Elasmobranches

L'auteur commence par déclarer que les observations consignées dans son mémoire ont été effectuées sur les trois genres suivants de Chondrichthyens : Scyllium, Pristiurus et Torpedo. La majorité de ses observations ont été réalisées sur des spécimens obtenus pour lui par l'intermédiaire de la Station zoologique de Naples ; mais il a également été fourni de manière très libérale avec des embryons de Scyllium par les directeurs de l'Aquarium de Brighton, grâce à la bienveillance de M. Henry Lee. Il constate que les embryons de Torpedo sont de loin plus appropriés que tout autre genre qu'il a utilisé pour l'étude du développement des nerfs.

@article{balfour1876on,
    author = "Balfour, Francis Maitland",
    title = "On the development of the spinal nerves in elasmobranch fishes",
    year = "1876",
    journal = "Proceedings of the Royal Society of London",
    abstract = "The author commences by stating that the observations recorded in his paper have been made upon the three following genera of Elasmobranchs—ScyIlium, Pristiurus, and Torpedo. The majority of his observations were made upon specimens procured for him through the agency of the Zoological Station at Naples; but he has also been supplied in a most liberal manner with Scyllium embryos by the Directors of the Brighton Aquarium, through the kindness of Mr. Henry Lee. He finds that Torpedo embryos are by far more suitable than any other genera he has employed for the investigation of the development of the nerves.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rspl.1875.0014",
    doi = "10.1098/rspl.1875.0014",
    number = "164-170",
    openalex = "W3092424191",
    pages = "134-136",
    volume = "24"
}

@misc{balfour1878a,
    author = "Balfour, Francis M.",
    title = "A monograph on the development of elasmobranch fishes / par F. M. Balfour.",
    year = "1878",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.7847",
    doi = "10.5962/bhl.title.7847",
    openalex = "W2503935562"
}

@misc{balfour1878a1,
    author = "Balfour, F. M",
    title = "A Monograph on the Development of Elasmobranch Fishes",
    year = "1878",
    howpublished = "London, Macmillan",
    note = "talkorigins\_source = {true}; raw\_reference = {Balfour, F. M., 1878, A Monograph on the Development of Elasmobranch Fishes: London, Macmillan.}"
}

@article{doi101038018113a0,
    author = "Lankester, E. Ray",
    title = "A Monograph on the Development of Elasmobranch Fishes",
    year = "1878",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/018113a0",
    doi = "10.1038/018113a0",
    openalex = "W2107131948"
}

@book{doi105962bhltitle7847,
    author = "Balfour, Francis M.",
    title = "A monograph on the development of elasmobranch fishes / by F. M. Balfour.",
    year = "1878",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.7847",
    doi = "10.5962/bhl.title.7847",
    openalex = "W2503935562"
}

@article{lankester1878a,
    author = "LANKESTER, E. RAY",
    title = "A Monograph on the Development of Elasmobranch Fishes",
    year = "1878",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/018113a0",
    doi = "10.1038/018113a0",
    number = "448",
    openalex = "W2107131948",
    pages = "113-115",
    volume = "18"
}

RÉSUMÉ Le développement de l'lamproie a occupé l'attention de nombreux embryologistes au cours des cinquante dernières années. Parmi ceux-ci, nous devons aux comptes les plus complets des changements par lesquels passe l'œuf à Max Schultze, Owsjannikow, Calberla, Scott, Balfour et Dohrn. J'ai récemment retravaillé le développement de Petromyzon et j'ai établi l'origine de plusieurs organes qui n'avaient jusqu'ici été que partiellement connus. Dans de nombreux points les plus importants, mes recherches confirment celles des observateurs antérieurs, et à ceux-ci je n'ai fait référence que dans la mesure nécessaire pour rendre le compte intelligible ; dans d'autres, tels que la persistance du blastopore, l'origine du mésoblaste ventral, etc., je diffère des descriptions précédentes ; et certains points, tels que le développement du cœur, des parties du cerveau et des nerfs crâniens, sont établis pour la première fois.

@article{doi101242jcss227107325,
    author = "Shipley, A. E.",
    title = "On Some Points in the Development of Petromyzon fluviatilis.1",
    year = "1887",
    journal = "Journal of Cell Science",
    abstract = "RÉSUMÉ Le développement de l'lamproie a occupé l'attention de nombreux embryologistes au cours des cinquante dernières années. Parmi ceux-ci, nous devons aux comptes les plus complets des changements par lesquels passe l'œuf à Max Schultze, Owsjannikow, Calberla, Scott, Balfour et Dohrn. J'ai récemment retravaillé le développement de Petromyzon et j'ai établi l'origine de plusieurs organes qui n'avaient jusqu'ici été que partiellement connus. Dans de nombreux points les plus importants, mes recherches confirment celles des observateurs antérieurs, et à ceux-ci je n'ai fait référence que dans la mesure nécessaire pour rendre le compte intelligible ; dans d'autres, tels que la persistance du blastopore, l'origine du mésoblaste ventral, \&c., je diffère des descriptions précédentes ; et certains points, tels que le développement du cœur, des parties du cerveau et des nerfs crâniens, sont établis pour la première fois.",
    url = "https://doi.org/10.1242/jcs.s2-27.107.325",
    doi = "10.1242/jcs.s2-27.107.325",
    openalex = "W2552515367"
}

RÉSUMÉ Il y a maintenant plus de dix ans que j'ai d'abord signalé l'insuffisance de la théorie cellulaire du développement. Il n'est pas besoin de dire que je l'ai fait d'une manière très prudente ; mais maintenant, après dix ans de travail mûri, je me sens justifié pour donner une expression plus forte aux vues que j'ai alors formées, et que tout mon travail ultérieur a amplement confirmées. Mes mots alors (en 1883) étaient les suivants :—« En somme, si ces faits sont généralement applicables, le développement embryonnaire ne peut plus être considéré comme étant essentiellement la formation par fission d'un certain nombre d'unités à partir d'une seule unité primitive, et la coordination et la modification de ces unités en un ensemble harmonieux. Mais il faut plutôt le considérer comme une multiplication de noyaux et une spécialisation de tractus et de vacuoles dans une masse continue de protoplasme vacuolisé. » De nouveau, en 1888, dans l'avant-propos de ma « Monographie sur le développement des espèces du Cap de Peripatus », 1 j'ai écrit : « Il semble en effet que chez Peripatus les cellules de l'adulte, dans la mesure où elles sont des structures distinctes et nettement délimitées, ne sont pas, comme il semble généralement le cas, présentes dans les stades embryonnaires les plus précoces, mais évoluent progressivement à mesure que le développement se poursuit. En d'autres termes, la théorie cellulaire, si elle implique que les cellules adultes sont dérivées de cellules embryonnaires qui ont été directement produites par la division de l'ovicell, ne s'applique pas aux embryons de Peripatus. »

@article{doi101242jcss23714587,
    author = "Sedgwick, Adam C.",
    title = "Sur l'insuffisance de la théorie cellulaire du développement et sur le développement précoce des nerfs, en particulier du troisième nerf et du sympathique chez les Elasmobranchii",
    year = "1894",
    journal = "Journal of Cell Science",
    abstract = "RÉSUMÉ Il y a maintenant plus de dix ans que j'ai d'abord signalé l'insuffisance de la théorie cellulaire du développement. Il n'est pas besoin de dire que je l'ai fait d'une manière très prudente ; mais maintenant, après dix ans de travail mûri, je me sens justifié pour donner une expression plus forte aux vues que j'ai alors formées, et que tout mon travail ultérieur a amplement confirmées. Mes mots alors (en 1883) étaient les suivants :—« En somme, si ces faits sont généralement applicables, le développement embryonnaire ne peut plus être considéré comme étant essentiellement la formation par fission d'un certain nombre d'unités à partir d'une seule unité primitive, et la coordination et la modification de ces unités en un ensemble harmonieux. Mais il faut plutôt le considérer comme une multiplication de noyaux et une spécialisation de tractus et de vacuoles dans une masse continue de protoplasme vacuolisé. » De nouveau, en 1888, dans l'avant-propos de ma « Monographie sur le développement des espèces du Cap de Peripatus », 1 j'ai écrit : « Il semble en effet que chez Peripatus les cellules de l'adulte, dans la mesure où elles sont des structures distinctes et nettement délimitées, ne sont pas, comme il semble généralement le cas, présentes dans les stades embryonnaires les plus précoces, mais évoluent progressivement à mesure que le développement se poursuit. En d'autres termes, la théorie cellulaire, si elle implique que les cellules adultes sont dérivées de cellules embryonnaires qui ont été directement produites par la division de l'ovicell, ne s'applique pas aux embryons de Peripatus. »",
    url = "https://doi.org/10.1242/jcs.s2-37.145.87",
    doi = "10.1242/jcs.s2-37.145.87",
    openalex = "W2601095885"
}

L'objectif du présent article est de décrire divers stades typiques du développement du dos, des membres et de la paroi corporelle chez l'homme. Le travail repose principalement sur des reconstructions, selon la méthode de Born, de parties de cinq embryons humains ; il a été étendu et contrôlé par l'étude de la forme externe et de coupes sériales de plusieurs autres embryons humains. Le Dr Lewis a consacré une étude spéciale à la formation du bras, le Dr Bardeen à celle de la jambe, de la paroi corporelle et du dos. Dans le tableau ci-joint, une liste est donnée des embryons utilisés. Ceux marqués d'une astérisque ont été reconstruits. Nous examinerons les premiers stades du développement des membres, de la paroi corporelle et du dos, d'abord du point de vue de la forme externe et, ensuite, du point de vue de la différenciation structurelle interne.

@article{doi101002aja1000010102,
    author = "Bardeen, Charles Russell et Lewis, Warren",
    title = "Développement des membres, de la paroi corporelle et du dos chez l'homme",
    year = "1901",
    journal = "American Journal of Anatomy",
    abstract = "L'objectif du présent article est de décrire divers stades typiques du développement du dos, des membres et de la paroi corporelle chez l'homme. Le travail repose principalement sur des reconstructions, selon la méthode de Born, de parties de cinq embryons humains ; il a été étendu et contrôlé par l'étude de la forme externe et de coupes sériales de plusieurs autres embryons humains. Le Dr Lewis a consacré une étude spéciale à la formation du bras, le Dr Bardeen à celle de la jambe, de la paroi corporelle et du dos. Dans le tableau ci-joint, une liste est donnée des embryons utilisés. Ceux marqués d'une astérisque ont été reconstruits. Nous examinerons les premiers stades du développement des membres, de la paroi corporelle et du dos, d'abord du point de vue de la forme externe et, ensuite, du point de vue de la différenciation structurelle interne.",
    url = "https://doi.org/10.1002/aja.1000010102",
    doi = "10.1002/aja.1000010102",
    openalex = "W2050962411"
}

Dans le mémoire suivant, certaines observations sont rapportées concernant la morphologie embryonnaire du nerf acoustique et le développement de la masse ganglionnaire incorporée dans son tronc. La différenciation de cette dernière masse, le ganglion acusticum, et sa subdivision en ganglion vestibulaire et ganglion spiral présentent plusieurs caractéristiques intéressantes ; et il convient d'accorder une attention particulière à la lumière supplémentaire que l'étude de ce processus jette sur la question de l'innervation du saccule et de l'ampoule du canal semi-circulaire postérieur. Il est établi, à savoir, que ces deux portions du labyrinthe membraneux ne sont pas innervées par le nerf cochléaire, comme le décrivent les manuels anglais et allemands, mais sont innervées par le nerf vestibulaire, comme l'ont soutenu certains auteurs français. Cela rassemble toutes les ampoules avec l'utricule et le saccule sous le contrôle du même nerf, et laisse le nerf cochléaire comme un nerf spécialisé et distinct pour lui-même, n'innervant que la ductus cochléaire. Cette disposition est celle qui devrait être gratifiante pour le physiologiste, car elle trace une ligne définie entre la partie du complexe nerveux qui contrôle l'analyse du son et celle qui contrôle l'équilibre.

@article{doi101002aja1000060103,
    author = "Streeter, George L.",
    title = "On the development of the membranous labyrinth and the acoustic and facial nerves in the human embryo",
    year = "1906",
    journal = "American Journal of Anatomy",
    abstract = "In the following paper some observations are reported concerning the embryonic morphology of the acoustic nerve and the development of the ganglion mass incorporated in its trunk.The differentiation of this latter mass, the ganglion acusticum, and its subdivision into the ganglion vestibulare and the ganglion spirale present several features of interest; and deserving of especial attention is the additional light which the study of this process throws upon the question of nerve supply of the saccule, and the ampulla of the posterior semi-circular canal.It is found, namely, that these two portions of the membranous labyrinth are not supplied by the cochlear nerve, as described in English and German text books, but are supplied by the vestibular nerve, as has been maintained by some of the French writers.This brings all of the ampulls together with the utricle and saccule under control of the same nerve, and leaves the cochlear nerve as a specialized and distinct nerve for itself, supplying only the cochlear duct.This arrangement is one which should be gratifying to the physiologist, for it draws a definite line between that portion of the nerve complex which controls the analysis of sound and that which controls equilibrium.",
    url = "https://doi.org/10.1002/aja.1000060103",
    doi = "10.1002/aja.1000060103",
    openalex = "W1909269994",
    references = "doi101002aja1000040106"
}

Including Families and Genera as Far as Known Class LEPTOCARDII (Myelozoa) Order AMPHIOXI (Cirrostomi) The Lancelets (or Leptocardii) are without doubt simplest in organiza tion of all fish-like chordates or vertebrates.

@book{doi105962bhltitle161386,
    author = "Jordan, David Starr",
    title = "A classification of fishes: including families and genera as far as known",
    year = "1923",
    booktitle = "Stanford University Press eBooks",
    abstract = "Including Families and Genera as Far as Known Class LEPTOCARDII (Myelozoa) Order AMPHIOXI (Cirrostomi) The Lancelets (or Leptocardii) are without doubt simplest in organiza tion of all fish-like chordates or vertebrates.",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.161386",
    doi = "10.5962/bhl.title.161386",
    openalex = "W658957599"
}

@article{doi101038124440c0,
    title = "Les poissons chondrichthyens",
    year = "1929",
    journal = "Nature",
    url = "https://doi.org/10.1038/124440c0",
    doi = "10.1038/124440c0",
    openalex = "W1523656269"
}

Résumé Ce mémoire, qui repose sur l'étude de Acipenser, Polypterus, Amia et Lepidosteus, est écrit en partie pour compléter, en partie pour corriger, quelques notes peu nombreuses que j'ai publiées sur le sujet en 1911. Des observations sur Plagiostomi, Teleostei et Amphibia, qui ont un rapport avec les problèmes discutés, sont incorporées dans le mémoire. Les muscles oculaires. L'étude du développement des muscles oculaires a été entreprise par Balfour (1878), qui a déclaré qu'il est probable que les parois de la 1re cavité céphalique des embryons de Selachiens se développent en muscles oculaires externes. Marshall (1881) a déclaré que les Recti supérieur, interne et inférieur, et probablement l'Obliquus inférieur, sont dérivés des parois de la 1re cavité céphalique. Il n'a pas trouvé les origines de l'Obliquus supérieur et du Rectus externus, mais à l'égard de ce dernier, il a dit qu'il est probable qu'il se développe à partir des parois des extrémités dorsales de la 2e et de la 3e cavité céphalique.

@article{doi101098rstb19290002,
    author = "Edgeworth, F. H.",
    title = "II. Le développement de certains muscles crâniens de poissons ganoides",
    year = "1929",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society of London Series B Containing Papers of a Biological Character",
    abstract = "Résumé Ce mémoire, qui repose sur l'étude de Acipenser, Polypterus, Amia et Lepidosteus, est écrit en partie pour compléter, en partie pour corriger, quelques notes peu nombreuses que j'ai publiées sur le sujet en 1911. Des observations sur Plagiostomi, Teleostei et Amphibia, qui ont un rapport avec les problèmes discutés, sont incorporées dans le mémoire. Les muscles oculaires. L'étude du développement des muscles oculaires a été entreprise par Balfour (1878), qui a déclaré qu'il est probable que les parois de la 1re cavité céphalique des embryons de Selachiens se développent en muscles oculaires externes. Marshall (1881) a déclaré que les Recti supérieur, interne et inférieur, et probablement l'Obliquus inférieur, sont dérivés des parois de la 1re cavité céphalique. Il n'a pas trouvé les origines de l'Obliquus supérieur et du Rectus externus, mais à l'égard de ce dernier, il a dit qu'il est probable qu'il se développe à partir des parois des extrémités dorsales de la 2e et de la 3e cavité céphalique.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.1929.0002",
    doi = "10.1098/rstb.1929.0002",
    openalex = "W2053133343"
}

@article{doi101152ajplegacy1931982296,
    author = "Smith, Homer W.",
    title = "THE ABSORPTION AND EXCRETION OF WATER AND SALTS BY THE ELASMOBRANCH FISHES",
    year = "1931",
    journal = "American Journal of Physiology-Contenu hérité",
    url = "https://doi.org/10.1152/ajplegacy.1931.98.2.296",
    doi = "10.1152/ajplegacy.1931.98.2.296",
    openalex = "W3160275924"
}

Des relevés concernant près de 2000 requins collectés dans la région d'Ilfracombe suggèrent que la saison de frai de ce poisson commence en novembre et se poursuit au moins jusqu'en juillet. Cette zone représente probablement un lieu de frai vers lequel les femelles migrent pendant la saison de reproduction ; les mâles les suivent beaucoup plus tard, en avril et mai. Des données sont fournies pour montrer le temps nécessaire à différentes températures pour que l'embryon se développe jusqu'à une série de stades morphologiques définis ; ces données suggèrent que la température caractéristique du développement (µ = 20 000) est sensiblement la même que pour plusieurs espèces de téléostéens.

@article{doi101017s002531540005298x,
    author = "Harris, John E.",
    title = "A note on the breeding season, sex ratio and embryonic development of the dogfish Scyliorhinus canicula (L.)",
    year = "1952",
    journal = "Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom",
    abstract = "Records of nearly 2000 dogfish collected from the Ilfracombe region suggest that the spawning season of this fish starts in November and continues at least until July. This area probably represents a spawning ground into which the females migrate during the spawning season; the males follow them much later in April and May. Figures are given to show the time taken at different temperatures for the embryo to develop to a series of definite morphological stages; these suggest that the temperature characteristic of the development (µ = 20,000) is substantially the same as for several teleost species.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s002531540005298x",
    doi = "10.1017/s002531540005298x",
    openalex = "W2158514519"
}

Lillie's Development of the Chick Accéder à Lillie's Development of the Chick. Révisé par Hamilton Howard L.. 624 pages, 283 figures. Henry Holt and Company, 383 Madison Avenue, New York 17, N. Y. (3e édition, 1952) 8,50 $. Bulletin AIBS, Volume 3, Numéro 1, janvier 1953, Page 15, https://doi.org/10.1093/aibsbulletin/3.1.15-f Publié : 01 janvier 1953

@article{doi101093aibsbulletin3115f,
    title = "Lillie's Development of the Chick",
    year = "1953",
    journal = "AIBS Bulletin",
    abstract = "Lillie's Development of the Chick Accéder à Lillie's Development of the Chick. Révisé par Hamilton Howard L.. 624 pages, 283 figures. Henry Holt and Company, 383 Madison Avenue, New York 17, N. Y. (3e édition, 1952) 8,50 $. Bulletin AIBS, Volume 3, Numéro 1, janvier 1953, Page 15, https://doi.org/10.1093/aibsbulletin/3.1.15-f Publié : 01 janvier 1953",
    url = "https://doi.org/10.1093/aibsbulletin/3.1.15-f",
    doi = "10.1093/aibsbulletin/3.1.15-f",
    openalex = "W4240919262"
}

RÉSUMÉ Des expériences avec des champs électrostatiques et magnétiques mobiles montrent que Gymnarchus niloticus est sensible à un gradient de potentiel d'environ 0 · 03 µ V./cm. Des explications alternatives de certaines expériences précédentes sont données en termes de cette haute sensibilité en courant continu. Une explication en termes similaires est donnée pour des expériences dans lesquelles Gymnotus carapo est entraîné à détecter un aimant stationnaire. Les mécanismes disponibles pour la localisation d'objets par les poissons électriques sont examinés. Il est conclu à partir des résultats d'une expérience critique (décrite dans une section suivante) que Gymnarchus niloticus peut détecter des objets par la perturbation de son propre champ électrique dans l'eau. La théorie approximative de cette méthode de localisation d'objets est dérivée. L'effet sur les récepteurs du champ perturbateur dû à un objet dépend des propriétés électriques des récepteurs : dans les cas extrêmes, la stimulation des récepteurs est proportionnelle soit au potentiel, soit à sa dérivée seconde. Des graphiques sont donnés montrant l'effet d'un objet sur le potentiel et sur sa dérivée seconde autour de la surface du poisson. Des expériences sont décrites utilisant Gymnarchus niloticus qui (a) confirment que le mécanisme de localisation d'objets emploie la distorsion du champ électrique ; (i) indiquent les limites de la sensibilité du poisson. Le mode de dérivée seconde semble être le plus probable en action chez Gymnarchus. Les limites de détermination expérimentale sont discutées en relation avec le bruit aléatoire dans le circuit récepteur : il est conclu que l'intégration spatiale et temporelle sont probablement employées. Les seuils pour la localisation d'objets et pour la réponse aux courants directs sont comparés : il est conclu que les mêmes récepteurs sont probablement en action dans les deux cas.

@article{doi101242jeb352451,
    author = "Lissmann, H. W. et Machin, K. E.",
    title = "Le mécanisme de la localisation d'objets chez Gymnarchus Niloticus et poissons similaires",
    year = "1958",
    journal = "Journal of Experimental Biology",
    abstract = "RÉSUMÉ Des expériences avec des champs électrostatiques et magnétiques mobiles montrent que Gymnarchus niloticus est sensible à un gradient de potentiel d'environ 0 · 03 µ V./cm. Des explications alternatives de certaines expériences précédentes sont données en termes de cette haute sensibilité en courant continu. Une explication en termes similaires est donnée pour des expériences dans lesquelles Gymnotus carapo est entraîné à détecter un aimant stationnaire. Les mécanismes disponibles pour la localisation d'objets par les poissons électriques sont examinés. Il est conclu à partir des résultats d'une expérience critique (décrite dans une section suivante) que Gymnarchus niloticus peut détecter des objets par la perturbation de son propre champ électrique dans l'eau. La théorie approximative de cette méthode de localisation d'objets est dérivée. L'effet sur les récepteurs du champ perturbateur dû à un objet dépend des propriétés électriques des récepteurs : dans les cas extrêmes, la stimulation des récepteurs est proportionnelle soit au potentiel, soit à sa dérivée seconde. Des graphiques sont donnés montrant l'effet d'un objet sur le potentiel et sur sa dérivée seconde autour de la surface du poisson. Des expériences sont décrites utilisant Gymnarchus niloticus qui (a) confirment que le mécanisme de localisation d'objets emploie la distorsion du champ électrique ; (i) indiquent les limites de la sensibilité du poisson. Le mode de dérivée seconde semble être le plus probable en action chez Gymnarchus. Les limites de détermination expérimentale sont discutées en relation avec le bruit aléatoire dans le circuit récepteur : il est conclu que l'intégration spatiale et temporelle sont probablement employées. Les seuils pour la localisation d'objets et pour la réponse aux courants directs sont comparés : il est conclu que les mêmes récepteurs sont probablement en action dans les deux cas.",
    url = "https://doi.org/10.1242/jeb.35.2.451",
    doi = "10.1242/jeb.35.2.451",
    openalex = "W1957563271",
    references = "doi101007bf00340757, doi101016s0096417418301082, doi101016s0096417418301239, doi101038143960c0, doi101038167201a0, doi101152ajplegacy1917443405, lissmann1958on, openalexw3038515387"
}

Les décharges électriques de Gymnarchus niloticus et d'espèces représentatives de sept genres de la famille des Mormyridae ont été examinées dans leur habitat naturel en Afrique et en laboratoire. Des investigations comparables sur les Gymnotidae d'Amérique du Sud ont montré l'existence de deux types de décharge dans ces deux familles de poissons non apparentées. Le premier type de décharge électrique consiste en des séquences très régulières de pulses monophasiques émis en continu, variant d'une espèce à l'autre en fréquence, et dans des limites plus étroites d'un individu à l'autre. Les poissons émettant ce premier type de pulses incluent Gymnarchus, Hypopomus et Eigenmannia. La plage de fréquence pour ces poissons se situe entre 60 et 400 décharges/seconde. La fréquence ne change pas avec l'état d'excitation du poisson. La durée des pulses individuels est relativement longue, soit 2–10 msec. Le second type de décharge est moins régulier en fréquence, la durée du pulse beaucoup plus courte et la forme du pulse plus complexe. La décharge individuelle de l'organe électrique entier dure environ 0,2 msec chez Petrocephalus. Ce type de décharge est trouvé chez toutes les espèces examinées des Mormyridae et chez des formes telles que Gymnotus carapo et Staetogenes elegans. Le taux de décharge de base d'un mormyrid au repos est quelque peu variable et n'est pas strictement rythmique. Il se situe généralement entre 1 et 6 pulses/seconde. Les stimuli qui excitent les mormyrids provoquent une augmentation de la fréquence de décharge. Le maximum enregistré est d'environ 130 pulses/seconde. Des stimuli appropriés peuvent inhiber les décharges des Mormyridae pendant de longues périodes. Chez Gymnotus carapo et Staetogenes elegans, le taux de décharge de base est plus élevé et de rythmicité régulière. Selon la température, les fréquences se situent entre 30 et 87 pulses/seconde. Lorsque ces poissons sont excités, les fréquences augmentent jusqu'à 200 pulses/seconde, pendant un court instant. La forme du champ électrique, qui est établi à chaque pulse autour du poisson, a été examinée. Une théorie a été proposée selon laquelle ces poissons, grâce à leurs pulses électriques, peuvent localiser des objets si leur conductivité électrique diffère de celle de l'eau. Ces poissons se sont montrés extrêmement sensibles aux influences affectant le champ électrique. Cela a été étudié en appliquant des stimuli électriques artificiels, en étudiant les effets des conducteurs et des non-conducteurs introduits dans le champ, et les réactions envers les champs magnétiques et les charges électrostatiques. Des expériences de réflexes conditionnés avec Gymnarchus niloticus et Gymnotus carapo ont montré que ces poissons peuvent détecter la présence d'un aimant stationnaire et qu'ils peuvent discriminer entre conducteurs et non-conducteurs. La proie de ces poissons ne semble pas être affectée par les décharges. Entre autres, les pulses électriques ont une signification sociale. Ce mécanisme de localisation peut être considéré comme une adaptation à la vie dans l'eau trouble. Les Gymnotidae et les Mormyridae (considérés comme incluant Gymnarchus) montrent des caractéristiques frappantes d'évolution convergente. Des adaptations locomotrices inhabituelles telles que la nage par l'aide de la nageoire dorsale (Gymnarchus), la nageoire anale (Gymnotidae) et les « os de Gemminger » (Mormyridae) peuvent être considérées comme un moyen qui tend à faire coïncider l'axe de symétrie du poisson et de son champ électrique pendant les mouvements actifs. Une nouvelle théorie pour l'évolution des organes électriques a été suggérée. Un prérequis majeur semble être un récepteur sensible à la stimulation électrique. Il est suggéré que les différenciations sensorielles et nerveuses spéciales du système latéral (« mormyromasts », valvulae cerebelli) sont concernées par la perception et l'intégration des stimuli électriques. Des potentiels d'action musculaires ont été enregistrés dans l'eau à quelque distance de poissons non électriques. L'explication la plus simple pour l'évolution d'organes électriques puissants semblerait partir de tels potentiels d'action musculaires et passer par des organes électriques faibles utilisés pour l'orientation, jusqu'aux organes électriques offensifs et défensifs puissants.

@article{lissmann1958on,
    author = "Lissmann, H. W.",
    title = "Sur la fonction et l'évolution des organes électriques chez les poissons",
    year = "1958",
    journal = "Journal of Experimental Biology",
    abstract = {Les décharges électriques de Gymnarchus niloticus et de représentants de sept genres des Mormyridae ont été examinées dans leur habitat naturel en Afrique et en laboratoire. Des investigations comparables sur les Gymnotidae d'Amérique du Sud ont montré l'existence de deux types de décharge chez ces deux familles de poissons non apparentées. Le premier type de décharge électrique consiste en des séquences très régulières d'impulsions monophasiques émises en continu, variant d'une espèce à l'autre en fréquence, et dans des limites plus étroites d'un individu à l'autre. Les poissons émettant ce premier type d'impulsions incluent Gymnarchus, Hypopomus et Eigenmannia. La plage de fréquence pour ces poissons se situe entre 60 et 400 décharges/seconde. La fréquence ne change pas avec l'état d'excitation du poisson. La durée des impulsions individuelles est relativement longue, soit 2–10 msec. Le second type de décharge est moins régulier en fréquence, la durée de l'impulsion beaucoup plus courte et la forme de l'impulsion plus complexe. La décharge individuelle de l'organe électrique entier dure environ 0,2 msec chez Petrocephalus. Ce type de décharge est trouvé chez toutes les espèces examinées des Mormyridae et chez des formes telles que Gymnotus carapo et Staetogenes elegans. La fréquence de décharge de base d'un mormyrid au repos est quelque peu variable et n'est pas strictement rythmique. Elle se situe généralement entre 1 et 6 impulsions/seconde. Les stimuli qui excitent les mormyrids provoquent une augmentation de la fréquence de décharge. Le maximum enregistré est d'environ 130 impulsions/seconde. Des stimuli appropriés peuvent inhiber les décharges des Mormyridae pendant de longues périodes. Chez Gymnotus carapo et Staetogenes elegans, la fréquence de décharge de base est plus élevée et de rythmicité régulière. Selon la température, les fréquences se situent entre 30 et 87 impulsions/seconde. Lorsque ces poissons sont excités, les fréquences augmentent jusqu'à 200 impulsions/seconde, pendant un court instant. La forme du champ électrique, qui est établi à chaque impulsion autour du poisson, a été examinée. Une théorie a été proposée selon laquelle ces poissons, grâce à leurs impulsions électriques, peuvent localiser des objets si leur conductivité électrique diffère de celle de l'eau. Ces poissons se sont montrés extrêmement sensibles aux influences affectant le champ électrique. Cela a été étudié en appliquant des stimuli électriques artificiels, en étudiant les effets des conducteurs et des non-conducteurs introduits dans le champ, et les réactions envers les champs magnétiques et les charges électrostatiques. Des expériences de réflexes conditionnés avec Gymnarchus niloticus et Gymnotus carapo ont montré que ces poissons peuvent détecter la présence d'un aimant stationnaire et qu'ils peuvent discriminer entre conducteurs et non-conducteurs. La proie de ces poissons ne semble pas être affectée par les décharges. Entre autres, les impulsions électriques ont une signification sociale. Ce mécanisme de localisation peut être considéré comme une adaptation à la vie dans l'eau trouble. Les Gymnotidae et les Mormyridae (considérés comme incluant Gymnarchus) présentent des caractéristiques frappantes d'évolution convergente. Des adaptations locomotrices inhabituelles telles que la nage par l'aide de la nageoire dorsale (Gymnarchus), la nageoire anale (Gymnotidae) et les « os de Gemminger » (Mormyridae) peuvent être considérées comme un moyen qui tend à faire coïncider l'axe de symétrie du poisson et de son champ électrique pendant les mouvements actifs. Une nouvelle théorie pour l'évolution des organes électriques a été suggérée. Un prérequis majeur semble être un récepteur sensible à la stimulation électrique. Il est suggéré que les différenciations sensorielles et nerveuses spéciales du système latéral (« mormyromastes », valvulae cerebelli) sont concernées par la perception et l'intégration des stimuli électriques. Des potentiels d'action musculaires ont été enregistrés dans l'eau à quelque distance de poissons non électriques. L'explication la plus simple pour l'évolution d'organes électriques puissants semblerait partir de tels potentiels d'action musculaires et passer par des organes électriques faibles utilisés pour l'orientation, jusqu'aux organes électriques offensifs et défensifs puissants.},
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    doi = "10.1242/jeb.35.1.156",
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    pages = "156-191",
    volume = "35",
    references = "doi101002cne910110302, doi101017cbo9780511693281002, doi101038167201a0, doi10108000222931108692993, doi101098rspb19380041, doi101113jphysiol1952sp004695, doi101113jphysiol1953sp004849, doi1023071416035, doi1023072485224, doi105962bhltitle53990"
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Fishes of the Western North Atlantic Get access Fishes of the Western North Atlantic, Memoir I, Part 5 by Anderson William W.et al., The Sears Foundation for Marine Research, New Haven, Conn., 1966. 647 pp. $27.50. BioScience, Volume 16, Issue 10, October 1966, Page 752, https://doi.org/10.1093/bioscience/16.10.752-a Published: 01 October 1966

@article{doi101093bioscience1610752a,
    title = "Fishes of the Western North Atlantic",
    year = "1966",
    journal = "BioScience",
    abstract = "Fishes of the Western North Atlantic Get access Fishes of the Western North Atlantic, Memoir I, Part 5 by Anderson William W.et al., The Sears Foundation for Marine Research, New Haven, Conn., 1966. 647 pp. $27.50. BioScience, Volume 16, Issue 10, October 1966, Page 752, https://doi.org/10.1093/bioscience/16.10.752-a Published: 01 October 1966",
    url = "https://doi.org/10.1093/bioscience/16.10.752-a",
    doi = "10.1093/bioscience/16.10.752-a",
    openalex = "W2260363390"
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Résumé Les poissons annuels peuvent maintenir des populations permanentes dans des habitats aquatiques temporaires car la population survit aux saisons sèches sous la forme d'œufs en diapause. Les populations persistent même si elles sont soumises à des cycles environnementaux erratiques et à des catastrophes écologiques récurrentes. L'arrêt du développement se produit à l'un ou à tous les stades suivants : Diapause I (Phase de cellules dispersées) ; Diapause II (Embryon de somites longs) ; Diapause III (Pré-éclosion). Chez Austrofundulus, la Diapause I est facultative. La Diapause II et III sont obligatoires, longues et variables (105 ± 20 jours chacune). Des sous-populations (environ 10 %) d'« œufs d'évasion » contournent la Diapause II et/ou la Diapause III. Les œufs de Pterolebias et de Rachovia se comportent beaucoup comme ceux d'Austrofundulus. Chez Rachovia, la durée de la Diapause II est de 80 ± 33 jours et celle de la Diapause III d'au moins 61 ± 23 jours. Des sous-populations d'« œufs d'évasion » sont présentes. Cynolebias et Nothobranchius peuvent subir un arrêt facultatif à la Diapause I et II et entrer dans un arrêt obligatoire à la Diapause III. Les espèces annuelles d'Aphyosemion peuvent subir un arrêt facultatif à la Diapause I et II, et un arrêt obligatoire à la Diapause III. Quelques espèces peuvent également subir un arrêt obligatoire à la Diapause II. Un phénomène d'arrêt à court terme, « éclosion retardée », est parfois rencontré chez les Aphyosemions non annuels et autres cyprinodontes non annuels. La stratégie de survie repose sur l'« effet multiplicateur » ; c'est-à-dire que l'insertion dans la voie de développement de trois points de bifurcation contenant des stades de diapause de durée prolongée et variable génère huit distributions différentes du temps de développement total. Ainsi, une seule population d'œufs d'âge identique peut générer plusieurs sous-populations, toutes se développant selon des calendriers différents. Un programme de développement est établi qui permet la perte répétée d'œufs individuels dans des conditions qui peuvent initier l'éclosion mais ne permettent pas la maturation et la reproduction réussie. L'« effet multiplicateur » augmenté par d'autres adaptations garantit qu'une partie de la population d'œufs survivra pour se reproduire.

