Bioherms

Nous avons effectué des estimations de la production annuelle de boue d'aragonite fine (14 déterminations d'âge d'échantillons de sous-surface. En ne considérant que la production dans les zones de dépôt maximal de boue, nous avons calculé que depuis que les zones ont été inondées par la montée du niveau de la mer il y a 4000 à 10 000 ans, le taux actuel de production par Penicillus sp. pourrait expliquer toute la boue d'aragonite fine dans le récif de Floride intérieur et un tiers du même matériau dans la baie de Floride du nord-est. La production de boue d'aragonite par Penicillus sp. fournit une base pour évaluer la production d'autres algues similaires. Dans le récif et les marges sud-est et ouest de la baie de Floride, deux autres algues vertes apparentées sont ensemble plus abondantes que Penicillus sp ; dans la baie de Floride du nord-est, une algue est plus abondante que Penicillus. Une autre source de boue de calcaire fine est la décomposition biologique et mécanique de squelettes résistants, mollusques, algues, coraux, etc. Cette décomposition donne un limon squelettique reconnaissable (15-62mu), mais des particules plus fines appréciables (

@article{doi10130674d7173a2b2111d78648000102c1865d,
    author = "Stockman, R. N. Ginsburg K. W.",
    title = "The Production of Lime Mud by Algae in South Florida",
    year = "1967",
    journal = "Journal of Sedimentary Research",
    abstract = "We have made estimates of the annual production of fine aragonite mud (14 age determinations of subsurface samples. Considering only production within the areas of maximum mud accumulation, we calculated that since the areas were flooded by rising sea level 4000 to 10,000 years ago, the present rate of production by Penicillus sp. could account for all the fine aragonite mud in the inner Florida Reef Tract and one,third of the same material in northeastern Florida Bay. The production of aragonite mud by Penicillus sp. provides a base line for evaluating the production of other similar algae. In the reef tract and the southeastern and western margins of Florida Bay, two other related green algae together are more abundant than Penicillus sp, in northeastern Florida Bay, one alga is more abundant than Penicillus. Another source of fine lime mud is the biological and mechanical breakdown of resistant skeletons, mollusks, algae, corals, etc. This breakdown gives recognizable skeletal silt (15-62mu), but appreciable finer particles (",
    url = "https://doi.org/10.1306/74d7173a-2b21-11d7-8648000102c1865d",
    doi = "10.1306/74d7173a-2b21-11d7-8648000102c1865d",
    openalex = "W2159278218"
}

Résumé 1. Le classique « problème des récifs coralliens » concernait les relations géologiques des récifs en tant que caractéristiques topographiques majeures ; les études coralliennes modernes considèrent les récifs à la fois comme des systèmes biologiques complexes à haute productivité et comme des structures géologiques formant un cadre et étant modifiées par la croissance des coraux. 2. Les forages profonds dans les récifs ont confirmé de manière concluante les arguments généraux de Darwin, selon lesquels les récifs océaniques se sont développés par subsidence progressive de leurs fondations. Darwin n'a pas tenu compte des changements du niveau de la mer au Pléistocène et de leurs effets sur les caractéristiques de surface actuelles des récifs. La théorie alternative de Daly, le « contrôle glaciaire », reposait sur des hypothèses fausses concernant les taux d'érosion marine pendant les périodes glaciaires, mais si le niveau de la mer au Holocène était plus élevé qu'actuellement, comme Daly le supposait également, les effets sur les caractéristiques des récifs seraient profonds. 3. Les récifs sont des systèmes biologiques complexes en eaux tropicales, dominés par les coraux scléractiniens. Les faunes coralliennes sont plus importantes et plus diversifiées dans l'Indo‐Pacifique qu' dans l'Atlantique. Les coraux hermatypiques sont limités aux eaux peu profondes par les exigences lumineuses de leurs algues symbiotiques, mais la température est un facteur de contrôle majeur des distributions mondiales. La tolérance des coraux à la température, à la salinité et aux sédiments est plus large qu'on ne le pensait auparavant, et les coraux peuvent survivre à une brève émergence, sauf lorsqu'elle coïncide avec de fortes précipitations. La turbulence de l'eau est un contrôle écologique important, mais difficile à mesurer. 4. Le statut trophique des coraux reste incertain, mais malgré leur spécialisation anatomique et physiologique en tant que carnivores, il est probable qu'ils tirent certaines substances nutritives des zooxanthelles. Les suggestions selon lesquelles les algues filamenteuses dans les têtes de corail jouent un rôle majeur dans l'économie des coraux n'ont pas été soutenues par des travaux ultérieurs, mais les pyramides de biomasse construites sur la base des travaux d'Odum et Odum restent les seules disponibles. La plupart des récifs sont apparemment autotrophes, avec une fixation de 1500–3500 g de carbone par m² par an. 5. Peu d'animaux mangent des coraux, ce qui peut expliquer leur succès. Les prédateurs importants sont les poissons et l'échinoderme Acanthaster. Les estimations quantitatives de l'érosion biogénique des squelettes organiques sur les récifs sont élevées. Les poissons affectent non seulement les coraux, mais aussi d'autres invertébrés, algues et phanérogames marines. 6. Les coraux peuvent être tués par l'« eau sombre », des pluies intenses ou les eaux de crue des rivières, des mouvements terrestres, des interférences humaines et surtout des ouragans. La récupération des récifs après les ouragans peut prendre 10 à 20 ans. 7. En plus des récifs frangeants, barrières et atolls, des types intermédiaires sont reconnus. Les principaux types peuvent consister en des récifs linéaires ou des faros. Les petits récifs de lagune incluent des pinnacles, des taches et des plateformes, ainsi que des buttes submergées. Des motifs de récifs cellulaires complexes ou en maille sont également observés. 8. Les récifs sont remarquablement zonés, à la fois latéralement en réponse à l'exposition changeante aux vagues pour former des récifs sous le vent et au vent, et transversalement, en raison de gradients environnementaux raides à travers les bancs de récifs de la mer à la lagune. Les zones topographiques et écologiques peuvent être caractérisées par des espèces coralliennes particulières, mais celles-ci varient considérablement d'un récif à l'autre. Une distinction majeure peut être faite entre les récifs avec et sans crêtes algales, qui sont courantes sur les récifs des vents alizés en haute mer, dans l'Indo‐Pacifique, mais absentes sur les récifs des Caraïbes et sur les récifs indo‐paciens dans des eaux plus abritées. Les gorgonaires sont courantes sur les récifs des Caraïbes, les alcyonacés dans l'Indo‐Pacifique. 9. Une grande partie de la difficulté à comparer les récifs provient du manque d'uniformité des méthodes d'enquête. Les problèmes de description des motifs tridimensionnels complexes des organismes sur les récifs n'ont pas encore été résolus, et par conséquent peu de progrès ont été réalisés dans l'explication de ces motifs. L'explication en termes de contrôles environnementaux simples est insuffisante. 10. La compréhension de la distribution des coraux est rendue plus difficile à la fois par les problèmes taxonomiques et par la plasticité de la forme de croissance dans différentes situations. 11. La croissance des coraux et des récifs peut être estimée en mesurant la croissance des colonies individuelles, en mesurant les taux de dépôt de carbonate de calcium dans le squelette, en mesurant le changement topographique sur le récif et en déduisant les taux nets de croissance des récifs à partir de preuves géologiques. Les coraux massifs peuvent augmenter de diamètre de 1 cm/an, les branches des coraux ramifiés peuvent augmenter de longueur de 10 cm/an. L'étude des taux de dépôt montre des variations au sein des colonies, entre les espèces, dans la lumière et l'ombre, et saisonnièrement. Les taux de croissance des récifs extrapolés à partir des mesures de colonies atteignent 2–5 cm/an, et contrastent avec des chiffres aussi bas que 0–02 cm/an en moyenne sur 70 millions d'années à partir de données de forages. À la fois les taux de croissance des colonies et les données géologiques suggèrent des variations mondiales dans les taux de croissance des récifs. 12. Malgré des preuves claires d'une subsidence prolongée, les caractéristiques de surface actuelles des récifs, souvent seulement finement recouvertes par des coraux modernes, ont été beaucoup affectées par les fluctuations récentes du niveau de la mer. De nombreux récifs légèrement surélevés à 2–10 m au-dessus du niveau de la mer datent de 90–160 mille ans BP ; il existe des preuves d'un niveau de la mer à environ le niveau actuel il y a 30–35 mille ans BP ; et le débat continue sur le fait que le niveau de la mer a été plus élevé qu'actuel à un moment donné depuis le début de la dernière montée du niveau de la mer il y a environ 20 000 ans. Les preuves de nombreux récifs suggèrent un niveau de la mer légèrement plus élevé au cours des 4000 dernières années, mais sur d'autres récifs de telles preuves font défaut. 13. Plusieurs caractéristiques des récifs (terrasses submergées, systèmes de rainures et épaulements, crêtes algales, bancs de récifs, blocs de récifs et îles de récifs) ont été interprétées soit comme des caractéristiques reliques datant d'un niveau de la mer plus élevé au cours des 5000 dernières années, soit comme des caractéristiques contemporaines développées en réponse aux processus actuels. Dans certains cas, les preuves sont ambiguës ; dans d'autres, il est clair que des caractéristiques diverses sont regroupées sous le même nom. Si de telles caractéristiques sont attribuables à un niveau de la mer plus élevé, celui-ci aurait pu être de l'Interglaciaire ou même de l'Interstadial le plus récent plutôt que du Holocène. 14. Un récif consiste en un cadre rigide définissant plusieurs environnements de dépôt majeurs à l'intérieur et autour de celui-ci. Les sédiments sont d'origine biologique, principalement squelettique, sauf dans des environnements inhabituels tels que les Bahama Banks. Les caractéristiques des sédiments dérivés des organismes dépendent en partie des motifs de dégradation de squelettes particuliers, en partie des processus de transport et de tri. Les sédiments fins peuvent être soit détritiques, soit des précipitations physico-chimiques. 15. Les organismes affectent les sédiments après le dépôt, par perturbation, transport et probablement comminution. Les poissons et les holothuries ont été étudiés en détail. 16. Bien que de nouvelles théories sur les récifs coralliens soient proposées de temps en temps, le besoin est moins de nouvelles théories que de procédures standardisées pour assurer la comparabilité des études sur les récifs et l'identification des variations dans les récifs à la fois à l'échelle locale et régionale. Bien que les récifs en tant que systèmes biologiques s'ajustent relativement rapidement aux changements, les récifs en tant que systèmes géologiques s'ajustent beaucoup plus lentement. En raison de l'ampleur et de la récence des fluctuations du niveau de la mer au Pléistocène, de nombreuses caractéristiques biologiques des récifs sont hors phase avec les caractéristiques géologiques héritées, et cela a conduit à beaucoup de controverses.

@article{doi101111j1469185x1969tb00609x,
    author = "Stoddart, D. R.",
    title = "ECOLOGY AND MORPHOLOGY OF RECENT CORAL REEFS",
    year = "1969",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Summary 1. The classical ‘coral reef problem’ concerned the geological relationships of reefs as major topographical features; modern coral studies consider reefs both as complex biological systems of high productivity and as geological structures forming a framework for and being modified by coral growth. 2. Deep borings in reefs have conclusively confirmed the general arguments of Darwin, that oceanic reefs developed by progressive subsidence of their foundations. Darwin failed to take account of Pleistocene changes in sea level and their effect on the present surface features of reefs. Daly's alternative ‘glacial control theory’ was based on false assumptions concerning marine erosion rates during glacial periods, but if sea level during the Holocene was higher than at present, as Daly also supposed, the effects on reef features would be profound. 3. Reefs are complex biological systems in tropical seas, dominated by scleractinian corals. Coral faunas are larger and more diverse in the Indo‐Pacific than in the Atlantic. Hermatypic corals are restricted to shallow water by the light requirements of their symbiotic algae, but temperature is a major control of worldwide distributions. Temperature, salinity and sediment tolerances of corals are wider than formerly supposed, and corals can survive brief emersion except when it coincides with heavy rainfall. Water turbulence is an important ecological control, but difficult to measure. 4. The trophic status of corals is still unclear, but in spite of their anatomical and physiological specialization as carnivores it is likely that they derive some nutrient substances from zooxanthellae. Suggestions that filamentous algae in coral heads play a major part in the economy of the corals have not been supported by later work, but biomass pyramids constructed on the basis by Odum and Odum remain the only ones available. Most reefs are apparently autotrophic, with 1500–3500 g. Carbon being fixed per m. 2 per year. 5. Few animals eat corals, which may account for their success. Important predators are fish and the echinoderm Acanthaster. Quantitative estimates of biogenic erosion of organic skeletons on reefs are high. Fish affect not only corals but other invertebrates, algae and marine phanerogams. 6. Corals may be killed by ‘dark water’, intense rain or river floodwaters, earth movements, human interference and especially hurricanes. Reef recovery after hurricanes may take 10–20 years. 7. In addition to fringing, barrier and atoll reefs, intermediate types are recognised. The main types may consist of linear reefs or faros. Smaller lagoon reefs include pinnacles, patches and platforms, and submerged knolls. Complex cellular or mesh reef patterns are also found. 8. Reefs are conspicuously zoned, both laterally in response to changing exposure to waves to form windward and leeward reefs, and transversely, as a result of steep environmental gradients across reef flats from sea to lagoon. Topographic and ecological zones may be characterized by particular coral species, but these vary widely from reef to reef. A major distinction can be made between reefs with and without algal ridges, which are common on open‐ocean trade‐wind reefs, in the Indo‐Pacific, but are absent on Caribbean reefs and on Indo‐Pacific reefs in more sheltered waters. gorgonians are common on Caribbean reefs, alcyonaceans in the Indo‐Pacific. 9. Much of the difficulty in comparing reefs stems from the lack of uniformity in surveying methods. Problems of describing the complex three‐dimensional patterns of organisms on reefs have yet to be solved, and hence little progress has been made in explanation of these patterns. Explanation in terms of simple environmental controls is inadequate. 10. Understanding the distribution of corals is made more difficult both by taxo‐nomic problems and by the plasticity of growth form in different situations. 11. Growth of corals and reefs may be estimated by measuring the growth of individual colonies, measuring rates of calcium carbonate deposition in the skeleton, measuring topographic change on the reef and deducing net rates of reef growth from geological evidence. Massive corals may increase in diameter by 1 cm./year, branches of branching corals may increase in length by 10 cm./year. Study of deposition rates shows variation within colonies, between species, in light and dark, and seasonally. Rates of reef growth extrapolated from colony measurements reach 2–5 cm./year, and contrast with figures as low as 0–02 cm/year averaged over 70 million years from borehole data. Both colony growth rates and geological data suggest worldwide variations in rates of reef growth. 12. In spite of clear evidence of long‐continued subsidence, present surface features of reefs, often only thinly veneered by modern corals, have been much affected by recent sea level fluctuations. Many slightly raised reefs at 2–10 m. above sea level date at 90–160 thousand years B.P.; there is evidence for a sea level at about the present level at 30–35 thousand years B.P.; and controversy continues over whether sea level has stood higher than the present at any time since the last sea level rise began about 20,000 years ago. Evidence from many reefs suggests a slightly higher sea level in the last 4000 years, but on other reefs such evidence is lacking. 13. Several reef features (submerged terraces, groove‐spur systems, algal ridge, reef flat, reef blocks and reef islands) have been interpreted either as relict features dating from a higher sea level in the last 5000 years, or contemporary features developed in response to present processes. In some cases the evidence is equivocal; in others it is clear that diverse features are being grouped together under the same name. If such features are referable to a higher sea level, this may have been of last Interglacial or even Interstadial age rather than Holocene. 14. A reef consists of a rigid framework defining several major depositional environments within and around it. Sediments are of biological, mainly skeletal origin, except in unusual environments such as the Bahama Banks. The characteristics of sediments derived from organisms depend partly on the breakdown patterns of particular skeletons, partly on transportation and sorting processes. Fine sediments may be either detrital, or physicochemical precipitates. 15. Organisms affect sediments after deposition, by disturbance, transportation and probably comminution. Fish and holothurians have been studied in detail. 16. While new theories of coral reefs are proposed from time to time, the need is less for new theories than for standardised procedures to ensure comparability of reef studies and the identification of variations in reefs both on local and regional scales. While reefs as biological systems adjust relatively rapidly to changes, reefs as geological systems adjust much more slowly. Because of the magnitude and recency of Pleistocene fluctuations in sea level, many biological features of reefs are out of phase with inherited geological features, and this had led to much controversy.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1969.tb00609.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1969.tb00609.x",
    openalex = "W2172280477",
    references = "doi1010160025322764900489, doi1010160079194661900040, doi101016s0065288108604381, doi101086626295, doi101086626809, doi1023071929924, doi1023071942181, doi1023071943285, doi104319lo1956120102, openalexw3126336940, openalexw574363047"
}

@misc{chave1972calcium1,
    author = "Chave, K. E. et Smith, S. V. et Roy, K. J",
    title = "Production de carbonate de calcium par les récifs coralliens",
    year = "1972",
    howpublished = "Marine Geology, v. 12, no. 2, p. 123-140",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Chave, K. E., Smith, S. V., et Roy, K. J., 1972, Production de carbonate de calcium par les récifs coralliens : Marine Geology, v. 12, no. 2, p. 123-140.}"
}

@article{chave1972carbonate,
    author = "Chave, Keith E. et Smith, Stephen V. et Roy, Kenneth J.",
    title = "Production de carbonates par les récifs coralliens",
    year = "1972",
    journal = "Marine Geology",
    url = "https://doi.org/10.1016/0025-3227(72)90024-2",
    doi = "10.1016/0025-3227(72)90024-2",
    number = "2",
    openalex = "W1978422970",
    pages = "123-140",
    volume = "12",
    references = "doi101007bf00379161, doi101016001282526790311x, doi101029tr030i002p00245, doi101111j1469185x1969tb00609x, doi101126science16238581121, doi101130mem67v2, doi10130674d7173a2b2111d78648000102c1865d, doi1023071943285, openalexw2404703234, openalexw3216129607"
}

Des autoradiographies et des radiographies aux rayons X ont été réalisées sur des sections verticales passant par le centre de coraux de récif provenant d'Eniwetok. Les bandes de radioactivité dans la structure corallienne sont causées par le strontium-90 et sont liées à des séries spécifiques d'essais nucléaires, rendant ainsi possible le calcul des taux de croissance à long terme. Ces données indiquent que les variations cycliques de la densité radiale révélées par la radiographie aux rayons X sont annuelles.

@article{doi101126science1774045270,
    author = "Knutson, D W et Buddemeier, Robert W. et Smith, Stephen V.",
    title = "Chronomètres coralliens : bandes de croissance saisonnière dans les coraux de récif",
    year = "1972",
    journal = "Science",
    abstract = "Des autoradiographies et des radiographies aux rayons X ont été réalisées sur des sections verticales passant par le centre de coraux de récif provenant d'Eniwetok. Les bandes de radioactivité dans la structure corallienne sont causées par le strontium-90 et sont liées à des séries spécifiques d'essais nucléaires, rendant ainsi possible le calcul des taux de croissance à long terme. Ces données indiquent que les variations cycliques de la densité radiale révélées par la radiographie aux rayons X sont annuelles.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.177.4045.270",
    doi = "10.1126/science.177.4045.270",
    openalex = "W2004026365",
    references = "chave1972carbonate"
}

Article de journal Reef Corals: Mutualistic Symbioses Adapted to Nutrient-Poor Environments Accéder L. Muscatine, L. Muscatine Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar James W. Porter James W. Porter Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 27, Issue 7, July 1977, Pages 454–460, https://doi.org/10.2307/1297526 Publié : 01 juillet 1977 Historique de l'article Accepté : 21 décembre 1976 Publié : 01 juillet 1977

@article{doi1023071297526,
    author = "Muscatine, L. and Porter, James W.",
    title = "Reef Corals: Mutualistic Symbioses Adapted to Nutrient-Poor Environments",
    year = "1977",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Article de journal Reef Corals: Mutualistic Symbioses Adapted to Nutrient-Poor Environments Accéder L. Muscatine, L. Muscatine Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar James W. Porter James W. Porter Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 27, Issue 7, July 1977, Pages 454–460, https://doi.org/10.2307/1297526 Publié : 01 juillet 1977 Historique de l'article Accepté : 21 décembre 1976 Publié : 01 juillet 1977",
    url = "https://doi.org/10.2307/1297526",
    doi = "10.2307/1297526",
    openalex = "W2110117799",
    references = "doi101021j150446a008, doi101111j1469185x1969tb00609x"
}

La diversité élevée couramment observée des arbres dans les forêts tropicales humides et des coraux sur les récifs tropicaux est un état hors équilibre qui, s'il n'est pas davantage perturbé, évoluera vers une communauté à faible diversité en équilibre. Cela peut ne pas se produire si des changements climatiques progressifs favorisent différentes espèces. Si l'équilibre est atteint, un degré moindre de diversité peut être maintenu par la diversification des niches ou par une mortalité compensatoire qui favorise les compétiteurs inférieurs. Cependant, les forêts tropicales et les récifs sont soumis à des perturbations sévères assez fréquemment pour que l'équilibre puisse jamais être atteint.

@article{doi101126science19943351302,
    author = "Connell, Joseph H.",
    title = "Diversité dans les forêts tropicales humides et les récifs coralliens",
    year = "1978",
    journal = "Science",
    abstract = "La diversité élevée couramment observée des arbres dans les forêts tropicales humides et des coraux sur les récifs tropicaux est un état hors équilibre qui, s'il n'est pas davantage perturbé, évoluera vers une communauté à faible diversité en équilibre. Cela peut ne pas se produire si des changements climatiques progressifs favorisent différentes espèces. Si l'équilibre est atteint, un degré moindre de diversité peut être maintenu par la diversification des niches ou par une mortalité compensatoire qui favorise les compétiteurs inférieurs. Cependant, les forêts tropicales et les récifs sont soumis à des perturbations sévères assez fréquemment pour que l'équilibre puisse jamais être atteint.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.199.4335.1302",
    doi = "10.1126/science.199.4335.1302",
    openalex = "W2166722801",
    references = "doi101086282171, doi101086282687, doi101086283164, doi101086283241, doi101086283366, doi101111j1469185x1969tb00609x, doi101126science1653889131, doi101126science185414527, doi1023071218190, doi1023071942565, doi1023072256497, doi1023072260296, doi1023072989823"
}

La production de nouvelles colonies par fragmentation de colonies établies est montrée comme étant un mode de reproduction et de distribution locale extrêmement important chez les principaux coraux constructeurs de récifs. Ce type de reproduction évite les taux de mortalité élevés des larves et des juvéniles et répartit le risque de mortalité pour le génotype. La fragmentation par des coraux à taux de croissance élevé entraîne leur domination de certaines zones de récif, une croissance rapide des récifs sur lesquels ces coraux sont abondants, et une récupération rapide après des perturbations. Je conclus qu'un certain nombre des coraux les plus réussis sont adaptés à la fragmentation, c'est-à-dire qu'ils ont intégré la fragmentation dans leurs histoires de vie.

@article{doi103354meps007207,
    author = "Highsmith, R. Tod",
    title = "Reproduction par fragmentation chez les coraux",
    year = "1982",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "La production de nouvelles colonies par fragmentation de colonies établies est montrée comme étant un mode de reproduction et de distribution locale extrêmement important chez les principaux coraux constructeurs de récifs. Ce type de reproduction évite les taux de mortalité élevés des larves et des juvéniles et répartit le risque de mortalité pour le génotype. La fragmentation par des coraux à taux de croissance élevé entraîne leur domination de certaines zones de récif, une croissance rapide des récifs sur lesquels ces coraux sont abondants, et une récupération rapide après des perturbations. Je conclus qu'un certain nombre des coraux les plus réussis sont adaptés à la fragmentation, c'est-à-dire qu'ils ont intégré la fragmentation dans leurs histoires de vie",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps007207",
    doi = "10.3354/meps007207",
    openalex = "W2007323570",
    references = "doi101007bf02407510, doi101016b9780123955265500158, doi101016b9780123955289x50015, doi101086283186, doi101086627283, doi101126science19943351302, doi101126science203437547, doi101126science2094457713, doi102110pec74180009, doi1023071540123"
}

@article{doi101007bf00302170,
    author = "Szmant, Alina M.",
    title = "Écologie reproductive des coraux de récif des Caraïbes",
    year = "1986",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00302170",
    doi = "10.1007/bf00302170",
    openalex = "W2011426613",
    references = "doi101111j1469185x1969tb00609x, doi1023071942565"
}

Les taux de croissance des coraux sur les récifs du Holocène indiquent que les plateformes carbonatées devraient facilement suivre le rythme de l'affaissement à long terme et des changements du niveau de la mer, pourtant les récifs et plateformes submergés sont courants dans le registre géologique. La reconnaissance de l'influence négative des nutriments sur les communautés de récifs fournit une clé pour ce paradoxe. Les producteurs principaux de sédiments carbonatés de la communauté des récifs coralliens sont hautement adaptés à des environnements déficients en nutriments. L'apport de nitrates et de phosphates stimule la croissance du plancton, ce qui réduit la transparence de l'eau, limitant les profondeurs de répartition des coraux zooxanthellés et des algues calcaires et réduisant ainsi la production de carbonate. Des concentrations plus élevées de nutriments et de densités de plancton stimulent également la croissance d'algues charnues et d'animaux filtreurs suspension ahermatypiques dans le benthos. En plus de déplacer les algues et coraux hermatypiques, beaucoup de ces compétiteurs à croissance rapide sont des bioérodeurs qui détruisent activement la structure récifale. Étant donné que les taux de production de carbonate et de bioérosion sont similaires, même de modestes augmentations de la disponibilité des nutriments peuvent faire passer une communauté de récif de la production nette à l'érosion nette. Dans le registre géologique, les récifs submergés et les plateformes carbonatées présentent généralement des preuves de non-dépôt, de bioérosion et de potentiel redox réduit, qui indiquent une disponibilité excessive de nutriments lors de la submersion. Les récifs submergés recouverts par des schistes sont de possibles victimes des nutriments dans les ruissellements terrestres qui ont supprimé la croissance des récifs avant l'arrivée des sédiments siliciclastiques. D'autres plateformes submergées peuvent avoir succombé lors de pulses rapides de montée du niveau de la mer qui ont inondé des plateformes précédemment subaériennes. Les nutriments dans les sols de la plateforme inondée ont été mélangés aux eaux de surface, supprimant la croissance des récifs. Le récif s'est submergé si la submersion a dépassé la profondeur critique avant que les nutriments excédentaires ne soient exportés du système. D'autres mécanismes de submersion des récifs par excès de nutriments incluent des changements dans les modèles locaux ou régionaux de remontée d'eau ou de renversement en milieu océanique.

@article{doi1023073514476,
    author = "Hallock, Pamela et Schlager, Wolfgang",
    title = "Excès de nutriments et la disparition des récifs coralliens et des plateformes carbonatées",
    year = "1986",
    journal = "Palaios",
    abstract = "Les taux de croissance des coraux sur les récifs du Holocène indiquent que les plateformes carbonatées devraient facilement suivre le rythme de l'affaissement à long terme et des changements du niveau de la mer, pourtant les récifs et plateformes submergés sont courants dans le registre géologique. La reconnaissance de l'influence négative des nutriments sur les communautés de récifs fournit une clé pour ce paradoxe. Les producteurs principaux de sédiments carbonatés de la communauté des récifs coralliens sont hautement adaptés à des environnements déficients en nutriments. L'apport de nitrates et de phosphates stimule la croissance du plancton, ce qui réduit la transparence de l'eau, limitant les profondeurs de répartition des coraux zooxanthellés et des algues calcaires et réduisant ainsi la production de carbonate. Des concentrations plus élevées de nutriments et de densités de plancton stimulent également la croissance d'algues charnues et d'animaux filtreurs suspension ahermatypiques dans le benthos. En plus de déplacer les algues et coraux hermatypiques, beaucoup de ces compétiteurs à croissance rapide sont des bioérodeurs qui détruisent activement la structure récifale. Étant donné que les taux de production de carbonate et de bioérosion sont similaires, même de modestes augmentations de la disponibilité des nutriments peuvent faire passer une communauté de récif de la production nette à l'érosion nette. Dans le registre géologique, les récifs submergés et les plateformes carbonatées présentent généralement des preuves de non-dépôt, de bioérosion et de potentiel redox réduit, qui indiquent une disponibilité excessive de nutriments lors de la submersion. Les récifs submergés recouverts par des schistes sont de possibles victimes des nutriments dans les ruissellements terrestres qui ont supprimé la croissance des récifs avant l'arrivée des sédiments siliciclastiques. D'autres plateformes submergées peuvent avoir succombé lors de pulses rapides de montée du niveau de la mer qui ont inondé des plateformes précédemment subaériennes. Les nutriments dans les sols de la plateforme inondée ont été mélangés aux eaux de surface, supprimant la croissance des récifs. Le récif s'est submergé si la submersion a dépassé la profondeur critique avant que les nutriments excédentaires ne soient exportés du système. D'autres mécanismes de submersion des récifs par excès de nutriments incluent des changements dans les modèles locaux ou régionaux de remontée d'eau ou de renversement en milieu océanique.",
    url = "https://doi.org/10.2307/3514476",
    doi = "10.2307/3514476",
    openalex = "W2327706037",
    references = "doi101038187123a0, doi101144gsjgs13620175"
}

Un développement sans précédent le long des côtes tropicales provoque une dégradation sévère des récifs coralliens, principalement due à l'augmentation de la sédimentation. Les particules de sédiment étouffent les organismes des récifs et réduisent la lumière disponible pour la photosynthèse. Une sédimentation excessive peut affecter négativement la structure et le fonctionnement de l'écosystème récifal en modifiant à la fois les processus physiques et biologiques. Les taux moyens de sédimentation et les concentrations de sédiments en suspension pour les récifs non soumis à des stress d'origine humaine sont < 1 à environ 10 mg cm-* d-' et < 10 mg l-' respectivement. Des taux et des concentrations chroniques supérieurs à ces valeurs sont 'élevés'. Une forte sédimentation est associée à un nombre réduit d'espèces de coraux, moins de coraux vivants, des taux de croissance corallienne plus faibles, une plus grande abondance de formes ramifiées, un recrutement corallien réduit, une calcification diminuée, une productivité nette des coraux réduite et des taux plus lents d'accrétion récifale. Les espèces de coraux ont des capacités différentes pour se débarrasser des particules de sédiment ou survivre à des niveaux de lumière plus faibles. Le rejet du sédiment est une fonction de la morphologie, de l'orientation, de l'habitat de croissance et du comportement ; ainsi que de la quantité et du type de sédiment. Les taux de croissance des coraux ne sont pas de simples indicateurs des niveaux de sédimentation. Le déclin des pêcheries tropicales est partiellement attribuable à la détérioration des récifs coralliens, des herbiers marins et des mangroves due à la sédimentation. La sédimentation peut modifier les interactions complexes entre les poissons et leur habitat récifal. Par exemple, la sédimentation peut endormir les principaux coraux constructeurs de récifs, conduisant à un effondrement éventuel du cadre récifal. Une diminution de la quantité d'abri que le récif fournit entraîne une réduction à la fois du nombre d'individus et du nombre d'espèces de poissons. Actuellement, nous ne sommes pas en mesure de prédire rigoureusement les réponses des récifs coralliens et des organismes récifaux à une sédimentation excessive provenant du développement côtier et d'autres sources. Étant donné des informations sur la quantité de sédiment qui sera introduite dans l'environnement récifal, la composition de la communauté corallienne, la profondeur du récif, le pourcentage de couverture corallienne et les modèles actuels, nous devrions être capables de prédire les conséquences d'une activité particulière. Les modèles des processus physiques (par exemple, le transport de sédiment) doivent être complétés par une meilleure compréhension des réponses des organismes et de l'écosystème au stress sédimentaire. Plus spécifiquement, nous avons besoin de données sur les niveaux de seuil pour les organismes récifaux et pour l'écosystème récifal dans son ensemble - les niveaux au-dessus desquels la sédimentation a des effets létaux pour des espèces particulières et au-dessus desquels le fonctionnement normal du récif cesse. Des études de terrain supplémentaires sur les réponses des organismes récifaux aux sédiments tant terrigènes que carbonatés de calcium sont nécessaires. Pour évaluer efficacement les tendances sur les récifs coralliens, par exemple les changements dans l'abondance et l'arrangement spatial des organismes benthiques dominants, les scientifiques doivent commencer à utiliser des méthodes de surveillance standardisées. Les ensembles de données à long terme sont essentiels pour suivre ces écosystèmes complexes.

@article{doi103354meps062185,
    author = "Rogers, CS",
    title = "Réponses des récifs coralliens et des organismes récifaux à la sédimentation",
    year = "1990",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "Un développement sans précédent le long des côtes tropicales provoque une dégradation sévère des récifs coralliens, principalement due à l'augmentation de la sédimentation. Les particules de sédiment étouffent les organismes récifaux et réduisent la lumière disponible pour la photosynthèse. Une sédimentation excessive peut affecter négativement la structure et le fonctionnement de l'écosystème récifal corallien en modifiant à la fois les processus physiques et biologiques. Les taux moyens de sédimentation et les concentrations de sédiments en suspension pour les récifs non soumis à des stress liés aux activités humaines sont < 1 à environ 10 mg cm-* d-' et < 10 mg I-', respectivement. Les taux et concentrations chroniques supérieurs à ces valeurs sont 'élevés'. Une forte sédimentation est associée à un nombre réduit d'espèces de coraux, moins de coraux vivants, des taux de croissance corallienne plus faibles, une plus grande abondance de formes ramifiées, un recrutement corallien réduit, une calcification diminuée, une productivité nette des coraux réduite et des taux plus lents d'accrétion récifale. Les espèces de coraux ont des capacités différentes pour se débarrasser des particules de sédiment ou survivre à des niveaux de lumière plus faibles. Le rejet du sédiment est une fonction de la morphologie, de l'orientation, de l'habitat de croissance et du comportement ; et de la quantité et du type de sédiment. Les taux de croissance des coraux ne sont pas de simples indicateurs des niveaux de sédimentation. Le déclin des pêcheries tropicales est partiellement attribuable à la détérioration des récifs coralliens, des herbiers de posidonie et des mangroves due à la sédimentation. La sédimentation peut modifier les interactions complexes entre les poissons et leur habitat récifal. Par exemple, la sédimentation peut endormir les principaux coraux constructeurs de récifs, conduisant à un effondrement éventuel du cadre récifal. Une diminution de la quantité d'abri que le récif fournit entraîne une réduction à la fois du nombre d'individus et du nombre d'espèces de poissons. Actuellement, nous ne sommes pas en mesure de prédire rigoureusement les réponses des récifs coralliens et des organismes récifaux à une sédimentation excessive due au développement côtier et à d'autres sources. Étant donné des informations sur la quantité de sédiment qui sera introduite dans l'environnement récifal, la composition de la communauté corallienne, la profondeur du récif, le pourcentage de couverture corallienne et les modèles actuels, nous devrions être en mesure de prédire les conséquences d'une activité particulière. Les modèles des processus physiques (par exemple, le transport de sédiment) doivent être complétés par une meilleure compréhension des réponses des organismes et de l'écosystème au stress de la sédimentation. Plus spécifiquement, nous avons besoin de données sur les niveaux de seuil pour les organismes récifaux et pour l'écosystème récifal dans son ensemble - les niveaux au-dessus desquels la sédimentation a des effets létaux pour des espèces particulières et au-dessus desquels le fonctionnement normal du récif cesse. Des études de terrain supplémentaires sur les réponses des organismes récifaux aux sédiments tant téphrogènes que carbonatés de calcium sont nécessaires. Pour évaluer efficacement les tendances sur les récifs coralliens, par exemple les changements dans l'abondance et l'arrangement spatial des organismes benthiques dominants, les scientifiques doivent commencer à utiliser des méthodes de surveillance standardisées. Les ensembles de données à long terme sont essentiels pour suivre ces écosystèmes complexes.",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps062185",
    doi = "10.3354/meps062185",
    openalex = "W2077170976"
}

@article{doi101007bf00303779,
    author = "Glynn, Peter W.",
    title = "Coral reef bleaching: ecological perspectives",
    year = "1993",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00303779",
    doi = "10.1007/bf00303779",
    openalex = "W2004619429",
    references = "doi101111j1469185x1969tb00609x, doi101126science2434891638, doi102110pec77250019, doi1023071942565, doi103354meps007207"
}

La production actuelle de CaCO3 dans l'océan mondial est calculée à environ 5 milliards de tonnes (bt) par an, dont environ 3 bt s'accumulent dans les sédiments ; les autres 40 % sont dissous. Presque la moitié du sédiment carbonaté s'accumule sur les récifs, les plateaux et les étagères tropicales, et consiste principalement d'aragonite métastable et de calcite magnésienne. Les carbonates des eaux profondes, principalement des coccolithes calcitiques et des foraminifères planctoniques, ont des taux de productivité et d'accumulation des ordres de grandeur inférieurs à ceux des carbonates des eaux peu profondes, mais ils couvrent des surfaces de bassin des ordres de grandeur plus grandes. Le double de calcium est retiré des océans par l'accumulation carbonatée actuelle que ce qui est estimé être apporté par les rivières et l'activité hydrothermale (1,6 bt), suggérant que les sorties ont été surestimées ou les entrées sous-estimées, qu'une ou plusieurs autres entrées n'ont pas été identifiées, et/ou que les océans ne sont pas actuellement en état stationnaire. Une source de calcium « manquante » pourrait être les eaux souterraines, bien que son apport actuel soit probablement beaucoup plus faible que celui des rivières. Si, comme il semble probable, l'accumulation de CaCO3 dépasse actuellement l'apport terrestre et hydrothermal, cet déséquilibre est probablement compensé par une accumulation réduite et un apport accru lors d'un niveau de la mer abaissé : l'accumulation des eaux peu profondes diminue d'un ordre de grandeur avec une baisse de 100 m du niveau de la mer, tandis que l'afflux d'eaux souterraines augmente en raison d'une tête piézométrique accrue et de la diagenèse de l'aragonite métastable et de la calcite magnésienne provenant de carbonates des eaux peu profondes exposés à l'air libre.

