Publicar ou Perder: Algumas Obras Publicadas sobre a Evolução Bioquímica

Outros Links: Links externos abrem em novas janelas A Base Científica Elusiva do Design Inteligente Teoria A chamada "teoria do design inteligente", da qual Behe é um grande defensor, não produziu publicações em revistas científicas principais. Quem foi que disse publicar ou perecer? A Caixa Vazia de Behe Esta página da web contém muitos links para páginas da web que apoiam ou criticam o trabalho de Behe. Complexidade Irredutível e a Literatura Evolutiva: Resposta aos Críticos Este artigo inclui a resposta de Behe a esta página.

Na página 179 de A Caixa Preta de Darwin Michael Behe afirma:

"Nunca houve uma reunião, ou um livro, ou um artigo sobre os detalhes da evolução de sistemas bioquímicos complexos."

Ele encerra o capítulo com esta afirmação ridícula:

"Na prática, a teoria da evolução molecular darwiniana não foi publicada, e, portanto, deveria perecer"

(Alguém disse publicar ou perecer?: A Base Científica Elusiva da Teoria do Design Inteligente)

Para ser honesto, suspeito que o nível de detalhe que Behe exige exigiria uma combinação de um laboratório de bioquímica de ponta e uma máquina do tempo. De outra forma, como a ciência pode recuperar plenamente, por exemplo, cada único passo na evolução do flagelo bacteriano que ocorreu há bilhões de anos?

De qualquer forma, a alegação em si é falsa, pois existem, de fato, artigos que tentam detalhar a evolução de vários sistemas e estruturas bioquímicas. Muitas dessas citações estão incluídas abaixo.

Mas isso é apenas parte da história. Existem milhares de artigos publicados adicionais contendo evidências sólidas e detalhadas da evolução bioquímica:

• Evidência de duplicações gênicas e subsequente divergência funcional, ou perda funcional na forma de pseudogenes.
• Evidência de rearranjo de éxons e reutilização modular dentro de proteínas.
• Evidência tanto de seleção natural quanto de deriva neutra no nível molecular.
• Evidência da natureza maleável e adaptativa da própria evolução molecular. Por exemplo, em casos recentes chocantes de resistência bacteriana a medicamentos - a evolução da evolvibilidade.
• Evidência de que a filogenia inferida a partir de comparações de sequências de proteínas e DNA está correlacionada com a filogenia inferida da biologia evolutiva.
• Evidência de que, dentro de todo o sistema bioquímico estudado, os "componentes" em si evoluíram, e as interações entre esses componentes também evoluíram. Devemos acreditar que um designer inteligente constrói com componentes que evoluem através das forças cegas de mutação, seleção e deriva?

A maioria das citações e resumos abaixo foi encontrada usando o PubMed motor de busca MEDLINE e banco de dados de microbiologia. Uma busca simples revela que existem mais de 13.000 artigos que contêm "evolução" como palavra-chave principal de assunto - dificilmente o silêncio absoluto que Behe proclama. Concedido que muitos desses não abordam diretamente o problema da complexidade adaptativa em sistemas bioquímicos, mas muitos deles o fazem.

Observe que excluí artigos que discutem comparações de sequências sendo usadas exclusivamente para determinar linhas de descendência. Michael Behe já admite que a descendência comum é razoável.

Lembre-se de que esta é apenas uma pequena amostra de citações coletadas de minhas próprias buscas e das sugestões de outros (obrigado pelas sugestões!)

Por último, mas não menos importante. Por favor, ajude-me a encontrar mais citações e continue a fazer crescer esta página - especialmente se você tiver formação em bioquímica ou microbiologia. Obrigado.

