Mutations de l'apolipoprotéine AI et Informations

Une réponse à Answers in Genesis concernant la mutation Apo AI Milano

par
Ian Musgrave, Steven Pirie-Shepherd, et Douglas Theobald
Copyright © 2003
[Publié : 20 avril 2003, Révisé le 6 mai]
[Liens mis à jour : 14 juillet 2005]
Version 1.5

Introduction :

Glossaire
allèle : l'une des plusieurs formes possibles d'un gène.
acide aminé : une petite molécule organique utilisée comme brique de construction pour les protéines.
apolipoprotéine : la composante protéique d'une lipoprotéine.
apolipoprotéine AI (Apo-AI): la principale protéine pour former le HDL cholestérol lipoprotéines ; c'est-à-dire le bon HDL.
cholestérol : un lipide (graisse) qui est une partie importante des cellules animales. Il est transporté dans le sang sous forme de lipoprotéines ; mais isolé, il se solidifierait.
dimère : une molécule formée par deux unités plus simples identiques, appelées monomères.
gène : un segment d'ADN qui contribue à la fonction ou à la forme d'un organisme. Les gènes fonctionnent principalement en codant pour les protéines.
hétérozygote : Un organisme qui porte deux allèles différents du même gène.
homozygote : Un organisme qui porte deux allèles identiques du même gène.
lipide : les lipides (graisses) sont définis comme des substances qui se dissolvent dans l'alcool mais pas dans l'eau. Les graisses sont une partie importante de toutes les cellules, et une source majeure de carburant.
lipoprotéine : une particule qui combine des lipides et des protéines. Les protéines permettent à la particule de se dissoudre dans l'eau, ce qui signifie que le lipide peut être transporté dans le sang.
LDL, HDL : lipoprotéine à faible densité, lipoprotéine à haute densité. Les lipoprotéines sont caractérisées par leur densité.
cholestérol LDL, cholestérol HDL : Le cholestérol dans les lipoprotéines LDL est appelé "mauvais" cholestérol, car le LDL peut déposer du cholestérol sur les parois artérielles, restreignant le flux sanguin.
Le cholestérol dans les lipoprotéines HDL est appelé "bon" cholestérol, car le HDL peut capturer et éliminer le cholestérol des artères et être transporté hors du sang par le foie. Une bonne, explication simple est fournie par l'École de médecine de l'Université de Miami.
protéine : une grande molécule organique composée d'acides aminés liés en chaîne.

Dans les années 1980, une petite communauté italienne a été identifiée comme ayant une version mutante d'une protéine, appelée Apolipoprotéine AI (Apo-AI), associée à un risque réduit d'artériosclérose (artères bouchées), d'infarctus du myocarde et d'AVC (1). La réduction du risque chez ces personnes a été attribuée à la protéine mutante (connue sous le nom d'allèle Milano de l'Apolipoprotéine AI, désignée dorénavant par Apo-AIM), et l'Apo-AIM a souvent été utilisée comme exemple de mutation bénéfique.

L'Apo-AI est une protéine liant les lipides et constitue le composant majeur des particules de lipoprotéine de haute densité (HDL), qui jouent un rôle important dans l'élimination du cholestérol des cellules. Des recherches ultérieures détaillées sur la mutation Apo-AIM ont démontré qu'elle présente une fonction biologique améliorée qui contribue directement à réduire l'incidence des maladies cardiovasculaires chez les individus qui la portent.

Cependant, Answers in Genesis a une réponse aux commentaires (dernière consultation le 5/02/2003 [voir Note]), qui affirme que la mutation ne fournit aucune preuve en faveur de l'évolution car elle a perdu la « spécificité » (et par implication a perdu de l'« information »). AiG affirme également que la mutant Apo-AIM est limitée dans sa capacité à former des particules HDL utiles. La base de ces affirmations semble être deux communiqués de presse (2,3), plutôt que la littérature primaire.