@article{doi10102993gb02524,
    author = "Milliman, John D.",
    title = "Production and accumulation of calcium carbonate in the ocean: Budget of a nonsteady state",
    year = "1993",
    journal = "Global Biogeochemical Cycles",
    abstract = "La production actuelle de CaCO3 dans l'océan mondial est calculée à environ 5 milliards de tonnes (bt) par an, dont environ 3 bt s'accumulent dans les sédiments ; les autres 40 % sont dissous. Presque la moitié du sédiment carbonaté s'accumule sur les récifs, les plateaux et les étagères tropicales, et consiste principalement d'aragonite métastable et de calcite magnésienne. Les carbonates des eaux profondes, principalement des coccolithes calcitiques et des foraminifères planctoniques, ont des taux de productivité et d'accumulation des ordres de grandeur inférieurs à ceux des carbonates des eaux peu profondes, mais ils couvrent des surfaces de bassin des ordres de grandeur plus grandes. Le double de calcium est retiré des océans par l'accumulation carbonatée actuelle que ce qui est estimé être apporté par les rivières et l'activité hydrothermale (1,6 bt), suggérant que les sorties ont été surestimées ou les entrées sous-estimées, qu'une ou plusieurs autres entrées n'ont pas été identifiées, et/ou que les océans ne sont pas actuellement en état stationnaire. Une source de calcium « manquante » pourrait être les eaux souterraines, bien que son apport actuel soit probablement beaucoup plus faible que celui des rivières. Si, comme il semble probable, l'accumulation de CaCO3 dépasse actuellement l'apport terrestre et hydrothermal, cet déséquilibre est probablement compensé par une accumulation réduite et un apport accru lors d'un niveau de la mer abaissé : l'accumulation des eaux peu profondes diminue d'un ordre de grandeur avec une baisse de 100 m du niveau de la mer, tandis que l'afflux d'eaux souterraines augmente en raison d'une tête piézométrique accrue et de la diagenèse de l'aragonite métastable et de la calcite magnésienne provenant de carbonates des eaux peu profondes exposés à l'air libre.",
    url = "https://doi.org/10.1029/93gb02524",
    doi = "10.1029/93gb02524",
    openalex = "W2058721748",
    references = "doi10102993gb01731, doi101126science1944268937, doi101126science2264677965, doi101126science2434891638, doi1011300091761319920200733rotcrh23co2, openalexw1490382454"
}

De nombreux récifs coralliens ont été dégradés au cours des deux à trois dernières décennies par une combinaison de perturbations humaines et naturelles. À Jamaïque, les effets de la surpêche, des dégâts causés par les ouragans et des maladies se sont combinés pour détruire la plupart des coraux, dont l'abondance a diminué de plus de 50 % à la fin des années 1970 à moins de 5 % aujourd'hui. Un changement de phase dramatique s'est produit, produisant un système dominé par les macroalgues charnues (plus de 90 % de couverture). La mise en œuvre immédiate de procédures de gestion est nécessaire pour éviter d'autres dégâts catastrophiques.

@article{doi101126science26551781547,
    author = "Hughes, Terry P.",
    title = "Catastrophes, Phase Shifts, and Large-Scale Degradation of a Caribbean Coral Reef",
    year = "1994",
    journal = "Science",
    abstract = "Many coral reefs have been degraded over the past two to three decades through a combination of human and natural disturbances. In Jamaica, the effects of overfishing, hurricane damage, and disease have combined to destroy most corals, whose abundance has declined from more than 50 percent in the late 1970s to less than 5 percent today. A dramatic phase shift has occurred, producing a system dominated by fleshy macroalgae (more than 90 percent cover). Immediate implementation of management procedures is necessary to avoid further catastrophic damage.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.265.5178.1547",
    doi = "10.1126/science.265.5178.1547",
    openalex = "W2102998760",
    references = "doi101126science19943351302"
}

Au cours des deux dernières décennies, les récifs coralliens de la région caribéenne ont été modifiés par des changements de phase s'éloignant des coraux vers les algues macroscopiques ou les tapis d'algues. Cette étude a testé l'hypothèse que, puisque le changement de phase sur les récifs de Jamaïque et du sud-est de la Floride impliquait des algues macroscopiques frondueuses, le contrôle bottom-up via l'enrichissement en nutriments doit être un facteur causal. L'approche était multifacette et comprenait la mesure des concentrations de nutriments près du fond, de la salinité, des bioessais d'enrichissement en nutriments, des essais de phosphatase alcaline, des ratios C: N: P des tissus, et des ratios 15 N: 14 N (δ 15 N) des tissus. Dans les deux emplacements, les concentrations d'azote inorganique dissous (DIN) et de phosphore réactif soluble (SRP) ont dépassé les seuils de nutriments (∼1,0 µ M DIN, 0,1 µ M SRP) notés pour maintenir les efflorescences d'algues macroscopiques sur les récifs coralliens caribéens. Les ratios élevés de DIN: SRP de l'eau de mer, l'activité de la phosphatase alcaline, et les ratios C: P et N: P des tissus des algues macroscopiques sur le récif jamaïcain riche en carbonates suggéraient une limitation du SRP de la productivité par rapport aux valeurs plus basses de ces variables sur les récifs siliciclastiques en Floride qui suggéraient une limitation du DIN. Ce schéma a été corroboré expérimentalement lorsque l'enrichissement en SRP a augmenté P max (capacité photosynthétique à la saturation lumineuse) de la chlorophyte Chaetomorpha linum en Jamaïque par rapport à l'enrichissement en DIN qui a augmenté a (l'efficacité photosynthétique sous faible irradiance) de la chlorophyte Codium isthmocladum poussant plus profondément dans le sud-est de la Floride. Les concentrations accrues de DIN ont été associées à une salinité réduite sur les deux récifs, indiquant que la décharge d'eaux souterraines sous-marines était une source significative de DIN. Les valeurs élevées de δ 15 N des tissus de C. isthmocladum ont également indiqué que le DIN des eaux usées était une source d'azote contribuant aux efflorescences dans le sud-est de la Floride.

@article{doi104319lo1997425part21119,
    author = "Lapointe, Brian E.",
    title = "Nutrient thresholds for bottom‐up control of macroalgal blooms on coral reefs in Jamaica and southeast Florida",
    year = "1997",
    journal = "Limnology and Oceanography",
    abstract = "During the past two decades coral reefs in the greater Caribbean area have been altered by phase shifts away from corals and toward macroalgae or algal turfs. This study tested the hypothesis that because the phase shift on reefs in Jamaica and southeast Florida involved frondose macroalgae, bottom‐up control via nutrient enrichment must be a causal factor. The approach was multifaceted and included measurement of near‐bottom nutrient concentrations, salinity, nutrient enrichment bioassays, alkaline phosphatase assays, tissue C: N: P ratios, and tissue 15 N: 14 N (δ 15 N) ratios. In both locations, concentrations of dissolved inorganic nitrogen (DIN) and soluble reactive phosphorus (SRP) exceeded nutrient thresholds (∼1.0 µ M DIN, 0.1 µ M SRP) noted to sustain macroalgal blooms on Caribbean coral reefs. High seawater DIN: SRP ratios, alkaline phosphatase activity, and tissue C: P and N: P ratios of macroalgae on the carbonate‐rich Jamaican reef suggested SRP limitation of productivity compared to lower values of these variables on siliciclastic reefs in Florida that suggested DIN limitation. This pattern was corroborated experimentally when SRP enrichment increased P max (photosynthetic capacity at light saturation) of the chlorophyte Chaetomorpha linum in Jamaica compared to DIN enrichment that increased a (the photosynthetic efficiency under low irradiance) of the deeper growing chlorophyte Codium isthmocladum in southeast Florida. Increased DIN concentrations were associated with reduced salinity on both reefs, indicating submarine groundwater discharge was a significant source of DIN. Elevated δ 15 N values of C. isthmocladum tissue further pointed to wastewater DIN as a source of nitrogen contributing to the blooms in southeast Florida.",
    url = "https://doi.org/10.4319/lo.1997.42.5\_part\_2.1119",
    doi = "10.4319/lo.1997.42.5\_part\_2.1119",
    openalex = "W2105082791"
}

@article{doi101016s0921818198000356,
    author = "Gattuso, Jean‐Pierre",
    title = "Effet de la saturation en carbonate de calcium de l'eau de mer sur la calcification des coraux",
    year = "1998",
    journal = "Global and Planetary Change",
    url = "https://doi.org/10.1016/s0921-8181(98)00035-6",
    doi = "10.1016/s0921-8181(98)00035-6",
    openalex = "W1999570930"
}

@article{doi101007s003380050213,
    author = "McCook, Laurence J.",
    title = "Macroalgues, nutriments et changements de phase sur les récifs coralliens : enjeux scientifiques et conséquences de gestion pour le Grand Barrière de Corail",
    year = "1999",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s003380050213",
    doi = "10.1007/s003380050213",
    openalex = "W1999306630"
}

Les températures de la mer dans de nombreuses régions tropicales ont augmenté d'environ 1°C au cours des 100 dernières années et augmentent actuellement à un rythme d'environ 1–2°C par siècle. Le blanchissement des coraux se produit lorsque la tolérance thermique des coraux et de leurs symbiotes photosynthétiques (zooxanthelles) est dépassée. Des épisodes massifs de blanchissement des coraux se sont produits en association avec des périodes de températures de la mer élevées au cours des 20 dernières années et impliquent la perte des zooxanthelles suite à une photoinhibition chronique. Le blanchissement massif a entraîné des pertes significatives de coraux vivants dans de nombreuses parties du monde. Cet article examine les perspectives biochimiques, physiologiques et écologiques du blanchissement des coraux. Il utilise également les résultats de quatre simulations issues de trois modèles de changement climatique mondial qui simulent les changements de température de la mer et, par conséquent, la manière dont la fréquence et l'intensité des événements de blanchissement évolueront au cours des 100 prochaines années. Les résultats suggèrent que les tolérances thermiques des coraux constructeurs de récifs seront probablement dépassées chaque année au cours des prochaines décennies. Des événements aussi graves que celui de 1998, le plus grave jamais enregistré, deviendront probablement courants dans 20 ans. La plupart des informations suggèrent que la capacité d'acclimatation des coraux a déjà été dépassée et que l'adaptation sera trop lente pour éviter un déclin de la qualité des récifs du monde. La rapidité des changements prédits indique un problème majeur pour les écosystèmes marins tropicaux et suggère que le réchauffement non contrôlé ne peut se produire sans la perte et la dégradation des récifs coralliens à l'échelle mondiale.

@article{doi101071mf99078,
    author = "Hoegh‐Guldberg, Ove",
    title = "Changement climatique, blanchissement des coraux et l'avenir des récifs coralliens du monde",
    year = "1999",
    journal = "Marine and Freshwater Research",
    abstract = "Les températures de la mer dans de nombreuses régions tropicales ont augmenté d'environ 1°C au cours des 100 dernières années et augmentent actuellement à un rythme d'environ \textasciitilde 1–2°C par siècle. Le blanchissement des coraux se produit lorsque la tolérance thermique des coraux et de leurs symbiotes photosynthétiques (zooxanthelles) est dépassée. Des épisodes massifs de blanchissement des coraux se sont produits en association avec des périodes de températures de la mer élevées au cours des 20 dernières années et impliquent la perte des zooxanthelles suite à une photoinhibition chronique. Le blanchissement massif a entraîné des pertes significatives de coraux vivants dans de nombreuses parties du monde. Cet article examine les perspectives biochimiques, physiologiques et écologiques du blanchissement des coraux. Il utilise également les résultats de quatre simulations issues de trois modèles de changement climatique mondial qui simulent les changements de température de la mer et, par conséquent, la manière dont la fréquence et l'intensité des événements de blanchissement évolueront au cours des 100 prochaines années. Les résultats suggèrent que les tolérances thermiques des coraux constructeurs de récifs seront probablement dépassées chaque année au cours des prochaines décennies. Des événements aussi graves que celui de 1998, le plus grave jamais enregistré, deviendront probablement courants dans 20 ans. La plupart des informations suggèrent que la capacité d'acclimatation des coraux a déjà été dépassée et que l'adaptation sera trop lente pour éviter un déclin de la qualité des récifs du monde. La rapidité des changements prédits indique un problème majeur pour les écosystèmes marins tropicaux et suggère que le réchauffement non contrôlé ne peut se produire sans la perte et la dégradation des récifs coralliens à l'échelle mondiale.",
    url = "https://doi.org/10.1071/mf99078",
    doi = "10.1071/mf99078",
    openalex = "W1991462310",
    references = "doi101007bf00303779, doi101007s003380050249, doi101016000527289090088l, doi10103819505, doi101073pnas892110302, doi101093icb391146, doi101126science26551781547, doi101126science2845411118, doi1023071297526, openalexw1759145845, openalexw2341328186"
}

SYNTHÈSE. Comprendre comment les récifs varient dans les gammes actuelles de conditions environnementales est essentiel pour comprendre comment les récifs coralliens s'adapteront à un environnement changeant. Des données environnementales mondiales sur la température, la salinité, la lumière, l'état de saturation en carbonate et les nutriments ont récemment été compilées pour près de 1 000 sites de récifs. Ces données ont été analysées statistiquement afin de (1) redéfinir les limites environnementales au-delà desquelles les récifs existent aujourd'hui, (2) identifier les récifs « marginaux », c'est-à-dire ceux qui existent près ou au-delà des limites environnementales « normales » de la distribution des récifs, et (3) classer de manière générale les récifs en fonction de ces variables environnementales majeures. Les limites de température et de salinité pour les récifs coralliens, telles que déterminées par cette analyse, sont très proches de celles déterminées par des chercheurs précédents ; mais les niveaux précis de nutriments qui pourraient être considérés comme limitants pour les récifs coralliens n'étaient pas évidents à l'échelle de cette analyse. Cependant, contrairement à de nombreuses études précédentes qui invoquent une basse température comme facteur limitant pour les récifs à des latitudes plus élevées, cette étude indique que la saturation réduite en aragonite et la pénétration de la lumière, qui covarient toutes deux avec la température, peuvent également être limitantes. L'identification des environnements de récifs « marginaux » et une nouvelle classification des récifs basée sur des ensembles de conditions environnementales offrent une perspective mondiale améliorée pour prédire comment les récifs réagiront aux conditions environnementales changeantes.

@article{doi101093icb391146,
    author = "Kleypas, Joan A. and McManus, John and Menez, L.A.B.",
    title = "Environmental Limits to Coral Reef Development: Where Do We Draw the Line?",
    year = "1999",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = "SYNTHÈSE. Comprendre comment les récifs varient dans les gammes actuelles de conditions environnementales est essentiel pour comprendre comment les récifs coralliens s'adapteront à un environnement changeant. Des données environnementales mondiales sur la température, la salinité, la lumière, l'état de saturation en carbonate et les nutriments ont récemment été compilées pour près de 1 000 sites de récifs. Ces données ont été analysées statistiquement afin de (1) redéfinir les limites environnementales au-delà desquelles les récifs existent aujourd'hui, (2) identifier les récifs « marginaux », c'est-à-dire ceux qui existent près ou au-delà des limites environnementales « normales » de la distribution des récifs, et (3) classer de manière générale les récifs en fonction de ces variables environnementales majeures. Les limites de température et de salinité pour les récifs coralliens, telles que déterminées par cette analyse, sont très proches de celles déterminées par des chercheurs précédents ; mais les niveaux précis de nutriments qui pourraient être considérés comme limitants pour les récifs coralliens n'étaient pas évidents à l'échelle de cette analyse. Cependant, contrairement à de nombreuses études précédentes qui invoquent une basse température comme facteur limitant pour les récifs à des latitudes plus élevées, cette étude indique que la saturation réduite en aragonite et la pénétration de la lumière, qui covarient toutes deux avec la température, peuvent également être limitantes. L'identification des environnements de récifs « marginaux » et une nouvelle classification des récifs basée sur des ensembles de conditions environnementales offrent une perspective mondiale améliorée pour prédire comment les récifs réagiront aux conditions environnementales changeantes.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/39.1.146",
    doi = "10.1093/icb/39.1.146",
    openalex = "W2152904629",
    references = "doi1010160031018288901009, doi1010160037073888901285, doi101016s0921818198000356, doi1010291999gb001195, doi101029eo064i049p0096202, doi101038371123a0, doi1011751520044219930060114airtgs20co2, doi1023073514476, doi102475ajs2837780, openalexw1587057093"
}

revue par des pairs

@article{doi101093icb391160,
    author = "Gattuso, Jean‐Pierre et Allemand, Denis et Frankignoulle, Michel",
    title = "Photosynthèse et calcification aux niveaux cellulaire, organismal et communautaire dans les récifs coralliens : Revue des interactions et du contrôle par la chimie du carbonate",
    year = "1999",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = "revue par des pairs",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/39.1.160",
    doi = "10.1093/icb/39.1.160",
    openalex = "W2103819980",
    references = "doi101093icb391146, doi1011300091761319920200733rotcrh23co2"
}

Un récif corallien représente l'accumulation nette de carbonate de calcium (CaCO3) produite par les coraux et d'autres organismes calcifiants. Si la calcification diminue, la capacité de construction de récifs diminue également. La calcification des récifs coralliens dépend de l'état de saturation du minéral carbonaté aragonite des eaux de surface. Au milieu du siècle prochain, une concentration accrue de dioxyde de carbone réduira l'état de saturation de l'aragonite dans les tropiques de 30 % et la précipitation d'aragonite biogénique de 14 à 30 %. Les récifs coralliens sont particulièrement menacés, car les organismes constructeurs de récifs sécrètent des formes métastables de CaCO3, mais les conséquences biogéochimiques sur d'autres écosystèmes marins calcifiants peuvent être tout aussi graves.

@article{doi101126science2845411118,
    author = "Kleypas, Joan A. et Buddemeier, Robert W. et Archer, David et Gattuso, Jean‐Pierre et Langdon, Chris et Opdyke, Bradley N.",
    title = "Conséquences géochimiques de l'augmentation du dioxyde de carbone atmosphérique sur les récifs coralliens",
    year = "1999",
    journal = "Science",
    abstract = "Un récif corallien représente l'accumulation nette de carbonate de calcium (CaCO3) produite par les coraux et d'autres organismes calcifiants. Si la calcification diminue, la capacité de construction de récifs diminue également. La calcification des récifs coralliens dépend de l'état de saturation du minéral carbonaté aragonite des eaux de surface. Au milieu du siècle prochain, une concentration accrue de dioxyde de carbone réduira l'état de saturation de l'aragonite dans les tropiques de 30 % et la précipitation d'aragonite biogénique de 14 à 30 %. Les récifs coralliens sont particulièrement menacés, car les organismes constructeurs de récifs sécrètent des formes métastables de CaCO3, mais les conséquences biogéochimiques sur d'autres écosystèmes marins calcifiants peuvent être tout aussi graves.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.284.5411.118",
    doi = "10.1126/science.284.5411.118",
    openalex = "W1976061944",
    references = "doi101007bf01054491, doi101016001670379400354o, doi1010160198014987900215, doi1010160304420374900152, doi101029gm032, doi10103837333, doi101093icb391146, doi101093icb391160, doi102475ajs2837780, openalexw1587057093"
}

@article{doi101007s003380000086,
    author = "Marshall, Paul et Baird, Andrew H.",
    title = "Blanchissement des coraux sur le Grand Barrière de Corail : susceptibilités différentielles entre les taxons",
    year = "2000",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s003380000086",
    doi = "10.1007/s003380000086",
    openalex = "W2011181238"
}

@article{doi101007s003380050220,
    author = "Glynn, Peter W. et Ault, Jerald S.",
    title = "Analyse biogéographique et revue de la région des récifs coralliens du Pacifique oriental lointain",
    year = "2000",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s003380050220",
    doi = "10.1007/s003380050220",
    openalex = "W2163066808",
    references = "chave1972carbonate, doi1010160012821x87901543, doi101038342637a0, doi101093aibsbulletin3217e, doi101146annureves24110193001201, doi1023072531616, doi1023073514476, doi105962bhltitle46292, doi105962bhltitle59991, openalexw1524247963, openalexw2341328186"
}

La concentration de CO 2 dans l'atmosphère est projetée pour atteindre le double du niveau préindustriel d'ici le milieu du XXIe siècle. Cette augmentation réduira la concentration de CO 3 2− de l'océan de surface de 30 % par rapport au niveau préindustriel et réduira l'état de saturation en carbonate de calcium de l'océan de surface d'un pourcentage égal. En utilisant le grand mésocosme de récif corallien de 2650 m 3 situé dans les installations BIOSPHERE‐2 près de Tucson, en Arizona, nous avons étudié l'effet des changements projetés de la chimie du carbonate de l'eau de mer sur la calcification des organismes de récif corallien à l'échelle de la communauté. Notre conception expérimentale visait à obtenir une série temporelle longue (3,8 ans) de la calcification nette du système complet et de toutes les variables physiques et chimiques pertinentes (température, salinité, lumière, nutriments, Ca 2+, p CO 2, T CO 2 et alcalinité totale). Des ajouts périodiques de NaHCO 3, Na 2 CO 3 et/ou CaCl 2 ont été effectués pour modifier l'état de saturation en carbonate de calcium de l'eau. Nous avons constaté qu'il y avait des changements cohérents et reproductibles dans le taux de calcification en réponse à nos manipulations de l'état de saturation. Nous montrons que le taux de calcification nette de la communauté répond aux manipulations des concentrations de Ca 2+ et CO 3 2− et que le taux est bien décrit comme une fonction linéaire du produit des concentrations ioniques, [Ca 2+] 0.69 [CO 3 2−]. Cela suggère que l'état de saturation ou une quantité étroitement liée est un facteur environnemental primaire qui influence la calcification sur les récifs coralliens au niveau de l'écosystème. Nous comparons la sensibilité de la calcification aux changements à court terme (jours) et à long terme (mois à années) de l'état de saturation et constatons que la réponse n'est pas significativement différente. Cela indique que les organismes de récif corallien ne semblent pas pouvoir s'acclimater aux changements d'état de saturation. La diminution prévue de la calcification des récifs coralliens entre les années 1880 et 2065 apr. J.-C. basée sur nos résultats à long terme est de 40 %. Les études antérieures à petite échelle et à court terme sur les organismes prédisaient une réduction de la calcification de 14 à 30 %. Cette étude beaucoup plus longue à l'échelle de la communauté suggère que l'impact sur les récifs coralliens pourrait être plus important que ce qui était soupçonné. Au cours du prochain siècle, les récifs coralliens seront moins capables de faire face à la montée du niveau de la mer et à d'autres stress anthropiques.

@article{doi1010291999gb001195,
    author = "Langdon, Chris et Takahashi, Taro et Sweeney, Colm et Chipman, Dave et Goddard, J. et Marubini, Francesca et Aceves, Heather L. et Barnett, H. et Atkinson, Marlin J.",
    title = "Effet de l'état de saturation en carbonate de calcium sur le taux de calcification d'un récif corallien expérimental",
    year = "2000",
    journal = "Global Biogeochemical Cycles",
    abstract = "La concentration de CO 2 dans l'atmosphère est projetée pour atteindre le double du niveau préindustriel d'ici le milieu du XXIe siècle. Cette augmentation réduira la concentration de CO 3 2− de l'océan de surface de 30 % par rapport au niveau préindustriel et réduira l'état de saturation en carbonate de calcium de l'océan de surface d'un pourcentage égal. En utilisant le grand mésocosme de récif corallien de 2650 m 3 situé dans les installations BIOSPHERE‐2 près de Tucson, en Arizona, nous avons étudié l'effet des changements projetés de la chimie du carbonate de l'eau de mer sur la calcification des organismes de récif corallien à l'échelle de la communauté. Notre conception expérimentale visait à obtenir une série temporelle longue (3,8 ans) de la calcification nette du système complet et de toutes les variables physiques et chimiques pertinentes (température, salinité, lumière, nutriments, Ca 2+, p CO 2, T CO 2 et alcalinité totale). Des ajouts périodiques de NaHCO 3, Na 2 CO 3 et/ou CaCl 2 ont été effectués pour modifier l'état de saturation en carbonate de calcium de l'eau. Nous avons constaté qu'il y avait des changements cohérents et reproductibles dans le taux de calcification en réponse à nos manipulations de l'état de saturation. Nous montrons que le taux de calcification nette de la communauté répond aux manipulations des concentrations de Ca 2+ et CO 3 2− et que le taux est bien décrit comme une fonction linéaire du produit des concentrations ioniques, [Ca 2+] 0.69 [CO 3 2−]. Cela suggère que l'état de saturation ou une quantité étroitement liée est un facteur environnemental primaire qui influence la calcification sur les récifs coralliens au niveau de l'écosystème. Nous comparons la sensibilité de la calcification aux changements à court terme (jours) et à long terme (mois à années) de l'état de saturation et constatons que la réponse n'est pas significativement différente. Cela indique que les organismes de récif corallien ne semblent pas pouvoir s'acclimater aux changements d'état de saturation. La diminution prévue de la calcification des récifs coralliens entre les années 1880 et 2065 apr. J.-C. basée sur nos résultats à long terme est de 40 %. Les études antérieures à petite échelle et à court terme sur les organismes prédisaient une réduction de la calcification de 14 à 30 %. Cette étude beaucoup plus longue à l'échelle de la communauté suggère que l'impact sur les récifs coralliens pourrait être plus important que ce qui était soupçonné. Au cours du prochain siècle, les récifs coralliens seront moins capables de faire face à la montée du niveau de la mer et à d'autres stress anthropiques.",
    url = "https://doi.org/10.1029/1999gb001195",
    doi = "10.1029/1999gb001195",
    openalex = "W2059732463"
}

Les poissons récifaux tropicaux et les coraux présentent des motifs hautement prévisibles de composition taxonomique à travers les océans Indien et Pacifique. Malgré des gradients longitudinaux et latitudinaux prononcés en termes de richesse spécifique totale, la composition de ces taxons clés est contrainte dans une gamme de valeurs remarquablement étroite. La variation à l'échelle régionale de la biodiversité récifale est le mieux expliquée par les motifs à grande échelle de la disponibilité des habitats en eaux peu profondes. Une fois la superficie de l'habitat prise en compte, il y a étonnamment peu d'effet résiduel de la latitude ou de la longitude. Les régions à faible diversité sont les plus vulnérables aux impacts humains tels que le réchauffement climatique, soulignant le besoin urgent d'une gestion intégrée à l'échelle multinationale.

@article{doi101126science1058635,
    author = "Bellwood, David R. et Hughes, Terry P.",
    title = "Règles d'assemblage à l'échelle régionale et biodiversité des récifs coralliens",
    year = "2001",
    journal = "Science",
    abstract = "Les poissons récifaux tropicaux et les coraux présentent des motifs hautement prévisibles de composition taxonomique à travers les océans Indien et Pacifique. Malgré des gradients longitudinaux et latitudinaux prononcés en termes de richesse spécifique totale, la composition de ces taxons clés est contrainte dans une gamme de valeurs remarquablement étroite. La variation à l'échelle régionale de la biodiversité récifale est le mieux expliquée par les motifs à grande échelle de la disponibilité des habitats en eaux peu profondes. Une fois la superficie de l'habitat prise en compte, il y a étonnamment peu d'effet résiduel de la latitude ou de la longitude. Les régions à faible diversité sont les plus vulnérables aux impacts humains tels que le réchauffement climatique, soulignant le besoin urgent d'une gestion intégrée à l'échelle multinationale.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1058635",
    doi = "10.1126/science.1058635",
    openalex = "W1999174996",
    references = "doi101007s003380050220, doi101111j155856461999tb03769x, doi101126science2314734129"
}

Les récifs coralliens sont l'un des habitats biologiquement les plus diversifiés de la planète, abritant une variété extraordinaire de plantes et d'animaux marins. Ils constituent également l'un des écosystèmes les plus fragiles et les plus menacés du monde. La croissance du tourisme de masse, combinée à l'essor de la popularité de la plongée sous-marine, a attiré l'attention du public sur ces écosystèmes spectaculaires à travers le globe. Les récifs coralliens fournissent un habitat essentiel aux poissons, soutiennent des espèces en danger et menacées, et abritent des mammifères marins et des tortues protégés. Ils constituent une source importante d'aliments, génèrent des revenus et des emplois grâce au tourisme et aux loisirs marins, et offrent d'innombrables autres avantages aux humains, notamment en fournissant des composés pour les médicaments. Pourtant, les récifs coralliens du monde entier sont rapidement dégradés par de nombreuses activités humaines, telles que la surpêche, le développement côtier et l'introduction d'eaux usées, d'engrais et de sédiments. World Atlas of Coral Reefs offre le premier compte rendu détaillé et définitif de l'état actuel des récifs coralliens de notre planète. Grâce à sa richesse d'informations autorisées et à jour, aux meilleures cartes disponibles, ainsi qu'à des textes descriptifs détaillés et des images réalisés par des experts de premier plan, ce volume en couleurs sera une ressource cruciale pour quiconque s'intéresse à ces environnements vitaux. World Atlas of Coral Reefs contient quatre-vingt-quatre cartes en couleurs entièrement nouvelles, recherchées et dessinées sur une page complète, ainsi que plus de deux cents photos en couleurs illustrant les récifs, les animaux de récif et des images prises depuis l'espace par des astronautes de la NASA lors des vols de la navette spatiale en 2000 et 2001. Les auteurs fournissent une richesse d'informations sur la géographie, la biodiversité et les utilisations humaines des récifs coralliens, ainsi que des détails sur les menaces pesant sur leur existence. Préparé au Centre de surveillance de la conservation mondiale de l'UNEP à Cambridge, en Angleterre -- le bureau des Nations Unies chargé de fournir des informations autorisées sur l'état de la biodiversité mondiale -- l'Atlas sera un outil crucial pour les scientifiques, les étudiants, les décideurs politiques et les planificateurs aux niveaux local, national et international. La publication de World Atlas of Coral Reefs est soutenue par des institutions internationales, notamment le Programme des Nations Unies pour l'environnement, le Conseil des aquariums marins, l'Initiative internationale pour les récifs coralliens, l'ICLARM -- The World Fish Center, l'Association professionnelle des instructeurs de plongée et la Fondation Aventis.

@book{openalexw253507229,
    author = "Spalding, Mark and Ravilious, Corinna and Green, Edmund P.",
    title = "World atlas of coral reefs",
    year = "2001",
    abstract = "Les récifs coralliens sont l'un des habitats biologiquement les plus diversifiés de la planète, abritant une variété extraordinaire de plantes et d'animaux marins. Ils constituent également l'un des écosystèmes les plus fragiles et les plus menacés du monde. La croissance du tourisme de masse, combinée à l'essor de la popularité de la plongée sous-marine, a attiré l'attention du public sur ces écosystèmes spectaculaires à travers le globe. Les récifs coralliens fournissent un habitat essentiel aux poissons, soutiennent des espèces en danger et menacées, et abritent des mammifères marins et des tortues protégés. Ils constituent une source importante d'aliments, génèrent des revenus et des emplois grâce au tourisme et aux loisirs marins, et offrent d'innombrables autres avantages aux humains, notamment en fournissant des composés pour les médicaments. Pourtant, les récifs coralliens du monde entier sont rapidement dégradés par de nombreuses activités humaines, telles que la surpêche, le développement côtier et l'introduction d'eaux usées, d'engrais et de sédiments. World Atlas of Coral Reefs offre le premier compte rendu détaillé et définitif de l'état actuel des récifs coralliens de notre planète. Grâce à sa richesse d'informations autorisées et à jour, aux meilleures cartes disponibles, ainsi qu'à des textes descriptifs détaillés et des images réalisés par des experts de premier plan, ce volume en couleurs sera une ressource cruciale pour quiconque s'intéresse à ces environnements vitaux. World Atlas of Coral Reefs contient quatre-vingt-quatre cartes en couleurs entièrement nouvelles, recherchées et dessinées sur une page complète, ainsi que plus de deux cents photos en couleurs illustrant les récifs, les animaux de récif et des images prises depuis l'espace par des astronautes de la NASA lors des vols de la navette spatiale en 2000 et 2001. Les auteurs fournissent une richesse d'informations sur la géographie, la biodiversité et les utilisations humaines des récifs coralliens, ainsi que des détails sur les menaces pesant sur leur existence. Préparé au Centre de surveillance de la conservation mondiale de l'UNEP à Cambridge, en Angleterre -- le bureau des Nations Unies chargé de fournir des informations autorisées sur l'état de la biodiversité mondiale -- l'Atlas sera un outil crucial pour les scientifiques, les étudiants, les décideurs politiques et les planificateurs aux niveaux local, national et international. La publication de World Atlas of Coral Reefs est soutenue par des institutions internationales, notamment le Programme des Nations Unies pour l'environnement, le Conseil des aquariums marins, l'Initiative internationale pour les récifs coralliens, l'ICLARM -- The World Fish Center, l'Association professionnelle des instructeurs de plongée et la Fondation Aventis.",
    openalex = "W253507229"
}

Malgré des recherches étendues sur le phénomène de blanchissement des coraux, il existe très peu de données examinant la biologie des populations des espèces touchées. Ces données sont nécessaires pour prédire la capacité des coraux à répondre aux changements environnementaux. Nous avons suivi des colonies individuelles de 4 espèces de coraux courantes pendant 8 mois après des températures de surface de la mer historiquement élevées sur le Great Barrier Reef en 1998, afin de comparer leur réponse au stress thermique et leur récupération, et d'examiner l'effet du blanchissement sur la croissance et la reproduction chez 2 espèces d'Acropora. Les colonies de Platygyra daedalea et P. lobata ont mis plus de temps à blanchir, plus de temps à récupérer et plus de temps à mourir. En revanche, les colonies d'Acropora hyacinthus et A. millepora ont blanchi rapidement et la plupart avaient soit récupéré, soit mouru, dans les 14 semaines suivant les premiers rapports de blanchissement. La mortalité des colonies entières était élevée chez A. hyacinthus (88 %) et A. millepora (32 %) et la mortalité partielle rare. En revanche, la plupart des colonies de P. daedalea et P. lobata ont perdu du tissu et peu de colonies entières sont mortes. La proportion moyenne de tissu perdu par colonie était de 43 ± 6,6 % et 11 ± 1,1 % respectivement. Par conséquent, les hiérarchies observées de la susceptibilité des espèces dépendront critique ment du temps écoulé depuis le début du stress et doivent prendre en compte à la fois la mortalité des colonies entières et la mortalité partielle. La mortalité des colonies était fortement dépendante des estimations visuelles de la sévérité du blanchissement mais indépendante de la taille. Les taux de croissance des colonies d'Acropora étaient très variables et largement indépendants de la sévérité du blanchissement. A. hyacinthus était plus susceptible au blanchissement que A. millepora, avec 45 % des colonies survivantes gravides contre 88 %. La forte mortalité des colonies entières combinée à une réduction de la production reproductive des Acropora survivantes suggère que la récupération aux niveaux d'abondance précédents sera probablement lente.

@article{doi103354meps237133,
    author = "Baird, AH et Marshall, PA",
    title = "Mortalité, croissance et reproduction chez les coraux scléractiniens après blanchissement sur le Great Barrier Reef",
    year = "2002",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "Malgré des recherches étendues sur le phénomène de blanchissement des coraux, il existe très peu de données examinant la biologie des populations des espèces touchées. Ces données sont nécessaires pour prédire la capacité des coraux à répondre aux changements environnementaux. Nous avons suivi des colonies individuelles de 4 espèces de coraux courantes pendant 8 mois après des températures de surface de la mer historiquement élevées sur le Great Barrier Reef en 1998, afin de comparer leur réponse au stress thermique et leur récupération, et d'examiner l'effet du blanchissement sur la croissance et la reproduction chez 2 espèces d'Acropora. Les colonies de Platygyra daedalea et P. lobata ont mis plus de temps à blanchir, plus de temps à récupérer et plus de temps à mourir. En revanche, les colonies d'Acropora hyacinthus et A. millepora ont blanchi rapidement et la plupart avaient soit récupéré, soit mouru, dans les 14 semaines suivant les premiers rapports de blanchissement. La mortalité des colonies entières était élevée chez A. hyacinthus (88 %) et A. millepora (32 %) et la mortalité partielle rare. En revanche, la plupart des colonies de P. daedalea et P. lobata ont perdu du tissu et peu de colonies entières sont mortes. La proportion moyenne de tissu perdu par colonie était de 43 ± 6,6 % et 11 ± 1,1 % respectivement. Par conséquent, les hiérarchies observées de la susceptibilité des espèces dépendront critique ment du temps écoulé depuis le début du stress et doivent prendre en compte à la fois la mortalité des colonies entières et la mortalité partielle. La mortalité des colonies était fortement dépendante des estimations visuelles de la sévérité du blanchissement mais indépendante de la taille. Les taux de croissance des colonies d'Acropora étaient très variables et largement indépendants de la sévérité du blanchissement. A. hyacinthus était plus susceptible au blanchissement que A. millepora, avec 45 % des colonies survivantes gravides contre 88 %. La forte mortalité des colonies entières combinée à une réduction de la production reproductive des Acropora survivantes suggère que la récupération aux niveaux d'abondance précédents sera probablement lente.",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps237133",
    doi = "10.3354/meps237133",
    openalex = "W2148447618",
    references = "doi103354meps007207"
}

La diversité, la fréquence et l'ampleur des impacts humains sur les récifs coralliens augmentent au point que les récifs sont menacés à l'échelle mondiale. Les augmentations projetées de dioxyde de carbone et de température au cours des 50 prochaines années dépassent les conditions dans lesquelles les récifs coralliens ont prospéré au cours des demi-million dernières années. Cependant, les récifs changeront plutôt que de disparaître entièrement, certaines espèces montrant déjà une bien plus grande tolérance au changement climatique et au blanchissement des coraux que d'autres. L'intégration internationale des stratégies de gestion qui soutiennent la résilience des récifs doit être vigoureusement mise en œuvre et complétée par des décisions politiques fortes visant à réduire le taux de réchauffement climatique.