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Introdução

• + Evolução Molecular - resumo breve com definição

Livros

• Células, Embriões e Evolução: Em direção a uma compreensão celular e do desenvolvimento da variação fenotípica e da adaptabilidade evolutiva - um livro-texto recente de John Gerhart e Marc Kirschner (1997 Blackwell Science) - "Ao escrever Células, Embriões e Evolução, nosso objetivo foi continuar o que Darwin iniciou: entender não apenas a influência da seleção no caminho da evolução, mas também a capacidade do organismo de gerar variação hereditária sobre a qual a seleção pode atuar."
  Prefácio / livraria amazon.com
• Quatro Bilhões de Anos: Um Ensaio sobre a Evolução de Genes e Organismos por Willam F. Loomis
• Poeira Vital: A Vida como um Imperativo Cósmicode Christian De Duve
• Muitos desses livros sugeridos por David Ussery, Ph.D (obrigado!):
• +Estratégias Moleculares na Evolução Biológica - Atas de uma conferência da Academia de Ciências de Nova York, 27 a 29 de junho de 1998. Lynn Helena Caporale, Editor.
• + Abordagens Moleculares à Ecologia e Evolução por Rob Desalle (Editor), B. Schierwater (Editor) (98)
• + Evolução Molecular de Wen-Hsiung Li (97)
• + Padrões na Evolução: A Nova Visão Molecular por Roger Lewin (96)
• + Evolução Química: Física da Origem e Evolução da Vida (96)
• + Rastreamento da Evolução Biológica em Estruturas de Proteínas e Genes (96)
• + Evolução Molecular (Biomatemática V. 24) por Vadim Aleksandrovich Ratner (Editor) (96)
• +ESTRUTURA DE FAMÍLIAS DE GENES, GENÉTICA E EVOLUÇÃO Proceedings of the VIII International Congress on Isozymes (95)
• + Genética e Evolução: As Moléculas da Herança (Nova Enciclopédia de Ciência) (95)
• + As Causas da Evolução Molecular (94)
• + As Origens da Ordem: Auto-organização e Seleção na Evolução de Stuart A. Kauffman (92)
• + Evolução Molecular do Complexo de Histocompatibilidade Majors (92)
• + Evolução Molecular em Paisagens Acidentadas; Proteínas, RNA e o Sistema Imunológico de Stuart A. Kauffman (91)
• + Evolução no Nível Molecular por Robert K. Selander, Andrew G. Clark, Thomas S. Whittam (Editor) (91)
• + Evolução da Vida: Fósseis, Moléculas e Cultura por S. Osawa, T. Honjo (Editor) (91)
• + Teoria Molecular da Evolução (85)
• + Proteínas Multidomínio: Estrutura e Evolução
• +Design Evolutivo por Computadores editado por Peter J. Bentley. Edição de livro & CD-ROM (maio 1999) Amazon.com ou Amazon.co.uk- Sim, a evolução produz complexidade irredutível!
  • Página do livro do autor com links relacionados, Página inicial do autor, Mais Informações de Encomenda
• + Pesquisar por vida em Marte de Malcolm Walter, 1999 - contém cenários de origem da vida

Conferências

• + Os Genomas Melhoram Sua Própria Evolução? - "Em uma conferência sobre estratégias moleculares na evolução biológica, pesquisadores discutiram como as estratégias evolutivas podem evoluir, tornando o processo de evolução mais eficiente."
• + Nova Paixão pela Evo-Devo - Quinta Reunião Anual da Sociedade de Biologia Molecular e Evolução

