Silvicultura

@article{brown1943some1,
    author = "Brown, R. W",
    title = "Some prehistoric trees of the United States",
    year = "1943",
    journal = "Journal of Forestry, v. 41, p. 861-868",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brown, R. W., 1943, Some prehistoric trees of the United States: Journal of Forestry, v. 41, p. 861-868.}"
}

@misc{cheney1948metasequoia3,
    author = "Cheney, R. W",
    title = "Descubrimiento de Metasequoia",
    year = "1948",
    howpublished = "American Scientist, v. 36, p. 490- 494",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Cheney, R. W., 1948, Descubrimiento de Metasequoia: American Scientist, v. 36, p. 490- 494.}"
}

@book{chaney1949evolutionary2,
    author = "Chaney, R. W",
    title = "Tendencias evolutivas en las angiospermas, en Jepsen, G. L., Simpson, G. G., y Mayr, E., eds., Genética, Paleontología y Evolución",
    year = "1949",
    publisher = "Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Chaney, R. W., 1949, Evolutionary trends in the angiosperms, in Jepsen, G. L., Simpson, G. G., and Mayr, E., eds., Genetics, Paleontology and Evolution: Princeton, New Jersey, Princeton University Press, p. 190-201; 474 p.}"
}

Artículo de revista SISTEMAS DE POLINIZACIÓN COMO MECANISMOS AISLANTES EN ANGIOSPERMAS Obtener acceso Verne Grant Verne Grant Departamento de Botánica Universidad de California Berkeley Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Evolución, Volumen 3, Número 1, 1 de marzo de 1949, Páginas 82–97, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x Publicado: 01 de marzo de 1949 Historial del artículo Recibido: 08 de diciembre de 1948 Publicado: 01 de marzo de 1949

@article{doi101111j155856461949tb00007x,
    author = "Grant, Verne",
    title = "SISTEMAS DE POLINIZACIÓN COMO MECANISMOS AISLANTES EN ANGIOSPERMAS",
    year = "1949",
    journal = "Evolución",
    abstract = "Artículo de revista SISTEMAS DE POLINIZACIÓN COMO MECANISMOS AISLANTES EN ANGIOSPERMAS Obtener acceso Verne Grant Verne Grant Departamento de Botánica Universidad de California Berkeley Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar Evolución, Volumen 3, Número 1, 1 de marzo de 1949, Páginas 82–97, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x Publicado: 01 de marzo de 1949 Historial del artículo Recibido: 08 de diciembre de 1948 Publicado: 01 de marzo de 1949",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1949.tb00007.x",
    openalex = "W2318566535",
    references = "doi101093aesa304641"
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@article{beal1950genetics,
    author = "Beal, J. M.",
    title = "Genética, Paleontología y Evolución. G. L. Jepsen, G. G. Simpson, Ernst Mayr",
    year = "1950",
    journal = "Botanical Gazette",
    url = "https://doi.org/10.1086/335639",
    doi = "10.1086/335639",
    number = "1",
    pages = "141-141",
    volume = "112"
}

@article{crossref1950genetics,
    title = "Genética, Paleontología y Evolución. Glenn L. Jepsen, Ernst Mayr, George Gaylord Simpson",
    year = "1950",
    journal = "The Journal of Geology",
    url = "https://doi.org/10.1086/625741",
    doi = "10.1086/625741",
    number = "3",
    pages = "283-283",
    volume = "58"
}

@article{glass1951genetics,
    author = "Glass, Bentley",
    title = "Genética, Paleontología y Evolución. Glenn L. Jepsen, Ernst Mayr, George Gaylord Simpson",
    year = "1951",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/398105",
    doi = "10.1086/398105",
    number = "2",
    pages = "202-203",
    volume = "26"
}

@incollection{doi101016s0065266008600486,
    author = "Bradshaw, A. D.",
    title = "Significado evolutivo de la plasticidad fenotípica en plantas",
    year = "1965",
    booktitle = "Avances en genética",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0065-2660(08)60048-6",
    doi = "10.1016/s0065-2660(08)60048-6",
    openalex = "W206110177",
    references = "doi101016s0065211308603971, doi101111j146918091949tb02451x, doi104159harvard9780674865327, doi107312steb94536"
}

@article{bryant1971genetics,
    author = "Bryant, Peter J.",
    title = "Genética de la evolución: Genética del proceso evolutivo T. Dobzhansky",
    year = "1971",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.2307/1295826",
    doi = "10.2307/1295826",
    number = "16",
    openalex = "W2325350562",
    pages = "879-879",
    volume = "21"
}

Se revisa la controversia sobre la ventaja evolutiva de la recombinación, inicialmente descubierta por Fisher y por Muller. Aquellos autores cuyos modelos tenían efectos de población finita encontraron una ventaja de la recombinación, y aquellos cuyos modelos tenían poblaciones infinitas no encontraron ninguna. La ventaja de la recombinación es que rompe el desequilibrio de ligamiento aleatorio generado por la deriva genética. Hill y Robertson encontraron que el efecto promedio de este desequilibrio de ligamiento generado aleatoriamente era causar que los loci enlazados interfirieran con la respuesta de cada uno a la selección, incluso donde no había interacción génica entre los loci. Este efecto se muestra idéntico al argumento original de Fisher y Muller. También predice el "mecanismo de engranaje" descubierto por Muller, quien señaló que los mutantes deletéreos aumentarían más fácilmente en una población sin recombinación. Las simulaciones por computadora de la sustitución de mutantes favorables y del aumento a largo plazo de mutantes deletéreos verificaron la esencial corrección del argumento original de Fisher-Muller y la realidad del mecanismo de engranaje de Muller. Se argumenta que estos constituyen una ventaja intrínseca de la recombinación capaz de explicar su persistencia frente a la selección por un ligamiento más estrecho entre polimorfismos interactuantes, y posiblemente capaz de explicar su origen.

@article{doi101093genetics782737,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "LA VENTAJA EVOLUCIONARIA DE LA RECOMBINACIÓN",
    year = "1974",
    journal = "Genetics",
    abstract = {Se revisa la controversia sobre la ventaja evolutiva de la recombinación, inicialmente descubierta por Fisher y por Muller. Aquellos autores cuyos modelos tenían efectos de población finita encontraron una ventaja de la recombinación, y aquellos cuyos modelos tenían poblaciones infinitas no encontraron ninguna. La ventaja de la recombinación es que rompe el desequilibrio de ligamiento aleatorio generado por la deriva genética. Hill y Robertson encontraron que el efecto promedio de este desequilibrio de ligamiento generado aleatoriamente era causar que los loci enlazados interfirieran con la respuesta de cada uno a la selección, incluso donde no había interacción génica entre los loci. Este efecto se muestra idéntico al argumento original de Fisher y Muller. También predice el "mecanismo de engranaje" descubierto por Muller, quien señaló que los mutantes deletéreos aumentarían más fácilmente en una población sin recombinación. Las simulaciones por computadora de la sustitución de mutantes favorables y del aumento a largo plazo de mutantes deletéreos verificaron la esencial corrección del argumento original de Fisher-Muller y la realidad del mecanismo de engranaje de Muller. Se argumenta que estos constituyen una ventaja intrínseca de la recombinación capaz de explicar su persistencia frente a la selección por un ligamiento más estrecho entre polimorfismos interactuantes, y posiblemente capaz de explicar su origen.},
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/78.2.737",
    doi = "10.1093/genetics/78.2.737",
    openalex = "W2130315111",
    references = "doi1023072341823"
}

@article{doi101111j155856461975tb00851x,
    author = "Felsenstein, Joseph",
    title = "THE GENÉTICA DE LA BASE DEL CAMBIO EVOLUCIONISTA",
    year = "1975",
    journal = "Evolución",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00851.x",
    openalex = "W1547248981"
}

Originalmente publicada en 1982, La obra maestra de la naturaleza examina la sexualidad como representativa del desafío más importante a la teoría moderna de la evolución. El libro sugiere que la sexualidad evolucionó, no como resultado de los procesos normales de selección natural darwiniana, sino a través de la competencia entre poblaciones o especies - una hipótesis casi universalmente desacreditada en otros lugares. El libro también discute la naturaleza de la sexualidad y sus consecuencias para el individuo y para la población, así como varias otras teorías sobre la sexualidad. Dado que el valor de estas teorías se considera que reside enteramente en su capacidad para predecir los patrones de sexualidad observados en la naturaleza, el libro busca proporcionar una revisión extensa de las circunstancias en las que la sexualidad se atenúa o se pierde a lo largo del reino animal, y estos hechos se utilizan luego para evaluar los méritos de las teorías rivales. Este libro será de interés para los investigadores en el área de la genética, la ecología y la biología evolutiva.

@book{openalexw1523843460,
    author = "Bell, Graham",
    title = "La obra maestra de la naturaleza: La evolución y la genética de la sexualidad",
    year = "1981",
    abstract = "Originalmente publicada en 1982, La obra maestra de la naturaleza examina la sexualidad como representativa del desafío más importante a la teoría moderna de la evolución. El libro sugiere que la sexualidad evolucionó, no como resultado de los procesos normales de selección natural darwiniana, sino a través de la competencia entre poblaciones o especies - una hipótesis casi universalmente desacreditada en otros lugares. El libro también discute la naturaleza de la sexualidad y sus consecuencias para el individuo y para la población, así como varias otras teorías sobre la sexualidad. Dado que el valor de estas teorías se considera que reside enteramente en su capacidad para predecir los patrones de sexualidad observados en la naturaleza, el libro busca proporcionar una revisión extensa de las circunstancias en las que la sexualidad se atenúa o se pierde a lo largo del reino animal, y estos hechos se utilizan luego para evaluar los méritos de las teorías rivales. Este libro será de interés para los investigadores en el área de la genética, la ecología y la biología evolutiva.",
    openalex = "W1523843460"
}

Parte 1 Variación genética: esenciales genéticas y moleculares tipos de polimorfismos organización de la variación genética endogamia. Parte 2 Las causas de la evolución: mutación migración selección natural deriva genética aleatoria. Parte 3 Genética de poblaciones molecular: polimorfismos moleculares patrones de cambio en secuencias de nucleótidos y aminoácidos polimorfismo y divergencia filogenética molecular elementos transponibles. Parte 4 La arquitectura genética de rasgos complejos: tipos de rasgos complejos variación fenotípica genética y ambiente selección artificial correlación entre parientes genética cuantitativa de poblaciones naturales rasgos complejos con expresión discreta loci de rasgos cuantitativos (QTLs).

@book{openalexw1525494019,
    author = "Hartl, Daniel L.",
    title = "A primer of population genetics",
    year = "1981",
    abstract = "Parte 1 Variación genética: esenciales genéticas y moleculares tipos de polimorfismos organización de la variación genética endogamia. Parte 2 Las causas de la evolución: mutación migración selección natural deriva genética aleatoria. Parte 3 Genética de poblaciones molecular: polimorfismos moleculares patrones de cambio en secuencias de nucleótidos y aminoácidos polimorfismo y divergencia filogenética molecular elementos transponibles. Parte 4 La arquitectura genética de rasgos complejos: tipos de rasgos complejos variación fenotípica genética y ambiente selección artificial correlación entre parientes genética cuantitativa de poblaciones naturales rasgos complejos con expresión discreta loci de rasgos cuantitativos (QTLs).",
    openalex = "W1525494019"
}

Artículo de Revista Una Teoría Evolutiva del Cambio Económico Obtener acceso Una Teoría Evolutiva del Cambio Económico. Por Richard R. Nelson y Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts & Londres: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby Universidad de Stirling Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Volumen 93, Número 371, 1 de septiembre de 1983, Páginas 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Publicado: 01 de septiembre de 1983

@article{doi1023072232409,
    author = "Loasby, Brian J. y Nelson, Richard R. y Winter, Sidney G.",
    title = "Una Teoría Evolutiva del Cambio Económico.",
    year = "1983",
    journal = "The Economic Journal",
    abstract = "Artículo de Revista Una Teoría Evolutiva del Cambio Económico Obtener acceso Una Teoría Evolutiva del Cambio Económico. Por Richard R. Nelson y Sidney G. Winter. (Cambridge, Massachusetts \& Londres: Harvard University Press, 1982. Pp. xi +437. £17.50.) Brian J. Loasby Brian J. Loasby Universidad de Stirling Buscar otras obras de este autor en: Oxford Academic Google Scholar The Economic Journal, Volumen 93, Número 371, 1 de septiembre de 1983, Páginas 652–654, https://doi.org/10.2307/2232409 Publicado: 01 de septiembre de 1983",
    url = "https://doi.org/10.2307/2232409",
    doi = "10.2307/2232409",
    openalex = "W2137358449"
}

La Cuarta Edición de Genética de Poblaciones es la introducción más actual, completa y accesible al campo para estudiantes de pregrado y posgrado avanzados, y para investigadores en genética, evolución, conservación y campos relacionados. En los últimos años, el interés en la aplicación de los principios de la genética de poblaciones a nuevos datos moleculares ha aumentado considerablemente, y la nueva edición del Dr. Hedrick ejemplifica su compromiso de mantenerse al día con este área dinámica de estudio. Reorganizada para permitir que los estudiantes se enfoquen más claramente en el material clave, la Cuarta Edición integra la cobertura de cuestiones teóricas con una presentación clara de la genética de poblaciones experimental y datos empíricos. Tomando ejemplos de estudios recientes y clásicos, y utilizando una variedad de organismos para ilustrar los vastos desarrollos de la genética de poblaciones, este texto proporciona a los estudiantes e investigadores el recurso más completo en el campo.

@book{openalexw1495050269,
    author = "Hedrick, Philip W.",
    title = "Genética de poblaciones",
    year = "1983",
    abstract = "La Cuarta Edición de Genética de Poblaciones es la introducción más actual, completa y accesible al campo para estudiantes de pregrado y posgrado avanzados, y para investigadores en genética, evolución, conservación y campos relacionados. En los últimos años, el interés en la aplicación de los principios de la genética de poblaciones a nuevos datos moleculares ha aumentado considerablemente, y la nueva edición del Dr. Hedrick ejemplifica su compromiso de mantenerse al día con este área dinámica de estudio. Reorganizada para permitir que los estudiantes se enfoquen más claramente en el material clave, la Cuarta Edición integra la cobertura de cuestiones teóricas con una presentación clara de la genética de poblaciones experimental y datos empíricos. Tomando ejemplos de estudios recientes y clásicos, y utilizando una variedad de organismos para ilustrar los vastos desarrollos de la genética de poblaciones, este texto proporciona a los estudiantes e investigadores el recurso más completo en el campo.",
    openalex = "W1495050269"
}

@incollection{doi10100797836425158802,
    author = "Nevo, Eviatar y Beiles, Avigdor y Ben‐Shlomo, Rachel",
    title = "La Significación Evolutiva de la Diversidad Genética: Correlatos Ecológicos, Demográficos e Históricos de la Vida",
    year = "1984",
    booktitle = "Apuntes de conferencias en biomatemáticas",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-642-51588-0\_2",
    doi = "10.1007/978-3-642-51588-0\_2",
    openalex = "W175060409",
    references = "doi101111j155856461960tb03113x, doi101126science16238611453, doi101146annureves10110179001133, openalexw1523843460"
}

(Subido por Plazi para el Proyecto de Literatura sobre Murciélagos) No se proporciona un resumen.

@article{doi101146annureves18110187001321,
    author = "Charlesworth, Deborah y Charlesworth, Brian",
    title = "DEPRESIÓN POR ENDOGAMIA Y SUS CONSECUENCIAS EVOLUTIVAS",
    year = "1987",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "(Subido por Plazi para el Proyecto de Literatura sobre Murciélagos) No se proporciona un resumen.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.18.110187.001321",
    doi = "10.1146/annurev.es.18.110187.001321",
    openalex = "W2167243456",
    references = "doi101017s0305004100015644, doi101073pnas4211855, doi101111j155856461975tb00851x, doi105962bhltitle122451, doi107312steb94536, openalexw2062594085"
}

Predecir la extinción de poblaciones individuales o especies requiere información ecológica y evolutiva. Los factores demográficos primarios que afectan la dinámica poblacional incluyen la estructura social, la variación en el ciclo de vida causada por fluctuaciones ambientales, la dispersión en ambientes espacialmente heterogéneos, y la extinción y colonización locales. En poblaciones pequeñas, la endogamia puede reducir considerablemente la aptitud promedio individual, y la pérdida de variabilidad genética debido a la deriva genética aleatoria puede disminuir la futura adaptabilidad a un ambiente cambiante. La teoría y ejemplos empíricos sugieren que la demografía suele ser de importancia más inmediata que la genética de poblaciones al determinar los tamaños mínimos viables de poblaciones silvestres. La necesidad práctica en la conservación biológica de comprender la interacción de factores demográficos y genéticos en la extinción puede proporcionar un enfoque para avances fundamentales en la interfaz entre ecología y evolución.

@article{doi101126science3420403,
    author = "Lande, Russell",
    title = "Genetics and Demography in Biological Conservation",
    year = "1988",
    journal = "Science",
    abstract = "Predicting the extinction of single populations or species requires ecological and evolutionary information. Primary demographic factors affecting population dynamics include social structure, life history variation caused by environmental fluctuation, dispersal in spatially heterogeneous environments, and local extinction and colonization. In small populations, inbreeding can greatly reduce the average individual fitness, and loss of genetic variability from random genetic drift can diminish future adaptability to a changing environment. Theory and empirical examples suggest that demography is usually of more immediate importance than population genetics in determining the minimum viable sizes of wild populations. The practical need in biological conservation for understanding the interaction of demographic and genetic factors in extinction may provide a focus for fundamental advances at the interface of ecology and evolution.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3420403",
    doi = "10.1126/science.3420403",
    openalex = "W2094387116",
    references = "doi101016000632078690025x, doi101016c20090029523, doi101017s0016672300016037, doi101093besa153237, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461975tb00851x, doi101126science2214609459, doi101126science2314734129, doi101146annureves18110187001321, doi1015159781400881376, doi1023071308256, doi1023072529912, openalexw1500291103, openalexw2318111898"
}

Resumen Desde Darwin, ha sido segunda naturaleza para los biólogos evolutivos pensar de manera comparativa, ya que las comparaciones establecen la generalidad de los fenómenos evolutivos. ¿Frenan los genomas grandes el desarrollo? ¿Qué estilos de vida seleccionan cerebros grandes? ¿Están las tasas de extinción relacionadas con el tamaño corporal? Todas estas son preguntas para el método comparativo, y este libro trata sobre cómo se pueden responder tales preguntas. El primer capítulo profundiza en las preguntas adecuadas para el enfoque comparativo y muestra cómo complementa otros enfoques para la resolución de problemas en la evolución. El segundo capítulo identifica las causas biológicas de la similitud entre especies estrechamente relacionadas para casi cualquier carácter observado. El tercer capítulo discute métodos para reconstruir árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales. El cuarto capítulo se propone desarrollar pruebas estadísticas que determinen si diferentes caracteres que existen en estados discretos muestran evidencia de evolución correlacionada. El capítulo 5 se centra en análisis comparativos de caracteres que varían continuamente. El capítulo 6 examina la alometría para ejemplificar los temas y métodos discutidos anteriormente, mientras que el último capítulo mira hacia el futuro desarrollo del enfoque comparativo tanto en biología molecular como en biología orgánica.

@book{doi101093oso97801985464120010001,
    author = "Harvey, Paul y Pagel, Mark",
    title = "The Comparative Method in Evolutionary Biology",
    year = "1991",
    abstract = "Resumen Desde Darwin, ha sido segunda naturaleza para los biólogos evolutivos pensar de manera comparativa, ya que las comparaciones establecen la generalidad de los fenómenos evolutivos. ¿Frenan los genomas grandes el desarrollo? ¿Qué estilos de vida seleccionan cerebros grandes? ¿Están las tasas de extinción relacionadas con el tamaño corporal? Todas estas son preguntas para el método comparativo, y este libro trata sobre cómo se pueden responder tales preguntas. El primer capítulo profundiza en las preguntas adecuadas para el enfoque comparativo y muestra cómo complementa otros enfoques para la resolución de problemas en la evolución. El segundo capítulo identifica las causas biológicas de la similitud entre especies estrechamente relacionadas para casi cualquier carácter observado. El tercer capítulo discute métodos para reconstruir árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales. El cuarto capítulo se propone desarrollar pruebas estadísticas que determinen si diferentes caracteres que existen en estados discretos muestran evidencia de evolución correlacionada. El capítulo 5 se centra en análisis comparativos de caracteres que varían continuamente. El capítulo 6 examina la alometría para ejemplificar los temas y métodos discutidos anteriormente, mientras que el último capítulo mira hacia el futuro desarrollo del enfoque comparativo tanto en biología molecular como en biología orgánica.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780198546412.001.0001",
    openalex = "W4388245928"
}

El método comparativo para estudiar la adaptación ¿por qué preocuparse por la filogenia? reconstrucción de árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales análisis comparativo de datos discretos análisis comparativo de variables continuas determinación de la forma de las relaciones comparativas.