@article{doi101002jez1401820310,
    author = "Wourms, John P.",
    title = "The developmental biology of annual fishes. III. Pre‐embryonic and embryonic diapause of variable duration in the eggs of annual fishes",
    year = "1972",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Résumé Les poissons annuels peuvent maintenir des populations permanentes dans des habitats aquatiques temporaires car la population survit aux saisons sèches sous la forme d'œufs en diapause. Les populations persistent même si elles sont soumises à des cycles environnementaux erratiques et à des catastrophes écologiques récurrentes. L'arrêt du développement se produit à l'un ou à tous les stades suivants : Diapause I (Phase de cellules dispersées) ; Diapause II (Embryon de somites longs) ; Diapause III (Pré-éclosion). Chez Austrofundulus, la Diapause I est facultative. La Diapause II et III sont obligatoires, longues et variables (105 ± 20 jours chacune). Des sous-populations (environ 10\%) d'« œufs d'évasion » contournent la Diapause II et/ou la Diapause III. Les œufs de Pterolebias et de Rachovia se comportent beaucoup comme ceux d'Austrofundulus. Chez Rachovia, la durée de la Diapause II est de 80 ± 33 jours et celle de la Diapause III d'au moins 61 ± 23 jours. Des sous-populations d'« œufs d'évasion » sont présentes. Cynolebias et Nothobranchius peuvent subir un arrêt facultatif à la Diapause I et II et entrer dans un arrêt obligatoire à la Diapause III. Les espèces annuelles d'Aphyosemion peuvent subir un arrêt facultatif à la Diapause I et II, et un arrêt obligatoire à la Diapause III. Quelques espèces peuvent également subir un arrêt obligatoire à la Diapause II. Un phénomène d'arrêt à court terme, « éclosion retardée », est parfois rencontré chez les Aphyosemions non annuels et autres cyprinodontes non annuels. La stratégie de survie repose sur l'« effet multiplicateur » ; c'est-à-dire que l'insertion dans la voie de développement de trois points de bifurcation contenant des stades de diapause de durée prolongée et variable génère huit distributions différentes du temps de développement total. Ainsi, une seule population d'œufs d'âge identique peut générer plusieurs sous-populations, toutes se développant selon des calendriers différents. Un programme de développement est établi qui permet la perte répétée d'œufs individuels dans des conditions qui peuvent initier l'éclosion mais ne permettent pas la maturation et la reproduction réussie. L'« effet multiplicateur » augmenté par d'autres adaptations garantit qu'une partie de la population d'œufs survivra pour se reproduire.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.1401820310",
    doi = "10.1002/jez.1401820310",
    openalex = "W2107973522",
    references = "doi105694j132653771943tb44800x"
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L'émergence d'un modélisation efficace des écosystèmes est gravement entravée par la nécessité d'une classification écologique des poissons. Une notion antérieure de groupes écologiques est ici étendue pour couvrir tous les poissons vivants. Cette classification écologique repose principalement sur la forme et la fonction dans les intervalles de développement précoces, sur les sites de fraie préférés et sur les caractéristiques du comportement reproducteur. Au sein des adaptations pour la reproduction et le développement embryonnaire, deux facteurs prédominent — les prédateurs et le régime d'oxygène ; par conséquent, le comportement de fraie et les sites de fraie déterminent les conditions respiratoires ultérieures et la protection disponible contre les prédateurs. Les facteurs restants sont plus ou moins associés à ces deux-là. Du point de vue de l'exploitation des ressources, les facteurs autres que les habitudes alimentaires régissant la densité, la biomasse et la production sont plus importants. En ce sens, les guildes reproductives sont plus significatives que les stratégies alimentaires, à laquelle une utilisation du terme « gilde » était limitée. Trente-deux guildes supposément englobent tous les 30 000 taxons de poissons vivants (ou environ 20 000 espèces) et forment une classification écologique non liée à la classification linnéenne. Les guildes conservent une signification phylogénétique en ce qui concerne les systèmes reproducteurs et constituent une base pour la construction de modèles sur la succession naturelle et culturelle. Le nombre de guildes et la fréquence des taxons au sein des guildes dans une zone donnée reflètent les séquences géochronologiques et les capacités d'invasion des membres de différentes guildes.

@article{doi101139f75110,
    author = "Balon, Eugene K.",
    title = "Reproductive Guilds of Fishes: A Proposal and Definition",
    year = "1975",
    journal = "Journal of the Fisheries Research Board of Canada",
    abstract = {L'émergence d'un modélisation efficace des écosystèmes est gravement entravée par la nécessité d'une classification écologique des poissons. Une notion antérieure de groupes écologiques est ici étendue pour couvrir tous les poissons vivants. Cette classification écologique repose principalement sur la forme et la fonction dans les intervalles de développement précoces, sur les sites de fraie préférés et sur les caractéristiques du comportement reproducteur. Au sein des adaptations pour la reproduction et le développement embryonnaire, deux facteurs prédominent — les prédateurs et le régime d'oxygène ; par conséquent, le comportement de fraie et les sites de fraie déterminent les conditions respiratoires ultérieures et la protection disponible contre les prédateurs. Les facteurs restants sont plus ou moins associés à ces deux-là. Du point de vue de l'exploitation des ressources, les facteurs autres que les habitudes alimentaires régissant la densité, la biomasse et la production sont plus importants. En ce sens, les guildes reproductives sont plus significatives que les stratégies alimentaires, à laquelle une utilisation du terme « gilde » était limitée. Trente-deux guildes supposément englobent tous les 30 000 taxons de poissons vivants (ou environ 20 000 espèces) et forment une classification écologique non liée à la classification linnéenne. Les guildes conservent une signification phylogénétique en ce qui concerne les systèmes reproducteurs et constituent une base pour la construction de modèles sur la succession naturelle et culturelle. Le nombre de guildes et la fréquence des taxons au sein des guildes dans une zone donnée reflètent les séquences géochronologiques et les capacités d'invasion des membres de différentes guildes.},
    url = "https://doi.org/10.1139/f75-110",
    doi = "10.1139/f75-110",
    openalex = "W2149718280"
}

Les modèles de reproduction et de développement des chondrichthyens sont divers. Les espèces sont soit activement reproductrices tout au long de l'année, soit ont un cycle annuel mal défini avec un ou deux pics d'activité, soit ont un cycle annuel ou biennal bien défini. Basé sur l'origine embryologique et la morphologie adulte, leur système reproducteur est plus similaire à celui des tétrapodes qu'à celui des téléostéens. Les cellules germinales primordiales sont d'origine endodermique. Les conduits de Wolff chez les mâles et les conduits de Müller chez les femelles deviennent les conduits urogénitaux fonctionnels. La différenciation est sous contrôle hormonal. Les caractéristiques inhabituelles du système reproducteur incluent un organe épigonal chez les mâles et les femelles. Il contient du tissu lymphoïde et hématopoïétique. La glande de Leydig, une région modifiée du rein, produit le liquide séminal. Chez certaines espèces, les spermatozoïdes passant par le vas deferens sont enfermés dans des spermatophores. En tournant autour de leur axe longitudinal, les spermatozoïdes hélicoïdaux peuvent avancer ou inverser leur direction. La spermatogenèse se produit souvent dans des unités bicellulaires, les spermatocystes. Ceux-ci consistent en un spermatogonium enfermé dans une cellule de Sertoli. La fécondation est interne. Les épines, portions modifiées des nageoires pelviennes, agissent comme organes intrometteurs. Chez de nombreux requins et raies vivipares, le système reproducteur femelle est asymétrique. Les œufs de certains requins sont les plus grandes cellules connues. Les platelets de vitellus contiennent de la lipovitelline. Les ovocytes ont des chromosomes en pinceau. Les œufs libérés de l'ovaire dans la cavité corporelle sont transportés par action ciliaire vers l'ostium de l'oviducte. Là, ils sont fécondés. La polyspermie physiologique est normale. La glande de la coquille, une région spécialisée de l'oviducte antérieur, fonctionne à la fois dans le stockage à long terme des spermatozoïdes et dans la production de la coquille d'œuf. Les coquilles d'œufs des requins et des raies consistent en une protéine collagène unique avec une période de 400 Å, organisée comme un cristal liquide cholestérique. Les coquilles d'œufs des chimères contiennent des pseudotubules de 550 Å dans des réseaux orthogonaux. Chez les petits requins, les mâles copulent en s'enroulant autour de la femelle. Une position parallèle est adoptée par les grands requins. Les raies et les raies copulent avec les surfaces ventrales appliquées ou par une approche dorsale. La morsure est un mécanisme de libération pré-copulatoire. Les soins parentaux, à l'exception de l'oviposition sélective, sont absents. Les œufs fortement vitellinés subissent une segmentation méroblastique, discoidale. Le développement est long, le plus court (2–4 mois) chez les raies, plus long chez les raies (3–8 mois) et le plus long (9–22 mois) chez les requins et les chimères. La plupart des requins et toutes les raies sont vivipares. Les chimères, les raies et certains requins sont ovipares. La viviparité implique soit un placenta vitellin, soit est aplacentaire. Si aplacentaire, l'embryon dérive des nutriments soit des réserves de vitellus, soit par cannibalisme embryonnaire intra-utérin, soit à partir d'analogues placentaires qui sécrètent du « lait utérin ». La position phylogénétique, la distribution géographique, l'habitat benthique vs pélagique, la taille adulte, la taille œuf-embryon, l'écologie alimentaire et l'osmorégulation embryonnaire sont des facteurs dans le maintien de l'oviparité ou l'évolution de la viviparité.

@article{doi101093icb172379,
    author = "Wourms, John P.",
    title = "Reproduction and Development in Chondrichthyan Fishes",
    year = "1977",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = "Les modes de reproduction et de développement des chondrichthyens sont divers. Les espèces sont soit reproductivement actives tout au long de l'année, soit ont un cycle annuel mal défini avec un ou deux pics d'activité, soit ont un cycle annuel ou biennal bien défini. Basé sur l'origine embryologique et la morphologie adulte, leur système reproducteur est plus similaire à celui des tétrapodes qu'à celui des téléostéens. Les cellules germinales primordiales sont d'origine endodermique. Les conduits de Wolff chez les mâles et les conduits de Müller chez les femelles deviennent les conduits urogénitaux fonctionnels. La différenciation est sous contrôle hormonal. Les caractéristiques inhabituelles du système reproducteur incluent un organe épigonal chez les mâles et les femelles. Il contient du tissu lymphoïde et hématopoïétique. La glande de Leydig, une région modifiée du rein, produit le liquide séminal. Chez certaines espèces, les spermatozoïdes passant par le vas deferens sont enfermés dans des spermatophores. En tournant autour de leur axe longitudinal, les spermatozoïdes hélicoïdaux peuvent avancer ou inverser leur direction. La spermatogenèse se produit souvent dans des unités bicellulaires, les spermatocystes. Ceux-ci consistent en un spermatogonium enfermé dans une cellule de Sertoli. La fécondation est interne. Les épines, portions modifiées des nageoires pelviennes, agissent comme organes intrometteurs. Chez de nombreux requins et raies vivipares, le système reproducteur femelle est asymétrique. Les œufs de certains requins sont les plus grandes cellules connues. Les platelets de vitellus contiennent de la lipovitelline. Les ovocytes ont des chromosomes en brosse. Les œufs libérés de l'ovaire dans la cavité corporelle sont transportés par action ciliaire vers l'ostium de l'oviducte. Là, ils sont fécondés. La polyspermie physiologique est normale. La glande de la coquille, une région spécialisée de l'oviducte antérieur, fonctionne à la fois dans le stockage à long terme des spermatozoïdes et dans la production de la coquille de l'œuf. Les coquilles d'œufs de requins et de raies consistent en une protéine collagène unique avec une période de 400 Å, organisée comme un cristal liquide cholestérique. Les coquilles d'œufs de chimères contiennent des pseudotubules de 550 Å dans des réseaux orthogonaux. Chez les petits requins, les mâles copulent en s'enroulant autour de la femelle. Une position parallèle est adoptée par les grands requins. Les raies et les raies copulent avec les surfaces ventrales appliquées ou par une approche dorsale. La morsure est un mécanisme de libération pré-copulatoire. Les soins parentaux, à l'exception de l'oviposition sélective, sont absents. Les œufs riches en vitellus subissent une segmentation méroblastique, discoidale. Le développement est long, le plus court (2–4 mois) chez les raies, plus long chez les raies (3–8 mois) et le plus long (9–22 mois) chez les requins et les chimères. La plupart des requins et toutes les raies sont vivipares. Les chimères, les raies et certains requins sont ovipares. La viviparité implique soit un placenta de sac vitellin, soit est aplacentaire. Si aplacentaire, l'embryon dérive des nutriments soit des réserves de vitellus, soit par cannibalisme embryonnaire intra-utérin, soit à partir d'analogues placentaires qui sécrètent du « lait utérin ». La position phylogénétique, la distribution géographique, l'habitat benthique vs. pélagique, la taille adulte, la taille œuf-embryon, l'écologie alimentaire et l'osmorégulation embryonnaire sont des facteurs dans le maintien de l'oviparité ou l'évolution de la viviparité.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/17.2.379",
    doi = "10.1093/icb/17.2.379",
    openalex = "W2113575423",
    references = "doi101016b9780122825019500065, doi101086282063, doi101093bioscience1610752a, doi101093icb172365, doi1010970000505319311100000026, doi101111j1469185x1936tb00497x, doi1023073221988, doi105694j132653771943tb44800x, openalexw3026020306, openalexw612600151"
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Des coupes sérieuses allant d'embryons très jeunes à des juvéniles éclos et d'embryons entiers de Scyliorhinus montrent que la dentition et le squelette dermique appartiennent à deux champs de développement secondaire indépendants qui diffèrent à la fois développementalement et structurellement. Le développement de la dentition commence très tôt, avec un épaississement de l'ectoderme dans la région de la bouche (étape 04), l'invagination de la lame dentaire (étape 18) et la formation des germes de la première génération (étape 20). Les mouvements de remplacement des dents ne commencent qu'à la fin de l'embryogenèse (étape 35). Les germes d'écaillés, en revanche, commencent d'abord à se former à l'étape 24. Les écaillés émergent peu avant que l'animal n'éclore (étape 43). Une seule génération d'écaillés est formée pendant l'embryogenèse. Les forces qui font émerger les écaillés peuvent provenir de pressions fluides dans les vacuoles de la couche fibreuse du derme. Ceux qui font émerger les dents résultent probablement également de pressions fluides similaires. La couronne et la partie supérieure de la base des écaillés et des dents sont formées par des cellules de l'épithélium dentaire interne qui se différencient à partir de l'ectoderme. Elles sont également formées par des odontoblastes qui sont dérivés de la couche vasculaire du derme. Cependant, les plaques basales des écaillés et des dents contenant les fibres d'ancrage sont formées par des ostéoblastes, qui sont dérivés de la couche fibreuse du derme.

@article{doi101002jmor1051660303,
    author = "Reif, Wolf‐Ernst",
    title = "Développement de la dentition et du squelette dermique chez l'embryon de Scyliorhinus canicula",
    year = "1980",
    journal = "Journal of Morphology",
    abstract = "Des coupes sérieuses allant d'embryons très jeunes à des juvéniles éclos et d'embryons entiers de Scyliorhinus montrent que la dentition et le squelette dermique appartiennent à deux champs de développement secondaire indépendants qui diffèrent à la fois développementalement et structurellement. Le développement de la dentition commence très tôt, avec un épaississement de l'ectoderme dans la région de la bouche (étape 04), l'invagination de la lame dentaire (étape 18) et la formation des germes de la première génération (étape 20). Les mouvements de remplacement des dents ne commencent qu'à la fin de l'embryogenèse (étape 35). Les germes d'écaillés, en revanche, commencent d'abord à se former à l'étape 24. Les écaillés émergent peu avant que l'animal n'éclore (étape 43). Une seule génération d'écaillés est formée pendant l'embryogenèse. Les forces qui font émerger les écaillés peuvent provenir de pressions fluides dans les vacuoles de la couche fibreuse du derme. Ceux qui font émerger les dents résultent probablement également de pressions fluides similaires. La couronne et la partie supérieure de la base des écaillés et des dents sont formées par des cellules de l'épithélium dentaire interne qui se différencient à partir de l'ectoderme. Elles sont également formées par des odontoblastes qui sont dérivés de la couche vasculaire du derme. Cependant, les plaques basales des écaillés et des dents contenant les fibres d'ancrage sont formées par des ostéoblastes, qui sont dérivés de la couche fibreuse du derme.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jmor.1051660303",
    doi = "10.1002/jmor.1051660303",
    openalex = "W2059396035",
    references = "balfour1878a, doi101002jmor1051330103, doi101007bf00995429, doi101007bf02568678, doi101007bf03006733, doi101111j146363951940tb00339x, doi101126science948762, doi1016690883135120010160418br20co2, doi105962bhltitle7847, openalexw115975037, openalexw2042807370"
}

Dans cet article, les stimuli et le motif de la prolifération des cellules de Schwann sont définis dans diverses conditions expérimentales. Nous avons utilisé un système de culture tissulaire dans lequel les ganglions de la racine dorsale de rat fœtaux, traités pour éliminer les fibroblastes contaminants (Wood, P., 1976, Brain Res. 115:361--375), semblent reproduire de nombreux aspects du système nerveux périphérique en développement. Nous avons observé que : (a) la prolifération des cellules de Schwann sur les neurites est initialement rapide, mais, à mesure que chaque neurite devient entièrement ensheathé, la division ralentit considérablement et se confine à la périphérie de la croissance ; (b) durant la période de prolifération rapide, l'excision du ganglion provoque un déclin rapide du nombre de cellules en division ; (c) l'excision du ganglion de cultures plus établies dans lesquelles il y avait peu de prolifération en cours a entraîné une légère augmentation de l'étiquetage au site d'excision pour toutes les cellules de Schwann et une augmentation substantielle de l'étiquetage pour les cellules liées à la myéline avec une période d'étiquetage maximal à 4 jours ; (d) la lésion mécanique directe durant la dégénérescence de Wallerian est mitogène pour les cellules de Schwann ; (e) une variété de mitogènes potentiels n'a pas réussi à stimuler la prolifération des cellules de Schwann, et (f) les cellules replantées ont un niveau légèrement plus élevé de prolifération et montrent une réponse petite et variable à l'ajout de cAMP.

@article{doi101083jcb843739,
    author = "Salzer, James L. et Bunge, R P",
    title = "Études sur la prolifération des cellules de Schwann. I. Une analyse en culture tissulaire de la prolifération durant le développement, la dégénérescence de Wallerian et la lésion directe.",
    year = "1980",
    journal = "The Journal of Cell Biology",
    abstract = "Dans cet article, les stimuli et le motif de la prolifération des cellules de Schwann sont définis dans diverses conditions expérimentales. Nous avons utilisé un système de culture tissulaire dans lequel les ganglions de la racine dorsale de rat fœtaux, traités pour éliminer les fibroblastes contaminants (Wood, P., 1976, Brain Res. 115:361--375), semblent reproduire de nombreux aspects du système nerveux périphérique en développement. Nous avons observé que : (a) la prolifération des cellules de Schwann sur les neurites est initialement rapide, mais, à mesure que chaque neurite devient entièrement ensheathé, la division ralentit considérablement et se confine à la périphérie de la croissance ; (b) durant la période de prolifération rapide, l'excision du ganglion provoque un déclin rapide du nombre de cellules en division ; (c) l'excision du ganglion de cultures plus établies dans lesquelles il y avait peu de prolifération en cours a entraîné une légère augmentation de l'étiquetage au site d'excision pour toutes les cellules de Schwann et une augmentation substantielle de l'étiquetage pour les cellules liées à la myéline avec une période d'étiquetage maximal à 4 jours ; (d) la lésion mécanique directe durant la dégénérescence de Wallerian est mitogène pour les cellules de Schwann ; (e) une variété de mitogènes potentiels n'a pas réussi à stimuler la prolifération des cellules de Schwann, et (f) les cellules replantées ont un niveau légèrement plus élevé de prolifération et montrent une réponse petite et variable à l'ajout de cAMP.",
    url = "https://doi.org/10.1083/jcb.84.3.739",
    doi = "10.1083/jcb.84.3.739",
    openalex = "W2047909489",
    references = "doi101002cne900370107"
}

ainsi qu'une distension osmotique des enveloppes d'œufs. Le fluide périvitellin et ses enveloppes multilamellaires contenant avec leurs motifs spécialisés variés et leurs élaborations filamentaires fournissent un certain nombre de fonctions protectrices, nutritives, flottantes, préventives de la polyspermie et régulatrices. Les œufs et embryons de poissons, en surveillant l'environnement immédiat, peuvent dans certains cas modifier la composition colloïdale du fluide périvitellin et l'organisation sous-structurale des enveloppes d'œufs, fournissant ainsi un mécanisme adaptatif pour la survie dans un environnement pollué. La revue inclut une discussion des problèmes entourant l'origine, la structure et la nomenclature des membranes, des suggestions pour des recherches supplémentaires et une bibliographie étendue.

@article{doi1023071443999,
    author = "Laale, Hans W.",
    title = "The Perivitelline Space and Egg Envelopes of Bony Fishes: A Review",
    year = "1980",
    journal = "Copeia",
    abstract = "well as an osmotic distension of the egg envelopes. The perivitelline fluid and its containing multilamellar envelopes with their varied specialized patterns and filamentous elaborations provide a number of protective, nutritive, flotative, polyspermy preventive and regulative functions. Fish eggs and embryos, by monitoring the immediate environment, possibly may modify the colloidal composition of the perivitelline fluid and the substructural organization of the egg envelopes in some instances, thus providing an adaptive mechanism for survival in a polluted environment. The review includes a discussion of the problematic issues surrounding membrane origin, structure and nomenclature, suggestions for further research and an extensive bibliography.",
    url = "https://doi.org/10.2307/1443999",
    doi = "10.2307/1443999",
    openalex = "W2312771443",
    references = "doi101002ar1090680102, doi101002jez1401820202, doi101002jez1401840103, doi101016s1546509808600850, doi101016s1546509808601144, doi101242dev63373, doi1023071539545, openalexw285943563, openalexw612600151, openalexw654064239"
}

SYNTHÈSE. La viviparité chez les vertébrés apparaît d'abord sur le plan évolutif chez les poissons. Elle a évolué indépendamment dans plusieurs lignées piscines divergentes. Les 54 familles de poissons actuels qui élèvent des jeunes vivants comprennent 40 familles de chondrichthyens (requins et raies), une famille monotypique de coélacanthes (Latimeria), et 13 familles d'ostéoglossiformes. Il existe des preuves fossiles de la viviparité chez les holocephalans et les chondrosteens. La viviparité prédomine chez les requins et les raies (40 familles, 99 genres, 420 espèces), mais est moins répandue chez les téléostéens (13 familles, 122 genres, 510 espèces). Après une introduction historique, l'organisation du système reproducteur femelle, les sites de gestation, les séquences de développement et la superfétation sont examinées. L'évolution de la viviparité établit des relations materno-fœtales spécialisées, à savoir : 1) développementales, 2) morphologiques, 3) trophiques, 4) osmorégulatrices, 5) respiratoires, 6) endocrinologiques, et 7) immunologiques. Bien que les quatre dernières catégories soient brièvement mentionnées, l'accent principal est mis sur la relation trophique et ses bases morphologiques et développementales. D'abord, une vue d'ensemble générale est présentée, puis les relations trophiques materno-fœtales dans chacun des principaux groupes de poissons sont systématiquement examinées. Les études anatomiques, histologiques, ultrastructurales, développementales, physiologiques et biochimiques pertinentes sont considérées. Les poissons vivipares sont soit lécitotrophes, c'est-à-dire exclusivement dépendants du jaune d'œuf, soit matrotrophes, c'est-à-dire en recevant un apport continu de nutriments maternels pendant la gestation. Le transfert de nutriments est accompli par 1) l'oophagie et l'adelphophagie, 2) les analogues placentaires, et 3) le placenta du sac vitellin. Les analogues placentaires comprennent : les surfaces absorbantes épithéliales externes, par exemple la peau, les nageoires, les branchies ; les trophonemata, modifications de l'épithélium utérin pour la sécrétion d'histotrophe ou de « lait utérin » ; les placentas branchiaux, apposition rapprochée entre l'épithélium branchial et soit l'épithélium utérin soit les villosités épithéliales ovaires ; le sac vitellin ; le péricarde amnion et chorio ; le pseudoplacenta folliculaire, apposition rapprochée entre les cellules folliculaires et l'épithélium absorbant embryonnaire ; l'intestin hypertrophié ; et les trophotaeniae, projections externes en forme de rosace ou de ruban de l'intestin embryonnaire. Chez les chondrichthyens, le placenta du sac vitellin (840–1 050 %), la sécrétion trophonematale et l'absorption embryonnaire d'histotrophe (1 680–4 900 %) et l'oophagie et l'adelphophagie (1,2 × 10⁶ %) sont les méthodes de transfert de nutriments les plus efficaces. Chez les téléostéens, le pseudoplacenta folliculaire (1 800–3 900 %), les trophotaeniae (8 400 %) et l'absorption d'histotrophe ovarienne à travers l'épithélium de surface et un intestin hypertrophié (1 100–34 000 %) sont les plus efficaces. Ces valeurs contrastent avec la perte de 30–40 % du poids sec caractéristique des poissons ovipares et des vivipares lécitotrophes.

@article{doi101093icb212473,
    author = "Wourms, John P.",
    title = "Viviparité : La relation mère-fœtus chez les poissons",
    year = "1981",
    journal = "American Zoologist",
    abstract = "SYNOPSIS. La viviparité dans la lignée des vertébrés apparaît d'abord sur le plan évolutif chez les poissons. Elle a évolué indépendamment dans plusieurs lignées piscines divergentes. Les 54 familles de poissons actuels qui donnent naissance à des jeunes vivants comprennent 40 familles de chondrichthyens (requins et raies), une famille monotypique de coelacanthes (Latimeria), et 13 familles d'actinoptérygiens. Il existe des preuves fossiles de la viviparité chez les holocephalans et les chondrosteens. La viviparité prédomine chez les requins et les raies (40 familles, 99 genres, 420 espèces) mais est moins répandue chez les actinoptérygiens (13 familles, 122 genres, 510 espèces). Après une introduction historique, l'organisation du système reproducteur femelle, les sites de gestation, les séquences de développement et la superfétation sont examinées. L'évolution de la viviparité établit des relations materno-fœtales spécialisées, à savoir : 1) développementales, 2) morphologiques, 3) trophiques, 4) osmorégulatrices, 5) respiratoires, 6) endocrinologiques, et 7) immunologiques. Bien que les quatre dernières catégories soient brièvement mentionnées, l'accent principal est mis sur la relation trophique et ses bases morphologiques et développementales. D'abord, un aperçu général est présenté, puis les relations materno-fœtales trophiques dans chacun des principaux groupes de poissons sont systématiquement examinées. Les études anatomiques, histologiques, ultrastructurales, développementales, physiologiques et biochimiques pertinentes sont examinées. Les poissons vivipares sont soit lécitotrophes, c'est-à-dire exclusivement dépendants du jaune d'œuf, soit matrotrophes, c'est-à-dire en recevant un apport continu de nutriments maternels pendant la gestation. Le transfert de nutriments est accompli par 1) l'oophagie et l'adelphophagie, 2) les analogues placentaires, et 3) le placenta du sac vitellin. Les analogues placentaires comprennent : les surfaces absorbantes épithéliales externes, par exemple la peau, les nageoires, les branchies ; les trophonemata, modifications de l'épithélium utérin pour la sécrétion d'histotrophe ou de « lait utérin » ; les placentas branchiaux, apposition rapprochée entre l'épithélium branchial et soit l'épithélium utérin soit les villosités épithéliales ovaires ; le sac vitellin ; le péricarde amnion et chorio ; le pseudoplacenta folliculaire, apposition rapprochée entre les cellules folliculaires et l'épithélium absorbant embryonnaire ; l'intestin hypertrophié ; et les trophotaeniae, projections externes en forme de rosace ou de ruban de l'intestin embryonnaire. Chez les chondrichthyens, le placenta du sac vitellin (840–1 050 %), la sécrétion trophonematale et l'absorption embryonnaire d'histotrophe (1 680–4 900 %) et l'oophagie et l'adelphophagie (1,2 × 10⁶ %) sont les méthodes les plus efficaces de transfert de nutriments. Chez les actinoptérygiens, le pseudoplacenta folliculaire (1 800–3 900 %), les trophotaeniae (8 400 %) et l'absorption d'histotrophe ovarienne à travers l'épithélium de surface et un intestin hypertrophié (1 100–34 000 %) sont les plus efficaces. Ces valeurs contrastent avec la perte de 30–40 % du poids sec caractéristique des poissons ovipares et des vivipares lécitotrophes.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icb/21.2.473",
    doi = "10.1093/icb/21.2.473",
    openalex = "W2062820559",
    references = "doi101093icb172303, doi101098rspb19800052, doi101126science19042191105, doi105694j132653771943tb44800x, openalexw2954279587, openalexw563680134"
}

Les requins, les raies et les raies électriques reçoivent des informations électriques sur la position de leurs proies, le courant des courants océaniques et leurs orientations magnétiques. En mer, des requins de mer et des requins bleus ont été observés à exécuter des réponses apparentes d'alimentation à des champs électriques dipolaires conçus pour imiter des proies. Dans des expériences d'entraînement, les raies électriques ont montré la capacité de s'orienter par rapport à des champs électriques uniformes similaires à ceux produits par les courants océaniques. Des gradients de tension de seulement 5 nanovolts par centimètre suffiraient à déclencher l'un ou l'autre comportement.

@article{doi101126science7134985,
    author = "Kalmijn, Ad. J.",
    title = "Electric and Magnetic Field Detection in Elasmobranch Fishes",
    year = "1982",
    journal = "Science",
    abstract = "Sharks, skates, and rays receive electrical information about the positions of their prey, the drift of ocean currents, and their magnetic compass headings. At sea, dogfish and blue sharks were observed to execute apparent feeding responses to dipole electric fields designed to mimic prey. In training experiments, stingrays showed the ability to orient relative to uniform electric fields similar to those produced by ocean currents. Voltage gradients of only 5 nanovolts per centimeter would elicit either behavior.",
    url = "https://doi.org/10.1126/science.7134985",
    doi = "10.1126/science.7134985",
    openalex = "W1967128502",
    references = "doi101242jeb552371"
}

Des coupes sérieuses de 105 embryons humains (incluant 20 préparations argentiques) de l'étape 11 (24 jours) à l'étape 22 (54 jours) ont été étudiées, et 23 reconstructions graphiques ont été préparées. Le noyau hypoglosse est évident à l'étape 12 et devient isolé des autres noyaux efférents à l'étape 14. Les premières fibres du nerf hypoglosse apparaissent à l'étape 12. Les racines s'unissent à l'étape 14 et le tronc principal arrive dans la langue à l'étape 15. Quatre somites occipitaux peuvent être identifiés durant l'étape 13, et le matériel sclérotomique forme deux masses bilatérales. Le quatrième sclérotome se sépare à l'étape 14 et se développe comme une vertèbre. Celui-ci et le matériel sclérotomique restant forment les parties basioccipitale et exoccipitale du chondrocrâne, qui sont les premières à apparaître. Quatre myotomes occipitaux se développent et grandissent vers la langue sous la forme du « cordon hypoglosse », qui arrive avant le nerf hypoglosse. La similitude de développement dans la région hypoglosse entre les oiseaux et les mammifères, combinée à des études expérimentales chez les oiseaux, rend extrêmement probable que la musculature hypoglosse chez les mammifères provienne également des somites occipitaux. La présente étude est la première dans laquelle cette conclusion est adéquatement soutenue chez l'humain. Cette investigation aide à l'interprétation et au chronométrage de l'origine des variations (par exemple, canal hypoglosse bipartite) et des anomalies (par exemple, artère hypoglosse persistante).

@article{doi101002aja1001690302,
    author = "O’Rahilly, Ronan et Müller, Fabiola",
    title = "Le développement précoce du nerf hypoglosse et des somites occipitaux dans des embryons humains étalonnés",
    year = "1984",
    journal = "American Journal of Anatomy",
    abstract = {Des coupes sérieuses de 105 embryons humains (incluant 20 préparations argentiques) de l'étape 11 (24 jours) à l'étape 22 (54 jours) ont été étudiées, et 23 reconstructions graphiques ont été préparées. Le noyau hypoglosse est évident à l'étape 12 et devient isolé des autres noyaux efférents à l'étape 14. Les premières fibres du nerf hypoglosse apparaissent à l'étape 12. Les racines s'unissent à l'étape 14 et le tronc principal arrive dans la langue à l'étape 15. Quatre somites occipitaux peuvent être identifiés durant l'étape 13, et le matériel sclérotomique forme deux masses bilatérales. Le quatrième sclérotome se sépare à l'étape 14 et se développe comme une vertèbre. Celui-ci et le matériel sclérotomique restant forment les parties basioccipitale et exoccipitale du chondrocrâne, qui sont les premières à apparaître. Quatre myotomes occipitaux se développent et grandissent vers la langue sous la forme du « cordon hypoglosse », qui arrive avant le nerf hypoglosse. La similitude de développement dans la région hypoglosse entre les oiseaux et les mammifères, combinée à des études expérimentales chez les oiseaux, rend extrêmement probable que la musculature hypoglosse chez les mammifères provienne également des somites occipitaux. La présente étude est la première dans laquelle cette conclusion est adéquatement soutenue chez l'humain. Cette investigation aide à l'interprétation et au chronométrage de l'origine des variations (par exemple, canal hypoglosse bipartite) et des anomalies (par exemple, artère hypoglosse persistante).},
    url = "https://doi.org/10.1002/aja.1001690302",
    doi = "10.1002/aja.1001690302",
    openalex = "W2107288999",
    references = "doi101002aja1000040106"
}

La qualité des soins parentaux semble corrélée positivement à la taille des œufs, tant entre les espèces de poissons qu'au sein des espèces. Les modèles passés concernant le compromis entre la quantité et la qualité de la descendance ont été insuffisants pour expliquer cette corrélation. En utilisant les caractéristiques des modèles de Smith et Fretwell (1974), Shine (1978) et Taylor et Williams (1984), nous avons construit un modèle pour expliquer la covariation continue entre la qualité des soins parentaux et la taille des œufs. Notre modèle contient trois hypothèses majeures concernant la dépendance de la survie de la descendance à la taille des œufs : la descendance issue d'œufs plus gros se développe plus lentement et met plus de temps à résorber ses sacs vitellins et à devenir juvénile ; la taille de l'œuf détermine la taille initiale des juvéniles ; et les juvéniles plus gros, qui éclosent d'œufs plus gros, ont une mortalité plus faible, connaissent une croissance plus rapide et mettent moins de temps à devenir adultes. Sous ces hypothèses, lorsque les soins parentaux réduisent la mortalité instantanée des œufs, la taille optimale de l'œuf augmente. Cette augmentation est attendue tant entre les populations qu'au sein des populations. Ainsi, la conclusion générale selon laquelle chaque population devrait avoir une seule taille optimale d'œuf (voir, par exemple, Smith et Fretwell 1974 ; Maynard Smith 1978) pourrait être incorrecte.