Ces communiqués de presse ne sont pas entièrement exacts et semblent avoir été substantiellement mal interprétés. Contrairement à ce qui est affirmé par AiG, Apo-AIM est une protéine pleinement fonctionnelle qui réduit le risque d'artériosclérose et de maladies cardiovasculaires par plusieurs mécanismes (4). Dans une expérience où des particules de HDL reconstituées à partir d'Apo-AIM ont été perfusées chez des lapins artérioscléreux, les lapins présentaient moins de plaques et des plaques moins étendues (4). Il y a eu une diminution du cholestérol aortique et une réduction de la prolifération cellulaire (les deux facteurs améliorant la flexibilité de la paroi cellulaire (4)).

Bien que toutes les actions anti-athérosclérotiques de l'Apo-AIM ne soient pas entièrement comprises, nous connaissons désormais deux mécanismes majeurs impliqués dans son action. L'Apo-AIM stimule activement l'élimination du cholestérol des cellules (5) et sa capacité antioxydante prévient également certains dommages inflammatoires dans l'athérosclérose (6). La créationnisme de la Terre jeune (AiG) s'est concentrée sur l'activité antioxydante (peut-être en raison de sa saillance dans le communiqué de presse du Département de l'Énergie des États-Unis (DOE) (2)), affirmant que cela représente une perte de spécificité. Dans les sections suivantes, nous examinerons plus en détail les affirmations de l'AiG.

Les dimères d'apolipoprotéine AI-M sont-ils d'utilité limitée?

Sur la page de AiG, il est indiqué :

« Un acide aminé a été remplacé par un résidu de cystéine dans une enzyme qui assemble normalement les lipoprotéines de haute densité (HDL), qui sont impliquées dans l'élimination du cholestérol « mauvais » des artères. La forme mutante de l'enzyme est moins efficace dans ce qu'elle est censée faire, mais elle agit comme un antioxydant, ce qui semble prévenir l'athérosclérose (durcissement des artères). En fait, en raison du groupe -SH ajouté sur la cystéine, 70 % des enzymes fabriquées se lient en paires (appelées dimères), limitant ainsi leur utilité. »

Cette affirmation contient un certain nombre d'imprécisions et d'erreurs. Apo-AI est une protéine liant les lipides (et non une enzyme) qui forme des complexes avec d'autres protéines (comme Apo-AII) et des lipides pour former des particules HDL. Apo-AI peut s'auto-associer et forme normalement des quantités modérées de dimères, de trimères et de quadrimères, en plus de se trouver sous forme monomérique, produisant ainsi des particules HDL d'une gamme de tailles (7). Dans Apo-AIM, l'acide aminé basique arginine (R) à la position 173 a été muté en un acide aminé contenant du soufre, la cystéine (C; R173C). Cela entraîne une capacité accrue à former des dimères stables par rapport à Apo-AI, car les deux cystéines peuvent former une liaison chimique entre elles via ces groupes soufrés (7).

Malgré l'affirmation de AiG selon laquelle la formation de dimères aboutit à restreindre leur utilité (cette affirmation n'apparaît dans aucune des communiqués de presse), ils sont en réalité pleinement fonctionnels. L'élimination du cholestérol des cellules se produit principalement par le transport inverse du cholestérol (RCT). La première étape du RCT est l'efflux du cholestérol non estérifié des cellules vers des accepteurs appropriés, normalement des apolipoprotéines (avec ou sans lipides déjà liés). Cela se produit par deux mécanismes distincts : a) l'interaction non spécifique des accepteurs de lipoprotéines avec la cellule, et la diffusion du cholestérol de la membrane cellulaire vers la surface de la lipoprotéine, et b) l'interaction des apolipoprotéines dépourvues de lipides avec des sites d'acceptation spécifiques sur la surface cellulaire. Le cholestérol diffuse ensuite dans les apolipoprotéines. Les deux de ces mécanismes dépendent de la structure de l'Apo-AI.

