Darwinisme

@article{darwin1839journal12,
    author = "Darwin, C",
    title = "Journal of researches into the geology and natural history of the various countries visited by H.M.S. Beagle",
    year = "1839",
    journal = "Londres, Henry Colbourn",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Darwin, C., 1839, Journal of researches into the geology and natural history of the various countries visited by H.M.S. Beagle: Londres, Henry Colbourn.}"
}

@article{darwin1845the13,
    author = "Darwin, C",
    title = "The Voyage of the Beagle. (Publié à l'origine sous le titre Journal of Researches, il est maintenant apparu dans de nombreuses publications",
    year = "1845",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Darwin, C., 1845, The Voyage of the Beagle. (Publié à l'origine sous le titre Journal of Researches, il est maintenant apparu dans de nombreuses publications.}"
}

@book{darwin1859on14,
    author = "Darwin, C",
    title = "Sur l'origine des espèces par le moyen de la sélection naturelle, ou la préservation des races favorisées dans la lutte pour la vie. Londres",
    year = "1859",
    publisher = "John Murray [Fac-similé de l'édition 1re] : Cambridge, Mass., Harvard University Press, 1964",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darwin, C., 1859, Sur l'origine des espèces par le moyen de la sélection naturelle, ou la préservation des races favorisées dans la lutte pour la vie. Londres : John Murray [Fac-similé de l'édition 1re] : Cambridge, Mass., Harvard University Press, 1964.}"
}

@article{jenkin1867review34,
    author = "Jenkin, F",
    title = "Review of the Origin of Species, in Hull, D. L., ed., Darwin and His Critics",
    year = "1867",
    journal = "Cambridge, Mass., Harvard University Press [1974]; The North British Review",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Jenkin, F., 1867, Review of the Origin of Species, in Hull, D. L., ed., Darwin and His Critics: Cambridge, Mass., Harvard University Press [1974]; The North British Review.}"
}

@misc{darwin1868the15,
    author = "Darwin, C",
    title = "The Variation of Animals and Plants Under Domestication",
    year = "1868",
    howpublished = "London, John Murray; 2 volumes",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darwin, C., 1868, The Variation of Animals and Plants Under Domestication: London, John Murray; 2 volumes.}"
}

@misc{darwin1874the16,
    author = "Darwin, C",
    title = "The Descent of Man and Selection in Relation to Sex. Chicago",
    year = "1874",
    howpublished = "Rand McNally and Co [Republication of illustrated revised ed.]: Detroit, Michigan, Gale Research, 1974",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darwin, C., 1874, The Descent of Man and Selection in Relation to Sex. Chicago: Rand McNally and Co [Republication of illustrated revised ed.]: Detroit, Michigan, Gale Research, 1974.}"
}

@misc{hodge1874what31,
    author = "Hodge, C",
    title = "Qu'est-ce que le darwinisme?",
    year = "1874",
    howpublished = "Londres",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hodge, C., 1874, Qu'est-ce que le darwinisme?: Londres.}"
}

@misc{darwin1876196917,
    author = "Darwin, C. et Barlow, N",
    title = "/1969, L'Autobiographie de Charles Darwin",
    year = "1876",
    howpublished = "New York, Norton",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darwin, C., et Barlow, N., 1876/1969, L'Autobiographie de Charles Darwin : New York, Norton.}"
}

@article{darwin1887the18,
    author = "Darwin, F",
    title = "The Life and Letters of Charles Darwin",
    year = "1887",
    journal = "Londres, John Murray",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Darwin, F., 1887, The Life and Letters of Charles Darwin : Londres, John Murray.}"
}

1. La diffusion de l'évolution 'Variation des Animaux et des Plantes' 1863-1866 2. La publication de la 'Variation des Animaux et des Plantes sous Domestication' janvier 1867-juin 1868 3. Travail sur 'L'Homme' 1864-1870 4. La publication de la 'Descendance de l'Homme', de l' 'Expression des Émotions' 1871-1873 5. Miscellanées, incluant les deuxième éditions de 'Récifs de Corail', de la 'Descendance de l'Homme' et de la 'Variation des Animaux et des Plantes' 1874-1875 6. Correspondance diversifiée 1876-1882 7. Fertilisation sur les fleurs 1839-1880 8. Les 'Effets de la Croisement et de l'Auto-Fertilisation dans le Règne Végétal' 1866-1877 9. 'Différentes Formes de Fleurs sur des Plantes de la Même Espèce' 1860-1878 10. Plantes grimpantes et carnivores 1863-1875 11. La 'Puissance du Mouvement dans les Plantes' 1878-1881 12. Correspondance botanique diversifiée 1873-1882 13. Conclusion Annexes.

@book{doi105962bhltitle50683,
    author = "Darwin, Charles et Darwin, Francis",
    title = "The life and letters of Charles Darwin : including an autobiographical chapter",
    year = "1887",
    booktitle = "D. Appleton eBooks",
    abstract = "1. La diffusion de l'évolution 'Variation des Animaux et des Plantes' 1863-1866 2. La publication de la 'Variation des Animaux et des Plantes sous Domestication' janvier 1867-juin 1868 3. Travail sur 'L'Homme' 1864-1870 4. La publication de la 'Descendance de l'Homme', de l' 'Expression des Émotions' 1871-1873 5. Miscellanées, incluant les deuxième éditions de 'Récifs de Corail', de la 'Descendance de l'Homme' et de la 'Variation des Animaux et des Plantes' 1874-1875 6. Correspondance diversifiée 1876-1882 7. Fertilisation sur les fleurs 1839-1880 8. Les 'Effets de la Croisement et de l'Auto-Fertilisation dans le Règne Végétal' 1866-1877 9. 'Différentes Formes de Fleurs sur des Plantes de la Même Espèce' 1860-1878 10. Plantes grimpantes et carnivores 1863-1875 11. La 'Puissance du Mouvement dans les Plantes' 1878-1881 12. Correspondance botanique diversifiée 1873-1882 13. Conclusion Annexes.",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.50683",
    doi = "10.5962/bhl.title.50683",
    openalex = "W2115400095"
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@article{huxley1900life33,
    author = "Huxley, L",
    title = "Life and Letters of Thomas H. Huxley",
    year = "1900",
    journal = "New York, D. Appleton and Co., v. 2",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Huxley, L., 1900, Life and Letters of Thomas H. Huxley: New York, D. Appleton and Co., v. 2.}"
}

@misc{kellogg1907darwinism35,
    author = "Kellogg, V. L",
    title = "Darwinisme d'aujourd'hui",
    year = "1907",
    howpublished = "Londres, Angleterre, Bell \& Sons",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kellogg, V. L., 1907, Darwinisme d'aujourd'hui: Londres, Angleterre, Bell \& Sons.}"
}

Nous n'avons pas besoin d'ajouter que la contemplation dans les sciences naturelles d'un domaine plus large que le réel conduit à une bien meilleure compréhension du réel.' (p. 267, The Nature of the Physical World.)x PREFACE La théorie de l'évolution était ainsi principalement régressive ; le vaste ensemble des recherches mendéliennes dans le monde a manifestement dépassé les erreurs avec lesquelles elle a d'abord été encouragée. En tant que pionnier de la génétique, il a fait plus que suffisant pour expier les polémiques imprudentes de ses écrits précoces. Traiter la sélection naturelle comme une agence basée indépendamment sur ses propres fondements n'est pas minimiser son importance dans la théorie de l'évolution. Au contraire, dès que nous devons former des opinions par d'autres moyens que par comparaison et analogie, une telle base déductive indépendante devient une nécessité. Cette nécessité est particulièrement à noter pour l'humanité ; puisque nous avons certaines connaissances de la structure de la société, des motivations humaines et des statistiques vitales de cette espèce, l'utilisation de la méthode déductive peut fournir une connaissance plus intime des processus évolutifs que ce qui est possible ailleurs. En outre, il sera important pour notre sujet d'appeler l'attention sur plusieurs conséquences du principe de la sélection naturelle ! qui, puisqu'elles ne consistent pas dans la modification adaptative de formes spécifiques I, ont nécessairement échappé à l'attention. Les phénomènes génétiques de dominance et de liaison semblent offrir des exemples de cette classe, l'investigation future de laquelle peut ajouter grandement à la portée de notre sujet. Aucun effort de ma part ne pourrait rendre le livre une lecture facile. J'ai essayé d'aider le lecteur en donnant de courts résumés à la fin de tous les chapitres, sauf le chapitre IV, qui est résumé conjointement avec le chapitre V. Ceux qui préfèrent le faire peuvent considérer le chapitre IV comme un appendice mathématique à la partie correspondante du résumé. Les déductions concernant l'homme sont strictement inséparables des chapitres plus généraux, mais ont été placées ensemble dans un groupe commençant avec le chapitre VIII. Je crois que personne ne sera surpris qu'un grand nombre des points considérés demandent un traitement beaucoup plus complet, plus rigoureux et plus complet. Il semble impossible que justice soit pleinement rendue au sujet de cette manière, tant qu'il n'y aura pas été construit une tradition de travail mathématique consacré aux problèmes biologiques, comparable aux recherches sur lesquelles un physicien mathématique peut s'appuyer dans la résolution de difficultés spéciales.

@book{doi105962bhltitle27468,
    author = "Fisher, Ronald Aylmer",
    title = "The genetical theory of natural selection",
    year = "1930",
    booktitle = "Clarendon Press eBooks",
    abstract = "Nous n'avons pas besoin d'ajouter que la contemplation dans les sciences naturelles d'un domaine plus large que le réel conduit à une bien meilleure compréhension du réel.' (p. 267, The Nature of the Physical World.)x PREFACE La théorie de l'évolution était ainsi principalement régressive ; le vaste ensemble des recherches mendéliennes dans le monde a manifestement dépassé les erreurs avec lesquelles elle a d'abord été encouragée. En tant que pionnier de la génétique, il a fait plus que suffisant pour expier les polémiques imprudentes de ses écrits précoces. Traiter la sélection naturelle comme une agence basée indépendamment sur ses propres fondements n'est pas minimiser son importance dans la théorie de l'évolution. Au contraire, dès que nous devons former des opinions par d'autres moyens que par comparaison et analogie, une telle base déductive indépendante devient une nécessité. Cette nécessité est particulièrement à noter pour l'humanité ; puisque nous avons certaines connaissances de la structure de la société, des motivations humaines et des statistiques vitales de cette espèce, l'utilisation de la méthode déductive peut fournir une connaissance plus intime des processus évolutifs que ce qui est possible ailleurs. En outre, il sera important pour notre sujet d'appeler l'attention sur plusieurs conséquences du principe de la sélection naturelle ! qui, puisqu'elles ne consistent pas dans la modification adaptative de formes spécifiques I, ont nécessairement échappé à l'attention. Les phénomènes génétiques de dominance et de liaison semblent offrir des exemples de cette classe, l'investigation future de laquelle peut ajouter grandement à la portée de notre sujet. Aucun effort de ma part ne pourrait rendre le livre une lecture facile. J'ai essayé d'aider le lecteur en donnant de courts résumés à la fin de tous les chapitres, sauf le chapitre IV, qui est résumé conjointement avec le chapitre V. Ceux qui préfèrent le faire peuvent considérer le chapitre IV comme un appendice mathématique à la partie correspondante du résumé. Les déductions concernant l'homme sont strictement inséparables des chapitres plus généraux, mais ont été placées ensemble dans un groupe commençant avec le chapitre VIII. Je crois que personne ne sera surpris qu'un grand nombre des points considérés demandent un traitement beaucoup plus complet, plus rigoureux et plus complet. Il semble impossible que justice soit pleinement rendue au sujet de cette manière, tant qu'il n'y aura pas été construit une tradition de travail mathématique consacré aux problèmes biologiques, comparable aux recherches sur lesquelles un physicien mathématique peut s'appuyer dans la résolution de difficultés spéciales.",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.27468",
    doi = "10.5962/bhl.title.27468",
    openalex = "W2004778468",
    references = "darwin2009the, doi101017cbo9780511693946006, doi101017cbo9780511702884, doi101038033529a0, doi101111j136523111908tb02141x, doi1023071929022, doi1023074345450, doi105962bhltitle121292, doi105962bhltitle61004, doi105962bhltitle87899, openalexw2163836228"
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@book{lack1947darwins39,
    author = "Lack, D",
    title = "Darwin's Finches",
    year = "1947",
    publisher = "An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Lack, D., 1947, Darwin's Finches: An essay on the General Biological Theory of Evolution: Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@misc{barlow1958the2,
    author = "Barlow, N",
    title = "The Autobiography of Charles Darwin 1809-1882",
    year = "1958",
    howpublished = "London, Collins",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Barlow, N., 1958, The Autobiography of Charles Darwin 1809-1882: London, Collins.}"
}

@misc{barnett1958a3,
    author = "Barnett, S. A",
    title = "A Century of Darwin",
    year = "1958",
    howpublished = "London, Heinemann",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Barnett, S. A., 1958, A Century of Darwin: London, Heinemann.}"
}

@misc{ellegard1958darwin21,
    author = "Ellegard, A",
    title = "Darwin et le Lecteur Général",
    year = "1958",
    howpublished = "Goteborg, Goteborgs Universitets Arsskrift",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ellegard, A., 1958, Darwin et le Lecteur Général: Goteborg, Goteborgs Universitets Arsskrift.}"
}

@book{millhauser1959just48,
    author = "Millhauser, M",
    title = "Just Before Darwin",
    year = "1959",
    publisher = "Robert Chambers et Vestiges : Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Millhauser, M., 1959, Just Before Darwin : Robert Chambers et Vestiges : Middletown, Connecticut, Wesleyan University Press.}"
}

@article{crossref1960review,
    title = "Revue : C. Charles Darwin : Le Voyage du Beagle",
    year = "1960",
    journal = "Anthropologie pratique",
    url = "https://doi.org/10.1177/009182966000700518",
    doi = "10.1177/009182966000700518",
    number = "5",
    pages = "231-231",
    volume = "os-7"
}

@article{doi1023073040342,
    author = "Greene, John C. et Ellegård, Alvar",
    title = "Darwin et le lecteur général. La réception de la théorie de l'évolution de Darwin dans la presse périodique britannique, 1859-1872.",
    year = "1960",
    journal = "Modern Language Notes",
    url = "https://doi.org/10.2307/3040342",
    doi = "10.2307/3040342",
    openalex = "W4243634495"
}

@book{openalexw645218623,
    author = "Tax, Sol",
    title = "Évolution après Darwin",
    year = "1960",
    openalex = "W645218623"
}

@book{greene1961darwin30,
    author = "Greene, J. C",
    title = "Darwin et la vision moderne du monde",
    year = "1961",
    publisher = "Baton Rouge, La., Presses de l'Université d'État de Louisiane",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Greene, J. C., 1961, Darwin et la vision moderne du monde : Baton Rouge, La., Presses de l'Université d'État de Louisiane.}"
}

@article{hindle1964charles,
    author = "Hindle, Edward et de Beer, Gavin",
    title = "Charles Darwin : Évolution par sélection naturelle",
    year = "1964",
    journal = "The Geographical Journal",
    url = "https://doi.org/10.2307/1794329",
    doi = "10.2307/1794329",
    number = "1",
    pages = "161",
    volume = "130"
}

@book{mayr1964introduction43,
    author = "Mayr, E",
    title = "Introduction, in On the Origin of Species by Means of Natural Selection, or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life (Darwin, C. 1859) [Facsimile of 1 ed.]",
    year = "1964",
    publisher = "London, John Murray, p. vii-xxvii; Cambridge, Mass. Harvard University Press, 1964",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Mayr, E., 1964, Introduction, in On the Origin of Species by Means of Natural Selection, or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life (Darwin, C. 1859) [Facsimile of 1 ed.]: London, John Murray, p. vii-xxvii; Cambridge, Mass. Harvard University Press, 1964.}"
}