@article{doi101086284621,
    author = "Sargent, Robert Craig et Taylor, Peter et Gross, Mart R.",
    title = "Parental Care and the Evolution of Egg Size in Fishes",
    year = "1987",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "La qualité des soins parentaux semble corrélée positivement à la taille des œufs, tant entre les espèces de poissons qu'au sein des espèces. Les modèles passés concernant le compromis entre la quantité et la qualité de la descendance ont été insuffisants pour expliquer cette corrélation. En utilisant les caractéristiques des modèles de Smith et Fretwell (1974), Shine (1978) et Taylor et Williams (1984), nous avons construit un modèle pour expliquer la covariation continue entre la qualité des soins parentaux et la taille des œufs. Notre modèle contient trois hypothèses majeures concernant la dépendance de la survie de la descendance à la taille des œufs : la descendance issue d'œufs plus gros se développe plus lentement et met plus de temps à résorber ses sacs vitellins et à devenir juvénile ; la taille de l'œuf détermine la taille initiale des juvéniles ; et les juvéniles plus gros, qui éclosent d'œufs plus gros, ont une mortalité plus faible, connaissent une croissance plus rapide et mettent moins de temps à devenir adultes. Sous ces hypothèses, lorsque les soins parentaux réduisent la mortalité instantanée des œufs, la taille optimale de l'œuf augmente. Cette augmentation est attendue tant entre les populations qu'au sein des populations. Ainsi, la conclusion générale selon laquelle chaque population devrait avoir une seule taille optimale d'œuf (voir, par exemple, Smith et Fretwell 1974 ; Maynard Smith 1978) pourrait être incorrecte.",
    url = "https://doi.org/10.1086/284621",
    doi = "10.1086/284621",
    openalex = "W1999772799",
    references = "doi1010160022519372900070, doi101016s1546509808600345, doi101017cbo9781139167826, doi101086282929, doi101086283037, doi101086284325, doi101093icb172379, doi101093icb253807, doi101093icesjms282211, doi1023071937508"
}

Cette revue aborde les sept aspects suivants des tissus skeletogéniques et odontogéniques des vertébrés. 1. La séquence évolutive dans laquelle ces tissus sont apparus parmi les taxons inférieurs à crâne. 2. L'association topographique entre les tissus squelettiques (cartilage, os) et dentaires (dentine, cément, émail) chez les plus anciens vertébrés de chaque grand taxon. 3. L'origine développementale séparée de l'exosquelette et de l'endosquelette. 4. L'origine de la crête neurale des tissus skeletogéniques et odontogéniques crâniens chez les vertébrés actuels. 5. L'origine de la crête neurale des tissus skeletogéniques et odontogéniques dermiques du tronc chez les vertébrés actuels. 6. Les processus développementaux qui contrôlent la différenciation des tissus skeletogéniques et odontogéniques chez les vertébrés actuels. 7. Le maintien des interactions développementales régulant la différenciation skeletogénique/odontogénique à travers les taxons de vertébrés. Nous déduisons douze postulats, huit concernant les tissus skeletogéniques et odontogéniques des premiers vertébrés et quatre concernant le développement de ces tissus chez les vertébrés actuels, et extrapolons les données développementales jusqu'à l'origine évolutive des tissus skeletogéniques et odontogéniques des vertébrés. Les conclusions que nous tirons de cette analyse sont les suivantes. 8. L'exosquelette dermique des thélodontes, hétéostracés et ostéostracés était composé de dentine, de tissu d'attache (cément ou os) et d'os. 9. Il peut être inféré que le cartilage (non minéralisé) était présent chez les hétéostracés et les ostéostracés, et que le cartilage minéralisé globulaire était présent chez Eriptychius, un vertébré du milieu de l'Ordovicien non attribué à aucun groupe établi, mais supposé être un agnathe ancestral. 10. L'émail et peut-être aussi l'émailoïde étaient présents chez certains agnathes précoces d'affinités incertaines. La majorité des tubercules de dentine étaient nus. 11. L'apparition simultanée de l'os cellulaire et acellulaire chez les hétéostracés et les ostéostracés durant l'Ordovicien ne fournit aucune indication quant à savoir lequel est plus primitif que l'autre. 12. Nous interprétons l'aspidine comme étant développementalement liée aux tissus d'attache odontogéniques, soit plus proche de la dentine ou d'une forme de cément, plutôt que comme étant dérivée de l'os. 13. La dentine est présente dans les fossiles de vertébrés supposés les plus anciens stratigraphiquement (Cambrien), actuellement inclus uniquement comme Problematica, et est cladistiquement primitive, par rapport à l'os. 14. La première capacité skeletogénique exosquelettique des vertébrés s'est exprimée sous forme de denticules de dentine. 15. La dentine, l'os d'attache associé à la dentine, l'os basal auquel les denticules dermiques sont fusionnés et le cartilage de l'exosquelette dermique des agnathes de l'Ordovicien ont tous été dérivés de la crête neurale et non du mésoderme. Par conséquent, les tissus skeletogéniques/odontogéniques des premiers vertébrés étaient d'origine de la crête neurale. (RÉSUMÉ TRONCÉ À 400 MOTS)

@article{doi101111j1469185x1990tb01427x,
    author = "Smith, Moya Meredith and Hall, Brian K.",
    title = "DÉVELOPPEMENT ET ORIGINES ÉVOLUTIONAIRES DES TISSUS SKELETOGÉNIQUES ET ODONTOGÉNIQUES DES VÉRÉBRÉS",
    year = "1990",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Cette revue traite des sept aspects suivants des tissus skeletogéniques et odontogéniques des vertébrés. 1. La séquence évolutive dans laquelle les tissus sont apparus parmi les taxons craniates inférieurs. 2. L'association topographique entre les tissus squelettiques (cartilage, os) et dentaires (dentine, cément, émail) chez les plus anciens vertébrés de chaque grand taxon. 3. L'origine développementale séparée de l'exosquelette et de l'endosquelette. 4. L'origine de la crête neurale des tissus skeletogéniques et odontogéniques crâniens chez les vertébrés actuels. 5. L'origine de la crête neurale des tissus skeletogéniques et odontogéniques dermiques du tronc chez les vertébrés actuels. 6. Les processus développementaux qui contrôlent la différenciation des tissus skeletogéniques et odontogéniques chez les vertébrés actuels. 7. Le maintien des interactions développementales régulant la différenciation skeletogénique/odontogénique à travers les taxons de vertébrés. Nous déduisons douze postulats, huit relatifs aux tissus skeletogéniques et odontogéniques des premiers vertébrés et quatre relatifs au développement de ces tissus chez les vertébrés actuels, et extrapolons les données développementales jusqu'à l'origine évolutive des tissus skeletogéniques et odontogéniques des vertébrés. Les conclusions que nous tirons de cette analyse sont les suivantes. 8. L'exosquelette dermique des thélodontes, hétéostracés et ostéostracés était composé de dentine, de tissu d'attache (cément ou os) et d'os. 9. Il peut être inféré que le cartilage (non minéralisé) était présent chez les hétéostracés et les ostéostracés, et que le cartilage minéralisé globulaire était présent chez Eriptychius, un vertébré du milieu de l'Ordovicien non attribué à aucun groupe établi, mais supposé être un agnathe stém. 10. L'émail et peut-être aussi l'émailoïde étaient présents chez certains agnathes précoces d'affinités incertaines. La majorité des tubercules de dentine étaient nus. 11. L'apparition simultanée de l'os cellulaire et acellulaire chez les hétéostracés et les ostéostracés pendant l'Ordovicien ne fournit aucune indication quant à savoir si l'un est plus primitif que l'autre. 12. Nous interprétons l'aspidine comme étant développementalement liée aux tissus d'attache odontogéniques, soit plus proche de la dentine ou d'une forme de cément, plutôt que comme dérivée de l'os. 13. La dentine est présente dans les fossiles de vertébrés supposés les plus anciens stratigraphiquement (Cambrien), actuellement inclus uniquement comme Problematica, et est cladistiquement primitive, par rapport à l'os. 14. La première capacité skeletogénique exosquelettique des vertébrés s'est exprimée sous forme de denticules de dentine. 15. La dentine, l'os d'attache associé à la dentine, l'os basal auquel les denticules dermiques sont fusionnés et le cartilage de l'exosquelette dermique des agnathes de l'Ordovicien ont tous été dérivés de la crête neurale et non du mésoderme. Par conséquent, les tissus skeletogéniques/odontogéniques des premiers vertébrés étaient d'origine de la crête neurale.(ABSTRACT TRUNCATED AT 400 WORDS)",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-185x.1990.tb01427.x",
    doi = "10.1111/j.1469-185x.1990.tb01427.x",
    openalex = "W2104126911",
    references = "doi10100797814615696887, doi101007bf02058654, doi1010160012160683903184, doi101017cbo9780511897948, doi101017s0016756800082856, doi101017s0080456800035237, doi101038282831a0, doi101038282833a0, doi101038scientificamerican0779122, doi10108002724634198110011886, doi10108002724634198410012014, doi101086413055, doi101093aesa323657, doi101111j109636421986tb00876x, doi101111j146363951940tb00339x, doi101111j146364091979tb00640x, doi101111j146364091980tb00660x, doi101111j1469185x1973tb01005x, doi101111j150239311983tb01993x, doi101111j150239311986tb00741x, doi101126science15737951472, doi101126science2204594268, doi101130gsab3153, doi1023072413259, doi1023072413454, doi1023072992444, doi105962bhltitle5752, doi105962bhltitle82144, halstead1969calcified, halstead1979agnathans, openalexw115975037, openalexw251296685, openalexw2591687711, openalexw2732375649, openalexw587905045"
}

Résumé Un grand échantillon de matériel embryologique du poisson-lance nord-américain Polyodon spathula (Acipenseriformes: Polyodontidae) confirme que le développement précoce chez Polyodon est très similaire à celui rapporté pour le groupe frère de la famille des Polyodontidae, les esturgeons (Acipenseridae). Polyodon illustre de nombreux aspects fondamentaux du développement de la tête des acipenseriformes (et des actinoptérygiens) qui n'ont pas été adéquatement décrits. Dans cet article, nous fournissons un aperçu des caractéristiques externes du développement crânien en utilisant la microscopie électronique à balayage. Les observations sont corrélées avec les schémas de stades précédemment proposés pour les poissons-lances et autres acipenseriformes. Nous mettons l'accent sur les événements qui se produisent après le début de la neurulation (stade 19) jusqu'au début de l'alimentation (stade 46). De nouvelles informations sur la structure et le repliement des segments mandibulaire et hyoïde permettent de comprendre le développement précoce de la région pharyngée. De plus, nous offrons de nouvelles descriptions de la glande d'éclosion, de l'organe olfactif, du barbillon sensoriel et de l'initiation de la croissance de la nageoire. Nous commentons également le mode d'origine de l'hypophyse et réfutons l'idée qu'elle est dérivée des lèvres du neuropore antérieur, comme suggéré dans la littérature ancienne. Ces informations préparent le terrain pour de futures études comparatives et expérimentales sur l'embryologie des actinoptérygiens basaux. © 1992 Wiley‐Liss, Inc.

@article{doi101002jmor1052130106,
    author = "Bemis, William E. and Grande, Lance",
    title = "Early development of the actinopterygian head. I. External development and staging of the paddlefish Polyodon spathula",
    year = "1992",
    journal = "Journal of Morphology",
    abstract = "Résumé Un grand échantillon de matériel embryologique du poisson-lance nord-américain Polyodon spathula (Acipenseriformes: Polyodontidae) confirme que le développement précoce chez Polyodon est très similaire à celui rapporté pour le groupe frère de la famille des Polyodontidae, les esturgeons (Acipenseridae). Polyodon illustre de nombreux aspects fondamentaux du développement de la tête des acipenseriformes (et des actinoptérygiens) qui n'ont pas été adéquatement décrits. Dans cet article, nous fournissons un aperçu des caractéristiques externes du développement crânien en utilisant la microscopie électronique à balayage. Les observations sont corrélées avec les schémas de stades précédemment proposés pour les poissons-lances et autres acipenseriformes. Nous mettons l'accent sur les événements qui se produisent après le début de la neurulation (stade 19) jusqu'au début de l'alimentation (stade 46). De nouvelles informations sur la structure et le repliement des segments mandibulaire et hyoïde permettent de comprendre le développement précoce de la région pharyngée. De plus, nous offrons de nouvelles descriptions de la glande d'éclosion, de l'organe olfactif, du barbillon sensoriel et de l'initiation de la croissance de la nageoire. Nous commentons également le mode d'origine de l'hypophyse et réfutons l'idée qu'elle est dérivée des lèvres du neuropore antérieur, comme suggéré dans la littérature ancienne. Ces informations préparent le terrain pour de futures études comparatives et expérimentales sur l'embryologie des actinoptérygiens basaux. © 1992 Wiley‐Liss, Inc.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jmor.1052130106",
    doi = "10.1002/jmor.1052130106",
    openalex = "W2032509800",
    references = "doi101111j146363951932tb00486x"
}

RÉSUMÉ L'embryologie de l'amphioxus présente de nombreuses similitudes avec l'embryologie des vertébrés, reflétant une relation phylogénétique étroite entre les deux groupes. L'embryologie de l'amphioxus est cependant plus simple à plusieurs égards clés, notamment l'absence de morphogenèse crâniofaciale prononcée. Pour obtenir des aperçus sur les changements moléculaires qui ont accompagné l'évolution de l'embryologie des vertébrés, et sur la relation entre les plans corporels de l'amphioxus et des vertébrés, nous avons entrepris la première investigation au niveau moléculaire du développement embryonnaire de l'amphioxus. Nous rapportons le clonage, la détermination complète de la séquence d'ADN, l'analyse de séquence et l'analyse d'expression d'un gène homeobox d'amphioxus, AmphiHox3, homologue évolutive au troisième groupe paralogue 3′ le plus proche des gènes Hox mammaliens. La comparaison de séquence avec un homologue mammalien, le gène Hox-2.7 de la souris (HoxB3), révèle plusieurs étirements de conservation d'acides aminés au sein des séquences protéiques déduites. L'hybridation in situ en coupe complète révèle l'expression localisée d'AmphiHox3 dans le mésoderme postérieur (mais pas dans les somites), et une expression spécifique à la région dans le cordon nerveux dorsal, chez les neurules d'amphioxus, les embryons et les larves ultérieurs. La limite antérieure d'expression dans le cordon nerveux se situe au niveau de la frontière quatre/cinq somites à l'étape de la neurule, et se stabilise juste en avant de la première tache pigmentaire du cordon nerveux à se former. La comparaison avec la limite d'expression antérieure du gène Hox-2.7 de la souris (HoxB3) et des gènes apparentés suggère que le cerveau des vertébrés est homologue à une région étendue du cordon nerveux de l'amphioxus qui contient la vésicule cérébrale (une région à l'extrémité rostrale la plus avancée) et s'étend postérieurement au quatrième somite. Cette homologie proposée implique que le cerveau des vertébrés n'a probablement pas évolué uniquement à partir de la vésicule cérébrale d'un ancêtre semblable à l'amphioxus, ni qu'il est apparu entièrement de novo en avant de la vésicule cérébrale.

@article{doi101242dev1163653,
    author = "Holland, Peter W. H. et Holland, Linda Z. et Williams, Nicola A. et Holland, Nicholas D.",
    title = "Un gène homeobox d'amphioxus : conservation de la séquence, expression spatiale durant le développement et aperçus sur l'évolution des vertébrés",
    year = "1992",
    journal = "Development",
    abstract = "RÉSUMÉ L'embryologie de l'amphioxus présente de nombreuses similitudes avec l'embryologie des vertébrés, reflétant une relation phylogénétique étroite entre les deux groupes. L'embryologie de l'amphioxus est cependant plus simple à plusieurs égards clés, notamment l'absence de morphogenèse crâniofaciale prononcée. Pour obtenir des aperçus sur les changements moléculaires qui ont accompagné l'évolution de l'embryologie des vertébrés, et sur la relation entre les plans corporels de l'amphioxus et des vertébrés, nous avons entrepris la première investigation au niveau moléculaire du développement embryonnaire de l'amphioxus. Nous rapportons le clonage, la détermination complète de la séquence d'ADN, l'analyse de séquence et l'analyse d'expression d'un gène homeobox d'amphioxus, AmphiHox3, homologue évolutive au troisième groupe paralogue 3′ le plus proche des gènes Hox mammaliens. La comparaison de séquence avec un homologue mammalien, le gène Hox-2.7 de la souris (HoxB3), révèle plusieurs étirements de conservation d'acides aminés au sein des séquences protéiques déduites. L'hybridation in situ en coupe complète révèle l'expression localisée d'AmphiHox3 dans le mésoderme postérieur (mais pas dans les somites), et une expression spécifique à la région dans le cordon nerveux dorsal, chez les neurules d'amphioxus, les embryons et les larves ultérieurs. La limite antérieure d'expression dans le cordon nerveux se situe au niveau de la frontière quatre/cinq somites à l'étape de la neurule, et se stabilise juste en avant de la première tache pigmentaire du cordon nerveux à se former. La comparaison avec la limite d'expression antérieure du gène Hox-2.7 de la souris (HoxB3) et des gènes apparentés suggère que le cerveau des vertébrés est homologue à une région étendue du cordon nerveux de l'amphioxus qui contient la vésicule cérébrale (une région à l'extrémité rostrale la plus avancée) et s'étend postérieurement au quatrième somite. Cette homologie proposée implique que le cerveau des vertébrés n'a probablement pas évolué uniquement à partir de la vésicule cérébrale d'un ancêtre semblable à l'amphioxus, ni qu'il est apparu entièrement de novo en avant de la vésicule cérébrale.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.116.3.653",
    doi = "10.1242/dev.116.3.653",
    openalex = "W2097360425",
    references = "doi101002j146020751989tb03534x, doi101007bf00291041, doi1010160020711x9390093t, doi1010160092867489909124, doi101016009286749290471n, doi1010160378111988903307, doi101016s0091679x08603076, doi101038313545a0, doi101038353861a0, doi101086413055, doi101242jcss231123445, doi1023071541578, doi105962bhltitle55924"
}

Résumé En observant de nombreux œufs vivants du requin-papillon Scyliorhinus canicula (L.) capturés près de Roscoff (France) et élevés à des températures enregistrées pendant leur développement de la première division jusqu'à l'éclosion, le premier tableau de développement raisonnablement complet a été établi pour ce matériel classique en embryologie vertébrée. Les stades successifs, décrits et numérotés de 1 à 34, corrigent et remplacent les stades incomplets A–Q proposés par Balfour (J.Anat. Physiol., 10: 555–576, 1876) et d'autres séries encore moins complètes publiées plus tard, et il est unique par l'inclusion d'un calendrier à 16°C. Les stades peuvent être identifiés, généralement à travers la paroi de l'enveloppe d'œuf clarifiée, à l'œil nu ou à faible grossissement. Ce tableau des stades normaux de Scyliorhinus peut être adapté avec de légères modifications à d'autres poissons chondrichthyens. © 1993 Wiley‐Liss, Inc.

@article{doi101002jez1402670309,
    author = "Ballard, William W. et Mellinger, J. et Lechenault, Henri",
    title = "A series of normal stages for development of Scyliorhinus canicula, the lesser spotted dogfish (Chondrichthyes: Scyliorhinidae)",
    year = "1993",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Résumé En observant de nombreux œufs vivants du requin-papillon Scyliorhinus canicula (L.) capturés près de Roscoff (France) et élevés à des températures enregistrées pendant leur développement de la première division jusqu'à l'éclosion, le premier tableau de développement raisonnablement complet a été établi pour ce matériel classique en embryologie vertébrée. Les stades successifs, décrits et numérotés de 1 à 34, corrigent et remplacent les stades incomplets A–Q proposés par Balfour (J.Anat. Physiol., 10: 555–576, 1876) et d'autres séries encore moins complètes publiées plus tard, et il est unique par l'inclusion d'un calendrier à 16°C. Les stades peuvent être identifiés, généralement à travers la paroi de l'enveloppe d'œuf clarifiée, à l'œil nu ou à faible grossissement. Ce tableau des stades normaux de Scyliorhinus peut être adapté avec de légères modifications à d'autres poissons chondrichthyens. © 1993 Wiley‐Liss, Inc.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.1402670309",
    doi = "10.1002/jez.1402670309",
    openalex = "W2053431317",
    references = "balfour1878a, doi101002jmor1050880104, doi1010079781461305033, doi101016s0168952500891295, doi101017s002531540005298x, doi101098rstb19390008, doi1023071439568, doi105962bhltitle3929, doi105962bhltitle7847, openalexw1534646565, openalexw2231568404"
}

Les muscles des membres chez les vertébrés proviennent de cellules dermomyotomales, qui, au cours du développement précoce, migrent de la région ventrolatérale des somites vers les bourgeons des membres. Ces cellules progénitrices n'expriment aucun gène marqueur spécifique du muscle ou facteur de transcription myogénique jusqu'à ce qu'elles atteignent leur destination dans les membres. Ici, nous démontrons par hybridation in situ que les cellules myogéniques dans les somites et une population de cellules progénitrices musculaires présumées migratrices dans le tissu somatopleural, ainsi que les myoblastes dans les membres en développement, expriment Pax-3. De manière significative, chez les souris mutantes homozygotes splotch, qui synthétisent un ARNm Pax-3 altéré mais ne produisent aucune protéine normale, aucune cellule positive pour les transcrits Pax-3 ne peut être détectée dans la région des progéniteurs musculaires des membres en migration ou dans le membre lui-même. En revanche, les cellules progénitrices myotomales et les muscles squelettiques axiaux contiennent des transcrits Pax-3 également chez le mutant. Intéressamment, ces animaux échouent à développer une musculature des membres, comme démontré par l'absence d'hybridation avec diverses sondes pour les facteurs de transcription myogéniques (Myf-5, myogénine, MyoD), mais produisent des muscles axiaux apparemment normaux. Ces observations suggèrent que Pax-3 est nécessaire à la formation des muscles des membres, affectant soit la génération de progéniteurs myogéniques dans le dermomyotome somitique, soit la migration de ces cellules vers le champ des membres.

@article{doi101242dev1203603,
    author = "Bober, Eva et Franz, Thomas et Arnold, Hans-Henning et Gruß, Peter et Tremblay, Patrick",
    title = "Pax-3 est requis pour le développement des muscles des membres : un rôle possible pour la migration des cellules progénitrices musculaires dermomyotomales",
    year = "1994",
    journal = "Development",
    abstract = "Les muscles des membres chez les vertébrés proviennent de cellules dermomyotomales, qui, au cours du développement précoce, migrent de la région ventrolatérale des somites vers les bourgeons des membres. Ces cellules progénitrices n'expriment aucun gène marqueur spécifique du muscle ou facteur de transcription myogénique jusqu'à ce qu'elles atteignent leur destination dans les membres. Ici, nous démontrons par hybridation in situ que les cellules myogéniques dans les somites et une population de cellules progénitrices musculaires présumées migratrices dans le tissu somatopleural, ainsi que les myoblastes dans les membres en développement, expriment Pax-3. De manière significative, chez les souris mutantes homozygotes splotch, qui synthétisent un ARNm Pax-3 altéré mais ne produisent aucune protéine normale, aucune cellule positive pour les transcrits Pax-3 ne peut être détectée dans la région des progéniteurs musculaires des membres en migration ou dans le membre lui-même. En revanche, les cellules progénitrices myotomales et les muscles squelettiques axiaux contiennent des transcrits Pax-3 également chez le mutant. Intéressamment, ces animaux échouent à développer une musculature des membres, comme démontré par l'absence d'hybridation avec diverses sondes pour les facteurs de transcription myogéniques (Myf-5, myogénine, MyoD), mais produisent des muscles axiaux apparemment normaux. Ces observations suggèrent que Pax-3 est nécessaire à la formation des muscles des membres, affectant soit la génération de progéniteurs myogéniques dans le dermomyotome somitique, soit la migration de ces cellules vers le champ des membres.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.120.3.603",
    doi = "10.1242/dev.120.3.603",
    openalex = "W2161699162",
    references = "doi101002aja1001680302"
}

Dans un criblage à grande échelle, nous avons isolé des mutants présentant un phénotype visible spécifique chez les embryons ou les larves précoces du poisson zèbre, Danio rerio. Les mâles ont été mutagénisés avec de l'éthyl-nitrosourée (ENU) et des familles F2 issues de croisements en paires simples entre des poissons F1 consanguins, hétérozygotes pour un génome mutagénisé, ont été élevés. Des pontes d'œufs ont été obtenues à partir de plusieurs croisements entre des frères et sœurs F2, ce qui a permis de noter 3857 génomes mutagénisés. La descendance F3 a été notée au deuxième, troisième et sixième jour de développement, en utilisant un stéréomicroscope. Dans un criblage ultérieur, des embryons fixés ont été analysés pour une projection rétino-tectale correcte. Un total de 4264 mutants a été identifié. Deux tiers des mutants présentant des anomalies plutôt générales ont finalement été éliminés. Nous avons conservé et caractérisé 1163 mutants. Dans des croisements de complémentarité effectués entre des mutants présentant des phénotypes similaires, 894 mutants ont été attribués à 372 gènes. La fréquence allélique moyenne est de 2,4. Nous avons identifié des gènes impliqués dans le développement précoce, la notochorde, le cerveau, la moelle épinière, les somites, les muscles, le cœur, la circulation, le sang, la peau, la nageoire, l'œil, la vésicule otique, la mâchoire et les arches branchiales, le motif de pigmentation, la formation de la pigmentation, l'intestin, le foie, la motilité et la réponse au toucher. Notre collection contient des allèles de presque tous les mutants de poisson zèbre décrits précédemment. À partir des fréquences alléliques et d'autres considérations, nous estimons que les 372 gènes définis par les mutants représentent probablement plus de la moitié de tous les gènes qui auraient pu être découverts en utilisant les critères de notre criblage. Ici, nous donnons un aperçu du spectre des phénotypes mutants obtenus et discutons des limites et des potentiels d'un criblage de saturation génétique chez le poisson zèbre.

@article{doi101242dev12311,
    author = "Haffter, Pascal et Granato, Michael et Brand, Michael et Mullins, Mary C. et Hammerschmidt, Matthias et Kane, Donald A. et Odenthal, Jörg et van Eeden, Fredericus J. M. et Jiang, Yun‐Jin et Heisenberg, Carl‐Philipp et Kelsh, Robert N. et Furutani‐Seiki, Makoto et Vogelsang, Elisabeth et Beuchle, Dirk et Schach, Ursula et Fabian, Cosima et Nüsslein‐Volhard, Christiane",
    title = "The identification of genes with unique and essential functions in the development of the zebrafish, Danio rerio",
    year = "1996",
    journal = "Development",
    abstract = "Dans un criblage à grande échelle, nous avons isolé des mutants présentant un phénotype visible spécifique chez les embryons ou les larves précoces du poisson zèbre, Danio rerio. Les mâles ont été mutagénisés avec de l'éthyl-nitrosourée (ENU) et des familles F2 issues de croisements en paires simples entre des poissons F1 consanguins, hétérozygotes pour un génome mutagénisé, ont été élevés. Des pontes d'œufs ont été obtenues à partir de plusieurs croisements entre des frères et sœurs F2, ce qui a permis de noter 3857 génomes mutagénisés. La descendance F3 a été notée au deuxième, troisième et sixième jour de développement, en utilisant un stéréomicroscope. Dans un criblage ultérieur, des embryons fixés ont été analysés pour une projection rétino-tectale correcte. Un total de 4264 mutants a été identifié. Deux tiers des mutants présentant des anomalies plutôt générales ont finalement été éliminés. Nous avons conservé et caractérisé 1163 mutants. Dans des croisements de complémentarité effectués entre des mutants présentant des phénotypes similaires, 894 mutants ont été attribués à 372 gènes. La fréquence allélique moyenne est de 2,4. Nous avons identifié des gènes impliqués dans le développement précoce, la notochorde, le cerveau, la moelle épinière, les somites, les muscles, le cœur, la circulation, le sang, la peau, la nageoire, l'œil, la vésicule otique, la mâchoire et les arches branchiales, le motif de pigmentation, la formation de la pigmentation, l'intestin, le foie, la motilité et la réponse au toucher. Notre collection contient des allèles de presque tous les mutants de poisson zèbre décrits précédemment. À partir des fréquences alléliques et d'autres considérations, nous estimons que les 372 gènes définis par les mutants représentent probablement plus de la moitié de tous les gènes qui auraient pu être découverts en utilisant les critères de notre criblage. Ici, nous donnons un aperçu du spectre des phénotypes mutants obtenus et discutons des limites et des potentiels d'un criblage de saturation génétique chez le poisson zèbre.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.123.1.1",
    doi = "10.1242/dev.123.1.1",
    openalex = "W2123938765",
    references = "doi101002aja1002030302"
}

Les poissons présentent l'une des plus grandes variétés d'intensité de compétition spermatique parmi tous les groupes animaux. Ici, nous présentons une étude comparative dont le but est d'investiguer l'effet de l'intensité relative de la compétition spermatique sur l'investissement dans la spermatogenèse et le nombre et la taille des spermatozoïdes produits. Nous constatons que l'indice gonadosomatique (GSI = [poids des gonades/poids du corps] x 100) et le nombre de spermatozoïdes augmentent avec l'intensité de la compétition spermatique entre les espèces, mais que la longueur des spermatozoïdes diminue. Ces nouvelles découvertes sont cohérentes avec un mode de compétition spermatique basé sur une loterie chez les poissons. La plupart de ces résultats (corrélation positive de l'indice GSI et du nombre de spermatozoïdes avec l'intensité de la compétition spermatique) concordent avec les prédictions de la théorie actuelle de la compétition spermatique. Cependant, nous constatons également que la longévité des spermatozoïdes diminue avec la longueur des spermatozoïdes entre les espèces. Les modèles actuels pour la fécondation continue suggèrent que si la longueur augmente la vitesse d'un spermatozoïde mais diminue sa longévité, la longueur des spermatozoïdes devrait augmenter avec l'intensité de la compétition spermatique, tandis que les modèles pour la fécondation instantanée suggèrent que la longueur des spermatozoïdes devrait rester constante. La relation négative trouvée entre la compétition spermatique et la longueur des spermatozoïdes ne correspond donc pas aux prédictions d'aucun des deux modèles.

@article{doi101086286031,
    author = "Stockley, Paula et Gage, M. J. G. et Parker, George A. et Møller, Anders Pape",
    title = "Compétition spermatique chez les poissons : l'évolution de la taille des testicules et des caractéristiques de l'éjaculat",
    year = "1997",
    journal = "The American Naturalist",
    abstract = "Les poissons présentent l'une des plus grandes variétés d'intensité de compétition spermatique parmi tous les groupes animaux. Ici, nous présentons une étude comparative dont le but est d'investiguer l'effet de l'intensité relative de la compétition spermatique sur l'investissement dans la spermatogenèse et le nombre et la taille des spermatozoïdes produits. Nous constatons que l'indice gonadosomatique (GSI = [poids des gonades/poids du corps] x 100) et le nombre de spermatozoïdes augmentent avec l'intensité de la compétition spermatique entre les espèces, mais que la longueur des spermatozoïdes diminue. Ces nouvelles découvertes sont cohérentes avec un mode de compétition spermatique basé sur une loterie chez les poissons. La plupart de ces résultats (corrélation positive de l'indice GSI et du nombre de spermatozoïdes avec l'intensité de la compétition spermatique) concordent avec les prédictions de la théorie actuelle de la compétition spermatique. Cependant, nous constatons également que la longévité des spermatozoïdes diminue avec la longueur des spermatozoïdes entre les espèces. Les modèles actuels pour la fécondation continue suggèrent que si la longueur augmente la vitesse d'un spermatozoïde mais diminue sa longévité, la longueur des spermatozoïdes devrait augmenter avec l'intensité de la compétition spermatique, tandis que les modèles pour la fécondation instantanée suggèrent que la longueur des spermatozoïdes devrait rester constante. La relation négative trouvée entre la compétition spermatique et la longueur des spermatozoïdes ne correspond donc pas aux prédictions d'aucun des deux modèles.",
    url = "https://doi.org/10.1086/286031",
    doi = "10.1086/286031",
    openalex = "W2126945764",
    references = "openalexw612600151"
}

Nous rapportons les résultats d'une enquête comparative sur la structure et la fonction des glandes oviducales (OG) de certains poissons chondrichthyens présentant des modes de reproduction différents, observés par microscopie optique et électronique à balayage, par exemple Scyliorhinus canicula, S. stellaris, Raja erinacea, R. eglanteria, R. clavata, Squalus acanthias, Mustelus canis et Urolophus jamaicensis. Les glandes oviducales présentent de manière constante quatre zones fondamentales, indépendamment du type de reproduction de l'espèce considérée. Ces zones correspondent à des lamelles qui s'étendent sur toute la largeur du lumen de la glande. Par le passé, les zones des OG étaient désignées comme sécrétant l'albumine et sécrétant la coquille. Cette terminologie trop simpliste ne s'applique pas avec précision à toutes les espèces. Nous avons adopté la terminologie récemment introduite (Hamlett et al. [1998] Cybium, à paraître) qui se réfère aux quatre zones de base sur une base morphologique plutôt que sur une fonction supposée qui peut ne pas être applicable entre les lignées d'espèces. Cela permet de faire des comparaisons précises entre les espèces. Les glandes oviducales possèdent une zone club proximale, une zone papillaire, une zone cloison et une zone terminale. Les variations dans la composition de chaque zone peuvent montrer une variabilité spécifique, mais l'organisation fondamentale est maintenue. Les zones club et papillaire remplacent l'ancienne désignation de la zone albumine. La zone club doit son nom à sa forme lorsqu'elle est observée en coupe transversale au microscope optique. De même, la zone papillaire se caractérise par un profil papillaire ou conique lorsqu'elle est observée en coupe. Les zones club et papillaire sont responsables de la production des divers manteaux de gelée qui entourent l'œuf. La zone cloison produit les divers types d'enveloppes d'œuf observés chez les chondrichthyens. Chez les espèces ovipares, telles que les requins S. Canicula et S. Stellaris et les raies R. Erinacea, R. Eglanteria et R. Clavata, les glandes tubulaires produisent des composants sécrétoires qui passent dans les ductes sécrétoires. Les ductes sécrétoires sont confluentes avec un spinneret qui possède des plaques cloisonnées appariées qui manipulent le matériau sécrétoire à mesure qu'il émerge du ducte sécrétoire. Le matériau sécrétoire provenant de ductes sécrétoires adjacents se mélange dans des sillons transversaux qui s'étendent sur toute la largeur de la glande, de sorte qu'un seul sillon transversal est responsable d'une seule couche sécrétée. La raie tachetée jaune, U. Jamaicensis, est inhabituelle en ce qu'elle ne produit pas d'enveloppe d'œuf autre que les manteaux de gelée et manque donc de plaques cloisonnées. Malgré les variations entre les espèces, les OG productrices de capsules que nous avons étudiées semblent utiliser le même processus d'assemblage de base pour produire des capsules d'œuf dures, flexibles et sélectivement perméables, des bougies ou des enveloppes d'œuf. Cela implique l'extrusion d'un matériau de capsule à travers des matrices, chacune s'ouvrant entre deux plaques cloisonnées et extrudant une bande plate contenant des molécules orientées avec précision et complexité. Les matrices déversent dans des sillons transversaux dans le lumen principal de la glande, chaque sillon sécrétant ainsi une seule lamelle du revêtement d'œuf. J. Exp. Zool. 282:399–420, 1998. © 1998 Wiley-Liss, Inc.

@article{doi101002sici1097010x1998111228245399aidjez230co26,
    author = "Hamlett, William C. et al.",
    title = "Enquête sur la structure et la fonction des glandes oviductales chez les élasmobranches",
    year = "1998",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Nous rapportons les résultats d'une enquête comparative sur la structure et la fonction des glandes oviductales (GO) chez certains poissons élasmobranches présentant des modes de reproduction différents, utilisant la microscopie optique et électronique à balayage, par exemple Scyliorhinus canicula, S. stellaris, Raja erinacea, R. eglanteria, R. clavata, Squalus acanthias, Mustelus canis et Urolophus jamaicensis. Les glandes oviductales présentent systématiquement quatre zones fondamentales, indépendamment du type de reproduction de l'espèce considérée. Ces zones correspondent à des lamelles qui s'étendent sur toute la largeur du lumen de la glande. Par le passé, les zones des GO étaient désignées comme sécrétant l'albumine et sécrétant la coquille. Cette terminologie trop simpliste ne s'applique pas avec précision à toutes les espèces. Nous avons adopté la terminologie récemment introduite (Hamlett et al. [1998] Cybium, à paraître) qui se réfère aux quatre zones de base sur une base morphologique plutôt que sur une fonction supposée qui peut ne pas être applicable entre les lignées d'espèces. Cela permet de faire des comparaisons précises entre les espèces. Les glandes oviductales possèdent une zone club proximale, une zone papillaire, une zone cloison et une zone terminale. Les variations dans la composition de chaque zone peuvent montrer une variabilité spécifique, mais l'organisation fondamentale est maintenue. Les zones club et papillaire remplacent l'ancienne désignation de la zone albumine. La zone club doit son nom à sa forme lorsqu'elle est vue en section transversale au microscope optique. De même, la zone papillaire se caractérise par un profil papillaire ou conique lorsqu'elle est vue en section. Les zones club et papillaire sont responsables de la production des diverses couches de gelée qui entourent l'œuf. La zone cloison produit les différents types d'enveloppes d'œuf observés chez les élasmobranches. Chez les espèces ovipares, telles que les requins S. Canicula et S. Stellaris et les raies R. Erinacea, R. Eglanteria et R. Clavata, les glandes tubulaires produisent des composants sécrétoires qui passent dans des ductes sécrétoires. Les ductes sécrétoires sont confluentes avec un spinneret qui possède des plaques cloisonnées jumelles qui manipulent le matériau sécrétoire au fur et à mesure qu'il émerge du ducte sécrétoire. Le matériau sécrétoire provenant de ductes sécrétoires adjacents se mélange dans des rainures transversales qui s'étendent sur toute la largeur de la glande, de sorte qu'une seule rainure transversale est responsable d'une seule couche sécrétée. La raie tachetée jaune, U. Jamaicensis, est inhabituelle en ce qu'elle ne produit pas d'enveloppe d'œuf autre que les couches de gelée et manque donc de plaques cloisonnées. Malgré les variations entre les espèces, les GO productrices de capsules que nous avons étudiées semblent utiliser le même processus d'assemblage de base pour produire des capsules d'œuf dures, flexibles et sélectivement perméables, des bougies ou des enveloppes d'œuf. Cela implique l'extrusion d'un matériau de capsule à travers des matrices, chacune s'ouvrant entre deux plaques cloisonnées et extrudant une bande aplatie contenant des molécules orientées avec précision et complexité. Les matrices déchargent dans des rainures transversales dans le lumen principal de la glande, chaque rainure sécrétant ainsi une seule lamelle de la couverture d'œuf. J. Exp. Zool. 282:399–420, 1998. © 1998 Wiley-Liss, Inc.",
    url = "https://doi.org/10.1002/(sici)1097-010x(199811/12)282:4/5<399::aid-jez2>3.0.co;2-6",
    doi = "10.1002/(sici)1097-010x(199811/12)282:4/5<399::aid-jez2>3.0.co;2-6",
    openalex = "W2014891025",
    references = "doi101017s002531540000967x"
}

Résumé Ce chapitre décrit la richesse spécifique et les relations phylogénétiques entre les poissons d'eau douce néotropicaux, en mettant l'accent sur les caractéristiques diagnostiques principales de chaque groupe. Les deux thèmes sont effervescents, impliquant des études et des discussions qui nécessitent des mises à jour constantes. Ils font également face à un taux élevé de descriptions de nouvelles espèces et de nouvelles hypothèses de relations. Dans ce chapitre, nous offrons une image des connaissances disponibles jusqu'au début de 2018, et nous suggérons aux lecteurs de l'utiliser pour rechercher des informations actualisées.

@book{openalexw3001739384,
    author = "Malabarba, Luiz Roberto et Malabarba, Maria Claudia",
    title = "Phylogeny and classification of neotropical fishes",
    year = "1998",
    abstract = "Résumé Ce chapitre décrit la richesse spécifique et les relations phylogénétiques entre les poissons d'eau douce néotropicaux, en mettant l'accent sur les caractéristiques diagnostiques principales de chaque groupe. Les deux thèmes sont effervescents, impliquant des études et des discussions qui nécessitent des mises à jour constantes. Ils font également face à un taux élevé de descriptions de nouvelles espèces et de nouvelles hypothèses de relations. Dans ce chapitre, nous offrons une image des connaissances disponibles jusqu'au début de 2018, et nous suggérons aux lecteurs de l'utiliser pour rechercher des informations actualisées.",
    openalex = "W3001739384",
    references = "doi101002aja1001590307, doi101007978940171356617, doi101007pl00006514, doi101093icb222241, doi101111j109636421981tb01575x, doi101111j109636421996tb02189x, doi101159000006600, doi1011632666064402801038, doi1023071441405, doi1023071446263"
}

Nous rapportons la génération et l'analyse de souris homozygotes pour une délétion ciblée du gène homeobox Dlx5. Les souris mutantes Dlx5 présentent de multiples défauts dans les structures craniofaciales, y compris leurs oreilles, nez, mandibules et calvaires, et meurent peu après la naissance. Un sous-ensemble (28 %) présente une exencéphalie. L'expression ectodermique de Dlx5 est requise pour le développement des épithéliums dérivés des placodes olfactives et otiques et des capsules environnantes. Les capsules nasales sont hypoplastiques (par exemple, dépourvues de turbinate) et, dans la plupart des cas, le côté droit est plus sévèrement affecté que le côté gauche. Les dérivés de la vésicule otique dorsale (par exemple, canaux semi-circulaires et conduit endolymphatique) et la capsule environnante sont plus sévèrement affectés que les structures ventrales (cochléaires). Dlx5 est également requis dans l'ectomesenchyme de l'arc mandibulaire, car le squelette de l'arc mandibulaire proximal est dysmorphique. Dlx5 peut contrôler le développement craniofacial en partie par la régulation du gène homeobox goosecoid. L'expression de goosecoid est fortement réduite chez les mutants Dlx5, et les mutants goosecoid et Dlx5 partagent un certain nombre de malformations craniofaciales similaires. Dlx5 peut jouer un rôle général dans la différenciation squelettique, comme l'exemplifie l'hypominéralisation au sein du calvaire. Les défauts focaux distincts au sein des arcs branchiaux des mutants Dlx1, Dlx2 et Dlx5, ainsi que l'expression imbriquée de leurs ARN, soutiennent un modèle dans lequel ces gènes ont à la fois des fonctions redondantes et uniques dans la régulation du motif régional du mésenchyme ectodermique craniofacial.