Sistema Imunológico

• +A Evolução da Aptidão Aprimorada por mutação aleatória mais seleção por Edward E. Max, M.D., Ph.D. [Arquivo TalkOrigins] Michael Behe gosta de falar sobre o sistema imunológico humano, mas que lições devemos realmente aprender de um sistema como esse?
• Imunidade e Invertebrados - "os fabulosamente complexos sistemas imunológicos de humanos e outros mamíferos evoluíram ao longo de centenas de milhões de anos - de maneiras às vezes surpreendentes. Scientific American Nov 1996
• Tubarões e as Origens da Imunidade Vertebrada. Scientific American Nov 1996
• + DNA Antigo que Pula Pode Ter Evoluido para Componente Chave do Sistema Imunológico Humano
• + Transposição mediada por RAG1 e RAG2 e suas implicações para a evolução do sistema imunológico
• Evolução das reações imunológicas - "A história e as vias evolutivas das reações de defesa entre várias formas de vida são reconstruídas"
• Novas perspectivas sobre a recombinação V(D)J e seu papel na evolução do sistema imunológico - sem resumo disponível
• Evolução e regulação do desenvolvimento do complexo principal de histocompatibilidade
• Evolução e regulação do desenvolvimento da família de citocinas IL-6/class IB no sistema imunológico e no sistema nervoso - "especulamos sobre uma viável via molecular"
• Evolução em camadas no sistema imunológico. Um modelo para a ontogenia e o desenvolvimento de múltiplas linhagens de linfócitos - sem resumo disponível
• Desenvolvimento de um sistema imunológico
• O ancestral do sistema imunológico adaptativo foi o sistema CAM para organogênese
• As origens evolutivas das imunoglobulinas e receptores de células T: possibilidades e probabilidades - sem resumo disponível
• Perspectivas evolutivas sobre as características amiloides e inflamatórias da doença de Alzheimer
• Organização do gene humano RH50A (RHAG) e evolução da composição de bases da família de genes RH.
• Evolução molecular do sistema imunológico vertebrado.
• Morfostase: uma perspectiva em evolução.
• Evolução rápida de domínios C2 da superfamília de imunoglobulinas expressos em células do sistema imunológico.

Coagulação Sanguínea

• Reconstrução da evolução da coagulação sanguínea dos vertebrados a partir da consideração das sequências de aminoácidos das proteínas de coagulação - não, esta é não a apresentação do "yin e yang" do livro de Behe
• Montagem evolutiva das proteínas de coagulação sanguínea - não há resumo disponível
• Evolução de éxons e domínios nas proenzimas da coagulação sanguínea e da fibrinólise - não há resumo disponível
• Evolução de enzimas proteolíticas
• Evolução da formação de fibrina nos vertebrados e o processo de sua dissolução.

Globina

• + Parasito Comum Inverte as Crenças Tradicionais Sobre a Evolução e o Papel da Hemoglobina - "revela que a hemoglobina evoluiu primeiramente para lidar com a molécula óxido nítrico (NO) em vez de oxigênio"
• + Cientistas Descobrem Como as Bactérias se Protegem Contra o Sistema Imunológico - "Assim, estamos agora fornecendo uma compreensão da base evolutiva da hemoglobina e da função original da família de hemoglobinas - detoxificar óxido nítrico."
• + A Evolução da Hemoglobina por Ross Hardison, (Resumo) American Scientist, Março-Abril 1999
• Globinas em espécies não vertebradas: dispersão por transferência horizontal de genes e evolução das relações estrutura-função
• Redução de dois genes funcionais de gama-globina para um: uma tendência evolutiva em macacos das Américas
• História evolutiva de intrões em um gene globina multidomínio
• Hemoglobina A2: origem, evolução e consequências - sem resumo disponível

Flagelos e Cilium

• Evolução inicial dos microtúbulos e undulipódios
• Padrões de batida flagelar e sua possível evolução - "Os mecanismos flagelares mais sofisticados são melhor explicados como tendo evoluído para a coleta de alimento particulado"
• Uma fase temporária de flagelado (mastigoto) na ameba vahlkampfiida Willaertia magna e sua possível significância evolutiva
• A origem evolutiva e a filogenia dos flagelos eucarióticos - sem resumo disponível
• + Análise molecular de flagelinas arqueais: semelhança com a superfamília de transporte de pilina do tipo IV amplamente distribuída em bactérias
• Evolução molecular do domínio citoplasmático C-terminal de uma superfamília de receptores bacterianos envolvidos na taxia - "O gene que codifica o domínio citoplasmático C-terminal dessas proteínas aparentemente evoluiu por duplicação gênica a partir de um ancestral comum"
• Família de proteínas motoras dineína: estado atual e questões futuras - evolução da dineína via duplicação gênica
• Origens dos organismos nucleados - "A filogenia apoia as hipóteses de que o flagelo se desenvolveu a partir do sistema do fuso"
• A origem evolutiva e a filogenia dos microtúbulos, fusos mitóticos e flagelos eucarióticos - sem resumo disponível
• A evolução do movimento celular em eucariotos: o papel dos microfilamentos e microtúbulos - sem resumo disponível