@article{doi101126science1085046,
    author = "Hughes, Terry P. et Baird, Andrew H. et Bellwood, David R. et Card, M. A. et Connolly, Sean R. et Folke, Carl et Grosberg, Richard K. et Hoegh‐Guldberg, Ove et Jackson, Jeremy B. C. et Kleypas, Joan A. et Lough, Janice et Marshall, Paul et Nyström, Magnus et Palumbi, Stephen R. et Pandolfi, John M. et Rosen, Brian et Roughgarden, Joan",
    title = "Climate Change, Human Impacts, and the Resilience of Coral Reefs",
    year = "2003",
    journal = "Science",
    abstract = "La diversité, la fréquence et l'ampleur des impacts humains sur les récifs coralliens augmentent au point que les récifs sont menacés à l'échelle mondiale. Les augmentations projetées de dioxyde de carbone et de température au cours des 50 prochaines années dépassent les conditions dans lesquelles les récifs coralliens ont prospéré au cours des demi-million dernières années. Cependant, les récifs changeront plutôt que de disparaître entièrement, certaines espèces montrant déjà une bien plus grande tolérance au changement climatique et au blanchissement des coraux que d'autres. L'intégration internationale des stratégies de gestion qui soutiennent la résilience des récifs doit être vigoureusement mise en œuvre et complétée par des décisions politiques fortes visant à réduire le taux de réchauffement climatique.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1085046",
    doi = "10.1126/science.1085046",
    openalex = "W2142598180",
    references = "doi101016s0921800999000099, doi101071mf99078, doi101126science1059199, doi101126science1085706, doi101126science2845411118"
}

La dégradation des écosystèmes de récifs coralliens a commencé il y a des siècles, mais il n'existe pas de synthèse mondiale sur l'ampleur des changements. Nous avons compilé des données remontant à des milliers d'années sur l'état et les tendances de sept grands groupes de carnivores, d'herbivores et d'espèces architecturales dans 14 régions. Les grands animaux ont décliné avant les petits animaux et les espèces architecturales, et les récifs de l'Atlantique ont décliné avant ceux de la mer Rouge et d'Australie, mais les trajectoires de déclin étaient nettement similaires dans le monde entier. Tous les récifs étaient considérablement dégradés bien avant les épidémies de maladies coralliennes et de blanchissement. Peu importe ces nouvelles menaces, les récifs ne survivront pas sans une protection immédiate contre l'exploitation humaine à grande échelle spatiale.

@article{doi101126science1085706,
    author = "Pandolfi, John M. et Bradbury, Roger et Sala, Enric et Hughes, Terry P. et Bjorndal, Karen A. et Cooke, Richard G. et McArdle, Deborah et McClenachan, Loren et Newman, Marah J. H. et Paredes, Gustavo et Warner, Robert R. et Jackson, Jeremy B. C.",
    title = "Trajectoires mondiales du déclin à long terme des écosystèmes de récifs coralliens",
    year = "2003",
    journal = "Science",
    abstract = "La dégradation des écosystèmes de récifs coralliens a commencé il y a des siècles, mais il n'existe pas de synthèse mondiale sur l'ampleur des changements. Nous avons compilé des données remontant à des milliers d'années sur l'état et les tendances de sept grands groupes de carnivores, d'herbivores et d'espèces architecturales dans 14 régions. Les grands animaux ont décliné avant les petits animaux et les espèces architecturales, et les récifs de l'Atlantique ont décliné avant ceux de la mer Rouge et d'Australie, mais les trajectoires de déclin étaient nettement similaires dans le monde entier. Tous les récifs étaient considérablement dégradés bien avant les épidémies de maladies coralliennes et de blanchissement. Peu importe ces nouvelles menaces, les récifs ne survivront pas sans une protection immédiate contre l'exploitation humaine à grande échelle spatiale.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1085706",
    doi = "10.1126/science.1085706",
    openalex = "W2100216289",
    references = "doi10100797894017328402, doi101016014362289090024j, doi101016016953479090113r, doi101071mf99078, doi101126science1059199, doi101126science1085046, doi101126science26551781547, doi101126science28554331505, doi1018900012961519970670461aysoca20co2, doi103354meps062185, openalexw570265017"
}

La relation entre les coraux et leurs endosymbiontes algues a été un facteur clé du succès des coraux scléractiniaires (durs) en tant que constructeurs modernes de récifs, mais peu est connu sur les premières étapes de l'établissement de la symbiose. Ici, nous montrons que l'absorption initiale de zooxanthelles par les coraux juvéniles lors d'une infection naturelle est non spécifique (un trait potentiellement adaptatif) ; l'association est flexible et caractérisée par un changement dans les souches (dominantes) de zooxanthelles au fil du temps ; et les taux de croissance des holobiontes de coraux infectés expérimentalement sont en partie contingents à la souche de zooxanthelle hébergée, avec des juvéniles infectés par le clade C qui croissent deux à trois fois plus vite que ceux infectés par le clade D.

@article{doi101126science1095733,
    author = "Little, Angela F. et van Oppen, Madeleine J. H. et Willis, Bette L.",
    title = "Flexibilité des endosymbioses algales façonne la croissance des coraux de récif",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = "La relation entre les coraux et leurs endosymbiontes algues a été un facteur clé du succès des coraux scléractiniaires (durs) en tant que constructeurs modernes de récifs, mais peu est connu sur les premières étapes de l'établissement de la symbiose. Ici, nous montrons que l'absorption initiale de zooxanthelles par les coraux juvéniles lors d'une infection naturelle est non spécifique (un trait potentiellement adaptatif) ; l'association est flexible et caractérisée par un changement dans les souches (dominantes) de zooxanthelles au fil du temps ; et les taux de croissance des holobiontes de coraux infectés expérimentalement sont en partie contingents à la souche de zooxanthelle hébergée, avec des juvéniles infectés par le clade C qui croissent deux à trois fois plus vite que ceux infectés par le clade D.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1095733",
    doi = "10.1126/science.1095733",
    openalex = "W2123619757"
}

La capacité des récifs coralliens à survivre aux augmentations de température projetées dues au réchauffement climatique dépendra largement de la capacité des coraux à s'adapter ou à s'acclimater aux extrêmes de température accrus au cours des prochaines décennies. De nombreuses espèces de coraux sont très sensibles au stress thermique et le nombre d'épisodes de stress (blanchissement) a augmenté au cours des dernières décennies. Nous avons étudié le potentiel d'acclimatation d'Acropora millepora, une espèce de corail dur répandue et commune dans l'Indo-Pacifique, par transplantation et manipulation expérimentale. Nous montrons que les coraux adultes, du moins dans certaines circonstances, sont capables d'acquérir une tolérance thermique accrue et que cette tolérance accrue est le résultat direct d'un changement du type de symbiote dominant leurs tissus, passant du type C du Symbiodinium au type D. Nos données suggèrent que le changement de type de symbiote dans notre expérience était dû à un mélange des types déjà présents dans les tissus des coraux, et non à une uptake exogène depuis l'environnement. Le niveau de tolérance accrue acquis par les coraux changeant leur type de symbiote dominant vers D (le type le plus résistant thermiquement connu) est d'environ 1-1,5 °C. Il s'agit de la première étude à montrer que l'acclimatation thermique est causalement liée au type de symbiote et fournit de nouveaux aperçus sur l'avantage écologique des coraux abritant des populations d'algues mixtes. Bien que cette augmentation soit d'une importance écologique énorme pour de nombreuses espèces de coraux, en l'absence d'autres mécanismes d'acclimatation/adaptation thermique, elle pourrait ne pas être suffisante pour survivre au changement climatique sous les scénarios de température de surface de la mer prédits pour les 100 prochaines années. Cependant, elle pourrait suffire à « gagner du temps » pendant que des mesures de réduction des gaz à effet de serre sont mises en place.

@article{doi101098rspb20063567,
    author = "Berkelmans, Ray et van Oppen, Madeleine J. H.",
    title = "Le rôle des zooxanthelles dans la tolérance thermique des coraux : un « grain d'espoir » pour les récifs coralliens à l'ère du changement climatique",
    year = "2006",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "La capacité des récifs coralliens à survivre aux augmentations de température projetées dues au réchauffement climatique dépendra largement de la capacité des coraux à s'adapter ou à s'acclimater aux extrêmes de température accrus au cours des prochaines décennies. De nombreuses espèces de coraux sont très sensibles au stress thermique et le nombre d'épisodes de stress (blanchissement) a augmenté au cours des dernières décennies. Nous avons étudié le potentiel d'acclimatation d'Acropora millepora, une espèce de corail dur répandue et commune dans l'Indo-Pacifique, par transplantation et manipulation expérimentale. Nous montrons que les coraux adultes, du moins dans certaines circonstances, sont capables d'acquérir une tolérance thermique accrue et que cette tolérance accrue est le résultat direct d'un changement du type de symbiote dominant leurs tissus, passant du type C du Symbiodinium au type D. Nos données suggèrent que le changement de type de symbiote dans notre expérience était dû à un mélange des types déjà présents dans les tissus des coraux, et non à une uptake exogène depuis l'environnement. Le niveau de tolérance accrue acquis par les coraux changeant leur type de symbiote dominant vers D (le type le plus résistant thermiquement connu) est d'environ 1-1,5 °C. Il s'agit de la première étude à montrer que l'acclimatation thermique est causalement liée au type de symbiote et fournit de nouveaux aperçus sur l'avantage écologique des coraux abritant des populations d'algues mixtes. Bien que cette augmentation soit d'une importance écologique énorme pour de nombreuses espèces de coraux, en l'absence d'autres mécanismes d'acclimatation/adaptation thermique, elle pourrait ne pas être suffisante pour survivre au changement climatique sous les scénarios de température de surface de la mer prédits pour les 100 prochaines années. Cependant, elle pourrait suffire à « gagner du temps » pendant que des mesures de réduction des gaz à effet de serre sont mises en place.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2006.3567",
    doi = "10.1098/rspb.2006.3567",
    openalex = "W2144114664",
    references = "doi101007s0022700414272, doi101146annurevecolsys34011802132417"
}

Les récifs coralliens sont généralement associés aux mers tropicales peu profondes ; cependant, l'exploration récente des océans profonds utilisant des acoustiques avancées et des sous-marins a révélé des écosystèmes coralliens inattendus, largement répandus et diversifiés dans les eaux profondes sur les plateaux continentaux, les pentes, les monts sous-marins et les systèmes de crêtes à travers le monde. Les avancées examinées ici incluent l'utilisation des coraux comme archives paléoclimatiques et leur fonctionnement biogéologique, leur biodiversité et leur biogéographie. Les menaces pour ces écosystèmes fragiles, longévifs et riches s'accumulent : les impacts de la pêche au chalut en eaux profondes sont déjà largement répandus, et les effets de l'acidification des océans sont potentiellement dévastateurs.

@article{doi101126science1119861,
    author = "Roberts, J. Murray et Wheeler, Andrew J. et Freiwald, André",
    title = "Reefs of the Deep : La biologie et la géologie des écosystèmes de coraux d'eaux froides",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    abstract = "Les récifs coralliens sont généralement associés aux mers tropicales peu profondes ; cependant, l'exploration récente des océans profonds utilisant des acoustiques avancées et des sous-marins a révélé des écosystèmes coralliens inattendus, largement répandus et diversifiés dans les eaux profondes sur les plateaux continentaux, les pentes, les monts sous-marins et les systèmes de crêtes à travers le monde. Les avancées examinées ici incluent l'utilisation des coraux comme archives paléoclimatiques et leur fonctionnement biogéologique, leur biodiversité et leur biogéographie. Les menaces pour ces écosystèmes fragiles, longévifs et riches s'accumulent : les impacts de la pêche au chalut en eaux profondes sont déjà largement répandus, et les effets de l'acidification des océans sont potentiellement dévastateurs.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1119861",
    doi = "10.1126/science.1119861",
    openalex = "W2137258492"
}

La concentration atmosphérique de dioxyde de carbone devrait dépasser 500 parties par million et les températures mondiales augmenter d'au moins 2 degrés C d'ici 2050 à 2100, des valeurs qui dépassent significativement celles d'au moins les 420 000 dernières années au cours desquelles la plupart des organismes marins actuels ont évolué. Dans les conditions attendues au XXIe siècle, le réchauffement climatique et l'acidification des océans compromettront l'accrétion carbonatée, les coraux devenant de plus en plus rares sur les systèmes de récifs. Le résultat sera des communautés de récifs moins diversifiées et des structures de récifs carbonatés qui ne seront pas maintenues. Le changement climatique exacerbe également les stress locaux dus à la dégradation de la qualité de l'eau et à la surexploitation d'espèces clés, poussant les récifs de plus en plus vers le point de bascule pour un effondrement fonctionnel. Cette revue présente des scénarios futurs pour les récifs coralliens qui prédisent des conséquences de plus en plus graves pour les pêcheries associées aux récifs, le tourisme, la protection côtière et les populations. Alors que débute l'Année internationale du récif en 2008, des interventions de gestion à plus grande échelle et des mesures décisives sur les émissions mondiales sont nécessaires si l'on veut éviter la perte des écosystèmes dominés par les coraux.

@article{doi101126science1152509,
    author = "Hoegh‐Guldberg, Ove et Mumby, Peter J. et Hooten, Anthony J. et Steneck, Robert S. et Greenfield, Paul et Gomez, E. D. et Harvell, C. Drew et Sale, Peter F. et Edwards, Alasdair J. et Caldeira, K. et Knowlton, Nancy et Eakin, C. Mark et Iglesias‐Prieto, Roberto et Muthiga, Nyawira A. et Bradbury, Roger et Dubi, Alfonse et Hatziolos, Marea Eleni",
    title = "Les récifs coralliens sous un changement climatique rapide et l'acidification des océans",
    year = "2007",
    journal = "Science",
    abstract = "La concentration atmosphérique de dioxyde de carbone devrait dépasser 500 parties par million et les températures mondiales augmenter d'au moins 2 degrés C d'ici 2050 à 2100, des valeurs qui dépassent significativement celles d'au moins les 420 000 dernières années au cours desquelles la plupart des organismes marins actuels ont évolué. Dans les conditions attendues au XXIe siècle, le réchauffement climatique et l'acidification des océans compromettront l'accrétion carbonatée, les coraux devenant de plus en plus rares sur les systèmes de récifs. Le résultat sera des communautés de récifs moins diversifiées et des structures de récifs carbonatés qui ne seront pas maintenues. Le changement climatique exacerbe également les stress locaux dus à la dégradation de la qualité de l'eau et à la surexploitation d'espèces clés, poussant les récifs de plus en plus vers le point de bascule pour un effondrement fonctionnel. Cette revue présente des scénarios futurs pour les récifs coralliens qui prédisent des conséquences de plus en plus graves pour les pêcheries associées aux récifs, le tourisme, la protection côtière et les populations. Alors que débute l'Année internationale du récif en 2008, des interventions de gestion à plus grande échelle et des mesures décisives sur les émissions mondiales sont nécessaires si l'on veut éviter la perte des écosystèmes dominés par les coraux.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1152509",
    doi = "10.1126/science.1152509",
    openalex = "W2123920115",
    references = "doi101016s0012825202001046, doi101016s0921800999000099, doi10103820859, doi101071mf99078, doi101073pnas0702737104, doi101093icb326674, doi101093icb391146, doi101126science1063699, doi101126science1085046, doi101126science1116448, doi101146annurevecolsys271477, doi101371journalpone0000711, doi102475ajs294156, doi102475ajs3012182, openalexw1621450917, openalexw2907110490, openalexw2939474406, openalexw2986345846, openalexw617039848"
}

@article{doi101007s003380080418z,
    author = "Perry, Chris T. et Spencer, Tom et Kench, Paul S.",
    title = "Bilans en carbonates et états de production des récifs : une perspective géomorphologique sur le concept de changement de phase écologique",
    year = "2008",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00338-008-0418-z",
    doi = "10.1007/s00338-008-0418-z",
    openalex = "W2072549492",
    references = "doi101016s0025326x99002374"
}

Le statut de conservation de 845 espèces de coraux constructeurs de récifs zooxanthellés a été évalué en utilisant les critères de la Liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature. Sur les 704 espèces pour lesquelles un statut de conservation a pu être attribué, 32,8 % se trouvent dans des catégories présentant un risque accru d'extinction. Les déclins d'abondance sont associés au blanchissement et aux maladies provoqués par des températures de surface de la mer élevées, le risque d'extinction étant encore exacerbé par des perturbations anthropiques à l'échelle locale. La proportion de coraux menacés d'extinction a augmenté de manière spectaculaire au cours des dernières décennies et dépasse celle de la plupart des groupes terrestres. Les Caraïbes comptent la plus grande proportion de coraux dans les catégories de haut risque d'extinction, tandis que le Triangle des coraux (Pacifique occidental) présente la plus forte proportion d'espèces dans toutes les catégories de risque d'extinction accru. Nos résultats soulignent la situation critique généralisée des récifs coralliens et l'urgence de mettre en œuvre des mesures de conservation.

@article{doi101126science1159196,
    author = "Carpenter, Kent E. et Abrar, Muhammad et Aeby, Greta S. et Aronson, Richard B. et Banks, Stuart et Bruckner, Andrew W. et Chiriboga, Angel I. et Cortés, Jorge et Delbeek, J. Charles et DeVantier, Lyndon et Edgar, Graham J. et Edwards, Alasdair J. et Fenner, Douglas et Guzmán, Héctor M. et Hoeksema, Bert W. et Hodgson, Gregor et Johan, Ofri et Licuanan, Wilfredo Y. et Livingstone, Suzanne R. et Lovell, Edward R. et Moore, Jennifer et Obura, David O. et Ochavillo, Domingo et Polidoro, Beth et Precht, William F. et Quibilan, Miledel Christine C. et Reboton, Clarissa et Richards, Zoe T. et Rogers, Alex D. et Sanciangco, Jonnell C. et Sheppard, Anne et Sheppard, Charles et Smith, Jennifer E. et Stuart, Simon N. et Turak, Emre et Veron, J. E. N. et Wallace, Carden C. et Weil, Ernesto et Wood, Elizabeth",
    title = "Un tiers des coraux constructeurs de récifs font face à un risque d'extinction accru dû aux changements climatiques et aux impacts locaux",
    year = "2008",
    journal = "Science",
    abstract = "Le statut de conservation de 845 espèces de coraux constructeurs de récifs zooxanthellés a été évalué en utilisant les critères de la Liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature. Sur les 704 espèces pour lesquelles un statut de conservation a pu être attribué, 32,8 % se trouvent dans des catégories présentant un risque accru d'extinction. Les déclins d'abondance sont associés au blanchissement et aux maladies provoqués par des températures de surface de la mer élevées, le risque d'extinction étant encore exacerbé par des perturbations anthropiques à l'échelle locale. La proportion de coraux menacés d'extinction a augmenté de manière spectaculaire au cours des dernières décennies et dépasse celle de la plupart des groupes terrestres. Les Caraïbes comptent la plus grande proportion de coraux dans les catégories de haut risque d'extinction, tandis que le Triangle des coraux (Pacifique occidental) présente la plus forte proportion d'espèces dans toutes les catégories de risque d'extinction accru. Nos résultats soulignent la situation critique généralisée des récifs coralliens et l'urgence de mettre en œuvre des mesures de conservation.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1159196",
    doi = "10.1126/science.1159196",
    openalex = "W2153213062",
    references = "doi101126science1085706"
}

Une conservation efficace nécessite des références de base rigoureuses des conditions vierges pour évaluer les impacts des activités humaines et pour juger de l'efficacité de la gestion. La plupart des récifs coralliens sont modérément à sévèrement dégradés par les activités humaines locales telles que la pêche et la pollution, ainsi que par les changements globaux, ce qui rend difficile la séparation des effets locaux des effets globaux. À cette fin, nous avons enquêté sur les récifs coralliens des atolls inhabités des îles Line du nord afin de fournir une référence de base de la structure de la communauté récifale, et sur des atolls de plus en plus peuplés pour documenter les changements associés aux activités humaines. Nous avons constaté que les prédateurs supérieurs et les organismes constructeurs de récifs dominaient les Kingman et Palmyra inhabités, tandis que les petits poissons planctonivores et les algues charnues dominaient les atolls peuplés de Tabuaeran et Kiritimati. Les requins et autres prédateurs supérieurs ont écrasé les assemblages de poissons sur Kingman et Palmyre de sorte que la pyramide de biomasse était inversée (surpeuplée au sommet). En revanche, la pyramide de biomasse à Tabuaeran et Kiritimati présentait le motif typique de surpeuplement au fond. Les récifs sans population humaine présentaient moins de maladies coralliennes et un recrutement corallien plus élevé par rapport aux récifs plus peuplés. Ainsi, la protection contre la surpêche et la pollution semble augmenter la résilience des écosystèmes récifaux aux effets du réchauffement climatique.

@article{doi101371journalpone0001548,
    author = "Sandin, Stuart A. et Smith, Jennifer E. et DeMartini, Edward E. et Dinsdale, Elizabeth A. et Donner, Simon D. et Friedlander, Alan M. et Konotchick, Talina et Malay, Maria Celia D. et Maragos, James E. et Obura, David et Pantos, Olga et Paulay, Gustav et Richie, Morgan et Rohwer, Forest et Schroeder, Robert E. et Walsh, Sheila et Jackson, Jeremy B. C. et Knowlton, Nancy et Sala, Enric",
    title = "Baselines and Degradation of Coral Reefs in the Northern Line Islands",
    year = "2008",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Une conservation efficace nécessite des références de base rigoureuses des conditions vierges pour évaluer les impacts des activités humaines et pour juger de l'efficacité de la gestion. La plupart des récifs coralliens sont modérément à sévèrement dégradés par les activités humaines locales telles que la pêche et la pollution, ainsi que par les changements globaux, ce qui rend difficile la séparation des effets locaux des effets globaux. À cette fin, nous avons enquêté sur les récifs coralliens des atolls inhabités des îles Line du nord afin de fournir une référence de base de la structure de la communauté récifale, et sur des atolls de plus en plus peuplés pour documenter les changements associés aux activités humaines. Nous avons constaté que les prédateurs supérieurs et les organismes constructeurs de récifs dominaient les Kingman et Palmyra inhabités, tandis que les petits poissons planctonivores et les algues charnues dominaient les atolls peuplés de Tabuaeran et Kiritimati. Les requins et autres prédateurs supérieurs ont écrasé les assemblages de poissons sur Kingman et Palmyre de sorte que la pyramide de biomasse était inversée (surpeuplée au sommet). En revanche, la pyramide de biomasse à Tabuaeran et Kiritimati présentait le motif typique de surpeuplement au fond. Les récifs sans population humaine présentaient moins de maladies coralliennes et un recrutement corallien plus élevé par rapport aux récifs plus peuplés. Ainsi, la protection contre la surpêche et la pollution semble augmenter la résilience des écosystèmes récifaux aux effets du réchauffement climatique.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0001548",
    doi = "10.1371/journal.pone.0001548",
    openalex = "W2113903666",
    references = "doi101046j14429993200101070x, doi101371journalpone0000711, openalexw2726333806"
}

Les récifs coralliens sont apparus comme l'un des écosystèmes les plus vulnérables aux variations et changements climatiques. Si la contribution d'un climat réchauffé à la perte de la couverture de corail vivant a été bien documentée à grande échelle spatiale et temporelle, les effets associés sur les poissons ne l'ont pas été. Ici, nous répondons aux appels récents et répétés à évaluer l'importance de la gestion locale pour la conservation des récifs coralliens dans le contexte du changement climatique mondial. Ces informations sont importantes, car les assemblages de poissons de récifs coralliens constituent les communautés vertébrées les plus denses en espèces sur terre, contribuant à des fonctions écosystémiques critiques et fournissant des services écosystémiques cruciaux aux sociétés humaines dans les pays tropicaux. Notre évaluation des impacts de l'événement de blanchissement massif de 1998 sur la couverture de corail, la complexité structurelle du récif et les poissons associés au récif couvre 7 pays, 66 sites et 26 degrés de latitude dans l'océan Indien. En utilisant une méta-analyse bayésienne, nous montrons que les changements dans la structure de taille, la diversité et la composition trophique de la communauté de poissons de récif ont suivi les déclins des coraux. Bien que l'intégrité à l'échelle océanique de ces écosystèmes de récifs coralliens ait été perdue, il est positif de constater que les effets sont spatialement variables à plusieurs échelles, avec des impacts et une vulnérabilité affectés par la géographie mais pas par le régime de gestion. Les aires marines protégées sans prélèvement existantes soutiennent encore une biomasse élevée de poissons, cependant elles n'ont eu aucun effet positif sur la réponse de l'écosystème à une perturbation à grande échelle. Cela suggère la nécessité pour les futurs efforts de conservation et de gestion d'identifier et de protéger des refuges régionaux, qui devraient être intégrés dans les cadres de gestion existants et combinés à des politiques visant à améliorer la résilience globale du système aux variations et changements climatiques.

@article{doi101371journalpone0003039,
    author = "Graham, Nicholas A. J. et McClanahan, Tim R. et MacNeil, M. Aaron et Wilson, Shaun K. et Polunin, Nicholas et Jennings, Simon et Chabanet, Pascale et Clark, Susan et Spalding, Mark et Letourneur, Yves et Bigot, Lionel et Galzin, René et Öhman, Marcus et Garpe, Kajsa et Edwards, Alasdair J. et Sheppard, Charles",
    title = "Climate Warming, Marine Protected Areas and the Ocean-Scale Integrity of Coral Reef Ecosystems",
    year = "2008",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Les récifs coralliens sont apparus comme l'un des écosystèmes les plus vulnérables aux variations et changements climatiques. Si la contribution d'un climat réchauffé à la perte de la couverture de corail vivant a été bien documentée à grande échelle spatiale et temporelle, les effets associés sur les poissons ne l'ont pas été. Ici, nous répondons aux appels récents et répétés à évaluer l'importance de la gestion locale pour la conservation des récifs coralliens dans le contexte du changement climatique mondial. Ces informations sont importantes, car les assemblages de poissons de récifs coralliens constituent les communautés vertébrées les plus denses en espèces sur terre, contribuant à des fonctions écosystémiques critiques et fournissant des services écosystémiques cruciaux aux sociétés humaines dans les pays tropicaux. Notre évaluation des impacts de l'événement de blanchissement massif de 1998 sur la couverture de corail, la complexité structurelle du récif et les poissons associés au récif couvre 7 pays, 66 sites et 26 degrés de latitude dans l'océan Indien. En utilisant une méta-analyse bayésienne, nous montrons que les changements dans la structure de taille, la diversité et la composition trophique de la communauté de poissons de récif ont suivi les déclins des coraux. Bien que l'intégrité à l'échelle océanique de ces écosystèmes de récifs coralliens ait été perdue, il est positif de constater que les effets sont spatialement variables à plusieurs échelles, avec des impacts et une vulnérabilité affectés par la géographie mais pas par le régime de gestion. Les aires marines protégées sans prélèvement existantes soutiennent encore une biomasse élevée de poissons, cependant elles n'ont eu aucun effet positif sur la réponse de l'écosystème à une perturbation à grande échelle. Cela suggère la nécessité pour les futurs efforts de conservation et de gestion d'identifier et de protéger des refuges régionaux, qui devraient être intégrés dans les cadres de gestion existants et combinés à des politiques visant à améliorer la résilience globale du système aux variations et changements climatiques.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0003039",
    doi = "10.1371/journal.pone.0003039",
    openalex = "W1994387974"
}

La dégradation des récifs coralliens est souvent associée à des changements dans la structure de la communauté où les macroalgues deviennent la forme de vie benthique dominante. Ces transitions de phase peuvent être difficiles à inverser. Le débat sur les transitions de phase des récifs coralliens n'a pas porté sur les rapports concernant la domination des récifs coralliens par d'autres formes de vie suite à une perturbation. Une revue de la littérature primaire et grise indique que les récifs dominés par les corallimorphaires, les coraux mous, les éponges et les oursins de mer peuvent entrer dans un état alternatif en raison d'une transition de phase. Les transitions peuvent être déclenchées par des perturbations ponctuelles qui causent une mortalité corallienne à grande échelle et peuvent devenir stables en raison de mécanismes de rétroaction positive. Cependant, elles peuvent différer de la transition archétypale corail-macroalgues, selon les facteurs qui entraînent la transition ; alors que les transitions corail-macroalgues et corail-oursin semblent être entraînées par la perte du contrôle top-down par la surpêche, les transitions vers la domination des corallimorphaires, des coraux mous et des éponges semblent plus associées à des changements dans les dynamiques bottom-up. La compréhension des différences et des similitudes dans les mécanismes qui causent et maintiennent cette variété d'états alternatifs aidera la gestion visant à prévenir et à inverser les transitions de phase des récifs coralliens.

@article{doi103354meps07815,
    author = "Norström, Albert V. et Nyström, Magnus et Lokrantz, Jerker et Folke, Carl",
    title = "États alternatifs sur les récifs coralliens : au-delà des transitions de phase corail–macroalgues",
    year = "2008",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "La dégradation des récifs coralliens est souvent associée à des changements dans la structure de la communauté où les macroalgues deviennent la forme de vie benthique dominante. Ces transitions de phase peuvent être difficiles à inverser. Le débat sur les transitions de phase des récifs coralliens n'a pas porté sur les rapports concernant la domination des récifs coralliens par d'autres formes de vie suite à une perturbation. Une revue de la littérature primaire et grise indique que les récifs dominés par les corallimorphaires, les coraux mous, les éponges et les oursins de mer peuvent entrer dans un état alternatif en raison d'une transition de phase. Les transitions peuvent être déclenchées par des perturbations ponctuelles qui causent une mortalité corallienne à grande échelle et peuvent devenir stables en raison de mécanismes de rétroaction positive. Cependant, elles peuvent différer de la transition archétypale corail-macroalgues, selon les facteurs qui entraînent la transition ; alors que les transitions corail-macroalgues et corail-oursin semblent être entraînées par la perte du contrôle top-down par la surpêche, les transitions vers la domination des corallimorphaires, des coraux mous et des éponges semblent plus associées à des changements dans les dynamiques bottom-up. La compréhension des différences et des similitudes dans les mécanismes qui causent et maintiennent cette variété d'états alternatifs aidera la gestion visant à prévenir et à inverser les transitions de phase des récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps07815",
    doi = "10.3354/meps07815",
    openalex = "W2100437705",
    references = "doi10100797894017328402"
}

Des blocs de corail Porites lobata âgés de huit mois, colonisés par des communautés naturelles d'euendolithes et d'épilithes hawaïens, ont été expérimentalement exposés à deux traitements aqueux de p CO 2 différents, 400 ppmv et 750 ppmv, pendant 3 mois. La chlorophyte Ostreobium quekettii dominait les communautés au début et à la fin de l'expérience (65–90 %). Il n'y avait pas de différences significatives dans l'abondance relative des espèces euendolithiques, ni de différences dans la surface bioérodiée à la surface des blocs (27 %) entre les traitements de p CO 2. Cependant, la profondeur de pénétration des filaments d'O. quekettii était significativement plus élevée sous 750 ppmv (1,4 mm) que sous 400 ppmv (1 mm). Par conséquent, les taux de dissolution du carbonate mesurés sous une p CO 2 élevée étaient de 48 % plus élevés que sous une p CO 2 ambiante (0,46 kg CaCO 3 dissous m −2 a −1 contre 0,31 kg m −2 a −1). Ainsi, la dissolution biogénique des carbonates par les euendolithes dans les récifs coralliens pourrait être un mécanisme dominant de dissolution du carbonate dans un océan plus acide.

@article{doi1010292008gb003286,
    author = "Tribollet, Aline et Godinot, Claire et Atkinson, M. J. et Langdon, Chris",
    title = "Effets d'une p CO 2 élevée sur la dissolution des carbonates de corail par des euendolithes microbiennes",
    year = "2009",
    journal = "Global Biogeochemical Cycles",
    abstract = "Des blocs de corail Porites lobata âgés de huit mois, colonisés par des communautés naturelles d'euendolithes et d'épilithes hawaïens, ont été expérimentalement exposés à deux traitements aqueux de p CO 2 différents, 400 ppmv et 750 ppmv, pendant 3 mois. La chlorophyte Ostreobium quekettii dominait les communautés au début et à la fin de l'expérience (65–90 %). Il n'y avait pas de différences significatives dans l'abondance relative des espèces euendolithiques, ni de différences dans la surface bioérodiée à la surface des blocs (27 %) entre les traitements de p CO 2. Cependant, la profondeur de pénétration des filaments d'O. quekettii était significativement plus élevée sous 750 ppmv (1,4 mm) que sous 400 ppmv (1 mm). Par conséquent, les taux de dissolution du carbonate mesurés sous une p CO 2 élevée étaient de 48 % plus élevés que sous une p CO 2 ambiante (0,46 kg CaCO 3 dissous m −2 a −1 contre 0,31 kg m −2 a −1). Ainsi, la dissolution biogénique des carbonates par les euendolithes dans les récifs coralliens pourrait être un mécanisme dominant de dissolution du carbonate dans un océan plus acide.",
    url = "https://doi.org/10.1029/2008gb003286",
    doi = "10.1029/2008gb003286",
    openalex = "W2095091888",
    references = "doi101016s0025326x99002374"
}

Les récifs coralliens sont riches en biodiversité, en grande partie parce que leur architecture hautement complexe offre abri et ressources à une large gamme d'organismes. Des déclins rapides de la couverture de coraux durs ont récemment eu lieu dans toute la région des Caraïbes, mais les conséquences concomitantes pour l'architecture du récif n'ont pas encore été quantifiées à grande échelle. Nous fournissons, à notre connaissance, la première analyse régionale des changements de complexité architecturale des récifs, utilisant près de 500 relevés sur 200 récifs, entre 1969 et 2008. La complexité architecturale des récifs des Caraïbes a diminué de manière non linéaire avec la quasi-disparition des récifs les plus complexes au cours des 40 dernières années. L'appauvrissement des récifs des Caraïbes était apparent dès le début des années 1980, suivi d'une période de stase entre 1985 et 1998, puis d'une reprise du déclin de la complexité jusqu'à présent. Les taux de perte sont similaires sur les récifs peu profonds (20 m) et sont cohérents dans les cinq sous-régions. Le schéma temporel du déclin de l'architecture coïncide avec des événements clés de l'histoire écologique récente des Caraïbes : la perte de coraux d'Acropora structurellement complexes, la mortalité massive de l'oursin brouteur Diadema antillarum et l'événement mondial de blanchissement des coraux induit par El Niño Southern Oscillation en 1998. Les estimations constamment faibles de la complexité architecturale actuelle suggèrent une dégradation et une homogénéisation à l'échelle régionale de la structure du récif. La perte généralisée de la complexité architecturale est susceptible d'avoir de graves conséquences pour la biodiversité des récifs, le fonctionnement des écosystèmes et les services environnementaux associés.

@article{doi101098rspb20090339,
    author = "Álvarez‐Filip, Lorenzo et Dulvy, Nicholas K. et Gill, Jennifer A. et Côté, Isabelle M. et Watkinson, Andrew R.",
    title = "Aplatissement des récifs coralliens des Caraïbes : déclins régionaux de la complexité architecturale",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Les récifs coralliens sont riches en biodiversité, en grande partie parce que leur architecture hautement complexe offre abri et ressources à une large gamme d'organismes. Des déclins rapides de la couverture de coraux durs ont récemment eu lieu dans toute la région des Caraïbes, mais les conséquences concomitantes pour l'architecture du récif n'ont pas encore été quantifiées à grande échelle. Nous fournissons, à notre connaissance, la première analyse régionale des changements de complexité architecturale des récifs, utilisant près de 500 relevés sur 200 récifs, entre 1969 et 2008. La complexité architecturale des récifs des Caraïbes a diminué de manière non linéaire avec la quasi-disparition des récifs les plus complexes au cours des 40 dernières années. L'appauvrissement des récifs des Caraïbes était apparent dès le début des années 1980, suivi d'une période de stase entre 1985 et 1998, puis d'une reprise du déclin de la complexité jusqu'à présent. Les taux de perte sont similaires sur les récifs peu profonds (20 m) et sont cohérents dans les cinq sous-régions. Le schéma temporel du déclin de l'architecture coïncide avec des événements clés de l'histoire écologique récente des Caraïbes : la perte de coraux d'Acropora structurellement complexes, la mortalité massive de l'oursin brouteur Diadema antillarum et l'événement mondial de blanchissement des coraux induit par El Niño Southern Oscillation en 1998. Les estimations constamment faibles de la complexité architecturale actuelle suggèrent une dégradation et une homogénéisation à l'échelle régionale de la structure du récif. La perte généralisée de la complexité architecturale est susceptible d'avoir de graves conséquences pour la biodiversité des récifs, le fonctionnement des écosystèmes et les services environnementaux associés.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2009.0339",
    doi = "10.1098/rspb.2009.0339",
    openalex = "W2150724621",
    references = "doi101002sim1545, doi1010079780387217062, doi10100797894017328402, doi101126science1085046, doi101126science1086050, doi101126science1152509, doi101371journalpone0000711, doi1023071932254, doi1023073802723, openalexw1608366422"
}

Résumé. Le corail d'eau froide Lophelia pertusa est l'une des rares espèces capables de construire des structures ressemblant à des récifs et un cadre corallien tridimensionnel dans les océans profonds. De plus, les biohermes de coraux d'eau froide profonds pourraient être parmi les premiers écosystèmes marins touchés par l'acidification des océans. Des colonies de L. pertusa ont été collectées lors d'une croisière en 2006 vers des biohermes de coraux d'eau froide du complexe récifal de Mingulay (Hébrides, Atlantique Nord). Peu après la collecte des échantillons à bord, ces coraux ont été marqués avec du calcium-45. La même approche expérimentale a été utilisée pour évaluer les taux de calcification et la manière dont ceux-ci ont changé en raison d'un pH réduit lors d'une croisière vers le Skagerrak (Mer du Nord) en 2007. Les taux de calcification les plus élevés ont été observés chez les polypes les plus jeunes, avec une croissance squelettique nouvelle allant jusqu'à 1% d−1 et des taux moyens de 0,11±0,02% d−1±E.E.). Une baisse de pH de 0,15 et 0,3 unité par rapport au niveau ambiant a entraîné une réduction de la calcification de 30 et 56%. Un pH plus bas a réduit davantage la calcification chez les polypes jeunes à croissance rapide (réduction de 59%) que chez les polypes plus âgés (réduction de 40%). Ainsi, la croissance squelettique des corallites jeunes et à calcification rapide a souffert davantage de l'acidification des océans. Néanmoins, L. pertusa a présenté une calcification nette positive (mesurée par l'incorporation de 45Ca) même à un état de saturation en aragonite (Ωa) inférieur à 1.