@article{doi101242dev126173831,
    author = "Depew, Michael J. et Liu, Jen Kuei et Long, Jason E. et Presley, R. et Meneses, Juanito J. et Pedersen, Roger A. et Rubenstein, John L.R.",
    title = "Dlx5 régule le développement régional des arcs branchiaux et des capsules sensorielles",
    year = "1999",
    journal = "Development",
    abstract = "Nous rapportons la génération et l'analyse de souris homozygotes pour une délétion ciblée du gène homeobox Dlx5. Les souris mutantes Dlx5 présentent de multiples défauts dans les structures craniofaciales, y compris leurs oreilles, nez, mandibules et calvaires, et meurent peu après la naissance. Un sous-ensemble (28 %) présente une exencéphalie. L'expression ectodermique de Dlx5 est requise pour le développement des épithéliums dérivés des placodes olfactives et otiques et des capsules environnantes. Les capsules nasales sont hypoplastiques (par exemple, dépourvues de turbinate) et, dans la plupart des cas, le côté droit est plus sévèrement affecté que le côté gauche. Les dérivés de la vésicule otique dorsale (par exemple, canaux semi-circulaires et conduit endolymphatique) et la capsule environnante sont plus sévèrement affectés que les structures ventrales (cochléaires). Dlx5 est également requis dans l'ectomesenchyme de l'arc mandibulaire, car le squelette de l'arc mandibulaire proximal est dysmorphique. Dlx5 peut contrôler le développement craniofacial en partie par la régulation du gène homeobox goosecoid. L'expression de goosecoid est fortement réduite chez les mutants Dlx5, et les mutants goosecoid et Dlx5 partagent un certain nombre de malformations craniofaciales similaires. Dlx5 peut jouer un rôle général dans la différenciation squelettique, comme l'exemplifie l'hypominéralisation au sein du calvaire. Les défauts focaux distincts au sein des arcs branchiaux des mutants Dlx1, Dlx2 et Dlx5, ainsi que l'expression imbriquée de leurs ARN, soutiennent un modèle dans lequel ces gènes ont à la fois des fonctions redondantes et uniques dans la régulation du motif régional du mésenchyme ectodermique craniofacial.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.126.17.3831",
    doi = "10.1242/dev.126.17.3831",
    openalex = "W2148339830",
    references = "doi1010970000505319311100000026"
}

L'impact de la pêche sur les stocks de chondrichthyens dans le monde fait actuellement l'objet d'une préoccupation internationale considérable. La plupart des populations de chondrichthyens ont une faible productivité par rapport aux poissons téléostéens, conséquence de leurs stratégies d'histoire de vie différentes. Cela se reflète dans le mauvais bilan de durabilité des pêches ciblées de requins. La plupart des requins et certaines raies sont des prédateurs au sommet ou près du sommet des réseaux trophiques marins. Les effets de la pêche sont examinés au niveau de l'espèce unique et à travers les interactions trophiques. Nous résumons l'état des pêches de chondrichthyens dans le monde. Environ 50 % de la capture mondiale estimée de chondrichthyens est prise comme capture accessoire, ne figure pas dans les statistiques officielles de la pêche et est presque totalement non gérée. Lorsqu'ils sont pris comme capture accessoire, ils sont souvent soumis à une forte mortalité par pêche dirigée contre les espèces cibles téléostéennes. Par conséquent, certains raies, sawfish et dogfish d'eau profonde ont été pratiquement éradiqués de grandes régions. Certains chondrichthyens sont plus résilients à la pêche et nous examinons les prévisions sur la vulnérabilité des différentes espèces basées sur leurs paramètres d'histoire de vie et de population. Au niveau de l'espèce, la pêche peut modifier la structure de taille et les paramètres de population en réponse aux changements d'abondance des espèces. Nous passons en revue les preuves de tels changements dépendants de la densité. La pêche peut affecter les interactions trophiques et nous examinons des cas de remplacement apparent d'espèces et de changements dans la composition des communautés. Les requins et les raies apprennent à associer les chalutiers à la nourriture et la consommation de rejets peut augmenter leurs populations. En utilisant ECOSIM, nous faisons certaines prévisions sur la réponse à long terme des écosystèmes à la pêche sur les requins. Trois environnements différents sont analysés : un écosystème de plateau tropical au Venezuela, un écosystème de récif corallien hawaïen et un écosystème océanique du Pacifique Nord.

@article{doi101006jmsc20000724,
    author = "Stevens, John D.",
    title = "The effects of fishing on sharks, rays, and chimaeras (chondrichthyans), and the implications for marine ecosystems",
    year = "2000",
    journal = "ICES Journal of Marine Science",
    abstract = "L'impact de la pêche sur les stocks de chondrichthyens dans le monde fait actuellement l'objet d'une préoccupation internationale considérable. La plupart des populations de chondrichthyens ont une faible productivité par rapport aux poissons téléostéens, conséquence de leurs stratégies d'histoire de vie différentes. Cela se reflète dans le mauvais bilan de durabilité des pêches ciblées de requins. La plupart des requins et certaines raies sont des prédateurs au sommet ou près du sommet des réseaux trophiques marins. Les effets de la pêche sont examinés au niveau de l'espèce unique et à travers les interactions trophiques. Nous résumons l'état des pêches de chondrichthyens dans le monde. Environ 50\% de la capture mondiale estimée de chondrichthyens est prise comme capture accessoire, ne figure pas dans les statistiques officielles de la pêche et est presque totalement non gérée. Lorsqu'ils sont pris comme capture accessoire, ils sont souvent soumis à une forte mortalité par pêche dirigée contre les espèces cibles téléostéennes. Par conséquent, certains raies, sawfish et dogfish d'eau profonde ont été pratiquement éradiqués de grandes régions. Certains chondrichthyens sont plus résilients à la pêche et nous examinons les prévisions sur la vulnérabilité des différentes espèces basées sur leurs paramètres d'histoire de vie et de population. Au niveau de l'espèce, la pêche peut modifier la structure de taille et les paramètres de population en réponse aux changements d'abondance des espèces. Nous passons en revue les preuves de tels changements dépendants de la densité. La pêche peut affecter les interactions trophiques et nous examinons des cas de remplacement apparent d'espèces et de changements dans la composition des communautés. Les requins et les raies apprennent à associer les chalutiers à la nourriture et la consommation de rejets peut augmenter leurs populations. En utilisant ECOSIM, nous faisons certaines prévisions sur la réponse à long terme des écosystèmes à la pêche sur les requins. Trois environnements différents sont analysés : un écosystème de plateau tropical au Venezuela, un écosystème de récif corallien hawaïen et un écosystème océanique du Pacifique Nord.",
    url = "https://doi.org/10.1006/jmsc.2000.0724",
    doi = "10.1006/jmsc.2000.0724",
    openalex = "W2121792431",
    references = "doi101006jmsc19990489, doi101098rspb19970181, doi101126science2795352860, doi1023071447035, doi1023071447424"
}

Résumé Les processus dépendants de la densité tels que la croissance, la survie, la reproduction et les déplacements sont compensatoires si leurs taux changent en réponse à la variation de la densité de population (ou du nombre) de telle sorte qu'ils entraînent un ralentissement du taux de croissance de la population à fortes densités et favorisent une augmentation numérique de la population à faibles densités. La dépendance compensatoire de la densité est importante pour la gestion des pêches car elle opère pour compenser les pertes d'individus. Bien que le concept de compensation soit simple, il reste l'un des problèmes les plus controversés en dynamique des populations. Les difficultés surviennent lorsqu'on passe des concepts généraux aux populations spécifiques. La compensation est généralement quantifiée en utilisant une combinaison de l'analyse des spawners–recruits, de la surveillance de terrain à long terme ou des études manipulatives, et de la modélisation informatique. Des problèmes surviennent car il existe des limites à chacune de ces approches, et ces limites proviennent généralement de l'incertitude élevée associée aux mesures de terrain. Nous proposons une approche hiérarchique pour prédire et comprendre la compensation, allant du très général, en utilisant la théorie de base de l'histoire de vie, au très spécifique au site, en utilisant des modèles de population détaillés. Nous analysons une base de données spawners–recruits pour tester les prévisions concernant la compensation et la réserve compensatoire qui découlent d'un cadre d'histoire de vie à trois points de fin conçu pour les poissons. Nous résumons ensuite des exemples de terrain de dépendance de la densité dans des processus spécifiques. Des études de surveillance de terrain à long terme sélectionnées, des études manipulatives et des exemples de modélisation informatique sont ensuite mis en évidence pour illustrer comment les processus dépendants de la densité ont conduit à des réponses compensatoires au niveau de la population. Certaines avancées théoriques et empiriques qui offrent de l'espoir pour des progrès futurs sur la question de la compensation sont discutées. Nous plaçons pour une approche de la compensation qui implique une compréhension au niveau des processus des mécanismes sous-jacents, la théorie de l'histoire de vie, une analyse minutieuse des données de terrain, et la modélisation matricielle et individuelle. Il y aura toujours débat si la quantification de la compensation ne comprend pas un certain degré de compréhension des mécanismes sous-jacents.

@article{doi101046j14672960200100056x,
    author = "Rose, Kenneth A. et Cowan, James H. et Winemiller, Kirk O. et Myers, Ransom A. et Hilborn, Ray",
    title = "Dépendance compensatoire de la densité dans les populations de poissons : importance, controverse, compréhension et pronostic",
    year = "2001",
    journal = "Fish and Fisheries",
    abstract = "Résumé Les processus dépendants de la densité tels que la croissance, la survie, la reproduction et les déplacements sont compensatoires si leurs taux changent en réponse à la variation de la densité de population (ou du nombre) de telle sorte qu'ils entraînent un ralentissement du taux de croissance de la population à fortes densités et favorisent une augmentation numérique de la population à faibles densités. La dépendance compensatoire de la densité est importante pour la gestion des pêches car elle opère pour compenser les pertes d'individus. Bien que le concept de compensation soit simple, il reste l'un des problèmes les plus controversés en dynamique des populations. Les difficultés surviennent lorsqu'on passe des concepts généraux aux populations spécifiques. La compensation est généralement quantifiée en utilisant une combinaison de l'analyse des spawners–recruits, de la surveillance de terrain à long terme ou des études manipulatives, et de la modélisation informatique. Des problèmes surviennent car il existe des limites à chacune de ces approches, et ces limites proviennent généralement de l'incertitude élevée associée aux mesures de terrain. Nous proposons une approche hiérarchique pour prédire et comprendre la compensation, allant du très général, en utilisant la théorie de base de l'histoire de vie, au très spécifique au site, en utilisant des modèles de population détaillés. Nous analysons une base de données spawners–recruits pour tester les prévisions concernant la compensation et la réserve compensatoire qui découlent d'un cadre d'histoire de vie à trois points de fin conçu pour les poissons. Nous résumons ensuite des exemples de terrain de dépendance de la densité dans des processus spécifiques. Des études de surveillance de terrain à long terme sélectionnées, des études manipulatives et des exemples de modélisation informatique sont ensuite mis en évidence pour illustrer comment les processus dépendants de la densité ont conduit à des réponses compensatoires au niveau de la population. Certaines avancées théoriques et empiriques qui offrent de l'espoir pour des progrès futurs sur la question de la compensation sont discutées. Nous plaçons pour une approche de la compensation qui implique une compréhension au niveau des processus des mécanismes sous-jacents, la théorie de l'histoire de vie, une analyse minutieuse des données de terrain, et la modélisation matricielle et individuelle. Il y aura toujours débat si la quantification de la compensation ne comprend pas un certain degré de compréhension des mécanismes sous-jacents.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1467-2960.2001.00056.x",
    doi = "10.1046/j.1467-2960.2001.00056.x",
    openalex = "W2132380992",
    references = "doi101007bf00042661, doi101016s006528810860187x, doi101111j193974452001tb00075x, doi1023072937041, doi103354meps188263"
}

La construction d'organismes à partir d'unités qui se développent sous un contrôle génétique semi-autonome (modules) a été proposée comme un composant important de leur capacité à subir une évolution phénotypique adaptative. L'organisation de la dentition des vertébrés en tant que système de parties répétées offre une opportunité d'étudier dans quelle mesure les modules phénotypiques, identifiés par leur indépendance évolutive par rapport à d'autres unités similaires, sont liés à la modularité du contrôle génétique du développement. L'histoire évolutive des vertébrés fournit de nombreux exemples à la fois d'évolution corrélée et indépendante de groupes de dents. La dentition elle-même semble être un module de l'exosquelette dermique, dont elle a longtemps été sous un contrôle génétique indépendant. La perte de dents spécifique à certaines régions a été une tendance commune dans l'évolution des vertébrés. Un déploiement novateur de dents et une réacquisition de dents perdues se sont également produits, bien que moins fréquemment. Les différences de forme des dents au sein de la dentition peuvent être discontinues (appelées hétérodontie) ou graduelles. L'occurrence de changements homéotiques dans la forme des dents fournit des preuves du découplage de la forme et de la localisation des dents au cours de l'évolution. Des mécanismes potentiels pour la perte évolutive spécifique à certaines régions de dents sont suggérés par de nombreux knockouts de gènes de souris et anomalies dentaires génétiques humaines, ainsi que par une comparaison entre dents pleinement développées et rudimentaires dans la dentition des rongeurs. Ces mécanismes incluent la perte d'un signal d'initiation spécifique au type de dent, des altérations de la force relative des signaux inducteurs et inhibiteurs agissant au moment de l'initiation de la dent et la réduction globale des niveaux de protéines nécessaires au développement de toutes les dents. L'expression ectopique de signaux d'initiation dentaire fournit un mécanisme potentiel pour le déploiement novateur ou la réacquisition de dents ; un seul cas est connu d'un dont l'expression ectopique chez des souris transgéniques peut entraîner des dents ectopiques. Les différences de forme entre les dents incisives et molaires chez la souris ont été proposées comme étant contrôlées par l'expression spécifique à certaines régions de molécules de signalisation dans l'épithélium oral. Ces molécules induisent l'expression de facteurs de transcription dans le mésenchyme de la mâchoire sous-jacent qui peuvent agir comme sélecteurs de type dentaire. Il est spéculé que les changements dans les domaines d'expression des molécules de signalisation épithéliales pourraient être responsables des changements homéotiques dans la forme des dents. L'observation que ces molécules sont régionalement restreintes chez le poulet, dont les ancêtres n'étaient pas hétéroodontes, suggère que l'hétérodontie mammalienne pourrait avoir évolué grâce à l'utilisation de mécanismes de modelage déjà agissant sur les éléments squelettiques des mâchoires. En général, les approches génétiques et morphologiques identifient des types de modules similaires dans la dentition, mais les données ne sont pas encore suffisantes pour identifier des correspondances exactes. Il est spéculé que la modularité peut être atteinte par des différences d'expression génique entre les dents ou par des différences dans le temps de leur développement, causant aux mutations des effets cumulatifs sur les dents se développant plus tardivement. La dentition mammalienne, pour laquelle pratiquement toutes les données génétiques du développement disponibles ont été collectées, représente un petit sous-ensemble de la diversité dentaire présente chez les vertébrés dans leur ensemble. En particulier, les poissons téléostéens peuvent avoir une dentition beaucoup plus étendue. L'extension de la recherche sur le contrôle génétique du développement dentaire à ce groupe et d'autres groupes de vertébrés a un grand potentiel pour approfondir la compréhension de la modularité dans la dentition.

@article{doi101098rstb20010917,
    author = "Stock, David W.",
    title = "Les bases génétiques de la modularité dans le développement et l'évolution de la dentition des vertébrés",
    year = "2001",
    journal = "Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences",
    abstract = "La construction d'organismes à partir d'unités qui se développent sous un contrôle génétique semi-autonome (modules) a été proposée comme un composant important de leur capacité à subir une évolution phénotypique adaptative. L'organisation de la dentition des vertébrés en tant que système de parties répétées offre une opportunité d'étudier dans quelle mesure les modules phénotypiques, identifiés par leur indépendance évolutive par rapport à d'autres unités similaires, sont liés à la modularité du contrôle génétique du développement. L'histoire évolutive des vertébrés fournit de nombreux exemples à la fois d'évolution corrélée et indépendante de groupes de dents. La dentition elle-même semble être un module de l'exosquelette dermique, dont elle a longtemps été sous contrôle génétique indépendant. La perte de dents spécifique à une région a été une tendance courante dans l'évolution des vertébrés. Un déploiement novateur de dents et une réacquisition de dents perdues se sont également produits, bien que moins fréquemment. Les différences de forme des dents au sein de la dentition peuvent être discontinues (appelées hétérodontie) ou graduelles. L'occurrence de changements homéotiques dans la forme des dents fournit des preuves du découplage de la forme et de l'emplacement des dents au cours de l'évolution. Des mécanismes potentiels pour la perte évolutive spécifique à une région de dents sont suggérés par de nombreux knockouts de gènes de souris et anomalies dentaires génétiques humaines, ainsi que par une comparaison entre dents pleinement développées et rudimentaires dans la dentition des rongeurs. Ces mécanismes incluent la perte d'un signal d'initiation spécifique au type de dent, des altérations de la force relative des signaux inducteurs et inhibiteurs agissant au moment de l'initiation de la dent et la réduction globale des niveaux de protéines nécessaires au développement de toutes les dents. L'expression ectopique des signaux d'initiation dentaire fournit un mécanisme potentiel pour le déploiement novateur ou la réacquisition de dents ; un seul cas est connu d'un dont l'expression ectopique chez des souris transgéniques peut entraîner des dents ectopiques. Les différences de forme entre les dents incisives et molaires chez la souris ont été proposées comme étant contrôlées par l'expression spécifique à une région de molécules de signalisation dans l'épithélium oral. Ces molécules induisent l'expression de facteurs de transcription dans le mésenchyme de la mâchoire sous-jacent qui peuvent agir comme sélecteurs de type dentaire. Il est spéculé que les changements dans les domaines d'expression des molécules de signalisation épithéliales pourraient être responsables des changements homéotiques dans la forme des dents. L'observation que ces molécules sont régionalement restreintes chez le poulet, dont les ancêtres n'étaient pas hétérodontes, suggère que l'hétérodontie mammalienne peut avoir évolué grâce à l'utilisation de mécanismes de modelage déjà agissant sur les éléments squelettiques des mâchoires. En général, les approches génétiques et morphologiques identifient des types de modules similaires dans la dentition, mais les données ne sont pas encore suffisantes pour identifier des correspondances exactes. Il est spéculé que la modularité peut être atteinte par des différences d'expression génique entre les dents ou par des différences dans le temps de leur développement, causant aux mutations des effets cumulatifs sur les dents se développant plus tardivement. La dentition mammalienne, pour laquelle pratiquement toutes les données génétiques du développement disponibles ont été collectées, représente un petit sous-ensemble de la diversité dentaire présente chez les vertébrés dans leur ensemble. En particulier, les poissons téléostéens peuvent avoir une dentition beaucoup plus étendue. L'extension de la recherche sur le contrôle génétique du développement dentaire à ce groupe et d'autres groupes de vertébrés a un grand potentiel pour approfondir la compréhension de la modularité dans la dentition.",
    url = "https://doi.org/10.1098/rstb.2001.0917",
    doi = "10.1098/rstb.2001.0917",
    openalex = "W2014935796",
    references = "doi101002jmor1051660303"
}

Chez les poissons d'eau douce, l'ammoniaque est excrétée à travers l'épithélium branchial par diffusion passive de NH(3). Ce NH(3) est ensuite piégé sous forme de NH(4)(+) dans une couche limite non agitée acide située à côté de la branchie, qui maintient le gradient de pression partielle de NH(3) du sang vers l'eau de la branchie. Les approches sur l'animal entier, in situ, ultrastructurales et moléculaires suggèrent que l'acidification de la couche limite résulte de l'hydratation du CO(2) dans l'eau de la branchie expirée, et dans une moindre mesure de l'excrétion de H(+) médiée par des H(+)-ATPases apicaux. L'acidification de la couche limite est insignifiante dans l'eau de mer fortement tamponnée, où l'excrétion d'ammoniaque se fait par diffusion de NH(3), ainsi que par diffusion passive de NH(4)(+) en raison de la perméabilité ionique plus élevée des branchies des poissons marins. Bien que des échangeurs Na(+)/H(+) (NHE) aient été isolés dans les branchies de poissons marins, un échange possible Na(+)/NH(4)(+) via ces protéines attend une évaluation utilisant des techniques électrophysiologiques et moléculaires modernes. Bien que l'excrétion d'urée (J(Urea)) ait été pensée comme se faisant par diffusion passive, il est maintenant clair que la gestion branchiale de l'urée nécessite des transporteurs d'urée spécialisés. Quatre transporteurs d'urée ont été clonés chez les poissons, y compris le transporteur d'urée du rein de requin (shUT), qui est un transporteur facilité d'urée similaire au transporteur rénal UT-A2 mammalien. Un autre transporteur d'urée, caractérisé mais pas encore cloné, est l'antiporteur d'urée dépendant du Na(+) basolatéral de la branchie du requin, qui est essentiel pour la rétention d'urée chez les élasmobranches uréosmotiques. Chez les téléostéens uréotéliques tels que le tilapia du lac Magadi et le poisson-grenouille du golfe, les mtUT et tUT clonés sont des transporteurs facilités d'urée impliqués dans J(Urea). Un transporteur d'urée basolatéral récemment cloné de la branchie de l'anguille japonaise (eUT) pourrait en réalité être important pour la rétention d'urée lors de l'acclimatation à l'eau salée. Une approche multifacette, incorporant des techniques sur l'animal entier, histologiques, biochimiques, pharmacologiques et moléculaires, est nécessaire pour en savoir plus sur l'emplacement, le mécanisme d'action et la signification fonctionnelle des transporteurs d'urée chez les poissons.

@article{doi101002jez10123,
    author = "Wilkie, Michael P.",
    title = "Excrétion d'ammoniaque et gestion de l'urée par les branchies de poissons : compréhension actuelle et défis de recherche futurs",
    year = "2002",
    journal = "Journal of Experimental Zoology",
    abstract = "Chez les poissons d'eau douce, l'ammoniaque est excrétée à travers l'épithélium branchial par diffusion passive de NH(3). Ce NH(3) est ensuite piégé sous forme de NH(4)(+) dans une couche limite non agitée acide située à côté de la branchie, qui maintient le gradient de pression partielle de NH(3) du sang vers l'eau de la branchie. Les approches sur l'animal entier, in situ, ultrastructurales et moléculaires suggèrent que l'acidification de la couche limite résulte de l'hydratation du CO(2) dans l'eau de la branchie expirée, et dans une moindre mesure de l'excrétion de H(+) médiée par des H(+)-ATPases apicaux. L'acidification de la couche limite est insignifiante dans l'eau de mer fortement tamponnée, où l'excrétion d'ammoniaque se fait par diffusion de NH(3), ainsi que par diffusion passive de NH(4)(+) en raison de la perméabilité ionique plus élevée des branchies des poissons marins. Bien que des échangeurs Na(+)/H(+) (NHE) aient été isolés dans les branchies de poissons marins, un échange possible Na(+)/NH(4)(+) via ces protéines attend une évaluation utilisant des techniques électrophysiologiques et moléculaires modernes. Bien que l'excrétion d'urée (J(Urea)) ait été pensée comme se faisant par diffusion passive, il est maintenant clair que la gestion branchiale de l'urée nécessite des transporteurs d'urée spécialisés. Quatre transporteurs d'urée ont été clonés chez les poissons, y compris le transporteur d'urée du rein de requin (shUT), qui est un transporteur facilité d'urée similaire au transporteur rénal UT-A2 mammalien. Un autre transporteur d'urée, caractérisé mais pas encore cloné, est l'antiporteur d'urée dépendant du Na(+) basolatéral de la branchie du requin, qui est essentiel pour la rétention d'urée chez les élasmobranches uréosmotiques. Chez les téléostéens uréotéliques tels que le tilapia du lac Magadi et le poisson-grenouille du golfe, les mtUT et tUT clonés sont des transporteurs facilités d'urée impliqués dans J(Urea). Un transporteur d'urée basolatéral récemment cloné de la branchie de l'anguille japonaise (eUT) pourrait en réalité être important pour la rétention d'urée lors de l'acclimatation à l'eau salée. Une approche multifacette, incorporant des techniques sur l'animal entier, histologiques, biochimiques, pharmacologiques et moléculaires, est nécessaire pour en savoir plus sur l'emplacement, le mécanisme d'action et la signification fonctionnelle des transporteurs d'urée chez les poissons.",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.10123",
    doi = "10.1002/jez.10123",
    openalex = "W2079933355",
    references = "doi101111j1469185x1936tb00497x, doi101242jeb1982273, openalexw2170405949"
}

Cette revue résume les informations sur le cannibalisme filial (l'acte de manger sa propre descendance) chez les poissons téléostéens. Les parents cannibales peuvent soit consommer leur couvée entière (cannibalisme filial total), soit ne manger qu'une partie des œufs dans le nid (cannibalisme filial partiel). La consommation de la descendance a été considérée comme adaptative sous l'hypothèse que la survie de la descendance est échangée contre l'alimentation, et que la descendance peut agir comme une source de nourriture alternative pour les parents. Les preuves soutenant les prédictions de base formulées sous ces hypothèses sont résumées pour le cannibalisme filial total et partiel. Ces deux formes de cannibalisme diffèrent considérablement, car la première représente un investissement uniquement dans le succès reproducteur futur, tandis que la seconde peut affecter à la fois le succès reproducteur présent et futur. Malgré quelques incohérences dans les données provenant d'études de laboratoire et sur le terrain, l'explication basée sur l'énergie semble valide pour les deux formes de cannibalisme. D'autres explications non basées sur l'énergie sont envisagées, mais elles ne peuvent expliquer la large distribution de ce comportement chez les téléostéens. Le conflit intersexuel découlant des tentatives du sexe non cannibale de minimiser le coût du cannibalisme filial est également discuté, ainsi que l'effet potentiel de ce comportement sur le ratio sexuel opérationnel au niveau de la population.

@article{doi101017s1464793101005905,
    author = "Manica, Andrea",
    title = "Cannibalisme filial chez les poissons téléostéens",
    year = "2002",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Société philosophique de Cambridge",
    abstract = "Cette revue résume les informations sur le cannibalisme filial (l'acte de manger sa propre descendance) chez les poissons téléostéens. Les parents cannibales peuvent soit consommer leur couvée entière (cannibalisme filial total), soit ne manger qu'une partie des œufs dans le nid (cannibalisme filial partiel). La consommation de la descendance a été considérée comme adaptative sous l'hypothèse que la survie de la descendance est échangée contre l'alimentation, et que la descendance peut agir comme une source de nourriture alternative pour les parents. Les preuves soutenant les prédictions de base formulées sous ces hypothèses sont résumées pour le cannibalisme filial total et partiel. Ces deux formes de cannibalisme diffèrent considérablement, car la première représente un investissement uniquement dans le succès reproducteur futur, tandis que la seconde peut affecter à la fois le succès reproducteur présent et futur. Malgré quelques incohérences dans les données provenant d'études de laboratoire et sur le terrain, l'explication basée sur l'énergie semble valide pour les deux formes de cannibalisme. D'autres explications non basées sur l'énergie sont envisagées, mais elles ne peuvent expliquer la large distribution de ce comportement chez les téléostéens. Le conflit intersexuel découlant des tentatives du sexe non cannibale de minimiser le coût du cannibalisme filial est également discuté, ainsi que l'effet potentiel de ce comportement sur le ratio sexuel opérationnel au niveau de la population.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s1464793101005905",
    doi = "10.1017/s1464793101005905",
    openalex = "W2079225060",
    references = "doi101007bf00042661"
}

Résumé Le cannibalisme est un phénomène fréquent chez les poissons, en particulier dans les environnements d'élevage où les poissons ne peuvent pas échapper à la prédation par la ségrégation d'habitat ou la migration. Toutes les espèces de poissons d'élevage ne commencent pas à présenter du cannibalisme au même âge ou à la même taille, et le cannibalisme n'est pas également intense chez différentes espèces ou à différents stades de vie. Les rapports de taille entre prédateur et proie varient considérablement entre les espèces et les stades de vie, principalement parce que le cannibalisme est régi par les limitations de la taille de la gueule et la croissance allométrique des pièces buccales. Le développement des organes sensoriels, des parties du corps dures, des capacités de nage et d'échappement chez à la fois le prédateur et la proie influencent également la sélectivité de la taille de la proie. La dynamique du cannibalisme est influencée par ces facteurs, ainsi que par des facteurs environnementaux qui ont des effets sur l'ingestion de nourriture, la décompensation de croissance et facilitent ou compliquent l'affichage du comportement cannibale. Les connaissances sur le comportement cannibale et la logistique du cannibalisme, ainsi que l'amélioration environnementale, sont des prérequis pour l'atténuation du cannibalisme en aquaculture. De plus, dans le contexte de la sélection de souches, il est important de déterminer si les cannibales sont des tueurs nés ou simplement des gagnants au hasard. Ces facteurs sont discutés, principalement dans la mesure où ils s'appliquent au cannibalisme intra-cohortes. De plus, des lignes directrices sont suggérées pour l'évaluation des risques de cannibalisme, et des méthodes d'atténuation du cannibalisme sont discutées.

@article{doi101046j13652109200200732x,
    author = "Baras, Etienne et Jobling, Malcolm",
    title = "Dynamique du cannibalisme intra-cohortes chez les poissons d'élevage",
    year = "2002",
    journal = "Aquaculture Research",
    abstract = "Résumé Le cannibalisme est un phénomène fréquent chez les poissons, en particulier dans les environnements d'élevage où les poissons ne peuvent pas échapper à la prédation par la ségrégation d'habitat ou la migration. Toutes les espèces de poissons d'élevage ne commencent pas à présenter du cannibalisme au même âge ou à la même taille, et le cannibalisme n'est pas également intense chez différentes espèces ou à différents stades de vie. Les rapports de taille entre prédateur et proie varient considérablement entre les espèces et les stades de vie, principalement parce que le cannibalisme est régi par les limitations de la taille de la gueule et la croissance allométrique des pièces buccales. Le développement des organes sensoriels, des parties du corps dures, des capacités de nage et d'échappement chez à la fois le prédateur et la proie influencent également la sélectivité de la taille de la proie. La dynamique du cannibalisme est influencée par ces facteurs, ainsi que par des facteurs environnementaux qui ont des effets sur l'ingestion de nourriture, la décompensation de croissance et facilitent ou compliquent l'affichage du comportement cannibale. Les connaissances sur le comportement cannibale et la logistique du cannibalisme, ainsi que l'amélioration environnementale, sont des prérequis pour l'atténuation du cannibalisme en aquaculture. De plus, dans le contexte de la sélection de souches, il est important de déterminer si les cannibales sont des tueurs nés ou simplement des gagnants au hasard. Ces facteurs sont discutés, principalement dans la mesure où ils s'appliquent au cannibalisme intra-cohortes. De plus, des lignes directrices sont suggérées pour l'évaluation des risques de cannibalisme, et des méthodes d'atténuation du cannibalisme sont discutées.",
    url = "https://doi.org/10.1046/j.1365-2109.2002.00732.x",
    doi = "10.1046/j.1365-2109.2002.00732.x",
    openalex = "W2099452444",
    references = "doi101007bf00042661"
}

Le développement des canaux latéraux crâniens et des organes neuromastiques est décrit chez le poisson zèbre postembryonnaire (0-80 jours post-fécondation). Le développement des canaux crâniens commence plusieurs semaines après l'éclosion, est initié à proximité des neuromastes individuels et se déroule en quatre stades discrets décrits histologiquement. Les neuromastes restent dans les sillons des canaux ouverts pendant plusieurs semaines, durant lesquelles ils changent considérablement de forme et augmentent de taille en ajoutant des cellules ciliées à un rythme dix fois inférieur à celui de l'oreille interne du poisson zèbre. La microscopie électronique à balayage démontre que les neuromastes s'allongent perpendiculairement à l'axe du canal et à l'axe de polarisation des cellules ciliées et qu'ils manquent d'une population de cellules non sensorielles proéminentes entourant les cellules ciliées - des caractéristiques qui rendent les neuromastes du poisson zèbre inhabituels parmi les poissons. Ces résultats exigent une réévaluation de la diversité des neuromastes et des canaux latéraux chez les poissons et soulignent l'utilité du système latéral du poisson zèbre postembryonnaire pour les études expérimentales et génétiques du développement et de la croissance des épithéliums de cellules ciliées.

@article{doi101002dvdy10385,
    author = "Webb, Jacqueline F. et Shirey, Jonathan E.",
    title = "Développement postembryonnaire des canaux latéraux crâniens et des neuromastes chez le poisson zèbre",
    year = "2003",
    journal = "Developmental Dynamics",
    abstract = "Le développement des canaux latéraux crâniens et des organes neuromastiques est décrit chez le poisson zèbre postembryonnaire (0-80 jours post-fécondation). Le développement des canaux crâniens commence plusieurs semaines après l'éclosion, est initié à proximité des neuromastes individuels et se déroule en quatre stades discrets décrits histologiquement. Les neuromastes restent dans les sillons des canaux ouverts pendant plusieurs semaines, durant lesquelles ils changent considérablement de forme et augmentent de taille en ajoutant des cellules ciliées à un rythme dix fois inférieur à celui de l'oreille interne du poisson zèbre. La microscopie électronique à balayage démontre que les neuromastes s'allongent perpendiculairement à l'axe du canal et à l'axe de polarisation des cellules ciliées et qu'ils manquent d'une population de cellules non sensorielles proéminentes entourant les cellules ciliées - des caractéristiques qui rendent les neuromastes du poisson zèbre inhabituels parmi les poissons. Ces résultats exigent une réévaluation de la diversité des neuromastes et des canaux latéraux chez les poissons et soulignent l'utilité du système latéral du poisson zèbre postembryonnaire pour les études expérimentales et génétiques du développement et de la croissance des épithéliums de cellules ciliées.",
    url = "https://doi.org/10.1002/dvdy.10385",
    doi = "10.1002/dvdy.10385",
    openalex = "W2061905890",
    references = "doi10100797814612053338, doi10100797814612356063"
}

Les poissons ostéichthyens et chondrichthyens présentent une diversité étonnante de tissus squelettiques et dentaires qui sont souvent difficiles à classer dans les catégories standard des manuels de biologie, c'est-à-dire os, cartilage, dentine et émail. Pour répondre à la question de la manière dont les tissus du squelette dermique ont évolué à partir de la situation ancestrale et donné naissance à la diversité réellement rencontrée, nous passons en revue les données antérieures sur le développement de plusieurs éléments du squelette dermique (odontodes, dents et denticules dermiques, os dermiques crâniens, plaques et écailles dermiques postcrâniennes, écailles élamoïdes et ganoïdes, et rayons des nageoires). Une comparaison des stades de développement au niveau tissulaire permet généralement d'identifier les populations cellulaires skeletogéniques comme étant soit odontogéniques soit ostéogéniques, sur la base du lieu de formation de leurs papilles dermiques et de la manière dont leurs tissus sont déposés. Nos études soutiennent les affinités évolutives (1) entre les odontodes, les dents et les denticules, (2) entre les écailles ganoïdes des polyptéridés et les écailles élamoïdes des téléostéens, et (3) dans une moindre mesure entre les différents éléments osseux. Il existe maintenant des preuves abondantes pour établir que les tissus de l'écaille élamoïde sont dérivés de tissus dentaires et non de tissus osseux. Cette revue démontre l'avantage que l'on peut tirer des études de développement, au niveau tissulaire, pour inférer les relations évolutives au sein du squelette dermique chez les chondrichthyens et les ostéichthyens.