@book{medawar1967mathematical47,
    author = "Medawar, P",
    title = "Défis mathématiques à l'interprétation néodarwinienne de l'évolution",
    year = "1967",
    publisher = "Philadelphia, Wistar Institute Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Medawar, P., 1967, Défis mathématiques à l'interprétation néodarwinienne de l'évolution : Philadelphia, Wistar Institute Press.}"
}

@article{beddall1968wallace4,
    author = "Beddall, B. G",
    title = "Wallace, Darwin, et la théorie de la sélection naturelle",
    year = "1968",
    journal = "Journal of Historical Biology, v. 1, p. 261-323",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Beddall, B. G., 1968, Wallace, Darwin, et la théorie de la sélection naturelle : Journal of Historical Biology, v. 1, p. 261-323.}"
}

@misc{decamp1968the19,
    author = "de Camp, L. S",
    title = "The Great Monkey Trial",
    year = "1968",
    howpublished = "New York, Doubleday",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {de Camp, L. S., 1968, The Great Monkey Trial: New York, Doubleday.}"
}

@misc{moorehead1969darwin50,
    author = "Moorehead, A",
    title = "Darwin et le Beagle",
    year = "1969",
    howpublished = "Londres, Hamish Hamilton",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Moorehead, A., 1969, Darwin et le Beagle : Londres, Hamish Hamilton.}"
}

@misc{appleman1970darwin1,
    author = "Appleman, P",
    title = "Darwin",
    year = "1970",
    howpublished = "A Norton Critical Edition: New York, W.W. Norton",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Appleman, P., 1970, Darwin: A Norton Critical Edition: New York, W.W. Norton.}"
}

@book{kuhn1970the38,
    author = "Kuhn, T",
    title = "The Structure of Scientific Revolutions",
    year = "1970",
    publisher = "Chicago et Londres, University of Chicago Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kuhn, T., 1970, The Structure of Scientific Revolutions : Chicago et Londres, University of Chicago Press.}"
}

@misc{macbeth1971darwin40,
    author = "Macbeth, N",
    title = "Darwin Retried",
    year = "1971",
    howpublished = "Boston, Mass., Gambit Books",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Macbeth, N., 1971, Darwin Retried: Boston, Mass., Gambit Books.}"
}

@misc{matthews1971introduction41,
    author = "Matthews, L. H",
    title = "Introduction to The Origin of Species",
    year = "1971",
    howpublished = "London, Dent",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Matthews, L. H., 1971, Introduction to The Origin of Species: London, Dent.}"
}

@book{mckinney1971lamarck46,
    author = "McKinney, H. L",
    title = "Lamarck to Darwin",
    year = "1971",
    publisher = "Contributions to Evolutionary Biology, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {McKinney, H. L., 1971, Lamarck to Darwin: Contributions to Evolutionary Biology, 1809-1859: Lawrence, Kansas, Coronado Press.}"
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@phdthesis{morison1971george51,
    author = "Morison, W. J",
    title = "George Fredrick Wright",
    year = "1971",
    publisher = "in Defense of Darwinism and Fundamentalism, 1838-1921 [Thèse de doctorat]: Vanderbilt",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Morison, W. J., 1971, George Fredrick Wright: in Defense of Darwinism and Fundamentalism, 1838-1921 [Thèse de doctorat]: Vanderbilt.}"
}

@misc{mayr1972the44,
    author = "Mayr, E",
    title = "La nature de la révolution darwinienne. L'acceptation de l'évolution par sélection naturelle a nécessité le rejet de nombreux concepts auparavant admis",
    year = "1972",
    howpublished = "Science, v. 176, p. 981-989",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Mayr, E., 1972, La nature de la révolution darwinienne. L'acceptation de l'évolution par sélection naturelle a nécessité le rejet de nombreux concepts auparavant admis: Science, v. 176, p. 981-989.}"
}

@book{hull1974darwin32,
    author = "Hull, D. L",
    title = "Darwin et ses critiques",
    year = "1974",
    publisher = "Cambridge, Mass., Harvard University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Hull, D. L., 1974, Darwin et ses critiques : Cambridge, Mass., Harvard University Press.}"
}

@misc{popper1974darwinism53,
    author = "Popper, K. R",
    title = "Darwinisme comme programme de recherche métaphysique, dans Schlipp, P. A., éd., La Philosophie de Karl Popper",
    year = "1974",
    howpublished = "La Salle, Ill., Open Court",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Popper, K. R., 1974, Darwinisme comme programme de recherche métaphysique, dans Schlipp, P. A., éd., La Philosophie de Karl Popper: La Salle, Ill., Open Court.}"
}

@misc{colloms1975charles11,
    author = "Colloms, B",
    title = "Charles Kingsley",
    year = "1975",
    howpublished = "Londres et New York, Constable and Barnes \& Noble",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Colloms, B., 1975, Charles Kingsley: Londres et New York, Constable and Barnes \& Noble.}"
}

@misc{bethell1976darwins6,
    author = "Bethell, T",
    title = "L'Erreur de Darwin",
    year = "1976",
    howpublished = "Harper's",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Bethell, T., 1976, L'Erreur de Darwin : Harper's.}"
}

@misc{gould1977ever26,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Ever Since Darwin",
    year = "1977",
    howpublished = "Reflections in Natural History: New York, W.W. Norton \& Co., 285 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1977, Ever Since Darwin: Reflections in Natural History: New York, W.W. Norton \& Co., 285 p.}"
}

@book{gillespie1979charles25,
    author = "Gillespie, N. C",
    title = "Charles Darwin et le Problème de la Création",
    year = "1979",
    publisher = "Chicago, Illinois, University of Chicago Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gillespie, N. C., 1979, Charles Darwin et le Problème de la Création : Chicago, Illinois, University of Chicago Press.}"
}

@book{keynes1979the36,
    author = "Keynes, R. D",
    title = "The Beagle Record",
    year = "1979",
    publisher = "Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Keynes, R. D., 1979, The Beagle Record : Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@book{moore1979the49,
    author = "Moore, J. R",
    title = "Les Controverses post-darwiniennes",
    year = "1979",
    publisher = "Étude de la lutte protestante pour accepter Darwin en Grande-Bretagne et aux États-Unis, 1870-1900 : Cambridge et New York, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Moore, J. R., 1979, Les Controverses post-darwiniennes : Étude de la lutte protestante pour accepter Darwin en Grande-Bretagne et aux États-Unis, 1870-1900 : Cambridge et New York, Cambridge University Press.}"
}

@techreport{raup1979conflicts54,
    author = "Raup, D. M",
    title = "Conflits entre Darwin et la paléontologie",
    year = "1979",
    howpublished = "Bulletin du Musée de l'histoire naturelle du Field, v. 50, p. 22-29; Chicago",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Raup, D. M., 1979, Conflits entre Darwin et la paléontologie : Bulletin du Musée de l'histoire naturelle du Field, v. 50, p. 22-29; Chicago.}"
}

@book{ruse1979the55,
    author = "Ruse, M",
    title = "La Révolution darwinienne",
    year = "1979",
    publisher = "Nature Red in Tooth and Claw : Chicago, Ill, University of Chicago Press",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Ruse, M., 1979, La Révolution darwinienne : Nature Red in Tooth and Claw : Chicago, Ill, University of Chicago Press.}"
}

@misc{brackman1980a7,
    author = "Brackman, A. C",
    title = "A Delicate Arrangement",
    year = "1980",
    howpublished = "The Strange Case of Charles Darwin and Alfred Russel Wallace: New York, Times Books",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brackman, A. C., 1980, A Delicate Arrangement: The Strange Case of Charles Darwin and Alfred Russel Wallace: New York, Times Books.}"
}

@misc{brent1981charles8,
    author = "Brent, P",
    title = "Charles Darwin",
    year = "1981",
    howpublished = "A Man of Enlarged Curiosity: New York, Harper and Row",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brent, P., 1981, Charles Darwin: A Man of Enlarged Curiosity: New York, Harper and Row.}"
}

@book{gillespie1981charles24,
    author = "Gillespie, C. S",
    title = "Charles Darwin et le Problème de la Création",
    year = "1981",
    publisher = "Chicago, Illinois, University of Chicago Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gillespie, C. S., 1981, Charles Darwin et le Problème de la Création : Chicago, Illinois, University of Chicago Press.}"
}

@book{ospovat1981the52,
    author = "Ospovat, D",
    title = "The Development of Darwin's Theory",
    year = "1981",
    publisher = "Natural History, Natural Theology, and Natural Selection, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ospovat, D., 1981, The Development of Darwin's Theory: Natural History, Natural Theology, and Natural Selection, 1838-1859: Cambridge, Cambridge University Press.}"
}

@misc{ruse1981darwinism56,
    author = "Ruse, M",
    title = "Darwinism Defended",
    year = "1981",
    howpublished = "Dordrecht, Reidel",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ruse, M., 1981, Darwinism Defended: Dordrecht, Reidel.}"
}

@article{doi101007bf00132004,
    author = "Sulloway, Frank J.",
    title = "Darwin et ses pinsons : L'évolution d'une légende",
    year = "1982",
    journal = "Journal of the History of Biology",
    url = "https://doi.org/10.1007/bf00132004",
    doi = "10.1007/bf00132004",
    openalex = "W2020068972",
    references = "doi101007bf00133143, doi10106313050879, doi1023071421785, doi1023071868881, doi1023072217783, doi1023072412932, doi105962bhltitle4489, doi105962bhltitle50683, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, openalexw1973833797, openalexw645218623"
}

@misc{flew1982darwin22,
    author = "Flew, A",
    title = "Darwin, Évolution et créationnisme",
    year = "1982",
    howpublished = "Free Inquiry, v. 2, no. 3, p. 46-49",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Flew, A., 1982, Darwin, Évolution et créationnisme: Free Inquiry, v. 2, no. 3, p. 46-49.}"
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@misc{gould1982darwinism27,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Darwinisme et l'expansion de la théorie de l'évolution",
    year = "1982",
    howpublished = "Science, v. 216, p. 380-387",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1982, Darwinisme et l'expansion de la théorie de l'évolution: Science, v. 216, p. 380-387.}"
}

@misc{ruse1982darwinism57,
    author = "Ruse, M",
    title = "Darwinisme défendu",
    year = "1982",
    howpublished = "A Guide to the Evolution Controversies: Reading, Mass., Addison-Wesley",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ruse, M., 1982, Darwinisme défendu : A Guide to the Evolution Controversies: Reading, Mass., Addison-Wesley.}"
}

@misc{stebbins1982darwin60,
    author = "Stebbins, C. L",
    title = "Darwin to DNA, Molecules to Humanity",
    year = "1982",
    howpublished = "San Francisco, W.H. Freeman",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stebbins, C. L., 1982, Darwin to DNA, Molecules to Humanity: San Francisco, W.H. Freeman.}"
}

@misc{stebbins1982darwin61,
    author = "Stebbins, G. L",
    title = "Darwin to DNA, Molecules to Humanity",
    year = "1982",
    howpublished = "San Francisco, W. H. Freeman, 491 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Stebbins, G. L., 1982, Darwin to DNA, Molecules to Humanity: San Francisco, W. H. Freeman, 491 p.}"
}

@article{sulloway1982darwin62,
    author = "Sulloway, F",
    title = "Darwin et ses pinsons",
    year = "1982",
    journal = "l'évolution d'une légende : Journal of Historical Biology, v. 15, p. 1-53",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Sulloway, F., 1982, Darwin et ses pinsons : l'évolution d'une légende : Journal of Historical Biology, v. 15, p. 1-53.}"
}

@misc{gould1983hens28,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Hen's Teeth and Horse's Toes",
    year = "1983",
    howpublished = "New York, W.W. Norton \& Co., 413 p",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1983, Hen's Teeth and Horse's Toes: New York, W.W. Norton \& Co., 413 p.}"
}

@book{mayr1983darwin45,
    author = "Mayr, E",
    title = "Darwin, Révolutionnaire intellectuel, dans Bendall, D. S., éd., Évolution des molécules à l'homme",
    year = "1983",
    publisher = "Cambridge, Mass., Cambridge University Press, p. 23-41",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Mayr, E., 1983, Darwin, Révolutionnaire intellectuel, dans Bendall, D. S., éd., Évolution des molécules à l'homme : Cambridge, Mass., Cambridge University Press, p. 23-41.}"
}

@book{wilson1983did63,
    author = "Wilson, D. B",
    title = "Le Diable a-t-il poussé Darwin à le faire ? Perspectives modernes sur le débat créationnisme-évolution",
    year = "1983",
    publisher = "Ames, Iowa, Iowa University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Wilson, D. B., 1983, Le Diable a-t-il poussé Darwin à le faire ? Perspectives modernes sur le débat créationnisme-évolution : Ames, Iowa, Iowa University Press.}"
}

@book{brooks1984just9,
    author = "Brooks, J. L",
    title = "Just Before the Origin",
    year = "1984",
    publisher = "Alfred Russel Wallace's Theory of Evolution: New York, Columbia University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Brooks, J. L., 1984, Just Before the Origin: Alfred Russel Wallace's Theory of Evolution: New York, Columbia University Press.}"
}

@misc{clark1984the10,
    author = "Clark, R. W",
    title = "The Survival of Charles Darwin",
    year = "1984",
    howpublished = "A Biography of Man and Idea: London, Weidenfield and Nicholson",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Clark, R. W., 1984, The Survival of Charles Darwin: A Biography of Man and Idea: London, Weidenfield and Nicholson.}"
}

Une procédure est développée et appliquée pour évaluer des explications alternatives aux motifs morphologiques dans les communautés de pinsons terrestres de Darwin. La première étape de la procédure consiste à calculer la densité de population attendue pour une espèce de pinson solitaire hypothétique sur une île, en fonction de la profondeur du bec. Cela a été fait pour 15 îles des Galápagos où les caractéristiques alimentaires ont été mesurées. La deuxième étape implique la construction de communautés de pinsons hypothétiques pour ces îles en utilisant cinq modèles différents. Les modèles diffèrent par la mesure dans laquelle les processus d'assemblage et/ou d'évolution favorisent les espèces de haute densité attendue, et par la mesure dans laquelle la compétition interspécifique influence ces processus. En comparant les prédictions des modèles aux communautés réelles, les rôles de l'approvisionnement alimentaire et de la compétition peuvent être évalués. Les résultats révèlent que la densité attendue est généralement une fonction polymodale de la profondeur du bec. Les îles diffèrent considérablement par la forme de leurs fonctions de densité. Les tailles moyennes des becs des espèces réellement présentes sur chaque île correspondent aux maxima locaux de la densité attendue. Cependant, deux espèces n'occupent jamais le même ou des maxima locaux très proches. Des modèles simples incorporant les effets de l'approvisionnement alimentaire et de la compétition interspécifique sur l'assemblage/évolution sont montrés comme prédisant avec précision les motifs morphologiques observés. Les résultats soutiennent l'hypothèse que l'approvisionnement alimentaire et la compétition interspécifique ont déterminé les propriétés morphologiques dans les communautés de ces pinsons.

