Cocvolution

Article de journal Les papillons de la péninsule malaise Accéder à Les papillons de la péninsule malaise, par Corbet et A. S. Pendlebury H. M.. Pages i-v et 1-252. Frontispice et une planche de texte en couleur. Deux cartes, 32 figures de texte et 14 planches photographiques avec 225 figures. 1934. Publié par Kyle, Palmer & Co., Ltd., Kuala Lumpur, États fédérés de Malaisie. Prix, 4,50 $. Annals of the Entomological Society of America, Volume 27, Numéro 1, 1er mars 1934, Page 42, https://doi.org/10.1093/aesa/27.1.42 Publié : 1er mars 1934

@article{doi101093aesa27142,
    title = "Les papillons de la péninsule malaise",
    year = "1934",
    journal = "Annals of the Entomological Society of America",
    abstract = "Article de journal Les papillons de la péninsule malaise Accéder à Les papillons de la péninsule malaise, par Corbet et A. S. Pendlebury H. M.. Pages i-v et 1-252. Frontispice et une planche de texte en couleur. Deux cartes, 32 figures de texte et 14 planches photographiques avec 225 figures. 1934. Publié par Kyle, Palmer \& Co., Ltd., Kuala Lumpur, États fédérés de Malaisie. Prix, 4,50 $. Annals of the Entomological Society of America, Volume 27, Numéro 1, 1er mars 1934, Page 42, https://doi.org/10.1093/aesa/27.1.42 Publié : 1er mars 1934",
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    doi = "10.1093/aesa/27.1.42",
    openalex = "W1480120354"
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Article de journal ÉTUDES EXPÉRIMENTALES SUR LE MIMÉTISME CHEZ CERTAINS PAPILLONS D'AMÉRIQUE DU NORD : PARTIE I. LE MONARQUE, DANAUS PLEXIPPUS, ET LE FAUX-MONARQUE, LIMENITIS ARCHIPPUS ARCHIPPUS Accéder Jane Van Zandt Brower Jane Van Zandt Brower Département de zoologie Université de Yale Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Évolution, Volume 12, Numéro 1, 1er mars 1958, Pages 32–47, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1958.tb02926.x Publié : 1er mars 1958 Historique de l'article Reçu : 25 mai 1957 Publié : 1er mars 1958

@article{doi101111j155856461958tb02926x,
    author = "Brower, Jane Van Zandt",
    title = "ÉTUDES EXPÉRIMENTALES SUR LE MIMÉTISME CHEZ CERTAINS PAPILLONS D'AMÉRIQUE DU NORD : PARTIE I. LE MONARQUE, DANAUS PLEXIPPUS, ET LE FAUX-MONARQUE, LIMENITIS ARCHIPPUS ARCHIPPUS",
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    abstract = "Article de journal ÉTUDES EXPÉRIMENTALES SUR LE MIMÉTISME CHEZ CERTAINS PAPILLONS D'AMÉRIQUE DU NORD : PARTIE I. LE MONARQUE, DANAUS PLEXIPPUS, ET LE FAUX-MONARQUE, LIMENITIS ARCHIPPUS ARCHIPPUS Accéder Jane Van Zandt Brower Jane Van Zandt Brower Département de zoologie Université de Yale Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Évolution, Volume 12, Numéro 1, 1er mars 1958, Pages 32–47, https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1958.tb02926.x Publié : 1er mars 1958 Historique de l'article Reçu : 25 mai 1957 Publié : 1er mars 1958",
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    openalex = "W2316835947"
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Article de journal Les Familles des Plantes à Fleurs. Vol. I, Dicotylédones. Vol. II, Monocotylédones Accéder à Les Familles des Plantes à Fleurs. Vol. I, Dicotylédones. Vol. II, Monocotylédones. Hutchinson J.. 2e éd., 792 p., ill. Oxford University Press, Londres. (1959) 23,55 $. Charles B. Heiser, Jr. Charles B. Heiser, Jr. Département de Botanique, Université d'Indiana. Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar AIBS Bulletin, Volume 10, Numéro 3, juin 1960, Page 38, https://doi.org/10.2307/1292633 Publié : 01 juin 1960

@article{doi1023071292633,
    author = "Heiser, Charles B. et Hutchinson, J.",
    title = "Les Familles des Plantes à Fleurs",
    year = "1960",
    journal = "AIBS Bulletin",
    abstract = "Article de journal Les Familles des Plantes à Fleurs. Vol. I, Dicotylédones. Vol. II, Monocotylédones Accéder à Les Familles des Plantes à Fleurs. Vol. I, Dicotylédones. Vol. II, Monocotylédones. Hutchinson J.. 2e éd., 792 p., ill. Oxford University Press, Londres. (1959) 23,55 $. Charles B. Heiser, Jr. Charles B. Heiser, Jr. Département de Botanique, Université d'Indiana. Rechercher d'autres travaux de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar AIBS Bulletin, Volume 10, Numéro 3, juin 1960, Page 38, https://doi.org/10.2307/1292633 Publié : 01 juin 1960",
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    doi = "10.2307/1292633",
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@article{doi101111j155856461964tb01674x,
    author = "Ehrlich, Paul R. et Raven, Peter H.",
    title = "PAPILLIONS ET PLANTES : UNE ÉTUDE SUR LA COÉVOLUTION",
    year = "1964",
    journal = "Évolution",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1964.tb01674.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1964.tb01674.x",
    openalex = "W2022751627",
    references = "doi101086282070, doi101086282281, doi101093aesa27142, doi101111j155856461954tb00107x, doi101111j155856461958tb02926x, doi101126science12933611466, doi101146annureven05010160001205, doi1023071292633, openalexw2065039187, openalexw3213156838, openalexw654953698"
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@article{doi1023072406212,
    author = "Ehrlich, Paul R. et Raven, Peter H.",
    title = "Papillons et plantes : une étude sur la coévolution",
    year = "1964",
    journal = "Évolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2406212",
    doi = "10.2307/2406212",
    openalex = "W4248722194"
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@article{ehrlich1964butterflies,
    author = "Ehrlich, Paul R. et Raven, Peter H.",
    title = "Papillons et plantes : une étude sur la coévolution",
    year = "1964",
    journal = "Évolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2406212",
    doi = "10.2307/2406212",
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    pages = "586",
    volume = "18"
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@misc{erhlich1964butterflies2,
    author = "Erhlich, P. R. et Raven, P. H",
    title = "Papillons et plantes",
    year = "1964",
    howpublished = "une étude sur la coévolution : Évolution, v. 18, p. 586-608",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Erhlich, P. R., et Raven, P. H., 1964, Papillons et plantes : une étude sur la coévolution : Évolution, v. 18, p. 586-608.}"
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Les mâles du papillon reine Danaus gilippus berenice, privés des deux pinceaux extrusibles en forme de « brosse » situés à l'arrière de leur abdomen, sont capables de courtiser les femelles mais incapables de les séduire. Lors d'un courtisan normal, une sécrétion aphrodisiaque associée aux pinceaux est transférée par de minuscules particules de « poussière » cuticulaires vers les antennes des femelles. Parmi les deux substances identifiées dans la sécrétion, l'une (la cétone) agit comme le messager chimique qui induit les femelles à s'accoupler. La seule fonction connue de l'autre composé (le diol) est de servir de colle qui fixe la poussière sur la femelle. Les mâles ont été élevés dans des conditions où ils produisaient des quantités subnormales de cétone et ont montré une capacité de séduction réduite. Dans certaines circonstances expérimentales, la compétence de ces mâles a été restaurée par l'ajout de cétone synthétique.

@article{doi101126science16438841170,
    author = "Pliske, Thomas E. et Eisner, Thomas",
    title = "Pheromone sex de la reine du papillon : Biology",
    year = "1969",
    journal = "Science",
    abstract = {Les mâles du papillon reine Danaus gilippus berenice, privés des deux pinceaux extrusibles en forme de « brosse » situés à l'arrière de leur abdomen, sont capables de courtiser les femelles mais incapables de les séduire. Lors d'un courtisan normal, une sécrétion aphrodisiaque associée aux pinceaux est transférée par de minuscules particules de « poussière » cuticulaires vers les antennes des femelles. Parmi les deux substances identifiées dans la sécrétion, l'une (la cétone) agit comme le messager chimique qui induit les femelles à s'accoupler. La seule fonction connue de l'autre composé (le diol) est de servir de colle qui fixe la poussière sur la femelle. Les mâles ont été élevés dans des conditions où ils produisaient des quantités subnormales de cétone et ont montré une capacité de séduction réduite. Dans certaines circonstances expérimentales, la compétence de ces mâles a été restaurée par l'ajout de cétone synthétique.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.164.3884.1170",
    doi = "10.1126/science.164.3884.1170",
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Deux composants majeurs de la sécrétion « crayon de poils » du mâle du papillon reine (Danaus gilippus berenice) ont été identifiés. L'un, une cétone cristalline (2,3-dihydro-7-méthyl-1H-pyrrolizin-1-one), est connue d'un autre papillon danaïde. L'autre, un alcool terpénique visqueux (trans, trans-3,7-diméthyldeca-2,6-dien-1,10-diol), est nouveau ; sa structure est confirmée par une synthèse sans ambiguïté.

@article{doi101126science16438841174,
    author = "Meinwald, Jerrold et Meinwald, Yvonne C. et Mazzocchi, Paul H.",
    title = "Phéromone sexuelle du papillon reine : Chimie",
    year = "1969",
    journal = "Science",
    abstract = {Deux composants majeurs de la sécrétion « crayon de poils » du mâle du papillon reine (Danaus gilippus berenice) ont été identifiés. L'un, une cétone cristalline (2,3-dihydro-7-méthyl-1H-pyrrolizin-1-one), est connue d'un autre papillon danaïde. L'autre, un alcool terpénique visqueux (trans, trans-3,7-diméthyldeca-2,6-dien-1,10-diol), est nouveau ; sa structure est confirmée par une synthèse sans ambiguïté.},
    url = "https://doi.org/10.1126/science.164.3884.1174",
    doi = "10.1126/science.164.3884.1174",
    openalex = "W1964202816"
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Le volume 5 d'Interactions Insecte-Plante fait partie d'une série qui présente des recherches dans le domaine. Les sujets abordés incluent les changements chimiques dans les plantes résultant de l'alimentation des insectes sur leurs feuilles, les éléments dynamiques de l'utilisation et de l'évitement des plantes hôtes par les mouches tephritidies en raison de la présence d'autres mouches, les volatils floraux en biologie des insectes, les champignons endophytes en tant que médiateurs des interactions plantes-insectes, le coût de la défense chimique contre l'herbivorie, et les traits d'histoire de vie chez les insectes herbivores en relation avec la qualité de l'hôte. Le livre présente également la première revue disponible sur les conditions physicochimiques du lumen intestinal sous un angle écologique.

@book{doi101722620506,
    author = "Conseil, Recherche nationale",
    title = "Interactions Insecte-Plante",
    year = "1969",
    booktitle = "eBooks de la National Academies Press",
    abstract = "Le volume 5 d'Interactions Insecte-Plante fait partie d'une série qui présente des recherches dans le domaine. Les sujets abordés incluent les changements chimiques dans les plantes résultant de l'alimentation des insectes sur leurs feuilles, les éléments dynamiques de l'utilisation et de l'évitement des plantes hôtes par les mouches tephritidies en raison de la présence d'autres mouches, les volatils floraux en biologie des insectes, les champignons endophytes en tant que médiateurs des interactions plantes-insectes, le coût de la défense chimique contre l'herbivorie, et les traits d'histoire de vie chez les insectes herbivores en relation avec la qualité de l'hôte. Le livre présente également la première revue disponible sur les conditions physicochimiques du lumen intestinal sous un angle écologique.",
    url = "https://doi.org/10.17226/20506",
    doi = "10.17226/20506",
    openalex = "W1554164719"
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@book{chambers1970biochemical1,
    author = "Chambers, K. L",
    title = "Biochemical Coévolution",
    year = "1970",
    publisher = "Eugene, Oregon State University Press, 117 p. ; 29e Colloque de Biologie",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Chambers, K. L., 1970, Biochemical Coévolution : Eugene, Oregon State University Press, 117 p. ; 29e Colloque de Biologie.}"
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Plantes à fleurs ; origine et dispersion, Plantes à fleurs ; origine et dispersion, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023072258301,
    author = "SPORNE, KENNETH R. et Takhtajan, Armen et Jeffrey, Christopher S.",
    title = "Flowering Plants--Origin and Dispersal.",
    year = "1970",
    journal = "Journal of Ecology",
    abstract = "Plantes à fleurs ; origine et dispersion, Plantes à fleurs ; origine et dispersion, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/2258301",
    doi = "10.2307/2258301",
    openalex = "W1580556981"
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Les papillons du genre néotropical Heliconius se nourrissent de pollen. Il s'agit du premier cas connu chez les papillons d'un comportement bien connu chez d'autres insectes. Les papillons retirent des acides aminés et des protéines du pollen ; cette innovation alimentaire joue un rôle dans la biologie reproductive et des populations de ces insectes. Il est suggéré que d'autres animaux peuvent utiliser le pollen d'une manière similaire.

@article{doi101073pnas6961403,
    author = "Gilbert, Lawrence E.",
    title = "Alimentation par le pollen et biologie reproductive des papillons Heliconius",
    year = "1972",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Les papillons du genre néotropical Heliconius se nourrissent de pollen. Il s'agit du premier cas connu chez les papillons d'un comportement bien connu chez d'autres insectes. Les papillons retirent des acides aminés et des protéines du pollen ; cette innovation alimentaire joue un rôle dans la biologie reproductive et des populations de ces insectes. Il est suggéré que d'autres animaux peuvent utiliser le pollen d'une manière similaire.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.69.6.1403",
    doi = "10.1073/pnas.69.6.1403",
    openalex = "W2000584214"
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Les choux sont cultivés à Ithaca, New York, dans deux habitats expérimentaux : des peuplements purs et des rangées simples bordées de chaque côté par une végétation de prairie diverse. Les arthropodes associés à ces plantes ont été échantillonnés sur 20 dates sur une période de 3 ans. Le statut des espèces herbivores a été mesuré par leur rang en biomasse dans chaque échantillon. Les deux espèces les plus importantes, Phyllotreta cruciferae et Pieris rapae, ont maintenu un statut élevé tout au long de l'enquête, mais une autre espèce importante, Brevicoryne brassicae, a été absente pendant une saison entière. Les mangeurs de galeries ont généralement formé la guild herbivore la plus importante. Néanmoins, le spectre des guildes, qui décrit la structure fonctionnelle de la faune, a varié considérablement dans le temps et l'espace. Les distributions de taille des espèces et des individus étaient toutes deux fortement asymétriques vers les tailles plus petites. Les charges herbivores, la biomasse moyenne des herbivores par 100 g de feuillage consommable, étaient systématiquement plus élevées dans les peuplements purs. De plus, les charges herbivores variaient significativement selon la saison dans chaque habitat expérimental. À la fois le nombre d'espèces herbivores et la diversité de la charge herbivore étaient plus élevés dans l'habitat diversifié. La biomasse était plus fortement concentrée parmi les herbivores importants dans les peuplements purs ; une dominance accrue, plutôt que des différences de richesse spécifique, semblait être la cause principale de la plus faible diversité herbivore dans cet habitat. La diversité des prédateurs et des parasitoïdes était plus élevée dans les peuplements purs. La plupart des espèces abondantes trouvées sur les choux partageaient une gamme d'hôtes similaire et étroite. En conséquence, les espèces de ce groupe central d'herbivores et de parasitoïdes étaient régulièrement associées les unes aux autres. Les prédateurs et les herbivores moins abondants avaient tendance à être moins spécialisés et servaient à relier l'association chou à la communauté environnante. Les associations plante-arthropodes sont représentatives de communautés composantes, des systèmes bien intégrés qui forment des parties de communautés composantes plus grandes. Cette distinction facilite l'analyse de la structure de la communauté. Les microclimats et l'efficacité des "ennemis" ne semblaient pas différer suffisamment dans les deux habitats expérimentaux pour expliquer les différences observées dans la charge herbivore. Les résultats suggèrent une nouvelle proposition, l'hypothèse de la concentration des ressources, qui stipule que les herbivores sont plus susceptibles de trouver et de rester sur des hôtes qui poussent dans des peuplements denses ou presque purs ; que les espèces les plus spécialisées atteignent fréquemment des densités relatives plus élevées dans des environnements simples ; et que, par conséquent, la biomasse tend à se concentrer dans quelques espèces, entraînant une diminution de la diversité des herbivores dans les peuplements purs.

@article{doi1023071942161,
    author = "Root, Richard B.",
    title = "Organization of a Plant‐Arthropod Association in Simple and Diverse Habitats: The Fauna of Collards (Brassica Oleracea)",
    year = "1973",
    journal = "Ecological Monographs",
    abstract = {Les choux sont cultivés à Ithaca, New York, dans deux habitats expérimentaux : des peuplements purs et des rangées simples bordées de chaque côté par une végétation de prairie diverse. Les arthropodes associés à ces plantes ont été échantillonnés sur 20 dates sur une période de 3 ans. Le statut des espèces herbivores a été mesuré par leur rang en biomasse dans chaque échantillon. Les deux espèces les plus importantes, Phyllotreta cruciferae et Pieris rapae, ont maintenu un statut élevé tout au long de l'enquête, mais une autre espèce importante, Brevicoryne brassicae, a été absente pendant une saison entière. Les mangeurs de galeries ont généralement formé la guild herbivore la plus importante. Néanmoins, le spectre des guildes, qui décrit la structure fonctionnelle de la faune, a varié considérablement dans le temps et l'espace. Les distributions de taille des espèces et des individus étaient toutes deux fortement asymétriques vers les tailles plus petites. Les charges herbivores, la biomasse moyenne des herbivores par 100 g de feuillage consommable, étaient systématiquement plus élevées dans les peuplements purs. De plus, les charges herbivores variaient significativement selon la saison dans chaque habitat expérimental. À la fois le nombre d'espèces herbivores et la diversité de la charge herbivore étaient plus élevés dans l'habitat diversifié. La biomasse était plus fortement concentrée parmi les herbivores importants dans les peuplements purs ; une dominance accrue, plutôt que des différences de richesse spécifique, semblait être la cause principale de la plus faible diversité herbivore dans cet habitat. La diversité des prédateurs et des parasitoïdes était plus élevée dans les peuplements purs. La plupart des espèces abondantes trouvées sur les choux partageaient une gamme d'hôtes similaire et étroite. En conséquence, les espèces de ce groupe central d'herbivores et de parasitoïdes étaient régulièrement associées les unes aux autres. Les prédateurs et les herbivores moins abondants avaient tendance à être moins spécialisés et servaient à relier l'association chou à la communauté environnante. Les associations plante-arthropodes sont représentatives de communautés composantes, des systèmes bien intégrés qui forment des parties de communautés composantes plus grandes. Cette distinction facilite l'analyse de la structure de la communauté. Les microclimats et l'efficacité des "ennemis" ne semblaient pas différer suffisamment dans les deux habitats expérimentaux pour expliquer les différences observées dans la charge herbivore. Les résultats suggèrent une nouvelle proposition, l'hypothèse de la concentration des ressources, qui stipule que les herbivores sont plus susceptibles de trouver et de rester sur des hôtes qui poussent dans des peuplements denses ou presque purs ; que les espèces les plus spécialisées atteignent fréquemment des densités relatives plus élevées dans des environnements simples ; et que, par conséquent, la biomasse tend à se concentrer dans quelques espèces, entraînant une diminution de la diversité des herbivores dans les peuplements purs.},
    url = "https://doi.org/10.2307/1942161",
    doi = "10.2307/1942161",
    openalex = "W2056816058"
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Les grands herbivores doivent sélectionner leur nourriture parmi une grande variété de parties de plantes, d'espèces et de souches. Ces dernières diffèrent par leur valeur nutritive (protéines, glucides, etc.), leur dureté, leur épineuxité, etc. Des différences encore plus grandes sont observées dans les types et les concentrations de composés secondaires. Chaque plante produit son propre ensemble de composés chimiques secondaires, qui sont dans une grande mesure uniques à elle ou à son espèce. L'ingestion de concentrations naturelles de ces composés peut entraîner soit la mort, soit un grave handicap physiologique. La nature ubiquitaire de ces composés rendrait l'herbivorie impossible si les animaux n'avaient pas de mécanismes pour les dégrader et les excréter. Un animal ne présentant aucun symptôme évident d'intoxication n'est pas exempt du problème de se débarrasser des composés toxiques ; s'il mange des plantes, il a presque certainement ce problème. Les herbivores sont capables de détoxifier et d'éliminer les composés secondaires. Les limitations de ces mécanismes obligent les herbivores mammaliens à consommer une variété d'aliments végétaux à tout moment, à traiter les nouvelles aliments avec prudence, à ingérer de petites quantités lors de la première rencontre et à échantillonner la nourriture en continu. Le choix des aliments est basé sur l'apprentissage en réponse à des effets physiologiques internes défavorables, et les herbivores ne peuvent probablement pas prédire ces effets à partir de l'odeur ou du goût de nouvelles aliments. Les herbivores préfèrent manger des aliments familiers et peuvent rechercher et consommer des aliments qui corrigent des déficiences nutritionnelles spécifiques induites par la détoxification. Ils devraient préférer se nourrir d'aliments contenant de petites quantités de composés secondaires, et leur taille corporelle et leurs stratégies de recherche devraient être adaptées pour optimiser le nombre de types d'aliments disponibles par rapport à la quantité totale d'aliments qui peuvent être consommés et qui seront présents à l'avenir. La sélection naturelle peut augmenter l'efficacité de la dégradation de certains composés secondaires. Les herbivores spécialistes, comme le koala et la viscacha des montagnes, sont attendus là où une grande quantité de plusieurs aliments toxiques apparentés est présente en approvisionnement toute l'année. Cependant, peu de grands herbivores sont spécialisés sur une telle gamme restreinte d'aliments.

@article{doi101086282907,
    author = "Freeland, W. J. et Janzen, Daniel H.",
    title = "Stratégies d'herbivorie chez les mammifères : Le rôle des composés secondaires des plantes",
    year = "1974",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Les grands herbivores doivent sélectionner leur nourriture parmi une grande variété de parties de plantes, d'espèces et de souches. Ces dernières diffèrent par leur valeur nutritive (protéines, glucides, etc.), leur dureté, leur épineuxité, etc. Des différences encore plus grandes sont observées dans les types et les concentrations de composés secondaires. Chaque plante produit son propre ensemble de composés chimiques secondaires, qui sont dans une grande mesure uniques à elle ou à son espèce. L'ingestion de concentrations naturelles de ces composés peut entraîner soit la mort, soit un grave handicap physiologique. La nature ubiquitaire de ces composés rendrait l'herbivorie impossible si les animaux n'avaient pas de mécanismes pour les dégrader et les excréter. Un animal ne présentant aucun symptôme évident d'intoxication n'est pas exempt du problème de se débarrasser des composés toxiques ; s'il mange des plantes, il a presque certainement ce problème. Les herbivores sont capables de détoxifier et d'éliminer les composés secondaires. Les limitations de ces mécanismes obligent les herbivores mammaliens à consommer une variété d'aliments végétaux à tout moment, à traiter les nouvelles aliments avec prudence, à ingérer de petites quantités lors de la première rencontre et à échantillonner la nourriture en continu. Le choix des aliments est basé sur l'apprentissage en réponse à des effets physiologiques internes défavorables, et les herbivores ne peuvent probablement pas prédire ces effets à partir de l'odeur ou du goût de nouvelles aliments. Les herbivores préfèrent manger des aliments familiers et peuvent rechercher et consommer des aliments qui corrigent des déficiences nutritionnelles spécifiques induites par la détoxification. Ils devraient préférer se nourrir d'aliments contenant de petites quantités de composés secondaires, et leur taille corporelle et leurs stratégies de recherche devraient être adaptées pour optimiser le nombre de types d'aliments disponibles par rapport à la quantité totale d'aliments qui peuvent être consommés et qui seront présents à l'avenir. La sélection naturelle peut augmenter l'efficacité de la dégradation de certains composés secondaires. Les herbivores spécialistes, comme le koala et la viscacha des montagnes, sont attendus là où une grande quantité de plusieurs aliments toxiques apparentés est présente en approvisionnement toute l'année. Cependant, peu de grands herbivores sont spécialisés sur une telle gamme restreinte d'aliments.",
    url = "https://doi.org/10.1086/282907",
    doi = "10.1086/282907",
    openalex = "W2045653366",
    references = "doi101002path1700890112, doi101016s003169972506884x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1723983579, doi101146annureves02110171002341, doi101146annureves03110172001025, doi1023071942161, doi105962bhltitle7320, openalexw2106632477"
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@article{edgar1974coevolution,
    author = "EDGAR, J. A. et CULVENOR, C. C. J. et PLISKE, T. E.",
    title = "Coevolution of Danaid butterflies with their host plants",
    year = "1974",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/250646a0",
    doi = "10.1038/250646a0",
    number = "5468",
    openalex = "W1970490318",
    pages = "646-648",
    volume = "250",
    references = "doi101007bf02806171, doi101016s0040403901972120, doi101038scientificamerican026922, doi101098rspb19730015, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science1613844861, doi101126science16438841170, doi101126science16438841174, doi1023072258301, doi1023072418914"
}

@article{benson1975coevolution,
    author = "Benson, Woodruff W. et Brown, Keith S. et Gilbert, Lawrence E.",
    title = "Coevolution of Plants and Herbivores: Passion Flower Butterflies",
    year = "1975",
    journal = "Évolution",
    url = "https://doi.org/10.2307/2407076",
    doi = "10.2307/2407076",
    number = "4",
    openalex = "W4235131215",
    pages = "659",
    volume = "29"
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@article{doi101111j155856461975tb00861x,
    author = "Benson, Woodruff W. et Brown, Keith S. et Gilbert, Lawrence E.",
    title = "COÉVOLUTION DES PLANTES ET DES HERBIVORES : PAPILLONS DE FLORE DE PASSION",
    year = "1975",
    journal = "Évolution",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1975.tb00861.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1975.tb00861.x",
    openalex = "W2328526454",
    references = "brower1964birds, doi101002j199681751974tb04032x, doi101007978147570432711, doi101073pnas6961403, doi101093aesa27142, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science17640421379, doi102307jctt1w0ddx8, doi104159harvard9780674865327, doi105962p203298, doi105962p203311, doi107560710313011, edgar1974coevolution"
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@incollection{doi107560710313007,
    author = "Baker, Herbert G. et Baker, Irene",
    title = "Études sur la constitution du nectar et la coévolution pollinisateur-plante",
    year = "1975",
    booktitle = "University of Texas Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.7560/710313-007",
    doi = "10.7560/710313-007",
    openalex = "W3212579148"
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@incollection{doi107560710313011,
    author = "Gilbert, Lawrence E.",
    title = "Conséquences écologiques d'un mutualisme coévolué entre papillons et plantes",
    year = "1975",
    booktitle = "University of Texas Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.7560/710313-011",
    doi = "10.7560/710313-011",
    openalex = "W3213507062"
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Introduction générale : Coévolution biochimique entre les plantes et leurs herbivores insectes (Paul Feeny) Remarques sur les caroténoïdes dans l'évolution des signaux (Miriam Rothschild) La coévolution des plantes et des prédateurs de graines (Christopher C. Smith) Mutualisme plante-fourmi : évolution et énergie (Brian Hocking) Coévolution des orchidées et des abeilles (Calaway H. Dodson) Études sur la constitution du nectar et la coévolution pollinisateur-plante (Herbert G. Baker et Irene Baker) Le rôle de l'énergétique dans les relations entre bourdons et fleurs (Bernd Heinrich) L'écologie des systèmes de dispersion des graines coévolus (Doyle McKey) Phénologie des forêts tropicales et coévolution plante-pollinisateur (Gordon W. Frankie) Conséquences écologiques d'un mutualisme coévolué entre papillons et plantes (Lawrence E. Gilbert) Index des auteurs

@book{openalexw1592882905,
    author = "Gilbert, Lawrence E. and Raven, Peter H.",
    title = "Coevolution of animals and plants: Symposium V, First International Congress of Systematic and Evolutionary Biology, Boulder, Colorado, August, 1973",
    year = "1975",
    booktitle = "University of Texas Press eBooks",
    abstract = "Introduction générale : Coévolution biochimique entre les plantes et leurs herbivores insectes (Paul Feeny) Remarques sur les caroténoïdes dans l'évolution des signaux (Miriam Rothschild) La coévolution des plantes et des prédateurs de graines (Christopher C. Smith) Mutualisme plante-fourmi : évolution et énergie (Brian Hocking) Coévolution des orchidées et des abeilles (Calaway H. Dodson) Études sur la constitution du nectar et la coévolution pollinisateur-plante (Herbert G. Baker et Irene Baker) Le rôle de l'énergétique dans les relations entre bourdons et fleurs (Bernd Heinrich) L'écologie des systèmes de dispersion des graines coévolus (Doyle McKey) Phénologie des forêts tropicales et coévolution plante-pollinisateur (Gordon W. Frankie) Conséquences écologiques d'un mutualisme coévolué entre papillons et plantes (Lawrence E. Gilbert) Index des auteurs",
    url = "https://openalex.org/W1592882905",
    openalex = "W1592882905"
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Les populations de plantes sont sujettes aux attaques de pathogènes et d'herbivores à toutes les étapes de leur cycle de vie. La pression des ravageurs peut être dévastatrice, comme l'illustrent les épidémies d'insectes et de maladies chez les plantes cultivées et indigènes (121, 173, 178, 198, 329) et le succès du contrôle des mauvaises herbes par des instruments biotiques (6, 141, 338, 340). Les épidémies ou les épisodes d'herbivorie intensive peuvent entraîner directement l'extinction locale d'une espèce végétale, ou affaiblir les plantes et les rendre vulnérables à des pressions ultérieures. La perte de capacité photosynthétique due à une maladie ou à une défoliation partielle réduit la résistance aux stress abiotiques ou à l'infection par d'autres ravageurs, et diminue la capacité compétitive (198, 240, 270). La défense contre les pathogènes et les herbivores peut être assurée par de nombreux mécanismes différents ; elle peut dépendre de la texture et de la composition de la surface de la plante (156, 182, 196, 242), de la présence de structures anatomiques telles que des épines ou des canaux à résine (123, 199, 229), de l'absence de nutriments requis par le ravageur (140), de la présence de substances hormonales qui affectent le développement des insectes (335), d'un pH ou d'une pression osmotique inadaptés (18, 199, 229), ou de l'accumulation de produits secondaires (47, 92, 169, 298). Ces produits sont divers, allant des alcaloïdes aux terpènes ; aux phénols ; et aux glycosides stéroïdiens, cyanogènes et à l'huile de moutarde. Certains (par exemple les phénols) sont ubiquitaires chez les plantes à graines, d'autres (par exemple les alcaloïdes) se rencontrent chez plusieurs milliers d'espèces et d'autres (par exemple les glycosides cyanogènes) ne se rencontrent que chez quelques centaines d'espèces (61). Les produits secondaires peuvent être séquestrés dans les cellules ou les organites qui y sont contenus et ne sont libérés que lorsque les cellules sont rompues. Ils peuvent également être stockés et sécrétés par des glandes épidermiques qui sont sessiles ou sur des trichomes (19, 69, 156, 182, 187, 269). Typiquement, les exsudats glandulaires ne contiennent qu'une seule classe de composés, mais cette classe varie d'une espèce à l'autre. Les exsudats glandulaires sont généralement des terpènes, des alcaloïdes, des res-

@article{doi101146annureves07110176001005,
    author = "Levin, Donald A.",
    title = "The Chemical Defenses of Plants to Pathogens and Herbivores",
    year = "1976",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Populations of plants are subject to attack by pathogens and herbivores at all stages of their life cycles. Pest pressure may be devastating, as illustrated by the outbreaks of insects apd diseases in cultivated and native plants (121, 173, 178, 198, 329) and in the success of weed control by biotic instruments (6, 141, 338, 340). Epidemics or episodes of intensive herbivory may lead directly to the local extinction of a plant species, or may weaken plants and make them vulnerable to subsequent pressures. Loss of photosynthetic capacity due to disease or partial defoliation lowers resistance to abiotic stresses or to infection by other pests, and reduces competitive ability (198, 240, 270). Defense against pathogens and herbivores may be secured by many different mechanisms; it may depend on the texture and composition of the plant surface (156, 182, 196, 242), the presence of anatomical structures such as thorns or resin ducts (123, 199, 229), the absence of nutrients required by the pest (140), the presence of hormonelike substances that affect the development of insects (335), unsuitable pH or osmotic pressure (18, 199, 229), or the accumulation of secondary products (47, 92, 169, 298). These products are diverse, ranging from alkaloids to terpenes; phenolics; and steroidal, cyanogenic, and mustard oil glycosides. Some (e.g. phenolics) are ubiquitous in seed plants, others (e.g. alkaloids) occur in several thousand species and others (e.g. cyanogenic glycosides) occur in only a few hundred species (61). Secondary products may be sequestered within cells or organelles therein and released only when the cells are broken. They also may be stored in and secreted by epidermal glands which are sessile or on trichomes (19, 69, 156, 182, 187, 269). Typically, glandular exudates contain only one class of compound, but this class varies among species. The glandular exudates usually are terpens, alkaloids, res-",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.07.110176.001005",
    doi = "10.1146/annurev.es.07.110176.001005",
    openalex = "W2108368130",
    references = "doi101126science188418319, edgar1974coevolution"
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RÉSUMÉ Selon l'hypothèse de « Gause », une conséquence du processus d'évolution par sélection naturelle, est que dans une communauté à l'équilibre, chaque espèce doit occuper un niché différent. De nombreux botanistes ont trouvé cette idée improbable car ils ont ignoré les processus de régénération dans les communautés végétales. La plupart des communautés végétales sont plus longévives que les plantes individuelles qui les constituent. Lorsqu'un individu meurt, il peut ou non être remplacé par un individu de la même espèce. C'est cette étape de remplacement qui est primordiale pour l'argumentation présentée. Plusieurs mécanismes ne impliquant pas la régénération contribuent également au maintien de la richesse spécifique : les différences de forme de vie couplées à l'incapacité des plantes plus grandes d'épuiser ou de couper tous les ressources, ainsi que le développement de relations de dépendance, les différences de phénologie couplées à la tolérance de la suppression, les fluctuations de l'environnement couplées à des différences relativement faibles en matière de capacité compétitive entre de nombreuses espèces, la capacité de certaines paires d'espèces à former des mélanges stables en raison d'un équilibre entre la compétition intraspécifique et la compétition interspécifique, la production de substances plus toxiques pour l'espèce productrice que pour les autres espèces, les différences dans les minéraux nutritifs limitants primaires ou les tailles de pores dans le sol pour les plantes voisines de différentes espèces, et les différences en matière de capacités compétitives des espèces dépendant de leur âge physiologique couplées à la structure d'âge inégale de nombreuses populations. Les mécanismes listés ci-dessus n'expliquent pas vraiment la persistance indéfinie en mélange de nombreuses espèces dans les communautés les plus riches en espèces connues. En revanche, il semble qu'il existe presque des possibilités illimitées de différences entre les espèces dans leurs besoins en matière de régénération, c'est-à-dire le remplacement des plantes individuelles d'une génération par celles de la suivante. Cette idée est illustrée pour les espèces d'arbres et il est souligné que les forestiers ont été les premiers, de loin, à apprécier son importance. Les processus impliqués dans l'invasion réussie d'un trou par une espèce végétale donnée et certains caractères du trou qui peuvent être importants sont résumés dans le Tableau 2. La définition du niché d'une plante nécessite la reconnaissance de quatre composantes : le niché d'habitat, le niché de forme de vie, le niché phénologique et le niché de régénération. Un bref compte rendu est donné des schémas de régénération dans différents types de communautés végétales pour fournir un contexte aux études de différenciation dans le niché de régénération. Toutes les étapes du cycle de régénération sont potentiellement importantes et des exemples de différenciation entre espèces sont donnés pour chacune des étapes suivantes : production de graines viables (y compris les sous-étapes de floraison, de pollinisation et de fructification), dispersion, dans l'espace et le temps, germination, établissement et développement ultérieur de la plante immature. Dans la discussion conclusive, l'accent est mis sur les thèmes suivants : les types de travaux nécessaires à l'avenir pour prouver ou infirmer que la différenciation dans le niché de régénération est l'explication majeure du maintien de la richesse spécifique dans les communautés végétales, la relation de la présente thèse aux idées publiées sur l'origine de l'étalement phénologique, la pertinence de la présente thèse à la discussion sur la présence de continus dans la végétation, la coïncidence de la présente thèse et des idées émergentes des évolutionnistes sur la différenciation des taxons d'angiospermes, et l'importance des études de régénération pour la conservation.

@article{doi101111j1469185x1977tb01347x,
    author = "Grubb, P. J.",
    title = "THE MAINTENANCE OF SPECIES‐RICHNESS IN PLANT COMMUNITIES: THE IMPORTANCE OF THE REGENERATION NICHE",
    year = "1977",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "RÉSUMÉ Selon l'hypothèse de 'Gause', une conséquence du processus d'évolution par sélection naturelle est que dans une communauté à l'équilibre, chaque espèce doit occuper un niché différent. De nombreux botanistes ont trouvé cette idée improbable car ils ont ignoré les processus de régénération dans les communautés végétales. La plupart des communautés végétales sont plus longévives que les plantes individuelles qui les constituent. Lorsqu'un individu meurt, il peut ou non être remplacé par un individu de la même espèce. C'est cette étape de remplacement qui est cruciale pour l'argumentation présentée. Plusieurs mécanismes ne impliquant pas la régénération contribuent également au maintien de la richesse spécifique : les différences de forme de vie couplées à l'incapacité des plantes plus grandes d'épuiser ou de couper toutes les ressources, le développement de relations de dépendance, les différences de phénologie couplées à la tolérance de la suppression, les fluctuations de l'environnement couplées à des différences relativement faibles dans la capacité compétitive entre de nombreuses espèces, la capacité de certaines paires d'espèces à former des mélanges stables en raison d'un équilibre entre la compétition intraspécifique et la compétition interspécifique, la production de substances plus toxiques pour l'espèce productrice que pour les autres espèces, les différences dans les minéraux nutritifs limitants primaires ou les tailles de pores dans le sol pour les plantes voisines de différentes espèces, et les différences dans les capacités compétitives des espèces dépendant de leur âge physiologique couplées à la structure d'âge inégale de nombreuses populations. Les mécanismes listés ci-dessus n'expliquent pas suffisamment la persistance indéfinie en mélange de nombreuses espèces dans les communautés les plus riches en espèces connues. En revanche, il semble qu'il existe presque des possibilités illimitées de différences entre les espèces dans leurs besoins en matière de régénération, c'est-à-dire le remplacement des plantes individuelles d'une génération par celles de la suivante. Cette idée est illustrée pour les espèces d'arbres et il est souligné que les forestiers ont été les premiers, de loin, à apprécier son importance. Les processus impliqués dans l'invasion réussie d'un trou par une espèce végétale donnée et certains caractères du trou qui peuvent être importants sont résumés dans le Tableau 2. La définition du niché d'une plante nécessite la reconnaissance de quatre composantes : le niché d'habitat, le niché de forme de vie, le niché phénologique et le niché de régénération. Un bref compte rendu est donné des modèles de régénération dans différents types de communautés végétales pour fournir un contexte pour les études de différenciation dans le niché de régénération. Toutes les étapes du cycle de régénération sont potentiellement importantes et des exemples de différenciation entre espèces sont donnés pour chacune des étapes suivantes : Production de graines viables (y compris les sous-étapes de floraison, de pollinisation et de mise en graine), dispersion, dans l'espace et le temps, germination, établissement et développement ultérieur de la plante immature. Dans la discussion conclusive, l'accent est mis sur les thèmes suivants : les types de travaux nécessaires à l'avenir pour prouver ou infirmer que la différenciation dans le niché de régénération est l'explication principale du maintien de la richesse spécifique dans les communautés végétales, la relation de la thèse actuelle aux idées publiées sur l'origine de l'étalement phénologique, la pertinence de la thèse actuelle à la discussion sur la présence de continus dans la végétation, la coïncidence de la thèse actuelle et des idées émergentes des évolutionnistes sur la différenciation des taxons d'angiospermes, et l'importance des études de régénération pour la conservation.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1977.tb01347.x",
    openalex = "W2119259345",
    references = "doi101038242344a0, doi101086282070, doi101086282687, doi101093biomet3812196, doi101111j155856461969tb03489x, doi101126science1473655250, doi1015159780691206912, doi1023071218190, doi1023071929601, doi1023072256497, doi1023072258550, doi1023072989767, openalexw1532540194"
}

@article{doi1023072484318,
    author = "Bernhardt, Peter et Gilbert, Lawrence E. et Raven, Peter H.",
    title = "Coevolution of Animals and Plants.",
    year = "1977",
    journal = "Bulletin of the Torrey Botanical Club",
    url = "https://doi.org/10.2307/2484318",
    doi = "10.2307/2484318",
    openalex = "W2797472291"
}

Le terme « coévolution » peut être utilement défini comme un changement évolutif d'un trait chez les individus d'une population en réponse à un trait des individus d'une seconde population, suivi d'une réponse évolutive de la seconde population au changement de la première. La « coévolution diffuse » se produit lorsque l'une ou les deux populations mentionnées dans la définition ci-dessus sont représentées par un ensemble de populations qui exercent une pression de sélection en tant que groupe. L'article classique d'Ehrlich et Raven (1964) sur les interactions entre papillons et plantes fut le premier essai explicitement centré sur la coévolution. Cependant, ils n'ont pas défini la coévolution, et les papillons n'ont ni été énoncés ni sous-entendus comme étant les seules populations ou l'ensemble d'herbivores ayant généré les traits végétaux dont ils discutent comme causes des distributions des papillons sur les plantes hôtes. Je pense que l'absence d'une définition originale de la « coévolution », l'inapplicabilité de l'exemple choisi par les promoteurs originaux de l'usage de ce terme, et le caractère évident et banal des événements de coévolution dans l'histoire des interactions plantes-animaux ont conduit à des usages trompeurs du terme dans la pensée et les études évolutives contemporaines. Ici, je souhaite appeler à une attention plus minutieuse à l'usage du mot et du concept de « coévolution ». Il existe actuellement trois abus manifestes : 1) Il est couramment supposé qu'une paire d'espèces dont les traits sont mutuellement congruents a coévolué. Par exemple, il est tout à fait possible que les traits fruitiers d'une graine dispersée par un mammifère aient coévolué avec les besoins alimentaires du mammifère. Cependant, il est également tout à fait possible que le mammifère soit entré dans l'habitat de la plante avec ses préférences alimentaires déjà établies et ait simplement commencé à se nourrir des fruits de l'espèce qui les satisfaisaient. Lorsque cela se produit, ce sont les espèces qui sont les plus exactement congruentes qui apparaîtront les plus coévolues, mais qui sont probablement les moins coévolues. Les graines dures de ces arbres de terres arides dispersées par passage dans le tube digestif d'un mammifère contemporain sont-elles coévoluées avec le mammifère ? Pas nécessairement. 2) De manière similaire, un herbivore parasite d'une plante est souvent considéré comme coévolué avec le calendrier de défense, la chimie, la morphologie, etc. Cependant, lorsqu'un parasite arrive dans un nouvel habitat, il se nourrira de celles des espèces dont les traits de défense il peut contourner grâce aux capacités qu'il possède à ce moment-là. Un tel parasite ne peut pas être distingué de celui qui a évolué la capacité de contourner une défense tout en étant en contact trophique avec son hôte. 3) Lorsque d'autres preuves rendent clair qu'un parasite a évolué des traits pour contourner les défenses de son hôte, il est fréquemment automatiquement supposé qu'une coévolution a eu lieu. Cependant, il n'est pas nécessaire de conclure que le trait de défense contourné a été produit évolutivement en réponse au parasite en question. En fait, il est probable que de nombreux traits de défense des plantes aient été produits par coévolution avec des animaux plus présents dans leur habitat ou ne parasitant plus ceux-ci s'ils sont présents. Les systèmes parasite-hôte fortement coévolus procèdent probablement aussi souvent à une indépendance écologique des participants qu'à un parasitisme relativement bénin. En résumé, je plaide pour le maintien de l'utilité du terme « coévolution » en le retirant de la synonymie d'usage avec « interaction », « symbiose », « mutualisme » et « interaction plante-animal ». Une abeille n'est pas nécessairement coévoluée avec la fleur qu'elle pollinise, une chenille n'est pas nécessairement

@article{doi101111j155856461980tb04849x,
    author = "Janzen, Daniel H.",
    title = "QUAND PARLE-T-IL DE COÉVOLUTION ?",
    year = "1980",
    journal = "Évolution",
    abstract = "Le terme 'coévolution' peut être utilement défini comme un changement évolutif d'un trait chez les individus d'une population en réponse à un trait des individus d'une seconde population, suivi d'une réponse évolutive de la seconde population au changement de la première. La 'coévolution diffuse' se produit lorsque l'une ou les deux populations mentionnées ci-dessus sont représentées par un ensemble de populations qui exercent une pression de sélection en tant que groupe. L'article classique d'Ehrlich et Raven (1964) sur les interactions entre papillons et plantes fut le premier essai explicitement centré sur la coévolution. Cependant, ils ne définirent pas la coévolution, et les papillons n'étaient ni déclarés ni sous-entendus comme étant les seules populations ou l'ensemble d'herbivores ayant généré les traits des plantes dont ils discutent comme cause de la distribution des papillons sur les plantes hôtes. Je pense que l'absence de définition originale de la 'coévolution', l'inapplicabilité de l'exemple choisi par les premiers défenseurs de l'usage de ce terme, et le caractère évident et banal des événements de coévolution dans l'histoire des interactions plantes-animaux ont conduit à des usages trompeurs du terme dans la pensée et les études évolutives contemporaines. Ici, je souhaite appeler à une attention plus minutieuse à l'usage du mot et du concept de 'coévolution'. Il existe actuellement trois abus manifestes : 1) Il est couramment supposé qu'une paire d'espèces dont les traits sont mutuellement congruents a coévolué. Par exemple, il est tout à fait possible que les traits fruitiers d'une graine dispersée par un mammifère aient coévolué avec les besoins alimentaires du mammifère. Cependant, il est également tout à fait possible que le mammifère soit entré dans l'habitat de la plante avec ses préférences alimentaires déjà établies et ait simplement commencé à se nourrir des fruits de l'espèce qui les satisfaisait. Lorsque cela se produit, ce sont les espèces qui sont le plus exactement congruentes qui apparaîtront les plus coévolues, mais qui sont probablement les moins coévolues. Les graines dures de ces arbres de terres arides dispersées par passage dans le tube digestif d'un mammifère contemporain sont-elles coévoluées avec le mammifère ? Pas nécessairement. 2) De manière similaire, un herbivore parasite d'une plante est souvent considéré comme coévolué avec le calendrier de défense, la chimie, la morphologie, etc. Cependant, lorsqu'un parasite arrive dans un nouvel habitat, il se nourrira de celles des espèces dont les traits de défense il peut contourner grâce aux capacités qu'il possède à ce moment-là. Un tel parasite ne peut pas être distingué de celui qui a évolué la capacité de contourner une défense tout en étant en contact trophique avec son hôte. 3) Lorsque d'autres preuves rendent clair qu'un parasite a évolué des traits pour contourner les défenses de son hôte, il est fréquemment automatiquement supposé qu'une coévolution a eu lieu. Cependant, il n'est pas nécessaire de conclure que le trait de défense contourné a été produit évolutivement en réponse au parasite en question. En fait, il est probable que de nombreux traits de défense des plantes aient été produits par coévolution avec des animaux plus présents dans leur habitat ou ne parasitant plus ceux-ci s'ils sont présents. Les systèmes parasite-hôte fortement coévolus aboutissent probablement aussi souvent à une indépendance écologique des participants qu'à un parasitisme relativement bénin. En résumé, je plaide pour le maintien de l'utilité du terme 'coévolution' en le retirant de la synonymie d'usage avec 'interaction', 'symbiose', 'mutualisme' et 'interaction plante-animal'. Une abeille n'est pas nécessairement coévoluée avec la fleur qu'elle pollinise, une chenille n'est pas nécessairement",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1980.tb04849.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1980.tb04849.x",
    openalex = "W2039913431",
    references = "doi101111j155856461964tb01674x"
}

Notre compréhension de la nutrition minérale des plantes provient en grande partie d'études sur les cultures herbacées qui ont évolué à partir d'espèces rudérales caractéristiques de sites perturbés riches en nutriments (52). Avec le développement de l'agriculture, ces espèces ancestrales ont été sélectionnées pour une plus grande productivité et une reproduction accrue à des niveaux de nutriments élevés, où il y avait peu d'avantage sélectif à utiliser efficacement les nutriments. Cet article passe brièvement en revue la nature des réponses des cultures au stress nutritionnel et compare ces réponses à celles d'espèces qui ont évolué dans des conditions plus naturelles, en particulier dans des environnements à faible teneur en nutriments. Je m'appuie principalement sur des études nutritionnelles de l'azote et du phosphore, car ces éléments limitent le plus souvent la croissance des plantes et parce que leur rôle dans le contrôle de la croissance et du métabolisme des plantes est le mieux compris (51). D'autres aspects plus spécifiques de l'écologie nutritionnelle des plantes non abordés ici incluent la nutrition ammonium/nitrate (79), la nutrition calcicole/calcifuge (51,88), la tolérance aux métaux lourds (4), et l'écologie des serpentinites (133).

@article{doi101146annureves11110180001313,
    author = "Chapin, F. Stuart",
    title = "The Mineral Nutrition of Wild Plants",
    year = "1980",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Our understanding of plant mineral nutrition comes largely from studies of herbaceous crops that evolved from ruderal species characteristic of nutri­ ent-rich disturbed sites (52). With the development of agriculture, these ancestral species were bred for greater productivity and reproductive output at high nutrient levels where there was little selective advantage in efficient nutrient use. This paper briefly reviews the nature of crop responses to nutrient stress and compares these responses to those of species that have evolved under more natural conditions, particularly in low-nutrient envi­ ronments. I draw primarily upon nutritional studies of nitrogen and phos­ phorus because these elements most commonly limit plant growth and because their role in controlling plant growth and metabolism is most clearly understood (51). Other more specific aspects of nutritional plant ecology not discussed here include ammonium/nitrate nutrition (79), cal­ cicole/calcifuge nutrition (51,88), heavy metal tolerance (4), and serpentine ecology (133).",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.11.110180.001313",
    doi = "10.1146/annurev.es.11.110180.001313",
    openalex = "W2114773779",
    references = "doi101086283244, openalexw2169917233"
}

L'idée que les niches des compétiteurs dans les communautés écologiques sont façonnées par une coévolution mutuelle, ce qui permet ainsi à de nombreuses espèces de coexister, est une opinion couramment admise. Deux espèces doivent vivre ensemble de manière constante pour coévoluer ; ainsi, depuis que les prédateurs (ou les parasites) dépendent de leurs proies, ils co-occurrence nécessairement avec elles et devraient donc coévoluer. En revanche, les espèces en compétition, qui ne dépendent pas les unes des autres, n'ont pas besoin de co-occurrence constante ou de coévolution. L'augmentation de la diversité, en réduisant la constance de la co-occurrence, réduit également la probabilité de coévolution. Pour démontrer la divergence coévolutrice des compétiteurs, il faut montrer : 1) que la divergence a réellement eu lieu : cela a été fait pour certaines séquences fossiles, mais pas pour aucun compétiteur actuel ; 2) que la compétition, plutôt qu'un autre mécanisme, en est responsable ; et 3) qu'elle a une base génétique. Pour démontrer 2) et 3) pour les populations naturelles, des expériences de terrain appropriées sont nécessaires, qui sont suggérées dans le papier. Cela a été fait, en partie, dans un seul cas. Ainsi, l'idée d'un façonnage coévolutif des niches des compétiteurs a peu de soutien actuellement. La théorie et les preuves suggèrent qu'il est probable uniquement dans les communautés à faible diversité.

@article{doi1023073544421,
    author = "Connell, Joseph H.",
    title = "Diversité et la coévolution des compétiteurs, ou le fantôme de la compétition passée",
    year = "1980",
    journal = "Oikos",
    abstract = "L'idée que les niches des compétiteurs dans les communautés écologiques sont façonnées par une coévolution mutuelle, ce qui permet ainsi à de nombreuses espèces de coexister, est une opinion couramment admise. Deux espèces doivent vivre ensemble de manière constante pour coévoluer ; ainsi, depuis que les prédateurs (ou les parasites) dépendent de leurs proies, ils co-occurrence nécessairement avec elles et devraient donc coévoluer. En revanche, les espèces en compétition, qui ne dépendent pas les unes des autres, n'ont pas besoin de co-occurrence constante ou de coévolution. L'augmentation de la diversité, en réduisant la constance de la co-occurrence, réduit également la probabilité de coévolution. Pour démontrer la divergence coévolutrice des compétiteurs, il faut montrer : 1) que la divergence a réellement eu lieu : cela a été fait pour certaines séquences fossiles, mais pas pour aucun compétiteur actuel ; 2) que la compétition, plutôt qu'un autre mécanisme, en est responsable ; et 3) qu'elle a une base génétique. Pour démontrer 2) et 3) pour les populations naturelles, des expériences de terrain appropriées sont nécessaires, qui sont suggérées dans le papier. Cela a été fait, en partie, dans un seul cas. Ainsi, l'idée d'un façonnage coévolutif des niches des compétiteurs a peu de soutien actuellement. La théorie et les preuves suggèrent qu'il est probable uniquement dans les communautés à faible diversité.",
    url = "https://doi.org/10.2307/3544421",
    doi = "10.2307/3544421",
    openalex = "W2125389285",
    references = "doi101016b9780127114422x50016, doi101038269471a0, doi101071zo9540009, doi101086282070, doi101111j109583121972tb00690x, doi101126science19943351302, doi101146annureves06110175002011, doi1023071942161, doi1023072479933, doi105962bhltitle56234, openalexw1500291103, openalexw2962874606"
}

Des expériences montrent que les papillons Heliconius pondent moins souvent sur les plantes hôtes qui possèdent des œufs ou des structures végétales ressemblant à des œufs. Ces mimétiques d'œufs constituent un exemple sans équivoque d'un trait végétal évolué en réponse à un groupe d'herbivores insectes restreint aux hôtes.

@article{doi101126science2124493467,
    author = "Williams, Kathy S. et Gilbert, Lawrence E.",
    title = "Insectes comme agents sélectifs sur la morphologie végétative des plantes : le mimétisme d'œufs réduit la ponte des papillons",
    year = "1981",
    journal = "Science",
    abstract = "Des expériences montrent que les papillons Heliconius pondent moins souvent sur les plantes hôtes qui possèdent des œufs ou des structures végétales ressemblant à des œufs. Ces mimétiques d'œufs constituent un exemple sans équivoque d'un trait végétal évolué en réponse à un groupe d'herbivores insectes restreint aux hôtes.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.212.4493.467",
    doi = "10.1126/science.212.4493.467",
    openalex = "W1990372591",
    references = "benson1975coevolution"
}

La coévolution des parasites et de leurs hôtes présente à la fois un intérêt biologique général et des implications pratiques dans les domaines agricole, vétérinaire et médical. Étonnamment, la plupart des textes médicaux, parasitologiques et écologiques rejettent ce sujet avec des affirmations non étayées selon lesquelles les espèces de parasites « réussies » évoluent pour devenir inoffensives pour leurs hôtes. Récemment, cependant, plusieurs personnes ont exploré les aspects théoriques de la génétique des populations des associations hôte-parasite ; ces auteurs concluent que de telles associations peuvent être responsables d'une grande partie de la diversité génétique observée au sein des populations naturelles, des polymorphismes des groupes sanguins (Haldane, 1949) aux polymorphismes de protéines en général (Clarke, 1975, 1976) et aux systèmes d'histocompatibilité (Duncan, Wakeland & Klein, 1980). Il a également été avancé que les pathogènes pourraient constituer la force sélective responsable de l'évolution et du maintien de la reproduction sexuée chez les espèces animales et végétales (Jaenike, 1978 ; Hamilton, 1980, 1981, 1982 ; Bremermann, 1980).

@article{doi101017s0031182000055360,
    author = "Anderson, Roy M. and May, Robert M.",
    title = "Coevolution of hosts and parasites",
    year = "1982",
    journal = "Parasitology",
    abstract = "The coevolution of parasites and their hosts has both general biological interest and practical implications in agricultural, veterinary and medical fields. Surprisingly, most medical, parasitological and ecological texts dismiss the subject with unsupported statements to the effect that ‘successful’ parasite species evolve to be harmless to their hosts. Recently, however, several people have explored theoretical aspects of the population genetics of host-parasite associations; these authors conclude that such associations may be responsible for much of the genetic diversity found within natural populations, from blood group polymorphisms (Haldane, 1949) to protein polymorphisms in general (Clarke, 1975, 1976) and to histocompatibility systems (Duncan, Wakeland \& Klein, 1980). It has also been argued that pathogens may constitute the selective force responsible for the evolution and maintenance of sexual reproduction in animal and plant species (Jaenike, 1978; Hamilton, 1980, 1981, 1982; Bremermann, 1980).",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0031182000055360",
    doi = "10.1017/s0031182000055360",
    openalex = "W2035349831",
    references = "doi1010079783642686351, doi101017s0031182000055360, doi101038246015a0, doi101038280361a0, doi101038280455a0, doi101098rspa19270118, doi101098rstb19810005, doi101126science7123238, doi1023073544435, openalexw2000871817"
}

L'hypothèse commune selon laquelle la coexistence des espèces dans la nature peut généralement être expliquée par des processus de sélection naturelle favorisant la différenciation de niche ne dispose pas d'un soutien empirique solide pour les plantes. La signification de la capacité compétitive a traditionnellement été intégrée dans une vision eltonienne de la niche. En particulier, en ce qui concerne les plantes, une véritable distinction entre les significations de niche et de capacité compétitive est établie sur la prémisse que pour qu'une espèce exclue compétitivement une autre, deux conditions distinctes doivent être satisfaites : (1) Il doit y avoir un degré suffisant de chevauchement dans les exigences de niche des deux espèces ; et (2) une espèce doit être suffisamment supérieure dans la réduction de la disponibilité des ressources pour l'autre. Suivant ces considérations, une théorie évolutive de la coexistence est proposée impliquant deux mécanismes alternatifs basés sur une interprétation plus large du fonctionnement de la sélection naturelle dans les systèmes de compétition que ce qui était précédemment reconnu. L'exclusion compétitive peut être évitée soit si la sélection naturelle aboutit à une différenciation de niche (sélection pour la capacité de combinaison écologique), soit si une sélection réciproque maintient un équilibre des capacités compétitives (sélection pour la capacité de combinaison compétitive). La capacité de combinaison compétitive, bien que précédemment négligée, a une large applicabilité aux plantes pour lesquelles la coexistence est fréquemment expliquée de manière incomplète par la capacité de combinaison écologique. L'argument principal est le suivant : Toutes les attributs biologiques d'une espèce joueront un rôle dans la détermination de ses exigences de niche d'une part, et de sa capacité compétitive relative pour ces exigences d'autre part. Étant donné l'hypothèse que les exigences de niche chevauchent généralement de manière large chez les plantes, je propose que la coexistence est permise car il existe de nombreuses permutations et combinaisons possibles d'attributs biologiques chez les plantes qui sont approximativement équivalentes en termes de pouvoir compétitif global qu'elles confèrent. Dans la sélection pour la capacité de combinaison compétitive, ces complexes d'attributs sont continuellement ajustés dans un processus continu de coévolution dans lequel les quartiers locaux sont constamment engagés dans un processus d'affinement qui modifie la manière dont les membres réagissent les uns aux autres. Par conséquent, la sélection naturelle maintient ultimement un équilibre des capacités compétitives relatives globales entre deux espèces pour des ressources essentiellement contestées identiques. Je discute de la pertinence de ce mécanisme et de sa relation avec d'autres théories et concepts associés à la coexistence dans des contextes de compétition. Il est proposé que, dans la nature, la sélection pour la capacité de combinaison écologique et la sélection pour la capacité de combinaison compétitive opèrent en concert, et cela fournit une réconciliation de la contradiction théorique entre l'adaptation convergente à un habitat commun et l'adaptation divergente à d'autres membres de la communauté.

