Frecuencias génicas

1. La hipofisectomía resulta en la pérdida de la capacidad de sobrevivir en agua dulce por parte del ciprínodont eurialino, Fundulus heteroclitus. El tiempo promedio de supervivencia es de 6-7 días para peces adaptados al agua salada. La preadaptación en agua dulce antes de la operación puede prolongar la supervivencia, pero no previene la muerte final. 2. Los peces hipofisectomizados no pueden sobrevivir en salinidades hasta 13 ‰. 3. Los síntomas de la muerte son los de astenia acompañados de un ligero aumento de peso, promediando 4,3% en peces que no son manipulados diariamente. 4. Los determinaciones de cloruro sérico mostraron que los peces normales en agua dulce o salada mantienen un nivel uniforme de ca. 0,886 gm.% NaCl. El suero de peces hipofisectomizados en agua salada no es significativamente menor (ca. 0,817 gm.%). Los peces hipofisectomizados que mueren en agua dulce tienen solo ca. 0,383 gm.%. 5. La terapia de reemplazo con brei de hipófisis de Fundulus permitió a los peces hipofisectomizados sobrevivir en agua dulce. El extracto de hipófisis de Perca flavescens, una especie estrictamente de agua dulce, fue parcialmente efectivo, mientras que los extractos de glándulas de Pollachius virens, una especie marina, no tuvieron influencia beneficiosa. 6. Las inyecciones de ACTH, GH, TSH, tiroxina, DOCA, extracto de lóbulo posterior y una combinación ACTH-GH-TSH fallaron en permitir que los peces sobrevivieran en agua dulce. 7. Los datos presentados anteriormente parecen indicar que la hipófisis de F. heteroclitus secreta un factor(s) desconocido que regula el equilibrio salino en ese pez en agua dulce. Este factor parece estar ausente en la especie marina estenohalina, P. virens, pero puede estar presente en la especie de agua dulce, P. flavescens. 8. La hipofisectomía no tiene efecto sobre la citología de las células cloruro, ya sea en la condición activa (agua de mar) o regresada (agua dulce). 9. Las células mucosas fueron más abundantes en las branquias de peces normales cuando estaban adaptados al agua dulce que cuando estaban adaptados al agua salada. La hipofisectomía resultó en atrofia de las células mucosas en cualquiera de los medios y una disminución de la abundancia en peces que mueren en agua dulce. La abundancia y condición de las células mucosas se restauró a la normalidad en peces hipofisectomizados que fueron inducidos a sobrevivir en agua dulce mediante inyecciones de brei de hipófisis de Fundulus. 10. Los datos sugieren que las células cloruro no están involucradas en el fracaso de los peces hipofisectomizados para sobrevivir en agua dulce, sino que la atrofia de las células mucosas puede estar involucrada.

@article{doi1023071538889,
    author = "BURDEN, CHARLES E.",
    title = "EL FRACASO DE FUNDULUS HETEROCLITUS HIPOFISECTOMIZADO PARA SOBREVIVIR EN AGUA DULCE",
    year = "1956",
    journal = "Biological Bulletin",
    abstract = "1. La hipofisectomía resulta en la pérdida de la capacidad de sobrevivir en agua dulce por parte del ciprínodont eurialino, Fundulus heteroclitus. El tiempo promedio de supervivencia es de 6-7 días para peces adaptados al agua salada. La preadaptación en agua dulce antes de la operación puede prolongar la supervivencia, pero no previene la muerte final. 2. Los peces hipofisectomizados no pueden sobrevivir en salinidades hasta 13 ‰. 3. Los síntomas de la muerte son los de astenia acompañados de un ligero aumento de peso, promediando 4,3% en peces que no son manipulados diariamente. 4. Los determinaciones de cloruro sérico mostraron que los peces normales en agua dulce o salada mantienen un nivel uniforme de ca. 0,886 gm.% NaCl. El suero de peces hipofisectomizados en agua salada no es significativamente menor (ca. 0,817 gm.%). Los peces hipofisectomizados que mueren en agua dulce tienen solo ca. 0,383 gm.%. 5. La terapia de reemplazo con brei de hipófisis de Fundulus permitió a los peces hipofisectomizados sobrevivir en agua dulce. El extracto de hipófisis de Perca flavescens, una especie estrictamente de agua dulce, fue parcialmente efectivo, mientras que los extractos de glándulas de Pollachius virens, una especie marina, no tuvieron influencia beneficiosa. 6. Las inyecciones de ACTH, GH, TSH, tiroxina, DOCA, extracto de lóbulo posterior y una combinación ACTH-GH-TSH fallaron en permitir que los peces sobrevivieran en agua dulce. 7. Los datos presentados anteriormente parecen indicar que la hipófisis de F. heteroclitus secreta un factor(s) desconocido que regula el equilibrio salino en ese pez en agua dulce. Este factor parece estar ausente en la especie marina estenohalina, P. virens, pero puede estar presente en la especie de agua dulce, P. flavescens. 8. La hipofisectomía no tiene efecto sobre la citología de las células cloruro, ya sea en la condición activa (agua de mar) o regresada (agua dulce). 9. Las células mucosas fueron más abundantes en las branquias de peces normales cuando estaban adaptados al agua dulce que cuando estaban adaptados al agua salada. La hipofisectomía resultó en atrofia de las células mucosas en cualquiera de los medios y una disminución de la abundancia en peces que mueren en agua dulce. La abundancia y condición de las células mucosas se restauró a la normalidad en peces hipofisectomizados que fueron inducidos a sobrevivir en agua dulce mediante inyecciones de brei de hipófisis de Fundulus. 10. Los datos sugieren que las células cloruro no están involucradas en el fracaso de los peces hipofisectomizados para sobrevivir en agua dulce, sino que la atrofia de las células mucosas puede estar involucrada.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1538889",
    doi = "10.2307/1538889",
    openalex = "W1870182586"
}

La variación en la frecuencia de genes entre poblaciones o entre generaciones dentro de una población es un resultado de la estructura de apareamiento y la selección. Pero la estructura de apareamiento debería afectar a todos los loci y alelos de la misma manera. Si existe una heterogeneidad significativa entre loci en sus coeficientes aparentes de endogamia F=s(p) (2)/p(1-p), esta heterogeneidad puede tomarse como evidencia de selección. Hemos dado las propiedades estadísticas de F y mostrado cómo se pueden realizar pruebas de heterogeneidad. Utilizando datos de poblaciones humanas hemos mostrado una heterogeneidad altamente significativa en los valores de F para genes polimórficos humanos en todo el mundo, demostrando así que una fracción significativa de los polimorfismos humanos deben sus frecuencias actuales de genes a la acción de la selección natural. También hemos aplicado el método a la variación temporal dentro de una población para datos sobre Dacus oleae y no hemos encontrado evidencia significativa de selección.

@article{doi101093genetics741175,
    author = "Lewontin, Richard C y Krakauer, Jesse",
    title = "DISTRIBUCIÓN DE LA FRECUENCIA DE GENES COMO PRUEBA DE LA TEORÍA DE LA NEUTRALIDAD SELECTIVA DE LOS POLIMORFISMOS",
    year = "1973",
    journal = "Genetics",
    abstract = "La variación en la frecuencia de genes entre poblaciones o entre generaciones dentro de una población es un resultado de la estructura de apareamiento y la selección. Pero la estructura de apareamiento debería afectar a todos los loci y alelos de la misma manera. Si existe una heterogeneidad significativa entre loci en sus coeficientes aparentes de endogamia F=s(p) (2)/p(1-p), esta heterogeneidad puede tomarse como evidencia de selección. Hemos dado las propiedades estadísticas de F y mostrado cómo se pueden realizar pruebas de heterogeneidad. Utilizando datos de poblaciones humanas hemos mostrado una heterogeneidad altamente significativa en los valores de F para genes polimórficos humanos en todo el mundo, demostrando así que una fracción significativa de los polimorfismos humanos deben sus frecuencias actuales de genes a la acción de la selección natural. También hemos aplicado el método a la variación temporal dentro de una población para datos sobre Dacus oleae y no hemos encontrado evidencia significativa de selección.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/74.1.175",
    doi = "10.1093/genetics/74.1.175",
    openalex = "W2103286878"
}

Se estudiaron poblaciones de Fundulus heteroclitus, (Cyprinodontidae), un pez marino costero de amplia distribución, en entornos de control y artificialmente calentados en la costa norte de Long Island, Nueva York, para determinar (1) patrones de variación en fenotipos bioquímicos y (2) en qué medida esta variación reflejaba adaptación a las características ambientales. La variación en tres de doce loci de isoenzimas polimórficos de la población de agua cálida estaba más allá del rango de variación entre las poblaciones de control y se asemejaba a la determinada para poblaciones que viven en latitudes más meridionales. Por lo tanto, estas diferencias se interpretaron como adaptaciones a entornos cálidos. Se encontraron diferencias significativas en las frecuencias alélicas y proporciones zigóticas en diez de doce loci de isoenzimas asociadas con diferencias en los entornos, sexos y/o clases de edad. Estos datos apoyan fuertemente la visión de que los polimorfismos de proteínas son adaptativos. Varias observaciones sugirieron que la selección actúa sobre fenotipos multilocus en lugar de sobre los de loci individuales. Se demostró que varias distribuciones fenotípicas de dos loci son no aleatorias, y aquellas que exhibieron patrones similares de dependencia a lo largo de los años se postuló que se mantienen por selección. Los peces altamente heterocigotos exhibieron una viabilidad superior cuando las cohortes se compararon a lo largo de años sucesivos. Se discuten las consecuencias del sistema de apareamiento polígino en esta especie para mantener la variación genética y permitir una respuesta evolutiva rápida a un entorno variable.

@article{doi101093genetics79197,
    author = "Mitton, Jeffry B. and Koehn, Richard K.",
    title = "GENETIC ORGANIZATION AND ADAPTIVE RESPONSE OF ALLOZYMES TO ECOLOGICAL VARIABLES IN FUNDULUS HETEROCLITUS",
    year = "1975",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Populations of Fundulus heteroclitus, (Cyprinodontidae) a widespread coastal marine fish, were studied in control and artificially heated environments on the North Shore of Long Island, New York to determine (1) patterns of variation in biochemical phenotypes and (2) the extent to which this variation reflected adaptation to environmental characteristics. Variation at three of twelve polymorphic isoenzyme loci from the warm water population was beyond the range of variation among control populations, and resembled those determined for populations living at more southern latitudes. Hence, these differences were interpreted as adaptations to warm environments. Significant differences in allele frequencies and zygotic proportions at ten of twelve isoenzyme loci were found associated with differences in environments, sexes, and/or age classes. These data strongly support the view that protein polymorphisms are adaptive. Several observations suggested that selection acts upon multilocus phenotypes rather than upon those of single loci. Several di-locus phenotypic distributions were demonstrated to be nonrandom, and those that exhibited similar patterns of dependence over years were postulated to be maintained by selection. Highly heterozygous fish exhibited superior viability when cohorts were compared over successive years. The consequences of the polygynous mating system in this species for maintaining genetic variation and for allowing rapid evolutionary response to a variable environment are discussed.",
    url = "https://doi.org/10.1093/genetics/79.1.97",
    doi = "10.1093/genetics/79.1.97",
    openalex = "W2137118500"
}

@article{doi101007bf00484222,
    author = "Powers, Dennis A. y Place, Allen R.",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). I. Variación temporal y espacial en las frecuencias génicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B y Pgm-A",
    year = "1978",
    journal = "Biochemical Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00484222",
    doi = "10.1007/bf00484222",
    openalex = "W2019968569",
    references = "doi101001jama195102920260071031, doi101093aibsbulletin2214b, doi101093genetics762379, doi101111j146918091937tb02153x, doi101111j155856461975tb00851x, doi1015159780691209418, doi1023072407692, doi102307jctvx5wbbh, openalexw2062594085"
}

@article{powers1978biochemical,
    author = "Powers, Dennis A. y Place, Allen R.",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). I. Variación temporal y espacial en las frecuencias génicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B y Pgm-A",
    year = "1978",
    journal = "Biochemical Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00484222",
    doi = "10.1007/bf00484222",
    number = "5-6",
    openalex = "W2019968569",
    pages = "593-607",
    volume = "16",
    references = "doi101001jama195102920260071031, doi101093aibsbulletin2214b, doi101093genetics762379, doi101111j146918091937tb02153x, doi101111j155856461975tb00851x, doi1015159780691209418, doi1023072407692, doi102307jctvx5wbbh, openalexw2062594085"
}

@misc{powers1978biochemical1,
    author = "Powers, D. A. y Place, A. R",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). 1. Variación temporal y espacial en las frecuencias génicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B y Pgm-A",
    year = "1978",
    howpublished = "Genética Bioquímica, v. 16, p. 593-607",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Powers, D. A., y Place, A. R., 1978, Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). 1. Variación temporal y espacial en las frecuencias génicas de Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B y Pgm-A: Genética Bioquímica, v. 16, p. 593-607.}"
}

Con el fin de evaluar si existen diferencias funcionales entre variantes alélicas de una lactato deshidrogenasa (LDH; L-lactato:NAD+ oxidoreductasa, EC 1.1.1.27) de tipo B en el pez teleósteo Fundulus heteroclitus (Linnaeus), se examinaron las propiedades cinéticas de la reducción de piruvato. Mientras que la dependencia del pH y la dependencia de la temperatura para la catálisis máxima eran indistinguibles entre las aloenzimas, las velocidades de reacción a concentraciones bajas de piruvato fueron significativamente diferentes. A valores de pH por debajo de 8.00, la aloenzima LDH-BbBb mostró una mayor velocidad de reacción a temperaturas más bajas (por ejemplo, 10 grados C) que la LDH-BaBa. El fenómeno se invirtió a temperaturas más altas (por ejemplo, mayores de 25 grados C) para valores de pH entre 6.50 y 7.00. Las tasas para el fenotipo heterocigoto, LDH-BaBb, no fueron el promedio aritmético de las dos aloenzimas homotetraméricas. Cuando se compararon las velocidades de reacción a alcalinidad relativa constante, es decir, una constante [OH-]/[H+] ratio, los hallazgos fueron similares. Las diferencias en la dependencia de la temperatura y la dependencia del pH para la reducción de piruvato encontradas entre las aloenzimas LDH-B pueden reflejar una adaptación selectiva y ayudar a explicar la variación geográfica en las frecuencias génicas del gen Ldh-B de F. heteroclitus.

@article{doi101073pnas7652354,
    author = "Place, Allen R. y Powers, Dennis A.",
    title = "Variación genética y eficiencias catalíticas relativas: aloenzimas de lactato deshidrogenasa B de Fundulus heteroclitus.",
    year = "1979",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Con el fin de evaluar si existen diferencias funcionales entre variantes alélicas de una lactato deshidrogenasa (LDH; L-lactato:NAD+ oxidoreductasa, EC 1.1.1.27) de tipo B en el pez teleósteo Fundulus heteroclitus (Linnaeus), se examinaron las propiedades cinéticas de la reducción de piruvato. Mientras que la dependencia del pH y la dependencia de la temperatura para la catálisis máxima eran indistinguibles entre las aloenzimas, las velocidades de reacción a concentraciones bajas de piruvato fueron significativamente diferentes. A valores de pH por debajo de 8.00, la aloenzima LDH-BbBb mostró una mayor velocidad de reacción a temperaturas más bajas (por ejemplo, 10 grados C) que la LDH-BaBa. El fenómeno se invirtió a temperaturas más altas (por ejemplo, mayores de 25 grados C) para valores de pH entre 6.50 y 7.00. Las tasas para el fenotipo heterocigoto, LDH-BaBb, no fueron el promedio aritmético de las dos aloenzimas homotetraméricas. Cuando se compararon las velocidades de reacción a alcalinidad relativa constante, es decir, una constante [OH-]/[H+] ratio, los hallazgos fueron similares. Las diferencias en la dependencia de la temperatura y la dependencia del pH para la reducción de piruvato encontradas entre las aloenzimas LDH-B pueden reflejar una adaptación selectiva y ayudar a explicar la variación geográfica en las frecuencias génicas del gen Ldh-B de F. heteroclitus.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.76.5.2354",
    doi = "10.1073/pnas.76.5.2354",
    openalex = "W2059454129",
    references = "doi1010160003269764902003, doi1010160160932778900819, doi101016b9780120913046x50010, doi101042bj1390715, doi101042bj1390721, doi101111j155856461975tb00851x, doi1013182nse61a15616, doi1023072407274, openalexw1889077695, openalexw1964262399"
}

@article{cashon1981biochemical,
    author = "Cashon, Robert E. y Van Beneden, Rebecca J. y Powers, Dennis A.",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). IV. Variación espacial en las frecuencias génicas de Idh-A, Idh-B, 6-Pgdh-A y Est-S",
    year = "1981",
    journal = "Biochemical Genetics",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00484004",
    doi = "10.1007/bf00484004",
    number = "7-8",
    openalex = "W2091365386",
    pages = "715-728",
    volume = "19",
    references = "doi101007bf00391612, doi1010160040580978900394, doi101038hdy197489, doi101073pnas7652354, doi101111j155856461975tb00851x, doi1023071442526, doi1023071935311, doi1023072407274, doi1023072407692, powers1978biochemical"
}

Los niveles de adenosina trifosfato en eritrocitos están correlacionados con el genotipo de LDH-B en Fundulus heteroclitus. La adenosina trifosfato es el modulador alostérico del afinidad del oxígeno de la hemoglobina del pez. Dado que el suministro de oxígeno al músculo afecta el rendimiento de natación, los peces de cada fenotipo homocigoto de LDH-B fueron nadados hasta el agotamiento a 10 grados o 25 grados C para determinar si las diferencias in vitro atribuidas a las isoenzimas alélicas de LDH-B se manifestaban in vivo. A 10 grados C, la velocidad crítica de natación del fenotipo LDH-BaBa fue de 3,6 longitudes corporales por segundo, mientras que la del fenotipo LDH-BbBb fue de 4,3 longitudes corporales por segundo. A 25 grados C no hubo diferencias entre los fenotipos de LDH-B en los niveles de adenosina trifosfato en eritrocitos, la afinidad del oxígeno en la sangre o el rendimiento de natación.