@article{doi101086284196,
    author = "Schluter, Dolph and Grant, Peter R.",
    title = "Déterminants des motifs morphologiques dans les communautés de pinsons de Darwin",
    year = "1984",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Une procédure est développée et appliquée pour évaluer des explications alternatives aux motifs morphologiques dans les communautés de pinsons terrestres de Darwin. La première étape de la procédure consiste à calculer la densité de population attendue pour une espèce de pinson solitaire hypothétique sur une île, en fonction de la profondeur du bec. Cela a été fait pour 15 îles des Galápagos où les caractéristiques alimentaires ont été mesurées. La deuxième étape implique la construction de communautés de pinsons hypothétiques pour ces îles en utilisant cinq modèles différents. Les modèles diffèrent par la mesure dans laquelle les processus d'assemblage et/ou d'évolution favorisent les espèces de haute densité attendue, et par la mesure dans laquelle la compétition interspécifique influence ces processus. En comparant les prédictions des modèles aux communautés réelles, les rôles de l'approvisionnement alimentaire et de la compétition peuvent être évalués. Les résultats révèlent que la densité attendue est généralement une fonction polymodale de la profondeur du bec. Les îles diffèrent considérablement par la forme de leurs fonctions de densité. Les tailles moyennes des becs des espèces réellement présentes sur chaque île correspondent aux maxima locaux de la densité attendue. Cependant, deux espèces n'occupent jamais le même ou des maxima locaux très proches. Des modèles simples incorporant les effets de l'approvisionnement alimentaire et de la compétition interspécifique sur l'assemblage/évolution sont montrés comme prédisant avec précision les motifs morphologiques observés. Les résultats soutiennent l'hypothèse que l'approvisionnement alimentaire et la compétition interspécifique ont déterminé les propriétés morphologiques dans les communautés de ces pinsons.",
    url = "https://doi.org/10.1086/284196",
    doi = "10.1086/284196",
    openalex = "W2015341730",
    references = "doi10100797814899732526, doi101007bf00132004, doi101016004058097690054x, doi101093auk972321, doi101111j155856461976tb00911x, doi1023071937166, doi1023072288753, doi1023072405671, doi1023072984653, openalexw1973833797"
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@incollection{doi101016b9780127817804500082,
    author = "Montgomery, William",
    title = "La pensée de Charles Darwin sur les mécanismes expressifs dans l'évolution",
    year = "1985",
    booktitle = "Elsevier eBooks",
    url = "https://doi.org/10.1016/b978-0-12-781780-4.50008-2",
    doi = "10.1016/b978-0-12-781780-4.50008-2",
    openalex = "W2895830950",
    references = "doi101007bf00133143"
}

@misc{eldredge1985time20,
    author = "Eldredge, N",
    title = "Time Frames",
    year = "1985",
    howpublished = "The Rethinking of Darwinian Evolution and the Theory of Punctuated Equilibria: New York, Simon and Schuster",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Eldredge, N., 1985, Time Frames: The Rethinking of Darwinian Evolution and the Theory of Punctuated Equilibria: New York, Simon and Schuster.}"
}

@book{kohn1985the37,
    author = "Kohn, D",
    title = "The Darwinian Heritage",
    year = "1985",
    publisher = "Princeton, Princeton University Press",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Kohn, D., 1985, The Darwinian Heritage: Princeton, Princeton University Press.}"
}

@book{speilberg1985seven59,
    author = "Speilberg, N. et Anderson, B. D",
    title = "Seven Ideas that Shook the World",
    year = "1985",
    publisher = "New York, John Wiley and Sons",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Speilberg, N., et Anderson, B. D., 1985, Seven Ideas that Shook the World : New York, John Wiley and Sons.}"
}

@misc{ruse1986taking58,
    author = "Ruse, M",
    title = "Taking Darwin Seriously",
    year = "1986",
    howpublished = "A Naturalistic Approach to Philosophy: Oxford, Basil Blackwell",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Ruse, M., 1986, Taking Darwin Seriously: A Naturalistic Approach to Philosophy: Oxford, Basil Blackwell.}"
}

@misc{gould1987darwinism29,
    author = "Gould, S. J",
    title = "Darwinism Defined",
    year = "1987",
    howpublished = "The Difference Between Fact and Theory: Discover, v. 8, p. 64-70",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Gould, S. J., 1987, Darwinism Defined: The Difference Between Fact and Theory: Discover, v. 8, p. 64-70.}"
}

@article{beddall1988darwin5,
    author = "Beddall, B. G",
    title = "Darwin et la divergence",
    year = "1988",
    journal = "le lien Wallace : Journal of Historical Biology, v. 21, p. 1-68",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Beddall, B. G., 1988, Darwin et la divergence : le lien Wallace : Journal of Historical Biology, v. 21, p. 1-68.}"
}

Après sa célèbre visite aux îles Galápagos, Darwin a spéculé que l'on pourrait imaginer qu'à partir d'une rareté initiale d'oiseaux dans cet archipel, une seule espèce a été prise et modifiée pour des fins différentes. Ce livre est le compte rendu classique de tout ce que nous avons appris depuis sur l'évolution de ces oiseaux remarquables. Basé sur plus d'une décennie de recherches, Grant montre comment la compétition interspécifique et la sélection naturelle agissent suffisamment fortement sur les populations contemporaines pour produire un changement évolutif observable et mesurable. Dans cette nouvelle édition, Grant décrit les nouvelles découvertes faites depuis les treize années écoulées depuis la publication du livre. Ecology and Evolution of Darwin's Finches est un compte rendu extraordinaire de l'évolution en action.

@article{doi1023074785,
    author = "Snow, D. W. et Grant, Peter R.",
    title = "Écologie et évolution des pinsons de Darwin",
    year = "1988",
    journal = "Journal of Animal Ecology",
    abstract = "Après sa célèbre visite aux îles Galápagos, Darwin a spéculé que l'on pourrait imaginer qu'à partir d'une rareté initiale d'oiseaux dans cet archipel, une seule espèce a été prise et modifiée pour des fins différentes. Ce livre est le compte rendu classique de tout ce que nous avons appris depuis sur l'évolution de ces oiseaux remarquables. Basé sur plus d'une décennie de recherches, Grant montre comment la compétition interspécifique et la sélection naturelle agissent suffisamment fortement sur les populations contemporaines pour produire un changement évolutif observable et mesurable. Dans cette nouvelle édition, Grant décrit les nouvelles découvertes faites depuis les treize années écoulées depuis la publication du livre. Ecology and Evolution of Darwin's Finches est un compte rendu extraordinaire de l'évolution en action.",
    url = "https://doi.org/10.2307/4785",
    doi = "10.2307/4785",
    openalex = "W2005862991"
}

@misc{fox1988the23,
    author = "Fox, S. W",
    title = "L'émergence de la vie",
    year = "1988",
    howpublished = "L'évolution darwinienne vue de l'intérieur : New York, Basic Books",
    note = "talkorigins_source = {true}; raw_reference = {Fox, S. W., 1988, L'émergence de la vie : L'évolution darwinienne vue de l'intérieur : New York, Basic Books.}"
}

@misc{maynardsmith1988did42,
    author = "Maynard Smith, J",
    title = "Darwin a-t-il raison ? Essais sur les jeux, le sexe et l'évolution",
    year = "1988",
    howpublished = "New York, Chapman and Hall",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Maynard Smith, J., 1988, Darwin a-t-il raison ? Essais sur les jeux, le sexe et l'évolution : New York, Chapman and Hall.}"
}

On connaît bien Darwin pour sa rhétorique étonnamment ambiguë. L'auteur qui a utilisé une « banque enchevêtrée » comme métaphore de la Nature et de ses relations complexes a construit la substance de son texte à partir d'un enchevêtrement correspondant de relations théoriques non résolues. Des positions ambiguës, des arguments qui semblent se replier sur eux-mêmes, des hésitations, des contradictions et des pluralités d'explication imprègnent la science de Darwin et sa métascience constituante. L'Origine regorge d'ambiguïtés concernant les aspects techniques de la biologie évolutive. Mais le domaine de l'ambiguïté que je souhaite aborder est la posture métaphysique de Darwin. Je souhaite aborder la question de Darwin et de la sécularisation à travers ce qui pourrait être appelé le trope de l'ambiguïté. Ma préoccupation principale porte sur les origines de cette ambiguïté. Elles résident dans les ressources culturelles et idéologiques conflictuelles que Darwin a utilisées pour construire la théorie de la sélection naturelle.

@article{doi101017s0007087400026005,
    author = "Kohn, David H.",
    title = "Darwin's Ambiguity: The Secularization of Biological Meaning",
    year = "1989",
    journal = "The British Journal for the History of Science",
    abstract = "On connaît bien Darwin pour sa rhétorique étonnamment ambiguë. L'auteur qui a utilisé une « banque enchevêtrée » comme métaphore de la Nature et de ses relations complexes a construit la substance de son texte à partir d'un enchevêtrement correspondant de relations théoriques non résolues. Des positions ambiguës, des arguments qui semblent se replier sur eux-mêmes, des hésitations, des contradictions et des pluralités d'explication imprègnent la science de Darwin et sa métascience constituante. L'Origine regorge d'ambiguïtés concernant les aspects techniques de la biologie évolutive. Mais le domaine de l'ambiguïté que je souhaite aborder est la posture métaphysique de Darwin. Je souhaite aborder la question de Darwin et de la sécularisation à travers ce qui pourrait être appelé le trope de l'ambiguïté. Ma préoccupation principale porte sur les origines de cette ambiguïté. Elles résident dans les ressources culturelles et idéologiques conflictuelles que Darwin a utilisées pour construire la théorie de la sélection naturelle.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0007087400026005",
    doi = "10.1017/s0007087400026005",
    openalex = "W2134431578",
    references = "darwin2009the, doi101007bf00125354, doi101007bf00125744, doi101007bf00133143, doi101017cbo9780511755101, doi101017cbo9781107280403, doi10103711845000, doi101177007327538202000301, doi1023071857970, doi102307429625, doi105962bhltitle46292, doi105962bhltitle68064, doi107208chicago97802261495160010001"
}

Résumé De nombreuses personnes ont soutenu que l'évolution de la faculté du langage humain ne peut être expliquée par la sélection naturelle darwinienne. Chomsky et Gould ont suggéré que le langage aurait pu évoluer comme sous-produit de la sélection d'autres capacités ou comme conséquence de lois de croissance et de forme encore inconnues. D'autres ont soutenu qu'une spécialisation biologique pour la grammaire est incompatible avec chaque principe de la théorie darwinienne – qu'elle ne montre aucune variation génétique, ne pourrait exister sous aucune forme intermédiaire, ne confère aucun avantage sélectif et nécessiterait plus de temps évolutif et d'espace génomique que ce qui est disponible. Nous examinons ces arguments et montrons qu'ils reposent sur des hypothèses inexactes concernant la biologie ou le langage ou les deux. La théorie évolutionniste offre des critères clairs pour déterminer lorsqu'un trait doit être attribué à la sélection naturelle : un design complexe pour une certaine fonction, et l'absence de processus alternatifs capables d'expliquer une telle complexité. Le langage humain répond à ces critères : la grammaire est un mécanisme complexe adapté à la transmission de structures propositionnelles via une interface sérielle. Des phénomènes grammaticaux autonomes et arbitraires ont été proposés comme contre-exemples à la position selon laquelle le langage est une adaptation, mais ce raisonnement est erroné : les protocoles de communication reposent sur des conventions arbitraires qui sont adaptatives tant qu'elles sont partagées. Par conséquent, l'acquisition du langage chez l'enfant devrait systématiquement différer de l'évolution du langage chez l'espèce, et les tentatives d'analogie entre les deux sont trompeuses. En examinant d'autres arguments et données, nous concluons qu'il y a toutes les raisons de croire qu'une spécialisation pour la grammaire a évolué par un processus néo-darwinien conventionnel.

@article{doi1017s0140525x00081061,
    author = "Pinker, Steven et Bloom, Paul",
    title = "Langage naturel et sélection naturelle",
    year = "1990",
    journal = "Behavioral and Brain Sciences",
    abstract = "Résumé De nombreuses personnes ont soutenu que l'évolution de la faculté du langage humain ne peut être expliquée par la sélection naturelle darwinienne. Chomsky et Gould ont suggéré que le langage aurait pu évoluer comme sous-produit de la sélection d'autres capacités ou comme conséquence de lois de croissance et de forme encore inconnues. D'autres ont soutenu qu'une spécialisation biologique pour la grammaire est incompatible avec chaque principe de la théorie darwinienne – qu'elle ne montre aucune variation génétique, ne pourrait exister sous aucune forme intermédiaire, ne confère aucun avantage sélectif et nécessiterait plus de temps évolutif et d'espace génomique que ce qui est disponible. Nous examinons ces arguments et montrons qu'ils reposent sur des hypothèses inexactes concernant la biologie ou le langage ou les deux. La théorie évolutionniste offre des critères clairs pour déterminer lorsqu'un trait doit être attribué à la sélection naturelle : un design complexe pour une certaine fonction, et l'absence de processus alternatifs capables d'expliquer une telle complexité. Le langage humain répond à ces critères : la grammaire est un mécanisme complexe adapté à la transmission de structures propositionnelles via une interface sérielle. Des phénomènes grammaticaux autonomes et arbitraires ont été proposés comme contre-exemples à la position selon laquelle le langage est une adaptation, mais ce raisonnement est erroné : les protocoles de communication reposent sur des conventions arbitraires qui sont adaptatives tant qu'elles sont partagées. Par conséquent, l'acquisition du langage chez l'enfant devrait systématiquement différer de l'évolution du langage chez l'espèce, et les tentatives d'analogie entre les deux sont trompeuses. En examinant d'autres arguments et données, nous concluons qu'il y a toutes les raisons de croire qu'une spécialisation pour la grammaire a évolué par un processus néo-darwinien conventionnel.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0140525x00081061",
    doi = "10.1017/s0140525x00081061",
    openalex = "W2162471372",
    references = "caplan1983morality, doi10160010027789900231, doi10160022283668903926, doi10160022519364900384, doi10160162309589900137, doi16s109051380100068x, doi1017s0094837300004310, doi1017s0094837300005224, doi1017s0140525x00047695, doi1017s0305004100015644, doi1038369716c0, doi1086276408, doi1086284064, doi1086406755, doi1098rspb19790086, doi1126science1090005, doi1126science6107993, doi1126science7455683, doi1126science7466396, doi1126science860134, doi1159000156428, doi15159783110884166, doi23071423235, doi23072103745, doi23072260026, doi23072803365, doi23073037993, doi2307414947, doi4159harvard9780674184404, doi5962bhltitle27468, doi7208chicago97802263088830010001, falk1983cerebral, openalexw1577806554, openalexw2171582839, openalexw2624262714, openalexw3038830718, openalexw3135630760"
}

Les structures et séquences moléculaires révèlent généralement davantage les relations évolutives que les phénotypes classiques (surtout chez les micro-organismes). Par conséquent, la base de la définition des taxa a progressivement basculé du niveau organismal au niveau cellulaire puis au niveau moléculaire. Les comparaisons moléculaires montrent que la vie sur cette planète se divise en trois groupements principaux, communément appelés les eubactéries, les archaebactéries et les eucaryotes. Les trois sont très différents, les différences qui les séparent étant de nature plus profonde que celles qui séparent les royaumes typiques, tels que les animaux et les plantes. Malheureusement, aucune des deux vues conventionnellement acceptées des relations naturelles entre les systèmes vivants — à savoir, la taxonomie à cinq royaumes ou la dichotomie eucaryote-prokaryote — ne reflète cette division tripartite primaire du monde vivant. Pour remédier à cette situation, nous proposons qu'un système formel d'organismes soit établi dans lequel, au-dessus du niveau de royaume, existe un nouveau taxon appelé « domaine ». La vie sur cette planète serait alors vue comme composée de trois domaines, les Bacteria, les Archaea et les Eucarya, chacun contenant deux royaumes ou plus. (Les Eucarya, par exemple, contiennent Animalia, Plantae, Fungi et un certain nombre d'autres encore à définir). Bien que la structure taxonomique au sein des Bacteria et des Eucarya ne soit pas traitée ici, les Archaea sont formellement subdivisés en deux royaumes : Euryarchaeota (englobant les méthanogènes et leurs parents phénotypiquement divers) et Crenarchaeota (composant le regroupement relativement serré des archaebactéries extrêmement thermophiles, dont le phénotype général semble ressembler le plus au phénotype ancestral des Archaea.

