Oiseaux du Crétacé

@article{sternberg1940a7,
    author = "Sternberg, C. M",
    title = "A toothless bird from the Cretaceous of Alberta",
    year = "1940",
    journal = "Journal of Paleontology, v. 14, p. 81-85",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sternberg, C. M., 1940, A toothless bird from the Cretaceous of Alberta: Journal of Paleontology, v. 14, p. 81-85.}"
}

@misc{gingerich1973skull1,
    author = "Gingerich, P. D",
    title = "Crâne de Hesperornis et l'évolution précoce des oiseaux",
    year = "1973",
    howpublished = "Nature, v. 243, p. 70-73",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gingerich, P. D., 1973, Crâne de Hesperornis et l'évolution précoce des oiseaux: Nature, v. 243, p. 70-73.}"
}

@article{doi101111j1474919x1974tb07648x,
    author = "Cracraft, Joël",
    title = "PHYLOGENY AND EVOLUTION OF THE RATITE BIRDS",
    year = "1974",
    journal = "Ibis",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1474-919x.1974.tb07648.x",
    doi = "10.1111/j.1474-919x.1974.tb07648.x",
    openalex = "W2086904451"
}

@misc{harrison1975the2,
    author = "Harrison, C. J. O. et Walker, C. A",
    title = "The Bradycnemidae, une nouvelle famille de chouettes du Crétacé supérieur de Roumanie",
    year = "1975",
    howpublished = "Palaeontology, v. 18, p. 563- 570",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Harrison, C. J. O., et Walker, C. A., 1975, The Bradycnemidae, une nouvelle famille de chouettes du Crétacé supérieur de Roumanie : Palaeontology, v. 18, p. 563- 570.}"
}

La question de l'origine des oiseaux peut être assimilée à l'origine de l'Archéoptéryx, le plus ancien oiseau connu. L'analyse des cinq spécimens squelettiques actuellement connus d'Archéoptéryx et la comparaison avec l'anatomie squelettique des plusieurs groupes reptiliens qui ont été proposés comme ancêtres possibles des oiseaux (Ornithopoda, Theropoda, Hseudosuchla et Sphenosuchidac), confirment les conclusions (longtemps rejetées par la plupart des chercheurs ultérieurs) de Heilmann (1926), Lowe (1935, 1944) et Holmgren (1955), à savoir que l'anatomie squelettique d'Archéoptéryx est extraordinairement similaire à celle des dinosaures coelurosauriens contemporains et postérieurs. Le rejet de ces similitudes comme structures adaptatives uniquement (similitudes parallèles ou convergentes), et donc sans importance phylogénétique, est ici considéré comme invalide. Heilmann a été le premier à identifier la seule preuve qui ait été citée jusqu'à présent pour rejeter les relations ancêtre-descendant coelurosaurien-avianes, la prétendue absence de clavicules chez tous les theropodes, et sur cette base a suggéré une ancêtre-descendant commune Archéoptéryx-dinosaure parmi les reptiles pseudosuchiens. Cette preuve est négative et donc inconclusive, et est maintenant connue pour être fausse. À l'exception des clavicules fusionnées et de la morphologie ischiale unique, pratiquement toutes les caractéristiques squelettiques d'Archéoptéryx sont connues chez plusieurs dinosaures coelurosauriens contemporains ou quasi-contemporains et beaucoup de ces conditions sont des caractères spécialisés non liés (la morphologie détaillée de la main, du métacarpe, du carpe, de l'humérus, du scapulo-coracoïde, du pied, du métatarse, du tarse, du fémur, du pubis, de l'ilium, du crâne et des mandibules). La présence de tant de caractères dérivés en commun établit clairement que les affinités ancestrales les plus proches d'Archéoptéryx sont avec les theropodes coelurosauriens. Il n'y a aucune preuve contraire et toute autre explication est illogique. Toutes les preuves disponibles indiquent sans équivoque qu'Archéoptéryx a évolué à partir d'un petit dinosaure coelurosaurien et que les oiseaux modernes sont des descendants dinosaures survivants. Énoncé simplement, la phylogénie avienne était : Pseudosuchia Coelurosauria Archéoptéryx oiseaux supérieurs. La question de l'origine des oiseaux peut être assimilée à la question de l'origine d'Archéoptéryx. Cette dernière question évoque deux réponses possibles, selon la manière dont on considère l'importance des « caractères primitifs versus dérivés » dans l'évaluation des relations phylogénétiques. Une réponse possible est : Archéoptéryx est un descendant direct d'un pseudosuchien inconnu, mais supposé semblable à Euparkeria. Cette réponse repose sur la croyance qu'Archéoptéryx ne fait que paralléliser ou converger avec divers coelosaures dans certaines similitudes squelettiques. C'est la vue maintenant tenue par la majorité des biologistes – une vue que je trouve inacceptable. La deuxième réponse possible est : Archéoptéryx est directement descendant d'un petit dinosaure coelurosaurien inconnu semblable à Ornitholestes. Cette réponse suppose que les similitudes squelettiques entre coelosaures et Archéoptéryx sont dérivées d'un ancêtre commun, lui-même un coelosaure. C'est la vue défendue ici. Il n'y a aucune preuve pour soutenir une origine ornithischienne des oiseaux. Le pubis d'Archéoptéryx n'était apparemment pas réfléchi vers l'arrière comme chez les ornithischiens et les oiseaux modernes, et de toute façon, le pubis ornithischien n'est que superficiellement semblable à celui des oiseaux vivants. De même, le pied dit ornithopode n'est pas semblable à celui des oiseaux. Cependant, les preuves de relations étroites theropode-Archéoptéryx sont abondantes : la présence des mêmes, multiples, adaptations spécialisées chez Archéoptéryx et divers coelosaures (main tridactyle, morphologie du métacarpe et du carpe, structure de l'avant-bras et de la ceinture pectorale, pied à quatre doigts, hallux inversé, morphologie du métatarse, articulation mésotarsale, construction des membres postérieurs, forme pelvienne, plus membres antérieurs allongés, posture bipède, structure et formule vertébrale, et morphologie crânienne de base). La présence chez Archéoptéryx, coelosaures et pseudosuchiens de plusieurs caractères primitifs en commun (dentition thecodonte, anneau sclérotique, vertèbres peut-être amphicoèles, longue série caudale, gastralia, symphyse pubienne, coracoïdes courts) indique seulement une ancêtre commune probable. Cela n'établit pas que les Coelurosauria n'auraient pas pu donner naissance à Archéoptéryx – et aux oiseaux supérieurs. Il n'y a aucune preuve (à l'exception de Lagosuchus et Lagerpeton) de caractères dérivés partagés pour suggérer une relation évolutive étroite entre les pseudosuchiens classiques et Archéoptéryx. De même, il n'y a aucune preuve claire sous la forme de caractères dérivés partagés pour lier Archéoptéryx à Sphenosuchus. L'absence de clavicules chez les theropodes (maintenant connue pour être fausse), autrefois considérée comme une preuve conclusive contre une origine coelurosaurienne des oiseaux, n'est pas plus significative que l'absence de sternum chez tous les pseudosuchiens connus comme preuve contre une origine pseudosuchienne de tous les autres archosaures. L'absence de tout « idéal » coelurosaurien pré-Archéoptéryx connu n'est qu'une preuve négative et inconclusive, surtout compte tenu de notre connaissance misérable et extrêmement déficiente sur les vertébrés terrestres du Jurassique inférieur et moyen. Toutes les preuves disponibles indiquent que l'ancêtre immédiat d'Archéoptéryx était un petit dinosaure coelurosaurien et que la phylogénie de l'ascendance avienne était : Pseudosuchia–Coelurosauria–Archéoptéryx :– oiseaux supérieurs. Les affinités ancêtre-descendant Ornithopode-Archéoptéryx peuvent être rejetées en raison de l'organisation pelvienne faussement « avienne » du spécimen de Berlin d'Archéoptéryx et de la construction pelvienne ornithischienne uniquement superficiellement semblable à celle des oiseaux. L'ensemble de caractères spécialisés uniques aux ornithischiens (par exemple, prédentaire, morphologie dentaire), qui se produisent même chez les représentants triasiques, est une preuve supplémentaire pour rejeter une affinité étroite entre ornithopodes et Archéoptéryx. La relation supposée étroite entre les oiseaux et les pseudosuchiens est jugée à tout le mieux lointaine, en raison de la nature complètement primitive des quelques caractéristiques anatomiques que les pseudosuchiens ont en common avec Archaeopteryx. Sphenosuchus, un archosaure primitif et ancien, est également un ancêtre aviaire potentiel, mais les preuves existantes consistent en des caractéristiques archosauriennes primitives plus quelques similitudes avec certains oiseaux modernes. Ces similitudes, qui sont présentes dans deux groupes séparés l'un de l'autre par plus de 200 millions d'années, et qui ne peuvent pas être démontrées chez Archaeopteryx, sont considérées comme sans rapport avec les origines d'Archaeopteryx et des oiseaux ultérieurs.

@article{doi101111j109583121976tb00244x,
    author = "Ostrom, John H.",
    title = "Archaeopteryx and the origin of birds",
    year = "1976",
    journal = "Biological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "The question of the origin of birds can be equated with the origin of Archaeopteryx, the oldest known bird. Analysis of the five presently known skeletal specimens of Archaeopteryx. and comparison with the skeletal anatomy of the several reptilian groups that have been proposed as possible ancestors of birds (Ornithopoda, Theropoda, Hseudosuchla and Sphenosuchidac), confirm the conclusions (long rejected by most subsequent workers) of Heilmann (1926), Lowe (1935, 1944) and Holmgren (1955), namely, that the skeletal anatomy of Archaeopteryx is extraordinarily similar to that of contemporaneous and succeeding coelurosaurian dinosaurs. Rejection of these similarities as adaptive structures only (parallel or convergent similarities), and therefore of no phylogenetic importance, is here considered invalid. Heilmann was the first to identify the only evidence that has been cited so far for dismissing coelurosaurian-avian ancestral–descendant relationships, the supposed absence of clavicles in all theropods, and on that basis suggested a common Archaeopteryx–dinosaur ancestry among pseudosuchian reptiles. That evidence is negative and thus inconclusive, and is now known to be false. With the exception of fused clavicles and unique ischial morphology, virtually every skeletal feature of Archaeopteryx is known in several contemporaneous or near-contemporary coelurosaurian dinosaurs and many of these conditions are unrelated, specialized features (the detailed morphology of the manus, metacarpus, carpus, humerus, scapulocoracoid, pes, metatarsus, tarsus, femur, pubis, ilium, skull and mandibles). The presence of so many derived characters in common clearly establishes that the closest ancestral affinities ot Archaeopteryx are with coelurosaurian theropods. There is no contrary evidence and any other explanation is illogical. All available evidence indicates unequivocally that Archaeopteryx evolved from a small coelurosaurian dinosaur and that modern birds are surviving dinosaurian descendants. Stated simply, avian phylogeny was: Pseudosuchia Coelurosauria Archaeopteryx higher birds. The question of the origin of birds can be equated with the question of the origin of Archaeopteryx. This last question evokes two possible answers, depending upon how one views the importance of “primitive versus derived characters” in assessing phylogenetic relationships. One possible answer is: Archaeopteryx is a direct descendant of some unknown, but presumably Euparkeria-like pseudosuchian. This answer is predicated on the belief that Archaeopteryx only parallels or converges with various coelurosaurs in certain skeletal similarities. This is the view now held by the majority of biologists– a view that I find unacceptable. The second possible answer is: Archaeopteryx is directly descendant from a small unknown Ornitholestes-like coelurosaurian dinosaur. This answer assumes that skeletal similarities between coelurosaurs and Archaeopteryx are derived from a common ancestor, itself a coelurosaur. This is the view advocated here. There is no evidence to support an ornithischian ancestry of birds. The pubis of Archaeopteryx apparently was not reflected backward as in ornithischians and modern birds, and in any case, the ornithischian pubis is only superficially like that of living birds. Nor is the so-called ornithopod foot like that of birds. Evidence of close theropod–Archaeopteryx relationships, however, is abundant: the presence of the same, multiple, specialized adaptations in both Archaeopteryx and various coelurosaurs (tridactyl manus, metacarpus and carpus morphology, forelimb and pectoral girdle structure, four-toed pes, reversed hallux, metatarsal morphology, mesotarsal joint, hindlimb construction, pelvic form, plus elongated forelimbs, bipedal posture, vertebral structure and formula, and basic cranial morphology). The presence in Archaeopteryx, coelurosaurs and pseudosuchians of several primitive characters in common (thecodont dentition, sclerotic ring, possibly amphicoelous vertebrae, long caudal series, gastralia, pubic symphysis, short coracoids) indicates only a probable common ancestry. It does not establish that the Coelurosauria could not have given rise to Archaeopteryx–and higher birds. There is no evidence (outside of Lagosuchus and Lagerpeton) of shared derived characters to suggest a close evolutionary relationship between classic pseudosuchians and Archaeopteryx. Similarly, there is no clear-cut evidence in the form of shared derived characters to link Archaeopteryx with Sphenosuchus. The absence of clavicles in theropods (now known to be false), once considered as conclusive evidence against a coelurosaurian ancestry of birds, is no more significant than is the absence of a sternum in all known pseudosuchians as evidence against a pseudosuchian ancestry of all other archosaurs. The absence of any known “ideal” coelurosaurian pre-Archaeopteryx is only negative and inconclusive evidence, especially in view of our meagre and exceedingly deficient knowledge about Early and Middle Jurassic terrestrial vertebrates. All available evidence indicates that the immediate ancestor of Archaeopteryx was a small coelurosaurian dinosaur and that the phylogeny of avian ancestry was: Pseudosuchia–Coelurosauria–Archaeopteryx:– higher birds. Ornithopod-Archaeopteryx ancestral-descendant affinities may be dismissed because of the false “avian” organization of the pelvis in the Berlin specimen of Archaeopteryx and the merely superficially bird-like construction of the ornithisehian pelvis. The suite of specialized characters unique to ornithischians (e.g., predentary, tooth morphology), that occur even in Triassic representatives, is further evidence for dismissing close affinity between ornithopods and Archaeopteryx. The supposed close relationship between birds and pseudosuchians is judged to be remote at best, due to the completely primitive nature of the few anatomical features which pseudosuchians have in common with Archaeopteryx. Sphenosuchus, a primitive and early archosaur, is also a potential avian ancestor, but existing evidence consists of primitive archosaurian features plus a few similarities with certain modern birds. These similarities, which are present in two groups that are separated from each other by more than 200 million years, and which cannot be demonstrated in Archaeopteryx, are considered irrelevant to the origins of Archaeopteryx and subsequent birds.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1976.tb00244.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8312.1976.tb00244.x",
    openalex = "W2090677329",
    references = "doi101002jmor1051140102, doi10103714088000, doi101038248168a0, doi101086407902, doi101098rstb19610007, doi101098rstb19650003, doi101111j146979981913tb06148x, doi101139e72031, doi101146annurevea03050175000415, doi101146annureven10010165000525, doi10129879781933789439, doi1023071292217, doi1023071441916, doi104095101672, doi104095105003, doi105281zenodo1040385, doi105479si03629236110i, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle68064, doi107312simp92414, gilmore1924a, openalexw1879660213, openalexw3146596760, openalexw607142922, ostrom2019osteology, ostrom2020stratigraphy, russell1969a, walker1964triassic"
}

RÉSUMÉ Une grande dalle de siltstone argileux a été collectée dans les strates de la formation de Gething (Aptien, Crétacé inférieur) dans le canyon de la rivière Peace, au nord-est de la Colombie-Britannique, Canada. Plus de 200 empreintes d'une longueur comprise entre 2,0 et 4,4 cm ont été trouvées sur un seul plan de stratification au sein de la dalle. Ces empreintes ont été faites par un minimum de quatre individus qui semblaient se nourrir. Les empreintes ont une divarication moyenne de 113° et un rapport largeur/longueur corrélé de 1,26, ce qui se situe dans la plage rencontrée chez les oiseaux. La divarication entre les doigts II et IV, même chez les plus petits dinosaures, n'excède jamais 100° en moyenne par piste. D'autres caractéristiques soutiennent l'identification de ces pistes provenant du canyon de la rivière Peace comme ayant été faites par des oiseaux. Le nouveau genre et espèce, Aquatilavipes swiboldae, est le plus ancien enregistrement connu d'empreintes d'oiseaux et représente probablement un taxon primitif d'oiseau vivant dans les marais.

@article{doi10108002724634198110011900,
    author = "Currie, Philip J.",
    title = "Bird footprints from the Gething Formation (Aptian, Lower Cretaceous) of northeastern British Columbia, Canada",
    year = "1981",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "RÉSUMÉ Une grande dalle de siltstone argileux a été collectée dans les strates de la formation de Gething (Aptien, Crétacé inférieur) dans le canyon de la rivière Peace, au nord-est de la Colombie-Britannique, Canada. Plus de 200 empreintes d'une longueur comprise entre 2,0 et 4,4 cm ont été trouvées sur un seul plan de stratification au sein de la dalle. Ces empreintes ont été faites par un minimum de quatre individus qui semblaient se nourrir. Les empreintes ont une divarication moyenne de 113° et un rapport largeur/longueur corrélé de 1,26, ce qui se situe dans la plage rencontrée chez les oiseaux. La divarication entre les doigts II et IV, même chez les plus petits dinosaures, n'excède jamais 100° en moyenne par piste. D'autres caractéristiques soutiennent l'identification de ces pistes provenant du canyon de la rivière Peace comme ayant été faites par des oiseaux. Le nouveau genre et espèce, Aquatilavipes swiboldae, est le plus ancien enregistrement connu d'empreintes d'oiseaux et représente probablement un taxon primitif d'oiseau vivant dans les marais.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.1981.10011900",
    doi = "10.1080/02724634.1981.10011900",
    openalex = "W2068872705",
    references = "doi101007978364265923214, doi1010160031018279901147, doi101038261129a0, doi10108001584197196611797177, doi1011639789004631793, doi102475ajss521125441, doi104095105049, doi105281zenodo16246150, openalexw2069202983, openalexw23418293, openalexw3146596760"
}

@misc{hou1984a3,
    author = "Hou, L. et Zhicheng, L",
    title = "Un nouvel oiseau fossile du Crétacé inférieur du Gansu, et l'évolution précoce des oiseaux",
    year = "1984",
    howpublished = "Sci. Sinica B, v. XXVII, p. 1296- 1302",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Hou, L., et Zhicheng, L., 1984, Un nouvel oiseau fossile du Crétacé inférieur du Gansu, et l'évolution précoce des oiseaux : Sci. Sinica B, v. XXVII, p. 1296- 1302.}"
}

@inproceedings{kesler1984lower4,
    author = "Kesler, E",
    title = "Oiseaux du Crétacé inférieur de Cornet (Roumanie), dans Reif, W. E., et Westphal, F., éd., Troisième Symposium sur les écosystèmes terrestres du Mésozoïque",
    year = "1984",
    booktitle = "Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 119-121",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Kesler, E., 1984, Oiseaux du Crétacé inférieur de Cornet (Roumanie), dans Reif, W. E., et Westphal, F., éd., Troisième Symposium sur les écosystèmes terrestres du Mésozoïque: Tbingen, ATTEMPTO-Verlag, p. 119-121.}"
}

@article{doi1010160195667185900503,
    author = "Курочкин, Е. Н.",
    title = "A true carinate bird from lower Cretaceous deposits in Mongolia and other evidence of early Cretaceous birds in Asia",
    year = "1985",
    journal = "Cretaceous Research",
    url = "https://doi.org/10.1016/0195-6671(85)90050-3",
    doi = "10.1016/0195-6671(85)90050-3",
    openalex = "W1998105085"
}

@misc{kurochkin1985a5,
    author = "Kurochkin, E. N",
    title = "Un véritable oiseau cariné des dépôts du Crétacé inférieur en Mongolie et autres preuves d'oiseaux du Crétacé inférieur en Asie",
    year = "1985",
    howpublished = "Cretaceous Research, v. 6, p. 271-278",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Kurochkin, E. N., 1985, Un véritable oiseau cariné des dépôts du Crétacé inférieur en Mongolie et autres preuves d'oiseaux du Crétacé inférieur en Asie: Cretaceous Research, v. 6, p. 271-278.}"
}

Une analyse cladistique numérique de 73 caractères crâniens et postcrâniens a abouti à une hypothèse fortement corroborée décrivant le modèle phylogénétique de l'évolution avienne précoce. En utilisant les dinosaures « theropodes non aviens » comme groupe externe comparatif et comme racine de l'arbre, l'analyse a confirmé que l'Archaeopteryx est le groupe frère de tous les taxons aviens restants, ou Ornithurae. Ce dernier taxon est subdivisé en deux lignées, les Hesperornithiformes et les Carinatae. Les carinates, à leur tour, ont également été résolues en deux groupes frères, les Ichthyornithiformes et les oiseaux modernes, ou Neornithes. Cet article fournit des données morphologiques corroborant la divergence des deux clades basaux des Neornithes : les Palaeognathae (tinamous et ratites) et les Neognathae (tous les autres oiseaux modernes). Les relations phylogénétiques de quatre taxons importants du Crétacé ont également été étudiées, mais ces taxons fossiles étaient trop fragmentaires pour déterminer leur position phylogénétique sans ambiguïté. Alexornis et Ambiortus sont tous deux des carinates, mais leurs relations ne peuvent être résolues avec plus de détails. Les relations des Enantiornithes peuvent se situer au sein des Carinatae ou ces deux taxons peuvent être des groupes frères. Gobipteryx est un neornithine et peut-être le groupe frère des Palaeognathae. Cette analyse indique que les principaux modèles de changement morphologique ont eu lieu au moment de l'origine des ancêtres des Ornithurae et des Carinatae. Les innovations ornithurines ont inclus des changements majeurs dans tout le squelette, tandis que celles des carinates, bien que substantielles, étaient principalement restreintes à la ceinture pectorale et à l'avant-bras. Les résultats phylogénétiques, conjugués aux âges connus des taxons fossiles, indiquent que les lignées précoces des oiseaux sont très probablement apparues au Jurassique. Les événements cladistiques précoces au sein de la lignée neornithine sont également plus anciens que généralement reconnu, et peuvent bien remonter au Crétacé inférieur.

@article{doi101017s0094837300003122,
    author = "Cracraft, Joël",
    title = "The origin and early diversification of birds",
    year = "1986",
    journal = "Paleobiology",
    abstract = "Numerical cladistic analysis of 73 cranial and postcranial characters has resulted in a highly corroborated hypothesis describing the phylogenetic pattern of early avian evolution. Using “non-avian theropod” dinosaurs as a comparative outgroup and root for the tree, the analysis confirmed Archaeopteryx to be the sister-group of all remaining avian taxa, or Ornithurae. This latter taxon is subdivided into two lineages, the Hesperornithiformes and the Carinatae. The carinates, in turn, were also resolved into two sister-groups, the Ichthyornithiformes and the modern birds, or Neornithes. This paper provides morphological data corroborating the divergence of the two basal clades of the Neornithes: the Palaeognathae (tinamous and ratites) and Neognathae (all other modern birds). The phylogenetic relationships of four important Cretaceous taxa were also investigated, but these fossil taxa were too fragmentary to determine their phylogenetic position unambiguously. Alexornis and Ambiortus are both carinates, but their relationships cannot be resolved in greater detail. The relationships of the Enantiornithes may lie within the Carinatae or these two taxa may be sister-groups. Gobipteryx is a neornithine and possibly the sister-group of the Palaeognathae. This analysis indicates that major patterns of morphological change took place at the time of origin of the ancestors of the Ornithurae and the Carinatae. Ornithurine innovations included major changes throughout the skeleton, whereas those of the carinates, while substantial, were primarily restricted to the pectoral girdle and forelimb. The phylogenetic results, in conjunction with the known ages of fossil taxa, indicate that the early lineages of birds very likely arose in the Jurassic. The early cladistic events within the neornithine lineage are also more ancient than generally recognized, and may well extend back to the early Cretaceous.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0094837300003122",
    doi = "10.1017/s0094837300003122",
    openalex = "W2487566718"
}

@misc{sanz1988unusual6,
    author = "Sanz, J. L. et Bonaparte, J. F. et Lacasa, A",
    title = "Oiseaux du Crétacé inférieur inhabituels d'Espagne",
    year = "1988",
    howpublished = "Nature, v. 331, p. 433-435",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sanz, J. L., Bonaparte, J. F., et Lacasa, A., 1988, Oiseaux du Crétacé inférieur inhabituels d'Espagne : Nature, v. 331, p. 433-435.}"
}

L'un des progrès les plus marquants en paléontologie des vertébrés au cours des dernières décennies a été la résolution de la question de l'origine des oiseaux, un problème qui a tourmenté les biologistes évolutionnistes bien avant Darwin. Il est vrai que le consensus n'est pas unanime et que de nombreux détails de cette branche de l'arbre phylogénétique restent à élucider, mais nous avons désormais une image beaucoup plus claire de ce problème qu'il y a une décennie. Moins résolue, mais tout aussi stimulante, est la controverse sur l'origine du vol chez les oiseaux et autres vertébrés volants. Y a-t-il eu une phase de planeur ? Le vol a-t-il commencé du sol vers le haut ou des arbres vers le bas ? Les oiseaux étaient-ils initialement arboricoles ? Quelles pressions sélectives ont poussé les ancêtres des oiseaux à profiter de l'opportunité aérienne ?

@article{doi101017s247526300000091x,
    author = "Gauthier, Jacques A. et Padian, Kevin",
    title = "The Origin of Birds and the Evolution of Flight",
    year = "1989",
    journal = "Short Courses in Paleontology",
    abstract = "L'un des progrès les plus marquants en paléontologie des vertébrés au cours des dernières décennies a été la résolution de la question de l'origine des oiseaux, un problème qui a tourmenté les biologistes évolutionnistes bien avant Darwin. Il est vrai que le consensus n'est pas unanime et que de nombreux détails de cette branche de l'arbre phylogénétique restent à élucider, mais nous avons désormais une image beaucoup plus claire de ce problème qu'il y a une décennie. Moins résolue, mais tout aussi stimulante, est la controverse sur l'origine du vol chez les oiseaux et autres vertébrés volants. Y a-t-il eu une phase de planeur ? Le vol a-t-il commencé du sol vers le haut ou des arbres vers le bas ? Les oiseaux étaient-ils initialement arboricoles ? Quelles pressions sélectives ont poussé les ancêtres des oiseaux à profiter de l'opportunité aérienne ?",
    url = "https://doi.org/10.1017/s247526300000091x",
    doi = "10.1017/s247526300000091x",
    openalex = "W3158295341"
}

Résumé Le plus ancien oiseau fossile connu du Trias supérieur (il y a environ 225 millions d'années), de la formation de Dockum au Texas, fournit des aperçus sur l'anatomie, l'évolution et les relations phylogénétiques des premiers oiseaux. De son vivant, cet oiseau adulte était à peu près de la taille d'un faisan (Phasianus) en comptant sa longue queue osseuse. De nombreux caractères du crâne montrent que l'espèce du Texas est plus étroitement liée à d'autres oiseaux qu'à tout groupe d'archosaures connu. Le crâne est léger, pneumatisé, avec une orbite énorme et une région temporale élargie. Les dents sont limitées à l'extrémité des mâchoires, les dents postérieures ayant été perdues. La région temporale est modifiée par rapport à la condition diapside, comme chez les oiseaux modernes, où l'orbite est confluent avec les ouvertures temporales supérieures et inférieures en raison de la disparition des arcades temporales. La taille relativement grande du cerveau et la modification de l'architecture cérébrale à la manière aviaire montrent des spécialisations neurosensorielles qui peuvent être associées à l'équilibre, la coordination, le vol, l'agilité et une activité métabolique élevée. La nouvelle espèce avait une vision binoculaire, ce qui suggère qu'il s'agissait d'un prédateur orienté visuellement. L'acuité auditive peut être associée à un comportement vocal. Le quadratum était streptostylique et toute la mâchoire supérieure était déplacée prokinétiquement comme chez les oiseaux modernes. Parmi les hypothèses actuelles concernant les relations des oiseaux parmi les archosaures, les hypothèses theropode et crocodilien ont toutes deux été soutenues par des apomorphies partagées. Certaines des caractéristiques aviaires du crâne crocodilien peuvent avoir été acquises convergemment en raison de l'homoplasie. À l'inverse, le crâne hautement akinétique et le quadratum monimostylique, ainsi que l'architecture cérébrale primitive chez les premiers crocodylomorphes, nient ses proches relations phylogénétiques avec les oiseaux. Parmi les archosaures, les theropodes sont les plus proches des oiseaux, mais il n'est pas encore certain quel taxon est le groupe frère parmi les theropodes. L'analyse cladistique numérique de 30 caractères crâniens a généré une hypothèse du motif phylogénétique de l'évolution aviaire précoce. En utilisant les theropodes et les sphénosuchidés comme groupes externes comparatifs et racine de l'arbre, l'analyse confirme la monophylie de la classe Aves. L'Archaeopteryx est le taxon le plus primitif et est groupe frère de tous les autres oiseaux. Archaeoptryx, Avimimus et l'oiseau du Texas sont successivement plus proches des taxons aviaires restants ou des Ornithurae. Hesprom, Ichthyornis et Gobipteryx sont les représentants du Crétacé des Ornithurae. L'oiseau du Trias étend le registre aviaire connu d'au moins 75 millions d'années et documente une étape précoce dans l'évolution des oiseaux modernes. Le crâne aviaire a évolué en réponse à deux exigences fonctionnelles : un mécanisme d'alimentation efficace, conduisant au développement de la cinétique crânienne, et des spécialisations neurosensorielles conduisant à l'agrandissement du boîtier crânien et de l'orbite. La cinétique crânienne, l'inflation du boîtier crânien et la spécialisation otique ont considérablement modifié l'architecture des premiers crânes aviaires par rapport à la condition theropode. L'analyse phylogénétique suggère que les theropodes partageaient une ascendance commune avec les oiseaux, mais il est indéterminé à partir du registre fossile si l'ancêtre commun immédiat lui-même était un theropode.

@article{doi101098rstb19910056,
    author = "Chatterjee, Sankar",
    title = "Anatomie crânienne et relations d'un nouveau oiseau du Trias du Texas",
    year = "1991",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Abstract Le plus ancien oiseau fossile connu du Trias supérieur (il y a environ 225 millions d'années), de la formation de Dockum au Texas, fournit des aperçus sur l'anatomie, l'évolution et les relations phylogénétiques des premiers oiseaux. De son vivant, cet oiseau adulte était à peu près de la taille d'un faisan (Phasianus) en comptant sa longue queue osseuse. De nombreux caractères du crâne montrent que l'espèce du Texas est plus étroitement liée à d'autres oiseaux qu'à tout groupe connu d'archosaures. Le crâne est léger, pneumatisé, avec une orbite énorme et une région temporale élargie. Les dents sont limitées à l'extrémité des mâchoires, les dents postérieures ayant été perdues. La région temporale est modifiée par rapport à la condition diapside, comme chez les oiseaux modernes, où l'orbite est confluent avec les ouvertures temporales supérieures et inférieures en raison de la disparition des arcades temporales. La taille relativement grande du cerveau et la modification de l'architecture cérébrale à la manière aviaire montrent des spécialisations neurosensorielles qui peuvent être associées à l'équilibre, la coordination, le vol, l'agilité et une activité métabolique élevée. La nouvelle espèce avait une vision binoculaire, ce qui suggère qu'elle était un prédateur orienté visuellement. L'acuité auditive peut être associée à un comportement vocal. Le quadrate était streptostyle et toute la mâchoire supérieure était déplacée prokinétiquement comme chez les oiseaux modernes. Parmi les hypothèses actuelles concernant les relations des oiseaux parmi les archosaures, les hypothèses theropode et crocodilien ont toutes deux été soutenues par des apomorphies partagées. Certaines des caractéristiques aviaires du crâne crocodilien peuvent avoir été acquises convergemment en raison de l'homoplasie. Inversement, le crâne hautement akinétique et le quadrate monimostyle, ainsi que l'architecture cérébrale primitive chez les premiers crocodylomorphes, nient ses proches relations phylogénétiques avec les oiseaux. Parmi les archosaures, les theropodes sont les plus proches des oiseaux, mais il n'est pas encore certain quel taxon est le groupe frère parmi les theropodes. L'analyse cladistique numérique de 30 caractères crâniens a généré une hypothèse du modèle phylogénétique de l'évolution aviaire précoce. En utilisant les theropodes et les sphénosuchiens comme groupes externes comparatifs et racine de l'arbre, l'analyse confirme la monophylie de la classe Aves. Archaeopteryx est le taxon le plus primitif et est groupe frère de tous les autres oiseaux. Archaeoptryx, Avimimus et l'oiseau du Texas sont successivement plus proches des taxons aviaires restants ou des Ornithurae. Hesprom, Ichthyornis et Gobipteryx sont les représentants du Crétacé des Ornithurae. L'oiseau du Trias étend le registre aviaire connu d'au moins 75 millions d'années et documente une étape précoce dans l'évolution des oiseaux modernes. Le crâne aviaire a évolué en réponse à deux exigences fonctionnelles : un mécanisme d'alimentation efficace, conduisant au développement de la cinétique crânienne, et des spécialisations neurosensorielles conduisant à l'agrandissement du boîtier crânien et de l'orbite. La cinétique crânienne, l'inflation du boîtier crânien et la spécialisation otique ont considérablement modifié l'architecture des premiers crânes aviaires par rapport à la condition theropode. L'analyse phylogénétique suggère que les theropodes partageaient une ascendance commune avec les oiseaux, mais il est indéterminé à partir du registre fossile si l'ancêtre commun immédiat lui-même était un theropode.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1991.0056",
    doi = "10.1098/rstb.1991.0056",
    openalex = "W2106587915",
    references = "crossref1976allosaurus, doi101016b978012249408650011x, doi101038142004a0, doi101111j109583121976tb00244x, doi101111j155856461951tb02756x, doi1023072407154, doi1023072413134, doi1023072806339, doi1023073514548, openalexw1489366593, openalexw3135630760"
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Partie 1 : un bref historique, structure et propriétés de l'ADN, structure et fonction des gènes, régulation génétique, réassociation de l'ADN et stabilité thermique, organisation en séquences du génome, familles d'ADN répété, homologie, études comparatives ADN-ADN, matériel et méthodes, analyse des données, tempo de l'évolution, facteurs démographiques et taux d'évolution de l'ADN, revue chronologique de la classification des oiseaux, principes et méthodes de classification, classification des oiseaux basée sur l'hybridation ADN-ADN, courbes de fusion et dendrogrammes. Partie 2 : comptes rendus des groupes d'oiseaux.

@book{doi102307jctt1xp3v3r,
    author = "Sibley, Charles G. et Ahlquist, Jon E.",
    title = "Phylogénie et classification des oiseaux",
    year = "1991",
    booktitle = "Yale University Press eBooks",
    abstract = "Partie 1 : un bref historique, structure et propriétés de l'ADN, structure et fonction des gènes, régulation génétique, réassociation de l'ADN et stabilité thermique, organisation en séquences du génome, familles d'ADN répété, homologie, études comparatives ADN-ADN, matériel et méthodes, analyse des données, tempo de l'évolution, facteurs démographiques et taux d'évolution de l'ADN, revue chronologique de la classification des oiseaux, principes et méthodes de classification, classification des oiseaux basée sur l'hybridation ADN-ADN, courbes de fusion et dendrogrammes. Partie 2 : comptes rendus des groupes d'oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.2307/j.ctt1xp3v3r",
    doi = "10.2307/j.ctt1xp3v3r",
    openalex = "W1564490336"
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Résumé L'occurrence, la systématique, l'importance paléobiologique et évolutive des traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Mésozoïque sont examinées à la lumière des récentes nouvelles découvertes en Asie de l'Est, en Afrique et en Amérique du Nord. Les preuves d'empreintes les plus abondantes proviennent actuellement des dépôts du Crétacé inférieur d'Asie de l'Est et d'Amérique du Nord, où il existe désormais un registre de traces substantiel pour les limicoles. Cependant, il existe également un registre significatif de traces d'oiseaux semblables pré-crétacées. La formation de Jindong du Crétacé en Corée du Sud a récemment fourni plus de 30 localités et niveaux stratigraphiques, triplant le précédent record mondial et fournissant des preuves de grandes limicoles jusqu'alors inconnues : Jindongornipes kimi ichnogen. et ichnosp. nov. Comme les autres ichnotaxa précédemment nommés, ce type de trace d'oiseau représente probablement une espèce charadriiforme. Il est inclus avec Ignotornis et Koreanaornis dans la nouvelle ichnofamille Ignotornidae. Les traces d'oiseaux du Crétacé inférieur sont abondantes, montrent généralement des densités élevées (100-300 traces m2) et se produisent souvent en association avec des traces d'invertébrés, supposées avoir été faites par les organismes sur lesquels les oiseaux se nourrissaient. De telles preuves de traces suggèrent que les communautés d'oiseaux aquatiques étaient bien établies à la fin du Crétacé inférieur. Cela correspond à environ 30 Ma avant la radiation supposée d'oiseaux aquatiques déduite des restes squelettiques aviens du Crétacé supérieur, mais est cohérent avec les hypothèses suggérant un stock ancestral de limicoles. Les traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Jurassique et du Crétacé supérieur sont variables en morphologie, toujours mal comprises, et parfois attribuées à de petits dinosaures coelurosauriens. Cependant, les preuves actuelles suggèrent que l'ichnogenre aviforme jurassique Trisauropodiscus peut être d'origine aviaire. Il est suffisamment distinct des traces typiques grallatorid (coelurosauriennes) pour justifier la reconnaissance d'une nouvelle ichnofamille (Trisauropodiscidae), qui inclut l'ichnoespèce nouvellement décrite Trisauropodiscus moabensis d'Amérique du Nord. Les traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Jurassique et du Crétacé sont montrées comme étant beaucoup plus abondantes et distinctives que précédemment supposé. De plus, elles ajoutent significativement à notre compréhension de l'évolution aviaire précoce et de la paléoécologie, et fournissent des aperçus sur le calendrier des événements dans l'évolution aviaire.

@article{doi101098rstb19920051,
    author = "Lockley, Martin G. et Yang, Seong Young et Matsukawa, Masaki et Fleming, Farley et Lim, Sang Kyoo",
    title = "The track record of Mesozoic birds: evidence and implications",
    year = "1992",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Résumé L'occurrence, la systématique, l'importance paléobiologique et évolutive des traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Mésozoïque sont examinées à la lumière des récentes nouvelles découvertes en Asie de l'Est, en Afrique et en Amérique du Nord. Les preuves d'empreintes les plus abondantes proviennent actuellement des dépôts du Crétacé inférieur d'Asie de l'Est et d'Amérique du Nord, où il existe désormais un registre de traces substantiel pour les limicoles. Cependant, il existe également un registre significatif de traces d'oiseaux semblables pré-crétacées. La formation de Jindong du Crétacé en Corée du Sud a récemment fourni plus de 30 localités et niveaux stratigraphiques, triplant le précédent record mondial et fournissant des preuves de grandes limicoles jusqu'alors inconnues : Jindongornipes kimi ichnogen. et ichnosp. nov. Comme les autres ichnotaxa précédemment nommés, ce type de trace d'oiseau représente probablement une espèce charadriiforme. Il est inclus avec Ignotornis et Koreanaornis dans la nouvelle ichnofamille Ignotornidae. Les traces d'oiseaux du Crétacé inférieur sont abondantes, montrent généralement des densités élevées (100-300 traces m2) et se produisent souvent en association avec des traces d'invertébrés, supposées avoir été faites par les organismes sur lesquels les oiseaux se nourrissaient. De telles preuves de traces suggèrent que les communautés d'oiseaux aquatiques étaient bien établies à la fin du Crétacé inférieur. Cela correspond à environ 30 Ma avant la radiation supposée d'oiseaux aquatiques déduite des restes squelettiques aviens du Crétacé supérieur, mais est cohérent avec les hypothèses suggérant un stock ancestral de limicoles. Les traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Jurassique et du Crétacé supérieur sont variables en morphologie, toujours mal comprises, et parfois attribuées à de petits dinosaures coelurosauriens. Cependant, les preuves actuelles suggèrent que l'ichnogenre aviforme jurassique Trisauropodiscus peut être d'origine aviaire. Il est suffisamment distinct des traces typiques grallatorid (coelurosauriennes) pour justifier la reconnaissance d'une nouvelle ichnofamille (Trisauropodiscidae), qui inclut l'ichnoespèce nouvellement décrite Trisauropodiscus moabensis d'Amérique du Nord. Les traces d'oiseaux et d'oiseaux semblables du Jurassique et du Crétacé sont montrées comme étant beaucoup plus abondantes et distinctives que précédemment supposé. De plus, elles ajoutent significativement à notre compréhension de l'évolution aviaire précoce et de la paléoécologie, et fournissent des aperçus sur le calendrier des événements dans l'évolution aviaire.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1992.0051",
    doi = "10.1098/rstb.1992.0051",
    openalex = "W2105064845",
    references = "doi101016b978012249408650011x, doi101038331433a0, doi10108002724634198110011900, doi101098rstb19910056, doi1023073514964, doi1035767gscpgbull353333, doi105281zenodo16171435, lull1915triassic, openalexw2206796883, openalexw3146596760"
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Des squelettes d'oiseaux fossiles découverts dans des dépôts lacustres du Crétacé inférieur en Chine jettent une nouvelle lumière sur l'évolution précoce du vol et de la perchoir avien. Les squelettes de la taille d'un moineau, âgés de 135 millions d'années, représentent un nouvel oiseau, Sinornis santensis, n. gen. n. sp., qui préserve des caractéristiques primitives frappantes telles qu'une main flexible avec des ongles, un pubis à pied, et des côtes gastriques (gastralia). Contrairement à Archaeoperyx, cependant, Sinornis présente des caractéristiques avancées telles qu'un sternum large, un mécanisme de repliement des ailes, un pygostyle, et un hallux grandement inversé. La fonction de vol avien moderne et la capacité de perchoir doivent donc avoir évolué chez de petits oiseaux dans des habitats intérieurs peu de temps après Archaeopteryx.

@article{doi101126science2555046845,
    author = "Sereno, Paul C. et Chenggang, Rao",
    title = "Évolution précoce du vol et de la perchoir avien : nouvelles preuves du Crétacé inférieur de la Chine",
    year = "1992",
    journal = "Science",
    abstract = "Des squelettes d'oiseaux fossiles découverts dans des dépôts lacustres du Crétacé inférieur en Chine jettent une nouvelle lumière sur l'évolution précoce du vol et de la perchoir avien. Les squelettes de la taille d'un moineau, âgés de 135 millions d'années, représentent un nouvel oiseau, Sinornis santensis, n. gen. n. sp., qui préserve des caractéristiques primitives frappantes telles qu'une main flexible avec des ongles, un pubis à pied, et des côtes gastriques (gastralia). Contrairement à Archaeoperyx, cependant, Sinornis présente des caractéristiques avancées telles qu'un sternum large, un mécanisme de repliement des ailes, un pygostyle, et un hallux grandement inversé. La fonction de vol avien moderne et la capacité de perchoir doivent donc avoir évolué chez de petits oiseaux dans des habitats intérieurs peu de temps après Archaeopteryx.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.255.5046.845",
    doi = "10.1126/science.255.5046.845",
    openalex = "W2095317708",
    references = "doi1010160031018275900115, doi101038022457a0, doi101038331433a0, doi101098rstb19910056, doi101111j1469185x1979tb01013x, doi101111j146979981990tb04039x, doi101111j1474919x1973tb02636x, doi101126science20343841021, doi101126science24148721495, gregor1988the"
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Résumé Les propriétés aérodynamiques de la queue d'un oiseau, ainsi que les forces qu'elle produit, peuvent être prédites en utilisant la théorie de la surface portante élancée. Les résultats du modèle montrent que, contrairement aux ailes conventionnelles qui génèrent une portance proportionnelle à leur surface, la portance générée par la queue est proportionnelle au carré de son envergure continue maximale. La portance n'est pas affectée par des variations substantielles de la forme de la queue, à condition que la queue s'élargisse initialement en largeur dans la direction de l'écoulement. Derrière le point de largeur maximale de la queue, l'écoulement est dominé par le sillage de la section avant. Toute surface située derrière ce point ne cause donc que de la traînée, pas de portance. Le centre de portance se trouve au centre de surface de la partie de la queue située en avant du point de largeur maximale. Le bras de moment de la queue, par rapport à son apex, est donc plus du double du bras de moment d'une aile conventionnelle par rapport à son bord d'attaque. La traînée de la queue est une combinaison de la traînée induite proportionnelle à la portance, et de la traînée de profil proportionnelle à la surface. La traînée induite peut être réduite de moitié en inclinant les plumes externes de la queue vers le bas pour générer une succion sur le bord d'attaque. Cela peut être utilisé pour le contrôle, en particulier lors de vols lents où les deux ailes et la queue génèrent une portance maximale. Le modèle de surface portante élancée est très précis pour des angles d'attaque inférieurs à environ 15°. À des angles d'attaque plus élevés, la formation de tourbillons sur le bord d'attaque peut stabiliser l'écoulement sur la queue et ainsi générer une portance accrue par un mécanisme de tourbillon détaché. L'asymétrie de l'orientation des bords d'attaque par rapport au flux libre (que ce soit en roulis, lacet ou causée par une asymétrie du plan de voilure) est amplifiée dans le champ d'écoulement et conduit à de grandes forces de roulis et de lacet qui pourraient être utilisées pour le contrôle lors de manœuvres de virage. Le modèle de surface portante élancée peut être utilisé pour examiner l'effet des variations de forme de la queue et d'écartement de la queue sur la performance aérodynamique de la queue. Une queue fourchue qui a un plan de voilure triangulaire lorsqu'elle est écartée à un peu plus de 120° offre la meilleure performance aérodynamique et cela pourrait être proche d'un optimum universel, en termes d'efficacité aérodynamique, pour un moyen de contrôler le tangage et le lacet. Cependant, la sélection naturelle peut agir pour optimiser la performance de la queue lorsqu'elle n'est pas largement écartée. La queue n'est normalement écartée que largement lors de manœuvres ou à faible vitesse ; la sélection peut alors agir pour améliorer l'efficacité de la queue lorsqu'elle est écartée à un angle relativement étroit - par exemple pour maximiser le rapport portance/traînée global de l'oiseau - la forme optimale à tout angle d'écartement est celle qui donne un bord arrière droit à la queue. Cela donnera toujours un plan de voilure légèrement fourchu, mais la profondeur de la fourche dépendra de la largeur à laquelle la queue est écartée lorsque la sélection agit, et cela dépend des critères d'optimisation sous la sélection naturelle. Une queue fourchue est plus sensible aux changements d'angle d'attaque et d'angle d'écartement que les autres types de queues. Les queues fourchues sont plus susceptibles aux dommages que les autres morphologies de queues, et subissent une perte de performance plus importante suite aux dommages. Les queues fourchues confèrent également moins de stabilité inhérente que tout autre type de queue. La performance aérodynamique peut ne pas être un critère d'optimisation important pour les oiseaux qui volent dans un environnement encombré ou qui ne volent pas beaucoup. La sélection naturelle, dans ces conditions, peut favoriser des queues de formes différentes. Les coûts aérodynamiques des queues allongées sélectionnées sexuellement peuvent être prédits à partir du modèle. Ces prédictions peuvent être utilisées pour distinguer entre les différents modèles de l'évolution des queues allongées. Les queues graduées allongées et les pintades pourraient avoir évolué soit par un mécanisme de Fisher soit par un mécanisme de handicap. L'évolution des queues fourchues longues peut initialement être favorisée par la sélection naturelle ; le motif d'allongement des plumes observé dans les queues fourchues sélectionnées sexuellement est prédit par l'hypothèse de Fisher (Fisher 1930) mais pas par aucune des autres théories de la sélection sexuelle.

@article{doi101098rstb19930079,
    author = "Thomas, Adrian L. R.",
    title = "Sur l'aérodynamique des queues d'oiseaux",
    year = "1993",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Abstract Les propriétés aérodynamiques de la queue d'un oiseau et les forces qu'elle produit peuvent être prédites en utilisant la théorie des surfaces élévées minces. Les résultats du modèle montrent que, contrairement aux ailes conventionnelles qui génèrent une portance proportionnelle à leur surface, la portance générée par la queue est proportionnelle au carré de son envergure continue maximale. La portance n'est pas affectée par des variations substantielles de la forme de la queue, à condition que la queue s'élargisse initialement en largeur dans la direction de l'écoulement. Derrière le point de largeur maximale de la queue, l'écoulement est dominé par le sillage de la section avant. Toute surface derrière ce point ne cause donc que de la traînée, pas de portance. Le centre de portance se trouve au centre de surface de la partie de la queue située en avant du point de largeur maximale. Le bras de moment de la queue, par rapport à son apex, est donc plus du double du bras de moment d'une aile conventionnelle par rapport à son bord d'attaque. La traînée de la queue est une combinaison de la traînée induite proportionnelle à la portance et de la traînée de profil proportionnelle à la surface. La traînée induite peut être divisée par deux en abaissant les plumes externes de la queue pour générer une succion sur le bord d'attaque. Cela peut être utilisé pour le contrôle, en particulier en vol lent lorsque les deux ailes et la queue génèrent une portance maximale. Le modèle de surface élévée mince est très précis pour des angles d'attaque inférieurs à environ 15°. À des angles d'attaque plus élevés, la formation de tourbillons sur le bord d'attaque peut stabiliser l'écoulement sur la queue et ainsi générer une portance accrue par un mécanisme de tourbillon détaché. L'asymétrie de l'orientation des bords d'attaque par rapport au flux libre (que ce soit en roulis, lacet ou causée par une asymétrie du plan de la voilure) est amplifiée dans le champ d'écoulement et conduit à de grandes forces de roulis et de lacet qui pourraient être utilisées pour le contrôle lors de manœuvres de virage. Le modèle de surface élévée mince peut être utilisé pour examiner l'effet des variations de forme de la queue et d'envergure sur la performance aérodynamique de la queue. Une queue fourchue qui a un plan triangulaire lorsqu'elle est écartée à un peu plus de 120° offre la meilleure performance aérodynamique et cela peut être proche d'un optimum universel, en termes d'efficacité aérodynamique, pour un moyen de contrôler le tangage et le lacet. Cependant, la sélection naturelle peut agir pour optimiser la performance de la queue lorsqu'elle n'est pas largement écartée. La queue n'est normalement écartée que largement lors de manœuvres ou à faible vitesse ; la sélection peut agir pour améliorer l'efficacité de la queue lorsqu'elle est écartée à un angle relativement étroit - par exemple pour maximiser le rapport portance/traînée global de l'oiseau - la forme optimale à tout angle d'écartement est celle qui donne un bord arrière droit à la queue. Cela donnera toujours un plan légèrement fourchu, mais la profondeur de la fourche dépendra de la largeur à laquelle la queue est écartée lorsque la sélection agit, et cela dépend des critères d'optimisation sous la sélection naturelle. Une queue fourchue est plus sensible aux changements d'angle d'attaque et d'angle d'écartement que les autres types de queues. Les queues fourchues sont plus susceptibles aux dommages que les autres morphologies de queues et subissent une perte de performance plus importante suite aux dommages. Les queues fourchues confèrent également moins de stabilité inhérente que tout autre type de queue. La performance aérodynamique peut ne pas être un critère d'optimisation important pour les oiseaux qui volent dans un environnement encombré ou qui ne volent pas beaucoup. La sélection naturelle, dans ces conditions, peut favoriser des queues d'autres formes. Les coûts aérodynamiques des queues allongées sélectionnées sexuellement peuvent être prédits à partir du modèle. Ces prédictions peuvent être utilisées pour distinguer entre les différents modèles de l'évolution des queues allongées. Les queues allongées graduées et les pintades pourraient avoir évolué soit par un mécanisme de Fisher soit par un mécanisme de handicap. L'évolution des queues fourchues longues peut initialement être favorisée par la sélection naturelle ; le motif d'allongement des plumes observé dans les queues fourchues sélectionnées sexuellement est prédit par l'hypothèse de Fisher (Fisher 1930) mais pas par aucune des autres théories de la sélection sexuelle.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1993.0079",
    doi = "10.1098/rstb.1993.0079",
    openalex = "W1995375509"
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@article{doi101038382442a0,
    author = "Sanz, J. L. et Chiappe, Luis M. et Pérez-Moreno, Bernardino P. et Buscalioni, Ángela D. et García, José Joaquín Moratalla et Ortega, Francisco et Poyato-Ariza, Francisco José",
    title = "An Early Cretaceous bird from Spain and its implications for the evolution of avian flight",
    year = "1996",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/382442a0",
    doi = "10.1038/382442a0",
    openalex = "W2070207665",
    references = "doi101038331433a0"
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Ce texte est une discussion complète et illustrée sur l'origine et du vol aviaire. L'ornithologue et biologiste évolutionniste Alan Feduccia, auteur de Age of Birds, s'appuie ici sur des preuves fossiles et des études de la structure et de la biochimie des oiseaux vivants pour présenter des connaissances et des données sur l'évolution aviaire et proposer un modèle de ce processus évolutif. Feduccia commence par un aperçu de l'évolution des oiseaux, exprimant son opinion sur le problème controversé de la paléontologie vertébrée : les oiseaux se sont-ils développés directement à partir de dinosaures bipèdes et terrestres (la théorie du bas vers le haut) ou à partir des ancêtres des dinosaures – peut-être de petits thécodontes arboricoles (la théorie du haut vers le bas). Il fournit ensuite des informations sur l'origine du vol aviaire et des plumes et discute des découvertes les plus spectaculaires en paléontologie aviaire au cours des dernières décennies – les oiseaux opposés qui étaient les oiseaux terrestres dominants du Mésozoïque. Feduccia propose ensuite une théorie de l'évolution aviaire au Tertiaire, arguant que l'évolution des oiseaux suit un schéma similaire à celui des mammifères, avec une évolution explosive (plutôt que graduelle) ne durant que de 5 à 10 millions d'années. Dans la seconde moitié du livre, il résume l'évolution de tous les ordres modernes d'oiseaux, abordant des sujets tels que l'évolution de l'alimentation par filtration chez les canards et les flamants, l'évolution de l'incapacité de voler, l'évolution des proies et l'essor des oiseaux terrestres. Le livre comprend également des reconstructions de fossiles anciens préparées par l'artiste ornithologique John O'Neill.

@article{doi105860choice343307,
    title = "L'origine et l'évolution des oiseaux",
    year = "1997",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Ce texte est une discussion complète et illustrée sur l'origine et du vol aviaire. L'ornithologue et biologiste évolutionniste Alan Feduccia, auteur de Age of Birds, s'appuie ici sur des preuves fossiles et des études de la structure et de la biochimie des oiseaux vivants pour présenter des connaissances et des données sur l'évolution aviaire et proposer un modèle de ce processus évolutif. Feduccia commence par un aperçu de l'évolution des oiseaux, exprimant son opinion sur le problème controversé de la paléontologie vertébrée : les oiseaux se sont-ils développés directement à partir de dinosaures bipèdes et terrestres (la théorie du bas vers le haut) ou à partir des ancêtres des dinosaures – peut-être de petits thécodontes arboricoles (la théorie du haut vers le bas). Il fournit ensuite des informations sur l'origine du vol aviaire et des plumes et discute des découvertes les plus spectaculaires en paléontologie aviaire au cours des dernières décennies – les oiseaux opposés qui étaient les oiseaux terrestres dominants du Mésozoïque. Feduccia propose ensuite une théorie de l'évolution aviaire au Tertiaire, arguant que l'évolution des oiseaux suit un schéma similaire à celui des mammifères, avec une évolution explosive (plutôt que graduelle) ne durant que de 5 à 10 millions d'années. Dans la seconde moitié du livre, il résume l'évolution de tous les ordres modernes d'oiseaux, abordant des sujets tels que l'évolution de l'alimentation par filtration chez les canards et les flamants, l'évolution de l'incapacité de voler, l'évolution des proies et l'essor des oiseaux terrestres. Le livre comprend également des reconstructions de fossiles anciens préparées par l'artiste ornithologique John O'Neill.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.34-3307",
    doi = "10.5860/choice.34-3307",
    openalex = "W1555551215"
}

Les oiseaux ont évolué à partir des dinosaures théropodes et sont reconnus phylogénétiquement comme des membres de ce groupe ; leur premier membre connu est l'Archaeopteryx du Jurassique supérieur, représenté aujourd'hui par sept squelettes et une plume, et leurs parents non-avians les plus proches connus sont les théropodes droméosauridés tels que Deinonychus. Le vol des oiseaux est largement considéré comme ayant évolué des arbres vers le bas, mais l'Archaeopteryx et ses groupes sœurs ne montrent aucun caractère arboricole ou grimpeur d'arbres évident, et la forme de leur aile et leur charge alaire ne ressemblent pas à celles des planeurs. Les ancêtres des oiseaux étaient bipèdes, terrestres, agiles, cursoriaux et carnivores ou omnivores. À part un pied de perchoir et certaines fusions squelettiques, un grand nombre de caractères qui sont généralement considérés comme ' aviens ' (par exemple, la furcula, l'avant-bras allongé, le poignet qui s'incline latéralement et les plumes apparentes) ont évolué chez les théropodes non-avians pour des raisons sans rapport avec les oiseaux ou le vol. Peu après l'Archaeopteryx, des caractéristiques aviaires telles que le pygostyle, la fusion du carpométacarpe et les griffes pédales allongées et courbées avec un hallux inversé, entièrement descendu et opposable, indiquent une capacité de vol améliorée et des habitudes arboricoles. Dans l'évolution ultérieure des oiseaux, les caractères liés à l'appareil de vol ont phylogénétiquement précédé ceux liés au reste du squelette et du crâne. Les oiseaux du Mésozoïque sont plus diversifiés et nombreux qu'on ne le pensait auparavant, et le groupe de oiseaux du Crétacé le plus diversifié connu, les Enantiornithes, n'a même été reconnu qu'en 1981. La grande majorité des groupes d'oiseaux du Mésozoïque n'ont pas de records du Tertiaire : les Enantiornithes, les Hesperornithiformes, les Ichthyornithiformes et plusieurs autres lignées ont disparu à la fin du Crétacé. À cette époque, quelques ' Ordres ' linéens d'oiseaux actuels avaient apparu, mais aucun de ces taxons n'appartient aux ' familles ' actuelles, et ce n'est qu'au Paléocène ou (dans la plupart des cas) à l'Éocène que la majorité des ' Ordres ' d'oiseaux actuels sont connus dans le registre fossile. Il n'y a aucune preuve d'une extinction majeure ou massive d'oiseaux à la fin du Crétacé, ni d'un ' goulot d'étranglement ' soudain de diversité qui aurait favorisé l'origine des ' Ordres ' d'oiseaux vivants du début du Tertiaire.

@article{doi101017s0006323197005100,
    author = "PADIAN, KEVIN et Chiappe, Luis M.",
    title = "The origin and early evolution of birds",
    year = "1998",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of la Société philosophique de Cambridge",
    abstract = "Les oiseaux ont évolué à partir des dinosaures théropodes et sont reconnus phylogénétiquement comme des membres de ce groupe ; leur premier membre connu est l'Archaeopteryx du Jurassique supérieur, représenté aujourd'hui par sept squelettes et une plume, et leurs parents non-avians les plus proches connus sont les théropodes droméosauridés tels que Deinonychus. Le vol des oiseaux est largement considéré comme ayant évolué des arbres vers le bas, mais l'Archaeopteryx et ses groupes sœurs ne montrent aucun caractère arboricole ou grimpeur d'arbres évident, et la forme de leur aile et leur charge alaire ne ressemblent pas à celles des planeurs. Les ancêtres des oiseaux étaient bipèdes, terrestres, agiles, cursoriaux et carnivores ou omnivores. À part un pied de perchoir et certaines fusions squelettiques, un grand nombre de caractères qui sont généralement considérés comme ' aviens ' (par exemple, la furcula, l'avant-bras allongé, le poignet qui s'incline latéralement et les plumes apparentes) ont évolué chez les théropodes non-avians pour des raisons sans rapport avec les oiseaux ou le vol. Peu après l'Archaeopteryx, des caractéristiques aviaires telles que le pygostyle, la fusion du carpométacarpe et les griffes pédales allongées et courbées avec un hallux inversé, entièrement descendu et opposable, indiquent une capacité de vol améliorée et des habitudes arboricoles. Dans l'évolution ultérieure des oiseaux, les caractères liés à l'appareil de vol ont phylogénétiquement précédé ceux liés au reste du squelette et du crâne. Les oiseaux du Mésozoïque sont plus diversifiés et nombreux qu'on ne le pensait auparavant, et le groupe de oiseaux du Crétacé le plus diversifié connu, les Enantiornithes, n'a même été reconnu qu'en 1981. La grande majorité des groupes d'oiseaux du Mésozoïque n'ont pas de records du Tertiaire : les Enantiornithes, les Hesperornithiformes, les Ichthyornithiformes et plusieurs autres lignées ont disparu à la fin du Crétacé. À cette époque, quelques ' Ordres ' linéens d'oiseaux actuels avaient apparu, mais aucun de ces taxons n'appartient aux ' familles ' actuelles, et ce n'est qu'au Paléocène ou (dans la plupart des cas) à l'Éocène que la majorité des ' Ordres ' d'oiseaux actuels sont connus dans le registre fossile. Il n'y a aucune preuve d'une extinction majeure ou massive d'oiseaux à la fin du Crétacé, ni d'un ' goulot d'étranglement ' soudain de diversité qui aurait favorisé l'origine des ' Ordres ' d'oiseaux vivants du début du Tertiaire.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0006323197005100",
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RÉSUMÉ Bien que les sauropodes aient joué un rôle majeur dans les écosystèmes terrestres pendant une grande partie de l'ère Mésozoïque, peu d'efforts ont été déployés pour diagnostiquer les Sauropoda et établir les relations interconnectées de haut niveau entre les sauropodes. En conséquence, l'origine et l'évolution des principales adaptations squelettiques chez les sauropodes sont restées largement spéculatives. L'analyse cladistique présentée ici se concentre sur les relations de haut niveau entre les sauropodes. Sur la base de 109 caractères (32 crâniens, 24 axiaux, 53 appendiculaires) pour 10 taxons de sauropodes, l'arrangement le plus parcimonieux place quatre genres (Vulcanodon, Shunosaurus, Barapasaurus et Omeisaurus) comme une séquence de taxons sœurs à un groupe de sauropodes avancés, définis ici comme les Neosauropoda. Les Neosauropoda sont, à leur tour, composés des clades sœurs Diplodocoidea et Macronaria ; ce dernier est un nouveau taxon qui inclut Haplocanthosaurus, Camarasaurus et les Titanosauriformes. Les Titanosauriformes incluent les Brachiosauridae et les Somphospondyli, un nouveau taxon unissant Euhelopus et les Titanosauria. Parmi les macronariens, la position de Haplocanthosaurus est la moins stable en raison de l'absence de restes crâniens. La structure de base de la phylogénie est résiliente face à divers tests et établit la séquence évolutive de nombreuses adaptations fonctionnellement significatives chez les sauropodes, telles que la posture digitigrade de la main chez les neosauropodes. D'autres adaptations caractéristiques des sauropodes, telles que les couronnes dentaires étroites, les augmentations de la longueur et du nombre de vertèbres cervicales, et les épines neurales bifides, sont montrées comme ayant évolué plus d'une fois. Comme ces résultats le soulignent, la phylogénie de haut niveau des sauropodes doit reposer sur un échantillonnage large de données de caractères. Le registre fossile des sauropodes, bien que relativement limité pendant la phase précoce de la radiation (Trias supérieur à Jurassique inférieur), indique néanmoins que tous les clades majeurs ont été établis avant le Jurassique supérieur, lorsque l'échange faunistique substantiel entre les principales régions continentales était encore possible. Les implications fonctionnelles, temporelles et biogéographiques de la phylogénie de haut niveau des sauropodes sont explorées.

@article{doi10108002724634199810011115,
    author = "Wilson, Jeffrey A. et Sereno, Paul C.",
    title = "Évolution précoce et phylogénie de haut niveau des dinosaures sauropodes",
    year = "1998",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "RÉSUMÉ Bien que les sauropodes aient joué un rôle majeur dans les écosystèmes terrestres pendant une grande partie de l'ère Mésozoïque, peu d'efforts ont été déployés pour diagnostiquer les Sauropoda et établir les relations interconnectées de haut niveau entre les sauropodes. En conséquence, l'origine et l'évolution des principales adaptations squelettiques chez les sauropodes sont restées largement spéculatives. L'analyse cladistique présentée ici se concentre sur les relations de haut niveau entre les sauropodes. Sur la base de 109 caractères (32 crâniens, 24 axiaux, 53 appendiculaires) pour 10 taxons de sauropodes, l'arrangement le plus parcimonieux place quatre genres (Vulcanodon, Shunosaurus, Barapasaurus et Omeisaurus) comme une séquence de taxons sœurs à un groupe de sauropodes avancés, définis ici comme les Neosauropoda. Les Neosauropoda sont, à leur tour, composés des clades sœurs Diplodocoidea et Macronaria ; ce dernier est un nouveau taxon qui inclut Haplocanthosaurus, Camarasaurus et les Titanosauriformes. Les Titanosauriformes incluent les Brachiosauridae et les Somphospondyli, un nouveau taxon unissant Euhelopus et les Titanosauria. Parmi les macronariens, la position de Haplocanthosaurus est la moins stable en raison de l'absence de restes crâniens. La structure de base de la phylogénie est résiliente face à divers tests et établit la séquence évolutive de nombreuses adaptations fonctionnellement significatives chez les sauropodes, telles que la posture digitigrade de la main chez les neosauropodes. D'autres adaptations caractéristiques des sauropodes, telles que les couronnes dentaires étroites, les augmentations de la longueur et du nombre de vertèbres cervicales, et les épines neurales bifides, sont montrées comme ayant évolué plus d'une fois. Comme ces résultats le soulignent, la phylogénie de haut niveau des sauropodes doit reposer sur un échantillonnage large de données de caractères. Le registre fossile des sauropodes, bien que relativement limité pendant la phase précoce de la radiation (Trias supérieur à Jurassique inférieur), indique néanmoins que tous les clades majeurs ont été établis avant le Jurassique supérieur, lorsque l'échange faunistique substantiel entre les principales régions continentales était encore possible. Les implications fonctionnelles, temporelles et biogéographiques de la phylogénie de haut niveau des sauropodes sont explorées.",
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    doi = "10.1080/02724634.1998.10011115",
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    references = "crossref1976allosaurus, doi1010079789400904095, doi101038063003a0, doi101038114085a0, doi10108002724634199110011386, doi10108002724634199410011523, doi10108002724634199410011524, doi10108002724634199710011027, doi101093oxfordjournalsafrafa100309, doi101098rstb19950125, doi101111j109583121965tb00944x, doi101111j109636421985tb00871x, doi101111j150239311985tb00690x, doi101126science2562999, doi101126science2665183267, doi101127njgpa210199841, doi1023071292217, doi1023073514751, doi1023073514816, doi102307jctv143mdjg, doi102475ajss31695411, doi102475ajss319111253, doi102475ajss321125417, doi102475ajss32313381, doi105281zenodo16171435, doi105860choice331556, openalexw1025856234, openalexw2173200745, openalexw2472827083, openalexw616953834, openalexw653009579"
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RÉSUMÉ Les oiseaux ont évolué à partir de dinosaures théropodes et sont reconnus phylogénétiquement comme des membres de ces derniers ; leur premier membre connu est l'Archaeopteryx du Jurassique supérieur, représenté aujourd'hui par sept squelettes et une plume, et leurs parents non aviens les plus proches connus sont les théropodes droméosauridés tels que Deinonychus. Le vol des oiseaux est largement considéré comme ayant évolué des arbres vers le bas, mais l'Archaeopteryx et ses groupes sœurs ne montrent aucun caractère arboricole ou grimpeur d'arbres évident, et leur plan de voilure et leur charge alaire ne ressemblent pas à ceux des planeurs. Les ancêtres des oiseaux étaient bipèdes, terrestres, agiles, cursoriaux et carnivores ou omnivores. À l'exception d'un pied de perchoir et de certaines fusions squelettiques, un grand nombre de caractères qui sont généralement considérés comme « aviens » (par exemple la furcula, l'avant-bras allongé, le poignet se pliant latéralement et les plumes apparentes) ont évolué chez les théropodes non aviens pour des raisons sans rapport avec les oiseaux ou le vol. Peu après l'Archaeopteryx, des caractéristiques aviaires telles que le pygostyle, la fusion du carpometacarpe, et les griffes pédales allongées et courbées avec un hallux inversé, entièrement descendu et opposable, indiquent une capacité de vol améliorée et des habitudes arboricoles. Dans l'évolution ultérieure des oiseaux, les caractères liés à l'appareil de vol ont précédé phylogénétiquement ceux liés au reste du squelette et du crâne. Les oiseaux du Mésozoïque sont plus diversifiés et nombreux qu'on ne le pensait auparavant, et le groupe de oiseaux du Crétacé le plus diversifié connu, les Enantiornithes, n'a même été reconnu qu'en 1981. La grande majorité des groupes d'oiseaux du Mésozoïque n'ont pas de records tertiaires : les Enantiornithes, les Hesperornithiformes, les Ichthyornithiformes et plusieurs autres lignées ont disparu à la fin du Crétacé. À cette époque, quelques « Ordres » linéens d'oiseaux actuels étaient apparus, mais aucun de ces taxons n'appartient aux « familles » actuelles, et ce n'est qu'au Paléocène ou (dans la plupart des cas) à l'Éocène que la majorité des « Ordres » d'oiseaux actuels sont connus dans le registre fossile. Il n'y a aucune preuve d'une extinction majeure ou massive d'oiseaux à la fin du Crétacé, ni d'un « goulot d'étranglement » soudain de diversité qui aurait favorisé l'origine des « Ordres » d'oiseaux vivants au début du Tertiaire.