Les dimères d'Apo-AIM se lient au site de liaison spécifique d'Apo-AI (lecithine:cholestérol acyltransférase ; LCAT) aussi efficacement que l'Apo-AI (5,7) et stimulent l'efflux du cholestérol (5,8). Les dimères d'Apo-AIM forment des particules HDL aussi facilement que les monomères d'Apo-AI (7), et les HDL formés à partir d'Apo-AIM stimulent l'efflux du cholestérol plus efficacement que les HDL formés à partir de monomères d'Apo-AI (5,8). Les HDL contenant de l'Apo-AIM sont également beaucoup plus efficaces pour inhiber l'estérification du cholestérol par la microsomale acylCoA:cholestérol acyltransférase (ACAT), que les HDL contenant de l'Apo AI (5). Cela entraîne la libération de plus de cholestérol de la membrane pour son efflux vers les particules HDL.

Apo-AIM forme bien une gamme de tailles plus restreinte de HDL, avec des tailles prédominantes de 7,8, 12,7 nm (et une forme rare de 10,8 nm), tandis que Apo-AI forme des particules de 7,8, 9,6, 12,7 et (surtout observées à des concentrations lipidiques élevées) 17,6 nm (7). Ceci est en partie dû au fait que, comme mentionné ci-dessus, Apo-AI peut former des dimères et des oligomères supérieurs, tandis que Apo-AIM ne peut former que des dimères et des quadramères. Notez encore que l'Apo-AI normal peut et forme des dimères, et que les dimères d'Apo-AI sont incorporés dans les particules de HDL tout comme les dimères d'Apo-AIM. Malgré la gamme de tailles restreinte, les HDL formés par les dimères d'Apo-AIM sont fonctionnels (5,8,7). Bien qu'il ait été affirmé dans le communiqué de presse du DOE (2) que la dimérisation était responsable de la déficience en HDL observée chez les personnes portant le gène Apo-AIM, les dimères sont en réalité plus stables que les monomères d'Apo-AI (9) ; en effet, une partie de leur capacité à réduire le risque d'artériosclérose peut être due à leur stabilité, ce qui entraîne leur persistance plus longue, l'élimination de plus de cholestérol et l'activation de tout ce qu'ils activent pour inhiber la prolifération cellulaire (9). Nous pouvons donc voir que les dimères d'Apo-AIM ne sont pas limités en termes d'utilité et forment bien des particules de HDL pleinement fonctionnelles. Ces particules de HDL dimères d'Apo-AIM sont plus stables que les particules de HDL d'Apo-AI (9), et sont supérieures aux particules de HDL d'Apo-AI pour stimuler l'efflux de cholestérol (5,8).

L'activité antioxydante de l'Apo-AIM est-elle non-spécifique?

Bien que AiG admette que Apo-AIM a acquis une nouvelle fonction, la capacité antioxydante, ils soutiennent que cela se fait au détriment de la spécificité.

« Maintenant, en acquérant une activité antioxydante, l'enzyme a perdu son activité pour la production des HDL. Ainsi, l'enzyme mutante a sacrifié une grande partie de sa spécificité. Puisque l'activité antioxydante n'est pas une activité très spécifique (une grande variété de produits chimiques simples peut agir comme antioxydant), il semble que le résultat net de cette mutation ait été une énorme perte de spécificité, ou, en d'autres termes, d'information. C'est exactement ce que nous attendrions d'un changement aléatoire. »

Comme nous l'avons vu, Apo-AIM n'a pas perdu la capacité de former des HDL, il n'a donc pas sacrifié sa spécificité. En effet, comme les particules d'HDL Apo-AIM sont plus efficaces pour favoriser l'élimination du cholestérol des cellules, on peut raisonnablement affirmer qu'il y a eu une augmentation de la spécificité. Cependant, l'activité antioxydante de l'Apo-AIM est-elle non spécifique ? L'activité antioxydante est possédée par un certain nombre de petites molécules, mais c'est aussi le cas de l'hydrolyse des protéines (catalysée par de petites molécules telles que l'acide aminé sérine), de l'estérification et de presque toutes les activités enzymatiques importantes. Ce qui compte dans une certaine mesure, c'est s'il existe une séquence spécifique qui lie un substrat pour le livrer à l'acide aminé antioxydant (de la même manière que la séquence du site catalytique dans une enzyme d'hydrolyse des protéines livre le substrat à la sérine catalytique). L'activité antioxydante de l'Apo-AIM est-elle spécifique au substrat et à la séquence ?