@article{doi101073pnas87124576,
    author = "Woese, C R et Kandler, O. et Wheelis, Mark L.",
    title = "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.",
    year = "1990",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Les structures et séquences moléculaires révèlent généralement davantage les relations évolutives que les phénotypes classiques (surtout chez les micro-organismes). Par conséquent, la base de la définition des taxa a progressivement basculé du niveau organismal au niveau cellulaire puis au niveau moléculaire. Les comparaisons moléculaires montrent que la vie sur cette planète se divise en trois groupements principaux, communément appelés les eubactéries, les archaebactéries et les eucaryotes. Les trois sont très différents, les différences qui les séparent étant de nature plus profonde que celles qui séparent les royaumes typiques, tels que les animaux et les plantes. Malheureusement, aucune des deux vues conventionnellement acceptées des relations naturelles entre les systèmes vivants — à savoir, la taxonomie à cinq royaumes ou la dichotomie eucaryote-prokaryote — ne reflète cette division tripartite primaire du monde vivant. Pour remédier à cette situation, nous proposons qu'un système formel d'organismes soit établi dans lequel, au-dessus du niveau de royaume, existe un nouveau taxon appelé « domaine ». La vie sur cette planète serait alors vue comme composée de trois domaines, les Bacteria, les Archaea et les Eucarya, chacun contenant deux royaumes ou plus. (Les Eucarya, par exemple, contiennent Animalia, Plantae, Fungi et un certain nombre d'autres encore à définir). Bien que la structure taxonomique au sein des Bacteria et des Eucarya ne soit pas traitée ici, les Archaea sont formellement subdivisés en deux royaumes : Euryarchaeota (englobant les méthanogènes et leurs parents phénotypiquement divers) et Crenarchaeota (composant le regroupement relativement serré des archaebactéries extrêmement thermophiles, dont le phénotype général semble ressembler le plus au phénotype ancestral des Archaea.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.87.12.4576",
    doi = "10.1073/pnas.87.12.4576",
    openalex = "W2166865790",
    references = "doi101007bf00425185, doi101007bf01796132, doi1010160303264778900230, doi101016s0079660308603487, doi101073pnas74115088, doi101073pnas86239355, doi101086402733, doi101126science202030, doi101126science6771870, doi101128mr5111351771987, doi101128mr5122212711987"
}

@book{openalexw179752181,
    author = "Moore, James et Desmond, Adrian",
    title = "Darwin : La vie d'un évolutionniste tourmenté",
    year = "1991",
    openalex = "W179752181"
}

: Le fait que l'évolution phénotypique puisse être étudiée sur une base caractère par caractère suggère que le corps est composé d'unités localement intégrées. Ces unités peuvent être considérées comme des parties modulaires du corps qui intègrent des caractères fonctionnellement liés en unités de transformation évolutive. Ces unités peuvent soit émerger spontanément par auto-organisation, soit être le produit de la sélection naturelle. Un scénario de sélection qui pourrait expliquer l'origine des unités modulaires doit expliquer la suppression différentielle des effets pléiotropiques entre différents modules et l'augmentation des effets pléiotropiques entre les éléments au sein du module. Quatre scénarios sont discutés : sélection pour le taux d'adaptation, sélection constructionnelle, sélection stabilisatrice et une combinaison de sélection directionnelle et stabilisatrice. Il est conclu qu'une combinaison de sélection directionnelle et stabilisatrice est un mode de sélection prévalent et une explication probable pour l'évolution de la modularité. 1 Introduct...

@article{doi101093icb36136,
    author = "Wagner, Günter P.",
    title = "Homologues, Natural Kinds and the Evolution of Modularity",
    year = "1996",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = ": Le fait que l'évolution phénotypique puisse être étudiée sur une base caractère par caractère suggère que le corps est composé d'unités localement intégrées. Ces unités peuvent être considérées comme des parties modulaires du corps qui intègrent des caractères fonctionnellement liés en unités de transformation évolutive. Ces unités peuvent soit émerger spontanément par auto-organisation, soit être le produit de la sélection naturelle. Un scénario de sélection qui pourrait expliquer l'origine des unités modulaires doit expliquer la suppression différentielle des effets pléiotropiques entre différents modules et l'augmentation des effets pléiotropiques entre les éléments au sein du module. Quatre scénarios sont discutés : sélection pour le taux d'adaptation, sélection constructionnelle, sélection stabilisatrice et une combinaison de sélection directionnelle et stabilisatrice. Il est conclu qu'une combinaison de sélection directionnelle et stabilisatrice est un mode de sélection prévalent et une explication probable pour l'évolution de la modularité. 1 Introduct...",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/36.1.36",
    doi = "10.1093/icb/36.1.36",
    openalex = "W2123257600"
}

Dans le livre Embryos, Genes, and Evolution, Raff et son co-auteur Thomas Kaufman ont proposé une synthèse de la biologie du développement et de l'évolution. Dans The Shape of Life, Raff analyse l'émergence de cette discipline expérimentale et expose des questions de recherche, des hypothèses et des approches pour guider son développement. Raff utilise l'évolution des plans corporels animaux pour illustrer l'interaction entre les mécanismes du développement et les modèles évolutifs. Les plans corporels animaux sont apparus il y a un demi-milliard d'années. L'évolution au sein de ces plans corporels au cours de cette période a conduit à la diversité immense des formes animales vivantes. Raff plaide pour une approche intégrée à l'étude des rôles imbriqués du développement et de l'évolution impliquant la phylogénie, la biologie comparative et fonctionnelle. Cette synthèse devrait intéresser non seulement les scientifiques travaillant dans ces domaines, mais aussi les paléontologues, les zoologistes, les morphologues, les biologistes moléculaires et les généticiens.

@article{doi105860choice341536,
    title = "The shape of life: genes, development, and the evolution of animal form",
    year = "1996",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Dans le livre Embryos, Genes, and Evolution, Raff et son co-auteur Thomas Kaufman ont proposé une synthèse de la biologie du développement et de l'évolution. Dans The Shape of Life, Raff analyse l'émergence de cette discipline expérimentale et expose des questions de recherche, des hypothèses et des approches pour guider son développement. Raff utilise l'évolution des plans corporels animaux pour illustrer l'interaction entre les mécanismes du développement et les modèles évolutifs. Les plans corporels animaux sont apparus il y a un demi-milliard d'années. L'évolution au sein de ces plans corporels au cours de cette période a conduit à la diversité immense des formes animales vivantes. Raff plaide pour une approche intégrée à l'étude des rôles imbriqués du développement et de l'évolution impliquant la phylogénie, la biologie comparative et fonctionnelle. Cette synthèse devrait intéresser non seulement les scientifiques travaillant dans ces domaines, mais aussi les paléontologues, les zoologistes, les morphologues, les biologistes moléculaires et les généticiens.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.34-1536",
    doi = "10.5860/choice.34-1536",
    openalex = "W1493346936"
}

<strong>Résumé:</strong> Le travail que Charles Darwin a développé tout au long de sa vie est commenté à partir d'une perspective baconienne, en prenant en compte deux historiens de la biologie éminents. L'œuvre d'Emanuel Radl <em>Geschichte der biologischen Theorien</em>, publiée à l'origine entre 1905 et 1909, est analysée, de même que les principaux travaux d'Ernst Mayr, savant célébré qui se consacre à l'étude du darwinisme. Cet article tente de montrer comment une même orientation philosophique peut donner naissance à des récits différents concernant les théories et idées darwiniennes. Il est possible de trouver des divergences en ce qui concerne des aspects logiques et historiques, tels que l'orientation politique de la théorie, sa relation avec le contexte social et sa concordance avec l'hérédité des caractères acquis. <strong>Mots-clés : </strong>Darwin ; darwinisme ; évolution ; sélection naturelle. <strong>Charles Darwin and the Academic World: The Baconian Approaches in the Past and Nowadays</strong> <strong>Abstract</strong>: Charles Darwin's life-long work is commented from a baconian perspective, taking into account two major historians of biology. Emanuel Radl's <em>Geschichte der biologischen Theorien</em>, originally published between 1905- 1909, is analysed, as well as the major works of Ernst Mayr, a celebrated Darwin scholar. This article is aimed at showing how the same philosophical orientation can give rise to two different accounts of Darwinian theories and ideas. There may be divergence on logical and historical grounds, such as the political orientation of the theory, its relation to the social context, and its agreement with the inheritance of acquired characters. <strong>Keywords</strong>: Darwin; Darwinism; evolution; natural selection.

@article{bizzo1997charles,
    author = "Bizzo, Nélio",
    title = "Charles Darwin et le monde académique - I approches baconiennes, hier et aujourd'hui",
    year = "1997",
    publisher = "Zenodo",
    abstract = "<strong>Résumé:</strong> Le travail que Charles Darwin a développé tout au long de sa vie est commenté à partir d'une perspective baconienne, en prenant en compte deux historiens de la biologie éminents. L'œuvre d'Emanuel Radl <em>Geschichte der biologischen Theorien</em>, publiée à l'origine entre 1905 et 1909, est analysée, de même que les principaux travaux d'Ernst Mayr, savant célébré qui se consacre à l'étude du darwinisme. Cet article tente de montrer comment une même orientation philosophique peut donner naissance à des récits différents concernant les théories et idées darwiniennes. Il est possible de trouver des divergences en ce qui concerne des aspects logiques et historiques, tels que l'orientation politique de la théorie, sa relation avec le contexte social et sa concordance avec l'hérédité des caractères acquis. <strong>Mots-clés : </strong>Darwin ; darwinisme ; évolution ; sélection naturelle. <strong>Charles Darwin and the Academic World: The Baconian Approaches in the Past and Nowadays</strong> <strong>Abstract</strong>: Charles Darwin's life-long work is commented from a baconian perspective, taking into account two major historians of biology. Emanuel Radl's <em>Geschichte der biologischen Theorien</em>, originally published between 1905- 1909, is analysed, as well as the major works of Ernst Mayr, a celebrated Darwin scholar. This article is aimed at showing how the same philosophical orientation can give rise to two different accounts of Darwinian theories and ideas. There may be divergence on logical and historical grounds, such as the political orientation of the theory, its relation to the social context, and its agreement with the inheritance of acquired characters. <strong>Keywords</strong>: Darwin; Darwinism; evolution; natural selection.",
    url = "https://zenodo.org/record/6476364",
    doi = "10.5281/zenodo.6476364"
}

The Cambridge Sandwich 1. Looking for Easter Island 2. Can we break the great code? 3. Universal Goo: life as a cosmic principle? 4. The origin of life: straining the soup or our credulity? 5. Uniquely lucky? The strangeness of Earth 6. Converging on the extreme 7. Seeing convergence 8. Alien convergences? 9. The non-prevalence of humanoids? 10. Evolution bound: the ubiquity of convergence 11. Towards a theology of evolution 12. Last word.

@article{doi105860choice415285,
    title = "Life's solution: inevitable humans in a lonely universe",
    year = "2004",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "The Cambridge Sandwich 1. Looking for Easter Island 2. Can we break the great code? 3. Universal Goo: life as a cosmic principle? 4. The origin of life: straining the soup or our credulity? 5. Uniquely lucky? The strangeness of Earth 6. Converging on the extreme 7. Seeing convergence 8. Alien convergences? 9. The non-prevalence of humanoids? 10. Evolution bound: the ubiquity of convergence 11. Towards a theology of evolution 12. Last word.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.41-5285",
    doi = "10.5860/choice.41-5285",
    openalex = "W1606584452"
}

L'évolution biologique est un fait, mais les nombreuses théories contradictoires de l'évolution restent controversées même aujourd'hui. En 1966, le darwinisme simple, qui soutient que l'évolution fonctionne principalement au niveau de l'organisme individuel, a été menacé par des concepts opposés tels que la sélection de groupe, une idée populaire affirmant que l'évolution agit pour sélectionner des espèces entières plutôt que des individus. L'argument célèbre de George Williams en faveur des darwinistes a porté un coup puissant à ceux des camps opposés. Son Adaptation et sélection naturelle, désormais un classique de la littérature scientifique, est un essai approfondi et convaincant en défense du darwinisme ; ses suggestions pour développer des principes efficaces pour traiter le débat sur l'évolution et sa pertinence pour de nombreux domaines en dehors de la biologie garantissent l'actualité intemporelle de ce travail critique.

@book{doi1015159781400820108,
    author = "Williams, George C.",
    title = "Adaptation et sélection naturelle",
    year = "2008",
    booktitle = "Princeton University Press eBooks",
    abstract = "L'évolution biologique est un fait, mais les nombreuses théories contradictoires de l'évolution restent controversées même aujourd'hui. En 1966, le darwinisme simple, qui soutient que l'évolution fonctionne principalement au niveau de l'organisme individuel, a été menacé par des concepts opposés tels que la sélection de groupe, une idée populaire affirmant que l'évolution agit pour sélectionner des espèces entières plutôt que des individus. L'argument célèbre de George Williams en faveur des darwinistes a porté un coup puissant à ceux des camps opposés. Son Adaptation et sélection naturelle, désormais un classique de la littérature scientifique, est un essai approfondi et convaincant en défense du darwinisme ; ses suggestions pour développer des principes efficaces pour traiter le débat sur l'évolution et sa pertinence pour de nombreux domaines en dehors de la biologie garantissent l'actualité intemporelle de ce travail critique.",
    url = "https://doi.org/10.1515/9781400820108",
    doi = "10.1515/9781400820108",
    openalex = "W2020289104"
}

Ce livre, le premier d'une trilogie détaillant la vie de Charles Darwin, publié cinq ans après sa mort, a été édité par son fils Francis, qui fut le collaborateur de son père dans les expériences de botanique et qui, après sa mort, a assumé la responsabilité de superviser la publication de ses manuscrits et lettres restants. Dans l'avant-propos du premier volume, Francis Darwin explique ses principes éditoriaux : « Dans le choix des lettres à publier, j'ai été largement guidé par le désir d'illustrer le caractère personnel de mon père. Mais sa vie fut essentiellement celle du travail, qu'il était impossible d'écrire l'histoire de l'homme sans suivre de près la carrière de l'auteur. » Parmi l'histoire familiale, les anecdotes et souvenirs de collègues scientifiques, se trouve un court essai autobiographique que Charles Darwin a écrit pour ses enfants et petits-enfants, plutôt que pour la publication. Ce récit de Darwin l'homme n'a jamais été surpassé.