@article{doi101086284167,
    author = "Aarssen, Lonnie W.",
    title = "Capacité de combinaison écologique et capacité de combinaison compétitive chez les plantes : Vers une théorie évolutive générale de la coexistence dans les systèmes de compétition",
    year = "1983",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "L'hypothèse courante selon laquelle la coexistence des espèces dans la nature peut être généralement expliquée par des processus de sélection naturelle pour la différenciation de la niche ne dispose pas d'un soutien empirique fort pour les plantes. La signification de la capacité compétitive a traditionnellement été intégrée dans une vision eltonienne de la niche. En particulier, en ce qui concerne les plantes, une véritable distinction entre les significations de la niche et de la capacité compétitive est établie sur la prémisse que pour qu'une espèce exclue compétitivement une autre, deux conditions distinctes doivent être satisfaites : (1) Il doit y avoir un degré suffisant de chevauchement dans les exigences de la niche des deux espèces ; et (2) une espèce doit être suffisamment supérieure à réduire la disponibilité des ressources pour l'autre. Suivant ces considérations, une théorie évolutive de la coexistence est proposée impliquant deux mécanismes alternatifs basés sur une interprétation plus large de l'opération de la sélection naturelle dans les systèmes de compétition que ce qui était précédemment reconnu. L'exclusion compétitive peut être évitée soit si la sélection naturelle résulte en une différenciation de la niche (sélection pour la capacité de combinaison écologique), soit si la sélection réciproque maintient un équilibre des capacités compétitives (sélection pour la capacité de combinaison compétitive). La capacité de combinaison compétitive, bien que précédemment négligée, a une large applicabilité aux plantes pour lesquelles la coexistence est fréquemment expliquée de manière incomplète par la capacité de combinaison écologique. L'argument principal est le suivant : Toutes les attributs biologiques d'une espèce joueront un rôle dans la détermination de ses exigences de la niche d'une part, et de sa capacité compétitive relative pour ces exigences d'autre part. Étant donné l'hypothèse que les exigences de la niche chevauchent généralement de manière large chez les plantes, je propose que la coexistence est permise parce qu'il existe de nombreuses permutations et combinaisons possibles d'attributs biologiques chez les plantes qui sont approximativement équivalentes en termes de pouvoir compétitif global qu'elles confèrent. Dans la sélection pour la capacité de combinaison compétitive, ces complexes d'attributs sont continuellement ajustés dans un processus continu de coévolution dans lequel les quartiers locaux sont constamment engagés dans un processus d'affinement qui modifie la manière dont les membres réagissent les uns aux autres. Par conséquent, la sélection naturelle maintient ultimement un équilibre des capacités compétitives relatives globales entre deux espèces pour des ressources essentiellement contestées identiques. Je discute de la pertinence de ce mécanisme et de sa relation avec d'autres théories et concepts associés à la coexistence dans des contextes de compétition. Il est proposé que, dans la nature, la sélection pour la capacité de combinaison écologique et la sélection pour la capacité de combinaison compétitive opèrent en concert, et cela fournit une réconciliation de la contradiction dans la théorie entre l'adaptation convergente à un habitat commun et l'adaptation divergente à d'autres membres de la communauté.",
    url = "https://doi.org/10.1086/284167",
    doi = "10.1086/284167",
    openalex = "W2017229876",
    references = "doi101038242344a0, doi101086282505, doi101086283366, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science185414527, doi102307jctvx5wbbh, doi105962bhltitle4489, openalexw1532540194, openalexw1592882905, openalexw2077454220"
}

Des études récentes suggèrent que les parasites (interprétés de manière large pour inclure les virus, les bactéries, les protozoaires et les helminthes) peuvent influencer la magnitude numérique ou la distribution géographique de leurs populations hôtes ; la plupart de ces études se concentrent sur la biologie des populations et l'épidémiologie de l'association hôte-parasite, sans tenir compte explicitement de la génétique. D'autres chercheurs ont exploré la possibilité que la coévolution des hôtes et des parasites puisse être responsable d'une grande partie de la diversité génétique trouvée dans les populations naturelles, et pourrait même être la raison principale de la reproduction sexuée ; de telles études génétiques prennent rarement en compte avec précision les effets dépendants de la densité et de la fréquence associés à la transmission et au maintien des infections parasitaires. Cet article vise à combiner l'épidémiologie et la génétique, en examinant la manière dont les études antérieures s'intègrent dans un schéma plus large et en proposant de nouvelles idées sur la coévolution hôte-parasite. Une conclusion centrale est que les parasites « réussis » n'ont pas nécessairement besoin d'évoluer pour devenir inoffensifs : à la fois la théorie et certaines preuves empiriques (particulièrement du système myxoma-lièvre) indiquent que de nombreux chemins de coévolution sont possibles, selon la relation entre la virulence et la transmissibilité du parasite ou du pathogène.

@article{doi101098rspb19830075,
    author = "May, Robert M. and Anderson, Roy M.",
    title = "Epidemiology and genetics in the coevolution of parasites and hosts",
    year = "1983",
    journal = "Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences",
    abstract = "Recent studies suggest that parasites (interpreted broadly to include viruses, bacteria, protozoans and helminths) may influence the numerical magnitude or geographical distribution of their host populations; most of such studies focus on the population biology and epidemiology of the host-parasite association, taking no explicit account of the genetics. Other researchers have explored the possibility that the coevolution of hosts and parasites may be responsible for much of the genetic diversity found in natural populations, and may even be the main reason for sexual reproduction; such genetic studies rarely take accurate account of the density- and frequency-dependent effects associated with the transmission and maintenance of parasitic infections. This paper aims to combine epidemiology and genetics, reviewing the way in which earlier studies fit into a wider scheme and offering some new ideas about host-parasite coevolution. One central conclusion is that 'successful' parasites need not necessarily evolve to be harmless: both theory and some empirical evidence (particularly from the myxoma-rabbit system) indicate that many coevolutionary paths are possible, depending on the relation between virulence and transmissibility of the parasite or pathogen.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.1983.0075",
    doi = "10.1098/rspb.1983.0075",
    openalex = "W2045372198",
    references = "doi101017s0031182000055360, doi101038261459a0, doi101038280361a0, doi101038280455a0, doi101098rspa19270118, doi101098rstb19810005, doi101126science7123238, doi1011370129022, doi1023073544435, doi1023073933, doi104171owr200540, openalexw1550375751, openalexw2000871817"
}

S. J. McNaughton, Croissance compensatoire des plantes en réponse à l'herbivorie, Oikos, Vol. 40, No. 3, Interactions herbivore-plante aux latitudes nord. Actes d'un symposium tenu du 14 au 18 septembre 1981, à Kevo, Finlande (mai 1983), pp. 329-336

@article{doi1023073544305,
    author = "McNaughton, S. J.",
    title = "Croissance compensatoire des plantes en réponse à l'herbivorie",
    year = "1983",
    journal = "Oikos",
    abstract = "S. J. McNaughton, Croissance compensatoire des plantes en réponse à l'herbivorie, Oikos, Vol. 40, No. 3, Interactions herbivore-plante aux latitudes nord. Actes d'un symposium tenu du 14 au 18 septembre 1981, à Kevo, Finlande (mai 1983), pp. 329-336",
    url = "https://doi.org/10.2307/3544305",
    doi = "10.2307/3544305",
    openalex = "W2018440025",
    references = "doi101086283426, doi101111j155856461980tb04849x, doi101126science1744011825"
}

John P. Bryant, F. Stuart Chapin, III, David R. Klein, Équilibre carbone/nutriments des plantes boréales en relation avec l'herbivorie des vertébrés, Oikos, Vol. 40, No. 3, Interactions herbivore-plante aux latitudes nordiques. Actes d'un colloque tenu du 14 au 18 septembre 1981, à Kevo, Finlande (mai 1983), pp. 357-368

@article{doi1023073544308,
    author = "Bryant, John P. et Chapin, F. Stuart et Klein, David R.",
    title = "Équilibre carbone/nutriments des plantes boréales en relation avec l'herbivorie des vertébrés",
    year = "1983",
    journal = "Oikos",
    abstract = "John P. Bryant, F. Stuart Chapin, III, David R. Klein, Équilibre carbone/nutriments des plantes boréales en relation avec l'herbivorie des vertébrés, Oikos, Vol. 40, No. 3, Interactions herbivore-plante aux latitudes nordiques. Actes d'un colloque tenu du 14 au 18 septembre 1981, à Kevo, Finlande (mai 1983), pp. 357-368",
    url = "https://doi.org/10.2307/3544308",
    doi = "10.2307/3544308",
    openalex = "W2063165095",
    references = "doi101086283426, doi1023072259845"
}

@article{doi101007bf00379780,
    author = "Wiklund, Christer",
    title = "Modèles de ponte chez les papillons en relation avec leur phénologie et la visibilité visuelle et l'abondance de leurs plantes hôtes",
    year = "1984",
    journal = "Oecologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00379780",
    doi = "10.1007/bf00379780",
    openalex = "W2052256242"
}

Les interactions évolutives entre les plantes et les insectes phytophages sont asymétriques : la diversité biochimique et structurale des angiospermes offre une profusion de niches pour la radiation évolutive (cladogenèse) des insectes, tandis que les insectes n'affectent pas l'évolution des plantes ou, au mieux, peuvent provoquer des changements anagéniques chez les plantes. (Les figuiers et les guêpes à figuiers peuvent représenter un cas rare de coévolution sensu stricto.) Ainsi, l'évolution des insectes suit généralement celle des plantes (« évolution séquentielle »). Parce que la pression de sélection exercée par les attaques d'insectes est faible ou absente, ils ne pouvaient pas être la cause principale de l'apparition et du maintien des allélochimiques chez les plantes. Néanmoins, ces composés déterminent fondamentalement le « profil biochimique » des plantes par lequel les insectes distinguent les plantes hôtes des plantes non hôtes. La compétition interspécifique est largement absente parmi les insectes phytophages dans les communautés naturelles, de sorte qu'elle n'a pas pu provoquer la sténophagie (c'est-à-dire la partition des ressources) chez les insectes. La dominance des formes sténophages peut être expliquée par (1) les avantages adaptatifs de la sténophagie par rapport à l'euryphagie ; (2) l'émergence de nouvelles formes sténophages à partir de formes similaires ou euryphages ; et (3) l'irréversibilité évolutive du développement de la sténophagie. Ainsi, les plantes ne sont pas devenues résistantes aux insectes, mais les espèces d'insectes sont devenues, ou ont toujours été depuis leur émergence, particulières dans leur sélection alimentaire. La sélection de la plante hôte est principalement un processus comportemental régi principalement par la chémoréception. Par conséquent, l'émergence de relations spécifiques insecte/plante hôte résulte le plus probablement de changements évolutifs dans les systèmes chémosensoriels des insectes. L'adaptation à la qualité nutritionnelle de la nouvelle plante hôte est un processus secondaire.

@article{doi101086284302,
    author = "Jermy, T.",
    title = "Évolution des relations Insecte/Plante Hôte",
    year = "1984",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = {Les interactions évolutives entre les plantes et les insectes phytophages sont asymétriques : la diversité biochimique et structurale des angiospermes offre une profusion de niches pour la radiation évolutive (cladogenèse) des insectes, tandis que les insectes n'affectent pas l'évolution des plantes ou, au mieux, peuvent provoquer des changements anagéniques chez les plantes. (Les figuiers et les guêpes à figuiers peuvent représenter un cas rare de coévolution sensu stricto.) Ainsi, l'évolution des insectes suit généralement celle des plantes (« évolution séquentielle »). Parce que la pression de sélection exercée par les attaques d'insectes est faible ou absente, ils ne pouvaient pas être la cause principale de l'apparition et du maintien des allélochimiques chez les plantes. Néanmoins, ces composés déterminent fondamentalement le « profil biochimique » des plantes par lequel les insectes distinguent les plantes hôtes des plantes non hôtes. La compétition interspécifique est largement absente parmi les insectes phytophages dans les communautés naturelles, de sorte qu'elle n'a pas pu provoquer la sténophagie (c'est-à-dire la partition des ressources) chez les insectes. La dominance des formes sténophages peut être expliquée par (1) les avantages adaptatifs de la sténophagie par rapport à l'euryphagie ; (2) l'émergence de nouvelles formes sténophages à partir de formes similaires ou euryphages ; et (3) l'irréversibilité évolutive du développement de la sténophagie. Ainsi, les plantes ne sont pas devenues résistantes aux insectes, mais les espèces d'insectes sont devenues, ou ont toujours été depuis leur émergence, particulières dans leur sélection alimentaire. La sélection de la plante hôte est principalement un processus comportemental régi principalement par la chémoréception. Par conséquent, l'émergence de relations spécifiques insecte/plante hôte résulte le plus probablement de changements évolutifs dans les systèmes chémosensoriels des insectes. L'adaptation à la qualité nutritionnelle de la nouvelle plante hôte est un processus secondaire.},
    url = "https://doi.org/10.1086/284302",
    doi = "10.1086/284302",
    openalex = "W2023744943",
    references = "edgar1974coevolution"
}

Le degré d'herbivorie et l'efficacité de la défense varient considérablement entre les espèces végétales. La disponibilité des ressources dans l'environnement est proposée comme le déterminant majeur à la fois de la quantité et du type de défense des plantes. Lorsque les ressources sont limitées, les plantes à croissance intrinsèquement lente sont favorisées par rapport à celles à taux de croissance rapide ; ces taux lents favorisent à leur tour de grands investissements dans les défenses antiherbivores. La durée de vie des feuilles, également déterminée par la disponibilité des ressources, affecte les avantages relatifs des défenses ayant des taux de renouvellement différents. La limitation relative de différentes ressources contraint également les types de défenses. Les propositions sont comparées à d'autres théories sur l'évolution des défenses des plantes.

@article{doi101126science2304728895,
    author = "Coley, Phyllis D. and Bryant, John P. and Chapin, F. Stuart",
    title = "Resource Availability and Plant Antiherbivore Defense",
    year = "1985",
    journal = "Science",
    abstract = "The degree of herbivory and the effectiveness of defense varies widely among plant species. Resource availability in the environment is proposed as the major determinant of both the amount and type of plant defense. When resource are limited, plants with inherently slow growth are favored over those with fast growth rates; slow rates in turn favor large investments in antiherbivore defenses. Leaf lifetime, also determined by resource availability, affects the relative advantages of defenses with different turnover rates. Relative limitation of different resources also constrains the types of defenses. The proposals are compared with other theories on the evolution of plant defenses.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.230.4728.895",
    doi = "10.1126/science.230.4728.895",
    openalex = "W2166390717",
    references = "doi10100797814684264651, doi101086283244, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science2114485887, doi101146annureven26010181001151, doi101146annureves11110180001003, doi101146annureves11110180001313, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023073544308, doi1023073817"
}

La capture d'énergie par la plante entière dépend non seulement de la réponse photosynthétique des feuilles individuelles, mais aussi de leur intégration dans un couvert efficace, et des coûts de production et de maintien de leur capacité photosynthétique. Cet article explore l'adaptation au niveau d'irradiance dans ce contexte, en se concentrant sur des traits dont la signification serait difficile à saisir si l'on les considérait uniquement en fonction de leur impact au niveau de la feuille. Je passe en revue les approches traditionnelles utilisées pour démontrer ou suggérer une adaptation au niveau d'irradiance, et je dégage trois compromis énergétiques susceptibles de façonner une telle adaptation, impliquant l'économie des échanges gazeux, du soutien et des interactions biotiques. Les modèles récents utilisant ces compromis pour expliquer les tendances dans la teneur en azote des feuilles, la conductance stomatique, la phyllotaxie et les allocations défensives sous soleil v. ombre sont évalués. Une réévaluation de l'étude classique sur l'acclimatation de la réponse à la lumière photosynthétique chez Atriplex, cruciale pour interpréter l'adaptation à l'irradiance de nombreux traits, montre qu'elle ne soutient pas complètement le dogme central de l'adaptation au soleil v. ombre, sauf si les résultats sont analysés en termes de capture d'énergie par la plante entière. Les calculs pour Liriodendron montrent que le point de compensation lumineux traditionnel a peu de sens pour le gain net de carbone, et que le point de compensation effectif est profondément influencé par les coûts de la respiration nocturne des feuilles, de la construction des feuilles et de la construction du soutien et du tissu racinaire associés. Les coûts du tissu de soutien sont particulièrement importants, augmentant le point de compensation effectif de 140 µmol m-2 s-1 chez les arbres de 1 m de haut, et de près de 1350 µmol m-2 s-1 chez les arbres de 30 m de haut. Les points de compensation effectifs donnent les hauteurs maximales des arbres en fonction de l'irradiance, et la tolérance à l'ombre en fonction de la hauteur de l'arbre ; les calculs de la hauteur maximale permise chez Liriodendron correspondent approximativement à la hauteur de l'individu le plus haut connu. Enfin, de nouveaux modèles pour l'évolution du rapport largeur/hauteur du couvert en réponse à l'irradiance et à la couverture au sein d'un strate arborée, et pour l'évolution des feuilles tachetées comme mesure défensive chez les herbacées de sous-bois, sont esquissés.

@article{doi101071pp9880063,
    author = "Givnish, TJ",
    title = "Adaptation to Sun and Shade: a Whole-Plant Perspective",
    year = "1988",
    journal = "Australian Journal of Plant Physiology",
    abstract = "Whole-plant energy capture depends not only on the photosynthetic response of individual leaves, but also on their integration into an effective canopy, and on the costs of producing and maintaining their photosynthetic capacity. This paper explores adaptation to irradiance level in this context, focusing on traits whose significance would be elusive if considered in terms of their impact at the leaf level alone. I review traditional approaches used to demonstrate or suggest adaptation to irradiance level, and outline three energetic tradeoffs likely to shape such adaptation, involving the economics of gas exchange, support, and biotic interactions. Recent models using these tradeoffs to account for trends in leaf nitrogen content, stornatal conductance, phyllotaxis, and defensive allocations in sun v. shade are evaluated. A re-evaluation of the classic study of acclimation of the photosynthetic light response in Atriplex, crucial to interpreting adaptation to irradiance in many traits, shows that it does not completely support the central dogma of adaptation to sun v. shade unless the results are analysed in terms of whole-plant energy capture. Calculations for Liriodendron show that the traditional light compensation point has little meaning for net carbon gain, and that the effective compensation point is profoundly influenced by the costs of night leaf respiration, leaf construction, and the construction of associated support and root tissue. The costs of support tissue are especially important, raising the effective compensation point by 140 µmol m-2 s-1 in trees 1 m tall, and by nearly 1350 µmol m-2 s-1 in trees 30 m tall. Effective compensation points give maximum tree heights as a function of irradiance, and shade tolerance as a function of tree height; calculations of maximum permissible height in Liriodendron correspond roughly with the height of the tallest known individual. Finally, new models for the evolution of canopy width/height ratio in response to irradiance and coverage within a tree stratum, and for the evolution of mottled leaves as a defensive measure in understory herbs, are outlined.",
    url = "https://doi.org/10.1071/pp9880063",
    doi = "10.1071/pp9880063",
    openalex = "W2136775576",
    references = "doi101104pp59186, doi101126science2304728895, doi1023071942495, openalexw2038423019"
}

En examinant les associations d'hôtes des papillons nymphalidés, une attention particulière est portée au problème insoluble de la classification des nymphalidés. Bien que ces données n'offrent que peu de conclusions certaines, si elles sont utilisées conjointement avec des caractères morphologiques plus formels, elles devraient contribuer à résoudre les relations interconnectées de nombreux groupements largement reconnus au sein des Nymphalidae, plusieurs desquels semblent être caractérisés de manière générale par des familles d'hôtes typiques. En conséquence directe de cette analyse, l'association supposée entre les plantes hôtes des larves et l'impalement est réévaluée.

@article{doi101111j109583121988tb00446x,
    author = "Ackery, P. R.",
    title = "Hostplants and classification: a review of nymphalid butterflies",
    year = "1988",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "In reviewing the hostplant associations of nymphalid butterflies, particular emphasis is placed on the intractable problem of nymphalid classification. Although offering few certain conclusions, if used in conjunction with more formal morphological characters, the data presented should contribute toward a resolution of the inter-relationships of the many widely recognized groupings within the Nymphalidae, several of which seem to be broadly characterized by typical host families. As a direct result of this analysis, the presumed association between larval hostplants and unpalatability is re-appraised.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1988.tb00446.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1988.tb00446.x",
    openalex = "W2089759276",
    references = "doi1018984lepid35247, edgar1974coevolution"
}

L'évolution et la classification des plantes à fleurs, L'évolution et la classification des plantes à fleurs, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی

@article{doi1023072418914,
    author = "Keener, Carl S. et Cronquist, Arthur",
    title = "L'évolution et la classification des plantes à fleurs.",
    year = "1989",
    journal = "Systematic Botany",
    abstract = "L'évolution et la classification des plantes à fleurs, L'évolution et la classification des plantes à fleurs, مرکز فناوری اطلاعات و اطلاع رسانی کشاورزی",
    url = "https://doi.org/10.2307/2418914",
    doi = "10.2307/2418914",
    openalex = "W3020856028"
}

Les plants de maïs libèrent de grandes quantités de volatils terpéniques après avoir été mangés par des chenilles. Les plants artificiellement endommagés ne libèrent pas ces volatils en quantités significatives, sauf si les sécrétions orales des chenilles sont appliquées sur les sites endommagés. Les feuilles non endommagées, qu'elles soient traitées ou non avec des sécrétions orales, ne libèrent pas de quantités détectables de terpénoides. Les femelles de la guêpe parasitoïde Cotesia marginiventris (Cresson) apprennent à tirer parti de ces volatils produits par les plantes pour localiser les hôtes lorsqu'elles sont exposées à ces volatils en association avec les hôtes ou les sous-produits des hôtes. Les terpénoides peuvent être produits en défense contre les herbivores, mais peuvent également servir une fonction secondaire dans l'attraction des ennemis naturels de ces herbivores.

@article{doi101126science25049851251,
    author = "Turlings, Ted C. J. et Tumlinson, James H. et Lewis, W. J.",
    title = "Exploitation des odeurs de plantes induites par les herbivores par les guêpes parasitoïdes à la recherche d'hôtes",
    year = "1990",
    journal = "Science",
    abstract = "Les plants de maïs libèrent de grandes quantités de volatils terpéniques après avoir été mangés par des chenilles. Les plants artificiellement endommagés ne libèrent pas ces volatils en quantités significatives, sauf si les sécrétions orales des chenilles sont appliquées sur les sites endommagés. Les feuilles non endommagées, qu'elles soient traitées ou non avec des sécrétions orales, ne libèrent pas de quantités détectables de terpénoides. Les femelles de la guêpe parasitoïde Cotesia marginiventris (Cresson) apprennent à tirer parti de ces volatils produits par les plantes pour localiser les hôtes lorsqu'elles sont exposées à ces volatils en association avec les hôtes ou les sous-produits des hôtes. Les terpénoides peuvent être produits en défense contre les herbivores, mais peuvent également servir une fonction secondaire dans l'attraction des ennemis naturels de ces herbivores.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.250.4985.1251",
    doi = "10.1126/science.250.4985.1251",
    openalex = "W2004737831",
    references = "doi1023072259845"
}

@book{doi1015159781503621534,
    author = "Durham, William H.",
    title = "Coevolution",
    year = "1991",
    booktitle = "Stanford University Press eBooks",
    url = "https://doi.org/10.1515/9781503621534",
    doi = "10.1515/9781503621534",
    openalex = "W4206956780"
}

Nous présentons une revue quantitative de la littérature pour évaluer dans quelle mesure les expériences de terrain avec des plantes ont abordé des questions concernant les modèles de compétition dans le temps et l'espace, les conséquences de la compétition sur la structure de la communauté, et les comparaisons de la capacité compétitive entre espèces. Nous décrivons les comparaisons de traitement et les analyses statistiques nécessaires pour répondre à chaque question, puis nous décrivons le nombre d'expériences qui répondent à ces critères et leurs résultats. Bien que nous ayons trouvé un total de 101 expériences dans 89 études, 63 % de ces expériences n'ont abordé que la question de savoir si la compétition affectait de manière significative un certain composant de la fitness individuelle d'une seule espèce à un seul moment et à un seul site. Malgré la base de données limitée pour aborder des questions plus complexes sur les interactions compétitives, nous avons trouvé des résultats cohérents pour quelques-unes des questions que nous avons examinées. Là où cela a été testé, la compétition a toujours eu des effets significatifs sur les modèles de distribution (cinq expériences), sur les abondances relatives (deux expériences) et sur la diversité (quatre expériences), ce qui est cohérent avec l'idée que la compétition a des effets forts sur la structure de la communauté. D'un autre côté, la compétition intraspécifique n'était pas généralement plus forte que la compétition interspécifique, que ce soit pour l'effet compétitif (quatre expériences) ou la réponse (trois expériences), ce qui suggère que la partition des ressources peut ne pas être un mécanisme important de coexistence chez les plantes.

@article{doi101086285357,
    author = "Goldberg, Deborah E. and Barton, Andrew M.",
    title = "Patterns and Consequences of Interspecific Competition in Natural Communities: A Review of Field Experiments with Plants",
    year = "1992",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Nous présentons une revue quantitative de la littérature pour évaluer dans quelle mesure les expériences de terrain avec des plantes ont abordé des questions concernant les modèles de compétition dans le temps et l'espace, les conséquences de la compétition sur la structure de la communauté, et les comparaisons de la capacité compétitive entre espèces. Nous décrivons les comparaisons de traitement et les analyses statistiques nécessaires pour répondre à chaque question, puis nous décrivons le nombre d'expériences qui répondent à ces critères et leurs résultats. Bien que nous ayons trouvé un total de 101 expériences dans 89 études, 63 % de ces expériences n'ont abordé que la question de savoir si la compétition affectait de manière significative un certain composant de la fitness individuelle d'une seule espèce à un seul moment et à un seul site. Malgré la base de données limitée pour aborder des questions plus complexes sur les interactions compétitives, nous avons trouvé des résultats cohérents pour quelques-unes des questions que nous avons examinées. Là où cela a été testé, la compétition a toujours eu des effets significatifs sur les modèles de distribution (cinq expériences), sur les abondances relatives (deux expériences) et sur la diversité (quatre expériences), ce qui est cohérent avec l'idée que la compétition a des effets forts sur la structure de la communauté. D'un autre côté, la compétition intraspécifique n'était pas généralement plus forte que la compétition interspécifique, que ce soit pour l'effet compétitif (quatre expériences) ou la réponse (trois expériences), ce qui suggère que la partition des ressources peut ne pas être un mécanisme important de coexistence chez les plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1086/285357",
    doi = "10.1086/285357",
    openalex = "W2136035194",
    references = "doi101086282697, doi101086283244, doi101086283366, doi101111j1469185x1977tb01347x, doi101126science2304728895, doi1015159781400881376, doi1023071942661, doi1023074549, openalexw2077454220, openalexw2169917233"
}

Les contraintes physiologiques et écologiques jouent un rôle clé dans l'évolution des modèles de croissance des plantes, en particulier par rapport aux défenses contre les herbivores. Les théories phénotypiques et de l'histoire de vie sont unifiées dans le cadre de l'équilibre croissance-différenciation (GDB), formant un système intégré de théories expliquant et prédisant les modèles de défense des plantes et les interactions compétitives dans le temps écologique et évolutif. L'activité végétale au niveau cellulaire peut être classée comme croissance (division et élargissement cellulaire) ou différenciation (changements chimiques et morphologiques menant à la maturation et à la spécialisation cellulaire). L'hypothèse GDB de la défense végétale repose sur un compromis physiologique entre les processus de croissance et de différenciation. Le compromis entre croissance et défense existe parce que le métabolisme secondaire et le renforcement structural sont physiologiquement contraints dans les cellules en division et en élargissement, et parce qu'ils détournent les ressources de la production de nouvelle surface foliaire. D'où le dilemme des plantes : elles doivent grandir assez vite pour compléter, tout en maintenant les défenses nécessaires pour survivre en présence de pathogènes et d'herbivores. Le compromis physiologique entre croissance et processus de différenciation interagit avec l'herbivorie et la compétition plante-plante pour se manifester comme un compromis génétique entre croissance et défense dans l'évolution des stratégies d'histoire de vie des plantes. Les théories évolutives de la défense végétale sont examinées. Nous étendons également un modèle standard de taux de croissance en séparant ses composantes écologiques et évolutives, et en formalisant le rôle de la compétition dans l'évolution de la défense végétale. Nous concluons par un modèle conceptuel de l'évolution de la défense végétale dans lequel les compromis physiologiques des plantes interagissent avec l'environnement abiotique, la compétition et l'herbivorie.

@article{doi101086417659,
    author = "Herms, Daniel A. and Mattson, William J.",
    title = "The Dilemma of Plants: To Grow or Defend",
    year = "1992",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = "Les contraintes physiologiques et écologiques jouent un rôle clé dans l'évolution des modèles de croissance des plantes, en particulier par rapport aux défenses contre les herbivores. Les théories phénotypiques et de l'histoire de vie sont unifiées dans le cadre de l'équilibre croissance-différenciation (GDB), formant un système intégré de théories expliquant et prédisant les modèles de défense des plantes et les interactions compétitives dans le temps écologique et évolutif. L'activité végétale au niveau cellulaire peut être classée comme croissance (division et élargissement cellulaire) ou différenciation (changements chimiques et morphologiques menant à la maturation et à la spécialisation cellulaire). L'hypothèse GDB de la défense végétale repose sur un compromis physiologique entre les processus de croissance et de différenciation. Le compromis entre croissance et défense existe parce que le métabolisme secondaire et le renforcement structural sont physiologiquement contraints dans les cellules en division et en élargissement, et parce qu'ils détournent les ressources de la production de nouvelle surface foliaire. D'où le dilemme des plantes : elles doivent grandir assez vite pour compléter, tout en maintenant les défenses nécessaires pour survivre en présence de pathogènes et d'herbivores. Le compromis physiologique entre croissance et processus de différenciation interagit avec l'herbivorie et la compétition plante-plante pour se manifester comme un compromis génétique entre croissance et défense dans l'évolution des stratégies d'histoire de vie des plantes. Les théories évolutives de la défense végétale sont examinées. Nous étendons également un modèle standard de taux de croissance en séparant ses composantes écologiques et évolutives, et en formalisant le rôle de la compétition dans l'évolution de la défense végétale. Nous concluons par un modèle conceptuel de l'évolution de la défense végétale dans lequel les compromis physiologiques des plantes interagissent avec l'environnement abiotique, la compétition et l'herbivorie.",
    url = "https://doi.org/10.1086/417659",
    doi = "10.1086/417659",
    openalex = "W1990151103",
    references = "doi101007bf02860717, doi101086283244, doi101086284531, doi101111j109583121989tb00492x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461985tb00391x, doi101126science12933611466, doi101126science1713973757, doi101126science188418319, doi101126science2304728895, doi101146annureves19110188000551, doi1023071942495, doi1023072259845, doi1023072389364, openalexw2169917233"
}

Article de revue Diversification à l'interface Insecte-Plante : Apports de la phylogénie Accéder Brian D. Farrell, Brian D. Farrell Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Charles Mitter, Charles Mitter Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Douglas J. Futuyma Douglas J. Futuyma Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 42, Issue 1, Janvier 1992, Pages 34–42, https://doi.org/10.2307/1311626 Publié : 01 Janvier 1992

@article{doi1023071311626,
    author = "Farrell, Brian D. et Mitter, Charles et Futuyma, Douglas J.",
    title = "Diversification à l'interface Insecte-Plante",
    year = "1992",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Article de revue Diversification à l'interface Insecte-Plante : Apports de la phylogénie Accéder Brian D. Farrell, Brian D. Farrell Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Charles Mitter, Charles Mitter Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar Douglas J. Futuyma Douglas J. Futuyma Rechercher d'autres œuvres de cet auteur sur : Oxford Academic Google Scholar BioScience, Volume 42, Issue 1, Janvier 1992, Pages 34–42, https://doi.org/10.2307/1311626 Publié : 01 Janvier 1992",
    url = "https://doi.org/10.2307/1311626",
    doi = "10.2307/1311626",
    openalex = "W2050570174",
    references = "benson1975coevolution"
}

Résumé La taille du groupe varie en corrélation avec le volume relatif du néocortex chez les primates non humains. Cette équation de régression prédit une taille de groupe pour les humains modernes très similaire à celle des sociétés de chasseurs-cueilleurs et de horticulteurs traditionnels. Des tailles de groupe similaires sont observées dans d'autres sociétés contemporaines et historiques. Les primates non humains maintiennent la cohésion du groupe par le toilettage social ; chez les singes et les grands singes de l'Ancien Monde, le temps consacré au toilettage social est linéairement lié à la taille du groupe. Maintenir la stabilité de groupes de taille humaine uniquement par le toilettage imposerait des exigences temporelles intolérables. Il est donc suggéré (1) que l'évolution de grands groupes dans la lignée humaine a dépendu du développement d'une méthode plus efficace pour partager le temps des processus de liaison sociale et (2) que le langage remplit de manière unique cette exigence. Les données sur la taille des groupes conversationnels et d'autres petits groupes d'interaction humains concordent avec l'efficacité relative prédite de la conversation par rapport au toilettage en tant que processus de liaison. Dans les conversations humaines, environ 60 % du temps est consacré à la rumeur sur les relations et les expériences personnelles. Le langage a peut-être évolué en conséquence pour permettre aux individus d'apprendre plus rapidement les caractéristiques comportementales d'autres membres du groupe que ce qui était possible par l'observation directe seule.

@article{doi101017s0140525x00032325,
    author = "Dunbar, Robin",
    title = "Coevolution of neocortical size, group size and language in humans",
    year = "1993",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Résumé La taille du groupe varie en corrélation avec le volume relatif du néocortex chez les primates non humains. Cette équation de régression prédit une taille de groupe pour les humains modernes très similaire à celle des sociétés de chasseurs-cueilleurs et de horticulteurs traditionnels. Des tailles de groupe similaires sont observées dans d'autres sociétés contemporaines et historiques. Les primates non humains maintiennent la cohésion du groupe par le toilettage social ; chez les singes et les grands singes de l'Ancien Monde, le temps consacré au toilettage social est linéairement lié à la taille du groupe. Maintenir la stabilité de groupes de taille humaine uniquement par le toilettage imposerait des exigences temporelles intolérables. Il est donc suggéré (1) que l'évolution de grands groupes dans la lignée humaine a dépendu du développement d'une méthode plus efficace pour partager le temps des processus de liaison sociale et (2) que le langage remplit de manière unique cette exigence. Les données sur la taille des groupes conversationnels et d'autres petits groupes d'interaction humains concordent avec l'efficacité relative prédite de la conversation par rapport au toilettage en tant que processus de liaison. Dans les conversations humaines, environ 60\% du temps est consacré à la rumeur sur les relations et les expériences personnelles. Le langage a peut-être évolué en conséquence pour permettre aux individus d'apprendre plus rapidement les caractéristiques comportementales d'autres membres du groupe que ce qui était possible par l'observation directe seule.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x00032325",
    doi = "10.1017/s0140525x00032325",
    openalex = "W2137391072",
    references = "doi1010079781468441482, doi1010160022519364900384, doi1010160047248487900224, doi101016004724849290081j, doi101016s0022519389801699, doi101017s0140525x00081061, doi101086284325, doi101093oso97801985464120010001, doi101098rstb19890106, doi101111j143903101963tb01161x, doi101152physrev1992721165, doi1023071367778, doi1023071438156, doi1023072063068, doi1023072185913, doi1023072407154, doi1043249780203037416, doi1043249781315132129, doi105860choice295104, falk1983cerebral, openalexw1659631989, openalexw1996270497"
}

L'accumulation de proline (Pro) a été corrélée à la tolérance aux stress de sécheresse et de salinité chez les plantes. Par conséquent, une surproduction de Pro chez les plantes pourrait entraîner une tolérance accrue à ces stress abiotiques. Pour tester cette hypothèse, nous avons surexprimé chez le tabac la [delta]-pyrroline-5-carboxylate synthétase du pois de faucon, une enzyme bifonctionnelle capable de catalyser la conversion du glutamate en [delta]-pyrroline-5-carboxylate, qui est ensuite réduite en Pro. Les plantes transgéniques ont produit un niveau élevé de l'enzyme et synthétisé 10 à 18 fois plus de Pro que les plantes témoins. Ces résultats suggèrent que l'activité de la première enzyme de la voie est le facteur limitant de la synthèse de Pro. L'apport exogène d'azote a encore accru la production de Pro. Les potentiels osmotiques du sève foliaire des plantes transgéniques ont été moins diminués dans des conditions de stress hydrique par rapport à ceux des plantes témoins. La surproduction de Pro a également accru la biomasse racinaire et le développement floral chez les plantes transgéniques dans des conditions de stress de sécheresse. Ces données démontrent que la Pro agit comme un osmoprotectant et que la surproduction de Pro entraîne une tolérance accrue au stress osmotique chez les plantes.

@article{doi101104pp10841387,
    author = "Kishor, PBK. et Hong, Zonglie et Miao, Guo-Hua et Hu, C.‐A. et Verma, D. P. S.",
    title = "Surexpression de la [delta]-pyrroline-5-carboxylate synthétase augmente la production de proline et confère une tolérance à l'osmose chez les plantes transgéniques",
    year = "1995",
    journal = "PLANT PHYSIOLOGY",
    abstract = "L'accumulation de proline (Pro) a été corrélée à la tolérance aux stress de sécheresse et de salinité chez les plantes. Par conséquent, une surproduction de Pro chez les plantes pourrait entraîner une tolérance accrue à ces stress abiotiques. Pour tester cette hypothèse, nous avons surexprimé chez le tabac la [delta]-pyrroline-5-carboxylate synthétase du pois de faucon, une enzyme bifonctionnelle capable de catalyser la conversion du glutamate en [delta]-pyrroline-5-carboxylate, qui est ensuite réduite en Pro. Les plantes transgéniques ont produit un niveau élevé de l'enzyme et synthétisé 10 à 18 fois plus de Pro que les plantes témoins. Ces résultats suggèrent que l'activité de la première enzyme de la voie est le facteur limitant de la synthèse de Pro. L'apport exogène d'azote a encore accru la production de Pro. Les potentiels osmotiques du sève foliaire des plantes transgéniques ont été moins diminués dans des conditions de stress hydrique par rapport à ceux des plantes témoins. La surproduction de Pro a également accru la biomasse racinaire et le développement floral chez les plantes transgéniques dans des conditions de stress de sécheresse. Ces données démontrent que la Pro agit comme un osmoprotectant et que la surproduction de Pro entraîne une tolérance accrue au stress osmotique chez les plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1104/pp.108.4.1387",
    doi = "10.1104/pp.108.4.1387",
    openalex = "W1832710699"
}

Préface. Remerciements. Introduction. 1. Modèles d'utilisation des plantes hôtes. 2. Substances chimiques dans les plantes. 3. Systèmes sensoriels. 4. Comportement : le processus de sélection de la plante hôte. 5. Comportement : l'impact de l'écologie et de la physiologie. 6. Effets de l'expérience. 7. Variation génétique dans la sélection de la plante hôte. 8. Évolution de la gamme d'hôtes. Glossaire. Index taxonomique. Index des sujets.

@article{doi105860choice323872,
    title = "Sélection de plantes hôtes par les insectes phytophages",
    year = "1995",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Préface. Remerciements. Introduction. 1. Modèles d'utilisation des plantes hôtes. 2. Substances chimiques dans les plantes. 3. Systèmes sensoriels. 4. Comportement : le processus de sélection de la plante hôte. 5. Comportement : l'impact de l'écologie et de la physiologie. 6. Effets de l'expérience. 7. Variation génétique dans la sélection de la plante hôte. 8. Évolution de la gamme d'hôtes. Glossaire. Index taxonomique. Index des sujets.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.32-3872",
    doi = "10.5860/choice.32-3872",
    openalex = "W571103110"
}

Les plantes produisent une diversité de métabolites secondaires, dont beaucoup ont une activité antifongique. Certains de ces composés sont constitutifs, existant dans les plantes saines sous leur forme biologiquement active. D'autres, tels que les glycosides cyanogènes et

@article{doi101105tpc8101821,
    author = "Osbourn, Anne",
    title = "Preformed Antimicrobial Compounds and Plant Defense against Fungal Attack.",
    year = "1996",
    journal = "The Plant Cell",
    abstract = "Plants produce a diverse array of secondary metabolites, many of which have antifungal activity. Some of these compounds are constitutive, existing in healthy plants in their biologically active forms. Others, such as cyanogenic glycosides and",
    url = "https://doi.org/10.1105/tpc.8.10.1821",
    doi = "10.1105/tpc.8.10.1821",
    openalex = "W2145830415"
}

▪ Résumé Dans cette revue, nous discutons des conséquences écologiques et évolutives des interactions plantes-herbivores dans les forêts tropicales. Nous notons d'abord que les taux d'herbivorie sont plus élevés dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées et que, contrairement aux feuilles des forêts tempérées, la plupart des dommages aux feuilles tropicales surviennent lorsqu'elles sont jeunes et en expansion. Les feuilles des forêts tropicales sèches subissent également des taux de dommages plus élevés que dans les forêts humides, et les dommages sont plus importants dans le sous-étage que dans le couvert. Les herbivores insectes, qui ont généralement une gamme d'hôtes étroite dans les tropiques, causent la plupart des dommages aux feuilles et ont sélectionné une grande variété de défenses chimiques, développementales et phénologiques chez les plantes. Les pathogènes sont moins étudiés mais causent des dommages considérables et, avec les herbivores insectes, peuvent contribuer au maintien de la diversité des arbres. Les mammifères folivores causent moins de dommages que les insectes ou les pathogènes mais ont évolué pour faire face aux hauts niveaux de défenses des plantes. Les feuilles des forêts tropicales sont défendues par une faible qualité nutritionnelle, une plus grande dureté et une grande variété de métabolites secondaires, dont beaucoup sont plus courants dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées. Les tanins, la dureté et la faible qualité nutritionnelle allongent les temps de développement des insectes, les rendant plus vulnérables aux prédateurs et aux parasitoïdes. La présence généralisée de ces défenses suggère que les ennemis naturels sont des participants clés dans les défenses des plantes et ont peut-être influencé l'évolution de ces traits. Pour échapper aux dommages, les feuilles peuvent s'étendre rapidement, être déployées simultanément ou être produites pendant la saison sèche lorsque les herbivores sont rares. Une stratégie pratiquement limitée aux forêts tropicales est pour les plantes de déployer des feuilles mais de retarder leur « verdissage » jusqu'à ce que les feuilles soient matures. Beaucoup de ces traits défensifs sont corrélés au sein des espèces, en raison de contraintes physiologiques et de compromis. En général, les espèces tolérantes à l'ombre investissent plus dans les défenses que celles nécessitant des clairières, et les espèces à feuilles longévives sont mieux défendues que celles à feuilles de courte durée.

@article{doi101146annurevecolsys271305,
    author = "Coley, Phyllis D. and Barone, John A.",
    title = "HERBIVORY AND PLANT DEFENSES IN TROPICAL FORESTS",
    year = "1996",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Résumé Dans cette revue, nous discutons des conséquences écologiques et évolutives des interactions plantes-herbivores dans les forêts tropicales. Nous notons d'abord que les taux d'herbivorie sont plus élevés dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées et que, contrairement aux feuilles des forêts tempérées, la plupart des dommages aux feuilles tropicales surviennent lorsqu'elles sont jeunes et en expansion. Les feuilles des forêts tropicales sèches subissent également des taux de dommages plus élevés que dans les forêts humides, et les dommages sont plus importants dans le sous-étage que dans le couvert. Les herbivores insectes, qui ont généralement une gamme d'hôtes étroite dans les tropiques, causent la plupart des dommages aux feuilles et ont sélectionné une grande variété de défenses chimiques, développementales et phénologiques chez les plantes. Les pathogènes sont moins étudiés mais causent des dommages considérables et, avec les herbivores insectes, peuvent contribuer au maintien de la diversité des arbres. Les mammifères folivores causent moins de dommages que les insectes ou les pathogènes mais ont évolué pour faire face aux hauts niveaux de défenses des plantes. Les feuilles des forêts tropicales sont défendues par une faible qualité nutritionnelle, une plus grande dureté et une grande variété de métabolites secondaires, dont beaucoup sont plus courants dans les forêts tropicales que dans les forêts tempérées. Les tanins, la dureté et la faible qualité nutritionnelle allongent les temps de développement des insectes, les rendant plus vulnérables aux prédateurs et aux parasitoïdes. La présence généralisée de ces défenses suggère que les ennemis naturels sont des participants clés dans les défenses des plantes et ont peut-être influencé l'évolution de ces traits. Pour échapper aux dommages, les feuilles peuvent s'étendre rapidement, être déployées simultanément ou être produites pendant la saison sèche lorsque les herbivores sont rares. Une stratégie pratiquement limitée aux forêts tropicales est pour les plantes de déployer des feuilles mais de retarder leur « verdissage » jusqu'à ce que les feuilles soient matures. Beaucoup de ces traits défensifs sont corrélés au sein des espèces, en raison de contraintes physiologiques et de compromis. En général, les espèces tolérantes à l'ombre investissent plus dans les défenses que celles nécessitant des clairières, et les espèces à feuilles longévives sont mieux défendues que celles à feuilles de courte durée.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.27.1.305",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.27.1.305",
    openalex = "W2150998549",
    references = "doi101001jama196203050110085031, doi101086284369, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science2304728895, doi1023071942495, doi1023072406212, ehrlich1964butterflies, openalexw2097385721"
}

La sélection de l'hôte par les insectes phytophages est largement déterminée par le choix, fait par les insectes adultes, du lieu de développement de la descendance. La connaissance de la sélection naturelle conduit à des prédictions théoriques sur la manière dont le comportement des adultes pourrait répondre à la qualité de l'hôte, à l'abondance des plantes hôtes, à la charge d'œufs des adultes, à l'âge et au temps de recherche disponible, à la dépendance par la densité et aux effets stochastiques. Les débats sur la valeur des modèles adaptatifs simples ne peuvent être tranchés que par des tests répétés et des reformulations. Les bases théoriques de la sélection adaptative de l'hôte sont solides, mais plusieurs défis subsistent. Il manque des modèles qui soient à la fois assez généraux pour s'appliquer à une large gamme d'espèces et faciles à tester. Le rôle de la variabilité de l'abondance des plantes et d'autres forces stochastiques nécessite une clarification. Sur le plan empirique, les bonnes études de terrain sur l'effet des plantes hôtes sur la fitness des insectes sont rares, mais sans elles, peu de progrès peuvent être réalisés. L'évaluation de la préférence pour l'hôte nécessite également une attention particulière. Les tests quantitatifs de la théorie sont rares, probablement parce que les modèles généraux n'envisagent pas assez d'histoire naturelle pertinente pour chaque espèce particulière. Cependant, beaucoup de témoignages anecdotiques et d'épreuves qualitatives semblent refléter les prédictions adaptatives. Un défi pour l'avenir est d'évaluer la valeur adaptative de mécanismes particuliers de sélection de l'hôte et de les relier aux prédictions faites dans les modèles adaptatifs simples.

@article{doi1023073546884,
    author = "Mayhew, Peter J.",
    title = "Adaptive Patterns of Host-Plant Selection by Phytophagous Insects",
    year = "1997",
    journal = "Oikos",
    abstract = "Host-plant selection by phytophagous insects is largely determined by adult insects choosing the developmental location of offspring. Knowledge of natural selection leads to theoretical predictions about how adult behaviour might respond to host quality, the abundance of host-plants, adult egg-load, age and available search time, density-dependence, and stochastic effects. Debates about the value of simple adaptive models can only be settled by repeated testing and reformulation. The theoretical basis of adaptive host-selection is quite strong, but several challenges remain. Models are lacking which are both general enough to be applicable to a wide range of species, and easy to test. The role of variability in plant abundance and other stochastic forces requires clarification. Empirically, good field studies of the effect of host-plants on insect fitness are rare, but without them little progress can be made. The assessment of host-preference also requires attention. Quantitative tests of theory are rare, probably because general models do not encompass enough relevant natural history for each particular species. However much anecdotal and qualitative evidence seems to reflect adaptive predictions. A challenge for the future is to assess the adaptive value of particular mechanisms of host-selection, and to relate these to the predictions made in simple adaptive models.",
    url = "https://doi.org/10.2307/3546884",
    doi = "10.2307/3546884",
    openalex = "W2086744406"
}

Une base de données sur les enregistrements de plantes hôtes provenant de 437 taxons du groupe a été utilisée pour tester un certain nombre d'hypothèses sur l'interaction entre les papillons et leurs plantes hôtes en utilisant des méthodes phylogénétiques (optimisation de caractères simples, test des changements concentrés et test des contrastes indépendants). La phylogénie des papillons a été assemblée à partir de diverses sources et les clades de plantes hôtes ont été identifiés selon la phylogénie basée sur rbcL de Chase et al. La plante hôte ancestrale semble être associée au sein d'un clade rosid hautement dérivé, incluant la famille des Fabaceae. Comme les données fossiles suggèrent que ce clade est plus ancien que les papillons, ils doivent avoir colonisé des plantes déjà diversifiées. Des études antérieures suggèrent également que les modèles d'association dans la plupart des interactions insecte-plante sont davantage façonnés par les changements d'hôte, par colonisation et spécialisation, que par la cospéciation. Par conséquent, nous nous sommes concentrés explicitement sur les mécanismes derrière les changements d'hôte. Nos résultats confirment, à la lumière de nouvelles preuves phylogénétiques, le modèle rapporté par Ehrlich et Raven selon lequel les papillons apparentés se nourrissent de plantes apparentées. Nous montrons que les changements d'hôte ont généralement été plus fréquents entre des plantes étroitement apparentées qu'entre des plantes plus éloignées. Cette découverte, ainsi que la possibilité d'une tendance plus élevée à recoloniser les hôtes ancestraux, aide à expliquer la conservation apparente à grande échelle des modèles d'association entre les insectes et leurs plantes hôtes, des modèles qui sont en même temps plus flexibles à un niveau plus détaillé. La forme de croissance des plantes était un aspect encore plus conservateur de l'interaction entre les papillons et leurs plantes hôtes que la phylogénie des plantes. Cependant, cela est largement expliqué par une probabilité plus élevée de colonisations et de changements d'hôte lors de l'alimentation sur des arbres que sur d'autres formes de croissance.

@article{doi101111j155856461998tb01648x,
    author = "Janz, Niklas et Nylin, Sören",
    title = "PAPILLIONS ET PLANTES : UNE ÉTUDE PHYLOGÉNÉTIQUE",
    year = "1998",
    journal = "Évolution",
    abstract = "Une base de données sur les enregistrements de plantes hôtes provenant de 437 taxons du groupe a été utilisée pour tester un certain nombre d'hypothèses sur l'interaction entre les papillons et leurs plantes hôtes en utilisant des méthodes phylogénétiques (optimisation de caractères simples, test des changements concentrés et test des contrastes indépendants). La phylogénie des papillons a été assemblée à partir de diverses sources et les clades de plantes hôtes ont été identifiés selon la phylogénie basée sur rbcL de Chase et al. La plante hôte ancestrale semble être associée au sein d'un clade rosid hautement dérivé, incluant la famille des Fabaceae. Comme les données fossiles suggèrent que ce clade est plus ancien que les papillons, ils doivent avoir colonisé des plantes déjà diversifiées. Des études antérieures suggèrent également que les modèles d'association dans la plupart des interactions insecte-plante sont davantage façonnés par les changements d'hôte, par colonisation et spécialisation, que par la cospéciation. Par conséquent, nous nous sommes concentrés explicitement sur les mécanismes derrière les changements d'hôte. Nos résultats confirment, à la lumière de nouvelles preuves phylogénétiques, le modèle rapporté par Ehrlich et Raven selon lequel les papillons apparentés se nourrissent de plantes apparentées. Nous montrons que les changements d'hôte ont généralement été plus fréquents entre des plantes étroitement apparentées qu'entre des plantes plus éloignées. Cette découverte, ainsi que la possibilité d'une tendance plus élevée à recoloniser les hôtes ancestraux, aide à expliquer la conservation apparente à grande échelle des modèles d'association entre les insectes et leurs plantes hôtes, des modèles qui sont en même temps plus flexibles à un niveau plus détaillé. La forme de croissance des plantes était un aspect encore plus conservateur de l'interaction entre les papillons et leurs plantes hôtes que la phylogénie des plantes. Cependant, cela est largement expliqué par une probabilité plus élevée de colonisations et de changements d'hôte lors de l'alimentation sur des arbres que sur d'autres formes de croissance.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1998.tb01648.x",
    doi = "10.1111/j.1558-5646.1998.tb01648.x",
    openalex = "W1971509985",
    references = "doi101111j155856461975tb00861x"
}

▪ Résumé La pollinisation des plantes à fleurs par les animaux représente un service écosystémique critique d'une grande valeur pour l'humanité, tant monétaire que d'autres manières. Cependant, le besoin d'une conservation active des interactions de pollinisation n'est maintenant apprécié que récemment. Les systèmes de pollinisation sont de plus en plus menacés par des sources anthropiques, notamment la fragmentation de l'habitat, les changements d'utilisation des terres, les pratiques agricoles modernes, l'utilisation de produits chimiques tels que les pesticides et les herbicides, et les invasions de plantes et d'animaux non indigènes. Les abeilles domestiques, qui elles-mêmes sont des pollinisateurs non indigènes sur la plupart des continents, et qui peuvent nuire aux abeilles indigènes et autres pollinisateurs, sont néanmoins cruciales pour la pollinisation des cultures. Les récentes diminutions du nombre d'abeilles domestiques aux États-Unis et en Europe soulignent l'importance des systèmes de pollinisation sains et la nécessité de développer davantage les abeilles indigènes et autres animaux comme pollinisateurs de cultures. La « crise de la pollinisation » qui se manifeste par la diminution des abeilles domestiques et des abeilles indigènes, ainsi que par les dommages aux réseaux d'interactions plantes-pollinisateurs, peut être atténuée non seulement par la culture d'une diversité de pollinisateurs de cultures, mais aussi par des changements dans l'utilisation de l'habitat et les pratiques agricoles, les réintroductions et suppressions d'espèces, et d'autres moyens. En outre, les écologistes doivent redoubler d'efforts pour étudier les aspects fondamentaux des interactions plantes-pollinisateurs si des décisions de gestion optimales doivent être prises pour la conservation de ces interactions dans les écosystèmes naturels et agricoles.

@article{doi101146annurevecolsys29183,
    author = "Kearns, Carol Ann and Inouye, David W. and Waser, Nickolas M.",
    title = "ENDANGERED MUTUALISMS: The Conservation of Plant-Pollinator Interactions",
    year = "1998",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Résumé La pollinisation des plantes à fleurs par les animaux représente un service écosystémique critique d'une grande valeur pour l'humanité, tant monétaire que d'autres manières. Cependant, le besoin d'une conservation active des interactions de pollinisation n'est maintenant apprécié que récemment. Les systèmes de pollinisation sont de plus en plus menacés par des sources anthropiques, notamment la fragmentation de l'habitat, les changements d'utilisation des terres, les pratiques agricoles modernes, l'utilisation de produits chimiques tels que les pesticides et les herbicides, et les invasions de plantes et d'animaux non indigènes. Les abeilles domestiques, qui elles-mêmes sont des pollinisateurs non indigènes sur la plupart des continents, et qui peuvent nuire aux abeilles indigènes et autres pollinisateurs, sont néanmoins cruciales pour la pollinisation des cultures. Les récentes diminutions du nombre d'abeilles domestiques aux États-Unis et en Europe soulignent l'importance des systèmes de pollinisation sains et la nécessité de développer davantage les abeilles indigènes et autres animaux comme pollinisateurs de cultures. La « crise de la pollinisation » qui se manifeste par la diminution des abeilles domestiques et des abeilles indigènes, ainsi que par les dommages aux réseaux d'interactions plantes-pollinisateurs, peut être atténuée non seulement par la culture d'une diversité de pollinisateurs de cultures, mais aussi par des changements dans l'utilisation de l'habitat et les pratiques agricoles, les réintroductions et suppressions d'espèces, et d'autres moyens. En outre, les écologistes doivent redoubler d'efforts pour étudier les aspects fondamentaux des interactions plantes-pollinisateurs si des décisions de gestion optimales doivent être prises pour la conservation de ces interactions dans les écosystèmes naturels et agricoles.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.29.1.83",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.29.1.83",
    openalex = "W2146345110",
    references = "doi101111j155856461964tb01674x, doi1023072265575, doi1023072406212, ehrlich1964butterflies"
}

Insectes en tant qu'herbivores. Plantes : variation chimique dans l'espace et le temps. Plantes comme nourriture pour les insectes. Sélection de plante hôte : orientation. Sélection de plante hôte : variabilité. Endocrinologie de la plante hôte et de l'herbivore. Écologie des interactions insecte-plante. Évolution des interactions insecte-plante. Insectes et fleurs. Insectes et plantes : aspects appliqués. Méthodologie des interactions insecte-plante.

@article{openalexw2119482121,
    author = "Schoonhoven, L. M. et Jermy, T. et van Loon, Joop J. A.",
    title = "Insect-plant biology: from physiology to evolution.",
    year = "1998",
    journal = "Socio-Environmental Systems Modeling",
    abstract = "Insectes en tant qu'herbivores. Plantes : variation chimique dans l'espace et le temps. Plantes comme nourriture pour les insectes. Sélection de plante hôte : orientation. Sélection de plante hôte : variabilité. Endocrinologie de la plante hôte et de l'herbivore. Écologie des interactions insecte-plante. Évolution des interactions insecte-plante. Insectes et fleurs. Insectes et plantes : aspects appliqués. Méthodologie des interactions insecte-plante.",
    openalex = "W2119482121"
}

Le déclin de la biodiversité représente l'un des aspects les plus dramatiques et irréversibles du changement global anthropique, bien que les implications écologiques de ce changement soient mal comprises. Des études récentes ont montré que la perte de biodiversité des espèces de base, telles que les autotrophes ou les plantes, affecte les processus fondamentaux des écosystèmes tels que la dynamique des nutriments et la production autotrophe. La théorie écologique prédit que les changements induits par la perte de biodiversité à la base d'un écosystème devraient impacter l'ensemble du système. Ici, nous montrons que les réductions expérimentales de la richesse spécifique végétale dans les prairies augmentent la vulnérabilité de l'écosystème aux invasions par des espèces végétales, favorisent la propagation des maladies fongiques des plantes et modifient la richesse et la structure des communautés d'insectes. Ces résultats suggèrent que la perte d'espèces de base peut avoir des effets profonds sur l'intégrité et le fonctionnement des écosystèmes.

