Crecimiento

@misc{brody1945bioenergetics2,
    author = "Brody, S",
    title = "Bioenergetics and Growth",
    year = "1945",
    howpublished = "New York, Van Nostrand Reinhold, 1023 p",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Brody, S., 1945, Bioenergetics and Growth: New York, Van Nostrand Reinhold, 1023 p.}"
}

@article{bertalanffy1957quantitative1,
    author = "Bertalanffy, L",
    title = "Leyes cuantitativas en el metabolismo y el crecimiento",
    year = "1957",
    journal = "Quarterly Review of Biology, v. 32, p. 217-231",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Bertalanffy, L., 1957, Leyes cuantitativas en el metabolismo y el crecimiento: Quarterly Review of Biology, v. 32, p. 217-231.}"
}

@article{vonbertalanffy1957quantitative,
    author = "von Bertalanffy, Ludwig",
    title = "Leyes Cuantitativas en el Metabolismo y el Crecimiento",
    year = "1957",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1086/401873",
    doi = "10.1086/401873",
    number = "3",
    openalex = "W2278685458",
    pages = "217-231",
    volume = "32",
    references = "doi101002ar1091000306, doi101002jcp1030570302, doi101007bf00650112, doi101007bf01722007, doi101016s0021925818555757, doi101016s0021925818566928, doi101021j150446a008, doi101086physzool17130151829, doi101126science1092841579, doi101152physrev1956362255"
}

@book{thompson1961on3,
    author = "Thompson, D'A. W",
    title = "On Growth and Form",
    year = "1961",
    publisher = "Cambridge, Cambridge University Press; [Edición abreviada por J.T. Bonner]",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Thompson, D'A. W., 1961, On Growth and Form: Cambridge, Cambridge University Press; [Edición abreviada por J.T. Bonner].}"
}

Resumen Los invertebrados modulares (coloniales) son mayormente acuáticos, sésiles, filtradores activos o pasivos. Este artículo propone y discute algunas generalizaciones sobre la forma que aparentemente están relacionadas con el modo de vida colonial sésil. A diferencia del tamaño de las formas unitarias relacionadas, los módulos son pequeños, maximizando la superficie de alimentación relativa a la masa metabólica y favoreciendo la producción de un alto excedente energético. El aumento de la integración colonial en ascidias e hidroides se asocia con una disminución del tamaño del módulo, pero en los briozoos, con el lófor como índice, con algún aumento de tamaño. Los lóforos más pequeños se encuentran en especies con ramificación aparentemente primitiva, casi lineal. Entre los briozoos con colonias incrustantes compactas, sin embargo, las especies con lóforos más grandes pueden superar en competencia a los vecinos adyacentes con lóforos más pequeños. El tamaño del lóforo puede ser entonces un compromiso entre la ventaja energética y la desventaja competitiva. Mientras que los filtradores internos tienden a tener módulos agrupados para producir aberturas exhalantes más grandes, favoreciendo un flujo de descarga más fuerte, en los briozoos parece ventajoso alcanzar la máxima cobertura de lóforos expandidos. En los Cheilostomata, los lóforos están generalmente muy juntos, excepto en las chimeneas excurrentes, y el tamaño y la forma de los zooides están entonces directamente vinculados a las dimensiones del lóforo. Los Bryozoa Cyclostomata, sin embargo, han evolucionado lejos de los lóforos muy juntos y los zooides quincunciales hacia arreglos fasciculados, posiblemente proporcionando canales excurrentes estructurales en un grupo que carece de la coordinación colonial para mantener chimeneas no esqueléticas. Las variaciones en la forma de la colonia están relacionadas con el modo de crecimiento, la disposición de los módulos para maximizar la filtración y las interacciones con los factores ambientales. El aumento de la superficie conduce a un aumento de la resistencia impuesta por los movimientos del agua. Esto puede imponer restricciones al crecimiento y la forma, o puede ser explotado para aumentar la filtración. Los filtradores pasivos a menudo producen colonias erectas, ramificadas y planas orientadas normales a las corrientes direccionales. Las colonias simétricas bilateralmente, en forma de plato, con zooides aguas abajo pueden ocurrir en flujo unidireccional. Las colonias de briozoos erectas son más comúnmente irregularmente enramadas o regularmente ramificadas en tres dimensiones, adaptándose entonces a flujos que varían en dirección o velocidad, o ambos.