@article{doi105194bg616712009,
    author = "Maier, Cornelia et Hegeman, J. et Weinbauer, Markus G. et Gattuso, Jean‐Pierre",
    title = "Calcification of the cold-water coral Lophelia pertusa, under ambient and reduced pH",
    year = "2009",
    journal = "Biogeosciences",
    abstract = "Résumé. Le corail d'eau froide Lophelia pertusa est l'une des rares espèces capables de construire des structures ressemblant à des récifs et un cadre corallien tridimensionnel dans les océans profonds. De plus, les biohermes de coraux d'eau froide profonds pourraient être parmi les premiers écosystèmes marins touchés par l'acidification des océans. Des colonies de L. pertusa ont été collectées lors d'une croisière en 2006 vers des biohermes de coraux d'eau froide du complexe récifal de Mingulay (Hébrides, Atlantique Nord). Peu après la collecte des échantillons à bord, ces coraux ont été marqués avec du calcium-45. La même approche expérimentale a été utilisée pour évaluer les taux de calcification et la manière dont ceux-ci ont changé en raison d'un pH réduit lors d'une croisière vers le Skagerrak (Mer du Nord) en 2007. Les taux de calcification les plus élevés ont été observés chez les polypes les plus jeunes, avec une croissance squelettique nouvelle allant jusqu'à 1\% d−1 et des taux moyens de 0,11±0,02\% d−1±E.E.). Une baisse de pH de 0,15 et 0,3 unité par rapport au niveau ambiant a entraîné une réduction de la calcification de 30 et 56\%. Un pH plus bas a réduit davantage la calcification chez les polypes jeunes à croissance rapide (réduction de 59\%) que chez les polypes plus âgés (réduction de 40\%). Ainsi, la croissance squelettique des corallites jeunes et à calcification rapide a souffert davantage de l'acidification des océans. Néanmoins, L. pertusa a présenté une calcification nette positive (mesurée par l'incorporation de 45Ca) même à un état de saturation en aragonite (Ωa) inférieur à 1.",
    url = "https://doi.org/10.5194/bg-6-1671-2009",
    doi = "10.5194/bg-6-1671-2009",
    openalex = "W2171829412",
    references = "doi101016s0921818198000356, doi1010291999gb001195, doi1010292004gb002247, doi1010292004jc002576, doi1010292006gl027207, doi1010292006gl028554, doi101038nature04095, doi101038nature07051, doi101093icb391160, doi101126science1119861"
}

La hausse anthropique de la concentration de dioxyde de carbone dans l'atmosphère entraîne le réchauffement climatique et l'acidification des océans. L'acidification des océans (OA) est nuisible à de nombreux organismes, mais particulièrement à ceux qui construisent des squelettes massifs de carbonate de calcium, tels que les coraux de récif. Ici, nous testons la suggestion récente selon laquelle l'OA ne conduit pas seulement à une calcification en déclin des coraux de récif et à des taux de croissance réduits des récifs, mais pourrait également avoir été un déclencheur des crises de récifs anciennes et des extinctions de masse en mer. Nous analysons le registre fossile des récifs biogéniques et des organismes marins afin de (1) évaluer le timing et l'intensité des crises de récifs anciennes, (2) vérifier quelles crises de récifs étaient concomitantes avec des impulsions déduites de concentrations de dioxyde de carbone et (3) évaluer la corrélation entre les crises de récifs et les extinctions de masse et leur sélectivité en termes de tamponnement physiologique déduit. Nous concluons que quatre des cinq crises de récifs métazoaires mondiales au cours des derniers 500 Myr ont probablement été au moins partiellement gouvernées par l'OA et le réchauffement climatique rapide. Cependant, seulement deux des cinq grandes extinctions de masse montrent des preuves géologiques d'OA.

@article{doi101111j13652486201002204x,
    author = "Kiessling, Wolfgang et Simpson, Carl",
    title = "On the potential for ocean acidification to be a general cause of ancient reef crises",
    year = "2010",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Anthropogenic rise in the carbon dioxide concentration in the atmosphere leads to global warming and acidification of the oceans. Ocean acidification (OA) is harmful to many organisms but especially to those that build massive skeletons of calcium carbonate, such as reef corals. Here, we test the recent suggestion that OA leads not only to declining calcification of reef corals and reduced growth rates of reefs but may also have been a trigger of ancient reef crises and mass extinctions in the sea. We analyse the fossil record of biogenic reefs and marine organisms to (1) assess the timing and intensity of ancient reef crises, (2) check which reef crises were concurrent with inferred pulses of carbon dioxide concentrations and (3) evaluate the correlation between reef crises and mass extinctions and their selectivity in terms of inferred physiological buffering. We conclude that four of five global metazoan reef crises in the last 500 Myr were probably at least partially governed by OA and rapid global warming. However, only two of the big five mass extinctions show geological evidence of OA.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2010.02204.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2010.02204.x",
    openalex = "W2100073969",
    references = "doi1011302007242401, doi101146annurevecolsys35021103105715, doi105194bg616712009"
}

[1] Les températures en hausse causées par le réchauffement climatique peuvent entraîner des déplacements et/ou des expansions de la distribution des espèces vers les pôles. Les coraux de récif tropicaux (ci-après coraux) sont parmi les espèces les plus importantes du monde, étant non seulement des producteurs primaires, mais aussi des espèces formant des habitats, et des modifications fondamentales des écosystèmes sont donc attendues selon les changements de leur distribution. Bien que la plupart des études sur les effets du changement climatique sur les coraux se soient concentrées sur le blanchissement des coraux induit par la température dans les zones tropicales, des déplacements et/ou des expansions vers les pôles peuvent également se produire dans les zones tempérées. Nous montrons les premières preuves à grande échelle de l'expansion vers les pôles de la distribution des coraux modernes, basées sur 80 ans de données nationales provenant des zones tempérées du Japon, où des mesures de longue durée des températures de surface de la mer in situ ont montré des hausses statistiquement significatives. Quatre catégories majeures d'espèces de coraux, y compris deux espèces clés pour la formation des récifs dans les zones tropicales, ont montré des expansions vers les pôles depuis les années 1930, tandis qu'aucune espèce n'a démontré de rétrécissement de la distribution vers le sud ou d'extinction locale. La vitesse de ces expansions a atteint jusqu'à 14 km/an, ce qui est bien supérieur à celle d'autres espèces. Nos résultats, combinés aux récentes découvertes suggérant des expansions de la distribution des organismes associés aux récifs de coraux tropicaux, suggèrent fortement que des modifications rapides et fondamentales des écosystèmes côtiers tempérés pourraient être en cours.

@article{doi1010292010gl046474,
    author = "Yamano, Hiroya et Sugihara, Kaoru et Nomura, Keiichi",
    title = "Expansion rapide vers les pôles de la distribution des coraux de récif tropicaux en réponse à la hausse des températures de surface de la mer",
    year = "2011",
    journal = "Geophysical Research Letters",
    abstract = "[1] Les températures en hausse causées par le réchauffement climatique peuvent entraîner des déplacements et/ou des expansions de la distribution des espèces vers les pôles. Les coraux de récif tropicaux (ci-après coraux) sont parmi les espèces les plus importantes du monde, étant non seulement des producteurs primaires, mais aussi des espèces formant des habitats, et des modifications fondamentales des écosystèmes sont donc attendues selon les changements de leur distribution. Bien que la plupart des études sur les effets du changement climatique sur les coraux se soient concentrées sur le blanchissement des coraux induit par la température dans les zones tropicales, des déplacements et/ou des expansions vers les pôles peuvent également se produire dans les zones tempérées. Nous montrons les premières preuves à grande échelle de l'expansion vers les pôles de la distribution des coraux modernes, basées sur 80 ans de données nationales provenant des zones tempérées du Japon, où des mesures de longue durée des températures de surface de la mer in situ ont montré des hausses statistiquement significatives. Quatre catégories majeures d'espèces de coraux, y compris deux espèces clés pour la formation des récifs dans les zones tropicales, ont montré des expansions vers les pôles depuis les années 1930, tandis qu'aucune espèce n'a démontré de rétrécissement de la distribution vers le sud ou d'extinction locale. La vitesse de ces expansions a atteint jusqu'à 14 km/an, ce qui est bien supérieur à celle d'autres espèces. Nos résultats, combinés aux récentes découvertes suggérant des expansions de la distribution des organismes associés aux récifs de coraux tropicaux, suggèrent fortement que des modifications rapides et fondamentales des écosystèmes côtiers tempérés pourraient être en cours.",
    url = "https://doi.org/10.1029/2010gl046474",
    doi = "10.1029/2010gl046474",
    openalex = "W1638036560"
}

Résumé Les îles de récifs coralliens sont parmi les environnements les plus vulnérables sur Terre au changement climatique car elles sont basses et construites en grande partie à partir de sédiments non consolidés qui peuvent être facilement remaniés par les vagues et les courants. Ces sédiments proviennent entièrement des environnements de récifs coralliens et de platiers de récifs environnants et sont donc très sensibles aux transitions écologiques qui peuvent modifier la composition et la productivité des communautés de récifs. La manière dont de telles modifications – pilotées par les perturbations anthropiques et les changements climatiques et environnementaux en cours et projetés – impacteront l'approvisionnement en sédiments des îles de récifs et leur stabilité géomorphologique reste une question critique mais mal résolue. Ici, nous examinons les liens écologiques–géomorphologiques uniques qui sous-tendent cette question et, en utilisant différents scénarios de changement environnemental pour lesquels les réponses de production de sédiments de récif peuvent être projetées, nous explorons la résilience probable de différents types d'îles. En général, les îles dominées par le sable sont probablement moins résilientes que celles dominées par des matériaux de calibre de gravats. Cependant, comme les différentes îles ont généralement des constituants de sédiments dominants différents (généralement soit du corail, soit des foraminifères benthiques, soit H alimeda) et comme ceux-ci réagissent différemment aux perturbations écologiques individuelles, la résilience des îles est probablement très variable. Les îles composées de sables de corail sont susceptibles de subir des changements morphologiques majeurs sous la plupart des scénarios de changement écologique à court terme, tandis que celles dominées par H alimeda pourraient être plus résilientes. Les îles composées principalement de foraminifères benthiques (un état courant dans la région P acifique) sont susceptibles d'exhiber des degrés de résilience variables selon la combinaison précise de perturbations écologiques rencontrées. L'étude démontre le besoin critique de recherches supplémentaires reliant le fossé écologique–géomorphologique pour comprendre : (1) les réponses de production de sédiments à différents scénarios de changement écologique et environnemental ; et (2) la vulnérabilité des formes de relief dépendantes.

@article{doi101111j13652486201102523x,
    author = "Perry, Chris T. et Kench, Paul S. et Smithers, S et Riegl, Bernhard et Yamano, Hiroya et O'Leary, Michael",
    title = "Implications of reef ecosystem change for the stability and maintenance of coral reef islands",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Résumé Les îles de récifs coralliens sont parmi les environnements les plus vulnérables sur Terre au changement climatique car elles sont basses et construites en grande partie à partir de sédiments non consolidés qui peuvent être facilement remaniés par les vagues et les courants. Ces sédiments proviennent entièrement des environnements de récifs coralliens et de platiers de récifs environnants et sont donc très sensibles aux transitions écologiques qui peuvent modifier la composition et la productivité des communautés de récifs. La manière dont de telles modifications – pilotées par les perturbations anthropiques et les changements climatiques et environnementaux en cours et projetés – impacteront l'approvisionnement en sédiments des îles de récifs et leur stabilité géomorphologique reste une question critique mais mal résolue. Ici, nous examinons les liens écologiques–géomorphologiques uniques qui sous-tendent cette question et, en utilisant différents scénarios de changement environnemental pour lesquels les réponses de production de sédiments de récif peuvent être projetées, nous explorons la résilience probable de différents types d'îles. En général, les îles dominées par le sable sont probablement moins résilientes que celles dominées par des matériaux de calibre de gravats. Cependant, comme les différentes îles ont généralement des constituants de sédiments dominants différents (généralement soit du corail, soit des foraminifères benthiques, soit H alimeda) et comme ceux-ci réagissent différemment aux perturbations écologiques individuelles, la résilience des îles est probablement très variable. Les îles composées de sables de corail sont susceptibles de subir des changements morphologiques majeurs sous la plupart des scénarios de changement écologique à court terme, tandis que celles dominées par H alimeda pourraient être plus résilientes. Les îles composées principalement de foraminifères benthiques (un état courant dans la région P acifique) sont susceptibles d'exhiber des degrés de résilience variables selon la combinaison précise de perturbations écologiques rencontrées. L'étude démontre le besoin critique de recherches supplémentaires reliant le fossé écologique–géomorphologique pour comprendre : (1) les réponses de production de sédiments à différents scénarios de changement écologique et environnemental ; et (2) la vulnérabilité des formes de relief dépendantes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02523.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02523.x",
    openalex = "W2114408276",
    references = "doi101016s0025326x99002374"
}

Résumé L'acidité des océans a augmenté de 30 % depuis l'ère préindustrielle en raison de l'absorption du CO2 anthropique et devrait augmenter d'un autre 120 % avant 2100 si les émissions de CO2 continuent au rythme actuel. L'acidification des océans devrait avoir des impacts vastes sur la vie marine, y compris une réduction de la croissance et une érosion nette des récifs coralliens. Notre compréhension actuelle des impacts de l'acidification des océans sur la vie marine repose cependant lourdement sur les résultats d'études de perturbation à court terme du CO2. Ici, nous présentons les résultats de la première étude de perturbation à long terme du CO2 sur le corail d'eau froide dominant Lophelia pertusa, et les comparons aux résultats d'une étude à court terme pour évaluer l'effet de la durée d'exposition sur les réponses du corail. Une exposition à court terme (1 semaine) à un CO2 élevé a entraîné une baisse de 26 à 29 % de la calcification pour une baisse de pH de 0,1 unité et une dissolution nette de carbonate de calcium. En revanche, L. pertusa a été capable de s'acclimater aux conditions acidifiées lors d'incubations à long terme (6 mois), entraînant même des taux de calcification légèrement accrus. La croissance nette est maintenue même dans des eaux sous-saturées par rapport à l'aragonite. L'acclimatation à l'acidification de l'eau de mer n'a pas provoqué d'augmentation mesurable des taux métaboliques. Il s'agit de la première preuve d'une acclimatation réussie chez une espèce de corail à l'acidification des océans, soulignant le besoin général d'incubations à long terme dans la recherche sur l'acidification des océans. Pour conclure sur la sensibilité des récifs coralliens d'eau froide à l'acidification future des océans, de nouvelles études écophysiologiques sont nécessaires, qui devraient également englober le rôle de la disponibilité alimentaire et de l'augmentation des températures.

@article{doi101111j13652486201102583x,
    author = "Form, Armin et Riebesell, Ulf",
    title = "Acclimatation à l'acidification des océans lors d'une exposition prolongée au CO2 dans le corail d'eau froide Lophelia pertusa",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Résumé L'acidité des océans a augmenté de 30 % depuis l'ère préindustrielle en raison de l'absorption du CO2 anthropique et devrait augmenter d'un autre 120 % avant 2100 si les émissions de CO2 continuent au rythme actuel. L'acidification des océans devrait avoir des impacts vastes sur la vie marine, y compris une réduction de la croissance et une érosion nette des récifs coralliens. Notre compréhension actuelle des impacts de l'acidification des océans sur la vie marine repose cependant lourdement sur les résultats d'études de perturbation à court terme du CO2. Ici, nous présentons les résultats de la première étude de perturbation à long terme du CO2 sur le corail d'eau froide dominant Lophelia pertusa, et les comparons aux résultats d'une étude à court terme pour évaluer l'effet de la durée d'exposition sur les réponses du corail. Une exposition à court terme (1 semaine) à un CO2 élevé a entraîné une baisse de 26 à 29 % de la calcification pour une baisse de pH de 0,1 unité et une dissolution nette de carbonate de calcium. En revanche, L. pertusa a été capable de s'acclimater aux conditions acidifiées lors d'incubations à long terme (6 mois), entraînant même des taux de calcification légèrement accrus. La croissance nette est maintenue même dans des eaux sous-saturées par rapport à l'aragonite. L'acclimatation à l'acidification de l'eau de mer n'a pas provoqué d'augmentation mesurable des taux métaboliques. Il s'agit de la première preuve d'une acclimatation réussie chez une espèce de corail à l'acidification des océans, soulignant le besoin général d'incubations à long terme dans la recherche sur l'acidification des océans. Pour conclure sur la sensibilité des récifs coralliens d'eau froide à l'acidification future des océans, de nouvelles études écophysiologiques sont nécessaires, qui devraient également englober le rôle de la disponibilité alimentaire et de l'augmentation des températures.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02583.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02583.x",
    openalex = "W2132881865",
    references = "doi105194bg616712009"
}

De nombreuses réponses physiologiques des récifs coralliens actuels au changement climatique sont interprétées comme étant cohérentes avec la disparition imminente des récifs modernes à l'échelle mondiale en raison d'événements de blanchissement de masse annuels, de la dissolution du carbonate et d'un temps insuffisant pour des réponses évolutives substantielles. Les preuves émergentes de la variabilité de la réponse de la calcification corallienne à l'acidification, de la variation géographique de la susceptibilité au blanchissement et de la récupération, des réponses au changement climatique passé et des taux potentiels d'adaptation au réchauffement rapide soutiennent un scénario alternatif dans lequel la dégradation des récifs se produit avec une hétérogénéité temporelle et spatiale plus grande que celle suggérée par les projections actuelles. Réduire l'incertitude dans la projection de l'avenir des récifs coralliens nécessite une meilleure compréhension des réponses passées au changement climatique rapide ; des réponses physiologiques à des facteurs interactifs, tels que la température, l'acidification et les nutriments ; et les coûts et contraintes imposés par l'acclimatation et l'adaptation.

@article{doi101126science1204794,
    author = "Pandolfi, John M. et Connolly, Sean R. et Marshall, Dustin J. et Cohen, Anne L.",
    title = "Projecting Coral Reef Futures Under Global Warming and Ocean Acidification",
    year = "2011",
    journal = "Science",
    abstract = "De nombreuses réponses physiologiques des récifs coralliens actuels au changement climatique sont interprétées comme étant cohérentes avec la disparition imminente des récifs modernes à l'échelle mondiale en raison d'événements de blanchissement de masse annuels, de la dissolution du carbonate et d'un temps insuffisant pour des réponses évolutives substantielles. Les preuves émergentes de la variabilité de la réponse de la calcification corallienne à l'acidification, de la variation géographique de la susceptibilité au blanchissement et de la récupération, des réponses au changement climatique passé et des taux potentiels d'adaptation au réchauffement rapide soutiennent un scénario alternatif dans lequel la dégradation des récifs se produit avec une hétérogénéité temporelle et spatiale plus grande que celle suggérée par les projections actuelles. Réduire l'incertitude dans la projection de l'avenir des récifs coralliens nécessite une meilleure compréhension des réponses passées au changement climatique rapide ; des réponses physiologiques à des facteurs interactifs, tels que la température, l'acidification et les nutriments ; et les coûts et contraintes imposés par l'acclimatation et l'adaptation.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1204794",
    doi = "10.1126/science.1204794",
    openalex = "W2075421824",
    references = "doi101016jecss200809003, doi101016jgca200511032, doi101016s0169534702000447, doi101071mf99078, doi101093icb391146, doi101093icesjmsfsn048, doi101093oso97801985052350010001, doi101098rspb20063567, doi101126science1081056, doi101126science1085046, doi101126science1085706, doi101126science1152509, doi101130g30210a1, doi105670oceanog2009101"
}

@article{doi101007s0033801209014,
    author = "Perry, Chris T. et Edinger, Evan et Kench, Paul S. et Murphy, Gary N. et Smithers, S et Steneck, Robert S. et Mumby, Peter J.",
    title = "Estimation des taux de production et d'érosion du cadre de récif corallien piloté biologiquement : une nouvelle méthodologie de budget carbonaté basée sur le recensement et applications aux récifs de Bonaire",
    year = "2012",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00338-012-0901-4",
    doi = "10.1007/s00338-012-0901-4",
    openalex = "W2090226803",
    references = "doi101016s0025326x99002374"
}

@article{doi101007s003380120984y,
    author = "Graham, Nicholas A. J. et Nash, Kirsty L.",
    title = "L'importance de la complexité structurelle dans les écosystèmes de récifs coralliens",
    year = "2012",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00338-012-0984-y",
    doi = "10.1007/s00338-012-0984-y",
    openalex = "W2022851871",
    references = "doi101098rspb20090339, doi101126science1204794, doi1023072937124"
}

Une revue de la littérature publiée sur la sensibilité des coraux à la turbidité et à la sédimentation est présentée, avec une insistance sur les effets du dragage. Les risques et la gravité de l'impact du dragage (et d'autres perturbations sédimentaires) sur les coraux sont principalement liés à l'intensité, la durée et la fréquence de l'exposition à une turbidité et une sédimentation accrues. La sensibilité d'un récif corallien aux impacts du dragage et sa capacité à se rétablir dépendent des conditions écologiques antécédentes du récif, de sa résilience et des conditions ambiantes normalement rencontrées. Les effets du stress sédimentaire ont jusqu'à présent été étudiés chez 89 espèces de coraux (~10 % de tous les coraux constructeurs de récifs connus). Les résultats de ces investigations ont fourni une compréhension générique des niveaux de tolérance, des mécanismes de réponse, des adaptations et des seuils de tolérance des coraux aux effets des perturbations sédimentaires naturelles et anthropiques. Les polypes de coraux subissent un stress dû aux fortes concentrations de sédiments en suspension et aux effets ultérieurs sur l'atténuation de la lumière qui affectent leurs symbiotes algues. Les besoins minimaux en lumière des coraux varient de 100 mg L(-1) dans les récifs côtiers marginaux. Certaines espèces individuelles de coraux peuvent tolérer une exposition à court terme (jours) à des concentrations de sédiments en suspension aussi élevées que 1000 mg L(-1), tandis que d'autres montrent une mortalité après une exposition (semaines) à des concentrations aussi faibles que 30 mg L(-1). La durée pendant laquelle les coraux peuvent survivre à des turbidités élevées varie de plusieurs jours (espèces sensibles) à au moins 5-6 semaines (espèces tolérantes). Une sédimentation accrue peut provoquer l'étouffement et l'enterrement des polypes de coraux, l'ombrage, la nécrose tissulaire et des explosions de population de bactéries dans le mucus des coraux. Les sédiments fins ont tendance à avoir des effets plus importants sur les coraux que les sédiments grossiers. La turbidité et la sédimentation réduisent également le recrutement, la survie et l'installation des larves de coraux. Les taux maximaux de sédimentation que différentes coraux peuvent tolérer varient de 400 mg cm(-2) d(-1). Les durées pendant lesquelles les coraux peuvent survivre à des taux de sédimentation élevés varient de 4 semaines de sédimentation élevée ou >14 jours d'enterrement complet) pour les espèces très tolérantes. Les hypothèses pour expliquer les différences substantielles de sensibilité entre différentes espèces de coraux incluent la forme de croissance des colonies de coraux et la taille du polype de corail ou du calice. La validité de ces hypothèses a été testée sur la base de 77 études publiées sur les effets de la turbidité et de la sédimentation sur 89 espèces de coraux. Les résultats de cette analyse révèlent une relation significative entre la sensibilité des coraux à la turbidité et à la sédimentation et la forme de croissance, mais pas avec la taille du calice. Une partie de la variation des sensibilités rapportée dans la littérature peut avoir été causée par des différences dans le type et la taille des particules des sédiments appliqués dans les expériences. La capacité de nombreux coraux (à des degrés divers) à rejeter activement les sédiments par gonflement des polypes, production de mucus, action ciliaire et tentaculaire (à un coût énergétique considérable), ainsi que la variation morphologique intraspécifique et la mobilité des coraux champignons libres, contribuent également aux différences observées. Étant donné l'large gamme de niveaux de sensibilité parmi les espèces de coraux et dans les conditions de qualité de l'eau de base parmi les récifs, des critères significatifs pour limiter l'étendue et la turbidité des panaches de dragage et leurs effets sur les coraux requerront toujours des évaluations spécifiques au site, en tenant compte de l'assemblage d'espèces présent sur le site et de la variabilité naturelle de la turbidité et de la sédimentation de fond locales.

@article{doi101016jmarpolbul201205008,
    author = "Erftemeijer, P.L.A. et Riegl, Bernhard et Hoeksema, Bert W. et Todd, Peter A.",
    title = "Impacts environnementaux du dragage et d'autres perturbations sédimentaires sur les coraux : Une revue",
    year = "2012",
    journal = "Marine Pollution Bulletin",
    abstract = "Une revue de la littérature publiée sur la sensibilité des coraux à la turbidité et à la sédimentation est présentée, avec une emphase sur les effets du dragage. Les risques et la gravité des impacts du dragage (et d'autres perturbations sédimentaires) sur les coraux sont principalement liés à l'intensité, la durée et la fréquence de l'exposition à une turbidité et une sédimentation accrues. La sensibilité d'un récif corallien aux impacts du dragage et sa capacité à se rétablir dépendent des conditions écologiques antécédentes du récif, de sa résilience et des conditions ambiantes normalement rencontrées. Les effets du stress sédimentaire ont jusqu'à présent été étudiés chez 89 espèces de coraux (\textasciitilde 10\% de tous les coraux constructeurs de récifs connus). Les résultats de ces investigations ont fourni une compréhension générique des niveaux de tolérance, des mécanismes de réponse, des adaptations et des niveaux de seuil des coraux face aux effets des perturbations sédimentaires naturelles et anthropiques. Les polypes de coraux subissent un stress dû aux fortes concentrations de sédiments en suspension et aux effets subséquents sur l'atténuation de la lumière, ce qui affecte leurs symbiotes algues. Les besoins minimaux en lumière des coraux varient de 100 mg L(-1) dans les récifs côtiers marginaux. Certaines espèces individuelles de coraux peuvent tolérer une exposition à court terme (jours) à des concentrations de sédiments en suspension aussi élevées que 1000 mg L(-1), tandis que d'autres montrent une mortalité après une exposition (semaines) à des concentrations aussi faibles que 30 mg L(-1). La durée pendant laquelle les coraux peuvent survivre à des turbidités élevées varie de plusieurs jours (espèces sensibles) à au moins 5-6 semaines (espèces tolérantes). Une sédimentation accrue peut provoquer l'étouffement et l'enterrement des polypes de coraux, l'ombrage, la nécrose tissulaire et des explosions de population de bactéries dans le mucus des coraux. Les sédiments fins ont tendance à avoir des effets plus importants sur les coraux que les sédiments grossiers. La turbidité et la sédimentation réduisent également le recrutement, la survie et l'installation des larves de coraux. Les taux maximaux de sédimentation que différents coraux peuvent tolérer varient de 400 mg cm(-2) d(-1). Les durées pendant lesquelles les coraux peuvent survivre à des taux de sédimentation élevés varient de 4 semaines de sédimentation élevée ou >14 jours d'enterrement complet) pour les espèces très tolérantes. Les hypothèses pour expliquer les différences substantielles de sensibilité entre différentes espèces de coraux incluent la forme de croissance des colonies de coraux et la taille du polype de corail ou du calice. La validité de ces hypothèses a été testée sur la base de 77 études publiées sur les effets de la turbidité et de la sédimentation sur 89 espèces de coraux. Les résultats de cette analyse révèlent une relation significative entre la sensibilité des coraux à la turbidité et à la sédimentation et la forme de croissance, mais pas avec la taille du calice. Une partie de la variation des sensibilités rapportée dans la littérature peut avoir été causée par des différences dans le type et la taille des particules des sédiments appliqués dans les expériences. La capacité de nombreux coraux (à des degrés divers) à rejeter activement les sédiments par gonflement des polypes, production de mucus, action ciliaire et tentaculaire (à un coût énergétique considérable), ainsi que la variation morphologique intraspécifique et la mobilité des coraux champignons libres, contribuent également aux différences observées. Étant donné l'large gamme de niveaux de sensibilité parmi les espèces de coraux et dans les conditions de qualité de l'eau de base parmi les récifs, des critères significatifs pour limiter l'étendue et la turbidité des panaches de dragage et leurs effets sur les coraux requerront toujours des évaluations spécifiques au site, en tenant compte de l'assemblage d'espèces présent sur le site et de la variabilité naturelle de la turbidité et de la sédimentation de fond locales.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2012.05.008",
    doi = "10.1016/j.marpolbul.2012.05.008",
    openalex = "W2051907680",
    references = "doi101093icb391146"
}

Les récifs coralliens du monde entier sont dégradés, et la nécessité de réduire les pressions locales pour compenser les effets des pressions globales croissantes est maintenant largement reconnue. Cette étude examine les dynamiques spatiales et temporelles de la couverture de corail, identifie les principaux facteurs de mortalité des coraux et quantifie les taux de récupération potentiels du Grand Barrière de Corail. Basée sur les données de séries temporelles les plus étendues au monde sur l'état des récifs (2 258 enquêtes sur 214 récifs entre 1985 et 2012), nous montrons un déclin majeur de la couverture de corail de 28,0 % à 13,8 % (0,53 % y(-1)), soit une perte de 50,7 % de la couverture initiale de corail. Les cyclones tropicaux, la prédation des coraux par les étoiles de couronne-de-mer (COTS) et le blanchissement des coraux ont respectivement contribué à 48 %, 42 % et 10 % des pertes estimées, soit un taux de mortalité de 3,38 % y(-1). Importamment, la région du nord, relativement vierge, n'a montré aucun déclin global. Le taux estimé d'augmentation de la couverture de corail en l'absence de cyclones, de COTS et de blanchissement était de 2,85 % y(-1), démontrant une capacité substantielle de récupération des récifs. En l'absence de COTS, la couverture de corail aurait augmenté à 0,89 % y(-1), malgré les pertes continues dues aux cyclones et au blanchissement. Ainsi, la réduction des populations de COTS, en améliorant la qualité de l'eau et en développant des mesures de contrôle alternatives, pourrait empêcher un déclin supplémentaire de corail et améliorer les perspectives pour le Grand Barrière de Corail. De telles stratégies ne peuvent cependant réussir que si les conditions climatiques sont stabilisées, car les pertes dues au blanchissement et aux cyclones augmenteraient autrement.

@article{doi101073pnas1208909109,
    author = "De’ath, Glenn et Fabricius, Katharina et Sweatman, Hugh et Puotinen, Marji",
    title = "Le déclin de la couverture de corail sur le Grand Barrière de Corail sur 27 ans et ses causes",
    year = "2012",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Les récifs coralliens du monde entier sont dégradés, et la nécessité de réduire les pressions locales pour compenser les effets des pressions globales croissantes est maintenant largement reconnue. Cette étude examine les dynamiques spatiales et temporelles de la couverture de corail, identifie les principaux facteurs de mortalité des coraux et quantifie les taux de récupération potentiels du Grand Barrière de Corail. Basée sur les données de séries temporelles les plus étendues au monde sur l'état des récifs (2 258 enquêtes sur 214 récifs entre 1985 et 2012), nous montrons un déclin majeur de la couverture de corail de 28,0\% à 13,8\% (0,53\% y(-1)), soit une perte de 50,7\% de la couverture initiale de corail. Les cyclones tropicaux, la prédation des coraux par les étoiles de couronne-de-mer (COTS) et le blanchissement des coraux ont respectivement contribué à 48\%, 42\% et 10\% des pertes estimées, soit un taux de mortalité de 3,38\% y(-1). Importamment, la région du nord, relativement vierge, n'a montré aucun déclin global. Le taux estimé d'augmentation de la couverture de corail en l'absence de cyclones, de COTS et de blanchissement était de 2,85\% y(-1), démontrant une capacité substantielle de récupération des récifs. En l'absence de COTS, la couverture de corail aurait augmenté à 0,89\% y(-1), malgré les pertes continues dues aux cyclones et au blanchissement. Ainsi, la réduction des populations de COTS, en améliorant la qualité de l'eau et en développant des mesures de contrôle alternatives, pourrait empêcher un déclin supplémentaire de corail et améliorer les perspectives pour le Grand Barrière de Corail. De telles stratégies ne peuvent cependant réussir que si les conditions climatiques sont stabilisées, car les pertes dues au blanchissement et aux cyclones augmenteraient autrement.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1208909109",
    doi = "10.1073/pnas.1208909109",
    openalex = "W2069864946",
    references = "doi10100797894017328402, doi101371journalpone0000711"
}

La persistance des structures carbonatées sur les récifs coralliens est essentielle pour fournir des habitats à un grand nombre d'espèces et maintenir la biodiversité extraordinaire associée à ces écosystèmes. En conséquence de l'acidification des océans (AO), la capacité des organismes calcifiants marins à produire du carbonate de calcium (CaCO(3)) et leur taux de production de CaCO(3) pourraient diminuer, tandis que les taux de bioérosion et de dissolution du CaCO(3) pourraient augmenter, entraînant une transition d'une condition de nette accrétion à une condition de nette érosion. Cela aurait des conséquences négatives pour le rôle et la fonction des récifs coralliens et les services écosystémiques qu'ils fournissent aux communautés humaines dépendantes. Dans cet article, nous passons en revue les estimations de la bioérosion, de la dissolution du CaCO(3) et de la calcification nette des écosystèmes (NEC) et la manière dont ces processus évolueront en réponse à l'AO. De plus, nous évaluons de manière critique les relations observées entre la NEC et l'état de saturation en aragonite de l'eau de mer (Ω(a)). Enfin, nous proposons que des taux de NEC standardisés combinés aux changements observés dans les ratios du carbone inorganique dissous à l'alcalinité totale dus au métabolisme net des récifs puissent fournir un outil biogéochimique pour surveiller les effets de l'AO dans les environnements de récifs coralliens.

@article{doi101146annurevmarine121211172241,
    author = "Andersson, Andreas J. et Gledhill, D. K.",
    title = "Acidification des océans et récifs coralliens : effets sur la dégradation, la dissolution et la calcification nette des écosystèmes",
    year = "2012",
    journal = "Annual Review of Marine Science",
    abstract = "La persistance des structures carbonatées sur les récifs coralliens est essentielle pour fournir des habitats à un grand nombre d'espèces et maintenir la biodiversité extraordinaire associée à ces écosystèmes. En conséquence de l'acidification des océans (AO), la capacité des organismes calcifiants marins à produire du carbonate de calcium (CaCO(3)) et leur taux de production de CaCO(3) pourraient diminuer, tandis que les taux de bioérosion et de dissolution du CaCO(3) pourraient augmenter, entraînant une transition d'une condition de nette accrétion à une condition de nette érosion. Cela aurait des conséquences négatives pour le rôle et la fonction des récifs coralliens et les services écosystémiques qu'ils fournissent aux communautés humaines dépendantes. Dans cet article, nous passons en revue les estimations de la bioérosion, de la dissolution du CaCO(3) et de la calcification nette des écosystèmes (NEC) et la manière dont ces processus évolueront en réponse à l'AO. De plus, nous évaluons de manière critique les relations observées entre la NEC et l'état de saturation en aragonite de l'eau de mer (Ω(a)). Enfin, nous proposons que des taux de NEC standardisés combinés aux changements observés dans les ratios du carbone inorganique dissous à l'alcalinité totale dus au métabolisme net des récifs puissent fournir un outil biogéochimique pour surveiller les effets de l'AO dans les environnements de récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-marine-121211-172241",
    doi = "10.1146/annurev-marine-121211-172241",
    openalex = "W2131106625",
    references = "chave1972carbonate, doi101016s0012825201000836, doi101126science1944268937"
}

[Extrait de l'Avant-propos] Le 12e Symposium international sur les récifs coralliens (ICRS 2012), tenu à Cairns, Queensland, Australie, du 9 au 13 juillet 2012, a réuni près de 2000 délégués. Le programme comprenait plus de 1500 communications et affiches. Nous sommes heureux de présenter les Actes, qui contiennent près de 200 contributions de scientifiques du monde entier issues du Symposium. Les Actes couvrent un large spectre de la science des récifs coralliens et démontrent une expansion croissante des sciences biologiques et de la Terre vers des disciplines non traditionnelles, notamment les sciences sociales et l'économie. La tendance observée lors des Symposiums ICRS précédents, vers une plus grande contribution des domaines de la planification et de la gestion de la conservation, s'est poursuivie à Cairns en 2012. Le Symposium a également inclus une attention accrue sur le changement climatique et l'acidification des océans, ainsi que sur les questions de gestion et de gouvernance des récifs, y compris l'Initiative du Triangle de corail. Pour la première fois dans l'histoire des Symposiums ICRS, les organisateurs de la réunion ont invité la soumission de manuscrits pour examen par les pairs avant le Symposium afin que les délégués puissent recevoir les Actes lors de leur arrivée au Symposium. Nous espérons que les avantages d'une publication rapide permettront une diffusion rapide des dernières percées dans la science des récifs coralliens et stimuleront d'autres avancées dans les connaissances nécessaires au maintien des récifs coralliens du monde. Un avantage supplémentaire de la publication rapide est celui de placer immédiatement les Actes en ligne sur le site Web de l'ICRS 2012 (http://www.icrs2012.com/), où ils sont librement accessibles à un public mondial. Le site Web du Symposium archivera également de nombreux autres résultats de l'ICRS 2012, y compris des enregistrements vidéo des conférences plénières. Nous remercions le WorldFish Center de Penang, en Malaisie, d'avoir accepté de télécharger les Actes de l'ICRS 2012 sur ReefBase (http://www.reefbase.org) ainsi que les Symposiums ICRS précédents.

