Succession botanique

@article{doi101086330610,
    author = "Fuller, G. D.",
    title = "Evaporation and Plant Succession",
    year = "1911",
    journal = "Botanical Gazette",
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    is_oa = "true",
    number = "3",
    pages = "193-208",
    semanticscholar_citation_count = "11",
    semanticscholar_id = "040233ea7b5b338b647838611a5173d3010b1150",
    volume = "52"
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@article{doi101086331398,
    author = "Fuller, G. D.",
    title = "Évaporation et humidité du sol en relation avec la succession des associations végétales",
    year = "1914",
    journal = "Botanical Gazette",
    url = "https://www.biodiversitylibrary.org/partpdf/224466",
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    is_oa = "true",
    number = "3",
    pages = "193-234",
    semanticscholar_citation_count = "29",
    semanticscholar_id = "a383381131d98f71858c43817bc8498948445744",
    volume = "58"
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Les métadonnées ci-dessous décrivent la numérisation originale. Suivez le lien « Tous les fichiers : HTTP » dans la boîte « Consulter le livre » à gauche pour trouver des fichiers XML contenant plus de métadonnées sur les images originales et les formats dérivés (résultats OCR, PDF, etc.). Voir également la FAQ Qu'est-ce que la structure de répertoire des textes ? pour des informations sur le contenu des fichiers et les conventions de nommage.

@book{doi105962bhltitle56234,
    author = "Clements, Frederic E.",
    title = "Plant succession; an analysis of the development of vegetation,",
    year = "1916",
    booktitle = "Carnegie Institution of Washington eBooks",
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@article{doi101086332587,
    author = "Cowles, H.",
    title = "Plant Succession",
    year = "1919",
    journal = "Botanical Gazette",
    url = "https://www.biodiversitylibrary.org/partpdf/224520",
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    volume = "68"
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@misc{clements1920plant1,
    author = "Clements, F. E",
    title = "Plant Succession",
    year = "1920",
    howpublished = "An Analysis of the Development of Vegetation: Washington, D.C., Carnegie Institute, 388 p.; Publication No. 290",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Clements, F. E., 1920, Plant Succession: An Analysis of the Development of Vegetation: Washington, D.C., Carnegie Institute, 388 p.; Publication No. 290.}"
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@article{doi101086333909,
    author = "Cain, S. A.",
    title = "Plant Succession and Ecological History of a Central Indiana Swamp",
    year = "1928",
    journal = "Botanical Gazette",
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    volume = "86"
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@article{doi1023072480528,
    author = "Cooper, William S.",
    title = "The Seed-Plants and Ferns of the Glacier Bay National Monument, Alaska",
    year = "1930",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
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    openalex = "W2796486108"
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@misc{doctersvanleeuwen1936krakatau4,
    author = "Docters van Leeuwen, W. M",
    title = "Krakatau, 1833 à 1933",
    year = "1936",
    howpublished = "Ann. Jard. Botan. Buitenzorg, v. 56-57, p. 1-506",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Docters van Leeuwen, W. M., 1936, Krakatau, 1833 à 1933: Ann. Jard. Botan. Buitenzorg, v. 56-57, p. 1-506.}"
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@article{doi101007bf02872308,
    author = "Loehwing, W. F.",
    title = "Interactions des racines des plantes",
    year = "1937",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02872308",
    doi = "10.1007/bf02872308",
    openalex = "W1991407465"
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@misc{daubenmire1956climate2,
    author = "Daubenmire, R. F",
    title = "Le climat comme déterminant de la distribution de la végétation dans l'Est de Washington et le Nord de l'Idaho",
    year = "1956",
    howpublished = "Ecological Monographs, v. 26, p. 131-154",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Daubenmire, R. F., 1956, Le climat comme déterminant de la distribution de la végétation dans l'Est de Washington et le Nord de l'Idaho: Ecological Monographs, v. 26, p. 131-154.}"
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Immigration végétale en avant des glaciers en recul, avec des exemples de la région de Kebnekaise, Suède du Nord.

@article{doi10108020014422196311881012,
    author = "Stork, Adelaide",
    title = "Plant Immigration in Front of Retreating Glaciers, with Examples from the Kebnekajse Area, Northern Sweden",
    year = "1963",
    journal = "Geografiska Annaler",
    abstract = "Plant immigration in front of retreating glaciers with examples from the Kebnekaise area, Northern Sweden.",
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    openalex = "W2767676906"
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La plupart des communautés végétales sont constituées de plusieurs ou de nombreuses espèces qui entrent en compétition pour la lumière, l'eau et les nutriments. Les espèces d'une communauté donnée peuvent être classées selon leur succès relatif dans la compétition ; la productivité semble être la meilleure mesure de leur succès ou de leur importance dans la communauté. Des courbes de productivité décroissante relient les quelques espèces les plus importantes (les dominantes) à un plus grand nombre d'espèces d'importance intermédiaire (dont le nombre détermine principalement la diversité ou la richesse en espèces de la communauté) et à un plus petit nombre d'espèces rares. Ces courbes présentent des formes variées et sont censées exprimer différents modèles de compétition et de différenciation de niche dans les communautés. Il est probablement vrai des plantes, comme des animaux, que deux espèces dans une communauté stable n'occupent pas la même niche. L'évolution de la différenciation de niche rend possible la coexistence de nombreuses espèces végétales qui sont des concurrentes partielles, plutôt que directes. Les espèces ont tendance à évoluer également vers une différenciation d'habitat, vers une dispersion de leurs centres de densité de population maximale par rapport aux gradients environnementaux, de sorte que peu d'espèces entrent en compétition les unes avec les autres dans leurs centres de population. L'évolution de la différenciation de niche et d'habitat permet à de nombreuses espèces de coexister dans les communautés en tant que concurrentes partielles, avec des distributions largement et continuellement superposées, formant les nombreuses communautés intergrades du paysage.

@article{doi101126science1473655250,
    author = "Whittaker, R. H.",
    title = "Dominance and Diversity in Land Plant Communities",
    year = "1965",
    journal = "Science",
    abstract = "La plupart des communautés végétales sont constituées de plusieurs ou de nombreuses espèces qui entrent en compétition pour la lumière, l'eau et les nutriments. Les espèces d'une communauté donnée peuvent être classées selon leur succès relatif dans la compétition ; la productivité semble être la meilleure mesure de leur succès ou de leur importance dans la communauté. Des courbes de productivité décroissante relient les quelques espèces les plus importantes (les dominantes) à un plus grand nombre d'espèces d'importance intermédiaire (dont le nombre détermine principalement la diversité ou la richesse en espèces de la communauté) et à un plus petit nombre d'espèces rares. Ces courbes présentent des formes variées et sont censées exprimer différents modèles de compétition et de différenciation de niche dans les communautés. Il est probablement vrai des plantes, comme des animaux, que deux espèces dans une communauté stable n'occupent pas la même niche. L'évolution de la différenciation de niche rend possible la coexistence de nombreuses espèces végétales qui sont des concurrentes partielles, plutôt que directes. Les espèces ont tendance à évoluer également vers une différenciation d'habitat, vers une dispersion de leurs centres de densité de population maximale par rapport aux gradients environnementaux, de sorte que peu d'espèces entrent en compétition les unes avec les autres dans leurs centres de population. L'évolution de la différenciation de niche et d'habitat permet à de nombreuses espèces de coexister dans les communautés en tant que concurrentes partielles, avec des distributions largement et continuellement superposées, formant les nombreuses communautés intergrades du paysage.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.147.3655.250",
    doi = "10.1126/science.147.3655.250",
    openalex = "W2035166278",
    references = "beauchamp1932competitive, doi101038163688a0, doi101086282070, doi101086282106, doi101086282286, doi101093biomet3812196, doi101126science13134091292, doi1023071411, doi1023071931600, doi1023071931976, doi1023071932254, doi1023071942268, doi1023071943563, doi1023072407089, doi1023072411924, doi104159harvard9780674865327, doi105962bhltitle4489, openalexw3035987306"
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@article{doi1023071942416,
    author = "Viereck, Leslie A.",
    title = "Plant Succession and Soil Development on Gravel Outwash of the Muldrow Glacier, Alaska",
    year = "1966",
    journal = "Ecological Monographs",
    url = "https://doi.org/10.2307/1942416",
    doi = "10.2307/1942416",
    openalex = "W2033020302"
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@article{doi1023072483411,
    author = "Tukey, H. B.",
    title = "Lessivage des métabolites des parties aériennes des plantes et ses implications",
    year = "1966",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
    url = "https://doi.org/10.2307/2483411",
    doi = "10.2307/2483411",
    openalex = "W195142880"
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La théorie de l'évolution par sélection naturelle est une théorie écologique fondée sur l'observation écologique par peut-être le plus grand de tous les écologistes. Elle a été adoptée et développée par la science de la génétique, et les écologistes, étant des gens modestes, ont tendance à oublier leur distinguished parenthood. En effet, l'écologie végétale darwinienne a été largement négligée et un enfant changeling nourri et élevé à l'âge adulte par Schimper et Warming qui ont posé des questions géographiques sur la végétation, et répondu aux questions en démontrant des corrélations entre climat et sols d'une part et physiologie comparative d'autre part. Par contraste avec le 'végétationaliste' et sa préoccupation à décrire et interpréter des zones de terre, les observations écologiques de Darwin et les questions qu'il a posées étaient basées sur une considération des individus et des populations - une préoccupation pour les nombres. 'Regardez une plante au milieu de son aire de répartition, pourquoi ne double-t-elle pas ou ne quadruple-t-elle pas ses nombres ?' '... si nous souhaitons dans l'imagination donner à la plante la puissance d'augmenter en nombre, nous devrions lui donner un avantage sur ses concurrents, ou sur les animaux qui se nourrissent d'elle'. 'Regardez l'espèce la plus vigoureuse ; dans la mesure où elle grouille en nombre, dans cette mesure elle tendra à augmenter encore davantage' (Darwin, Origine des espèces, Chapitre III).* Ces citations, avec leur insistance sur les nombres, posent des problèmes de biologie des populations - d'une démographie qui n'a jamais gagné de l'élan en écologie végétale, bien qu'elle ait joué un rôle vertébral en écologie animale. Deux propriétés interliées des plantes supérieures ont sérieusement entravé le développement de la démographie végétale : la plasticité et la reproduction végétative. Darwin a trouvé un pin de 26 ans sur une lande qui 'avait pendant de nombreuses années essayé de lever sa tête au-dessus des tiges de la lande et avait échoué'. Il est clairement injuste de compter une telle plante comme une unité égale à un arbre adulte dans un recensement de population. Une plante mature d'une mauvaise herbe annuelle telle que Chenopodium album peut produire quatre graines ou 100 000 graines, selon le statut nutritif et hydrique du sol. Il peut donc être soutenu qu'une affirmation sur le nombre de plantes implique très peu sur la nature réelle de la population. La reproduction végétative est un obstacle supplémentaire à l'établissement de recensements, car les descendants végétatifs restent dans une certaine mesure une partie du parent, souvent pendant une longue période. Quand faut-il compter un tel ramet comme un individu ? Des décisions arbitraires doivent être prises si les populations végétales doivent devenir numérables et l'arbitraire des décisions a souvent découragé les tentatives de compter les plantes. Ces problèmes ne sont cependant pas particuliers aux plantes et ont dû être affrontés en démographie animale où ils apparaissent sous une forme légèrement moins aiguë. La plasticité de la taille individuelle et de la capacité reproductive doivent être prises en compte dans les études de population de poissons et même de Drosophila. La reproduction végétative chez Hydra, où les 'ramets' lentement développent l'indépendance, n'a pas empêché son utilisation dans des études de population modèles. * Toutes les citations dans ce papier sont des Chapitres III et IV de The Origin of Species (1859), le texte étant l'édition Everyman de 1928. Les italiques sont les miennes. 247

@article{doi1023072257876,
    author = "Harper, John L.",
    title = "Une approche darwinienne de l'écologie végétale",
    year = "1967",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "La théorie de l'évolution par sélection naturelle est une théorie écologique-fondée sur l'observation écologique par peut-être le plus grand de tous les écologistes. Elle a été adoptée et développée par la science de la génétique, et les écologistes, étant des gens modestes, ont tendance à oublier leur distinguished parenthood. En effet, l'écologie végétale darwinienne a été largement négligée et un enfant changeling nourri et élevé à l'âge adulte par Schimper et Warming qui ont posé des questions géographiques sur la végétation, et ont répondu aux questions en démontrant des corrélations entre climat et sols d'une part et physiologie comparative d'autre part. Par contraste avec le 'végétationaliste' et sa préoccupation à décrire et interpréter des zones de terre, les observations écologiques de Darwin et les questions qu'il a posées étaient basées sur une considération des individus et des populations-une préoccupation pour les nombres. 'Regardez une plante au milieu de son aire de répartition, pourquoi ne double-t-elle pas ou ne quadruple-t-elle pas ses nombres ?' '... si nous souhaitons, dans l'imagination, donner à la plante la capacité d'augmenter en nombre, nous devrions lui donner un avantage sur ses concurrents, ou sur les animaux qui se nourrissent d'elle'. 'Regardez l'espèce la plus vigoureuse ; dans la mesure où elle pullule en nombre, dans cette mesure elle tendra à augmenter encore davantage' (Darwin, L'Origine des espèces, Chapitre III).* Ces citations, avec leur insistance sur les nombres, posent des problèmes de biologie des populations-d'une démographie qui n'a jamais gagné de l'élan en écologie végétale, bien qu'elle ait joué un rôle vertébral en écologie animale. Deux propriétés interconnectées des plantes supérieures ont sérieusement entravé le développement de la démographie végétale : la plasticité et la reproduction végétative. Darwin a trouvé un pin de 26 ans sur une lande qui 'avait pendant de nombreuses années essayé de soulever sa tête au-dessus des tiges de la lande et avait échoué'. Il est clairement injuste de compter une telle plante comme une unité égale à un arbre adulte dans un recensement de population. Une plante mature d'une mauvaise herbe annuelle telle que Chenopodium album peut produire quatre graines ou 100 000 graines, selon le statut nutritif et hydrique du sol. Il peut donc être soutenu qu'une affirmation sur le nombre de plantes implique très peu sur la nature réelle de la population. La reproduction végétative est un obstacle supplémentaire à l'établissement de recensements, car les descendants végétatifs restent dans une certaine mesure une partie du parent, souvent pendant une longue période. Quand faut-il compter un tel ramet comme un individu ? Des décisions arbitraires doivent être prises si les populations végétales doivent devenir numérables et l'arbitraire des décisions a souvent découragé les tentatives de compter les plantes. Ces problèmes ne sont cependant pas particuliers aux plantes et ont dû être affrontés en démographie animale où ils apparaissent sous une forme légèrement moins aiguë. La plasticité de la taille individuelle et de la capacité reproductive doivent être prises en compte dans les études de population de poissons et même de Drosophila. La reproduction végétative chez Hydra, où les 'ramets' lentement développent l'indépendance, n'a pas empêché son utilisation dans des études de population modèles. * Toutes les citations dans ce papier proviennent des Chapitres III et IV de L'Origine des espèces (1859), le texte étant l'édition Everyman de 1928. Les italiques sont les miennes. 247",
    url = "https://doi.org/10.2307/2257876",
    doi = "10.2307/2257876",
    openalex = "W2325216580"
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Ahmad S. Abdul-Wahab, Elroy L. Rice, Plant Inhibition by Johnson Grass and Its Possible Significance in Old- Field Succession, Bulletin of the Torrey Botanical Club, Vol. 94, No. 6 (Nov. - Dec., 1967), pp. 486-497

@article{doi1023072483566,
    author = "Abdul-Wahab, Ahmad S. and Rice, Elroy L.",
    title = "Plant Inhibition by Johnson Grass and Its Possible Significance in Old- Field Succession",
    year = "1967",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
    abstract = "Ahmad S. Abdul-Wahab, Elroy L. Rice, Plant Inhibition by Johnson Grass and Its Possible Significance in Old- Field Succession, Bulletin of the Torrey Botanical Club, Vol. 94, No. 6 (Nov. - Dec., 1967), pp. 486-497",
    url = "https://doi.org/10.2307/2483566",
    doi = "10.2307/2483566",
    openalex = "W2303135801"
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@article{doi1023072484043,
    author = "Floyd, Gary L. et Rice, Elroy L.",
    title = "Inhibition des plantes supérieures par trois inhibiteurs de croissance bactérienne",
    year = "1967",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
    url = "https://doi.org/10.2307/2484043",
    doi = "10.2307/2484043",
    openalex = "W2797634513"
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@misc{daubenmire1968plant3,
    author = "Daubenmire, R. F",
    title = "Plant Communities",
    year = "1968",
    howpublished = "New York, Harper \& Row, 300 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Daubenmire, R. F., 1968, Plant Communities: New York, Harper \& Row, 300 p.}"
}

Roger E. Wilson, Elroy L. Rice, Allélopathie telle qu'elle s'exprime chez Helianthus annuus et son rôle dans la succession des champs abandonnés, Bulletin of the Torrey Botanical Club, Vol. 95, No. 5 (Sep. - Oct., 1968), pp. 432-448

@article{doi1023072483475,
    author = "Wilson, Roger E. et Rice, Elroy L.",
    title = "Allélopathie telle qu'elle s'exprime chez Helianthus annuus et son rôle dans la succession des champs abandonnés",
    year = "1968",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
    abstract = "Roger E. Wilson, Elroy L. Rice, Allélopathie telle qu'elle s'exprime chez Helianthus annuus et son rôle dans la succession des champs abandonnés, Bulletin of the Torrey Botanical Club, Vol. 95, No. 5 (Sep. - Oct., 1968), pp. 432-448",
    url = "https://doi.org/10.2307/2483475",
    doi = "10.2307/2483475",
    openalex = "W2796430018"
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@article{olsen1968banding,
    author = "OLSEN, DAVID",
    title = "BANDING PATTERNS OF HALIOTIS RUFESCENS AS INDICATORS OF BOTANICAL AND ANIMAL SUCCESSION",
    year = "1968",
    journal = "The Biological Bulletin",
    url = "https://doi.org/10.2307/1539972",
    doi = "10.2307/1539972",
    number = "1",
    pages = "139-147",
    volume = "134"
}

@article{doi101007bf02859887,
    author = "Rovira, Albert",
    title = "Plant root exudates",
    year = "1969",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02859887",
    doi = "10.1007/bf02859887",
    openalex = "W2034558874"
}

Huit sites d'âge connu ont été échantillonnés dans le monument national de Glacier Bay, en Alaska, pour examiner les changements de diversité végétale lors de la succession primaire dans cette région. Quatre strates—arbres, arbustes hauts, arbustes bas—herbes, et bryoid—thalloïdes—ont été échantillonnés indépendamment. Les données suggèrent une séquence d'invasions en vagues sur les sites par les strates, principalement dans l'ordre de la taille croissante. Les bryoid—thalloïdes ont été exceptionnels en démontrant un pic tardif des valeurs de couverture. En général, la diversité d'une strate particulière a diminué pendant la période où la strate dominait la communauté en termes de couverture foliaire. La richesse (nombre d'espèces) des communautés a augmenté rapidement dans les 100 premières années, puis plus lentement pour atteindre un maximum dans l'état stationnaire de la tourbière. L'équitabilité (égalité de la distribution de la couverture foliaire entre les espèces) était erratique, mais tendait à augmenter avec l'âge. Après des augmentations initiales, trois indices de diversité ont montré des courbes presque plates avec deux exceptions : des diminutions marquées dans la période de 30— à 50—ans ; et une augmentation jusqu'à des niveaux maximaux dans l'état stationnaire final. L'information totale par unité de surface calculée à partir de la diversité et de la couverture foliaire a augmenté de manière sigmoïde avec un pic d'information dans la dernière étape de tourbière.

@article{doi1023071934737,
    author = "Reiners, William A. et Worley, Ian A. et Lawrence, Donald B.",
    title = "Plant Diversity in a Chronosequence at Glacier Bay, Alaska",
    year = "1971",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Eight sites of known age were sampled in Glacier Bay National Monument, Alaska, to examine the changes in plant diversity during primary succession in that region. Four strata–trees, tall shrubs, low shrubs—herbs, and bryoid—thalloids–were sampled independently. Data suggested a sequence of wave—like invasions on sites by strata, largely in order of increasing size. Bryoid—thalloids were exceptional in demonstrating a late peak in cover values. In general, diversity of a particular stratum declined during the period in which the stratum dominated the community in terms of foliar cover. Richness (species number) of communities increased rapidly in the first 100 years, then more gradually to reach a maximum in the muskeg steady state. Equitability (evenness of distribution of foliar cover among species) was erratic, but tended to increase with age. After initial rises, three diversity indices showed nearly flat curves with two exceptions: marked decreases in the 30— to 50—year period; and a rise to maximum levels in the final steady state. Total information per unit area calculated from diversity and foliar cover increased in a sigmoid manner with peak information in the final muskeg stage.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1934737",
    doi = "10.2307/1934737",
    openalex = "W2050060044"
}

Les choux sont cultivés à Ithaca, New York, dans deux habitats expérimentaux : des peuplements purs et des rangées simples bordées de chaque côté par une végétation de prairie diverse. Les arthropodes associés à ces plantes ont été échantillonnés sur 20 dates sur une période de 3 ans. Le statut des espèces herbivores a été mesuré par leur rang en biomasse dans chaque échantillon. Les deux espèces les plus importantes, Phyllotreta cruciferae et Pieris rapae, ont maintenu un statut élevé tout au long de l'enquête, mais une autre espèce importante, Brevicoryne brassicae, a été absente pendant une saison entière. Les foreurs de galeries ont généralement formé la guild herbivore la plus importante. Néanmoins, le spectre des guildes, qui décrit la structure fonctionnelle de la faune, a varié considérablement dans le temps et l'espace. Les distributions de taille des espèces et des individus étaient toutes deux fortement asymétriques vers les tailles plus petites. Les charges herbivores, la biomasse moyenne des herbivores par 100 g de feuillage consommable, ont été systématiquement plus élevées dans les peuplements purs. De plus, les charges herbivores ont varié significativement selon la saison dans chaque habitat expérimental. À la fois le nombre d'espèces herbivores et la diversité de la charge herbivore étaient plus élevés dans l'habitat diversifié. La biomasse était plus fortement concentrée parmi les herbivores importants dans les peuplements purs ; une dominance accrue, plutôt que des différences de richesse spécifique, semblait être la cause principale de la faible diversité herbivore dans cet habitat. La diversité des prédateurs et des parasitoïdes était plus élevée dans les peuplements purs. La plupart des espèces abondantes trouvées sur les choux partageaient une gamme d'hôtes similaire et étroite. En conséquence, les espèces de ce groupe central d'herbivores et de parasitoïdes étaient régulièrement associées les unes aux autres. Les prédateurs et les herbivores moins abondants avaient tendance à être moins spécialisés et servaient à relier l'association chou à la communauté environnante. Les associations plante-arthropode sont représentatives des communautés composantes, des systèmes bien intégrés qui forment des parties de communautés composantes plus grandes. Cette distinction facilite l'analyse de la structure de la communauté. Les microclimats et l'efficacité des "ennemis" ne semblaient pas différer suffisamment dans les deux habitats expérimentaux pour expliquer les différences observées dans la charge herbivore. Les résultats suggèrent une nouvelle proposition, l'hypothèse de la concentration des ressources, qui stipule que les herbivores sont plus susceptibles de trouver et de rester sur des hôtes qui poussent dans des peuplements denses ou presque purs ; que les espèces les plus spécialisées atteignent fréquemment des densités relatives plus élevées dans des environnements simples ; et que, par conséquent, la biomasse tend à se concentrer dans quelques espèces, entraînant une diminution de la diversité des herbivores dans les peuplements purs.

@article{doi1023071942161,
    author = "Root, Richard B.",
    title = "Organization of a Plant‐Arthropod Association in Simple and Diverse Habitats: The Fauna of Collards (Brassica Oleracea)",
    year = "1973",
    journal = "Ecological Monographs",
    abstract = {Les choux sont cultivés à Ithaca, New York, dans deux habitats expérimentaux : des peuplements purs et des rangées simples bordées de chaque côté par une végétation de prairie diverse. Les arthropodes associés à ces plantes ont été échantillonnés sur 20 dates sur une période de 3 ans. Le statut des espèces herbivores a été mesuré par leur rang en biomasse dans chaque échantillon. Les deux espèces les plus importantes, Phyllotreta cruciferae et Pieris rapae, ont maintenu un statut élevé tout au long de l'enquête, mais une autre espèce importante, Brevicoryne brassicae, a été absente pendant une saison entière. Les foreurs de galeries ont généralement formé la guild herbivore la plus importante. Néanmoins, le spectre des guildes, qui décrit la structure fonctionnelle de la faune, a varié considérablement dans le temps et l'espace. Les distributions de taille des espèces et des individus étaient toutes deux fortement asymétriques vers les tailles plus petites. Les charges herbivores, la biomasse moyenne des herbivores par 100 g de feuillage consommable, ont été systématiquement plus élevées dans les peuplements purs. De plus, les charges herbivores ont varié significativement selon la saison dans chaque habitat expérimental. À la fois le nombre d'espèces herbivores et la diversité de la charge herbivore étaient plus élevés dans l'habitat diversifié. La biomasse était plus fortement concentrée parmi les herbivores importants dans les peuplements purs ; une dominance accrue, plutôt que des différences de richesse spécifique, semblait être la cause principale de la faible diversité herbivore dans cet habitat. La diversité des prédateurs et des parasitoïdes était plus élevée dans les peuplements purs. La plupart des espèces abondantes trouvées sur les choux partageaient une gamme d'hôtes similaire et étroite. En conséquence, les espèces de ce groupe central d'herbivores et de parasitoïdes étaient régulièrement associées les unes aux autres. Les prédateurs et les herbivores moins abondants avaient tendance à être moins spécialisés et servaient à relier l'association chou à la communauté environnante. Les associations plante-arthropode sont représentatives des communautés composantes, des systèmes bien intégrés qui forment des parties de communautés composantes plus grandes. Cette distinction facilite l'analyse de la structure de la communauté. Les microclimats et l'efficacité des "ennemis" ne semblaient pas différer suffisamment dans les deux habitats expérimentaux pour expliquer les différences observées dans la charge herbivore. Les résultats suggèrent une nouvelle proposition, l'hypothèse de la concentration des ressources, qui stipule que les herbivores sont plus susceptibles de trouver et de rester sur des hôtes qui poussent dans des peuplements denses ou presque purs ; que les espèces les plus spécialisées atteignent fréquemment des densités relatives plus élevées dans des environnements simples ; et que, par conséquent, la biomasse tend à se concentrer dans quelques espèces, entraînant une diminution de la diversité des herbivores dans les peuplements purs.},
    url = "https://doi.org/10.2307/1942161",
    doi = "10.2307/1942161",
    openalex = "W2056816058"
}

Les changements de motif spatial au cours de la succession ont suscité un intérêt considérable ces dernières années. De tels changements sont intéressants non seulement en eux-mêmes, mais aussi parce qu'ils peuvent jeter de la lumière sur les mécanismes des changements successifs. Greig-Smith (1964) a résumé l'hypothèse actuellement acceptée des variations successives de motif. Il a suggéré que les variations sont déterminées par l'établissement et la croissance de grappes (souvent des clones) d'espèces persistantes. À mesure que ces grappes s'agrandissent et finissent par se fusionner, l'échelle du motif augmentera, pas nécessairement de manière fluide, jusqu'à un maximum au climax ; d'autre part, l'intensité du motif diminuera à mesure que la gamme d'échelle de contagion augmente avec l'âge. Les travaux de Whitford (1949), Greig-Smith (1952), Margalef (1958), Kershaw (1958), Pielou (1966) et Brereton (1971) soutiennent cette vue. Williams et al. (1969) ont examiné la question de savoir si la succession est un processus graduel ou par étapes, c'est-à-dire le taux de changement de la composition de la végétation fluctue-t-il ? Dans une succession secondaire dans une forêt pluviale du Queensland, ils ont constaté un changement d'une variation principalement temporelle à une variation principalement spatiale après 6 ans. Si des étapes successives existent, elles sont susceptibles d'influencer les variations de motif spatial : les motifs peuvent différer d'une étape à l'autre, mais le motif aux moments de transition peut également différer de celui à l'intérieur des étapes. Shafi & Yarranton (1973) ont démontré des étapes de hétérogénéité différente lors d'une succession post-incendie dans la forêt boréale. Leur découverte qu'une étape peut être suivie par une autre de plus grande homogénéité implique que l'échelle du motif peut diminuer pendant au moins une partie d'une succession. Anderson (1967) a également noté une diminution de l'échelle du motif au début d'une succession. Morrison & Yarranton (1973) ont montré que l'hétérogénéité est maximale lors d'une succession de dunes de sable à la transition entre les étapes. Webb, Tracey & Williams (1972) soulèvent la question de savoir si les patches de végétation apparaissant dans une succession représentent différentes étapes de maturité ; à la fois Morrison & Yarranton et Shafi & Yarranton (1973) suggèrent que les transitions d'une étape à l'autre se produisent de manière hétérogène sur le terrain, de sorte que c'est en effet le cas. Si cela est admis comme au moins une possibilité, cela établit le lien entre le mécanisme de la succession et les variations de motif spatial. Sur la base de ce raisonnement, il a été décidé qu'un examen détaillé du motif de la végétation sur le terrain avant, pendant et après une transition d'étape à étape dans une succession pourrait non seulement clarifier la séquence de motif spatial, mais aussi aider à élucider le mécanisme de la succession lui-même. La succession de dunes de sable à Grand Bend, en Ontario, précédemment décrite par Morrison (1973), a été sélectionnée pour une telle étude.

@article{doi1023072258988,
    author = "Yarranton, G. A. and Morrison, R. G.",
    title = "Dynamique spatiale d'une succession primaire : nucléation",
    year = "1974",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Les changements de motifs spatiaux au cours de la succession ont suscité un intérêt considérable ces dernières années. De tels changements sont intéressants non seulement pour eux-mêmes, mais aussi parce qu'ils peuvent jeter de la lumière sur les mécanismes des changements successifs. Greig-Smith (1964) a résumé l'hypothèse actuellement acceptée concernant les variations de motifs dans la succession. Il a suggéré que ces variations sont déterminées par l'établissement et la croissance de grappes (souvent des clones) d'espèces persistantes. À mesure que ces grappes s'agrandissent et finissent par se fusionner, l'échelle du motif augmentera, pas nécessairement de manière lisse, jusqu'à un maximum au climax ; d'autre part, l'intensité du motif diminuera à mesure que la gamme d'échelle de contagion augmente avec l'âge. Les travaux de Whitford (1949), Greig-Smith (1952), Margalef (1958), Kershaw (1958), Pielou (1966) et Brereton (1971) soutiennent cette vue. Williams et al. (1969) ont examiné la question de savoir si la succession est un processus graduel ou par étapes, c'est-à-dire le taux de changement de la composition de la végétation fluctue-t-il ? Dans une succession secondaire dans une forêt pluviale du Queensland, ils ont constaté un changement d'une variation principalement temporelle à une variation principalement spatiale après 6 ans. Si des étapes successives existent, elles sont susceptibles d'influencer les variations de motifs spatiaux : les motifs peuvent différer d'une étape à l'autre, mais le motif aux moments de transition peut également différer de celui à l'intérieur des étapes. Shafi & Yarranton (1973) ont démontré des étapes de hétérogénéité différente lors d'une succession post-incendie dans la forêt boréale. Leur découverte qu'une étape peut être suivie par une autre de plus grande homogénéité implique que l'échelle du motif peut diminuer pendant au moins une partie d'une succession. Anderson (1967) a également noté une diminution de l'échelle du motif au début d'une succession. Morrison & Yarranton (1973) ont montré que l'hétérogénéité est maximale lors d'une succession de dunes de sable à la transition entre les étapes. Webb, Tracey & Williams (1972) soulèvent la question de savoir si les patches de végétation apparaissant dans une succession représentent des étapes de maturité différentes ; à la fois Morrison & Yarranton et Shafi & Yarranton (1973) suggèrent que les transitions d'une étape à l'autre se produisent de manière hétérogène sur le terrain, de sorte que c'est effectivement le cas. Si cela est admis comme au moins une possibilité, cela établit le lien entre le mécanisme de la succession et les variations de motifs spatiaux. Sur la base de ce raisonnement, il a été décidé qu'un examen détaillé du motif de la végétation sur le terrain avant, pendant et après une transition d'étape à étape dans une succession pourrait non seulement clarifier la séquence de motifs spatiaux, mais aussi aider à élucider le mécanisme de la succession lui-même. La succession de dunes de sable à Grand Bend, en Ontario, précédemment décrite par Morrison (1973), a été sélectionnée pour une telle étude.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2258988",
    doi = "10.2307/2258988",
    openalex = "W2063934992",
    references = "doi1023071932934"
}

"L'Écologie des invasions par les animaux et les plantes a lancé un avertissement précoce sur une catastrophe environnementale qui est devenue trop familière aujourd'hui - l'invasion d'espèces non indigènes. De la kudzu aux moules zébrées aux coléoptères longicornes d'Asie, les espèces non indigènes colonisent de nouveaux habitats dans le monde à un rythme alarmant, grâce à l'intervention humaine accidentelle et délibérée. L'une des principales causes des extinctions d'animaux et de plantes indigènes, les espèces envahissantes provoquent également de graves ravages économiques, causant des milliards de dollars de dégâts chaque année aux États-Unis seulement." "Elton explique les effets dévastateurs que les espèces envahissantes peuvent avoir sur les écosystèmes locaux dans un langage clair et concis et avec de nombreux exemples. Le premier livre sur la biologie des invasions, et toujours le plus cité, le chef-d'œuvre d'Elton offre une introduction accessible et engageante à l'une des crises environnementales les plus importantes de notre temps."--COUVERTURE DU LIVRE.

@book{doi1010079789400958517,
    author = "Elton, Charles C.",
    title = "The Ecology of Invasions by Animals and Plants",
    year = "1977",
    abstract = {"The Ecology of Invasions by Animals and Plants sounded an early warning about an environmental catastrophe that has become all too familiar today - the invasion of nonnative species. From kudzu to zebra mussels to Asian long-horned beetles, nonnative species are colonizing new habitats around the world at an alarming rate, thanks to accidental and deliberate human intervention. One of the leading causes of extinctions of native animals and plants, invasive species also wreak severe economic havoc, causing billions of dollars in damage each year in the United States alone." "Elton explains the devastating effects that invasive species can have on local ecosystems in clear, concise language and with numerous examples. The first book on invasion biology, and still the most cited, Elton's masterpiece provides an accessible, engaging introduction to one of the most important environmental crises of our time."--BOOK JACKET.},
    url = "https://doi.org/10.1007/978-94-009-5851-7",
    doi = "10.1007/978-94-009-5851-7",
    openalex = "W2132145325"
}

La séquence d'espèces observée après qu'un espace relativement important se soit ouvert est une conséquence des mécanismes suivants. Les espèces « opportunistes », dotées de capacités de dispersion larges et d'une croissance rapide vers la maturité, arrivent généralement en premier et occupent l'espace vacant. Ces espèces ne peuvent pas envahir et se développer en présence d'adultes de leur propre espèce ou d'autres espèces. Plusieurs mécanismes alternatifs peuvent ensuite déterminer quelles espèces remplacent ces occupants initiaux. Trois modèles de tels mécanismes ont été proposés. Le premier modèle de « facilitation » suggère que l'entrée et la croissance des espèces ultérieures dépendent des espèces plus anciennes qui « préparent le terrain » ; seule après cela les espèces ultérieures peuvent coloniser. Les preuves en faveur de ce modèle s'appliquent principalement à certaines successions primaires et à la succession hétérotrophe. Un second modèle de « tolérance » suggère qu'une séquence prévisible est produite par l'existence d'espèces ayant évolué des stratégies différentes pour exploiter les ressources. Les espèces ultérieures seront celles capables de tolérer des niveaux de ressources plus faibles que les premières. Elles peuvent ainsi envahir et atteindre la maturité en présence de celles qui les ont précédées. À l'heure actuelle, il existe peu de preuves en faveur de ce modèle. Un troisième modèle d'« inhibition » suggère que toutes les espèces résistent aux invasions de leurs concurrents. Les premiers occupants s'approprient l'espace et continueront à exclure ou inhiber les colonisateurs ultérieurs jusqu'à ce que les premiers meurent ou soient endommagés, libérant ainsi les ressources. Seule à ce moment-là les colonisateurs ultérieurs peuvent atteindre la maturité. Un corpus considérable de preuves existe en faveur de ce modèle. Dans la majorité des communautés naturelles, la succession est fréquemment interrompue par des perturbations majeures, telles que des incendies, des tempêtes, des épidémies d'insectes, etc., ce qui relance le processus tout entier. Cependant, si elle n'est pas interrompue, elle atteint inévitablement une étape où les changements ultérieurs sont de faible ampleur, car les individus meurent et sont remplacés. Le schéma de ces changements dépendra de savoir si les individus sont plus susceptibles d'être remplacés par un membre de leur propre espèce ou d'une autre espèce. Si c'est le premier cas, la stabilité sera assurée. Cependant, dans les communautés terrestres, les conditions du sol dans le voisinage immédiat des plantes à longue durée de vie peuvent être modifiées de telle sorte que les descendants de la même espèce soient beaucoup moins favorisés que ceux d'autres espèces. Une cause probable est l'accumulation d'organismes du sol pathogènes spécifiques à l'hôte près d'une plante à longue durée de vie. Dans ce cas, les espèces à chaque site local continuent de changer, produisant une instabilité locale. Il n'a pas encore été décidé, pour aucune communauté naturelle, si la composition moyenne en espèces de l'ensemble du tractus ne change pas, exhibant une stabilité globale, ou si elle continue de changer.

@article{doi101086283241,
    author = "Connell, Joseph H. et Slatyer, Ralph O.",
    title = "Mécanismes de la succession dans les communautés naturelles et leur rôle dans la stabilité et l'organisation de la communauté",
    year = "1977",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = {La séquence d'espèces observée après l'ouverture d'un espace relativement vaste est la conséquence des mécanismes suivants. Les espèces « opportunistes », dotées de capacités de dispersion larges et d'une croissance rapide vers la maturité, arrivent généralement en premier et occupent l'espace vide. Ces espèces ne peuvent envahir et se développer en présence d'adultes de leur propre espèce ou d'autres espèces. Plusieurs mécanismes alternatifs peuvent alors déterminer quelles espèces remplacent ces occupants précoces. Trois modèles de tels mécanismes ont été proposés. Le premier modèle de « facilitation » suggère que l'entrée et la croissance des espèces ultérieures dépendent des espèces précoces « préparant le terrain » ; seule après cela les espèces ultérieures peuvent coloniser. Les preuves en faveur de ce modèle s'appliquent principalement à certaines successions primaires et à la succession hétérotrophe. Un second modèle de « tolérance » suggère qu'une séquence prévisible est produite par l'existence d'espèces ayant évolué des stratégies différentes pour exploiter les ressources. Les espèces ultérieures seront celles capables de tolérer des niveaux de ressources plus faibles que les premières. Elles peuvent donc envahir et se développer jusqu'à la maturité en présence de celles qui les ont précédées. À l'heure actuelle, il existe peu de preuves en faveur de ce modèle. Un troisième modèle d'« inhibition » suggère que toutes les espèces résistent aux invasions de leurs concurrents. Les premiers occupants s'approprient l'espace et continueront à exclure ou inhiber les colonisateurs ultérieurs jusqu'à ce que les premiers meurent ou soient endommagés, libérant ainsi les ressources. Seule à ce moment-là les colonisateurs ultérieurs peuvent atteindre la maturité. Un corpus considérable de preuves existe en faveur de ce modèle. Dans la majorité des communautés naturelles, la succession est fréquemment interrompue par des perturbations majeures, telles que des incendies, des tempêtes, des épidémies d'insectes, etc., redémarrant le processus tout entier. Cependant, si elle n'est pas interrompue, elle atteint inévitablement une étape où les changements ultérieurs sont de faible ampleur, car les individus meurent et sont remplacés. Le schéma de ces changements dépendra de savoir si les individus sont plus susceptibles d'être remplacés par un membre de leur propre espèce ou d'une autre espèce. Si c'est le premier cas, la stabilité sera assurée. Cependant, dans les communautés terrestres, les conditions du sol dans le voisinage immédiat des plantes à longue durée de vie peuvent être modifiées de telle sorte que les descendants de la même espèce soient beaucoup moins favorisés que ceux d'autres espèces. Une cause probable est l'accumulation d'organismes du sol pathogènes spécifiques à l'hôte près d'une plante à longue durée de vie. Dans ce cas, les espèces à chaque site local continuent de changer, produisant une instabilité locale. Il n'a pas encore été décidé, pour aucune communauté naturelle, si la composition moyenne en espèces de l'ensemble du tractus ne change pas, exhibant une stabilité globale, ou si elle continue de changer.},
    url = "https://doi.org/10.1086/283241",
    doi = "10.1086/283241",
    openalex = "W2091818139",
    references = "dayton1971competition, doi101007bf00275587, doi101038260204c0, doi101086282286, doi101086282687, doi1023071930070, doi1023071942352, doi1023072256497, doi1023072258550, doi102307jctvx5wbbh, openalexw1996657273, openalexw2962874606"
}

Il est suggéré que l'évolution chez les plantes peut être associée à l'émergence de trois stratégies primaires, chacune pouvant être identifiée en référence à un certain nombre de caractéristiques, y compris les caractéristiques morphologiques, l'allocation des ressources, la phénologie et la réponse au stress. La stratégie compétitive prévaut dans la végétation productive et relativement peu perturbée, la stratégie tolérante au stress est associée à des conditions continuellement non productives, et la stratégie rudérale est caractéristique des habitats fortement perturbés mais potentiellement productifs. Un modèle triangulaire basé sur les trois stratégies peut être concilié avec la théorie de la sélection r- et K-, offre une perspective sur les processus de succession et de dominance de la végétation, et semble être capable d'être étendu aux champignons et aux animaux.

@article{doi101086283244,
    author = "Grime, J. P.",
    title = "Preuves de l'existence de trois stratégies primaires chez les plantes et leur pertinence pour la théorie écologique et évolutive",
    year = "1977",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Il est suggéré que l'évolution chez les plantes peut être associée à l'émergence de trois stratégies primaires, chacune pouvant être identifiée en référence à un certain nombre de caractéristiques, y compris les caractéristiques morphologiques, l'allocation des ressources, la phénologie et la réponse au stress. La stratégie compétitive prévaut dans la végétation productive et relativement peu perturbée, la stratégie tolérante au stress est associée à des conditions continuellement non productives, et la stratégie rudérale est caractéristique des habitats fortement perturbés mais potentiellement productifs. Un modèle triangulaire basé sur les trois stratégies peut être concilié avec la théorie de la sélection r- et K-, offre une perspective sur les processus de succession et de dominance de la végétation, et semble être capable d'être étendu aux champignons et aux animaux.",
    url = "https://doi.org/10.1086/283244",
    doi = "10.1086/283244",
    openalex = "W2055424972",
    references = "doi101038242344a0, doi101038250026a0, doi101086282454, doi101086282455, doi1015159781400881376, doi102307213332, doi1023072258728, doi10230725528056, doi1023073241344, doi105962bhltitle59991"
}

RÉSUMÉ Selon l'hypothèse de « Gause », une conséquence du processus d'évolution par sélection naturelle est que dans une communauté à l'équilibre, chaque espèce doit occuper un niché différent. De nombreux botanistes ont trouvé cette idée improbable car ils ont ignoré les processus de régénération dans les communautés végétales. La plupart des communautés végétales sont plus longévives que les plantes individuelles qui les composent. Lorsqu'un individu meurt, il peut ou non être remplacé par un individu de la même espèce. C'est cette étape de remplacement qui est primordiale pour l'argumentation présentée. Plusieurs mécanismes ne impliquant pas la régénération contribuent également au maintien de la richesse spécifique : différences de forme de vie couplées à l'incapacité des plantes plus grandes d'épuiser ou de couper toutes les ressources, ainsi que le développement de relations de dépendance, différences de phénologie couplées à la tolérance de la suppression, fluctuations de l'environnement couplées à des différences relativement faibles en matière de capacité compétitive entre de nombreuses espèces, la capacité de certaines paires d'espèces à former des mélanges stables en raison d'un équilibre entre la compétition intraspécifique et la compétition interspécifique, la production de substances plus toxiques pour l'espèce productrice que pour les autres espèces, différences dans les minéraux nutritifs limitants primaires ou les tailles de pores dans le sol pour les plantes voisines de différentes espèces, et différences dans les capacités compétitives des espèces dépendant de leur âge physiologique couplées à la structure d'âge inégale de nombreuses populations. Les mécanismes listés ci-dessus n'expliquent pas suffisamment la persistance indéfinie en mélange de nombreuses espèces dans les communautés les plus riches en espèces connues. En revanche, il semble exister presque des possibilités illimitées de différences entre les espèces dans leurs besoins en matière de régénération, c'est-à-dire le remplacement des plantes individuelles d'une génération par celles de la suivante. Cette idée est illustrée pour les espèces d'arbres et il est souligné que les forestiers ont été les premiers, de loin, à apprécier son importance. Les processus impliqués dans l'invasion réussie d'un trou par une espèce végétale donnée et certains caractères du trou qui peuvent être importants sont résumés dans le Tableau 2. La définition du niché d'une plante nécessite la reconnaissance de quatre composantes : le niché d'habitat, le niché de forme de vie, le niché phénologique et le niché de régénération. Un bref compte rendu est donné des schémas de régénération dans différents types de communautés végétales pour fournir un contexte aux études de différenciation dans le niché de régénération. Toutes les étapes du cycle de régénération sont potentiellement importantes et des exemples de différenciation entre espèces sont donnés pour chacune des étapes suivantes : production de graines viables (incluant les sous-étapes de floraison, de pollinisation et de mise en graine), dispersion, dans l'espace et le temps, germination, établissement et développement ultérieur de la plante immature. Dans la discussion conclusive, l'accent est mis sur les thèmes suivants : les types de travaux nécessaires à l'avenir pour prouver ou infirmer que la différenciation dans le niché de régénération est l'explication principale du maintien de la richesse spécifique dans les communautés végétales, la relation de la présente thèse aux idées publiées sur l'origine de l'étalement phénologique, la pertinence de la présente thèse à la discussion sur la présence de continus dans la végétation, la coïncidence de la présente thèse et des idées émergentes des évolutionnistes sur la différenciation des taxons d'angiospermes, et l'importance des études de régénération pour la conservation.

@article{doi101111j1469185x1977tb01347x,
    author = "Grubb, P. J.",
    title = "THE MAINTENANCE OF SPECIES‐RICHNESS IN PLANT COMMUNITIES: THE IMPORTANCE OF THE REGENERATION NICHE",
    year = "1977",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "RÉSUMÉ Selon l'hypothèse de Gause, une conséquence du processus d'évolution par sélection naturelle est que dans une communauté à l'équilibre, chaque espèce doit occuper un niché différent. De nombreux botanistes ont trouvé cette idée improbable car ils ont ignoré les processus de régénération dans les communautés végétales. La plupart des communautés végétales sont plus longévives que les plantes individuelles qui les composent. Lorsqu'un individu meurt, il peut ou non être remplacé par un individu de la même espèce. C'est cette étape de remplacement qui est cruciale pour l'argumentation présentée. Plusieurs mécanismes ne impliquant pas la régénération contribuent également au maintien de la richesse spécifique : les différences de forme de vie couplées à l'incapacité des plantes plus grandes d'épuiser ou de couper toutes les ressources, le développement de relations de dépendance, les différences de phénologie couplées à la tolérance de la suppression, les fluctuations de l'environnement couplées à des différences relativement faibles dans la capacité compétitive entre de nombreuses espèces, la capacité de certaines paires d'espèces à former des mélanges stables en raison d'un équilibre entre la compétition intraspécifique et la compétition interspécifique, la production de substances plus toxiques pour l'espèce productrice que pour les autres espèces, les différences dans les minéraux nutritifs limitants primaires ou les tailles de pores dans le sol pour les plantes voisines de différentes espèces, et les différences dans les capacités compétitives des espèces dépendant de leur âge physiologique couplées à la structure d'âge inégale de nombreuses populations. Les mécanismes listés ci-dessus n'expliquent pas suffisamment la persistance indéfinie en mélange de nombreuses espèces dans les communautés les plus riches en espèces connues. En revanche, il semble y avoir presque des possibilités illimitées de différences entre les espèces dans leurs exigences de régénération, c'est-à-dire le remplacement des plantes individuelles d'une génération par celles de la suivante. Cette idée est illustrée pour les espèces d'arbres et il est souligné que les forestiers ont été les premiers, de loin, à apprécier son importance. Les processus impliqués dans l'invasion réussie d'un trou par une espèce végétale donnée et certains caractères du trou qui peuvent être importants sont résumés dans le Tableau 2. La définition du niché d'une plante nécessite la reconnaissance de quatre composantes : le niché d'habitat, le niché de forme de vie, le niché phénologique et le niché de régénération. Un bref compte rendu est donné des modèles de régénération dans différents types de communautés végétales pour fournir un contexte pour les études de différenciation dans le niché de régénération. Toutes les étapes du cycle de régénération sont potentiellement importantes et des exemples de différenciation entre espèces sont donnés pour chacune des étapes suivantes : Production de graines viables (y compris les sous-étapes de floraison, de pollinisation et de mise en graine), dispersion, dans l'espace et le temps, germination, établissement et développement ultérieur de la plante immature. Dans la discussion conclusive, l'accent est mis sur les thèmes suivants : les types de travaux nécessaires à l'avenir pour prouver ou infirmer que la différenciation dans le niché de régénération est l'explication principale du maintien de la richesse spécifique dans les communautés végétales, la relation de la thèse actuelle aux idées publiées sur l'origine de l'étalement phénologique, la pertinence de la thèse actuelle à la discussion sur la présence de continus dans la végétation, la coïncidence de la thèse actuelle et des idées émergentes des évolutionnistes sur la différenciation des taxons d'angiospermes, et l'importance des études de régénération pour la conservation.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    openalex = "W2119259345",
    references = "doi101038242344a0, doi101086282070, doi101086282687, doi101093biomet3812196, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1473655250, doi1015159780691206912, doi1023071218190, doi1023071929601, doi1023072256497, doi1023072258550, doi1023072989767, openalexw1532540194"
}

Résumé De nombreux noms de bactéries pathogènes des plantes ne seront pas inclus dans les Listes approuvées, 1980, si les listes ne contiennent que les noms d'espèces valides. Il est proposé que les pathogènes qui ne revendiquent pas le rang d'espèce soient classés comme pathovars. Tous les noms validement publiés de pathogènes végétaux pour lesquels des cultures authentiques existent sont listés ici comme espèces ou comme pathovars. Un guide pour l'utilisation du terme pathovar au niveau infrasubspécifique est suggéré. Les souches types désignées et les souches de référence sont listées, et des néotypes et de nouvelles souches de référence sont proposés là où aucun n'a été signalé ailleurs.

@article{doi10108000288233197810427397,
    author = "Young, J. M. et Dye, D. W. et Bradbury, J. F. et Panagopoulos, C. G. et Robbs, C. F.",
    title = "Une nomenclature et une classification proposées pour les bactéries pathogènes des plantes",
    year = "1978",
    journal = "New Zealand Journal of Agricultural Research",
    abstract = "Résumé De nombreux noms de bactéries pathogènes des plantes ne seront pas inclus dans les Listes approuvées, 1980, si les listes ne contiennent que les noms d'espèces valides. Il est proposé que les pathogènes qui ne revendiquent pas le rang d'espèce soient classés comme pathovars. Tous les noms validement publiés de pathogènes végétaux pour lesquels des cultures authentiques existent sont listés ici comme espèces ou comme pathovars. Un guide pour l'utilisation du terme pathovar au niveau infrasubspécifique est suggéré. Les souches types désignées et les souches de référence sont listées, et des néotypes et de nouvelles souches de référence sont proposés là où aucun n'a été signalé ailleurs.",
    url = "https://doi.org/10.1080/00288233.1978.10427397",
    doi = "10.1080/00288233.1978.10427397",
    openalex = "W2089338877",
    references = "openalexw2777527484"
}

La succession est un processus de colonisation continue et d'extinction sur un site par des populations d'espèces. Ce processus a longtemps été central dans la pensée écologique ; beaucoup de théorie et de nombreuses données sur la succession ont accumulé au fil des ans. Puisque presque toutes les espèces dans toutes les communautés participent aux interactions successionales, et parce que l'écologie physiologique englobe tout ce qu'une plante fait pendant son cycle de vie, une revue complète de l'écologie physiologique de toutes les espèces dans toutes les successions n'est pas possible. Ainsi, dans cette revue, je discute des adaptations physiologiques des espèces d'un gradient successional - du champ ouvert à la forêt décidue à larges feuilles. Je me concentre sur les adaptations physiologiques des plantes à succession précoce à la variabilité environnementale et j'assemble la littérature sur la physiologie des arbres pour faire des comparaisons avec les plantes à succession précoce. Ma discussion peut ne pas être applicable aux séries où il n'y a peu de différence de physionomie entre les plantes à succession précoce et tardive ou où la désignation des espèces comme à succession précoce ou tardive est injustifiée (par exemple, pour certains habitats désertiques et de toundra). Je discute de la nature des environnements successions, de la germination des graines, du développement des plantules et des plantes matures, de la croissance des plantes, de la photosynthèse, de l'utilisation de l'eau, et de l'écologie physiologique de la compétition et de l'interférence.

@article{doi101146annureves10110179002031,
    author = "Bazzaz, F. A.",
    title = "The Physiological Ecology of Plant Succession",
    year = "1979",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Succession is a process of continuous colonization of and extinction on a site by species populations. The process has long been central in ecological thinking; much theory and many data about succession have accumulated over the years. Since nearly all species in all communities participate in successional interactions, and because physiological ecology encompasses everything that a plant does during its life cycle, a complete review of physiological ecology of all species in all successions is not possible. Thus in this review I discuss the physiological adaptations of species of one successional gradient-from open field to broad-leaved deciduous forest. I concentrate on the physiological adaptations of early successional plants to environmental variability and collate the literature on tree physiology to make comparisons with early successional plants. My discussion may not be applicable to seres where there is little difference in physiognomy between early and late successional plants or where the designation of species as early or late successional is unjustified (e.g. for certain desert and tundra habitats). I discuss the nature of successional environments, seed germination, seedling and mature plant development, plant growth, photosynthesis, water use, and the physiological ecology of competition and interference.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.10.110179.002031",
    doi = "10.1146/annurev.es.10.110179.002031",
    openalex = "W2098654279"
}

STRATÉGIES DES PLANTES. Stratégies primaires dans la phase établie. Stratégies secondaires dans la phase établie. Stratégies régénératives. PROCÉDÉS DE VÉGÉTATION. Dominance. Succession. Coexistence. Références. Index.

@book{openalexw2169917233,
    author = "Grime, J. Philip",
    title = "Plant Strategies and Vegetation Processes",
    year = "1979",
    abstract = "STRATÉGIES DES PLANTES. Stratégies primaires dans la phase établie. Stratégies secondaires dans la phase établie. Stratégies régénératives. PROCÉDÉS DE VÉGÉTATION. Dominance. Succession. Coexistence. Références. Index.",
    openalex = "W2169917233"
}

Résumé La flore et la végétation de six moraines à noyau glaciaire du glacier Klutlan ont été analysées dans 65 parcelles à l'aide de techniques de phytosociologie européennes. L'âge de chaque parcelle a été estimé à partir des cernes de croissance annuels d'arbustes ou d'arbres présents dans les parcelles. Neuf types majeurs de végétation sont distingués : Crepis nana, Dryas drummondii, Hedysarum mackenzii, Hedysarum-Salix, Salix-Shepherdia canadensis, Picea-Salix, Picea-Arctostaphylos, Picea-Ledum, et Picea-Rhytidium. Ils contiennent des plantes âgées de 2–6, 9–23, 10–20, 24–30, 32–58, 58–80, 96–178, 177–240, et >163- >339 ans, respectivement. Six autres types de végétation sont décrits à partir de zones de chablis, de chenaux de drainage, de pentes de téphra volcanique, de rives de lacs, de tourbières et de lacs asséchés. Les types majeurs de végétation reflètent une succession végétale liée à l'âge et à la stabilité des moraines, avec le type Crepis nana comme végétation pionnière évoluant à travers les autres types de végétation jusqu'au type Picea-Rhytidium sur les moraines les plus anciennes. Les changements de diversité spécifique et de développement du sol, en particulier l'accumulation d'humus, parallèlent la succession végétale. Cette succession diffère des modèles de revegetation des paysages déglaçés en Alaska et en Colombie-Britannique aujourd'hui et au Minnesota à l'époque du Wisconsin tardif en raison de différences de climat, de migration végétale et d'écologie locale.

@article{doi1010160033589480900071,
    author = "Birks, H. J. B.",
    title = "The Present Flora and Vegetation of the Moraines of the Klutlan Glacier, Yukon Territory, Canada: A Study in Plant Succession",
    year = "1980",
    journal = "Quaternary Research",
    abstract = "Résumé La flore et la végétation de six moraines à noyau glaciaire du glacier Klutlan ont été analysées dans 65 parcelles à l'aide de techniques de phytosociologie européennes. L'âge de chaque parcelle a été estimé à partir des cernes de croissance annuels d'arbustes ou d'arbres présents dans les parcelles. Neuf types majeurs de végétation sont distingués : Crepis nana, Dryas drummondii, Hedysarum mackenzii, Hedysarum-Salix, Salix-Shepherdia canadensis, Picea-Salix, Picea-Arctostaphylos, Picea-Ledum, et Picea-Rhytidium. Ils contiennent des plantes âgées de 2–6, 9–23, 10–20, 24–30, 32–58, 58–80, 96–178, 177–240, et >163- >339 ans, respectivement. Six autres types de végétation sont décrits à partir de zones de chablis, de chenaux de drainage, de pentes de téphra volcanique, de rives de lacs, de tourbières et de lacs asséchés. Les types majeurs de végétation reflètent une succession végétale liée à l'âge et à la stabilité des moraines, avec le type Crepis nana comme végétation pionnière évoluant à travers les autres types de végétation jusqu'au type Picea-Rhytidium sur les moraines les plus anciennes. Les changements de diversité spécifique et de développement du sol, en particulier l'accumulation d'humus, parallèlent la succession végétale. Cette succession diffère des modèles de revegetation des paysages déglaçés en Alaska et en Colombie-Britannique aujourd'hui et au Minnesota à l'époque du Wisconsin tardif en raison de différences de climat, de migration végétale et d'écologie locale.",
    url = "https://doi.org/10.1016/0033-5894(80)90007-1",
    doi = "10.1016/0033-5894(80)90007-1",
    openalex = "W2140075036"
}

Résumé Ce papier conclut une série sur la végétation du parc national de Westland avec un aperçu du développement de la végétation sur de nouvelles surfaces. Une succession particulièrement longue, bien datée sur ses derniers 14 000 ans, a lieu sur des surfaces formées lors du retrait fluctuant des glaciers de basse altitude. Les surfaces ont été classées comme des pentes de gravier, des plaines alluviales, des blocs de roche lâches, du rocher solide, des cicatrices de glissement de terrain, et des pentes de talus. En général, elles montrent un développement depuis une végétation pionnière ouverte, à travers des landes arbustives et des forêts sérales jusqu'à la « forêt climax », et éventuellement, une détérioration vers une végétation de lande où les sols changent en podzols gleyiques avec des pans de fer imperméables. Sur les zones mal drainées, les successions mènent à des marais stériles. Les successions aux niveaux subalpin et alpin sont plus lentes et aucune dans le district n'est plus ancienne que la fin de la dernière grande glaciation. Par conséquent, elles n'atteignent pas un stade équivalent aux landes de basse altitude, sauf là où les anciens glaciers ont laissé un rocher érodé qui est encore presque nu de sol. Nothofagus menziesii a pénétré dans la partie sud-est du Parc, apparemment tard dans le temps post-glaciaire. Sa colonisation rapide de nouvelles surfaces contraste à la fois avec son invasion marginale très lente d'autres communautés forestières, et avec l'entrée retardée des conifères indigènes dans les successions primaires où le hêtre est absent.

@article{doi1010800028825x198010426921,
    author = "Wardle, P.",
    title = "Primary succession in Westland National Park and its vicinity, New Zealand",
    year = "1980",
    journal = "New Zealand Journal of Botany",
    abstract = "Résumé Ce papier conclut une série sur la végétation du parc national de Westland avec un aperçu du développement de la végétation sur de nouvelles surfaces. Une succession particulièrement longue, bien datée sur ses derniers 14 000 ans, a lieu sur des surfaces formées lors du retrait fluctuant des glaciers de basse altitude. Les surfaces ont été classées comme des pentes de gravier, des plaines alluviales, des blocs de roche lâches, du rocher solide, des cicatrices de glissement de terrain, et des pentes de talus. En général, elles montrent un développement depuis une végétation pionnière ouverte, à travers des landes arbustives et des forêts sérales jusqu'à la « forêt climax », et éventuellement, une détérioration vers une végétation de lande où les sols changent en podzols gleyiques avec des pans de fer imperméables. Sur les zones mal drainées, les successions mènent à des marais stériles. Les successions aux niveaux subalpin et alpin sont plus lentes et aucune dans le district n'est plus ancienne que la fin de la dernière grande glaciation. Par conséquent, elles n'atteignent pas un stade équivalent aux landes de basse altitude, sauf là où les anciens glaciers ont laissé un rocher érodé qui est encore presque nu de sol. Nothofagus menziesii a pénétré dans la partie sud-est du Parc, apparemment tard dans le temps post-glaciaire. Sa colonisation rapide de nouvelles surfaces contraste à la fois avec son invasion marginale très lente d'autres communautés forestières, et avec l'entrée retardée des conifères indigènes dans les successions primaires où le hêtre est absent.",
    url = "https://doi.org/10.1080/0028825x.1980.10426921",
    doi = "10.1080/0028825x.1980.10426921",
    openalex = "W2076587104"
}

Notre compréhension de la nutrition minérale des plantes provient en grande partie d'études sur les cultures herbacées qui ont évolué à partir d'espèces rudérales caractéristiques de sites perturbés riches en nutriments (52). Avec le développement de l'agriculture, ces espèces ancestrales ont été sélectionnées pour une plus grande productivité et un rendement reproductif plus élevé à des niveaux de nutriments élevés, où il y avait peu d'avantage sélectif à utiliser efficacement les nutriments. Cet article passe brièvement en revue la nature des réponses des cultures au stress nutritionnel et compare ces réponses à celles d'espèces qui ont évolué dans des conditions plus naturelles, en particulier dans des environnements à faible teneur en nutriments. Je m'appuie principalement sur des études nutritionnelles de l'azote et du phosphore, car ces éléments limitent le plus souvent la croissance des plantes et parce que leur rôle dans le contrôle de la croissance et du métabolisme des plantes est le mieux compris (51). D'autres aspects plus spécifiques de l'écologie nutritionnelle des plantes non abordés ici incluent la nutrition ammonium/nitrate (79), la nutrition calcicole/calcifuge (51,88), la tolérance aux métaux lourds (4), et l'écologie des serpentinites (133).