@article{doi101126science7079747,
    author = "DiMichele, Leonard y Powers, Dennis A.",
    title = "Bases fisiológicas para las diferencias en resistencia a la natación entre genotipos de LDH-B de Fundulus heteroclitus",
    year = "1982",
    journal = "Science",
    abstract = "Los niveles de adenosina trifosfato en eritrocitos están correlacionados con el genotipo de LDH-B en Fundulus heteroclitus. La adenosina trifosfato es el modulador alostérico del afinidad del oxígeno de la hemoglobina del pez. Dado que el suministro de oxígeno al músculo afecta el rendimiento de natación, los peces de cada fenotipo homocigoto de LDH-B fueron nadados hasta el agotamiento a 10 grados o 25 grados C para determinar si las diferencias in vitro atribuidas a las isoenzimas alélicas de LDH-B se manifestaban in vivo. A 10 grados C, la velocidad crítica de natación del fenotipo LDH-BaBa fue de 3,6 longitudes corporales por segundo, mientras que la del fenotipo LDH-BbBb fue de 4,3 longitudes corporales por segundo. A 25 grados C no hubo diferencias entre los fenotipos de LDH-B en los niveles de adenosina trifosfato en eritrocitos, la afinidad del oxígeno en la sangre o el rendimiento de natación.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.7079747",
    doi = "10.1126/science.7079747",
    openalex = "W2023346689"
}

Con el fin de evaluar si existen diferencias funcionales entre las variantes alélicas (alozimas) de la lactato deshidrogenasa de tipo B (L-lactato:NAD+ oxidoreductasa, EC 1.1.1.27) en el pez Fundulus heteroclitus, se examinaron las propiedades cinéticas. Se observaron diferencias en la inhibición del producto entre las isozimas alélicas. Se encontró que la LDH-Bb4 se inhibe a concentraciones más bajas tanto de lactato como de piruvato que la LDH-Ba/Bb o la LDH-Ba4. Si bien la dependencia del pH y la temperatura para la catálisis máxima (Vmax) en ambas direcciones, directa e inversa, era indistinguible entre las alocimas, las velocidades de reacción a concentraciones bajas de sustrato (Vmax/Km) fueron significativamente diferentes. Estas diferencias podrían explicarse por el hecho de que la LDH-Bb4 tiene una mayor afinidad por el sustrato que la LDH-Ba4 a temperaturas frías, mientras que lo contrario es cierto a temperaturas elevadas. A un pH dado, la LDH-Bb4 mostró una mayor velocidad de reacción a temperaturas más bajas (por ejemplo, 10 grados C) que la LDH-Ba4. El fenómeno se invirtió a temperaturas más altas (por ejemplo, mayores de 35 grados C). Cuando se compararon las velocidades de reacción a alcalinidad relativa constante, es decir, una relación constante [OH-]/[H+], se obtuvieron hallazgos similares. La respuesta de la alocima heterocigota, LDH-Ba/Bb, no fue el promedio aritmético de las dos alocimas homotetraméricas. Se discute la importancia biológica de estas diferencias alozimáticas.

@article{doi101016s0021925817436040,
    author = "Place, Allen R. y Powers, Dennis A.",
    title = "Caracterización cinética de las aloenzimas de la lactato deshidrogenasa (LDH-B4) de Fundulus heteroclitus.",
    year = "1984",
    journal = "Journal of Biological Chemistry",
    abstract = "Con el fin de evaluar si existen diferencias funcionales entre las variantes alélicas (alozimas) de la lactato deshidrogenasa de tipo B (L-lactato:NAD+ oxidoreductasa, EC 1.1.1.27) en el pez Fundulus heteroclitus, se examinaron las propiedades cinéticas. Se observaron diferencias en la inhibición del producto entre las isozimas alélicas. Se encontró que la LDH-Bb4 se inhibe a concentraciones más bajas tanto de lactato como de piruvato que la LDH-Ba/Bb o la LDH-Ba4. Si bien la dependencia del pH y la temperatura para la catálisis máxima (Vmax) en ambas direcciones, directa e inversa, era indistinguible entre las alocimas, las velocidades de reacción a concentraciones bajas de sustrato (Vmax/Km) fueron significativamente diferentes. Estas diferencias podrían explicarse por el hecho de que la LDH-Bb4 tiene una mayor afinidad por el sustrato que la LDH-Ba4 a temperaturas frías, mientras que lo contrario es cierto a temperaturas elevadas. A un pH dado, la LDH-Bb4 mostró una mayor velocidad de reacción a temperaturas más bajas (por ejemplo, 10 grados C) que la LDH-Ba4. El fenómeno se invirtió a temperaturas más altas (por ejemplo, mayores de 35 grados C). Cuando se compararon las velocidades de reacción a alcalinidad relativa constante, es decir, una relación constante [OH-]/[H+], se obtuvieron hallazgos similares. La respuesta de la alocima heterocigota, LDH-Ba/Bb, no fue el promedio aritmético de las dos alocimas homotetraméricas. Se discute la importancia biológica de estas diferencias alozimáticas.",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0021-9258(17)43604-0",
    doi = "10.1016/s0021-9258(17)43604-0",
    openalex = "W1515088892"
}

La electroforesis en gel de almidón ha demostrado que las poblaciones naturales de Fundulus heteroclitus tienen variantes electroforéticas para al menos 21 loci. Proporcionamos datos de herencia para 10 sistemas polimórficos: esterases (Est-B, EST-C y Est-D); aspartato aminotransferasas (Aat-A y Aat-B); isomerasa de manosa-6-fosfato (Mpl-A); fosfatasa ácida (Ap-A); fosfoglucomutasa (Pgm-B); hexosa-6-fosfato deshidrogenasa (H6pdh-A); y fumarasa (Fum-A). Las variantes de nueve de estos loci segregan como alelos codominantes heredados autosómicamente. El otro sistema, EST-C, no refleja tal herencia. Hemos identificado dos posibles grupos de ligamiento: H6pdh-A puede estar débilmente ligado a Pgm-B, y Fum-A parece estar ligado a Pgm-A. También se presentan la especificidad tisular y la localización intracelular para todos estos loci.

@article{brown1988biochemical,
    author = "Brown, D. C. y Ropson, I. J. y Powers, D. A.",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.): V. Herencia de 10 loci bioquímicos",
    year = "1988",
    journal = "Journal of Heredity",
    abstract = "La electroforesis en gel de almidón ha demostrado que las poblaciones naturales de Fundulus heteroclitus tienen variantes electroforéticas para al menos 21 loci. Proporcionamos datos de herencia para 10 sistemas polimórficos: esterases (Est-B, EST-C y Est-D); aspartato aminotransferasas (Aat-A y Aat-B); isomerasa de manosa-6-fosfato (Mpl-A); fosfatasa ácida (Ap-A); fosfoglucomutasa (Pgm-B); hexosa-6-fosfato deshidrogenasa (H6pdh-A); y fumarasa (Fum-A). Las variantes de nueve de estos loci segregan como alelos codominantes heredados autosómicamente. El otro sistema, EST-C, no refleja tal herencia. Hemos identificado dos posibles grupos de ligamiento: H6pdh-A puede estar débilmente ligado a Pgm-B, y Fum-A parece estar ligado a Pgm-A. También se presentan la especificidad tisular y la localización intracelular para todos estos loci.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.jhered.a110528",
    doi = "10.1093/oxfordjournals.jhered.a110528",
    number = "5",
    openalex = "W2278152654",
    pages = "359-365",
    volume = "79"
}

En los extremos de su distribución natural, las poblaciones del pez común Fundulus heteroclitus experimentan una diferencia de más de 15 grados C en la temperatura media anual. Estas poblaciones están virtualmente fijadas para dos alelos diferentes y codominantes en el locus de lactato deshidrogenasa de tipo cardíaco (Ldh-B), que codifican para aloenzimas con respuestas cinéticas diferentes y adaptativas a la temperatura. Se estudiaron dos poblaciones cerca de los extremos del rango de la especie (es decir, Maine y Georgia) para la adaptación térmica en este locus. En ausencia de diferencias cinéticas, se predeciría que para mantener una velocidad de reacción constante, se requeriría de 2 a 3 veces más enzima por cada disminución de 10 grados C en la temperatura ambiental. Coherente con esta estrategia adaptativa y además de las características cinéticas adaptativas, la concentración de la enzima LDH-B4 (EC 1.1.1.27) y su concentración de ARNm fueron aproximadamente el doble en la población norteña que en la población sur. Los experimentos de aclimatación nos permiten concluir que estas diferencias se deben a una combinación de rasgos genéticos fijos (adaptación evolutiva) y respuestas plásticas a la temperatura (aclimatación fisiológica). Además, nuestros cálculos muestran que las velocidades de reacción de la LDH-B4 son esencialmente equivalentes para estas dos poblaciones, a pesar de que viven en entornos térmicos significativamente diferentes.

@article{doi101073pnas86239365,
    author = "Crawford, D. L. and Powers, Dennis A.",
    title = "Bases moleculares de la adaptación evolutiva en el locus de lactato deshidrogenasa-B en el pez Fundulus heteroclitus.",
    year = "1989",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "En los extremos de su distribución natural, las poblaciones del pez común Fundulus heteroclitus experimentan una diferencia de más de 15 grados C en la temperatura media anual. Estas poblaciones están virtualmente fijadas para dos alelos diferentes y codominantes en el locus de lactato deshidrogenasa de tipo cardíaco (Ldh-B), que codifican para aloenzimas con respuestas cinéticas diferentes y adaptativas a la temperatura. Se estudiaron dos poblaciones cerca de los extremos del rango de la especie (es decir, Maine y Georgia) para la adaptación térmica en este locus. En ausencia de diferencias cinéticas, se predeciría que para mantener una velocidad de reacción constante, se requeriría de 2 a 3 veces más enzima por cada disminución de 10 grados C en la temperatura ambiental. Coherente con esta estrategia adaptativa y además de las características cinéticas adaptativas, la concentración de la enzima LDH-B4 (EC 1.1.1.27) y su concentración de ARNm fueron aproximadamente el doble en la población norteña que en la población sur. Los experimentos de aclimatación nos permiten concluir que estas diferencias se deben a una combinación de rasgos genéticos fijos (adaptación evolutiva) y respuestas plásticas a la temperatura (aclimatación fisiológica). Además, nuestros cálculos muestran que las velocidades de reacción de la LDH-B4 son esencialmente equivalentes para estas dos poblaciones, a pesar de que viven en entornos térmicos significativamente diferentes.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.86.23.9365",
    doi = "10.1073/pnas.86.23.9365",
    openalex = "W2034334508",
    references = "cashon1981biochemical, doi101002jez1402010102, doi1010079781461263302, doi1010160003269783904189, doi1010160003986177903460, doi101016s0021925817436040, doi101021bi00591a005, doi101073pnas74104562, doi101073pnas7652354, doi101126science7079747, powers1978biochemical"
}

@article{duggins1989biochemical,
    author = "Duggins, Charles F. y Relyea, Kenneth G. y Karlin, Alvan A.",
    title = "Sistemática bioquímica en poblaciones sureste de Fundulus heteroclitus y Fundulus grandis",
    year = "1989",
    journal = "Northeast Gulf Science",
    url = "https://doi.org/10.18785/negs.1002.03",
    doi = "10.18785/negs.1002.03",
    number = "2",
    openalex = "W2804340583",
    volume = "10",
    references = "doi101007bf00121817, doi1010160305197883900662, doi101093oxfordjournalsjhereda109497, doi105479si00963801983229215, doi1058782flmnhtlym5013, openalexw106653420"
}

Se estudió la variación geográfica en las frecuencias génicas correspondientes a 15 enzimas polimórficas en el pez cebra común Fundulus heteroclitus. Aat-A, Est-B, Fum-A, H6pdh-A, Mpi-A y Pgm-B mostraron variación clinal en las frecuencias alélicas a lo largo de la costa atlántica de América del Norte, mientras que Aat-B, Ap-A y los fenotipos EST-C no lo hicieron. La variación alélica clinal de seis loci previamente examinados (Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B, Idh-A, Pgm-A y 6-Pgdh-A) se extendió a ubicaciones más al norte. La diversidad génica fue más baja en las aguas frías de las latitudes septentrionales y más alta en las aguas más cálidas de las latitudes meridionales. La variedad de formas y anchuras clinales sugiere que la selección natural ha afectado las distribuciones alélicas de al menos algunos de estos loci. Esta hipótesis se discute en relación con las contracciones y extensiones del rango causadas por los avances y retrocesos glaciares durante el Pleistoceno.

@article{doi101111j155856461990tb04276x,
    author = "Ropson, Ira J. and ew C. Brown and Powers, Dennis A.",
    title = "BIOCHEMICAL GENETICS OF FUNDULUS HETEROCLITUS (L.). VI. GEOGRAPHICAL VARIATION IN THE GENE FREQUENCIES OF 15 LOCI",
    year = "1990",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Geographic variation in the gene frequencies corresponding to 15 polymorphic enzymes were studied in the common killifish Fundulus heteroclitus. Aat-A, Est-B, Fum-A, H6pdh-A, Mpi-A and Pgm-B showed clinal variation in allelic frequencies along the Atlantic coast of North America, while Aat-B, Ap-A, and the EST-C phenotypes did not. The clinal allelic variation of six previously examined loci (Ldh-B, Mdh-A, Gpi-B, Idh-A, Pgm-A, and 6-Pgdh-A) was extended to locations farther north. Gene diversity was lowest in the cold waters of northern latitudes and highest in the warmer waters of southern latitudes. The variety of clinal shapes and widths suggests that selection has affected the allelic distributions for at least some of these loci. This hypothesis is discussed with regard to the range contractions and extensions caused by the glacial advances and retreats during the Pleistocene.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1990.tb04276.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1990.tb04276.x",
    openalex = "W2326890067",
    references = "brown1988biochemical"
}

Fundulus heteroclitus es un pez altamente polimórfico distribuido a lo largo de la costa atlántica de América del Norte. Varios loci muestran cambios direccionales en la frecuencia génica con la latitud (es decir, clines). Tales cambios direccionales han sido clásicamente descritos por dos modelos generales: intergradación primaria y secundaria. Previamente, no ha sido posible distinguir entre estos modelos para Fundulus heteroclitus en base a isoenzimas alélicas o datos morfológicos. Sin embargo, el análisis reciente de electromorfos de restricción de ADN mitocondrial (ADNmt) ayuda a resolver este problema. Las muestras de ADN mitocondrial de 48 individuos que representan cuatro poblaciones fueron digeridas con 17 endonucleasas de restricción. Después de la electroforesis, los tamaños de los fragmentos de ADNmt se utilizaron para analizar la parentesc filogenético de los peces recolectados en la mayor parte del rango de la especie. El análisis identificó claramente dos razas principales dentro de la especie: una forma septentrional y una meridional. La distribución de los electromorfos de ADNmt, combinada con cambios zoogeográficos en isoenzimas alélicas y en la morfología de huevos y adultos (publicado en otro lugar), hace que la hipótesis de intergradación secundaria sea la más convincente.