@misc{darwin2009the,
    author = "Darwin, Charles",
    title = "The Life and Letters of Charles Darwin",
    year = "2009",
    abstract = "Ce livre, le premier d'une trilogie détaillant la vie de Charles Darwin, publié cinq ans après sa mort, a été édité par son fils Francis, qui fut le collaborateur de son père dans les expériences de botanique et qui, après sa mort, a assumé la responsabilité de superviser la publication de ses manuscrits et lettres restants. Dans l'avant-propos du premier volume, Francis Darwin explique ses principes éditoriaux : « Dans le choix des lettres à publier, j'ai été largement guidé par le désir d'illustrer le caractère personnel de mon père. Mais sa vie fut essentiellement celle du travail, qu'il était impossible d'écrire l'histoire de l'homme sans suivre de près la carrière de l'auteur. » Parmi l'histoire familiale, les anecdotes et souvenirs de collègues scientifiques, se trouve un court essai autobiographique que Charles Darwin a écrit pour ses enfants et petits-enfants, plutôt que pour la publication. Ce récit de Darwin l'homme n'a jamais été surpassé.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511702884",
    doi = "10.1017/cbo9780511702884",
    openalex = "W2159440094"
}

Résumé La croyance de Darwin en l'évolution par branches reposait sur sa familiarité avec la taxinomie de son époque. Les faits issus de la biogéographie, de l'embryologie et de la paléontologie ont acquis une signification profonde car les biologistes ont commencé à croire que la classification naturelle exprimait des relations réelles. Bien que la présentation de la théorie de Darwin dans L'Origine des espèces, ainsi que les descriptions du darwinisme après la Synthèse moderne des années 1940, impliquent que l'établissement du rôle causal de la sélection naturelle était essentiel pour prouver que l'évolution s'est produite, cela est contredit par l'expérience personnelle de Darwin et par ses propres mots. Il est utile de comparer l'histoire et la structure logique de la théorie révolutionnaire de Darwin à la Révolution copernicienne, car le mouvement de la Terre a été reconnu bien avant que Newton n'identifie les causes pour expliquer son mouvement. Copernic a vu que fixer le Soleil comme centre du mouvement planétaire expliquait mieux l'apparence des cieux que le système ptolémaïque, et Darwin a vu que l'évolution par branches explique le « fait vraiment merveilleux » qu'une hiérarchie de groupes imbriqués semble naturelle.

@article{doi101002tax581007,
    author = "Winsor, Mary P.",
    title = "Taxonomy was the foundation of Darwin's evolution",
    year = "2009",
    journal = "Taxon",
    abstract = {Résumé La croyance de Darwin en l'évolution par branches reposait sur sa familiarité avec la taxinomie de son époque. Les faits issus de la biogéographie, de l'embryologie et de la paléontologie ont acquis une signification profonde car les biologistes ont commencé à croire que la classification naturelle exprimait des relations réelles. Bien que la présentation de la théorie de Darwin dans L'Origine des espèces, ainsi que les descriptions du darwinisme après la Synthèse moderne des années 1940, impliquent que l'établissement du rôle causal de la sélection naturelle était essentiel pour prouver que l'évolution s'est produite, cela est contredit par l'expérience personnelle de Darwin et par ses propres mots. Il est utile de comparer l'histoire et la structure logique de la théorie révolutionnaire de Darwin à la Révolution copernicienne, car le mouvement de la Terre a été reconnu bien avant que Newton n'identifie les causes pour expliquer son mouvement. Copernic a vu que fixer le Soleil comme centre du mouvement planétaire expliquait mieux l'apparence des cieux que le système ptolémaïque, et Darwin a vu que l'évolution par branches explique le « fait vraiment merveilleux » qu'une hiérarchie de groupes imbriqués semble naturelle.},
    url = "https://doi.org/10.1002/tax.581007",
    doi = "10.1002/tax.581007",
    openalex = "W2399927024",
    references = "doi101007bf00133143, doi101007bf01734359, doi1010160006320792912013, doi101038369716c0, doi101086284325, doi101093oso97801985464120010001, doi101093sysbio274401, doi101146annureven10010165000525, doi1023072412923, doi105860choice396411"
}

Les mots de Charles Darwin sont apparus pour la première fois dans la presse en tant qu'étudiant au Christ's College, Cambridge, en 1829, et presque chaque année subséquente de sa vie, il a publié des essais, des articles, des lettres aux éditeurs ou d'autres œuvres brèves. Ces publications plus courtes contiennent une richesse de matériel précieux. Elles représentent une partie importante du Darwin visible par le public victorien, aux côtés de son sens de l'humour toujours présent, et révèlent une variété encore plus large de ses intérêts scientifiques et de ses compétences, qui ont continué jusqu'à ses derniers jours. Ce livre rassemble toutes les publications plus courtes connues et les articles imprimés que Darwin a écrits durant sa vie, y compris sa première et sa dernière publications, et la première publication, avec A. R. Wallace, de la théorie de l'évolution par sélection naturelle de Darwin. Avec plus de soixante-dix articles nouvellement découverts, le livre est entièrement édité et annoté, et contient des illustrations originales et une bibliographie complète.

@book{doi101017cbo9780511576799,
    author = "van Wyhe, John",
    title = "Charles Darwin's Shorter Publications, 1829–1883",
    year = "2009",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "Les mots de Charles Darwin sont apparus pour la première fois dans la presse en tant qu'étudiant au Christ's College, Cambridge, en 1829, et presque chaque année subséquente de sa vie, il a publié des essais, des articles, des lettres aux éditeurs ou d'autres œuvres brèves. Ces publications plus courtes contiennent une richesse de matériel précieux. Elles représentent une partie importante du Darwin visible par le public victorien, aux côtés de son sens de l'humour toujours présent, et révèlent une variété encore plus large de ses intérêts scientifiques et de ses compétences, qui ont continué jusqu'à ses derniers jours. Ce livre rassemble toutes les publications plus courtes connues et les articles imprimés que Darwin a écrits durant sa vie, y compris sa première et sa dernière publications, et la première publication, avec A. R. Wallace, de la théorie de l'évolution par sélection naturelle de Darwin. Avec plus de soixante-dix articles nouvellement découverts, le livre est entièrement édité et annoté, et contient des illustrations originales et une bibliographie complète.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511576799",
    doi = "10.1017/cbo9780511576799",
    openalex = "W2016657242",
    references = "doi101007s1033600400438, doi1010160039368174900247, openalexw1501278615"
}

Il existe une contradiction entre la méthodologie de Darwin et la manière dont il l'a décrite pour la consommation publique. Darwin a affirmé qu'il a procédé « selon de vrais principes baconiens [inductifs] et sans aucune théorie, en collectant des faits à grande échelle ». Il a également écrit : « Comme c'est étrange que personne ne voie que toute observation doit être pour ou contre une certaine vue si elle doit être utile ! » La méthode scientifique comprend deux étapes. La première consiste à formuler des hypothèses ; la seconde consiste à les tester expérimentalement. Ce qui différencie la science d'autres connaissances est la seconde étape : soumettre les hypothèses à un test empirique en observant si les prédictions dérivées d'une hypothèse sont vérifiées dans les observations et expériences pertinentes. Une hypothèse n'est scientifique que si elle est cohérente avec certains mais pas d'autres états de choses possibles non encore observés, de sorte qu'elle soit soumise à la possibilité d'être réfutée par référence à l'expérience. Darwin occupe une place exaltée dans l'histoire de la pensée occidentale, recevant à juste titre le crédit pour la théorie de l'évolution. Dans L'Origine des espèces, il a exposé les preuves démontrant l'évolution des organismes. Plus important encore, il a découvert la sélection naturelle, le processus qui explique les adaptations des organismes et leur complexité et leur diversification. La sélection naturelle et autres processus causaux de l'évolution sont étudiés en formulant et en testant des hypothèses. Darwin a avancé des hypothèses dans plusieurs domaines, y compris la géologie, la morphologie et la physiologie des plantes, la psychologie et l'évolution, et les a soumises à des tests empiriques sévères.

@article{doi101073pnas0901404106,
    author = "Ayala, Francisco J.",
    title = "Darwin et la méthode scientifique",
    year = "2009",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Il existe une contradiction entre la méthodologie de Darwin et la manière dont il l'a décrite pour la consommation publique. Darwin a affirmé qu'il a procédé « selon de vrais principes baconiens [inductifs] et sans aucune théorie, en collectant des faits à grande échelle ». Il a également écrit : « Comme c'est étrange que personne ne voie que toute observation doit être pour ou contre une certaine vue si elle doit être utile ! » La méthode scientifique comprend deux étapes. La première consiste à formuler des hypothèses ; la seconde consiste à les tester expérimentalement. Ce qui différencie la science d'autres connaissances est la seconde étape : soumettre les hypothèses à un test empirique en observant si les prédictions dérivées d'une hypothèse sont vérifiées dans les observations et expériences pertinentes. Une hypothèse n'est scientifique que si elle est cohérente avec certains mais pas d'autres états de choses possibles non encore observés, de sorte qu'elle soit soumise à la possibilité d'être réfutée par référence à l'expérience. Darwin occupe une place exaltée dans l'histoire de la pensée occidentale, recevant à juste titre le crédit pour la théorie de l'évolution. Dans L'Origine des espèces, il a exposé les preuves démontrant l'évolution des organismes. Plus important encore, il a découvert la sélection naturelle, le processus qui explique les adaptations des organismes et leur complexité et leur diversification. La sélection naturelle et autres processus causaux de l'évolution sont étudiés en formulant et en testant des hypothèses. Darwin a avancé des hypothèses dans plusieurs domaines, y compris la géologie, la morphologie et la physiologie des plantes, la psychologie et l'évolution, et les a soumises à des tests empiriques sévères.},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.0901404106",
    doi = "10.1073/pnas.0901404106",
    openalex = "W2047214198",
    references = "doi1010382261209a0, doi1010382261211a0, doi1023071447682, doi1023072106169, doi1023072218271, doi1023072551371, doi10432497802030907329, doi105962bhltitle2092, doi105962bhltitle59991, doi105962bhltitle82303, hindle1964charles, penrose1958the"
}

La répartition des espèces de moqueurs parmi les îles Galápagos a incité Charles Darwin à remettre, pour la première fois par écrit, en question la « stabilité des espèces ». Cependant, environ 50 ans après la visite de Darwin, le moqueur endémique de Floreana (Mimus trifasciatus) s'est éteint sur l'île de Floreana et, aujourd'hui, seules deux petites populations survivent sur deux îlots satellites. Comme Darwin l'a noté, la rareté précède souvent l'extinction. Pour éviter l'extinction, des plans sont en cours de développement pour réintroduire M. trifasciatus sur Floreana. Ici, nous intégrons la pensée évolutive et la pratique de la conservation en utilisant des analyses de coalescence et des données génétiques provenant d'échantillons contemporains et de musée, y compris deux collectés par Darwin et Robert Fitzroy sur Floreana en 1835. Nos résultats sur les microsatellites montrent une différenciation substantielle entre les deux populations existantes, mais notre modélisation basée sur la coalescence ne suggère pas d'histoires évolutives indépendantes et longues. L'une des populations est fortement consanguine, mais les deux abritent des allèles uniques présents sur Floreana en 1835, suggérant que des oiseaux des deux îlots devraient être utilisés pour établir une seule population mixte sur Floreana. Ainsi, les spécimens de moqueurs de Darwin non seulement lui ont révélé un niveau de variation suggérant une spéciation suite à l'isolement géographique, mais ils ont également, plus de 170 ans plus tard, retourné des informations importantes à leur lieu d'origine pour la conservation de leurs congénères.

@article{doi101098rsbl20090778,
    author = "Hoeck, Paquita E. A. et Beaumont, Mark et James, Karen E. et Grant, Rosemary B. et Grant, Peter R. et Keller, Lukas F.",
    title = "Sauver la muse de Darwin : génétique évolutive pour la réintroduction du moqueur de Floreana",
    year = "2009",
    journal = "Biology Letters",
    abstract = "La répartition des espèces de moqueurs parmi les îles Galápagos a incité Charles Darwin à remettre, pour la première fois par écrit, en question la « stabilité des espèces ». Cependant, environ 50 ans après la visite de Darwin, le moqueur endémique de Floreana (Mimus trifasciatus) s'est éteint sur l'île de Floreana et, aujourd'hui, seules deux petites populations survivent sur deux îlots satellites. Comme Darwin l'a noté, la rareté précède souvent l'extinction. Pour éviter l'extinction, des plans sont en cours de développement pour réintroduire M. trifasciatus sur Floreana. Ici, nous intégrons la pensée évolutive et la pratique de la conservation en utilisant des analyses de coalescence et des données génétiques provenant d'échantillons contemporains et de musée, y compris deux collectés par Darwin et Robert Fitzroy sur Floreana en 1835. Nos résultats sur les microsatellites montrent une différenciation substantielle entre les deux populations existantes, mais notre modélisation basée sur la coalescence ne suggère pas d'histoires évolutives indépendantes et longues. L'une des populations est fortement consanguine, mais les deux abritent des allèles uniques présents sur Floreana en 1835, suggérant que des oiseaux des deux îlots devraient être utilisés pour établir une seule population mixte sur Floreana. Ainsi, les spécimens de moqueurs de Darwin non seulement lui ont révélé un niveau de variation suggérant une spéciation suite à l'isolement géographique, mais ils ont également, plus de 170 ans plus tard, retourné des informations importantes à leur lieu d'origine pour la conservation de leurs congénères.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rsbl.2009.0778",
    doi = "10.1098/rsbl.2009.0778",
    openalex = "W2146887266",
    references = "doi101007s1033600400438"
}

CONTEXTE : L'année 2009 marque le 200e anniversaire de la publication de la Philosophie Zoologique de Jean-Bapteste Lamarck et le 150e anniversaire de L'Origine des espèces de Charles Darwin. Lamarck croyait que l'évolution est principalement pilotée par des changements phénotypiques bénéfiques acquis de manière non aléatoire, en particulier ceux directement affectés par l'utilisation d'organes, lesquels Lamarck croyait être héréditaires. En revanche, Darwin accordait une plus grande importance au changement aléatoire et non dirigé qui fournissait du matériel pour la sélection naturelle. LE CONCEPT : Le schéma lamarckien classique semble insoutenable en raison de l'absence de mécanismes de rétro-ingénierie directe des caractères phénotypiques adaptatifs acquis par un individu au cours de sa vie dans le génome. Cependant, divers phénomènes évolutifs qui sont apparus au premier plan ces dernières années semblent correspondre à un paradigme (quasi)-lamarckien plus largement interprété. Le système de défense CRISPR-Cas des procaryotes contre les éléments mobiles semble fonctionner via un mécanisme lamarckien authentique, à savoir en intégrant de petits segments d'ADN viral ou plasmidique dans des loci spécifiques du génome du procaryote hôte, puis en utilisant les transcrits respectifs pour détruire l'ADN (ou l'ARN) de l'élément mobile cognat. Un principe similaire semble être employé dans la branche piRNA de l'interférence ARN, qui intervient dans la défense contre les éléments transposables dans la lignée germinale animale. Le transfert horizontal de gènes (THG), un processus évolutif dominant, du moins chez les procaryotes, semble être une forme d'hérédité (quasi)-lamarckienne. Le taux de THG et la nature des gènes acquis dépendent de l'environnement de l'organisme receveur et, dans certains cas, les gènes transférés confèrent un avantage sélectif pour la croissance dans cet environnement, satisfaisant aux critères lamarckiens. Diverses formes de mutagenèse induite par le stress sont étroitement régulées et constituent une réponse adaptative universelle au stress environnemental chez les formes de vie cellulaires. La mutagenèse induite par le stress peut être interprétée comme un phénomène (quasi)-lamarckien car les changements génomiques induits, bien qu'aléatoires, sont déclenchés par des facteurs environnementaux et sont bénéfiques pour l'organisme. CONCLUSION : Les modalités darwiniennes et lamarckiennes de l'évolution semblent toutes deux importantes et reflètent différents aspects de l'interaction entre les populations et l'environnement.