@article{doi101098rstb19860025,
    author = "Ryland, J. S. and Warner, George F.",
    title = "Crecimiento y forma en animales modulares: ideas sobre el tamaño y la disposición de los zooides",
    year = "1986",
    journal = "Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences",
    abstract = "Resumen Los invertebrados modulares (coloniales) son mayormente acuáticos, sésiles, filtradores activos o pasivos. Este artículo propone y discute algunas generalizaciones sobre la forma que aparentemente están relacionadas con el modo de vida colonial sésil. A diferencia del tamaño de las formas unitarias relacionadas, los módulos son pequeños, maximizando la superficie de alimentación relativa a la masa metabólica y favoreciendo la producción de un alto excedente energético. El aumento de la integración colonial en ascidias e hidroides se asocia con una disminución del tamaño del módulo, pero en los briozoos, con el lófor como índice, con algún aumento de tamaño. Los lóforos más pequeños se encuentran en especies con ramificación aparentemente primitiva, casi lineal. Entre los briozoos con colonias incrustantes compactas, sin embargo, las especies con lóforos más grandes pueden superar en competencia a los vecinos adyacentes con lóforos más pequeños. El tamaño del lóforo puede ser entonces un compromiso entre la ventaja energética y la desventaja competitiva. Mientras que los filtradores internos tienden a tener módulos agrupados para producir aberturas exhalantes más grandes, favoreciendo un flujo de descarga más fuerte, en los briozoos parece ventajoso alcanzar la máxima cobertura de lóforos expandidos. En los Cheilostomata, los lóforos están generalmente muy juntos, excepto en las chimeneas excurrentes, y el tamaño y la forma de los zooides están entonces directamente vinculados a las dimensiones del lóforo. Los Bryozoa Cyclostomata, sin embargo, han evolucionado lejos de los lóforos muy juntos y los zooides quincunciales hacia arreglos fasciculados, posiblemente proporcionando canales excurrentes estructurales en un grupo que carece de la coordinación colonial para mantener chimeneas no esqueléticas. Las variaciones en la forma de la colonia están relacionadas con el modo de crecimiento, la disposición de los módulos para maximizar la filtración y las interacciones con los factores ambientales. El aumento de la superficie conduce a un aumento de la resistencia impuesta por los movimientos del agua. Esto puede imponer restricciones al crecimiento y la forma, o puede ser explotado para aumentar la filtración. Los filtradores pasivos a menudo producen colonias erectas, ramificadas y planas orientadas normales a las corrientes direccionales. Las colonias simétricas bilateralmente, en forma de plato, con zooides aguas abajo pueden ocurrir en flujo unidireccional. Las colonias de briozoos erectas son más comúnmente irregularmente enramadas o regularmente ramificadas en tres dimensiones, adaptándose entonces a flujos que varían en dirección o velocidad, o ambos.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1986.0025",
    doi = "10.1098/rstb.1986.0025",
    openalex = "W2153028084",
    references = "doi101007bf01722007"
}

Los modelos de equilibrio de flujo del metabolismo utilizan la estequiometría de las vías metabólicas, las demandas metabólicas del crecimiento y los principios de optimalidad para predecir la distribución del flujo metabólico y el crecimiento celular bajo condiciones ambientales especificadas. Estos modelos han proporcionado una interpretación mecanística de la fisiología metabólica sistémica, y también son útiles como una herramienta cuantitativa para el diseño de vías metabólicas. De estos modelos se pueden obtener predicciones cuantitativas del crecimiento celular y la secreción de productos metabólicos secundarios que son experimentalmente comprobables. En el presente informe, utilizamos mediciones independientes para determinar los parámetros del modelo para la cepa salvaje de Escherichia coli W3110. Determinamos experimentalmente la tasa máxima de utilización de oxígeno (15 mmol de O2 por g [peso seco] por h), la tasa máxima de utilización aeróbica de glucosa (10.5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), la tasa máxima de utilización anaeróbica de glucosa (18.5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), los requisitos de mantenimiento no asociados al crecimiento (7.6 mmol de ATP por g [peso seco] por h) y los requisitos de mantenimiento asociados al crecimiento (13 mmol de ATP por g de biomasa). El modelo de equilibrio de flujo especificado por estos parámetros se encontró que predice cuantitativamente las tasas de absorción de glucosa y oxígeno, así como las tasas de secreción de acetato observadas en experimentos de quimostato. Hemos formulado un algoritmo predictivo para aplicar el modelo de equilibrio de flujo a describir el crecimiento en estado no estacionario y la secreción de productos secundarios en cultivos por lotes aeróbicos, por lotes alimentados y por lotes anaeróbicos. En experimentos aeróbicos observamos la secreción de acetato, su acumulación en el medio de cultivo y su reutilización desde el medio de cultivo. En cultivos por lotes alimentados, el acetato es cometabolizado con glucosa durante la parte final del período de cultivo.(RESUMEN TRUNCADO EN 250 PALABRAS)

