Coopération

Variations and Fluctuations of the Number of Individuals in Animal Species living together Get access Vito Volterra Vito Volterra Professor Translated by Miss Mary Evelyn Wells, Doctor of MathematicsRome Search for other works by this author on: Oxford Academic Google Scholar ICES Journal of Marine Science, Volume 3, Issue 1, April 1928, Pages 3–51, https://doi.org/10.1093/icesjms/3.1.3 Published: 01 April 1928

@article{doi101093icesjms313,
    author = "Volterra, Vito",
    title = "Variations and Fluctuations of the Number of Individuals in Animal Species living together",
    year = "1928",
    journal = "ICES Journal of Marine Science",
    abstract = "Variations and Fluctuations of the Number of Individuals in Animal Species living together Get access Vito Volterra Vito Volterra Professor Translated by Miss Mary Evelyn Wells, Doctor of MathematicsRome Search for other works by this author on: Oxford Academic Google Scholar ICES Journal of Marine Science, Volume 3, Issue 1, April 1928, Pages 3–51, https://doi.org/10.1093/icesjms/3.1.3 Published: 01 April 1928",
    url = "https://doi.org/10.1093/icesjms/3.1.3",
    doi = "10.1093/icesjms/3.1.3",
    openalex = "W2061011338"
}

@misc{allee1951cooperation1,
    author = "Allee, W. C",
    title = "La coopération chez les animaux et ses implications pour l'homme",
    year = "1951",
    howpublished = "New York, Schuman, 233 p.; [Édition révisée de Social Life of Animals, Norton, New York, 1938]",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Allee, W. C., 1951, La coopération chez les animaux et ses implications pour l'homme: New York, Schuman, 233 p.; [Édition révisée de Social Life of Animals, Norton, New York, 1938].}"
}

@article{crossref1951allee,
    title = "Allee, W. C. La coopération chez les animaux et ses implications pour l'homme. New York : Henry Schuman, éditeur, 1951. 233 p.",
    year = "1951",
    journal = "Science Education",
    url = "https://doi.org/10.1002/sce.3730350525",
    doi = "10.1002/sce.3730350525",
    number = "5",
    openalex = "W4206837436",
    pages = "301-302",
    volume = "35"
}

@article{yothers1951review,
    author = "Yothers, Lee R.",
    title = "Revue : Cooperation among Animals: With Human Implications, par W. C. Allee",
    year = "1951",
    journal = "The American Biology Teacher",
    url = "https://doi.org/10.2307/4438292",
    doi = "10.2307/4438292",
    number = "6",
    openalex = "W4246039385",
    pages = "142-142",
    volume = "13"
}

@article{doi101176ajp1092158a,
    author = "Walker, Norma Ford",
    title = "Cooperation Among Animals with Human Implications",
    year = "1952",
    journal = "American Journal of Psychiatry",
    url = "https://doi.org/10.1176/ajp.109.2.158-a",
    doi = "10.1176/ajp.109.2.158-a",
    openalex = "W2050652524"
}

@article{doi1023074510320,
    author = "Nice, M. M. et Allee, W. C.",
    title = "La coopération chez les animaux avec des implications pour l'humain",
    year = "1952",
    journal = "Bird-Banding",
    url = "https://doi.org/10.2307/4510320",
    doi = "10.2307/4510320",
    openalex = "W1490215134"
}

@article{nice1952cooperation,
    author = "Nice, M. M. et Allee, W. C.",
    title = "La coopération chez les animaux avec des implications pour l'homme",
    year = "1952",
    journal = "Bird-Banding",
    url = "https://doi.org/10.2307/4510320",
    doi = "10.2307/4510320",
    number = "1",
    openalex = "W1490215134",
    pages = "49",
    volume = "23"
}

@article{walker1952cooperation,
    author = "WALKER, NORMA FORD",
    title = "Cooperation Among Animals with Human Implications",
    year = "1952",
    journal = "American Journal of Psychiatry",
    url = "https://doi.org/10.1176/ajp.109.2.158-a",
    doi = "10.1176/ajp.109.2.158-a",
    number = "2",
    openalex = "W2050652524",
    pages = "158-a-159",
    volume = "109"
}

Les modèles de distribution des espèces (MDE) sont des outils numériques qui combinent des observations sur la présence ou l'abondance des espèces avec des estimations environnementales. Ils sont utilisés pour acquérir des connaissances écologiques et évolutives et pour prédire les distributions à travers les paysages,...Lire la suite

@article{doi101146annureves02110171002341,
    author = "Janzen, Daniel H.",
    title = "Seed Predation by Animals",
    year = "1971",
    journal = "Annual Review of Ecology and Systematics",
    abstract = "Species distribution models (SDMs) are numerical tools that combine observations of species occurrence or abundance with environmental estimates. They are used to gain ecological and evolutionary insights and to predict distributions across landscapes,...Read More",
    url = "https://doi.org/10.1146/annurev.es.02.110171.002341",
    doi = "10.1146/annurev.es.02.110171.002341",
    openalex = "W2029894290",
    references = "doi101086282455, doi101111j155856461969tb03489x"
}

Aborde quatre sujets écologiques connexes : (1) la présence de rivières noires tropicales (riches en acides humiques et pauvres en nutriments) dans des zones à sols sableux blancs pauvres ; (2) la pauvreté des communautés animales présentes dans les forêts de ces zones ; (3) l'évolution de la fructification grégaire chez les Diptérocarpées du SE Asie ; et (4) la persistance de certaines espèces d'arbres tropicaux de basse altitude dans des forêts à très faible diversité spécifique. Dans les hypothèses avancées, une attention particulière est accordée au rôle des composés « secondaires » ou « défensifs » (généralement des phénols toxiques, difficiles à dégrader et donc relativement persistants) dans la végétation vivante et dans les lessivats de plantes et de litière en tant que facteur dans la formation des rivières noires et dans la défense des plantes contre les attaques animales. La fructification grégaire des Diptérocarpées est considérée comme un mécanisme d'évasion face aux consommateurs de graines, unique à la région concernée car il a réduit les communautés animales.

