Construction du génome
À partir du fil « Une simple arithmétique fournit un défi testable à l'évolution »

Article du mois : décembre 2001
par Prof Weird

Objet :    Re : Une simple arithmétique fournit un défi testable à l'évolution
Groupes de discussion : talk.origins
Date :     6 décembre 2001
Auteur :   Prof Weird
Message-ID : 3b9c6c39.0112060957.510a2067@posting.google.com

"Mark & Roslyn Elkington" <marilyn@zeta.org.au a écrit dans le message news:<V8GP7.374$ko4.28897@nasal.pacific.net.au>...
> Je demande des preuves empiriques dans des études contrôlées d'un génome
> en augmentation durable d'une population étudiée. Je ne vous demande pas
> d'appliquer vos présupposés évolutionnistes rétrospectivement à des génomes
> connus, je vous demande de pointer vers des études documentées d'une
> évolution réelle construisant un génome.

Si les gènes sont identiques, quelle autre conclusion pouvez-vous tirer
autre que la duplication ?

Il existe certaines preuves de deux duplications à l'échelle du génome (TOUTES
les gènes doublés) depuis les poissons sans mâchoires, mais je pense que
ces articles sont plus en accord avec ce que vous voulez :

"Duplications spontanées de séquences tandem inversent la stabilité
thermique de la 3-isopropylmalate déshydrogénase modifiée en terminaison
carboxy", S Akanuma, A Yamagishi, N Tanaka, T Oshimi, Journal of
Bacteriology
nov. 1996 #178, pg 6300-6304

Ils ont retiré 22 pb de l'extrémité du gène leuB d'un bactérie
thermophile (peut croître sans leucine à 65 degrés, mais pas à 75
degrés).

3 mutations spontanées sont apparues qui pouvaient croître sans leucine
à 75 degrés - elles étaient toutes des DUPLICATIONS d'ADN.

"Duplications de séquences tandem fonctionnellement complètent les
déletions dans la protéine D1 du photosystème II", H Kless et W Vermaas,
Journal of Biological Chemistry, 270 #28 (1995), pg 16536-16541

Séquences supprimées d'une protéine D1 de cyanobactérie - ne pouvaient
plus effectuer la glycosynthèse (nécessite du glucose pour la croissance).

Dans une lignée (dYNIV - délétion de 4 acides aminés) 3 mutants sont
apparus - par duplications d'ADN près du site de délétion. Certains
étaient décalés, mais l'ajout de nouveaux nucléotides a permis aux
cellules de produire à nouveau du glucose.

Dans une autre lignée (dNN - délétion de 2 acides aminés à un endroit
différent) 3 mutants sont apparus - encore par duplications d'ADN dans
la région. 2 des 3 étaient décalés (par rapport à la séquence parentale),
mais ils ont permis aux cellules de produire à nouveau du glucose.

"Évolution accélérée des gènes régulateurs dans une radiation adaptative",
M Barriu, RH Robichaux, MD Purugganam, Proceedings of the National
Academy of Sciences
(98) #18, pg 10208-10213

L'alliance des épées d'argent hawaïennes est une collection de 30 espèces
dans 3 genres trouvées à Hawaï - l'analyse de leur ADN et enzymes montre
qu'elles sont toutes issues d'une FUSION et duplication de 2 génomes
végétaux différents - les ancêtres étaient probablement Anisocarpus
scabridus
et Carlquisia muirii (tarweeds d'Amérique du Nord).

L'alliance des épées d'argent hawaïennes est tétraploïde, alors que les
lignées parentales sont diploïdes. C'est courant chez les plantes - bien
qu'un hybride entre deux espèces différentes mais apparentées soit
généralement stérile (les chromosomes ne peuvent pas s'apparier
correctement - ensemble de chromosomes [1A + 1B], où A provient d'un
parent, B de l'autre, et lors de la formation des gamètes, on divise A
et B par moitié mais DOIT être un entier).

Occasionnellement dans une pousse en croissance, les chromosomes doublent
[2A + 2B] mais aucune division cellulaire ne se produit. Cet hybride est
MAINTENANT AUTO-FERTILE, ET UNE NOUVELLE ESPÈCE. Les gamètes sont [A + B]
- peuvent produire une descendance par autofécondation, mais PAS avec les
stocks parentaux A ou B.

La plupart des plantes agricoles d'aujourd'hui sont tétraploïdes ou
octoploïdes - cela les rend plus grandes. Les fraises, je me souviens,
sont environ 16N (par croisement de deux espèces étroitement apparentées
puis doublement du nombre de chromosomes pour les rendre fertiles, fait
plusieurs fois).