@article{doi101146annureves11110180001313,
    author = "Chapin, F. Stuart",
    title = "The Mineral Nutrition of Wild Plants",
    year = "1980",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Our understanding of plant mineral nutrition comes largely from studies of herbaceous crops that evolved from ruderal species characteristic of nutri­ ent-rich disturbed sites (52). With the development of agriculture, these ancestral species were bred for greater productivity and reproductive output at high nutrient levels where there was little selective advantage in efficient nutrient use. This paper briefly reviews the nature of crop responses to nutrient stress and compares these responses to those of species that have evolved under more natural conditions, particularly in low-nutrient envi­ ronments. I draw primarily upon nutritional studies of nitrogen and phos­ phorus because these elements most commonly limit plant growth and because their role in controlling plant growth and metabolism is most clearly understood (51). Other more specific aspects of nutritional plant ecology not discussed here include ammonium/nitrate nutrition (79), cal­ cicole/calcifuge nutrition (51,88), heavy metal tolerance (4), and serpentine ecology (133).",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.11.110180.001313",
    doi = "10.1146/annurev.es.11.110180.001313",
    openalex = "W2114773779",
    references = "doi101086283244, openalexw2169917233"
}

Résumé Cette revue examine la présence, l'analyse et les propriétés des glucosinolates et des composés dérivés dans les plantes et les produits destinés à la consommation humaine et animale. L'article, qui inclut des références publiées en 1981, vise également à compléter les revues existantes sur la chimie de ces produits naturels contenant du soufre. Une attention particulière est portée aux membres de la famille des Brassicacées en raison de leur importance en tant que légumes, condiments, oléagineux et aliments pour animaux. Comme une grande partie du travail considéré ici concerne les produits de décomposition des glucosinolates, les informations biochimiques concernant la nature, la présence et les propriétés de l'enzyme dégradant les glucosinolates, la myrosinase, sont examinées dans la section III. Les méthodes disponibles pour l'analyse chimique des glucosinolates et de leurs divers produits de dégradation sont discutées de manière critique. Les facteurs affectant la teneur en glucosinolates des plantes et des produits végétaux sont exposés dans la section VII. Une attention particulière est portée à l'effet du traitement sur la concentration et la nature des produits de dégradation ainsi que sur l'activité de la myrosinase. Le rôle des produits de dégradation des glucosinolates dans le développement des arômes est examiné dans la section VIII. Les effets plus généraux, tant bénéfiques qu'nuisibles, de ces composés dans les aliments sont discutés dans la section X. Comme de tels effets dans les aliments pour animaux ont fait l'objet de revues régulières, ceux-ci ne sont considérés ici que brièvement. Les contradictions dans la littérature sont soulignées, les domaines qui ont été insuffisamment explorés sont mis en évidence, et des suggestions sont faites pour la recherche future.

@article{doi10108010408398209527361,
    author = "Fenwick, G. Roger et Heaney, Robert K. et Mullin, W.J. et VanEtten, C. H.",
    title = "Glucosinolates et leurs produits de dégradation dans les aliments et les plantes alimentaires",
    year = "1983",
    journal = "C R C Critical Reviews in Food Science and Nutrition",
    abstract = "Résumé Cette revue examine la présence, l'analyse et les propriétés des glucosinolates et des composés dérivés dans les plantes et les produits destinés à la consommation humaine et animale. L'article, qui inclut des références publiées en 1981, vise également à compléter les revues existantes sur la chimie de ces produits naturels contenant du soufre. Une attention particulière est portée aux membres de la famille des Brassicacées en raison de leur importance en tant que légumes, condiments, oléagineux et aliments pour animaux. Comme une grande partie du travail considéré ici concerne les produits de décomposition des glucosinolates, les informations biochimiques concernant la nature, la présence et les propriétés de l'enzyme dégradant les glucosinolates, la myrosinase, sont examinées dans la section III. Les méthodes disponibles pour l'analyse chimique des glucosinolates et de leurs divers produits de dégradation sont discutées de manière critique. Les facteurs affectant la teneur en glucosinolates des plantes et des produits végétaux sont exposés dans la section VII. Une attention particulière est portée à l'effet du traitement sur la concentration et la nature des produits de dégradation ainsi que sur l'activité de la myrosinase. Le rôle des produits de dégradation des glucosinolates dans le développement des arômes est examiné dans la section VIII. Les effets plus généraux, tant bénéfiques qu'nuisibles, de ces composés dans les aliments sont discutés dans la section X. Comme de tels effets dans les aliments pour animaux ont fait l'objet de revues régulières, ceux-ci ne sont considérés ici que brièvement. Les contradictions dans la littérature sont soulignées, les domaines qui ont été insuffisamment explorés sont mis en évidence, et des suggestions sont faites pour la recherche future.",
    url = "https://doi.org/10.1080/10408398209527361",
    doi = "10.1080/10408398209527361",
    openalex = "W2041550216",
    references = "doi101126science1713973757"
}

Le degré d'herbivorie et l'efficacité de la défense varient considérablement entre les espèces végétales. La disponibilité des ressources dans l'environnement est proposée comme le déterminant majeur tant de la quantité que du type de défense des plantes. Lorsque les ressources sont limitées, les plantes à croissance intrinsèquement lente sont favorisées par rapport à celles à taux de croissance rapide ; ces taux lents favorisent à leur tour de grands investissements dans les défenses antiherbivores. La durée de vie des feuilles, également déterminée par la disponibilité des ressources, affecte les avantages relatifs des défenses ayant des taux de renouvellement différents. La limitation relative de différentes ressources contraint également les types de défenses. Les propositions sont comparées à d'autres théories sur l'évolution des défenses des plantes.

@article{doi101126science2304728895,
    author = "Coley, Phyllis D. et Bryant, John P. et Chapin, F. Stuart",
    title = "Disponibilité des ressources et défense antiherbivore des plantes",
    year = "1985",
    journal = "Science",
    abstract = "Le degré d'herbivorie et l'efficacité de la défense varient considérablement entre les espèces végétales. La disponibilité des ressources dans l'environnement est proposée comme le déterminant majeur tant de la quantité que du type de défense des plantes. Lorsque les ressources sont limitées, les plantes à croissance intrinsèquement lente sont favorisées par rapport à celles à taux de croissance rapide ; ces taux lents favorisent à leur tour de grands investissements dans les défenses antiherbivores. La durée de vie des feuilles, également déterminée par la disponibilité des ressources, affecte les avantages relatifs des défenses ayant des taux de renouvellement différents. La limitation relative de différentes ressources contraint également les types de défenses. Les propositions sont comparées à d'autres théories sur l'évolution des défenses des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.230.4728.895",
    doi = "10.1126/science.230.4728.895",
    openalex = "W2166390717",
    references = "doi10100797814684264651, doi101086283244, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science2114485887, doi101146annureven26010181001151, doi101146annureves11110180001003, doi101146annureves11110180001313, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023073544308, doi1023073817"
}

Écologie végétale quantitative et dynamique, Écologie végétale quantitative et dynamique, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023072260374,
    author = "Etherington, John et Kershaw, K. A. et Looney, John Henry H.",
    title = "Écologie végétale quantitative et dynamique.",
    year = "1986",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Écologie végétale quantitative et dynamique, Écologie végétale quantitative et dynamique, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/2260374",
    doi = "10.2307/2260374",
    openalex = "W1976291170"
}

John A. Matthews, Robert J. Whittaker, Succession végétale sur le foreland du glacier Storbreen, Jotunheimen, Norvège : une revue, Arctic and Alpine Research, Vol. 19, No. 4, Restoration and Vegetation Succession in Circumpolar Lands : Septième Conférence du Comité Arctique International (Nov., 1987), pp. 385-395

@article{doi1023071551403,
    author = "Matthews, John A. et Whittaker, Robert J.",
    title = "Succession végétale sur le foreland du glacier Storbreen, Jotunheimen, Norvège : une revue",
    year = "1987",
    journal = "Arctic and Alpine Research",
    abstract = "John A. Matthews, Robert J. Whittaker, Succession végétale sur le foreland du glacier Storbreen, Jotunheimen, Norvège : une revue, Arctic and Alpine Research, Vol. 19, No. 4, Restoration and Vegetation Succession in Circumpolar Lands : Septième Conférence du Comité Arctique International (Nov., 1987), pp. 385-395",
    url = "https://doi.org/10.2307/1551403",
    doi = "10.2307/1551403",
    openalex = "W2796580479"
}

Des allélochimiques appartenant à de nombreux groupes chimiques ont été isolés à partir de plus de 30 familles de plantes terrestres et aquatiques. Certains de ces composés ont également été isolés du sol en quantités suffisantes pour réduire la croissance des plantes. Bien que certains allélochimiques sélectionnés soient censés influencer les densités et les distributions des plantes, aucun isolé de plantes supérieures n'a été jugé suffisamment actif pour être développé en produit herbicide commercial. Presque tous les allélochimiques herbicides existent dans les plantes sous forme non toxique et conjuguée. La partie toxique peut être libérée lors de l'exposition à un stress ou à la mort du tissu. L'utilisation la plus réussie des allélochimiques dans le contrôle des mauvaises herbes a été la gestion des résidus de plantes sélectivement toxiques. Par exemple, les résidus de seigle ont contrôlé efficacement les mauvaises herbes dans divers systèmes de culture. Plusieurs espèces de mauvaises herbes peuvent interférer avec la croissance des cultures grâce aux substances chimiques libérées par leurs résidus. Un certain nombre d'espèces pérennes nuisibles semblent exploiter les allélochimiques dans leurs processus d'interférence. Cette revue se concentre sur les découvertes chimiques plus récentes et sur la manière dont elles pourraient être exploitées pour le contrôle des mauvaises herbes.

@article{doi101017s0890037x00032371,
    author = "Putnam, Alan R.",
    title = "Allélochimiques issus des plantes comme herbicides",
    year = "1988",
    journal = "Weed Technology",
    abstract = "Des allélochimiques appartenant à de nombreux groupes chimiques ont été isolés à partir de plus de 30 familles de plantes terrestres et aquatiques. Certains de ces composés ont également été isolés du sol en quantités suffisantes pour réduire la croissance des plantes. Bien que certains allélochimiques sélectionnés soient censés influencer les densités et les distributions des plantes, aucun isolé de plantes supérieures n'a été jugé suffisamment actif pour être développé en produit herbicide commercial. Presque tous les allélochimiques herbicides existent dans les plantes sous forme non toxique et conjuguée. La partie toxique peut être libérée lors de l'exposition à un stress ou à la mort du tissu. L'utilisation la plus réussie des allélochimiques dans le contrôle des mauvaises herbes a été la gestion des résidus de plantes sélectivement toxiques. Par exemple, les résidus de seigle ont contrôlé efficacement les mauvaises herbes dans divers systèmes de culture. Plusieurs espèces de mauvaises herbes peuvent interférer avec la croissance des cultures grâce aux substances chimiques libérées par leurs résidus. Un certain nombre d'espèces pérennes nuisibles semblent exploiter les allélochimiques dans leurs processus d'interférence. Cette revue se concentre sur les découvertes chimiques plus récentes et sur la manière dont elles pourraient être exploitées pour le contrôle des mauvaises herbes.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0890037x00032371",
    doi = "10.1017/s0890037x00032371",
    openalex = "W2791499975",
    references = "doi101007bf00982210, doi101007bf01020168, doi101016026121948390042x, doi101016s003194220081818x, doi101017s0043174500067035, doi101021bk19870330, doi101146annurevpp31060180002245, doi102134agronj196600021962005800030017x, doi1023072483566, openalexw1637981159, openalexw1937271242"
}

Même si les écologues ont longtemps considéré que la morphologie et l'histoire de vie étaient des déterminants importants de la distribution, de l'abondance et de la dynamique des plantes dans la nature, ce livre contient la première théorie à prédire explicitement à la fois l'évolution des traits des plantes et les effets de ces traits sur la structure et la dynamique des communautés végétales. David Tilman se concentre sur la nécessité universelle des plantes terrestres en ce qui concerne les ressources souterraines et aériennes. La séparation physique de ces ressources signifie que les plantes font face à un compromis inévitable. Pour obtenir une proportion plus élevée d'une ressource, une plante doit allouer plus de sa croissance aux structures impliquées dans son acquisition, et obtient ainsi nécessairement une proportion plus faible d'une autre ressource. Le professeur Tilman présente une théorie simple qui inclut cette contrainte et ce compromis, et utilise cette théorie pour explorer l'évolution des histoires de vie et des morphologies des plantes le long des gradients de productivité et de perturbation. Le livre montre que le taux de croissance relatif, qui est prédit être fortement influencé par l'allocation proportionnelle d'une plante aux feuilles, est un déterminant majeur de la dynamique transitoire de la compétition. Ces dynamiques peuvent expliquer les différences entre les successions sur des sols pauvres par rapport à des sols riches et suggèrent que la plupart des expériences de terrain réalisées à ce jour ont été d'une durée trop courte pour permettre une interprétation non ambiguë de leurs résultats.

@article{doi105860choice260924,
    title = "Plant strategies and the dynamics and structure of plant communities",
    year = "1988",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Although ecologists have long considered morphology and life history to be important determinants of the distribution, abundance, and dynamics of plants in nature, this book contains the first theory to predict explicitly both the evolution of plant traits and the effects of these traits on plant community structure and dynamics. David Tilman focuses on the universal requirement of terrestrial plants for both below-ground and above-ground resources. The physical separation of these resources means that plants face an unavoidable tradeoff. To obtain a higher proportion of one resource, a plant must allocate more of its growth to the structures involved in its acquisition, and thus necessarily obtain a lower proportion of another resource. Professor Tilman presents a simple theory that includes this constraint and tradeoff, and uses the theory to explore the evolution of plant life histories and morphologies along productivity and disturbance gradients. The book shows that relative growth rate, which is predicted to be strongly influenced by a plant's proportional allocation to leaves, is a major determinant of the transient dynamics of competition. These dynamics may explain the differences between successions on poor versus rich soils and suggest that most field experiments performed to date have been of too short a duration to allow unambiguous interpretation of their results.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.26-0924",
    doi = "10.5860/choice.26-0924",
    openalex = "W1488595547"
}

Les résultats suggèrent que la concentration de phosphate présente au site d'infection a influencé le degré de protection par le phosphite observé chez les plantes traitées. Chez les trois combinaisons champignon-plante examinées, les concentrations de phosphite ont été suffisantes pour réduire la croissance fongique par action directe. Cependant, les défenses de la plante seraient importantes pour arrêter complètement l'invasion du pathogène.

@article{doi101094phyto79921,
    author = "Smillie, R.H.",
    title = "The Mode of Action of Phosphite: Evidence for Both Direct and Indirect Modes of Action on Three Phytophthora spp. in Plants",
    year = "1989",
    journal = "Phytopathology",
    abstract = "Les résultats suggèrent que la concentration de phosphate présente au site d'infection a influencé le degré de protection par le phosphite observé chez les plantes traitées. Chez les trois combinaisons champignon-plante examinées, les concentrations de phosphite ont été suffisantes pour réduire la croissance fongique par action directe. Cependant, les défenses de la plante seraient importantes pour arrêter complètement l'invasion du pathogène.",
    url = "https://doi.org/10.1094/phyto-79-921",
    doi = "10.1094/phyto-79-921",
    openalex = "W1965058750"
}

Myrica faya, un fixateur d'azote actinorhizal introduit, envahit des sites volcaniques jeunes dans le parc national des volcans d'Hawaï. Nous avons examiné la biologie des populations de l'espèce envahissante et les conséquences au niveau de l'écosystème de son invasion dans des forêts à canopée ouverte résultant de chutes de cendres volcaniques. Bien que Myrica faya soit nominellement dioïque, les mâles et les femelles produisent de grandes quantités de fruits utilisés par de nombreux oiseaux exotiques et indigènes, en particulier l'exotique Zosterops japonica. Dans les zones de colonisation active, la pluie de graines de Myrica sous les arbres perchoirs de l'espèce indigène dominante Metrosideros polymorpha variait de 6 à 60 graines · m — 2 · yr — 1 ; aucune graine n'a été capturée en plein air. Les graines plantées de Myrica ont également germé et s'établi mieux sous des individus isolés de Metrosideros qu'en plein air. La croissance en diamètre de Myrica est >15—fois supérieure à celle de Metrosideros, et la population de Myrica augmente rapidement. Les taux de fixation d'azote ont été mesurés à l'aide du test de réduction de l'acétylène étalonné avec 1 5 N. Les nodosités de Myrica réduisaient l'acétylène entre 5 et 20 µmol · g — 1 · h — 1, un taux qui extrapolé à une fixation d'azote de 18 kg · ha — 1 · yr — 1 dans un site densément colonisé. Par comparaison, toutes les sources indigènes de fixation d'azote additionnées atteignaient 0,2 kg · ha — 1 · yr — 1, et les précipitations ajoutaient <4 kg · ha — 1 · yr — 1. Les mesures de la décomposition de la litière et de la libération d'azote, de la minéralisation de l'azote du sol et de la croissance végétale dans les bioessais ont toutes démontré que l'azote fixé par Myrica devient disponible pour d'autres organismes également. Nous avons conclu que l'invasion biologique par Myrica faya modifie les propriétés au niveau de l'écosystème dans cette zone volcanique jeune ; au moins dans ce cas, la démographie et la physiologie d'une espèce contrôlent les caractéristiques d'un écosystème entier.

@article{doi1023071942601,
    author = "Vitousek, Peter M. and Walker, Lawrence R.",
    title = "Biological Invasion by Myrica Faya in Hawai'i: Plant Demography, Nitrogen Fixation, Ecosystem Effects",
    year = "1989",
    journal = "Ecological Monographs",
    abstract = "Myrica faya, an introduced actinorhizal nitrogen fixer, is invading young volcanic sites in Hawaii Volcanoes National Park. We examined the population biology of the invader and ecosystem—level consequences of its invasion in open—canopied forests resulting from volcanic cinder—fall. Although Myrica faya is nominally dioecious, both males and females produce large amounts of fruit that are utilized by a number of exotic and native birds, particularly the exotic Zosterops japonica. In areas of active colonization, Myrica seed rain under perch trees of the dominant native Metrosideros polymorpha ranged from 6 to 60 seeds · m — 2 · yr — 1; no seeds were captured in the open. Planted seeds of Myrica also germinated and established better under isolated individuals of Metrosideros than in the open. Diameter growth of Myrica is >15—fold greater than that of Metrosideros, and the Myrica population is increasing rapidly. Rates of nitrogen fixation were measured using the acetylene reduction assay calibrated with 1 5 N. Myrica nodules reduced acetylene at between 5 and 20 µmol · g — 1 · h — 1, a rate that extrapolated to nitrogen fixation of 18 kg · ha — 1 · yr — 1 in a densely colonized site. By comparison, all native sources of nitrogen fixation summed to 0.2 kg · ha — 1 · yr — 1, and precipitation added <4 kg · ha — 1 · yr — 1. Measurements of litter decomposition and nitrogen release, soil nitrogen mineralization, and plant growth in bioassays all demonstrated that nitrogen fixed by Myrica becomes available to other organisms as well. We concluded that biological invasion by Myrica faya alters ecosystem—level properties in this young volcanic area; at least in this case, the demography and physiology of one species controls characteristics of a whole ecosystem.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1942601",
    doi = "10.2307/1942601",
    openalex = "W2144450527",
    references = "doi1023074785, mountainspring1985interspecific"
}

(1990). Caractérisation des canopées végétales par photographies hémisphériques. Remote Sensing Reviews : Vol. 5, Instrumentation pour l'étude des canopées végétales pour la télédétection dans les régions infrarouge optique et thermique, pp. 13-29.

@article{doi10108002757259009532119,
    author = "Rich, Paul M.",
    title = "Caractérisation des canopées végétales par photographies hémisphériques",
    year = "1990",
    journal = "Remote Sensing Reviews",
    abstract = "(1990). Caractérisation des canopées végétales par photographies hémisphériques. Remote Sensing Reviews : Vol. 5, Instrumentation pour l'étude des canopées végétales pour la télédétection dans les régions infrarouge optique et thermique, pp. 13-29.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02757259009532119",
    doi = "10.1080/02757259009532119",
    openalex = "W2017208387",
    references = "doi101038114085a0"
}

@article{doi101007bf02858763,
    author = "Facelli, José M. et Pickett, Steward T. A.",
    title = "Plant litter: Its dynamics and effects on plant community structure",
    year = "1991",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02858763",
    doi = "10.1007/bf02858763",
    openalex = "W2028836169",
    references = "doi101016s006525040860121x, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science1643877262, doi101126science2304728895, doi1023071932179, doi1023072258550, doi1023072402622, doi1023072483566, openalexw2077454220, openalexw2169917233"
}

@article{doi101007bf02858600,
    author = "Kozlowski, T. T.",
    title = "Sources et puits de glucides chez les plantes ligneuses",
    year = "1992",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02858600",
    doi = "10.1007/bf02858600",
    openalex = "W2089469242",
    references = "doi101007bf02862630, doi101016b9780124250505x50018, doi101086282907, doi1023072403413, doi1023072424020"
}

Les contraintes physiologiques et écologiques jouent un rôle clé dans l'évolution des modèles de croissance des plantes, en particulier par rapport aux défenses contre les herbivores. Les théories phénotypiques et de l'histoire de vie sont unifiées dans le cadre de l'équilibre croissance-différenciation (GDB), formant un système intégré de théories expliquant et prédisant les modèles de défense des plantes et les interactions compétitives dans le temps écologique et évolutif. L'activité végétale au niveau cellulaire peut être classée comme croissance (division et élargissement des cellules) ou différenciation (changements chimiques et morphologiques menant à la maturation et à la spécialisation des cellules). L'hypothèse GDB de la défense végétale repose sur un compromis physiologique entre les processus de croissance et de différenciation. Le compromis entre croissance et défense existe parce que le métabolisme secondaire et le renforcement structurel sont physiologiquement contraints dans les cellules en division et en élargissement, et parce qu'ils détournent les ressources de la production de nouvelle surface foliaire. D'où le dilemme des plantes : elles doivent grandir assez vite pour compléter, tout en maintenant les défenses nécessaires pour survivre en présence de pathogènes et d'herbivores. Le compromis physiologique entre croissance et processus de différenciation interagit avec l'herbivorie et la compétition plante-plante pour se manifester comme un compromis génétique entre croissance et défense dans l'évolution des stratégies d'histoire de vie des plantes. Les théories évolutives de la défense végétale sont examinées. Nous étendons également un modèle standard de taux de croissance en séparant ses composantes écologiques et évolutives, et en formalisant le rôle de la compétition dans l'évolution de la défense végétale. Nous concluons avec un modèle conceptuel de l'évolution de la défense végétale dans lequel les compromis physiologiques des plantes interagissent avec l'environnement abiotique, la compétition et l'herbivorie.

@article{doi101086417659,
    author = "Herms, Daniel A. and Mattson, William J.",
    title = "The Dilemma of Plants: To Grow or Defend",
    year = "1992",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Physiological and ecological constraints play key roles in the evolution of plant growth patterns, especially in relation to defenses against herbivores. Phenotypic and life history theories are unified within the growth-differentiation balance (GDB) framework, forming an integrated system of theories explaining and predicting patterns of plant defense and competitive interactions in ecological and evolutionary time. Plant activity at the cellular level can be classified as growth (cell division and enlargement) of differentiation (chemical and morphological changes leading to cell maturation and specialization). The GDB hypothesis of plant defense is premised upon a physiological trade-off between growth and differentiation processes. The trade-off between growth and defense exists because secondary metabolism and structural reinforcement are physiologically constrained in dividing and enlarging cells, and because they divert resources from the production of new leaf area. Hence the dilemma of plants: They must grow fast enough to complete, yet maintain the defenses necessary to survive in the presence of pathogens and hervivores. The physiological trade-off between growth and differentiation processes interacts with herbivory and plant-plant competition to manifest itself as a genetic trade-off between growth and defense in the evolution of plant life history strategies. Evolutionary theories of plant defense are reviewed. We also extend a standard growth rate model by separating its ecological and evolutionary components,and formalizing the role of competition in the evolution of plant defense. We conclude with a conceptual model of the evolution of plant defense in which plant physioligical trade-offs interact with the abiotic environment, competition and herbivory.",
    url = "https://doi.org/10.1086/417659",
    doi = "10.1086/417659",
    openalex = "W1990151103",
    references = "doi101007bf02860717, doi101086283244, doi101086284531, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461985tb00391x, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science188418319, doi101126science2304728895, doi101146annureves19110188000551, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023072389364, openalexw2169917233"
}

@article{doi101007bf02856599,
    author = "Gopal, Brij et Goel, Usha",
    title = "Compétition et allélopathie dans les communautés de plantes aquatiques",
    year = "1993",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02856599",
    doi = "10.1007/bf02856599",
    openalex = "W2066152331",
    references = "doi101007bf00008684, doi101016s0065211308606331, doi101017s0890037x00032371, doi101086282146, doi101111j136524271990tb00293x, doi1023072402622, doi1023072485224, doi1023072807146, doi105962bhltitle56234, openalexw1498087204, openalexw2077454220, openalexw2169917233"
}

Dans la succession primaire suivant la déglaciation à Glacier Bay, en Alaska, nous avons testé l'hypothèse selon laquelle l'effet majeur des colonisateurs initiaux fixant l'azote est de faciliter l'établissement des dominants tardifs de la succession et que d'autres causes possibles de changement successional (par exemple, les facteurs d'histoire de vie régissant la pluie de graines et les interactions compétitives entre espèces) n'ont pas besoin d'être invoqués. L'environnement a changé de manière spectaculaire au cours des 200 premières années de succession. La matière organique du sol a augmenté de 10 fois dans le sol minéral supérieur, avec des augmentations correspondantes de l'humidité du sol, de l'azote total (N) et de la capacité à soutenir la croissance des plantes, ainsi que des baisses de la densité apparente, du pH et du phosphore total (P). La croissance des plantes dans les sols pionniers tendait à être simultanément limitée par le N et le P, ainsi que par des facteurs inconnus (peut-être le manque de mycorhizes), tandis que seul le P limitait la croissance dans les sols plus âgés. La disponibilité de la lumière pour les semis a diminué au cours de la succession. Les espèces de succession précoce (Epilobium latifolium, Dryas drummondii) avaient des graines plus petites, un âge plus jeune à la première reproduction, une durée de vie plus courte et une hauteur plus courte à maturité que les espèces de succession intermédiaire (aulne, Alnus sinuata) et tardive (sapin de Sitka, Picea sitchensis). La pluie de graines d'aulne et de sapin était négligeable au stade pionnier, a augmenté avant le stade dans lequel une espèce était dominante et était la plus grande au stade dans lequel une espèce dominait. La végétation de chaque stade successional a inhibé la germination et l'établissement initial des graines d'aulne et de sapin semées (sauf une tendance de la communauté algale/microbienne de la "croûte noire" au stade pionnier à améliorer la survie). Le retrait de la couche de litière de surface a généralement favorisé la germination et la survie, en particulier de l'aulne. Les comparaisons de la germination en serre et sur le terrain ont indiqué que les effets climatiques ou indirects de la végétation (par exemple, prédation différentielle des graines) et l'allelopathie ont également réduit la germination et l'établissement dans les communautés végétalisées. Les semis de sapin naturellement apparus ont poussé le plus rapidement dans les stades Dryas et aulne et le plus lentement dans le stade sapin. De même, la croissance des semis de sapin transplantés dans chaque stade successional a été facilitée par les stades Dryas (non significativement) et aulne mais inhibée par le stade sapin, par rapport aux stades successions plus précoces. La facilitation de la croissance des semis de sapin naturels et transplantés par les stades Dryas et aulne était associée à une absorption plus élevée de N et P et des concentrations de nutriments dans les tissus, tandis que l'absorption et la concentration de nutriments dans les semis de sapin diminuaient dans le stade sapin. En revanche, les semis d'aulne transplantés ont poussé rapidement et accumulé la plupart des nutriments au stade pionnier et ont été fortement inhibés par les stades ultérieurs. L'effet facilitateur de Dryas et d'aulne provient principalement des apports de matière organique et du N associé. L'ajout de litière d'aulne a stimulé l'absorption de nutriments et la croissance des semis de sapin transplantés aux stades pionnier et Dryas, tandis que l'ombrage n'a eu aucun effet sur la croissance des semis de sapin. Le creusement de tranchées racinaires et la plantation de sapin près d'aulnes isolés ont indiqué que, bien que l'effet net de l'aulne soit facilitateur, l'aulne inhibe également la croissance des semis de sapin par compétition pour les ressources du sol. Une forte compétition racinaire se produit également dans le stade sapin. L'aulne inhibe compétitivement Dryas, principalement par ombrage mais aussi par les effets physiques et allelopathiques de sa litière. En général, tant à Glacier Bay qu'ailleurs, les traits d'histoire de vie déterminent le schéma de succession. Les changements d'équilibre compétitif accompagnant les changements successionnels de l'environnement fournissent le mécanisme pour les changements de dominance des espèces. Les conditions initiales du site (et la facilitation, lorsqu'elle est présente) influencent le taux de changement et l'état final de la composition et de la productivité de la communauté. Nous concluons qu'aucun facteur unique ou mécanisme ne rend pleinement compte de la succession primaire à Glacier Bay.

@article{doi1023072937039,
    author = "Chapin, F. Stuart and Walker, Lawrence R. and Fastie, Christopher L. and Sharman, Lewis C.",
    title = "Mécanismes de la succession primaire suivant la déglaciation à Glacier Bay, en Alaska",
    year = "1994",
    journal = "Ecological Monographs",
    abstract = {Dans la succession primaire suivant la déglaciation à Glacier Bay, en Alaska, nous avons testé l'hypothèse selon laquelle l'effet majeur des colonisateurs initiaux fixant l'azote est de faciliter l'établissement des dominants tardifs de la succession et que d'autres causes possibles des changements successoraux (par exemple, les facteurs d'histoire de vie régissant la pluie de graines et les interactions compétitives entre espèces) n'ont pas besoin d'être invoqués. L'environnement a changé de manière spectaculaire au cours des 200 premières années de succession. La matière organique du sol a augmenté de 10 fois dans le sol minéral supérieur, avec des augmentations correspondantes de l'humidité du sol, de l'azote total (N) et de la capacité à soutenir la croissance des plantes, ainsi que des baisses de la densité apparente, du pH et du phosphore total (P). La croissance des plantes dans les sols pionniers tendait à être simultanément limitée par le N et le P, ainsi que par des facteurs inconnus (peut-être le manque de mycorhizes), tandis que seul le P limitait la croissance dans les sols plus âgés. La disponibilité de la lumière pour les semis a diminué au cours de la succession. Les espèces à succession précoce (Epilobium latifolium, Dryas drummondii) avaient des graines plus petites, un âge plus jeune à la première reproduction, une durée de vie plus courte et une hauteur plus courte à maturité que les espèces à succession intermédiaire (aulne, Alnus sinuata) et tardive (sapin de Sitka, Picea sitchensis). La pluie de graines d'aulne et de sapin était négligeable au stade pionnier, augmentait avant le stade dans lequel une espèce était dominante et était la plus grande au stade dans lequel une espèce dominait. La végétation de chaque stade successional inhibait la germination et l'établissement initial des graines d'aulne et de sapin semées (sauf une tendance de la communauté algale/microbienne de la "croûte noire" au stade pionnier à améliorer la survie). Le retrait de la couche de litière de surface a généralement amélioré la germination et la survie, en particulier de l'aulne. Les comparaisons de la germination en serre et sur le terrain ont indiqué que les effets climatiques ou indirects de la végétation (par exemple, la prédation différentielle des graines) et l'allopathie ont également réduit la germination et l'établissement dans les communautés végétalisées. Les semis de sapin naturellement apparus ont poussé le plus rapidement aux stades Dryas et aulne et le plus lentement au stade sapin. De même, la croissance des semis de sapin transplantés dans chaque stade successional était facilitée par les stades Dryas (non significativement) et aulne mais inhibée par le stade sapin, par rapport aux stades successions plus précoces. La facilitation de la croissance des semis de sapin naturels et transplantés par les stades Dryas et aulne était associée à une plus grande absorption de N et P et des concentrations de nutriments dans les tissus, tandis que l'absorption et la concentration de nutriments dans les semis de sapin diminuaient au stade sapin. En revanche, les semis d'aulne transplantés ont poussé rapidement et accumulé la plupart des nutriments au stade pionnier et ont été fortement inhibés par les stades ultérieurs. L'effet facilitateur de Dryas et d'aulne provient principalement des apports de matière organique et du N associé. L'ajout de litière d'aulne a stimulé l'absorption de nutriments et la croissance des semis de sapin transplantés aux stades pionnier et Dryas, tandis que l'ombrage n'a eu aucun effet sur la croissance des semis de sapin. Le creusement de tranchées racinaires et la plantation de sapin près d'aulnes isolés ont indiqué que, bien que l'effet net de l'aulne soit facilitateur, l'aulne inhibe également la croissance des semis de sapin par la compétition pour les ressources du sol. Une forte compétition racinaire se produit également au stade sapin. L'aulne inhibe compétitivement Dryas, principalement par l'ombrage mais aussi par les effets physiques et allopathiques de sa litière. En général, tant à Glacier Bay qu'ailleurs, les traits d'histoire de vie déterminent le schéma de succession. Les changements d'équilibre compétitif accompagnant les changements successoraux de l'environnement fournissent le mécanisme des changements de dominance des espèces. Les conditions initiales du site (et la facilitation, lorsqu'elle est présente) influencent le taux de changement et l'état final de la composition et de la productivité de la communauté. Nous concluons qu'aucun facteur unique ou mécanisme ne rend pleinement compte de la succession primaire à Glacier Bay.},
    url = "https://doi.org/10.2307/2937039",
    doi = "10.2307/2937039",
    openalex = "W2068028745",
    references = "doi101007bf00002772, doi1010160016706176900665, doi101086283241, doi101126science1643877262, doi101146annureves10110179002031, doi1023071942484, doi1023071942661, doi1023071943075, doi1023072258728, doi1023074549, doi105962bhltitle56234"
}

@article{doi101007bf02912621,
    author = "Callaway, Ragan M.",
    title = "Positive interactions among plants",
    year = "1995",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02912621",
    doi = "10.1007/bf02912621",
    openalex = "W1975867518",
    references = "doi1010160169534794900884, doi101016s006525040860121x, doi101086283241, doi101086284133, doi101086284165, doi101086285357, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi1023071942161, doi1023072256497, doi1023072479933, doi1023072937039, doi105962bhltitle56234"
}

@article{doi101007bf02857921,
    author = "Inderjit, Inderjit",
    title = "Plant phenolics in allelopathy",
    year = "1996",
    journal = "The Botanical Review",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02857921",
    doi = "10.1007/bf02857921",
    openalex = "W1985715974",
    references = "doi101007bf00332847, doi101007bf00997160, doi1023072424020"
}

▪ Résumé Dans cette revue, nous discutons des conséquences écologiques et évolutives des interactions plantes-herbivores dans les forêts tropicales. Nous notons d'abord que les taux d'herbivorie sont plus élevés dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées et que, contrairement aux feuilles des forêts tempérées, la plupart des dommages subis par les feuilles tropicales surviennent lorsqu'elles sont jeunes et en expansion. Les feuilles des forêts tropicales sèches subissent également des taux de dommages plus élevés que dans les forêts humides, et les dommages sont plus importants dans le sous-bois que dans le couvert forestier. Les herbivores insectes, qui ont généralement une gamme d'hôtes étroite dans les tropiques, causent la plupart des dommages aux feuilles et ont sélectionné une grande variété de défenses chimiques, développementales et phénologiques chez les plantes. Les pathogènes sont moins étudiés mais causent des dommages considérables et, avec les herbivores insectes, peuvent contribuer au maintien de la diversité des arbres. Les mammifères folivores causent moins de dommages que les insectes ou les pathogènes mais ont évolué pour faire face aux hauts niveaux de défenses des plantes. Les feuilles des forêts tropicales sont défendues par une faible qualité nutritionnelle, une plus grande dureté et une grande variété de métabolites secondaires, dont beaucoup sont plus courants dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées. Les tanins, la dureté et la faible qualité nutritionnelle allongent les temps de développement des insectes, les rendant plus vulnérables aux prédateurs et aux parasitoïdes. La présence généralisée de ces défenses suggère que les ennemis naturels sont des participants clés dans les défenses des plantes et ont peut-être influencé l'évolution de ces traits. Pour échapper aux dommages, les feuilles peuvent s'étendre rapidement, être déployées simultanément ou être produites pendant la saison sèche lorsque les herbivores sont rares. Une stratégie pratiquement limitée aux forêts tropicales est pour les plantes de déployer des feuilles mais de retarder leur « verdissage » jusqu'à ce que les feuilles soient matures. Beaucoup de ces traits défensifs sont corrélés au sein des espèces, en raison de contraintes physiologiques et de compromis. En général, les espèces tolérantes à l'ombre investissent plus dans les défenses que celles nécessitant des clairières, et les espèces à feuilles longévives sont mieux défendues que celles à feuilles de courte durée de vie.

@article{doi101146annurevecolsys271305,
    author = "Coley, Phyllis D. and Barone, John A.",
    title = "HERBIVORY AND PLANT DEFENSES IN TROPICAL FORESTS",
    year = "1996",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Résumé Dans cette revue, nous discutons des conséquences écologiques et évolutives des interactions plantes-herbivores dans les forêts tropicales. Nous notons d'abord que les taux d'herbivorie sont plus élevés dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées et que, contrairement aux feuilles des forêts tempérées, la plupart des dommages subis par les feuilles tropicales surviennent lorsqu'elles sont jeunes et en expansion. Les feuilles des forêts tropicales sèches subissent également des taux de dommages plus élevés que dans les forêts humides, et les dommages sont plus importants dans le sous-bois que dans le couvert forestier. Les herbivores insectes, qui ont généralement une gamme d'hôtes étroite dans les tropiques, causent la plupart des dommages aux feuilles et ont sélectionné une grande variété de défenses chimiques, développementales et phénologiques chez les plantes. Les pathogènes sont moins étudiés mais causent des dommages considérables et, avec les herbivores insectes, peuvent contribuer au maintien de la diversité des arbres. Les mammifères folivores causent moins de dommages que les insectes ou les pathogènes mais ont évolué pour faire face aux hauts niveaux de défenses des plantes. Les feuilles des forêts tropicales sont défendues par une faible qualité nutritionnelle, une plus grande dureté et une grande variété de métabolites secondaires, dont beaucoup sont plus courants dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées. Les tanins, la dureté et la faible qualité nutritionnelle allongent les temps de développement des insectes, les rendant plus vulnérables aux prédateurs et aux parasitoïdes. La présence généralisée de ces défenses suggère que les ennemis naturels sont des participants clés dans les défenses des plantes et ont peut-être influencé l'évolution de ces traits. Pour échapper aux dommages, les feuilles peuvent s'étendre rapidement, être déployées simultanément ou être produites pendant la saison sèche lorsque les herbivores sont rares. Une stratégie pratiquement limitée aux forêts tropicales est pour les plantes de déployer des feuilles mais de retarder leur « verdissage » jusqu'à ce que les feuilles soient matures. Beaucoup de ces traits défensifs sont corrélés au sein des espèces, en raison de contraintes physiologiques et de compromis. En général, les espèces tolérantes à l'ombre investissent plus dans les défenses que celles nécessitant des clairières, et les espèces à feuilles longévives sont mieux défendues que celles à feuilles de courte durée de vie.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.27.1.305",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.27.1.305",
    openalex = "W2150998549",
    references = "doi101001jama196203050110085031, doi101086284369, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science2304728895, doi1023071942495, doi1023072406212, ehrlich1964butterflies, openalexw2097385721"
}

Malgré des différences frappantes dans le climat, les sols et l'histoire évolutive parmi des biomes divers allant des forêts tropicales et tempérées à la toundra alpine et aux déserts, nous avons trouvé des relations interspécifiques similaires entre la structure et la fonction des feuilles et la croissance des plantes dans tous les biomes. Nos résultats démontrent ainsi une évolution convergente et une généralité globale dans le fonctionnement des plantes, malgré la diversité énorme des espèces végétales et des biomes. Pour 280 espèces végétales issues de deux ensembles de données mondiaux, nous avons trouvé que le gain potentiel de carbone (photosynthèse) et la perte de carbone (respiration) augmentent dans une proportion similaire avec la diminution de la durée de vie des feuilles, l'augmentation de la concentration en azote des feuilles et l'augmentation du rapport surface-masse des feuilles. La productivité des plantes individuelles et des feuilles dans les canopées végétales change également dans une proportion constante par rapport à la durée de vie des feuilles et au rapport surface-masse des feuilles. Ces relations fonctionnelles végétales globales ont des implications significatives pour la modélisation à l'échelle globale de l'échange CO2 végétation-atmosphère.

@article{doi101073pnas942513730,
    author = "Reich, Peter B. et Walters, Michael B. et Ellsworth, David S.",
    title = "Des tropiques à la toundra : convergence globale dans le fonctionnement des plantes",
    year = "1997",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Malgré des différences frappantes dans le climat, les sols et l'histoire évolutive parmi des biomes divers allant des forêts tropicales et tempérées à la toundra alpine et aux déserts, nous avons trouvé des relations interspécifiques similaires entre la structure et la fonction des feuilles et la croissance des plantes dans tous les biomes. Nos résultats démontrent ainsi une évolution convergente et une généralité globale dans le fonctionnement des plantes, malgré la diversité énorme des espèces végétales et des biomes. Pour 280 espèces végétales issues de deux ensembles de données mondiaux, nous avons trouvé que le gain potentiel de carbone (photosynthèse) et la perte de carbone (respiration) augmentent dans une proportion similaire avec la diminution de la durée de vie des feuilles, l'augmentation de la concentration en azote des feuilles et l'augmentation du rapport surface-masse des feuilles. La productivité des plantes individuelles et des feuilles dans les canopées végétales change également dans une proportion constante par rapport à la durée de vie des feuilles et au rapport surface-masse des feuilles. Ces relations fonctionnelles végétales globales ont des implications significatives pour la modélisation à l'échelle globale de l'échange CO2 végétation-atmosphère.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.94.25.13730",
    doi = "10.1073/pnas.94.25.13730",
    openalex = "W2031418293",
    references = "doi101017cbo9780511608551, doi101126science2304728895"
}

Les effets relatifs de la richesse des plantes (le nombre de groupes fonctionnels de plantes) et de leur composition (l'identité des groupes fonctionnels de plantes) sur la productivité primaire et les réserves d'azote du sol ont été testés expérimentalement. Les différences de composition des plantes expliquent plus de la variation de la production et de la dynamique de l'azote que le nombre de groupes fonctionnels présents. Ainsi, il est possible d'identifier et de différencier les mécanismes potentiels sous-jacents aux modèles de réponse des écosystèmes à la variation de la diversité des plantes, avec des implications pour la gestion des ressources.

@article{doi101126science27753301302,
    author = "Hooper, David U. et Vitousek, Peter M.",
    title = "Les effets de la composition et de la diversité des plantes sur les processus écosystémiques",
    year = "1997",
    journal = "Science",
    abstract = "Les effets relatifs de la richesse des plantes (le nombre de groupes fonctionnels de plantes) et de leur composition (l'identité des groupes fonctionnels de plantes) sur la productivité primaire et les réserves d'azote du sol ont été testés expérimentalement. Les différences de composition des plantes expliquent plus de la variation de la production et de la dynamique de l'azote que le nombre de groupes fonctionnels présents. Ainsi, il est possible d'identifier et de différencier les mécanismes potentiels sous-jacents aux modèles de réponse des écosystèmes à la variation de la diversité des plantes, avec des implications pour la gestion des ressources.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.277.5330.1302",
    doi = "10.1126/science.277.5330.1302",
    openalex = "W2051624184",
    references = "doi1023072937039"
}

La compétition souterraine se produit lorsque les plantes réduisent la croissance, la survie ou la fécondité de leurs voisins en diminuant les ressources du sol disponibles. La compétition souterraine peut être plus intense et impliquer beaucoup plus de voisins que la compétition aérienne. Les écophysiologistes et les écologistes des populations ou des communautés ont traditionnellement étudié la compétition souterraine sous des angles différents. Les études basées sur la physiologie mesurent souvent l'absorption des ressources sans déterminer les conséquences intégrées pour la performance des plantes, tandis que les études au niveau des populations ou des communautés examinent la performance des plantes mais échouent à identifier l'intermédiaire ou le mécanisme des ressources. La capacité compétitive souterraine est corrélée à des attributs tels que la densité des racines, la surface et la plasticité, que ce soit dans la croissance des racines ou dans les propriétés des enzymes impliquées dans l'absorption des nutriments. Contrairement à la compétition pour la lumière, dans laquelle les plantes plus grandes ont un avantage disproportionné en ombrageant les plus petites, la compétition pour les ressources du sol semble être plus symétrique. La compétition souterraine diminue souvent avec l'augmentation des niveaux de nutriments, mais il est prématuré de généraliser sur l'importance relative de la compétition aérienne et souterraine à travers les gradients de ressources. Bien que la compétition entre tiges et racines soit souvent supposée avoir des effets additifs sur la croissance des plantes, certaines études fournissent des preuves contraires, et les interactions potentielles entre ces deux formes de compétition devraient être prises en compte dans les futures investigations. D'autres recommandations de recherche incluent l'étude simultanée des espaces racinaires et aériens, car leurs fermetures peuvent ne pas se produire simultanément, et des estimations améliorées du voisinage souterrain. Seule la combinaison des outils et des perspectives de l'écophysiologie et de la biologie des populations et des communautés nous permettra de comprendre pleinement comment les caractéristiques du sol, la structure du voisinage et le changement climatique mondial influencent ou sont influencés par la compétition souterraine des plantes.

@article{doi101146annurevecolsys281545,
    author = "Casper, Brenda B. et Jackson, Robert B.",
    title = "Plant Competition Underground",
    year = "1997",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "La compétition souterraine se produit lorsque les plantes réduisent la croissance, la survie ou la fécondité de leurs voisins en diminuant les ressources du sol disponibles. La compétition souterraine peut être plus intense et impliquer beaucoup plus de voisins que la compétition aérienne. Les écophysiologistes et les écologistes des populations ou des communautés ont traditionnellement étudié la compétition souterraine sous des angles différents. Les études basées sur la physiologie mesurent souvent l'absorption des ressources sans déterminer les conséquences intégrées pour la performance des plantes, tandis que les études au niveau des populations ou des communautés examinent la performance des plantes mais échouent à identifier l'intermédiaire ou le mécanisme des ressources. La capacité compétitive souterraine est corrélée à des attributs tels que la densité des racines, la surface et la plasticité, que ce soit dans la croissance des racines ou dans les propriétés des enzymes impliquées dans l'absorption des nutriments. Contrairement à la compétition pour la lumière, dans laquelle les plantes plus grandes ont un avantage disproportionné en ombrageant les plus petites, la compétition pour les ressources du sol semble être plus symétrique. La compétition souterraine diminue souvent avec l'augmentation des niveaux de nutriments, mais il est prématuré de généraliser sur l'importance relative de la compétition aérienne et souterraine à travers les gradients de ressources. Bien que la compétition entre tiges et racines soit souvent supposée avoir des effets additifs sur la croissance des plantes, certaines études fournissent des preuves contraires, et les interactions potentielles entre ces deux formes de compétition devraient être prises en compte dans les futures investigations. D'autres recommandations de recherche incluent l'étude simultanée des espaces racinaires et aériens, car leurs fermetures peuvent ne pas se produire simultanément, et des estimations améliorées du voisinage souterrain. Seule la combinaison des outils et des perspectives de l'écophysiologie et de la biologie des populations et des communautés nous permettra de comprendre pleinement comment les caractéristiques du sol, la structure du voisinage et le changement climatique mondial influencent ou sont influencés par la compétition souterraine des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.28.1.545",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.28.1.545",
    openalex = "W2138626896",
    references = "doi101007bf02912621, doi1023072937039"
}

Les interactions entre les organismes se produisent au sein d'un milieu complexe de processus abiotiques et biotiques, mais nous les étudions généralement comme des phénomènes isolés. Des combinaisons complexes d'interactions négatives et positives ont été identifiées dans de nombreuses communautés végétales. L'importance de ces deux processus dans la structuration des communautés végétales peut être mieux comprise en les comparant le long de gradients de stress abiotique, de pression des consommateurs, et entre différents stades de vie, tailles et densités des espèces en interaction. Ici, nous discutons des rôles du stade de vie, de la physiologie, des interactions indirectes et de l'environnement physique sur l'équilibre entre la concurrence et la facilitation dans les communautés végétales.

@article{doi1018900012965819970781958cafasa20co2,
    author = "Callaway, Ragan M. et Walker, Lawrence R.",
    title = "CONCURRENCE ET FACILITATION : UNE APPROCHE SYNTHÉTIQUE DES INTERACTIONS DANS LES COMMUNAUTÉS VÉGÉTALES",
    year = "1997",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Les interactions entre les organismes se produisent au sein d'un milieu complexe de processus abiotiques et biotiques, mais nous les étudions généralement comme des phénomènes isolés. Des combinaisons complexes d'interactions négatives et positives ont été identifiées dans de nombreuses communautés végétales. L'importance de ces deux processus dans la structuration des communautés végétales peut être mieux comprise en les comparant le long de gradients de stress abiotique, de pression des consommateurs, et entre différents stades de vie, tailles et densités des espèces en interaction. Ici, nous discutons des rôles du stade de vie, de la physiologie, des interactions indirectes et de l'environnement physique sur l'équilibre entre la concurrence et la facilitation dans les communautés végétales.",
    url = "https://doi.org/10.1890/0012-9658(1997)078[1958:cafasa]2.0.co;2",
    doi = "10.1890/0012-9658(1997)078[1958:cafasa]2.0.co;2",
    openalex = "W2084253034",
    references = "doi101007bf02912621, doi1010160169534794900884, doi101086283241, doi101086284133, doi101086284165, doi101086285357, doi1018900012965819970781966tiofac20co2, doi1023072937039, doi105860choice260924, doi105860choice330294, doi105962bhltitle56234, openalexw2169917233"
}

Le métabolisme acide des crassulacées (CAM) est un mécanisme de concentration du CO2 sélectionné en réponse à l'aridité dans les habitats terrestres, et, dans les environnements aquatiques, aux limitations ambiantes du carbone. Les preuves de sa présence chez cinq genres de plantes vasculaires aquatiques, dont Isoëtes, Sagittaria, Vallisneria, Crassula et Littorella, sont examinées. Initialement, le CAM aquatique a été considéré par certains comme un oxymore, mais certaines espèces aquatiques ont été étudiées avec suffisamment de détails pour affirmer définitivement qu'elles possèdent la photosynthèse CAM. Les mécanismes de concentration du CO2 dans les organes photosynthétiques nécessitent une barrière contre les fuites ; par exemple, les plantes C4 terrestres ont des cellules du feuillets vasculaire subérifiées et les plantes CAM terrestres une forte résistance stomatique. Chez les plantes CAM aquatiques, la barrière principale contre les fuites de CO2 est la résistance diffusionnelle extrêmement élevée de l'eau. Cela, couplé au puits fourni par l'espace gazeux intercellulaire étendu, génère une concentration de CO2 (pi) diurne comparable à celle des plantes CAM terrestres. Le CAM contribue au budget carbone par un gain net de carbone et un recyclage du carbone, et l'ampleur de chacun est influencée par l'environnement. Les plantes CAM aquatiques habitent des sites où la photosynthèse est potentiellement limitée par le carbone. Beaucoup occupent des étangs peu profonds et temporairement fertiles qui subissent des fluctuations extrêmes de la disponibilité du carbone sur un cycle jour-nuit. Les plantes CAM sont capables de tirer parti des niveaux élevés de CO2 nocturnes dans ces habitats. Cela leur confère un avantage compétitif par rapport aux espèces non-CAM qui sont affamées de carbone pendant la journée et un avantage par rapport aux espèces qui dépensent de l'énergie dans le transport membranaire du bicarbonate. Certaines plantes CAM aquatiques sont réparties dans des lacs très infertiles, où la limitation extrême du carbone et la lumière sont des facteurs sélectifs importants. La compilation de rapports sur les changements diurnes de l'acidité titrable et du malate montre que 69 sur 180 espèces présentent une accumulation significative au cours de la nuit, bien que des preuves soient présentées pour contester le CAM chez certaines. Il est conclu que des proportions similaires de la flore aquatique et terrestre ont évolué vers la photosynthèse CAM. Les Isoëtes aquatiques (Lycophyta) représentent la lignée la plus ancienne de plantes CAM et l'analyse cladistique soutient une origine du CAM dans les zones humides saisonnières, à partir desquelles il s'est irradié vers les lacs oligotrophes et vers les habitats terrestres. Les espèces terrestres de la zone tempérée partagent de nombreuses caractéristiques avec leurs ancêtres amphibies, qui, dans leur phase terrestre temporaire, produisent des stomates fonctionnels et basculent du CAM vers le C3. De nombreuses Isoëtes lacustres ont conservé la plasticité phénotypique des espèces amphibies et peuvent s'adapter à un environnement aérien par le développement de stomates et le basculement vers le C3. Cependant, chez certaines espèces alpines néotropicales, les adaptations à l'environnement lacustre sont génétiquement fixées et ces espèces constitutives échouent à produire des stomates ou à perdre le CAM lorsqu'elles sont artificiellement maintenues dans un environnement aérien. Il est hypothesé que les espèces lacustres néotropicales peuvent être plus anciennes et avoir donné naissance à des espèces terrestres, qui ont conservé la plupart des caractéristiques de leur ascendance aquatique, y compris des feuilles astomatiques, le CAM et la nutrition carbone basée sur les sédiments.

@article{doi101007bf02856581,
    author = "Keeley, Jon E.",
    title = "Photosynthèse CAM chez les plantes aquatiques submergées",
    year = "1998",
    journal = "The Botanical Review",
    abstract = "Le métabolisme acide des Crassulacées (CAM) est un mécanisme de concentration du CO2 sélectionné en réponse à l'aridité dans les habitats terrestres, et, dans les environnements aquatiques, aux limitations ambiantes du carbone. Des preuves sont examinées concernant sa présence chez cinq genres de plantes vasculaires aquatiques, notamment Isoëtes, Sagittaria, Vallisneria, Crassula et Littorella. Initialement, le CAM aquatique a été considéré par certains comme un oxymore, mais certaines espèces aquatiques ont été étudiées avec suffisamment de détails pour affirmer définitivement qu'elles possèdent une photosynthèse CAM. Les mécanismes de concentration du CO2 dans les organes photosynthétiques nécessitent une barrière contre les fuites ; par exemple, les plantes terrestres C4 ont des cellules du feuillets vasculaire subérifiées et les plantes CAM terrestres une forte résistance stomatique. Chez les plantes CAM aquatiques, la barrière principale contre les fuites de CO2 est la résistance diffusionnelle extrêmement élevée de l'eau. Cela, couplé au puits fourni par l'espace intercellulaire gazeux étendu, génère un CO2 diurne (pi) comparable à celui des plantes CAM terrestres. Le CAM contribue au budget carbone par un gain net de carbone et un recyclage du carbone, et l'ampleur de chacun est influencée par l'environnement. Les plantes CAM aquatiques habitent des sites où la photosynthèse est potentiellement limitée par le carbone. Beaucoup occupent des étangs peu profonds et temporairement fertiles qui subissent des fluctuations diurnes extrêmes de la disponibilité du carbone. Les plantes CAM sont capables de tirer parti des niveaux élevés de CO2 nocturnes dans ces habitats. Cela leur confère un avantage compétitif par rapport aux espèces non-CAM qui sont affamées de carbone pendant la journée et un avantage par rapport aux espèces qui dépensent de l'énergie dans le transport membranaire du bicarbonate. Certaines plantes CAM aquatiques sont réparties dans des lacs très infertiles, où la limitation extrême du carbone et la lumière sont des facteurs sélectifs importants. La compilation de rapports sur les changements diurnes de l'acidité titrable et du malate montre que 69 sur 180 espèces ont une accumulation significative overnight, bien que des preuves soient présentées pour contester le CAM chez certaines. Il est conclu que des proportions similaires de la flore aquatique et terrestre ont évolué vers la photosynthèse CAM. Les Isoëtes aquatiques (Lycophyta) représentent la lignée la plus ancienne de plantes CAM et l'analyse cladistique soutient une origine du CAM dans les zones humides saisonnières, à partir de laquelle il s'est irradié vers les lacs oligotrophes et vers les habitats terrestres. Les espèces terrestres de la zone tempérée partagent de nombreuses caractéristiques avec des ancêtres amphibies, qui, dans leur phase terrestre temporaire, produisent des stomates fonctionnels et passent du CAM au C3. De nombreuses Isoëtes lacustres ont conservé la plasticité phénotypique des espèces amphibies et peuvent s'adapter à un environnement aérien par le développement de stomates et le passage au C3. Cependant, chez certaines espèces alpines néotropicales, les adaptations à l'environnement lacustre sont génétiquement fixées et ces espèces constitutives échouent à produire des stomates ou à perdre le CAM lorsqu'elles sont artificiellement maintenues dans un environnement aérien. Il est hypothesé que les espèces lacustres néotropicales peuvent être plus anciennes et avoir donné naissance à des espèces terrestres, qui ont conservé la plupart des caractéristiques de leur ascendance aquatique, y compris des feuilles astomatiques, le CAM et la nutrition carbone basée sur les sédiments.",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02856581",
    doi = "10.1007/bf02856581",
    openalex = "W1988352209",
    references = "doi101046j13652427199700183x"
}

@article{doi101023a1004327224729,
    author = "Westoby, Mark",
    title = "A leaf-height-seed (LHS) plant ecology strategy scheme",
    year = "1998",
    journal = "Plant and Soil",
    url = "https://doi.org/10.1023/a:1004327224729",
    doi = "10.1023/a:1004327224729",
    openalex = "W201316592",
    references = "doi10100797814684264651, doi101073pnas942513730, doi101086283244, doi101086284133, doi101086284165, doi101086285357, doi101126science2304728895, doi101146annureves11110180001313, doi101146annureves16110185001413, doi1015159781400881376, doi102307213332, doi1023074549, openalexw2169917233"
}

1 Il est utile de distinguer les effets immédiats de la richesse spécifique sur les écosystèmes de ceux qui ne deviennent apparents qu'à une échelle de temps plus longue, décrits ici comme effets de filtre et d'effet fondateur. 2 Les relations entre la diversité végétale et les propriétés des écosystèmes peuvent être explorées en classifiant les espèces composantes en trois catégories : dominantes, subordonnées et transitoires. Les dominantes réapparaissent dans des types de végétation particuliers, sont relativement grandes, présentent une alimentation à grain grossier pour les ressources et, en tant qu'espèces individuelles, contribuent de manière substantielle à la biomasse végétale. Les subordonnées montrent également une forte fidélité d'association avec des types de végétation particuliers, mais elles sont plus petites, s'alimentent à une échelle plus restreinte et ont tendance à occuper des microhabitats délimités par l'architecture et la phénologie de leurs dominantes associées. Les transitoires comprennent un assortiment hétérogène d'espèces à faible abondance et persistance ; une grande proportion sont des juvéniles d'espèces qui apparaissent comme dominantes ou subordonnées dans les écosystèmes voisins. 3 Une théorie du « rapport de masse » propose que les contrôles immédiats sont proportionnels aux entrées de production primaire, sont déterminés dans une large mesure par les traits et la diversité fonctionnelle des plantes dominantes et sont relativement insensibles à la richesse des subordonnées et des transitoires. Des expériences récentes soutiennent l'hypothèse du rapport de masse et la conclusion de Huston (1997) selon laquelle les affirmations de bénéfices immédiats de la richesse spécifique élevée pour les fonctions des écosystèmes découlent d'une mauvaise interprétation des données. 4 L'attribution du contrôle immédiat aux dominantes n'exclut pas les subordonnées et les transitoires de l'implication dans la détermination de la fonction et de la durabilité des écosystèmes. Les deux sont soupçonnés de jouer un rôle crucial, bien qu'intermittent, en influençant le recrutement des dominantes. Certaines subordonnées peuvent agir comme un filtre influençant la régénération par les dominantes après des perturbations majeures. 5 Les transitoires proviennent de la pluie de graines et des banques de graines et fournissent un indice de la pool de dominantes et de subordonnées potentielles sur des sites spécifiques. Là où le carrousel du paysage opère sur un fond de diversité en déclin dans le réservoir de transitoires colonisateurs, nous pouvons prédire qu'une perte progressive des fonctions des écosystèmes découlera de la diminution de la précision avec laquelle les dominantes peuvent s'engager dans le réassemblage et le relocalisation des écosystèmes.