@article{doi101111j1469185x1997tb00024x,
    author = "Padian, Kevin and Chiappe, Luis M.",
    title = "The origin and early evolution of birds",
    year = "1998",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "RÉSUMÉ Les oiseaux ont évolué à partir de dinosaures théropodes et sont reconnus phylogénétiquement comme des membres de ces derniers ; leur premier membre connu est l'Archaeopteryx du Jurassique supérieur, représenté aujourd'hui par sept squelettes et une plume, et leurs parents non aviens les plus proches connus sont les théropodes droméosauridés tels que Deinonychus. Le vol des oiseaux est largement considéré comme ayant évolué des arbres vers le bas, mais l'Archaeopteryx et ses groupes sœurs ne montrent aucun caractère arboricole ou grimpeur d'arbres évident, et leur plan de voilure et leur charge alaire ne ressemblent pas à ceux des planeurs. Les ancêtres des oiseaux étaient bipèdes, terrestres, agiles, cursoriaux et carnivores ou omnivores. À l'exception d'un pied de perchoir et de certaines fusions squelettiques, un grand nombre de caractères qui sont généralement considérés comme « aviens » (par exemple la furcula, l'avant-bras allongé, le poignet se pliant latéralement et les plumes apparentes) ont évolué chez les théropodes non aviens pour des raisons sans rapport avec les oiseaux ou le vol. Peu après l'Archaeopteryx, des caractéristiques aviaires telles que le pygostyle, la fusion du carpometacarpe, et les griffes pédales allongées et courbées avec un hallux inversé, entièrement descendu et opposable, indiquent une capacité de vol améliorée et des habitudes arboricoles. Dans l'évolution ultérieure des oiseaux, les caractères liés à l'appareil de vol ont précédé phylogénétiquement ceux liés au reste du squelette et du crâne. Les oiseaux du Mésozoïque sont plus diversifiés et nombreux qu'on ne le pensait auparavant, et le groupe de oiseaux du Crétacé le plus diversifié connu, les Enantiornithes, n'a même été reconnu qu'en 1981. La grande majorité des groupes d'oiseaux du Mésozoïque n'ont pas de records tertiaires : les Enantiornithes, les Hesperornithiformes, les Ichthyornithiformes et plusieurs autres lignées ont disparu à la fin du Crétacé. À cette époque, quelques « Ordres » linéens d'oiseaux actuels étaient apparus, mais aucun de ces taxons n'appartient aux « familles » actuelles, et ce n'est qu'au Paléocène ou (dans la plupart des cas) à l'Éocène que la majorité des « Ordres » d'oiseaux actuels sont connus dans le registre fossile. Il n'y a aucune preuve d'une extinction majeure ou massive d'oiseaux à la fin du Crétacé, ni d'un « goulot d'étranglement » soudain de diversité qui aurait favorisé l'origine des « Ordres » d'oiseaux vivants au début du Tertiaire.",
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Résumé Nous présentons une liste de travail annotée des espèces d'oiseaux nichant en Nouvelle-Zélande durant le Pléistocène supérieur et le Holocène, jusqu'au moment du contact humain. La Nouvelle-Zélande est définie comme incluant les trois îles principales et les îles plus petites environnantes, ainsi que les groupes d'îles éloignées depuis l'île de Norfolk dans le nord-ouest, les îles Kermadec, Chatham, Bounty, Antipodes, Campbell, Auckland, Snares, jusqu'aux îles Macquarie, mais excluant les îles au sud de l'île Macquarie et la dépendance de Ross. Les inclusions ou exclusions d'espèces de la liste étaient basées sur des critères spécifiés. Nous incluons uniquement les espèces ayant une population nicheuse et non les vagabonds qui se produisent en Nouvelle-Zélande mais qui nichent ailleurs. Les espèces avec des noms validement publiés ont été incluses s'il y avait des preuves fossiles d'une population nicheuse avant le contact humain. Les espèces ayant une population nicheuse au moment du contact européen ont été incluses sauf si des preuves contraires du registre fossile indiquent qu'elles ont en réalité colonisé après l'établissement humain. Les espèces sans registre fossile ont été incluses si une population nicheuse existe sur une île relativement peu perturbée au sein de l'archipel de Nouvelle-Zélande tel que défini ci-dessus. Les espèces actuellement présentes sur les îles principales ont été exclues si elles sont absentes de toutes les faunes fossiles bien documentées. Les espèces ont été exclues de la faune nicheuse et traitées comme des vagabonds là où une reproduction soutenue n'a pas été démontrée. Le concept d'espèce phylogénétique est appliqué aussi bien aux taxons fossiles qu'aux taxons vivants. Le registre fossile des oiseaux de Nouvelle-Zélande du Quaternaire récent est excellent, et la contribution des taxons éteints à la liste totale est comprise au moins aussi bien que celle des taxons survivants. De nombreux taxons actuellement reconnus au niveau subspécifique sont traités ici comme des espèces complètes. Douze espèces éteintes dont la présence passée est connue à partir de preuves fossiles, mais pour lesquelles aucune description n'a été publiée, sont listées sous des désignations d'espèces informelles. Les considérations taxonomiques ont limité la mesure dans laquelle la liste principale pouvait refléter la compréhension actuelle de la diversité de l'avifaune ; certaines espèces non décrites sont actuellement subsumées sous un nom d'espèce. Là où les publications taxonomiques précédentes fournissent une précedence, les noms disponibles au niveau de l'espèce ont été utilisés. Une liste d'espèces hypothétiques supplémentaires inclut tous les changements nomenclaturaux signalés dans des annotations étendues à la liste principale. Dans cette liste, nous acceptons 245 espèces dans 110 genres représentant 46 familles ; 176 espèces étaient endémiques de l'archipel. Les analyses biogéographiques préliminaires basées sur la composition de la liste supplémentaire montrent qu'il y avait quatre faunes régionales distinctes : une faune subtropicale du nord (Norfolk, Kermadecs) ; la faune majeure des îles principales (Nord, Sud, Stewart, et îles côtières) ; une faune des Chatham (îles Chatham uniquement) ; et une faune subantarctique sur les îles du sud. Les espèces avec des distributions plus larges ont formé des groupes de liaison. L'origine et les compositions des faunes aviaires régionales et de leurs espèces endémiques diffèrent selon leur position géographique, leur climat et leur proximité avec les faunes sources. Des cas de spéciation dans des groupes tels que les bécasseaux Coenocoiypha et les martinets Petroica, et des radiations adaptatives dans des groupes incluant les moas et les troglodytes acanthisittid, montrent qu'il y a de nombreuses voies de recherche sur le taux d'évolution dans les populations insulaires et continentales des oiseaux de Nouvelle-Zélande et qu'il existe de grandes lacunes dans les connaissances même des taxons courants. Une brève étude de cas démontre les insuffisances de l'utilisation de listes d'espèces qui n'incluent pas les espèces fossiles du Holocène. Les courbes espèce-surface basées sur la faune totale diffèrent substantiellement de celles développées dans des études précédentes basées sur des listes incomplètes ou biaisées. Les glaciations du Pléistocène ont causé le motif de distribution des espèces sur les îles principales à changer en concert avec les changements de végétation. D'autres effets possibles incluent l'élimination des espèces de climat chaud au début de la phase de refroidissement il y a plus d'un million d'années, la spéciation dans des groupes incluant les limicoles et les perroquets alors que de nouveaux habitats (par exemple, les lits de rivières entrelacés et les zones alpines) apparaissaient, et l'apparition régulière durant le Pléistocène d'îles qui étaient des points de transit potentiels pour la colonisation des îles Chatham. Pendant au moins les 100 000 dernières années, jusqu'à il y a 2000 ans, la faune semble avoir été très stable en composition, malgré de fortes fluctuations cycliques du climat et de la végétation. Les effets des extinctions au cours des 2000 dernières années sur la composition de la faune actuelle incluent l'élimination de la plupart des taxons endémiques de toutes les faunes sauf celles subantarctiques. Seules 169 espèces de la faune nicheuse du Holocène tardif originale survivent. Les extinctions ont résulté en un biais fort vers les taxons marins et côtiers dans l'avifaune actuelle, en contraste avec la représentation équilibrée des espèces terrestres et marines dans la faune du Pléistocène et du Holocène. L'importance des études systématiques et de la détermination du statut des populations insulaires pour la conservation et la recherche ornithologique de base est soulignée. Le statut systématique de nombreux oiseaux de Nouvelle-Zélande est mal connu actuellement.

@article{doi1010800301422320019518262,
    author = "Holdaway, Richard N. et Worthy, Trevor H. et Tennyson, Alan J. D.",
    title = "Une liste de travail des espèces d'oiseaux nicheurs de la région de Nouvelle-Zélande au premier contact humain",
    year = "2001",
    journal = "New Zealand Journal of Zoology",
    abstract = "Résumé Nous présentons une liste de travail annotée des espèces d'oiseaux nicheurs en Nouvelle-Zélande durant le Pléistocène supérieur et le Holocène, jusqu'au moment du contact humain. La Nouvelle-Zélande est définie comme incluant les trois îles principales et les îles plus petites environnantes, ainsi que les groupes d'îles périphériques depuis l'île de Norfolk dans le nord-ouest, les Kermadec, Chatham, Bounty, Antipodes, Campbell, Auckland, Snares, jusqu'aux îles Macquarie, mais excluant les îles au sud de l'île Macquarie et la dépendance de Ross. Les inclusions ou exclusions d'espèces dans la liste étaient basées sur des critères spécifiés. Nous incluons uniquement les espèces ayant une population nicheuse et non les vagabonds qui se produisent en Nouvelle-Zélande mais qui nichent ailleurs. Les espèces avec des noms validement publiés ont été incluses s'il y avait des preuves fossiles d'une population nicheuse avant le contact humain. Les espèces ayant une population nicheuse au moment du contact européen ont été incluses sauf si des preuves contraires du registre fossile indiquent qu'elles ont réellement colonisé après l'établissement humain. Les espèces sans registre fossile ont été incluses si une population nicheuse existe sur une île relativement peu perturbée au sein de l'archipel de Nouvelle-Zélande tel que défini ci-dessus. Les espèces actuellement présentes sur les îles principales ont été exclues si elles sont absentes de toutes les faunes fossiles bien documentées. Les espèces ont été exclues de la faune nicheuse et traitées comme des vagabonds là où une reproduction soutenue n'a pas été démontrée. Le concept d'espèce phylogénétique est appliqué aussi bien aux taxons fossiles qu'aux taxons vivants. Le registre fossile des oiseaux de Nouvelle-Zélande du Quaternaire supérieur est excellent, et la contribution des taxons éteints à la liste totale est comprise au moins aussi bien que celle des taxons survivants. De nombreux taxons actuellement reconnus au niveau subspécifique sont traités ici comme des espèces complètes. Douze espèces éteintes dont la présence antérieure est connue à partir de preuves fossiles, mais pour lesquelles aucune description n'a été publiée, sont listées sous des désignations d'espèces informelles. Les considérations taxonomiques ont limité la mesure dans laquelle la liste principale pouvait refléter la compréhension actuelle de la diversité de l'avifaune ; certaines espèces non décrites sont actuellement subsumées sous un nom d'espèce. Là où les publications taxonomiques précédentes fournissent un précédent, les noms disponibles au niveau de l'espèce ont été utilisés. Une liste d'espèces hypothétiques supplémentaires inclut tous les changements de nomenclature signalés dans des annotations étendues à la liste principale. Dans cette liste, nous acceptons 245 espèces dans 110 genres représentant 46 familles ; 176 espèces étaient endémiques de l'archipel. Les analyses biogéographiques préliminaires basées sur la composition de la liste supplémentaire montrent qu'il y avait quatre faunes régionales distinctes : une faune subtropicale du nord (Norfolk, Kermadecs) ; la faune majeure des îles principales (Nord, Sud, Stewart, et îles côtières) ; une faune des Chatham (îles Chatham uniquement) ; et une faune subantarctique sur les îles du sud. Les espèces avec des distributions plus larges ont formé des groupes de liaison. L'origine et les compositions des faunes aviaires régionales et de leurs espèces endémiques diffèrent selon leur position géographique, leur climat et leur proximité avec les faunes sources. Des cas de spéciation dans des groupes tels que le Coenocoiypha snipe et les Petroica flycatchers, et des radiations adaptatives dans des groupes incluant les moa et les wrens acanthisittid, montrent qu'il y a de nombreuses voies de recherche sur le taux d'évolution dans les populations d'oiseaux de Nouvelle-Zélande insulaires et continentales et qu'il existe de grandes lacunes dans les connaissances même des taxons communs. Une brève étude de cas démontre les insuffisances de l'utilisation de listes d'espèces qui n'incluent pas les espèces fossiles du Holocène. Les courbes aire-espèces basées sur la faune totale diffèrent substantiellement de celles développées dans des études précédentes basées sur des listes incomplètes ou biaisées. Les glaciations du Pléistocène ont causé le motif de distribution des espèces sur les îles principales à changer en concert avec les changements de végétation. D'autres effets possibles incluent l'élimination des espèces de climat chaud au début de la phase de refroidissement il y a plus d'un million d'années, la spéciation dans des groupes incluant les limicoles et les perroquets alors que de nouveaux habitats (par exemple, des lits de rivières entrelacés et des zones alpines) apparaissaient, et l'apparition régulière durant le Pléistocène d'îles qui étaient des points de transit potentiels pour la colonisation des îles Chatham. Pendant au moins les 100 000 dernières années, jusqu'à il y a 2000 ans, la faune semble avoir été très stable en composition, malgré de fortes fluctuations cycliques du climat et de la végétation. Les effets des extinctions au cours des 2000 dernières années sur la composition de la faune actuelle incluent l'élimination de la plupart des taxons endémiques de toutes les faunes sauf celles subantarctiques. Seules 169 espèces de la faune nicheuse du Holocène tardif originale survivent. Les extinctions ont résulté en un biais fort vers les taxons marins et côtiers dans l'avifaune actuelle, en contraste avec la représentation équilibrée des espèces terrestres et marines dans la faune du Pléistocène et du Holocène. L'importance des études systématiques et de la détermination du statut des populations insulaires pour la conservation et la recherche ornithologique de base est soulignée. Le statut systématique de nombreux oiseaux de Nouvelle-Zélande est mal connu actuellement.",
    url = "https://doi.org/10.1080/03014223.2001.9518262",
    doi = "10.1080/03014223.2001.9518262",
    openalex = "W2003138611",
    references = "doi101016b978012249408650011x, doi101111j109636421932tb01553x, doi101111j1474919x1955tb01923x"
}

Le registre fossile a été utilisé pour soutenir l'origine et la radiation des oiseaux modernes (Neornithes) en Laurasie après l'événement d'extinction de masse du Crétacé-Tertiaire, tandis que les horloges moléculaires ont suggéré une origine crétacée pour la plupart des ordres aviens. Ces vues alternatives sur l'évolution des néornithines sont examinées à l'aide d'un ensemble d'épreuves indépendant, à savoir les relations phylogénétiques et la biogéographie historique. Les relations phylogénétiques des lignées basales des néornithines, y compris les oiseaux ratites et leurs alliés (Palaleocognathae), les gallinacés et les anseriformes (Galloanserae), ainsi que les lignées des Néoves plus avancés (Gruiformes, (Capimulgiformes, Passeriformes et autres) démontrent des modèles de distribution trans-antarctique répandus. L'histoire temporelle des néornithines peut être déduite des taxons fossiles et des âges des événements de vicariance, et, conjointement à leurs modèles biogéographiques, conduit à la conclusion que les néornithines sont apparus en Gondwana avant l'événement d'extinction du Crétacé Tertiaire.

@article{doi101098rspb20001368,
    author = "Cracraft, Joël",
    title = "Avian evolution, Gondwana biogeography and the Cretaceous–Tertiary mass extinction event",
    year = "2001",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "The fossil record has been used to support the origin and radiation of modern birds (Neornithes) in Laurasia after the Cretaceous-Tertiary mass extinction event, whereas molecular clocks have suggested a Cretaceous origin for most avian orders. These alternative views of neornithine evolution are examined using an independent set of evidence, namely phylogenetic relationships and historical biogeography. Pylogenetic relationships of basal lineages of neornithines, including ratite birds and their allies (Palaleocognathae), galliforms and anseriforms (Galloanserae), as well as lineages of the more advanced Neoves (Gruiformes, (Capimulgiformes, Passeriformes and others) demonstrate pervasive trans-Antarctic distribution patterns. The temporal history of the neornithines can be inferred from fossil taxa and the ages of vicariance events, and along with their biogeographical patterns, leads to the conclusion that neornithines arose in Gondwana prior to the Cretaceous Tertiary extinction event.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2000.1368",
    doi = "10.1098/rspb.2000.1368",
    openalex = "W2110007690",
    references = "doi1010160040195188902697, doi101016b978012249408650011x, doi101016s0012821x98002829, doi10102996rg03038, doi101038377301a0, doi101038381226a0, doi101111j1469185x1997tb00024x, doi101126science2585084975, doi10113008137233291, doi102307jctt1xp3v3r, doi105281zenodo16171435, doi105860choice343307, openalexw2135985426, openalexw2607033038"
}

L'ostéologie fémorale et les tissus mous ont évolué selon un schéma progressif chez les reptiles archosauroformes sur la lignée menant aux oiseaux du groupe couronne. Les Crocodylia conservent la plupart des traits ancestraux archosauriens, tandis que les Dinosauromorpha (incluant les oiseaux) ont acquis de nombreux traits dérivés. La séquence complexe de changements a inclus des décalages majeurs de plusieurs insertions musculaires de la cuisse. La rotation médiale du fémur proximal (par exemple, la tête fémorale) chez les archosaures a déplacé le grand trochanter latéralement, entraînant l'insertion du M. pubo‐ischio‐fémoralis externus. Au sein des Dinosauromorpha, le petit trochanter s'est déplacé proximalement, s'éloignant de la crête trochantérienne. Supposément, le petit trochanter indique l'insertion du M. iliotrochantericus caudalis, tandis que la crête trochantérienne indique l'insertion du M. iliofémoralis externus. Un trochanter accessoire à la base du petit trochanter marque l'insertion du M. pubo‐ischio‐fémoralis internus 2 chez les théropodes tétanuraens. Je propose des hypothèses concernant les homologies de plusieurs lignes intermusculaires et d'autres caractéristiques sur le corps fémoral. Sur la lignée menant aux Neornithes, la plupart des changements de morphologie fémorale ont précédé les Aves et l'origine du vol ; peu de caractéristiques fémorales sont uniques aux oiseaux. Globalement, le schéma d'évolution morphologique est cohérent avec l'évolution fonctionnelle progressive de l'appendice postérieur au sein des Dinosauromorpha sur la lignée menant aux Neornithes. Le clade Ornithurae a évolué les dernières apomorphies de l'appendice postérieur caractérisant les oiseaux actuels, conjointement avec des articulations de hanche et de genou plus fléchies.

@article{doi101111j109636422001tb01314x,
    author = "Hutchinson, John R.",
    title = "The evolution of femoral osteology and soft tissues on the line to extant birds (Neornithes)",
    year = "2001",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Femoral osteology and soft tissues evolved in a stepwise pattern in archosauromorph reptiles on the line to crown group birds. Crocodylia retains most ancestral archosaurian traits, whereas Dinosauromorpha (including birds) acquired many more derived traits. The complex sequence of changes included major shifts of several thigh muscle insertions. Medial rotation of the proximal femur (e.g. the femoral head) in archosaurs moved the greater trochanter laterally, bringing along the insertion of M. pubo‐ischio‐femoralis externus. Within Dinosauromorpha, the lesser trochanter moved proximally away from the trochanteric shelf. Presumably the lesser trochanter indicates the insertion of M. iliotrochantericus caudalis whereas the trochanteric shelf indicates the insertion of M. iliofemoralis externus. An accessory trochanter at the base of the lesser trochanter marks the insertion of M. pubo‐ischio‐femoralis internus 2 in tetanuran theropods. I propose hypotheses for the homologies of several intermuscular lines and other features on the femoral shaft. On the line to Neornithes, most changes of femoral morphology predated Aves and the origin of flight; few femoral features are unique to birds. Overall, the pattern of morphological evolution is consistent with stepwise functional evolution of the hindlimb within Dinosauromorpha on the line to Neornithes. The clade Ornithurae evolved the last few hindlimb apomorphies that characterize extant birds, in conjunction with more flexed hip and knee joints.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-3642.2001.tb01314.x",
    doi = "10.1111/j.1096-3642.2001.tb01314.x",
    openalex = "W2020878527",
    references = "coria1995a, doi101007bf02985709, doi101016b9781483231426500124, doi101017cbo9780511608377010, doi101017s0022336000026706, doi101017s0094837300009866, doi101038248168a0, doi101038292051a0, doi101038387390a0, doi10103845769, doi10108002724634199110011386, doi10108002724634199110011426, doi10108002724634199310011511, doi10108002724634199410011523, doi10108002724634199410011538, doi10108002724634199710011027, doi101086283367, doi101093sysbio33183, doi101098rstb19610007, doi101098rstb19650003, doi101098rstb19830079, doi101098rstb19850092, doi101098rstb19920117, doi101098rstb19990489, doi101111j109583121976tb00244x, doi101111j109600311988tb00514x, doi101111j109600311991tb00045x, doi101111j109600311995tb00092x, doi101111j109636422001tb01313x, doi101111j146979981991tb04794x, doi101111j155856461996tb04496x, doi101126science2555046845, doi101126science27853411267, doi101126science27953581915, doi101139e72031, doi101139e93179, doi1015468p4gnhz, doi1016660094837320000260734aaateo20co2, doi1023071292217, doi10230730135049, doi104095101672, doi105281zenodo1038220, doi105281zenodo16120887, doi105281zenodo16171435, doi105281zenodo16492064, doi105479si03629236110i, doi105860choice300927, doi105860choice326223, doi105860choice392183, doi105962p226819, gregor1988the, madsen1976a, openalexw2788234611, openalexw617951419, openalexw638862129, openalexw646636017, rowe1989a, walker1964triassic"
}

Les données zoogéographiques, paléontologiques et biochimiques soutiennent une origine hémisphère Sud pour les oiseaux passériformes, tandis que les données moléculaires accumulées suggèrent que la plupart des ordres d'oiseaux actuels sont apparus au Crétacé moyen-tardif. Nous avons obtenu des données de séquences d'ADN à partir des gènes nucléaires c-myc et RAG-1 des principaux groupes passériformes et démontrons ici que les troglodytes endémiques de Nouvelle-Zélande (Acanthisittidae) sont le taxon frère de tous les autres passériformes actuels, soutenant une origine gondwanienne et une radiation précoce des passériformes. Nous proposons que (i) les acanthisittidés aient été isolés lorsque la Nouvelle-Zélande s'est séparée de la Gondwana (il y a environ 82-85 Myr), (ii) les sous-oscines, à leur tour, aient été dérivés d'une lignée ancestrale qui habitait la Gondwana occidentale, et (iii) les ancêtres des oscines (oiseaux chanteurs) aient ensuite été isolés par la séparation de l'Australie de l'Antarctique. La diffusion ultérieure des passériformes dans l'hémisphère Nord reflète la migration vers le Nord de ces éléments gondwaniens antérieurs.

@article{doi101098rspb20011877,
    author = "Ericson, Per G. P. et Christidis, Les et Cooper, Alan et Irestedt, Martin et Jackson, Jennifer A. et Johansson, Ulf S. et Norman, Janette A.",
    title = "Une origine gondwanienne des oiseaux passériformes soutenue par des séquences d'ADN des troglodytes endémiques de Nouvelle-Zélande",
    year = "2002",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Les données zoogéographiques, paléontologiques et biochimiques soutiennent une origine hémisphère Sud pour les oiseaux passériformes, tandis que les données moléculaires accumulées suggèrent que la plupart des ordres d'oiseaux actuels sont apparus au Crétacé moyen-tardif. Nous avons obtenu des données de séquences d'ADN à partir des gènes nucléaires c-myc et RAG-1 des principaux groupes passériformes et démontrons ici que les troglodytes endémiques de Nouvelle-Zélande (Acanthisittidae) sont le taxon frère de tous les autres passériformes actuels, soutenant une origine gondwanienne et une radiation précoce des passériformes. Nous proposons que (i) les acanthisittidés aient été isolés lorsque la Nouvelle-Zélande s'est séparée de la Gondwana (il y a environ 82-85 Myr), (ii) les sous-oscines, à leur tour, aient été dérivés d'une lignée ancestrale qui habitait la Gondwana occidentale, et (iii) les ancêtres des oscines (oiseaux chanteurs) aient ensuite été isolés par la séparation de l'Australie de l'Antarctique. La diffusion ultérieure des passériformes dans l'hémisphère Nord reflète la migration vers le Nord de ces éléments gondwaniens antérieurs.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2001.1877",
    doi = "10.1098/rspb.2001.1877",
    openalex = "W1989551086",
    references = "doi101098rspb20001368, doi105860choice343307"
}

Le taxon avialan Apsaravis ukhaana du Crétacé supérieur du sud de la Mongolie est décrit en entier et sa position phylogénétique est évaluée. Apsaravis ukhaana provient de grès continentaux exposés au site de Ukhaa Tolgod, Omnogov Aimag, Mongolie. L'exemplaire holotype consiste en un squelette articulé presque complet d'un petit avialan volant. Apsaravis ukhaana est sans ambiguïté différencié des autres avialans sur la base de la présence de plusieurs morphologies uniques : un tubercule fort sur l'humérus proximal, une crête trochantérienne hypertrophiée sur le fémur, et des ailes postérieures extrêmement bien projetées d'une surface du tibiotarse distal qui chez les Aves s'articule avec le cartilage tibial. Dix autres caractères homoplastiques s'optimisent comme autapomorphies de Apsaravis ukhaana dans l'analyse phylogénétique. Ils sont les suivants : symphyse mandibulaire ossifiée ; dentaire fortement fourchu postérieurement ; processus acromial crochu sur l'omoplate ; condyle dorsal fortement angulé de l'humérus ; condyles huméraux faiblement définis ; bord distal de l'humérus s'inclinant fortement ventralement ; humérus évasé dorsoventralement à son terminus distal ; condyle latéral du tibiotarse plus large que le médial ; aucun des condyles du tibiotarse ne s'amincissant vers la ligne médiane ; et trochlée du métatarsien II arrondie plutôt que ginglymoïde. La position phylogénétique de Apsaravis ukhaana en tant que taxon sœur des Hesperornithes Aves résulte de l'analyse de 202 caractères notés pour 17 taxons ingroupes avialans. Les implications de Apsaravis ukhaana, et les résultats de l'analyse phylogénétique, pour l'évolution du vol après son origine et le soutien au caractère de la monophylie des enantiornithines sont étendument discutés.

@article{doi1012060003008220023870001tmappo20co2,
    author = "Clarke, Julia A. et Norell, Mark A.",
    title = "La morphologie et la position phylogénétique de Apsaravis ukhaana du Crétacé supérieur de Mongolie",
    year = "2002",
    journal = "American Museum Novitates",
    abstract = "Le taxon avialan Apsaravis ukhaana du Crétacé supérieur du sud de la Mongolie est décrit en entier et sa position phylogénétique est évaluée. Apsaravis ukhaana provient de grès continentaux exposés au site de Ukhaa Tolgod, Omnogov Aimag, Mongolie. L'exemplaire holotype consiste en un squelette articulé presque complet d'un petit avialan volant. Apsaravis ukhaana est sans ambiguïté différencié des autres avialans sur la base de la présence de plusieurs morphologies uniques : un tubercule fort sur l'humérus proximal, une crête trochantérienne hypertrophiée sur le fémur, et des ailes postérieures extrêmement bien projetées d'une surface du tibiotarse distal qui chez les Aves s'articule avec le cartilage tibial. Dix autres caractères homoplastiques s'optimisent comme autapomorphies de Apsaravis ukhaana dans l'analyse phylogénétique. Ils sont les suivants : symphyse mandibulaire ossifiée ; dentaire fortement fourchu postérieurement ; processus acromial crochu sur l'omoplate ; condyle dorsal fortement angulé de l'humérus ; condyles huméraux faiblement définis ; bord distal de l'humérus s'inclinant fortement ventralement ; humérus évasé dorsoventralement à son terminus distal ; condyle latéral du tibiotarse plus large que le médial ; aucun des condyles du tibiotarse ne s'amincissant vers la ligne médiane ; et trochlée du métatarsien II arrondie plutôt que ginglymoïde. La position phylogénétique de Apsaravis ukhaana en tant que taxon sœur des Hesperornithes Aves résulte de l'analyse de 202 caractères notés pour 17 taxons ingroupes avialans. Les implications de Apsaravis ukhaana, et les résultats de l'analyse phylogénétique, pour l'évolution du vol après son origine et le soutien au caractère de la monophylie des enantiornithines sont étendument discutés.",
    url = "https://doi.org/10.1206/0003-0082(2002)387<0001:tmappo>2.0.co;2",
    doi = "10.1206/0003-0082(2002)387<0001:tmappo>2.0.co;2",
    openalex = "W2178079533",
    references = "doi101016b978012249408650011x, doi101127njgpa210199841, doi1015159783110848281, doi102307jctt1xp3v3r, doi102475ajss319111253, doi102475ajss321125417, doi105281zenodo16171435, doi105860choice343307, doi105962bhltitle156765, openalexw2607033038"
}

@article{doi1023074090253,
    author = "Olson, Storrs L.",
    title = "Nouvelles perspectives sur l'origine et l'évolution précoce des oiseaux. Proceedings of the International Symposium in Honor of John H. Ostrom Jacques Gauthier Lawrence F. Gall",
    year = "2002",
    journal = "The Auk",
    url = "https://doi.org/10.2307/4090253",
    doi = "10.2307/4090253",
    openalex = "W2315287591"
}

Les caractères dérivés d'un nouveau mammifère boreosphenidan de la Formation de Yixian du Crétacé inférieur de Chine suggèrent qu'il a une relation plus proche avec les métatheriens (y compris les marsupiaux actuels) qu'avec les eutheriens (y compris les placentaires actuels). Ce fossile date de 125 millions d'années et prolonge le registre des parents des marsupiaux avec des restes squelettiques de 50 millions d'années. Il possède également de nombreuses structures de pattes connues uniquement chez les mammifères actuels grimpeurs et arboricoles, suggérant que les premiers theriens de la couronne ont exploité des niches diversifiées. De nouvelles données issues de ce fossile soutiennent l'idée que l'Asie était probablement le centre de la diversification des premiers métatheriens et eutheriens au cours du Crétacé inférieur.

@article{doi101126science1090718,
    author = "Luo, Zhe‐Xi et Ji, Qiang et Wible, John R. et Yuan, Chong-Xi",
    title = "Un mammifère tribosphenique du Crétacé inférieur et l'évolution des métatheriens",
    year = "2003",
    journal = "Science",
    abstract = "Les caractères dérivés d'un nouveau mammifère boreosphenidan de la Formation de Yixian du Crétacé inférieur de Chine suggèrent qu'il a une relation plus proche avec les métatheriens (y compris les marsupiaux actuels) qu'avec les eutheriens (y compris les placentaires actuels). Ce fossile date de 125 millions d'années et prolonge le registre des parents des marsupiaux avec des restes squelettiques de 50 millions d'années. Il possède également de nombreuses structures de pattes connues uniquement chez les mammifères actuels grimpeurs et arboricoles, suggérant que les premiers theriens de la couronne ont exploité des niches diversifiées. De nouvelles données issues de ce fossile soutiennent l'idée que l'Asie était probablement le centre de la diversification des premiers métatheriens et eutheriens au cours du Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1090718",
    doi = "10.1126/science.1090718",
    openalex = "W2089259767",
    references = "doi107312kiel11918"
}

Deux nouveaux squelettes presque entièrement articulés de Sapeornis chaoyangensis fournissent beaucoup d'informations nouvelles sur l'anatomie de cet oiseau basal, en particulier dans le crâne, la ceinture pectorale, le membre antérieur et le membre postérieur. Ce nouveau matériel montre que la main de Sapeornis, avec une formule phalangienne de "2–3–2," était plus dérivée que précédemment reconstruite. Le squelette de Sapeornis présente plusieurs caractéristiques uniques, telles qu'une fenêtre distinctement allongée à l'extrémité proximale de l'humérus, une furcula robuste avec un hypocleidum distinctif, et un membre antérieur allongé. Sapeornis présente une combinaison de caractères dérivés et primitifs, incluant un coracoïde court, robuste et non en forme de strut, et une fibula atteignant l'extrémité distale de l'articulation tarsale (comme chez Archaeopteryx), un pygostyle, des doigts manuels réduits, et un carpometacarpe bien fusionné (comme chez les oiseaux plus avancés). Ces caractéristiques indiquent davantage le motif mosaïque dans l'évolution précoce des oiseaux et confirment la position basale de Sapeornis près d'Archaeopteryx et de Jeholornis dans la phylogénie des premiers oiseaux. La préservation de gastrolithes dans l'un des nouveaux spécimens représente également le premier oiseau mésozoïque chinois avec de telles preuves, indiquant un régime herbivore et fournissant davantage de preuves pour notre compréhension de la diversification du régime alimentaire dans l'évolution précoce des oiseaux.

@article{doi101139e03011,
    author = "Zhou, Zhonghe and Zhang, Fucheng",
    title = "Anatomie de l'oiseau primitif Sapeornis chaoyangensis du Crétacé inférieur du Liaoning, Chine",
    year = "2003",
    journal = "Canadian Journal of Earth Sciences",
    abstract = {Deux nouveaux squelettes presque entièrement articulés de Sapeornis chaoyangensis fournissent beaucoup d'informations nouvelles sur l'anatomie de cet oiseau basal, en particulier dans le crâne, la ceinture pectorale, le membre antérieur et le membre postérieur. Ce nouveau matériel montre que la main de Sapeornis, avec une formule phalangienne de "2–3–2," était plus dérivée que précédemment reconstruite. Le squelette de Sapeornis présente plusieurs caractéristiques uniques, telles qu'une fenêtre distinctement allongée à l'extrémité proximale de l'humérus, une furcula robuste avec un hypocleidum distinctif, et un membre antérieur allongé. Sapeornis présente une combinaison de caractères dérivés et primitifs, incluant un coracoïde court, robuste et non en forme de strut, et une fibula atteignant l'extrémité distale de l'articulation tarsale (comme chez Archaeopteryx), un pygostyle, des doigts manuels réduits, et un carpometacarpe bien fusionné (comme chez les oiseaux plus avancés). Ces caractéristiques indiquent davantage le motif mosaïque dans l'évolution précoce des oiseaux et confirment la position basale de Sapeornis près d'Archaeopteryx et de Jeholornis dans la phylogénie des premiers oiseaux. La préservation de gastrolithes dans l'un des nouveaux spécimens représente également le premier oiseau mésozoïque chinois avec de telles preuves, indiquant un régime herbivore et fournissant davantage de preuves pour notre compréhension de la diversification du régime alimentaire dans l'évolution précoce des oiseaux.},
    url = "https://doi.org/10.1139/e03-011",
    doi = "10.1139/e03-011",
    openalex = "W1973835690",
    references = "doi10103835047056, doi101038382442a0, doi10103845769, doi101038nature00930, doi101126science2555046845, doi101126science27953581915, doi101126science29054981955, openalexw1489366593, openalexw1589617690, openalexw2607033038"
}

Le débat sur l'ascendance avienne : phylogénie, fonction et fossiles / Lawrence M. Witmer -- Approches cladistiques des relations entre les oiseaux et d'autres dinosaures théropodes / James M. Clark, Mark A. Norell et Peter J. Makovicky -- Le dinosaure énigmatique et oiseau-like Avimimus portentosus : commentaires et atlas illustré / Patricia Vickers-Rich, Luis M. Chiappe et Sergei Kurzanov -- Les Alvarezsauridae à bras courts du Crétacé : Mononykus et ses proches / Luis M. Chiappe, Mark A. Norell et James M. Clark -- Les relations alvarezsaures réexaminées / Fernando E. Novas et Diego Pol -- Archaeopterygidae (Jurassique supérieur d'Allemagne) / Andrzej Elzanowski -- La découverte et l'étude des oiseaux du Mésozoïque en Chine / Zhou Zhonghe et Hou Lianhai -- Sinornis santensis (Aves : Enantiornithes) du Crétacé inférieur du nord-est de la Chine / Paul C. Sereno, Rao Chenggang et Li Jianjun -- Les oiseaux du Crétacé inférieur de Las Hoyas (province de Cuenca, Espagne) / Jose L. Sanz... [et al.] -- Nogueromis gonzalezi (Aves : Ornithothoraces) du Crétacé inférieur d'Espagne / Luis M. Chiappe et Antonio Lacasa-Ruiz -- Morphologie squelettique et systématique des Euenantiornithes du Crétacé (Ornithothoraces : Enantiornithes) / Luis M. Chiappe et Cyril A. Walker -- Vorona berivotrensis, un oiseau primitif du Crétacé supérieur de Madagascar / Catherine A. Forster... [et al.] -- Ostéologie du Patagopteryx deferrariisi, un oiseau incapable de voler du Crétacé supérieur de Patagonie (Argentine) / Luis M. Chiappe -- Enaliornis, un oiseau hespérorinthiforme du Crétacé inférieur d'Angleterre, avec des commentaires sur d'autres Hesperornithiformes / Peter M. Galton et Larry D. Martin -- La radiation des Neornithes au Mésozoïque / Sylvia Hope -- Un examen des plumes fossiles aviennes du Mésozoïque / Alexander W.A. Kellner -- Le registre de traces des oiseaux et ptérosaures du Mésozoïque : une perspective ichnologique et paléoécologique / Martin G. Lockley et Emma C. Rainforth -- Microstructure osseuse des premiers oiseaux / Anusuya Chinsamy -- Évolution locomotrice sur la lignée menant aux oiseaux modernes / Stephen M. Gatesy -- Phylogénie avienne basale : problèmes et solutions / Luis M. Chiappe.

@article{doi1016660022336020030770822mbatho20co2,
    author = "Clarke, Julia",
    title = "Oiseaux du Mésozoïque : Au-dessus des têtes des dinosaures",
    year = "2003",
    journal = "Journal of Paleontology",
    abstract = "Le débat sur l'ascendance avienne : phylogénie, fonction et fossiles / Lawrence M. Witmer -- Approches cladistiques des relations entre les oiseaux et d'autres dinosaures théropodes / James M. Clark, Mark A. Norell et Peter J. Makovicky -- Le dinosaure énigmatique et oiseau-like Avimimus portentosus : commentaires et atlas illustré / Patricia Vickers-Rich, Luis M. Chiappe et Sergei Kurzanov -- Les Alvarezsauridae à bras courts du Crétacé : Mononykus et ses proches / Luis M. Chiappe, Mark A. Norell et James M. Clark -- Les relations alvarezsaures réexaminées / Fernando E. Novas et Diego Pol -- Archaeopterygidae (Jurassique supérieur d'Allemagne) / Andrzej Elzanowski -- La découverte et l'étude des oiseaux du Mésozoïque en Chine / Zhou Zhonghe et Hou Lianhai -- Sinornis santensis (Aves : Enantiornithes) du Crétacé inférieur du nord-est de la Chine / Paul C. Sereno, Rao Chenggang et Li Jianjun -- Les oiseaux du Crétacé inférieur de Las Hoyas (province de Cuenca, Espagne) / Jose L. Sanz... [et al.] -- Nogueromis gonzalezi (Aves : Ornithothoraces) du Crétacé inférieur d'Espagne / Luis M. Chiappe et Antonio Lacasa-Ruiz -- Morphologie squelettique et systématique des Euenantiornithes du Crétacé (Ornithothoraces : Enantiornithes) / Luis M. Chiappe et Cyril A. Walker -- Vorona berivotrensis, un oiseau primitif du Crétacé supérieur de Madagascar / Catherine A. Forster... [et al.] -- Ostéologie du Patagopteryx deferrariisi, un oiseau incapable de voler du Crétacé supérieur de Patagonie (Argentine) / Luis M. Chiappe -- Enaliornis, un oiseau hespérorinthiforme du Crétacé inférieur d'Angleterre, avec des commentaires sur d'autres Hesperornithiformes / Peter M. Galton et Larry D. Martin -- La radiation des Neornithes au Mésozoïque / Sylvia Hope -- Un examen des plumes fossiles aviennes du Mésozoïque / Alexander W.A. Kellner -- Le registre de traces des oiseaux et ptérosaures du Mésozoïque : une perspective ichnologique et paléoécologique / Martin G. Lockley et Emma C. Rainforth -- Microstructure osseuse des premiers oiseaux / Anusuya Chinsamy -- Évolution locomotrice sur la lignée menant aux oiseaux modernes / Stephen M. Gatesy -- Phylogénie avienne basale : problèmes et solutions / Luis M. Chiappe.",
    url = "https://doi.org/10.1666/0022-3360(2003)077<0822:mbatho>2.0.co;2",
    doi = "10.1666/0022-3360(2003)077<0822:mbatho>2.0.co;2",
    openalex = "W4301871956",
    references = "doi101038292051a0"
}

Préface Partie I : Le patrimoine archosaurien des oiseaux 1. Le débat sur l'ascendance avienne : phylogénie, fonction et fossiles LAWRENCE M. WITMER 2. Approches cladistiques des relations entre les oiseaux et autres dinosaures théropodes JAMES M. CLARK, MARK A. NORELL, ET PETER J. MAKOVICKY Partie II : Taxons de statut controversé 3. Le dinosaure énigmatique et oiseau-like Avimimus portentosus : commentaires et un atlas pictorial PATRICIA VICKERS-RICH, LUIS M. CHIAPPE, ET SERGEI KURZANOV 4. Les Alvarezsauridae du Crétacé, à bras courts : Mononykus et ses proches LUIS M. CHIAPPE, MARK A. NORELL, ET JAMES M. CLARK 5. Les relations alvarezsaures réexaminées FERNANDO E. NOVAS ET DIEGO POL Partie III : L'avifaune du Mésozoïque : anatomie et systématique 6. Archaeopterygidae (Jurassique supérieur d'Allemagne) ANDRZEJ ELZANOWSKI 7. La découverte et l'étude des oiseaux du Mésozoïque en Chine ZHOU ZHONGHE ET HOU LIANHAI 8. Sinornis santensis (Aves : Enantiornithes) du Crétacé inférieur du Nord-Est de la Chine PAUL C. SERENO, RAO CHENGGANG, ET LI JIANJUN 9. Les oiseaux du Crétacé inférieur de Las Hoyas (province de Cuenca, Espagne) JOSE L. SANZ, BERNARDINO P. PEREZ-MORENO, LUIS M. CHIAPPE, ET ANGELA D. BUSCALIONI 10. Noguerornis gonzalezi (Aves) du Crétacé inférieur d'Espagne LUIS M. CHIAPPE ET ANTONIO LACASA-RUIZ 11. Morphologie squelettique et systématique des Euenantiornithes du Crétacé (Ornithothoraces : Enantiornithes) LUIS M. CHIAPPE ET CYRIL A. WALKER 12. Vorona berivotrensis, un oiseau primitif du Crétacé supérieur de Madagascar CATHERINE A. FORSTER, LUIS M. CHIAPPE, DAVID W. KRAUSE, ET SCOTT D. SAMPSON 13. Ostéologie du Patagopteryx deferrariisi, un oiseau incapable de voler du Crétacé supérieur de Patagonie (Argentine) LUIS M. CHIAPPE 14. Enaliornis, un oiseau hespérorinthiforme du Crétacé inférieur d'Angleterre, avec des commentaires sur d'autres Hesperornithiformes PETER M. GALTON ET LARRY D. MARTIN 15. La radiation des Neornithes au Mésozoïque SYLVIA HOPE 16. Un examen des plumes fossiles aviennes du Mésozoïque ALEXANDER W. A. KELLNER 17. Le bilan des oiseaux et ptérosaures du Mésozoïque : une perspective ichnologique et paléoécologique MARTIN G. LOCKLEY ET EMMA C. RAINFORTH Partie IV : Morphologie fonctionnelle et évolution 18. Microstructure osseuse des premiers oiseaux ANUSUYA CHINSAMY 19. Évolution locomotrice sur la lignée menant aux oiseaux modernes STEPHEN M. GATESY 20. Phylogénie des oiseaux basaux : problèmes et solutions LUIS M. CHIAPPE Contributeurs Index

@article{doi105860choice405235,
    title = "Oiseaux du Mésozoïque : au-dessus des têtes des dinosaures",
    year = "2003",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Préface Partie I : Le patrimoine archosaurien des oiseaux 1. Le débat sur l'ascendance avienne : phylogénie, fonction et fossiles LAWRENCE M. WITMER 2. Approches cladistiques des relations entre les oiseaux et autres dinosaures théropodes JAMES M. CLARK, MARK A. NORELL, ET PETER J. MAKOVICKY Partie II : Taxons de statut controversé 3. Le dinosaure énigmatique et oiseau-like Avimimus portentosus : commentaires et un atlas pictorial PATRICIA VICKERS-RICH, LUIS M. CHIAPPE, ET SERGEI KURZANOV 4. Les Alvarezsauridae du Crétacé, à bras courts : Mononykus et ses proches LUIS M. CHIAPPE, MARK A. NORELL, ET JAMES M. CLARK 5. Les relations alvarezsaures réexaminées FERNANDO E. NOVAS ET DIEGO POL Partie III : L'avifaune du Mésozoïque : anatomie et systématique 6. Archaeopterygidae (Jurassique supérieur d'Allemagne) ANDRZEJ ELZANOWSKI 7. La découverte et l'étude des oiseaux du Mésozoïque en Chine ZHOU ZHONGHE ET HOU LIANHAI 8. Sinornis santensis (Aves : Enantiornithes) du Crétacé inférieur du Nord-Est de la Chine PAUL C. SERENO, RAO CHENGGANG, ET LI JIANJUN 9. Les oiseaux du Crétacé inférieur de Las Hoyas (province de Cuenca, Espagne) JOSE L. SANZ, BERNARDINO P. PEREZ-MORENO, LUIS M. CHIAPPE, ET ANGELA D. BUSCALIONI 10. Noguerornis gonzalezi (Aves) du Crétacé inférieur d'Espagne LUIS M. CHIAPPE ET ANTONIO LACASA-RUIZ 11. Morphologie squelettique et systématique des Euenantiornithes du Crétacé (Ornithothoraces : Enantiornithes) LUIS M. CHIAPPE ET CYRIL A. WALKER 12. Vorona berivotrensis, un oiseau primitif du Crétacé supérieur de Madagascar CATHERINE A. FORSTER, LUIS M. CHIAPPE, DAVID W. KRAUSE, ET SCOTT D. SAMPSON 13. Ostéologie du Patagopteryx deferrariisi, un oiseau incapable de voler du Crétacé supérieur de Patagonie (Argentine) LUIS M. CHIAPPE 14. Enaliornis, un oiseau hespérorinthiforme du Crétacé inférieur d'Angleterre, avec des commentaires sur d'autres Hesperornithiformes PETER M. GALTON ET LARRY D. MARTIN 15. La radiation des Neornithes au Mésozoïque SYLVIA HOPE 16. Un examen des plumes fossiles aviennes du Mésozoïque ALEXANDER W. A. KELLNER 17. Le bilan des oiseaux et ptérosaures du Mésozoïque : une perspective ichnologique et paléoécologique MARTIN G. LOCKLEY ET EMMA C. RAINFORTH Partie IV : Morphologie fonctionnelle et évolution 18. Microstructure osseuse des premiers oiseaux ANUSUYA CHINSAMY 19. Évolution locomotrice sur la lignée menant aux oiseaux modernes STEPHEN M. GATESY 20. Phylogénie des oiseaux basaux : problèmes et solutions LUIS M. CHIAPPE Contributeurs Index",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.40-5235",
    doi = "10.5860/choice.40-5235",
    openalex = "W586262331",
    references = "doi101038nature01342, doi101093auk11941187"
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Les espèces à élevage coopératif sont celles où plus d'un couple d'individus aide à la production de jeunes. L'élevage coopératif est présent chez seulement quelques centaines d'espèces d'oiseaux dans le monde, et la compréhension de ce comportement souvent remarquablement altruiste est restée un défi important en écologie comportementale depuis plus de 30 ans. Ce livre met en évidence les avancées théoriques, empiriques et techniques qui ont eu lieu dans le domaine de la recherche sur l'élevage coopératif depuis la publication de l'ouvrage fondateur Elevage coopératif chez les oiseaux : Études à long terme du comportement et de l'écologie (1990, ISBN HB 0521 372984, ISBN PB 0521 378907). Organisé conceptuellement, une attention particulière est portée aux manières dont les espèces à élevage coopératif se sont révélées être des sujets fertiles pour tester les avancées modernes aux problèmes évolutifs classiques, notamment ceux de la sélection sexuelle, de la manipulation du ratio des sexes, de l'évolution de l'histoire de vie, de la partition de la reproduction et de l'évitement de l'inceste. Il intéressera aussi bien les étudiants que les chercheurs intéressés par le comportement et l'écologie.

@book{doi101017cbo9780511606816,
    author = "Koenig, Walter D. et Koenig, Walter D. et Ligon, J. David et Ekman, Jan et Dickinson, Janis L. et Heinsohn, Robert et Cockburn, Andrew et Komdeur, Jan et Plessis, Morné A. Du et Schoech, Stephan J. et Koenig, Walter D. et Magrath, Robert D. et Vehrencamp, Sandra L. et Walters, Jeffrey R. et Russell, Andrew F. et Pruett‐Jones, Stephen",
    title = "Écologie et évolution de l'élevage coopératif chez les oiseaux",
    year = "2004",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Les espèces à élevage coopératif sont celles où plus d'un couple d'individus aide à la production de jeunes. L'élevage coopératif est présent chez seulement quelques centaines d'espèces d'oiseaux dans le monde, et la compréhension de ce comportement souvent remarquablement altruiste est restée un défi important en écologie comportementale depuis plus de 30 ans. Ce livre met en évidence les avancées théoriques, empiriques et techniques qui ont eu lieu dans le domaine de la recherche sur l'élevage coopératif depuis la publication de l'ouvrage fondateur Elevage coopératif chez les oiseaux : Études à long terme du comportement et de l'écologie (1990, ISBN HB 0521 372984, ISBN PB 0521 378907). Organisé conceptuellement, une attention particulière est portée aux manières dont les espèces à élevage coopératif se sont révélées être des sujets fertiles pour tester les avancées modernes aux problèmes évolutifs classiques, notamment ceux de la sélection sexuelle, de la manipulation du ratio des sexes, de l'évolution de l'histoire de vie, de la partition de la reproduction et de l'évitement de l'inceste. Il intéressera aussi bien les étudiants que les chercheurs intéressés par le comportement et l'écologie.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511606816",
    doi = "10.1017/cbo9780511606816",
    openalex = "W1575039682",
    references = "doi1010160169534796100288, doi101111j1474919x1968tb00058x, doi101146annurevnutr191247, doi105860choice343307, openalexw563887495"
}

@article{doi101016jpalaeo200507006,
    author = "Friis, Else Marie et Pedersen, Kaj Raunsgaard et Crane, Peter R.",
    title = "Fleurs d'angiospermes du Crétacé : Innovation et évolution dans la reproduction des plantes",
    year = "2005",
    journal = "Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    doi = "10.1016/j.palaeo.2005.07.006",
    openalex = "W2001715812",
    references = "doi101007bf02860067, doi101007bf02860540, doi101007bf02861082, doi101016s0012821x0000159x, doi101038363342a0, doi10103846536, doi101038nature01420, doi1010719780643090149, doi1023071485834, doi1023072399030, doi1023072418725, doi1023072807789, doi105860choice323883, doi105860choice323884"
}

Un oiseau ornithurine, Hongshanornis longicresta gen. et sp. nov., représenté par un squelette presque complet et articulé dans son plumage complet, a été découvert dans les dépôts lacustres du groupe de Jehol du Crétacé inférieur en Mongolie intérieure, dans le nord-est de la Chine. L'oiseau avait des dents complètement réduites et possédait un bec à la fois dans la mâchoire supérieure et inférieure, représentant le premier ornithurine à bec connu. La préservation d'un os prédentaire confirme que cette structure n'est pas unique aux dinosaures ornithischiens mais était commune chez les premiers oiseaux ornithurines. Cet oiseau de petite taille avait une forte capacité de vol avec une aile à faible allongement. Il était probablement un limicole, se nourrissant dans des eaux peu profondes ou des marais. Cette découverte confirme que l'environnement aquatique a joué un rôle clé dans l'origine et la radiation précoce des ornithurines, dont une branche a donné naissance aux oiseaux actuels près de la limite Crétacé/Tertiaire. Cette découverte fournit des informations importantes non seulement pour étudier l'origine et l'évolution précoce des ornithurines, mais aussi pour comprendre la différenciation en morphologie, taille corporelle et régime alimentaire des oiseaux du Crétacé inférieur.

@article{doi101073pnas0507106102,
    author = "Zhou, Zhonghe et Zhang, Fucheng",
    title = "Découverte d'un oiseau ornithurine et ses implications pour la radiation avienne du Crétacé inférieur",
    year = "2005",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Un oiseau ornithurine, Hongshanornis longicresta gen. et sp. nov., représenté par un squelette presque complet et articulé dans son plumage complet, a été découvert dans les dépôts lacustres du groupe de Jehol du Crétacé inférieur en Mongolie intérieure, dans le nord-est de la Chine. L'oiseau avait des dents complètement réduites et possédait un bec à la fois dans la mâchoire supérieure et inférieure, représentant le premier ornithurine à bec connu. La préservation d'un os prédentaire confirme que cette structure n'est pas unique aux dinosaures ornithischiens mais était commune chez les premiers oiseaux ornithurines. Cet oiseau de petite taille avait une forte capacité de vol avec une aile à faible allongement. Il était probablement un limicole, se nourrissant dans des eaux peu profondes ou des marais. Cette découverte confirme que l'environnement aquatique a joué un rôle clé dans l'origine et la radiation précoce des ornithurines, dont une branche a donné naissance aux oiseaux actuels près de la limite Crétacé/Tertiaire. Cette découverte fournit des informations importantes non seulement pour étudier l'origine et l'évolution précoce des ornithurines, mais aussi pour comprendre la différenciation en morphologie, taille corporelle et régime alimentaire des oiseaux du Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0507106102",
    doi = "10.1073/pnas.0507106102",
    openalex = "W2094628056",
    references = "doi1010292004gl019790, doi10103821872, doi101038nature00930, doi101038nature01420, doi101038nature03150, doi101126science29054981955, doi101139e03011, doi10560219780801881206, doi105860choice343307, doi105860choice405235"
}

Des tissus végétaux silicifiés (phytolithes) conservés dans des coprolites du Crétacé supérieur provenant de l'Inde montrent que au moins cinq taxons issus de sous-clades de graminées actuelles (Poaceae) étaient présents sur le sous-continent indien à la fin du Crétacé. Cette diversité taxonomique suggère que les Poaceae du groupe couronne avaient déjà diversifié et étendu leur répartition dans la Gondwana avant que l'Inde ne devienne géographiquement isolée. D'autres phytolithes extraits des coprolites (provenant de dicotylédones, de conifères et de palmiers) suggèrent que les producteurs de fèces suspectés (sauropodes titanosauriens) se nourrissaient indifféremment d'une large gamme de plantes. Ces données rendent également plausible l'hypothèse selon laquelle les mammifères gondwanathériens à dents hypsodontes étaient des herbivores.

@article{doi101126science1118806,
    author = "Prasad, Vandana et Strömberg, Caroline A. E. et Alimohammadian, Habib et Sahni, Ashok",
    title = "Coprolites de dinosaures et l'évolution précoce des graminées et des herbivores",
    year = "2005",
    journal = "Science",
    abstract = "Des tissus végétaux silicifiés (phytolithes) conservés dans des coprolites du Crétacé supérieur provenant de l'Inde montrent que au moins cinq taxons issus de sous-clades de graminées actuelles (Poaceae) étaient présents sur le sous-continent indien à la fin du Crétacé. Cette diversité taxonomique suggère que les Poaceae du groupe couronne avaient déjà diversifié et étendu leur répartition dans la Gondwana avant que l'Inde ne devienne géographiquement isolée. D'autres phytolithes extraits des coprolites (provenant de dicotylédones, de conifères et de palmiers) suggèrent que les producteurs de fèces suspectés (sauropodes titanosauriens) se nourrissaient indifféremment d'une large gamme de plantes. Ces données rendent également plausible l'hypothèse selon laquelle les mammifères gondwanathériens à dents hypsodontes étaient des herbivores.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1118806",
    doi = "10.1126/science.1118806",
    openalex = "W2157319590",
    references = "doi101016jpalaeo200309028, doi101017s1464793101005735, doi101038333843a0, doi101071bt00023, doi101073pnas0505700102, doi101111j10958339200400345x, doi101130spe332, doi1023072398811, doi1023072666186, doi1023073298585, doi1023073889325"
}

Tester les modèles de macroévolution, et surtout la suffisance des processus microévolutifs, nécessite une bonne collaboration entre biologistes moléculaires et paléontologues. Nous rapportons un tel test pour les événements autour du Crétacé supérieur en décrivant les premiers fossiles de pingouins, en analysant des génomes mitochondriaux complets d'un albatros, d'un pétrel et d'un plongeon, et en décrivant le déclin progressif des ptérosaures au même moment où les oiseaux modernes se radiationnent. Les fossiles de pingouins comprennent quatre squelettes naturellement associés du Greensand de Waipara en Nouvelle-Zélande, une formation du Paléocène (Tertiaire précoce) juste au-dessus d'un site de frontière Crétacé/Tertiaire bien connu. Les fossiles, dans un nouveau genre (Waimanu), fournissent une estimation inférieure de 61-62 Ma pour la divergence entre les pingouins et les autres oiseaux et établissent ainsi un point de calibration fiable pour l'évolution aviaire. En combinant les points de calibration fossiles, les séquences d'ADN, la vraisemblance maximale et l'analyse bayésienne, les calibrations de pingouins impliquent une radiation d'oiseaux modernes (groupe couronne) au Crétacé supérieur. Cela inclut une estimation conservatrice que les lignées marines et côtières modernes se sont divergées au plus tard au Crétacé supérieur vers 74 +/- 3 Ma (Campanien). Il est clair que les oiseaux modernes depuis au moins le Crétacé supérieur tardif vivaient au même moment que les oiseaux archaïques incluant Hesperornis, Ichthyornis et les divers Enantiornithiformes. Les ptérosaures, qui coexistaient également avec les premiers oiseaux couronne, montrent des changements notables tout au long du Crétacé supérieur. Il y a eu une diminution de la diversité taxonomique, et les espèces de petite à moyenne taille ont disparu bien avant la fin du Crétacé. Une lecture simple du registre fossile pourrait suggérer des interactions compétitives avec les oiseaux, mais beaucoup plus doit être compris sur les histoires de vie des ptérosaures. Des fossiles supplémentaires et des données moléculaires sont toujours nécessaires pour aider à comprendre le rôle des interactions biotiques dans l'évolution des oiseaux du Crétacé supérieur et ainsi tester que les mécanismes de la microévolution sont suffisants pour expliquer la macroévolution.

@article{doi101093molbevmsj124,
    author = "Slack, Kerryn E. et Jones, Craig M. et Ando, Tatsuro et Harrison, G. L. Abby et Fordyce, R. Éwan et Árnason, Úlfur et Penny, David",
    title = "Fossiles de pingouins précoces, plus génomes mitochondriaux, calibrent l'évolution aviaire",
    year = "2006",
    journal = "Molecular Biology and Evolution",
    abstract = "Tester les modèles de macroévolution, et surtout la suffisance des processus microévolutifs, nécessite une bonne collaboration entre biologistes moléculaires et paléontologues. Nous rapportons un tel test pour les événements autour du Crétacé supérieur en décrivant les premiers fossiles de pingouins, en analysant des génomes mitochondriaux complets d'un albatros, d'un pétrel et d'un plongeon, et en décrivant le déclin progressif des ptérosaures au même moment où les oiseaux modernes se radiationnent. Les fossiles de pingouins comprennent quatre squelettes naturellement associés du Greensand de Waipara en Nouvelle-Zélande, une formation du Paléocène (Tertiaire précoce) juste au-dessus d'un site de frontière Crétacé/Tertiaire bien connu. Les fossiles, dans un nouveau genre (Waimanu), fournissent une estimation inférieure de 61-62 Ma pour la divergence entre les pingouins et les autres oiseaux et établissent ainsi un point de calibration fiable pour l'évolution aviaire. En combinant les points de calibration fossiles, les séquences d'ADN, la vraisemblance maximale et l'analyse bayésienne, les calibrations de pingouins impliquent une radiation d'oiseaux modernes (groupe couronne) au Crétacé supérieur. Cela inclut une estimation conservatrice que les lignées marines et côtières modernes se sont divergées au plus tard au Crétacé supérieur vers 74 +/- 3 Ma (Campanien). Il est clair que les oiseaux modernes depuis au moins le Crétacé supérieur tardif vivaient au même moment que les oiseaux archaïques incluant Hesperornis, Ichthyornis et les divers Enantiornithiformes. Les ptérosaures, qui coexistaient également avec les premiers oiseaux couronne, montrent des changements notables tout au long du Crétacé supérieur. Il y a eu une diminution de la diversité taxonomique, et les espèces de petite à moyenne taille ont disparu bien avant la fin du Crétacé. Une lecture simple du registre fossile pourrait suggérer des interactions compétitives avec les oiseaux, mais beaucoup plus doit être compris sur les histoires de vie des ptérosaures. Des fossiles supplémentaires et des données moléculaires sont toujours nécessaires pour aider à comprendre le rôle des interactions biotiques dans l'évolution des oiseaux du Crétacé supérieur et ainsi tester que les mécanismes de la microévolution sont suffisants pour expliquer la macroévolution.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molbev/msj124",
    doi = "10.1093/molbev/msj124",
    openalex = "W2162762023",
    references = "doi101111j109600312003tb00387x, doi101126science1064706, doi101144gslsp20032170111, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi105860choice405235"
}

Nous rapportons ici l'un des premiers oiseaux ornithurines à bec connus des dépôts du Crétacé inférieur du Liaoning, dans le nord-est de la Chine. Le nouveau basal ornithurine, Archaeorhynchus spathula gen. et sp. nov., possède un crâne rhynchokinétique avec des mâchoires dépourvues de dents. Il contient également plus de trois douze pierres de gésier conservées, suggérant un régime herbivore. L'extrémité distale du tibiotarse est non fusionnée, permettant d'identifier l'astragale avec un processus ascendant large, généralement similaire à celui de l'Archaeoptéryx. Cette nouvelle découverte jette une nouvelle lumière sur notre compréhension de la radiation précoce et de la diversification du régime alimentaire des premiers oiseaux du Crétacé inférieur.

@article{doi101111j14636409200600234x,
    author = "Zhou, Zhonghe et Zhang, Fucheng",
    title = "Un oiseau ornithurine basal à bec (Aves, Ornithurae) du Crétacé inférieur de Chine",
    year = "2006",
    journal = "Zoologica Scripta",
    abstract = "Nous rapportons ici l'un des premiers oiseaux ornithurines à bec connus des dépôts du Crétacé inférieur du Liaoning, dans le nord-est de la Chine. Le nouveau basal ornithurine, Archaeorhynchus spathula gen. et sp. nov., possède un crâne rhynchokinétique avec des mâchoires dépourvues de dents. Il contient également plus de trois douze pierres de gésier conservées, suggérant un régime herbivore. L'extrémité distale du tibiotarse est non fusionnée, permettant d'identifier l'astragale avec un processus ascendant large, généralement similaire à celui de l'Archaeoptéryx. Cette nouvelle découverte jette une nouvelle lumière sur notre compréhension de la radiation précoce et de la diversification du régime alimentaire des premiers oiseaux du Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1463-6409.2006.00234.x",
    doi = "10.1111/j.1463-6409.2006.00234.x",
    openalex = "W2060934644",
    references = "doi1010292004gl019790, doi10103821872, doi101038nature00930, doi101038nature01342, doi101073pnas0507106102, doi101126science27953581915, doi101126science29054981955, doi101139e03011, doi10136002tb9031, doi105860choice343307, openalexw2607033038"
}

Dans les études sur l'évolution du vol avien, il y a eu une préoccupation unique à démêler son origine. Par contraste, les changements morphologiques complexes qui se sont produits entre la forme la plus ancienne de vol battant avien et l'émergence des capacités de vol des oiseaux actuels restent relativement peu explorés. Tout travail de ce type a été limité par une pénurie comparative de fossiles éclairant l'évolution des oiseaux près de l'origine du clade des oiseaux actuels (c'est-à-dire 'modernes') (Aves). Ici, nous reconnaissons trois espèces du Crétacé inférieur de Chine comme constituant une nouvelle lignée d'oiseaux ornithurines basaux. Ornithurae est un clade qui inclut, approximativement, des parents relativement proches du clade couronne Aves (oiseaux actuels) et ce clade couronne. La morphologie de l'exemplaire le mieux conservé de cette diversité asiatique nouvellement reconnue, l'exemplaire holotype de Yixianornis grabaui Zhou et Zhang 2001, complet avec des impressions d'ailes et de plumes de queue finement conservées, est utilisé pour illustrer les nouvelles perspectives offertes par la reconnaissance de cette lignée. Les hypothèses sur l'évolution morphologique avienne et, en particulier, les schémas de changement proposés dans différents modules locomoteurs aviens après l'origine du vol sont impactés par la reconnaissance de la nouvelle lignée. L'exemplaire holotype articulé complet de Yixianornis grabaui, de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur de la province du Liaoning, dans le nord-est de la Chine, probablement le meilleur exemplaire ornithurine basal découvert à ce jour, fournit les premières preuves cohérentes avec la présence de plumes de queue avienne actuelles en éventail.

@article{doi101111j14697580200600534x,
    author = "Clarke, Julia A. et Zhou, Zhonghe et Zhang, Fucheng",
    title = "Insight into the evolution of avian flight from a new clade of Early Cretaceous ornithurines from China and the morphology of Yixianornis grabaui",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Anatomy",
    abstract = "Dans les études sur l'évolution du vol avien, il y a eu une préoccupation unique à démêler son origine. Par contraste, les changements morphologiques complexes qui se sont produits entre la forme la plus ancienne de vol battant avien et l'émergence des capacités de vol des oiseaux actuels restent relativement peu explorés. Tout travail de ce type a été limité par une pénurie comparative de fossiles éclairant l'évolution des oiseaux près de l'origine du clade des oiseaux actuels (c'est-à-dire 'modernes') (Aves). Ici, nous reconnaissons trois espèces du Crétacé inférieur de Chine comme constituant une nouvelle lignée d'oiseaux ornithurines basaux. Ornithurae est un clade qui inclut, approximativement, des parents relativement proches du clade couronne Aves (oiseaux actuels) et ce clade couronne. La morphologie de l'exemplaire le mieux conservé de cette diversité asiatique nouvellement reconnue, l'exemplaire holotype de Yixianornis grabaui Zhou et Zhang 2001, complet avec des impressions d'ailes et de plumes de queue finement conservées, est utilisé pour illustrer les nouvelles perspectives offertes par la reconnaissance de cette lignée. Les hypothèses sur l'évolution morphologique avienne et, en particulier, les schémas de changement proposés dans différents modules locomoteurs aviens après l'origine du vol sont impactés par la reconnaissance de la nouvelle lignée. L'exemplaire holotype articulé complet de Yixianornis grabaui, de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur de la province du Liaoning, dans le nord-est de la Chine, probablement le meilleur exemplaire ornithurine basal découvert à ce jour, fournit les premières preuves cohérentes avec la présence de plumes de queue avienne actuelles en éventail.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-7580.2006.00534.x",
    doi = "10.1111/j.1469-7580.2006.00534.x",
    openalex = "W2060028132",
    references = "doi10100797814615678751, doi1010292004gl019790, doi101038nature01420, doi101038nature03150, doi101111j109636422001tb01314x, doi101111j155856461988tb02497x, doi101139e03011, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi1015159783110848281, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi10230730135049, doi105281zenodo16171435, openalexw2607033038"
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Des spécimens tridimensionnels de l'oiseau fossile volant Gansus yumenensis de la formation de Xiagou du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine démontrent que ce taxon possède des caractéristiques anatomiques avancées précédemment connues uniquement chez les oiseaux ornithuraux du Crétacé supérieur et du Cénozoïque. L'analyse phylogénétique place Gansus au sein des Ornithurae, en faisant le membre le plus ancien connu du clade. La formation de Xiagou conserve l'assemblage aviaire le plus ancien connu dominé par les ornithuromorphes. L'anatomie de Gansus, comme celle d'autres oiseaux ornithuraux non néornithéens (non modernes), indique une spécialisation pour un mode de vie amphibie, soutenant l'hypothèse selon laquelle les oiseaux modernes sont originaires de niches aquatiques ou littorales.