@article{doi101111j155856461990tb04277x,
    author = "González‐Villaseñor, Lucia Irene y Powers, Dennis A.",
    title = "POLIMORFISMOS DE RESTRICCIÓN EN SÍTIOS DE ADN MITOCONDRIAL EN EL TELEÓSTEO FUNDULUS HETEROCLITUS APOYAN LA INTERGRADACIÓN SECUNDARIA",
    year = "1990",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Fundulus heteroclitus es un pez altamente polimórfico distribuido a lo largo de la costa atlántica de América del Norte. Varios loci muestran cambios direccionales en la frecuencia génica con la latitud (es decir, clines). Tales cambios direccionales han sido clásicamente descritos por dos modelos generales: intergradación primaria y secundaria. Previamente, no ha sido posible distinguir entre estos modelos para Fundulus heteroclitus en base a isoenzimas alélicas o datos morfológicos. Sin embargo, el análisis reciente de electromorfos de restricción de ADN mitocondrial (ADNmt) ayuda a resolver este problema. Las muestras de ADN mitocondrial de 48 individuos que representan cuatro poblaciones fueron digeridas con 17 endonucleasas de restricción. Después de la electroforesis, los tamaños de los fragmentos de ADNmt se utilizaron para analizar la parentesc filogenético de los peces recolectados en la mayor parte del rango de la especie. El análisis identificó claramente dos razas principales dentro de la especie: una forma septentrional y una meridional. La distribución de los electromorfos de ADNmt, combinada con cambios zoogeográficos en isoenzimas alélicas y en la morfología de huevos y adultos (publicado en otro lugar), hace que la hipótesis de intergradación secundaria sea la más convincente.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1990.tb04277.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1990.tb04277.x",
    openalex = "W2312265334",
    references = "brown1988biochemical, doi101007bf01734101, doi1010160307441283900687, doi101073pnas76105269, doi101073pnas7641967, doi101111j146918091937tb02153x, doi101146annureves18110187001413, doi101146annureves18110187002421, doi1023072407738, doi104159harvard9780674865327, openalexw2144634347"
}

@article{ropson1990biochemical,
    author = "Ropson, Ira J. y Brown, Drew C. y Powers, Dennis A.",
    title = "Genética bioquímica de Fundulus heteroclitus (L.). VI. Variación geográfica en las frecuencias génicas de 15 loci",
    year = "1990",
    journal = "Evolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2409521",
    doi = "10.2307/2409521",
    number = "1",
    openalex = "W4252252776",
    pages = "16",
    volume = "44"
}

Se sabe que las poblaciones del Golfo de México y del Atlántico de varias especies costeras en el sureste de los Estados Unidos difieren marcadamente en su composición genética, pero la mayoría de las zonas transicionales no han sido examinadas detalladamente hasta ahora. Aquí empleamos marcadores moleculares de loci mitocondriales y nucleares para caracterizar las asociaciones genéticas citonucleares a escalas meso- y microgeográficas a lo largo de una zona transicional al este de Florida entre poblaciones genéticamente distintas del Atlántico y del Golfo de la ostra americana, Crassostrea virginica. Los patrones citonucleares monolocus y multilocus muestran: (1) un clino que se extiende a lo largo de 340 km de la costa este de Florida; (2) un paso pronunciado en el clino centrado en Cape Canaveral (cambios en las frecuencias alélicas del 50-75% a lo largo de una distancia de 20 km); (3) una estrecha concordancia entre las frecuencias genotípicas observadas y las expectativas de Hardy-Weinberg dentro de las localidades; y (4) un desequilibrio nuclear y citonuclear leve o inexistente en la mayoría de las muestras de poblaciones locales. Estos resultados implican: (1) restricciones considerables al flujo génico interpopulacional a lo largo de la costa este de Florida; (2) dentro de las localidades, apareamiento libre (en contraposición a una mera mezcla de poblaciones) entre las formas de ostra del Golfo y del Atlántico; y (3) reclutamiento poblacional localizado en las localidades de la zona de transición. Estos hallazgos demuestran que los organismos marinos con alto potencial de dispersión mediante larvas pelágicas de larga duración pueden, no obstante, mostrar una estructura genética poblacional espacial pronunciada, y de manera más general ejemplifican la utilidad de las zonas de transición genética pronunciadas para el estudio de los procesos a nivel poblacional.

@article{doi101111j155856461996tb03618x,
    author = "Hare, Matthew P. y Avise, John C.",
    title = "ANÁLISIS GENÉTICO MOLECULAR DE UN CLINO MULTILÓCULO ESCALONADO EN LA OSTRERA AMERICANA (CRASSOSTREA VIRGINICA)",
    year = "1996",
    journal = "Evolución",
    abstract = "Se sabe que las poblaciones del Golfo de México y del Atlántico de varias especies costeras en el sureste de los Estados Unidos difieren marcadamente en su composición genética, pero la mayoría de las zonas transicionales no han sido examinadas detalladamente hasta ahora. Aquí empleamos marcadores moleculares de loci mitocondriales y nucleares para caracterizar las asociaciones genéticas citonucleares a escalas meso- y microgeográficas a lo largo de una zona transicional al este de Florida entre poblaciones genéticamente distintas del Atlántico y del Golfo de la ostra americana, Crassostrea virginica. Los patrones citonucleares monolocus y multilocus muestran: (1) un clino que se extiende a lo largo de 340 km de la costa este de Florida; (2) un paso pronunciado en el clino centrado en Cape Canaveral (cambios en las frecuencias alélicas del 50-75% a lo largo de una distancia de 20 km); (3) una estrecha concordancia entre las frecuencias genotípicas observadas y las expectativas de Hardy-Weinberg dentro de las localidades; y (4) un desequilibrio nuclear y citonuclear leve o inexistente en la mayoría de las muestras de poblaciones locales. Estos resultados implican: (1) restricciones considerables al flujo génico interpopulacional a lo largo de la costa este de Florida; (2) dentro de las localidades, apareamiento libre (en contraposición a una mera mezcla de poblaciones) entre las formas de ostra del Golfo y del Atlántico; y (3) reclutamiento poblacional localizado en las localidades de la zona de transición. Estos hallazgos demuestran que los organismos marinos con alto potencial de dispersión mediante larvas pelágicas de larga duración pueden, no obstante, mostrar una estructura genética poblacional espacial pronunciada, y de manera más general ejemplifican la utilidad de las zonas de transición genética pronunciadas para el estudio de los procesos a nivel poblacional.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1996.tb03618.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1996.tb03618.x",
    openalex = "W2061179033",
    references = "duggins1989biochemical"
}

1. Se diseñaron experimentos para revelar la diferenciación geográfica y su importancia evolutiva en los caracteres de historia de vida temprana de Fundulus heteroclitus. Se estudió la capacidad heredada para el crecimiento en cinco poblaciones, desde Carolina del Sur hasta Maine, EE. UU., a tres temperaturas representativas de las condiciones de campo. Se criaron y probaron dos generaciones de peces recién eclosionados. La segunda generación de peces se produjo a partir de padres que también se criaron en el laboratorio, con el fin de controlar los efectos ambientales transmitidos maternamente. 2. Durante las primeras tres semanas después del eclosionamiento, los individuos de poblaciones del norte crecieron más rápidamente que los de poblaciones del sur a temperaturas más altas (21 y 28 °C), mientras que generalmente no hubo diferencias entre poblaciones a la temperatura más baja (17 °C). 3. Los resultados no se ajustan a los modelos de adaptación térmica, en los que se espera que las poblaciones del norte muestren tasas de crecimiento más altas que las del sur a temperaturas frías, y viceversa a temperaturas más altas. En cambio, la tasa de crecimiento más alta de los peces del norte se interpreta como una adaptación a una temporada de crecimiento corta. Esto representa un ejemplo de variación contragradiente, ya que las influencias genéticas que favorecen el crecimiento rápido en latitudes altas se oponen al efecto ambiental de una temporada de crecimiento más corta. El clino de las tasas de crecimiento es concordante con los contrastes morfológicos, conductuales y genéticos entre las subespecies de Fundulus heteroclitus.

@article{doi1023072390285,
    author = "Schultz, Eric T. y Reynolds, K. E. y Conover, David O.",
    title = "Variación contragradiente en el crecimiento entre Fundulus heteroclitus recién eclosionados: Diferencias geográficas reveladas por experimentos en ambiente común",
    year = "1996",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "1. Se diseñaron experimentos para revelar la diferenciación geográfica y su importancia evolutiva en los caracteres de historia de vida temprana de Fundulus heteroclitus. Se estudió la capacidad heredada para el crecimiento en cinco poblaciones, desde Carolina del Sur hasta Maine, EE. UU., a tres temperaturas representativas de las condiciones de campo. Se criaron y probaron dos generaciones de peces recién eclosionados. La segunda generación de peces se produjo a partir de padres que también se criaron en el laboratorio, con el fin de controlar los efectos ambientales transmitidos maternamente. 2. Durante las primeras tres semanas después del eclosionamiento, los individuos de poblaciones del norte crecieron más rápidamente que los de poblaciones del sur a temperaturas más altas (21 y 28 °C), mientras que generalmente no hubo diferencias entre poblaciones a la temperatura más baja (17 °C). 3. Los resultados no se ajustan a los modelos de adaptación térmica, en los que se espera que las poblaciones del norte muestren tasas de crecimiento más altas que las del sur a temperaturas frías, y viceversa a temperaturas más altas. En cambio, la tasa de crecimiento más alta de los peces del norte se interpreta como una adaptación a una temporada de crecimiento corta. Esto representa un ejemplo de variación contragradiente, ya que las influencias genéticas que favorecen el crecimiento rápido en latitudes altas se oponen al efecto ambiental de una temporada de crecimiento más corta. El clino de las tasas de crecimiento es concordante con los contrastes morfológicos, conductuales y genéticos entre las subespecies de Fundulus heteroclitus.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2390285",
    doi = "10.2307/2390285",
    openalex = "W2089469721",
    references = "cashon1981biochemical, doi101007bf00317554, doi101016s0169534700890813, doi101086410622, doi101111j155856461982tb05466x, doi101139f88197, doi101139f91065, doi102307jctvx5wbbh, doi102960jv8a6, openalexw1538205139, openalexw2047770073"
}

Se sabe que las poblaciones del Golfo de México y del Atlántico de varias especies costeras en el sureste de los Estados Unidos difieren marcadamente en su composición genética, pero la mayoría de las zonas transicionales no han sido examinadas detalladamente anteriormente. Aquí empleamos marcadores moleculares de loci mitocondriales y nucleares para caracterizar asociaciones genéticas citonucleares a escalas meso- y microgeográficas a lo largo de una zona transicional al este de Florida entre poblaciones genéticamente distintas del Atlántico y del Golfo de la ostra americana, Crassostrea virginica. Los patrones citonucleares de un solo locus y multilocus muestran: (1) un clino que se extiende a lo largo de 340 km de la costa este de Florida; (2) un paso pronunciado en el clino centrado en Cape Canaveral (cambios en las frecuencias alélicas del 50-75% a lo largo de una distancia de 20 km); (3) una estrecha concordancia entre las frecuencias genotípicas observadas y las expectativas de Hardy-Weinberg dentro de las localidades; y (4) desequilibrios nucleares y citonucleares leves o inexistentes en la mayoría de las muestras de poblaciones locales. Estos resultados implican: (1) restricciones considerables al flujo génico interpopulacional a lo largo de la costa este de Florida; (2) dentro de las localidades, apareamiento libre (en oposición a una mera mezcla de poblaciones) entre las formas de ostra del Golfo y del Atlántico; y (3) reclutamiento poblacional localizado en las localidades de la zona de transición. Estos hallazgos demuestran que los organismos marinos con alto potencial de dispersión a través de larvas pelágicas de larga duración pueden, no obstante, mostrar una estructura genética poblacional espacial pronunciada, y más generalmente ejemplifican la utilidad de las zonas de transición genética pronunciadas para el estudio de procesos a nivel poblacional.

@article{doi1023072410699,
    author = "Hare, Matthew P. y Avise, John C.",
    title = "Análisis genético molecular de un clino multilocus escalonado en la ostra americana (Crassostrea virginica)",
    year = "1996",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Se sabe que las poblaciones del Golfo de México y del Atlántico de varias especies costeras en el sureste de los Estados Unidos difieren marcadamente en su composición genética, pero la mayoría de las zonas transicionales no han sido examinadas detalladamente anteriormente. Aquí empleamos marcadores moleculares de loci mitocondriales y nucleares para caracterizar asociaciones genéticas citonucleares a escalas meso- y microgeográficas a lo largo de una zona transicional al este de Florida entre poblaciones genéticamente distintas del Atlántico y del Golfo de la ostra americana, Crassostrea virginica. Los patrones citonucleares de un solo locus y multilocus muestran: (1) un clino que se extiende a lo largo de 340 km de la costa este de Florida; (2) un paso pronunciado en el clino centrado en Cape Canaveral (cambios en las frecuencias alélicas del 50-75% a lo largo de una distancia de 20 km); (3) una estrecha concordancia entre las frecuencias genotípicas observadas y las expectativas de Hardy-Weinberg dentro de las localidades; y (4) desequilibrios nucleares y citonucleares leves o inexistentes en la mayoría de las muestras de poblaciones locales. Estos resultados implican: (1) restricciones considerables al flujo génico interpopulacional a lo largo de la costa este de Florida; (2) dentro de las localidades, apareamiento libre (en oposición a una mera mezcla de poblaciones) entre las formas de ostra del Golfo y del Atlántico; y (3) reclutamiento poblacional localizado en las localidades de la zona de transición. Estos hallazgos demuestran que los organismos marinos con alto potencial de dispersión a través de larvas pelágicas de larga duración pueden, no obstante, mostrar una estructura genética poblacional espacial pronunciada, y más generalmente ejemplifican la utilidad de las zonas de transición genética pronunciadas para el estudio de procesos a nivel poblacional.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2410699",
    doi = "10.2307/2410699",
    openalex = "W4254810384",
    references = "duggins1989biochemical"
}

Hemos utilizado una estrategia basada en experimentos para abordar los mecanismos moleculares subyacentes a la adaptación en Fundulus heteroclitus. En un intento por refutar la hipótesis de que la selección es una fuerza motriz principal en el mantenimiento de la diversidad genética, empleamos un enfoque multidisciplinario que incluye isoenzimas alélicas y filogeografía de ADNmt, análisis cinéticos de isoenzimas alélicas, análisis de variación en secuencias de ADN codificante y regulador, bioquímica metabólica, fisiología del organismo y experimentos de selección. Las diferencias observadas en la estructura y expresión génica nos llevaron a formular predicciones comprobables sobre diferencias en el flujo metabólico, el rendimiento del organismo completo y la supervivencia diferencial entre alotipos. Hemos demostrado que la variación en la proteína lactato deshidrogenasa-B (Ldh-B) da lugar a diferencias en la función fisiológica y se correlaciona con diferencias en la supervivencia a altas temperaturas. Trabajos recientes han investigado el papel de la variación en la expresión de Ldh-B. Existen diferencias en los niveles de proteína Ldh-B, ARNm y tasa de transcripción. Hemos abordado los mecanismos responsables de las diferencias en la tasa de transcripción mediante una combinación de comparación de secuencias, huella de DNase I y análisis funcionales tanto in vitro como in vivo. Hemos demostrado que la variación en la secuencia reguladora de Ldh-B es responsable de las diferencias en la tasa de transcripción entre poblaciones y que los patrones de variación son inconsistentes con un modelo neutral de evolución molecular. Esta diferenciación funcional, junto con desviaciones de las expectativas neutrales, sugiere que la selección natural ha actuado sobre la regulación de Ldh-B. Este artículo ilustra el valor de un enfoque multidisciplinario para abordar problemas de estructura génica, expresión y adaptación evolutiva.