@article{doi101046j14610248199900083x,
    author = "Knops, Johannes M. H. et Tilman, David et Haddad, Nick M. et Naeem, Shahid et Mitchell, Charles E. et Haarstad, John et Ritchie, Mark E. et Howe, Katherine M. et Reich, Peter B. et Siemann, Evan et Groth, J. V.",
    title = "Effets de la richesse spécifique végétale sur la dynamique d'invasion, les épidémies de maladies, les abondances et la diversité",
    year = "1999",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "Le déclin de la biodiversité représente l'un des aspects les plus dramatiques et irréversibles du changement global anthropique, bien que les implications écologiques de ce changement soient mal comprises. Des études récentes ont montré que la perte de biodiversité des espèces de base, telles que les autotrophes ou les plantes, affecte les processus fondamentaux des écosystèmes tels que la dynamique des nutriments et la production autotrophe. La théorie écologique prédit que les changements induits par la perte de biodiversité à la base d'un écosystème devraient impacter l'ensemble du système. Ici, nous montrons que les réductions expérimentales de la richesse spécifique végétale dans les prairies augmentent la vulnérabilité de l'écosystème aux invasions par des espèces végétales, favorisent la propagation des maladies fongiques des plantes et modifient la richesse et la structure des communautés d'insectes. Ces résultats suggèrent que la perte d'espèces de base peut avoir des effets profonds sur l'intégrité et le fonctionnement des écosystèmes.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1461-0248.1999.00083.x",
    doi = "10.1046/j.1461-0248.1999.00083.x",
    openalex = "W1993644529",
    references = "doi101038280455a0"
}

Résumé Pour mieux comprendre les effets écologiques de la récolte de géophytes à des fins alimentaires par les Amérindiens, une enquête sur l'ethnobotanique et la dynamique des populations de Dichelostemma capitatum (blue dicks), une source de nutrition attrayante pour de nombreux groupes indiens de Californie, a été entreprise. Certains groupes culturels récoltent les bulbes et replantent les bulbelets, épargnent les plantes et récoltent après la floraison pour assurer le renouvellement des graines. Certains anciens indiens assimilent la récolte judicieuse au maintien et à l'amélioration des populations de terrain de cette géophyte. Une expérience de terrain a été menée pour déterminer dans quelle mesure les différences d'intensité et de moment de la récolte, avec ou sans replantation de bulbelets, ont un effet sur la production de bulbes et de bulbelets. Nous avons constaté que la récolte à 100 % d'intensité, par l'arrachage de toutes les plantes et bulbes, et sans replantation de bulbelets au stade de la graine, réduit considérablement le nombre de bulbes et de bulbelets par rapport aux témoins (aucune récolte). Cependant, la récolte à 50 % d'intensité, par l'arrachage de la moitié de toutes les plantes et bulbes aux stades de floraison ou de graine, sans replantation de bulbelets, n'était pas significativement différente des témoins (aucune récolte). Les résultats suggèrent que la récolte des bulbes de blue dicks avec un bâton de creusement de cette manière pourrait donner un niveau de récolte durable. Les régimes de récolte et de gestion indigènes peuvent offrir certains des meilleurs exemples d'utilisations et de gestion à long terme de la flore régionale sans préjudice pour sa biodiversité. Les restaurateurs sont invités à étudier et à imiter expérimentalement les régimes de perturbation indigènes et leurs effets écologiques connus pour se produire historiquement dans divers écosystèmes. Dans certains cas, les zones bénéficieront grandement de la réintroduction de régimes de gestion et de récolte qui simulent authentiquement les interactions indigènes anciennes.

@article{doi101046j1526100x199972016x,
    author = "Anderson, M. Kat and Rowney, David L.",
    title = "The Edible Plant Dichelostemma capitatum: Its Vegetative Reproduction Response to Different Indigenous Harvesting Regimes in California",
    year = "1999",
    journal = "Restoration Ecology",
    abstract = "Résumé Pour mieux comprendre les effets écologiques de la récolte de géophytes à des fins alimentaires par les Amérindiens, une enquête sur l'ethnobotanique et la dynamique des populations de Dichelostemma capitatum (blue dicks), une source de nutrition attrayante pour de nombreux groupes indiens de Californie, a été entreprise. Certains groupes culturels récoltent les bulbes et replantent les bulbelets, épargnent les plantes et récoltent après la floraison pour assurer le renouvellement des graines. Certains anciens indiens assimilent la récolte judicieuse au maintien et à l'amélioration des populations de terrain de cette géophyte. Une expérience de terrain a été menée pour déterminer dans quelle mesure les différences d'intensité et de moment de la récolte, avec ou sans replantation de bulbelets, ont un effet sur la production de bulbes et de bulbelets. Nous avons constaté que la récolte à 100\% d'intensité, par l'arrachage de toutes les plantes et bulbes, et sans replantation de bulbelets au stade de la graine, réduit considérablement le nombre de bulbes et de bulbelets par rapport aux témoins (aucune récolte). Cependant, la récolte à 50\% d'intensité, par l'arrachage de la moitié de toutes les plantes et bulbes aux stades de floraison ou de graine, sans replantation de bulbelets, n'était pas significativement différente des témoins (aucune récolte). Les résultats suggèrent que la récolte des bulbes de blue dicks avec un bâton de creusement de cette manière pourrait donner un niveau de récolte durable. Les régimes de récolte et de gestion indigènes peuvent offrir certains des meilleurs exemples d'utilisations et de gestion à long terme de la flore régionale sans préjudice pour sa biodiversité. Les restaurateurs sont invités à étudier et à imiter expérimentalement les régimes de perturbation indigènes et leurs effets écologiques connus pour se produire historiquement dans divers écosystèmes. Dans certains cas, les zones bénéficieront grandement de la réintroduction de régimes de gestion et de récolte qui simulent authentiquement les interactions indigènes anciennes.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1526-100x.1999.72016.x",
    doi = "10.1046/j.1526-100x.1999.72016.x",
    openalex = "W2059406508",
    references = "doi1010079781461381228, doi10100797894009920092, doi101007bf02860857, doi101086283241, doi101111an197819824, doi102307142540, doi1023072807611, doi105860choice322131, openalexw1592882905, openalexw1593528102"
}

La coévolution est l'un des principaux processus organisant la biodiversité de la Terre. Le besoin de comprendre la coévolution comme un processus en cours s'est accru alors que les préoccupations écologiques ont augmenté concernant la dynamique des communautés biologiques en rapide mutation, la conservation de la diversité génétique et la biologie des populations des maladies. Le plus grand défi actuel est de comprendre comment la coévolution opère à travers de vastes paysages géographiques, reliant les processus écologiques locaux aux modèles phylogéographiques. La théorie du mosaïque géographique de la coévolution fournit un cadre pour se demander comment la coévolution remodelle continuellement les interactions à différentes échelles spatiales et temporelles. Elle produit des hypothèses spécifiques sur la manière dont la coévolution structurée géographiquement diffère de la coévolution à l'échelle locale. Elle fournit également un cadre pour comprendre comment la maladaptation locale peut résulter de la coévolution et pourquoi les interactions coévolues produisent rarement de longues listes de traits coévolus qui deviennent fixes au sein des espèces. Les études de terrain à long terme de la même interaction à travers plusieurs communautés et les modèles mathématiques structurés spatialement commencent ensemble à montrer que la coévolution peut être un processus en cours plus important que ce que l'avaient indiqué les études empiriques et théoriques antérieures dépourvues d'une perspective géographique.

@article{doi101086303208,
    author = "Thompson, John N.",
    title = "Hypothèses spécifiques sur le mosaïque géographique de la coévolution",
    year = "1999",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "La coévolution est l'un des principaux processus organisant la biodiversité de la Terre. Le besoin de comprendre la coévolution comme un processus en cours s'est accru alors que les préoccupations écologiques ont augmenté concernant la dynamique des communautés biologiques en rapide mutation, la conservation de la diversité génétique et la biologie des populations des maladies. Le plus grand défi actuel est de comprendre comment la coévolution opère à travers de vastes paysages géographiques, reliant les processus écologiques locaux aux modèles phylogéographiques. La théorie du mosaïque géographique de la coévolution fournit un cadre pour se demander comment la coévolution remodelle continuellement les interactions à différentes échelles spatiales et temporelles. Elle produit des hypothèses spécifiques sur la manière dont la coévolution structurée géographiquement diffère de la coévolution à l'échelle locale. Elle fournit également un cadre pour comprendre comment la maladaptation locale peut résulter de la coévolution et pourquoi les interactions coévolues produisent rarement de longues listes de traits coévolus qui deviennent fixes au sein des espèces. Les études de terrain à long terme de la même interaction à travers plusieurs communautés et les modèles mathématiques structurés spatialement commencent ensemble à montrer que la coévolution peut être un processus en cours plus important que ce que l'avaient indiqué les études empiriques et théoriques antérieures dépourvues d'une perspective géographique.",
    url = "https://doi.org/10.1086/303208",
    doi = "10.1086/303208",
    openalex = "W2071357982",
    references = "doi101073pnas8793566"
}

Ce dictionnaire, toujours best-seller, offre aux nutritionnistes, aux scientifiques de l'alimentation et aux chercheurs un accès aux informations couramment nécessaires, y compris les formules structurales, sur les constituants végétaux. Il présente plus de 3000 substances, des phénols et alcaloïdes aux glucides et glycosides végétaux, jusqu'aux huiles et triterpénoïdes. Pour chaque substance, les éditeurs présentent son nom trivial, ses synonymes, son type structural, sa structure chimique montrant la stéréochimie, sa masse moléculaire et sa formule, ainsi que sa présence naturelle, son activité biologique et ses usages courants et commerciaux. Des références clés sont fournies pour chaque classe et sous-classe.

@book{openalexw1491177125,
    author = "Harborne, Jeffrey B. and Baxter, Herbert and Moss, Gerard P.",
    title = "Phytochemical dictionary. A handbook of bioactive compounds from plants.",
    year = "1999",
    abstract = "Ce dictionnaire, toujours best-seller, offre aux nutritionnistes, aux scientifiques de l'alimentation et aux chercheurs un accès aux informations couramment nécessaires, y compris les formules structurales, sur les constituants végétaux. Il présente plus de 3000 substances, des phénols et alcaloïdes aux glucides et glycosides végétaux, jusqu'aux huiles et triterpénoïdes. Pour chaque substance, les éditeurs présentent son nom trivial, ses synonymes, son type structural, sa structure chimique montrant la stéréochimie, sa masse moléculaire et sa formule, ainsi que sa présence naturelle, son activité biologique et ses usages courants et commerciaux. Des références clés sont fournies pour chaque classe et sous-classe.",
    openalex = "W1491177125"
}

Deux modèles généraux ont émergé des études intensives sur les associations insecte-hôte plante : une prédominance des spécialistes sur les généralistes et un conservatisme taxonomique dans l'utilisation des hôtes-plantes. Dans la plupart des systèmes insecte-hôte plante, les explications de ces modèles doivent reposer sur des biais dans les processus de colonisation des hôtes, de changement d'hôte et de spécialisation, plutôt que de cospéciation. Dans le présent article, nous investiguons les changements de gamme d'hôtes dans la tribu des papillons nymphalidés Nymphalini, en utilisant des optimisations de parcimonie des données sur les hôtes-plantes sur la phylogénie du papillon. De plus, nous avons effectué des tests d'établissement larvaire pour rechercher la capacité larvaire à se nourrir et survivre sur des plantes qui ont été perdues du répertoire de ponte des femelles. Les optimisations suggèrent une association ancestrale avec les Urticaceae, et la plupart des espèces testées ont montré une capacité à se nourrir sur Urtica dioica indépendamment de l'utilisation réelle de l'hôte-plante. De plus, il y avait un biais parmi les établissements réussis sur des non-hôtes vers des plantes qui sont utilisées comme hôtes par d'autres espèces dans les Nymphalini. Une probabilité accrue de coloniser des plantes ancestrales ou apparentées pourrait également fournir une explication alternative au modèle observé selon lequel certaines familles de plantes semblent avoir été colonisées indépendamment plusieurs fois dans la tribu. Nous montrons également qu'il n'y a pas de directionnalité dans l'évolution de la gamme d'hôtes vers une spécialisation accrue, c'est-à-dire que la spécialisation n'est pas une impasse. Au lieu de cela, les changements de gamme d'hôtes montrent un modèle très dynamique.

@article{doi1015540014382020010550783edohps20co2,
    author = "Janz, Niklas et Nyblom, Klas et Nylin, Sören",
    title = "DYNAMIQUE ÉVOLUTIVE DE LA SPÉCIALISATION DES HÔTES-PLANTES : UNE ÉTUDE DE CAS SUR LA TRIBU DES NYMPHALINI",
    year = "2001",
    journal = "Évolution",
    abstract = "Deux modèles généraux ont émergé des études intensives sur les associations insecte-hôte plante : une prédominance des spécialistes sur les généralistes et un conservatisme taxonomique dans l'utilisation des hôtes-plantes. Dans la plupart des systèmes insecte-hôte plante, les explications de ces modèles doivent reposer sur des biais dans les processus de colonisation des hôtes, de changement d'hôte et de spécialisation, plutôt que de cospéciation. Dans le présent article, nous investiguons les changements de gamme d'hôtes dans la tribu des papillons nymphalidés Nymphalini, en utilisant des optimisations de parcimonie des données sur les hôtes-plantes sur la phylogénie du papillon. De plus, nous avons effectué des tests d'établissement larvaire pour rechercher la capacité larvaire à se nourrir et survivre sur des plantes qui ont été perdues du répertoire de ponte des femelles. Les optimisations suggèrent une association ancestrale avec les Urticaceae, et la plupart des espèces testées ont montré une capacité à se nourrir sur Urtica dioica indépendamment de l'utilisation réelle de l'hôte-plante. De plus, il y avait un biais parmi les établissements réussis sur des non-hôtes vers des plantes qui sont utilisées comme hôtes par d'autres espèces dans les Nymphalini. Une probabilité accrue de coloniser des plantes ancestrales ou apparentées pourrait également fournir une explication alternative au modèle observé selon lequel certaines familles de plantes semblent avoir été colonisées indépendamment plusieurs fois dans la tribu. Nous montrons également qu'il n'y a pas de directionnalité dans l'évolution de la gamme d'hôtes vers une spécialisation accrue, c'est-à-dire que la spécialisation n'est pas une impasse. Au lieu de cela, les changements de gamme d'hôtes montrent un modèle très dynamique.",
    url = "https://doi.org/10.1554/0014-3820(2001)055[0783:edohps]2.0.co;2",
    doi = "10.1554/0014-3820(2001)055[0783:edohps]2.0.co;2",
    openalex = "W2176674420",
    references = "doi101111j155856461975tb00861x"
}

Cette revue rapporte sur les processus associés aux coûts de la reproduction, y compris certaines considérations théoriques, des définitions et des aspects méthodologiques, suivis d'une liste des situations où les coûts sont difficiles à trouver. Malgré quelques exceptions, les études de cas, examinées par les compromis entre la reproduction et d'autres traits de l'histoire de vie, soutiennent généralement les prédictions de l'hypothèse des coûts de la reproduction. Le coût de la reproduction en tant que déterminant évolutif du dimorphisme sexuel dans les traits de l'histoire de vie chez les espèces dioïques a été spécifiquement testé, en considérant que le coût plus élevé de la reproduction chez les femelles a conduit aux traits de l'histoire de vie liés au dimorphisme sexuel. Les femelles des espèces dioïques ligneuses ont été systématiquement plus petites que les mâles, ce qui soutient l'hypothèse des coûts de la reproduction. Par contraste, les femelles des plantes herbacées vivaces ont généralement été le sexe plus grand, ce qui ne correspondait pas aux attentes de l'hypothèse. Enfin, les mécanismes qui permettent la compensation des coûts de la reproduction sont détaillés, y compris les réponses plastiques de la photosynthèse et de la croissance, les effets du moment de l'investissement, l'architecture végétale et l'intégration physiologique végétale. Résumé des contenus 321 I. Introduction 321 II. Théorie sur les coûts de la reproduction 322 III. Aspects méthodologiques 324 IV. Preuves empiriques 328 V. Taille des plantes et coûts de la reproduction 330 VI. Coûts de la reproduction chez les plantes dimorphes sexuellement 331 VII. Compensation des coûts 333 VIII. Commentaires conclusifs et perspectives futures 336 Remerciements 337 Références 337.

@article{doi101046j14698137200200477x,
    author = "Obeso, José Ramón",
    title = "The costs of reproduction in plants",
    year = "2002",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Cette revue rapporte sur les processus associés aux coûts de la reproduction, y compris certaines considérations théoriques, des définitions et des aspects méthodologiques, suivis d'une liste des situations où les coûts sont difficiles à trouver. Malgré quelques exceptions, les études de cas, examinées par les compromis entre la reproduction et d'autres traits de l'histoire de vie, soutiennent généralement les prédictions de l'hypothèse des coûts de la reproduction. Le coût de la reproduction en tant que déterminant évolutif du dimorphisme sexuel dans les traits de l'histoire de vie chez les espèces dioïques a été spécifiquement testé, en considérant que le coût plus élevé de la reproduction chez les femelles a conduit aux traits de l'histoire de vie liés au dimorphisme sexuel. Les femelles des espèces dioïques ligneuses ont été systématiquement plus petites que les mâles, ce qui soutient l'hypothèse des coûts de la reproduction. Par contraste, les femelles des plantes herbacées vivaces ont généralement été le sexe plus grand, ce qui ne correspondait pas aux attentes de l'hypothèse. Enfin, les mécanismes qui permettent la compensation des coûts de la reproduction sont détaillés, y compris les réponses plastiques de la photosynthèse et de la croissance, les effets du moment de l'investissement, l'architecture végétale et l'intégration physiologique végétale. Résumé des contenus 321 I. Introduction 321 II. Théorie sur les coûts de la reproduction 322 III. Aspects méthodologiques 324 IV. Preuves empiriques 328 V. Taille des plantes et coûts de la reproduction 330 VI. Coûts de la reproduction chez les plantes dimorphes sexuellement 331 VII. Compensation des coûts 333 VIII. Commentaires conclusifs et perspectives futures 336 Remerciements 337 Références 337.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1469-8137.2002.00477.x",
    doi = "10.1046/j.1469-8137.2002.00477.x",
    openalex = "W2149139127",
    references = "doi101007bf02860717, doi101086282461, doi101126science1061967, doi101146annurevecolsys281659, doi1015159780691207278, doi1023072389364, doi107312rens91062, openalexw2000871817"
}

La plasticité phénotypique adaptative dans la défense chimique est censée jouer un rôle majeur dans les interactions plante-herbivore. Nous avons étudié la variation génétique de l'inductibilité des traits défensifs chez les plantes de radis sauvages et nous avons demandé si l'évolution de l'induction est contrainte par les coûts de la plasticité phénotypique. Dans une expérience en serre utilisant des familles de demi-frères paternels, nous montrons une variation génétique additive pour la plasticité de la concentration en glucosinolates. La variation génétique des glucosinolates n'a pas été détectée chez les plantes indemnes, mais elle était significative après herbivorie par un herbivore spécialiste, Pieris rapae. En moyenne, les plantes endommagées présentaient des concentrations de glucosinolates 55 % plus élevées que les témoins. De plus, nous avons trouvé des héritabilités au sens étroit significatives pour la taille des feuilles, le nombre de trichomes, la phénologie de la floraison et la production de fruits sur toute la durée de vie. Dans une deuxième expérience, nous avons trouvé des preuves de variation génétique dans la résistance induite des plantes à P. rapae. Bien qu'il y ait globalement peu de preuves de corrélations génétiques entre les traits défensifs et les traits de l'histoire de vie que nous avons mesurés, nous montrons que les familles plus plastiques avaient une fitness plus faible que les familles moins plastiques en l'absence d'herbivorie (c'est-à-dire des preuves de coûts génétiques de la plasticité). Ainsi, il existe une variation génétique pour l'induction de la défense chez le radis sauvage, et l'évolution de l'inductibilité peut être contrainte par les coûts de la plasticité.

@article{doi101111j001438202002tb00145x,
    author = "Agrawal, Anurag A. et Conner, Jeffrey K. et Johnson, Marc T. J. et Wallsgrove, Roger M.",
    title = "GÉNÉTIQUE ÉCOLOGIQUE D'UNE DÉFENSE VÉGÉTALE INDUITE CONTRE LES HERBIVORES : VARIANCE GÉNÉTIQUE ADDITIVE ET COÛTS DE LA PLASTICITÉ PHÉNOTYPIQUE",
    year = "2002",
    journal = "Évolution",
    abstract = "La plasticité phénotypique adaptative dans la défense chimique est censée jouer un rôle majeur dans les interactions plante-herbivore. Nous avons étudié la variation génétique de l'inductibilité des traits défensifs chez les plantes de radis sauvages et nous avons demandé si l'évolution de l'induction est contrainte par les coûts de la plasticité phénotypique. Dans une expérience en serre utilisant des familles de demi-frères paternels, nous montrons une variation génétique additive pour la plasticité de la concentration en glucosinolates. La variation génétique des glucosinolates n'a pas été détectée chez les plantes indemnes, mais elle était significative après herbivorie par un herbivore spécialiste, Pieris rapae. En moyenne, les plantes endommagées présentaient des concentrations de glucosinolates 55 % plus élevées que les témoins. De plus, nous avons trouvé des héritabilités au sens étroit significatives pour la taille des feuilles, le nombre de trichomes, la phénologie de la floraison et la production de fruits sur toute la durée de vie. Dans une deuxième expérience, nous avons trouvé des preuves de variation génétique dans la résistance induite des plantes à P. rapae. Bien qu'il y ait globalement peu de preuves de corrélations génétiques entre les traits défensifs et les traits de l'histoire de vie que nous avons mesurés, nous montrons que les familles plus plastiques avaient une fitness plus faible que les familles moins plastiques en l'absence d'herbivorie (c'est-à-dire des preuves de coûts génétiques de la plasticité). Ainsi, il existe une variation génétique pour l'induction de la défense chez le radis sauvage, et l'évolution de l'inductibilité peut être contrainte par les coûts de la plasticité.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0014-3820.2002.tb00145.x",
    doi = "10.1111/j.0014-3820.2002.tb00145.x",
    openalex = "W2177795929",
    references = "doi10100797830308394061, doi101016s0169534797012743, doi101038hdy1987113, doi101086416841, doi101093genetics1301195, doi101126science1060701, doi1023071942495, doi1023072529912, doi107208chicago97802264249720010001, openalexw1512719169"
}

▪ Résumé Un objectif important de l'écologie végétale est d'identifier les dimensions principales de la variation écologique entre les espèces et de comprendre leur fondement. Les dimensions qui peuvent être facilement mesurées seraient particulièrement utiles, car elles pourraient offrir une voie vers une synthèse mondiale améliorée à travers les milliers d'expériences de terrain et d'études écophysiologiques qui utilisent chacune seulement quelques espèces. Quatre dimensions sont examinées ici. La dimension masse foliaire par surface–durée de vie foliaire (LMA-LL) exprime un turnover lent des parties de la plante (à LMA élevée et LL longue), des temps de résidence des nutriments longs, et une réponse lente aux conditions de croissance favorables. La dimension masse des graines–production de graines (SM-SO) est un prédicteur important de la dispersion vers les opportunités d'établissement (production de graines) et du succès d'établissement face aux dangers (masse des graines). Les dimensions LMA-LL et SM-SO sont chacune soutenues par un compromis unique et compréhensible, et leurs conséquences sont assez bien comprises. Le spectre taille foliaire–taille de brindille (LS-TS) a des conséquences évidentes sur la texture des canopées, mais les coûts et bénéfices de la taille foliaire et de brindille grande par rapport à petite sont mal compris. La dimension hauteur a universellement été considérée comme écologiquement importante et incluse dans les schémas de stratégie écologique. Néanmoins, la hauteur inclut plusieurs compromis et éléments adaptatifs, qui devraient idéalement être traités séparément. Chacune de ces quatre dimensions varie aux échelles des zones climatiques et des types de sites au sein des paysages. Cette variation peut être interprétée comme une adaptation à l'environnement physique. Chaque dimension varie également largement entre les espèces coexistantes. Il est le plus probable que cette variation intra-site survienne parce que les opportunités écologiques pour chaque espèce dépendent fortement de quelles autres espèces sont présentes, en d'autres termes, parce que l'ensemble des espèces sur un site est un mélange stable de stratégies.

@article{doi101146annurevecolsys33010802150452,
    author = "Westoby, Mark et Falster, Daniel S. et Moles, Angela T. et Vesk, Peter A. et Wright, Ian J.",
    title = "Plant Ecological Strategies: Some Leading Dimensions of Variation Between Species",
    year = "2002",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "▪ Résumé Un objectif important de l'écologie végétale est d'identifier les dimensions principales de la variation écologique entre les espèces et de comprendre leur fondement. Les dimensions qui peuvent être facilement mesurées seraient particulièrement utiles, car elles pourraient offrir une voie vers une synthèse mondiale améliorée à travers les milliers d'expériences de terrain et d'études écophysiologiques qui utilisent chacune seulement quelques espèces. Quatre dimensions sont examinées ici. La dimension masse foliaire par surface–durée de vie foliaire (LMA-LL) exprime un turnover lent des parties de la plante (à LMA élevée et LL longue), des temps de résidence des nutriments longs, et une réponse lente aux conditions de croissance favorables. La dimension masse des graines–production de graines (SM-SO) est un prédicteur important de la dispersion vers les opportunités d'établissement (production de graines) et du succès d'établissement face aux dangers (masse des graines). Les dimensions LMA-LL et SM-SO sont chacune soutenues par un compromis unique et compréhensible, et leurs conséquences sont assez bien comprises. Le spectre taille foliaire–taille de brindille (LS-TS) a des conséquences évidentes sur la texture des canopées, mais les coûts et bénéfices de la taille foliaire et de brindille grande par rapport à petite sont mal compris. La dimension hauteur a universellement été considérée comme écologiquement importante et incluse dans les schémas de stratégie écologique. Néanmoins, la hauteur inclut plusieurs compromis et éléments adaptatifs, qui devraient idéalement être traités séparément. Chacune de ces quatre dimensions varie aux échelles des zones climatiques et des types de sites au sein des paysages. Cette variation peut être interprétée comme une adaptation à l'environnement physique. Chaque dimension varie également largement entre les espèces coexistantes. Il est le plus probable que cette variation intra-site survienne parce que les opportunités écologiques pour chaque espèce dépendent fortement de quelles autres espèces sont présentes, en d'autres termes, parce que l'ensemble des espèces sur un site est un mélange stable de stratégies.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150452",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.33.010802.150452",
    openalex = "W2167109558",
    references = "doi1010079789401090131, doi101007bf02860997, doi101016s0065250408600161, doi101023a1004327224729, doi10103823251, doi101086283244, doi101086284133, doi101086284165, doi101086284325, doi101086285357, doi101086417659, doi101111j109583121989tb00492x, doi101126science2304728895, doi101146annurevecolsys311343, doi101146annureves11110180001313, doi1023071942495, openalexw2169917233"
}

De nombreuses espèces de papillons et de papillons diurnes aposematiques séquestrent des substances désagréables ou toxiques à partir de leurs plantes hôtes plutôt que de fabriquer leurs propres substances défensives. Malgré une grande diversité dans leurs histoires de vie, il existe certaines caractéristiques générales dans l'utilisation sélective des métabolites secondaires des plantes pour assurer une protection efficace contre les prédateurs. Cette revue illustre les caractéristiques biochimiques, physiologiques et écologiques des systèmes de défense basés sur les phytochimiques qui peuvent jeter de la lumière sur l'évolution des modes de vie de séquestration largement développés chez les Lépidoptères.

@article{doi101146annurevento47091201145121,
    author = "Nishida, Ritsuo",
    title = "Sequestration of Defensive Substances from Plants by Lepidoptera",
    year = "2002",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "A number of aposematic butterfly and diurnal moth species sequester unpalatable or toxic substances from their host plants rather than manufacturing their own defensive substances. Despite a great diversity in their life histories, there are some general features in the selective utilization of plant secondary metabolites to achieve effective protection from predators. This review illustrates the biochemical, physiological, and ecological characteristics of phytochemical-based defense systems that can shed light on the evolution of the widely developed sequestering lifestyles among the Lepidoptera.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ento.47.091201.145121",
    doi = "10.1146/annurev.ento.47.091201.145121",
    openalex = "W2155710214",
    references = "doi1010079781489932006, doi101007b102508, doi101016b9780121083809x50017, doi101111j155856461964tb01674x, doi101111j155856461975tb00861x, doi101111j155856461980tb04849x, doi101146annurevecolsys301201, doi105860choice323872, huheey1984warning, openalexw1491177125, openalexw1538761328, openalexw2119482121"
}

La plupart des études sur les mutualismes plantes-animaux concernent un petit nombre d'espèces. Il existe presque aucune information sur l'organisation structurelle des réseaux mutualistes riches en espèces, malgré son importance potentielle pour le maintien de la diversité. Ici, nous analysons 52 réseaux mutualistes et montrons qu'ils sont hautement imbriqués ; c'est-à-dire que les espèces plus spécialisées interagissent uniquement avec des sous-ensembles propres de celles qui interagissent avec les plus généralistes. Ce motif d'assemblage génère des interactions hautement asymétriques et organise la communauté de manière cohésive autour d'un noyau central d'interactions. Ainsi, les réseaux mutualistes ne sont ni assemblés aléatoirement ni organisés en compartiments résultant d'une spécialisation parallèle serrée. De plus, l'imbrication augmente avec la complexité (nombre d'interactions) du réseau : pour un nombre donné d'espèces, les communautés avec plus d'interactions sont significativement plus imbriquées. Nos résultats indiquent un motif non aléatoire d'organisation de la communauté qui peut être pertinent pour notre compréhension de l'organisation et de la persistance de la biodiversité.

@article{doi101073pnas1633576100,
    author = "Bascompte, Jordi et Jordano, Pedro et Melián, Carlos J. et Olesen, Jens M.",
    title = "The nested assembly of plant–animal mutualistic networks",
    year = "2003",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Most studies of plant-animal mutualisms involve a small number of species. There is almost no information on the structural organization of species-rich mutualistic networks despite its potential importance for the maintenance of diversity. Here we analyze 52 mutualistic networks and show that they are highly nested; that is, the more specialist species interact only with proper subsets of those species interacting with the more generalists. This assembly pattern generates highly asymmetrical interactions and organizes the community cohesively around a central core of interactions. Thus, mutualistic networks are neither randomly assembled nor organized in compartments arising from tight, parallel specialization. Furthermore, nestedness increases with the complexity (number of interactions) of the network: for a given number of species, communities with more interactions are significantly more nested. Our results indicate a nonrandom pattern of community organization that may be relevant for our understanding of the organization and persistence of biodiversity.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1633576100",
    doi = "10.1073/pnas.1633576100",
    openalex = "W2168793216",
    references = "doi101007bf00317508, doi101038238413a0, doi101046j14610248200300403x, doi101073pnas192407699, doi101086285208, doi101111j155856461980tb04849x, doi1023071440574, doi1023072265575, doi105281zenodo19670225, doi107208chicago97802267976700010001"
}

Plusieurs hypothèses, principalement la Défense Optimale (OD), l'Équilibre Carbone : Nutriments (CNB), le Taux de Croissance (GR) et l'Équilibre Croissance-Différenciation (GDB), ont individuellement servi de cadres pour étudier les modèles de défense des plantes contre les herbivores, en particulier le modèle de défense constitutive. Les prédictions et les tests de ces hypothèses ont posé problème pour diverses raisons et ont conduit à une grande confusion concernant l'état de la « théorie de la défense des plantes ». La contribution principale de l'hypothèse OD est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de l'expression génotypique de la défense des plantes, avec un accent sur le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse CNB est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de la manière dont les ressources affectent l'expression phénotypique de la défense des plantes, souvent avec des études préoccupées par le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse GR est qu'elle explique comment le taux de croissance intrinsèque des plantes, façonné évolutionnairement par la disponibilité des ressources, affecte les modèles de défense. La contribution principale de l'hypothèse GDB élargie est qu'elle reconnaît le compromis physiologique constant entre la croissance et la différenciation aux niveaux cellulaire et tissulaire par rapport aux pressions de sélection de la disponibilité des ressources, en tenant explicitement compte de la tolérance des plantes aux dommages causés par les ennemis. Une compréhension plus claire de ces hypothèses et de ce que nous avons appris des enquêtes qui les utilisent peut faciliter le développement d'expériences bien conçues qui combleront les lacunes de nos connaissances sur la défense des plantes.

@article{doi101086367580,
    author = "Stamp, Nancy E.",
    title = "Out Of The Quagmire Of Plant Defense Hypotheses",
    year = "2003",
    journal = "The Quarterly Review of Biology",
    abstract = {Plusieurs hypothèses, principalement la Défense Optimale (OD), l'Équilibre Carbone : Nutriments (CNB), le Taux de Croissance (GR) et l'Équilibre Croissance-Différenciation (GDB), ont individuellement servi de cadres pour étudier les modèles de défense des plantes contre les herbivores, en particulier le modèle de défense constitutive. Les prédictions et les tests de ces hypothèses ont posé problème pour diverses raisons et ont conduit à une grande confusion concernant l'état de la « théorie de la défense des plantes ». La contribution principale de l'hypothèse OD est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de l'expression génotypique de la défense des plantes, avec un accent sur le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse CNB est qu'elle a servi de cadre principal pour l'étude de la manière dont les ressources affectent l'expression phénotypique de la défense des plantes, souvent avec des études préoccupées par le coût d'allocation de la défense. La contribution principale de l'hypothèse GR est qu'elle explique comment le taux de croissance intrinsèque des plantes, façonné évolutionnairement par la disponibilité des ressources, affecte les modèles de défense. La contribution principale de l'hypothèse GDB élargie est qu'elle reconnaît le compromis physiologique constant entre la croissance et la différenciation aux niveaux cellulaire et tissulaire par rapport aux pressions de sélection de la disponibilité des ressources, en tenant explicitement compte de la tolérance des plantes aux dommages causés par les ennemis. Une compréhension plus claire de ces hypothèses et de ce que nous avons appris des enquêtes qui les utilisent peut faciliter le développement d'expériences bien conçues qui combleront les lacunes de nos connaissances sur la défense des plantes.},
    url = "https://doi.org/10.1086/367580",
    doi = "10.1086/367580",
    openalex = "W2129668362",
    references = "doi101098rspb19790081, doi101111j155856461980tb04849x, doi101126science1713973757, doi107208chicago97802264249720010001"
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Le dimorphisme sexuel de la morphologie du bec et de la taille corporelle du colibri à gorge violette des Caraïbes est associé à une inversion du dimorphisme floral de ses plantes nourricières du genre Heliconia. Ce colibri est le seul pollinisateur de H. caribaea et H. bihai, avec des fleurs de la première espèce correspondant aux becs courts et droits des mâles, le sexe plus grand, et des fleurs de la seconde espèce correspondant aux becs longs et courbés des femelles. À Sainte-Lucie, H. bihai compense la rareté de H. caribaea en évoluant un second morphisme de couleur avec des fleurs qui correspondent aux becs des mâles, tandis qu'à Dominique, H. caribaea évolue un second morphisme de couleur avec des fleurs qui correspondent aux becs des femelles. Les récompenses en nectar de tous les morphismes d'Heliconia sont cohérentes avec le choix de chaque sexe du morphisme qui correspond à sa morphologie du bec et à ses besoins énergétiques, soutenant l'hypothèse que les préférences alimentaires ont conduit à leur coadaptation.

@article{doi101126science1080003,
    author = "Temeles, Ethan J. et Kress, W. John",
    title = "Adaptation dans une association plante-hummingbird",
    year = "2003",
    journal = "Science",
    abstract = "Le dimorphisme sexuel de la morphologie du bec et de la taille corporelle du colibri à gorge violette des Caraïbes est associé à une inversion du dimorphisme floral de ses plantes nourricières du genre Heliconia. Ce colibri est le seul pollinisateur de H. caribaea et H. bihai, avec des fleurs de la première espèce correspondant aux becs courts et droits des mâles, le sexe plus grand, et des fleurs de la seconde espèce correspondant aux becs longs et courbés des femelles. À Sainte-Lucie, H. bihai compense la rareté de H. caribaea en évoluant un second morphisme de couleur avec des fleurs qui correspondent aux becs des mâles, tandis qu'à Dominique, H. caribaea évolue un second morphisme de couleur avec des fleurs qui correspondent aux becs des femelles. Les récompenses en nectar de tous les morphismes d'Heliconia sont cohérentes avec le choix de chaque sexe du morphisme qui correspond à sa morphologie du bec et à ses besoins énergétiques, soutenant l'hypothèse que les préférences alimentaires ont conduit à leur coadaptation.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1080003",
    doi = "10.1126/science.1080003",
    openalex = "W1986696838"
}

La beauté et la grâce des papillons ont longtemps captivé les gens du monde entier, mais leur diversité et leur complexité ont attiré l'attention particulière des scientifiques amateurs et professionnels depuis au moins l'époque de Darwin. Grâce à cette longue histoire de recherche, on en sait plus sur les papillons que sur presque tout autre groupe d'insectes. Dans Papillons : écologie et évolution en plein vol, les experts mondiaux synthétisent les connaissances actuelles sur les papillons pour montrer comment l'étude de ces créatures fascinantes en tant que systèmes modèles peut conduire à une compréhension plus profonde des modèles et processus écologiques et évolutifs en général. Les 26 chapitres sont organisés en grandes zones fonctionnelles, couvrant les utilisations des papillons dans l'étude du comportement, de l'écologie, de la génétique et de l'évolution, de la systématique et de la biologie de la conservation. Surtout dans le contexte de l'actuelle crise de la biodiversité, ce livre montre comment les résultats obtenus avec les papillons peuvent nous aider à comprendre les grands changements rapides dans le monde que nous partageons avec eux - par exemple, les distributions géographiques de certains papillons ont commencé à se déplacer en réponse au réchauffement climatique, fournissant des preuves précoces du changement climatique que les scientifiques, les politiciens et les citoyens doivent prendre en compte. La première synthèse internationale de la biologie des papillons en deux décennies, Papillons : écologie et évolution en plein vol offre aux étudiants, aux scientifiques et aux naturalistes amateurs un aperçu concis des dernières avancées dans le domaine. De plus, elle énonce un nouveau point de vue passionnant sur l'ensemble du groupe d'environ 15 000 espèces de papillons en tant que système modèle complet pour toutes les sciences concernées par la biodiversité et sa préservation.

@article{doi105860choice412175,
    title = "Papillons : écologie et évolution en plein vol",
    year = "2003",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "La beauté et la grâce des papillons ont longtemps captivé les gens du monde entier, mais leur diversité et leur complexité ont attiré l'attention particulière des scientifiques amateurs et professionnels depuis au moins l'époque de Darwin. Grâce à cette longue histoire de recherche, on en sait plus sur les papillons que sur presque tout autre groupe d'insectes. Dans Papillons : écologie et évolution en plein vol, les experts mondiaux synthétisent les connaissances actuelles sur les papillons pour montrer comment l'étude de ces créatures fascinantes en tant que systèmes modèles peut conduire à une compréhension plus profonde des modèles et processus écologiques et évolutifs en général. Les 26 chapitres sont organisés en grandes zones fonctionnelles, couvrant les utilisations des papillons dans l'étude du comportement, de l'écologie, de la génétique et de l'évolution, de la systématique et de la biologie de la conservation. Surtout dans le contexte de l'actuelle crise de la biodiversité, ce livre montre comment les résultats obtenus avec les papillons peuvent nous aider à comprendre les grands changements rapides dans le monde que nous partageons avec eux - par exemple, les distributions géographiques de certains papillons ont commencé à se déplacer en réponse au réchauffement climatique, fournissant des preuves précoces du changement climatique que les scientifiques, les politiciens et les citoyens doivent prendre en compte. La première synthèse internationale de la biologie des papillons en deux décennies, Papillons : écologie et évolution en plein vol offre aux étudiants, aux scientifiques et aux naturalistes amateurs un aperçu concis des dernières avancées dans le domaine. De plus, elle énonce un nouveau point de vue passionnant sur l'ensemble du groupe d'environ 15 000 espèces de papillons en tant que système modèle complet pour toutes les sciences concernées par la biodiversité et sa préservation.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.41-2175",
    doi = "10.5860/choice.41-2175",
    openalex = "W28467456"
}

Les communautés végétales ont traditionnellement été considérées soit comme un ensemble aléatoire d'individus, soit comme des entités organismales. Pour la plupart des écologues, cependant, aucune de ces perspectives ne fournit une vue moderne et complète des communautés végétales, mais nous n'avons pas encore formalisé la vision que nous soutenons actuellement. Ici, nous affirmons qu'une réévaluation explicite de la théorie formelle des communautés doit intégrer des interactions qui ont récemment pris de l'importance en écologie végétale, à savoir la facilitation et les effets indirects entre compétiteurs. Ces interactions ne soutiennent pas la perspective individualiste traditionnelle. Nous croyons que le rejet de la théorie individualiste stricte permettra aux écologues d'expliquer mieux les variations se produisant à différentes échelles spatiales, de synthétiser des théories prédictives plus générales de la dynamique des communautés et de développer des modèles pour les réponses au niveau des communautés face aux changements globaux. Ici, nous introduisons le concept de communauté intégrée (CI) qui propose que les communautés végétales naturelles varient d'une individualisme élevé à une interdépendance élevée selon le synergisme entre : (i) les processus stochastiques, (ii) les tolérances abiotiques des espèces, (iii) les interactions positives et négatives entre les plantes, et (iv) les interactions indirectes au sein et entre les niveaux trophiques. Tous ces processus sont bien acceptés par les écologues végétaux, mais aucune théorie unique n'a cherché à intégrer ces différents processus dans notre concept de communautés.

@article{doi101111j00301299200413250x,
    author = "Lortie, Christopher J. et Brooker, Rob W. et Choler, Philippe et Kikvidze, Zaal et Michalet, Richard et Pugnaire, Francisco I. et Callaway, Ragan M.",
    title = "Rethinking plant community theory",
    year = "2004",
    journal = "Oikos",
    abstract = "Les communautés végétales ont traditionnellement été considérées soit comme un ensemble aléatoire d'individus, soit comme des entités organismales. Pour la plupart des écologues, cependant, aucune de ces perspectives ne fournit une vue moderne et complète des communautés végétales, mais nous n'avons pas encore formalisé la vision que nous soutenons actuellement. Ici, nous affirmons qu'une réévaluation explicite de la théorie formelle des communautés doit intégrer des interactions qui ont récemment pris de l'importance en écologie végétale, à savoir la facilitation et les effets indirects entre compétiteurs. Ces interactions ne soutiennent pas la perspective individualiste traditionnelle. Nous croyons que le rejet de la théorie individualiste stricte permettra aux écologues d'expliquer mieux les variations se produisant à différentes échelles spatiales, de synthétiser des théories prédictives plus générales de la dynamique des communautés et de développer des modèles pour les réponses au niveau des communautés face aux changements globaux. Ici, nous introduisons le concept de communauté intégrée (CI) qui propose que les communautés végétales naturelles varient d'une individualisme élevé à une interdépendance élevée selon le synergisme entre : (i) les processus stochastiques, (ii) les tolérances abiotiques des espèces, (iii) les interactions positives et négatives entre les plantes, et (iv) les interactions indirectes au sein et entre les niveaux trophiques. Tous ces processus sont bien acceptés par les écologues végétaux, mais aucune théorie unique n'a cherché à intégrer ces différents processus dans notre concept de communautés.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0030-1299.2004.13250.x",
    doi = "10.1111/j.0030-1299.2004.13250.x",
    openalex = "W2114826865",
    references = "doi101086284167"
}

Résumé Lorsque les racines rencontrent une zone ou une tache riche en nutriments, elles prolifèrent souvent à l'intérieur. Les racines exposées à des taches riches en nutriments peuvent également améliorer leurs capacités physiologiques d'absorption d'ions par rapport aux racines de la même plante situées en dehors de la zone de la tache. Ces réponses plastiques du système racinaire ont été proposées comme le mécanisme principal par lequel les plantes font face aux apports hétérogènes de nutriments naturellement présents dans le sol. Diverses tentatives ont été faites pour prédire comment des espèces contrastées réagiront aux taches, basées sur la longueur spécifique des racines (SRL), la démographie racinaire et l'allocation de la biomasse au sein de la zone de la tache. Aucun critère n'a prouvé être définitif. Démontrer effectivement que la prolifération racinaire est bénéfique pour la plante, surtout en termes de capture d'azote à partir des taches, s'est également avéré difficile. Pourtant, en cultivant des plantes dans des conditions plus réalistes, telles que dans la compétition inter spécifique entre plantes, et avec une tache organique complexe, un bénéfice direct peut être démontré. Ainsi, comme souligné dans cette revue, le contexte environnemental dans lequel la réponse racinaire s'exprime est aussi important que l'amplitude de la réponse elle-même. Table des matières I. Introduction 9 II. Réponses morphologiques 10 III. Démographie racinaire 14 IV. Plasticité physiologique 14 V. Plasticité racinaire dans les taches en compétition et symbiose avec les microorganismes 16 VI. Influence des attributs de la tache 17 VII. Contrôle de la prolifération racinaire 19 VIII. Conclusions 20 Remerciements 20 Références 20

@article{doi101111j14698137200401015x,
    author = "Hodge, Angela",
    title = "The plastic plant: root responses to heterogeneous supplies of nutrients",
    year = "2004",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Résumé Lorsque les racines rencontrent une zone ou une tache riche en nutriments, elles prolifèrent souvent à l'intérieur. Les racines exposées à des taches riches en nutriments peuvent également améliorer leurs capacités physiologiques d'absorption d'ions par rapport aux racines de la même plante situées en dehors de la zone de la tache. Ces réponses plastiques du système racinaire ont été proposées comme le mécanisme principal par lequel les plantes font face aux apports hétérogènes de nutriments naturellement présents dans le sol. Diverses tentatives ont été faites pour prédire comment des espèces contrastées réagiront aux taches, basées sur la longueur spécifique des racines (SRL), la démographie racinaire et l'allocation de la biomasse au sein de la zone de la tache. Aucun critère n'a prouvé être définitif. Démontrer effectivement que la prolifération racinaire est bénéfique pour la plante, surtout en termes de capture d'azote à partir des taches, s'est également avéré difficile. Pourtant, en cultivant des plantes dans des conditions plus réalistes, telles que dans la compétition inter spécifique entre plantes, et avec une tache organique complexe, un bénéfice direct peut être démontré. Ainsi, comme souligné dans cette revue, le contexte environnemental dans lequel la réponse racinaire s'exprime est aussi important que l'amplitude de la réponse elle-même. Table des matières I. Introduction 9 II. Réponses morphologiques 10 III. Démographie racinaire 14 IV. Plasticité physiologique 14 V. Plasticité racinaire dans les taches en compétition et symbiose avec les microorganismes 16 VI. Influence des attributs de la tache 17 VII. Contrôle de la prolifération racinaire 19 VIII. Conclusions 20 Remerciements 20 Références 20",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2004.01015.x",
    doi = "10.1111/j.1469-8137.2004.01015.x",
    openalex = "W2152895243"
}

Nous avons transformé le tabac indigène, Nicotiana attenuata, pour silencier ses gènes de lipoxygénase, hydroperoxyde lyase et allène oxyde synthase afin d'inhiber la signalisation des oxylipines, connue pour médier les défenses directes et indirectes de la plante. Lorsqu'ils ont été plantés dans des habitats indigènes, les plantes déficientes en lipoxygénase étaient plus vulnérables aux herbivores adaptés de N. attenuata, mais ont également attiré de nouvelles espèces d'herbivores, qui se sont nourries et reproduites avec succès. En plus de souligner la valeur du silencage génétique des plantes pour étudier les interactions écologiques dans la nature, ces résultats montrent que la signalisation dépendante de la lipoxygénase détermine la sélection de l'hôte par les herbivores opportunistes et que les défenses induites influencent la composition de la communauté d'herbivores.

@article{doi101126science1096931,
    author = "Keßler, André et Halitschke, Rayko et Baldwin, Ian T.",
    title = "Silencing the Jasmonate Cascade: Induced Plant Defenses and Insect Populations",
    year = "2004",
    journal = "Science",
    abstract = "We transformed the native tobacco, Nicotiana attenuata, to silence its lipoxygenase, hydroperoxide lyase, and allene oxide synthase genes in order to inhibit oxylipin signaling, known to mediate the plant's direct and indirect defenses. When planted into native habitats, lipoxygenase-deficient plants were more vulnerable to N. attenuata's adapted herbivores but also attracted novel herbivore species, which fed and reproduced successfully. In addition to highlighting the value of genetically silencing plants to study ecological interactions in nature, these results show that lipoxygenase-dependent signaling determines host selection for opportunistic herbivores and that induced defenses influence herbivore community composition.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1096931",
    doi = "10.1126/science.1096931",
    openalex = "W2127891636"
}

Le haut potentiel de bénéfice en termes de fitness de la plasticité phénotypique nous incite à s'attendre à ce que la plasticité phénotypique soit une adaptation fréquente à l'hétérogénéité environnementale. Cependant, les exemples de plasticité adaptative avérée chez les plantes sont rares et la plupart des réponses plastiques sont en réalité « passives » plutôt qu'adaptatives. Cela suggère que les exigences pour l'évolution de la plasticité adaptative ne sont souvent pas remplies ou que cette évolution est entravée par des contraintes. Ici, nous décrivons les exigences et les contraintes potentielles pour l'évolution de la plasticité phénotypique adaptative, identifions les questions ouvertes et proposons de nouvelles approches de recherche. Les questions ouvertes importantes concernent le fondement génétique de la plasticité, la variation génétique de la plasticité, la sélection pour la plasticité dans les habitats naturels, ainsi que la nature et l'occurrence des coûts et limites de la plasticité. Les outils particulièrement prometteurs pour répondre à ces questions sont l'analyse des gradients de sélection, la méta-analyse des études sur les interactions génotype-environnement, l'analyse QTL, le balayage par microarray de cADN et la PCR quantitative pour quantifier l'expression des gènes, ainsi que l'électrophorèse bidimensionnelle sur gel pour quantifier l'expression des protéines. L'étude de la plasticité le long du chemin allant de l'expression des gènes au phénotype et de sa relation avec le fitness nous aidera à mieux comprendre pourquoi la plasticité adaptative n'est pas plus universelle et à prédire plus réalistement l'évolution des réponses plastiques aux changements environnementaux.

@article{doi101111j14698137200401296x,
    author = "van Kleunen, Mark et Fischer, Markus",
    title = "Contraintes sur l'évolution de la plasticité phénotypique adaptative chez les plantes",
    year = "2005",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Le haut potentiel de bénéfice en termes de fitness de la plasticité phénotypique nous incite à s'attendre à ce que la plasticité phénotypique soit une adaptation fréquente à l'hétérogénéité environnementale. Cependant, les exemples de plasticité adaptative avérée chez les plantes sont rares et la plupart des réponses plastiques sont en réalité « passives » plutôt qu'adaptatives. Cela suggère que les exigences pour l'évolution de la plasticité adaptative ne sont souvent pas remplies ou que cette évolution est entravée par des contraintes. Ici, nous décrivons les exigences et les contraintes potentielles pour l'évolution de la plasticité phénotypique adaptative, identifions les questions ouvertes et proposons de nouvelles approches de recherche. Les questions ouvertes importantes concernent le fondement génétique de la plasticité, la variation génétique de la plasticité, la sélection pour la plasticité dans les habitats naturels, ainsi que la nature et l'occurrence des coûts et limites de la plasticité. Les outils particulièrement prometteurs pour répondre à ces questions sont l'analyse des gradients de sélection, la méta-analyse des études sur les interactions génotype-environnement, l'analyse QTL, le balayage par microarray de cADN et la PCR quantitative pour quantifier l'expression des gènes, ainsi que l'électrophorèse bidimensionnelle sur gel pour quantifier l'expression des protéines. L'étude de la plasticité le long du chemin allant de l'expression des gènes au phénotype et de sa relation avec le fitness nous aidera à mieux comprendre pourquoi la plasticité adaptative n'est pas plus universelle et à prédire plus réalistement l'évolution des réponses plastiques aux changements environnementaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2004.01296.x",
    doi = "10.1111/j.1469-8137.2004.01296.x",
    openalex = "W2153863902",
    references = "doi101001jama195002910300087029, doi101111j001438202002tb00145x"
}

Des progrès considérables ont été réalisés concernant notre compréhension de la manière dont la chimie des plantes hôtes influence les interactions entre les herbivores et leurs ennemis naturels. Alors que la plupart des travaux se sont concentrés sur les effets de la chimie des plantes sur la localisation et l'acceptation des hôtes par les ennemis naturels, un nombre croissant d'études examinent les effets négatifs. Le rôle tritrophique de la chimie des plantes est central pour plusieurs aspects des phénomènes trophiques, y compris le contrôle top-down versus bottom-up des herbivores, l'espace exempt d'ennemis et le choix de l'hôte, ainsi que les théories de la défense des plantes. De plus, les effets tritrophiques de la chimie des plantes sont importants pour évaluer le degré de compatibilité entre les approches de lutte biologique et de résistance des plantes dans le contrôle des ravageurs. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre les effets physiologiques de la chimie des plantes sur les parasitoïdes. Des tests explicites sont requis pour déterminer si les ennemis naturels peuvent agir comme des forces sélectives sur la défense des plantes. Enfin, de nouvelles études sur les systèmes naturels sont cruciales pour comprendre l'évolution des relations multitrophiques.

@article{doi101146annurevento51110104151110,
    author = "Ode, Paul J.",
    title = "CHIMIE DES PLANTES ET ADAPTATION DES ENNEMIS NATURELS : Effets sur les interactions entre herbivores et ennemis naturels",
    year = "2005",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Des progrès considérables ont été réalisés concernant notre compréhension de la manière dont la chimie des plantes hôtes influence les interactions entre les herbivores et leurs ennemis naturels. Alors que la plupart des travaux se sont concentrés sur les effets de la chimie des plantes sur la localisation et l'acceptation des hôtes par les ennemis naturels, un nombre croissant d'études examinent les effets négatifs. Le rôle tritrophique de la chimie des plantes est central pour plusieurs aspects des phénomènes trophiques, y compris le contrôle top-down versus bottom-up des herbivores, l'espace exempt d'ennemis et le choix de l'hôte, ainsi que les théories de la défense des plantes. De plus, les effets tritrophiques de la chimie des plantes sont importants pour évaluer le degré de compatibilité entre les approches de lutte biologique et de résistance des plantes dans le contrôle des ravageurs. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour comprendre les effets physiologiques de la chimie des plantes sur les parasitoïdes. Des tests explicites sont requis pour déterminer si les ennemis naturels peuvent agir comme des forces sélectives sur la défense des plantes. Enfin, de nouvelles études sur les systèmes naturels sont cruciales pour comprendre l'évolution des relations multitrophiques.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ento.51.110104.151110",
    doi = "10.1146/annurev.ento.51.110104.151110",
    openalex = "W2163714844",
    references = "doi101111j001438202002tb00145x"
}

Il y a trente ans, des chercheurs ont découvert que les fleurs pollinisées par des papillons sont constamment riches en acides aminés du nectar, et des recherches plus récentes ont montré que les papillons préfèrent le nectar riche en acides aminés. Ces observations ont conduit à spéculer que les acides aminés du nectar améliorent la fitness des papillons et que les papillons ont agi comme agents de sélection naturelle sur la composition du nectar. Malgré de nombreux efforts expérimentaux au fil des ans, des preuves convaincantes que les acides aminés du nectar affectent la fitness des papillons ont fait défaut. Ici, nous fournissons les premières preuves que les acides aminés du nectar ont un effet positif sur la fécondité d'une espèce de papillon, soutenant l'existence d'une relation entre les préférences de nectar et les avantages en matière de fitness. Les papillons Map (Araschnia levana L.) élevés dans des conditions alimentaires larvaires naturelles ont pondu plus d'œufs lorsqu'ils ont été nourris avec du nectar contenant des acides aminés, tandis que les acides aminés du nectar n'ont eu aucun effet sur le nombre d'œufs pondus par les papillons élevés sur une nourriture larvaire riche en azote. L'absorption et l'utilisation des acides aminés du nectar par les papillons Map semblent être des mécanismes compensatoires leur permettant de surmonter les impacts d'une mauvaise nourriture larvaire. Ces résultats fournissent un soutien solide au postulat de longue date selon lequel les acides aminés du nectar profitent aux papillons.

@article{doi1023073473471,
    author = "Mevi-Schütz et Erhardt",
    title = "Les acides aminés du nectar améliorent la fécondité des papillons : un lien longtemps attendu",
    year = "2005",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Il y a trente ans, des chercheurs ont découvert que les fleurs pollinisées par des papillons sont constamment riches en acides aminés du nectar, et des recherches plus récentes ont montré que les papillons préfèrent le nectar riche en acides aminés. Ces observations ont conduit à spéculer que les acides aminés du nectar améliorent la fitness des papillons et que les papillons ont agi comme agents de sélection naturelle sur la composition du nectar. Malgré de nombreux efforts expérimentaux au fil des ans, des preuves convaincantes que les acides aminés du nectar affectent la fitness des papillons ont fait défaut. Ici, nous fournissons les premières preuves que les acides aminés du nectar ont un effet positif sur la fécondité d'une espèce de papillon, soutenant l'existence d'une relation entre les préférences de nectar et les avantages en matière de fitness. Les papillons Map (Araschnia levana L.) élevés dans des conditions alimentaires larvaires naturelles ont pondu plus d'œufs lorsqu'ils ont été nourris avec du nectar contenant des acides aminés, tandis que les acides aminés du nectar n'ont eu aucun effet sur le nombre d'œufs pondus par les papillons élevés sur une nourriture larvaire riche en azote. L'absorption et l'utilisation des acides aminés du nectar par les papillons Map semblent être des mécanismes compensatoires leur permettant de surmonter les impacts d'une mauvaise nourriture larvaire. Ces résultats fournissent un soutien solide au postulat de longue date selon lequel les acides aminés du nectar profitent aux papillons.",
    url = "https://doi.org/10.2307/3473471",
    doi = "10.2307/3473471",
    openalex = "W3150272243"
}

La coévolution - changement évolutif réciproque chez les espèces en interaction, piloté par la sélection naturelle - est l'un des processus écologiques et génétiques les plus importants organisant la biodiversité de la Terre : la plupart des plantes et des animaux nécessitent des interactions coévolues avec d'autres espèces pour survivre et se reproduire. Le Mosaïque géographique de la coévolution analyse comment la biologie des espèces fournit la matière première pour la coévolution à long terme, évalue comment la coadaptation locale forme le module de base du changement coévolutif, et explore comment le processus coévolutif remodelles les interactions coévoluant localement à travers les paysages constamment changeants de la Terre. Reprenant là où son ouvrage influent The Coevolutionary Process s'est arrêté, John N. Thompson synthétise l'état d'une science en rapide développement qui intègre des approches provenant de l'écologie évolutive, de la génétique des populations, de la phylogéographie, de la systématique, de la biochimie et de la physiologie évolutives, et de la biologie moléculaire. En utilisant des modèles, des données et des hypothèses pour élaborer un cadre conceptuel complet, Thompson s'appuie également sur des exemples tirés d'une large gamme de taxons et d'environnements, illustrant l'élargissement de la portée et de la profondeur de la recherche en biologie coévolutif.

@article{doi105860choice432194,
    title = "The geographic mosaic of coevolution",
    year = "2005",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Coevolution - reciprocal evolutionary change in interacting species driven by natural selection - is one of the most important ecological and genetic processes organizing the earth's biodiversity: most plants and animals require coevolved interactions with other species to survive and reproduce. The Geographic Mosaic of Coevolution analyzes how the biology of species provides the raw material for long-term coevolution, evaluates how local coadaptation forms the basic module of coevolutionary change, and explores how the coevolutionary process reshapes locally coevolving interactions across the earth's constantly changing landscapes. Picking up where his influential The Coevolutionary Process left off, John N. Thompson synthesizes the state of a rapidly developing science that integrates approaches from evolutionary ecology, population genetics, phylogeography, systematics, evolutionary biochemistry and physiology, and molecular biology. Using models, data, and hypotheses to develop a complete conceptual framework, Thompson also draws on examples from a wide range of taxa and environments, illustrating the expanding breadth and depth of research in coevolutionary biology.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.43-2194",
    doi = "10.5860/choice.43-2194",
    openalex = "W572179489",
    references = "doi101086303213, doi101126science1080003, doi1023074995, doi1023074996, doi107208chicago97802267976700010001"
}

@book{doi107208chicago97802261186970010001,
    author = "Thompson, John N.",
    title = "The Geographic Mosaic of Coevolution",
    year = "2005",
    url = "https://doi.org/10.7208/chicago/9780226118697.001.0001",
    doi = "10.7208/chicago/9780226118697.001.0001",
    openalex = "W4300517352"
}

@article{doi101007s1088600692078,
    author = "Engler-Chaouat, Helene S. et Gilbert, Lawrence E.",
    title = "Synthèse de novo vs. Séquestration : Traits métaboliques négativement corrélés et l'évolution de la spécialisation sur plante hôte chez les papillons cyanogènes",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Chemical Ecology",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10886-006-9207-8",
    doi = "10.1007/s10886-006-9207-8",
    openalex = "W2095321706",
    references = "benson1975coevolution, doi101007b102508, doi101086284325, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio423265, doi101098rstb19890106, doi101111j155856461964tb01674x, doi101146annureves11110180000353, doi105860choice295104, doi105860choice323872, ehrlich1964butterflies"
}

Dans les paysages soumis à une agriculture intensive, la fertilité des sols et les perturbations de la végétation sont capables d'impacter fortement, uniformément et simultanément la couverture végétale herbacée, et chacune tend à imposer une uniformité aux traits des espèces constitutives. Dans les prairies plus naturelles et anciennes, une plus grande variation spatiale et temporelle de la productivité et des perturbations se produit, et les deux facteurs ont été impliqués dans le maintien de la richesse spécifique dans les communautés herbacées. Cependant, les données empiriques suggèrent que la perturbation est le moteur plus puissant de la différenciation des traits et de la coexistence des espèces à une échelle locale. Cela peut découler de la grande diversité des opportunités d'établissement, de croissance ou de reproduction qui apparaissent lorsque l'intensité de la compétition est réduite par des dommages à la végétation. Contrairement aux effets diversifiants des perturbations locales, les traits des plantes liés à la productivité (taux de croissance, longévité des feuilles, chimie des feuilles, dureté des feuilles, taux de décomposition) semblent moins variables à une échelle locale. Cette différence dans les effets des filtres de productivité et de perturbation provient de la constance relative de la productivité au sein de la communauté et de la diversité en termes d'agents et d'échelles spatiales et temporelles exhibées par les événements de perturbation. De plus, les réponses évolutives aux perturbations impliquent des ajustements adaptatifs mineurs dans les traits phénologiques et régénératifs et sont plus susceptibles de se produire sous forme d'étapes micro-évolutives que les changements dans les traits liés de la physiologie centrale associés à la capacité d'exploiter les habitats productifs et non productifs. Lors de l'assemblage d'une communauté et au cours de sa durée de vie subséquente, des filtres aux effets diversifiants et convergents peuvent fonctionner simultanément sur le recrutement depuis le pool d'espèces local et imposer des effets contrastés sur la similarité des valeurs de traits exhibées par les espèces coexistantes. De plus, en conséquence de l'association fréquente de la productivité avec le filtre de convergence, une différence supplémentaire est prédite en termes des effets des deux filtres sur le fonctionnement de l'écosystème. La convergence dans les traits sélectionnés par le filtre de productivité exercera des effets à la fois sur la communauté végétale et sur l'écosystème, tandis que les effets divergents du filtre de perturbation seront restreints à la communauté végétale.