@article{doi101128aem6010372437311994,
    author = "Varma, Amit y Palsson, Bernhard Ø.",
    title = "Los modelos de equilibrio de flujo estequiométricos predicen cuantitativamente el crecimiento y la secreción de productos metabólicos secundarios en la cepa salvaje Escherichia coli W3110",
    year = "1994",
    journal = "Applied and Environmental Microbiology",
    abstract = "Los modelos de equilibrio de flujo del metabolismo utilizan la estequiometría de las vías metabólicas, las demandas metabólicas del crecimiento y los principios de optimalidad para predecir la distribución del flujo metabólico y el crecimiento celular bajo condiciones ambientales especificadas. Estos modelos han proporcionado una interpretación mecanística de la fisiología metabólica sistémica, y también son útiles como una herramienta cuantitativa para el diseño de vías metabólicas. De estos modelos se pueden obtener predicciones cuantitativas del crecimiento celular y la secreción de productos metabólicos secundarios que son experimentalmente comprobables. En el presente informe, utilizamos mediciones independientes para determinar los parámetros del modelo para la cepa salvaje de Escherichia coli W3110. Determinamos experimentalmente la tasa máxima de utilización de oxígeno (15 mmol de O2 por g [peso seco] por h), la tasa máxima de utilización aeróbica de glucosa (10.5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), la tasa máxima de utilización anaeróbica de glucosa (18.5 mmol de Glc por g [peso seco] por h), los requisitos de mantenimiento no asociados al crecimiento (7.6 mmol de ATP por g [peso seco] por h) y los requisitos de mantenimiento asociados al crecimiento (13 mmol de ATP por g de biomasa). El modelo de equilibrio de flujo especificado por estos parámetros se encontró que predice cuantitativamente las tasas de absorción de glucosa y oxígeno, así como las tasas de secreción de acetato observadas en experimentos de quimostato. Hemos formulado un algoritmo predictivo para aplicar el modelo de equilibrio de flujo a describir el crecimiento en estado no estacionario y la secreción de productos secundarios en cultivos por lotes aeróbicos, por lotes alimentados y por lotes anaeróbicos. En experimentos aeróbicos observamos la secreción de acetato, su acumulación en el medio de cultivo y su reutilización desde el medio de cultivo. En cultivos por lotes alimentados, el acetato es cometabolizado con glucosa durante la parte final del período de cultivo.(RESUMEN TRUNCADO EN 250 PALABRAS)",
    url = "https://doi.org/10.1128/aem.60.10.3724-3731.1994",
    doi = "10.1128/aem.60.10.3724-3731.1994",
    openalex = "W2143861551"
}