@article{doi1023072989823,
    author = "Janzen, Daniel H.",
    title = "Tropical Blackwater Rivers, Animals, and Mast Fruiting by the Dipterocarpaceae",
    year = "1974",
    journal = "Biotropica",
    abstract = "Aborde quatre sujets écologiques connexes : (1) la présence de rivières noires tropicales (riches en acides humiques et pauvres en nutriments) dans des zones à sols sableux blancs pauvres ; (2) la pauvreté des communautés animales présentes dans les forêts de ces zones ; (3) l'évolution de la fructification grégaire chez les Diptérocarpées du SE Asie ; et (4) la persistance de certaines espèces d'arbres tropicaux de basse altitude dans des forêts à très faible diversité spécifique. Dans les hypothèses avancées, une attention particulière est accordée au rôle des composés « secondaires » ou « défensifs » (généralement des phénols toxiques, difficiles à dégrader et donc relativement persistants) dans la végétation vivante et dans les lessivats de plantes et de litière en tant que facteur dans la formation des rivières noires et dans la défense des plantes contre les attaques animales. La fructification grégaire des Diptérocarpées est considérée comme un mécanisme d'évasion face aux consommateurs de graines, unique à la région concernée car il a réduit les communautés animales.",
    url = "https://doi.org/10.2307/2989823",
    doi = "10.2307/2989823",
    openalex = "W2320023580",
    references = "doi101086282907, doi1023071933565, doi1023072259009"
}

Un modèle de compétition entre deux espèces est construit en supposant des interactions hypothétiques de second ordre afin de prendre en compte les effets de l'exploitation sur deux espèces de poissons concurrentes avec des interactions non linéaires. La caractéristique la plus importante de ce modèle, par rapport au modèle de compétition linéaire de type Lotka-Volterra, est que ce modèle peut posséder plusieurs points d'équilibre stables. Par conséquent, il existe une possibilité que deux espèces maintenant l'état d'équilibre à un point d'équilibre stable soient attirées vers l'autre point d'équilibre stable après une perturbation importante. Dans ce modèle, un changement réversible de la pression de pêche ne conduit pas toujours à celui des captures à l'équilibre. Dans ce sens, le concept de RMC (rendement maximal durable) pour une seule espèce ne peut pas être étendu à ce modèle. S'il existe plusieurs points d'équilibre stables, le changement de l'espèce de poisson dominante, un changement catastrophique et irréversible des captures à l'équilibre de chaque espèce peut être observé lorsque la perturbation due à l'exploitation est ajoutée. Ce phénomène nous rappelle immédiatement le changement de l'espèce de poisson dominante entre le bonite commune japonaise et le saumon du Pacifique dans l'océan Pacifique nord-ouest. Dans le cas de la gestion de deux espèces de poissons concurrentes avec des interactions non linéaires, la prise en compte de l'équilibre entre la pression de pêche pour chaque espèce peut être aussi importante que la décision sur la limite de capture pour chaque espèce. Le niveau de RMC pour chaque espèce basé sur la théorie de l'espèce unique pourrait être tout à fait erroné.

@article{doi101007bf02512979,
    author = "Shirakihara, Kunio et TANAKA, Syoiti",
    title = "Two fish species competition model with nonlinear interactions and equilibrium catches",
    year = "1978",
    journal = "Population Ecology",
    abstract = "Summary Two species competition model is built up by assuming the hypothetical second order interactions in order to consider effects of exploitation on two competing fish species with non‐linear interactions. Most important characteristic of this model, compared with Lotka‐Volterra type linear competition model, is that this model can possess multiple stable equilibrium points. Therefore there is a possibility that two species keeping the equilibrium state at one stable equilibrium point will be attracted to the other stable equilibrium point after a heavy perturbation. In this model reversible change of the fishing pressure does not always results in that of the equilibrium catch. In this sence MSY concept for single species can not be extended to this model. If there are multiple stable equilibrium points, the change of the dominant fish species, catastrophic and irreversible change of each equilibrium catch may be observed when the perturbation by the exploitation is added. This phenomenon immediately reminds us of the change of the dominant fish species between Japanese common mackerel and Pacific saury in the northwest Pacific Ocean. In case of the management of two competing fish species with nonlinear interactions, the consideration on the balance between the fishing pressure for each species may be as important as the decision on the catch limit for each species. MSY level for each species based on the single‐species theory could be quite erroneous.",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf02512979",
    doi = "10.1007/bf02512979",
    openalex = "W1966020396",
    references = "doi101007bf00044132, doi101038116461b0, doi101086282272, doi101086282961, doi101093icesjms313, doi101139f57025, doi101176ajp1092158a, doi1015159780691206912, doi1023072298330, doi1023072965538, walker1952cooperation"
}