@article{doi105860choice295104,
    title = "El método comparativo en biología evolutiva",
    year = "1992",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "El método comparativo para estudiar la adaptación ¿por qué preocuparse por la filogenia? reconstrucción de árboles filogenéticos y estados de caracteres ancestrales análisis comparativo de datos discretos análisis comparativo de variables continuas determinación de la forma de las relaciones comparativas.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.29-5104",
    doi = "10.5860/choice.29-5104",
    openalex = "W1488393970"
}

@article{doi1010160304377093900688,
    author = "Barrett, Spencer C. H. y Eckert, Christopher G. y Husband, Brian C.",
    title = "Procesos evolutivos en poblaciones de plantas acuáticas",
    year = "1993",
    journal = "Aquatic Botany",
    url = "https://doi.org/10.1016/0304-3770(93)90068-8",
    doi = "10.1016/0304-3770(93)90068-8",
    openalex = "W1985368951",
    references = "doi101016037811199090073z, doi101086282771, doi101093genetics16297, doi101111j146918091949tb02451x, doi101146annureves16110185002141, doi1023072402622, doi1023072444338, doi1023072529912, laushman1993population, openalexw2021831883, openalexw2077454220, openalexw2146778590"
}

@article{laushman1993population,
    author = "Laushman, Roger H.",
    title = "Genética de poblaciones de angiospermas hidrófilas",
    year = "1993",
    journal = "Aquatic Botany",
    url = "https://doi.org/10.1016/0304-3770(93)90069-9",
    doi = "10.1016/0304-3770(93)90069-9",
    number = "2-3",
    openalex = "W2060939568",
    pages = "147-158",
    volume = "44",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi1010160304377093900688, doi101093oxfordjournalsjhereda109497, doi101111j155856461975tb00851x, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi1023072444338, openalexw1495050269, openalexw1525494019, openalexw2146778590"
}

La diversidad genética es uno de los tres niveles de diversidad biológica que requieren conservación. La teoría genética predice que los niveles de variación genética deberían aumentar con el tamaño efectivo de la población. Soulé (1976) compiló la primera evidencia convincente de que los niveles de variación genética en la vida silvestre estaban relacionados con el tamaño de la población, pero este tema sigue siendo controvertido. La hipótesis de que la variación genética está relacionada con el tamaño de la población conduce a las siguientes predicciones: (1) la variación genética dentro de las especies debería estar relacionada con el tamaño de la población; (2) la variación genética dentro de las especies debería estar relacionada con el tamaño de la isla; (3) la variación genética debería estar relacionada con el tamaño de la población dentro de los grupos taxonómicos; (4) las especies de amplia distribución deberían tener más variación genética que las especies restringidas; (5) la variación genética en los animales debería estar negativamente correlacionada con el tamaño corporal; (6) la variación genética debería estar negativamente correlacionada con la tasa de evolución cromosómica; (7) la variación genética entre especies debería estar relacionada con el tamaño de la población; (8) los vertebrados deberían tener menos variación genética que los invertebrados o las plantas; (9) las poblaciones insulares deberían tener menos variación genética que las poblaciones continentales; y (10) las especies en peligro deberían tener menos variación genética que las especies no en peligro. Las observaciones empíricas apoyan todas estas hipótesis. No puede haber duda de que la variación genética está relacionada con el tamaño de la población, como propuso Soulé. El pequeño tamaño de la población reduce el potencial evolutivo de las especies de vida silvestre.

@article{doi101046j15231739199610061500x,
    author = "Frankham, Richard",
    title = "Relationship of Genetic Variation to Population Size in Wildlife",
    year = "1996",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "Genetic diversity is one of three levels of biological diversity requiring conservation. Genetic theory predicts that levels of genetic variation should increase with effective population size. Soulé (1976) compiled the first convincing evidence that levels of genetic variation in wildlife were related to population size, but this issue remains controversial. The hypothesis that genetic variation is related to population size leads to the following predictions: (1) genetic variation within species should be related to population size; (2) genetic variation within species should be related to island size; (3) genetic variation should be related to population size within taxonomic groups; (4) widespread species should have more genetic variation than restricted species; (5) genetic variation in animals should be negatively correlated with body size; (6) genetic variation should be negatively correlated with rate of chromosome evolution; (7) genetic variation across species should be related to population size; (8) vertebrates should have less genetic variation than invertebrates or plants; (9) island populations should have less genetic variation than mainland populations; and (10) endangered species should have less genetic variation than nonendangered species. Empirical observations support all these hypotheses. There can be no doubt that genetic variation is related to population size, as Soulé proposed. Small population size reduces the evolutionary potential of wildlife species.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1523-1739.1996.10061500.x",
    doi = "10.1046/j.1523-1739.1996.10061500.x",
    openalex = "W2164595396",
    references = "openalexw2146778590"
}

▪ Resumen El estudio de poblaciones vegetales naturales ha proporcionado algunos de los casos más fuertes y convincentes de la operación de la selección natural conocidos actualmente, en parte debido a la facilidad para realizar experimentos de trasplante recíproco, trabajos en jardín común y manipulación in situ a largo plazo. La diferenciación genética entre poblaciones vegetales a pequeña escala (unos pocos cm a unos cientos de cm) ha sido documentada y se revisa aquí, en anuales y perennes herbáceas, perennes leñosas, acuáticas, terrestres, endémicas de distribución restringida y especies ampliamente distribuidas. La diferenciación de caracteres ha sido documentada para la mayoría de las características importantes de la estructura y función de las plantas. Se conocen ejemplos para caracteres de semillas, rasgos foliares, fenología, actividades fisiológicas y bioquímicas, tolerancia a metales pesados, resistencia a herbicidas, resistencia a parásitos, capacidad competitiva, caracteres organelares, sistemas de apareamiento e historia de vida. Entre las fuerzas que han moldeado estos patrones de diferenciación se encuentran suelos tóxicos, fertilizantes, siega y pastoreo, humedad del suelo, temperatura, intensidad de la luz, vectores de polinización, parasitismo, flujo génico y dinámicas naturales. La amplitud y profundidad de la evidencia revisada aquí apoyan fuertemente la idea de que la selección natural es la fuerza principal que moldea la arquitectura genética en poblaciones vegetales naturales; esa visión necesita ser más ampliamente apreciada de lo que es actualmente.

@article{doi101146annurevecolsys271237,
    author = "Linhart, Yan B. y Grant, Michael C.",
    title = "SIGNIFICADO EVOLUCIONISTA DE LA DIFERENCIACIÓN GENÉTICA LOCAL EN LAS PLANTAS",
    year = "1996",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Resumen El estudio de poblaciones vegetales naturales ha proporcionado algunos de los casos más fuertes y convincentes de la operación de la selección natural conocidos actualmente, en parte debido a la facilidad para realizar experimentos de trasplante recíproco, trabajos en jardín común y manipulación in situ a largo plazo. La diferenciación genética entre poblaciones vegetales a pequeña escala (unos pocos cm a unos cientos de cm) ha sido documentada y se revisa aquí, en anuales y perennes herbáceas, perennes leñosas, acuáticas, terrestres, endémicas de distribución restringida y especies ampliamente distribuidas. La diferenciación de caracteres ha sido documentada para la mayoría de las características importantes de la estructura y función de las plantas. Se conocen ejemplos para caracteres de semillas, rasgos foliares, fenología, actividades fisiológicas y bioquímicas, tolerancia a metales pesados, resistencia a herbicidas, resistencia a parásitos, capacidad competitiva, caracteres organelares, sistemas de apareamiento e historia de vida. Entre las fuerzas que han moldeado estos patrones de diferenciación se encuentran suelos tóxicos, fertilizantes, siega y pastoreo, humedad del suelo, temperatura, intensidad de la luz, vectores de polinización, parasitismo, flujo génico y dinámicas naturales. La amplitud y profundidad de la evidencia revisada aquí apoyan fuertemente la idea de que la selección natural es la fuerza principal que moldea la arquitectura genética en poblaciones vegetales naturales; esa visión necesita ser más ampliamente apreciada de lo que es actualmente.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.27.1.237",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.27.1.237",
    openalex = "W2130703487",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi10100797814615694425, doi1010079781489930439, doi101016037811199090073z, doi101038scientificamerican117998, doi101111j155856461993tb01215x, doi101126science15739260, doi101146annureves06110175002011, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi101146annureves18110187000323, doi101146annureves19110188000551, doi101146annurevge25120191000245, doi1015159781400820108, doi1023072444338, doi104159harvard9780674865327, openalexw2080618944, openalexw2146778590"
}

ambientes y se volvieron acuáticos. Las plantas acuáticas son especies que perpetúan su ciclo de vida en agua estancada o corriente, o en suelos hídricos inundados o no inundados. Las angiospermas acuáticas habitan océanos, lagos, ríos y humedales. La transición a una vida acuática ha sido lograda por solo el 2% de las aproximadamente 350.000 especies de angiospermas (Cook 1990). No obstante, se estima que la invasión evolutiva de ambientes acuáticos por angiospermas terrestres representa 50-100 eventos independientes (Cook 1990). Aunque las plantas acuáticas se discuten típicamente como un grupo biológico unificado, las formas en que las especies han evolucionado para vivir en el medio acuático son tan diversas como las diferentes

@article{doi1023071312967,
    author = "Philbrick, C. Thomas y Les, Donald H.",
    title = "Evolución de los sistemas reproductivos de angiospermas acuáticas",
    year = "1996",
    journal = "BioScience",
    abstract = "ambientes y se volvieron acuáticos. Las plantas acuáticas son especies que perpetúan su ciclo de vida en agua estancada o corriente, o en suelos hídricos inundados o no inundados. Las angiospermas acuáticas habitan océanos, lagos, ríos y humedales. La transición a una vida acuática ha sido lograda por solo el 2% de las aproximadamente 350.000 especies de angiospermas (Cook 1990). No obstante, se estima que la invasión evolutiva de ambientes acuáticos por angiospermas terrestres representa 50-100 eventos independientes (Cook 1990). Aunque las plantas acuáticas se discuten típicamente como un grupo biológico unificado, las formas en que las especies han evolucionado para vivir en el medio acuático son tan diversas como las diferentes",
    url = "https://doi.org/10.2307/1312967",
    doi = "10.2307/1312967",
    openalex = "W1847045724",
    references = "laushman1993population"
}

Las organizaciones evolucionan a través de periodos de cambio incremental o evolutivo, interrumpidos por cambios discontinuos o revolucionarios. El desafío para los gerentes es adaptar la cultura y la estrategia de sus organizaciones a su entorno actual, pero de manera que no comprometa su capacidad para ajustarse a cambios radicales en ese entorno. Deben, en otras palabras, crear una organización ambidiestra —una capaz de perseguir simultáneamente tanto la innovación incremental como la discontinua.

@article{doi10230741165852,
    author = "Tushman, Michael L. y O’Reilly, Charles A.",
    title = "Organizaciones ambidiestras: Gestionando el cambio evolutivo y revolucionario",
    year = "1996",
    journal = "California Management Review",
    abstract = "Las organizaciones evolucionan a través de periodos de cambio incremental o evolutivo, interrumpidos por cambios discontinuos o revolucionarios. El desafío para los gerentes es adaptar la cultura y la estrategia de sus organizaciones a su entorno actual, pero de manera que no comprometa su capacidad para ajustarse a cambios radicales en ese entorno. Deben, en otras palabras, crear una organización ambidiestra —una capaz de perseguir simultáneamente tanto la innovación incremental como la discontinua.",
    url = "https://doi.org/10.2307/41165852",
    doi = "10.2307/41165852",
    openalex = "W2023596193"
}

Donald H. Les, Maryke A. Cleland, Michelle Waycott, Estudios filogenéticos en Alismatidae, II: Evolución de Angiospermas Marinos (Posidonia) y Hidrofilia, Systematic Botany, Vol. 22, No. 3 (Jul. - Sep., 1997), pp. 443-463

@article{doi1023072419820,
    author = "Les, Donald H. y Cleland, Maryke A. y Waycott, Michelle",
    title = "Estudios filogenéticos en Alismatidae, II: Evolución de Angiospermas Marinos (Posidonia) y Hidrofilia",
    year = "1997",
    journal = "Systematic Botany",
    abstract = "Donald H. Les, Maryke A. Cleland, Michelle Waycott, Estudios filogenéticos en Alismatidae, II: Evolución de Angiospermas Marinos (Posidonia) y Hidrofilia, Systematic Botany, Vol. 22, No. 3 (Jul. - Sep., 1997), pp. 443-463",
    url = "https://doi.org/10.2307/2419820",
    doi = "10.2307/2419820",
    openalex = "W2149777618",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

Las islas Hawái se forman a medida que la Placa del Pacífico se mueve sobre un 'punto caliente' en el manto de la Tierra donde el magma se extruye a través de la corteza para construir enormes volcanes de escudo. Las islas se hunden y se erosionan a medida que la placa las transporta hacia el noroeste, convirtiéndose eventualmente en atolones de coral y montes submarinos. Por lo tanto, las islas están ordenadas linealmente por edad, con las islas más antiguas en el noroeste (por ejemplo, Kauai a 5,1 Ma) y las más jóvenes en el sureste (por ejemplo, Hawaii a 0,43 Ma). Las estimaciones de K-Ar de la fecha de formación de una isla proporcionan una edad máxima para los taxones que habitan la isla. Estas edades pueden utilizarse para calibrar las tasas de cambio molecular bajo las siguientes suposiciones: (i) las fechas de K-Ar son precisas; (ii) las topologías de los árboles muestran que la derivación de los taxones sigue el momento de la formación de la isla; (iii) las poblaciones no colonizan mucho tiempo después de la emergencia de la isla; (iv) el punto de coalescencia para los taxones hermanos no antecede mucho a la formación de la isla más joven colonizada; (v) los efectos de saturación y (vi) la variación de tasas entre linajes son mínimas o corregibles; y (vii) los errores estándar no sesgados de las distancias y las regresiones pueden estimarse a partir de múltiples comparaciones por pares. Utilizamos este enfoque para obtener calibraciones de tasas corregidas generales para: (i) parte del gen mitocondrial citocromo b en los drepanidines de Hawái (0,016 divergencia de secuencia/Myr); (ii) el gen Yp1 en Drosophila de Hawái (0,019/Myr Kambysellis et al. 1995); y (iii) partes del ARNr mitocondrial 12S y 16S y el tRNAval en los grillos Laupala (0,024-0,102/Myr, Shaw 1996). Discutimos la fiabilidad de las estimaciones dadas las suposiciones (i-vii) anteriores y contrastamos los resultados con calibraciones anteriores de Adh en Drosophila de Hawái y ADN cloroplástico en lobeliods.

@article{doi101046j1365294x199800364x,
    author = "Fleischer, Robert C. and McIntosh, Carl and Tarr, Cheryl L.",
    title = "Evolución en una cinta transportadora volcánica: utilizando reconstrucciones filogeográficas y edades basadas en K–Ar de las islas Hawái para estimar las tasas de evolución molecular",
    year = "1998",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Las islas Hawái se forman a medida que la Placa del Pacífico se mueve sobre un 'punto caliente' en el manto de la Tierra donde el magma se extruye a través de la corteza para construir enormes volcanes de escudo. Las islas se hunden y se erosionan a medida que la placa las transporta hacia el noroeste, convirtiéndose eventualmente en atolones de coral y montes submarinos. Por lo tanto, las islas están ordenadas linealmente por edad, con las islas más antiguas en el noroeste (por ejemplo, Kauai a 5,1 Ma) y las más jóvenes en el sureste (por ejemplo, Hawaii a 0,43 Ma). Las estimaciones de K-Ar de la fecha de formación de una isla proporcionan una edad máxima para los taxones que habitan la isla. Estas edades pueden utilizarse para calibrar las tasas de cambio molecular bajo las siguientes suposiciones: (i) las fechas de K-Ar son precisas; (ii) las topologías de los árboles muestran que la derivación de los taxones sigue el momento de la formación de la isla; (iii) las poblaciones no colonizan mucho tiempo después de la emergencia de la isla; (iv) el punto de coalescencia para los taxones hermanos no antecede mucho a la formación de la isla más joven colonizada; (v) los efectos de saturación y (vi) la variación de tasas entre linajes son mínimas o corregibles; y (vii) los errores estándar no sesgados de las distancias y las regresiones pueden estimarse a partir de múltiples comparaciones por pares. Utilizamos este enfoque para obtener calibraciones de tasas corregidas generales para: (i) parte del gen mitocondrial citocromo b en los drepanidines de Hawái (0,016 divergencia de secuencia/Myr); (ii) el gen Yp1 en Drosophila de Hawái (0,019/Myr Kambysellis et al. 1995); y (iii) partes del ARNr mitocondrial 12S y 16S y el tRNAval en los grillos Laupala (0,024-0,102/Myr, Shaw 1996). Discutimos la fiabilidad de las estimaciones dadas las suposiciones (i-vii) anteriores y contrastamos los resultados con calibraciones anteriores de Adh en Drosophila de Hawái y ADN cloroplástico en lobeliods.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.1998.00364.x",
    doi = "10.1046/j.1365-294x.1998.00364.x",
    openalex = "W2093111338",
    references = "doi101093oxfordjournalsjhereda109497"
}

Sabemos muy poco sobre la base genética de la adaptación. De hecho, no podemos hacer predicciones teóricas, por heurísticas que sean, sobre la distribución de los efectos fenotípicos entre los factores fijados durante la adaptación ni sobre el tamaño esperado del factor más grande fijado. El estudio de este problema requiere tener en cuenta que las poblaciones se acercan gradualmente a un óptimo fenotípico durante la adaptación mediante la sustitución escalonada de mutaciones favorables. Utilizando el modelo geométrico de adaptación de Fisher, analizo este acercamiento al óptimo y deduzco una solución aproximada a la distribución de tamaños de los factores fijados durante la adaptación. Generalizo además estos resultados para permitir la entrada de cualquier distribución de efectos mutacionales. La distribución de los factores fijados durante la adaptación asume una forma exponencial sorprendentemente simple. Este resultado es notablemente insensible a los cambios en la función de aptitud y en la distribución de los efectos mutacionales. Una tendencia exponencial entre los factores fijados parece ser una propiedad general de la adaptación hacia un óptimo fijo.