@article{doi101017s1464793102006073,
    author = "Sire, Jean‐Yves et Huysseune, Ann",
    title = "Formation des tissus squelettiques dermiques et dentaires chez les poissons : une approche comparative et évolutive",
    year = "2003",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews de la Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Les poissons ostéichthyens et chondrichthyens présentent une diversité étonnante de tissus squelettiques et dentaires qui sont souvent difficiles à classer dans les catégories standard des manuels de biologie, c'est-à-dire os, cartilage, dentine et émail. Pour répondre à la question de la manière dont les tissus du squelette dermique ont évolué à partir de la situation ancestrale et donné naissance à la diversité réellement rencontrée, nous passons en revue les données antérieures sur le développement de plusieurs éléments du squelette dermique (odontodes, dents et denticules dermiques, os dermiques crâniens, plaques et écailles dermiques postcrâniennes, écailles élamoïdes et ganoïdes, et rayons des nageoires). Une comparaison des stades de développement au niveau tissulaire permet généralement d'identifier les populations cellulaires skeletogéniques comme étant soit odontogéniques soit ostéogéniques, sur la base du lieu de formation de leurs papilles dermiques et de la manière dont leurs tissus sont déposés. Nos études soutiennent les affinités évolutives (1) entre les odontodes, les dents et les denticules, (2) entre les écailles ganoïdes des polyptéridés et les écailles élamoïdes des téléostéens, et (3) dans une moindre mesure entre les différents éléments osseux. Il existe maintenant des preuves abondantes pour établir que les tissus de l'écaille élamoïde sont dérivés de tissus dentaires et non de tissus osseux. Cette revue démontre l'avantage que l'on peut tirer des études de développement, au niveau tissulaire, pour inférer les relations évolutives au sein du squelette dermique chez les chondrichthyens et les ostéichthyens.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s1464793102006073",
    doi = "10.1017/s1464793102006073",
    openalex = "W2036850921",
    references = "doi101002jmor1051660303, doi10100797814615696887, doi101111j1469185x1999tb00045x, doi101111j160007221998tb02212x"
}

L'homologie est à la base des études comparatives en biologie à tous les niveaux, des gènes aux phénotypes. L'homologie est une similitude due à la descendance et à l'ascendance communes ; l'homoplasie est une similitude acquise par évolution indépendante. Cependant, étant donné qu'il n'existe qu'un seul arbre de la vie, tous les organismes, et donc toutes les caractéristiques des organismes, partagent un certain degré de relation et de similitude les uns avec les autres. Ce partage peut être une similitude, voire une identité de structure et le partage d'un ancêtre commun le plus récent – comme dans l'homologie des bras des humains et des singes – ou il peut refléter un certain (souvent faible) degré de similitude, tel que celui entre les ailes des insectes et les ailes des oiseaux, groupes dont l'ancêtre commun se trouve profondément dans l'histoire évolutive des Métazoaires. Il peut refléter le partage de voies de développement entières, un partage partiel ou des voies divergentes. Cette revue compare les caractéristiques classées comme homologues aux classes de caractéristiques normalement regroupées comme homoplastiques, ces dernières étant la convergence, le parallélisme, les réversions, les rudiments, les vestiges et les atavismes. D'une part, les mécanismes de développement peuvent être conservés, même lorsqu'une structure complète ne se forme pas (rudiments, vestiges), ou lorsqu'une structure n'apparaît que chez certains individus (atavismes). D'autre part, différents mécanismes de développement peuvent produire des caractéristiques similaires (homologues). L'examen conjoint de la proximité de la relation et du degré de développement partagé révèle un continuum au sein d'une catégorie élargie d'homologie, s'étendant de l'homologie → réversions → rudiments → vestiges → atavismes → parallélisme, avec la convergence comme seule classe d'homoplasie, une idée qui s'avère être surprenamment ancienne. Ce réalignement offre un aperçu d'une manière de relier les approches phylogénétiques et développementales de l'homologie et de l'homoplasie, un pont qui devrait fournir un pilier clé pour la biologie évolutive du développement (evo-devo). Il ne modifiera pas, et ne peut pas, dans un sens pratique, la manière dont les caractéristiques homoplastiques sont identifiées dans les analyses phylogénétiques. Mais considérer les rudiments, les réversions, les vestiges, les atavismes et le parallélisme comme plus proches de l'homologie que de l'homoplasie devrait nous guider vers la recherche des éléments communs sous-jacents à la formation du phénotype (ce que certains ont appelé l'homologie profonde des mécanismes génétiques et/ou cellulaires), plutôt que de discuter des caractéristiques en termes d'évolution partagée ou indépendante.

@article{doi101017s1464793102006097,
    author = "Hall, Brian K.",
    title = "Descent with modification: the unity underlying homology and homoplasy as seen through an analysis of development and evolution",
    year = "2003",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "L'homologie est à la base des études comparatives en biologie à tous les niveaux, des gènes aux phénotypes. L'homologie est une similitude due à la descendance et à l'ascendance communes ; l'homoplasie est une similitude acquise par évolution indépendante. Cependant, étant donné qu'il n'existe qu'un seul arbre de la vie, tous les organismes, et donc toutes les caractéristiques des organismes, partagent un certain degré de relation et de similitude les uns avec les autres. Ce partage peut être une similitude, voire une identité de structure et le partage d'un ancêtre commun le plus récent – comme dans l'homologie des bras des humains et des singes – ou il peut refléter un certain (souvent faible) degré de similitude, tel que celui entre les ailes des insectes et les ailes des oiseaux, groupes dont l'ancêtre commun se trouve profondément dans l'histoire évolutive des Métazoaires. Il peut refléter le partage de voies de développement entières, un partage partiel ou des voies divergentes. Cette revue compare les caractéristiques classées comme homologues aux classes de caractéristiques normalement regroupées comme homoplastiques, ces dernières étant la convergence, le parallélisme, les réversions, les rudiments, les vestiges et les atavismes. D'une part, les mécanismes de développement peuvent être conservés, même lorsqu'une structure complète ne se forme pas (rudiments, vestiges), ou lorsqu'une structure n'apparaît que chez certains individus (atavismes). D'autre part, différents mécanismes de développement peuvent produire des caractéristiques similaires (homologues). L'examen conjoint de la proximité de la relation et du degré de développement partagé révèle un continuum au sein d'une catégorie élargie d'homologie, s'étendant de l'homologie → réversions → rudiments → vestiges → atavismes → parallélisme, avec la convergence comme seule classe d'homoplasie, une idée qui s'avère être surprenamment ancienne. Ce réalignement offre un aperçu d'une manière de relier les approches phylogénétiques et développementales de l'homologie et de l'homoplasie, un pont qui devrait fournir un pilier clé pour la biologie évolutive du développement (evo-devo). Il ne modifiera pas, et ne peut pas, dans un sens pratique, la manière dont les caractéristiques homoplastiques sont identifiées dans les analyses phylogénétiques. Mais considérer les rudiments, les réversions, les vestiges, les atavismes et le parallélisme comme plus proches de l'homologie que de l'homoplasie devrait nous guider vers la recherche des éléments communs sous-jacents à la formation du phénotype (ce que certains ont appelé l'homologie profonde des mécanismes génétiques et/ou cellulaires), plutôt que de discuter des caractéristiques en termes d'évolution partagée ou indépendante.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s1464793102006097",
    doi = "10.1017/s1464793102006097",
    openalex = "W2168524476",
    references = "doi10100797814899175155, doi1010079789401579261, doi1016680003156920000400718bgadbt20co2, doi1023071377078, doi1023072992444, openalexw1511255518, openalexw1593551567, openalexw1600651929, openalexw2163836228, openalexw635257420"
}

Dans la première partie de cet article, nous passons en revue les connaissances actuelles concernant les écailles de poissons, en nous concentrant sur les écailles élasmoïdes, le seul type présent chez deux espèces modèles, le poisson-zèbre et le medaka. Après avoir examiné la structure des écailles et leur origine évolutive, nous décrivons la formation du motif de squamation. La régularité de ce processus suggère une pré-motivation de la peau avant l'initiation des écailles. Nous résumons ensuite la dynamique du développement des écailles sur la base d'observations morphologiques. En l'absence de données moléculaires, ces observations soutiennent l'existence de cascades génétiques impliquées dans le contrôle du développement des écailles. Dans la deuxième partie de cet article, nous illustrons le potentiel que le développement des écailles offre comme modèle pour étudier l'organogenèse médiée par les interactions épithélial-mésenchymateuses. En utilisant le poisson-zèbre (Danio rerio), nous avons combiné la coloration à l'alizarine rouge, la microscopie optique et électronique en transmission et l'hybridation in situ utilisant une sonde ARN anti-sens pour le gène sonic hedgehog (shh). Les écailles se développent tardivement dans l'ontogenèse (30 jours post-fécondation) et près du revêtement épidermique. Seules les cellules de la couche épidermique basale expriment shh. Les transcrits sont d'abord détectés après la formation des papilles des écailles. Ainsi, shh n'est pas impliqué dans les mécanismes contrôlant la squamation et l'initiation des écailles. À mesure que les écailles s'agrandissent, l'expression de shh est progressivement restreinte à un sous-ensemble de cellules épidermiques basales situées dans la région qui recouvre leur champ postérieur. Ce motif d'expression suggère que shh pourrait être impliqué dans le contrôle de la morphogenèse et de la différenciation des écailles en relation avec la formation du repli épidermique dans la région postérieure.

@article{doi101387ijdb15272389,
    author = "Sire, Jean‐Yves et Akimenko, Marie‐Andrée",
    title = "Scale development in fish: a review, with description of sonic hedgehog (shh) expression in the zebrafish (Danio rerio).",
    year = "2004",
    journal = "The International Journal of Developmental Biology",
    abstract = "Dans la première partie de cet article, nous passons en revue les connaissances actuelles concernant les écailles de poissons, en nous concentrant sur les écailles élasmoïdes, le seul type présent chez deux espèces modèles, le poisson-zèbre et le medaka. Après avoir examiné la structure des écailles et leur origine évolutive, nous décrivons la formation du motif de squamation. La régularité de ce processus suggère une pré-motivation de la peau avant l'initiation des écailles. Nous résumons ensuite la dynamique du développement des écailles sur la base d'observations morphologiques. En l'absence de données moléculaires, ces observations soutiennent l'existence de cascades génétiques impliquées dans le contrôle du développement des écailles. Dans la deuxième partie de cet article, nous illustrons le potentiel que le développement des écailles offre comme modèle pour étudier l'organogenèse médiée par les interactions épithélial-mésenchymateuses. En utilisant le poisson-zèbre (Danio rerio), nous avons combiné la coloration à l'alizarine rouge, la microscopie optique et électronique en transmission et l'hybridation in situ utilisant une sonde ARN anti-sens pour le gène sonic hedgehog (shh). Les écailles se développent tardivement dans l'ontogenèse (30 jours post-fécondation) et près du revêtement épidermique. Seules les cellules de la couche épidermique basale expriment shh. Les transcrits sont d'abord détectés après la formation des papilles des écailles. Ainsi, shh n'est pas impliqué dans les mécanismes contrôlant la squamation et l'initiation des écailles. À mesure que les écailles s'agrandissent, l'expression de shh est progressivement restreinte à un sous-ensemble de cellules épidermiques basales situées dans la région qui recouvre leur champ postérieur. Ce motif d'expression suggère que shh pourrait être impliqué dans le contrôle de la morphogenèse et de la différenciation des écailles en relation avec la formation du repli épidermique dans la région postérieure.",
    url = "https://doi.org/10.1387/ijdb.15272389",
    doi = "10.1387/ijdb.15272389",
    openalex = "W2094026255",
    references = "doi101002jmor1051660303, doi10100797814615696887, doi105962bhltitle4275"
}

Historiquement, les philosophes de la biologie ont tendance à éviter le problème du développement en se concentrant principalement sur la biologie évolutive et, plus récemment, sur la biologie moléculaire et la génétique. Très souvent aussi, le développement a été mal compris comme étant simplement, voire principalement, une question d'activation et de régulation des gènes. Aujourd'hui, un nombre croissant de philosophes des sciences concentrent leurs analyses sur les complexités du développement, et dans Embryologie, Épigenèse et Évolution, Jason Scott Robert explore la nature du développement à l'encontre des tendances actuelles en théorie et pratique biologiques et examine les interrelations entre le développement et l'évolution (évo-dévo), un domaine d'intérêt biologique en pleine résurgence. Clair et bien écrit, ce livre devrait intéresser les étudiants et les professionnels en philosophie des sciences et en philosophie de la biologie.

@article{doi105860choice422215,
    title = "Embryologie, épigénèse et évolution : prendre le développement au sérieux",
    year = "2004",
    journal = "Choice Reviews Online",
    abstract = "Historiquement, les philosophes de la biologie ont tendance à éviter le problème du développement en se concentrant principalement sur la biologie évolutive et, plus récemment, sur la biologie moléculaire et la génétique. Très souvent aussi, le développement a été mal compris comme étant simplement, voire principalement, une question d'activation et de régulation des gènes. Aujourd'hui, un nombre croissant de philosophes des sciences concentrent leurs analyses sur les complexités du développement, et dans Embryologie, Épigenèse et Évolution, Jason Scott Robert explore la nature du développement à l'encontre des tendances actuelles en théorie et pratique biologiques et examine les interrelations entre le développement et l'évolution (évo-dévo), un domaine d'intérêt biologique en pleine résurgence. Clair et bien écrit, ce livre devrait intéresser les étudiants et les professionnels en philosophie des sciences et en philosophie de la biologie.",
    url = "https://doi.org/10.5860/choice.42-2215",
    doi = "10.5860/choice.42-2215",
    openalex = "W563979555",
    references = "doi101038276565a0, doi10103835057062, doi101046j1525142x2001003002047x, doi101098rspb19790086, doi101126science1058040, doi1023072026953, doi1023072576242, doi1023072678463, doi105860choice396411, openalexw2506868775, openalexw2624262714, openalexw3135630760"
}

@article{doi101007s1106800583531,
    author = "Hansen, Anne et Zielinski, Barbara S.",
    title = "Diversité dans l'épithélium olfactif des poissons osseux : Développement, arrangement lamellaire, types de cellules des neurones sensoriels et composants de transduction",
    year = "2005",
    journal = "Journal of Neurocytology",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11068-005-8353-1",
    doi = "10.1007/s11068-005-8353-1",
    openalex = "W2056529429",
    references = "doi101002cne920200404, doi101111j109636421932tb01553x"
}

Les données publiées sur la diversité, l'histoire de vie, l'écologie et le statut des elasmobranches d'eau douce et eurihalines ont été examinées dans le contexte des menaces anthropiques et des principes de la biologie de la conservation. Au moins 171 espèces d'elasmobranches, représentant 68 genres et 34 familles, sont enregistrées dans les eaux douces ou estuariennes. Parmi celles-ci, plus de la moitié sont marginales dans les estuaires, moins d'un dixième sont eurihalines, et un cinquième sont obligatoires en eau douce. Les elasmobranches obligatoirement d'eau douce sont dominés par les raies myliobatoides, dont les deux tiers sont des potamotrygonides endémiques des bassins versants atlantiques d'Amérique du Sud. Les elasmobranches d'eau douce et eurihalines suivent des histoires de vie fortement sélectionnées par le facteur K et se nourrissent à des niveaux trophiques élevés, similaires à ceux de leurs parents marins. Cependant, les elasmobranches d'eau douce et eurihalines sont également soumises à des contraintes d'habitat, notamment un volume et une variabilité physico-chimique plus limités que l'océan, ce qui peut les rendre plus vulnérables que les elasmobranches marins aux effets des activités humaines. La plus grande diversité et abondance d'elasmobranches d'eau douce et eurihalines se trouvent dans les pays tropicaux avec des populations humaines énormes et en croissance rapide, notamment en Amérique du Sud, en Afrique de l'Ouest et en Asie du Sud-Est. La connaissance de la biologie, de la distribution, de l'écologie et du statut des elasmobranches d'eau douce et eurihalines est entravée par des problèmes taxonomiques non résolus, qui sont brièvement résumés. Pour clarifier certains problèmes liés à la conservation des elasmobranches d'eau douce et eurihalines, une attention particulière est portée aux requins du genre Glyphis, aux pristidés et aux potamotrygonides. Pour favoriser la libération en vie lorsque cela est possible, ainsi que prévenir l'élimination d'échantillons et la perte de données, une clé illustrée pour différencier les requins Carcharhinus de Glyphis est fournie. Les elasmobranches obligatoirement d'eau douce à répartition géographique limitée sont considérées comme les plus vulnérables à l'extinction, mais les elasmobranches eurihalines qui nécessitent un accès à la mer pour se reproduire sont également exposées à un risque significatif. Sur la base des données et des principes de la biologie de la conservation susmentionnés, des plans d'action suggérés pour la conservation des elasmobranches d'eau douce et eurihalines et la conservation des habitats d'eau douce sont fournis.

@article{doi101017s0025315405012105,
    author = "Martin, Ralph",
    title = "conservation of freshwater and euryhaline elasmobranchs: a review",
    year = "2005",
    journal = "Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom",
    abstract = "Les données publiées sur la diversité, l'histoire de vie, l'écologie et le statut des elasmobranches d'eau douce et eurihalines ont été examinées dans le contexte des menaces anthropiques et des principes de la biologie de la conservation. Au moins 171 espèces d'elasmobranches, représentant 68 genres et 34 familles, sont enregistrées dans les eaux douces ou estuariennes. Parmi celles-ci, plus de la moitié sont marginales dans les estuaires, moins d'un dixième sont eurihalines, et un cinquième sont obligatoires en eau douce. Les elasmobranches obligatoirement d'eau douce sont dominés par les raies myliobatoides, dont les deux tiers sont des potamotrygonides endémiques des bassins versants atlantiques d'Amérique du Sud. Les elasmobranches d'eau douce et eurihalines suivent des histoires de vie fortement sélectionnées par le facteur K et se nourrissent à des niveaux trophiques élevés, similaires à ceux de leurs parents marins. Cependant, les elasmobranches d'eau douce et eurihalines sont également soumises à des contraintes d'habitat, notamment un volume et une variabilité physico-chimique plus limités que l'océan, ce qui peut les rendre plus vulnérables que les elasmobranches marins aux effets des activités humaines. La plus grande diversité et abondance d'elasmobranches d'eau douce et eurihalines se trouvent dans les pays tropicaux avec des populations humaines énormes et en croissance rapide, notamment en Amérique du Sud, en Afrique de l'Ouest et en Asie du Sud-Est. La connaissance de la biologie, de la distribution, de l'écologie et du statut des elasmobranches d'eau douce et eurihalines est entravée par des problèmes taxonomiques non résolus, qui sont brièvement résumés. Pour clarifier certains problèmes liés à la conservation des elasmobranches d'eau douce et eurihalines, une attention particulière est portée aux requins du genre Glyphis, aux pristidés et aux potamotrygonides. Pour favoriser la libération en vie lorsque cela est possible, ainsi que prévenir l'élimination d'échantillons et la perte de données, une clé illustrée pour différencier les requins Carcharhinus de Glyphis est fournie. Les elasmobranches obligatoirement d'eau douce à répartition géographique limitée sont considérées comme les plus vulnérables à l'extinction, mais les elasmobranches eurihalines qui nécessitent un accès à la mer pour se reproduire sont également exposées à un risque significatif. Sur la base des données et des principes de la biologie de la conservation susmentionnés, des plans d'action suggérés pour la conservation des elasmobranches d'eau douce et eurihalines et la conservation des habitats d'eau douce sont fournis.",
    url = "https://doi.org/10.1017/s0025315405012105",
    doi = "10.1017/s0025315405012105",
    openalex = "W2096292907",
    references = "doi101111j109636421996tb02189x, openalexw1511461941"
}

Les arcs branchiaux sont des structures vertébrées méristiques, étant métabriques à la fois entre eux au sein de la série rostrocaudale le long de la surface ventrocéphalique de la tête embryonnaire et au sein de chaque arc individuel : ainsi, tout comme chaque arc branchial doit acquérir une identité unique le long de l'axe rostrocaudal, chaque structure au sein de l'axe proximodistal d'un arc doit également acquérir une identité unique. On pense que la spécification régionale des structures métabriques est contrôlée par l'expression imbriquée de gènes apparentés aboutissant à un code régional, un principe qui est censé être démontré par la régulation du développement de l'axe rostrocaudal chez les animaux exercée par les gènes HOM-C/Hox imbriqués. Le motif d'expression imbriqué des gènes Dlx au sein de l'ectomesenchyme des arcs branchiaux murins a plus récemment conduit à la proposition d'un code Dlx pour la spécification régionale le long de l'axe proximodistal des arcs branchiaux (c'est-à-dire qu'il établit l'identité intra-arc). Cette revue réexamine cette hypothèse et présente de nouveaux travaux sur une série allélique de mutants de souris à perte de fonction Dlx qui comprend diverses combinaisons de Dlx1, Dlx2, Dlx3, Dlx5 et Dlx6. Bien que nous confirmions des aspects fondamentaux de l'hypothèse, nous rapportons également un certain nombre de découvertes nouvelles. Premièrement, contrairement aux rapports initiaux, les hétérozygotes Dlx1, Dlx2 et Dlx1/2 présentent des altérations des structures des arcs branchiaux et les mutants Dlx2-/- et Dlx1/2-/- présentent de légères altérations des structures dérivées des portions distales de leurs arcs branchiaux. Deuxièmement, nous présentons des preuves d'un rôle du Dlx3 murin dans le développement des arcs branchiaux. Troisièmement, l'analyse des mutants Dlx composés révèle quatre degrés de transformations de l'arc mandibulaire et que les interactions génétiques des paralogues cis de premier ordre (par exemple Dlx5 et Dlx6), trans de second ordre (par exemple Dlx5 et Dlx2) et trans de troisième ordre (par exemple Dlx5 et Dlx1) entraînent des différences morphologiques significatives et distinctes dans le développement de l'arc mandibulaire. Nous concluons en intégrant les fonctions des gènes Dlx dans le contexte d'un mécanisme général hypothétique pour l'établissement du motif et de la polarité dans le premier arc branchial des gnathostomes qui inclut des facteurs de croissance sécrétés de manière régionale tels que Fgf8 et Bmp et d'autres facteurs de transcription tels que Msx1, et est à la fois cohérent avec la structure du plan corporel conservé de la mâchoire des gnathostomes et l'élaboration de ce plan corporel pour répondre aux conceptions finales de l'organisme.

@article{doi101111j14697580200500487x,
    author = "Depew, Michael J. and Simpson, Carol A. and Morasso, María I. and Rubenstein, John L.R.",
    title = "Reassessing the Dlx code: the genetic regulation of branchial arch skeletal pattern and development",
    year = "2005",
    journal = "Journal of Anatomy",
    abstract = "Les arcs branchiaux sont des structures vertébrées méristiques, étant métabriques à la fois entre eux au sein de la série rostrocaudale le long de la surface ventrocéphalique de la tête embryonnaire et au sein de chaque arc individuel : ainsi, tout comme chaque arc branchial doit acquérir une identité unique le long de l'axe rostrocaudal, chaque structure au sein de l'axe proximodistal d'un arc doit également acquérir une identité unique. On pense que la spécification régionale des structures métabriques est contrôlée par l'expression imbriquée de gènes apparentés aboutissant à un code régional, un principe qui est censé être démontré par la régulation du développement de l'axe rostrocaudal chez les animaux exercée par les gènes HOM-C/Hox imbriqués. Le motif d'expression imbriqué des gènes Dlx au sein de l'ectomesenchyme des arcs branchiaux murins a plus récemment conduit à la proposition d'un code Dlx pour la spécification régionale le long de l'axe proximodistal des arcs branchiaux (c'est-à-dire qu'il établit l'identité intra-arc). Cette revue réexamine cette hypothèse et présente de nouveaux travaux sur une série allélique de mutants de souris à perte de fonction Dlx qui comprend diverses combinaisons de Dlx1, Dlx2, Dlx3, Dlx5 et Dlx6. Bien que nous confirmions des aspects fondamentaux de l'hypothèse, nous rapportons également un certain nombre de découvertes nouvelles. Premièrement, contrairement aux rapports initiaux, les hétérozygotes Dlx1, Dlx2 et Dlx1/2 présentent des altérations des structures des arcs branchiaux et les mutants Dlx2-/- et Dlx1/2-/- présentent de légères altérations des structures dérivées des portions distales de leurs arcs branchiaux. Deuxièmement, nous présentons des preuves d'un rôle du Dlx3 murin dans le développement des arcs branchiaux. Troisièmement, l'analyse des mutants Dlx composés révèle quatre degrés de transformations de l'arc mandibulaire et que les interactions génétiques des paralogues cis de premier ordre (par exemple Dlx5 et Dlx6), trans de second ordre (par exemple Dlx5 et Dlx2) et trans de troisième ordre (par exemple Dlx5 et Dlx1) entraînent des différences morphologiques significatives et distinctes dans le développement de l'arc mandibulaire. Nous concluons en intégrant les fonctions des gènes Dlx dans le contexte d'un mécanisme général hypothétique pour l'établissement du motif et de la polarité dans le premier arc branchial des gnathostomes qui inclut des facteurs de croissance sécrétés de manière régionale tels que Fgf8 et Bmp et d'autres facteurs de transcription tels que Msx1, et est à la fois cohérent avec la structure du plan corporel conservé de la mâchoire des gnathostomes et l'élaboration de ce plan corporel pour répondre aux conceptions finales de l'organisme.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1469-7580.2005.00487.x",
    doi = "10.1111/j.1469-7580.2005.00487.x",
    openalex = "W1602845636",
    references = "doi101007978146122784737, doi1010970000505319311100000026, doi105962bhltitle6408, openalexw1568405999"
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L'anatomie neurologique de l'amphioxus est importante non seulement en soi, mais aussi pour les aperçus qu'elle fournit concernant l'origine évolutive et l'organisation de base du système nerveux des vertébrés. Cette revue résume la disposition générale du système nerveux central (SNC), des nerfs périphériques et des plexus nerveux chez l'amphioxus, ainsi que ce qui est actuellement connu de leur histologie et de leurs types cellulaires, avec une attention particulière aux nouvelles informations sur le cordon nerveux antérieur. La région intercalaire (RI) suscite un intérêt fonctionnel et évolutif particulier. Elle s'étend caudalement jusqu'à l'extrémité du somite 4, traditionnellement considéré comme la limite de la région cérébrale de l'amphioxus, et se distingue par la présence de plusieurs groupes cellulaires migrés. Contrairement à la plupart des autres neurones du cordon, ces cellules migrées se détachent du lumen ventriculaire et se déplacent dans le neuropile adjacent, tout comme les neurones en développement le font chez les vertébrés. Le système nerveux larvaire est également examiné, car il existe une abondance de nouvelles données sur l'organisation et les types cellulaires du cordon nerveux antérieur chez les jeunes larves, basées sur des analyses microscopiques électroniques détaillées et des études de traçage nerveux, ainsi qu'un consensus émergent concernant la manière dont cette région se rapporte au cerveau des vertébrés. On sait beaucoup moins sur la période intermédiaire de l'histoire de vie, c'est-à-dire la période entre la jeune larve et l'adulte, mais beaucoup de développement neural doit se produire durant cette période pour générer un système nerveux entièrement mature. Il est particulièrement intéressant que les équivalents vertébrés d'au moins certains événements postembryonniques de la neurogenèse de l'amphioxus se produisent, chez les vertébrés, dans l'embryon. Cela implique que l'ensemble de la phase postembryonnaire du développement neural chez l'amphioxus doit être pris en compte lors des comparaisons phylogénétiques. Pourtant, c'est une période sur laquelle on sait presque rien. Compte tenu de cela, ainsi que du nombre de nouvelles techniques moléculaires et immunocytochimiques désormais disponibles pour les chercheurs, il n'y a pas de manque de sujets de recherche intéressants utilisant l'amphioxus, quelle que soit sa stade, comme objet d'étude.

@article{doi101139z04163,
    author = "Wicht, Helmut and Lacalli, Thurston C.",
    title = "The nervous system of amphioxus: structure, development, and evolutionary significance",
    year = "2005",
    journal = "Canadian Journal of Zoology",
    abstract = "Amphioxus neuroanatomy is important not just in its own right but also for the insights it provides regarding the evolutionary origin and basic organization of the vertebrate nervous system. This review summarizes the overall layout of the central nervous system (CNS), peripheral nerves, and nerve plexuses in amphioxus, and what is currently known of their histology and cell types, with special attention to new information on the anterior nerve cord. The intercalated region (IR) is of special functional and evolutionary interest. It extends caudally to the end of somite 4, traditionally considered the limit of the brain-like region of the amphioxus CNS, and is notable for the presence of a number of migrated cell groups. Unlike most other neurons in the cord, these migrated cells detach from the ventricular lumen and move into the adjacent neuropile, much as developing neurons do in vertebrates. The larval nervous system is also considered, as there is a wealth of new data on the organization and cell types of the anterior nerve cord in young larvae, based on detailed electron microscopical analyses and nerve tracing studies, and an emerging consensus regarding how this region relates to the vertebrate brain. Much less is known about the intervening period of the life history, i.e., the period between the young larva and the adult, but a great deal of neural development must occur during this time to generate a fully mature nervous system. It is especially interesting that the vertebrate counterparts of at least some postembryonic events of amphioxus neurogenesis occur, in vertebrates, in the embryo. The implication is that the whole of the postembryonic phase of neural development in amphioxus needs to be considered when making phylogenetic comparisons. Yet this is a period about which almost nothing is known. Considering this, plus the number of new molecular and immunocytochemical techniques now available to researchers, there is no shortage of worthwhile research topics using amphioxus, of whatever stage, as a subject.",
    url = "https://doi.org/10.1139/z04-163",
    doi = "10.1139/z04-163",
    openalex = "W2092757339",
    references = "anadn1998distribution, bone1959the, bone1961the, castro2003distribution, dogiel1903das, doi101002cne901150105, doi101002jmor1050540103, doi1010079783642182624, doi101007bf00348527, doi101007bf02028391, doi101016jydbio200604457, doi101016s0022532062800070, doi101098rstb19940059, doi101098rstb19960022, doi101111j146363951995tb00986x, doi101139z04160, doi101159000079744, doi101159000147530, doi101242dev125142701, doi101242jcss310052509, doi1023071535762, doi103166jds1391111, doi105962bhltitle159385, doi105962bhltitle55924, flood1974histochemistry, holmes1953the, openalexw2394638245, openalexw659399033, ruiz1991the, stokes1995ciliary"
}

Une comparaison quantitative a été effectuée sur la taille relative du cerveau (encéphalisation) et le développement relatif de cinq zones cérébrales chez les requins pélagiques et les téléostéens. Deux zones d'intégration (le télencéphale et le corpus calleux) et trois zones sensorielles du cerveau (les bulbules olfactifs, le tectum optique et la zone octavolaterale, qui reçoivent respectivement les projections primaires de l'épithélium olfactif, de l'œil et des sens octavolateraux), ont été étudiées chez quatre espèces de requins pélagiques et six espèces de téléostéens pélagiques. Les proportions relatives des trois zones sensorielles du cerveau ont été évaluées en proportion du cerveau total « sensoriel », tandis que les deux zones d'intégration ont été évaluées par rapport au cerveau sensoriel. L'analyse allométrique de la taille relative du cerveau a révélé que les requins pélagiques avaient des cerveaux plus grands que les téléostéens pélagiques. Le volume du télencéphale était significativement plus grand chez les requins, tandis que le corpus calleux était également plus grand et plus fortement feuilleté chez ces animaux. Il y avait également des différences significatives dans le développement relatif des zones sensorielles du cerveau entre les deux groupes, les requins ayant des bulbules olfactifs et des zones octavolaterales plus grands, tandis que les téléostéens avaient des tecta optiques plus grands. L'analyse en clusters effectuée sur les données des zones sensorielles du cerveau a confirmé les différences dans la composition du cerveau sensoriel chez les requins et les téléostéens et indiqué que ces deux groupes de poissons pélagiques avaient évolué des stratégies sensorielles différentes pour faire face aux exigences de la vie en haute mer.

@article{doi101111j00221112200600940x,
    author = "Lisney, Thomas J. and Collin, Shaun P.",
    title = "Brain morphology in large pelagic fishes: a comparison between sharks and teleosts",
    year = "2006",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Une comparaison quantitative a été effectuée sur la taille relative du cerveau (encéphalisation) et le développement relatif de cinq zones cérébrales chez les requins pélagiques et les téléostéens. Deux zones d'intégration (le télencéphale et le corpus calleux) et trois zones sensorielles du cerveau (les bulbules olfactifs, le tectum optique et la zone octavolaterale, qui reçoivent respectivement les projections primaires de l'épithélium olfactif, de l'œil et des sens octavolateraux), ont été étudiées chez quatre espèces de requins pélagiques et six espèces de téléostéens pélagiques. Les proportions relatives des trois zones sensorielles du cerveau ont été évaluées en proportion du cerveau total « sensoriel », tandis que les deux zones d'intégration ont été évaluées par rapport au cerveau sensoriel. L'analyse allométrique de la taille relative du cerveau a révélé que les requins pélagiques avaient des cerveaux plus grands que les téléostéens pélagiques. Le volume du télencéphale était significativement plus grand chez les requins, tandis que le corpus calleux était également plus grand et plus fortement feuilleté chez ces animaux. Il y avait également des différences significatives dans le développement relatif des zones sensorielles du cerveau entre les deux groupes, les requins ayant des bulbules olfactifs et des zones octavolaterales plus grands, tandis que les téléostéens avaient des tecta optiques plus grands. L'analyse en clusters effectuée sur les données des zones sensorielles du cerveau a confirmé les différences dans la composition du cerveau sensoriel chez les requins et les téléostéens et indiqué que ces deux groupes de poissons pélagiques avaient évolué des stratégies sensorielles différentes pour faire face aux exigences de la vie en haute mer.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.0022-1112.2006.00940.x",
    doi = "10.1111/j.0022-1112.2006.00940.x",
    openalex = "W2057916053",
    references = "doi101007978364218262412"
}

Nous avons décrit les stades de développement pour les périodes embryonnaire, larvaire et juvénile précoce du tilapia du Nil Oreochromis niloticus afin d'élucider les événements séquentiels du développement crâniofacial. Le développement crâniofacial des cichlidés, en particulier la différenciation et la morphogenèse du squelette pharyngien, progresse jusqu'à environ 30 jours post-fécondation (jpf). Étant donné qu'il n'existe aucun rapport complet décrivant les processus séquentiels du développement crâniofacial jusqu'à 30 jpf, nous avons nouvellement défini 32 stades en utilisant un système de numérotation. Pour le développement embryonnaire, nous avons défini 18 stades (stades 1-18), regroupés en sept périodes nommées les périodes de zygote, de clivage, de blastula, de gastrula, de segmentation, de pharyngula et d'éclosion. Pour le développement larvaire, nous avons défini sept stades (stades 19-25), regroupés en deux périodes, larve précoce et larve tardive. Pour le développement juvénile jusqu'à 30 jpf, nous avons défini sept stades (stades 26-32) dans la période juvénile précoce. Ce système de stades de développement pour le tilapia du Nil O. niloticus bénéficiera aux chercheurs étudiant la skeletogenesis tout au long de l'ontogenèse du tilapia et facilitera également les études de biologie évolutive du développement comparatives des cichlidés haplochromines, qui comprennent les espèces des lacs Malawi et Victoria.

@article{doi101111j1440169x200700926x,
    author = "Fujimura, Koji et Okada, Norihiro",
    title = "Développement de l'embryon, de la larve et du juvénile précoce du tilapia du Nil Oreochromis niloticus (Pisces: Cichlidae). Système de stades de développement",
    year = "2007",
    journal = "Development Growth \& Differentiation",
    abstract = "Nous avons décrit les stades de développement pour les périodes embryonnaire, larvaire et juvénile précoce du tilapia du Nil Oreochromis niloticus afin d'élucider les événements séquentiels du développement crâniofacial. Le développement crâniofacial des cichlidés, en particulier la différenciation et la morphogenèse du squelette pharyngien, progresse jusqu'à environ 30 jours post-fécondation (jpf). Étant donné qu'il n'existe aucun rapport complet décrivant les processus séquentiels du développement crâniofacial jusqu'à 30 jpf, nous avons nouvellement défini 32 stades en utilisant un système de numérotation. Pour le développement embryonnaire, nous avons défini 18 stades (stades 1-18), regroupés en sept périodes nommées les périodes de zygote, de clivage, de blastula, de gastrula, de segmentation, de pharyngula et d'éclosion. Pour le développement larvaire, nous avons défini sept stades (stades 19-25), regroupés en deux périodes, larve précoce et larve tardive. Pour le développement juvénile jusqu'à 30 jpf, nous avons défini sept stades (stades 26-32) dans la période juvénile précoce. Ce système de stades de développement pour le tilapia du Nil O. niloticus bénéficiera aux chercheurs étudiant la skeletogenesis tout au long de l'ontogenèse du tilapia et facilitera également les études de biologie évolutive du développement comparatives des cichlidés haplochromines, qui comprennent les espèces des lacs Malawi et Victoria.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1440-169x.2007.00926.x",
    doi = "10.1111/j.1440-169x.2007.00926.x",
    openalex = "W1795668487",
    references = "doi101002jez1402670309, doi101139f75196"
}

@article{doi101016jcbpa200909031,
    author = "Speers‐Roesch, Ben et Treberg, Jason R.",
    title = "Le métabolisme énergétique inhabituel des poissons chondrichthyens",
    year = "2009",
    journal = "Comparative Biochemistry and Physiology Part A Molecular \& Integrative Physiology",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cbpa.2009.09.031",
    doi = "10.1016/j.cbpa.2009.09.031",
    openalex = "W2007450572",
    references = "doi101007978940113194013, doi101007bf00007454, doi101111j1469185x1936tb00497x, doi101201b118678"
}

@article{doi101007s1075001001203,
    author = "Logan, John M. et Lutcavage, Molly E.",
    title = "Dynamique des isotopes stables chez les poissons élasmobranches",
    year = "2010",
    journal = "Hydrobiologia",
    url = "https://doi.org/10.1007/s10750-010-0120-3",
    doi = "10.1007/s10750-010-0120-3",
    openalex = "W1993685048",
    references = "doi101111j1469185x1936tb00497x"
}

Chez la plupart des espèces, les spermatozoïdes de poissons activent leur motilité au contact du milieu extérieur (eau de mer ou eau douce selon leur habitat reproducteur). Leurs flagelles développent immédiatement des ondes propagées à une fréquence de battement élevée (jusqu'à 70 battements s(-1)), ce qui propulse ces cellules spermiques à grande vitesse (6-10 mm min(-1)), mais pour une période très courte, généralement limitée à quelques minutes. Leur incapacité spécifique à restaurer leur contenu énergétique (principalement l'adénosine triphosphate) assez rapidement par rapport à leur taux élevé de consommation d'énergie par les flagelles contribue principalement à l'arrêt de l'activité motrice, car les spermatozoïdes doivent compter sur l'énergie accumulée avant l'activation. Cette revue des données publiées explique la compréhension actuelle des mécanismes physico-chimiques par lesquels la motilité flagellaire est activée (principalement par régulation osmotique et ionique) et propulse ensuite les cellules spermiques à grande vitesse. Elle vise également à décrire l'arrêt progressif de leur motilité, dont une grande partie se produit en quelques minutes.