@article{doi101046j13652745199800306x,
    author = "Grime, J. Philip",
    title = "Benefits of plant diversity to ecosystems: immediate, filter and founder effects",
    year = "1998",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "1 Il est utile de distinguer les effets immédiats de la richesse spécifique sur les écosystèmes de ceux qui ne deviennent apparents qu'à une échelle de temps plus longue, décrits ici comme effets de filtre et d'effet fondateur. 2 Les relations entre la diversité végétale et les propriétés des écosystèmes peuvent être explorées en classifiant les espèces composantes en trois catégories : dominantes, subordonnées et transitoires. Les dominantes réapparaissent dans des types de végétation particuliers, sont relativement grandes, présentent une alimentation à grain grossier pour les ressources et, en tant qu'espèces individuelles, contribuent de manière substantielle à la biomasse végétale. Les subordonnées montrent également une forte fidélité d'association avec des types de végétation particuliers, mais elles sont plus petites, s'alimentent à une échelle plus restreinte et ont tendance à occuper des microhabitats délimités par l'architecture et la phénologie de leurs dominantes associées. Les transitoires comprennent un assortiment hétérogène d'espèces à faible abondance et persistance ; une grande proportion sont des juvéniles d'espèces qui apparaissent comme dominantes ou subordonnées dans les écosystèmes voisins. 3 Une théorie du « rapport de masse » propose que les contrôles immédiats sont proportionnels aux entrées de production primaire, sont déterminés dans une large mesure par les traits et la diversité fonctionnelle des plantes dominantes et sont relativement insensibles à la richesse des subordonnées et des transitoires. Des expériences récentes soutiennent l'hypothèse du rapport de masse et la conclusion de Huston (1997) selon laquelle les affirmations de bénéfices immédiats de la richesse spécifique élevée pour les fonctions des écosystèmes découlent d'une mauvaise interprétation des données. 4 L'attribution du contrôle immédiat aux dominantes n'exclut pas les subordonnées et les transitoires de l'implication dans la détermination de la fonction et de la durabilité des écosystèmes. Les deux sont soupçonnés de jouer un rôle crucial, bien qu'intermittent, en influençant le recrutement des dominantes. Certaines subordonnées peuvent agir comme un filtre influençant la régénération par les dominantes après des perturbations majeures. 5 Les transitoires proviennent de la pluie de graines et des banques de graines et fournissent un indice de la pool de dominantes et de subordonnées potentielles sur des sites spécifiques. Là où le carrousel du paysage opère sur un fond de diversité en déclin dans le réservoir de transitoires colonisateurs, nous pouvons prédire qu'une perte progressive des fonctions des écosystèmes découlera de la diminution de la précision avec laquelle les dominantes peuvent s'engager dans le réassemblage et le relocalisation des écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2745.1998.00306.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2745.1998.00306.x",
    openalex = "W2064604453",
    references = "doi1010079781461262329, doi1010160006320787901224, doi101038379718a0, doi101086283241, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science1473655250, doi1023072256497"
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@article{doi101023a1004475206351,
    author = "Wali, Mohan K.",
    title = "Succession écologique et la réhabilitation des écosystèmes terrestres perturbés",
    year = "1999",
    journal = "Plant and Soil",
    url = "https://doi.org/10.1023/a:1004475206351",
    doi = "10.1023/a:1004475206351",
    openalex = "W14602362",
    references = "doi101038238413a0, doi101038307321a0, doi101086283241, doi101126science1643877262, doi101126science2775325494, doi1015159780691206912, doi102136sssaj198703615995005100050015x, doi1023071218190, doi1023071938672, doi1023072483566, doi105962bhltitle56234"
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1 Écologie végétale en haute altitude.- Le concept de limitation.- Un compte rendu régional et historique.- Le défi de la recherche sur les plantes alpines.- 2 La zone de vie alpine.- Limites altitudinales.- Superficie terrestre alpine mondiale.- Diversité végétale alpine.- Origine des flores alpines.- Formes de croissance alpines.- 3 Climat alpin.- Quel climat alpin.- Caractéristiques communes des climats alpins.- Caractéristiques régionales des climats alpins.- 4 Le climat que les plantes subissent.- Interactions du relief, du vent et du soleil.- Comment les plantes alpines influencent leur climat.- La variation géographique du climat alpin.- 5 Vie sous la neige : protection et limitation.- Températures sous la neige.- Rayonnement solaire sous la neige.- Concentrations de gaz sous la neige.- Réponses des plantes à la couverture neigeuse.- 6 Sols alpins.- Physique de la formation des sols alpins.- Le composé organique.- L'interaction entre composés organiques et inorganiques.- 7 Lisières alpines.- À propos des arbres et des lignes.- Positions altitudinales actuelles des lisières climatiques.- Relations entre lisière et climat.- Variations intrazonales et plateauing pantropical des lisières alpines.- Lisières dans le passé.- Tentatives d'explication fonctionnelle des lisières.- Une hypothèse pour la formation des lisières.- Tendances de croissance près des lisières.- Preuves de limitation par le puits.- 8 Stress climatique.- Survie aux extrêmes de basse température.- Évitement et tolérance des extrêmes de basse température.- Stress thermique chez les plantes alpines.- Rayonnement ultraviolet - un facteur de stress.- 9 Relations hydriques.- Bilan hydrique des écosystèmes.- Humidité du sol en haute altitude.- Relations hydriques des plantes - un bref aperçu des principes.- Relations hydriques des plantes alpines.- Stress de dessiccation.- Relations hydriques de types de plantes particuliers.- 10 Nutrition minérale.- Nutriments du sol.- État nutritionnel des plantes alpines.- Cycle des nutriments et budgets de nutriments.- Fixation d'azote.- Mycorhize.- Réponses de la végétation à un apport de nutriments variable.- 11 Absorption et perte de carbone.- Capacité photosynthétique des plantes alpines.- Réponses photosynthétiques à l'environnement.- Gain quotidien de carbone des feuilles.- Gain saisonnier de carbone des feuilles.- Photosynthèse C4 et CAM en haute altitude.- Respiration tissulaire des plantes alpines.- Bilan carbone des écosystèmes.- 12 Investissements en carbone.- Glucides non structuraux.- Lipides et teneur énergétique.- Coûts carbone des feuilles et des racines.- Allocation carbone de la plante entière.- 13 Dynamique de croissance et phénologie.- Croissance saisonnière.- Extension foliaire diurne.- Taux d'accumulation de matière sèche végétale.- Durée fonctionnelle des feuilles et des racines.- 14 Division cellulaire et formation tissulaire.- Taille cellulaire et taille végétale.- Mitose et cycle cellulaire.- De l'activité méristématique au contrôle de la croissance.- 15 Production de biomasse végétale.- Structure des canopées alpines.- Productivité primaire de la végétation alpine.- Puits de matière sèche végétale.- Pertes de biomasse par les herbivores.- 16 Reproduction végétale.- Floraison et pollinisation.- Développement des graines et taille des graines.- Germination.- Banques de graines alpines et recrutement naturel.- Propagation clonale.- Âge des plantes alpines.- Processus communautaires.- 17 Changement global en haute altitude.- Utilisation des terres alpines.- L'impact de la chimie atmosphérique altérée.- Changement climatique et écosystèmes alpins.- Références (avec annotation des chapitres).- Index taxonomique (genres).- Index géographique.- Planches en couleurs.- Formes de vie végétale.- La zone de vie alpine.- Stress environnemental.- La dimension humaine.

@book{openalexw1564371012,
    author = "Körner, Christian",
    title = "Alpine plant life",
    year = "1999",
    abstract = "1 Écologie végétale en haute altitude.- Le concept de limitation.- Un compte rendu régional et historique.- Le défi de la recherche sur la vie végétale alpine.- 2 La zone de vie alpine.- Limites altitudinales.- Superficie terrestre alpine mondiale.- Diversité végétale alpine.- Origine des flores alpines.- Formes de croissance alpines.- 3 Le climat alpin.- Quel climat alpin.- Caractéristiques communes des climats alpins.- Caractéristiques régionales des climats alpins.- 4 Le climat que les plantes subissent.- Interactions du relief, du vent et du soleil.- Comment les plantes alpines influencent leur climat.- La variation géographique du climat alpin.- 5 La vie sous la neige : protection et limitation.- Températures sous la neige.- Rayonnement solaire sous la neige.- Concentrations gazeuses sous la neige.- Réponses des plantes à la couverture neigeuse.- 6 Les sols alpins.- Physique de la formation des sols alpins.- Le composé organique.- L'interaction entre composés organiques et inorganiques.- 7 Les lignes de treillis alpines.- À propos des arbres et des lignes.- Positions altitudinales actuelles des lignes de treillis climatiques.- Relations entre ligne de treillis et climat.- Variations intrazonales et plateauing pantropical des lignes de treillis alpines.- Lignes de treillis dans le passé.- Tentatives d'explication fonctionnelle des lignes de treillis.- Une hypothèse pour la formation des lignes de treillis.- Tendances de croissance près des lignes de treillis.- Preuves de limitation par le puits.- 8 Stress climatique.- Survie aux extrêmes de basse température.- Évitement et tolérance des extrêmes de basse température.- Stress thermique chez les plantes alpines.- Rayonnement ultraviolet - un facteur de stress.- 9 Relations hydriques.- Bilan hydrique des écosystèmes.- Humidité du sol en haute altitude.- Relations hydriques des plantes - un bref aperçu des principes.- Relations hydriques des plantes alpines.- Stress de dessiccation.- Relations hydriques de types végétaux particuliers.- 10 Nutrition minérale.- Nutriments du sol.- État nutritionnel des plantes alpines.- Cycle des nutriments et budgets de nutriments.- Fixation d'azote.- Mycorhize.- Réponses de la végétation à un apport variable de nutriments.- 11 Absorption et perte de carbone.- Capacité photosynthétique des plantes alpines.- Réponses photosynthétiques à l'environnement.- Gain quotidien de carbone des feuilles.- Gain saisonnier de carbone des feuilles.- Photosynthèse C4 et CAM en haute altitude.- Respiration tissulaire des plantes alpines.- Bilan carbone des écosystèmes.- 12 Investissements en carbone.- Glucides non structurés.- Lipides et teneur énergétique.- Coûts carbone des feuilles et des racines.- Allocation carbone de la plante entière.- 13 Dynamique de croissance et phénologie.- Croissance saisonnière.- Extension diurne des feuilles.- Taux d'accumulation de matière sèche végétale.- Durée fonctionnelle des feuilles et des racines.- 14 Division cellulaire et formation tissulaire.- Taille cellulaire et taille végétale.- Mitose et cycle cellulaire.- De l'activité méristématique au contrôle de la croissance.- 15 Production de biomasse végétale.- Structure des canopées végétales alpines.- Productivité primaire de la végétation alpine.- Puits de matière sèche végétale.- Pertes de biomasse par les herbivores.- 16 Reproduction végétale.- Floraison et pollinisation.- Développement des graines et taille des graines.- Germination.- Banques de graines alpines et recrutement naturel.- Propagation clonale.- Âge des plantes alpines.- Processus communautaires.- 17 Changement climatique en haute altitude.- Utilisation des terres alpines.- L'impact de la chimie atmosphérique altérée.- Changement climatique et écosystèmes alpins.- Références (avec annotation par chapitre).- Index taxonomique (genres).- Index géographique.- Planches en couleurs.- Formes de vie végétale.- La zone de vie alpine.- Stress environnemental.- La dimension humaine.",
    openalex = "W1564371012"
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Résumé. Une grande confusion règne dans la littérature en langue anglaise sur les invasions végétales concernant les termes « naturalisé » et « invasif » et leurs concepts associés. Plusieurs auteurs ont utilisé ces termes pour proposer des schémas de conceptualisation de la séquence d'événements allant de l'introduction à l'invasion, mais souvent de manière imprécise, erronée ou contradictoire. Cela complique grandement la formulation de généralisations robustes en écologie des invasions. Sur la base d'une enquête extensive et critique de la littérature, nous avons défini un ensemble minimal de termes clés liés à un schéma graphique qui conceptualise le processus de naturalisation/invasion. L'introduction signifie que la plante (ou son propagule) a été transportée par l'homme à travers une barrière géographique majeure. La naturalisation commence lorsque les barrières abiotiques et biotiques à la survie sont surmontées et lorsque diverses barrières à la reproduction régulière sont vaincues. L'invasion exige en outre que les plantes introduites produisent une descendance reproductrice dans des zones éloignées des sites d'introduction (échelles approximatives : > 100 m sur 6 m/3 ans pour les taxons se propageant par racines, rhizomes, stolons ou tiges rampantes). Les taxons capables de faire face à l'environnement abiotique et à la biote de la zone générale peuvent envahir des communautés perturbées, seminaturelles. L'invasion de communautés matures en termes de succession, non perturbées, nécessite généralement que le taxon exotique surmonte une catégorie différente de barrières. Nous proposons que le terme « invasif » soit utilisé sans aucune inférence d'impact environnemental ou économique. Des termes comme « ravageurs » et « mauvaises herbes » sont des étiquettes appropriées pour les 50–80 % des envahisseurs qui ont des effets nocifs. Environ 10 % des plantes invasives qui modifient le caractère, l'état, la forme ou la nature des écosystèmes sur de vastes étendues peuvent être qualifiées de « transformateurs ».

@article{doi101046j14724642200000083x,
    author = "Richardson, David M. et Pyšek, Petr et Rejmánek, Marcel et Barbour, Michael G. et Panetta, F. D. et West, Carol J.",
    title = "Naturalisation et invasion des plantes exotiques : concepts et définitions",
    year = "2000",
    journal = "Diversity and Distributions",
    abstract = "Résumé. Une grande confusion règne dans la littérature en langue anglaise sur les invasions végétales concernant les termes « naturalisé » et « invasif » et leurs concepts associés. Plusieurs auteurs ont utilisé ces termes pour proposer des schémas de conceptualisation de la séquence d'événements allant de l'introduction à l'invasion, mais souvent de manière imprécise, erronée ou contradictoire. Cela complique grandement la formulation de généralisations robustes en écologie des invasions. Sur la base d'une enquête extensive et critique de la littérature, nous avons défini un ensemble minimal de termes clés liés à un schéma graphique qui conceptualise le processus de naturalisation/invasion. L'introduction signifie que la plante (ou son propagule) a été transportée par l'homme à travers une barrière géographique majeure. La naturalisation commence lorsque les barrières abiotiques et biotiques à la survie sont surmontées et lorsque diverses barrières à la reproduction régulière sont vaincues. L'invasion exige en outre que les plantes introduites produisent une descendance reproductrice dans des zones éloignées des sites d'introduction (échelles approximatives : > 100 m sur 6 m/3 ans pour les taxons se propageant par racines, rhizomes, stolons ou tiges rampantes). Les taxons capables de faire face à l'environnement abiotique et à la biote de la zone générale peuvent envahir des communautés perturbées, seminaturelles. L'invasion de communautés matures en termes de succession, non perturbées, nécessite généralement que le taxon exotique surmonte une catégorie différente de barrières. Nous proposons que le terme « invasif » soit utilisé sans aucune inférence d'impact environnemental ou économique. Des termes comme « ravageurs » et « mauvaises herbes » sont des étiquettes appropriées pour les 50–80\% des envahisseurs qui ont des effets nocifs. Environ 10\% des plantes invasives qui modifient le caractère, l'état, la forme ou la nature des écosystèmes sur de vastes étendues peuvent être qualifiées de « transformateurs ».",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1472-4642.2000.00083.x",
    doi = "10.1046/j.1472-4642.2000.00083.x",
    openalex = "W2163826476",
    references = "doi1010079781489972149, doi1010079789400958517, doi101046j13652745200000473x, doi101093auk1002507, doi1018900012965819990801522gpopia20co2, doi1023072257385, doi105281zenodo18199125, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw1550375751, openalexw2101875448, openalexw2990282461"
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La rhizosphère est définie ici comme le volume de sol affecté par la présence des racines des plantes en croissance. Le changement global peut être considéré comme biologique, mais les propriétés chimiques, biologiques et physiques du sol, à leur tour, sont affectées. Une multitude de composés sont libérés dans la rhizosphère des plantes cultivées en sol, la plupart étant des composés organiques et constituant des éléments normaux des plantes dérivés de la photosynthèse et d'autres processus végétaux (Tableau 1). Les quantités relatives et absolues de ces composés produits par les racines des plantes varient selon l'espèce végétale, les cultivars, l'âge de la plante, les conditions environnementales – y compris les propriétés du sol en particulier, le niveau de stress physique, chimique et biologique, etc. (1,2,10-13).

@incollection{doi10120197808493849748,
    author = "Uren, Nicholas C.",
    title = "Types, Amounts, and Possible Functions of Compounds Released into the Rhizosphere by Soil-Grown Plants",
    year = "2000",
    abstract = "La rhizosphère est définie ici comme le volume de sol affecté par la présence des racines des plantes en croissance. Le changement global peut être considéré comme biologique, mais les propriétés chimiques, biologiques et physiques du sol, à leur tour, sont affectées. Une multitude de composés sont libérés dans la rhizosphère des plantes cultivées en sol, la plupart étant des composés organiques et constituant des éléments normaux des plantes dérivés de la photosynthèse et d'autres processus végétaux (Tableau 1). Les quantités relatives et absolues de ces composés produits par les racines des plantes varient selon l'espèce végétale, les cultivars, l'âge de la plante, les conditions environnementales – y compris les propriétés du sol en particulier, le niveau de stress physique, chimique et biologique, etc. (1,2,10-13).",
    url = "https://doi.org/10.1201/9780849384974-8",
    doi = "10.1201/9780849384974-8",
    openalex = "W8309970",
    references = "doi101007bf00997160, doi101007bf02857949"
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@article{doi10108011263500112331350930,
    author = "Andreis, Carlo et Caccianiga, Marco et Cerabolini, Bruno Enrico Leone",
    title = "Végétation et facteurs environnementaux lors de la succession primaire sur les moraines glaciaires : Quelques aperçus des Alpes italiennes",
    year = "2001",
    journal = "Plant Biosystems - An International Journal Dealing with all Aspects of Plant Biology",
    url = "https://doi.org/10.1080/11263500112331350930",
    doi = "10.1080/11263500112331350930",
    openalex = "W2053671446"
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Résumé Les phosphites (H2PO3 −; Phi) sont des sels de métaux alcalins de l'acide phosphoreux [HPO(OH)2] qui sont largement commercialisés soit comme fongicide agricole, soit comme une source supérieure de nutrition en phosphore (P) pour les plantes. Les recherches publiées indiquent de manière concluante que Phi fonctionne comme un agent de contrôle efficace pour un certain nombre de maladies des cultures causées par diverses espèces de pseudo-fongus pathogènes appartenant au genre Phytophthora. Cependant, il manque des preuves que Phi puisse être utilisé directement par les plantes comme source unique de P nutritionnel. Lorsque Phi est administré d'une manière telle qu'il entre en contact avec des bactéries, soit associées aux systèmes racinaires des plantes, soit dans le sol, l'oxydation de Phi en phosphate (HPO4 2−; Pi) peut alors se produire. Par cette méthode indirecte, Phi peut ainsi devenir disponible pour la plante comme nutriment en P. Les taux à lesquels cela se produit sont lents, prenant des mois ou jusqu'à un an, selon le type de sol. Phi n'est pas sans effets directs sur les plantes lui-même, car les concentrations de Phi comparables à celles requises pour contrôler l'infection des plantes par le Phytophthora pathogène, ou pour restreindre la croissance du Phytophthora en culture stérile, sont extrêmement phytotoxiques pour les plantes privées de Pi, mais pas pour les plantes fertilisées en Pi. C'est parce que le traitement par Phi annule l'acclimatation des plantes à la carence en Pi en perturbant l'induction d'enzymes (par exemple, l'acide phosphatase) et de transporteurs (par exemple, le translocateur de Pi à haute affinité de la plasmalemma) caractéristiques de leur réponse à la famine en Pi. Ainsi, Phi intensifie les effets délétères de la carence en P en « trompant » les cellules végétales privées de Pi pour qu'elles perçoivent qu'elles sont suffisantes en Pi, alors qu'en réalité, leur contenu cellulaire en Pi est extrêmement faible. L'anion Phi semble efficacement obstruer la voie de transduction du signal par laquelle les plantes (et les levures) perçoivent et répondent à la privation de Pi au niveau moléculaire. La revue conclut en citant des préoccupations et des recommandations concernant l'apport significatif de Phi dans les produits alimentaires et l'environnement qui découle de son utilisation extensive dans l'agriculture et l'industrie. REMERCIEMENTS Les travaux dans le laboratoire de W.C.P sont soutenus par des subventions de recherche et d'équipement du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG). Nous sommes également reconnaissants envers le Prof. K.G. Ragothama (Purdue Univ.) et le Dr Julie Niere (Royal Melbourne Institute of Technology) pour leurs discussions et commentaires utiles sur le manuscrit. Notes 1Bien que les termes phosphite et phosphonate aient tous deux été utilisés pour décrire les sels de l'acide phosphoreux, HPO(OH)2, le terme phosphonate est également employé pour la nomenclature des composés contenant une liaison C-P Citation[5]. Pour éviter toute ambiguïté, cette revue utilise donc le terme phosphite pour décrire les sels de métaux alcalins de l'acide phosphoreux. 2De grandes quantités d'hypophosphite (H2PO2 −; Fig. 1) sont utilisées pour réduire les ions métalliques dans des procédés de galvanoplastie chimique tels que ceux utilisés dans la fabrication de disques compacts Citation[2]. Après la galvanoplastie, des eaux usées contenant de fortes concentrations de Phi ont été rejetées dans l'environnement. Le traitement des déchets industriels contenant du Phi devient un problème difficile associé à de telles industries de haute technologie Citation[2].

@article{doi101081pln100106017,
    author = "McDonald, Allison E. and Grant, Bruce R. and Plaxton, William C.",
    title = "PHOSPHITE (ACIDE PHOSPHOREUX) : SON IMPORTANCE DANS L'ENVIRONNEMENT ET L'AGRICULTURE ET SON INFLUENCE SUR LA RÉPONSE DES PLANTES À LA CARENCE EN PHOSPHATE",
    year = "2001",
    journal = "Journal of Plant Nutrition",
    abstract = "Résumé Les phosphites (H2PO3 −; Phi) sont des sels de métaux alcalins de l'acide phosphoreux [HPO(OH)2] qui sont commercialisés à grande échère soit comme fongicide agricole, soit comme une source supérieure de nutrition en phosphore (P) pour les plantes. Les recherches publiées indiquent de manière concluante que Phi fonctionne comme un agent de contrôle efficace pour de nombreuses maladies des cultures causées par diverses espèces de pseudo-fongus pathogènes appartenant au genre Phytophthora. Cependant, il manque des preuves que Phi puisse être utilisé directement par les plantes comme source unique de nutrition en P. Lorsque Phi est administré d'une manière qui lui permet de entrer en contact avec des bactéries, soit associées aux systèmes racinaires des plantes, soit dans le sol, alors l'oxydation de Phi en phosphate (HPO4 2−; Pi) peut se produire. Par cette méthode indirecte, Phi pourrait ainsi devenir disponible pour la plante comme nutriment en P. Les taux à lesquels cela se produit sont lents, prenant des mois ou jusqu'à un an, selon le type de sol. Phi n'est pas sans effets directs sur les plantes elle-même, car les concentrations de Phi comparables à celles requises pour contrôler l'infection des plantes par le Phytophthora pathogène, ou pour restreindre la croissance du Phytophthora en culture stérile, sont extrêmement phytotoxiques pour les plantes privées de Pi, mais pas pour les plantes fertilisées en Pi. C'est parce que le traitement par Phi annule l'acclimatation des plantes à la carence en Pi en perturbant l'induction d'enzymes (par exemple, l'acide phosphatase) et de transporteurs (par exemple, le translocateur de Pi à haute affinité de la plasmalemma) caractéristiques de leur réponse à la carence en Pi. Ainsi, Phi intensifie les effets délétères de la carence en P en « trompant » les cellules végétales privées de Pi pour qu'elles sentent qu'elles sont suffisantes en Pi, alors qu'en réalité, leur contenu cellulaire en Pi est extrêmement faible. L'anion Phi semble efficacement obstruer la voie de transduction du signal par laquelle les plantes (et les levures) perçoivent et répondent à la privation de Pi au niveau moléculaire. La revue conclut en citant des préoccupations et des recommandations concernant l'apport significatif de Phi dans les produits alimentaires et l'environnement qui découle de son utilisation extensive dans l'agriculture et l'industrie. REMERCIEMENTS Les travaux dans le laboratoire de W.C.P. sont soutenus par des subventions de recherche et d'équipement du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG). Nous sommes également reconnaissants envers le Prof. K.G. Ragothama (Université Purdue) et le Dr Julie Niere (Institut royal de technologie de Melbourne) pour leurs discussions et commentaires utiles sur le manuscrit. Notes 1Bien que les termes phosphite et phosphonate aient tous deux été utilisés pour décrire les sels de l'acide phosphoreux, HPO(OH)2, le phosphonate est également employé pour la nomenclature des composés contenant une liaison C-P Citation[5]. Pour éviter toute ambiguïté, cette revue utilise donc le terme phosphite pour la description des sels de métaux alcalins de l'acide phosphoreux. 2De grandes quantités d'hypophosphite (H2PO2 −; Fig. 1) sont utilisées pour réduire les ions métalliques dans des procédés de plaquage chimique tels que ceux utilisés dans la fabrication de disques compacts Citation[2]. Après le plaquage métallique, des eaux usées contenant de fortes concentrations de Phi ont été rejetées dans l'environnement. Le traitement des déchets industriels contenant du Phi devient un problème difficile associé à de telles industries de haute technologie Citation[2].",
    url = "https://doi.org/10.1081/pln-100106017",
    doi = "10.1081/pln-100106017",
    openalex = "W1964864024",
    references = "doi101111j1469185x1991tb01139x"
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Les épidémies de maladies végétales résultant de l'introduction de pathogènes fongiques exotiques sont un phénomène bien connu. Une résistance limitée chez l'hôte et une agressivité excessive chez le pathogène (réfléchissant leur manque de co-évolution antérieure) peuvent entraîner une épidémie explosive de maladie. Les événements d'introduction offrent également une fenêtre d'opportunité évolutive pour le pathogène. Dans son emplacement endémique, un pathogène végétal tend à être soumis à des contraintes de sélection routinières, favorisant le maintien d'une structure de population relativement stable, bien que fluctuante, au fil du temps. Lorsqu'il est introduit dans un nouvel environnement, il sera souvent soumis à une sélection nouvelle ou épisodique, reflétant une exposition soudaine à de nouvelles influences biotiques et abiotiques, telles qu'une nouvelle population d'hôtes, de nouveaux vecteurs, de nouveaux concurrents ou un climat différent. Ces influences offrent le potentiel d'une évolution rapide (Brasier 1995). Relevant de la catégorie de la sélection épisodique est le contact soudain qui peut se produire entre des pathogènes étroitement apparentés mais précédemment isolés géographiquement en raison des introductions. Théoriquement, ce processus présente une opportunité d'émergence rapide de nouveaux ou de pathogènes modifiés via un flux génique interspécifique (Brasier 1995). Jusqu'à récemment, ce phénomène a été peu étudié. Maintenant, la maladie du hêtre hollandais, un accident écologique majeur du 20e siècle (Heybroek 1993), fournit des aperçus remarquables sur l'évolution rapide d'un pathogène végétal en dehors de son environnement endémique. Cet article décrit les événements migratoires et les événements génétiques inhabituels qui se sont produits chez ce champignon et d'autres nouveaux exemples d'évolution rapide de pathogènes via un flux génique interspécifique, et discute de certaines des implications environnementales, évolutives et de quarantaine plus larges. Les pathogènes de la maladie du hêtre hollandais Les arbres de hêtre (Ulmus) sont confinés principalement aux régions tempérées de l'hémisphère nord. La Chine et le Japon ont au total environ 25 espèces de hêtres, tandis que l'Eurasie, l'Amérique du Nord et l'Himalaya ont chacun environ cinq ou six espèces. La maladie du hêtre hollandais (ainsi appelée parce que les premières recherches fondamentales ont été menées aux Pays-Bas (Holmes et Heybroek 1990)) est le principal ennemi du hêtre. C'est une maladie de flétrissement, causée par des champignons ascomycètes du genre Ophiostoma, qui se propage dans le système vasculaire de l'arbre. Les pathogènes sont transmis des hêtres malades aux hêtres sains par des coléoptères de l'écorce de hêtre du genre Scolytus (Fransen 1935, Webber et Brasier 1984).

@article{doi1016410006356820010510123reoipp20co2,
    author = "Brasier, C. M.",
    title = "Évolution rapide des pathogènes végétaux introduits par hybridation interspécifique",
    year = "2001",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Les épidémies de maladies végétales résultant de l'introduction de pathogènes fongiques exotiques sont un phénomène bien connu. Une résistance limitée chez l'hôte et une agressivité excessive chez le pathogène (réfléchissant leur manque de co-évolution antérieure) peuvent entraîner une épidémie explosive de maladie. Les événements d'introduction offrent également une fenêtre d'opportunité évolutive pour le pathogène. Dans son emplacement endémique, un pathogène végétal tend à être soumis à des contraintes de sélection routinières, favorisant le maintien d'une structure de population relativement stable, bien que fluctuante, au fil du temps. Lorsqu'il est introduit dans un nouvel environnement, il sera souvent soumis à une sélection nouvelle ou épisodique, reflétant une exposition soudaine à de nouvelles influences biotiques et abiotiques, telles qu'une nouvelle population d'hôtes, de nouveaux vecteurs, de nouveaux concurrents ou un climat différent. Ces influences offrent le potentiel d'une évolution rapide (Brasier 1995). Relevant de la catégorie de la sélection épisodique est le contact soudain qui peut se produire entre des pathogènes étroitement apparentés mais précédemment isolés géographiquement en raison des introductions. Théoriquement, ce processus présente une opportunité d'émergence rapide de nouveaux ou de pathogènes modifiés via un flux génique interspécifique (Brasier 1995). Jusqu'à récemment, ce phénomène a été peu étudié. Maintenant, la maladie du hêtre hollandais, un accident écologique majeur du 20e siècle (Heybroek 1993), fournit des aperçus remarquables sur l'évolution rapide d'un pathogène végétal en dehors de son environnement endémique. Cet article décrit les événements migratoires et les événements génétiques inhabituels qui se sont produits chez ce champignon et d'autres nouveaux exemples d'évolution rapide de pathogènes via un flux génique interspécifique, et discute de certaines des implications environnementales, évolutives et de quarantaine plus larges. Les pathogènes de la maladie du hêtre hollandais Les arbres de hêtre (Ulmus) sont confinés principalement aux régions tempérées de l'hémisphère nord. La Chine et le Japon ont au total environ 25 espèces de hêtres, tandis que l'Eurasie, l'Amérique du Nord et l'Himalaya ont chacun environ cinq ou six espèces. La maladie du hêtre hollandais (ainsi appelée parce que les premières recherches fondamentales ont été menées aux Pays-Bas (Holmes et Heybroek 1990)) est le principal ennemi du hêtre. C'est une maladie de flétrissement, causée par des champignons ascomycètes du genre Ophiostoma, qui se propage dans le système vasculaire de l'arbre. Les pathogènes sont transmis des hêtres malades aux hêtres sains par des coléoptères de l'écorce de hêtre du genre Scolytus (Fransen 1935, Webber et Brasier 1984).",
    url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2001)051[0123:reoipp]2.0.co;2",
    doi = "10.1641/0006-3568(2001)051[0123:reoipp]2.0.co;2",
    openalex = "W1932364112",
    references = "openalexw2777527484"
}

Préface. Préface à la première édition. Introduction. Résumés des chapitres. STRATÉGIES DES PLANTES. Stratégies primaires dans la phase établie. Stratégies secondaires dans la phase établie. Stratégies régénératives. STRATÉGIES DES PLANTES ET PROCESSUS DE VÉGÉTATION. Dominance. Assemblage des communautés. Rarification et extinction. Colonisation et invasion. Succession. Coexistence. STRATÉGIES DES PLANTES ET PROPRIÉTÉS DES ÉCOSYSTÈMES. Structure trophique, productivité et stabilité. Références. Liste des espèces. Index

@book{openalexw2097450069,
    author = "Grime, J. P.",
    title = "Plant Strategies, Vegetation Processes, and Ecosystem Properties",
    year = "2001",
    abstract = "Préface. Préface à la première édition. Introduction. Résumés des chapitres. STRATÉGIES DES PLANTES. Stratégies primaires dans la phase établie. Stratégies secondaires dans la phase établie. Stratégies régénératives. STRATÉGIES DES PLANTES ET PROCESSUS DE VÉGÉTATION. Dominance. Assemblage des communautés. Rarification et extinction. Colonisation et invasion. Succession. Coexistence. STRATÉGIES DES PLANTES ET PROPRIÉTÉS DES ÉCOSYSTÈMES. Structure trophique, productivité et stabilité. Références. Liste des espèces. Index",
    openalex = "W2097450069"
}

Résumé Le concept de type fonctionnel de plante propose que les espèces puissent être regroupées selon des réponses communes à l'environnement et/ou des effets communs sur les processus des écosystèmes. Cependant, la connaissance des relations entre les traits associés à la réponse des plantes aux facteurs environnementaux tels que les ressources et les perturbations (traits de réponse), et les traits qui déterminent les effets des plantes sur les fonctions des écosystèmes (traits d'effet), tels que le cycle biogéochimique ou la propension aux perturbations, reste rudimentaire. Nous présentons un cadre utilisant des concepts et des résultats de l'écologie des communautés, de l'écologie des écosystèmes et de la biologie évolutive pour fournir ce lien. Le fonctionnement des écosystèmes est le résultat final de l'opération de multiples filtres environnementaux dans une hiérarchie d'échelles qui, en sélectionnant des individus avec des réponses appropriées, aboutissent à des assemblages avec une composition de traits variable. Les liens fonctionnels et les compromis entre les traits, chacun étant lié à un ou plusieurs processus, déterminent si le filtrage par différents facteurs donne une correspondance et si les effets des écosystèmes peuvent être facilement déduits de la connaissance des filtres. Pour illustrer ce cadre, nous analysons un ensemble de facteurs environnementaux clés et de processus des écosystèmes. Bien que les traits associés à la réponse aux gradients de nutriments se chevauchent fortement avec ceux déterminant la production primaire nette, peu de chevauchement direct a été trouvé entre la réponse au feu et l' inflammabilité. Nous hypothèse que ces motifs reflètent des tendances générales. Les réponses à la disponibilité des ressources seraient déterminées par des traits qui sont également impliqués dans le cycle biogéochimique, car ces réponses et effets sont tous deux entraînés par le compromis entre acquisition et conservation. D'un autre côté, les traits de régénération et démographiques associés à la réponse aux perturbations, qui sont connus pour avoir peu de lien avec les traits adultes impliqués dans l'écophysiologie des plantes, seraient de peu de pertinence pour les processus des écosystèmes. Ce cadre est susceptible d'être largement applicable, bien qu'une prudence doit être exercée pour utiliser les liens de traits et les compromis appropriés à l'échelle, aux conditions environnementales et au contexte évolutif. Il peut diriger la sélection de types fonctionnels de plantes pour les modèles de végétation à une gamme d'échelles, et aider à la conception d'études expérimentales des relations entre la diversité des plantes et les propriétés des écosystèmes.

@article{doi101046j13652435200200664x,
    author = "Lavorel, Sandra et Garnier, Éric",
    title = "Prédire les changements de composition des communautés et du fonctionnement des écosystèmes à partir des traits des plantes : revisiter le Graal",
    year = "2002",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Résumé Le concept de type fonctionnel de plante propose que les espèces puissent être regroupées selon des réponses communes à l'environnement et/ou des effets communs sur les processus des écosystèmes. Cependant, la connaissance des relations entre les traits associés à la réponse des plantes aux facteurs environnementaux tels que les ressources et les perturbations (traits de réponse), et les traits qui déterminent les effets des plantes sur les fonctions des écosystèmes (traits d'effet), tels que le cycle biogéochimique ou la propension aux perturbations, reste rudimentaire. Nous présentons un cadre utilisant des concepts et des résultats de l'écologie des communautés, de l'écologie des écosystèmes et de la biologie évolutive pour fournir ce lien. Le fonctionnement des écosystèmes est le résultat final de l'opération de multiples filtres environnementaux dans une hiérarchie d'échelles qui, en sélectionnant des individus avec des réponses appropriées, aboutissent à des assemblages avec une composition de traits variable. Les liens fonctionnels et les compromis entre les traits, chacun étant lié à un ou plusieurs processus, déterminent si le filtrage par différents facteurs donne une correspondance et si les effets des écosystèmes peuvent être facilement déduits de la connaissance des filtres. Pour illustrer ce cadre, nous analysons un ensemble de facteurs environnementaux clés et de processus des écosystèmes. Bien que les traits associés à la réponse aux gradients de nutriments se chevauchent fortement avec ceux déterminant la production primaire nette, peu de chevauchement direct a été trouvé entre la réponse au feu et l' inflammabilité. Nous hypothèse que ces motifs reflètent des tendances générales. Les réponses à la disponibilité des ressources seraient déterminées par des traits qui sont également impliqués dans le cycle biogéochimique, car ces réponses et effets sont tous deux entraînés par le compromis entre acquisition et conservation. D'un autre côté, les traits de régénération et démographiques associés à la réponse aux perturbations, qui sont connus pour avoir peu de lien avec les traits adultes impliqués dans l'écophysiologie des plantes, seraient de peu de pertinence pour les processus des écosystèmes. Ce cadre est susceptible d'être largement applicable, bien qu'une prudence doit être exercée pour utiliser les liens de traits et les compromis appropriés à l'échelle, aux conditions environnementales et au contexte évolutif. Il peut diriger la sélection de types fonctionnels de plantes pour les modèles de végétation à une gamme d'échelles, et aider à la conception d'études expérimentales des relations entre la diversité des plantes et les propriétés des écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2435.2002.00664.x",
    openalex = "W2168173042",
    references = "doi1010079783642809132, doi101007bf00002772, doi101023a1004327224729, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}

Résumé L'application de nouvelles technologies moléculaires a considérablement accru notre compréhension du rôle du changement chromosomique dans l'évolution des plantes. Il existe désormais une large base de données sur la variation de la taille du génome au sein et entre les espèces, ainsi qu'une grande variété de marqueurs génétiques nucléaires et cytoplasmiques. Il existe une variété de littérature traitant de ce sujet, mais une grande partie est dispersée. Ce livre a créé une synthèse contemporaine des travaux dans ce domaine et aborde des questions telles que l'hétérogénéité, la polyploïdie, les réarrangements chromosomiques au sein des espèces et les conséquences phénotypiques de la duplication chromosomique.

@book{doi101093oso97801951385970010001,
    author = "Levin, Donald A.",
    title = "Le rôle du changement chromosomique dans l'évolution des plantes",
    year = "2002",
    abstract = "Résumé L'application de nouvelles technologies moléculaires a considérablement accru notre compréhension du rôle du changement chromosomique dans l'évolution des plantes. Il existe désormais une large base de données sur la variation de la taille du génome au sein et entre les espèces, ainsi qu'une grande variété de marqueurs génétiques nucléaires et cytoplasmiques. Il existe une variété de littérature traitant de ce sujet, mais une grande partie est dispersée. Ce livre a créé une synthèse contemporaine des travaux dans ce domaine et aborde des questions telles que l'hétérogénéité, la polyploïdie, les réarrangements chromosomiques au sein des espèces et les conséquences phénotypiques de la duplication chromosomique.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780195138597.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780195138597.001.0001",
    openalex = "W599917843"
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Quelques-unes des conséquences les plus frappantes et les plus extrêmes de la dispersion aérienne rapide et sur de longues distances concernent les pathogènes des plantes cultivées. La dispersion sur de longues distances des spores fongiques par le vent peut propager les maladies des plantes à travers et même entre les continents et rétablir des maladies dans des zones où les plantes hôtes sont absentes de manière saisonnière. Pour que de telles épidémies se produisent, les hôtes sensibles aux mêmes génotypes de pathogènes doivent être cultivés sur de vastes étendues, comme c'est le cas pour de nombreuses cultures modernes. La nature fortement stochastique de la dispersion sur de longues distances provoque des effets fondateurs dans les populations de pathogènes, de sorte que les génotypes qui provoquent des épidémies dans de nouveaux territoires ou sur des cultivars dotés de gènes de résistance auparavant efficaces peuvent être atypiques. Des dynamiques de population similaires mais moins extrêmes peuvent survenir à la suite de la dispersion aérienne sur de longues distances d'autres organismes, y compris les plantes, les virus et les pathogènes fongiques des humains.

@article{doi101126science1072678,
    author = "Brown, James K. M. et Hovmøller, Mogens S.",
    title = "Dispersal aérien des pathogènes à l'échelle mondiale et continentale et son impact sur les maladies des plantes",
    year = "2002",
    journal = "Science",
    abstract = "Quelques-unes des conséquences les plus frappantes et les plus extrêmes de la dispersion aérienne rapide et sur de longues distances concernent les pathogènes des plantes cultivées. La dispersion sur de longues distances des spores fongiques par le vent peut propager les maladies des plantes à travers et même entre les continents et rétablir des maladies dans des zones où les plantes hôtes sont absentes de manière saisonnière. Pour que de telles épidémies se produisent, les hôtes sensibles aux mêmes génotypes de pathogènes doivent être cultivés sur de vastes étendues, comme c'est le cas pour de nombreuses cultures modernes. La nature fortement stochastique de la dispersion sur de longues distances provoque des effets fondateurs dans les populations de pathogènes, de sorte que les génotypes qui provoquent des épidémies dans de nouveaux territoires ou sur des cultivars dotés de gènes de résistance auparavant efficaces peuvent être atypiques. Des dynamiques de population similaires mais moins extrêmes peuvent survenir à la suite de la dispersion aérienne sur de longues distances d'autres organismes, y compris les plantes, les virus et les pathogènes fongiques des humains.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1072678",
    doi = "10.1126/science.1072678",
    openalex = "W2038370512"
}

▪ Résumé Un objectif important de l'écologie végétale est d'identifier les dimensions principales de la variation écologique entre les espèces et de comprendre leur fondement. Les dimensions qui peuvent être facilement mesurées seraient particulièrement utiles, car elles pourraient offrir une voie vers une synthèse mondiale améliorée à travers les milliers d'expériences de terrain et d'études écophysiologiques qui utilisent chacune seulement quelques espèces. Quatre dimensions sont examinées ici. La dimension masse foliaire par surface–durée de vie foliaire (LMA-LL) exprime un turnover lent des parties de la plante (à LMA élevé et LL long), des temps de résidence des nutriments longs, et une réponse lente aux conditions de croissance favorables. La dimension masse des graines–production de graines (SM-SO) est un prédicteur important de la dispersion vers les opportunités d'établissement (production de graines) et du succès d'établissement face aux dangers (masse des graines). Les dimensions LMA-LL et SM-SO sont chacune soutenues par un compromis unique et compréhensible, et leurs conséquences sont assez bien comprises. Le spectre taille foliaire–taille de brindille (LS-TS) a des conséquences évidentes sur la texture des canopées, mais les coûts et bénéfices de la taille foliaire et de brindille grande par rapport à petite sont mal compris. La dimension hauteur a universellement été vue comme écologiquement importante et incluse dans les schémas de stratégie écologique. Néanmoins, la hauteur inclut plusieurs compromis et éléments adaptatifs, qui devraient idéalement être traités séparément. Chacune de ces quatre dimensions varie aux échelles des zones climatiques et des types de sites au sein des paysages. Cette variation peut être interprétée comme une adaptation à l'environnement physique. Chaque dimension varie également largement entre les espèces coexistantes. Il est le plus probable que cette variation intra-site survienne parce que les opportunités écologiques pour chaque espèce dépendent fortement de quelles autres espèces sont présentes, autrement dit, parce que l'ensemble des espèces sur un site est un mélange stable de stratégies.

@article{doi101146annurevecolsys33010802150452,
    author = "Westoby, Mark et Falster, Daniel S. et Moles, Angela T. et Vesk, Peter A. et Wright, Ian J.",
    title = "Plant Ecological Strategies: Some Leading Dimensions of Variation Between Species",
    year = "2002",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Résumé Un objectif important de l'écologie végétale est d'identifier les dimensions principales de la variation écologique entre les espèces et de comprendre leur fondement. Les dimensions qui peuvent être facilement mesurées seraient particulièrement utiles, car elles pourraient offrir une voie vers une synthèse mondiale améliorée à travers les milliers d'expériences de terrain et d'études écophysiologiques qui utilisent chacune seulement quelques espèces. Quatre dimensions sont examinées ici. La dimension masse foliaire par surface–durée de vie foliaire (LMA-LL) exprime un turnover lent des parties de la plante (à LMA élevé et LL long), des temps de résidence des nutriments longs, et une réponse lente aux conditions de croissance favorables. La dimension masse des graines–production de graines (SM-SO) est un prédicteur important de la dispersion vers les opportunités d'établissement (production de graines) et du succès d'établissement face aux dangers (masse des graines). Les dimensions LMA-LL et SM-SO sont chacune soutenues par un compromis unique et compréhensible, et leurs conséquences sont assez bien comprises. Le spectre taille foliaire–taille de brindille (LS-TS) a des conséquences évidentes sur la texture des canopées, mais les coûts et bénéfices de la taille foliaire et de brindille grande par rapport à petite sont mal compris. La dimension hauteur a universellement été vue comme écologiquement importante et incluse dans les schémas de stratégie écologique. Néanmoins, la hauteur inclut plusieurs compromis et éléments adaptatifs, qui devraient idéalement être traités séparément. Chacune de ces quatre dimensions varie aux échelles des zones climatiques et des types de sites au sein des paysages. Cette variation peut être interprétée comme une adaptation à l'environnement physique. Chaque dimension varie également largement entre les espèces coexistantes. Il est le plus probable que cette variation intra-site survienne parce que les opportunités écologiques pour chaque espèce dépendent fortement de quelles autres espèces sont présentes, autrement dit, parce que l'ensemble des espèces sur un site est un mélange stable de stratégies.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150452",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150452",
    openalex = "W2167109558",
    references = "doi1010079789401090131, doi101007bf02860997, doi101016s0065250408600161, doi101023a1004327224729, doi10103823251, doi101086283244, doi101086284133, doi101086284165, doi101086284325, doi101086285357, doi101086417659, doi101111j109583121989tb00492x, doi101126science2304728895, doi101146annurevecolsys311343, doi101146annureves11110180001313, doi1023071942495, openalexw2169917233"
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@article{s2ea86fe03870114760ce0d4d890abdb5d7571818b,
    author = "Laser, H. et Durand, J. et Emile, J. et Huyghe, C. et Lemaire, G.",
    title = "Effets à long terme et à court terme de la succession végétale non perturbée, du paillage et de l'utilisation des prairies sur la diversité botanique dans une prairie humide d'Arrhenatherum elatius.",
    year = "2002",
    journal = "Prairies multifonctionnelles : fourrages de qualité, produits animaux et paysages. Actes de la 19e Réunion Générale de la Fédération Européenne des Prairies, La Rochelle, France, 27-30 mai 2002.",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/ea86fe03870114760ce0d4d890abdb5d7571818b",
    is_oa = "true",
    openalex = "W318234072",
    semanticscholar_citation_count = "2",
    semanticscholar_id = "ea86fe03870114760ce0d4d890abdb5d7571818b"
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Les perturbations naturelles telles que les coulées de lave, les glissements de terrain et les moraines glaciaires, ainsi que les sites endommagés par l'homme tels que les pavages, les bordures de routes et les déchets miniers, laissent souvent peu ou pas de sol ou de patrimoine biologique. Ce livre de 2003 a fourni le premier résumé complet de la manière dont les communautés végétales, animales et microbiennes se développent dans des conditions difficiles suivant de telles perturbations dramatiques. Les auteurs examinent les principes fondamentaux qui déterminent le développement des écosystèmes et appliquent les règles générales au besoin pratique urgent de promouvoir la réhabilitation des terres endommagées. Écrit pour les écologistes concernés par les perturbations, la dynamique du paysage, la restauration, les histoires de vie, les invasions, la modélisation, la formation des sols et la dynamique des communautés ou des populations, ce livre servira également de texte d'autorité pour les étudiants de niveau master et de référence précieuse pour les professionnels impliqués dans la gestion des terres.

@book{doi101017cbo9780511615078,
    author = "Walker, Lawrence R. et del Moral, Roger",
    title = "Primary Succession and Ecosystem Rehabilitation",
    year = "2003",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Les perturbations naturelles telles que les coulées de lave, les glissements de terrain et les moraines glaciaires, ainsi que les sites endommagés par l'homme tels que les pavages, les bordures de routes et les déchets miniers, laissent souvent peu ou pas de sol ou de patrimoine biologique. Ce livre de 2003 a fourni le premier résumé complet de la manière dont les communautés végétales, animales et microbiennes se développent dans des conditions difficiles suivant de telles perturbations dramatiques. Les auteurs examinent les principes fondamentaux qui déterminent le développement des écosystèmes et appliquent les règles générales au besoin pratique urgent de promouvoir la réhabilitation des terres endommagées. Écrit pour les écologistes concernés par les perturbations, la dynamique du paysage, la restauration, les histoires de vie, les invasions, la modélisation, la formation des sols et la dynamique des communautés ou des populations, ce livre servira également de texte d'autorité pour les étudiants de niveau master et de référence précieuse pour les professionnels impliqués dans la gestion des terres.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511615078",
    doi = "10.1017/cbo9780511615078",
    openalex = "W1685406372",
    references = "doi101007bf00039928, doi101007bf02857949, doi101023a1004475206351, doi101046j13652745200200696x, doi101111j109583122000tb01221x, doi1015159780691239477, doi1023071930735, doi1023071932934, doi1023072424020, doi105860choice380926, moral1998early"
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@article{doi101023a1023042929441,
    author = "Тимошок, Е. Е. et Narozhnyi, Yu. K. et Dirks, M. N. et Berezov, A. A.",
    title = "Expérience en études glaciologiques et botaniques combinées sur les successions végétales primaires sur des moraines jeunes dans l'Altai central",
    year = "2003",
    journal = "Russian Journal of Ecology",
    url = "https://doi.org/10.1023/a:1023042929441",
    doi = "10.1023/a:1023042929441",
    openalex = "W118777005",
    references = "doi1023071930735, doi1023071932934, doi1023072937039"
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@article{doi101023a1026208327014,
    author = "Hierro, José L. et Callaway, Ragan M.",
    title = "Allélopathie et invasion par des plantes exotiques",
    year = "2003",
    journal = "Plant and Soil",
    url = "https://doi.org/10.1023/a:1026208327014",
    doi = "10.1023/a:1026208327014",
    openalex = "W2060001561",
    references = "doi1010079781489972149, doi101007bf00332847, doi101086283244, doi101086417659, doi101126science2304728895, doi101146annurevecolsys32081501114037, doi1018901051076120000100689bicegc20co2, doi1023072257385, doi1023072483566, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw2077454220"
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@article{doi101046j109583392003t01100158x,
    author = "GROUP*, LA PHYLOGÉNIE DES ANGIOSPERMES",
    title = "Mise à jour de la classification du groupe de la phylogénie des angiospermes pour les ordres et les familles de plantes à fleurs : APG II",
    year = "2003",
    journal = "Journal botanique de la Société Linneenne",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    doi = "10.1046/j.1095-8339.2003.t01-1-00158.x",
    openalex = "W2980373194",
    references = "doi1023072399846"
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Résumé Objectif La succession primaire dans un environnement arctique élevé a été examinée pour déterminer si les motifs correspondent aux modèles basés sur des études dans les régions tempérées. Le lieu offrait également une occasion unique d'examiner une communauté végétale bien conservée pré‐petite ère glaciaire et un paléosol enrichi en matière organique qui sont libérés du glacier ainsi que les sédiments glaciaires et glaciofluviaux. Emplacements L'emplacement principal était le terrain récemment dégagé du foreland du glacier Twin à Alexandra Fjord, île d'Ellesmere (79° N). La position du glacier à partir de photos aériennes en 1959 et 1981, et la surveillance directe périodique de la position du front depuis 1980 ont fourni un bon contrôle chronologique. Des enquêtes sur les motifs de succession ont également été menées à quatre autres sites dans la région d'Alexandra Fiord de l'île d'Ellesmere, centre-est. Méthodes La couverture végétale des mousses et des plantes vasculaires (les lichens n'étaient pas présents) a été mesurée en 1994 et 1995 en utilisant un design aléatoire stratifié. twinspan et l'analyse de correspondance canonique ont été utilisés ensemble pour examiner les motifs de végétation successionale par rapport à un ensemble de variables environnementales. La richesse spécifique, la couverture végétale totale et un ensemble combiné de paramètres du sol (pH, teneur en matière organique, humidité et substrat fin) ont été comparés entre les deux principaux types de sol, paléosol et sédiment glaciofluvial. Résultats L'âge du terrain expliquait la majeure partie de la variation dans la composition des espèces sur la zone d'étude. La succession a suivi une série de remplacement directionnel avec quatre étapes principales de dominance en au moins 44 ans : (1) mousses → (2) graminoid‐forb → (3) arbuste caducifolié‐mousse → (4) arbuste nain persistant‐mousse. Il y avait peu de différence dans les motifs de richesse spécifique au fil du temps sur le paléosol par rapport au sédiment glaciofluvial. Cependant, la couverture végétale totale était significativement plus élevée sur le paléosol et il y avait une différence significative dans un ensemble combiné de paramètres du sol entre les deux types de sol, ce qui indique que le paléosol peut fournir des conditions plus favorables à l'établissement et à la croissance. Conclusions principales La succession de remplacement directionnel est possible dans un environnement oasien arctique élevé ; cependant, ce mode de succession est probablement atypique pour la plupart des environnements arctiques élevés plus étendus tels que les déserts polaires. Les résultats descriptifs de quatre autres forelands de glacier échantillonnés en 1995 sur l'île d'Ellesmere, centre-est, ont montré une succession directionnelle sans remplacement d'espèces à deux sites et une succession non directionnelle sans remplacement d'espèces à un autre site. La succession primaire dans ces sites arctiques élevés est fortement contrôlée par les conditions environnementales locales.

@article{doi101046j13652699200300818x,
    author = "Jones, Glenda A. and Henry, Greg H. R.",
    title = "Primary plant succession on recently deglaciated terrain in the Canadian High Arctic",
    year = "2003",
    journal = "Journal of Biogeography",
    abstract = "Résumé Objectif La succession primaire dans un environnement arctique élevé a été examinée pour déterminer si les motifs correspondent aux modèles basés sur des études dans les régions tempérées. Le lieu offrait également une occasion unique d'examiner une communauté végétale bien conservée pré‐petite ère glaciaire et un paléosol enrichi en matière organique qui sont libérés du glacier ainsi que les sédiments glaciaires et glaciofluviaux. Emplacements L'emplacement principal était le terrain récemment dégagé du foreland du glacier Twin à Alexandra Fjord, île d'Ellesmere (79° N). La position du glacier à partir de photos aériennes en 1959 et 1981, et la surveillance directe périodique de la position du front depuis 1980 ont fourni un bon contrôle chronologique. Des enquêtes sur les motifs de succession ont également été menées à quatre autres sites dans la région d'Alexandra Fiord de l'île d'Ellesmere, centre-est. Méthodes La couverture végétale des mousses et des plantes vasculaires (les lichens n'étaient pas présents) a été mesurée en 1994 et 1995 en utilisant un design aléatoire stratifié. twinspan et l'analyse de correspondance canonique ont été utilisés ensemble pour examiner les motifs de végétation successionale par rapport à un ensemble de variables environnementales. La richesse spécifique, la couverture végétale totale et un ensemble combiné de paramètres du sol (pH, teneur en matière organique, humidité et substrat fin) ont été comparés entre les deux principaux types de sol, paléosol et sédiment glaciofluvial. Résultats L'âge du terrain expliquait la majeure partie de la variation dans la composition des espèces sur la zone d'étude. La succession a suivi une série de remplacement directionnel avec quatre étapes principales de dominance en au moins 44 ans : (1) mousses → (2) graminoid‐forb → (3) arbuste caducifolié‐mousse → (4) arbuste nain persistant‐mousse. Il y avait peu de différence dans les motifs de richesse spécifique au fil du temps sur le paléosol par rapport au sédiment glaciofluvial. Cependant, la couverture végétale totale était significativement plus élevée sur le paléosol et il y avait une différence significative dans un ensemble combiné de paramètres du sol entre les deux types de sol, ce qui indique que le paléosol peut fournir des conditions plus favorables à l'établissement et à la croissance. Conclusions principales La succession de remplacement directionnel est possible dans un environnement oasien arctique élevé ; cependant, ce mode de succession est probablement atypique pour la plupart des environnements arctiques élevés plus étendus tels que les déserts polaires. Les résultats descriptifs de quatre autres forelands de glacier échantillonnés en 1995 sur l'île d'Ellesmere, centre-est, ont montré une succession directionnelle sans remplacement d'espèces à deux sites et une succession non directionnelle sans remplacement d'espèces à un autre site. La succession primaire dans ces sites arctiques élevés est fortement contrôlée par les conditions environnementales locales.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2699.2003.00818.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2699.2003.00818.x",
    openalex = "W2001443201"
}

Il y a une reconnaissance croissante du fait que la classification des espèces végétales terrestres sur la base de leur fonction (en « types fonctionnels ») plutôt que de leur identité taxonomique supérieure, constitue une voie prometteuse pour aborder des questions écologiques importantes à l'échelle des écosystèmes, des paysages ou des biomes. Ces questions incluent celles relatives aux réponses de la végétation aux changements environnementaux (par exemple, changements du climat, de la chimie atmosphérique, de l'utilisation des terres ou d'autres perturbations) et aux effets de la végétation sur ces changements. Il existe également un consensus croissant sur une liste restreinte de traits végétaux qui devraient sous-tendre de telles classifications fonctionnelles des plantes, car ils ont un pouvoir prédictif fort des réponses importantes des écosystèmes aux changements environnementaux et/ou ils ont eux-mêmes un impact fort sur les processus des écosystèmes. Les traits les plus favorisés sont ceux qui sont également relativement faciles et peu coûteux à mesurer pour un grand nombre d'espèces végétales. De grands efforts de recherche internationaux, promus par le Programme IGBP–GCTE, sont en cours pour cribler les espèces végétales prédominantes dans divers écosystèmes et biomes du monde entier pour de tels traits. Cet article fournit un protocole méthodologique international visant à standardiser cet effort de recherche, basé sur un consensus parmi un large groupe de scientifiques dans ce domaine. Il présente un manuel pratique avec des recettes étape par étape, avec des informations relativement brèves sur le contexte écologique, pour 28 traits fonctionnels reconnus comme critiques pour aborder des questions écologiques à grande échelle.

@article{doi101071bt02124,
    author = "Cornelissen, J. H. C. et Lavorel, Sandra et Garnier, Éric et Dı́az, Sandra et Buchmann, Nina et Gurvich, Diego E. et Reich, Peter B. et ter Steege, Hans et Morgan, Huw D. et van der Heijden, Marcel G. A. et Pausas, Juli G. et Poorter, Hendrik",
    title = "A handbook of protocols for standardised and easy measurement of plant functional traits worldwide",
    year = "2003",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Il y a une reconnaissance croissante du fait que la classification des espèces végétales terrestres sur la base de leur fonction (en « types fonctionnels ») plutôt que de leur identité taxonomique supérieure, constitue une voie prometteuse pour aborder des questions écologiques importantes à l'échelle des écosystèmes, des paysages ou des biomes. Ces questions incluent celles relatives aux réponses de la végétation aux changements environnementaux (par exemple, changements du climat, de la chimie atmosphérique, de l'utilisation des terres ou d'autres perturbations) et aux effets de la végétation sur ces changements. Il existe également un consensus croissant sur une liste restreinte de traits végétaux qui devraient sous-tendre de telles classifications fonctionnelles des plantes, car ils ont un pouvoir prédictif fort des réponses importantes des écosystèmes aux changements environnementaux et/ou ils ont eux-mêmes un impact fort sur les processus des écosystèmes. Les traits les plus favorisés sont ceux qui sont également relativement faciles et peu coûteux à mesurer pour un grand nombre d'espèces végétales. De grands efforts de recherche internationaux, promus par le Programme IGBP–GCTE, sont en cours pour cribler les espèces végétales prédominantes dans divers écosystèmes et biomes du monde entier pour de tels traits. Cet article fournit un protocole méthodologique international visant à standardiser cet effort de recherche, basé sur un consensus parmi un large groupe de scientifiques dans ce domaine. Il présente un manuel pratique avec des recettes étape par étape, avec des informations relativement brèves sur le contexte écologique, pour 28 traits fonctionnels reconnus comme critiques pour aborder des questions écologiques à grande échelle.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt02124",
    doi = "10.1071/bt02124",
    openalex = "W2144042033",
    references = "doi101006anbo20001261, doi1010160031942281851345, doi101023a1004327224729, doi10103835012241, doi101126science1060391, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi105860choice324498, openalexw1573494572, openalexw2097450069, openalexw2586781288"
}

Les bioessais constituent une partie intégrante de la recherche sur l'allopathie. L'inadéquation des bioessais de laboratoire pour expliquer les situations de terrain a été discutée précédemment. Dans cet article, nous discutons des progrès réalisés dans la conception expérimentale des bioessais et de plusieurs problèmes non résolus associés à la recherche sur l'allopathie. Les objectifs de cet article sont de discuter des problèmes liés à (1) la collecte de matériel allopathique pour les bioessais, (2) la quantification des allochimiques dans les bioessais, (3) le choix de la concentration des allochimiques dans les bioessais, (4) le choix d'un contrôle approprié, (5) l'interaction entre les allochimiques et d'autres substances, et (6) les bioessais d'allochimiques in situ. Nous avons conclu que de nouvelles conceptions expérimentales pour les bioessais in situ sont nécessaires, capables de prendre en compte le grand nombre de facteurs confondants dans un environnement de terrain complexe, et pouvant être liées à la surveillance physiologique des espèces cibles et à la surveillance biochimique du milieu de culture. Rapporteur : Dr. Stella Elakovich, Dept. of Chemistry and Biochemistry, University of Southern Mississippi, Hattiesburg, MS 390406-5043

@article{doi101080713610857,
    author = "Inderjit et Nilsen, Erik T.",
    title = "Bioessais et études de terrain pour l'allopathie chez les plantes terrestres : Progrès et problèmes",
    year = "2003",
    journal = "Critical Reviews in Plant Sciences",
    abstract = "Les bioessais constituent une partie intégrante de la recherche sur l'allopathie. L'inadéquation des bioessais de laboratoire pour expliquer les situations de terrain a été discutée précédemment. Dans cet article, nous discutons des progrès réalisés dans la conception expérimentale des bioessais et de plusieurs problèmes non résolus associés à la recherche sur l'allopathie. Les objectifs de cet article sont de discuter des problèmes liés à (1) la collecte de matériel allopathique pour les bioessais, (2) la quantification des allochimiques dans les bioessais, (3) le choix de la concentration des allochimiques dans les bioessais, (4) le choix d'un contrôle approprié, (5) l'interaction entre les allochimiques et d'autres substances, et (6) les bioessais d'allochimiques in situ. Nous avons conclu que de nouvelles conceptions expérimentales pour les bioessais in situ sont nécessaires, capables de prendre en compte le grand nombre de facteurs confondants dans un environnement de terrain complexe, et pouvant être liées à la surveillance physiologique des espèces cibles et à la surveillance biochimique du milieu de culture. Rapporteur : Dr. Stella Elakovich, Dept. of Chemistry and Biochemistry, University of Southern Mississippi, Hattiesburg, MS 390406-5043",
    url = "https://doi.org/10.1080/713610857",
    doi = "10.1080/713610857",
    openalex = "W1982284003",
    references = "doi1023072424020"
}

Plusieurs hypothèses, principalement la Défense Optimale (OD), l'Équilibre Carbone : Nutriments (CNB), le Taux de Croissance (GR) et l'Équilibre Croissance-Différenciation (GDB), ont individuellement servi de cadres pour étudier les modèles de défense des plantes contre les herbivores, en particulier le modèle de défense constitutive. Les prédictions et les tests de ces hypothèses ont posé problème pour diverses raisons et ont conduit à une confusion considérable concernant l'état de la « théorie de la défense des plantes ». La contribution principale de l'hypothèse OD est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de l'expression génotypique de la défense des plantes, avec un accent sur le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse CNB est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de la manière dont les ressources affectent l'expression phénotypique de la défense des plantes, souvent avec des études préoccupées par le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse GR est qu'elle explique comment le taux de croissance intrinsèque des plantes, façonné évolutionnairement par la disponibilité des ressources, affecte les modèles de défense. La contribution principale de l'hypothèse GDB élargie est qu'elle reconnaît le compromis physiologique constant entre la croissance et la différenciation aux niveaux cellulaire et tissulaire par rapport aux pressions de sélection de la disponibilité des ressources, en tenant explicitement compte de la tolérance des plantes aux dommages causés par les ennemis. Une compréhension plus claire de ces hypothèses et de ce que nous avons appris des enquêtes qui les utilisent peut faciliter le développement d'expériences bien conçues qui combleront les lacunes de nos connaissances sur la défense des plantes.

@article{doi101086367580,
    author = "Stamp, Nancy E.",
    title = "Out Of The Quagmire Of Plant Defense Hypotheses",
    year = "2003",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = {Plusieurs hypothèses, principalement la Défense Optimale (OD), l'Équilibre Carbone : Nutriments (CNB), le Taux de Croissance (GR) et l'Équilibre Croissance-Différenciation (GDB), ont individuellement servi de cadres pour étudier les modèles de défense des plantes contre les herbivores, en particulier le modèle de défense constitutive. Les prédictions et les tests de ces hypothèses ont posé problème pour diverses raisons et ont conduit à une confusion considérable concernant l'état de la « théorie de la défense des plantes ». La contribution principale de l'hypothèse OD est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de l'expression génotypique de la défense des plantes, avec un accent sur le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse CNB est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de la manière dont les ressources affectent l'expression phénotypique de la défense des plantes, souvent avec des études préoccupées par le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse GR est qu'elle explique comment le taux de croissance intrinsèque des plantes, façonné évolutionnairement par la disponibilité des ressources, affecte les modèles de défense. La contribution principale de l'hypothèse GDB élargie est qu'elle reconnaît le compromis physiologique constant entre la croissance et la différenciation aux niveaux cellulaire et tissulaire par rapport aux pressions de sélection de la disponibilité des ressources, en tenant explicitement compte de la tolérance des plantes aux dommages causés par les ennemis. Une compréhension plus claire de ces hypothèses et de ce que nous avons appris des enquêtes qui les utilisent peut faciliter le développement d'expériences bien conçues qui combleront les lacunes de nos connaissances sur la défense des plantes.},
    url = "https://doi.org/10.1086/367580",
    doi = "10.1086/367580",
    openalex = "W2129668362",
    references = "doi101098rspb19790081, doi101111j155856461980tb04849x, doi101126science1713973757, doi107208chicago97802264249720010001"
}

Si les impacts des invasions de plantes exotiques sur la structure des communautés et les processus écosystémiques sont bien reconnus, les voies ou mécanismes qui sous-tendent ces impacts sont mal compris. Une meilleure exploration de ces processus est essentielle pour comprendre pourquoi les plantes exotiques n'impactent que certains systèmes, et pourquoi seuls certains envahisseurs ont de grands impacts. Ici, nous passons en revue plus de 150 études pour évaluer les mécanismes sous-jacents aux impacts des invasions de plantes exotiques sur la structure des communautés végétales et animales, le cycle des nutriments, l'hydrologie et les régimes d'incendies. Nous constatons que, bien que de nombreuses études aient examiné les impacts des invasions sur la diversité et la composition des plantes, moins de 5 % testent si ces effets proviennent de la compétition, de l'allopathie, de l'altération des variables écosystémiques ou d'autres processus. Néanmoins, la compétition a souvent été supposée, et presque toutes les études comparant des plantes natives et exotiques ont trouvé des effets compétitifs forts des espèces exotiques. Contrairement aux études sur les impacts sur la structure des communautés végétales et les niveaux trophiques supérieurs, la recherche examinant les impacts sur le cycle de l'azote, l'hydrologie et les régimes d'incendies est généralement hautement mécanistique, souvent motivée par des traits spécifiques des envahisseurs. Nous encourageons les futures études qui lient les impacts sur la structure des communautés aux processus écosystémiques, et relient les contrôles de l'invasibilité aux contrôles de l'impact.