@article{doi101111j155856461998tb01823x,
    author = "Orr, H. Allen",
    title = "THE POPULATION GENETICS OF ADAPTATION: THE DISTRIBUTION OF FACTORS FIXED DURING ADAPTIVE EVOLUTION",
    year = "1998",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Sabemos muy poco sobre la base genética de la adaptación. De hecho, no podemos hacer predicciones teóricas, por heurísticas que sean, sobre la distribución de los efectos fenotípicos entre los factores fijados durante la adaptación ni sobre el tamaño esperado del factor más grande fijado. El estudio de este problema requiere tener en cuenta que las poblaciones se acercan gradualmente a un óptimo fenotípico durante la adaptación mediante la sustitución escalonada de mutaciones favorables. Utilizando el modelo geométrico de adaptación de Fisher, analizo este acercamiento al óptimo y deduzco una solución aproximada a la distribución de tamaños de los factores fijados durante la adaptación. Generalizo además estos resultados para permitir la entrada de cualquier distribución de efectos mutacionales. La distribución de los factores fijados durante la adaptación asume una forma exponencial sorprendentemente simple. Este resultado es notablemente insensible a los cambios en la función de aptitud y en la distribución de los efectos mutacionales. Una tendencia exponencial entre los factores fijados parece ser una propiedad general de la adaptación hacia un óptimo fijo.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1998.tb01823.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1998.tb01823.x",
    openalex = "W2004671976",
    references = "doi101038376479a0, doi101038scientificamerican117998, doi101073pnas91156808, doi101093aibsbulletin2214b, doi101098rspb19790086, doi101146annurevge27120193001225, doi1023071435536, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, doi107312gumb92958, doi107312rens91062"
}

@article{doi1023072411226,
    author = "Orr, H. Allen",
    title = "The Population Genetics of Adaptation: The Distribution of Factors Fixed during Adaptive Evolution",
    year = "1998",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2411226",
    doi = "10.2307/2411226",
    openalex = "W4252998353"
}

Resumen 1 Los eventos de dispersión a larga distancia son biológicamente muy importantes para las plantas porque afectan las probabilidades de colonización, las probabilidades de persistencia de la población en un hábitat fragmentado y la estructura de metapoblación. Sin embargo, son muy difíciles de investigar debido a su baja frecuencia. Revisamos el uso de marcadores moleculares en el enfoque de genética de poblaciones para estudiar la dispersión. Con estos métodos se estudian las consecuencias de la dispersión a larga distancia, en lugar de la frecuencia de los eventos de dispersión en sí mismos. 2 Los marcadores moleculares varían, mostrando diferentes cantidades de variación y diferentes modos de herencia: pueden ser dominantes o codominantes, y pueden o no estar sujetos a recombinación genética. El uso de marcadores ha inspirado el desarrollo de técnicas de máxima verosimilitud que tienen en cuenta la historia evolutiva de los alelos al estimar el flujo génico. 3 Inferir las tasas de dispersión de semillas a partir de mediciones indirectas del flujo génico implica tres pasos: (i) cuantificar la diferenciación genética entre poblaciones y utilizar esto para estimar la tasa de flujo génico; (ii) producir una curva de dispersión genética regresando la distancia geográfica entre poblaciones contra la cantidad de flujo génico; y (iii) separar el flujo génico mediado por semillas del flujo génico mediado por polen, comparando la diferenciación en marcadores moleculares nucleares vs. citoplasmáticos. De esta manera, se pueden detectar niveles potencialmente muy bajos de flujo génico. 4 El enfoque indirecto se basa en una serie de suposiciones. La validez de cada suposición debe evaluarse mediante métodos independientes o las estimaciones del flujo génico y la dispersión deben utilizarse principalmente en un contexto comparativo. En las metapoblaciones, con extinción y colonización frecuentes, la relación entre la diferenciación genética y el flujo génico no es directa, y deben utilizarse otros métodos. 5 Los marcadores moleculares altamente variables, especialmente los microsatélites, han facilitado un enfoque genético directo para medir el flujo génico, basado en análisis parentales. 6 El enfoque de genética de poblaciones proporciona información diferente sobre la dispersión que los métodos ecológicos. Por lo tanto, los métodos de genética de poblaciones y ecológicos pueden complementarse entre sí, y juntos conducen a una mejor comprensión del proceso de dispersión que cualquiera de los métodos por sí solo.

@article{doi101046j13652745199900389x,
    author = "Ouborg, N. Joop and Piquot, Yves and van Groenendael, J.M.",
    title = "Genética de poblaciones, marcadores moleculares y el estudio de la dispersión en plantas",
    year = "1999",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Resumen 1 Los eventos de dispersión a larga distancia son biológicamente muy importantes para las plantas porque afectan las probabilidades de colonización, las probabilidades de persistencia de la población en un hábitat fragmentado y la estructura de metapoblación. Sin embargo, son muy difíciles de investigar debido a su baja frecuencia. Revisamos el uso de marcadores moleculares en el enfoque de genética de poblaciones para estudiar la dispersión. Con estos métodos se estudian las consecuencias de la dispersión a larga distancia, en lugar de la frecuencia de los eventos de dispersión en sí mismos. 2 Los marcadores moleculares varían, mostrando diferentes cantidades de variación y diferentes modos de herencia: pueden ser dominantes o codominantes, y pueden o no estar sujetos a recombinación genética. El uso de marcadores ha inspirado el desarrollo de técnicas de máxima verosimilitud que tienen en cuenta la historia evolutiva de los alelos al estimar el flujo génico. 3 Inferir las tasas de dispersión de semillas a partir de mediciones indirectas del flujo génico implica tres pasos: (i) cuantificar la diferenciación genética entre poblaciones y utilizar esto para estimar la tasa de flujo génico; (ii) producir una curva de dispersión genética regresando la distancia geográfica entre poblaciones contra la cantidad de flujo génico; y (iii) separar el flujo génico mediado por semillas del flujo génico mediado por polen, comparando la diferenciación en marcadores moleculares nucleares vs. citoplasmáticos. De esta manera, se pueden detectar niveles potencialmente muy bajos de flujo génico. 4 El enfoque indirecto se basa en una serie de suposiciones. La validez de cada suposición debe evaluarse mediante métodos independientes o las estimaciones del flujo génico y la dispersión deben utilizarse principalmente en un contexto comparativo. En las metapoblaciones, con extinción y colonización frecuentes, la relación entre la diferenciación genética y el flujo génico no es directa, y deben utilizarse otros métodos. 5 Los marcadores moleculares altamente variables, especialmente los microsatélites, han facilitado un enfoque genético directo para medir el flujo génico, basado en análisis parentales. 6 El enfoque de genética de poblaciones proporciona información diferente sobre la dispersión que los métodos ecológicos. Por lo tanto, los métodos de genética de poblaciones y ecológicos pueden complementarse entre sí, y juntos conducen a una mejor comprensión del proceso de dispersión que cualquiera de los métodos por sí solo.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2745.1999.00389.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2745.1999.00389.x",
    openalex = "W2032487465",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

@article{doi10103835046017,
    author = "Kopp, Artyom y Duncan, Ian y Carroll, Sean B.",
    title = "Control genético y evolución de caracteres dimórficos sexuales en Drosophila",
    year = "2000",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/35046017",
    doi = "10.1038/35046017",
    openalex = "W1588649406",
    references = "doi101038384236a0, doi101073pnas7863721, doi101093oxfordjournalsmolbeva040214, doi101111j155856461982tb05003x, doi101111j155856461998tb05132x, doi101146annurevgenet301637, doi101242dev1212333, doi1015159780691207278, doi1023072341823, doi105962bhltitle27468"
}

Resumen: En esta revisión exhaustiva, se consideran una serie de factores que pueden influir en la importancia de la diversidad genética para la supervivencia de una población. La variación genética es esencial para la adaptabilidad de una población en la que los rasgos cuantitativamente heredados y relacionados con la aptitud son cruciales. Por lo tanto, debe estudiarse la relación entre la diversidad genética y la aptitud para hacer predicciones sobre la importancia de la diversidad genética para una población específica. El nivel de diversidad genética encontrado en una población depende en gran medida del sistema de apareamiento, la historia evolutiva de una especie y la historia de la población (esta última suele ser desconocida), y del nivel de heterogeneidad ambiental. Una estimación precisa de la aptitud sigue siendo compleja, a pesar de la disponibilidad de una serie de parámetros directos e indirectos de aptitud. No existe una relación general entre la diversidad genética y los diversos componentes de la aptitud. Sin embargo, si un nivel más bajo de heterocigosidad representa un nivel más alto de endogamia, se puede esperar una reducción de la aptitud. Los marcadores moleculares pueden utilizarse para estudiar la adaptabilidad o la aptitud, siempre que representen un locus de rasgo cuantitativo (QTL) o sean genes funcionales en sí mismos implicados en estos procesos. Además de la respuesta genética de una población al cambio ambiental, la plasticidad fenotípica en un genotipo puede afectar la aptitud. La importancia relativa de la plasticidad frente a la diversidad genética depende de la especie y la población estudiadas y de las condiciones ambientales. Se discuten las posibilidades de aplicación del conocimiento actual sobre la diversidad genética y la supervivencia de las poblaciones para la gestión de poblaciones naturales.

@article{doi101055s20005958,
    author = "Booy, G. y Hendriks, Rob J. J. y Smulders, M.J.M. y van Groenendael, J.M. y Vosman, B.",
    title = "Diversidad genética y la supervivencia de las poblaciones",
    year = "2000",
    journal = "Plant Biology",
    abstract = "Resumen: En esta revisión exhaustiva, se consideran una serie de factores que pueden influir en la importancia de la diversidad genética para la supervivencia de una población. La variación genética es esencial para la adaptabilidad de una población en la que los rasgos cuantitativamente heredados y relacionados con la aptitud son cruciales. Por lo tanto, debe estudiarse la relación entre la diversidad genética y la aptitud para hacer predicciones sobre la importancia de la diversidad genética para una población específica. El nivel de diversidad genética encontrado en una población depende en gran medida del sistema de apareamiento, la historia evolutiva de una especie y la historia de la población (esta última suele ser desconocida), y del nivel de heterogeneidad ambiental. Una estimación precisa de la aptitud sigue siendo compleja, a pesar de la disponibilidad de una serie de parámetros directos e indirectos de aptitud. No existe una relación general entre la diversidad genética y los diversos componentes de la aptitud. Sin embargo, si un nivel más bajo de heterocigosidad representa un nivel más alto de endogamia, se puede esperar una reducción de la aptitud. Los marcadores moleculares pueden utilizarse para estudiar la adaptabilidad o la aptitud, siempre que representen un locus de rasgo cuantitativo (QTL) o sean genes funcionales en sí mismos implicados en estos procesos. Además de la respuesta genética de una población al cambio ambiental, la plasticidad fenotípica en un genotipo puede afectar la aptitud. La importancia relativa de la plasticidad frente a la diversidad genética depende de la especie y la población estudiadas y de las condiciones ambientales. Se discuten las posibilidades de aplicación del conocimiento actual sobre la diversidad genética y la supervivencia de las poblaciones para la gestión de poblaciones naturales.",
    url = "https://doi.org/10.1055/s-2000-5958",
    doi = "10.1055/s-2000-5958",
    openalex = "W1970411761",
    references = "doi101002j153721971987tb08586x, doi101086285558"
}

Las especies raras se consideran típicamente que mantienen bajos niveles de variación genética, y esta visión ha sido respaldada por varias revisiones de un gran número de estudios de isoenzimas. Aunque estas revisiones han proporcionado datos valiosos sobre los niveles de variabilidad en especies de plantas en general, y en especies raras en particular, estas revisiones generales implican comparaciones que pueden confundir los efectos de la rareza con una multitud de otros factores que afectan la variabilidad genética. Además, los análisis estadísticos empleados asumen que los datos son independientes, lo cual no es el caso para los organismos que comparten una historia filogenética común. A medida que se ha comprendido mejor el papel de la historia evolutiva y las restricciones históricas, más investigadores han estudiado congéneres de amplia distribución al investigar la diversidad genética de especies raras en un esfuerzo por controlar estos efectos. Resumimos los datos disponibles de dichos estudios, comparando para congéneres raros y de amplia distribución (1) los niveles de variabilidad genética a nivel de población y de especie y (2) medidas de subestructuración de la población. A nivel de población, resumimos datos para el porcentaje de loci polimórficos (%P(pop)), el número medio de alelos por locus (A(pop)) y la heterocigosidad observada (H(o)). Las medidas a nivel de especie utilizadas fueron el porcentaje de loci polimórficos (%P(spp)), el número medio de alelos por locus (A(spp)) y la diversidad genética total (H(T)). También se examinaron los índices de subdivisión de la población (ya sea F(ST) o G(ST)). Utilizando pruebas de rango de Wilcoxon firmados, encontramos diferencias significativas, pero pequeñas, entre especies raras y de amplia distribución para todas las medidas de diversidad excepto H(T). Sin embargo, no parece haber una diferencia entre congéneres raros y de amplia distribución en cuanto a cómo se particiona la variación genética dentro y entre poblaciones. Los niveles de diversidad, para todas las medidas examinadas, entre congéneres raros y de amplia distribución están altamente correlacionados.

@article{doi1023072656886,
    author = "Gitzendanner, Matthew A. y Soltis, Pamela S.",
    title = "Patrones de variación genética en congéneres de plantas raras y de amplia distribución",
    year = "2000",
    journal = "American Journal of Botany",
    abstract = "Las especies raras se consideran típicamente que mantienen bajos niveles de variación genética, y esta visión ha sido respaldada por varias revisiones de un gran número de estudios de isoenzimas. Aunque estas revisiones han proporcionado datos valiosos sobre los niveles de variabilidad en especies de plantas en general, y en especies raras en particular, estas revisiones generales implican comparaciones que pueden confundir los efectos de la rareza con una multitud de otros factores que afectan la variabilidad genética. Además, los análisis estadísticos empleados asumen que los datos son independientes, lo cual no es el caso para los organismos que comparten una historia filogenética común. A medida que se ha comprendido mejor el papel de la historia evolutiva y las restricciones históricas, más investigadores han estudiado congéneres de amplia distribución al investigar la diversidad genética de especies raras en un esfuerzo por controlar estos efectos. Resumimos los datos disponibles de dichos estudios, comparando para congéneres raros y de amplia distribución (1) los niveles de variabilidad genética a nivel de población y de especie y (2) medidas de subestructuración de la población. A nivel de población, resumimos datos para el porcentaje de loci polimórficos (%P(pop)), el número medio de alelos por locus (A(pop)) y la heterocigosidad observada (H(o)). Las medidas a nivel de especie utilizadas fueron el porcentaje de loci polimórficos (%P(spp)), el número medio de alelos por locus (A(spp)) y la diversidad genética total (H(T)). También se examinaron los índices de subdivisión de la población (ya sea F(ST) o G(ST)). Utilizando pruebas de rango de Wilcoxon firmados, encontramos diferencias significativas, pero pequeñas, entre especies raras y de amplia distribución para todas las medidas de diversidad excepto H(T). Sin embargo, no parece haber una diferencia entre congéneres raros y de amplia distribución en cuanto a cómo se particiona la variación genética dentro y entre poblaciones. Los niveles de diversidad, para todas las medidas examinadas, entre congéneres raros y de amplia distribución están altamente correlacionados.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2656886",
    doi = "10.2307/2656886",
    openalex = "W2141860334",
    references = "doi101146annureves10110179001133"
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@book{doi101016b9780127300559x50058,
    title = "El concepto de carácter en la biología evolutiva",
    year = "2001",
    booktitle = "Elsevier eBooks",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-12-730055-9.x5005-8",
    doi = "10.1016/b978-0-12-730055-9.x5005-8",
    openalex = "W565848724",
    references = "doi101038384236a0"
}

Ecología Evolutiva unifica simultáneamente los avances conceptuales y empíricos en ecología evolutiva y proporciona un volumen que puede utilizarse como un libro de texto principal o una lectura complementaria en un curso avanzado de pregrado o posgrado. El enfoque del libro está en los conceptos actuales en ecología evolutiva y el estudio empírico de estos conceptos. Los editores han reunido un grupo de biólogos prominentes que han realizado contribuciones significativas a este campo. Tanto sintetizan el estado actual del conocimiento como identifican áreas para futuras investigaciones. Ecología Evolutiva será de interés general para investigadores y estudiantes tanto en ecología como en biología evolutiva. Los investigadores en ecología evolutiva que deseen una visión general del estado actual del campo, y los estudiantes de posgrado que deseen una introducción al campo, encontrarán este libro muy valioso. Este volumen también puede utilizarse como un libro de texto principal o una lectura complementaria en cursos/seminarios de nivel superior y de posgrado en Ecología Evolutiva.

@book{doi101093oso97801951315430010001,
    title = "Ecología Evolutiva",
    year = "2001",
    booktitle = "eBooks de la Universidad de Oxford",
    abstract = "Ecología Evolutiva unifica simultáneamente los avances conceptuales y empíricos en ecología evolutiva y proporciona un volumen que puede utilizarse como un libro de texto principal o una lectura complementaria en un curso avanzado de pregrado o posgrado. El enfoque del libro está en los conceptos actuales en ecología evolutiva y el estudio empírico de estos conceptos. Los editores han reunido un grupo de biólogos prominentes que han realizado contribuciones significativas a este campo. Tanto sintetizan el estado actual del conocimiento como identifican áreas para futuras investigaciones. Ecología Evolutiva será de interés general para investigadores y estudiantes tanto en ecología como en biología evolutiva. Los investigadores en ecología evolutiva que deseen una visión general del estado actual del campo, y los estudiantes de posgrado que deseen una introducción al campo, encontrarán este libro muy valioso. Este volumen también puede utilizarse como un libro de texto principal o una lectura complementaria en cursos/seminarios de nivel superior y de posgrado en Ecología Evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195131543.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780195131543.001.0001",
    openalex = "W4235189111"
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@article{gibson2001evolution,
    author = "Gibson, Greg y Palsson, Arnar",
    title = "Evolución: Un complemento para la genética evolutiva",
    year = "2001",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0960-9822(01)00014-8",
    doi = "10.1016/s0960-9822(01)00014-8",
    number = "2",
    pages = "R74-R76",
    volume = "11"
}

@article{doi101038sjhdy6800154,
    author = "Gostling, Neil J.",
    title = "From DNA to Diversity: Genética molecular y la evolución del diseño animal",
    year = "2002",
    journal = "Heredity",
    url = "https://doi.org/10.1038/sj.hdy.6800154",
    doi = "10.1038/sj.hdy.6800154",
    openalex = "W1968814137",
    references = "doi101016s0168952598016710"
}

Prólogo.1. Breve historia de los animales.2. El kit de herramientas genético para el desarrollo.3. Construcción de animales.4. Evolución del kit de herramientas.5. Diversificación de los planes corporales y de las partes del cuerpo.6. Evolución de novedades morfológicas.7. Variación morfológica y divergencia de especies.8. From DNA to Diversity: La primacía de la evolución regulatoria.Glosario.Índice

@article{doi105860choice395182,
    title = "From DNA to diversity: molecular genetics and the evolution of animal design",
    year = "2002",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Prólogo.1. Breve historia de los animales.2. El kit de herramientas genético para el desarrollo.3. Construcción de animales.4. Evolución del kit de herramientas.5. Diversificación de los planes corporales y de las partes del cuerpo.6. Evolución de novedades morfológicas.7. Variación morfológica y divergencia de especies.8. From DNA to Diversity: La primacía de la evolución regulatoria.Glosario.Índice",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.39-5182",
    doi = "10.5860/choice.39-5182",
    openalex = "W2034536549",
    references = "doi1010079783642455322, doi101016b9780122053511x50009, doi101016b9780127300559x50058, doi101016s0070215321x00026, doi101037003329091274504, doi105860choice341536, openalexw1865748464, openalexw2506868775, openalexw587813093"
}

@article{doi101038nature01568,
    author = "Lenski, Richard E. y Ofria, Charles y Pennock, Robert T. y Adami, Christoph",
    title = "El origen evolutivo de características complejas",
    year = "2003",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature01568",
    doi = "10.1038/nature01568",
    openalex = "W2005946215",
    references = "doi101002j232619511995tb03633x, doi101002sici10990526199609102132aidcplx830co2h, doi10103835023115, doi10103835085569, doi101038nature01151, doi101093genetics14841667, doi101126science860134, doi1023072485224, doi107551mitpress10900010001, openalexw2074397232"
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@article{doi101038nrg1088,
    author = "Elena, Santiago F. y Lenski, Richard E.",
    title = "Experimentos de evolución con microorganismos: la dinámica y las bases genéticas de la adaptación",
    year = "2003",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg1088",
    doi = "10.1038/nrg1088",
    openalex = "W2112945902",
    references = "doi101007978940115210512, doi101023a1017067816551, doi101038336435a0, doi10103842701, doi101038nature01568, doi101073pnas74115088, doi101073pnas91156808, doi101086285289, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oso97801985464120010001, doi101111j155856461998tb01823x, doi101126science147365368, doi101126science28854691251, doi1011289781555816704, doi1015159780691209418, doi1023072485224, doi1023074785, doi102307jctvx5wbbh, doi105860choice273873, doi105860choice295104, doi105962bhltitle27468"
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@article{doi101038nature02415,
    author = "Shapiro, Michael D. y Marks, Melissa E. y Peichel, Catherine L. y Blackman, Benjamin K. y Nereng, Kirsten S. y Jónsson, Bjarni y Schluter, Dolph y Kingsley, David M.",
    title = "Bases genéticas y del desarrollo de la reducción pélvica evolutiva en espinosos de tres espinas",
    year = "2004",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature02415",
    doi = "10.1038/nature02415",
    openalex = "W2066908868",
    references = "doi1010020471142905, doi101016s0092867400808685, doi101016s0092867401004937, doi10103820944, doi10103835046017, doi101038414901a, doi101038nature02064, doi101073pnas9794530, doi101111j001438202000tb00544x, openalexw2062594085"
}

@article{doi101038nature02698,
    author = "Wittkopp, Patricia J. y Haerum, Belinda K. y Clark, Andrew G.",
    title = "Cambios evolutivos en la regulación génica cis y trans",
    year = "2004",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature02698",
    doi = "10.1038/nature02698",
    openalex = "W2085454778",
    references = "doi101093molbevmsg140, doi105860choice395182"
}

@article{doi101038nrmicro863,
    author = "Moyá, Andrés y Holmes, Edward C. y Gónzález‐Candelas, Fernando",
    title = "La genética de poblaciones y la epidemiología evolutiva de los virus de ARN",
    year = "2004",
    journal = "Nature Reviews Microbiology",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrmicro863",
    doi = "10.1038/nrmicro863",
    openalex = "W1990653767",
    references = "doi101038nature01151, doi101128mmbr6511511852001"
}

Avida es una plataforma de software para experimentos con programas informáticos autorreplicantes y evolutivos. Proporciona un control detallado de los parámetros experimentales y los protocolos, una amplia gama de herramientas de medición y métodos sofisticados para analizar y procesar posteriormente los datos experimentales. Explicamos los principios generales en los que se basa Avida, así como sus componentes principales y sus interacciones. También explicamos cómo se configuran, realizan y analizan los experimentos.