@article{doi101126science1126377,
    author = "You, Hai‐Lu et Lamanna, Matthew C. et Harris, Jerald D. et Chiappe, Luis M. et O’Connor, Jingmai K. et Shu'an, JI et Lü, Junchang et Yuan, Chong-Xi et Li, Daqing et Zhang, Xing et Lacovara, Kenneth J. et Dodson, Peter et Ji, Qiang",
    title = "Un oiseau amphibie presque moderne du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine",
    year = "2006",
    journal = "Science",
    abstract = "Des spécimens tridimensionnels de l'oiseau fossile volant Gansus yumenensis de la formation de Xiagou du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine démontrent que ce taxon possède des caractéristiques anatomiques avancées précédemment connues uniquement chez les oiseaux ornithuraux du Crétacé supérieur et du Cénozoïque. L'analyse phylogénétique place Gansus au sein des Ornithurae, en faisant le membre le plus ancien connu du clade. La formation de Xiagou conserve l'assemblage aviaire le plus ancien connu dominé par les ornithuromorphes. L'anatomie de Gansus, comme celle d'autres oiseaux ornithuraux non néornithéens (non modernes), indique une spécialisation pour un mode de vie amphibie, soutenant l'hypothèse selon laquelle les oiseaux modernes sont originaires de niches aquatiques ou littorales.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1126377",
    doi = "10.1126/science.1126377",
    openalex = "W2133606327",
    references = "doi101007bf03184320, doi101007s001140050715, doi101016s016953470300017x, doi101017cbo9780511536045, doi101038nature03150, doi101130b254021, doi1012060003008220023860001anpbaa20co2, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi105860choice405235, openalexw2989049194"
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@article{doi101038nature06277,
    author = "Luo, Zhe‐Xi",
    title = "Transformation et diversification dans l'évolution précoce des mammifères",
    year = "2007",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature06277",
    doi = "10.1038/nature06277",
    openalex = "W2146098040",
    references = "doi101007978146122784737, doi10100797814684216682, doi101023a1011317930838, doi101038416816a, doi101038nature01420, doi101038nature03102, doi101038nature05627, doi101038nature05634, doi101046j10958312200300146x, doi101073pnas0334222100, doi101073pnas0606028103, doi10108002724634198810011708, doi101093molbevmsl150, doi101098rstb19760022, doi101111j109636421973tb00786x, doi101111j109636421981tb01127x, doi101126science1067179, doi101126science1085672, doi101126science28554362031a, doi105860choice355657, doi105962bhltitle118972, doi105962bhltitle3460, doi107312kiel11918, openalexw1539913220, openalexw78894702"
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Ces dernières années, la systématique aviaire a été caractérisée par une diminution de la dépendance à la cladistique morphologique des taxons modernes, une recherche paléornithologique intensive stimulée par de nouvelles découvertes et une inondation d'analyses basées sur des séquences d'ADN. Malheureusement, contrairement aux aperçus significatifs concernant les origines basales, l'ensemble général de la phylogénie des néornithes reste largement non résolu. Les études morphologiques ont mis l'accent sur des caractères utiles dans des contextes paléontologiques. Les études moléculaires, après le désenchantement face au travail pionnier mais non cladistique de Sibley et Ahlquist, se sont différencié notablement les unes des autres et des travaux morphologiques tant sur le plan des méthodes que des résultats. Par conséquent, au tournant du millénaire, les points de consensus robuste parmi les écoles concernant la phylogénie d'ordre supérieur des néornithes se sont limités aux deux groupes basaux et à plusieurs groupes primaires de niveau intermédiaire. Cet article décrit une analyse phylogénétique (cladistique) de 150 taxons de Néornithes, incluant des exemplaires de toutes les familles non passériformes, et des représentants sous-ordinaux des Passeriformes. Trente-cinq taxons de groupe externe englobant les Crocodylia, principalement les Dinosaures theropodes, et des oiseaux mésozoïques sélectionnés ont été utilisés pour ancrer les arbres. Basé sur l'étude d'échantillons et de la littérature, 2954 caractères morphologiques ont été définis ; ces caractères ont été décrits dans un travail complémentaire, dont environ un tiers étaient multistats (c'est-à-dire comprenaient au moins trois états), et les états au sein de plus de la moitié de ces caractères multistats ont été ordonnés pour l'analyse. Des recherches heuristiques complètes utilisant 10 000 réplications d'ajout aléatoire ont récupéré un ensemble de solutions total de 97 arbres les plus parcimonieux bien résolus (MPT). L'ensemble des MPT a été confirmé par une recherche heuristique élargie basée sur 10 000 réplications d'ajout aléatoire et une exploration complète augmentée par un ratchet pour déterminer les optima globaux. Un arbre de consensus strict des MPT ne comprenait que six trichotomies, c'est-à-dire des nœuds différant topologiquement parmi les MPT. Les pourcentages de bootstrap (basés sur 10 000 réplications) et les indices de support minimisés par ratchet (Bremer) indiquaient que la plupart des nœuds étaient robustes. Plusieurs néornithes fossiles (par exemple, Dinornithiformes, Aepyornithiformes) ont été placés dans le groupe interne a posteriori soit par des recherches heuristiques non contraintes basées sur la matrice complète augmentée par ces taxons séparément, soit en utilisant des contraintes de squelette. L'analyse a confirmé la topologie parmi les theropodes du groupe externe et a atteint une résolution robuste à pratiquement tous les niveaux des néornithes. Les résultats ont inclus la monophylie des oiseaux paléognathes, composant les taxons sœurs Tinamiformes et ratites respectivement, et les Anseriformes et Galliformes comme groupes sœurs monophylétiques, formant ensemble le groupe sœur des autres néornithes exclus des Paléognathes (Neoaves). Les inférences notables incluent : (i) le groupe sœur des Neoaves restants comprend une diversité d'oiseaux marins et pélicanidés ; (ii) les Podicipedidae sont le groupe sœur des Gaviidae, et non étroitement liés aux Phoenicopteridae, comme récemment suggéré ; (iii) les Pelecaniformes traditionnels, incluant le balaeniceps (Balaeniceps rex) comme taxon sœur à d'autres membres, sont monophylétiques ; (iv) les Ciconiiformes traditionnels sont monophylétiques ; (v) les Strigiformes et Falconiformes sont des groupes sœurs ; (vi) les Cathartidae sont le groupe sœur des Falconiformes restants ; (vii) les Ralliformes (Rallidae et Heliornithidae) sont le groupe sœur des Charadriiformes monophylétiques, avec les Gruiformes et Turniciformes (Turnicidae et Mesitornithidae) traditionnellement composés paraphylétiques séquentiellement à l'ensemble du cladus précédent ; (viii) Opisthocomus hoazin est le taxon sœur des Cuculiformes (incluant les Musophagidae) ; (ix) les Caprimulgiformes traditionnels sont monophylétiques et le groupe sœur des Apodiformes ; (x) les Trogoniformes sont le groupe sœur des Coliiformes ; (xi) les Coraciiformes, Piciformes et Passeriformes sont mutuellement monophylétiques et étroitement liés ; et (xii) les Galbulae sont conservés au sein des Piciformes. Les parties non résolues des néornithes (nœuds ayant plus d'une solution la plus parcimonieuse) comprenaient trois parties de l'arbre : (a) plusieurs nœuds interfamiliaux au sein des Charadriiformes ; (b) une trichotomie comprenant les (i) Psittaciformes, (ii) Columbiformes et (iii) Trogonomorphae (Trogoniformes, Coliiformes) + Passerimorphae (Coraciiformes, Piciformes, Passeriformes) ; et (c) une trichotomie comprenant les Coraciiformes, Piciformes et Passeriformes. Les polytomies restantes étaient parmi les groupes externes, bien que plusieurs des nœuds d'ordre supérieur n'étaient soutenus que marginalement ; cependant, la majorité des nœuds étaient résolus et ont atteint ou surpassé les normes conventionnelles de support. Les comparaisons quantitatives avec des hypothèses alternatives, l'examen de caractères hautement soutenus et diagnostiques pour les taxons supérieurs, les correspondances avec des études antérieures, la complémentarité et les différences philosophiques avec la phylogénétique paléontologique, les promesses et défis de la paléogéographie et de la calibration des taux d'évolution des oiseaux, ainsi que les classes de preuves prometteuses et les directions futures d'étude sont examinés. L'homologie, appliquée aux exemples aviaires d'homologues apparents, est considérée en termes de théorie récente, et une classification annotée révisée des taxons d'ordre supérieur des néornithes et d'autres theropodes étroitement liés est proposée. (c) 2007 The Linnean Society of London, Zoological Journal of the Linnean Society, 2007, 149, 1-95.

@article{doi101111j10963642200600293x,
    author = "Livezey, Bradley C. and Zusi, Richard L.",
    title = "Higher-order phylogeny of modern birds (Theropoda, Aves: Neornithes) based on comparative anatomy. II. Analysis and discussion",
    year = "2007",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "In recent years, avian systematics has been characterized by a diminished reliance on morphological cladistics of modern taxa, intensive palaeornithogical research stimulated by new discoveries and an inundation by analyses based on DNA sequences. Unfortunately, in contrast to significant insights into basal origins, the broad picture of neornithine phylogeny remains largely unresolved. Morphological studies have emphasized characters of use in palaeontological contexts. Molecular studies, following disillusionment with the pioneering, but non-cladistic, work of Sibley and Ahlquist, have differed markedly from each other and from morphological works in both methods and findings. Consequently, at the turn of the millennium, points of robust agreement among schools concerning higher-order neornithine phylogeny have been limited to the two basalmost and several mid-level, primary groups. This paper describes a phylogenetic (cladistic) analysis of 150 taxa of Neornithes, including exemplars from all non-passeriform families, and subordinal representatives of Passeriformes. Thirty-five outgroup taxa encompassing Crocodylia, predominately theropod Dinosauria, and selected Mesozoic birds were used to root the trees. Based on study of specimens and the literature, 2954 morphological characters were defined; these characters have been described in a companion work, approximately one-third of which were multistate (i.e. comprised at least three states), and states within more than one-half of these multistate characters were ordered for analysis. Complete heuristic searches using 10 000 random-addition replicates recovered a total solution set of 97 well-resolved, most-parsimonious trees (MPTs). The set of MPTs was confirmed by an expanded heuristic search based on 10 000 random-addition replicates and a full ratchet-augmented exploration to ascertain global optima. A strict consensus tree of MPTs included only six trichotomies, i.e. nodes differing topologically among MPTs. Bootstrapping (based on 10 000 replicates) percentages and ratchet-minimized support (Bremer) indices indicated most nodes to be robust. Several fossil Neornithes (e.g. Dinornithiformes, Aepyornithiformes) were placed within the ingroup a posteriori either through unconstrained, heursitic searches based on the complete matrix augmented by these taxa separately or using backbone-constraints. Analysis confirmed the topology among outgroup Theropoda and achieved robust resolution at virtually all levels of the Neornithes. Findings included monophyly of the palaeognathous birds, comprising the sister taxa Tinamiformes and ratites, respectively, and the Anseriformes and Galliformes as monophyletic sister-groups, together forming the sister-group to other Neornithes exclusive of the Palaeognathae (Neoaves). Noteworthy inferences include: (i) the sister-group to remaining Neoaves comprises a diversity of marine and wading birds; (ii) Podicipedidae are the sister-group of Gaviidae, and not closely related to the Phoenicopteridae, as recently suggested; (iii) the traditional Pelecaniformes, including the shoebill (Balaeniceps rex) as sister-taxon to other members, are monophyletic; (iv) traditional Ciconiiformes are monophyletic; (v) Strigiformes and Falconiformes are sister-groups; (vi) Cathartidae is the sister-group of the remaining Falconiformes; (vii) Ralliformes (Rallidae and Heliornithidae) are the sister-group to the monophyletic Charadriiformes, with the traditionally composed Gruiformes and Turniciformes (Turnicidae and Mesitornithidae) sequentially paraphyletic to the entire foregoing clade; (viii) Opisthocomus hoazin is the sister-taxon to the Cuculiformes (including the Musophagidae); (ix) traditional Caprimulgiformes are monophyletic and the sister-group of the Apodiformes; (x) Trogoniformes are the sister-group of Coliiformes; (xi) Coraciiformes, Piciformes and Passeriformes are mutually monophyletic and closely related; and (xii) the Galbulae are retained within the Piciformes. Unresolved portions of the Neornithes (nodes having more than one most-parsimonious solution) comprised three parts of the tree: (a) several interfamilial nodes within the Charadriiformes; (b) a trichotomy comprising the (i) Psittaciformes, (ii) Columbiformes and (iii) Trogonomorphae (Trogoniformes, Coliiformes) + Passerimorphae (Coraciiformes, Piciformes, Passeriformes); and (c) a trichotomy comprising the Coraciiformes, Piciformes and Passeriformes. The remaining polytomies were among outgroups, although several of the highest-order nodes were only marginally supported; however, the majority of nodes were resolved and met or surpassed conventional standards of support. Quantitative comparisons with alternative hypotheses, examination of highly supportive and diagnostic characters for higher taxa, correspondences with prior studies, complementarity and philosophical differences with palaeontological phylogenetics, promises and challenges of palaeogeography and calibration of evolutionary rates of birds, and classes of promising evidence and future directions of study are reviewed. Homology, as applied to avian examples of apparent homologues, is considered in terms of recent theory, and a revised annotated classification of higher-order taxa of Neornithes and other closely related Theropoda is proposed. (c) 2007 The Linnean Society of London, Zoological Journal of the Linnean Society, 2007, 149, 1-95.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1096-3642.2006.00293.x",
    doi = "10.1111/j.1096-3642.2006.00293.x",
    openalex = "W2153165351",
    references = "crossref1995systematics, doi101002jmor10382, doi101002jmor10406, doi101002jmor1052090107, doi101007bf02101113, doi101016b978012249408650011x, doi101017s0006323197005100, doi101017s1464793102006103, doi101017s1464793105006779, doi101038nature03150, doi101073pnas0507106102, doi10108002724634199410011524, doi10108010635150500234583, doi10108010635150590950326, doi101093oso97801951223430010001, doi101093oso97801985052350010001, doi101093oxfordjournalsmolbeva026092, doi101093sysbio33183, doi101093sysbio422182, doi101098rspb20001368, doi101111j109600311989tb00573x, doi101111j109600311993tb00217x, doi101111j109600312003tb00387x, doi101111j109636422001tb01313x, doi101111j109636422001tb01314x, doi101111j1469185x1997tb00024x, doi101111j146979981991tb04794x, doi101111j155856461959tb03005x, doi101111j155856461985tb00420x, doi101126science2665186779, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi1016660094837320050310192meam20co2, doi1023072408678, doi1023072413134, doi1023072992540, doi10230740168337, doi102992014590582006371pon20co2, doi105860choice323881, doi105860choice343307, doi105860choice392183, doi105860choice405235, doi105962bhltitle106607, gregor1988the, openalexw2506868775, openalexw3217097258"
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@article{doi101007s0011400804883,
    author = "Hutchinson, John R. et Allen, Vivian",
    title = "La continuité évolutive de la fonction des membres des premiers théropodes aux oiseaux",
    year = "2008",
    journal = "Die Naturwissenschaften",
    url = "https://doi.org/10.1007/s00114-008-0488-3",
    doi = "10.1007/s00114-008-0488-3",
    openalex = "W2164139482",
    references = "carpenter2005the, coombs1980swimming, doi101002jmor10406, doi1010079789400904095, doi101016s002192900000155x, doi101016s0966636202000681, doi101038261129a0, doi1010384151018a, doi101073pnas0507106102, doi10108002724634199710010977, doi10108010635150802022231, doi101111j10963642200600245x, doi101111j14697580200600534x, doi101111j14754983200600585x, doi101111j15585646200700206x, doi101126science1078237, doi101126science2251499, doi101126science2740914, doi101126science28454232137, doi101130g23452a1, doi101144gslsp20042280106, doi101152jappl20008951991, doi10117702783649922066655, doi101242jeb001701, doi101242jeb005801, doi1016660094837320000260734aaateo20co2, doi1016660094837320050310676aohmma20co2, doi101666040141, doi105281zenodo16171435, doi105860choice326223, doi105860choice421568, doi105860choice434677"
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Les ratites (autruches, émeus, nandous, casuars et kiwis) sont de grands oiseaux incapables de voler qui fascinent les biologistes depuis longtemps. Leur répartition actuelle sur des masses terrestres isolées du sud est censée refléter la fragmentation du paléocontinent de Gondwana. La vision dominante est que les ratites sont monophylétiques, avec les tinamous volants comme groupe sœur, suggérant une perte unique du vol dans l'ascendance commune des ratites. Cependant, les analyses phylogénétiques de 20 gènes nucléaires non liés révèlent un signal à l'échelle du génome qui place sans équivoque les tinamous au sein des ratites, rendant les ratites polyphylétiques et suggérant plusieurs pertes du vol. Les phénomènes qui peuvent induire en erreur les analyses phylogénétiques, y compris l'attraction des branches longues, le biais de composition des bases, la discordance entre les arbres génétiques et les arbres d'espèces, et les erreurs d'alignement de séquence, ont été éliminés comme explications pour ce résultat. L'hypothèse la plus plausible nécessite au moins trois pertes du vol et explique les nombreuses similarités morphologiques et comportementales parmi les ratites par une évolution parallèle ou convergente. Enfin, cette phylogénie exige une reconsidération fondamentale des propositions qui relient l'évolution des ratites à la dérive des continents.

@article{doi101073pnas0803242105,
    author = "Harshman, John et Braun, Edward L. et Braun, Michael J. et Huddleston, Christopher J. et Bowie, Rauri C. K. et Chojnowski, Jena L. et Hackett, Shannon J. et Han, Kin-Lan et Kimball, Rebecca T. et Marks, Ben D. et Miglia, Kathleen J. et Moore, William S. et Reddy, Sushma et Sheldon, Frederick H. et Steadman, David W. et Steppan, Scott J. et Witt, Christopher C. et Yuri, Tamaki",
    title = "Phylogenomic evidence for multiple losses of flight in ratite birds",
    year = "2008",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Ratites (ostriches, emus, rheas, cassowaries, and kiwis) are large, flightless birds that have long fascinated biologists. Their current distribution on isolated southern land masses is believed to reflect the breakup of the paleocontinent of Gondwana. The prevailing view is that ratites are monophyletic, with the flighted tinamous as their sister group, suggesting a single loss of flight in the common ancestry of ratites. However, phylogenetic analyses of 20 unlinked nuclear genes reveal a genome-wide signal that unequivocally places tinamous within ratites, making ratites polyphyletic and suggesting multiple losses of flight. Phenomena that can mislead phylogenetic analyses, including long branch attraction, base compositional bias, discordance between gene trees and species trees, and sequence alignment errors, have been eliminated as explanations for this result. The most plausible hypothesis requires at least three losses of flight and explains the many morphological and behavioral similarities among ratites by parallel or convergent evolution. Finally, this phylogeny demands fundamental reconsideration of proposals that relate ratite evolution to continental drift.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0803242105",
    doi = "10.1073/pnas.0803242105",
    openalex = "W2100742818",
    references = "doi101016b978012249408650011x"
}

L'étude de l'évolution morphologique après l'origine supposée du vol actif, homologue à celui des Aves, a historiquement été caractérisée par une insistance sur des motifs de changement anatomiquement disjoints et mosaïques. Relativement peu d'études antérieures ont utilisé des données de caractères morphologiques discrets dans un contexte phylogénétique pour investiguer quantitativement l'évolution morphologique ou l'évolution mosaïque en particulier. Une méthode précédemment employée, qui utilisait des synapomorphies non ambiguement optimisées additionnées, a servi de base à la proposition de systèmes locomoteurs pectoraux puis pelviens « modernisés » ou « affinés » dissociés et séquentiels après l'origine du vol (« hypothèse pectoral tôt-pelvien tardif »). Nous utilisons l'un des ensembles de données phylogénétiques les plus inclusifs sur les oiseaux basaux pour investiguer les propriétés de cette méthode et pour considérer l'application d'une approche phylogénétique bayésienne. Les facteurs de Bayes et les comparaisons statistiques des estimations de longueur de branche ont été utilisés pour évaluer le soutien apporté à un motif mosaïque de changement de caractère et à l'hypothèse spécifique pectoral tôt-pelvien tardif. Les partitions ont été définies a priori en fonction de la sous-région anatomique (par exemple, pelvienne, pectorale) et se basaient sur celles hypothétisées en utilisant l'approche de la synapomorphie additionnée. Nous comparons 80 modèles, tous implémentant le modèle M(k) pour les données morphologiques, mais variant en nombre de partitions de sous-régions anatomiques, les modèles de variation des taux entre partitions et de variation des taux entre caractères, ainsi que la prior de longueur de branche. L'analyse statistique révèle que la partition des données par sous-région anatomique, l'estimation indépendante des longueurs de branche pour les données partitionnées, et l'utilisation d'une distribution gamma partagée ou par partition entre les taux de variation des caractères augmentent significativement les vraisemblances des modèles estimés. Les études de simulation révèlent que les modèles partitionnés où les caractères sont assignés aléatoirement fonctionnent significativement moins bien que le modèle observé et le modèle à partition unique à taux égal, suggérant que seule la partition par sous-région anatomique améliore les performances du modèle. La préférence pour les modèles avec des partitions définies a priori par sous-région anatomique est cohérente avec un motif disjonctif de changement de caractère pour l'ensemble de données investigué et peut avoir des implications pour la paramétrisation des analyses bayésiennes des données morphologiques en général. Les tests statistiques des différences dans les longueurs de branche estimées à partir des partitions pectorales et pelviennes ne soutiennent pas l'hypothèse spécifique pectoral tôt-pelvien tardif proposée à partir de l'approche de la synapomorphie additionnée ; cependant, les résultats suggèrent un soutien limité pour certaines longueurs de branche pectorales étant significativement plus longues uniquement tôt à/après l'origine du vol.

@article{doi10108010635150802022231,
    author = "Clarke, Julia A. et Middleton, Kevin M.",
    title = "Mosaïcisme, modules et l'évolution des oiseaux : résultats d'une approche bayésienne à l'étude de l'évolution morphologique utilisant des données de caractères discrets",
    year = "2008",
    journal = "Systematic Biology",
    abstract = {L'étude de l'évolution morphologique après l'origine inférée du vol actif, homologue à celui des Aves, a historiquement été caractérisée par une insistance sur des motifs de changement anatomiquement disjoints et mosaïques. Relativement peu d'études antérieures ont utilisé des données de caractères morphologiques discrets dans un contexte phylogénétique pour investiguer quantitativement l'évolution morphologique ou l'évolution mosaïque en particulier. Une telle méthode précédemment employée, qui utilisait des synapomorphies non ambiguement optimisées additionnées, a servi de base à la proposition de systèmes locomoteurs pectoraux puis pelviens « modernisés » ou « affinés » dissociés et séquentiels après l'origine du vol (« hypothèse pectoral tôt-pelvien tardif »). Nous utilisons l'un des ensembles de données phylogénétiques les plus inclusifs d'oiseaux basaux pour investiguer les propriétés de cette méthode et pour considérer l'application d'une approche phylogénétique bayésienne. Les facteurs de Bayes et les comparaisons statistiques des estimations de longueur de branche ont été utilisés pour évaluer le soutien à un motif mosaïque de changement de caractère et à l'hypothèse spécifique pectoral tôt-pelvien tardif. Les partitions ont été définies a priori en fonction de sous-régions anatomiques (par exemple, pelvienne, pectorale) et se basaient sur celles hypothétisées en utilisant l'approche de la synapomorphie additionnée. Nous comparons 80 modèles, tous implémentant le modèle M(k) pour les données morphologiques, mais variant en nombre de partitions de sous-régions anatomiques, les modèles de variation de taux entre partitions et de variation de taux entre caractères, ainsi que la prior de longueur de branche. L'analyse statistique révèle que la partition des données par sous-région anatomique, l'estimation indépendante des longueurs de branche pour les données partitionnées, et l'utilisation d'une distribution de taux entre caractères de forme gamma partagée ou par partition augmentent significativement les vraisemblances de modèle estimées. Les études de simulation révèlent que les modèles partitionnés où les caractères sont assignés aléatoirement fonctionnent significativement moins bien que le modèle observé et le modèle à partition unique à taux égal, suggérant que seule la partition par sous-région anatomique améliore les performances du modèle. La préférence pour les modèles avec des partitions définies a priori par sous-région anatomique est cohérente avec un motif disjonctif de changement de caractère pour l'ensemble de données investigué et peut avoir des implications pour la paramétrisation des analyses bayésiennes des données morphologiques plus généralement. Les tests statistiques des différences dans les longueurs de branche estimées à partir des partitions pectorales et pelviennes ne soutiennent pas l'hypothèse spécifique pectoral tôt-pelvien tardif proposée à partir de l'approche de la synapomorphie additionnée ; cependant, les résultats suggèrent un soutien limité pour certaines longueurs de branche pectorales étant significativement plus longues uniquement tôt à/après l'origine du vol.},
    url = "https://doi.org/10.1080/10635150802022231",
    doi = "10.1080/10635150802022231",
    openalex = "W2118740788",
    references = "doi1010079780387217062, doi101007bf00160154, doi10108001621459199510476572, doi101080106351501753462876, doi10108010635150490264699, doi10108010635150600755396, doi101093bioinformatics178754, doi101093bioinformaticsbtg180, doi101111j14697580200600534x, doi101242jeb001701, doi102992014590582006371pon20co2, doi105860choice353862, doi105860choice392183, openalexw2994240441, openalexw3217097258"
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La règle de Cope, la tendance vers des augmentations évolutives de la taille du corps, est une généralisation macroévolutif bien établie qui a le potentiel de fournir des aperçus sur la directionnalité dans l'évolution ; cependant, à la fois la définition et l'identification de la règle de Cope sont controversées et problématiques. Une étude récente [J. Evol. Biol. 21 (2008) 618] a examiné l'évolution de la taille du corps chez les oiseaux du Mésozoïque et a affirmé avoir identifié des preuves de la règle de Cope survenant en raison d'un tri d'espèces entre lignées. Nous réévaluons ici les résultats de cette étude et effectuons en outre des analyses novelles testant les modèles intra-lignées dans l'évolution de la taille du corps chez les oiseaux du Mésozoïque. Nous démontrons que les méthodes non phylogénétiques utilisées par cette étude précédente ne peuvent pas distinguer entre les processus inter- et intra-lignées, et que le soutien statistique pour leurs résultats et conclusions est extrêmement faible. Nos analyses intra-lignées ancêtre-descendant intègrent explicitement des hypothèses phylogénétiques récentes et trouvent peu de preuves convaincantes en faveur de la règle de Cope. La règle de Cope n'est pas soutenue chez les oiseaux du Mésozoïque par les données disponibles, et l'évolution de la taille du corps ne fournit actuellement aucun aperçu sur la survie aviaire à travers l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène.

@article{doi101111j14209101200801594x,
    author = "Butler, Richard J. et Goswami, Anjali",
    title = "Évolution de la taille du corps chez les oiseaux du Mésozoïque : peu de preuves en faveur de la règle de Cope",
    year = "2008",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "La règle de Cope, la tendance vers des augmentations évolutives de la taille du corps, est une généralisation macroévolutif bien établie qui a le potentiel de fournir des aperçus sur la directionnalité dans l'évolution ; cependant, à la fois la définition et l'identification de la règle de Cope sont controversées et problématiques. Une étude récente [J. Evol. Biol. 21 (2008) 618] a examiné l'évolution de la taille du corps chez les oiseaux du Mésozoïque et a affirmé avoir identifié des preuves de la règle de Cope survenant en raison d'un tri d'espèces entre lignées. Nous réévaluons ici les résultats de cette étude et effectuons en outre des analyses novelles testant les modèles intra-lignées dans l'évolution de la taille du corps chez les oiseaux du Mésozoïque. Nous démontrons que les méthodes non phylogénétiques utilisées par cette étude précédente ne peuvent pas distinguer entre les processus inter- et intra-lignées, et que le soutien statistique pour leurs résultats et conclusions est extrêmement faible. Nos analyses intra-lignées ancêtre-descendant intègrent explicitement des hypothèses phylogénétiques récentes et trouvent peu de preuves convaincantes en faveur de la règle de Cope. La règle de Cope n'est pas soutenue chez les oiseaux du Mésozoïque par les données disponibles, et l'évolution de la taille du corps ne fournit actuellement aucun aperçu sur la survie aviaire à travers l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2008.01594.x",
    doi = "10.1111/j.1420-9101.2008.01594.x",
    openalex = "W1975990166",
    references = "doi101126science1126377"
}

La plupart de la diversité des oiseaux du Mésozoïque comprend des espèces qui font partie de l'un des deux grands lignages, à savoir les Ornithurae, incluant les oiseaux vivants, et les Enantiornithes, une grande radiation traditionnellement appelée 'oiseaux opposés'. Ici, nous rapportons le plus grand oiseau enantiornithine du Crétacé inférieur de l'Est de la Chine, qui fournit des preuves que les membres basaux des Enantiornithes partagent plus de morphologies avec les oiseaux ornithurines que ce qui était reconnu précédemment. L'évolution morphologique dans ces deux groupes a été considérée comme largement parallèle, avec des membres dérivés des Enantiornithes convergents sur les capacités de vol 'avancées' des oiseaux ornithurines. La présence d'une gamme de morphologies précédemment considérées comme dérivées au sein des oiseaux ornithurines et enantiornithines dans une espèce enantiornithine basale fournit des preuves de l'évolution complexe des caractères dans ces deux grands lignages. La morphologie crânienne du nouveau spécimen est l'une des mieux conservées pour les oiseaux du Mésozoïque. La nouvelle espèce étend considérablement la gamme de tailles connue pour les Enantiornithes du Crétacé inférieur et fournit des preuves de proportions entre les membres antérieurs et postérieurs distinctes de tous les autres membres connus du clade. En tant que tel, il jette une nouvelle lumière sur l'évolution de la taille corporelle et la diversité aviaire, et permet une réévaluation d'une hypothèse précédemment proposée d'exclusion compétitive entre les clades aviaires du Crétacé inférieur.

@article{doi101111j14697580200800880x,
    author = "Zhou, Zhonghe et Clarke, Julia A. et Zhang, Fucheng",
    title = "Insight into diversity, body size and morphological evolution from the largest Early Cretaceous enantiornithine bird",
    year = "2008",
    journal = "Journal of Anatomy",
    abstract = "La plupart de la diversité des oiseaux du Mésozoïque comprend des espèces qui font partie de l'un des deux grands lignages, à savoir les Ornithurae, incluant les oiseaux vivants, et les Enantiornithes, une grande radiation traditionnellement appelée 'oiseaux opposés'. Ici, nous rapportons le plus grand oiseau enantiornithine du Crétacé inférieur de l'Est de la Chine, qui fournit des preuves que les membres basaux des Enantiornithes partagent plus de morphologies avec les oiseaux ornithurines que ce qui était reconnu précédemment. L'évolution morphologique dans ces deux groupes a été considérée comme largement parallèle, avec des membres dérivés des Enantiornithes convergents sur les capacités de vol 'avancées' des oiseaux ornithurines. La présence d'une gamme de morphologies précédemment considérées comme dérivées au sein des oiseaux ornithurines et enantiornithines dans une espèce enantiornithine basale fournit des preuves de l'évolution complexe des caractères dans ces deux grands lignages. La morphologie crânienne du nouveau spécimen est l'une des mieux conservées pour les oiseaux du Mésozoïque. La nouvelle espèce étend considérablement la gamme de tailles connue pour les Enantiornithes du Crétacé inférieur et fournit des preuves de proportions entre les membres antérieurs et postérieurs distinctes de tous les autres membres connus du clade. En tant que tel, il jette une nouvelle lumière sur l'évolution de la taille corporelle et la diversité aviaire, et permet une réévaluation d'une hypothèse précédemment proposée d'exclusion compétitive entre les clades aviaires du Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-7580.2008.00880.x",
    doi = "10.1111/j.1469-7580.2008.00880.x",
    openalex = "W2012419237",
    references = "doi1010292004gl019790, doi101073pnas0507106102, doi101111j109636422001tb01314x, doi101111j14636409200600234x, doi101111j14697580200600534x, doi101126science1144066, doi101126science29054981955, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi10230730135049, doi105281zenodo16171435, doi105860choice405235, openalexw2607033038"
}

Les relations évolutives profondes chez les oiseaux ont été difficiles à résoudre en raison d'une radiation explosive supposée. Notre étude a examiné environ 32 kilobases de séquences d'ADN nucléaire alignées provenant de 19 locus indépendants pour 169 espèces, représentant tous les groupes majeurs existants, et a récupéré une phylogénie robuste à partir d'un signal à l'échelle du génome soutenu par plusieurs méthodes analytiques. Nous avons documenté des relations interordres bien étayées et précédemment inconnues (telles qu'une relation de sœur entre les passereaux et les perroquets) et confirmé des groupements précédemment contestés (telles que les flamants roses et les hérons à aigrettes). Nos conclusions remettent en question les classifications actuelles et modifient notre compréhension de l'évolution des traits ; par exemple, certains oiseaux diurnes se sont évolus à partir d'ancêtres nocturnes. Nos résultats fournissent une ressource précieuse pour les études phylogénétiques et comparatives chez les oiseaux.

@article{doi101126science1157704,
    author = "Hackett, Shannon J. et Kimball, Rebecca T. et Reddy, Sushma et Bowie, Rauri C. K. et Braun, Edward L. et Braun, Michael J. et Chojnowski, Jena L. et Cox, W. Andrew et Han, Kin-Lan et Harshman, John et Huddleston, Christopher J. et Marks, Ben D. et Miglia, Kathleen J. et Moore, William S. et Sheldon, Frederick H. et Steadman, David W. et Witt, Christopher C. et Yuri, Tamaki",
    title = "A Phylogenomic Study of Birds Reveals Their Evolutionary History",
    year = "2008",
    journal = "Science",
    abstract = "Les relations évolutives profondes chez les oiseaux ont été difficiles à résoudre en raison d'une radiation explosive supposée. Notre étude a examiné environ 32 kilobases de séquences d'ADN nucléaire alignées provenant de 19 locus indépendants pour 169 espèces, représentant tous les groupes majeurs existants, et a récupéré une phylogénie robuste à partir d'un signal à l'échelle du génome soutenu par plusieurs méthodes analytiques. Nous avons documenté des relations interordres bien étayées et précédemment inconnues (telles qu'une relation de sœur entre les passereaux et les perroquets) et confirmé des groupements précédemment contestés (telles que les flamants roses et les hérons à aigrettes). Nos conclusions remettent en question les classifications actuelles et modifient notre compréhension de l'évolution des traits ; par exemple, certains oiseaux diurnes se sont évolus à partir d'ancêtres nocturnes. Nos résultats fournissent une ressource précieuse pour les études phylogénétiques et comparatives chez les oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1157704",
    doi = "10.1126/science.1157704",
    openalex = "W2107555182",
    references = "doi101006mpev19980603, doi101038nrg1603, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbio422182, doi101098rsbl20060523, doi101111j109600312003tb00387x, doi101111j10963642200600293x, doi1023072992540, doi102307jctt1xp3v3r, doi105962bhltitle14581, openalexw1569611434"
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Un nouveau genre et espèce d'oiseau, Zhongjianornis yangi gen. et sp. nov., est signalé dans les dépôts lacustres du Crétacé inférieur de la formation de Jiufotang, dans le Liaoning, au nord-est de la Chine. Le nouveau taxon se caractérise par la combinaison des caractéristiques suivantes : mâchoires supérieures et inférieures sans dents, bec pointu, humérus avec une crête deltopectorale large et robuste, deuxième phalange du doigt manuel majeur plus longue que la première phalange, ongles des doigts alulaires et majeurs de longueur similaire et nettement plus courts que les phalanges penultimes correspondantes, tibiotarse fin et plus que deux fois la longueur du tarsométatarsus, et métatarsien IV plus long que les autres métatarsiens. L'analyse phylogénétique indique que Zhongjianornis est phylogénétiquement basal par rapport à Confuciusornis et aux groupes d'oiseaux dominants du Mésozoïque, les Enantiornithes et les Ornithurae, et fournit donc des informations nouvelles importantes concernant la diversification des oiseaux au Crétacé inférieur. Il représente également l'oiseau le plus basal qui manque complètement de dents, suggérant que la perte de dents était plus fréquente que prévu dans l'évolution précoce des oiseaux et que le bec aviaire est apparu indépendamment dans plusieurs lignées aviaires, probablement en réponse à une pression de sélection pour la réduction de poids. Enfin, la présence d'une crête deltopectorale humérale significativement élargie suggère que Zhongjianornis partage avec d'autres oiseaux basaux tels que Jeholornis, Sapeornis et Confuciusornis un mode d'adaptation distinctif pour le vol, contrastant avec celui observé chez les oiseaux plus avancés, qui possèdent à la place un sternum allongé et une carène proéminente.

@article{doi101098rspb20090885,
    author = "Zhou, Zhonghe et Li, Fucheng Zhang Zhiheng",
    title = "Un nouvel oiseau du Crétacé inférieur de Chine et la réduction dentaire dans l'évolution précoce des oiseaux",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Un nouveau genre et espèce d'oiseau, Zhongjianornis yangi gen. et sp. nov., est signalé dans les dépôts lacustres du Crétacé inférieur de la formation de Jiufotang, dans le Liaoning, au nord-est de la Chine. Le nouveau taxon se caractérise par la combinaison des caractéristiques suivantes : mâchoires supérieures et inférieures sans dents, bec pointu, humérus avec une crête deltopectorale large et robuste, deuxième phalange du doigt manuel majeur plus longue que la première phalange, ongles des doigts alulaires et majeurs de longueur similaire et nettement plus courts que les phalanges penultimes correspondantes, tibiotarse fin et plus que deux fois la longueur du tarsométatarsus, et métatarsien IV plus long que les autres métatarsiens. L'analyse phylogénétique indique que Zhongjianornis est phylogénétiquement basal par rapport à Confuciusornis et aux groupes d'oiseaux dominants du Mésozoïque, les Enantiornithes et les Ornithurae, et fournit donc des informations nouvelles importantes concernant la diversification des oiseaux au Crétacé inférieur. Il représente également l'oiseau le plus basal qui manque complètement de dents, suggérant que la perte de dents était plus fréquente que prévu dans l'évolution précoce des oiseaux et que le bec aviaire est apparu indépendamment dans plusieurs lignées aviaires, probablement en réponse à une pression de sélection pour la réduction de poids. Enfin, la présence d'une crête deltopectorale humérale significativement élargie suggère que Zhongjianornis partage avec d'autres oiseaux basaux tels que Jeholornis, Sapeornis et Confuciusornis un mode d'adaptation distinctif pour le vol, contrastant avec celui observé chez les oiseaux plus avancés, qui possèdent à la place un sternum allongé et une carène proéminente.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2009.0885",
    doi = "10.1098/rspb.2009.0885",
    openalex = "W2130068087",
    references = "doi1010292004gl019790, doi101038nature00930, doi101093auk12041206, doi101111j14636409200600234x, doi101111j14697580200600534x, doi101111j14697580200800880x, doi101126science29054981955, doi101139e03011, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, openalexw2607033038"
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Aardonyx celestae gen. et sp. nov. est décrit à partir de la formation supérieure d'Elliot (Jurassique inférieur) d'Afrique du Sud. Il peut être diagnostiqué par des autapomorphies du crâne, en particulier les mâchoires, la colonne cervicale, l'avant-bras et le pied. Il est trouvé être le groupe frère d'un clade de sauropodomorphes quadrupèdes obligatoires (Melanorosaurus + Sauropoda) et se situe donc au cœur de la transition basale sauropodomorphe-sauropode. Les mâchoires étroites d'A. celestae conservent une symphyse pointue mais semblent avoir manqué de joues charnues. Des mâchoires larges en forme de U étaient auparavant censées avoir évolué avant la perte des joues limitant l'ouverture de la bouche. Cependant, les mâchoires étroites d'A. celestae conservent une symphyse pointue mais semblent avoir manqué de joues charnues, démontrant une homoplasie sous-estimée dans l'évolution de l'appareil de broutage en masse des sauropodes. Les membres d'A. celestae indiquent qu'il a conservé une démarche bipède habituelle, bien que des caractères incipients associés à la pronation de la main et à l'adoption d'une démarche quadrupède soient évidents grâce à une analyse morphométrique géométrique (en utilisant des splines à plaques minces) de l'ulna et du fémur. La capacité cursoriale semble avoir été réduite et l'axe de support du poids du pied a été déplacé vers une position médiale, entaxonique, infirmant l'hypothèse selon laquelle l'entaxonie a évolué chez les sauropodes uniquement après l'adoption d'une démarche quadrupède obligatoire.

@article{doi101098rspb20091440,
    author = "Yates, Adam M. et Bonnan, Matthew F. et Neveling, Johann et Chinsamy, Anusuya et Blackbeard, Marc G.",
    title = "Un nouveau dinosaure sauropodomorphe transitionnel du Jurassique inférieur d'Afrique du Sud et l'évolution de l'alimentation des sauropodes et du quadrupédalisme",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Aardonyx celestae gen. et sp. nov. est décrit à partir de la formation supérieure d'Elliot (Jurassique inférieur) d'Afrique du Sud. Il peut être diagnostiqué par des autapomorphies du crâne, en particulier les mâchoires, la colonne cervicale, l'avant-bras et le pied. Il est trouvé être le groupe frère d'un clade de sauropodomorphes quadrupèdes obligatoires (Melanorosaurus + Sauropoda) et se situe donc au cœur de la transition basale sauropodomorphe-sauropode. Les mâchoires étroites d'A. celestae conservent une symphyse pointue mais semblent avoir manqué de joues charnues. Des mâchoires larges en forme de U étaient auparavant censées avoir évolué avant la perte des joues limitant l'ouverture de la bouche. Cependant, les mâchoires étroites d'A. celestae conservent une symphyse pointue mais semblent avoir manqué de joues charnues, démontrant une homoplasie sous-estimée dans l'évolution de l'appareil de broutage en masse des sauropodes. Les membres d'A. celestae indiquent qu'il a conservé une démarche bipède habituelle, bien que des caractères incipients associés à la pronation de la main et à l'adoption d'une démarche quadrupède soient évidents grâce à une analyse morphométrique géométrique (en utilisant des splines à plaques minces) de l'ulna et du fémur. La capacité cursoriale semble avoir été réduite et l'axe de support du poids du pied a été déplacé vers une position médiale, entaxonique, infirmant l'hypothèse selon laquelle l'entaxonie a évolué chez les sauropodes uniquement après l'adoption d'une démarche quadrupède obligatoire.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2009.1440",
    doi = "10.1098/rspb.2009.1440",
    openalex = "W2163894176",
    references = "doi10560219780801881206"
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Les enregistrements incontestables les plus anciens de Dinosauria ont été découverts dans des roches du Trias supérieur (environ 230 Ma) accumulées dans des bassins de rift extensionnels dans le sud-ouest de Pangea. Les mieux connus de ces derniers sont Herrerasaurus ischigualastensis, Pisanosaurus mertii, Eoraptor lunensis et Panphagia protos de la Formation d'Ischigualasto, en Argentine, et Staurikosaurus pricei et Saturnalia tupiniquim de la Formation de Santa Maria, au Brésil. Aucun fossile corporel de dinosaure non controversé n'est connu des strates plus anciennes, mais l'origine du lignage au Trias moyen peut être déduite à la fois du registre des traces de pas et de sa relation de groupe sœur avec les dinosauremorfes basaux du Ladinien. Ceux-ci incluent le Marasuchus lilloensis typique, des formes plus basales telles que Lagerpeton et Dromomeron, ainsi que les silesauridés : un groupe possiblement monophylétique composé de formes du Trias moyen-supérieur qui pourraient représenter des taxons sœurs immédiats des dinosaures. La première définition phylogénétique correspondant à la compréhension actuelle de Dinosauria comme un taxon basé sur un nœud composé exclusivement de Saurischia et Ornithischia mutuellement exclusifs a été donnée comme « tous les descendants du dernier ancêtre commun des oiseaux et du Tricératops ». Les analyses cladistiques récentes des dinosaures précoces concordent pour dire que Pisanosaurus mertii est un ornithischien basal ; que Herrerasaurus ischigualastensis et Staurikosaurus pricei appartiennent à une Herrerasauridae monophylétique ; que les herréassauridés, Eoraptor lunensis et Guaibasaurus candelariensis sont des saurischiens ; que les Saurischia comprennent deux groupes principaux, les Sauropodomorpha et les Theropoda ; et que Saturnalia tupiniquim est un membre basal de la lignée sauropodomorphe. Au contraire, plusieurs aspects de la phylogénie des dinosaures basaux restent controversés, notamment la position des herréassauridés, de E. lunensis et de G. candelariensis en tant que theropodes basaux ou saurischiens basaux, ainsi que l'affinité et/ou la validité de taxons plus fragmentaires tels qu'Agnosphitys cromhallensis, Alwalkeria maleriensis, Chindesaurus bryansmalli, Saltopus elginensis et Spondylosoma absconditum. L'identification des apomorphies des dinosaures est compromise par l'incomplétude des restes squelettiques attribués à la plupart des dinosauremorfes basaux, dont les crânes et les membres antérieurs sont particulièrement mal connus. Néanmoins, Dinosauria peuvent être diagnostiqués par une série de traits dérivés, dont la plupart sont liés à l'anatomie de la ceinture pelvienne et des membres. Certains de ces traits sont liés à l'acquisition d'une marche bipède entièrement érigée, ce qui a traditionnellement été suggéré comme représentant une adaptation clé qui a permis, voire favorisé, la radiation des dinosaures au cours du Trias supérieur. Pourtant, contrairement aux modèles classiques de « compétition », les dinosaures n'ont pas progressivement remplacé d'autres tétrapodes terrestres au cours du Trias supérieur. En fait, la radiation du groupe comprend au moins trois moments marquants, séparés par des événements d'extinction controversés (Carnien-Norien, Trias-Jurassique). Ceux-ci sont principalement caractérisés par une diversification précoce au Carnien, une augmentation de la diversité et (surtout) de l'abondance au Norien, et l'occupation de nouvelles niches dès le Jurassique inférieur. Les dinosaures sont apparus à partir d'ancêtres entièrement bipèdes, dont le régime alimentaire pouvait être carnivore ou omnivore. Alors que les dinosaures les plus anciens étaient géographiquement restreints au sud de Pangea, incluant des ornithischiens rares et des membres basaux plus abondants de la lignée saurischiene, le groupe a atteint une distribution presque mondiale à la fin du Trias, en particulier avec la radiation de groupes saurischiens tels que les « prosauropodes » et les coélyphoïdes.

@article{doi101111j1469185x200900094x,
    author = "Langer, Max C. et Ezcurra, Martín D. et Bittencourt, Jonathas S. et Novas, Fernando E.",
    title = "L'origine et l'évolution précoce des dinosaures",
    year = "2009",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = {Les enregistrements les plus anciens et sans équivoque de Dinosauria ont été découverts dans des roches du Trias supérieur (environ 230 Ma) accumulées dans des bassins de rift extensionnels dans le sud-ouest de Pangea. Les plus connus de ces spécimens sont Herrerasaurus ischigualastensis, Pisanosaurus mertii, Eoraptor lunensis et Panphagia protos de la Formation d'Ischigualasto, en Argentine, ainsi que Staurikosaurus pricei et Saturnalia tupiniquim de la Formation de Santa Maria, au Brésil. Aucun fossile corporel de dinosaure non controversé n'est connu des strates plus anciennes, mais l'origine du lignage au Trias moyen peut être déduite à la fois du registre des traces de pas et de sa relation de groupe sœur avec les dinosauremorfes basaux du Ladinien. Ceux-ci incluent le Marasuchus lilloensis typique, des formes plus basales telles que Lagerpeton et Dromomeron, ainsi que les silesauridés : un groupe possiblement monophylétique composé de formes du Trias moyen et supérieur qui pourraient représenter des taxons sœurs immédiats des dinosaures. La première définition phylogénétique correspondant à la compréhension actuelle de Dinosauria comme un taxon basé sur un nœud composé exclusivement de Saurischia et Ornithischia mutuellement exclusifs a été donnée comme « tous les descendants du dernier ancêtre commun des oiseaux et du Tricératops ». Les analyses cladistiques récentes des dinosaures précoces s'accordent pour dire que Pisanosaurus mertii est un ornithischien basal ; que Herrerasaurus ischigualastensis et Staurikosaurus pricei appartiennent à une famille monophylétique, les Herrerasauridae ; que les herrerasauridés, Eoraptor lunensis et Guaibasaurus candelariensis sont des saurischiens ; que les Saurischia comprennent deux groupes principaux, les Sauropodomorpha et les Theropoda ; et que Saturnalia tupiniquim est un membre basal du lignage sauropodomorphe. Au contraire, plusieurs aspects de la phylogénie des dinosaures basaux restent controversés, notamment la position des herrerasauridés, E. lunensis et G. candelariensis en tant que theropodes basaux ou saurischiens basaux, ainsi que l'affinité et/ou la validité de taxons plus fragmentaires tels qu'Agnosphitys cromhallensis, Alwalkeria maleriensis, Chindesaurus bryansmalli, Saltopus elginensis et Spondylosoma absconditum. L'identification des apomorphies des dinosaures est compromise par l'incomplétude des restes squelettiques attribués à la plupart des dinosauremorfes basaux, dont les crânes et les membres antérieurs sont particulièrement mal connus. Néanmoins, Dinosauria peut être diagnostiqué par un ensemble de traits dérivés, dont la plupart sont liés à l'anatomie du bassin et des membres. Certains de ces traits sont liés à l'acquisition d'une marche bipède entièrement dressée, qui a traditionnellement été suggérée comme représentant une adaptation clé qui a permis, voire favorisé, la radiation des dinosaures au Trias supérieur. Pourtant, contrairement aux modèles classiques de « compétition », les dinosaures n'ont pas progressivement remplacé d'autres tétrapodes terrestres au cours du Trias supérieur. En fait, la radiation du groupe comprend au moins trois moments marquants, séparés par des événements d'extinction controversés (Carnien-Norien, Trias-Jurassique). Ceux-ci sont principalement caractérisés par une diversification précoce au Carnien, une augmentation de la diversité et (surtout) de l'abondance au Norien, et l'occupation de nouvelles niches dès le Jurassique inférieur. Les dinosaures sont apparus à partir d'ancêtres entièrement bipèdes, dont le régime alimentaire pouvait être carnivore ou omnivore. Alors que les dinosaures les plus anciens étaient géographiquement restreints au sud de Pangea, incluant des ornithischiens rares et des membres basaux plus abondants du lignage sauorchien, le groupe a atteint une distribution presque mondiale à la fin du Trias, en particulier avec la radiation de groupes sauorchiens tels que les « prosauropodes » et les coélyphoïdes.},
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.2009.00094.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.2009.00094.x",
    openalex = "W2121596487",
    references = "chatterjee2013a, crossref1998encyclopedia, currie2009stratigraphy, doi1010160031018281900924, doi1010160031018295000178, doi101016c20090644421, doi101016jjsames200504002, doi101016jpalaeo200606041, doi101016s0012825203000825, doi101016s0016699580800386, doi101016s0016699583800205, doi101016s0031018298001175, doi101017cbo9780511628948, doi101017s0094837300010575, doi101017s1477201906001970, doi101017s1477201907002040, doi101017s1477201907002246, doi101017s1477201907002271, doi101017s247526300000091x, doi10103820167, doi10106313060577, doi101073pnas0606028103, doi10108002724634199410011538, doi10108002724634199510011271, doi10108002724634199810011115, doi10108002724634199910011124, doi101098rspb20042692, doi101098rspb20080715, doi101098rspl18870117, doi101098rstb19990489, doi101111j109636421985tb01796x, doi101111j10963642200400130x, doi101126science1143325, doi101126science21545391501, doi101126science2645160828, doi101126science2845414616, doi101126science3616622, doi101127njgpa210199841, doi101144gsjgs14720321, doi1012060003009020073021taoeoa20co2, doi101525california97805202420980010001, doi1015468gbdyof, doi1016710272463420020220510toomka20co2, doi1016710272463420072773tclagn20co2, doi101671a1097, doi1023071292217, doi1023071441916, doi1023073889325, doi102475ajss319111253, doi102475ajss32313381, doi104202app20080415, doi10432497802030907329, doi105281zenodo16120887, doi105281zenodo16171435, doi105281zenodo16246150, doi105860choice325663, doi105860choice393984, doi105860choice465038, doi107146moggeosciv32i140904, doi10718895fylantbak30809522, openalexw114509570, openalexw1496509561, openalexw1535663436, openalexw205674743, openalexw2242116350, openalexw2788234611, openalexw2991310333, openalexw3208547338, openalexw3215057009, padian1989presence, rowe1989a, walker1964triassic"
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CONTEXTE : Archaeopteryx est l'oiseau le plus ancien et le plus primitif connu (Avialae). On croit que la croissance et la physiologie énergétique des oiseaux les plus basaux, tels qu'Archaeopteryx, ont été intégralement héritées des dinosaures non avialans. Cette hypothèse prédit que les os longs de ces oiseaux se sont formés à l'aide d'un tissu tissulaire entrelacé, bien vascularisé et en croissance rapide, typique des dinosaures non avialans. MÉTHODOLOGIE/RÉSULTATS PRINCIPAUX : Nous rapportons que les os longs d'Archaeopteryx sont composés d'un os à fibres parallèles presque avasculaire. Il s'agit d'un des tissus osseux à croissance la plus lente et est courant chez les reptiles ectothermes. Ces résultats contredisent l'hypothèse selon laquelle la croissance et la physiologie des dinosaures non avialans ont été intégralement transmises aux premiers oiseaux. L'examen de ces résultats dans un contexte phylogénétique a nécessité un échantillonnage intensif de dinosaures hors groupe et d'oiseaux les plus basaux. Nos résultats démontrent la présence d'un continuum histologique maniraptorien dépendant de l'échelle que suivent Archaeopteryx et d'autres oiseaux les plus basaux. L'analyse de la croissance d'Archaeopteryx suggère que ces animaux ont montré des taux de croissance exponentiels comme les dinosaures non avialans, trois fois plus lents que les oiseaux précoces vivants, mais toujours dans la gamme la plus basse pour tous les vertébrés endothermes. CONCLUSIONS/IMPORTANCE : L'histologie inattendue d'Archaeopteryx et d'autres oiseaux les plus basaux est en fait cohérente avec le maintien de la condition de dinosaure paravian phylogénétiquement plus ancienne lorsque la taille est prise en compte. Les premiers oiseaux étaient simplement des dinosaures plumeux en ce qui concerne la croissance et la physiologie énergétique. L'évolution du nouveau motif chez les formes modernes s'est produite plus tard dans l'histoire du groupe.

@article{doi101371journalpone0007390,
    author = "Erickson, Gregory M. and Rauhut, Oliver W. M. and Zhou, Zhonghe and Turner, Alan H. and Inouye, Brian D. and Hu, Dongyu and Norell, Mark A.",
    title = "Was Dinosaurian Physiology Inherited by Birds? Reconciling Slow Growth in Archaeopteryx",
    year = "2009",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "CONTEXTE : Archaeopteryx est l'oiseau le plus ancien et le plus primitif connu (Avialae). On croit que la croissance et la physiologie énergétique des oiseaux les plus basaux, tels qu'Archaeopteryx, ont été intégralement héritées des dinosaures non avialans. Cette hypothèse prédit que les os longs de ces oiseaux se sont formés à l'aide d'un tissu tissulaire entrelacé, bien vascularisé et en croissance rapide, typique des dinosaures non avialans. MÉTHODOLOGIE/RÉSULTATS PRINCIPAUX : Nous rapportons que les os longs d'Archaeopteryx sont composés d'un os à fibres parallèles presque avasculaire. Il s'agit d'un des tissus osseux à croissance la plus lente et est courant chez les reptiles ectothermes. Ces résultats contredisent l'hypothèse selon laquelle la croissance et la physiologie des dinosaures non avialans ont été intégralement transmises aux premiers oiseaux. L'examen de ces résultats dans un contexte phylogénétique a nécessité un échantillonnage intensif de dinosaures hors groupe et d'oiseaux les plus basaux. Nos résultats démontrent la présence d'un continuum histologique maniraptorien dépendant de l'échelle que suivent Archaeopteryx et d'autres oiseaux les plus basaux. L'analyse de la croissance d'Archaeopteryx suggère que ces animaux ont montré des taux de croissance exponentiels comme les dinosaures non avialans, trois fois plus lents que les oiseaux précoces vivants, mais toujours dans la gamme la plus basse pour tous les vertébrés endothermes. CONCLUSIONS/IMPORTANCE : L'histologie inattendue d'Archaeopteryx et d'autres oiseaux les plus basaux est en fait cohérente avec le maintien de la condition de dinosaure paravian phylogénétiquement plus ancienne lorsque la taille est prise en compte. Les premiers oiseaux étaient simplement des dinosaures plumeux en ce qui concerne la croissance et la physiologie énergétique. L'évolution du nouveau motif chez les formes modernes s'est produite plus tard dans l'histoire du groupe.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0007390",
    doi = "10.1371/journal.pone.0007390",
    openalex = "W2036031391",
    references = "doi101007bf00344996, doi101016jtree200508012, doi101016s0764446900001815, doi101023a1008929526011, doi101029sc005p0175, doi101038nature02699, doi101086410622, doi101111j109636422000tb02201x, doi101111j1474919x1968tb00058x, doi101111j1474919x1973tb02636x, doi101126science1144066, doi101525california97805202420980030031, doi1016710272463420040240555gisdap20co2, openalexw1558456135, openalexw1607828269, openalexw3206657856"
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@article{doi101016jearscirev201005004,
    author = "Chough, Sung Kwun et Sohn, Young Kwan",
    title = "Évolution tectonique et sédimentaire d'un système d'arc continental–arrière-arc crétacé sur la péninsule coréenne : Nouvelle perspective",
    year = "2010",
    journal = "Earth-Science Reviews",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2010.05.004",
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    references = "doi101016s0012825200000295, openalexw2206796883"
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La récente découverte de fleurs fossiles et d'organes floraux diversifiés dans des strates du Crétacé a révélé des détails étonnants sur la diversité structurelle et systématique des premières angiospermes. En explorant le riche registre fossile accumulé au cours des trois dernières décennies, cette étude unique examine l'histoire évolutive des plantes à fleurs, de leurs premières phases dans l'obscurité à leur domination dans la végétation moderne. La discussion fournit des informations de contexte biologiques et géologiques complètes avant de passer à un résumé détaillé du registre fossile. Incluant des résultats précédemment inédits basés sur la recherche de flores fossiles du Crétacé inférieur et supérieur en Europe et en Amérique du Nord, les auteurs s'appuient sur des preuves paléontologiques directes du schéma d'évolution des angiospermes au fil du temps. En synthétisant les données paléobotaniques avec des informations provenant de plantes vivantes, ce livre unique explore les dernières recherches dans le domaine, en mettant en évidence les liens avec la systématique phylogénétique, la structure et la biologie des angiospermes actuelles.

@book{doi101017cbo9780511980206,
    author = "Friis, Else Marie et Crane, Peter R. et Pedersen, Kaj Raunsgaard",
    title = "Early Flowers and Angiosperm Evolution",
    year = "2011",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "La récente découverte de fleurs fossiles et d'organes floraux diversifiés dans des strates du Crétacé a révélé des détails étonnants sur la diversité structurelle et systématique des premières angiospermes. En explorant le riche registre fossile accumulé au cours des trois dernières décennies, cette étude unique examine l'histoire évolutive des plantes à fleurs, de leurs premières phases dans l'obscurité à leur domination dans la végétation moderne. La discussion fournit des informations de contexte biologiques et géologiques complètes avant de passer à un résumé détaillé du registre fossile. Incluant des résultats précédemment inédits basés sur la recherche de flores fossiles du Crétacé inférieur et supérieur en Europe et en Amérique du Nord, les auteurs s'appuient sur des preuves paléontologiques directes du schéma d'évolution des angiospermes au fil du temps. En synthétisant les données paléobotaniques avec des informations provenant de plantes vivantes, ce livre unique explore les dernières recherches dans le domaine, en mettant en évidence les liens avec la systématique phylogénétique, la structure et la biologie des angiospermes actuelles.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511980206",
    doi = "10.1017/cbo9780511980206",
    openalex = "W1565681752"
}

L'effet de l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène (K-Pg) (anciennement Crétacé-Tertiaire, K-T) sur l'évolution aviaire est débattu, principalement en raison du registre fossile pauvre des oiseaux du Crétacé supérieur. En particulier, il reste incertain si les oiseaux archaïques ont disparu progressivement au cours du Crétacé ou s'ils sont restés diversifiés jusqu'à la fin du Crétacé et ont péri lors de l'extinction de masse du K-Pg. Ici, nous décrivons une avifaune diversifiée du Maastrichtien terminal de l'Amérique du Nord occidentale, qui fournit une preuve définitive de la persistance d'une gamme d'oiseaux archaïques jusqu'à 300 000 ans de la limite K-Pg. Un total de 17 espèces sont identifiées, dont 7 espèces d'oiseaux archaïques, représentant les Enantiornithes, les Ichthyornithes, les Hesperornithes et un oiseau semblable à l'Apsaravis. Aucun de ces groupes n'est connu pour avoir survécu au Paléogène, et leur persistance jusqu'au Maastrichtien terminal fournit donc une forte preuve d'une extinction de masse d'oiseaux archaïques coïncidant avec l'impact de l'astéroïde de Chicxulub. La plupart des oiseaux décrits ici représentent des ornithurines avancées, montrant qu'une radiation majeure des Ornithurae a précédé la fin du Crétacé, mais aucun ne peut être définitivement rattaché aux Neornithes. Cette avifaune est la plus diverse connue du Crétacé supérieur, et bien que la disparité de taille soit inférieure à celle des oiseaux modernes, l'assemblage comprend à la fois des formes plus petites et certains des plus grands oiseaux volants connus du Mésozoïque, soulignant le degré auquel la diversification aviaire avait progressé à la fin de l'ère des dinosaures.

@article{doi101073pnas1110395108,
    author = "Longrich, Nicholas R. et Tokaryk, Tim T. et Field, Daniel J.",
    title = "Extinction de masse des oiseaux à la limite Crétacé–Paléogène (K–Pg)",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "L'effet de l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène (K-Pg) (anciennement Crétacé-Tertiaire, K-T) sur l'évolution aviaire est débattu, principalement en raison du registre fossile pauvre des oiseaux du Crétacé supérieur. En particulier, il reste incertain si les oiseaux archaïques ont disparu progressivement au cours du Crétacé ou s'ils sont restés diversifiés jusqu'à la fin du Crétacé et ont péri lors de l'extinction de masse du K-Pg. Ici, nous décrivons une avifaune diversifiée du Maastrichtien terminal de l'Amérique du Nord occidentale, qui fournit une preuve définitive de la persistance d'une gamme d'oiseaux archaïques jusqu'à 300 000 ans de la limite K-Pg. Un total de 17 espèces sont identifiées, dont 7 espèces d'oiseaux archaïques, représentant les Enantiornithes, les Ichthyornithes, les Hesperornithes et un oiseau semblable à l'Apsaravis. Aucun de ces groupes n'est connu pour avoir survécu au Paléogène, et leur persistance jusqu'au Maastrichtien terminal fournit donc une forte preuve d'une extinction de masse d'oiseaux archaïques coïncidant avec l'impact de l'astéroïde de Chicxulub. La plupart des oiseaux décrits ici représentent des ornithurines avancées, montrant qu'une radiation majeure des Ornithurae a précédé la fin du Crétacé, mais aucun ne peut être définitivement rattaché aux Neornithes. Cette avifaune est la plus diverse connue du Crétacé supérieur, et bien que la disparité de taille soit inférieure à celle des oiseaux modernes, l'assemblage comprend à la fois des formes plus petites et certains des plus grands oiseaux volants connus du Mésozoïque, soulignant le degré auquel la diversification aviaire avait progressé à la fin de l'ère des dinosaures.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1110395108",
    doi = "10.1073/pnas.1110395108",
    openalex = "W2083202587",
    references = "doi1010029780470750711, doi101038381226a0, doi101098rsbl20060523, doi101126science1177265, doi101126science27553031109, doi101126science27553031113, doi1012019781420064452, doi105860choice343307, openalexw1535663436, openalexw3217097258"
}

Le jabot est caractéristique des oiseaux granivores d'aujourd'hui, mais peu est connu de son histoire précoce malgré les découvertes remarquables de nombreux oiseaux granivores du Mésozoïque au cours de la dernière décennie. Ici, nous rapportons la découverte de certaines preuves fossiles précoces de la présence d'un jabot chez les oiseaux. Deux oiseaux du Crétacé inférieur, l'ornithurine basale Hongshanornis et un oiseau basal Sapeornis, démontrent qu'un système digestif essentiellement moderne chez les oiseaux s'est formé tôt dans l'évolution aviaire. La découverte d'un jabot chez deux lignées phylogénétiquement éloignées d'oiseaux du Crétacé inférieur et son absence chez la plupart des formes intermédiaires indique qu'il a été acquis indépendamment comme une adaptation spécialisée à la granivorie. Enfin, la réduction ou la perte de dents chez les formes présentant des jabots remplis de graines suggère que la granivorie a été l'un des facteurs ayant conduit à la réduction des dents chez les premiers oiseaux.

@article{doi101073pnas1112694108,
    author = "Zheng, Xiaoting et Martin, Larry D. et Zhou, Zhonghe et Burnham, David A. et Zhang, Fucheng et Miao, Desui",
    title = "Preuves fossiles de jabots chez les oiseaux du Crétacé inférieur de Chine",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Le jabot est caractéristique des oiseaux granivores d'aujourd'hui, mais peu est connu de son histoire précoce malgré les découvertes remarquables de nombreux oiseaux granivores du Mésozoïque au cours de la dernière décennie. Ici, nous rapportons la découverte de certaines preuves fossiles précoces de la présence d'un jabot chez les oiseaux. Deux oiseaux du Crétacé inférieur, l'ornithurine basale Hongshanornis et un oiseau basal Sapeornis, démontrent qu'un système digestif essentiellement moderne chez les oiseaux s'est formé tôt dans l'évolution aviaire. La découverte d'un jabot chez deux lignées phylogénétiquement éloignées d'oiseaux du Crétacé inférieur et son absence chez la plupart des formes intermédiaires indique qu'il a été acquis indépendamment comme une adaptation spécialisée à la granivorie. Enfin, la réduction ou la perte de dents chez les formes présentant des jabots remplis de graines suggère que la granivorie a été l'un des facteurs ayant conduit à la réduction des dents chez les premiers oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1112694108",
    doi = "10.1073/pnas.1112694108",
    openalex = "W2018519510",
    references = "doi101007s1143001040949, doi101017cbo9780511980206, doi101038nature00930, doi101038nature01342, doi101038nature08322, doi101098rspb20090885, doi101111j14636409200600234x, doi101139e03011, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi105860choice343307, openalexw2607033038"
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Peu de choses sont connues sur les capacités olfactives des oiseaux basaux (non-neornithines) éteints ou sur les changements évolutifs de l'olfaction survenus des theropodes non aviens jusqu'aux oiseaux modernes. Bien que les oiseaux modernes soient connus pour avoir des capacités olfactives diverses, l'olfaction est généralement considérée comme ayant décliné au cours de l'évolution aviaire alors que des améliorations sensorielles visuelles et vestibulaires se sont produites en association avec le vol. Pour tester l'hypothèse que l'olfaction a diminué au cours de l'évolution aviaire, nous avons évalué la taille relative du bulbe olfactif, utilisée ici comme proxy neuroanatomique des capacités olfactives, chez 157 espèces de theropodes non aviens, d'oiseaux fossiles et d'oiseaux vivants. Nous montrons que la taille relative du bulbe olfactif a augmenté au cours de l'évolution des maniraptoriformes non aviens, est restée stable à travers la transition theropode/oiseau non avien, et a augmenté au cours de l'évolution des oiseaux basaux et des neornithines précoces. Des neornithines précoces jusqu'à une grande partie de l'évolution des neornithines, la taille relative des bulbes olfactifs est restée stable avant de diminuer dans les clades neoavians dérivés. Nos résultats montrent que, plutôt que de diminuer, l'importance de l'olfaction a en réalité augmenté au cours de l'évolution précoce des oiseaux, représentant une amélioration sensorielle précédemment non reconnue. Les bulbes olfactifs relativement plus grands des neornithines les plus anciennes, par rapport à ceux des oiseaux basaux, ont peut-être conféré aux neornithines une olfaction améliorée pour des compétences de recherche de nourriture ou de navigation plus efficaces, ce qui à son tour a pu être un facteur leur permettant de survivre à l'extinction de masse du Crétacé terminal.