@book{openalexw171744082,
    author = "Yellowlees, David et Hughes, Terry P.",
    title = "Proceedings of the 12th International Coral Reef Symposium",
    year = "2012",
    booktitle = "ResearchOnline at James Cook University (James Cook University)",
    abstract = "[Extrait de l'Avant-propos] Le 12e Symposium international sur les récifs coralliens (ICRS 2012), tenu à Cairns, Queensland, Australie, du 9 au 13 juillet 2012, a réuni près de 2000 délégués. Le programme comprenait plus de 1500 communications et affiches. Nous sommes heureux de présenter les Actes, qui contiennent près de 200 contributions de scientifiques du monde entier issues du Symposium. Les Actes couvrent un large spectre de la science des récifs coralliens et démontrent une expansion croissante des sciences biologiques et de la Terre vers des disciplines non traditionnelles, notamment les sciences sociales et l'économie. La tendance observée lors des Symposiums ICRS précédents, vers une plus grande contribution des domaines de la planification et de la gestion de la conservation, s'est poursuivie à Cairns en 2012. Le Symposium a également inclus une attention accrue sur le changement climatique et l'acidification des océans, ainsi que sur les questions de gestion et de gouvernance des récifs, y compris l'Initiative du Triangle de corail. Pour la première fois dans l'histoire des Symposiums ICRS, les organisateurs de la réunion ont invité la soumission de manuscrits pour examen par les pairs avant le Symposium afin que les délégués puissent recevoir les Actes lors de leur arrivée au Symposium. Nous espérons que les avantages d'une publication rapide permettront une diffusion rapide des dernières percées dans la science des récifs coralliens et stimuleront d'autres avancées dans les connaissances nécessaires au maintien des récifs coralliens du monde. Un avantage supplémentaire de la publication rapide est celui de placer immédiatement les Actes en ligne sur le site Web de l'ICRS 2012 (http://www.icrs2012.com/), où ils sont librement accessibles à un public mondial. Le site Web du Symposium archivera également de nombreux autres résultats de l'ICRS 2012, y compris des enregistrements vidéo des conférences plénières. Nous remercions le WorldFish Center de Penang, en Malaisie, d'avoir accepté de télécharger les Actes de l'ICRS 2012 sur ReefBase (http://www.reefbase.org) ainsi que les Symposiums ICRS précédents.",
    openalex = "W171744082"
}

Les détériorations à l'échelle mondiale de la santé des récifs coralliens ont provoqué des changements majeurs dans la composition des espèces. Une conséquence projetée est une baisse des taux de production de carbonates des récifs, ce qui pourrait compromettre la croissance des récifs, nuire à la fonctionnalité de l'écosystème et entraîner in fine une érosion nette des récifs. Ici, en utilisant des mesures de la production brute et nette de carbonates et de l'érosion provenant de 19 récifs des Caraïbes, nous montrons que les taux de production de carbonates contemporains sont désormais sensiblement inférieurs aux valeurs historiques (milieu à fin du Holocène). En moyenne, les taux de production actuels sont réduits d'au moins 50 %, et 37 % des sites enquêtés étaient en érosion nette. Les taux d'accrétion calculés (mm année(-1)) pour les habitats de fore-récif peu profonds sont également proches d'un ordre de grandeur inférieur aux moyennes du Holocène. Un seuil de couverture de corail vivant d'environ 10 % semble critique pour maintenir des états de production positifs. En dessous de ce seuil écologique, les budgets de carbonates deviennent généralement nets négatifs et menacent l'accrétion des récifs. Collectivement, ces données suggèrent que les déclins écologiques récents suppriment désormais le potentiel de croissance des récifs des Caraïbes.

@article{doi101038ncomms2409,
    author = "Perry, Chris T. et Murphy, Gary N. et Kench, Paul S. et Smithers, S et Edinger, Evan et Steneck, Robert S. et Mumby, Peter J.",
    title = "Déclin à l'échelle des Caraïbes de la production de carbonates menace la croissance des récifs coralliens",
    year = "2013",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les détériorations à l'échelle mondiale de la santé des récifs coralliens ont provoqué des changements majeurs dans la composition des espèces. Une conséquence projetée est une baisse des taux de production de carbonates des récifs, ce qui pourrait compromettre la croissance des récifs, nuire à la fonctionnalité de l'écosystème et entraîner in fine une érosion nette des récifs. Ici, en utilisant des mesures de la production brute et nette de carbonates et de l'érosion provenant de 19 récifs des Caraïbes, nous montrons que les taux de production de carbonates contemporains sont désormais sensiblement inférieurs aux valeurs historiques (milieu à fin du Holocène). En moyenne, les taux de production actuels sont réduits d'au moins 50 %, et 37 % des sites enquêtés étaient en érosion nette. Les taux d'accrétion calculés (mm année(-1)) pour les habitats de fore-récif peu profonds sont également proches d'un ordre de grandeur inférieur aux moyennes du Holocène. Un seuil de couverture de corail vivant d'environ 10 % semble critique pour maintenir des états de production positifs. En dessous de ce seuil écologique, les budgets de carbonates deviennent généralement nets négatifs et menacent l'accrétion des récifs. Collectivement, ces données suggèrent que les déclins écologiques récents suppriment désormais le potentiel de croissance des récifs des Caraïbes.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms2409",
    doi = "10.1038/ncomms2409",
    openalex = "W2047295906",
    references = "doi1010079780387874586, doi1010079781441903181, doi101016jecss200809003, doi101038nature02691, doi101038ngeo202, doi101098rspb20090339, doi101126science1086050, doi101126science1152509, doi101198tech2001s574, doi101371journalpone0000711"
}

La récupération des récifs coralliens suite à une perturbation majeure est supposée dépendre de l'arrivée de propagules depuis des récifs voisins non perturbés. Par conséquent, les récifs isolés par la distance ou les courants sont considérés comme hautement vulnérables aux perturbations catastrophiques. Nous avons constaté que sur un système de récif isolé dans le nord de l'Australie occidentale, la couverture corallienne a augmenté de 9 % à 44 % dans les 12 ans suivant un événement de blanchissement des coraux, malgré une réduction de 94 % de l'apport larvaire pendant 6 ans après le blanchissement. L'augmentation initiale de la couverture corallienne est le résultat de taux élevés de croissance et de survie des colonies résiduelles, suivi d'une augmentation rapide du recrutement juvénile à mesure que les colonies mûrissent. Nous montrons que les récifs isolés peuvent se rétablir après une perturbation majeure, et que les avantages de leur isolement face aux pressions anthropiques chroniques peuvent surpasser les coûts d'une connectivité limitée.

@article{doi101126science1232310,
    author = "Gilmour, James et Smith, Luke et Heyward, Andrew et Baird, Andrew H. et Pratchett, Morgan S.",
    title = "Récupération d'un système de récif corallien isolé après une perturbation sévère",
    year = "2013",
    journal = "Science",
    abstract = "La récupération des récifs coralliens suite à une perturbation majeure est supposée dépendre de l'arrivée de propagules depuis des récifs voisins non perturbés. Par conséquent, les récifs isolés par la distance ou les courants sont considérés comme hautement vulnérables aux perturbations catastrophiques. Nous avons constaté que sur un système de récif isolé dans le nord de l'Australie occidentale, la couverture corallienne a augmenté de 9\% à 44\% dans les 12 ans suivant un événement de blanchissement des coraux, malgré une réduction de 94\% de l'apport larvaire pendant 6 ans après le blanchissement. L'augmentation initiale de la couverture corallienne est le résultat de taux élevés de croissance et de survie des colonies résiduelles, suivi d'une augmentation rapide du recrutement juvénile à mesure que les colonies mûrissent. Nous montrons que les récifs isolés peuvent se rétablir après une perturbation majeure, et que les avantages de leur isolement face aux pressions anthropiques chroniques peuvent surpasser les coûts d'une connectivité limitée.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1232310",
    doi = "10.1126/science.1232310",
    openalex = "W2049337196"
}

Depuis les premières descriptions des récifs coralliens par Darwin, les scientifiques débattent de la manière dont l'un des écosystèmes les plus productifs et diversifiés du monde peut prospérer dans l'équivalent marin d'un désert. C'est un énigme que le flux de matière organique dissoute (MOD), la plus grande ressource produite sur les récifs, soit transférée aux niveaux trophiques supérieurs. Ici, nous montrons que les éponges rendent la MOD disponible pour la faune en expulsant rapidement des cellules filtrantes sous forme de détritus qui sont ensuite consommés par la faune des récifs. Ce « boucle d'éponge » a été confirmé dans des expériences de réseaux trophiques en aquarium et in situ, en utilisant de la MOD enrichie en (13)C et (15)N. La voie MOD-éponge-faune explique pourquoi des points chauds biologiques tels que les récifs coralliens persistent dans les mers oligotrophes -- le paradoxe du récif -- et a des implications pour le fonctionnement des écosystèmes de récifs et les stratégies de conservation.

@article{doi101126science1241981,
    author = "de Goeij, Jasper M. et van Oevelen, Dick et Vermeij, Mark J. A. et Osinga, Ronald et Middelburg, Jack J. et de Goeij, Anton F.P.M. et Admiraal, Wim",
    title = "Surviving in a Marine Desert: The Sponge Loop Retains Resources Within Coral Reefs",
    year = "2013",
    journal = "Science",
    abstract = {Depuis les premières descriptions des récifs coralliens par Darwin, les scientifiques débattent de la manière dont l'un des écosystèmes les plus productifs et diversifiés du monde peut prospérer dans l'équivalent marin d'un désert. C'est un énigme que le flux de matière organique dissoute (MOD), la plus grande ressource produite sur les récifs, soit transférée aux niveaux trophiques supérieurs. Ici, nous montrons que les éponges rendent la MOD disponible pour la faune en expulsant rapidement des cellules filtrantes sous forme de détritus qui sont ensuite consommés par la faune des récifs. Ce « boucle d'éponge » a été confirmé dans des expériences de réseaux trophiques en aquarium et in situ, en utilisant de la MOD enrichie en (13)C et (15)N. La voie MOD-éponge-faune explique pourquoi des points chauds biologiques tels que les récifs coralliens persistent dans les mers oligotrophes -- le paradoxe du récif -- et a des implications pour le fonctionnement des écosystèmes de récifs et les stratégies de conservation.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1241981",
    doi = "10.1126/science.1241981",
    openalex = "W2109476731"
}

L'enrichissement anthropique en nutriments est souvent associé au déclin des récifs coralliens. Par conséquent, il existe un large consensus selon lequel l'augmentation des apports de nutriments dans les eaux des récifs a des conséquences négatives à long terme pour les coraux. Cependant, les mécanismes par lesquels les nutriments inorganiques dissous peuvent perturber les coraux et leurs algues symbiotiques font l'objet de débats controversés. Dans cet article, nous discutons des études récentes qui démontrent comment l'enrichissement en nutriments affecte la tolérance au stress thermique et lumineux des coraux et leur susceptibilité au blanchissement. Nous intégrons les effets directs et indirects de l'enrichissement en nutriments sur les coraux dans un modèle qui explique pourquoi les récifs coralliens sains peuvent exister sur une gamme plutôt large d'environnements naturels en nutriments à l'extrémité inférieure de l'échelle de concentration et que l'enrichissement anthropique en nutriments peut perturber les processus finement équilibrés via plusieurs voies. Nous conceptualisons que les coraux peuvent souffrir d'effets secondaires négatifs des nutriments en raison de l'altération de leur environnement naturel en nutriments par une augmentation des charges de phytoplancton. Dans ce contexte, nous suggérons que le phytoplancton représente un vecteur probable qui peut traduire les effets des nutriments, induits par exemple par le ruissellement côtier, en stress nutritionnel sur les récifs coralliens à une distance considérable du site d'enrichissement primaire en nutriments. La synthèse présentée de la littérature suggère que les effets de l'enrichissement en nutriments et de l'eutrophisation au-delà de certains seuils sont négatifs pour la performance physiologique de l'individu corallien et pour le fonctionnement de l'écosystème. Par conséquent, la mise en œuvre immédiate de stratégies de gestion des nutriments basées sur les connaissances est cruciale pour la survie des récifs coralliens.

@article{doi101016jcosust201311029,
    author = "D'Angelo, Cecilia et Wiedenmann, Jörg",
    title = "Impacts de l'enrichissement en nutriments sur les récifs coralliens : nouvelles perspectives et implications pour la gestion côtière et la survie des récifs",
    year = "2014",
    journal = "Current Opinion in Environmental Sustainability",
    abstract = "L'enrichissement anthropique en nutriments est souvent associé au déclin des récifs coralliens. Par conséquent, il existe un large consensus selon lequel l'augmentation des apports de nutriments dans les eaux des récifs a des conséquences négatives à long terme pour les coraux. Cependant, les mécanismes par lesquels les nutriments inorganiques dissous peuvent perturber les coraux et leurs algues symbiotiques font l'objet de débats controversés. Dans cet article, nous discutons des études récentes qui démontrent comment l'enrichissement en nutriments affecte la tolérance au stress thermique et lumineux des coraux et leur susceptibilité au blanchissement. Nous intégrons les effets directs et indirects de l'enrichissement en nutriments sur les coraux dans un modèle qui explique pourquoi les récifs coralliens sains peuvent exister sur une gamme plutôt large d'environnements naturels en nutriments à l'extrémité inférieure de l'échelle de concentration et que l'enrichissement anthropique en nutriments peut perturber les processus finement équilibrés via plusieurs voies. Nous conceptualisons que les coraux peuvent souffrir d'effets secondaires négatifs des nutriments en raison de l'altération de leur environnement naturel en nutriments par une augmentation des charges de phytoplancton. Dans ce contexte, nous suggérons que le phytoplancton représente un vecteur probable qui peut traduire les effets des nutriments, induits par exemple par le ruissellement côtier, en stress nutritionnel sur les récifs coralliens à une distance considérable du site d'enrichissement primaire en nutriments. La synthèse présentée de la littérature suggère que les effets de l'enrichissement en nutriments et de l'eutrophisation au-delà de certains seuils sont négatifs pour la performance physiologique de l'individu corallien et pour le fonctionnement de l'écosystème. Par conséquent, la mise en œuvre immédiate de stratégies de gestion des nutriments basées sur les connaissances est cruciale pour la survie des récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cosust.2013.11.029",
    doi = "10.1016/j.cosust.2013.11.029",
    openalex = "W1974182285",
    references = "doi101016s0025326x99002374"
}

Les zones côtières du monde connaissent un développement rapide et une augmentation des tempêtes et des inondations. Ces aléas exposent les communautés côtières à des risques accrus, qui peuvent augmenter avec la perte d'habitats. Ici, nous analysons à l'échelle mondiale le rôle et l'efficacité économique des récifs coralliens dans la réduction des risques. Les méta-analyses révèlent que les récifs coralliens offrent une protection substantielle contre les aléas naturels en réduisant l'énergie des vagues en moyenne de 97 %. Les crêtes des récifs dissipent seules la majeure partie de cette énergie (86 %). Cent millions de personnes ou plus peuvent bénéficier de la réduction des risques grâce aux récifs ou supporter les coûts de mitigation des aléas et d'adaptation si les récifs se dégradent. Nous montrons que les récifs coralliens peuvent offrir des avantages comparables en termes d'atténuation des vagues aux défenses artificielles telles que les brise-lames, et que les défenses des récifs peuvent être renforcées de manière économiquement efficace. Les récifs font face à des menaces croissantes, mais il existe une opportunité d'orienter les investissements d'adaptation et de mitigation des aléas vers la restauration des récifs pour renforcer cette première ligne de défense côtière.

@article{doi101038ncomms4794,
    author = "Ferrario, Filippo et Beck, Michael W. et Storlazzi, Curt D. et Micheli, Fiorenza et Shepard, Christine C. et Airoldi, Laura",
    title = "The effectiveness of coral reefs for coastal hazard risk reduction and adaptation",
    year = "2014",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les zones côtières du monde connaissent un développement rapide et une augmentation des tempêtes et des inondations. Ces aléas exposent les communautés côtières à des risques accrus, qui peuvent augmenter avec la perte d'habitats. Ici, nous analysons à l'échelle mondiale le rôle et l'efficacité économique des récifs coralliens dans la réduction des risques. Les méta-analyses révèlent que les récifs coralliens offrent une protection substantielle contre les aléas naturels en réduisant l'énergie des vagues en moyenne de 97 %. Les crêtes des récifs dissipent seules la majeure partie de cette énergie (86 %). Cent millions de personnes ou plus peuvent bénéficier de la réduction des risques grâce aux récifs ou supporter les coûts de mitigation des aléas et d'adaptation si les récifs se dégradent. Nous montrons que les récifs coralliens peuvent offrir des avantages comparables en termes d'atténuation des vagues aux défenses artificielles telles que les brise-lames, et que les défenses des récifs peuvent être renforcées de manière économiquement efficace. Les récifs font face à des menaces croissantes, mais il existe une opportunité d'orienter les investissements d'adaptation et de mitigation des aléas vers la restauration des récifs pour renforcer cette première ligne de défense côtière.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms4794",
    doi = "10.1038/ncomms4794",
    openalex = "W2107960291",
    references = "doi101098rspb20090339, doi101126science1204794"
}

Les coraux de récif sont très sensibles à la chaleur, mais des populations résistantes aux changements climatiques ont récemment été identifiées. Pour déterminer les mécanismes de tolérance à la température, nous avons transplanté réciproquement des coraux entre des sites de récif exposés à des régimes de température distincts et nous avons testé les profils physiologiques et d'expression génique subséquents. L'acclimatation locale et les effets fixes, tels que l'adaptation, contribuent de manière égale à la tolérance à la chaleur et sont reflétés dans les motifs d'expression génique. En moins de 2 ans, l'acclimatation atteint la même tolérance à la chaleur que nous attendrions d'une forte sélection naturelle sur plusieurs générations pour ces organismes à longue durée de vie. Nos résultats montrent à la fois l'acquisition à court terme d'une acclimatation et à long terme d'une adaptation de la résistance climatique. L'ajout de ces capacités adaptatives aux modèles d'écosystèmes ralentira probablement les prédictions de disparition pour les écosystèmes de récifs coralliens.

@article{doi101126science1251336,
    author = "Palumbi, Stephen R. et Barshis, Daniel J. et Traylor‐Knowles, Nikki et Bay, Rachael A.",
    title = "Mécanismes de résistance des coraux de récif aux changements climatiques futurs",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "Les coraux de récif sont très sensibles à la chaleur, mais des populations résistantes aux changements climatiques ont récemment été identifiées. Pour déterminer les mécanismes de tolérance à la température, nous avons transplanté réciproquement des coraux entre des sites de récif exposés à des régimes de température distincts et nous avons testé les profils physiologiques et d'expression génique subséquents. L'acclimatation locale et les effets fixes, tels que l'adaptation, contribuent de manière égale à la tolérance à la chaleur et sont reflétés dans les motifs d'expression génique. En moins de 2 ans, l'acclimatation atteint la même tolérance à la chaleur que nous attendrions d'une forte sélection naturelle sur plusieurs générations pour ces organismes à longue durée de vie. Nos résultats montrent à la fois l'acquisition à court terme d'une acclimatation et à long terme d'une adaptation de la résistance climatique. L'ajout de ces capacités adaptatives aux modèles d'écosystèmes ralentira probablement les prédictions de disparition pour les écosystèmes de récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1251336",
    doi = "10.1126/science.1251336",
    openalex = "W2051481587"
}

L'amélioration génétique des animaux et des plantes sauvages pour des caractéristiques bénéfiques aux populations humaines est pratiquée depuis des milliers d'années, entraînant des améliorations impressionnantes chez les espèces commercialement précieuses. Malgré ces avantages, les manipulations génétiques sont rarement envisagées à des fins non commerciales, telles que les initiatives de conservation et de restauration. Au cours du dernier siècle, les humains ont conduit au changement climatique mondial par l'industrialisation et la libération de quantités croissantes de CO2, entraînant des modifications de la température océanique, de la chimie océanique et du niveau de la mer, ainsi qu'une fréquence accrue des tempêtes, toutes choses qui peuvent avoir un impact profond sur les écosystèmes marins. Les récifs coralliens sont des écosystèmes hautement diversifiés qui ont subi des déclins massifs de santé et d'abondance en raison de ces perturbations anthropiques directes et d'autres. Il existe une grande inquiétude quant au fait que les taux, les amplitudes et la complexité élevés du changement environnemental submergent la capacité intrinsèque des coraux à s'adapter et à survivre. Bien qu'il soit important de traiter les causes profondes du changement climatique, il est également prudent d'explorer le potentiel d'augmenter la capacité des organismes de récif à tolérer le stress et de faciliter la récupération après les perturbations. Ici, nous examinons les risques et les avantages de l'amélioration des stocks naturels et commerciaux dans les systèmes non récifaux coralliens et préconisons une série d'expériences pour déterminer la faisabilité de développer des stocks de coraux avec une tolérance au stress accrue par l'accélération de processus naturels, une approche connue sous le nom d'évolution assistée (humaine), tout en lançant simultanément un dialogue public sur les risques et les avantages de cette approche.

@article{doi101073pnas1422301112,
    author = "van Oppen, Madeleine J. H. et Oliver, James K. et Putnam, Hollie M. et Gates, Ruth D.",
    title = "Building coral reef resilience through assisted evolution",
    year = "2015",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "L'amélioration génétique des animaux et des plantes sauvages pour des caractéristiques bénéfiques aux populations humaines est pratiquée depuis des milliers d'années, entraînant des améliorations impressionnantes chez les espèces commercialement précieuses. Malgré ces avantages, les manipulations génétiques sont rarement envisagées à des fins non commerciales, telles que les initiatives de conservation et de restauration. Au cours du dernier siècle, les humains ont conduit au changement climatique mondial par l'industrialisation et la libération de quantités croissantes de CO2, entraînant des modifications de la température océanique, de la chimie océanique et du niveau de la mer, ainsi qu'une fréquence accrue des tempêtes, toutes choses qui peuvent avoir un impact profond sur les écosystèmes marins. Les récifs coralliens sont des écosystèmes hautement diversifiés qui ont subi des déclins massifs de santé et d'abondance en raison de ces perturbations anthropiques directes et d'autres. Il existe une grande inquiétude quant au fait que les taux, les amplitudes et la complexité élevés du changement environnemental submergent la capacité intrinsèque des coraux à s'adapter et à survivre. Bien qu'il soit important de traiter les causes profondes du changement climatique, il est également prudent d'explorer le potentiel d'augmenter la capacité des organismes de récif à tolérer le stress et de faciliter la récupération après les perturbations. Ici, nous examinons les risques et les avantages de l'amélioration des stocks naturels et commerciaux dans les systèmes non récifaux coralliens et préconisons une série d'expériences pour déterminer la faisabilité de développer des stocks de coraux avec une tolérance au stress accrue par l'accélération de processus naturels, une approche connue sous le nom d'évolution assistée (humaine), tout en lançant simultanément un dialogue public sur les risques et les avantages de cette approche.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1422301112",
    doi = "10.1073/pnas.1422301112",
    openalex = "W2096973757",
    references = "doi101016jcell201402045, doi101016jtree201202003, doi101038ismej2007106, doi101073pnas1208909109, doi101073pnas1218525110, doi101098rspb20063567, doi1011111574697612025, doi101111gcb12179, doi101111j17524571201100192x, doi101146annurevecolsys34011802132417, doi101146annurevgenet110410132549, doi101371journalpone0000711, doi1018900617151"
}

Les récifs de coraux d'eau froide et les fonds d'éponges adjacents sont largement répartis dans l'océan profond, où seule une petite fraction de la productivité de surface atteint le fond marin sous forme de détritus. Il reste difficile à comprendre comment ces points chauds de biodiversité peuvent prospérer dans un environnement aussi limité en nourriture, car les données sur le flux d'énergie et l'utilisation du carbone organique font cruellement défaut. Ici, nous rapportons les taux de respiration communautaire in situ pour les écosystèmes de coraux d'eau froide et d'éponges obtenus par la technique non invasive de corrélation d'eddies aquatiques. Les taux d'absorption d'oxygène sur les récifs de coraux et les fonds d'éponges adjacents dans le Træna Coral Field (Norvège) étaient 9 à 20 fois plus élevés que ceux des sédiments mous environnants. Ces taux de respiration élevés indiquent une forte consommation de matière organique et suggèrent donc un focalisation locale sur ces écosystèmes du flux descendant de matière organique exporté de l'océan de surface. Dans l'ensemble, nos résultats montrent que les récifs de coraux et les fonds d'éponges adjacents sont des points chauds de traitement du carbone dans l'océan profond limité en nourriture, et que ces écosystèmes marins jouent un rôle plus important dans les cycles biogéochimiques marins que ce qui était reconnu précédemment.

@article{doi103389fmars201500037,
    author = "Cathalot, Cécile et van Oevelen, Dick et Cox, Tom J. S. et Kutti, Tina et Lavaleye, Marc et Duineveld, Gerard et Meysman, Filip J. R.",
    title = "Récifs de coraux d'eau froide et fonds d'éponges adjacents : points chauds de la respiration benthique et du cycle du carbone organique dans l'océan profond",
    year = "2015",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Les récifs de coraux d'eau froide et les fonds d'éponges adjacents sont largement répartis dans l'océan profond, où seule une petite fraction de la productivité de surface atteint le fond marin sous forme de détritus. Il reste difficile à comprendre comment ces points chauds de biodiversité peuvent prospérer dans un environnement aussi limité en nourriture, car les données sur le flux d'énergie et l'utilisation du carbone organique font cruellement défaut. Ici, nous rapportons les taux de respiration communautaire in situ pour les écosystèmes de coraux d'eau froide et d'éponges obtenus par la technique non invasive de corrélation d'eddies aquatiques. Les taux d'absorption d'oxygène sur les récifs de coraux et les fonds d'éponges adjacents dans le Træna Coral Field (Norvège) étaient 9 à 20 fois plus élevés que ceux des sédiments mous environnants. Ces taux de respiration élevés indiquent une forte consommation de matière organique et suggèrent donc un focalisation locale sur ces écosystèmes du flux descendant de matière organique exporté de l'océan de surface. Dans l'ensemble, nos résultats montrent que les récifs de coraux et les fonds d'éponges adjacents sont des points chauds de traitement du carbone dans l'océan profond limité en nourriture, et que ces écosystèmes marins jouent un rôle plus important dans les cycles biogéochimiques marins que ce qui était reconnu précédemment.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2015.00037",
    doi = "10.3389/fmars.2015.00037",
    openalex = "W1916037364",
    references = "doi105194bg616712009"
}

Les habitats naturels ont la capacité de protéger les communautés côtières contre les impacts des vagues et des tempêtes, mais il est incertain comment différents habitats se complètent pour réduire ces impacts. Ici, nous investiguons les services individuels et combinés de protection côtière fournis par les coraux vivants sur les récifs, les herbiers et les forêts de mangroves, tant en conditions non-tempête qu'en conditions de tempête, et sous des niveaux actuels et futurs de la mer. En utilisant des profils idéalisés de récifs frangeants et de barrière, nous quantifions les services fournis par ces habitats en utilisant diverses métriques d'inondation et d'érosion. Nous trouvons que, ensemble, les coraux vivants, les herbiers et les mangroves fournissent plus de services de protection que n'importe quel habitat individuel ou n'importe quelle combinaison de deux habitats. Plus spécifiquement, nous trouvons que, bien que les mangroves soient les plus efficaces pour protéger la côte en conditions non-tempête et de tempête, les coraux vivants et les herbiers modèrent également l'impact des vagues et des tempêtes, réduisant ainsi davantage la vulnérabilité des régions côtières. De plus, en plus des différences structurelles, la quantité de service fournie par les habitats dans notre analyse dépend fortement du contexte géomorphologique, de l'emplacement de l'habitat et des conditions de forçage : les coraux vivants dans le profil de récif frangeant fournissent plus de services de protection que les herbiers ; les herbiers dans le profil de récif de barrière fournissent plus de services de protection que les coraux vivants ; et les herbiers, dans nos simulations, peuvent même compenser la dégradation à long terme du récif de barrière. Les résultats de cette étude démontrent l'importance d'adopter des approches intégrées et basées sur le lieu lors de la quantification et de la gestion des services de protection côtière fournis par les écosystèmes.

@article{doi101371journalpone0158094,
    author = "Guannel, Greg et Arkema, Katie K. et Ruggiero, Peter et Verutes, Gregory M.",
    title = "The Power of Three : les récifs coralliens, les herbiers et les mangroves protègent les régions côtières et augmentent leur résilience",
    year = "2016",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Les habitats naturels ont la capacité de protéger les communautés côtières contre les impacts des vagues et des tempêtes, mais il est incertain comment différents habitats se complètent pour réduire ces impacts. Ici, nous investiguons les services individuels et combinés de protection côtière fournis par les coraux vivants sur les récifs, les herbiers et les forêts de mangroves, tant en conditions non-tempête qu'en conditions de tempête, et sous des niveaux actuels et futurs de la mer. En utilisant des profils idéalisés de récifs frangeants et de barrière, nous quantifions les services fournis par ces habitats en utilisant diverses métriques d'inondation et d'érosion. Nous trouvons que, ensemble, les coraux vivants, les herbiers et les mangroves fournissent plus de services de protection que n'importe quel habitat individuel ou n'importe quelle combinaison de deux habitats. Plus spécifiquement, nous trouvons que, bien que les mangroves soient les plus efficaces pour protéger la côte en conditions non-tempête et de tempête, les coraux vivants et les herbiers modèrent également l'impact des vagues et des tempêtes, réduisant ainsi davantage la vulnérabilité des régions côtières. De plus, en plus des différences structurelles, la quantité de service fournie par les habitats dans notre analyse dépend fortement du contexte géomorphologique, de l'emplacement de l'habitat et des conditions de forçage : les coraux vivants dans le profil de récif frangeant fournissent plus de services de protection que les herbiers ; les herbiers dans le profil de récif de barrière fournissent plus de services de protection que les coraux vivants ; et les herbiers, dans nos simulations, peuvent même compenser la dégradation à long terme du récif de barrière. Les résultats de cette étude démontrent l'importance d'adopter des approches intégrées et basées sur le lieu lors de la quantification et de la gestion des services de protection côtière fournis par les écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0158094",
    doi = "10.1371/journal.pone.0158094",
    openalex = "W2474682767",
    references = "doi101016joceaneng200907018, doi101038ncomms2409"
}

De nombreux écosystèmes dans le monde se détériorent rapidement en raison des pressions locales et globales, et peut-être aucun aussi précipitamment que les récifs coralliens. La gestion des récifs coralliens par l'entretien (par exemple, zones marines protégées, gestion des bassins versants pour améliorer la qualité de l'eau), la restauration, ainsi que les accords gouvernementaux nationaux et internationaux visant à réduire les émissions de gaz à effet de serre (par exemple, l'Accord de Paris de 2015) est essentielle à la persistance des récifs coralliens. Malgré ces initiatives, la santé et l'abondance des récifs coralliens déclinent rapidement et d'autres solutions seront bientôt nécessaires. Nous avons récemment discuté des options pour utiliser l'évolution assistée (c'est-à-dire l'élevage sélectif, le flux génique assisté, la conditionnement ou la programmation épigénétique, et la manipulation du microbiome des coraux) comme moyen d'améliorer la tolérance au stress environnemental des coraux et le succès des efforts de restauration des récifs coralliens. L'événement mondial de blanchissement des coraux de 2014-2016 a accru l'attention portée à ces approches interventionnistes. Nous soulignons la nécessité de prendre en compte des états d'écosystème alternatifs (par exemple, hybrides), discutons des traits des coraux résilients et des écosystèmes de récifs coralliens, et proposons un arbre de décision pour intégrer l'évolution assistée dans les initiatives de restauration afin d'améliorer la résilience climatique des récifs coralliens.

@article{doi101111gcb13647,
    author = "van Oppen, Madeleine J. H. et Gates, Ruth D. et Blackall, Linda L. et Cantin, Neal E. et Chakravarti, Leela J. et Chan, Wing Yan et Cormick, Craig et Crean, Angela J. et Damjanovic, Katarina et Epstein, Hannah E. et Harrison, Peter L. et Jones, Thomas A. et Miller, Margaret W. et Pears, Rachel et Peplow, Lesa M. et Raftos, David A. et Schaffelke, Britta et Stewart, Kristen et Torda, Gergely et Wachenfeld, David et Weeks, Andrew R. et Putnam, Hollie M.",
    title = "Shifting paradigms in restoration of the world's coral reefs",
    year = "2017",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "De nombreux écosystèmes dans le monde se détériorent rapidement en raison des pressions locales et globales, et peut-être aucun aussi précipitamment que les récifs coralliens. La gestion des récifs coralliens par l'entretien (par exemple, zones marines protégées, gestion des bassins versants pour améliorer la qualité de l'eau), la restauration, ainsi que les accords gouvernementaux nationaux et internationaux visant à réduire les émissions de gaz à effet de serre (par exemple, l'Accord de Paris de 2015) est essentielle à la persistance des récifs coralliens. Malgré ces initiatives, la santé et l'abondance des récifs coralliens déclinent rapidement et d'autres solutions seront bientôt nécessaires. Nous avons récemment discuté des options pour utiliser l'évolution assistée (c'est-à-dire l'élevage sélectif, le flux génique assisté, la conditionnement ou la programmation épigénétique, et la manipulation du microbiome des coraux) comme moyen d'améliorer la tolérance au stress environnemental des coraux et le succès des efforts de restauration des récifs coralliens. L'événement mondial de blanchissement des coraux de 2014-2016 a accru l'attention portée à ces approches interventionnistes. Nous soulignons la nécessité de prendre en compte des états d'écosystème alternatifs (par exemple, hybrides), discutons des traits des coraux résilients et des écosystèmes de récifs coralliens, et proposons un arbre de décision pour intégrer l'évolution assistée dans les initiatives de restauration afin d'améliorer la résilience climatique des récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.13647",
    doi = "10.1111/gcb.13647",
    openalex = "W2594335126",
    references = "doi101038ncomms2409, doi101073pnas1422301112, doi101890es15001211"
}

Les récifs coralliens se trouvent dans une large gamme d'environnements, où ils fournissent de la nourriture et un habitat à une grande variété d'organismes ainsi que d'autres biens et services écologiques. Par exemple, les récifs coralliens d'eaux chaudes occupent des eaux peu profondes, ensoleillées, chaudes et alcalines afin de croître et de calcifier aux taux élevés nécessaires pour construire et maintenir leurs structures de carbonate de calcium. À des profondeurs plus grandes (40 – 150 m), les récifs coralliens « mésophotiques » (faible luminosité) accumulent du carbonate de calcium à des taux beaucoup plus faibles (voire pas du tout dans certains cas), tout en restant importants comme habitat pour une large gamme d'organismes, y compris ceux importants pour la pêche. Enfin, encore plus profond, jusqu'à 2000 m ou plus, les récifs coralliens dits « d'eaux froides » se trouvent dans les profondeurs sombres. Malgré leur importance, les récifs coralliens font face à des défis importants liés aux activités humaines, notamment la pollution, la surpêche, la destruction physique et le changement climatique. Dans ce dernier cas, même des scénarios d'émissions de gaz à effet de serre plus bas (tels que le Trajet de Concentration Représentatif RCP 4.5) sont susceptibles de conduire à l'élimination de la plupart des récifs coralliens d'eaux chaudes d'ici 2040-2050. Les coraux d'eaux froides sont également menacés par le réchauffement des températures et l'acidification océanique, bien que les preuves de l'effet direct du changement climatique soient moins claires. Les preuves selon lesquelles les récifs coralliens peuvent s'adapter à des taux suffisants pour suivre le réchauffement rapide de l'océan et l'acidification sont minimes, surtout compte tenu du fait que les coraux ont une longue durée de vie et ont donc des taux d'évolution lents. Les conclusions selon lesquelles les récifs coralliens migreront vers des latitudes plus élevées en se réchauffant sont tout aussi infondées, les observations d'espèces tropicales apparaissant à haute latitude constituant une preuve « nécessaire mais non suffisante » que les écosystèmes de récifs coralliens entiers se déplacent. Au contraire, les récifs coralliens sont susceptibles de se dégrader rapidement au cours des 20 prochaines années, posant des défis fondamentaux pour les 500 millions de personnes qui tirent de la nourriture, des revenus, une protection côtière et une gamme d'autres services des récifs coralliens. À moins que des progrès rapides vers les objectifs de l'Accord de Paris sur le changement climatique ne surviennent au cours de la prochaine décennie, des centaines de millions de personnes risquent de faire face à des quantités croissantes de pauvreté et de troubles sociaux, et, dans certains cas, d'insécurité régionale.