La vida es el fenómeno físico más complejo del Universo, manifestando una diversidad extraordinaria de forma y función a una escala enorme, desde los animales y plantas más grandes hasta los microbios más pequeños y las unidades subcelulares. A pesar de esto, muchos de sus fenómenos más fundamentales y complejos escalan con el tamaño de una manera sorprendentemente simple. Por ejemplo, la tasa metabólica escala como la potencia de 3/4 de la masa a lo largo de 27 órdenes de magnitud, desde niveles moleculares e intracelulares hasta los organismos más grandes. De manera similar, las escalas de tiempo (como la esperanza de vida y las tasas de crecimiento) y los tamaños (como las longitudes del genoma bacteriano, las alturas de los árboles y las densidades mitocondriales) escalan con exponentes que son típicamente potencias simples de 1/4. La universalidad y la simplicidad de estas relaciones sugieren que principios universales fundamentales subyacen a gran parte de la estructura y organización genérica de los sistemas vivos. Hemos propuesto un conjunto de principios basados en la observación de que casi toda la vida se sostiene mediante redes jerárquicas ramificadas, que asumimos tienen unidades terminales invariantes, son rellenas de espacio y se optimizan mediante el proceso de selección natural. Mostramos cómo estas restricciones generales explican la escalado de potencia de cuarto y conducen a una teoría cuantitativa y predictiva que captura muchas de las características esenciales de diversos sistemas biológicos. Los ejemplos considerados incluyen los sistemas circulatorios animales, los sistemas vasculares de las plantas, el crecimiento, las densidades mitocondriales y el concepto de un reloj molecular universal. Se discuten consideraciones de temperatura, dimensionalidad y el papel de los invariantes. También se abordan las críticas y controversias asociadas con este enfoque.

@article{doi101242jeb01589,
    author = "West, Geoffrey B. y Brown, James H.",
    title = "El origen de las leyes de escala alométrica en la biología desde los genomas hasta los ecosistemas: hacia una teoría unificadora cuantitativa de la estructura y organización biológica",
    year = "2005",
    journal = "Journal of Experimental Biology",
    abstract = "La vida es el fenómeno físico más complejo del Universo, manifestando una diversidad extraordinaria de forma y función a una escala enorme, desde los animales y plantas más grandes hasta los microbios más pequeños y las unidades subcelulares. A pesar de esto, muchos de sus fenómenos más fundamentales y complejos escalan con el tamaño de una manera sorprendentemente simple. Por ejemplo, la tasa metabólica escala como la potencia de 3/4 de la masa a lo largo de 27 órdenes de magnitud, desde niveles moleculares e intracelulares hasta los organismos más grandes. De manera similar, las escalas de tiempo (como la esperanza de vida y las tasas de crecimiento) y los tamaños (como las longitudes del genoma bacteriano, las alturas de los árboles y las densidades mitocondriales) escalan con exponentes que son típicamente potencias simples de 1/4. La universalidad y la simplicidad de estas relaciones sugieren que principios universales fundamentales subyacen a gran parte de la estructura y organización genérica de los sistemas vivos. Hemos propuesto un conjunto de principios basados en la observación de que casi toda la vida se sostiene mediante redes jerárquicas ramificadas, que asumimos tienen unidades terminales invariantes, son rellenas de espacio y se optimizan mediante el proceso de selección natural. Mostramos cómo estas restricciones generales explican la escalado de potencia de cuarto y conducen a una teoría cuantitativa y predictiva que captura muchas de las características esenciales de diversos sistemas biológicos. Los ejemplos considerados incluyen los sistemas circulatorios animales, los sistemas vasculares de las plantas, el crecimiento, las densidades mitocondriales y el concepto de un reloj molecular universal. Se discuten consideraciones de temperatura, dimensionalidad y el papel de los invariantes. También se abordan las críticas y controversias asociadas con este enfoque.",
    url = "https://doi.org/10.1242/jeb.01589",
    doi = "10.1242/jeb.01589",
    openalex = "W2117184765",
    references = "doi101001jama196203050110085031, doi101016jresp200401006, doi101017cbo9780511608551, doi101021j150446a008, doi10103835098076, doi101113jphysiol1952sp004719, doi101119113295, doi101126science1061967, doi101126science2765309122, doi101126science28454201677, doi103733hilgv06n11p315, openalexw1558456135"
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@misc{crossref2007bioenergetics,
    title = "Bioenergética y Metabolismo",
    year = "2007",
    booktitle = "Principios y Práctica del Entrenamiento de Resistencia",
    url = "https://doi.org/10.5040/9781492596875.part-002",
    doi = "10.5040/9781492596875.part-002",
    openalex = "W4251395485",
    pages = "61-62"
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La regulación dependiente de la tasa de crecimiento del tamaño celular, el contenido ribosomal y la eficiencia metabólica sigue un patrón común en organismos unicelulares: con tasas de crecimiento crecientes, aumenta el tamaño celular y el contenido ribosomal, y se produce un cambio hacia un metabolismo energéticamente ineficiente. Estos dos últimos fenómenos también se observan en células tumorales y líneas celulares de rápido crecimiento. Estos patrones sugieren un principio fundamental de diseño. En biología, tales diseños a menudo pueden entenderse como el resultado de la optimización de la aptitud. Aquí mostramos que en modelos básicos de sistemas de autorreplicación, estos patrones son consecuencia de maximizar la tasa de crecimiento. Mientras que la mayoría de los modelos de crecimiento celular consideran una parte de la fisiología, por ejemplo solo el metabolismo, el enfoque presentado aquí integra varios subsistemas en un sistema completo de autorreplicación. Tales modelos pueden producir estrategias óptimas fundamentalmente diferentes. En particular, se muestra cómo el cambio en la eficiencia metabólica surge de una compensación entre las inversiones en la síntesis de enzimas y los rendimientos metabólicos para vías catabólicas alternativas. Los modelos aclaran cómo la optimización del crecimiento por selección natural moldea las estrategias de crecimiento.