Outras Proteínas Motoras

• +Árvore Filogenética do Motor de Cinesina - Behe gosta de minimizar a importância das comparações de sequências. Não é para menos - basta clicar ao redor deste diagrama por um tempo. Torna-se óbvio que uma proteína motora importante como a cinesina evoluiu gradualmente ao longo de muitas espécies. Da Página Inicial da Cinesina.

Actina

• Evolução de um citoesqueleto dinâmico
• Isolamento, caracterização e evolução de nove genes de actina de peixe-porco-espinho (Fugu rubripes)
• Evolução de genes de actina de cordados: evidências da organização genômica e sequências de aminoácidos
• Comparações estruturais de actinas musculares e não musculares fornecem insights sobre a evolução de suas diferenças funcionais

Membrana Celular - Receptores, Bombas, etc.

• + Evolução molecular de receptores de glutamato: um mecanismo de sinalização primitivo que existiu antes da divergência entre plantas e animais.
• Co-evolução de pares de ligante-receptor na superfamília de peptídeos bioativos de vasopressina/ocitocina
• A evolução das sinapses no sistema nervoso central dos vertebrados
• Origens evolutivas de bombas de efluxo multidrogas e específicas de drogas em bactérias.
• Uma análise evolutiva abrangente baseada em sequências de nucleotídeos e aminoácidos das subunidades alfa e beta da família de genes de hormônios glicoproteicos.

Ciclo do Ácido Cítrico (Ciclo de Krebs)

• O enigma do ciclo do ácido cítrico de Krebs: montar as peças de reações quimicamente viáveis, e o oportunismo no design de vias metabólicas durante a evolução
• A evolução de ciclos metabólicos
• Evolução dos primeiros ciclos metabólicos
• Evolução química do ciclo do ácido cítrico: fotólise por luz solar dos aminoácidos glutamato e aspartato
• Especulações sobre a origem e evolução do metabolismo
• A Anatomia Molecular de um Evento Adaptativo Antigode Anthony M. Dean (American Scientist jan-fev 1998) - "Usando uma combinação das técnicas modernas de bioquímica estrutural e engenharia de proteínas, combinadas com filogenia molecular, o autor recria a história deste evento muito antigo."

Biossíntese de aminoácidos

• Novas perspectivas para deduzir a história evolutiva das vias metabólicas em procariotos: biossíntese aromática como um caso exemplar
• As vias bioquímicas em procariotos podem ser rastreadas para trás através do tempo evolutivo
• Especialização enzimática durante a evolução das vias de biossíntese de aminoácidos
• Reclutamento enzimático na evolução de novas funções

Glicólise

• Evolução da glicólise - sem resumo disponível
• Bioenergética: a evolução de mecanismos moleculares e o desenvolvimento de conceitos bioenergéticos
• Abordagens teóricas para a otimização evolutiva da glicólise – análise química
• A evolução dos glicosomas de cinetoplastídeos

Fotossíntese

• Evolução molecular passo a passo da conversão de energia fotossintética bacteriana
• Evolução dos centros de reação fotossintéticos e das proteínas de clorofila para captação de luz
• Evolução dos centros de reação fotossintéticos
• Evolução inicial da fotossíntese: pistas da nitrogenase e das proteínas de ferro da clorofila
• Evolução do controle do desenvolvimento de pigmentos e plastos em organismos fotossintetizantes
• Evolução química da fotossíntese

Lisossomo

• Evolução molecular das lisozimas de ruminantes
• Evolução adaptativa da lisozima: alterações na sequência de aminoácidos, regulação
  da expressão e número de genes
• Evolução da lisozima gástrica: o gene da lisozima do porco