@article{doi101098rspb20032327,
    author = "Levine, Jonathan M. et Vilà, Montserrat et Antonio, Carla M. D et Dukes, Jeffrey S. et Grigulis, Karl et Lavorel, Sandra",
    title = "Mécanismes sous-jacents aux impacts des invasions de plantes exotiques",
    year = "2003",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Si les impacts des invasions de plantes exotiques sur la structure des communautés et les processus écosystémiques sont bien reconnus, les voies ou mécanismes qui sous-tendent ces impacts sont mal compris. Une meilleure exploration de ces processus est essentielle pour comprendre pourquoi les plantes exotiques n'impactent que certains systèmes, et pourquoi seuls certains envahisseurs ont de grands impacts. Ici, nous passons en revue plus de 150 études pour évaluer les mécanismes sous-jacents aux impacts des invasions de plantes exotiques sur la structure des communautés végétales et animales, le cycle des nutriments, l'hydrologie et les régimes d'incendies. Nous constatons que, bien que de nombreuses études aient examiné les impacts des invasions sur la diversité et la composition des plantes, moins de 5 % testent si ces effets proviennent de la compétition, de l'allopathie, de l'altération des variables écosystémiques ou d'autres processus. Néanmoins, la compétition a souvent été supposée, et presque toutes les études comparant des plantes natives et exotiques ont trouvé des effets compétitifs forts des espèces exotiques. Contrairement aux études sur les impacts sur la structure des communautés végétales et les niveaux trophiques supérieurs, la recherche examinant les impacts sur le cycle de l'azote, l'hydrologie et les régimes d'incendies est généralement hautement mécanistique, souvent motivée par des traits spécifiques des envahisseurs. Nous encourageons les futures études qui lient les impacts sur la structure des communautés aux processus écosystémiques, et relient les contrôles de l'invasibilité aux contrôles de l'impact.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2003.2327",
    doi = "10.1098/rspb.2003.2327",
    openalex = "W1969996400",
    references = "doi101046j13652745200000473x, openalexw2101875448"
}

@article{tanaka2003succession,
    author = "TANAKA, Shuhei et FUJII, Shigeo et YAMADA, Kiyoshi et UNEHARA, Kiyoko et NISHIKAWA, Hiroaki",
    title = "ANALYSE DE LA SUCCESSION DES COMMUNAUTÉS BOTANIQUES DANS LES CHAMPIONS DE SAULE",
    year = "2003",
    journal = "Doboku Gakkai Ronbunshu",
    url = "https://doi.org/10.2208/jscej.2003.727\_13",
    doi = "10.2208/jscej.2003.727\_13",
    number = "727",
    pages = "13-22",
    volume = "2003"
}

La plupart des théories et des recherches empiriques sur les invasions exotiques reposent sur l'hypothèse que les espèces exotiques problématiques sont beaucoup plus abondantes dans les régions qu'elles envahissent que dans les régions où elles sont natives. Cependant, la grande majorité des études sur les plantes exotiques ont été menées uniquement dans l'aire d'introduction. À quelques exceptions près, les écologues savent étonnamment peu sur l'abondance, les forces d'interaction et les impacts sur les écosystèmes, même des espèces exotiques bien étudiées dans leur aire native. Nous soutenons qu'une approche biogéographique est essentielle pour comprendre les invasions de plantes exotiques. Sur un plan descriptif, une quantification sans ambiguïté des distributions et des abondances des exotiques dans les aires native et introduite est cruciale. Des expériences menées à l'échelle biogéographique sont également nécessaires pour élucider les mécanismes qui permettent aux exotiques très réussis d'être présents à des abondances nettement plus élevées dans leurs communautés introduites par rapport à leurs communautés natives. Nous résumons les principales hypothèses concernant le succès des plantes exotiques. Nous affirmons que les tests de ces grandes hypothèses sur les invasions (les ennemis naturels, l'évolution de l'invasivité, les niches vides et les armes nouvelles) nécessitent des approches biogéographiques comparatives. En plus de se concentrer sur des travaux comparatifs dans les aires native et introduite, nous suggérons également d'autres approches qui pourraient fournir des aperçus importants sur les processus influençant le succès des exotiques. Une meilleure compréhension des invasions a le potentiel de fournir des aperçus uniques sur la théorie écologique fondamentale, y compris celle sur la structure individualiste-holistique, le rôle des interactions trophiques dans la régulation des populations et l'importance de la coévolution dans les communautés.

@article{doi101111j00220477200400953x,
    author = "Hierro, José L. and Maron, John L. and Callaway, Ragan M.",
    title = "A biogeographical approach to plant invasions: the importance of studying exotics in their introduced and native range",
    year = "2004",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "La plupart des théories et des recherches empiriques sur les invasions exotiques reposent sur l'hypothèse que les espèces exotiques problématiques sont beaucoup plus abondantes dans les régions qu'elles envahissent que dans les régions où elles sont natives. Cependant, la grande majorité des études sur les plantes exotiques ont été menées uniquement dans l'aire d'introduction. À quelques exceptions près, les écologues savent étonnamment peu sur l'abondance, les forces d'interaction et les impacts sur les écosystèmes, même des espèces exotiques bien étudiées dans leur aire native. Nous soutenons qu'une approche biogéographique est essentielle pour comprendre les invasions de plantes exotiques. Sur un plan descriptif, une quantification sans ambiguïté des distributions et des abondances des exotiques dans les aires native et introduite est cruciale. Des expériences menées à l'échelle biogéographique sont également nécessaires pour élucider les mécanismes qui permettent aux exotiques très réussis d'être présents à des abondances nettement plus élevées dans leurs communautés introduites par rapport à leurs communautés natives. Nous résumons les principales hypothèses concernant le succès des plantes exotiques. Nous affirmons que les tests de ces grandes hypothèses sur les invasions (les ennemis naturels, l'évolution de l'invasivité, les niches vides et les armes nouvelles) nécessitent des approches biogéographiques comparatives. En plus de se concentrer sur des travaux comparatifs dans les aires native et introduite, nous suggérons également d'autres approches qui pourraient fournir des aperçus importants sur les processus influençant le succès des exotiques. Une meilleure compréhension des invasions a le potentiel de fournir des aperçus uniques sur la théorie écologique fondamentale, y compris celle sur la structure individualiste-holistique, le rôle des interactions trophiques dans la régulation des populations et l'importance de la coévolution dans les communautés.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0022-0477.2004.00953.x",
    doi = "10.1111/j.0022-0477.2004.00953.x",
    openalex = "W2143395390",
    references = "doi101007bf00332847, doi101017s0094837300010617, doi101126science25350241099"
}

Si l'on sait que la structure et la composition des communautés végétales influencent le fonctionnement des écosystèmes, il n'existe pas encore d'accord sur la manière de les décrire d'un point de vue fonctionnel. Nous avons testé l'hypothèse du rapport de biomasse, qui postule que les propriétés des écosystèmes devraient dépendre des traits des espèces et de la contribution des espèces à la biomasse totale de la communauté, dans une série de succession suivant l'abandon de vignobles dans la région méditerranéenne de la France. La productivité primaire nette spécifique à l'écosystème, le taux de décomposition de la litière, et le carbone et l'azote totaux du sol ont varié significativement avec l'âge du champ, et ont corrélé avec les traits fonctionnels des feuilles agrégés à la communauté (c'est-à-dire pondés selon l'abondance relative des espèces). Les trois traits facilement mesurables testés, la surface spécifique des feuilles, la teneur en matière sèche des feuilles et la concentration en azote, offrent un moyen simple d'extrapoler du niveau de l'organe au niveau de l'écosystème dans les communautés végétales complexes. Nous proposons qu'ils soient appelés « marqueurs fonctionnels » et soient utilisés pour évaluer les impacts des changements de communauté sur les propriétés des écosystèmes induits, en particulier, par les facteurs du changement global.

@article{doi101890030799,
    author = "Garnier, Éric et Cortez, Jacques et Billès, G. et Navas, Marie‐Laure et Roumet, Catherine et Debussche, Max et Laurent, Gérard et Blanchard, Alain et Aubry, David A. et Bellmann, Astrid et Neill, Cathy et Toussaint, Jean-Patrick",
    title = "LES MARQUEURS FONCTIONNELS DES PLANTES CAPTURENT LES PROPRIÉTÉS DES ÉCOSYSTÈMES PENDANT LA SUCCESSION SECONDAIRE",
    year = "2004",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Si l'on sait que la structure et la composition des communautés végétales influencent le fonctionnement des écosystèmes, il n'existe pas encore d'accord sur la manière de les décrire d'un point de vue fonctionnel. Nous avons testé l'hypothèse du rapport de biomasse, qui postule que les propriétés des écosystèmes devraient dépendre des traits des espèces et de la contribution des espèces à la biomasse totale de la communauté, dans une série de succession suivant l'abandon de vignobles dans la région méditerranéenne de la France. La productivité primaire nette spécifique à l'écosystème, le taux de décomposition de la litière, et le carbone et l'azote totaux du sol ont varié significativement avec l'âge du champ, et ont corrélé avec les traits fonctionnels des feuilles agrégés à la communauté (c'est-à-dire pondés selon l'abondance relative des espèces). Les trois traits facilement mesurables testés, la surface spécifique des feuilles, la teneur en matière sèche des feuilles et la concentration en azote, offrent un moyen simple d'extrapoler du niveau de l'organe au niveau de l'écosystème dans les communautés végétales complexes. Nous proposons qu'ils soient appelés « marqueurs fonctionnels » et soient utilisés pour évaluer les impacts des changements de communauté sur les propriétés des écosystèmes induits, en particulier, par les facteurs du changement global.",
    url = "https://doi.org/10.1890/03-0799",
    doi = "10.1890/03-0799",
    openalex = "W2119567434",
    references = "doi101126science1643877262, doi101146annurevecolsys33010802150452"
}

@article{doi101007s1125800528431,
    author = "Jones, Chad C. et del Moral, Roger",
    title = "Patterns of Primary Succession on the Foreland of Coleman Glacier, Washington, USA",
    year = "2005",
    journal = "Plant Ecology",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11258-005-2843-1",
    doi = "10.1007/s11258-005-2843-1",
    openalex = "W2017768881",
    references = "moral1998early"
}

Les micro-organismes pathogènes affectant la santé des plantes constituent une menace majeure et chronique pour la production alimentaire et la stabilité des écosystèmes dans le monde entier. Alors que la production agricole s'est intensifiée au cours des dernières décennies, les producteurs sont devenus de plus en plus dépendants des agrochimiques en tant que méthode relativement fiable de culture

@article{doi101128aem719495149592005,
    author = "Compant, Stéphane et Duffy, Brion et Nowak, Jerzy et Clément, Christophe et Barka, Essaïd Ait",
    title = "Utilisation de bactéries favorisant la croissance des plantes pour le contrôle biologique des maladies des plantes : Principes, mécanismes d'action et perspectives futures",
    year = "2005",
    journal = "Applied and Environmental Microbiology",
    abstract = "Les micro-organismes pathogènes affectant la santé des plantes constituent une menace majeure et chronique pour la production alimentaire et la stabilité des écosystèmes dans le monde entier. Alors que la production agricole s'est intensifiée au cours des dernières décennies, les producteurs sont devenus de plus en plus dépendants des agrochimiques en tant que méthode relativement fiable de culture",
    url = "https://doi.org/10.1128/aem.71.9.4951-4959.2005",
    doi = "10.1128/aem.71.9.4951-4959.2005",
    openalex = "W2135333204"
}

Résumé Alors que les espèces végétales exotiques envahissent les écosystèmes, les écologues tentent d'évaluer les effets de ces invasions sur les communautés indigènes et de déterminer quels facteurs influencent les processus d'invasion. Bien que beaucoup de ce travail se soit concentré sur la flore et la faune aériennes, les communautés de sol structurales et fonctionnellement diverses peuvent également réagir et médier les invasions de plantes exotiques. Dans de nombreux écosystèmes, l'invasion d'espèces végétales exotiques a provoqué des changements majeurs dans la composition et la fonction des communautés de sol. Les organismes du sol, tels que les champignons pathogènes ou mutualistes, ont des effets directs sur l'établissement, la croissance et les interactions biotiques des plantes exotiques. Une compréhension intégrée de la manière dont la biote aérienne et souterraine interagit avec les plantes exotiques est nécessaire pour gérer et restaurer les communautés envahies par des espèces végétales exotiques.

@article{doi1016410006356820050550477bngsca20co2,
    author = "Wolfe, Benjamin E. and Klironomos, John N.",
    title = "Breaking New Ground: Soil Communities and Exotic Plant Invasion",
    year = "2005",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Résumé Alors que les espèces végétales exotiques envahissent les écosystèmes, les écologues tentent d'évaluer les effets de ces invasions sur les communautés indigènes et de déterminer quels facteurs influencent les processus d'invasion. Bien que beaucoup de ce travail se soit concentré sur la flore et la faune aériennes, les communautés de sol structurales et fonctionnellement diverses peuvent également réagir et médier les invasions de plantes exotiques. Dans de nombreux écosystèmes, l'invasion d'espèces végétales exotiques a provoqué des changements majeurs dans la composition et la fonction des communautés de sol. Les organismes du sol, tels que les champignons pathogènes ou mutualistes, ont des effets directs sur l'établissement, la croissance et les interactions biotiques des plantes exotiques. Une compréhension intégrée de la manière dont la biote aérienne et souterraine interagit avec les plantes exotiques est nécessaire pour gérer et restaurer les communautés envahies par des espèces végétales exotiques.",
    url = "https://doi.org/10.1641/0006-3568(2005)055[0477:bngsca]2.0.co;2",
    doi = "10.1641/0006-3568(2005)055[0477:bngsca]2.0.co;2",
    openalex = "W2178257952",
    references = "doi101023a1026208327014"
}

Les plantes aquatiques sont des composants importants de nombreux écosystèmes d'eau douce. Dans cette revue, nous examinons les influences naturelles et anthropiques sur la distribution et l'abondance des plantes aquatiques, et élaborons un modèle conceptuel de ces interactions diverses. Les espèces de plantes aquatiques varient considérablement en ce qui concerne leur anatomie, leur physiologie, leurs traits d'histoire de vie et leur capacité à tolérer les stress inorganiques et biologiques. Des exemples clés de stress inorganiques sont les régimes extrêmes de vitesse d'écoulement, d'irradiance, de salinité, de couverture de glace, de température, de nutriments et de polluants. Les stress associés à la compétition, à l'herbivorie et aux maladies peuvent également limiter la capacité des espèces à utiliser des habitats autrement appropriés. Certaines plantes aquatiques ont une distribution cosmopolite et affichent des niveaux élevés de polymorphisme et de plasticité phénotypique en réponse aux variations des facteurs environnementaux ; ces qualités leur permettent de se développer dans une large gamme de conditions. D'autres espèces, en revanche, ont des tolérances plus étroites et peuvent être des indicateurs utiles des conditions environnementales, en termes de leur présence ou de leur abondance relative au sein des communautés. Dans cette revue, nous examinons les influences environnementales clés affectant les plantes aquatiques et leur potentiel d'utilisation comme indicateurs à des échelles locale, de bassin versant et régionale. Mots-clés : plantes aquatiques (macrophytes aquatiques), facteurs environnementaux, indicateurs environnementaux, stress environnementaux.

@article{doi101139a06001,
    author = "Lacoul, P. and Freedman, Bill",
    title = "Environmental influences on aquatic plants in freshwater ecosystems",
    year = "2006",
    journal = "Environmental Reviews",
    abstract = "Aquatic plants are important components of many freshwater ecosystems. In this review we examine natural and anthropogenic influences on the distribution and abundance of aquatic plants, and develop a conceptual model of those diverse interactions. Species of aquatic plants vary greatly in their anatomy, physiology, life-history traits, and ability to tolerate inorganic and biological stressors. Key examples of inorganic stressors are extreme regimes of flow velocity, irradiance, salinity, ice cover, temperature, nutrients, and pollutants. Stressors associated with competition, herbivory, and disease may also limit the ability of species to utilize otherwise suitable habitats. Some aquatic plants have a cosmopolitan distribution and display high levels of polymorphism and phenotypic plasticity in response to variations of environmental factors; these qualities allow them to occur over a wide range of conditions. Other species, however, have narrower tolerances and are potentially useful indicators of environmental conditions, in terms of either their presence or relative abundance within communities. In this review, we examine key environmental influences affecting aquatic plants, and their potential use as indicators at local, watershed, and regional scales.Key words: aquatic plants (aquatic macrophytes), environmental factors, environmental indicators, environmental stressors.",
    url = "https://doi.org/10.1139/a06-001",
    doi = "10.1139/a06-001",
    openalex = "W2115384857",
    references = "doi101007bf00008684, doi101007bf02856599, doi101016s0304377002000281, doi101046j13652427199700183x"
}

Le fondement mécanistique sous-tendant la succession forestière est le paradigme de la phase de trouée, dans lequel la perturbation du couvert supérieur interagit avec la tolérance à l'ombre des semis et des jeunes arbres pour déterminer les trajectoires de succession. La théorie, et les modèles de simulation qui en découlent, supposent généralement que les plantes de l'ombre d'arbres ont peu d'impact sur la composition de la couche de régénération avancée. Nous remettons en question cette hypothèse en examinant plus de 125 articles sur 38 espèces dans le monde entier qui forment des canopées d'ombre denses et persistantes. Une fois établie, cette couche réduit fortement la régénération des arbres, modifiant ainsi le rythme et la direction de la succession forestière. Nous désignons ces strates denses par couches d'ombre denses récalcitrantes. Plus de la moitié des cas examinés étaient liés à une augmentation de la perturbation du couvert et soit à une herbivorie modifiée, soit à des régimes d'incendie. Près de 75 % des études ont déclaré que la compétition et l'allopathie étaient les mécanismes d'interférence probables réduisant la régénération des arbres, mais seulement 25 % des études ont utilisé des expériences de terrain manipulatives pour tester ces mécanismes supposés. Nous présentons un modèle conceptuel qui relie les facteurs prédisposant la formation de couches d'ombre denses récalcitrantes à leurs mécanismes d'interférence et à leurs impacts ultérieurs sur la succession. Nous proposons que leur présence restreint la diversité floristique et plaçons pour leur inclusion explicite dans la théorie et les modèles de dynamique forestière. Enfin, nous offrons des suggestions de gestion pour limiter leur établissement et atténuer leurs impacts.

@article{doi101139x06025,
    author = "Royo, Alejandro A. and Carson, Walter P.",
    title = "On the formation of dense understory layers in forests worldwide: consequences and implications for forest dynamics, biodiversity, and succession",
    year = "2006",
    journal = "Canadian Journal of Forest Research",
    abstract = "The mechanistic basis underpinning forest succession is the gap-phase paradigm in which overstory disturbance interacts with seedling and sapling shade tolerance to determine successional trajectories. The theory, and ensuing simulation models, typically assume that understory plants have little impact on the advance regeneration layer's composition. We challenge that assumption by reviewing over 125 papers on 38 species worldwide that form dense and persistent understory canopies. Once established, this layer strongly diminishes tree regeneration, thus altering the rate and direction of forest succession. We term these dense strata recalcitrant understory layers. Over half of the cases reviewed were linked to increases in canopy disturbance and either altered herbivory or fire regimes. Nearly 75\% of the studies declared that competition and allelopathy were the likely interference mechanisms decreasing tree regeneration, yet only 25\% of the studies used manipulative field experiments to test these putative mechanisms. We present a conceptual model that links the factors predisposing the formation of recalcitrant understory layers with their interference mechanisms and subsequent impacts on succession. We propose that their presence constricts floristic diversity and argue for their explicit inclusion in forest dynamics theory and models. Finally, we offer management suggestions to limit their establishment and mitigate their impacts.",
    url = "https://doi.org/10.1139/x06-025",
    doi = "10.1139/x06-025",
    openalex = "W2126544822",
    references = "doi101007bf00332847, doi101146annurevecolsys35021103105725"
}

La rhizosphère englobe les millimètres de sol entourant une racine de plante où se produisent des processus biologiques et écologiques complexes. Cette revue décrit les récents progrès dans l'élucidation du rôle des exsudats racinaires dans les interactions entre les racines de plantes et d'autres plantes, micro-organismes et nématodes présents dans la rhizosphère. Des preuves indiquant que les exsudats racinaires peuvent participer aux événements de signalisation qui initient l'exécution de ces interactions sont également présentées. Diverses interactions positives et négatives plante-plante et plante-microbe sont mises en évidence et décrites de l'échelle moléculaire à l'échelle de l'écosystème. De plus, des méthodologies pour aborder ces interactions dans des conditions de laboratoire sont présentées.

@article{doi101146annurevarplant57032905105159,
    author = "Bais, Harsh P. et Weir, Tiffany L. et Perry, Laura G. et Gilroy, Simon et Vivanco, Jorge M.",
    title = "THE ROLE OF ROOT EXUDATES IN RHIZOSPHERE INTERACTIONS WITH PLANTS AND OTHER ORGANISMS",
    year = "2006",
    journal = "Annual Review of Plant Biology",
    abstract = "La rhizosphère englobe les millimètres de sol entourant une racine de plante où se produisent des processus biologiques et écologiques complexes. Cette revue décrit les récents progrès dans l'élucidation du rôle des exsudats racinaires dans les interactions entre les racines de plantes et d'autres plantes, micro-organismes et nématodes présents dans la rhizosphère. Des preuves indiquant que les exsudats racinaires peuvent participer aux événements de signalisation qui initient l'exécution de ces interactions sont également présentées. Diverses interactions positives et négatives plante-plante et plante-microbe sont mises en évidence et décrites de l'échelle moléculaire à l'échelle de l'écosystème. De plus, des méthodologies pour aborder ces interactions dans des conditions de laboratoire sont présentées.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.arplant.57.032905.105159",
    doi = "10.1146/annurev.arplant.57.032905.105159",
    openalex = "W2118355172",
    references = "doi101023a1026208327014, doi101038nature01485"
}

Le pathogène du sol envahissant Phytophthora cinnamomi Rands est un processus menaçant majeur dans la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale, une hotte de biodiversité reconnue internationalement. L'introduction relativement récente de P. cinnamomi dans les communautés végétales indigènes de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale depuis le début des années 1900 a causé d'importants dommages irréversibles et modifié les changements successoraux dans une large gamme de communautés végétales uniques, diverses et principalement sensibles. Le coût de l'infestation par P. cinnamomi pour les valeurs communautaires est illustré par l'examen des impacts directs (courbes de mortalité, changements de couverture végétale) et indirects sur la biodiversité et la dynamique des écosystèmes, la proportion de communautés écologiques menacées infestées, de flore rare déclarée directement ou indirectement menacée par l'infestation et des estimations de la proportion de la flore indigène de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale sensible au pathogène. Bien que les impacts directs de P. cinnamomi aient été mal documentés dans la province botanique du Sud-ouest, encore moins d'attention a été accordée aux impacts indirects où la destruction de l'habitat par le pathogène affecte des taxons non directement touchés par l'infection. La mauvaise compréhension et quantification actuelles des impacts indirects de P. cinnamomi par destruction de l'habitat entraînent une sous-estimation de l'impact réel du pathogène sur la flore de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale. La considérable variation de sensibilité à P. cinnamomi entre et au sein des familles de flore menacée et les réponses des taxons au sein du genre Lambertia montrent comment la classification au niveau de la famille et du genre sont de mauvais prédicteurs de la sensibilité des espèces. Au sein d'espèces végétales apparemment sensibles, les individus sont résistants à l'infection par P. cinnamomi. La variation intra-spécifique de sensibilité peut être utilisée dans la gestion à long terme des populations de flore menacée et doit être une priorité de recherche majeure. Les stratégies de contrôle actuelles pour la conservation de la flore menacée par P. cinnamomi intègrent l'hygiène et la conservation ex situ avec le contrôle de la maladie par fongicide. L'application du fongicide phosphite s'est avérée efficace pour ralentir la progression de P. cinnamomi dans les communautés infestées et menacées. Cependant, la variation des réponses des espèces végétales à l'application de phosphite est un facteur majeur influençant le contrôle efficace de P. cinnamomi dans les communautés indigènes. Une meilleure compréhension des mécanismes d'action du phosphite dans les espèces végétales montrant des réponses différentes au fongicide pourrait fournir des options pour la modification des prescriptions afin d'augmenter l'efficacité du phosphite dans une gamme d'espèces végétales. La gamme de réponses à l'infection par P. cinnamomi et à l'application de phosphite décrite pour les taxons de Lambertia suggère que le genre constituerait un système modèle idéal pour élucider les mécanismes de résistance à P. cinnamomi et l'efficacité du phosphite contre le pathogène.

@article{doi101071bt06019,
    author = "Shearer, B. L. and Crane, C. E. and Barrett, Sarah and Cochrane, Anne",
    title = "Invasion de Phytophthora cinnamomi, un processus menaçant majeur pour la conservation de la diversité floristique dans la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale",
    year = "2007",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Le pathogène végétal solitaire invasif Phytophthora cinnamomi Rands est un processus menaçant majeur dans la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale, un point chaud de la biodiversité reconnu internationalement. L'introduction relativement récente de P. cinnamomi dans les communautés végétales indigènes de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale depuis le début des années 1900 a causé d'importants dommages irréversibles et modifié les changements successoraux dans une large gamme de communautés végétales uniques, diverses et principalement sensibles. Le coût de l'infestation par P. cinnamomi pour les valeurs communautaires est illustré par l'examen des impacts directs (courbes de mortalité, changements de couverture végétale) et indirects sur la biodiversité et la dynamique des écosystèmes, la proportion de communautés écologiques menacées infestées, la flore rare déclarée menacée directement ou indirectement par l'infestation et les estimations de la proportion de la flore indigène de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale sensible au pathogène. Bien que les impacts directs de P. cinnamomi aient été mal documentés dans la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale, encore moins d'attention a été accordée aux impacts indirects où la destruction de l'habitat par le pathogène affecte des taxons non directement touchés par l'infection. La mauvaise compréhension et quantification actuelles des impacts indirects de P. cinnamomi par destruction de l'habitat entraînent une sous-estimation de l'impact réel du pathogène sur la flore de la province botanique du Sud-ouest de l'Australie-Occidentale. La variation considérable de la sensibilité à P. cinnamomi entre et au sein des familles de flore menacée et les réponses des taxons au sein du genre Lambertia montrent comment la classification au niveau de la famille et du genre sont de mauvais prédicteurs de la sensibilité des espèces. Au sein des espèces végétales apparemment sensibles, les individus sont résistants à l'infection par P. cinnamomi. La variation intra-spécifique de la sensibilité peut être utilisée dans la gestion à long terme des populations de flore menacée et doit être une priorité de recherche majeure. Les stratégies de contrôle actuelles pour la conservation de la flore menacée par P. cinnamomi intègrent l'hygiène et la conservation ex situ avec le contrôle de la maladie en utilisant des fongicides. L'application du fongicide phosphite s'est avérée efficace pour ralentir la progression de P. cinnamomi dans les communautés infestées et menacées. Cependant, la variation des réponses des espèces végétales à l'application de phosphite est un facteur majeur influençant le contrôle efficace de P. cinnamomi dans les communautés indigènes. Une meilleure compréhension des mécanismes d'action du phosphite dans les espèces végétales montrant des réponses différentes au fongicide pourrait fournir des options pour la modification des prescriptions afin d'augmenter l'efficacité du phosphite dans une gamme d'espèces végétales. La gamme de réponses à l'infection par P. cinnamomi et à l'application de phosphite décrite pour les taxons de Lambertia suggère que le genre constituerait un système modèle idéal pour élucider les mécanismes de résistance à P. cinnamomi et l'efficacité du phosphite contre le pathogène.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt06019",
    doi = "10.1071/bt06019",
    openalex = "W2000980675",
    references = "doi101007s003820060115y, doi10103835002501, doi101093forestry72159, doi101111j1466822x200600212x, doi101111j1469185x1991tb01139x, doi101146annurevecolsys35112202130201, doi1018901540929520050030012ispmaf20co2, openalexw1525511537, openalexw2101875448, openalexw2777527484"
}

1 Autrefois négligé, le rôle des interactions facilitatrices dans les communautés végétales a fait l'objet d'une attention considérable au cours des deux dernières décennies et est maintenant largement reconnu. Il est opportun d'examiner les progrès réalisés par la recherche dans ce domaine. 2 Nous passons en revue le développement de la recherche sur la facilitation végétale, en nous concentrant sur l'histoire du domaine, la relation entre les interactions plante–plante et les gradients de sévérité environnementale, ainsi que les tentatives d'intégration de la facilitation dans la théorie écologique dominante. Nous examinons ensuite les perspectives futures pour la recherche sur la facilitation. 3 En ce qui concerne notre compréhension fondamentale de la facilitation végétale, la clarification de la relation entre les interactions et les gradients environnementaux est centrale pour les progrès futurs et nécessite la conception et la mise en œuvre d'expériences qui dépassent les limites claires des études précédentes. 4 Il existe un vaste champ d'exploration des effets facilitateurs indirects dans les communautés végétales, y compris leurs impacts sur la diversité et l'évolution, et les études futures devraient relier le degré de non-transitivité dans les réseaux de compétition végétale à la diversité des communautés et à la promotion facilitatrice de la coexistence des espèces, et explorer comment le rôle de la facilitation indirecte varie avec la sévérité environnementale. 5 Certaines approches de modélisation écologique (par exemple, la modélisation basée sur les individus), bien que jusqu'à présent largement négligées, offrent des outils très utiles pour explorer ces processus fondamentaux. 6 Les réponses évolutives pourraient résulter d'interactions facilitatrices, et la prise en compte de la facilitation pourrait conduire à une réévaluation de l'évolution des formes de croissance des plantes. 7 Une meilleure compréhension des processus de facilitation a une pertinence directe pour le développement d'outils de restauration des écosystèmes et pour améliorer notre compréhension de la réponse des espèces et communautés végétales aux facteurs de changement environnemental. 8 Les tentatives d'appliquer nos connaissances écologiques en développement bénéficieraient d'une reconnaissance explicite du rôle potentiel des interactions facilitatrices plante–plante dans la conception et l'interprétation des études issues des domaines de l'écologie de la restauration et de l'écologie du changement global. 9 Synthèse : La recherche sur la facilitation végétale offre de nouveaux aperçus sur la théorie écologique classique et les problèmes environnementaux urgents. La prise de conscience et la compréhension de la facilitation devraient faire partie des connaissances écologiques de base de tous les écologistes végétaux.

@article{doi101111j13652745200701295x,
    author = "Brooker, Rob W. et al.",
    title = "Facilitation in plant communities: the past, the present, and the future",
    year = "2007",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "1 Autrefois négligé, le rôle des interactions facilitatrices dans les communautés végétales a fait l'objet d'une attention considérable au cours des deux dernières décennies et est maintenant largement reconnu. Il est opportun d'examiner les progrès réalisés par la recherche dans ce domaine. 2 Nous passons en revue le développement de la recherche sur la facilitation végétale, en nous concentrant sur l'histoire du domaine, la relation entre les interactions plante–plante et les gradients de sévérité environnementale, et les tentatives d'intégration de la facilitation dans la théorie écologique dominante. Nous examinons ensuite les perspectives futures pour la recherche sur la facilitation. 3 En ce qui concerne notre compréhension fondamentale de la facilitation végétale, la clarification de la relation entre les interactions et les gradients environnementaux est centrale pour les progrès futurs et nécessite la conception et la mise en œuvre d'expériences qui dépassent les limites claires des études précédentes. 4 Il existe un vaste champ d'exploration pour les effets facilitateurs indirects dans les communautés végétales, y compris leurs impacts sur la diversité et l'évolution, et les études futures devraient relier le degré de non-transitivité dans les réseaux de compétition végétale à la diversité des communautés et à la promotion facilitatrice de la coexistence des espèces, et explorer comment le rôle de la facilitation indirecte varie avec la sévérité environnementale. 5 Certaines approches de modélisation écologique (par exemple, la modélisation basée sur les individus), bien que jusqu'à présent largement négligées, offrent des outils très utiles pour explorer ces processus fondamentaux. 6 Les réponses évolutives pourraient résulter d'interactions facilitatrices, et la prise en compte de la facilitation pourrait conduire à une réévaluation de l'évolution des formes de croissance des plantes. 7 Une meilleure compréhension des processus de facilitation a une pertinence directe pour le développement d'outils de restauration des écosystèmes et pour améliorer notre compréhension de la réponse des espèces végétales et des communautés aux facteurs de changement environnemental. 8 Les tentatives d'appliquer nos connaissances écologiques en développement bénéficieraient d'une reconnaissance explicite du rôle potentiel des interactions facilitatrices plante–plante dans la conception et l'interprétation des études issues des domaines de l'écologie de la restauration et de l'écologie du changement global. 9 Synthèse : La recherche sur la facilitation végétale offre de nouvelles perspectives sur la théorie écologique classique et les problèmes environnementaux urgents. La prise de conscience et la compréhension de la facilitation devraient faire partie des connaissances écologiques de base de tous les écologistes végétaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2745.2007.01295.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2745.2007.01295.x",
    openalex = "W1986322390",
    references = "doi101007bf02912621, doi101016s0169534702000459, doi101023a1010086329619, doi101038nrg700, doi101111j13652745200501017x, doi101111j1466822x200600212x, doi1018900012965819970781958cafasa20co2, doi1018900012965819970781966tiofac20co2, doi1023071939337, doi1023072937039"
}

RÉSUMÉ Les rivières sont des conduits pour les matériaux et l'énergie ; ceci, les perturbations fréquentes et intenses que ces systèmes subissent, et leur nature étroite et linéaire, créent des problèmes pour la conservation de la biodiversité et du fonctionnement des écosystèmes face à l'influence humaine croissante. Dans la plupart des régions du monde, les zones riveraines sont fortement modifiées. Les changements causés par les plantes exotiques — ou les changements environnementaux qui facilitent les décalages de dominance créant des écosystèmes nouveaux — sont souvent des agents importants de perturbation dans ces systèmes. De nombreux projets de restauration sont en cours. Des cadres objectifs basés sur la compréhension des processus biogéographiques à différentes échelles spatiales (étendue, segment, bassin versant), les relations spécifiques entre les plantes envahissantes et la résilience et le fonctionnement des écosystèmes, et des objectifs réalistes sont nécessaires pour guider les initiatives de restauration durable. Cet article examine la biogéographie et les déterminants de la composition et de la structure de la végétation riveraine dans les régions tempérées et subtropicales et conceptualise les composants de résilience dans ces systèmes. Nous considérons les changements de structure et de fonctionnement causés par, ou associés à, les invasions de plantes exotiques, en particulier ceux qui conduisent à des seuils abiotiques ou biotiques franchis. Ces derniers posent des défis lors de la formulation de programmes de restauration. Les changements humains médiatisés, répandus et croissants, affectant de multiples facteurs et à différentes échelles dans les environnements riverains, exigent des approches innovantes et pragmatiques pour la restauration. L'application d'un nouveau cadre accommodant une telle complexité est démontrée par référence à un écosystème riverain hypothétique sous trois scénarios : (1) système non affecté par les plantes envahissantes ; (2) système initialement non envahi, mais avec une incursion de plantes exotiques générée par les inondations et une altération croissante entraînée par l'invasion ; et (3) système affecté à la fois par les invasions et par les interventions d'ingénierie. Le schéma a été utilisé pour élaborer un cadre de prise de décision pour la restauration des zones riveraines en Afrique du Sud et pourrait guider des initiatives similaires dans d'autres parties du monde.

@article{doi101111j13669516200600314x,
    author = "Richardson, David M. et Holmes, Patricia M. et Esler, Karen J. et Galatowitsch, Susan M. et Stromberg, Juliet C. et Kirkman, Steven P. et Pyšek, Petr et Hobbs, Richard J.",
    title = "Riparian vegetation: degradation, alien plant invasions, and restoration prospects",
    year = "2007",
    journal = "Diversity and Distributions",
    abstract = "RÉSUMÉ Les rivières sont des conduits pour les matériaux et l'énergie ; ceci, les perturbations fréquentes et intenses que ces systèmes subissent, et leur nature étroite et linéaire, créent des problèmes pour la conservation de la biodiversité et du fonctionnement des écosystèmes face à l'influence humaine croissante. Dans la plupart des régions du monde, les zones riveraines sont fortement modifiées. Les changements causés par les plantes exotiques — ou les changements environnementaux qui facilitent les décalages de dominance créant des écosystèmes nouveaux — sont souvent des agents importants de perturbation dans ces systèmes. De nombreux projets de restauration sont en cours. Des cadres objectifs basés sur la compréhension des processus biogéographiques à différentes échelles spatiales (étendue, segment, bassin versant), les relations spécifiques entre les plantes envahissantes et la résilience et le fonctionnement des écosystèmes, et des objectifs réalistes sont nécessaires pour guider les initiatives de restauration durable. Cet article examine la biogéographie et les déterminants de la composition et de la structure de la végétation riveraine dans les régions tempérées et subtropicales et conceptualise les composants de résilience dans ces systèmes. Nous considérons les changements de structure et de fonctionnement causés par, ou associés à, les invasions de plantes exotiques, en particulier ceux qui conduisent à des seuils abiotiques ou biotiques franchis. Ces derniers posent des défis lors de la formulation de programmes de restauration. Les changements humains médiatisés, répandus et croissants, affectant de multiples facteurs et à différentes échelles dans les environnements riverains, exigent des approches innovantes et pragmatiques pour la restauration. L'application d'un nouveau cadre accommodant une telle complexité est démontrée par référence à un écosystème riverain hypothétique sous trois scénarios : (1) système non affecté par les plantes envahissantes ; (2) système initialement non envahi, mais avec une incursion de plantes exotiques générée par les inondations et une altération croissante entraînée par l'invasion ; et (3) système affecté à la fois par les invasions et par les interventions d'ingénierie. Le schéma a été utilisé pour élaborer un cadre de prise de décision pour la restauration des zones riveraines en Afrique du Sud et pourrait guider des initiatives similaires dans d'autres parties du monde.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1366-9516.2006.00314.x",
    doi = "10.1111/j.1366-9516.2006.00314.x",
    openalex = "W2141713151",
    references = "doi101023a1004475206351"
}

@article{doi101016jplaphy200806011,
    author = "Sels, Jan et Mathys, Janick et Coninck, Barbara De et Cammue, Bruno P.A. et Bolle, Miguel F. C. De",
    title = "Plant pathogenesis-related (PR) proteins : Un focus sur les peptides PR",
    year = "2008",
    journal = "Plant Physiology and Biochemistry",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2008.06.011",
    doi = "10.1016/j.plaphy.2008.06.011",
    openalex = "W2063888937"
}

Les communautés végétales indigènes, les forêts et les paysages au Royaume-Uni et à travers le monde souffrent de pathogènes introduits par les activités humaines. De nombreux de ces pathogènes arrivent sur ou avec des plantes vivantes. Le potentiel de dommages à l'avenir peut être important, mais les réglementations internationales actuelles visant à réduire les risques ne tiennent pas suffisamment compte des preuves scientifiques et, en pratique, sont souvent très insuffisantes. Dans cette lettre, je dépeins les problèmes et discute de certaines approches possibles pour réduire les menaces.

@article{doi101111j13653059200801886x,
    author = "Brasier, C. M.",
    title = "The biosecurity threat to the UK and global environment from international trade in plants",
    year = "2008",
    journal = "Plant Pathology",
    abstract = "Native plant communities, woodlands and landscapes in the UK and across the world are suffering from pathogens introduced by human activities. Many of these pathogens arrive on or with living plants. The potential for damage in the future may be large, but current international regulations aimed at reducing the risks take insufficient account of scientific evidence and, in practice, are often highly inadequate. In this Letter I outline the problems and discuss some possible approaches to reducing the threats.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2008.01886.x",
    doi = "10.1111/j.1365-3059.2008.01886.x",
    openalex = "W2098970393",
    references = "doi101111mpp12568"
}

De nombreux manuels d'écologie introductifs illustrent la succession, au moins en partie, en utilisant certaines études classiques (par exemple, les dunes de sable, les étangs/bourbiers, les dépôts glaciaires et les champs abandonnés) qui ont substitué l'espace au temps (chronoséquence) pour déterminer les séquences de la succession. Malgré les critiques passées de cette méthode, il existe une utilisation continue, souvent non critique, des chronoséquences dans la recherche actuelle sur des sujets autres que la succession, y compris les changements temporels de la biodiversité, de la productivité, du cycle des nutriments, etc. Pour montrer le problème des études basées sur les chronoséquences en général, nous examinons les preuves provenant d'études qui ont utilisé des méthodes non basées sur les chronoséquences (telles que l'étude à long terme de parcelles permanentes, la palynologie et la reconstruction des peuplements) pour tester la substitution espace-temps dans quatre études classiques de succession. Dans plusieurs cas, les tests ont utilisé les mêmes emplacements et, dans un cas, les mêmes parcelles que dans les études originales. Nous montrons que les preuves empiriques invalident les séquences basées sur les chronoséquences déduites dans ces études classiques.

@article{doi101111j14610248200801173x,
    author = "Johnson, Edward A. et Miyanishi, Kiyoko",
    title = "Testing the assumptions of chronosequences in succession",
    year = "2008",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "De nombreux manuels d'écologie introductifs illustrent la succession, au moins en partie, en utilisant certaines études classiques (par exemple, les dunes de sable, les étangs/bourbiers, les dépôts glaciaires et les champs abandonnés) qui ont substitué l'espace au temps (chronoséquence) pour déterminer les séquences de la succession. Malgré les critiques passées de cette méthode, il existe une utilisation continue, souvent non critique, des chronoséquences dans la recherche actuelle sur des sujets autres que la succession, y compris les changements temporels de la biodiversité, de la productivité, du cycle des nutriments, etc. Pour montrer le problème des études basées sur les chronoséquences en général, nous examinons les preuves provenant d'études qui ont utilisé des méthodes non basées sur les chronoséquences (telles que l'étude à long terme de parcelles permanentes, la palynologie et la reconstruction des peuplements) pour tester la substitution espace-temps dans quatre études classiques de succession. Dans plusieurs cas, les tests ont utilisé les mêmes emplacements et, dans un cas, les mêmes parcelles que dans les études originales. Nous montrons que les preuves empiriques invalident les séquences basées sur les chronoséquences déduites dans ces études classiques.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2008.01173.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2008.01173.x",
    openalex = "W2071908967",
    references = "doi1023071930735, doi1023071932934"
}

Les taux de décomposition à travers le monde dépendent à la fois du climat et de l'héritage des traits fonctionnels des plantes en tant que qualité de la litière. Pour quantifier dans quelle mesure la différenciation fonctionnelle entre espèces affecte leurs taux de décomposition de la litière, nous avons rassemblé des données sur les traits foliaires et la perte de masse de la litière pour 818 espèces issues de 66 expériences de décomposition sur six continents. Nous montrons que : (i) l'ampleur des différences induites par les espèces est beaucoup plus grande qu'on ne le pensait auparavant et supérieure à la variation induite par le climat ; (ii) la décomposabilité de la litière d'une espèce est constamment corrélée à la stratégie écologique de cette espèce au sein d'écosystèmes différents à travers le monde, représentant une nouvelle connexion entre la stratégie globale de carbone des plantes et le cycle biogéochimique. Cette connexion entre les stratégies végétales et la décomposabilité est cruciale tant pour comprendre les rétroactions végétation-sol que pour améliorer les prévisions du cycle global du carbone.

@article{doi101111j14610248200801219x,
    author = "Cornwell, William K. et Cornelissen, Johannes H. C. et Amatangelo, Kathryn L. et Dorrepaal, Ellen et Eviner, Valerie T. et Godoy, Óscar et Hobbie, Sarah E. et Hoorens, Bart et Kurokawa, Hiroko et Harguindeguy, Natalia Pérez et Quested, Helen M. et Santiago, Louis S. et Wardle, David A. et Wright, Ian J. et Aerts, Rien et Allison, Steven et van Bodegom, Peter M. et Brovkin, Victor et Chatain, Alex et Callaghan, Terry V. et Dı́az, Sandra et Garnier, Éric et Gurvich, Diego E. et Kazakou, Elena et Klein, Julia A. et Read, Jenny et Reich, Peter B. et Soudzilovskaia, Nadejda A. et Vaieretti, María V. et Westoby, Mark",
    title = "Les traits des espèces végétales sont le contrôle prédominant des taux de décomposition de la litière au sein des biomes à travers le monde",
    year = "2008",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Les taux de décomposition à travers le monde dépendent à la fois du climat et de l'héritage des traits fonctionnels des plantes en tant que qualité de la litière. Pour quantifier dans quelle mesure la différenciation fonctionnelle entre espèces affecte leurs taux de décomposition de la litière, nous avons rassemblé des données sur les traits foliaires et la perte de masse de la litière pour 818 espèces issues de 66 expériences de décomposition sur six continents. Nous montrons que : (i) l'ampleur des différences induites par les espèces est beaucoup plus grande qu'on ne le pensait auparavant et supérieure à la variation induite par le climat ; (ii) la décomposabilité de la litière d'une espèce est constamment corrélée à la stratégie écologique de cette espèce au sein d'écosystèmes différents à travers le monde, représentant une nouvelle connexion entre la stratégie globale de carbone des plantes et le cycle biogéochimique. Cette connexion entre les stratégies végétales et la décomposabilité est cruciale tant pour comprendre les rétroactions végétation-sol que pour améliorer les prévisions du cycle global du carbone.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2008.01219.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2008.01219.x",
    openalex = "W2159549065",
    references = "doi101016s0065250408600161, doi101038nature02403, doi101046j13652486200300569x, doi101073pnas0702737104, doi101073pnas942513730, doi101111j14698137200501349x, doi101175jcli38001, doi101256004316502320517344, doi101890030799, doi1023071936780, openalexw2097450069"
}

Les sécheresses sévères ont été associées à la mortalité forestière à l'échelle régionale dans le monde entier. Le changement climatique devrait exacerber les événements de mortalité régionale ; cependant, la prédiction reste difficile car les mécanismes physiologiques sous-jacents à la survie et à la mortalité en période de sécheresse sont mal compris. Nous avons élaboré une théorie basée sur l'hydraulique tenant compte de l'équilibre du carbone et de la résistance aux insectes, permettant de formuler et d'examiner des hypothèses concernant la survie et la mortalité. Plusieurs mécanismes peuvent causer la mortalité pendant la sécheresse. Un mécanisme courant pour les plantes avec une régulation isohydrique de l'état hydrique résulte de l'évitement de l'échec hydraulique induit par la sécheresse via la fermeture des stomates, entraînant une famine en carbone et une cascade d'effets en aval tels qu'une résistance réduite aux agents biotiques. La mortalité par échec hydraulique en soi peut survenir chez les plantules ou les arbres isohydriques proches de leur hauteur maximale. Bien que les plantes anisohydriques soient relativement tolérantes à la sécheresse, elles sont prédisposées à l'échec hydraulique car elles fonctionnent avec des marges de sécurité hydrauliques plus étroites pendant la sécheresse. Les températures élevées devraient exacerber la famine en carbone et l'échec hydraulique. Les agents biotiques peuvent amplifier et être amplifiés par le stress des plantes induit par la sécheresse. Les oscillations climatiques multidécadales humides peuvent augmenter la susceptibilité des plantes à la mortalité induite par la sécheresse en stimulant des changements dans l'architecture hydraulique, prédisposant efficacement les plantes au stress hydrique. Le réchauffement climatique et l'augmentation de la fréquence des événements extrêmes entraîneront probablement une augmentation des épisodes de mortalité régionale. La régulation du potentiel hydrique isohydrique et anisohydrique peut partitionner les espèces entre survie et mortalité, et, en tant que tel, l'intégration de ce cadre hydraulique pourrait être efficace pour modéliser la survie et la mortalité des plantes dans les conditions climatiques futures.

@article{doi101111j14698137200802436x,
    author = "McDowell, Nate G. et Pockman, William T. et Allen, Craig D. et Breshears, David D. et Cobb, Neil S. et Kolb, Thomas E. et Plaut, Jennifer A. et Sperry, John S. et West, Adam G. et Williams, David G. et Yépez, Enrico A.",
    title = "Mécanismes de survie et de mortalité des plantes en période de sécheresse : pourquoi certaines plantes survivent-elles tandis que d'autres succombent à la sécheresse ?",
    year = "2008",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les sécheresses sévères ont été associées à la mortalité forestière à l'échelle régionale dans le monde entier. Le changement climatique devrait exacerber les événements de mortalité régionale ; cependant, la prédiction reste difficile car les mécanismes physiologiques sous-jacents à la survie et à la mortalité en période de sécheresse sont mal compris. Nous avons élaboré une théorie basée sur l'hydraulique tenant compte de l'équilibre du carbone et de la résistance aux insectes, permettant de formuler et d'examiner des hypothèses concernant la survie et la mortalité. Plusieurs mécanismes peuvent causer la mortalité pendant la sécheresse. Un mécanisme courant pour les plantes avec une régulation isohydrique de l'état hydrique résulte de l'évitement de l'échec hydraulique induit par la sécheresse via la fermeture des stomates, entraînant une famine en carbone et une cascade d'effets en aval tels qu'une résistance réduite aux agents biotiques. La mortalité par échec hydraulique en soi peut survenir chez les plantules ou les arbres isohydriques proches de leur hauteur maximale. Bien que les plantes anisohydriques soient relativement tolérantes à la sécheresse, elles sont prédisposées à l'échec hydraulique car elles fonctionnent avec des marges de sécurité hydrauliques plus étroites pendant la sécheresse. Les températures élevées devraient exacerber la famine en carbone et l'échec hydraulique. Les agents biotiques peuvent amplifier et être amplifiés par le stress des plantes induit par la sécheresse. Les oscillations climatiques multidécadales humides peuvent augmenter la susceptibilité des plantes à la mortalité induite par la sécheresse en stimulant des changements dans l'architecture hydraulique, prédisposant efficacement les plantes au stress hydrique. Le réchauffement climatique et l'augmentation de la fréquence des événements extrêmes entraîneront probablement une augmentation des épisodes de mortalité régionale. La régulation du potentiel hydrique isohydrique et anisohydrique peut partitionner les espèces entre survie et mortalité, et, en tant que tel, l'intégration de ce cadre hydraulique pourrait être efficace pour modéliser la survie et la mortalité des plantes dans les conditions climatiques futures.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2008.02436.x",
    doi = "10.1111/j.1469-8137.2008.02436.x",
    openalex = "W2169017109",
    references = "doi101038nature03972, doi101073pnas0505734102, openalexw617039848"
}

@article{doi101007s1110400898779,
    author = "Brundrett, Mark",
    title = "Associations mycorhiziennes et autres modes de nutrition des plantes vasculaires : comprendre la diversité mondiale des plantes hôtes en résolvant les informations contradictoires et en développant des moyens fiables de diagnostic",
    year = "2009",
    journal = "Plant and Soil",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11104-008-9877-9",
    doi = "10.1007/s11104-008-9877-9",
    openalex = "W1973374750",
    references = "doi101146annurevecolsys35112202130201"
}

Les sols sont le produit des activités des plantes, qui fournissent de la matière organique et jouent un rôle central dans l'altération des roches et des minéraux. De nombreuses espèces végétales ont une amplitude écologique distincte qui montre une restriction à des types de sols spécifiques. Dans les nombreuses interactions entre les plantes et le sol, les micro-organismes jouent également un rôle clé. Ici, nous passons en revue la littérature existante sur les interactions entre les plantes, les micro-organismes et les sols, et incluons, lorsque possible, des considérations sur les échelles de temps évolutives. Certaines de ces interactions impliquent des systèmes de communication complexes, qui, dans le cas de symbioses telles que la symbiose mycorhizienne arbusculaire, ont plusieurs centaines de millions d'années ; d'autres impliquent la libération d'exsudats par les racines et d'autres produits de la rhizodéposition qui sont utilisés comme substrats pour les micro-organismes du sol. Les raisons possibles de la valeur de survie de cette perte de carbone sur des dizaines ou des centaines de millions d'années d'évolution des plantes supérieures sont discutées, en adoptant une approche coûts-bénéfices. La co-évolution des plantes et des micro-organismes de la rhizosphère est discutée, à la lumière des interactions écologiques connues entre les différents partenaires des écosystèmes terrestres. Enfin, le rôle des plantes supérieures, en particulier des plantes à racines profondes et des micro-organismes associés, dans l'altération des roches et des minéraux, contribuant ultimement à la pédogenèse, est abordé. Nous montrons que les processus de la rhizosphère, à long terme, sont centraux pour les cycles biogéochimiques, la formation des sols et l'histoire de la Terre. Les découvertes majeures anticipées amélioreront notre compréhension fondamentale et permettront d'appliquer de nouvelles connaissances pour faire face aux carences en nutriments, aux ravageurs et aux maladies, ainsi qu'aux défis de l'augmentation de la production alimentaire mondiale et de la productivité des agroécosystèmes d'une manière responsable sur le plan environnemental.

@article{doi101007s111040090042x,
    author = "Lambers, Hans et Mougel, Christophe et Jaillard, Benoît et Hinsinger, Philippe",
    title = "Interactions plantes-microbes-sol dans la rhizosphère : une perspective évolutive",
    year = "2009",
    journal = "Plant and Soil",
    abstract = "Les sols sont le produit des activités des plantes, qui fournissent de la matière organique et jouent un rôle central dans l'altération des roches et des minéraux. De nombreuses espèces végétales ont une amplitude écologique distincte qui montre une restriction à des types de sols spécifiques. Dans les nombreuses interactions entre les plantes et le sol, les micro-organismes jouent également un rôle clé. Ici, nous passons en revue la littérature existante sur les interactions entre les plantes, les micro-organismes et les sols, et incluons, lorsque possible, des considérations sur les échelles de temps évolutives. Certaines de ces interactions impliquent des systèmes de communication complexes, qui, dans le cas de symbioses telles que la symbiose mycorhizienne arbusculaire, ont plusieurs centaines de millions d'années ; d'autres impliquent la libération d'exsudats par les racines et d'autres produits de la rhizodéposition qui sont utilisés comme substrats pour les micro-organismes du sol. Les raisons possibles de la valeur de survie de cette perte de carbone sur des dizaines ou des centaines de millions d'années d'évolution des plantes supérieures sont discutées, en adoptant une approche coûts-bénéfices. La co-évolution des plantes et des micro-organismes de la rhizosphère est discutée, à la lumière des interactions écologiques connues entre les différents partenaires des écosystèmes terrestres. Enfin, le rôle des plantes supérieures, en particulier des plantes à racines profondes et des micro-organismes associés, dans l'altération des roches et des minéraux, contribuant ultimement à la pédogenèse, est abordé. Nous montrons que les processus de la rhizosphère, à long terme, sont centraux pour les cycles biogéochimiques, la formation des sols et l'histoire de la Terre. Les découvertes majeures anticipées amélioreront notre compréhension fondamentale et permettront d'appliquer de nouvelles connaissances pour faire face aux carences en nutriments, aux ravageurs et aux maladies, ainsi qu'aux défis de l'augmentation de la production alimentaire mondiale et de la productivité des agroécosystèmes d'une manière responsable sur le plan environnemental.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11104-009-0042-x",
    doi = "10.1007/s11104-009-0042-x",
    openalex = "W2142996073",
    references = "doi101146annurevecolsys35112202130201"
}

Un objectif majeur en écologie est l'identification des déterminants de l'invasivité. Nous avons réalisé une méta-analyse de 117 études de terrain ou de jardins expérimentaux qui ont mesuré les différences de traits par paires d'un total de 125 espèces végétales envahissantes et de 196 espèces végétales non envahissantes dans la zone d'invasion des espèces envahissantes. Nous avons testé si l'invasivité est associée à des traits liés aux performances (physiologie, allocation de la surface foliaire, allocation de la tige, taux de croissance, taille et fitness), et si de telles associations dépendent du type d'étude et de facteurs biogéographiques ou biologiques. Dans l'ensemble, les espèces envahissantes présentaient des valeurs significativement plus élevées que les espèces non envahissantes pour les six catégories de traits. Plus de différences de traits étaient significatives pour les comparaisons envahissantes vs. indigènes que pour les comparaisons envahissantes vs. espèces exotiques non envahissantes. De plus, pour les comparaisons entre espèces envahissantes et espèces indigènes qui sont elles-mêmes envahissantes ailleurs, aucune différence de trait n'était significative. Les différences de physiologie et de taux de croissance étaient plus importantes dans les régions tropicales que dans les régions tempérées. Les différences de traits ne dépendaient pas de l'origine de l'espèce exotique envahissante en Europe, ni de l'environnement de test. Nous concluons que les espèces exotiques envahissantes présentaient des valeurs plus élevées pour les traits liés aux performances que les espèces non envahissantes. Cela suggère qu'il pourrait devenir possible de prédire les futures invasions végétales à partir des traits des espèces.

@article{doi101111j14610248200901418x,
    author = "van Kleunen, Mark et Weber, Ewald et Fischer, Markus",
    title = "Une méta-analyse des différences de traits entre les espèces végétales envahissantes et non envahissantes",
    year = "2009",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Un objectif majeur en écologie est l'identification des déterminants de l'invasivité. Nous avons réalisé une méta-analyse de 117 études de terrain ou de jardins expérimentaux qui ont mesuré les différences de traits par paires d'un total de 125 espèces végétales envahissantes et de 196 espèces végétales non envahissantes dans la zone d'invasion des espèces envahissantes. Nous avons testé si l'invasivité est associée à des traits liés aux performances (physiologie, allocation de la surface foliaire, allocation de la tige, taux de croissance, taille et fitness), et si de telles associations dépendent du type d'étude et de facteurs biogéographiques ou biologiques. Dans l'ensemble, les espèces envahissantes présentaient des valeurs significativement plus élevées que les espèces non envahissantes pour les six catégories de traits. Plus de différences de traits étaient significatives pour les comparaisons envahissantes vs. indigènes que pour les comparaisons envahissantes vs. espèces exotiques non envahissantes. De plus, pour les comparaisons entre espèces envahissantes et espèces indigènes qui sont elles-mêmes envahissantes ailleurs, aucune différence de trait n'était significative. Les différences de physiologie et de taux de croissance étaient plus importantes dans les régions tropicales que dans les régions tempérées. Les différences de traits ne dépendaient pas de l'origine de l'espèce exotique envahissante en Europe, ni de l'environnement de test. Nous concluons que les espèces exotiques envahissantes présentaient des valeurs plus élevées pour les traits liés aux performances que les espèces non envahissantes. Cela suggère qu'il pourrait devenir possible de prédire les futures invasions végétales à partir des traits des espèces.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01418.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01418.x",
    openalex = "W2110328754",
    references = "doi101016s0169534701021012, doi101046j13652745200000473x, doi101146annurevecolsys33010802150452"
}

Les modèles écologiques, évolutifs et moléculaires des interactions entre les hôtes végétaux et les pathogènes microbiens reposent largement sur le concept d'interactions étroitement couplées entre des paires d'espèces. Cependant, les associations hautement pathogènes et obligatoires entre les espèces hôtes et pathogènes ne représentent qu'une fraction de la diversité rencontrée dans les systèmes naturels et gérés. Au contraire, de nombreux pathogènes peuvent infecter une large gamme d'hôtes, et la plupart des hôtes sont exposés à plus d'une espèce de pathogène, souvent simultanément. De plus, les résultats de l'infection par un pathogène varient considérablement car les plantes hôtes varient en termes de résistance et de tolérance à l'infection, tandis que les pathogènes varient également en ce qui concerne leur capacité à se développer sur ou dans les hôtes. L'hétérogénéité environnementale augmente davantage le potentiel de variation des interactions hôte–pathogène des plantes en influençant le degré et les conséquences sur la fitness de l'infection. Ici, nous décrivons ces continuum de spécificité et de virulence inhérents aux interactions hôte–pathogène des plantes. En utilisant ce cadre, nous décrivons et mettons en contraste les mécanismes génétiques et environnementaux qui sous-tendent cette variation, esquissons les conséquences pour l'épidémiologie et la structure des communautés, explorons les facteurs écologiques et évolutifs probables et mettons en lumière plusieurs domaines clés pour la recherche future.

@article{doi101111j14698137200902927x,
    author = "Barrett, Luke G. et Kniskern, Joel M. et Bodenhausen, Natacha et Zhang, Wen et Bergelson, Joy",
    title = "Continuum de spécificité et de virulence dans les interactions hôte–pathogène des plantes : causes et conséquences",
    year = "2009",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les modèles écologiques, évolutifs et moléculaires des interactions entre les hôtes végétaux et les pathogènes microbiens reposent largement sur le concept d'interactions étroitement couplées entre des paires d'espèces. Cependant, les associations hautement pathogènes et obligatoires entre les espèces hôtes et pathogènes ne représentent qu'une fraction de la diversité rencontrée dans les systèmes naturels et gérés. Au contraire, de nombreux pathogènes peuvent infecter une large gamme d'hôtes, et la plupart des hôtes sont exposés à plus d'une espèce de pathogène, souvent simultanément. De plus, les résultats de l'infection par un pathogène varient considérablement car les plantes hôtes varient en termes de résistance et de tolérance à l'infection, tandis que les pathogènes varient également en ce qui concerne leur capacité à se développer sur ou dans les hôtes. L'hétérogénéité environnementale augmente davantage le potentiel de variation des interactions hôte–pathogène des plantes en influençant le degré et les conséquences sur la fitness de l'infection. Ici, nous décrivons ces continuum de spécificité et de virulence inhérents aux interactions hôte–pathogène des plantes. En utilisant ce cadre, nous décrivons et mettons en contraste les mécanismes génétiques et environnementaux qui sous-tendent cette variation, esquissons les conséquences pour l'épidémiologie et la structure des communautés, explorons les facteurs écologiques et évolutifs probables et mettons en lumière plusieurs domaines clés pour la recherche future.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2009.02927.x",
    doi = "10.1111/j.1469-8137.2009.02927.x",
    openalex = "W2143949443",
    references = "doi1010160040580977900429, doi101016jcell200602008, doi101071bt06019, doi101086282687, doi101128aem719495149592005, doi101146annureves19110188001231, doi101146annurevphyto43040204135923, doi1015159780691209418, doi102307jctvx5wbbh, doi107208chicago97802267976700010001, openalexw2962874606"
}

Les activités humaines ont accru la disponibilité des nutriments dans les écosystèmes terrestres et aquatiques. Dans les prairies, cette eutrophisation entraîne une perte de diversité des espèces végétales, mais le mécanisme de cette perte a été difficile à déterminer. En utilisant des communautés végétales expérimentales de prairies, nous avons constaté que l'apport de lumière dans le sous-bois de la prairie empêchait la perte de biodiversité causée par l'eutrophisation. Aucun rôle détectable de la compétition pour les ressources du sol n'a été observé dans la perte de diversité. Ainsi, la compétition pour la lumière est un mécanisme majeur de la perte de diversité végétale après l'eutrophisation et explique la menace particulière que représente l'eutrophisation pour la diversité végétale. Nos conclusions ont des implications pour la gestion des prairies et les politiques de conservation et soulignent la nécessité de contrôler l'enrichissement en nutriments si l'on veut préserver la diversité végétale.