La réponse est oui. L'effet antioxydant dépend de la séquence. La mutation de Milan (R173C) est beaucoup plus efficace pour inhiber l'oxydation des lipides qu'une autre mutation, la mutation de Paris (R151C) (6). Il existe également une spécificité de substrat. Aucune des deux mutations ne peut éteindre les anions superoxyde en solution aqueuse (6), ce qui suggère que la mutation R->C ne génère pas un antioxydant générique, mais plutôt un antioxydant ciblé spécifique qui ne fonctionne que d'une manière précise. Aucune des deux mutations n'est capable d'empêcher l'oxydation d'une protéine témoin (cytochrome c) (6), de sorte que la mutation est spécifique aux substrats lipidiques. Des études supplémentaires (10) ont indiqué que les petits peptides dérivés de ces régions (acides aminés 167-R173C-184 et 145-R151C-162) conservent également la spécificité pour les lipides, indiquant qu'il ne s'agit pas simplement de la présence de la cystéine, mais plutôt de la position de la cystéine au sein des contraintes structurelles de la protéine, qui confèrent les propriétés antioxydantes bénéfiques. Ainsi, nous pouvons voir que les propriétés antioxydantes sont spécifiques, dans le sens où elles dépendent du substrat et de la séquence.

La réponse de AiG implique également que la dimérisation de l'Apo-AIM est irréversible. En fait, la dimérisation par cystéine est une réaction facilement réversible et est utilisée comme mécanisme de contrôle dans plusieurs protéines (par exemple HSP33 (11)). La formation de dimères est réversible par exposition à des environnements réducteurs (6), et bien que la liaison aux plaques athérosclérotiques place l'Apo-AIM HDL dans un environnement oxydant, l'Apo-AI HDL se lie également à de nombreux autres environnements cellulaires où se produisent des réactions couplées de réduction-oxydation qui inversent spécifiquement la dimérisation par cystéine. De plus, les disulfures (R-S-S-R, où R est un composé organique ou une protéine) sont également des antioxydants dans certaines circonstances. Les composés R-S-S-R sont tout à fait capables d'être des puits pour l'oxydation par électrons (12).

La mutation Apo-AIM représente-t-elle une perte d'information ?

La page de AiG affirme que les mutations à augmentation d'information sont nécessaires à l'évolution. Le concept d'"information" est problématique en biologie, car la plupart des mesures ne capturent qu'imparfaitement les aspects clés du changement génétique. Les biologistes préfèrent raisonner en termes de nombre de gènes et de fonction gène/proprotéine. Bien qu'une augmentation du nombre de gènes et de fonction ne soit pas requise (les parasites qui ont perdu des gènes se débrouillent très bien), une augmentation du nombre de gènes s'est produite. Certes, le vertébré moyen possède plus de gènes codant pour des protéines que les vers ou les insectes, et ceux-ci en ont à leur tour plus que les levures unicellulaires. La base de cette augmentation repose largement sur la duplication de gènes préexistants. Par exemple, l'une des principales différences entre les vertébrés et les vers, ainsi qu'entre les vers et les levures, réside dans l'augmentation du nombre de copies modifiées d'une classe d'enzymes appelées tyrosine kinases. Selon la plupart des mesures de "information", un vertébré avec 30 000 gènes dans son génome possède plus d'information qu'une levure avec à peine 6 000 gènes, et le rôle de la duplication de gènes dans cette hausse est bien compris (13).

AiG utilise une autre définition de « l'information », l'identifiant à la « spécificité ». Cette notion a été originellement forgée par Dr . L. Spetner, et est liée au nombre de substrats auxquels une enzyme se lie (moins il y a de substrats, plus l'enzyme est spécifique et plus elle possède d'« information » (14)). L'application de cette mesure aux non-enzymes n'est pas entièrement simple. Avec cette mesure, il est affirmé que les mutations aléatoires n'augmentent pas l'« information » dans une protéine. Dans le cas de l'Apo-AIM, AiG soutient que la protéine apolipoprotéine mutée a perdu sa spécificité car elle a perdu (ou restreint) la capacité de former des particules HDL, et que la capacité antioxydante de l'Apo-AIM est « non-spécifique ». Nous avons vu que, en fait, l'Apo-AIM n'a pas perdu la capacité de former des particules HDL, et que ces particules HDL qui se forment se lient à des sites d'acceptation spécifiques et sont plus efficaces pour promouvoir l'efflux du cholestérol que les particules HDL normales. Nous avons également vu que la capacité antioxydante de l'Apo-AIM est à la fois spécifique de la séquence et du substrat. Ainsi, l'Apo-AIM n'a pas perdu d'« information » selon les propres mesures d'AiG. Si quoi que ce soit, il a gagné de l'« information » de Spetner.