@article{doi103389fmars201700158,
    author = "Hoegh‐Guldberg, Ove et Poloczanska, Elvira S. et Skirving, William et Dove, Sophie",
    title = "Écosystèmes de récifs coralliens sous changement climatique et acidification océanique",
    year = "2017",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Les récifs coralliens se trouvent dans une large gamme d'environnements, où ils fournissent de la nourriture et un habitat à une grande variété d'organismes ainsi que d'autres biens et services écologiques. Par exemple, les récifs coralliens d'eaux chaudes occupent des eaux peu profondes, ensoleillées, chaudes et alcalines afin de croître et de calcifier aux taux élevés nécessaires pour construire et maintenir leurs structures de carbonate de calcium. À des profondeurs plus grandes (40 – 150 m), les récifs coralliens « mésophotiques » (faible luminosité) accumulent du carbonate de calcium à des taux beaucoup plus faibles (voire pas du tout dans certains cas), tout en restant importants comme habitat pour une large gamme d'organismes, y compris ceux importants pour la pêche. Enfin, encore plus profond, jusqu'à 2000 m ou plus, les récifs coralliens dits « d'eaux froides » se trouvent dans les profondeurs sombres. Malgré leur importance, les récifs coralliens font face à des défis importants liés aux activités humaines, notamment la pollution, la surpêche, la destruction physique et le changement climatique. Dans ce dernier cas, même des scénarios d'émissions de gaz à effet de serre plus bas (tels que le Trajet de Concentration Représentatif RCP 4.5) sont susceptibles de conduire à l'élimination de la plupart des récifs coralliens d'eaux chaudes d'ici 2040-2050. Les coraux d'eaux froides sont également menacés par le réchauffement des températures et l'acidification océanique, bien que les preuves de l'effet direct du changement climatique soient moins claires. Les preuves selon lesquelles les récifs coralliens peuvent s'adapter à des taux suffisants pour suivre le réchauffement rapide de l'océan et l'acidification sont minimes, surtout compte tenu du fait que les coraux ont une longue durée de vie et ont donc des taux d'évolution lents. Les conclusions selon lesquelles les récifs coralliens migreront vers des latitudes plus élevées en se réchauffant sont tout aussi infondées, les observations d'espèces tropicales apparaissant à haute latitude constituant une preuve « nécessaire mais non suffisante » que les écosystèmes de récifs coralliens entiers se déplacent. Au contraire, les récifs coralliens sont susceptibles de se dégrader rapidement au cours des 20 prochaines années, posant des défis fondamentaux pour les 500 millions de personnes qui tirent de la nourriture, des revenus, une protection côtière et une gamme d'autres services des récifs coralliens. À moins que des progrès rapides vers les objectifs de l'Accord de Paris sur le changement climatique ne surviennent au cours de la prochaine décennie, des centaines de millions de personnes risquent de faire face à des quantités croissantes de pauvreté et de troubles sociaux, et, dans certains cas, d'insécurité régionale.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2017.00158",
    doi = "10.3389/fmars.2017.00158",
    openalex = "W2613802059",
    references = "doi1010022016jc012326, doi101016jecss200809003, doi101016jgloenvcha201404002, doi101017cbo9781107415386, doi1010292002jd002670, doi10103820859, doi101038nature04095, doi101093icb391146, doi101126science1059199, doi101126science1152509, doi101146annurevmarine010908163834, doi101371journalpone0030580, doi105194bg616712009, openalexw2530597942, openalexw2924055038"
}

Les récifs coralliens peuvent fournir des avantages significatifs de protection côtière aux personnes et aux biens. Ici, nous montrons que les dommages annuels attendus dus aux inondations doubleraient et que les coûts dus aux tempêtes fréquentes tripleraient sans récifs. Pour les événements de tempête centennaux, les dommages dus aux inondations augmenteraient de 91 % à 272 milliards de dollars US sans récifs. Les pays qui ont le plus à gagner de la gestion des récifs sont l'Indonésie, les Philippines, la Malaisie, le Mexique et Cuba ; les économies annuelles attendues dues aux inondations dépassent 400 millions de dollars pour chacune de ces nations. La montée du niveau de la mer augmentera le risque d'inondation, mais des impacts substantiels pourraient survenir uniquement à cause de la perte de récifs sans une meilleure gestion à court terme. Nous fournissons une évaluation mondiale, basée sur les processus, d'un service écosystémique à travers tout un biome marin aux niveaux (sub)nationaux. Ces avantages spatialement explicites éclairent les décisions critiques de gestion des risques et de l'environnement, et les avantages attendus peuvent être directement pris en compte par les gouvernements (par exemple, comptes nationaux, plans de relance) et les entreprises (par exemple, assurances).

@article{doi101038s4146701804568z,
    author = "Beck, Michael W. et Losada, Íñigo J. et Menéndez, Pelayo et Reguero, Borja G. et Díaz-Simal, Pedro et Fernández, Felipe",
    title = "Les économies de protection contre les inondations mondiales fournies par les récifs coralliens",
    year = "2018",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les récifs coralliens peuvent fournir des avantages significatifs de protection côtière aux personnes et aux biens. Ici, nous montrons que les dommages annuels attendus dus aux inondations doubleraient et que les coûts dus aux tempêtes fréquentes tripleraient sans récifs. Pour les événements de tempête centennaux, les dommages dus aux inondations augmenteraient de 91 % à 272 milliards de dollars US sans récifs. Les pays qui ont le plus à gagner de la gestion des récifs sont l'Indonésie, les Philippines, la Malaisie, le Mexique et Cuba ; les économies annuelles attendues dues aux inondations dépassent 400 millions de dollars pour chacune de ces nations. La montée du niveau de la mer augmentera le risque d'inondation, mais des impacts substantiels pourraient survenir uniquement à cause de la perte de récifs sans une meilleure gestion à court terme. Nous fournissons une évaluation mondiale, basée sur les processus, d'un service écosystémique à travers tout un biome marin aux niveaux (sub)nationaux. Ces avantages spatialement explicites éclairent les décisions critiques de gestion des risques et de l'environnement, et les avantages attendus peuvent être directement pris en compte par les gouvernements (par exemple, comptes nationaux, plans de relance) et les entreprises (par exemple, assurances).",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-018-04568-z",
    doi = "10.1038/s41467-018-04568-z",
    openalex = "W2805548573",
    references = "doi101038nature18607, doi101098rspb20090339, doi101126science1204794, doi1011751520042620020190183eimobo20co2"
}

Les récifs coralliens fournissent des biens et des services écosystémiques à des millions de personnes dans les tropiques, mais les conditions des récifs déclinent dans le monde entier. Des solutions efficaces à la crise qui menace les récifs coralliens dépendent en partie de la compréhension du contexte dans lequel différents types de bénéfices de conservation peuvent être maximisés. Notre analyse mondiale de près de 1 800 récifs tropicaux révèle comment l'intensité des impacts humains dans le paysage marin environnant, mesurée en fonction de la taille de la population humaine et de l'accessibilité aux récifs (« gravité »), diminue l'efficacité des réserves marines pour maintenir la biomasse des poissons de récif et la présence de prédateurs supérieurs, même lorsque le respect des règles de la réserve est élevé. De manière critique, la biomasse de poissons dans les réserves marines à haut respect situées là où les impacts humains étaient intenses tendait à être inférieure à un quart de celle des réserves où les impacts humains étaient faibles. De même, la probabilité de rencontrer des prédateurs supérieurs sur des récifs à forts impacts humains était proche de zéro, même dans des réserves marines à haut respect. Cependant, nous constatons que la différence relative entre les sites pêchés en libre accès et les réserves (ce à quoi nous nous référons comme des gains de conservation) est la plus élevée pour la biomasse de poissons (à l'exclusion des prédateurs) lorsque les impacts humains sont modérés et pour les prédateurs supérieurs lorsque les impacts humains sont faibles. Nos résultats illustrent des compromis écologiques critiques pour atteindre des objectifs de conservation clés : les réserves placées là où il existe des impacts humains modérés à élevés peuvent fournir des gains de conservation substantiels pour la biomasse de poissons, mais elles sont peu susceptibles de soutenir des fonctions écosystémiques clés comme la prédation d'ordre supérieur, qui est plus répandue dans les emplacements de réserves à faibles impacts humains.

@article{doi101073pnas1708001115,
    author = "Cinner, Joshua E. et Maire, Eva et Huchery, Cindy et MacNeil, M. Aaron et Graham, Nicholas A. J. et Mora, Camilo et McClanahan, Tim R. et Barnes, Michele L. et Kittinger, John N. et Hicks, Christina C. et D'Agata, Stéphanie et Hoey, Andrew S. et Gurney, Georgina G. et Feary, David A. et Williams, Ivor D. et Kulbicki, Michel et Vigliola, Laurent et Wantiez, Laurent et Edgar, Graham J. et Stuart‐Smith, Rick D. et Sandin, Stuart A. et Green, Alison et Hardt, Marah J. et Beger, Maria et Friedlander, Alan M. et Wilson, Shaun K. et Brokovich, Eran et Brooks, Andrew J. et Cruz‐Motta, Juan J. et Booth, David J. et Chabanet, Pascale et Gough, Charlotte et Tupper, Mark et Ferse, Sebastian C. A. et Sumaila, U. Rashid et Pardede, Shinta et Mouillot, David",
    title = "Gravity of human impacts mediates coral reef conservation gains",
    year = "2018",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Les récifs coralliens fournissent des biens et des services écosystémiques à des millions de personnes dans les tropiques, mais les conditions des récifs déclinent dans le monde entier. Des solutions efficaces à la crise qui menace les récifs coralliens dépendent en partie de la compréhension du contexte dans lequel différents types de bénéfices de conservation peuvent être maximisés. Notre analyse mondiale de près de 1 800 récifs tropicaux révèle comment l'intensité des impacts humains dans le paysage marin environnant, mesurée en fonction de la taille de la population humaine et de l'accessibilité aux récifs (« gravité »), diminue l'efficacité des réserves marines pour maintenir la biomasse des poissons de récif et la présence de prédateurs supérieurs, même lorsque le respect des règles de la réserve est élevé. De manière critique, la biomasse de poissons dans les réserves marines à haut respect situées là où les impacts humains étaient intenses tendait à être inférieure à un quart de celle des réserves où les impacts humains étaient faibles. De même, la probabilité de rencontrer des prédateurs supérieurs sur des récifs à forts impacts humains était proche de zéro, même dans des réserves marines à haut respect. Cependant, nous constatons que la différence relative entre les sites pêchés en libre accès et les réserves (ce à quoi nous nous référons comme des gains de conservation) est la plus élevée pour la biomasse de poissons (à l'exclusion des prédateurs) lorsque les impacts humains sont modérés et pour les prédateurs supérieurs lorsque les impacts humains sont faibles. Nos résultats illustrent des compromis écologiques critiques pour atteindre des objectifs de conservation clés : les réserves placées là où il existe des impacts humains modérés à élevés peuvent fournir des gains de conservation substantiels pour la biomasse de poissons, mais elles sont peu susceptibles de soutenir des fonctions écosystémiques clés comme la prédation d'ordre supérieur, qui est plus répandue dans les emplacements de réserves à faibles impacts humains.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1708001115",
    doi = "10.1073/pnas.1708001115",
    openalex = "W2809574340",
    references = "doi101038nature18607"
}

Résumé L'écologie de nombreuses récifs coralliens a considérablement changé au cours des dernières décennies en réponse à diverses combinaisons de stress locaux et globaux. Ces changements écologiques ont des implications importantes pour l'abondance des taxons qui régulent la production et l'érosion des carbonates squelettiques, et donc pour de nombreuses fonctions géo-écologiques que les récifs coralliens fournissent, notamment la production du cadre du récif et la génération de sédiments, le maintien de la complexité de l'habitat du récif et le potentiel de croissance du récif. Ces attributs fonctionnels sous-tendent de nombreux biens et services écosystémiques que les récifs fournissent à la société. Les conditions rapidement changeantes des récifs dans l'Anthropocène sont susceptibles d'impacter significativement la capacité des récifs à maintenir ces fonctions géo-écologiques. Bien que l'empreinte anthropocène des perturbations s'exprimera différemment à travers les éco-régions et les habitats, l'aboutissement pour de nombreux récifs peut être globalement similaire : (a) un déplacement progressif vers des états de budget carbonaté nettement neutre ou négatif ; (b) une structure de plus en plus plate ; et (c) des taux de croissance verticale plus faibles. Il est également probable qu'une homogénéisation progressive de la profondeur se produise en termes de ces processus. L'Anthropocène sera probablement défini par une dissociation croissante entre les processus écologiques qui pilotent la production de carbonates à la surface du récif et le résultat géologique net de cette production, c'est-à-dire l'accumulation de la structure sous-jacente du récif. Les structures de récifs deviendront ainsi de plus en plus des caractéristiques relictuelles ou séniles, ce qui réduira la complexité de l'habitat du récif et les taux de génération de sédiments, et limitera le potentiel des récifs à s'accrétir verticalement à des taux capables de suivre la montée du niveau de la mer. En l'absence de stresseurs généralisés, la récupération des communautés coralliennes dégradées a été observée, entraînant le regain de budgets nettement positifs. Cependant, la fréquence et l'intensité des événements de blanchissement induits par le climat sont prédits à augmenter au cours des prochaines décennies. Cela augmentera l'empreinte spatiale des perturbations et exacerbera l'ampleur des changements décrits ici, limitant la capacité de nombreux récifs à maintenir leurs fonctions géo-écologiques. L'application de protections marines efficaces ou les avantages de l'isolement géographique ou de conditions environnementales favorables (« sites de refuge ») peuvent offrir l'espoir de futurs plus optimistes dans certains endroits. Un résumé en langage simple est disponible pour cet article.

@article{doi1011111365243513247,
    author = "Perry, Chris T. et Álvarez‐Filip, Lorenzo",
    title = "Changing geo‐ecological functions of coral reefs in the Anthropocene",
    year = "2018",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Résumé L'écologie de nombreuses récifs coralliens a considérablement changé au cours des dernières décennies en réponse à diverses combinaisons de stress locaux et globaux. Ces changements écologiques ont des implications importantes pour l'abondance des taxons qui régulent la production et l'érosion des carbonates squelettiques, et donc pour de nombreuses fonctions géo-écologiques que les récifs coralliens fournissent, notamment la production du cadre du récif et la génération de sédiments, le maintien de la complexité de l'habitat du récif et le potentiel de croissance du récif. Ces attributs fonctionnels sous-tendent de nombreux biens et services écosystémiques que les récifs fournissent à la société. Les conditions rapidement changeantes des récifs dans l'Anthropocène sont susceptibles d'impacter significativement la capacité des récifs à maintenir ces fonctions géo-écologiques. Bien que l'empreinte anthropocène des perturbations s'exprimera différemment à travers les éco-régions et les habitats, l'aboutissement pour de nombreux récifs peut être globalement similaire : (a) un déplacement progressif vers des états de budget carbonaté nettement neutre ou négatif ; (b) une structure de plus en plus plate ; et (c) des taux de croissance verticale plus faibles. Il est également probable qu'une homogénéisation progressive de la profondeur se produise en termes de ces processus. L'Anthropocène sera probablement défini par une dissociation croissante entre les processus écologiques qui pilotent la production de carbonates à la surface du récif et le résultat géologique net de cette production, c'est-à-dire l'accumulation de la structure sous-jacente du récif. Les structures de récifs deviendront ainsi de plus en plus des caractéristiques relictuelles ou séniles, ce qui réduira la complexité de l'habitat du récif et les taux de génération de sédiments, et limitera le potentiel des récifs à s'accrétir verticalement à des taux capables de suivre la montée du niveau de la mer. En l'absence de stresseurs généralisés, la récupération des communautés coralliennes dégradées a été observée, entraînant le regain de budgets nettement positifs. Cependant, la fréquence et l'intensité des événements de blanchissement induits par le climat sont prédits à augmenter au cours des prochaines décennies. Cela augmentera l'empreinte spatiale des perturbations et exacerbera l'ampleur des changements décrits ici, limitant la capacité de nombreux récifs à maintenir leurs fonctions géo-écologiques. L'application de protections marines efficaces ou les avantages de l'isolement géographique ou de conditions environnementales favorables (« sites de refuge ») peuvent offrir l'espoir de futurs plus optimistes dans certains endroits. Un résumé en langage simple est disponible pour cet article.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2435.13247",
    doi = "10.1111/1365-2435.13247",
    openalex = "W2901925152",
    references = "doi103389fmars201600181"
}

Les déchets plastiques peuvent favoriser la colonisation microbienne par des pathogènes impliqués dans des épidémies de maladies dans l'océan. Nous avons évalué l'influence des déchets plastiques sur le risque de maladie chez 124 000 coraux constructeurs de récifs provenant de 159 récifs dans la région Asie-Pacifique. La probabilité de maladie augmente de 4 % à 89 % lorsque les coraux sont en contact avec du plastique. Les coraux de structure complexe sont huit fois plus susceptibles d'être affectés par le plastique, ce qui suggère que les microhabitats pour les organismes associés aux récifs et les pêches précieuses seront affectés de manière disproportionnée. Les niveaux de plastique sur les récifs coralliens correspondent aux estimations des déchets plastiques mal gérés d'origine terrestre entrant dans l'océan. Nous estimons que 11,1 milliards d'articles en plastique sont enchevêtrés sur les récifs coralliens dans l'ensemble de l'Asie-Pacifique et prévoyons que ce nombre augmentera de 40 % d'ici 2025. La gestion des déchets plastiques est cruciale pour réduire les maladies qui menacent la santé des écosystèmes et les moyens de subsistance humains.

@article{doi101126scienceaar3320,
    author = "Lamb, Joleah B. et Willis, Bette L. et Fiorenza, Evan A. et Couch, Courtney S. et Howard, Robert et Rader, Douglas N. et True, James et Kelly, Lisa A. et Ahmad, Awaludinnoer et Jompa, Jamaluddin et Harvell, C. Drew",
    title = "Déchets plastiques associés aux maladies sur les récifs coralliens",
    year = "2018",
    journal = "Science",
    abstract = "Les déchets plastiques peuvent favoriser la colonisation microbienne par des pathogènes impliqués dans des épidémies de maladies dans l'océan. Nous avons évalué l'influence des déchets plastiques sur le risque de maladie chez 124 000 coraux constructeurs de récifs provenant de 159 récifs dans la région Asie-Pacifique. La probabilité de maladie augmente de 4 % à 89 % lorsque les coraux sont en contact avec du plastique. Les coraux de structure complexe sont huit fois plus susceptibles d'être affectés par le plastique, ce qui suggère que les microhabitats pour les organismes associés aux récifs et les pêches précieuses seront affectés de manière disproportionnée. Les niveaux de plastique sur les récifs coralliens correspondent aux estimations des déchets plastiques mal gérés d'origine terrestre entrant dans l'océan. Nous estimons que 11,1 milliards d'articles en plastique sont enchevêtrés sur les récifs coralliens dans l'ensemble de l'Asie-Pacifique et prévoyons que ce nombre augmentera de 40 % d'ici 2025. La gestion des déchets plastiques est cruciale pour réduire les maladies qui menacent la santé des écosystèmes et les moyens de subsistance humains.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aar3320",
    doi = "10.1126/science.aar3320",
    openalex = "W2785173370",
    references = "doi101038nature21707"
}

Les scientifiques ont plaidé pour des interventions locales, telles que la création d'aires marines protégées et la mise en œuvre de restrictions sur la pêche, en tant que moyens d'atténuer les stress locaux afin de limiter les effets du changement climatique sur les coraux constructeurs de récifs. Cependant, dans une revue de littérature, nous trouvons peu de soutien empirique à l'idée de résilience gérée. Nous exposons certaines raisons pour lesquelles les aires marines protégées et la protection des poissons herbivores (en particulier les poissons perroquets) ont eu peu d'effet sur la résilience des coraux. Une explication clé est que les impacts des stress locaux (par exemple, la pollution et la pêche) sont souvent noyés par l'effet beaucoup plus grand du réchauffement des océans sur les coraux. Une autre est la complexité pure (y compris de nombreuses dépendances contextuelles) des cinq maillons en cascade supposés par l'hypothèse de la résilience gérée. Si les récifs ne peuvent pas être sauvés par des actions locales seules, alors il est temps de faire face frontalement à la dégradation des récifs, en traitant directement le changement climatique anthropique - la cause racine du déclin mondial des coraux.

@article{doi101146annurevmarine010318095300,
    author = "Bruno, John F. and Côté, Isabelle M. and Toth, Lauren T.",
    title = "Climate Change, Coral Loss, and the Curious Case of the Parrotfish Paradigm: Why Don't Marine Protected Areas Improve Reef Resilience?",
    year = "2019",
    journal = "Annual Review of Marine Science",
    abstract = "Scientists have advocated for local interventions, such as creating marine protected areas and implementing fishery restrictions, as ways to mitigate local stressors to limit the effects of climate change on reef-building corals. However, in a literature review, we find little empirical support for the notion of managed resilience. We outline some reasons for why marine protected areas and the protection of herbivorous fish (especially parrotfish) have had little effect on coral resilience. One key explanation is that the impacts of local stressors (e.g., pollution and fishing) are often swamped by the much greater effect of ocean warming on corals. Another is the sheer complexity (including numerous context dependencies) of the five cascading links assumed by the managed-resilience hypothesis. If reefs cannot be saved by local actions alone, then it is time to face reef degradation head-on, by directly addressing anthropogenic climate change-the root cause of global coral decline.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-marine-010318-095300",
    doi = "10.1146/annurev-marine-010318-095300",
    openalex = "W2908138043",
    references = "doi101038ncomms2409"
}

@article{tortolerolangarica2019accelerated,
    author = "Tortolero-Langarica, J.J. Adolfo et Rodríguez-Troncoso, Alma P. et Cupul-Magaña, Amílcar L. et Alarcón-Ortega, Lucy C. et Santiago-Valentín, Jeimy D.",
    title = "Récupération accélérée de la production de carbonate de calcium dans les récifs coralliens grâce à la restauration écologique à faible technologie",
    year = "2019",
    journal = "Ecological Engineering",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2019.01.002",
    doi = "10.1016/j.ecoleng.2019.01.002",
    openalex = "W2908714274",
    pages = "89-97",
    volume = "128",
    references = "doi101016jecss200809003, doi101016jpocean200603009, doi101071mf99078, doi101098rspb20090339, doi101126science1152509, doi101126science1204794, doi101126science2845411118, doi101126scienceaan8048, doi101371journalpone0000711, doi103354meps007207"
}

@article{doi101007s0033802001966y,
    author = "Burt, John A. et Camp, Emma F. et Enochs, Ian C. et Johansen, Jacob L. et Morgan, Kyle M. et Riegl, Bernhard et Hoey, Andrew S.",
    title = "Insights from extreme coral reefs in a changing world",
    year = "2020",
    journal = "Coral Reefs",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00338-020-01966-y",
    doi = "10.1007/s00338-020-01966-y",
    openalex = "W3035397619",
    references = "doi101038s4155802007379, doi101111oik05946, doi103389fmars201800004"
}

Résumé L'empreinte accélérée combinée du changement climatique et des pressions anthropiques accrues, ainsi que les résultats médiocres de nombreuses activités de gestion traditionnelles, soulignent la nécessité de tactiques actives de restauration des récifs (visant l'aquaculture et le transplantation de coraux), soutenues par des approches d'ingénierie écologique. Ces approches incluent, entre autres, l'utilisation d'espèces ingénieurs d'écosystème, qui, par des modifications de leurs propriétés physiques ou biologiques, créent de nouveaux habitats caractérisés par une biodiversité nouvelle (par le biais d'actes d'ingénierie autogène ou allogène). Seule une petite étude sur la restauration des récifs coralliens a discuté/mentionné « ingénierie écologique » ou « ingénierie des récifs coralliens ». L'examen des publications sur la restauration des récifs (2016–2019 ; 145 publications) révèle seulement 39 (26,9 %) traitant des aspects de l'ingénierie écologique, avec 10 classes d'« applications » (26 publications) et 4 classes de « propriétés » (n = 13). Les « applications » d'ingénierie écologique englobent tous les aspects de la restauration des récifs, tandis que les « propriétés » d'ingénierie écologique traitent de la génétique assistée, du chimérisme corallien, de l'aquaculture des organismes vivant sur les récifs, et de la prise en compte des paramètres d'histoire de vie des espèces clés aquaculées/transplantées. Pourtant, de nombreuses applications d'ingénierie écologique se concentrent sur des espèces de coraux particulières, abordant leurs problèmes communautaires spécifiques, tandis que peu répondent aux besoins de la restauration de l'écosystème/du paysage dans son ensemble. Il est conclu que plutôt que de tenter de ramener les écosystèmes à des états historiques, l'ingénierie écologique devrait se tourner vers la création de nouveaux écosystèmes qui n'existaient pas auparavant.

@article{doi101093icesjmsfsaa022,
    author = "Rinkevich, Baruch",
    title = "Ecological engineering approaches in coral reef restoration",
    year = "2020",
    journal = "ICES Journal of Marine Science",
    abstract = "Résumé L'empreinte accélérée combinée du changement climatique et des pressions anthropiques accrues, ainsi que les résultats médiocres de nombreuses activités de gestion traditionnelles, soulignent la nécessité de tactiques actives de restauration des récifs (visant l'aquaculture et le transplantation de coraux), soutenues par des approches d'ingénierie écologique. Ces approches incluent, entre autres, l'utilisation d'espèces ingénieurs d'écosystème, qui, par des modifications de leurs propriétés physiques ou biologiques, créent de nouveaux habitats caractérisés par une biodiversité nouvelle (par le biais d'actes d'ingénierie autogène ou allogène). Seule une petite étude sur la restauration des récifs coralliens a discuté/mentionné « ingénierie écologique » ou « ingénierie des récifs coralliens ». L'examen des publications sur la restauration des récifs (2016–2019 ; 145 publications) révèle seulement 39 (26,9 %) traitant des aspects de l'ingénierie écologique, avec 10 classes d'« applications » (26 publications) et 4 classes de « propriétés » (n = 13). Les « applications » d'ingénierie écologique englobent tous les aspects de la restauration des récifs, tandis que les « propriétés » d'ingénierie écologique traitent de la génétique assistée, du chimérisme corallien, de l'aquaculture des organismes vivant sur les récifs, et de la prise en compte des paramètres d'histoire de vie des espèces clés aquaculées/transplantées. Pourtant, de nombreuses applications d'ingénierie écologique se concentrent sur des espèces de coraux particulières, abordant leurs problèmes communautaires spécifiques, tandis que peu répondent aux besoins de la restauration de l'écosystème/du paysage dans son ensemble. Il est conclu que plutôt que de tenter de ramener les écosystèmes à des états historiques, l'ingénierie écologique devrait se tourner vers la création de nouveaux écosystèmes qui n'existaient pas auparavant.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icesjms/fsaa022",
    doi = "10.1093/icesjms/fsaa022",
    openalex = "W3009701001",
    references = "doi101007978146124018114, doi101016jecoleng200410003, doi101016jecoleng201901002, doi101038nature21708, doi101073pnas091092998, doi101073pnas1208909109, doi1011111365243513331, doi101111j13652664200901751x, doi101126science1255641, doi1023073545850, doi103354meps07815, tortolerolangarica2019accelerated"
}

Le blanchissement massif des coraux a augmenté en intensité et en fréquence et a gravement impacté les récifs tropicaux peu profonds dans le monde entier. Bien que de nombreuses investigations aient été menées sur la résistance et la résilience des récifs coralliens dans le Pacifique indo-Asiatique et les Caraïbes, les récifs uniques de l'Atlantique Sud restent largement inévalués. Ici, nous avons compilé des données primaires et bibliographiques pour les récifs de trois régions biogéographiques : le Pacifique indo-Asiatique, les Caraïbes et l'Atlantique Sud, et avons effectué des analyses comparatives pour examiner si ces derniers pourraient être plus résistants au blanchissement. Nos résultats montrent que les coraux de l'Atlantique Sud présentent des caractéristiques critiques qui les rendent moins susceptibles de subir un blanchissement massif : (i) une distribution bathymétrique plus profonde, car les espèces ont une profondeur maximale moyenne d'occurrence de 70 m ; (ii) une tolérance plus élevée à la turbidité, car près de 60 % des espèces sont trouvées dans des conditions turbides ; (iii) une tolérance plus élevée à l'enrichissement en nutriments, car la concentration en nitrate dans l'Atlantique Sud est naturellement élevée ; (iv) une résistance morphologique plus élevée, car les formes de croissance massives sont dominantes et représentent deux tiers des espèces ; et (v) des associations symbiotiques plus flexibles, car 75 % des coraux et 60 % des phylotypes de symbiontes sont des généralistes. Ces caractéristiques sont associées à une occurrence d'épisodes de blanchissement avec mortalité de coraux plus faible dans l'Atlantique Sud, environ 60 % de moins que dans le Pacifique indo-Asiatique et 50 % de moins que dans les Caraïbes. De plus, aucun épisode de mortalité massive de coraux associé aux trois événements de blanchissement massif mondial n'a été signalé pour l'Atlantique Sud, qui a subi considérablement moins de blanchissement. Ces résultats montrent que les récifs de l'Atlantique Sud présentent plusieurs caractéristiques remarquables pour résister au stress thermique. Ensemble avec une expérience historique de moins de stress thermique, nos résultats peuvent expliquer pourquoi les impacts du changement climatique dans cette région ont été moins intenses. Compte tenu de l'ampleur étendue et de la distribution latitudinale des récifs coralliens et des communautés de l'Atlantique Sud, la région peut être reconnue comme un refuge majeur et susceptible de résister plus efficacement aux impacts du changement climatique que les récifs du Pacifique indo-Asiatique et des Caraïbes.

@article{doi103389fmars202000514,
    author = "Mies, Miguel et Francini‐Filho, Ronaldo B. et Zilberberg, Carla et Garrido, Amana G. et Longo, Guilherme Ortigara et Laurentino, Eduarda et Güth, Arthur Z. et Sumida, Paulo Yukio Gomes et Banha., Thomás Nei Soto",
    title = "Les récifs coralliens de l'Atlantique Sud sont des refuges majeurs contre le réchauffement climatique mondial et moins susceptibles de subir le blanchissement",
    year = "2020",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Le blanchissement massif des coraux a augmenté en intensité et en fréquence et a gravement impacté les récifs tropicaux peu profonds dans le monde entier. Bien que de nombreuses investigations aient été menées sur la résistance et la résilience des récifs coralliens dans le Pacifique indo-Asiatique et les Caraïbes, les récifs uniques de l'Atlantique Sud restent largement inévalués. Ici, nous avons compilé des données primaires et bibliographiques pour les récifs de trois régions biogéographiques : le Pacifique indo-Asiatique, les Caraïbes et l'Atlantique Sud, et avons effectué des analyses comparatives pour examiner si ces derniers pourraient être plus résistants au blanchissement. Nos résultats montrent que les coraux de l'Atlantique Sud présentent des caractéristiques critiques qui les rendent moins susceptibles de subir un blanchissement massif : (i) une distribution bathymétrique plus profonde, car les espèces ont une profondeur maximale moyenne d'occurrence de 70 m ; (ii) une tolérance plus élevée à la turbidité, car près de 60 % des espèces sont trouvées dans des conditions turbides ; (iii) une tolérance plus élevée à l'enrichissement en nutriments, car la concentration en nitrate dans l'Atlantique Sud est naturellement élevée ; (iv) une résistance morphologique plus élevée, car les formes de croissance massives sont dominantes et représentent deux tiers des espèces ; et (v) des associations symbiotiques plus flexibles, car 75 % des coraux et 60 % des phylotypes de symbiontes sont des généralistes. Ces caractéristiques sont associées à une occurrence d'épisodes de blanchissement avec mortalité de coraux plus faible dans l'Atlantique Sud, environ 60 % de moins que dans le Pacifique indo-Asiatique et 50 % de moins que dans les Caraïbes. De plus, aucun épisode de mortalité massive de coraux associé aux trois événements de blanchissement massif mondial n'a été signalé pour l'Atlantique Sud, qui a subi considérablement moins de blanchissement. Ces résultats montrent que les récifs de l'Atlantique Sud présentent plusieurs caractéristiques remarquables pour résister au stress thermique. Ensemble avec une expérience historique de moins de stress thermique, nos résultats peuvent expliquer pourquoi les impacts du changement climatique dans cette région ont été moins intenses. Compte tenu de l'ampleur étendue et de la distribution latitudinale des récifs coralliens et des communautés de l'Atlantique Sud, la région peut être reconnue comme un refuge majeur et susceptible de résister plus efficacement aux impacts du changement climatique que les récifs du Pacifique indo-Asiatique et des Caraïbes.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2020.00514",
    doi = "10.3389/fmars.2020.00514",
    openalex = "W3034843423",
    references = "doi101126sciadv1501252"
}

La production et l'accumulation du cadre récifal carbonaté constituent le composant positif du développement récifal. Les principaux organismes participant à ce processus sont les coraux et les algues corallines crustacées (CCA) car leurs squelettes calcaires combinés construisent et aident à consolider les cadres récifaux. Nous avons évalué la contribution (c'est-à-dire la production brute) des coraux et des CCA au budget de carbonate de calcium (CaCO 3) des 2 plus grands et plus développés récifs de l'île de Gorgona (côte pacifique de la Colombie). Dans chaque zone (arrière-récif [BR], platier récifal [RP], front récifal [RF], et pente récifale [RS]) de ces récifs, nous avons mesuré la rugosité du substrat, la couverture de coraux (Pocillopora spp.) et de CCA, la densité des colonies pour les coraux, la densité squelettique pour les CCA, et les taux de croissance pour l'estimation des taux de production de CaCO 3. Les coraux Pocillopora spp. ont contribué à 93,1 % de la production totale de carbonate, tandis que les CCA ont fourni les 6,9 % restants. La production de CaCO 3 était plus élevée au récif de Playa Blanca, bien que la production de CaCO 3 dans le RF de La Azufrada (12,31 kg m -2 yr -1) soit plus élevée par rapport au RF de Playa Blanca (8,45 kg m -2 yr -1). Par ailleurs, la production de CaCO 3 était plus élevée dans toutes les autres zones récifales (BR, RP, RS) de Playa Blanca, bien que seule la BR soit significativement plus élevée (2,25 kg m -2 yr -1 à Playa Blanca contre 0,29 kg m -2 yr -1 à La Azufrada). Le RF a contribué le plus de CaCO 3, principalement en raison de sa haute couverture de coraux vivants et de sa croissance rapide des coraux. Bien que la contribution des CCA soit faible, elles sont essentielles pour la stabilité récifale. Les taux de production de CaCO 3 rapportés ici (2,86 et 3,80 kg m -2 yr -1 à La Azufrada et Playa Blanca, respectivement) sont dans les limites rapportées pour les récifs de l'océan Pacifique tropical oriental, et suscitent l'espoir de la persistance des récifs coralliens à une époque de menaces croissantes pour cet écosystème.

@article{céspedesrodríguez2021gross,
    author = "Céspedes-Rodríguez, EC et Londoño-Cruz, E",
    title = "Production brute de carbonate de calcium dans les récifs coralliens de l'océan Pacifique tropical oriental (île de Gorgona, Colombie)",
    year = "2021",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "La production et l'accumulation du cadre récifal carbonaté constituent le composant positif du développement récifal. Les principaux organismes participant à ce processus sont les coraux et les algues corallines crustacées (CCA) car leurs squelettes calcaires combinés construisent et aident à consolider les cadres récifaux. Nous avons évalué la contribution (c'est-à-dire la production brute) des coraux et des CCA au budget de carbonate de calcium (CaCO 3) des 2 plus grands et plus développés récifs de l'île de Gorgona (côte pacifique de la Colombie). Dans chaque zone (arrière-récif [BR], platier récifal [RP], front récifal [RF], et pente récifale [RS]) de ces récifs, nous avons mesuré la rugosité du substrat, la couverture de coraux (Pocillopora spp.) et de CCA, la densité des colonies pour les coraux, la densité squelettique pour les CCA, et les taux de croissance pour l'estimation des taux de production de CaCO 3. Les coraux Pocillopora spp. ont contribué à 93,1 % de la production totale de carbonate, tandis que les CCA ont fourni les 6,9 % restants. La production de CaCO 3 était plus élevée au récif de Playa Blanca, bien que la production de CaCO 3 dans le RF de La Azufrada (12,31 kg m -2 yr -1) soit plus élevée par rapport au RF de Playa Blanca (8,45 kg m -2 yr -1). Par ailleurs, la production de CaCO 3 était plus élevée dans toutes les autres zones récifales (BR, RP, RS) de Playa Blanca, bien que seule la BR soit significativement plus élevée (2,25 kg m -2 yr -1 à Playa Blanca contre 0,29 kg m -2 yr -1 à La Azufrada). Le RF a contribué le plus de CaCO 3, principalement en raison de sa haute couverture de coraux vivants et de sa croissance rapide des coraux. Bien que la contribution des CCA soit faible, elles sont essentielles pour la stabilité récifale. Les taux de production de CaCO 3 rapportés ici (2,86 et 3,80 kg m -2 yr -1 à La Azufrada et Playa Blanca, respectivement) sont dans les limites rapportées pour les récifs de l'océan Pacifique tropical oriental, et suscitent l'espoir de la persistance des récifs coralliens à une époque de menaces croissantes pour cet écosystème.",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps13643",
    doi = "10.3354/meps13643",
    openalex = "W3121727345",
    pages = "37-46",
    volume = "665",
    references = "doi10100797894017749944, doi101007s003380050220, doi101016s0025326x99002374, doi101038nature02691, doi101038nature18607, doi101038nature21707, doi101093icb391146, doi101093icesjmsfsn048, doi101126science1085706, doi1023071942565"
}

La perte d'oxygène dans l'océan mondial s'accélère en raison du changement climatique et de l'eutrophisation, mais la manière dont les événements de désoxygénation aiguë affectent les écosystèmes marins tropicaux reste mal comprise. Ici, nous intégrons des analyses des communautés benthiques des récifs coralliens avec le séquençage des communautés microbiennes pour montrer comment un événement de désoxygénation a rapidement modifié la composition des communautés benthiques et les assemblages microbiens dans un écosystème de récif tropical peu profond. Les conditions associées à l'événement ont provoqué un blanchiment des coraux et une mortalité massive, entraînant une perte de 50 % de coraux vivants et un changement dans la communauté benthique qui a persisté un an plus tard. À l'inverse, le profil taxonomique et fonctionnel unique des microbes associés à l'hypoxie a rapidement régressé à un assemblage normoxique un mois après l'événement. Le découplage des trajectoires écologiques entre ces principaux groupes fonctionnels suivant un événement aigu souligne la nécessité d'intégrer la désoxygénation en tant que facteur de stress émergent dans la recherche et les plans de gestion des récifs coralliens pour lutter contre les menaces croissantes pour la persistance des récifs.

@article{doi101038s41467021247773,
    author = "Johnson, Maggie D. et Scott, Jarrod J. et Leray, Matthieu et Lucey, Noelle et Bravo, Lucia M. Rodriguez et Wied, William L. et Altieri, Andrew H.",
    title = "Conséquences à l'échelle de l'écosystème d'une désoxygénation aiguë sur un récif corallien des Caraïbes",
    year = "2021",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "La perte d'oxygène dans l'océan mondial s'accélère en raison du changement climatique et de l'eutrophisation, mais la manière dont les événements de désoxygénation aiguë affectent les écosystèmes marins tropicaux reste mal comprise. Ici, nous intégrons des analyses des communautés benthiques des récifs coralliens avec le séquençage des communautés microbiennes pour montrer comment un événement de désoxygénation a rapidement modifié la composition des communautés benthiques et les assemblages microbiens dans un écosystème de récif tropical peu profond. Les conditions associées à l'événement ont provoqué un blanchiment des coraux et une mortalité massive, entraînant une perte de 50 % de coraux vivants et un changement dans la communauté benthique qui a persisté un an plus tard. À l'inverse, le profil taxonomique et fonctionnel unique des microbes associés à l'hypoxie a rapidement régressé à un assemblage normoxique un mois après l'événement. Le découplage des trajectoires écologiques entre ces principaux groupes fonctionnels suivant un événement aigu souligne la nécessité d'intégrer la désoxygénation en tant que facteur de stress émergent dans la recherche et les plans de gestion des récifs coralliens pour lutter contre les menaces croissantes pour la persistance des récifs.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-021-24777-3",
    doi = "10.1038/s41467-021-24777-3",
    openalex = "W3070971032",
    references = "doi101038s4155802007379"
}

émissions.