@article{doi101126science1169640,
    author = "Hautier, Yann et Niklaus, Pascal A. et Hector, Andy",
    title = "La compétition pour la lumière provoque une perte de biodiversité végétale après l'eutrophisation",
    year = "2009",
    journal = "Science",
    abstract = "Les activités humaines ont accru la disponibilité des nutriments dans les écosystèmes terrestres et aquatiques. Dans les prairies, cette eutrophisation entraîne une perte de diversité des espèces végétales, mais le mécanisme de cette perte a été difficile à déterminer. En utilisant des communautés végétales expérimentales de prairies, nous avons constaté que l'apport de lumière dans le sous-bois de la prairie empêchait la perte de biodiversité causée par l'eutrophisation. Aucun rôle détectable de la compétition pour les ressources du sol n'a été observé dans la perte de diversité. Ainsi, la compétition pour la lumière est un mécanisme majeur de la perte de diversité végétale après l'eutrophisation et explique la menace particulière que représente l'eutrophisation pour la diversité végétale. Nos conclusions ont des implications pour la gestion des prairies et les politiques de conservation et soulignent la nécessité de contrôler l'enrichissement en nutriments si l'on veut préserver la diversité végétale.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1169640",
    doi = "10.1126/science.1169640",
    openalex = "W2094142413",
    references = "doi101038242344a0, doi101038nature01014, doi101038nature06503, doi101073pnas0408648102, doi101126science1057544, doi101126science1094678, doi101126science2775325494, doi101126science28754591770, doi1023074549, openalexw2097450069"
}

@article{doi101016jflora200910001,
    author = "Burga, Conradin A. et Krüsi, Bertil et Egli, Markus et Wernli, Michael et Elsener, Stefan et Ziefle, Michael et Fischer, Thomas et Mavris, Christian",
    title = "Succession végétale et développement du sol sur le foreland du glacier du Morteratsch (Pontresina, Suisse) : Direct ou chaotique ?",
    year = "2010",
    journal = "Flora",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.flora.2009.10.001",
    doi = "10.1016/j.flora.2009.10.001",
    openalex = "W2105213008"
}

@article{doi101016jtplants201009008,
    author = "Nicotra, Adrienne B. et Atkin, Owen K. et Bonser, Stephen P. et Davidson, Amy Michelle et Finnegan, E. Jean et Mathesius, Ulrike et Poot, Pieter et Purugganan, Michael D. et Richards, Christina L. et Valladares, Fernando et van Kleunen, Mark",
    title = "Plasticité phénotypique des plantes dans un climat en mutation",
    year = "2010",
    journal = "Trends in Plant Science",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tplants.2010.09.008",
    doi = "10.1016/j.tplants.2010.09.008",
    openalex = "W2101364071",
    references = "doi101023a1004327224729, doi1010781433831900083, doi101086598822, doi101111j13652435200701283x, doi101111j14610248200801277x"
}

Résumé 1. Les relations saisonnières entre les populations de macrophytes et de phytoplancton peuvent changer considérablement lorsque les lacs subissent une eutrophisation. La compréhension de ces changements peut être essentielle pour interpréter les processus écologiques opérant sur des échelles de temps plus longues (décennales à centennales). 2. Nous explorons les dynamiques saisonnières des macrophytes (mesurées deux fois en juin et août) et du phytoplancton (mesuré mensuellement de mai à septembre) dans 39 lacs peu profonds (29 au Royaume-Uni et 10 au Danemark) couvrant des gradients larges en termes de nutriments et d'abondance végétale. 3. Trois groupes de sites ont été identifiés en fonction de la saisonnalité des macrophytes : 16 lacs où l'abondance des macrophytes était perpétuellement faible et l'eau généralement trouble (« lacs turbides ») ; 7 où l'abondance des macrophytes était élevée en juin mais faible en août (« lacs en chute ») ; et 12 où l'abondance des macrophytes était élevée à la fois en juin et en août (« lacs stables »). Le comportement saisonnier des lacs en chute et turbides était extrêmement similaire, avec une augmentation constante des concentrations en nutriments et en chlorophylle a de mai à septembre. En revanche, dans les lacs stables, les changements saisonniers étaient atténués, la chlorophylle a restant constamment faible (<10–15 μg L −1) tout au long de l'été. Les lacs en chute étaient dominés par une ou une combinaison de Potamogeton pusillus, Potamogeton pectinatus et Zannichellia palustris, tandis que Ceratophyllum demersum et Chara spp. étaient plus abondants dans les lacs stables. 4. Une perte à long terme de la diversité spécifique des macrophytes s'est produite dans de nombreux lacs peu profonds affectés par l'eutrophisation. Un chemin commun est celui d'une communauté végétale riche en espèces avec des charophytes vers une communauté pauvre en espèces dominée par P. pusillus, P. pectinatus et Z. palustris. De tels changements de composition peuvent souvent s'accompagner d'une réduction substantielle de la durée saisonnière de la dominance végétale et d'une plus grande tendance aux incursions du phytoplancton. Nous hypothétons une boucle de rétroaction à action lente (10–100 s années) dans les lacs peu profonds enrichis en nutriments, selon laquelle les augmentations de l'abondance algale sont associées à des pertes d'espèces de macrophytes et donc à différentes stratégies saisonnières végétales. À leur tour, de tels changements peuvent favoriser une production accrue de phytoplancton, exerçant ainsi une pression supplémentaire sur les macrophytes restants. Cette étude brouille la distinction entre les lacs peu profonds dits dominés par le phytoplancton trouble et ceux dominés par les plantes clairs, et suggère que la perte de végétation de ces derniers peut être un processus progressif.

@article{doi101111j13652427200902365x,
    author = "Sayer, Carl D. et Davidson, Thomas A. et Jones, J. Iwan",
    title = "Dynamiques saisonnières des macrophytes et du phytoplancton dans les lacs peu profonds : un chemin menant des plantes au plancton piloté par l'eutrophisation ?",
    year = "2010",
    journal = "Freshwater Biology",
    abstract = "Résumé 1. Les relations saisonnières entre les populations de macrophytes et de phytoplancton peuvent changer considérablement lorsque les lacs subissent une eutrophisation. La compréhension de ces changements peut être essentielle pour interpréter les processus écologiques opérant sur des échelles de temps plus longues (décennales à centennales). 2. Nous explorons les dynamiques saisonnières des macrophytes (mesurées deux fois en juin et août) et du phytoplancton (mesuré mensuellement de mai à septembre) dans 39 lacs peu profonds (29 au Royaume-Uni et 10 au Danemark) couvrant des gradients larges en termes de nutriments et d'abondance végétale. 3. Trois groupes de sites ont été identifiés en fonction de la saisonnalité des macrophytes : 16 lacs où l'abondance des macrophytes était perpétuellement faible et l'eau généralement trouble (« lacs turbides ») ; 7 où l'abondance des macrophytes était élevée en juin mais faible en août (« lacs en chute ») ; et 12 où l'abondance des macrophytes était élevée à la fois en juin et en août (« lacs stables »). Le comportement saisonnier des lacs en chute et turbides était extrêmement similaire, avec une augmentation constante des concentrations en nutriments et en chlorophylle a de mai à septembre. En revanche, dans les lacs stables, les changements saisonniers étaient atténués, la chlorophylle a restant constamment faible (<10–15 μg L −1) tout au long de l'été. Les lacs en chute étaient dominés par une ou une combinaison de Potamogeton pusillus, Potamogeton pectinatus et Zannichellia palustris, tandis que Ceratophyllum demersum et Chara spp. étaient plus abondants dans les lacs stables. 4. Une perte à long terme de la diversité spécifique des macrophytes s'est produite dans de nombreux lacs peu profonds affectés par l'eutrophisation. Un chemin commun est celui d'une communauté végétale riche en espèces avec des charophytes vers une communauté pauvre en espèces dominée par P. pusillus, P. pectinatus et Z. palustris. De tels changements de composition peuvent souvent s'accompagner d'une réduction substantielle de la durée saisonnière de la dominance végétale et d'une plus grande tendance aux incursions du phytoplancton. Nous hypothétons une boucle de rétroaction à action lente (10–100 s années) dans les lacs peu profonds enrichis en nutriments, selon laquelle les augmentations de l'abondance algale sont associées à des pertes d'espèces de macrophytes et donc à différentes stratégies saisonnières végétales. À leur tour, de tels changements peuvent favoriser une production accrue de phytoplancton, exerçant ainsi une pression supplémentaire sur les macrophytes restants. Cette étude brouille la distinction entre les lacs peu profonds dits dominés par le phytoplancton trouble et ceux dominés par les plantes clairs, et suggère que la perte de végétation de ces derniers peut être un processus progressif.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2427.2009.02365.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2427.2009.02365.x",
    openalex = "W2007002953",
    references = "doi101111j13652427200902353x"
}

Résumé 1. Les chronoséquences et les substitutions associées d'espace pour le temps sont un outil important et souvent nécessaire pour étudier la dynamique temporelle des communautés végétales et du développement des sols à travers plusieurs échelles de temps. Cependant, elles sont souvent utilisées de manière inappropriée, conduisant à de fausses conclusions sur les modèles et processus écologiques, ce qui a suscité une critique récente et forte de l'approche. Ici, nous évaluons quand les chronoséquences peuvent ou ne peuvent pas être appropriées pour étudier le développement des communautés et des écosystèmes. 2. Les chronoséquences sont appropriées pour étudier la succession végétale à des échelles de temps décennales à millénaires lorsqu'il existe des preuves que des sites d'âges différents suivent la même trajectoire. Elles peuvent également être utilisées de manière fiable pour étudier des aspects du développement des sols qui se produisent entre des sites liés temporellement sur des échelles de temps de siècles à millénaires, parfois indépendamment de leur application à des communautés biologiques végétales et du sol à plus court terme. 3. Certaines caractéristiques des communautés biologiques végétales et du sol en changement (par exemple, la richesse spécifique, la couverture végétale, la structure de la végétation, l'accumulation de matière organique du sol) sont plus susceptibles d'être liées de manière prédictible et linéaire dans le temps que d'autres caractéristiques (par exemple, la composition et l'abondance des espèces) et sont donc plus fiablement étudiées en utilisant une approche de chronoséquence. 4. Les chronoséquences sont les plus appropriées pour étudier des communautés qui suivent des trajectoires successionales convergentes et ont une faible biodiversité, un turnover rapide des espèces et une faible fréquence et sévérité de perturbation. Les chronoséquences sont les moins adaptées pour étudier des trajectoires successionales divergentes, riches en espèces, fortement perturbées ou arrêtées dans le temps, car il y a alors souvent des difficultés majeures pour déterminer les liens temporels entre les stades. 5. Synthèse. Nous concluons que, lorsque les trajectoires successionales dépassent la durée de vie des investigateurs et les études expérimentales et observationnelles qu'ils réalisent, le changement temporel peut être exploré avec succès grâce à l'utilisation judicieuse des chronoséquences.

@article{doi101111j13652745201001664x,
    author = "Walker, Lawrence R. et Wardle, David A. et Bardgett, Richard D. et Clarkson, Bruce D.",
    title = "L'utilisation des chronoséquences dans les études de la succession écologique et du développement des sols",
    year = "2010",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Résumé 1. Les chronoséquences et les substitutions associées d'espace pour le temps sont un outil important et souvent nécessaire pour étudier la dynamique temporelle des communautés végétales et du développement des sols à travers plusieurs échelles de temps. Cependant, elles sont souvent utilisées de manière inappropriée, conduisant à de fausses conclusions sur les modèles et processus écologiques, ce qui a suscité une critique récente et forte de l'approche. Ici, nous évaluons quand les chronoséquences peuvent ou ne peuvent pas être appropriées pour étudier le développement des communautés et des écosystèmes. 2. Les chronoséquences sont appropriées pour étudier la succession végétale à des échelles de temps décennales à millénaires lorsqu'il existe des preuves que des sites d'âges différents suivent la même trajectoire. Elles peuvent également être utilisées de manière fiable pour étudier des aspects du développement des sols qui se produisent entre des sites liés temporellement sur des échelles de temps de siècles à millénaires, parfois indépendamment de leur application à des communautés biologiques végétales et du sol à plus court terme. 3. Certaines caractéristiques des communautés biologiques végétales et du sol en changement (par exemple, la richesse spécifique, la couverture végétale, la structure de la végétation, l'accumulation de matière organique du sol) sont plus susceptibles d'être liées de manière prédictible et linéaire dans le temps que d'autres caractéristiques (par exemple, la composition et l'abondance des espèces) et sont donc plus fiablement étudiées en utilisant une approche de chronoséquence. 4. Les chronoséquences sont les plus appropriées pour étudier des communautés qui suivent des trajectoires successionales convergentes et ont une faible biodiversité, un turnover rapide des espèces et une faible fréquence et sévérité de perturbation. Les chronoséquences sont les moins adaptées pour étudier des trajectoires successionales divergentes, riches en espèces, fortement perturbées ou arrêtées dans le temps, car il y a alors souvent des difficultés majeures pour déterminer les liens temporels entre les stades. 5. Synthèse. Nous concluons que, lorsque les trajectoires successionales dépassent la durée de vie des investigateurs et les études expérimentales et observationnelles qu'ils réalisent, le changement temporel peut être exploré avec succès grâce à l'utilisation judicieuse des chronoséquences.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2745.2010.01664.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2745.2010.01664.x",
    openalex = "W2148679320",
    references = "doi1023071943519, doi1023072937039, openalexw1996657273"
}

Le changement global (changement climatique associé à d'autres processus anthropiques mondiaux tels que le commerce croissant, la pollution atmosphérique et l'urbanisation) affectera la santé des plantes au niveau génétique, individuel, populationnel et paysager. Les effets directs incluent le stress des écosystèmes dû à la pénurie ou au déséquilibre des ressources naturelles. Les effets indirects incluent (i) une fréquence accrue de phénomènes naturels délétères, (ii) une pression accrue due aux ravageurs et maladies déjà présents, (iii) l'introduction de nouvelles espèces envahissantes, soit en raison d'une meilleure adéquation des conditions climatiques, soit en raison du commerce accru, et (iv) la réponse humaine au changement global. Dans cette revue, nous fournissons un aperçu des études récentes sur la santé des plantes terrestres en présence de facteurs de changement global. Nous résumons les liens entre le changement climatique et certains problèmes clés de la santé des plantes, y compris la mortalité des arbres, les changements dans les régimes d'incendies de forêt, les invasions biologiques et le rôle de la diversité génétique pour la résilience des écosystèmes. La prédiction et la gestion des effets du changement global sont compliquées par les interactions entre la mondialisation, le climat et les plantes envahissantes et/ou les pathogènes. Nous résumons des lignes directrices pratiques pour la gestion des paysages et tirons des conclusions générales d'un corpus littéraire en expansion.

@article{doi101111j1469185x201000123x,
    author = "Pautasso, Marco et Dehnen‐Schmutz, Katharina et Holdenrieder, Ottmar et Pietravalle, Stéphane et Salama, Nabeil K. G. et Jeger, M. J. et Lange, Eckart et Hehl‐Lange, Sigrid",
    title = "Santé des plantes et changement global – certaines implications pour la gestion des paysages",
    year = "2010",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Le changement global (changement climatique associé à d'autres processus anthropiques mondiaux tels que le commerce croissant, la pollution atmosphérique et l'urbanisation) affectera la santé des plantes au niveau génétique, individuel, populationnel et paysager. Les effets directs incluent le stress des écosystèmes dû à la pénurie ou au déséquilibre des ressources naturelles. Les effets indirects incluent (i) une fréquence accrue de phénomènes naturels délétères, (ii) une pression accrue due aux ravageurs et maladies déjà présents, (iii) l'introduction de nouvelles espèces envahissantes, soit en raison d'une meilleure adéquation des conditions climatiques, soit en raison du commerce accru, et (iv) la réponse humaine au changement global. Dans cette revue, nous fournissons un aperçu des études récentes sur la santé des plantes terrestres en présence de facteurs de changement global. Nous résumons les liens entre le changement climatique et certains problèmes clés de la santé des plantes, y compris la mortalité des arbres, les changements dans les régimes d'incendies de forêt, les invasions biologiques et le rôle de la diversité génétique pour la résilience des écosystèmes. La prédiction et la gestion des effets du changement global sont compliquées par les interactions entre la mondialisation, le climat et les plantes envahissantes et/ou les pathogènes. Nous résumons des lignes directrices pratiques pour la gestion des paysages et tirons des conclusions générales d'un corpus littéraire en expansion.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.2010.00123.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.2010.00123.x",
    openalex = "W2089579692",
    references = "doi1018901540929520050030012ispmaf20co2"
}

FOND : Pythium ultimum est un oomycète pathogène des plantes omniprésent responsable d'une variété de maladies sur une large gamme d'espèces cultivées et ornementales. RÉSULTATS : Le génome de P. ultimum (42,8 Mb) encode 15 290 gènes et présente une grande similarité de séquence et une syntenie étendues avec des espèces apparentées du genre Phytophthora, y compris le pathogène de la pourriture de la pomme de terre Phytophthora infestans. Le séquençage de l'ensemble du transcriptome a révélé l'expression de 86 % des gènes, avec une expression différentielle détectable de suites de gènes sous stress abiotique et en présence d'un hôte. Le protéome prédit comprend un large répertoire de protéines impliquées dans les interactions plante-pathogène, bien que, de manière surprenante, le génome de P. ultimum n'encode aucun effecteur RXLR classique et relativement peu de gènes Crinkler par rapport aux oomycètes phytopathogènes apparentés. Un nombre inférieur d'enzymes impliquées dans le métabolisme des glucides était présent par rapport aux espèces Phytophthora, avec l'absence notable de cutinases, suggérant une différence significative dans les mécanismes de virulence entre P. ultimum et les espèces d'oomycètes plus spécifiques à l'hôte. Bien que nous ayons observé un haut degré d'orthologie avec les génomes de Phytophthora, il y avait des caractéristiques nouvelles du protéome de P. ultimum, y compris une expansion de gènes impliqués dans la protéolyse et des gènes uniques à Pythium. Nous avons identifié une petite famille de gènes de cadhérines, des protéines impliquées dans l'adhésion cellulaire, le premier rapport de ces protéines dans un génome en dehors des métazoaires. CONCLUSIONS : L'accès au génome de P. ultimum a révélé non seulement les mécanismes pathogènes de base au sein des oomycètes, mais aussi des gènes spécifiques aux lignées associés à la virulence alternative et aux modes de vie trouvés au sein des lignées pythiacées par rapport aux Peronosporaceae.

@article{doi101186gb2010117r73,
    author = "Lévesque, C. André and Brouwer, Henk J. and Cano, Liliana M. and Hamilton, John P. and Holt, Carson and Huitema, Edgar and Raffaele, Sylvain and Robideau, G.P. and Thines, Marco and Win, Joe and Zerillo, Marcelo M. and Beakes, Gordon W. and Boore, Jeffrey L. and Busam, Dana and Dumas, Bernard and Ferriera, Steve and Fuerstenberg, Susan I. and Gachon, Claire M. M. and Gaulin, Elodie and Govers, Francine and Grenville‐Briggs, Laura J. and Horner, Neil and Hostetler, Jessica B. and Jiang, Rays H. Y. and Johnson, Justin and Krajaejun, Theerapong and Lin, Haining and Meijer, H.J.G. and Moore, Barry and Morris, Paul F. and Phuntmart, Vipaporn and Puiu, Daniela and Shetty, Jyoti and Stajich, Jason and Tripathy, Sucheta and Wawra, Stephan and van West, Pieter and Whitty, Brett R. and Coutinho, Pedro M. and Henrissat, Bernard and Martin, Frank N. and Thomas, Paul D. and Tyler, Brett M. and de Vries, Ronald P. and Kamoun, Sophien and Yandell, Mark and Tisserat, Ned and Buell, C. Robin",
    title = "Genome sequence of the necrotrophic plant pathogen Pythium ultimum reveals original pathogenicity mechanisms and effector repertoire",
    year = "2010",
    journal = "Genome biology",
    abstract = "FOND : Pythium ultimum est un oomycète pathogène des plantes omniprésent responsable d'une variété de maladies sur une large gamme d'espèces cultivées et ornementales. RÉSULTATS : Le génome de P. ultimum (42,8 Mb) encode 15 290 gènes et présente une grande similarité de séquence et une syntenie étendues avec des espèces apparentées du genre Phytophthora, y compris le pathogène de la pourriture de la pomme de terre Phytophthora infestans. Le séquençage de l'ensemble du transcriptome a révélé l'expression de 86 % des gènes, avec une expression différentielle détectable de suites de gènes sous stress abiotique et en présence d'un hôte. Le protéome prédit comprend un large répertoire de protéines impliquées dans les interactions plante-pathogène, bien que, de manière surprenante, le génome de P. ultimum n'encode aucun effecteur RXLR classique et relativement peu de gènes Crinkler par rapport aux oomycètes phytopathogènes apparentés. Un nombre inférieur d'enzymes impliquées dans le métabolisme des glucides était présent par rapport aux espèces Phytophthora, avec l'absence notable de cutinases, suggérant une différence significative dans les mécanismes de virulence entre P. ultimum et les espèces d'oomycètes plus spécifiques à l'hôte. Bien que nous ayons observé un haut degré d'orthologie avec les génomes de Phytophthora, il y avait des caractéristiques nouvelles du protéome de P. ultimum, y compris une expansion de gènes impliqués dans la protéolyse et des gènes uniques à Pythium. Nous avons identifié une petite famille de gènes de cadhérines, des protéines impliquées dans l'adhésion cellulaire, le premier rapport de ces protéines dans un génome en dehors des métazoaires. CONCLUSIONS : L'accès au génome de P. ultimum a révélé non seulement les mécanismes pathogènes de base au sein des oomycètes, mais aussi des gènes spécifiques aux lignées associés à la virulence alternative et aux modes de vie trouvés au sein des lignées pythiacées par rapport aux Peronosporaceae.",
    url = "https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-7-r73",
    doi = "10.1186/gb-2010-11-7-r73",
    openalex = "W2101000074",
    references = "openalexw2777527484"
}

Résumé Les caractéristiques des plantes – les caractéristiques morphologiques, anatomiques, physiologiques, biochimiques et phénologiques des plantes et de leurs organes – déterminent comment les producteurs primaires répondent aux facteurs environnementaux, affectent d'autres niveaux trophiques, influencent les processus et services écosystémiques et constituent un lien entre la richesse spécifique et la diversité fonctionnelle écosystémique. Les données sur les caractéristiques représentent ainsi la matière première pour une large gamme de recherches, de la biologie évolutive à l'écologie communautaire et fonctionnelle, en passant par la biogéographie. Ici, nous présentons l'initiative de base de données mondiale nommée TRY, qui a réuni une large partie de la communauté de recherche sur les caractéristiques des plantes dans le monde et obtenu un soutien sans précédent pour les données sur les caractéristiques : jusqu'à présent, 93 bases de données sur les caractéristiques ont été fournies. Le dépôt de données contient actuellement près de trois millions d'entrées de caractéristiques pour 69 000 des 300 000 espèces végétales du monde, avec un accent sur 52 groupes de caractéristiques caractérisant les stades végétatif et de régénération du cycle de vie des plantes, y compris la croissance, la dispersion, l'établissement et la persistance. Une première analyse des données montre que la plupart des caractéristiques des plantes sont approximativement distribuées selon une loi log-normale, avec des gammes de variation très différentes entre les caractéristiques. La plupart de la variation des caractéristiques est entre les espèces (interspécifique), mais une variation intraspécifique significative est également documentée, jusqu'à 40 % de la variation globale. Les types fonctionnels des plantes (PFT), tels qu'ils sont couramment utilisés dans les modèles de végétation, capturent une fraction substantielle de la variation observée – mais pour plusieurs caractéristiques, la plupart de la variation se produit au sein des PFT, jusqu'à 75 % de la variation globale. Dans le contexte des modèles de végétation, ces caractéristiques seraient mieux représentées par des variables d'état plutôt que par des valeurs de paramètres fixes. L'amélioration de la disponibilité des données sur les caractéristiques des plantes dans la base de données mondiale unifiée devrait soutenir un changement de paradigme de l'écologie basée sur les espèces à l'écologie basée sur les caractéristiques, offrir de nouvelles opportunités pour la recherche synthétique sur les caractéristiques des plantes et permettre une représentation plus réaliste et empiriquement fondée de la végétation terrestre dans les modèles du système terrestre.

@article{doi101111j13652486201102451x,
    author = "Kattge, Jens and Dı́az, Soledad et al.",
    title = "TRY – une base de données mondiale des traits des plantes",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Abstract Les traits des plantes – les caractéristiques morphologiques, anatomiques, physiologiques, biochimiques et phénologiques des plantes et de leurs organes – déterminent comment les producteurs primaires répondent aux facteurs environnementaux, affectent d'autres niveaux trophiques, influencent les processus et services écosystémiques et constituent un lien entre la richesse spécifique et la diversité fonctionnelle écosystémique. Les données sur les traits représentent ainsi la matière première pour une large gamme de recherches, de la biologie évolutive à l'écologie communautaire et fonctionnelle, en passant par la biogéographie. Ici, nous présentons l'initiative de base de données mondiale nommée TRY, qui a réuni une large partie de la communauté de recherche sur les traits des plantes dans le monde entier et obtenu un soutien sans précédent pour les données sur les traits : jusqu'à présent, 93 bases de données sur les traits ont été fournies. Le dépôt de données contient actuellement près de trois millions d'entrées de traits pour 69 000 des 300 000 espèces végétales du monde, avec un accent sur 52 groupes de traits caractérisant les stades végétatif et de régénération du cycle de vie des plantes, y compris la croissance, la dispersion, l'établissement et la persistance. Une première analyse des données montre que la plupart des traits des plantes sont distribués de manière approximativement log-normale, avec des gammes de variation très différentes entre les traits. La plupart de la variation des traits se situe entre les espèces (interspécifique), mais une variation intraspécifique significative est également documentée, jusqu'à 40 % de la variation globale. Les types fonctionnels des plantes (PFT), tels qu'ils sont couramment utilisés dans les modèles de végétation, capturent une fraction substantielle de la variation observée – mais pour plusieurs traits, la plupart de la variation se produit au sein des PFT, jusqu'à 75 % de la variation globale. Dans le contexte des modèles de végétation, ces traits seraient mieux représentés par des variables d'état plutôt que par des valeurs de paramètres fixes. L'amélioration de la disponibilité des données sur les traits des plantes dans la base de données mondiale unifiée devrait soutenir un changement de paradigme d'une écologie basée sur les espèces à une écologie basée sur les traits, offrir de nouvelles opportunités pour la recherche synthétique sur les traits des plantes et permettre une représentation plus réaliste et empiriquement fondée de la végétation terrestre dans les modèles du système terrestre.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02451.x",
    openalex = "W2162584119",
    references = "doi101007bf00386231, doi1010160165176580900245, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652486200300569x, doi101071bt02124, doi101086283244, doi101111j00301299200715559x, doi101111j14610248200600924x, doi101111j14610248200801219x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi1011552009421425"
}

Résumé Avec l'augmentation du corpus de littérature évaluant l'impact des plantes exotiques envahissantes sur les espèces résidentes et les écosystèmes, une évaluation complète de la relation entre les traits des espèces envahissantes et les contextes environnementaux de l'invasion sur les caractéristiques des impacts est nécessaire. Basée sur 287 publications comportant 1551 cas individuels traitant de l'impact de 167 espèces de plantes envahissantes appartenant à 49 familles, nous présentons la première vue d'ensemble mondiale des fréquences des impacts écologiques significatifs et non significatifs et de leurs directions sur 15 résultats liés aux réponses des populations, espèces, communautés et écosystèmes résidents. Les résultats au niveau des espèces et des communautés ont tendance à diminuer après les invasions, en particulier pour les plantes, mais l'abondance et la richesse de la biote du sol, ainsi que les concentrations de nutriments et d'eau dans le sol, augmentent plus souvent que ne diminuent après l'invasion. Les outils de fouille de données ont révélé que les plantes envahissantes exercent des impacts significatifs cohérents sur certains résultats (survie de la biote résidente, activité des animaux résidents, productivité de la communauté résidente, teneur en minéraux et nutriments dans les tissus végétaux, et fréquence et intensité des incendies), tandis que pour les résultats au niveau de la communauté, tels que la richesse spécifique, la diversité et les ressources du sol, la signification des impacts est déterminée par les interactions entre les traits des espèces et le biome envahi. Ces derniers résultats sont le plus susceptibles d'être impactés par les graminées annuelles et par les arbres pollinisés par le vent envahissant les biomes méditerranéens ou tropicaux. L'un des signaux les plus clairs dans cette analyse est que les plantes envahissantes sont beaucoup plus susceptibles de causer des impacts significatifs sur la richesse des plantes et des animaux résidents sur les îles que sur le continent. Cette étude montre qu'il n'existe pas de mesure universelle de l'impact et que le motif observé dépend de la mesure écologique examinée. Bien que l'impact soit fortement dépendant du contexte, certains traits des espèces, en particulier la forme de vie, la taille et le syndrome de pollinisation, peuvent fournir un moyen de prédire l'impact, indépendamment de l'habitat et de la région géographique envahis.

@article{doi101111j13652486201102636x,
    author = "Pyšek, Petr et Jaros̆ı́k, Vojtĕch et Hulme, Philip E. et Pergl, Jan et Hejda, Martin et Schaffner, Urs et Vilà, Montserrat",
    title = "Une évaluation mondiale des impacts des plantes envahissantes sur les espèces résidentes, les communautés et les écosystèmes : l'interaction entre les mesures d'impact, les traits des espèces envahissantes et l'environnement",
    year = "2011",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "Résumé Avec l'augmentation du corpus de littérature évaluant l'impact des plantes exotiques envahissantes sur les espèces résidentes et les écosystèmes, une évaluation complète de la relation entre les traits des espèces envahissantes et les contextes environnementaux de l'invasion sur les caractéristiques des impacts est nécessaire. Basée sur 287 publications comportant 1551 cas individuels traitant de l'impact de 167 espèces de plantes envahissantes appartenant à 49 familles, nous présentons la première vue d'ensemble mondiale des fréquences des impacts écologiques significatifs et non significatifs et de leurs directions sur 15 résultats liés aux réponses des populations, espèces, communautés et écosystèmes résidents. Les résultats au niveau des espèces et des communautés ont tendance à diminuer après les invasions, en particulier pour les plantes, mais l'abondance et la richesse de la biote du sol, ainsi que les concentrations de nutriments et d'eau dans le sol, augmentent plus souvent que ne diminuent après l'invasion. Les outils de fouille de données ont révélé que les plantes envahissantes exercent des impacts significatifs cohérents sur certains résultats (survie de la biote résidente, activité des animaux résidents, productivité de la communauté résidente, teneur en minéraux et nutriments dans les tissus végétaux, et fréquence et intensité des incendies), tandis que pour les résultats au niveau de la communauté, tels que la richesse spécifique, la diversité et les ressources du sol, la signification des impacts est déterminée par les interactions entre les traits des espèces et le biome envahi. Ces derniers résultats sont le plus susceptibles d'être impactés par les graminées annuelles et par les arbres pollinisés par le vent envahissant les biomes méditerranéens ou tropicaux. L'un des signaux les plus clairs dans cette analyse est que les plantes envahissantes sont beaucoup plus susceptibles de causer des impacts significatifs sur la richesse des plantes et des animaux résidents sur les îles que sur le continent. Cette étude montre qu'il n'existe pas de mesure universelle de l'impact et que le motif observé dépend de la mesure écologique examinée. Bien que l'impact soit fortement dépendant du contexte, certains traits des espèces, en particulier la forme de vie, la taille et le syndrome de pollinisation, peuvent fournir un moyen de prédire l'impact, indépendamment de l'habitat et de la région géographique envahis.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02636.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2486.2011.02636.x",
    openalex = "W2043734488",
    references = "doi101046j14724642200000083x, doi101111j14610248201101628x, doi101111j1466822x200600212x"
}

Les impacts du changement climatique sur les services écosystémiques sont complexes dans le sens où une prédiction efficace nécessite la prise en compte d'une large gamme de facteurs. Une analyse utile des impacts du changement climatique sur les cultures et les systèmes de plantes indigènes nécessitera souvent la prise en compte de la vaste diversité d'autres biotes qui interagissent avec les plantes, y compris les maladies des plantes, les herbivores animaux et les mauvaises herbes. Nous présentons un cadre d'analyse de la complexité des effets du changement climatique médiatisés par les maladies des plantes. Ce cadre peut soutenir l'évaluation du niveau de complexité du modèle susceptible d'être nécessaire pour analyser les impacts du changement climatique médiatisés par les maladies. Notre analyse intègre la prise en compte de l'ensemble suivant de questions pour un hôte particulier, un pathogène, une combinaison hôte–pathogène ou une région géographique. 1. Les interactions biologiques multiples sont-elles importantes ? 2. Y a-t-il des seuils environnementaux pour les réponses des populations ? 3. Y a-t-il des effets indirects des facteurs de changement global sur le développement des maladies ? 4. Les composantes spatiales des processus épidémiques sont-elles affectées par le climat ? 5. Y a-t-il des boucles de rétroaction pour la gestion ? 6. Les réseaux de technologies d'intervention sont-ils plus lents que les réseaux épidémiques ? 7. Y a-t-il des effets des maladies des plantes sur plusieurs services écosystémiques ? 8. Y a-t-il des boucles de rétroaction des maladies des plantes vers le changement climatique ? L'évaluation de ces questions aidera à évaluer la complexité du système, comme illustré pour la fusariose de la tête et la tardive de la pomme de terre. En pratique, il peut être nécessaire d'élargir les modèles pour inclure plus de composants, d'identifier ceux qui sont les plus importants, et de synthétiser de tels modèles pour inclure le niveau optimal de complexité pour la planification et la priorisation de la recherche.

@article{doi101111j13653059201002409x,
    author = "Garrett, Karen A. et Forbes, G. A. et Savary, Serge et Skelsey, P. et Sparks, Adam et Valdivia, Corinne et van Bruggen, A.H.C. et Willocquet, Laetitia et Djurle, Annika et Duveiller, E. et Eckersten, Henrik et Pande, S. et Cruz, Casiana Vera et Yuen, Jonathan",
    title = "Complexité des impacts du changement climatique : un cadre analytique pour les effets médiatisés par les maladies des plantes",
    year = "2011",
    journal = "Plant Pathology",
    abstract = "Les impacts du changement climatique sur les services écosystémiques sont complexes dans le sens où une prédiction efficace nécessite la prise en compte d'une large gamme de facteurs. Une analyse utile des impacts du changement climatique sur les cultures et les systèmes de plantes indigènes nécessitera souvent la prise en compte de la vaste diversité d'autres biotes qui interagissent avec les plantes, y compris les maladies des plantes, les herbivores animaux et les mauvaises herbes. Nous présentons un cadre d'analyse de la complexité des effets du changement climatique médiatisés par les maladies des plantes. Ce cadre peut soutenir l'évaluation du niveau de complexité du modèle susceptible d'être nécessaire pour analyser les impacts du changement climatique médiatisés par les maladies. Notre analyse intègre la prise en compte de l'ensemble suivant de questions pour un hôte particulier, un pathogène, une combinaison hôte–pathogène ou une région géographique. 1. Les interactions biologiques multiples sont-elles importantes ? 2. Y a-t-il des seuils environnementaux pour les réponses des populations ? 3. Y a-t-il des effets indirects des facteurs de changement global sur le développement des maladies ? 4. Les composantes spatiales des processus épidémiques sont-elles affectées par le climat ? 5. Y a-t-il des boucles de rétroaction pour la gestion ? 6. Les réseaux de technologies d'intervention sont-ils plus lents que les réseaux épidémiques ? 7. Y a-t-il des effets des maladies des plantes sur plusieurs services écosystémiques ? 8. Y a-t-il des boucles de rétroaction des maladies des plantes vers le changement climatique ? L'évaluation de ces questions aidera à évaluer la complexité du système, comme illustré pour la fusariose de la tête et la tardive de la pomme de terre. En pratique, il peut être nécessaire d'élargir les modèles pour inclure plus de composants, d'identifier ceux qui sont les plus importants, et de synthétiser de tels modèles pour inclure le niveau optimal de complexité pour la planification et la priorisation de la recherche.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2010.02409.x",
    doi = "10.1111/j.1365-3059.2010.02409.x",
    openalex = "W2139820890",
    references = "doi101071bt07159"
}

Les plantes génèrent des réponses efficaces à l'infection en reconnaissant à la fois des molécules codées par les pathogènes conservées et variables. Les pathogènes déploient des protéines effectrices de virulence dans les cellules hôtes, où elles interagissent physiquement avec les protéines hôtes pour moduler la défense. Nous avons généré un réseau d'interactions entre effecteurs de plantes et pathogènes provenant de deux pathogènes couvrant la divergence entre eucaryotes et eubactéries, trois classes de protéines du système immunitaire d'Arabidopsis, et environ 8000 autres protéines d'Arabidopsis. Nous avons noté une convergence des effecteurs vers des protéines hôtes hautement interconnectées et des connexions indirectes, plutôt que directes, entre les effecteurs et les récepteurs immunitaires des plantes. Nous avons démontré des fonctions du système immunitaire des plantes pour 15 des 17 protéines hôtes testées qui interagissent avec des effecteurs provenant des deux pathogènes. Ainsi, les pathogènes provenant de différents règnes déploient des protéines de virulence évoluant indépendamment qui interagissent avec un ensemble limité de nœuds cellulaires hautement connectés pour faciliter leurs diverses stratégies de cycle de vie.

@article{doi101126science1203659,
    author = "Mukhtar, M. Shahid et Carvunis, Anne‐Ruxandra et Dreze, Matija et Epple, Petra et Steinbrenner, Jens et Moore, Jonathan D. et Taşan, Murat et Galli, Mary et Hao, Tong et Nishimura, Marc T. et Pevzner, Samuel et Donovan, Susan E. et Ghamsari, Lila et Santhanam, Balaji et Romero, Viviana et Poulin, Matthew M. et Gebreab, Fana et Gutierrez, Bryan J. et Tam, Stanley et Monachello, Dario et Boxem, Mike et Harbort, Christopher J. et McDonald, Nathan A. et Gai, Lantian et Chen, Huaming et He, Yijian et Vandenhaute, Jean et Roth, Frederick P. et Hill, David E. et Ecker, Joseph R. et Vidal, Marc et Beynon, Jim et Falter‐Braun, Pascal et Dangl, Jeffery L.",
    title = "Des effecteurs de virulence évoluant indépendamment convergent vers des nœuds centraux dans un réseau du système immunitaire des plantes",
    year = "2011",
    journal = "Science",
    abstract = "Les plantes génèrent des réponses efficaces à l'infection en reconnaissant à la fois des molécules codées par les pathogènes conservées et variables. Les pathogènes déploient des protéines effectrices de virulence dans les cellules hôtes, où elles interagissent physiquement avec les protéines hôtes pour moduler la défense. Nous avons généré un réseau d'interactions entre effecteurs de plantes et pathogènes provenant de deux pathogènes couvrant la divergence entre eucaryotes et eubactéries, trois classes de protéines du système immunitaire d'Arabidopsis, et \textasciitilde 8000 autres protéines d'Arabidopsis. Nous avons noté une convergence des effecteurs vers des protéines hôtes hautement interconnectées et des connexions indirectes, plutôt que directes, entre les effecteurs et les récepteurs immunitaires des plantes. Nous avons démontré des fonctions du système immunitaire des plantes pour 15 des 17 protéines hôtes testées qui interagissent avec des effecteurs provenant des deux pathogènes. Ainsi, les pathogènes provenant de différents règnes déploient des protéines de virulence évoluant indépendamment qui interagissent avec un ensemble limité de nœuds cellulaires hautement connectés pour faciliter leurs diverses stratégies de cycle de vie.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1203659",
    doi = "10.1126/science.1203659",
    openalex = "W2029835563"
}

Nous passons en revue les idées actuelles sur la coévolution des plantes et des parasites, en particulier les processus qui génèrent la diversité génétique. Les fréquences des allèles de résistance de l'hôte et de virulence du parasite qui interagissent dans des relations gène-pour-gène (GFG) coévoluent dans le cycle familier de boom et de buste, dans lequel la résistance est sélectionnée lorsque la virulence est rare, et la virulence est sélectionnée lorsque la résistance est commune. Le cycle peut aboutir à un polymorphisme stable lorsque divers facteurs écologiques et épidémiologiques provoquent une sélection dépendante de la fréquence directe négative (ndFDS) sur la résistance de l'hôte, la virulence du parasite, ou les deux, de telle sorte que l'avantage d'un trait pour la fitness diminue à mesure que sa fréquence augmente. Le polymorphisme peut également être stabilisé par l'hétérozygotie, lorsque les hôtes hétérozygotes ont une résistance supérieure à celle des homozygotes face à divers pathogènes. La diversité génétique peut également persister sous la forme d'un polymorphisme statistique, soutenu par des processus aléatoires agissant sur les fréquences des gènes et la taille de la population. Le polymorphisme stable permet aux allèles d'être de longue durée et à la variation génétique d'être détectable dans les populations naturelles. En agriculture, de nombreux facteurs favorisant la stabilité des interactions hôte-parasite ont été perdus, conduisant à des courses aux armements entre les défenses de l'hôte et les effecteurs du parasite.

@article{doi101146annurevphyto072910095301,
    author = "Brown, James K. M. et Tellier, Aurélien",
    title = "Plant-Parasite Coevolution: Bridging the Gap between Genetics and Ecology",
    year = "2011",
    journal = "Annual Review of Phytopathology",
    abstract = "Nous passons en revue les idées actuelles sur la coévolution des plantes et des parasites, en particulier les processus qui génèrent la diversité génétique. Les fréquences des allèles de résistance de l'hôte et de virulence du parasite qui interagissent dans des relations gène-pour-gène (GFG) coévoluent dans le cycle familier de boom et de buste, dans lequel la résistance est sélectionnée lorsque la virulence est rare, et la virulence est sélectionnée lorsque la résistance est commune. Le cycle peut aboutir à un polymorphisme stable lorsque divers facteurs écologiques et épidémiologiques provoquent une sélection dépendante de la fréquence directe négative (ndFDS) sur la résistance de l'hôte, la virulence du parasite, ou les deux, de telle sorte que l'avantage d'un trait pour la fitness diminue à mesure que sa fréquence augmente. Le polymorphisme peut également être stabilisé par l'hétérozygotie, lorsque les hôtes hétérozygotes ont une résistance supérieure à celle des homozygotes face à divers pathogènes. La diversité génétique peut également persister sous la forme d'un polymorphisme statistique, soutenu par des processus aléatoires agissant sur les fréquences des gènes et la taille de la population. Le polymorphisme stable permet aux allèles d'être de longue durée et à la variation génétique d'être détectable dans les populations naturelles. En agriculture, de nombreux facteurs favorisant la stabilité des interactions hôte-parasite ont été perdus, conduisant à des courses aux armements entre les défenses de l'hôte et les effecteurs du parasite.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-072910-095301",
    doi = "10.1146/annurev-phyto-072910-095301",
    openalex = "W2156406442",
    references = "doi101111j14698137200902927x"
}

La végétation dans la succession primaire est influencée par de multiples facteurs stochastiques et environnementaux à différentes échelles spatiales et temporelles. Dans cette étude, nous analysons l'effet de l'hétérogénéité mésotopographique sur le développement de la végétation suivant le retrait du Glaciar Seco dans les Andes patagoniennes du sud. La composition et la couverture des algues, lichens, mousses et plantes vasculaires ont été enregistrées dans 580 parcelles situées à différentes positions topographiques au sein d'une chronoséquence de huit moraines consécutives. Les parcelles d'échantillonnage ont été caractérisées par des caractéristiques topographiques et de surface. Les motifs spatio-temporels de la composition de la végétation et leurs relations avec les facteurs environnementaux ont été évalués par classification et ordination. Nous avons reconnu huit communautés correspondant à quatre grands stades successifs. La séquence successionale est caractérisée par un développement physiognomonique depuis les lichens saxicoles pionniers (premier stade) jusqu'aux lichens colonisateurs secondaires (deuxième stade), suivi de la colonisation par des arbustes (troisième stade) et du développement de forêts de Nothofagus spp. (quatrième stade). Les trajectoires successionales alternatives sur différentes positions topographiques varient dans la séquence de ces quatre grands stades successifs, les trajectoires sur le sommet et la base de la crête de moraine ne passant pas par certains de ces stades. Une procédure de partition de la variance montre que le temps écoulé depuis la déglaciation et la position topographique sur les moraines expliquent des quantités comparables de variance de la végétation, soulignant l'importance de l'analyse spatio-temporelle du développement de la végétation sur des paysages hétérogènes. Les tendances générales du développement de la végétation suivent les gradients environnementaux. Cependant, l'émergence et la persistance des motifs de végétation peuvent également être attribuées à des processus géomorphologiques dynamiques tels que la dégradation des pentes de moraine affectant la distribution des blocs le long de la pente frontale de la moraine. À l'échelle du paysage, les trajectoires successionales convergent vers un état dominé par Nothofagus, mais une variabilité significative demeure dans le sous-étage en raison de la distribution différentielle des cryptogames le long du gradient topographique de la moraine. La convergence est principalement liée à l'expansion des communautés depuis des sites plus favorables vers la crête plus hostile de la moraine, mais ce n'est pas un processus de changements déterministes progressifs le long des différentes voies successionales.

@article{doi10165719384246434555,
    author = "Garibotti, Irene A. and Pissolito, Clara and Villalba, Ricardo",
    title = "Motif spatio-temporel de la succession primaire en relation avec les gradients mésotopographiques sur des terrains récemment déglacés dans les Andes patagoniennes",
    year = "2011",
    journal = "Arctic Antarctic and Alpine Research",
    abstract = "La végétation dans la succession primaire est influencée par de multiples facteurs stochastiques et environnementaux à différentes échelles spatiales et temporelles. Dans cette étude, nous analysons l'effet de l'hétérogénéité mésotopographique sur le développement de la végétation suivant le retrait du Glaciar Seco dans les Andes patagoniennes du sud. La composition et la couverture des algues, lichens, mousses et plantes vasculaires ont été enregistrées dans 580 parcelles situées à différentes positions topographiques au sein d'une chronoséquence de huit moraines consécutives. Les parcelles d'échantillonnage ont été caractérisées par des caractéristiques topographiques et de surface. Les motifs spatio-temporels de la composition de la végétation et leurs relations avec les facteurs environnementaux ont été évalués par classification et ordination. Nous avons reconnu huit communautés correspondant à quatre grands stades successifs. La séquence successionale est caractérisée par un développement physiognomonique depuis les lichens saxicoles pionniers (premier stade) jusqu'aux lichens colonisateurs secondaires (deuxième stade), suivi de la colonisation par des arbustes (troisième stade) et du développement de forêts de Nothofagus spp. (quatrième stade). Les trajectoires successionales alternatives sur différentes positions topographiques varient dans la séquence de ces quatre grands stades successifs, les trajectoires sur le sommet et la base de la crête de moraine ne passant pas par certains de ces stades. Une procédure de partition de la variance montre que le temps écoulé depuis la déglaciation et la position topographique sur les moraines expliquent des quantités comparables de variance de la végétation, soulignant l'importance de l'analyse spatio-temporelle du développement de la végétation sur des paysages hétérogènes. Les tendances générales du développement de la végétation suivent les gradients environnementaux. Cependant, l'émergence et la persistance des motifs de végétation peuvent également être attribuées à des processus géomorphologiques dynamiques tels que la dégradation des pentes de moraine affectant la distribution des blocs le long de la pente frontale de la moraine. À l'échelle du paysage, les trajectoires successionales convergent vers un état dominé par Nothofagus, mais une variabilité significative demeure dans le sous-étage en raison de la distribution différentielle des cryptogames le long du gradient topographique de la moraine. La convergence est principalement liée à l'expansion des communautés depuis des sites plus favorables vers la crête plus hostile de la moraine, mais ce n'est pas un processus de changements déterministes progressifs le long des différentes voies successionales.",
    url = "https://doi.org/10.1657/1938-4246-43.4.555",
    doi = "10.1657/1938-4246-43.4.555",
    openalex = "W2004377268"
}

1. Introduction.- 2. Modélisation de la structure et de la fonction écologiques.- A. Modèles de végétation mondiale en général.- B. Le modèle actuel.- C. Structure du modèle et considérations techniques.- 3. Classification écologique de la végétation mondiale.- A. Description de la végétation et données de végétation.- B. Caractères écopysiognomiques de la végétation terrestre.- C. Formes de vie de la végétation terrestre mondiale.- 4. Modélisation de l'environnement effectif.- A. Données climatiques.- B. Sélection de variables écoclimatiques.- C. Les variables écoclimatiques et leur signification.- 5. Le modèle écologique : limitation par la forme de vie, couverture et dominance.- A. Données écologiques.- B. Le modèle de limitation environnementale.- C. Le modèle de couverture.- D. Le modèle de dominance.- E. Proximité des limites environnementales.- F. Interprétation des formations végétales.- 6. Résultats du modèle.- A. Sortie du modèle et applicabilité.- B. Génération et cartographie des résultats mondiaux.- C. Aperçu des écoclimats mondiaux.- D. Fréquence de prédiction des formes de vie.- E. Répartition prédite des formes végétales.- F. Prédiction des types de végétation mondiale.- G. Diversité pysiognomique de la végétation.- H. Observations générales et problèmes.- 7. Évaluation des résultats du modèle.- A. Comparaison sur site de la végétation prédite et réelle.- B. Végétation et climat sur des sites inhabituels.- C. Sensibilité de la végétation aux variations climatiques.- 8. Conclusions et prochaines étapes.- Annexes.- Annexe A. Description des types de plantes.- Annexe B. Végétation prédite sur des sites représentatifs et bien connus sélectionnés.- Annexe C. Végétation prédite sur les sites de validation.- Annexe D. Végétation réelle sur les sites de validation.- Annexe E. La base de données macroclimatique.- Annexe F. Les programmes de traitement et de cartographie.- Références.

@book{openalexw2123743885,
    author = "Box, Elgene O.",
    title = "Macroclimate and Plant Forms: An Introduction to Predictive Modeling in Phytogeography",
    year = "2011",
    journal = "Medical Entomology and Zoology",
    abstract = "1. Introduction.- 2. Modélisation de la structure et de la fonction écologiques.- A. Modèles de végétation mondiale en général.- B. Le modèle actuel.- C. Structure du modèle et considérations techniques.- 3. Classification écologique de la végétation mondiale.- A. Description de la végétation et données de végétation.- B. Caractères écopysiognomiques de la végétation terrestre.- C. Formes de vie de la végétation terrestre mondiale.- 4. Modélisation de l'environnement effectif.- A. Données climatiques.- B. Sélection de variables écoclimatiques.- C. Les variables écoclimatiques et leur signification.- 5. Le modèle écologique : limitation par la forme de vie, couverture et dominance.- A. Données écologiques.- B. Le modèle de limitation environnementale.- C. Le modèle de couverture.- D. Le modèle de dominance.- E. Proximité des limites environnementales.- F. Interprétation des formations végétales.- 6. Résultats du modèle.- A. Sortie du modèle et applicabilité.- B. Génération et cartographie des résultats mondiaux.- C. Aperçu des écoclimats mondiaux.- D. Fréquence de prédiction des formes de vie.- E. Répartition prédite des formes végétales.- F. Prédiction des types de végétation mondiale.- G. Diversité pysiognomique de la végétation.- H. Observations générales et problèmes.- 7. Évaluation des résultats du modèle.- A. Comparaison sur site de la végétation prédite et réelle.- B. Végétation et climat sur des sites inhabituels.- C. Sensibilité de la végétation aux variations climatiques.- 8. Conclusions et prochaines étapes.- Annexes.- Annexe A. Description des types de plantes.- Annexe B. Végétation prédite sur des sites représentatifs et bien connus sélectionnés.- Annexe C. Végétation prédite sur les sites de validation.- Annexe D. Végétation réelle sur les sites de validation.- Annexe E. La base de données macroclimatique.- Annexe F. Les programmes de traitement et de cartographie.- Références.",
    openalex = "W2123743885"
}

Dans tous les habitats naturels, les plantes sont entourées d'un nombre énorme d'ennemis potentiels (biotiques) et de divers types de stress environnemental abiotique. Presque tous les écosystèmes contiennent une grande variété de bactéries, virus, champignons, nématodes, acariens, insectes, mammifères et autres animaux herbivores, responsables en grande partie d'une forte réduction de la productivité des cultures. Par leur nature, les plantes se protègent en produisant certains composés appelés métabolites secondaires. Les métabolites secondaires, y compris les terpènes, les phénols et les composés contenant de l'azote (N) et du soufre (S), défendent les plantes contre une variété d'herbivores et de micro-organismes pathogènes, ainsi que contre divers types de stress abiotiques. Cette revue présente un aperçu de certains mécanismes par lesquels les plantes se protègent contre l'herbivorie, les microbes pathogènes et divers stress abiotiques, ainsi que des réponses spécifiques des plantes à l'attaque par des pathogènes et le contrôle génétique des interactions hôte-pathogène.

@article{openalexw2184001384,
    author = "Mazid, M.S. et Khan, Taqi Ahmed et Mohammad, Firoz",
    title = "Rôle des métabolites secondaires dans les mécanismes de défense des plantes",
    year = "2011",
    journal = "Biologie et médecine",
    abstract = "Dans tous les habitats naturels, les plantes sont entourées d'un nombre énorme d'ennemis potentiels (biotiques) et de divers types de stress environnemental abiotique. Presque tous les écosystèmes contiennent une grande variété de bactéries, virus, champignons, nématodes, acariens, insectes, mammifères et autres animaux herbivores, responsables en grande partie d'une forte réduction de la productivité des cultures. Par leur nature, les plantes se protègent en produisant certains composés appelés métabolites secondaires. Les métabolites secondaires, y compris les terpènes, les phénols et les composés contenant de l'azote (N) et du soufre (S), défendent les plantes contre une variété d'herbivores et de micro-organismes pathogènes, ainsi que contre divers types de stress abiotiques. Cette revue présente un aperçu de certains mécanismes par lesquels les plantes se protègent contre l'herbivorie, les microbes pathogènes et divers stress abiotiques, ainsi que des réponses spécifiques des plantes à l'attaque par des pathogènes et le contrôle génétique des interactions hôte-pathogène.",
    openalex = "W2184001384",
    references = "doi10108007352689991309405"
}

Les traits fonctionnels des plantes sont les caractéristiques (morphologiques, physiologiques, phénologiques) qui représentent des stratégies écologiques et déterminent comment les plantes répondent aux facteurs environnementaux, affectent d'autres niveaux trophiques et influencent les propriétés des écosystèmes. La variation des traits fonctionnels des plantes et des syndromes de traits s'est avérée utile pour aborder de nombreuses questions écologiques importantes à différentes échelles, donnant naissance à une demande de méthodes standardisées pour mesurer des traits de plantes écologiquement significatifs. Cette ligne de recherche a été l'une des voies les plus fructueuses pour comprendre les modèles et processus écologiques et évolutifs. Elle a également le potentiel de construire un ensemble prédictif de relations locales, régionales et globales entre les plantes et l'environnement, et de quantifier une large gamme de processus naturels et pilotés par l'homme, y compris les changements de biodiversité, les impacts des invasions d'espèces, les altérations des processus biogéochimiques et les interactions végétation-atmosphère. L'importance de ces sujets dicte le besoin urgent de plus et de meilleures données, et augmente la valeur des protocoles standardisés pour quantifier la variation de traits de différentes espèces, en particulier pour les traits ayant le pouvoir de prédire les processus au niveau des plantes et des écosystèmes, et pour les traits qui peuvent être mesurés relativement facilement. Mis à jour et élargi par rapport à la version précédente largement utilisée, ce manuel conserve l'accent sur des présentations claires, des applications larges et des recettes étape par étape, avec un minimum de texte sur la théorie, et non seulement inclut des méthodes mises à jour pour les traits précédemment couverts, mais introduit également de nombreux nouveaux protocoles pour d'autres traits. Ce nouveau manuel a un meilleur équilibre entre les traits de plante entière, les traits foliaires, les traits racinaires et de tige et les traits régénératifs, et met un accent particulier sur les traits importants pour prédire les effets des espèces sur les propriétés clés des écosystèmes. Nous espérons que ce nouveau manuel deviendra un compagnon standard dans les efforts locaux et globaux pour apprendre à connaître les réponses et impacts des différentes espèces de plantes par rapport aux changements environnementaux du présent, du passé et du futur.

@article{doi101071bt12225,
    author = "Harguindeguy, Natalia Pérez et al.",
    title = "New handbook for standardised measurement of plant functional traits worldwide",
    year = "2013",
    journal = "Australian Journal of Botany",
    abstract = "Les traits fonctionnels des plantes sont les caractéristiques (morphologiques, physiologiques, phénologiques) qui représentent des stratégies écologiques et déterminent la manière dont les plantes répondent aux facteurs environnementaux, affectent d'autres niveaux trophiques et influencent les propriétés des écosystèmes. La variation des traits fonctionnels des plantes et des syndromes de traits s'est avérée utile pour aborder de nombreuses questions écologiques importantes à différentes échelles, donnant lieu à une demande de méthodes standardisées pour mesurer des traits de plantes écologiquement significatifs. Cette ligne de recherche a été l'une des voies les plus fructueuses pour comprendre les modèles et processus écologiques et évolutifs. Elle a également le potentiel de construire un ensemble prédictif de relations locales, régionales et globales entre les plantes et l'environnement, et de quantifier une large gamme de processus naturels et pilotés par l'homme, y compris les changements de biodiversité, les impacts des invasions d'espèces, les altérations des processus biogéochimiques et les interactions végétation-atmosphère. L'importance de ces sujets dicte le besoin urgent de plus et de meilleures données, et augmente la valeur des protocoles standardisés pour quantifier la variation des traits de différentes espèces, en particulier pour les traits ayant le pouvoir de prédire les processus au niveau des plantes et des écosystèmes, et pour les traits qui peuvent être mesurés relativement facilement. Mis à jour et élargi par rapport à la version précédente largement utilisée, ce manuel conserve son accent sur des présentations claires, des applications larges et des recettes étape par étape, avec un minimum de texte sur la théorie, et non seulement inclut des méthodes mises à jour pour les traits précédemment couverts, mais introduit également de nombreux nouveaux protocoles pour d'autres traits. Ce nouveau manuel a un meilleur équilibre entre les traits de plante entière, les traits foliaires, les traits racinaires et de tige, et les traits régénératifs, et met un accent particulier sur les traits importants pour prédire les effets des espèces sur les propriétés clés des écosystèmes. Nous espérons que ce nouveau manuel deviendra un compagnon standard dans les efforts locaux et globaux pour apprendre sur les réponses et impacts des différentes espèces de plantes par rapport aux changements environnementaux dans le présent, le passé et le futur.",
    url = "https://doi.org/10.1071/bt12225",
    doi = "10.1071/bt12225",
    openalex = "W2101020813",
    references = "doi101006anbo20001261, doi101007s004420050100x, doi1010160031942281851345, doi101016b9780124735422x50007, doi101016jtree200602002, doi101023a1004327224729, doi10103835012241, doi101038nature02403, doi101038nature11148, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annurevecolsys33010802150452, doi101146annurevpp40060189002443, doi1023073241344, doi105860choice324498, openalexw1573494572, openalexw2058502945, openalexw2764433274, openalexw569951484"
}

Résumé La compétition pour les ressources a longtemps été considérée comme une force prévalente dans la structuration des communautés végétales et la sélection naturelle, bien que notre compréhension des mécanismes sous-jacents à la compétition pour les ressources soit encore en développement. La complexité de la compétition pour les ressources découle non seulement de la variabilité de la limitation des ressources dans l'espace et le temps et entre les espèces, mais aussi de la complexité des ressources elles-mêmes. Les nutriments, l'eau et la lumière diffèrent chacun par leurs propriétés, ce qui génère des modes de compétition uniques pour ces ressources. Ici, nous discutons des rôles de la préemption de l'approvisionnement et de la réduction de la disponibilité dans la compétition pour les trois ressources lorsqu'elles sont fournies de manière uniforme dans l'espace et le temps. Les plantes entrent en compétition pour les nutriments en préemptant les approvisionnements en nutriments pour qu'ils ne soient pas en contact avec les voisins, ce qui nécessite de maximiser la longueur des racines. Bien que l'eau soit également une ressource du sol, la compétition pour l'eau est généralement considérée comme se produisant par réduction de la disponibilité, favorisant les plantes capables de résister au potentiel hydrique le plus faible. Parce que la lumière est fournie depuis le haut des plantes, les individus qui situent leurs feuilles au-dessus de celles de leurs voisins bénéficient directement d'un taux de photosynthèse accru et indirectement en réduisant la croissance de ces voisins par l'ombre. Dans les communautés où les juvéniles recrutent à l'ombre des adultes, les traits des espèces les plus compétitives sont biaisés vers ceux qui confèrent une meilleure survie et une croissance accrue au stade juvénile, même si ces traits viennent au détriment des performances des adultes. La compréhension des mécanismes de la compétition révèle également comment la compétition a influencé l'évolution des espèces végétales. Par exemple, la compétition pour les nutriments a sélectionné des plantes pour maintenir une longueur de racine plus élevée et la compétition pour la lumière des plantes plus hautes, avec des canopées plus profondes et plus plates que ce qui serait optimal en l'absence de compétition. Dans l'ensemble, bien que plus de recherches soient nécessaires sur la compétition pour les approvisionnements en ressources hétérogènes ainsi que pour l'eau, la compréhension des mécanismes de la compétition augmente la prédictibilité des interactions interspécifiques et révèle comment la compétition a altéré l'évolution des plantes.