@article{doi101098rspb20110238,
    author = "Zelenitsky, Darla K. et Therrien, François et Ridgely, Ryan C. et McGee, Amanda et Witmer, Lawrence M.",
    title = "Évolution de l'olfaction chez les dinosaures theropodes non aviens et les oiseaux",
    year = "2011",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Peu de choses sont connues sur les capacités olfactives des oiseaux basaux (non-neornithines) éteints ou sur les changements évolutifs de l'olfaction survenus des theropodes non aviens jusqu'aux oiseaux modernes. Bien que les oiseaux modernes soient connus pour avoir des capacités olfactives diverses, l'olfaction est généralement considérée comme ayant décliné au cours de l'évolution aviaire alors que des améliorations sensorielles visuelles et vestibulaires se sont produites en association avec le vol. Pour tester l'hypothèse que l'olfaction a diminué au cours de l'évolution aviaire, nous avons évalué la taille relative du bulbe olfactif, utilisée ici comme proxy neuroanatomique des capacités olfactives, chez 157 espèces de theropodes non aviens, d'oiseaux fossiles et d'oiseaux vivants. Nous montrons que la taille relative du bulbe olfactif a augmenté au cours de l'évolution des maniraptoriformes non aviens, est restée stable à travers la transition theropode/oiseau non avien, et a augmenté au cours de l'évolution des oiseaux basaux et des neornithines précoces. Des neornithines précoces jusqu'à une grande partie de l'évolution des neornithines, la taille relative des bulbes olfactifs est restée stable avant de diminuer dans les clades neoavians dérivés. Nos résultats montrent que, plutôt que de diminuer, l'importance de l'olfaction a en réalité augmenté au cours de l'évolution précoce des oiseaux, représentant une amélioration sensorielle précédemment non reconnue. Les bulbes olfactifs relativement plus grands des neornithines les plus anciennes, par rapport à ceux des oiseaux basaux, ont peut-être conféré aux neornithines une olfaction améliorée pour des compétences de recherche de nourriture ou de navigation plus efficaces, ce qui à son tour a pu être un facteur leur permettant de survivre à l'extinction de masse du Crétacé terminal.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2011.0238",
    doi = "10.1098/rspb.2011.0238",
    openalex = "W2144479326",
    references = "doi101002ar20983, doi101016s0065345413600017, doi101038nature02706, doi101073pnas1006970107, doi101086284325, doi101093sysbio423265, doi101098rspb20090885, doi101111j155856461951tb02756x, doi101126science1157704, doi101126science2865440711, doi101136bjo592111c, doi1012019781420064452, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi101242jeb002246, doi101371journalpone0007390, doi1023072407154, doi105860choice421568, larsson2000forebrain, openalexw2611511275, russell1969a"
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Les os postcrâniens pneumatiques (remplis d'air) sont uniques aux oiseaux parmi les tétrapodes existants. Les corrélations squelettiques sans ambiguïté de la pneumatique postcrânienne sont apparues pour la première fois au Trias supérieur (il y a environ 210 millions d'années), lorsqu'elles ont évolué indépendamment dans plusieurs groupes d'archosaures de la lignée des oiseaux (ornithodirans). Ceux-ci incluent les dinosaures théropodes (dont les oiseaux sont des représentants existants), les ptérosaures et les dinosaures sauropodomorphes. Les fonctions postulées de la pneumatisation squelettique incluent la réduction du poids chez les taxons de grande taille ou volants, et la réduction de la densité entraînant des économies d'énergie lors de la recherche de nourriture et de la locomotion. Cependant, l'influence de ces hypothèses sur l'évolution précoce de la pneumatique n'a pas été étudiée en détail auparavant. Nous passons en revue les travaux récents sur l'importance de la pneumatique pour comprendre la biologie des ornithodirans éteints, et présentons de nouvelles données détaillées sur la proportion du squelette qui était pneumatisée chez 131 théropodes non aviens et Archaeopteryx. Cela inclut tous les taxons connus à partir de restes postcrâniens significatifs. La pneumatique des vertèbres cervicales et dorsales antérieures s'est produite tôt dans l'évolution des théropodes. Ce « motif commun » a été conservé sur la lignée menant aux oiseaux, et est probablement présent chez Archaeopteryx. Les augmentations de la pneumatique squelettique se sont produites indépendamment dans jusqu'à 12 lignées, soulignant un nombre remarquablement élevé d'acquisitions parallèles d'une caractéristique semblable à celle des oiseaux parmi les théropodes non aviens. En utilisant un cadre comparatif quantitatif, nous montrons que les augmentations évolutives de la pneumatique squelettique sont significativement concentrées dans les lignées à grande taille corporelle, suggérant que la réduction de masse en réponse aux contraintes gravitationnelles à grande taille corporelle a influencé l'évolution précoce de la pneumatique. Cependant, le seuil de taille corporelle pour une pneumatique étendue est plus bas dans les lignées de théropodes plus étroitement apparentées aux oiseaux (maniraptora). Ainsi, le relâchement de la relation entre la taille corporelle et la pneumatique a précédé l'origine des oiseaux et ne peut être expliqué comme une adaptation au vol. Nous hypothesons que la modulation de la densité squelettique chez les petits maniraptora non volants a entraîné des économies d'énergie dans le cadre d'une réponse multi-systémique aux demandes métaboliques accrues. L'acquisition d'une pneumatique postcrânienne étendue chez les maniraptora de petite taille corporelle peut indiquer une endothermie à haute performance semblable à celle des oiseaux.

@article{doi101111j1469185x201100190x,
    author = "Benson, Roger and Butler, Richard J. and Carrano, Matthew T. and O’Connor, Patrick M.",
    title = "Os postcrâniens remplis d'air chez les dinosaures théropodes : implications physiologiques et la transition « reptile »–oiseau",
    year = "2011",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Les os postcrâniens pneumatisés (remplis d'air) sont uniques aux oiseaux parmi les tétrapodes existants. Les corrélations squelettiques non ambiguës de la pneumatisation postcrânienne sont apparues pour la première fois au Trias supérieur (environ il y a 210 millions d'années), lorsqu'elles ont évolué indépendamment chez plusieurs groupes d'archosaures de la lignée des oiseaux (ornithodirans). Ceux-ci incluent les dinosaures théropodes (dont les oiseaux sont des représentants existants), les ptérosaures et les dinosaures sauropodomorphes. Les fonctions postulées de la pneumatisation squelettique incluent la réduction de poids chez les taxons de grande taille ou volants, et la réduction de densité entraînant des économies d'énergie lors de la recherche de nourriture et de la locomotion. Cependant, l'influence de ces hypothèses sur l'évolution précoce de la pneumatisation n'a pas été étudiée en détail auparavant. Nous passons en revue les travaux récents sur l'importance de la pneumatisation pour comprendre la biologie des ornithodirans éteints, et présentons de nouvelles données détaillées sur la proportion du squelette qui était pneumatisée chez 131 théropodes non aviens et Archaeopteryx. Cela inclut tous les taxons connus à partir de restes postcrâniens significatifs. La pneumatisation des vertèbres cervicales et dorsales antérieures s'est produite tôt dans l'évolution des théropodes. Ce « motif commun » a été conservé sur la lignée menant aux oiseaux, et est probablement présent chez Archaeopteryx. Des augmentations de la pneumatisation squelettique sont survenues indépendamment chez jusqu'à 12 lignées, soulignant un nombre remarquablement élevé d'acquisitions parallèles d'une caractéristique semblable à celle des oiseaux chez les théropodes non aviens. En utilisant un cadre comparatif quantitatif, nous montrons que les augmentations évolutives de la pneumatisation squelettique sont significativement concentrées dans les lignées de grande taille corporelle, suggérant que la réduction de masse en réponse aux contraintes gravitationnelles à grande taille corporelle a influencé l'évolution précoce de la pneumatisation. Cependant, le seuil de taille corporelle pour une pneumatisation étendue est plus bas chez les lignées de théropodes plus étroitement apparentées aux oiseaux (maniraptora). Ainsi, le relâchement de la relation entre la taille corporelle et la pneumatisation a précédé l'origine des oiseaux et ne peut être expliqué comme une adaptation au vol. Nous hypothesons que la modulation de la densité squelettique chez les petits maniraptora non volants a entraîné des économies d'énergie dans le cadre d'une réponse multi-systémique à des demandes métaboliques accrues. L'acquisition d'une pneumatisation postcrânienne étendue chez les maniraptora de petite taille corporelle pourrait indiquer une endothermie à haute performance semblable à celle des oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.2011.00190.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.2011.00190.x",
    openalex = "W2003924744",
    references = "doi101002jez513, doi101002jmor10470, doi101002sici1097018520000215261125aidar630co27, doi101007s0011400804883, doi101007s001140090614x, doi101017s0094837300021308, doi101038nature07856, doi101073pnas0708903105, doi10108002724634199710011018, doi101086284325, doi101093auk12041206, doi101093bioinformaticsbtg412, doi101093sysbio41118, doi101098rstb19890106, doi101111j10963642200600245x, doi101111j10963642200900569x, doi101126science1180219, doi1012066481, doi101371journalpone0003303, doi101371journalpone0007390, doi10167102724634200727127tpasom20co2, doi1023071292217, doi1023071441916, doi105281zenodo16171435, doi105860choice392183, doi105860choice434677, doi105962bhltitle60562, openalexw2611511275, openalexw3086315876, ostrom2019osteology, owen1857monograph, owen2015monograph"
}

Les analyses précédentes des relations, des temps de divergence et des modèles de diversification parmi les familles de mammifères actuelles se sont appuyées sur des méthodes de supertree et des horloges moléculaires locales. Nous avons construit une supermatrice moléculaire pour les familles de mammifères et analysé ces données avec des méthodes basées sur la vraisemblance et des horloges moléculaires relâchées. Les analyses phylogénétiques ont abouti à une phylogénie robuste avec une meilleure résolution que les phylogénies issues des méthodes de supertree. Les analyses d'horloges relâchées soutiennent le modèle de long délai de diversification et soulignent l'importance d'inclure plusieurs calibrations fossiles réparties sur l'arbre. Les arbres temporels moléculaires et les analyses de diversification suggèrent des rôles importants pour la Révolution terrestre du Crétacé et l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène (KPg) dans l'ouverture d'espaces écologiques qui ont favorisé respectivement la diversification interordinaire et intraordinaire. Par contraste, les analyses de diversification ne fournissent aucun soutien à l'hypothèse concernant la montée tardive des mammifères actuels durant la période du Cénozoïque (Éocène).

@article{doi101126science1211028,
    author = "Meredith, Robert W. et Janečka, Jan E. et Gatesy, John et Ryder, Oliver A. et Fisher, Colleen A. et Teeling, Emma C. et Goodbla, Alisha et Eizirik, Eduardo et Simão, Taiz L. L. et Stadler, Tanja et Rabosky, Daniel L. et Honeycutt, Rodney L. et Flynn, John J. et Ingram, Colleen M. et Steiner, Cynthia et Williams, Tiffani L. et Robinson, Terence J. et Burk-Herrick, Angela et Westerman, Michael et Ayoub, Nadia A. et Springer, Mark S. et Murphy, William J.",
    title = "Impacts of the Cretaceous Terrestrial Revolution and KPg Extinction on Mammal Diversification",
    year = "2011",
    journal = "Science",
    abstract = "Les analyses précédentes des relations, des temps de divergence et des modèles de diversification parmi les familles de mammifères actuelles se sont appuyées sur des méthodes de supertree et des horloges moléculaires locales. Nous avons construit une supermatrice moléculaire pour les familles de mammifères et analysé ces données avec des méthodes basées sur la vraisemblance et des horloges moléculaires relâchées. Les analyses phylogénétiques ont abouti à une phylogénie robuste avec une meilleure résolution que les phylogénies issues des méthodes de supertree. Les analyses d'horloges relâchées soutiennent le modèle de long délai de diversification et soulignent l'importance d'inclure plusieurs calibrations fossiles réparties sur l'arbre. Les arbres temporels moléculaires et les analyses de diversification suggèrent des rôles importants pour la Révolution terrestre du Crétacé et l'extinction de masse du Crétacé-Paléogène (KPg) dans l'ouverture d'espaces écologiques qui ont favorisé respectivement la diversification interordinaire et intraordinaire. Par contraste, les analyses de diversification ne fournissent aucun soutien à l'hypothèse concernant la montée tardive des mammifères actuels durant la période du Cénozoïque (Éocène).",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1211028",
    doi = "10.1126/science.1211028",
    openalex = "W2140803428",
    references = "doi101016jtree200610002, doi101023a1011317930838, doi101038381226a0, doi101038nature05634, doi101038nature09705, doi101038nature10291, doi101073pnas0334222100, doi101073pnas1016876108, doi101093sysbiosyp031, doi101101gr5918807, doi101126science1067179, doi101353book59141"
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Les archosaures possèdent un registre de 250 millions d'années qui a débuté peu après l'événement d'extinction Permien-Triasique et qui se poursuit aujourd'hui par deux clades existants, les crocodiliens et les oiseaux. Les deux lignées existantes illustrent deux extrêmes de plans corporels au sein d'une histoire évolutive diverse et complexe, mais peu est connu sur l'ancêtre commun de ces lignées. Un regain d'intérêt pour les archosaures précoces a conduit à une quasi-doubling des taxons connus au cours des 20 dernières années. Cette étude présente une analyse phylogénétique approfondie de 80 taxons au niveau des espèces, allant du Permien supérieur à la partie initiale du Jurassique, en utilisant un jeu de données de 412 caractères. Chaque taxon terminal est explicitement décrit et tous les spécimens utilisés dans l'analyse sont clairement indiqués. De plus, chaque caractère est discuté en détail et presque tous les états de caractères sont illustrés soit par un dessin, soit mis en évidence sur une photographie de spécimen. Une combinaison de caractères novateurs et d'un échantillonnage de caractères exhaustif a permis de combler les lacunes entre les analyses précédemment publiées qui se concentraient sur des sous-clades archosauriformes particuliers. Un arbre de consensus bien résolu et robustement soutenu (MPTs = 360) a révélé un Archosauria monophylétique composé de deux branches majeures, les lignées crocodiliennes et aviaires. La monophylie de clades tels que les Ornithosuchidae, les Phytosauria, les Aetosauria, les Crocodylomorpha et les Dinosauria est soutenue par cette analyse. Cependant, les phytosaures sont récupérés pour la première fois comme le taxon frère le plus proche de l'Archosauria, plutôt que comme des archosaures de la lignée crocodilienne basaux. Parmi les taxons classiquement appelés « rauisuchiens », un clade poposauroïde monophylétique a été trouvé comme taxon frère d'un groupe de « rauisuchiens » paraphylétiques et de crocodylomorphes monophylétiques. Par conséquent, les crocodylomorphes sont bien inclus dans un clade de « rauisuchiens » et ne sont pas plus étroitement apparentés aux aetosauriens qu'à des taxons tels que Postosuchus. Des crocodylomorphes basaux tels que Hesperosuchus et des formes similaires (« Sphenosuchia ») ont été trouvés comme un grade paraphylétique menant au clade Crocodyliformes. Parmi les archosaures de la lignée aviaire, les Dinosauria sont bien soutenus. Un clade monophylétique contenant Silesaurus et des formes similaires est bien soutenu comme taxon frère des Dinosauria. Les ptérosaures sont robustement soutenus à la base de la lignée aviaire. Une phylogénie calibrée dans le temps des Archosauriformes indique que l'origine et la diversification initiale de l'Archosauria ont eu lieu au Trias inférieur suivant l'extinction Permien-Triasique. De plus, tous les clades archosauriens basaux majeurs sauf les Crocodylomorpha ont été établis à la fin de l'Anisien. L'évolution archosaurienne précoce se caractérise par des taux élevés d'homoplasie, de longues lignées fantômes et des taux élevés d'évolution des caractères. Le taux d'évolution des caractères chez les archosaures au Trias inférieur est inégalé par rapport aux taux archosauriens pour le reste du Trias. Ces données impliquent que beaucoup de l'histoire précoce de l'Archosauria n'a pas été récupérée à partir du registre fossile. Non seulement les archosaures étaient diversifiés au Trias moyen, mais ils avaient une distribution biogéographique presque cosmopolite à la fin de l'Anisien.

@article{doi1012063521,
    author = "Nesbitt, Sterling J.",
    title = "L'évolution précoce des archosaures : relations et origine des grands clades",
    year = "2011",
    journal = "Bulletin of the American Museum of Natural History",
    abstract = {Les archosaures ont un registre de 250 millions d'années qui a commencé peu après l'événement d'extinction Permien-Trias et qui se poursuit aujourd'hui par deux clades existants, les crocodiliens et les oiseaux. Les deux lignées existantes illustrent deux extrêmes de plans corporels au sein d'une histoire évolutive diverse et complexe, mais peu est connu sur l'ancêtre commun de ces lignées. Un regain d'intérêt pour les archosaures précoces a conduit à une quasi-doubling des taxons connus au cours des 20 dernières années. Cette étude présente une analyse phylogénétique approfondie de 80 taxons au niveau des espèces, allant du Permien supérieur à la partie initiale du Jurassique, en utilisant un jeu de données de 412 caractères. Chaque taxon terminal est explicitement décrit et tous les spécimens utilisés dans l'analyse sont clairement indiqués. De plus, chaque caractère est discuté en détail et presque tous les états de caractère sont illustrés soit dans un dessin, soit mis en évidence sur une photographie de spécimen. Une combinaison de caractères novateurs et d'un échantillonnage de caractères exhaustif a permis de combler les analyses précédemment publiées qui se concentraient sur des sous-clades archosauriformes particuliers. Un arbre de consensus bien résolu et robustement soutenu (MPTs = 360) a trouvé un Archosauria monophylétique composé de deux branches majeures, les lignées crocodiliennes et aviaires. La monophylie de clades tels que Ornithosuchidae, Phytosauria, Aetosauria, Crocodylomorpha et Dinosauria est soutenue dans cette analyse. Cependant, les phytosaures sont récupérés pour la première fois comme le taxon frère le plus proche de l'Archosauria, plutôt que comme des archosaures de la lignée crocodilienne basaux. Parmi les taxons classiquement appelés « rauisuchiens », un clade poposauroïde monophylétique a été trouvé comme taxon frère d'un groupe de rauisuchiens paraphylétiques et de crocodylomorphes monophylétiques. Par conséquent, les crocodylomorphes sont bien inclus dans un clade de « rauisuchiens » et ne sont pas plus étroitement apparentés aux aetosauriens qu'à des taxons tels que Postosuchus. Les crocodylomorphes basaux tels que Hesperosuchus et des formes similaires (« Sphenosuchia ») ont été trouvés comme un grade paraphylétique menant au clade Crocodyliformes. Parmi les archosaures de la lignée aviaire, Dinosauria est bien soutenu. Un clade monophylétique contenant Silesaurus et des formes similaires est bien soutenu comme taxon frère de Dinosauria. Les ptérosaures sont robustement soutenus à la base de la lignée aviaire. Une phylogénie calibrée dans le temps des Archosauriformes indique que l'origine et la diversification initiale de l'Archosauria ont eu lieu au Trias inférieur suivant l'extinction Permien-Trias. De plus, tous les grands clades archosauriens basaux sauf Crocodylomorpha ont été établis à la fin de l'Anisien. L'évolution archosaurienne précoce est caractérisée par des taux élevés d'homoplasie, de longues lignées fantômes et des taux élevés d'évolution des caractères. Le taux d'évolution des caractères parmi les archosaures au Trias inférieur est inégalé par rapport aux taux archosauriens pour le reste du Trias. Ces données impliquent que beaucoup de l'histoire précoce de l'Archosauria n'a pas été récupérée à partir du registre fossile. Non seulement les archosaures étaient diversifiés au Trias moyen, mais ils avaient presque une distribution biogéographique cosmopolite à la fin de l'Anisien.},
    url = "https://doi.org/10.1206/352.1",
    doi = "10.1206/352.1",
    openalex = "W2009094188",
    references = "benton1983dinosaur, boulenger1904vion, doi101002jmor10018, doi101007bf02101113, doi101007bf02986571, doi1010160034666791900282, doi101016jcretres200405002, doi101016jgeobios200304008, doi101016jjsames200504002, doi101016s001669959880123x, doi101016s0031018298001175, doi101017s0006323197005100, doi101017s0016756807003925, doi101017s0022336000026706, doi101017s1477201906001970, doi101017s1477201907002040, doi101017s1477201907002271, doi101038114085a0, doi101038248168a0, doi10108002724634199110011386, doi10108002724634199110011426, doi10108002724634199210011473, doi10108002724634199310011511, doi10108002724634199410011523, doi10108002724634199410011524, doi10108002724634199410011538, doi10108002724634199610011283, doi10108002724634199910011124, doi10108002724634199910011178, doi10108002724634199910011201, doi10108002724634200310010947, doi10108008912960600719988, doi101093oxfordjournalsafrafa100309, doi101098rspb20043047, doi101098rspb20071370, doi101098rspl18870117, doi101098rstb19610007, doi101098rstb19650003, doi101098rstb19830079, doi101098rstb19850092, doi101098rstb19990489, doi101111j00310239200300301x, doi101111j109600311988tb00514x, doi101111j10960031200800217x, doi101111j109636421985tb01796x, doi101111j109636422001tb01313x, doi101111j109636422001tb01314x, doi101111j10963642200700325x, doi101126science10246376, doi101126science1101012, doi101126science1143325, doi101126science1144066, doi101126science1161833, doi101126science1874180947, doi101126science2562999, doi101126science2665183267, doi101126science2725264986, doi101126science28454232137, doi101127njgpa210199841, doi101144gslsp20032170111, doi101146annurevearth251435, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi1012060003009020073021taoeoa20co2, doi101371journalpone0002995, doi1016710272463420020220510toomka20co2, doi1016710272463420020220593cvancf20co2, doi10167102724634200727350asoitp20co2, doi1016710390290218, doi101671a1097, doi102475ajss319111253, doi102475ajss321125417, doi105962bhlpart22965, doi107146moggeosciv32i140904, galton1977onstaurikosaums, nesbitt2009a, openalexw1574544995, openalexw2183707334, openalexw2310875238, openalexw2894525608, openalexw834136096, padian1990the, riggs2003isotopic, rowe1989a, sereno1997the, smith1990osteology, walker1964triassic, welles1954new"
}

La plupart des dinosaures theropodes non aviens se caractérisent par des dents effrayantes et dentelées ainsi que des griffes aiguës et recourbées. L'interprétation de l'écologie prédatrice des theropodes repose généralement sur une analyse morphologique fonctionnelle de ces caractéristiques physiques et d'autres. La fameuse griffe hypertrophiée de « tuerie » sur le doigt pédal (D) II du theropode maniraptoran Deinonychus (Paraves : Dromaeosauridae) est supposée avoir été une adaptation prédatrice pour trancher ou grimper, conduisant à la suggestion que Deinonychus et autres dromaeosauridés étaient des prédateurs cursoriaux spécialisés pour attaquer activement et tuer des proies plusieurs fois plus grandes qu'eux-mêmes. Cependant, cette hypothèse est problématique car les animaux actuels possédant des griffes similaires hypertrophiées ne les utilisent pas pour trancher ou grimper sur leurs proies. Ici, nous proposons une interprétation alternative : que la griffe D-II hypertrophiée des dromaeosauridés était fonctionnellement analogue à l'ongle élargi également trouvé sur le D-II des Accipitridés actuels (faucons et aigles ; une famille des oiseaux communément connus sous le nom de « rapaces »). Ici, l'ongle est utilisé pour maintenir la prise sur une proie de taille corporelle subégale à celle du prédateur, tandis que la victime est immobilisée par le poids corporel du rapace et désarticulée par le bec. Le pied de Deinonychus présente une morphologie cohérente avec une fonction de préhension, soutenant le modèle de comportement d'immobilisation de la proie. Des tendances morphologiques opposées au sein des Deinonychosauria (Dromaeosauridae + Troodontidae) sont indicatives d'une séparation écologique. Placé dans le contexte de l'évolution avienne, le pied préhensile de Deinonychus et d'autres paraviens prédateurs terrestres est supposé avoir été une exaptation pour le pied préhensile des oiseaux perchés arboricoles. Ici, nous décrivons également le « battement de stabilité », un comportement nouveau exécuté pour le positionnement et la stabilité pendant les étapes initiales de l'immobilisation de la proie, qui a pu être crucial pour l'évolution du battement. Ces résultats bouleversent notre perception des dinosaures prédateurs et mettent en évidence le rôle de l'exaptation dans l'évolution de structures et comportements nouveaux.

@article{doi101371journalpone0028964,
    author = "Fowler, Denver W. et Freedman, Elizabeth A. et Scannella, John B. et Kambic, Robert E.",
    title = "L'écologie prédatrice de Deinonychus et l'origine du battement des ailes chez les oiseaux",
    year = "2011",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = {La plupart des dinosaures theropodes non aviens se caractérisent par des dents effrayantes et dentelées ainsi que des griffes aiguës et recourbées. L'interprétation de l'écologie prédatrice des theropodes repose généralement sur une analyse morphologique fonctionnelle de ces caractéristiques physiques et d'autres. La fameuse griffe hypertrophiée de « tuerie » sur le doigt pédal (D) II du theropode maniraptoran Deinonychus (Paraves : Dromaeosauridae) est supposée avoir été une adaptation prédatrice pour trancher ou grimper, conduisant à la suggestion que Deinonychus et autres dromaeosauridés étaient des prédateurs cursoriaux spécialisés pour attaquer activement et tuer des proies plusieurs fois plus grandes qu'eux-mêmes. Cependant, cette hypothèse est problématique car les animaux actuels possédant des griffes similaires hypertrophiées ne les utilisent pas pour trancher ou grimper sur leurs proies. Ici, nous proposons une interprétation alternative : que la griffe D-II hypertrophiée des dromaeosauridés était fonctionnellement analogue à l'ongle élargi également trouvé sur le D-II des Accipitridés actuels (faucons et aigles ; une famille des oiseaux communément connus sous le nom de « rapaces »). Ici, l'ongle est utilisé pour maintenir la prise sur une proie de taille corporelle subégale à celle du prédateur, tandis que la victime est immobilisée par le poids corporel du rapace et désarticulée par le bec. Le pied de Deinonychus présente une morphologie cohérente avec une fonction de préhension, soutenant le modèle de comportement d'immobilisation de la proie. Des tendances morphologiques opposées au sein des Deinonychosauria (Dromaeosauridae + Troodontidae) sont indicatives d'une séparation écologique. Placé dans le contexte de l'évolution avienne, le pied préhensile de Deinonychus et d'autres paraviens prédateurs terrestres est supposé avoir été une exaptation pour le pied préhensile des oiseaux perchés arboricoles. Ici, nous décrivons également le « battement de stabilité », un comportement nouveau exécuté pour le positionnement et la stabilité pendant les étapes initiales de l'immobilisation de la proie, qui a pu être crucial pour l'évolution du battement. Ces résultats bouleversent notre perception des dinosaures prédateurs et mettent en évidence le rôle de l'exaptation dans l'évolution de structures et comportements nouveaux.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0028964",
    doi = "10.1371/journal.pone.0028964",
    openalex = "W2059526119",
    references = "carpenter2005the, crossref1976allosaurus, doi101002ar20986, doi101007s0011400804883, doi101017cbo9780511608377011, doi10103831635, doi10103835047056, doi10103845769, doi10108002724634198710011651, doi10108010618600199610474713, doi101126science1144066, doi101126science27953581915, doi101666040141, doi1023071390807, doi102307jctvqc6gzx, russell1969a, wilson1985stenonychosaurus"
}

@article{doi101038ncomms2104,
    author = "Zheng, Xiaoting et Wang, Xiaoli et O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Aperçu sur l'évolution précoce du sternum aviaire à partir d'enantiornithes juvéniles",
    year = "2012",
    journal = "Nature Communications",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms2104",
    doi = "10.1038/ncomms2104",
    openalex = "W2156664741",
    references = "doi10103835086650, doi101098rsbl20090310, doi102992014590582006371pon20co2, xu2010a"
}

RÉSUMÉ Des études récentes ont brouillé la distinction entre deux grands groupes d'oiseaux : les Enantiornithes, une importante radiation d'oiseaux précoces du Crétacé, et les Ornithuromorpha, le clade incluant les oiseaux actuels. Ici, nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine du Jiufotang Formation du Crétacé inférieur du Liaoning occidental, Chine, Xiangornis shenmi, gen. et sp. nov., qui réduit davantage encore l'écart morphologique entre les deux groupes. Xiangornis shenmi présente plusieurs caractéristiques enantiornithines, notamment une furcula avec un hypocleidium significativement allongé, un coracoïde avec une marge latérale convexe, et un métacarpien mineur qui s'étend plus distalement que le métacarpien majeur. Cependant, il possède également certaines caractéristiques dérivées ornithurines, telles qu'un métacarpien alular court (environ un sixième de la longueur du métacarpien majeur) complètement fusionné au métacarpien majeur, un grand processus extenseur sur le métacarpien alular, une fusion proximale et distale entre les métacarpiens mineur et majeur, et un espace intermétacarpal situé significativement plus distalement que le métacarpien alular. Cette nouvelle découverte indique qu'une morphologie carpométacarpale similaire à celle observée chez les oiseaux modernes a probablement évolué indépendamment chez les enantiornithes et est apparue plus tôt que chez les Ornithuromorpha, et démontre que l'évolution des caractères chez les oiseaux précoces était plus complexe qu'on ne le croyait auparavant. REMERCIEMENTS Nous remercions l'équipe de terrain de l'Université normale de Shenyang pour avoir collecté et préparé ce spécimen, R. Li pour avoir réalisé ces dessins, P. O'Connor, R. L. Nydam et A. Michel pour leurs corrections, et G. J. Dyke et un relecteur anonyme pour leur relecture et leurs suggestions constructives. Cette étude a été soutenue par la National Natural Science Foundation of China (41172026), la Natural Science Foundation of Liaoning Province, et le Scientific Research Fund of Education Bureau of Liaoning Province (numéro de subvention 2008S214). Le travail de X. Xu a également été soutenu par l'Académie chinoise des sciences. Éditeur responsable : Patrick O'Connor

@article{doi101080027246342012652321,
    author = "Hu, Dongyu et Xu, Xing et Hou, Lianhai et Sullivan, Corwin",
    title = "Un nouvel oiseau enantiornithine du Crétacé inférieur du Liaoning occidental, Chine, et ses implications pour l'évolution précoce des oiseaux",
    year = "2012",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "RÉSUMÉ Des études récentes ont brouillé la distinction entre deux grands groupes d'oiseaux : les Enantiornithes, une importante radiation d'oiseaux précoces du Crétacé, et les Ornithuromorpha, le clade incluant les oiseaux actuels. Ici, nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine du Jiufotang Formation du Crétacé inférieur du Liaoning occidental, Chine, Xiangornis shenmi, gen. et sp. nov., qui réduit davantage encore l'écart morphologique entre les deux groupes. Xiangornis shenmi présente plusieurs caractéristiques enantiornithines, notamment une furcula avec un hypocleidium significativement allongé, un coracoïde avec une marge latérale convexe, et un métacarpien mineur qui s'étend plus distalement que le métacarpien majeur. Cependant, il possède également certaines caractéristiques dérivées ornithurines, telles qu'un métacarpien alular court (environ un sixième de la longueur du métacarpien majeur) complètement fusionné au métacarpien majeur, un grand processus extenseur sur le métacarpien alular, une fusion proximale et distale entre les métacarpiens mineur et majeur, et un espace intermétacarpal situé significativement plus distalement que le métacarpien alular. Cette nouvelle découverte indique qu'une morphologie carpométacarpale similaire à celle observée chez les oiseaux modernes a probablement évolué indépendamment chez les enantiornithes et est apparue plus tôt que chez les Ornithuromorpha, et démontre que l'évolution des caractères chez les oiseaux précoces était plus complexe qu'on ne le croyait auparavant. REMERCIEMENTS Nous remercions l'équipe de terrain de l'Université normale de Shenyang pour avoir collecté et préparé ce spécimen, R. Li pour avoir réalisé ces dessins, P. O'Connor, R. L. Nydam et A. Michel pour leurs corrections, et G. J. Dyke et un relecteur anonyme pour leur relecture et leurs suggestions constructives. Cette étude a été soutenue par la National Natural Science Foundation of China (41172026), la Natural Science Foundation of Liaoning Province, et le Scientific Research Fund of Education Bureau of Liaoning Province (numéro de subvention 2008S214). Le travail de X. Xu a également été soutenu par l'Académie chinoise des sciences. Éditeur responsable : Patrick O'Connor",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.2012.652321",
    doi = "10.1080/02724634.2012.652321",
    openalex = "W2158649413",
    references = "doi101111j10960031200800217x, doi101111j14697580200600534x, doi101111j14697580200800880x, doi101126science1126377, doi101126science29054981955, doi101139e03011, doi1012060003008220023870001tmappo20co2, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi105860choice405235"
}

Nous examinons l'énigmatique Chaoyangia beishanensis, l'un des premiers oiseaux décrits à partir de la formation de Jiufotang, dans le nord-est de la Chine, et le premier à être identifié comme un ornithurine (Aves: Ornithothoraces) et donc un membre du clade qui comprend les oiseaux vivants. Une discussion complète de la validité de ce taxon, qui comprenait autrefois l'holotype de Songlingornis, est fournie, ainsi qu'un diagnostic révisé. La morphologie de Chaoyangia est décrite, y compris une comparaison étendue avec des ornithurines mieux connues et récemment découvertes ainsi qu'avec plusieurs autres groupes d'oiseaux du Mésozoïque (Confuciusornithiformes, Sapeornithiformes, Enantiornithes). Bien que les informations préservées soient limitées, le grand nombre de vertèbres sacrées fusionnées et la présence d'un processus dorsal distal sur l'ischium font partie des caractéristiques soutenant les hypothèses précoces selon lesquelles le seul spécimen connu de Chaoyangia représente un ornithurine. Unique parmi les ornithurines, Chaoyangia possède deux processus dorsaux sur l'ischium, et reste donc un taxon valide. Nous incluons ce taxon dans une analyse cladistique pour tester les hypothèses morphologiques concernant sa position systématique. Bien que les résultats de l'analyse soient hautement résolus et soutiennent le transfert de Chaoyangia et de Zhongjianornis vers Ornithurae, le soutien pour l'arbre dans son ensemble est très faible. Les taxons récemment découverts ont brouillé le fossé morphologique autrefois clair séparant les deux clades ornithothoracines (Ornithurae et Enantiornithes), et donc l'augmentation de la diversité taxonomique a causé une diminution de la stabilité des relations hypothétiques&break;.

@article{doi101080147720192012690455,
    author = "O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Une nouvelle description de Chaoyangia beishanensis (Aves) et une phylogénie complète des oiseaux du Mésozoïque",
    year = "2012",
    journal = "Journal of Systematic Palaeontology",
    abstract = "Nous examinons l'énigmatique Chaoyangia beishanensis, l'un des premiers oiseaux décrits à partir de la formation de Jiufotang, dans le nord-est de la Chine, et le premier à être identifié comme un ornithurine (Aves: Ornithothoraces) et donc un membre du clade qui comprend les oiseaux vivants. Une discussion complète de la validité de ce taxon, qui comprenait autrefois l'holotype de Songlingornis, est fournie, ainsi qu'un diagnostic révisé. La morphologie de Chaoyangia est décrite, y compris une comparaison étendue avec des ornithurines mieux connues et récemment découvertes ainsi qu'avec plusieurs autres groupes d'oiseaux du Mésozoïque (Confuciusornithiformes, Sapeornithiformes, Enantiornithes). Bien que les informations préservées soient limitées, le grand nombre de vertèbres sacrées fusionnées et la présence d'un processus dorsal distal sur l'ischium font partie des caractéristiques soutenant les hypothèses précoces selon lesquelles le seul spécimen connu de Chaoyangia représente un ornithurine. Unique parmi les ornithurines, Chaoyangia possède deux processus dorsaux sur l'ischium, et reste donc un taxon valide. Nous incluons ce taxon dans une analyse cladistique pour tester les hypothèses morphologiques concernant sa position systématique. Bien que les résultats de l'analyse soient hautement résolus et soutiennent le transfert de Chaoyangia et de Zhongjianornis vers Ornithurae, le soutien pour l'arbre dans son ensemble est très faible. Les taxons récemment découverts ont brouillé le fossé morphologique autrefois clair séparant les deux clades ornithothoracines (Ornithurae et Enantiornithes), et donc l'augmentation de la diversité taxonomique a causé une diminution de la stabilité des relations hypothétiques\&break;.",
    url = "https://doi.org/10.1080/14772019.2012.690455",
    doi = "10.1080/14772019.2012.690455",
    openalex = "W2041801879",
    references = "doi101126science1126377"
}

De nombreuses analyses paléobiologiques ont conclu que les oiseaux modernes (Neornithes) n'ont pas rayonné avant le Maastrichtien, tandis que les études d'horloges moléculaires ont plaidé pour une origine beaucoup plus ancienne. Ici, nous évaluons la qualité du registre fossile des espèces aviaires du Mésozoïque, en utilisant un indicateur de complétude des caractères récemment proposé qui calcule le pourcentage de caractères phylogénétiques qui peuvent être notés pour chaque taxon. Les estimations de la qualité du registre fossile sont tracées en fonction du temps géologique et comparées aux estimations de la diversité au niveau des espèces, du niveau de la mer et de l'environnement de dépôt. Les contrôles géographiques sur le registre fossile aviaire sont étudiés en comparant les scores de complétude des espèces dans différentes régions continentales et classes de latitude. La qualité du registre fossile aviaire varie considérablement avec des pics durant le Tithonien-début Berriasien, l'Aptien et le Coniacien-Santonien, et des creux durant l'Albien-Turonien et le Maastrichtien. L'indicateur de complétude corrèle plus fortement avec une courbe de diversité résiduelle « corrigée par l'échantillonnage » des espèces aviaires qu'avec la courbe de diversité taxique brute, suggérant que l'abondance et la diversité des oiseaux pourraient influencer la probabilité que des spécimens de haute qualité soient préservés. Il n'y a aucune corrélation entre la complétude aviaire et le niveau de la mer, le nombre de localités fluviolacustres ou un indicateur de complétude des caractères récemment construit pour les dinosaures sauropodomorphes. Les comparaisons entre la complétude des oiseaux du Mésozoïque et des sauropodomorphes suggèrent que les squelettes vertébrés petits et délicats sont plus facilement détruits par les processus taphonomiques, mais plus facilement préservés entiers. Les dépôts de Lagerstätten pourraient donc avoir un impact plus fort sur les reconstructions de la diversité des organismes plus petits par rapport aux formes plus robustes. La qualité relativement faible du registre fossile aviaire au Crétacé supérieur combinée à un échantillonnage régional très discontinu signifie qu'il est possible que les lignées néornithines aient été présentes tout au long de cet intervalle mais n'ont pas encore été échantillonnées ou sont difficiles à identifier en raison de la nature fragmentaire des spécimens.

@article{doi101371journalpone0039056,
    author = "Brocklehurst, Neil et Upchurch, Paul et Mannion, Philip D. et O’Connor, Jingmai K.",
    title = "La complétude du registre fossile des oiseaux du Mésozoïque : implications pour l'évolution précoce des oiseaux",
    year = "2012",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "De nombreuses analyses paléobiologiques ont conclu que les oiseaux modernes (Neornithes) n'ont pas rayonné avant le Maastrichtien, tandis que les études d'horloges moléculaires ont plaidé pour une origine beaucoup plus ancienne. Ici, nous évaluons la qualité du registre fossile des espèces aviaires du Mésozoïque, en utilisant un indicateur de complétude des caractères récemment proposé qui calcule le pourcentage de caractères phylogénétiques qui peuvent être notés pour chaque taxon. Les estimations de la qualité du registre fossile sont tracées en fonction du temps géologique et comparées aux estimations de la diversité au niveau des espèces, du niveau de la mer et de l'environnement de dépôt. Les contrôles géographiques sur le registre fossile aviaire sont étudiés en comparant les scores de complétude des espèces dans différentes régions continentales et classes de latitude. La qualité du registre fossile aviaire varie considérablement avec des pics durant le Tithonien-début Berriasien, l'Aptien et le Coniacien-Santonien, et des creux durant l'Albien-Turonien et le Maastrichtien. L'indicateur de complétude corrèle plus fortement avec une courbe de diversité résiduelle « corrigée par l'échantillonnage » des espèces aviaires qu'avec la courbe de diversité taxique brute, suggérant que l'abondance et la diversité des oiseaux pourraient influencer la probabilité que des spécimens de haute qualité soient préservés. Il n'y a aucune corrélation entre la complétude aviaire et le niveau de la mer, le nombre de localités fluviolacustres ou un indicateur de complétude des caractères récemment construit pour les dinosaures sauropodomorphes. Les comparaisons entre la complétude des oiseaux du Mésozoïque et des sauropodomorphes suggèrent que les squelettes vertébrés petits et délicats sont plus facilement détruits par les processus taphonomiques, mais plus facilement préservés entiers. Les dépôts de Lagerstätten pourraient donc avoir un impact plus fort sur les reconstructions de la diversité des organismes plus petits par rapport aux formes plus robustes. La qualité relativement faible du registre fossile aviaire au Crétacé supérieur combinée à un échantillonnage régional très discontinu signifie qu'il est possible que les lignées néornithines aient été présentes tout au long de cet intervalle mais n'ont pas encore été échantillonnées ou sont difficiles à identifier en raison de la nature fragmentaire des spécimens.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039056",
    doi = "10.1371/journal.pone.0039056",
    openalex = "W2096415445",
    references = "doi10108008912969009386535, doi101111j14636409200600234x, doi101111j14697580200800880x"
}

@article{doi101016jcretres201304001,
    author = "Novas, Fernando E. et Agnolín, Federico L. et Ezcurra, Martín D. et Porfiri, Juan D. et Canale, Juan I.",
    title = "Évolution des dinosaures carnivores au Crétacé : Les preuves de Patagonia",
    year = "2013",
    journal = "Cretaceous Research",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cretres.2013.04.001",
    doi = "10.1016/j.cretres.2013.04.001",
    openalex = "W2009733453",
    references = "crossref1976allosaurus, deklerk2000a, doi101007s001140090614x, doi101016jjafrearsci201205005, doi101016jpgeola201205008, doi101016s1631068303000022, doi101017s1477201907002246, doi101029jb095ib11p17475, doi101038277560a0, doi10103835047056, doi101038362623a0, doi101038385247a0, doi101038nature07447, doi101038nature08322, doi101073pnas813801, doi101080027246342010520779, doi10108014772011003594870, doi101080147720192011630927, doi101098rspb20042692, doi101111j10963642200900569x, doi101111j10963642200900591x, doi101111j136531211990tb00103x, doi101126science2725264986, doi101126science28454232137, doi101371journalpone0003303, doi101371journalpone0006190, doi101371journalpone0017932, doi101371journalpone0037122, doi101590s000137652011000100008, doi10167102724634200727127tpasom20co2, doi1023073889334, doi103897zookeys28325, doi105281zenodo16171435, doi105281zenodo16246150, doi105281zenodo16492064, doi105281zenodo16692311, doi105281zenodo4664674, doi105860choice434677, doi107312kiel11918, leanza2004cretaceous, openalexw1025856234, openalexw1539913220, openalexw2603335639, openalexw3214948090"
}

@article{doi1038nature11985,
    author = "Zheng, Xiaoting et O’Connor, Jingmai K. et Huchzermeyer, F. W. et Wang, Xiaoli et Wang, Yan et Wang, Min et Zhou, Zhonghe",
    title = "Préservation des follicules ovariens révèle l'évolution précoce du comportement reproducteur aviaire",
    year = "2013",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature11985",
    doi = "10.1038/nature11985",
    openalex = "W1974421300",
    references = "doi101073pnas1112694108"
}

@article{doi101038nature12059,
    author = "Allen, Vivian et Bates, Karl T. et Li, Zhiheng et Hutchinson, John R.",
    title = "Relier l'évolution de la forme corporelle et de la biomécanique locomotrice chez les archosaures de la lignée avienne",
    year = "2013",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature12059",
    doi = "10.1038/nature12059",
    openalex = "W2095233827",
    references = "doi101002jmor1052090107, doi101007s0011400804883, doi1016660094837320000260734aaateo20co2"
}

RÉSUMÉ Nous décrivons l'anatomie et l'histologie osseuse d'un spécimen d'enantiornithe du groupe de Jehol du Crétacé inférieur du nord-est de la Chine. CNUVB-0903 est plus grand que la plupart des oiseaux enantiornithes du Crétacé inférieur et diffère également de tous les autres taxons nommés. Par conséquent, nous érigons la nouvelle espèce Zhouornis hani pour ce nouveau spécimen. CNUVB-0903 préserve un ensemble de nouvelles morphologies pour le clade. Notables sont celles du crâne et de la région occipitale du crâne, qui étaient auparavant mal connues chez les enantiornithes. La morphologie et la position des grands processus basiptérygoïdes et de la dépression bien développée du basisphénoïde — comparable en morphologie à celles des dinosaures non aviens — mettent en évidence la conservation évolutive du crâne des enantiornithes. La caractérisation histologique de CNUVB-0903 indique qu'il ne s'agissait pas encore d'un individu adulte au moment de la mort. Cela, combiné à la taille relativement grande du squelette, soutient les preuves antérieures indiquant que, tôt dans leur histoire, les enantiornithes étaient capables d'atteindre des tailles relativement grandes.

@article{doi101080027246342013762708,
    author = "Zhang, Zihui et Chiappe, Luis M. et Han, Gang et Chinsamy, Anusuya",
    title = "Un grand oiseau du Crétacé inférieur de Chine : nouvelles informations sur le crâne des enantiornithes",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "RÉSUMÉ Nous décrivons l'anatomie et l'histologie osseuse d'un spécimen d'enantiornithe du groupe de Jehol du Crétacé inférieur du nord-est de la Chine. CNUVB-0903 est plus grand que la plupart des oiseaux enantiornithes du Crétacé inférieur et diffère également de tous les autres taxons nommés. Par conséquent, nous érigons la nouvelle espèce Zhouornis hani pour ce nouveau spécimen. CNUVB-0903 préserve un ensemble de nouvelles morphologies pour le clade. Notables sont celles du crâne et de la région occipitale du crâne, qui étaient auparavant mal connues chez les enantiornithes. La morphologie et la position des grands processus basiptérygoïdes et de la dépression bien développée du basisphénoïde — comparable en morphologie à celles des dinosaures non aviens — mettent en évidence la conservation évolutive du crâne des enantiornithes. La caractérisation histologique de CNUVB-0903 indique qu'il ne s'agissait pas encore d'un individu adulte au moment de la mort. Cela, combiné à la taille relativement grande du squelette, soutient les preuves antérieures indiquant que, tôt dans leur histoire, les enantiornithes étaient capables d'atteindre des tailles relativement grandes.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.2013.762708",
    doi = "10.1080/02724634.2013.762708",
    openalex = "W2004145470",
    references = "doi101002ar20983, doi10108002724634199710011027, doi101080027246342012652321, doi101126science11282807, doi101126science29054981955, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi103929ethzb000667478, doi105479si03629236110i, doi105962bhltitle156765, doi105962bhltitle542, openalexw2607033038"
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Les oiseaux sont le groupe de tétrapodes vivants le plus diversifié et constituent un modèle de radiation adaptative à grande échelle. Les études néontologiques suggèrent une radiation au sein du groupe couronne avien, bien après l'origine du vol. Cependant, les modèles d'évolution des oiseaux sur de longues périodes restent obscurs car seules des données fossiles limitées ont été prises en compte. Nous analysons la cladogenèse et l'évolution des membres sur l'ensemble de l'arbre des théropodes du Mésozoïque, documentant la transition dinosaure-oiseau et les origines immédiates du vol motorisé. Les oiseaux du Mésozoïque ont hérité de contraintes sur l'évolution des membres antérieurs de leurs ancêtres non volants, et les taux de diversification des espèces n'ont pas accéléré chez les premiers taxons volants. Cependant, les oiseaux à queue courte du Crétacé inférieur présentent à la fois une libération phénotypique des membres postérieurs et des taux de diversification accrus, inégalés en magnitude à aucun autre moment au cours des 155 premiers Myr d'évolution des théropodes. Ainsi, une radiation adaptative du Crétacé des oiseaux du groupe tige a été rendue possible par la restructuration du module locomoteur terrestre, qui représente une innovation clé. Nos résultats suggèrent deux phases de radiation chez les Avialae : avec la diversification du Crétacé effacée par les extinctions des oiseaux du groupe tige à la limite Crétacé-Paléogène, et la diversification ultérieure du groupe couronne. Nos résultats illustrent l'importance des données fossiles pour comprendre les processus macroévolutifs générant la biodiversité moderne.

@article{doi101098rspb20131780,
    author = "Benson, Roger et Choiniere, Jonah N.",
    title = "Les taux d'évolution des membres des dinosaures fournissent des preuves d'une radiation exceptionnelle chez les oiseaux du Mésozoïque",
    year = "2013",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "Les oiseaux sont le groupe de tétrapodes vivants le plus diversifié et constituent un modèle de radiation adaptative à grande échelle. Les études néontologiques suggèrent une radiation au sein du groupe couronne avien, bien après l'origine du vol. Cependant, les modèles d'évolution des oiseaux sur de longues périodes restent obscurs car seules des données fossiles limitées ont été prises en compte. Nous analysons la cladogenèse et l'évolution des membres sur l'ensemble de l'arbre des théropodes du Mésozoïque, documentant la transition dinosaure-oiseau et les origines immédiates du vol motorisé. Les oiseaux du Mésozoïque ont hérité de contraintes sur l'évolution des membres antérieurs de leurs ancêtres non volants, et les taux de diversification des espèces n'ont pas accéléré chez les premiers taxons volants. Cependant, les oiseaux à queue courte du Crétacé inférieur présentent à la fois une libération phénotypique des membres postérieurs et des taux de diversification accrus, inégalés en magnitude à aucun autre moment au cours des 155 premiers Myr d'évolution des théropodes. Ainsi, une radiation adaptative du Crétacé des oiseaux du groupe tige a été rendue possible par la restructuration du module locomoteur terrestre, qui représente une innovation clé. Nos résultats suggèrent deux phases de radiation chez les Avialae : avec la diversification du Crétacé effacée par les extinctions des oiseaux du groupe tige à la limite Crétacé-Paléogène, et la diversification ultérieure du groupe couronne. Nos résultats illustrent l'importance des données fossiles pour comprendre les processus macroévolutifs générant la biodiversité moderne.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2013.1780",
    doi = "10.1098/rspb.2013.1780",
    openalex = "W2148541760",
    references = "doi101007s1143001040949, doi101080147720192010526639"
}

L'origine des oiseaux et du vol motorisé est une transition évolutive majeure classique. Les recherches sur leur origine se concentrent souvent sur l'évolution de l'aile, avec des tendances d'allongement des membres antérieurs retracées à travers de nombreux dinosaures maniraptoriens non aviens. Nous présentons des preuves que l'allongement relatif des membres antérieurs au sein des ancêtres aviens est principalement dû à l'allométrie et est plutôt entraîné par une réduction de la taille du corps. Une fois la taille du corps prise en compte, il n'y a pas de tendance à l'augmentation de la longueur des membres antérieurs jusqu'à l'origine des oiseaux. Nous rapportons que les premiers oiseaux et les thérapsides non aviens ont des relations d'échelle significativement différentes au sein du squelette des membres antérieurs et postérieurs. L'échelle allométrique ancestrale des membres antérieurs et postérieurs par rapport à la taille du corps est rapidement découplée à l'origine des oiseaux, lorsque les ailes s'allongent significativement, en évoluant une relation allométrique positive avec la taille du corps à partir d'un motif allométrique négatif ancestral, et lorsque les jambes raccourcissent significativement en maintenant une relation similaire, quasi isométrique, mais avec une ordonnée à l'origine réduite. Ces résultats ont des implications pour l'évolution du vol motorisé et la diversification précoce des oiseaux. Ils suggèrent que leurs longueurs de membres ont d'abord dû être dissociées de l'échelle générale de la taille du corps avant de s'étendre à la large gamme de formes et de tailles de membres antérieurs et postérieurs présents chez les oiseaux d'aujourd'hui.

@article{doi101111evo12150,
    author = "Dececchi, T. Alexander et Larsson, Hans C. E.",
    title = "DISSOCIATION DE LA TAILLE DU CORPS ET DES MEMBRES À L'ORIGINE DES OISEAUX : DÉCOUPLAGE DES CONTRAINTES ALLOMÉTRIQUES AU COURS D'UNE TRANSITION MACROÉVOLUTIVE",
    year = "2013",
    journal = "Évolution",
    abstract = "L'origine des oiseaux et du vol motorisé est une transition évolutive majeure classique. Les recherches sur leur origine se concentrent souvent sur l'évolution de l'aile, avec des tendances d'allongement des membres antérieurs retracées à travers de nombreux dinosaures maniraptoriens non aviens. Nous présentons des preuves que l'allongement relatif des membres antérieurs au sein des ancêtres aviens est principalement dû à l'allométrie et est plutôt entraîné par une réduction de la taille du corps. Une fois la taille du corps prise en compte, il n'y a pas de tendance à l'augmentation de la longueur des membres antérieurs jusqu'à l'origine des oiseaux. Nous rapportons que les premiers oiseaux et les thérapsides non aviens ont des relations d'échelle significativement différentes au sein du squelette des membres antérieurs et postérieurs. L'échelle allométrique ancestrale des membres antérieurs et postérieurs par rapport à la taille du corps est rapidement découplée à l'origine des oiseaux, lorsque les ailes s'allongent significativement, en évoluant une relation allométrique positive avec la taille du corps à partir d'un motif allométrique négatif ancestral, et lorsque les jambes raccourcissent significativement en maintenant une relation similaire, quasi isométrique, mais avec une ordonnée à l'origine réduite. Ces résultats ont des implications pour l'évolution du vol motorisé et la diversification précoce des oiseaux. Ils suggèrent que leurs longueurs de membres ont d'abord dû être dissociées de l'échelle générale de la taille du corps avant de s'étendre à la large gamme de formes et de tailles de membres antérieurs et postérieurs présents chez les oiseaux d'aujourd'hui.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12150",
    doi = "10.1111/evo.12150",
    openalex = "W1805585697",
    references = "doi101007s0011400804883, doi101016jearscirev201206007, doi101017cbo9781139167826, doi101038nature08322, doi101038nature10288, doi101111j14209101201102427x, doi101126science1144066, doi101242jeb01745, doi101371journalpbio0050022, doi101371journalpone0028964, doi101590s000137652011000100008, doi102307jctvqc6gzx, doi104159harvard9780674184404, doi104159harvard9780674184404c5, openalexw2611511275"
}

Oiseaux à quatre ailes ? Récemment, des dinosaures non aviens dotés de plumes sur leurs membres antérieurs et postérieurs ont été décrits. Zheng et al. (p. 1309) décrivent onze fossiles aviens basaux présentant des preuves claires de membres postérieurs plumés. Ensemble, ces fossiles montrent que les premiers aviens possédaient quatre ailes plutôt que deux. Une réduction progressive de la plumure des membres postérieurs a finalement abouti à la condition à deux ailes observée chez les oiseaux actuels. Une telle transition a peut-être accompagné un découplage locomoteur des membres antérieurs et postérieurs, ce qui a facilité le développement des membres antérieurs en ailes capables de vol.

@article{doi101126science1228753,
    author = "Zheng, Xiaoting et Zhou, Zhonghe et Wang, Xiaoli et Zhang, Fucheng et Zhang, Xiaomei et Wang, Yan et Wei, Guangjin et Wang, Shuo et Xu, Xing",
    title = "Ailes postérieures chez les oiseaux basaux et l'évolution des plumes des pattes",
    year = "2013",
    journal = "Science",
    abstract = "Oiseaux à quatre ailes ? Récemment, des dinosaures non aviens dotés de plumes sur leurs membres antérieurs et postérieurs ont été décrits. Zheng et al. (p. 1309) décrivent onze fossiles aviens basaux présentant des preuves claires de membres postérieurs plumés. Ensemble, ces fossiles montrent que les premiers aviens possédaient quatre ailes plutôt que deux. Une réduction progressive de la plumure des membres postérieurs a finalement abouti à la condition à deux ailes observée chez les oiseaux actuels. Une telle transition a peut-être accompagné un découplage locomoteur des membres antérieurs et postérieurs, ce qui a facilité le développement des membres antérieurs en ailes capables de vol.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1228753",
    doi = "10.1126/science.1228753",
    openalex = "W1964562470",
    references = "doi10103820670, doi10103831635, doi101038nature01342, doi101038nature01420, doi101038nature08322, doi101038nature10288, doi101038nature10906, doi101073pnas0507106102, doi101111j14697580200800880x, doi101111j155856461996tb04496x, doi101126science1126377, doi101126science1144066, doi101126science28454232137, doi101371journalpone0036790, doi101666040141, openalexw2607033038"
}

Les relations évolutives entre les oiseaux de Neoaves, le clade comprenant la vaste majorité de la diversité aviaire, ont posé problème aux systématiciens en raison de la radiation ancienne et rapide de nombreuses lignées. Nous avons appliqué une nouvelle approche phylogénomique pour résoudre les relations au sein de Neoaves en utilisant l'enrichissement ciblé (capture de séquence) et le séquençage à haut débit d'éléments ultraconservés (UCE) dans les génomes aviaires. Nous avons collecté des données de séquence à partir de loci UCE pour 32 membres de Neoaves et un groupe externe (poulet) et analysé des ensembles de données qui différaient par leur quantité de données manquantes. Un alignement de 1 541 loci autorisant les données manquantes était à 87 % complet et a abouti à une phylogénie hautement résolue avec un large accord entre les arbres bayésiens et de vraisemblance maximale (ML). Bien que les résultats de la matrice à 100 % complète de 416 loci UCE soient similaires, les arbres bayésiens et ML ont différé dans une plus grande mesure dans cette analyse, suggérant que le passage de 416 à 1 541 loci a conduit à une stabilité et une résolution accrues de l'arbre. Les résultats nouveaux de notre étude incluent des relations surprenamment proches entre des familles d'oiseaux phénotypiquement divergentes, telles que les tropiques (Phaethontidae) et le sunbittern (Eurypygidae), ainsi qu'entre les bustards (Otididae) et les turacos (Musophagidae). Cette phylogénie renforce le soutien pour les clades monophylétiques d'oiseaux aquatiques et terrestres et soutient également fortement des résultats controversés d'études précédentes, notamment la relation de sœur entre les passereaux et les perroquets et la non-monophylie des oiseaux de proie dans les familles des faucons et des faucons. Bien que des défis significatifs subsistent pour résoudre pleinement certaines des relations profondes au sein de Neoaves, en particulier parmi les lignées en dehors des oiseaux aquatiques et terrestres, cette étude suggère que des données accrues aboutiront à une phylogénie aviaire de plus en plus résolue.

@article{doi101371journalpone0054848,
    author = "McCormack, John E. et Harvey, Michael et Faircloth, Brant C. et Crawford, Nicholas G. et Glenn, Travis C. et Brumfield, Robb T.",
    title = "Une phylogénie des oiseaux basée sur plus de 1 500 loci collectés par enrichissement ciblé et séquençage à haut débit",
    year = "2013",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Les relations évolutives entre les oiseaux de Neoaves, le clade comprenant la vaste majorité de la diversité aviaire, ont posé problème aux systématiciens en raison de la radiation ancienne et rapide de nombreuses lignées. Nous avons appliqué une nouvelle approche phylogénomique pour résoudre les relations au sein de Neoaves en utilisant l'enrichissement ciblé (capture de séquence) et le séquençage à haut débit d'éléments ultraconservés (UCE) dans les génomes aviaires. Nous avons collecté des données de séquence à partir de loci UCE pour 32 membres de Neoaves et un groupe externe (poulet) et analysé des ensembles de données qui différaient par leur quantité de données manquantes. Un alignement de 1 541 loci autorisant les données manquantes était à 87 % complet et a abouti à une phylogénie hautement résolue avec un large accord entre les arbres bayésiens et de vraisemblance maximale (ML). Bien que les résultats de la matrice à 100 % complète de 416 loci UCE soient similaires, les arbres bayésiens et ML ont différé dans une plus grande mesure dans cette analyse, suggérant que le passage de 416 à 1 541 loci a conduit à une stabilité et une résolution accrues de l'arbre. Les résultats nouveaux de notre étude incluent des relations surprenamment proches entre des familles d'oiseaux phénotypiquement divergentes, telles que les tropiques (Phaethontidae) et le sunbittern (Eurypygidae), ainsi qu'entre les bustards (Otididae) et les turacos (Musophagidae). Cette phylogénie renforce le soutien pour les clades monophylétiques d'oiseaux aquatiques et terrestres et soutient également fortement des résultats controversés d'études précédentes, notamment la relation de sœur entre les passereaux et les perroquets et la non-monophylie des oiseaux de proie dans les familles des faucons et des faucons. Bien que des défis significatifs subsistent pour résoudre pleinement certaines des relations profondes au sein de Neoaves, en particulier parmi les lignées en dehors des oiseaux aquatiques et terrestres, cette étude suggère que des données accrues aboutiront à une phylogénie aviaire de plus en plus résolue.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054848",
    doi = "10.1371/journal.pone.0054848",
    openalex = "W1978199447",
    references = "doi101111j10963642200600293x"
}

@article{doi101016jcub201408034,
    author = "Brusatte, Stephen L. et Lloyd, Graeme T. et Wang, Steve C. et Norell, Mark A.",
    title = "Assemblage progressif du plan corporel aviaire culminant dans des taux rapides d'évolution à travers la transition dinosaure-oiseau",
    year = "2014",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2014.08.034",
    doi = "10.1016/j.cub.2014.08.034",
    openalex = "W2000971221",
    references = "crossref1976allosaurus, doi10100703064746897, doi101007s001140090614x, doi101016jcretres201103005, doi101016jearscirev201004001, doi101016jjafrearsci201205005, doi101017s0006323197005100, doi101017s009483730001263x, doi10103832884, doi10103835086558, doi101038378774a0, doi101038nature02855, doi101038nature03996, doi101038nature04511, doi101038nature07447, doi101038nature10288, doi101038nature10906, doi101038nature12168, doi101038ncomms1815, doi101073pnas1006970107, doi101080027246342010520779, doi101093aesa383396, doi101111evo12150, doi101111j10960031200700161x, doi101111j10960031200800217x, doi101111j10963642200900571x, doi101111j14209101201002039x, doi101111j1469185x1997tb00024x, doi101111j14697580200600534x, doi101111j15585646201001025x, doi101111j2041210x201100169x, doi101111j2041210x201200223x, doi101126science1144066, doi101126science1161833, doi101126science1193304, doi101126science1252243, doi101144sp31516, doi10120600030082200635451andtfu20co2, doi1012067481, doi101371journalpbio1001853, doi101371journalpone0031838, doi1022179revmacn14372, doi1022179revmacn8325, doi105281zenodo16171435, doi105281zenodo16651680, openalexw2183707334"
}

Reconstituer l'origine et l'évolution des plantes terrestres et de leurs algues apparentées est un problème fondamental en phylogénie des plantes, et est essentiel pour comprendre comment des adaptations critiques sont apparues, notamment l'embryon, le tissu vasculaire, les graines et les fleurs. Malgré les progrès en systématique moléculaire, certaines hypothèses de relations restent faiblement résolues. Inférer des phylogénies profondes avec des épisodes de diversification rapide peut être problématique ; cependant, les données à l'échelle du génome devraient augmenter significativement le nombre de caractères informatifs pour les analyses. Les reconstructions phylogénomiques récentes centrées sur les divergences majeures des plantes ont abouti à des résultats prometteurs mais incohérents. Une limitation est l'échantillonnage taxonomique sparse, probablement résultant de la difficulté et du coût de la génération de données. Pour répondre à cette limitation, des données de transcriptome pour 92 taxons de streptophytes ont été générées et analysées conjointement avec 11 séquences de génomes de plantes publiées. Des reconstructions phylogénétiques ont été menées en utilisant jusqu'à 852 gènes nucléaires et 1 701 170 sites alignés. Soixante-neuf analyses ont été effectuées pour tester la robustesse des inférences phylogénétiques aux permutations de la matrice de données ou aux méthodes phylogénétiques, y compris les approches supermatrice, suparbre et basées sur la coalescence, les méthodes de vraisemblance maximale et bayésiennes, les analyses partitionnées et non partitionnées, et les alignements d'acides aminés versus ADN. Parmi d'autres résultats, nous trouvons un soutien robuste pour une relation de groupe sœur entre les plantes terrestres et un groupe d'algues vertes streptophytes, les Zygnematophyceae. Un soutien fort et robuste pour un clade comprenant les hépatiques et les mousses est incohérent avec une vue largement acceptée de l'évolution précoce des plantes terrestres, et suggère que les hypothèses phylogénétiques utilisées pour comprendre l'évolution des traits fondamentaux des plantes devraient être réévaluées.