Après que cette page a été rendue publique [20/4/03], AiG a ajouté un paragraphe qui développe le concept de spécificité. Ici, ils introduisent l'analogie de « réparation de voitures » et affirment qu'une énonciation « répare la Porsche » contient plus d'informations que l'énonciation « répare la voiture et le camion », car la seconde, bien qu'ayant deux « fonctions », est moins spécifique que la première. Ils indiquent ensuite aux lecteurs la page de Werner Gitt.

Il existe deux problèmes fondamentaux avec cet argument. Premièrement, comme nous l'avons montré ci-dessus, Apo-AIM n'est pas moins spécifique que Apo-AI, et peut raisonnablement être considéré comme plus spécifique selon les propres critères de AiG. Apo-AIM produit une gamme plus spécifique de tailles de particules HDL, plutôt qu'une distribution plus large et non spécifique ; il est plus spécifique dans l'activation de l'ACAT, et il inverse spécifiquement l'oxydation des lipides se liant à une séquence de reconnaissance spécifique - tout cela augmente la quantité d'information dans Apo-AIM selon la logique de AiG. Deuxièmement, ils ont choisi la mauvaise analogie pour illustrer la « fonction » de Apo-AIM, et lorsqu'on applique la théorie de l'information, il faut être très prudent concernant l'analogie utilisée. Dans ce cas, les fonctions sont (1) l'efflux accru de cholestérol et (2) la réparation des protéines endommagées, très différentes du scénario général de « réparer la voiture » dont parle AiG. Ces fonctions sont plus proches de la phrase « remplir la voiture de carburant et, si la voiture a un pneu crevé, la réparer ». Cette phrase a-t-elle vraiment moins d'information que « réparer la Porsche » ? Nous aborderons cela à la suite, mais il est évident que la conclusion de AiG est invalide en raison de ces deux problèmes fondamentaux.

Avec cette analogie plus appropriée, nous pouvons maintenant aborder la question de savoir si Apo-AIM contient plus ou moins d'information que Apo-AI. Nous utiliserons une approche formelle de la théorie de l'information appelée théorie de l'information algorithmique, qui convient pour comparer des systèmes à multiples fonctions et illustrera le cas plus clairement. Nous pouvons représenter formellement une fonction enzymatique comme un programme informatique qui exécute un ensemble donné de fonctions. Dans la théorie de l'information algorithmique, la taille du programme est directement proportionnelle à la teneur en information, à condition que les programmes soient écrits dans la même langue et avec une efficacité égale. Une enzyme à multiples fonctions doit avoir un programme plus long pour coder ses fonctions, par rapport à une enzyme qui exécute un sous-ensemble plus restreint de ces fonctions. Par conséquent, une enzyme exécutant à la fois les fonctions A et B doit nécessairement contenir plus d'information qu'une enzyme qui n'exécute que la fonction A ou seulement la fonction B.

Nous pouvons représenter notre analogie plus raisonnable dans la théorie de l'information algorithmique en envisageant l'Apo-AI de type sauvage comme un robot programmé pour remplir une voiture de carburant (dans l'esprit de l'analogie de la voiture de AiG, car l'activation de l'ACAT remplit les HDL de cholestérol). Pour accomplir cette tâche, un programme doit avoir une certaine longueur en bits. Maintenant, l'Apo-AIM serait comme un robot programmé pour remplir des voitures de carburant et reconnaître et remplacer les pneus crevés (une analogie pour l'activité de « réparation » antioxydante). Il est clair que ce programme doit être plus long que celui qui remplit simplement les voitures de carburant. Par conséquent, selon la théorie de l'information algorithmique, le programme plus long contient plus de bits d'information.