@article{doi1011111365243512081,
    author = "Craine, Joseph M. and Dybzinski, Ray",
    title = "Mécanismes de la compétition végétale pour les nutriments, l'eau et la lumière",
    year = "2013",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Résumé La compétition pour les ressources a longtemps été considérée comme une force prévalente dans la structuration des communautés végétales et la sélection naturelle, bien que notre compréhension des mécanismes sous-jacents à la compétition pour les ressources soit encore en développement. La complexité de la compétition pour les ressources découle non seulement de la variabilité de la limitation des ressources dans l'espace et le temps et entre les espèces, mais aussi de la complexité des ressources elles-mêmes. Les nutriments, l'eau et la lumière diffèrent chacun par leurs propriétés, ce qui génère des modes de compétition uniques pour ces ressources. Ici, nous discutons des rôles de la préemption de l'approvisionnement et de la réduction de la disponibilité dans la compétition pour les trois ressources lorsqu'elles sont fournies de manière uniforme dans l'espace et le temps. Les plantes entrent en compétition pour les nutriments en préemptant les approvisionnements en nutriments pour qu'ils ne soient pas en contact avec les voisins, ce qui nécessite de maximiser la longueur des racines. Bien que l'eau soit également une ressource du sol, la compétition pour l'eau est généralement considérée comme se produisant par réduction de la disponibilité, favorisant les plantes capables de résister au potentiel hydrique le plus faible. Parce que la lumière est fournie depuis le haut des plantes, les individus qui situent leurs feuilles au-dessus de celles de leurs voisins bénéficient directement d'un taux de photosynthèse accru et indirectement en réduisant la croissance de ces voisins par l'ombre. Dans les communautés où les juvéniles recrutent à l'ombre des adultes, les traits des espèces les plus compétitives sont biaisés vers ceux qui confèrent une meilleure survie et une croissance accrue au stade juvénile, même si ces traits viennent au détriment des performances des adultes. La compréhension des mécanismes de la compétition révèle également comment la compétition a influencé l'évolution des espèces végétales. Par exemple, la compétition pour les nutriments a sélectionné des plantes pour maintenir une longueur de racine plus élevée et la compétition pour la lumière des plantes plus hautes, avec des canopées plus profondes et plus plates que ce qui serait optimal en l'absence de compétition. Dans l'ensemble, bien que plus de recherches soient nécessaires sur la compétition pour les approvisionnements en ressources hétérogènes ainsi que pour l'eau, la compréhension des mécanismes de la compétition augmente la prédictibilité des interactions interspécifiques et révèle comment la compétition a altéré l'évolution des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2435.12081",
    doi = "10.1111/1365-2435.12081",
    openalex = "W1965066646",
    references = "doi101126science1169640"
}

Le concept des feedbacks plante-sol devient important pour expliquer la dynamique de la végétation, l'invasivité des espèces exotiques introduites dans de nouveaux habitats et la manière dont les écosystèmes terrestres réagissent à l'utilisation des terres et aux changements climatiques mondiaux. En utilisant un nouveau modèle conceptuel, nous montrons comment des altérations critiques des interactions de feedbacks plante-sol peuvent modifier l'assemblage des communautés végétales. Nous mettons en évidence les avancées récentes, définissons les termes et identifions les défis futurs dans ce domaine de recherche et discutons de la manière dont les variations en intensité et direction des feedbacks plante-sol peuvent expliquer la succession, l'invasion, la réponse au réchauffement climatique et les relations diversité-productivité. Bien qu'il y ait eu une augmentation rapide de la compréhension des mécanismes biologiques, chimiques et physiques et de leurs interdépendances sous-jacents aux interactions de feedbacks plante-sol, des progrès supplémentaires sont attendus grâce à l'application de nouvelles techniques et technologies expérimentales, reliant les études empiriques à la modélisation et aux études de terrain qui peuvent inclure les interactions de feedbacks plante-sol sur des échelles de temps plus longues, incluant également des processus à long terme tels que la décomposition de la litière et la minéralisation. Des progrès significatifs ont également été réalisés dans l'analyse des conséquences des feedbacks plante-sol pour les relations biodiversité-fonctionnement, la fitness des plantes et la sélection. Pour intégrer davantage les feedbacks plante-sol dans la théorie écologique, il sera important de déterminer où et comment les motifs observés peuvent être généralisés et comment ils peuvent influencer l'évolution. Synthèse. Une meilleure compréhension des feedbacks plante-sol et des mécanismes sous-jacents améliore notre capacité à prédire les conséquences de ces interactions pour la composition et la productivité des communautés végétales dans diverses conditions. Les recherches futures permettront une meilleure prédiction et atténuation des conséquences des changements globaux induits par l'homme, amélioreront les efforts de restauration et de conservation et favoriseront la fourniture durable de services écosystémiques dans un monde en rapide évolution.

@article{doi1011111365274512054,
    author = "van der Putten, Wim H. et Bardgett, Richard D. et Bever, James D. et Bezemer, Т. Martijn et Casper, Brenda B. et Fukami, Tadashi et Kardol, Paul et Klironomos, John N. et Kulmatiski, Andrew et Schweitzer, Jennifer A. et Suding, Katharine N. et van de Voorde, Tess F. J. et Wardle, David A.",
    title = "Plant–sol feedbacks : le passé, le présent et les défis futurs",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Le concept des feedbacks plante-sol devient important pour expliquer la dynamique de la végétation, l'invasivité des espèces exotiques introduites dans de nouveaux habitats et la manière dont les écosystèmes terrestres réagissent à l'utilisation des terres et aux changements climatiques mondiaux. En utilisant un nouveau modèle conceptuel, nous montrons comment des altérations critiques des interactions de feedbacks plante-sol peuvent modifier l'assemblage des communautés végétales. Nous mettons en évidence les avancées récentes, définissons les termes et identifions les défis futurs dans ce domaine de recherche et discutons de la manière dont les variations en intensité et direction des feedbacks plante-sol peuvent expliquer la succession, l'invasion, la réponse au réchauffement climatique et les relations diversité-productivité. Bien qu'il y ait eu une augmentation rapide de la compréhension des mécanismes biologiques, chimiques et physiques et de leurs interdépendances sous-jacents aux interactions de feedbacks plante-sol, des progrès supplémentaires sont attendus grâce à l'application de nouvelles techniques et technologies expérimentales, reliant les études empiriques à la modélisation et aux études de terrain qui peuvent inclure les interactions de feedbacks plante-sol sur des échelles de temps plus longues, incluant également des processus à long terme tels que la décomposition de la litière et la minéralisation. Des progrès significatifs ont également été réalisés dans l'analyse des conséquences des feedbacks plante-sol pour les relations biodiversité-fonctionnement, la fitness des plantes et la sélection. Pour intégrer davantage les feedbacks plante-sol dans la théorie écologique, il sera important de déterminer où et comment les motifs observés peuvent être généralisés et comment ils peuvent influencer l'évolution. Synthèse. Une meilleure compréhension des feedbacks plante-sol et des mécanismes sous-jacents améliore notre capacité à prédire les conséquences de ces interactions pour la composition et la productivité des communautés végétales dans diverses conditions. Les recherches futures permettront une meilleure prédiction et atténuation des conséquences des changements globaux induits par l'homme, amélioreront les efforts de restauration et de conservation et favoriseront la fourniture durable de services écosystémiques dans un monde en rapide évolution.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12054",
    doi = "10.1111/1365-2745.12054",
    openalex = "W2076471462",
    references = "doi101038nrg1877, doi101111j13652745200501017x, doi1018900012965820030840559caegac20co2, doi1023072937039, doi1023072960528"
}

Nous décrivons le contexte général et les progrès récents de la recherche sur la photosynthèse sous-marine de segments de feuilles, de communautés entières et d'écosystèmes aquatiques dominés par les plantes, et nous présentons des méthodes contemporaines spécialement conçues pour quantifier la photosynthèse et la fixation du carbone sous l'eau. La majorité des études sur la photosynthèse aquatique ont été réalisées avec des feuilles détachées ou des thalles, et cette sélectivité influence la perception de la régulation de la photosynthèse aquatique. Nous recommandons donc d'évaluer l'influence du carbone inorganique et de la température sur les communautés aquatiques naturelles de densité variable, en plus d'étudier des feuilles détachées dans les scénarios de hausse du CO2 et de la température. De plus, un nombre croissant de chercheurs s'intéressent à la tolérance des plantes terrestres lors des inondations, car les pluies torrentielles peuvent parfois provoquer des inondations sur les terres qui submergent les plantes terrestres. Nous proposons d'entreprendre des études pour élucider l'importance de l'acclimatation des feuilles des plantes terrestres afin de faciliter les échanges gazeux et l'utilisation de la lumière sous l'eau, car ces acclimations influencent la photosynthèse sous-marine ainsi que l'aération interne des tissus végétaux lors de la submersion.

@article{doi103389fpls201300140,
    author = "Pedersen, Ole et Colmer, Timothy D. et Sand‐Jensen, Kaj",
    title = "Photosynthèse sous-marine des plantes submergées – Progrès récents et méthodes",
    year = "2013",
    journal = "Frontiers in Plant Science",
    abstract = "Nous décrivons le contexte général et les progrès récents de la recherche sur la photosynthèse sous-marine de segments de feuilles, de communautés entières et d'écosystèmes aquatiques dominés par les plantes, et nous présentons des méthodes contemporaines spécialement conçues pour quantifier la photosynthèse et la fixation du carbone sous l'eau. La majorité des études sur la photosynthèse aquatique ont été réalisées avec des feuilles détachées ou des thalles, et cette sélectivité influence la perception de la régulation de la photosynthèse aquatique. Nous recommandons donc d'évaluer l'influence du carbone inorganique et de la température sur les communautés aquatiques naturelles de densité variable, en plus d'étudier des feuilles détachées dans les scénarios de hausse du CO2 et de la température. De plus, un nombre croissant de chercheurs s'intéressent à la tolérance des plantes terrestres lors des inondations, car les pluies torrentielles peuvent parfois provoquer des inondations sur les terres qui submergent les plantes terrestres. Nous proposons d'entreprendre des études pour élucider l'importance de l'acclimatation des feuilles des plantes terrestres afin de faciliter les échanges gazeux et l'utilisation de la lumière sous l'eau, car ces acclimations influencent la photosynthèse sous-marine ainsi que l'aération interne des tissus végétaux lors de la submersion.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fpls.2013.00140",
    doi = "10.3389/fpls.2013.00140",
    openalex = "W2167619298",
    references = "doi101046j13652427199700183x"
}

L'urbanisation contribue à la perte de la biodiversité mondiale et à l'homogénéisation de sa biote. Cependant, les études comparatives de la biodiversité urbaine menant à des généralités robustes sur l'état et les facteurs de la biodiversité dans les villes à l'échelle mondiale font défaut. Ici, nous avons compilé le plus grand jeu de données mondial à ce jour de deux taxons divers dans les villes : les oiseaux (54 villes) et les plantes (110 villes). Nous avons constaté que la majorité des espèces d'oiseaux et de plantes urbaines sont indigènes dans les villes du monde. Peu de plantes et d'oiseaux sont cosmopolites, les plus courants étant Columba livia et Poa annua. La densité des espèces d'oiseaux et de plantes (le nombre d'espèces par km(2)) a considérablement diminué : seules 8 % des espèces d'oiseaux indigènes et 25 % des espèces de plantes indigènes sont actuellement présentes par rapport aux estimations de la densité des espèces non urbaines. La densité actuelle des espèces dans les villes et la perte de densité des espèces ont été le mieux expliquées par des caractéristiques anthropiques (landcover, âge de la ville) plutôt que par des facteurs non anthropiques (géographie, climat, topographie). Alors que l'urbanisation continue de s'étendre, les efforts dirigés vers la conservation de la végétation intacte au sein des paysages urbains pourraient soutenir des concentrations plus élevées à la fois d'espèces d'oiseaux et de plantes. Malgré la baisse de la densité des espèces, les villes conservent encore des espèces indigènes endémiques, offrant ainsi des opportunités pour la conservation, la restauration et l'éducation de la biodiversité régionale et mondiale.

@article{doi101098rspb20133330,
    author = "Aronson, Myla F. J. et Sorte, Frank A. La et Nilon, Charles H. et Katti, Madhusudan et Goddard, Mark A. et Lepczyk, Christopher A. et Warren, Paige S. et Williams, Nicholas S. G. et Cilliers, Sarel S. et Clarkson, Bruce D. et Dobbs, Cynnamon et Dolan, Rebecca W. et Hedblom, Marcus et Klotz, Stefan et Kooijmans, Jip Louwe et Kühn, Ingolf et MacGregor‐Fors, Ian et McDonnell, Mark J. et Mörtberg, Ulla et Pyšek, Petr et Siebert, Stefan J. et Sushinsky, Jessica R. et Werner, P. et Winter, Marten",
    title = "Une analyse mondiale des impacts de l'urbanisation sur la diversité des oiseaux et des plantes révèle des facteurs anthropiques clés",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "L'urbanisation contribue à la perte de la biodiversité mondiale et à l'homogénéisation de sa biote. Cependant, les études comparatives de la biodiversité urbaine menant à des généralités robustes sur l'état et les facteurs de la biodiversité dans les villes à l'échelle mondiale font défaut. Ici, nous avons compilé le plus grand jeu de données mondial à ce jour de deux taxons divers dans les villes : les oiseaux (54 villes) et les plantes (110 villes). Nous avons constaté que la majorité des espèces d'oiseaux et de plantes urbaines sont indigènes dans les villes du monde. Peu de plantes et d'oiseaux sont cosmopolites, les plus courants étant Columba livia et Poa annua. La densité des espèces d'oiseaux et de plantes (le nombre d'espèces par km(2)) a considérablement diminué : seules 8 % des espèces d'oiseaux indigènes et 25 % des espèces de plantes indigènes sont actuellement présentes par rapport aux estimations de la densité des espèces non urbaines. La densité actuelle des espèces dans les villes et la perte de densité des espèces ont été le mieux expliquées par des caractéristiques anthropiques (landcover, âge de la ville) plutôt que par des facteurs non anthropiques (géographie, climat, topographie). Alors que l'urbanisation continue de s'étendre, les efforts dirigés vers la conservation de la végétation intacte au sein des paysages urbains pourraient soutenir des concentrations plus élevées à la fois d'espèces d'oiseaux et de plantes. Malgré la baisse de la densité des espèces, les villes conservent encore des espèces indigènes endémiques, offrant ainsi des opportunités pour la conservation, la restauration et l'éducation de la biodiversité régionale et mondiale.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2013.3330",
    doi = "10.1098/rspb.2013.3330",
    openalex = "W2122058323",
    references = "doi10103835012228, doi101073pnas0608361104, doi101111j1466822x200600212x"
}

Résumé Le spectre de l'économie foliaire (LES) offre un cadre utile pour examiner les stratégies des espèces façonnées par leur histoire évolutive. Cependant, ce spectre, tel qu'il a été décrit à l'origine, impliquait seulement deux ressources clés (le carbone et les nutriments) et l'un des trois organes végétaux économiquement importants. Dans cet article, j'évalue si l'idée du spectre économique peut être étendue de manière générale à l'eau – la troisième ressource clé –, aux tiges, aux racines et aux plantes entières, ainsi qu'aux échelles individuelle, communautaire et d'écosystème. Mon hypothèse globale est qu'une sélection forte le long des axes de compromis de traits, en tandem avec les contraintes biophysiques, conduit à une convergence pour tout taxon sur une stratégie uniformément rapide, moyenne ou lente (c'est-à-dire les taux d'acquisition et de traitement des ressources) pour tous les organes et toutes les ressources. Des preuves de spectres de traits économiques existent pour les tiges et les racines, ainsi que pour les feuilles, et pour les traits liés à l'eau, ainsi qu'au carbone et aux nutriments. Ces observations s'appliquent généralement à l'intérieur et entre les échelles (à l'intérieur et entre les communautés, les zones climatiques, les biomes et les lignées). Il existe des liens entre les organes et un couplage entre les ressources, aboutissant à un spectre économique intégré de la plante entière. Les espèces capables de déplacer l'eau rapidement ont une faible densité de tissus, une courte durée de vie des tissus et des taux élevés d'acquisition et de flux de ressources aux échelles organique et individuelle. L'inverse est vrai pour les espèces ayant la stratégie lente. Différents traits peuvent être importants dans des conditions différentes, mais comme être rapide dans un aspect nécessite généralement d'être rapide dans d'autres, être rapide ou lent est une caractéristique générale des espèces. Les traits économiques influencent la performance et l'aptitude de manière cohérente avec la théorie basée sur les traits concernant les mécanismes adaptatifs sous-jacents. Les traits aident à expliquer les différences de croissance et de survie à travers les gradients de ressources et contribuent ainsi à expliquer la distribution des espèces et l'assemblage des communautés à travers les gradients de lumière, d'eau et de nutriments. Les traits s'étendent à l'échelle – les traits rapides sont associés à des taux plus rapides de processus écosystémiques tels que la décomposition ou la productivité primaire, et les traits lents à des taux de processus lents. Synthèse. Les traits comptent. Un unique spectre économique des plantes « rapide–lent » qui intègre les feuilles, les tiges et les racines est une caractéristique clé de l'univers végétal et aide à expliquer les stratégies écologiques individuelles, les processus d'assemblage des communautés et le fonctionnement des écosystèmes.

@article{doi1011111365274512211,
    author = "Reich, Peter B.",
    title = "The world‐wide 'fast–slow' plant economics spectrum: a traits manifesto",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Résumé Le spectre de l'économie foliaire (LES) offre un cadre utile pour examiner les stratégies des espèces façonnées par leur histoire évolutive. Cependant, ce spectre, tel qu'il a été décrit à l'origine, impliquait seulement deux ressources clés (le carbone et les nutriments) et l'un des trois organes végétaux économiquement importants. Dans cet article, j'évalue si l'idée du spectre économique peut être étendue de manière générale à l'eau – la troisième ressource clé –, aux tiges, aux racines et aux plantes entières, ainsi qu'aux échelles individuelle, communautaire et d'écosystème. Mon hypothèse globale est qu'une sélection forte le long des axes de compromis de traits, en tandem avec les contraintes biophysiques, conduit à une convergence pour tout taxon sur une stratégie uniformément rapide, moyenne ou lente (c'est-à-dire les taux d'acquisition et de traitement des ressources) pour tous les organes et toutes les ressources. Des preuves de spectres de traits économiques existent pour les tiges et les racines, ainsi que pour les feuilles, et pour les traits liés à l'eau, ainsi qu'au carbone et aux nutriments. Ces observations s'appliquent généralement à l'intérieur et entre les échelles (à l'intérieur et entre les communautés, les zones climatiques, les biomes et les lignées). Il existe des liens entre les organes et un couplage entre les ressources, aboutissant à un spectre économique intégré de la plante entière. Les espèces capables de déplacer l'eau rapidement ont une faible densité de tissus, une courte durée de vie des tissus et des taux élevés d'acquisition et de flux de ressources aux échelles organique et individuelle. L'inverse est vrai pour les espèces ayant la stratégie lente. Différents traits peuvent être importants dans des conditions différentes, mais comme être rapide dans un aspect nécessite généralement d'être rapide dans d'autres, être rapide ou lent est une caractéristique générale des espèces. Les traits économiques influencent la performance et l'aptitude de manière cohérente avec la théorie basée sur les traits concernant les mécanismes adaptatifs sous-jacents. Les traits aident à expliquer les différences de croissance et de survie à travers les gradients de ressources et contribuent ainsi à expliquer la distribution des espèces et l'assemblage des communautés à travers les gradients de lumière, d'eau et de nutriments. Les traits s'étendent à l'échelle – les traits rapides sont associés à des taux plus rapides de processus écosystémiques tels que la décomposition ou la productivité primaire, et les traits lents à des taux de processus lents. Synthèse. Les traits comptent. Un unique spectre économique des plantes « rapide–lent » qui intègre les feuilles, les tiges et les racines est une caractéristique clé de l'univers végétal et aide à expliquer les stratégies écologiques individuelles, les processus d'assemblage des communautés et le fonctionnement des écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12211",
    doi = "10.1111/1365-2745.12211",
    openalex = "W2127928904",
    references = "doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652435200200664x, doi101046j13652745199800306x, doi101086283244, doi101098rspb20081919, doi101104pp107101352, doi101111j00301299200715559x, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j13652486201102451x, doi101111j14610248200801219x, doi101111j14610248200901285x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14610248200901410x, doi101146annureves11110180001313, doi1018900012965819970781958cafasa20co2, doi1023072259756, doi1023074549, doi1034172009143, openalexw1564371012, openalexw2097450069, openalexw2169917233"
}

Les oomycètes forment une lignée profonde d'organismes eucaryotes qui comprend un grand nombre de pathogènes végétaux menaçant les écosystèmes naturels et gérés. Nous avons mené une enquête pour demander à la communauté de classer les espèces d'oomycètes pathogènes des plantes selon leur importance scientifique et économique. Au total, nous avons reçu 263 votes de 62 scientifiques de 15 pays pour un total de 33 espèces. Les dix premières espèces et leur classement sont : (1) Phytophthora infestans ; (2, ex æquo) Hyaloperonospora arabidopsidis ; (2, ex æquo) Phytophthora ramorum ; (4) Phytophthora sojae ; (5) Phytophthora capsici ; (6) Plasmopara viticola ; (7) Phytophthora cinnamomi ; (8, ex æquo) Phytophthora parasitica ; (8, ex æquo) Pythium ultimum ; et (10) Albugo candida. Cet article fournit une introduction à ces 10 taxons et un aperçu de la recherche actuelle. Nous espérons que cette liste servira de référence pour les tendances futures de la recherche sur les oomycètes.

@article{doi101111mpp12190,
    author = "Kamoun, Sophien et Furzer, Oliver J. et Jones, Jonathan D. G. et Judelson, Howard S. et Ali, Gul Shad et Dalio, Ronaldo J. D. et Roy, Sanjoy Guha et Schena, Leonardo et Zambounis, Antonios et Panabières, Franck et Cahill, David M. et Ruocco, Michelina et Figueiredo, Andreia et Chen, Xiao‐Ren et Hulvey, Jon et Stam, Remco et Lamour, Kurt et Gijzen, Mark et Tyler, Brett M. et Grünwald, Niklaus J. et Mukhtar, M. Shahid et Tomé, Daniel et Tör, Mahmut et den Ackerveken, Guido Van et McDowell, John M. et Daayf, Fouad et Fry, William E. et Lindqvist‐Kreuze, Hannele et Meijer, H.J.G. et Pêtre, Benjamin et Ristaino, Jean B. et Yoshida, Kentaro et Birch, Paul R. J. et Govers, Francine",
    title = "Les dix principaux pathogènes oomycètes en pathologie moléculaire des plantes",
    year = "2014",
    journal = "Molecular Plant Pathology",
    abstract = "Les oomycètes forment une lignée profonde d'organismes eucaryotes qui comprend un grand nombre de pathogènes végétaux menaçant les écosystèmes naturels et gérés. Nous avons mené une enquête pour demander à la communauté de classer les espèces d'oomycètes pathogènes des plantes selon leur importance scientifique et économique. Au total, nous avons reçu 263 votes de 62 scientifiques de 15 pays pour un total de 33 espèces. Les dix premières espèces et leur classement sont : (1) Phytophthora infestans ; (2, ex æquo) Hyaloperonospora arabidopsidis ; (2, ex æquo) Phytophthora ramorum ; (4) Phytophthora sojae ; (5) Phytophthora capsici ; (6) Plasmopara viticola ; (7) Phytophthora cinnamomi ; (8, ex æquo) Phytophthora parasitica ; (8, ex æquo) Pythium ultimum ; et (10) Albugo candida. Cet article fournit une introduction à ces 10 taxons et un aperçu de la recherche actuelle. Nous espérons que cette liste servira de référence pour les tendances futures de la recherche sur les oomycètes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mpp.12190",
    doi = "10.1111/mpp.12190",
    openalex = "W2131002525"
}

La décomposition de la litière dans les écosystèmes terrestres constitue une première étape importante pour le cycle du carbone et des nutriments, car la matière végétale sénescente est dégradée et incorporée, avec les produits microbiens, dans la matière organique du sol. L'identification des effets d'affinité de la litière, par lesquels la décomposition est accélérée dans son environnement d'origine (avantage du champ d'origine, AFO), met en évidence l'importance des interactions plante-sol qui ont des conséquences pour le cycle biogéochimique. Bien que non universels, ces effets d'affinité ont été identifiés dans une variété d'écosystèmes, en particulier dans les forêts sans perturbation. L'optimisation de la communauté locale de décomposeurs pour dégrader une combinaison particulière de traits de la litière est l'explication la plus souvent citée des effets AFO, mais les manières dont cette communauté spécialisée peut se développer ne sont que débutant à être comprises. Nous explorons les manières dont l'AFO, ou plus largement les effets d'affinité de la litière, pourraient survenir dans les écosystèmes terrestres. Les interactions plante-herbivore, la symbiose microbienne, les héritages des communautés de la phyllosphère et les attracteurs de faunes du sol spécifiques pourraient contribuer à des effets d'affinité spatialement définis pour la décomposition de la litière. Le pyroséquençage des communautés du sol et les liens fonctionnels de la faune du sol offrent de grandes promesses pour faire progresser notre compréhension mécanistique de ces interactions, et pourraient conduire à une plus grande appréciation du rôle de l'affinité litière-décomposeur dans le maintien de la diversité fonctionnelle du sol.

@article{doi101111nph12959,
    author = "Austin, Amy T. et Vivanco, Lucía et González‐Arzac, Adelia et Pérez, Luis I.",
    title = "There's no place like home? Une exploration des mécanismes derrière l'affinité entre la litière végétale et les décomposeurs dans les écosystèmes terrestres",
    year = "2014",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "La décomposition de la litière dans les écosystèmes terrestres constitue une première étape importante pour le cycle du carbone et des nutriments, car la matière végétale sénescente est dégradée et incorporée, avec les produits microbiens, dans la matière organique du sol. L'identification des effets d'affinité de la litière, par lesquels la décomposition est accélérée dans son environnement d'origine (avantage du champ d'origine, AFO), met en évidence l'importance des interactions plante-sol qui ont des conséquences pour le cycle biogéochimique. Bien que non universels, ces effets d'affinité ont été identifiés dans une variété d'écosystèmes, en particulier dans les forêts sans perturbation. L'optimisation de la communauté locale de décomposeurs pour dégrader une combinaison particulière de traits de la litière est l'explication la plus souvent citée des effets AFO, mais les manières dont cette communauté spécialisée peut se développer ne sont que débutant à être comprises. Nous explorons les manières dont l'AFO, ou plus largement les effets d'affinité de la litière, pourraient survenir dans les écosystèmes terrestres. Les interactions plante-herbivore, la symbiose microbienne, les héritages des communautés de la phyllosphère et les attracteurs de faunes du sol spécifiques pourraient contribuer à des effets d'affinité spatialement définis pour la décomposition de la litière. Le pyroséquençage des communautés du sol et les liens fonctionnels de la faune du sol offrent de grandes promesses pour faire progresser notre compréhension mécanistique de ces interactions, et pourraient conduire à une plus grande appréciation du rôle de l'affinité litière-décomposeur dans le maintien de la diversité fonctionnelle du sol.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.12959",
    doi = "10.1111/nph.12959",
    openalex = "W2027623120",
    references = "doi101111j14698137200902927x"
}

Les forêts hyperdiverses se trouvent dans les tropiques de basse altitude, tandis que les landes les plus riches en espèces sont situées dans des régions telles que l'Australie du sud-ouest (kwongan) et l'Afrique du Sud (fynbos). Malgré de grandes différences, ces écosystèmes partagent une caractéristique importante : leurs sols sont fortement altérés et le phosphore (P) est un nutriment limitant la croissance clé. Les pathogènes du sol sont de plus en plus reconnus comme des moteurs de la diversité végétale dans les forêts tropicales humides de basse altitude, mais ont reçu peu d'attention dans les landes riches en espèces. Nous suggérons un compromis dans lequel les espèces les plus compétentes pour acquérir le P ont des racines éphémères qui sont particulièrement sensibles aux pathogènes du sol. Cela pourrait égaliser les différences de capacité compétitive entre les espèces coexistantes dans ces écosystèmes, contribuant ainsi à la coexistence. De plus, une protection efficace contre les pathogènes du sol par les champignons ectomycorhiziens (ECM) pourrait expliquer l'apparition de peuplements monodominants d'arbres et d'arbustes ECM au sein d'autres communautés riches en espèces. Nous identifions des lacunes dans nos connaissances qui doivent être comblées afin d'évaluer un lien possible entre la limitation en P, les traits des racines fines, les pathogènes du sol et la diversité locale des espèces végétales. Un tel lien pourrait aider à expliquer comment de nombreuses espèces végétales peuvent coexister dans les forêts tropicales humides et les landes hyperdiverses, et, à l'inverse, comment les peuplements monodominants peuvent se développer dans ces écosystèmes.

@article{doi101111nph13203,
    author = "Laliberté, Étienne et Lambers, Hans et Burgess, Treena I. et Wright‬, S. Joseph",
    title = "Limitation en phosphore, pathogènes du sol et la coexistence des espèces végétales dans les forêts hyperdiverses et les landes",
    year = "2014",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les forêts hyperdiverses se trouvent dans les tropiques de basse altitude, tandis que les landes les plus riches en espèces sont situées dans des régions telles que l'Australie du sud-ouest (kwongan) et l'Afrique du Sud (fynbos). Malgré de grandes différences, ces écosystèmes partagent une caractéristique importante : leurs sols sont fortement altérés et le phosphore (P) est un nutriment limitant la croissance clé. Les pathogènes du sol sont de plus en plus reconnus comme des moteurs de la diversité végétale dans les forêts tropicales humides de basse altitude, mais ont reçu peu d'attention dans les landes riches en espèces. Nous suggérons un compromis dans lequel les espèces les plus compétentes pour acquérir le P ont des racines éphémères qui sont particulièrement sensibles aux pathogènes du sol. Cela pourrait égaliser les différences de capacité compétitive entre les espèces coexistantes dans ces écosystèmes, contribuant ainsi à la coexistence. De plus, une protection efficace contre les pathogènes du sol par les champignons ectomycorhiziens (ECM) pourrait expliquer l'apparition de peuplements monodominants d'arbres et d'arbustes ECM au sein d'autres communautés riches en espèces. Nous identifions des lacunes dans nos connaissances qui doivent être comblées afin d'évaluer un lien possible entre la limitation en P, les traits des racines fines, les pathogènes du sol et la diversité locale des espèces végétales. Un tel lien pourrait aider à expliquer comment de nombreuses espèces végétales peuvent coexister dans les forêts tropicales humides et les landes hyperdiverses, et, à l'inverse, comment les peuplements monodominants peuvent se développer dans ces écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13203",
    doi = "10.1111/nph.13203",
    openalex = "W2157559274",
    references = "doi101007bf00002772, doi1010160016706176900665, doi101016b9780123705266x50016, doi101071bt06019, doi101086282687, doi101086318629, doi101086417659, doi1011111365274512211, doi101111j14610248200701113x, doi101126science2304728895, doi101146annurevecolsys311343, doi105860choice260924"
}

Les invasions par des plantes exotiques offrent une occasion unique d'examiner les interactions compétitives entre les plantes. Bien que la compétition pour les ressources ait longtemps été considérée comme un mécanisme majeur responsable des invasions réussies, compte tenu de la capacité bien connue de nombreux envahisseurs à devenir dominants et à réduire la diversité végétale dans les communautés envahies, peu d'études ont mesuré directement la compétition pour les ressources ou évalué son importance par rapport à celle d'autres mécanismes, à différentes étapes d'un processus d'invasion. Ici, nous examinons les preuves comparant la capacité compétitive des espèces envahissantes par rapport à celle des plantes natives co-occurent, le long d'une gamme de gradients environnementaux, montrant que de nombreuses espèces envahissantes ont une capacité compétitive supérieure aux espèces natives, bien que les congénères envahissants ne soient pas nécessairement compétitivement supérieurs aux congénères natives, ni que les dominants exotiques soient de meilleurs compétiteurs que les dominants natives. Nous discutons de la manière dont les résultats de la compétition dépendent de nombreux facteurs, tels que la distribution hétérogène des ressources, l'étape du processus d'invasion, ainsi que la plasticité phénotypique et l'adaptation évolutive, qui peuvent entraîner une capacité compétitive accrue ou diminuée chez les espèces envahissantes et natives. Les avantages compétitifs des espèces envahissantes par rapport aux natives sont souvent transitoires et n'importent que dans les premières étapes d'un processus d'invasion. Il reste incertain quelle est l'importance de la compétition pour les ressources par rapport à d'autres mécanismes (évitement de la compétition via des différences phénologiques, différenciation de niche dans l'espace associée à la distance phylogénétique, limitation du recrutement et de la dispersion, compétition indirecte et allélopathie). Enfin, nous identifions les problèmes conceptuels et méthodologiques caractérisant les études de compétition dans les invasions végétales, et nous discutons des besoins de recherche futurs, y compris l'examen de la dynamique de la compétition pour les ressources et de l'impact du changement environnemental mondial sur les interactions compétitives entre les espèces envahissantes et natives.

@article{doi103389fpls201400501,
    author = "Gioria, Margherita et Osborne, Bruce",
    title = "Compétition pour les ressources dans les invasions végétales : modèles émergents et besoins de recherche",
    year = "2014",
    journal = "Frontiers in Plant Science",
    abstract = "Les invasions par des plantes exotiques offrent une occasion unique d'examiner les interactions compétitives entre les plantes. Bien que la compétition pour les ressources ait longtemps été considérée comme un mécanisme majeur responsable des invasions réussies, compte tenu de la capacité bien connue de nombreux envahisseurs à devenir dominants et à réduire la diversité végétale dans les communautés envahies, peu d'études ont mesuré directement la compétition pour les ressources ou évalué son importance par rapport à celle d'autres mécanismes, à différentes étapes d'un processus d'invasion. Ici, nous examinons les preuves comparant la capacité compétitive des espèces envahissantes par rapport à celle des plantes natives co-occurent, le long d'une gamme de gradients environnementaux, montrant que de nombreuses espèces envahissantes ont une capacité compétitive supérieure aux espèces natives, bien que les congénères envahissants ne soient pas nécessairement compétitivement supérieurs aux congénères natives, ni que les dominants exotiques soient de meilleurs compétiteurs que les dominants natives. Nous discutons de la manière dont les résultats de la compétition dépendent de nombreux facteurs, tels que la distribution hétérogène des ressources, l'étape du processus d'invasion, ainsi que la plasticité phénotypique et l'adaptation évolutive, qui peuvent entraîner une capacité compétitive accrue ou diminuée chez les espèces envahissantes et natives. Les avantages compétitifs des espèces envahissantes par rapport aux natives sont souvent transitoires et n'importent que dans les premières étapes d'un processus d'invasion. Il reste incertain quelle est l'importance de la compétition pour les ressources par rapport à d'autres mécanismes (évitement de la compétition via des différences phénologiques, différenciation de niche dans l'espace associée à la distance phylogénétique, limitation du recrutement et de la dispersion, compétition indirecte et allélopathie). Enfin, nous identifions les problèmes conceptuels et méthodologiques caractérisant les études de compétition dans les invasions végétales, et nous discutons des besoins de recherche futurs, y compris l'examen de la dynamique de la compétition pour les ressources et de l'impact du changement environnemental mondial sur les interactions compétitives entre les espèces envahissantes et natives.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fpls.2014.00501",
    doi = "10.3389/fpls.2014.00501",
    openalex = "W2001790803",
    references = "doi101007bf02857949, doi101023a1026208327014, doi101111j14698137200702207x, doi101126science1121407"
}

@article{doi101016jtplants201510014,
    author = "Tollenaere, Charlotte et Susi, Hanna et Laine, Anna‐Liisa",
    title = "Implications évolutives et épidémiologiques des infections multiples chez les plantes",
    year = "2015",
    journal = "Trends in Plant Science",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tplants.2015.10.014",
    doi = "10.1016/j.tplants.2015.10.014",
    openalex = "W2185565115",
    references = "doi101111j14698137200902927x"
}

@article{doi101038nplants201550,
    author = "Zemunik, Graham et Turner, Benjamin L. et Lambers, Hans et Laliberté, Étienne",
    title = "Diversité des stratégies d'acquisition des nutriments par les plantes augmente au cours du développement à long terme des écosystèmes",
    year = "2015",
    journal = "Nature Plants",
    url = "https://doi.org/10.1038/nplants.2015.50",
    doi = "10.1038/nplants.2015.50",
    openalex = "W2332866159",
    references = "doi101111nph13203"
}

Aujourd'hui, les fibres naturelles sont un choix populaire pour les applications dans la fabrication de composites. Basées sur les avantages de durabilité, les biofibres telles que les fibres végétales remplacent les fibres synthétiques dans les composites. Ces fibres sont utilisées pour fabriquer plusieurs biocomposites. La composition chimique et les propriétés de chacune des fibres changent, ce qui exige une comparaison détaillée de ces fibres. Le potentiel de renforcement des fibres naturelles et leurs propriétés ont été décrits dans de nombreux articles. Aujourd'hui, des biocomposites haute performance sont produits grâce à plusieurs années de recherche. Les fibres végétales, en particulier les fibres de tige et de feuille, trouvent des applications dans l'industrie automobile. Alors que la plupart des autres fibres sont explorées à l'échelle du laboratoire, elles n'ont pas encore trouvé d'applications commerciales à grande échelle. Il est nécessaire de considérer également d'autres fibres, telles que celles fabriquées à partir de graines (coir) et d'animaux (plume de poulet), car elles sont secondaires ou fabriquées à partir de déchets. Peu de fibres végétales, telles que les fibres de tige, sont souvent résumées brièvement, mais d'autres fibres végétales et animales ne sont pas discutées en détail. Cet article de revue examine les six types de fibres végétales, à savoir les fibres de tige, de feuille, de graine, de paille, d'herbe et de bois, ainsi que les fibres animales et les fibres de cellulose régénérée. De plus, la revue examine les développements concernant les fibres naturelles et leurs composites. La source de la fibre, l'extraction, la disponibilité, le type, la composition et les propriétés mécaniques sont discutées. Les avantages et les inconvénients de l'utilisation de chaque biofibre sont examinés. Trois architectures de tissu, telles que non tissé, tissé et tricoté, ont été brièvement discutées. Enfin, l'article présente une vue d'ensemble des résultats des composites fabriqués à partir de chaque fibre avec des références appropriées pour des études approfondies.

@article{doi101080155837242014971124,
    author = "Ramamoorthy, Sunil Kumar et Skrifvars, Mikael et Persson, Anders",
    title = "A Review of Natural Fibers Used in Biocomposites: Plant, Animal and Regenerated Cellulose Fibers",
    year = "2015",
    journal = "Polymer Reviews",
    abstract = "Aujourd'hui, les fibres naturelles sont un choix populaire pour les applications dans la fabrication de composites. Basées sur les avantages de durabilité, les biofibres telles que les fibres végétales remplacent les fibres synthétiques dans les composites. Ces fibres sont utilisées pour fabriquer plusieurs biocomposites. La composition chimique et les propriétés de chacune des fibres changent, ce qui exige une comparaison détaillée de ces fibres. Le potentiel de renforcement des fibres naturelles et leurs propriétés ont été décrits dans de nombreux articles. Aujourd'hui, des biocomposites haute performance sont produits grâce à plusieurs années de recherche. Les fibres végétales, en particulier les fibres de tige et de feuille, trouvent des applications dans l'industrie automobile. Alors que la plupart des autres fibres sont explorées à l'échelle du laboratoire, elles n'ont pas encore trouvé d'applications commerciales à grande échelle. Il est nécessaire de considérer également d'autres fibres, telles que celles fabriquées à partir de graines (coir) et d'animaux (plume de poulet), car elles sont secondaires ou fabriquées à partir de déchets. Peu de fibres végétales, telles que les fibres de tige, sont souvent résumées brièvement, mais d'autres fibres végétales et animales ne sont pas discutées en détail. Cet article de revue examine les six types de fibres végétales, à savoir les fibres de tige, de feuille, de graine, de paille, d'herbe et de bois, ainsi que les fibres animales et les fibres de cellulose régénérée. De plus, la revue examine les développements concernant les fibres naturelles et leurs composites. La source de la fibre, l'extraction, la disponibilité, le type, la composition et les propriétés mécaniques sont discutées. Les avantages et les inconvénients de l'utilisation de chaque biofibre sont examinés. Trois architectures de tissu, telles que non tissé, tissé et tricoté, ont été brièvement discutées. Enfin, l'article présente une vue d'ensemble des résultats des composites fabriqués à partir de chaque fibre avec des références appropriées pour des études approfondies.",
    url = "https://doi.org/10.1080/15583724.2014.971124",
    doi = "10.1080/15583724.2014.971124",
    openalex = "W1998803072",
    references = "openalexw2777527484"
}

Des études récentes ont montré que la prise en compte de la variation des traits intra-spécifiques (ITV) peut mieux répondre aux grandes questions de l'écologie communautaire. Cependant, une vue d'ensemble de l'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques par rapport à la variation des traits inter-spécifiques dans les communautés végétales fait encore défaut. Ici, nous avons mené une méta-analyse de l'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques au sein et entre les communautés végétales à travers le monde, en utilisant un ensemble de données englobant 629 communautés (parcelles) et 36 traits fonctionnels. Dans l'ensemble, la variation des traits intra-spécifiques représentait 25 % de la variation totale des traits au sein des communautés et 32 % de la variation totale des traits entre les communautés en moyenne. L'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques tendait à être plus grande pour les traits de plante entière (par exemple, la hauteur de la plante) par rapport aux traits au niveau des organes et pour les traits chimiques des feuilles (par exemple, la concentration en N et P des feuilles) par rapport aux traits morphologiques des feuilles (par exemple, la surface et l'épaisseur des feuilles). L'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques diminuait avec l'augmentation de la richesse spécifique et de l'étendue spatiale, mais ne variait pas avec la forme de croissance des plantes ou le climat. Ces résultats mettent en évidence des modèles mondiaux de l'importance relative de la variation des traits intra-spécifiques dans les communautés végétales, offrant des lignes directrices pratiques pour déterminer quand les chercheurs devraient inclure la variation des traits intra-spécifiques dans les études communautaires et écosystémiques basées sur les traits.

@article{doi101111ele12508,
    author = "Siefert, Andrew et Violle, Cyrille et Chalmandrier, Loïc et Albert, Cécile H. et Taudiere, Adrien et Fajardo, Alex et Aarssen, Lonnie W. et Baraloto, Christopher et Carlucci, Marcos B. et Cianciaruso, Marcus V. et de L. Dantas, Vinícius et de Bello, Francesco et Duarte, Leandro D. S. et Fonseca, Carlos R. et Freschet, Grégoire T. et Gaucherand, Stéphanie et Gross, Nicolas et Hikosaka, Kouki et Jackson, Benjamin et Jung, Vincent et Kamiyama, Chiho et Katabuchi, Masatoshi et Kembel, Steven W. et Kichenin, Emilie et Kraft, Nathan J. B. et Lagerström, Anna et Bagousse‐Pinguet, Yoann Le et Li, Yuanzhi et Mason, Norman et Messier, Julie et Nakashizuka, Tohru et Overton, Jacob McC. et Peltzer, Duane A. et Pérez‐Ramos, I. M. et Pillar, Valério D. et Prentice, Honor C. et Richardson, Sarah et Sasaki, Takehiro et Schamp, Brandon S. et Schöb, Christian et Shipley, Bill et Sundqvist, Maja et Sykes, Martin T. et Vandewalle, Marie et Wardle, David A.",
    title = "Une méta-analyse mondiale de l'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques dans les communautés végétales",
    year = "2015",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Des études récentes ont montré que la prise en compte de la variation des traits intra-spécifiques (ITV) peut mieux répondre aux grandes questions de l'écologie communautaire. Cependant, une vue d'ensemble de l'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques par rapport à la variation des traits inter-spécifiques dans les communautés végétales fait encore défaut. Ici, nous avons mené une méta-analyse de l'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques au sein et entre les communautés végétales à travers le monde, en utilisant un ensemble de données englobant 629 communautés (parcelles) et 36 traits fonctionnels. Dans l'ensemble, la variation des traits intra-spécifiques représentait 25 % de la variation totale des traits au sein des communautés et 32 % de la variation totale des traits entre les communautés en moyenne. L'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques tendait à être plus grande pour les traits de plante entière (par exemple, la hauteur de la plante) par rapport aux traits au niveau des organes et pour les traits chimiques des feuilles (par exemple, la concentration en N et P des feuilles) par rapport aux traits morphologiques des feuilles (par exemple, la surface et l'épaisseur des feuilles). L'ampleur relative de la variation des traits intra-spécifiques diminuait avec l'augmentation de la richesse spécifique et de l'étendue spatiale, mais ne variait pas avec la forme de croissance des plantes ou le climat. Ces résultats mettent en évidence des modèles mondiaux de l'importance relative de la variation des traits intra-spécifiques dans les communautés végétales, offrant des lignes directrices pratiques pour déterminer quand les chercheurs devraient inclure la variation des traits intra-spécifiques dans les études communautaires et écosystémiques basées sur les traits.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.12508",
    doi = "10.1111/ele.12508",
    openalex = "W2124019912",
    references = "doi101038nrg1877, doi101071bt12225, doi1011111365274512211, doi101146annurevecolsys102209144628"
}

Les plantes ne peuvent plus être considérées comme des entités autonomes et une perception plus holistique est nécessaire. En effet, les plantes abritent une grande diversité de micro-organismes à l'intérieur et à l'extérieur de leurs tissus, dans l'endosphère et l'ectosphère, respectivement. Ces micro-organismes, qui appartiennent principalement aux Bactéries et aux Champignons, sont impliqués dans des fonctions majeures telles que la nutrition des plantes et la résistance des plantes aux stress biotiques et abiotiques. Ainsi, le microbiote impacte la croissance et la survie des plantes, deux composantes clés de l'aptitude. L'aptitude des plantes est donc une conséquence de la plante en elle-même et de son microbiote, qui forment collectivement un holobionte. En complément de la perception réductionniste des pressions évolutives agissant sur les compartiments végétaux ou symbiotiques, le concept d'holobionte végétal nécessite une nouvelle perception de l'évolution. Les interconnexions entre les composants de l'holobionte végétal sont explorées ici à la lumière des théories écologiques et évolutives actuelles. La complexité du microbiome et les règles d'assemblage des communautés microbiotes ne sont pas encore entièrement comprises. Il est suggéré que la plante peut moduler son microbiote pour s'ajuster dynamiquement à son environnement. Pour mieux comprendre le niveau de dépendance des plantes aux composants microbiotes, le microbiote central doit être déterminé à différentes échelles hiérarchiques de l'écologie, tandis que les analyses pan-microbiome amélioreraient la caractérisation des fonctions affichées.

@article{doi101111nph13312,
    author = "Vandenkoornhuyse, Philippe et Quaiser, Achim et Duhamel, Marie et Van, Amandine Lê et Dufresne, Alexis",
    title = "L'importance du microbiome de l'holobionte végétal",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les plantes ne peuvent plus être considérées comme des entités autonomes et une perception plus holistique est nécessaire. En effet, les plantes abritent une grande diversité de micro-organismes à l'intérieur et à l'extérieur de leurs tissus, dans l'endosphère et l'ectosphère, respectivement. Ces micro-organismes, qui appartiennent principalement aux Bactéries et aux Champignons, sont impliqués dans des fonctions majeures telles que la nutrition des plantes et la résistance des plantes aux stress biotiques et abiotiques. Ainsi, le microbiote impacte la croissance et la survie des plantes, deux composantes clés de l'aptitude. L'aptitude des plantes est donc une conséquence de la plante en elle-même et de son microbiote, qui forment collectivement un holobionte. En complément de la perception réductionniste des pressions évolutives agissant sur les compartiments végétaux ou symbiotiques, le concept d'holobionte végétal nécessite une nouvelle perception de l'évolution. Les interconnexions entre les composants de l'holobionte végétal sont explorées ici à la lumière des théories écologiques et évolutives actuelles. La complexité du microbiome et les règles d'assemblage des communautés microbiotes ne sont pas encore entièrement comprises. Il est suggéré que la plante peut moduler son microbiote pour s'ajuster dynamiquement à son environnement. Pour mieux comprendre le niveau de dépendance des plantes aux composants microbiotes, le microbiote central doit être déterminé à différentes échelles hiérarchiques de l'écologie, tandis que les analyses pan-microbiome amélioreraient la caractérisation des fonctions affichées.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13312",
    doi = "10.1111/nph.13312",
    openalex = "W2082376470",
    references = "doi101016b9780123705266x50016, doi101016jtplants201204001, doi101086383541, doi101146annurevarplant050312120106, doi101146annurevcellbio092910154055, doi1023072259756"
}

Les pathogènes végétaux co-évolus jouent un rôle important dans la structuration des écosystèmes naturels. Cependant, les plantes utilisées en agriculture et en sylviculture ont été distribuées à l'échelle mondiale, et leurs pathogènes associés se sont déplacés avec elles. Les eucalyptus constituent le plus grand composant des plantations de bois dur à l'échelle mondiale, et ils sont de plus en plus touchés par de nombreux pathogènes, tous sans conséquence dans les forêts natives. Les eucalyptus offrent un modèle particulièrement intéressant pour étudier les maladies des arbres, car les plantations ont été établies dans des pays où ces arbres sont exotiques, mais aussi en Australie à proximité des forêts d'eucalyptus natives. Ces situations offrent des opportunités de déplacement de pathogènes entre les deux systèmes. Nous présentons sept scénarios différents concernant le déplacement de pathogènes, les épidémies de maladies importantes et les risques de biosécurité, illustrés par des exemples de pathogènes d'eucalyptus bien connus et des recherches provenant en grande partie de nos laboratoires. L'ensemble montre qu'une biosécurité vigilante est nécessaire pour protéger la biodiversité des forêts natives et la durabilité des plantations d'eucalyptus.

@article{doi101093bioscibiw146,
    author = "Burgess, Treena I. and Wingfield, Michael J.",
    title = "Pathogens on the Move: A 100-Year Global Experiment with Planted Eucalypts",
    year = "2016",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Les pathogènes végétaux co-évolus jouent un rôle important dans la structuration des écosystèmes naturels. Cependant, les plantes utilisées en agriculture et en sylviculture ont été distribuées à l'échelle mondiale, et leurs pathogènes associés se sont déplacés avec elles. Les eucalyptus constituent le plus grand composant des plantations de bois dur à l'échelle mondiale, et ils sont de plus en plus touchés par de nombreux pathogènes, tous sans conséquence dans les forêts natives. Les eucalyptus offrent un modèle particulièrement intéressant pour étudier les maladies des arbres, car les plantations ont été établies dans des pays où ces arbres sont exotiques, mais aussi en Australie à proximité des forêts d'eucalyptus natives. Ces situations offrent des opportunités de déplacement de pathogènes entre les deux systèmes. Nous présentons sept scénarios différents concernant le déplacement de pathogènes, les épidémies de maladies importantes et les risques de biosécurité, illustrés par des exemples de pathogènes d'eucalyptus bien connus et des recherches provenant en grande partie de nos laboratoires. L'ensemble montre qu'une biosécurité vigilante est nécessaire pour protéger la biodiversité des forêts natives et la durabilité des plantations d'eucalyptus.",
    url = "https://doi.org/10.1093/biosci/biw146",
    doi = "10.1093/biosci/biw146",
    openalex = "W2559909861",
    references = "doi101111gcb13492"
}

Résumé Il est de plus en plus reconnu que les rétroactions plante-sol peuvent jouer un rôle important dans la détermination de la composition des communautés végétales et du fonctionnement des écosystèmes terrestres. Cependant, la compréhension mécanistique des rétroactions plante-sol, ainsi que de leurs rôles dans les écosystèmes naturels par rapport à d'autres facteurs possibles, en est encore à ses débuts. De telles connaissances amélioreront notre capacité à déterminer la contribution des rétroactions plante-sol aux réponses des communautés et des écosystèmes face aux changements environnementaux mondiaux. Ici, nous examinons comment les rétroactions plante-sol peuvent se développer sous l'effet d'événements extrêmes de sécheresse et de précipitations, d'enrichissement en CO2 et en azote, d'augmentation de la température, de changement d'utilisation des terres et de perte ou de gain d'espèces végétales. Nous présentons un cadre pour ouvrir la « boîte noire du sol » en considérant les réponses des diverses composantes biotiques (ennemis, symbiotes et décomposeurs) des rétroactions plante-sol aux changements environnementaux mondiaux, et nous discutons de la manière d'intégrer ces composantes pour comprendre et prédire les effets nets des rétroactions plante-sol sous les différents scénarios de changement. Pour comprendre comment les rétroactions plante-sol se manifestent dans des contextes réalistes, nous utilisons également ce cadre pour discuter de leurs interactions avec d'autres facteurs influençant la composition des communautés végétales, notamment la compétition, la facilitation, l'herbivorie, ainsi que les propriétés physiques et chimiques du sol. Nous concluons que la compréhension du rôle que jouent les rétroactions plante-sol dans la façonnage des réponses de la composition des communautés végétales et des processus écosystémiques aux changements environnementaux mondiaux nécessite de démêler les contributions individuelles des ennemis, des symbiotes et des décomposeurs. Ces facteurs biotiques peuvent présenter des taux et des intensités de réponse différents, entraînant ainsi des magnitudes et des directions nettes différentes des rétroactions plante-sol sous divers scénarios de changement global. Nous avons également besoin de tests des rétroactions plante-sol dans des conditions plus réalistes afin de déterminer leur contribution aux changements de motifs et de processus dans le champ, à la fois à des échelles de temps écologiquement et évolutivement pertinentes.

@article{doi1011111365243512657,
    author = "van der Putten, Wim H. et Bradford, Mark A. et Brinkman, E. Pernilla et van de Voorde, Tess F. J. et Veen, G. F.",
    title = "Where, when and how plant–soil feedback matters in a changing world",
    year = "2016",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Résumé Il est de plus en plus reconnu que les rétroactions plante-sol peuvent jouer un rôle important dans la détermination de la composition des communautés végétales et du fonctionnement des écosystèmes terrestres. Cependant, la compréhension mécanistique des rétroactions plante-sol, ainsi que de leurs rôles dans les écosystèmes naturels par rapport à d'autres facteurs possibles, en est encore à ses débuts. De telles connaissances amélioreront notre capacité à déterminer la contribution des rétroactions plante-sol aux réponses des communautés et des écosystèmes face aux changements environnementaux mondiaux. Ici, nous examinons comment les rétroactions plante-sol peuvent se développer sous l'effet d'événements extrêmes de sécheresse et de précipitations, d'enrichissement en CO2 et en azote, d'augmentation de la température, de changement d'utilisation des terres et de perte ou de gain d'espèces végétales. Nous présentons un cadre pour ouvrir la « boîte noire du sol » en considérant les réponses des diverses composantes biotiques (ennemis, symbiotes et décomposeurs) des rétroactions plante-sol aux changements environnementaux mondiaux, et nous discutons de la manière d'intégrer ces composantes pour comprendre et prédire les effets nets des rétroactions plante-sol sous les différents scénarios de changement. Pour comprendre comment les rétroactions plante-sol se manifestent dans des contextes réalistes, nous utilisons également ce cadre pour discuter de leurs interactions avec d'autres facteurs influençant la composition des communautés végétales, notamment la compétition, la facilitation, l'herbivorie, ainsi que les propriétés physiques et chimiques du sol. Nous concluons que la compréhension du rôle que jouent les rétroactions plante-sol dans la façonnage des réponses de la composition des communautés végétales et des processus écosystémiques aux changements environnementaux mondiaux nécessite de démêler les contributions individuelles des ennemis, des symbiotes et des décomposeurs. Ces facteurs biotiques peuvent présenter des taux et des intensités de réponse différents, entraînant ainsi des magnitudes et des directions nettes différentes des rétroactions plante-sol sous divers scénarios de changement global. Nous avons également besoin de tests des rétroactions plante-sol dans des conditions plus réalistes afin de déterminer leur contribution aux changements de motifs et de processus dans le champ, à la fois à des échelles de temps écologiquement et évolutivement pertinentes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2435.12657",
    doi = "10.1111/1365-2435.12657",
    openalex = "W2315870915",
    references = "doi101111j13652745200901566x, doi101111nph13203, doi101890es15002171"
}

Les traits racinaires, de tige et de feuille sont censés être fonctionnellement coordonnés pour maximiser l'efficacité de l'acquisition et de l'utilisation des ressources limitées. Cependant, les preuves concernant une coordination cohérente des traits de l'ensemble de la plante chez les plantes ligneuses sont mitigées, et nous manquons d'une compréhension claire de la valeur adaptative des traits racinaires le long des gradients de ressources du sol. Si les racines fines sont l'analogue souterrain des feuilles, alors une faible longueur spécifique des racines (SRL) et une forte densité tissulaire devraient être courantes sur les sols infertiles. Ici, nous testons la prédiction selon laquelle les traits racinaires, de tige et de feuille ainsi que le taux de croissance relatif réagissent de concert aux gradients de fertilité du sol. Nous avons mesuré les traits racinaires fins, de tige et de feuille ainsi que le taux de croissance relatif sur des plantules individuelles de 66 espèces d'arbres cultivées dans des conditions contrôlées. Nos objectifs étaient (i) de déterminer si plusieurs traits racinaires s'alignent avec le taux de croissance, les traits de feuille et de tige et entre eux, et (ii) de quantifier les relations entre les traits racinaires moyens pondérés par la communauté et deux forts gradients de fertilité du sol qui diffèrent par leur étendue spatiale et leur composition communautaire. Au niveau de l'espèce, les taux de croissance rapides étaient associés à une faible densité tissulaire racinaire et de tige et à une grande surface spécifique des feuilles. La SRL et le diamètre racinaire n'étaient pas clairement liés au taux de croissance et se chargeaient sur un composant principal séparé du spectre économique des plantes. Au niveau de la communauté, le taux de croissance était positivement lié à la fertilité du sol, et la densité tissulaire racinaire (RTD) et la ramification étaient négativement liées à la fertilité du sol. La SRL était négativement liée et le diamètre racinaire positivement lié à la fertilité du sol sur le gradient à grande échelle qui comprenait les angiospermes ectomycorhiziens. Synthèse. Les traits tissulaires racinaires, de tige et de feuille des plantules d'arbres sont coordonnés et influencent la fitness le long des gradients de fertilité du sol. La RTD réagit de concert avec les traits aériens aux gradients de fertilité du sol ; cependant, les traits racinaires sont multidimensionnels car la SRL est orthogonale au spectre économique des plantes. Contrairement aux feuilles, les arbres ne sont pas contraints dans la manière dont ils construisent les racines fines : les plantes peuvent construire des racines à SRL élevée ou faible de toute densité tissulaire. Une RTD élevée est le trait souterrain le plus cohérent qui reflète l'adaptation aux sols infertiles.

@article{doi1011111365274512562,
    author = "Kramer-Walter, K. et Bellingham, Peter J. et Millar, Timothy R. et Smissen, Rob D. et Richardson, Sarah J. et Laughlin, Daniel C.",
    title = "Les traits racinaires sont multidimensionnels : la longueur spécifique des racines est indépendante de la densité des tissus racinaires et du spectre économique des plantes",
    year = "2016",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Les traits racinaires, de tige et de feuille sont censés être fonctionnellement coordonnés pour maximiser l'efficacité de l'acquisition et de l'utilisation des ressources limitées. Cependant, les preuves concernant une coordination cohérente des traits de l'ensemble de la plante chez les plantes ligneuses sont mitigées, et nous manquons d'une compréhension claire de la valeur adaptative des traits racinaires le long des gradients de ressources du sol. Si les racines fines sont l'analogue souterrain des feuilles, alors une faible longueur spécifique des racines (SRL) et une forte densité tissulaire devraient être courantes sur les sols infertiles. Ici, nous testons la prédiction selon laquelle les traits racinaires, de tige et de feuille ainsi que le taux de croissance relatif réagissent de concert aux gradients de fertilité du sol. Nous avons mesuré les traits racinaires fins, de tige et de feuille ainsi que le taux de croissance relatif sur des plantules individuelles de 66 espèces d'arbres cultivées dans des conditions contrôlées. Nos objectifs étaient (i) de déterminer si plusieurs traits racinaires s'alignent avec le taux de croissance, les traits de feuille et de tige et entre eux, et (ii) de quantifier les relations entre les traits racinaires moyens pondérés par la communauté et deux forts gradients de fertilité du sol qui diffèrent par leur étendue spatiale et leur composition communautaire. Au niveau de l'espèce, les taux de croissance rapides étaient associés à une faible densité tissulaire racinaire et de tige et à une grande surface spécifique des feuilles. La SRL et le diamètre racinaire n'étaient pas clairement liés au taux de croissance et se chargeaient sur un composant principal séparé du spectre économique des plantes. Au niveau de la communauté, le taux de croissance était positivement lié à la fertilité du sol, et la densité tissulaire racinaire (RTD) et la ramification étaient négativement liées à la fertilité du sol. La SRL était négativement liée et le diamètre racinaire positivement lié à la fertilité du sol sur le gradient à grande échelle qui comprenait les angiospermes ectomycorhiziens. Synthèse. Les traits tissulaires racinaires, de tige et de feuille des plantules d'arbres sont coordonnés et influencent la fitness le long des gradients de fertilité du sol. La RTD réagit de concert avec les traits aériens aux gradients de fertilité du sol ; cependant, les traits racinaires sont multidimensionnels car la SRL est orthogonale au spectre économique des plantes. Contrairement aux feuilles, les arbres ne sont pas contraints dans la manière dont ils construisent les racines fines : les plantes peuvent construire des racines à SRL élevée ou faible de toute densité tissulaire. Une RTD élevée est le trait souterrain le plus cohérent qui reflète l'adaptation aux sols infertiles.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2745.12562",
    doi = "10.1111/1365-2745.12562",
    openalex = "W2284861330",
    references = "doi101111j2041210x201100153x, doi101111nph13203"
}

© 2016 The Linnean Society of London. Une mise à jour de la classification du groupe de phylogénie des angiospermes (APG) des ordres et des familles d'angiospermes est présentée. Plusieurs nouveaux ordres sont reconnus : Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales et Vahliales. Cela porte le nombre total d'ordres et de familles reconnus dans le système APG à 64 et 416, respectivement. Nous proposons deux cladés majeurs informels supplémentaires, les superrosids et les superasterids, qui comprennent chacun les ordres supplémentaires inclus dans les cladés plus larges dominés par les rosids et les asterids. Les familles qui constituaient potentiellement des ordres monofamiliaux, Dasypogonaceae et Sabiaceae, sont à présent référées aux Arecales et aux Proteales, respectivement. Deux familles parasitaires dont la position était auparavant incertaine sont maintenant placées : Cynomoriaceae dans Saxifragales et Apodanthaceae dans Cucurbitales. Bien qu'il existe des preuves que certaines familles reconnues dans APG III ne sont pas monophylétiques, nous ne faisons aucun changement dans Dioscoreales et Santalales par rapport à APG III et laissons certains genres dans Lamiales non placés (par exemple, Peltanthera). Ces changements de délimitation et de reconnaissance familiales sont tous le résultat de nouvelles publications depuis APG III, à l'exception de certains changements simplement dus à des questions de nomenclature, qui incluent le remplacement d'Asphodelaceae par Xanthorrhoeaceae (Asparagales) et de Francoaceae par Melianthaceae (Geraniales) ; cependant, dans Francoaceae, nous incluons également Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae et Vivianiaceae. D'autres changements aux limites familiales ne sont pas drastiques ou nombreux et sont principalement axés sur certains membres des lamiids, en particulier l'ancienne Icacinaceae qui a longtemps été problématique avec plusieurs genres déplacés vers l'ancienne monogénérique Metteniusaceae, mais les changements mineurs de délimitation incluent Aristolochiaceae (maintenant incluant Lactoridaceae et Hydnoraceae ; Aristolochiales), Maundiaceae (retirée de Juncaginaceae ; Alismatales), Restionaceae (maintenant ré-incluant Anarthriaceae et Centrolepidaceae ; Poales), Buxaceae (maintenant incluant Haptanthaceae ; Buxales), Peraceae (scindée de Euphorbiaceae ; Malpighiales), reconnaissance de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae et Microteaceae (tous Caryophyllales), Petiveriaceae scindée de Phytolaccaceae (Caryophyllales), changements à la composition générique d'Ixonanthaceae et Irvingiaceae (avec transfert d'Allantospermum de l'une à l'autre ; Malpighiales), transfert de Pakaraimaea (anciennement Dipterocarpaceae) à Cistaceae (Malvales), transfert de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis et Tirania (anciennement toutes Capparaceae) à Resedaceae (Brassicales), Nyssaceae scindée de Cornaceae (Cornales), Pteleocarpa déplacée à Gelsemiaceae (Gentianales), changements à la composition générique de Gesneriaceae (Sanango déplacé de Loganiaceae) et Orobanchaceae (maintenant incluant Lindenbergiaceae et Rehmanniaceae) et reconnaissance de Mazaceae distincte de Phrymaceae (tous Lamiales).