@article{doi101002sici1097010x199809102821271aidjez1130co2j,
    author = "Powers, Dennis A. and Schulte, Patricia M.",
    title = "Adaptaciones evolutivas de la estructura y expresión génica en poblaciones naturales en relación con un entorno cambiante: Un enfoque multidisciplinario para abordar la saga de un millón de años de un pequeño pez",
    year = "1998",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Hemos utilizado una estrategia basada en experimentos para abordar los mecanismos moleculares subyacentes a la adaptación en Fundulus heteroclitus. En un intento por refutar la hipótesis de que la selección es una fuerza motriz principal en el mantenimiento de la diversidad genética, empleamos un enfoque multidisciplinario que incluye isoenzimas alélicas y filogeografía de ADNmt, análisis cinéticos de isoenzimas alélicas, análisis de variación en secuencias de ADN codificante y regulador, bioquímica metabólica, fisiología del organismo y experimentos de selección. Las diferencias observadas en la estructura y expresión génica nos llevaron a formular predicciones comprobables sobre diferencias en el flujo metabólico, el rendimiento del organismo completo y la supervivencia diferencial entre alotipos. Hemos demostrado que la variación en la proteína lactato deshidrogenasa-B (Ldh-B) da lugar a diferencias en la función fisiológica y se correlaciona con diferencias en la supervivencia a altas temperaturas. Trabajos recientes han investigado el papel de la variación en la expresión de Ldh-B. Existen diferencias en los niveles de proteína Ldh-B, ARNm y tasa de transcripción. Hemos abordado los mecanismos responsables de las diferencias en la tasa de transcripción mediante una combinación de comparación de secuencias, huella de DNase I y análisis funcionales tanto in vitro como in vivo. Hemos demostrado que la variación en la secuencia reguladora de Ldh-B es responsable de las diferencias en la tasa de transcripción entre poblaciones y que los patrones de variación son inconsistentes con un modelo neutral de evolución molecular. Esta diferenciación funcional, junto con desviaciones de las expectativas neutrales, sugiere que la selección natural ha actuado sobre la regulación de Ldh-B. Este artículo ilustra el valor de un enfoque multidisciplinario para abordar problemas de estructura génica, expresión y adaptación evolutiva.",
    url = "https://doi.org/10.1002/(sici)1097-010x(199809/10)282:1/2<71::aid-jez11>3.0.co;2-j",
    doi = "10.1002/(sici)1097-010x(199809/10)282:1/2<71::aid-jez11>3.0.co;2-j",
    openalex = "W1982599952",
    references = "brown1988biochemical, cashon1981biochemical, doi1010160092867489901761, doi101017cbo9780511693281002, doi101038351652a0, doi101093genetics1161153, doi101111j155856461975tb00851x, doi101111j155856461986tb05740x, doi101126science1690918, doi101126science2678474, doi101146annureves26110195002155, doi101146annurevge25120191003213"
}

En muchas especies marinas, los altos niveles de flujo génico aseguran que la señal genética de la diferenciación poblacional sea débil. Como consecuencia, varios errores asociados con la estimación de parámetros genéticos de poblaciones que normalmente podrían ignorarse con seguridad asumen una importancia relativamente mayor. Este hecho tiene implicaciones importantes para el uso de datos genéticos para abordar dos preguntas comunes en la conservación y gestión de pesquerías: (1) ¿Cuántas poblaciones de una especie dada existen? y (2) ¿Cuánto flujo génico ocurre entre poblaciones? Este artículo discute estrategias para maximizar la relación señal:ruido en estudios genéticos de especies marinas y sugiere un método cuantitativo para corregir el sesgo debido a un problema común de muestreo. Para muchas especies marinas, sin embargo, los métodos genéticos por sí solos no pueden resolver completamente estas preguntas clave de gestión porque la cantidad de migración necesaria para eliminar la mayor parte de la evidencia genética de la estructura de poblaciones (solo una docena de individuos por generación) generalmente será insignificante como fuerza para reconstruir poblaciones agotadas en una escala de tiempo de interés para los humanos. Estas limitaciones enfatizan la importancia de comprender la biología e historia de vida de la especie objetivo, primero, para guiar el diseño del programa de muestreo, y segundo, para que se pueda utilizar información adicional para complementar las estimaciones indirectas de tasas de migración basadas en datos genéticos.

@article{doi101093jhered895438,
    author = "Waples, Robin S.",
    title = "Separating the wheat from the chaff: patrones de diferenciación genética en especies con alta flujo génico",
    year = "1998",
    journal = "Journal of Heredity",
    abstract = "En muchas especies marinas, los altos niveles de flujo génico aseguran que la señal genética de la diferenciación poblacional sea débil. Como consecuencia, varios errores asociados con la estimación de parámetros genéticos de poblaciones que normalmente podrían ignorarse con seguridad asumen una importancia relativamente mayor. Este hecho tiene implicaciones importantes para el uso de datos genéticos para abordar dos preguntas comunes en la conservación y gestión de pesquerías: (1) ¿Cuántas poblaciones de una especie dada existen? y (2) ¿Cuánto flujo génico ocurre entre poblaciones? Este artículo discute estrategias para maximizar la relación señal:ruido en estudios genéticos de especies marinas y sugiere un método cuantitativo para corregir el sesgo debido a un problema común de muestreo. Para muchas especies marinas, sin embargo, los métodos genéticos por sí solos no pueden resolver completamente estas preguntas clave de gestión porque la cantidad de migración necesaria para eliminar la mayor parte de la evidencia genética de la estructura de poblaciones (solo una docena de individuos por generación) generalmente será insignificante como fuerza para reconstruir poblaciones agotadas en una escala de tiempo de interés para los humanos. Estas limitaciones enfatizan la importancia de comprender la biología e historia de vida de la especie objetivo, primero, para guiar el diseño del programa de muestreo, y segundo, para que se pueda utilizar información adicional para complementar las estimaciones indirectas de tasas de migración basadas en datos genéticos.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jhered/89.5.438",
    doi = "10.1093/jhered/89.5.438",
    openalex = "W2098787755",
    references = "doi101146annureves16110185002141"
}

La adaptación a contaminantes en el entorno ha sido estudiada extensamente en microbios, insectos y plantas, y la evidencia creciente sugiere que ciertas poblaciones de vertebrados también evolucionan en respuesta a la contaminación. Aquí, mostramos que la descendencia F1 y F2 de laboratorio de pez de estuario (Fundulus heteroclitus, también conocido como mummichog) de un sitio altamente contaminado en el río Elizabeth (Virginia, EE. UU.) es más resistente a la toxicidad de los sedimentos del río Elizabeth que la descendencia de peces de estuario de un sitio de referencia. Esta resistencia es más marcada en la generación F1 que en la F2, pero sigue siendo significativa en la generación F2, lo que indica que el fenotipo resistente en el pez de estuario feral del río Elizabeth se basa tanto en mecanismos genéticos como no genéticos. Además, tanto la descendencia de la generación F1 como F2 del pez de estuario del río Elizabeth es más susceptible a otros factores de estrés, tanto antropogénicos (toxicidad potenciada por la luz) como naturales (hipoxia), lo que sugiere que los cambios que han conferido resistencia a la toxicidad de los sedimentos del río Elizabeth conllevan un coste de reducción de la aptitud en otros contextos. Editor correspondiente: J. E. McDowell.

@article{doi1018901051076120030130490haafci20co2,
    author = "Meyer, Joel N. y Giulio, Richard T. Di",
    title = "ADAPTACIÓN HEREDITARIA Y COSTES DE APTITUD EN PEZ DE ESTUARIO (FUNDULUS HETEROCLITUS) QUE HABITA UN ESTUARIO CONTAMINADO",
    year = "2003",
    journal = "Ecological Applications",
    abstract = "La adaptación a contaminantes en el entorno ha sido estudiada extensamente en microbios, insectos y plantas, y la evidencia creciente sugiere que ciertas poblaciones de vertebrados también evolucionan en respuesta a la contaminación. Aquí, mostramos que la descendencia F1 y F2 de laboratorio de pez de estuario (Fundulus heteroclitus, también conocido como mummichog) de un sitio altamente contaminado en el río Elizabeth (Virginia, EE. UU.) es más resistente a la toxicidad de los sedimentos del río Elizabeth que la descendencia de peces de estuario de un sitio de referencia. Esta resistencia es más marcada en la generación F1 que en la F2, pero sigue siendo significativa en la generación F2, lo que indica que el fenotipo resistente en el pez de estuario feral del río Elizabeth se basa tanto en mecanismos genéticos como no genéticos. Además, tanto la descendencia de la generación F1 como F2 del pez de estuario del río Elizabeth es más susceptible a otros factores de estrés, tanto antropogénicos (toxicidad potenciada por la luz) como naturales (hipoxia), lo que sugiere que los cambios que han conferido resistencia a la toxicidad de los sedimentos del río Elizabeth conllevan un coste de reducción de la aptitud en otros contextos. Editor correspondiente: J. E. McDowell.",
    url = "https://doi.org/10.1890/1051-0761(2003)013[0490:haafci]2.0.co;2",
    doi = "10.1890/1051-0761(2003)013[0490:haafci]2.0.co;2",
    openalex = "W2147639663",
    references = "doi101007s002270050520"
}

El mantenimiento del equilibrio iónico requiere que los epitelios ionorreguladores modulen el flujo iónico en respuesta a desafíos osmóticos internos o ambientales. Hemos explorado la base de esta plasticidad funcional en las branquias del pez cebra eurialino Fundulus heteroclitus. Se cuantificaron los patrones de expresión de varios genes que codifican proteínas de transporte iónico tras la transferencia desde agua salobre casi isoosmótica [10 partes por mil (ppt)] hacia agua dulce (AD) o agua de mar (AM). Muchos cambios en respuesta a la transferencia a AM fueron transitorios. La expresión aumentada de ARNm ocurrió 1 día después de la transferencia para Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) (3 veces), Na(+)-K(+)-2Cl(-)-cotransportador 1 (NKCC1) (3 veces) y receptor de glucocorticoides (1,3 veces) y fue paralela a una actividad elevada de Na(+)-K(+)-ATPase (2 veces). El aumento transitorio en la expresión de ARNm de NKCC1 fue seguido posteriormente por un aumento de 2 veces en la abundancia de proteína NKCC. En contraste con los otros genes estudiados en el presente trabajo, la expresión de ARNm del regulador de conductancia transmembrana de fibrosis quística (CFTR) Cl(-) generalmente permaneció elevada (2 veces) en AM. Sin embargo, no se detectó ningún cambio en la abundancia de proteína, lo que sugiere una regulación posttranscripcional. Las respuestas a la transferencia a AD fueron bastante diferentes de las a la transferencia a AM. En particular, la transferencia a AD aumentó la expresión de ARNm de Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) y la actividad de Na(+)-K(+)-ATPase en mayor medida que la transferencia a AM, pero no tuvo efecto sobre la expresión de ATPasa H(+)-V tipo, apoyando la sugerencia actual de que las branquias del pez cebra transportan Na(+) mediante intercambio Na(+)/H(+). Estos hallazgos demuestran patrones únicos de expresión de transportadores iónicos en las branquias del pez cebra tras la transferencia de salinidad e ilustran mecanismos importantes de plasticidad funcional en epitelios que transportan iones.

@article{doi101152ajpcell000542004,
    author = "Scott, Graham R. y Richards, Jeff G. y Forbush, Biff e Isenring, Paul y Schulte, Patricia M.",
    title = "Cambios en la expresión génica en las branquias del pez cebra eurialino Fundulus heteroclitus tras una transferencia abrupta de salinidad",
    year = "2004",
    journal = "American Journal of Physiology-Cell Physiology",
    abstract = "El mantenimiento del equilibrio iónico requiere que los epitelios ionorreguladores modulen el flujo iónico en respuesta a desafíos osmóticos internos o ambientales. Hemos explorado la base de esta plasticidad funcional en las branquias del pez cebra eurialino Fundulus heteroclitus. Se cuantificaron los patrones de expresión de varios genes que codifican proteínas de transporte iónico tras la transferencia desde agua salobre casi isoosmótica [10 partes por mil (ppt)] hacia agua dulce (AD) o agua de mar (AM). Muchos cambios en respuesta a la transferencia a AM fueron transitorios. La expresión aumentada de ARNm ocurrió 1 día después de la transferencia para Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) (3 veces), Na(+)-K(+)-2Cl(-)-cotransportador 1 (NKCC1) (3 veces) y receptor de glucocorticoides (1,3 veces) y fue paralela a una actividad elevada de Na(+)-K(+)-ATPase (2 veces). El aumento transitorio en la expresión de ARNm de NKCC1 fue seguido posteriormente por un aumento de 2 veces en la abundancia de proteína NKCC. En contraste con los otros genes estudiados en el presente trabajo, la expresión de ARNm del regulador de conductancia transmembrana de fibrosis quística (CFTR) Cl(-) generalmente permaneció elevada (2 veces) en AM. Sin embargo, no se detectó ningún cambio en la abundancia de proteína, lo que sugiere una regulación posttranscripcional. Las respuestas a la transferencia a AD fueron bastante diferentes de las a la transferencia a AM. En particular, la transferencia a AD aumentó la expresión de ARNm de Na(+)-K(+)-ATPase-alpha(1a) y la actividad de Na(+)-K(+)-ATPase en mayor medida que la transferencia a AM, pero no tuvo efecto sobre la expresión de ATPasa H(+)-V tipo, apoyando la sugerencia actual de que las branquias del pez cebra transportan Na(+) mediante intercambio Na(+)/H(+). Estos hallazgos demuestran patrones únicos de expresión de transportadores iónicos en las branquias del pez cebra tras la transferencia de salinidad e ilustran mecanismos importantes de plasticidad funcional en epitelios que transportan iones.",
    url = "https://doi.org/10.1152/ajpcell.00054.2004",
    doi = "10.1152/ajpcell.00054.2004",
    openalex = "W2058526501",
    references = "doi1023071442526"
}

La variación entre poblaciones en la expresión génica debería estar relacionada con la acumulación de cambios aleatorios neutrales y la evolución por selección natural. El siguiente análisis evolutivo tiene aplicabilidad general para la ciencia biológica y médica porque tiene en cuenta la parentesco genético e identifica patrones de variación en la expresión afectados por la selección natural. Para identificar genes que evolucionan por selección natural, asignamos la máxima variación entre poblaciones a la distancia genética y luego examinamos la variación restante en relación con un parámetro ecológico importante hipotetizado (temperatura). Estos análisis miden la expresión de genes metabólicos en poblaciones de peces Fundulus heteroclitus cultivadas en condiciones comunes, cuyo hábitat se distribuye a lo largo de un gradiente térmico pronunciado. Aunque gran parte de la variación en la expresión génica se ajusta a un modelo nulo de deriva neutral, la variación en la expresión para el 22% de los genes que regresan con la temperatura del hábitat fue mucho mayor de lo que podría explicarse solo por la distancia genética. La explicación más parsimoniosa para la variación entre poblaciones para estos genes es la evolución por selección natural. Además, muchos genes metabólicos tienen patrones de variación incongruentes con la evolución neutral: tienen demasiada o muy poca variación. Estos patrones de variación biológica en la expresión pueden reflejar funciones fisiológicas o ecológicas importantes.

@article{doi101073pnas0507648103,
    author = "Whitehead, Andrew y Crawford, D. L.",
    title = "Variación neutral y adaptativa en la expresión génica",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "La variación entre poblaciones en la expresión génica debería estar relacionada con la acumulación de cambios aleatorios neutrales y la evolución por selección natural. El siguiente análisis evolutivo tiene aplicabilidad general para la ciencia biológica y médica porque tiene en cuenta la parentesco genético e identifica patrones de variación en la expresión afectados por la selección natural. Para identificar genes que evolucionan por selección natural, asignamos la máxima variación entre poblaciones a la distancia genética y luego examinamos la variación restante en relación con un parámetro ecológico importante hipotetizado (temperatura). Estos análisis miden la expresión de genes metabólicos en poblaciones de peces Fundulus heteroclitus cultivadas en condiciones comunes, cuyo hábitat se distribuye a lo largo de un gradiente térmico pronunciado. Aunque gran parte de la variación en la expresión génica se ajusta a un modelo nulo de deriva neutral, la variación en la expresión para el 22% de los genes que regresan con la temperatura del hábitat fue mucho mayor de lo que podría explicarse solo por la distancia genética. La explicación más parsimoniosa para la variación entre poblaciones para estos genes es la evolución por selección natural. Además, muchos genes metabólicos tienen patrones de variación incongruentes con la evolución neutral: tienen demasiada o muy poca variación. Estos patrones de variación biológica en la expresión pueden reflejar funciones fisiológicas o ecológicas importantes.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0507648103",
    doi = "10.1073/pnas.0507648103",
    openalex = "W2171931257",
    references = "cashon1981biochemical, doi101038ng1201365, doi101073pnas1530509100, doi101073pnas86239365, doi101086284325, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio41118, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j1365294x200602859x, doi101111j155856461967tb03411x, doi101126science1090005, doi105860choice295104, openalexw2080618944"
}

El conocimiento de las escalas geográficas y temporales de la variación genética adaptativa es crucial para la conservación de las especies, sin embargo, la comprensión de estos fenómenos, particularmente en sistemas marinos, es escasa. Hasta hace poco, se creía que, dado que la mayoría de las especies marinas tienen etapas de vida altamente dispersivas o móviles, la adaptación local solo podía ocurrir en escalas geográficas amplias. Esta visión está respaldada por niveles comparativamente bajos de variación genética entre poblaciones, detectados mediante marcadores neutros. De manera similar, se ha asumido que la escala temporal de la divergencia adaptativa es muy larga, requiriendo miles de generaciones. Estudios recientes de una variedad de especies han desafiado estas creencias. En primer lugar, existe una fuerte evidencia de adaptación local estructurada geográficamente en rasgos fisiológicos y morfológicos. En segundo lugar, la proporción de variación de rasgos cuantitativos a nivel entre poblaciones (Q ST) es mucho mayor que para los marcadores neutros (F ST) y estas dos métricas de variación genética están mal correlacionadas. En tercer lugar, se resume la evidencia de que la selección es una fuerza evolutiva potente capaz de sostener la divergencia adaptativa en escalas temporales contemporáneas. Las escalas espaciales y temporales diferentes de la divergencia genética adaptativa v. neutra exigen un nuevo paradigma en el pensamiento sobre la relación entre fenogeografía (la geografía de la variación fenotípica) y filogeografía (la geografía de las linajes) en especies marinas. La idea de que los procesos selectivos contemporáneos pueden causar divergencia espacial y temporal a escala fina subraya la necesidad de un nuevo énfasis en la ciencia pesquera darwiniana.