Visão

• + A evolução da visão tricromática por duplicação do gene da opsinia em primatas das Américas Novas e Velhas
• A Evolução da Visão das Cores - por Mickey Rowe do Arquivo TalkOrigins.
• Base molecular para a visão tetracromática - as rodopsinas divergiram do pigmento do tipo cone
• Evolução molecular do gene Rh3 em Drosophila
• Proteína de ligação de retinoides interfotorreceptora. Caracterização do gene, estrutura de repetição proteica e sua evolução
• Afinamento espectral e evolução molecular dos pigmentos visuais bastonetares na espécie de cardume de peixes cottoides no Lago Baikal
• A evolução das rodopsinas e receptores de neurotransmissores - outro exemplo da importância das comparações de sequências no estudo da evolução. Behe rejeita as comparações como uma ferramenta limitada na determinação das linhas de descendência.
• Otimização, restrição e história na evolução dos olhos
• Uma estimativa pessimista do tempo necessário para a evolução de um olho - lembre-se da última alegação de complexidade irredutível?
• Análise de sequências da lactato desidrogenase C específica da retina de teleósteos: implicações evolutivas para a família de genes de lactato desidrogenase dos vertebrados
• O olho do rato cego mole (Spalax ehrenbergi): evolução regressiva no nível molecular - sem resumo disponível
• A evolução dos olhos. - "...A presença de moléculas constituintes homólogas em estruturas não homólogas nos lembra que as moléculas não são olhos."
  

Desenvolvimento

• + Programação do embrião de Drosophila
• + Evolução dos clusters de genes hox de cordados
• + Genes Hox em braquiópodes e priapulídeos e a evolução dos protostômios.
• +Mudança evolutiva radical possível em poucas gerações
• + Evolução: Membros Animais Reesculpidos por Chaves Genéticas Uma Vez Pensadas Como Demasiado Drásticas para a Sobrevivência - "A descoberta de hoje marca a primeira vez que mudanças no controle de genes homóticos foram mostradas como a base de uma tendência evolutiva que leva a novas estruturas corporais." (também aqui: Evolução de Membros Animais)
• + Planárias São os Ancestrais Vivos Mais Antigos dos Que Possuem Lados Direito e Esquerdo, Relatam Pesquisadores em Science
• A origem e evolução dos apêndices animais
• Genes Hox na evolução: superfícies proteicas e grupos parálogos
• Evolução do plano corporal de insetos revelada pelo padrão de expressão reduzida de Sex combs
• Genes Hox de ouriço-do-mar: insights sobre o cluster ancestral de Hox
• Abordagens teóricas para a análise da evolução de genes homeobox
• Genes HoxD e HoxA de teleósteos: comparação com tetrápodes e evolução funcional do complexo HOXD
• Origem evolutiva das asas de insetos a partir de brânquias ancestrais
• Rastreamento da evolução da coluna vertebral através da cauda perdida de um tunicado
• Classificação e filogenia da família multigênica MADS-box sugerem papéis definidos de subfamílias de genes MADS-box na evolução morfológica dos eucariotos
• Modificação da expressão e regulação cis de Hoxc8 na evolução de morfologia axial divergente.
• O cluster de genes ParaHox é uma irmã evolutiva do cluster de genes Hox.

Transcrição / Tradução / Duplicação

• Duplicações gênicas na evolução da família B de DNA polimerases arqueais
• Substituições adaptativas de aminoácidos acompanhadas por fusão de domínio na transcriptase reversa
• Evolução molecular de genes que codificam ribonucleases em espécies ruminantes
• Estudos sobre os sítios que expressam mudanças evolutivas na estrutura do RNA ribossomal 5S eucariótico
• Evolução de um gene de RNA de transferência através de uma mutação pontual no anticódon
• Iniciação da tradução em arqueais revisitada: o fator de iniciação 2 e as famílias de subunidades alfa-beta-delta do fator de iniciação eucariótico 2B
• Fatores de iniciação da tradução universalmente conservados
• Código genético na evolução: troca da aminoacilação específica de espécie por um transplante peptídico.
• Evolução de elementos regulatórios transcricionais dentro do promotor de um gene mamífero.
• Reatribuição de códons e composição de aminoácidos em mitocôndrias de hemiordados.

