Biochronologie

@incollection{crossref1978biochronology,
    title = "Biochronologie",
    year = "1978",
    booktitle = "Contributions to the Geologic Time Scale",
    url = "https://doi.org/10.1306/st6398c4",
    doi = "10.1306/st6398c4",
    pages = "39-55"
}

@article{lewin1985molecular,
    author = "Lewin, Roger",
    title = "Molecular Clocks Scrutinized",
    year = "1985",
    journal = "Science",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.3983640",
    doi = "10.1126/science.3983640",
    number = "4699",
    pages = "571-571",
    volume = "228"
}

@misc{lewin1985molecular2,
    author = "Lewin, R",
    title = "Les horloges moléculaires examinées de près",
    year = "1985",
    howpublished = "Science, v. 228, p. 571",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Lewin, R., 1985, Les horloges moléculaires examinées de près : Science, v. 228, p. 571.}"
}

@article{bralower1993towards,
    author = "{BRALOWER, T. J., S. E. MOCK, J. H.}",
    title = "Vers une biochronologie morphométrique",
    year = "1993",
    journal = "AAPG Bulletin",
    url = "https://doi.org/10.1306/d9cb52af-1715-11d7-8645000102c1865d",
    doi = "10.1306/d9cb52af-1715-11d7-8645000102c1865d",
    volume = "77"
}

@article{hall1998molecular,
    author = "Hall, Jeffrey C et Sassone-Corsi, Paolo",
    title = "Molecular clocks",
    year = "1998",
    journal = "Current Opinion in Neurobiology",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0959-4388(98)80091-3",
    doi = "10.1016/s0959-4388(98)80091-3",
    number = "5",
    pages = "633-634",
    volume = "8"
}

@incollection{albright2000biostratigraphy,
    author = "Albright, III, L. Barry",
    title = "Biostratigraphie et Biochronologie",
    year = "2000",
    booktitle = "Biostratigraphie et Paléontologie des Vertébrés des Badlands de San Timoteo, Californie du Sud",
    url = "https://doi.org/10.1525/california/9780520098367.003.0003",
    doi = "10.1525/california/9780520098367.003.0003",
    pages = "8-21"
}

Des molécules telles que les protéines et l'ADN évoluent au fil du temps en conséquence de la fixation de mutations dans l'ADN. L'évolution moléculaire s'est révélée être approximativement constante entre les espèces, un phénomène connu sous le nom d'horloge moléculaire.

@misc{martin2001molecular,
    author = "Martin, Andrew Peter",
    title = "Horloges moléculaires",
    year = "2001",
    booktitle = "Encyclopédie des sciences de la vie",
    abstract = "Des molécules telles que les protéines et l'ADN évoluent au fil du temps en conséquence de la fixation de mutations dans l'ADN. L'évolution moléculaire s'est révélée être approximativement constante entre les espèces, un phénomène connu sous le nom d'horloge moléculaire.",
    url = "https://doi.org/10.1038/npg.els.0001669",
    doi = "10.1038/npg.els.0001669"
}

Une méthode de spectrométrie de masse pratique et précise pour la mesure des taux de déamidation des résidus glutaminyl et asparaginyl dans les peptides et les protéines a été développée ; les taux de déamidation de 306 séquences asparaginyl dans des peptides modèles à pH 7,4, 37,0°C, dans un tampon Tris⋅HCl 0,15 M ont été déterminés ; une bibliothèque de 913 peptides contenant des amides pour utilisation par d'autres chercheurs dans des études similaires a été établie ; et, grâce à des mesures simultanées des taux de déamidation de l'aldolase de muscle de lapin et de peptides modèles appropriés dans les mêmes solutions, l'utilisation de cette méthode pour la mesure quantitative des effets relatifs de la structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire des protéines sur les taux de déamidation a été démontrée. Les taux mesurés sont discutés par rapport à l'hypothèse selon laquelle les résidus glutaminyl et asparaginyl servent, par déamidation, de chronomètres moléculaires d'événements biologiques.

@article{robinson2001molecular,
    author = "Robinson, Noah E. et Robinson, Arthur B.",
    title = "Molecular clocks",
    year = "2001",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Une méthode de spectrométrie de masse pratique et précise pour la mesure des taux de déamidation des résidus glutaminyl et asparaginyl dans les peptides et les protéines a été développée ; les taux de déamidation de 306 séquences asparaginyl dans des peptides modèles à pH 7,4, 37,0°C, dans un tampon Tris⋅HCl 0,15 M ont été déterminés ; une bibliothèque de 913 peptides contenant des amides pour utilisation par d'autres chercheurs dans des études similaires a été établie ; et, grâce à des mesures simultanées des taux de déamidation de l'aldolase de muscle de lapin et de peptides modèles appropriés dans les mêmes solutions, l'utilisation de cette méthode pour la mesure quantitative des effets relatifs de la structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire des protéines sur les taux de déamidation a été démontrée. Les taux mesurés sont discutés par rapport à l'hypothèse selon laquelle les résidus glutaminyl et asparaginyl servent, par déamidation, de chronomètres moléculaires d'événements biologiques.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.98.3.944",
    doi = "10.1073/pnas.98.3.944",
    number = "3",
    pages = "944-949",
    volume = "98"
}

Des molécules telles que les protéines et l'ADN évoluent au fil du temps en conséquence de la fixation de mutations dans l'ADN. L'évolution moléculaire s'est révélée être approximativement constante entre les espèces, un phénomène connu sous le nom d'horloge moléculaire.