@article{doi101111j10958649200601274x,
    author = "Conover, David O. y Clarke, Lora M. y Munch, Stephan B. y Wagner, Gunar",
    title = "Escalas espaciales y temporales de la divergencia adaptativa en peces marinos y las implicaciones para la conservación",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "El conocimiento de las escalas geográficas y temporales de la variación genética adaptativa es crucial para la conservación de las especies, sin embargo, la comprensión de estos fenómenos, particularmente en sistemas marinos, es escasa. Hasta hace poco, se creía que, dado que la mayoría de las especies marinas tienen etapas de vida altamente dispersivas o móviles, la adaptación local solo podía ocurrir en escalas geográficas amplias. Esta visión está respaldada por niveles comparativamente bajos de variación genética entre poblaciones, detectados mediante marcadores neutros. De manera similar, se ha asumido que la escala temporal de la divergencia adaptativa es muy larga, requiriendo miles de generaciones. Estudios recientes de una variedad de especies han desafiado estas creencias. En primer lugar, existe una fuerte evidencia de adaptación local estructurada geográficamente en rasgos fisiológicos y morfológicos. En segundo lugar, la proporción de variación de rasgos cuantitativos a nivel entre poblaciones (Q ST) es mucho mayor que para los marcadores neutros (F ST) y estas dos métricas de variación genética están mal correlacionadas. En tercer lugar, se resume la evidencia de que la selección es una fuerza evolutiva potente capaz de sostener la divergencia adaptativa en escalas temporales contemporáneas. Las escalas espaciales y temporales diferentes de la divergencia genética adaptativa v. neutra exigen un nuevo paradigma en el pensamiento sobre la relación entre fenogeografía (la geografía de la variación fenotípica) y filogeografía (la geografía de las linajes) en especies marinas. La idea de que los procesos selectivos contemporáneos pueden causar divergencia espacial y temporal a escala fina subraya la necesidad de un nuevo énfasis en la ciencia pesquera darwiniana.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2006.01274.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8649.2006.01274.x",
    openalex = "W2157229536",
    references = "doi101002sici1097010x199809102821271aidjez1130co2j, doi101071mf03023, doi1023072390285"
}

El mummichog, Fundulus heteroclitus, presenta una extensa variación clinal latitudinal en una serie de rasgos fisiológicos y bioquímicos, junto con patrones filogeográficos en loci de ADN mitocondrial y nuclear que sugieren una historia complicada de selección espacialmente variable e intergradación secundaria. Esta especie continúa sirviendo como modelo para comprender la adaptación local y regional a entornos variables. Resolver las influencias de los procesos históricos sobre la distribución de la variación genética dentro y entre poblaciones extantes de F. heteroclitus es crucial para una mejor comprensión de cómo evolucionan las poblaciones en el contexto de los entornos contemporáneos. En este estudio, analizamos los patrones geográficos de la variación genética en ocho loci de microsatélites entre 15 poblaciones de F. heteroclitus distribuidas a lo largo del rango de la especie en América del Norte, desde Nueva Escocia hasta Georgia. La variación genética en las poblaciones del norte fue menor que en las del sur y estuvo fuertemente correlacionada con la latitud a lo largo del rango de la especie. Los alelos más comunes del norte en los ocho loci exhibieron patrones clinales latitudinales concordantes, y la existencia de una zona de transición abrupta en las frecuencias alélicas entre las poblaciones del norte y del sur fue similar a la observada para los loci de ADN mitocondrial y aloenzimas. Se observó un patrón significativo de aislamiento por distancia tanto dentro como entre las regiones del norte y del sur. Este patrón fue inesperado, particularmente para las poblaciones del norte, dada la historia de colonización reciente de los hábitats postpleistocénicos, e era inconsistente tanto con una expansión poblacional reciente hacia el norte como con un refugio pleistocénico del norte geográficamente restringido. Los datos no proporcionaron evidencia de cuellos de botella poblacionales recientes, y las estimaciones de los tamaños efectivos históricos de la población sugieren que las poblaciones postpleistocénicas han sido grandes a lo largo de la distribución de la especie. Estos resultados sugieren que F. heteroclitus estaba ampliamente distribuido por la mayor parte de su rango actual durante el último evento glacial y que la transición abrupta en las frecuencias alélicas que separan las poblaciones del norte y del sur puede reflejar condiciones de desequilibrio regional asociadas con la historia de colonización postpleistocénica de los hábitats en esa región.

@article{doi101111j1365294x200602859x,
    author = "Adams, Stephanie M. and LINDMEIER, JAMES B. and Duvernell, David D.",
    title = "Microsatellite analysis of the phylogeography, Pleistocene history and secondary contact hypotheses for the killifish, Fundulus heteroclitus",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "El mummichog, Fundulus heteroclitus, presenta una extensa variación clinal latitudinal en una serie de rasgos fisiológicos y bioquímicos, junto con patrones filogeográficos en loci de ADN mitocondrial y nuclear que sugieren una historia complicada de selección espacialmente variable e intergradación secundaria. Esta especie continúa sirviendo como modelo para comprender la adaptación local y regional a entornos variables. Resolver las influencias de los procesos históricos sobre la distribución de la variación genética dentro y entre poblaciones extantes de F. heteroclitus es crucial para una mejor comprensión de cómo evolucionan las poblaciones en el contexto de los entornos contemporáneos. En este estudio, analizamos los patrones geográficos de la variación genética en ocho loci de microsatélites entre 15 poblaciones de F. heteroclitus distribuidas a lo largo del rango de la especie en América del Norte, desde Nueva Escocia hasta Georgia. La variación genética en las poblaciones del norte fue menor que en las del sur y estuvo fuertemente correlacionada con la latitud a lo largo del rango de la especie. Los alelos más comunes del norte en los ocho loci exhibieron patrones clinales latitudinales concordantes, y la existencia de una zona de transición abrupta en las frecuencias alélicas entre las poblaciones del norte y del sur fue similar a la observada para los loci de ADN mitocondrial y aloenzimas. Se observó un patrón significativo de aislamiento por distancia tanto dentro como entre las regiones del norte y del sur. Este patrón fue inesperado, particularmente para las poblaciones del norte, dada la historia de colonización reciente de los hábitats postpleistocénicos, e era inconsistente tanto con una expansión poblacional reciente hacia el norte como con un refugio pleistocénico del norte geográficamente restringido. Los datos no proporcionaron evidencia de cuellos de botella poblacionales recientes, y las estimaciones de los tamaños efectivos históricos de la población sugieren que las poblaciones postpleistocénicas han sido grandes a lo largo de la distribución de la especie. Estos resultados sugieren que F. heteroclitus estaba ampliamente distribuido por la mayor parte de su rango actual durante el último evento glacial y que la transición abrupta en las frecuencias alélicas que separan las poblaciones del norte y del sur puede reflejar condiciones de desequilibrio regional asociadas con la historia de colonización postpleistocénica de los hábitats en esa región.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2006.02859.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2006.02859.x",
    openalex = "W2140008960",
    references = "cashon1981biochemical, doi101007bf02300753, doi10103835016000, doi101093genetics1312479, doi101093genetics1391457, doi101093genetics14442001, doi101093genetics1552945, doi101111j1365294x200402396x, doi101111j146918091949tb02451x, doi101111j155856461984tb05657x, doi101146annureves16110185000553, whitmore1967elephant"
}

Las poblaciones del pez cebra común, Fundulus heteroclitus, se distribuyen a lo largo de la costa atlántica de América del Norte a través de un gradiente térmico latitudinal pronunciado. Examinamos la variación intraspecífica en la tolerancia térmica del organismo completo y su relación con la respuesta al choque térmico en peces cebra procedentes de los extremos norte y sur del rango de la especie. Los máximos térmicos críticos fueron significativamente más altos en los peces del sur que en los del norte, aproximadamente 1,5 grados C, en un amplio rango de temperaturas de aclimatación (de 2-34 grados C), y los mínimos térmicos críticos diferían aproximadamente 1,5 grados C en temperaturas de aclimatación superiores a 22 grados C, convergiendo en el punto de congelación del agua salobre a temperaturas de aclimatación más bajas. Para determinar si estas diferencias en la tolerancia térmica del organismo completo se reflejaban en diferencias en la secuencia o regulación de los genes de proteínas de choque térmico (hsps), obtuvimos secuencias completas de cDNA para hsc70, hsp70-1 y hsp70-2, y secuencias parciales de hsp90alpha y hsp90beta. No hubo diferencias fijas en la secuencia de aminoácidos entre poblaciones en ninguno de hsp70-1 ni hsp70-2, y solo hubo una única sustitución conservadora entre poblaciones en hsc70. Por el contrario, hubo diferencias significativas entre poblaciones en la expresión de muchos, pero no todos, de estos genes. Tanto los peces cebra del norte como los del sur aumentaron significativamente los niveles de hsp70-2 por encima de los valores de control (T(on)) a una temperatura de choque térmico de 33 grados C, pero la magnitud de esta inducción fue mayor en los peces del norte, lo que sugiere que los peces del norte pueden ser más susceptibles al daño térmico que los del sur. Por el contrario, los niveles de mRNA de hsp70-1 aumentaron gradualmente y en la misma medida en respuesta al choque térmico en ambas poblaciones. Los niveles de mRNA de Hsc70 se elevaron significativamente por el choque térmico en los peces del sur, pero no en los del norte. De manera similar, los peces cebra del sur, más tolerantes al calor, tenían un T(on) para hsp90alpha de 30 grados C, 2 grados C inferior al de los peces del norte. Esta observación combinada con la capacidad de los peces cebra del sur de regular a la alza hsc70 en respuesta al choque térmico sugiere un posible papel de estas hsps en las diferencias del organismo completo en la tolerancia térmica. Estos datos resaltan la importancia de considerar la complejidad de la respuesta al choque térmico a través de múltiples isoformas al intentar establecer vínculos con rasgos del organismo completo como la tolerancia térmica.

@article{doi101242jeb02260,
    author = "Fangue, Nann A. y Hofmeister, Myriam y Schulte, Patricia M.",
    title = "Variación intraspecífica en la tolerancia térmica y la expresión génica de proteínas de choque térmico en el pez cebra común, Fundulus heteroclitus",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Experimental Biology",
    abstract = "Las poblaciones del pez cebra común, Fundulus heteroclitus, se distribuyen a lo largo de la costa atlántica de América del Norte a través de un gradiente térmico latitudinal pronunciado. Examinamos la variación intraspecífica en la tolerancia térmica del organismo completo y su relación con la respuesta al choque térmico en peces cebra procedentes de los extremos norte y sur del rango de la especie. Los máximos térmicos críticos fueron significativamente más altos en los peces del sur que en los del norte, aproximadamente 1,5 grados C, en un amplio rango de temperaturas de aclimatación (de 2-34 grados C), y los mínimos térmicos críticos diferían aproximadamente 1,5 grados C en temperaturas de aclimatación superiores a 22 grados C, convergiendo en el punto de congelación del agua salobre a temperaturas de aclimatación más bajas. Para determinar si estas diferencias en la tolerancia térmica del organismo completo se reflejaban en diferencias en la secuencia o regulación de los genes de proteínas de choque térmico (hsps), obtuvimos secuencias completas de cDNA para hsc70, hsp70-1 y hsp70-2, y secuencias parciales de hsp90alpha y hsp90beta. No hubo diferencias fijas en la secuencia de aminoácidos entre poblaciones en ninguno de hsp70-1 ni hsp70-2, y solo hubo una única sustitución conservadora entre poblaciones en hsc70. Por el contrario, hubo diferencias significativas entre poblaciones en la expresión de muchos, pero no todos, de estos genes. Tanto los peces cebra del norte como los del sur aumentaron significativamente los niveles de hsp70-2 por encima de los valores de control (T(on)) a una temperatura de choque térmico de 33 grados C, pero la magnitud de esta inducción fue mayor en los peces del norte, lo que sugiere que los peces del norte pueden ser más susceptibles al daño térmico que los del sur. Por el contrario, los niveles de mRNA de hsp70-1 aumentaron gradualmente y en la misma medida en respuesta al choque térmico en ambas poblaciones. Los niveles de mRNA de Hsc70 se elevaron significativamente por el choque térmico en los peces del sur, pero no en los del norte. De manera similar, los peces cebra del sur, más tolerantes al calor, tenían un T(on) para hsp90alpha de 30 grados C, 2 grados C inferior al de los peces del norte. Esta observación combinada con la capacidad de los peces cebra del sur de regular a la alza hsc70 en respuesta al choque térmico sugiere un posible papel de estas hsps en las diferencias del organismo completo en la tolerancia térmica. Estos datos resaltan la importancia de considerar la complejidad de la respuesta al choque térmico a través de múltiples isoformas al intentar establecer vínculos con rasgos del organismo completo como la tolerancia térmica.",
    url = "https://doi.org/10.1242/jeb.02260",
    doi = "10.1242/jeb.02260",
    openalex = "W2153013358",
    references = "doi101002sici1097010x199809102821271aidjez1130co2j"
}

Se han propuesto varios mecanismos evolutivos para generar una estructuración genética baja pero significativa entre poblaciones de peces marinos. Utilizamos nueve loci de microsatélites y métodos recientemente desarrollados en genética del paisaje y estimación basada en coalescencia del flujo génico histórico y tamaños efectivos de población para evaluar las dinámicas temporales y espaciales de la estructura de población en la lubina europea (Platichthys flesus L.). Recogimos 1062 lubinas de 13 localidades en el noreste del Atlántico y los mares del Báltico y encontramos una diferenciación genética temporalmente estable y altamente significativa entre muestras que cubren una gran parte del rango de la especie (F(ST) global = 0.024, P < 0.0001). Además de los procesos históricos, varios mecanismos evolutivos contemporáneos actuantes se asociaron con la estructuración genética. Las fuerzas físicas, como las barreras oceanográficas y batimétricas, probablemente están relacionadas con el aislamiento extremo de la población insular de las Islas Faroe. Una ruptura genética aguda se asoció con un cambio en el ciclo de vida de desovadores pelágicos a bentónicos en el mar Báltico. Las pruebas de Mantel parciales mostraron que la distancia geográfica per se no estaba relacionada con la estructuración genética entre muestras del Atlántico y el mar Báltico occidental. Factores alternativos, como el potencial de dispersión y/o gradientes ambientales, podrían ser importantes para generar divergencia genética en esta región. Los resultados muestran que la magnitud y la escala de la estructuración generada por un mecanismo específico dependen críticamente de su interacción con otros mecanismos evolutivos, destacando la importancia de investigar especies con amplias distribuciones geográficas y ecológicas para aumentar nuestra comprensión de la evolución en el medio marino.