@article{doi10118617456150442,
    author = "Koonin, Eugene V. et Wolf, Yuri I.",
    title = "L'évolution est-elle darwinienne et/ou lamarckienne ?",
    year = "2009",
    journal = "Biology Direct",
    abstract = "CONTEXTE : L'année 2009 marque le 200e anniversaire de la publication de la Philosophie Zoologique de Jean-Bapteste Lamarck et le 150e anniversaire de L'Origine des espèces de Charles Darwin. Lamarck croyait que l'évolution est principalement pilotée par des changements phénotypiques bénéfiques acquis de manière non aléatoire, en particulier ceux directement affectés par l'utilisation d'organes, lesquels Lamarck croyait être héréditaires. En revanche, Darwin accordait une plus grande importance au changement aléatoire et non dirigé qui fournissait du matériel pour la sélection naturelle. LE CONCEPT : Le schéma lamarckien classique semble insoutenable en raison de l'absence de mécanismes de rétro-ingénierie directe des caractères phénotypiques adaptatifs acquis par un individu au cours de sa vie dans le génome. Cependant, divers phénomènes évolutifs qui sont apparus au premier plan ces dernières années semblent correspondre à un paradigme (quasi)-lamarckien plus largement interprété. Le système de défense CRISPR-Cas des procaryotes contre les éléments mobiles semble fonctionner via un mécanisme lamarckien authentique, à savoir en intégrant de petits segments d'ADN viral ou plasmidique dans des loci spécifiques du génome du procaryote hôte, puis en utilisant les transcrits respectifs pour détruire l'ADN (ou l'ARN) de l'élément mobile cognat. Un principe similaire semble être employé dans la branche piRNA de l'interférence ARN, qui intervient dans la défense contre les éléments transposables dans la lignée germinale animale. Le transfert horizontal de gènes (THG), un processus évolutif dominant, du moins chez les procaryotes, semble être une forme d'hérédité (quasi)-lamarckienne. Le taux de THG et la nature des gènes acquis dépendent de l'environnement de l'organisme receveur et, dans certains cas, les gènes transférés confèrent un avantage sélectif pour la croissance dans cet environnement, satisfaisant aux critères lamarckiens. Diverses formes de mutagenèse induite par le stress sont étroitement régulées et constituent une réponse adaptative universelle au stress environnemental chez les formes de vie cellulaires. La mutagenèse induite par le stress peut être interprétée comme un phénomène (quasi)-lamarckien car les changements génomiques induits, bien qu'aléatoires, sont déclenchés par des facteurs environnementaux et sont bénéfiques pour l'organisme. CONCLUSION : Les modalités darwiniennes et lamarckiennes de l'évolution semblent toutes deux importantes et reflètent différents aspects de l'interaction entre les populations et l'environnement.",
    url = "https://doi.org/10.1186/1745-6150-4-42",
    doi = "10.1186/1745-6150-4-42",
    openalex = "W2159322112",
    references = "doi101007s0023900400463, doi101016jcell200901035, doi101016jcell200901046, doi101017s0094837300004310, doi101038227561a0, doi101126science1138140, doi101126science1159689, doi101126science15739260, doi1023071852361, doi105860choice396411, openalexw2624262714"
}

Nous examinons l'arbre de la vie (TOL) en tant qu'hypothèse évolutive et un outil heuristique. L'hypothèse originale de l'arbre de la vie a échoué, mais une nouvelle « hypothèse statistique de l'arbre de la vie » est prometteuse. L'heuristique de l'arbre de la vie organise utilement les données sans postuler une vérité évolutive fondamentale.

@article{doi10118617456150632,
    author = "O’Malley, Maureen A. et Koonin, Eugene V.",
    title = "How stands the Tree of Life a century and a half after The Origin?",
    year = "2011",
    journal = "Biology Direct",
    abstract = {Nous examinons l'arbre de la vie (TOL) en tant qu'hypothèse évolutive et un outil heuristique. L'hypothèse originale de l'arbre de la vie a échoué, mais une nouvelle « hypothèse statistique de l'arbre de la vie » est prometteuse. L'heuristique de l'arbre de la vie organise utilement les données sans postuler une vérité évolutive fondamentale.},
    url = "https://doi.org/10.1186/1745-6150-6-32",
    doi = "10.1186/1745-6150-6-32",
    openalex = "W2123233911",
    references = "doi101073pnas0901404106"
}

Si la théorie darwinienne a révolutionné de manière spectaculaire la compréhension biologique, son focus strictement biologique a entraîné un écart conceptuel croissant entre les sciences biologiques et les sciences physiques. Dans cet article, nous nous efforçons d'étendre et de reformuler la théorie darwinienne en termes physico-chimiques afin qu'elle puisse accommoder à la fois les systèmes vivants et inanimés, contribuant ainsi à combler ce fossé scientifique. La formulation étendue repose sur le concept récemment proposé de stabilité cinétique dynamique et sur des données provenant du domaine nouvellement émergent de la chimie des systèmes. L'analyse nous conduit à conclure que l'abiogenèse et l'évolution, plutôt que de se manifester comme deux étapes discrètes dans l'émergence de la vie complexe, constituent en réalité un seul et unique processus physico-chimique. Sur la base de cette unification proposée, la théorie étendue offre quelques aperçus supplémentaires sur les caractéristiques uniques de la vie, ainsi que des moyens additionnels pour aborder les trois questions centrales de la biologie : qu'est-ce que la vie, comment est-elle apparue, et comment pourrait-on la créer ?

@article{doi1011861759220821,
    author = "Pross, Addy",
    title = "Vers une théorie générale de l'évolution : Extension de la théorie darwinienne à la matière inanimée",
    year = "2011",
    journal = "Journal of Systems Chemistry",
    abstract = "Si la théorie darwinienne a révolutionné de manière spectaculaire la compréhension biologique, son focus strictement biologique a entraîné un écart conceptuel croissant entre les sciences biologiques et les sciences physiques. Dans cet article, nous nous efforçons d'étendre et de reformuler la théorie darwinienne en termes physico-chimiques afin qu'elle puisse accommoder à la fois les systèmes vivants et inanimés, contribuant ainsi à combler ce fossé scientifique. La formulation étendue repose sur le concept récemment proposé de stabilité cinétique dynamique et sur des données provenant du domaine nouvellement émergent de la chimie des systèmes. L'analyse nous conduit à conclure que l'abiogenèse et l'évolution, plutôt que de se manifester comme deux étapes discrètes dans l'émergence de la vie complexe, constituent en réalité un seul et unique processus physico-chimique. Sur la base de cette unification proposée, la théorie étendue offre quelques aperçus supplémentaires sur les caractéristiques uniques de la vie, ainsi que des moyens additionnels pour aborder les trois questions centrales de la biologie : qu'est-ce que la vie, comment est-elle apparue, et comment pourrait-on la créer ?",
    url = "https://doi.org/10.1186/1759-2208-2-1",
    doi = "10.1186/1759-2208-2-1",
    openalex = "W2128762442",
    references = "doi101007bf00132004, doi101007bf00450633, doi101126science13134091292, doi101146annurevbiochem671425, doi1023074444260, doi105962bhltitle27468, openalexw1548554945, openalexw1556913189, openalexw1759691579, openalexw2040525210, openalexw2074397232"
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Les travaux de notre laboratoire sont soutenus par les subventions BIO2008-00090 du ministère espagnol de la Science et de l'Innovation et KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR), et HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) de l'Union européenne.

@article{doi103389fmicb201200001,
    author = "Martínez, José Luis",
    title = "Résistance naturelle aux antibiotiques et contamination par des déterminants de résistance aux antibiotiques : Les deux âges dans l'évolution de la résistance aux antimicrobiens",
    year = "2012",
    journal = "Frontiers in Microbiology",
    abstract = "Les travaux de notre laboratoire sont soutenus par les subventions BIO2008-00090 du ministère espagnol de la Science et de l'Innovation et KBBE-227258 (BIOHYPO), HEALTH-F3-2011-282004 (EVOTAR), et HEALTH-F3-2010-241476 (PAR) de l'Union européenne.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmicb.2012.00001",
    doi = "10.3389/fmicb.2012.00001",
    openalex = "W2026352429",
    references = "doi101017s0094837300004310, doi101128mmbr0001610, doi103929ethzb000667478"
}

En ces trente dernières années, une nouvelle conception systémique de la vie a émergé à l'avant-garde de la science. Une nouvelle importance a été accordée à la complexité, aux réseaux et aux modèles d'organisation menant à un nouveau type de pensée « systémique ». Ce volume intègre les idées, modèles et théories sous-jacents à la vision systémique de la vie dans un cadre cohérent unique. En parcourant largement l'histoire et les disciplines scientifiques, les auteurs examinent l'apparition de concepts clés tels que l'autopoïèse, les structures dissipatives, les réseaux sociaux et une compréhension systémique de l'évolution. Les implications de la vision systémique de la vie pour les soins de santé, la gestion et nos crises écologiques et économiques mondiales sont également discutées. Écrit principalement pour les étudiants de premier cycle, il constitue également une lecture essentielle pour les étudiants de niveau supérieur et les chercheurs intéressés par la compréhension de la nouvelle conception systémique de la vie et de ses implications pour une large gamme de professions - de l'économie et de la politique à la médecine, la psychologie et le droit.

@book{doi101017cbo9780511895555,
    author = "Capra, Fritjof et Luisi, Pier Luigi",
    title = "The Systems View of Life",
    year = "2014",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = "En ces trente dernières années, une nouvelle conception systémique de la vie a émergé à l'avant-garde de la science. Une nouvelle importance a été accordée à la complexité, aux réseaux et aux modèles d'organisation menant à un nouveau type de pensée « systémique ». Ce volume intègre les idées, modèles et théories sous-jacents à la vision systémique de la vie dans un cadre cohérent unique. En parcourant largement l'histoire et les disciplines scientifiques, les auteurs examinent l'apparition de concepts clés tels que l'autopoïèse, les structures dissipatives, les réseaux sociaux et une compréhension systémique de l'évolution. Les implications de la vision systémique de la vie pour les soins de santé, la gestion et nos crises écologiques et économiques mondiales sont également discutées. Écrit principalement pour les étudiants de premier cycle, il constitue également une lecture essentielle pour les étudiants de niveau supérieur et les chercheurs intéressés par la compréhension de la nouvelle conception systémique de la vie et de ses implications pour une large gamme de professions - de l'économie et de la politique à la médecine, la psychologie et le droit.",
    url = "https://doi.org/10.1017/cbo9780511895555",
    doi = "10.1017/cbo9780511895555",
    openalex = "W654350894",
    references = "crossref2007scientists, doi1010161074552195900314, doi101016b9780750610490500095, doi101038416076a, doi101038nature08013, doi10106312820190, doi10106313050879, doi101111j155856461971tb01930x, doi10111911987158, doi101126science1173046528, doi101126science1185383, doi101126science2605108640, doi101126science7466396, doi1015159783110848281, doi101537ase188722495, doi1023072981858, doi104324978020382643011, doi104324978100306096359, doi105860choice396411, doi105962bhltitle27468, doi107208chicago97802264709930010001, doi107551mitpress97802625136780010001, miller1953a, openalexw1557693421, openalexw1882072473, openalexw1996657273, openalexw2492572670, openalexw2624262714"
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Les idées sur l'hérédité et l'évolution subissent un changement révolutionnaire. De nouvelles découvertes en biologie moléculaire remettent en cause la version centrée sur le gène de la théorie darwinienne selon laquelle l'adaptation ne se produit que par sélection naturelle de variations d'ADN aléatoires. Dans Évolution en quatre dimensions, Eva Jablonka et Marion Lamb soutiennent qu'il y a plus à l'hérédité que des gènes. Ils retracent quatre dimensions dans l'évolution -- quatre systèmes d'hérédité qui jouent un rôle dans l'évolution : génétique, épigénétique (ou transmission cellulaire non-ADN de traits), comportementale et symbolique (transmission par le langage et d'autres formes de communication symbolique). Ces systèmes, soutiennent-ils, peuvent tous fournir des variations sur lesquelles la sélection naturelle peut agir. Évolution en quatre dimensions offre une vision plus riche et plus complexe de l'évolution que la vision basée sur les gènes, à une dimension, tenue par beaucoup aujourd'hui. La nouvelle synthèse avancée par Jablonka et Lamb met en évidence que les changements induits et acquis jouent également un rôle dans l'évolution. Après avoir discuté chacun des quatre systèmes d'hérédité en détail, Jablonka et Lamb remettent Humpty Dumpty ensemble en montrant comment tous ces systèmes interagissent. Ils examinent comment chacun peut avoir émergé et guidé l'histoire évolutive et discutent des implications sociales et philosophiques de la vision à quatre dimensions de l'évolution. Chaque chapitre se termine par un dialogue dans lequel les auteurs s'engagent dans les contrariétés d'I.M. (Ifcha Mistabra) fictif (et sceptique) -- araméen pour la conjecture opposée -- en affinant leurs arguments contre les contre-arguments vigoureux d'I.M. Le texte lucide et accessible est accompagné des dessins animés de l'artiste-médecin Anna Zeligowski, qui illustrent de manière humoristique et efficace les points des auteurs.

@article{doi105860choice185702,
    author = "Blackwell, Aaron D",
    title = "Évolution en quatre dimensions : variation génétique, épigénétique, comportementale et symbolique dans l'histoire de la vie",
    year = "2014",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Les idées sur l'hérédité et l'évolution subissent un changement révolutionnaire. De nouvelles découvertes en biologie moléculaire remettent en cause la version centrée sur le gène de la théorie darwinienne selon laquelle l'adaptation ne se produit que par sélection naturelle de variations d'ADN aléatoires. Dans Évolution en quatre dimensions, Eva Jablonka et Marion Lamb soutiennent qu'il y a plus à l'hérédité que des gènes. Ils retracent quatre dimensions dans l'évolution -- quatre systèmes d'hérédité qui jouent un rôle dans l'évolution : génétique, épigénétique (ou transmission cellulaire non-ADN de traits), comportementale et symbolique (transmission par le langage et d'autres formes de communication symbolique). Ces systèmes, soutiennent-ils, peuvent tous fournir des variations sur lesquelles la sélection naturelle peut agir. Évolution en quatre dimensions offre une vision plus riche et plus complexe de l'évolution que la vision basée sur les gènes, à une dimension, tenue par beaucoup aujourd'hui. La nouvelle synthèse avancée par Jablonka et Lamb met en évidence que les changements induits et acquis jouent également un rôle dans l'évolution. Après avoir discuté chacun des quatre systèmes d'hérédité en détail, Jablonka et Lamb remettent Humpty Dumpty ensemble en montrant comment tous ces systèmes interagissent. Ils examinent comment chacun peut avoir émergé et guidé l'histoire évolutive et discutent des implications sociales et philosophiques de la vision à quatre dimensions de l'évolution. Chaque chapitre se termine par un dialogue dans lequel les auteurs s'engagent dans les contrariétés d'I.M. (Ifcha Mistabra) fictif (et sceptique) -- araméen pour la conjecture opposée -- en affinant leurs arguments contre les contre-arguments vigoureux d'I.M. Le texte lucide et accessible est accompagné des dessins animés de l'artiste-médecin Anna Zeligowski, qui illustrent de manière humoristique et efficace les points des auteurs.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.185702",
    doi = "10.5860/choice.185702",
    openalex = "W1571255846"
}

L'arbre de la vie est l'un des principes d'organisation les plus importants en biologie(1). Les enquêtes génétiques suggèrent l'existence d'un nombre énorme de branches(2), mais même une approximation de l'échelle complète de l'arbre est restée inaccessible. Les représentations récentes de l'arbre de la vie se sont concentrées soit sur la nature des relations évolutives profondes(3-5), soit sur la diversité connue et bien classifiée de la vie avec une emphase sur les eucaryotes(6). Ces approches négligent le changement dramatique dans notre compréhension de la diversité de la vie résultant de l'échantillonnage génomique d'environnements auparavant inexplorés. De nouvelles méthodes pour générer des séquences génomiques éclairent l'identité des organismes et leurs capacités métaboliques, les plaçant dans des contextes communautaires et écosystémiques(7,8). Ici, nous utilisons de nouvelles données génomiques provenant de plus de 1 000 organismes non cultivés et peu connus, ainsi que des séquences publiées, pour inférer une version considérablement élargie de l'arbre de la vie, incluant les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes. La représentation est à la fois une vue d'ensemble globale et un instantané de la diversité au sein de chaque lignée majeure. Les résultats révèlent la domination de la diversification bactérienne et soulignent l'importance des organismes dépourvus de représentants isolés, avec une évolution substantielle concentrée dans une radiation majeure de tels organismes. Cet arbre met en évidence les lignées majeures actuellement sous-représentées dans les modèles biogéochimiques et identifie des radiations qui sont probablement importantes pour les analyses évolutives futures.

