiers in Ecology and Evolution",
    abstract = "La biología evolutiva se consideraba anteriormente una ciencia histórica, con predicciones sobre trayectorias evolutivas que se creía que eran casi imposibles. El desarrollo de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento y análisis de datos ha desafiado esta creencia y ha proporcionado una abundancia de datos que arroja nuevos conocimientos sobre los procesos evolutivos. Las predicciones evolutivas ahora se utilizan cada vez más para desarrollar conocimientos fundamentales sobre sistemas en evolución y/o para demostrar el control evolutivo. Aquí investigamos los factores que hacen que la repetibilidad evolutiva sea más o menos probable para aumentar la precisión de las predicciones evolutivas. Identificamos preguntas pendientes y proporcionamos un punto de partida potencial para determinar cómo la repetibilidad evolutiva se ve afectada por la parentela genética.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fevo.2024.1335452",
    doi = "10.3389/fevo.2024.1335452",
    openalex = "W4395036902",
    references = "doi101038nature04742, doi101038nrg2626, doi101038nrmicro3380, doi101093genetics14841667, doi101093oso97801985464120010001, doi101111evo14268, doi101111j1469185x201100216x, doi101126science959840, doi105860choice273873, doi105962bhltitle68064, doi107312simp92414"
}

Efim Liberman (1925-2011) introdujo en 1972 la idea de la computación natural realizada internamente por los sistemas vivos. Consideró los principios físicos empleados por los sistemas vivos como restricciones esenciales que limitan el proceso computacional que ocurre durante la adaptación, la morfogénesis y la actividad neural. Los límites más generales determinados por las constantes fundamentales físicas son universales para toda la naturaleza. Sin embargo, las restricciones más específicas son intrínsecas a cada sistema biológico y pueden superarse durante el proceso evolutivo. Discutimos los roles de las macromoléculas biológicas, particularmente el citoesqueleto, en la formación de los patrones de actualización que se generan en el proceso de medición interna que ocurre en los sistemas vivos. Los reordenamientos del citoesqueleto determinan las transformaciones celulares, morfogenéticas y perceptivas en los sistemas vivos y participan en los eventos genéticos combinatorios que conducen a las transformaciones evolutivas. El funcionamiento de las neuronas se basa en la transmisión de señales a través del citoesqueleto, donde se genera una salida digital que puede ser decodificada mediante una acción reflexiva del agente perceptivo. Se concluye que los principios de la computación natural formulados por Liberman representan la característica más fundamental de los seres vivos y forman la base para la teoría general de los sistemas biológicos, con consecuencias esenciales para comprender el cierre metabólico, la morfogénesis, la evolución y la conciencia.

@article{doi101016jbiosystems2025105451,
    author = "Igamberdiev, Abir U. y Shklovskiy-Kordi, Nikita E.",
    title = "Límites físicos de la computación natural como las restricciones biológicas de la morfogénesis, la evolución y la conciencia: En el centenario de Efim Liberman (1925–2011)",
    year = "2025",
    journal = "Biosystems",
    abstract = "Efim Liberman (1925-2011) introdujo en 1972 la idea de la computación natural realizada internamente por los sistemas vivos. Consideró los principios físicos empleados por los sistemas vivos como restricciones esenciales que limitan el proceso computacional que ocurre durante la adaptación, la morfogénesis y la actividad neural. Los límites más generales determinados por las constantes fundamentales físicas son universales para toda la naturaleza. Sin embargo, las restricciones más específicas son intrínsecas a cada sistema biológico y pueden superarse durante el proceso evolutivo. Discutimos los roles de las macromoléculas biológicas, particularmente el citoesqueleto, en la formación de los patrones de actualización que se generan en el proceso de medición interna que ocurre en los sistemas vivos. Los reordenamientos del citoesqueleto determinan las transformaciones celulares, morfogenéticas y perceptivas en los sistemas vivos y participan en los eventos genéticos combinatorios que conducen a las transformaciones evolutivas. El funcionamiento de las neuronas se basa en la transmisión de señales a través del citoesqueleto, donde se genera una salida digital que puede ser decodificada mediante una acción reflexiva del agente perceptivo. Se concluye que los principios de la computación natural formulados por Liberman representan la característica más fundamental de los seres vivos y forman la base para la teoría general de los sistemas biológicos, con consecuencias esenciales para comprender el cierre metabólico, la morfogénesis, la evolución y la conciencia.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2025.105451",
    doi = "10.1016/j.biosystems.2025.105451",
    openalex = "W4408252251",
    references = "doi101016jbiosystems2022104706, doi101093biolinneanblac093, doi101093biolinneanblad037"
}