@article{doi101162106454604773563612,
    author = "Ofria, Charles y Wilke, Claus O.",
    title = "Avida: Una Plataforma de Software para la Investigación en Biología Evolutiva Computacional",
    year = "2004",
    journal = "Artificial Life",
    abstract = "Avida es una plataforma de software para experimentos con programas informáticos autorreplicantes y evolutivos. Proporciona un control detallado de los parámetros experimentales y los protocolos, una amplia gama de herramientas de medición y métodos sofisticados para analizar y procesar posteriormente los datos experimentales. Explicamos los principios generales en los que se basa Avida, así como sus componentes principales y sus interacciones. También explicamos cómo se configuran, realizan y analizan los experimentos.",
    url = "https://doi.org/10.1162/106454604773563612",
    doi = "10.1162/106454604773563612",
    openalex = "W2147276070",
    references = "doi101038nature01151, doi101038nature01568"
}

@article{bell2005evolutionary,
    author = "Bell, G",
    title = "Genética evolutiva: La evolución de la evolución",
    year = "2005",
    journal = "Heredity",
    url = "https://doi.org/10.1038/sj.hdy.6800608",
    doi = "10.1038/sj.hdy.6800608",
    number = "1",
    pages = "1-2",
    volume = "94"
}

@article{doi101038nature03842,
    author = "Dekel, E. y Alon, Uri",
    title = "Optimality and evolutionary tuning of the expression level of a protein",
    year = "2005",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature03842",
    doi = "10.1038/nature03842",
    openalex = "W2068872007",
    references = "doi101038nrg1088, doi101146annurevge18120184000335"
}

▪ Resumen El apareamiento mixto, en el que las especies de plantas hermafroditas se reproducen mediante autofecundación y fecundación cruzada, presenta un problema desafiante para los biólogos evolutivos. La teoría sugiere que la depresión por endogamia, el principal factor selectivo que se opone a la evolución de la autofecundación, puede eliminarse mediante la autofecundación, un proceso que se espera que produzca estrategias puras de entrecruzamiento o autofecundación. Aquí presentamos evidencia actualizada que sugiere que los sistemas de apareamiento mixto son frecuentes en las plantas con semillas. Esbozamos los mecanismos florales y de polinización que pueden conducir a un entrecruzamiento intermedio, revisamos los modelos teóricos que abordan la estabilidad del entrecruzamiento intermedio y examinamos la evidencia empírica relevante. Un análisis comparativo de los coeficientes estimados de endogamia y las tasas de entrecruzamiento sugiere que el apareamiento mixto a menudo evoluciona a pesar de una fuerte depresión por endogamia. La importancia adaptativa del apareamiento mixto aún no se ha explicado completamente para ninguna especie. El trabajo teórico y empírico reciente sugiere que el progreso futuro vendrá de una mejor integración de los estudios de los mecanismos florales, la genética y la ecología, y del reconocimiento de cómo varían las presiones selectivas en el espacio y el tiempo.

@article{doi101146annurevecolsys36091704175539,
    author = "Goodwillie, Carol y Kalisz, Susan y Eckert, Christopher G.",
    title = "El enigma evolutivo de los sistemas de apareamiento mixto en plantas: Ocurrencia, explicaciones teóricas y evidencia empírica",
    year = "2005",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "▪ Resumen El apareamiento mixto, en el que las especies de plantas hermafroditas se reproducen mediante autofecundación y fecundación cruzada, presenta un problema desafiante para los biólogos evolutivos. La teoría sugiere que la depresión por endogamia, el principal factor selectivo que se opone a la evolución de la autofecundación, puede eliminarse mediante la autofecundación, un proceso que se espera que produzca estrategias puras de entrecruzamiento o autofecundación. Aquí presentamos evidencia actualizada que sugiere que los sistemas de apareamiento mixto son frecuentes en las plantas con semillas. Esbozamos los mecanismos florales y de polinización que pueden conducir a un entrecruzamiento intermedio, revisamos los modelos teóricos que abordan la estabilidad del entrecruzamiento intermedio y examinamos la evidencia empírica relevante. Un análisis comparativo de los coeficientes estimados de endogamia y las tasas de entrecruzamiento sugiere que el apareamiento mixto a menudo evoluciona a pesar de una fuerte depresión por endogamia. La importancia adaptativa del apareamiento mixto aún no se ha explicado completamente para ninguna especie. El trabajo teórico y empírico reciente sugiere que el progreso futuro vendrá de una mejor integración de los estudios de los mecanismos florales, la genética y la ecología, y del reconocimiento de cómo varían las presiones selectivas en el espacio y el tiempo.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.36.091704.175539",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.36.091704.175539",
    openalex = "W2127588110",
    references = "doi10100797814615694425, doi101111j109583122000tb01221x, doi101146annureves15110184000433, doi105860choice355054, doi105962bhltitle110800, openalexw2491318968"
}

La epistasis para la aptitud significa que el efecto selectivo de una mutación es condicional al fondo genético en el que aparece. Aunque la epistasis se observa ampliamente en la naturaleza, nuestra comprensión de sus consecuencias para la evolución por selección natural sigue siendo incompleta. En particular, gran atención se centra únicamente en su influencia sobre la tasa instantánea de cambios en la frecuencia de alelos seleccionados a través de la contribución epistática a la varianza genética aditiva para la aptitud. Por lo tanto, en este marco, la epistasis solo tiene importancia evolutiva si los loci interactuantes están segregando simultáneamente en la población. Sin embargo, la accesibilidad selectiva de las trayectorias mutacionales a genotipos de alta aptitud puede depender del fondo genético en el que aparecen las mutaciones novedosas, y este efecto es independiente del polimorfismo poblacional en otros loci. Aquí exploramos esta segunda influencia de la epistasis sobre la evolución por selección natural. Mostramos que es la consecuencia de una forma particular de epistasis, que designamos como epistasis de signo. La epistasis de signo significa que el signo del efecto de aptitud de una mutación está bajo control epistático; por lo tanto, tal mutación es beneficiosa en algunos fondos genéticos y deletérea en otros. Las innovaciones experimentales recientes en sistemas microbianos ahora permiten evaluar los efectos de aptitud de mutaciones individuales en múltiples fondos genéticos. Revisamos esta literatura e identificamos muchos ejemplos de epistasis de signo, y sugerimos que las implicaciones de estos resultados pueden generalizarse a otros organismos. Estas consideraciones teóricas y empíricas implican que puede existir una fuerte constricción genética sobre la accesibilidad selectiva de trayectorias a genotipos de alta aptitud y sugieren áreas específicas de investigación para futuras investigaciones.

@article{doi10155404272,
    author = "Weinreich, Daniel y Watson, Richard A. y Chao, Lin",
    title = "PERSPECTIVA: EPISTASIS DE SIGNO Y CONSTRICCIÓN GENÉTICA EN LAS TRAYECTORIAS EVOLUTIVAS",
    year = "2005",
    journal = "Evolution",
    abstract = "La epistasis para la aptitud significa que el efecto selectivo de una mutación es condicional al fondo genético en el que aparece. Aunque la epistasis se observa ampliamente en la naturaleza, nuestra comprensión de sus consecuencias para la evolución por selección natural sigue siendo incompleta. En particular, gran atención se centra únicamente en su influencia sobre la tasa instantánea de cambios en la frecuencia de alelos seleccionados a través de la contribución epistática a la varianza genética aditiva para la aptitud. Por lo tanto, en este marco, la epistasis solo tiene importancia evolutiva si los loci interactuantes están segregando simultáneamente en la población. Sin embargo, la accesibilidad selectiva de las trayectorias mutacionales a genotipos de alta aptitud puede depender del fondo genético en el que aparecen las mutaciones novedosas, y este efecto es independiente del polimorfismo poblacional en otros loci. Aquí exploramos esta segunda influencia de la epistasis sobre la evolución por selección natural. Mostramos que es la consecuencia de una forma particular de epistasis, que designamos como epistasis de signo. La epistasis de signo significa que el signo del efecto de aptitud de una mutación está bajo control epistático; por lo tanto, tal mutación es beneficiosa en algunos fondos genéticos y deletérea en otros. Las innovaciones experimentales recientes en sistemas microbianos ahora permiten evaluar los efectos de aptitud de mutaciones individuales en múltiples fondos genéticos. Revisamos esta literatura e identificamos muchos ejemplos de epistasis de signo, y sugerimos que las implicaciones de estos resultados pueden generalizarse a otros organismos. Estas consideraciones teóricas y empíricas implican que puede existir una fuerte constricción genética sobre la accesibilidad selectiva de trayectorias a genotipos de alta aptitud y sugieren áreas específicas de investigación para futuras investigaciones.",
    url = "https://doi.org/10.1554/04-272",
    doi = "10.1554/04-272",
    openalex = "W4246887724"
}

La ausencia de variación genética en rasgos bajo selección es quizás la explicación más antigua de un límite al cambio evolutivo, pero también ha sido la más fácilmente descartada. Revisamos una serie de resultados teóricos y empíricos que abarcan desde rasgos individuales hasta sistemas multivariados más complejos, y mostramos que la ausencia de variación genética puede ser más común de lo que se aprecia actualmente. Desde una perspectiva de rasgo único, destacamos que está quedando claro que algunos tipos de rasgos no muestran niveles significativos de variación genética, y planteamos la posibilidad de que las especies con rangos restringidos difieran cualitativamente de las especies más extendidas en los niveles de variación genética en rasgos ecológicamente importantes. Un error común en muchos estudios de historia de vida es que la falta de variación genética en rasgos individuales y las restricciones genéticas como consecuencia de correlaciones genéticas bivariadas son causas diferentes de los límites de la selección. Detallamos cómo las interpretaciones de patrones bivariados es poco probable que demuestren límites genéticos a la selección en muchos casos. Abogamos por una definición multivariada de las restricciones genéticas que enfatiza la presencia (o ausencia) de variación genética en la dirección multivariada de la selección. Para sistemas multirrasgo, resultados recientes utilizando estudios a largo plazo de organismos, en los que se comprende más sobre qué rasgos pueden estar bajo selección, han indicado que la selección puede agotar la variación genética, resultando en un límite a la respuesta a la selección.

@article{doi101890041209,
    author = "Blows, Mark W. y Hoffmann, Ary A.",
    title = "UNA REEVALUACIÓN DE LOS LÍMITES GENÉTICOS AL CAMBIO EVOLUCIONISTA",
    year = "2005",
    journal = "Ecology",
    abstract = "La ausencia de variación genética en rasgos bajo selección es quizás la explicación más antigua de un límite al cambio evolutivo, pero también ha sido la más fácilmente descartada. Revisamos una serie de resultados teóricos y empíricos que abarcan desde rasgos individuales hasta sistemas multivariados más complejos, y mostramos que la ausencia de variación genética puede ser más común de lo que se aprecia actualmente. Desde una perspectiva de rasgo único, destacamos que está quedando claro que algunos tipos de rasgos no muestran niveles significativos de variación genética, y planteamos la posibilidad de que las especies con rangos restringidos difieran cualitativamente de las especies más extendidas en los niveles de variación genética en rasgos ecológicamente importantes. Un error común en muchos estudios de historia de vida es que la falta de variación genética en rasgos individuales y las restricciones genéticas como consecuencia de correlaciones genéticas bivariadas son causas diferentes de los límites de la selección. Detallamos cómo las interpretaciones de patrones bivariados es poco probable que demuestren límites genéticos a la selección en muchos casos. Abogamos por una definición multivariada de las restricciones genéticas que enfatiza la presencia (o ausencia) de variación genética en la dirección multivariada de la selección. Para sistemas multirrasgo, resultados recientes utilizando estudios a largo plazo de organismos, en los que se comprende más sobre qué rasgos pueden estar bajo selección, han indicado que la selección puede agotar la variación genética, resultando en un límite a la respuesta a la selección.",
    url = "https://doi.org/10.1890/04-1209",
    doi = "10.1890/04-1209",
    openalex = "W1991431672",
    references = "doi1023072411226"
}

@article{doi101038nrc2013,
    author = "Merlo, Lauren M.F. y Pepper, John W. y Reid, Brian J. y Maley, Carlo C.",
    title = "El cáncer como un proceso evolutivo y ecológico",
    year = "2006",
    journal = "Nature reviews. Cancer",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrc2013",
    doi = "10.1038/nrc2013",
    openalex = "W2123558100",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016s0169534701021012, doi101016s0169534702024953, doi10103842701, doi101038nrg1088, doi101146annurevgenet341401, doi1023072407274"
}

¿Por qué los individuos dejan de reproducirse después de cierta edad y cómo se determina esta edad? La teoría de la pleiotropía antagonista para la evolución del envejecimiento predice que el aumento del rendimiento en la vida temprana debería ir acompañado de un envejecimiento más temprano (o más rápido). Por lo tanto, un individuo que ha comenzado a criar temprano también debería perder sus capacidades reproductivas temprano. Aquí investigamos la relación entre la edad de la primera reproducción (AFR) y la edad de la última reproducción (ALR) en una población de cisne mudo (Cygnus olor) monitoreada durante 36 años. Utilizando análisis multivariados sobre los datos longitudinales, mostramos que ambos rasgos están fuertemente seleccionados en direcciones opuestas. El análisis de la covarianza fenotípica entre estos caracteres muestra que los individuos varían en su calidad inherente, de modo que algunos individuos tienen una AFR más temprana y una ALR más tardía de lo esperado. Los análisis de pedigree genético cuantitativo muestran que ambos rasgos poseen varianza genética aditiva, pero también que la AFR y la ALR están genéticamente correlacionadas positivamente. Por lo tanto, aunque ambos rasgos muestran variación heredable y están bajo selección direccional opuesta, su evolución está restringida por un fuerte compromiso evolutivo. Estos resultados son consistentes con la teoría de que el aumento del rendimiento en la vida temprana conlleva un envejecimiento más rápido debido a compromisos genéticos.

@article{doi101073pnas0511123103,
    author = "Charmantier, Anne and Perrins, Christopher M. and McCleery, R. H. and Sheldon, Ben C.",
    title = "Genética cuantitativa de la edad de reproducción en cisnes salvajes: Apoyo a los modelos de pleiotropía antagonista del envejecimiento",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "¿Por qué los individuos dejan de reproducirse después de cierta edad y cómo se determina esta edad? La teoría de la pleiotropía antagonista para la evolución del envejecimiento predice que el aumento del rendimiento en la vida temprana debería ir acompañado de un envejecimiento más temprano (o más rápido). Por lo tanto, un individuo que ha comenzado a criar temprano también debería perder sus capacidades reproductivas temprano. Aquí investigamos la relación entre la edad de la primera reproducción (AFR) y la edad de la última reproducción (ALR) en una población de cisne mudo (Cygnus olor) monitoreada durante 36 años. Utilizando análisis multivariados sobre los datos longitudinales, mostramos que ambos rasgos están fuertemente seleccionados en direcciones opuestas. El análisis de la covarianza fenotípica entre estos caracteres muestra que los individuos varían en su calidad inherente, de modo que algunos individuos tienen una AFR más temprana y una ALR más tardía de lo esperado. Los análisis de pedigree genético cuantitativo muestran que ambos rasgos poseen varianza genética aditiva, pero también que la AFR y la ALR están genéticamente correlacionadas positivamente. Por lo tanto, aunque ambos rasgos muestran variación heredable y están bajo selección direccional opuesta, su evolución está restringida por un fuerte compromiso evolutivo. Estos resultados son consistentes con la teoría de que el aumento del rendimiento en la vida temprana conlleva un envejecimiento más rápido debido a compromisos genéticos.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0511123103",
    doi = "10.1073/pnas.0511123103",
    openalex = "W2036516886",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

El artículo explica las similitudes y diferencias entre los enfoques neoclásico, institucional y evolutivo que han sido influyentes en la geografía económica durante las últimas dos décadas. Al separar los tres enfoques en términos de contenido teórico y metodología de investigación, podemos apreciar tanto las similitudes como las diferencias entre los tres enfoques. También es evidente que la teorización innovadora ocurre actualmente en la interfaz entre la teoría neoclásica y la teoría evolutiva (especialmente en la modelización) y en la interfaz entre la teoría institucional y la teoría evolutiva (especialmente en la 'teorización apreciativa'). En conjunto, argumentamos que la Geografía Económica Evolutiva es un paradigma emergente en la geografía económica, pero lo hace sin aislarse de los desarrollos en otros enfoques teóricos.

@article{doi101093jeglbi022,
    author = "Boschma, Ron y Frenken, Koen",
    title = "¿Por qué la geografía económica no es una ciencia evolutiva? Hacia una geografía económica evolutiva",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Economic Geography",
    abstract = "El artículo explica las similitudes y diferencias entre los enfoques neoclásico, institucional y evolutivo que han sido influyentes en la geografía económica durante las últimas dos décadas. Al separar los tres enfoques en términos de contenido teórico y metodología de investigación, podemos apreciar tanto las similitudes como las diferencias entre los tres enfoques. También es evidente que la teorización innovadora ocurre actualmente en la interfaz entre la teoría neoclásica y la teoría evolutiva (especialmente en la modelización) y en la interfaz entre la teoría institucional y la teoría evolutiva (especialmente en la 'teorización apreciativa'). En conjunto, argumentamos que la Geografía Económica Evolutiva es un paradigma emergente en la geografía económica, pero lo hace sin aislarse de los desarrollos en otros enfoques teóricos.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jeg/lbi022",
    doi = "10.1093/jeg/lbi022",
    openalex = "W2130277684",
    references = "doi101002sici10970266199708187509aidsmj88230co2z, doi101007s001910050089, doi101017cbo9780511808678, doi101017cbo9780511815478, doi101086228311, doi101093iccdth026, doi101093oxfordjournalscjea013725, doi101103revmodphys7447, doi101111j146802971997tb00064x, doi101126science2865439509, doi1015159780691206820, doi1023071060065, doi1023071884852, doi1023072232409, doi105860choice416654, openalexw2061901927"
}

Las relaciones entre el tamaño de la población de plantas, la aptitud y la diversidad genética dentro de la población son fundamentales para la ecología, la evolución y la conservación de las plantas. Realizamos metaanálisis de estudios publicados entre 1987 y 2005 para probar si estas relaciones son generalmente positivas, si son sensibles a las diferencias metodológicas entre estudios, si difieren entre especies de diferente esperanza de vida, sistema de apareamiento o rareza y si dependen de los rangos de tamaño de las poblaciones estudiadas. Las correlaciones medias entre el tamaño de la población, la aptitud y la variación genética fueron todas significativamente positivas. La correlación positiva entre el tamaño de la población y la aptitud femenina tendía a ser más fuerte en estudios de campo que en estudios de jardín común, y la correlación positiva entre la variación genética y la aptitud fue significativamente más fuerte en estudios de ADN que en estudios de isoenzimas. La fuerza y la dirección de las correlaciones entre el tamaño de la población, la aptitud y la variación genética fueron independientes de la esperanza de vida de las plantas y del rango de tamaño de las poblaciones estudiadas. Las correlaciones medias tendían a ser más fuertes para las especies raras que para las especies comunes. La heterocigosidad esperada, el número de alelos y el número o proporción de loci polimórficos aumentaron significativamente con el tamaño de la población, pero el nivel de endogamia F IS fue independiente del tamaño de la población. La relación positiva entre el tamaño de la población y el número de alelos y el número o proporción de loci polimórficos fue más fuerte en especies autocompatibles que en especies autocompatibles. Además, la aptitud y la variación genética estaban correlacionadas positivamente en especies autocompatibles, pero independientes entre sí en especies autocompatibles. Las estrechas relaciones entre el tamaño de la población, la variación genética y la aptitud sugieren que el tamaño de la población siempre debe tenerse en cuenta en estudios multipoblacionales de la aptitud o variación genética de las plantas. La generalidad observada de las relaciones positivas entre el tamaño de la población, la aptitud de las plantas y la diversidad genética implica que los efectos negativos de la fragmentación del hábitat sobre la aptitud y la variación genética de las plantas son comunes. Además, las asociaciones positivas más fuertes observadas en especies autocompatibles y en cierto grado en especies raras, sugieren que estas especies son las más propensas a los efectos negativos de la fragmentación del hábitat.