@article{doi101073pnas1323926111,
    author = "Wickett, Norman J. et Mirarab, Siavash et Nguyen, Nam et Warnow, Tandy et Carpenter, Eric et Matasci, Naim et Ayyampalayam, Saravanaraj et Barker, Michael S. et Burleigh, J. Gordon et Gitzendanner, Matthew A. et Ruhfel, Brad R. et Wafula, Eric et Der, Joshua P. et Graham, Sean W. et Mathews, Sarah et Melkonian, Michael et Soltis, Pamela S. et Soltis, Pamela S. et Miles, Nicholas W. et Rothfels, Carl J. et Pokorny, Lisa et Shaw, A. Jonathan et DeGironimo, Lisa et Stevenson, Dennis et Surek, Barbara et Villarreal, Juan Carlos et Roure, Béatrice et Philippe, Hervé et dePamphilis, Claude W. et Chen, Tao et Deyholos, Michael K. et Baucom, Regina S. et Kutchan, Toni M. et Augustin, Megan M. et Wang, Jun et Zhang, Yong et Tian, Zhijian et Yan, Zhixiang et Wu, Xiaolei et Sun, Xiao et Wong, Gane Ka‐Shu et Leebens-Mack, James",
    title = "Analyse phylotranscriptomique de l'origine et de la diversification précoce des plantes terrestres",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Reconstituer l'origine et l'évolution des plantes terrestres et de leurs algues apparentées est un problème fondamental en phylogénie des plantes, et est essentiel pour comprendre comment des adaptations critiques sont apparues, notamment l'embryon, le tissu vasculaire, les graines et les fleurs. Malgré les progrès en systématique moléculaire, certaines hypothèses de relations restent faiblement résolues. Inférer des phylogénies profondes avec des épisodes de diversification rapide peut être problématique ; cependant, les données à l'échelle du génome devraient augmenter significativement le nombre de caractères informatifs pour les analyses. Les reconstructions phylogénomiques récentes centrées sur les divergences majeures des plantes ont abouti à des résultats prometteurs mais incohérents. Une limitation est l'échantillonnage taxonomique sparse, probablement résultant de la difficulté et du coût de la génération de données. Pour répondre à cette limitation, des données de transcriptome pour 92 taxons de streptophytes ont été générées et analysées conjointement avec 11 séquences de génomes de plantes publiées. Des reconstructions phylogénétiques ont été menées en utilisant jusqu'à 852 gènes nucléaires et 1 701 170 sites alignés. Soixante-neuf analyses ont été effectuées pour tester la robustesse des inférences phylogénétiques aux permutations de la matrice de données ou aux méthodes phylogénétiques, y compris les approches supermatrice, suparbre et basées sur la coalescence, les méthodes de vraisemblance maximale et bayésiennes, les analyses partitionnées et non partitionnées, et les alignements d'acides aminés versus ADN. Parmi d'autres résultats, nous trouvons un soutien robuste pour une relation de groupe sœur entre les plantes terrestres et un groupe d'algues vertes streptophytes, les Zygnematophyceae. Un soutien fort et robuste pour un clade comprenant les hépatiques et les mousses est incohérent avec une vue largement acceptée de l'évolution précoce des plantes terrestres, et suggère que les hypothèses phylogénétiques utilisées pour comprendre l'évolution des traits fondamentaux des plantes devraient être réévaluées.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1323926111",
    doi = "10.1073/pnas.1323926111",
    openalex = "W2013277649",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101016s0022283605803602, doi10103837918, doi101046j109583392003t01100158x, doi101093bioinformatics83275, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093sysbio463523, doi101093sysbiosyt022, doi101111boj12385, doi101111j10958339200900996x, doi101111j10960031200800217x, doi1011861471214811104, doi101371journalpcbi1002195, doi1023072346830, openalexw3148514506"
}

Nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Fortunguavis xiaotaizicus, gen. et sp. nov, provenant des dépôts lacustres du Crétacé inférieur de la formation de Jiufotang dans le nord-est de la Chine. Le nouveau taxon possède une furcula fortement arquée dorsoventralement, indiquant que les enantiornithines ont évolué des morphologies de furcula en parallèle avec les ornithuromorphes. Le nouveau spécimen présente des membres très robustes par rapport aux autres enantiornithines et une morphologie du pied unique avec le métatarsien II beaucoup plus court que le métatarsien IV, des doigts pédiaux robustes et des ongles pédiaux fortement recourbés. Bien que les ongles recourbés caractérisent les Enantiornithes, la courbure extrême présente chez Fortunguavis suggère une spécialisation scansoriale chez cette espèce. Ces caractéristiques laissent entrevoir une écologie unique pour ce taxon et augmentent davantage la diversité connue des plans corporels chez les enantiornithines du Crétacé inférieur. DONNÉES COMPLÉMENTAIRES—Des matériaux supplémentaires sont disponibles gratuitement pour cet article à http://www.tandfonline.com/UJVP.

@article{doi101080027246342013812101,
    author = "Wang, Min et O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Un nouvel oiseau enantiornithine robuste du Crétacé inférieur de la Chine avec des adaptations scansoriales",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "Nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Fortunguavis xiaotaizicus, gen. et sp. nov, provenant des dépôts lacustres du Crétacé inférieur de la formation de Jiufotang dans le nord-est de la Chine. Le nouveau taxon possède une furcula fortement arquée dorsoventralement, indiquant que les enantiornithines ont évolué des morphologies de furcula en parallèle avec les ornithuromorphes. Le nouveau spécimen présente des membres très robustes par rapport aux autres enantiornithines et une morphologie du pied unique avec le métatarsien II beaucoup plus court que le métatarsien IV, des doigts pédiaux robustes et des ongles pédiaux fortement recourbés. Bien que les ongles recourbés caractérisent les Enantiornithes, la courbure extrême présente chez Fortunguavis suggère une spécialisation scansoriale chez cette espèce. Ces caractéristiques laissent entrevoir une écologie unique pour ce taxon et augmentent davantage la diversité connue des plans corporels chez les enantiornithines du Crétacé inférieur. DONNÉES COMPLÉMENTAIRES—Des matériaux supplémentaires sont disponibles gratuitement pour cet article à http://www.tandfonline.com/UJVP.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.2013.812101",
    doi = "10.1080/02724634.2013.812101",
    openalex = "W2082457326",
    references = "doi101080027246342013794814"
}

Résumé L'étude de la biote terrestre de Jehol du Crétacé inférieur, qui offre une fenêtre rare pour la reconstruction d'un écosystème terrestre du Crétacé inférieur, est revue avec un accent sur certains des derniers progrès. Une nouvelle définition de la biote, basée sur la paléoécologie et la taphonomie, est acceptée. Bien que les fossiles de Jehol soient principalement conservés dans deux types de roches sédimentaires, il existe divers types de conservation avec un mécanisme complexe qui reste à comprendre. Les nouvelles découvertes de taxons significatifs de la biote de Jehol, avec une introduction actualisée de sa diversité, confirment que la biote de Jehol représente l'une des biotes les plus diversifiées du Mésozoïque. L'importance évolutive des grands groupes biologiques (par exemple, les dinosaures, les oiseaux, les mammifères, les ptérosaures, les insectes et les plantes) est discutée principalement à la lumière des découvertes récentes, et certains des aspects les plus remarquables de la biote sont mis en évidence. Le contexte géologique, paléogéographique et paléo-environnemental global et local de la biote de Jehol a contribué à la composition unique, l'évolution et la conservation de la biote, démontrant des échanges fauniques répandus entre l'Asie et d'autres continents causés par la présence de la masse continentale Eurasiatique–américaine du Nord et son lien avec l'Amérique du Sud, et confirmant le nord-est de la Chine comme centre d'origine et de diversification pour une variété de groupes biologiques du Crétacé. Bien que des progrès aient été réalisés sur la reconstruction de la paléotempérature au moment de la biote de Jehol, beaucoup plus de travail est nécessaire pour confirmer un lien possible entre la remarquable diversité de la biote et les intervalles froids du Crétacé inférieur. Enfin, des directions futures pour l'étude de la biote de Jehol sont proposées qui mettent en évidence le grand potentiel d'études plus complètes et multidisciplinaires pour approfondir notre compréhension des implications biologiques et géologiques du Lagerstätte de Jehol.

@article{doi101093nsrnwu055,
    author = "Zhou, Zhonghe",
    title = "The Jehol Biota, an Early Cretaceous terrestrial Lagerstätte: new discoveries and implications",
    year = "2014",
    journal = "National Science Review",
    abstract = "Résumé L'étude de la biote terrestre de Jehol du Crétacé inférieur, qui offre une fenêtre rare pour la reconstruction d'un écosystème terrestre du Crétacé inférieur, est revue avec un accent sur certains des derniers progrès. Une nouvelle définition de la biote, basée sur la paléoécologie et la taphonomie, est acceptée. Bien que les fossiles de Jehol soient principalement conservés dans deux types de roches sédimentaires, il existe divers types de conservation avec un mécanisme complexe qui reste à comprendre. Les nouvelles découvertes de taxons significatifs de la biote de Jehol, avec une introduction actualisée de sa diversité, confirment que la biote de Jehol représente l'une des biotes les plus diversifiées du Mésozoïque. L'importance évolutive des grands groupes biologiques (par exemple, les dinosaures, les oiseaux, les mammifères, les ptérosaures, les insectes et les plantes) est discutée principalement à la lumière des découvertes récentes, et certains des aspects les plus remarquables de la biote sont mis en évidence. Le contexte géologique, paléogéographique et paléo-environnemental global et local de la biote de Jehol a contribué à la composition unique, l'évolution et la conservation de la biote, démontrant des échanges fauniques répandus entre l'Asie et d'autres continents causés par la présence de la masse continentale Eurasiatique–américaine du Nord et son lien avec l'Amérique du Sud, et confirmant le nord-est de la Chine comme centre d'origine et de diversification pour une variété de groupes biologiques du Crétacé. Bien que des progrès aient été réalisés sur la reconstruction de la paléotempérature au moment de la biote de Jehol, beaucoup plus de travail est nécessaire pour confirmer un lien possible entre la remarquable diversité de la biote et les intervalles froids du Crétacé inférieur. Enfin, des directions futures pour l'étude de la biote de Jehol sont proposées qui mettent en évidence le grand potentiel d'études plus complètes et multidisciplinaires pour approfondir notre compréhension des implications biologiques et géologiques du Lagerstätte de Jehol.",
    url = "https://doi.org/10.1093/nsr/nwu055",
    doi = "10.1093/nsr/nwu055",
    openalex = "W2109861196",
    references = "doi101002gj1045, doi101007s0011401208891, doi101007s1143001040949, doi101016jepsl200502019, doi1010291999pa900040, doi10102992jb00648, doi10103821872, doi10103834356, doi101038nature01342, doi101038nature01420, doi101038nature05627, doi101038nature08322, doi101038nature10906, doi101038nature12973, doi101073pnas0507106102, doi101073pnas1011369108, doi101073pnas1112694108, doi101098rspb20090885, doi101111j14636409200600234x, doi101111j14697580200800880x, doi101126science1069439, doi101126science1213780, doi101126science1228753, doi10113008137233291, doi105194cp813232012"
}

La divergence écologique est considérée comme étant couplée aux radiations évolutives, bien que l'intensité de ce couplage reste incertaine. La question de savoir quand les oiseaux se sont diversifiés écologiquement a reçu beaucoup moins d'attention que leur temps de divergence de la couronne, qui fait l'objet de vifs débats. Ici, nous quantifions dans quelle mesure la morphologie squelettique peut prédire l'écologie chez les oiseaux vivants et éteints, et montrons que le premier assemblage connu d'oiseaux (=pygostyliens) du Biote de Jehol (≈125 Ma) était considérablement appauvri écologiquement. L'avifaune de Jehol compte peu de représentants d'écotypes hautement préservables (par exemple, des formes aquatiques) et présente un manque notable de chevauchement écomorphologique avec l'assemblage de ptérosaures (par exemple, aucun pygostylien de grande taille ou se nourrissant en vol). Les comparaisons de la diversité fonctionnelle de Jehol avec les assemblages aviens modernes et subfossiles montrent que le biais taphonomique seul ne peut expliquer l'appauvrissement écomorphologique. Cependant, des simulations évolutives suggèrent que la diversité écologique contrainte des pygostyliens du Crétacé inférieur est cohérente avec ce qui est attendu d'une radiation relativement récente. Quelle que soit l'explication biologique immédiate, la diversité fonctionnelle anormalement faible des oiseaux de Jehol constitue une preuve à la fois de vacuances écologiques dans les écosystèmes du Crétacé, qui ont ensuite été comblées par la radiation de la couronne Aves, et de la discordance entre la richesse taxonomique et la diversité écologique dans l'écosystème mésozoïque le mieux connu.

@article{doi101098rspb20140608,
    author = "Mitchell, Jonathan S. et Makovicky, Peter J.",
    title = "Faible disparité écologique chez les oiseaux du Crétacé inférieur",
    year = "2014",
    journal = "Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "La divergence écologique est considérée comme étant couplée aux radiations évolutives, bien que l'intensité de ce couplage reste incertaine. La question de savoir quand les oiseaux se sont diversifiés écologiquement a reçu beaucoup moins d'attention que leur temps de divergence de la couronne, qui fait l'objet de vifs débats. Ici, nous quantifions dans quelle mesure la morphologie squelettique peut prédire l'écologie chez les oiseaux vivants et éteints, et montrons que le premier assemblage connu d'oiseaux (=pygostyliens) du Biote de Jehol (≈125 Ma) était considérablement appauvri écologiquement. L'avifaune de Jehol compte peu de représentants d'écotypes hautement préservables (par exemple, des formes aquatiques) et présente un manque notable de chevauchement écomorphologique avec l'assemblage de ptérosaures (par exemple, aucun pygostylien de grande taille ou se nourrissant en vol). Les comparaisons de la diversité fonctionnelle de Jehol avec les assemblages aviens modernes et subfossiles montrent que le biais taphonomique seul ne peut expliquer l'appauvrissement écomorphologique. Cependant, des simulations évolutives suggèrent que la diversité écologique contrainte des pygostyliens du Crétacé inférieur est cohérente avec ce qui est attendu d'une radiation relativement récente. Quelle que soit l'explication biologique immédiate, la diversité fonctionnelle anormalement faible des oiseaux de Jehol constitue une preuve à la fois de vacuances écologiques dans les écosystèmes du Crétacé, qui ont ensuite été comblées par la radiation de la couronne Aves, et de la discordance entre la richesse taxonomique et la diversité écologique dans l'écosystème mésozoïque le mieux connu.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspb.2014.0608",
    doi = "10.1098/rspb.2014.0608",
    openalex = "W2111876552",
    references = "doi101111jzo12113, doi10166613052"
}

Résumé Entre le Jurassique moyen et l'Holocène, les oiseaux ont évolué une diversité énorme de comportements. La répartition et l'antiquité de ces comportements sont difficiles à établir compte tenu d'un registre fossile relativement pauvre. Les rares contenus de jabot, d'estomac et d'intestin révèlent généralement des régimes alimentaires cohérents avec la morphologie, mais les membres de la tige de certaines lignées (y compris les Cariamae et les Coraciiformes) semblent avoir été différents sur le plan écologique de leurs parents actuels. La plupart de nos idées sur le comportement des oiseaux fossiles sont basées sur l'analogie (la forme du crâne, les proportions des membres et la courbure des griffes étant utilisées pour guider les hypothèses). Cependant, cela a des limites étant donné que certains taxons éteints manquent d'analogues actuels et que certains taxons actuels ne se comportent pas comme prévu par l'ostéologie. Des méthodes réductionnistes ont été utilisées pour tester le style de prédation et la capacité de course chez les taxons fossiles, y compris les moas, Gastornis et les phorusrhacides. Presque rien n'est connu sur le comportement de nidification et de construction de nids, mais la nidification coloniale est connue depuis le Crétacé. Les rares nids végétaux démontrent une construction de nids moderne depuis l'Éocène. Les rectrices ornementales indiquent que l'affichage piloté par le sexe a conduit certains aspects de l'évolution des plumes et qu'il existe des preuves de comportements vocaux bruyants et de combats intraspécifiques chez certains taxons. Nos connaissances sur le comportement des oiseaux fossiles indiquent que les comportements « modernes » sont au moins aussi anciens que les oiseaux couronne. Cependant, les membres de la tige des lignées actuelles peuvent parfois ou souvent avoir différé des taxons actuels.

@article{doi101111jzo12113,
    author = "Naish, Darren",
    title = "The fossil record of bird behaviour",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Zoology",
    abstract = "Résumé Entre le Jurassique moyen et l'Holocène, les oiseaux ont évolué une diversité énorme de comportements. La répartition et l'antiquité de ces comportements sont difficiles à établir compte tenu d'un registre fossile relativement pauvre. Les rares contenus de jabot, d'estomac et d'intestin révèlent généralement des régimes alimentaires cohérents avec la morphologie, mais les membres de la tige de certaines lignées (y compris les Cariamae et les Coraciiformes) semblent avoir été différents sur le plan écologique de leurs parents actuels. La plupart de nos idées sur le comportement des oiseaux fossiles sont basées sur l'analogie (la forme du crâne, les proportions des membres et la courbure des griffes étant utilisées pour guider les hypothèses). Cependant, cela a des limites étant donné que certains taxons éteints manquent d'analogues actuels et que certains taxons actuels ne se comportent pas comme prévu par l'ostéologie. Des méthodes réductionnistes ont été utilisées pour tester le style de prédation et la capacité de course chez les taxons fossiles, y compris les moas, Gastornis et les phorusrhacides. Presque rien n'est connu sur le comportement de nidification et de construction de nids, mais la nidification coloniale est connue depuis le Crétacé. Les rares nids végétaux démontrent une construction de nids moderne depuis l'Éocène. Les rectrices ornementales indiquent que l'affichage piloté par le sexe a conduit certains aspects de l'évolution des plumes et qu'il existe des preuves de comportements vocaux bruyants et de combats intraspécifiques chez certains taxons. Nos connaissances sur le comportement des oiseaux fossiles indiquent que les comportements « modernes » sont au moins aussi anciens que les oiseaux couronne. Cependant, les membres de la tige des lignées actuelles peuvent parfois ou souvent avoir différé des taxons actuels.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jzo.12113",
    doi = "10.1111/jzo.12113",
    openalex = "W2113579774",
    references = "doi1010079783030876456, doi101007s0011401209171, doi101016s014019631831231x, doi101017s0094837300006564, doi101038nature00930, doi101073pnas1011924108, doi101080027246342012719176, doi101093icb302251, doi101098rspb19980308, doi101111j15023931201100300x, doi101146annurevento48091801112725, doi1023073889096, openalexw114509570, witmer1991biomechanics"
}

Les découvertes récentes ont mis en évidence la transformation évolutive spectaculaire des dinosaures theropodes massifs et terrestres en oiseaux légers et volants. Ici, nous appliquons des approches bayésiennes (initialement développées pour inférer la propagation géographique et les taux d'évolution moléculaire chez les virus) dans un contexte différent : pour inférer les changements de taille et les taux d'innovation anatomique (sur jusqu'à 1549 caractères squelettiques) dans les fossiles. Ces approches identifient deux moteurs sous-jacents à la transition dinosaure-oiseau. La lignée theropode directement ancestrale aux oiseaux subit une miniaturisation soutenue sur 50 millions d'années et au moins 12 branches consécutives (internodes) et évolue des adaptations squelettiques quatre fois plus rapidement que les autres dinosaures. La phase distincte et prolongée de miniaturisation le long du tronc des oiseaux aurait facilité l'évolution de nombreuses nouveautés associées à une petite taille corporelle, telles que la réorientation de la masse corporelle, une capacité aérienne accrue, et des crânes paedomorphiques avec des museaux réduits mais des yeux et des cerveaux agrandis.

@article{doi101126science1252243,
    author = "Lee, Michael S. Y. et Cau, Andrea et Naish, Darren et Dyke, Gareth J.",
    title = "Miniaturisation soutenue et innovation anatomique chez les ancêtres dinosaures des oiseaux",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "Les découvertes récentes ont mis en évidence la transformation évolutive spectaculaire des dinosaures theropodes massifs et terrestres en oiseaux légers et volants. Ici, nous appliquons des approches bayésiennes (initialement développées pour inférer la propagation géographique et les taux d'évolution moléculaire chez les virus) dans un contexte différent : pour inférer les changements de taille et les taux d'innovation anatomique (sur jusqu'à 1549 caractères squelettiques) dans les fossiles. Ces approches identifient deux moteurs sous-jacents à la transition dinosaure-oiseau. La lignée theropode directement ancestrale aux oiseaux subit une miniaturisation soutenue sur 50 millions d'années et au moins 12 branches consécutives (internodes) et évolue des adaptations squelettiques quatre fois plus rapidement que les autres dinosaures. La phase distincte et prolongée de miniaturisation le long du tronc des oiseaux aurait facilité l'évolution de nombreuses nouveautés associées à une petite taille corporelle, telles que la réorientation de la masse corporelle, une capacité aérienne accrue, et des crânes paedomorphiques avec des museaux réduits mais des yeux et des cerveaux agrandis.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1252243",
    doi = "10.1126/science.1252243",
    openalex = "W2068703220",
    references = "christiansen2004mass, doi101016jearscirev201004001, doi101038nature10906, doi101038nature11146, doi101038nature12168, doi101073pnas1203238109, doi10108001621459199510476572, doi101080106351501753462876, doi101080147720192010484650, doi101080147720192011630927, doi101093bioinformaticsbtm388, doi101093molbevmss075, doi101093oxfordjournalsmolbeva003872, doi101093sysbiosys029, doi101098rspb20122526, doi101111evo12150, doi101111j10963642200900591x, doi101111j1469185x200900094x, doi101126science1193304, doi101126science1225376, doi101126science1228753, doi101371journalpbio0040088, doi101371journalpbio1001853, doi1022179revmacn14372, doi102307409735, doi105281zenodo16171435, nesbitt2013the, openalexw2611511275, rauhut2003a"
}

Les découvertes récentes de fossiles de dinosaures spectaculaires soutiennent de manière écrasante l'hypothèse selon laquelle les oiseaux descendent de dinosaures theropodes maniraptoriens, et démontrent en outre que des caractéristiques distinctives des oiseaux telles que les plumes, le vol, la physiologie endothermique, des stratégies uniques de reproduction et de croissance, ainsi qu'un système pulmonaire novateur, sont apparues chez les dinosaures terrestres du Mésozoïque. La transition des dinosaures theropodes terrestres à des dinosaures theropodes capables de voler représente désormais probablement l'une des transitions évolutives majeures les mieux documentées de l'histoire de la vie. Des études récentes en biologie du développement et dans d'autres disciplines offrent des aperçus supplémentaires sur la manière dont les caractéristiques des oiseaux sont apparues et ont évolué. Les caractéristiques emblématiques des oiseaux actuels se sont pour la plupart développées de manière progressive et par étapes tout au long de l'évolution des archosaures. Cependant, de nouvelles données mettent également en évidence des poussées occasionnelles de nouveauté morphologique à certaines étapes, particulièrement proches de l'origine des oiseaux, ainsi qu'une distribution évolutive complexe et mosaïque inévitable des caractéristiques majeures des oiseaux sur l'arbre des theropodes. La recherche sur l'origine des oiseaux offre un exemple de premier plan de la manière dont les données paléontologiques et néontologiques peuvent interagir pour révéler la complexité des innovations majeures, répondre à des questions évolutives clés et ouvrir de nouvelles directions de recherche. Une meilleure compréhension de l'origine des oiseaux nécessite des approches multifacettes et intégratives, mais les fossiles fournissent nécessairement le test ultime de tout modèle évolutif.

@article{doi101126science1253293,
    author = "Xu, Xing et Zhou, Zhonghe et Dudley, Robert et Mackem, Susan et Chuong, Cheng‐Ming et Erickson, Gregory M. et Varricchio, David J.",
    title = "Une approche intégrative pour comprendre l'origine des oiseaux",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "Les découvertes récentes de fossiles de dinosaures spectaculaires soutiennent de manière écrasante l'hypothèse selon laquelle les oiseaux descendent de dinosaures theropodes maniraptoriens, et démontrent en outre que des caractéristiques distinctives des oiseaux telles que les plumes, le vol, la physiologie endothermique, des stratégies uniques de reproduction et de croissance, ainsi qu'un système pulmonaire novateur, sont apparues chez les dinosaures terrestres du Mésozoïque. La transition des dinosaures theropodes terrestres à des dinosaures theropodes capables de voler représente désormais probablement l'une des transitions évolutives majeures les mieux documentées de l'histoire de la vie. Des études récentes en biologie du développement et dans d'autres disciplines offrent des aperçus supplémentaires sur la manière dont les caractéristiques des oiseaux sont apparues et ont évolué. Les caractéristiques emblématiques des oiseaux actuels se sont pour la plupart développées de manière progressive et par étapes tout au long de l'évolution des archosaures. Cependant, de nouvelles données mettent également en évidence des poussées occasionnelles de nouveauté morphologique à certaines étapes, particulièrement proches de l'origine des oiseaux, ainsi qu'une distribution évolutive complexe et mosaïque inévitable des caractéristiques majeures des oiseaux sur l'arbre des theropodes. La recherche sur l'origine des oiseaux offre un exemple de premier plan de la manière dont les données paléontologiques et néontologiques peuvent interagir pour révéler la complexité des innovations majeures, répondre à des questions évolutives clés et ouvrir de nouvelles directions de recherche. Une meilleure compréhension de l'origine des oiseaux nécessite des approches multifacettes et intégratives, mais les fossiles fournissent nécessairement le test ultime de tout modèle évolutif.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1253293",
    doi = "10.1126/science.1253293",
    openalex = "W2033992760",
    references = "doi101002sici1097010x199912152854291aidjez130co29, doi10100797814615698316, doi101016jcub201209052, doi10103831635, doi10103834356, doi10103835086500, doi10103835086558, doi101038368196a0, doi101038378774a0, doi101038385247a0, doi101038387390a0, doi101038415780a, doi101038nature00930, doi101038nature01342, doi101038nature02898, doi101038nature03996, doi101038nature04511, doi101038nature05621, doi101038nature07447, doi101038nature07856, doi101038nature08322, doi101038nature08740, doi101038nature11146, doi101038nature12168, doi101038nature12424, doi101038nature12973, doi101038nature13467, doi101073pnas1203238109, doi10108002724634199910011125, doi101098rsbl20070254, doi101111j10963642200600245x, doi101111j1469185x201100190x, doi101111j155856461996tb04496x, doi101126science1078237, doi101126science1144066, doi101126science1180219, doi101126science1213780, doi101126science1225376, doi101126science1228753, doi101126science1252243, doi101126science1253143, doi101126science28454232137, doi101139e03011, doi1012067481, doi101371journalpone0003303, doi101371journalpone0007390, doi101371journalpone0036790, doi101371journalpone0081917, doi1015468gbdyof, doi105281zenodo16171435, doi105860choice421568, ostrom2019osteology"
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Pour mieux déterminer l'histoire des oiseaux modernes, nous avons réalisé une analyse phylogénétique à l'échelle du génome de 48 espèces représentant tous les ordres des Neoaves, en utilisant des méthodes phylogénomiques conçues pour gérer des données à l'échelle du génome. Nous avons obtenu un arbre hautement résolu qui confirme des relations de sœurs ou proches auparavant controversées. Nous avons identifié la première divergence chez les Neoaves, deux groupes que nous avons nommés Passerea et Columbea, représentant des lignées indépendantes d'espèces d'oiseaux terrestres et aquatiques diversifiées et ayant évolué de manière convergente. Parmi les Passerea, nous inférons que l'ancêtre commun des oiseaux terrestres de cœur était un prédateur apical et confirmons des gains indépendants de l'apprentissage vocal. Parmi les Columbea, nous identifions les pigeons et les flamants comme appartenant à des clades sœurs. Même avec des génomes entiers, certaines des branches les plus anciennes chez les Neoaves se sont révélées difficiles à résoudre, ce qui s'explique le mieux par une convergence massive des séquences codant pour des protéines et des niveaux élevés de tri de lignée incomplet survenus lors d'une radiation rapide après l'événement d'extinction de masse du Crétacé-Paléogène, il y a environ 66 millions d'années.

@article{doi101126science1253451,
    author = "Jarvis, Erich D. and Mirarab, Siavash and Aberer, Andre J. and Li, Bo and Houde, Peter and Li, Cai and Ho, Simon Y. W. and Faircloth, Brant C. and Nabholz, Benoît and Howard, Jason T. and Suh, Alexander and Weber, Claudia and da Fonseca, Rute R. and Li, Jianwen and Zhang, Fang and Li, Hui and Zhou, Long and Narula, Nitish and Liu, Liang and Ganapathy, Ganesh and Boussau, Bastien and Bayzid, Md. Shamsuzzoha and Zavidovych, Volodymyr and Subramanian, Sankar and Gabaldón, Toni and Capella-Gutiérrez, Salvador and Huerta‐Cepas, Jaime and Rekepalli, Bhanu and Munch, Kasper and Schierup, Mikkel Heide and Lindow, Bent Erik Kramer and Warren, Wesley C. and Ray, David A. and Green, Richard E. and Bruford, Michael W. and Zhan, Xiangjiang and Dixon, Andrew and Li, Shengbin and Li, Ning and Huang, Yinhua and Derryberry, Elizabeth P. and Bertelsen, Mads F. and Sheldon, Frederick H. and Brumfield, Robb T. and Mello, Claudio V. and Lovell, Peter V. and Wirthlin, Morgan and Schneider, Maria Paula Cruz and Prosdocimi, Francisco and Castruita, José Alfredo Samaniego and Velazquez, Amhed Missael Vargas and Alfaro‐Núñez, Alonzo and Campos, Paula F. and Petersen, Bent and Sicheritz‐Pontén, Thomas and Pas, An and Bailey, Tom and Scofield, R. Paul and Bunce, Michael and Lambert, David M. and Zhou, Qi and Perelman, Polina L. and Driskell, Amy C. and Shapiro, Beth and Xiong, Zijun and Zeng, Yongli and Liu, Shiping and Li, Zhenyu and Liu, Binghang and Wu, Kui and Xiao, Jin and Yinqi, Xiong and Zheng, Qiuemei and Zhang, Yong and Yang, Huanming and Wang, Jian and Smeds, Linnéa and Rheindt, Frank E. and Braun, Michael J. and Fjeldså, Jon and Orlando, Ludovic and Barker, F. Keith and Jønsson, Knud A. and Johnson, Warren E. and Koepfli, Klaus‐Peter and O'Brien, Stephen J. and Haussler, David and Ryder, Oliver A. and Rahbek, Carsten and Willerslev, Eske and Graves, Gary R. and Glenn, Travis C. and McCormack, John E. and Burt, David W. and Ellegren, Hans and Alström, Per and Edwards, Scott V. and Stamatakis, Alexandros and Mindell, David P. and Cracraft, Joël",
    title = "Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds",
    year = "2014",
    journal = "Science",
    abstract = "To better determine the history of modern birds, we performed a genome-scale phylogenetic analysis of 48 species representing all orders of Neoaves using phylogenomic methods created to handle genome-scale data. We recovered a highly resolved tree that confirms previously controversial sister or close relationships. We identified the first divergence in Neoaves, two groups we named Passerea and Columbea, representing independent lineages of diverse and convergently evolved land and water bird species. Among Passerea, we infer the common ancestor of core landbirds to have been an apex predator and confirm independent gains of vocal learning. Among Columbea, we identify pigeons and flamingoes as belonging to sister clades. Even with whole genomes, some of the earliest branches in Neoaves proved challenging to resolve, which was best explained by massive protein-coding sequence convergence and high levels of incomplete lineage sorting that occurred during a rapid radiation after the Cretaceous-Paleogene mass extinction event about 66 million years ago.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.1253451",
    doi = "10.1126/science.1253451",
    openalex = "W2119837484",
    references = "doi101016jtree200901009, doi101038nature03150, doi101038nature11631, doi101038nature12130, doi101073pnas0401892101, doi101073pnas1110395108, doi101093bibbbn013, doi101093bioinformaticsbtp348, doi101093nargki198, doi101093oxfordjournalsmolbeva026334, doi101093sysbio463523, doi101093sysbiosys004, doi101111j10960031200800217x, doi101111j10963642200600293x, doi101111j14209101201002029x, doi101126science1157704, doi101126science1177265, doi101126science1211028, doi101126science1229237, doi101186147121487214, doi1012019781420064452, doi101371journalpbio0040088, doi1018814epiiugs2013v36i3002, doi102307jctt1xp3v3r, doi105860choice392183"
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Notre connaissance de l'arbre de vie des oiseaux reste incertaine, en particulier aux niveaux plus profonds en raison de la diversification rapide au début de leur histoire évolutive. Ils sont le vertébré terrestre le plus abondant de la planète et ont suscité un grand intérêt historique pour les systématiciens. Les oiseaux sont également importants sur le plan économique et écologique et, par conséquent, font l'objet d'études intensives, mais malgré leur importance et leur intérêt pour les humains, environ 13 % des taxons actuellement figurant sur la liste des espèces menacées, peut-être en raison des activités humaines. Malgré tout, aucune phylogénie complète incluant à la fois les espèces éteintes et existantes n'existe actuellement. Ici, nous présentons une supertree au niveau des espèces, construite à l'aide de la méthode de la Représentation matricielle avec parcimonie, de l'Aves contenant environ deux tiers de toutes les espèces provenant de près de 1000 phylogénies sources avec une large couverture taxonomique. Les données sources de l'arbre ont été collectées et traitées selon un protocole strict pour garantir un traitement des données robuste et précis. La topologie de l'arbre résultante est largement cohérente avec les hypothèses moléculaires de la phylogénie aviaire. Nous identifions les domaines qui sont en large accord avec les vues actuelles sur la systématicique aviaire, ainsi que ceux qui nécessitent des travaux supplémentaires. Nous mettons également en évidence la nécessité de mesures de soutien basées sur les feuilles pour permettre l'identification de taxons errants dans les supertrees. Il s'agit d'une première tentative de supertree des oiseaux éteints et existants ; elle n'est pas destinée à être utilisée dans une refonte de la systématicique aviaire ou comme base pour une réclassification taxonomique, mais fournit une base solide sur laquelle fonder d'autres études sur la macroévolution, la conservation, la biodiversité, la biologie comparative et l'évolution des caractères ; en particulier, l'inclusion de fossiles permettra d'étudier l'évolution et la diversification des oiseaux tout au long du temps profond.

@article{doi101371currentstolc1af68dda7c999ed9f1e4b2d2df7a08e,
    author = "Davis, Katie E. and Page, Roderic",
    title = "Reweaving the Tapestry: a Supertree of Birds",
    year = "2014",
    journal = "PLoS Currents",
    abstract = "Notre connaissance de l'arbre de vie des oiseaux reste incertaine, en particulier aux niveaux plus profonds en raison de la diversification rapide au début de leur histoire évolutive. Ils sont le vertébré terrestre le plus abondant de la planète et ont suscité un grand intérêt historique pour les systématiciens. Les oiseaux sont également importants sur le plan économique et écologique et, par conséquent, font l'objet d'études intensives, mais malgré leur importance et leur intérêt pour les humains, environ 13 % des taxons actuellement figurant sur la liste des espèces menacées, peut-être en raison des activités humaines. Malgré tout, aucune phylogénie complète incluant à la fois les espèces éteintes et existantes n'existe actuellement. Ici, nous présentons une supertree au niveau des espèces, construite à l'aide de la méthode de la Représentation matricielle avec parcimonie, de l'Aves contenant environ deux tiers de toutes les espèces provenant de près de 1000 phylogénies sources avec une large couverture taxonomique. Les données sources de l'arbre ont été collectées et traitées selon un protocole strict pour garantir un traitement des données robuste et précis. La topologie de l'arbre résultante est largement cohérente avec les hypothèses moléculaires de la phylogénie aviaire. Nous identifions les domaines qui sont en large accord avec les vues actuelles sur la systématicique aviaire, ainsi que ceux qui nécessitent des travaux supplémentaires. Nous mettons également en évidence la nécessité de mesures de soutien basées sur les feuilles pour permettre l'identification de taxons errants dans les supertrees. Il s'agit d'une première tentative de supertree des oiseaux éteints et existants ; elle n'est pas destinée à être utilisée dans une refonte de la systématicique aviaire ou comme base pour une réclassification taxonomique, mais fournit une base solide sur laquelle fonder d'autres études sur la macroévolution, la conservation, la biodiversité, la biologie comparative et l'évolution des caractères ; en particulier, l'inclusion de fossiles permettra d'étudier l'évolution et la diversification des oiseaux tout au long du temps profond.",
    url = "https://doi.org/10.1371/currents.tol.c1af68dda7c999ed9f1e4b2d2df7a08e",
    doi = "10.1371/currents.tol.c1af68dda7c999ed9f1e4b2d2df7a08e",
    openalex = "W2016609453",
    references = "doi101080027246342012719176"
}

Un nouveau spécimen de Bohaiornis guoi provenant de la formation de Jiufotang, comprenant un squelette presque complet, jette une lumière nouvelle sur la variation morphologique et la spécialisation écologique des enantiornithines. Le nouveau spécimen a été recueilli près du village de Lamadong, dans la province du Liaoning, qui est la même zone où le spécimen holotype juvénile a été signalé. Il fournit de nouvelles informations sur l'anatomie du crâne et de la ceinture pectorale de l'espèce, par exemple, un nasal large, un acromion remarquablement robuste, un processus acrocoracoïde courbé vers le médian. Contrairement à l'holotype, le nouveau spécimen attribué possède de petites pierres arrondies dans la région thoracique qui, chez d'autres taxons éteints, ont été interprétées comme une preuve directe de l'alimentation. Une preuve directe de l'alimentation est jusqu'à présent inconnue chez d'autres Enantiornithes. Plus spécifiquement, l'absence de « pierres d'estomac » ou de gastrolithes chez les enantiornithes, malgré leur excellent registre fossile, a été proposée comme étant liée à leur régime alimentaire insectivore ainsi qu'à leur écologie arboricole. Nous hypothesons que la morphologie crânienne ainsi que le nombre et la forme des pierres préservées chez Bohaiornis peuvent être les plus cohérentes avec une écologie raptatoire précédemment inconnue chez les Enantiornithes et considérée comme rare chez les Avialae. Alors que la forme du rostre a une forte relation avec l'écologie alimentaire chez les oiseaux vivants, chez les oiseaux avialans basaux, la plupart de la diversité se trouve dans la morphologie dentaire, le nombre et la distribution des dents.

@article{doi10166613052,
    author = "Li, Zhiheng et Zhou, Zhonghe et Wang, Min et Clarke, Julia A.",
    title = "Un nouveau spécimen d'Enantiornithine basal à gros corps, Bohaiornis, du Crétacé inférieur de Chine et l'inférence de l'écologie alimentaire chez les oiseaux du Mésozoïque",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Paleontology",
    abstract = "Un nouveau spécimen de Bohaiornis guoi provenant de la formation de Jiufotang, comprenant un squelette presque complet, jette une lumière nouvelle sur la variation morphologique et la spécialisation écologique des enantiornithines. Le nouveau spécimen a été recueilli près du village de Lamadong, dans la province du Liaoning, qui est la même zone où le spécimen holotype juvénile a été signalé. Il fournit de nouvelles informations sur l'anatomie du crâne et de la ceinture pectorale de l'espèce, par exemple, un nasal large, un acromion remarquablement robuste, un processus acrocoracoïde courbé vers le médian. Contrairement à l'holotype, le nouveau spécimen attribué possède de petites pierres arrondies dans la région thoracique qui, chez d'autres taxons éteints, ont été interprétées comme une preuve directe de l'alimentation. Une preuve directe de l'alimentation est jusqu'à présent inconnue chez d'autres Enantiornithes. Plus spécifiquement, l'absence de « pierres d'estomac » ou de gastrolithes chez les enantiornithes, malgré leur excellent registre fossile, a été proposée comme étant liée à leur régime alimentaire insectivore ainsi qu'à leur écologie arboricole. Nous hypothesons que la morphologie crânienne ainsi que le nombre et la forme des pierres préservées chez Bohaiornis peuvent être les plus cohérentes avec une écologie raptatoire précédemment inconnue chez les Enantiornithes et considérée comme rare chez les Avialae. Alors que la forme du rostre a une forte relation avec l'écologie alimentaire chez les oiseaux vivants, chez les oiseaux avialans basaux, la plupart de la diversité se trouve dans la morphologie dentaire, le nombre et la distribution des dents.",
    url = "https://doi.org/10.1666/13-052",
    doi = "10.1666/13-052",
    openalex = "W2054832267",
    references = "doi101007978140206754912413, doi101017s247526300000091x, doi101038nature00930, doi101038nature11146, doi101080027246342012652321, doi101126science29054981955, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi105281zenodo16171435, openalexw2607033038, openalexw3217097258"
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Nous menons une analyse histologique de deux oiseaux fossiles sexuellement matures du groupe de Jehol du Crétacé inférieur, attribuables à Jeholornis sp. et Enantiornithes indet. L'histologie confirme que dans ces lignées d'oiseaux primitifs, la maturité sexuelle était atteinte avant la maturité squelettique. Les échantillons révèlent des différences structurelles par rapport aux spécimens pertinents précédemment décrits, indiquant que les changements ontogénétiques dans le tissu osseux qui se produisent chez les oiseaux du Mésozoïque sont plus complexes qu'il n'était précédemment reconnu. Le spécimen femelle de Jeholornis sectionné ici est plus vascularisé que les spécimens précédemment décrits, avec à la fois des canaux réticulés et longitudinaux. Le tissu osseux enantiornithine est le plus similaire à celui rapporté pour le Concornis du Crétacé inférieur, principalement formé par un os à fibres parallèles mais plus vascularisé que d'autres spécimens adultes enantiornithes rapportés. L'os montre une diminution distincte du taux de dépôt osseux, inférée pour représenter le début de la maturité sexuelle.

@article{openalexw2417334803,
    author = "K, O’Connor Jingmai et Wang, Min et Xiaoting, Zheng et Xiao-li, Wang et Zhou, Zhonghe",
    title = "L'histologie de deux oiseaux du Crétacé inférieur femelles",
    year = "2014",
    abstract = "Nous menons une analyse histologique de deux oiseaux fossiles sexuellement matures du groupe de Jehol du Crétacé inférieur, attribuables à Jeholornis sp. et Enantiornithes indet. L'histologie confirme que dans ces lignées d'oiseaux primitifs, la maturité sexuelle était atteinte avant la maturité squelettique. Les échantillons révèlent des différences structurelles par rapport aux spécimens pertinents précédemment décrits, indiquant que les changements ontogénétiques dans le tissu osseux qui se produisent chez les oiseaux du Mésozoïque sont plus complexes qu'il n'était précédemment reconnu. Le spécimen femelle de Jeholornis sectionné ici est plus vascularisé que les spécimens précédemment décrits, avec à la fois des canaux réticulés et longitudinaux. Le tissu osseux enantiornithine est le plus similaire à celui rapporté pour le Concornis du Crétacé inférieur, principalement formé par un os à fibres parallèles mais plus vascularisé que d'autres spécimens adultes enantiornithes rapportés. L'os montre une diminution distincte du taux de dépôt osseux, inférée pour représenter le début de la maturité sexuelle.",
    openalex = "W2417334803",
    references = "doi101080027246342013794814"
}

@article{doi101007s1033601512225,
    author = "O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Évolution précoce de l’oiseau biologique : perspectives tirées de nouvelles découvertes fossiles en Chine",
    year = "2015",
    journal = "Journal für Ornithologie",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10336-015-1222-5",
    doi = "10.1007/s10336-015-1222-5",
    openalex = "W1976770478",
    references = "doi10166613052"
}

@article{doi101016jcub201511036,
    author = "O’Connor, Jingmai K. et Wang, Xiaoli et Zheng, Xiaoting et Hu, Han et Zhang, Xiaomei et Zhou, Zhonghe",
    title = "Un Enantiornithine avec une Queue en Forme d’Éventail, et l’Évolution du Complexe Rectricial chez les Premiers Oiseaux",
    year = "2015",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2015.11.036",
    doi = "10.1016/j.cub.2015.11.036",
    openalex = "W2252124564",
    references = "doi101371journalpone0126791"
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@article{doi101038nature15697,
    author = "Prum, Richard O. et Berv, Jacob S. et Dornburg, Alex et Field, Daniel J. et Townsend, Jeffrey P. et Lemmon, Emily Moriarty et Lemmon, Alan R.",
    title = "Une phylogénie complète des oiseaux (Aves) utilisant le séquençage ADN de nouvelle génération ciblé",
    year = "2015",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature15697",
    doi = "10.1038/nature15697",
    openalex = "W1887892324",
    references = "doi101038nature11631, doi101073pnas0401892101, doi101073pnas1110395108, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101093bioinformaticsbtu033, doi101093molbevmsl150, doi101093molbevmss020, doi101093molbevmss075, doi101093molbevmst010, doi101093sysbiosyr107, doi101098rspb20120683, doi101126science1157704, doi101126science1253451, doi101126science1257570, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi101371journalpbio0040088"
}

Les Ornithuromorpha constituent le clade le plus inclusif contenant les oiseaux actuels, mais pas les Enantiornithes du Mésozoïque. L'histoire évolutive précoce de ce clade aviaire a été avancée grâce aux découvertes récentes dans les dépôts du Crétacé, indiquant que les Ornithuromorpha et les Enantiornithes sont les deux principaux groupes aviaires du Mésozoïque. Ici, nous rapportons un nouveau oiseau ornithuromorphe, Archaeornithura meemannae gen. et sp. nov., issu des dépôts contenant des oiseaux deuxièmement plus anciens (130,7 Ma) au monde. Le nouveau taxon est rattachable aux Hongshanornithidae et constitue le plus ancien registre des Ornithuromorpha. Cependant, A. meemannae présente peu de caractères primitifs par rapport aux hongshanornithes plus jeunes et est profondément imbriquée au sein des Hongshanornithidae, suggérant que ce clade est déjà bien établi. La nouvelle découverte étend le registre des Ornithuromorpha de cinq à six millions d'années, ce qui repousse à son tour les temps de divergence des lignées aviaires précoces vers le Crétacé inférieur.

@article{doi101038ncomms7987,
    author = "Wang, Min et Zheng, Xiaoting et O’Connor, Jingmai K. et Lloyd, Graeme T. et Wang, Xiaoli et Wang, Yan et Zhang, Xiaomei et Zhou, Zhonghe",
    title = "Le plus ancien registre d'ornithuromorpha du Crétacé inférieur de Chine",
    year = "2015",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les Ornithuromorpha constituent le clade le plus inclusif contenant les oiseaux actuels, mais pas les Enantiornithes du Mésozoïque. L'histoire évolutive précoce de ce clade aviaire a été avancée grâce aux découvertes récentes dans les dépôts du Crétacé, indiquant que les Ornithuromorpha et les Enantiornithes sont les deux principaux groupes aviaires du Mésozoïque. Ici, nous rapportons un nouveau oiseau ornithuromorphe, Archaeornithura meemannae gen. et sp. nov., issu des dépôts contenant des oiseaux deuxièmement plus anciens (130,7 Ma) au monde. Le nouveau taxon est rattachable aux Hongshanornithidae et constitue le plus ancien registre des Ornithuromorpha. Cependant, A. meemannae présente peu de caractères primitifs par rapport aux hongshanornithes plus jeunes et est profondément imbriquée au sein des Hongshanornithidae, suggérant que ce clade est déjà bien établi. La nouvelle découverte étend le registre des Ornithuromorpha de cinq à six millions d'années, ce qui repousse à son tour les temps de divergence des lignées aviaires précoces vers le Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms7987",
    doi = "10.1038/ncomms7987",
    openalex = "W2255397308",
    references = "doi101007s1143001040949, doi101016jcretres201303007, doi101038382442a0, doi101038nature01420, doi101038nature13467, doi101073pnas0507106102, doi101098rstb19930079, doi101111j10960031200800217x, doi101111j14636409200600234x, doi101111j14697580200600534x, doi101126science1126377, doi101126science1144066, doi101126science29054981955, doi10120600030082200635451andtfu20co2"
}

Les Enantiornithes constituent le clade avien du Mésozoïque le plus diversifié. Environ la moitié de la diversité mondiale connue des Enantiornithes provient de la biote de Jehol du Crétacé inférieur de Chine. Les enantiornithes de Jehol sont généralement articulés et complets, mais les os se chevauchent et sont conservés en deux dimensions, ce qui limite sévèrement le nombre de caractères crâniens qui peuvent être identifiés. Ici, nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Pterygornis dapingfangensis gen. et sp. nov., de la biote de Jehol. Le nouveau taxon présente une morphologie sternale unique avec une épine rostrale externe et une paire de processus craniolatéraux. L'analyse phylogénétique place le nouveau taxon dans une position dérivée au sein des Enantiornithes. L'exemplaire est disarticulé avec plusieurs os crâniens exceptionnellement bien conservés, notamment le jugal et le quadratojugal, dont les morphologies restent mal comprises chez les enantiornithes. Nos résultats indiquent que le quadratojugal est un élément en forme de L inversé, morphologiquement similaire à celui d'oiseaux plus basaux tels qu'Archaeopteryx bavarica, Jeholornis prima, Confuciusornis sanctus et Sapeornis chaoyangensis. Nos constatations illustrent également que le quadratojugal a subi de grandes modifications avec la réduction successive des processus caudoventral et squamosal durant l'évolution avienne précoce, contribuant à l'affinement de la cinétique crânienne chez les premiers oiseaux.http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:384D11F5-1CD3-4447-B01E-58D320B42D49

@article{doi1010801477201920151073801,
    author = "Wang, Min et Hu, Han et Li, Zhiheng",
    title = "Un nouvel oiseau enantiornithine de petite taille de la biote de Jehol, avec des implications pour l'évolution précoce de la morphologie du crâne avien",
    year = "2015",
    journal = "Journal of Systematic Palaeontology",
    abstract = "Les Enantiornithes constituent le clade avien du Mésozoïque le plus diversifié. Environ la moitié de la diversité mondiale connue des Enantiornithes provient de la biote de Jehol du Crétacé inférieur de Chine. Les enantiornithes de Jehol sont généralement articulés et complets, mais les os se chevauchent et sont conservés en deux dimensions, ce qui limite sévèrement le nombre de caractères crâniens qui peuvent être identifiés. Ici, nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Pterygornis dapingfangensis gen. et sp. nov., de la biote de Jehol. Le nouveau taxon présente une morphologie sternale unique avec une épine rostrale externe et une paire de processus craniolatéraux. L'analyse phylogénétique place le nouveau taxon dans une position dérivée au sein des Enantiornithes. L'exemplaire est disarticulé avec plusieurs os crâniens exceptionnellement bien conservés, notamment le jugal et le quadratojugal, dont les morphologies restent mal comprises chez les enantiornithes. Nos résultats indiquent que le quadratojugal est un élément en forme de L inversé, morphologiquement similaire à celui d'oiseaux plus basaux tels qu'Archaeopteryx bavarica, Jeholornis prima, Confuciusornis sanctus et Sapeornis chaoyangensis. Nos constatations illustrent également que le quadratojugal a subi de grandes modifications avec la réduction successive des processus caudoventral et squamosal durant l'évolution avienne précoce, contribuant à l'affinement de la cinétique crânienne chez les premiers oiseaux.http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:384D11F5-1CD3-4447-B01E-58D320B42D49",
    url = "https://doi.org/10.1080/14772019.2015.1073801",
    doi = "10.1080/14772019.2015.1073801",
    openalex = "W1949609553",
    references = "doi101080027246342013762708, doi101080027246342013794814"
}

Le bec aviaire est une innovation évolutive clé dont la flexibilité a permis aux oiseaux de se diversifier dans une gamme de niches écologiques disparates. Nous avons abordé le problème du mécanisme derrière cette innovation en utilisant une approche reliant la paléontologie, l'anatomie comparée et la biologie du développement expérimentale. Premièrement, nous avons utilisé des données fossiles et actuelles pour montrer que le bec est distinctif en ce qu'il est constitué de prémaxillaires fusionnés qui sont géométriquement distincts de ceux des archosaures ancestraux. Pour élucider les mécanismes développementaux sous-jacents, nous avons examiné les domaines d'expression des gènes candidats dans le visage embryonnaire : la zone ectodermique frontonasale plus précoce (FEZ) et la région WNT-répondante du milieu du visage plus tardive, chez les oiseaux et plusieurs reptiles. Cela a permis l'identification d'une région d'expression génique médiane autapomorphique chez les Aves. Pour tester le mécanisme, nous avons utilisé des inhibiteurs des deux voies pour reproduire chez le poulet l'expression amniote ancestrale. Modifier la FEZ a altéré la réactivité WNT ultérieure au motif ancestral. Les phénotypes squelettiques issus des deux types d'expériences présentaient des prémaxillaires qui se regroupaient géométriquement avec les formes fossiles ancestrales plutôt qu'avec les oiseaux à bec. La région palatine a également été altérée vers un phénotype plus ancestral. Cela est cohérent avec le registre fossile et avec l'association fonctionnelle étroite des prémaxillaires aviaires et du palais dans la formation d'un bec cinétique.

@article{doi101111evo12684,
    author = "Bhullar, Bhart‐Anjan S. et Morris, Zachary S. et Sefton, Elizabeth M. et Tok, Atalay et Tokita, Masayoshi et Namkoong, Bumjin et Camacho, Jasmin et Burnham, David A. et Abzhanov, Arhat",
    title = "A molecular mechanism for the origin of a key evolutionary innovation, the bird beak and palate, revealed by an integrative approach to major transitions in vertebrate history",
    year = "2015",
    journal = "Evolution",
    abstract = "Le bec aviaire est une innovation évolutive clé dont la flexibilité a permis aux oiseaux de se diversifier dans une gamme de niches écologiques disparates. Nous avons abordé le problème du mécanisme derrière cette innovation en utilisant une approche reliant la paléontologie, l'anatomie comparée et la biologie du développement expérimentale. Premièrement, nous avons utilisé des données fossiles et actuelles pour montrer que le bec est distinctif en ce qu'il est constitué de prémaxillaires fusionnés qui sont géométriquement distincts de ceux des archosaures ancestraux. Pour élucider les mécanismes développementaux sous-jacents, nous avons examiné les domaines d'expression des gènes candidats dans le visage embryonnaire : la zone ectodermique frontonasale plus précoce (FEZ) et la région WNT-répondante du milieu du visage plus tardive, chez les oiseaux et plusieurs reptiles. Cela a permis l'identification d'une région d'expression génique médiane autapomorphique chez les Aves. Pour tester le mécanisme, nous avons utilisé des inhibiteurs des deux voies pour reproduire chez le poulet l'expression amniote ancestrale. Modifier la FEZ a altéré la réactivité WNT ultérieure au motif ancestral. Les phénotypes squelettiques issus des deux types d'expériences présentaient des prémaxillaires qui se regroupaient géométriquement avec les formes fossiles ancestrales plutôt qu'avec les oiseaux à bec. La région palatine a également été altérée vers un phénotype plus ancestral. Cela est cohérent avec le registre fossile et avec l'association fonctionnelle étroite des prémaxillaires aviaires et du palais dans la formation d'un bec cinétique.",
    url = "https://doi.org/10.1111/evo.12684",
    doi = "10.1111/evo.12684",
    openalex = "W1535284157",
    references = "doi101016jydbio201302022, doi101017cbo9780511693281002, doi101038nature11631, doi101080147720192010526639, doi101098rspb20090885, doi101111j17550998201002924x, doi101126science1182213, doi101126science2204594268, doi101146annureven10010165000525, doi101242dev1172409, doi1023072485224, doi1023073514548, doi107312simp93764"
}

Le motif médian d'ossification sternale caractéristique des oiseaux enantiornithes du Crétacé est unique parmi les Ornithodira, le groupe contenant les oiseaux, les dinosaures non aviens et les ptérosaures. Cela a été suggéré comme indiquant que les Enantiornithes ne sont pas le groupe frère des Ornithuromorpha, le clade qui comprend les oiseaux vivants et leurs proches parents, ce qui impliquerait une convergence rampante de nombreuses caractéristiques non sternales entre les enantiornithes et les ornithuromorphes. Cependant, des comparaisons détaillées révèlent une plus grande similitude entre les modes d'ossification sternale des néornithines (c'est-à-dire les oiseaux du groupe couronne) et des enantiornithes que ce qui était reconnu précédemment. De plus, un nouveau spécimen d'enantiornithe subadulte démontre que l'ossification sternale a suivi un motif plus typiquement ornithodirien chez les membres basaux du clade. Ce nouveau spécimen, attribuable aux Pengornithidae, indique que le motif d'ossification unique observé chez d'autres enantiornithes juvéniles est dérivé au sein des Enantiornithes. Un motif similaire mais clairement distinct semble s'être évolué en parallèle dans la lignée ornithuromorphe. Le mode atypique d'ossification sternale chez certains enantiornithes dérivés devrait être considéré comme une condition autapomorphique plutôt que comme une indication que les enantiornithes ne sont pas des proches parents des ornithuromorphes. Sur la base de ce qui est connu des mécanismes moléculaires de la morphogenèse et des avantages sélectifs possibles, les changements parallèles vers l'ossification médiane survenus chez les enantiornithes dérivés et les oiseaux néognathes vivants semblent avoir été liés au développement d'un grand carène ventrale, qui n'est présent que chez les ornithuromorphes et les enantiornithes. L'ossification médiane peut servir à renforcer médulairement le sternum à un stade ontogénétique relativement précoce, ce qui aurait été particulièrement bénéfique durant le développement prolongé des enantiornithes du Crétacé superprécoces.

@article{doi101111jeb12675,
    author = "O’Connor, Jingmai K. et Zheng, Xiaoting et Sullivan, Corwin et Chuong, Cheng‐Ming et Wang, Xiuli et Li, A. et Wang, Y. et Zhang, Xian–Chun et Zhou, Zhao‐Hui",
    title = "Évolution et signification fonctionnelle des motifs d'ossification sternale dérivés chez les oiseaux ornithothoracines",
    year = "2015",
    journal = "Journal of Evolutionary Biology",
    abstract = "Le motif médian d'ossification sternale caractéristique des oiseaux enantiornithes du Crétacé est unique parmi les Ornithodira, le groupe contenant les oiseaux, les dinosaures non aviens et les ptérosaures. Cela a été suggéré comme indiquant que les Enantiornithes ne sont pas le groupe frère des Ornithuromorpha, le clade qui comprend les oiseaux vivants et leurs proches parents, ce qui impliquerait une convergence rampante de nombreuses caractéristiques non sternales entre les enantiornithes et les ornithuromorphes. Cependant, des comparaisons détaillées révèlent une plus grande similitude entre les modes d'ossification sternale des néornithines (c'est-à-dire les oiseaux du groupe couronne) et des enantiornithes que ce qui était reconnu précédemment. De plus, un nouveau spécimen d'enantiornithe subadulte démontre que l'ossification sternale a suivi un motif plus typiquement ornithodirien chez les membres basaux du clade. Ce nouveau spécimen, attribuable aux Pengornithidae, indique que le motif d'ossification unique observé chez d'autres enantiornithes juvéniles est dérivé au sein des Enantiornithes. Un motif similaire mais clairement distinct semble s'être évolué en parallèle dans la lignée ornithuromorphe. Le mode atypique d'ossification sternale chez certains enantiornithes dérivés devrait être considéré comme une condition autapomorphique plutôt que comme une indication que les enantiornithes ne sont pas des proches parents des ornithuromorphes. Sur la base de ce qui est connu des mécanismes moléculaires de la morphogenèse et des avantages sélectifs possibles, les changements parallèles vers l'ossification médiane survenus chez les enantiornithes dérivés et les oiseaux néognathes vivants semblent avoir été liés au développement d'un grand carène ventrale, qui n'est présent que chez les ornithuromorphes et les enantiornithes. L'ossification médiane peut servir à renforcer médulairement le sternum à un stade ontogénétique relativement précoce, ce qui aurait été particulièrement bénéfique durant le développement prolongé des enantiornithes du Crétacé superprécoces.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jeb.12675",
    doi = "10.1111/jeb.12675",
    openalex = "W2104842482",
    references = "doi101371journalpone0126791"
}

Déterminer le moment de la diversification des oiseaux modernes a été difficile. Nous avons combiné des séquences d'ADN de gènes à horloge pour la plupart des familles d'oiseaux avec 130 oiseaux fossiles pour générer un nouvel arbre temporel pour les Neornithes et étudié leurs dynamiques biogéographiques et de diversification. Nous avons trouvé que l'ancêtre commun le plus récent des oiseaux modernes habitait l'Amérique du Sud il y a environ 95 millions d'années, mais ce n'est qu'après la transition Crétacé-Paléogène (il y a 66 millions d'années) que les Neornithes ont commencé à se diversifier rapidement dans le monde entier. Les oiseaux ont utilisé deux principales routes de dispersion : atteindre le monde ancien par l'Amérique du Nord, et atteindre l'Australie et la Zealandia par l'Antarctique. Les taux nets de diversification ont augmenté pendant les périodes de refroidissement global, suggérant que la fragmentation des biomes tropicaux a stimulé la spéciation. Ainsi, nous avons trouvé des preuves omniprésentes que l'évolution aviaire a été influencée par la tectonique des plaques et les changements environnementaux, deux caractéristiques fondamentales de la dynamique de la Terre.

@article{doi101126sciadv1501005,
    author = "Claramunt, Santiago et Cracraft, Joël",
    title = "Un nouvel arbre temporel révèle l'empreinte de l'histoire de la Terre sur l'évolution des oiseaux modernes",
    year = "2015",
    journal = "Science Advances",
    abstract = "Déterminer le moment de la diversification des oiseaux modernes a été difficile. Nous avons combiné des séquences d'ADN de gènes à horloge pour la plupart des familles d'oiseaux avec 130 oiseaux fossiles pour générer un nouvel arbre temporel pour les Neornithes et étudié leurs dynamiques biogéographiques et de diversification. Nous avons trouvé que l'ancêtre commun le plus récent des oiseaux modernes habitait l'Amérique du Sud il y a environ 95 millions d'années, mais ce n'est qu'après la transition Crétacé-Paléogène (il y a 66 millions d'années) que les Neornithes ont commencé à se diversifier rapidement dans le monde entier. Les oiseaux ont utilisé deux principales routes de dispersion : atteindre le monde ancien par l'Amérique du Nord, et atteindre l'Australie et la Zealandia par l'Antarctique. Les taux nets de diversification ont augmenté pendant les périodes de refroidissement global, suggérant que la fragmentation des biomes tropicaux a stimulé la spéciation. Ainsi, nous avons trouvé des preuves omniprésentes que l'évolution aviaire a été influencée par la tectonique des plaques et les changements environnementaux, deux caractéristiques fondamentales de la dynamique de la Terre.",
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.1501005",
    doi = "10.1126/sciadv.1501005",
    openalex = "W2256663809",
    references = "doi101038nature03150, doi101038nature15697, doi101073pnas1110395108, doi101098rspb20001368, doi101111j10958312201101657x, doi101111j10963642200600293x, doi101146annurevearth031208100055, doi101146annurevearth050212124217, doi101371journalpone0052455, doi1021425f55419694"
}

Nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Parapengornis eurycaudatus gen. et sp. nov., provenant de la formation de Jiufotang du Crétacé inférieur du Liaoning, en Chine. Bien que morphologiquement similaire aux pengornithides précédemment décrits, Pengornis houi, Pengornis IVPP V18632 et Eopengornis martini, les différences morphologiques indiquent qu'il représente un nouveau taxon de la famille des Pengornithidae. Sur la base de nouvelles informations issues de ce spécimen, nous réattribuons IVPP V18632 à Parapengornis sp. Le pygostyle bien conservé du nouveau spécimen élucide la morphologie de cet élément pour le clade, qui est unique chez les pengornithides parmi les oiseaux du Mésozoïque. Les similitudes avec les scansores modernes tels que les pics peuvent indiquer un comportement de grimpe verticale et d'accrochage spécialisé qui n'avait pas été inféré auparavant pour les premiers oiseaux. Le nouveau spécimen conserve une paire de plumes entièrement pennacées dominées par la rachis, comme celles du holotype d'Eopengornis martini ; conjointement avec la morphologie unique du pygostyle, cette découverte apporte des preuves aux hypothèses anciennes selon lesquelles les plumes dominées par la rachis pouvaient avoir une signification fonctionnelle. Cette découverte s'ajoute à la diversité des niches écologiques occupées par les enantiornithines et, si elle est correcte, révèle une quantité remarquable de différenciation locomotrice parmi les Enantiornithes.

@article{doi101371journalpone0126791,
    author = "Hu, Han and O'Connor, Jingmai K. and Zhou, Zhonghe",
    title = "Une nouvelle espèce de Pengornithidae (Aves : Enantiornithes) du Crétacé inférieur de Chine suggère un habitat spécialisé arboricole auparavant inconnu chez les premiers oiseaux",
    year = "2015",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Parapengornis eurycaudatus gen. et sp. nov., provenant de la formation de Jiufotang du Crétacé inférieur du Liaoning, en Chine. Bien que morphologiquement similaire aux pengornithides précédemment décrits, Pengornis houi, Pengornis IVPP V18632 et Eopengornis martini, les différences morphologiques indiquent qu'il représente un nouveau taxon de la famille des Pengornithidae. Sur la base de nouvelles informations issues de ce spécimen, nous réattribuons IVPP V18632 à Parapengornis sp. Le pygostyle bien conservé du nouveau spécimen élucide la morphologie de cet élément pour le clade, qui est unique chez les pengornithides parmi les oiseaux du Mésozoïque. Les similitudes avec les scansores modernes tels que les pics peuvent indiquer un comportement de grimpe verticale et d'accrochage spécialisé qui n'avait pas été inféré auparavant pour les premiers oiseaux. Le nouveau spécimen conserve une paire de plumes entièrement pennacées dominées par la rachis, comme celles du holotype d'Eopengornis martini ; conjointement avec la morphologie unique du pygostyle, cette découverte apporte des preuves aux hypothèses anciennes selon lesquelles les plumes dominées par la rachis pouvaient avoir une signification fonctionnelle. Cette découverte s'ajoute à la diversité des niches écologiques occupées par les enantiornithines et, si elle est correcte, révèle une quantité remarquable de différenciation locomotrice parmi les Enantiornithes.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0126791",
    doi = "10.1371/journal.pone.0126791",
    openalex = "W2144140277",
    references = "doi101016jcretres201303007, doi1010292004gl019790, doi101046j10958312200300200x, doi101080027246342012652321, doi101111j10960031200800217x, doi101126science29054981955, doi10230730135049, doi105860choice405235, doi105860choice432219, openalexw2607033038, openalexw617951419"
}

Le registre fossile des oiseaux dans la Gondwana est presque restreint au Crétacé supérieur. Dans cet article, nous décrivons un nouveau fossile provenant du bassin d'Araripe, Cratoavis cearensis nov. gen et sp., composé d'un squelette articulé avec des plumes attachées aux ailes et entourant le corps. Cette découverte étend considérablement l'enregistrement temporel des oiseaux Enantiornithes en Amérique du Sud jusqu'au Crétacé inférieur. Pour la première fois, un squelette presque complet et articulé d'un oiseau du Crétacé inférieur d'Amérique du Sud est documenté.

@article{doi10159023174889201500020001,
    author = "de Souza Carvalho, Ismar et Novas, Fernando E. et Agnolín, Federico L. et Isasi, Marcelo P. et de Freitas, Francisco Idalécio et de Andrade, José Artur Ferreira Gomes",
    title = "Un nouveau genre et une nouvelle espèce d'oiseau enantiornithine du Crétacé inférieur du Brésil",
    year = "2015",
    journal = "Brazilian Journal of Geology",
    abstract = "Le registre fossile des oiseaux dans la Gondwana est presque restreint au Crétacé supérieur. Dans cet article, nous décrivons un nouveau fossile provenant du bassin d'Araripe, Cratoavis cearensis nov. gen et sp., composé d'un squelette articulé avec des plumes attachées aux ailes et entourant le corps. Cette découverte étend considérablement l'enregistrement temporel des oiseaux Enantiornithes en Amérique du Sud jusqu'au Crétacé inférieur. Pour la première fois, un squelette presque complet et articulé d'un oiseau du Crétacé inférieur d'Amérique du Sud est documenté.",
    url = "https://doi.org/10.1590/23174889201500020001",
    doi = "10.1590/23174889201500020001",
    openalex = "W2234463765",
    references = "doi101017cbo9780511535512, doi101038ncomms2104, doi10108002724634199410011554, doi101080027246342012652321, doi101111j13653091200901114x, doi101111j14697580200800880x, doi101126science29054981955, doi101144gslsp20032170101, doi101371journalpone0039056, openalexw193970361, openalexw2607033038"
}

La taille relative des bulbes olfactifs (BO) est corrélée aux capacités olfactives chez les vertébrés et est largement utilisée pour évaluer l'importance relative de l'olfaction pour l'écologie d'une espèce. Chez les oiseaux, les variations de la taille relative des BO sont corrélées à certains comportements ; cependant, les facteurs qui ont conduit au haut niveau de diversité observé dans les tailles de BO chez les oiseaux ne sont toujours pas bien compris. Dans cette étude, nous utilisons la taille relative des BO comme proxy neuroanatomique des capacités olfactives chez 135 espèces d'oiseaux, représentant 21 ordres. Nous examinons l'échelle des BO par rapport à la taille du cerveau chez les ordres aviens, déterminons les états ancestraux probables et testons les corrélations entre les tailles de BO, l'habitat, l'écologie et le comportement. La taille des BO aviens variait avec la taille du cerveau et cette relation allométrique était pour la plupart isométrique, bien que les espèces aient dévié de cette tendance. Les grands BO étaient caractéristiques des espèces plus basales et chez les espèces plus récemment dérivées, les BO étaient petits. Vivre et se nourrir dans un environnement semi-aquatique était la variable la plus forte conduisant à l'évolution de grands BO chez les oiseaux ; l'olfaction peut fournir des indices pour la navigation et la recherche de nourriture dans cet environnement autrement sans caractéristiques. Une partie de la diversité des tailles de BO était également sans doute due à des différences de comportement migratoire, de stratégies de recherche de nourriture et de structure sociale. En résumé, la taille relative des BO chez les oiseaux reflète l'allométrie, la phylogénie et le comportement de manière à paralléliser celle des autres classes de vertébrés. Cela fournit des preuves comparatives qui soutiennent les études expérimentales récentes sur l'olfaction aviaire et suggèrent que l'olfaction est une modalité sensorielle importante pour toutes les espèces aviaires.