De Russell F. Doolittle

• Reconstrução da evolução da coagulação sanguínea dos vertebrados a partir da consideração das sequências de aminoácidos das proteínas de coagulação - não, esta é não a apresentação do "yin e yang" do livro de Behe
• Determinação dos tempos de divergência dos principais reinos de organismos vivos com um relógio proteico - Pelo menos Behe acha que a descendência comum é "razoável".
• A multiplicidade de domínios em proteínas - evolução via reordenamento de domínios
• Caracterização, estrutura primária e evolução da albumina plasmática de lampreia - evolução proteica via duplicação gênica
• As origens e a evolução de proteínas eucarióticas
• Evolução da formação de fibrina nos vertebrados e o processo de sua dissolução.

A resistência a medicamentos é evolução bioquímica

• +HIV Mutando Muito Rápido Para a Coquetel de Medicamentos - "Devido à alta taxa de mutação do HIV, ele oferece uma oportunidade única para estudar os processos de evolução,"
• O Desafio da Resistência aos Antibióticos. SciAm, Março 98

Outros

• + Famílias de Vírus Muito Diferentes Podem Estar Relacionadas
• + Varredura seletiva de um gene recém-evoluído específico de espermatozoides em Drosophila
• + Ácido acético ativado pela fixação de carbono em (Fe,Ni)S sob condições primordiais
• Evolução molecular da via biossintética da histidina
• Evolução acelerada em domínios inibidores de membros da família elafina de porco
• Arranjo tandem do multigene da albumina sérica humana na região sub-cêntrica de 4q: evolução e direção cromossômica da transcrição
• A ribonucleotid redutase dependente de B12 do arquébacterio Thermoplasma acidophila: uma solução evolutiva para o enigma da ribonucleotid redutase
• Divergência antiga de isoformas longas e curtas de adenilato quinase: evolução molecular da família de quinases de monofosfato de nucleosídeo
• Evolução convergente de glicoproteínas anti-congelantes em peixes nototenioides antárticos e bacalhau ártico
• + Evolução do gene de glicoproteína anti-congelante a partir de um gene de tripsinogênio em peixes nototenioides antárticos - "Descobrimos que as glicoproteínas anti-congelantes (AGPs) do principal táxon de peixes antárticos, os nototenioides, evoluíram a partir de um tripsinogênio pancreático. Determinamos o provável processo evolutivo..."
• + Evolução de uma glicoproteína anti-congelante (sem resumo)
• Um modelo para a evolução do aparelho sec dos plastidios inferido a partir da filogenia do gene secY
• A história evolutiva da família multigênica da amilase em Drosophila pseudoobscura
• Aceleração da evolução dos genes codificantes da isoenzima fosfolipase A2 da glândula de veneno de Trimeresurus okinavensis
• A evolução de um sítio alostérico na fosforilase
• Evolução molecular dos hormônios neurohipofisários de peixes: mecanismos evolutivos neutros e seletivos
• Pseudogenes na evolução da ribonuclease: uma fonte de nova função biomacromolecular?
• Evolução de ligantes hemopoiéticos e seus receptores. Influência da seleção positiva em substituições correlacionadas ao longo de proteínas de ligante e receptor
• Relações evolutivas dos genes da carbamoilfosfato sintetase
• A evolução molecular das proteínas de choque térmico pequenas em plantas
• Análise filogenética dos genes de carbamoilfosfato sintetase: história evolutiva complexa que inclui uma duplicação interna dentro de um gene que pode enraizar a árvore da vida
• Duplicação e divergência funcional na família de genes da chalcona sintase de Asteraceae: evolução com mudança de substrato e simplificação catalítica
• História evolutiva da família de genes mucina 11p15 humana.
• Evolução molecular da superfamília do gene aldo-ceto redutase.
• A evolução molecular permite o contornamento da necessidade de fosforilação do loop de ativação da quinase dependente de ciclina Cdc28.