@article{doi101111j165411032006tb02444x,
    author = "Grime, J. P.",
    title = "Convergence et divergence des traits dans les communautés de plantes herbacées : Mécanismes et conséquences",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Vegetation Science",
    abstract = "Dans les paysages soumis à une agriculture intensive, la fertilité des sols et les perturbations de la végétation sont capables d'impacter fortement, uniformément et simultanément la couverture végétale herbacée, et chacune tend à imposer une uniformité aux traits des espèces constitutives. Dans les prairies plus naturelles et anciennes, une plus grande variation spatiale et temporelle de la productivité et des perturbations se produit, et les deux facteurs ont été impliqués dans le maintien de la richesse spécifique dans les communautés herbacées. Cependant, les données empiriques suggèrent que la perturbation est le moteur plus puissant de la différenciation des traits et de la coexistence des espèces à une échelle locale. Cela peut découler de la grande diversité des opportunités d'établissement, de croissance ou de reproduction qui apparaissent lorsque l'intensité de la compétition est réduite par des dommages à la végétation. Contrairement aux effets diversifiants des perturbations locales, les traits des plantes liés à la productivité (taux de croissance, longévité des feuilles, chimie des feuilles, dureté des feuilles, taux de décomposition) semblent moins variables à une échelle locale. Cette différence dans les effets des filtres de productivité et de perturbation provient de la constance relative de la productivité au sein de la communauté et de la diversité en termes d'agents et d'échelles spatiales et temporelles exhibées par les événements de perturbation. De plus, les réponses évolutives aux perturbations impliquent des ajustements adaptatifs mineurs dans les traits phénologiques et régénératifs et sont plus susceptibles de se produire sous forme d'étapes micro-évolutives que les changements dans les traits liés de la physiologie centrale associés à la capacité d'exploiter les habitats productifs et non productifs. Lors de l'assemblage d'une communauté et au cours de sa durée de vie subséquente, des filtres aux effets diversifiants et convergents peuvent fonctionner simultanément sur le recrutement depuis le pool d'espèces local et imposer des effets contrastés sur la similarité des valeurs de traits exhibées par les espèces coexistantes. De plus, en conséquence de l'association fréquente de la productivité avec le filtre de convergence, une différence supplémentaire est prédite en termes des effets des deux filtres sur le fonctionnement de l'écosystème. La convergence dans les traits sélectionnés par le filtre de productivité exercera des effets à la fois sur la communauté végétale et sur l'écosystème, tandis que les effets divergents du filtre de perturbation seront restreints à la communauté végétale.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1654-1103.2006.tb02444.x",
    doi = "10.1111/j.1654-1103.2006.tb02444.x",
    openalex = "W2126535795",
    references = "doi1023073544421, doi105962bhltitle46292"
}

« Les ravageurs colonisent rapidement les plantes cultivées à grande échelle, les espèces végétales recrutent différentes espèces de ravageurs dans différentes régions, et les associations entre insectes et plantes sont souvent plus occasionnelles, fortuites et labiles que celles généralement interprétées comme coévolutives. » (, p. 89) « … lorsqu'un parasite arrive dans un nouvel habitat, il se nourrira de celles dont les traits de défense il peut contourner grâce aux capacités qu'il possède à ce moment-là. Un tel parasite ne peut pas être distingué de celui qui a évolué la capacité de contourner une défense tout en étant en contact trophique avec son hôte. » (, p. 611) « Nous pensons qu'une hypothèse nulle raisonnable … est que de nombreuses associations entre insectes et plantes peuvent se produire sans beaucoup d'évolution … » (Rey, McCoy et Strong 1981, p. 620) « Le rôle principal des substances secondaires des plantes dans les relations insecte/hôte plante est qu'elles forment l'« empreinte digitale » … par laquelle l'insecte reconnaît les plantes … La reconnaissance d'une plante comme hôte n'est pas liée au fait que la plante et l'insecte aient évolué ensemble ou qu'ils se rencontrent pour la première fois dans leur histoire évolutive. » (, p. 620)

@article{doi101111j20060030129915025x,
    author = "Agosta, Salvatoe J.",
    title = "On ecological fitting, plant–insect associations, herbivore host shifts, and host plant selection",
    year = "2006",
    journal = "Oikos",
    abstract = "« Les ravageurs colonisent rapidement les plantes cultivées à grande échelle, les espèces végétales recrutent différentes espèces de ravageurs dans différentes régions, et les associations entre insectes et plantes sont souvent plus occasionnelles, fortuites et labiles que celles généralement interprétées comme coévolutives. » (, p. 89) « … lorsqu'un parasite arrive dans un nouvel habitat, il se nourrira de celles dont les traits de défense il peut contourner grâce aux capacités qu'il possède à ce moment-là. Un tel parasite ne peut pas être distingué de celui qui a évolué la capacité de contourner une défense tout en étant en contact trophique avec son hôte. » (, p. 611) « Nous pensons qu'une hypothèse nulle raisonnable … est que de nombreuses associations entre insectes et plantes peuvent se produire sans beaucoup d'évolution … » (Rey, McCoy et Strong 1981, p. 620) « Le rôle principal des substances secondaires des plantes dans les relations insecte/hôte plante est qu'elles forment l'« empreinte digitale » … par laquelle l'insecte reconnaît les plantes … La reconnaissance d'une plante comme hôte n'est pas liée au fait que la plante et l'insecte aient évolué ensemble ou qu'ils se rencontrent pour la première fois dans leur histoire évolutive. » (, p. 620)",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.2006.0030-1299.15025.x",
    doi = "10.1111/j.2006.0030-1299.15025.x",
    openalex = "W2067174381",
    references = "doi101111j155856461975tb00861x"
}

Les volatils végétaux (VV) sont des molécules lipophiles à haute pression de vapeur qui remplissent diverses fonctions écologiques. La synthèse des VV implique l'élimination de groupements hydrophiles et des réactions d'oxydation/hydroxylation, de réduction, de méthylation et d'acylation. Certaines enzymes de biosynthèse des VV produisent plusieurs produits à partir d'un seul substrat ou agissent sur plusieurs substrats. Les gènes de biosynthèse des VV évoluent par duplication de gènes qui dirigent d'autres aspects du métabolisme végétal ; ces gènes dupliqués divergent ensuite les uns des autres au fil du temps. Des modifications du substrat préféré ou du produit résultant des enzymes des VV peuvent survenir par des changements minimaux de résidus critiques. L'évolution convergente est souvent responsable de la capacité d'espèces distantes à synthétiser le même volatil.

@article{doi101126science1118510,
    author = "Pichersky, Eran et Noel, Joseph P. et Dudareva, Natalia",
    title = "Biosynthèse des volatils végétaux : la diversité et l'ingéniosité de la nature",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    abstract = "Les volatils végétaux (VV) sont des molécules lipophiles à haute pression de vapeur qui remplissent diverses fonctions écologiques. La synthèse des VV implique l'élimination de groupements hydrophiles et des réactions d'oxydation/hydroxylation, de réduction, de méthylation et d'acylation. Certaines enzymes de biosynthèse des VV produisent plusieurs produits à partir d'un seul substrat ou agissent sur plusieurs substrats. Les gènes de biosynthèse des VV évoluent par duplication de gènes qui dirigent d'autres aspects du métabolisme végétal ; ces gènes dupliqués divergent ensuite les uns des autres au fil du temps. Des modifications du substrat préféré ou du produit résultant des enzymes des VV peuvent survenir par des changements minimaux de résidus critiques. L'évolution convergente est souvent responsable de la capacité d'espèces distantes à synthétiser le même volatil.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1118510",
    doi = "10.1126/science.1118510",
    openalex = "W2124255498"
}

Étant donné que la stratégie de défense d'une plante contre l'herbivorie ne sera jamais vraisemblablement un seul trait, nous développons le concept de syndromes de défense des plantes, où l'association avec des interactions écologiques spécifiques peut entraîner une convergence sur des ensembles de traits défensifs covariant. Les syndromes de défense peuvent être étudiés au sein de communautés de diverses espèces végétales ainsi que au sein de clades d'espèces étroitement apparentées. Dans les deux cas, la théorie prédit que les traits de défense des plantes peuvent covarier de manière cohérente entre les espèces, en raison d'une ascendance évolutive partagée ou en raison d'une convergence adaptative. Nous avons examiné les syndromes de défense potentiels chez 24 espèces de laitues (Asclepias spp.) dans une expérience de terrain. En utilisant des contrastes phylogénétiquement indépendants, nous avons trouvé peu de corrélations entre sept traits défensifs, aucune compensation bivariée, et des corrélations positives notables entre la densité de trichomes et la production de latex, ainsi qu'entre le rapport C:N et la dureté des feuilles. Nous avons ensuite utilisé une analyse de cluster hiérarchique pour produire un phénogramme de similarité des traits de défense parmi les 24 espèces. Cette analyse a révélé trois clusters distincts d'espèces. Les syndromes de défense de ces clusters d'espèces sont associés soit à une faible qualité nutritionnelle, soit à un équilibre entre une qualité nutritionnelle plus élevée et des défenses physiques ou chimiques. Le phénogramme basé sur les traits de défense n'était cependant pas congruent avec une phylogénie moléculaire du groupe, suggérant une convergence sur les syndromes de défense. Enfin, nous avons examiné la performance des chenilles de papillons monarques sur les 24 espèces de laitues dans le champ ; la croissance et la survie des monarques ne différaient pas sur les plantes des trois syndromes, bien que la régression multiple ait révélé que les trichomes foliaires et la dureté réduisaient significativement la croissance des chenilles. La découverte de syndromes de défense des plantes convergents peut être utilisée comme un cadre pour poser des questions sur la manière dont les environnements abiotiques, les communautés d'herbivores et la biogéographie sont associés à des stratégies de défense particulières des plantes.

@article{doi10189000129658200687132pds20co2,
    author = "Agrawal, Anurag A. et Fishbein, Mark",
    title = "SYNDROMES DE DÉFENSE DES PLANTES",
    year = "2006",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Étant donné que la stratégie de défense d'une plante contre l'herbivorie ne sera jamais vraisemblablement un seul trait, nous développons le concept de syndromes de défense des plantes, où l'association avec des interactions écologiques spécifiques peut entraîner une convergence sur des ensembles de traits défensifs covariant. Les syndromes de défense peuvent être étudiés au sein de communautés de diverses espèces végétales ainsi que au sein de clades d'espèces étroitement apparentées. Dans les deux cas, la théorie prédit que les traits de défense des plantes peuvent covarier de manière cohérente entre les espèces, en raison d'une ascendance évolutive partagée ou en raison d'une convergence adaptative. Nous avons examiné les syndromes de défense potentiels chez 24 espèces de laitues (Asclepias spp.) dans une expérience de terrain. En utilisant des contrastes phylogénétiquement indépendants, nous avons trouvé peu de corrélations entre sept traits défensifs, aucune compensation bivariée, et des corrélations positives notables entre la densité de trichomes et la production de latex, ainsi qu'entre le rapport C:N et la dureté des feuilles. Nous avons ensuite utilisé une analyse de cluster hiérarchique pour produire un phénogramme de similarité des traits de défense parmi les 24 espèces. Cette analyse a révélé trois clusters distincts d'espèces. Les syndromes de défense de ces clusters d'espèces sont associés soit à une faible qualité nutritionnelle, soit à un équilibre entre une qualité nutritionnelle plus élevée et des défenses physiques ou chimiques. Le phénogramme basé sur les traits de défense n'était cependant pas congruent avec une phylogénie moléculaire du groupe, suggérant une convergence sur les syndromes de défense. Enfin, nous avons examiné la performance des chenilles de papillons monarques sur les 24 espèces de laitues dans le champ ; la croissance et la survie des monarques ne différaient pas sur les plantes des trois syndromes, bien que la régression multiple ait révélé que les trichomes foliaires et la dureté réduisaient significativement la croissance des chenilles. La découverte de syndromes de défense des plantes convergents peut être utilisée comme un cadre pour poser des questions sur la manière dont les environnements abiotiques, les communautés d'herbivores et la biogéographie sont associés à des stratégies de défense particulières des plantes.",
    url = "https://doi.org/10.1890/0012-9658(2006)87[132:pds]2.0.co;2",
    doi = "10.1890/0012-9658(2006)87[132:pds]2.0.co;2",
    openalex = "W2172012101",
    references = "doi101086285258, doi101146annurevecolsys34011802132347, doi105860choice415285"
}

Les interactions mutuellement bénéfiques entre les plantes et leurs pollinisateurs animaux ainsi que leurs disperseurs de graines ont été primordiales dans la génération de la biodiversité terrestre. Ces interactions mutualistes impliquent souvent des dizaines, voire des centaines d'espèces qui forment des réseaux complexes d'interdépendances. Comprendre comment la coévolution se déroule dans ces mutualismes hautement diversifiés entre espèces libres présente un défi conceptuel. Les travaux récents ont conduit à la conclusion sans équivoque que les réseaux mutualistes sont très hétérogènes (la majorité des espèces ont peu d'interactions, mais quelques espèces sont beaucoup plus connectées que prévu par hasard), imbriqués (les spécialistes interagissent avec des sous-ensembles des espèces avec lesquelles les généralistes interagissent) et construits sur des liens faibles et asymétriques entre les espèces. Tant les variables écologiques (par exemple, la phénologie, l'abondance locale et la répartition géographique) que l'histoire évolutive passée peuvent expliquer de tels motifs de réseau. La structure du réseau a des implications importantes pour la coexistence et la stabilité des espèces ainsi que pour le processus de coévolution. Les réseaux mutualistes peuvent donc être considérés comme l'architecture de la biodiversité.

@article{doi101146annurevecolsys38091206095818,
    author = "Bascompte, Jordi et Jordano, Pedro",
    title = "Plant-Animal Mutualistic Networks: The Architecture of Biodiversity",
    year = "2007",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Les interactions mutuellement bénéfiques entre les plantes et leurs pollinisateurs animaux ainsi que leurs disperseurs de graines ont été primordiales dans la génération de la biodiversité terrestre. Ces interactions mutualistes impliquent souvent des dizaines, voire des centaines d'espèces qui forment des réseaux complexes d'interdépendances. Comprendre comment la coévolution se déroule dans ces mutualismes hautement diversifiés entre espèces libres présente un défi conceptuel. Les travaux récents ont conduit à la conclusion sans équivoque que les réseaux mutualistes sont très hétérogènes (la majorité des espèces ont peu d'interactions, mais quelques espèces sont beaucoup plus connectées que prévu par hasard), imbriqués (les spécialistes interagissent avec des sous-ensembles des espèces avec lesquelles les généralistes interagissent) et construits sur des liens faibles et asymétriques entre les espèces. Tant les variables écologiques (par exemple, la phénologie, l'abondance locale et la répartition géographique) que l'histoire évolutive passée peuvent expliquer de tels motifs de réseau. La structure du réseau a des implications importantes pour la coexistence et la stabilité des espèces ainsi que pour le processus de coévolution. Les réseaux mutualistes peuvent donc être considérés comme l'architecture de la biodiversité.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.ecolsys.38.091206.095818",
    doi = "10.1146/annurev.ecolsys.38.091206.095818",
    openalex = "W2113618723",
    references = "doi101038nature05956, doi101073pnas1633576100, doi101086343873, doi101111j001438202003tb00285x, doi101111j155856461980tb04849x, doi101242jeb01745, doi1023072265575, doi1023074220, doi107208chicago97802261186970010001"
}

Le comportement est en partie la capacité à répondre rapidement et de manière réversible aux stimuli environnementaux au cours de la vie d'un individu. Les plantes et les animaux présentent tous les deux un comportement, mais le comportement des plantes est le plus souvent examiné dans le contexte d'une croissance plastiquement morphologique. La production et la libération rapides et réversibles de métabolites secondaires constituent également un mécanisme clé par lequel les plantes se comportent. Ici, nous passons en revue la plasticité biochimique des plantes en tant que comportement végétal et nous concentrons explicitement sur les preuves de réponses qui affichent une induction rapide, une réversibilité et une pertinence écologique. L'induction rapide et l'atténuation des métabolites secondaires des plantes se produisent lors de la recherche de nourriture racinaire médiée chimiquement, de la défense des plantes, de l'allochimie et pour réguler les relations mutualistes. Nous décrivons une abondance d'informations sur l'induction de diverses réponses biochimiques des plantes aux stimuli environnementaux, mais nous avons trouvé un corpus limité de littérature sur la réversibilité des réponses biochimiques induites. Comprendre le cycle complet de la plasticité dynamique des métabolites secondaires est un important créneau pour la recherche future. Les comportements biochimiques s'étendent au-delà du règne végétal ; cependant, ils illustrent clairement la capacité des plantes à se comporter d'une manière qui reflète étroitement les définitions classiques et les approches de recherche appliquées au comportement chez les animaux.

@article{doi101111j13653040200801910x,
    author = "Metlen, Kerry L. et Aschehoug, Erik T. et Callaway, Ragan M.",
    title = "Plant behavioural ecology: dynamic plasticity in secondary metabolites",
    year = "2008",
    journal = "Plant Cell \& Environment",
    abstract = "Le comportement est en partie la capacité à répondre rapidement et de manière réversible aux stimuli environnementaux au cours de la vie d'un individu. Les plantes et les animaux présentent tous les deux un comportement, mais le comportement des plantes est le plus souvent examiné dans le contexte d'une croissance plastiquement morphologique. La production et la libération rapides et réversibles de métabolites secondaires constituent également un mécanisme clé par lequel les plantes se comportent. Ici, nous passons en revue la plasticité biochimique des plantes en tant que comportement végétal et nous concentrons explicitement sur les preuves de réponses qui affichent une induction rapide, une réversibilité et une pertinence écologique. L'induction rapide et l'atténuation des métabolites secondaires des plantes se produisent lors de la recherche de nourriture racinaire médiée chimiquement, de la défense des plantes, de l'allochimie et pour réguler les relations mutualistes. Nous décrivons une abondance d'informations sur l'induction de diverses réponses biochimiques des plantes aux stimuli environnementaux, mais nous avons trouvé un corpus limité de littérature sur la réversibilité des réponses biochimiques induites. Comprendre le cycle complet de la plasticité dynamique des métabolites secondaires est un important créneau pour la recherche future. Les comportements biochimiques s'étendent au-delà du règne végétal ; cependant, ils illustrent clairement la capacité des plantes à se comporter d'une manière qui reflète étroitement les définitions classiques et les approches de recherche appliquées au comportement chez les animaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-3040.2008.01910.x",
    doi = "10.1111/j.1365-3040.2008.01910.x",
    openalex = "W2121261368",
    references = "doi101007978940171570623, doi101023a1013351617532, doi101023a1020809400075, doi101086283426, doi101086416841, doi101093aobmcl114, doi101111j14698137200401015x, doi101126science25049851251, doi101146annureves111101800013131, doi107208chicago97802264249720010001"
}

Nous présentons ici la théorie du hologénome de l'évolution, qui considère l'holobionte (l'animal ou la plante avec tous ses microorganismes associés) comme une unité de sélection dans l'évolution. Le hologénome est défini comme la somme des informations génétiques de l'hôte et de sa microbiote. La théorie repose sur quatre généralisations : (1) Tous les animaux et les plantes établissent des relations symbiotiques avec des microorganismes. (2) Les microorganismes symbiotiques sont transmis d'une génération à l'autre. (3) L'association entre l'hôte et les symbiotes affecte la fitness de l'holobionte dans son environnement. (4) Les variations du hologénome peuvent être provoquées par des changements soit dans le génome de l'hôte, soit dans celui de la microbiote ; sous stress environnemental, la communauté microbienne symbiotique peut changer rapidement. Ces points pris ensemble suggèrent que la richesse génétique des divers symbiotes microbiens peut jouer un rôle important tant dans l'adaptation que dans l'évolution des organismes supérieurs. Pendant les périodes de changements rapides dans l'environnement, la communauté diversifiée de symbiotes microbiens peut aider l'holobionte à survivre, à se multiplier et à gagner le temps nécessaire pour que le génome de l'hôte évolue. La caractéristique distinctive de la théorie du hologénome est qu'elle considère tous les microbiotes divers associés à l'animal ou à la plante comme faisant partie de l'holobionte en évolution. Ainsi, la théorie du hologénome s'inscrit dans le cadre du 'superorganisme' proposé par Wilson et Sober.

@article{doi101111j15746976200800123x,
    author = "Zilber‐Rosenberg, Ilana et Rosenberg, Eugene",
    title = "Rôle des microorganismes dans l'évolution des animaux et des plantes : la théorie du hologénome de l'évolution",
    year = "2008",
    journal = "FEMS Microbiology Reviews",
    abstract = "Nous présentons ici la théorie du hologénome de l'évolution, qui considère l'holobionte (l'animal ou la plante avec tous ses microorganismes associés) comme une unité de sélection dans l'évolution. Le hologénome est défini comme la somme des informations génétiques de l'hôte et de sa microbiote. La théorie repose sur quatre généralisations : (1) Tous les animaux et les plantes établissent des relations symbiotiques avec des microorganismes. (2) Les microorganismes symbiotiques sont transmis d'une génération à l'autre. (3) L'association entre l'hôte et les symbiotes affecte la fitness de l'holobionte dans son environnement. (4) Les variations du hologénome peuvent être provoquées par des changements soit dans le génome de l'hôte, soit dans celui de la microbiote ; sous stress environnemental, la communauté microbienne symbiotique peut changer rapidement. Ces points pris ensemble suggèrent que la richesse génétique des divers symbiotes microbiens peut jouer un rôle important tant dans l'adaptation que dans l'évolution des organismes supérieurs. Pendant les périodes de changements rapides dans l'environnement, la communauté diversifiée de symbiotes microbiens peut aider l'holobionte à survivre, à se multiplier et à gagner le temps nécessaire pour que le génome de l'hôte évolue. La caractéristique distinctive de la théorie du hologénome est qu'elle considère tous les microbiotes divers associés à l'animal ou à la plante comme faisant partie de l'holobionte en évolution. Ainsi, la théorie du hologénome s'inscrit dans le cadre du 'superorganisme' proposé par Wilson et Sober.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2008.00123.x",
    doi = "10.1111/j.1574-6976.2008.00123.x",
    openalex = "W2170025869",
    references = "doi101016s0022519389801699, doi101086383541, doi101093oso97801985029440010001, doi101111j155856461995tb04464x, doi1015159781400858712"
}

Les agents pathogènes des plantes peuvent émerger dans les écosystèmes agricoles par plusieurs mécanismes, notamment le suivi de l'hôte, les sauts d'hôte, l'hybridation et le transfert horizontal de gènes. Le séquençage ADN à haut débit couplé à de nouvelles approches analytiques permet de différencier ces mécanismes et d'inférer le moment et le lieu où les agents pathogènes ont émergé pour la première fois. Nous présentons plusieurs exemples pour illustrer les différents mécanismes et échelles de temps associés à l'origine des agents pathogènes des plantes importants. Dans certains cas, les agents pathogènes ont été domestiqués avec leurs hôtes lors de l'invention de l'agriculture il y a environ 10 000 ans. Dans d'autres cas, les agents pathogènes semblent avoir émergé très récemment et presque instantanément après un transfert horizontal de gènes ou une hybridation. La caractéristique unificatrice prédominante dans ces exemples est l'uniformité environnementale et génétique de l'écosystème agricole dans lequel les agents pathogènes ont émergé. Nous concluons que les écosystèmes agricoles continueront à sélectionner de nouveaux agents pathogènes à moins qu'ils ne soient réingénierisés pour les rendre moins propices à l'émergence des agents pathogènes.

@article{doi101146annurevphyto010708154114,
    author = "Stukenbrock, Eva H. et McDonald, Bruce A.",
    title = "The Origins of Plant Pathogens in Agro-Ecosystems",
    year = "2008",
    journal = "Annual Review of Phytopathology",
    abstract = "Les agents pathogènes des plantes peuvent émerger dans les écosystèmes agricoles par plusieurs mécanismes, notamment le suivi de l'hôte, les sauts d'hôte, l'hybridation et le transfert horizontal de gènes. Le séquençage ADN à haut débit couplé à de nouvelles approches analytiques permet de différencier ces mécanismes et d'inférer le moment et le lieu où les agents pathogènes ont émergé pour la première fois. Nous présentons plusieurs exemples pour illustrer les différents mécanismes et échelles de temps associés à l'origine des agents pathogènes des plantes importants. Dans certains cas, les agents pathogènes ont été domestiqués avec leurs hôtes lors de l'invention de l'agriculture il y a environ 10 000 ans. Dans d'autres cas, les agents pathogènes semblent avoir émergé très récemment et presque instantanément après un transfert horizontal de gènes ou une hybridation. La caractéristique unificatrice prédominante dans ces exemples est l'uniformité environnementale et génétique de l'écosystème agricole dans lequel les agents pathogènes ont émergé. Nous concluons que les écosystèmes agricoles continueront à sélectionner de nouveaux agents pathogènes à moins qu'ils ne soient réingénierisés pour les rendre moins propices à l'émergence des agents pathogènes.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.phyto.010708.154114",
    doi = "10.1146/annurev.phyto.010708.154114",
    openalex = "W2120607107",
    references = "doi101098rspb19830075"
}

CONTEXTE : Chez les Lépidoptères, il était historiquement admis que les papillons adultes dépendaient principalement des nutriments issus de la larve pour la reproduction et le maintien somatique. Cependant, des études récentes soulignent les interactions complexes entre les réserves de stockage et les revenus adultes, et que ces derniers peuvent contribuer de manière significative à la reproduction. Les effets de l'alimentation adulte ont généralement été évalués en déterminant le nombre et/ou la taille des œufs produits, tandis que leurs conséquences sur la composition des œufs et la viabilité de la descendance ont été largement négligées (ce qui est généralement vrai pour les insectes). Nous nous concentrons ici spécifiquement sur ces derniers aspects en utilisant le papillon tropical nourri de fruits Bicyclus anynana, qui dépend fortement des glucides d'origine adulte pour la reproduction. RÉSULTATS : L'alimentation des femelles B. anynana a eu des effets marqués sur la fécondité, la composition des œufs et le taux d'éclosion, les papillons se nourrissant de la nutrition complexe du fruit de banane ayant obtenu les meilleurs résultats. L'ajout de vitamines et de minéraux à une alimentation à base de saccharose a augmenté la fécondité, mais pas la viabilité de la descendance. Tous les autres groupes (solution de saccharose simple, solution de saccharose enrichie en lipides ou levure) ont présenté une fécondité et un taux d'éclosion des œufs nettement inférieurs à celui du groupe banane. Les différences étaient particulièrement marquées plus tard dans la vie, indiquant probablement l'épuisement des nutriments essentiels chez les femelles nourries au saccharose. Les effets de l'alimentation adulte sur la composition des œufs n'étaient pas simples, indiquant des interactions complexes entre composés spécifiques. Il y a eu quelques preuves que l'énergie totale des œufs et la teneur en eau étaient liées au taux d'éclosion, tandis que la teneur en protéines, lipides, glycogène et glucides libres des œufs ne semblait pas limiter le développement réussi. CONCLUSION : Les motifs montrés ici illustrent la complexité de l'allocation des ressources reproductives chez B. anynana et la nécessité de prendre en compte la composition des œufs et la viabilité de la descendance lorsqu'on tente d'estimer les effets de la nutrition adulte sur le fitness chez ce papillon et d'autres insectes.

@article{doi10118617429994510,
    author = "Geister, Thorin L. et Lorenz, Matthias et Hoffmann, Klaus H. et Fischer, Klaus",
    title = "Nutrition adulte et fitness des papillons : effets de la qualité de l'alimentation sur la production reproductive, la composition des œufs et le taux d'éclosion",
    year = "2008",
    journal = "Frontiers in Zoology",
    abstract = "CONTEXTE : Chez les Lépidoptères, il était historiquement admis que les papillons adultes dépendaient principalement des nutriments issus de la larve pour la reproduction et le maintien somatique. Cependant, des études récentes soulignent les interactions complexes entre les réserves de stockage et les revenus adultes, et que ces derniers peuvent contribuer de manière significative à la reproduction. Les effets de l'alimentation adulte ont généralement été évalués en déterminant le nombre et/ou la taille des œufs produits, tandis que leurs conséquences sur la composition des œufs et la viabilité de la descendance ont été largement négligées (ce qui est généralement vrai pour les insectes). Nous nous concentrons ici spécifiquement sur ces derniers aspects en utilisant le papillon tropical nourri de fruits Bicyclus anynana, qui dépend fortement des glucides d'origine adulte pour la reproduction. RÉSULTATS : L'alimentation des femelles B. anynana a eu des effets marqués sur la fécondité, la composition des œufs et le taux d'éclosion, les papillons se nourrissant de la nutrition complexe du fruit de banane ayant obtenu les meilleurs résultats. L'ajout de vitamines et de minéraux à une alimentation à base de saccharose a augmenté la fécondité, mais pas la viabilité de la descendance. Tous les autres groupes (solution de saccharose simple, solution de saccharose enrichie en lipides ou levure) ont présenté une fécondité et un taux d'éclosion des œufs nettement inférieurs à celui du groupe banane. Les différences étaient particulièrement marquées plus tard dans la vie, indiquant probablement l'épuisement des nutriments essentiels chez les femelles nourries au saccharose. Les effets de l'alimentation adulte sur la composition des œufs n'étaient pas simples, indiquant des interactions complexes entre composés spécifiques. Il y a eu quelques preuves que l'énergie totale des œufs et la teneur en eau étaient liées au taux d'éclosion, tandis que la teneur en protéines, lipides, glycogène et glucides libres des œufs ne semblait pas limiter le développement réussi. CONCLUSION : Les motifs montrés ici illustrent la complexité de l'allocation des ressources reproductives chez B. anynana et la nécessité de prendre en compte la composition des œufs et la viabilité de la descendance lorsqu'on tente d'estimer les effets de la nutrition adulte sur le fitness chez ce papillon et d'autres insectes.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1742-9994-5-10",
    doi = "10.1186/1742-9994-5-10",
    openalex = "W2165304788",
    references = "doi101016jtree200508015"
}

L'adaptation locale revêt une importance fondamentale en biologie évolutive, des populations, de la conservation et du changement global. Cependant, la généralité de l'adaptation locale chez les plantes et la manière dont elle est influencée par des caractéristiques spécifiques des espèces, des populations et des habitats n'ont pas encore fait l'objet d'une revue quantitative. Par conséquent, nous avons examiné des données publiées sur les résultats d'expériences de transplantation réciproque en utilisant deux approches. Nous avons mené une méta-analyse pour comparer la performance des plantes locales et étrangères sur tous les sites de transplantation. De plus, nous avons analysé les fréquences des paires d'origine des plantes pour examiner si les plantes locales performaient mieux que les plantes étrangères sur les deux sites de transplantation comparés. Dans les deux approches, nous avons également examiné les effets de la taille de la population et des caractéristiques de l'habitat et des espèces prédits pour affecter l'adaptation locale. Nous montrons que, dans l'ensemble, les plantes locales ont performé significativement mieux que les plantes étrangères sur leur site d'origine : c'est le cas dans 71,0 % des sites étudiés. Cependant, les plantes locales ont performé mieux que les plantes étrangères sur les deux sites d'une comparaison par paires (définition stricte de l'adaptation locale) seulement dans 45,3 % des 1032 paires de populations comparées. De plus, nous avons trouvé que l'adaptation locale était beaucoup plus courante pour les grandes populations de plantes (>1000 individus floraux) que pour les petites populations (<1000 individus floraux) pour lesquelles l'adaptation locale était très rare. Le degré d'adaptation locale était indépendant de l'histoire de vie des plantes, de l'hétérogénéité spatiale ou temporelle de l'habitat et de l'échelle géographique. Nos résultats suggèrent que l'adaptation locale est moins courante dans les populations de plantes que généralement supposé. De plus, nos renforts renforcent l'importance fondamentale de la taille de la population pour la théorie évolutive. Le rôle clair de la taille de la population pour la capacité à évoluer une adaptation locale soulève d'importantes doutes sur la capacité des petites populations de plantes à faire face aux environnements changeants.

@article{doi101371journalpone0004010,
    author = "Leimu, Roosa et Fischer, Markus",
    title = "Une méta-analyse de l'adaptation locale chez les plantes",
    year = "2008",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "L'adaptation locale revêt une importance fondamentale en biologie évolutive, des populations, de la conservation et du changement global. Cependant, la généralité de l'adaptation locale chez les plantes et la manière dont elle est influencée par des caractéristiques spécifiques des espèces, des populations et des habitats n'ont pas encore fait l'objet d'une revue quantitative. Par conséquent, nous avons examiné des données publiées sur les résultats d'expériences de transplantation réciproque en utilisant deux approches. Nous avons mené une méta-analyse pour comparer la performance des plantes locales et étrangères sur tous les sites de transplantation. De plus, nous avons analysé les fréquences des paires d'origine des plantes pour examiner si les plantes locales performaient mieux que les plantes étrangères sur les deux sites de transplantation comparés. Dans les deux approches, nous avons également examiné les effets de la taille de la population et des caractéristiques de l'habitat et des espèces prédits pour affecter l'adaptation locale. Nous montrons que, dans l'ensemble, les plantes locales ont performé significativement mieux que les plantes étrangères sur leur site d'origine : c'est le cas dans 71,0\% des sites étudiés. Cependant, les plantes locales ont performé mieux que les plantes étrangères sur les deux sites d'une comparaison par paires (définition stricte de l'adaptation locale) seulement dans 45,3\% des 1032 paires de populations comparées. De plus, nous avons trouvé que l'adaptation locale était beaucoup plus courante pour les grandes populations de plantes (>1000 individus floraux) que pour les petites populations (<1000 individus floraux) pour lesquelles l'adaptation locale était très rare. Le degré d'adaptation locale était indépendant de l'histoire de vie des plantes, de l'hétérogénéité spatiale ou temporelle de l'habitat et de l'échelle géographique. Nos résultats suggèrent que l'adaptation locale est moins courante dans les populations de plantes que généralement supposé. De plus, nos renforts renforcent l'importance fondamentale de la taille de la population pour la théorie évolutive. Le rôle clair de la taille de la population pour la capacité à évoluer une adaptation locale soulève d'importantes doutes sur la capacité des petites populations de plantes à faire face aux environnements changeants.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0004010",
    doi = "10.1371/journal.pone.0004010",
    openalex = "W2035317733",
    references = "doi101016s0169534702000447, doi101093oso97801985774160010001, doi101146annurevecolsys271237, doi105860choice432194"
}

La théorie du mosaïque géographique de la coévolution prédit que la sélection coévolutif divergente produit une différenciation génétique entre les populations. Les 29 études examinées ici soutiennent cette hypothèse car elles rapportent toutes des trajectoires de sélection spatialement divergentes qui ont généré des résultats variables dans les traits d'interaction entre les populations. Cela s'applique aussi bien aux interactions mutualistes, telles que celles entre les plantes hôtes et leurs symbiontes racinaires, ou les plantes et leurs pollinisateurs, qu'aux interactions antagonistes, telles que les plantes et leurs pathogènes ou herbivores. Le plus souvent, c'est l'intensité de la sélection qui varie à travers les paysages. La variation peut être générée à la fois par l'environnement physique (à savoir la température) et par la communauté locale -- concurrents, parasites et hôtes alternatifs -- qui intensifie ou dilue localement la sélection pour une large gamme d'interactions entre espèces. À son extrême, les trajectoires de sélection peuvent être inversées, une interaction antagoniste devenant commensaliste dans certaines populations et mutualiste dans d'autres, selon le contexte de la communauté locale. Les trajectoires de sélection ont été trouvées divergentes entre les continents, mais aussi plus localement entre les populations voisines et même au sein d'une seule population. Ce résultat met en évidence l'importance de la sélection coévolutif générant la diversité biologique avec des implications à long terme tant pour la conservation de la biodiversité que pour la biologie appliquée.

@article{doi101093jxberp168,
    author = "Laine, Anna‐Liisa",
    title = "Rôle de la coévolution dans la génération de la diversité biologique : trajectoires de sélection spatialement divergentes",
    year = "2009",
    journal = "Journal of Experimental Botany",
    abstract = "La théorie du mosaïque géographique de la coévolution prédit que la sélection coévolutif divergente produit une différenciation génétique entre les populations. Les 29 études examinées ici soutiennent cette hypothèse car elles rapportent toutes des trajectoires de sélection spatialement divergentes qui ont généré des résultats variables dans les traits d'interaction entre les populations. Cela s'applique aussi bien aux interactions mutualistes, telles que celles entre les plantes hôtes et leurs symbiontes racinaires, ou les plantes et leurs pollinisateurs, qu'aux interactions antagonistes, telles que les plantes et leurs pathogènes ou herbivores. Le plus souvent, c'est l'intensité de la sélection qui varie à travers les paysages. La variation peut être générée à la fois par l'environnement physique (à savoir la température) et par la communauté locale -- concurrents, parasites et hôtes alternatifs -- qui intensifie ou dilue localement la sélection pour une large gamme d'interactions entre espèces. À son extrême, les trajectoires de sélection peuvent être inversées, une interaction antagoniste devenant commensaliste dans certaines populations et mutualiste dans d'autres, selon le contexte de la communauté locale. Les trajectoires de sélection ont été trouvées divergentes entre les continents, mais aussi plus localement entre les populations voisines et même au sein d'une seule population. Ce résultat met en évidence l'importance de la sélection coévolutif générant la diversité biologique avec des implications à long terme tant pour la conservation de la biodiversité que pour la biologie appliquée.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jxb/erp168",
    doi = "10.1093/jxb/erp168",
    openalex = "W2161751567",
    references = "edgar1974coevolution"
}

La fragmentation et la destruction des écosystèmes peuvent entraîner des politiques administratives restrictives sur la récolte traditionnelle par les peuples autochtones à partir des parcelles d'écosystèmes restantes. En Nouvelle-Zélande, les préoccupations concernant les espèces menacées et les politiques gouvernementales axées sur la conservation des espèces et des écosystèmes ont conduit à une restriction sévère des droits de récolte traditionnelle. Bien que des dispositions aient été faites pour une collecte limitée de plantes traditionnelles sur les terres de conservation administrées par le gouvernement, il est incertain dans quelle mesure la récolte est effectuée sur ces terres et ailleurs et de quoi cette récolte pourrait consister. Nous avons interviewé sept aînés experts maoris du Waikato, en Nouvelle-Zélande, pour identifier les espèces végétales qu'ils récoltent actuellement et d'où. Nous avons comparé ces données avec les données que nous avons collectées sur les permis émis pour la collecte de plantes sur les terres de conservation dans la même région. Nous avons cherché à obtenir des informations sur la récolte de plantes autochtones pour déterminer l'étendue de la récolte autorisée à partir des terres de conservation du Waikato et pour identifier les problèmes qui pourraient affecter la récolte et la gestion des plantes. Les aînés ont identifié 58 espèces qu'ils récoltent régulièrement ou considèrent culturellement importantes ; plus de 50 % de ces espèces sont récoltées à des fins médicinales. Les données sur les permis de 1996 à 2006 indiquent aucune relation apparente entre les espèces de signification culturelle déclarée et le nombre de permis émis pour chacune de ces espèces. Actuellement, peu d'espèces végétales sont récoltées sur les terres de conservation, bien qu'une récolte non officielle se produise. Les aînés ont plutôt signalé que les plantes médicinales sont fréquemment collectées dans les zones urbaines et autres zones publiques. Ils ont signalé que les espèces végétales utilisées pour le teinture, la sculpture et le tissage sont difficiles d'accès. Les aînés ont également discuté de préoccupations telles que le pulvérisation des bordures de routes, qui a entraîné la mort d'espèces médicinales, et l'utilisation d'hybrides commerciaux dans l'urbanisme. Le gouvernement local pourrait jouer un rôle de plus en plus important dans le soutien aux traditions autochtones grâce à l'urbanisme, qui prend en compte les besoins de récolte culturelle tout en réduisant potentiellement la pression future de récolte sur les terres de conservation. Nous suggérons que la participation active de la communauté maorie au développement et à la gestion des ressources de récolte urbaine donnera des résultats positifs.

@article{doi101111j15231739200901376x,
    author = "Wehi, Priscilla M. et Wehi, William L.",
    title = "Récolte traditionnelle de plantes dans des paysages contemporains fragmentés et urbains",
    year = "2009",
    journal = "Conservation Biology",
    abstract = "La fragmentation et la destruction des écosystèmes peuvent entraîner des politiques administratives restrictives sur la récolte traditionnelle par les peuples autochtones à partir des parcelles d'écosystèmes restantes. En Nouvelle-Zélande, les préoccupations concernant les espèces menacées et les politiques gouvernementales axées sur la conservation des espèces et des écosystèmes ont conduit à une restriction sévère des droits de récolte traditionnelle. Bien que des dispositions aient été faites pour une collecte limitée de plantes traditionnelles sur les terres de conservation administrées par le gouvernement, il est incertain dans quelle mesure la récolte est effectuée sur ces terres et ailleurs et de quoi cette récolte pourrait consister. Nous avons interviewé sept aînés experts maoris du Waikato, en Nouvelle-Zélande, pour identifier les espèces végétales qu'ils récoltent actuellement et d'où. Nous avons comparé ces données avec les données que nous avons collectées sur les permis émis pour la collecte de plantes sur les terres de conservation dans la même région. Nous avons cherché à obtenir des informations sur la récolte de plantes autochtones pour déterminer l'étendue de la récolte autorisée à partir des terres de conservation du Waikato et pour identifier les problèmes qui pourraient affecter la récolte et la gestion des plantes. Les aînés ont identifié 58 espèces qu'ils récoltent régulièrement ou considèrent culturellement importantes ; plus de 50\% de ces espèces sont récoltées à des fins médicinales. Les données sur les permis de 1996 à 2006 indiquent aucune relation apparente entre les espèces de signification culturelle déclarée et le nombre de permis émis pour chacune de ces espèces. Actuellement, peu d'espèces végétales sont récoltées sur les terres de conservation, bien qu'une récolte non officielle se produise. Les aînés ont plutôt signalé que les plantes médicinales sont fréquemment collectées dans les zones urbaines et autres zones publiques. Ils ont signalé que les espèces végétales utilisées pour le teinture, la sculpture et le tissage sont difficiles d'accès. Les aînés ont également discuté de préoccupations telles que le pulvérisation des bordures de routes, qui a entraîné la mort d'espèces médicinales, et l'utilisation d'hybrides commerciaux dans l'urbanisme. Le gouvernement local pourrait jouer un rôle de plus en plus important dans le soutien aux traditions autochtones grâce à l'urbanisme, qui prend en compte les besoins de récolte culturelle tout en réduisant potentiellement la pression future de récolte sur les terres de conservation. Nous suggérons que la participation active de la communauté maorie au développement et à la gestion des ressources de récolte urbaine donnera des résultats positifs.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2009.01376.x",
    doi = "10.1111/j.1523-1739.2009.01376.x",
    openalex = "W2039160143",
    references = "doi101046j1526100x199972016x"
}

Résumé 1. Dans cet essai, je résume les tendances actuelles en écologie évolutive de la défense des plantes, tout en plaidant pour des approches qui intègrent l'écologie communautaire avec des tests spécifiques des hypothèses évolutives classiques. Plusieurs conclusions émergent. 2. La microévolution de la défense est peut-être mieux étudiée par des expériences de transplantations réciproques de populations végétales différenciées, tout en manipulant simultanément la présence des herbivores(s) supposés être l'agent(s) de la sélection naturelle. 3. Bien qu'il y ait un intérêt continu pour les coûts de la défense, je soutiens que certaines approches empiriques pour estimer ces coûts (par exemple, l'ingénierie génétique) peuvent fournir des aperçus limités sur les processus évolutifs. 4. Presque toutes les plantes emploient plusieurs lignes de défense différentes contre l'herbivorie. Il est donc temps d'abandonner la recherche de traits uniques et magiques et du modèle simple de compromis (où les traits sont arbitrairement supposés covarier négativement entre génotypes ou espèces). Nous savons encore très peu de choses sur quelles combinaisons de traits sont les plus efficaces et ont évolué ensemble à plusieurs reprises. Ainsi, certaines de nos théories importantes (par exemple, un compromis prédit entre la défense directe et indirecte) doivent être révisées. 5. Les études sur la macroévolution de la défense des plantes bénéficient d'un regain d'intérêt grâce aux phylogénies et aux méthodes analytiques disponibles. Bien que les tendances générales ne soient pas actuellement prévisibles, nous aurons bientôt des études de cas solides évaluant à la fois les facteurs biotiques et abiotiques de l'évolution convergente dans les stratégies de défense et le rôle de l'évolution de la défense dans la radiation adaptative des lignées végétales. 6. L'évolution de la spécificité est proposée comme une frontière ultime pour comprendre la complexité dans les interactions plante–herbivore. Bien qu'il soit abondamment clair que les plantes peuvent déployer des réponses défensives hautement spécifiques qui sont différemment perçues par les espèces d'herbivores, la manière dont ces réponses évoluent et sont régulées physiologiquement reste un important vide. Des méthodologies relativement simples sont maintenant disponibles pour fermer la boucle entre la perception par la plante de l'herbivorie, les réponses hormonales et la production de produits finaux défensifs à travers les génotypes ou les espèces.

@article{doi101111j13652435201001796x,
    author = "Agrawal, Anurag A.",
    title = "Tendances actuelles en écologie évolutive de la défense des plantes",
    year = "2010",
    journal = "Functional Ecology",
    abstract = "Résumé 1. Dans cet essai, je résume les tendances actuelles en écologie évolutive de la défense des plantes, tout en plaidant pour des approches qui intègrent l'écologie communautaire avec des tests spécifiques des hypothèses évolutives classiques. Plusieurs conclusions émergent. 2. La microévolution de la défense est peut-être mieux étudiée par des expériences de transplantations réciproques de populations végétales différenciées, tout en manipulant simultanément la présence des herbivores(s) supposés être l'agent(s) de la sélection naturelle. 3. Bien qu'il y ait un intérêt continu pour les coûts de la défense, je soutiens que certaines approches empiriques pour estimer ces coûts (par exemple, l'ingénierie génétique) peuvent fournir des aperçus limités sur les processus évolutifs. 4. Presque toutes les plantes emploient plusieurs lignes de défense différentes contre l'herbivorie. Il est donc temps d'abandonner la recherche de traits uniques et magiques et du modèle simple de compromis (où les traits sont arbitrairement supposés covarier négativement entre génotypes ou espèces). Nous savons encore très peu de choses sur quelles combinaisons de traits sont les plus efficaces et ont évolué ensemble à plusieurs reprises. Ainsi, certaines de nos théories importantes (par exemple, un compromis prédit entre la défense directe et indirecte) doivent être révisées. 5. Les études sur la macroévolution de la défense des plantes bénéficient d'un regain d'intérêt grâce aux phylogénies et aux méthodes analytiques disponibles. Bien que les tendances générales ne soient pas actuellement prévisibles, nous aurons bientôt des études de cas solides évaluant à la fois les facteurs biotiques et abiotiques de l'évolution convergente dans les stratégies de défense et le rôle de l'évolution de la défense dans la radiation adaptative des lignées végétales. 6. L'évolution de la spécificité est proposée comme une frontière ultime pour comprendre la complexité dans les interactions plante–herbivore. Bien qu'il soit abondamment clair que les plantes peuvent déployer des réponses défensives hautement spécifiques qui sont différemment perçues par les espèces d'herbivores, la manière dont ces réponses évoluent et sont régulées physiologiquement reste un important vide. Des méthodologies relativement simples sont maintenant disponibles pour fermer la boucle entre la perception par la plante de l'herbivorie, les réponses hormonales et la production de produits finaux défensifs à travers les génotypes ou les espèces.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1365-2435.2010.01796.x",
    doi = "10.1111/j.1365-2435.2010.01796.x",
    openalex = "W2109047372",
    references = "doi10103844766, doi101038nature05960, doi101038nchembio164, doi101086284547, doi101093oso97801985052350010001, doi101111j001438202002tb00145x, doi101111j13652435201001794x, doi101111j14610248200901314x, doi101111j14698137200702330x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science2304728895, doi101146annurevarplant59032607092825, doi101146annurecolsys110308120307, doi101146annureves11110180000353"
}

Les plantes libèrent souvent un mélange de composés organiques volatils en réponse aux dommages causés par les insectes herbivores, ce qui peut servir d'indices pour localiser ces herbivores par leurs ennemis naturels. Le mélange de composés émis par les plantes peut être plus variable que ce qui est généralement admis. La quantité et la composition des mélanges peuvent varier selon l'espèce de l'herbivore, l'espèce de plante et le génotype au sein de l'espèce, les conditions environnementales dans lesquelles les plantes sont cultivées, et le nombre d'espèces d'herbivores attaquant la plante. Bien qu'il soit souvent admis que l'émission induite de ces composés constitue une tactique adaptative de la part des plantes, les preuves que de telles réponses minimisent les pertes de fitness des plantes restent rares, car les données nécessaires sur le fitness des plantes ont rarement été collectées. L'application des techniques de la génétique quantitative évolutive peut faciliter le test d'hypothèses largement répandues concernant l'évolution de la production induite de composés volatils dans des conditions naturelles.

@article{doi101146annurevento120709144753,
    author = "Hare, J. Daniel",
    title = "Ecological Role of Volatiles Produced by Plants in Response to Damage by Herbivorous Insects",
    year = "2010",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Plants often release a blend of volatile organic compounds in response to damage by herbivorous insects that may serve as cues to locate those herbivores by natural enemies. The blend of compounds emitted by plants may be more variable than is generally assumed. The quantity and the composition of the blends may vary with the species of the herbivore, the plant species and genotype within species, the environmental conditions under which plants are grown, and the number of herbivore species attacking the plant. Although it is often assumed that induced emission of these compounds is an adaptive tactic on the part of plants, the evidence that such responses minimize fitness losses of plants remains sparse because the necessary data on plant fitness rarely have been collected. The application of techniques of evolutionary quantitative genetics may facilitate the testing of widely held hypotheses about the evolution of induced production of volatile compounds under natural conditions.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ento-120709-144753",
    doi = "10.1146/annurev-ento-120709-144753",
    openalex = "W2100923668",
    references = "doi101111j14698137200702330x, doi101146annurevento47091201145121"
}

Il est bien connu depuis longtemps que la proline s'accumule chez les plantes soumises à une limitation hydrique, ce qui a conduit à des études sur la proline en tant que soluté bénéfique permettant aux plantes d'augmenter l'osmolarité cellulaire lors d'une limitation hydrique. Le métabolisme de la proline joue également un rôle dans le tamponnement redox et le transfert d'énergie et intervient dans l'interaction plante-pathogène et la mort cellulaire programmée. Certaines de ces fonctions uniques de la proline dépendent des propriétés de la proline elle-même, tandis que d'autres dépendent du « cycle de la proline » de synthèse coordonnée de la proline dans le chloroplaste et le cytoplasme avec catabolisme de la proline dans les mitochondries. Les mécanismes de régulation contrôlant le métabolisme de la proline, le transport intercellulaire et intracellulaire et les connexions de la proline à d'autres voies métaboliques sont tous importants pour les fonctions in vivo du métabolisme de la proline. Les connexions du métabolisme de la proline à la voie oxydative du pentose phosphate et au métabolisme du glutamate-glutamine sont particulièrement intéressantes. La voie de l'N-acétyl glutamate peut également produire de l'ornithine et, potentiellement, de la proline, mais son rôle et son activité restent incertains. L'utilisation de systèmes modèles tels qu'Arabidopsis thaliana pour mieux comprendre à la fois ces fonctions longuement étudiées et nouvellement émergentes de la proline peut aider à la conception d'expériences de nouvelle génération testant si le métabolisme de la proline est une cible prometteuse d'ingénierie métabolique pour améliorer la résistance au stress des plantes économiquement importantes.

@article{doi101199tab0140,
    author = "Verslues, Paul E. et Sharma, Sandeep",
    title = "Métabolisme de la proline et ses implications pour l'interaction plante-environnement",
    year = "2010",
    journal = "The Arabidopsis Book",
    abstract = {Il est bien connu depuis longtemps que la proline s'accumule chez les plantes soumises à une limitation hydrique, ce qui a conduit à des études sur la proline en tant que soluté bénéfique permettant aux plantes d'augmenter l'osmolarité cellulaire lors d'une limitation hydrique. Le métabolisme de la proline joue également un rôle dans le tamponnement redox et le transfert d'énergie et intervient dans l'interaction plante-pathogène et la mort cellulaire programmée. Certaines de ces fonctions uniques de la proline dépendent des propriétés de la proline elle-même, tandis que d'autres dépendent du « cycle de la proline » de synthèse coordonnée de la proline dans le chloroplaste et le cytoplasme avec catabolisme de la proline dans les mitochondries. Les mécanismes de régulation contrôlant le métabolisme de la proline, le transport intercellulaire et intracellulaire et les connexions de la proline à d'autres voies métaboliques sont tous importants pour les fonctions in vivo du métabolisme de la proline. Les connexions du métabolisme de la proline à la voie oxydative du pentose phosphate et au métabolisme du glutamate-glutamine sont particulièrement intéressantes. La voie de l'N-acétyl glutamate peut également produire de l'ornithine et, potentiellement, de la proline, mais son rôle et son activité restent incertains. L'utilisation de systèmes modèles tels qu'Arabidopsis thaliana pour mieux comprendre à la fois ces fonctions longuement étudiées et nouvellement émergentes de la proline peut aider à la conception d'expériences de nouvelle génération testant si le métabolisme de la proline est une cible prometteuse d'ingénierie métabolique pour améliorer la résistance au stress des plantes économiquement importantes.},
    url = "https://doi.org/10.1199/tab.0140",
    doi = "10.1199/tab.0140",
    openalex = "W1995360494",
    references = "doi101007s0011400500621"
}

Les plantes ont évolué une multitude de défenses chimiques différentes couvrant presque toutes les classes de métabolites (secondaires) qui constituent un obstacle majeur à l'herbivorie : certaines sont constitutives ; d'autres sont induites après une attaque. De nombreux composés agissent directement sur l'herbivore, tandis que d'autres agissent indirectement par l'attraction d'organismes d'autres niveaux trophiques qui, à leur tour, protègent la plante. Une diversité énorme de produits chimiques (bio)végétaux est toxique, répulsive ou antinutritive pour les herbivores de tous types. Parmi les exemples figurent les glycosides cyanogéniques, les glucosinolates, les alcaloïdes et les terpénoïdes ; d'autres sont des macromolécules et comprennent le latex ou les inhibiteurs de protéases. Leurs modes d'action incluent la perturbation des membranes, l'inhibition du transport des nutriments et des ions, l'inhibition des processus de transduction du signal, l'inhibition du métabolisme ou la perturbation du contrôle hormonal des processus physiologiques. Reconnaître le défi posé par les herbivores et le timing précis des activités végétales, ainsi que la modulation adaptative du métabolisme des plantes, est important afin que les métabolites et l'énergie puissent être efficacement alloués aux activités de défense.

@article{doi101146annurevarplant042110103854,
    author = "Mithöfer, Axel et Boland, Wilhelm",
    title = "Plant Defense Against Herbivores: Chemical Aspects",
    year = "2012",
    journal = "Annual Review of Plant Biology",
    abstract = "Les plantes ont évolué une multitude de défenses chimiques différentes couvrant presque toutes les classes de métabolites (secondaires) qui constituent un obstacle majeur à l'herbivorie : certaines sont constitutives ; d'autres sont induites après une attaque. De nombreux composés agissent directement sur l'herbivore, tandis que d'autres agissent indirectement par l'attraction d'organismes d'autres niveaux trophiques qui, à leur tour, protègent la plante. Une diversité énorme de produits chimiques (bio)végétaux est toxique, répulsive ou antinutritive pour les herbivores de tous types. Parmi les exemples figurent les glycosides cyanogéniques, les glucosinolates, les alcaloïdes et les terpénoïdes ; d'autres sont des macromolécules et comprennent le latex ou les inhibiteurs de protéases. Leurs modes d'action incluent la perturbation des membranes, l'inhibition du transport des nutriments et des ions, l'inhibition des processus de transduction du signal, l'inhibition du métabolisme ou la perturbation du contrôle hormonal des processus physiologiques. Reconnaître le défi posé par les herbivores et le timing précis des activités végétales, ainsi que la modulation adaptative du métabolisme des plantes, est important afin que les métabolites et l'énergie puissent être efficacement alloués aux activités de défense.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-042110-103854",
    doi = "10.1146/annurev-arplant-042110-103854",
    openalex = "W2158718877",
    references = "doi101007s0004900900186, doi101098rspb19790081, doi101111j14698137200702330x, doi101146annurevecolsys110308120307, doi1023072259845"
}

La composition de la communauté microbienne du sol peut être modifiée de manière spectaculaire en raison de l'association avec des espèces végétales individuelles, et ces effets sur la communauté microbienne peuvent avoir des rétroactions importantes sur l'écologie végétale. Les rétroactions négatives plante-sol jouent un rôle primordial dans le maintien de la diversité des communautés végétales, tandis que les rétroactions positives plante-sol peuvent entraîner une conversion de la communauté. La différenciation spécifique à l'hôte de la communauté microbienne résulte des compromis associés à la surmonte des défenses végétales et des bénéfices spécifiques associés aux récompenses végétales. L'accumulation de pathogènes spécifiques à l'hôte génère probablement une rétroaction négative sur la plante, tandis que les changements dans la densité des mutualistes microbiens génèrent probablement une rétroaction positive. Cependant, la dynamique compétitive entre les microbes dépend des coûts multidimensionnels de la virulence et du mutualisme, de la structure spatiale à fine échelle au sein des racines des plantes, et de l'allocation active de la plante et de la défense localisée. En raison de cela, intégrer une vue complète des dynamiques microbiennes est essentiel pour expliquer la dynamique des rétroactions plante-sol et donc l'écologie des communautés végétales.