Plus d'informations techniques peuvent être trouvées sur cette page concernant la théorie de l'information algorithmique, et cette page contient une critique des idées de Werner Gitt. Une fois de plus, nous renvoyons les lecteurs vers cette page sur la formulation de l'information par Spetner pour des critiques spécifiques des idées de Spetner. Il est important de noter que les formulations de la théorie de l'information de Werner Gitt et les applications de la théorie de l'information par Lee Spetner n'ont pas été publiées dans des revues scientifiques et n'ont pas fait l'objet d'un examen par les pairs. Actuellement, elles sont simplement des concepts pseudo-scientifiques, totalement inutilisés par les chercheurs professionnels. Plus important encore, cependant, même en utilisant ces formulations, nous pouvons voir que Apo-AIM possède plus d'"information" de style AiG.

Les mutations homozygotes Apo-AIM sont-elles létales ?

De plus, AiG affirme que seuls les hétérozygotes de la mutation Apo-AIM ont été identifiés à ce jour,

"Cela pourrait suggérer que la mutation A-I de Milano chez l'homozygote (les deux gènes identiques) est létale."

Contrairement à l'affirmation de AiG, cette découverte n'est pas surprenante compte tenu de la rareté actuelle de la mutation de Milano. Les premiers travaux étudiant les porteurs hétérozygotes de cet allèle mutant n'ont identifié que 33 individus, après test génétique de tous les habitants d'un village isolé du nord de l'Italie (environ 1000 personnes, 15). Dans le pool génétique de ce village, où l'allèle mutant est originaire et qui présente une concentration extrêmement élevée de mutants Apo-AIM par rapport à d'autres populations humaines, l'allèle de Milano a une fréquence de seulement 1,65 % (33 allèles mutants sur 2000 allèles totaux de ce gène). En supposant que ces individus se reproduisent de manière aléatoire, il serait quelque peu surprenant de trouver un individu homozygote dans une population de 1000 personnes, car nous nous attendons à trouver un homozygote à une fréquence d'environ 1/3700 (la probabilité d'un homozygote est équivalente au carré de 0,0165). Cependant, il est connu que tous ces 33 individus sont des descendants d'un seul couple du XVIIIe siècle portant la mutation de Milano. Les humains se reproduisent avec des parents beaucoup moins aléatoirement que prévu, et par conséquent, la découverte d'un homozygote dans cette population de porteurs est hautement improbable. Ainsi, sur la base de nos connaissances actuelles concernant la distribution allélique, il n'y a aucune raison de soupçonner que les mutations de Milano homozygotes soient létales [voir Note].

De plus, des souris transgéniques ont été créées qui sont homozygotes pour le gène humain Apo-AI Milano, et elles sont en bonne santé (16). En fait, les résultats indiquent qu'il existe un bénéfice dose-dépendant pour l'allèle : un allèle mutant est meilleur que nul, mais deux sont optimaux. La physiologie et la biochimie de ces souris transgéniques (tant homozygotes qu'hétérozygotes) sont extrêmement similaires à celles observées chez l'humain. Ces faits ont incité les auteurs à conclure que les souris transgéniques Apo-AIM constituent un excellent système modèle expérimental pour étudier les effets de cette mutation bénéfique.

La mutation Apo-AIM et le mode de vie

AiG suggère également que même si la mutation Apo-AIM est bénéfique, les changements de mode de vie visant à réduire le risque de maladies cardiaques rendraient la mutation Apo-AIM inutile.

"Il va sans dire que si quelqu'un adopte un mode de vie sain, mange les bonnes choses (quelque chose comme la pyramide alimentaire, récemment révisée par l'École de médecine de Harvard, bien que cela puisse encore être amélioré), fait de l'exercice, maintient un poids sain et n'abuse pas de son corps en fumant, la mutation A-I de Milano sera probablement inutile. Des études épidémiologiques montrent que les maladies cardiaques peuvent probablement être évitées."