@article{doi101111j13652745200601150x,
    author = "Leimu, Roosa y Mutikäinen, Pia y Koricheva, Julia y Fischer, Markus",
    title = "¿Qué tan generales son las relaciones positivas entre el tamaño de la población de plantas, la aptitud y la variación genética?",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Resumen Las relaciones entre el tamaño de la población de plantas, la aptitud y la diversidad genética dentro de la población son fundamentales para la ecología, la evolución y la conservación de las plantas. Realizamos metaanálisis de estudios publicados entre 1987 y 2005 para probar si estas relaciones son generalmente positivas, si son sensibles a las diferencias metodológicas entre estudios, si difieren entre especies de diferente esperanza de vida, sistema de apareamiento o rareza y si dependen de los rangos de tamaño de las poblaciones estudiadas. Las correlaciones medias entre el tamaño de la población, la aptitud y la variación genética fueron todas significativamente positivas. La correlación positiva entre el tamaño de la población y la aptitud femenina tendía a ser más fuerte en estudios de campo que en estudios de jardín común, y la correlación positiva entre la variación genética y la aptitud fue significativamente más fuerte en estudios de ADN que en estudios de isoenzimas. La fuerza y la dirección de las correlaciones entre el tamaño de la población, la aptitud y la variación genética fueron independientes de la esperanza de vida de las plantas y del rango de tamaño de las poblaciones estudiadas. Las correlaciones medias tendían a ser más fuertes para las especies raras que para las especies comunes. La heterocigosidad esperada, el número de alelos y el número o proporción de loci polimórficos aumentaron significativamente con el tamaño de la población, pero el nivel de endogamia F IS fue independiente del tamaño de la población. La relación positiva entre el tamaño de la población y el número de alelos y el número o proporción de loci polimórficos fue más fuerte en especies autocompatibles que en especies autocompatibles. Además, la aptitud y la variación genética estaban correlacionadas positivamente en especies autocompatibles, pero independientes entre sí en especies autocompatibles. Las estrechas relaciones entre el tamaño de la población, la variación genética y la aptitud sugieren que el tamaño de la población siempre debe tenerse en cuenta en estudios multipoblacionales de la aptitud o variación genética de las plantas. La generalidad observada de las relaciones positivas entre el tamaño de la población, la aptitud de las plantas y la diversidad genética implica que los efectos negativos de la fragmentación del hábitat sobre la aptitud y la variación genética de las plantas son comunes. Además, las asociaciones positivas más fuertes observadas en especies autocompatibles y en cierto grado en especies raras, sugieren que estas especies son las más propensas a los efectos negativos de la fragmentación del hábitat.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2745.2006.01150.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2745.2006.01150.x",
    openalex = "W2041902086",
    references = "doi101146annureves10110179001133"
}

Revisamos las definiciones de población comúnmente utilizadas bajo tanto el paradigma ecológico (que enfatiza la cohesión demográfica) como el paradigma evolutivo (que enfatiza la cohesión reproductiva) y encontramos que ninguna es realmente operativa. Sugerimos varios criterios cuantitativos que podrían utilizarse para determinar cuándo los grupos de individuos son lo suficientemente diferentes como para ser considerados 'poblaciones'. Las unidades para estos criterios son la tasa de migración (m) para el paradigma ecológico y los migrantes por generación (Nm) para el paradigma evolutivo. Estos criterios se evalúan luego aplicando métodos analíticos a datos genéticos simulados para un modelo de isla finito. Bajo el conjunto de parámetros estándar que incluye L = 20 loci de alta mutación (tipo microsatélite) y muestras de S = 50 individuos de cada una de las n = 4 subpoblaciones, la potencia para detectar desviaciones de la panmixia fue muy alta (aproximadamente 100%; P < 0.001) incluso con un flujo génico alto (Nm = 25). Un nuevo método, que compara el número de asignaciones de población correctas con la expectativa aleatoria, funcionó tan bien como una prueba de contingencia multilocus y merece una consideración adicional. El uso de marcadores de baja mutación (tipo aloenzima) redujo la potencia más que reducir a la mitad S o L. Bajo el conjunto de parámetros estándar, la potencia para detectar un flujo génico restringido por debajo de cierto nivel X (H(0): Nm < X) también puede ser alta, siempre que el Nm verdadero sea < o = 0.5X. Sin embargo, desarrollar el criterio de prueba apropiado requiere suposiciones sobre varios parámetros clave que son difíciles de estimar en la mayoría de las poblaciones naturales. Los métodos que agrupan individuos sin utilizar información de muestreo a priori detectaron el número verdadero de poblaciones solo bajo condiciones de flujo génico moderado o bajo (Nm < o = 5), y la potencia cayó bruscamente con muestras más pequeñas de loci e individuos. Un algoritmo simple basado en una prueba de contingencia multilocus de frecuencias alélicas en pares de muestras tiene alta potencia para detectar el número verdadero de poblaciones incluso con Nm = 25, pero requiere una evaluación estadística más rigurosa. El paradigma ecológico sigue siendo un desafío para las evaluaciones que utilizan marcadores genéticos, porque la transición de la dependencia demográfica a la independencia ocurre en una región de alta migración donde los métodos genéticos tienen relativamente poca potencia. Algunos desarrollos teóricos recientes y los continuos avances en la potencia computacional ofrecen esperanza de que esta situación pueda cambiar en el futuro.

@article{doi101111j1365294x200602890x,
    author = "Waples, Robin S. and Gaggiotti, Oscar E.",
    title = "INVITED REVIEW: What is a population? An empirical evaluation of some genetic methods for identifying the number of gene pools and their degree of connectivity",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Revisamos las definiciones de población comúnmente utilizadas bajo tanto el paradigma ecológico (que enfatiza la cohesión demográfica) como el paradigma evolutivo (que enfatiza la cohesión reproductiva) y encontramos que ninguna es realmente operativa. Sugerimos varios criterios cuantitativos que podrían utilizarse para determinar cuándo los grupos de individuos son lo suficientemente diferentes como para ser considerados 'poblaciones'. Las unidades para estos criterios son la tasa de migración (m) para el paradigma ecológico y los migrantes por generación (Nm) para el paradigma evolutivo. Estos criterios se evalúan luego aplicando métodos analíticos a datos genéticos simulados para un modelo de isla finito. Bajo el conjunto de parámetros estándar que incluye L = 20 loci de alta mutación (tipo microsatélite) y muestras de S = 50 individuos de cada una de las n = 4 subpoblaciones, la potencia para detectar desviaciones de la panmixia fue muy alta (aproximadamente 100\%; P < 0.001) incluso con un flujo génico alto (Nm = 25). Un nuevo método, que compara el número de asignaciones de población correctas con la expectativa aleatoria, funcionó tan bien como una prueba de contingencia multilocus y merece una consideración adicional. El uso de marcadores de baja mutación (tipo aloenzima) redujo la potencia más que reducir a la mitad S o L. Bajo el conjunto de parámetros estándar, la potencia para detectar un flujo génico restringido por debajo de cierto nivel X (H(0): Nm < X) también puede ser alta, siempre que el Nm verdadero sea < o = 0.5X. Sin embargo, desarrollar el criterio de prueba apropiado requiere suposiciones sobre varios parámetros clave que son difíciles de estimar en la mayoría de las poblaciones naturales. Los métodos que agrupan individuos sin utilizar información de muestreo a priori detectaron el número verdadero de poblaciones solo bajo condiciones de flujo génico moderado o bajo (Nm < o = 5), y la potencia cayó bruscamente con muestras más pequeñas de loci e individuos. Un algoritmo simple basado en una prueba de contingencia multilocus de frecuencias alélicas en pares de muestras tiene alta potencia para detectar el número verdadero de poblaciones incluso con Nm = 25, pero requiere una evaluación estadística más rigurosa. El paradigma ecológico sigue siendo un desafío para las evaluaciones que utilizan marcadores genéticos, porque la transición de la dependencia demográfica a la independencia ocurre en una región de alta migración donde los métodos genéticos tienen relativamente poca potencia. Algunos desarrollos teóricos recientes y los continuos avances en la potencia computacional ofrecen esperanza de que esta situación pueda cambiar en el futuro.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2006.02890.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2006.02890.x",
    openalex = "W2172086791",
    references = "doi101046j1365294x200402008x, doi101093jheredesh074, doi101111j146918091975tb00129x, doi105281zenodo10742832, openalexw1495050269"
}

Las Escherichia coli patógenas causan más de 160 millones de casos de disentería y un millón de muertes al año, mientras que las E. coli no patógenas constituyen parte de la flora intestinal normal de mamíferos y aves sanas. Las vías evolutivas subyacentes a esta dicotomía en el estilo de vida bacteriano fueron investigadas mediante tipado de secuencias multilocus de una colección global de aislamientos. Tipos específicos de patógenos [E. coli enterohemorrágica, E. coli enteropatógena, E. coli enteroinvasiva, K1 y Shigella] han surgido de forma independiente y repetida en varias linajes, mientras que otros linajes contienen solo pocos patógenos. Las tasas de evolución han acelerado en linajes patógenos, culminando en organismos altamente virulentos cuyo contenido genómico se altera frecuentemente por tasas aumentadas de recombinación homóloga; por lo tanto, la evolución de la virulencia está vinculada al sexo bacteriano. Este patrón a largo plazo de evolución fue observado en genes distribuidos por todo el genoma, y por lo tanto es probablemente el resultado de una selección episódica para cepas que pueden escapar de la respuesta inmune del hospedador.

@article{doi101111j13652958200605172x,
    author = "Wirth, Thierry y Falush, Daniel y Lan, Ruiting y Colles, Frances M. y Mensa, Patience y Wieler, Lothar H. y Karch, Helge y Reeves, Peter R. y Maiden, Martin y Ochman, Howard y Achtman, Mark",
    title = "Sexo y virulencia en Escherichia coli: una perspectiva evolutiva",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Microbiology",
    abstract = "Las Escherichia coli patógenas causan más de 160 millones de casos de disentería y un millón de muertes al año, mientras que las E. coli no patógenas constituyen parte de la flora intestinal normal de mamíferos y aves sanas. Las vías evolutivas subyacentes a esta dicotomía en el estilo de vida bacteriano fueron investigadas mediante tipado de secuencias multilocus de una colección global de aislamientos. Tipos específicos de patógenos [E. coli enterohemorrágica, E. coli enteropatógena, E. coli enteroinvasiva, K1 y Shigella] han surgido de forma independiente y repetida en varias linajes, mientras que otros linajes contienen solo pocos patógenos. Las tasas de evolución han acelerado en linajes patógenos, culminando en organismos altamente virulentos cuyo contenido genómico se altera frecuentemente por tasas aumentadas de recombinación homóloga; por lo tanto, la evolución de la virulencia está vinculada al sexo bacteriano. Este patrón a largo plazo de evolución fue observado en genes distribuidos por todo el genoma, y por lo tanto es probablemente el resultado de una selección episódica para cepas que pueden escapar de la respuesta inmune del hospedador.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2006.05172.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2958.2006.05172.x",
    openalex = "W2161060487",
    references = "doi101007bf02111283, doi10103842701, doi101093bioinformatics183502, doi101111j1365294x200502553x"
}

Los árboles no forman un grupo natural, pero comparten atributos como gran tamaño, longevidad y alta producción reproductiva que afectan su modo y ritmo de evolución. En particular, los árboles son únicos en que mantienen altos niveles de diversidad mientras acumulan nuevas mutaciones solo lentamente. También son capaces de adaptación local rápida y pueden evolucionar rápidamente de ancestros no arbóreos, pero la mayoría de las líneas filogenéticas de árboles existentes típicamente experimentan bajas tasas de especiación y extinción. Discutimos por qué el hábito de crecimiento arbóreo debería llevar a estas características aparentemente paradójicas.

@article{doi101146annurevecolsys37091305110215,
    author = "Petit, Rémy J. y Hampe, Arndt",
    title = "Algunas Consecuencias Evolutivas de Ser un Árbol",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Los árboles no forman un grupo natural, pero comparten atributos como gran tamaño, longevidad y alta producción reproductiva que afectan su modo y ritmo de evolución. En particular, los árboles son únicos en que mantienen altos niveles de diversidad mientras acumulan nuevas mutaciones solo lentamente. También son capaces de adaptación local rápida y pueden evolucionar rápidamente de ancestros no arbóreos, pero la mayoría de las líneas filogenéticas de árboles existentes típicamente experimentan bajas tasas de especiación y extinción. Discutimos por qué el hábito de crecimiento arbóreo debería llevar a estas características aparentemente paradójicas.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215",
    openalex = "W2102352162",
    references = "doi101111j001438202001tb00826x, doi101111j14610248200500739x, doi101126science1061967, doi101146annurevecolsys271237, doi101146annureves10110179001133, doi101146annureves15110184000433, doi107208chicago97802261186970010001, openalexw2065039187, openalexw2145250129, openalexw2146778590"
}

@article{doi101038nrg2063,
    author = "Wray, Gregory A.",
    title = "La importancia evolutiva de las mutaciones cis-reguladoras",
    year = "2007",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2063",
    doi = "10.1038/nrg2063",
    openalex = "W2012354488",
    references = "doi101016s0022283661800727, doi10103835046017, doi101038nature02415, doi101038ng1946, doi101038sjmp4001851, doi101056nejm197608052950602, doi101073pnas0431157100, doi101073pnas9794530, doi101086406830, doi101086421051, doi101093genetics15141531, doi101093molbevmsg140, doi101111j001438202000tb00544x, doi101126science1071829, doi101126science1072290, doi101126science1090005"
}

Las diversificaciones evolutivas se atribuyen comúnmente a las modificaciones continuas de un conjunto de herramientas genéticas conservadas de vías de desarrollo, de modo que la complejidad y la convergencia en las formas de los organismos se asumen debidas a la similitud en los mecanismos genéticos o las condiciones ambientales. Sin embargo, este enfoque confunde las causas del desarrollo de los organismos con las causas de las diferencias entre organismos y, por lo tanto, tiene una utilidad limitada para abordar la causa del cambio evolutivo. Los mecanismos moleculares que están estrechamente involucrados tanto en la respuesta del desarrollo a las señales ambientales como en las innovaciones y diversificaciones evolutivas mayores están especialmente adecuados para cerrar esta brecha conectando explícitamente las causas de la variación dentro de una generación con las causas de la divergencia de los taxones. Las vías de desarrollo de la formación ósea y un papel común de las proteínas morfogenéticas óseas (BMPs) tanto en el remodelado epigenético óseo como en la evolución de diversificaciones adaptativas mayores proporcionan tal oportunidad. Mostramos que la variación en el momento de la osificación puede resultar en patrones fenotípicos similares a través de cambios en la expresión génica inducidos epigenéticamente y proponemos que tanto la acomodación genética de las vías de desarrollo inducidas por el ambiente como la flexibilidad en el desarrollo a través de los ambientes evolucionan a través de cambios heterocrónicos en la maduración ósea relativa a la exposición a ambientes impredecibles. Sugerimos que tales cambios heterocrónicos en la osificación no solo pueden amortiguar el desarrollo bajo ambientes fluctuantes mientras mantienen la sensibilidad epigenética crítica para la formación esquelética normal, sino que también permiten que la expresión génica inducida epigenéticamente genere adaptaciones morfológicas especializadas. Revisamos estudios sobre la sensibilidad ambiental de las vías BMP y su regulación de la formación, remodelado y reparación del cartílago y el hueso para examinar la hipótesis de que las adaptaciones esqueléticas mediadas por BMP se facilitan por la reactividad evolucionada de las BMP a señales externas. Sorprendentemente, ningún estudio empírico hasta la fecha ha identificado el mecanismo molecular detrás de la plasticidad del desarrollo en rasgos esqueléticos. Esbozamos un marco conceptual para estudios futuros que se centren en la mediación de la plasticidad fenotípica en el desarrollo esquelético por los patrones de expresión de BMP.

@article{doi101093icbicm025,
    author = "Young, Rebecca L. and Badyaev, Alexander V.",
    title = "Evolución de la ontogenia: vincular el remodelado epigenético y la adaptación genética en estructuras esqueléticas",
    year = "2007",
    journal = "Integrative and Comparative Biology",
    abstract = "Las diversificaciones evolutivas se atribuyen comúnmente a las modificaciones continuas de un conjunto de herramientas genéticas conservadas de vías de desarrollo, de modo que la complejidad y la convergencia en las formas de los organismos se asumen debidas a la similitud en los mecanismos genéticos o las condiciones ambientales. Sin embargo, este enfoque confunde las causas del desarrollo de los organismos con las causas de las diferencias entre organismos y, por lo tanto, tiene una utilidad limitada para abordar la causa del cambio evolutivo. Los mecanismos moleculares que están estrechamente involucrados tanto en la respuesta del desarrollo a las señales ambientales como en las innovaciones y diversificaciones evolutivas mayores están especialmente adecuados para cerrar esta brecha conectando explícitamente las causas de la variación dentro de una generación con las causas de la divergencia de los taxones. Las vías de desarrollo de la formación ósea y un papel común de las proteínas morfogenéticas óseas (BMPs) tanto en el remodelado epigenético óseo como en la evolución de diversificaciones adaptativas mayores proporcionan tal oportunidad. Mostramos que la variación en el momento de la osificación puede resultar en patrones fenotípicos similares a través de cambios en la expresión génica inducidos epigenéticamente y proponemos que tanto la acomodación genética de las vías de desarrollo inducidas por el ambiente como la flexibilidad en el desarrollo a través de los ambientes evolucionan a través de cambios heterocrónicos en la maduración ósea relativa a la exposición a ambientes impredecibles. Sugerimos que tales cambios heterocrónicos en la osificación no solo pueden amortiguar el desarrollo bajo ambientes fluctuantes mientras mantienen la sensibilidad epigenética crítica para la formación esquelética normal, sino que también permiten que la expresión génica inducida epigenéticamente genere adaptaciones morfológicas especializadas. Revisamos estudios sobre la sensibilidad ambiental de las vías BMP y su regulación de la formación, remodelado y reparación del cartílago y el hueso para examinar la hipótesis de que las adaptaciones esqueléticas mediadas por BMP se facilitan por la reactividad evolucionada de las BMP a señales externas. Sorprendentemente, ningún estudio empírico hasta la fecha ha identificado el mecanismo molecular detrás de la plasticidad del desarrollo en rasgos esqueléticos. Esbozamos un marco conceptual para estudios futuros que se centren en la mediación de la plasticidad fenotípica en el desarrollo esquelético por los patrones de expresión de BMP.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/icm025",
    doi = "10.1093/icb/icm025",
    openalex = "W2129912251",
    references = "doi101046j14209101200200455x"
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Un principio importante de la biología del desarrollo evolutivo ("evo devo") es que las mutaciones adaptativas que afectan la morfología es más probable que ocurran en las regiones cis-reguladoras que en las regiones de codificación de proteínas de los genes. Este argumento se basa en dos afirmaciones: (1) la naturaleza modular de los elementos cis-reguladores los libera en gran medida de efectos pleiotrópicos deletéreos, y (2) un creciente cuerpo de evidencia empírica parece apoyar el papel predominante del cambio en la regulación génica en la adaptación, especialmente la adaptación morfológica. Aquí discutimos y criticamos estas afirmaciones. Primero mostramos que no hay base teórica ni empírica para la postura evo devo de que las adaptaciones que involucran morfología evolucionan mediante mecanismos genéticos diferentes a los que involucran fisiología y otros rasgos. Además, algunas formas de evolución de proteínas pueden evitar las consecuencias negativas de la pleiotropía, más notoriamente mediante la duplicación génica. A la luz de las afirmaciones evo devo, luego examinamos los datos sustanciales sobre la base genética de la adaptación tanto de encuestas a nivel genómico como de estudios de un solo locus. Los estudios genómicos brindan poco apoyo a la teoría cis-reguladora: muchos de estos han detectado adaptación en regiones de codificación de proteínas, incluyendo factores de transcripción, mientras que pocos han examinado regiones reguladoras. Volviendo a los estudios de un solo locus, notamos que los ejemplos más ampliamente citados de mutaciones cis-reguladoras adaptativas se centran en la pérdida de rasgos en lugar de la ganancia, y ninguno ha identificado aún un sitio regulador evolucionado. Por el contrario, hay muchos estudios que han identificado tanto mutaciones estructurales como verificado funcionalmente su contribución a la adaptación y la especiación. Ni los argumentos teóricos ni los datos de la naturaleza, entonces, apoyan la afirmación de una predominancia de mutaciones cis-reguladoras en la evolución. Aunque esta afirmación pueda ser verdadera, es a lo sumo prematura. La adaptación y la especiación probablemente proceden a través de una combinación de mutaciones cis-reguladoras y estructurales, con una contribución sustancial de estas últimas.