@article{doi101146annurevmicro092611150107,
    author = "Bever, James D. and Platt, Thomas G. and Morton, Elise R.",
    title = "Microbial Population and Community Dynamics on Plant Roots and Their Feedbacks on Plant Communities",
    year = "2012",
    journal = "Annual Review of Microbiology",
    abstract = "La composition de la communauté microbienne du sol peut être modifiée de manière spectaculaire en raison de l'association avec des espèces végétales individuelles, et ces effets sur la communauté microbienne peuvent avoir des rétroactions importantes sur l'écologie végétale. Les rétroactions négatives plante-sol jouent un rôle primordial dans le maintien de la diversité des communautés végétales, tandis que les rétroactions positives plante-sol peuvent entraîner une conversion de la communauté. La différenciation spécifique à l'hôte de la communauté microbienne résulte des compromis associés à la surmonte des défenses végétales et des bénéfices spécifiques associés aux récompenses végétales. L'accumulation de pathogènes spécifiques à l'hôte génère probablement une rétroaction négative sur la plante, tandis que les changements dans la densité des mutualistes microbiens génèrent probablement une rétroaction positive. Cependant, la dynamique compétitive entre les microbes dépend des coûts multidimensionnels de la virulence et du mutualisme, de la structure spatiale à fine échelle au sein des racines des plantes, et de l'allocation active de la plante et de la défense localisée. En raison de cela, intégrer une vue complète des dynamiques microbiennes est essentiel pour expliquer la dynamique des rétroactions plante-sol et donc l'écologie des communautés végétales.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-micro-092611-150107",
    doi = "10.1146/annurev-micro-092611-150107",
    openalex = "W2129528999",
    references = "doi101111j14209101200801658x"
}

Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont omniprésents chez les plantes et jouent de nombreux rôles écologiques. Chaque composé peut varier en présence et/ou en quantité, et la composition du mélange de produits chimiques peut varier, de sorte que la chimiodiversité peut être partitionnée au sein et entre les individus. L'ontogenèse végétale et les variations environnementales et génétiques sont reconnues comme des sources de variation chimique, mais les récentes avancées dans la compréhension de la base moléculaire de la variation pourraient permettre le déploiement futur de mutants isogéniques pour tester la fonction adaptative spécifique de la variation des MSV. Une conséquence importante de la forte variation intraspécifique est la capacité à évoluer rapidement. Il devient de plus en plus clair que la variance des traits liée à la fois aux variations macro- et micro-environnementales peut également évoluer et peut répondre plus fortement à la sélection que les valeurs moyennes des traits. Cette recherche, qui en est à ses débuts chez les plantes, met en lumière ce qui pourrait être une pièce manquante du tableau de l'évolution des MSV. Les polymorphismes des MSV sont probablement maintenus par plusieurs forces sélectives agissant à de nombreuses échelles spatiales et temporelles, mais des exemples convaincants qui reconnaissent la diversité des structures de population végétale sont rares. Nous décrivons comment la diversité peut être intrinsèquement bénéfique pour les plantes et suggérons des voies fructueuses pour la recherche future afin de démêler les causes et les conséquences de la variation intraspécifique.

@article{doi101111nph12526,
    author = "Moore, Ben D. et Andrew, Rose L. et Külheim, Carsten et Foley, William J.",
    title = "Explaining intraspecific diversity in plant secondary metabolites in an ecological context",
    year = "2013",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont omniprésents chez les plantes et jouent de nombreux rôles écologiques. Chaque composé peut varier en présence et/ou en quantité, et la composition du mélange de produits chimiques peut varier, de sorte que la chimiodiversité peut être partitionnée au sein et entre les individus. L'ontogenèse végétale et les variations environnementales et génétiques sont reconnues comme des sources de variation chimique, mais les récentes avancées dans la compréhension de la base moléculaire de la variation pourraient permettre le déploiement futur de mutants isogéniques pour tester la fonction adaptative spécifique de la variation des MSV. Une conséquence importante de la forte variation intraspécifique est la capacité à évoluer rapidement. Il devient de plus en plus clair que la variance des traits liée à la fois aux variations macro- et micro-environnementales peut également évoluer et peut répondre plus fortement à la sélection que les valeurs moyennes des traits. Cette recherche, qui en est à ses débuts chez les plantes, met en lumière ce qui pourrait être une pièce manquante du tableau de l'évolution des MSV. Les polymorphismes des MSV sont probablement maintenus par plusieurs forces sélectives agissant à de nombreuses échelles spatiales et temporelles, mais des exemples convaincants qui reconnaissent la diversité des structures de population végétale sont rares. Nous décrivons comment la diversité peut être intrinsèquement bénéfique pour les plantes et suggérons des voies fructueuses pour la recherche future afin de démêler les causes et les conséquences de la variation intraspécifique.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.12526",
    doi = "10.1111/nph.12526",
    openalex = "W2172124708",
    references = "doi101038nrg2278, doi101111j001438202002tb00145x, doi101111j13652435201001794x, doi101111j13652435201001796x"
}

Des trous noirs supermassifs (TNS) ont été détectés dans 85 galaxies grâce à la modélisation dynamique de la cinématique résolue spatialement. Le télescope spatial Hubble a révolutionné la recherche sur les TNS en faisant passer la discipline de sa phase de démonstration de concept à des études quantitatives de la démographie des TNS. La découverte la plus influente fut celle d'une corrélation étroite entre la masse du TNS [Formula: see text] et la dispersion de vitesses σ du composant du bulbe de la galaxie hôte. Combinée à des corrélations similaires avec la luminosité et la masse du bulbe, cela a conduit à la croyance répandue que les TNS et les bulbes coévoluent en régulant mutuellement leur croissance. Pendant plus d'une décennie, les conclusions basées sur un ensemble de corrélations, allant des galaxies elliptiques les plus brillantes des amas [Formula: see text] aux plus petites galaxies [Formula: see text], ont dominé les travaux sur les TNS. De nouveaux résultats remplacent désormais cette histoire simple par une image plus riche et plus plausible dans laquelle les TNS présentent des corrélations différentes avec différents composants galactiques. Un objectif raisonnable est d'utiliser ces progrès pour affiner notre compréhension de la coévolution TNS-galaxie. Des TNS de masses de 10 5 −10 6 M ⊙ sont trouvés dans de nombreuses galaxies dépourvues de bulbe. Par conséquent, les bulbes classiques (ressemblant à des galaxies elliptiques) ne sont pas nécessaires à la formation des TNS. D'un autre côté, bien qu'ils vivent dans les disques galactiques, les TNS ne présentent pas de corrélation avec les disques galactiques. De plus, toute corrélation [Formula: see text] avec les propriétés des pseudobulbes formés dans les disques et des halos de matière noire est trop faible pour impliquer une coévolution étroite. Les corrélations ci-dessus et d'autres entre les paramètres de la galaxie hôte entre eux et avec [Formula: see text] suggèrent qu'il existe quatre régimes de rétroaction des TNS. (1) L'alimentation locale, séculaire, épisodique et stochastique de petits TNS dans des galaxies largement dépourvues de bulbe implique trop peu d'énergie pour entraîner une coévolution. (2) L'alimentation globale lors de fusions majeures et humides de galaxies fait croître rapidement des TNS géants lors d'événements de courte durée, semblables aux quasars, dont la rétroaction énergétique affecte l'évolution galactique. Les hôtes résultants sont des bulbes classiques et des elliptiques rotatifs à disque sans cœur. (3) Après ces phases d'AGN et aux plus grandes masses galactiques, la rétroaction des TNS en mode de maintenance vers le gaz émettant des rayons X a principalement un effet négatif en aidant à maintenir les baryons enfermés dans un gaz chaud et empêchant ainsi la formation galactique d'aboutir. Cela se produit dans des elliptiques géants, à cœur non rotatif et de forme boîtière. Leurs propriétés, y compris leurs corrélations étroites entre [Formula: see text] et les paramètres du cœur, soutiennent la conclusion que les elliptiques à cœur se forment par des fusions majeures sans dissipation. Elles héritent d'effets de coévolution de galaxies progénitrices plus petites. De plus, (4) indépendamment de toute physique de rétroaction, dans les modes de croissance 2 et 3 des TNS, la moyenne résultant de fusions successives joue un rôle majeur dans la réduction de la dispersion des corrélations [Formula: see text] des grandes valeurs observées dans les galaxies dépourvues de bulbe et les pseudobulbes aux petites valeurs observées dans les galaxies elliptiques géantes.

@article{doi101146annurevastro082708101811,
    author = "Kormendy, John et Ho, Luis C.",
    title = "Coevolution (ou pas) des trous noirs supermassifs et de leurs galaxies hôtes",
    year = "2013",
    journal = "Annual Review of Astronomy and Astrophysics",
    abstract = "Des trous noirs supermassifs (BHs) ont été détectés dans 85 galaxies grâce à la modélisation dynamique de la cinématique résolue spatialement. Le télescope spatial Hubble a révolutionné la recherche sur les BH en faisant passer la discipline de sa phase de preuve de concept à des études quantitatives de la démographie des BH. La découverte la plus influente fut celle d'une corrélation étroite entre la masse du BH [Formula: see text] et la dispersion de vitesses σ du composant en relief (bulge) de la galaxie hôte. Combinée à des corrélations similaires avec la luminosité et la masse du bulge, cela a conduit à la croyance répandue que les BH et les bulges coévoluent en régulant mutuellement leur croissance. Pendant plus d'une décennie, les travaux sur les BH ont été dominés par des conclusions basées sur un ensemble de corrélations, allant des galaxies elliptiques les plus brillantes des amas [Formula: see text] aux plus petites galaxies [Formula: see text]. De nouveaux résultats remplacent désormais cette histoire simple par une image plus riche et plus plausible dans laquelle les BH présentent des corrélations différentes avec différents composants galactiques. Un objectif raisonnable est d'utiliser ces progrès pour affiner notre compréhension de la coévolution BH-galaxie. Des BH de masses de 10 5 −10 6 M ⊙ sont trouvés dans de nombreuses galaxies sans bulge. Par conséquent, les bulges classiques (ressemblant à des galaxies elliptiques) ne sont pas nécessaires à la formation des BH. D'un autre côté, bien qu'ils vivent dans les disques galactiques, les BH ne présentent pas de corrélation avec les disques galactiques. De plus, toute corrélation [Formula: see text] avec les propriétés des pseudobulges formés dans les disques et des halos de matière noire est trop faible pour impliquer une coévolution étroite. Les corrélations ci-dessus et d'autres entre les paramètres de la galaxie hôte suggèrent qu'il existe quatre régimes de rétroaction (feedback) des BH. (1) L'alimentation locale, séculaire, épisodique et stochastique de petits BH dans des galaxies principalement sans bulge implique trop peu d'énergie pour entraîner une coévolution. (2) L'alimentation globale lors de fusions majeures de galaxies humides fait croître rapidement des BH géants lors d'événements de courte durée, semblables aux quasars, dont la rétroaction énergétique affecte l'évolution galactique. Les hôtes résultants sont des bulges classiques et des elliptiques à rotation disky sans cœur. (3) Après ces phases d'AGN et aux plus grandes masses galactiques, la rétroaction des BH en mode de maintenance vers le gaz émetteur de rayons X a principalement un effet négatif en aidant à maintenir les baryons enfermés dans un gaz chaud, empêchant ainsi la formation galactique d'atteindre son achèvement. Cela se produit dans des elliptiques géantes à cœur non rotatif et de forme boxy. Leurs propriétés, y compris leurs corrélations étroites entre [Formula: see text] et les paramètres du cœur, soutiennent la conclusion que les elliptiques à cœur se forment par des fusions majeures sans dissipation. Elles héritent d'effets de coévolution de galaxies progénitrices plus petites. De plus, (4) indépendamment de toute physique de rétroaction, dans les modes de croissance des BH 2 et 3, la moyenne résultant de fusions successives joue un rôle majeur dans la réduction de la dispersion des corrélations [Formula: see text] des grandes valeurs observées dans les galaxies sans bulge et pseudobulge aux petites valeurs observées dans les galaxies elliptiques géantes.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-astro-082708-101811",
    doi = "10.1146/annurev-astro-082708-101811",
    openalex = "W2124811735",
    references = "doi101038nature03597, doi101046j13658711200104022x, doi101086304888, doi101086305772, doi101086312838, doi101086498708, doi1010880004637x7372103, doi101088006700491802330, doi101146annurevastro361189, doi1015159781400828722"
}

Les composés secondaires des plantes sont de puissants dissuadants de la ponte et de l'alimentation des insectes, mais peuvent également être des attractifs pour les herbivores spécialistes. Ces interactions insecte-plante sont médiées par les récepteurs gustatifs (Grs) et les récepteurs olfactifs (Ors) des insectes. Une analyse du génome de référence du papillon Heliconius melpomene, qui se nourrit de lianes de passion (Passiflora spp.), ainsi que le séquençage du génome entier au sein de l'espèce et à travers la phylogénie du Heliconius ont permis une opportunité sans précédent d'étudier les motifs de duplication des gènes et de variation du nombre de copies (CNV) parmi ces gènes sensoriels clés. Nous rapportons des prédictions de gènes in silico de 73 gènes Gr dans le génome de référence de H. melpomene, incluant des récepteurs putatifs de CO2, de sucre, d'alcool de sucre, de fructose et d'amertume. La majorité de ces Grs sont le résultat de duplications de gènes depuis que Heliconius a partagé un ancêtre commun avec le papillon monarque ou le ver à soie. Parmi les Grs mais pas les Ors, les CNV sont plus courantes au sein des espèces dans ces lignées de gènes qui ont également été dupliquées au cours de cette échelle de temps évolutive, suggérant une évolution rapide continue de la famille de gènes. Le séquençage profond (∼1 milliard de lectures) des transcriptomes provenant du proboscis et des palpes labiaux, des antennes et des pattes des mâles et femelles adultes de H. melpomene indique que 67 des 73 gènes Gr prédits et 67 des 70 gènes Or prédits sont exprimés dans ces trois tissus. Fait intrigant, nous constatons qu'un tiers de tous les Grs montrent une expression de gène biaisée vers les femelles (n = 26) et presque tous ceux-ci (n = 21) sont des Grs spécifiques à Heliconius. En fait, un excès significatif de Grs exprimés dans les pattes femelles mais pas dans les pattes mâles est le résultat d'une duplication récente de gènes. Cette différence de diversité d'expression des gènes Gr entre les sexes est accompagnée d'un dimorphisme sexuel frappant dans l'abondance des sensilles gustatifs sur les pattes antérieures de H. melpomene, suggérant que le comportement de ponte des femelles conduit à l'évolution de nouveaux récepteurs gustatifs dans les génomes des papillons.

@article{doi101371journalpgen1003620,
    author = "Briscoe, Adriana D. et Macias-Muñoz, Aide et Kozak, Krzysztof M. et Walters, James R. et Yuan, Furong et Jamie, Gabriel A. et Martin, Simon H. et Dasmahapatra, Kanchon K. et Ferguson, Laura et Mallet, James et Jacquin‐Joly, Emmanuelle et Jiggins, Chris D.",
    title = "Female Behaviour Drives Expression and Evolution of Gustatory Receptors in Butterflies",
    year = "2013",
    journal = "PLoS Genetics",
    abstract = "Les composés secondaires des plantes sont de puissants dissuadants de la ponte et de l'alimentation des insectes, mais peuvent également être des attractifs pour les herbivores spécialistes. Ces interactions insecte-plante sont médiées par les récepteurs gustatifs (Grs) et les récepteurs olfactifs (Ors) des insectes. Une analyse du génome de référence du papillon Heliconius melpomene, qui se nourrit de lianes de passion (Passiflora spp.), ainsi que le séquençage du génome entier au sein de l'espèce et à travers la phylogénie du Heliconius ont permis une opportunité sans précédent d'étudier les motifs de duplication des gènes et de variation du nombre de copies (CNV) parmi ces gènes sensoriels clés. Nous rapportons des prédictions de gènes in silico de 73 gènes Gr dans le génome de référence de H. melpomene, incluant des récepteurs putatifs de CO2, de sucre, d'alcool de sucre, de fructose et d'amertume. La majorité de ces Grs sont le résultat de duplications de gènes depuis que Heliconius a partagé un ancêtre commun avec le papillon monarque ou le ver à soie. Parmi les Grs mais pas les Ors, les CNV sont plus courantes au sein des espèces dans ces lignées de gènes qui ont également été dupliquées au cours de cette échelle de temps évolutive, suggérant une évolution rapide continue de la famille de gènes. Le séquençage profond (∼1 milliard de lectures) des transcriptomes provenant du proboscis et des palpes labiaux, des antennes et des pattes des mâles et femelles adultes de H. melpomene indique que 67 des 73 gènes Gr prédits et 67 des 70 gènes Or prédits sont exprimés dans ces trois tissus. Fait intrigant, nous constatons qu'un tiers de tous les Grs montrent une expression de gène biaisée vers les femelles (n = 26) et presque tous ceux-ci (n = 21) sont des Grs spécifiques à Heliconius. En fait, un excès significatif de Grs exprimés dans les pattes femelles mais pas dans les pattes mâles est le résultat d'une duplication récente de gènes. Cette différence de diversité d'expression des gènes Gr entre les sexes est accompagnée d'un dimorphisme sexuel frappant dans l'abondance des sensilles gustatifs sur les pattes antérieures de H. melpomene, suggérant que le comportement de ponte des femelles conduit à l'évolution de nouveaux récepteurs gustatifs dans les génomes des papillons.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003620",
    doi = "10.1371/journal.pgen.1003620",
    openalex = "W2118172195",
    references = "benson1975coevolution, doi101007s1088600692078, doi101111j155856461975tb00861x"
}

Les plantes interagissent avec les insectes depuis plusieurs centaines de millions d'années, ce qui a conduit à des approches de défense complexes face à diverses stratégies d'alimentation des insectes. Certaines défenses sont constitutives tandis que d'autres sont induites, bien que les classes de composés ou de protéines à activité insecticide soient souvent similaires. La herbivorie par les insectes induit plusieurs signaux internes provenant des tissus blessés, y compris des flux d'ions calcium, des cascades de phosphorylation et des signaux systémiques et jasmonates. Ces signaux sont perçus dans les tissus non endommagés, qui renforcent ensuite leur défense en produisant différents composés de défense, principalement de faible poids moléculaire. Ces composés de défense spécialisés bioactifs peuvent repousser ou intoxiquer les insectes, tandis que les protéines de défense interfèrent souvent avec leur digestion. Des volatils sont libérés lors de la herbivorie pour repousser les herbivores, attirer les prédateurs ou pour la communication entre feuilles ou plantes, et pour induire des réponses de défense. Les plantes utilisent également des caractéristiques morphologiques comme les cires, les trichomes et les latices pour rendre l'alimentation plus difficile pour les insectes. Le nectar extrafloral, les corps de nourriture et les sites de nidification ou de refuge sont produits pour héberger et nourrir les prédateurs des herbivores. En même temps, les insectes herbivores se sont adaptés pour résister aux défenses des plantes et, dans certains cas, séquestrent même les composés et les réutilisent dans leur propre défense. La défense des plantes et l'adaptation des insectes impliquent tous deux des coûts métaboliques, de sorte que la plupart des interactions plantes-insectes aboutissent à une impasse, où l'hôte et l'herbivore survivent bien que leur développement soit sous-optimal.

@article{doi103390ijms140510242,
    author = "Fürstenberg-Hägg, Joel et Zagrobelny, Mika et Bak, Søren",
    title = "Plant Defense against Insect Herbivores",
    year = "2013",
    journal = "International Journal of Molecular Sciences",
    abstract = "Les plantes interagissent avec les insectes depuis plusieurs centaines de millions d'années, ce qui a conduit à des approches de défense complexes face à diverses stratégies d'alimentation des insectes. Certaines défenses sont constitutives tandis que d'autres sont induites, bien que les classes de composés ou de protéines à activité insecticide soient souvent similaires. La herbivorie par les insectes induit plusieurs signaux internes provenant des tissus blessés, y compris des flux d'ions calcium, des cascades de phosphorylation et des signaux systémiques et jasmonates. Ces signaux sont perçus dans les tissus non endommagés, qui renforcent ensuite leur défense en produisant différents composés de défense, principalement de faible poids moléculaire. Ces composés de défense spécialisés bioactifs peuvent repousser ou intoxiquer les insectes, tandis que les protéines de défense interfèrent souvent avec leur digestion. Des volatils sont libérés lors de la herbivorie pour repousser les herbivores, attirer les prédateurs ou pour la communication entre feuilles ou plantes, et pour induire des réponses de défense. Les plantes utilisent également des caractéristiques morphologiques comme les cires, les trichomes et les latices pour rendre l'alimentation plus difficile pour les insectes. Le nectar extrafloral, les corps de nourriture et les sites de nidification ou de refuge sont produits pour héberger et nourrir les prédateurs des herbivores. En même temps, les insectes herbivores se sont adaptés pour résister aux défenses des plantes et, dans certains cas, séquestrent même les composés et les réutilisent dans leur propre défense. La défense des plantes et l'adaptation des insectes impliquent tous deux des coûts métaboliques, de sorte que la plupart des interactions plantes-insectes aboutissent à une impasse, où l'hôte et l'herbivore survivent bien que leur développement soit sous-optimal.",
    url = "https://doi.org/10.3390/ijms140510242",
    doi = "10.3390/ijms140510242",
    openalex = "W2103353162",
    references = "doi10100797814684264651, doi101016c20090007363, doi10103835081161, doi101038nature05960, doi101038nature06006, doi101093nargkv1164, doi101111j14698137200702330x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101146annurevarplant481251, doi101146annurevarplant59032607092825, doi101146annurevecolsys110308120307, doi105860choice383895"
}

La coévolution, adaptation réciproque entre deux taxons ou plus, est souvent invoquée comme un mécanisme principal responsable de la génération d'une grande partie de la biodiversité terrestre. Cette hypothèse, qui a un attrait conceptuel, est incroyablement large en termes d'échelle évolutive, englobant des motifs et processus divers opérant sur des échelles de temps allant des générations microbiennes aux ères géologiques. Cependant, nous disposons de preuves surprenamment peu nombreuses que les associations à grande échelle entre la coévolution et la diversité reflètent une relation causale à des échelles de temps plus petites, dans lesquelles la sélection coévolutif est directement responsable de la formation de nouvelles espèces. Dans cette synthèse, nous évaluons de manière critique les preuves à l'appui de l'hypothèse souvent invoquée selon laquelle la coévolution est un processus important favorisant la diversification biologique. Nous concluons que le manque de preuves généralisées en faveur de la diversification coévolutif peut être le mieux expliqué par le fait que l'importance de la coévolution dans la diversification varie selon le type d'interaction et l'échelle de la diversification considérée.

@article{doi101086677928,
    author = "Hembry, David H. et Yoder, Jeremy B. et Goodman, Kari Roesch",
    title = "Coevolution and the Diversification of Life",
    year = "2014",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Coevolution, reciprocal adaptation between two or more taxa, is commonly invoked as a primary mechanism responsible for generating much of Earth's biodiversity. This conceptually appealing hypothesis is incredibly broad in evolutionary scope, encompassing diverse patterns and processes operating over timescales ranging from microbial generations to geological eras. However, we have surprisingly little evidence that large-scale associations between coevolution and diversity reflect a causal relationship at smaller timescales, in which coevolutionary selection is directly responsible for the formation of new species. In this synthesis, we critically evaluate evidence for the often-invoked hypothesis that coevolution is an important process promoting biological diversification. We conclude that the lack of widespread evidence for coevolutionary diversification may be best explained by the fact that coevolution's importance in diversification varies depending on the type of interaction and the scale of the diversification under consideration.",
    url = "https://doi.org/10.1086/677928",
    doi = "10.1086/677928",
    openalex = "W2083313949",
    references = "doi101016jtree201311003"
}

La consommation de plantes par les animaux sous-tend des processus évolutifs et écologiques importants dans la nature. L'herbivorie par les arthropodes s'est développée il y a environ 415 Ma et la coévolution subséquente entre les plantes et les herbivores est créditée d'avoir généré une grande partie de la diversité macroscopique sur la Terre. Dans les écosystèmes contemporains, l'herbivorie fournit le principal conduit d'énergie des producteurs primaires aux consommateurs. Ici, nous montrons que lorsqu'on moyenne sur tous les lignages majeurs de plantes vasculaires, les herbivores consomment 5,3 % du tissu foliaire produit annuellement par les plantes, alors que les estimations précédentes sont jusqu'à 3,8 fois plus élevées. Ce résultat suggère que pour de nombreuses espèces de plantes, l'herbivorie foliaire peut jouer un rôle plus faible dans le flux d'énergie et de nutriments qu'on ne le pense actuellement. Des analyses comparatives d'un échantillon mondial diversifié de 1058 espèces sur 2085 populations révèlent que les modèles de sélection stabilisatrice décrivent le mieux les taux de consommation foliaire, et que ces taux varient considérablement au sein et entre les lignages majeurs de plantes. Un déterminant clé de cette variation est la forme de croissance des plantes, où les espèces de plantes ligneuses subissent une herbivorie foliaire 64 % plus élevée que les plantes non ligneuses. Une herbivorie foliaire plus élevée chez les espèces ligneuses soutient une prédiction clé de la théorie de l'apparence des plantes. Notre étude fournit des aperçus sur la manière dont une longue histoire de coévolution a façonné les relations écologiques et évolutives entre les plantes et les herbivores.

@article{doi101098rspb20140555,
    author = "Turcotte, Martin M. et Davies, T. Jonathan et Thomsen, Christina J. M. et Johnson, Marc T. J.",
    title = "Macroécologie et modèles macroévolutifs de l'herbivorie foliaire chez les plantes vasculaires",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "La consommation de plantes par les animaux sous-tend des processus évolutifs et écologiques importants dans la nature. L'herbivorie par les arthropodes s'est développée il y a environ 415 Ma et la coévolution subséquente entre les plantes et les herbivores est créditée d'avoir généré une grande partie de la diversité macroscopique sur la Terre. Dans les écosystèmes contemporains, l'herbivorie fournit le principal conduit d'énergie des producteurs primaires aux consommateurs. Ici, nous montrons que lorsqu'on moyenne sur tous les lignages majeurs de plantes vasculaires, les herbivores consomment 5,3 % du tissu foliaire produit annuellement par les plantes, alors que les estimations précédentes sont jusqu'à 3,8 fois plus élevées. Ce résultat suggère que pour de nombreuses espèces de plantes, l'herbivorie foliaire peut jouer un rôle plus faible dans le flux d'énergie et de nutriments qu'on ne le pense actuellement. Des analyses comparatives d'un échantillon mondial diversifié de 1058 espèces sur 2085 populations révèlent que les modèles de sélection stabilisatrice décrivent le mieux les taux de consommation foliaire, et que ces taux varient considérablement au sein et entre les lignages majeurs de plantes. Un déterminant clé de cette variation est la forme de croissance des plantes, où les espèces de plantes ligneuses subissent une herbivorie foliaire 64 % plus élevée que les plantes non ligneuses. Une herbivorie foliaire plus élevée chez les espèces ligneuses soutient une prédiction clé de la théorie de l'apparence des plantes. Notre étude fournit des aperçus sur la manière dont une longue histoire de coévolution a façonné les relations écologiques et évolutives entre les plantes et les herbivores.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2014.0555",
    doi = "10.1098/rspb.2014.0555",
    openalex = "W2024643470",
    references = "doi101016jtree201311003"
}

La coévolution bactéries-phages, l'évolution réciproque entre les hôtes bactériens et les phages qui les infectent, est un moteur important des processus écologiques et évolutifs dans les communautés microbiennes. Il existe de plus en plus de preuves, provenant à la fois de populations de laboratoire et naturelles, que la coévolution peut maintenir la diversité phénotypique et génétique, augmenter le taux d'évolution et de divergence des bactéries et des phages, affecter la structure de la communauté et façonner l'évolution de traits bactériens écologiquement pertinents. Bien que l'étude de la coévolution bactéries-phages soit encore à ses débuts, avec des questions ouvertes concernant la spécificité de l'interaction, les réseaux génétiques des partenaires en coévolution et l'importance relative de l'interaction en coévolution dans les communautés et environnements complexes, des avancées majeures ont récemment été réalisées dans le domaine. Dans cette revue, nous résumons notre compréhension actuelle de la coévolution bactéries-phages à la fois en laboratoire et dans la nature, discutons des récentes découvertes sur le processus de coévolution lui-même et l'impact de la coévolution sur le phénotype bactérien, la diversité et les interactions avec d'autres espèces (en particulier leurs hôtes eucaryotes), et esquissons les perspectives futures pour le domaine.

@article{doi1011111574697612072,
    author = "Koskella, Britt et Brockhurst, Michael A.",
    title = "Bactéries–phages coévolution comme moteur des processus écologiques et évolutifs dans les communautés microbiennes",
    year = "2014",
    journal = "FEMS Microbiology Reviews",
    abstract = "La coévolution bactéries-phages, l'évolution réciproque entre les hôtes bactériens et les phages qui les infectent, est un moteur important des processus écologiques et évolutifs dans les communautés microbiennes. Il existe de plus en plus de preuves, provenant à la fois de populations de laboratoire et naturelles, que la coévolution peut maintenir la diversité phénotypique et génétique, augmenter le taux d'évolution et de divergence des bactéries et des phages, affecter la structure de la communauté et façonner l'évolution de traits bactériens écologiquement pertinents. Bien que l'étude de la coévolution bactéries-phages soit encore à ses débuts, avec des questions ouvertes concernant la spécificité de l'interaction, les réseaux génétiques des partenaires en coévolution et l'importance relative de l'interaction en coévolution dans les communautés et environnements complexes, des avancées majeures ont récemment été réalisées dans le domaine. Dans cette revue, nous résumons notre compréhension actuelle de la coévolution bactéries-phages à la fois en laboratoire et dans la nature, discutons des récentes découvertes sur le processus de coévolution lui-même et l'impact de la coévolution sur le phénotype bactérien, la diversité et les interactions avec d'autres espèces (en particulier leurs hôtes eucaryotes), et esquissons les perspectives futures pour le domaine.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1574-6976.12072",
    doi = "10.1111/1574-6976.12072",
    openalex = "W2070190014",
    references = "doi101073pnas1014353108, doi101111j155856461980tb04849x"
}

La signalisation visuelle chez les animaux peut servir à de nombreuses fonctions, y compris la dissuasion des prédateurs et l'attraction des partenaires. Dans de nombreux cas, les signaux utilisés pour annoncer l'infécondité aux prédateurs sont également utilisés pour la communication intraspécifique. Bien que l'aposématisme et le choix du partenaire soient des forces significatives conduisant à l'évolution de nombreux phénotypes animaux, l'interaction entre les signaux visuels pertinents reste peu explorée. Ici, nous abordons cette question chez le papillon passion-vine aposématique Heliconius erato en utilisant des modèles manipulés en couleur et en motif pour tester les contributions de différentes caractéristiques visuelles à la fois au choix du partenaire et à la coloration d'alerte. Nous avons constaté que l'efficacité relative d'un modèle pour échapper à la prédation était corrélée à son efficacité pour induire un comportement d'accouplement, et dans les deux cas, la couleur des ailes était plus prédictive des bénéfices de fitness présumés que le motif des ailes. Dans l'ensemble, cependant, une combinaison de la couleur (locale) naturelle et du motif était la plus efficace pour la dissuasion des prédateurs et l'attraction des partenaires. En explorant les contributions relatives de la composition couleur versus motif dans les études de prédation et de préférence sexuelle, nous avons montré comment la sélection naturelle et la sélection sexuelle peuvent fonctionner en parallèle pour conduire à l'évolution de motifs de couleur spécifiques chez les animaux.

@article{doi101111evo12524,
    author = "Finkbeiner, Susan D. and Briscoe, Adriana D. and Reed, Robert D.",
    title = "Warning signals are seductive: Relative contributions of color and pattern to predator avoidance and mate attraction in Heliconius butterflies",
    year = "2014",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Visual signaling in animals can serve many uses, including predator deterrence and mate attraction. In many cases, signals used to advertise unprofitability to predators are also used for intraspecific communication. Although aposematism and mate choice are significant forces driving the evolution of many animal phenotypes, the interplay between relevant visual signals remains little explored. Here, we address this question in the aposematic passion-vine butterfly Heliconius erato by using color- and pattern-manipulated models to test the contributions of different visual features to both mate choice and warning coloration. We found that the relative effectiveness of a model at escaping predation was correlated with its effectiveness at inducing mating behavior, and in both cases wing color was more predictive of presumptive fitness benefits than wing pattern. Overall, however, a combination of the natural (local) color and pattern was most successful for both predator deterrence and mate attraction. By exploring the relative contributions of color versus pattern composition in predation and mate preference studies, we have shown how both natural and sexual selection may work in parallel to drive the evolution of specific animal color patterns.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12524",
    doi = "10.1111/evo.12524",
    openalex = "W1873020453",
    references = "doi101007s1088600692078, doi1010160022519375901113, doi101017cbo9781139087759, doi10108000031305199810480559, doi10108001621459199510476572, doi101086285308, doi101098rspb20111932, doi1018637jssv027i08, doi1023071437762, doi1023072965438, openalexw68436435"
}

Les papillons sont des insectes charismatiques qui ont longtemps été au cœur de la recherche biologique. Ils constituent également des habitats pour les micro-organismes, bien que ces symbiotes microbiens soient peu étudiés, malgré leur importance probable pour l'écologie et l'évolution des papillons. En particulier, la diversité et la composition des communautés microbiennes peuplant les papillons adultes restent inconnues, et il est incertain comment la microflore larvaire (chenille) et celle des adultes se comparent. Pour combler ces lacunes de connaissances, nous avons utilisé le séquençage Illumina des gènes 16S rRNA provenant des communautés bactériennes internes associées à plusieurs stades de vie du papillon néotropical Heliconius erato. Nous avons constaté que les chenilles folivores et les adultes nourris de nectar et de pollen de H. erato abritent des communautés bactériennes nettement distinctes, un motif probablement ancré dans leurs régimes alimentaires distincts. Les chenilles et les papillons adultes hébergent un nombre relativement faible et similaire de phylotypes bactériens, mais peu sont communs aux deux stades. La microflore larvaire se simplifie et se réorganise clairement lors de la métamorphose ; ainsi, les changements structurels de la communauté bactérienne d'un papillon parallèlent ceux de sa propre morphologie. Nous identifions également des taxons bactériens spécifiques qui pourraient médier la biologie de l'alimentation larvaire et adulte chez Heliconius et d'autres papillons. Bien que les adultes mâles et femelles de Heliconius diffèrent par leur physiologie reproductive et le degré d'alimentation en pollen, les communautés bactériennes associées à H. erato ne sont pas dimorphes sexuellement. Enfin, nous montrons que les individus captifs et sauvages hébergent des microflore différentes, une découverte qui pourrait avoir des implications importantes pour la pertinence des études expérimentales utilisant des papillons captifs.

@article{doi101371journalpone0086995,
    author = "Hammer, Tobin J. et McMillan, W. Owen et Fierer, Noah",
    title = "Métamorphose d'une communauté bactérienne associée à un papillon",
    year = "2014",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Les papillons sont des insectes charismatiques qui ont longtemps été au cœur de la recherche biologique. Ils constituent également des habitats pour les micro-organismes, bien que ces symbiotes microbiens soient peu étudiés, malgré leur importance probable pour l'écologie et l'évolution des papillons. En particulier, la diversité et la composition des communautés microbiennes peuplant les papillons adultes restent inconnues, et il est incertain comment la microflore larvaire (chenille) et celle des adultes se comparent. Pour combler ces lacunes de connaissances, nous avons utilisé le séquençage Illumina des gènes 16S rRNA provenant des communautés bactériennes internes associées à plusieurs stades de vie du papillon néotropical Heliconius erato. Nous avons constaté que les chenilles folivores et les adultes nourris de nectar et de pollen de H. erato abritent des communautés bactériennes nettement distinctes, un motif probablement ancré dans leurs régimes alimentaires distincts. Les chenilles et les papillons adultes hébergent un nombre relativement faible et similaire de phylotypes bactériens, mais peu sont communs aux deux stades. La microflore larvaire se simplifie et se réorganise clairement lors de la métamorphose ; ainsi, les changements structurels de la communauté bactérienne d'un papillon parallèlent ceux de sa propre morphologie. Nous identifions également des taxons bactériens spécifiques qui pourraient médier la biologie de l'alimentation larvaire et adulte chez Heliconius et d'autres papillons. Bien que les adultes mâles et femelles de Heliconius diffèrent par leur physiologie reproductive et le degré d'alimentation en pollen, les communautés bactériennes associées à H. erato ne sont pas dimorphes sexuellement. Enfin, nous montrons que les individus captifs et sauvages hébergent des microflore différentes, une découverte qui pourrait avoir des implications importantes pour la pertinence des études expérimentales utilisant des papillons captifs.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0086995",
    doi = "10.1371/journal.pone.0086995",
    openalex = "W2045178952",
    references = "doi101007s1088600692078, doi101098rsif20130304"
}

FOND : Les plantes sont des foyers propices aux parasites tels que les herbivores arthropodes, qui acquièrent des nutriments et de l'énergie de leurs hôtes afin de grandir et de se reproduire. Par conséquent, les plantes sont sélectionnées pour évoluer une résistance, ce qui à son tour sélectionne des herbivores capables de faire face à cette résistance. Pour préserver leur fitness lorsqu'elles sont attaquées par des herbivores, les plantes peuvent employer des stratégies complexes incluant la réallocation des ressources et la production de métabolites et de structures défensives. Les défenses des plantes peuvent être soit préfabriquées, soit produites uniquement lors d'une attaque. Celles qui sont prêtes à l'emploi sont désignées comme des défenses constitutives. Certaines défenses constitutives sont opérationnelles à tout moment, tandis que d'autres nécessitent une activation. Les défenses produites uniquement lorsque des herbivores sont présents sont désignées comme des défenses induites. Ces dernières peuvent être établies via la biosynthèse de novo de substances défensives ou via des modifications de substances préfabriquées et, par conséquent, elles sont actives uniquement lorsqu'elles sont nécessaires. L'inductibilité de la défense peut servir à économiser de l'énergie et à prévenir l'intoxication auto-induite, mais implique également qu'il y a un délai avant que ces défenses ne deviennent opérationnelles. Les défenses induites peuvent être caractérisées par des altérations de la morphologie végétale et de la chimie moléculaire et sont associées à une diminution des performances des herbivores. Ces altérations sont mises en mouvement par des signaux générés par les herbivores. Enfin, un sous-ensemble de métabolites induits est libéré dans l'air sous forme de volatils et fonctionne comme un phare pour les ennemis naturels de recherche de proie cherchant des proies, et cela est désigné comme une défense indirecte induite. PORTÉE : L'objectif de cette revue est d'évaluer (1) quelles stratégies les plantes ont évoluées pour faire face aux herbivores et (2) quels traits les herbivores ont évolués qui leur permettent de contrer ces défenses. L'accent principal est mis sur l'induction et la suppression des défenses des plantes et la revue décrit comment la palette de traits qui déterminent l'induction/suppression de, et la résistance/sensibilité des herbivores aux, défenses des plantes peut donner naissance à une compétition exploitative et à une facilitation au sein des communautés écologiques « habitan » une plante. CONCLUSIONS : Les herbivores ont évolué des stratégies diverses, qui ne sont pas mutuellement exclusives, pour diminuer les effets négatifs des défenses des plantes afin de maximiser la conversion du matériel végétal en descendants. De nombreuses adaptations ont été trouvées chez les herbivores, leur permettant de démanteler ou de contourner les barrières défensives, d'éviter les tissus présentant des niveaux relativement élevés de produits chimiques défensifs ou de métaboliser ces produits chimiques une fois ingérés. En outre, certains herbivores interfèrent avec le début ou la fin des défenses des plantes induites, entraînant une suppression partielle ou totale de la résistance de la plante. La capacité de supprimer les défenses des plantes induites semble se produire chez les parasites végétaux de différents règnes, y compris les arthropodes herbivores, et il existe une diversité remarquable dans les mécanismes de suppression. La suppression peut affecter fortement la structure du réseau trophique, car la capacité de supprimer l'activation des défenses d'un hôte commun peut faciliter les concurrents, tandis que la capacité d'un herbivore à faire face aux défenses des plantes activées ne le fera pas. Une caractérisation plus approfondie des mécanismes et des traits qui donnent naissance à la suppression des défenses des plantes nous permettra de déterminer leur rôle dans la formation des interactions directes et indirectes dans les réseaux trophiques et dans quelle mesure celles-ci déterminent la coexistence et la persistance des espèces.

@article{doi101093aobmcv054,
    author = "Kant, Merijn R. et al.",
    title = "Mécanismes et conséquences écologiques de l'induction et de la suppression de la défense des plantes dans les communautés d'herbivores",
    year = "2015",
    journal = "Annals of Botany",
    abstract = {CONTEXTE : Les plantes sont des foyers propices aux parasites tels que les herbivores arthropodes, qui acquièrent des nutriments et de l'énergie de leurs hôtes afin de grandir et de se reproduire. Par conséquent, les plantes sont sélectionnées pour évoluer une résistance, ce qui sélectionne à son tour des herbivores capables de faire face à cette résistance. Pour préserver leur fitness lorsqu'elles sont attaquées par des herbivores, les plantes peuvent employer des stratégies complexes incluant la réallocation des ressources et la production de métabolites et de structures défensives. Les défenses des plantes peuvent être soit préfabriquées, soit produites uniquement lors d'une attaque. Celles qui sont prêtes à l'emploi sont désignées comme des défenses constitutives. Certaines défenses constitutives sont opérationnelles à tout moment, tandis que d'autres nécessitent une activation. Les défenses produites uniquement lorsque des herbivores sont présents sont désignées comme des défenses induites. Ces dernières peuvent être établies via la biosynthèse de novo de substances défensives ou via des modifications de substances préfabriquées et, par conséquent, elles sont actives uniquement lorsqu'elles sont nécessaires. L'inductibilité de la défense peut servir à économiser de l'énergie et à prévenir l'intoxication auto-induite, mais implique également qu'il y a un délai avant que ces défenses ne deviennent opérationnelles. Les défenses induites peuvent être caractérisées par des altérations de la morphologie végétale et de la chimie moléculaire et sont associées à une diminution des performances des herbivores. Ces altérations sont mises en mouvement par des signaux générés par les herbivores. Enfin, un sous-ensemble de métabolites induits est libéré dans l'air sous forme de volatils et fonctionne comme un phare pour les ennemis naturels de recherche de proie, et cela est désigné comme une défense indirecte induite. PORTÉE : L'objectif de cette revue est d'évaluer (1) quelles stratégies les plantes ont évoluées pour faire face aux herbivores et (2) quels traits les herbivores ont évolués qui leur permettent de contrer ces défenses. L'accent principal est mis sur l'induction et la suppression des défenses des plantes et la revue décrit comment la palette de traits qui déterminent l'induction/suppression de, et la résistance/sensibilité des herbivores aux, défenses des plantes peut donner naissance à une compétition exploitative et une facilitation au sein des communautés écologiques « habitant » une plante. CONCLUSIONS : Les herbivores ont évolué des stratégies diverses, qui ne sont pas mutuellement exclusives, pour diminuer les effets négatifs des défenses des plantes afin de maximiser la conversion du matériel végétal en descendants. De nombreuses adaptations ont été trouvées chez les herbivores, leur permettant de démanteler ou de contourner les barrières défensives, d'éviter les tissus présentant des niveaux relativement élevés de produits chimiques défensifs ou de métaboliser ces produits chimiques une fois ingérés. De plus, certains herbivores interfèrent avec le début ou la fin des défenses induites des plantes, entraînant une suppression partielle ou totale de la résistance de la plante. La capacité de supprimer les défenses induites des plantes semble se produire chez les parasites végétaux de différents règnes, y compris les arthropodes herbivores, et il existe une diversité remarquable des mécanismes de suppression. La suppression peut affecter fortement la structure du réseau trophique, car la capacité de supprimer l'activation des défenses d'un hôte commun peut faciliter les concurrents, tandis que la capacité d'un herbivore à faire face aux défenses végétales activées ne le fera pas. Une caractérisation plus approfondie des mécanismes et des traits qui donnent naissance à la suppression des défenses des plantes nous permettra de déterminer leur rôle dans la formation des interactions directes et indirectes dans les réseaux trophiques et dans quelle mesure celles-ci déterminent la coexistence et la persistance des espèces.},
    url = "https://doi.org/10.1093/aob/mcv054",
    doi = "10.1093/aob/mcv054",
    openalex = "W1930167759",
    references = "doi101007s0004900900186, doi1010160022519364900384, doi101016jfoodchem200507042, doi10103835081161, doi101038nature07890, doi101038nrm1746, doi101086282146, doi101086417659, doi101111j14698137201104049x, doi101126science2304728895, doi101146annurevarplant54031902134938, doi101146annureves11110180001003, doi101146annurevphyto43040204135923"
}

L'utilisation de systèmes de phénotypage à haut débit et d'imagerie non destructive est largement considérée comme une technologie clé permettant aux scientifiques et aux sélectionneurs de développer des cultures capables de bien performer dans des conditions environnementales variées. Cependant, de nombreuses études de phénotypage ont été optimisées en utilisant la plante modèle Arabidopsis thaliana. Dans cette étude, The Plant Accelerator(®) de l'Université d'Adelaïde, en Australie, a été utilisé pour étudier la croissance et la réponse phénotypique de la céréale importante Sorghum bicolor L. Moench et des hybrides connexes à des conditions limitées en eau et à différents niveaux d'engrais. L'imagerie dans différentes gammes spectrales a été utilisée pour surveiller la composition des plantes, la chlorophylle et la teneur en humidité. L'analyse d'images phénotypiques a permis de mesurer avec précision la biomasse végétale. L'ensemble de données obtenu a permis de différencier et de modéliser les réponses des différentes variétés de sorgho aux traitements expérimentaux. L'architecture végétale plutôt que les éléments architecturaux a été déterminée par imagerie et s'est révélée corrélée à une meilleure tolérance au stress, par exemple le repliement diurne des feuilles et l'indice de surface foliaire. L'analyse des images en couleur a révélé que la « vert » des feuilles était corrélée à l'azote foliaire et à la chlorophylle, tandis que l'analyse de la réflectance infrarouge proche (NIR) était un bon prédicteur de la teneur en eau et de l'épaisseur des feuilles, et était corrélée à la teneur en humidité des plantes. Il est démontré que l'imagerie du sorgho à l'aide d'un système à haut débit peut identifier et différencier avec précision la croissance et des traits phénotypiques spécifiques. Des scripts R pour des modèles robustes et parcimonieux sont fournis afin de permettre à d'autres utilisateurs de systèmes d'imagerie phénomique d'extraire facilement des données utiles, et ainsi de soulager un goulot d'étranglement dans le criblage phénotypique de multiples génotypes de plantes cultivées clés.

@article{doi101093jxberu526,
    author = "Neilson, Elizabeth Heather Jakobsen et Edwards, Aaron M. et Blomstedt, Cecilia K. et Berger, Bettina et Møller, Birger Lindberg et Gleadow, Roslyn M.",
    title = "Utilisation d'un système d'imagerie de haut débit pour examiner les réponses phénotypiques dynamiques d'une plante céréalière C4 à la carence en azote et en eau au fil du temps",
    year = "2015",
    journal = "Journal of Experimental Botany",
    abstract = "L'utilisation de systèmes de phénotypage à haut débit et d'imagerie non destructive est largement considérée comme une technologie clé permettant aux scientifiques et aux sélectionneurs de développer des cultures capables de bien performer dans des conditions environnementales variées. Cependant, de nombreuses études de phénotypage ont été optimisées en utilisant la plante modèle Arabidopsis thaliana. Dans cette étude, The Plant Accelerator(®) de l'Université d'Adelaïde, en Australie, a été utilisé pour étudier la croissance et la réponse phénotypique de la céréale importante Sorghum bicolor L. Moench et des hybrides connexes à des conditions limitées en eau et à différents niveaux d'engrais. L'imagerie dans différentes gammes spectrales a été utilisée pour surveiller la composition des plantes, la chlorophylle et la teneur en humidité. L'analyse d'images phénotypiques a permis de mesurer avec précision la biomasse végétale. L'ensemble de données obtenu a permis de différencier et de modéliser les réponses des différentes variétés de sorgho aux traitements expérimentaux. L'architecture végétale plutôt que les éléments architecturaux a été déterminée par imagerie et s'est révélée corrélée à une meilleure tolérance au stress, par exemple le repliement diurne des feuilles et l'indice de surface foliaire. L'analyse des images en couleur a révélé que la « vert » des feuilles était corrélée à l'azote foliaire et à la chlorophylle, tandis que l'analyse de la réflectance infrarouge proche (NIR) était un bon prédicteur de la teneur en eau et de l'épaisseur des feuilles, et était corrélée à la teneur en humidité des plantes. Il est démontré que l'imagerie du sorgho à l'aide d'un système à haut débit peut identifier et différencier avec précision la croissance et des traits phénotypiques spécifiques. Des scripts R pour des modèles robustes et parcimonieux sont fournis afin de permettre à d'autres utilisateurs de systèmes d'imagerie phénomique d'extraire facilement des données utiles, et ainsi de soulager un goulot d'étranglement dans le criblage phénotypique de multiples génotypes de plantes cultivées clés.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jxb/eru526",
    doi = "10.1093/jxb/eru526",
    openalex = "W2115796666",
    references = "doi101146annurevarplant050213040027"
}

Le mimétisme mullérien chez les papillons Heliconiini néotropicaux est un excellent exemple de sélection naturelle, associé à la diversification d'une grande radiation à l'échelle continentale. Certains des processus conduisant à l'évolution des anneaux de mimétisme sont susceptibles de générer des signaux phylogénétiques incongruents au sein de l'ensemble, et constituent ainsi un défi pour la systématique. Nous utilisons un jeu de données de 22 marqueurs mitochondriaux et nucléaires provenant de 92 % des espèces du tribu, obtenus par séquençage Sanger et assemblage de novo de données de lectures courtes, pour réexaminer la phylogénie des Heliconiini à la fois par des approches de supermatrice et de coalescence multispécifique, caractériser les motifs de signal conflictuel et comparer la performance de diverses approches méthodologiques pour refléter l'hétérogénéité au sein des données. Malgré l'ampleur importante du signal réticulé et les conflits marqués entre les marqueurs, des topologies presque identiques sont systématiquement retrouvées par la plupart des analyses, bien que l'approche de supermatrice ait échoué à refléter la variation sous-jacente dans l'histoire des locus individuels. Cependant, la supermatrice représente une approximation utile où plusieurs espèces rares représentées par des séquences courtes peuvent être incorporées facilement. La première phylogénie complète et calibrée dans le temps de ce groupe est utilisée pour tester les hypothèses d'une augmentation du taux de diversification entraînée par les changements environnementaux dramatiques survenus dans les Néotropiques au cours des 23 derniers millions d'années, ou de changements causés par des effets dépendants de la diversité sur le taux de diversification. Nous constatons que le taux de diversification a augmenté sur la branche menant au genre Heliconius, actuellement le plus riche en espèces, mais que le changement s'est produit progressivement et ne peut être sans équivoque attribué à un facteur environnemental spécifique. Notre étude fournit une comparaison complète de méthodes de reconstruction d'arbres d'espèces philosophiquement distinctes et apporte des éclairages sur la diversification d'une radiation d'insectes importante dans la région la plus biodiverse de la planète.

@article{doi101093sysbiosyv007,
    author = "Kozak, Krzysztof M. et Wahlberg, Niklas et Neild, Andrew F. E. et Dasmahapatra, Kanchon K. et Mallet, James et Jiggins, Chris D.",
    title = "Multilocus Species Trees Show the Recent Adaptive Radiation of the Mimetic Heliconius Butterflies",
    year = "2015",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = "Le mimétisme mullérien chez les papillons Heliconiini néotropicaux est un excellent exemple de sélection naturelle, associé à la diversification d'une grande radiation à l'échelle continentale. Certains des processus conduisant à l'évolution des anneaux de mimétisme sont susceptibles de générer des signaux phylogénétiques incongruents au sein de l'ensemble, et constituent ainsi un défi pour la systématique. Nous utilisons un jeu de données de 22 marqueurs mitochondriaux et nucléaires provenant de 92 % des espèces du tribu, obtenus par séquençage Sanger et assemblage de novo de données de lectures courtes, pour réexaminer la phylogénie des Heliconiini à la fois par des approches de supermatrice et de coalescence multispécifique, caractériser les motifs de signal conflictuel et comparer la performance de diverses approches méthodologiques pour refléter l'hétérogénéité au sein des données. Malgré l'ampleur importante du signal réticulé et les conflits marqués entre les marqueurs, des topologies presque identiques sont systématiquement retrouvées par la plupart des analyses, bien que l'approche de supermatrice ait échoué à refléter la variation sous-jacente dans l'histoire des locus individuels. Cependant, la supermatrice représente une approximation utile où plusieurs espèces rares représentées par des séquences courtes peuvent être incorporées facilement. La première phylogénie complète et calibrée dans le temps de ce groupe est utilisée pour tester les hypothèses d'une augmentation du taux de diversification entraînée par les changements environnementaux dramatiques survenus dans les Néotropiques au cours des 23 derniers millions d'années, ou de changements causés par des effets dépendants de la diversité sur le taux de diversification. Nous constatons que le taux de diversification a augmenté sur la branche menant au genre Heliconius, actuellement le plus riche en espèces, mais que le changement s'est produit progressivement et ne peut être sans équivoque attribué à un facteur environnemental spécifique. Notre étude fournit une comparaison complète de méthodes de reconstruction d'arbres d'espèces philosophiquement distinctes et apporte des éclairages sur la diversification d'une radiation d'insectes importante dans la région la plus biodiverse de la planète.",
    url = "https://doi.org/10.1093/sysbio/syv007",
    doi = "10.1093/sysbio/syv007",
    openalex = "W2134077503",
    references = "doi101111j155856461975tb00861x, doi101111j2041210x201200223x, doi101146annureven26010181002235"
}

Les recherches sur les papillons Heliconius ont apporté une contribution significative à la biologie évolutive. Ici, nous passons en revue notre compréhension de la diversification de ces papillons, couvrant les avancées récentes et un vaste fondement de travaux antérieurs. Si aucun groupe d'organismes ne peut suffire à comprendre la diversité de la vie, après des années d'études intensives, les recherches sur Heliconius ont abordé une grande variété de questions évolutives. Nous discutons d'abord des preuves d'un flux génétique généralisé entre les espèces Heliconius et ce que cela révèle sur la nature des espèces. Nous abordons ensuite l'évolution et la diversité des motifs d'avertissement, tant en tant que cible de la sélection que par rapport à leur base génétique sous-jacente. L'identification des gènes majeurs impliqués dans les changements mimétiques et l'homologie à ces loci entre des taxons éloignés a révélé une prévisibilité surprenante de la base génétique de l'évolution. Dans les sections finales, nous considérons l'évolution des motifs d'avertissement et la diversité Heliconius plus généralement, dans un contexte plus large de sélection écologique et sexuelle. Nous examinons comment différents traits et modes de sélection peuvent interagir et influencer l'évolution de l'isolement reproductif.

@article{doi101111jeb12672,
    author = "Merrill, Richard M. et Dasmahapatra, Kanchon K. et Davey, John W. et Dell'Aglio, Denise Dalbosco et Hanly, Joseph J. et Huber, Bárbara et Jiggins, Chris D. et Joron, Mathieu et Kozak, Krzysztof M. et Llaurens, Violaine et Martin, Simon H. et Montgomery, Stephen H. et Morris, Jake et Nadeau, Nicola J. et Pinharanda, Ana et Rosser, Neil et Thompson, Martin et Vanjari, Sohini et Wallbank, Richard W. R. et Yu, Qiuhan",
    title = "La diversification des papillons Heliconius : que savons-nous après 150 ans ?",
    year = "2015",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "Les recherches sur les papillons Heliconius ont apporté une contribution significative à la biologie évolutive. Ici, nous passons en revue notre compréhension de la diversification de ces papillons, couvrant les avancées récentes et un vaste fondement de travaux antérieurs. Si aucun groupe d'organismes ne peut suffire à comprendre la diversité de la vie, après des années d'études intensives, les recherches sur Heliconius ont abordé une grande variété de questions évolutives. Nous discutons d'abord des preuves d'un flux génétique généralisé entre les espèces Heliconius et ce que cela révèle sur la nature des espèces. Nous abordons ensuite l'évolution et la diversité des motifs d'avertissement, tant en tant que cible de la sélection que par rapport à leur base génétique sous-jacente. L'identification des gènes majeurs impliqués dans les changements mimétiques et l'homologie à ces loci entre des taxons éloignés a révélé une prévisibilité surprenante de la base génétique de l'évolution. Dans les sections finales, nous considérons l'évolution des motifs d'avertissement et la diversité Heliconius plus généralement, dans un contexte plus large de sélection écologique et sexuelle. Nous examinons comment différents traits et modes de sélection peuvent interagir et influencer l'évolution de l'isolement reproductif.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jeb.12672",
    doi = "10.1111/jeb.12672",
    openalex = "W1738689544",
    references = "doi101007s1088600692078, doi101086285072, doi101111evo12524, doi105962p203304, doi105962p203427"
}

Les plantes ne peuvent plus être considérées comme des entités autonomes et une perception plus holistique est nécessaire. En effet, les plantes abritent une grande diversité de micro-organismes à l'intérieur et à l'extérieur de leurs tissus, dans l'endosphère et l'ectosphère, respectivement. Ces micro-organismes, qui appartiennent principalement aux Bactéries et aux Champignons, sont impliqués dans des fonctions majeures telles que la nutrition des plantes et la résistance des plantes aux stress biotiques et abiotiques. Par conséquent, le microbiote impacte la croissance et la survie des plantes, deux composantes clés de l'aptitude. L'aptitude des plantes est donc une conséquence de la plante en soi et de son microbiote, qui forment collectivement un holobionte. En complément de la perception réductionniste des pressions évolutives agissant sur les compartiments végétaux ou symbiotiques, le concept d'holobionte végétal nécessite une perception nouvelle de l'évolution. Les interconnexions entre les composants de l'holobionte végétal sont explorées ici à la lumière des théories écologiques et évolutives actuelles. La complexité du microbiome et les règles d'assemblage des communautés microbiotes ne sont pas encore entièrement comprises. Il est suggéré que la plante peut moduler son microbiote pour s'ajuster dynamiquement à son environnement. Pour mieux comprendre le niveau de dépendance des plantes aux composants microbiotes, le microbiote central doit être déterminé à différentes échelles hiérarchiques de l'écologie, tandis que les analyses pan-microbiome amélioreraient la caractérisation des fonctions affichées.

@article{doi101111nph13312,
    author = "Vandenkoornhuyse, Philippe et Quaiser, Achim et Duhamel, Marie et Van, Amandine Lê et Dufresne, Alexis",
    title = "L'importance du microbiome de l'holobionte végétal",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les plantes ne peuvent plus être considérées comme des entités autonomes et une perception plus holistique est nécessaire. En effet, les plantes abritent une grande diversité de micro-organismes à l'intérieur et à l'extérieur de leurs tissus, dans l'endosphère et l'ectosphère, respectivement. Ces micro-organismes, qui appartiennent principalement aux Bactéries et aux Champignons, sont impliqués dans des fonctions majeures telles que la nutrition des plantes et la résistance des plantes aux stress biotiques et abiotiques. Par conséquent, le microbiote impacte la croissance et la survie des plantes, deux composantes clés de l'aptitude. L'aptitude des plantes est donc une conséquence de la plante en soi et de son microbiote, qui forment collectivement un holobionte. En complément de la perception réductionniste des pressions évolutives agissant sur les compartiments végétaux ou symbiotiques, le concept d'holobionte végétal nécessite une perception nouvelle de l'évolution. Les interconnexions entre les composants de l'holobionte végétal sont explorées ici à la lumière des théories écologiques et évolutives actuelles. La complexité du microbiome et les règles d'assemblage des communautés microbiotes ne sont pas encore entièrement comprises. Il est suggéré que la plante peut moduler son microbiote pour s'ajuster dynamiquement à son environnement. Pour mieux comprendre le niveau de dépendance des plantes aux composants microbiotes, le microbiote central doit être déterminé à différentes échelles hiérarchiques de l'écologie, tandis que les analyses pan-microbiome amélioreraient la caractérisation des fonctions affichées.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13312",
    doi = "10.1111/nph.13312",
    openalex = "W2082376470",
    references = "doi101016b9780123705266x50016, doi101016jtplants201204001, doi101086383541, doi101146annurevarplant050312120106, doi101146annurevcellbio092910154055, doi1023072259756"
}

Les métabolites secondaires des plantes remplissent de nombreuses fonctions dans les interactions entre les plantes et une large gamme d'autres organismes. Les preuves expérimentales soutiennent fortement la contribution indispensable de nombreux phytochimiques constitutifs et induits par les pathogènes à l'immunité innée des plantes. De nombreuses études sur des espèces modèles de plantes, en particulier Arabidopsis thaliana, ont apporté des avancées significatives à notre compréhension des mécanismes moléculaires sous-jacents à la biosynthèse et à l'activation des métabolites secondaires de défense déclenchés par les pathogènes. Cependant, malgré l'importance prouvée des métabolites secondaires dans la réponse des plantes aux micro-organismes pathogènes, peu est connu sur les mécanismes précis sous-jacents à leur contribution à l'immunité des plantes. Cette insuffisance concerne les informations sur la dynamique de la localisation cellulaire et subcellulaire des phytochimiques de défense lors des rencontres avec les pathogènes microbiens et les connaissances précises sur leur mode d'action. Comme de nombreux métabolites secondaires se caractérisent par leur activité antimicrobienne in vitro, ces composés ont été couramment considérés comme fonctionnant dans la défense des plantes comme des antibiotiques in planta. Étonnamment, les preuves expérimentales récentes suggèrent que au moins certains de ces composés peuvent alternativement être impliqués dans le contrôle de plusieurs réponses immunitaires qui sont conservées de manière évolutive dans le règne végétal, y compris la déposition de callose et la mort cellulaire programmée.