@article{doi101073pnas2015265118,
    author = "Cornwall, Christopher E. et Comeau, Steeve et Kornder, Niklas A. et Perry, Chris T. et van Hooidonk, Ruben et DeCarlo, Thomas M. et Pratchett, Morgan S. et Anderson, Kristen D. et Browne, Nicola K. et Carpenter, R. C. et Díaz-Pulido, Guillermo et D’Olivo, Juan Pablo et Doo, Steve S. et Figueiredo, Joana et Fortunato, Sofia et Kennedy, Emma et Lantz, Coulson A. et McCulloch, Malcolm T. et González‐Rivero, Manuel et Schoepf, Verena et Smithers, S et Lowe, Ryan",
    title = "Global declines in coral reef calcium carbonate production under ocean acidification and warming",
    year = "2021",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "émissions.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.2015265118",
    doi = "10.1073/pnas.2015265118",
    openalex = "W3161219580",
    references = "doi101038ncomms2409, doi101126scienceaao1118"
}

Résumé La capacité des récifs coralliens à fournir des services écosystémiques est largement reconnue, mais cette capacité dépend de la production continue de carbonate au sein de la communauté corallienne. L'archipel des Îles Marías (21° 29.5′ N–106° 15′ W) est soumis à des pressions anthropiques minimales. Cet archipel sert de modèle pour étudier l'influence des variables environnementales [par exemple, la température de surface de la mer (SST), les périodes de remontée d'eau, les événements d'oscillation australe El Niño (ENSO) et le pH] sur la structure de la communauté corallienne. L'objectif de cette étude était d'évaluer les paramètres de croissance, le volume écologique et la production de CaCO3 des coraux Pocillopora, qui constituent le genre dominant dans le Pacifique tropical oriental (PTE). Au cours d'une période annuelle (2016–2017), 10 colonies ont été colorées avec de l'alizarine rouge et les mesures de hauteur, de diamètre majeur et de diamètre mineur ont été enregistrées. La couverture de corail vivant, le taux d'extension annuel (cm/an), la densité squelettique (g/cm3), le taux de calcification (g/cm2 an−1), le volume écologique (cm−3) et la production de carbonate (kg m−2 an−1) ont également été calculés. Le taux d'extension moyen (± écart-type), la densité squelettique et le taux de calcification étaient respectivement de 1,86 ± 0,31 cm/an, 2,28 ± 0,34 g CaCO3 cm−3 et 4,34 ± 1,28 g CaCO3 cm−2 an−1. La couverture moyenne de corail vivant était de 3,19 ± 3,17 % et la couverture relative des coraux Pocillopora était de 65 %. Le volume écologique a augmenté de 140,6 ± 84,28 % par rapport au volume initial, et la production moyenne de CaCO3 était de 0,46 ± 0,41 kg CaCO3 m−2 an−1. Cette étude montre des preuves de taux de croissance faibles, de faible génération de tridimensionnalité et de faible production de CaCO3 dans la zone d'étude par rapport à d'autres sites du PTE. Ces résultats sont pertinents car ils indiquent un entretien à long terme compromis et un développement de récif aux Îles Marías, ce qui peut entraîner une faible fonctionnalité du récif et compromettre la stabilité de la biodiversité associée aux récifs et des services écosystémiques.

@article{doi101111maec12678,
    author = "González‐Pabón, María A. et Tortolero‐Langarica, J. J. Adolfo et Calderón‐Aguilera, Luis E. et Solana‐Arellano, Elena et Rodríguez‐Troncoso, Alma Paola et Cupul‐Magaña, Amilcar Leví et Cabral‐Tena, Rafael A.",
    title = "Faible taux de calcification, complexité structurelle et production de carbonate de calcium des coraux Pocillopora dans une réserve de biosphère du Pacifique central mexicain",
    year = "2021",
    journal = "Marine Ecology",
    abstract = "Résumé La capacité des récifs coralliens à fournir des services écosystémiques est largement reconnue, mais cette capacité dépend de la production continue de carbonate au sein de la communauté corallienne. L'archipel des Îles Marías (21° 29.5′ N–106° 15′ W) est soumis à des pressions anthropiques minimales. Cet archipel sert de modèle pour étudier l'influence des variables environnementales [par exemple, la température de surface de la mer (SST), les périodes de remontée d'eau, les événements d'oscillation australe El Niño (ENSO) et le pH] sur la structure de la communauté corallienne. L'objectif de cette étude était d'évaluer les paramètres de croissance, le volume écologique et la production de CaCO3 des coraux Pocillopora, qui constituent le genre dominant dans le Pacifique tropical oriental (PTE). Au cours d'une période annuelle (2016–2017), 10 colonies ont été colorées avec de l'alizarine rouge et les mesures de hauteur, de diamètre majeur et de diamètre mineur ont été enregistrées. La couverture de corail vivant, le taux d'extension annuel (cm/an), la densité squelettique (g/cm3), le taux de calcification (g/cm2 an−1), le volume écologique (cm−3) et la production de carbonate (kg m−2 an−1) ont également été calculés. Le taux d'extension moyen (± écart-type), la densité squelettique et le taux de calcification étaient respectivement de 1,86 ± 0,31 cm/an, 2,28 ± 0,34 g CaCO3 cm−3 et 4,34 ± 1,28 g CaCO3 cm−2 an−1. La couverture moyenne de corail vivant était de 3,19 ± 3,17 %, et la couverture relative des coraux Pocillopora était de 65 %. Le volume écologique a augmenté de 140,6 ± 84,28 % par rapport au volume initial, et la production moyenne de CaCO3 était de 0,46 ± 0,41 kg CaCO3 m−2 an−1. Cette étude montre des preuves de taux de croissance faibles, de faible génération de tridimensionnalité et de faible production de CaCO3 dans la zone d'étude par rapport à d'autres sites du PTE. Ces résultats sont pertinents car ils indiquent un entretien à long terme compromis et un développement de récif aux Îles Marías, ce qui peut entraîner une faible fonctionnalité du récif et compromettre la stabilité de la biodiversité associée aux récifs et des services écosystémiques.",
    url = "https://doi.org/10.1111/maec.12678",
    doi = "10.1111/maec.12678",
    openalex = "W3199876163",
    references = "doi101016jcub201807008, doi101016jecoleng201901002, doi101016jecoser201207005, doi101016s0921800999000099, doi101038387253a0, doi101038nmeth2089, doi101038s4158601800412, doi101071mf99078, doi101073pnas1208909109, doi10108001621459199510476572, doi101126science19943351302, doi103390ijerph17186574, tortolerolangarica2019accelerated"
}

Des preuves croissantes suggèrent que les récifs coralliens exposés à une turbidité élevée peuvent être plus résilients aux impacts du changement climatique et servir de point chaud de conservation important. Cependant, les difficultés logistiques liées à l'étude des environnements turbides ont conduit à une représentation insuffisante de ces types de récifs dans la littérature scientifique, les études utilisant différentes méthodes et définitions pour caractériser les récifs turbides. Ici, nous passons en revue les origines géologiques et les histoires de croissance des récifs turbides du Holocène (passé), leurs états écologiques et environnementaux actuels (présent), ainsi que leurs réponses potentielles et leur résilience face aux pressions locales et globales croissantes (futur). Nous classifions les récifs turbides en utilisant de nouveaux descripteurs basés sur leur régime de turbidité (persistante, fluctuante, transitionnelle) et les sources d'apport sédimentaire (naturelles versus anthropiques). De plus, en comparant la composition, la fonction et la résilience de deux des récifs turbides les plus étudiés, le complexe de récifs Paluma Shoals en Australie (turbidité naturelle) et les récifs de Singapour (turbidité anthropique), nous avons constaté qu'il s'agit de deux types distincts de récifs turbides avec un statut de conservation différent. À mesure que la répartition géographique des récifs turbides devrait augmenter en raison des stress locaux et globaux, l'amélioration de notre compréhension de leurs réponses aux changements environnementaux sera centrale pour les efforts de conservation mondiale des récifs coralliens.

@article{doi103390d13060251,
    author = "Zweifler, Adi et O’Leary, Michael et Morgan, Kyle M. et Browne, Nicola K.",
    title = "Turbid Coral Reefs: Past, Present and Future—A Review",
    year = "2021",
    journal = "Diversity",
    abstract = "Des preuves croissantes suggèrent que les récifs coralliens exposés à une turbidité élevée peuvent être plus résilients aux impacts du changement climatique et servir de point chaud de conservation important. Cependant, les difficultés logistiques liées à l'étude des environnements turbides ont conduit à une représentation insuffisante de ces types de récifs dans la littérature scientifique, les études utilisant différentes méthodes et définitions pour caractériser les récifs turbides. Ici, nous passons en revue les origines géologiques et les histoires de croissance des récifs turbides du Holocène (passé), leurs états écologiques et environnementaux actuels (présent), ainsi que leurs réponses potentielles et leur résilience face aux pressions locales et globales croissantes (futur). Nous classifions les récifs turbides en utilisant de nouveaux descripteurs basés sur leur régime de turbidité (persistante, fluctuante, transitionnelle) et les sources d'apport sédimentaire (naturelles versus anthropiques). De plus, en comparant la composition, la fonction et la résilience de deux des récifs turbides les plus étudiés, le complexe de récifs Paluma Shoals en Australie (turbidité naturelle) et les récifs de Singapour (turbidité anthropique), nous avons constaté qu'il s'agit de deux types distincts de récifs turbides avec un statut de conservation différent. À mesure que la répartition géographique des récifs turbides devrait augmenter en raison des stress locaux et globaux, l'amélioration de notre compréhension de leurs réponses aux changements environnementaux sera centrale pour les efforts de conservation mondiale des récifs coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.3390/d13060251",
    doi = "10.3390/d13060251",
    openalex = "W3170581537",
    references = "doi101007s00338019018522, doi101111oik05946"
}

, avec une différence significative (trois fois plus) entre les zones de récif (shallow vs deep), mettant en évidence une production de carbonate plus élevée sur les sites de récifs profonds. La couverture corallienne, la production de carbonate et les caractéristiques sclérochronologiques ont montré un taux de diminution (entre 30 et 60 %) associé à des événements d'anomalie thermique tels que La Niña (2010-2011) et El Niño (2014-2016), avec des signes positifs de récupération (deux fois plus) au cours des années suivantes 2017-2018. Cette étude fournit des preuves que les coraux massifs Pavona et ramifiés Pocillopora sont des espèces clés de construction de récifs à l'archipel des Islas Marias, en raison de leur capacité à maintenir la couverture de coraux vivants et le carbonate pendant les périodes de perturbation thermique. Révélant que les coraux à des profondeurs intermédiaires (>10 m) peuvent contribuer significativement à la stabilité à long terme du cadre de récif biogénique et à la fonctionnalité géo-écologique des récifs du Pacifique tropical oriental.

@article{doi101111gbi12491,
    author = "Tortolero‐Langarica, J. J. Adolfo et Rodríguez‐Troncoso, Alma Paola et Cupul‐Magaña, Amilcar Leví et Morales-de-Anda, Diana et Caselle, Jennifer E. et Carricart‐Ganivet, Juan P.",
    title = "Calcification corallienne et production de carbonate dans l'océan Pacifique tropical oriental : Le rôle des coraux ramifiés et massifs dans le maintien des récifs",
    year = "2022",
    journal = "Geobiology",
    abstract = ", avec une différence significative (trois fois plus) entre les zones de récif (shallow vs deep), mettant en évidence une production de carbonate plus élevée sur les sites de récifs profonds. La couverture corallienne, la production de carbonate et les caractéristiques sclérochronologiques ont montré un taux de diminution (entre 30 et 60 %) associé à des événements d'anomalie thermique tels que La Niña (2010-2011) et El Niño (2014-2016), avec des signes positifs de récupération (deux fois plus) au cours des années suivantes 2017-2018. Cette étude fournit des preuves que les coraux massifs Pavona et ramifiés Pocillopora sont des espèces clés de construction de récifs à l'archipel des Islas Marias, en raison de leur capacité à maintenir la couverture de coraux vivants et le carbonate pendant les périodes de perturbation thermique. Révélant que les coraux à des profondeurs intermédiaires (>10 m) peuvent contribuer significativement à la stabilité à long terme du cadre de récif biogénique et à la fonctionnalité géo-écologique des récifs du Pacifique tropical oriental.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gbi.12491",
    doi = "10.1111/gbi.12491",
    openalex = "W4221084184",
    references = "céspedesrodríguez2021gross, doi101016jcub201807008, doi101016jpocean200603009, doi101016jpocean200603012, doi101038nature22901, doi101038s4158601800412, doi101098rspb20090339, doi101111j1469185x200800058x, doi101126science1152509, doi101126science1232310, doi101126science1251336, doi103390ijerph17186574"
}

Introduction : L'événement El Niño de 1997-98 a provoqué un blanchissement massif de coraux et une mortalité dans le Pacifique central mexicain (PCM). Seule Punta de Mita abritait autrefois plus de 30 % de la couverture corallienne dans cette région, avec une couverture mono-spécifique de Pocillopora. L'événement ENSO de 1997-1998 a causé une mortalité massive de coraux, réduisant la couverture de coraux vivants à < 5 %. Bien que considérée comme une région corallienne peu susceptible de se rétablir, des efforts de restauration récents ont été mis en œuvre pour réhabiliter la communauté corallienne. Objectif : Évaluer la récupération des coraux en analysant les taux de croissance et de survie des espèces de Pocillopora ramifiées à Punta de Mita. Méthodes : Des fragments de coraux sains opportunistes ont été ré-attachés aux substrats naturels à l'aide de liens en plastique et mesurés en fonction de leur croissance en termes de longueur et de largeur maximales (cm) pour déterminer leurs taux d'extension annuelle. Résultats : Après 50 semaines, les coraux ont doublé leur taille, avec une croissance moyenne d'environ 4 cm par an. Après 100 semaines (2 ans), les coraux ont triplé leur taille, augmentant en moyenne de 8 à 9 cm dans chaque diamètre. Conclusions : Les activités de restauration des récifs coralliens réussies dans le Pacifique central mexicain sont le résultat des processus physiologiques de Pocillopora, tels que les taux de croissance rapides, et des traits récents de l'histoire de vie, comme la capacité à faire face aux anomalies thermiques, ce qui leur permet de prospérer dans une région dynamique gravement affectée par les perturbations naturelles et anthropiques. En effet, une région considérée comme peu susceptible de se rétablir a regagné sa couverture de coraux vivants, passant de < 5 % en 1998 à 15 % en 20 ans. Cela démontre l'importance d'assister à la récupération naturelle des coraux par des efforts de restauration, en particulier dans les emplacements coralliens qui, malgré les perturbations environnementales, se sont avérés résilients et peuvent devenir des zones de refuge corallien dans le scénario actuel de changement climatique.

@article{doi1015517revbioltropv71is154795,
    author = "Martínez-Castillo, Violeta et Rodríguez‐Troncoso, Alma Paola et Tortolero‐Langarica, J. J. Adolfo et Cupul‐Magaña, Amilcar Leví",
    title = "Les efforts de restauration active dans le Pacifique central mexicain comme stratégie de récupération des récifs coralliens",
    year = "2023",
    journal = "Revista de Biología Tropical",
    abstract = "Introduction : L'événement El Niño de 1997-98 a provoqué un blanchissement massif de coraux et une mortalité dans le Pacifique central mexicain (PCM). Seule Punta de Mita abritait autrefois plus de 30 % de la couverture corallienne dans cette région, avec une couverture mono-spécifique de Pocillopora. L'événement ENSO de 1997-1998 a causé une mortalité massive de coraux, réduisant la couverture de coraux vivants à < 5 %. Bien que considérée comme une région corallienne peu susceptible de se rétablir, des efforts de restauration récents ont été mis en œuvre pour réhabiliter la communauté corallienne. Objectif : Évaluer la récupération des coraux en analysant les taux de croissance et de survie des espèces de Pocillopora ramifiées à Punta de Mita. Méthodes : Des fragments de coraux sains opportunistes ont été ré-attachés aux substrats naturels à l'aide de liens en plastique et mesurés en fonction de leur croissance en termes de longueur et de largeur maximales (cm) pour déterminer leurs taux d'extension annuelle. Résultats : Après 50 semaines, les coraux ont doublé leur taille, avec une croissance moyenne d'environ 4 cm par an. Après 100 semaines (2 ans), les coraux ont triplé leur taille, augmentant en moyenne de 8 à 9 cm dans chaque diamètre. Conclusions : Les activités de restauration des récifs coralliens réussies dans le Pacifique central mexicain sont le résultat des processus physiologiques de Pocillopora, tels que les taux de croissance rapides, et des traits récents de l'histoire de vie, comme la capacité à faire face aux anomalies thermiques, ce qui leur permet de prospérer dans une région dynamique gravement affectée par les perturbations naturelles et anthropiques. En effet, une région considérée comme peu susceptible de se rétablir a regagné sa couverture de coraux vivants, passant de < 5 % en 1998 à 15 % en 20 ans. Cela démontre l'importance d'assister à la récupération naturelle des coraux par des efforts de restauration, en particulier dans les emplacements coralliens qui, malgré les perturbations environnementales, se sont avérés résilients et peuvent devenir des zones de refuge corallien dans le scénario actuel de changement climatique.",
    url = "https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71is1.54795",
    doi = "10.15517/rev.biol.trop..v71is1.54795",
    openalex = "W4367856319",
    references = "doi101111gbi12491, doi101111maec12678"
}

La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde de colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.

@misc{doi107287peerj14586v01reviews1,
    title = {Avis de révision \#1 de « Variabilité spatio-temporelle de la concentration en oxygène dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona (Pacifique tropical oriental) et son effet sur le corail Pocillopora capitata (v0.1) »},
    year = "2023",
    abstract = "La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde de colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.",
    url = "https://doi.org/10.7287/peerj.14586v0.1/reviews/1",
    doi = "10.7287/peerj.14586v0.1/reviews/1",
    openalex = "W4318591813",
    references = "céspedesrodríguez2021gross, doi101002sim1545, doi101016jmarpolbul200411028, doi101016jpocean200603008, doi101038nature21399, doi101073pnas0803833105, doi101093icb391146, doi101126science1153847, doi101126scienceaan8048, doi101146annurevmarine010908163855, doi103389fmars201700158"
}

La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde des colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.

@misc{doi107287peerj14586v01reviews2,
    title = {Avis de révision \#2 de « Variabilité spatio-temporelle de la concentration en oxygène dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona (Pacifique tropical oriental) et son effet sur le corail Pocillopora capitata (v0.1) »},
    year = "2023",
    abstract = "La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde des colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.",
    url = "https://doi.org/10.7287/peerj.14586v0.1/reviews/2",
    doi = "10.7287/peerj.14586v0.1/reviews/2",
    openalex = "W4318591823",
    references = "céspedesrodríguez2021gross, doi101002sim1545, doi101016jmarpolbul200411028, doi101016jpocean200603008, doi101038nature21399, doi101073pnas0803833105, doi101093icb391146, doi101126science1153847, doi101126scienceaan8048, doi101146annurevmarine010908163855, doi103389fmars201700158"
}

La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde de colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.

@misc{doi107287peerj14586v02reviews1,
    title = {Avis de révision \#1 de « Variabilité spatio-temporelle de la concentration en oxygène dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona (Pacifique tropical oriental) et son effet sur le corail Pocillopora capitata (v0.2) »},
    year = "2023",
    abstract = "La concentration en oxygène dissous (OD) est l'un des principaux facteurs limitant la distribution des espèces benthiques. En raison du réchauffement des océans et de l'eutrophisation, les océans se désoxygènent. Dans le Pacifique tropical oriental (PTE), les eaux profondes à faible OD (20 m de profondeur) coïncident avec la distribution bathymétrique la plus profonde de colonies dispersées de Pocillopora. Étant donné que les concentrations en OD dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona étaient comparativement faibles par rapport à d'autres récifs coralliens du Pacifique tropical oriental, et que le seuil d'hypoxie de P. capitata était proche du minimum d'enregistrement de l'OD sur les récifs, les événements d'hypoxie pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.",
    url = "https://doi.org/10.7287/peerj.14586v0.2/reviews/1",
    doi = "10.7287/peerj.14586v0.2/reviews/1",
    openalex = "W4318591815",
    references = "céspedesrodríguez2021gross, doi101002sim1545, doi101016jmarpolbul200411028, doi101016jpocean200603008, doi101038nature21399, doi101073pnas0803833105, doi101093icb391146, doi101126science1153847, doi101126scienceaan8048, doi101146annurevmarine010908163855, doi103389fmars201700158"
}

était proche du minimum d'enregistrement de DO sur les récifs, les événements hypoxiques pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.

@article{doi107717peerj14586,
    author = "Castrillón-Cifuentes, Ana Lucia et Zapata, Fernando A. et Giraldo, Alan et Wild, Christian",
    title = "Variabilité spatio-temporelle de la concentration en oxygène dans les récifs coralliens de l'île de Gorgona (Pacifique tropical oriental) et son effet sur le corail Pocillopora capitata",
    year = "2023",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "était proche du minimum d'enregistrement de DO sur les récifs, les événements hypoxiques pourraient représenter une menace si les conditions favorisant l'eutrophisation (et par conséquent l'hypoxie) augmentent.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.14586",
    doi = "10.7717/peerj.14586",
    openalex = "W4318066501",
    references = "céspedesrodríguez2021gross, doi101002sim1545, doi101016jmarpolbul200411028, doi101016jpocean200603008, doi101038nature21399, doi101073pnas0803833105, doi101093icb391146, doi101126science1153847, doi101126scienceaan8048, doi101146annurevmarine010908163855, doi103389fmars201700158"
}

Introduction : Les coraux hermatypiques ont la capacité de construire le cadre physique du récif et de maintenir l'équilibre de la fonctionnalité des récifs coralliens. Cependant, au cours des trois dernières décennies, les communautés de coraux ont été menacées par des pressions naturelles et anthropiques, entraînant une baisse brutale de la couverture corallienne et une récupération naturelle lente. Pour atténuer l'effondrement des récifs coralliens, des techniques de restauration assistée ont été mises en œuvre et améliorées dans le monde entier. Cependant, les effets à long terme de telles interventions sur les attributs écologiques ont été rarement rapportés. Objectif : Cette étude a évalué l'effet de l'intervention de restauration assistée des coraux sur la production de carbonate de calcium (kg CaCO3 m-2 yr-1) et le volume écologique (cm3) produits par des coraux ramifiés et massifs du Pacifique mexicain central. Méthodes : Nous avons utilisé des mesures de taille des colonies, de taux d'extension et de densité squelettique de colonies de coraux Pocillopora et Pavona directement transplantées pour calculer la production de carbonate de corail, le volume écologique et modéliser leur potentiel à long terme. Résultats : Le carbonate de corail produit après un an de transplantation a augmenté de 42 % (1,17 kg CaCO3 m-2 yr-1), où les coraux Pocillopora spp. et Pavona clavus contribuent respectivement avec 0,97 et 0,20 kg CaCO3 m-2 yr-1. Le volume écologique a également augmenté de 384 cm3 pour Pocillopora et de 56 cm3 pour Pavona après une période d'un an. De plus, les résultats suggèrent que les actions de restauration à long terme des coraux (10 ans) ont le potentiel d'augmenter significativement la production de carbonate. Conclusions : nos données indiquent que les initiatives de restauration des coraux ont le potentiel d'aider à atténuer la faible production actuelle de carbonate de calcium des récifs du Pacifique mexicain et peuvent contribuer significativement au maintien à long terme du cadre du récif basé sur des outils d'ingénierie écologique ; de telles initiatives représentent des propriétés fonctionnelles essentielles liées à la fourniture de services écosystémiques des récifs.

@article{tortolerolangarica2023the,
    author = "Tortolero-Langarica, J. J. Adolfo et Rodríguez-Troncoso, Alma P. et Alvarez-Filip, Lorenzo et Cupul-Magaña, Amílcar L. et Carricart-Ganivet, Juan P.",
    title = "La contribution de la restauration assistée des coraux à la production de carbonate de calcium dans les récifs de l'océan Pacifique oriental",
    year = "2023",
    journal = "Revista de Biología Tropical",
    abstract = "Introduction : Les coraux hermatypiques ont la capacité de construire le cadre physique du récif et de maintenir l'équilibre de la fonctionnalité des récifs coralliens. Cependant, au cours des trois dernières décennies, les communautés de coraux ont été menacées par des pressions naturelles et anthropiques, entraînant une baisse brutale de la couverture corallienne et une récupération naturelle lente. Pour atténuer l'effondrement des récifs coralliens, des techniques de restauration assistée ont été mises en œuvre et améliorées dans le monde entier. Cependant, les effets à long terme de telles interventions sur les attributs écologiques ont été rarement rapportés. Objectif : Cette étude a évalué l'effet de l'intervention de restauration assistée des coraux sur la production de carbonate de calcium (kg CaCO3 m-2 yr-1) et le volume écologique (cm3) produits par des coraux ramifiés et massifs du Pacifique mexicain central. Méthodes : Nous avons utilisé des mesures de taille des colonies, de taux d'extension et de densité squelettique de colonies de coraux Pocillopora et Pavona directement transplantées pour calculer la production de carbonate de corail, le volume écologique et modéliser leur potentiel à long terme. Résultats : Le carbonate de corail produit après un an de transplantation a augmenté de 42 % (1,17 kg CaCO3 m-2 yr-1), où les coraux Pocillopora spp. et Pavona clavus contribuent respectivement avec 0,97 et 0,20 kg CaCO3 m-2 yr-1. Le volume écologique a également augmenté de 384 cm3 pour Pocillopora et de 56 cm3 pour Pavona après une période d'un an. De plus, les résultats suggèrent que les actions de restauration à long terme des coraux (10 ans) ont le potentiel d'augmenter significativement la production de carbonate. Conclusions : nos données indiquent que les initiatives de restauration des coraux ont le potentiel d'aider à atténuer la faible production actuelle de carbonate de calcium des récifs du Pacifique mexicain et peuvent contribuer significativement au maintien à long terme du cadre du récif basé sur des outils d'ingénierie écologique ; de telles initiatives représentent des propriétés fonctionnelles essentielles liées à la fourniture de services écosystémiques des récifs.",
    url = "https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71is1.54849",
    doi = "10.15517/rev.biol.trop..v71is1.54849",
    number = "S1",
    openalex = "W4367856271",
    pages = "e54849",
    volume = "71",
    references = "doi10100797894007011449, doi101007s0033801209014, doi101016jpocean200603004, doi101016jpocean200603012, doi101038nature22901, doi1011111365243513247, doi101111gbi12491, doi101111maec12678, doi101126scienceaaa4216, doi101371journalpone0003039, doi101371journalpone0009278, doi101371journalpone0226631"
}

Résumé La compréhension et l'intégration des perceptions des parties prenantes sont fondamentales pour gérer efficacement les aires marines protégées (AMP). Le parc national des Îles Marietas (IMNP), un écosystème de récif corallien écologiquement important dans le Pacifique central mexicain (PCM), a connu d'importantes fluctuations dans les pressions touristiques, la santé environnementale et les changements réglementaires au cours de la dernière décennie, ce qui a conduit à des efforts de surveillance et de restauration ; cependant, peu de recherches ont été menées pour comprendre les perceptions des parties prenantes du système socio-écologique. La présente étude intègre les attributs écologiques du parc, principalement les changements dans la couverture de corail vivant (LCC), et les perceptions des parties prenantes de l'écosystème de récif corallien pour déterminer comment les utilisateurs et les opérateurs touristiques perçoivent les changements écologiques dans la région. Elle utilise une approche mixte, incluant des marqueurs écologiques tels que les changements dans la couverture de corail vivant de 2012 à 2022 et des enquêtes récentes recueillies auprès des parties prenantes du tourisme. Les résultats montrent que, bien que la couverture de corail vivant ait augmenté de 12,11 ± 6,21 % en 2012 à 25,29 ± 15,00 %, les touristes et les opérateurs touristiques perçoivent une diminution et une dégradation de l'environnement naturel. De plus, les touristes perçoivent un déclin écologique plus important que les opérateurs touristiques, et cette perception n'est pas corrélée à leur tranche d'âge. Les perceptions de la santé environnementale ne correspondent pas à l'état de santé évalué par la surveillance écologique, et le manque de conscience de la récupération écologique à l'IMNP pourrait entraver la réussite continue et étendue des efforts de gestion. Par conséquent, le développement d'initiatives de communication plus efficaces, la participation citoyenne et l'éducation sont importants pour la conservation et la gestion des communautés de coraux dans le parc.

@article{doi101007s44289024000149,
    author = "Burroughs, Carina et Rodríguez‐Troncoso, Alma Paola",
    title = "Contrastes dans l'évaluation écologique et les perceptions du secteur touristique des récifs coralliens : une étude de cas au parc national des Îles Marietas",
    year = "2024",
    journal = "Discover Oceans",
    abstract = "Résumé La compréhension et l'intégration des perceptions des parties prenantes sont fondamentales pour gérer efficacement les aires marines protégées (AMP). Le parc national des Îles Marietas (IMNP), un écosystème de récif corallien écologiquement important dans le Pacifique central mexicain (PCM), a connu d'importantes fluctuations dans les pressions touristiques, la santé environnementale et les changements réglementaires au cours de la dernière décennie, ce qui a conduit à des efforts de surveillance et de restauration ; cependant, peu de recherches ont été menées pour comprendre les perceptions des parties prenantes du système socio-écologique. La présente étude intègre les attributs écologiques du parc, principalement les changements dans la couverture de corail vivant (LCC), et les perceptions des parties prenantes de l'écosystème de récif corallien pour déterminer comment les utilisateurs et les opérateurs touristiques perçoivent les changements écologiques dans la région. Elle utilise une approche mixte, incluant des marqueurs écologiques tels que les changements dans la couverture de corail vivant de 2012 à 2022 et des enquêtes récentes recueillies auprès des parties prenantes du tourisme. Les résultats montrent que, bien que la couverture de corail vivant ait augmenté de 12,11 ± 6,21 % en 2012 à 25,29 ± 15,00 %, les touristes et les opérateurs touristiques perçoivent une diminution et une dégradation de l'environnement naturel. De plus, les touristes perçoivent un déclin écologique plus important que les opérateurs touristiques, et cette perception n'est pas corrélée à leur tranche d'âge. Les perceptions de la santé environnementale ne correspondent pas à l'état de santé évalué par la surveillance écologique, et le manque de conscience de la récupération écologique à l'IMNP pourrait entraver la réussite continue et étendue des efforts de gestion. Par conséquent, le développement d'initiatives de communication plus efficaces, la participation citoyenne et l'éducation sont importants pour la conservation et la gestion des communautés de coraux dans le parc.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s44289-024-00014-9",
    doi = "10.1007/s44289-024-00014-9",
    openalex = "W4399953693",
    references = "doi1010022017rg000560, doi1010029781394260645, doi101016c20130114110, doi101016jecoleng201901002, doi101016jgloenvcha201307020, doi101016jgloenvcha201404002, doi101038nature18607, doi101073pnas1121215109, doi101126science1152509, doi101126science1204794, doi102167jost7100, tortolerolangarica2019accelerated"
}

, tandis que les parcelles témoins présentaient des états nettement érosifs. Les parcelles de restauration de coraux de corne de cerf ont maintenu une production nette de carbonate positive à un seuil d'environ 2,96 % de couverture corallienne. Cependant, le blanchissement, les tempêtes et les maladies menacent ces récifs, soulignant la nécessité de stratégies de restauration qui renforcent la résilience face aux stress environnementaux. L'établissement d'agrégations d'Acroporidés par transplantation, associé à des stratégies d'adaptation climatique, pourrait favoriser la croissance de l'habitat récifal et améliorer la récupération des services écosystémiques.

@article{doi101038s41598024767998,
    author = "Esplandiu, Emily et Morris, John T. et Enochs, Ian C. et Besemer, Nicole et Lirman, Diego",
    title = "Enhancing reef carbonate budgets through coral restoration",
    year = "2024",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = ", tandis que les parcelles témoins présentaient des états nettement érosifs. Les parcelles de restauration de coraux de corne de cerf ont maintenu une production nette de carbonate positive à un seuil d'environ 2,96 % de couverture corallienne. Cependant, le blanchissement, les tempêtes et les maladies menacent ces récifs, soulignant la nécessité de stratégies de restauration qui renforcent la résilience face aux stress environnementaux. L'établissement d'agrégations d'Acroporidés par transplantation, associé à des stratégies d'adaptation climatique, pourrait favoriser la croissance de l'habitat récifal et améliorer la récupération des services écosystémiques.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-024-76799-8",
    doi = "10.1038/s41598-024-76799-8",
    openalex = "W4404240930",
    references = "doi103389fmars20231298411, tortolerolangarica2023the"
}

Résumé Le programme Indonesia Coral Reef Garden (ICRG) est annoncé comme un programme de restauration des récifs coralliens et comprend 5 zones de site, dont celle de Buleleng, Bali. Un programme de plantation a été réalisé en 2020, mais il est nécessaire de surveiller et d'étudier la qualité de l'eau entourant la zone de restauration. Une enquête de terrain à Buleleng a été menée les 6-7 octobre 2022 pour mesurer les paramètres océaniques, tant les caractéristiques physiques que chimiques, favorables à la vie des coraux. Les résultats de la bathymétrie à Buleleng ont varié considérablement, de l'eau peu profonde à l'eau plus profonde. De nombreux coraux ont été trouvés dans la zone peu profonde avec les coraux naturels, tandis que les coraux de restauration ont été placés à plus de 3 m de profondeur. Dans cette étude, les conditions marines de température, salinité, pH, turbidité et DO sont de 28,52 -29,66 °C, 33,6 - 33,9 ‰, 8,0 - 8,13, 1,04 -1,78 FTU et 4,27 - 4,85 mg/L, respectivement. Sur la base de la conformité de la qualité de l'eau, les conditions de l'eau sont bonnes pour la croissance des coraux. Les métaux lourds détectés dans l'eau d'échantillon présentent des niveaux faibles par rapport au seuil de la biote marine dans la norme nationale.

@article{doi1010881755131514101012009,
    author = "Badriana, Mochamad Riam et Nur, A A et Hidayatullah, A I et Oktaviani, Dian et Widyananto, Prastyo Abi et Park, Hae‐Sim et Hutahean, A A",
    title = "Évaluation de la qualité de l'eau dans le jardin de récifs coralliens d'Indonésie, site de Buleleng, Bali",
    year = "2024",
    journal = "IOP Conference Series Earth and Environmental Science",
    abstract = "Résumé Le programme Indonesia Coral Reef Garden (ICRG) est annoncé comme un programme de restauration des récifs coralliens et comprend 5 zones de site, dont celle de Buleleng, Bali. Un programme de plantation a été réalisé en 2020, mais il est nécessaire de surveiller et d'étudier la qualité de l'eau entourant la zone de restauration. Une enquête de terrain à Buleleng a été menée les 6-7 octobre 2022 pour mesurer les paramètres océaniques, tant les caractéristiques physiques que chimiques, favorables à la vie des coraux. Les résultats de la bathymétrie à Buleleng ont varié considérablement, de l'eau peu profonde à l'eau plus profonde. De nombreux coraux ont été trouvés dans la zone peu profonde avec les coraux naturels, tandis que les coraux de restauration ont été placés à plus de 3 m de profondeur. Dans cette étude, les conditions marines de température, salinité, pH, turbidité et DO sont de 28,52 -29,66 °C, 33,6 - 33,9 ‰, 8,0 - 8,13, 1,04 -1,78 FTU et 4,27 - 4,85 mg/L, respectivement. Sur la base de la conformité de la qualité de l'eau, les conditions de l'eau sont bonnes pour la croissance des coraux. Les métaux lourds détectés dans l'eau d'échantillon présentent des niveaux faibles par rapport au seuil de la biote marine dans la norme nationale.",
    url = "https://doi.org/10.1088/1755-1315/1410/1/012009",
    doi = "10.1088/1755-1315/1410/1/012009",
    openalex = "W4404618440",
    references = "doi107717peerj14586"
}

Les bioherms de Nubecularia représentent des bioconstructions uniques qui sont restreintes au Serravallien supérieur de la Paratéthys et ont été signalées depuis le 19e siècle. Ils se produisent dans la Paratéthys centrale au Sarmatien tardif et dans la Paratéthys orientale au Bessarabien, les deux étapes régionales des zones respectives de la Paratéthys. Dans cette étude, plusieurs sites dans les bassins de Vienne et de Styrie de la Paratéthys centrale ont été étudiés, dont quatre localités ont été documentées en détail (Wolfsthal, Maustrenk, St. Margarethen-Zollhaus, Vienna-Ruzickagasse) pour reconstruire leur cadre sédimentaire, leur composition interne et leurs indications de paramètres environnementaux. Les études détaillées ont inclus la levée de sections d'affleurement, des analyses pétrographiques, de faciès et biotiques de dalles polies et de fines coupes, ainsi que des analyses de cathodoluminescence. Ces dernières ont conclu que ces bioconstructions ne sont pas seulement composées du foraminifère Nubecularia, mais représentent un mélange complexe et des relations interdépendantes de Nubecularia, de serpulides et de carbonate microbien. Quatre types de boundstone peuvent être différenciés : boundstone de Nubecularia, boundstone de Nubecularia-algue coralline, boundstone stromatolitique/thrombolitique et boundstone serpulide-nubeculariid-microbien. Les trois premiers types sont caractéristiques de localités spécifiques ; le quatrième type se produit dans toutes les localités étudiées et représente l'association terminale au-dessus des trois autres types. Les trois boundstones basaux sont principalement de forme de croissance colonnaire, indépendamment de la dominance de Nubecularia, d'algues corallines ou de carbonate microbien, et le boundstone terminal est largement irrégulièrement organisé. L'environnement de dépôt général est caractérisé par des grainstones oolitiques stratifiés avec des grains abondants de quartz, des foraminifères miliolides et des mollusques. Intercalés sont des carbonates microbiens, principalement des stromatolites, mais aussi des thrombolites. Cela indique un environnement général d'énergie élevée de l'eau interrompu par des périodes plus calmes lorsque le carbonate microbien a été construit. Les trois types basaux de bioconstructions sont interprétés comme reflétant une diminution de l'approvisionnement en nourriture et/ou de l'oxygénation de Nubecularia vers le boundstone de Nubecularia-algue coralline jusqu'au boundstone stromatolitique/thrombolitique. Le boundstone serpulide-nubeculariid-microbien reflète une succession interne avec une diminution des mêmes paramètres. La profondeur de l'eau est considérée comme très peu profonde, allant de 0 à quelques mètres, et la salinité était marine normale à hypersaline. Le paléo-environnement reconstruit avec des bancs d'oolite dominants et des prairies de posidonie n'était pas restreint à la Paratéthys centrale, mais s'étendait sur l'ensemble de la Paratéthys et représentait la plus grande zone de faciès oolitique de tout le Cénozoïque !