@article{doi101111j15585646200700105x,
    author = "Hoekstra, Hopi E. and Coyne, Jerry A.",
    title = "THE LOCUS OF EVOLUTION: EVO DEVO AND THE GENETICS OF ADAPTATION",
    year = "2007",
    journal = "Evolution",
    abstract = {Un principio importante de la biología del desarrollo evolutivo ("evo devo") es que las mutaciones adaptativas que afectan la morfología es más probable que ocurran en las regiones cis-reguladoras que en las regiones de codificación de proteínas de los genes. Este argumento se basa en dos afirmaciones: (1) la naturaleza modular de los elementos cis-reguladores los libera en gran medida de efectos pleiotrópicos deletéreos, y (2) un creciente cuerpo de evidencia empírica parece apoyar el papel predominante del cambio en la regulación génica en la adaptación, especialmente la adaptación morfológica. Aquí discutimos y criticamos estas afirmaciones. Primero mostramos que no hay base teórica ni empírica para la postura evo devo de que las adaptaciones que involucran morfología evolucionan mediante mecanismos genéticos diferentes a los que involucran fisiología y otros rasgos. Además, algunas formas de evolución de proteínas pueden evitar las consecuencias negativas de la pleiotropía, más notoriamente mediante la duplicación génica. A la luz de las afirmaciones evo devo, luego examinamos los datos sustanciales sobre la base genética de la adaptación tanto de encuestas a nivel genómico como de estudios de un solo locus. Los estudios genómicos brindan poco apoyo a la teoría cis-reguladora: muchos de estos han detectado adaptación en regiones de codificación de proteínas, incluyendo factores de transcripción, mientras que pocos han examinado regiones reguladoras. Volviendo a los estudios de un solo locus, notamos que los ejemplos más ampliamente citados de mutaciones cis-reguladoras adaptativas se centran en la pérdida de rasgos en lugar de la ganancia, y ninguno ha identificado aún un sitio regulador evolucionado. Por el contrario, hay muchos estudios que han identificado tanto mutaciones estructurales como verificado funcionalmente su contribución a la adaptación y la especiación. Ni los argumentos teóricos ni los datos de la naturaleza, entonces, apoyan la afirmación de una predominancia de mutaciones cis-reguladoras en la evolución. Aunque esta afirmación pueda ser verdadera, es a lo sumo prematura. La adaptación y la especiación probablemente proceden a través de una combinación de mutaciones cis-reguladoras y estructurales, con una contribución sustancial de estas últimas.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2007.00105.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2007.00105.x",
    openalex = "W2101103652",
    references = "doi1010079783642866593, doi101016s0022283661800727, doi101017s0094837300005224, doi101038366223a0, doi10103847412, doi101038nature04843, doi101038nrg2063, doi101038scientificamerican117998, doi101038sjhdy6800154, doi101073pnas0431157100, doi101073pnas7183028, doi101073pnas9794530, doi101093molbevmsg140, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j001438202004tb00462x, doi101126science1090005, doi101126science1098095, doi101126science1113832, doi101126science29054941151, doi101126science860134, doi101146annurevphysiol631359, doi101371journalpbio0030245, doi105860choice395182, doi105962bhltitle27468, openalexw3135630760"
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La Síntesis Moderna (SM) es el paradigma actual en biología evolutiva. De hecho, se construyó ampliando las bases conceptuales establecidas por sus predecesores, el darwinismo y el neodarwinismo. Durante algún tiempo ha habido conversaciones sobre una nueva Síntesis Evolutiva Extendida (SEE), y este artículo comienza a delinear por qué podríamos necesitar tal extensión y cómo podría surgir. Como el filósofo Karl Popper ha notado, la teoría evolutiva actual es una teoría de genes, y aún nos falta una teoría de formas. El campo comenzó, de hecho, como una teoría de formas en los días de Darwin, y el objetivo principal que una SEE buscará es la unificación de nuestras teorías de genes y de formas. Esto puede lograrse mediante un injerto orgánico de conceptos novedosos sobre la estructura fundamental de la SM, particularmente la evolvabilidad, la plasticidad fenotípica, la herencia epigenética, la teoría de la complejidad y la teoría de la evolución en paisajes adaptativos de alta dimensión.

@article{doi101111j15585646200700246x,
    author = "Pigliucci, Massimo",
    title = "¿NECESITAMOS UNA SÍNTESIS EVOLUTIVA EXTENDIDA?",
    year = "2007",
    journal = "Evolution",
    abstract = "La Síntesis Moderna (SM) es el paradigma actual en biología evolutiva. De hecho, se construyó ampliando las bases conceptuales establecidas por sus predecesores, el darwinismo y el neodarwinismo. Durante algún tiempo ha habido conversaciones sobre una nueva Síntesis Evolutiva Extendida (SEE), y este artículo comienza a delinear por qué podríamos necesitar tal extensión y cómo podría surgir. Como el filósofo Karl Popper ha notado, la teoría evolutiva actual es una teoría de genes, y aún nos falta una teoría de formas. El campo comenzó, de hecho, como una teoría de formas en los días de Darwin, y el objetivo principal que una SEE buscará es la unificación de nuestras teorías de genes y de formas. Esto puede lograrse mediante un injerto orgánico de conceptos novedosos sobre la estructura fundamental de la SM, particularmente la evolvabilidad, la plasticidad fenotípica, la herencia epigenética, la teoría de la complejidad y la teoría de la evolución en paisajes adaptativos de alta dimensión.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2007.00246.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2007.00246.x",
    openalex = "W2114930668",
    references = "doi1010021097010x200012152884304aidjez330co2g, doi101002jezb21081, doi101017cbo9780511701559, doi101046j14209101200200455x"
}

@article{turner2007the,
    author = "Turner, Thomas F.",
    title = "La evolución de la genética evolutiva",
    year = "2007",
    journal = "BioScience",
    url = "https://doi.org/10.1641/b570413",
    doi = "10.1641/b570413",
    number = "4",
    pages = "375-376",
    volume = "57"
}

@article{doi101016jcell200806030,
    author = "Carroll, Sean B.",
    title = "Evo-Devo y una Síntesis Evolutiva en Expansión: Una Teoría Genética de la Evolución Morfológica",
    year = "2008",
    journal = "Cell",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.030",
    doi = "10.1016/j.cell.2008.06.030",
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@article{doi101038nrg2323,
    author = "Duffy, Siobain y Shackelton, Laura A. y Holmes, Edward C.",
    title = "Tasas de cambio evolutivo en virus: patrones y determinantes",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2323",
    doi = "10.1038/nrg2323",
    openalex = "W2020939898",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016s0169534703002167, doi101038nrg2146, doi101371journalpbio0040088"
}

@article{doi101038nrg2398,
    author = "López‐Maury, Luis y Marguerat, Samuel y Bähler, Jürg",
    title = "Ajustar la expresión génica a entornos cambiantes: desde respuestas rápidas hasta adaptación evolutiva",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2398",
    doi = "10.1038/nrg2398",
    openalex = "W2028979517",
    references = "doi101038nrg1088, doi101038nrg2063"
}

@article{doi101038nrg2452,
    author = "Phillips, Patrick C.",
    title = "Epistasis — el papel esencial de las interacciones génicas en la estructura y la evolución de los sistemas genéticos",
    year = "2008",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg2452",
    doi = "10.1038/nrg2452",
    openalex = "W2094189284",
    references = "doi1010160020711x94901198, doi101017s0080456800012163, doi101038091009b0, doi101038nature05874, doi101038nature05911, doi101038ng1537, doi101073pnas0702207104, doi101093hmg11202463, doi101111j001438202003tb00377x, doi101126science1065810, doi101126science1091317, doi101126science1123348, doi101126science1123539, doi101126science860134, doi101159000073735, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle44575, openalexw1554403518"
}

En teoría, las hembras que se reproducen asexualmente deberían disfrutar de una ventaja doble en aptitud en comparación con las hembras sexuales, sin embargo, el sexo sigue siendo el modo predominante de reproducción en prácticamente todos los eucariotas. El mantenimiento evolutivo del sexo es especialmente desconcertante en las plantas clonales porque la transición de la reproducción sexual a la reproducción exclusivamente asexual es una posibilidad siempre presente en estas especies. En este artículo, utilizo datos publicados sobre la diversidad genotípica de poblaciones de plantas clonales para probar cinco hipótesis sobre las situaciones ecológicas que limitan o favorecen la reproducción clonal en plantas vasculares. Los datos provienen de 248 estudios que abarcan 69.000 individuos en >2000 poblaciones de 218 especies en 74 familias de plantas. Las pruebas mostraron lo siguiente: (1) la frecuencia de la clonalidad aumenta con la edad de la población, indicando que la reproducción clonal está limitada por la perturbación; (2) la reproducción clonal está limitada por la dispersión; los clones son más frecuentes en especies acuáticas y apomícticas en las que la dispersión de propagulos producidos clonalmente es menos limitante; (3) los clones son más frecuentes en poblaciones de especies raras o en peligro de extinción; (4) las poblaciones de plantas exóticas tienen frecuencias más altas de clonalidad; y (5) los clones son más frecuentes en los bordes de los rangos geográficos de las especies. Por lo tanto, parece que la planta clonal finalmente exitosa sería una apomixis acuática, exótica y rara que vive en un hábitat geográficamente marginal sin perturbaciones. Dado que esta combinación de circunstancias es tan restrictiva, quizás sea mejor considerarla como un signo de fracaso sexual que como una receta para el éxito clonal.

@article{doi101086523357,
    author = "Silvertown, Jonathan",
    title = "The Evolutionary Maintenance of Sexual Reproduction: Evidence from the Ecological Distribution of Asexual Reproduction in Clonal Plants",
    year = "2008",
    journal = "International Journal of Plant Sciences",
    abstract = "En teoría, las hembras que se reproducen asexualmente deberían disfrutar de una ventaja doble en aptitud en comparación con las hembras sexuales, sin embargo, el sexo sigue siendo el modo predominante de reproducción en prácticamente todos los eucariotas. El mantenimiento evolutivo del sexo es especialmente desconcertante en las plantas clonales porque la transición de la reproducción sexual a la reproducción exclusivamente asexual es una posibilidad siempre presente en estas especies. En este artículo, utilizo datos publicados sobre la diversidad genotípica de poblaciones de plantas clonales para probar cinco hipótesis sobre las situaciones ecológicas que limitan o favorecen la reproducción clonal en plantas vasculares. Los datos provienen de 248 estudios que abarcan 69.000 individuos en >2000 poblaciones de 218 especies en 74 familias de plantas. Las pruebas mostraron lo siguiente: (1) la frecuencia de la clonalidad aumenta con la edad de la población, indicando que la reproducción clonal está limitada por la perturbación; (2) la reproducción clonal está limitada por la dispersión; los clones son más frecuentes en especies acuáticas y apomícticas en las que la dispersión de propagulos producidos clonalmente es menos limitante; (3) los clones son más frecuentes en poblaciones de especies raras o en peligro de extinción; (4) las poblaciones de plantas exóticas tienen frecuencias más altas de clonalidad; y (5) los clones son más frecuentes en los bordes de los rangos geográficos de las especies. Por lo tanto, parece que la planta clonal finalmente exitosa sería una apomixis acuática, exótica y rara que vive en un hábitat geográficamente marginal sin perturbaciones. Dado que esta combinación de circunstancias es tan restrictiva, quizás sea mejor considerarla como un signo de fracaso sexual que como una receta para el éxito clonal.",
    url = "https://doi.org/10.1086/523357",
    doi = "10.1086/523357",
    openalex = "W2127863127",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

La conservación de la diversidad genética, una de las tres formas principales de biodiversidad, es una preocupación fundamental en la biología de la conservación, ya que proporciona la materia prima para el cambio evolutivo y, por lo tanto, el potencial para adaptarse a entornos cambiantes. Mediante metaanálisis, probamos la generalidad de las hipótesis de que la fragmentación del hábitat afecta la diversidad genética de las poblaciones de plantas y que ciertos rasgos de historia de vida y ecológicos de las plantas pueden determinar la susceptibilidad diferencial a la erosión genética en hábitats fragmentados. Además, evaluamos si ciertos enfoques metodológicos utilizados por los autores influyen en la capacidad de detectar los efectos de la fragmentación en la diversidad genética de las plantas. Encontramos efectos generales grandes y negativos de la fragmentación en la diversidad genética y en las tasas de cruzamiento, pero no efectos en los coeficientes de endogamia. Aumentos significativos en el coeficiente de endogamia en hábitats fragmentados solo se observaron en estudios que analizaban progenies. El sistema de apareamiento y el estado de rareza de las plantas explicaron la mayor proporción de variación en los tamaños de efecto entre especies. La edad del fragmento también fue decisiva para explicar la variabilidad entre los tamaños de efecto: cuanto mayor fue el número de generaciones transcurridas en condiciones de fragmentación, mayor fue la magnitud negativa de los tamaños de efecto sobre la heterocigosidad. Nuestros resultados también sugieren que la fragmentación está desplazando los patrones de apareamiento hacia un mayor autopolinización. Concluimos que los esfuerzos actuales de conservación en hábitats fragmentados deberían centrarse en especies comunes o recientemente raras y principalmente en especies de cruzamiento, y delineamos problemas importantes que deben abordarse en futuras investigaciones sobre este tema.

@article{doi101111j1365294x200803971x,
    author = "Aguilar, Ramiro and Quesada, Maurício and Ashworth, Lorena and Herrerías‐Diego, Yvonne and Lobo, Jorge A.",
    title = "Genetic consequences of habitat fragmentation in plant populations: susceptible signals in plant traits and methodological approaches",
    year = "2008",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Conservation of genetic diversity, one of the three main forms of biodiversity, is a fundamental concern in conservation biology as it provides the raw material for evolutionary change and thus the potential to adapt to changing environments. By means of meta-analyses, we tested the generality of the hypotheses that habitat fragmentation affects genetic diversity of plant populations and that certain life history and ecological traits of plants can determine differential susceptibility to genetic erosion in fragmented habitats. Additionally, we assessed whether certain methodological approaches used by authors influence the ability to detect fragmentation effects on plant genetic diversity. We found overall large and negative effects of fragmentation on genetic diversity and outcrossing rates but no effects on inbreeding coefficients. Significant increases in inbreeding coefficient in fragmented habitats were only observed in studies analyzing progenies. The mating system and the rarity status of plants explained the highest proportion of variation in the effect sizes among species. The age of the fragment was also decisive in explaining variability among effect sizes: the larger the number of generations elapsed in fragmentation conditions, the larger the negative magnitude of effect sizes on heterozygosity. Our results also suggest that fragmentation is shifting mating patterns towards increased selfing. We conclude that current conservation efforts in fragmented habitats should be focused on common or recently rare species and mainly outcrossing species and outline important issues that need to be addressed in future research on this area.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2008.03971.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2008.03971.x",
    openalex = "W2143144439",
    references = "doi101126science8290956, doi101146annureves15110184000433"
}

¿Es predecible la evolución genética? Los biólogos del desarrollo evolutivo han argumentado que, al menos para los rasgos morfológicos, la respuesta es un rotundo sí. Se espera que la mayoría de las mutaciones que causan variación morfológica residan en las regiones cis-reguladoras, en lugar de las regiones codificantes, de los genes del desarrollo. Esta "hipótesis cis-reguladora" ha sido recientemente objeto de críticas. En esta revisión, primero describimos y criticamos los argumentos que se han propuesto a favor de la hipótesis cis-reguladora. Luego, probamos el apoyo empírico para la hipótesis cis-reguladora con una encuesta exhaustiva de las mutaciones responsables de la evolución fenotípica en organismos multicelulares. Las mutaciones cis-reguladoras actualmente representan aproximadamente el 22% de los 331 cambios genéticos identificados, aunque el número de cambios cis-reguladores publicados anualmente está aumentando rápidamente. Por encima del nivel de especie, las mutaciones cis-reguladoras que alteran la morfología son más comunes que los cambios codificantes. Además, por encima del nivel de especie, las mutaciones cis-reguladoras predominan para genes no involucrados en la diferenciación terminal. Estos patrones implican que la simple pregunta "¿Las mutaciones codificantes o cis-reguladoras causan más evolución fenotípica?" oculta fenómenos más interesantes. La evolución en diferentes tipos de poblaciones y durante diferentes duraciones puede resultar en la selección de diferentes tipos de mutaciones. Predecir la base genética de la evolución requiere una síntesis exhaustiva de la biología del desarrollo molecular y la genética de poblaciones.

@article{doi101111j15585646200800450x,
    author = "Stern, David L. y Courtier‐Orgogozo, Virginie",
    title = "THE LOCI OF EVOLUTION: ¿CÓMO DE PREDECIBLE ES LA EVOLUCIÓN GENÉTICA?",
    year = "2008",
    journal = "Evolution",
    abstract = {¿Es predecible la evolución genética? Los biólogos del desarrollo evolutivo han argumentado que, al menos para los rasgos morfológicos, la respuesta es un rotundo sí. Se espera que la mayoría de las mutaciones que causan variación morfológica residan en las regiones cis-reguladoras, en lugar de las regiones codificantes, de los genes del desarrollo. Esta "hipótesis cis-reguladora" ha sido recientemente objeto de críticas. En esta revisión, primero describimos y criticamos los argumentos que se han propuesto a favor de la hipótesis cis-reguladora. Luego, probamos el apoyo empírico para la hipótesis cis-reguladora con una encuesta exhaustiva de las mutaciones responsables de la evolución fenotípica en organismos multicelulares. Las mutaciones cis-reguladoras actualmente representan aproximadamente el 22% de los 331 cambios genéticos identificados, aunque el número de cambios cis-reguladores publicados anualmente está aumentando rápidamente. Por encima del nivel de especie, las mutaciones cis-reguladoras que alteran la morfología son más comunes que los cambios codificantes. Además, por encima del nivel de especie, las mutaciones cis-reguladoras predominan para genes no involucrados en la diferenciación terminal. Estos patrones implican que la simple pregunta "¿Las mutaciones codificantes o cis-reguladoras causan más evolución fenotípica?" oculta fenómenos más interesantes. La evolución en diferentes tipos de poblaciones y durante diferentes duraciones puede resultar en la selección de diferentes tipos de mutaciones. Predecir la base genética de la evolución requiere una síntesis exhaustiva de la biología del desarrollo molecular y la genética de poblaciones.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.2008.00450.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.2008.00450.x",
    openalex = "W2094005099",
    references = "doi101006dbio19960034, doi1010079783642866593, doi101016jibmb200403018, doi101038376479a0, doi101038nature05874, doi101073pnas9794530, doi101093genetics15141531, doi101093genetics16297, doi101098rspb19790086, doi101111j001438202000tb00002x, doi101126science1098095, doi101126science1113832, doi101126science29054941151, doi1023072529912, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle27468, doi105962bhltitle46292, doi105962bhltitle59991"
}

Las presiones evolutivas sobre las proteínas se cuantifican a menudo mediante la razón de las tasas de sustitución en sitios no sinónimos y sinónimos. La razón dN/dS se desarrolló originalmente para su aplicación a secuencias distantes, cuyas diferencias representan sustituciones que se han fijado a lo largo de linajes independientes. No obstante, la medida dN/dS se aplica a menudo a secuencias muestreadas de una sola población, cuyas diferencias representan polimorfismos segregantes. Aquí, estudiamos la razón dN/dS esperada para muestras extraídas de una sola población bajo selección, y encontramos que, en este contexto, dN/dS es relativamente insensible al coeficiente de selección. Además, la firma característica de la selección positiva a lo largo de linajes divergentes, dN/dS>1, se viola dentro de una población. Para las muestras de población, la relación entre la selección y dN/dS no sigue una función monótona, y por lo tanto puede ser imposible inferir las presiones de selección a partir de dN/dS. Estos resultados tienen implicaciones significativas para la interpretación de las mediciones dN/dS entre muestras de genética de poblaciones.

