Construção do Genoma
Do tópico "Aritmética simples oferece um desafio testável à evolução"
Post do Mês: Dezembro de 2001
por Prof Weird 

Subject:    Re: Aritmética simples oferece um desafio testável à evolução
Newsgroups: talk.origins
Date:       6 de dezembro de 2001
Author:     Prof Weird
Message-ID: 3b9c6c39.0112060957.510a2067@posting.google.com
"Mark & Roslyn Elkington" <marilyn@zeta.org.au escreveu na mensagem news:<V8GP7.374$ko4.28897@nasal.pacific.net.au>...
> Estou pedindo evidências empíricas em estudos controlados de um genoma
> em crescimento sustentável de uma população em estudo. Não estou pedindo
> que você aplique suas premissas evolutivas retrospectivamente a genomas
> conhecidos, estou pedindo que você aponte para estudos documentados de
> evolução real construindo um genoma.

Se os genes são idênticos, que outra conclusão você poderia tirar além
da duplicação?

Há alguma evidência para duas duplicações em todo o genoma (todos os genes
duplicados) desde os peixes sem mandíbula, mas acredito que esses artigos
podem estar mais alinhados com o que você deseja:

"Duplicações espontâneas de sequências tandem revertem a estabilidade térmica
da 3-isopropilmalatodehidrogenase modificada no extremo carboxil", S Akanuma,
A Yamagishi, N Tanaka, T Oshimi, Journal of Bacteriology Nov 1996 #178,
pg 6300-6304

Eles removeram 22 bp da extremidade do gene leuB de uma bactéria termofílica
(pode crescer sem leucina a 65 graus, mas não a 75 graus).

3 mutações espontâneas surgiram que podiam crescer sem leucina a 75 graus -
todas foram DUPLICAÇÕES de DNA.

"Duplicações de sequências tandem complementam funcionalmente deleções na
proteína D1 do fotossistema II", H Kless e W Vermaas, Journal of
Biological Chemistry, 270 #28 (1995), pg 16536-16541

Sequências deletadas da proteína D1 de uma cianobactéria - não conseguiram
mais realizar a glicosíntese (requer glicose para crescimento).

Em uma linhagem (dYNIV - deleção de 4 aminoácidos) 3 mutantes surgiram -
por duplicações de DNA próximo ao local da deleção. Alguns sofreram
deslocamento de quadro, mas a adição dos novos nucleotídeos permitiu que
as células produzissem glicose novamente.

Em outra linhagem (dNN - deleção de 2 aminoácidos em uma localização
diferente) 3 mutantes surgiram - novamente por duplicações de DNA na área.
2 dos 3 sofreram deslocamento de quadro (em relação à sequência parental),
mas permitiram que as células produzissem glicose novamente.

"Aceleração da evolução de genes regulatórios em uma radiação adaptativa",
M Barriu, RH Robichaux, MD Purugganam, Proceedings of the National
Academy of Sciences (98) #18, pg 10208-10213

A aliança das espadas de prata havaianas é uma coleção de 30 espécies em
3 gêneros encontrados em Hawaii - a análise de seu DNA e enzimas mostra
que todas surgiram de uma FUSÃO e duplicação de 2 genomas vegetais
diferentes - os ancestrais foram provavelmente Anisocarpus scabridus e
Carlquisia muirii (tarweeds da América do Norte).

A aliança das espadas de prata havaianas é tetraploide, enquanto as linhas
parentais são diploides. Isso é comum em plantas - embora um híbrido entre
duas espécies diferentes, mas relacionadas, seja geralmente estéril
(cromossomos não podem se emparelhar corretamente - conjunto cromossômico
[1A + 1B], onde A é de um progenitor, B é do outro, e ao formar gametas,
divide-se A e B pela metade, mas DEVE ser um inteiro).

Ocasionalmente, em um broto em crescimento, os cromossomos duplicam-se
[2A + 2B], mas não ocorre divisão celular. Este híbrido é AGORA
AUTO-FÉRTIL, E UMA NOVA ESPÉCIE. Gametas são [A + B] - podem produzir
prole por autofecundação, mas NÃO com estoques parentais A ou B.

A maioria das plantas agrícolas hoje é tetraploide ou octoploide - isso
as torna maiores. Morangos, se não me engano, são 16N ou mais (de cruzamento
de duas espécies estreitamente relacionadas e depois duplicação do número
de cromossomos para torná-las férteis, feito várias vezes).