La prise en compte des interactions entre espèces est un élément clé de la gestion écosystémique. Les modèles simples des interactions entre espèces fournissent un cadre pour effectuer des comparaisons qualitatives et identifier les dynamiques critiques. Une revue des modèles de pêchies multiespèces et de réserves marines indique que l'intégration des interactions entre espèces conduit à des prédictions théoriques réduites pour le rendement durable et les taux de pêche, et à des prédictions théoriques accrues pour la taille de la réserve nécessaire pour protéger les populations ; les changements ontogénétiques dans les interactions ont également un effet significatif sur les prédictions des modèles multiespèces. Bien que les modèles précédents aient exploré les interactions négatives entre espèces (c'est-à-dire la prédation et la compétition), cet article présente un exemple de modèle de réserve marine avec une interaction positive : une chaîne trophique de homard épineux-oursin de mer-algue rouge où les algues rouges facilitent le recrutement du homard. Les résultats du modèle indiquent que la facilitation du recrutement affecte principalement l'échelle de temps des dynamiques des espèces et le débordement de homard des réserves vers les zones pêchées ; la direction de ces changements dépend de la référence sans facilitation. Dans l'ensemble, ces modèles indiquent l'importance d'intégrer les interactions entre espèces dans les décisions de gestion des pêcheries et des réserves.

@article{openalexw332345030,
    author = "Baskett, Marissa L.",
    title = "Modèles simples de pêcheries et de réserves marines pour des espèces interagissant : Vue d'ensemble et exemple avec facilitation du recrutement",
    year = "2007",
    journal = "eScholarship (California Digital Library)",
    abstract = "La prise en compte des interactions entre espèces est un élément clé de la gestion écosystémique. Les modèles simples des interactions entre espèces fournissent un cadre pour effectuer des comparaisons qualitatives et identifier les dynamiques critiques. Une revue des modèles de pêchies multiespèces et de réserves marines indique que l'intégration des interactions entre espèces conduit à des prédictions théoriques réduites pour le rendement durable et les taux de pêche, et à des prédictions théoriques accrues pour la taille de la réserve nécessaire pour protéger les populations ; les changements ontogénétiques dans les interactions ont également un effet significatif sur les prédictions des modèles multiespèces. Bien que les modèles précédents aient exploré les interactions négatives entre espèces (c'est-à-dire la prédation et la compétition), cet article présente un exemple de modèle de réserve marine avec une interaction positive : une chaîne trophique de homard épineux-oursin de mer-algue rouge où les algues rouges facilitent le recrutement du homard. Les résultats du modèle indiquent que la facilitation du recrutement affecte principalement l'échelle de temps des dynamiques des espèces et le débordement de homard des réserves vers les zones pêchées ; la direction de ces changements dépend de la référence sans facilitation. Dans l'ensemble, ces modèles indiquent l'importance d'intégrer les interactions entre espèces dans les décisions de gestion des pêcheries et des réserves.",
    openalex = "W332345030",
    references = "doi101007bf02512979"
}

Nous analysons un modèle épidémiologique de souches concurrentes de pathogènes et donc les différences de transmission pour une première infection par rapport à une infection secondaire en raison de l'interaction des souches avec des immunités précédemment acquises, comme cela a été décrit pour la dengue, est connu sous le nom d'amélioration dépendante des anticorps (ADE). Ces modèles montrent une riche variété de dynamiques à travers des bifurcations jusqu'au chaos déterministe. L'inclusion d'une immunité croisée temporaire élargit même la plage de paramètres de tels attracteurs chaotiques et donne également naissance à divers attracteurs coexistants, qui sont difficiles à identifier par des programmes numériques de bifurcation standards utilisant des méthodes de continuation. Une combinaison de techniques, y compris des diagrammes de bifurcation classiques et des spectres d'exposants de Lyapunov, doit être appliquée en comparaison pour obtenir une compréhension plus approfondie de telles structures dynamiques. Ici, nous présentons pour la première fois des études multi-paramètres dans une plage de valeurs biologiquement plausibles pour la dengue. L'interaction multi-souche avec le système immunitaire est susceptible d'avoir des implications pour l'épidémiologie d'autres maladies également.

@article{doi10108000207160902783532,
    author = "Aguiar, Maíra et Stollenwerk, Nico et Kooi, Bob W.",
    title = "Torus bifurcations, isolas et attracteurs chaotiques dans un modèle simple de la dengue avec ADE et immunité croisée temporaire",
    year = "2009",
    journal = "International Journal of Computer Mathematics",
    abstract = "Nous analysons un modèle épidémiologique de souches concurrentes de pathogènes et donc les différences de transmission pour une première infection par rapport à une infection secondaire en raison de l'interaction des souches avec des immunités précédemment acquises, comme cela a été décrit pour la dengue, est connu sous le nom d'amélioration dépendante des anticorps (ADE). Ces modèles montrent une riche variété de dynamiques à travers des bifurcations jusqu'au chaos déterministe. L'inclusion d'une immunité croisée temporaire élargit même la plage de paramètres de tels attracteurs chaotiques et donne également naissance à divers attracteurs coexistants, qui sont difficiles à identifier par des programmes numériques de bifurcation standards utilisant des méthodes de continuation. Une combinaison de techniques, y compris des diagrammes de bifurcation classiques et des spectres d'exposants de Lyapunov, doit être appliquée en comparaison pour obtenir une compréhension plus approfondie de telles structures dynamiques. Ici, nous présentons pour la première fois des études multi-paramètres dans une plage de valeurs biologiquement plausibles pour la dengue. L'interaction multi-souche avec le système immunitaire est susceptible d'avoir des implications pour l'épidémiologie d'autres maladies également.",
    url = "https://doi.org/10.1080/00207160902783532",
    doi = "10.1080/00207160902783532",
    openalex = "W2148427710",
    references = "doi101007s0028500302560"
}

La théorie du rapport des ressources prédit que deux espèces peuvent coexister en présence de deux nutriments limitants, à condition que chaque espèce soit limitée par la ressource dont elle est le moins capable de s'appauvrir. Nous modifions ce modèle classique de compétition pour permettre la coopération interspécifique par l'échange. Nous montrons que l'échange de ressources élargit le domaine de la coexistence stable, et que les partenaires d'échange optimaux envahissent et excluent toute autre stratégie d'échange ou non-échange par compétition. Nous montrons que la sélection naturelle favorise l'évolution vers l'établissement d'une relation d'échange tant que les partenaires peuvent établir des associations à long terme, même si la coopération peut entraîner une diminution de l'abondance d'une espèce. Cette théorie élargit substantiellement les applications traditionnelles des modèles de compétition des ressources et suggère des expérimentations empiriques supplémentaires.