@article{doi101371journalpgen1000304,
    author = "Kryazhimskiy, Sergey y Plotkin, Joshua B.",
    title = "La genética de poblaciones de dN/dS",
    year = "2008",
    journal = "PLoS Genetics",
    abstract = "Las presiones evolutivas sobre las proteínas se cuantifican a menudo mediante la razón de las tasas de sustitución en sitios no sinónimos y sinónimos. La razón dN/dS se desarrolló originalmente para su aplicación a secuencias distantes, cuyas diferencias representan sustituciones que se han fijado a lo largo de linajes independientes. No obstante, la medida dN/dS se aplica a menudo a secuencias muestreadas de una sola población, cuyas diferencias representan polimorfismos segregantes. Aquí, estudiamos la razón dN/dS esperada para muestras extraídas de una sola población bajo selección, y encontramos que, en este contexto, dN/dS es relativamente insensible al coeficiente de selección. Además, la firma característica de la selección positiva a lo largo de linajes divergentes, dN/dS>1, se viola dentro de una población. Para las muestras de población, la relación entre la selección y dN/dS no sigue una función monótona, y por lo tanto puede ser imposible inferir las presiones de selección a partir de dN/dS. Estos resultados tienen implicaciones significativas para la interpretación de las mediciones dN/dS entre muestras de genética de poblaciones.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000304",
    doi = "10.1371/journal.pgen.1000304",
    openalex = "W2045641296",
    references = "doi101007978940115210512, doi101023a1017067816551, doi101146annureves23110192001403"
}

@article{doi101057jibs200995,
    author = "Cantwell, John y Dunning, John H. y Lundan, Sarianna M.",
    title = "Un enfoque evolutivo para comprender la actividad empresarial internacional: La co-evolución de las MNEs y el entorno institucional",
    year = "2009",
    journal = "Journal of International Business Studies",
    url = "https://doi.org/10.1057/jibs.2009.95",
    doi = "10.1057/jibs.2009.95",
    openalex = "W2093229054",
    references = "doi105860choice416654"
}

La reproducción sexual conlleva una serie de costos, y sin embargo la mayoría de los eucariotas se reproducen sexualmente, al menos ocasionalmente. En este artículo, reviso los modelos tempranos para explicar la evolución del sexo y por qué no lograron hacerlo. Esfuerzos más recientes han intentado dar cuenta de las complejidades de la evolución en el mundo real, con una selección que varía en el tiempo y el espacio, con diferencias entre individuos en la tendencia a reproducirse sexualmente, y con poblaciones limitadas en tamaño. Estos esfuerzos recientes han aclarado las condiciones más probables para explicar por qué el sexo es tan común, como se ejemplifica en los artículos de esta edición especial del simposio de The American Naturalist.

@article{doi101086599084,
    author = "Otto, Sarah P.",
    title = "The Evolutionary Enigma of Sex",
    year = "2009",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Sexual reproduction entails a number of costs, and yet the majority of eukaryotes engage in sex, at least occasionally. In this article, I review early models to explain the evolution of sex and why they failed to do so. More recent efforts have attempted to account for the complexities of evolution in the real world, with selection that varies over time and space, with differences among individuals in the tendency to reproduce sexually, and with populations that are limited in size. These recent efforts have clarified the conditions that are most likely to explain why sex is so common, as exemplified by the articles in this symposium issue of the American Naturalist.",
    url = "https://doi.org/10.1086/599084",
    doi = "10.1086/599084",
    openalex = "W1995865334",
    references = "doi101111j001438202002tb00188x"
}

Muchas, si no la mayoría, de las enzimas pueden catalizar reacciones de manera promiscua, o actuar sobre sustratos distintos a aquellos para los que evolucionaron. Aquí, discutimos las implicaciones estructurales, mecanísticas y evolutivas de esta manifestación de infidelidad del reconocimiento molecular. Definimos la promiscuidad y fenómenos relacionados y también abordamos su generalidad e implicaciones fisiológicas. Discutimos la enzimología mecanística de la promiscuidad: cómo las enzimas, que generalmente ejercen una especificidad exquisita, catalizan otras reacciones, y a veces apenas relacionadas. Finalmente, abordamos la hipótesis de que las actividades enzimáticas promiscuas sirven como puntos de partida evolutivos y destacamos las características evolutivas únicas de las funciones de las enzimas promiscuas.

@article{doi101146annurevbiochem030409143718,
    author = "Khersonsky, Olga y Tawfik, Dan S.",
    title = "Promiscuidad enzimática: Una perspectiva mecanística y evolutiva",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Biochemistry",
    abstract = "Muchas, si no la mayoría, de las enzimas pueden catalizar reacciones de manera promiscua, o actuar sobre sustratos distintos a aquellos para los que evolucionaron. Aquí, discutimos las implicaciones estructurales, mecanísticas y evolutivas de esta manifestación de infidelidad del reconocimiento molecular. Definimos la promiscuidad y fenómenos relacionados y también abordamos su generalidad e implicaciones fisiológicas. Discutimos la enzimología mecanística de la promiscuidad: cómo las enzimas, que generalmente ejercen una especificidad exquisita, catalizan otras reacciones, y a veces apenas relacionadas. Finalmente, abordamos la hipótesis de que las actividades enzimáticas promiscuas sirven como puntos de partida evolutivos y destacamos las características evolutivas únicas de las funciones de las enzimas promiscuas.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-030409-143718",
    doi = "10.1146/annurev-biochem-030409-143718",
    openalex = "W2128312954",
    references = "doi1010079783642866593, doi101038nature06879, doi101038nrg2482, doi101073pnas95158420, doi101126science1123348, doi101126science1123539, doi101126science1152692, doi101126science860134, doi101146annurevmi30100176002205, doi105860choice370939, openalexw3086983054, openalexw588942190"
}

Muchas plantas con flores exhiben modos reproductivos duales, produciendo tanto descendencia sexual como asexual. La forma más común de reproducción asexual es el crecimiento clonal, en el cual los módulos vegetativos (ramets) son producidos por el genotipo parental (genet). En las plantas, la reproducción sexual y asexual suelen ocurrir simultáneamente, y esto puede llevar a compromisos de asignación y antagonismo entre los modos reproductivos. Nuestra revisión considera las consecuencias ecológicas y evolutivas de las interacciones funcionales entre la reproducción clonal y la polinización y el apareamiento. La reproducción clonal está comúnmente asociada con la floración masiva, la dispersión restringida de polen y la autopolinización geitonógama, procesos que pueden resultar en depresión por endogamia y descuento de polen. Revisamos la evidencia de la evolución correlacionada de la clonalidad y los sistemas sexuales, particularmente la incompatibilidad sexual, e identificamos varios mecanismos florales que funcionan para reducir los costos de apareamiento limitando la autogamia y el descuento de polen. Concluimos discutiendo la pérdida de sexualidad en plantas clonales y consideramos la base genética y ambiental de la disfunción sexual.

@article{doi101146annurevecolsys110308120258,
    author = "Vallejo‐Marín, Mario y Dorken, Marcel E. y Barrett, Spencer C. H.",
    title = "Las Consecuencias Ecológicas y Evolutivas de la Clonalidad para la Reproducción de las Plantas",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Muchas plantas con flores exhiben modos reproductivos duales, produciendo tanto descendencia sexual como asexual. La forma más común de reproducción asexual es el crecimiento clonal, en el cual los módulos vegetativos (ramets) son producidos por el genotipo parental (genet). En las plantas, la reproducción sexual y asexual suelen ocurrir simultáneamente, y esto puede llevar a compromisos de asignación y antagonismo entre los modos reproductivos. Nuestra revisión considera las consecuencias ecológicas y evolutivas de las interacciones funcionales entre la reproducción clonal y la polinización y el apareamiento. La reproducción clonal está comúnmente asociada con la floración masiva, la dispersión restringida de polen y la autopolinización geitonógama, procesos que pueden resultar en depresión por endogamia y descuento de polen. Revisamos la evidencia de la evolución correlacionada de la clonalidad y los sistemas sexuales, particularmente la incompatibilidad sexual, e identificamos varios mecanismos florales que funcionan para reducir los costos de apareamiento limitando la autogamia y el descuento de polen. Concluimos discutiendo la pérdida de sexualidad en plantas clonales y consideramos la base genética y ambiental de la disfunción sexual.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.110308.120258",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.110308.120258",
    openalex = "W1993026968",
    references = "doi1010160304377093900688"
}

Más de medio siglo ha pasado desde la integración de varias corrientes del pensamiento evolutivo en lo que llegó a llamarse la Síntesis Moderna (SM), el marco conceptual que ha definido la teoría evolutiva desde la década de 1940. A pesar de los avances significativos desde entonces en todos los dominios metodológicos y disciplinares de la biología, incluyendo la genética molecular, la biología del desarrollo y los campos de las "-ómicas", el marco de la Síntesis Moderna ha permanecido sorprendentemente inalterado. Aunque todavía se considera el paradigma teórico estándar de la biología evolutiva, durante varios años ahora los disidentes de diversos campos de la biología han estado cuestionando aspectos de la Síntesis Moderna, y se han elaborado conceptos novedosos clave que se extienden más allá de su alcance original (por ejemplo, Maynard Smith y Szathmary 1995; Jablonka y Lamb 1995; Schlichting y Pigliucci 1998; Gould 2002; Muller y Newman 2003; Odling-Smee et al. 2003; West-Eberhard 2003; Kirschner y Gerhart 2005). Como resultado, las llamadas para una expansión del marco de la Síntesis Moderna se han intensificado (R. L. Carroll 2000; Love 2003a; Kutschera y Niklas 2004; Muller 2007; Pigliucci 2007; Rose y Oakley 2007; S. B. Carroll 2008), provocando un debate científico adicional (Pennisi 2008; Whitfield 2008). Bajo el título "Síntesis Extendida", este volumen representa una amplia encuesta de las ideas clave en este programa de investigación multifacético, y una primera mirada a una teoría expandida de la evolución como un trabajo en curso. Hemos reunido a algunos de los autores más prominentes que han estado escribiendo sobre nuevas direcciones en la biología evolutiva y les hemos pedido que expliquen hacia dónde creen que va el campo, y cómo los nuevos conceptos se alinean con la visión de la Síntesis Moderna sobre qué es la evolución. Algunos de estos autores son escépticos de que se puedan discernir cambios fundamentales en las posiciones actuales, mientras que otros se inclinan hacia revisiones mayores de la SM. La mayoría de los contribuyentes caen en algún punto intermedio, aceptando muchos de

@incollection{doi107551mitpress82780030003,
    author = "Pigliucci, Massimo and Müller, Gerd B.",
    title = "Elementos de una síntesis evolutiva extendida",
    year = "2010",
    booktitle = "Los eBooks de The MIT Press",
    abstract = "Más de medio siglo ha pasado desde la integración de varias corrientes del pensamiento evolutivo en lo que llegó a llamarse la Síntesis Moderna (SM), el marco conceptual que ha definido la teoría evolutiva desde la década de 1940. A pesar de los avances significativos desde entonces en todos los dominios metodológicos y disciplinares de la biología, incluyendo la genética molecular, la biología del desarrollo y los campos de las "-ómicas", el marco de la Síntesis Moderna ha permanecido sorprendentemente inalterado. Aunque todavía se considera el paradigma teórico estándar de la biología evolutiva, durante varios años ahora los disidentes de diversos campos de la biología han estado cuestionando aspectos de la Síntesis Moderna, y se han elaborado conceptos novedosos clave que se extienden más allá de su alcance original (por ejemplo, Maynard Smith y Szathmary 1995; Jablonka y Lamb 1995; Schlichting y Pigliucci 1998; Gould 2002; Muller y Newman 2003; Odling-Smee et al. 2003; West-Eberhard 2003; Kirschner y Gerhart 2005). Como resultado, las llamadas para una expansión del marco de la Síntesis Moderna se han intensificado (R. L. Carroll 2000; Love 2003a; Kutschera y Niklas 2004; Muller 2007; Pigliucci 2007; Rose y Oakley 2007; S. B. Carroll 2008), provocando un debate científico adicional (Pennisi 2008; Whitfield 2008). Bajo el título "Síntesis Extendida", este volumen representa una amplia encuesta de las ideas clave en este programa de investigación multifacético, y una primera mirada a una teoría expandida de la evolución como un trabajo en curso. Hemos reunido a algunos de los autores más prominentes que han estado escribiendo sobre nuevas direcciones en la biología evolutiva y les hemos pedido que expliquen hacia dónde creen que va el campo, y cómo los nuevos conceptos se alinean con la visión de la Síntesis Moderna sobre qué es la evolución. Algunos de estos autores son escépticos de que se puedan discernir cambios fundamentales en las posiciones actuales, mientras que otros se inclinan hacia revisiones mayores de la SM. La mayoría de los contribuyentes caen en algún punto intermedio, aceptando muchos de",
    url = "https://doi.org/10.7551/mitpress/8278.003.0003",
    doi = "10.7551/mitpress/8278.003.0003",
    openalex = "W2461851698",
    references = "doi101046j14209101200200455x"
}

@article{doi101038ng1034,
    author = "Toprak, Erdal y Veres, Adrian y Michel, Jean-Baptiste y Chait, Remy y Hartl, Daniel L. y Kishony, Roy",
    title = "Senderos evolutivos hacia la resistencia a los antibióticos bajo selección de fármacos sostenida dinámicamente",
    year = "2011",
    journal = "Nature Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/ng.1034",
    doi = "10.1038/ng.1034",
    openalex = "W2012977051",
    references = "doi101126science1123539"
}

Explicar los orígenes de rasgos novedosos es central para la biología evolutiva. La teoría establecida sugiere que la plasticidad del desarrollo, la capacidad de un individuo para modificar su desarrollo en respuesta a las condiciones ambientales, podría facilitar la evolución de rasgos novedosos. Sin embargo, si y cómo dicha flexibilidad del desarrollo promueve innovaciones que persisten a lo largo del tiempo evolutivo sigue siendo poco claro. Aquí, examinamos tres formas distintas por las cuales la plasticidad del desarrollo puede promover la innovación evolutiva. Primero, mostramos cómo el proceso de acomodación genética proporciona una vía factible y posiblemente común por la cual los fenotipos inducidos por el ambiente pueden volverse sujetos a modificación heredable. Segundo, planteamos que los fundamentos del desarrollo de la plasticidad aumentan los grados de libertad por los cuales los factores ambientales y genéticos influyen en la ontogenia, diversificando así los objetivos para que los procesos evolutivos actúen sobre ellos y aumentando las oportunidades para la construcción de fenotipos novedosos, funcionales y potencialmente adaptativos. Finalmente, examinamos las arquitecturas genéticas del desarrollo de la expresión de rasgos dependientes del ambiente, y destacamos sus implicaciones específicas para el origen evolutivo de rasgos novedosos. Revisamos críticamente la evidencia empírica que respalda cada uno de estos procesos, y proponemos experimentos y pruebas futuras que iluminarían aún más la interacción entre los factores ambientales, el desarrollo dependiente de las condiciones, y la iniciación y elaboración de fenotipos novedosos.

@article{doi101098rspb20110971,
    author = "Moczek, Armin P. y Sultan, Sonia E. y Foster, Susan A. y Ledón-Rettig, Cris C. y Dworkin, Ian y Nijhout, H. Fred y Abouheif, Ehab y Pfennig, David W.",
    title = "El papel de la plasticidad del desarrollo en la innovación evolutiva",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Explicar los orígenes de rasgos novedosos es central para la biología evolutiva. La teoría establecida sugiere que la plasticidad del desarrollo, la capacidad de un individuo para modificar su desarrollo en respuesta a las condiciones ambientales, podría facilitar la evolución de rasgos novedosos. Sin embargo, si y cómo dicha flexibilidad del desarrollo promueve innovaciones que persisten a lo largo del tiempo evolutivo sigue siendo poco claro. Aquí, examinamos tres formas distintas por las cuales la plasticidad del desarrollo puede promover la innovación evolutiva. Primero, mostramos cómo el proceso de acomodación genética proporciona una vía factible y posiblemente común por la cual los fenotipos inducidos por el ambiente pueden volverse sujetos a modificación heredable. Segundo, planteamos que los fundamentos del desarrollo de la plasticidad aumentan los grados de libertad por los cuales los factores ambientales y genéticos influyen en la ontogenia, diversificando así los objetivos para que los procesos evolutivos actúen sobre ellos y aumentando las oportunidades para la construcción de fenotipos novedosos, funcionales y potencialmente adaptativos. Finalmente, examinamos las arquitecturas genéticas del desarrollo de la expresión de rasgos dependientes del ambiente, y destacamos sus implicaciones específicas para el origen evolutivo de rasgos novedosos. Revisamos críticamente la evidencia empírica que respalda cada uno de estos procesos, y proponemos experimentos y pruebas futuras que iluminarían aún más la interacción entre los factores ambientales, el desarrollo dependiente de las condiciones, y la iniciación y elaboración de fenotipos novedosos.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2011.0971",
    doi = "10.1098/rspb.2011.0971",
    openalex = "W2142774476",
    references = "doi101038sjhdy6800154, doi101098rstb20090263, doi101111j001438202003tb00377x, doi1023072411226"
}

@article{salverda2011evolutionary,
    author = "Salverda, Merijn L.M. y de Visser, J. Arjan G.M.",
    title = "Genética evolutiva: Evolución con previsión",
    year = "2011",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2011.04.023",
    doi = "10.1016/j.cub.2011.04.023",
    number = "10",
    pages = "R398-R400",
    volume = "21"
}

Las ectosimbiosis entre escarabajos de la corteza (Curculionidae, Scolytinae) y hongos (principalmente Ascomicetos ophiostomatoides) son generalizadas y diversas. Las asociaciones van desde mutualistas hasta comensales, y desde facultativas hasta obligadas. Algunos hongos son altamente específicos y asociados solo con una sola especie de escarabajo, mientras que otros pueden asociarse con muchas. Además, la mayoría de estas simbiosis son multipartitas, con el escarabajo huésped asociado con dos o más socios consistentes. Los micangios, estructuras del tegumento del escarabajo que funcionan en el transporte fúngico, han evolucionado numerosas veces en los Scolytinae. La evolución de tales estructuras complejas y especializadas indica un alto grado de dependencia mutua entre los escarabajos y sus socios fúngicos. Desafortunadamente, los procesos que dieron forma a las simbiosis actuales entre escarabajos y hongos siguen siendo poco comprendidos. La filogenia, el grado y tipo de dependencia de los socios, el modo de transmisión de los simbiontes (vertical vs. horizontal), los efectos del ambiente abiótico y las interacciones entre los simbiontes mismos o con otros miembros de la comunidad biótica, todos juegan roles importantes en determinar la composición, fidelidad y longevidad de las asociaciones entre escarabajos y sus asociados fúngicos. En esta revisión, proporciono una visión general de estas asociaciones y discuto cómo la evolución y los procesos ecológicos actuaron en concierto para dar forma a estas fascinantes y complejas simbiosis.