@article{doi101038nmicrobiol201648,
    author = "Hug, Laura et Baker, Brett J. et Anantharaman, Karthik et Brown, Christopher T. et Probst, Alexander J. et Castelle, Cindy J. et Butterfield, Cristina N. et Hernsdorf, Alex W et Amano, Yuki et Ise, Kotaro et Suzuki, Yohey et Dudek, Natasha K. et Relman, David A. et Finstad, Kari et Amundson, Ronald et Thomas, Brian C. et Banfield, Jillian F.",
    title = "Une nouvelle vision de l'arbre de la vie",
    year = "2016",
    journal = "Nature Microbiology",
    abstract = "L'arbre de la vie est l'un des principes d'organisation les plus importants en biologie(1). Les enquêtes génétiques suggèrent l'existence d'un nombre énorme de branches(2), mais même une approximation de l'échelle complète de l'arbre est restée inaccessible. Les représentations récentes de l'arbre de la vie se sont concentrées soit sur la nature des relations évolutives profondes(3-5), soit sur la diversité connue et bien classifiée de la vie avec une emphase sur les eucaryotes(6). Ces approches négligent le changement dramatique dans notre compréhension de la diversité de la vie résultant de l'échantillonnage génomique d'environnements auparavant inexplorés. De nouvelles méthodes pour générer des séquences génomiques éclairent l'identité des organismes et leurs capacités métaboliques, les plaçant dans des contextes communautaires et écosystémiques(7,8). Ici, nous utilisons de nouvelles données génomiques provenant de plus de 1 000 organismes non cultivés et peu connus, ainsi que des séquences publiées, pour inférer une version considérablement élargie de l'arbre de la vie, incluant les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes. La représentation est à la fois une vue d'ensemble globale et un instantané de la diversité au sein de chaque lignée majeure. Les résultats révèlent la domination de la diversification bactérienne et soulignent l'importance des organismes dépourvus de représentants isolés, avec une évolution substantielle concentrée dans une radiation majeure de tels organismes. Cet arbre met en évidence les lignées majeures actuellement sous-représentées dans les modèles biogéochimiques et identifie des radiations qui sont probablement importantes pour les analyses évolutives futures.",
    url = "https://doi.org/10.1038/nmicrobiol.2016.48",
    doi = "10.1038/nmicrobiol.2016.48",
    openalex = "W2315521535",
    references = "doi101038nature12352, doi101038nature14447, doi101038nature14486, doi101038nrmicro3330, doi101073pnas82206955, doi101073pnas87124576, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093bioinformaticsbts252, doi101093nargkh340, doi101093nargkm864, doi101093nargks808, doi101109gce20105676129, doi101126science7542800"
}

@incollection{doi10100797833196912377,
    author = "Delisle, Richard G.",
    title = "De Charles Darwin à la synthèse évolutionniste : des liens faibles et diffus uniquement",
    year = "2017",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-319-69123-7\_7",
    doi = "10.1007/978-3-319-69123-7\_7",
    openalex = "W2777333355",
    references = "doi101177007327536500400102, doi101177007327538402200401"
}

Il a longtemps été cru que les théories de l'évolution ont reçu une réception presque universellement froide dans les cercles de l'histoire naturelle britanniques dans la première moitié du XIXe siècle. Mais récemment, de sérieux doutes ont été jetés sur cette hypothèse. Ce livre sera la première grande étude de ce qui était le centre le plus important ou la pensée évolutionniste pré-darwinienne dans les îles britanniques. Il montre qu'Édimbourg à la fin des années 1820 et au début des années 1830 a été témoin d'un véritable ferment d'idées nouvelles radicales sur le monde naturel, y compris des spéculations sur l'origine et l'évolution de la vie, au moment même où Charles Darwin étudiait la médecine dans la ville. Ceux qui étaient étudiants à Édimbourg à l'époque auraient à peine pu éviter de entrer en contact avec ces nouvelles idées, soutenues par de nombreux professeurs, camarades d'études et connaissances à Édimbourg. Ce livre jette une nouvelle lumière sur la genèse et le développement de l'une des théories scientifiques les plus importantes dans l'histoire de la pensée occidentale.

@book{doi103366edinburgh97814744457880010001,
    author = "Jenkins, Bill",
    title = "Évolution avant Darwin",
    year = "2019",
    booktitle = "Edinburgh University Press eBooks",
    abstract = "Il a longtemps été cru que les théories de l'évolution ont reçu une réception presque universellement froide dans les cercles de l'histoire naturelle britanniques dans la première moitié du XIXe siècle. Mais récemment, de sérieux doutes ont été jetés sur cette hypothèse. Ce livre sera la première grande étude de ce qui était le centre le plus important ou la pensée évolutionniste pré-darwinienne dans les îles britanniques. Il montre qu'Édimbourg à la fin des années 1820 et au début des années 1830 a été témoin d'un véritable ferment d'idées nouvelles radicales sur le monde naturel, y compris des spéculations sur l'origine et l'évolution de la vie, au moment même où Charles Darwin étudiait la médecine dans la ville. Ceux qui étaient étudiants à Édimbourg à l'époque auraient à peine pu éviter de entrer en contact avec ces nouvelles idées, soutenues par de nombreux professeurs, camarades d'études et connaissances à Édimbourg. Ce livre jette une nouvelle lumière sur la genèse et le développement de l'une des théories scientifiques les plus importantes dans l'histoire de la pensée occidentale.",
    url = "https://doi.org/10.3366/edinburgh/9781474445788.001.0001",
    doi = "10.3366/edinburgh/9781474445788.001.0001",
    openalex = "W4247341602"
}

Notre article vise à mettre en lumière le rôle crucial que jouent les habitudes dans la théorie de l'évolution de Charles Darwin par le biais de la sélection naturelle. Nous avons organisé l'article en deux étapes : d'abord, nous analysons la valeur et les fonctions du concept d'habitude dans les premiers travaux de Darwin, notamment dans ses Notebooks, et comparons ces vues à sa compréhension mature du concept dans L'Origine des espèces et ses travaux ultérieurs ; ensuite, nous discutons des idées de Darwin sur les habitudes à la lumière des théories actuelles de l'héritage épigénétique, qui décrivent la manière dont le fonctionnement et l'expression des gènes sont modifiés par l'environnement, et comment ces modifications sont transmises d'une génération à l'autre. Nous soutenons que l'intérêt durable et multifacette de Darwin pour la notion d'habitude, tout au long de sa vie intellectuelle, est à la fois conceptuellement et méthodologiquement pertinent. D'un point de vue conceptuel, des similitudes intrigantes peuvent être trouvées entre la conception (précoce) de Darwin de l'habitude et les vues contemporaines sur l'héritage épigénétique. D'un point de vue méthodologique, nous suggérons que l'approche plastique de Darwin aux habitudes, de ses écrits précoces jusqu'à ses travaux matures, peut fournir aux scientifiques évolutionnistes d'aujourd'hui un modèle méthodologique viable pour aborder la tâche difficile d'étendre et d'élargir la théorie de l'évolution, avec une référence particulière à l'intégration des mécanismes épigénétiques dans les modèles existants de changement évolutif. Tout au long de sa vie, Darwin a modifié et réévalué ses vues sur les habitudes autant de fois que nécessaire selon les preuves : son travail sur cette notion peut représenter le paradigme d'une habitude de bonne méthodologie de recherche scientifique.

@article{doi101007s40656021003769,
    author = "Portera, Mariagrazia et Mandrioli, Mauro",
    title = "Qui a peur de l'épigénétique ? Habitudes, instincts et la théorie de l'évolution de Charles Darwin",
    year = "2021",
    journal = "History \& Philosophy of the Life Sciences",
    abstract = "Notre article vise à mettre en lumière le rôle crucial que jouent les habitudes dans la théorie de l'évolution de Charles Darwin par le biais de la sélection naturelle. Nous avons organisé l'article en deux étapes : d'abord, nous analysons la valeur et les fonctions du concept d'habitude dans les premiers travaux de Darwin, notamment dans ses Notebooks, et comparons ces vues à sa compréhension mature du concept dans L'Origine des espèces et ses travaux ultérieurs ; ensuite, nous discutons des idées de Darwin sur les habitudes à la lumière des théories actuelles de l'héritage épigénétique, qui décrivent la manière dont le fonctionnement et l'expression des gènes sont modifiés par l'environnement, et comment ces modifications sont transmises d'une génération à l'autre. Nous soutenons que l'intérêt durable et multifacette de Darwin pour la notion d'habitude, tout au long de sa vie intellectuelle, est à la fois conceptuellement et méthodologiquement pertinent. D'un point de vue conceptuel, des similitudes intrigantes peuvent être trouvées entre la conception (précoce) de Darwin de l'habitude et les vues contemporaines sur l'héritage épigénétique. D'un point de vue méthodologique, nous suggérons que l'approche plastique de Darwin aux habitudes, de ses écrits précoces jusqu'à ses travaux matures, peut fournir aux scientifiques évolutionnistes d'aujourd'hui un modèle méthodologique viable pour aborder la tâche difficile d'étendre et d'élargir la théorie de l'évolution, avec une référence particulière à l'intégration des mécanismes épigénétiques dans les modèles existants de changement évolutif. Tout au long de sa vie, Darwin a modifié et réévalué ses vues sur les habitudes autant de fois que nécessaire selon les preuves : son travail sur cette notion peut représenter le paradigme d'une habitude de bonne méthodologie de recherche scientifique.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s40656-021-00376-9",
    doi = "10.1007/s40656-021-00376-9",
    openalex = "W3127041822",
    references = "doi101007s406560150090x, doi1010160022519364900384, doi1010160022519364900396, doi101017cbo9781139171434, doi101038nature05913, doi101038nn3594, doi101073pnas0806560105, doi101086288419, doi101146annurevneuro29051605112851, doi1015159781400847266, doi103366edinburgh97814744457880010001, doi105860choice185702"
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Dans les années 1940, la « synthèse moderne » (SM) du darwinisme et de la génétique a présenté la mutation et la recombination génétiques comme la source de la variabilité à partir de laquelle les événements environnementaux sélectionnent naturellement les plus aptes, la « sélection naturelle » constituant ainsi la cause de l'évolution. La biologie récente remet de plus en plus en cause cette vision en présentant les gènes comme des suiveurs et en attribuant le rôle principal dans la genèse des adaptations à l'agence et à la plasticité des phénotypes en développement, faisant de la sélection naturelle une conséquence d'autres processus causaux. Les deux visions de la sélection naturelle prétendent capturer l'essence des arguments de Darwin dans L'Origine des espèces. Aujourd'hui, les historiens s'accordent largement sur l'interprétation de la SM de l'Origine comme un livre visant à prouver que la sélection naturelle est la cause (vera causa) du changement adaptatif. Cet article trouve les preuves de cette conclusion insuffisantes. Je m'efforce d'examiner le contexte et le sens de tous les usages connus de Darwin de l'expression vera causa, documentant en particulier la résistance de Darwin à la pression de prouver que la sélection naturelle est une vera causa dans des lettres écrites au début de 1860. Sa résistance souligne la dépendance logique de la sélection naturelle, un phénomène non observable, sur les processus causaux produisant les événements observables capturés par les lois de l'hérédité, de la variation et de la lutte pour l'existence, établies dans les chapitres 1-3 de l'Origine.

@article{doi101007s4065602200485z,
    author = "Bradley, Ben",
    title = "La sélection naturelle selon Darwin : cause ou effet ?",
    year = "2022",
    journal = "History \& Philosophy of the Life Sciences",
    abstract = "Dans les années 1940, la « synthèse moderne » (SM) du darwinisme et de la génétique a présenté la mutation et la recombination génétiques comme la source de la variabilité à partir de laquelle les événements environnementaux sélectionnent naturellement les plus aptes, la « sélection naturelle » constituant ainsi la cause de l'évolution. La biologie récente remet de plus en plus en cause cette vision en présentant les gènes comme des suiveurs et en attribuant le rôle principal dans la genèse des adaptations à l'agence et à la plasticité des phénotypes en développement, faisant de la sélection naturelle une conséquence d'autres processus causaux. Les deux visions de la sélection naturelle prétendent capturer l'essence des arguments de Darwin dans L'Origine des espèces. Aujourd'hui, les historiens s'accordent largement sur l'interprétation de la SM de l'Origine comme un livre visant à prouver que la sélection naturelle est la cause (vera causa) du changement adaptatif. Cet article trouve les preuves de cette conclusion insuffisantes. Je m'efforce d'examiner le contexte et le sens de tous les usages connus de Darwin de l'expression vera causa, documentant en particulier la résistance de Darwin à la pression de prouver que la sélection naturelle est une vera causa dans des lettres écrites au début de 1860. Sa résistance souligne la dépendance logique de la sélection naturelle, un phénomène non observable, sur les processus causaux produisant les événements observables capturés par les lois de l'hérédité, de la variation et de la lutte pour l'existence, établies dans les chapitres 1-3 de l'Origine.",
    url = "https://doi.org/10.1007/s40656-022-00485-z",
    doi = "10.1007/s40656-022-00485-z",
    openalex = "W4223493992",
    references = "doi1010160039368174900247"
}

La génomique englobe l'ensemble de l'arbre de la vie, tant éteint qu'existant, ainsi que les processus évolutifs qui façonnent cette diversité. À ce jour, la recherche génomique s'est concentrée sur les humains, un petit nombre d'espèces agricoles et des modèles de laboratoire établis. Moins de 18 000 des ∼2 000 000 d'espèces eucaryotes (<1 %) ont une séquence génomique représentative dans GenBank, et seule une fraction de celles-ci dispose d'informations complémentaires sur la structure du génome, la variation génétique, l'expression des gènes, les modifications épigénétiques et la diversité des populations. Ce déséquilibre reflète une perception selon laquelle les études sur les humains sont primordiales dans la recherche sur les maladies. Pourtant, comprendre comment fonctionnent les génomes et comment la variation génétique façonne les phénotypes nécessite une vision large qui embrasse la vaste diversité de la vie. Nous possédons la technologie pour collecter des ensembles de données massifs et extrêmement détaillés sur le monde, mais l'expertise est cloisonnée dans des domaines distincts. Une nouvelle approche, intégrant la génomique comparative avec la biologie cellulaire et évolutive, l'écologie, l'archéologie, l'anthropologie et la biologie de la conservation, est essentielle pour comprendre et protéger nous-mêmes et notre monde. Ici, nous décrivons le potentiel de découverte scientifique lorsque la génomique comparative travaille en étroite collaboration avec une large gamme de domaines, ainsi que les contraintes techniques, scientifiques et sociales qui doivent être abordées.