@article{doi101111gbi12590,
    author = "Piller, Werner E and Harzhauser, Mathias",
    title = "Nubecularia-coralline algal-serpulid-microbial bioherms of the Paratethys Sea-Distribution and paleoecological significance (upper Serravallian, upper Sarmatian, Middle Miocene).",
    year = "2024",
    journal = "Geobiology",
    abstract = "Les bioherms de Nubecularia représentent des bioconstructions uniques qui sont restreintes au Serravallien supérieur de la Paratéthys et ont été signalées depuis le 19e siècle. Ils se produisent dans la Paratéthys centrale au Sarmatien tardif et dans la Paratéthys orientale au Bessarabien, les deux étapes régionales des zones respectives de la Paratéthys. Dans cette étude, plusieurs sites dans les bassins de Vienne et de Styrie de la Paratéthys centrale ont été étudiés, dont quatre localités ont été documentées en détail (Wolfsthal, Maustrenk, St. Margarethen-Zollhaus, Vienna-Ruzickagasse) pour reconstruire leur cadre sédimentaire, leur composition interne et leurs indications de paramètres environnementaux. Les études détaillées ont inclus la levée de sections d'affleurement, des analyses pétrographiques, de faciès et biotiques de dalles polies et de fines coupes, ainsi que des analyses de cathodoluminescence. Ces dernières ont conclu que ces bioconstructions ne sont pas seulement composées du foraminifère Nubecularia, mais représentent un mélange complexe et des relations interdépendantes de Nubecularia, de serpulides et de carbonate microbien. Quatre types de boundstone peuvent être différenciés : boundstone de Nubecularia, boundstone de Nubecularia-algue coralline, boundstone stromatolitique/thrombolitique et boundstone serpulide-nubeculariid-microbien. Les trois premiers types sont caractéristiques de localités spécifiques ; le quatrième type se produit dans toutes les localités étudiées et représente l'association terminale au-dessus des trois autres types. Les trois boundstones basaux sont principalement de forme de croissance colonnaire, indépendamment de la dominance de Nubecularia, d'algues corallines ou de carbonate microbien, et le boundstone terminal est largement irrégulièrement organisé. L'environnement de dépôt général est caractérisé par des grainstones oolitiques stratifiés avec des grains abondants de quartz, des foraminifères miliolides et des mollusques. Intercalés sont des carbonates microbiens, principalement des stromatolites, mais aussi des thrombolites. Cela indique un environnement général d'énergie élevée de l'eau interrompu par des périodes plus calmes lorsque le carbonate microbien a été construit. Les trois types basaux de bioconstructions sont interprétés comme reflétant une diminution de l'approvisionnement en nourriture et/ou de l'oxygénation de Nubecularia vers le boundstone de Nubecularia-algue coralline jusqu'au boundstone stromatolitique/thrombolitique. Le boundstone serpulide-nubeculariid-microbien reflète une succession interne avec une diminution des mêmes paramètres. La profondeur de l'eau est considérée comme très peu profonde, allant de 0 à quelques mètres, et la salinité était marine normale à hypersaline. Le paléo-environnement reconstruit avec des bancs d'oolite dominants et des prairies de posidonie n'était pas restreint à la Paratéthys centrale, mais s'étendait sur l'ensemble de la Paratéthys et représentait la plus grande zone de faciès oolitique de tout le Cénozoïque !",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38468508/",
    doi = "10.1111/gbi.12590",
    pmid = "38468508"
}

Les motifs de bandes de densité des squelettes des coraux constructeurs de récifs massifs peuvent être utilisés comme enregistrements historiques de leur croissance, de leur histoire de vie et des conditions environnementales. En analysant ces motifs, il est possible d'estimer des paramètres de croissance tels que la densité squelettique, le taux d'extension et le taux de calcification. Les réponses des coraux durs au stress environnemental dépendent de la quantité d'énergie disponible pour les processus métaboliques à haute énergie, y compris la calcification squelettique et la reproduction sexuelle. Le sexe d'une colonie peut également influencer son taux de calcification et sa résistance aux facteurs de stress environnementaux tels que les anomalies thermiques. Ici, nous passons en revue et résumons la littérature qui se concentre sur les différences liées au sexe dans les taux de calcification des coraux entre les colonies mâles et femelles, puis nous examinons leurs réponses différentielles aux changements de température de surface de la mer (SST) chez Porites panamensis, P. lobata, Pavona gigantea, Siderastrea siderea, Montastraea cavernosa, Dichocoenia stokesi et Dengrogyra cylindrus des régions du Pacifique oriental et des Caraïbes par une réanalyse de données publiées. Les différences dans les taux de calcification entre les sexes sont dues à l'énergie disponible pour la calcification et à la stratégie employée pour la croissance squelettique. Les coraux femelles ont présenté des taux de calcification inférieurs à ceux des colonies mâles chez toutes les espèces de coraux. Les résultats révèlent que, dans l'ensemble, le taux de calcification était négativement lié à la SST lorsque les données des deux sexes ont été combinées. Cependant, lorsque les données ont été analysées séparément par sexe, seul le taux de calcification des femelles était significativement dépendant de la SST. Ces résultats soulignent les implications pour les reconstructions paléo-environnementales utilisant les squelettes de coraux et les disparités potentielles dans les populations de coraux gonochoriques.

@article{doi103354meps14661,
    author = "Cabral-Tena, RA et Tortolero-Langarica, JJA et Carricart-Ganivet, JP et Rodríguez‐Troncoso, Alma Paola et Cruz-Ortega, Israel et Cupul‐Magaña, Amilcar Leví et Balart, Eduardo F. et Reyes‐Bonilla, Héctor et López‐Pérez, Andrés",
    title = "Différences liées au sexe dans la sclérochronologie et la sensibilité au stress thermique chez les coraux constructeurs de récifs des Caraïbes et du Pacifique oriental",
    year = "2024",
    journal = "Marine Ecology Progress Series",
    abstract = "Les motifs de bandes de densité des squelettes des coraux constructeurs de récifs massifs peuvent être utilisés comme enregistrements historiques de leur croissance, de leur histoire de vie et des conditions environnementales. En analysant ces motifs, il est possible d'estimer des paramètres de croissance tels que la densité squelettique, le taux d'extension et le taux de calcification. Les réponses des coraux durs au stress environnemental dépendent de la quantité d'énergie disponible pour les processus métaboliques à haute énergie, y compris la calcification squelettique et la reproduction sexuelle. Le sexe d'une colonie peut également influencer son taux de calcification et sa résistance aux facteurs de stress environnementaux tels que les anomalies thermiques. Ici, nous passons en revue et résumons la littérature qui se concentre sur les différences liées au sexe dans les taux de calcification des coraux entre les colonies mâles et femelles, puis nous examinons leurs réponses différentielles aux changements de température de surface de la mer (SST) chez Porites panamensis, P. lobata, Pavona gigantea, Siderastrea siderea, Montastraea cavernosa, Dichocoenia stokesi et Dengrogyra cylindrus des régions du Pacifique oriental et des Caraïbes par une réanalyse de données publiées. Les différences dans les taux de calcification entre les sexes sont dues à l'énergie disponible pour la calcification et à la stratégie employée pour la croissance squelettique. Les coraux femelles ont présenté des taux de calcification inférieurs à ceux des colonies mâles chez toutes les espèces de coraux. Les résultats révèlent que, dans l'ensemble, le taux de calcification était négativement lié à la SST lorsque les données des deux sexes ont été combinées. Cependant, lorsque les données ont été analysées séparément par sexe, seul le taux de calcification des femelles était significativement dépendant de la SST. Ces résultats soulignent les implications pour les reconstructions paléo-environnementales utilisant les squelettes de coraux et les disparités potentielles dans les populations de coraux gonochoriques.",
    url = "https://doi.org/10.3354/meps14661",
    doi = "10.3354/meps14661",
    openalex = "W4400985534",
    references = "doi101111gbi12491"
}

La production de carbonate corallien est fondamentale pour l'accrétion des récifs et, par conséquent, pour la préservation des services écosystémiques essentiels des récifs, tels que l'atténuation des vagues et la biodiversité des récifs maintenue. Cependant, la perte sans précédent de récifs coralliens due aux impacts anthropiques a mis ces précieux services écosystémiques en danger. Pour contrer cette perte, la réhabilitation active de sites de récifs dégradés s'est accélérée à l'échelle mondiale. Diverses pratiques de restauration existent, adaptées aux besoins locaux des sites et aux types de récifs. Pour les sites où il existe un substrat non consolidé significatif, le Mars Assisted Reef Restoration System (MARRS, ou « Reef Stars ») a été utilisé pour contribuer à la stabilisation des débris et à l'accrétion du récif. Cependant, l'effet des Reef Stars sur les budgets locaux de carbonate et la complexité structurelle n'a pas été évalué. À cette fin, nous évaluons la couverture corallienne et la complexité du récif par une approche basée sur un recensement pour identifier la contribution des producteurs et érodants de carbonate, tout en étudiant les propriétés squelettiques des coraux pour estimer les budgets actuels de carbonate sur un site réhabilité par rapport aux récifs naturels non réhabilités et aux zones de débris sur le récif de la Grande Barrière de Corail moyen. Nos recherches ont identifié des processus écologiques et des fonctions écologiques positifs, tels qu'un budget de carbonate accru, une couverture corallienne et une complexité structurelle accrues sur le site restauré par rapport aux récifs et zones de débris non intervenus. En général, aucun impact sur la rigidité squelettique par rapport à cette restauration active du récif n'a été trouvé pour deux espèces de coraux clés et les débris d'Acropora pour la plupart des traits squelettiques. Cependant, la dureté de Pocillopora damicornis semblait diminuer sur le site restauré par rapport aux autres sites, démontrant des performances différentes des espèces de coraux pendant les activités de restauration qui devraient être prises en compte pour maximiser le retour sur investissement des activités de restauration. Dans l'ensemble, nos données démontrent que la prise en compte des budgets de carbonate est importante pour mesurer le succès des initiatives de restauration corallienne et que la restauration corallienne peut être un outil pertinent pour récupérer les budgets de carbonate locaux perdus.

@article{doi103389fmars20231298411,
    author = "Lendo, C. Isabel Nuñez et Suggett, David J. et Boote, Chloë et McArdle, Alicia et Nicholson, Freda et Fisher, Eric E. et Smith, David J. et Camp, Emma F.",
    title = "Carbonate budgets induced by coral restoration of a Great Barrier Reef site following cyclone damage",
    year = "2024",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "La production de carbonate corallien est fondamentale pour l'accrétion des récifs et, par conséquent, pour la préservation des services écosystémiques essentiels des récifs, tels que l'atténuation des vagues et la biodiversité des récifs maintenue. Cependant, la perte sans précédent de récifs coralliens due aux impacts anthropiques a mis ces précieux services écosystémiques en danger. Pour contrer cette perte, la réhabilitation active de sites de récifs dégradés s'est accélérée à l'échelle mondiale. Diverses pratiques de restauration existent, adaptées aux besoins locaux des sites et aux types de récifs. Pour les sites où il existe un substrat non consolidé significatif, le Mars Assisted Reef Restoration System (MARRS, ou « Reef Stars ») a été utilisé pour contribuer à la stabilisation des débris et à l'accrétion du récif. Cependant, l'effet des Reef Stars sur les budgets locaux de carbonate et la complexité structurelle n'a pas été évalué. À cette fin, nous évaluons la couverture corallienne et la complexité du récif par une approche basée sur un recensement pour identifier la contribution des producteurs et érodants de carbonate, tout en étudiant les propriétés squelettiques des coraux pour estimer les budgets actuels de carbonate sur un site réhabilité par rapport aux récifs naturels non réhabilités et aux zones de débris sur le récif de la Grande Barrière de Corail moyen. Nos recherches ont identifié des processus écologiques et des fonctions écologiques positifs, tels qu'un budget de carbonate accru, une couverture corallienne et une complexité structurelle accrues sur le site restauré par rapport aux récifs et zones de débris non intervenus. En général, aucun impact sur la rigidité squelettique par rapport à cette restauration active du récif n'a été trouvé pour deux espèces de coraux clés et les débris d'Acropora pour la plupart des traits squelettiques. Cependant, la dureté de Pocillopora damicornis semblait diminuer sur le site restauré par rapport aux autres sites, démontrant des performances différentes des espèces de coraux pendant les activités de restauration qui devraient être prises en compte pour maximiser le retour sur investissement des activités de restauration. Dans l'ensemble, nos données démontrent que la prise en compte des budgets de carbonate est importante pour mesurer le succès des initiatives de restauration corallienne et que la restauration corallienne peut être un outil pertinent pour récupérer les budgets de carbonate locaux perdus.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2023.1298411",
    doi = "10.3389/fmars.2023.1298411",
    openalex = "W4391261256",
    references = "doi101007s003380000086, doi1010160026080085900515, doi101016jecoleng201901002, doi101038nature21707, doi101038s4158601800412, doi101046j14610248200100203x, doi101073pnas1208909109, doi101093biomet5234591, doi101098rspb20090339, doi101126science1086050, doi101126science1149345, tortolerolangarica2019accelerated"
}

Contexte : Le faible taux d'oxygène dans les environnements marins, intensifié par le changement climatique et la pollution locale, constitue une menace importante pour les écosystèmes marins mondiaux, en particulier en affectant les récifs coralliens vulnérables et en provoquant des crises métaboliques et une mortalité induite par le blanchissement. Cependant, notre compréhension des impacts potentiels dans les régions tropicales est incomplète. De plus, des incertitudes entourent les réponses physiologiques des coraux aux conditions d'hypoxie et d'anoxie. Méthodes :). Nous avons mesuré et comparé l'efficacité photosynthétique, la densité de Symbiodiniaceae, la concentration en chlorophylle, les taux respiratoires, la production primaire et la calcification à travers les différents traitements. Résultats :, exposés à l'anoxie, ont connu une mortalité avec perte de tissu en moins de 24 heures. Cette étude met en évidence des variations spécifiques à l'espèce en matière de susceptibilité associées à différentes morphologies dans des conditions de faible teneur en oxygène. Les résultats démontrent l'impact substantiel de la désoxygénation sur la croissance et la santé des coraux, les défis cumulés du changement climatique et de la pollution côtière aggravant la disponibilité en oxygène, ce qui entraîne des implications de plus en plus significatives pour les écosystèmes coralliens.

@article{doi107717peerj18095,
    author = "Long, Ying et Sinutok, Sutinee et Buapet, Pimchanok et Yucharoen, Mathinee",
    title = "Unraveling the physiological responses of morphologically distinct corals to low oxygen",
    year = "2024",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "Contexte : Le faible taux d'oxygène dans les environnements marins, intensifié par le changement climatique et la pollution locale, constitue une menace importante pour les écosystèmes marins mondiaux, en particulier en affectant les récifs coralliens vulnérables et en provoquant des crises métaboliques et une mortalité induite par le blanchissement. Cependant, notre compréhension des impacts potentiels dans les régions tropicales est incomplète. De plus, des incertitudes entourent les réponses physiologiques des coraux aux conditions d'hypoxie et d'anoxie. Méthodes :). Nous avons mesuré et comparé l'efficacité photosynthétique, la densité de Symbiodiniaceae, la concentration en chlorophylle, les taux respiratoires, la production primaire et la calcification à travers les différents traitements. Résultats :, exposés à l'anoxie, ont connu une mortalité avec perte de tissu en moins de 24 heures. Cette étude met en évidence des variations spécifiques à l'espèce en matière de susceptibilité associées à différentes morphologies dans des conditions de faible teneur en oxygène. Les résultats démontrent l'impact substantiel de la désoxygénation sur la croissance et la santé des coraux, les défis cumulés du changement climatique et de la pollution côtière aggravant la disponibilité en oxygène, ce qui entraîne des implications de plus en plus significatives pour les écosystèmes coralliens.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.18095",
    doi = "10.7717/peerj.18095",
    openalex = "W4402751852",
    references = "doi103389fmars20231212717"
}

Les organismes calcifiants soutiennent des fonctions géo-écologiques clés dans les récifs tropicaux et tempérés peu profonds du monde entier, notamment la création de structures d'habitat, la production de sédiments et le soutien à l'accrétion des récifs. Ces fonctions dépendent du budget en carbonates : l'équilibre entre la production de carbonate de calcium et l'érosion. Si les budgets en carbonates sont bien caractérisés dans les récifs coralliens tropicaux, les budgets en carbonates des récifs rocheux tempérés et leur variabilité à différentes échelles spatio-temporelles restent beaucoup moins bien compris. Ici, nous quantifions le budget en carbonates d'un écosystème de récif rocheux dominé par des algues marines au sein du plus grand système de dépôt de carbonates en eau froide du monde. Nous avons d'abord mesuré les taux de calcification saisonniers et annuels des groupes calcifiants clés (invertébrés mobiles, coraux et algues corallines) à différentes profondeurs de 5, 10 et 18 m sur deux sites. En utilisant une approche basée sur le recensement, nous avons ensuite estimé comment la production brute de carbonates à l'échelle du récif et l'érosion variaient en fonction de la profondeur. Les algues corallines crustacées ont présenté des taux de calcification similaires à ceux enregistrés dans les études tropicales, mais leur calcification était 2 à 7 fois inférieure à celle des coraux. À l'échelle du récif, la production brute de carbonates variait de 9 à 2369 g CaCO3 m-2 yr-1 et était dominée par les algues corallines crustacées et articulées à faible profondeur (68-96 % de la production totale, profondeur de 5-10 m), les coraux devenant les principaux contributeurs (58-62 %) à plus grande profondeur. Les invertébrés mobiles (gastéropodes et oursins de mer) ont été des contributeurs mineurs à la production de carbonates dans l'ensemble (1-3 %). Les oursins de mer ont entièrement conduit la bioérosion, qui était relativement faible (8-114 g CaCO3 m-2 yr-1) et augmentait avec la profondeur. Bien que la production nette moyenne de carbonates dans les récifs tempérés étudiés (216-671 g CaCO3 m-2 yr-1) soit relativement faible par rapport à celle des récifs coralliens sains de la région (1400-3880 g CaCO3 m-2 yr-1), les vastes étendues de récifs rocheux dominés par des algues marines dans la zone d'étude et dans le monde suggèrent que ces écosystèmes peuvent jouer un rôle sous-estimé dans la production de carbonates en eau froide et mondiale. En effet, des estimations préliminaires suggèrent que la production de carbonates à travers le Grand Récif du Sud tempéré d'Australie pourrait être comparable à des systèmes tropicaux réputés pour leur haute production de carbonates tels que le Grand Barrière de Corail.

@article{doi101016jmarenvres2025107416,
    author = "Pessarrodona, Albert and Attlan, Océane and Wernberg, Thomas",
    title = "Significant carbonate production on a temperate reef system in southwestern Australia.",
    year = "2025",
    journal = "Marine environmental research",
    abstract = "Calcifying organisms support key geo-ecological functions in shallow tropical and temperate reefs worldwide, including creating habitat structure, producing sediments, and supporting reef accretion. These functions depend on the carbonate budget: the balance between calcium carbonate production and erosion. While carbonate budgets are well characterized in tropical coral reefs, the carbonate budgets of temperate rocky reefs, and their variability across spatiotemporal scales, remain much less well understood. Here, we quantify the carbonate budget of a seaweed-dominated rocky reef ecosystem within the world's largest cool-water carbonate depositional system. We first measured the seasonal and annual calcification rates of key calcifying groups (mobile invertebrates, corals, and coralline algae) across depths of 5, 10 and 18 m at two sites. Using a census-based approach, we then estimated how reef-scale gross carbonate production and erosion varied over depth. Crustose coralline algae exhibited calcification rates similar to those recorded in tropical studies, but their calcification was 2-7 times lower than that of corals. At the reef scale, gross carbonate production ranged from 9 to 2369 g CaCO3 m-2 yr-1, and was dominated by crustose and articulated coralline algae at shallow depths (68-96 \% of the total production, 5-10 m depth), with corals becoming the principal contributors (58-62 \%) at greater depths. Mobile invertebrates (gastropods and sea urchins) were minor contributors to carbonate production overall (1-3 \%). Sea urchins entirely drove bioerosion however, which was relatively low (8-114 g CaCO3 m-2 yr-1) and increased with depth. Although the average net carbonate production in the studied temperate reefs (216-671 g CaCO3 m-2 yr-1) is relatively low compared to that of healthy coral reefs in the region (1400-3880 g CaCO3 m-2 yr-1), the vast expanses of seaweed-dominated rocky reefs in the study area and globally suggest that these ecosystems may play an underappreciated role in cool-water and global carbonate production. Indeed, preliminary estimates suggest that carbonate production across Australia's temperate Great Southern Reef could be comparable to tropical systems renowned for their high carbonate production such as the Great Barrier Reef.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40769114/",
    doi = "10.1016/j.marenvres.2025.107416",
    openalex = "W4412987784",
    pmid = "40769114",
    references = "doi101016jmarenvres2025107218, doi1010292010gl046474, doi10102993gb02524, doi101071mf15232, doi101098rstb20130269, doi101126scienceaad8745, doi101146annureves17110186001421, doi1023071933661, doi1032614rj2017066, doi103354meps10573, openalexw171744082"
}

et a entraîné des augmentations significatives de la complexité structurelle. Il n'y a eu aucun impact mesurable de la restauration de coraux massifs à croissance lente sur le potentiel d'accrétion des récifs en bordure côtière ; cependant, alors que l'événement de blanchissement des coraux sévère de 2023, survenant immédiatement après notre étude, a causé une mortalité quasi totale de A. cervicornis, 59 % des coraux massifs ont survécu, soulignant les compromis potentiels entre la croissance des coraux et leur survie pour l'efficacité future de la restauration. Nous concluons que, bien que la restauration puisse produire des augmentations rapides et à petite échelle du potentiel d'accrétion des récifs, des incertitudes importantes subsistent quant à la manière et à la mesure dont les bénéfices à l'échelle de l'écosystème de la restauration sur les fonctions géo-écologiques importantes des récifs peuvent persister à long terme.

@article{doi101038s41598025048183,
    author = "Toth, Lauren T. et Johnson, Selena A. Kupfner et Lyons, E. et Spadaro, Jason et Stathakopoulos, Anastasios et Bloomer, Sierra et Mallon, Jennifer et Jenkins, Connor M. et Williams, Sara D. et Combs, Ian R. et Craig, Zachary et Muller, Erinn M.",
    title = "Coral restoration can drive rapid increases in reef accretion potential",
    year = "2025",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "et a entraîné des augmentations significatives de la complexité structurelle. Il n'y a eu aucun impact mesurable de la restauration de coraux massifs à croissance lente sur le potentiel d'accrétion des récifs en bordure côtière ; cependant, alors que l'événement de blanchissement des coraux sévère de 2023, survenant immédiatement après notre étude, a causé une mortalité quasi totale de A. cervicornis, 59 % des coraux massifs ont survécu, soulignant les compromis potentiels entre la croissance des coraux et leur survie pour l'efficacité future de la restauration. Nous concluons que, bien que la restauration puisse produire des augmentations rapides et à petite échelle du potentiel d'accrétion des récifs, des incertitudes importantes subsistent quant à la manière et à la mesure dont les bénéfices à l'échelle de l'écosystème de la restauration sur les fonctions géo-écologiques importantes des récifs peuvent persister à long terme.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-025-04818-3",
    doi = "10.1038/s41598-025-04818-3",
    openalex = "W4412937695",
    references = "doi101007s003380120984y, doi101016jecoleng201901002, doi101016joneear202108016, doi101038ncomms2409, doi101038srep39666, doi101098rspb20090339, doi1011111365243513331, doi101371journalpone0226631, doi1021932005723, doi103389fmars20231298411, doi105479si007756301531, tortolerolangarica2019accelerated"
}

Les changements climatiques entraînent des modifications de l'abondance et de la répartition des espèces formant l'habitat, transformant ainsi la manière dont les écosystèmes produisent et recyclent le carbone, les nutriments et l'énergie. Les forêts de kelp tempérées sont de plus en plus remplacées par des espèces formant l'habitat d'affinité tropicale ou chaude, comme les algues de type tapis et les coraux, c'est-à-dire « tropicalisées ». Ces changements peuvent avoir des effets en cascade sur les espèces associées, telles que les organismes calcifiants, qui contribuent à la génération de sédiments et au cycle du carbone via la production de carbonate de calcium. Cette étude a quantifié la production et l'érosion du carbonate à travers une forêt de kelp tempérée et trois états de récif tropicalisés suite à la vague de chaleur marine de 2011 : mélange kelp-tapis, algues d'affinité plus chaude et dominance coraux-tapis. Les résultats montrent que la production brute de carbonate était la plus élevée dans les récifs coraux-tapis (1,85 ± 0,65 kg m-2 yr-1), la plus faible dans les récifs d'algues d'affinité plus chaude (0,04 ± 0,02 kg m-2 yr-1) et intermédiaire dans les forêts de kelp tempérées (0,60 ± 0,19 kg m-2 yr-1). Ces différences étaient liées à l'abondance des coraux dans l'état coraux-tapis et à la rareté des algues calcifiantes dans l'état d'algues d'affinité plus chaude. La bioérosion a joué un rôle modéré dans le bilan global, mais les bioérodeurs dominants différaient selon les habitats : les oursins dans les récifs tempérés ont contribué 80 % de moins que les poissons perroquets dans les récifs tropicalisés. Dans l'ensemble, la tropicalisation peut soit augmenter soit diminuer la disponibilité du carbonate, selon les espèces dominantes formant l'habitat. Ces changements peuvent avoir un impact significatif sur le cycle du carbone inorganique et l'intégrité structurelle et fonctionnelle des écosystèmes de récifs côtiers.

@article{doi101098rspb20252578,
    author = "Attlan, Océane et Wernberg, Thomas et Wood, Georgina et Pessarrodona, Albert",
    title = "Budgets carbonatés divergents suite à la tropicalisation des récifs tempérés.",
    year = "2025",
    journal = "Proceedings. Biological sciences",
    abstract = "Les changements climatiques entraînent des modifications de l'abondance et de la répartition des espèces formant l'habitat, transformant ainsi la manière dont les écosystèmes produisent et recyclent le carbone, les nutriments et l'énergie. Les forêts de kelp tempérées sont de plus en plus remplacées par des espèces formant l'habitat d'affinité tropicale ou chaude, comme les algues de type tapis et les coraux, c'est-à-dire « tropicalisées ». Ces changements peuvent avoir des effets en cascade sur les espèces associées, telles que les organismes calcifiants, qui contribuent à la génération de sédiments et au cycle du carbone via la production de carbonate de calcium. Cette étude a quantifié la production et l'érosion du carbonate à travers une forêt de kelp tempérée et trois états de récif tropicalisés suite à la vague de chaleur marine de 2011 : mélange kelp-tapis, algues d'affinité plus chaude et dominance coraux-tapis. Les résultats montrent que la production brute de carbonate était la plus élevée dans les récifs coraux-tapis (1,85 ± 0,65 kg m-2 yr-1), la plus faible dans les récifs d'algues d'affinité plus chaude (0,04 ± 0,02 kg m-2 yr-1) et intermédiaire dans les forêts de kelp tempérées (0,60 ± 0,19 kg m-2 yr-1). Ces différences étaient liées à l'abondance des coraux dans l'état coraux-tapis et à la rareté des algues calcifiantes dans l'état d'algues d'affinité plus chaude. La bioérosion a joué un rôle modéré dans le bilan global, mais les bioérodeurs dominants différaient selon les habitats : les oursins dans les récifs tempérés ont contribué 80 % de moins que les poissons perroquets dans les récifs tropicalisés. Dans l'ensemble, la tropicalisation peut soit augmenter soit diminuer la disponibilité du carbonate, selon les espèces dominantes formant l'habitat. Ces changements peuvent avoir un impact significatif sur le cycle du carbone inorganique et l'intégrité structurelle et fonctionnelle des écosystèmes de récifs côtiers.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41538033/",
    doi = "10.1098/rspb.2025.2578",
    openalex = "W7117327002",
    pmid = "41538033",
    references = "doi101016jmarenvres2025107416, doi101038nature12857, doi101093icb391146, doi101098rspb20140846, doi101126science1132294, doi101126science1165283, doi101126science1824116975, doi101126scienceaad8745, doi101126scienceaai9214, doi1023073545860, doi1032614rj2017066"
}

Une investigation hydrographique a été menée sur des récifs coralliens le long de la côte de la baie d'Iligan pour évaluer l'influence des marées sur la distribution spatiale des paramètres de l'eau et déterminer la relation entre les paramètres de l'eau et la couverture de corail dans la zone. Des échantillons d'eau ont été prélevés à 0 m, 5 m et 8 m à l'aide d'une bouteille Niskin de 1,5 L et les paramètres de l'eau ont été immédiatement mesurés à bord à l'aide de compteurs portables étalonnés. L'évaluation du corail a été réalisée à l'aide de la technique Photo-transect et l'estimation de la couverture de corail dur a été effectuée à l'aide de Coral Point Count avec des extensions Excel (CPCe). La salinité augmentait avec la profondeur et les valeurs étaient plus élevées à la marée haute. La salinité sous-optimale observée pourrait expliquer la faible couverture de coraux durs. La température était la plus élevée en surface et diminuait avec la profondeur dans les deux marées. Le récif 1 avait les eaux les plus froides dans les deux marées, les plus chaudes aux récifs les plus éloignés 3 et 4 de l'estuaire. L'oxygène dissous diminue avec la profondeur dans les deux marées et est plus élevé à la marée haute. À marée basse, le pH était le plus élevé en surface ; à marée haute, le pH était le plus élevé à 5 m. À marée basse, le pH était le plus élevé au récif 1 et le plus bas au récif 4. Pendant la marée haute, le pH était uniforme à 8,1 dans les quatre récifs. La température, le pH et l'oxygène dissous étaient dans la plage idéale pour une croissance optimale et le développement des récifs coralliens. Par conséquent, la faible couverture de corail observée n'était pas associée à l'état de ces paramètres.

@article{doi1012692ijb2735261,
    author = "{Angelo A. Responte, Jonalyn B. Galorio, Mary Dorothy Anne Y. Seno, Immanuel N. Galorio, Frence Eliza E. Elecho}",
    title = "Spatial and tidal profiles of seawater properties, and their relation to coral cover of selected reefs in Iligan City, Lanao Del Norte, Philippines",
    year = "2025",
    journal = "International Journal of Biosciences (IJB)",
    abstract = "Une investigation hydrographique a été menée sur des récifs coralliens le long de la côte de la baie d'Iligan pour évaluer l'influence des marées sur la distribution spatiale des paramètres de l'eau et déterminer la relation entre les paramètres de l'eau et la couverture de corail dans la zone. Des échantillons d'eau ont été prélevés à 0 m, 5 m et 8 m à l'aide d'une bouteille Niskin de 1,5 L et les paramètres de l'eau ont été immédiatement mesurés à bord à l'aide de compteurs portables étalonnés. L'évaluation du corail a été réalisée à l'aide de la technique Photo-transect et l'estimation de la couverture de corail dur a été effectuée à l'aide de Coral Point Count avec des extensions Excel (CPCe). La salinité augmentait avec la profondeur et les valeurs étaient plus élevées à la marée haute. La salinité sous-optimale observée pourrait expliquer la faible couverture de coraux durs. La température était la plus élevée en surface et diminuait avec la profondeur dans les deux marées. Le récif 1 avait les eaux les plus froides dans les deux marées, les plus chaudes aux récifs les plus éloignés 3 et 4 de l'estuaire. L'oxygène dissous diminue avec la profondeur dans les deux marées et est plus élevé à la marée haute. À marée basse, le pH était le plus élevé en surface ; à marée haute, le pH était le plus élevé à 5 m. À marée basse, le pH était le plus élevé au récif 1 et le plus bas au récif 4. Pendant la marée haute, le pH était uniforme à 8,1 dans les quatre récifs. La température, le pH et l'oxygène dissous étaient dans la plage idéale pour une croissance optimale et le développement des récifs coralliens. Par conséquent, la faible couverture de corail observée n'était pas associée à l'état de ces paramètres.",
    url = "https://doi.org/10.12692/ijb/27.3.52-61",
    doi = "10.12692/ijb/27.3.52-61",
    openalex = "W4414443861",
    references = "doi107717peerj14586"
}

@article{oliveira2025calcium,
    author = "Oliveira, L.S. et Sanches, Fábio H.C. et Silva, M.A. et Longo, P.A.S. et Laurino, Ivan R.A. et Motta, Fabio dos Santos et Pereira-Filho, Guilherme H.",
    title = "Production de carbonate de calcium par le corail massif Mussismilia hispida dans les récifs subtropicaux de l'Atlantique sud-ouest",
    year = "2025",
    journal = "Marine Environmental Research",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2025.107218",
    doi = "10.1016/j.marenvres.2025.107218",
    openalex = "W4410250628",
    pages = "107218",
    volume = "209",
    references = "doi10100797894017328402, doi101016s0012825202001046, doi101016s0025326x99002374, doi101038nature04095, doi101038ncomms2409, doi101093icb391146, doi101111j13652699201102613x, doi101126sciadv1501252, doi101126scienceaan8048, doi103389fmars201700158"
}

Les contributions acoustiques des producteurs primaires aux paysages sonores océaniques sont mal comprises par rapport à celles des animaux marins. Cette étude a investigué les signaux acoustiques générés par des bulles photosynthétiques produites par des algues dans un écosystème de récif corallien sur l'île de Dongshan, en Chine. En utilisant une surveillance acoustique passive continue (PAM), nous avons enregistré les sons de bulles et appliqué un code basé sur Python pour extraire des signaux candidats, qui ont ensuite été classifiés à l'aide d'un réseau de neurones entraîné. Une analyse ultérieure a révélé des motifs saisonniers distincts dans les taux de signaux, avec le plus élevé en été (103,2 impulsions/30 min), suivi du printemps (60,4) et de l'hiver (41,3). Les données d'automne (4,2) étaient considérablement plus faibles et ont été exclues des comparaisons inter-saisonnières car l'enregistreur était déployé loin du récif. Les taux les plus élevés de détection acoustique se produisaient souvent la nuit. Nous attribuons ce phénomène à la production de bulles de tailles comparables via d'autres processus et au détachement retardé des bulles photosynthétiques, modulé par des facteurs rythmiques supplémentaires. Nous avons développé un modèle de régression ridge utilisant des paramètres environnementaux pour examiner les événements photosynthétiques pendant la journée, montrant que les signaux directement liés à la photosynthèse atteignaient un pic vers midi et étaient positivement corrélés aux concentrations d'oxygène dissous (OD) la plupart des jours échantillonnés, soutenant ainsi partiellement le modèle prédictif. Ce travail pourrait faire progresser la recherche sur l'évaluation des flux d'oxygène ébullitif des producteurs primaires et offre un outil novateur et non invasif pour la surveillance rapide et continue de la santé de l'écosystème.

@article{doi1034133olar0137,
    author = "Zhang, F et al.",
    title = "Caractéristiques acoustiques et variations saisonnières des sons photosynthétiques dans les récifs coralliens de l'île de Dongshan, Chine",
    year = "2026",
    journal = "Ocean-Land-Atmosphere Research",
    abstract = "Les contributions acoustiques des producteurs primaires aux paysages sonores océaniques sont mal comprises par rapport à celles des animaux marins. Cette étude a investigué les signaux acoustiques générés par des bulles photosynthétiques produites par des algues dans un écosystème de récif corallien sur l'île de Dongshan, en Chine. En utilisant une surveillance acoustique passive continue (PAM), nous avons enregistré les sons de bulles et appliqué un code basé sur Python pour extraire des signaux candidats, qui ont ensuite été classifiés à l'aide d'un réseau de neurones entraîné. Une analyse ultérieure a révélé des motifs saisonniers distincts dans les taux de signaux, avec le plus élevé en été (103,2 impulsions/30 min), suivi du printemps (60,4) et de l'hiver (41,3). Les données d'automne (4,2) étaient considérablement plus faibles et ont été exclues des comparaisons inter-saisonnières car l'enregistreur était déployé loin du récif. Les taux les plus élevés de détection acoustique se produisaient souvent la nuit. Nous attribuons ce phénomène à la production de bulles de tailles comparables via d'autres processus et au détachement retardé des bulles photosynthétiques, modulé par des facteurs rythmiques supplémentaires. Nous avons développé un modèle de régression ridge utilisant des paramètres environnementaux pour examiner les événements photosynthétiques pendant la journée, montrant que les signaux directement liés à la photosynthèse atteignaient un pic vers midi et étaient positivement corrélés aux concentrations d'oxygène dissous (OD) la plupart des jours échantillonnés, soutenant ainsi partiellement le modèle prédictif. Ce travail pourrait faire progresser la recherche sur l'évaluation des flux d'oxygène ébullitif des producteurs primaires et offre un outil novateur et non invasif pour la surveillance rapide et continue de la santé de l'écosystème.",
    url = "https://doi.org/10.34133/olar.0137",
    doi = "10.34133/olar.0137",
    openalex = "W7129031454",
    references = "doi107717peerj14586"
}