@article{doi101111nph13325,
    author = "Piasecka, Anna et Jedrzejczak‐Rey, Nicolas et Bednarek, Paweł",
    title = "Métabolites secondaires dans l'immunité innée des plantes : fonction conservée de produits chimiques divergents",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Les métabolites secondaires des plantes remplissent de nombreuses fonctions dans les interactions entre les plantes et une large gamme d'autres organismes. Les preuves expérimentales soutiennent fortement la contribution indispensable de nombreux phytochimiques constitutifs et induits par les pathogènes à l'immunité innée des plantes. De nombreuses études sur des espèces modèles de plantes, en particulier Arabidopsis thaliana, ont apporté des avancées significatives à notre compréhension des mécanismes moléculaires sous-jacents à la biosynthèse et à l'activation des métabolites secondaires de défense déclenchés par les pathogènes. Cependant, malgré l'importance prouvée des métabolites secondaires dans la réponse des plantes aux micro-organismes pathogènes, peu est connu sur les mécanismes précis sous-jacents à leur contribution à l'immunité des plantes. Cette insuffisance concerne les informations sur la dynamique de la localisation cellulaire et subcellulaire des phytochimiques de défense lors des rencontres avec les pathogènes microbiens et les connaissances précises sur leur mode d'action. Comme de nombreux métabolites secondaires se caractérisent par leur activité antimicrobienne in vitro, ces composés ont été couramment considérés comme fonctionnant dans la défense des plantes comme des antibiotiques in planta. Étonnamment, les preuves expérimentales récentes suggèrent que au moins certains de ces composés peuvent alternativement être impliqués dans le contrôle de plusieurs réponses immunitaires qui sont conservées de manière évolutive dans le règne végétal, y compris la déposition de callose et la mort cellulaire programmée.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13325",
    doi = "10.1111/nph.13325",
    openalex = "W1968883627",
    references = "doi101146annurevarplant050213040027"
}

De nombreuses espèces végétales produisent des composés défensifs qui sont souvent très diversifiés au sein et entre les populations. Les mécanismes génétiques et cellulaires par lesquels la diversité des métabolites est produite sont de plus en plus compris, mais les explications évolutives de la diversification persistante des métabolites secondaires végétaux ont reçu moins d'attention. Ici, nous examinons le rôle de la coévolution plante-herbivore dans le maintien et les caractéristiques de la diversité des métabolites secondaires végétaux. Nous présentons un modèle simple dans lequel les plantes peuvent évoluer pour investir dans une gamme de toxines défensives, et les herbivores peuvent évoluer une résistance à ces toxines. Nous autorisons soit l'évolution d'une seule espèce, soit la coévolution réciproque. Notre modèle montre que la coévolution maintient la diversité des toxines au sein des populations. De plus, il existe une asymétrie coévolutionnaire fondamentale entre les plantes et leurs herbivores, car les herbivores doivent résister à toutes les toxines végétales, tandis que les plantes n'ont besoin de défier et d'annuler qu'un seul trait de résistance. En conséquence, la fitness moyenne des plantes augmente et la fitness des insectes diminue à mesure que le nombre de toxines augmente. Lorsque des coûts s'appliquent, le modèle a montré à la fois une escalade de la course aux armements et une forte fluctuation coévolutionnaire des concentrations de toxines au fil du temps. Nous discutons des résultats dans le contexte d'autres explications évolutives de la diversification des métabolites secondaires.

@article{doi101111nph13560,
    author = "Speed, Michael P. et Fenton, Andy et Jones, Meriel G. et Ruxton, Graeme D. et Brockhurst, Michael A.",
    title = "La coévolution peut expliquer la diversité des métabolites secondaires défensifs chez les plantes",
    year = "2015",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "De nombreuses espèces végétales produisent des composés défensifs qui sont souvent très diversifiés au sein et entre les populations. Les mécanismes génétiques et cellulaires par lesquels la diversité des métabolites est produite sont de plus en plus compris, mais les explications évolutives de la diversification persistante des métabolites secondaires végétaux ont reçu moins d'attention. Ici, nous examinons le rôle de la coévolution plante-herbivore dans le maintien et les caractéristiques de la diversité des métabolites secondaires végétaux. Nous présentons un modèle simple dans lequel les plantes peuvent évoluer pour investir dans une gamme de toxines défensives, et les herbivores peuvent évoluer une résistance à ces toxines. Nous autorisons soit l'évolution d'une seule espèce, soit la coévolution réciproque. Notre modèle montre que la coévolution maintient la diversité des toxines au sein des populations. De plus, il existe une asymétrie coévolutionnaire fondamentale entre les plantes et leurs herbivores, car les herbivores doivent résister à toutes les toxines végétales, tandis que les plantes n'ont besoin de défier et d'annuler qu'un seul trait de résistance. En conséquence, la fitness moyenne des plantes augmente et la fitness des insectes diminue à mesure que le nombre de toxines augmente. Lorsque des coûts s'appliquent, le modèle a montré à la fois une escalade de la course aux armements et une forte fluctuation coévolutionnaire des concentrations de toxines au fil du temps. Nous discutons des résultats dans le contexte d'autres explications évolutives de la diversification des métabolites secondaires.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.13560",
    doi = "10.1111/nph.13560",
    openalex = "W2133928433",
    references = "doi101016jtree201311003"
}

Les strigolactones (SL) sont des hormones végétales et molécules de signalisation dérivées des caroténoïdes. Lorsqu'elles sont libérées dans le sol, les SL indiquent la présence d'un hôte pour les champignons symbiotiques et les plantes parasites des racines. Dans la plante, elles régulent plusieurs processus de développement qui adaptent l'architecture végétale à la disponibilité des nutriments. Des mutants fortement ramifiés/tillérés chez Arabidopsis, le pois et le riz ont permis d'identifier quatre enzymes de biosynthèse des SL : une isomérase carotène cis/trans, deux dioxygénases de clivage des caroténoïdes et un cytochrome P450 (MAX1). Des essais enzymatiques in vitro et in vivo et l'analyse de mutants ont montré que la voie implique une combinaison de nouvelles réactions menant à la carlactone, qui est convertie par un homologue de MAX1 du riz en une molécule parente de SL avec un groupement lactone tricyclique. Dans cette revue, nous nous concentrons sur la biosynthèse des SL, décrivons les facteurs hormonaux et environnementaux qui déterminent ce processus, et discutons du transport des SL et de la signalisation en aval ainsi que du rôle des SL dans la régulation du développement végétal.

@article{doi101146annurevarplant043014114759,
    author = "Al‐Babili, Salim et Bouwmeester, Harro J.",
    title = "Strigolactones, une nouvelle hormone végétale dérivée des caroténoïdes",
    year = "2015",
    journal = "Annual Review of Plant Biology",
    abstract = "Les strigolactones (SL) sont des hormones végétales et molécules de signalisation dérivées des caroténoïdes. Lorsqu'elles sont libérées dans le sol, les SL indiquent la présence d'un hôte pour les champignons symbiotiques et les plantes parasites des racines. Dans la plante, elles régulent plusieurs processus de développement qui adaptent l'architecture végétale à la disponibilité des nutriments. Des mutants fortement ramifiés/tillérés chez Arabidopsis, le pois et le riz ont permis d'identifier quatre enzymes de biosynthèse des SL : une isomérase carotène cis/trans, deux dioxygénases de clivage des caroténoïdes et un cytochrome P450 (MAX1). Des essais enzymatiques in vitro et in vivo et l'analyse de mutants ont montré que la voie implique une combinaison de nouvelles réactions menant à la carlactone, qui est convertie par un homologue de MAX1 du riz en une molécule parente de SL avec un groupement lactone tricyclique. Dans cette revue, nous nous concentrons sur la biosynthèse des SL, décrivons les facteurs hormonaux et environnementaux qui déterminent ce processus, et discutons du transport des SL et de la signalisation en aval ainsi que du rôle des SL dans la régulation du développement végétal.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-043014-114759",
    doi = "10.1146/annurev-arplant-043014-114759",
    openalex = "W2117164391"
}

Le mimétisme des motifs d'ailes chez les papillons a fourni un exemple important d'adaptation depuis que Charles Darwin et Alfred Russell Wallace ont proposé l'évolution par sélection naturelle il y a plus de 150 ans. Le genre de papillons néotropicaux Heliconius a joué un rôle central dans le développement de la théorie du mimétisme et a depuis été étudié de manière approfondie dans le contexte de l'écologie et de la biologie des populations, du comportement et de la génétique du mimétisme. Les espèces Heliconius se distinguent par leurs motifs de couleurs diversifiés, et des expériences de croisement antérieures ont révélé que beaucoup de cette variation est contrôlée par un petit nombre de loci de commutation à grand effet mendéliens. Des analyses comparatives récentes ont montré que les mêmes loci de commutation contrôlent la diversité des motifs d'ailes dans tout le genre, et plusieurs d'entre eux ont maintenant été clonés par position. En utilisant une combinaison de cartographie génétique comparative, de tests d'association et d'analyses d'expression génique, la variation des motifs d'ailes rouges dans tout Heliconius a été retracée jusqu'à l'action du facteur de transcription optix. De même, le ligand de signalisation WntA a été montré pour contrôler la variation des motifs de mélanine chez Heliconius et d'autres papillons. Notre compréhension des bases moléculaires du mimétisme chez Heliconius fournit maintenant des aperçus importants sur une variété de phénomènes évolutifs supplémentaires, notamment l'origine des supergènes, l'interaction entre la contrainte et l'évolvabilité, les bases génétiques de la convergence, le potentiel de l'introgression pour faciliter l'adaptation, les mécanismes de la spéciation hybride chez les animaux, et le processus de spéciation écologique.

@article{doi101534genetics114172387,
    author = "Kronforst, Marcus R. et Papa, Riccardo",
    title = "Les fondements fonctionnels de la mise en place des motifs d'ailes chez les papillons Heliconius : Les molécules derrière le mimétisme",
    year = "2015",
    journal = "Genetics",
    abstract = "Le mimétisme des motifs d'ailes chez les papillons a fourni un exemple important d'adaptation depuis que Charles Darwin et Alfred Russell Wallace ont proposé l'évolution par sélection naturelle il y a plus de 150 ans. Le genre de papillons néotropicaux Heliconius a joué un rôle central dans le développement de la théorie du mimétisme et a depuis été étudié de manière approfondie dans le contexte de l'écologie et de la biologie des populations, du comportement et de la génétique du mimétisme. Les espèces Heliconius se distinguent par leurs motifs de couleurs diversifiés, et des expériences de croisement antérieures ont révélé que beaucoup de cette variation est contrôlée par un petit nombre de loci de commutation à grand effet mendéliens. Des analyses comparatives récentes ont montré que les mêmes loci de commutation contrôlent la diversité des motifs d'ailes dans tout le genre, et plusieurs d'entre eux ont maintenant été clonés par position. En utilisant une combinaison de cartographie génétique comparative, de tests d'association et d'analyses d'expression génique, la variation des motifs d'ailes rouges dans tout Heliconius a été retracée jusqu'à l'action du facteur de transcription optix. De même, le ligand de signalisation WntA a été montré pour contrôler la variation des motifs de mélanine chez Heliconius et d'autres papillons. Notre compréhension des bases moléculaires du mimétisme chez Heliconius fournit maintenant des aperçus importants sur une variété de phénomènes évolutifs supplémentaires, notamment l'origine des supergènes, l'interaction entre la contrainte et l'évolvabilité, les bases génétiques de la convergence, le potentiel de l'introgression pour faciliter l'adaptation, les mécanismes de la spéciation hybride chez les animaux, et le processus de spéciation écologique.",
    url = "https://doi.org/10.1534/genetics.114.172387",
    doi = "10.1534/genetics.114.172387",
    openalex = "W2165614639",
    references = "doi101007s1088600692078, doi101111evo12524, doi105962p203304"
}

La proline est un acide aminé protéinogène et s'accumule à la fois dans des conditions de stress et non de stress en tant que soluté bénéfique chez les plantes. Les découvertes récentes montrent que la proline joue un rôle important dans la croissance et la différenciation des plantes tout au long du cycle de vie. Elle est un déterminant clé de nombreuses protéines de paroi cellulaire qui jouent des rôles importants dans le développement des plantes. Le rôle des extensines, des protéines arabinogalactane et des protéines riches en hydroxyproline et en proline en tant que composants importants des protéines de paroi cellulaire qui jouent un rôle pivot dans les cascades de transduction du signal de la paroi cellulaire, le développement des plantes et la tolérance au stress est discuté dans cette revue. Des aperçus moléculaires sont également fournis ici sur les rôles plausibles des transporteurs de proline modulant les événements clés dans le développement des plantes. De plus, les rôles de la proline lors des transitions de développement des graines, y compris la synthèse des protéines de stockage, sont discutés.

@article{doi103389fpls201500544,
    author = "Kishor, P. B. Kavi",
    title = "Rôle de la proline dans la synthèse de la paroi cellulaire et le développement des plantes et ses implications dans l'ontogenèse des plantes",
    year = "2015",
    journal = "Frontiers in Plant Science",
    abstract = "La proline est un acide aminé protéinogène et s'accumule à la fois dans des conditions de stress et non de stress en tant que soluté bénéfique chez les plantes. Les découvertes récentes montrent que la proline joue un rôle important dans la croissance et la différenciation des plantes tout au long du cycle de vie. Elle est un déterminant clé de nombreuses protéines de paroi cellulaire qui jouent des rôles importants dans le développement des plantes. Le rôle des extensines, des protéines arabinogalactane et des protéines riches en hydroxyproline et en proline en tant que composants importants des protéines de paroi cellulaire qui jouent un rôle pivot dans les cascades de transduction du signal de la paroi cellulaire, le développement des plantes et la tolérance au stress est discuté dans cette revue. Des aperçus moléculaires sont également fournis ici sur les rôles plausibles des transporteurs de proline modulant les événements clés dans le développement des plantes. De plus, les rôles de la proline lors des transitions de développement des graines, y compris la synthèse des protéines de stockage, sont discutés.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fpls.2015.00544",
    doi = "10.3389/fpls.2015.00544",
    openalex = "W1509492762",
    references = "doi101007s0011400500621"
}

Une espèce d'insecte qui montre une variation dans l'association avec l'espèce d'hôte à travers sa gamme géographique peut le faire soit en raison d'une adaptation locale dans la préférence de plante hôte de l'insecte, soit par des différences induites par l'environnement ou génétiquement dans les plantes, causant une variation dans l'adéquation de la plante hôte entre les régions. Dans la présente étude, nous investiguons expérimentalement la préférence de plante hôte d'Anthocharis cardamines (papillon à pointe orange) dans deux populations du Royaume-Uni et deux de Suède. Des rapports précédents indiquent que les larves d'A. cardamines sont trouvées sur différentes espèces de plantes hôtes dans différentes régions du Royaume-Uni, et certaines variations ont été rapportées en Suède. Les essais de choix de plante hôte ont montré que les femelles préfèrent pondre sur des plantes à un stade phénologique plus précoce, ainsi que sur des plantes plus grandes. Lorsque l'on contrôle le stade phénologique et la taille de la plante, l'espèce d'hôte n'a eu aucun effet statistiquement significatif sur le choix des femelles. De plus, il n'y avait pas de différences dans la préférence d'espèce de plante hôte parmi les quatre populations de papillons. Basé sur notre expérience, le choix de ponte par A. cardamines dépend principalement du stade phénologique et de la taille de la plante hôte. Cette découverte soutient l'idée que les modèles géographiques d'association hôte-plante d'A. cardamines au Royaume-Uni et en Suède sont des conséquences de la phénologie et de la disponibilité des hôtes locaux, plutôt que des différences génétiques régionales dans la préférence d'espèce d'hôte du papillon.

@article{doi101111bij12838,
    author = "Stålhandske, Sandra et Olofsson, Martin et Gotthard, Karl et Ehrlén, Johan et Wiklund, Christer et Leimar, Olof",
    title = "L'adaptation phénologique plutôt que la variation génétique dans la préférence d'hôte sous-tend la variation géographique des plantes hôtes utilisées par les papillons à pointe orange",
    year = "2016",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Une espèce d'insecte qui montre une variation dans l'association avec l'espèce d'hôte à travers sa gamme géographique peut le faire soit en raison d'une adaptation locale dans la préférence de plante hôte de l'insecte, soit par des différences induites par l'environnement ou génétiquement dans les plantes, causant une variation dans l'adéquation de la plante hôte entre les régions. Dans la présente étude, nous investiguons expérimentalement la préférence de plante hôte d'Anthocharis cardamines (papillon à pointe orange) dans deux populations du Royaume-Uni et deux de Suède. Des rapports précédents indiquent que les larves d'A. cardamines sont trouvées sur différentes espèces de plantes hôtes dans différentes régions du Royaume-Uni, et certaines variations ont été rapportées en Suède. Les essais de choix de plante hôte ont montré que les femelles préfèrent pondre sur des plantes à un stade phénologique plus précoce, ainsi que sur des plantes plus grandes. Lorsque l'on contrôle le stade phénologique et la taille de la plante, l'espèce d'hôte n'a eu aucun effet statistiquement significatif sur le choix des femelles. De plus, il n'y avait pas de différences dans la préférence d'espèce de plante hôte parmi les quatre populations de papillons. Basé sur notre expérience, le choix de ponte par A. cardamines dépend principalement du stade phénologique et de la taille de la plante hôte. Cette découverte soutient l'idée que les modèles géographiques d'association hôte-plante d'A. cardamines au Royaume-Uni et en Suède sont des conséquences de la phénologie et de la disponibilité des hôtes locaux, plutôt que des différences génétiques régionales dans la préférence d'espèce d'hôte du papillon.",
    url = "https://doi.org/10.1111/bij.12838",
    doi = "10.1111/bij.12838",
    openalex = "W2441188813",
    references = "doi10100797814684264651, doi101007bf00379780, doi101017cbo9781107415324, doi101098rspb20053356, doi101111j155856461964tb01674x, doi101146annureves19110188001231, doi1018637jssv033i02, doi1018637jssv067i01, doi1023073546884, ehrlich1964butterflies, openalexw1592882905"
}

Toutes les plantes synthétisent une gamme de plusieurs centaines de composés terpénoïdes dont les rôles incluent les phytohormones, les réactifs de modification des protéines, les anti-oxydants, et bien d'autres. Différentes lignées végétales synthétisent également des centaines de terpénoïdes distincts, le nombre total de tels terpénoïdes végétaux spécialisés étant estimé à des dizaines de milliers. Les terpénoïdes restreints phylogénétiquement sont impliqués dans la défense ou dans l'attraction d'organismes bénéfiques. Une hypothèse populaire est que la capacité des plantes à synthétiser de nouveaux composés est apparue de manière incrémentale par sélection lorsque, en raison de changements progressifs de leurs partenaires et ennemis biotiques, les composés « anciens » des plantes n'étaient plus efficaces, un processus surnommé la « course aux armements coévolutifs ». Une autre hypothèse postule que souvent, la simple diversité de tels composés fournit des avantages qu'un seul composé ne peut offrir. Dans cet article, nous examinons les caractéristiques uniques de l'appareil biosynthétique des terpènes chez les plantes qui facilitent la production de grands nombres de terpénoïdes distincts dans chaque espèce et comment des changements génétiques et biochimiques faciles peuvent conduire à une diversification supplémentaire des terpénoïdes. Nous discutons ensuite des preuves relatives aux hypothèses selon lesquelles les fonctions écologiques données peuvent être renforcées par la présence de mélanges de terpènes et que l'acquisition de nouvelles fonctions par les terpénoïdes peut favoriser leur rétention une fois les fonctions originales perdues.

@article{doi101111nph14178,
    author = "Pichersky, Eran et Raguso, Robert A.",
    title = "Pourquoi les plantes produisent-elles autant de composés terpénoïdes ?",
    year = "2016",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "Toutes les plantes synthétisent une gamme de plusieurs centaines de composés terpénoïdes dont les rôles incluent les phytohormones, les réactifs de modification des protéines, les anti-oxydants, et bien d'autres. Différentes lignées végétales synthétisent également des centaines de terpénoïdes distincts, le nombre total de tels terpénoïdes végétaux spécialisés étant estimé à des dizaines de milliers. Les terpénoïdes restreints phylogénétiquement sont impliqués dans la défense ou dans l'attraction d'organismes bénéfiques. Une hypothèse populaire est que la capacité des plantes à synthétiser de nouveaux composés est apparue de manière incrémentale par sélection lorsque, en raison de changements progressifs de leurs partenaires et ennemis biotiques, les composés « anciens » des plantes n'étaient plus efficaces, un processus surnommé la « course aux armements coévolutifs ». Une autre hypothèse postule que souvent, la simple diversité de tels composés fournit des avantages qu'un seul composé ne peut offrir. Dans cet article, nous examinons les caractéristiques uniques de l'appareil biosynthétique des terpènes chez les plantes qui facilitent la production de grands nombres de terpénoïdes distincts dans chaque espèce et comment des changements génétiques et biochimiques faciles peuvent conduire à une diversification supplémentaire des terpénoïdes. Nous discutons ensuite des preuves relatives aux hypothèses selon lesquelles les fonctions écologiques données peuvent être renforcées par la présence de mélanges de terpènes et que l'acquisition de nouvelles fonctions par les terpénoïdes peut favoriser leur rétention une fois les fonctions originales perdues.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.14178",
    doi = "10.1111/nph.14178",
    openalex = "W2509940547",
    references = "doi101016jforeco200808008, doi101016jphytochem200709017, doi101016jtplants201601008, doi101111j14698137201104049x, doi101111j155856461964tb01674x, doi101126science1096931, doi101126science1118510, doi101126science12933611466, doi101146annurevarplant043014114759, doi101146annurevecolsys110308120307, doi101146annurevmarine010908163708, doi10189000129658200687132pds20co2"
}

Sur les 100 dernières années, des études couvrant des milliers de taxons à travers presque tous les biomes ont démontré que la compétition a des effets négatifs puissants sur la performance des individus et peut affecter la composition des communautés végétales, l'évolution des traits et le fonctionnement des écosystèmes entiers. Dans cette revue, nous mettons en lumière de nouveaux et importants développements qui ont le potentiel d'améliorer considérablement notre compréhension de la façon dont les plantes entrent en compétition et des conséquences de la compétition des individus aux communautés dans les domaines de recherche suivants : (a) mécanismes de la compétition, (b) effet et réponse compétitive, (c) effets directs et indirects de la compétition, (d) effets de la compétition au niveau des populations, (e) différences biogéographiques dans la compétition, et (f) conditionnalité de la compétition. Les écologistes ont découvert beaucoup sur la compétition, mais les mécanismes de la compétition et la façon dont la compétition affecte l'organisation des communautés dans la nature nécessitent encore à la fois une exploration théorique et empirique.

@article{doi101146annurevecolsys121415032123,
    author = "Aschehoug, Erik T. et Brooker, Rob W. et Atwater, Daniel Z. et Maron, John L. et Callaway, Ragan M.",
    title = "Les mécanismes et les conséquences de la compétition interspécifique chez les plantes",
    year = "2016",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Sur les 100 dernières années, des études couvrant des milliers de taxons à travers presque tous les biomes ont démontré que la compétition a des effets négatifs puissants sur la performance des individus et peut affecter la composition des communautés végétales, l'évolution des traits et le fonctionnement des écosystèmes entiers. Dans cette revue, nous mettons en lumière de nouveaux et importants développements qui ont le potentiel d'améliorer considérablement notre compréhension de la façon dont les plantes entrent en compétition et des conséquences de la compétition des individus aux communautés dans les domaines de recherche suivants : (a) mécanismes de la compétition, (b) effet et réponse compétitive, (c) effets directs et indirects de la compétition, (d) effets de la compétition au niveau des populations, (e) différences biogéographiques dans la compétition, et (f) conditionnalité de la compétition. Les écologistes ont découvert beaucoup sur la compétition, mais les mécanismes de la compétition et la façon dont la compétition affecte l'organisation des communautés dans la nature nécessitent encore à la fois une exploration théorique et empirique.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-121415-032123",
    doi = "10.1146/annurev-ecolsys-121415-032123",
    openalex = "W2340872654",
    references = "doi101111j13653040200801910x"
}

Les changements climatiques dans les phénologies relatives des espèces interagissantes peuvent potentiellement modifier l'issue des interactions entre espèces. La plasticité phénotypique est susceptible d'être importante pour la réponse à court terme aux nouvelles conditions climatiques, et les différences entre espèces en matière de plasticité sont susceptibles d'influencer leur chevauchement temporel et leurs modèles d'interaction. Comme les normes de réaction des espèces interagissantes peuvent être localement adaptées, tout changement induit par le climat dans les modèles d'interaction peut varier selon les localités. Cependant, les conséquences de la variation spatiale des réponses plastiques pour les interactions entre espèces sont peu étudiées. Nous avons exploré expérimentalement comment la température affectait la synchronisation entre l'émergence printanière d'un papillon, Anthocharis cardamines, et le début de la floraison de cinq de ses espèces de plantes hôtes le long d'un gradient latitudinal. Nous avons également étudié les effets potentiels sur la synchronisation si les expansions vers le nord induites par le climat étaient plus rapides chez les papillons que chez les plantes hôtes. Enfin, pour évaluer comment les changements de synchronisation influencent l'utilisation des hôtes, nous avons mené une expérience pour examiner l'importance du stade de développement des structures reproductives des plantes pour la préférence d'oviposition du papillon. Dans les régions méridionales, les papillons étaient bien synchronisés avec la majorité de leurs espèces de plantes hôtes locales à travers les températures, suggérant que la plasticité thermique dans le développement du papillon correspond à l'oviposition au développement de la plante hôte et que les normes de réaction thermiques des insectes et des plantes entraînent une avancage similaire de la phénologie printanière en réponse au réchauffement. Dans la région la plus septentrionale, cependant, la phénologie relative entre le papillon et deux de ses espèces de plantes hôtes a changé avec l'augmentation de la température. Nous montrons également que le stade de développement des plantes était important pour la ponte, et concluons que les changements de synchronisation induits par la température dans la région la plus septentrionale sont susceptibles d'entraîner des changements dans l'utilisation des hôtes chez A. cardamines si les températures printanières deviennent plus chaudes. L'expansion vers le nord des populations de papillons pourrait éventuellement avoir un effet positif sur le maintien au rythme de la phénologie des plantes hôtes avec des populations de plantes hôtes plus septentrionales. Compte tenu du fait que la majorité des herbivores insectes exploitent plusieurs espèces de plantes différant par leur réponse phénologique aux températures printanières, les changements de synchronisation induits par la température pourraient entraîner des changements dans l'utilisation des hôtes et des modifications des interactions entre espèces dans de nombreuses communautés tempérées.

@article{doi1011111365265612770,
    author = "Posledovich, Diana et Toftegaard, Tenna et Wiklund, Christer et Ehrlén, Johan et Gotthard, Karl",
    title = "Synchronisation phénologique entre un papillon et ses plantes hôtes : Test expérimental des effets de la température printanière",
    year = "2017",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Les changements climatiques dans les phénologies relatives des espèces interagissantes peuvent potentiellement modifier l'issue des interactions entre espèces. La plasticité phénotypique est susceptible d'être importante pour la réponse à court terme aux nouvelles conditions climatiques, et les différences entre espèces en matière de plasticité sont susceptibles d'influencer leur chevauchement temporel et leurs modèles d'interaction. Comme les normes de réaction des espèces interagissantes peuvent être localement adaptées, tout changement induit par le climat dans les modèles d'interaction peut varier selon les localités. Cependant, les conséquences de la variation spatiale des réponses plastiques pour les interactions entre espèces sont peu étudiées. Nous avons exploré expérimentalement comment la température affectait la synchronisation entre l'émergence printanière d'un papillon, Anthocharis cardamines, et le début de la floraison de cinq de ses espèces de plantes hôtes le long d'un gradient latitudinal. Nous avons également étudié les effets potentiels sur la synchronisation si les expansions vers le nord induites par le climat étaient plus rapides chez les papillons que chez les plantes hôtes. Enfin, pour évaluer comment les changements de synchronisation influencent l'utilisation des hôtes, nous avons mené une expérience pour examiner l'importance du stade de développement des structures reproductives des plantes pour la préférence d'oviposition du papillon. Dans les régions méridionales, les papillons étaient bien synchronisés avec la majorité de leurs espèces de plantes hôtes locales à travers les températures, suggérant que la plasticité thermique dans le développement du papillon correspond à l'oviposition au développement de la plante hôte et que les normes de réaction thermiques des insectes et des plantes entraînent une avancage similaire de la phénologie printanière en réponse au réchauffement. Dans la région la plus septentrionale, cependant, la phénologie relative entre le papillon et deux de ses espèces de plantes hôtes a changé avec l'augmentation de la température. Nous montrons également que le stade de développement des plantes était important pour la ponte, et concluons que les changements de synchronisation induits par la température dans la région la plus septentrionale sont susceptibles d'entraîner des changements dans l'utilisation des hôtes chez A. cardamines si les températures printanières deviennent plus chaudes. L'expansion vers le nord des populations de papillons pourrait éventuellement avoir un effet positif sur le maintien au rythme de la phénologie des plantes hôtes avec des populations de plantes hôtes plus septentrionales. Compte tenu du fait que la majorité des herbivores insectes exploitent plusieurs espèces de plantes différant par leur réponse phénologique aux températures printanières, les changements de synchronisation induits par la température pourraient entraîner des changements dans l'utilisation des hôtes et des modifications des interactions entre espèces dans de nombreuses communautés tempérées.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2656.12770",
    doi = "10.1111/1365-2656.12770",
    openalex = "W2766237007",
    references = "doi101111bij12838"
}

Le changement climatique en cours constitue une menace majeure pour la biodiversité. Cependant, bien que de nombreuses espèces souffrent clairement du changement climatique en cours, d'autres en bénéficient, par exemple en montrant des expansions de leur aire de répartition. Cependant, quelles caractéristiques spécifiques déterminent la vulnérabilité d'une espèce au changement climatique ? La plasticité phénotypique, qui a été décrite comme la première ligne de défense contre les changements environnementaux, pourrait être d'une importance capitale ici. Dans ce contexte, nous comparons ici la plasticité de la tolérance au stress chez 3 espèces de papillons cuivrés, qui diffèrent probablement en termes de vulnérabilité au changement climatique. Plus précisément, nous avons étudié la résistance à la chaleur, au froid et à la dessiccation après acclimatation à différentes températures chez les adultes. Nous démontrons que l'acclimatation à une température plus élevée augmente la résistance à la chaleur mais diminue la tolérance au froid et la résistance à la dessiccation. Contrairement à nos prédictions, les espèces n'ont pas montré de variation marquée de la résistance au stress, bien que les capacités plastiques en matière de résistance au stress thermique aient varié d'une espèce à l'autre. Dans l'ensemble, nos résultats semblent refléter des patterns spécifiques aux populations plutôt qu'aux espèces. Nous concluons que l'origine géographique des populations utilisées doit être prise en compte, même dans les études comparatives. Cependant, nos résultats suggèrent que, pour les 3 espèces étudiées ici, la vulnérabilité au changement climatique n'est pas principalement déterminée par la résistance au stress chez les adultes. Comme les études entomologiques se concentrent trop souvent uniquement sur les adultes, nous soutenons qu'un effort de recherche plus important devrait être consacré à d'autres stades de développement lorsqu'on cherche à comprendre les réponses des insectes aux changements environnementaux.

@article{doi1011111744791712456,
    author = "Klockmann, Michael et Wallmeyer, Leonard et Fischer, Klaus",
    title = "Variation in adult stress resistance does not explain vulnerability to climate change in copper butterflies",
    year = "2017",
    journal = "Insect Science",
    abstract = "Le changement climatique en cours constitue une menace majeure pour la biodiversité. Cependant, bien que de nombreuses espèces souffrent clairement du changement climatique en cours, d'autres en bénéficient, par exemple en montrant des expansions de leur aire de répartition. Cependant, quelles caractéristiques spécifiques déterminent la vulnérabilité d'une espèce au changement climatique ? La plasticité phénotypique, qui a été décrite comme la première ligne de défense contre les changements environnementaux, pourrait être d'une importance capitale ici. Dans ce contexte, nous comparons ici la plasticité de la tolérance au stress chez 3 espèces de papillons cuivrés, qui diffèrent probablement en termes de vulnérabilité au changement climatique. Plus précisément, nous avons étudié la résistance à la chaleur, au froid et à la dessiccation après acclimatation à différentes températures chez les adultes. Nous démontrons que l'acclimatation à une température plus élevée augmente la résistance à la chaleur mais diminue la tolérance au froid et la résistance à la dessiccation. Contrairement à nos prédictions, les espèces n'ont pas montré de variation marquée de la résistance au stress, bien que les capacités plastiques en matière de résistance au stress thermique aient varié d'une espèce à l'autre. Dans l'ensemble, nos résultats semblent refléter des patterns spécifiques aux populations plutôt qu'aux espèces. Nous concluons que l'origine géographique des populations utilisées doit être prise en compte, même dans les études comparatives. Cependant, nos résultats suggèrent que, pour les 3 espèces étudiées ici, la vulnérabilité au changement climatique n'est pas principalement déterminée par la résistance au stress chez les adultes. Comme les études entomologiques se concentrent trop souvent uniquement sur les adultes, nous soutenons qu'un effort de recherche plus important devrait être consacré à d'autres stades de développement lorsqu'on cherche à comprendre les réponses des insectes aux changements environnementaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1744-7917.12456",
    doi = "10.1111/1744-7917.12456",
    openalex = "W2595567838",
    references = "doi101111bij12838"
}

Les stratégies de détection et de réponse aux voisins chez les plantes sont des médiateurs importants des interactions entre espèces. Malgré une connaissance croissante de la détection et de la réponse aux voisins impliquant des volatils végétaux, on sait moins comment les signaux chimiques transportés par le sol peuvent agir sous terre dans les interactions plante-plante. Ici, nous démontrons expérimentalement la détection des voisins et les réponses allélopathiques entre le blé et 100 autres espèces végétales via des signaux sous-terrestres. Le blé peut détecter à la fois des voisins de même espèce et des voisins d'espèces différentes et répond en augmentant la production d'allélochimiques. De plus, nous montrons que la (-)-loliolide et l'acide jasmonique sont présents dans les exsudats racinaires d'une large gamme d'espèces et sont capables de déclencher la production d'allélochimiques chez le blé. Ces résultats suggèrent que la (-)-loliolide et l'acide jasmonique sécrétés par les racines sont impliqués dans la détection des voisins et la réponse aux allélochimiques chez les plantes et pourraient être des médiateurs répandus des interactions plante-plante sous-terrestres.

@article{doi101038s41467018064291,
    author = "Kong, Chui‐Hua et Zhang, Songzhu et Li‐Beisson, Yonghua et Xia, Zhichao et Yang, Xuefang et Meiners, Scott J. et Wang, Peng",
    title = "La détection des voisins et la réponse aux allélochimiques chez les plantes sont pilotées par des signaux chimiques sécrétés par les racines",
    year = "2018",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les stratégies de détection et de réponse aux voisins chez les plantes sont des médiateurs importants des interactions entre espèces. Malgré une connaissance croissante de la détection et de la réponse aux voisins impliquant des volatils végétaux, on sait moins comment les signaux chimiques transportés par le sol peuvent agir sous terre dans les interactions plante-plante. Ici, nous démontrons expérimentalement la détection des voisins et les réponses allélopathiques entre le blé et 100 autres espèces végétales via des signaux sous-terrestres. Le blé peut détecter à la fois des voisins de même espèce et des voisins d'espèces différentes et répond en augmentant la production d'allélochimiques. De plus, nous montrons que la (-)-loliolide et l'acide jasmonique sont présents dans les exsudats racinaires d'une large gamme d'espèces et sont capables de déclencher la production d'allélochimiques chez le blé. Ces résultats suggèrent que la (-)-loliolide et l'acide jasmonique sécrétés par les racines sont impliqués dans la détection des voisins et la réponse aux allélochimiques chez les plantes et pourraient être des médiateurs répandus des interactions plante-plante sous-terrestres.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-018-06429-1",
    doi = "10.1038/s41467-018-06429-1",
    openalex = "W2891293973",
    references = "doi101111j13653040200801910x"
}

La variation du degré de synchronie entre les plantes hôtes et les herbivores peut perturber ou intensifier les interactions entre espèces, modifier l'intensité de la sélection naturelle sur les traits associés au calendrier phénologique et entraîner de nouvelles associations avec les plantes hôtes. Nous avons utilisé des observations de terrain de trois régions sur quatre saisons pour examiner comment le calendrier du papillon herbivore Anthocharis cardamines par rapport à six espèces de plantes hôtes (Arabis hirsuta, Cardamine pratensis, Arabis glabra, Arabidopsis thaliana, Thlaspi caerulescens et Capsella bursa‐pastoris) influençait l'utilisation des espèces hôtes et le choix des individus de plantes hôtes au sein des populations. Les papillons ont déposé une fraction plus importante de leurs œufs sur les espèces qui étaient plus proches du stade de développement préféré du papillon que sur les autres espèces hôtes. Au sein des populations de plantes hôtes, les papillons ont montré une préférence plus forte pour les individus à phénologie tardive lorsque les plantes au sein de la population étaient en moyenne plus développées au moment du vol des papillons. Nos résultats suggèrent que les changements de synchronie entre les herbivores et leurs plantes hôtes sont associés à des changements à la fois dans l'utilisation des espèces hôtes et dans le choix des individus de plantes hôtes différant par leur phénologie au sein des populations. Ceci est probablement un mécanisme important générant une variation dans les intensités d'interaction et la sélection de traits dans la nature, et donc également pertinent pour comprendre comment les changements induits par l'activité humaine, tels que le réchauffement climatique, influenceront les communautés naturelles.

@article{doi101111oik05720,
    author = "Toftegaard, Tenna et Posledovich, Diana et Navarro‐Cano, José A. et Wiklund, Christer et Gotthard, Karl et Ehrlén, Johan",
    title = "Synchronie papillon-plante hôte détermine les schémas d'utilisation des hôtes à travers les années et les régions",
    year = "2018",
    journal = "Oikos",
    abstract = "La variation du degré de synchronie entre les plantes hôtes et les herbivores peut perturber ou intensifier les interactions entre espèces, modifier l'intensité de la sélection naturelle sur les traits associés au calendrier phénologique et entraîner de nouvelles associations avec les plantes hôtes. Nous avons utilisé des observations de terrain de trois régions sur quatre saisons pour examiner comment le calendrier du papillon herbivore Anthocharis cardamines par rapport à six espèces de plantes hôtes (Arabis hirsuta, Cardamine pratensis, Arabis glabra, Arabidopsis thaliana, Thlaspi caerulescens et Capsella bursa‐pastoris) influençait l'utilisation des espèces hôtes et le choix des individus de plantes hôtes au sein des populations. Les papillons ont déposé une fraction plus importante de leurs œufs sur les espèces qui étaient plus proches du stade de développement préféré du papillon que sur les autres espèces hôtes. Au sein des populations de plantes hôtes, les papillons ont montré une préférence plus forte pour les individus à phénologie tardive lorsque les plantes au sein de la population étaient en moyenne plus développées au moment du vol des papillons. Nos résultats suggèrent que les changements de synchronie entre les herbivores et leurs plantes hôtes sont associés à des changements à la fois dans l'utilisation des espèces hôtes et dans le choix des individus de plantes hôtes différant par leur phénologie au sein des populations. Ceci est probablement un mécanisme important générant une variation dans les intensités d'interaction et la sélection de traits dans la nature, et donc également pertinent pour comprendre comment les changements induits par l'activité humaine, tels que le réchauffement climatique, influenceront les communautés naturelles.",
    url = "https://doi.org/10.1111/oik.05720",
    doi = "10.1111/oik.05720",
    openalex = "W2897498368",
    references = "doi101111bij12838"
}

Dès l'isolement et l'identification des premiers métabolites secondaires végétaux (MSV), des questions concernant leurs fonctions écologiques et leur diversité ont été soulevées. Les récents progrès en chimie analytique et en traitement complexe des données, ainsi que les avancées en écologie chimique, passant des questions mécanistiques aux questions fonctionnelles et évolutives, ouvrent une nouvelle boîte d'hypothèses. L'élaboration de ces hypothèses inclut la mesure de traits complexes, tels que la chémiodiversité, d'une manière dépendante du contexte, et permet une compréhension plus approfondie de la multifonctionnalité et de la redondance fonctionnelle des MSV. Ici, nous passons en revue un cadre hypothétique qui aborde la diversité des MSV à plusieurs niveaux écologiques (chémiodiversité α, β et γ), sa variation dans l'espace et le temps, et les agents potentiels de la sélection naturelle. Nous utilisons le concept de transfert d'information chimique comme médiateur des interactions antagonistes et mutualistes pour interpréter les études fonctionnelles et microévolutives et créer un cadre hypothétique pour comprendre la chémiodiversité comme un facteur conduisant les processus écologiques.

@article{doi101146annurevecolsys110617062406,
    author = "Keßler, André et Kalske, Aino",
    title = "Plant Secondary Metabolite Diversity and Species Interactions",
    year = "2018",
    journal = "Annual Review of Ecology Evolution and Systematics",
    abstract = "Ever since the first plant secondary metabolites (PSMs) were isolated and identified, questions about their ecological functions and diversity have been raised. Recent advances in analytical chemistry and complex data computation, as well as progress in chemical ecology from mechanistic to functional and evolutionary questions, open a new box of hypotheses. Addressing these hypotheses includes the measurement of complex traits, such as chemodiversity, in a context-dependent manner and allows for a deeper understanding of the multifunctionality and functional redundancy of PSMs. Here we review a hypothesis framework that addresses PSM diversity on multiple ecological levels (α, β, and γ chemodiversity), its variation in space and time, and the potential agents of natural selection. We use the concept of chemical information transfer as mediator of antagonistic and mutualistic interaction to interpret functional and microevolutionary studies and create a hypothesis framework for understanding chemodiversity as a factor driving ecological processes.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ecolsys-110617-062406",
    doi = "10.1146/annurev-ecolsys-110617-062406",
    openalex = "W2842718607",
    references = "doi101111j001438202002tb00145x, doi101111j13652435201001794x"
}

Les métabolites secondaires des plantes (MS) ne constituent pas seulement une gamme utile de produits naturels, mais aussi une partie importante du système de défense des plantes contre les attaques pathogènes et les stress environnementaux. Grâce à leurs remarquables activités biologiques, les MS végétaux sont de plus en plus utilisés comme ingrédients médicinaux et additifs alimentaires à des fins thérapeutiques, aromatiques et culinaires. Divers facteurs génétiques, ontogéniques, morphogénétiques et environnementaux peuvent influencer la biosynthèse et l'accumulation des MS. Selon les rapports de la littérature, par exemple, l'accumulation des MS dépend fortement d'une variété de facteurs environnementaux tels que la lumière, la température, l'eau du sol, la fertilité du sol et la salinité, et pour la plupart des plantes, un changement d'un facteur individuel peut modifier la teneur en MS même si les autres facteurs restent constants. Ici, nous passons en revue avec insistance comment chaque facteur individuel affecte l'accumulation des métabolites secondaires des plantes, et effectuons une analyse comparative des produits naturels pertinents dans les plantes stressées et non stressées. Espérons que cette revue documentaire dressera un tableau général des facteurs environnementaux responsables des fluctuations des MS végétaux, fournira un moyen pratique d'obtenir une qualité constante et une quantité élevée de composés bioactifs dans la végétation, et présentera certaines suggestions pour la recherche et le développement futurs.

@article{doi103390molecules23040762,
    author = "Li, Yang et Wen, Kuishan et Ruan, Xiao et Zhao, Yingxian et Wei, Feng et Wang, Qiang",
    title = "Réponse des métabolites secondaires des plantes aux facteurs environnementaux",
    year = "2018",
    journal = "Molecules",
    abstract = "Les métabolites secondaires des plantes (MS) ne constituent pas seulement une gamme utile de produits naturels, mais aussi une partie importante du système de défense des plantes contre les attaques pathogènes et les stress environnementaux. Grâce à leurs remarquables activités biologiques, les MS végétaux sont de plus en plus utilisés comme ingrédients médicinaux et additifs alimentaires à des fins thérapeutiques, aromatiques et culinaires. Divers facteurs génétiques, ontogéniques, morphogénétiques et environnementaux peuvent influencer la biosynthèse et l'accumulation des MS. Selon les rapports de la littérature, par exemple, l'accumulation des MS dépend fortement d'une variété de facteurs environnementaux tels que la lumière, la température, l'eau du sol, la fertilité du sol et la salinité, et pour la plupart des plantes, un changement d'un facteur individuel peut modifier la teneur en MS même si les autres facteurs restent constants. Ici, nous passons en revue avec insistance comment chaque facteur individuel affecte l'accumulation des métabolites secondaires des plantes, et effectuons une analyse comparative des produits naturels pertinents dans les plantes stressées et non stressées. Espérons que cette revue documentaire dressera un tableau général des facteurs environnementaux responsables des fluctuations des MS végétaux, fournira un moyen pratique d'obtenir une qualité constante et une quantité élevée de composés bioactifs dans la végétation, et présentera certaines suggestions pour la recherche et le développement futurs.",
    url = "https://doi.org/10.3390/molecules23040762",
    doi = "10.3390/molecules23040762",
    openalex = "W2794597140",
    references = "doi101111j13653040200801910x"
}

Les altérations induites par la température de la phénologie et de la taille corporelle sont le résultat cumulatif d'effets séquentiels impactant le développement et constituent des réponses universelles au changement climatique. La plupart des études se sont jusqu'à présent concentrées sur les réponses phénologiques au réchauffement chez de multiples taxons à travers l'espace et le temps, ou sur les effets ontogénétiques de la température en laboratoire. Je complète ici ce travail en investiguant les décalages de la phénologie et de la taille corporelle (longueur des ailes) attribuables aux changements de température agissant sur l'ensemble de la durée de vie du papillon Anthocharis cardamines à pointe orange univoltin dans une seule population sauvage sur 14 générations. La phénologie a été affectée par les températures durant trois périodes discrètes de l'année précédant l'émergence, correspondant à la fin de la vie larvaire/début de la vie pupale, le début de la période de refroidissement nécessaire pour rompre la diapause pupale, et le développement pupal postdiapause avant l'éclosion. Des températures plus élevées durant la fin de la vie larvaire/début de la vie pupale et le développement pupal postdiapause ont avancé l'émergence subséquente des papillons, tandis que des températures plus élevées au début de la période de refroidissement l'ont retardée. La synchronisation du calendrier d'émergence des papillons a augmenté lorsque les pupes ont été exposées à des températures plus douces en milieu d'hiver. La longueur des ailes a augmenté avec des températures plus chaudes à des points distincts des périodes précoce et intermédiaire de la vie pupale ; de tels effets directs de la température sur la taille corporelle pourraient compléter les effets de la longueur de la saison dans l'explication de l'inversion de la règle de la taille-température chez les insectes univoltins. Les périodes durant lesquelles la température a affecté la phénologie du papillon ne se chevauchaient que partiellement avec celles affectant la date de première floraison de ses plantes hôtes, la capucine des prés (Cardamine pratensis) et la moutarde à feuilles d'ail (Alliaria petiolata). Les effets thermiques observés sur le temps de floraison, le moment de l'émergence et la synchronisation de l'émergence indiquent que la convergence phénologique ainsi que le décalage phénologique pourraient affecter la disponibilité des plantes hôtes et l'étendue du régime alimentaire ; les effets thermiques sur la taille corporelle impliquent que des processus importants au niveau des populations pourraient être impactés par des changements corrélés dans la fécondité et le taux de dispersion. En général, les effets combinés des réponses phénologiques et ontogénétiques aux changements de température sur l'ensemble de la durée de vie seront probablement importants pour modéliser les réponses démographiques des espèces interagissant au changement climatique.

@article{doi101002ecy2612,
    author = "Davies, W. James",
    title = "Multiple temperature effects on phenology and body size in wild butterflies predict a complex response to climate change",
    year = "2019",
    journal = "Ecology",
    abstract = "Temperature-induced alterations in phenology and body size are the cumulative outcome of sequential effects impacting development and are universal responses to climate change. Most studies have so far focused on phenological responses to warming in multiple taxa across space and time, or the ontogenetic effects of temperature in the laboratory. I here complement this work by investigating shifts in phenology and body size (wing length) attributable to temperature changes operating over the entire lifespan of the univoltine orange-tip butterfly Anthocharis cardamines in a single wild population over 14 generations. Phenology was affected by temperatures during three discrete periods in the year prior to emergence, corresponding to late larval/early pupal life, the onset of the chilling period required to break pupal diapause, and postdiapause pupal development prior to eclosion. Higher temperatures during late larval/early pupal life and postdiapause pupal development advanced the subsequent emergence of the butterflies, whereas higher temperatures at the onset of the chilling period retarded it. The synchronization of the butterflies' emergence schedule increased when pupae were exposed to milder midwinter temperatures. Wing length increased with warmer temperatures at distinct points in the early and midpupal periods; such direct effects of temperature on body size could complement season length effects in explaining the reversal of the temperature-size rule in univoltine insects. The periods during which temperature affected the phenology of the butterfly only partially overlapped those affecting the first flowering date of its host plants lady's smock (Cardamine pratensis) and garlic mustard (Alliaria petiolata). Observed thermal effects on flowering time, emergence timing, and emergence synchronization indicate that phenological convergence as well as phenological mismatching could affect host-plant availability and diet breadth; thermal effects on body size imply that important population-level processes could be impacted through correlated changes in fecundity and dispersal rate. In general, the combined effects of phenological and ontogenetic responses to temperature changes across the whole lifespan will likely be important in modeling the demographic responses of interacting species to climate change.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ecy.2612",
    doi = "10.1002/ecy.2612",
    openalex = "W2909956747",
    references = "doi101111bij12838"
}

Le changement climatique peut modifier la dynamique des espèces en épidémie en altérant la synchronie phénologique entre les herbivores et leurs plantes hôtes. Comme la phénologie de la plante hôte possède une composante génétique qui peut interagir avec le climat, les niveaux d'infestation parmi les génotypes peuvent changer en conséquence. Lorsque l'herbivore en épidémie est actif tôt dans la saison, ses niveaux d'infestation peuvent également laisser une empreinte détectable sur les herbivores colonisant la plante plus tard dans la saison. Dans cette étude, nous avons d'abord examiné comment la phénologie printanière et le génotype de Quercus robur influencent la densité du mineur de feuilles actif au printemps et en épidémie, Acrocercops brongniardellus. Nous avons ensuite évalué comment la densité intraspécifique affecte la performance de A. brongniardellus et comment le génotype du chêne et la densité de A. brongniardellus affectent la communauté d'herbivores insectes. Nous avons constaté que les individus de Q. robur à phénologie printanière tardive étaient plus fortement infestés par A. brongniardellus. Les pupes conspécifiques sur les chênes fortement infestés avaient tendance à être plus légères, et moins d'herbivores insectes hétérospécifiques ont colonisé le chêne plus tard dans la saison. Au-delà de ses effets via la phénologie, le génotype de la plante a laissé une empreinte sur la richesse spécifique des herbivores et sur deux herbivores insectes. Nos résultats suggèrent une chaîne d'effets en cascade de la phénologie de la plante, à travers l'espèce en épidémie jusqu'à la communauté d'herbivores insectes. Compte tenu de la découverte de la manière dont la synchronie phénologique entre l'espèce en épidémie et sa plante hôte influence les niveaux d'infestation, un décalage de la synchronie peut alors modifier la dynamique de l'épidémie et provoquer des effets en cascade sur la communauté insecte.

@article{doi1011111365265613151,
    author = "Ekholm, Adam et Tack, Ayco J. M. et Pulkkinen, Pertti et Roslin, Tomas",
    title = "Host plant phenology, insect outbreaks and herbivore communities – The importance of timing",
    year = "2019",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Le changement climatique peut modifier la dynamique des espèces en épidémie en altérant la synchronie phénologique entre les herbivores et leurs plantes hôtes. Comme la phénologie de la plante hôte possède une composante génétique qui peut interagir avec le climat, les niveaux d'infestation parmi les génotypes peuvent changer en conséquence. Lorsque l'herbivore en épidémie est actif tôt dans la saison, ses niveaux d'infestation peuvent également laisser une empreinte détectable sur les herbivores colonisant la plante plus tard dans la saison. Dans cette étude, nous avons d'abord examiné comment la phénologie printanière et le génotype de Quercus robur influencent la densité du mineur de feuilles actif au printemps et en épidémie, Acrocercops brongniardellus. Nous avons ensuite évalué comment la densité intraspécifique affecte la performance de A. brongniardellus et comment le génotype du chêne et la densité de A. brongniardellus affectent la communauté d'herbivores insectes. Nous avons constaté que les individus de Q. robur à phénologie printanière tardive étaient plus fortement infestés par A. brongniardellus. Les pupes conspécifiques sur les chênes fortement infestés avaient tendance à être plus légères, et moins d'herbivores insectes hétérospécifiques ont colonisé le chêne plus tard dans la saison. Au-delà de ses effets via la phénologie, le génotype de la plante a laissé une empreinte sur la richesse spécifique des herbivores et sur deux herbivores insectes. Nos résultats suggèrent une chaîne d'effets en cascade de la phénologie de la plante, à travers l'espèce en épidémie jusqu'à la communauté d'herbivores insectes. Compte tenu de la découverte de la manière dont la synchronie phénologique entre l'espèce en épidémie et sa plante hôte influence les niveaux d'infestation, un décalage de la synchronie peut alors modifier la dynamique de l'épidémie et provoquer des effets en cascade sur la communauté insecte.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2656.13151",
    doi = "10.1111/1365-2656.13151",
    openalex = "W2989980784",
    references = "doi101111bij12838"
}

Les composés volatils régissent les interactions entre les plantes et leurs pollinisateurs, leurs herbivores et leurs ennemis naturels, ainsi qu'avec d'autres plantes et micro-organismes. Avec l'augmentation des connaissances sur ces interactions, les mécanismes sous-jacents se révèlent de plus en plus complexes. Les mécanismes de biosynthèse et de perception des composés volatils sont progressivement élucidés. Les connaissances scientifiques croissantes peuvent être utilisées pour concevoir et appliquer des stratégies agricoles basées sur les composés volatils.

@article{doi101111tpj14496,
    author = "Bouwmeester, Harro J. et Schuurink, Robert C. et Bleeker, Petra et Schiestl, Florian P.",
    title = "Le rôle des composés volatils dans la communication végétale",
    year = "2019",
    journal = "The Plant Journal",
    abstract = "Les composés volatils régissent les interactions entre les plantes et leurs pollinisateurs, leurs herbivores et leurs ennemis naturels, ainsi qu'avec d'autres plantes et micro-organismes. Avec l'augmentation des connaissances sur ces interactions, les mécanismes sous-jacents se révèlent de plus en plus complexes. Les mécanismes de biosynthèse et de perception des composés volatils sont progressivement élucidés. Les connaissances scientifiques croissantes peuvent être utilisées pour concevoir et appliquer des stratégies agricoles basées sur les composés volatils.",
    url = "https://doi.org/10.1111/tpj.14496",
    doi = "10.1111/tpj.14496",
    openalex = "W2968374930",
    references = "doi101093aobmcv054, doi101111nph14178"
}

Nous avons utilisé 20 assemblages de génome de novo pour explorer l'histoire de la spéciation et l'architecture du flux génique chez les papillons Heliconius en rapide radiation. Nos tests visant à distinguer le tri de lignées incomplet de l'introgression indiquent que le flux génique a obscurci plusieurs relations phylogénétiques anciennes dans ce groupe sur de vastes portions du génome. Les loci introgressés sont sous-représentés dans les régions à faible recombinaison et riches en gènes, ce qui est cohérent avec l'élimination des allèles étrangers plus étroitement liés aux loci d'incompatibilité. Ici, nous identifions une inversion jusqu'alors inconnue qui piège un locus de bascule de motif de couleur. Nous inférons que cette inversion a été transférée entre lignées par introgression et est convergente avec une réarrangement similaire dans une autre partie du genre. Ces séquences multiples de génome de novo permettent une meilleure compréhension de l'importance de l'introgression et des processus sélectifs dans la radiation adaptative.

@article{doi101126scienceaaw2090,
    author = "Edelman, Nathaniel B. et Frandsen, Paul B. et Miyagi, Miriam et Clavijo, Bernardo et Davey, John W. et Dikow, Rebecca B. et Accinelli, Gonzalo Garcia et Belleghem, Steven M. Van et Patterson, Nick et Neafsey, Daniel E. et Challis, Richard et Kumar, Sujai et Moreira, Gilson R. P. et Salazar, Camilo et Chouteau, Mathieu et Counterman, Brian A. et Papa, Riccardo et Blaxter, Mark et Reed, Robert D. et Dasmahapatra, Kanchon K. et Kronforst, Marcus R. et Joron, Mathieu et Jiggins, Chris D. et McMillan, W. Owen et Palma, Federica Di et Blumberg, Andrew J. et Wakeley, John et Jaffe, David B. et Mallet, James",
    title = "Genomic architecture and introgression shape a butterfly radiation",
    year = "2019",
    journal = "Science",
    abstract = "Nous avons utilisé 20 assemblages de génome de novo pour explorer l'histoire de la spéciation et l'architecture du flux génique chez les papillons Heliconius en rapide radiation. Nos tests visant à distinguer le tri de lignées incomplet de l'introgression indiquent que le flux génique a obscurci plusieurs relations phylogénétiques anciennes dans ce groupe sur de vastes portions du génome. Les loci introgressés sont sous-représentés dans les régions à faible recombinaison et riches en gènes, ce qui est cohérent avec l'élimination des allèles étrangers plus étroitement liés aux loci d'incompatibilité. Ici, nous identifions une inversion jusqu'alors inconnue qui piège un locus de bascule de motif de couleur. Nous inférons que cette inversion a été transférée entre lignées par introgression et est convergente avec une réarrangement similaire dans une autre partie du genre. Ces séquences multiples de génome de novo permettent une meilleure compréhension de l'importance de l'introgression et des processus sélectifs dans la radiation adaptative.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.aaw2090",
    doi = "10.1126/science.aaw2090",
    openalex = "W2982348757",
    references = "doi101038ncomms14363, doi101371journalpbio1002379"
}

, espèces réactives de l'oxygène, et kinases MAP. La reprogrammation spécifique de la défense se fait via des réseaux de signalisation qui incluent des phytohormones, des métabolites secondaires et des facteurs de transcription. La régulation locale et systémique des toxines, des protéines de défense, des barrières physiques et des traits de tolérance protège les plantes contre les herbivores. Les herbivores contrecarrent les défenses des plantes par désactivation biochimique des défenses, suppression de la signalisation de défense médiée par des effecteurs, et changements comportementaux contrôlés chimiquement. Les bases moléculaires des interactions plantes-herbivores sont maintenant bien établies pour les systèmes modèles. L'extension des approches moléculaires aux dimensions inexplorées des interactions plantes-insectes devrait être une priorité future.