@article{doi103389fnana201500102,
    author = "Corfield, Jeremy R. et Price, Kasandra et Iwaniuk, Andrew N. et Gutierrez-Ibañez, Cristian et Birkhead, T. R. et Wylie, Douglas R.",
    title = "Diversité de la taille des bulbes olfactifs chez les oiseaux reflète l'allométrie, l'écologie et la phylogénie",
    year = "2015",
    journal = "Frontiers in Neuroanatomy",
    abstract = "La taille relative des bulbes olfactifs (BO) est corrélée aux capacités olfactives chez les vertébrés et est largement utilisée pour évaluer l'importance relative de l'olfaction pour l'écologie d'une espèce. Chez les oiseaux, les variations de la taille relative des BO sont corrélées à certains comportements ; cependant, les facteurs qui ont conduit au haut niveau de diversité observé dans les tailles de BO chez les oiseaux ne sont toujours pas bien compris. Dans cette étude, nous utilisons la taille relative des BO comme proxy neuroanatomique des capacités olfactives chez 135 espèces d'oiseaux, représentant 21 ordres. Nous examinons l'échelle des BO par rapport à la taille du cerveau chez les ordres aviens, déterminons les états ancestraux probables et testons les corrélations entre les tailles de BO, l'habitat, l'écologie et le comportement. La taille des BO aviens variait avec la taille du cerveau et cette relation allométrique était pour la plupart isométrique, bien que les espèces aient dévié de cette tendance. Les grands BO étaient caractéristiques des espèces plus basales et chez les espèces plus récemment dérivées, les BO étaient petits. Vivre et se nourrir dans un environnement semi-aquatique était la variable la plus forte conduisant à l'évolution de grands BO chez les oiseaux ; l'olfaction peut fournir des indices pour la navigation et la recherche de nourriture dans cet environnement autrement sans caractéristiques. Une partie de la diversité des tailles de BO était également sans doute due à des différences de comportement migratoire, de stratégies de recherche de nourriture et de structure sociale. En résumé, la taille relative des BO chez les oiseaux reflète l'allométrie, la phylogénie et le comportement de manière à paralléliser celle des autres classes de vertébrés. Cela fournit des preuves comparatives qui soutiennent les études expérimentales récentes sur l'olfaction aviaire et suggèrent que l'olfaction est une modalité sensorielle importante pour toutes les espèces aviaires.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fnana.2015.00102",
    doi = "10.3389/fnana.2015.00102",
    openalex = "W1506785858",
    references = "doi101073pnas1002195107, doi101098rspb20110238"
}

Le Crétacé supérieur fut une période de changements globaux considérables, car les dernières étapes de l'Âge des Dinosaures furent façonnées par les fluctuations climatiques et du niveau de la mer et marquées par des changements paléogéographiques et fauniques, avant l'impact bolide du Crétacé terminal. Le registre fossile terrestre du Crétacé supérieur d'Europe devient de plus en plus bien compris, grâce en grande partie à des travaux de terrain intensifs au cours des deux dernières décennies, promettant de nouvelles perspectives sur l'évolution faunique du Crétacé terminal. Nous passons en revue le registre terrestre du Crétacé supérieur d'Europe et discutons de son importance pour comprendre la paléogéographie, l'écologie, l'évolution et l'extinction des vertébrés terrestres. Nous passons en revue les principales faunes du Crétacé supérieur d'Autriche, Hongrie, France, Espagne, Portugal et Roumanie, ainsi que des registres plus fragmentaires d'autres régions d'Europe. Nous discutons du contexte paléogéographique et de l'histoire de l'assemblage de ces faunes, et soutenons qu'elles sont composées d'un noyau « endémique » complété par diverses vagues d'immigration. Ces faunes vivaient sur un archipel insulaire, et nous décrivons comment ce cadre insulaire a conduit à des particularités écologiques telles qu'une faible diversité, une prépondérance de taxons primitifs et des changements marqués de morphologie (en particulier le nainisme de la taille corporelle). Nous concluons en discutant de l'importance du registre européen pour comprendre l'extinction du Crétacé terminal et montrons qu'il n'existe aucune preuve claire que les dinosaures ou d'autres groupes aient connu des déclins à long terme en Europe avant l'impact bolide.

@article{doi103897zookeys4698439,
    author = "Csiki‐Sava, Zoltán et Buffetaut, Éric et Ősi, Attila et Suberbiola, Xabier Pereda et Brusatte, Stephen L.",
    title = "Vie insulaire au Crétacé - composition faunique, biogéographie, évolution et extinction des vertébrés terrestres sur l'archipel européen du Crétacé supérieur",
    year = "2015",
    journal = "ZooKeys",
    abstract = "Le Crétacé supérieur fut une période de changements globaux considérables, car les dernières étapes de l'Âge des Dinosaures furent façonnées par les fluctuations climatiques et du niveau de la mer et marquées par des changements paléogéographiques et fauniques, avant l'impact bolide du Crétacé terminal. Le registre fossile terrestre du Crétacé supérieur d'Europe devient de plus en plus bien compris, grâce en grande partie à des travaux de terrain intensifs au cours des deux dernières décennies, promettant de nouvelles perspectives sur l'évolution faunique du Crétacé terminal. Nous passons en revue le registre terrestre du Crétacé supérieur d'Europe et discutons de son importance pour comprendre la paléogéographie, l'écologie, l'évolution et l'extinction des vertébrés terrestres. Nous passons en revue les principales faunes du Crétacé supérieur d'Autriche, Hongrie, France, Espagne, Portugal et Roumanie, ainsi que des registres plus fragmentaires d'autres régions d'Europe. Nous discutons du contexte paléogéographique et de l'histoire de l'assemblage de ces faunes, et soutenons qu'elles sont composées d'un noyau « endémique » complété par diverses vagues d'immigration. Ces faunes vivaient sur un archipel insulaire, et nous décrivons comment ce cadre insulaire a conduit à des particularités écologiques telles qu'une faible diversité, une prépondérance de taxons primitifs et des changements marqués de morphologie (en particulier le nainisme de la taille corporelle). Nous concluons en discutant de l'importance du registre européen pour comprendre l'extinction du Crétacé terminal et montrons qu'il n'existe aucune preuve claire que les dinosaures ou d'autres groupes aient connu des déclins à long terme en Europe avant l'impact bolide.",
    url = "https://doi.org/10.3897/zookeys.469.8439",
    doi = "10.3897/zookeys.469.8439",
    openalex = "W2133891947",
    references = "apesteguía2011tunasniyoj, doi101002mmng20010040112, doi101006cres20000236, doi101007s0001500812473, doi101007s0011401209171, doi101016004019518690199x, doi101016jcretres200802004, doi101016jearscirev201009005, doi101016jearscirev201203002, doi101016jgloplacha201312007, doi101016jpalaeo200412005, doi101016jpalaeo200909018, doi101016jpalaeo201206008, doi101016s0012825202000752, doi101016s1631068303000022, doi101017cbo9780511608377011, doi101017s0016756800012413, doi101017s1477201907002246, doi101038nature04633, doi101038ncomms1815, doi101038sjhdy6885841, doi101073pnas1006970107, doi101073pnas1211526110, doi101080089129632012763034, doi101080089129632013777533, doi10108010420940601006859, doi101080147720192011630927, doi101098rspb20090229, doi101111brv12128, doi101111j10963642200900617x, doi101111j10963642201000642x, doi101111j13652699200501314x, doi101111j136531211990tb00103x, doi101126science23547931156, doi1011302014250315, doi101139e72031, doi101139e93176, doi101144gsljgs1934090010405, doi101146annurevearth31100901141308, doi1012067481, doi101371journalpbio0040321, doi101371journalpone0012292, doi101371journalpone0020011, doi101371journalpone0044318, doi101371journalpone0054991, doi101371journalpone0072579, doi101371journalpone0080405, doi101525california97805202420980030015, doi10166612041, doi10167102724634200727931dtftco20co2, doi1016710390290428, doi103090610262296200073181198, doi104202app20120121, doi105860choice435902, doi105860choice514447, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle68064, garilli2009first, lehman1987late, leloeuff1994the, martinsander2006bone, openalexw3015256845, openalexw51761775"
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Le dinosaure roumain exceptionnellement bien conservé Balaur bondoc est le theropode le plus complet connu à ce jour du Crétacé supérieur d'Europe. Les études précédentes de ce taxon remarquable ont inclus son interprétation phylogénétique en tant que droméosauridé aberrant avec des affinités velociraptorines. Cependant, Balaur présente une combinaison de caractères à la fois apparemment plesiomorphiques et dérivés ressemblant à des oiseaux. Ici, nous analysons ces caractéristiques dans une révision phylogénétique et montrons comment elles remettent en question son attribution à la famille des Dromaeosauridae. Notre réanalyse de deux ensembles de données phylogénétiques distincts se concentrant sur les taxons paravians basaux soutient la réinterprétation de Balaur comme un avialan plus proche de la couronne que Archaeopteryx mais en dehors de Pygostylia, et comme un taxon incapable de voler au sein d'un assemblage paraphylétique d'oiseaux à longue queue. Notre placement de Balaur au sein des Avialae n'est pas biaisé par le pondération des caractères. Le placement parmi les droméosauridés a conduit à une alternative sous-optimale qui ne peut être rejetée sur la base des données disponibles. Interprété comme un droméosauridé, Balaur a été supposé être hypercarnivore et prédateur, présentant une morphologie particulière influencée par l'endémisme insulaire. Cependant, une écologie semblable à celle des droméosauridés est contredite par plusieurs détails de la morphologie de Balaur, notamment la perte d'un troisième doigt manuel fonctionnel, l'extrémité distale non ginglymoïde du métatarsien II, et un ongle non falciforme sur le deuxième doigt pédal qui manque d'un tubercle fléchisseur proéminent. À l'inverse, une écologie omnivore est mieux soutenue par la morphologie de Balaur et est cohérente avec son placement phylogénétique au sein des Avialae. Notre réinterprétation de Balaur implique qu'un taxon superficiellement semblable à un droméosauridé représente le descendant agrandi et terrestre d'ancêtres plus petits et probablement volants.

@article{doi107717peerj1032,
    author = "Cau, Andrea and Brougham, Tom and Naish, Darren",
    title = "The phylogenetic affinities of the bizarre Late Cretaceous Romanian theropod Balaur bondoc (Dinosauria, Maniraptora): dromaeosaurid or flightless bird?",
    year = "2015",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "The exceptionally well-preserved Romanian dinosaur Balaur bondoc is the most complete theropod known to date from the Upper Cretaceous of Europe. Previous studies of this remarkable taxon have included its phylogenetic interpretation as an aberrant dromaeosaurid with velociraptorine affinities. However, Balaur displays a combination of both apparently plesiomorphic and derived bird-like characters. Here, we analyse those features in a phylogenetic revision and show how they challenge its referral to Dromaeosauridae. Our reanalysis of two distinct phylogenetic datasets focusing on basal paravian taxa supports the reinterpretation of Balaur as an avialan more crownward than Archaeopteryx but outside of Pygostylia, and as a flightless taxon within a paraphyletic assemblage of long-tailed birds. Our placement of Balaur within Avialae is not biased by character weighting. The placement among dromaeosaurids resulted in a suboptimal alternative that cannot be rejected based on the data to hand. Interpreted as a dromaeosaurid, Balaur has been assumed to be hypercarnivorous and predatory, exhibiting a peculiar morphology influenced by island endemism. However, a dromaeosaurid-like ecology is contradicted by several details of Balaur's morphology, including the loss of a third functional manual digit, the non-ginglymoid distal end of metatarsal II, and a non-falciform ungual on the second pedal digit that lacks a prominent flexor tubercle. Conversely, an omnivorous ecology is better supported by Balaur's morphology and is consistent with its phylogenetic placement within Avialae. Our reinterpretation of Balaur implies that a superficially dromaeosaurid-like taxon represents the enlarged, terrestrialised descendant of smaller and probably volant ancestors.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.1032",
    doi = "10.7717/peerj.1032",
    openalex = "W1544877698",
    references = "crossref1976allosaurus, doi10108002724634200310010947, doi101080027246342012652321, doi101080027246342013762708, doi101111j109600311993tb00209x, doi101111j10960031200700161x, doi101111j10960031200800209x, doi101111j10960031200800217x, doi101111j155856461983tb05533x, doi101139e93179, doi101590s000137652011000100008, doi1023072408332, doi10230730135049"
}

Le zygoma (appelé barre jugale) chez les oiseaux modernes représente une grande partie de la marge ventrale du crâne. En tant qu'élément délicat et en forme de barre, la barre jugale est fonctionnellement intégrée à la cinétique crânienne aviaire, une propriété unique qui permet au bec d'être élevé ou abaissé par rapport au cerveau et qui distingue ainsi les oiseaux de tous les autres vertébrés modernes. Des études développementales montrent que la barre jugale des oiseaux modernes est formée par la fusion du jugal et du quadratojugal, qui s'ossifient à partir de centres séparés. Cependant, ces deux os ne sont pas fusionnés et présentent des variations morphologiques complexes chez les oiseaux basaux et leurs parents dinosaures. De plus, le jugal et le quadratojugal forment des articulations rigides avec le postorbitaire et le squamosal, respectivement, entravant ainsi le mouvement de la mâchoire supérieure chez la plupart des dinosaures non aviaires et certains oiseaux basaux. Une étude comparative de la morphologie du jugal et du quadratojugal chez les oiseaux basaux et leurs proches parents, tels que les droméosauridés et les oviraptoridés, éclaire la manière dont les oiseaux modernes ont atteint leur morphologie dérivée de barre jugale et jette de la lumière sur l'évolution de la configuration postorbitale des oiseaux. Nous proposons que de nombreuses modifications morphologiques de ces deux éléments (changements de morphologie et réduction de l'articulation avec d'autres éléments) se sont produites dans l'histoire des oiseaux primitifs, et que certaines d'entre elles sont pertinentes pour l'affinement de la cinétique crânienne. Anat Rec, 300:62-75, 2017. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.

@article{doi101002ar23446,
    author = "Wang, Min et Hu, Han",
    title = "Une étude morphologique comparative du jugal et du quadratojugal chez les oiseaux primitifs et leurs parents dinosaures",
    year = "2016",
    journal = "The Anatomical Record",
    abstract = "Le zygoma (appelé barre jugale) chez les oiseaux modernes représente une grande partie de la marge ventrale du crâne. En tant qu'élément délicat et en forme de barre, la barre jugale est fonctionnellement intégrée à la cinétique crânienne aviaire, une propriété unique qui permet au bec d'être élevé ou abaissé par rapport au cerveau et qui distingue ainsi les oiseaux de tous les autres vertébrés modernes. Des études développementales montrent que la barre jugale des oiseaux modernes est formée par la fusion du jugal et du quadratojugal, qui s'ossifient à partir de centres séparés. Cependant, ces deux os ne sont pas fusionnés et présentent des variations morphologiques complexes chez les oiseaux basaux et leurs parents dinosaures. De plus, le jugal et le quadratojugal forment des articulations rigides avec le postorbitaire et le squamosal, respectivement, entravant ainsi le mouvement de la mâchoire supérieure chez la plupart des dinosaures non aviaires et certains oiseaux basaux. Une étude comparative de la morphologie du jugal et du quadratojugal chez les oiseaux basaux et leurs proches parents, tels que les droméosauridés et les oviraptoridés, éclaire la manière dont les oiseaux modernes ont atteint leur morphologie dérivée de barre jugale et jette de la lumière sur l'évolution de la configuration postorbitale des oiseaux. Nous proposons que de nombreuses modifications morphologiques de ces deux éléments (changements de morphologie et réduction de l'articulation avec d'autres éléments) se sont produites dans l'histoire des oiseaux primitifs, et que certaines d'entre elles sont pertinentes pour l'affinement de la cinétique crânienne. Anat Rec, 300:62-75, 2017. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ar.23446",
    doi = "10.1002/ar.23446",
    openalex = "W2567544716",
    references = "doi101080027246342014874529"
}

@article{doi101038nature19417,
    author = "Prum, Richard O. et Berv, Jacob S. et Dornburg, Alex et Field, Daniel J. et Townsend, Jeffrey P. et Lemmon, Emily Moriarty et Lemmon, Alan R.",
    title = "Une phylogénie complète des oiseaux (Aves) utilisant le séquençage de nouvelle génération ciblé de l'ADN",
    year = "2016",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/nature19417",
    doi = "10.1038/nature19417",
    openalex = "W4231969088",
    references = "doi105860choice405235"
}

Les becs d'oiseaux sont des exemples classiques d'adaptation écologique au régime alimentaire, mais leurs formes sont également contrôlées par l'histoire génétique et développementale. Pour tester les effets de ces facteurs sur le squelette crâniofacial aviaire, nous avons mené des analyses morphométriques sur les rapaces, un groupe polyphylétique à la base de la radiation des oiseaux terrestres. Contrairement à la perception commune, nous constatons que le bec n'est pas un module ciblé indépendamment par la sélection. Au contraire, le bec et le crâne sont des structures hautement intégrées, fortement régulées par la taille, avec des axes de changement de forme liés aux actions de gènes régulateurs récemment identifiés. Ensemble, la taille et l'intégration expliquent près de 80 % de la variation de forme observée entre différentes espèces, à l'exclusion de l'adaptation morphologique au régime alimentaire. Au lieu de cela, les oiseaux de proie utilisent la taille comme mécanisme pour modifier leur écologie alimentaire. Dans la mesure où la variation de forme est confinée à quelques axes majeurs, cela peut offrir un avantage en facilitant une évolution morphologique rapide via des changements de taille corporelle, mais cela peut également rendre les rapaces particulièrement vulnérables lorsque les pressions de sélection s'exercent contre ces axes. La position phylogénétique des rapaces suggère que cette contrainte est prévalente chez tous les oiseaux terrestres et que la rupture de la correspondance développementale entre le bec et le boîtier crânien pourrait être la nouveauté clé dans les radiations adaptatives classiques des passereaux.

@article{doi101073pnas1602683113,
    author = "Bright, Jen A. et Marugán‐Lobón, Jesús et Cobb, Samuel N. et Rayfield, Emily J.",
    title = "Les formes des becs d'oiseaux sont fortement contrôlées par des facteurs non alimentaires",
    year = "2016",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "Les becs d'oiseaux sont des exemples classiques d'adaptation écologique au régime alimentaire, mais leurs formes sont également contrôlées par l'histoire génétique et développementale. Pour tester les effets de ces facteurs sur le squelette crâniofacial aviaire, nous avons mené des analyses morphométriques sur les rapaces, un groupe polyphylétique à la base de la radiation des oiseaux terrestres. Contrairement à la perception commune, nous constatons que le bec n'est pas un module ciblé indépendamment par la sélection. Au contraire, le bec et le crâne sont des structures hautement intégrées, fortement régulées par la taille, avec des axes de changement de forme liés aux actions de gènes régulateurs récemment identifiés. Ensemble, la taille et l'intégration expliquent près de 80 % de la variation de forme observée entre différentes espèces, à l'exclusion de l'adaptation morphologique au régime alimentaire. Au lieu de cela, les oiseaux de proie utilisent la taille comme mécanisme pour modifier leur écologie alimentaire. Dans la mesure où la variation de forme est confinée à quelques axes majeurs, cela peut offrir un avantage en facilitant une évolution morphologique rapide via des changements de taille corporelle, mais cela peut également rendre les rapaces particulièrement vulnérables lorsque les pressions de sélection s'exercent contre ces axes. La position phylogénétique des rapaces suggère que cette contrainte est prévalente chez tous les oiseaux terrestres et que la rupture de la correspondance développementale entre le bec et le boîtier crânien pourrait être la nouveauté clé dans les radiations adaptatives classiques des passereaux.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1602683113",
    doi = "10.1073/pnas.1602683113",
    openalex = "W2345261486",
    references = "doi101007s1169200990765, doi101038nature11146, doi101111evo12684, doi101371journalpbio1001853"
}

La plupart des oiseaux vivants se caractérisent par une croissance rapide et atteignent leur taille adulte dans l'année. Néanmoins, peu de choses sont connues sur la manière dont une telle stratégie développementale avancée a évolué malgré de nombreuses découvertes d'oiseaux fossiles précoces. Ici, nous évaluons l'histologie des os longs à partir d'un nouveau spécimen adulte d'Archaeorhynchus spathula, le taxon le plus basal des Ornithuromorpha. Les Ornithuromorpha constituent le clade le plus inclusif contenant les oiseaux actuels, mais pas les Enantiornithes du Mésozoïque. L'analyse histologique révèle que le cortex est composé d'os à fibres parallèles avec trois lignes de croissance arrêtée, indiquant une croissance lente et interrompue annuellement pour ce taxon. Une telle histologie osseuse diffère significativement de celle d'autres ornithuromorphes basaux connus, mais ressemble à celle des enantiornithes, ce qui nous amène à suggérer une croissance lente prolongée chez l'ancêtre commun des Ornithuromorpha et des Enantiornithes. La séquence de fusion du tarsométatarsus entre les Enantiornithes et les Ornithuromorpha a longtemps été supposée différente et considérée comme indicative du fait que les enantiornithes ne sont pas des proches parents des ornithuromorphes. En raison d'un manque de fossiles enregistrant les stades ontogénétiques précoces, peu de choses sont connues sur le développement du tarsométatarsus chez les ornithuromorphes basaux, rendant cette hypothèse impossible à tester. Ici, nous montrons que la séquence de fusion du tarsométatarsus chez Archaeorhynchus est similaire à celle des enantiornithes, et que la fusion proximale précoce du tarsométatarsus représente un caractère plesiomorphe pour les oiseaux basaux. Nos résultats éclairent également la variation ontogénétique de la morphologie sternale, ce qui met en évidence l'importance de l'ontogenèse dans l'étude taxonomique et phylogénétique des oiseaux précoces.

@article{doi1010801477201920151136968,
    author = "Wang, Min et Zhou, Zhonghe",
    title = "Un nouveau spécimen adulte de l'oiseau ornithuromorphe le plus basal Archaeorhynchus spathula (Aves: Ornithuromorpha) et ses implications pour l'ontogenèse avienne précoce",
    year = "2016",
    journal = "Journal of Systematic Palaeontology",
    abstract = "La plupart des oiseaux vivants se caractérisent par une croissance rapide et atteignent leur taille adulte dans l'année. Néanmoins, peu de choses sont connues sur la manière dont une telle stratégie développementale avancée a évolué malgré de nombreuses découvertes d'oiseaux fossiles précoces. Ici, nous évaluons l'histologie des os longs à partir d'un nouveau spécimen adulte d'Archaeorhynchus spathula, le taxon le plus basal des Ornithuromorpha. Les Ornithuromorpha constituent le clade le plus inclusif contenant les oiseaux actuels, mais pas les Enantiornithes du Mésozoïque. L'analyse histologique révèle que le cortex est composé d'os à fibres parallèles avec trois lignes de croissance arrêtée, indiquant une croissance lente et interrompue annuellement pour ce taxon. Une telle histologie osseuse diffère significativement de celle d'autres ornithuromorphes basaux connus, mais ressemble à celle des enantiornithes, ce qui nous amène à suggérer une croissance lente prolongée chez l'ancêtre commun des Ornithuromorpha et des Enantiornithes. La séquence de fusion du tarsométatarsus entre les Enantiornithes et les Ornithuromorpha a longtemps été supposée différente et considérée comme indicative du fait que les enantiornithes ne sont pas des proches parents des ornithuromorphes. En raison d'un manque de fossiles enregistrant les stades ontogénétiques précoces, peu de choses sont connues sur le développement du tarsométatarsus chez les ornithuromorphes basaux, rendant cette hypothèse impossible à tester. Ici, nous montrons que la séquence de fusion du tarsométatarsus chez Archaeorhynchus est similaire à celle des enantiornithes, et que la fusion proximale précoce du tarsométatarsus représente un caractère plesiomorphe pour les oiseaux basaux. Nos résultats éclairent également la variation ontogénétique de la morphologie sternale, ce qui met en évidence l'importance de l'ontogenèse dans l'étude taxonomique et phylogénétique des oiseaux précoces.",
    url = "https://doi.org/10.1080/14772019.2015.1136968",
    doi = "10.1080/14772019.2015.1136968",
    openalex = "W4242268476",
    references = "doi101080027246342013794814"
}

Le crâne avien se distingue par sa construction et sa fonction. Une grande partie de la variété anatomique des oiseaux s'exprime dans le bec ; mais le bec lui-même, formé en grande partie de l'os prémaxillaire, est implanté sur un visage raccourci et un boîtier crânien bulbiforme et agrandi. Ici, nous utilisons des observations anatomiques originales et des reconstructions pour décrire la forme globale du crâne avien dans un contexte plus large et fournir un compte rendu général de la transformation évolutive du crâne du dinosaure primitif — le crâne d'un macroprédateur archosaurien — à celui des oiseaux modernes. Le raccourcissement facial, l'agrandissement du boîtier crânien autour d'un cerveau agrandi (avec la réduction consécutive des éléments circumorbitaux et de la chambre adductrice), et l'amincissement général et l'articulation plus lâche des os sont des tendances. Beaucoup de ces phénomènes sont dus à la juvénilité ou à la paedomorphose, ce qui est abondamment évident par la comparaison d'un juvénile de theropode primitif (Coelophysis) à des avialans primitifs comme Archaeopteryx. Près de la couronne avienne, le prémaxillaire devient considérablement agrandi et intégré dans le système cinétique mobile caractéristique des oiseaux. Nous posons que cette addition d'un grand élément au crâne n'est peut-être biologiquement faisable que grâce au raccourcissement paedomorphique du visage ; et la cinésie du bec que grâce à l'amincissement paedomorphique des os et au relâchement des articulations, tel qu'il se déroule à l'envers lors de la maturation de Coelophysis. Enfin, le bec lui-même devient élaboré alors que les mains sont intégrées dans l'aile. Il existe des similitudes structurelles, cinématiques et neurologiques entre le picorage avien et la préhension primatienne. La capacité à sélectionner avec précision des aliments de haute qualité sur un fond complexe mais pauvre a peut-être permis aux oiseaux de la couronne de survivre au cataclysme du Crétacé terminal en se nourrissant d'insectes, de graines et d'autres détritus après l'effondrement des niveaux trophiques supérieurs dans le réseau alimentaire.

@article{doi101093icbicw069,
    author = "Bhullar, Bhart‐Anjan S. et Hanson, Michael et Fabbri, Matteo et Pritchard, Adam C. et Bever, Gabe S. et Hoffman, Eva A.",
    title = "Comment fabriquer un crâne d'oiseau : transitions majeures dans l'évolution du crâne avien, la paedomorphose et le bec comme main substitutive",
    year = "2016",
    journal = "Biologie intégrative et comparative",
    abstract = "Le crâne avien se distingue par sa construction et sa fonction. Une grande partie de la variété anatomique des oiseaux s'exprime dans le bec ; mais le bec lui-même, formé en grande partie de l'os prémaxillaire, est implanté sur un visage raccourci et un boîtier crânien bulbiforme et agrandi. Ici, nous utilisons des observations anatomiques originales et des reconstructions pour décrire la forme globale du crâne avien dans un contexte plus large et fournir un compte rendu général de la transformation évolutive du crâne du dinosaure primitif — le crâne d'un macroprédateur archosaurien — à celui des oiseaux modernes. Le raccourcissement facial, l'agrandissement du boîtier crânien autour d'un cerveau agrandi (avec la réduction consécutive des éléments circumorbitaux et de la chambre adductrice), et l'amincissement général et l'articulation plus lâche des os sont des tendances. Beaucoup de ces phénomènes sont dus à la juvénilité ou à la paedomorphose, ce qui est abondamment évident par la comparaison d'un juvénile de theropode primitif (Coelophysis) à des avialans primitifs comme Archaeopteryx. Près de la couronne avienne, le prémaxillaire devient considérablement agrandi et intégré dans le système cinétique mobile caractéristique des oiseaux. Nous posons que cette addition d'un grand élément au crâne n'est peut-être biologiquement faisable que grâce au raccourcissement paedomorphique du visage ; et la cinésie du bec que grâce à l'amincissement paedomorphique des os et au relâchement des articulations, tel qu'il se déroule à l'envers lors de la maturation de Coelophysis. Enfin, le bec lui-même devient élaboré alors que les mains sont intégrées dans l'aile. Il existe des similitudes structurelles, cinématiques et neurologiques entre le picorage avien et la préhension primatienne. La capacité à sélectionner avec précision des aliments de haute qualité sur un fond complexe mais pauvre a peut-être permis aux oiseaux de la couronne de survivre au cataclysme du Crétacé terminal en se nourrissant d'insectes, de graines et d'autres détritus après l'effondrement des niveaux trophiques supérieurs dans le réseau alimentaire.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/icw069",
    doi = "10.1093/icb/icw069",
    openalex = "W2464686792",
    references = "doi101016jcub201508003, doi101017s0094837300006588, doi101038379249a0, doi101038nature15697, doi101038nature19417, doi101038ncomms7987, doi101038nrn1606, doi101080027246342012719176, doi101080147720192010526639, doi101098rspb20110238, doi101111evo12684, doi101111j109600311988tb00514x, doi101126science1098095, doi101139e05044, doi1012063521, doi105281zenodo16171435, houck1990allometric, openalexw2506868775"
}

Les données paléontologiques récentes et les nouvelles hypothèses physiologiques permettent désormais une reconstruction à l'échelle du temps de l'évolution de l'endothermie chez les oiseaux et les mammifères. Un modèle itératif à trois phases décrivant comment l'endothermie s'est développée à partir d'ancêtres ectothermes du Permien est présenté. Dans la Phase Un, je propose que l'élévation de l'endothermie - métabolisme accru et température corporelle (T b) - a complété l'homéothermie de grande taille corporelle durant le Permien et le Trias en réponse aux avantages de fitness du développement embryonnaire amélioré (soin parental) et aux exigences d'activité de la conquête des terres arides. Je propose que la Phase Deux a commencé au Trias supérieur et au Jurassique et a été marquée par une miniaturisation extrême de la taille corporelle, l'évolution d'une isolation corporelle améliorée (poils et plumes), une augmentation de la taille du cerveau, un contrôle de la thermorégulation et une diversité écomorphologique accrue. Je suggère que la Phase Trois s'est produite au Crétacé et au Cénozoïque et a impliqué des pulsations endothermiques associées à l'évolution du vol battant propulsé par les muscles chez les oiseaux, de la cursorialité terrestre chez les mammifères et de l'adaptation climatique en réponse au refroidissement du Cénozoïque supérieur chez les oiseaux et les mammifères. Bien que le modèle triphasique plaide pour une évolution itérative de l'endothermie par pulsations tout au long du Mésozoïque et du Cénozoïque, il est également soutenu que l'endothermie a pu être abandonnée à tout moment où un oiseau ou un mammifère ne dépendait pas de ses avantages thermiques pour le soin parental ou le succès de la reproduction. L'abandon aurait pris la forme soit d'hibernation, soit de torpeur diurne, comme observé chez les endothermes actuels. Ainsi, la torpeur et l'hibernation sont considérées comme aussi anciennes que les origines de l'endothermie elle-même, une caractéristique plesiomorphe observée aujourd'hui chez de nombreux petits oiseaux et mammifères.

@article{doi101111brv12280,
    author = "Lovegrove, Barry G.",
    title = "A phenology of the evolution of endothermy in birds and mammals",
    year = "2016",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Société philosophique de Cambridge",
    abstract = "Les données paléontologiques récentes et les nouvelles hypothèses physiologiques permettent désormais une reconstruction à l'échelle du temps de l'évolution de l'endothermie chez les oiseaux et les mammifères. Un modèle itératif à trois phases décrivant comment l'endothermie s'est développée à partir d'ancêtres ectothermes du Permien est présenté. Dans la Phase Un, je propose que l'élévation de l'endothermie - métabolisme accru et température corporelle (T b) - a complété l'homéothermie de grande taille corporelle durant le Permien et le Trias en réponse aux avantages de fitness du développement embryonnaire amélioré (soin parental) et aux exigences d'activité de la conquête des terres arides. Je propose que la Phase Deux a commencé au Trias supérieur et au Jurassique et a été marquée par une miniaturisation extrême de la taille corporelle, l'évolution d'une isolation corporelle améliorée (poils et plumes), une augmentation de la taille du cerveau, un contrôle de la thermorégulation et une diversité écomorphologique accrue. Je suggère que la Phase Trois s'est produite au Crétacé et au Cénozoïque et a impliqué des pulsations endothermiques associées à l'évolution du vol battant propulsé par les muscles chez les oiseaux, de la cursorialité terrestre chez les mammifères et de l'adaptation climatique en réponse au refroidissement du Cénozoïque supérieur chez les oiseaux et les mammifères. Bien que le modèle triphasique plaide pour une évolution itérative de l'endothermie par pulsations tout au long du Mésozoïque et du Cénozoïque, il est également soutenu que l'endothermie a pu être abandonnée à tout moment où un oiseau ou un mammifère ne dépendait pas de ses avantages thermiques pour le soin parental ou le succès de la reproduction. L'abandon aurait pris la forme soit d'hibernation, soit de torpeur diurne, comme observé chez les endothermes actuels. Ainsi, la torpeur et l'hibernation sont considérées comme aussi anciennes que les origines de l'endothermie elle-même, une caractéristique plesiomorphe observée aujourd'hui chez de nombreux petits oiseaux et mammifères.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12280",
    doi = "10.1111/brv.12280",
    openalex = "W2346237294",
    references = "doi101002ara20206, doi101016jcub201408034, doi101016jcub201508003, doi101038nature11146, doi101038nature12424, doi101038nature12973, doi101038nature13467, doi101038nature13718, doi101073pnas1203238109, doi101073pnas1519387112, doi101086422766, doi101086425185, doi101098rspb20110238, doi101098rspb20130508, doi101111brv12157, doi101111j1469185x201100190x, doi101126science1180219, doi101126science1200043, doi101126science1206196, doi101126science1213780, doi101126science1228753, doi101126science1253143, doi101126science1253293, doi101371journalpone0068714, doi1016660094837320030290605etatoo20co2, doi1016710272463420050250865hitrif20co2"
}

Résumé Les brillants displays de couleurs et les morphologies de plumes diverses qui sont souvent des ornements sexuels sont courants dans une grande partie des Avialae actuels. Ici, nous décrivons un nouveau spécimen d'oiseau basal enantiornithine récupéré de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur de la province du Liaoning dans le nord-est de la Chine. Nous présentons de nouvelles informations sur le plumage des Bohaiornithidae ainsi que la première reconstruction détaillée de la couleur d'un oiseau enantiornithine. Le nouveau spécimen conserve des caractéristiques squelettiques subadultes, y compris la pitting périostée des épiphyses des os longs et des éléments non fusionnés, tout en préservant des preuves de plumage cohérentes avec la maturité sexuelle au moment de la mort. Des plumes exceptionnellement bien conservées couvrent le corps, y compris des plumes de couronne allongées, des plumes de contour du corps, des primaires d'aile à nervures asymétriques, une alula et deux rectrices dominées par le rachis allongées qui pouvaient être des ornements sexuels. La couronne, le cou et les plumes de contour du corps conservent des morphologies de mélanosome allongées associées à une coloration faiblement iridescente dans les plumes actuelles. Nous fournissons des preuves supplémentaires de mélanine préservée utilisant la spectroscopie Raman ; une technique chimique rapide et non destructive. Le nouveau spécimen fournit des données sur l'ontogenèse squelettique dans les Bohaiornithidae ainsi que des preuves des fonctions de communication intraspécifique du plumage.

@article{doi101111pala12270,
    author = "Peteya, Jennifer A. et Clarke, Julia A. et Li, Quanguo et Gao, Ke‐Qin et Shawkey, Matthew D.",
    title = "Le plumage et la coloration d'un oiseau enantiornithine du crétacé inférieur de Chine",
    year = "2016",
    journal = "Palaeontology",
    abstract = "Résumé Les brillants displays de couleurs et les morphologies de plumes diverses qui sont souvent des ornements sexuels sont courants dans une grande partie des Avialae actuels. Ici, nous décrivons un nouveau spécimen d'oiseau basal enantiornithine récupéré de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur de la province du Liaoning dans le nord-est de la Chine. Nous présentons de nouvelles informations sur le plumage des Bohaiornithidae ainsi que la première reconstruction détaillée de la couleur d'un oiseau enantiornithine. Le nouveau spécimen conserve des caractéristiques squelettiques subadultes, y compris la pitting périostée des épiphyses des os longs et des éléments non fusionnés, tout en préservant des preuves de plumage cohérentes avec la maturité sexuelle au moment de la mort. Des plumes exceptionnellement bien conservées couvrent le corps, y compris des plumes de couronne allongées, des plumes de contour du corps, des primaires d'aile à nervures asymétriques, une alula et deux rectrices dominées par le rachis allongées qui pouvaient être des ornements sexuels. La couronne, le cou et les plumes de contour du corps conservent des morphologies de mélanosome allongées associées à une coloration faiblement iridescente dans les plumes actuelles. Nous fournissons des preuves supplémentaires de mélanine préservée utilisant la spectroscopie Raman ; une technique chimique rapide et non destructive. Le nouveau spécimen fournit des données sur l'ontogenèse squelettique dans les Bohaiornithidae ainsi que des preuves des fonctions de communication intraspécifique du plumage.",
    url = "https://doi.org/10.1111/pala.12270",
    doi = "10.1111/pala.12270",
    openalex = "W2550259249",
    references = "doi101038299818a0, doi101038nature08322, doi101080027246342012652321, doi101080027246342013762708, doi101098rsif20080395focus, doi101126science1253293, doi101242jeb205233747, doi101371journalpone0126791, doi1016660022336020030770822mbatho20co2, doi105281zenodo16171435, doi105962bhltitle542, openalexw2607033038"
}

Les Enantiornithes constituent le clade le plus réussi d'oiseaux du Mésozoïque. Ici, nous décrivons un nouvel oiseau enantiornithine, Cruralispennia multidonta gen. et sp. nov., issu de l'horizon Protopteryx de la formation de Huajiying du Crétacé inférieur en Chine. Bien qu'il s'agisse l'un des enantiornithes les plus anciens connus, Cruralispennia présente des morphologies dérivées inattendues à un stade aussi précoce de l'évolution de ce clade. Un pygostyle en forme de charrue, comme celui des Ornithuromorpha, a évolué de manière convergente dans la lignée de Cruralispennia, soulignant la nature homoplastique de l'évolution aviaire précoce. La morphologie extrêmement fine du coracoïde était inconnue parmi les enantiornithes du Crétacé inférieur mais est courante chez les taxons du Crétacé supérieur, indiquant que vers il y a 131 millions d'années, ce clade avait déjà connu une différenciation morphologique considérable. Cruralispennia conserve des plumes crurales inhabituelles qui sont filiformes à la base et possèdent des extrémités distales filamenteuses, un nouveau morphotype inconnu parmi les plumes fossiles ou modernes, augmentant ainsi davantage la diversité connue des morphologies de plumes primitives.

@article{doi101038ncomms14141,
    author = "Wang, Min and O’Connor, Jingmai K. and Pan, Yanhong and Zhou, Zhonghe",
    title = "A bizarre Early Cretaceous enantiornithine bird with unique crural feathers and an ornithuromorph plough-shaped pygostyle",
    year = "2017",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Enantiornithes are the most successful clade of Mesozoic birds. Here, we describe a new enantiornithine bird, Cruralispennia multidonta gen. et sp. nov., from the Protopteryx-horizon of the Early Cretaceous Huajiying Formation of China. Despite being among the oldest known enantiornithines, Cruralispennia displays derived morphologies that are unexpected at such an early stage in the evolution of this clade. A plough-shaped pygostyle, like that of the Ornithuromorpha, evolved convergently in the Cruralispennia lineage, highlighting the homoplastic nature of early avian evolution. The extremely slender coracoid morphology was previously unknown among Early Cretaceous enantiornithines but is common in Late Cretaceous taxa, indicating that by 131 million years ago this clade had already experienced considerable morphological differentiation. Cruralispennia preserves unusual crural feathers that are proximally wire-like with filamentous distal tips, a new morphotype previously unknown among fossil or modern feathers, further increasing the known diversity of primitive feather morphologies.",
    url = "https://doi.org/10.1038/ncomms14141",
    doi = "10.1038/ncomms14141",
    openalex = "W2583568278",
    references = "doi101371journalpone0126791"
}

@article{doi101038s4155901702882,
    author = "Fabbri, Matteo et Koch, Nicolás Mongiardino et Pritchard, Adam C. et Hanson, Michael et Hoffman, Eva A. et Bever, Gabriel S. et Balanoff, Amy M. et Morris, Zachary S. et Field, Daniel J. et Camacho, Jasmin et Rowe, Timothy B. et Norell, Mark A. et Smith, Roger M. H. et Abzhanov, Arhat et Bhullar, Bhart‐Anjan S.",
    title = "Le toit crânien suit l'évolution et le développement du cerveau chez les reptiles, y compris les oiseaux",
    year = "2017",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41559-017-0288-2",
    doi = "10.1038/s41559-017-0288-2",
    openalex = "W2756279390",
    references = "doi101093icbicw069, doi101111evo12684, doi1011861471214814128"
}

La taille du génome chez les mammifères et les oiseaux présente une variation interspécifique remarquablement faible par rapport à d'autres taxons. Cependant, le séquençage du génome a révélé que de nombreuses lignées de mammifères et d'oiseaux ont connu des taux différentiels d'accumulation d'éléments transposables (ET), ce qui serait prédit pour causer une variation substantielle de la taille du génome entre les espèces. Ainsi, nous hypothesisons qu'il y a eu une covariation entre la quantité d'ADN gagnée par transposition et perdue par délétion au cours de l'évolution des mammifères et des oiseaux, aboutissant à un équilibre de la taille du génome. Pour tester ce modèle, nous avons développé des méthodes informatiques pour quantifier la quantité d'ADN gagnée par l'expansion des ET et perdue par délétion au cours des 100 derniers millions d'années dans les lignées de 10 espèces de mammifères eutheriens et 24 espèces d'oiseaux. Les résultats révèlent une variation étendue de la quantité d'ADN gagnée via une transposition spécifique à la lignée, mais que la perte d'ADN a contrebalancé cette expansion à des degrés divers selon les lignées. Notre analyse du taux et du spectre de taille des événements de délétion implique que l'élimination de l'ADN chez les mammifères et les oiseaux s'est faite principalement par de grandes délétions segmentaires (>10 kb). Ces résultats soutiennent un modèle unifié « accordéon » de l'évolution de la taille du génome chez les eucaryotes, selon lequel la perte d'ADN contrebalançant l'expansion des ET est un déterminant majeur de la taille du génome. De plus, nous proposons que la perte étendue d'ADN, et non nécessairement une pénurie d'activité des ET, a été la force principale maintenant la compaction génomique plus grande des oiseaux et des chauves-souris volants par rapport à leurs parents incapables de voler.

@article{doi101073pnas1616702114,
    author = "Kapusta, Aurélie et Suh, Alexander et Feschotte, Cédric",
    title = "Dynamique de l'évolution de la taille du génome chez les oiseaux et les mammifères",
    year = "2017",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {La taille du génome chez les mammifères et les oiseaux présente une variation interspécifique remarquablement faible par rapport à d'autres taxons. Cependant, le séquençage du génome a révélé que de nombreuses lignées de mammifères et d'oiseaux ont connu des taux différentiels d'accumulation d'éléments transposables (ET), ce qui serait prédit pour causer une variation substantielle de la taille du génome entre les espèces. Ainsi, nous hypothesisons qu'il y a eu une covariation entre la quantité d'ADN gagnée par transposition et perdue par délétion au cours de l'évolution des mammifères et des oiseaux, aboutissant à un équilibre de la taille du génome. Pour tester ce modèle, nous avons développé des méthodes informatiques pour quantifier la quantité d'ADN gagnée par l'expansion des ET et perdue par délétion au cours des 100 derniers millions d'années dans les lignées de 10 espèces de mammifères eutheriens et 24 espèces d'oiseaux. Les résultats révèlent une variation étendue de la quantité d'ADN gagnée via une transposition spécifique à la lignée, mais que la perte d'ADN a contrebalancé cette expansion à des degrés divers selon les lignées. Notre analyse du taux et du spectre de taille des événements de délétion implique que l'élimination de l'ADN chez les mammifères et les oiseaux s'est faite principalement par de grandes délétions segmentaires (>10 kb). Ces résultats soutiennent un modèle unifié « accordéon » de l'évolution de la taille du génome chez les eucaryotes, selon lequel la perte d'ADN contrebalançant l'expansion des ET est un déterminant majeur de la taille du génome. De plus, nous proposons que la perte étendue d'ADN, et non nécessairement une pénurie d'activité des ET, a été la force principale maintenant la compaction génomique plus grande des oiseaux et des chauves-souris volants par rapport à leurs parents incapables de voler.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1616702114",
    doi = "10.1073/pnas.1616702114",
    openalex = "W2587213787",
    references = "doi101038nature05621, doi101111j146979981983tb02087x, doi101126science1105113, doi101126science1254390"
}

Résumé Le monde naturel contient une énorme quantité d'informations en constante évolution. Les limitations et les spécialisations au sein des systèmes sensoriels signifient que chaque espèce ne reçoit qu'une petite partie de ces informations. En essence, l'information est filtrée par les systèmes sensoriels. L'écologie sensorielle vise à comprendre la nature et les fonctions de ces filtres pour chaque espèce et chaque système sensoriel. Les flux d'informations et les défis perceptuels posés par différents environnements naturels sont si importants que les spécialisations sensorielles et comportementales ont été inévitables. Il y a eu de nombreux compromis dans l'évolution des capacités sensorielles, ainsi que des compromis et une complémentarité entre différentes capacités sensorielles au sein des espèces. De nombreuses tâches comportementales ont pu influencer l'évolution des capacités sensorielles chez les oiseaux, mais les principaux moteurs ont été associés à seulement deux tâches : la recherche de nourriture et la détection des prédateurs. La tâche clé est le contrôle de la position et du moment de l'approche du bec vers une cible. D'autres tâches, telles que la locomotion et la reproduction, sont réalisées dans le cadre des exigences de la recherche de nourriture et de la détection des prédateurs. Les informations qui guident les comportements peuvent souvent être rares et partielles, et les comportements clés ne sont possibles que grâce à des capacités cognitives qui permettent une interprétation adéquate des informations partielles. Les modifications humaines des environnements naturels présentent des défis perceptuels qui ne peuvent pas toujours être relevés par les informations disponibles pour certains oiseaux. Les mesures d'atténuation des effets négatifs des intrusions humaines dans les environnements naturels doivent tenir compte de l'écologie sensorielle des espèces concernées. Les effets des changements environnementaux ne peuvent pas être suffisamment compris en les observant à travers les filtres des systèmes sensoriels humains.

@book{doi101093oso97801996945320010001,
    author = "Martin, Graham R.",
    title = "The Sensory Ecology of Birds",
    year = "2017",
    abstract = "Résumé Le monde naturel contient une énorme quantité d'informations en constante évolution. Les limitations et les spécialisations au sein des systèmes sensoriels signifient que chaque espèce ne reçoit qu'une petite partie de ces informations. En essence, l'information est filtrée par les systèmes sensoriels. L'écologie sensorielle vise à comprendre la nature et les fonctions de ces filtres pour chaque espèce et chaque système sensoriel. Les flux d'informations et les défis perceptuels posés par différents environnements naturels sont si importants que les spécialisations sensorielles et comportementales ont été inévitables. Il y a eu de nombreux compromis dans l'évolution des capacités sensorielles, ainsi que des compromis et une complémentarité entre différentes capacités sensorielles au sein des espèces. De nombreuses tâches comportementales ont pu influencer l'évolution des capacités sensorielles chez les oiseaux, mais les principaux moteurs ont été associés à seulement deux tâches : la recherche de nourriture et la détection des prédateurs. La tâche clé est le contrôle de la position et du moment de l'approche du bec vers une cible. D'autres tâches, telles que la locomotion et la reproduction, sont réalisées dans le cadre des exigences de la recherche de nourriture et de la détection des prédateurs. Les informations qui guident les comportements peuvent souvent être rares et partielles, et les comportements clés ne sont possibles que grâce à des capacités cognitives qui permettent une interprétation adéquate des informations partielles. Les modifications humaines des environnements naturels présentent des défis perceptuels qui ne peuvent pas toujours être relevés par les informations disponibles pour certains oiseaux. Les mesures d'atténuation des effets négatifs des intrusions humaines dans les environnements naturels doivent tenir compte de l'écologie sensorielle des espèces concernées. Les effets des changements environnementaux ne peuvent pas être suffisamment compris en les observant à travers les filtres des systèmes sensoriels humains.",
    url = "https://doi.org/10.1093/oso/9780199694532.001.0001",
    doi = "10.1093/oso/9780199694532.001.0001",
    openalex = "W2974893960",
    references = "doi101007s1033600702136, doi101126science1228753"
}

L'intervalle du Jurassique supérieur au Crétacé inférieur représente une période de bouleversements environnementaux et d'événements cataclysmiques, combinés à des perturbations des écosystèmes terrestres et marins. Historiquement, la limite Jurassique/Crétacé (J/K) a été classée comme l'une des huit extinctions de masse. Cependant, des recherches plus récentes ont largement renversé cette vision, révélant un modèle beaucoup plus complexe de dynamiques biotiques et abiotiques que ce qui avait été apprécié jusqu'à présent. Ici, nous présentons une synthèse de nos connaissances actuelles sur les événements du Jurassique supérieur-Crétacé inférieur, en nous concentrant particulièrement sur les événements les plus proches de la limite J/K. Nous trouvons des preuves d'une combinaison d'événements catastrophiques à court terme, de processus tectoniques à grande échelle et de perturbations environnementales, ainsi que d'interactions majeures entre clades qui ont conduit à un turnover faunique et écologique apparemment dramatique dans les domaines marins et terrestres. Cela est couplé à une grande réduction de la biodiversité mondiale qui pourrait en partie être expliquée par un échantillonnage insuffisant. Très peu de groupes semblent avoir été entièrement résilients à cet « événement » de la limite J/K, ce qui laisse entrevoir un « modèle en cascade » de changements d'écosystèmes conduisant à la dynamique faunique. Au sein des écosystèmes terrestres, les organismes plus grands et plus spécialisés, tels que les dinosaures saurischiens, semblent avoir souffert le plus. Les téranurans theropodes de taille moyenne ont décliné et ont été remplacés par des groupes de plus grande taille, et les eusauropodes basaux ont été remplacés par des faunes de neosauropodes. L'ascension des theropodes paravians est soulignée par une compétition exacerbée avec les groupes contemporains de ptérosaures, aboutissant à la radiation explosive des oiseaux, bien que le calendrier de cet événement soit obscurci par des biais d'échantillonnage. Les non-archosaures terrestres plus petits et plus écologiquement diversifiés, tels que les lissamphibiens et les mammaliaformes, ont été relativement résilients face aux extinctions, documentant au lieu de cela l'origine de nombreux groupes actuels autour de la limite J/K. Dans le domaine marin, les extinctions se sont concentrées sur les faunes de faible latitude vivant sur les plateaux marins peu profonds, correspondant à une baisse eustatique significative du niveau de la mer au Jurassique terminal. Les groupes marins plus mobiles et écologiquement plastiques, tels que les ichthyosaures, ont survécu à la limite relativement indemnes. Des taux élevés d'extinction et de turnover dans d'autres groupes marins macropredaceurs, y compris les plésiosaures, sont accompagnés de l'origine de la plupart des lignées majeures des requins actuels. Les groupes qui occupaient à la fois les écosystèmes marins et terrestres, y compris les crocodylomorphes, documentent une extinction sélective chez les formes marines peu profondes, tandis que les tortues semblent avoir diversifié. Ces modèles suggèrent que différentes sélectivités d'extinction et processus écologiques opéraient entre les écosystèmes marins et terrestres, qui ont été déterminants pour les destins de nombreux groupes clés, ainsi que pour les origines de nombreuses lignées majeures actuelles. Nous identifions une série de candidats abiotiques potentiels pour conduire à ces modèles, y compris des impacts multiples de bolides, plusieurs épisodes d'éruptions de basaltes de flood, des changements climatiques dramatiques et des perturbations majeures des systèmes océaniques. La transition J/K représente donc, bien qu'elle ne soit pas une extinction de masse, une période de transition importante dans l'histoire de la co-évolution de la vie sur Terre.

@article{doi101111brv12255,
    author = "Tennant, Jonathan P and Mannion, Philip D and Upchurch, Paul et al.",
    title = "Dynamiques biotiques et environnementales à travers la transition Jurassique supérieur-Crétacé inférieur : preuves d'un turnover faunique et écologique prolongé.",
    year = "2017",
    journal = "Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "L'intervalle du Jurassique supérieur au Crétacé inférieur représente une période de bouleversements environnementaux et d'événements cataclysmiques, combinés à des perturbations des écosystèmes terrestres et marins. Historiquement, la limite Jurassique/Crétacé (J/K) a été classée comme l'une des huit extinctions de masse. Cependant, des recherches plus récentes ont largement renversé cette vision, révélant un modèle beaucoup plus complexe de dynamiques biotiques et abiotiques que ce qui avait été apprécié jusqu'à présent. Ici, nous présentons une synthèse de nos connaissances actuelles sur les événements du Jurassique supérieur-Crétacé inférieur, en nous concentrant particulièrement sur les événements les plus proches de la limite J/K. Nous trouvons des preuves d'une combinaison d'événements catastrophiques à court terme, de processus tectoniques à grande échelle et de perturbations environnementales, ainsi que d'interactions majeures entre clades qui ont conduit à un turnover faunique et écologique apparemment dramatique dans les domaines marins et terrestres. Cela est couplé à une grande réduction de la biodiversité mondiale qui pourrait en partie être expliquée par un mauvais échantillonnage. Très peu de groupes semblent avoir été entièrement résilients à cet « événement » de la limite J/K, ce qui laisse entrevoir un « modèle en cascade » de changements d'écosystèmes conduisant à la dynamique faunique. Au sein des écosystèmes terrestres, les organismes plus grands et plus spécialisés, tels que les dinosaures saurischiens, semblent avoir souffert le plus. Les téranurans theropodes de taille moyenne ont décliné et ont été remplacés par des groupes à corps plus grands, et les eusauropodes basaux ont été remplacés par des faunes de neosauropodes. L'ascension des theropodes paravians est soulignée par une compétition exacerbée avec les groupes contemporains de ptérosaures, aboutissant à la radiation explosive des oiseaux, bien que le timing de celle-ci soit obscurci par des biais d'échantillonnage. Les non-archosaures terrestres plus petits et plus écologiquement diversifiés, tels que les lissamphibiens et les mammaliaformes, ont été comparativement résilients aux extinctions, documentant au lieu de cela l'origine de nombreux groupes actuels autour de la limite J/K. Dans le domaine marin, les extinctions se sont concentrées sur les faunes de faible latitude vivant sur les plateaux marins peu profonds, correspondant à une baisse eustatique significative du niveau de la mer au Jurassique terminal. Les groupes marins plus mobiles et écologiquement plastiques, tels que les ichthyosaures, ont survécu à la limite relativement indemnes. Des taux élevés d'extinction et de turnover dans d'autres groupes marins macropredateurs, y compris les plésiosaures, sont accompagnés de l'origine de la plupart des lignées majeures de requins actuels. Les groupes qui occupaient à la fois les écosystèmes marins et terrestres, y compris les crocodilomorphes, documentent une extinction sélective dans les formes marines peu profondes, tandis que les tortues semblent avoir diversifié. Ces modèles suggèrent que différentes sélectivités d'extinction et processus écologiques opéraient entre les écosystèmes marins et terrestres, qui ont été ultimement importants pour déterminer le sort de nombreux groupes clés, ainsi que l'origine de nombreuses lignées majeures actuelles. Nous identifions une série de candidats abiotiques potentiels pour conduire à ces modèles, y compris des impacts multiples de bolides, plusieurs épisodes d'éruptions de basaltes de inondation, des changements climatiques dramatiques et des perturbations majeures des systèmes océaniques. La transition J/K représente donc, bien qu'elle ne soit pas une extinction de masse, une période de transition importante dans l'histoire de la co-évolution de la vie sur Terre.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6849608/",
    doi = "10.1111/brv.12255",
    openalex = "W2283352195",
    pmcid = "PMC6849608",
    pmid = "26888552",
    references = "doi101007s1143001040949, doi1010160031018274900194, doi101016b9780444594259000263, doi101016jcretres201112005, doi101016jcretres201304001, doi101016jcub201408034, doi101016jearscirev201203002, doi101016jgloplacha201105009, doi101016s0009254199000819, doi101017s0016756812000994, doi1010291998rg000054, doi10102993rg02508, doi101038ncomms3827, doi101038ncomms7987, doi101038ncomms9438, doi101080027246342012694385, doi10108014772011003603556, doi101080147720192011630927, doi1010801477201920151059985, doi101086319243, doi101111brv12038, doi101111j1469185x200900107x, doi101111zoj12029, doi101126science1095964, doi101126science1116412, doi101126science1177265, doi101126science17540271199, doi101126science21545391501, doi101126science23547931156, doi101126scienceaaa3716, doi101144gslsp20032170111, doi101144sp35813, doi101371journalpone0029234, doi101371journalpone0103152, doi101371journalpone0112055, doi101371journalpone0125819, doi1016660022336020040780989dapftc20co2, doi1016660094837320000260056cefisg20co2, doi1026879529, doi103090610262296200073181198, doi104202app20110144"
}

Nous décrivons un nouveau fossile aviaire exceptionnellement bien conservé (BMNHC-PH-919) provenant de la formation de Yixian du Crétacé inférieur, dans l'Est de la Mongolie-Intérieure, en Chine. Bien que morphologiquement similaire aux Cathayornithidae et à d'autres enantiornithines de petite taille issues de la biote de Jehol de Chine, de nombreuses caractéristiques morphologiques indiquent qu'il s'agit d'une nouvelle espèce, nommée ici Junornis houi. Le nouveau fossile présente la majeure partie de son plumage, y compris une paire de plumes de queue allongées dominées par le rachis, également présentes chez une variété d'autres enantiornithines. BMNHC-PH-919 représente le premier enantiornithine de Jehol signalé en Mongolie-Intérieure, étendant ainsi la distribution connue de ces oiseaux vers la partie orientale de cette région. De plus, son squelette bien conservé et la silhouette de ses ailes offrent des aperçus sur les performances aérodynamiques des enantiornithines, suggérant que ces oiseaux avaient évolué vers un vol bondissant – un mode de vol commun aux passériformes et à d'autres oiseaux vivants de petite taille – dès il y a 125 millions d'années.

@article{doi101371journalpone0184637,
    author = "Liu, Di et Chiappe, Luis M. et Serrano, Francisco J. et Habib, Michael et Zhang, Yuguang et Meng, Qinjing",
    title = "Aérodynamisme du vol chez les enantiornithines : Informations issues d'un nouveau oiseau du Crétacé inférieur chinois",
    year = "2017",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Nous décrivons un nouveau fossile aviaire exceptionnellement bien conservé (BMNHC-PH-919) provenant de la formation de Yixian du Crétacé inférieur, dans l'Est de la Mongolie-Intérieure, en Chine. Bien que morphologiquement similaire aux Cathayornithidae et à d'autres enantiornithines de petite taille issues de la biote de Jehol de Chine, de nombreuses caractéristiques morphologiques indiquent qu'il s'agit d'une nouvelle espèce, nommée ici Junornis houi. Le nouveau fossile présente la majeure partie de son plumage, y compris une paire de plumes de queue allongées dominées par le rachis, également présentes chez une variété d'autres enantiornithines. BMNHC-PH-919 représente le premier enantiornithine de Jehol signalé en Mongolie-Intérieure, étendant ainsi la distribution connue de ces oiseaux vers la partie orientale de cette région. De plus, son squelette bien conservé et la silhouette de ses ailes offrent des aperçus sur les performances aérodynamiques des enantiornithines, suggérant que ces oiseaux avaient évolué vers un vol bondissant – un mode de vol commun aux passériformes et à d'autres oiseaux vivants de petite taille – dès il y a 125 millions d'années.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0184637",
    doi = "10.1371/journal.pone.0184637",
    openalex = "W2761010710",
    references = "doi10159023174889201500020001"
}

@article{doi101016jcub201804062,
    author = "Field, Daniel J. et Bercovici, Antoine et Berv, Jacob S. et Dunn, Regan E. et Fastovsky, David E. et Lyson, Tyler R. et Vajda, Vivi et Gauthier, Jacques A.",
    title = "Early Evolution of Modern Birds Structured by Global Forest Collapse at the End-Cretaceous Mass Extinction",
    year = "2018",
    journal = "Current Biology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cub.2018.04.062",
    doi = "10.1016/j.cub.2018.04.062",
    openalex = "W2804487112",
    references = "doi101016jtree201109004, doi101038nature15697, doi101038nature19417, doi101093auk12041206, doi101093bioinformaticsbtg412, doi101093bioinformaticsbtq706, doi101111brv12128, doi101111j2041210x201100169x, doi101126science1177265, doi101126science1253451, doi10118614712105788, doi101642auk152161, doi105281zenodo16171435, openalexw1550095290"
}

Si le caractère axial et dominant géocentrique du champ magnétique terrestre signifie que la paléolongitude est indéterminée, la paléomagnétisme est autrement la seule méthode vraiment quantitative disponible pour le scientifique de la Terre pour contraindre la paléogéographie et reconstruire l'évolution cinématique des blocs continentaux. Au cours de la dernière demi-century, de nombreux résultats paléomagnétiques ont fourni des contraintes quantitatives substantielles sur l'origine et l'évolution tectonique des principales divisions tectoniques maintenant composant l'Asie de l'Est. Dans cet article, nous évaluons d'abord les résultats paléomagnétiques disponibles du Paléozoïque précoce au Crétacé précoce provenant des blocs de la Chine du Sud, de la Chine du Nord et du Tarim en utilisant des critères de fiabilité reconnus internationalement. Nous construisons ensuite une moyenne courante à travers une fenêtre de 20 Ma en pondérant les pôles selon leurs facteurs Q et nous ajustons une spline sphérique avec un facteur de lissage de 300 pour dériver les trajectoires de dérive polaire apparente (DPA) pour ces trois principaux blocs durant cet intervalle de temps du Paléozoïque précoce au Mésozoïque tardif. Ensemble avec les pôles paléomagnétiques du Paléozoïque tardif au Mésozoïque précoce provenant du Qaidam, du Qiangtang, de Lhassa, du Sibumasu, de l'Indochine et de certains autres petits blocs/terranes de l'Asie de l'Est, nous produisons une série de reconstructions paléogéographiques pour ces principaux blocs et les moindres terranes de l'Asie de l'Est entre le milieu de l'Ordovicien et la fin du Jurassique (~460–160 Ma), lesquelles, bien que basées principalement sur des preuves paléomagnétiques, visent à embrasser les contraintes géologiques. Enfin, nous discutons des preuves actuelles concernant les temps de fermeture des océans Paléo-Asiatique, Mianlue et Est Paléo-Téthysien qui incorporent des questions fondamentales concernant la formation de la collage continentale de l'Asie de l'Est et la collision avec le corps principal septentrional du supercontinent Pangée. Nous utilisons les preuves collectives pour soutenir que ces principaux paléo-océans avaient fermé au Trias tardif, et que le secteur de l'Asie de l'Est du supercontinent avait uni pour devenir une partie intégrante de la Pangée à cette époque (~220 Ma).

@article{doi101016jearscirev201802004,
    author = "Huang, Baochun et Yan, Yonggang et Piper, J. D. A. et Zhang, Donghai et Yi, Zhiyu et Yu, Shan et Zhou, Tinghong",
    title = "Contraintes paléomagnétiques sur la paléogéographie des blocs de l'Asie de l'Est durant les temps du Paléozoïque tardif et du Mésozoïque précoce",
    year = "2018",
    journal = "Earth-Science Reviews",
    abstract = "Si le caractère axial et dominant géocentrique du champ magnétique terrestre signifie que la paléolongitude est indéterminée, la paléomagnétisme est autrement la seule méthode vraiment quantitative disponible pour le scientifique de la Terre pour contraindre la paléogéographie et reconstruire l'évolution cinématique des blocs continentaux. Au cours de la dernière demi-century, de nombreux résultats paléomagnétiques ont fourni des contraintes quantitatives substantielles sur l'origine et l'évolution tectonique des principales divisions tectoniques maintenant composant l'Asie de l'Est. Dans cet article, nous évaluons d'abord les résultats paléomagnétiques disponibles du Paléozoïque précoce au Crétacé précoce provenant des blocs de la Chine du Sud, de la Chine du Nord et du Tarim en utilisant des critères de fiabilité reconnus internationalement. Nous construisons ensuite une moyenne courante à travers une fenêtre de 20 Ma en pondérant les pôles selon leurs facteurs Q et nous ajustons une spline sphérique avec un facteur de lissage de 300 pour dériver les trajectoires de dérive polaire apparente (DPA) pour ces trois principaux blocs durant cet intervalle de temps du Paléozoïque précoce au Mésozoïque tardif. Ensemble avec les pôles paléomagnétiques du Paléozoïque tardif au Mésozoïque précoce provenant du Qaidam, du Qiangtang, de Lhassa, du Sibumasu, de l'Indochine et de certains autres petits blocs/terranes de l'Asie de l'Est, nous produisons une série de reconstructions paléogéographiques pour ces principaux blocs et les moindres terranes de l'Asie de l'Est entre le milieu de l'Ordovicien et la fin du Jurassique (\textasciitilde 460–160 Ma), lesquelles, bien que basées principalement sur des preuves paléomagnétiques, visent à embrasser les contraintes géologiques. Enfin, nous discutons des preuves actuelles concernant les temps de fermeture des océans Paléo-Asiatique, Mianlue et Est Paléo-Téthysien qui incorporent des questions fondamentales concernant la formation de la collage continentale de l'Asie de l'Est et la collision avec le corps principal septentrional du supercontinent Pangée. Nous utilisons les preuves collectives pour soutenir que ces principaux paléo-océans avaient fermé au Trias tardif, et que le secteur de l'Asie de l'Est du supercontinent avait uni pour devenir une partie intégrante de la Pangée à cette époque (\textasciitilde 220 Ma).",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.earscirev.2018.02.004",
    doi = "10.1016/j.earscirev.2018.02.004",
    openalex = "W2794050677",
    references = "doi101016jearscirev201109001, doi101016jearscirev201212001, doi101016jgr201202019, doi101016jjseaes201212020, doi101016s0012825200000295, doi101146annurevearth060614105254, doi101371journalpone0126946"
}

Les fossiles d'oiseaux juvéniles du Mésozoïque offrent des aperçus sur l'évolution précoce du développement aviaire, bien que de tels fossiles soient rares. L'analyse de la séquence d'ossification chez ces oiseaux à branches précoces a le potentiel de répondre à des questions importantes concernant leur biologie du développement comparative et de contribuer à comprendre leur évolution morphologique et leur différenciation écologique. Ici, nous rapportons un spécimen d'enantiornithine juvénile précoce du Crétacé inférieur d'Europe, qui jette une nouvelle lumière sur l'ostéogenèse chez ce clade le plus riche en espèces d'oiseaux du Mésozoïque. Composé d'un squelette presque complet, il fait partie des fossiles aviens du Mésozoïque les plus petits connus représentant des stades de développement post-éclosion. Les comparaisons entre ce nouveau spécimen et d'autres enantiornithines juvéniles connues soutiennent un modèle d'ostéogenèse asynchrone à l'échelle du clade dans le sternum et la colonne vertébrale, et indiquent fortement que les poussins de ces oiseaux phylogénétiquement basaux variaient considérablement en taille et en rythme de maturation squelettique.