Esta revisión explora la agencia, el comportamiento intrínseco a un organismo e iniciado por él, en relación con el desarrollo de organismos multicelulares y su evolución. Preguntamos cómo los comportamientos agenciales contribuyen y cambian concomitantemente con las transiciones evolutivas de la unicelularidad a la multicelularidad, incluida la evolución de los animales desde sus antecesores unicelulares más cercanos. Consideramos la relación entre las propiedades organizativas y la agencia de los organismos multicelulares y concluimos, sorprendentemente, que no es tan estricta como lo es para las células individuales. Las principales razones son las inherencias morfogenéticas previamente no reconocidas de la materia multicelular y la capacidad del desarrollo para amplificar y particionar las funcionalidades de las células constituyentes. Estas modalidades generan habilitaciones fenotípicas novedosas que amplían el alcance del comportamiento agencial. Discutimos los enfoques experimentales para distinguir entre la agencia y los comportamientos estereotipados evolucionados de los organismos, incluidas las acciones intencionales. Argumentamos que las complejidades evolucionadas del desarrollo animal lo hacen inadecuado para explorar experimentalmente las transformaciones de célula única a multicelularidad en la agencia. En su lugar, centramos nuestra atención en la agencia en los ciclos de vida de bacterias sociales y amebas, y en las transiciones entre estados multicelulares y unicelulares en el cáncer. Finalmente, discutimos las representaciones matemáticas de sistemas dinámicos incompletamente especificados y cómo pueden utilizarse para caracterizar la autonomía biológica y la agencia.

@article{doi101086735964,
    author = "Newman, Stuart A. y Benítez, Mariana y Bhat, Ramray y Glimm, Tilmann y Kumar, K. Vijay y Nanjundiah, Vidyanand y Nicholson, Daniel J. y Sarkar, Sahotra",
    title = "Agencia en la transición evolutiva a la multicelularidad",
    year = "2025",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Esta revisión explora la agencia, el comportamiento intrínseco a un organismo e iniciado por él, en relación con el desarrollo de organismos multicelulares y su evolución. Preguntamos cómo los comportamientos agenciales contribuyen y cambian concomitantemente con las transiciones evolutivas de la unicelularidad a la multicelularidad, incluida la evolución de los animales desde sus antecesores unicelulares más cercanos. Consideramos la relación entre las propiedades organizativas y la agencia de los organismos multicelulares y concluimos, sorprendentemente, que no es tan estricta como lo es para las células individuales. Las principales razones son las inherencias morfogenéticas previamente no reconocidas de la materia multicelular y la capacidad del desarrollo para amplificar y particionar las funcionalidades de las células constituyentes. Estas modalidades generan habilitaciones fenotípicas novedosas que amplían el alcance del comportamiento agencial. Discutimos los enfoques experimentales para distinguir entre la agencia y los comportamientos estereotipados evolucionados de los organismos, incluidas las acciones intencionales. Argumentamos que las complejidades evolucionadas del desarrollo animal lo hacen inadecuado para explorar experimentalmente las transformaciones de célula única a multicelularidad en la agencia. En su lugar, centramos nuestra atención en la agencia en los ciclos de vida de bacterias sociales y amebas, y en las transiciones entre estados multicelulares y unicelulares en el cáncer. Finalmente, discutimos las representaciones matemáticas de sistemas dinámicos incompletamente especificados y cómo pueden utilizarse para caracterizar la autonomía biológica y la agencia.",
    url = "https://doi.org/10.1086/735964",
    doi = "10.1086/735964",
    openalex = "W4410763737",
    references = "doi101007s13752024004717, doi1010179781108616751"
}

@article{doi101093evolutqpaf036,
    author = "Bailey, Nick",
    title = "Pasos hacia una genómica evolutiva unificada",
    year = "2025",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1093/evolut/qpaf036",
    doi = "10.1093/evolut/qpaf036",
    openalex = "W4407796936",
    references = "doi101007978303122028911"
}