@article{doi101111j10958649200902504x,
    author = "Cosson, J.",
    title = "Activation frénétique des flagelles des spermatozoïdes de poissons entraîne une motilité à court terme, présageant leur décadence précoce",
    year = "2010",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Chez la plupart des espèces, les spermatozoïdes de poissons activent leur motilité au contact du milieu extérieur (eau de mer ou eau douce selon leur habitat reproducteur). Leurs flagelles développent immédiatement des ondes propagées à une fréquence de battement élevée (jusqu'à 70 battements s(-1)), ce qui propulse ces cellules spermiques à grande vitesse (6-10 mm min(-1)), mais pour une période très courte, généralement limitée à quelques minutes. Leur incapacité spécifique à restaurer leur contenu énergétique (principalement l'adénosine triphosphate) assez rapidement par rapport à leur taux élevé de consommation d'énergie par les flagelles contribue principalement à l'arrêt de l'activité motrice, car les spermatozoïdes doivent compter sur l'énergie accumulée avant l'activation. Cette revue des données publiées explique la compréhension actuelle des mécanismes physico-chimiques par lesquels la motilité flagellaire est activée (principalement par régulation osmotique et ionique) et propulse ensuite les cellules spermiques à grande vitesse. Elle vise également à décrire l'arrêt progressif de leur motilité, dont une grande partie se produit en quelques minutes.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2009.02504.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8649.2009.02504.x",
    openalex = "W2057524967",
    references = "openalexw612600151"
}

@book{doi105962bhltitle32902,
    author = "Dean, Bashford",
    title = "Chimæroid Fishes and Their Development",
    year = "2010",
    booktitle = "Biodiversity Heritage Library (Smithsonian Institution)",
    url = "https://doi.org/10.5962/bhl.title.32902",
    doi = "10.5962/bhl.title.32902",
    openalex = "W564594173"
}

Les muscles squelettiques exercent des fonctions diverses, permettant à la fois de broyer avec une grande force et de bouger avec une précision extrême. Un répertoire remarquablement distinct de gènes et de caractéristiques ontologiques caractérise ce tissu, et des preuves récentes ont montré que les muscles squelettiques de la tête, les muscles craniofaciaux, sont distincts sur le plan évolutif, morphologique et moléculaire de ceux du tronc. Ici, nous passons en revue la base moléculaire du développement des muscles craniofaciaux et discutons de la manière dont ce processus diffère du développement des muscles du tronc et des membres. Grâce à des comparaisons évolutives de chordés primitifs (tels que l'amphioxus) et de vertébrés à mâchoires (tels que les lampreys) avec les vertébrés à mâchoires, nous fournissons également quelques indices sur la manière dont cette dichotomie est apparue.

@article{doi101242dev040972,
    author = "Sambasivan, Ramkumar et Kuratani, Shigeru et Tajbakhsh, Shahragim",
    title = "An eye on the head : le développement et l'évolution des muscles craniofaciaux",
    year = "2011",
    journal = "Development",
    abstract = "Les muscles squelettiques exercent des fonctions diverses, permettant à la fois de broyer avec une grande force et de bouger avec une précision extrême. Un répertoire remarquablement distinct de gènes et de caractéristiques ontologiques caractérise ce tissu, et des preuves récentes ont montré que les muscles squelettiques de la tête, les muscles craniofaciaux, sont distincts sur le plan évolutif, morphologique et moléculaire de ceux du tronc. Ici, nous passons en revue la base moléculaire du développement des muscles craniofaciaux et discutons de la manière dont ce processus diffère du développement des muscles du tronc et des membres. Grâce à des comparaisons évolutives de chordés primitifs (tels que l'amphioxus) et de vertébrés à mâchoires (tels que les lampreys) avec les vertébrés à mâchoires, nous fournissons également quelques indices sur la manière dont cette dichotomie est apparue.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.040972",
    doi = "10.1242/dev.040972",
    openalex = "W2004543760",
    references = "doi101006dbio19999266, doi101046j1525142x199999019x, doi1010970000505319311100000026"
}

Les poissons d'eau douce invasifs représentent une menace majeure pour la biodiversité. Ici, nous démontrons d'abord l'expansion de domaine spectaculaire, médiatisée par l'homme, du guppy trinitarien (Poecilia reticulata), un poisson invasif réputé pour impacter négativement les communautés d'eau douce natives. Ensuite, nous explorons les mécanismes possibles qui pourraient expliquer l'établissement mondial réussi de cette espèce. Les guppies, ainsi que d'autres espèces de poissons invasives notables telles que le poisson-lion (Gambusia spp.), possèdent des adaptations reproductives aux habitats éphémères qui peuvent permettre aux introductions de très petits nombres de fondateurs de réussir. La remarquable capacité des guppies individuellement enceintes d'établir régulièrement des populations viables est démontrée à l'aide d'un mésocosme réplicatif mis en place. Dans 86 % des cas, ces populations ont persisté pendant deux ans (la durée de l'expérience). Le succès de l'établissement était indépendant de l'origine des fondateurs (habitats à forte et faible prédation), et il n'y a eu aucune perte de performance comportementale chez les juvéniles des mésocosmes. Cependant, les « signatures » comportementales du lieu de fondation étaient évidentes chez les poissons des mésocosmes. Nos résultats démontrent que les introductions consistant en un seul individu peuvent conduire à des populations prospères de ce poisson invasif et suggèrent qu'une prudence particulière doit être exercée lors de l'introduction de cette espèce, ou d'autres vivipares, dans les masses d'eau naturelles.

@article{doi101371journalpone0024416,
    author = "Deacon, Amy E. et Ramnarine, Indar W. et Magurran, Anne E.",
    title = "Comment l'écologie reproductive contribue à la propagation d'un poisson globalement invasif",
    year = "2011",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = {Les poissons d'eau douce invasifs représentent une menace majeure pour la biodiversité. Ici, nous démontrons d'abord l'expansion de domaine spectaculaire, médiatisée par l'homme, du guppy trinitarien (Poecilia reticulata), un poisson invasif réputé pour impacter négativement les communautés d'eau douce natives. Ensuite, nous explorons les mécanismes possibles qui pourraient expliquer l'établissement mondial réussi de cette espèce. Les guppies, ainsi que d'autres espèces de poissons invasives notables telles que le poisson-lion (Gambusia spp.), possèdent des adaptations reproductives aux habitats éphémères qui peuvent permettre aux introductions de très petits nombres de fondateurs de réussir. La remarquable capacité des guppies individuellement enceintes d'établir régulièrement des populations viables est démontrée à l'aide d'un mésocosme réplicatif mis en place. Dans 86\% des cas, ces populations ont persisté pendant deux ans (la durée de l'expérience). Le succès de l'établissement était indépendant de l'origine des fondateurs (habitats à forte et faible prédation), et il n'y a eu aucune perte de performance comportementale chez les juvéniles des mésocosmes. Cependant, les « signatures » comportementales du lieu de fondation étaient évidentes chez les poissons des mésocosmes. Nos résultats démontrent que les introductions consistant en un seul individu peuvent conduire à des populations prospères de ce poisson invasif et suggèrent qu'une prudence particulière doit être exercée lors de l'introduction de cette espèce, ou d'autres vivipares, dans les masses d'eau naturelles.},
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024416",
    doi = "10.1371/journal.pone.0024416",
    openalex = "W2171862242",
    references = "doi101007bf00042661"
}

Les poissons à nageoires rayonnées constituent la moitié de toutes les espèces de vertébrés vivantes. Presque tous les poissons à nageoires rayonnées sont des téléostéens, qui comprennent la plupart des espèces de poissons commercialement importantes, plusieurs organismes modèles pour la génomique et la biologie du développement, et le composant dominant des faunes de vertébrés marins et d'eau douce. Malgré l'importance économique et scientifique des poissons à nageoires rayonnées, l'absence d'une phylogénie unique et complète avec des estimations de temps de divergence correspondantes a limité notre compréhension de l'évolution et de la diversification de cette radiation. Nos analyses, qui utilisent plusieurs séquences de gènes nucléaires conjointement avec 36 contraintes d'âge fossiles, aboutissent à une phylogénie bien étayée de tous les lignages majeurs de poissons à nageoires rayonnées et à des estimations d'âge moléculaires généralement cohérentes avec le registre fossile. Cette phylogénie éclaire trois problèmes de longue date : identifier spécifiquement les elopomorphes (anguilles et tarpons) comme lignage sœur de tous les autres téléostéens, fournir une hypothèse unique sur la radiation des euteleostéens précoces, et offrir une stratégie prometteuse pour la résolution de la « brousse au sommet de l'arbre » qui comprend les percomorphes et autres téléostéens à nageoires épineuses. En confrontant nos estimations de temps de divergence avec des études utilisant un seul gène nucléaire ou des génomes mitochondriaux entiers, nous constatons que les premières sous-estiment les âges des divergences les plus anciennes de poissons à nageoires rayonnées, tandis que les secondes surestiment considérablement les âges des lignages téléostéens dérivés. Notre phylogénie calibrée dans le temps révèle que la majeure partie de la diversification menant aux groupes actuels de téléostéens s'est produite entre le Mésozoïque tardif et le Cénozoïque précoce, identifiant cette période comme le « Second Âge des Poissons ».

@article{doi101073pnas1206625109,
    author = "Near, Thomas J. et Eytan, Ron I. et Dornburg, Alex et Kuhn, Kristen L. et Moore, Jon A. et Davis, Matthew P. et Wainwright, Peter C. et Friedman, Matt et Smith, W. Leo",
    title = "Résolution de la phylogénie des poissons à nageoires rayonnées et datation de la diversification",
    year = "2012",
    journal = "Proceedings of the National Academy of Sciences",
    abstract = {Les poissons à nageoires rayonnées constituent la moitié de toutes les espèces de vertébrés vivants. Presque tous les poissons à nageoires rayonnées sont des téléostéens, qui comprennent la plupart des espèces de poissons commercialement importantes, plusieurs organismes modèles pour la génomique et la biologie du développement, et le composant dominant des faunes de vertébrés marins et d'eau douce. Malgré l'importance économique et scientifique des poissons à nageoires rayonnées, l'absence d'une phylogénie unique et complète avec des estimations de temps de divergence correspondantes a limité notre compréhension de l'évolution et de la diversification de cette radiation. Nos analyses, qui utilisent plusieurs séquences de gènes nucléaires conjointement avec 36 contraintes d'âge fossiles, aboutissent à une phylogénie bien étayée de tous les lignages majeurs de poissons à nageoires rayonnées et à des estimations d'âge moléculaires généralement cohérentes avec le registre fossile. Cette phylogénie éclaire trois problèmes de longue date : identifier spécifiquement les elopomorphes (anguilles et tarpons) comme lignage sœur de tous les autres téléostéens, fournir une hypothèse unique sur la radiation des euteleostéens précoces, et offrir une stratégie prometteuse pour la résolution de la « brousse au sommet de l'arbre » qui comprend les percomorphes et autres téléostéens à nageoires épineuses. En confrontant nos estimations de temps de divergence avec des études utilisant un seul gène nucléaire ou des génomes mitochondriaux entiers, nous constatons que les premières sous-estiment les âges des divergences les plus anciennes de poissons à nageoires rayonnées, tandis que les secondes surestiment considérablement les âges des lignages téléostéens dérivés. Notre phylogénie calibrée dans le temps révèle que la majeure partie de la diversification menant aux groupes actuels de téléostéens s'est produite entre le Mésozoïque tardif et le Cénozoïque précoce, identifiant cette période comme le « Second Âge des Poissons ».},
    url = "https://doi.org/10.1073/pnas.1206625109",
    doi = "10.1073/pnas.1206625109",
    openalex = "W2081778808",
    references = "doi101016b9780126709506500138, doi101016s1055790302003329, doi101073pnas0811087106, doi101093bioinformaticsbtl446, doi101093bioinformaticsbtq228, doi101093oso97801985404720010001, doi101111j14754983201201165x, doi101126science1157704, doi101126science1211028, doi101186147121487214, doi101371journalpbio0040088, doi1023072412685, openalexw653978695"
}

Il est largement admis que le développement neuronal peut refléter des adaptations morphologiques et des spécialisations sensorielles. L'objectif de cette revue est de fournir une vue d'ensemble de l'état actuel des données cérébrales disponibles pour les poissons cartilagineux et d'examiner comment les perspectives sur l'échelle allométrique de la taille du cerveau au sein de ce groupe de poissons ont évolué au cours des 50 dernières années grâce à l'ajout de nouvelles données et à des analyses statistiques plus rigoureuses. Les connaissances actuelles en neuroanatomie des poissons cartilagineux sont révisées et les données sur la taille du cerveau (encéphalisation, n = 151) et la variation interspécifique de l'organisation cérébrale (n = 84) ont été explorées pour déterminer les relations d'échelle au sein de ce clade. Il est déterminé si des modèles similaires d'organisation cérébrale, appelés cébrotypes, existent chez les espèces partageant certaines caractéristiques de mode de vie. Des modèles clairs d'organisation cérébrale existent chez les poissons cartilagineux, indépendamment du regroupement phylogénétique et, bien que cette étude ne soit pas une analyse fonctionnelle, elle fournit des preuves supplémentaires que les structures cérébrales des chondrichthyens se sont développées en conjonction avec des comportements spécifiques ou des capacités cognitives accrues. Des cerveaux plus grands, avec des télencéphales bien développés et de grands cerveaux fortement foliés, sont rapportés chez les espèces occupant des habitats de récifs complexes ou océaniques, identifiant potentiellement un cébrotype associé aux récifs. En revanche, les espèces benthiques et benthopélagiques démersales constituent le groupe ayant les plus petits cerveaux, avec un télencéphale relativement réduit et un corpus cérébelleux lisse. Il existe également des preuves ici d'un cébrotype bathyal ; les requins benthopélagiques des profondeurs possèdent des cerveaux relativement petits et montrent une hypertrophie relative claire de la moelle allongée. Malgré les modèles observés et documentés, des lacunes significatives dans la littérature ont été soulignées. Les données sur la masse cérébrale ne sont actuellement disponibles que pour environ 16 % de toutes les espèces de chondrichthyens, et seulement 8 % des espèces ont des données disponibles sur leur organisation cérébrale, avec encore moins sur les sous-sections des zones cérébrales majeures qui reçoivent des entrées sensorielles distinctes. La variabilité interspécifique dans l'organisation cérébrale renforce encore l'importance de réaliser des études fonctionnelles sur une gamme plus large d'espèces. Seule une base de données expansive, composée d'espèces couvrant une variété d'habitats et de groupes taxonomiques, avec des répertoires comportementaux très disparates, combinée à des analyses fonctionnelles supplémentaires, permettra de mieux comprendre dans quelle mesure les cerveaux des chondrichthyens ont évolué en conséquence du comportement, de l'habitat et du mode de vie, en plus de la phylogénie.

@article{doi101111j10958649201203254x,
    author = "Yopak, Kara E.",
    title = "Neuroécologie des poissons cartilagineux : les implications fonctionnelles de l'échelle cérébrale",
    year = "2012",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Il est largement admis que le développement neuronal peut refléter des adaptations morphologiques et des spécialisations sensorielles. L'objectif de cette revue est de fournir une vue d'ensemble de l'état actuel des données cérébrales disponibles pour les poissons cartilagineux et d'examiner comment les perspectives sur l'échelle allométrique de la taille du cerveau au sein de ce groupe de poissons ont évolué au cours des 50 dernières années grâce à l'ajout de nouvelles données et à des analyses statistiques plus rigoureuses. Les connaissances actuelles en neuroanatomie des poissons cartilagineux sont révisées et les données sur la taille du cerveau (encéphalisation, n = 151) et la variation interspécifique de l'organisation cérébrale (n = 84) ont été explorées pour déterminer les relations d'échelle au sein de ce clade. Il est déterminé si des modèles similaires d'organisation cérébrale, appelés cébrotypes, existent chez les espèces partageant certaines caractéristiques de mode de vie. Des modèles clairs d'organisation cérébrale existent chez les poissons cartilagineux, indépendamment du regroupement phylogénétique et, bien que cette étude ne soit pas une analyse fonctionnelle, elle fournit des preuves supplémentaires que les structures cérébrales des chondrichthyens se sont développées en conjonction avec des comportements spécifiques ou des capacités cognitives accrues. Des cerveaux plus grands, avec des télencéphales bien développés et de grands cerveaux fortement foliés, sont rapportés chez les espèces occupant des habitats de récifs complexes ou océaniques, identifiant potentiellement un cébrotype associé aux récifs. En revanche, les espèces benthiques et benthopélagiques démersales constituent le groupe ayant les plus petits cerveaux, avec un télencéphale relativement réduit et un corpus cérébelleux lisse. Il existe également des preuves ici d'un cébrotype bathyal ; les requins benthopélagiques des profondeurs possèdent des cerveaux relativement petits et montrent une hypertrophie relative claire de la moelle allongée. Malgré les modèles observés et documentés, des lacunes significatives dans la littérature ont été soulignées. Les données sur la masse cérébrale ne sont actuellement disponibles que pour environ 16 % de toutes les espèces de chondrichthyens, et seulement 8 % des espèces ont des données disponibles sur leur organisation cérébrale, avec encore moins sur les sous-sections des zones cérébrales majeures qui reçoivent des entrées sensorielles distinctes. La variabilité interspécifique dans l'organisation cérébrale renforce encore l'importance de réaliser des études fonctionnelles sur une gamme plus large d'espèces. Seule une base de données expansive, composée d'espèces couvrant une variété d'habitats et de groupes taxonomiques, avec des répertoires comportementaux très disparates, combinée à des analyses fonctionnelles supplémentaires, permettra de mieux comprendre dans quelle mesure les cerveaux des chondrichthyens ont évolué en conséquence du comportement, de l'habitat et du mode de vie, en plus de la phylogénie.",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1095-8649.2012.03254.x",
    doi = "10.1111/j.1095-8649.2012.03254.x",
    openalex = "W2039393659",
    references = "doi101007978364218262412"
}

Résumé : Les poissons représentent plus de la moitié de tous les animaux vivants possédant une colonne vertébrale, mais les modèles paléobiologiques à grande échelle de cet ensemble n'ont pas reçu la même attention que ceux des vertébrés terrestres. Les enquêtes précédentes sur le registre des poissons ont généralement été anecdotiques, ou limitées soit dans leur portée stratigraphique, soit dans leur portée taxonomique. Ici, nous fournissons un aperçu général de l'histoire phanérozoïque de la diversité des poissons, en mettant un accent particulier sur les intervalles de turnover, de radiation évolutive et d'extinction. En particulier, nous fournissons des revues approfondies des changements survenus pendant, et de la récupération écologique et évolutive après, les extinctions du Dévonien terminal (Hangenberg) et du Crétacé–Paléogène (K–Pg).

@article{doi101111j14754983201201165x,
    author = "Friedman, Matt et Sallan, Lauren",
    title = "Five hundred million years of extinction and recovery: a phanerozoic survey of large‐scale diversity patterns in fishes",
    year = "2012",
    journal = "Palaeontology",
    abstract = "Résumé : Les poissons représentent plus de la moitié de tous les animaux vivants possédant une colonne vertébrale, mais les modèles paléobiologiques à grande échelle de cet ensemble n'ont pas reçu la même attention que ceux des vertébrés terrestres. Les enquêtes précédentes sur le registre des poissons ont généralement été anecdotiques, ou limitées soit dans leur portée stratigraphique, soit dans leur portée taxonomique. Ici, nous fournissons un aperçu général de l'histoire phanérozoïque de la diversité des poissons, en mettant un accent particulier sur les intervalles de turnover, de radiation évolutive et d'extinction. En particulier, nous fournissons des revues approfondies des changements survenus pendant, et de la récupération écologique et évolutive après, les extinctions du Dévonien terminal (Hangenberg) et du Crétacé–Paléogène (K–Pg).",
    url = "https://doi.org/10.1111/j.1475-4983.2012.01165.x",
    doi = "10.1111/j.1475-4983.2012.01165.x",
    openalex = "W1522554964",
    references = "brinkman1990paleooecology, brinkman2002teleost, crossref1977patterns, doi101002gj1072, doi1010079781468464658, doi101016jpalaeo200907017, doi101016jpalaeo200910010, doi101016s0016699588800664, doi101017s0022336000024331, doi101017s0094837300005352, doi101017s0094837300008174, doi101017s1477201908002551, doi101038nature01264, doi101038nature07855, doi101038nature08745, doi101038nature09038, doi101073pnas0811087106, doi101073pnas1010350107, doi101073pnas1117332109, doi10108002724634199710010948, doi101098rspb20011826, doi101098rspb20080715, doi101111j1469185x1999tb00045x, doi101111j14754983201001019x, doi101111j150239311983tb01993x, doi101126science1177265, doi101126science1598573, doi101126science21545391501, doi101146annurevearth040809152556, doi101146annurevecolsys35021103105715, doi1016710272463420010210438anscft20co2, doi1023071441916, doi1023073514548, doi102475ajs2882101, doi104072rbp2005205, doi105252g2010n4a1, doi105860choice435902, doi105962bhltitle4275, openalexw1485830652, openalexw2106559152, openalexw2208603329, openalexw3001739384, openalexw595691412, openalexw606525048"
}

L'intérêt pour la biodiversité et la taxonomie des elasmobranches a augmenté ces dernières années, principalement catalysé par quatre influences : (1) le grand nombre de nouvelles espèces décrites au cours des 30 dernières années (par exemple, Last et Stevens, 2009) ; (2) la reconnaissance que de nombreuses espèces d'elasmobranches, dont plusieurs n'ont pas encore été formellement décrites, pourraient être menacées d'extinction par les pressions de la pêche et la destruction des habitats (Stevens et al., 2000) ; (3) l'intérêt croissant pour le « codage-barcode » de l'ADN en tant qu'outil pour compléter la description taxonomique (par exemple, Ward et al., 2007) ; et (4) une reconnaissance émergente du rôle important que jouent les elasmobranches en tant que prédateurs apex dans les écosystèmes marins (Heithaus et al., 2008).

@incollection{doi101201b118679,
    author = "Naylor, Janine N. Caira Gavin",
    title = "Phylogénie des Elasmobranches : une estimation mitochondriale basée sur 595 espèces",
    year = "2012",
    abstract = "L'intérêt pour la biodiversité et la taxonomie des elasmobranches a augmenté ces dernières années, principalement catalysé par quatre influences : (1) le grand nombre de nouvelles espèces décrites au cours des 30 dernières années (par exemple, Last et Stevens, 2009) ; (2) la reconnaissance que de nombreuses espèces d'elasmobranches, dont plusieurs n'ont pas encore été formellement décrites, pourraient être menacées d'extinction par les pressions de la pêche et la destruction des habitats (Stevens et al., 2000) ; (3) l'intérêt croissant pour le « codage-barcode » de l'ADN en tant qu'outil pour compléter la description taxonomique (par exemple, Ward et al., 2007) ; et (4) une reconnaissance émergente du rôle important que jouent les elasmobranches en tant que prédateurs apex dans les écosystèmes marins (Heithaus et al., 2008).",
    url = "https://doi.org/10.1201/b11867-9",
    doi = "10.1201/b11867-9",
    openalex = "W2500401673",
    references = "doi101093icb172303, doi101111j109636421996tb02189x, doi1012060003009020042840001fsotgr20co2, doi1023071447424, openalexw3211386673"
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RÉSUMÉ Cette étude présente la première révision complète des poissons « pholidophoriformes », qui constituent un taxon clé pour comprendre la diversification précoce des poissons téléostéens. Les révisions systématiques des pholidophoridés du Trias, basées sur de nombreux spécimens bien conservés, incluent †Annaichthys, gen. et sp. nov., †Knerichthys, gen. nov., †Parapholidophorus, †Pholidoctenus, †Pholidophoretes, †Pholidophorus, †Pholidorhynchodon, et †Zambellichthys, gen. et sp. nov. Les descriptions morphologiques présentées soutiennent une analyse phylogénétique qui propose une nouvelle hypothèse pour l'évolution des caractères au sein des Teleostei basaux, avec des implications pour les holostéens et les téléostéens. L'analyse phylogénétique résout les espèces traditionnelles « pholidophoriformes » comme un assemblage paraphylétique, certaines étant regroupées dans une famille monophylétique †Pholidophoridae et d'autres étant plus étroitement apparentées aux téléostéens du groupe couronne. La famille monophylétique †Pholidophoridae est restreinte aux taxa triasiques européens et est le groupe sœur du genre jurassique †Eurycormus plus tous les autres téléostéens. Ce dernier clade est soutenu par plusieurs synapomorphies, telles qu'un processus postérovéntral allongé du quadrate, de longs processus épineuraux, et sept ou plus d'arches neurales ural modifiées en uroneuraux. †Pholidophorus bechei est retiré de †Pholidophoridae et reconnu comme le nouveau genre †Dorsetichthys. Les preuves actuelles indiquent que le †Pholidophoretes salvus et le †Knerichthys bronni du Trias supérieur représentent les pholidophoridés les plus anciens connus, et le †Prohalecites de la limite Trias moyen/supérieur représente le téléostéenne stém le plus ancien. Les Aspidorhynchiformes, Pachycormiformes et †Prohalecites sont résolus comme téléostéens stém. La monophylie des Teleostei, qui incluent désormais les pholidophoridés du Trias, est soutenue par de nombreuses synapomorphies, telles qu'un suborbitaire, deux supramaxillaires, et l'articulaire fusionné aux os angulaire et rétroarticulaire — avec des transformations supplémentaires au sein des téléostéens plus avancés. Les synapomorphies des Teleosteomorpha, le clade incluant les téléostéens du groupe couronne et tous les poissons plus étroitement apparentés à eux qu'à leurs parents vivants les plus proches, incluent l'autosphenotique dépourvu de composant dermique, un vomer non apparié, et un long appendage denté et scie sur le cleithrum.

@article{doi101080027246342013835642,
    author = "Arratia, Gloria",
    title = "Morphologie, taxonomie et phylogénie des poissons pholidophoridés du Trias (Actinopterygii, Teleostei)",
    year = "2013",
    journal = "Journal of Vertebrate Paleontology",
    abstract = "RÉSUMÉ Cette étude présente la première révision complète des poissons « pholidophoriformes », qui constituent un taxon clé pour comprendre la diversification précoce des poissons téléostéens. Les révisions systématiques des pholidophoridés du Trias, basées sur de nombreux spécimens bien conservés, incluent †Annaichthys, gen. et sp. nov., †Knerichthys, gen. nov., †Parapholidophorus, †Pholidoctenus, †Pholidophoretes, †Pholidophorus, †Pholidorhynchodon, et †Zambellichthys, gen. et sp. nov. Les descriptions morphologiques présentées soutiennent une analyse phylogénétique qui propose une nouvelle hypothèse pour l'évolution des caractères au sein des Teleostei basaux, avec des implications pour les holostéens et les téléostéens. L'analyse phylogénétique résout les espèces traditionnelles « pholidophoriformes » comme un assemblage paraphylétique, certaines étant regroupées dans une famille monophylétique †Pholidophoridae et d'autres étant plus étroitement apparentées aux téléostéens du groupe couronne. La famille monophylétique †Pholidophoridae est restreinte aux taxa triasiques européens et est le groupe sœur du genre jurassique †Eurycormus plus tous les autres téléostéens. Ce dernier clade est soutenu par plusieurs synapomorphies, telles qu'un processus postérovéntral allongé du quadrate, de longs processus épineuraux, et sept ou plus d'arches neurales ural modifiées en uroneuraux. †Pholidophorus bechei est retiré de †Pholidophoridae et reconnu comme le nouveau genre †Dorsetichthys. Les preuves actuelles indiquent que le †Pholidophoretes salvus et le †Knerichthys bronni du Trias supérieur représentent les pholidophoridés les plus anciens connus, et le †Prohalecites de la limite Trias moyen/supérieur représente le téléostéenne stém le plus ancien. Les Aspidorhynchiformes, Pachycormiformes et †Prohalecites sont résolus comme téléostéens stém. La monophylie des Teleostei, qui incluent désormais les pholidophoridés du Trias, est soutenue par de nombreuses synapomorphies, telles qu'un suborbitaire, deux supramaxillaires, et l'articulaire fusionné aux os angulaire et rétroarticulaire — avec des transformations supplémentaires au sein des téléostéens plus avancés. Les synapomorphies des Teleosteomorpha, le clade incluant les téléostéens du groupe couronne et tous les poissons plus étroitement apparentés à eux qu'à leurs parents vivants les plus proches, incluent l'autosphenotique dépourvu de composant dermique, un vomer non apparié, et un long appendage denté et scie sur le cleithrum.",
    url = "https://doi.org/10.1080/02724634.2013.835642",
    doi = "10.1080/02724634.2013.835642",
    openalex = "W2113950930",
    references = "doi10100797814612356063, doi101007978146848851721, doi105962bhltitle6408, openalexw2898156694"
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Résumé Engelhard, G. H., Peck, M. A., Rindorf, A., Smout, S. C., van Deurs, M., Raab, K., Andersen, K. H., Garthe, S., Lauerburg, R. A. M., Scott, F., Brunel, T., Aarts, G., van Kooten, T., et Dickey-Collas, M. Poissons de fond, leurs pêcheries et leurs prédateurs : qui mène qui ? – ICES Journal of Marine Science, 71:. La mer du Nord abrite un assemblage diversifié de poissons de fond, incluant le hareng, ciblé pour la consommation humaine ; le sandeel, le sprat et la morue norvégienne, exploités par les pêcheries industrielles ; ainsi que certains sardins et anchois, soutenant des pêcheries artisanales. Tous présentent de fortes fluctuations d'abondance, impactant les pêcheries et les prédateurs. Nous passons en revue des études de terrain, en laboratoire et de modélisation pour investiguer les moteurs de ce système complexe de poissons de fond. Le climat influence clairement la productivité des poissons de fond ; cependant, toute considération centrée sur une seule espèce de l'influence du climat pourrait échouer si des interactions fortes existent entre les poissons de fond, comme c'est le cas dans la mer du Nord. Le sandeel semble être le poisson de fond proie le plus important. Les oiseaux marins sont les plus dépendants des poissons de fond, en raison de leur régime alimentaire spécialisé et des contraintes de répartition (colonies de nidification). À l'exception des pêcheries, les prédateurs clés des poissons de fond sont quelques espèces de poissons piscivores, notamment le pollack, le merlan, le maquereau et le maquereau cheval, eux-mêmes exploités par les pêcheries ; les oiseaux marins et les phoques ont un impact plus modeste. La modélisation de la chaîne alimentaire basée sur la taille suggère que la réduction de la mortalité par pêche ne conduit pas nécessairement à des stocks plus importants de poissons piscivores, en particulier si leurs stades précoces de vie entrent en compétition avec les poissons de fond pour les ressources en zooplancton. Dans les systèmes complexes, les changements dans l'impact des pêcheries sur les poissons de fond peuvent avoir des conséquences potentiellement complexes (et peut-être inattendues) sur d'autres espèces commercialement et/ou écologiquement importantes.

@article{doi101093icesjmsfst087,
    author = "Engelhard, Georg H. et Peck, Myron A. et Rindorf, Anna et Smout, Sophie et van Deurs, Mikael et Raab, Kristina et Andersen, Ken H. et Garthe, Stefan et Lauerburg, Rebecca A.M. et Finlay, Scott et Brunel, Thomas et Aarts, Geert et van Kooten, Tobias et Dickey‐Collas, Mark",
    title = "Poissons de fond, leurs pêcheries et leurs prédateurs : qui mène qui ?",
    year = "2013",
    journal = "ICES Journal of Marine Science",
    abstract = "Résumé Engelhard, G. H., Peck, M. A., Rindorf, A., Smout, S. C., van Deurs, M., Raab, K., Andersen, K. H., Garthe, S., Lauerburg, R. A. M., Scott, F., Brunel, T., Aarts, G., van Kooten, T., et Dickey-Collas, M. Poissons de fond, leurs pêcheries et leurs prédateurs : qui mène qui ? – ICES Journal of Marine Science, 71:. La mer du Nord abrite un assemblage diversifié de poissons de fond, incluant le hareng, ciblé pour la consommation humaine ; le sandeel, le sprat et la morue norvégienne, exploités par les pêcheries industrielles ; ainsi que certains sardins et anchois, soutenant des pêcheries artisanales. Tous présentent de fortes fluctuations d'abondance, impactant les pêcheries et les prédateurs. Nous passons en revue des études de terrain, en laboratoire et de modélisation pour investiguer les moteurs de ce système complexe de poissons de fond. Le climat influence clairement la productivité des poissons de fond ; cependant, toute considération centrée sur une seule espèce de l'influence du climat pourrait échouer si des interactions fortes existent entre les poissons de fond, comme c'est le cas dans la mer du Nord. Le sandeel semble être le poisson de fond proie le plus important. Les oiseaux marins sont les plus dépendants des poissons de fond, en raison de leur régime alimentaire spécialisé et des contraintes de répartition (colonies de nidification). À l'exception des pêcheries, les prédateurs clés des poissons de fond sont quelques espèces de poissons piscivores, notamment le pollack, le merlan, le maquereau et le maquereau cheval, eux-mêmes exploités par les pêcheries ; les oiseaux marins et les phoques ont un impact plus modeste. La modélisation de la chaîne alimentaire basée sur la taille suggère que la réduction de la mortalité par pêche ne conduit pas nécessairement à des stocks plus importants de poissons piscivores, en particulier si leurs stades précoces de vie entrent en compétition avec les poissons de fond pour les ressources en zooplancton. Dans les systèmes complexes, les changements dans l'impact des pêcheries sur les poissons de fond peuvent avoir des conséquences potentiellement complexes (et peut-être inattendues) sur d'autres espèces commercialement et/ou écologiquement importantes.",
    url = "https://doi.org/10.1093/icesjms/fst087",
    doi = "10.1093/icesjms/fst087",
    openalex = "W2136507145",
    references = "doi101007bf00042661"
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Le développement des glandes utérines (adénogenèse) chez les mammifères commence généralement pendant la période post-natale précoce et implique la formation de bourgeons de glandes naissantes à partir de l'épithélium luminal et une prolifération cellulaire étendue dans ces structures à mesure qu'elles grandissent dans le stroma environnant, s'allongent et mûrissent. Les glandes utérines sont essentielles pour la grossesse, comme le démontre l'infertilité qui résulte de l'inhibition du développement de ces glandes par mutation génique ou stratégies épigénétiques. Plusieurs gènes, dont forkhead box A2, bêta-caténine et des membres des familles de gènes Wnt et Hox, sont impliqués dans le développement des glandes utérines. Les progestatifs inhibent la prolifération de l'épithélium utérin, et cela a été utilisé comme stratégie pour développer un modèle dans lequel le traitement des brebis par des progestatifs pendant 8 semaines à partir de la naissance produit des adultes stériles dépourvus de glandes utérines. Plus récemment, des modèles murins ont été développés dans lesquels le traitement néonatal par des progestatifs a été utilisé pour inhiber de manière permanente l'adénogenèse et la fertilité adulte. Ces études ont révélé une fenêtre étroite et bien définie dans laquelle les traitements par des progestatifs induisaient une stérilité permanente en altérant le développement des glandes néonatales et en établissant des modifications endométriales qui entraînent des défauts d'implantation. Ces systèmes modèles sont utilisés pour mieux comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents à l'adénogenèse utérine et à la fonction endométriale. La capacité du traitement néonatal par des progestatifs chez les brebis et les souris à produire une infertilité suggère qu'une approche de ce type pourrait fournir une stratégie contraceptive applicable à d'autres espèces. Des études récentes ont défini les motifs temporels de l'adénogenèse dans les utérus de chiens néonataux et juvéniles et des travaux sont en cours pour déterminer si le traitement néonatal par des progestatifs ou d'autres hormones stéroïdiennes pourrait être une approche contraceptive viable chez cette espèce.