@article{doi101038s41467018032959,
    author = "Knoll, Fabien et Chiappe, Luis M. et Sanchez, Sophie et Garwood, Russell J. et Edwards, Nicholas P. et Wogelius, Roy A. et Sellers, William I. et Manning, Phillip L. et Ortega, Francisco et Serrano, Francisco J. et Marugán‐Lobón, Jesús et Cuesta, Elena et Escaso, Fernando et Sanz, J. L.",
    title = "Un diminutive perinate European Enantiornithes révèle un modèle d'ossification asynchrone chez les premiers oiseaux",
    year = "2018",
    journal = "Nature Communications",
    abstract = "Les fossiles d'oiseaux juvéniles du Mésozoïque offrent des aperçus sur l'évolution précoce du développement aviaire, bien que de tels fossiles soient rares. L'analyse de la séquence d'ossification chez ces oiseaux à branches précoces a le potentiel de répondre à des questions importantes concernant leur biologie du développement comparative et de contribuer à comprendre leur évolution morphologique et leur différenciation écologique. Ici, nous rapportons un spécimen d'enantiornithine juvénile précoce du Crétacé inférieur d'Europe, qui jette une nouvelle lumière sur l'ostéogenèse chez ce clade le plus riche en espèces d'oiseaux du Mésozoïque. Composé d'un squelette presque complet, il fait partie des fossiles aviens du Mésozoïque les plus petits connus représentant des stades de développement post-éclosion. Les comparaisons entre ce nouveau spécimen et d'autres enantiornithines juvéniles connues soutiennent un modèle d'ostéogenèse asynchrone à l'échelle du clade dans le sternum et la colonne vertébrale, et indiquent fortement que les poussins de ces oiseaux phylogénétiquement basaux variaient considérablement en taille et en rythme de maturation squelettique.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41467-018-03295-9",
    doi = "10.1038/s41467-018-03295-9",
    openalex = "W2791847597",
    references = "doi101080027246342013794814"
}

À travers le prisme du registre fossile, la diversification des angiospermes a déclenché une révolution terrestre du Crétacé (KTR) au cours de laquelle les pollinisateurs, les herbivores et les prédateurs ont connu une co-diversification explosive. Les études de datation moléculaire suggèrent que l'évolution précoce des angiospermes n'est pas documentée dans le registre fossile. Ce décalage reste controversé. Nous avons utilisé une méthode de datation moléculaire bayésienne pour analyser un jeu de données de 83 gènes provenant de 644 taxons et de 52 calibrations fossiles afin d'explorer l'effet de différentes interprétations du registre fossile, des modèles d'horloge moléculaire, de la partition des données, entre autres facteurs, sur l'estimation des temps de divergence des angiospermes. Le contrôle de différentes sources d'incertitude indique que l'échelle de temps de la diversification des angiospermes est beaucoup moins certaine que ce que les études précédentes de datation moléculaire ont suggéré. La discordance entre les interprétations de la diversification des angiospermes basées sur l'horloge moléculaire et purement fossiles peut être une conséquence d'une fausse précision des deux côtés. Nous rejetons une origine post-jurassique des angiospermes, soutenant l'idée d'une histoire précoce cryptique des angiospermes, mais cette histoire peut être aussi longue que 121 Myr, ou aussi courte que 23 Myr. Ces conclusions restent compatibles avec les preuves paléobotaniques et une KTR plus générale dans laquelle les grands groupes d'angiospermes ont divergé plus tard au cours du Crétacé, parallèlement à la diversification des pollinisateurs, des herbivores et de leurs prédateurs.

@article{doi101111nph15011,
    author = "Barba‐Montoya, Jose et dos Reis, Mario et Schneider, Harald et Donoghue, Philip C. J. et Yang, Ziheng",
    title = "Contrainte de l'incertitude dans l'échelle de temps de l'évolution des angiospermes et la véracité d'une révolution terrestre du Crétacé",
    year = "2018",
    journal = "New Phytologist",
    abstract = "À travers le prisme du registre fossile, la diversification des angiospermes a déclenché une révolution terrestre du Crétacé (KTR) au cours de laquelle les pollinisateurs, les herbivores et les prédateurs ont connu une co-diversification explosive. Les études de datation moléculaire suggèrent que l'évolution précoce des angiospermes n'est pas documentée dans le registre fossile. Ce décalage reste controversé. Nous avons utilisé une méthode de datation moléculaire bayésienne pour analyser un jeu de données de 83 gènes provenant de 644 taxons et de 52 calibrations fossiles afin d'explorer l'effet de différentes interprétations du registre fossile, des modèles d'horloge moléculaire, de la partition des données, entre autres facteurs, sur l'estimation des temps de divergence des angiospermes. Le contrôle de différentes sources d'incertitude indique que l'échelle de temps de la diversification des angiospermes est beaucoup moins certaine que ce que les études précédentes de datation moléculaire ont suggéré. La discordance entre les interprétations de la diversification des angiospermes basées sur l'horloge moléculaire et purement fossiles peut être une conséquence d'une fausse précision des deux côtés. Nous rejetons une origine post-jurassique des angiospermes, soutenant l'idée d'une histoire précoce cryptique des angiospermes, mais cette histoire peut être aussi longue que 121 Myr, ou aussi courte que 23 Myr. Ces conclusions restent compatibles avec les preuves paléobotaniques et une KTR plus générale dans laquelle les grands groupes d'angiospermes ont divergé plus tard au cours du Crétacé, parallèlement à la diversification des pollinisateurs, des herbivores et de leurs prédateurs.",
    url = "https://doi.org/10.1111/nph.15011",
    doi = "10.1111/nph.15011",
    openalex = "W2788554788",
    references = "doi101016b9780444594259000202, doi1010292004gl019790, doi101038nature08745, doi101086675935, doi101093sysbiosyv080, doi105860choice503272"
}

étaient présents à un stade relativement précoce de l'évolution aviaire, montrant l'importance de la coloration et du motif pour l'évolution des plumes.

@article{doi107717peerj5831,
    author = "Li, Quanguo et Clarke, Julia A. et Gao, Ke‐Qin et Peteya, Jennifer A. et Shawkey, Matthew D.",
    title = "Elaborate plumage patterning in a Cretaceous bird",
    year = "2018",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "étaient présents à un stade relativement précoce de l'évolution aviaire, montrant l'importance de la coloration et du motif pour l'évolution des plumes.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.5831",
    doi = "10.7717/peerj.5831",
    openalex = "W2898646682",
    references = "diamond2013concealing, doi101038nature08740, doi101073pnas1118448109, doi101098rsbl20080302, doi101111pala12270, doi101126science1186290, doi101126science1193604, doi101126science1205748, doi101126science1213780, doi101152physrev000592017, doi1023074089371, openalexw2607033038"
}

Ces dernières années ont été marquées par la découverte d'une grande diversité d'oiseaux primitifs ainsi que de theropodes non aviens étroitement apparentés, ce qui a modifié les conceptions précédentes sur l'origine des oiseaux et leur vol. Nous présentons ici une revue de la composition taxonomique actuelle et des principales caractéristiques anatomiques de ces familles de theropodes étroitement apparentées aux premiers oiseaux, dans le but d'analyser et de discuter les principales hypothèses phylogénétiques qui s'affrontent sur certains aspects de la transition dinosaure non avien-oiseau. Nous concluons que les affinités troodontidées des anchiornithines, et les affinités droméosauridées des microraptorians et des unenlagiids sont rejetées au profit de relations de groupe sœur avec les Avialae. Après la recodification des unenlagiids, la topologie du schéma phylogénétique TWiG révèle une grande polytomie à la base des Pennaraptora. Concernant l'évolution des caractères, nous avons constaté que : 1) la présence de sternum ossifié va de pair avec la présence de processus uncinaux ossifiés ; 2) la présence de membres antérieurs repliés chez les archosaures basaux indique une distribution généralisée parmi les reptiles, contredisant les propositions précédentes selon lesquelles le repliement des membres antérieurs, entraîné par le propatagium et les tendons associés, était exclusif à la lignée avienne ; 3) chez les paravians et avialans basaux tels que l'Archaeopteryx, les ailes sont relativement grandes et larges, avec des plumes rectriciales relativement courtes, et un contour alaire arrondi, présentant une marge d'attaque convexe. Ces taxa présentent des capacités de repliement restreintes des membres antérieurs, conservant des mains avec des angles fléchisseurs (par rapport au radius/ulna) inférieurs ou égaux à 90º. Chez les oiseaux plus dérivés, au contraire, les rectrices sont notablement allongées et l'angle décrit entre la main et l'avant-bras est beaucoup moins de 90º, indiquant non seulement une capacité accrue de repliement des membres antérieurs, mais aussi une variété accrue de mouvements de battement de l'aile pendant le vol. En raison des fortes similitudes dans la conformation de la ceinture pectorale entre les ratites et les avialans et paravians basaux, il est possible de déduire que les principaux mouvements des membres antérieurs étaient similaires chez tous ces taxa, sans la complexe excursion dorsoventrale de l'aile caractéristique des néognathes vivants.

@article{doi103389feart201800252,
    author = "Agnolín, Federico L. et Motta, Matías J. et Egli, Federico Brissón et Coco, Gastón Lo et Novas, Fernando E.",
    title = "Phylogénie des paravians et la transition dinosaure-oiseau : un aperçu",
    year = "2019",
    journal = "Frontiers in Earth Science",
    abstract = "Ces dernières années ont été marquées par la découverte d'une grande diversité d'oiseaux primitifs ainsi que de theropodes non aviens étroitement apparentés, ce qui a modifié les conceptions précédentes sur l'origine des oiseaux et leur vol. Nous présentons ici une revue de la composition taxonomique actuelle et des principales caractéristiques anatomiques de ces familles de theropodes étroitement apparentées aux premiers oiseaux, dans le but d'analyser et de discuter les principales hypothèses phylogénétiques qui s'affrontent sur certains aspects de la transition dinosaure non avien-oiseau. Nous concluons que les affinités troodontidées des anchiornithines, et les affinités droméosauridées des microraptorians et des unenlagiids sont rejetées au profit de relations de groupe sœur avec les Avialae. Après la recodification des unenlagiids, la topologie du schéma phylogénétique TWiG révèle une grande polytomie à la base des Pennaraptora. Concernant l'évolution des caractères, nous avons constaté que : 1) la présence de sternum ossifié va de pair avec la présence de processus uncinaux ossifiés ; 2) la présence de membres antérieurs repliés chez les archosaures basaux indique une distribution généralisée parmi les reptiles, contredisant les propositions précédentes selon lesquelles le repliement des membres antérieurs, entraîné par le propatagium et les tendons associés, était exclusif à la lignée avienne ; 3) chez les paravians et avialans basaux tels que l'Archaeopteryx, les ailes sont relativement grandes et larges, avec des plumes rectriciales relativement courtes, et un contour alaire arrondi, présentant une marge d'attaque convexe. Ces taxa présentent des capacités de repliement restreintes des membres antérieurs, conservant des mains avec des angles fléchisseurs (par rapport au radius/ulna) inférieurs ou égaux à 90º. Chez les oiseaux plus dérivés, au contraire, les rectrices sont notablement allongées et l'angle décrit entre la main et l'avant-bras est beaucoup moins de 90º, indiquant non seulement une capacité accrue de repliement des membres antérieurs, mais aussi une variété accrue de mouvements de battement de l'aile pendant le vol. En raison des fortes similitudes dans la conformation de la ceinture pectorale entre les ratites et les avialans et paravians basaux, il est possible de déduire que les principaux mouvements des membres antérieurs étaient similaires chez tous ces taxa, sans la complexe excursion dorsoventrale de l'aile caractéristique des néognathes vivants.",
    url = "https://doi.org/10.3389/feart.2018.00252",
    doi = "10.3389/feart.2018.00252",
    openalex = "W2911963001",
    references = "cau2018redescription, doi10103831635, doi10103835047056, doi101038nature01342, doi101038nature08322, doi101111j109583121976tb00244x, doi101126science28454232137, doi101127njgpm19821982440, doi101139cjes20170031, doi101139e93179, doi101146annurevearth251435, doi101371journalpone0126791, doi101371journalpone0137709, doi101590s000137652011000100008, doi105281zenodo16171435, doi105860choice343307, doi107717peerj2159, doi107717peerj4558, osmólska1982hulsanpes"
}

Les projets de séquençage à l'échelle du génome peuplent de plus en plus l'arbre de la vie et caractérisent la biodiversité 1-4. Un échantillonnage taxonomique sparse a précédemment été proposé pour brouiller l'inférence phylogénétique 5, ne capturant qu'une fraction de la diversité génomique. Ici, nous rapportons une étape substantielle vers la représentation dense de la diversité phylogénétique et moléculaire aviaire, en analysant 363 génomes provenant de 92,4 % des familles d'oiseaux, incluant 267 génomes nouvellement séquencés produits pour la phase II du Projet Bird 10,000 Genomes (B10K). Nous utilisons cet ensemble de données de génomes comparatifs en combinaison avec un pipeline qui exploite un alignement de génome entier sans référence pour identifier des régions orthologues en plus grand nombre que ce qui a été possible auparavant et pour reconnaître des nouveautés génomiques en particulier chez certaines lignées d'oiseaux. L'alignement densément échantillonné fournit une carte à la paire de bases unique de la sélection, a plus que doublé la fraction de bases qui sont prédictées avec confiance d'être sous conservation et révèle des motifs étendus de sélection faible dans l'ADN non codant prédominant. Nos résultats démontrent que l'augmentation de la diversité des génomes utilisés dans les études comparatives peut révéler plus de variations partagées et spécifiques à la lignée, et améliorer l'investigation des caractéristiques génomiques. Nous anticipons que cette ressource génomique offrira de nouvelles perspectives sur les processus évolutifs dans les analyses comparatives inter-espèces et assistera les efforts de conservation des espèces.

@article{doi101038s4158602028739,
    author = "Feng, Shaohong and Stiller, Josefin and Deng, Yuan and Armstrong, Joel and Fang, Qi and Reeve, Andrew Hart and Xie, Duo and Chen, Guangji and Guo, Chunxue and Faircloth, Brant C. and Petersen, Bent and Wang, Zongji and Zhou, Qi and Diekhans, Mark and Chen, Wanjun and Andreu‐Sánchez, Sergio and Margaryan, Ashot and Howard, Jason T. and Parent, Carole A. and Pacheco, George and Sinding, Mikkel‐Holger S. and Puetz, Lara and Cavill, Emily Louisa and Ribeiro, Ângela M. and Eckhart, Leopold and Fjeldså, Jon and Hosner, Peter A. and Brumfield, Robb T. and Christidis, Les and Bertelsen, Mads F. and Sicheritz‐Pontén, Thomas and Tietze, Dieter Thomas and Robertson, Bruce C. and Song, Gang and Borgia, Gerald and Claramunt, Santiago and Lovette, Irby J. and Cowen, Saul and Njoroge, Peter and Dumbacher, John P. and Ryder, Oliver A. and Fuchs, Jérôme and Bunce, Michael and Burt, David W. and Cracraft, Joël and Meng, Guanliang and Hackett, Shannon J. and Ryan, Peter G. and Jønsson, Knud A. and Jamieson, Ian G. and da Fonseca, Rute R. and Braun, Edward L. and Houde, Peter and Mirarab, Siavash and Suh, Alexander and Hansson, Bengt and Ponnikas, Suvi and Sigeman, Hanna and Stervander, Martin and Frandsen, Paul B. and van der Zwan, Henriëtte and van der Sluis, Rencia and Visser, Carina and Balakrishnan, Christopher N. and Clark, Andrew G. and Fitzpatrick, John W. and Bowman, Reed and Chen, Nancy and Cloutier, Alison and Sackton, Timothy B. and Edwards, Scott V. and Foote, Dustin J. and Shakya, Subir B. and Sheldon, Frederick H. and Vignal, Alain and Soares, André E. R. and Shapiro, Beth and González‐Solís, Jacob and Ferrer, Joan and Rozas, Julio and Riutort, Marta and Tigano, Anna and Friesen, Vicki L. and Dalén, Love and Urrutia, Araxi O. and Székely, Tamás and Liu, Yang and Campana, Michael G. and Corvelo, André and Fleischer, Robert C. and Rutherford, Kim and Gemmell, Neil J. and Dussex, Nicolás and Mouritsen, Henrik and Thiele, Nadine and Delmore, Kira E. and Liedvogel, Miriam and Franke, André and Hoeppner, Marc P. and Krone, Oliver",
    title = "Dense sampling of bird diversity increases power of comparative genomics",
    year = "2020",
    journal = "Nature",
    abstract = "Whole-genome sequencing projects are increasingly populating the tree of life and characterizing biodiversity 1-4. Sparse taxon sampling has previously been proposed to confound phylogenetic inference 5, and captures only a fraction of the genomic diversity. Here we report a substantial step towards the dense representation of avian phylogenetic and molecular diversity, by analysing 363 genomes from 92.4\% of bird families-including 267 newly sequenced genomes produced for phase II of the Bird 10,000 Genomes (B10K) Project. We use this comparative genome dataset in combination with a pipeline that leverages a reference-free whole-genome alignment to identify orthologous regions in greater numbers than has previously been possible and to recognize genomic novelties in particular bird lineages. The densely sampled alignment provides a single-base-pair map of selection, has more than doubled the fraction of bases that are confidently predicted to be under conservation and reveals extensive patterns of weak selection in predominantly non-coding DNA. Our results demonstrate that increasing the diversity of genomes used in comparative studies can reveal more shared and lineage-specific variation, and improve the investigation of genomic characteristics. We anticipate that this genomic resource will offer new perspectives on evolutionary processes in cross-species comparative analyses and assist in efforts to conserve species.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-020-2873-9",
    doi = "10.1038/s41586-020-2873-9",
    openalex = "W3042072141",
    references = "doi101038nature15697, doi101126science1254390, doi101126scienceaav6202"
}

Toutes les lignes de preuves suggèrent une réduction importante de la force de morsure affectant l'évolution des dents lors de la transition dinosaure-oiseau. Les changements dans la microstructure des dents et le décalage alimentaire associé auraient contribué au succès évolutif précoce des oiseaux de type ancêtre à l'ombre d'autres théropodes non aviens.

@article{doi101186s1286202001611w,
    author = "Li, Zhiheng et Wang, Chun‐Chieh et Wang, Min et Chiang, Cheng-Cheng et Wang, Yan et Zheng, Xiaoting et Huang, E‐Wen et Hsiao, Kiko et Zhou, Zhonghe",
    title = "Réductions ultramicrostructurales des dents : implications pour la transition alimentaire des dinosaures non aviens aux oiseaux",
    year = "2020",
    journal = "BMC Evolutionary Biology",
    abstract = "Toutes les lignes de preuves suggèrent une réduction importante de la force de morsure affectant l'évolution des dents lors de la transition dinosaure-oiseau. Les changements dans la microstructure des dents et le décalage alimentaire associé auraient contribué au succès évolutif précoce des oiseaux de type ancêtre à l'ombre d'autres théropodes non aviens.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s12862-020-01611-w",
    doi = "10.1186/s12862-020-01611-w",
    openalex = "W3016872961",
    references = "doi101016jcub201803042, doi101016jpalaeo201803006, doi101080027246342012719176, doi101111j1469185x201000142x, doi107717peerj4129"
}

La Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur, dans la province du Liaoning occidental, au nord-est de la Chine, contient des fossiles importants de vertébrés de la biote tardive de Jehol, par exemple le dinosaure non aviaire à quatre ailes Microraptor. Cette formation documente la phase tardive de la biote de Jehol, produisant les enregistrements fossiles les plus abondants des oiseaux du Mésozoïque. Cependant, les contraintes d'âge précises sur les couches fossilifères de cette formation restent rares et un consensus chronologique sur cette formation n'a pas été atteint, limitant notre compréhension de l'histoire évolutive de la biote de Jehol et de sa distribution temporo-spatiale. Ici, nous présentons les résultats de l'analyse par spectrométrie de masse d'ions secondaires (SIMS) U-Pb sur zircons de quatre échantillons de tuf intercalés dans les couches portant des fossiles de Jehol provenant des affleurements de la Formation de Jiufotang aux sections de Sanmendian et Xiaotaizi dans le bassin de Jianchang, Liaoning occidental. La corrélation stratigraphique entre les deux sections d'affleurement est réalisée en combinant les résultats de la lithostratigraphie, de la biostratigraphie et de la datation par SIMS U-Pb sur zircons. Un lit de tuf SMD17-1 fermé à la limite des formations Yixian/Jiufotang provenant de la section de Sanmendian a donné un âge de 122,0 ± 0,9 Ma, et trois lits de tuf XTZ17-1, XTZ17-2 et XTZ17-3 provenant de la section de Xiaotaizi datés de 118,9 ± 0,8 Ma, 118,8 ± 0,6 Ma et 118,6 ± 1,1 Ma, respectivement. Ces âges suggèrent que la Formation de Jiufotang dans le bassin de Jianchang a été déposée vers 122,0–118,9 Ma, le stade barémien–aptien le plus récent du Crétacé inférieur et fournit des contraintes strictes sur les vertébrés du Mésozoïque découverts dans le bassin de Jianchang. De plus, les documents de la biote tardive de Jehol dans la Formation de Jiufotang ont été placés entre ~123 et ~119 Ma sur la base de notre nouvelle chronologie et des datations radiométriques précédentes. Il est crucial d'évaluer l'histoire évolutive de divers taxons importants du Mésozoïque découverts dans la biote de Jehol et d'explorer les modèles et modes des lignées majeures de vertébrés documentées dans cet intervalle.

@article{doi101016jpalaeo2021110657,
    author = "Yu, Zhiqiang et Wang, Min et Li, Youjuan et Deng, Chenglong et He, Huaiyu",
    title = "Nouvelles contraintes géochronologiques pour la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur dans le bassin de Jianchang, NE Chine, et leurs implications pour la biote tardive de Jehol",
    year = "2021",
    journal = "Paléogéographie Paléoclimatologie Paléoécologie",
    abstract = "La Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur, dans la province du Liaoning occidental, au nord-est de la Chine, contient des fossiles importants de vertébrés de la biote tardive de Jehol, par exemple le dinosaure non aviaire à quatre ailes Microraptor. Cette formation documente la phase tardive de la biote de Jehol, produisant les enregistrements fossiles les plus abondants des oiseaux du Mésozoïque. Cependant, les contraintes d'âge précises sur les couches fossilifères de cette formation restent rares et un consensus chronologique sur cette formation n'a pas été atteint, limitant notre compréhension de l'histoire évolutive de la biote de Jehol et de sa distribution temporo-spatiale. Ici, nous présentons les résultats de l'analyse par spectrométrie de masse d'ions secondaires (SIMS) U-Pb sur zircons de quatre échantillons de tuf intercalés dans les couches portant des fossiles de Jehol provenant des affleurements de la Formation de Jiufotang aux sections de Sanmendian et Xiaotaizi dans le bassin de Jianchang, Liaoning occidental. La corrélation stratigraphique entre les deux sections d'affleurement est réalisée en combinant les résultats de la lithostratigraphie, de la biostratigraphie et de la datation par SIMS U-Pb sur zircons. Un lit de tuf SMD17-1 fermé à la limite des formations Yixian/Jiufotang provenant de la section de Sanmendian a donné un âge de 122,0 ± 0,9 Ma, et trois lits de tuf XTZ17-1, XTZ17-2 et XTZ17-3 provenant de la section de Xiaotaizi datés de 118,9 ± 0,8 Ma, 118,8 ± 0,6 Ma et 118,6 ± 1,1 Ma, respectivement. Ces âges suggèrent que la Formation de Jiufotang dans le bassin de Jianchang a été déposée vers 122,0–118,9 Ma, le stade barémien–aptien le plus récent du Crétacé inférieur et fournit des contraintes strictes sur les vertébrés du Mésozoïque découverts dans le bassin de Jianchang. De plus, les documents de la biote tardive de Jehol dans la Formation de Jiufotang ont été placés entre \textasciitilde 123 et \textasciitilde 119 Ma sur la base de notre nouvelle chronologie et des datations radiométriques précédentes. Il est crucial d'évaluer l'histoire évolutive de divers taxons importants du Mésozoïque découverts dans la biote de Jehol et d'explorer les modèles et modes des lignées majeures de vertébrés documentées dans cet intervalle.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.palaeo.2021.110657",
    doi = "10.1016/j.palaeo.2021.110657",
    openalex = "W3199825891",
    references = "doi101093nsrnwu055, doi10166613052"
}

La biote du Crétacé inférieur de Jehol est une lagerstätte terrestre qui contient des fossiles exceptionnellement bien conservés indiquant l'origine et l'évolution précoce de la vie mésozoïque, tels que les oiseaux, les dinosaures, les ptérosaures, les mammifères, les insectes et les plantes à fleurs. De nouvelles études géochronologiques ont davantage contraint les âges des couches contenant des fossiles, et des recherches récentes sur les contextes tectoniques du Crétacé inférieur ont fourni beaucoup d'informations nouvelles pour comprendre la distribution spatio-temporelle de la biote et le modèle de dispersion de ses membres. Notamment, l'apparition de la biote de Jehol coïncide avec les étapes initiale et culminante de la destruction du craton de Chine du Nord au Crétacé inférieur, et ainsi l'évolution biotique est liée à la destruction du craton de Chine du Nord. Cependant, il reste largement inconnu comment les activités tectoniques ont impacté le développement de la biote de Jehol dans le nord-est de la Chine et d'autres biotes contemporains dans les régions voisines en Asie de l'Est et centrale. Il est proposé que les bassins de rift du Crétacé inférieur se sont déplacés vers l'est sur la marge nord du craton de Chine du Nord et de la Grande chaîne de Xing'an, et ce déplacement est considéré comme résultant du retrait vers l'est de la plaque paléo-Pacifique subductée. Le développement diachrone des bassins de rift a conduit aux variations latérales des séquences stratigraphiques et des environnements de dépôt, ce qui a à son tour influencé l'évolution spatio-temporelle de la biote de Jehol. Cette étude représente un effort pour explorer le lien entre l'évolution de la biote terrestre et la tectonique régionale et comment la tectonique des plaques a contraint l'évolution d'une biote terrestre à travers divers processus géologiques de surface.

@article{doi101073pnas2107859118,
    author = "Zhou, Zhonghe et Meng, Qing‐Ren et Zhu, Rixiang et Wang, Min",
    title = "Évolution spatio-temporelle de la biote de Jehol : Réponses à la destruction du craton de Chine du Nord au Crétacé inférieur",
    year = "2021",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "La biote du Crétacé inférieur de Jehol est une lagerstätte terrestre qui contient des fossiles exceptionnellement bien conservés indiquant l'origine et l'évolution précoce de la vie mésozoïque, tels que les oiseaux, les dinosaures, les ptérosaures, les mammifères, les insectes et les plantes à fleurs. De nouvelles études géochronologiques ont davantage contraint les âges des couches contenant des fossiles, et des recherches récentes sur les contextes tectoniques du Crétacé inférieur ont fourni beaucoup d'informations nouvelles pour comprendre la distribution spatio-temporelle de la biote et le modèle de dispersion de ses membres. Notamment, l'apparition de la biote de Jehol coïncide avec les étapes initiale et culminante de la destruction du craton de Chine du Nord au Crétacé inférieur, et ainsi l'évolution biotique est liée à la destruction du craton de Chine du Nord. Cependant, il reste largement inconnu comment les activités tectoniques ont impacté le développement de la biote de Jehol dans le nord-est de la Chine et d'autres biotes contemporains dans les régions voisines en Asie de l'Est et centrale. Il est proposé que les bassins de rift du Crétacé inférieur se sont déplacés vers l'est sur la marge nord du craton de Chine du Nord et de la Grande chaîne de Xing'an, et ce déplacement est considéré comme résultant du retrait vers l'est de la plaque paléo-Pacifique subductée. Le développement diachrone des bassins de rift a conduit aux variations latérales des séquences stratigraphiques et des environnements de dépôt, ce qui a à son tour influencé l'évolution spatio-temporelle de la biote de Jehol. Cette étude représente un effort pour explorer le lien entre l'évolution de la biote terrestre et la tectonique régionale et comment la tectonique des plaques a contraint l'évolution d'une biote terrestre à travers divers processus géologiques de surface.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.2107859118",
    doi = "10.1073/pnas.2107859118",
    openalex = "W3194987836",
    references = "doi101016jpalaeo201803006, doi101093nsrnwu055"
}

Les oiseaux sont parmi les organismes les plus diversifiés de la Terre, avec des espèces occupant une grande variété de niches à travers tous les grands biomes. En conséquence, les oiseaux sont essentiels à notre compréhension des écosystèmes modernes. Malheureusement, notre compréhension de l'histoire évolutive des écosystèmes modernes est entravée par des lacunes de connaissances concernant l'origine de la diversité actuelle des oiseaux et l'écologie des écosystèmes. Une partie cruciale pour remédier à ces insuffisances consiste à améliorer notre compréhension des premiers oiseaux, les avialans non aviens (c'est-à-dire les oiseaux non couronne), en particulier de leur régime alimentaire. Le régime alimentaire des avialans non aviens a fait l'objet de débats, en grande partie en raison des approches qualitatives ambiguës utilisées pour le reconstituer. Ici, nous passons en revue les méthodes pour déterminer le régime alimentaire chez les oiseaux modernes et fossiles (c'est-à-dire les oiseaux couronne) ainsi que chez les théropodes non aviens, et nous commentons leur utilité lorsqu'elles sont appliquées aux avialans non aviens. Nous utilisons cela pour proposer un ensemble d'approches quantitatives comparables afin d'établir le régime alimentaire des oiseaux fossiles et, sur cette base, fournir un consensus sur ce que nous savons actuellement du régime alimentaire des oiseaux fossiles. Bien qu'aucune approche unique ne puisse prédire avec précision le régime alimentaire chez les oiseaux, chacune peut exclure certains régimes alimentaires et réduire les possibilités alimentaires. Nous recommandons de combiner (i) la micropoussière dentaire, (ii) la reconstruction musculaire basée sur des repères, (iii) la géochimie des isotopes stables, (iv) les estimations de masse corporelle, (v) l'analyse morphométrique traditionnelle et/ou géométrique, (vi) la modélisation des leviers, et (vii) l'analyse par éléments finis pour reconstituer avec précision le régime alimentaire des oiseaux fossiles. Notre revue fournit des méthodologies spécifiques pour mettre en œuvre chaque approche et discute des complications que les futurs chercheurs doivent garder à l'esprit. Nous notons que les formes actuelles d'évaluation de la mésousure dentaire, de la morphométrie traditionnelle du crâne, de la morphométrie géométrique et de certains systèmes d'isotopes stables n'ont pas encore été prouvées efficaces pour discerner le régime alimentaire des oiseaux fossiles. Sur cette base, nous rapportons l'état actuel des connaissances sur le régime alimentaire des avialans non aviens, qui reste très incomplet. La condition alimentaire ancestrale chez les avialans non aviens reste incertaine en raison de données rares et de preuves contradictoires chez l'Archéoptéryx. Parmi les pygostyliens non aviens précoces, le Confuciusornis présente des preuves d'analyse par éléments finis et d'avantage mécanique pointant vers l'herbivorie, tandis que le Sapeornis ne possède que des preuves d'avantage mécanique indiquant la granivorie, ce qui est en accord avec les matériaux ingérés fossilisés connus pour ce taxon. L'enantiornithine ornithothoracine Shenqiornis présente des preuves d'avantage mécanique et de morphométrie pédale pointant vers la carnivorie. Chez le hongshanornithidé ornithuromorphe Hongshanornis, seul l'avantage mécanique indique la granivorie, mais cela est en accord avec les preuves d'ingestion de gastrolithes chez ce taxon. L'avantage mécanique et les poissons ingérés soutiennent la carnivorie chez l'ornithuromorphe songlingornithidé Yanornis. En raison de la rareté des attributions alimentaires robustes, aucune tendance claire dans l'évolution du régime alimentaire des avialans non aviens n'a encore émergé. La diversité alimentaire semble augmenter au fil du temps, mais cela est un biais de préservation associé à une prédominance de données provenant du Lagerstätte de Jehol du Crétacé inférieur. Avec ce nouveau cadre et notre synthèse des connaissances actuelles sur le régime alimentaire des avialans non aviens, nous nous attendons à ce que les connaissances sur le régime alimentaire et les tendances évolutives deviennent beaucoup plus claires dans les années à venir, en particulier à mesure que des fossiles provenant d'autres lieux et climats seront découverts. Cela permettra une compréhension plus profonde et plus robuste du rôle que les oiseaux ont joué dans les écosystèmes du Mésozoïque et de la manière dont cela s'est développé en leur rôle pivot dans les écosystèmes modernes.

@article{doi101111brv12743,
    author = "Miller, Case Vincent et Pittman, Michael",
    title = "Le régime alimentaire des premiers oiseaux basé sur des preuves modernes et fossiles et un nouveau cadre pour sa reconstruction",
    year = "2021",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Les oiseaux sont certains des organismes les plus diversifiés de la Terre, avec des espèces occupant une grande variété de niches à travers tous les grands biomes. En conséquence, les oiseaux sont essentiels à notre compréhension des écosystèmes modernes. Malheureusement, notre compréhension de l'histoire évolutive des écosystèmes modernes est entravée par des lacunes de connaissances concernant l'origine de la diversité moderne des oiseaux et l'écologie des écosystèmes. Une partie cruciale pour remédier à ces lacunes consiste à améliorer notre compréhension des premiers oiseaux, les avialans non aviens (c'est-à-dire non oiseaux-couronne), en particulier de leur régime alimentaire. Le régime alimentaire des avialans non aviens a fait l'objet de débats, en grande partie en raison des approches qualitatives ambiguës qui ont été utilisées pour le reconstruire. Ici, nous passons en revue les méthodes pour déterminer le régime alimentaire chez les oiseaux modernes et fossiles (c'est-à-dire oiseaux-couronne) ainsi que chez les théropodes non aviens, et nous commentons leur utilité lorsqu'elles sont appliquées aux avialans non aviens. Nous utilisons cela pour proposer un ensemble d'approches comparables et quantitatives afin d'établir le régime alimentaire des oiseaux fossiles et, sur cette base, fournir un consensus sur ce que nous savons actuellement du régime alimentaire des oiseaux fossiles. Bien qu'aucune approche unique ne puisse prédire précisément le régime alimentaire chez les oiseaux, chacune peut exclure certains régimes alimentaires et réduire les possibilités alimentaires. Nous recommandons de combiner (i) la micropoussière dentaire, (ii) la reconstruction musculaire basée sur des repères, (iii) la géochimie des isotopes stables, (iv) les estimations de masse corporelle, (v) l'analyse morphométrique traditionnelle et/ou géométrique, (vi) la modélisation des leviers, et (vii) l'analyse par éléments finis pour reconstruire avec précision le régime alimentaire des oiseaux fossiles. Notre revue fournit des méthodologies spécifiques pour mettre en œuvre chaque approche et discute des complications que les futurs chercheurs doivent garder à l'esprit. Nous notons que les formes actuelles d'évaluation de la mésousure dentaire, de la morphométrie traditionnelle du crâne, de la morphométrie géométrique et de certains systèmes d'isotopes stables n'ont pas encore été prouvées efficaces pour distinguer le régime alimentaire des oiseaux fossiles. Sur cette base, nous rapportons l'état actuel des connaissances sur le régime alimentaire des avialans non aviens, qui reste très incomplet. La condition alimentaire ancestrale chez les avialans non aviens reste incertaine en raison de données rares et de preuves contradictoires chez l'Archaeopteryx. Parmi les pygostyliens non aviens précoces, Confuciusornis présente des preuves d'analyse par éléments finis et d'avantage mécanique pointant vers l'herbivorie, tandis que Sapeornis ne possède que des preuves d'avantage mécanique indiquant la granivorie, ce qui est en accord avec les matériaux ingérés fossilisés connus pour ce taxon. L'enantiornithine ornithothoracine Shenqiornis présente des preuves d'avantage mécanique et de morphométrie pédale pointant vers la carnivorie. Chez le hongshanornithid ornithuromorphe Hongshanornis, seul l'avantage mécanique indique la granivorie, mais cela est en accord avec les preuves d'ingestion de gastrolithes chez ce taxon. L'avantage mécanique et les poissons ingérés soutiennent la carnivorie chez l'ornithuromorphe songlingornithid Yanornis. En raison de la rareté des attributions alimentaires robustes, aucune tendance claire dans l'évolution du régime alimentaire des avialans non aviens n'a encore émergé. La diversité alimentaire semble augmenter au fil du temps, mais cela est un biais de préservation associé à une prédominance de données provenant du Lagerstätte de Jehol du Crétacé inférieur. Avec ce nouveau cadre et notre synthèse des connaissances actuelles sur le régime alimentaire des avialans non aviens, nous nous attendons à ce que les connaissances sur le régime alimentaire et les tendances évolutives deviennent beaucoup plus claires dans les années à venir, en particulier à mesure que des fossiles provenant d'autres lieux et climats seront découverts. Cela permettra une compréhension plus profonde et plus robuste du rôle que les oiseaux ont joué dans les écosystèmes du Mésozoïque et de la manière dont cela s'est développé en leur rôle pivot dans les écosystèmes modernes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12743",
    doi = "10.1111/brv.12743",
    openalex = "W3080110636",
    references = "doi101002ar24241, doi101016jcretres2019104312, doi101016jcub201803042, doi101016jcub201910050, doi101038s4146701909259x, doi101080027246342013762708, doi101080027246342013794814, doi101098rsos140350, doi101111pala12270, doi101371journalpone0126791, doi10159023174889201500020001, doi107717peerj5831"
}

présentait un wulst et un palais segmenté, auparavant proposés comme ayant émergé au sein des oiseaux actuels. L'origine des Aves est marquée par des cerveaux plus grands et remodelés indiquant une sélection pour des télencéphales et des yeux relativement grands, mais pas par une taille corporelle unique. Les différences du système sensoriel, potentiellement liées à ces changements, pourraient aider à expliquer la survie aviaire par rapport aux autres dinosaures.

@article{doi101126sciadvabg7099,
    author = "Torres, Christopher R. et Norell, Mark A. et Clarke, Julia A.",
    title = "Évolution du neurocrâne et de la masse corporelle des oiseaux à travers l'extinction de masse du Crétacé terminal : La forme du cerveau aviaire a laissé les autres dinosaures pour compte",
    year = "2021",
    journal = "Science Advances",
    abstract = "présentait un wulst et un palais segmenté, auparavant proposés comme ayant émergé au sein des oiseaux actuels. L'origine des Aves est marquée par des cerveaux plus grands et remodelés indiquant une sélection pour des télencéphales et des yeux relativement grands, mais pas par une taille corporelle unique. Les différences du système sensoriel, potentiellement liées à ces changements, pourraient aider à expliquer la survie aviaire par rapport aux autres dinosaures.",
    url = "https://doi.org/10.1126/sciadv.abg7099",
    doi = "10.1126/sciadv.abg7099",
    openalex = "W3186419283",
    references = "doi101016jcub201804062, doi101098rsos170975, doi101111j155856461951tb02756x, doi101371journalpone0082000, doi10166613052"
}

Les communautés de dinosaures bien échantillonnées du Jurassique jusqu'au Crétacé supérieur précoce montrent une diversité taxonomique plus grande parmi les taxons de thérapsodes plus grands (>50 kg) que les communautés du Campanien-Maastrichtien, en particulier celles de l'Asie de l'Est/centrale et de la Laramidia. Les guildes de carnivores de grande taille dans les assemblages d'Asiamérique sont monopolisées par les tyrannosauridés, les prédateurs de taille moyenne (50–500 kg) adultes étant rares ou absents. En revanche, divers clades de thérapsodes sont trouvés occupant ces tailles corporelles dans des faunes plus anciennes, y compris les premiers tyrannosauroïdes. Les assemblages avec des prédateurs de « taille moyenne manquante » ne sont pas trouvés avoir une diversité correspondante plus faible d'espèces de proies potentielles enregistrées dans ces mêmes faunes. Les niches de « taille moyenne manquante » dans les guildes de thérapsodes de la Laramidia et de l'Asie du Crétacé supérieur tardif ont peut-être été assimilées par les juvéniles et les subadultes des espèces tyrannosauridées, fonctionnellement distinctes de leurs écomorphologies adultes. Il est spéculé que si les tyrannosauridés ont assimilé les niches précédemment occupées par les prédateurs de thérapsodes de taille moyenne, nous nous attendrions à l'évolution de transitions morphologiques distinctes et peut-être au retard de l'atteinte de la maturité somatique chez les espèces de ce taxon.

@article{doi101139cjes20200174,
    author = "Holtz, Thomas R.",
    title = "Theropod guild structure and the tyrannosaurid niche assimilation hypothesis: implications for predatory dinosaur macroecology and ontogeny in later Late Cretaceous Asiamerica 1",
    year = "2021",
    journal = "Canadian Journal of Earth Sciences",
    abstract = "Well-sampled dinosaur communities from the Jurassic through the early Late Cretaceous show greater taxonomic diversity among larger (>50 kg) theropod taxa than communities of the Campano-Maastrichtian, particularly to those of eastern/central Asia and Laramidia. The large carnivore guilds in Asiamerican assemblages are monopolized by tyrannosaurids, with adult medium-sized (50–500 kg) predators rare or absent. In contrast, various clades of theropods are found to occupy these body sizes in earlier faunas, including early tyrannosauroids. Assemblages with “missing middle-sized” predators are not found to have correspondingly sparser diversity of potential prey species recorded in these same faunas. The “missing middle-sized” niches in the theropod guilds of Late Cretaceous Laramidia and Asia may have been assimilated by juvenile and subadults of tyrannosaurid species, functionally distinct from their adult ecomorphologies. It is speculated that if tyrannosaurids assimilated the niches previously occupied by mid-sized theropod predators, we would expect the evolution of distinct transitions in morphology and possibly the delay of the achievement of somatic maturity in species of this taxon.",
    url = "https://doi.org/10.1139/cjes-2020-0174",
    doi = "10.1139/cjes-2020-0174",
    openalex = "W3168560974",
    references = "doi101016jcub201803042, doi101017pab201519, doi101017s0094837300011891, doi10103846266, doi101038nature02699, doi101038ncomms3827, doi101038s4155901908880, doi101038s41598019517095, doi101038srep20252, doi101073pnas1600140113, doi101093nsrnwu055, doi101098rspb20202258, doi101111brv12638, doi101111j1469185x201000137x, doi101111j15023931200900187x, doi101126sciadvaax6250, doi101126science1065522, doi101126science1161833, doi101126science28454232137, doi101139cjes20120185, doi101139cjes20170031, doi101139cjes20190019, doi101371journalpone0054329, doi101371journalpone0188426, doi1017161paleo180818764, doi1023071942327, doi1023072411924, doi1029920070860302, doi103897zookeys92847517, doi107717peerj9192, openalexw2183707334, openalexw2971401580"
}

.

@article{doi101038s4158602205445y,
    author = "Benito, Juan et Kuo, Pei‐Chen et Widrig, Klara E. et Jagt, John W.M. et Field, Daniel J.",
    title = "Cretaceous ornithurine supports a neognathous crown bird ancestor",
    year = "2022",
    journal = "Nature",
    abstract = ".",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-022-05445-y",
    doi = "10.1038/s41586-022-05445-y",
    openalex = "W4310483852",
    references = "doi101080027246342013762708, doi101098rsos170975, doi1012060003009044011"
}

Les confuciusornithidés sont les premiers oiseaux à bec connus et constituent le seul clade riche en espèces d'oiseaux pygostyliens du Crétacé inférieur qui ont existé avant la cladogenèse des Ornithothoraces. Ici, nous rapportons une nouvelle espèce de confuciusornithidé du Crétacé inférieur du Liaoning occidental, dans le nord-est de la Chine. Par rapport aux autres confuciusornithidés, cette nouvelle espèce et le Yangavis confucii récemment rapporté montrent tous deux des preuves d'une capacité de vol plus forte, bien que les ailes des deux taxons diffèrent à bien des égards. Nos analyses aérodynamiques sous phylogénie indiquent que des modes variés d'adaptation au vol sont apparus à travers la diversité des confuciusornithidés, et dans une moindre mesure au cours de leur ontogenèse, et suggèrent spécifiquement qu'une tendance vers une capacité de vol améliorée et un changement de stratégie de vol se sont produits dans l'évolution des confuciusornithidés. Le nouveau confuciusornithidé diffère le plus nettement des autres oiseaux du Mésozoïque par la présence d'un os supplémentaire en forme de coussinet dans le premier doigt de l'aile, une caractéristique très inhabituelle qui aurait pu aider à répondre aux demandes fonctionnelles du vol à une étape où la croissance squelettique était encore incomplète. La nouvelle découverte illustre de manière frappante la diversité morphologique, développementale et fonctionnelle des premiers oiseaux à bec.

@article{doi101038s42003022043166,
    author = "Wang, Renfei et Hu, Dongyu et Zhang, Meisheng et Wang, Shiying et Zhao, Qi et Sullivan, Corwin et Xu, Xing",
    title = "Un nouvel oiseau confuciusornithidé avec une ossification épiphysaire secondaire révèle des changements phylogénétiques dans le mode de vol des confuciusornithidés.",
    year = "2022",
    journal = "Communications biology",
    abstract = "Les confuciusornithidés sont les premiers oiseaux à bec connus et constituent le seul clade riche en espèces d'oiseaux pygostyliens du Crétacé inférieur qui ont existé avant la cladogenèse des Ornithothoraces. Ici, nous rapportons une nouvelle espèce de confuciusornithidé du Crétacé inférieur du Liaoning occidental, dans le nord-est de la Chine. Par rapport aux autres confuciusornithidés, cette nouvelle espèce et le Yangavis confucii récemment rapporté montrent tous deux des preuves d'une capacité de vol plus forte, bien que les ailes des deux taxons diffèrent à bien des égards. Nos analyses aérodynamiques sous phylogénie indiquent que des modes variés d'adaptation au vol sont apparus à travers la diversité des confuciusornithidés, et dans une moindre mesure au cours de leur ontogenèse, et suggèrent spécifiquement qu'une tendance vers une capacité de vol améliorée et un changement de stratégie de vol se sont produits dans l'évolution des confuciusornithidés. Le nouveau confuciusornithidé diffère le plus nettement des autres oiseaux du Mésozoïque par la présence d'un os supplémentaire en forme de coussinet dans le premier doigt de l'aile, une caractéristique très inhabituelle qui aurait pu aider à répondre aux demandes fonctionnelles du vol à une étape où la croissance squelettique était encore incomplète. La nouvelle découverte illustre de manière frappante la diversité morphologique, développementale et fonctionnelle des premiers oiseaux à bec.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9772404/",
    doi = "10.1038/s42003-022-04316-6",
    openalex = "W4312061382",
    pmcid = "PMC9772404",
    pmid = "36543908",
    references = "doi101002jmor10013, doi101038nature07447, doi101111cla12160, doi101111j14697580200600534x, doi101126science1252243, doi101139e03011, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, doi101371journalpone0007390, doi101525california97805202735280030004, doi102992014590582006371pon20co2"
}

-like upstroke. Both factors are supported by a slender ventral body profile. These data validate the ancestral shoulder/chest flight system and provide insights into novel upstroke-enhanced flight strokes and early sternum loss, filling important gaps in our understanding of the appearance of modern flight.

@article{doi101073pnas2205476119,
    author = "Pittman, Michael et Kaye, Thomas G. et Wang, Xiaoli et Zheng, Xiaoting et Dececchi, T. Alexander et Hartman, Scott",
    title = "L'anatomie molle préservée confirme la poussée ascendante propulsée par les épaules chez les premiers volatiles theropodes, révèle une poussée ascendante améliorée chez les premiers pygostyliens et explique la perte précoce du sternum",
    year = "2022",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "-like upstroke. Both factors are supported by a slender ventral body profile. These data validate the ancestral shoulder/chest flight system and provide insights into novel upstroke-enhanced flight strokes and early sternum loss, filling important gaps in our understanding of the appearance of modern flight.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.2205476119",
    doi = "10.1073/pnas.2205476119",
    openalex = "W4308964372",
    references = "doi101016jcub202111060, doi107554elife76086"
}

Résumé Les mouvements indépendants et la flexibilité de diverses parties du crâne, appelés cinétique crânienne, constituent une innovation évolutive qui n'est observée chez les vertébrés vivants que chez certains squamates et oiseaux de couronne, et sont considérés comme un facteur majeur sous-tendant une grande partie de la diversité phénotypique et écologique énorme des oiseaux vivants, le groupe le plus diversifié d'amniotes existants. Comparé au postcrâne, notre compréhension de l'assemblage évolutif du crâne d'oiseau moderne caractéristique a été entravée par des registres fossiles épars de matériaux crâniens précoces, avec des hypothèses concurrentes concernant le développement évolutif de la cinétique crânienne chez les premiers membres des avialans. Ici, une reconstruction tridimensionnelle détaillée du crâne de l'enantiornithine du Crétacé inférieur Yuanchuavis kompsosoura permet sa description approfondie, y compris des éléments peu connus parmi les avialans à divergence précoce mais centraux pour décrypter l'assemblage en mosaïque des caractéristiques nécessaires à la cinétique crânienne avienne moderne. Notre reconstruction du crâne montre une conservation évolutive et fonctionnelle des régions temporales et palatines en maintenant la configuration ancestrale de dinosaure théropode à l'intérieur du crâne de cet oiseau dérivé et volant. L'analyse morphométrique géométrique du palatin suggère que la perte du processus jugal représente la première étape des modifications structurelles de cet élément menant à la condition d'oiseau de couronne cinétique. Le mélange de structures temporales et palatines plésiomorphes avec un rostre avialan dérivé et un squelette postcrânien encapsulés dans Yuanchuavis manifeste le rôle clé du mosaïcisme évolutif et de l'expérimentation dans la diversification précoce des oiseaux.

@misc{doi10110120220713499923,
    author = "Wang, Min et Stidham, Thomas A. et O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Insight into the evolutionary assemblage of cranial kinesis from a Cretaceous bird",
    year = "2022",
    booktitle = "bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)",
    abstract = "Résumé Les mouvements indépendants et la flexibilité de diverses parties du crâne, appelés cinétique crânienne, constituent une innovation évolutive qui n'est observée chez les vertébrés vivants que chez certains squamates et oiseaux de couronne, et sont considérés comme un facteur majeur sous-tendant une grande partie de la diversité phénotypique et écologique énorme des oiseaux vivants, le groupe le plus diversifié d'amniotes existants. Comparé au postcrâne, notre compréhension de l'assemblage évolutif du crâne d'oiseau moderne caractéristique a été entravée par des registres fossiles épars de matériaux crâniens précoces, avec des hypothèses concurrentes concernant le développement évolutif de la cinétique crânienne chez les premiers membres des avialans. Ici, une reconstruction tridimensionnelle détaillée du crâne de l'enantiornithine du Crétacé inférieur Yuanchuavis kompsosoura permet sa description approfondie, y compris des éléments peu connus parmi les avialans à divergence précoce mais centraux pour décrypter l'assemblage en mosaïque des caractéristiques nécessaires à la cinétique crânienne avienne moderne. Notre reconstruction du crâne montre une conservation évolutive et fonctionnelle des régions temporales et palatines en maintenant la configuration ancestrale de dinosaure théropode à l'intérieur du crâne de cet oiseau dérivé et volant. L'analyse morphométrique géométrique du palatin suggère que la perte du processus jugal représente la première étape des modifications structurelles de cet élément menant à la condition d'oiseau de couronne cinétique. Le mélange de structures temporales et palatines plésiomorphes avec un rostre avialan dérivé et un squelette postcrânien encapsulés dans Yuanchuavis manifeste le rôle clé du mosaïcisme évolutif et de l'expérimentation dans la diversification précoce des oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.1101/2022.07.13.499923",
    doi = "10.1101/2022.07.13.499923",
    openalex = "W4285597292",
    references = "doi101111joa13588"
}

Le clade éteint globalement réparti Enantiornithes comprend la radiation précoce la plus diversifiée d'oiseaux au Mésozoïque, avec des espèces présentant une large gamme de tailles corporelles, de morphologies et d'écologies. Le fossile d'un nouvel oiseau enantiornithine, Brevirostruavis macrohyoideus gen. et sp. nov., de la formation de Jiufotang du Crétacé inférieur dans la province du Liaoning, dans le nord-est de la Chine, préserve quelques caractéristiques squelettiques importantes précédemment inconnues chez les oiseaux de tige et actuels, y compris un élément osseux hyoïde extrêmement allongé (légèrement plus court que le crâne), combiné à un rostrum crânien court. Le long hyoïde fournit une preuve directe de l'évolution d'une alimentation spécialisée chez cette espèce éteinte et semble similaire à la langue hautement mobile qui est mobilisée par les épibranchiaux paires présents chez les colibris, les nectarivores et les pics vivants. Le lien probable entre l'acquisition de nourriture et la protrusion de la langue a pu être un facteur clé dans l'évolution indépendante de hyobranchiaux particulièrement allongés chez les premiers oiseaux.

@article{doi101111joa13588,
    author = "Li, Zhiheng et Wang, Min et Stidham, Thomas A et Zhou, Zhonghe et Clarke, Julia",
    title = "Nouvelle évolution d'une langue hyper-allongée chez un enantiornithine du Crétacé en Chine et l'évolution de l'appareil hyolingual et de l'alimentation chez les oiseaux.",
    year = "2022",
    journal = "Journal of anatomy",
    abstract = "Le clade éteint globalement réparti Enantiornithes comprend la radiation précoce la plus diversifiée d'oiseaux au Mésozoïque, avec des espèces présentant une large gamme de tailles corporelles, de morphologies et d'écologies. Le fossile d'un nouvel oiseau enantiornithine, Brevirostruavis macrohyoideus gen. et sp. nov., de la formation de Jiufotang du Crétacé inférieur dans la province du Liaoning, dans le nord-est de la Chine, préserve quelques caractéristiques squelettiques importantes précédemment inconnues chez les oiseaux de tige et actuels, y compris un élément osseux hyoïde extrêmement allongé (légèrement plus court que le crâne), combiné à un rostrum crânien court. Le long hyoïde fournit une preuve directe de l'évolution d'une alimentation spécialisée chez cette espèce éteinte et semble similaire à la langue hautement mobile qui est mobilisée par les épibranchiaux paires présents chez les colibris, les nectarivores et les pics vivants. Le lien probable entre l'acquisition de nourriture et la protrusion de la langue a pu être un facteur clé dans l'évolution indépendante de hyobranchiaux particulièrement allongés chez les premiers oiseaux.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8930807/",
    doi = "10.1111/joa.13588",
    openalex = "W3215467381",
    pmcid = "PMC8930807",
    pmid = "34854094",
    references = "doi1010292004gl019790, doi101038nature01420, doi101038s4146702020314w, doi101073pnas1011924108, doi101093nsrnwu055, doi101111j10960031200800217x, doi101111j10960031200900258x, doi101111j14697580200800880x, doi101111joa13588, doi101139e03011, doi1016660022336020030770822mbatho20co2"
}

, représentant une étape de transition dans l'évolution de l'appareil de vol avant l'apparition d'un canal triosséal osseux entièrement fermé comme chez les oiseaux modernes. Notre étude révèle des variations supplémentaires spécifiques aux lignées dans l'anatomie de la ceinture pectorale, ainsi qu'une modification significative de la ceinture pectorale le long de la lignée menant aux oiseaux couronne. Ces modifications ont produit des morphologies de ceinture pectorale diverses parmi les oiseaux du Mésozoïque, ce qui a permis l'émergence d'une gamme correspondante de niveaux et de styles de capacités pendant l'évolution précoce du vol.

@article{doi107554elife76086,
    author = "Wang, Shiying et Ma, Yubo et Wu, Qian et Wang, Min et Hu, Dongyu et Sullivan, Corwin et Xu, Xing",
    title = "Restauration numérique des ceintures pectorales de deux oiseaux du Crétacé inférieur et implications pour l'évolution du vol précoce",
    year = "2022",
    journal = "eLife",
    abstract = ", représentant une étape de transition dans l'évolution de l'appareil de vol avant l'apparition d'un canal triosséal osseux entièrement fermé comme chez les oiseaux modernes. Notre étude révèle des variations supplémentaires spécifiques aux lignées dans l'anatomie de la ceinture pectorale, ainsi qu'une modification significative de la ceinture pectorale le long de la lignée menant aux oiseaux couronne. Ces modifications ont produit des morphologies de ceinture pectorale diverses parmi les oiseaux du Mésozoïque, ce qui a permis l'émergence d'une gamme correspondante de niveaux et de styles de capacités pendant l'évolution précoce du vol.",
    url = "https://doi.org/10.7554/elife.76086",
    doi = "10.7554/elife.76086",
    openalex = "W4226064306",
    references = "doi10103845769, doi101038nature01342, doi101038nature02898, doi101038nature03996, doi101038nature08322, doi101038nature10288, doi101080027246342012652321, doi101086407902, doi101126science29054981955, doi1012067481, doi102992014590582006371pon20co2"
}

illustre le rôle clé du mosaïcisme évolutif et de l'expérimentation dans la diversification précoce des oiseaux.

@article{doi107554elife81337,
    author = "Wang, Min et Stidham, Thomas A. et O’Connor, Jingmai K. et Zhou, Zhonghe",
    title = "Aperçu sur l'assemblage évolutif de la cinétique crânienne chez un oiseau du Crétacé",
    year = "2022",
    journal = "eLife",
    abstract = "illustre le rôle clé du mosaïcisme évolutif et de l'expérimentation dans la diversification précoce des oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.7554/elife.81337",
    doi = "10.7554/elife.81337",
    openalex = "W4310947376",
    references = "doi101111joa13588"
}

Ichthyornis a longtemps été reconnu comme un taxon fossile pivot pour comprendre les dernières étapes de la transition dinosaure-oiseau, mais peu de nouveaux matériaux postcrâniens significatifs ont été mis au jour depuis les descriptions initiales de squelettes partiels au 19e siècle. Ici, nous présentons de nouvelles informations sur la morphologie postcrânienne d'Ichthyornis à partir de 40 spécimens précédemment non décrits, offrant l'évaluation morphologique la plus complète à ce jour du squelette postcrânien d'Ichthyornis. Le nouveau matériel comprend quatre squelettes partiellement complets et de nombreux éléments isolés bien conservés, permettant de nouvelles observations anatomiques telles que des insertions musculaires précédemment non décrites pour les euornithes du Mésozoïque. Parmi les éléments qui étaient auparavant inconnus ou mal représentés pour Ichthyornis, les nouveaux spécimens incluent une série axiale presque complète, une furcula portant un hypocleideum, des os carpiens radiaux, des fibules, un tarsométatarsus complet portant un hypotarse rudimentaire, et l'un des premiers sternas presque complets en trois dimensions connus d'un avialan du Mésozoïque. Plusieurs phalanges pédales sont conservées, révélant un pied remarquablement élargi, probablement lié à la nage propulsée par les pattes. Bien que diagnostiquables comme Ichthyornis, les nouveaux spécimens présentent un degré substantiel de variation morphologique, dont certaines peuvent être liées à des changements ontogénétiques. Les analyses phylogénétiques incorporant nos nouvelles données et employant des ensembles de données morphologiques alternatifs récupèrent Ichthyornis en amont de Hesperornithes et Iaceornis, en accord avec certaines hypothèses récentes concernant la topologie de la portion la plus proche de la couronne du groupe tige avien, et nous établissons des noms de clades définis phylogénétiquement pour les sous-clades aviens pertinents afin de faciliter un discours cohérent dans les travaux futurs. Les nouvelles informations fournies par ces spécimens améliorent notre compréhension de l'évolution morphologique parmi les avialans non néornithines les plus proches de la couronne immédiatement précédant l'origine du groupe couronne d'oiseaux.

@article{doi107717peerj13919,
    author = "Benito, Juan et Chen, Albert et Wilson, Laura E. et Bhullar, Bhart‐Anjan S. et Burnham, David A. et Field, Daniel J.",
    title = "Quarante nouveaux spécimens d'Ichthyornis offrent un aperçu sans précédent de la morphologie postcrânienne des oiseaux du groupe tige vers la couronne",
    year = "2022",
    journal = "PeerJ",
    abstract = "Ichthyornis a longtemps été reconnu comme un taxon fossile pivot pour comprendre les dernières étapes de la transition dinosaure-oiseau, mais peu de nouveaux matériaux postcrâniens significatifs ont été mis au jour depuis les descriptions initiales de squelettes partiels au 19e siècle. Ici, nous présentons de nouvelles informations sur la morphologie postcrânienne d'Ichthyornis à partir de 40 spécimens précédemment non décrits, offrant l'évaluation morphologique la plus complète à ce jour du squelette postcrânien d'Ichthyornis. Le nouveau matériel comprend quatre squelettes partiellement complets et de nombreux éléments isolés bien conservés, permettant de nouvelles observations anatomiques telles que des insertions musculaires précédemment non décrites pour les euornithes du Mésozoïque. Parmi les éléments qui étaient auparavant inconnus ou mal représentés pour Ichthyornis, les nouveaux spécimens incluent une série axiale presque complète, une furcula portant un hypocleideum, des os carpiens radiaux, des fibules, un tarsométatarsus complet portant un hypotarse rudimentaire, et l'un des premiers sternas presque complets en trois dimensions connus d'un avialan du Mésozoïque. Plusieurs phalanges pédales sont conservées, révélant un pied remarquablement élargi, probablement lié à la nage propulsée par les pattes. Bien que diagnostiquables comme Ichthyornis, les nouveaux spécimens présentent un degré substantiel de variation morphologique, dont certaines peuvent être liées à des changements ontogénétiques. Les analyses phylogénétiques incorporant nos nouvelles données et employant des ensembles de données morphologiques alternatifs récupèrent Ichthyornis en amont de Hesperornithes et Iaceornis, en accord avec certaines hypothèses récentes concernant la topologie de la portion la plus proche de la couronne du groupe tige avien, et nous établissons des noms de clades définis phylogénétiquement pour les sous-clades aviens pertinents afin de faciliter un discours cohérent dans les travaux futurs. Les nouvelles informations fournies par ces spécimens améliorent notre compréhension de l'évolution morphologique parmi les avialans non néornithines les plus proches de la couronne immédiatement précédant l'origine du groupe couronne d'oiseaux.",
    url = "https://doi.org/10.7717/peerj.13919",
    doi = "10.7717/peerj.13919",
    openalex = "W4312112859",
    references = "doi101016jcretres200806007, doi101016jcub202006105, doi101016jpalaeo201803006, doi101038s4146701909259x, doi101073pnas1613813113, doi101111brv12666, doi101139cjes20170031, doi101139cjes20200145, doi1012060003009044011, doi101371journalpone0032623, doi10166613052, doi103389fevo2022828006, doi107717peerj1032, doi107717peerj7247, doi107717peerj9192"
}

En tant que l'un des mystères des vertébrés volants, les ptérosaures ont été complètement éteints lors de l'événement d'extinction K-Pg, ce qui a entravé notre compréhension de leur vol. Les études récentes sur le vol des ptérosaures utilisent généralement les oiseaux comme analogies, car leur ceinture scapulaire partage de nombreuses caractéristiques. Cependant, il a également été proposé que ces deux groupes puissent différer sur certains mécanismes de vol critiques, tels que les muscles primaires pour la phase de battement ascendant des ailes. Ici, nous décrivons et caractérisons pour la première fois les détails de la morphologie et de l'histologie de la ceinture pectorale de Hamipterus du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine. Nos recherches révèlent que l'omoplate et le coracoïde de Hamipterus forment une articulation synostotique, représentant une adaptation distincte de la ceinture pectorale pendant l'évolution du vol des ptérosaures, différente de celle des oiseaux. Le résidu du cartilage articulaire de la fosse glénoïde soutient le potentiel de préservation du tissu cartilagineux à cet endroit. La morphologie du processus acrocoracoïde de Hamipterus indique qu'il peut fonctionner comme une poulie pour le M. supracoracoïdeus, car la puissance principale du battement ascendant du vol ressemble à celle des oiseaux. Mais le type selle de l'articulation scapulaire du ptérosaure peut limiter la rotation de la tête de l'humérus, suggérant un mécanisme particulier pour contrôler l'angle d'attaque, contrairement aux oiseaux. La présence à la fois de similitudes et de différences entre l'appareil de vol des ptérosaures et des oiseaux est soulignée dans nos recherches, ce qui peut être lié au mécanisme de vol et à l'adaptation fonctionnelle des membres antérieurs. La caractéristique distinctive de l'appareil de vol des ptérosaures doit être traitée avec prudence dans les recherches futures, pour mieux comprendre la vie de ce vertébré volant unique et éteint.