@article{doi101111j14610248200901431x,
    author = "de Mazancourt, Claire et Schwartz, Mark W.",
    title = "Une théorie du rapport des ressources de la coopération",
    year = "2010",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "La théorie du rapport des ressources prédit que deux espèces peuvent coexister en présence de deux nutriments limitants, à condition que chaque espèce soit limitée par la ressource dont elle est le moins capable de s'appauvrir. Nous modifions ce modèle classique de compétition pour permettre la coopération interspécifique par l'échange. Nous montrons que l'échange de ressources élargit le domaine de la coexistence stable, et que les partenaires d'échange optimaux envahissent et excluent toute autre stratégie d'échange ou non-échange par compétition. Nous montrons que la sélection naturelle favorise l'évolution vers l'établissement d'une relation d'échange tant que les partenaires peuvent établir des associations à long terme, même si la coopération peut entraîner une diminution de l'abondance d'une espèce. Cette théorie élargit substantiellement les applications traditionnelles des modèles de compétition des ressources et suggère des expérimentations empiriques supplémentaires.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2009.01431.x",
    doi = "10.1111/j.1461-0248.2009.01431.x",
    openalex = "W2058458736",
    references = "doi1010160304380085900067"
}

La colinéarité fait référence à l'indépendance non existante des variables prédictives, généralement dans une analyse de type régression. C'est une caractéristique courante de tout ensemble de données écologiques descriptif et peut poser problème pour l'estimation des paramètres car elle gonfle la variance des paramètres de régression et peut ainsi conduire à l'identification erronée des prédicteurs pertinents dans un modèle statistique. La colinéarité est un problème grave lorsqu'un modèle est entraîné sur des données d'une région ou d'une période donnée, puis prédit pour une autre région ou période ayant une structure de colinéarité différente ou inconnue. Pour démontrer l'ampleur du problème de la colinéarité en écologie, nous montrons comment les relations entre les prédicteurs diffèrent entre les biomes, changent selon les échelles spatiales et au fil du temps. À travers les disciplines, différentes approches pour résoudre les problèmes de colinéarité ont été développées, allant du regroupement des prédicteurs, de la pré-sélection basée sur des seuils, aux méthodes de variables latentes, jusqu'à la régression et la régularisation. En utilisant des données simulées avec cinq relations prédicteur-réponse de complexité croissante et huit niveaux de colinéarité, nous avons comparé les méthodes pour résoudre la colinéarité avec la régression multiple standard et les approches d'apprentissage automatique. Nous avons évalué la performance de chaque approche en testant son impact sur la prédiction de nouvelles données. Dans le cas extrême, nous avons testé si les méthodes étaient capables d'identifier la véritable relation sous-jacente dans un ensemble d'apprentissage avec une forte colinéarité en évaluant leur performance sur un ensemble de test sans aucune colinéarité. Nous avons constaté que les méthodes spécifiquement conçues pour la colinéarité, telles que les méthodes de variables latentes et les modèles basés sur les arbres, ne surpassaient pas la régression linéaire généralisée (GLM) traditionnelle et la pré-sélection basée sur des seuils. Nos résultats soulignent la valeur de la GLM en combinaison avec des méthodes pénalisées (en particulier ridge) et la pré-sélection basée sur des seuils lorsque des variables omises sont prises en compte dans l'interprétation finale. Cependant, toutes les approches testées ont produit des prédictions dégradées en cas de changement de structure de colinéarité et les seuils « folkloriques » de coefficients de corrélation entre les variables prédictives de |r| > 0,7 constituent un indicateur approprié du moment où la colinéarité commence à déformer sévèrement l'estimation du modèle et la prédiction ultérieure. L'utilisation de la compréhension écologique du système dans la sélection de variables en pré-analyse et le choix des approches statistiques les moins sensibles réduisent les problèmes de colinéarité, mais ne peuvent ultimement les résoudre.