@article{doi103390insects3010339,
    author = "Six, Diana L.",
    title = "Determinantes ecológicos y evolutivos de las simbiosis entre escarabajos de la corteza y hongos",
    year = "2012",
    journal = "Insects",
    abstract = "Las ectosimbiosis entre escarabajos de la corteza (Curculionidae, Scolytinae) y hongos (principalmente Ascomicetos ophiostomatoides) son generalizadas y diversas. Las asociaciones van desde mutualistas hasta comensales, y desde facultativas hasta obligadas. Algunos hongos son altamente específicos y asociados solo con una sola especie de escarabajo, mientras que otros pueden asociarse con muchas. Además, la mayoría de estas simbiosis son multipartitas, con el escarabajo huésped asociado con dos o más socios consistentes. Los micangios, estructuras del tegumento del escarabajo que funcionan en el transporte fúngico, han evolucionado numerosas veces en los Scolytinae. La evolución de tales estructuras complejas y especializadas indica un alto grado de dependencia mutua entre los escarabajos y sus socios fúngicos. Desafortunadamente, los procesos que dieron forma a las simbiosis actuales entre escarabajos y hongos siguen siendo poco comprendidos. La filogenia, el grado y tipo de dependencia de los socios, el modo de transmisión de los simbiontes (vertical vs. horizontal), los efectos del ambiente abiótico y las interacciones entre los simbiontes mismos o con otros miembros de la comunidad biótica, todos juegan roles importantes en determinar la composición, fidelidad y longevidad de las asociaciones entre escarabajos y sus asociados fúngicos. En esta revisión, proporciono una visión general de estas asociaciones y discuto cómo la evolución y los procesos ecológicos actuaron en concierto para dar forma a estas fascinantes y complejas simbiosis.",
    url = "https://doi.org/10.3390/insects3010339",
    doi = "10.3390/insects3010339",
    openalex = "W1982731458",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

@article{doi101038nrg3483,
    author = "Stern, David L.",
    title = "Las causas genéticas de la evolución convergente",
    year = "2013",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg3483",
    doi = "10.1038/nrg3483",
    openalex = "W2046793790",
    references = "doi101016jcell200806030, doi101016jtree200709008, doi101038287795a0, doi101038nature10944, doi101038nature11041, doi101038ng1946, doi101038nrg2452, doi101073pnas9794530, doi101093acref97801995711230010001, doi101105tpc115949, doi101111j001438202000tb00544x, doi101111j15585646200800450x, doi101111j15585646201101289x, doi101126science1113832, doi101126science1123539, doi101126science1188021, doi101126science1208227, doi101146annurevento451371, openalexw2080618944"
}

Una pregunta biológica central es cómo los organismos naturales son tan evolutivos (capaces de adaptarse rápidamente a nuevos entornos). Un impulsor clave de la evolutividad es la modularidad generalizada de las redes biológicas—su organización como subunidades funcionales y escasamente conectadas—pero no hay consenso sobre por qué la modularidad misma evolucionó. Aunque la mayoría de las hipótesis asumen una selección indirecta para la evolutividad, aquí demostramos que la presión de selección directa y ubicua para reducir el costo de las conexiones entre los nodos de la red causa el surgimiento de redes modulares. Los experimentos de evolución computacional con presiones de selección para maximizar el rendimiento de la red y minimizar los costos de conexión producen redes que son significativamente más modulares y más evolutivas que los experimentos de control que solo seleccionan por rendimiento. Estos resultados catalizarán la investigación en numerosas disciplinas, como las neurociencias y la genética, y mejorarán nuestra capacidad para aprovechar la evolución con fines de ingeniería.

@article{doi101098rspb20122863,
    author = "Clune, Jeff y Mouret, Jean-Baptiste y Lipson, Hod",
    title = "Los orígenes evolutivos de la modularidad",
    year = "2013",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Una pregunta biológica central es cómo los organismos naturales son tan evolutivos (capaces de adaptarse rápidamente a nuevos entornos). Un impulsor clave de la evolutividad es la modularidad generalizada de las redes biológicas—su organización como subunidades funcionales y escasamente conectadas—pero no hay consenso sobre por qué la modularidad misma evolucionó. Aunque la mayoría de las hipótesis asumen una selección indirecta para la evolutividad, aquí demostramos que la presión de selección directa y ubicua para reducir el costo de las conexiones entre los nodos de la red causa el surgimiento de redes modulares. Los experimentos de evolución computacional con presiones de selección para maximizar el rendimiento de la red y minimizar los costos de conexión producen redes que son significativamente más modulares y más evolutivas que los experimentos de control que solo seleccionan por rendimiento. Estos resultados catalizarán la investigación en numerosas disciplinas, como las neurociencias y la genética, y mejorarán nuestra capacidad para aprovechar la evolución con fines de ingeniería.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2012.2863",
    doi = "10.1098/rspb.2012.2863",
    openalex = "W2097351860",
    references = "doi101038nature01568, doi101038nrg2278"
}

Comprender los efectos de la heterogeneidad del paisaje sobre la variación genética espacial es un objetivo principal de la genética del paisaje. Las variables ecológicas y geográficas pueden contribuir a la estructura genética a través del aislamiento geográfico, en el que las barreras y distancias geográficas restringen el flujo génico, y el aislamiento ecológico, en el que el flujo génico entre poblaciones que habitan diferentes entornos se limita por la selección en contra de los dispersores que se mueven entre ellos. Aunque se han desarrollado métodos para estudiar el aislamiento geográfico en detalle, el aislamiento ecológico ha recibido mucha menos atención, en parte porque desentrañar los efectos de estos mecanismos es inherentemente difícil. Aquí, describo un enfoque novedoso para cuantificar los efectos del aislamiento geográfico y ecológico utilizando regresión de matriz múltiple con aleatorización. Exploré el espacio de parámetros sobre el cual este método es efectivo utilizando una serie de simulaciones basadas en individuos y encontré que describe con precisión los efectos del aislamiento geográfico y ecológico en un amplio rango de condiciones. También apliqué este método a un conjunto de conjuntos de datos del mundo real para mostrar que el aislamiento ecológico es un contribuyente a menudo pasado por alto pero importante para los patrones de variación genética espacial y para demostrar cómo este análisis puede proporcionar nuevas perspectivas sobre cómo los paisajes contribuyen a la evolución de la variación genética en la naturaleza.

@article{doi101111evo12134,
    author = "Wang, Ian",
    title = "EXAMINANDO LOS EFECTOS COMPLETOS DE LA HETEROGENEIDAD DEL PAISAJE SOBRE LA VARIACIÓN GENÉTICA ESPACIAL: UN ENFOQUE DE REGRESIÓN DE MATRIZ MÚLTIPLE PARA CUANTIFICAR EL AISLAMIENTO GEOGRÁFICO Y ECOLÓGICO",
    year = "2013",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Comprender los efectos de la heterogeneidad del paisaje sobre la variación genética espacial es un objetivo principal de la genética del paisaje. Las variables ecológicas y geográficas pueden contribuir a la estructura genética a través del aislamiento geográfico, en el que las barreras y distancias geográficas restringen el flujo génico, y el aislamiento ecológico, en el que el flujo génico entre poblaciones que habitan diferentes entornos se limita por la selección en contra de los dispersores que se mueven entre ellos. Aunque se han desarrollado métodos para estudiar el aislamiento geográfico en detalle, el aislamiento ecológico ha recibido mucha menos atención, en parte porque desentrañar los efectos de estos mecanismos es inherentemente difícil. Aquí, describo un enfoque novedoso para cuantificar los efectos del aislamiento geográfico y ecológico utilizando regresión de matriz múltiple con aleatorización. Exploré el espacio de parámetros sobre el cual este método es efectivo utilizando una serie de simulaciones basadas en individuos y encontré que describe con precisión los efectos del aislamiento geográfico y ecológico en un amplio rango de condiciones. También apliqué este método a un conjunto de conjuntos de datos del mundo real para mostrar que el aislamiento ecológico es un contribuyente a menudo pasado por alto pero importante para los patrones de variación genética espacial y para demostrar cómo este análisis puede proporcionar nuevas perspectivas sobre cómo los paisajes contribuyen a la evolución de la variación genética en la naturaleza.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12134",
    doi = "10.1111/evo.12134",
    openalex = "W1976017021",
    references = "doi101093aesa304641, doi101146annurevecolsys102209144644"
}

Los sistemas naturales albergan interacciones complejas que son partes fundamentales de la ecología y la evolución. Estas interacciones desafían nuestras inclinaciones y formación para buscar las explicaciones más simples de los patrones en la naturaleza. No menos importante es la probabilidad de que algunos procesos complejos puedan pasar desapercibidos cuando sus patrones parecen similares a las predicciones para mecanismos más simples. En esta línea, la teoría y la evidencia empírica sugieren cada vez más que los procesos ambientales, ecológicos, fenotípicos y genéticos pueden estar estrechamente entrelazados, dando lugar a dinámicas eco‐evolutivas complejas y a veces sorprendentes. El objetivo de esta revisión es moderar la inclinación de buscar sin cuestionar las explicaciones más simples en ecología y evolución, reconociendo que algunos resultados eco‐evolutivos pueden parecer muy similares a las expectativas puramente ecológicas, puramente evolutivas o incluso nulas, y por lo tanto ser ocultos. Proporcionamos evidencia teórica y empírica sobre sesgos observacionales y mecanismos que podrían operar entre los diversos eslabones en los retroalimentaciones eco‐evolutivas para producir patrones ocultos. El reconocimiento de que las dinámicas ocultas pueden asociarse con resultados como estabilidad, resiliencia, recuperación o coexistencia en un mundo dinámicamente cambiante proporciona un impulso adicional para encontrar formas de estudiarlas.

@article{doi101111nyas12974,
    author = "Kinnison, Michael T. y Hairston, Nelson G. y Hendry, Andrew P.",
    title = "Dinámicas eco‐evolutivas ocultas",
    year = "2015",
    journal = "Annals of the New York Academy of Sciences",
    abstract = "Los sistemas naturales albergan interacciones complejas que son partes fundamentales de la ecología y la evolución. Estas interacciones desafían nuestras inclinaciones y formación para buscar las explicaciones más simples de los patrones en la naturaleza. No menos importante es la probabilidad de que algunos procesos complejos puedan pasar desapercibidos cuando sus patrones parecen similares a las predicciones para mecanismos más simples. En esta línea, la teoría y la evidencia empírica sugieren cada vez más que los procesos ambientales, ecológicos, fenotípicos y genéticos pueden estar estrechamente entrelazados, dando lugar a dinámicas eco‐evolutivas complejas y a veces sorprendentes. El objetivo de esta revisión es moderar la inclinación de buscar sin cuestionar las explicaciones más simples en ecología y evolución, reconociendo que algunos resultados eco‐evolutivos pueden parecer muy similares a las expectativas puramente ecológicas, puramente evolutivas o incluso nulas, y por lo tanto ser ocultos. Proporcionamos evidencia teórica y empírica sobre sesgos observacionales y mecanismos que podrían operar entre los diversos eslabones en los retroalimentaciones eco‐evolutivas para producir patrones ocultos. El reconocimiento de que las dinámicas ocultas pueden asociarse con resultados como estabilidad, resiliencia, recuperación o coexistencia en un mundo dinámicamente cambiante proporciona un impulso adicional para encontrar formas de estudiarlas.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nyas.12974",
    doi = "10.1111/nyas.12974",
    openalex = "W2173108007",
    references = "doi101093oso97801951315430010001"
}

@article{doi101038nrg2016104,
    author = "Lynch, Michael y Ackerman, Matthew S. y Goût, Jean-François y Long, Hongan y Sung, Way y Thomas, W. Kelley y Foster, Patricia L.",
    title = "Deriva genética, selección y la evolución de la tasa de mutación",
    year = "2016",
    journal = "Nature Reviews Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1038/nrg.2016.104",
    doi = "10.1038/nrg.2016.104",
    openalex = "W2529873061",
    references = "doi1010021521187820001222121057aidbies330co2w, doi101016jtig201005003, doi101038nrg2146, doi101073pnas0404656101"
}

La evolución biológica es un hecho, pero las muchas teorías contradictorias sobre la evolución siguen siendo controvertidas incluso hoy. Cuando Adaptación y selección natural se publicó por primera vez en 1966, golpeó con fuerza contra aquellos que argumentaban a favor del concepto de selección de grupos -la idea de que la evolución actúa para seleccionar especies enteras en lugar de individuos-. La famosa obra de Williams a favor del darwinismo simple sobre la selección de grupos se ha convertido en un clásico de la literatura científica, valorada por su argumento exhaustivo y convincente y su relevancia para muchos campos fuera de la biología. Ahora con una nueva introducción de Richard Dawkins, Adaptación y selección natural es un texto esencial para comprender la naturaleza del debate científico.

@book{doi1015159780691185507,
    author = "Williams, George C.",
    title = "Adaptación y selección natural: Una crítica de algunos pensamientos evolutivos actuales",
    year = "2018",
    abstract = "La evolución biológica es un hecho, pero las muchas teorías contradictorias sobre la evolución siguen siendo controvertidas incluso hoy. Cuando Adaptación y selección natural se publicó por primera vez en 1966, golpeó con fuerza contra aquellos que argumentaban a favor del concepto de selección de grupos -la idea de que la evolución actúa para seleccionar especies enteras en lugar de individuos-. La famosa obra de Williams a favor del darwinismo simple sobre la selección de grupos se ha convertido en un clásico de la literatura científica, valorada por su argumento exhaustivo y convincente y su relevancia para muchos campos fuera de la biología. Ahora con una nueva introducción de Richard Dawkins, Adaptación y selección natural es un texto esencial para comprender la naturaleza del debate científico",
    url = "https://doi.org/10.1515/9780691185507",
    doi = "10.1515/9780691185507",
    openalex = "W1480083809"
}

proceso que trasciende el sustrato en el que ocurre. De hecho, muchos investigadores en el campo de la evolución digital pueden proporcionar ejemplos de cómo sus algoritmos y organismos evolutivos han subvertido creativamente sus expectativas o intenciones, expuesto errores no reconocidos en su código, producido adaptaciones inesperadas o se han involucrado en comportamientos y resultados, de una manera inquietantemente convergente con los encontrados en la naturaleza. Tales historias rutinariamente revelan sorpresa y creatividad por parte de la evolución en estos mundos digitales, pero raramente encajan en el relato científico estándar. En su lugar, a menudo se tratan como meros obstáculos que deben superarse, en lugar de resultados que merecen estudio por derecho propio. Los errores se corrigen, los experimentos se refocalizan y las sorpresas únicas se colapsan en un solo punto de datos. Las historias mismas se intercambian entre investigadores a través de la tradición oral, pero ese modo de transmisión de información es ineficiente y propenso a errores y pérdidas totales. Además, el hecho de que estas historias tiendan a compartirse solo entre los practicantes significa que muchos científicos naturales no se dan cuenta de lo interesantes y realistas que son los organismos digitales y de lo natural que puede ser su evolución. Hasta donde sabemos, no se ha publicado anteriormente ninguna colección de tales anécdotas. Este artículo es el producto de investigación colectiva de investigadores en los campos de la vida artificial y la computación evolutiva que han proporcionado relatos de primera mano de tales casos. Por lo tanto, sirve como una colección escrita y verificada de historias científicamente importantes e incluso entretenidas. Al hacerlo, también presentamos aquí evidencia sustancial de que la existencia e importancia de las sorpresas evolutivas se extiende más allá del mundo natural y, de hecho, puede ser una propiedad universal de todos los sistemas complejos evolutivos.

@article{doi101162artla00319,
    author = "Lehman, Joel and Clune, Jeff and Misevic, Dusan and Adami, Christoph and Altenberg, Lee and Beaulieu, Julie and Bentley, Peter J. and BERNARD, S and Beslon, Guillaume and Bryson, David M. and Cheney, Nick and Chrabąszcz, Patryk and Cully, Antoine and Doncieux, Stéphane and Dyer, Fred C. and Ellefsen, Kai Olav and Feldt, Robert and Fischer, Stephan and Forrest, Stephanie and Frénoy, Antoine and Gagné, Christian and Goff, Léni Le and Grabowski, Laura M. and Hodjat, Babak and Hutter, Frank and Keller, Laurent and Knibbe, Carole and Krčah, Peter and Lenski, Richard E. and Lipson, Hod and MacCurdy, Robert and Maestre, Carlos and Miikkulainen, Risto and Mitri, Sara and Moriarty, David E. and Mouret, Jean-Baptiste and Nguyen, Anh and Ofria, Charles and Parizeau, Marc and Parsons, David and Pennock, Robert T. and Punch, William F. and Ray, Thomas S. and Schoenauer, Marc and Schulte, Eric and Sims, Karl and Stanley, Kenneth O. and Taddei, François and Tarapore, Danesh and Thibault, Simon and Watson, Richard A. and Weimer, Westley and Yosinski, Jason",
    title = "La Sorprendente Creatividad de la Evolución Digital: Una Colección de Anécdotas de las Comunidades de Investigación en Computación Evolutiva y Vida Artificial",
    year = "2020",
    journal = "Artificial Life",
    abstract = "proceso que trasciende el sustrato en el que ocurre. De hecho, muchos investigadores en el campo de la evolución digital pueden proporcionar ejemplos de cómo sus algoritmos y organismos evolutivos han subvertido creativamente sus expectativas o intenciones, expuesto errores no reconocidos en su código, producido adaptaciones inesperadas o se han involucrado en comportamientos y resultados, de una manera inquietantemente convergente con los encontrados en la naturaleza. Tales historias rutinariamente revelan sorpresa y creatividad por parte de la evolución en estos mundos digitales, pero raramente encajan en el relato científico estándar. En su lugar, a menudo se tratan como meros obstáculos que deben superarse, en lugar de resultados que merecen estudio por derecho propio. Los errores se corrigen, los experimentos se refocalizan y las sorpresas únicas se colapsan en un solo punto de datos. Las historias mismas se intercambian entre investigadores a través de la tradición oral, pero ese modo de transmisión de información es ineficiente y propenso a errores y pérdidas totales. Además, el hecho de que estas historias tiendan a compartirse solo entre los practicantes significa que muchos científicos naturales no se dan cuenta de lo interesantes y realistas que son los organismos digitales y de lo natural que puede ser su evolución. Hasta donde sabemos, no se ha publicado anteriormente ninguna colección de tales anécdotas. Este artículo es el producto de investigación colectiva de investigadores en los campos de la vida artificial y la computación evolutiva que han proporcionado relatos de primera mano de tales casos. Por lo tanto, sirve como una colección escrita y verificada de historias científicamente importantes e incluso entretenidas. Al hacerlo, también presentamos aquí evidencia sustancial de que la existencia e importancia de las sorpresas evolutivas se extiende más allá del mundo natural y, de hecho, puede ser una propiedad universal de todos los sistemas complejos evolutivos.",
    url = "https://doi.org/10.1162/artl\_a\_00319",
    doi = "10.1162/artl\_a\_00319",
    openalex = "W3015475346",
    references = "doi101017cbo9780511730191, doi101038nature01151"
}

@book{doi101016s0070215321x00026,
    title = "Biología del Desarrollo Evolutivo",
    year = "2021",
    booktitle = "Temas actuales en biología del desarrollo/Temas Actuales en Biología del Desarrollo",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0070-2153(21)x0002-6",
    doi = "10.1016/s0070-2153(21)x0002-6",
    openalex = "W1556619877"
}

Se presentan los resultados de la síntesis de la genética evolutiva y la genética del desarrollo, se explican las causas de la crisis de la genética evolutiva y las formas de superarla, y se explica el mecanismo de especiación de los organismos superiores. Palabras clave: nueva síntesis evolutiva, genética evolutiva, genética del ontogénesis, programa morfogenético, genes del desarrollo.

@article{vagyn2021evolution,
    author = "Vagyn, Yu. V.",
    title = "Evolución del darwinismo. Una nueva síntesis evolutiva: combinando genética evolutiva y genética del desarrollo",
    year = "2021",
    journal = "Visnik ukrains'kogo tovaristva genetikiv i selekcioneriv",
    abstract = "Se presentan los resultados de la síntesis de la genética evolutiva y la genética del desarrollo, se explican las causas de la crisis de la genética evolutiva y las formas de superarla, y se explica el mecanismo de especiación de los organismos superiores. Palabras clave: nueva síntesis evolutiva, genética evolutiva, genética del ontogénesis, programa morfogenético, genes del desarrollo.",
    url = "https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    doi = "10.7124/visnyk.utgis.18.1-2.1356",
    number = "1-2",
    openalex = "W3134902110",
    pages = "70-75",
    volume = "18",
    references = "doi105860choice474406, doi105962bhltitle61216, doi107124visnykutgis161904, doi107124visnykutgis1711201"
}