Bien qu'il soit vrai que les changements de mode de vie peuvent réduire les maladies cardiaques, la population originale Apo-AIM a été découverte en Italie. C'est le pays qui incarne le régime méditerranéen sain pour le cœur, un régime recommandé pour diminuer les maladies cardiaques (17). L'Italie présente moins de la moitié des cas de maladies cardiaques observés dans des régions comme l'Amérique du Nord. De plus, la population porteuse de l'Apo-AIM se trouve dans une communauté qui affiche des taux de maladies cardiaques encore inférieurs à la moyenne pour l'Italie elle-même (1, 15). Ainsi, la mutation Apo-AIM reste bénéfique même dans des populations saines présentant des facteurs de risque faibles pour les maladies cardiovasculaires.

Conclusions :

AiG affirme que la mutation Apo-AIM, qui entraîne une réduction du risque d'infarctus et d'AVC, provoque une perte de spécificité. Cependant, ces affirmations sont incorrectes. Au contraire, Apo-AIM est 1) d'une structure tertiaire plus complexe, 2) plus stable et 3) active l'efflux du cholestérol plus efficacement que Apo-AI. De plus, Apo-AIM possède une activité antioxydante absente chez Apo-AI, qui est spécifique de la séquence et du substrat. Ainsi, loin d'une perte de spécificité, Apo-AIM représente un gain de spécificité et d'"information" selon les propres mesures d'AiG. Contrairement à la suggestion d'AiG, toutes les preuves actuelles indiquent que la mutation Apo-AIM est bénéfique pour ses porteurs, qu'ils soient hétérozygotes ou homozygotes.

Références :

1. Franceschini G, et al. (1980) « A-IMilano apoprotéine. Diminution des taux de cholestérol des lipoprotéines de haute densité avec des modifications significatives des lipoprotéines et sans athérosclérose clinique dans une famille italienne. » J Clin Invest. 66, 892-900. [PubMed]

2. http://www.science.doe.gov/Science_News/feature_articles_2002/May/Milano_Mutation/Milano%20Mutation.htm

3. http://www.eurekalert.org/pub_releases/2000-02/CMC-bbgm-1502100.php

4. Soma MR, et al. (1995) « Dimère de l'apolipoprotéine A-IMilano recombinante inhibe l'épaississement intimal carotidien induit par la manipulation périvasculaire chez les lapins. » Circ Res. 76, 405-11. http://circres.ahajournals.org/cgi/content/full/76/3/405

5. Calabresi L, et al. (1999) « Efflux du cholestérol cellulaire vers des lipoprotéines de haute densité reconstituées contenant le dimère de l'apolipoprotéine A-IMilano. » Biochimie 38, 16307-14. [PubMed]

6. Bielicki et Oda (2002) « L'apolipoprotéine A-IMilano et l'apolipoprotéine A-IParis présentent une activité antioxydante distincte de celle de l'apolipoprotéine A-I de type sauvage. » Biochimie 41, 2089-2096. [PubMed]

7. Calabresi L, et al. (1997) « Lipoprotéines de haute densité reconstituées avec un dimère d'apolipoprotéine A-I lié par disulfure : preuve d'une hétérogénéité de taille de particule restreinte. » Biochimie 36, 12428-33. [PubMed]

8. Calabresi L, et al. (1997) « Activation de la lécithine cholestérol acyltransférase par un dimère d'apolipoprotéine A-I lié par un pont disulfure. » Biochem Biophys Res Commun. 232, 345-9. [PubMed]

9. Franceschini G, et al. (1990) « Apolipoprotéine AIMilano. Les dimères liés par des ponts disulfure augmentent la stabilité des lipoprotéines de haute densité et entravent l'interconversion des particules dans le plasma des transporteurs. » J Biol Chem 265, 12224-31. [PubMed]

10. Jia et al (2002) « Les peptides synthétiques porteurs de thiols conservent l'activité antioxydante de l'apolipoprotéine A-IMilano. » Biochem Biophys Res Commun 297, 206-213. [PubMed]