@article{doi101111j16000587201207348x,
    author = "Dormann, Carsten F. and Elith, Jane and Bacher, Sven and Buchmann, Carsten M. and Carl, Gudrun and Carré, Gabriel and Márquez, Jaime and Gruber, Bernd and Lafourcade, Bruno and Leitão, Pedro J. and Münkemüller, Tamara and McClean, Colin J. and Osborne, Patrick E. and Reineking, Björn and Schröder, Boris and Skidmore, Andrew K. and Zurell, Damaris and Lautenbach, Sven",
    title = "Collinearity: a review of methods to deal with it and a simulation study evaluating their performance",
    year = "2012",
    journal = "Ecography",
    abstract = "Collinearity refers to the non independence of predictor variables, usually in a regression‐type analysis. It is a common feature of any descriptive ecological data set and can be a problem for parameter estimation because it inflates the variance of regression parameters and hence potentially leads to the wrong identification of relevant predictors in a statistical model. Collinearity is a severe problem when a model is trained on data from one region or time, and predicted to another with a different or unknown structure of collinearity. To demonstrate the reach of the problem of collinearity in ecology, we show how relationships among predictors differ between biomes, change over spatial scales and through time. Across disciplines, different approaches to addressing collinearity problems have been developed, ranging from clustering of predictors, threshold‐based pre‐selection, through latent variable methods, to shrinkage and regularisation. Using simulated data with five predictor‐response relationships of increasing complexity and eight levels of collinearity we compared ways to address collinearity with standard multiple regression and machine‐learning approaches. We assessed the performance of each approach by testing its impact on prediction to new data. In the extreme, we tested whether the methods were able to identify the true underlying relationship in a training dataset with strong collinearity by evaluating its performance on a test dataset without any collinearity. We found that methods specifically designed for collinearity, such as latent variable methods and tree based models, did not outperform the traditional GLM and threshold‐based pre‐selection. Our results highlight the value of GLM in combination with penalised methods (particularly ridge) and threshold‐based pre‐selection when omitted variables are considered in the final interpretation. However, all approaches tested yielded degraded predictions under change in collinearity structure and the ‘folk lore’‐thresholds of correlation coefficients between predictor variables of |r| >0.7 was an appropriate indicator for when collinearity begins to severely distort model estimation and subsequent prediction. The use of ecological understanding of the system in pre‐analysis variable selection and the choice of the least sensitive statistical approaches reduce the problems of collinearity, but cannot ultimately solve them.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1600-0587.2012.07348.x",
    doi = "10.1111/j.1600-0587.2012.07348.x",
    openalex = "W1998025025",
    references = "doi10100797814471034794, doi101023a1010933404324, doi101111j14610248200801277x, doi101111j14679868200500503x, doi101111j2041210x200900001x, doi1012019781420010404, openalexw2097360283"
}

Nous considérons l'existence d'au moins trois solutions positives d'un problème non linéaire du premier ordre avec une condition aux limites non locale non linéaire donnée par

@article{doi107494opmath201636169,
    author = "Padhi, Seshadev et Pati, Smita et Hota, D. K.",
    title = "Solutions positives de problèmes aux limites avec conditions aux limites non locales non linéaires",
    year = "2015",
    journal = "Opuscula Mathematica",
    abstract = "Nous considérons l'existence d'au moins trois solutions positives d'un problème non linéaire du premier ordre avec une condition aux limites non locale non linéaire donnée par",
    url = "https://doi.org/10.7494/opmath.2016.36.1.69",
    doi = "10.7494/opmath.2016.36.1.69",
    openalex = "W1641159214",
    references = "doi101016jnonrwa201107044"
}

Dans cet article, nous concevons, analysons et validons numériquement des schémas aux volumes finis dissipant l'énergie pour une équation de compétition-mutation avec une structure de flot de gradient. Le modèle décrit l'évolution d'une population structurée par rapport à un trait continu. Les schémas semi-discrets et entièrement discrets sont démontrés pour satisfaire les deux propriétés souhaitées : positivité des solutions numériques et dissipation d'énergie. Cela garantit que l'état stationnaire positif est asymptotiquement stable. De plus, l'état stationnaire discret est prouvé être identique au minimiseur d'une fonction d'énergie discrète. À titre de comparaison, l'état stationnaire positif peut également être produit par un solveur de programmation non linéaire. Enfin, une série de tests numériques est fournie pour démontrer à la fois la précision et la propriété de dissipation d'énergie des schémas numériques. Les solutions numériques du modèle avec une petite mutation sont montrées comme étant proches de celles du modèle correspondant avec une compétition linéaire.

@article{doi101051m2an2016058,
    author = "Cai, Wenli et Liu, Hailiang",
    title = "Une méthode aux volumes finis pour des équations de compétition-mutation non locales avec une structure de flot de gradient",
    year = "2016",
    journal = "ESAIM Modélisation mathématique et analyse numérique",
    abstract = "Dans cet article, nous concevons, analysons et validons numériquement des schémas aux volumes finis dissipant l'énergie pour une équation de compétition-mutation avec une structure de flot de gradient. Le modèle décrit l'évolution d'une population structurée par rapport à un trait continu. Les schémas semi-discrets et entièrement discrets sont démontrés pour satisfaire les deux propriétés souhaitées : positivité des solutions numériques et dissipation d'énergie. Cela garantit que l'état stationnaire positif est asymptotiquement stable. De plus, l'état stationnaire discret est prouvé être identique au minimiseur d'une fonction d'énergie discrète. À titre de comparaison, l'état stationnaire positif peut également être produit par un solveur de programmation non linéaire. Enfin, une série de tests numériques est fournie pour démontrer à la fois la précision et la propriété de dissipation d'énergie des schémas numériques. Les solutions numériques du modèle avec une petite mutation sont montrées comme étant proches de celles du modèle correspondant avec une compétition linéaire.",
    url = "https://doi.org/10.1051/m2an/2016058",
    doi = "10.1051/m2an/2016058",
    openalex = "W2534102177",
    references = "doi101007bf02512979"
}

Dans cet article, nous nous intéressons à un modèle intégral-différentiel avec un terme de compétition non linéaire qui décrit l'évolution d'une population structurée par rapport à un trait continu. Sous certaines hypothèses, la solution stationnaire est montrée unique et strictement positive, ainsi que globalement stable. Le taux de convergence exponentielle vers l'état stationnaire est également établi.