@article{doi101038msb200982,
    author = "Molenaar, Douwe and van Berlo, Rogier and de Ridder, Dick and Teusink, Bas",
    title = "Shifts in growth strategies reflect tradeoffs in cellular economics",
    year = "2009",
    journal = "Molecular Systems Biology",
    abstract = "The growth rate-dependent regulation of cell size, ribosomal content, and metabolic efficiency follows a common pattern in unicellular organisms: with increasing growth rates, cell size and ribosomal content increase and a shift to energetically inefficient metabolism takes place. The latter two phenomena are also observed in fast growing tumour cells and cell lines. These patterns suggest a fundamental principle of design. In biology such designs can often be understood as the result of the optimization of fitness. Here we show that in basic models of self-replicating systems these patterns are the consequence of maximizing the growth rate. Whereas most models of cellular growth consider a part of physiology, for instance only metabolism, the approach presented here integrates several subsystems to a complete self-replicating system. Such models can yield fundamentally different optimal strategies. In particular, it is shown how the shift in metabolic efficiency originates from a tradeoff between investments in enzyme synthesis and metabolic yields for alternative catabolic pathways. The models elucidate how the optimization of growth by natural selection shapes growth strategies.",
    url = "https://doi.org/10.1038/msb.2009.82",
    doi = "10.1038/msb.2009.82",
    openalex = "W2107275175",
    references = "doi101016jccr200604023, doi101016jcell200808021, doi101038nrmicro1023, doi101073pnas91156808, doi10109900221287193592, doi101126science1058079, doi101126science1233191309, doi101126science2785338680, doi101128aem6010372437311994, doi101146annurevmi03100149002103"
}

@article{bouillaud2010ucp2,
    author = "Bouillaud, Frédéric y Pecqueur, Claire",
    title = "Bioenergética y metabolismo de UCP2",
    year = "2010",
    journal = "Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergética",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2010.04.252",
    doi = "10.1016/j.bbabio.2010.04.252",
    openalex = "W2000325152",
    pages = "84",
    volume = "1797"
}

El metabolismo genera radicales de oxígeno, que contribuyen a mutaciones oncogénicas. Los oncogenes activados y la pérdida de supresores de tumores, a su vez, alteran el metabolismo e inducen glucólisis aeróbica. La glucólisis aeróbica o el efecto Warburg vincula la alta tasa de fermentación de glucosa con el cáncer. Juntamente con la glutamina, la glucosa mediante la glucólisis proporciona los esqueletos de carbono, NADPH y ATP para construir nuevas células cancerosas, que persisten en hipoxia que, a su vez, reconfigura las vías metabólicas para el crecimiento y supervivencia celular. El exceso de ingesta calórica se asocia con un mayor riesgo de cáncer, mientras que la restricción calórica es protectora, quizás mediante la eliminación de mitocondrias o mitofagia, reduciendo así el estrés oxidativo. Por lo tanto, los enlaces entre el metabolismo y el cáncer son multifacéticos, abarcando desde la baja incidencia de cáncer en mamíferos grandes con bajas tasas metabólicas específicas hasta el metabolismo alterado de células cancerosas resultante de enzimas mutadas o genes cancerígenos.