11. Kim SJ, et al., (2001) "Structure cristalline des fragments protéolytiques de la chaperonne redox-sensible Hsp33 avec activité chaperonne constitutive." Nat Struct Biol. 8, 459-66. [PubMed]

12. Thomas JA et Mallis RJ (2001) « Ging et oxydation des sulfhydryls de protéines réactives. » Exp Geront., 36, 1519-1526. [PubMed]

13. Long M (2001) « Évolution de gènes nouveaux. » Curr Opin Genet Dev. 11, 673-80. [PubMed]

14. Spetner, L. M. (1998) NOT BY CHANCE! Shattering the Modern Theory of Évolution, Judaica Press, New York.

15. Gualandri V, Franceschini G, Sirtori CR, Gianfranceschi G, Orsini GB, Cerrone A, Menotti A (1985) « Identification de l'apolipoprotéine AIMilano de la lignée complète et preuve d'une transmission génétique dominante. » Am J Hum Genet. 37, 1083-97. [PubMed]

16. Franceschini G, Calabresi L, Chiesa G, Parolini C, Sirtori CR, Canavesi M, Bernini F. (1999) « Augmentation du potentiel d'efflux du cholestérol des sérums des porteurs d'ApoA-IMilano et de souris transgéniques. » Arterioscler Thromb Vasc Biol. 19, 1257-62. http://atvb.ahajournals.org/cgi/content/full/19/5/1257

17. Curtis BM, O'Keefe JH Jr. (2002) « Comprendre le régime méditerranéen. Peut-être s'agit-il du nouveau « standard or » pour la prévention des maladies cardiaques ? » Postgrad Med. 112, 35-8. [Pubmed]

Note :

AiG a été informé de certaines erreurs présentes sur sa page de commentaires (tel qu'accédée le 17/3/03) ; après correspondance avec le Dr. Pirie-Shepherd, ils ont apporté plusieurs modifications (accédée le 23/3/03) mais n'ont pas reconnu le Dr. Pirie-Shepherd. À cette époque, ils n'ont pas clairement indiqué que l'approbation enthousiaste de l'élément de commentaire était destinée à la version précédente. AiG a été notifié lorsque cette page a été rendue publique [20/4/03]. Depuis lors, ils ont reconnu qu'ils avaient modifié la page, que l'approbation concernait une version antérieure et ont crédité le Dr. Pirie-Shepherd. Des erreurs significatives subsistent.

70 % des enzymes fabriquées se lient en paires (appelées dimères) et sont inutiles. est devenu
70 % des enzymes fabriquées se lient en paires (appelées dimères), limitant leur utilité.

..[T]l'enzyme a perdu son activité pour la production des HDL. Ainsi, l'enzyme mutante a sacrifié beaucoup de spécificité. est devenu
..[T]l'enzyme a perdu son activité pour la production des HDL. Ainsi, l'enzyme mutante a sacrifié sa spécificité.

Un paragraphe a été ajouté après que notre page ait été rendue publique [20/4/03], qui incorpore notre point concernant la raison de l'absence d'hétérozygotes humains, mais omet curieusement l'information selon laquelle les souris homozygotes pour le gène Apo-AIM humain sont parfaitement en bonne santé.

Comme nous l'avons vu, ces modifications n'améliorent pas substantiellement les erreurs, ni ne répondent aux critiques dans les e-mails originaux du Dr Pirie-Shepherd, ni aux critiques dans cet essai.

AiG a également retiré l'e-mail du Dr. Pirie-Shepherd de la réponse initiale aux commentaires, qui soulignait certaines erreurs dans les hypothèses concernant la réversibilité du processus de dimérisation. AiG reconnaît maintenant que la correspondance a eu lieu, mais déforme cette correspondance. AiG proteste également contre le fait que le Dr. Pirie-Shepherd soit un signataire de Project Steve, une parodie à la fois ironique et légère d'une tradition créationniste consistant à compiler des listes de « scientifiques qui mettent en doute l'évolution » ou de « scientifiques qui s'opposent au darwinisme ».

Remerciements :

Merci beaucoup à Chris Ho-Stuart, Adam Marczyk et Michael Hopkins pour leurs suggestions utiles, la relecture et la codification XHTML.

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