@article{doi10108813616544aa85da,
    author = "Jabin, Pierre‐Emmanuel et Liu, Hailiang",
    title = "Sur un modèle de sélection–mutation non local avec une structure de flot de gradient",
    year = "2017",
    journal = "Nonlinearity",
    abstract = "Dans cet article, nous nous intéressons à un modèle intégral-différentiel avec un terme de compétition non linéaire qui décrit l'évolution d'une population structurée par rapport à un trait continu. Sous certaines hypothèses, la solution stationnaire est montrée unique et strictement positive, ainsi que globalement stable. Le taux de convergence exponentielle vers l'état stationnaire est également établi.",
    url = "https://doi.org/10.1088/1361-6544/aa85da",
    doi = "10.1088/1361-6544/aa85da",
    openalex = "W2765995902",
    references = "doi101007bf02512979"
}

Nous considérons un système prédateur--proie avec une réponse fonctionnelle non monotone et un effet Allee de recherche de partenaire de type hyperbolique sur les proies. Une analyse mathématique détaillée du système, incluant la stabilité et une série de bifurcations (une bifurcation nœud-col, une bifurcation de Hopf et une bifurcation de Bogdanov--Takens), a été fournie. Les résultats mathématiques montrent que le système est très sensible aux paramètres et à l'état initial. Il présente un cycle limite stable, ou différents types de courbes hétéroclines, ou une boucle homocline lorsque les paramètres prennent des valeurs appropriées.

@article{doi103906mat14118,
    author = "Wu, Ruiwen et Liu, Xiuxiang",
    title = "Dynamique d'un système prédateur-proie avec un effet Allee de recherche de partenaire sur les proies",
    year = "2017",
    journal = "TURKISH JOURNAL OF MATHEMATICS",
    abstract = "Nous considérons un système prédateur--proie avec une réponse fonctionnelle non monotone et un effet Allee de recherche de partenaire de type hyperbolique sur les proies. Une analyse mathématique détaillée du système, incluant la stabilité et une série de bifurcations (une bifurcation nœud-col, une bifurcation de Hopf et une bifurcation de Bogdanov--Takens), a été fournie. Les résultats mathématiques montrent que le système est très sensible aux paramètres et à l'état initial. Il présente un cycle limite stable, ou différents types de courbes hétéroclines, ou une boucle homocline lorsque les paramètres prennent des valeurs appropriées.",
    url = "https://doi.org/10.3906/mat-1411-8",
    doi = "10.3906/mat-1411-8",
    openalex = "W2618798731",
    references = "doi101016jnonrwa201107044"
}

Les modèles de la distribution spatiale des animaux fournissent des outils utiles pour aider les écologistes à quantifier les relations entre les espèces et leur environnement, et ils sont de plus en plus utilisés pour aider à déterminer les impacts des changements climatiques et d'habitat sur les espèces. Bien que des données de type enquête de haute qualité avec un effort connu soient parfois disponibles, les chercheurs ont souvent plusieurs ensembles de données de qualité et de type variables. En particulier, les collections d'observations réalisées par des scientifiques citoyens deviennent de plus en plus courantes, sans qu'aucune information ne soit généralement fournie sur leur effort d'observation. De nombreuses approches de modélisation standard ignorent complètement l'effort d'observation, ce qui peut fausser gravement les estimations de la distribution d'un animal. Combiner des données d'observations provenant d'observateurs qui ont suivi des protocoles différents est difficile. Toutes les différences de compétence des observateurs, d'effort spatial et de détectabilité des animaux dans l'espace doivent être prises en compte. Pour y parvenir, nous nous appuyons sur les récentes avancées réalisées dans les modèles intégrés de distribution des espèces et présentons un nouveau cadre de processus ponctuel spatio-temporel marqué pour estimer la distribution d'utilisation (UD) des individus d'une espèce hautement mobile. Nous montrons que, dans certains contextes, nous pouvons également utiliser le cadre pour combiner les UD des individus échantillonnés afin d'estimer la distribution de l'espèce. Nous combinons les résultats empiriques d'une étude de simulation avec les implications décrites dans un graphe acyclique dirigé causal pour identifier les hypothèses nécessaires requises pour que notre cadre contrôle l'effort d'observation lorsqu'il est inconnu. Nous appliquons ensuite notre cadre pour combiner plusieurs ensembles de données collectés sur les orques résidentes du sud, en voie de disparition, afin d'estimer leur utilisation de l'espace mensuelle corrigée par l'effort.

@article{doi10121421aoas1472,
    author = "Watson, Joe et Joy, Ruth et Tollit, Dominic et Thornton, Sheila J. et Auger‐Méthé, Marie",
    title = "Estimation des distributions d'utilisation animales à partir de multiples types de données : Un cadre de processus ponctuel spatio-temporel conjoint",
    year = "2021",
    journal = "The Annals of Applied Statistics",
    abstract = "Les modèles de la distribution spatiale des animaux fournissent des outils utiles pour aider les écologistes à quantifier les relations entre les espèces et leur environnement, et ils sont de plus en plus utilisés pour aider à déterminer les impacts des changements climatiques et d'habitat sur les espèces. Bien que des données de type enquête de haute qualité avec un effort connu soient parfois disponibles, les chercheurs ont souvent plusieurs ensembles de données de qualité et de type variables. En particulier, les collections d'observations réalisées par des scientifiques citoyens deviennent de plus en plus courantes, sans qu'aucune information ne soit généralement fournie sur leur effort d'observation. De nombreuses approches de modélisation standard ignorent complètement l'effort d'observation, ce qui peut fausser gravement les estimations de la distribution d'un animal. Combiner des données d'observations provenant d'observateurs qui ont suivi des protocoles différents est difficile. Toutes les différences de compétence des observateurs, d'effort spatial et de détectabilité des animaux dans l'espace doivent être prises en compte. Pour y parvenir, nous nous appuyons sur les récentes avancées réalisées dans les modèles intégrés de distribution des espèces et présentons un nouveau cadre de processus ponctuel spatio-temporel marqué pour estimer la distribution d'utilisation (UD) des individus d'une espèce hautement mobile. Nous montrons que, dans certains contextes, nous pouvons également utiliser le cadre pour combiner les UD des individus échantillonnés afin d'estimer la distribution de l'espèce. Nous combinons les résultats empiriques d'une étude de simulation avec les implications décrites dans un graphe acyclique dirigé causal pour identifier les hypothèses nécessaires requises pour que notre cadre contrôle l'effort d'observation lorsqu'il est inconnu. Nous appliquons ensuite notre cadre pour combiner plusieurs ensembles de données collectés sur les orques résidentes du sud, en voie de disparition, afin d'estimer leur utilisation de l'espace mensuelle corrigée par l'effort.",
    url = "https://doi.org/10.1214/21-aoas1472",
    doi = "10.1214/21-aoas1472",
    openalex = "W3082630804",
    references = "doi10249262020081320"
}