@article{doi101073pnas2115644119,
    author = "Stephan, Taylorlyn et Burgess, Shawn M. et Cheng, Hans et Danko, Charles G. et Gill, Clare A. et Jarvis, Erich D. et Koepfli, Klaus-Peter et Koltes, James E. et Lyons, Eric et Ronald, Pamela et Ryder, Oliver A. et Schriml, Lynn M. et Soltis, Pamela et VandeWoude, Sue et Zhou, Huaijun et Ostrander, Elaine A. et Karlsson, Elinor K.",
    title = "Darwinian genomics and diversity in the tree of life",
    year = "2022",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = "La génomique englobe l'ensemble de l'arbre de la vie, tant éteint qu'existant, ainsi que les processus évolutifs qui façonnent cette diversité. À ce jour, la recherche génomique s'est concentrée sur les humains, un petit nombre d'espèces agricoles et des modèles de laboratoire établis. Moins de 18 000 des ∼2 000 000 d'espèces eucaryotes (<1 %) ont une séquence génomique représentative dans GenBank, et seule une fraction de celles-ci dispose d'informations complémentaires sur la structure du génome, la variation génétique, l'expression des gènes, les modifications épigénétiques et la diversité des populations. Ce déséquilibre reflète une perception selon laquelle les études sur les humains sont primordiales dans la recherche sur les maladies. Pourtant, comprendre comment fonctionnent les génomes et comment la variation génétique façonne les phénotypes nécessite une vision large qui embrasse la vaste diversité de la vie. Nous possédons la technologie pour collecter des ensembles de données massifs et extrêmement détaillés sur le monde, mais l'expertise est cloisonnée dans des domaines distincts. Une nouvelle approche, intégrant la génomique comparative avec la biologie cellulaire et évolutive, l'écologie, l'archéologie, l'anthropologie et la biologie de la conservation, est essentielle pour comprendre et protéger nous-mêmes et notre monde. Ici, nous décrivons le potentiel de découverte scientifique lorsque la génomique comparative travaille en étroite collaboration avec une large gamme de domaines, ainsi que les contraintes techniques, scientifiques et sociales qui doivent être abordées.",
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.2115644119",
    doi = "10.1073/pnas.2115644119",
    openalex = "W4206342341",
    references = "doi101007s1033600400438, doi107554elife29944"
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La génomique englobe l'ensemble de l'arbre de la vie, tant éteint qu'existant, ainsi que les processus évolutifs qui façonnent cette diversité. À ce jour, la recherche génomique s'est concentrée sur les humains, un petit nombre d'espèces agricoles et des modèles de laboratoire établis. Moins de 18 000 des environ 2 000 000 d'espèces eucaryotes (< 1 %) ont une séquence génomique représentative dans GenBank, et seule une fraction de celles-ci dispose d'informations annexes sur la structure du génome, la variation génétique, l'expression des gènes, les modifications épigénétiques et la diversité des populations. Ce déséquilibre reflète une perception selon laquelle les études sur les humains sont primordiales dans la recherche sur les maladies. Pourtant, comprendre comment fonctionnent les génomes et comment la variation génétique façonne les phénotypes nécessite une vision large qui embrasse la vaste diversité de la vie. Nous possédons la technologie pour collecter des ensembles de données massifs et extrêmement détaillés sur le monde, mais l'expertise est cloisonnée dans des domaines distincts. Une nouvelle approche, intégrant la génomique comparative avec la biologie cellulaire et évolutive, l'écologie, l'archéologie, l'anthropologie et la biologie de la conservation, est essentielle pour comprendre et protéger nous-mêmes et notre monde. Ici, nous décrivons le potentiel de découverte scientifique lorsque la génomique comparative travaille en étroite collaboration avec une large gamme de domaines, ainsi que les contraintes techniques, scientifiques et sociales qui doivent être abordées.

@article{openalexw4206985195,
    author = "Stephan, Taylorlyn et Karlsson, Elinor K.",
    title = "Génomique darwinienne et diversité dans l'arbre de la vie",
    year = "2022",
    journal = "The Journal of the American Medical Association (JAMA) Network (American Medical Association)",
    abstract = "La génomique englobe l'ensemble de l'arbre de la vie, tant éteint qu'existant, ainsi que les processus évolutifs qui façonnent cette diversité. À ce jour, la recherche génomique s'est concentrée sur les humains, un petit nombre d'espèces agricoles et des modèles de laboratoire établis. Moins de 18 000 des environ 2 000 000 d'espèces eucaryotes (< 1 %) ont une séquence génomique représentative dans GenBank, et seule une fraction de celles-ci dispose d'informations annexes sur la structure du génome, la variation génétique, l'expression des gènes, les modifications épigénétiques et la diversité des populations. Ce déséquilibre reflète une perception selon laquelle les études sur les humains sont primordiales dans la recherche sur les maladies. Pourtant, comprendre comment fonctionnent les génomes et comment la variation génétique façonne les phénotypes nécessite une vision large qui embrasse la vaste diversité de la vie. Nous possédons la technologie pour collecter des ensembles de données massifs et extrêmement détaillés sur le monde, mais l'expertise est cloisonnée dans des domaines distincts. Une nouvelle approche, intégrant la génomique comparative avec la biologie cellulaire et évolutive, l'écologie, l'archéologie, l'anthropologie et la biologie de la conservation, est essentielle pour comprendre et protéger nous-mêmes et notre monde. Ici, nous décrivons le potentiel de découverte scientifique lorsque la génomique comparative travaille en étroite collaboration avec une large gamme de domaines, ainsi que les contraintes techniques, scientifiques et sociales qui doivent être abordées.",
    openalex = "W4206985195",
    references = "doi101007s1033600400438"
}

@incollection{doi10100797830313102325,
    author = "Vergata, Antonello La",
    title = "« Lutte pour la vie » contre l'évolution",
    year = "2023",
    booktitle = "Biologie évolutive/Biologie évolutive",
    url = "https://doi.org/10.1007/978-3-031-31023-2\_5",
    doi = "10.1007/978-3-031-31023-2\_5",
    openalex = "W4387359998",
    references = "doi101007s10739021096465, doi101017cbo9781139164856, doi101093bjpsxv60314, doi101177007327537601400301, doi1023072412825, doi103366edinburgh97814744457880010001, doi105860choice333293, doi105962bhltitle61216, doi105962bhltitle82303, doi107208chicago97802261582590010001, openalexw1580259316, openalexw3022919901"
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Beaucoup de gens supposent un conflit incessant entre la science naturelle et le christianisme, mais le véritable conflit a été entre le scientisme et le christianisme. Le scientisme est la vision selon laquelle seules les sciences (en particulier pas la théologie) génèrent des connaissances ou des croyances rationnelles. Je montre comment le christianisme a généré des croyances rationnelles qui ont contribué à l'émergence de la science. Cette croyance rationnelle favorisant la science comprenait des justifications pour savoir quand pratiquer le naturalisme méthodologique et quand étudier la nature sans cette restriction. Les deux pratiques ont cultivé la science, bien que de manières différentes. Cette différence historique est d'une valeur durable pour les débats récents sur le naturalisme métaphysique (athéisme), le créationnisme, l'évolution théiste et le dessein intelligent.

@article{doi103390rel14070927,
    author = "Keas, Michael N.",
    title = "Christianity Cultivated Science with and without Methodological Naturalism",
    year = "2023",
    journal = "Religions",
    abstract = "Many people assume ceaseless conflict between natural science and Christianity, but the real conflict has been between scientism and Christianity. Scientism is the view that only the sciences (especially not theology) generate knowledge or rational belief. I show how Christianity generated rational beliefs that contributed to the rise of science. This science-fostering rational belief included rationales for when to practice methodological naturalism, and when to study nature without that restriction. Both practices cultivated science, though in different ways. This historical difference is of enduring value for recent debates about metaphysical naturalism (atheism), creationism, theistic evolution, and intelligent design.",
    url = "https://doi.org/10.3390/rel14070927",
    doi = "10.3390/rel14070927",
    openalex = "W4384827733",
    references = "doi103390rel12090694"
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Antérieur à la course actuelle des milliardaires pour l'espace, Prometheus de Ridley Scott explore une interaction d'explications concurrentes de l'origine de la vie, telles qu'elles peuvent être découvertes dans l'univers grâce à l'exploration spatiale. L'intrigue du film débat de l'évolution contre la foi quant à l'origine de la vie, et démontre l'évolution comme victorieuse sur et utilisant la foi. Accompagnant cette analyse se trouve un focus sur la scène de prologue en ligne précédemment diffusée du film, un discours fictif de TED Talk qui entrelace les avancées technologiques et les thèmes religieux qui affichent une survie du plus apte hiérarchique darwinienne brutale comme réponse à l'origine de la vie. À l'ère de la ré-émergence de l'exploration spatiale, Prometheus et son discours de prologue diffusé sur les réseaux sociaux démontrent le contrôle technologique sur l'évolution et relèguent la foi à fonctionner comme un mécanisme de survie en réponse à des espèces supérieures et hyperagressives. La valeur de la foi réside dans l'assistance à l'humanité pour continuer à chercher des réponses transcendantes lorsqu'elle affronte les débuts de la vie et les fins violentes.

@article{doi1072021097590ar,
    author = "Yergensen, Brent",
    title = "La concurrence sur l'origine de la vie et la tradition de l'oratoire scientifique : polariser l'évolution et sa foi instinctuelle dans Prometheus",
    year = "2023",
    journal = "Nouvelles explorations",
    abstract = "Antérieur à la course actuelle des milliardaires pour l'espace, Prometheus de Ridley Scott explore une interaction d'explications concurrentes de l'origine de la vie, telles qu'elles peuvent être découvertes dans l'univers grâce à l'exploration spatiale. L'intrigue du film débat de l'évolution contre la foi quant à l'origine de la vie, et démontre l'évolution comme victorieuse sur et utilisant la foi. Accompagnant cette analyse se trouve un focus sur la scène de prologue en ligne précédemment diffusée du film, un discours fictif de TED Talk qui entrelace les avancées technologiques et les thèmes religieux qui affichent une survie du plus apte hiérarchique darwinienne brutale comme réponse à l'origine de la vie. À l'ère de la ré-émergence de l'exploration spatiale, Prometheus et son discours de prologue diffusé sur les réseaux sociaux démontrent le contrôle technologique sur l'évolution et relèguent la foi à fonctionner comme un mécanisme de survie en réponse à des espèces supérieures et hyperagressives. La valeur de la foi réside dans l'assistance à l'humanité pour continuer à chercher des réponses transcendantes lorsqu'elle affronte les débuts de la vie et les fins violentes.",
    url = "https://doi.org/10.7202/1097590ar",
    doi = "10.7202/1097590ar",
    openalex = "W4365446212",
    references = "doi103390rel12090694"
}

Charles Darwin est souvent présenté comme la personne qui a « découvert » l'évolution, parfois avec Alfred Russel Wallace. Dans certains cas, des références sont faites aux écrits de Jean Baptiste Lamarck ou au grand-père de Darwin, Erasmus, mais celles-ci sont rapidement rejetées comme spéculatives. C'est ainsi Darwin qui reste l'unique individu ayant compris que les espèces émergent de processus évolutifs naturels, plutôt que de la création spéciale. Cependant, cela est loin d'être exact. L'histoire de l'étude de l'évolution avant Darwin inclut non seulement Lamarck, mais aussi une communauté intellectuelle beaucoup plus large en Europe qui a discuté de la stabilité des espèces et produit de nombreuses vues différentes sur le sujet. La scène scientifique européenne de la fin du XVIIIe siècle au milieu du XIXe siècle était complexe, et les débats sur la transformation des espèces avaient déjà eu lieu vers 1800. Ce milieu s'étendait au-delà des naturalistes en Angleterre et en France aux géologues et botanistes italiens, aux naturalistes et anatomistes allemands, et aux paléontologues et zoologistes russes. Ce chapitre attire l'attention sur un certain nombre d'auteurs et de lecteurs participant à des conversations largement « évolutives ».

@incollection{doi1010179781009375719003,
    author = "Corsi, Pietro",
    title = "Que la plupart des naturalistes européens avant Darwin ne pensaient pas que le changement des espèces était possible",
    year = "2024",
    booktitle = "Cambridge University Press eBooks",
    abstract = {Charles Darwin est souvent présenté comme la personne qui a « découvert » l'évolution, parfois avec Alfred Russel Wallace. Dans certains cas, des références sont faites aux écrits de Jean Baptiste Lamarck ou au grand-père de Darwin, Erasmus, mais celles-ci sont rapidement rejetées comme spéculatives. C'est ainsi Darwin qui reste l'unique individu ayant compris que les espèces émergent de processus évolutifs naturels, plutôt que de la création spéciale. Cependant, cela est loin d'être exact. L'histoire de l'étude de l'évolution avant Darwin inclut non seulement Lamarck, mais aussi une communauté intellectuelle beaucoup plus large en Europe qui a discuté de la stabilité des espèces et produit de nombreuses vues différentes sur le sujet. La scène scientifique européenne de la fin du XVIIIe siècle au milieu du XIXe siècle était complexe, et les débats sur la transformation des espèces avaient déjà eu lieu vers 1800. Ce milieu s'étendait au-delà des naturalistes en Angleterre et en France aux géologues et botanistes italiens, aux naturalistes et anatomistes allemands, et aux paléontologues et zoologistes russes. Ce chapitre attire l'attention sur un certain nombre d'auteurs et de lecteurs participant à des conversations largement « évolutives ».},
    url = "https://doi.org/10.1017/9781009375719.003",
    doi = "10.1017/9781009375719.003",
    openalex = "W4399195453",
    references = "doi101007s10739021096465"
}

La question est de savoir dans quelle mesure la théorie de l'évolution par sélection naturelle de Charles Darwin est responsable de la violence causée par le communisme, le nazisme et d'autres dysfonctionnements sociétaux. Les opposants chrétiens conservateurs affirment que le darwinisme affaiblit l'autorité biblique et soutient des idéologies provoquant la violence. Les partisans laïcs et chrétiens du darwinisme soutiennent que le darwinisme n'a pas encouragé la violence, mais a été utilisé pour fournir une justification scientifique à une violence qui aurait été causée de toute façon. De plus, les partisans chrétiens du darwinisme soutiennent que le darwinisme n'est en aucun cas incompatible avec la Bible. Cet article examine les affirmations des deux côtés ainsi que les tentatives des opposants chrétiens du darwinisme de remplacer le darwinisme par des théories qu'ils espèrent restaurer l'autorité biblique, y compris le créationnisme, la science de la création et la théorie du dessein intelligent. L'article conclut que malgré les échecs juridiques rencontrés par les adeptes de ces théories alternatives, le conflit persiste.

@article{doi103390rel15101221,
    author = "Cross, Malcolm",
    title = "Doing Violence to Darwin : Évaluations chrétiennes conflictuelles du darwinisme et de la violence",
    year = "2024",
    journal = "Religions",
    abstract = "La question est de savoir dans quelle mesure la théorie de l'évolution par sélection naturelle de Charles Darwin est responsable de la violence causée par le communisme, le nazisme et d'autres dysfonctionnements sociétaux. Les opposants chrétiens conservateurs affirment que le darwinisme affaiblit l'autorité biblique et soutient des idéologies provoquant la violence. Les partisans laïcs et chrétiens du darwinisme soutiennent que le darwinisme n'a pas encouragé la violence, mais a été utilisé pour fournir une justification scientifique à une violence qui aurait été causée de toute façon. De plus, les partisans chrétiens du darwinisme soutiennent que le darwinisme n'est en aucun cas incompatible avec la Bible. Cet article examine les affirmations des deux côtés ainsi que les tentatives des opposants chrétiens du darwinisme de remplacer le darwinisme par des théories qu'ils espèrent restaurer l'autorité biblique, y compris le créationnisme, la science de la création et la théorie du dessein intelligent. L'article conclut que malgré les échecs juridiques rencontrés par les adeptes de ces théories alternatives, le conflit persiste.",
    url = "https://doi.org/10.3390/rel15101221",
    doi = "10.3390/rel15101221",
    openalex = "W4403216515",
    references = "doi103390rel12090694"
}

@incollection{wilmNoneevolution,
    author = "Wilm, E. C.",
    title = "Théories de l'évolution (suite) : sélection naturelle. Darwin et le néo-darwinisme.",
    year = "None",
    booktitle = "Les théories de l'instinct : Une étude en histoire de la psychologie.",
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    doi = "10.1037/13444-012",
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    pages = "168-181"
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