@misc{martin2007molecular,
    author = "Martin, Andrew Peter",
    title = "Horloges moléculaires",
    year = "2007",
    booktitle = "Encyclopédie des sciences de la vie",
    abstract = "Des molécules telles que les protéines et l'ADN évoluent au fil du temps en conséquence de la fixation de mutations dans l'ADN. L'évolution moléculaire s'est révélée être approximativement constante entre les espèces, un phénomène connu sous le nom d'horloge moléculaire.",
    url = "https://doi.org/10.1002/9780470015902.a0001669.pub2",
    doi = "10.1002/9780470015902.a0001669.pub2"
}

@article{kushmerick2009molecular,
    author = "Kushmerick, James",
    title = "Transistors moléculaires examinés de près",
    year = "2009",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/462994a",
    doi = "10.1038/462994a",
    number = "7276",
    pages = "994-995",
    volume = "462"
}

@incollection{ho2013molecular,
    author = "Ho, Simon Y. W.",
    title = "Horloges moléculaires",
    year = "2013",
    booktitle = "Encyclopédie des méthodes de datation scientifique",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-007-6326-5\_92-2",
    doi = "10.1007/978-94-007-6326-5\_92-2",
    pages = "1-9"
}

@misc{bell2014molecular,
    author = "Bell, Charles D.",
    title = "Molecular Clocks",
    year = "2014",
    booktitle = "Oxford Bibliographies Online Datasets",
    url = "https://doi.org/10.1093/obo/9780199941728-0048",
    doi = "10.1093/obo/9780199941728-0048"
}

@incollection{ho2015molecular,
    author = "Ho, Simon Y. W. et Endicott, Phillip",
    title = "Molecular Clocks, Human Evolution",
    year = "2015",
    booktitle = "Encyclopedia of Earth Sciences Series",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-007-6304-3\_79",
    doi = "10.1007/978-94-007-6304-3\_79",
    pages = "588-591"
}

@article{lee2016molecular,
    author = "Lee, Michael S.Y. et Ho, Simon Y.W.",
    title = "Horloges moléculaires",
    year = "2016",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2016.03.071",
    doi = "10.1016/j.cub.2016.03.071",
    number = "10",
    pages = "R399-R402",
    volume = "26"
}

La position géographique de la Turquie entre l'Europe, l'Asie et l'Afrique lui confère une importance cruciale pour comprendre les dynamiques locales, interrégionales et intercontinentales de l'évolution des vertébrés au Néogène. Bien que riche en dépôts de fossiles de vertébrés couvrant le Miocène moyen et supérieur, la géochronologie associée a été limitée par le manque de matériaux volcaniques disponibles permettant la datation radioisotopique et la corrélation géochimique. En conséquence, l'étalonnage de l'évolution des mammifères a été largement restreint à l'application semi-circulaire des inférences paléomagnétiques combinées à des déductions biochronologiques mal contraintes temporellement et géographiquement éloignées. Par exemple, les fossiles de trois localités grecques et d'une localité anatolienne attribués au genre de primate Ouranopithecus manquent d'échantillons datables, laissant ses âges mal contraints. L'étalonnage chronologique basé sur les résultats de 40Ar/39Ar rapportés ici démontre comment une géochronologie de précision axée sur la faune peut améliorer la compréhension des lignées d'espèces en évolution et des écosystèmes qu'elles composent.

@article{doi101073pnas2424428122,
    author = "Tholt, Andrew et Başoğlu, Okşan et Bektaş, Yener et Bernor, Raymond et Carlson, Joshua P et Dağ, Ömer et Doğan, Uğur et Erkman, Ahmet Cem et Kaya, Ferhat et Kaymakçı, Nuretdin et Gözlük Kırmızıoğlu, Pınar et Meijers, Maud J M et Parıldar, Özge Kahya et Pehlevan, Cesur et Şimşek, Emrah et White, Tim et Renne, Paul",
    title = "Building better biochronology: New fossils and 40Ar/39Ar radioisotopic dates from Central Anatolia.",
    year = "2025",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America",
    abstract = "La position géographique de la Turquie entre l'Europe, l'Asie et l'Afrique lui confère une importance cruciale pour comprendre les dynamiques locales, interrégionales et intercontinentales de l'évolution des vertébrés au Néogène. Bien que riche en dépôts de fossiles de vertébrés couvrant le Miocène moyen et supérieur, la géochronologie associée a été limitée par le manque de matériaux volcaniques disponibles permettant la datation radioisotopique et la corrélation géochimique. En conséquence, l'étalonnage de l'évolution des mammifères a été largement restreint à l'application semi-circulaire des inférences paléomagnétiques combinées à des déductions biochronologiques mal contraintes temporellement et géographiquement éloignées. Par exemple, les fossiles de trois localités grecques et d'une localité anatolienne attribués au genre de primate Ouranopithecus manquent d'échantillons datables, laissant ses âges mal contraints. L'étalonnage chronologique basé sur les résultats de 40Ar/39Ar rapportés ici démontre comment une géochronologie de précision axée sur la faune peut améliorer la compréhension des lignées d'espèces en évolution et des écosystèmes qu'elles composent.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11962512/",
    doi = "10.1073/pnas.2424428122",
    pmcid = "PMC11962512",
    pmid = "40096598"
}