@article{doi101111j1365294x200703367x,
    author = "Hemmer‐Hansen, Jakob and Nielsen, Einar Eg and Grønkjær, Peter and Loeschcke, Volker",
    title = "Evolutionary mechanisms shaping the genetic population structure of marine fishes; lessons from the European flounder (Platichthys flesus L.)",
    year = "2007",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "A number of evolutionary mechanisms have been suggested for generating low but significant genetic structuring among marine fish populations. We used nine microsatellite loci and recently developed methods in landscape genetics and coalescence-based estimation of historical gene flow and effective population sizes to assess temporal and spatial dynamics of the population structure in European flounder (Platichthys flesus L.). We collected 1062 flounders from 13 localities in the northeast Atlantic and Baltic Seas and found temporally stable and highly significant genetic differentiation among samples covering a large part of the species' range (global F(ST) = 0.024, P < 0.0001). In addition to historical processes, a number of contemporary acting evolutionary mechanisms were associated with genetic structuring. Physical forces, such as oceanographic and bathymetric barriers, were most likely related with the extreme isolation of the island population at the Faroe Islands. A sharp genetic break was associated with a change in life history from pelagic to benthic spawners in the Baltic Sea. Partial Mantel tests showed that geographical distance per se was not related with genetic structuring among Atlantic and western Baltic Sea samples. Alternative factors, such as dispersal potential and/or environmental gradients, could be important for generating genetic divergence in this region. The results show that the magnitude and scale of structuring generated by a specific mechanism depend critically on its interplay with other evolutionary mechanisms, highlighting the importance of investigating species with wide geographical and ecological distributions to increase our understanding of evolution in the marine environment.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2007.03367.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2007.03367.x",
    openalex = "W2120255171",
    references = "doi101111j1365294x200602859x"
}

La admixture genética de distintos pools génicos es la consecuencia de procesos espaciotemporales complejos que podrían haber involucrado migración masiva y apareamiento local durante la historia de una especie. Sin embargo, los métodos actuales para estimar proporciones de admixture individuales carecen de la incorporación de tal información. Aquí, extendemos los algoritmos de agrupamiento bayesianos incluyendo superficies de tendencia global y autocorrelación espacial en la distribución a priori de los coeficientes de admixture individuales. Probamos nuestro algoritmo utilizando simulaciones de coalescencia explícitas espacialmente y realistas de colonización seguidas de contacto secundario. Acoplando nuestros análisis espaciales multiescala con una evaluación bayesiana de la complejidad y ajuste del modelo, mostramos que el algoritmo proporciona una descripción correcta de la variación clinal suave, mientras sigue detectando zonas de variación aguda cuando están presentes en los datos. También aplicamos nuestro enfoque para entender la estructura poblacional del pez killifish, Fundulus heteroclitus, para el cual el algoritmo descubre una zona de contacto presumida en la costa atlántica de América del Norte.

@article{doi101093molbevmsp106,
    author = "Durand, Éric y Jay, Frédéric y Gaggiotti, Oscar E. y François, Olivier",
    title = "Inferencia Espacial de Proporciones de Admixture y Zonas de Contacto Secundario",
    year = "2009",
    journal = "Biología Molecular y Evolución",
    abstract = "La admixture genética de distintos pools génicos es la consecuencia de procesos espaciotemporales complejos que podrían haber involucrado migración masiva y apareamiento local durante la historia de una especie. Sin embargo, los métodos actuales para estimar proporciones de admixture individuales carecen de la incorporación de tal información. Aquí, extendemos los algoritmos de agrupamiento bayesianos incluyendo superficies de tendencia global y autocorrelación espacial en la distribución a priori de los coeficientes de admixture individuales. Probamos nuestro algoritmo utilizando simulaciones de coalescencia explícitas espacialmente y realistas de colonización seguidas de contacto secundario. Acoplando nuestros análisis espaciales multiescala con una evaluación bayesiana de la complejidad y ajuste del modelo, mostramos que el algoritmo proporciona una descripción correcta de la variación clinal suave, mientras sigue detectando zonas de variación aguda cuando están presentes en los datos. También aplicamos nuestro enfoque para entender la estructura poblacional del pez killifish, Fundulus heteroclitus, para el cual el algoritmo descubre una zona de contacto presumida en la costa atlántica de América del Norte.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msp106",
    doi = "10.1093/molbev/msp106",
    openalex = "W2106728534",
    references = "doi101111j1365294x200602859x, doi101146annurevge25120191003213"
}

Aunque las expansiones de rango han ocurrido recurrentemente en la historia de la mayoría de las especies, sus consecuencias genéticas han sido poco investigadas. Los estudios teóricos muestran que las expansiones de rango son bastante diferentes de las expansiones demográficas puras y que la magnitud del flujo génico reciente condiciona los patrones esperados de diversidad molecular dentro y entre poblaciones. Los estudios de simulación explícitos espacialmente han llevado a resultados inesperados y fascinantes sobre los patrones genéticos que emergen después de una expansión de rango. Por ejemplo, las expansiones espaciales pueden generar gradientes de frecuencia alélica, promover el surf de variantes raras hacia territorios recién ocupados, inducir la estructuración de áreas recién colonizadas en sectores distintos de baja diversidad genética, o llevar a una introgresión masiva de genes locales en el genoma de una especie invasora. Curiosamente, la mayoría de estos patrones habían sido anteriormente atribuidos a procesos selectivos distintos, mostrando que tener en cuenta la naturaleza dinámica del rango de una especie puede llevar a un cambio de paradigma en nuestra percepción de los procesos evolutivos.

@article{doi101146annurevecolsys39110707173414,
    author = "Excoffier, Laurent y Foll, Matthieu y Petit, Rémy J.",
    title = "Consecuencias genéticas de las expansiones de rango",
    year = "2009",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Aunque las expansiones de rango han ocurrido recurrentemente en la historia de la mayoría de las especies, sus consecuencias genéticas han sido poco investigadas. Los estudios teóricos muestran que las expansiones de rango son bastante diferentes de las expansiones demográficas puras y que la magnitud del flujo génico reciente condiciona los patrones esperados de diversidad molecular dentro y entre poblaciones. Los estudios de simulación explícitos espacialmente han llevado a resultados inesperados y fascinantes sobre los patrones genéticos que emergen después de una expansión de rango. Por ejemplo, las expansiones espaciales pueden generar gradientes de frecuencia alélica, promover el surf de variantes raras hacia territorios recién ocupados, inducir la estructuración de áreas recién colonizadas en sectores distintos de baja diversidad genética, o llevar a una introgresión masiva de genes locales en el genoma de una especie invasora. Curiosamente, la mayoría de estos patrones habían sido anteriormente atribuidos a procesos selectivos distintos, mostrando que tener en cuenta la naturaleza dinámica del rango de una especie puede llevar a un cambio de paradigma en nuestra percepción de los procesos evolutivos.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.39.110707.173414",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.39.110707.173414",
    openalex = "W2113401798",
    references = "doi10103835016000, doi101093genetics1472915, doi101111j146918091937tb02153x, doi101146annurevecolsys39110707173430, doi101146annureves16110185000553"
}

Los límites de los rangos de especies pueden determinarse mediante una serie de interacciones bióticas y abióticas, y en áreas donde se superponen especies estrechamente relacionadas, debe existir algún grado de aislamiento reproductivo para que permanezcan distintas. Comprender estas interacciones es esencial para entender qué limita las distribuciones de las especies o causa la hibridación. Fundulus heteroclitus (Mummichog) y Fundulus grandis (Gulf Killifish) son dos especies estrechamente relacionadas con morfologías y nichos ecológicos similares. Ambas especies tienen distribuciones amplias que se superponen en el noreste de Florida. En el presente estudio, se utilizaron dos loci altamente divergentes (uno nuclear y uno mitocondrial) para distinguir estas especies de fundúlidos con el fin de identificar sus rangos y detectar híbridos. El análisis de especímenes recolectados a lo largo de un gradiente de norte a sur en los marismas salinos del noreste de Florida estableció que existe una transición relativamente nítida (≈38 km) desde poblaciones relativamente puras de Mummichog hasta poblaciones relativamente puras de F. grandis al sur de Jacksonville, FL, centrada cerca de Flagler Beach, FL. Se detectaron genotipos híbridos putativos a frecuencias moderadas dentro de la zona de contacto, lo que sugiere que la hibridación exitosa probablemente está ocurriendo entre las dos especies, pero es relativamente poco común. Estos resultados proporcionan un punto de partida para investigar los tipos de barreras reproductivas involucradas en el mantenimiento de las distinciones de especies en este sistema y sus efectos sobre los rangos de las especies y sus interacciones ecológicas.

@article{doi1016560580080203,
    author = "Gonzalez, Iara and Levin, Michael and Jermanus, Sura and Watson, Brent and Gilg, Matthew R.",
    title = "Genetic Assessment of Species Ranges in Fundulus heteroclitus and F. grandis in Northeastern Florida Salt Marshes",
    year = "2009",
    journal = "Southeastern Naturalist",
    abstract = "Los límites de los rangos de especies pueden determinarse mediante una serie de interacciones bióticas y abióticas, y en áreas donde se superponen especies estrechamente relacionadas, debe existir algún grado de aislamiento reproductivo para que permanezcan distintas. Comprender estas interacciones es esencial para entender qué limita las distribuciones de las especies o causa la hibridación. Fundulus heteroclitus (Mummichog) y Fundulus grandis (Gulf Killifish) son dos especies estrechamente relacionadas con morfologías y nichos ecológicos similares. Ambas especies tienen distribuciones amplias que se superponen en el noreste de Florida. En el presente estudio, se utilizaron dos loci altamente divergentes (uno nuclear y uno mitocondrial) para distinguir estas especies de fundúlidos con el fin de identificar sus rangos y detectar híbridos. El análisis de especímenes recolectados a lo largo de un gradiente de norte a sur en los marismas salinos del noreste de Florida estableció que existe una transición relativamente nítida (≈38 km) desde poblaciones relativamente puras de Mummichog hasta poblaciones relativamente puras de F. grandis al sur de Jacksonville, FL, centrada cerca de Flagler Beach, FL. Se detectaron genotipos híbridos putativos a frecuencias moderadas dentro de la zona de contacto, lo que sugiere que la hibridación exitosa probablemente está ocurriendo entre las dos especies, pero es relativamente poco común. Estos resultados proporcionan un punto de partida para investigar los tipos de barreras reproductivas involucradas en el mantenimiento de las distinciones de especies en este sistema y sus efectos sobre los rangos de las especies y sus interacciones ecológicas.",
    url = "https://doi.org/10.1656/058.008.0203",
    doi = "10.1656/058.008.0203",
    openalex = "W2079968376",
    references = "duggins1989biochemical"
}

Uno de los principales desafíos que enfrentan los genetistas del paisaje que estudian la variación adaptativa es incluir todas las variables ambientales que podrían estar correlacionadas con las frecuencias alélicas a lo largo del genoma. Una forma de identificar loci que posiblemente estén bajo selección es ver cuáles están asociados con un gradiente ambiental o heterogeneidad. Dado que es difícil medir todas las variables ambientales, se puede aprovechar la naturaleza espacial de los filtros ambientales para incorporar el efecto de las variables ambientales no contabilizadas en el análisis. Asumiendo que la firma espacial de estas variables es de gran escala, los mapas de autovectores de Moran a gran escala (MEM) pueden incluirse como variables explicativas en el análisis como sustitutos de las variables ambientales no medidas. Aplicamos este enfoque a dos conjuntos de datos de la planta alpina Arabis alpina. El primero consistió en 140 loci AFLP muestreados en 130 sitios a través de los Alpes europeos (gran escala). El segundo consistió en 712 loci AFLP muestreados en 93 sitios (escala regional) en tres macizos montañosos (escala local) de los Alpes franceses. Para cada escala, regresamos las frecuencias de cada alelo AFLP sobre un conjunto de variables eco-climáticas y MEM como predictores. El 12% (gran escala) y el 11% (escala regional) de todos los loci se detectaron como significativamente correlacionados con al menos uno de los predictores (> 0.5), y, excepto por un macizo, el 17% a escala local. Después de tener en cuenta los efectos espaciales, la temperatura y las precipitaciones fueron los dos principales determinantes de las distribuciones alélicas. Nuestro estudio muestra cómo los modelos MEM pueden tener en cuenta la variación ambiental no medida en los modelos de genética del paisaje.

@article{doi101111j1365294x201004716x,
    author = "Manel, Stéphanie y Poncet, Bénédicte y Legendre, Pierre y Gugerli, Félix y Holderegger, Rolf",
    title = "Factores comunes impulsan la variación genética adaptativa en diferentes escalas espaciales en Arabis alpina",
    year = "2010",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Uno de los principales desafíos que enfrentan los genetistas del paisaje que estudian la variación adaptativa es incluir todas las variables ambientales que podrían estar correlacionadas con las frecuencias alélicas a lo largo del genoma. Una forma de identificar loci que posiblemente estén bajo selección es ver cuáles están asociados con un gradiente ambiental o heterogeneidad. Dado que es difícil medir todas las variables ambientales, se puede aprovechar la naturaleza espacial de los filtros ambientales para incorporar el efecto de las variables ambientales no contabilizadas en el análisis. Asumiendo que la firma espacial de estas variables es de gran escala, los mapas de autovectores de Moran a gran escala (MEM) pueden incluirse como variables explicativas en el análisis como sustitutos de las variables ambientales no medidas. Aplicamos este enfoque a dos conjuntos de datos de la planta alpina Arabis alpina. El primero consistió en 140 loci AFLP muestreados en 130 sitios a través de los Alpes europeos (gran escala). El segundo consistió en 712 loci AFLP muestreados en 93 sitios (escala regional) en tres macizos montañosos (escala local) de los Alpes franceses. Para cada escala, regresamos las frecuencias de cada alelo AFLP sobre un conjunto de variables eco-climáticas y MEM como predictores. El 12% (gran escala) y el 11% (escala regional) de todos los loci se detectaron como significativamente correlacionados con al menos uno de los predictores (> 0.5), y, excepto por un macizo, el 17% a escala local. Después de tener en cuenta los efectos espaciales, la temperatura y las precipitaciones fueron los dos principales determinantes de las distribuciones alélicas. Nuestro estudio muestra cómo los modelos MEM pueden tener en cuenta la variación ambiental no medida en los modelos de genética del paisaje.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2010.04716.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2010.04716.x",
    openalex = "W2156951592",
    references = "doi1018900711621"
}

El vínculo fisiológico entre la disponibilidad de oxígeno y la función mitocondrial está bien establecido. Sin embargo, si la variación en la aptitud está asociada con genotipos mitocondriales en el campo sigue siendo un tema controvertido en la biología evolutiva. En este estudio, nos basamos en una población del pez teleósteo, Fundulus heteroclitus, donde se hibridan subespecies funcionalmente distintas, probablemente como resultado de eventos glaciares pasados. Teníamos dos objetivos específicos: (i) determinar el efecto del genotipo de ADNmt sobre la supervivencia de peces macho y hembra bajo estrés hipóxico y (ii) determinar el efecto del estrés hipóxico, el sexo y el genotipo de ADNmt sobre la expresión génica. Encontramos un efecto inesperado y altamente significativo del sexo sobre la supervivencia bajo condiciones hipóxicas, pero ningún efecto significativo del genotipo de ADNmt. Los análisis de expresión génica revelaron cientos de transcritos diferencialmente regulados por el sexo y la hipoxia. Los transcritos mitocondriales y otras vías predichas estaban entre aquellos influenciados por el estrés hipóxico, y un transcrito correspondiente a la región de control del ADNmt fue el transcrito más suprimido bajo las condiciones de hipoxia. Un experimento de RT-PCR sobre la región de control fue consistente con los resultados de microarrays. Los efectos de la variación de la secuencia de ADNmt sobre la expresión del genoma fueron limitados; sin embargo, se descubrió una epistasis potencialmente importante entre la secuencia de ADNmt y la expresión de una proteína de traducción mitocondrial codificada en el núcleo. En general, estos resultados confirman que la regulación mitocondrial es un componente principal de la tolerancia a la hipoxia y sugieren además que la selección purificadora ha sido la fuerza selectiva predominante sobre los genomas mitocondriales en estas dos subespecies.