@article{doi101146annurevarplant050718095910,
    author = "Erb, Matthias et Reymond, Philippe",
    title = "Interactions moléculaires entre les plantes et les herbivores insectes",
    year = "2019",
    journal = "Annual Review of Plant Biology",
    abstract = ", espèces réactives de l'oxygène, et kinases MAP. La reprogrammation spécifique de la défense se fait via des réseaux de signalisation qui incluent des phytohormones, des métabolites secondaires et des facteurs de transcription. La régulation locale et systémique des toxines, des protéines de défense, des barrières physiques et des traits de tolérance protège les plantes contre les herbivores. Les herbivores contrecarrent les défenses des plantes par désactivation biochimique des défenses, suppression de la signalisation de défense médiée par des effecteurs, et changements comportementaux contrôlés chimiquement. Les bases moléculaires des interactions plantes-herbivores sont maintenant bien établies pour les systèmes modèles. L'extension des approches moléculaires aux dimensions inexplorées des interactions plantes-insectes devrait être une priorité future.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-050718-095910",
    doi = "10.1146/annurev-arplant-050718-095910",
    openalex = "W2916551902",
    references = "doi101038nplants2015206"
}

Dans les conditions de croissance des plantes, de nombreux métabolites secondaires (MS) sont produits par elles pour servir à diverses fonctions cellulaires essentielles aux processus physiologiques, et des preuves récentes croissantes ont impliqué les signaux de stress et de réponse de défense dans leur production. Le type et la concentration des molécules secondaires produites par une plante sont déterminés par l'espèce, le génotype, la physiologie, le stade de développement et les facteurs environnementaux pendant la croissance. Cela suggère les réponses adaptatives physiologiques employées par divers groupes taxonomiques de plantes pour faire face aux stimuli de stress et de défense. Les dernières décennies ont vu un regain d'intérêt pour l'étude des facteurs abiotiques qui influencent le métabolisme secondaire pendant la croissance in vitro et in vivo des plantes. L'application des outils et techniques de biologie moléculaire facilite la compréhension des processus et voies de signalisation impliqués dans la production de MS au niveau subcellulaire, cellulaire, organique et au niveau de la plante entière pendant la croissance in vivo et in vitro, avec application dans l'ingénierie métabolique des intermédiaires des voies biosynthétiques.

@article{doi101186s4065901902463,
    author = "Isah, Tasiu",
    title = "Stress et réponses de défense dans la production de métabolites secondaires chez les plantes",
    year = "2019",
    journal = "Biological Research",
    abstract = "Dans les conditions de croissance des plantes, de nombreux métabolites secondaires (MS) sont produits par elles pour servir à diverses fonctions cellulaires essentielles aux processus physiologiques, et des preuves récentes croissantes ont impliqué les signaux de stress et de réponse de défense dans leur production. Le type et la concentration des molécules secondaires produites par une plante sont déterminés par l'espèce, le génotype, la physiologie, le stade de développement et les facteurs environnementaux pendant la croissance. Cela suggère les réponses adaptatives physiologiques employées par divers groupes taxonomiques de plantes pour faire face aux stimuli de stress et de défense. Les dernières décennies ont vu un regain d'intérêt pour l'étude des facteurs abiotiques qui influencent le métabolisme secondaire pendant la croissance in vitro et in vivo des plantes. L'application des outils et techniques de biologie moléculaire facilite la compréhension des processus et voies de signalisation impliqués dans la production de MS au niveau subcellulaire, cellulaire, organique et au niveau de la plante entière pendant la croissance in vivo et in vitro, avec application dans l'ingénierie métabolique des intermédiaires des voies biosynthétiques.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s40659-019-0246-3",
    doi = "10.1186/s40659-019-0246-3",
    openalex = "W2965574859",
    references = "doi101111j13653040200801910x"
}

L'urbanisation modifie rapidement les paysages naturels et agricoles, avec des conséquences pour les arthropodes herbivores vivant dans ou à proximité des villes. Ici, nous passons en revue les preuves concernant les effets de l'urbanisation sur l'écologie et l'évolution des interactions plantes-herbivores. Nous résumons d'abord comment les facteurs abiotiques associés à l'urbanisation affectent l'écologie et l'évolution des arthropodes herbivores. Ensuite, nous explorons comment l'urbanisation affecte les interactions plantes-herbivores, en examinant comment les environnements urbains peuvent perturber les processus écologiques top-down et bottom-up qui influencent l'herbivorie. Les changements abiotiques dans l'environnement urbain, tels que l'effet d'îlot de chaleur urbain, ont provoqué des décalages phénologiques chez certains arthropodes herbivores. D'autres changements abiotiques dans les zones urbaines, notamment la disponibilité en eau, la pollution et la fragmentation des habitats, ont entraîné des modifications de la physiologie, du comportement et de l'abondance des populations. La richesse spécifique des espèces natives tend à diminuer dans les zones urbaines, mais les changements d'abondance semblent spécifiques aux espèces. Ces décalages écologiques suggèrent que l'urbanisation pourrait affecter à la fois l'évolution adaptative et non adaptative des arthropodes herbivores et de leurs plantes hôtes dans les environnements urbains. Cependant, les interactions plantes-herbivores pourraient être considérablement altérées si les arthropodes ou les plantes ne sont pas capables de tolérer les environnements urbains. Ainsi, si certaines espèces peuvent s'acclimater physiologiquement ou s'adapter génétiquement à l'environnement urbain abiotique, les interactions biotiques peuvent entraîner le déclin de nombreuses espèces. Nous concluons avec des suggestions pour des recherches futures afin d'avancer notre compréhension de la manière dont l'urbanisation modifie l'écologie et l'évolution des interactions plantes-herbivores.

@article{doi103389fevo201900310,
    author = "Miles, Lindsay S. et Breitbart, Sophie T. et Wagner, Helene H. et Johnson, Marc T. J.",
    title = "Urbanization Shapes the Ecology and Evolution of Plant-Arthropod Herbivore Interactions",
    year = "2019",
    journal = "Frontiers in Ecology and Evolution",
    abstract = "L'urbanisation modifie rapidement les paysages naturels et agricoles, avec des conséquences pour les arthropodes herbivores vivant dans ou à proximité des villes. Ici, nous passons en revue les preuves concernant les effets de l'urbanisation sur l'écologie et l'évolution des interactions plantes-herbivores. Nous résumons d'abord comment les facteurs abiotiques associés à l'urbanisation affectent l'écologie et l'évolution des arthropodes herbivores. Ensuite, nous explorons comment l'urbanisation affecte les interactions plantes-herbivores, en examinant comment les environnements urbains peuvent perturber les processus écologiques top-down et bottom-up qui influencent l'herbivorie. Les changements abiotiques dans l'environnement urbain, tels que l'effet d'îlot de chaleur urbain, ont provoqué des décalages phénologiques chez certains arthropodes herbivores. D'autres changements abiotiques dans les zones urbaines, notamment la disponibilité en eau, la pollution et la fragmentation des habitats, ont entraîné des modifications de la physiologie, du comportement et de l'abondance des populations. La richesse spécifique des espèces natives tend à diminuer dans les zones urbaines, mais les changements d'abondance semblent spécifiques aux espèces. Ces décalages écologiques suggèrent que l'urbanisation pourrait affecter à la fois l'évolution adaptative et non adaptative des arthropodes herbivores et de leurs plantes hôtes dans les environnements urbains. Cependant, les interactions plantes-herbivores pourraient être considérablement altérées si les arthropodes ou les plantes ne sont pas capables de tolérer les environnements urbains. Ainsi, si certaines espèces peuvent s'acclimater physiologiquement ou s'adapter génétiquement à l'environnement urbain abiotique, les interactions biotiques peuvent entraîner le déclin de nombreuses espèces. Nous concluons avec des suggestions pour des recherches futures afin d'avancer notre compréhension de la manière dont l'urbanisation modifie l'écologie et l'évolution des interactions plantes-herbivores.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fevo.2019.00310",
    doi = "10.3389/fevo.2019.00310",
    openalex = "W2966492928",
    references = "doi101016jtree201311003"
}

Les plantes regorgent d'ingrédients actifs. Parmi ces constituants naturels, les allelochimiques et les substances de signalisation libérés dans l'environnement jouent un rôle important dans la régulation des interactions entre les plantes et les autres organismes. Les allelochimiques participent à la défense des plantes contre les attaques microbiennes, la prédation par les herbivores et/ou la compétition avec d'autres plantes, notamment dans l'allopathie, qui affecte l'établissement des plantes concurrentes. Les allelochimiques pourraient servir de pistes pour les efforts de découverte de nouveaux pesticides. Les substances de signalisation sont impliquées dans la détection des voisins végétaux ou l'identification des ravageurs, et elles induisent la production et la libération de métabolites de défense des plantes. Grâce aux substances de signalisation, les plantes peuvent soit détecter soit identifier les concurrents, les herbivores ou les pathogènes, et réagir en augmentant les niveaux de métabolites de défense, offrant ainsi un avantage pour leur propre croissance. Les interactions plante-organisme médiées par les allelochimiques et les substances de signalisation se produisent à la fois au-dessus et en dessous du sol. Dans le cas des interactions aériennes, les substances aériennes médiatrices sont bien établies. Les interactions souterraines, en particulier dans le contexte des substances du sol pilotant les interactions de signalisation, sont largement inconnues, en raison de la complexité des interactions plante-sol. Le manque de méthodes efficaces et fiables d'identification et de clarification de leur mode d'action est l'un des plus grands défis liés aux allelochimiques et substances de signalisation du sol. Les récentes avancées dans les stratégies méthodologiques visent la qualité, la quantité et la dynamique spatio-temporelle des substances du sol. Cette revue décrit les recherches récentes concernant les allelochimiques et substances de signalisation d'origine végétale, ainsi que leurs rôles dans la gestion des ravageurs agricoles. Cet effort représente une vue mécanistiquement exhaustive des interactions plante-organisme médiées par les allelochimiques et substances de signalisation et fournit des perspectives plus réalistes sur les implications et applications potentielles dans l'agriculture durable.

@article{doi103390molecules24152737,
    author = "Kong, Chui‐Hua et Xuan, Tran Dang et Khanh, Tran Dang et Tran, Hoang-Dung et Trung, Nguyễn Thành",
    title = "Allelochimiques et substances de signalisation chez les plantes",
    year = "2019",
    journal = "Molecules",
    abstract = "Les plantes regorgent d'ingrédients actifs. Parmi ces constituants naturels, les allelochimiques et les substances de signalisation libérés dans l'environnement jouent un rôle important dans la régulation des interactions entre les plantes et les autres organismes. Les allelochimiques participent à la défense des plantes contre les attaques microbiennes, la prédation par les herbivores et/ou la compétition avec d'autres plantes, notamment dans l'allopathie, qui affecte l'établissement des plantes concurrentes. Les allelochimiques pourraient servir de pistes pour les efforts de découverte de nouveaux pesticides. Les substances de signalisation sont impliquées dans la détection des voisins végétaux ou l'identification des ravageurs, et elles induisent la production et la libération de métabolites de défense des plantes. Grâce aux substances de signalisation, les plantes peuvent soit détecter soit identifier les concurrents, les herbivores ou les pathogènes, et réagir en augmentant les niveaux de métabolites de défense, offrant ainsi un avantage pour leur propre croissance. Les interactions plante-organisme médiées par les allelochimiques et les substances de signalisation se produisent à la fois au-dessus et en dessous du sol. Dans le cas des interactions aériennes, les substances aériennes médiatrices sont bien établies. Les interactions souterraines, en particulier dans le contexte des substances du sol pilotant les interactions de signalisation, sont largement inconnues, en raison de la complexité des interactions plante-sol. Le manque de méthodes efficaces et fiables d'identification et de clarification de leur mode d'action est l'un des plus grands défis liés aux allelochimiques et substances de signalisation du sol. Les récentes avancées dans les stratégies méthodologiques visent la qualité, la quantité et la dynamique spatio-temporelle des substances du sol. Cette revue décrit les recherches récentes concernant les allelochimiques et substances de signalisation d'origine végétale, ainsi que leurs rôles dans la gestion des ravageurs agricoles. Cet effort représente une vue mécanistiquement exhaustive des interactions plante-organisme médiées par les allelochimiques et substances de signalisation et fournit des perspectives plus réalistes sur les implications et applications potentielles dans l'agriculture durable.",
    url = "https://doi.org/10.3390/molecules24152737",
    doi = "10.3390/molecules24152737",
    openalex = "W2964537381",
    references = "doi101111j13653040200801910x"
}

Toutes les plantes synthétisent une grande variété de métabolites terpénoïdes. Certains sont communs à tous, mais beaucoup ne sont synthétisés que chez des taxons spécifiques et ont vraisemblablement évolué comme adaptations à des conditions écologiques particulières. Bien que les voies biosynthétiques terpénoïdes de base soient communes à toutes les plantes, des découvertes récentes ont révélé de nombreuses variations dans la manière dont les plantes synthétisent des terpènes spécifiques. Un thème majeur est le nombre beaucoup plus élevé de substrats qui peuvent être utilisés par les enzymes appartenant à la famille des terpène synthases (TPS). D'autres découvertes récentes incluent des enzymes non-TPS qui catalysent la formation de terpènes, ainsi que de nouveaux mécanismes de transport.

@article{doi101016jpbi202001005,
    author = "Zhou, Fei and Pichersky, Eran",
    title = "More is better: the diversity of terpene metabolism in plants",
    year = "2020",
    journal = "Current Opinion in Plant Biology",
    abstract = "All plants synthesize a diverse array of terpenoid metabolites. Some are common to all, but many are synthesized only in specific taxa and presumably evolved as adaptations to specific ecological conditions. While the basic terpenoid biosynthetic pathways are common in all plants, recent discoveries have revealed many variations in the way plants synthesized specific terpenes. A major theme is the much greater number of substrates that can be used by enzymes belonging to the terpene synthase (TPS) family. Other recent discoveries include non-TPS enzymes that catalyze the formation of terpenes, and novel transport mechanisms.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.pbi.2020.01.005",
    doi = "10.1016/j.pbi.2020.01.005",
    openalex = "W3007987127",
    references = "doi101111nph14178"
}

En tant qu'organismes sessiles, les plantes ne peuvent pas éviter d'être soumises à des stress environnementaux qui affectent négativement leur croissance et leur productivité. Au lieu de cela, elles utilisent divers mécanismes aux niveaux morphologique, physiologique et biochimique pour atténuer les effets délétères de ces stress. Parmi ceux-ci, les métabolites secondaires produits par les plantes représentent un composant important du système de défense. Les métabolites secondaires, à savoir les phénols, les terpènes et les composés azotés, ont été largement démontrés comme protégeant les plantes contre de multiples stress, tant biotiques (herbivores et micro-organismes pathogènes) qu'abiotiques (par exemple, sécheresse, salinité et métaux lourds). La régulation du métabolisme secondaire par des éléments bénéfiques tels que le silicium (Si) est un sujet important. L'atténuation des stress biotiques et abiotiques médiée par le silicium a été bien documentée chez de nombreuses espèces végétales. Récemment, de nombreuses études ont démontré l'implication du Si dans le renforcement de la tolérance au stress par la modulation du métabolisme secondaire. Dans cette revue, nous discutons de la régulation médiée par le Si de la synthèse, du métabolisme et de la modification des métabolites secondaires qui conduisent à une tolérance accrue au stress, en mettant l'accent sur les aspects physiologiques, biochimiques et moléculaires. Bien que les mécanismes impliqués dans la régulation médiée par le Si de la résistance aux pathogènes via le métabolisme secondaire aient été établis chez les plantes, ils sont largement inconnus dans le cas des stress abiotiques, laissant ainsi un important vide dans nos connaissances actuelles.

@article{doi101093jxberaa291,
    author = "Ahanger, Mohammad Abass et Bhat, Javaid Akhter et Siddiqui, Manzer H. et Rinklebe, Jörg et Ahmad, Parvaiz",
    title = "Intégration du silicium et des métabolites secondaires chez les plantes : une association significative dans la tolérance au stress",
    year = "2020",
    journal = "Journal of Experimental Botany",
    abstract = "En tant qu'organismes sessiles, les plantes ne peuvent pas éviter d'être soumises à des stress environnementaux qui affectent négativement leur croissance et leur productivité. Au lieu de cela, elles utilisent divers mécanismes aux niveaux morphologique, physiologique et biochimique pour atténuer les effets délétères de ces stress. Parmi ceux-ci, les métabolites secondaires produits par les plantes représentent un composant important du système de défense. Les métabolites secondaires, à savoir les phénols, les terpènes et les composés azotés, ont été largement démontrés comme protégeant les plantes contre de multiples stress, tant biotiques (herbivores et micro-organismes pathogènes) qu'abiotiques (par exemple, sécheresse, salinité et métaux lourds). La régulation du métabolisme secondaire par des éléments bénéfiques tels que le silicium (Si) est un sujet important. L'atténuation des stress biotiques et abiotiques médiée par le silicium a été bien documentée chez de nombreuses espèces végétales. Récemment, de nombreuses études ont démontré l'implication du Si dans le renforcement de la tolérance au stress par la modulation du métabolisme secondaire. Dans cette revue, nous discutons de la régulation médiée par le Si de la synthèse, du métabolisme et de la modification des métabolites secondaires qui conduisent à une tolérance accrue au stress, en mettant l'accent sur les aspects physiologiques, biochimiques et moléculaires. Bien que les mécanismes impliqués dans la régulation médiée par le Si de la résistance aux pathogènes via le métabolisme secondaire aient été établis chez les plantes, ils sont largement inconnus dans le cas des stress abiotiques, laissant ainsi un important vide dans nos connaissances actuelles.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jxb/eraa291",
    doi = "10.1093/jxb/eraa291",
    openalex = "W3037209499",
    references = "doi101093aobmcv054, doi101111nph14178"
}

Le règne végétal produit des centaines de milliers de composés organiques de faible poids moléculaire. Sur la base des fonctions supposées de ces composés, la communauté de recherche les a classés en trois groupes principaux : les métabolites primaires, directement nécessaires à la croissance des plantes ; les métabolites secondaires (ou spécialisés), qui médient les interactions plante-environnement ; et les hormones, qui régulent les processus et le métabolisme de l'organisme. Pendant des décennies, cette trichotomie fonctionnelle du métabolisme végétal a façonné la théorie et l'expérimentation en biologie végétale. Cependant, les limites biochimiques exactes entre ces différentes classes de métabolites n'ont jamais été pleinement établies. Une nouvelle vague d'études génétiques et chimiques brouille désormais davantage ces limites en démontrant que les métabolites secondaires sont multifonctionnels ; ils peuvent fonctionner comme de puissants régulateurs de la croissance et de la défense des plantes, ainsi que comme des métabolites primaires sensu lato. Plusieurs scénarios adaptatifs ont pu favoriser cette diversité fonctionnelle des métabolites secondaires, notamment la robustesse du signalage et le stockage et le recyclage rentables. La multifonctionnalité des métabolites secondaires peut fournir de nouvelles explications aux modèles ontogénétiques de production de défenses et affiner notre compréhension des interactions plante-herbivore, en particulier en tenant compte de la découverte que les herbivores adaptés détournent les métabolites secondaires végétaux à des fins multiples, dont certaines reflètent leurs fonctions chez les plantes. En conclusion, les travaux récents révèlent les limites de notre système de classification fonctionnel actuel des métabolites végétaux. Considérer les métabolites secondaires comme des composants intégrés des réseaux métaboliques, dynamiquement façonnés par les pressions de sélection environnementale et transcendant plusieurs niveaux trophiques, peut améliorer notre compréhension du métabolisme végétal et des interactions plante-environnement.

@article{doi101104pp2000433,
    author = "Erb, Matthias et Kliebenstein, Daniel J.",
    title = "Les métabolites secondaires végétaux en tant que défenses, régulateurs et métabolites primaires : la trichotomie fonctionnelle floue",
    year = "2020",
    journal = "PLANT PHYSIOLOGY",
    abstract = "Le règne végétal produit des centaines de milliers de composés organiques de faible poids moléculaire. Sur la base des fonctions supposées de ces composés, la communauté de recherche les a classés en trois groupes principaux : les métabolites primaires, directement nécessaires à la croissance des plantes ; les métabolites secondaires (ou spécialisés), qui médient les interactions plante-environnement ; et les hormones, qui régulent les processus et le métabolisme de l'organisme. Pendant des décennies, cette trichotomie fonctionnelle du métabolisme végétal a façonné la théorie et l'expérimentation en biologie végétale. Cependant, les limites biochimiques exactes entre ces différentes classes de métabolites n'ont jamais été pleinement établies. Une nouvelle vague d'études génétiques et chimiques brouille désormais davantage ces limites en démontrant que les métabolites secondaires sont multifonctionnels ; ils peuvent fonctionner comme de puissants régulateurs de la croissance et de la défense des plantes, ainsi que comme des métabolites primaires sensu lato. Plusieurs scénarios adaptatifs ont pu favoriser cette diversité fonctionnelle des métabolites secondaires, notamment la robustesse du signalage et le stockage et le recyclage rentables. La multifonctionnalité des métabolites secondaires peut fournir de nouvelles explications aux modèles ontogénétiques de production de défenses et affiner notre compréhension des interactions plante-herbivore, en particulier en tenant compte de la découverte que les herbivores adaptés détournent les métabolites secondaires végétaux à des fins multiples, dont certaines reflètent leurs fonctions chez les plantes. En conclusion, les travaux récents révèlent les limites de notre système de classification fonctionnel actuel des métabolites végétaux. Considérer les métabolites secondaires comme des composants intégrés des réseaux métaboliques, dynamiquement façonnés par les pressions de sélection environnementale et transcendant plusieurs niveaux trophiques, peut améliorer notre compréhension du métabolisme végétal et des interactions plante-environnement.",
    url = "https://doi.org/10.1104/pp.20.00433",
    doi = "10.1104/pp.20.00433",
    openalex = "W3040871428",
    references = "doi101007s0004900900186, doi101111nph14178, doi101146annurevento47091201145121, doi1023072406212, ehrlich1964butterflies"
}

La spécialisation sur l'hôte végétal est une force majeure conduisant à la partition des niches écologiques et à la diversification chez les herbivores insectes. Les défenses cyanogéniques des plantes de Passiflora éloignent la plupart des herbivores, mais pas les larves de papillons Heliconius, qui peuvent à la fois séquestrer et biosynthétiser des composés cyanogéniques. Ici, nous démontrons que Heliconius cydno chioneus et H. melpomene rosina présentent une plasticité remarquable dans leurs défenses chimiques. Lorsqu'ils se nourrissent d'espèces de Passiflora contenant des composés cyanogéniques qu'ils peuvent facilement séquestrer, les deux espèces réduisent la biosynthèse de ces composés. À l'inverse, lorsqu'ils sont nourris avec des plantes de Passiflora ne contenant pas de glucosides cyanogéniques séquestrables, les deux espèces augmentent la biosynthèse. Cette plasticité biochimique a un coût en termes de fitness pour le spécialiste H. m. rosina, car la taille et le poids des adultes de cette espèce sont négativement corrélés aux niveaux de biosynthèse, mais pas pour le généraliste H. c. chioneus. À l'inverse, H. m rosina présente une meilleure performance lorsque la séquestration est possible sur son hôte végétal spécialisé. En résumé, la plasticité phénotypique dans les réponses biochimiques à différents hôtes végétaux offre à ces papillons la capacité d'élargir leur gamme d'hôtes potentiels au sein du genre Passiflora, tout en maintenant leurs défenses chimiques.

@article{doi101098rsbl20200863,
    author = "de Castro, Érika C P et Musgrove, Jamie et Bak, Søren et McMillan, W Owen et Jiggins, Chris D",
    title = "Plasticité phénotypique dans la défense chimique des papillons permettant l'utilisation d'hôtes divers.",
    year = "2021",
    journal = "Biology letters",
    abstract = "La spécialisation sur l'hôte végétal est une force majeure conduisant à la partition des niches écologiques et à la diversification chez les herbivores insectes. Les défenses cyanogéniques des plantes de Passiflora éloignent la plupart des herbivores, mais pas les larves de papillons Heliconius, qui peuvent à la fois séquestrer et biosynthétiser des composés cyanogéniques. Ici, nous démontrons que Heliconius cydno chioneus et H. melpomene rosina présentent une plasticité remarquable dans leurs défenses chimiques. Lorsqu'ils se nourrissent d'espèces de Passiflora contenant des composés cyanogéniques qu'ils peuvent facilement séquestrer, les deux espèces réduisent la biosynthèse de ces composés. À l'inverse, lorsqu'ils sont nourris avec des plantes de Passiflora ne contenant pas de glucosides cyanogéniques séquestrables, les deux espèces augmentent la biosynthèse. Cette plasticité biochimique a un coût en termes de fitness pour le spécialiste H. m. rosina, car la taille et le poids des adultes de cette espèce sont négativement corrélés aux niveaux de biosynthèse, mais pas pour le généraliste H. c. chioneus. À l'inverse, H. m rosina présente une meilleure performance lorsque la séquestration est possible sur son hôte végétal spécialisé. En résumé, la plasticité phénotypique dans les réponses biochimiques à différents hôtes végétaux offre à ces papillons la capacité d'élargir leur gamme d'hôtes potentiels au sein du genre Passiflora, tout en maintenant leurs défenses chimiques.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8086984/",
    doi = "10.1098/rsbl.2020.0863",
    openalex = "W3142425381",
    pmcid = "PMC8086984",
    pmid = "33784874",
    references = "doi101007s0004900900186, doi101007s1088600692078, doi101016jtree201311003, doi101098rspb20161690, doi101098rstb20090263, doi101111j001438202002tb00145x, doi101111j13653040200801910x, doi101111j155856461975tb00861x, doi101146annurevarplant050213040027, doi101146annurevento47091201145121, doi107717peerj11523"
}

Les papillons et les papillons de nuit (Lepidoptera) constituent l'un des groupes animaux les plus étudiés, diversifiés et répandus, ce qui en fait un modèle idéal pour la recherche sur le changement climatique. Ils constituent un modèle particulièrement instructif pour étudier les effets du changement climatique sur l'écologie des espèces, car ce sont des ectothermes qui régulent leur température corporelle grâce à un ensemble de traits physiologiques, comportementaux et phénotypiques. Si certaines espèces ont été négativement affectées par les perturbations climatiques, d'autres ont prospéré, en grande partie conformément à la diversité de leurs traits d'histoire de vie. Ici, nous tirons parti d'un large éventail d'études sur les papillons et les papillons de nuit pour fournir un examen des nombreuses façons dont le changement climatique affecte les insectes, les animaux et les écosystèmes. En étudiant ces impacts liés au climat sur les processus écologiques des Lépidoptères, nous proposons des stratégies appropriées pour la conservation des espèces et la gestion des habitats de manière générale pour les animaux.

@article{doi101111brv12746,
    author = "Hill, Geena M. et Kawahara, Akito Y. et Daniels, Jaret C. et Bateman, Craig et Scheffers, Brett R.",
    title = "Effets du changement climatique sur l'écologie animale : papillons et papillons de nuit comme étude de cas",
    year = "2021",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Société philosophique de Cambridge",
    abstract = "Les papillons et les papillons de nuit (Lepidoptera) constituent l'un des groupes animaux les plus étudiés, diversifiés et répandus, ce qui en fait un modèle idéal pour la recherche sur le changement climatique. Ils constituent un modèle particulièrement instructif pour étudier les effets du changement climatique sur l'écologie des espèces, car ce sont des ectothermes qui régulent leur température corporelle grâce à un ensemble de traits physiologiques, comportementaux et phénotypiques. Si certaines espèces ont été négativement affectées par les perturbations climatiques, d'autres ont prospéré, en grande partie conformément à la diversité de leurs traits d'histoire de vie. Ici, nous tirons parti d'un large éventail d'études sur les papillons et les papillons de nuit pour fournir un examen des nombreuses façons dont le changement climatique affecte les insectes, les animaux et les écosystèmes. En étudiant ces impacts liés au climat sur les processus écologiques des Lépidoptères, nous proposons des stratégies appropriées pour la conservation des espèces et la gestion des habitats de manière générale pour les animaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12746",
    doi = "10.1111/brv.12746",
    openalex = "W3164668752",
    references = "doi101111bij12838"
}

Le nectar floral est considéré comme la récompense florale la plus importante pour attirer les pollinisateurs. Il contient de grandes quantités de glucides, ainsi que des concentrations variables d'acides aminés, et représente ainsi une source alimentaire importante pour de nombreux pollinisateurs. Cependant, sa teneur et sa composition en nutriments peuvent varier considérablement au sein et entre les espèces végétales. Les facteurs qui entraînent cette variation de la qualité du nectar sont encore largement inconnus. Nous avons étudié les facteurs sous-jacents à la variation interspécifique de la composition en macronutriments du nectar floral chez 34 espèces végétales différentes de prairies. Plus précisément, nous avons testé les corrélations entre la parenté phylogénétique et la morphologie des plantes et la composition en glucides (C) et en acides aminés totaux (AA) ainsi que les ratios C:AA du nectar. Nous avons constaté que les compositions en glucides et en acides aminés (essentiels) ainsi que les ratios C:AA dans le nectar variaient de manière significative au sein et entre les espèces végétales. Elles ne présentaient aucun signal phylogénétique clair. De plus, la variation de la composition en glucides était liée à des caractéristiques structurelles spécifiques à la famille et à des combinaisons de traits morphologiques. Les plantes possédant des fleurs exposant le nectar, des fleurs en forme de bol ou paraboliques, comme souvent observées chez les Apiaceae et les Asteraceae, présentaient un nectar avec des proportions plus élevées d'hexoses, indiquant une pression de sélection visant à ralentir l'évaporation en augmentant l'osmolarité du nectar. Notre étude suggère que la variation de la composition en nutriments du nectar est, entre autres, affectée par des combinaisons de traits morphologiques spécifiques à la famille. Cependant, même au sein d'une même espèce, la variation de la qualité du nectar est élevée. Étant donné que la qualité du nectar peut fortement affecter les modèles de visite des pollinisateurs et donc le succès de la pollinisation, cette variation intra- et interspécifique nécessite davantage d'études pour élucider pleinement les causes sous-jacentes et les conséquences pour le comportement des pollinisateurs.

@article{doi101111plb13343,
    author = "Venjakob, Christine et Ruedenauer, Fabian A. et Klein, Alexandra‐Maria et Leonhardt, Sara D.",
    title = "Variation in nectar quality across 34 grassland plant species",
    year = "2021",
    journal = "Plant Biology",
    abstract = "Le nectar floral est considéré comme la récompense florale la plus importante pour attirer les pollinisateurs. Il contient de grandes quantités de glucides, ainsi que des concentrations variables d'acides aminés, et représente ainsi une source alimentaire importante pour de nombreux pollinisateurs. Cependant, sa teneur et sa composition en nutriments peuvent varier considérablement au sein et entre les espèces végétales. Les facteurs qui entraînent cette variation de la qualité du nectar sont encore largement inconnus. Nous avons étudié les facteurs sous-jacents à la variation interspécifique de la composition en macronutriments du nectar floral chez 34 espèces végétales différentes de prairies. Plus précisément, nous avons testé les corrélations entre la parenté phylogénétique et la morphologie des plantes et la composition en glucides (C) et en acides aminés totaux (AA) ainsi que les ratios C:AA du nectar. Nous avons constaté que les compositions en glucides et en acides aminés (essentiels) ainsi que les ratios C:AA dans le nectar variaient de manière significative au sein et entre les espèces végétales. Elles ne présentaient aucun signal phylogénétique clair. De plus, la variation de la composition en glucides était liée à des caractéristiques structurelles spécifiques à la famille et à des combinaisons de traits morphologiques. Les plantes possédant des fleurs exposant le nectar, des fleurs en forme de bol ou paraboliques, comme souvent observées chez les Apiaceae et les Asteraceae, présentaient un nectar avec des proportions plus élevées d'hexoses, indiquant une pression de sélection visant à ralentir l'évaporation en augmentant l'osmolarité du nectar. Notre étude suggère que la variation de la composition en nutriments du nectar est, entre autres, affectée par des combinaisons de traits morphologiques spécifiques à la famille. Cependant, même au sein d'une même espèce, la variation de la qualité du nectar est élevée. Étant donné que la qualité du nectar peut fortement affecter les modèles de visite des pollinisateurs et donc le succès de la pollinisation, cette variation intra- et interspécifique nécessite davantage d'études pour élucider pleinement les causes sous-jacentes et les conséquences pour le comportement des pollinisateurs.",
    url = "https://doi.org/10.1111/plb.13343",
    doi = "10.1111/plb.13343",
    openalex = "W3203231282",
    references = "doi101016jtree200508015"
}

lorsqu'elles sont comparées aux autres régimes alimentaires de plantes de la famille des Solanacées, ce qui pourrait être lié à l'adaptabilité de l'hôte à ce régime. Des quantifications moléculaires des genres bactériens qui ont été substantiellement affectés par les différents régimes alimentaires ont été mises en œuvre comme vérification supplémentaire des observations basées sur le microbiome. Des expériences complémentaires avec des bactéries isolées d'aphides nourris avec différentes plantes ont indiqué que des souches tolérantes à la nicotine se produisent chez les spécimens nourris avec des Solanacées, mais elles ne sont pas limitées à ceux-ci. Dans l'ensemble, notre approche mécanistique menée dans des conditions contrôlées a fourni de fortes indications que le microbiome de l'aphide montre des réponses à différents régimes alimentaires de plantes. Ces connaissances pourraient être utilisées à l'avenir pour développer des méthodes respectueuses de l'environnement pour le contrôle des ravageurs insectes en agriculture.

@article{doi103389fmicb2021667257,
    author = "He, Baoyu et Chen, Xiaoyulong et Yang, Hong et Cernava, Tomislav",
    title = "Structure du microbiome de l'aphide Myzus persicae (Sulzer) façonnée par différents régimes alimentaires de plantes de la famille des Solanacées",
    year = "2021",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "lorsqu'elles sont comparées aux autres régimes alimentaires de plantes de la famille des Solanacées, ce qui pourrait être lié à l'adaptabilité de l'hôte à ce régime. Des quantifications moléculaires des genres bactériens qui ont été substantiellement affectés par les différents régimes alimentaires ont été mises en œuvre comme vérification supplémentaire des observations basées sur le microbiome. Des expériences complémentaires avec des bactéries isolées d'aphides nourris avec différentes plantes ont indiqué que des souches tolérantes à la nicotine se produisent chez les spécimens nourris avec des Solanacées, mais elles ne sont pas limitées à ceux-ci. Dans l'ensemble, notre approche mécanistique menée dans des conditions contrôlées a fourni de fortes indications que le microbiome de l'aphide montre des réponses à différents régimes alimentaires de plantes. Ces connaissances pourraient être utilisées à l'avenir pour développer des méthodes respectueuses de l'environnement pour le contrôle des ravageurs insectes en agriculture.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.667257",
    doi = "10.3389/fmicb.2021.667257",
    openalex = "W3180318733",
    references = "doi101016bsaiip202003005"
}

. Nous constatons que les traits d'histoire de vie énergétiquement coûteux sont soit non associés, soit montrent une association positive générale avec la toxicité cyanogène biosynthétisée. Les individus plus toxiques se développent plus rapidement, ont une masse plus élevée à l'âge adulte et présentent une tendance à une durée de vie et une fécondité accrues. Ces résultats indiquent ainsi que le niveau de toxicité des papillons adultes peut dépendre de la condition individuelle, influencée par le fond génétique ou des conditions antérieures, avec les effets maternels comme un mécanisme candidat fort. De plus, la toxicité était plus élevée chez les individus plus âgés, ce qui est cohérent avec des études antérieures indiquant l'accumulation de toxines avec l'âge. Puisque le niveau de toxicité au moment du décès était indépendant de la durée de vie, les composés de glucosides cyanogènes ont pu être recyclés pour libérer des ressources pertinentes pour la longévité chez ces papillons à longue durée de vie. Comprendre les origines et le maintien de la variation dans les défenses est nécessaire pour construire une image plus complète des facteurs façonnant l'évolution des systèmes aposematiques et mimétiques.

@article{doi101002ece39041,
    author = "Mattila, Anniina L. K. et Jiggins, Chris D. et Saastamoinen, Marjo",
    title = "Dépendance des conditions dans les défenses chimiques biosynthétisées d'un papillon Heliconius aposematique et mimétique",
    year = "2022",
    journal = "Ecology and Evolution",
    abstract = ". Nous constatons que les traits d'histoire de vie énergétiquement coûteux sont soit non associés, soit montrent une association positive générale avec la toxicité cyanogène biosynthétisée. Les individus plus toxiques se développent plus rapidement, ont une masse plus élevée à l'âge adulte et présentent une tendance à une durée de vie et une fécondité accrues. Ces résultats indiquent ainsi que le niveau de toxicité des papillons adultes peut dépendre de la condition individuelle, influencée par le fond génétique ou des conditions antérieures, avec les effets maternels comme un mécanisme candidat fort. De plus, la toxicité était plus élevée chez les individus plus âgés, ce qui est cohérent avec des études antérieures indiquant l'accumulation de toxines avec l'âge. Puisque le niveau de toxicité au moment du décès était indépendant de la durée de vie, les composés de glucosides cyanogènes ont pu être recyclés pour libérer des ressources pertinentes pour la longévité chez ces papillons à longue durée de vie. Comprendre les origines et le maintien de la variation dans les défenses est nécessaire pour construire une image plus complète des facteurs façonnant l'évolution des systèmes aposematiques et mimétiques.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ece3.9041",
    doi = "10.1002/ece3.9041",
    openalex = "W4283364846",
    references = "doi107717peerj11523"
}

La fleur est une innovation étonnante apparue au cours de l'évolution des plantes, permettant aux plantes à fleurs - également appelées angiospermes - de dominer la vie sur terre en un temps géologique relativement court. Les fleurs se forment à partir de méristèmes secondaires par une différenciation coordonnée des organes floraux, tels que les sépales, les pétales, les étamines et les carpelles. La position, le nombre et la morphologie de ces organes floraux imposent un motif géométrique - ou type de symétrie - au sein de la fleur, qui est un trait étroitement lié à une reproduction réussie. Au cours de l'évolution, la symétrie florale est passée à plusieurs reprises du type ancestral poly-symétrique (symétrie radiale) au type mono-symétrique (symétrie bilatérale), y compris de nombreuses réversions, ces événements étant liés à la coévolution avec les pollinisateurs et les stratégies de reproduction. Dans cette revue, nous présentons la diversité de la symétrie florale, retraçons son évolution chez les angiospermes et mettons en évidence la base génétique conservée sous-tendant le contrôle de la symétrie dans les fleurs. Enfin, nous discutons de l'importance de s'appuyer sur le concept de symétrie florale en examinant les mécanismes orchestrant la symétrie au sein des organes floraux individuels et résumons la situation actuelle concernant le motif de symétrie de l'organe reproducteur femelle, le gynécée, la structure florale ultime présidant à la fécondation et à la production de graines.

@article{doi101042etls20210270,
    author = "Jiang, Yuxiang et Moubayidin, Laila",
    title = "Symétrie florale : la géométrie de la reproduction végétale",
    year = "2022",
    journal = "Emerging Topics in Life Sciences",
    abstract = "La fleur est une innovation étonnante apparue au cours de l'évolution des plantes, permettant aux plantes à fleurs - également appelées angiospermes - de dominer la vie sur terre en un temps géologique relativement court. Les fleurs se forment à partir de méristèmes secondaires par une différenciation coordonnée des organes floraux, tels que les sépales, les pétales, les étamines et les carpelles. La position, le nombre et la morphologie de ces organes floraux imposent un motif géométrique - ou type de symétrie - au sein de la fleur, qui est un trait étroitement lié à une reproduction réussie. Au cours de l'évolution, la symétrie florale est passée à plusieurs reprises du type ancestral poly-symétrique (symétrie radiale) au type mono-symétrique (symétrie bilatérale), y compris de nombreuses réversions, ces événements étant liés à la coévolution avec les pollinisateurs et les stratégies de reproduction. Dans cette revue, nous présentons la diversité de la symétrie florale, retraçons son évolution chez les angiospermes et mettons en évidence la base génétique conservée sous-tendant le contrôle de la symétrie dans les fleurs. Enfin, nous discutons de l'importance de s'appuyer sur le concept de symétrie florale en examinant les mécanismes orchestrant la symétrie au sein des organes floraux individuels et résumons la situation actuelle concernant le motif de symétrie de l'organe reproducteur femelle, le gynécée, la structure florale ultime présidant à la fécondation et à la production de graines.",
    url = "https://doi.org/10.1042/etls20210270",
    doi = "10.1042/etls20210270",
    openalex = "W4292649659",
    references = "doi101007s00359019013504"
}

Les composés de défense des plantes jouent un rôle clé dans l'évolution des associations insecte-plante en sélectionnant des adaptations comportementales, morphologiques et physiologiques chez les insectes. La séquestration, la capacité des insectes herbivores à accumuler des composés de défense des plantes pour obtenir un avantage en termes de fitness, représente un syndrome complexe d'adaptations qui s'est développé dans tous les lignages majeurs d'insectes herbivores et implique diverses classes de composés de défense des plantes. Dans cet article, nous passons en revue les progrès réalisés pour comprendre comment les insectes accumulent sélectivement des métabolites de défense des plantes et comment l'évolution de mécanismes de résistance spécifiques à ces composés de défense permet la séquestration. Ces considérations mécanistiques sont ensuite intégrées dans le concept de coévolution insecte-plante. Les analyses comparatives du génome et du transcriptome, combinées à des approches basées sur la chimie analytique centrées sur des cadres phylogénétiques, permettront de révéler les adaptations sous-jacentes au syndrome de séquestration, ce qui est essentiel pour comprendre l'influence de la séquestration sur la coévolution insecte-plante.

@article{doi101146annurevento062821062319,
    author = "Beran, Franziska et Petschenka, Georg",
    title = "Séquestration des composés de défense des plantes par les insectes : Des mécanismes à la coévolution insecte–plante",
    year = "2022",
    journal = "Annual Review of Entomology",
    abstract = "Les composés de défense des plantes jouent un rôle clé dans l'évolution des associations insecte-plante en sélectionnant des adaptations comportementales, morphologiques et physiologiques chez les insectes. La séquestration, la capacité des insectes herbivores à accumuler des composés de défense des plantes pour obtenir un avantage en termes de fitness, représente un syndrome complexe d'adaptations qui s'est développé dans tous les lignages majeurs d'insectes herbivores et implique diverses classes de composés de défense des plantes. Dans cet article, nous passons en revue les progrès réalisés pour comprendre comment les insectes accumulent sélectivement des métabolites de défense des plantes et comment l'évolution de mécanismes de résistance spécifiques à ces composés de défense permet la séquestration. Ces considérations mécanistiques sont ensuite intégrées dans le concept de coévolution insecte-plante. Les analyses comparatives du génome et du transcriptome, combinées à des approches basées sur la chimie analytique centrées sur des cadres phylogénétiques, permettront de révéler les adaptations sous-jacentes au syndrome de séquestration, ce qui est essentiel pour comprendre l'influence de la séquestration sur la coévolution insecte-plante.",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev-ento-062821-062319",
    doi = "10.1146/annurev-ento-062821-062319",
    openalex = "W4206495906",
    references = "doi101007bf00317222, doi101007s1088600692078, doi101038s4158601916108"
}

Les insectes herbivores rencontrent dans leur régime alimentaire divers métabolites spécialisés végétaux (MSV) qui possèdent des propriétés dissuasives, anti-nutritionnelles ou toxiques. Comprendre comment ils font face aux MSV est crucial pour comprendre leur biologie, leurs dynamiques de population et leur évolution. Cette revue résume les méthodes de pointe actuelles et émergentes qui peuvent être utilisées pour caractériser le devenir métabolique des MSV, de l'ingestion à l'excrétion ou à la séquestration. Elle met également l'accent sur un flux de travail qui permet non seulement d'étudier le métabolisme des MSV à différentes échelles, mais aussi d'aborder et de valider les mécanismes génétiques et biochimiques impliqués dans la résistance aux MSV chez les herbivores. Cette revue vise ainsi à faciliter la recherche sur les interactions plantes-herbivores médiées par les MSV.

@article{doi103389fphys20221001032,
    author = "Jeckel, Adriana M. et Beran, Franziska et Züst, Tobias et Younkin, Gordon C. et Petschenka, Georg et Pokharel, Prayan et Dreisbach, Domenic et Ganal‐Vonarburg, Stephanie C. et Robert, Christelle A. M.",
    title = "Métabolisation et séquestration des métabolites spécialisés végétaux chez les herbivores insectes : Approches actuelles et émergentes",
    year = "2022",
    journal = "Frontiers in Physiology",
    abstract = "Les insectes herbivores rencontrent dans leur régime alimentaire divers métabolites spécialisés végétaux (MSV) qui possèdent des propriétés dissuasives, anti-nutritionnelles ou toxiques. Comprendre comment ils font face aux MSV est crucial pour comprendre leur biologie, leurs dynamiques de population et leur évolution. Cette revue résume les méthodes de pointe actuelles et émergentes qui peuvent être utilisées pour caractériser le devenir métabolique des MSV, de l'ingestion à l'excrétion ou à la séquestration. Elle met également l'accent sur un flux de travail qui permet non seulement d'étudier le métabolisme des MSV à différentes échelles, mais aussi d'aborder et de valider les mécanismes génétiques et biochimiques impliqués dans la résistance aux MSV chez les herbivores. Cette revue vise ainsi à faciliter la recherche sur les interactions plantes-herbivores médiées par les MSV.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fphys.2022.1001032",
    doi = "10.3389/fphys.2022.1001032",
    openalex = "W4297314436",
    references = "doi101098rspb20220176"
}

Les plantes ont évolué plusieurs stratégies adaptatives par des changements physiologiques en réponse aux attaques d'herbivores. Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont synthétisés pour fournir des fonctions de défense et réguler les voies de signalisation de défense afin de protéger les plantes contre les herbivores. Les blessures causées par les herbivores déclenchent des réactions complexes qui aboutissent finalement à la synthèse et à l'accumulation de MSV. La biosynthèse de ces métabolites est régulée par l'interaction de molécules de signalisation comprenant des phytohormones. Les métabolites volatils végétaux sont libérés lors d'une attaque d'herbivore et sont capables d'induire directement ou de primer les voies de signalisation de défense hormonales. Les métabolites secondaires permettent aux plantes de détecter rapidement les attaques d'herbivores et de réagir de manière opportune dans un scénario rapidement changeant de ravageurs et d'environnement. Plusieurs études ont suggéré que le potentiel d'adaptation et/ou de résistance des herbivores insectes aux métabolites secondaires est limité. Ces métabolites causent une toxicité directe aux ravageurs insectes, stimulent les mécanismes d'antixénose chez les plantes contre les herbivores insectes et, en recrutant les ennemis naturels des herbivores, protègent indirectement les plantes. Les herbivores s'adaptent aux métabolites secondaires par la régulation ascendante/descendante des gènes sensoriels, et la séquestration ou la détoxification des métabolites toxiques. Les MSV modulent les interactions multi-trophiques impliquant les plantes hôtes, les herbivores, les ennemis naturels et les pollinisateurs. Bien que le rôle des métabolites secondaires dans l'interaction plante-pollinisateur ait été peu exploré, plusieurs rapports suggèrent que les plantes et les pollinisateurs bénéficient mutuellement. Les connaissances moléculaires sur les protéines régulatrices et les gènes impliqués dans la biosynthèse des métabolites secondaires ouvriront la voie à l'ingénierie métabolique des intermédiaires des voies biosynthétiques pour améliorer la tolérance des plantes aux herbivores. Cette revue met en lumière le rôle des MSV dans la modulation des interactions multi-trophiques, contribuant à la connaissance des interactions plante-herbivore pour permettre leur gestion d'une manière écologique et durable.

@article{doi103390ijms23052690,
    author = "Divekar, Pratap A. et Srinivasa, N et Divekar, Bhupendra Adinath et Kumar, Rajeev et Gowda, G. Basana et Ray, Aishwarya et Singh, Achuit K. et Rani, Vijaya et Singh, Vikas et Singh, A. K. et Kumar, Amit et Singh, Rudra Pratap et Meena, Radhe Shyam et Behera, Tusar Kanti",
    title = "Les métabolites secondaires végétaux comme outils de défense contre les herbivores pour une protection durable des cultures",
    year = "2022",
    journal = "International Journal of Molecular Sciences",
    abstract = "Les plantes ont évolué plusieurs stratégies adaptatives par des changements physiologiques en réponse aux attaques d'herbivores. Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont synthétisés pour fournir des fonctions de défense et réguler les voies de signalisation de défense afin de protéger les plantes contre les herbivores. Les blessures causées par les herbivores déclenchent des réactions complexes qui aboutissent finalement à la synthèse et à l'accumulation de MSV. La biosynthèse de ces métabolites est régulée par l'interaction de molécules de signalisation comprenant des phytohormones. Les métabolites volatils végétaux sont libérés lors d'une attaque d'herbivore et sont capables d'induire directement ou de primer les voies de signalisation de défense hormonales. Les métabolites secondaires permettent aux plantes de détecter rapidement les attaques d'herbivores et de réagir de manière opportune dans un scénario rapidement changeant de ravageurs et d'environnement. Plusieurs études ont suggéré que le potentiel d'adaptation et/ou de résistance des herbivores insectes aux métabolites secondaires est limité. Ces métabolites causent une toxicité directe aux ravageurs insectes, stimulent les mécanismes d'antixénose chez les plantes contre les herbivores insectes et, en recrutant les ennemis naturels des herbivores, protègent indirectement les plantes. Les herbivores s'adaptent aux métabolites secondaires par la régulation ascendante/descendante des gènes sensoriels, et la séquestration ou la détoxification des métabolites toxiques. Les MSV modulent les interactions multi-trophiques impliquant les plantes hôtes, les herbivores, les ennemis naturels et les pollinisateurs. Bien que le rôle des métabolites secondaires dans l'interaction plante-pollinisateur ait été peu exploré, plusieurs rapports suggèrent que les plantes et les pollinisateurs bénéficient mutuellement. Les connaissances moléculaires sur les protéines régulatrices et les gènes impliqués dans la biosynthèse des métabolites secondaires ouvriront la voie à l'ingénierie métabolique des intermédiaires des voies biosynthétiques pour améliorer la tolérance des plantes aux herbivores. Cette revue met en lumière le rôle des MSV dans la modulation des interactions multi-trophiques, contribuant à la connaissance des interactions plante-herbivore pour permettre leur gestion d'une manière écologique et durable.",
    url = "https://doi.org/10.3390/ijms23052690",
    doi = "10.3390/ijms23052690",
    openalex = "W4214510073",
    references = "doi101007s0004900900186, doi101038nplants2015206, doi103390molecules24213961"
}

Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont vitaux pour la santé humaine et constituent le cadre structurel de nombreux médicaments pharmaceutiques. En effet, plus de 25 % des médicaments existants appartiennent aux MSV. L'un des défis persistants pour la découverte de médicaments et les industries pharmaceutiques est l'accès aux produits naturels, y compris aux plantes médicinales. Ce goulot d'étranglement s'accentue pour les espèces menacées interdites pour la collecte d'échantillons importants, même si elles montrent des résultats biologiques. Bien que la culture des espèces végétales d'intérêt pharmaceutique puisse être une solution, il n'est pas toujours possible de cultiver l'organisme en dehors de son habitat naturel. Les plantes affectées par le stress abiotique présentent une source potentielle alternative pour la découverte de médicaments. Afin de surmonter les facteurs de stress environnementaux abiotiques, les plantes peuvent déclencher une réponse de défense en produisant une diversité de MSV pour éviter les dommages cellulaires et tissulaires. Les plantes synthétisent soit de nouveaux produits chimiques, soit augmentent la concentration (dans la plupart des cas) des produits chimiques existants, y compris les composés bioactifs principaux morphine, camptothécine, catharanthine, épicatechine-3-gallate (EGCG), quercétine, resvératrol et kaempférol. La plupart des MSV produits dans diverses conditions de stress abiotique sont des produits chimiques de défense des plantes et sont fonctionnellement anti-inflammatoires et antioxydants. Les principaux groupes de MSV sont les terpénoïdes, suivis par les alcaloïdes et les composés phénoliques. Nous avons recherché dans la littérature sur les plantes affectées par le stress abiotique (principalement étudiées dans des conditions de croissance simulées) et leurs MSV (y compris les activités pharmacologiques) à partir de PubMed, Scopus, MEDLINE Ovid, Google Scholar, des bases de données et des sites web de journaux. Nous avons utilisé les mots-clés de recherche : « plantes affectées par le stress », « métabolites secondaires végétaux », « stress abiotique », « influence climatique », « activités pharmacologiques », « composés bioactifs », « découverte de médicaments » et « plantes médicinales » et avons récupéré la littérature publiée entre 1973 et 2021. Cette revue fournit une vue d'ensemble de la variation de la production de phytochimiques bioactifs chez les plantes sous divers stress abiotiques et de leur potentiel dans la biodécouverte de médicaments thérapeutiques. Nous avons exclu les études sur les effets du stress biotique sur les MSV.

@article{doi103390molecules27010313,
    author = "Yeshi, Karma et Crayn, Darren M. et Ritmejerytė, Edita et Wangchuk, Phurpa",
    title = "Les métabolites secondaires végétaux produits en réponse aux stress abiotiques ont un potentiel d'application dans le développement de produits pharmaceutiques",
    year = "2022",
    journal = "Molecules",
    abstract = {Les métabolites secondaires végétaux (MSV) sont vitaux pour la santé humaine et constituent le cadre structurel de nombreux médicaments pharmaceutiques. En effet, plus de 25 % des médicaments existants appartiennent aux MSV. L'un des défis persistants pour la découverte de médicaments et les industries pharmaceutiques est l'accès aux produits naturels, y compris aux plantes médicinales. Ce goulot d'étranglement s'accentue pour les espèces menacées interdites pour la collecte d'échantillons importants, même si elles montrent des résultats biologiques. Bien que la culture des espèces végétales d'intérêt pharmaceutique puisse être une solution, il n'est pas toujours possible de cultiver l'organisme en dehors de son habitat naturel. Les plantes affectées par le stress abiotique présentent une source potentielle alternative pour la découverte de médicaments. Afin de surmonter les facteurs de stress environnementaux abiotiques, les plantes peuvent déclencher une réponse de défense en produisant une diversité de MSV pour éviter les dommages cellulaires et tissulaires. Les plantes synthétisent soit de nouveaux produits chimiques, soit augmentent la concentration (dans la plupart des cas) des produits chimiques existants, y compris les composés bioactifs principaux morphine, camptothécine, catharanthine, épicatechine-3-gallate (EGCG), quercétine, resvératrol et kaempférol. La plupart des MSV produits dans diverses conditions de stress abiotique sont des produits chimiques de défense des plantes et sont fonctionnellement anti-inflammatoires et antioxydants. Les principaux groupes de MSV sont les terpénoïdes, suivis par les alcaloïdes et les composés phénoliques. Nous avons recherché dans la littérature sur les plantes affectées par le stress abiotique (principalement étudiées dans des conditions de croissance simulées) et leurs MSV (y compris les activités pharmacologiques) à partir de PubMed, Scopus, MEDLINE Ovid, Google Scholar, des bases de données et des sites web de journaux. Nous avons utilisé les mots-clés de recherche : « plantes affectées par le stress », « métabolites secondaires végétaux », « stress abiotique », « influence climatique », « activités pharmacologiques », « composés bioactifs », « découverte de médicaments » et « plantes médicinales » et avons récupéré la littérature publiée entre 1973 et 2021. Cette revue fournit une vue d'ensemble de la variation de la production de phytochimiques bioactifs chez les plantes sous divers stress abiotiques et de leur potentiel dans la biodécouverte de médicaments thérapeutiques. Nous avons exclu les études sur les effets du stress biotique sur les MSV.},
    url = "https://doi.org/10.3390/molecules27010313",
    doi = "10.3390/molecules27010313",
    openalex = "W4206442306",
    references = "doi101038s4158601800056, doi101146annurevarplant050213040027"
}

Résumé Les relations évolutives entre l'écologie, la cognition et la neurobiologie restent obscures, malgré des contributions importantes provenant d'études fonctionnelles et d'analyses comparatives. Récemment, les papillons Heliconius et leurs alliés Heliconiini sont apparus comme un système prometteur pour investiguer l'évolution et l'écologie de la cognition. Chez Heliconius, les régions du cerveau impliquées dans l'apprentissage et la mémoire, appelées corps fongiformes, ont quadruplé en taille et contiennent jusqu'à 8 fois plus de neurones que chez les genres étroitement apparentés. Cette expansion, largement pilotée par une augmentation de la consécration au traitement des entrées visuelles, s'est produite relativement récemment (~12–18 Ma) et coïncide avec l'évolution d'un nouveau comportement de recherche de nourriture — la recherche de nourriture le long de traînées entre des ressources de pollen, qui fournissent une source d'acides aminés pour les adultes. Des expériences comportementales montrent que, par rapport à d'autres Heliconiini, Heliconius présentent une mémoire visuelle à long terme supérieure et un apprentissage non élémentaire, des comportements qui ont une pertinence putative pour l'apprentissage visuel lors de la recherche de nourriture le long de traînées, tout en ne présentant aucune différence dans l'apprentissage de la forme ou l'apprentissage par renversement. Ces différences cognitives sont également associées à des changements dans la réponse plastique du corps fongiforme à l'apprentissage et à l'expérience. Heliconius constituent ainsi un exemple clair d'un ensemble d'adaptations neuronales qui coïncide avec un nouveau comportement reposant sur des changements cognitifs distincts. Nous mettons en avant les Heliconiini comme une étude de cas bien positionnée et en développement en écologie cognitive et évolution, où il est possible de synthétiser des données neuroanatomiques comparatives, développementales et comportementales avec des ressources génomiques étendues. Cela fournirait un ensemble de données riche reliant gènes, cerveaux, comportements et écologie, et offrirait des aperçus clés sur les mécanismes et les pressions sélectives façonnant l'évolution de la variation cognitive interspécifique.

@article{doi101007s00265023033993,
    author = "Young, Fletcher J. et Montgomery, Stephen H.",
    title = "Les papillons Heliconiini comme étude de cas en écologie cognitive évolutive : innovation comportementale et expansion des corps fongiformes",
    year = "2023",
    journal = "Behavioral Ecology and Sociobiology",
    abstract = "Résumé Les relations évolutives entre l'écologie, la cognition et la neurobiologie restent obscures, malgré des contributions importantes provenant d'études fonctionnelles et d'analyses comparatives. Récemment, les papillons Heliconius et leurs alliés Heliconiini sont apparus comme un système prometteur pour investiguer l'évolution et l'écologie de la cognition. Chez Heliconius, les régions du cerveau impliquées dans l'apprentissage et la mémoire, appelées corps fongiformes, ont quadruplé en taille et contiennent jusqu'à 8 fois plus de neurones que chez les genres étroitement apparentés. Cette expansion, largement pilotée par une augmentation de la consécration au traitement des entrées visuelles, s'est produite relativement récemment (\textasciitilde 12–18 Ma) et coïncide avec l'évolution d'un nouveau comportement de recherche de nourriture — la recherche de nourriture le long de traînées entre des ressources de pollen, qui fournissent une source d'acides aminés pour les adultes. Des expériences comportementales montrent que, par rapport à d'autres Heliconiini, Heliconius présentent une mémoire visuelle à long terme supérieure et un apprentissage non élémentaire, des comportements qui ont une pertinence putative pour l'apprentissage visuel lors de la recherche de nourriture le long de traînées, tout en ne présentant aucune différence dans l'apprentissage de la forme ou l'apprentissage par renversement. Ces différences cognitives sont également associées à des changements dans la réponse plastique du corps fongiforme à l'apprentissage et à l'expérience. Heliconius constituent ainsi un exemple clair d'un ensemble d'adaptations neuronales qui coïncide avec un nouveau comportement reposant sur des changements cognitifs distincts. Nous mettons en avant les Heliconiini comme une étude de cas bien positionnée et en développement en écologie cognitive et évolution, où il est possible de synthétiser des données neuroanatomiques comparatives, développementales et comportementales avec des ressources génomiques étendues. Cela fournirait un ensemble de données riche reliant gènes, cerveaux, comportements et écologie, et offrirait des aperçus clés sur les mécanismes et les pressions sélectives façonnant l'évolution de la variation cognitive interspécifique.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00265-023-03399-3",
    doi = "10.1007/s00265-023-03399-3",
    openalex = "W4389068808",
    references = "doi101038s41467023414125"
}

Les papillons Heliconius, un genre diversifié de mimétiques de Müller, représentent un exemple classique de radiation adaptative incluant une gamme de traits dérivés liés à l'alimentation, à l'histoire de vie, à la physiologie et au système nerveux. Cependant, les lignées clés au sein du genre, et à travers la tribu Heliconiini plus large, manquent de ressources génomiques, limitant notre compréhension de la manière dont les processus adaptatifs et neutres ont façonné l'évolution du génome au cours de leur radiation. Ici, nous générons des assemblages génomiques hautement continus pour neuf Heliconiini, 29 génomes supplémentaires assemblés par référence, et améliorons 10 assemblages existants. Ensemble, nous fournissons un jeu de données de génomes annotés pour un total de 63 espèces, incluant 58 espèces au sein de la tribu Heliconiini. Nous utilisons cet ensemble de données étendu pour générer une phylogénie heliconiine robuste et datée, décrire les principaux motifs d'introgession, explorer l'évolution de l'architecture du génome, et la base génomique des innovations clés dans ce groupe énigmatique, y compris une évaluation de l'évolution des régions régulatrices supposées au niveau de la tige Heliconius. Notre travail illustre comment la résolution accrue fournie par un tel échantillonnage génomique dense améliore notre capacité à générer et tester des hypothèses gène-phénotype, et à caractériser précisément comment les génomes évoluent.