Geral

• +Uma Classificação de Possíveis Rotas da Evolução Darwiniana por Richard T. Thornhill e David W. Ussery, Journal of Theoretical Biology, 203:111-116, 2000 - "...Esta classificação fornece uma estrutura conceitual dentro da qual investigar a acessibilidade pela evolução darwiniana de estruturas biológicas complexas." (Para registro, eu não concordo com sua conclusão de que a rota proposta por Orr não pode produzir complexidade irredutível - John C)
• + Geração de novidade evolutiva por mudança funcional+Insights Evolutivos Derivados da Descoberta de Cópia Imperfeita
• + Sequências de DNA Móveis Podem Ser a Causa de Mutações Cromossômicas Durante a Evolução das Espécies
• + Um modelo de domínio para a organização do DNA eucariótico: uma base molecular para a diferenciação celular e a evolução cromossômica.
• + O modelo de domínio para a organização do DNA eucariótico. 2: Uma base molecular para restrições ao desenvolvimento e à evolução.
• +Baralho Menor Faz Proteína Dobrar - "a descoberta torna a evolução de novas formas de proteína mais fácil de entender, porque implica que as proteínas podem se adaptar através de pequenas mudanças e preservar alguns elementos estruturais enquanto descartam outros."
• + Estowaways Genéticos Podem Contribuir Para Mudanças Evolutivas
• +Mecanismo Molecular Evolutivo em Mamíferos Encontrado
• +Genomas Completos - "Esta página contém os resultados de uma análise aprofundada de sequências de genomas completos de formas de vida celulares"
• Redundância genética causada por duplicações gênicas e sua evolução em redes de reguladores transcricionais
• Conservação evolutiva forte de isoformas de proteínas amplamente expressas na família do gene troponina I e em outras famílias de genes de vertebrados
• Casos de inserções de DNA de elementos móveis antigos que agora afetam a regulação gênica
• Evolução pontuada causada pela seleção de mutações benéficas raras
• A origem da morte celular programada - sem resumo disponível
• A origem e o desenvolvimento inicial de catalisadores biológicos
• Estruturas secundárias do DNA e a evolução de arranjos tandem hipervariáveis
• Evolução adaptativa episódica das lisozimas de primatas - testando para adaptação
• Plasticidade do genoma como paradigma da evolução de eubactérias
• Motivo evolutivo e sua significância biológica e estrutural
• Mutações neutras e não neutras: a mistura criativa – evolução da complexidade em sistemas de interação gênica
• Reordenamento de éxons e outras formas de troca de módulos e Organizações de domínios de proteínas da matriz extracelular modular e sua evolução
• Intrões e evolução gênica
• Novos introns de Drosophila originam-se por duplicação.
• Evolução e os domínios estruturais das proteínas
• O papel da auto-organização restrita na evolução estrutural do genoma
• Uma possível origem de genes bacterianos recém-nascidos: significância do quadro não-stop rico em GC no cordão antisense
• A coevolução das árvores de famílias gênicas
• A evolução dos ciclos metabólicos
• A emergência de processos celulares principais na evolução
• Uma interpretação de hardware da evolução do código genético - "Desenvolve-se uma justificativa quantitativa para a evolução do código genético considerando o princípio de hardware mínimo" - note que "minimizar hardware" é um caminho plausível para evoluir sistemas "complexos irredutivelmente".
• Especulações sobre a origem e evolução do metabolismo
• Reconstrução probabilística de sequências de proteínas ancestrais e Busca por padrões antigos em sequências de proteínas
• A contribuição de processos semelhantes ao deslizamento para a evolução do genoma
• Evolução molecular em bactérias
• A base estrutural da adaptação molecular.

Alguém diz Design Inteligente?