@article{doi101111j1365294x201105290x,
    author = "Flight, Patrick A. y Nacci, Diane y Champlin, Denise y Whitehead, Andrew y Rand, David M.",
    title = "Los efectos del genotipo mitocondrial sobre la supervivencia hipóxica y la expresión génica en una población híbrida del pez Fundulus heteroclitus",
    year = "2011",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "El vínculo fisiológico entre la disponibilidad de oxígeno y la función mitocondrial está bien establecido. Sin embargo, si la variación en la aptitud está asociada con genotipos mitocondriales en el campo sigue siendo un tema controvertido en la biología evolutiva. En este estudio, nos basamos en una población del pez teleósteo, Fundulus heteroclitus, donde se hibridan subespecies funcionalmente distintas, probablemente como resultado de eventos glaciares pasados. Teníamos dos objetivos específicos: (i) determinar el efecto del genotipo de ADNmt sobre la supervivencia de peces macho y hembra bajo estrés hipóxico y (ii) determinar el efecto del estrés hipóxico, el sexo y el genotipo de ADNmt sobre la expresión génica. Encontramos un efecto inesperado y altamente significativo del sexo sobre la supervivencia bajo condiciones hipóxicas, pero ningún efecto significativo del genotipo de ADNmt. Los análisis de expresión génica revelaron cientos de transcritos diferencialmente regulados por el sexo y la hipoxia. Los transcritos mitocondriales y otras vías predichas estaban entre aquellos influenciados por el estrés hipóxico, y un transcrito correspondiente a la región de control del ADNmt fue el transcrito más suprimido bajo las condiciones de hipoxia. Un experimento de RT-PCR sobre la región de control fue consistente con los resultados de microarrays. Los efectos de la variación de la secuencia de ADNmt sobre la expresión del genoma fueron limitados; sin embargo, se descubrió una epistasis potencialmente importante entre la secuencia de ADNmt y la expresión de una proteína de traducción mitocondrial codificada en el núcleo. En general, estos resultados confirman que la regulación mitocondrial es un componente principal de la tolerancia a la hipoxia y sugieren además que la selección purificadora ha sido la fuerza selectiva predominante sobre los genomas mitocondriales en estas dos subespecies.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.2011.05290.x",
    doi = "10.1111/j.1365-294x.2011.05290.x",
    openalex = "W1902953741",
    references = "doi1010160003269790905984, doi101038nprot2008211, doi101093bioinformaticsbti551, doi101093bioinformaticsbtp187, doi101093molbevmsm092, doi1011111467986800346, doi101126science1156401, doi101146annureves16110185000553, doi101186gb200345p3, ropson1990biochemical"
}

El pez cebra Fundulus heteroclitus es abundante en estuarios dinámicamente osmóticos y puede ajustar rápidamente a extremos en la salinidad ambiental. Realizamos un experimento comparativo de desafío osmótico para rastrear las respuestas transcriptómicas y fisiológicas a dos salinidades a lo largo de un curso temporal de aclimatación, y para explorar los mecanismos reguladores del genoma que permiten la aclimatación osmótica extrema. Se utilizaron como modelo comparativo una población costera del sur y una del norte, conocidas por diferir en su tolerancia a la exposición hipo-osmótica. Ambas poblaciones pudieron mantener la homeostasis osmótica al ser transferidas de 32 a 0.4 p.p.t., pero divergieron en sus capacidades compensatorias al ser desafiadas hasta 0.1 p.p.t., en paralelo con una transformación divergente de la morfología branquial. Los genes involucrados en la regulación del volumen celular, el mantenimiento de los nucleosomas, el transporte iónico, la energética, la función mitocondrial, la regulación transcripcional y la apoptosis mostraron patrones de expresión dependientes de la población y la salinidad durante la aclimatación. El análisis de redes confirmó el papel de las vías de señalización de citoquinas y quinasas en la coordinación de la respuesta reguladora del genoma al desafío osmótico, y también planteó la importancia de la señalización coordinada a través del factor de transcripción HNF-4α. Estas respuestas del genoma apoyan hipótesis sobre qué mecanismos reguladores son particularmente relevantes para permitir la flexibilidad fisiológica extrema.

@article{doi101242jeb062075,
    author = "Whitehead, Andrew y Roach, Jennifer L. y Zhang, Shujun y Gálvez, Fernando",
    title = "Respuesta reguladora del genoma dependiente de la salinidad y la población durante la aclimatación osmótica en la branquia del pez cebra (Fundulus heteroclitus)",
    year = "2012",
    journal = "Journal of Experimental Biology",
    abstract = "El pez cebra Fundulus heteroclitus es abundante en estuarios dinámicamente osmóticos y puede ajustar rápidamente a extremos en la salinidad ambiental. Realizamos un experimento comparativo de desafío osmótico para rastrear las respuestas transcriptómicas y fisiológicas a dos salinidades a lo largo de un curso temporal de aclimatación, y para explorar los mecanismos reguladores del genoma que permiten la aclimatación osmótica extrema. Se utilizaron como modelo comparativo una población costera del sur y una del norte, conocidas por diferir en su tolerancia a la exposición hipo-osmótica. Ambas poblaciones pudieron mantener la homeostasis osmótica al ser transferidas de 32 a 0.4 p.p.t., pero divergieron en sus capacidades compensatorias al ser desafiadas hasta 0.1 p.p.t., en paralelo con una transformación divergente de la morfología branquial. Los genes involucrados en la regulación del volumen celular, el mantenimiento de los nucleosomas, el transporte iónico, la energética, la función mitocondrial, la regulación transcripcional y la apoptosis mostraron patrones de expresión dependientes de la población y la salinidad durante la aclimatación. El análisis de redes confirmó el papel de las vías de señalización de citoquinas y quinasas en la coordinación de la respuesta reguladora del genoma al desafío osmótico, y también planteó la importancia de la señalización coordinada a través del factor de transcripción HNF-4α. Estas respuestas del genoma apoyan hipótesis sobre qué mecanismos reguladores son particularmente relevantes para permitir la flexibilidad fisiológica extrema.",
    url = "https://doi.org/10.1242/jeb.062075",
    doi = "10.1242/jeb.062075",
    openalex = "W2133306656",
    references = "doi101111j1365294x201105290x"
}

Un patrón geográfico común de variación genética es el cline unidimensional. Los clines pueden mantenerse mediante selección diversificadora a lo largo de un gradiente geográfico, pero también pueden reflejar procesos históricos como la alopatria seguida de contacto secundario. Para identificar loci que pueden estar experimentando selección diversificadora, examinamos la distribución de patrones de variación geográfica en el rango del pez de río (Fundulus heteroclitus) en 310 loci, incluyendo microsatélites, aloenzimas y polimorfismos de nucleótido simple. Empleamos dos enfoques para detectar loci bajo fuerte selección diversificadora. Primero, desarrollamos un método automatizado para identificar variación clinal en una base por locus y examinamos la distribución de clines para detectar aquellos que exhibieron pendientes significativamente más pronunciadas. Segundo, empleamos un método clásico de outlier [Fórmula: ver texto] como un enfoque complementario. También evaluamos el rendimiento de estas técnicas utilizando simulaciones. En general, se detectaron clines latitudinales en casi la mitad de todos los loci genotipados (es decir, los ocho loci de microsatélite, 12 de 16 loci de aloenzima y el 44% de los 285 SNPs). Con la excepción de pocos loci de outlier (notablemente mtDNA y malato deshidrogenasa), las posiciones y pendientes de los clines de Fundulus fueron estadísticamente indistinguibles. La alta frecuencia de clines latitudinales a lo largo del genoma indica que el contacto secundario juega un papel central en la demografía histórica de esta especie. Nuestros resultados de simulación indican que detectar con precisión la selección diversificadora utilizando escaneos genómicos es extremadamente difícil en especies con una fuerte señal de contacto secundario; la evolución neutral bajo esta historia produce clines tan pronunciados como los esperados bajo selección. Basándonos en estos resultados, proponemos que la historia demográfica puede explicar todos los patrones clinales observados en F. heteroclitus sin invocar la selección natural para establecer o mantener el patrón que observamos hoy.

@article{doi101371journalpone0045138,
    author = "Strand, Allan E. y Williams, LM y Oleksiak, Marjorie F. y Sotka, Erik E.",
    title = "¿Puede distinguirse la selección diversificadora de la historia en clines geográficos? Un estudio genómico de poblaciones de peces de río (Fundulus heteroclitus)",
    year = "2012",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Un patrón geográfico común de variación genética es el cline unidimensional. Los clines pueden mantenerse mediante selección diversificadora a lo largo de un gradiente geográfico, pero también pueden reflejar procesos históricos como la alopatria seguida de contacto secundario. Para identificar loci que pueden estar experimentando selección diversificadora, examinamos la distribución de patrones de variación geográfica en el rango del pez de río (Fundulus heteroclitus) en 310 loci, incluyendo microsatélites, aloenzimas y polimorfismos de nucleótido simple. Empleamos dos enfoques para detectar loci bajo fuerte selección diversificadora. Primero, desarrollamos un método automatizado para identificar variación clinal en una base por locus y examinamos la distribución de clines para detectar aquellos que exhibieron pendientes significativamente más pronunciadas. Segundo, empleamos un método clásico de outlier [Fórmula: ver texto] como un enfoque complementario. También evaluamos el rendimiento de estas técnicas utilizando simulaciones. En general, se detectaron clines latitudinales en casi la mitad de todos los loci genotipados (es decir, los ocho loci de microsatélite, 12 de 16 loci de aloenzima y el 44% de los 285 SNPs). Con la excepción de pocos loci de outlier (notablemente mtDNA y malato deshidrogenasa), las posiciones y pendientes de los clines de Fundulus fueron estadísticamente indistinguibles. La alta frecuencia de clines latitudinales a lo largo del genoma indica que el contacto secundario juega un papel central en la demografía histórica de esta especie. Nuestros resultados de simulación indican que detectar con precisión la selección diversificadora utilizando escaneos genómicos es extremadamente difícil en especies con una fuerte señal de contacto secundario; la evolución neutral bajo esta historia produce clines tan pronunciados como los esperados bajo selección. Basándonos en estos resultados, proponemos que la historia demográfica puede explicar todos los patrones clinales observados en F. heteroclitus sin invocar la selección natural para establecer o mantener el patrón que observamos hoy.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0045138",
    doi = "10.1371/journal.pone.0045138",
    openalex = "W2005710170",
    references = "doi101046j1365294x200302063x, doi101093bioinformatics182337, doi101093oso97801950997440010001, doi101111j1365294x201105290x, doi101111j14718286200400828x, doi101111jbi14281, doi101146annureves16110185000553, doi101242jeb037473, doi1023073390, doi105860choice350883, openalexw1546828436, ropson1990biochemical"
}

Los enfoques de genómica de poblaciones están avanzando rápidamente en el estudio de organismos no modelo, incluidos los taxones marinos. Hasta la fecha, estos estudios marinos se han centrado predominantemente en métricas rudimentarias que describen el contexto espacial y ambiental de su región de estudio (por ejemplo, distancia geográfica, temperatura media de la superficie del mar, salinidad media). Sostenemos que un enfoque más matizado y reflexivo para cuantificar la dinámica y los patrones de los paisajes marinos puede fortalecer las investigaciones de genómica de poblaciones y ayudar a identificar factores espaciales, temporales y ambientales asociados con regímenes selectivos diferentes o historias demográficas. No obstante, los enfoques para cuantificar los paisajes marinos son complicados. Las características características del medio marino, incluida la vida pelágica en agua corriente (experimentada por la mayoría de los taxones marinos en algún punto de su ciclo de vida), requieren una estrategia de muestreo y análisis espacio-temporal bien diseñada. Muchas estadísticas genéticas resumen utilizadas para describir poblaciones pueden ser inadecuadas para especies marinas con tamaños de población grandes, amplios rangos de especies, reclutamiento estocástico y flujo génico asimétrico. Finalmente, los enfoques estadísticos para probar asociaciones entre paisajes marinos y patrones de genómica de poblaciones aún están madurando, sin un único enfoque capaz de capturar todas las consideraciones relevantes. Ninguno de estos problemas es completamente único de los sistemas marinos y, por lo tanto, problemas y soluciones similares se compartirán para muchos organismos independientemente del hábitat. Aquí, delineamos objetivos y enfoques espaciales para la genómica de paisajes con énfasis en los sistemas marinos y revisamos la creciente literatura empírica sobre la genómica de paisajes marinos. Revisamos herramientas y enfoques establecidos y destacamos nuevas estrategias prometedoras para superar problemas selectos, incluida una estrategia para optimizar espacialmente el muestreo. A pesar de los muchos desafíos, argumentamos que los sistemas marinos pueden estar especialmente bien adaptados para identificar regiones genómicas candidatas bajo selección mediada por el ambiente y que los enfoques de genómica de paisajes son especialmente útiles para identificar asociaciones robustas locus por ambiente.

@article{doi101093czzow067,
    author = "Riginos, Cynthia and Crandall, Eric D. and Liggins, Libby and Bongaerts, Pim and Treml, Eric A.",
    title = "Navigating the currents of seascape genomics: how spatial analyses can augment population genomic studies",
    year = "2016",
    journal = "Current Zoology",
    abstract = "Los enfoques de genómica de poblaciones están avanzando rápidamente en el estudio de organismos no modelo, incluidos los taxones marinos. Hasta la fecha, estos estudios marinos se han centrado predominantemente en métricas rudimentarias que describen el contexto espacial y ambiental de su región de estudio (por ejemplo, distancia geográfica, temperatura media de la superficie del mar, salinidad media). Sostenemos que un enfoque más matizado y reflexivo para cuantificar la dinámica y los patrones de los paisajes marinos puede fortalecer las investigaciones de genómica de poblaciones y ayudar a identificar factores espaciales, temporales y ambientales asociados con regímenes selectivos diferentes o historias demográficas. No obstante, los enfoques para cuantificar los paisajes marinos son complicados. Las características características del medio marino, incluida la vida pelágica en agua corriente (experimentada por la mayoría de los taxones marinos en algún punto de su ciclo de vida), requieren una estrategia de muestreo y análisis espacio-temporal bien diseñada. Muchas estadísticas genéticas resumen utilizadas para describir poblaciones pueden ser inadecuadas para especies marinas con tamaños de población grandes, amplios rangos de especies, reclutamiento estocástico y flujo génico asimétrico. Finalmente, los enfoques estadísticos para probar asociaciones entre paisajes marinos y patrones de genómica de poblaciones aún están madurando, sin un único enfoque capaz de capturar todas las consideraciones relevantes. Ninguno de estos problemas es completamente único de los sistemas marinos y, por lo tanto, problemas y soluciones similares se compartirán para muchos organismos independientemente del hábitat. Aquí, delineamos objetivos y enfoques espaciales para la genómica de paisajes con énfasis en los sistemas marinos y revisamos la creciente literatura empírica sobre la genómica de paisajes marinos. Revisamos herramientas y enfoques establecidos y destacamos nuevas estrategias prometedoras para superar problemas selectos, incluida una estrategia para optimizar espacialmente el muestreo. A pesar de los muchos desafíos, argumentamos que los sistemas marinos pueden estar especialmente bien adaptados para identificar regiones genómicas candidatas bajo selección mediada por el ambiente y que los enfoques de genómica de paisajes son especialmente útiles para identificar asociaciones robustas locus por ambiente.",
    url = "https://doi.org/10.1093/cz/zow067",
    doi = "10.1093/cz/zow067",
    openalex = "W2463608285",
    references = "doi101093czzow088, doi101111eva12288"
}

Las especies marinas altamente fértiles con etapas del ciclo de vida dispersivas a menudo muestran grandes tamaños poblacionales y amplios rangos de distribución geográfica. En consecuencia, se espera que experimenten una deriva genética reducida, una selección eficiente impulsada por mutaciones adaptativas frecuentes y altas cargas de migración. Esto tiene importantes consecuencias para comprender cómo procede la adaptación local en el mar. Un tema clave en este sentido se relaciona con la arquitectura genética subyacente a los rasgos de aptitud. La teoría predice que la adaptación puede implicar muchos genes pero con una alta varianza en el tamaño del efecto. Por lo tanto, el efecto de la selección sobre las frecuencias alélicas puede ser sustancial para los loci de mayor tamaño de efecto, pero insignificante para los genes de pequeño efecto. En tal contexto, el rendimiento de los métodos de genómica de poblaciones para desentrañar la base genética de la adaptación depende de la fracción de la varianza genética adaptativa explicada por el efecto acumulativo de los loci atípicos. Aquí, abordamos algunos desafíos metodológicos asociados con la detección de la adaptación local utilizando enfoques moleculares. Proporcionamos una visión general de los métodos de escaneo genómico para detectar la selección, incluidos aquellos que asumen modelos demográficos complejos que describen mejor la estructura espacial de las poblaciones. Luego nos enfocamos en los enfoques de genética de poblaciones que buscan asociaciones genotipo-fenotipo a diferentes escalas genómicas, incluidos los métodos a nivel genómico que evalúan el efecto acumulativo de las variantes. Argumentamos que la potencia limitada de las pruebas de locus único puede aliviarse mediante el uso de puntuaciones poligénicas para estimar la contribución conjunta de las variantes candidatas a la variación fenotípica.