@article{doi101111boj12385,
    author = "Group, The Angiosperm Phylogeny",
    title = "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV",
    year = "2016",
    journal = "Botanical Journal of the Linnean Society",
    abstract = "© 2016 The Linnean Society of London. Une mise à jour de la classification du groupe de phylogénie des angiospermes (APG) des ordres et des familles d'angiospermes est présentée. Plusieurs nouveaux ordres sont reconnus : Boraginales, Dilleniales, Icacinales, Metteniusiales et Vahliales. Cela porte le nombre total d'ordres et de familles reconnus dans le système APG à 64 et 416, respectivement. Nous proposons deux clades majeurs informels supplémentaires, les superrosids et les superasterids, qui comprennent chacun les ordres supplémentaires inclus dans les clades plus larges dominés par les rosids et les asterids. Les familles qui constituaient potentiellement des ordres monofamiliaux, Dasypogonaceae et Sabiaceae, sont plutôt rattachées aux Arecales et aux Proteales, respectivement. Deux familles parasitaires dont la position était auparavant incertaine sont maintenant placées : Cynomoriaceae dans Saxifragales et Apodanthaceae dans Cucurbitales. Bien qu'il existe des preuves que certaines familles reconnues dans APG III ne sont pas monophylétiques, nous ne faisons aucun changement dans Dioscoreales et Santalales par rapport à APG III et laissons certains genres dans Lamiales non placés (par exemple, Peltanthera). Ces changements de délimitation et de reconnaissance familiales sont tous le résultat de nouvelles publications depuis APG III, sauf certains changements simplement dus à des questions de nomenclature, qui incluent le remplacement de Xanthorrhoeaceae par Asphodelaceae (Asparagales) et de Melianthaceae par Francoaceae (Geraniales) ; cependant, dans Francoaceae, nous incluons également Bersamaceae, Ledocarpaceae, Rhynchothecaceae et Vivianiaceae. D'autres changements aux limites familiales ne sont pas drastiques ou nombreux et sont principalement axés sur certains membres des lamiids, en particulier l'ancienne Icacinaceae qui a longtemps été problématique avec plusieurs genres déplacés vers l'ancienne Metteniusaceae monogénérique, mais les changements mineurs de délimitation incluent Aristolochiaceae (incluant maintenant Lactoridaceae et Hydnoraceae ; Aristolochiales), Maundiaceae (retirée de Juncaginaceae ; Alismatales), Restionaceae (incluant maintenant Anarthriaceae et Centrolepidaceae ; Poales), Buxaceae (incluant maintenant Haptanthaceae ; Buxales), Peraceae (scindée de Euphorbiaceae ; Malpighiales), reconnaissance de Petenaeaceae (Huerteales), Kewaceae, Limeaceae, Macarthuriaceae et Microteaceae (tous Caryophyllales), scission de Petiveriaceae de Phytolaccaceae (Caryophyllales), changements à la composition générique de Ixonanthaceae et Irvingiaceae (avec transfert de Allantospermum de l'une à l'autre ; Malpighiales), transfert de Pakaraimaea (anciennement Dipterocarpaceae) à Cistaceae (Malvales), transfert de Borthwickia, Forchhammeria, Stixis et Tirania (anciennement toutes Capparaceae) à Resedaceae (Brassicales), scission de Nyssaceae de Cornaceae (Cornales), déplacement de Pteleocarpa à Gelsemiaceae (Gentianales), changements à la composition générique de Gesneriaceae (Sanango déplacé de Loganiaceae) et Orobanchaceae (incluant maintenant Lindenbergiaceae et Rehmanniaceae) et reconnaissance de Mazaceae distincte de Phrymaceae (tous Lamiales).",
    url = "https://doi.org/10.1111/boj.12385",
    doi = "10.1111/boj.12385",
    openalex = "W2166152751",
    references = "doi1010079783642143977, doi101046j109583392003t01100158x, doi101073pnas1323926111, doi101111j10958339200900996x, doi101111j109600311996tb00196x, doi101111j155856461985tb00420x, doi1023071222465, doi1023072399846, doi10230725065646, doi103732ajb0800047, openalexw3148514506, openalexw70084438"
}

L'un des grands défis de l'écologie est de développer des règles générales pour expliquer et prédire des systèmes hautement complexes. La compréhension et la prédiction des processus écologiques à partir des traits des espèces ont été considérées comme une « Sainte Grenouille » en écologie. Les traits fonctionnels des plantes sont de plus en plus utilisés pour développer des modèles mécanistiques capables de prédire comment les communautés écologiques réagiront aux perturbations abiotiques et biotiques et comment les espèces affecteront le fonctionnement des écosystèmes et les services écosystémiques dans un monde en rapide changement ; cependant, des défis importants subsistent. Dans cette revue, nous mettons en évidence des travaux récents et des questions en suspens dans trois domaines : (i) la sélection de traits pertinents ; (ii) la description de la variation intraspécifique des traits et l'intégration de cette variation dans les modèles ; et (iii) l'échelle des données de traits aux processus au niveau de la communauté et de l'écosystème. Au cours de la dernière décennie, il y a eu des avancées significatives dans la caractérisation des stratégies végétales basées sur les traits et les relations entre traits, ainsi que l'intégration des traits dans des indices multivariés et des modèles de fonctionnement de la communauté et de l'écosystème. Cependant, l'utilité des approches basées sur les traits en écologie bénéficiera d'efforts démontrant comment ces traits et indices influencent les processus au niveau de l'organisme, de la communauté et de l'écosystème à travers les types de végétation, ce qui peut être réalisé par méta-analyse et amélioration des bases de données de traits. De plus, la variation intraspécifique des traits et les interactions entre espèces doivent être intégrées dans les modèles prédictifs en utilisant des outils tels que la modélisation hiérarchique bayésienne. Enfin, les modèles existants reliant les traits aux processus de communauté et d'écosystème doivent être testés empiriquement pour que leur applicabilité soit réalisée.

@article{doi101111brv12275,
    author = "Funk, Jennifer L. et Larson, Julie E. et Ames, Gregory M. et Butterfield, Bradley J. et Cavender‐Bares, Jeannine et Firn, Jennifer et Laughlin, Daniel C. et Sutton‐Grier, Ariana E. et Williams, Laura et Wright, Justin P.",
    title = "Revisiting the Holy Grail : utiliser les traits fonctionnels des plantes pour comprendre les processus écologiques",
    year = "2016",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "L'un des grands défis de l'écologie est de développer des règles générales pour expliquer et prédire des systèmes hautement complexes. La compréhension et la prédiction des processus écologiques à partir des traits des espèces ont été considérées comme une « Sainte Grenouille » en écologie. Les traits fonctionnels des plantes sont de plus en plus utilisés pour développer des modèles mécanistiques capables de prédire comment les communautés écologiques réagiront aux perturbations abiotiques et biotiques et comment les espèces affecteront le fonctionnement des écosystèmes et les services écosystémiques dans un monde en rapide changement ; cependant, des défis importants subsistent. Dans cette revue, nous mettons en évidence des travaux récents et des questions en suspens dans trois domaines : (i) la sélection de traits pertinents ; (ii) la description de la variation intraspécifique des traits et l'intégration de cette variation dans les modèles ; et (iii) l'échelle des données de traits aux processus au niveau de la communauté et de l'écosystème. Au cours de la dernière décennie, il y a eu des avancées significatives dans la caractérisation des stratégies végétales basées sur les traits et les relations entre traits, ainsi que l'intégration des traits dans des indices multivariés et des modèles de fonctionnement de la communauté et de l'écosystème. Cependant, l'utilité des approches basées sur les traits en écologie bénéficiera d'efforts démontrant comment ces traits et indices influencent les processus au niveau de l'organisme, de la communauté et de l'écosystème à travers les types de végétation, ce qui peut être réalisé par méta-analyse et amélioration des bases de données de traits. De plus, la variation intraspécifique des traits et les interactions entre espèces doivent être intégrées dans les modèles prédictifs en utilisant des outils tels que la modélisation hiérarchique bayésienne. Enfin, les modèles existants reliant les traits aux processus de communauté et d'écosystème doivent être testés empiriquement pour que leur applicabilité soit réalisée.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12275",
    doi = "10.1111/brv.12275",
    openalex = "W2345536912",
    references = "doi1010781433831900083, doi101098rspb20081919, doi1011111365274512211"
}

À l'échelle mondiale, Phytophthora cinnamomi est classée parmi les 100 pires espèces exotiques envahissantes et une gestion active est requise pour réduire l'impact et empêcher la propagation tant dans l'horticulture que dans les écosystèmes naturels. À l'inverse, il existe des régions considérées comme favorables au pathogène où aucune maladie n'est observée. Nous avons développé un modèle climex pour la distribution mondiale de P. cinnamomi basé sur la réponse du pathogène à la température et à l'humidité et en intégrant des preuves empiriques étendues sur la présence et l'absence du pathogène. Le modèle climex a capturé les zones de convenance climatique où P. cinnamomi se produit, ce qui est cohérent avec tous les registres disponibles. Le modèle a été validé par la collecte d'échantillons de sol à partir de végétation asymptomatique dans des zones projetées comme favorables par le modèle pour lesquelles il y avait peu de registres. L'ADN a été extrait et la présence ou l'absence de P. cinnamomi a été déterminée par séquençage à haut débit (HTS). Bien que non détecté par les méthodes d'isolement traditionnelles, l'HTS a détecté P. cinnamomi à des altitudes plus élevées en Australie orientale et en Tasmanie centrale, comme projeté par le modèle climex. Un soutien supplémentaire au modèle climex a été obtenu à l'aide de l'ensemble de données important de l'Australie du sud-ouest où la proportion de registres positifs dans une zone est liée à la valeur de l'indice écoclimatique pour la même zone. Nous fournissons pour la première fois une carte mondiale complète de la distribution actuelle de P. cinnamomi, un modèle climex amélioré de la distribution et une projection jusqu'en 2080 de la distribution avec le changement climatique prédit. Ces informations fournissent la base pour une modélisation plus détaillée à l'échelle régionale et soutiennent l'évaluation des risques pour les gouvernements afin de planifier la gestion de ce pathogène végétal important transmis par le sol.

@article{doi101111gcb13492,
    author = "Burgess, Treena I. et Scott, J. K. et McDougall, Keith L. et Stukely, M. et Crane, C. E. et Dunstan, W. et Brigg, Frances et Andjic, Vera et White, Diane et Rudman, T. et Arentz, F. et Ota, Noboru et Hardy, G.E.St.J.",
    title = "Distribution actuelle et projetée mondiale de Phytophthora cinnamomi, l'un des pires agents pathogènes végétaux au monde",
    year = "2016",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = "À l'échelle mondiale, Phytophthora cinnamomi est classée parmi les 100 pires espèces exotiques envahissantes et une gestion active est requise pour réduire l'impact et empêcher la propagation tant dans l'horticulture que dans les écosystèmes naturels. À l'inverse, il existe des régions considérées comme favorables au pathogène où aucune maladie n'est observée. Nous avons développé un modèle climex pour la distribution mondiale de P. cinnamomi basé sur la réponse du pathogène à la température et à l'humidité et en intégrant des preuves empiriques étendues sur la présence et l'absence du pathogène. Le modèle climex a capturé les zones de convenance climatique où P. cinnamomi se produit, ce qui est cohérent avec tous les registres disponibles. Le modèle a été validé par la collecte d'échantillons de sol à partir de végétation asymptomatique dans des zones projetées comme favorables par le modèle pour lesquelles il y avait peu de registres. L'ADN a été extrait et la présence ou l'absence de P. cinnamomi a été déterminée par séquençage à haut débit (HTS). Bien que non détecté par les méthodes d'isolement traditionnelles, l'HTS a détecté P. cinnamomi à des altitudes plus élevées en Australie orientale et en Tasmanie centrale, comme projeté par le modèle climex. Un soutien supplémentaire au modèle climex a été obtenu à l'aide de l'ensemble de données important de l'Australie du sud-ouest où la proportion de registres positifs dans une zone est liée à la valeur de l'indice écoclimatique pour la même zone. Nous fournissons pour la première fois une carte mondiale complète de la distribution actuelle de P. cinnamomi, un modèle climex amélioré de la distribution et une projection jusqu'en 2080 de la distribution avec le changement climatique prédit. Ces informations fournissent la base pour une modélisation plus détaillée à l'échelle régionale et soutiennent l'évaluation des risques pour les gouvernements afin de planifier la gestion de ce pathogène végétal important transmis par le sol.",
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.13492",
    doi = "10.1111/gcb.13492",
    openalex = "W2514385591",
    references = "doi101016s0261219497832206, doi101017cbo9781107415386, doi101038nclimate1783, doi101051forest19960217, doi101051forest2006040, doi101071bt06019, doi101071bt07159, doi101073pnas0700609104, doi101111j13653059200801886x, doi101111j14724642201000652x, doi101111j2041210x201100134x"
}

Table des matières 1597 I. 1597 II. 1597 III. 1598 IV. 1598 V. 1600 VI. 1601 VII. 1601 VIII. 1601 1602 Références 1602 RÉSUMÉ : Les approches basées sur les traits ont conduit à des avancées significatives en écologie végétale, mais sont actuellement biaisées vers les traits aériens. Il devient clair qu'une plus grande emphase sur les traits souterrains est nécessaire pour mieux prédire les changements futurs de la biodiversité végétale et leurs conséquences pour le fonctionnement des écosystèmes. Ici, je propose six « frontières souterraines » dans l'écologie végétale basée sur les traits, avec une emphase sur les traits régissant l'acquisition des nutriments du sol : redéfinir les racines fines ; quantifier la dimensionnalité des traits racinaires ; intégrer les mycorhizes ; élargir la gamme des traits racinaires ; déterminer les liens entre les traits racinaires et les facteurs abiotiques et biotiques ; et comprendre les conséquences au niveau de l'écosystème des traits racinaires. Concentrer les efforts de recherche le long de ces frontières devrait aider à réaliser la promesse de l'écologie basée sur les traits : une capacité prédictive améliorée à travers les échelles écologiques.

@article{doi101111nph14247,
    author = "Laliberté, Étienne",
    title = "Below‐ground frontiers in trait‐based plant ecology",
    year = "2016",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Contents 1597 I. 1597 II. 1597 III. 1598 IV. 1598 V. 1600 VI. 1601 VII. 1601 VIII. 1601 1602 References 1602 SUMMARY: Trait-based approaches have led to significant advances in plant ecology, but are currently biased toward above-ground traits. It is becoming clear that a stronger emphasis on below-ground traits is needed to better predict future changes in plant biodiversity and their consequences for ecosystem functioning. Here I propose six 'below-ground frontiers' in trait-based plant ecology, with an emphasis on traits governing soil nutrient acquisition: redefining fine roots; quantifying root trait dimensionality; integrating mycorrhizas; broadening the suite of root traits; determining linkages between root traits and abiotic and biotic factors; and understanding ecosystem-level consequences of root traits. Focusing research efforts along these frontiers should help to fulfil the promise of trait-based ecology: enhanced predictive capacity across ecological scales.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.14247",
    doi = "10.1111/nph.14247",
    openalex = "W2531475305",
    references = "doi101111nph13203"
}

Les micro-organismes associés aux plantes ont été montrés à affecter de manière critique la physiologie et les performances de l'hôte, suggérant que l'évolution et l'écologie des plantes et des animaux ne peuvent être comprises que dans un contexte de holobionte (hôte et ses organismes associés). Les structures des communautés microbiennes associées à l'hôte sont affectées par des facteurs abiotiques et de l'hôte, et une attention accrue est portée au rôle du microbiome dans des interactions telles que l'inhibition des pathogènes. Cependant, peu est connu sur la manière dont ces facteurs agissent sur la communauté microbienne, et surtout quel rôle jouent les dynamiques d'interaction microbe-microbe. Nous avons commencé à combler ce manque de connaissances concernant les microbiomes de la phyllosphère des plantes en étudiant simultanément trois grands groupes de symbiotes d'Arabidopsis thaliana (bactéries, champignons et oomycètes) en utilisant une approche de biologie des systèmes. Nous avons évalué plusieurs facteurs potentiels de contrôle des communautés microbiennes : nous avons échantillonné diverses populations sauvages d'A. thaliana à différents moments, effectué des plantations de terrain avec différents génotypes d'hôtes et mis en œuvre des expériences de colonisation successive de l'hôte dans des conditions de laboratoire où les facteurs abiotiques, le génotype de l'hôte et la colonisation par des pathogènes ont été manipulés. Nos résultats indiquent que les facteurs abiotiques et le génotype de l'hôte interagissent tous deux pour affecter la colonisation des plantes par les trois groupes de microbes. En considérant les interactions microbe-microbe, cependant, nous avons découvert un réseau d'interactions interroyaumes avec des contributions significatives à la structure de la communauté. Comme dans d'autres réseaux sans échelle, un petit nombre de taxons, que nous appelons des « hubs » microbiens, sont fortement interconnectés et ont un effet sévère sur les communautés. En documentant ces interactions microbe-microbe, nous révélons un mécanisme important expliquant comment les facteurs abiotiques et les signatures génotypiques de l'hôte contrôlent les communautés microbiennes. En bref, ils agissent directement sur les microbes « hub », qui, via les interactions microbe-microbe, transmettent les effets à la communauté microbienne. Nous avons analysé plus en détail deux microbes « hub » (le pathogène oomycète biotrophe obligatoire Albugo et le champignon levure basidiomycète Dioszegia). Albugo a eu des effets forts sur la colonisation bactérienne épiphyte et endophyte. Plus précisément, la diversité alpha a diminué et la diversité bêta s'est stabilisée en présence d'infection par Albugo, tandis qu'elles variaient autrement entre les plantes. Dioszegia, en revanche, a fourni des preuves d'une interaction directe de hub avec les bactéries de la phyllosphère. L'identification des microbes « hub » et de leur importance dans la structuration du microbiome de la phyllosphère a des implications cruciales pour la recherche plante-pathogène et microbe-microbe et ouvre de nouveaux points d'entrée pour la gestion des écosystèmes et le biocontrôle ciblé futur. La révélation que les effets peuvent se propager à travers les communautés via les microbes « hub » est importante pour comprendre les perturbations de la structure de la communauté dans des domaines parallèles incluant les microbiomes humains et les bioprocédés. En particulier, les parallèles avec les pathogènes et microbes « keystone » du microbiome humain ouvrent de nouvelles avenues de recherche interdisciplinaire qui promettent d'améliorer notre compréhension des fonctions des microbiomes associés à l'hôte.

@article{doi101371journalpbio1002352,
    author = "Agler, Matthew T. et Ruhe, Jonas et Kroll, Samuel et Morhenn, Constanze et Kim, Sang‐Tae et Weigel, Detlef et Kemen, Eric",
    title = "Les taxons hub microbiens relient les facteurs hôtes et abiotiques à la variation du microbiome végétal",
    year = "2016",
    journal = "PLoS Biology",
    abstract = {Les micro-organismes associés aux plantes ont été montrés à affecter de manière critique la physiologie et les performances de l'hôte, suggérant que l'évolution et l'écologie des plantes et des animaux ne peuvent être comprises que dans un contexte de holobionte (hôte et ses organismes associés). Les structures des communautés microbiennes associées à l'hôte sont affectées par des facteurs abiotiques et de l'hôte, et une attention accrue est portée au rôle du microbiome dans des interactions telles que l'inhibition des pathogènes. Cependant, peu de choses sont connues sur la manière dont ces facteurs agissent sur la communauté microbienne, et surtout quel rôle jouent les dynamiques d'interaction microbe-microbe. Nous avons commencé à combler ce manque de connaissances pour les microbiomes de la phyllosphère des plantes en étudiant simultanément trois grands groupes de symbiotes d'Arabidopsis thaliana (bactéries, champignons et oomycètes) en utilisant une approche de biologie des systèmes. Nous avons évalué plusieurs facteurs potentiels de contrôle des communautés microbiennes : nous avons échantillonné diverses populations sauvages d'A. thaliana à différents moments, effectué des plantations de terrain avec différents génotypes d'hôtes et mis en œuvre des expériences de colonisation successive de l'hôte dans des conditions de laboratoire où les facteurs abiotiques, le génotype de l'hôte et la colonisation par des pathogènes ont été manipulés. Nos résultats indiquent que les facteurs abiotiques et le génotype de l'hôte interagissent pour affecter la colonisation des plantes par les trois groupes de microbes. En considérant les interactions microbe-microbe, cependant, nous avons découvert un réseau d'interactions interroyaumes avec des contributions significatives à la structure de la communauté. Comme dans d'autres réseaux sans échelle, un petit nombre de taxons, que nous appelons des « hubs » microbiens, sont fortement interconnectés et ont un effet sévère sur les communautés. En documentant ces interactions microbe-microbe, nous révélons un mécanisme important expliquant comment les facteurs abiotiques et les signatures génotypiques de l'hôte contrôlent les communautés microbiennes. En bref, ils agissent directement sur les microbes « hub », qui, via les interactions microbe-microbe, transmettent les effets à la communauté microbienne. Nous avons analysé plus en détail deux microbes « hub » (le pathogène oomycète biotrophe obligatoire Albugo et le champignon levure basidiomycète Dioszegia). Albugo a eu des effets forts sur la colonisation bactérienne épiphyte et endophyte. Plus précisément, la diversité alpha a diminué et la diversité bêta s'est stabilisée en présence d'infection par Albugo, tandis qu'elles variaient autrement entre les plantes. Dioszegia, en revanche, a fourni des preuves d'une interaction directe hub avec les bactéries de la phyllosphère. L'identification des microbes « hub » et de leur importance dans la structuration du microbiome de la phyllosphère a des implications cruciales pour la recherche plante-pathogène et microbe-microbe et ouvre de nouveaux points d'entrée pour la gestion des écosystèmes et le biocontrôle ciblé futur. La révélation que les effets peuvent se propager à travers les communautés via les microbes « hub » est importante pour comprendre les perturbations de la structure de la communauté dans des domaines parallèles incluant les microbiomes humains et les bioprocédés. En particulier, les parallèles avec les pathogènes et microbes « keystone » du microbiome humain ouvrent de nouvelles avenues de recherche interdisciplinaire qui promettent d'améliorer notre compréhension des fonctions des microbiomes associés à l'hôte.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1002352",
    doi = "10.1371/journal.pbio.1002352",
    openalex = "W2281227836",
    references = "doi101016jcell201409053, doi101016jphysrep200510009, doi10103823932, doi101038ismej20128, doi101038nature05286, doi101038nature11237, doi101038nri3785, doi101073pnas1218525110, doi101073pnas1414592112, doi101146annurevarplant050312120106, doi101146annurevphyto082712102340"
}

@incollection{doi101016bsabr201612001,
    author = "Latif, Sajid et Chiapusio, Geneviève et Weston, Leslie A.",
    title = "Allélopathie et le rôle des allélochimiques dans la défense des plantes",
    year = "2017",
    booktitle = "Progrès dans la recherche botanique",
    url = "https://doi.org/10.1016/bs.abr.2016.12.001",
    doi = "10.1016/bs.abr.2016.12.001",
    openalex = "W2588024733",
    references = "doi101017s0890037x00032371, doi1016140043174520020500138ipcfnf20co2"
}

@article{doi101016jtplants201701005,
    author = "Faucon, Michel‐Pierre et Houben, David et Lambers, Hans",
    title = "Plant Functional Traits : Soil and Ecosystem Services",
    year = "2017",
    journal = "Trends in Plant Science",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.tplants.2017.01.005",
    doi = "10.1016/j.tplants.2017.01.005",
    openalex = "W2588568219",
    references = "doi101111nph13203"
}

Les changements climatiques rapides et l'influence humaine croissante à haute altitude dans le monde auront des impacts profonds sur la biodiversité des montagnes. Cependant, les prévisions issues de modèles statistiques (par exemple, les modèles de distribution des espèces) négligent rarement le fait que les changements des communautés végétales pourraient considérablement retarder par rapport aux changements climatiques, entravant notre capacité à établir des projections temporellement réalistes pour le siècle à venir. En effet, les amplitudes des retards et l'importance relative des différents facteurs à leur origine restent mal comprises. Nous passons en revue les preuves concernant trois types de retard : les « retards de dispersion » affectant la propagation des espèces végétales le long des gradients d'altitude, les « retards d'établissement » suivant leur arrivée dans les communautés réceptrices, et les « retards d'extinction » des espèces résidentes. La variation des retards est expliquée par la variation entre les espèces des réponses physiologiques et démographiques, par les effets des interactions biotiques altérées, et par des aspects de l'environnement physique. Parmi ceux-ci, les interactions biotiques altérées pourraient contribuer considérablement aux retards d'établissement et d'extinction, bien que les impacts des interactions biotiques sur la dynamique des aires soient mal compris. Nous développons un modèle de communauté mécanistique pour illustrer comment le turnover des espèces dans les futures communautés pourrait retarder par rapport aux attentes simples basées sur les déplacements d'aires des espèces avec une dispersion illimitée. Le modèle montre une contribution combinée des interactions biotiques altérées et des retards de dispersion au turnover des communautés végétales le long d'un gradient d'altitude suivant le réchauffement climatique. Notre revue et notre simulation soutiennent l'idée que la prise en compte de la dynamique des aires hors équilibre sera essentielle pour des prévisions réalistes des schémas de biodiversité sous le changement climatique, avec des implications pour la conservation des espèces de montagne et des fonctions écosystémiques qu'elles fournissent.

@article{doi101111gcb13976,
    author = "Alexander, Jake M. et Chalmandrier, Loïc et Lenoir, Jonathan et Burgess, Treena I. et Essl, Franz et Haider, Sylvia et Kueffer, Christoph et McDougall, Keith L. et Milbau, Ann et Núñez, Martín A. et Pauchard, Aníbal et Rabitsch, Wolfgang et Rew, Lisa J. et Sanders, Nathan J. et Pellissier, Loïc",
    title = "Lags in the response of mountain plant communities to climate change",
    year = "2017",
    journal = "Global Change Biology",
    abstract = {Les changements climatiques rapides et l'influence humaine croissante à haute altitude dans le monde auront des impacts profonds sur la biodiversité des montagnes. Cependant, les prévisions issues de modèles statistiques (par exemple, les modèles de distribution des espèces) négligent rarement le fait que les changements des communautés végétales pourraient considérablement retarder par rapport aux changements climatiques, entravant notre capacité à établir des projections temporellement réalistes pour le siècle à venir. En effet, les amplitudes des retards et l'importance relative des différents facteurs à leur origine restent mal comprises. Nous passons en revue les preuves concernant trois types de retard : les « retards de dispersion » affectant la propagation des espèces végétales le long des gradients d'altitude, les « retards d'établissement » suivant leur arrivée dans les communautés réceptrices, et les « retards d'extinction » des espèces résidentes. La variation des retards est expliquée par la variation entre les espèces des réponses physiologiques et démographiques, par les effets des interactions biotiques altérées, et par des aspects de l'environnement physique. Parmi ceux-ci, les interactions biotiques altérées pourraient contribuer considérablement aux retards d'établissement et d'extinction, bien que les impacts des interactions biotiques sur la dynamique des aires soient mal compris. Nous développons un modèle de communauté mécanistique pour illustrer comment le turnover des espèces dans les futures communautés pourrait retarder par rapport aux attentes simples basées sur les déplacements d'aires des espèces avec une dispersion illimitée. Le modèle montre une contribution combinée des interactions biotiques altérées et des retards de dispersion au turnover des communautés végétales le long d'un gradient d'altitude suivant le réchauffement climatique. Notre revue et notre simulation soutiennent l'idée que la prise en compte de la dynamique des aires hors équilibre sera essentielle pour des prévisions réalistes des schémas de biodiversité sous le changement climatique, avec des implications pour la conservation des espèces de montagne et des fonctions écosystémiques qu'elles fournissent.},
    url = "https://doi.org/10.1111/gcb.13976",
    doi = "10.1111/gcb.13976",
    openalex = "W2767366136",
    references = "doi1010079783642189708, doi101038nature00812, doi101038nclimate2563, doi101071bt07159, doi101073pnas0409902102, doi101086283244, doi101111gcb13492, doi101111j1469185x201200235x, doi101126science1156831, doi101126science1206432, doi101146annurevecolsys311343, doi1018900617361, lenoir2017climatic"
}

Le contrôle efficace des maladies des plantes reste un défi majeur. Les tentatives d'éradication impliquent souvent l'élimination des plantes hôtes dans un certain rayon de détection, ciblant l'infection asymptomatique. Ici, nous développons et testons des stratégies de contrôle potentiellement plus efficaces, motivées par l'épidémiologie, en utilisant un modèle mathématique précédemment ajusté à la propagation de la tache du citrus en Floride. Nous testons le contrôle basé sur les risques, qui élimine préférentiellement les hôtes susceptibles de causer un grand nombre d'infections dans la population restante d'hôtes. Les éliminations dépendent ensuite des schémas passés de propagation du pathogène et d'élimination des hôtes, ce qui peut être non transparent pour les parties prenantes concernées. Cela motive une stratégie à rayon variable, qui approxime le contrôle basé sur les risques via des rayons d'élimination qui varient selon l'emplacement, mais qui sont fixés avant toute épidémie. Le contrôle basé sur les risques surperforme le contrôle à rayon variable, qui à son tour surperforme l'élimination à rayon constant. Ce résultat est robuste aux changements des paramètres de propagation de la maladie et des schémas initiaux des plantes hôtes sensibles. Cependant, l'efficacité se dégrade si les paramètres épidémiologiques sont incorrectement caractérisés. Le contrôle basé sur les risques incluant une épidémiologie supplémentaire peut être utilisé pour améliorer la gestion des maladies, mais il nécessite de bonnes connaissances préalables pour une performance optimale. Cela concentre l'attention sur l'obtention d'informations maximales à partir des épidémies passées, sur la compréhension de la transférabilité du modèle entre les emplacements et sur les stratégies de gestion adaptative qui évoluent dans le temps.

@article{doi101111nph14488,
    author = "Hyatt‐Twynam, Samuel R. et Parnell, Stephen et Stutt, Richard O. J. H. et Gottwald, T. R. et Gilligan, Christopher A. et Cunniffe, Nik J.",
    title = "Gestion basée sur les risques des maladies des plantes envahissantes",
    year = "2017",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Le contrôle efficace des maladies des plantes reste un défi majeur. Les tentatives d'éradication impliquent souvent l'élimination des plantes hôtes dans un certain rayon de détection, ciblant l'infection asymptomatique. Ici, nous développons et testons des stratégies de contrôle potentiellement plus efficaces, motivées par l'épidémiologie, en utilisant un modèle mathématique précédemment ajusté à la propagation de la tache du citrus en Floride. Nous testons le contrôle basé sur les risques, qui élimine préférentiellement les hôtes susceptibles de causer un grand nombre d'infections dans la population restante d'hôtes. Les éliminations dépendent ensuite des schémas passés de propagation du pathogène et d'élimination des hôtes, ce qui peut être non transparent pour les parties prenantes concernées. Cela motive une stratégie à rayon variable, qui approxime le contrôle basé sur les risques via des rayons d'élimination qui varient selon l'emplacement, mais qui sont fixés avant toute épidémie. Le contrôle basé sur les risques surperforme le contrôle à rayon variable, qui à son tour surperforme l'élimination à rayon constant. Ce résultat est robuste aux changements des paramètres de propagation de la maladie et des schémas initiaux des plantes hôtes sensibles. Cependant, l'efficacité se dégrade si les paramètres épidémiologiques sont incorrectement caractérisés. Le contrôle basé sur les risques incluant une épidémiologie supplémentaire peut être utilisé pour améliorer la gestion des maladies, mais il nécessite de bonnes connaissances préalables pour une performance optimale. Cela concentre l'attention sur l'obtention d'informations maximales à partir des épidémies passées, sur la compréhension de la transférabilité du modèle entre les emplacements et sur les stratégies de gestion adaptative qui évoluent dans le temps.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.14488",
    doi = "10.1111/nph.14488",
    openalex = "W2599742035",
    references = "doi101073pnas1602153113"
}

Les interactions avec la biote du sol sont un déterminant important de la diversité des plantes terrestres. Cependant, les facteurs régulant les rétroactions plante-sol, qui varient de positives à négatives entre les espèces végétales, restent incertains. Dans une étude à grande échelle impliquant 55 espèces et 550 populations d'arbres d'Amérique du Nord, le type d'association mycorhizienne explique une grande partie de la variation des rétroactions plante-sol. Dans le sol récolté sous des conspécifiques, les arbres à mycorhizes arbusculaires ont subi des rétroactions négatives, tandis que les arbres à mycorhizes ectomycorhiziennes ont affiché des rétroactions positives. De plus, les arbres à mycorhizes arbusculaires ont montré une forte inhibition conspécifique à plusieurs échelles spatiales, tandis que les arbres à mycorhizes ectomycorhiziennes ont montré une facilitation conspécifique localement et une inhibition conspécifique moins sévère à l'échelle régionale. Ces résultats suggèrent que le type de mycorhize, par ses effets sur les rétroactions plante-sol, pourrait être un contributeur important à la régulation des populations et à la structure des communautés dans les forêts tempérées.

@article{doi101126scienceaai8212,
    author = "Bennett, Jonathan et Maherali, Hafiz et Reinhart, Kurt O. et Lekberg, Ylva et Hart, Miranda M. et Klironomos, John N.",
    title = "Les rétroactions plante-sol et le type de mycorhize influencent la dynamique des populations des forêts tempérées",
    year = "2017",
    journal = "Science",
    abstract = "Les interactions avec la biote du sol sont un déterminant important de la diversité des plantes terrestres. Cependant, les facteurs régulant les rétroactions plante-sol, qui varient de positives à négatives entre les espèces végétales, restent incertains. Dans une étude à grande échelle impliquant 55 espèces et 550 populations d'arbres d'Amérique du Nord, le type d'association mycorhizienne explique une grande partie de la variation des rétroactions plante-sol. Dans le sol récolté sous des conspécifiques, les arbres à mycorhizes arbusculaires ont subi des rétroactions négatives, tandis que les arbres à mycorhizes ectomycorhiziennes ont affiché des rétroactions positives. De plus, les arbres à mycorhizes arbusculaires ont montré une forte inhibition conspécifique à plusieurs échelles spatiales, tandis que les arbres à mycorhizes ectomycorhiziennes ont montré une facilitation conspécifique localement et une inhibition conspécifique moins sévère à l'échelle régionale. Ces résultats suggèrent que le type de mycorhize, par ses effets sur les rétroactions plante-sol, pourrait être un contributeur important à la régulation des populations et à la structure des communautés dans les forêts tempérées.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aai8212",
    doi = "10.1126/science.aai8212",
    openalex = "W2577618845",
    references = "doi101038nature12872, doi101086284967, doi101111nph13203"
}

La biote du sol influence la performance des plantes par les rétroactions plante-sol, mais il est incertain si l'intensité de ces rétroactions dépend des traits des plantes et si les rétroactions plante-sol conduisent à la diversité locale des plantes. Nous avons cultivé 16 espèces de plantes co-occurentes dotées de stratégies d'acquisition de nutriments contrastées, issues de landes australiennes hyperdiverses, et les avons exposées à la biote du sol provenant de sous leurs propres espèces ou d'autres espèces végétales. Les réponses des plantes à la biote du sol ont varié selon leur stratégie d'acquisition de nutriments, incluant des rétroactions positives pour les plantes ectomycorhiziennes et des rétroactions négatives pour les plantes fixatrices d'azote et non mycorhiziennes. Les simulations ont révélé que de telles rétroactions dépendantes de la stratégie sont suffisantes pour maintenir la haute diversité taxonomique et fonctionnelle caractérisant ces landes à climat méditerranéen. Notre étude identifie la stratégie d'acquisition de nutriments comme un trait clé expliquant comment les différentes réponses des plantes à la biote du sol favorisent la diversité locale des plantes.

@article{doi101126scienceaai8291,
    author = "Teste, François P. et Kardol, Paul et Turner, Benjamin L. et Wardle, David A. et Zemunik, Graham et Renton, Michael et Laliberté, Étienne",
    title = "Rétroactions plante-sol et maintien de la diversité dans les landes à climat méditerranéen",
    year = "2017",
    journal = "Science",
    abstract = "La biote du sol influence la performance des plantes par les rétroactions plante-sol, mais il est incertain si l'intensité de ces rétroactions dépend des traits des plantes et si les rétroactions plante-sol conduisent à la diversité locale des plantes. Nous avons cultivé 16 espèces de plantes co-occurentes dotées de stratégies d'acquisition de nutriments contrastées, issues de landes australiennes hyperdiverses, et les avons exposées à la biote du sol provenant de sous leurs propres espèces ou d'autres espèces végétales. Les réponses des plantes à la biote du sol ont varié selon leur stratégie d'acquisition de nutriments, incluant des rétroactions positives pour les plantes ectomycorhiziennes et des rétroactions négatives pour les plantes fixatrices d'azote et non mycorhiziennes. Les simulations ont révélé que de telles rétroactions dépendantes de la stratégie sont suffisantes pour maintenir la haute diversité taxonomique et fonctionnelle caractérisant ces landes à climat méditerranéen. Notre étude identifie la stratégie d'acquisition de nutriments comme un trait clé expliquant comment les différentes réponses des plantes à la biote du sol favorisent la diversité locale des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aai8291",
    doi = "10.1126/science.aai8291",
    openalex = "W2578172153",
    references = "doi101086284967, doi101111nph13203"
}

La montée des pathogènes et souches émergents a conduit à des appels accrus pour une surveillance plus efficace en matière de santé des plantes. Nous montrons comment les insights épidémiologiques sur la dynamique de propagation des maladies peuvent améliorer le ciblage du moment et du lieu d'échantillonnage. Nous décrivons certaines approches statistiques relativement simples mais puissantes pour informer la surveillance et expliquons comment elles peuvent être adaptées pour inclure des informations épidémiologiques. Cela nous permet d'aborder des questions telles que : Après le premier rapport d'un pathogène envahissant, quelle est la probabilité d'incidence de la maladie ? Si aucun cas de maladie n'a été trouvé, à quel point pouvons-nous être certains que la maladie n'a pas simplement été manquée par hasard ? Nous illustrons l'utilisation de modèles stochastiques explicites spatialement pour optimiser le ciblage des ressources de surveillance et de contrôle. Enfin, nous discutons de la manière dont les technologies modernes de détection et de diagnostic ainsi que les informations provenant de réseaux de surveillance passive (par exemple, la science citoyenne) peuvent être intégrées dans les stratégies de surveillance.

@article{doi101146annurevphyto080516035334,
    author = "Parnell, Stephen et van den Bosch, Frank et Gottwald, T. R. et Gilligan, Christopher A.",
    title = "Surveillance pour informer le contrôle des maladies émergentes des plantes : une perspective épidémiologique",
    year = "2017",
    journal = "Annual Review of Phytopathology",
    abstract = "La montée des pathogènes et souches émergents a conduit à des appels accrus pour une surveillance plus efficace en matière de santé des plantes. Nous montrons comment les insights épidémiologiques sur la dynamique de propagation des maladies peuvent améliorer le ciblage du moment et du lieu d'échantillonnage. Nous décrivons certaines approches statistiques relativement simples mais puissantes pour informer la surveillance et expliquons comment elles peuvent être adaptées pour inclure des informations épidémiologiques. Cela nous permet d'aborder des questions telles que : Après le premier rapport d'un pathogène envahissant, quelle est la probabilité d'incidence de la maladie ? Si aucun cas de maladie n'a été trouvé, à quel point pouvons-nous être certains que la maladie n'a pas simplement été manquée par hasard ? Nous illustrons l'utilisation de modèles stochastiques explicites spatialement pour optimiser le ciblage des ressources de surveillance et de contrôle. Enfin, nous discutons de la manière dont les technologies modernes de détection et de diagnostic ainsi que les informations provenant de réseaux de surveillance passive (par exemple, la science citoyenne) peuvent être intégrées dans les stratégies de surveillance.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-080516-035334",
    doi = "10.1146/annurev-phyto-080516-035334",
    openalex = "W2584214915",
    references = "doi101073pnas1602153113"
}

@article{doi103159torreyd1600018,
    author = "Flinn, Kathryn M. et Kuhns, Hannah A. D. et Mikes, Jennifer L. et Lonsdorf, E. et Lake, J.",
    title = "Invasion et succession modifient les traits fonctionnels des communautés végétales de serpentine1,3",
    year = "2017",
    journal = "The Journal of the Torrey Botanical Society",
    url = "https://www.semanticscholar.org/paper/6292dbf1f873e51532369c0ae218cb2fcaa9b6b4",
    doi = "10.3159/TORREY-D-16-00018",
    is_oa = "true",
    number = "2",
    pages = "109",
    semanticscholar_citation_count = "8",
    semanticscholar_id = "6292dbf1f873e51532369c0ae218cb2fcaa9b6b4",
    volume = "144"
}

@article{doi101007s1065801815700,
    author = "Adams, Ian P. et Fox, Adrian et Boonham, Neil et Massart, Sébastien et Jonghe, Kris De",
    title = "L'impact du séquençage à haut débit sur le diagnostic de la santé des plantes",
    year = "2018",
    journal = "European Journal of Plant Pathology",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10658-018-1570-0",
    doi = "10.1007/s10658-018-1570-0",
    openalex = "W2890534901",
    references = "doi101073pnas1602153113"
}

Les plantes interagissent simultanément les unes avec les autres et avec la biote du sol, mais l'importance relative de la compétition par rapport aux rétroactions plante-sol (RPS) sur la performance des plantes est mal comprise. En utilisant une méta-analyse de 38 études publiées et 150 espèces végétales, nous montrons que les effets de la compétition interspécifique (que ce soit en cultivant des plantes avec un compétiteur ou seules, ou en comparant la compétition interspécifique à la compétition intraspécifique) et de la RPS (en comparant le sol d'origine à un sol étranger, le sol vivant à un sol stérile, ou le témoin à un sol traité avec un fongicide) dépendaient des traitements, mais étaient principalement négatifs, globalement comparables en magnitude, et additifs ou synergiques. Les compétiteurs plus forts ont subi des RPS plus négatives que les compétiteurs plus faibles lorsqu'on contrôle pour la densité (de la compétition interspécifique à la compétition intraspécifique), suggérant que la RPS pourrait empêcher la domination compétitive et favoriser la coexistence. Lorsque la compétition a été mesurée par rapport à des plantes cultivées seules, l'intensité de la compétition a écrasé la RPS, indiquant que l'importance relative de la RPS peut dépendre non seulement de l'identité du voisin mais aussi de la densité. Nous évaluons comment la compétition et les RPS pourraient interagir à travers les gradients de ressources ; la RPS renforcera probablement les interactions compétitives dans les environnements riches en ressources et améliorera les interactions facilitatrices dans les environnements pauvres en ressources. Enfin, nous fournissons un cadre pour combler les lacunes de connaissances clés et faire progresser notre compréhension de la manière dont ces interactions biotiques influencent la structure des communautés.

@article{doi101111ele13093,
    author = "Lekberg, Ylva et Bever, James D. et Bunn, Rebecca A. et Callaway, Ragan M. et Hart, Miranda M. et Kivlin, Stephanie N. et Klironomos, John N. et Larkin, Beau et Maron, John L. et Reinhart, Kurt O. et Remke, Michael et van der Putten, Wim H.",
    title = "Importance relative de la compétition et des rétroactions plante-sol, leur synergie, leur dépendance au contexte et leurs implications pour la coexistence",
    year = "2018",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Les plantes interagissent simultanément les unes avec les autres et avec la biote du sol, mais l'importance relative de la compétition par rapport aux rétroactions plante-sol (RPS) sur la performance des plantes est mal comprise. En utilisant une méta-analyse de 38 études publiées et 150 espèces végétales, nous montrons que les effets de la compétition interspécifique (que ce soit en cultivant des plantes avec un compétiteur ou seules, ou en comparant la compétition interspécifique à la compétition intraspécifique) et de la RPS (en comparant le sol d'origine à un sol étranger, le sol vivant à un sol stérile, ou le témoin à un sol traité avec un fongicide) dépendaient des traitements, mais étaient principalement négatifs, globalement comparables en magnitude, et additifs ou synergiques. Les compétiteurs plus forts ont subi des RPS plus négatives que les compétiteurs plus faibles lorsqu'on contrôle pour la densité (de la compétition interspécifique à la compétition intraspécifique), suggérant que la RPS pourrait empêcher la domination compétitive et favoriser la coexistence. Lorsque la compétition a été mesurée par rapport à des plantes cultivées seules, l'intensité de la compétition a écrasé la RPS, indiquant que l'importance relative de la RPS peut dépendre non seulement de l'identité du voisin mais aussi de la densité. Nous évaluons comment la compétition et les RPS pourraient interagir à travers les gradients de ressources ; la RPS renforcera probablement les interactions compétitives dans les environnements riches en ressources et améliorera les interactions facilitatrices dans les environnements pauvres en ressources. Enfin, nous fournissons un cadre pour combler les lacunes de connaissances clés et faire progresser notre compréhension de la manière dont ces interactions biotiques influencent la structure des communautés.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.13093",
    doi = "10.1111/ele.13093",
    openalex = "W2807811452",
    references = "doi101111gcb13492, doi101111nph13203"
}

@article{doi101007s1110401904190y,
    author = "Scavo, Aurelio et Abbate, Cristina et Mauromicale, Giovanni",
    title = "Les allélochimiques végétaux : pertinence agronomique, nutritionnelle et écologique dans le système du sol",
    year = "2019",
    journal = "Plant and Soil",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11104-019-04190-y",
    doi = "10.1007/s11104-019-04190-y",
    openalex = "W2955687994",
    references = "doi1023072424020"
}

Les oomycètes pathogènes chez les plantes comprennent de nombreuses espèces qui constituent des menaces persistantes pour l'agriculture et les écosystèmes naturels. La compréhension des dialogues moléculaires entre les oomycètes et les plantes est essentielle pour maintenir un contrôle efficace des maladies. Les plantes répondent à l'infection par des oomycètes par de multiples actions de défense, notamment le renforcement des barrières physiques, la production de molécules antimicrobiennes et la mort cellulaire programmée. Ces réponses sont étroitement contrôlées et intégrées via un système immunitaire à trois couches composé d'une couche de reconnaissance multiplex, d'une couche de signalisation résiliente et d'une couche d'action de défense diversifiée. Les pathogènes oomycètes adaptés utilisent des arsenaux d'effecteurs apoplastiques et intracellulaires pour contrer les mécanismes d'immunité végétale au sein de chaque couche, notamment par l'évasion ou la suppression de la reconnaissance, l'interférence avec de nombreux composants de signalisation et la neutralisation ou la suppression des actions de défense. Une course aux armements coévolutif conduit continuellement à l'émergence de nouveaux mécanismes de défense végétale et de contre-défense des oomycètes.

@article{doi101146annurevmicro020518120022,
    author = "Wang, Yan et Tyler, Brett M. et Wang, Yuanchao",
    title = "Défense et contre-défense lors de l'infection par des oomycètes pathogènes chez les plantes",
    year = "2019",
    journal = "Annual Review of Microbiology",
    abstract = "Les oomycètes pathogènes chez les plantes comprennent de nombreuses espèces qui constituent des menaces persistantes pour l'agriculture et les écosystèmes naturels. La compréhension des dialogues moléculaires entre les oomycètes et les plantes est essentielle pour maintenir un contrôle efficace des maladies. Les plantes répondent à l'infection par des oomycètes par de multiples actions de défense, notamment le renforcement des barrières physiques, la production de molécules antimicrobiennes et la mort cellulaire programmée. Ces réponses sont étroitement contrôlées et intégrées via un système immunitaire à trois couches composé d'une couche de reconnaissance multiplex, d'une couche de signalisation résiliente et d'une couche d'action de défense diversifiée. Les pathogènes oomycètes adaptés utilisent des arsenaux d'effecteurs apoplastiques et intracellulaires pour contrer les mécanismes d'immunité végétale au sein de chaque couche, notamment par l'évasion ou la suppression de la reconnaissance, l'interférence avec de nombreux composants de signalisation et la neutralisation ou la suppression des actions de défense. Une course aux armements coévolutif conduit continuellement à l'émergence de nouveaux mécanismes de défense végétale et de contre-défense des oomycètes.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-micro-020518-120022",
    doi = "10.1146/annurev-micro-020518-120022",
    openalex = "W2949788437",
    references = "doi101111mpp12568"
}

Malgré un siècle d'études par des écologues, la récupération après des perturbations (succession) n'est pas entièrement comprise. Ce livre fournit la première synthèse mondiale qui compare la succession végétale dans tous les principaux biomes terrestres et après toutes les perturbations terrestres majeures. Il pose des questions critiques telles que : La succession suit-elle des modèles généraux à travers les biomes et les types de perturbations ? Les facteurs qui contrôlent la succession diffèrent-ils d'un biome à l'autre ? Si des moteurs communs existent, quels sont-ils ? Sont-ils abiotiques ou biotiques, ou les deux ? Les auteurs fournissent des aperçus sur des modèles larges et généralisables qui vont au-delà des études spécifiques à un site, et présentent des discussions sur des facteurs tels que des dynamiques temporelles variables, des différences latitudinales, des perturbations causées par l'homme vs. naturelles, et le rôle des espèces exotiques envahissantes. Ce livre est un must-read pour les chercheurs et les étudiants en écologie, écologie végétale, écologie de la restauration et biologie de la conservation. Il fournit également un cadre précieux pour aider les gestionnaires de terres tentant de manipuler la récupération successionale après des perturbations faites par l'homme de plus en plus intenses et répandues.

@book{doi1010179781108561167,
    author = "Prach, Karel et Walker, Lawrence R.",
    title = "Comparative Plant Succession among Terrestrial Biomes of the World",
    year = "2020",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Malgré un siècle d'études par des écologues, la récupération après des perturbations (succession) n'est pas entièrement comprise. Ce livre fournit la première synthèse mondiale qui compare la succession végétale dans tous les principaux biomes terrestres et après toutes les perturbations terrestres majeures. Il pose des questions critiques telles que : La succession suit-elle des modèles généraux à travers les biomes et les types de perturbations ? Les facteurs qui contrôlent la succession diffèrent-ils d'un biome à l'autre ? Si des moteurs communs existent, quels sont-ils ? Sont-ils abiotiques ou biotiques, ou les deux ? Les auteurs fournissent des aperçus sur des modèles larges et généralisables qui vont au-delà des études spécifiques à un site, et présentent des discussions sur des facteurs tels que des dynamiques temporelles variables, des différences latitudinales, des perturbations causées par l'homme vs. naturelles, et le rôle des espèces exotiques envahissantes. Ce livre est un must-read pour les chercheurs et les étudiants en écologie, écologie végétale, écologie de la restauration et biologie de la conservation. Il fournit également un cadre précieux pour aider les gestionnaires de terres tentant de manipuler la récupération successionale après des perturbations faites par l'homme de plus en plus intenses et répandues.",
    url = "https://doi.org/10.1017/9781108561167",
    doi = "10.1017/9781108561167",
    openalex = "W3014221657",
    references = "doi101007bf00039928, doi101016jgeomorph200607031"
}

Résumé Les espèces végétales envahissantes peuvent entraver l'établissement et la croissance des plantes indigènes et impacter plusieurs propriétés des écosystèmes, telles que la couverture du sol, le cycle des nutriments, les régimes de feux et l'hydrologie. Contrôler les plantes envahissantes est donc une étape nécessaire, mais généralement coûteuse, vers la restauration d'un écosystème. Une synthèse de la littérature est nécessaire pour comprendre les variations des impacts des plantes envahissantes et leur contrôle pratique dans les contextes de restauration, et pour identifier les lacunes de connaissances associées. Nous avons examiné 372 articles publiés entre 2000 et 2019 couvrant le contrôle des plantes indésirables (à la fois des espèces exotiques envahissantes et des espèces végétales indigènes surabondantes) dans la restauration écologique afin de recueillir des informations sur les principales plantes contrôlées et les méthodes utilisées, en considérant la répartition des études entre les biomes et les pays regroupés selon l'Indice de développement humain (IDH). Les graminées et les plantes herbacées non ligneuses ont été les espèces végétales envahissantes les plus étudiées dans les sites de restauration, mais les arbres envahissants ont été bien étudiés dans les tropiques. Les familles Poaceae et Asteraceae ont été les familles d'espèces végétales envahissantes les plus étudiées. Les interventions non chimiques (principalement le fauchage et les feux prescrits) ont été utilisées dans plus de la moitié des études examinées à l'échelle mondiale, mais les méthodes chimiques (principalement l'application de glyphosate, utilisée dans 40 % des projets utilisant des herbicides) sont également courantes. Les études examinées ont été principalement réalisées dans des pays à très haut IDH. Les pays à faible et moyen IDH n'ont utilisé que des méthodes non chimiques. Synthèse et applications. Les décisions concernant la méthode de contrôle à utiliser dépendent fortement des formes de croissance des espèces végétales envahissantes, de la situation économique locale où sont situés les sites de restauration et des ressources disponibles pour le contrôle. Les pays plus développés ont tendance à utiliser plus de contrôle chimique, tandis que les moins développés utilisent principalement des méthodes non chimiques. Puisque la plupart des études examinées ont été réalisées dans des pays à très haut IDH, nous manquons d'informations provenant des pays en développement, qui concentrent les hotspots mondiaux de conservation de la biodiversité et les engagements mondiaux en matière de restauration forestière et paysagère.

@article{doi1011111365266413656,
    author = "Weidlich, Emanuela W. A. et Florido, Flávia Garcia et Sorrini, Taísi B. et Brancalion, Pedro H. S.",
    title = "Contrôler les espèces végétales envahissantes dans la restauration écologique : une revue mondiale",
    year = "2020",
    journal = "Journal of Applied Ecology",
    abstract = "Résumé Les espèces végétales envahissantes peuvent entraver l'établissement et la croissance des plantes indigènes et impacter plusieurs propriétés des écosystèmes, telles que la couverture du sol, le cycle des nutriments, les régimes de feux et l'hydrologie. Contrôler les plantes envahissantes est donc une étape nécessaire, mais généralement coûteuse, vers la restauration d'un écosystème. Une synthèse de la littérature est nécessaire pour comprendre les variations des impacts des plantes envahissantes et leur contrôle pratique dans les contextes de restauration, et pour identifier les lacunes de connaissances associées. Nous avons examiné 372 articles publiés entre 2000 et 2019 couvrant le contrôle des plantes indésirables (à la fois des espèces exotiques envahissantes et des espèces végétales indigènes surabondantes) dans la restauration écologique afin de recueillir des informations sur les principales plantes contrôlées et les méthodes utilisées, en considérant la répartition des études entre les biomes et les pays regroupés selon l'Indice de développement humain (IDH). Les graminées et les plantes herbacées non ligneuses ont été les espèces végétales envahissantes les plus étudiées dans les sites de restauration, mais les arbres envahissants ont été bien étudiés dans les tropiques. Les familles Poaceae et Asteraceae ont été les familles d'espèces végétales envahissantes les plus étudiées. Les interventions non chimiques (principalement le fauchage et les feux prescrits) ont été utilisées dans plus de la moitié des études examinées à l'échelle mondiale, mais les méthodes chimiques (principalement l'application de glyphosate, utilisée dans 40 % des projets utilisant des herbicides) sont également courantes. Les études examinées ont été principalement réalisées dans des pays à très haut IDH. Les pays à faible et moyen IDH n'ont utilisé que des méthodes non chimiques. Synthèse et applications. Les décisions concernant la méthode de contrôle à utiliser dépendent fortement des formes de croissance des espèces végétales envahissantes, de la situation économique locale où sont situés les sites de restauration et des ressources disponibles pour le contrôle. Les pays plus développés ont tendance à utiliser plus de contrôle chimique, tandis que les moins développés utilisent principalement des méthodes non chimiques. Puisque la plupart des études examinées ont été réalisées dans des pays à très haut IDH, nous manquons d'informations provenant des pays en développement, qui concentrent les hotspots mondiaux de conservation de la biodiversité et les engagements mondiaux en matière de restauration forestière et paysagère.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2664.13656",
    doi = "10.1111/1365-2664.13656",
    openalex = "W3021992282",
    references = "doi101023a1026208327014"
}

L'accès à une résolution génomique accrue grâce aux nouvelles technologies de séquençage transforme le domaine de la phytopathologie. Alors que les scientifiques adoptent ces nouvelles méthodes, certains modèles et observations généraux se mettent en relief. Les études de génomique évolutive sont utilisées non seulement pour déterminer les origines des lignées de pathogènes et les modèles géographiques de la diversité génétique, mais aussi pour discerner comment la sélection naturelle structure la variation génétique à travers le génome. Avec une résolution de plus en plus grande, nous pouvons maintenant identifier avec précision les cibles de la sélection à grande échelle. À plusieurs niveaux, la cryptis et l'évolution convergente sont évidentes. Les sauts et les changements d'hôte peuvent être plus répandus qu'on ne le croyait autrefois, et l'hybridation et le transfert horizontal de gènes (THG) jouent probablement un rôle important dans l'émergence de la nouveauté génétique.

@article{doi101111nph16458,
    author = "de Vries, Sophie et Stukenbrock, Eva H. et Rose, Laura",
    title = "Évolution rapide dans les interactions plante–microbe – une perspective de génomique évolutive",
    year = "2020",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "L'accès à une résolution génomique accrue grâce aux nouvelles technologies de séquençage transforme le domaine de la phytopathologie. Alors que les scientifiques adoptent ces nouvelles méthodes, certains modèles et observations généraux se mettent en relief. Les études de génomique évolutive sont utilisées non seulement pour déterminer les origines des lignées de pathogènes et les modèles géographiques de la diversité génétique, mais aussi pour discerner comment la sélection naturelle structure la variation génétique à travers le génome. Avec une résolution de plus en plus grande, nous pouvons maintenant identifier avec précision les cibles de la sélection à grande échelle. À plusieurs niveaux, la cryptis et l'évolution convergente sont évidentes. Les sauts et les changements d'hôte peuvent être plus répandus qu'on ne le croyait autrefois, et l'hybridation et le transfert horizontal de gènes (THG) jouent probablement un rôle important dans l'émergence de la nouveauté génétique.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.16458",
    doi = "10.1111/nph.16458",
    openalex = "W3004135024",
    references = "doi101111nph16092"
}

L'économie végétale fonctionne au carbone et aux nutriments plutôt qu'à l'argent. Les stratégies foliaires au-dessus du sol couvrent un spectre économique allant de « vivre vite et mourir jeune » à « lent et régulier », mais l'économie définie par les stratégies racinaires en dessous du sol reste floue. Ici, nous adoptons une vision holistique de l'économie souterraine et montrons que la collaboration racine-mycorhizienne peut court-circuiter un spectre économique unidimensionnel, offrant ainsi un espace entier de possibilités économiques. Les données sur les traits racinaires de 1810 espèces à travers le monde confirment un gradient classique « rapide-lent » de « conservation », mais montrent que la plupart des variations sont expliquées par un gradient orthogonal de « collaboration », allant de l'acquisition de ressources « faites maison » à l'externalisation de l'acquisition de ressources aux champignons mycorhiziens. Cet élargi « espace économique racinaire » fournit une base solide pour une compréhension prédictive des réponses souterraines aux conditions environnementales changeantes.

@article{doi101126sciadvaba3756,
    author = "Bergmann, Joana et Weigelt, Alexandra et van der Plas, Fons et Laughlin, Daniel C. et Kuyper, Thomas W. et Guerrero‐Ramírez, Nathaly R. et Valverde‐Barrantes, Oscar J. et Bruelheide, Helge et Freschet, Grégoire T. et Iversen, Colleen M. et Kattge, Jens et McCormack, Michael et Meier, Ina C. et Rillig, Matthias C. et Roumet, Catherine et Semchenko, Marina et Sweeney, Christopher J. et van Ruijven, Jasper et York, Larry M. et Mommer, Liesje",
    title = "Le gradient de collaboration fongique domine l'espace économique des racines chez les plantes",
    year = "2020",
    journal = "Science Advances",
    abstract = {L'économie végétale fonctionne au carbone et aux nutriments plutôt qu'à l'argent. Les stratégies foliaires au-dessus du sol couvrent un spectre économique allant de « vivre vite et mourir jeune » à « lent et régulier », mais l'économie définie par les stratégies racinaires en dessous du sol reste floue. Ici, nous adoptons une vision holistique de l'économie souterraine et montrons que la collaboration racine-mycorhizienne peut court-circuiter un spectre économique unidimensionnel, offrant ainsi un espace entier de possibilités économiques. Les données sur les traits racinaires de 1810 espèces à travers le monde confirment un gradient classique « rapide-lent » de « conservation », mais montrent que la plupart des variations sont expliquées par un gradient orthogonal de « collaboration », allant de l'acquisition de ressources « faites maison » à l'externalisation de l'acquisition de ressources aux champignons mycorhiziens. Cet élargi « espace économique racinaire » fournit une base solide pour une compréhension prédictive des réponses souterraines aux conditions environnementales changeantes.},
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.aba3756",
    doi = "10.1126/sciadv.aba3756",
    openalex = "W3038582858",
    references = "doi101038nature12872, doi1011111365274512211, doi101111j2041210x201100169x"
}

Les champignons mycorhiziens offrent aux plantes une gamme d'avantages, notamment des nutriments minéraux et une protection contre le stress et les pathogènes. Ici, nous synthétisons les informations actuelles sur la manière dont la présence et le type d'association mycorhizienne affectent les communautés végétales. Nous soutenons que les champignons mycorhiziens régulent l'établissement des plantules et la coexistence des espèces grâce à des mécanismes stabilisateurs et égalisateurs tels que la partition des nutriments du sol, les rétroactions aux antagonistes du sol, les bénéfices mycorhiziens différentiels et le commerce des nutriments. Les champignons mycorhiziens ont des effets puissants sur la biologie des populations et des communautés végétales, avec des effets spécifiques au type mycorhizien sur la dispersion des graines, l'établissement des plantules et la différenciation de la niche du sol, ainsi que sur la compétition interspécifique et intraspécifique, et donc sur la diversité végétale.