• DNA mitocondrial: fósseis moleculares no núcleo
• Casos de inserções de DNA de elementos móveis antigos que agora afetam a regulação gênica
• Tiggers e fósseis de transposons de DNA no genoma humano
• O olho do rato cego (Spalax ehrenbergi): evolução regressiva no nível molecular - sem resumo disponível
• Tiggers e fósseis de transposons de DNA no genoma humano

Câncer como Evolução Molecular

• Competição gênica e o possível papel evolutivo dos tumores

Tubo de Ensaio e Evolução Artificial

• + New Scientist Planet Science: Replaying life -Por fim, podemos assistir à evolução acontecer repetidamente nos micromundos do laboratório. E, ao jogar o papel de Deus, estamos expondo as próprias forças que moldam todos os seres vivos, diz Kate Douglas
• Evolução molecular de uma via de detoxificação de arsenato por emparelhamento de DNA - "Estes resultados mostram que o emparelhamento de DNA pode melhorar a função de vias por mecanismos mutacionais complexos e inesperados que podem ser ativados por mutação pontual. Estes mecanismos podem ser difíceis de explicar e provavelmente serão ignorados pelo design racional"
• Pesquisador da UB Desenvolve Método que Emprega a Evolução Para Desenvolver Novos Leads de Medicamentos
• Evolução dirigida de uma proteína anti-congelante do tipo I expressa em Escherichia coli com cloreto de sódio como pressão seletiva e seu efeito na tolerância anti-congelante
• Evolução dirigida de vias biossintéticas. Recrutamento de tioéteres de cisteína para construção da parede celular de Escherichia coli
• Explorando a robustez funcional de uma enzima por evolução in vitro
• Algoritmos evolutivos em design molecular auxiliado por computador
• Mutações a Favor - undesign inteligente
• + Pesquisadores Engenheiram uma Forma de Melhorar Receptores de Células T - usando seleção darwiniana
• + Organismos Digitais Dão Vida a Questões de Evolução (A Página Inicial do Grupo de Vida Artificial Avida)

Origem da Vida e Células

• +Boa introdução: Mentiras, Damned mentiras, Estatísticas e Probabilidade de Cálculos de Abiogênese
• +Estudo da Purdue Dá Nova Vida à Questão de Como a Vida Começou - peptídeos auto-replicantes
• + Amônia das Profundas Oceanos da Terra Um Passo Chave na Busca pelas Origens da Vida
• + Estudo do Whitehead Apóia a Existência do Antigo Mundo de RNA Ajuda a Fornecer Insights Sobre a Evolução Inicial da Vida
• + Cientistas de Yale Recriam Fósseis Moleculares Agora Extintos Que Poderiam Ter Existido no Início da Vida
• +Um mundo antigo inteiro - nova evidência para "O Mundo de RNA"
• O caminho do mundo de RNA.
• Relíquias do mundo de RNA.
• Um modelo supersimétrico para a evolução do código genético.
• A hipótese do hidrogênio para o primeiro eucarioto.
• + Impulso inicial para a vida na terra
• Os Começos da Vida na Terra por Christian de Duve
• +As Probabilidades Contra a Origem da Vida São Muito Grandes para Serem Aceitas? : Adendos à Revisão de David Foster's The Philosophical Scientists por Richard C. Carrier. De Má Ciência Pior Filosofia a Charlatanismo e Lógica-Corte de David Foster's The Philosophical Scientists

Mais Submissões de Visitantes(obrigado!)

Aqui estão vários artigos de uma busca rápida no Journal of Biological Chemistry usando a palavra "evolução" em http://www.jbc.org/ --

Andrew P. Spicer e John A. McDonald Caracterização e Evolução Molecular de uma Família de Genes de Sintase de Hialuronano em Vertebrados J. Biol. Chem. 1998 273: 1923-1932.

Catherine TomHon, Wei Zhu, David Millinoff, Kenji Hayasaka, Jerry L. Slightom, Morris Goodman e Deborah L. Gumucio Evolução de um Padrão de Expressão Fetal via Mudanças cis Próximas ao Gene da Globina J. Biol. Chem. 1997 272: 14062-14066.

Chien-Chia Wang, Andrey Pavlov e Jim D. Karam Evolução da Especificidade de Ligação a RNA na DNA Polimerase T4 J. Biol. Chem. 1997 272: 17703-17710.

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(major MeSH 1998 Jan-May)

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