@article{doi101093czzow088,
    author = "Gagnaire, Pierre‐Alexandre y Gaggiotti, Oscar E.",
    title = "Detecting polygenic selection in marine populations by combining population genomics and quantitative genetics approaches",
    year = "2016",
    journal = "Current Zoology",
    abstract = "Las especies marinas altamente fértiles con etapas del ciclo de vida dispersivas a menudo muestran grandes tamaños poblacionales y amplios rangos de distribución geográfica. En consecuencia, se espera que experimenten una deriva genética reducida, una selección eficiente impulsada por mutaciones adaptativas frecuentes y altas cargas de migración. Esto tiene importantes consecuencias para comprender cómo procede la adaptación local en el mar. Un tema clave en este sentido se relaciona con la arquitectura genética subyacente a los rasgos de aptitud. La teoría predice que la adaptación puede implicar muchos genes pero con una alta varianza en el tamaño del efecto. Por lo tanto, el efecto de la selección sobre las frecuencias alélicas puede ser sustancial para los loci de mayor tamaño de efecto, pero insignificante para los genes de pequeño efecto. En tal contexto, el rendimiento de los métodos de genómica de poblaciones para desentrañar la base genética de la adaptación depende de la fracción de la varianza genética adaptativa explicada por el efecto acumulativo de los loci atípicos. Aquí, abordamos algunos desafíos metodológicos asociados con la detección de la adaptación local utilizando enfoques moleculares. Proporcionamos una visión general de los métodos de escaneo genómico para detectar la selección, incluidos aquellos que asumen modelos demográficos complejos que describen mejor la estructura espacial de las poblaciones. Luego nos enfocamos en los enfoques de genética de poblaciones que buscan asociaciones genotipo-fenotipo a diferentes escalas genómicas, incluidos los métodos a nivel genómico que evalúan el efecto acumulativo de las variantes. Argumentamos que la potencia limitada de las pruebas de locus único puede aliviarse mediante el uso de puntuaciones poligénicas para estimar la contribución conjunta de las variantes candidatas a la variación fenotípica.",
    url = "https://doi.org/10.1093/cz/zow088",
    doi = "10.1093/cz/zow088",
    openalex = "W2518584709",
    references = "doi101007bf00484222, doi101038nature08185, doi101038nbt1486, doi101038ng608, doi101038ng686, doi101046j14390388200200356x, doi101073pnas0506580102, doi101093genetics1233585, doi101111j14610248200400684x, doi101111mec13360, doi101159000353879, doi1023072529912, powers1978biochemical"
}

La heterogeneidad genética caótica (CGP) se refiere a patrones sorprendentes de estructura genética espacial y temporal observados en algunas especies marinas a una escala donde la variación genética debería homogeneizarse eficientemente por el flujo génico a través de la dispersión larvaria. Aquí revisamos y discutimos 4 mecanismos que podrían generar tales patrones inesperados: selección, éxito reproductivo de lotería, dispersión colectiva y cambios temporales en la dinámica de poblaciones locales. Primero, revisamos ejemplos donde la diferenciación genética en loci específicos fue impulsada por selección diversificadora, que históricamente fue el primer proceso invocado para explicar la CGP. Segundo, nos turnamos a procesos demográficos neutrales que pueden impulsar efectos a nivel del genoma, y cuyos efectos sobre la CGP pueden verse potenciados cuando actúan conjuntamente. Discutimos cómo el éxito reproductivo de lotería acelera la deriva genética y por lo tanto puede generar estructura genética, siempre que el flujo génico no sea demasiado fuerte. La dispersión colectiva es otro mecanismo mediante el cual la estructura genética puede mantenerse independientemente de la intensidad de la dispersión, porque puede evitar que las cohortes larvarias se mezclen completamente. Se presentan análisis teóricos tanto de la idea de éxito reproductivo de lotería como de la de dispersión colectiva. Finalmente, discutimos una idea que ha recibido menos atención que las otras mencionadas anteriormente, a saber, los cambios temporales en la dinámica de poblaciones locales.

@article{doi101093czzow094,
    author = "Eldon, Bjarki y Riquet, Florentine y Yearsley, Jon M. y Jollivet, Didier y Broquet, Thomas",
    title = "Hipótesis actuales para explicar el caos genético bajo el mar",
    year = "2016",
    journal = "Current Zoology",
    abstract = "La heterogeneidad genética caótica (CGP) se refiere a patrones sorprendentes de estructura genética espacial y temporal observados en algunas especies marinas a una escala donde la variación genética debería homogeneizarse eficientemente por el flujo génico a través de la dispersión larvaria. Aquí revisamos y discutimos 4 mecanismos que podrían generar tales patrones inesperados: selección, éxito reproductivo de lotería, dispersión colectiva y cambios temporales en la dinámica de poblaciones locales. Primero, revisamos ejemplos donde la diferenciación genética en loci específicos fue impulsada por selección diversificadora, que históricamente fue el primer proceso invocado para explicar la CGP. Segundo, nos turnamos a procesos demográficos neutrales que pueden impulsar efectos a nivel del genoma, y cuyos efectos sobre la CGP pueden verse potenciados cuando actúan conjuntamente. Discutimos cómo el éxito reproductivo de lotería acelera la deriva genética y por lo tanto puede generar estructura genética, siempre que el flujo génico no sea demasiado fuerte. La dispersión colectiva es otro mecanismo mediante el cual la estructura genética puede mantenerse independientemente de la intensidad de la dispersión, porque puede evitar que las cohortes larvarias se mezclen completamente. Se presentan análisis teóricos tanto de la idea de éxito reproductivo de lotería como de la de dispersión colectiva. Finalmente, discutimos una idea que ha recibido menos atención que las otras mencionadas anteriormente, a saber, los cambios temporales en la dinámica de poblaciones locales.",
    url = "https://doi.org/10.1093/cz/zow094",
    doi = "10.1093/cz/zow094",
    openalex = "W2509367417",
    references = "doi101093czzow088"
}

La vía de fosforilación oxidativa (OxPhos) es responsable de la mayor parte de la producción aeróbica de ATP y es la única vía con proteínas codificadas tanto por el núcleo como por la mitocondria. La importancia de las interacciones entre estos dos genomas ha recibido recientemente más atención debido a sus posibles efectos evolutivos y a cómo pueden afectar la salud y las enfermedades humanas. En muchos organismos diferentes, los híbridos de genomas nucleares y mitocondriales sanos entre especies o entre poblaciones distantes dentro de una especie afectan la aptitud y las funciones de OxPhos. Sin embargo, lo que se entiende menos es si estas interacciones impactan a los individuos dentro de una sola población natural. La importancia de este impacto depende de la fuerza de la selección para las interacciones mito-núcleo. Examinamos si las interacciones mito-núcleo alteran las frecuencias alélicas para ~11.000 SNPs nucleares dentro de una sola población natural de Fundulus heteroclitus que contiene dos haplotipos mitocondriales divergentes (mt-haplotipos). Entre los dos mt-haplotipos, existen diferencias significativas en la frecuencia alélica nuclear para 349 SNPs con un valor p del 1% (236 con 10% FDR). A diferencia del resto del genoma, estos 349 SNPs atípicos forman dos grupos asociados con cada mt-haplotipo, con una minoría de individuos que tienen ascendencia mixta. Usamos esta ascendencia mixta en combinación con el mt-haplotipo como un factor poligénico para explicar una fracción significativa de la variación individual de OxPhos. Estos datos sugieren que las interacciones mito-núcleo afectan la función de OxPhos cardíaca. Los 349 SNPs atípicos ocurren en genes involucrados en la regulación de procesos metabólicos, pero no están directamente asociados con las 79 proteínas nucleares de OxPhos. Por lo tanto, postulamos que la evolución de las interacciones mito-núcleo afecta la función de OxPhos actuando aguas arriba de OxPhos.

@article{doi101371journalpgen1006517,
    author = "Baris, Tara Z. y Wagner, Dominique N. y Dayan, David I. y Du, Xiao y Blier, Pierre y Pichaud, Nicolas y Oleksiak, Marjorie F. y Crawford, D. L.",
    title = "Diferencias genéticas y fenotípicas evolucionadas debido a interacciones mitocondria-núcleo",
    year = "2017",
    journal = "PLoS Genetics",
    abstract = "La vía de fosforilación oxidativa (OxPhos) es responsable de la mayor parte de la producción aeróbica de ATP y es la única vía con proteínas codificadas tanto por el núcleo como por la mitocondria. La importancia de las interacciones entre estos dos genomas ha recibido recientemente más atención debido a sus posibles efectos evolutivos y a cómo pueden afectar la salud y las enfermedades humanas. En muchos organismos diferentes, los híbridos de genomas nucleares y mitocondriales sanos entre especies o entre poblaciones distantes dentro de una especie afectan la aptitud y las funciones de OxPhos. Sin embargo, lo que se entiende menos es si estas interacciones impactan a los individuos dentro de una sola población natural. La importancia de este impacto depende de la fuerza de la selección para las interacciones mito-núcleo. Examinamos si las interacciones mito-núcleo alteran las frecuencias alélicas para \textasciitilde 11.000 SNPs nucleares dentro de una sola población natural de Fundulus heteroclitus que contiene dos haplotipos mitocondriales divergentes (mt-haplotipos). Entre los dos mt-haplotipos, existen diferencias significativas en la frecuencia alélica nuclear para 349 SNPs con un valor p del 1\% (236 con 10\% FDR). A diferencia del resto del genoma, estos 349 SNPs atípicos forman dos grupos asociados con cada mt-haplotipo, con una minoría de individuos que tienen ascendencia mixta. Usamos esta ascendencia mixta en combinación con el mt-haplotipo como un factor poligénico para explicar una fracción significativa de la variación individual de OxPhos. Estos datos sugieren que las interacciones mito-núcleo afectan la función de OxPhos cardíaca. Los 349 SNPs atípicos ocurren en genes involucrados en la regulación de procesos metabólicos, pero no están directamente asociados con las 79 proteínas nucleares de OxPhos. Por lo tanto, postulamos que la evolución de las interacciones mito-núcleo afecta la función de OxPhos actuando aguas arriba de OxPhos.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006517",
    doi = "10.1371/journal.pgen.1006517",
    openalex = "W2598891531",
    references = "doi101111j1365294x201105290x, doi101111j155856461990tb04277x"
}

La genética evolutiva ha luchado durante mucho tiempo por comprender cómo los genes funcionales bajo selección permanecen polimórficos en poblaciones naturales. Tomando como punto de partida que la selección natural es en última instancia una manifestación de procesos ecológicos, destacamos un efecto ecológico poco enfatizado y potencialmente ubicuo que puede tener efectos fundamentales en el mantenimiento de la variación genética. La dependencia de frecuencia negativa es una propiedad emergente bien establecida de la dependencia de densidad en ecología, porque la rentabilidad relativa de diferentes modos de explotar o utilizar recursos limitantes tiende a ser inversamente proporcional a su frecuencia en una población. Sugerimos que esto a menudo puede generar selección dependiente de frecuencia negativa (NFDS) en loci de efecto mayor que afectan procesos fisiológicos dependientes de la tasa, como la tasa metabólica, que se manifiestan fenotípicamente como polimorfismo en síndromes de ritmo de vida. Cuando un locus bajo NFDS muestra polimorfismo de frecuencia intermedia estable, esto debería generar selección epistática que potencialmente involucra un gran número de loci con efectos más menores en rasgos de historia de vida (LH). Cuando los alelos alternativos en tales loci muestran epistasis de signo con un locus de efecto mayor, esta NFDS asociativa promoverá el mantenimiento de la variación poligénica en genes LH. Proporcionamos ejemplos del tipo de loci de efecto mayor que podrían estar involucrados y sugerimos vías empíricas que podrían informarnos mejor sobre la importancia y alcance de este proceso.

@article{doi101111mec17062,
    author = "Arnqvist, Göran y Rowe, Locke",
    title = "Ecology, el ritmo de la vida, la selección epistática y el mantenimiento de la variación genética en genes de historia de vida",
    year = "2023",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "La genética evolutiva ha luchado durante mucho tiempo por comprender cómo los genes funcionales bajo selección permanecen polimórficos en poblaciones naturales. Tomando como punto de partida que la selección natural es en última instancia una manifestación de procesos ecológicos, destacamos un efecto ecológico poco enfatizado y potencialmente ubicuo que puede tener efectos fundamentales en el mantenimiento de la variación genética. La dependencia de frecuencia negativa es una propiedad emergente bien establecida de la dependencia de densidad en ecología, porque la rentabilidad relativa de diferentes modos de explotar o utilizar recursos limitantes tiende a ser inversamente proporcional a su frecuencia en una población. Sugerimos que esto a menudo puede generar selección dependiente de frecuencia negativa (NFDS) en loci de efecto mayor que afectan procesos fisiológicos dependientes de la tasa, como la tasa metabólica, que se manifiestan fenotípicamente como polimorfismo en síndromes de ritmo de vida. Cuando un locus bajo NFDS muestra polimorfismo de frecuencia intermedia estable, esto debería generar selección epistática que potencialmente involucra un gran número de loci con efectos más menores en rasgos de historia de vida (LH). Cuando los alelos alternativos en tales loci muestran epistasis de signo con un locus de efecto mayor, esta NFDS asociativa promoverá el mantenimiento de la variación poligénica en genes LH. Proporcionamos ejemplos del tipo de loci de efecto mayor que podrían estar involucrados y sugerimos vías empíricas que podrían informarnos mejor sobre la importancia y alcance de este proceso.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.17062",
    doi = "10.1111/mec.17062",
    openalex = "W4382632412",
    references = "doi101093icbicz124"
}

Las señales de selección natural pueden erosionarse rápidamente en sistemas de alto flujo génico, limitando los esfuerzos para comprender cómo y cuándo ocurre la adaptación genética en el océano. Este tema de larga data y sin resolver en ecología y evolución ha cobrado nueva importancia debido a que las condiciones ambientales cambiantes están impulsando expansiones de rango que pueden requerir respuestas evolutivas rápidas. Un ejemplo ocurre en la caracola de Kellet (Kelletia kelletii), un gasterópodo subtidal común con una duración larvaria pelágica de ~40 a 60 días que expandió su rango biogeográfico hacia el norte en la década de 1970 en más de 300 km. Para probar la adaptación genética, realizamos una serie de cruces experimentales con adultos de caracola de Kellet recolectados de su rango histórico (HxH) y de su rango recientemente expandido (ExE), y realizamos RNA-Seq en la descendencia que criamos en un ambiente de jardín común. Identificamos 2770 genes diferencialmente expresados (DEGs) entre 54 muestras de descendencia con ascendencia de solo rango histórico (descendencia HxH) o de rango expandido (descendencia ExE). Utilizando SNPs llamados directamente de los DEGs, asignamos muestras de origen conocido de vuelta a su rango de origen con una precisión sin precedentes para una especie marina (92,6% y 94,5% para la descendencia HxH y ExE, respectivamente). El SNP con la mayor importancia predictiva ocurrió en la triosa fosfato isomerasa (TPI), una enzima metabólica esencial involucrada en la respuesta al estrés por frío. La TPI se reguló significativamente a la alza y contenía una mutación no sinónima en el rango expandido. Nuestros hallazgos allanan el camino para identificar con precisión patrones de dispersión, flujo génico y conectividad poblacional en el océano al demostrar que la transcriptómica experimental puede revelar mecanismos de cómo los organismos marinos responden a las condiciones ambientales cambiantes.

@article{doi101111mec17511,
    author = "Lee, Andy y Daniels, Benjamin N. y Hemstrom, William y López, Cataixa y Kagaya, Yuki y Kihara, Daisuke y Davidson, Jean M. y Toonen, Robert J. y White, Crow y Christie, Mark R.",
    title = "Adaptación genética a pesar de un alto flujo génico en una población en expansión de rango",
    year = "2024",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Las señales de selección natural pueden erosionarse rápidamente en sistemas de alto flujo génico, limitando los esfuerzos para comprender cómo y cuándo ocurre la adaptación genética en el océano. Este tema de larga data y sin resolver en ecología y evolución ha cobrado nueva importancia debido a que las condiciones ambientales cambiantes están impulsando expansiones de rango que pueden requerir respuestas evolutivas rápidas. Un ejemplo ocurre en la caracola de Kellet (Kelletia kelletii), un gasterópodo subtidal común con una duración larvaria pelágica de \textasciitilde 40 a 60 días que expandió su rango biogeográfico hacia el norte en la década de 1970 en más de 300 km. Para probar la adaptación genética, realizamos una serie de cruces experimentales con adultos de caracola de Kellet recolectados de su rango histórico (HxH) y de su rango recientemente expandido (ExE), y realizamos RNA-Seq en la descendencia que criamos en un ambiente de jardín común. Identificamos 2770 genes diferencialmente expresados (DEGs) entre 54 muestras de descendencia con ascendencia de solo rango histórico (descendencia HxH) o de rango expandido (descendencia ExE). Utilizando SNPs llamados directamente de los DEGs, asignamos muestras de origen conocido de vuelta a su rango de origen con una precisión sin precedentes para una especie marina (92,6\% y 94,5\% para la descendencia HxH y ExE, respectivamente). El SNP con la mayor importancia predictiva ocurrió en la triosa fosfato isomerasa (TPI), una enzima metabólica esencial involucrada en la respuesta al estrés por frío. La TPI se reguló significativamente a la alza y contenía una mutación no sinónima en el rango expandido. Nuestros hallazgos allanan el camino para identificar con precisión patrones de dispersión, flujo génico y conectividad poblacional en el océano al demostrar que la transcriptómica experimental puede revelar mecanismos de cómo los organismos marinos responden a las condiciones ambientales cambiantes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.17511",
    doi = "10.1111/mec.17511",
    openalex = "W4402094791",
    references = "doi101002evl3189"
}