Un modèle de population logistique non autonome présentant une caractéristique de seuil d'Allee a été étudié dans un environnement périodiquement fluctuant. Une périodicité lente de l'effort de pêche a été considérée et peut survenir en réponse à des fluctuations relativement lentes de l'environnement. Cette hypothèse permet d'obtenir des solutions analytiques approchées de ce modèle en utilisant une approche de perturbation basée sur la variation lente. Ainsi, les expressions analytiques de l'évolution de la population dans les situations de pêche sous-critique et sur-critique ont été obtenues et discutées dans le cadre de l'effet Allee. Étant donné que la solution exacte n'était pas disponible en raison de la non-linéarité du système, un calcul numérique a été envisagé pour valider notre approximation analytique. La comparaison entre les deux méthodes a montré un accord remarquable au fur et à mesure que le temps progressait, tandis que cet accord diminuait lorsque le temps était proche de la densité initiale. De plus, en l'absence de périodicité du terme de pêche, les expressions de l'évolution de la population se réduisent aux solutions exactes, mais sous forme implicite. Les résultats obtenus sont appropriés pour une large gamme de valeurs de paramètres, ce qui permet d'éviter des recalculations étendues tout en affichant le comportement de la population.

@article{doi103934math2024430,
    author = "Alharbi, Fahad M.",
    title = "Harvesting a population model with Allee effect in a periodically varying environment",
    year = "2024",
    journal = "AIMS Mathematics",
    abstract = "Un modèle de population logistique non autonome présentant une caractéristique de seuil d'Allee a été étudié dans un environnement périodiquement fluctuant. Une périodicité lente de l'effort de pêche a été considérée et peut survenir en réponse à des fluctuations relativement lentes de l'environnement. Cette hypothèse permet d'obtenir des solutions analytiques approchées de ce modèle en utilisant une approche de perturbation basée sur la variation lente. Ainsi, les expressions analytiques de l'évolution de la population dans les situations de pêche sous-critique et sur-critique ont été obtenues et discutées dans le cadre de l'effet Allee. Étant donné que la solution exacte n'était pas disponible en raison de la non-linéarité du système, un calcul numérique a été envisagé pour valider notre approximation analytique. La comparaison entre les deux méthodes a montré un accord remarquable au fur et à mesure que le temps progressait, tandis que cet accord diminuait lorsque le temps était proche de la densité initiale. De plus, en l'absence de périodicité du terme de pêche, les expressions de l'évolution de la population se réduisent aux solutions exactes, mais sous forme implicite. Les résultats obtenus sont appropriés pour une large gamme de valeurs de paramètres, ce qui permet d'éviter des recalculations étendues tout en affichant le comportement de la population.",
    url = "https://doi.org/10.3934/math.2024430",
    doi = "10.3934/math.2024430",
    openalex = "W4392400231",
    references = "doi101016jnonrwa201107044"
}

Résumé La dispersion est un composant fondamental de l'histoire de vie des espèces, affectant les processus écologiques et évolutifs. Des modèles de dispersion spécifiques au sexe peuvent survenir pour atténuer les effets de la consanguinité, de la compétition entre parents ou de ressources limitées, et sont courants chez de nombreux taxons. Nous avons examiné la dispersion biaisée par le sexe de Fratercula arctica (Puffin d'Atlantique) éclos sur l'île Machias Seal vers 4 colonies de reproduction dans le golfe du Maine en utilisant des données de marquage-recapture. Nous avons évalué si un sexe se disperse plus fréquemment, s'il existe un biais sexuel dans le choix de la colonie de reproduction des F. arctica dispersés, et si le sexe interagit avec d'autres facteurs individuels pour influencer la dispersion. Il n'y a pas eu de différence significative dans la fréquence à laquelle les femelles et les mâles F. arctica se dispersaient, ni dans la colonie de reproduction vers laquelle ils se dispersaient. Cependant, nous avons trouvé qu'avec une date de décollage croissante, les femelles F. arctica étaient plus susceptibles de se disperser et les mâles moins susceptibles de se disperser, cette relation étant plus faible pour les mâles F. arctica. La date de décollage n'était pas liée à l'état corporel, et donc d'autres conditions d'élevage ou contraintes environnementales plus larges reflétées par la date de décollage peuvent être plus influentes pour les femelles lors de la prise de décisions de dispersion. Nos résultats suggèrent que les plus petites colonies du golfe du Maine reçoivent un ratio sexé équilibré d'immigrants de l'île Machias Seal, ce qui améliore notre compréhension de la dynamique des métapopulations. La fréquence de la dispersion a varié d'une année à l'autre et n'était pas entièrement expliquée par le sexe ou la date de décollage, soulignant la nécessité de recherches supplémentaires pour comprendre quels facteurs influencent la dispersion de F. arctica.