@article{doi101126scienceaba1223,
    author = "Tedersoo, Leho et Bahram, Mohammad et Zobel, Martin",
    title = "Comment les associations mycorhiziennes pilotent la biologie des populations et des communautés végétales",
    year = "2020",
    journal = "Science",
    abstract = "Les champignons mycorhiziens offrent aux plantes une gamme d'avantages, notamment des nutriments minéraux et une protection contre le stress et les pathogènes. Ici, nous synthétisons les informations actuelles sur la manière dont la présence et le type d'association mycorhizienne affectent les communautés végétales. Nous soutenons que les champignons mycorhiziens régulent l'établissement des plantules et la coexistence des espèces grâce à des mécanismes stabilisateurs et égalisateurs tels que la partition des nutriments du sol, les rétroactions aux antagonistes du sol, les bénéfices mycorhiziens différentiels et le commerce des nutriments. Les champignons mycorhiziens ont des effets puissants sur la biologie des populations et des communautés végétales, avec des effets spécifiques au type mycorhizien sur la dispersion des graines, l'établissement des plantules et la différenciation de la niche du sol, ainsi que sur la compétition interspécifique et intraspécifique, et donc sur la diversité végétale.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aba1223",
    doi = "10.1126/science.aba1223",
    openalex = "W3008013786",
    references = "doi1011111365274513035, doi101111nph13203"
}

Les successions primaires de la végétation ont été étudiées dans les conditions continentales du centre de la glaciation actuelle Severo-Chuiskiy (Altai central), de la colonisation des terrains dégagés par les premières plantes à la formation de groupes végétaux simples jusqu'aux communautés végétales primaires. Les observations ont été menées pendant 15 ans sur les jeunes moraines des glaciers de vallée du Malyi Aktru (2200–2250 m d'altitude) et du Bolshoi–Levyi Aktru (2370–2500 m d'altitude) dans des séquences chronologiques allant des extrémités des glaciers aux moraines du milieu du XIXe siècle. Trois stades et quatre sous-stades de la succession primaire de la végétation ont été identifiés. La composition spécifique des plantes vasculaires, des mousses et des lichens terrestres a été déterminée ; les espèces dominantes et les particularités de la végétation primaire ont été caractérisées. Des idées sur le déroulement des successions et leurs particularités à différentes altitudes dans la partie supérieure de la zone forestière et de la zone sous-alpine ont été obtenues. Il a été constaté que, sur une période de 150 ans, une jeune communauté forestière s'est formée sur de nouvelles moraines dans la partie supérieure de la zone forestière, et une combinaison de microcénozes similaires aux communautés de toundra s'est formée dans la zone alpine. La succession primaire de la végétation sur les deux forelands glaciaires présente certaines similitudes, en particulier aux stades précoces du développement de l'écosystème (composition des espèces pionnières et structure en trois stades des successions). De fortes différences apparaissent lors des stades tardifs de la succession. La succession primaire de la végétation sur le foreland du glacier du Malyi Aktru implique 146 espèces de plantes vasculaires, 44 espèces de mousses et 6 espèces de lichens. Sur le foreland du Bolshoi Levyi Aktru, 128 espèces de plantes vasculaires, 26 espèces de mousses et 8 lichens terrestres ont été recensées.

@article{doi101134s1995425520010114,
    author = "Тимошок, Е. Е. et Timoshok, Eugeny N. et Gureyeva, I. I. et Skorokhodov, Sergey N.",
    title = "Primary Successions of Vegetation on the Young Moraines in the Severo-Chuiskiy Center of Glaciation (Central Altai)",
    year = "2020",
    journal = "Contemporary Problems of Ecology",
    abstract = "Les successions primaires de la végétation ont été étudiées dans les conditions continentales du centre de la glaciation actuelle Severo-Chuiskiy (Altai central), de la colonisation des terrains dégagés par les premières plantes à la formation de groupes végétaux simples jusqu'aux communautés végétales primaires. Les observations ont été menées pendant 15 ans sur les jeunes moraines des glaciers de vallée du Malyi Aktru (2200–2250 m d'altitude) et du Bolshoi–Levyi Aktru (2370–2500 m d'altitude) dans des séquences chronologiques allant des extrémités des glaciers aux moraines du milieu du XIXe siècle. Trois stades et quatre sous-stades de la succession primaire de la végétation ont été identifiés. La composition spécifique des plantes vasculaires, des mousses et des lichens terrestres a été déterminée ; les espèces dominantes et les particularités de la végétation primaire ont été caractérisées. Des idées sur le déroulement des successions et leurs particularités à différentes altitudes dans la partie supérieure de la zone forestière et de la zone sous-alpine ont été obtenues. Il a été constaté que, sur une période de 150 ans, une jeune communauté forestière s'est formée sur de nouvelles moraines dans la partie supérieure de la zone forestière, et une combinaison de microcénozes similaires aux communautés de toundra s'est formée dans la zone alpine. La succession primaire de la végétation sur les deux forelands glaciaires présente certaines similitudes, en particulier aux stades précoces du développement de l'écosystème (composition des espèces pionnières et structure en trois stades des successions). De fortes différences apparaissent lors des stades tardifs de la succession. La succession primaire de la végétation sur le foreland du glacier du Malyi Aktru implique 146 espèces de plantes vasculaires, 44 espèces de mousses et 6 espèces de lichens. Sur le foreland du Bolshoi Levyi Aktru, 128 espèces de plantes vasculaires, 26 espèces de mousses et 8 lichens terrestres ont été recensées.",
    url = "https://doi.org/10.1134/s1995425520010114",
    doi = "10.1134/s1995425520010114",
    openalex = "W3010910840",
    references = "doi101007s1125800528431, doi101007s1328001101660, doi1010160033589480900071, doi101016jflora200910001, doi101023a1023042929441, doi10108011263500112331350930, doi10108817551315481012008, doi1011910309133306pp478ra, doi1023071551403, doi1023071930735, doi1023071934737"
}

Depuis les années 1970, les pathogènes végétaux ont joué un rôle important dans le contrôle biologique des mauvaises herbes. À ce jour, 36 pathogènes fongiques ont été autorisés pour l'introduction dans 18 pays dans le cadre du contrôle biologique classique des mauvaises herbes. Leur bilan de sécurité a été excellent, mais des questions continuent d'être posées concernant le risque qu'ils puissent se transférer à d'autres plantes. Les données quantitatives documentant leur impact sur les populations de mauvaises herbes restent limitées. Sur les 15 bioherbicides à base de micro-organismes vivants qui ont jamais été enregistrés, seuls deux étaient disponibles sur le marché au moment de cette revue. Le développement et la commercialisation de bioherbicides dans les pays riches sont toujours entravés par des obstacles technologiques et un potentiel de marché limité. Les systèmes de production et de distribution à petite échelle et à but non lucratif de bioherbicides dans les pays à faible revenu pourraient avoir un potentiel en tant qu'approche peu coûteuse pour contrôler les mauvaises herbes omniprésentes. Les types de recherche sous-tendant les approches de contrôle biologique et les défis rencontrés sont mis en évidence à l'aide d'exemples spécifiques.

@article{doi101146annurevphyto010820012823,
    author = "Morin, L.",
    title = "Progress in Biological Control of Weeds with Plant Pathogens",
    year = "2020",
    journal = "Annual Review of Phytopathology",
    abstract = "Plant pathogens have played an important role in weed biological control since the 1970s. So far, 36 fungal pathogens have been authorized for introduction across 18 countries for the classical biological control of weeds. Their safety record has been excellent, but questions continue to be asked about the risk that they could transfer to other plants. Quantitative data documenting their impact on the weed populations are still limited. Of the 15 bioherbicides based on living microorganisms that have ever been registered, only two were commercially available at the time of this review. The development and commercialization of bioherbicides in affluent countries are still plagued by technological hurdles and limited market potential. Not-for-profit small-scale production and distribution systems for bioherbicides in low-income countries may have potential as an inexpensive approach to controlling pervasive weeds. The types of research underpinning biological control approaches and challenges encountered are highlighted using specific examples.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-010820-012823",
    doi = "10.1146/annurev-phyto-010820-012823",
    openalex = "W3023087833",
    references = "doi101111nph16092"
}

Les pathogènes fongiques nécrotrophes causent des maladies considérables sur de nombreuses cultures économiquement importantes. Certains de ces pathogènes sont spécialisés sur une ou quelques espèces végétales étroitement apparentées, tandis que d'autres sont pathogènes sur de nombreux hôtes non apparentés. Les bases évolutives et moléculaires de la nécrotrophie à large spectre d'hôtes chez les pathogènes des plantes ne sont pas très bien définies et constituent un domaine de recherche en cours. Dans cette revue, nous discutons de ce qui est connu sur les pathogènes nécrotrophes à large spectre d'hôtes et les comparons avec leurs homologues à spectre d'hôtes restreint. Nous discutons des processus évolutifs associés au généralisme de l'hôte, et mettons en évidence les caractéristiques moléculaires communes du mode de vie nécrotrophe à large spectre d'hôtes, telles que l'ajustement fin du pH de l'hôte, la modulation des espèces réactives de l'oxygène de l'hôte et la dégradation métabolique des antimicrobiens divers de l'hôte. Nous concluons que les pathogènes des plantes nécrotrophes à large spectre d'hôtes ont évolué une gamme de réponses diverses et parfois convergentes à un régime sélectif similaire régi par les interactions avec un paysage d'hôte hautement hétérogène.

@article{doi103389fpls2020591733,
    author = "Newman, Toby E. et Derbyshire, Mark C.",
    title = "Les Caractéristiques Évolutionnaires et Moléculaires de la Nécrétrophie à Large Spectre d'Hôtes chez les Champignons Pathogènes des Plantes",
    year = "2020",
    journal = "Frontiers in Plant Science",
    abstract = "Les pathogènes fongiques nécrotrophes causent des maladies considérables sur de nombreuses cultures économiquement importantes. Certains de ces pathogènes sont spécialisés sur une ou quelques espèces végétales étroitement apparentées, tandis que d'autres sont pathogènes sur de nombreux hôtes non apparentés. Les bases évolutives et moléculaires de la nécrotrophie à large spectre d'hôtes chez les pathogènes des plantes ne sont pas très bien définies et constituent un domaine de recherche en cours. Dans cette revue, nous discutons de ce qui est connu sur les pathogènes nécrotrophes à large spectre d'hôtes et les comparons avec leurs homologues à spectre d'hôtes restreint. Nous discutons des processus évolutifs associés au généralisme de l'hôte, et mettons en évidence les caractéristiques moléculaires communes du mode de vie nécrotrophe à large spectre d'hôtes, telles que l'ajustement fin du pH de l'hôte, la modulation des espèces réactives de l'oxygène de l'hôte et la dégradation métabolique des antimicrobiens divers de l'hôte. Nous concluons que les pathogènes des plantes nécrotrophes à large spectre d'hôtes ont évolué une gamme de réponses diverses et parfois convergentes à un régime sélectif similaire régi par les interactions avec un paysage d'hôte hautement hétérogène.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fpls.2020.591733",
    doi = "10.3389/fpls.2020.591733",
    openalex = "W3099533184",
    references = "doi101111nph16092"
}

Cet article traite du développement de la végétation dans quatre plaines glaciaires, alignées sur une distance de 250 km d'Ouest en Est dans les Alpes centrales orientales siliceuses. L'étude utilise une approche de chronoséquence, qui suppose une séquence temporelle dans le développement de la végétation par des sites spatialement différents en fonction du temps écoulé depuis la déglaciation. Les chronoséquences couvrent la zone comprise entre l'extension maximale des glaciers de la petite période glaciaire (LIA) vers 1850 et le terminus glaciaire actuel. Malgré certaines limites, les chronoséquences permettent d'identifier des motifs généraux de la succession primaire des plantes en fonction de l'âge du site et des conditions environnementales locales, par exemple, les changements de richesse spécifique, de couverture du sol, de traits fonctionnels des plantes et de structure de la communauté. Bien qu'il n'y ait pas de pénurie d'études de chronoséquence dans les plaines glaciaires des Alpes, une comparaison directe visant à déduire des trajectoires successionales générales est délicate, en raison de procédures différentes d'échantillonnage de la végétation et d'analyses de données. L'examen comparatif par un protocole standardisé d'échantillonnage et d'analyse de quatre plaines glaciaires dans les Alpes centrales orientales présenté ici prouve l'existence de plusieurs motifs communs dans la succession primaire, mais aussi des trajectoires successionales divergentes d'Ouest en Est. Alors que l'étape pionnière dans toutes les plaines glaciaires est similaire tant floristiquement que structurellement, dès l'étape successionale précoce, les différences augmentent, conduisant à des phases différentes dans l'étape successionale tardive, qui est dominée par les arbustes dans tout le site d'étude le plus à l'ouest, dominée par les herbacées-grasses-arbustes nains dans tout le site d'étude le plus à l'est, et divisée en une phase plus précoce d'herbacées-grasses-arbustes nains et une phase plus tardive d'arbustes dans les deux sites d'étude intermédiaires.

@article{doi103390d12050191,
    author = "Fickert, Thomas",
    title = "Patterns communs et trajectoires divergentes dans la succession primaire des plantes dans les plaines glaciaires des Alpes orientales",
    year = "2020",
    journal = "Diversité",
    abstract = "Cet article traite du développement de la végétation dans quatre plaines glaciaires, alignées sur une distance de 250 km d'Ouest en Est dans les Alpes centrales orientales siliceuses. L'étude utilise une approche de chronoséquence, qui suppose une séquence temporelle dans le développement de la végétation par des sites spatialement différents en fonction du temps écoulé depuis la déglaciation. Les chronoséquences couvrent la zone comprise entre l'extension maximale des glaciers de la petite période glaciaire (LIA) vers 1850 et le terminus glaciaire actuel. Malgré certaines limites, les chronoséquences permettent d'identifier des motifs généraux de la succession primaire des plantes en fonction de l'âge du site et des conditions environnementales locales, par exemple, les changements de richesse spécifique, de couverture du sol, de traits fonctionnels des plantes et de structure de la communauté. Bien qu'il n'y ait pas de pénurie d'études de chronoséquence dans les plaines glaciaires des Alpes, une comparaison directe visant à déduire des trajectoires successionales générales est délicate, en raison de procédures différentes d'échantillonnage de la végétation et d'analyses de données. L'examen comparatif par un protocole standardisé d'échantillonnage et d'analyse de quatre plaines glaciaires dans les Alpes centrales orientales présenté ici prouve l'existence de plusieurs motifs communs dans la succession primaire, mais aussi des trajectoires successionales divergentes d'Ouest en Est. Alors que l'étape pionnière dans toutes les plaines glaciaires est similaire tant floristiquement que structurellement, dès l'étape successionale précoce, les différences augmentent, conduisant à des phases différentes dans l'étape successionale tardive, qui est dominée par les arbustes dans tout le site d'étude le plus à l'ouest, dominée par les herbacées-grasses-arbustes nains dans tout le site d'étude le plus à l'est, et divisée en une phase plus précoce d'herbacées-grasses-arbustes nains et une phase plus tardive d'arbustes dans les deux sites d'étude intermédiaires.",
    url = "https://doi.org/10.3390/d12050191",
    doi = "10.3390/d12050191",
    openalex = "W3024770865",
    references = "doi101134s1995425520010114"
}

Noms scientifiques sont cruciaux pour communiquer les connaissances concernant les champignons et les organismes semblables aux champignons. En pathologie végétale, ils relient les informations concernant la biologie, l'étendue des hôtes, la distribution et le risque potentiel pour l'agriculture et la sécurité alimentaire. Dans le passé, la délimitation entre les taxons pathogènes était principalement basée sur les caractéristiques morphologiques. En raison d'espèces distinctes partageant des caractéristiques chevauchantes, l'identification morphologique des espèces est souvent ni simple ni fiable. Par conséquent, le concept d'espèce phylogénétique basé sur les reconstructions phylogénétiques moléculaires a gagné en importance. L'opinion actuelle discute de ce qu'est une espèce fongique et de la manière dont l'identification des espèces en pathologie végétale a changé au cours des dernières décennies. Dans ce contexte, la spécialisation des hôtes et les complexes d'espèces sont discutés. De plus, les concepts d'espèces en pathologie végétale sont examinés à l'aide d'études de cas provenant de Bipolaris, Colletotrichum, Curvularia, Diaporthe, Diplodia, Meliola, Plasmopara, champignons rouille et Trichoderma. Chaque entrée contient une brève introduction au genre, les concepts utilisés dans l'identification des espèces jusqu'à présent et les problèmes dans la description d'une espèce suivis de recommandations. L'importance de nommer et identifier correctement une espèce est abordée dans le contexte des introductions récentes, et nous discutons également si l'introduction de nouvelles espèces dans les genres pathogènes a été surestimée. Nous fournissons également des lignes directrices à considérer lors de l'introduction d'une nouvelle espèce dans un genre pathogène des plantes.

@article{doi101007s13225021004848,
    author = "Jayawardena, Ruvishika S. et Hyde, Kevin D. et de Farias, Antônio Roberto Gomes et Bhunjun, Chitrabhanu S. et Ferdinandez, Himashi S. et Manamgoda, Dimuthu S. et Udayanga, Dhanushka et Herath, Indunil S. et Thambugala, Kasun M. et Manawasinghe, Ishara S. et Gajanayake, Achala J. et Samarakoon, Binu C. et Bundhun, Digvijayini et Gomdola, Deecksha et Huanraluek, Naruemon et Sun, Ya-Ru et Tang, Xia et Promputtha, Itthayakorn et Thines, Marco",
    title = "Qu'est-ce qu'une espèce chez les pathogènes fongiques des plantes ?",
    year = "2021",
    journal = "Fungal Diversity",
    abstract = "Noms scientifiques sont cruciaux pour communiquer les connaissances concernant les champignons et les organismes semblables aux champignons. En pathologie végétale, ils relient les informations concernant la biologie, l'étendue des hôtes, la distribution et le risque potentiel pour l'agriculture et la sécurité alimentaire. Dans le passé, la délimitation entre les taxons pathogènes était principalement basée sur les caractéristiques morphologiques. En raison d'espèces distinctes partageant des caractéristiques chevauchantes, l'identification morphologique des espèces est souvent ni simple ni fiable. Par conséquent, le concept d'espèce phylogénétique basé sur les reconstructions phylogénétiques moléculaires a gagné en importance. L'opinion actuelle discute de ce qu'est une espèce fongique et de la manière dont l'identification des espèces en pathologie végétale a changé au cours des dernières décennies. Dans ce contexte, la spécialisation des hôtes et les complexes d'espèces sont discutés. De plus, les concepts d'espèces en pathologie végétale sont examinés à l'aide d'études de cas provenant de Bipolaris, Colletotrichum, Curvularia, Diaporthe, Diplodia, Meliola, Plasmopara, champignons rouille et Trichoderma. Chaque entrée contient une brève introduction au genre, les concepts utilisés dans l'identification des espèces jusqu'à présent et les problèmes dans la description d'une espèce suivis de recommandations. L'importance de nommer et identifier correctement une espèce est abordée dans le contexte des introductions récentes, et nous discutons également si l'introduction de nouvelles espèces dans les genres pathogènes a été surestimée. Nous fournissons également des lignes directrices à considérer lors de l'introduction d'une nouvelle espèce dans un genre pathogène des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s13225-021-00484-8",
    doi = "10.1007/s13225-021-00484-8",
    openalex = "W3193104585",
    references = "doi101111nph16092"
}

espèces. Phi peut également contrôler les symptômes de la maladie et la propagation de bactéries, de champignons et de nématodes pathogènes. Phi joue des rôles critiques en tant que fongicide, pesticide, engrais ou biostimulant. Dans l'ensemble, Phi peut atténuer la gravité de la maladie causée par les oomycètes, les champignons, les bactéries pathogènes et les nématodes (feuilles, tiges, fruits, tubercules et racines) chez diverses plantes (légumes, fruits, cultures, cultures racines/tubercules, plantes ornementales et forêts). Les recherches avancées dans les approches moléculaires, physiologiques et biochimiques ont confirmé le rôle clé de Phi dans l'amélioration de la croissance, de la quantité et de la qualité de plusieurs espèces végétales. Phi est chimiquement similaire au phosphate ortho et, à l'intérieur des cellules, il est susceptible d'intervenir dans différentes caractéristiques du métabolisme du phosphate chez les plantes et les pathogènes. Chez les plantes, une gamme d'altérations physiobiochimiques sont induites par le stress des pathogènes végétaux, ce qui entraîne une baisse des activités de photosynthèse, des activités enzymatiques, une accumulation accrue d'espèces réactives de l'oxygène (ROS) et une modification d'un grand groupe de gènes. À ce jour, plusieurs tentatives ont été faites pour étudier les interactions plante-pathogène dans le but de minimiser la perte de productivité des cultures. La fonction émergente de Phi en tant que biostimulant chez les plantes a boosté le rendement des plantes et la tolérance contre divers facteurs de stress. Cette revue discute des effets biostimulants médiés par Phi contre les stress biotiques et abiotiques.

@article{doi103389fmicb2021631318,
    author = "Mohammadi, Mohammad Aqa et Cheng, Yan et Aslam, Mohammad et Jakada, Bello Hassan et Wai, Myat Hnin et Ye, Kangzhuo et He, Xiaoxue et Luo, Tiantian et Li, Ye et Dong, Chunxing et Hu, Bin et Priyadarshani, S. V. G. N. et Wang‐Pruski, Gefu et Qin, Yuan",
    title = "ROS et systèmes de réponse oxydative chez les plantes sous stress biotique et abiotique : Revisitant le rôle crucial de la phosphite déclenchant la réponse de défense des plantes",
    year = "2021",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "espèces. Phi peut également contrôler les symptômes de la maladie et la propagation de bactéries, de champignons et de nématodes pathogènes. Phi joue des rôles critiques en tant que fongicide, pesticide, engrais ou biostimulant. Dans l'ensemble, Phi peut atténuer la gravité de la maladie causée par les oomycètes, les champignons, les bactéries pathogènes et les nématodes (feuilles, tiges, fruits, tubercules et racines) chez diverses plantes (légumes, fruits, cultures, cultures racines/tubercules, plantes ornementales et forêts). Les recherches avancées dans les approches moléculaires, physiologiques et biochimiques ont confirmé le rôle clé de Phi dans l'amélioration de la croissance, de la quantité et de la qualité de plusieurs espèces végétales. Phi est chimiquement similaire au phosphate ortho et, à l'intérieur des cellules, il est susceptible d'intervenir dans différentes caractéristiques du métabolisme du phosphate chez les plantes et les pathogènes. Chez les plantes, une gamme d'altérations physiobiochimiques sont induites par le stress des pathogènes végétaux, ce qui entraîne une baisse des activités de photosynthèse, des activités enzymatiques, une accumulation accrue d'espèces réactives de l'oxygène (ROS) et une modification d'un grand groupe de gènes. À ce jour, plusieurs tentatives ont été faites pour étudier les interactions plante-pathogène dans le but de minimiser la perte de productivité des cultures. La fonction émergente de Phi en tant que biostimulant chez les plantes a boosté le rendement des plantes et la tolérance contre divers facteurs de stress. Cette revue discute des effets biostimulants médiés par Phi contre les stress biotiques et abiotiques.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.631318",
    doi = "10.3389/fmicb.2021.631318",
    openalex = "W3183678052",
    references = "doi101111mpp12568"
}

Sur le territoire de la République du Bachkortostan, les principales régularités de la différenciation du paysage se manifestent par une zonation latitudinale, une zonation altitudinale et un effet de barrière, qui déterminent la différenciation territoriale de la couverture végétale. Les schémas existants de zonation botanique-géographique et géobotanique reflètent ces motifs. Les plus grandes unités de zonation sont les structures zonales (régions forestières, forestières-steppe et steppe), au sein desquelles, sur la base des caractéristiques géologiques et géomorphologiques, sont distinguées des unités taxonomiques plus petites : provinces, zones, districts. La méthode de zonation proposée par S.M. Razumovsky, qui repose sur le concept d'un système de succession, est intéressante. Selon ce concept, la couverture végétale de la Terre est divisée entre les systèmes de succession. Les limites des systèmes de succession sont délimitées par les limites des zones géographiques des espèces clés édificatrices des phytocénoses forestières indigènes. S.M. Razumovsky a présenté un schéma de zonation botanique-géographique, réalisé à une petite échelle. Les limites des systèmes de succession, à l'exception de certaines zones, ne sont pas délimitées. L'auteur s'est fixé pour objectif : déterminer une liste de systèmes de succession communs sur le territoire de la République du Bachkortostan, délimiter leurs frontières et donner leurs caractéristiques brèves. À la suite de l'étude et de l'analyse des sources littéraires, l'auteur est arrivé à la conclusion que 4 systèmes de succession sont répandus sur le territoire de la République du Bachkortostan : 1) forêts mixtes à feuilles larges et conifères sombres avec des espèces climax de sapin sibérien, épicéa sibérien, chêne pédonculé, tilleul à larges feuilles et érable sycomore ; 2) forêts conifères sombres, avec des espèces climax de sapin sibérien et épicéa sibérien ; 3) forêts à feuilles larges avec des espèces climax de chêne pédonculé, tilleul à larges feuilles et érable sycomore ; 4) forêts conifères claires avec des espèces sous-climax de pin sylvestre et larix de Sukachev.

@article{gorichev2021botanicalgeographical,
    author = "Gorichev, Yuriy Petrovich",
    title = "Différenciation botanique-géographique et systèmes de succession sur le territoire de la République du Bachkortostan",
    year = "2021",
    journal = "Samara Journal of Science",
    abstract = "Sur le territoire de la République du Bachkortostan, les principales régularités de la différenciation du paysage se manifestent par une zonation latitudinale, une zonation altitudinale et un effet de barrière, qui déterminent la différenciation territoriale de la couverture végétale. Les schémas existants de zonation botanique-géographique et géobotanique reflètent ces motifs. Les plus grandes unités de zonation sont les structures zonales (régions forestières, forestières-steppe et steppe), au sein desquelles, sur la base des caractéristiques géologiques et géomorphologiques, sont distinguées des unités taxonomiques plus petites : provinces, zones, districts. La méthode de zonation proposée par S.M. Razumovsky, qui repose sur le concept d'un système de succession, est intéressante. Selon ce concept, la couverture végétale de la Terre est divisée entre les systèmes de succession. Les limites des systèmes de succession sont délimitées par les limites des zones géographiques des espèces clés édificatrices des phytocénoses forestières indigènes. S.M. Razumovsky a présenté un schéma de zonation botanique-géographique, réalisé à une petite échelle. Les limites des systèmes de succession, à l'exception de certaines zones, ne sont pas délimitées. L'auteur s'est fixé pour objectif : déterminer une liste de systèmes de succession communs sur le territoire de la République du Bachkortostan, délimiter leurs frontières et donner leurs caractéristiques brèves. À la suite de l'étude et de l'analyse des sources littéraires, l'auteur est arrivé à la conclusion que 4 systèmes de succession sont répandus sur le territoire de la République du Bachkortostan : 1) forêts mixtes à feuilles larges et conifères sombres avec des espèces climax de sapin sibérien, épicéa sibérien, chêne pédonculé, tilleul à larges feuilles et érable sycomore ; 2) forêts conifères sombres, avec des espèces climax de sapin sibérien et épicéa sibérien ; 3) forêts à feuilles larges avec des espèces climax de chêne pédonculé, tilleul à larges feuilles et érable sycomore ; 4) forêts conifères claires avec des espèces sous-climax de pin sylvestre et larix de Sukachev.",
    url = "https://doi.org/10.17816/snv2021104103",
    doi = "10.17816/snv2021104103",
    number = "4",
    pages = "24-28",
    volume = "10"
}

L'Himalaya oriental est réputé pour sa grande diversité végétale. Pour comprendre comment cette richesse botanique moderne s'est formée, il est crucial d'étudier la biodiversité végétale passée préservée sous forme de fossiles tout au long de la succession des Siwaliks de l'Himalaya oriental (Miocène moyen−Pleistocène précoce). Ici, nous présentons un résumé des enregistrements de diversité végétale qui documentent les changements floristiques et climatiques du Néogène. Nous le faisons en compilant les enregistrements publiés de restes végétaux mégafossiles, car ceux-ci offrent une meilleure résolution spatiale et temporelle que les enregistrements palynologiques. Les analyses des assemblages floraux des Siwaliks basées sur la distribution des taxons de parents vivants les plus proches suggèrent qu'une forêt tropicale humide sempervirente se développait dans un climat humide et chaud de type mousson au moment du dépôt. Cette interprétation qualitative est également corroborée par des analyses CLAMP (Climate Leaf Analysis Multivariate Program) publiées. Ici, nous reconstruisons également le climat en appliquant une nouvelle calibration WorldClim2 de proxy commun. Cela permet de détecter des différences climatiques subtiles entre les assemblages floraux, exemptes d'artefacts introduits par l'utilisation de méthodologies et de calibrations climatiques différentes. Une analyse des flores des Siwaliks indique qu'il y a eu un changement progressif dans la composition floristique. Les assemblages des Siwaliks inférieurs fournissent des preuves d'une prédominance d'éléments sempervirents. Une augmentation des éléments caducifoliés dans la composition florale est notée vers la fin des Siwaliks moyens et le début de la formation des Siwaliks supérieurs. Ce changement reflète une différence climatique entre les époques du Miocène et du Plio-Pleistocène. Cette revue nous aide à comprendre dans quelles conditions paléo-environnementales la diversité végétale s'est produite et évolué dans l'Himalaya oriental tout au long du Cénozoïque.

@article{doi101016jpld202212003,
    author = "Khan, M. et Mahato, Sumana et Spicer, R. et Spicer, T. et Ali, Ashif et Hazra, Taposhi et Bera, S.",
    title = "Diversité des mégafossiles végétaux des Siwaliks dans l'Himalaya oriental : Une revue",
    year = "2022",
    journal = "Plant Diversity",
    abstract = "L'Himalaya oriental est réputé pour sa grande diversité végétale. Pour comprendre comment cette richesse botanique moderne s'est formée, il est crucial d'étudier la biodiversité végétale passée préservée sous forme de fossiles tout au long de la succession des Siwaliks de l'Himalaya oriental (Miocène moyen−Pleistocène précoce). Ici, nous présentons un résumé des enregistrements de diversité végétale qui documentent les changements floristiques et climatiques du Néogène. Nous le faisons en compilant les enregistrements publiés de restes végétaux mégafossiles, car ceux-ci offrent une meilleure résolution spatiale et temporelle que les enregistrements palynologiques. Les analyses des assemblages floraux des Siwaliks basées sur la distribution des taxons de parents vivants les plus proches suggèrent qu'une forêt tropicale humide sempervirente se développait dans un climat humide et chaud de type mousson au moment du dépôt. Cette interprétation qualitative est également corroborée par des analyses CLAMP (Climate Leaf Analysis Multivariate Program) publiées. Ici, nous reconstruisons également le climat en appliquant une nouvelle calibration WorldClim2 de proxy commun. Cela permet de détecter des différences climatiques subtiles entre les assemblages floraux, exemptes d'artefacts introduits par l'utilisation de méthodologies et de calibrations climatiques différentes. Une analyse des flores des Siwaliks indique qu'il y a eu un changement progressif dans la composition floristique. Les assemblages des Siwaliks inférieurs fournissent des preuves d'une prédominance d'éléments sempervirents. Une augmentation des éléments caducifoliés dans la composition florale est notée vers la fin des Siwaliks moyens et le début de la formation des Siwaliks supérieurs. Ce changement reflète une différence climatique entre les époques du Miocène et du Plio-Pleistocène. Cette revue nous aide à comprendre dans quelles conditions paléo-environnementales la diversité végétale s'est produite et évolué dans l'Himalaya oriental tout au long du Cénozoïque.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.pld.2022.12.003",
    doi = "10.1016/j.pld.2022.12.003",
    is_oa = "true",
    number = "3",
    pages = "243-264",
    semanticscholar_citation_count = "17",
    semanticscholar_id = "6a81e9a49c37271801833c899e981d7642d612bc",
    volume = "45"
}

@article{svistova2022ecological,
    author = "Svistova, I. D. et Nazarenko, N. N.",
    title = "Tendances écologiques de la succession dans le mycobiome du vieux jardin botanique chernozem",
    year = "2022",
    journal = "Écologie théorique et appliquée",
    url = "https://doi.org/10.25750/1995-4301-2022-3-142-148",
    doi = "10.25750/1995-4301-2022-3-142-148",
    number = "3",
    pages = "142-148"
}

Les endophytes sont essentiels à la succession et à l'évolution des plantes, et essentiels à la résistance au stress. La racine coralloïde est une structure racinaire unique trouvée chez les cycas qui a joué un rôle dans la résistance aux environnements défavorables, mais les taxons centraux et la communauté microbienne des différentes espèces de Cycas n'ont pas été approfondis. En utilisant le séquençage d'amplificateurs, nous avons réussi à élucider les microbiomes présents dans les racines coralloïdes de 10 espèces de Cycas, représentant les quatre sections de Cycas en Chine. Nous avons trouvé que les bactéries endophytes dans les racines coralloïdes, c'est-à-dire les Cyanobactéries, étaient principalement composées de Desmonostoc_PCC-7422, Nostoc_PCC-73102 et unclassified_f__Nostocaceae. De plus, les champignons Ascomycota d'Exophiala, Paraboeremia, Leptobacillium, Fusarium, Alternaria et Diaporthe ont été identifiés comme les taxons fongiques centraux. Les champignons Ascomycota de Nectriaceae, Herpotrichiellaceae, Cordycipitaceae, Helotiaceae, Diaporthaceae, Didymellaceae, Clavicipitaceae et Pleosporaceae ont été identifiés comme les taxons familiaux centraux dans les racines coralloïdes des quatre sections. Une abondance élevée mais une faible diversité de la communauté bactérienne a été détectée dans les racines coralloïdes, mais aucune différence significative entre les espèces. La communauté fongique a présenté une complexité beaucoup plus élevée par rapport aux bactéries, et une diversité a été notée entre les différentes espèces ou sections. Ces taxons centraux, qui étaient un sous-ensemble du microbiome qui se produisait fréquemment chez tous, ou la plupart, des individus des espèces de Cycas, représentent des cibles pour le développement de la conservation des Cycas.

@article{doi103390microorganisms11092144,
    author = "Wang, Zhaochun et Liu, Jian et Xu, Hai-Kun et Liu, Jiating et Zhao, Zhiwei et Gong, X.",
    title = "Core Microbiome and Microbial Community Structure in Coralloid Roots of Cycas in Ex Situ Collection of Kunming Botanical Garden in China",
    year = "2023",
    journal = "Microorganisms",
    abstract = "Les endophytes sont essentiels à la succession et à l'évolution des plantes, et essentiels à la résistance au stress. La racine coralloïde est une structure racinaire unique trouvée chez les cycas qui a joué un rôle dans la résistance aux environnements défavorables, mais les taxons centraux et la communauté microbienne des différentes espèces de Cycas n'ont pas été approfondis. En utilisant le séquençage d'amplificateurs, nous avons réussi à élucider les microbiomes présents dans les racines coralloïdes de 10 espèces de Cycas, représentant les quatre sections de Cycas en Chine. Nous avons trouvé que les bactéries endophytes dans les racines coralloïdes, c'est-à-dire les Cyanobactéries, étaient principalement composées de Desmonostoc\_PCC-7422, Nostoc\_PCC-73102 et unclassified\_f\_\_Nostocaceae. De plus, les champignons Ascomycota d'Exophiala, Paraboeremia, Leptobacillium, Fusarium, Alternaria et Diaporthe ont été identifiés comme les taxons fongiques centraux. Les champignons Ascomycota de Nectriaceae, Herpotrichiellaceae, Cordycipitaceae, Helotiaceae, Diaporthaceae, Didymellaceae, Clavicipitaceae et Pleosporaceae ont été identifiés comme les taxons familiaux centraux dans les racines coralloïdes des quatre sections. Une abondance élevée mais une faible diversité de la communauté bactérienne a été détectée dans les racines coralloïdes, mais aucune différence significative entre les espèces. La communauté fongique a présenté une complexité beaucoup plus élevée par rapport aux bactéries, et une diversité a été notée entre les différentes espèces ou sections. Ces taxons centraux, qui étaient un sous-ensemble du microbiome qui se produisait fréquemment chez tous, ou la plupart, des individus des espèces de Cycas, représentent des cibles pour le développement de la conservation des Cycas.",
    url = "https://www.mdpi.com/2076-2607/11/9/2144/pdf?version=1692931075",
    doi = "10.3390/microorganisms11092144",
    is_oa = "true",
    number = "9",
    pages = "2144",
    semanticscholar_citation_count = "8",
    semanticscholar_id = "02dd503e0adfc5c0b594d982c18d80c4f012be39",
    volume = "11"
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Le district de Samara est l'un des districts définis par S.M. Razoumovski dans le schéma de zonage botanique et géographique. Cette zone délimite géographiquement le domaine du système de succession des forêts à feuilles larges avec les espèces clés Tilia cordata, Quercus robur, Acer platanoides, Ulmus glabra. S.M. Razoumovski a tracé les limites du district sur un schéma à petite échelle et fourni une liste d'espèces indicatrices. Le but de cet article est de donner une brève description de la zone, de définir ses limites et d'identifier les caractéristiques de la structure territoriale de la couverture végétale. Les matériaux utilisés sont des publications scientifiques sur la structure de la couverture végétale du territoire considéré. La région de Samara couvre la partie orientale de la plaine d'Europe de l'Est, à l'est du fleuve Volga, y compris la région du Volga et les Oural, ainsi que le versant occidental des Oural du Sud. La structure territoriale du système de succession peut être représentée sous la forme de deux parties structurelles : le noyau et la périphérie. Le noyau du système est décalé vers le nord-est, occupe l'espace de la zone forestière et la partie nord de la zone forestière-steppe. La périphérie couvre l'espace de la zone forestière-steppe et la partie nord de la zone steppe. Dans le noyau du système de succession, la végétation zonale est formée par des associations de forêts à feuilles larges ombragées avec le tilleul comme espèce fondatrice ; à la périphérie, il existe des associations de forêts à feuilles larges lumineuses (chênaie).

@article{gorichev2023the,
    author = "Gorichev, Yuriy Petrovitch",
    title = "Le système de succession de la région botanique et géographique de Samara (limites administratives et structure territoriale)",
    year = "2023",
    journal = "Samara Journal of Science",
    abstract = "Le district de Samara est l'un des districts définis par S.M. Razoumovski dans le schéma de zonage botanique et géographique. Cette zone délimite géographiquement le domaine du système de succession des forêts à feuilles larges avec les espèces clés Tilia cordata, Quercus robur, Acer platanoides, Ulmus glabra. S.M. Razoumovski a tracé les limites du district sur un schéma à petite échelle et fourni une liste d'espèces indicatrices. Le but de cet article est de donner une brève description de la zone, de définir ses limites et d'identifier les caractéristiques de la structure territoriale de la couverture végétale. Les matériaux utilisés sont des publications scientifiques sur la structure de la couverture végétale du territoire considéré. La région de Samara couvre la partie orientale de la plaine d'Europe de l'Est, à l'est du fleuve Volga, y compris la région du Volga et les Oural, ainsi que le versant occidental des Oural du Sud. La structure territoriale du système de succession peut être représentée sous la forme de deux parties structurelles : le noyau et la périphérie. Le noyau du système est décalé vers le nord-est, occupe l'espace de la zone forestière et la partie nord de la zone forestière-steppe. La périphérie couvre l'espace de la zone forestière-steppe et la partie nord de la zone steppe. Dans le noyau du système de succession, la végétation zonale est formée par des associations de forêts à feuilles larges ombragées avec le tilleul comme espèce fondatrice ; à la périphérie, il existe des associations de forêts à feuilles larges lumineuses (chênaie).",
    url = "https://doi.org/10.55355/snv2023121107",
    doi = "10.55355/snv2023121107",
    number = "1",
    pages = "43-47",
    volume = "12"
}

Les plantes sauvages comestibles, définies botaniquement comme des espèces phytoalimurgiques, ont historiquement constitué une source alimentaire utile pour faire face aux famines récurrentes et aux mauvaises conditions agricoles. Si elles sont correctement identifiées, récoltées, transformées et promues, les plantes alimurgiques pourraient encore améliorer le bien-être des communautés rurales et urbaines ainsi que la productivité multifonctionnelle de l'agriculture. La recherche visait à inventorier les espèces alimurgiques dans une zone humide, à cartographier leur localisation, à détecter leur richesse spatiale et à élaborer un plan de suivi pour la succession végétale en cours. La zone d'étude est la lagune du Roi, une zone humide qui a récemment subi une restauration radicale de son aménagement naturel. Une image satellite a été utilisée pour créer une carte d'occupation des sols et interpréter la relation entre les espèces végétales et l'occupation des sols. L'inventaire a fourni un aperçu de l'état actuel de l'écosystème de la zone humide et a utilisé l'analyse botanique et des indices écologiques pour investiguer les niveaux de biodiversité. Les niveaux alpha, bêta et gamma de la biodiversité ont été explorés et interprétés grâce au traitement statistique d'un jeu de données complet sur la présence et l'abondance des espèces, ainsi qu'au calcul des indices de Shannon, de Simpson et de Jaccard. Il a été observé que la biodiversité dans la zone humide se développe progressivement après la restauration et devrait augmenter au fil du temps à mesure que les stades de succession s'installent. La biodiversité est plus marquée le long des berges des canaux et des cours d'eau reliant les bassins et les étangs ouverts, tandis qu'elle est moins marquée dans les zones où le sol a été perturbé par des excavations précédentes. Salicornia spp., Beta vulgaris subsp. maritima et Suaeda vera ont été identifiés comme les espèces les plus courantes et intéressantes trouvées dans la zone d'étude. Le potentiel de culture de certaines espèces halophytes surveillées a également été mis en évidence, avec une référence particulière à la sélection des espèces les plus intéressantes sur le plan commercial, aux meilleures associations d'espèces et aux pratiques d'association culturale dans un contexte de zone humide, qui doivent toujours prioriser la conservation de la biodiversité sauvage. Les inventaires printaniers devraient être répétés au cours des prochaines années afin de tracer avec précision la dynamique de la succession écologique de cet écosystème particulier, une fois qu'il sera retourné à son développement naturel.

@article{doi103390horticulturae10060632,
    author = "Cammerino, A. and Piacquadio, Lorenzo and Ingaramo, Michela and Gioiosa, Maurizio and Monteleone, Massimo",
    title = "Wild Edible Plant Species in the ‘King’s Lagoon’ Coastal Wetland: Survey, Collection, Mapping and Ecological Characterization",
    year = "2024",
    journal = "Horticulturae",
    abstract = "Les plantes sauvages comestibles, définies botaniquement comme des espèces phytoalimurgiques, ont historiquement constitué une source alimentaire utile pour faire face aux famines récurrentes et aux mauvaises conditions agricoles. Si elles sont correctement identifiées, récoltées, transformées et promues, les plantes alimurgiques pourraient encore améliorer le bien-être des communautés rurales et urbaines ainsi que la productivité multifonctionnelle de l'agriculture. La recherche visait à inventorier les espèces alimurgiques dans une zone humide, à cartographier leur localisation, à détecter leur richesse spatiale et à élaborer un plan de suivi pour la succession végétale en cours. La zone d'étude est la lagune du Roi, une zone humide qui a récemment subi une restauration radicale de son aménagement naturel. Une image satellite a été utilisée pour créer une carte d'occupation des sols et interpréter la relation entre les espèces végétales et l'occupation des sols. L'inventaire a fourni un aperçu de l'état actuel de l'écosystème de la zone humide et a utilisé l'analyse botanique et des indices écologiques pour investiguer les niveaux de biodiversité. Les niveaux alpha, bêta et gamma de la biodiversité ont été explorés et interprétés grâce au traitement statistique d'un jeu de données complet sur la présence et l'abondance des espèces, ainsi qu'au calcul des indices de Shannon, de Simpson et de Jaccard. Il a été observé que la biodiversité dans la zone humide se développe progressivement après la restauration et devrait augmenter au fil du temps à mesure que les stades de succession s'installent. La biodiversité est plus marquée le long des berges des canaux et des cours d'eau reliant les bassins et les étangs ouverts, tandis qu'elle est moins marquée dans les zones où le sol a été perturbé par des excavations précédentes. Salicornia spp., Beta vulgaris subsp. maritima et Suaeda vera ont été identifiés comme les espèces les plus courantes et intéressantes trouvées dans la zone d'étude. Le potentiel de culture de certaines espèces halophytes surveillées a également été mis en évidence, avec une référence particulière à la sélection des espèces les plus intéressantes sur le plan commercial, aux meilleures associations d'espèces et aux pratiques d'association culturale dans un contexte de zone humide, qui doivent toujours prioriser la conservation de la biodiversité sauvage. Les inventaires printaniers devraient être répétés au cours des prochaines années afin de tracer avec précision la dynamique de la succession écologique de cet écosystème particulier, une fois qu'il sera retourné à son développement naturel.",
    url = "https://www.mdpi.com/2311-7524/10/6/632/pdf?version=1718204340",
    doi = "10.3390/horticulturae10060632",
    is_oa = "true",
    number = "6",
    pages = "632",
    semanticscholar_citation_count = "3",
    semanticscholar_id = "99e84a789e4b0f8d521a786791d865efa9d57157",
    volume = "10"
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, prospéraient dans des conditions stabilisées et enrichies en nutriments. L'analyse CCA a montré que l'âge successional expliquait 12,9 % de la variabilité de la composition des espèces, tandis que les différences géographiques contribuaient à 7,9 %. Le turnover des espèces était influencé par les caractéristiques du substrat (sédiment à fines particules vs. substrat rocheux grossier), la compétition et l'érosion, qui était encore façonnée par la stabilité environnementale. La succession des lichens suit le schéma attendu, principalement façonnée par la microtopographie du terrain, le climat et le type de substrat. Pour affiner la dynamique successionale des communautés de lichens et d'autres groupes d'organismes impliqués dans la colonisation des habitats nouvellement dégagés par les glaciers, des études à long terme provenant de différentes régions seront nécessaires.

@article{doi101002ece371848,
    author = "Halda, Josef P. et Košnar, Jan et Lukešová, Alena",
    title = "Succession of Lichens in Front of Retreating Glaciers in Sweden and Norway",
    year = "2025",
    journal = "Ecology and Evolution",
    abstract = ", prospéraient dans des conditions stabilisées et enrichies en nutriments. L'analyse CCA a montré que l'âge successional expliquait 12,9 % de la variabilité de la composition des espèces, tandis que les différences géographiques contribuaient à 7,9 %. Le turnover des espèces était influencé par les caractéristiques du substrat (sédiment à fines particules vs. substrat rocheux grossier), la compétition et l'érosion, qui était encore façonnée par la stabilité environnementale. La succession des lichens suit le schéma attendu, principalement façonnée par la microtopographie du terrain, le climat et le type de substrat. Pour affiner la dynamique successionale des communautés de lichens et d'autres groupes d'organismes impliqués dans la colonisation des habitats nouvellement dégagés par les glaciers, des études à long terme provenant de différentes régions seront nécessaires.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ece3.71848",
    doi = "10.1002/ece3.71848",
    openalex = "W4412648488",
    references = "doi101134s1995425520010114"
}

Dans les conditions cryoarides du centre de glaciation du Chuya du Sud (monts Altaï), au pied-avant du glacier Sophiysky (2410–2500 m d'altitude), les successions de végétation primaire ont été étudiées depuis l'établissement des premières plantes vasculaires, mousses feuillées et lichens terrestres et la formation de groupements simples jusqu'aux communautés végétales primaires dans une zone déglacée entre la langue de glace moderne et le front de moraine terminal de la fin du XIXe siècle. Trois stades de succession de végétation primaire sont identifiés ; la composition spécifique des plantes vasculaires, mousses feuillées et lichens terrestres, principaux participants de la succession, et les espèces dominantes sont déterminées ; et les caractéristiques de la végétation primaire sont caractérisées. Des conclusions sur le déroulement de la succession primaire dans les conditions cryoarides se produisant dans la partie supérieure de la ceinture montagneuse-pâturage du massif du Chuya du Sud sont établies. Il a été révélé qu'au cours de 150 ans, un complexe de phytocénoses similaire aux toundras de haute montagne s'est formé dans ces conditions froides et sèches. Au total, 126 espèces de plantes vasculaires, 22 espèces de mousses feuillées et 6 espèces de lichens terrestres participent à la succession primaire au pied-avant du glacier Sophiysky.

@article{doi101134s1995425525700398,
    author = "Тимошок, Е. Е. and Timoshok, Eugeny N.",
    title = "Primary Vegetation Successions at a Foreland of the South Chuya Glacation Center (Altai Mountains)",
    year = "2025",
    journal = "Contemporary Problems of Ecology",
    abstract = "In the cryoaridic conditions of the South Chuya glaciation center (Altai Mountains) on the foreland of the Sophiysky glacier (2410–2500 m above sea level), primary vegetation successions have been studied from the settlement of the first vascular plants, leafy mosses, and ground lichens and the formation of simple groupings to primary plant communities in a deglaciated area between the modern glacier tongue to the terminal moraine rim of the mid-19th century. Three stages of primary vegetation succession are identified; the species composition of vascular plants, leafy mosses and ground lichens, the primary participants in succession, and dominant species are determined; and the features of primary vegetation are characterized. Conclusions about the course of primary succession in cryoaridic conditions occurring in the upper part of the mountain–steppe belt of the South Chuya Range are made. It has been revealed that, over 150 years, a complex of phytocoenoses similar to high-mountain tundras was formed in these cold and dry conditions. A total of 126 species of vascular plants, 22 species of leafy mosses, and 6 species of ground lichens participate in the primary succession on the foreland of the Sophiysky glacier.",
    url = "https://doi.org/10.1134/s1995425525700398",
    doi = "10.1134/s1995425525700398",
    openalex = "W4414473134",
    references = "doi101007s1328001101660, doi1010160033589480900071, doi101016016953479390150n, doi101023a1023042929441, doi101038132300a0, doi1010800028825x198010426921, doi101134s1995425520010114, doi1011910309133306pp478ra, doi10165719384246434555, doi1023071934737, doi1023071942416, doi1023072937039"
}

Les informations sur les caractéristiques existantes du site, tant les facteurs biotiques que les facteurs abiotiques, sont obligatoires pour fournir une image initiale servant de base pour développer un jardin botanique. Cette étude visait à analyser la biodiversité et les services écosystémiques dans la zone candidate pour un jardin botanique en tant que site existant, une étude de cas à l'Université de Palangka Raya (UPR) afin de préparer le développement du jardin botanique de l'université. Les travaux de terrain ont été réalisés dans 5 transects composés de 100 parcelles avec une taille de parcelle de 20x20 m2. Les résultats ont montré que le site est catégorisé comme une éco-région de forêt de tourbière de Sundaland. L'épaisseur des tourbières varie de peu profonde à moyenne et profonde, avec une superficie restante atteignant 75 % du campus total. La condition floristique est catégorisée comme une phase précoce de succession après les incendies, composée de 26 espèces végétales appartenant à 25 genres et 18 familles, avec divers usages potentiels. La faune comprenait 42 espèces, y compris les amphibiens, les reptiles, les oiseaux, les poissons et les crevettes, ainsi que les insectes. Trois plantes à haute valeur de conservation et deux espèces animales ont été documentées. Le stockage de carbone de la parcelle a atteint 14,33 tonnes/ha. Un jardin botanique comprend à la fois des écosystèmes naturels et artificiels ; il est donc important de planifier stratégiquement la disposition des collections végétales et les efforts d'enrichissement des espèces. Le jardin botanique de l'UPR assurera la conservation des plantes indigènes et endémiques de Kalimantan, à haute valeur de conservation, à fort potentiel et à valeur de savoir local ; et fournira des services écosystémiques pour le stockage du carbone, l'amélioration des services hydrologiques, l'habitat et la protection pour diverses espèces animales existantes et à venir.

@article{doi1022146jtbb12520,
    author = "Hapsari, Lia et Rizki, M. et Maulidi, Andri et Witono, J. et Astuti, I. P. et Safarinanugraha, D. et Wihermanto et Shinta, Erna et Gunawan, Yohanes Edy et Segah, Hendrik et Gumiri, S. et Binti, Furzani et Pa’ee et Nopitasari, Sri",
    title = "Biodiversité et analyse des services écosystémiques pour développer un jardin botanique universitaire : Étude de cas à l'Université de Palangka Raya, Kalimantan central",
    year = "2025",
    journal = "Journal of Tropical Biodiversity and Biotechnology",
    abstract = "Les informations sur les caractéristiques existantes du site, tant les facteurs biotiques que les facteurs abiotiques, sont obligatoires pour fournir une image initiale servant de base pour développer un jardin botanique. Cette étude visait à analyser la biodiversité et les services écosystémiques dans la zone candidate pour un jardin botanique en tant que site existant, une étude de cas à l'Université de Palangka Raya (UPR) afin de préparer le développement du jardin botanique de l'université. Les travaux de terrain ont été réalisés dans 5 transects composés de 100 parcelles avec une taille de parcelle de 20x20 m2. Les résultats ont montré que le site est catégorisé comme une éco-région de forêt de tourbière de Sundaland. L'épaisseur des tourbières varie de peu profonde à moyenne et profonde, avec une superficie restante atteignant 75 % du campus total. La condition floristique est catégorisée comme une phase précoce de succession après les incendies, composée de 26 espèces végétales appartenant à 25 genres et 18 familles, avec divers usages potentiels. La faune comprenait 42 espèces, y compris les amphibiens, les reptiles, les oiseaux, les poissons et les crevettes, ainsi que les insectes. Trois plantes à haute valeur de conservation et deux espèces animales ont été documentées. Le stockage de carbone de la parcelle a atteint 14,33 tonnes/ha. Un jardin botanique comprend à la fois des écosystèmes naturels et artificiels ; il est donc important de planifier stratégiquement la disposition des collections végétales et les efforts d'enrichissement des espèces. Le jardin botanique de l'UPR assurera la conservation des plantes indigènes et endémiques de Kalimantan, à haute valeur de conservation, à fort potentiel et à valeur de savoir local ; et fournira des services écosystémiques pour le stockage du carbone, l'amélioration des services hydrologiques, l'habitat et la protection pour diverses espèces animales existantes et à venir.",
    url = "https://doi.org/10.22146/jtbb.12520",
    doi = "10.22146/jtbb.12520",
    is_oa = "true",
    number = "1",
    pages = "jtbb12520",
    semanticscholar_id = "9685d6e671fdd02e9183b8bbd7f233b875441c70",
    volume = "10"
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UNLABELLED: Comprendre comment les communautés microbiennes du sol répondent à la succession forestière est essentiel pour prédire les fonctions écosystémiques et la stabilité biogéochimique. Nous avons étudié les communautés bactériennes et fongiques à travers trois stades successifs (précoce, intermédiaire, tardif) et trois profondeurs de sol (0–10, 10–20, 20–50 cm) dans les forêts du Pakistan et de la Chine en utilisant le séquençage d'amplificateurs à haut débit de 108 échantillons de sol. Cette étude transrégionale et résolue en profondeur visait à déterminer si les trajectoires successives microbiennes et les relations sol–microbe sont générales ou spécifiques à la région. Les résultats préliminaires ont montré que la succession forestière s'accompagnait d'une augmentation du carbone organique du sol (SOC), de l'azote total (TN) et d'une baisse du pH du sol au Pakistan. Cela indique une acidification constante et une limitation potentielle en phosphore dans les peuplements matures. Alors que le SOC et le potassium total (TK) ont présenté des pics à l'étape intermédiaire de succession en Chine, ce qui indique des dynamiques de ressources/nutriments différentes. Les stades de succession forestière intermédiaires ont montré une diversité bactérienne maximale, tandis que la succession tardive a révélé la plus grande diversité fongique (réponses spécifiques au règne). La composition de la communauté a évolué des taxons copiotrophes aux stades précoces vers des taxons oligotrophes dans les forêts matures. Le pH du sol était le facteur le plus influent façonnant la composition microbienne au Pakistan, tandis que la disponibilité en potassium était le facteur le plus influent en Chine. Ces résultats transrégionaux et résolus en profondeur révèlent à la fois les modèles successifs et les contrôles environnementaux spécifiques à la région, offrant de nouvelles perspectives sur la composition des communautés microbiennes lors du développement forestier et fournissant des orientations pour la restauration forestière et la gestion du carbone du sol dans des régions biogéographiquement diverses. SUPPLEMENTARY INFORMATION: La version en ligne contient du matériel supplémentaire disponible à 10.1007/s00248-026-02734-1.

@article{doi101007s00248026027341,
    author = "Muhammad, Waseem et Zhou, Xinyu et Yu, Xiaocheng et Yang, Kechen et Bai, Rong et Feng, Leiyun et Luo, Qiang et Zhou, Zhiqing et Wang, Cong et Li, Jingchao et Ji, Kui et Lu, Hua-Zheng",
    title = "Forest Succession Shapes Soil microbial Communities through Region-specific Edaphic Filters in Tropical and Subtropical Forests.",
    year = "2026",
    journal = "Microbial ecology",
    abstract = "UNLABELLED: Comprendre comment les communautés microbiennes du sol répondent à la succession forestière est essentiel pour prédire les fonctions écosystémiques et la stabilité biogéochimique. Nous avons étudié les communautés bactériennes et fongiques à travers trois stades successifs (précoce, intermédiaire, tardif) et trois profondeurs de sol (0–10, 10–20, 20–50 cm) dans les forêts du Pakistan et de la Chine en utilisant le séquençage d'amplificateurs à haut débit de 108 échantillons de sol. Cette étude transrégionale et résolue en profondeur visait à déterminer si les trajectoires successives microbiennes et les relations sol–microbe sont générales ou spécifiques à la région. Les résultats préliminaires ont montré que la succession forestière s'accompagnait d'une augmentation du carbone organique du sol (SOC), de l'azote total (TN) et d'une baisse du pH du sol au Pakistan. Cela indique une acidification constante et une limitation potentielle en phosphore dans les peuplements matures. Alors que le SOC et le potassium total (TK) ont présenté des pics à l'étape intermédiaire de succession en Chine, ce qui indique des dynamiques de ressources/nutriments différentes. Les stades de succession forestière intermédiaires ont montré une diversité bactérienne maximale, tandis que la succession tardive a révélé la plus grande diversité fongique (réponses spécifiques au règne). La composition de la communauté a évolué des taxons copiotrophes aux stades précoces vers des taxons oligotrophes dans les forêts matures. Le pH du sol était le facteur le plus influent façonnant la composition microbienne au Pakistan, tandis que la disponibilité en potassium était le facteur le plus influent en Chine. Ces résultats transrégionaux et résolus en profondeur révèlent à la fois les modèles successifs et les contrôles environnementaux spécifiques à la région, offrant de nouvelles perspectives sur la composition des communautés microbiennes lors du développement forestier et fournissant des orientations pour la restauration forestière et la gestion du carbone du sol dans des régions biogéographiquement diverses. SUPPLEMENTARY INFORMATION: La version en ligne contient du matériel supplémentaire disponible à 10.1007/s00248-026-02734-1.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC13053364/",
    doi = "10.1007/s00248-026-02734-1",
    pmcid = "PMC13053364",
    pmid = "41870584"
}

Les lacs peu profonds subtropicaux connaissent souvent une succession monospécifique de macrophytes aquatiques immergés, aboutissant à deux structures communautaires typiques : à couvert (associées aux stades eutrophes) et à rosette (associées aux conditions post-réhabilitation). Cependant, la compréhension actuelle de la manière dont ces deux structures communautaires influencent la colonisation végétale ultérieure reste limitée. Cette étude a utilisé une expérience en mésocosme avec différentes structures de communautés végétales (SCV) : communautés à couvert (CA), communautés à rosette (RO) et témoins sans plante (CK), combinées à deux profondeurs d'eau, pour examiner les effets des SCV sur la croissance de huit espèces de macrophytes aquatiques immergés. Sur la base du trait fonctionnel clé hauteur de la plante, ces huit espèces typiques ont été classées en deux formes de croissance : espèces longues et espèces courtes, avec un accent sur l'élucidation de modèles cohérents de réponses végétales sous les effets combinés des SCV et de la profondeur d'eau. Les résultats ont montré que : (i) Les effets des SCV sur la croissance des plantes variaient et étaient modulés par la profondeur d'eau : les CA inhibaient la colonisation végétale ultérieure par une compétition intense pour les ressources lumineuses, avec cet effet inhibiteur s'intensifiant avec l'augmentation de la profondeur d'eau ; les RO homogénéisaient l'hétérogénéité environnementale sous-marine, atténuant efficacement le stress de l'eau profonde, réduisant les différences de biomasse végétale induites par le traitement de la profondeur d'eau et affaiblissant le déséquilibre compétitif entre les espèces longues et courtes. (ii) La classification fonctionnelle basée sur la hauteur de la plante a permis de prédire efficacement les réponses des espèces : les espèces longues ont montré des performances intermédiaires entre l'eau peu profonde, ou sous le fond des CA, et le CK, mais ces avantages dépendaient du contexte, diminuant considérablement ou disparaissant dans l'eau profonde et sous le fond des RO. Notamment, Potamogeton maackianus, malgré la similarité morphologique avec les espèces longues, a affiché des modèles de réponse caractéristiques des espèces courtes, soulignant l'importance de la classification fonctionnelle écologique. Cette étude a démontré que les SCV régulaient la colonisation des espèces ultérieures par un filtrage microenvironnemental et que la hauteur de la plante pourrait servir d'indicateur fonctionnel clé pour prédire les modèles de coexistence parmi les macrophytes aquatiques immergés. Nos résultats fournissent des preuves expérimentales pour l'assemblage communautaire des macrophytes aquatiques immergés, et ces connaissances peuvent être utilisées dans la restauration des lacs naturels pour améliorer la diversité végétale.

@article{doi101016jjenvman2026129504,
    author = "Xia, Manli and Li, Wei and Zhi, Yongwei and Cao, Yu",
    title = "Optimizing submerged plant restoration in eutrophic lakes: Insights from plant community structure and water depth.",
    year = "2026",
    journal = "Journal of environmental management",
    abstract = "Les lacs peu profonds subtropicaux connaissent souvent une succession monospécifique de macrophytes aquatiques immergés, aboutissant à deux structures communautaires typiques : à couvert (associées aux stades eutrophes) et à rosette (associées aux conditions post-réhabilitation). Cependant, la compréhension actuelle de la manière dont ces deux structures communautaires influencent la colonisation végétale ultérieure reste limitée. Cette étude a utilisé une expérience en mésocosme avec différentes structures de communautés végétales (SCV) : communautés à couvert (CA), communautés à rosette (RO) et témoins sans plante (CK), combinées à deux profondeurs d'eau, pour examiner les effets des SCV sur la croissance de huit espèces de macrophytes aquatiques immergés. Sur la base du trait fonctionnel clé hauteur de la plante, ces huit espèces typiques ont été classées en deux formes de croissance : espèces longues et espèces courtes, avec un accent sur l'élucidation de modèles cohérents de réponses végétales sous les effets combinés des SCV et de la profondeur d'eau. Les résultats ont montré que : (i) Les effets des SCV sur la croissance des plantes variaient et étaient modulés par la profondeur d'eau : les CA inhibaient la colonisation végétale ultérieure par une compétition intense pour les ressources lumineuses, avec cet effet inhibiteur s'intensifiant avec l'augmentation de la profondeur d'eau ; les RO homogénéisaient l'hétérogénéité environnementale sous-marine, atténuant efficacement le stress de l'eau profonde, réduisant les différences de biomasse végétale induites par le traitement de la profondeur d'eau et affaiblissant le déséquilibre compétitif entre les espèces longues et courtes. (ii) La classification fonctionnelle basée sur la hauteur de la plante a permis de prédire efficacement les réponses des espèces : les espèces longues ont montré des performances intermédiaires entre l'eau peu profonde, ou sous le fond des CA, et le CK, mais ces avantages dépendaient du contexte, diminuant considérablement ou disparaissant dans l'eau profonde et sous le fond des RO. Notamment, Potamogeton maackianus, malgré la similarité morphologique avec les espèces longues, a affiché des modèles de réponse caractéristiques des espèces courtes, soulignant l'importance de la classification fonctionnelle écologique. Cette étude a démontré que les SCV régulaient la colonisation des espèces ultérieures par un filtrage microenvironnemental et que la hauteur de la plante pourrait servir d'indicateur fonctionnel clé pour prédire les modèles de coexistence parmi les macrophytes aquatiques immergés. Nos résultats fournissent des preuves expérimentales pour l'assemblage communautaire des macrophytes aquatiques immergés, et ces connaissances peuvent être utilisées dans la restauration des lacs naturels pour améliorer la diversité végétale.",
    url = "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41905139/",
    doi = "10.1016/j.jenvman.2026.129504",
    openalex = "W7142464057",
    pmid = "41905139",
    references = "doi101016jisci201902020, doi101016jwatres201809007, doi101016s0043135403004056, doi101023a1004327224729, doi101038nature02403, doi101046j13652427199700183x, doi1011111365274512211, doi101111j13652427200902353x, doi101126science1169640, doi101146annurevecolsys33010802150452"
}