@article{doi101038s41467023414125,
    author = "Cicconardi, Francesco et Milanetti, Edoardo et de Castro, Érika C. Pinheiro et Mazo‐Vargas, Anyi et Belleghem, Steven M. Van et Ruggieri, Angelo Alberto et Rastas, Pasi et Hanly, Joseph J. et Evans, Elizabeth et Jiggins, Chris D. et McMillan, W. Owen et Papa, Riccardo et Marino, Daniele Di et Martin, Arnaud et Montgomery, Stephen H.",
    title = "Dynamique évolutive de la taille et du contenu du génome au cours de la radiation adaptative des papillons Heliconiini",
    year = "2023",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les papillons Heliconius, un genre diversifié de mimétiques de Müller, représentent un exemple classique de radiation adaptative incluant une gamme de traits dérivés liés à l'alimentation, à l'histoire de vie, à la physiologie et au système nerveux. Cependant, les lignées clés au sein du genre, et à travers la tribu Heliconiini plus large, manquent de ressources génomiques, limitant notre compréhension de la manière dont les processus adaptatifs et neutres ont façonné l'évolution du génome au cours de leur radiation. Ici, nous générons des assemblages génomiques hautement continus pour neuf Heliconiini, 29 génomes supplémentaires assemblés par référence, et améliorons 10 assemblages existants. Ensemble, nous fournissons un jeu de données de génomes annotés pour un total de 63 espèces, incluant 58 espèces au sein de la tribu Heliconiini. Nous utilisons cet ensemble de données étendu pour générer une phylogénie heliconiine robuste et datée, décrire les principaux motifs d'introgession, explorer l'évolution de l'architecture du génome, et la base génomique des innovations clés dans ce groupe énigmatique, y compris une évaluation de l'évolution des régions régulatrices supposées au niveau de la tige Heliconius. Notre travail illustre comment la résolution accrue fournie par un tel échantillonnage génomique dense améliore notre capacité à générer et tester des hypothèses gène-phénotype, et à caractériser précisément comment les génomes évoluent.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-023-41412-5",
    doi = "10.1038/s41467-023-41412-5",
    openalex = "W4386692244",
    references = "doi101038nbt1621, doi101089cmb20120021, doi101093bioinformaticsbtm404, doi101093bioinformaticsbtp352, doi101093bioinformaticsbts635, doi101093bioinformaticsbtu170, doi101093bioinformaticsbty191, doi101093molbevmsaa015, doi101098rsbl20200863, doi101186gb2009103r25, doi101371journalpone0009490"
}

en modifiant la microbiote intestinale des larves et son soutien nutritionnel à l'hôte. En effet, des expériences visant à restaurer la communauté microbienne fonctionnelle dans l'intestin permettent une récupération complète. Nos résultats mettent en lumière un nouveau rôle joué par un microorganisme du sol dans la modulation des interactions plante-insecte, préparant le terrain pour une analyse plus complète de l'impact que les agents de biocontrôle peuvent avoir sur la durabilité écologique des systèmes agricoles.

@article{doi101073pnas2216922120,
    author = "Lelio, Ilaria Di et Forni, Giobbe et Magoga, Giulia et Brunetti, Matteo et Bruno, Daniele et Becchimanzi, Andrea et Luca, Maria G. De et Sinno, Martina et Barra, Eleonora et Bonelli, M. et Frusciante, Sarah et Diretto, Gianfranco et Digilio, M. Cristina et Woo, Sheridan L. et Tettamanti, Gianluca et Rao, Rosa et Lorito, Matteo et Casartelli, Morena et Montagna, Matteo et Pennacchio, Francesco",
    title = "Un champignon du sol confère à la plante une résistance contre un insecte phytophage en perturbant le rôle symbiotique de sa microbiote intestinale",
    year = "2023",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "en modifiant la microbiote intestinale des larves et son soutien nutritionnel à l'hôte. En effet, des expériences visant à restaurer la communauté microbienne fonctionnelle dans l'intestin permettent une récupération complète. Nos résultats mettent en lumière un nouveau rôle joué par un microorganisme du sol dans la modulation des interactions plante-insecte, préparant le terrain pour une analyse plus complète de l'impact que les agents de biocontrôle peuvent avoir sur la durabilité écologique des systèmes agricoles.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.2216922120",
    doi = "10.1073/pnas.2216922120",
    openalex = "W4322421547"
}

Comprendre le taux et l'ampleur à laquelle les populations peuvent s'adapter à des environnements nouveaux à leurs marges écologiques est fondamental pour prédire la persistance des communautés biologiques lors des changements globaux en cours et rapides. La récente expansion de l'aire de répartition en réponse au changement climatique chez le papillon du Royaume-Uni Aricia agestis est associée à l'évolution d'interactions nouvelles avec une plante alimentaire larvaire, et à la perte de sa capacité à utiliser une espèce hôte ancestrale. En utilisant une analyse ddRAD de 61 210 SNP variables provenant de 261 femelles issues de l'ensemble de l'aire de répartition de cette espèce au Royaume-Uni, nous identifions des régions génomiques sur plusieurs chromosomes associées aux réponses évolutives, ainsi que leur association avec l'histoire démographique et la variation écologique. Le flux génique semble répandu sur l'ensemble de l'aire de répartition, malgré la nature apparemment fragmentée des habitats utilisés par cette espèce. Les motifs de variation des haplotypes entre les régions génomiques sélectionnées et neutres suggèrent que l'évolution associée à l'adaptation climatique est polygénique, résultant de la propagation indépendante d'allèles sur l'aire de répartition établie de cette espèce, plutôt que de la colonisation de génotypes pré-adaptés provenant de populations côtières. Ces données suggèrent que les réponses rapides au changement climatique ne dépendent pas de la disponibilité de génotypes pré-adaptés. Au contraire, l'évolution de nouvelles formes d'interactions biotiques chez A. agestis s'est produite lors de l'expansion de l'aire de répartition, par l'assemblage de génotypes nouveaux à partir d'allèles provenant de plusieurs localités.

@article{doi101111mec17138,
    author = "de Jong, M. et van Rensburg, Alexandra Jansen et Whiteford, Samuel et Yung, Carl J. et Beaumont, Mark et Jiggins, Chris D. et Bridle, Jon R.",
    title = "Évolution rapide d'interactions biotiques nouvelles chez le papillon Brown Argus du Royaume-Uni utilisant la variation génomique sur l'ensemble de son aire géographique",
    year = "2023",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Comprendre le taux et l'ampleur à laquelle les populations peuvent s'adapter à des environnements nouveaux à leurs marges écologiques est fondamental pour prédire la persistance des communautés biologiques lors des changements globaux en cours et rapides. La récente expansion de l'aire de répartition en réponse au changement climatique chez le papillon du Royaume-Uni Aricia agestis est associée à l'évolution d'interactions nouvelles avec une plante alimentaire larvaire, et à la perte de sa capacité à utiliser une espèce hôte ancestrale. En utilisant une analyse ddRAD de 61 210 SNP variables provenant de 261 femelles issues de l'ensemble de l'aire de répartition de cette espèce au Royaume-Uni, nous identifions des régions génomiques sur plusieurs chromosomes associées aux réponses évolutives, ainsi que leur association avec l'histoire démographique et la variation écologique. Le flux génique semble répandu sur l'ensemble de l'aire de répartition, malgré la nature apparemment fragmentée des habitats utilisés par cette espèce. Les motifs de variation des haplotypes entre les régions génomiques sélectionnées et neutres suggèrent que l'évolution associée à l'adaptation climatique est polygénique, résultant de la propagation indépendante d'allèles sur l'aire de répartition établie de cette espèce, plutôt que de la colonisation de génotypes pré-adaptés provenant de populations côtières. Ces données suggèrent que les réponses rapides au changement climatique ne dépendent pas de la disponibilité de génotypes pré-adaptés. Au contraire, l'évolution de nouvelles formes d'interactions biotiques chez A. agestis s'est produite lors de l'expansion de l'aire de répartition, par l'assemblage de génotypes nouveaux à partir d'allèles provenant de plusieurs localités.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.17138",
    doi = "10.1111/mec.17138",
    openalex = "W4387392962",
    references = "doi101111bij12838"
}

Plusieurs insectes herbivores consomment certains métabolites végétaux à des fins autres que la nutrition, telles que la défense. Les adultes de la guêpe à scie du navet, Athalia rosae, absorbent des terpénoïdes spécifiques, appelés clérodoïdes, provenant d'Ajuga reptans. Ces métabolites sont légèrement modifiés par les guêpes à scie et influencent leur comportement d'accouplement et leur défense contre les prédateurs. Nous avons caractérisé ces métabolites et étudié leur localisation chez l'insecte ainsi que la spécificité de l'absorption et de la modification des métabolites. Par conséquent, nous avons réalisé des essais d'alimentation avec des adultes et des larves d'A. rosae, ainsi que des larves de Spodoptera exigua, suivis d'analyses chimiques. Deux métabolites dérivés de clérodoïdes principaux ont été détectés dans l'abdomen et le thorax, mais également à la surface des adultes. De petites quantités ont également été trouvées chez les larves de la guêpe à scie, alors qu'elles n'étaient pas détectables chez S. exigua. Nos résultats apportent de nouvelles perspectives sur les particularités de la pharmacophagie et du métabolisme spécialisé chez A. rosae.

@article{doi101371journalpone0291180,
    author = "Brueggemann, Leon et Tewes, Lisa Johanna et Müller, Caroline",
    title = "Caractérisation et localisation des métabolites végétaux impliqués dans la pharmacophagie chez la guêpe à scie du navet",
    year = "2023",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Plusieurs insectes herbivores consomment certains métabolites végétaux à des fins autres que la nutrition, telles que la défense. Les adultes de la guêpe à scie du navet, Athalia rosae, absorbent des terpénoïdes spécifiques, appelés clérodoïdes, provenant d'Ajuga reptans. Ces métabolites sont légèrement modifiés par les guêpes à scie et influencent leur comportement d'accouplement et leur défense contre les prédateurs. Nous avons caractérisé ces métabolites et étudié leur localisation chez l'insecte ainsi que la spécificité de l'absorption et de la modification des métabolites. Par conséquent, nous avons réalisé des essais d'alimentation avec des adultes et des larves d'A. rosae, ainsi que des larves de Spodoptera exigua, suivis d'analyses chimiques. Deux métabolites dérivés de clérodoïdes principaux ont été détectés dans l'abdomen et le thorax, mais également à la surface des adultes. De petites quantités ont également été trouvées chez les larves de la guêpe à scie, alors qu'elles n'étaient pas détectables chez S. exigua. Nos résultats apportent de nouvelles perspectives sur les particularités de la pharmacophagie et du métabolisme spécialisé chez A. rosae.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0291180",
    doi = "10.1371/journal.pone.0291180",
    openalex = "W4387362874",
    references = "doi101098rspb20220176"
}

Le flux génique entre espèces, bien que généralement délétère, est un processus évolutif important qui peut faciliter l'adaptation et conduire à la diversification des espèces. Il rend également difficile l'estimation des relations entre espèces. Ici, nous utilisons l'approche de coalescence multispecies (MSC) à pleine vraisemblance pour estimer la phylogénie des espèces et les principaux événements d'introgression chez les papillons Heliconius à partir de données de séquences génomiques complètes. Nous obtenons une estimation robuste de l'ordre de ramification des espèces parmi les grands clades du genre, y compris le groupe « melpomene-silvaniforme », qui montre un flux génique historique et continu étendu. Nous obtenons des estimations au niveau des chromosomes des paramètres clés de la phylogénie des espèces, y compris les temps de divergence des espèces, les tailles de population actuelles et ancestrales, ainsi que la direction, le moment et l'intensité du flux génique. Notre analyse conduit à une phylogénie avec des événements d'introgression qui diffèrent de ceux obtenus dans des études précédentes. Nous constatons que Heliconius aoede représente probablement la lignée la plus ancienne du genre et que les espèces « silvaniformes » sont paraphylétiques au sein du groupe melpomene-silvaniforme. Notre phylogénie fournit de nouvelles histoires parcimonieuses pour l'origine des traits clés chez Heliconius, y compris l'alimentation par pollen et une inversion impliquée dans le mimétisme des motifs d'ailes. Nos résultats démontrent la puissance et la faisabilité de l'approche MSC à pleine vraisemblance pour estimer la phylogénie des espèces et les paramètres de population clés malgré un flux génique étendu. Les méthodes utilisées ici devraient être utiles pour l'analyse d'autres groupes d'espèces difficiles avec des taux élevés d'introgression.

@article{doi107554elife906563,
    author = "Thawornwattana, Yuttapong et Seixas, Fernando et Yang, Ziheng et Mallet, James",
    title = "Major patterns in the introgression history of Heliconius butterflies",
    year = "2023",
    journal = "eLife",
    abstract = "Le flux génique entre espèces, bien que généralement délétère, est un processus évolutif important qui peut faciliter l'adaptation et conduire à la diversification des espèces. Il rend également difficile l'estimation des relations entre espèces. Ici, nous utilisons l'approche de coalescence multispecies (MSC) à pleine vraisemblance pour estimer la phylogénie des espèces et les principaux événements d'introgression chez les papillons Heliconius à partir de données de séquences génomiques complètes. Nous obtenons une estimation robuste de l'ordre de ramification des espèces parmi les grands clades du genre, y compris le groupe « melpomene-silvaniforme », qui montre un flux génique historique et continu étendu. Nous obtenons des estimations au niveau des chromosomes des paramètres clés de la phylogénie des espèces, y compris les temps de divergence des espèces, les tailles de population actuelles et ancestrales, ainsi que la direction, le moment et l'intensité du flux génique. Notre analyse conduit à une phylogénie avec des événements d'introgression qui diffèrent de ceux obtenus dans des études précédentes. Nous constatons que Heliconius aoede représente probablement la lignée la plus ancienne du genre et que les espèces « silvaniformes » sont paraphylétiques au sein du groupe melpomene-silvaniforme. Notre phylogénie fournit de nouvelles histoires parcimonieuses pour l'origine des traits clés chez Heliconius, y compris l'alimentation par pollen et une inversion impliquée dans le mimétisme des motifs d'ailes. Nos résultats démontrent la puissance et la faisabilité de l'approche MSC à pleine vraisemblance pour estimer la phylogénie des espèces et les paramètres de population clés malgré un flux génique étendu. Les méthodes utilisées ici devraient être utiles pour l'analyse d'autres groupes d'espèces difficiles avec des taux élevés d'introgression.",
    url = "https://doi.org/10.7554/elife.90656.3",
    doi = "10.7554/elife.90656.3",
    openalex = "W4389916376",
    references = "doi101038s41467023414125"
}

Les herbivores insectes, tels que les larves lépidoptères, ont souvent des relations évolutives étroites avec leurs plantes hôtes, avec lesquelles ils peuvent être enlisés dans une course aux armements évolutive. Le comportement de regroupement larvaire peut être une adaptation comportementale qui améliore l'alimentation sur la plante hôte, mais l'agrégation comporte également des coûts, tels qu'une concurrence plus élevée et un accès limité aux ressources. Ici, nous utilisons la tribu de papillons Heliconiini pour explorer l'impact des traits des plantes hôtes sur l'évolution de la grégarité larvaire. Les Heliconiini utilisent presque exclusivement des espèces de la famille des Passifloraceae comme plantes hôtes larvaires. Les Passifloraceae présentent une diversité incroyable dans la forme des feuilles et une gamme de défenses anti-herbivores, suggérant qu'elles répondent à et influencent l'évolution des larves Heliconiini. En analysant le comportement social larvaire comme un trait binaire (solitaire ou grégaire) et catégoriel (augmentation de la taille du groupe larvaire), nous réexaminons les origines multiples de la grégarité larvaire chez les Heliconiini. Nous investiguons si l'habitat de la plante hôte, les défenses des feuilles et la taille des feuilles sont des moteurs importants ou des contraintes sur la grégarité larvaire. Alors que nos données ne révèlent pas de liens entre la grégarité larvaire et les traits des plantes hôtes inclus dans cette étude, nous trouvons une interaction entre la spécialisation sur la plante hôte et le comportement larvaire, révélant que les larves grégaires sont plus susceptibles de se nourrir d'une gamme plus étroite d'espèces de plantes hôtes que les larves solitaires. Nous trouvons également des preuves que cette spécialisation accrue précède généralement la transition évolutive vers le comportement grégaire. La spécialisation comparative plus grande des larves grégaires suggère qu'il existe des caractéristiques morphologiques et/ou écologiques spécifiques de leurs plantes hôtes qui favorisent ce comportement.

@article{doi101002ece311002,
    author = "McLellan, Callum F. and Montgomery, Stephen H.",
    title = "Évolution de la grégarité larvaire associée à la spécialisation sur la plante hôte, mais pas à la morphologie de la plante hôte, chez les papillons Heliconiini",
    year = "2024",
    journal = "Ecology and Evolution",
    abstract = "Les herbivores insectes, tels que les larves lépidoptères, ont souvent des relations évolutives étroites avec leurs plantes hôtes, avec lesquelles ils peuvent être enlisés dans une course aux armements évolutive. Le comportement de regroupement larvaire peut être une adaptation comportementale qui améliore l'alimentation sur la plante hôte, mais l'agrégation comporte également des coûts, tels qu'une concurrence plus élevée et un accès limité aux ressources. Ici, nous utilisons la tribu de papillons Heliconiini pour explorer l'impact des traits des plantes hôtes sur l'évolution de la grégarité larvaire. Les Heliconiini utilisent presque exclusivement des espèces de la famille des Passifloraceae comme plantes hôtes larvaires. Les Passifloraceae présentent une diversité incroyable dans la forme des feuilles et une gamme de défenses anti-herbivores, suggérant qu'elles répondent à et influencent l'évolution des larves Heliconiini. En analysant le comportement social larvaire comme un trait binaire (solitaire ou grégaire) et catégoriel (augmentation de la taille du groupe larvaire), nous réexaminons les origines multiples de la grégarité larvaire chez les Heliconiini. Nous investiguons si l'habitat de la plante hôte, les défenses des feuilles et la taille des feuilles sont des moteurs importants ou des contraintes sur la grégarité larvaire. Alors que nos données ne révèlent pas de liens entre la grégarité larvaire et les traits des plantes hôtes inclus dans cette étude, nous trouvons une interaction entre la spécialisation sur la plante hôte et le comportement larvaire, révélant que les larves grégaires sont plus susceptibles de se nourrir d'une gamme plus étroite d'espèces de plantes hôtes que les larves solitaires. Nous trouvons également des preuves que cette spécialisation accrue précède généralement la transition évolutive vers le comportement grégaire. La spécialisation comparative plus grande des larves grégaires suggère qu'il existe des caractéristiques morphologiques et/ou écologiques spécifiques de leurs plantes hôtes qui favorisent ce comportement.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ece3.11002",
    doi = "10.1002/ece3.11002",
    openalex = "W4391691251",
    references = "doi101002ece311002, doi101016s1369526602002649, doi10103844766, doi101093bioinformaticsbtu181, doi101093bioinformaticsbty633, doi101098rsbl20200863, doi101111j13652435201001789x, doi101111j14610248200901433x, doi101111j155856461975tb00861x, doi101146annureven26010181002235, doi1018637jssv033i02, doi103390ijms140510242"
}

Comment les circuits neuronaux s'adaptent-ils aux changements qui produisent une variation cognitive ? Nous explorons cette question en analysant les dynamiques évolutives d'un circuit d'apprentissage et de mémoire chez les insectes centré dans le corps fongique. Les corps fongiques sont composés d'une logique de câblage conservée, principalement constituée de cellules de Kenyon, de neurones dopaminergiques et de neurones de sortie du corps fongique. Malgré cette composition conservée, il existe une grande diversité dans la taille et la forme des corps fongiques chez les insectes. Cependant, les données empiriques sur la manière dont l'évolution modifie la fonction et l'architecture de ce circuit sont largement manquantes. Pour y remédier, nous exploitons la récente radiation d'une tribu de papillons néotropicaux, les Heliconiini (Nymphalidae), qui présentent une variation extensive de la taille du corps fongique sur des échelles de temps phylogénétiques relativement courtes, liée à des changements spécifiques dans l'écologie de la recherche de nourriture, l'histoire de vie et la cognition. Pour comprendre comment une telle augmentation extensive de la taille est accommodée par des changements dans l'architecture du circuit des lobes, nous avons combiné des immunomarquages de marqueurs structuraux, de neurotransmetteurs et des injections neuronales pour générer de nouvelles anatomies quantitatives du lobe du corps fongique des Nymphalid. Nos analyses comparatives chez les Heliconiini démontrent que certaines sous-populations de cellules de Kenyon se sont étendues à des taux plus élevés que d'autres chez Heliconius et identifient une augmentation supplémentaire de neurones de rétroaction GABA-ergiques, qui sont essentiels pour l'apprentissage non élémentaire et le codage épars. Ensemble, nos résultats démontrent une évolution en mosaïque de systèmes neuronaux et de types cellulaires fonctionnellement liés et identifient que la malléabilité évolutive dans un circuit parallèle architecturalement conservé guide l'adaptation des capacités cognitives.

@article{doi101016jcub202409069,
    author = "Farnworth, Max S. et Loupasaki, Theodora et Couto, Antoine et Montgomery, Stephen H.",
    title = "Évolution en mosaïque d'un circuit d'apprentissage et de mémoire chez les papillons Heliconiini",
    year = "2024",
    journal = "Current Biology",
    abstract = "Comment les circuits neuronaux s'adaptent-ils aux changements qui produisent une variation cognitive ? Nous explorons cette question en analysant les dynamiques évolutives d'un circuit d'apprentissage et de mémoire chez les insectes centré dans le corps fongique. Les corps fongiques sont composés d'une logique de câblage conservée, principalement constituée de cellules de Kenyon, de neurones dopaminergiques et de neurones de sortie du corps fongique. Malgré cette composition conservée, il existe une grande diversité dans la taille et la forme des corps fongiques chez les insectes. Cependant, les données empiriques sur la manière dont l'évolution modifie la fonction et l'architecture de ce circuit sont largement manquantes. Pour y remédier, nous exploitons la récente radiation d'une tribu de papillons néotropicaux, les Heliconiini (Nymphalidae), qui présentent une variation extensive de la taille du corps fongique sur des échelles de temps phylogénétiques relativement courtes, liée à des changements spécifiques dans l'écologie de la recherche de nourriture, l'histoire de vie et la cognition. Pour comprendre comment une telle augmentation extensive de la taille est accommodée par des changements dans l'architecture du circuit des lobes, nous avons combiné des immunomarquages de marqueurs structuraux, de neurotransmetteurs et des injections neuronales pour générer de nouvelles anatomies quantitatives du lobe du corps fongique des Nymphalid. Nos analyses comparatives chez les Heliconiini démontrent que certaines sous-populations de cellules de Kenyon se sont étendues à des taux plus élevés que d'autres chez Heliconius et identifient une augmentation supplémentaire de neurones de rétroaction GABA-ergiques, qui sont essentiels pour l'apprentissage non élémentaire et le codage épars. Ensemble, nos résultats démontrent une évolution en mosaïque de systèmes neuronaux et de types cellulaires fonctionnellement liés et identifient que la malléabilité évolutive dans un circuit parallèle architecturalement conservé guide l'adaptation des capacités cognitives.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.09.069",
    doi = "10.1016/j.cub.2024.09.069",
    openalex = "W4403538267",
    references = "doi101038s41467023414125"
}

Le stress par l'imidaclopride (IMI) est positivement corrélé au potentiel des coumarines à atténuer le stress abiotique. Cependant, peu est connu des voies et mécanismes par lesquels les coumarines réduisent le résidu d'IMI en régulant le métabolisme secondaire des plantes et les interactions plante-microbes. Cette étude a examiné l'impact des coumarines sur l'absorption, la translocation et le métabolisme de l'IMI chez les plantes de poivron en modulant les niveaux de molécules de signalisation et les communautés microbiennes dans la rhizosphère et la phyllosphère. L'analyse de la dynamique des résidus de pesticides sur 2 h─28 jours a révélé que les coumarines réduisaient considérablement la concentration d'IMI dans les fruits de poivron. Les coumarines ont régulé à la hausse les gènes de la voie des phénylpropanoïdes, ce qui a augmenté les niveaux de flavonoïdes, d'acides phénoliques, de phytohormones et de capsaïcinoïdes. Importamment, les résultats sur la diversité microbienne de la phyllosphère et de la rhizosphère ont montré que les coumarines amélioraient l'abondance des micro-organismes bénéfiques et étaient positivement corrélées à la sécrétion de métabolites secondaires. Par conséquent, les coumarines ont exploité l'interaction entre les voies de synthèse des phénylpropanoïdes et des coumarines ainsi que les micro-organismes bénéfiques pour améliorer la qualité nutritionnelle et la dégradation de l'IMI.

@article{doi101021acsjafc4c10038,
    author = "Li, Mengmeng et Pan, Canping et Zhang, Zhijia et Wang, Jialing et Wang, Shuai et Li, Wenzhuo et Zhou, Tianbing et Wang, Xiaoyi et Liu, Ziyi et Hu, Zhan et Sun, Ranfeng et Li, Dong",
    title = "Plant Coumarin Metabolism–Microbe Interactions: An Effective Strategy for Reducing Imidacloprid Residues and Enhancing the Nutritional Quality of Pepper",
    year = "2024",
    journal = "Journal of Agricultural and Food Chemistry",
    abstract = "Le stress par l'imidaclopride (IMI) est positivement corrélé au potentiel des coumarines à atténuer le stress abiotique. Cependant, peu est connu des voies et mécanismes par lesquels les coumarines réduisent le résidu d'IMI en régulant le métabolisme secondaire des plantes et les interactions plante-microbes. Cette étude a examiné l'impact des coumarines sur l'absorption, la translocation et le métabolisme de l'IMI chez les plantes de poivron en modulant les niveaux de molécules de signalisation et les communautés microbiennes dans la rhizosphère et la phyllosphère. L'analyse de la dynamique des résidus de pesticides sur 2 h─28 jours a révélé que les coumarines réduisaient considérablement la concentration d'IMI dans les fruits de poivron. Les coumarines ont régulé à la hausse les gènes de la voie des phénylpropanoïdes, ce qui a augmenté les niveaux de flavonoïdes, d'acides phénoliques, de phytohormones et de capsaïcinoïdes. Importamment, les résultats sur la diversité microbienne de la phyllosphère et de la rhizosphère ont montré que les coumarines amélioraient l'abondance des micro-organismes bénéfiques et étaient positivement corrélées à la sécrétion de métabolites secondaires. Par conséquent, les coumarines ont exploité l'interaction entre les voies de synthèse des phénylpropanoïdes et des coumarines ainsi que les micro-organismes bénéfiques pour améliorer la qualité nutritionnelle et la dégradation de l'IMI.",
    url = "https://doi.org/10.1021/acs.jafc.4c10038",
    doi = "10.1021/acs.jafc.4c10038",
    openalex = "W4405867784",
    references = "doi101016jtplants202405010"
}

Les radiations adaptatives se caractérisent par une diversification écologique rapide et des événements de spéciation, conduisant à des frontières floues entre les espèces écologiquement différenciées. Les radiations adaptatives sont donc des systèmes clés pour comprendre comment les espèces se forment et sont maintenues, y compris le rôle des mutations de novo par rapport à la variation préexistante dans l'adaptation écologique et les conséquences à l'échelle du génome des événements d'hybridation. Par exemple, l'introgression adaptative, où des allèles bénéfiques sont transférés entre lignées par hybridation, peut alimenter la diversification dans les radiations adaptatives et faciliter l'adaptation à de nouveaux environnements. Dans cette étude, nous avons utilisé des données de re-séquençage du génome entier pour investiguer l'origine évolutive des fleurs pollinisées par les colibris et caractériser les motifs à l'échelle du génome de discordance phylogénétique et d'introgression dans le sous-genre Penstemon Dasanthera, une petite et diverse radiation adaptative de plantes. Nous avons trouvé que les fleurs adaptées aux colibris de couleur magenta ont apparemment évolué deux fois à partir de fleurs ancestrales pollinisées par les abeilles de couleur bleu-violet au sein de cette radiation. Ces changements de couleur florale sont accompagnés d'une variété de mutations inactivatrices d'une enzyme clé de la voie des anthocyanes, suggérant que des mutations indépendantes de perte de fonction de novo sous-tendent l'évolution parallèle de ce trait. Bien que les motifs d'introgression et de discordance phylogénétique aient été hétérogènes à travers le génome, un fort effet de la densité de gènes suggère que, en général, la sélection naturelle s'oppose à l'introgression et maintient la différenciation génétique dans les régions génomiques riches en gènes. Nos résultats soulignent l'importance à la fois de la mutation de novo et de l'introgression comme sources de changement évolutif et indiquent un rôle de la mutation de novo dans la conduite de l'évolution parallèle dans les radiations adaptatives.

@article{doi101093molbevmsae007,
    author = "Stone, Benjamin W. et Wessinger, Carolyn A.",
    title = "Diversification écologique dans une radiation adaptative de plantes : le rôle de la mutation de novo et de l'introgression",
    year = "2024",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Les radiations adaptatives se caractérisent par une diversification écologique rapide et des événements de spéciation, conduisant à des frontières floues entre les espèces écologiquement différenciées. Les radiations adaptatives sont donc des systèmes clés pour comprendre comment les espèces se forment et sont maintenues, y compris le rôle des mutations de novo par rapport à la variation préexistante dans l'adaptation écologique et les conséquences à l'échelle du génome des événements d'hybridation. Par exemple, l'introgression adaptative, où des allèles bénéfiques sont transférés entre lignées par hybridation, peut alimenter la diversification dans les radiations adaptatives et faciliter l'adaptation à de nouveaux environnements. Dans cette étude, nous avons utilisé des données de re-séquençage du génome entier pour investiguer l'origine évolutive des fleurs pollinisées par les colibris et caractériser les motifs à l'échelle du génome de discordance phylogénétique et d'introgression dans le sous-genre Penstemon Dasanthera, une petite et diverse radiation adaptative de plantes. Nous avons trouvé que les fleurs adaptées aux colibris de couleur magenta ont apparemment évolué deux fois à partir de fleurs ancestrales pollinisées par les abeilles de couleur bleu-violet au sein de cette radiation. Ces changements de couleur florale sont accompagnés d'une variété de mutations inactivatrices d'une enzyme clé de la voie des anthocyanes, suggérant que des mutations indépendantes de perte de fonction de novo sous-tendent l'évolution parallèle de ce trait. Bien que les motifs d'introgression et de discordance phylogénétique aient été hétérogènes à travers le génome, un fort effet de la densité de gènes suggère que, en général, la sélection naturelle s'oppose à l'introgression et maintient la différenciation génétique dans les régions génomiques riches en gènes. Nos résultats soulignent l'importance à la fois de la mutation de novo et de l'introgression comme sources de changement évolutif et indiquent un rôle de la mutation de novo dans la conduite de l'évolution parallèle dans les radiations adaptatives.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msae007",
    doi = "10.1093/molbev/msae007",
    openalex = "W4390937010",
    references = "doi101038s41467023414125"
}

Résumé Plusieurs papillons polyphages sont de graves ravageurs des cultures. Les modèles et mécanismes de la largeur du régime alimentaire chez les insectes polyphages offrent un système excellent pour étudier les processus écologiques et évolutifs chez les herbivores, conduisant à la spécialisation alimentaire. Cependant, les études sur la largeur du régime alimentaire sur plus d'une poignée de cultures sont rares. Ici, nous avons estimé la largeur du régime alimentaire chez deux espèces d'herbivores lépidoptères du genre Spodoptera : S. littoralis (SL), dont l'aire d'hôtes inclut à la fois des plantes monocotylédones et dicotylédones, et S. frugiperda (SF) souche maïs, principalement adaptée à différentes espèces de graminées. La performance larvaire sur 23 espèces de plantes cultivées et sauvages de 17 familles provenant d'habitats terrestres et de zones humides a été comparée à un régime artificiel dans des bioessais d'alimentation sans choix. La SL a survécu et a mieux performé sur la plupart des plantes testées, particulièrement au niveau familial, sauf sur deux plantes monocotylédones (maïs et oignon vert), où la SF a bien performé. Il y avait cinq plantes sauvages non hôtes où les deux généralistes ont échoué à survivre. L'essai des indices nutritionnels corrobore les résultats sur un sous-ensemble de plantes. Chez un sous-ensemble de plantes, la préférence alimentaire larvaire a partiellement corrélé, et l'attraction larvaire a bien corrélé avec la performance larvaire. Le choix de ponte des femelles a montré une faible corrélation avec la performance larvaire. Cette faible corrélation implique que ces traits sont découplés, et d'autres facteurs sont cruciaux pour la sélection de la plante hôte par les femelles. Pendant les expériences de dispersion larvaire en serre, les larves de SL et de SF ont fortement tendance à migrer vers leurs plantes hôtes appropriées, indiquant que c'est un facteur qui module la sélection de la plante hôte par les femelles. En résumé, la SL a une largeur de régime alimentaire plus large que la SF, survivant sur des plantes sauvages sans exposition préalable. La présente étude fournit les premières données complètes sur la largeur du régime alimentaire de deux herbivores polyphages à aire de répartition en expansion et hautement invasifs.

@misc{doi10110120240725605058,
    author = "Roy, Amit et Waschke, Nicole et Chattington, Sophie et Modlinger, Roman et Chakraborty, Amrita et Chirere, Thabani Chirere et Larsson, Mattias C. et Heckel, David G. et Anderson, Peter et Schlyter, Fredrik",
    title = "Largeur du régime alimentaire chez deux papillons polyphages du genre Spodoptera dans une large gamme d'hôtes et de plantes non hôtes et le potentiel d'expansion de l'aire de répartition",
    year = "2024",
    booktitle = "bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)",
    abstract = "Résumé Plusieurs papillons polyphages sont de graves ravageurs des cultures. Les modèles et mécanismes de la largeur du régime alimentaire chez les insectes polyphages offrent un système excellent pour étudier les processus écologiques et évolutifs chez les herbivores, conduisant à la spécialisation alimentaire. Cependant, les études sur la largeur du régime alimentaire sur plus d'une poignée de cultures sont rares. Ici, nous avons estimé la largeur du régime alimentaire chez deux espèces d'herbivores lépidoptères du genre Spodoptera : S. littoralis (SL), dont l'aire d'hôtes inclut à la fois des plantes monocotylédones et dicotylédones, et S. frugiperda (SF) souche maïs, principalement adaptée à différentes espèces de graminées. La performance larvaire sur 23 espèces de plantes cultivées et sauvages de 17 familles provenant d'habitats terrestres et de zones humides a été comparée à un régime artificiel dans des bioessais d'alimentation sans choix. La SL a survécu et a mieux performé sur la plupart des plantes testées, particulièrement au niveau familial, sauf sur deux plantes monocotylédones (maïs et oignon vert), où la SF a bien performé. Il y avait cinq plantes sauvages non hôtes où les deux généralistes ont échoué à survivre. L'essai des indices nutritionnels corrobore les résultats sur un sous-ensemble de plantes. Chez un sous-ensemble de plantes, la préférence alimentaire larvaire a partiellement corrélé, et l'attraction larvaire a bien corrélé avec la performance larvaire. Le choix de ponte des femelles a montré une faible corrélation avec la performance larvaire. Cette faible corrélation implique que ces traits sont découplés, et d'autres facteurs sont cruciaux pour la sélection de la plante hôte par les femelles. Pendant les expériences de dispersion larvaire en serre, les larves de SL et de SF ont fortement tendance à migrer vers leurs plantes hôtes appropriées, indiquant que c'est un facteur qui module la sélection de la plante hôte par les femelles. En résumé, la SL a une largeur de régime alimentaire plus large que la SF, survivant sur des plantes sauvages sans exposition préalable. La présente étude fournit les premières données complètes sur la largeur du régime alimentaire de deux herbivores polyphages à aire de répartition en expansion et hautement invasifs.",
    url = "https://doi.org/10.1101/2024.07.25.605058",
    doi = "10.1101/2024.07.25.605058",
    openalex = "W4400973351",
    references = "doi101016jibmb2023104061"
}

Les interactions sociales influencent la propagation des maladies, le flux d'informations et l'allocation des ressources entre les espèces, mais l'hétérogénéité de la fréquence des interactions sociales et ses conséquences sur la fitness restent mal comprises. De plus, le rôle des produits chimiques exogènes, tels que les métabolites végétaux non nutritifs utilisés par plusieurs espèces animales, dans la formation des réseaux sociaux reste incertain. Ici, nous avons étudié comment les métabolites végétaux non nutritifs impactent les interactions sociales et la longévité du guêpeon à navets, Athalia rosae. Les guêpeons adultes acquièrent des diterpènes néo-clérodanes (« clérodanoïdes ») à partir de plantes non alimentaires, ce qui peut servir de défense contre la prédation et augmenter le succès de l'accouplement. Nous avons observé une variation intraspécifique des clérodanoïdes dans les populations naturelles et les individus élevés en laboratoire. Les clérodanoïdes peuvent également être acquis à partir de congénères ayant eu un accès préalable aux métabolites végétaux, ce qui a conduit à une augmentation des interactions sociales agonistiques. L'analyse des réseaux a indiqué une augmentation des interactions sociales dans les groupes de guêpeons où certains ou tous les individus avaient un accès préalable aux clérodanoïdes, tandis que les groupes sans accès préalable avaient moins d'interactions. La fréquence des interactions sociales était influencée par le statut clérodanoïde de l'individu focal et de ceux de ses congénères. Enfin, nous avons observé une longévité plus courte chez les adultes ayant eu un accès préalable aux clérodanoïdes lorsqu'ils étaient regroupés avec des individus sans accès préalable, suggérant que les interactions sociales pour obtenir des clérodanoïdes ont un coût en termes de fitness. Nos résultats mettent en évidence le rôle de la variation intraspécifique dans l'acquisition de métabolites végétaux non nutritifs dans la formation des réseaux sociaux. Cette variation influence la fitness individuelle et les interactions sociales, façonnant ainsi la niche sociale individualisée.

@article{doi1011111365265614189,
    author = "Singh, Pragya et Brueggemann, Leon et Janz, Steven et Saidi, Yasmina et Baruah, Gaurav et Müller, Caroline",
    title = "Plant metabolites modulate social networks and lifespan in a sawfly",
    year = "2024",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Les interactions sociales influencent la propagation des maladies, le flux d'informations et l'allocation des ressources entre les espèces, mais l'hétérogénéité de la fréquence des interactions sociales et ses conséquences sur la fitness restent mal comprises. De plus, le rôle des produits chimiques exogènes, tels que les métabolites végétaux non nutritifs utilisés par plusieurs espèces animales, dans la formation des réseaux sociaux reste incertain. Ici, nous avons étudié comment les métabolites végétaux non nutritifs impactent les interactions sociales et la longévité du guêpeon à navets, Athalia rosae. Les guêpeons adultes acquièrent des diterpènes néo-clérodanes (« clérodanoïdes ») à partir de plantes non alimentaires, ce qui peut servir de défense contre la prédation et augmenter le succès de l'accouplement. Nous avons observé une variation intraspécifique des clérodanoïdes dans les populations naturelles et les individus élevés en laboratoire. Les clérodanoïdes peuvent également être acquis à partir de congénères ayant eu un accès préalable aux métabolites végétaux, ce qui a conduit à une augmentation des interactions sociales agonistiques. L'analyse des réseaux a indiqué une augmentation des interactions sociales dans les groupes de guêpeons où certains ou tous les individus avaient un accès préalable aux clérodanoïdes, tandis que les groupes sans accès préalable avaient moins d'interactions. La fréquence des interactions sociales était influencée par le statut clérodanoïde de l'individu focal et de ceux de ses congénères. Enfin, nous avons observé une longévité plus courte chez les adultes ayant eu un accès préalable aux clérodanoïdes lorsqu'ils étaient regroupés avec des individus sans accès préalable, suggérant que les interactions sociales pour obtenir des clérodanoïdes ont un coût en termes de fitness. Nos résultats mettent en évidence le rôle de la variation intraspécifique dans l'acquisition de métabolites végétaux non nutritifs dans la formation des réseaux sociaux. Cette variation influence la fitness individuelle et les interactions sociales, façonnant ainsi la niche sociale individualisée.",
    url = "https://doi.org/10.1111/1365-2656.14189",
    doi = "10.1111/1365-2656.14189",
    openalex = "W4402723119",
    references = "doi101098rspb20220176, doi107717peerj11523"
}

Les insectes généralistes se nourrissant de plantes se caractérisent par un large répertoire d'hôtes qui peut comprendre plusieurs familles, voire des ordres différents de plantes. Les mécanismes génétiques et physiologiques sous-jacents à l'utilisation d'une telle large gamme d'hôtes ne sont pas encore entièrement compris. Des études antérieures indiquent que la consommation de différentes plantes hôtes est associée à des profils d'expression génique spécifiques à l'hôte. Cependant, il restait unclear si et comment les larves peuvent modifier ces profils dans le cas d'un environnement hôte changeant. En utilisant le papillon polyphage comma (Polygonia c-album), nous montrons que les larves peuvent ajuster leurs profils transcriptionnels en réponse à une nouvelle plante hôte. Le passage à certaines des plantes hôtes a cependant entraîné une réponse transcriptionnelle plus importante et semble donc plus difficile. Au niveau physiologique, aucune correspondance pour ces motifs n'a pu être trouvée dans la performance larvaire. Cela suggère qu'une flexibilité transcriptionnelle mais aussi phénotypique élevée sont essentielles pour l'utilisation d'une large gamme d'hôtes diversifiée. Nous proposons également que les tests de changement d'hôte en laboratoire suivis d'investigations transcriptomiques puissent être un outil précieux pour examiner non seulement la plasticité dans l'utilisation de l'hôte, mais aussi les compromis subtils et/ou transitoires dans l'évolution des répertoires de plantes hôtes.

@article{doi101111mec17479,
    author = "Schneider, Katharina et Steward, Rachel et de la Paz Celorio‐Mancera, Maria et Janz, Niklas et Moberg, Dick et Wheat, Christopher W. et Nylin, Sören",
    title = "Plasticity for the win : réponse transcriptionnelle flexible aux changements d'hôte chez le papillon comma (Polygonia c‐album)",
    year = "2024",
    journal = "Molecular Ecology",
    abstract = "Les insectes généralistes se nourrissant de plantes se caractérisent par un large répertoire d'hôtes qui peut comprendre plusieurs familles, voire des ordres différents de plantes. Les mécanismes génétiques et physiologiques sous-jacents à l'utilisation d'une telle large gamme d'hôtes ne sont pas encore entièrement compris. Des études antérieures indiquent que la consommation de différentes plantes hôtes est associée à des profils d'expression génique spécifiques à l'hôte. Cependant, il restait unclear si et comment les larves peuvent modifier ces profils dans le cas d'un environnement hôte changeant. En utilisant le papillon polyphage comma (Polygonia c-album), nous montrons que les larves peuvent ajuster leurs profils transcriptionnels en réponse à une nouvelle plante hôte. Le passage à certaines des plantes hôtes a cependant entraîné une réponse transcriptionnelle plus importante et semble donc plus difficile. Au niveau physiologique, aucune correspondance pour ces motifs n'a pu être trouvée dans la performance larvaire. Cela suggère qu'une flexibilité transcriptionnelle mais aussi phénotypique élevée sont essentielles pour l'utilisation d'une large gamme d'hôtes diversifiée. Nous proposons également que les tests de changement d'hôte en laboratoire suivis d'investigations transcriptomiques puissent être un outil précieux pour examiner non seulement la plasticité dans l'utilisation de l'hôte, mais aussi les compromis subtils et/ou transitoires dans l'évolution des répertoires de plantes hôtes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/mec.17479",
    doi = "10.1111/mec.17479",
    openalex = "W4400870055",
    references = "doi101016jibmb2023104061"
}

L'évolution des systèmes sensoriels joue un rôle crucial dans la façonnage des interactions des espèces avec leur environnement, mais il reste incertain dans quelle mesure la diversité des systèmes olfactifs reflète les pressions écologiques et évolutives à l'échelle macroévolutif. Ici, nous investiguons l'évolution du système olfactif au sein de la tribu des papillons Heliconiini, un groupe écologiquement diversifié mais étroitement apparenté. En utilisant une approche comparative, nous avons examiné les variations de la morphologie du lobe antennaire et de ses structures constituantes, les glomérules et le hub du lobe antennaire, ainsi que les répertoires de récepteurs odorants au sein des espèces. Nous avons constaté que les variations de taille du lobe antennaire sont pilotées par des changements indépendants des volumes glomérulaires et du hub du lobe antennaire, les différences spécifiques aux espèces survenant sur un fond de stabilité phylogénétique plus large. Bien qu'aucune association directe avec des traits écologiques n'ait été observée, certaines espèces ont montré de grandes expansions du volume glomérulaire total et du nombre de récepteurs odorants, justifiant des investigations supplémentaires sur des facteurs écologiques ou comportementaux non mesurés. De plus, des comparaisons entre des individus capturés en milieu naturel et élevés en laboratoire ont révélé un motif surprenant de plasticité développementale, avec une augmentation des volumes du hub du lobe antennaire et une diminution des volumes glomérulaires en captivité, soulignant l'influence des conditions environnementales sur le développement neuronal. Ces résultats suggèrent que l'évolution olfactive chez les Heliconiini est façonnée à la fois par la divergence évolutive et la plasticité développementale, soulignant la nécessité d'intégrer les perspectives phylogénétiques, écologiques et développementales pour comprendre pleinement l'adaptation des systèmes sensoriels.

@article{doi101093jebvoaf114,
    author = "Toh, Yi Peng et Cicconardi, Francesco et Bianchini, Giorgio et Merrill, Richard M. et Montgomery, Stephen H.",
    title = "Évolution du système olfactif durant la radiation des papillons du genre Heliconiini",
    year = "2025",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "L'évolution des systèmes sensoriels joue un rôle crucial dans la façonnage des interactions des espèces avec leur environnement, mais il reste incertain dans quelle mesure la diversité des systèmes olfactifs reflète les pressions écologiques et évolutives à l'échelle macroévolutif. Ici, nous investiguons l'évolution du système olfactif au sein de la tribu des papillons Heliconiini, un groupe écologiquement diversifié mais étroitement apparenté. En utilisant une approche comparative, nous avons examiné les variations de la morphologie du lobe antennaire et de ses structures constituantes, les glomérules et le hub du lobe antennaire, ainsi que les répertoires de récepteurs odorants au sein des espèces. Nous avons constaté que les variations de taille du lobe antennaire sont pilotées par des changements indépendants des volumes glomérulaires et du hub du lobe antennaire, les différences spécifiques aux espèces survenant sur un fond de stabilité phylogénétique plus large. Bien qu'aucune association directe avec des traits écologiques n'ait été observée, certaines espèces ont montré de grandes expansions du volume glomérulaire total et du nombre de récepteurs odorants, justifiant des investigations supplémentaires sur des facteurs écologiques ou comportementaux non mesurés. De plus, des comparaisons entre des individus capturés en milieu naturel et élevés en laboratoire ont révélé un motif surprenant de plasticité développementale, avec une augmentation des volumes du hub du lobe antennaire et une diminution des volumes glomérulaires en captivité, soulignant l'influence des conditions environnementales sur le développement neuronal. Ces résultats suggèrent que l'évolution olfactive chez les Heliconiini est façonnée à la fois par la divergence évolutive et la plasticité développementale, soulignant la nécessité d'intégrer les perspectives phylogénétiques, écologiques et développementales pour comprendre pleinement l'adaptation des systèmes sensoriels.",
    url = "https://doi.org/10.1093/jeb/voaf114",
    doi = "10.1093/jeb/voaf114",
    openalex = "W4414509623",
    references = "doi101002ece311002"
}

Résumé L'évolution des systèmes sensoriels joue un rôle crucial dans la façonnage des interactions des espèces avec leur environnement, mais il reste incertain dans quelle mesure la diversité des systèmes olfactifs reflète les pressions écologiques et évolutives à l'échelle macroévolutif. Ici, nous investiguons l'évolution du système olfactif au sein de la tribu des papillons Heliconiini, un groupe écologiquement diversifié mais étroitement apparenté. En utilisant une approche comparative, nous avons examiné les variations de la morphologie du lobe antennaire et de ses structures constituantes, les glomérules et le hub du lobe antennaire, ainsi que les répertoires de récepteurs olfactifs au sein des espèces. Nous avons constaté que les variations de la taille du lobe antennaire sont pilotées par des changements indépendants des volumes glomérulaires et du hub du lobe antennaire, avec des différences spécifiques aux espèces survenant sur un fond de stabilité phylogénétique plus large. Bien qu'aucune association directe avec des traits écologiques n'ait été observée, certaines espèces ont montré de grandes expansions du volume glomérulaire total et du nombre de récepteurs olfactifs, justifiant une investigation plus poussée des facteurs écologiques ou comportementaux non mesurés. De plus, les comparaisons entre des individus capturés en milieu naturel et élevés en laboratoire ont révélé un motif surprenant de plasticité développementale, avec une augmentation des volumes du hub du lobe antennaire et une diminution des volumes glomérulaires en captivité, soulignant l'influence des conditions environnementales sur le développement neuronal. Ces résultats suggèrent que l'évolution olfactive chez les Heliconiini est façonnée à la fois par la divergence évolutive et la plasticité développementale, soulignant la nécessité d'intégrer les perspectives phylogénétiques, écologiques et développementales pour comprendre pleinement l'adaptation des systèmes sensoriels.

@misc{doi10110120250406647427,
    author = "Toh, Yi Peng et Cicconardi, Francesco et Bianchini, Giorgio et Merrill, Richard M. et Montgomery, Stephen H.",
    title = "Évolution du système olfactif durant la radiation des papillons du genre Heliconiini",
    year = "2025",
    booktitle = "bioRxiv (Laboratoire Cold Spring Harbor)",
    abstract = "Résumé L'évolution des systèmes sensoriels joue un rôle crucial dans la façonnage des interactions des espèces avec leur environnement, mais il reste incertain dans quelle mesure la diversité des systèmes olfactifs reflète les pressions écologiques et évolutives à l'échelle macroévolutif. Ici, nous investiguons l'évolution du système olfactif au sein de la tribu des papillons Heliconiini, un groupe écologiquement diversifié mais étroitement apparenté. En utilisant une approche comparative, nous avons examiné les variations de la morphologie du lobe antennaire et de ses structures constituantes, les glomérules et le hub du lobe antennaire, ainsi que les répertoires de récepteurs olfactifs au sein des espèces. Nous avons constaté que les variations de la taille du lobe antennaire sont pilotées par des changements indépendants des volumes glomérulaires et du hub du lobe antennaire, avec des différences spécifiques aux espèces survenant sur un fond de stabilité phylogénétique plus large. Bien qu'aucune association directe avec des traits écologiques n'ait été observée, certaines espèces ont montré de grandes expansions du volume glomérulaire total et du nombre de récepteurs olfactifs, justifiant une investigation plus poussée des facteurs écologiques ou comportementaux non mesurés. De plus, les comparaisons entre des individus capturés en milieu naturel et élevés en laboratoire ont révélé un motif surprenant de plasticité développementale, avec une augmentation des volumes du hub du lobe antennaire et une diminution des volumes glomérulaires en captivité, soulignant l'influence des conditions environnementales sur le développement neuronal. Ces résultats suggèrent que l'évolution olfactive chez les Heliconiini est façonnée à la fois par la divergence évolutive et la plasticité développementale, soulignant la nécessité d'intégrer les perspectives phylogénétiques, écologiques et développementales pour comprendre pleinement l'adaptation des systèmes sensoriels.",
    url = "https://doi.org/10.1101/2025.04.06.647427",
    doi = "10.1101/2025.04.06.647427",
    openalex = "W4409209433",
    references = "doi101002ece311002"
}

Résumé Les insectes herbivores peuvent interagir avec les plantes de manière à dépasser la simple nutrition, les métabolites spécialisés (secondaires) des plantes (PSM) médiatisant des relations non nutritionnelles complexes. Bien que les PSM fonctionnent souvent comme des défenses anti‐herbivores, de nombreux insectes ont évolué des stratégies pour contrer et même exploiter ces composés, les utilisant à des fins telles que leur propre défense contre les antagonistes, un succès reproducteur amélioré ou l'automédication. Cette revue explore la pharmacophagie, où les insectes recherchent activement et acquièrent des PSM spécifiques à la fois chez les plantes alimentaires et non alimentaires pour des avantages non liés à la nutrition, à travers différents ordres d'insectes tels que Orthoptera, Lepidoptera, Hymenoptera, Coleoptera, Diptera et Neuroptera. Des exemples clés sont fournis pour des espèces absorbant des PSM de différentes classes de composés, notamment les alcaloïdes pyrrolizidine, les glycosides cardiaques, les diterpénoïdes néo‐clérodane, les cucurbitacines, la framboïsetone, le méthyleugénol et d'autres métabolites tels que l'éthanol ou la résine. Les espèces d'insectes démontrent des utilisations adaptatives uniques de ces produits chimiques végétaux non nutritionnels. Nous discutons du transfert intra‐ et intergénérationnel de PSM acquis par pharmacophagie entre congénères et des méthodes pour identifier et tester la pharmacophagie, en soulignant l'importance des approches interdisciplinaires qui combinent observations de terrain, études comportementales et analyses chimiques. Les voies évolutives menant à la pharmacophagie sont examinées, mettant en évidence des pressions sélectives telles que la prédation, le parasitisme et la sélection sexuelle. Nous abordons également les coûts associés à la pharmacophagie, y compris les demandes énergétiques et la toxicité potentielle. En étendant la discussion aux taxons non insectes, nous suggérons que la pharmacophagie peut être un phénomène écologique plus large. En établissant un cadre complet pour comprendre la pharmacophagie, nous visons à stimuler de nouvelles recherches sur cet aspect intrigant des interactions plante‐insecte et à mettre en évidence ses applications potentielles dans la gestion des ravageurs, la conservation et la santé humaine.

@article{doi101111eea13586,
    author = "Singh, Pragya et Müller, Caroline",
    title = "Pharmacophagie chez les insectes : perspectives écologiques et évolutives sur l'utilisation non nutritionnelle des métabolites spécialisés des plantes",
    year = "2025",
    journal = "Entomologia Experimentalis et Applicata",
    abstract = "Résumé Les insectes herbivores peuvent interagir avec les plantes de manière à dépasser la simple nutrition, les métabolites spécialisés (secondaires) des plantes (PSM) médiatisant des relations non nutritionnelles complexes. Bien que les PSM fonctionnent souvent comme des défenses anti‐herbivores, de nombreux insectes ont évolué des stratégies pour contrer et même exploiter ces composés, les utilisant à des fins telles que leur propre défense contre les antagonistes, un succès reproducteur amélioré ou l'automédication. Cette revue explore la pharmacophagie, où les insectes recherchent activement et acquièrent des PSM spécifiques à la fois chez les plantes alimentaires et non alimentaires pour des avantages non liés à la nutrition, à travers différents ordres d'insectes tels que Orthoptera, Lepidoptera, Hymenoptera, Coleoptera, Diptera et Neuroptera. Des exemples clés sont fournis pour des espèces absorbant des PSM de différentes classes de composés, notamment les alcaloïdes pyrrolizidine, les glycosides cardiaques, les diterpénoïdes néo‐clérodane, les cucurbitacines, la framboïsetone, le méthyleugénol et d'autres métabolites tels que l'éthanol ou la résine. Les espèces d'insectes démontrent des utilisations adaptatives uniques de ces produits chimiques végétaux non nutritionnels. Nous discutons du transfert intra‐ et intergénérationnel de PSM acquis par pharmacophagie entre congénères et des méthodes pour identifier et tester la pharmacophagie, en soulignant l'importance des approches interdisciplinaires qui combinent observations de terrain, études comportementales et analyses chimiques. Les voies évolutives menant à la pharmacophagie sont examinées, mettant en évidence des pressions sélectives telles que la prédation, le parasitisme et la sélection sexuelle. Nous abordons également les coûts associés à la pharmacophagie, y compris les demandes énergétiques et la toxicité potentielle. En étendant la discussion aux taxons non insectes, nous suggérons que la pharmacophagie peut être un phénomène écologique plus large. En établissant un cadre complet pour comprendre la pharmacophagie, nous visons à stimuler de nouvelles recherches sur cet aspect intrigant des interactions plante‐insecte et à mettre en évidence ses applications potentielles dans la gestion des ravageurs, la conservation et la santé humaine.",
    url = "https://doi.org/10.1111/eea.13586",
    doi = "10.1111/eea.13586",
    openalex = "W4410251156",
    references = "doi101098rspb20220176"
}

La croissance et la productivité des plantes sont fortement contraintes par les insectes herbivores, qui réduisent à la fois le rendement et la qualité. Au cours des deux derniers siècles, d'importants efforts ont été consacrés à l'identification des traits et gènes naturellement résistants aux insectes qui ont évolué chez les plantes. Ici, nous passons en revue d'abord les jalons clés et les avancées, y compris l'observation empirique, le déclenchement des mécanismes, l'émergence théorique, l'identification des gènes et l'application en sélection. Ensuite, nous catégorisons la recherche sur les défenses des plantes contre les insectes en quatre grands types : défenses physiques, chimiques, modulation écologique et défenses comportementales, et les intégrons pour mettre en évidence la coordination et la synergie entre les différentes défenses. Enfin, nous proposons des domaines prioritaires et des orientations futures pour la recherche afin de faire progresser les études sur les interactions plantes-insectes et de soutenir une gestion efficace et durable des ravageurs.

@article{doi101111jipb70209,
    author = "Zhu, Liuhong et Yang, Hua et Li, Peixuan et Dong, Lina et Zhao, Shang et Lv, Honghao et Crickmore, Neil et Zhou, Xuguo et Zhang, Youjun et Guo, Zhaojiang",
    title = "Plant strategies against herbivorous insects",
    year = "2026",
    journal = "Journal of Integrative Plant Biology",
    abstract = "Plant growth and productivity are strongly constrained by herbivorous insects, which reduce both yield and quality. Over the past two centuries, extensive efforts have been devoted to identifying natural insect-resistant traits and genes that have evolved in plants. Here, we first review key milestones and advances, including empirical observation, mechanism onset, theoretical emergence, gene identification, and breeding application. Then, we categorize research on plant defenses for insect resistance into four major types: physical, chemical, ecological modulation, and behavioral defenses, and integrate them to highlight the coordination and synergy among different defenses. Finally, we propose priority areas and future directions for research to advance studies on plant-insect interactions and support effective and sustainable pest management.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jipb.70209",
    doi = "10.1111/jipb.70209",
    openalex = "W7134190481",
    references = "doi101016jtplants202405010"
}