@article{doi101093ornithologyukaf073,
    author = "Carvey, Quinn B. et Diamond, Antony W et Lyons, Donald E et Major, Heather",
    title = "Le sexe interagit avec la date de décollage pour influencer la probabilité de dispersion chez Fratercula arctica (Puffin d'Atlantique)",
    year = "2025",
    journal = "The Auk",
    abstract = "Résumé La dispersion est un composant fondamental de l'histoire de vie des espèces, affectant les processus écologiques et évolutifs. Des modèles de dispersion spécifiques au sexe peuvent survenir pour atténuer les effets de la consanguinité, de la compétition entre parents ou de ressources limitées, et sont courants chez de nombreux taxons. Nous avons examiné la dispersion biaisée par le sexe de Fratercula arctica (Puffin d'Atlantique) éclos sur l'île Machias Seal vers 4 colonies de reproduction dans le golfe du Maine en utilisant des données de marquage-recapture. Nous avons évalué si un sexe se disperse plus fréquemment, s'il existe un biais sexuel dans le choix de la colonie de reproduction des F. arctica dispersés, et si le sexe interagit avec d'autres facteurs individuels pour influencer la dispersion. Il n'y a pas eu de différence significative dans la fréquence à laquelle les femelles et les mâles F. arctica se dispersaient, ni dans la colonie de reproduction vers laquelle ils se dispersaient. Cependant, nous avons trouvé qu'avec une date de décollage croissante, les femelles F. arctica étaient plus susceptibles de se disperser et les mâles moins susceptibles de se disperser, cette relation étant plus faible pour les mâles F. arctica. La date de décollage n'était pas liée à l'état corporel, et donc d'autres conditions d'élevage ou contraintes environnementales plus larges reflétées par la date de décollage peuvent être plus influentes pour les femelles lors de la prise de décisions de dispersion. Nos résultats suggèrent que les plus petites colonies du golfe du Maine reçoivent un ratio sexé équilibré d'immigrants de l'île Machias Seal, ce qui améliore notre compréhension de la dynamique des métapopulations. La fréquence de la dispersion a varié d'une année à l'autre et n'était pas entièrement expliquée par le sexe ou la date de décollage, soulignant la nécessité de recherches supplémentaires pour comprendre quels facteurs influencent la dispersion de F. arctica.",
    url = "https://doi.org/10.1093/ornithology/ukaf073",
    doi = "10.1093/ornithology/ukaf073",
    openalex = "W7117249024",
    references = "doi101007s10980022015096"
}

La dispersion est un processus fondamental qui entraîne de nombreux modèles écologiques. Lors du transfert, les espèces effectuent souvent des déplacements à grande échelle entraînant des pertes d'énergie significatives avec des implications pour l'aptitude et la survie, bien que la généralisation de ces pertes à travers différents groupes taxonomiques soit difficile. Nous avons développé un modèle de dispersion bioénergétique basé sur des processus fondamentaux dérivés des traits des espèces. En équilibrant le stockage d'énergie et la perte d'énergie lors de la dispersion active, notre modèle mécanistique peut quantifier les dépenses énergétiques en fonction de la configuration du paysage et de l'espèce en question. De plus, il peut être utilisé pour prédire la capacité de dispersion maximale des animaux, que nous comparons aux distances de dispersion maximales enregistrées (n = 1571). En raison de son fondement en bioénergétique, il peut facilement être intégré dans divers modèles écologiques, tels que les modèles de réseaux trophiques et de métacommunautés. De plus, comme la dispersion est intégrale à la recherche écologique, la quantification des capacités de dispersion fournit des aperçus précieux sur la connectivité du paysage, la persistance des espèces et les modèles de distribution avec des implications pour la recherche en conservation.

@article{doi101111ele70085,
    author = "Wilkinson, Caitlin et Brose, Ulrich et Dyer, Alexander et Hirt, Myriam R. et Ryser, Remo",
    title = "Une approche mécanistique de la dispersion animale—Quantification des énergétiques et des distances maximales",
    year = "2025",
    journal = "Ecology Letters",
    abstract = "La dispersion est un processus fondamental qui entraîne de nombreux modèles écologiques. Lors du transfert, les espèces effectuent souvent des déplacements à grande échelle entraînant des pertes d'énergie significatives avec des implications pour l'aptitude et la survie, bien que la généralisation de ces pertes à travers différents groupes taxonomiques soit difficile. Nous avons développé un modèle de dispersion bioénergétique basé sur des processus fondamentaux dérivés des traits des espèces. En équilibrant le stockage d'énergie et la perte d'énergie lors de la dispersion active, notre modèle mécanistique peut quantifier les dépenses énergétiques en fonction de la configuration du paysage et de l'espèce en question. De plus, il peut être utilisé pour prédire la capacité de dispersion maximale des animaux, que nous comparons aux distances de dispersion maximales enregistrées (n = 1571). En raison de son fondement en bioénergétique, il peut facilement être intégré dans divers modèles écologiques, tels que les modèles de réseaux trophiques et de métacommunautés. De plus, comme la dispersion est intégrale à la recherche écologique, la quantification des capacités de dispersion fournit des aperçus précieux sur la connectivité du paysage, la persistance des espèces et les modèles de distribution avec des implications pour la recherche en conservation.",
    url = "https://doi.org/10.1111/ele.70085",
    doi = "10.1111/ele.70085",
    openalex = "W4407777456",
    references = "doi101007s10980022015096"
}