@article{doi101101gad189365112,
    author = "Dang, Chi V.",
    title = "Enlaces entre el metabolismo y el cáncer",
    year = "2012",
    journal = "Genes \& Desarrollo",
    abstract = "El metabolismo genera radicales de oxígeno, que contribuyen a mutaciones oncogénicas. Los oncogenes activados y la pérdida de supresores de tumores, a su vez, alteran el metabolismo e inducen glucólisis aeróbica. La glucólisis aeróbica o el efecto Warburg vincula la alta tasa de fermentación de glucosa con el cáncer. Juntamente con la glutamina, la glucosa mediante la glucólisis proporciona los esqueletos de carbono, NADPH y ATP para construir nuevas células cancerosas, que persisten en hipoxia que, a su vez, reconfigura las vías metabólicas para el crecimiento y supervivencia celular. El exceso de ingesta calórica se asocia con un mayor riesgo de cáncer, mientras que la restricción calórica es protectora, quizás mediante la eliminación de mitocondrias o mitofagia, reduciendo así el estrés oxidativo. Por lo tanto, los enlaces entre el metabolismo y el cáncer son multifacéticos, abarcando desde la baja incidencia de cáncer en mamíferos grandes con bajas tasas metabólicas específicas hasta el metabolismo alterado de células cancerosas resultante de enzimas mutadas o genes cancerígenos.",
    url = "https://doi.org/10.1101/gad.189365.112",
    doi = "10.1101/gad.189365.112",
    openalex = "W2105665764",
    references = "doi101016jcellsig201201008, doi101016jcmet200602002, doi101038nature08617, doi101038nrc2981, doi101038nrc3038, doi101038nrm3025, doi101056nejmoa0808710, doi101126science1160809, doi101126science1164382, doi101126science1233191309"
}

El crecimiento es un proceso fundamental de la vida. Los requisitos de crecimiento están bien caracterizados experimentalmente para muchos microbios; sin embargo, carecemos de un modelo unificado para el crecimiento celular. Un modelo de este tipo debe ser predictivo de los eventos a escala molecular y capaz de explicar el comportamiento de alto nivel de la célula en su conjunto. Aquí, construimos un modelo ME para Escherichia coli, un modelo a escala genómica que integra de manera fluida las vías de expresión de productos metabólicos y génicos. El modelo calcula ~80% del proteoma funcional (por masa), que es utilizado por la célula para soportar el crecimiento bajo una condición dada. El metabolismo y la expresión génica son procesos interdependientes que se afectan y limitan mutuamente. Formalizamos estas restricciones y aplicamos el principio de optimización del crecimiento para permitir la predicción precisa de fenotipos multiescala, que van desde los de grano grueso (tasa de crecimiento, absorción de nutrientes, secreción de subproductos) hasta los de grano fino (flujos metabólicos, niveles de expresión génica). Nuestros resultados unifican muchos principios existentes desarrollados para describir el crecimiento bacteriano.

@article{doi101038msb201352,
    author = "O'Brien, Edward J. y Lerman, Joshua A. y Chang, Roger L. y Hyduke, Daniel R. y Palsson, Bernhard Ø.",
    title = "Modelos a escala genómica del metabolismo y la expresión génica extienden y refinan la predicción del fenotipo de crecimiento",
    year = "2013",
    journal = "Molecular Systems Biology",
    abstract = "El crecimiento es un proceso fundamental de la vida. Los requisitos de crecimiento están bien caracterizados experimentalmente para muchos microbios; sin embargo, carecemos de un modelo unificado para el crecimiento celular. Un modelo de este tipo debe ser predictivo de los eventos a escala molecular y capaz de explicar el comportamiento de alto nivel de la célula en su conjunto. Aquí, construimos un modelo ME para Escherichia coli, un modelo a escala genómica que integra de manera fluida las vías de expresión de productos metabólicos y génicos. El modelo calcula \textasciitilde 80% del proteoma funcional (por masa), que es utilizado por la célula para soportar el crecimiento bajo una condición dada. El metabolismo y la expresión génica son procesos interdependientes que se afectan y limitan mutuamente. Formalizamos estas restricciones y aplicamos el principio de optimización del crecimiento para permitir la predicción precisa de fenotipos multiescala, que van desde los de grano grueso (tasa de crecimiento, absorción de nutrientes, secreción de subproductos) hasta los de grano fino (flujos metabólicos, niveles de expresión génica). Nuestros resultados unifican muchos principios existentes desarrollados para describir el crecimiento bacteriano.",
    url = "https://doi.org/10.1038/msb.2013.52",
    doi = "10.1038/msb.2013.52",
    openalex = "W2122860350",
    references = "doi101038msb200982"
}