@article{doi101002ar25167,
    author = "Wu, Qian et Chen, He et Li, Zhiheng et Jiang, Shunxing et Wang, Xiaolin et Zhou, Zhonghe",
    title = "La morphologie et l'histologie de la ceinture pectorale de Hamipterus (Pterosauria), du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine",
    year = "2023",
    journal = "The Anatomical Record",
    abstract = "En tant que l'un des mystères des vertébrés volants, les ptérosaures ont été complètement éteints lors de l'événement d'extinction K-Pg, ce qui a entravé notre compréhension de leur vol. Les études récentes sur le vol des ptérosaures utilisent généralement les oiseaux comme analogies, car leur ceinture scapulaire partage de nombreuses caractéristiques. Cependant, il a également été proposé que ces deux groupes puissent différer sur certains mécanismes de vol critiques, tels que les muscles primaires pour la phase de battement ascendant des ailes. Ici, nous décrivons et caractérisons pour la première fois les détails de la morphologie et de l'histologie de la ceinture pectorale de Hamipterus du Crétacé inférieur du nord-ouest de la Chine. Nos recherches révèlent que l'omoplate et le coracoïde de Hamipterus forment une articulation synostotique, représentant une adaptation distincte de la ceinture pectorale pendant l'évolution du vol des ptérosaures, différente de celle des oiseaux. Le résidu du cartilage articulaire de la fosse glénoïde soutient le potentiel de préservation du tissu cartilagineux à cet endroit. La morphologie du processus acrocoracoïde de Hamipterus indique qu'il peut fonctionner comme une poulie pour le M. supracoracoïdeus, car la puissance principale du battement ascendant du vol ressemble à celle des oiseaux. Mais le type selle de l'articulation scapulaire du ptérosaure peut limiter la rotation de la tête de l'humérus, suggérant un mécanisme particulier pour contrôler l'angle d'attaque, contrairement aux oiseaux. La présence à la fois de similitudes et de différences entre l'appareil de vol des ptérosaures et des oiseaux est soulignée dans nos recherches, ce qui peut être lié au mécanisme de vol et à l'adaptation fonctionnelle des membres antérieurs. La caractéristique distinctive de l'appareil de vol des ptérosaures doit être traitée avec prudence dans les recherches futures, pour mieux comprendre la vie de ce vertébré volant unique et éteint.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ar.25167",
    doi = "10.1002/ar.25167",
    openalex = "W4320709116",
    references = "doi107554elife76086"
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@incollection{doi10100797830311485211,
    author = "Ritchison, Gary",
    title = "Origine et évolution des oiseaux",
    year = "2023",
    booktitle = "Sciences de la vie fascinantes",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-14852-1\_1",
    doi = "10.1007/978-3-031-14852-1\_1",
    openalex = "W4388445452",
    references = "doi101017s1464793104006517, doi101038nature11631, doi101038nature15697, doi101038s42003022043166, doi101073pnas0401892101, doi101073pnas071034898, doi101073pnas0811087106, doi101111j14754983200600585x, doi101126science1157704, doi101126science1253451, doi101126science20844481095, doi1016410006356820010510933teotwa20co2, doi107717peerj5831"
}

Récemment, Nature Communications a publié une étude sur les habitudes alimentaires d'un oiseau éteint et ancien appelé Jeholornis, provenant de la biote du Crétacé inférieur de Jehol en Chine, menée par des chercheurs de l'Institut de paléontologie des vertébrés et de paléoanthropologie de l'Académie chinoise des sciences.1Wu Y. Ge Y. Hu H. et al.Intra-gastric phytoliths provide evidence for folivory in basal avialans of the Early Cretaceous Jehol Biota.Nat. Commun. 2023; 14: 4558Crossref PubMed Scopus (0) Google Scholar Jeholornis et ses espèces étroitement apparentées sont considérées comme faisant partie de la deuxième lignée la plus primitive de l'arbre généalogique des oiseaux, conservant une longue queue osseuse dinosaurienne, de petites dents et de grandes griffes sur les ailes. Adoptant une approche interdisciplinaire, l'équipe scientifique a découvert des centaines de phytoliths originaires des feuilles du groupe d'angiospermes basaux appelé magnoliidées (qui comprend les magnolias, le cannellier et l'avocatiers vivants), tout en examinant les résidus gastriques d'un fossile de Jeholornis juvénile bien conservé d'il y a 120 millions d'années. Ces phytoliths fossiles constituent la première confirmation aidant à pointer vers l'origine et l'évolution du folivore chez les oiseaux anciens et à esquisser une histoire scientifique intéressante sur les premières interactions entre les oiseaux et les plantes à fleurs (Figure 1). Les angiospermes dominent une grande partie du paysage à travers les écosystèmes terrestres de notre planète aujourd'hui, et ils jouent un rôle clé dans le maintien et la structuration de la biodiversité à travers différentes interactions écologiques et groupes phylogénétiques, y compris les humains. Basé sur les relations mutualistes étroites entre les oiseaux vivants et les plantes (dans la dispersion des graines, la pollinisation et le mécanisme de consommation de nectar, par exemple), les oiseaux ont longtemps été notés pour leur rôle crucial de coévolution dans l'origine et la diversification précoce des angiospermes. Cependant, le manque de preuves fossiles explicites d'interactions entre oiseaux et plantes a rendu difficile la test et le soutien complet de cette hypothèse jusqu'à récemment. La préservation exceptionnelle des fossiles dans la biote du Crétacé inférieur de Jehol dans le nord-est de la Chine a conduit à une série de découvertes importantes concernant l'évolution des angiospermes anciennes et les premiers assemblages d'oiseaux diversifiés connus. Cette biote permet une compréhension sans précédent des écosystèmes forestiers du Mésozoïque grâce à sa surabondance de fossiles de vertébrés, d'invertébrés et de plantes spectaculeusement bien conservés. Pour explorer davantage les relations écologiques entre les angiospermes du Crétacé et les premiers oiseaux, notre équipe de chercheurs a pionnier l'application de l'analyse des phytoliths pour étudier les contenus gastriques d'un oiseau herbivore ancien. En tant que l'une des lignées les plus anciennes d'oiseaux, les inférences sur les habitudes alimentaires de Jeholornis sont primordiales pour la compréhension globale de l'origine de la diversité écologique des oiseaux, ainsi que pour aider à déduire la longévité des interactions étroites et potentiellement coévolutives entre les oiseaux et les plantes à fleurs. Des travaux antérieurs ont montré que les plus proches parents des oiseaux, les dinosaures theropodes plumeux de petite taille comme les troodontidés et les droméosauridés, étaient des prédateurs. En revanche, de nombreux oiseaux du Crétacé inférieur étaient des herbivores volants arboricoles, pointant vers un changement précoce dans les régimes alimentaires, les systèmes digestifs et les écologies dans l'évolution des oiseaux, ainsi que l'initiation d'interactions directes entre les oiseaux et les plantes (à fleurs). L'impact de leur alimentation végétale se voit dans la diminution évolutive du nombre et de la taille de leurs dents et la présence de gastrolithes (pierres dans l'estomac ou le gésier qui pourraient fonctionner dans le broyage de matériel végétal), comme en témoignent les restes fossiles dans les squelettes. Bien que la présence de gastrolithes à l'intérieur des fossiles pointe vers un régime herbivore large parmi les premiers oiseaux, les détails de ce menu alimentaire ont été évasifs. Une partie des meilleures preuves d'un régime à base de plantes chez les oiseaux anciens provient d'autres spécimens fossiles de Jeholornis avec des graines conservées dans leur système digestif. Maintenant, avec l'ajout de feuilles à ce répertoire d'articles alimentaires végétaux, nous pouvons voir que les lignées précoces d'oiseaux pouvaient obtenir et extraire des nutriments non seulement à partir d'articles riches en énergie et faciles à digérer comme les fruits et les graines, mais aussi à partir d'articles moins facilement transformés comme les feuilles. Jeholornis marque également la première preuve d'une niche herbivore arboricole au sein de l'arbre généalogique des oiseaux, un rôle écologique important et commun que les oiseaux occupent dans le monde entier aujourd'hui. L'identification de plantes spécifiques dans le régime alimentaire de Jeholornis a nécessité une myriade de méthodes analytiques et de collecte de données. Nos membres de l'équipe scientifique ont intégré une reconstruction complète sur l'évolution précoce des habitudes alimentaires des oiseaux anciens avec l'association d'habitudes alimentaires similaires d'oiseaux actuels. Les approches incluent la tomographie par ordinateur (CT), la microscopie électronique à balayage et l'évaluation quantitative par analyse morphométrique de la forme de la mandibule de l'oiseau. Plus spécifiquement, notre équipe de recherche a tenté d'extraire les restes de phytolithes de plantes à partir des résidus de l'estomac à l'intérieur du squelette fossilisé de Jeholornis pour analyser son régime végétal. En prélevant des échantillons de la zone autour des gastrolithes conservés et en traitant les échantillons pour les phytolithes, des centaines de phytolithes de plusieurs taxons de plantes ont été récupérés. Des échantillons similaires provenant de l'extérieur du squelette fossile n'ont produit aucun phytolithe. Cela a confirmé que les phytolithes provenaient de et étaient restreints au corps de l'oiseau. Après une comparaison minutieuse avec plus de 4 000 types de phytolithes modernes représentant une grande partie de la diversité végétale dérivée de bases de données complètes et de collections de phytolithes, nous avons conclu que la plupart des phytolithes fossiles identifiables de l'estomac proviennent des feuilles du groupe d'angiospermes (clade) appelé magnoliidées. Bien que ces phytolithes magnoliidées ne documentent pas seulement la diversité végétale supplémentaire au sein de la biote de Jehol et représentent certains des fossiles les plus anciens du clade magnoliidées, elles représentent également la première identification d'un sType spécifique de plante au sein du régime alimentaire d'un oiseau précoce. Outre les magnoliidés, Jeholornis consommait une variété d'autres parties de plantes arboricoles, et cette découverte marque probablement le début de ce qui est aujourd'hui un régime herbivore répandu chez les oiseaux. Pour étayer davantage l'hypothèse de l'alimentation par feuilles et d'un régime herbivore plus large chez Jeholornis, la forme tridimensionnelle de la mandibule a été comparée entre différents groupes écologiques d'oiseaux vivants et Jeholornis, en utilisant une analyse morphométrique sur des mâchoires inférieures scannées par CT. Les résultats analytiques ont placé la mâchoire inférieure de Jeholornis comme la plus similaire à celles des oiseaux vivants qui mangent principalement des plantes, en particulier le spécialiste des feuilles vivant, le hoatzin, trouvé dans les forêts tropicales d'Amérique du Sud. Cette ligne indépendante de preuves comparatives concorde avec les résultats de l'analyse des phytolithes et contribue à renforcer les hypothèses relatives au régime et aux habitudes de cet oiseau éteint. Plus important encore, l'application de l'analyse des phytolithes au sein d'un squelette de vertébré mésozoïque fossile a permis de débloquer un aspect clé de l'étude paléobiologique qui avait été abordé précédemment par des moyens largement indirects. De plus, la réalisation de ce projet de recherche interdisciplinaire et collaboratif a non seulement fourni des preuves directes du régime alimentaire spécifique d'un oiseau précoce, mais a également contribué à construire un nouveau cadre pour étendre davantage l'étude de l'interplay co-évolutif à long terme non seulement entre les oiseaux et les plantes à fleurs, mais aussi des liens plus larges entre les vertébrés, les plantes et leur environnement. Avec cette découverte, il est facile d'imaginer que les origines évolutives d'activités courantes aujourd'hui, comme les oiseaux tirant leur nutrition de matériaux végétaux et obtenant certaines de leurs couleurs de plumes sexuellement sélectionnées vives de ces éléments alimentaires, et les plantes ayant leurs fleurs pollinisées et leurs graines dispersées par des oiseaux, font partie d'une association ininterrompue s'étendant sur les derniers 120 millions d'années. Ce travail a été soutenu par la National Science Foundation of China (Grant No. 42288201, Craton destruction and terrestrial life evolution) et NSFC 41877427 et le Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Science (No. XDB26000000), le National Key R&D Program of China (2022YFF0801500). Nous remercions Xu Yong pour avoir produit la reconstruction artistique attrayante du nouveau spécimen. Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d'intérêts.

@article{doi101016jxinn2023100500,
    author = "Wu, Yan and Li, Zhiheng and Stidham, Thomas A. and Foong, Swee Yeok",
    title = "Phytolith evidence reveals the origin of angiosperm leaf eating habits among ancient Cretaceous birds",
    year = "2023",
    journal = "The Innovation",
    abstract = "Recently, Nature Communications published a study on the feeding habits of an ancient extinct bird called Jeholornis from the Early Cretaceous Jehol Biota of China led by researchers from the Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology of the Chinese Academy of Sciences.1Wu Y. Ge Y. Hu H. et al.Intra-gastric phytoliths provide evidence for folivory in basal avialans of the Early Cretaceous Jehol Biota.Nat. Commun. 2023; 14: 4558Crossref PubMed Scopus (0) Google Scholar Jeholornis and its closely related species are regarded as part of the second most primitive lineage in the family tree of birds, retaining a long bony dinosaurian tail, small teeth, and large claws on the wings. Adopting an interdisciplinary approach, the scientific team discovered hundreds of phytoliths originated from the leaves of the basal angiosperm group called magnoliids (which includes living magnolias, cinnamon, and avocadoes), while investigating the stomach residues contents of a well-preserved 120-million-year-old juvenile Jeholornis fossil. These fossil phytoliths are the first confirmation that help point to the origin and evolution of leaf eating in ancient birds and further sketch an interesting scientific story about the early interactions between birds and flowering plants (Figure 1). Angiosperms dominate much of the landscape across the terrestrial ecosystems of our planet today, and they play a key role in the maintenance and structuring of biodiversity across different ecological interactions and phylogenetic groups, including humans. Based on the close, mutualistic relationships between living birds and plants (in seed dispersal, pollination and mechanism in nectar consumption, for instance), birds have long been noted on their crucial co-evolutionary role in the origin and early diversification of angiosperms. However, the lack of explicit fossil-based evidence of bird-plant interactions has made it difficult to test and fully support such a hypothesis until recently. The exceptional preservation of fossils in the Early Cretaceous Jehol Biota in northeastern China has led to a series of important discoveries pertaining to the evolution of ancient angiosperms and the earliest known diverse bird assemblages. That biota allows for an unparalleled insight into forested Mesozoic ecosystems with its overflowing abundance of spectacularly preserved vertebrate, invertebrate, and plant fossils. To further explore the ecological interrelationships between Cretaceous angiosperms and early birds, our team of researchers pioneered the application of phytolith analysis to study the stomach contents of an ancient herbivorous bird. As one of the earliest lineages of birds, inferences of the feeding habits of Jeholornis are paramount to the overall understanding of the origin of the ecological diversity of birds, as well as helping to deduce the longevity of close and potentially co-evolutionary interactions between birds and flowering plants. Prior work has shown that the closest relatives of birds, the small-sized feathered theropod dinosaurs like troodontids and dromaeosaurs were predators. In contrast, many Early Cretaceous birds were arboreal flying herbivores, pointing to an early change in diets, digestive systems, and ecologies in the evolution of birds, along with the initiation of direct interactions between birds and (flowering) plants. The impact of their plant eating is seen in the evolutionary decrease in the number and size of their teeth and the presence of gastroliths (stones in the stomach or gizzard that could function in plant material grinding), as evidenced by the fossil remains in skeletons. While the presence of gastroliths inside fossils point to a broad herbivorous diet among early birds, details of that dietary menu have been elusive. Some of the best evidence for a plant-based diet in ancient birds comes from other fossil specimens of Jeholornis with seeds preserved in their digestive system. Now, with the addition of leaves to that repertoire of plant dietary items, we can see that the early lineages of birds could obtain and extract nutrients from not only energy rich and easy-to-digest items like fruits and seeds, but also less easily processed items like leaves. Jeholornis also marks the earliest evidence of an arboreal herbivorous niche within the bird family tree, an important and common ecological role that birds occupy around the world today. The identification of specific plants in the diet of Jeholornis required a myriad of analytical and data collection methods. Our scientific team members integrated a comprehensive reconstruction on the early evolution of ancient bird feeding habits with the association of similar feeding habits of extant birds. The approaches include computed tomography (CT) scanning, scanning electron microscopy, and quantitative evaluation through morphometric analysis of the shape of the bird’s mandible. Specifically, our research team attempted to extract the phytolith remains of plants from the residues of the stomach within the fossilized skeleton of Jeholornis to analyze its plant diet. By sampling the area around the preserved gastroliths and processing the samples for phytoliths, hundreds of phytoliths of multiple plant taxa were recovered. Similar samples from outside the fossil skeleton produced no phytoliths. This confirmed the phytoliths were originated from and restricted within the bird’s body. After careful comparison with more than 4,000 kinds of modern phytoliths representing much of plant diversity derived from comprehensive databases and collections of phytoliths, we concluded that most of the identifiable fossil phytoliths from the stomach come from the leaves of the angiosperm group (clade) called magnoliids. While these magnoliid phytoliths not only document additional plant diversity within the Jehol biota and represent some of the oldest fossils of the magnoliid clade, they also represent the first identification of a specific plant type within the diet of an early bird. Besides magnoliid, Jeholornis consumed a variety of other arboreal plant parts, and this discovery likely marks the initiation of what is now widespread herbivory diet among birds. To further support the hypothesis of leaf eating and a broader herbivorous diet in Jeholornis, the three-dimensional mandible shape was compared across different ecological groups of living birds and Jeholornis using a morphometric analysis on CT-scanned lower jaws. The analytical results placed the lower jaw of Jeholornis as most similar to those of living birds that eat mostly plants, particularly the living leaf specialist, the hoatzin, found in tropical forests in South America. That independent line of comparative evidence concurs with the results of the phytolith analysis and helps to strengthen the hypotheses related to the diet and habits of this extinct bird. Most important, the application of phytolith analysis within a fossil Mesozoic vertebrate skeleton has unlocked a key aspect of paleobiological study that has been addressed previously through largely indirect means. Furthermore, the achievement of this interdisciplinary and collaborative research project has not only provided direct evidence for the specific diet of an early bird, but also helps to build a new framework for further expanding the study of the long-term co-evolutionary interplay not only between birds and flowering plants, but also wider linkages among vertebrates, plants, and their environment. With this discovery, it is easy to envision that the evolutionary origins of commonplace activities today, like birds deriving nutrition from plant materials and obtaining some of their bright sexually selected feather colors from those dietary items, and plants having their flowers pollinated and seeds dispersed by birds, are part of an unbroken association spanning the last 120 million years. This work was supported by the National Science Foundation of China (Grant No. 42288201, Craton destruction and terrestrial life evolution) and NSFC 41877427 and the Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Science (No. XDB26000000), the National Key R\&D Program of China (2022YFF0801500). We thank Xu Yong for producing the attractive artistic reconstruction of the new specimen. The authors declare no competing interests.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.xinn.2023.100500",
    doi = "10.1016/j.xinn.2023.100500",
    openalex = "W4385856306",
    references = "doi101038s4146702340311z"
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Les angiospermes sont devenus le groupe de plantes dominant dans les écosystèmes terrestres du Crétacé inférieur à moyen, coïncidant avec le moment du premier pic de diversification des oiseaux. Bien que les oiseaux vivants et les angiospermes présentent des interactions fortes à travers la pollinisation/nectivorie, la dispersion des graines/frugivorie et la folivorie, la documentation des origines évolutives et de la construction de cette complexité écologique reste rare au Mésozoïque. Grâce à la première étude des phytoliths alimentaires préservés in situ dans un squelette presque complet du clade d'avialans à divergence précoce Jeholornithidae, nous fournissons des preuves alimentaires directes que Jeholornis consommait des feuilles, probablement issues du clade d'angiospermes magnoliid, et ces résultats apportent un soutien supplémentaire aux connexions écologiques précoces entre les premiers oiseaux et les angiospermes. Le régime alimentaire large de l'avialan à divergence précoce Jeholornis, incluant au moins des fruits et des feuilles, marque une transition claire dans l'évolution précoce des oiseaux lors de l'établissement d'une niche d'herbivore arboricole (angiosperme) au Crétacé inférieur, occupée aujourd'hui en grande partie par des oiseaux. La réanalyse morphométrique de la mâchoire inférieure de Jeholornis soutient davantage une morphologie généralisée partagée avec d'autres oiseaux herbivores, y compris un folivore aviaire actuel, le hoatzin.

@article{doi101038s4146702340311z,
    author = "Wu, Yan et Ge, Yong et Hu, Han et Stidham, Thomas A et Li, Zhiheng et Bailleul, Alida M et Zhou, Zhonghe",
    title = "Les phytoliths intragastriques apportent des preuves de la folivorie chez les avialans basaux du Biota de Jehol du Crétacé inférieur.",
    year = "2023",
    journal = "Nature communications",
    abstract = "Les angiospermes sont devenus le groupe de plantes dominant dans les écosystèmes terrestres du Crétacé inférieur à moyen, coïncidant avec le moment du premier pic de diversification des oiseaux. Bien que les oiseaux vivants et les angiospermes présentent des interactions fortes à travers la pollinisation/nectivorie, la dispersion des graines/frugivorie et la folivorie, la documentation des origines évolutives et de la construction de cette complexité écologique reste rare au Mésozoïque. Grâce à la première étude des phytoliths alimentaires préservés in situ dans un squelette presque complet du clade d'avialans à divergence précoce Jeholornithidae, nous fournissons des preuves alimentaires directes que Jeholornis consommait des feuilles, probablement issues du clade d'angiospermes magnoliid, et ces résultats apportent un soutien supplémentaire aux connexions écologiques précoces entre les premiers oiseaux et les angiospermes. Le régime alimentaire large de l'avialan à divergence précoce Jeholornis, incluant au moins des fruits et des feuilles, marque une transition claire dans l'évolution précoce des oiseaux lors de l'établissement d'une niche d'herbivore arboricole (angiosperme) au Crétacé inférieur, occupée aujourd'hui en grande partie par des oiseaux. La réanalyse morphométrique de la mâchoire inférieure de Jeholornis soutient davantage une morphologie généralisée partagée avec d'autres oiseaux herbivores, y compris un folivore aviaire actuel, le hoatzin.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10382595/",
    doi = "10.1038/s41467-023-40311-z",
    openalex = "W4385349855",
    pmcid = "PMC10382595",
    pmid = "37507397",
    references = "doi101016s0034666799000184, doi101017cbo9780511980206, doi101038nature01420, doi101038s4147701904210, doi101093aobmcz064, doi1011112041210x12035, doi101111nph17822, doi101126science1069439, doi101126science1118806, doi101126science28253941692"
}

Le Confuciusornis sanctus chinois du Crétacé inférieur est l'oiseau mésozoïque le plus abondant et une espèce modèle pour les études sur l'évolution avienne précoce. Alors que les investigations précédentes se sont principalement concentrées sur des aspects de l'anatomie, de la taxonomie et de la systématique, ainsi que de l'histoire de vie et de l'écologie de cet oiseau, il y a eu peu de recherches sur ses propriétés de vol. Notre étude se concentre sur un spécimen bien conservé présentant des détails exquis de son plumage. NHMW 1997z0112/0001 fournit de nouvelles informations sur des aspects de sa morphologie squelettique, en particulier à partir des squelettes axial et appendiculaire, et son plumage offre l'opportunité de quantifier des variables clés liées au vol, notamment l'extrémité de l'aile, la corde de l'aile, la masse corporelle, l'envergure et la surface de l'aile. Nous utilisons ces paramètres pour fournir une évaluation quantitative des propriétés de vol du C. sanctus. La plupart des études précédentes ont suggéré que cette espèce était incapable d'accomplir des vols prolongés. Cependant, nos résultats indiquent que la capacité de cet oiseau à effectuer des vols prolongés ne peut être écartée, étant donné que nos données montrent qu'il aurait pu combiner des périodes de battement d'ailes avec des périodes de planeage efficace à basse vitesse. Plus spécifiquement, nos résultats indiquent que, bien que possédant une capacité légèrement inférieure à celle des oiseaux planeurs modernes, la capacité de planeage du C. sanctus aurait été significativement supérieure à celle des oiseaux volants à court terme modernes tels que les volailles terrestres. Sur la base de ces inférences, nous concluons que le C. sanctus pouvait voler efficacement pendant de longues périodes lorsqu'il utilisait une combinaison de périodes de battement d'ailes et de planeage.

@article{doi107203sjp27543,
    author = "Chiappe, Luis M. and Serrano, Francisco J. and Abramowicz, Stephanie and Göhlich, Ursula B.",
    title = "Flight Performance of the Early Cretaceous Bird Confuciusornis sanctus: Evidence from an Exceptionally Preserved Fossil",
    year = "2023",
    journal = "Spanish Journal of Palaeontology",
    abstract = "Le Confuciusornis sanctus chinois du Crétacé inférieur est l'oiseau mésozoïque le plus abondant et une espèce modèle pour les études sur l'évolution avienne précoce. Alors que les investigations précédentes se sont principalement concentrées sur des aspects de l'anatomie, de la taxonomie et de la systématique, ainsi que de l'histoire de vie et de l'écologie de cet oiseau, il y a eu peu de recherches sur ses propriétés de vol. Notre étude se concentre sur un spécimen bien conservé présentant des détails exquis de son plumage. NHMW 1997z0112/0001 fournit de nouvelles informations sur des aspects de sa morphologie squelettique, en particulier à partir des squelettes axial et appendiculaire, et son plumage offre l'opportunité de quantifier des variables clés liées au vol, notamment l'extrémité de l'aile, la corde de l'aile, la masse corporelle, l'envergure et la surface de l'aile. Nous utilisons ces paramètres pour fournir une évaluation quantitative des propriétés de vol du C. sanctus. La plupart des études précédentes ont suggéré que cette espèce était incapable d'accomplir des vols prolongés. Cependant, nos résultats indiquent que la capacité de cet oiseau à effectuer des vols prolongés ne peut être écartée, étant donné que nos données montrent qu'il aurait pu combiner des périodes de battement d'ailes avec des périodes de planeage efficace à basse vitesse. Plus spécifiquement, nos résultats indiquent que, bien que possédant une capacité légèrement inférieure à celle des oiseaux planeurs modernes, la capacité de planeage du C. sanctus aurait été significativement supérieure à celle des oiseaux volants à court terme modernes tels que les volailles terrestres. Sur la base de ces inférences, nous concluons que le C. sanctus pouvait voler efficacement pendant de longues périodes lorsqu'il utilisait une combinaison de périodes de battement d'ailes et de planeage.",
    url = "https://doi.org/10.7203/sjp.27543",
    doi = "10.7203/sjp.27543",
    openalex = "W4388226859",
    references = "doi101038s42003022043166"
}

L'étude des oiseaux du Crétacé les plus proches des espèces euornithines vivantes s'est principalement concentrée sur les modèles évolutifs menant au groupe moderne. Pourtant, la diversité morphologique et écologique des branches euornithines non directement ancestrales au groupe couronne est probablement sous-estimée. Un nouvel oiseau euornithine, Shuilingornis angelai gen. et sp. nov., est décrit sur la base d'un matériel squelettique presque complet provenant de la faune de Jehol du Crétacé inférieur (Aptien) dans le Liaoning occidental, en Chine. Le nouveau taxon ressemble aux gansuides pénemodernes, mais il se distingue par une taille corporelle plus petite et par la conservation de caractères plesiomorphiques répandus chez les euornithines non gansuides. L'analyse ostéohistologique indique que Shuilingornis gen. nov. représente un stade adulte précoce au moment du décès. L'analyse phylogénétique soutient robustement l'attribution de Shuilingornis gen. nov. aux Gansuidae. À l'exception du controversé Hollanda, les gansuides ont été découverts dans quatre bassins aptiens déposés dans des conditions paléoclimatiques similaires. Le succès des gansuides au cours de la partie médiane du Crétacé démontre que l'exploration des écosystèmes semi-aquatiques était un modèle euornithine cohérent qui a précédé la radiation ultérieure des ornithurines.

@article{doi101016jcretres2024106014,
    author = "Wang, Xuri et Cau, Andrea et Wang, Yinuo et Kundrát, Martin et Zhang, Guili et Liu, Yichuan et Chiappe, Luis M.",
    title = "Un nouvel oiseau gansuide (Avialae, Euornithes) de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur (Aptien) de Jianchang, dans le Liaoning occidental, Chine",
    year = "2024",
    journal = "Cretaceous Research",
    abstract = "L'étude des oiseaux du Crétacé les plus proches des espèces euornithines vivantes s'est principalement concentrée sur les modèles évolutifs menant au groupe moderne. Pourtant, la diversité morphologique et écologique des branches euornithines non directement ancestrales au groupe couronne est probablement sous-estimée. Un nouvel oiseau euornithine, Shuilingornis angelai gen. et sp. nov., est décrit sur la base d'un matériel squelettique presque complet provenant de la faune de Jehol du Crétacé inférieur (Aptien) dans le Liaoning occidental, en Chine. Le nouveau taxon ressemble aux gansuides pénemodernes, mais il se distingue par une taille corporelle plus petite et par la conservation de caractères plesiomorphiques répandus chez les euornithines non gansuides. L'analyse ostéohistologique indique que Shuilingornis gen. nov. représente un stade adulte précoce au moment du décès. L'analyse phylogénétique soutient robustement l'attribution de Shuilingornis gen. nov. aux Gansuidae. À l'exception du controversé Hollanda, les gansuides ont été découverts dans quatre bassins aptiens déposés dans des conditions paléoclimatiques similaires. Le succès des gansuides au cours de la partie médiane du Crétacé démontre que l'exploration des écosystèmes semi-aquatiques était un modèle euornithine cohérent qui a précédé la radiation ultérieure des ornithurines.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cretres.2024.106014",
    doi = "10.1016/j.cretres.2024.106014",
    openalex = "W4402787766",
    references = "doi101038s4146702340311z"
}

. Navaornis offre un aperçu longtemps recherché sur la morphologie détaillée du crâne et de l'endocrâne des oiseaux ancêtres phylogénétiquement situés au-dessus de l'Archéoptéryx, clarifiant le schéma et le moment à partir desquels la neuroanatomie distinctive des oiseaux vivants a été assemblée.

@article{doi101038s41586024081144,
    author = "Chiappe, Luis M. et Navalón, Guillermo et Martinelli, Agustín G. et de Souza Carvalho, Ismar et Santucci, Rodrigo et Wu, Yun-Hsin et Field, Daniel J.",
    title = "Oiseau du Crétacé du Brésil éclaire l'évolution du crâne et du cerveau des oiseaux",
    year = "2024",
    journal = "Nature",
    abstract = ". Navaornis offre un aperçu longtemps recherché sur la morphologie détaillée du crâne et de l'endocrâne des oiseaux ancêtres phylogénétiquement situés au-dessus de l'Archéoptéryx, clarifiant le schéma et le moment à partir desquels la neuroanatomie distinctive des oiseaux vivants a été assemblée.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41586-024-08114-4",
    doi = "10.1038/s41586-024-08114-4",
    openalex = "W4404305447",
    references = "doi101007s0011401411439, doi101080027246342012719176, doi101098rsos220519, doi101111cla12524, doi10159023174889201500020001"
}

Le processus acrocoracoïdien de la clavicule sur l'épicléide furculaire de certains oiseaux actuels a été supposé s'être développé indépendamment du corps principal de la furcula, représentant potentiellement un centre secondaire d'ossification au sein de la furcula aviaire. Cependant, le motif de développement du processus acrocoracoïdien de la clavicule reste flou, entravant notre compréhension de son homologie et de son évolution. Ici, nous avons analysé la morphologie, l'articulation et le motif de développement de l'épicléide furculaire aviaire par scanner à rayons X par tomodensitométrie et coloration histochimique chez plusieurs exemplaires d'oiseaux. Les résultats montrent que le processus acrocoracoïdien de la clavicule est une ossification endochondrale secondaire dans la furcula, distincte de la furcula principale ossifiée intramembraneuse et séparée par du tissu conjonctif. Le processus acrocoracoïdien de la clavicule se fusionne avec la furcula pendant le développement postnatal et forme la surface articulaire de l'acrocoracoclaviculaire. Le motif de développement suggère que les processus acrocoracoïdiens de la clavicule gauche et droite peuvent être formés par la fusion d'un os sésamoïde avec le rameau furculaire respectif et ont évolué de manière convergente parmi les lignées néornithiniennes différentes. Cette structure unique de la furcula augmente non seulement la diversité morphologique de l'acrocoracoclaviculaire chez les oiseaux néornithiniens, mais pose également les bases de leurs styles de vol complexes et divers.

@article{doi1010800891296320242364337,
    author = "Wu, Qian et Zhou, Zhonghe et Li, Zhiheng",
    title = "Un centre secondaire d'ossification endochondrale dans la furcula des oiseaux actuels et son importance pour l'évolution de l'acrocoracoclaviculaire néornithinien",
    year = "2024",
    journal = "Historical Biology",
    abstract = "Le processus acrocoracoïdien de la clavicule sur l'épicléide furculaire de certains oiseaux actuels a été supposé s'être développé indépendamment du corps principal de la furcula, représentant potentiellement un centre secondaire d'ossification au sein de la furcula aviaire. Cependant, le motif de développement du processus acrocoracoïdien de la clavicule reste flou, entravant notre compréhension de son homologie et de son évolution. Ici, nous avons analysé la morphologie, l'articulation et le motif de développement de l'épicléide furculaire aviaire par scanner à rayons X par tomodensitométrie et coloration histochimique chez plusieurs exemplaires d'oiseaux. Les résultats montrent que le processus acrocoracoïdien de la clavicule est une ossification endochondrale secondaire dans la furcula, distincte de la furcula principale ossifiée intramembraneuse et séparée par du tissu conjonctif. Le processus acrocoracoïdien de la clavicule se fusionne avec la furcula pendant le développement postnatal et forme la surface articulaire de l'acrocoracoclaviculaire. Le motif de développement suggère que les processus acrocoracoïdiens de la clavicule gauche et droite peuvent être formés par la fusion d'un os sésamoïde avec le rameau furculaire respectif et ont évolué de manière convergente parmi les lignées néornithiniennes différentes. Cette structure unique de la furcula augmente non seulement la diversité morphologique de l'acrocoracoclaviculaire chez les oiseaux néornithiniens, mais pose également les bases de leurs styles de vol complexes et divers.",
    url = "https://doi.org/10.1080/08912963.2024.2364337",
    doi = "10.1080/08912963.2024.2364337",
    openalex = "W4399927280",
    references = "doi107717peerj16960"
}

Résumé La radiation explosive des premiers oiseaux a été bien documentée par les découvertes extraordinaires d'oiseaux fossiles du Crétacé inférieur en Chine au cours des trois dernières décennies. Elles ont considérablement élargi la diversité, la disparité et la distribution temporelle des oiseaux du Mésozoïque, affinant notre connaissance de la voie évolutive menant au plan corporel caractéristique des oiseaux, incluant les plumes et le vol actif, la locomotion et la différenciation des habitats, l'alimentation et la digestion, la reproduction et le développement, les couleurs des plumes et leur mise en scène. De plus, les études sur le contexte géologique de la biote de Jehol, qui a produit la majorité des oiseaux du Crétacé chinois, ont fourni des indices importants pour notre compréhension de la taphonomie ainsi que de l'interaction entre les processus géologiques profonds et l'évolution biologique dans le nord-est de la Chine et en Asie de l'Est durant le Crétacé inférieur. Les futures études multidisciplinaires devraient faire progresser notre connaissance de la paléogéographie des oiseaux du Crétacé inférieur, de ce qui a impacté les changements de diversité des premiers oiseaux en Chine, et des rôles que les premiers oiseaux ont joués dans l'écosystème terrestre du Crétacé inférieur.

@article{doi101144sp5442023129,
    author = "Zhou, Zhonghe et Wang, Min",
    title = "Oiseaux fossiles du Crétacé de Chine",
    year = "2024",
    journal = "Geological Society London Special Publications",
    abstract = "Résumé La radiation explosive des premiers oiseaux a été bien documentée par les découvertes extraordinaires d'oiseaux fossiles du Crétacé inférieur en Chine au cours des trois dernières décennies. Elles ont considérablement élargi la diversité, la disparité et la distribution temporelle des oiseaux du Mésozoïque, affinant notre connaissance de la voie évolutive menant au plan corporel caractéristique des oiseaux, incluant les plumes et le vol actif, la locomotion et la différenciation des habitats, l'alimentation et la digestion, la reproduction et le développement, les couleurs des plumes et leur mise en scène. De plus, les études sur le contexte géologique de la biote de Jehol, qui a produit la majorité des oiseaux du Crétacé chinois, ont fourni des indices importants pour notre compréhension de la taphonomie ainsi que de l'interaction entre les processus géologiques profonds et l'évolution biologique dans le nord-est de la Chine et en Asie de l'Est durant le Crétacé inférieur. Les futures études multidisciplinaires devraient faire progresser notre connaissance de la paléogéographie des oiseaux du Crétacé inférieur, de ce qui a impacté les changements de diversité des premiers oiseaux en Chine, et des rôles que les premiers oiseaux ont joués dans l'écosystème terrestre du Crétacé inférieur.",
    url = "https://doi.org/10.1144/sp544-2023-129",
    doi = "10.1144/sp544-2023-129",
    openalex = "W4390976843",
    references = "doi101111joa13588"
}

Les Paraves constituent le groupe taxonomique incluant les Dromaeosauridae, les Troodontidae et les Avialae, et enregistrent ainsi l'origine des oiseaux, l'évolution des plumes pennacées et leur exaptation pour le vol. La technologie d'imagerie par fluorescence X micro (micro-XRF) non destructive a été utilisée pour analyser deux spécimens de fossiles paraviens, l'un référable aux Microraptorinae (Dromaeosauridae) et l'autre aux Yanornithidae (Avialae). Les deux fossiles proviennent de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur Aptien, un Lagerstätte qui enregistre la phase la plus récente de la célèbre biote de Jehol dans le Liaoning occidental, en Chine. Les analyses montrent que les os conservent de grandes quantités de Calcium (Ca), de Phosphore (P) et de Soufre (S), avec des quantités significatives d'éléments lourds tels que le Strontium (Sr) et le Yttrium (Y) qui pourraient être liés à l'apatite biologique. Les plumes conservées montrent de grandes quantités de Cuivre (Cu), de Nickel (Ni) et de Titane (Ti). Les gaine des griffes présentent des niveaux élevés de P et de Ca, ce qui suggère qu'elles ont été conservées par phosphatisation. Notamment, de grandes quantités de Fer (Fe) se produisent aux articulations intrasquelettiques dans les deux spécimens et dans le tronc du microraptorine. D'autres analyses indiquent que l'enrichissement en Fe pourrait être lié à la présence de pyrite. La distribution du Fe indique que la précipitation de cet élément était un processus taphonomique post-enterrage. Ces données micro-XRF révèlent la distribution des éléments dans différents types de tissus dans ces deux fossiles paraviens et fournissent des informations pour reconstruire les processus taphonomiques responsables de la conservation exceptionnelle des fossiles paraviens dans la Formation de Jiufotang.

@article{doi1046770as2024033,
    author = "Ji, Qiang et Wang, Xuri",
    title = "Cartographie Micro-XRF : élucidation de la taphonomie de deux fossiles paraviens du Crétacé inférieur de Liaoning occidental, Chine",
    year = "2024",
    journal = "Spectroscopie atomique",
    abstract = "Les Paraves constituent le groupe taxonomique incluant les Dromaeosauridae, les Troodontidae et les Avialae, et enregistrent ainsi l'origine des oiseaux, l'évolution des plumes pennacées et leur exaptation pour le vol. La technologie d'imagerie par fluorescence X micro (micro-XRF) non destructive a été utilisée pour analyser deux spécimens de fossiles paraviens, l'un référable aux Microraptorinae (Dromaeosauridae) et l'autre aux Yanornithidae (Avialae). Les deux fossiles proviennent de la Formation de Jiufotang du Crétacé inférieur Aptien, un Lagerstätte qui enregistre la phase la plus récente de la célèbre biote de Jehol dans le Liaoning occidental, en Chine. Les analyses montrent que les os conservent de grandes quantités de Calcium (Ca), de Phosphore (P) et de Soufre (S), avec des quantités significatives d'éléments lourds tels que le Strontium (Sr) et le Yttrium (Y) qui pourraient être liés à l'apatite biologique. Les plumes conservées montrent de grandes quantités de Cuivre (Cu), de Nickel (Ni) et de Titane (Ti). Les gaine des griffes présentent des niveaux élevés de P et de Ca, ce qui suggère qu'elles ont été conservées par phosphatisation. Notamment, de grandes quantités de Fer (Fe) se produisent aux articulations intrasquelettiques dans les deux spécimens et dans le tronc du microraptorine. D'autres analyses indiquent que l'enrichissement en Fe pourrait être lié à la présence de pyrite. La distribution du Fe indique que la précipitation de cet élément était un processus taphonomique post-enterrage. Ces données micro-XRF révèlent la distribution des éléments dans différents types de tissus dans ces deux fossiles paraviens et fournissent des informations pour reconstruire les processus taphonomiques responsables de la conservation exceptionnelle des fossiles paraviens dans la Formation de Jiufotang.",
    url = "https://doi.org/10.46770/as.2024.033",
    doi = "10.46770/as.2024.033",
    openalex = "W4399924137",
    references = "doi101038s4146702340311z"
}

Un sternum agrandi avec un carène proéminente est une caractéristique centrale de l'appareil de vol des oiseaux modernes. Cependant, les sternums des dinosaures proches des oiseaux (Pennaraptora) et des premiers avialans sont soit sensiblement différents de ceux des oiseaux vivants, soit totalement absents, soulevant des questions sur la manière dont les structures sternales spécialisées ont évolué chez les oiseaux et sur leur relation avec la fonction. Cela reste mal compris en raison de la nature fragmentaire du registre fossile et des difficultés à inférer la forme et la fonction à partir de fossiles écrasés. Nous utilisons des estimations de caractères ancestraux pour retracer l'acquisition des traits sternaux au sein du groupe tige des oiseaux, et des régressions phylogénétiques multivariées pour analyser les relations entre la morphologie du sternum, la masse corporelle et les capacités de vol. Nous constatons que l'évolution du sternum a été épisodique : les membres basaux des Pennaraptora avaient des sternums proportionnellement petits, qui sont devenus plus grands et plus allongés craniocaudalement chez les Avialae. Cet agrandissement précède l'apparition d'une crête médiane, un possible précurseur de la carène sternale, chez les Pygostylia. La taille du sternum a augmenté à nouveau chez les Ornithuromorpha orientés vers la couronne, accompagnée d'une carène sternale entièrement formée et de projections caudales agrandies, toutes deux des zones critiques d'attachement des muscles de vol. L'expérimentation sternale en relation avec les caractéristiques de vol se produit plusieurs fois au cours des Pennaraptora, y compris au sein des Paraves et des Enantiornithes, indiquant que le vol motorisé peut avoir évolué plusieurs fois avant de proliférer chez les oiseaux du groupe couronne.

@article{doi101038s41559025027954,
    author = "Lowi-Merri, Talia M et Benson, Roger et Hu, Han et O'Connor, Jingmai et Claramunt, Santiago et Evans, David C",
    title = "L'agrandissement des caractéristiques du sternum a facilité l'évolution du vol motorisé chez les oiseaux.",
    year = "2025",
    journal = "Nature ecology \& evolution",
    abstract = "Un sternum agrandi avec un carène proéminente est une caractéristique centrale de l'appareil de vol des oiseaux modernes. Cependant, les sternums des dinosaures proches des oiseaux (Pennaraptora) et des premiers avialans sont soit sensiblement différents de ceux des oiseaux vivants, soit totalement absents, soulevant des questions sur la manière dont les structures sternales spécialisées ont évolué chez les oiseaux et sur leur relation avec la fonction. Cela reste mal compris en raison de la nature fragmentaire du registre fossile et des difficultés à inférer la forme et la fonction à partir de fossiles écrasés. Nous utilisons des estimations de caractères ancestraux pour retracer l'acquisition des traits sternaux au sein du groupe tige des oiseaux, et des régressions phylogénétiques multivariées pour analyser les relations entre la morphologie du sternum, la masse corporelle et les capacités de vol. Nous constatons que l'évolution du sternum a été épisodique : les membres basaux des Pennaraptora avaient des sternums proportionnellement petits, qui sont devenus plus grands et plus allongés craniocaudalement chez les Avialae. Cet agrandissement précède l'apparition d'une crête médiane, un possible précurseur de la carène sternale, chez les Pygostylia. La taille du sternum a augmenté à nouveau chez les Ornithuromorpha orientés vers la couronne, accompagnée d'une carène sternale entièrement formée et de projections caudales agrandies, toutes deux des zones critiques d'attachement des muscles de vol. L'expérimentation sternale en relation avec les caractéristiques de vol se produit plusieurs fois au cours des Pennaraptora, y compris au sein des Paraves et des Enantiornithes, indiquant que le vol motorisé peut avoir évolué plusieurs fois avant de proliférer chez les oiseaux du groupe couronne.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/5548695/",
    doi = "10.1038/s41559-025-02795-4",
    openalex = "W4412640183",
    pmcid = "5548695",
    pmid = "40707813",
    references = "doi101038nature11631, doi101038nature15697, doi101038nmeth2089, doi10108003610927808827599, doi101080106351501753462876, doi101086284325, doi101098rstb19890106, doi101109tac19741100705, doi101111j2041210x201100169x, doi10118614712105788"
}

Les analyses phylogénétiques des caractères phénotypiques chez les oiseaux de la couronne aboutissent souvent à des résultats fortement incongruents avec les conclusions des analyses phylogénomiques récentes. De plus, les ensembles de données morphologiques existants pour les oiseaux de la couronne sont fréquemment limités par un échantillonnage restreint des taxons ou des caractères, une construction incohérente des caractères, un codage incorrect, ou une combinaison de plusieurs de ces facteurs. Dans le cadre d'un effort visant à remédier à ces limitations, cette étude se concentre sur l'identification de caractères phylogénétiquement informatifs de la ceinture pectorale et du squelette des membres antérieurs des oiseaux, des éléments qui sont couramment préservés dans les fossiles aviens. Nous avons assemblé et validé un ensemble de données de 203 caractères, qui ont ensuite été codés pour une gamme phylogénétiquement diverse de 75 taxons aviens actuels et intégrés dans des analyses phylogénétiques. Les analyses exécutées sans contraintes topologiques ont montré des conflits notables avec les résultats des études phylogénomiques récentes, possiblement en raison de la convergence fonctionnelle et de la cladogenèse rapide dans les premiers stades de l'histoire évolutive des oiseaux de la couronne. Des comparaisons anatomiques qualitatives et des métriques quantitatives de l'homoplasie ont mis en évidence le fait que des morphologies similaires dans les éléments de la ceinture pectorale et des membres antérieurs se sont développées à plusieurs reprises chez des groupes d'oiseaux éloignés, représentant un facteur de confusion majeur en phylogénétique morphologique avienne. Cependant, l'utilisation d'échafaudages moléculaires a permis d'identifier des combinaisons de caractères diagnostiques pour de nombreux clades aviens précédemment reconnus uniquement grâce aux données moléculaires, tels que les Phaethontimorphae, les Aequornithes et les Telluraves. Bien que les grands ensembles de données morphologiques ne garantissent pas une congruence accrue avec les études phylogénétiques moléculaires, ils peuvent néanmoins être des outils précieux pour identifier les synapomorphies anatomiques des clades clés, placer les fossiles dans un contexte phylogénétique et étudier les modèles macroévolutifs au sein des grands groupes d'organismes.

@article{doi101093iobobaf029,
    author = "Chen, Albert et Steell, Elizabeth M. et Benson, Roger et Field, Daniel J.",
    title = "Vers une matrice anatomique complète pour les oiseaux de la couronne : aperçus phylogénétiques à partir de la ceinture pectorale et du squelette des membres antérieurs",
    year = "2025",
    journal = "Biologie intégrative de l'organisme",
    abstract = "Les analyses phylogénétiques des caractères phénotypiques chez les oiseaux de la couronne aboutissent souvent à des résultats fortement incongruents avec les conclusions des analyses phylogénomiques récentes. De plus, les ensembles de données morphologiques existants pour les oiseaux de la couronne sont fréquemment limités par un échantillonnage restreint des taxons ou des caractères, une construction incohérente des caractères, un codage incorrect, ou une combinaison de plusieurs de ces facteurs. Dans le cadre d'un effort visant à remédier à ces limitations, cette étude se concentre sur l'identification de caractères phylogénétiquement informatifs de la ceinture pectorale et du squelette des membres antérieurs des oiseaux, des éléments qui sont couramment préservés dans les fossiles aviens. Nous avons assemblé et validé un ensemble de données de 203 caractères, qui ont ensuite été codés pour une gamme phylogénétiquement diverse de 75 taxons aviens actuels et intégrés dans des analyses phylogénétiques. Les analyses exécutées sans contraintes topologiques ont montré des conflits notables avec les résultats des études phylogénomiques récentes, possiblement en raison de la convergence fonctionnelle et de la cladogenèse rapide dans les premiers stades de l'histoire évolutive des oiseaux de la couronne. Des comparaisons anatomiques qualitatives et des métriques quantitatives de l'homoplasie ont mis en évidence le fait que des morphologies similaires dans les éléments de la ceinture pectorale et des membres antérieurs se sont développées à plusieurs reprises chez des groupes d'oiseaux éloignés, représentant un facteur de confusion majeur en phylogénétique morphologique avienne. Cependant, l'utilisation d'échafaudages moléculaires a permis d'identifier des combinaisons de caractères diagnostiques pour de nombreux clades aviens précédemment reconnus uniquement grâce aux données moléculaires, tels que les Phaethontimorphae, les Aequornithes et les Telluraves. Bien que les grands ensembles de données morphologiques ne garantissent pas une congruence accrue avec les études phylogénétiques moléculaires, ils peuvent néanmoins être des outils précieux pour identifier les synapomorphies anatomiques des clades clés, placer les fossiles dans un contexte phylogénétique et étudier les modèles macroévolutifs au sein des grands groupes d'organismes.",
    url = "https://doi.org/10.1093/iob/obaf029",
    doi = "10.1093/iob/obaf029",
    openalex = "W4412628626",
    references = "doi101038s41586025092323, doi101126scienceadt5189, doi107554elife76086, doi107717peerj16960"
}

Résumé La transformation morphologique d'un avant-bras hautement mobile et préhensile en une aile battante est une transition clé dans l'évolution du vol des oiseaux. Cette transformation évolutive se caractérise par une mobilité du coude et du poignet plus canalisée (restreinte) et une capacité préhensile (graspe) réduite des doigts, nécessitant un ensemble de modifications ostéologiques. Ici, nous employons l'imagerie micro-tomographique (μCT) pour reconstruire les avant-bras de Confuciusornis à partir d'un nouveau spécimen du groupe de Jehol du Crétacé inférieur dans le Liaoning occidental, en Chine. Notre rendu est la première reconstruction tridimensionnelle de l'avant-bras pour cet oiseau clé du Crétacé inférieur, révélant des détails ostéologiques critiques qui avancent notre compréhension de l'évolution précoce du vol. La reconstruction révèle des caractéristiques précédemment inconnues, notamment des structures canalisées dans les articulations du coude et du poignet, un pisiforme triangulaire relativement plus petit, une projection en forme de crochet sur le métacarpien alulaire, et une morphologie digitale distinctive. Nous fournissons des descriptions morphologiques détaillées du coude, du poignet, et des articulations métacarpo-phalangiennes et interphalangiennes, qui sont essentielles pour évaluer les capacités de vol, la mécanique de repliement de l'avant-bras et la capacité de préhension manuelle. De plus, nos données soutiennent la présence d'un os en forme de coussinet à l'extrémité distale du métacarpien alulaire de Confuciusornis et démontrent la fusion de ce coussinet avec le condyle crânien.

@article{doi101093zoolinneanzlaf149,
    author = "Duan, Menghan et Li, Li et Wang, Shiying et Stidham, Thomas A. et Wang, Renfei et Dong, Xinwei et Hu, Dongyu",
    title = "Morphologie de l'avant-bras de Confuciusornis et ses implications pour l'évolution précoce du vol",
    year = "2025",
    journal = "Zoological Journal of the Linnean Society",
    abstract = "Résumé La transformation morphologique d'un avant-bras hautement mobile et préhensile en une aile battante est une transition clé dans l'évolution du vol des oiseaux. Cette transformation évolutive se caractérise par une mobilité du coude et du poignet plus canalisée (restreinte) et une capacité préhensile (graspe) réduite des doigts, nécessitant un ensemble de modifications ostéologiques. Ici, nous employons l'imagerie micro-tomographique (μCT) pour reconstruire les avant-bras de Confuciusornis à partir d'un nouveau spécimen du groupe de Jehol du Crétacé inférieur dans le Liaoning occidental, en Chine. Notre rendu est la première reconstruction tridimensionnelle de l'avant-bras pour cet oiseau clé du Crétacé inférieur, révélant des détails ostéologiques critiques qui avancent notre compréhension de l'évolution précoce du vol. La reconstruction révèle des caractéristiques précédemment inconnues, notamment des structures canalisées dans les articulations du coude et du poignet, un pisiforme triangulaire relativement plus petit, une projection en forme de crochet sur le métacarpien alulaire, et une morphologie digitale distinctive. Nous fournissons des descriptions morphologiques détaillées du coude, du poignet, et des articulations métacarpo-phalangiennes et interphalangiennes, qui sont essentielles pour évaluer les capacités de vol, la mécanique de repliement de l'avant-bras et la capacité de préhension manuelle. De plus, nos données soutiennent la présence d'un os en forme de coussinet à l'extrémité distale du métacarpien alulaire de Confuciusornis et démontrent la fusion de ce coussinet avec le condyle crânien.",
    url = "https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlaf149",
    doi = "10.1093/zoolinnean/zlaf149",
    openalex = "W4416294577",
    references = "doi101016jxinn2025101086, doi10103835047056, doi10103845769, doi101038nature00930, doi101038nature08322, doi101038s41586025092323, doi101038s42003022043166, doi101111j10963642200600245x, doi101111j14697580200800880x, doi101126science1078237, doi101139e03011, doi1012060003009020042860001mptaso20co2, sereno1997the"
}

Une des découvertes les plus révolutionnaires issues de 200 ans de recherches sur les dinosaures est que le clade Dinosauria est représenté par environ 11 000 espèces vivantes d'oiseaux. Bien que l'origine des oiseaux parmi les dinosaures ait été largement revue, ces dernières années ont témoigné d'un progrès considérable dans notre compréhension des origines évolutives profondes de nombreux systèmes anatomiques aviens distinctifs. Ces avancées ont été rendues possibles par de nouvelles découvertes fossiles passionnantes, conduisant à un cadre phylogénétique en perpétuelle expansion permettant de localiser les origines des caractéristiques aviens caractéristiques. La présente revue se concentre sur quatre systèmes aviens remarquables dont l'histoire évolutive du Mésozoïque a été grandement clarifiée par des découvertes récentes : cerveau, palais cinétique, ceinture pectorale et pneumatisation postcrânienne du squelette.

@article{doi101098rsbl20240500,
    author = "Field, Daniel J. et Burton, Maria Grace et Benito, Juan et Plateau, Olivia et Navalón, Guillermo",
    title = "Whence the birds : 200 ans de dinosaures, ancêtres aviens",
    year = "2025",
    journal = "Biology Letters",
    abstract = "Une des découvertes les plus révolutionnaires issues de 200 ans de recherches sur les dinosaures est que le clade Dinosauria est représenté par environ 11 000 espèces vivantes d'oiseaux. Bien que l'origine des oiseaux parmi les dinosaures ait été largement revue, ces dernières années ont témoigné d'un progrès considérable dans notre compréhension des origines évolutives profondes de nombreux systèmes anatomiques aviens distinctifs. Ces avancées ont été rendues possibles par de nouvelles découvertes fossiles passionnantes, conduisant à un cadre phylogénétique en perpétuelle expansion permettant de localiser les origines des caractéristiques aviens caractéristiques. La présente revue se concentre sur quatre systèmes aviens remarquables dont l'histoire évolutive du Mésozoïque a été grandement clarifiée par des découvertes récentes : cerveau, palais cinétique, ceinture pectorale et pneumatisation postcrânienne du squelette.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsbl.2024.0500",
    doi = "10.1098/rsbl.2024.0500",
    openalex = "W4406641140",
    references = "doi103389fevo2022828006, doi107554elife76086, doi107717peerj16960"
}

, avec ses ailes presque modernes mais un squelette plesiomorphe, a démontré il y a plus de 160 ans que les spécialisations des tissus mous ont précédé les modifications squelettiques pour le vol. Les tissus mous sont donc d'une grande importance pour comprendre l'évolution précoce de la physiologie aviaire moderne. Le plus souvent, des traces du système cutané sont conservées ; les découvertes exceptionnelles incluent des restes d'organes. Ensemble, ces éléments ont aidé à élucider l'évolution des poumons, des ovaires, du plumage et du bec chez les oiseaux primitifs. Ces fossiles révèlent que de nombreuses adaptations importantes pour une digestion efficace, une haute prise d'oxygène, une masse corporelle réduite et une structure d'aile améliorée, toutes contribuant à améliorer les capacités aériennes et/ou à répondre aux demandes énergétiques de cette forme coûteuse de locomotion, se sont développées dans les premiers 20-30 Myr de l'évolution aviaire. La conservation des tissus mous fournit également des indices importants pour comprendre l'écologie des oiseaux primitifs et pourrait même élucider l'extinction de certains groupes. Cependant, le registre fossile actuel des tissus mous aviaires du Mésozoïque est presque entièrement limité au Crétacé inférieur et ainsi, les découvertes du Crétacé supérieur ont le potentiel de transformer radicalement notre interprétation des données disponibles.Cet article fait partie du numéro thématique 'La biologie du système respiratoire aviaire'.

@article{doi101098rstb20230426,
    author = "O’Connor, Jingmai K.",
    title = "Insights into the early evolution of modern avian physiology from fossilized soft tissues from the Mesozoic",
    year = "2025",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = ", avec ses ailes presque modernes mais un squelette plesiomorphe, a démontré il y a plus de 160 ans que les spécialisations des tissus mous ont précédé les modifications squelettiques pour le vol. Les tissus mous sont donc d'une grande importance pour comprendre l'évolution précoce de la physiologie aviaire moderne. Le plus souvent, des traces du système cutané sont conservées ; les découvertes exceptionnelles incluent des restes d'organes. Ensemble, ces éléments ont aidé à élucider l'évolution des poumons, des ovaires, du plumage et du bec chez les oiseaux primitifs. Ces fossiles révèlent que de nombreuses adaptations importantes pour une digestion efficace, une haute prise d'oxygène, une masse corporelle réduite et une structure d'aile améliorée, toutes contribuant à améliorer les capacités aériennes et/ou à répondre aux demandes énergétiques de cette forme coûteuse de locomotion, se sont développées dans les premiers 20-30 Myr de l'évolution aviaire. La conservation des tissus mous fournit également des indices importants pour comprendre l'écologie des oiseaux primitifs et pourrait même élucider l'extinction de certains groupes. Cependant, le registre fossile actuel des tissus mous aviaires du Mésozoïque est presque entièrement limité au Crétacé inférieur et ainsi, les découvertes du Crétacé supérieur ont le potentiel de transformer radicalement notre interprétation des données disponibles.Cet article fait partie du numéro thématique 'La biologie du système respiratoire aviaire'.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2023.0426",
    doi = "10.1098/rstb.2023.0426",
    openalex = "W4407947322",
    references = "doi107717peerj16960"
}

Résumé Les analyses phylogénétiques des caractères phénotypiques chez les oiseaux de la couronne recouvrent souvent des résultats fortement incongruents avec les conclusions des analyses phylogénomiques récentes. De plus, les ensembles de données morphologiques existants pour les oiseaux de la couronne sont fréquemment limités par un échantillonnage restreint des taxons ou des caractères, une construction incohérente des caractères, un score incorrect, ou une combinaison de plusieurs de ces facteurs. Dans le cadre d'un effort visant à remédier à ces limitations, cette étude se concentre sur l'identification de caractères phylogénétiquement informatifs de la ceinture pectorale et du squelette de l'avant-bras des oiseaux, des éléments qui sont couramment conservés sous forme de fossiles aviens. Nous avons assemblé et validé un ensemble de données de 204 caractères, qui ont ensuite été notés pour une gamme phylogénétiquement diverse de 75 taxons aviens existants et intégrés dans des analyses phylogénétiques. Les analyses exécutées sans contraintes topologiques ont montré des conflits notables avec les résultats des études phylogénomiques récentes, possiblement en raison de la convergence fonctionnelle et de la cladogenèse rapide dans les premiers stades de l'histoire évolutive des oiseaux de la couronne. Des comparaisons anatomiques qualitatives et des métriques quantitatives de l'homoplasie ont mis en évidence le fait que des morphologies similaires dans les éléments de la ceinture pectorale et de l'avant-bras se sont développées à plusieurs reprises chez des groupes d'oiseaux éloignés, représentant un facteur de confusion majeur en phylogénétique morphologique aviaire. Cependant, la mise en œuvre de squelettes moléculaires a permis d'identifier des combinaisons de caractères diagnostiques pour de nombreux clades aviens précédemment reconnus uniquement grâce aux données moléculaires, tels que Phaethontimorphae, Aequornithes et Telluraves. Bien que les grands ensembles de données morphologiques ne garantissent pas une congruence accrue avec les études phylogénétiques moléculaires, ils peuvent néanmoins être des outils précieux pour identifier les synapomorphies anatomiques des clades clés, placer les fossiles dans un contexte phylogénétique et étudier les modèles macroévolutifs au sein des grands groupes d'organismes.

@misc{doi10110120250117633553,
    author = "Chen, Albert et Steell, Elizabeth M. et Benson, Roger et Field, Daniel J.",
    title = "Vers une matrice anatomique complète pour les oiseaux de la couronne : aperçus phylogénétiques à partir de la ceinture pectorale et du squelette de l'avant-bras",
    year = "2025",
    booktitle = "bioRxiv (Laboratoire Cold Spring Harbor)",
    abstract = "Résumé Les analyses phylogénétiques des caractères phénotypiques chez les oiseaux de la couronne recouvrent souvent des résultats fortement incongruents avec les conclusions des analyses phylogénomiques récentes. De plus, les ensembles de données morphologiques existants pour les oiseaux de la couronne sont fréquemment limités par un échantillonnage restreint des taxons ou des caractères, une construction incohérente des caractères, un score incorrect, ou une combinaison de plusieurs de ces facteurs. Dans le cadre d'un effort visant à remédier à ces limitations, cette étude se concentre sur l'identification de caractères phylogénétiquement informatifs de la ceinture pectorale et du squelette de l'avant-bras des oiseaux, des éléments qui sont couramment conservés sous forme de fossiles aviens. Nous avons assemblé et validé un ensemble de données de 204 caractères, qui ont ensuite été notés pour une gamme phylogénétiquement diverse de 75 taxons aviens existants et intégrés dans des analyses phylogénétiques. Les analyses exécutées sans contraintes topologiques ont montré des conflits notables avec les résultats des études phylogénomiques récentes, possiblement en raison de la convergence fonctionnelle et de la cladogenèse rapide dans les premiers stades de l'histoire évolutive des oiseaux de la couronne. Des comparaisons anatomiques qualitatives et des métriques quantitatives de l'homoplasie ont mis en évidence le fait que des morphologies similaires dans les éléments de la ceinture pectorale et de l'avant-bras se sont développées à plusieurs reprises chez des groupes d'oiseaux éloignés, représentant un facteur de confusion majeur en phylogénétique morphologique aviaire. Cependant, la mise en œuvre de squelettes moléculaires a permis d'identifier des combinaisons de caractères diagnostiques pour de nombreux clades aviens précédemment reconnus uniquement grâce aux données moléculaires, tels que Phaethontimorphae, Aequornithes et Telluraves. Bien que les grands ensembles de données morphologiques ne garantissent pas une congruence accrue avec les études phylogénétiques moléculaires, ils peuvent néanmoins être des outils précieux pour identifier les synapomorphies anatomiques des clades clés, placer les fossiles dans un contexte phylogénétique et étudier les modèles macroévolutifs au sein des grands groupes d'organismes.",
    url = "https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633553",
    doi = "10.1101/2025.01.17.633553",
    openalex = "W4406710206",
    references = "doi107717peerj16960"
}

Résumé La compréhension de l'histoire de la végétation du Cénozoïque de ce qui est maintenant la Plateau Qinghai–Tibétain est cruciale pour élucider les dynamiques co‐évolutives entre le développement du plateau, son environnement et les organismes qu'il abrite. Dans cette étude, nous menons une analyse complète des phytolithes au sein de la section sédimentaire lacustre de l'Oligocène tardif–Miocène inférieur du bassin de Lunpola, dans le centre du Plateau Qinghai–Tibétain. Les assemblages morphotypiques diversifiés de phytolithes indiquent que la végétation de la région tibétaine centrale comprenait principalement une forêt mixte de conifères et à feuilles larges. Les graminées du sous‐étage étaient principalement composées de Pooideae, distinguées par des morphotypologies de phytolithes telles que rondel, crénelé et formes bilobées de type Stipa. Combiné à des travaux antérieurs, nous inférons que la végétation riparienne de la région tibétaine centrale est passée d'une forêt subtropicale humide, dominée par des plantes ligneuses à feuilles larges durant l'Éocène moyen, à une forêt ouverte plus saisonnièrement aride contenant une abondance de plantes ligneuses et herbacées durant l'Éocène tardif, avant de se développer en une forêt mixte plus fraîche de conifères et à feuilles larges durant l'Oligocène tardif–Miocène inférieur. La croissance de la région tibétaine centrale et le retrait de l'Océan Téthys, ainsi que le soulèvement de l'Himalaya, ont contribué à ce changement de végétation. Cette étude fournit de nouvelles preuves sous l'angle des phytolithes pour l'histoire évolutive de la végétation du Plateau Qinghai–Tibétain étant liée à la formation du plateau et aux changements climatiques régionaux.

@article{doi101111jse13152,
    author = "Zhang, Xinwen et Liu, Jia et Spicer, Robert A. et Gao, Yi et Yao, Xuan‐Rong et Qin, Xing‐Yuan et Zhou, Zhe‐Kun et Su, Tao",
    title = "Histoire de la végétation de la région tibétaine centrale durant l'Oligocène tardif–Miocène inférieur",
    year = "2025",
    journal = "Journal of Systematics and Evolution",
    abstract = "Résumé La compréhension de l'histoire de la végétation du Cénozoïque de ce qui est maintenant la Plateau Qinghai–Tibétain est cruciale pour élucider les dynamiques co‐évolutives entre le développement du plateau, son environnement et les organismes qu'il abrite. Dans cette étude, nous menons une analyse complète des phytolithes au sein de la section sédimentaire lacustre de l'Oligocène tardif–Miocène inférieur du bassin de Lunpola, dans le centre du Plateau Qinghai–Tibétain. Les assemblages morphotypiques diversifiés de phytolithes indiquent que la végétation de la région tibétaine centrale comprenait principalement une forêt mixte de conifères et à feuilles larges. Les graminées du sous‐étage étaient principalement composées de Pooideae, distinguées par des morphotypologies de phytolithes telles que rondel, crénelé et formes bilobées de type Stipa. Combiné à des travaux antérieurs, nous inférons que la végétation riparienne de la région tibétaine centrale est passée d'une forêt subtropicale humide, dominée par des plantes ligneuses à feuilles larges durant l'Éocène moyen, à une forêt ouverte plus saisonnièrement aride contenant une abondance de plantes ligneuses et herbacées durant l'Éocène tardif, avant de se développer en une forêt mixte plus fraîche de conifères et à feuilles larges durant l'Oligocène tardif–Miocène inférieur. La croissance de la région tibétaine centrale et le retrait de l'Océan Téthys, ainsi que le soulèvement de l'Himalaya, ont contribué à ce changement de végétation. Cette étude fournit de nouvelles preuves sous l'angle des phytolithes pour l'histoire évolutive de la végétation du Plateau Qinghai–Tibétain étant liée à la formation du plateau et aux changements climatiques régionaux.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jse.13152",
    doi = "10.1111/jse.13152",
    openalex = "W4406229169",
    references = "doi101038s4146702340311z"
}

Plusieurs études ont analysé l'origine des oiseaux battant des ailes, mais peu d'entre elles ont exploré la myologie de la ceinture scapulaire chez les premiers oiseaux et les paraviens non aviens. Nous analysons la morphologie de la ceinture pectorale chez différents groupes de paraviens non ornithothoraciques dans le but d'hypothétiser les sites d'ancrage de certains muscles pectoraux et de déterminer leurs principales fonctions dans les mouvements des membres antérieurs. Notamment, la ceinture pectorale est restée morphologiquement stable parmi les paraviens non ornithothoraciques, car certains aspects du coracoïde et de la scapula sont similaires chez les taxons non volants, tels que le cursorial Buitreraptor, ainsi que chez ceux ayant la capacité de voler, tels que le Microraptor à quatre ailes, l'Archaeopteryx à longue queue et les pygostyliens Confuciusornis et Sapeornis. Les distinctions entre ces taxons sont légèrement discernables dans la morphologie osseuse, mais elles sont évidentes dans la couverture de plumes des membres antérieurs. En ce sens, les principaux muscles pectoraux (c'est-à-dire mm. supracoracoïdien, pectoralis et deltoïdien scapulaire/majeur) avaient des origines et des insertions similaires, et leurs fonctions déduites étaient similaires à travers une large gamme de formes corporelles chez les premiers paraviens. Les changements musculaires les plus significatifs se sont produits chez l'ancêtre commun des Pygostylia, et consistaient en le déplacement de l'origine des mm. biceps brachii et coracobrachialis p. cranialis, accompagnant le développement accru du processus acrocoracoïdien et la perte de la fosse sous-glénoïde. Ces modifications ont permis à plus de muscles de participer à la protraction humérale et au maintien de l'extension de l'aile. Par la suite, au nœud des Ornithothoraces, les transformations du coracoïde ont contribué à la réorientation médiale du canal supracoracoïdien, permettant ainsi au m. supracoracoïdien d'accomplir une fonction d'élévation de l'aile. Notre étude suggère que chez les paraviens non ornithothoraciques, les principaux mouvements du membre antérieur (volants ou non) étaient principalement craniodorsaux à caudoventraux. Les mouvements huméraux étaient effectués d'une manière similaire, dans laquelle les principaux élévateurs étaient le groupe des mm. deltoïdien et grand dorsal, tandis que les mm. supracoracoïdien et pectoralis auraient agi comme protracteur et déprimeur, respectivement. Par conséquent, la capacité de maintenir un vol battant continu présent chez les oiseaux volants actuels aurait pu être acquise au nœud des Ornithothoraces, tandis que les Archaeopterygidae, Confuciusornithidae et Omnivoropterygidae auraient pu avoir un vol fonctionnel, de courte durée et de déplacement spatial limité.

@article{doi101186s1286202502454z,
    author = "Lo Coco, Gastón E and Motta, Matías J and Agnolín, Federico L and Novas, Fernando E",
    title = "Reconstruction of pectoral musculature in non-avialan paravians and basal birds: implications in the acquisition of flapping flight.",
    year = "2025",
    journal = "BMC ecology and evolution",
    abstract = "Plusieurs études ont analysé l'origine des oiseaux battant des ailes, mais peu d'entre elles ont exploré la myologie de la ceinture scapulaire chez les premiers oiseaux et les paraviens non aviens. Nous analysons la morphologie de la ceinture pectorale chez différents groupes de paraviens non ornithothoraciques dans le but d'hypothétiser les sites d'ancrage de certains muscles pectoraux et de déterminer leurs principales fonctions dans les mouvements des membres antérieurs. Notamment, la ceinture pectorale est restée morphologiquement stable parmi les paraviens non ornithothoraciques, car certains aspects du coracoïde et de la scapula sont similaires chez les taxons non volants, tels que le cursorial Buitreraptor, ainsi que chez ceux ayant la capacité de voler, tels que le Microraptor à quatre ailes, l'Archaeopteryx à longue queue et les pygostyliens Confuciusornis et Sapeornis. Les distinctions entre ces taxons sont légèrement discernables dans la morphologie osseuse, mais elles sont évidentes dans la couverture de plumes des membres antérieurs. En ce sens, les principaux muscles pectoraux (c'est-à-dire mm. supracoracoïdien, pectoralis et deltoïdien scapulaire/majeur) avaient des origines et des insertions similaires, et leurs fonctions déduites étaient similaires à travers une large gamme de formes corporelles chez les premiers paraviens. Les changements musculaires les plus significatifs se sont produits chez l'ancêtre commun des Pygostylia, et consistaient en le déplacement de l'origine des mm. biceps brachii et coracobrachialis p. cranialis, accompagnant le développement accru du processus acrocoracoïdien et la perte de la fosse sous-glénoïde. Ces modifications ont permis à plus de muscles de participer à la protraction humérale et au maintien de l'extension de l'aile. Par la suite, au nœud des Ornithothoraces, les transformations du coracoïde ont contribué à la réorientation médiale du canal supracoracoïdien, permettant ainsi au m. supracoracoïdien d'accomplir une fonction d'élévation de l'aile. Notre étude suggère que chez les paraviens non ornithothoraciques, les principaux mouvements du membre antérieur (volants ou non) étaient principalement craniodorsaux à caudoventraux. Les mouvements huméraux étaient effectués d'une manière similaire, dans laquelle les principaux élévateurs étaient le groupe des mm. deltoïdien et grand dorsal, tandis que les mm. supracoracoïdien et pectoralis auraient agi comme protracteur et déprimeur, respectivement. Par conséquent, la capacité de maintenir un vol battant continu présent chez les oiseaux volants actuels aurait pu être acquise au nœud des Ornithothoraces, tandis que les Archaeopterygidae, Confuciusornithidae et Omnivoropterygidae auraient pu avoir un vol fonctionnel, de courte durée et de déplacement spatial limité.",
    url = "https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12548140/",
    doi = "10.1186/s12862-025-02454-z",
    openalex = "W4415467005",
    pmcid = "PMC12548140",
    pmid = "41131457",
    references = "doi101002ara10097, doi101016jcub201508003, doi101038nature02855, doi101038nature08322, doi101038nature12059, doi101038nature24679, doi101038s41559025027954, doi101086407902, doi101126science1078237, doi101126science1253293, doi1012067481"
}