@article{doi101093molehrgat031,
    author = "Cooke, Paul S. et Spencer, Thomas E. et Bartol, Frank F. et Hayashi, Kanako",
    title = "Glandes utérines : développement, fonction et systèmes modèles expérimentaux",
    year = "2013",
    journal = "Molecular Human Reproduction",
    abstract = "Le développement des glandes utérines (adénogenèse) chez les mammifères commence généralement pendant la période post-natale précoce et implique la formation de bourgeons de glandes naissantes à partir de l'épithélium luminal et une prolifération cellulaire étendue dans ces structures à mesure qu'elles grandissent dans le stroma environnant, s'allongent et mûrissent. Les glandes utérines sont essentielles pour la grossesse, comme le démontre l'infertilité qui résulte de l'inhibition du développement de ces glandes par mutation génique ou stratégies épigénétiques. Plusieurs gènes, dont forkhead box A2, bêta-caténine et des membres des familles de gènes Wnt et Hox, sont impliqués dans le développement des glandes utérines. Les progestatifs inhibent la prolifération de l'épithélium utérin, et cela a été utilisé comme stratégie pour développer un modèle dans lequel le traitement des brebis par des progestatifs pendant 8 semaines à partir de la naissance produit des adultes stériles dépourvus de glandes utérines. Plus récemment, des modèles murins ont été développés dans lesquels le traitement néonatal par des progestatifs a été utilisé pour inhiber de manière permanente l'adénogenèse et la fertilité adulte. Ces études ont révélé une fenêtre étroite et bien définie dans laquelle les traitements par des progestatifs induisaient une stérilité permanente en altérant le développement des glandes néonatales et en établissant des modifications endométriales qui entraînent des défauts d'implantation. Ces systèmes modèles sont utilisés pour mieux comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents à l'adénogenèse utérine et à la fonction endométriale. La capacité du traitement néonatal par des progestatifs chez les brebis et les souris à produire une infertilité suggère qu'une approche de ce type pourrait fournir une stratégie contraceptive applicable à d'autres espèces. Des études récentes ont défini les motifs temporels de l'adénogenèse dans les utérus de chiens néonataux et juvéniles et des travaux sont en cours pour déterminer si le traitement néonatal par des progestatifs ou d'autres hormones stéroïdiennes pourrait être une approche contraceptive viable chez cette espèce.",
    url = "https://doi.org/10.1093/molehr/gat031",
    doi = "10.1093/molehr/gat031",
    openalex = "W2098274784",
    references = "doi105694j132653771943tb44800x"
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Au vu de l'aval de recherches publiées rencontrées aujourd'hui, il est important de réfléchir occasionnellement à la manière dont nous sommes arrivés à notre compréhension actuelle dans une discipline scientifique particulière, plaçant ainsi les nouvelles découvertes dans un contexte approprié avec les modèles bien établis. Cette revue historique met en lumière certaines des contributions scientifiques importantes dans le domaine du développement des placodes neurogéniques. En considérant cumulativement les riches données historiques, nous pouvons mieux apprécier et appliquer ce qui a été accompli. Les premiers travaux descriptifs chez les poissons et les approches expérimentales chez les amphibiens et le poulet ont produit des modèles conceptuels importants de l'induction des placodes et de la différenciation cellulaire. Les efforts actuels pour découvrir des gènes et leurs fonctions moléculaires continuent d'élargir notre compréhension des placodes. Une réflexion attentive sur l'ensemble des travaux peut améliorer les modèles actuels et aider à orienter la conception expérimentale moderne.

@article{doi101002dvdy24152,
    author = "Stark, Michael R.",
    title = "Développement des placodes neurogéniques chez les vertébrés : points historiques ayant façonné notre compréhension actuelle",
    year = "2014",
    journal = "Developmental Dynamics",
    abstract = "Au vu de l'aval de recherches publiées rencontrées aujourd'hui, il est important de réfléchir occasionnellement à la manière dont nous sommes arrivés à notre compréhension actuelle dans une discipline scientifique particulière, plaçant ainsi les nouvelles découvertes dans un contexte approprié avec les modèles bien établis. Cette revue historique met en lumière certaines des contributions scientifiques importantes dans le domaine du développement des placodes neurogéniques. En considérant cumulativement les riches données historiques, nous pouvons mieux apprécier et appliquer ce qui a été accompli. Les premiers travaux descriptifs chez les poissons et les approches expérimentales chez les amphibiens et le poulet ont produit des modèles conceptuels importants de l'induction des placodes et de la différenciation cellulaire. Les efforts actuels pour découvrir des gènes et leurs fonctions moléculaires continuent d'élargir notre compréhension des placodes. Une réflexion attentive sur l'ensemble des travaux peut améliorer les modèles actuels et aider à orienter la conception expérimentale moderne.",
    url = "https://doi.org/10.1002/dvdy.24152",
    doi = "10.1002/dvdy.24152",
    openalex = "W1552342615",
    references = "doi101242jcss229114153"
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Les comparaisons morphologiques entre les animaux actuels ont longtemps été utilisées pour inférer leurs ancêtres éteints depuis longtemps, pour lesquels le registre fossile est pauvre ou inexistant. Pour l'évolution des vertébrés, la comparaison a généralement impliqué l'amphioxus et les vertébrés. Les deux groupes évoluent relativement lentement et leurs génomes partagent un haut niveau de synténie. Les vertébrés et l'amphioxus ont un développement régulateur dans lequel les destins cellulaires ne se fixent que progressivement pendant l'embryogenèse. Ainsi, leur développement correspond à un modèle de verre à vin modifié dans lequel les contraintes sont maximales au stade phylotypique (c'est-à-dire la neurula tardive/la larve précoce), mais sont quelque peu plus fortes pour le développement précoce que pour le développement tardif. En revanche, le troisième groupe de chordés, les tunicés, qui sont le groupe frère des vertébrés, évoluent rapidement. Les contraintes sur l'évolution des génomes des tunicés sont relâchées, et ils ont éliminé des gènes développementaux clés et organisé une grande partie de leurs séquences codantes en opérons, qui sont transcrits en un seul ARNm qui subit un trans-splicing. Cela contraste avec les vertébrés et l'amphioxus, dont les génomes ne sont pas organisés en opérons. Parallèlement, les tunicés ont basculé vers un développement déterministe avec une fixation très précoce des destins cellulaires. Ainsi, le développement des tunicés correspond plus étroitement à un modèle de divergence progressive (plus en forme de verre à vin qu'en forme de verre à vin) dans lequel les contraintes sur le zygote et le développement très précoce sont maximales. Ce modèle peut aider à expliquer pourquoi les plans corporels des tunicés sont si diversifiés. Les contraintes relâchées sur le développement après les stades de division cellulaire précoce sont corrélées aux contraintes relâchées sur l'évolution du génome. La question reste : lequel est venu en premier ?

@article{doi101002jezb22569,
    author = "Holland, Linda Z.",
    title = "Génomique, évolution et développement de l'amphioxus et des tunicés : Le principe de la zone de confort",
    year = "2014",
    journal = "Journal of Experimental Zoology Part B Molecular and Developmental Evolution",
    abstract = "Les comparaisons morphologiques entre les animaux actuels ont longtemps été utilisées pour inférer leurs ancêtres éteints depuis longtemps, pour lesquels le registre fossile est pauvre ou inexistant. Pour l'évolution des vertébrés, la comparaison a généralement impliqué l'amphioxus et les vertébrés. Les deux groupes évoluent relativement lentement et leurs génomes partagent un haut niveau de synténie. Les vertébrés et l'amphioxus ont un développement régulateur dans lequel les destins cellulaires ne se fixent que progressivement pendant l'embryogenèse. Ainsi, leur développement correspond à un modèle de verre à vin modifié dans lequel les contraintes sont maximales au stade phylotypique (c'est-à-dire la neurula tardive/la larve précoce), mais sont quelque peu plus fortes pour le développement précoce que pour le développement tardif. En revanche, le troisième groupe de chordés, les tunicés, qui sont le groupe frère des vertébrés, évoluent rapidement. Les contraintes sur l'évolution des génomes des tunicés sont relâchées, et ils ont éliminé des gènes développementaux clés et organisé une grande partie de leurs séquences codantes en opérons, qui sont transcrits en un seul ARNm qui subit un trans-splicing. Cela contraste avec les vertébrés et l'amphioxus, dont les génomes ne sont pas organisés en opérons. Parallèlement, les tunicés ont basculé vers un développement déterministe avec une fixation très précoce des destins cellulaires. Ainsi, le développement des tunicés correspond plus étroitement à un modèle de divergence progressive (plus en forme de verre à vin qu'en forme de verre à vin) dans lequel les contraintes sur le zygote et le développement très précoce sont maximales. Ce modèle peut aider à expliquer pourquoi les plans corporels des tunicés sont si diversifiés. Les contraintes relâchées sur le développement après les stades de division cellulaire précoce sont corrélées aux contraintes relâchées sur l'évolution du génome. La question reste : lequel est venu en premier ?",
    url = "https://doi.org/10.1002/jez.b.22569",
    doi = "10.1002/jez.b.22569",
    openalex = "W1560143667",
    references = "doi101186147121487127, doi101186147122021359, doi105962bhltitle55924, zhou2012systematic"
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La ligne latérale du poisson zèbre est un système sensoriel utilisé pour détecter les changements de courant d'eau. Elle est composée de grappes de cellules ciliées mécanosensorielles appelées neuromastes. La ligne latérale est initialement établie par un groupe de cellules migratoires, appelé primordium, qui dépose des neuromastes à des emplacements stéréotypés le long de la surface du poisson. Les signaux Wnt, FGF et Notch sont tous des régulateurs importants de divers aspects du développement de la ligne latérale, de la migration du primordium à la spécification des cellules ciliées. À mesure que le poisson zèbre vieillit, l'organisation de la ligne latérale devient plus complexe afin de s'adapter à la taille accrue du poisson. Cette expansion est régulée par de nombreux facteurs impliqués dans le développement initial. De plus, contrairement aux cellules ciliées mammaliennes, les cellules ciliées de la ligne latérale ont la capacité de se régénérer après des dommages. De nouvelles cellules ciliées apparaissent à partir de la prolifération et de la différenciation des cellules de soutien environnantes, et les voies moléculaires et cellulaires régulant ce processus commencent à être élucidées. Dans l'ensemble, la ligne latérale du poisson zèbre s'est révélée être un excellent modèle pour étudier une variété de processus, y compris la migration collective de cellules, la polarité cellulaire, le destin cellulaire et la régénération.

@article{doi101002wdev160,
    author = "Thomas, Eric D. et Cruz, Ivan et Hailey, Dale W. et Raible, David W.",
    title = "There and back again : développement et régénération du système de la ligne latérale du poisson zèbre",
    year = "2014",
    journal = "Wiley Interdisciplinary Reviews Developmental Biology",
    abstract = "La ligne latérale du poisson zèbre est un système sensoriel utilisé pour détecter les changements de courant d'eau. Elle est composée de grappes de cellules ciliées mécanosensorielles appelées neuromastes. La ligne latérale est initialement établie par un groupe de cellules migratoires, appelé primordium, qui dépose des neuromastes à des emplacements stéréotypés le long de la surface du poisson. Les signaux Wnt, FGF et Notch sont tous des régulateurs importants de divers aspects du développement de la ligne latérale, de la migration du primordium à la spécification des cellules ciliées. À mesure que le poisson zèbre vieillit, l'organisation de la ligne latérale devient plus complexe afin de s'adapter à la taille accrue du poisson. Cette expansion est régulée par de nombreux facteurs impliqués dans le développement initial. De plus, contrairement aux cellules ciliées mammaliennes, les cellules ciliées de la ligne latérale ont la capacité de se régénérer après des dommages. De nouvelles cellules ciliées apparaissent à partir de la prolifération et de la différenciation des cellules de soutien environnantes, et les voies moléculaires et cellulaires régulant ce processus commencent à être élucidées. Dans l'ensemble, la ligne latérale du poisson zèbre s'est révélée être un excellent modèle pour étudier une variété de processus, y compris la migration collective de cellules, la polarité cellulaire, le destin cellulaire et la régénération.",
    url = "https://doi.org/10.1002/wdev.160",
    doi = "10.1002/wdev.160",
    openalex = "W1999024564",
    references = "doi101016jydbio201402016"
}

Le Permien et le Trias ont été des intervalles temporels clés dans l'histoire de la vie sur Terre. Les deux périodes sont marquées par une série de crises biotiques, y compris la plus catastrophique d'entre elles, l'extinction de masse du Permien terminal, qui a finalement conduit à un turnover majeur des faunes et flores paléozoïques typiques vers celles qui sont emblématiques du Mésozoïque et du Cénozoïque. Ici, nous examinons les patterns des poissons osseux du Permien-Trias, un groupe dont les dynamiques évolutives sont peu étudiées. Basés sur des données de la littérature primaire, nous analysons les changements dans leur diversité taxonomique et leur taille corporelle (comme un proxy pour la position trophique) et explorons leur réponse aux événements du Permien-Trias. La diversité et la taille corporelle sont étudiées séparément pour différents groupes d'Osteichthyes (Dipnoi, Actinistia, 'Palaeopterygii', 'Subholostei', Holostei, Teleosteomorpha), dans les milieux marins et d'eau douce et à l'échelle mondiale (diversité totale) ainsi que à travers des ceintures paléolatitudinales. La diversité est également mesurée pour différentes provinces paléogéographiques. Nos résultats suggèrent une tendance générale d'une faible diversité ostéichthyenne au Permien vers des niveaux plus élevés au Trias. Les dynamiques de diversité au Permien sont marquées par un déclin des taxons d'eau douce durant le Cisuralien. Un événement d'extinction durant la crise du Guadalupien terminal n'est pas évident dans nos données, mais les 'palaeoptérygiens' ont connu une augmentation significative de la taille corporelle à travers la limite Guadalupien-Lopingien et ces poissons ont maintenu leur position en tant que grands prédateurs supérieurs du Permien terminal au Trias terminal. Des taux de turnover élevés sont documentés à la limite Permien-Trias, et deux événements de diversification distincts sont notés à la suite de cette crise biotique, un premier durant le Trias inférieur (dipnoans, actinistiens, 'palaeoptérygiens', 'subholostéens') et un second durant le Trias moyen ('subholostéens', néoptérygiens). L'apparition de nouveaux taxons petits, principalement parmi ces groupes durant l'événement du Trias moyen, a causé une réduction significative de la taille corporelle ostéichthyenne. Les Néoptérygiens, le clade qui englobe la vaste majorité des poissons actuels, ont connu une autre phase de diversification au Trias supérieur. La radiation triasique des Osteichthyes, principalement des Actinoptérygiens, qui n'a eu lieu qu'après des extinctions sévères parmi les Chondrichthyens durant le Permien moyen-terminal, a résulté en un changement profond au sein des communautés mondiales de poissons, des faunes riches en chondrichthyens du Permien-Carbonifère vers des associations typiques du Mésozoïque et du Cénozoïque dominées par les actinoptérygiens. Ce turnover n'a pas été soudain mais a suivi un pattern par étapes, avec des sauts durant les événements d'extinction.

@article{doi101111brv12161,
    author = "Romano, Carlo et Koot, Martha B. et Kogan, Ilja et Brayard, Arnaud et Minikh, Alla V. et Brinkmann, Winand et Bucher, Hugo et Kriwet, Jürgen",
    title = "Osteichthyes (poissons osseux) du Permien au Trias : dynamique de la diversité et évolution de la taille corporelle",
    year = "2014",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "Le Permien et le Trias ont été des intervalles de temps clés dans l'histoire de la vie sur Terre. Les deux périodes sont marquées par une série de crises biotiques, y compris la plus catastrophique de ces événements, l'extinction de masse du Permien terminal, qui a finalement conduit à un turnover majeur des faunes et flores paléozoïques typiques vers celles qui sont emblématiques du Mésozoïque et du Cénozoïque. Ici, nous passons en revue les motifs chez les poissons osseux du Permien au Trias, un groupe dont la dynamique évolutive est peu étudiée. Sur la base de données issues de la littérature primaire, nous analysons les changements dans leur diversité taxonomique et leur taille corporelle (en tant que proxy pour la position trophique) et explorons leur réponse aux événements du Permien-Trias. La diversité et la taille corporelle sont étudiées séparément pour différents groupes d'Osteichthyes (Dipnoi, Actinistia, 'Palaeopterygii', 'Subholostei', Holostei, Teleosteomorpha), dans les domaines marin et d'eau douce et à l'échelle mondiale (diversité totale) ainsi que sur les paléolatitudes. La diversité est également mesurée pour différentes provinces paléogéographiques. Nos résultats suggèrent une tendance générale d'une faible diversité d'osteichthyens au Permien à des niveaux plus élevés au Trias. La dynamique de la diversité au Permien est marquée par un déclin des taxons d'eau douce durant le Cisuralien. Un événement d'extinction durant la crise du Guadalupien terminal n'est pas évident dans nos données, mais les 'palaeopterygiens' ont connu une augmentation significative de la taille corporelle à travers la limite Guadalupien-Lopingien et ces poissons ont maintenu leur position en tant que grands prédateurs supérieurs du Permien terminal au Trias terminal. Des taux de turnover élevés sont documentés à la limite Permien-Trias, et deux événements de diversification distincts sont notés à la suite de cette crise biotique, un premier durant le Trias inférieur (dipnoans, actinistians, 'palaeopterygiens', 'subholosteans') et un second durant le Trias moyen ('subholosteans', neopterygians). L'apparition de nouveaux taxons petits, principalement parmi ces groupes, durant l'événement du Trias moyen a causé une réduction significative de la taille corporelle des osteichthyens. Les Neopterygii, le clade qui englobe la vaste majorité des poissons actuels, ont connu une autre phase de diversification au Trias supérieur. La radiation triasique des Osteichthyes, principalement des Actinopterygii, qui n'a eu lieu qu'après des extinctions sévères parmi les Chondrichthyes durant le Permien moyen-terminal, a entraîné un changement profond au sein des communautés mondiales de poissons, des faunes riches en chondrichthyens du Permien-Carbonifère aux associations typiques du Mésozoïque et du Cénozoïque dominées par les actinoptérygiens. Ce turnover n'a pas été soudain mais a suivi un motif par étapes, avec des sauts durant les événements d'extinction.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12161",
    doi = "10.1111/brv.12161",
    openalex = "W1940825182",
    references = "doi101002bies201200145, doi101002jmor20272, doi101016jearscirev201305014, doi101016jgr201212010, doi101046j14672979200000015x, doi101073pnas1206625109, doi101093jpertr044, doi101093oso97801985404720010001, doi101126science1097023, doi101126science1157719, doi101126science1213454, doi101126science1224126, doi101371currentstol53ba26640df0ccaee75bb165c8c26288, doi101371journalpone0088987, doi1018901119521, doi102475ajs28211, doi105252g2010n4a1, doi105962bhltitle159141, doi105962p313860, doi107146moggeosciv32i140904, openalexw2183707334, openalexw2898156694, openalexw628087051, schultze1986wirbeltierreste"
}

Les connexions axonales entre les côtés gauche et droit du cerveau sont cruciales pour l'intégration bilatérale des fonctions sensorielles, motrices et associatives latéralisées. Chez toutes les espèces de vertébrés, les commissures du cerveau antérieur partagent un plan de développement conservé, une position similaire les unes par rapport aux autres au sein du cerveau et des motifs de connectivité similaires. Cependant, des événements majeurs dans l'évolution du cerveau des vertébrés, tels que l'expansion du télencéphale chez les tétrapodes et l'origine de l'isocortex à six couches chez les mammifères, ont conduit à l'émergence et à la diversification de nouvelles voies commissurales. Ces nouvelles connexions interhémisphériques incluent la commissure palliale, apparue chez les ancêtres des tétrapodes et reliant les côtés gauche et droit du pallium médian (hippocampe chez les mammifères), et le corps calleux, exclusif aux mammifères eutheriens (placentaires) et reliant les deux hémisphères isocorticaux. Une analyse comparative des systèmes commissuraux chez les vertébrés révèle que l'émergence de nouvelles voies commissurales a pu impliquer l'emprunt de mécanismes de développement et de substrats anatomiques de voies commissurales préexistantes. L'une des régions embryonnaires d'intérêt pour l'étude de ces processus est la plaque commissurale, une portion de la ligne médiane télencéphalique précoce qui fournit une spécification moléculaire et un échafaudage cellulaire pour le développement des axones commissuraux. De nouvelles investigations sur ces processus embryonnaires chez des espèces soigneusement sélectionnées fourniront des éclairages non seulement sur les mécanismes conduisant à l'évolution commissurale, mais aussi sur des problèmes biologiques plus généraux tels que le rôle de la plasticité développementale dans le changement évolutif.

@article{doi103389fnhum201400497,
    author = "Suárez, Rodrigo et Gobius, Ilan et Richards, Linda J.",
    title = "Évolution et développement des connexions interhémisphériques dans le télencéphale des vertébrés",
    year = "2014",
    journal = "Frontiers in Human Neuroscience",
    abstract = "Les connexions axonales entre les côtés gauche et droit du cerveau sont cruciales pour l'intégration bilatérale des fonctions sensorielles, motrices et associatives latéralisées. Chez toutes les espèces de vertébrés, les commissures du cerveau antérieur partagent un plan de développement conservé, une position similaire les unes par rapport aux autres au sein du cerveau et des motifs de connectivité similaires. Cependant, des événements majeurs dans l'évolution du cerveau des vertébrés, tels que l'expansion du télencéphale chez les tétrapodes et l'origine de l'isocortex à six couches chez les mammifères, ont conduit à l'émergence et à la diversification de nouvelles voies commissurales. Ces nouvelles connexions interhémisphériques incluent la commissure palliale, apparue chez les ancêtres des tétrapodes et reliant les côtés gauche et droit du pallium médian (hippocampe chez les mammifères), et le corps calleux, exclusif aux mammifères eutheriens (placentaires) et reliant les deux hémisphères isocorticaux. Une analyse comparative des systèmes commissuraux chez les vertébrés révèle que l'émergence de nouvelles voies commissurales a pu impliquer l'emprunt de mécanismes de développement et de substrats anatomiques de voies commissurales préexistantes. L'une des régions embryonnaires d'intérêt pour l'étude de ces processus est la plaque commissurale, une portion de la ligne médiane télencéphalique précoce qui fournit une spécification moléculaire et un échafaudage cellulaire pour le développement des axones commissuraux. De nouvelles investigations sur ces processus embryonnaires chez des espèces soigneusement sélectionnées fourniront des éclairages non seulement sur les mécanismes conduisant à l'évolution commissurale, mais aussi sur des problèmes biologiques plus généraux tels que le rôle de la plasticité développementale dans le changement évolutif.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fnhum.2014.00497",
    doi = "10.3389/fnhum.2014.00497",
    openalex = "W2003046304",
    references = "doi101007978364218262412"
}

L'origine évolutive de la mâchoire des vertébrés demeure un mystère profondément énigmatique. Plus de 99 % des vertébrés vivants possèdent des mâchoires, mais la séquence évolutive qui a finalement donné naissance à cette innovation hautement réussie reste controversée. Une synthèse des récentes découvertes fossiles et embryologiques offre une solution nouvelle à ce puzzle durable. L'hypothèse de la restriction mandibulaire propose que la mâchoire a évolué par la restriction spatiale de l'arche mandibulaire (l'arche pharyngienne la plus antérieure dans laquelle la mâchoire est apparue). Les preuves fossiles et anatomiques révèlent : (i) la région mandibulaire était initialement étendue et distincte parmi les arches pharyngiennes ; et (ii) avec la restriction spatiale, l'arche mandibulaire n'a acquis un motif pharyngien commun qu'à l'origine de la mâchoire. La restriction s'est produite par un déplacement d'une frontière de domaine qui a restreint l'espace que pouvaient occuper les cellules mésenchymateuses de l'arche mandibulaire. À mesure que les domaines environnants remplaçaient les structures mandibulaires à la périphérie, ce déplacement a permis aux cellules de la crête neurale et au mésenchyme mésodermique de l'arche mandibulaire d'acquérir des programmes de modelage qui opèrent dans les arches plus postérieures. La population mésenchymateuse au sein de l'arche mandibulaire n'était donc plus nécessaire pour se différencier en structures spécialisées d'alimentation et de ventilation, et a été remodelée en une mâchoire. Les preuves embryologiques corroborent que l'arche mandibulaire doit être spatialement restreinte pour qu'une mâchoire se développe. Cette nouvelle interprétation suggère la crête neurale comme un facilitateur clé dans la corrélation des éléments de la segmentation classique de la tête des vertébrés.

@article{doi101111brv12187,
    author = "Miyashita, Tetsuto",
    title = "Fishing for jaws in early vertebrate evolution: a new hypothesis of mandibular confinement",
    year = "2015",
    journal = "Biological reviews/Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society",
    abstract = "L'origine évolutive de la mâchoire des vertébrés demeure un mystère profondément énigmatique. Plus de 99\% des vertébrés vivants possèdent des mâchoires, mais la séquence évolutive qui a finalement donné naissance à cette innovation hautement réussie reste controversée. Une synthèse des récentes découvertes fossiles et embryologiques offre une solution nouvelle à ce puzzle durable. L'hypothèse de la restriction mandibulaire propose que la mâchoire a évolué par la restriction spatiale de l'arche mandibulaire (l'arche pharyngienne la plus antérieure dans laquelle la mâchoire est apparue). Les preuves fossiles et anatomiques révèlent : (i) la région mandibulaire était initialement étendue et distincte parmi les arches pharyngiennes ; et (ii) avec la restriction spatiale, l'arche mandibulaire n'a acquis un motif pharyngien commun qu'à l'origine de la mâchoire. La restriction s'est produite par un déplacement d'une frontière de domaine qui a restreint l'espace que pouvaient occuper les cellules mésenchymateuses de l'arche mandibulaire. À mesure que les domaines environnants remplaçaient les structures mandibulaires à la périphérie, ce déplacement a permis aux cellules de la crête neurale et au mésenchyme mésodermique de l'arche mandibulaire d'acquérir des programmes de modelage qui opèrent dans les arches plus postérieures. La population mésenchymateuse au sein de l'arche mandibulaire n'était donc plus nécessaire pour se différencier en structures spécialisées d'alimentation et de ventilation, et a été remodelée en une mâchoire. Les preuves embryologiques corroborent que l'arche mandibulaire doit être spatialement restreinte pour qu'une mâchoire se développe. Cette nouvelle interprétation suggère la crête neurale comme un facilitateur clé dans la corrélation des éléments de la segmentation classique de la tête des vertébrés.",
    url = "https://doi.org/10.1111/brv.12187",
    doi = "10.1111/brv.12187",
    openalex = "W1548546189",
    references = "doi101016jydbio201108003, doi101016jydbio201302022, doi101093icb12177, doi101111j146364091974tb00816x, doi101111j146364091978tb00792x, doi101111zoj12111, doi101111zoj12186"
}

Nous démontrons que la signalisation Nodal est nécessaire pour établir l'axe embryonnaire gauche-droite et pour développer une asymétrie profonde chez l'amphioxus. Nos données suggèrent que la rupture initiale de symétrie chez l'amphioxus et la propagation de la voie sur le côté gauche correspondent à la situation chez les vertébrés. Cependant, les organes qui deviennent des cibles de la voie diffèrent entre l'amphioxus et les vertébrés, ce qui peut expliquer l'asymétrie prononcée de ses structures oropharyngées et axiales ainsi que la position latérale gauche de la bouche.

@article{doi1011862041913965,
    author = "Soukup, Vladimír et Yong, Luok Wen et Lu, Tsai-Ming et Huang, Song-Wei et Kozmík, Zbyněk et Yu, Jr‐Kai",
    title = "La voie de signalisation Nodal contrôle le développement asymétrique gauche-droite chez l'amphioxus",
    year = "2015",
    journal = "EvoDevo",
    abstract = "Nous démontrons que la signalisation Nodal est nécessaire pour établir l'axe embryonnaire gauche-droite et pour développer une asymétrie profonde chez l'amphioxus. Nos données suggèrent que la rupture initiale de symétrie chez l'amphioxus et la propagation de la voie sur le côté gauche correspondent à la situation chez les vertébrés. Cependant, les organes qui deviennent des cibles de la voie diffèrent entre l'amphioxus et les vertébrés, ce qui peut expliquer l'asymétrie prononcée de ses structures oropharyngées et axiales ainsi que la position latérale gauche de la bouche.",
    url = "https://doi.org/10.1186/2041-9139-6-5",
    doi = "10.1186/2041-9139-6-5",
    openalex = "W2147537972",
    references = "doi101002dvdy20401, doi101006dbio20009630, doi101007s004270050309, doi101016jydbio201005016, doi101016jydbio201102014, doi101016jydbio201108003, doi101242dev073833, doi105962bhltitle55924"
}

Deux grands systèmes squelettiques - l'endosquelette et l'exosquelette - sont reconnus dans l'évolution des vertébrés. Ici, nous proposons que ces deux systèmes sont distingués principalement par leurs positions relatives, et non par des différences dans l'histogenèse embryonnaire ou la lignée cellulaire d'origine. Des analyses embryologiques comparatives ont montré que les deux types de squelette ont changé leur mode d'histogenèse au cours de l'évolution. Bien que les exosquelettes aient été pensés comme n'ayant une origine exclusive dans la crête neurale, des expériences récentes chez les téléostéens ont montré que les exosquelettes du tronc sont d'origine mésodermique. L'exosquelette postcrânien recouvert d'émailloïde et de dentine observé chez de nombreux vertébrés ne semble pas représenter une condition ancestrale, comme précédemment supposé, mais plutôt une condition dérivée, dans laquelle les tissus d'émailloïde et de dentine se sont accolés aux os. Des données récentes provenant de fossiles de placodermes sont compatibles avec ce scénario. En revanche, le crâne contient des os dérivés de la crête neurale dans sa partie rostrale. Des études développementales récentes suggèrent que la frontière entre les os dérivés de la crête neurale et ceux dérivés du mésoderme peut ne pas être cohérente tout au long de l'évolution. Au contraire, les positions relatives des éléments osseux peuvent être conservées, et les homologies des éléments osseux ont été maintenues, avec des changements opportunistes dans les mécanismes et les lignées cellulaires du développement.

@article{doi101186s4085101400077,
    author = "Hirasawa, Tatsuya et Kuratani, Shigeru",
    title = "Évolution du squelette des vertébrés : morphologie, embryologie et développement",
    year = "2015",
    journal = "Zoological Letters",
    abstract = "Deux grands systèmes squelettiques - l'endosquelette et l'exosquelette - sont reconnus dans l'évolution des vertébrés. Ici, nous proposons que ces deux systèmes sont distingués principalement par leurs positions relatives, et non par des différences dans l'histogenèse embryonnaire ou la lignée cellulaire d'origine. Des analyses embryologiques comparatives ont montré que les deux types de squelette ont changé leur mode d'histogenèse au cours de l'évolution. Bien que les exosquelettes aient été pensés comme n'ayant une origine exclusive dans la crête neurale, des expériences récentes chez les téléostéens ont montré que les exosquelettes du tronc sont d'origine mésodermique. L'exosquelette postcrânien recouvert d'émailloïde et de dentine observé chez de nombreux vertébrés ne semble pas représenter une condition ancestrale, comme précédemment supposé, mais plutôt une condition dérivée, dans laquelle les tissus d'émailloïde et de dentine se sont accolés aux os. Des données récentes provenant de fossiles de placodermes sont compatibles avec ce scénario. En revanche, le crâne contient des os dérivés de la crête neurale dans sa partie rostrale. Des études développementales récentes suggèrent que la frontière entre les os dérivés de la crête neurale et ceux dérivés du mésoderme peut ne pas être cohérente tout au long de l'évolution. Au contraire, les positions relatives des éléments osseux peuvent être conservées, et les homologies des éléments osseux ont été maintenues, avec des changements opportunistes dans les mécanismes et les lignées cellulaires du développement.",
    url = "https://doi.org/10.1186/s40851-014-0007-7",
    doi = "10.1186/s40851-014-0007-7",
    openalex = "W2102956717",
    references = "doi10100703064746897, doi101016jdevcel201007010, doi101017cbo9780511897948, doi101038142004a0, doi101093aesa383396, doi101098rspb19790086, doi101242dev1172409, doi101242dev12781671, doi101671a11168, doi105962bhltitle82144, openalexw1964182146"
}

L'évolution des dents orales est considérée comme un facteur majeur de la réussite globale des vertébrés à mâchoires. Cela est particulièrement évident chez les poissons cartilagineux, y compris les requins et les raies, qui développent des ensembles élaborés de dents hautement spécialisées, organisées en rangées et conservent la capacité de régénération tout au long de la vie. La régénération perpétuelle des dents orales a été soit perdue soit fortement réduite dans de nombreuses autres lignées, y compris des espèces modèles importantes du développement, de sorte que les poissons cartilagineux sont particulièrement adaptés pour des analyses comparatives approfondies du développement et de la régénération des dents. De plus, les requins et les raies peuvent offrir des aperçus cruciaux sur les caractères de la dentition chez l'ancêtre de tous les vertébrés à mâchoires. Malgré cela, le développement et la régénération des dents chez les chondrichthyens sont mal compris et restent pratiquement non caractérisés d'un point de vue génétique du développement. En utilisant le modèle émergent de chondrichthyens, le requin-chat (Scyliorhinus spp.), nous avons caractérisé l'expression de gènes homologues à ceux connus pour être exprimés lors des stades de compétence dentaire précoce, d'initiation des dents, de morphogenèse et de régénération chez les vertébrés osseux. Nous avons constaté que les motifs d'expression de plusieurs gènes des voies de signalisation Hh, Wnt/β-caténine, Bmp et Fgf indiquent une conservation profonde sur environ ~450 millions d'années du développement et de la régénération des dents. Nous décrivons comment ces gènes participent à l'émergence initiale de la dentition du requin et comment ils sont redéployés lors de la régénération des générations successives de dents. Nous suggérons qu'à l'aube de la lignée des vertébrés, les dents (i) étaient probablement des structures continuellement régénératives, et (ii) utilisaient un ensemble de gènes de base provenant de membres de voies de signalisation développementales clés qui ont été instrumentales dans la création d'un héritage dentaire redéployé tout au long de l'évolution des vertébrés. Ces données posent les bases pour de futures investigations expérimentales utilisant la capacité de régénération unique des modèles de chondrichthyens pour répondre à des questions biologiques évolutives, développementales et régénératives qui sont impossibles à explorer dans les modèles classiques.

@article{doi101016jydbio201601038,
    author = "Rasch, Liam J. and Martin, Kyle J. and Cooper, Rory L. and Metscher, Brian and Underwood, Charlie J. and Fraser, Gareth J.",
    title = "An ancient dental gene set governs development and continuous regeneration of teeth in sharks",
    year = "2016",
    journal = "Developmental Biology",
    abstract = "L'évolution des dents orales est considérée comme un facteur majeur de la réussite globale des vertébrés à mâchoires. Cela est particulièrement évident chez les poissons cartilagineux, y compris les requins et les raies, qui développent des ensembles élaborés de dents hautement spécialisées, organisées en rangées et conservent la capacité de régénération tout au long de la vie. La régénération perpétuelle des dents orales a été soit perdue soit fortement réduite dans de nombreuses autres lignées, y compris des espèces modèles importantes du développement, de sorte que les poissons cartilagineux sont particulièrement adaptés pour des analyses comparatives approfondies du développement et de la régénération des dents. De plus, les requins et les raies peuvent offrir des aperçus cruciaux sur les caractères de la dentition chez l'ancêtre de tous les vertébrés à mâchoires. Malgré cela, le développement et la régénération des dents chez les chondrichthyens sont mal compris et restent pratiquement non caractérisés d'un point de vue génétique du développement. En utilisant le modèle émergent de chondrichthyens, le requin-chat (Scyliorhinus spp.), nous avons caractérisé l'expression de gènes homologues à ceux connus pour être exprimés lors des stades de compétence dentaire précoce, d'initiation des dents, de morphogenèse et de régénération chez les vertébrés osseux. Nous avons constaté que les motifs d'expression de plusieurs gènes des voies de signalisation Hh, Wnt/β-caténine, Bmp et Fgf indiquent une conservation profonde sur environ \textasciitilde 450 millions d'années du développement et de la régénération des dents. Nous décrivons comment ces gènes participent à l'émergence initiale de la dentition du requin et comment ils sont redéployés lors de la régénération des générations successives de dents. Nous suggérons qu'à l'aube de la lignée des vertébrés, les dents (i) étaient probablement des structures continuellement régénératives, et (ii) utilisaient un ensemble de gènes de base provenant de membres de voies de signalisation développementales clés qui ont été instrumentales dans la création d'un héritage dentaire redéployé tout au long de l'évolution des vertébrés. Ces données posent les bases pour de futures investigations expérimentales utilisant la capacité de régénération unique des modèles de chondrichthyens pour répondre à des questions biologiques évolutives, développementales et régénératives qui sont impossibles à explorer dans les modèles classiques.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2016.01.038",
    doi = "10.1016/j.ydbio.2016.01.038",
    openalex = "W2268493813",
    references = "doi101002bies200900151, doi101002jmor1051660303, doi101038nature14065, doi101038nature14438"
}

Le changement climatique et la variabilité décennale affectent les espèces de poissons et d'invertébrés marins dans le monde entier, et ces impacts se poursuivront pour l'avenir prévisible. Des approches quantitatives ont été développées pour examiner les impacts du climat sur la productivité, l'abondance et la distribution de diverses espèces de poissons et d'invertébrés marins. Cependant, il est difficile d'appliquer ces approches à un grand nombre d'espèces en raison du manque de compréhension mécanistique suffisant pour les analyses quantitatives, ainsi que du manque d'infrastructures scientifiques pour soutenir ces études plus détaillées. Les évaluations de vulnérabilité fournissent un cadre pour évaluer les impacts climatiques sur une large gamme d'espèces avec les informations existantes. Ces méthodes combinent l'exposition d'une espèce à un facteur de stress (changement climatique et variabilité décennale) et la sensibilité des espèces au facteur de stress. Ces deux composantes sont ensuite combinées pour estimer une vulnérabilité globale. Les données quantitatives sont utilisées lorsqu'elles sont disponibles, mais les informations qualitatives et l'opinion d'experts sont utilisées lorsque les données quantitatives font défaut. Ici, nous menons une évaluation de la vulnérabilité climatique sur 82 espèces de poissons et d'invertébrés dans l'étagère nord-est des États-Unis, y compris les espèces exploitées, de subsistance et protégées. Nous définissons la vulnérabilité climatique comme la mesure dans laquelle l'abondance ou la productivité d'une espèce dans la région pourrait être affectée par le changement climatique et la variabilité décennale. Nous constatons que la vulnérabilité climatique globale est élevée à très élevée pour environ la moitié des espèces évaluées ; les espèces d'invertébrés diadromes et benthiques présentent la plus grande vulnérabilité. En outre, la majorité des espèces incluses dans l'évaluation ont un potentiel élevé de changement de distribution en réponse aux changements climatiques projetés. Des effets négatifs du changement climatique sont attendus pour environ la moitié des espèces évaluées, mais certaines espèces sont susceptibles d'être positivement affectées (par exemple, augmentation de la productivité ou déplacement dans la région). Ces résultats informeront les activités de recherche et de gestion liées à la compréhension et à l'adaptation de la gestion et de la conservation des pêches marines au changement climatique et à la variabilité décennale.