Las bacterias deben adaptar constantemente su crecimiento a los cambios en la disponibilidad de nutrientes; sin embargo, a pesar de los cambios a gran escala en la expresión de proteínas asociados con la detección, la adaptación y el procesamiento de diferentes nutrientes ambientales, las leyes de crecimiento simples conectan la abundancia de ribosomas y la tasa de crecimiento. Aquí, investigamos el origen de estas leyes de crecimiento analizando las características de la regulación ribosómica que coordinan los cambios en la expresión a nivel proteómico con el crecimiento celular en una variedad de condiciones de nutrientes en el organismo modelo Escherichia coli. Identificamos la activación feedforward impulsada por el suministro de la síntesis de proteínas ribosómicas como el motivo regulatorio clave que maximiza el flujo de aminoácidos y guía autónomamente a una célula para lograr un crecimiento óptimo en diferentes entornos. Las leyes de crecimiento surgen naturalmente de la estrategia regulatoria robusta subyacente al control de la tasa de crecimiento, independientemente de los detalles de la implementación molecular. El estudio destaca la interacción entre el modelado fenomenológico y los mecanismos moleculares en la revelación de restricciones operativas fundamentales, con implicaciones para el diseño endógeno y sintético de microorganismos.

@article{doi1015252msb20145379,
    author = "Scott, Matthew P. y Klumpp, Stefan y Mateescu, Eduard M. y Hwa, Terence",
    title = "Emergence of robust growth laws from optimal regulation of ribosome synthesis",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Systems Biology",
    abstract = "Las bacterias deben adaptar constantemente su crecimiento a los cambios en la disponibilidad de nutrientes; sin embargo, a pesar de los cambios a gran escala en la expresión de proteínas asociados con la detección, la adaptación y el procesamiento de diferentes nutrientes ambientales, las leyes de crecimiento simples conectan la abundancia de ribosomas y la tasa de crecimiento. Aquí, investigamos el origen de estas leyes de crecimiento analizando las características de la regulación ribosómica que coordinan los cambios en la expresión a nivel proteómico con el crecimiento celular en una variedad de condiciones de nutrientes en el organismo modelo Escherichia coli. Identificamos la activación feedforward impulsada por el suministro de la síntesis de proteínas ribosómicas como el motivo regulatorio clave que maximiza el flujo de aminoácidos y guía autónomamente a una célula para lograr un crecimiento óptimo en diferentes entornos. Las leyes de crecimiento surgen naturalmente de la estrategia regulatoria robusta subyacente al control de la tasa de crecimiento, independientemente de los detalles de la implementación molecular. El estudio destaca la interacción entre el modelado fenomenológico y los mecanismos moleculares en la revelación de restricciones operativas fundamentales, con implicaciones para el diseño endógeno y sintético de microorganismos.",
    url = "https://doi.org/10.15252/msb.20145379",
    doi = "10.15252/msb.20145379",
    openalex = "W2111354165",
    references = "doi101038msb200982"
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Introducción John Tyler Bonner VII 1. Introductorio 2. Sobre la magnitud 3. Las formas de las células 4. Las formas de los tejidos, de los agregados celulares 5. Sobre las espículas y los esqueletos espiculados 6. La espiral equiangular 7. Las formas de los cuernos y de los dientes o colmillos 8. Sobre la forma y la eficiencia mecánica 9. Sobre la teoría de las transformaciones, o la comparación de formas relacionadas 10. Epílogo Índice.

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    author = "Thompson, D’Arcy Wentworth",
    title = "On Growth and Form, 1917",
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@incollection{chatterjee2023bioenergetics,
    author = "Chatterjee, Sankar",
    title = "Bioenergética y Metabolismo Primitivo",
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