@article{doi101371journalpone0146756,
    author = "Hare, Jonathan A. and Morrison, Wendy E. and Nelson, Mark and Stachura, Megan M. and Teeters, Eric J. and Griffis, Roger B. and Alexander, Michael A. and Scott, James D. and Alade, Larry and Bell, Richard J. and Chute, Antonie S. and Curti, Kiersten L. and Curtis, Tobey H. and Kircheis, Daniel and Kocik, John F. and Lucey, Seán and McCandless, Camilla T. and Milke, Lisa M. and Richardson, David E. and Robillard, Eric and Walsh, Harvey J. and McManus, M. Conor and Marancik, Katrin E. and Griswold, Carolyn A.",
    title = "A Vulnerability Assessment of Fish and Invertebrates to Climate Change on the Northeast U.S. Continental Shelf",
    year = "2016",
    journal = "PLoS ONE",
    abstract = "Le changement climatique et la variabilité décennale affectent les espèces de poissons et d'invertébrés marins dans le monde entier, et ces impacts se poursuivront pour l'avenir prévisible. Des approches quantitatives ont été développées pour examiner les impacts du climat sur la productivité, l'abondance et la distribution de diverses espèces de poissons et d'invertébrés marins. Cependant, il est difficile d'appliquer ces approches à un grand nombre d'espèces en raison du manque de compréhension mécanistique suffisant pour les analyses quantitatives, ainsi que du manque d'infrastructures scientifiques pour soutenir ces études plus détaillées. Les évaluations de vulnérabilité fournissent un cadre pour évaluer les impacts climatiques sur une large gamme d'espèces avec les informations existantes. Ces méthodes combinent l'exposition d'une espèce à un facteur de stress (changement climatique et variabilité décennale) et la sensibilité des espèces au facteur de stress. Ces deux composantes sont ensuite combinées pour estimer une vulnérabilité globale. Les données quantitatives sont utilisées lorsqu'elles sont disponibles, mais les informations qualitatives et l'opinion d'experts sont utilisées lorsque les données quantitatives font défaut. Ici, nous menons une évaluation de la vulnérabilité climatique sur 82 espèces de poissons et d'invertébrés dans l'étagère nord-est des États-Unis, y compris les espèces exploitées, de subsistance et protégées. Nous définissons la vulnérabilité climatique comme la mesure dans laquelle l'abondance ou la productivité d'une espèce dans la région pourrait être affectée par le changement climatique et la variabilité décennale. Nous constatons que la vulnérabilité climatique globale est élevée à très élevée pour environ la moitié des espèces évaluées ; les espèces d'invertébrés diadromes et benthiques présentent la plus grande vulnérabilité. En outre, la majorité des espèces incluses dans l'évaluation ont un potentiel élevé de changement de distribution en réponse aux changements climatiques projetés. Des effets négatifs du changement climatique sont attendus pour environ la moitié des espèces évaluées, mais certaines espèces sont susceptibles d'être positivement affectées (par exemple, augmentation de la productivité ou déplacement dans la région). Ces résultats informeront les activités de recherche et de gestion liées à la compréhension et à l'adaptation de la gestion et de la conservation des pêches marines au changement climatique et à la variabilité décennale.",
    url = "https://doi.org/10.1371/journal.pone.0146756",
    doi = "10.1371/journal.pone.0146756",
    openalex = "W2256116549",
    references = "doi101111j13652486200902128x"
}

La sensation du toucher est médiée par des neurones mécanosensoriels qui sont intégrés dans la peau et relaient des signaux de la périphérie vers le système nerveux central. Pendant l'embryogenèse, les axones s'allongent à partir de ces neurones pour entrer en contact avec la peau en développement. Parallèlement, l'épithélium de la peau se transforme d'un tissu homogène en un organe hétérogène composé de couches distinctes et de microdomaines. Tout au long de ce processus, chaque terminaison neuronale doit former des connexions avec une région appropriée de la peau pour remplir sa fonction. Cette revue présente les connaissances actuelles sur le développement des microdomaines sensoriels dans la peau des mammifères et des neurones mécanosensoriels qui les innervent.

@article{doi101242dev120402,
    author = "Jenkins, Blair A. and Lumpkin, Ellen A.",
    title = "Développer un sens du toucher",
    year = "2017",
    journal = "Développement",
    abstract = "La sensation du toucher est médiée par des neurones mécanosensoriels qui sont intégrés dans la peau et relaient des signaux de la périphérie vers le système nerveux central. Pendant l'embryogenèse, les axones s'allongent à partir de ces neurones pour entrer en contact avec la peau en développement. Parallèlement, l'épithélium de la peau se transforme d'un tissu homogène en un organe hétérogène composé de couches distinctes et de microdomaines. Tout au long de ce processus, chaque terminaison neuronale doit former des connexions avec une région appropriée de la peau pour remplir sa fonction. Cette revue présente les connaissances actuelles sur le développement des microdomaines sensoriels dans la peau des mammifères et des neurones mécanosensoriels qui les innervent.",
    url = "https://doi.org/10.1242/dev.120402",
    doi = "10.1242/dev.120402",
    openalex = "W2769136057",
    references = "doi101016jydbio201402016"
}

INTRODUCTION : Le onzième nerf crânien, le nerf accessoire, possède une anatomie complexe et unique et a fait l'objet de nombreux débats. Dans cet article, nous passons en revue la morphologie, l'embryologie, l'anatomie chirurgicale et les manifestations cliniques du nerf accessoire. Cette revue inclut également l'anatomie variant, le développement moléculaire, l'histologie et l'imagerie du nerf accessoire. CONCLUSIONS : Le nerf accessoire continue d'être un sujet de discussion concernant sa fonction exacte et, en particulier, ses racines crâniennes. Récemment, diverses procédures chirurgicales ont été conçues pour réutiliser le nerf accessoire (par exemple, des procédures d'allongement, des procédures de neurotisation contralatérale). Actuellement, nous continuons d'apprendre et avons beaucoup à apprendre sur ce nerf crânien inférieur. Anat Rec, 302:620-629, 2019. © 2018 Wiley Periodicals, Inc.

@article{doi101002ar23823,
    author = "Johal, Jaspreet et Iwanaga, Joe et Tubbs, Kevin et Loukas, Marios et Oskouian, Rod J. et Tubbs, R. Shane",
    title = "Le nerf accessoire : Revue complète de son anatomie, développement, variations, repères et considérations cliniques",
    year = "2018",
    journal = "The Anatomical Record",
    abstract = "INTRODUCTION : Le onzième nerf crânien, le nerf accessoire, possède une anatomie complexe et unique et a fait l'objet de nombreux débats. Dans cet article, nous passons en revue la morphologie, l'embryologie, l'anatomie chirurgicale et les manifestations cliniques du nerf accessoire. Cette revue inclut également l'anatomie variant, le développement moléculaire, l'histologie et l'imagerie du nerf accessoire. CONCLUSIONS : Le nerf accessoire continue d'être un sujet de discussion concernant sa fonction exacte et, en particulier, ses racines crâniennes. Récemment, diverses procédures chirurgicales ont été conçues pour réutiliser le nerf accessoire (par exemple, des procédures d'allongement, des procédures de neurotisation contralatérale). Actuellement, nous continuons d'apprendre et avons beaucoup à apprendre sur ce nerf crânien inférieur. Anat Rec, 302:620-629, 2019. © 2018 Wiley Periodicals, Inc.",
    url = "https://doi.org/10.1002/ar.23823",
    doi = "10.1002/ar.23823",
    openalex = "W2801886639",
    references = "doi101002aja1000040106"
}

Les poissons cartilagineux modernes sont divisés en élasmobranches (requins, raies et pastenagues) et chimères, et l'absence de séquences génomiques complètes établies pour les premiers a empêché notre compréhension de l'évolution précoce des vertébrés et des phénotypes uniques des élasmobranches. Ici, nous présentons des assemblages génomiques complets de novo du requin à rayures brunes et du requin-chat nuageux, ainsi qu'un assemblage amélioré du génome du requin baleine. Ces génomes relativement grands (3,8-6,7 Gbp) contiennent des distributions dispersées de gènes codants et d'éléments régulateurs et présentent des taux d'évolution moléculaire réduits. Notre annotation génomique approfondie a révélé des gènes Hox C qui avaient été supposés avoir été perdus, ainsi que des répertoires génétiques distincts d'opsines et de récepteurs olfactifs qui seraient associés à l'adaptation à des niches sous-marines uniques. Nous montrons également l'établissement précoce de la machinerie génétique régulant l'homéostasie et la reproduction chez les mammifères chez l'ancêtre des vertébrés à mâchoires. Cette étude, soutenue par des ressources génomiques, transcriptomiques et épigénomiques, fournit une base pour l'exploration moléculaire complète des phénotypes uniques aux requins et des éclairages sur les origines évolutives des vertébrés.

@article{doi101038s4155901806735,
    author = "Hara, Yuichiro et Yamaguchi, Kazuaki et Onimaru, Koh et Kadota, Mitsutaka et Koyanagi, Mitsumasa et Keeley, Sean D. et Tatsumi, Kaori et Tanaka, Kaori et Motone, Fumio et Kageyama, Yuka et Nozu, Ryo et Adachi, Noritaka et Nishimura, Osamu et Nakagawa, Reiko et Tanegashima, Chiharu et Kiyatake, Itsuki et Matsumoto, Rui et Murakumo, Kiyomi et Nishida, Kiyonori et Terakita, Akihisa et Kuratani, Shigeru et Sato, Keiichi et Hyodo, Susumu et Kuraku, Shigehiro",
    title = "Shark genomes provide insights into elasmobranch evolution and the origin of vertebrates",
    year = "2018",
    journal = "Nature Ecology \& Evolution",
    abstract = "Les poissons cartilagineux modernes sont divisés en élasmobranches (requins, raies et pastenagues) et chimères, et l'absence de séquences génomiques complètes établies pour les premiers a empêché notre compréhension de l'évolution précoce des vertébrés et des phénotypes uniques des élasmobranches. Ici, nous présentons des assemblages génomiques complets de novo du requin à rayures brunes et du requin-chat nuageux, ainsi qu'un assemblage amélioré du génome du requin baleine. Ces génomes relativement grands (3,8-6,7 Gbp) contiennent des distributions dispersées de gènes codants et d'éléments régulateurs et présentent des taux d'évolution moléculaire réduits. Notre annotation génomique approfondie a révélé des gènes Hox C qui avaient été supposés avoir été perdus, ainsi que des répertoires génétiques distincts d'opsines et de récepteurs olfactifs qui seraient associés à l'adaptation à des niches sous-marines uniques. Nous montrons également l'établissement précoce de la machinerie génétique régulant l'homéostasie et la reproduction chez les mammifères chez l'ancêtre des vertébrés à mâchoires. Cette étude, soutenue par des ressources génomiques, transcriptomiques et épigénomiques, fournit une base pour l'exploration moléculaire complète des phénotypes uniques aux requins et des éclairages sur les origines évolutives des vertébrés.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41559-018-0673-5",
    doi = "10.1038/s41559-018-0673-5",
    openalex = "W2894335751",
    references = "doi101002jez1402670309, doi101038s4155901704484"
}

Les poissons sont capables de détecter et de percevoir l'environnement hydrodynamique et physique qu'ils habitent et traitent ces informations sensorielles pour guider le comportement résultant grâce à leur système latéral mécanosensoriel. Ce système sensoriel est composé de jusqu'à plusieurs milliers de neuromastes répartis sur l'ensemble du corps de l'animal. En utilisant le système latéral, les poissons perçoivent les mouvements de l'eau d'origine biotique et abiotique. L'anatomie du système latéral varie considérablement entre et au sein des espèces. Il est encore question de débat sur la manière dont les différentes anatomies latérales reflètent les adaptations aux conditions hydrodynamiques auxquelles les poissons sont exposés. Bien qu'il existe de nombreux comptes rendus d'adaptations du système latéral pour la détection de signaux hydrodynamiques dans des contextes comportementaux et des environnements distincts pour des espèces de poissons spécifiques, il existe seulement des connaissances limitées sur la manière dont l'environnement influence les variations intra et interspécifiques de la morphologie latérale. Les poissons vivent dans une large gamme d'habitats avec des conditions hydrodynamiques hautement diversifiées, des étangs et lacs et courants océaniques profonds lentement mobiles aux rivières turbulentes et rapides et régions de surf côtier rugueux. Peut-être surprenant, les caractérisations détaillées des propriétés hydrodynamiques des masses d'eau naturelles sont rares. En particulier, peu est connu sur les modèles spatio-temporels des mouvements d'eau à petite échelle qui sont les plus pertinents pour de nombreux comportements de poissons, rendant difficile de relier les stimuli environnementaux à la morphologie et la fonction du système sensoriel. Les humains utilisent les masses d'eau étendument pour des loisirs, des industries et des usages domestiques et en faisant souvent altèrent l'environnement aquatique, tel que par la libération de toxiques, le blocage des rivières par des barrages et le bruit acoustique émergeant des bateaux et chantiers de construction. Bien que les effets des interférences anthropiques ne soient souvent pas bien compris ou quantifiés, il semble évident qu'ils changent non seulement la qualité et l'apparence de l'eau mais aussi, ils altèrent les conditions hydrodynamiques et ainsi les types de stimuli hydrodynamiques agissant sur les poissons. À ce jour, peu est connu sur la manière dont les influences anthropiques sur l'environnement aquatique affectent la morphologie et la fonction des systèmes sensoriels en général et le système latéral en particulier. Cette revue commence par une brève description des stimuli hydrodynamiques naturellement survenants et la morphologie et neurobiologie du système latéral de poisson. Dans la partie principale, les adaptations du système latéral de poisson pour la détection et l'analyse des mouvements d'eau pendant divers comportements sont présentées. Finalement, les influences anthropiques sur l'environnement aquatique et les effets potentiels sur le système latéral de poisson sont discutés.

@article{doi101111jfb13966,
    author = "Mogdans, Joachim",
    title = "Écologie sensorielle du système latéral des poissons : adaptations morphologiques et physiologiques pour la perception des stimuli hydrodynamiques",
    year = "2019",
    journal = "Journal of Fish Biology",
    abstract = "Les poissons sont capables de détecter et de percevoir l'environnement hydrodynamique et physique qu'ils habitent et traitent ces informations sensorielles pour guider le comportement résultant grâce à leur système latéral mécanosensoriel. Ce système sensoriel est composé de jusqu'à plusieurs milliers de neuromastes répartis sur tout le corps de l'animal. En utilisant le système latéral, les poissons perçoivent les mouvements de l'eau d'origine biotique et abiotique. L'anatomie du système latéral varie considérablement entre et au sein des espèces. Il est encore débattu de savoir comment les différentes anatomies latérales reflètent les adaptations aux conditions hydrodynamiques auxquelles les poissons sont exposés. Bien qu'il existe de nombreux comptes rendus d'adaptations du système latéral pour la détection de signaux hydrodynamiques dans des contextes comportementaux et des environnements distincts pour des espèces de poissons spécifiques, il existe peu de connaissances sur la manière dont l'environnement influence les variations intra et interspécifiques de la morphologie latérale. Les poissons vivent dans une large gamme d'habitats avec des conditions hydrodynamiques très diverses, des étangs et lacs aux courants profonds lentement mobiles, jusqu'aux rivières turbulentes et rapides et aux zones de surf côtière agitée. Peut-être surprenant, les caractérisations détaillées des propriétés hydrodynamiques des masses d'eau naturelles sont rares. En particulier, peu est connu sur les modèles spatio-temporels des mouvements d'eau à petite échelle qui sont les plus pertinents pour de nombreux comportements de poissons, ce qui rend difficile la relation entre les stimuli environnementaux et la morphologie et la fonction du système sensoriel. Les humains utilisent les masses d'eau étendument pour des loisirs, des industries et des usages domestiques et, en le faisant, modifient souvent l'environnement aquatique, par exemple par la libération de toxiques, le blocage des rivières par des barrages et le bruit acoustique émanant des bateaux et des chantiers de construction. Bien que les effets des interférences anthropiques ne soient souvent pas bien compris ou quantifiés, il semble évident qu'ils ne changent pas seulement la qualité et l'apparence de l'eau, mais qu'ils modifient également les conditions hydrodynamiques et donc les types de stimuli hydrodynamiques agissant sur les poissons. À ce jour, peu est connu sur la manière dont les influences anthropiques sur l'environnement aquatique affectent la morphologie et la fonction des systèmes sensoriels en général et du système latéral en particulier. Cette revue commence par une brève description des stimuli hydrodynamiques naturels et de la morphologie et de la neurobiologie du système latéral des poissons. Dans la partie principale, les adaptations du système latéral des poissons pour la détection et l'analyse des mouvements de l'eau pendant divers comportements sont présentées. Enfin, les influences anthropiques sur l'environnement aquatique et les effets potentiels sur le système latéral des poissons sont discutés.",
    url = "https://doi.org/10.1111/jfb.13966",
    doi = "10.1111/jfb.13966",
    openalex = "W2922278223",
    references = "doi10100797814612356063, doi101098rspb20160839"
}

-expressing dermal cells. Epidermal Noggin overexpression at E14.5 disrupted touch-dome formation but not hair-follicle specification, demonstrating a temporally distinct requirement for BMP signaling in placode-derived structures. Surprisingly, two neuronal populations preferentially targeted touch domes during development but only one persisted in mature touch domes. Finally, Keratin-17-expressing keratinocytes but not Merkel cells were necessary to establish innervation patterns during development. These findings identify key cell types and signaling pathways required for targeting Merkel-cell afferents to discrete mechanosensory compartments.

@article{doi107554elife42633,
    author = "Jenkins, Blair A. et Fontecilla, Natalia M. et Lu, Ping et Fuchs, Elaine et Lumpkin, Ellen A.",
    title = "Les bases cellulaires de l'innervation mécano-sensorielle des cellules de Merkel durant le développement",
    year = "2019",
    journal = "eLife",
    abstract = "-expressing dermal cells. Epidermal Noggin overexpression at E14.5 disrupted touch-dome formation but not hair-follicle specification, demonstrating a temporally distinct requirement for BMP signaling in placode-derived structures. Surprisingly, two neuronal populations preferentially targeted touch domes during development but only one persisted in mature touch domes. Finally, Keratin-17-expressing keratinocytes but not Merkel cells were necessary to establish innervation patterns during development. These findings identify key cell types and signaling pathways required for targeting Merkel-cell afferents to discrete mechanosensory compartments.",
    url = "https://doi.org/10.7554/elife.42633",
    doi = "10.7554/elife.42633",
    openalex = "W2917631679",
    references = "doi101016jydbio201402016"
}

@article{wheeler2020anthropogenic,
    author = "Wheeler, Carolyn R. et Gervais, Connor R. et Johnson, Martijn S. et Vance, Shelby et Rosa, Rui et Mandelman, John W. et Rummer, Jodie L.",
    title = "Anthropogenic stressors influence reproduction and development in elasmobranch fishes",
    year = "2020",
    journal = "Reviews in Fish Biology and Fisheries",
    url = "https://doi.org/10.1007/s11160-020-09604-0",
    doi = "10.1007/s11160-020-09604-0",
    number = "2",
    openalex = "W3026967763",
    pages = "373-386",
    volume = "30",
    references = "doi101006jmsc20000724, doi101038srep46864, doi1010719780643109148, doi101086284913, doi101111gcb13903, doi101126scienceaac4722, doi101126scienceaan8048, doi101371journalpone0146756, doi107554elife00590, openalexw2530597942"
}

Résumé Nous développons un cadre potentiellement largement applicable pour analyser la vulnérabilité, le risque de résilience et l'exposition des espèces chondrichthyennes à tous les types de stress anthropiques dans l'environnement marin. L'approche combine les trois composantes de l'analyse de vulnérabilité largement appliquée (exposition, sensibilité et adaptabilité) (ESA) avec trois composantes (exposition, susceptibilité et productivité) (ESP) de notre adaptation de l'analyse de productivité–susceptibilité (PSA). Nous appliquons notre analyse ESA‒ESP en 12 étapes pour évaluer la vulnérabilité (risque d'une réduction marquée de la population) de chacune des 132 espèces chondrichthyennes dans la zone économique exclusive du sud de l'Australie. La vulnérabilité concerne la résilience d'une espèce face à une réduction spatiale (ou de convenance) de ses habitats due à l'exposition à jusqu'à huit stress du changement climatique. La vulnérabilité concerne également la mortalité anthropique ajoutée à la mortalité naturelle due à l'exposition aux stress de cinq types de pêche et sept autres types de dangers anthropiques. Nous utilisons des attributs biologiques comme facteurs de risque pour évaluer le risque lié à la résilience au niveau de l'espèce ou d'un niveau taxonomique supérieur. Nous évaluons l'exposition de chaque espèce aux stress anthropiques en l'assignant à l'un des six groupes écologiques basés sur son mode de vie (benthique versus pélagique) et son habitat, défini par la gamme bathymétrique et les substrats. Nous évaluons la vulnérabilité pour 11 scénarios : 2000–2006 lorsque l'effort de pêche a atteint son pic ; 2018 suivant une décennie de réformes de gestion des pêches ; les scénarios d'émissions futures de dioxyde de carbone équivalent à faible, moyenne et haute intensité ; et leurs six combinaisons possibles climat–pêche. Nos résultats démontrent la valeur des refuges contre la pêche et la manière dont le changement climatique exacerbe les risques de la pêche.

@article{doi101111faf12571,
    author = "Walker, Terence I. et Day, Robert W. et Awruch, Cynthia A. et Bell, Justin D. et Braccini, Juan Matias et Dapp, Derek R. et Finotto, Licia et Frick, Lorenz H. et Garcés‐García, Karla C. et Guida, Leonardo et Huveneers, Charlie et Martins, Camila Leite et Rochowski, Bastien et Tovar‐Ávila, Javier et Trinnie, Fabian I. et Reina, Richard D.",
    title = "Vulnérabilité écologique de la faune chondrichthyenne du sud de l'Australie face aux stress du changement climatique, de la pêche et d'autres dangers anthropiques",
    year = "2021",
    journal = "Fish and Fisheries",
    abstract = "Résumé Nous développons un cadre potentiellement largement applicable pour analyser la vulnérabilité, le risque de résilience et l'exposition des espèces chondrichthyennes à tous les types de stress anthropiques dans l'environnement marin. L'approche combine les trois composantes de l'analyse de vulnérabilité largement appliquée (exposition, sensibilité et adaptabilité) (ESA) avec trois composantes (exposition, susceptibilité et productivité) (ESP) de notre adaptation de l'analyse de productivité–susceptibilité (PSA). Nous appliquons notre analyse ESA‒ESP en 12 étapes pour évaluer la vulnérabilité (risque d'une réduction marquée de la population) de chacune des 132 espèces chondrichthyennes dans la zone économique exclusive du sud de l'Australie. La vulnérabilité concerne la résilience d'une espèce face à une réduction spatiale (ou de convenance) de ses habitats due à l'exposition à jusqu'à huit stress du changement climatique. La vulnérabilité concerne également la mortalité anthropique ajoutée à la mortalité naturelle due à l'exposition aux stress de cinq types de pêche et sept autres types de dangers anthropiques. Nous utilisons des attributs biologiques comme facteurs de risque pour évaluer le risque lié à la résilience au niveau de l'espèce ou d'un niveau taxonomique supérieur. Nous évaluons l'exposition de chaque espèce aux stress anthropiques en l'assignant à l'un des six groupes écologiques basés sur son mode de vie (benthique versus pélagique) et son habitat, défini par la gamme bathymétrique et les substrats. Nous évaluons la vulnérabilité pour 11 scénarios : 2000–2006 lorsque l'effort de pêche a atteint son pic ; 2018 suivant une décennie de réformes de gestion des pêches ; les scénarios d'émissions futures de dioxyde de carbone équivalent à faible, moyenne et haute intensité ; et leurs six combinaisons possibles climat–pêche. Nos résultats démontrent la valeur des refuges contre la pêche et la manière dont le changement climatique exacerbe les risques de la pêche.",
    url = "https://doi.org/10.1111/faf.12571",
    doi = "10.1111/faf.12571",
    openalex = "W3170191348",
    references = "doi101007s11160020096040, wheeler2020anthropogenic"
}

Malgré la longue histoire évolutive de ce groupe, les défis apportés par l'Anthropocène exercent une pression extensive sur les requins et leurs apparentés. La surexploitation entraîne un déclin mondial des populations d'élasmobranches, et les changements environnementaux rapides, déclenchés par les activités anthropiques, pourraient encore tester la résilience de ce groupe. Dans ce contexte, nous avons recherché dans la littérature des études à comité de lecture présentant une exposition soutenue (>24 h) et contrôlée d'espèces d'élasmobranches au réchauffement, à l'acidification et/ou à la désoxygénation : trois des symptômes les plus pressants du changement dans l'océan. Dans un cadre comparatif standardisé, nous avons mené une série de méta-analyses à modèles mixtes (basées sur 368 contrastes contrôle-traitement provenant de 53 études) pour évaluer les effets de ces facteurs et de leur combinaison en tant que traitements expérimentaux. Nous avons également comparé ces effets selon différents attributs (lignées, climats, modes de vie, modes reproductifs et stades de vie) et évalué la direction de l'impact sur un ensemble complet de réponses biologiques (survie, développement, croissance, métabolisme aérobie, métabolisme anaérobie, transport d'oxygène, alimentation, comportement, statut acido-basique, tolérance thermique, tolérance à l'hypoxie et stress cellulaire). Sur la base des résultats actuels, le réchauffement apparaît comme le facteur le plus influent, avec des effets directionnels clairs, à savoir une diminution du temps de développement et une augmentation du métabolisme aérobie, de l'alimentation et de la tolérance thermique. Bien que l'influence du réchauffement soit omniprésente à travers les attributs, les effets de l'acidification semblent plus spécifiques au contexte, sans tendances directionnelles perceptibles à travers les réponses biologiques autres que celles nécessaires pour atteindre l'équilibre acido-basique. Parallèlement, malgré son potentiel d'impacts sévères, la désoxygénation est le facteur le plus négligé, la pénurie de données empêchant finalement des conclusions solides. De même, la mise en œuvre de traitements multifactoriels a été principalement restreinte à la combinaison du réchauffement et de l'acidification, avec des effets approximativement équivalents à ceux du réchauffement. Malgré les progrès considérables réalisés ces dernières années, la recherche concernant l'impact de ces facteurs sur les élasmobranches est en retard par rapport à d'autres taxons, et davantage de recherches sont nécessaires pour démêler de nombreux effets observés. Compte tenu des niveaux actuels de risque d'extinction et du rythme rapide du changement global, il est également crucial que nous intégrions les connaissances accumulées grâce à différentes approches scientifiques dans une perspective holistique pour mieux comprendre comment ce groupe pourrait faire face à un océan en changement.

@article{doi103389fmars2021735377,
    author = "Santos, Catarina Pereira and Sampaio, Eduardo and Pereira, Beatriz P. and Pegado, Maria Rita and Borges, Francisco O. and Wheeler, Carolyn R. and Bouyoucos, Ian A. and Rummer, Jodie L. and Santos, Catarina and Rosa, Rui",
    title = "Elasmobranch Responses to Experimental Warming, Acidification, and Oxygen Loss—A Meta-Analysis",
    year = "2021",
    journal = "Frontiers in Marine Science",
    abstract = "Malgré la longue histoire évolutive de ce groupe, les défis apportés par l'Anthropocène exercent une pression extensive sur les requins et leurs apparentés. La surexploitation entraîne un déclin mondial des populations d'élasmobranches, et les changements environnementaux rapides, déclenchés par les activités anthropiques, pourraient encore tester la résilience de ce groupe. Dans ce contexte, nous avons recherché dans la littérature des études à comité de lecture présentant une exposition soutenue (\>24 h) et contrôlée d'espèces d'élasmobranches au réchauffement, à l'acidification et/ou à la désoxygénation : trois des symptômes les plus pressants du changement dans l'océan. Dans un cadre comparatif standardisé, nous avons mené une série de méta-analyses à modèles mixtes (basées sur 368 contrastes contrôle-traitement provenant de 53 études) pour évaluer les effets de ces facteurs et de leur combinaison en tant que traitements expérimentaux. Nous avons également comparé ces effets selon différents attributs (lignées, climats, modes de vie, modes reproductifs et stades de vie) et évalué la direction de l'impact sur un ensemble complet de réponses biologiques (survie, développement, croissance, métabolisme aérobie, métabolisme anaérobie, transport d'oxygène, alimentation, comportement, statut acido-basique, tolérance thermique, tolérance à l'hypoxie et stress cellulaire). Sur la base des résultats actuels, le réchauffement apparaît comme le facteur le plus influent, avec des effets directionnels clairs, à savoir une diminution du temps de développement et une augmentation du métabolisme aérobie, de l'alimentation et de la tolérance thermique. Bien que l'influence du réchauffement soit omniprésente à travers les attributs, les effets de l'acidification semblent plus spécifiques au contexte, sans tendances directionnelles perceptibles à travers les réponses biologiques autres que celles nécessaires pour atteindre l'équilibre acido-basique. Parallèlement, malgré son potentiel d'impacts sévères, la désoxygénation est le facteur le plus négligé, la pénurie de données empêchant finalement des conclusions solides. De même, la mise en œuvre de traitements multifactoriels a été principalement restreinte à la combinaison du réchauffement et de l'acidification, avec des effets approximativement équivalents à ceux du réchauffement. Malgré les progrès considérables réalisés ces dernières années, la recherche concernant l'impact de ces facteurs sur les élasmobranches est en retard par rapport à d'autres taxons, et davantage de recherches sont nécessaires pour démêler de nombreux effets observés. Compte tenu des niveaux actuels de risque d'extinction et du rythme rapide du changement global, il est également crucial que nous intégrions les connaissances accumulées grâce à différentes approches scientifiques dans une perspective holistique pour mieux comprendre comment ce groupe pourrait faire face à un océan en changement.",
    url = "https://doi.org/10.3389/fmars.2021.735377",
    doi = "10.3389/fmars.2021.735377",
    openalex = "W3202172281",
    references = "doi101007s11160020096040, doi101016jzool2020125799, wheeler2020anthropogenic"
}

Quelques poissons marins se nourrissent d'algues, et les micro-organismes présents dans leur tube digestif produisent des enzymes hydrolysant les glucides telles que l'agarase et la fucosidase, qui constituent une ressource potentiellement intéressante pour de nouvelles enzymes fonctionnelles. L'objectif de cette étude était d'établir une méthode pour identifier et utiliser des bactéries caractéristiques provenant de l'intestin de deux espèces de poissons herbivores : Andamia tetradactylus, qui se nourrit exclusivement d'algues sur la surface des rochers, et le sauteur rocheux stellaire Entomacrodus stellifer, qui se nourrit à la fois d'algues et d'invertébrés. Nous avons testé la composition spécifique de la flore bactérienne intestinale et constaté que les Proteobacteria étaient couramment présents dans les deux espèces ainsi que dans les communautés intestinales communes des poissons marins, tandis que les Spirochaetes et les Tenericutes occupaient la flore de A. tetradactylus. Nous avons ensuite réalisé des cultures anaérobies et aérobies et isolé 34 et 44 souches, dont 48 souches appartenant à l'espèce Vibrio, provenant de A. tetradactylus et E. stellifer. Nous avons observé que certaines souches de Vibrio formaient une frontière claire pour éviter le contact avec d'autres souches bactériennes. Le séquençage du génome entier de ces deux souches de Vibrio alginolyticus a révélé deux chromosomes circulaires couramment présents dans le génome des espèces de Vibrio, ainsi que certains gènes uniques codant pour l'alginate lyase, les chitinasés et l'endoribonucléase associée au CRISPR de type I-F, pour la première fois chez Vibrio alginolyticus.

@article{doi101038s41598022085117,
    author = "Yoshida, Masaaki et Tanabe, Takuma et Akiyoshi, Hideo et Kawamukai, Makoto",
    title = "Analyse du microbiote intestinal des poissons de la famille des Blenniidae, incluant un poisson herbivore et formation d'une frontière claire entre des souches isolées de Vibrio",
    year = "2022",
    journal = "Scientific Reports",
    abstract = "Quelques poissons marins se nourrissent d'algues, et les micro-organismes présents dans leur tube digestif produisent des enzymes hydrolysant les glucides telles que l'agarase et la fucosidase, qui constituent une ressource potentiellement intéressante pour de nouvelles enzymes fonctionnelles. L'objectif de cette étude était d'établir une méthode pour identifier et utiliser des bactéries caractéristiques provenant de l'intestin de deux espèces de poissons herbivores : Andamia tetradactylus, qui se nourrit exclusivement d'algues sur la surface des rochers, et le sauteur rocheux stellaire Entomacrodus stellifer, qui se nourrit à la fois d'algues et d'invertébrés. Nous avons testé la composition spécifique de la flore bactérienne intestinale et constaté que les Proteobacteria étaient couramment présents dans les deux espèces ainsi que dans les communautés intestinales communes des poissons marins, tandis que les Spirochaetes et les Tenericutes occupaient la flore de A. tetradactylus. Nous avons ensuite réalisé des cultures anaérobies et aérobies et isolé 34 et 44 souches, dont 48 souches appartenant à l'espèce Vibrio, provenant de A. tetradactylus et E. stellifer. Nous avons observé que certaines souches de Vibrio formaient une frontière claire pour éviter le contact avec d'autres souches bactériennes. Le séquençage du génome entier de ces deux souches de Vibrio alginolyticus a révélé deux chromosomes circulaires couramment présents dans le génome des espèces de Vibrio, ainsi que certains gènes uniques codant pour l'alginate lyase, les chitinasés et l'endoribonucléase associée au CRISPR de type I-F, pour la première fois chez Vibrio alginolyticus.",
    url = "https://doi.org/10.1038/s41598-022-08511-7",
    doi = "10.1038/s41598-022-08511-7",
    openalex = "W4221011340",
    references = "doi105962bhltitle992"
}

L'évolution et le développement de la tête ont longtemps captivé les chercheurs en raison du rôle crucial de la tête en tant que porte d'entrée pour les stimuli sensoriels et de la complexité structurelle intriquée de la tête. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés pour comprendre le développement de la tête chez diverses espèces vertébrées, nos connaissances sur l'ontogenèse précoce de la tête humaine restent limitées. Ici, nous avons utilisé des techniques avancées de coloration immunologique en coupe complète et d'imagerie 3D pour générer un atlas cellulaire 3D complet de l'embryogenèse de la tête humaine. Nous présentons des séries de développement détaillées de divers tissus et types cellulaires de la tête, y compris les muscles, la vasculature, le cartilage, les nerfs périphériques et les glandes exocrines. Ces ensembles de données, accessibles via une interface web dédiée, offrent des aperçus sur l'embryogenèse humaine. Nous offrons des perspectives sur la morphogenèse par bourgeonnement des glandes exocrines humaines et les caractéristiques inconnues du développement des structures neurovasculaires et squelettomusculaires. Ces aperçus sur l'embryologie humaine ont des implications importantes pour la compréhension des défauts craniofaciaux et des troubles neurologiques et pour le développement de stratégies diagnostiques et thérapeutiques.

@article{doi101016jcell202311013,
    author = "Blain, Raphaël et Couly, G et Shotar, Eimad et Blévinal, Joséphine et Toupin, Maryne et Favre, A. et Abjaghou, Ali et Inoue, M. et Hernández-Garzón, Edwin et Clarençon, Frédéric et Chalmel, Frédéric et Mazaud‐Guittot, Séverine et Giacobini, Paolo et Gitton, Yorick et Chédotal, Alain",
    title = "Atlas tridimensionnel de la tête humaine en développement",
    year = "2023",
    journal = "Cell",
    abstract = "L'évolution et le développement de la tête ont longtemps captivé les chercheurs en raison du rôle crucial de la tête en tant que porte d'entrée pour les stimuli sensoriels et de la complexité structurelle intriquée de la tête. Bien que des progrès significatifs aient été réalisés pour comprendre le développement de la tête chez diverses espèces vertébrées, nos connaissances sur l'ontogenèse précoce de la tête humaine restent limitées. Ici, nous avons utilisé des techniques avancées de coloration immunologique en coupe complète et d'imagerie 3D pour générer un atlas cellulaire 3D complet de l'embryogenèse de la tête humaine. Nous présentons des séries de développement détaillées de divers tissus et types cellulaires de la tête, y compris les muscles, la vasculature, le cartilage, les nerfs périphériques et les glandes exocrines. Ces ensembles de données, accessibles via une interface web dédiée, offrent des aperçus sur l'embryogenèse humaine. Nous offrons des perspectives sur la morphogenèse par bourgeonnement des glandes exocrines humaines et les caractéristiques inconnues du développement des structures neurovasculaires et squelettomusculaires. Ces aperçus sur l'embryologie humaine ont des implications importantes pour la compréhension des défauts craniofaciaux et des troubles neurologiques et pour le développement de stratégies diagnostiques et thérapeutiques.",
    url = "https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.11.013",
    doi = "10.1016/j.cell.2023.11.013",
    openalex = "W4389489563",
    references = "doi101002aja1000040106"
}